Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168270.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
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Warning! 124000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 110 of 147
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * ** ** * *
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* * * * * * * *
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AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAATTT
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*
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TTTAAATAATTATCTA
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* *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * **
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* * * **
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* * * *
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* * * * **
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* * * **
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* *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAATA
* * ** *
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* * * *
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* ** ** *
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* * * *
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** ** * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * **
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* * * * * *
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1 TTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAAT-
* * * * * * * **
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * * *
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* * * * * * ** *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAATA
* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * ** * **
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* * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ***
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* ** * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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127 TTCAAATAGTTATGACTATTTG----AATAATTATCTATTTC-AAATCTTATGACC
* * * * **
19801318 TTTTGTTTTATCATAAAAGAA-GGTTT-TAGTTCATATTAAGCCCTT-TTTGGGAATAAAATAAT
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* ** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAA-ATAAT
19801559 TACAATATTT
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0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
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* * * * * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
19798209 TTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTAT
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* * * * *
19798273 GACTTTCTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAC
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251 TCTGTTTACTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * **
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316 GAT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
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19798676 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTAAAAA-TAATAAGTAAAAATTTAA
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19798740 AAAATAAATAATTTTTTTAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
66 AAAATAAAT-ATTTTTTTAAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * *
19798805 ATCGTTATGACCTTTTATATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAAGCTTATATTGAA
129 ATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAAGCTTAT-TTGAA
* * * * *
19798870 TAAAATAATGCTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATG
191 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * *
19798935 TTTACT-AA-GTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCGAATTGCTATGA
255 TTTACTGAACAT--GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* *
19798998 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCACAT
318 T-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* * * **
19799037 AAGTTTA-TTCAAAATAAAATAAT-TCTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAAAGCT
1 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAAAAT
* * * * *
19799100 TTAAAAAATAAAT-TTGTTCATTGAACAAGTTCATATAGTTA-GATCCATTTG-------AGCTA
62 TTAAAAAATAAATATT-TT-TTTAAACAA-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTA
* * ** **
19799156 --TCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTCTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTT
123 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* *
19799219 AAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAACTAA
188 -GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * **
19799279 ATCTATTTA-TCGAACCAAT-TTT-AATAGTTATGGTTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA
250 ATCTGTTTACT-GAA-C-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * *
19799341 TTATAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTATATTCGTAC
312 TTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* ** * * * * * * *
19799385 AAGCTTAATTGTAGTAAATTATTATTAAATTAATAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT
** * * * * *
19799450 AAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAATTCAAGT-GATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTT
64 AAAAAATAAA--TATTTTTTTAAACAATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * **
19799514 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-TGTTT-TCAGCTCATGCATGTTTATACG
126 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
19799577 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAA
189 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AATAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * * ***
19799641 TCTATTT-TTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAAT
251 TCTGTTTACT-GAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTGTT
** ** *
19799704 ATGACCTTTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAA
314 ATGA--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* * * * * * * * *
19799747 AAGTTTATCTGAAATAAAATAATATGACTTTATTAATGTTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG-TA-AAAATT
* * ** **** * * * * *
19799812 TAAAAAA-AAGTTAGTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTT
63 TAAAAAATAA-ATA-TTTTTTTAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * ** * * * * * * * *
19799876 TAAATTGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATAAAAG-TCTATTCG
126 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT-TATT-T
* **
19799939 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAATTTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
188 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* *
19800003 TCTGTTTACCGAAC------CAAT--TCT-TG--TA--TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
251 TCTGTTTACTGAACATGTTTAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * *
19800055 TAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATAT
315 TGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATAC
* ** * * *
19800097 AAACTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT
* * * * * * * * *
19800162 AAAAAATTAATCTATTTGTTAAAACAGTTCAAACAATTAAGACTATATGGATAATTATCTATTTC
64 AAAAAA-TAA-ATATTTTTTTAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * *
19800227 AAATCGCTAAGACATGTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGTTTATTTGAAA
127 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG-AA
* * * * *
19800292 TAAAATAATATAGTAATTTATTAATATTTTCAAAA-T--TAATAAGTA-ATTTAAAAAGTGAA-C
191 TAAAAT-A-ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATAAG-AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *** *
19800352 TTGTTTACCGAATCA-GTTCAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTATCTATTCCAAATTGTTAT
253 -TGTTTACTGAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * ** *
19800416 TACCTTTTGTTTGGTCATATAAA-AATTGTATTTAAACATTC
316 GA-TTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTTTATTCATAC
* * * *
19800457 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AGAA-TTA
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
*** * * * * * ** *
19800519 AAAAATAAACCTA-TTTACCAAAGTAGTT-AAATAGTTCTGACTATTTGAACAATTGTAAACTTC
65 AAAAATAAA--TATTTTTTTAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * * * **
19800582 AAATCCTTATAACTTTTTGTATTGTCATAAAGCAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
127 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAA
* * * * * *
19800647 TAAAGTAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGCA-TCAAAAAATAAATTT
191 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-TAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * ** *
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254 GTTTACTGAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * *
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318 --TTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTT--ATTCATAC
* * * *
19800817 TAGCTTATTTGC-AATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT---GATTT
1 AAGCTTATTT-CAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAATTT
* * * * * *
19800878 AAAAAAT-AAT-TTTATTTACCTAACTAGTTTAAATAATTATGAGTATTTGAACAATTATCTATT
64 AAAAAATAAATATTTTTTTA---AAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * *
19800941 TCAAATCATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCACACAAGTTTGTTCAG
125 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TG
* * * * *
19801006 AATAAAGTAATACT-ATTCTATTAATATTTTGAATATTAAT-A-AA-AGATTTAAAAAATAAATA
189 AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
19801067 TATTTA-TCAAGC-TAGTTTAAATAGTTATAACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTA
253 TGTTTACTGAA-CAT-GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * *
19801129 TGATTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATAC
315 TGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* * * * * * *
19801171 AAGCTTA-TTCGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACATTTAATAAGTAAAAAAATT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT-AAAAATTT
* * * * * *
19801235 AAAAAAT-AAT-TTTGTTTACCAAACTAAATCAAATAATCATGATTATTTGAATAAATAATTATT
64 AAAAAATAAATATTT-TTT--TAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTG----AATAATTATC
* * * *
19801298 TATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAGAA-GGTTT-TAGTTCATATTAAGCC
121 TATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAG--
* *
19801360 CTT-TTTGGGAATAAAATAATAGCTAATTTATT-ATAATCCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAA
181 CTTATTT--GAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAA
* * * *
19801423 AAAATGAATCTGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAA
243 AAAATAAATCTGTTTACTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * *
19801488 ATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTTT-TTCATAC
308 ATTGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* *
19801535 AAGCTTATTTAAAAAAAACATAAT
1 AAGCTTATTTCAAATAAA-ATAAT
19801559 TACAATATTT
Statistics
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AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
AAAATAAATATTTTTTTAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
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TTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
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19798461 TGTTTTGTAA
* ** * * *
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*
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* * * *
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* * * * *
19798666 CTGTTCACGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTAAAAATAATAAGTA
195 ATATTCACACAAGCTTAATTCAAATAAAATAATATAAATTTAATAATATTTAAAAATAATAAGTA
** * * *
19798731 AAAATTTAAAAAATAAATAATTTTTTTAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
260 AAAATTTAAAAAATAAATAATTTGCTGAAACACATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT
* * *
19798796 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAAGCT
325 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATATTAGTCATAAAACAATTGTTTCTACTCATAAAAAGCT
* * **
19798861 TATATTGAATAAAATAATGCTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAA
390 TATATCGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAACAAAAATATTTAAAAA
* ** * * * * *
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455 ATAAATATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAGAATA
** * * ** *
19798991 GCTATGATCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTATTCACATAAGTTTAT-TCAAAATAA
520 AATATGACCTTTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTTATCT-AAAATAA
19799054 AATAATTCTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAAAATAAATTTGTTC
583 AATAATTCTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAAAATAAATTTGTTC
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648 ATTGAACAAGTTCATATAGTTAGATCCATTTGAGCTATCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTCTT
19799184 G
713 G
19799185 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATT
1 TAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATT
* * *
19799249 TCAAAAA-T-T-AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCGAACCAAT-TTT-AATAGTT
65 CCAAAAATTATGAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA-C-ATGTTTAAATAGTT
** *
19799308 ATGGTTATTTGAACAATTATCTATCTC-AAATCATTAT-A-ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
127 ATGACTATCTGAACAATTATCTATCTCAAAAT-ATTATGATAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* ** ** * * * *
19799370 TCTTTATATTCGTACAAGCTTAATTGTAGTAAATTATTATTAAA-TTAATAGTATTCTAAAAATT
190 TCGTTATATTCACACAAGCTTAATTCAAATAAAATAATA-TAAATTTAATAATATT-TAAAAA-T
* * * *
19799434 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCA-ATTCAAGT-GATTAAGACTATT
252 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT-AATTTGCTGAAACACATTCAAATAG-TTAAGACTATT
* *
19799497 AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTAGTCATAAAATAA-TGTTT-TCAG
314 AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATATTAGTCATAAAACAATTGTTTCT-A-
** * * *
19799559 CTCAT-GCATGTTTATA-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAATTAATAAAC
377 CTCATAAAAAGCTTATATCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAAT-AAC
* * *
19799621 AACAAAT-TTTAAAAAATAAATCTAT-TTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAAC
440 AA-AAATATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAC
** *
19799683 AATTATCTATTTATTATAAATATGACCTTTTTTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAA
502 AATTATCTATTTAGAATAAATATGACCTTTTTTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAA
*
19799748 AGTTTATCTGAAATAAAATAAT
567 AGTTTATCTAAAATAAAATAAT
19799770 ATGACTTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (713 bp):
TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTC
CAAAAATTATGAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACATGTTTAAATAGTTATGA
CTATCTGAACAATTATCTATCTCAAAATATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCGTTA
TATTCACACAAGCTTAATTCAAATAAAATAATATAAATTTAATAATATTTAAAAATAATAAGTAA
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ATATCGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAACAAAAATATTTAAAAAA
TAAATATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAGAATAA
ATATGACCTTTTTTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTTATCTAAAATAAAAT
AATTCTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAAAATAAATTTGTTCATT
GAACAAGTTCATATAGTTAGATCCATTTGAGCTATCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTCTTG
Found at i:19799860 original size:710 final size:701
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Indices: 19791642--19800333 Score: 1995
Period size: 719 Copynumber: 12.2 Consensus size: 701
19791632 TGGCCATTTA
* * * * * * *
19791642 AATAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTCGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAAT-A
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG--TTTCATTCA
* ** * * * * *
19791706 TAAAAGCCTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAAT-----AAGA
64 TACAAGTTTATAT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAACAAAAA
* * * *
19791765 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAG-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
127 TATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
*** * ** * * *
19791829 TATTTCA-AATTGTTATAACCTTTT-TTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTT
191 TATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTT-TATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTT
* * * * * * * **
19791892 ATTTAGAATAAAAATAA-TACTAATTTAGTATTATTCTAAAAATTATTAA-CTAAGAAATTTAAA
254 ATTCAAAAT-AAAATAATTA-TAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTAAA
* ** * * * ** *
19791955 AAATAAATCCA-TTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTACATGAACAATTATTTATTTTA
316 AAATAAAT-TAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTTAGAG-CCATTTGAAC----A--TA-TCTA
* ** * * * * * * * *
19792018 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTT-TGTTGATATAAGTT-TGTTCAAA
372 AATCGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAACAATTGT-TTCTATTCATAAAAATTAT-TT-GAA
* * * * *
19792081 ATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGGTTTAAAAAGTAAATC
434 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
19792146 TGTTTACTAAACC-ATTTCAA-A--TA--GTTTTG-ACTATT-TCTATTTCAAATCATTATAACT
494 TATTTAC-GAACCAATTTTAATAGTTATGGTATTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATAA-T
* * ** * * ** ** *
19792203 TCTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTCCTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
556 T-TTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA
* * * * * *
19792268 TTTAATAATATT-TCAAAACTTAATAACCATGAAA-A-TTAAAAAATAAATCTAATTGCTAAACC
619 ATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAA--GT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGTTAAAAC
* *
19792330 AATTCAAACAGTTAAAACTA-TATG
679 AATTCAAATA-TTAAGACTATTA-G
** * * * * * * * * *
19792354 AACGATTATTTGTTCCAAATTGTTGTGACCTTTTTCTTTTGTCTTAAAATAGTTGTTTTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCATTCAT
* * * * * * * ** *
19792419 ACAAGCTTTTTCT-AATTAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTTTAAAAATTAAT-AAGTAAGAT
65 ACAAG-TTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAACAAAAAT
* ** * * *
19792481 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TTAGTTCAAATAGTTAAGATTA-TTAGAATAATTATC
128 ATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATC
* *** * * * * * * **
19792544 CATTT-GAAATCGTTCTGACCTCTTGTTTAATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCCTA
191 TATTTAG-AATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTTA
* * * * * * *
19792608 TTCAAAATAAATTAA-TACTAATTTAGTAACATTC-GAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAA
255 TTCAAAATAAAATAATTA-TAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTT-AAAA
* * * * *
19792670 AATAAATCTATTTAAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATTA-CTATTTGAACAATTGTTGATTTAAA
317 AATAAAT-TAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-GAGCCATTTGAAC-A----T-ATCT-AA
* * * * * * * * ** ** *
19792733 ATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATGGAAT
373 ATCGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAATTATTTGAAAT
* * * * * *
19792797 AAAATAATACTAATTTATAAATACTTACTAAAAAAGTAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTAT
436 AAAATAATATTAATTTATTAATA-TT--TCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* ** ** ** * * * *
19792862 TTACCAAATTAGCTAAAATAATTATAGTTGT-TTGAACATTTATCTATTTCAAATGGTTATGACC
497 TTA-CGAACCAATTTTAATAGTTAT-G--GTATTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTAT-A-A
** * * * *
19792926 TTTCATTTTGTCATAAAA-CATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATACAATAATACTAA
555 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA
* * * * ** * *
19792990 TTTATTAATATT-TCAAACATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAT
619 ATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGTTAAAACAA
* *
19793054 TTCAAATAGTTATGACTATTTG
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125 AATATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAAG-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATT
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*** * * *
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492 -TCTATTTAC-GAACCAATTTTAATAGTTATG-GTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTA
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552 T-A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
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614 ATTAAATTAATA-ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGTTAAA
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCATTCAT
* * * * ** *
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65 ACAAGTTTATAT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-CAAAAATTAATAA-ACA-AAA
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126 ATATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* * * * * * * * ** * * * *
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190 C-TA-TTTAGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCAATTCACAAAAGT
* ** * * * *
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252 TTATTCAAAATAAAATAATTA-TAACT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTA
* ** ** * *
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314 AAAAATAAATTAGTTCATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAGAG-CCATTTGAACATATCTAAATC-
* * * * * * * * ** *
19794156 ATTCCAAATCATTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCGAAAT
376 GTTACAAA-C--TTCTGTTTTCTTATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATA-AAAATTATTTGAAAT
* * * * * * * *
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436 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA----TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* ** ** * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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619 ATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGTTAAAAC-AAT
* * *
19794475 TCAAAAAGTTATGACTATTTG
682 TCAAATA-TTAAGACTATTAG
** * * * ** * * * * * * ** * * *
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-ATTCAT
* ** * * * **
19794561 AAAAACTTAT-TTAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAA-
65 ACAAGTTTATATGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAACAAAAAT
* * * * * * * * * *
19794624 ATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAATCTAGATCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAGTAT-TC
128 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT-
* * * * * * * * * *
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192 ATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCAATTCACA-AAAGTTT
* * * * *
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254 ATTCAAAATAAAATAATTA-TAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAAA
* * * * * *
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374 TCGTTACAAAC-TTCTGTTTTCTTA-TAAAACAATTGTTTCTATTCA-TA-AAAATTATTTGAAA
* * * * *
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435 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATA--AG-AGATTT-AAAAAATAAATCT
* * ** ** ** * * *
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* * * * *
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554 ATT-TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATT
* * * *
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** *
19795191 AACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTG
676 AACAA-TTCAAATA-TTAAGACTATTAG
* * * *
19795219 AATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-ATTCAT
* * * *** * *
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127 TATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
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192 ATTT-AGAATA-AATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCAATTCACAAAAGTTT
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19795471 ATTTC-AAATACAATAA-TATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAA
254 A-TTCAAAATAAAATAATTAT-AACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAA
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19795533 AATAAA-TATGTTTTTTGAACTA-TTCAAATAGTCATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
317 AATAAATTA-GTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-GAGCCATTTGAA-CA-TATC----T-AA
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19795595 ATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAGCTTATTCGGAATAA
373 ATCGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTATTTGAAATAA
* * * *
19795660 AATAATAATAATTTATTTAA-ATTCCAAAAATTAATAGGTAAAACATTTAAAAGAAGT-AATCTA
438 AATAATATTAATTTA-TTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAA-AA-TAAATCTA
* * * ** * * * * * *
19795723 TTTACCAAGCTAGTTCAAATAGTTATGACTTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCT
496 TTTACGAA-CCAATTTTAATAGTTATG-GTATTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTAT-A-AT
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556 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAA
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19795853 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAA-TA--TGTTCAGCGAACAA
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* * * * *
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681 -TTCAAATA-TTAAGACTATTAG
* * * * * * * * *
19795938 AGCT-GTTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTT-ACTGTAAAATAATTATTTCCATTG
1 A-ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAATAATTGTTT-CATTC
* * *
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19796060 AGACTT-AAAAATCAAATCTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTA
126 ATATTTAAAAAAT-AAATATGTTTA-CGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTA
* *** * * * * ** * * *
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* * * * * * *
19796185 TTATTCGAAGTAAAAT-ATTATGAAATTAATAATATTCCAAAAATCAATAAG-TAAGAGATTTAA
252 TTATTCAAAATAAAATAATTAT-AACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTAA
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* * * * * ** * * * * *** * *
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** * *
19796373 AATAAAATAATGCTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAAATTTTAAAAAAATAA
433 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAA-T--T-AATAAGAGA-TTT-AAAAAATAA
* * * ** ** * * * * *
19796437 ATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGCTATGATTATTTGAACTATTATCTATTT-ATAAGAAGT
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* * * * * * * * * *
19796501 ATGACCTTTCGCTTTATCACAAAATGATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAA
551 AT-A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
** ** * * * * * *
19796566 TATTACTTTCTTGATATT-TCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTGAAAAAATAAGTCAATTTATC
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* * * *
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19796658 AACAATTATCTCTTTCAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTCATT-A
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG--TTTCATTCA
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19796722 TACAAGCCTAT-TAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAAA
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* * * * * * * * * *
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191 TA-TTTAGAATAAATATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTT
*** * * * * * **
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254 ATTCAAAATAAAATAATTA-TAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTAAAA
* * * * * * *
19796963 AATAAATCT-GTTTATCAAAGC-AGTTCAAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTATA
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*** **** * * * ** * *** *
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* * *
19797088 ATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCT
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** * * ** ** ** * *
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* * * * **
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555 -TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTA
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19797280 GATCTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCA
618 AAT-TAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAA-TTATTTGTTAAAACA
*
19797345 GTTCAAATATTTAAGACTA-TATG
680 ATTCAAATA-TTAAGACTATTA-G
* *
19797368 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAGTT-TTTCTGAATT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTC---ATT
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19797495 GAGATTTAAAAAAT-AATTTGGTTTACCTAA-CCAGTTTAAATAATTATAACTATTTAAATAATT
125 AATATTTAAAAAATAAATAT-GTTTA-CGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT
** * ** *** * *
19797558 ATCTATTTCA-AATAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAG
188 ATCTATTT-AGAATAAATATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAG
* * * * *
19797622 TTTGTT-AGGAATAAATTAA-TACTAA-TCTGTTAATATT-TCAAAAATTAAT-A---AAAGATT
251 TTTATTCA-AAATAAAATAATTA-TAACT-TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAAAGCTT
* * * * * * *
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312 TAAAAAATAAATTAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-GAGCCATTTGAAC-A-TA----TC
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19797741 TCAAATAGTTA-TTACTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATAT-
370 T-AAATCGTTACAAACTT-CTGTTTTCTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAATTATTTG
* * * * * * * *
19797804 AGATTAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATAAACAAGTAAAAATTTTTTAAAAATAA
432 A-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGA--TTTAAAAAATAA
* * * ** * * * * * *
19797869 ATATGTTTACTGAACTAGA-TCAAATAATCATGACTTCTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATT
491 ATCTATTTAC-GAACCA-ATTTTAATAGTTATG--GTATTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATT
*
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551 AT-AA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* * * * * * *
19797979 ACTAAGTT-ATCAATATTAC-GAAAATTAATAAG---AGACTTAAAAAATGAATCTTTTTGCT-A
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* * * **
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19798066 AATCATTTTCTTTTTGAAATTGCTACAACTTTTTGTTTTGTCATAATTTGATTTTTTTTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCATTCAT
* ** * * **
19798131 ACAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATAAGAATTTATTAATA-TAAAGATAATTAATAAGTAAAAC
65 ACAAGTTTA-TATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAA-A-AATTAATAAACAAAA-
* * * *
19798194 AT-TTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTAT
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* *** * * * * * * * *
19798256 TTATTTCA-AATTCTTATGA-CTTTCTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCT
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* * * * * * * * ** *
19798319 TACTCAAACTACAATAA-TATTAATTTATGAATATT-TCGACAATTAATAAGTAAAATTTTTAAG
253 TATTCAAAATAAAATAATTA-TAACTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAA
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19798382 AAATAAA-TATGTTTTTTGAACAAGTACAAATAGTCTTCA-CTATTTAAATAATTATCTATTTTA
316 AAATAAATTA-GTTCATCGAACAAGTTCAAATAGT-TAGAGCCATTTGAA-CA-TATC-----TA
* * * * * * * **
19798445 AATCATTGCGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAA
372 AATCGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAATTATTTGAAA
* * * *
19798509 TAAAATAATCTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAATAAGAGAATTAAAAAATGAATCTA
435 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* *
19798574 TTTACTGAA-C-ATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAATATTATGA
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* * ** *
19798637 TATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCACGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-T
554 -ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATT
* * * * *
19798701 AAATTTATTAATATT-TAAAAA-TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAATTTTTTTAAACAC
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* *
19798764 ATTCAAATAGTTATGACTATTTG
680 ATTCAAATA-TTAAGACTATTAG
* **
19798787 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAATAATTGTTTC-ATTCA
* * * **
19798852 TAAAAAGCTTATATTG-AATAAAATAATGCTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAAT-AAGTAAA
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* ** * * *
19798915 ATATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATT
126 ATATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
* *** * * ** *
19798980 TATTTCGAATTGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCACATAAGTTTAT
191 TATTTAGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTTAT
* *
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256 TCAAAATAAAATAATTATAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAAAATA
* * * * * **
19799110 AATTTGTTCATTGAACAAGTTCATATAGTTAGATCCATTTGAGC-TATC-AAATCGTTA-TGACA
321 AATTAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTTAGAGCCATTTGAACATATCTAAATCGTTACAAAC-
* * * *
19799172 TTTTGTTTTCTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATATCAA
385 TTCTGTTTTCTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAATTATTTGAAATAAAATAATATTAA
*
19799237 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAATTTTA
449 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAATTTTA
* *
19799302 ATAGTTATGGTTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATAATCTTTGTTTTGTCATAAAAC
513 ATAGTTATGG-TA-TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATAAT-TTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * * * *
19799367 AATTCTTTATATTCGTACAAGCTTAATTGTAGTAAATTATTATTAAATTAATAGTATTCTAAAAA
574 AATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAATTAATAATATTCTAAAAA
* * * *
19799432 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAATTCAAGTGATTAAGACTATT
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19799497 AG
700 AG
* *
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCA-TTCA
* * * *
19799563 TGCATGTTTATACGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAACAACAAAT
64 TACAAGTTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAATTAATAAACAA-AAAT
* * *
19799628 -TTTAAAAAATAAATCTAT-TTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATC
128 ATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
** *
19799690 TATTTATTATAAATATGACCTTTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTA
191 TATTTAGAATAAATATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTTA
* * * * * *
19799754 -TCTGAAATAAAATAA-TATGACTTTATTAATGTT-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTTAAA
255 TTC-AAAATAAAATAATTATAAC-TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAAAG-CTTTAAA
* * *** * *
19799816 AAA-AAGTTAGTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTG-GCCATTTGAACAATTATCTATTTTAA
316 AAATAAATTAGTTCATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTAGAGCCATTTGAAC-A-TATC-----TAA
* * * * * *
19799879 ATTGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATAAAAGTCTATTCGGAAT
373 ATCGTTACAAACTTCTGTTTTCTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAAT-TATTTGAAAT
*
19799943 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAATTTTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
436 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA----AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* *
19800007 TTTACCGAACCAA---T--T--CT-T-GTA-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTT
496 TTTA-CGAACCAATTTTAATAGTTATGGTATTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATAA--TT
* * * * * * *
19800062 TTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTTGGAATAAAATAATATTAATT
557 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAAT
* * * *
19800127 TAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTGTTAAAACAGTTC
621 TAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGTTAAAACAATTC
*
19800192 AAACAATTAAGACTA-TATG
684 AAA-TATTAAGACTATTA-G
* * * * *
19800211 GATAATTATCTATTTCAAATCGCTAAGACATGTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-ATTCAT
* * *
19800276 ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATAGTAATTTATTAATATTTTC-AAAATTAATAA
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Statistics
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Consensus pattern (701 bp):
AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCATTCATA
CAAGTTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAATTAATAAACAAAAATATT
TAAAAAATAAATATGTTTACGAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCACAAAAGTTTATTCAAA
ATAAAATAATTATAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGCTTTAAAAAATAAATTA
GTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTTAGAGCCATTTGAACATATCTAAATCGTTACAAACTTCTGT
TTTCTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTA
ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGAACCAATTTTAATAGTTAT
GGTATTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATAATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTATT
CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAG
ATTTAAAAAATAAATTATTTGTTAAAACAATTCAAATATTAAGACTATTAG
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19799849 TTTGGCCATT
* * * *
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* * * ** * *
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* * **
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*
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*
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Statistics
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TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTCTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTTACATC
ATAAAACTCTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAG
ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCTTGTA
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** * * * * * * *
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** * *
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* * ** * * * * * *
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* * *
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* * *
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** * *
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323 GTTCAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTATTTGGTC
* ** * *
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388 ATATAAAAAATGTATTTAAACACACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
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*
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517 TATTT-AAGCAATTATAAAC
*
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* * * *
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* * * *
19800709 TTGTTTGCCAAACCAATTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
129 TTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTAAG
* * * * * * *
19800774 ACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGCAATAAAATAA
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* * *
19800839 AAT-G-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAAT-AATTTTATTTACCTAA
256 AATAGTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAATTTAAAAAATGAA-CTTATTTACCGAA
* * *** * *
19800901 -CTAGTTTAAATAATTATGAG-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATT
320 TC-AGTTCAAATAATTATG-GCCATGCCAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTATT
* * ** *
19800964 TTGTCATA-AAACAAATGTTTTTATTCACACAAG-TT-TGTTCAGAATAAAGTAATACT-ATTCT
383 TGGTCATATAAA-AAATGTATTTAAACACACAAGCTTAT-TTCA-AATAAAATAATACTAATT-T
** * * * *
19801025 ATTAATATTTTGAATATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAGCTAGTTTAAATA
444 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGAATTAAAAAATAAACATATTTACCAAGCTAGTTTAAATA
** *
19801090 GTTATAACTATTTAAGCAATTATTTAT
509 GTTATAACTATTTAAGCAATTATAAAC
* * * * * * * *
19801117 TTCAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCCTTATAACTTTTTGTATTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * * * * *
19801182 ATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACATTTAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAATTT
66 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT-AAAAGATTAAAAAATAAATT
* * *
19801247 TGTTTACCAAACTAAATCAAATAAT
130 TGTTTGCCAAACCAATTCAAATAAT
19801272 CATGATTATT
Statistics
Matches: 567, Mismatches: 109, Indels: 33
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (535 bp):
TTCAAATCCTTATAACTTTTTGTATTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTAAAAAATAAATTT
GTTTGCCAAACCAATTCAAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTAAGAC
ATGTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAAATAG
TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAATTTAAAAAATGAACTTATTTACCGAATCAGTT
CAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTATTTGGTCATA
TAAAAAATGTATTTAAACACACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
AAAATTAATAAAAGAATTAAAAAATAAACATATTTACCAAGCTAGTTTAAATAGTTATAACTATT
TAAGCAATTATAAAC
Found at i:19805376 original size:181 final size:182
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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129 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * * **
19804831 TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGATTCAGCAAACCTATTTATTTTTAAA-
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAAT
* * *
19804894 -TC-T-CTTATTAATTATAGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAAT-AAGCTTGT
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** * * * *
19804954 ATGATA-AAAAACAATTATTTTATGAGAAAAC-AAA-GATCATAATGATTTGAGA
129 ATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * * ** *** * *
19805006 TTGATATTTGTTTAAACAGTCATAATTATTT-AAAATGATTCAAAAAATAGCTTTAATTTTTAAA
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTT-ATTTTTAAA
* * * * * * * *
19805070 TCTCTTGCATA-TAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGTTTT
64 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AAGCTTG
* *
19805132 TATGAATTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTT-ATAATGACTTT-AAA
128 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGA-TTTGAAA
* * * * *
19805186 TAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCAATTTCAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTGAAT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAAT
* * ** * * *
19805250 CTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAACAAATTAGTATCATTTTATTCTGAATAAAGCTTGTA
65 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTGTA
* * *
19805315 TGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTCA-AATGATTTGAAA
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* * * * * * *
19805367 TAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAATTATTTGAACTGGTTCAGCAAACACATTTATCTTTTTAAA
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA--TTTTTAAA
* * * *
19805432 TCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGCA-TATTTTAATC-GAAT-AAGCTTGT
64 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTGT
** * * * * *
19805494 ATGAAAAGAAACACTTGTTTTATGACAAAA-TAAA-GATCATAAAGATTTGAGA
129 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * *
19805546 TAGATAATTGTTGAAATAGTCATAAATATTTGAACTAT-TTTGGT-AATAGATTTTGTTTTTAAA
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTAAA
* *** * * ** **
19805609 --TC-T-CTTATTAATTATCAAAATATTAATAGATAAGTATTATTTTATTCTGAAT-AATTTTAC
64 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTGT
* * *
19805669 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATTATGATTTGAAA
129 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * *
19805722 TAGATAATAGTTCAAAT-GAACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
1 TAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAA
** * * * ** * *
19805786 TCTCAAACTTATTAATTTTTAGAAAATTAATAAATTAATAGGATTTTATT-TCAAATAAA-ATTG
64 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAAGCTTG
*
19805849 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAA
128 TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * ** *
19805903 TAAATAATTATTGAAATAGTTA-AACTATTTGAACTTACTCGGTAAACAGATATATTTTTTAAAT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
* * *
19805967 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAA-AAAGCTTTT
65 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAAGCTTGT
* * * *
19806030 ATGAACAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGTTTTGAAA
129 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
19806083 TAAATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTGAAAT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTT-AAAT
*
19806148 -T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTC-GAA-ATAAGCTTG
65 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AAGCTTG
* * * *
19806208 CATGAA-TAGAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTT-ATAATGTTTTGAAA
128 TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
19806262 TAGATAATTTTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTCTTTTTTTAATT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATT-TATTTTTAAAT
* *
19806327 CTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA-TCT-TTCTTGAA-ATAAGC-TG
65 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-TGAATA-AAGCTTG
* * * *
19806388 ATATAAACTGAAACAAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGG-TCATAATGATTTGAAA
128 -TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * ** * *
19806443 TAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAAT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
* * * *** * * * *
19806508 CTTTTACTTATTAATATTT---ATA-AAATCCCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTATATT
65 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-TATT-A-TTTT--ATTCTGA--ATA-A
* * * ** * * * * * * *
19806569 AGTATTGTTTTATTTCG-AATAATTATTTTATGACATAAGAAAAAGTT-ATAACGATTTGAAG
122 AG-CTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * * * *
19806630 TATAGAATTGTTTAAAAAGTAATAACTATTTGAACTAGTTTGGTATATAGATTCATCTTTTAAAT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTAAAT
* * * * * * *
19806695 CTATTACTTAATAATTTTTGAAAGATTAATAAATTATTAATATTTTATTTTGAAT-AAGCTTGTA
65 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTGTA
* * * ** **
19806759 T-AA-TAAAAAACAATTGTTTTATGACCAAACAAAATG-TGGTAACAATTTGAAA
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* *** * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAATA-CATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAATACATTTAT-TTTTTAAA
* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * ** **
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* *
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* * * * ** * * *
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1 TAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAATACATTTATTTTTTAAA
** * * * ** **
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* * *
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130 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
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195 AAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTCATTA
** * * *
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259 ATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAAGCTTGTATGAACAGAAACA
* * *
19806043 ATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAA
323 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * *
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1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCAGAAAATACATTTATTTTTTAAA
*
19806147 T-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTG
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* * * * * * *
19806208 CATGAATAGAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAATTTT
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* * * * * *
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** * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAATACATTTATTTTTTAAAT
*
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Statistics
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CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
AATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTCATTAAT
TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
Found at i:19806293 original size:540 final size:534
Alignment explanation
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Period size: 540 Copynumber: 3.5 Consensus size: 534
19804639 GCTAAGAGGG
* *
19804649 TAGATAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTGATAAA-AAGATTTATTTTTTCAA
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAA-ATTTATTTTTT-AA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
19804778 ATGAATTGAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATT
129 ATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * *
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* * *
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* * * * * * *
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322 ATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA
* * * * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * * *
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319 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* ** ** * * * **
19805569 AAATATTTGAACTATTTTGGTAATAGATTTTGTTTTTAAA-TCTCTTATTAATTATCAAAATATT
384 AAATATTTGAACTGTTCAGAAAATAGA-TTTATTTTTAAATTTTCTTATTAATTTTTGAAATATT
* * *
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* * *
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* * * *
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1 TAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * ** *
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65 TCTCATACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTA
* * *
19805851 TGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATT
130 TGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * *
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* * * * * *
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259 AATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATATCGAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAA
* * * * * * * *
19806044 TTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATAAATAATTCTTCAAATAGTCATAAC
323 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA
* *
19806109 TATTTGAACGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTGAAATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
387 TATTTGAAC-TGTTCAGAAAATAGATTTATTTTT-AAATTTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
19806174 ATAAATTTAAATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGATAAAA
449 ATAAA--TAAATTATTTTATTCGAAATAAGTTTACATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
*
19806239 CAAAAGGTTATAATGTTTTGAAA
512 CAAAAGGTTATAATGATTTGAAA
* * * * * *
19806262 TAGATAATTTTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTCT-TTTTTTAAT
1 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATT-TATTTTTTAAA
* * * * *
19806326 TCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTT-CTTGAAATAAGC-TGA
65 TCTCATACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCAAATAAACTTG-
* * * * *
19806389 TATAAACTGAAACAAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
128 TATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * *
19806454 TCAAATAGT-TATGACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
193 TCAAATAGTCTA-AACTATTTGAAC-TGATTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
19806517 ATTAAT
256 ATTAAT
19806523 ATTTATAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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539 26 0.02
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TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
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GAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
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TTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATATCGAATAAGCTTGTATGAAAGAAACAATTG
TTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATT
TGAACTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAATTTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATA
AATTATTTTATTCGAAATAAGTTTACATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT
ATAATGATTTGAAA
Found at i:19806526 original size:26 final size:26
Alignment explanation
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19806486 TAAATATATT
* **
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* *
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19806553 GGAATATTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TATTTTTAAAATCCCTTACTTATTAA
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19806695 CTATTACTTA
* *
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* * * **
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* **
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* * ** *
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*
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Statistics
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ATAATTGTTGAAAGATTAATAAATTATAAATATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAATAAAAAAC
AATTATTTTAAGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAG
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19806839 AAATTATTTT
* *
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* * * *
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131 TTAAACTCCTGGTTATTAATTTTTTTTAAAAAA
* * * * *
19807012 ATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCATAACGAT
1 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTAAGAT-AAAACAAAAGATCATAACGAT
* * * * *
19807076 TTTATATAAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAGATTTATTT
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19807141 TTT
129 TTT
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Statistics
Matches: 114, Mismatches: 16, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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ATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTAAGATAAAACAAAAGATCATAACGATT
TTAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTT
TTAAACTCCTGGTTATTAATTTTTTTTAAAAAA
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* * * * * * * *
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* * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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128 TTTAAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATAAATA
* * * * * * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
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* * * * *
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** * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * * * **
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* ** * * * **
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* * * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* ** * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * ** * ** * * *
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* * * ** * **
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* * * * * * *
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** * * ** *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * **** *
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66 GTCATAACTATTTGAAAT-GTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T
* * * * ***
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* * * * * * * *
19808479 AAAACAATTG-TTTATAACAAAA-CAAAAGGTAATAATGATTT-AAGATTGATAGTTGTTTAAAT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * * *
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65 AGTC-ATAACTATTTGAAATG-TTTGGCAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * * * **
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* * * * * * * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * ** *
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66 GTCATAACTATTTGAA-ATGTTTGGCAAATAGATTTA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-T
* * * * * * *
19808787 TTTTGAATGTCAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACT-
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* * * * * * * * * *
19808841 GAAATAATTATTATATGACTAAA-CAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * *** *
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66 GTCATAACTATTTGAAATG-TTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T
** **
19808966 CAAAATATTTTTAAATTAGTATTATTTT
129 TTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
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Statistics
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19809331 CTTTATTTCG
** *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * ** * * *
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* * **
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* * * * * *
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* * **
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* * * * * * * *
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* * *
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* * ** * ** * *
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1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
19810663 ATTTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGAT-ATAAAACAATTATTTC-AGTTTATACAAG
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* * ** ** * *
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* * * * * * * * * *
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1 AAAGATTTAAAA-AATAAATATGTTTACGAACATGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-
* * *
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* * * * *** * *
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* * * ** * * * *
19810965 AGAGATTTAAAAACTAAAACCAT-TTTTTGAAC-TAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTCAACAAA
1 AAAGATTTAAAAAAT-AAA-TATGTTTACGAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
19811028 TATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTTTTCTCATAAAACAACTATTTTTGA-TCATCCAA
63 TATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * * *
19811090 GCTTA-TTAAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-AG--
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* * ** * * * *
19811142 -GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAAC-TAGTTAAAATAGTTAAGAAC-ATTAGAATAAT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAACAT-GTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
19811204 TATCTATTTCAAATCGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATATAATAATT-TTTTTACTTCATACAAG
63 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * ** *
19811268 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-----TATT--TATTTC
127 CTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* ** ** * * * * * *
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1 AAAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACGAACATGTTCAA-A-TAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
19811366 ----TATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTT-TAGCTCATACACG
63 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * ** * * * *
19811426 CATATTAGGAATAGGATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTA
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* * * * * * * *
19811480 AGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTATCGAACCA-GTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * **
19811544 ATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTAATCAAACTATTG-TTCTGTTCATACTATTT
64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * * **
19811608 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCA
129 TATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
19811660 AGAA-AATTAAAAAATAAAT-TGAATTGT-CGAA-TTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAACT
1 A-AAGATTTAAAAAATAAATATG--TT-TACGAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** *
19811721 ATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAA
61 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * ***
19811785 GCTTATTCT-AATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAG--
126 GCTTATT-TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * * *
19811838 --AGATTTAAAAACTAAATTTATTTACTGAA-TTAATTCAAATGGTCAAGACTATTAGAATAATT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
19811900 ATCTATTTGAAATTATTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-TTCCA---ATATAAGC-
64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * * ** *
19811960 TAATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAGCATT-CAAAAATTAATGAG-A
129 TATTTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
19812011 AAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTAC---CAT-TTGAGCA-A--T-TGTCTATTT-AA-AAT
1 AA-AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACGAACATGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAA-
* * ** * * ** * * *
19812066 TGTTATAACTTTTTGATTTGTCA-TA-AAACAATTGTTTAAGT--TAATACAA--G-CT-TAGTT
62 --TTAT--CTATTTCA--AATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * ** * * * * *
19812123 CGAATA-AA-ATAATATT--AATTTATTAATATT--TTCTA--AA-A-T--AATAAGTAAAAAAT
119 C--ATACAAGCTTAT-TTGAAATAAAATAATATTAATT-TATTAATATTCCAA-AAATTAATAAG
*
19812176 TT
179 TA
* ** *** * * * * **
19812178 AAA-A---AATAAATCTAT-TTACT--GAATCA-ATT-AAAGTAATTATGGCTATATGAATGATT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAA-CATGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
19812234 ATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTT-TTTATCATTCAAGC
64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGC
* * *
19812298 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
128 TTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
19812351 AGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTATCGAACCA-GTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
19812415 ATCAATCTCAAAT-GTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGA-TCATAGAAGC
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** * *
19812477 TTATTTG-GTTAAATATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG--
128 TTATTTGAAATAAA-ATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * ** * *
19812528 --AGATTTAAAAAAAAAATTTATTTGTCAAACCA-GTTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * ** * * * * *
19812590 ATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTACTTATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACATGC
64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGC
* * *** * ** *
19812654 TTTTTTGGAATAAAATAATCCCAATTTATTAAAATTTGAAAAATTAATAAGGA
128 TTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* **
19812707 AAATATTTGAAAAAATAAATTCAT-TTGT-CGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 AAAGATTT-AAAAAATAAA-T-ATGTT-TACGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
19812770 TTAAT-TATTTAAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGAT-ATAAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAA
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*** * * *
19812832 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAA--A
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* * * * **
19812887 CAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTTTTTATTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 AAAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTA-CGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * * *
19812952 TGTCTATTGAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCAATTCATATAAGT
63 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * *
19813017 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAATTA
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* * * * * * * * * *
19813070 AGAGA-TTAAAAAGTGAATCTGTTCACCAA-ATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATT
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* * * * * *
19813133 ATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCGTACAAGT
64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGC
* * * *
19813197 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTA
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19813250 AGAGATTTACAAAAA-AAATATGTTTACCAA-ATTAGTTTAAATAGTTATGAC-ATGTGAACAAT
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* * * * * * * * **
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63 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * * * *
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* * * * * *
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1 AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
19813491 TATCTATTTTAAATC---AT----TTTTGTTTTGCCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATA-ATAG
63 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AG
* * *
19813548 CTTA-TTGAGAATAAAATAA-ATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTA
127 CTTATTTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
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1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
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64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * *
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128 TTATTTGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
19813781 --AGATTTAAAAAAT-AA-ATGTTTCTCAAACCA-ATTCAAATAGTTATAACTATTTGAGA-AAT
1 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAAT
* * * * * * * *
19813840 TATTTATTTCAAAAT-TTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTCTATTCATACAAG
63 TATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * ** * *
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127 CTTATTTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * *
19813958 AAA-ATCTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTTGACCAAATTGTTATGACTATTTGAATAAAT
1 AAAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
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64 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* ** * * *
19814086 ATTATTCAAAATAAAGTAATACT-ATGTTATTAAT-TTCCAAAAATTAATAATTA
127 CTTATTTGAAATAAAATAATATTAAT-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
19814139 AGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAACAATT
1 AAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTA-CGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
*
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19811293 TTTATTAATA
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* *
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* *
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19811169 GAACTAGTTA
* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * **
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TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTT
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*
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*
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TTCAAATAATTATAACTAT
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* * *
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* * * * * ** * *
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* **
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * **
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* * * **
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*
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* * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* * ** * * ** ** * * *
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1 AAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTAT--CTATTTCA--AATCATTATGAC-CTTTTATTTAG
* * * * *
19812106 T--TAATACAA--GCTTAGTTCGAATA-AA----A--TAAT--ATTAAT--TTA-TTAATA-T-T
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
19812270 TAAAATAATTATTTTTTATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * ** **
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* * * * ** *
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* ** * * * * *
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1 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAA
* * ** * * * * * * * *
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66 AACAATTGTTTTGT-TCATACAAGCTTATTT--AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAA
* * * ** *
19812694 AAATTAATAAGGAAAATATTTGAAAAAATAAATTC-ATTT-GTCGAACAAATTC
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* * * * * * *
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1 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAG-TCAT
* * * ** ** *
19812809 AAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTC
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* * * * ** *
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* * * * ** * * * *
19812927 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAA
*** * * * * * **
19812992 AACAATTGCTTCAATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAA
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* * * * **
19813057 AAACTAATAATTAAGAGA-TTAAAAAGTGAA-TCTGTTCACCAAATTAGTTC
127 AAA-T-TTAA-TAAGAGATTTAAAAA-TAAATTCTATTTACTGAATTAGTTC
* * * * ** * * * * *
19813107 AAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATAT
1 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAA
* * * * * *
19813172 AACAATTGTTTTTGATCGTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAA
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* * * ** *
19813237 AAATTAATAAGTAAGAGATTTACAAAA-AAAATATGTTTACCAAATTAGTTT
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* * * * * * *
19813288 AAATAGTTATGAC-ATGT-GAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTGT-TCTA-TCAT
1 AAATAGTTAAGACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TATTTAGTCAT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
19813639 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGGT-GTA
1 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-ATTTAGTCATA
* * * * * * * * * * *
19813703 AAATAAATGTTTTTGTTCATATATGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACTAATCTATTAGTATTTC
65 AAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTT--AAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTT
* * * ** *
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126 AAAATTTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATTCTATTTACT-GAATTAGTTC
* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** **
19813941 TTGACAA-TTAATAAGTCAAAATCTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAACTT-GACC
123 TTTAAAATTTAATAAG---AGAT-TT-AAAAATAAATTCTATTTACTGAA-TTAGTTC
* * * * * * * *
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19814061 AA
66 AA
19814063 AAAATTATTT
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Matches are distributed among these distances:
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AACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAT
TTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTCTATTTACTGAATTAGTTC
Found at i:19814203 original size:712 final size:712
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Indices: 19812075--19814216 Score: 1491
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19812065 TTGTTATAAC
* * * * * * * *
19812075 TTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTAATACAAGCTTAGTTC-GAATAAAATAATAT
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* ** * ** * *
19812138 TAATTTATTAATATTTTCTAAAA-TAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTGAA
64 TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAACAAGAGCTTAAAAAAATAAAT-TTTTGTACTGAA
* * * ** ** * *
19812201 TC-AATT-AAAGTAATTATGGCTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTT
127 -CAAATTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTGTT
* * * ** * * * *
19812264 TTATCATAAAATAATTAT-TTTTTA-TCAT-TCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
190 TTGTCATAAAACAA--ATGCTTCAATTCATAT-AAGTTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTA
* * * * * * * *
19812326 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTT-ATCGAACCAGTTTA
252 TTAATATTCCAAAAACT-ATAATTAAGAGA-TTAAAAAATAAATCTG-TTCACCAAACCAATTCA
* * * * * * * *
19812390 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAAT-GTTAAGATC-TTTGTTTTG-TCATAA
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* * ** * *
19812452 AACAATTA-TTTCTGATCATAGAAGCTTATT-TGGTTAAATATAATACTAATTTAATAATATTCC
378 AACAA-TAGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCAGAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * ** ** *** **
19812515 AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTATTTGTCAAACCAGTTTAAATAGTTAAAA
441 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTACAAAAAAAATATGTTTACCAAATTAGACCAAATAGTTATGA
* * * * ** * * * * *
19812576 CTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTT-TACTTATAAAATATTTGTT
506 C-ATGT-GAACAAATATATACTTCAAATCATTATAACC-TTTGTTCTA-TCATAAAAAAATTATT
** * *** * *** * * * * * **
19812639 TCATATCTTACATGCTTTTTTGGAATAAAATAATCCCAATTTATTAAAATTTGAAAAATTAATAA
567 TCAGCTCATACAAAATTATTCAAAATAAAA-AATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAA
* * ** * * * * * *
19812704 GGAAA-ATATTTGAAAAAATAAATTCAT-T-TGTCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGA
631 -CAAAGAGATTT-AAAAAATAAA-T-ATGTCTACCAAACAAGTTCAAATAATTAAGACTATATCA
* *
19812766 ACAATTAAT-TATTTAAAAACATTA
692 ACAATT-ATCTATTT--GAA-ATCA
* *
19812790 TGACCTTTTGTTTTGATATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT
1 T----TTTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT
* * * *
19812855 ACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTTTTTATTGAA
62 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGCTTAAAAAAATAAATTTTTGTACTGAA
* *
19812920 CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
127 CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
* * * *
19812985 GTCATAAAACAATTGCTTCAATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
192 GTCATAAAACAAATGCTTCAATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTATTAAT
* * ** *
19813050 ATTCCAAAAACTAATAATTAAGAGATTAAAAAGTGAATCTGTTCACCAAATTAGTTCAAATAATT
257 ATTCCAAAAACT-ATAATTAAGAGATTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAACCAATTCAAATAATT
** * * * *
19813115 ATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTG
321 ATAACCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGATCATAAAACAATAG
* * * ** *
19813180 TTTTTGATCGTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT
386 TTTCTGATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
***
19813245 AAGTAAGAGATTTACAAAAAAAATATGTTTACCAAATTAGTTTAAATAGTTATGACATGTGAACA
451 AAGTAAGAGATTTACAAAAAAAATATGTTTACCAAATTAGACCAAATAGTTATGACATGTGAACA
* * * ** *
19813310 ATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGCTCATACAAG
516 AATATATACTTCAAATCATTATAACCTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTCAGCTCATACAAA
* * *
19813375 CTTATTCAAAATAAAAAATATTAATATAATAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAA
581 ATTATTCAAAATAAAAAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
19813440 AATAGATTTGTCTACCTAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTTAAAT
646 AATAAATATGTCTACCAAACAAGTTCAAATAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTGAAAT
19813505 CA
711 CA
* ** * * ** *
19813507 TTTTTGTTTTGCCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATAATAGCTTATTGAGAATAAAATAA-A-TG
1 TTTTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-
***
19813570 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGACTT-AAAAAAT-AATTTTGTGTACCT-AA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAG-CTTAAAAAAATAAATTTT-TGTA-CTGAA
* * ** *
19813632 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
127 CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
* * * *** * * **
19813697 GGT-GTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATATGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACTAATCTATTA
192 -GTCATAAAACAAATGCTTCAATTCATATAAGTTTATTCAAAAT-AAAAAAATACTAATCTATTA
* * * * *
19813761 GTATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-TTC-TCAAACCAATTCAAATAG
255 ATATTCCAAAAACTATAATTAAGAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAACCAATTCAAATAA
* * * * * * *
19813821 TTATAACTATTTGAGA-AATTATTTATTTCAAAAT-TTTATGACTTTTTGTTCT-ATTATAAAAT
319 TTATAACCATTTCA-ACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTT-TGATCATAAAAC
* * *
19813883 AATAGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-GAC
381 AATAGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAA
*
19813946 AATTAATAAGTCAA-A-ATCTTA-AAAAATAAATATGTTTACCAAACTT-GACCAAATTGTTATG
444 AATTAATAAGT-AAGAGAT-TTACAAAAA-AAATATGTTTACCAAA-TTAGACCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
19814007 ACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTATT
505 AC-ATGTGAACAAATATATACTTCAAATCATTAT-AACCTTTGTTCTATCAT-AAAAAAATTATT
* * * * *
19814072 TCAGTTCATATAAAATTATTCAAAATAAAGTAATACT-ATGTTATTAAT-TTCCAAAAATTAATA
567 TCAGCTCATACAAAATTATTCAAAATAAA-AAATACTAAT-ATAATAATATTCCAAAAATTAATA
** * * *
19814135 ATTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATA-ACTATTTCAA
630 ACAAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGTTCAAATAATTA-AGACTATATCAA
19814199 CAATTATCTATTTGAAAT
693 CAATTATCTATTTGAAAT
19814217 TGCTATAAAC
Statistics
Matches: 1143, Mismatches: 232, Indels: 107
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
707 8 0.01
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724 45 0.04
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (712 bp):
TTTTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGCTTAAAAAAATAAATTTTTGTACTGAACAAA
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAAATGCTTCAATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTATTAATATTC
CAAAAACTATAATTAAGAGATTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAACCAATTCAAATAATTATAAC
CATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGATCATAAAACAATAGTTTCT
GATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
AGAGATTTACAAAAAAAATATGTTTACCAAATTAGACCAAATAGTTATGACATGTGAACAAATAT
ATACTTCAAATCATTATAACCTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTCAGCTCATACAAAATTAT
TCAAAATAAAAAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAA
ATATGTCTACCAAACAAGTTCAAATAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTGAAATCA
Found at i:19814540 original size:181 final size:175
Alignment explanation
Indices: 19814274--19814870 Score: 535
Period size: 181 Copynumber: 3.3 Consensus size: 175
19814264 ACAAATTTAC
* * **
19814274 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATCTTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
** * * *
19814338 TATTTGAACAATT-TTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGATTTGTCATAAAACAATTATATCT
64 TATTCAAACAATTATCTATTTTAAA-TGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TCT
* * * *
19814402 GATTATATAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACA
126 G-TTATAAAAGCTTATTCA-A-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTCT-AAA
* * *
19814456 AA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAATAAGTTCAAGTAGTCATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** *
19814520 TTCAAATAATTACCTATTTTAAATGATTGTTCCCTTTTGTTTTG-CAATAAAACAATTGTTTCAG
66 TTCAAACAATTATCTATTTTAAATG-TT-ATGACTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTG-TTCTG
* **
19814584 TTTATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCTAAA
127 -TTATAAAAGCTTATTC--AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAA
* * * * * * *
19814636 AATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAATGAATATGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * *
19814701 -TCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAGCTTTTGTTTTATGATAAAACAATTGGTTTTG
66 TTC-AAACAATTATCTATTT-TAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTCTG
**
19814765 TTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAA
127 TT-ATAAAAGCTTA-TTC-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAA
* * *
19814817 AATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAAT--ATATGTTTTCTGAACATGTTCAAATAG
1 AATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG
19814871 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 339, Mismatches: 59, Indels: 37
0.78 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
179 24 0.07
180 50 0.15
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182 13 0.04
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTCAAACAATTATCTATTTTAAATGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTGTTAT
AAAAGCTTATTCAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAA
Found at i:19815136 original size:322 final size:321
Alignment explanation
Indices: 19814552--19815149 Score: 769
Period size: 322 Copynumber: 1.9 Consensus size: 321
19814542 ATGATTGTTC
* **
19814552 CCTTTTGTTTTGCAATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACC
1 CCTTTTGTTTTGCAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACC
* * * * * * *
19814617 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAATGAATATGTTTACCAAACAT
66 AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAT
* *
19814682 GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAGCTTTTGTTTTATG
131 GTTCAAATAATTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAGCTTTTGTTTTATC
* * *
19814747 ATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT
196 ATAAAACAATTGATTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATAAATATT
19814812 CTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATATATGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGGA
261 CTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATATATGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGGA
* **
19814873 CCTTTTGTTTTGTC-ATAAATCAATTGTTTC-GATTCATAAAAGCCTATTTGAAATAAAATAATA
1 CCTTTTGTTTTG-CAATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATAAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
19814936 CTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAGA
64 CCAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATATTTAC-CA-A
* * * * * * **
19815001 A-A-GTTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTATTTTTTGTT
127 ACATG-TTCAAATAATTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAGCTTTTGTT
* * **
19815064 TTGTCATAAAATAATT-ATTTCTGTTCATACAATTTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTA
191 TTATCATAAAACAATTGATTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTA
19815126 TAAATATTCTAAAAATTAATAAGT
253 TAAATATTCTAAAAATTAATAAGT
19815150 TGGAGATTTA
Statistics
Matches: 235, Mismatches: 34, Indels: 15
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
320 1 0.00
321 108 0.46
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323 3 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (321 bp):
CCTTTTGTTTTGCAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACC
AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAT
GTTCAAATAATTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAGCTTTTGTTTTATC
ATAAAACAATTGATTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATAAATATT
CTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATATATGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGGA
Found at i:19815163 original size:503 final size:498
Alignment explanation
Indices: 19814380--19815852 Score: 1334
Period size: 503 Copynumber: 2.9 Consensus size: 498
19814370 ACTTTTTGAT
* * * * * *
19814380 TTGTCATAAAACAATTATATCTGATT-ATATAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATATTAATTTAT
1 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-GATTCATAAAAGCCTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * *
19814443 TAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAATAAGTTCAA
64 TAA-AATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAA
* * * * * * * *
19814507 GTAGTCATGACTATTCA-AATAATTACCTATTTTAAATGATTGTTCCCTTTTGTTTTG-CAATAA
127 ATAGTTATGACTATT-AGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTC-ATAA
* * * ** *
19814570 AACAATTGTTTCAGTTTATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCTAA
190 AATAATT-TTTCTGTTTATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * *
19814635 AAATTAATGAGTAAGATAA-TTAAAAAATGAATATGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGAC
254 AAATTAATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *
19814699 TATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAGC-TTTTGTTTTATGATAAAACAATTGGTTT
318 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-ATTATGA-CATTTTGTTTTATGATAAAACAATTGGTTT
* * *
19814763 TGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
381 TGTTCATACAAGATTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
* * * * *
19814828 AAAAATTTTAAAAAATATATGT-TTTCTGAACA-T-GTTCAAA-TAGGACCTTTTGTT
445 -AAAA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATGAA-ATTAGTTCAAATTAAGACC-TTTGTG
* *
19814882 TTGTCATAAATCAATTGTTTCGATTCATAAAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
1 TTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
19814947 AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAGA-AAGTTTTAAA
66 AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GA-ACAAG-TTCAAA
* * * **
19815011 TAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTATTTTTTGTTTTGTCATAAAAT
128 TAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * *
19815076 AATTATTTCTGTTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTCTAAAAA
193 AATT-TTTCTGTTTATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
** * * ** * *
19815141 TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATG-TTCAT
257 TTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-AT
* * * * * * *
19815205 TTGAACTATCATTTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCG-TAAAAGAATT-GTTTCTA
321 TTGAACAATTATCTATTTCAAA-AATTATGACATTTTGTTTTAT-GATAAAACAATTGGTTT-TG
* * * *
19815268 CTCATACAAAATTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAAG--
383 TTCATACAAGATTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* * * *
19815330 AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAATTAGTTCAAATCGTTAAGATCTTTGTG
446 AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATGAAATTAGTTCAAA---TTAAGACCTTTGTG
* * ** * * * * * *
19815386 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATA
1 TTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * ** *
19815451 ATATTCTAAAAATTGATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATGGGTTCACTGAACCAA-TTCAAAT
66 AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAA-CAAGTTCAAAT
* * * ** *
19815515 AGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATA
129 AGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * *
19815580 ATTTTTTTAGTTTA-ATCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA
194 ATTTTTCT-GTTTATA-CAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * *
19815644 TTAATATGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT-T
257 TTAATAAGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * * * *
19815708 TTGAATAATTATCTATTTAAAATAAACATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTAGT
321 TTGAACAATTATCTATTTCAAA-AATTATGA-CATTTTGTTTTATGATAAAACAATTGGTTTTGT
* * * * * *
19815773 TCATAAAAGTTTATCTAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATAGTTC-AAAAATTGATAAGTTA
384 TCATACAAGATTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAG-TA
19815837 GAAATTTAAAAAATAA
446 -AAATTTAAAAAATAA
19815853 GTCAATTTGT
Statistics
Matches: 776, Mismatches: 158, Indels: 68
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
499 14 0.02
500 9 0.01
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502 102 0.13
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508 13 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (498 bp):
TTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACAAGTTCAAATAG
TTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
TTTTCTGTTTATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
TAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
CAATTATCTATTTCAAAAATTATGACATTTTGTTTTATGATAAAACAATTGGTTTTGTTCATACA
AGATTATTTAGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAA
AATAAATCTATTTATGAAATTAGTTCAAATTAAGACCTTTGTG
Found at i:19815304 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 19814875--19815353 Score: 487
Period size: 181 Copynumber: 2.7 Consensus size: 182
19814865 AAATAGGACC
** * * * ** *
19814875 TTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCGATTCATA-AAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTCTACTCATACAAA-ATTATTAGAAATAAAATAATACTA
*
19814939 ATTTATTAAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAGAAA
65 ATTTA-TAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAGAAA
* * * * **
19815003 GTTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTATT
129 GTTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATCATTTATTTCAAATCATTATGACA
* ** ** *
19815057 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTCTACTCATACAAAATTATTAGAAATAAAATAATACTAA
*** * * **
19815122 TTTATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGA-ACAAG
66 TTTATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAGA-AAG
* * *
19815186 -TTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAACTATCATTTATTTCAAAT-AGTTATGACA
130 TTTCAAATAATCATGACT-ATTTGAACAATCATTTATTTCAAATCA-TTATGACA
* *
19815238 TTTTGTTTTGTCGTAAAAGAATTGTTTCTACTCATACAAAATTATTA-AGAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTCTACTCATACAAAATTATTAGA-AATAAAATAATACTA
* * *
19815302 ATTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTATTTA
65 ATTTATAAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
19815354 TTAAATTAGT
Statistics
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Consensus pattern (182 bp):
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TTTATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAGAAAGT
TTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATCATTTATTTCAAATCATTATGACA
Found at i:19815649 original size:322 final size:322
Alignment explanation
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Period size: 322 Copynumber: 1.8 Consensus size: 322
19815048 ATTATTATTT
* * * * *
19815058 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTGTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* ** ** * *
19815123 TTATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTT
66 TAATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGGGTTCACTGAACAAGTT
* * * * * * *
19815188 CAAATAGTCATGTTCATTTGAACTATCATTTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTA
131 CAAATAGTCAAGTTCATTAGAACAATCATCTATTTCAAATAGTTAAGACATTTTGTTTAGTCATA
* * *
19815253 AAAGAATTGTTTCTACTCATACAAAATTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCA
196 AAAGAATTGTTTCTACTAATACAAAATTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCA
19815318 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAATTAGTTCAAATCGTTAAGATC
261 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAATTAGTTCAAATCGTTAAGATC
* * * * *
19815380 TTTGTGTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAA
1 TTTGTGTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT-AA
* *
19815445 TTAAT-AATATTCTAAAAATTGATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATGGGTTCACTGAACCAA-
65 TTAATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGGGTTCACTGAA-CAAG
* * * *
19815508 TTCAAATAGTTAAGATT-ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGACCTTTTGTTTAGTC
129 TTCAAATAGTCAAG-TTCATTAGAACAATCATCTATTTCAAATAGTTAAGACATTTTGTTTAGTC
* * * ** *
19815572 ATAAAATAATT-TTTTTAGTTTAAT-CAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
193 ATAAAAGAATTGTTTCTA--CTAATACAAAATTATTAAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAC
19815634 A-TTCAAAAAATTAATA
255 ATTTC-AAAAATTAATA
19815650 TGCAAGAAAT
Statistics
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (322 bp):
TTTGTGTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
TAATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGGGTTCACTGAACAAGTT
CAAATAGTCAAGTTCATTAGAACAATCATCTATTTCAAATAGTTAAGACATTTTGTTTAGTCATA
AAAGAATTGTTTCTACTAATACAAAATTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCA
AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAATTAGTTCAAATCGTTAAGATC
Found at i:19815720 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19815363--19818715 Score: 1941
Period size: 181 Copynumber: 18.8 Consensus size: 180
19815353 ATTAAATTAG
* * * * * * * *
19815363 TTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTGTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * * * * * * * *
19815426 GGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTGATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
** * * * * *
19815491 TGGGTTCA-CTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTAT
129 TCTGTTTATC-GAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
19815543 TTCAAATCGTTAAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTTAAT-CAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTTAATACAAGCTTATTT
* *
19815607 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATATGCAAGAAATTTTAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATATGTAAGAAA-TTTAAAAAATAA
* * *
19815672 ATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT-TTTGAATAATTATCTAT
128 ATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * ** * * * * *
19815724 TTAAAATAAACATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTAGTTCATAAAAGTTTATCT
1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * * * * * *
19815789 AAAATAAAATAATATTATTTTATTAATAGTTCAAAAATTGATAAGTTAGAAATTTAAAAAATAAG
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
** * ** * * *
19815854 TCAATTTGTCGAATCGGTTCAAATAATTATTG-CCATTTGAATAATTATCTAT
129 TCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * *
19815906 TTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTTGTAATAAAGCAATTGTTTTTCA--TCATATAAGCCTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTTAATACAAGCTTATT
* * *
19815969 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATATGGAAGAGATTTAAAAAATAAA
64 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * *
19816034 TTTGTTTA-C---T-AG----ACTAG-T-T-CCTATTTAAACAATTTTCTAT
129 TCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * * * * * * * *
19816074 TTCAAATCATTACAACCTTTTATTCTATTATAAAATAAATGTTTTAGTTCATATAAGCATA-TTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTTG
* ** *
19816138 ATAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
19816203 TCTGTTTGTCTAAGT-AGTTTAAACAATTAAGACTATATT-AACAATTATCTAT
129 TCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
19816255 TTCAAATCATTATGA-CTTTCTGTTTTATCATAAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTGTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCAT-AAAACAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATT
** * * * *
19816319 CAAAATAAAATAATACTAA-CTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT--G--ATTTATAAAGTAA
64 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
19816379 AT-TCATTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTAT
128 ATCT-GTTTATCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * **
19816432 TTCAAAAATCGTTATTA-CTTTT-TATTTGTCGCT-TAACAATTATTTTT-TATCATACAATTTT
1 TTC--AAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTC-ATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTT
* * * * * * * * *
19816493 ATTTGGAACAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTAAAAAATGAATAAGTATGAGATTTAATAAA
61 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAA
* * * * * * * * *
19816558 TAAATCTGTTTATCAAACT-AGTTTAAATAATTATAACTATCTGAATAATTGTATAC
125 TAAATCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
19816614 TTCAAATCATTATAACCTTGTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTT-GTTCATACTAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * * ** * *
19816678 G-AATAAAATAATACTAATATAATAATATTCTAAAAGTTAATAACTGAGAGATTTAAAAAAT-AA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
** * * * * *
19816741 T-TGTTTGCCAAACTAA-TTCTAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTAT
129 TCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * **
19816792 TTCAAATC---AT----TTTTGTTTTACCGTAAAACAA-ATTTTTAATTCATACTAGCTTATTCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTTG
* * * * * * ** *
19816849 AAATACAATACA-ACGAATTTATTAATATTTTAGAAACTAACATGTAAGGGATTTAAAAAATAAT
66 AAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* ** * * * *
19816913 TTTGTTTATTTAACT-AGTTTAAATAATTATGACTATTT-AACAACTATTTAT
129 TCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * ** * * * *
19816964 TTCAAACCGTTATGACCTGTTGTTTTGTCATAAAATAAATGCTTTTA-TTCATATAAGTTTGTTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * * ** * *
19817028 G---GAAAA-AATGCTAATCTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGGTGTAAAAAACAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* ** * * * * *
19817085 TCTATTTATC-AAGCCACTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTCT
129 TCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * * *
19817137 TTCAAATTGTTATG-GC-TTT-TTTTCT-ATTAAAATAATAGTTTCTA-TTCACACAAGCTTA-T
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAAT-TTTTTTATTTAATACAAGCTTATT
* * * * *
19817196 TCAGATTAAAATAATACTAATATATTAATATTTCAATAATTAATAACTG-AA-AAATTTTAAAAA
64 TGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-A-TGTAAGAAATTTAAAAAA
* * * * * * * *
19817259 TAAATATGTTTATCGAACT-AGATCAATTTGTCATGATTATTTGAATAAATATCTAT
125 TAAATCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
19817315 TTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAA-ATATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * *
19817379 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAT-TAAGAGATTTAAAAAATGA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-ATGTAAGAAATTTAAAAAATAA
* * * * * * **
19817443 ATCTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTTATTAATTATCTAT
128 ATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
19817496 TTGAAA-C-TGCTAT-AACTGTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATTTTTTCTA-TTCATACAAGC-T
1 TTCAAATCAT--TATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTTTTT-TATTTAATACAAGCTT
* *
19817555 ATTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAA
61 ATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATATGTAAGAA-ATTTAAA
* * * ** *
19817617 AAATAAATAT-TTTACCAAATAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
122 AAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * *
19817675 TTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * * *
19817739 -AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATA
65 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAA-ATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
19817802 AATATATTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATCTGAATAATTATGTAT
127 AATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
19817855 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT-AGTAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * *
19817919 GAAACAAAATAATACTAAATTATTAATATTCCAAAAATTAATGA-GTAAGAGAA-TTAAAAAATG
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT-ATGTAAGA-AATTTAAAAAATA
* * * * *
19817982 AATCTGTTTATCGAATATGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAGTTATCTAT
127 AATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
19818036 TTCAAAACATTATTACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGCTTA-TT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
*
19818099 GCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATA
65 G-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * *
19818162 ACTATGTTTTTTGAACACA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTATCTAT
127 AATCTGTTTATCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * ** * * *
19818216 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTTT-GGTCATAAAAGCTTATTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* * * *
19818280 GAAATAAAATTATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTATTAAGTAA-AAGATTTTAAAAAATA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATATGTAAGAA-A-TTTAAAAAATA
** * * *
19818344 AATCTACTTATCGAGAGAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
127 AATCTGTTTATCGA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
19818398 TTCAAATCATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-CTCATACAATTTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTTAATACAAGCTTATTT
* ** ** * *
19818462 GAAATAAAATAATACGAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTTGGAGATTGAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
19818527 TCTATTAACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATCATCTAT
129 TCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
19818579 TTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAA-TTGTTTATATTCATACAAAATTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTAT-TTAATACAAGCTTATTT
* * * *
19818643 AAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAAAA-T--TA-GTAAGAGATTTAAAAACT-AA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
19818703 TCTGTTTATCGAA
129 TCTGTTTATCGAA
19818716 CCAATTCAGA
Statistics
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0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 1 0.00
167 6 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTTAATACAAGCTTATTTG
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATATGTAAGAAATTTAAAAAATAAATC
TGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:19817624 original size:361 final size:355
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Indices: 19815380--19818715 Score: 2029
Period size: 360 Copynumber: 9.3 Consensus size: 355
19815370 CGTTAAGATC
* * * * * * * *
19815380 TTTGTGTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAA
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* * * * * ** * *
19815445 TTAATAATATTCTAAAAATTGATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATGGGTTCA-CTGAACCA-A
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-TAGA
* * * * * *
19815508 TTCAAATAGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGACCTTTTGTTTAGTCA
126 -TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
19815573 TAAAATAATT-TTTTTAGTTTA-ATCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-
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* * * * * *
19815635 TTCAAAAAATTAATATGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGT
253 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAAT
* * *
19815700 TATGACT-TTTGAATAATTATCTATTTAAAATAAAC-ATGACCTT
316 TAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--GCTAT-AAC-T
* ** * * * * *
19815743 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTAGTTCATAAAAGTTTA-TCTAAAATAAAATAATATTAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
19815807 TTTATTAATAGTTCAAAAATTGATAAGTTAGAA-ATTTAAAAAATAAGTCA-ATTTGTCGAATCG
63 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG-CAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAAT-A
* * * * ** *
19815870 GTTCAAATAATTATTG-CCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTTGT
124 GATCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ***
19815934 AATAAAGCAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
188 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
19815998 -TTCAAAAATTAATATGGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAGACTAGTTC-------
252 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGA-ACAAGTTCAAATAAT
* * * *
19816054 ----CTATTTAAACAATTTTCTATTTCAAAT-CATTACAACCT
316 TATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGC--TATAA-CT
* * * * * * * *
19816092 TTTATTCTATTATAAAATAAATGTTTTAGTTCATATAAGCATATTC-ATAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAA
* * * * *
19816156 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCTAAGTAG
63 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAG
* * * * * *
19816220 TTTAAACAATTAAGACTATATT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTCTGTTTTAT
125 ATCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGT
* * *
19816283 CATAAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATACTAA-CTATTAATA
188 CAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
19816347 TTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTATAAAGTAAAT-TCATTTACCAAATCAA-TTCAAATAA
252 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAA
* * * * *
19816406 TTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAAAATCGTTATTACT
315 TTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTC--AAAT-GCTATAACT
* * * ** * * *
19816451 TTT-TATTTGTCGCTTAACAATTATTTTT-TATCATACAATTTTATTTGGAACAAAATAATACTA
1 TTTGT-TTTGTC-ATAAAAAATT-TTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * * ** * * *
19816514 ATTTATTAATCTTTAAAAAATGAATAAGTATGAGATTTAATAAATAAATCTGTTTATCAAACTAG
62 ATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAG
* * * * * * * * * * * * *
19816579 TTTAAATAATTATAACTATCTGAATAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTGTGTTCTATCA
125 ATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** * *
19816644 TAAAATAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATATAATAATA-TT
190 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
19816707 CTAAAAGTTAATAACTGAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TGTTTGCCAAACTAA-TTCTAATAATTA
255 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAAC-AAGTTCAAATAATT-
* * *
19816769 AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-C-AT---T
317 ATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGCTATAACT
** * * * * * * *
19816803 TTTGTTTTACCGTAAAACAAATTTTTAATTCATACTAGCTTATTCAAAATACAATACA-ACGAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA-ATACTAAT
* * * * * * ** * * ** *
19816867 TTATTAATATTTTAGAAACTAACATGTAAGGGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATTTAACTAGTT
64 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAGAT
* * * * * * *
19816932 TAAATAATTATGACTATTT-AACAACTATTTATTTCAAACCGTTATGACCTGTTGTTTTGTCATA
127 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *** * *
19816996 AAATAAATGCTTT-TATTCATATAAGTTTGTT---TGGAAAA-AATGCTAATCTATTAATATTTC
192 AAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
19817056 AAAAATTAATAAG--AG-G-TGTAAAAAACAAATCTATTTATC-AAGCCACTTCAAATAGTTATA
256 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAATTAT-
** * * * **
19817116 ACTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTGTTATGGC-
319 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TGCTATAACT
* * * * *
19817153 TTT-TTTTCT-ATTAAAATAATAGTTTCTATTCACACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCA-TAAAA-AAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTA
* * *
19817215 ATATATTAATATTTCAATAATTAATAA-CTGAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACT
62 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGC--AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-T
* * * * * * * *
19817278 AGATCAATTTGTCATGATTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGT
123 AGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
19817343 CATAAAA-ATATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
188 CATAAAACA-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
19817407 TTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAATT
252 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAATT
* * *
19817472 ATAACTATTTTATTAATTATCTATTTGAAACTGCTATAACT
317 AT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TGCTATAACT
19817513 GTTTGTTTTGTCATAAAAAGATTTTTTCTATTCATACAAGC-TATTTCG-AATAAAATAATACTA
1 -TTTGTTTTGTCATAAAAA-ATTTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTA
* *
19817576 ATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-TTTACCAAATAA
62 ATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT-A
* ** * ** *
19817639 GTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
124 GATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
19817704 ATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
189 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *** *
19817769 TCGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
254 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTAT
* * *
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319 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGC--TATAA-CT
* * * * *
19817873 TTTGTTTTAT-AGTAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAACAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCA-TAAAA-AATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
19817937 ATTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTATCGAATATGT
63 TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATA-GA
* * * * * * *
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126 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
19818067 AAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
191 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * ***
19818130 CCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAACTATGTTTTTTGAACACA-TTCAAATAATTA
254 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACA-AGTTCAAATAATTA
* * *
19818193 TGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
318 T-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TGCTAT-AACT
* ** * * *
19818234 TTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTTTGGTCATAAAAGCTTATTGGAAATAAAATTATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAA-AAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** *
19818299 TTATTAAAATTCCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTACTTATCG-AGAGAA
64 TTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGCAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAG-A
* * * *
19818363 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAATCTTTTGTTTTGTCA
126 -TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** ** *
19818428 TAAAACAATTGTTTCTACTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACGAATTTATTAATA-TT
190 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * * * * * *
19818492 CTAAAAATTAATAACTTGGAGATTGAAAAAATAAATCTATTAACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT
255 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * ** *
19818557 GTCCATTTGAACT-ATCATCTATTTCAAATTATTATGACAT
319 -ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAA-TGCTATAAC-T
* * ** **
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1 TTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
19818662 TTTTTAATATTTCAAAAATTAGTAAG----AGATTTAAAAACT-AATCTGTTTATCGAA
64 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA
19818716 CCAATTCAGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
343 8 0.00
344 8 0.00
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TTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
ATTAATATTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAGATCAAA
TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATACTATTT
GAATAATTATCTATTTCAAATGCTATAACT
Found at i:19818643 original size:20 final size:21
Alignment explanation
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Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
19818595 ATTTTGTTTT
*
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1 TTCATAAAACAATTATTTATA
*
19818626 TTCATACAA-AATTATTTA
1 TTCATAAAACAATTATTTA
19818644 AAATAAAATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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21 8 0.50
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Consensus pattern (21 bp):
TTCATAAAACAATTATTTATA
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Alignment explanation
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Period size: 502 Copynumber: 1.9 Consensus size: 504
19818215 TTTCAAATTG
* * * *
19818225 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTTTGGTCATAAAAGCTTATTGGAAATAAAAT
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* * *
19818290 TATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTACTTAT
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* * * * *** * *
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* * * * *
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* ** * ** * *
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* * * * * *
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* ** * *
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456 TTAGTAAGAGATTTAAAAACTAATCTGTTTATCGAACCAATTCAGATCA
* * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTAGTCATAAAAGCTTATTGCAAA-TAAAA
** * * * * * **
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65 TTA-TACTAAGTTAATAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTACTT
* * * *
19818855 A-CCAAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATCAAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTT
129 ATCCAAA-CAATTTAAATAGTTAAGACTATCAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * *
19818919 TTGTTTAGTCAAAAAATAATT-TTTTTAGTTCATAC-ATGCTTAATCGAAATAAAATAATACTAA
193 TTGTTTAGTCAAAAAACAATTGTTTCTA-CTCATACAAT-CTTAATCGAAATAAAATAATACGAA
* * * * *
19818982 TTTATTAACATTAAAAAAATCAATGCAC-AAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
256 TTTATTAACATTAAAAAAATCAAT-AACTAAGAAA-TTAAAAAAATAAATCTATTAACCAAACAA
* * ** * *
19819046 G-TCTAACTAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTT-TTTTAT
319 GTTC-AAATAGTCATGACCATTTGAACAATCATCTATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTTAT
* * *
19819109 CATAAAACAATTGTTCCA-ATTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAAT
383 CATAAAACAATTGTT-CATATTCATACAAA-ATTATCCAAAATAAAATAATACTAATATATTAAT
19819172 ATTTCAAAAATT
446 ATTTCAAAAATT
19819184 GATAAGTTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (504 bp):
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTAGTCATAAAAGCTTATTGCAAATAAAAT
TATACTAAGTTAATAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTACTTAT
CCAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATCAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
TTTAGTCAAAAAACAATTGTTTCTACTCATACAATCTTAATCGAAATAAAATAATACGAATTTAT
TAACATTAAAAAAATCAATAACTAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTAACCAAACAAGTTCAAA
TAGTCATGACCATTTGAACAATCATCTATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTTATCATAAAAC
AATTGTTCATATTCATACAAAATTATCCAAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTCAAAAA
TTAGTAAGAGATTTAAAAACTAATCTGTTTATCGAACCAATTCAGATCA
Found at i:19819617 original size:164 final size:163
Alignment explanation
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Period size: 163 Copynumber: 1.9 Consensus size: 163
19819407 TTCTTGTTTG
* * * * * **
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* * ** *
19819482 ATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCTAAAA-TTAATAACTAAGAGA
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129 TTTAA-AAAGTAAATCTGTTTGCTGAAGTAGTTCAA
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA-TATTTTGTTTTGTATAAAACAATCGTTTCAGATCAT
* * *
19819645 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGTGAT
65 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAATTTAATAACTAAGAGAT
*
19819710 TTAAAAAGTGAATCTGTTT
130 TTAAAAAGTAAATCTGTTT
19819729 AACCAGAGTT
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 16, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
162 7 0.05
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (163 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTGTATAAAACAATCGTTTCAGATCATA
CAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAATTTAATAACTAAGAGATT
TAAAAAGTAAATCTGTTTGCTGAAGTAGTTCAA
Found at i:19819865 original size:342 final size:350
Alignment explanation
Indices: 19819417--19820089 Score: 805
Period size: 342 Copynumber: 1.9 Consensus size: 350
19819407 TTCTTGTTTG
* * * *
19819417 AACAATTATCTATTTTAAATCATTATAATATTTTGTTTTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTTGT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCGT
* * * *
19819482 ATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCTAA-AATTAATAACTAAGAGA
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** * * *
19819546 -TTTAAGAAATAAATCTGTTTGCTGAA-G-T-AGT-TC-A-A-AACAATTATCTATTTCAAATCA
130 TTTTAA-AAATAAATAAGTTTACTAAACGATAAATATCAACATAACAATTATCTATTTCAAATCA
* *
19819603 TTATAACTTTTTGTTTTGT-ATAAAACAATCGTTTCAGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
194 TTATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATCGTTTCAGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
19819667 AAAACTAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGT-AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTAA
259 AAAACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAA
19819731 CCAGAGTTCAAATAATTATGGCTATGTC
323 CCAGAGTTCAAATAATTATGGCTATGTC
* *
19819759 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACT-TTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA-TATTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTC-AGTTC
* * * * *
19819822 GTACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAATTAAAAA
64 GTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAAAA
*
19819887 ATTTTAAAAATAAATAAGTTTACTAAACTGGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTA
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* * * * * * *
19819952 TTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTC
184 TTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATCGTTTCAGATCATACAAGCTTATTC
*
19820017 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAA
249 AAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAA
19820082 TCTGTTTA
314 TCTGTTTA
19820090 TTGAGCATAT
Statistics
Matches: 273, Mismatches: 35, Indels: 28
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (350 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCGT
ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAAAAAT
TTTAAAAATAAATAAGTTTACTAAACGATAAATATCAACATAACAATTATCTATTTCAAATCATT
ATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATCGTTTCAGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
AACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAACCA
GAGTTCAAATAATTATGGCTATGTC
Found at i:19820013 original size:181 final size:181
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Indices: 19819581--19824665 Score: 2473
Period size: 181 Copynumber: 28.1 Consensus size: 181
19819571 AGTAGTTCAA
* * * *
19819581 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGT-ATAAAACAATCGTTTCAGATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT
** * * * ***
19819645 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGTGAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAAT
* * * * * * * *
19819710 TTAAAAAGTGAATCTG-TT--TAACCAGAGTTCAAATAATTATGGCTATGTC
131 TTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
19819759 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCA
* * * *
19819823 TACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAATTAAAAAA
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* * ** * * *
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130 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
19819940 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT
* ** * * *
19820005 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGA
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* * * * * * *
19820069 TTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAGCATA-TTTAAATAATTAT--CTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
19820119 -A-AA-TAGC-A--T--AA-C-------C-TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTTCTGTTCA
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* *
19820166 TCCAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGAAATTAATAAGTAAAA
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* * * *
19820228 GAGTTAAAAAAAATAAATATGTTTGCTAAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTG
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* * ** *
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383 AATCATTATGACTATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA
* * *
19819498 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCTAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAGAAATAAATCTG
448 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTG
**
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512 TTTATTGA
* * * * *
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1 GACTA-TT-TAAACAATTATCTATTTAAAAT-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** * *
19819634 TTTCAGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACT-AATTTATTAATATTCCAAAATTTAA
63 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT--AAAAATTAA
** * * * * * * * * *
19819698 TAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTG-TTTAACCAGAGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAAC
125 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGC
* *
19819762 AATTATTTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACA
189 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACA
* * * * *
19819827 AGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAATTAAAAAATTTT
254 AGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* ** * * *
19819892 AAAAATAAATAAGTTTACTAAACTGGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
319 AAAAATAAATAA-TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * **
19819957 AATCGTTATGACT-TTTTATTTTATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAA
383 AATCATTATGACTATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA
*
19820021 TAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
448 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAAT-AATCT
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511 GTTTATTGA
* * ** * *
19820094 G-CATATTTAAATAATTATCTATTTGAAATAGCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTT
1 GAC-TATTTAAACAATTATCTATTTAAAATATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
*
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* *
19820223 TAAAAGAGTTAAAAAAAATAAATATGTTTGCTAAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAGCA
129 TAAAAGA-TT-TAAAAAATAAATATGTTT--TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
* * * * *
19820288 ATTATTTATTTCAACAT-GTTATGATTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCTGTTCATACA
190 ATTATTTATTTCAA-ATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACA
* * ** *
19820352 AGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTA
254 AGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * *
19820417 AAAAATAAATATATTTACCGAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
319 AAAAATAAATA-ATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
19820482 AATTATTATGAC-ATTTTCTTTTGTAATAAAA-AACTTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAA
383 AATCATTATGACTATTTTGTTTTATCATAAAATAA-TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19820545 GTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATATTT
447 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAG-ATT-TAAAAAATA---
*
19820610 TTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-A
507 --ATC---T--GTT----TA-TTGA
* * *
19820634 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAACATTATAACCTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
1 -GACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAAATATTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
19820699 GTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTAAATAAAATAATTTAAATTTATTAATAATCCAAAAATTAAT
63 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATATAAATTTATTAAT-AT-TAAAAATTAAT
* * * *
19820764 AAGTAAAA-TTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAATT-AACTAGTTATGACTATTTGAAG
126 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG--TTTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AG
* * * *
19820827 -AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTT-TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCGTAA
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* * * ** * *
19820890 AACCTTT-TTCGAAACAAAATATTACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
253 AA-GTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * *
19820953 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
316 TTAAAAAATAAAT-AATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * **
19821018 TCAAATTGTTATGA-TATTTTGTTTTTTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAATTTTATTT
380 TCAAATCATTATGACTATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTT
* * * **
19821081 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAT
444 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAT
19821146 TCTATTTGTC
Statistics
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CTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTA
AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATT
TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGTTTAT
TTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
AATAATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
TGACTATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATCTGTTTATTGA
Found at i:19821070 original size:720 final size:706
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19819571 AGTAGTTCAA
* * * * ** *
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* ** * * * * **
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* ** * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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259 TGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAATAA
** * * * *
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* * * **
19820668 ATAACCTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGCTTATTTTAAATAAAAT
387 ATAA-CTCTTTATTTTATCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * *
19820732 AAT-TTAAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAGTAAA-A-TTTTAAAAAATAAATATGTTTT
450 AATACT-AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
** * *
19820794 TTGAACAAATTAACTAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTT
513 TTGAAC--A-T-A-T--TTA--A--A--T----AATTATCTATTTCAAAT-AGCATAACCTTTTG
** * *
19820858 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCGTAAAACCTT-TTTCGAAACAAAATATTACT-AATTT
560 TTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATAAAACCTTATTT-GAAACAAAATAATA-TAAATTT
* * * *
19820921 ATTAAAATTCTAA-AAATTAATAAGTAAAAGA-TT-TAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGT
623 ATTAAAA-T-TAAGAAATTAATAAGTAAAAGAGTTAAAAAAAATAAATATATTTACTAAACAAGT
19820983 TCAAATAGTTATGACTATTTG
686 TCAAATAGTTATGACTATTTG
* *
19821004 AACAATTATTTATTTCAA-ATTGTTATGATATTTTGTTTT-TTCACAAAATAATTGTTTCTATTC
1 AACAATTATTTATTTCAACA-TGTTATGATATTTTGTTTTGTT-ACAAAACAATTATTTCTATTC
* * * ***
19821067 ATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAG
64 ATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG
* * ** **
19821132 ATTTAAAAAATAATTCTATTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTCATTTCCATTTAAACT-ATTATCT
129 ATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTAAACTAATTATCT
* ** * * ** * **
19821196 ATTTCAAATCATAATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTTGCTCATGCAAAATTATT
194 ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * * *** * * * *
19821261 CAGAA-TAAACA-AATACTTATCTATTAAGATTTTGATAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACA
259 -TGAAGTAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAA-T
* ** * * * * * * *
19821320 AAATCTA-TTTACCAAAAC-ATTTTAAATATTTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTGAAATC
321 AAAT-AAGTTTACC-AAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAC
* * * * ***
19821383 TTTATGA-TCTTTATTGTGTCATAAAACAATTGTTTCCT--TTCATACAAGCTTATTCAGCTTAA
384 ATTATAACTCTTTATTTTATCATAAAACAATTG-TT-CTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * * *
19821445 AATAATACTAATTAAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTT
447 AATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
19821509 T
511 T
19821510 GTCGAACAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (706 bp):
AACAATTATTTATTTCAACATGTTATGATATTTTGTTTTGTTACAAAACAATTATTTCTATTCAT
ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
TTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTAAACTAATTATCTAT
TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
AAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAATAAATA
AGTTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAA
CTCTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAT
ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAGCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTAT
TCATAAAACCTTATTTGAAACAAAATAATATAAATTTATTAAAATTAAGAAATTAATAAGTAAAA
GAGTTAAAAAAAATAAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
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Indices: 19820271--19821782 Score: 1148
Period size: 538 Copynumber: 2.8 Consensus size: 537
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* * * * * * * *
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* * * ** ** ** * * * * *
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* * * * *
19820399 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTT
127 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATAT
* * * * * ** *
19820464 GAATAATTATCTAT-TTCAAAT-TATTATGACATTTTCTTTTGTAATAAAA-AACTTGTTTCAGT
192 GAACAATTATCTATCTT-AAATATGTTA-GA-TTTTTGTTTAGTCCTAAAACAA-TTATTTCAGT
* * ** * * * * * * *
19820526 TCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAG
253 TCATACAAGCTCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATAAGTAAG
* * * * * * * *
19820591 AGAATTAAAAAAA--ATAT-T-TTTACCAAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT
318 ACATTTAAAAAAATTAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAATAGATT-T-ACCATTTAAATAATT
* * * * * * * * *
19820651 ATTTATTTCAAA-ACATTATAACCTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAG
381 ATCTATTT-AAAGTCAATATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGCTCATGCAAA
* * * * * *** * * *
19820715 CTTATTTTA-AATAAA-ATAAT--TTAAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTT
444 ATTA-TTCAGAATAAACA-AATACTT--ATCTATTAAGATTTTGATAATTAAAAAG--AGA-TTT
* * **** ** * *
19820776 AAAAA-ATAAATATGTTT-TTTGAACAAATTAACTAG
502 AAAAACA-AAATCTATTTACCAAAACATTTTAAATAT
* * * * *
19820811 TTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTTTTTGTCATAAACCAATT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTATTGTGTCATAAAACAATT
* * * * *
19820876 GTTTCTATTCGTAAAACCTTTTTCGAAACAAAATATTACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAA
66 GTTTCTATTCATAAAACCTTATTC-AAACAAAATAATACTAATTAAATAAAATTCTAAAAATTAA
* * *
19820941 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
130 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATATGAA
* ** * *
19821006 CAATTATTTAT-TTCAAAT-TGTTATGATATTTTGTTTTTTCAC-AAAATAATTGTTTCTA-TTC
195 CAATTATCTATCTT-AAATATGTTA-GAT-TTTTGTTTAGTC-CTAAAACAATTATTTC-AGTTC
** * ** * ** * * ** *
19821067 ATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAG
255 ATACAAGCTCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATAAGTAAGAC
* * *
19821132 ATTT-AAAAAA-TAATTCTATTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTCATTT-CCATTTAAACT-ATTA
320 ATTTAAAAAAATTAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAATAG--ATTTACCATTTAAA-TAATTA
* *
19821193 TCTATTTCAAA-TC-ATAATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTTGCTCATGCAAAA
382 TCTATTT-AAAGTCAAT-ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGCTCATGCAAAA
19821256 TTATTCAGAATAAACAAATACTTATCTATTAAGATTTTGATAATTAAAAAGAGATTTAAAAACAA
445 TTATTCAGAATAAACAAATACTTATCTATTAAGATTTTGATAATTAAAAAGAGATTTAAAAACAA
19821321 AATCTATTTACCAAAACATTTTAAATAT
510 AATCTATTTACCAAAACATTTTAAATAT
* * *
19821349 TTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTGAAATCTTTATGA-TCTTTATTGTGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACT-TTTATTGTGTCATAAAACAAT
* * * *
19821413 TGTTTCCT-TTCATACAAGCTTATTC-AGCTTAAAATAATACTAATTAAATAATATT-TCAAAAA
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* * * * * *
19821475 TTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAACAAATTCAAGTAGTTGA-GACTA
126 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAATTCAAATAGTT-ATGACTA
* *
19821538 CTAT-AACAATTATCTATCTTAAATCATTTTAGCTTTTTGTTTAGTCCTAAAACAATTATTTCAG
189 -TATGAACAATTATCTATCTTAAAT-ATGTTAGATTTTTGTTTAGTCCTAAAACAATTATTTCAG
*
19821602 TTCATACAAGCTCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGTAA
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* * * *
19821667 GACATTTAAAAAAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTGAAATAGATTTGACTATTTGAATAATT
317 GACATTTAAAAAAATTAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAATAGATTT-ACCATTTAAATAATT
*
19821732 ATCTATTTAAAGTCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
381 ATCTATTTAAAGTCAATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
19821783 AGTTCATAAA
Statistics
Matches: 783, Mismatches: 148, Indels: 82
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
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542 2 0.00
543 1 0.00
544 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (537 bp):
TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTATTGTGTCATAAAACAATT
GTTTCTATTCATAAAACCTTATTCAAACAAAATAATACTAATTAAATAAAATTCTAAAAATTAAT
AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATATGAAC
AATTATCTATCTTAAATATGTTAGATTTTTGTTTAGTCCTAAAACAATTATTTCAGTTCATACAA
GCTCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATAAGTAAGACATTTAA
AAAAATTAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAATAGATTTACCATTTAAATAATTATCTATTTAA
AGTCAATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGCTCATGCAAAATTATTCAGAAT
AAACAAATACTTATCTATTAAGATTTTGATAATTAAAAAGAGATTTAAAAACAAAATCTATTTAC
CAAAACATTTTAAATAT
Found at i:19821681 original size:720 final size:718
Alignment explanation
Indices: 19820106--19821867 Score: 1789
Period size: 720 Copynumber: 2.4 Consensus size: 718
19820096 ATATTTAAAT
* ** * * * * * *
19820106 AATTATCTATTTGAAAT-AGCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCTGTTCATCCA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACA
** * *
19820170 AGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-AAGAAATTAATAAGTAAAAGAGTT
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TT
* * * *
19820233 AAAAAAAATAAATATGTTTGCTAAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATT
129 TAAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
* * * *
19820298 TCAACA-TGTTATGATTTTTTGTTTTGTT-ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTT
194 TCAA-ATTGTTATGATATTTTGTTTT-TTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTT
* * * * * *
19820361 GGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
257 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
19820426 TATATTTACCGAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
321 TATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATAAT
* * ** * *
19820491 GACATTTTCTTTTGTAATAAAAAACTTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATA
386 GACATTTTCTTTTGTAATAAAAAACTTGTTTCAGCTCATACAAAATTATTAGAAGTAAGAAAATA
* *
19820556 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATATTTTTACCAAATAA
451 CTAATCTATTAAGATTCCAAAAATTAA-GAG-AAGAGAATTAAAAAAAATATTTTTACCAAATAA
* * * *
19820621 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAACATTATAACCTCTTTGTTTTGT
514 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATAA-CTCTTTATTGTGT
* * * * *
19820686 CATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTAAATAAAATAATTTAAATTTATTAATAA
578 CATAAAACAATTGGTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATCTAAATTAAATAATAA
* *
19820751 TCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAATTAACTAGTTATG
643 TCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAACAAATTAACTAGTTATG
* *
19820816 ACTATTTGAAG
708 ACTATATGAAC
* * * *
19820827 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTT-TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCGTAA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATAC
* * * * * *
19820890 AACCTTTTTCGAAACAAAATATTACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * *
19820955 -AAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
130 AAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * *
19821019 CAAATTGTTATGATATTTTGTTTTTTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAA
195 CAAATTGTTATGATATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTTGAA
* *** * *
19821084 ATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAATTCT
260 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
** **
19821149 ATTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTCATTTCCATTTAAACT-ATTATCTATTTCAAATCATAATGA
324 ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTAAA-TAATTATCTATTTCAAATCATAATGA
* ** ** *
19821213 CATTTTGTTTTGTCGTAAAATAA-TTGTTTTTGCTCATGCAAAATTATTCAGAA-TAA-ACAAAT
388 CATTTTCTTTTGTAATAAAA-AACTTGTTTCAGCTCATACAAAATTATT-AGAAGTAAGA-AAAT
* *** * *
19821275 ACTTATCTATTAAGATTTTGATAATTAA-A-AAGAGATTTAAAAACAAA-ATCTATTTACCAAA-
450 ACTAATCTATTAAGATTCCAAAAATTAAGAGAAGAGAATTAAAAA-AAATAT-T-TTTACCAAAT
* * * * * * * *
19821336 ACATTTTAAATATTTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTGAAATCTTTATGA-TCTTTATTGT
512 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATAACTCTTTATTGT
* **
19821400 GTCATAAAACAATTGTTTCCT-TTCATACAAGCTTA-TTCAGCTTAAAATAATACT-AATTAAAT
576 GTCATAAAACAATTGGTT-CTGTTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAAT-CTAAATTAAAT
* * * * *
19821462 AATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACAAATTCAAG
638 AATAATCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAACAAATT-AAC
19821526 TAGTTGA-GACTACTAT-AAC
700 TAGTT-ATGACTA-TATGAAC
* * *
19821545 AATTATCTATCTT-AAATCATT-TTAGCTTTTTGTTTAGTCCTAAAACAATTATTTCAGTTCATA
1 AATTATCTAT-TTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATA
* * * * * * *
19821608 CAAGCTCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGTAAGACATT
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
19821673 TAAAAAAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTATCTA
129 TAAAAAAA-TAAATCTGTTTGCTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATTTA
*** ** * * *
19821737 TTT-AAAGTCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTAT
192 TTTCAAA-TTGTTATGATATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAATTTAT
* * * * ** * *
19821800 CTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAGATTTAAAAACTA
255 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
19821865 AAT
319 AAT
19821868 CTGTTTTCTG
Statistics
Matches: 853, Mismatches: 155, Indels: 66
0.79 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
715 3 0.00
716 89 0.10
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719 87 0.10
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (718 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACA
AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
AAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
AAATTGTTATGATATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTTGAAA
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATAT
TTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACAT
TTTCTTTTGTAATAAAAAACTTGTTTCAGCTCATACAAAATTATTAGAAGTAAGAAAATACTAAT
CTATTAAGATTCCAAAAATTAAGAGAAGAGAATTAAAAAAAATATTTTTACCAAATAAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATAACTCTTTATTGTGTCATAAAAC
AATTGGTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATCTAAATTAAATAATAATCCAAAAA
TTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAACAAATTAACTAGTTATGACTATATG
AAC
Found at i:19822100 original size:231 final size:233
Alignment explanation
Indices: 19821664--19822113 Score: 543
Period size: 230 Copynumber: 1.9 Consensus size: 233
19821654 AAGTAATGAG
* * **
19821664 TAAGACATTTAAAAAAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTGAAATAGATTTGACTATTTGAATA
1 TAAGACATTTAAAAAAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGATTAGACTATTAAAATA
* * * * *
19821729 ATTATCTATTTAAAGTCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAA
66 ATTATCTATTCAAAGTCAATATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAA
* *
19821794 ACTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAGATTTAA
131 ACTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAGATTTAA
*
19821859 AAACTAAATCTGTTT-TCTGAACAATATTCTAAAATTAA
196 AAAATAAATCTGTTTATC-GAACAATATTCTAAAATTAA
* * * *
19821897 TAAGAGATTT-AAAAAA-TAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATCG-TTAAGACTATTAAAAT
1 TAAGACATTTAAAAAAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGATT-AGACTATTAAAAT
* * * * * * *
19821959 AGTTATCTATTCAAA-TCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTCAATTTATACA
65 AATTATCTATTCAAAGTCAATATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAA
* * * * * ** *
19822023 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAGGCATGAGATTT
130 AACTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTC-AAAAAGTAATAAACAAGAGATTT
19822087 GAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
194 -AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
19822114 GTTCAAATAA
Statistics
Matches: 182, Mismatches: 31, Indels: 10
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
229 3 0.02
230 91 0.50
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ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.09, T:0.37
Consensus pattern (233 bp):
TAAGACATTTAAAAAAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGATTAGACTATTAAAATA
ATTATCTATTCAAAGTCAATATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAA
ACTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAGATTTAA
AAAATAAATCTGTTTATCGAACAATATTCTAAAATTAA
Found at i:19822249 original size:412 final size:414
Alignment explanation
Indices: 19821483--19822279 Score: 1075
Period size: 412 Copynumber: 1.9 Consensus size: 414
19821473 AATTAGTAAG
* * * * *
19821483 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACAAATTCAAGTAGTTGAGACTACTATAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACAAATTCAAATAGTTAAGACTACTAAAACAAT
* * * *
19821548 TATCTATCTTAAATCATTTTAGCTTTTTGTTTAGTCCTAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGC
66 TATCTATCTCAAATCATTTTAGCCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGC
*
19821613 TCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGTAAGACATTTAAAA
131 TCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGCAAGACATTTAAAA
* * * * *
19821678 AAATTAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTGAAATAGATTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
196 AAATTAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTAAATATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * *
19821743 GTCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATA
261 ATCAATATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATA
* *
19821808 AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTT
326 AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTT
19821873 TTCTGAACAATATTCTAAAATTAA
391 TTCTGAACAATATTCTAAAATTAA
* * * * * *
19821897 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATCGTTAAGACTATTAAAATAGT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACAAATTCAAATAGTTAAGACTACTAAAACAAT
* * *
19821962 TATCTAT-TCAAATCATTTT-GACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTCAATTTATACAAG
66 TATCTATCTCAAATCATTTTAG-CCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAG
* * * * * * * * *
19822025 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAAT-AGGCATGAGATTTGA
130 CTCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATGA-GCAAGACATTTAA
* * **
19822089 AAAAA-TAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATA-ATTATAAATATTTTCACAATTATCTATTT
194 AAAAATTAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TAAATATTTGAACAATTATCTATTT
* **
19822152 AAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGTTTATCCAAA
258 AAAATCAATATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAACTTATCCAAA
* * *
19822217 ATAGAATAATACTA-TTTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
323 ATAAAATAATACTACTTT-ATTAATATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAAATTTAAAAAATAAAT
19822280 TAGTTTATCA
Statistics
Matches: 330, Mismatches: 49, Indels: 10
0.85 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
411 6 0.02
412 159 0.48
413 104 0.32
414 61 0.18
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.09, T:0.37
Consensus pattern (414 bp):
TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACAAATTCAAATAGTTAAGACTACTAAAACAAT
TATCTATCTCAAATCATTTTAGCCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGC
TCATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGCAAGACATTTAAAA
AAATTAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTAAATATTTGAACAATTATCTATTTAAA
ATCAATATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATA
AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAACAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTT
TTCTGAACAATATTCTAAAATTAA
Found at i:19823043 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 19823022--19823054 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
19823012 CTAGTTTTTA
19823022 CTATTT-AAATAATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
*
19823038 CTATTTCAAATCATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
19823055 AACCTTTTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
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Consensus pattern (17 bp):
CTATTTCAAATAATTAT
Found at i:19823526 original size:361 final size:359
Alignment explanation
Indices: 19821897--19824345 Score: 1813
Period size: 361 Copynumber: 6.8 Consensus size: 359
19821887 CTAAAATTAA
** * * *
19821897 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATCGTTAAGACTATTAAAATAGT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAGATTATTAGAATAAT
* * * * *
19821962 TATCTA-TTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTCAATTTATACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
* * * * *
19822026 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAGGCATGAGATTTGAA
130 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA
* * * * ** *
19822090 AAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAATTATA-AATATTTTCACAATTATCTATTTA
193 AAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * **
19822153 AAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAA
256 AAATCATTATAACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAA
*
19822218 TAGAATAATACT-ATTTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
319 TAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** * * * * * *
19822259 CAAGAAATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATCATGGTCATTTA-AACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATT-GTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAGATTA-TTAGAATAA
* * *
19822323 TTATCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAA--CATACAA
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAA
* * * *
19822386 GCTTTTTCTA-AATAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG--A-A-ATTTT
128 GCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * ** * ** * *
19822445 AAAAACAAATCAATTTGTTGAACCAATTTAAATAGTTGTGACTATTTGACCAATTATCTATATCA
192 AAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * *
19822510 AATTGTTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATT-TTTCTGCTCAT-AAAGCTTATTTGGAATA
257 AATCATTATAACCTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATA
* ** *
19822573 AAATAATAATAATTTGGTAATA-TTCTAAAAATTAATAAC
321 AAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * *
19822612 TATGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTGCCATACCAATTCAAATAGTTAAGATTA-TACGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATT-GTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAGATTATTA-GAATAA
* ** * * * * *
19822676 TTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAACTCATACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* * * * *
19822741 CTTATTT-GAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TATGAGATTTAG
129 CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
19822801 AAAATAATTCTATTTATGAAACCAATTTAAATAATTATA-ACTATTTGCACAATTATTTATTTCA
193 AAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
*** * * * * * * *
19822865 AATCATTATTATTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCATT-TGTTAATATAAA-TTTGTTTGAA
257 AATCATTA-TAACCTTT-TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATA-AAAGCTTATTCGGA
*
19822928 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTAG
318 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * * * *** *
19822970 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCTAAACCATTTCAACTAGTTTTTACTATTTA-AATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAGATTA-TTAGAATAA
* * * * * * * * * *
19823034 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTATTTATACTAT
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* * * * * * * * * * *
19823099 TTTATTCAAAATAAAATAATGCAAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAATTAAGAAAATTAAA
129 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * **
19823164 AAATAAATCTAATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAA
194 AAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * ** * **
19823229 TTATTATGACCTTTTCTCTTGTCGTAAAGTAATTATTT-TGTTTGTACAAGCTTATTCGGTTTAA
259 TCATTATAACCTTTT-T-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAA
*
19823293 AATAATACTAATTTCA-TAATATTTCAAAAACTAATAAG
322 AATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
19823331 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATCATTTTAAATGATTAAGATTACTAGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAGATTATTAGAATAAT
* * * * *
19823396 TATATACTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
* * * * * *
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***
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATA-AAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * *
19836996 TAATACTAATTTATTACTATT-TGAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCTCTTTAC
64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTAAAAA-AAAATTTGTTTAC
* * * * *
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127 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * * *
19837109 TTATAATC-TTTGTTCTGTCTTAAAACATTTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* * * * * ** ** * * * *
19837173 ATTGCTAAATTAATAATATTCCAAATGTTAATAAGT-AAGGATT--TAGAAAATGTGTTTACCAA
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*
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* * * * * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* * * * * * *
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65 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTAAAAAAAAATTTGTTTACCGA
* * * * * * *
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130 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* * * * * * * * * ** **
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65 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAAAATTAAAA-AAAAATTTGTTTACC
* * ** * * * *
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* * * * * * **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTT--ATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * *
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64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA-AAAAATTAAAAAA-AAATTTGTTTA
** * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* * * * * * **
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* * * * * *
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127 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTG-TTTTATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAA
*
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* * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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188 AAGAAAATTA-AAACAACAAATTTGTTTACCGAACAAGCTCAAATA-TTATAACTATCTTAAAT-
* *
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* * * * * * *
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* ** ** * *
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ATAAACTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAAGAGTAAGAAAAT
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CAAAACGTTATGACCATTTATTTTCTCATAAAAAAATTGGTTCTATTCATAAAAGCTTAATCCAA
ATAAAATAATATAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAAATAT
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TTGTTTTTTCCTAAAACATTATTTCTATTCAACAAGCTTATTTGGAGTAATAGATTGCTAAATTA
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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*
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* * ** * * *
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* * *
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326 ATTGTTATAATA
* *
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** * * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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190 GTAC-AACTGTATTCAAAACAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAGA
* * * *
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254 GATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAATTCAAACAATTATGACTATTT
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AACTAAGACATTTAAAAAATAAATCAATTTATCGAACTAGGTAAAAAATTAAGGCTATGTGAACA
ATTATCTATGTCAAATCGTTATGCACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCGTACAA
CTGTATTCAAAACAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAA
AAAATAAATATATTTATCAAACCAATTCAAACAATTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAA
ATTGTTATAATA
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1 ATTAATA
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ATTAATAAAATAATAAAATTT
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*
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1 AATTTATTAATAA
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1 AAT
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AATTTATTAATAA
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AATAGTTATGACTATTTCA
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19835901 AAAATTTATT
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* * * * **
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* * * * * **
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* * *** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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*
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** * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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** * ** ** ** *
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* ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
19837288 GACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGCTTCAGCTCATACATGCTTATTTAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAA
* * * *
19837341 AATAAAATAATACCAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGT-AAGAAATT--AAAA-AAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
19837402 TATTTA-CTGAATAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATG
65 TATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * * *
19837466 ACC-TTT-TTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTTAGAAAAGCTTGTCTAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAA
* * ** * * * *
19837516 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTATAGAAATTGATAAGATAGAGATTTAAAACATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * *
19837581 -AGTTTATTAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATTTGTTTCAAATCATTAT
65 TA-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
19837644 TAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCA--TCATACAAGCCTATTCAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-CAGTTCATACAAGCTTATTTAA
* * * * *
19837697 AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * ** *
19837762 TGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAT-AGCTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATA
65 TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * *
19837826 ACATTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTTAA
* * * *
19837878 AA-AAAA-AATACTAATGTAGTAATATTCTAAAAATTAATAAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
19837941 TTATTTGTCGAATC-AGTTCAAATAATTTTGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
64 CTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* ** * * ** *
19838005 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGCTTGA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAA
* *
19838058 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
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Statistics
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Consensus pattern (180 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCT
ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAA
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Period size: 361 Copynumber: 6.1 Consensus size: 357
19835901 AAAATTTATT
* *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAA-AAGTAAAGGAATTTAAAAAATAA
* * * **
19835971 ATATGT-TTATCGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTTT
63 AT-T-TCTT-TCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
** * * * * * * ** *
19836034 TATGACATTTTTTTTTTGTCGTAAAATAATTGTTT-TCGTCCATATGAGCTTATTT--ATTAAAA
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* * * * *
19836096 TAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA-TT-AAAAAT--ATATATATA-
186 TAATA-TAATTTA-TAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* * * * * * * * *
19836156 CTAA-AGAAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATTTATACTTCAAATCATTGTGACCTTT
248 CGAACA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * *** * *
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* * * *
19836266 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAGGAGCAAGGGAATTAAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGTAAAGGAATTTAAAAAATAAAT
* * * *
19836331 TTGCTTATCGAACAAGTTC-AATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTCGAAAT-ATTAT
65 TT-CTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTAT
* * * ** * * *
19836394 GACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCGTGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA
127 AACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA
* * * * * *
19836459 TAAATTTATCAATGTCCTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAGTAAATCTATTTTTTGAACA
191 T-AATTTAT-AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA
* * *
19836524 CA-TTCAAATAGTTATCACTATTTGAGCAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTG
254 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* *
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* *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGTAAAGGAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
19836690 CTATTCCCAAAGCAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATGT-TTTAATTTCAAATAATTA
65 TTCTT-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCT-ATTTCAAATCGTTA
* * * *
19836754 TAATCCTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAA
126 TAA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAA
* * * *
19836818 CACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTATCAA
189 TA-TAATTTA-TAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGA
* * * * * * * ** *
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** * * *
19836947 TTGTTGTAAAACAATTGTTTGTGTTCATACAAAA--TTATTCAA
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* ** *
19836989 AATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTGAAAAATT--AA-T-AA-GAGATTTAAAAACTAAAT
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* * * * *
19837049 CTCTTTACCAAGCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATA
65 TTCTTT-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATA
* * * * * ** * * *
19837114 ATCTTTGTTCTGTCTTAAAACATTTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCT
128 ACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-AT
* * ** * * * * *
19837179 AAATTAATAATATTCCAAATGTTAATAAGTAAGGATTT---AGA-AAATGTGTTTA-CCAA-ATC
192 -AATTTATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA-C
* * * * *
19837238 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA-TTACTTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAG
255 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
19837302 TCATAAAATAATTGCTTC-AGCTC-ATACATGCTTATTTAA
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* * * * * **
19837341 AATAAAATAATACCAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGT-AAGAAATTAAAAAAATCTAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGTAAAGGAATTTAAAAAATAAAT
* * * *
19837405 TTAC--T-GAATAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGA
65 TT-CTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
* * * * * * * * *
19837467 CCTTT-TTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTTAGAAAAGCTTGTCTAAAATAAAATAATATT
129 CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-T
* * * * * * *
19837530 ACTTTATTAATATTATAGAAATTGATAAGATAGAGATTTAAAACATAAATC-AGTTTAT-TAA-A
192 AATTTA-TAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAACA
* * * * * * * *
19837592 TCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATT-TGTTTCAAATCATTATTAACTTTTTTTT
254 -CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
19837656 TGTCATAAAACAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATTCAA
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* * *
19837697 AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAA--ATAGGAGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGTAAAGGA-ATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
19837760 TTTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAT-AGCTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTA
64 TTT-CTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * *
19837824 TAACATTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAAA-AAAAAAAT
126 TAAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT
* * * *
19837887 ACTAATGTAGTAATATTCTAAAAATTAATAAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTCGA
190 A-TAATTTA-TAATATTCTAAAAATTAAT-AAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGA
* * * * *
19837952 A-TCAGTTCAAATAATTTTGACTATTTAAACAATTATT-TATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
251 ACACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * ** *
19838015 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGT-TTGCTTGA
315 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-AAAAATCTTATTTAA
* *
19838058 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
19838097 TAAGAGATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
349 2 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAGTAAAGGAATTTAAAAAATAAATT
TCTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAATT
TATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACACAGTTCA
AATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTCTATTCAAAAAATCTTATTTAA
Found at i:19838302 original size:178 final size:176
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 6.6 Consensus size: 176
19838096 ATAAGAGATT
** *
19838106 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
1 TAAAACAATTG-TTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
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* * * * *
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* * *
19838284 TAAAACAATTGCTTCTATTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTACTATT
1 TAAAACAATTG-TTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * *
19838348 TCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAATTAAATCTTTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGA
64 T-AAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAA-TAAATCTAGTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * *
19838411 CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-GTTATG--ATCTTTGTTTTGTCC
127 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTGATTTGTCA
* * * *
19838459 TAAAACATATAT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAAT-ATATCTAAATTAATAATAT
1 TAAAACA-AT-TGTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATAT
* * * *
19838522 TCTAAACATTAATAAGTAAGGACTTAAAAAATAAATGT-GTTGTCGAACCAA-TTCAAATAGTTA
63 T-TAAAAATTAATAAGTAA-GA-TTTAAAAATAAATCTAGTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
19838585 AGACTATTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACTTTTTG-TTTAGTCA
124 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGATTT-GTCA
* * * * * **
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1 TAAAACAATTG-TTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * *
19838703 AAAAAATTAATAAGT---A-TGAAAAA-AAATCTATTTATTGAACAAGTTTAAACAGTTTTGACT
64 TAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAATAAATCTAGTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
19838763 ATTT-CATTATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTATTA
129 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGA-TTTGTCA
* * * * *
19838811 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATATTACTGTATTAATATT
1 TAAAACAATTGTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
19838875 ATAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATC-AGTTTATCGAATC-GGTTCAAATAATT
64 -TAAAAATTAATAAG-TA-AGATTTAAAA-ATAAATCTAG-TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * *
19838938 ATG-GTGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA-ACTTTTGTTTTGTCA
123 ATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACA-TTTTGATTTGTCA
* * * * *
19838992 TAAAACAATTATT-T-TTCATCATACCAGCCTATTTAGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATAT
1 TAAAACAATTGTTCTATTCAT-A-A-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
19839055 TTCAAAAATTAATAAGTAGGTGAATTAAAAACTAAATAT-GTTTATCAAACCAA-TGCAAATAAT
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* * * * *
19839118 TATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTC-TTATAACTTTTTG-TTCTATCA
122 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACATTTTGATT-TGTCA
* * * * * ** * *
19839173 AAAAACAAATGTTTTTGTTGA-AATAAATTTGTTCAGAATAAAAT-ATATTAATTTATTAATATT
1 TAAAACAATTG-TTCTATTCATAA-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
*
19839236 TTAAAAATTAATAAGTAAGA--GAAAAATAAATCT
63 TTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAATAAATCT
19839269 GTTTACTAAA
Statistics
Matches: 774, Mismatches: 152, Indels: 121
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Matches are distributed among these distances:
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184 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
TAAAACAATTGTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA
AAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAATAAATCTAGTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGATTTGTCA
Found at i:19838710 original size:616 final size:623
Alignment explanation
Indices: 19837516--19838716 Score: 1436
Period size: 616 Copynumber: 1.9 Consensus size: 623
19837506 GCTTGTCTAA
* * *
19837516 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTATAGAAATTGATAAGATAGAGATTTAAAACATAAATC
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* * * * *
19837581 AGTTTATTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATTTGTTTCAAATCATTATTA
66 AGTTTATGAAA-CAGTTCAAATAATCATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
*** * **
19837646 ACTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACT
130 ACTTTTGAATTGTCATAAAACAATTGTCTTCCATCATACAAAACTATTCAAAATAAAATAATACT
***
19837711 AATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCA
195 AATTTACTAATATTTCAAAAATTAAT-AATAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCA
* * *
19837776 GTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGAC
259 GTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATAACA-TTTGTTTTGAC
* *
19837841 ATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAAAAAAAATACTAATGTAGTAATATTCT
323 ATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAAAAAAAATACTAATGTAATAATATTCT
* * * * * **
19837906 AAAAATTAATAAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTCGAATCAGTTCAAATAATTTTG
388 AAAAATTAATAAAATAAGAGACTTAAAAAATAAATGTAGTTGTCGAACCAATTCAAATAATTAAG
* * *
19837971 ACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT
453 ACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGCTT
* ** * * * *
19838036 TTGTTCATATAAGTTTGCTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
518 CTACTCATATAAGCTTGATTAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATAGTTCAAAAATTAATAAG
19838101 AGATTTAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTTATTCTG
583 AGATTTAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTTATTCTG
* * * *
19838142 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAATTAATAAG-TCGAAGATTTAAAAGATCAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAGAAATTAATAAGATAG-AGATTTAAAACATAAAT
* * * * *
19838205 TAG-TTATCGAAA-AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATG
65 CAGTTTAT-GAAACAGTTCAAATAATCATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
19838268 -ACATTTTGAATTGTTATAAAACAATTG-CTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAT
129 AAC-TTTTGAATTGTCATAAAACAATTGTCTTCCA-TCATACAAAACTATTCAAAATAAAATAAT
* * *
19838331 ACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT-A-A-GAGATTTAAAAATTAAATCTT-TTTACCAAA
192 ACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAATAGGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAA
* * *
19838392 CTAGTTTAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAA-TGTTATGATC-TTTGTTT
256 CCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTAT-AACATTTGTTT
* * * ** *
19838454 TGTCCTAAAAC-ATATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATATCTAAAT-TAAT
319 TGACATAAAACAAT-TATTTATATTCATACAAGCTTATTCA-AAAAAAAAATA-CT-AATGTAAT
* *
19838517 AATATTCTAAACATTAAT-AAGTAAG-GACTTAAAAAATAAATGT-GTTGTCGAACCAATTCAAA
380 AATATTCTAAAAATTAATAAAATAAGAGACTTAAAAAATAAATGTAGTTGTCGAACCAATTCAAA
* * * *
19838579 TAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACTTTTTGTTTAGTCATAAAA
445 TAATTAAGACTATTTA-AACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* * * * *
19838643 TAATTGCTTCTACTCATATATGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CGTTCAAA
509 CAAATGCTTCTACTCATATAAGCTTGATT-AAAATAAAATAATACTAATCTATTAATAGTTC-AA
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572 AAATTAATAAG
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AGTTTATGAAACAGTTCAAATAATCATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
CTTTTGAATTGTCATAAAACAATTGTCTTCCATCATACAAAACTATTCAAAATAAAATAATACTA
ATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAATAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGT
TCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATAACATTTGTTTTGACATA
AAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAAAAAAAATACTAATGTAATAATATTCTAAA
AATTAATAAAATAAGAGACTTAAAAAATAAATGTAGTTGTCGAACCAATTCAAATAATTAAGACT
ATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGCTTCTA
CTCATATAAGCTTGATTAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATAGTTCAAAAATTAATAAGAGA
TTTAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTTATTCTG
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19838096 ATAAGAGATT
** *
19838106 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAATTTATTCTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
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* * * * * *
19838170 TTAAAATTAATAAG-TCGAAGATTTAAAAGATCAATTAG-TTATCGAAAAGTTCAAATAGTCATG
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* * * *
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* **
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188 CTACTCATAC-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC--TTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
19838362 GAGATTTAAAAATTAAATCTTTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
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* * * *
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* * * * *
19838459 TAAAACATATAT-TTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAAT-ATATCTAAATTAATAATA
1 TAAAACA-AT-TGTTTTATTCATAAAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATAT-T-AATTATTAATA
* * * * *
19838521 TTCTAAACATTAATAAGTAAG-GACTTAAAAAATAAAT-GTGTTGTCGAACCAATTCAAATAGTT
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* * * * * *
19838584 AAGACTATTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG
123 ATG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTT-GTCATAAAACAATTG
* *
19838649 CTTCTACTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACGTTCAAAAAATTAAT
185 CTTCTACTCATACA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACTTTC-AAAAATTAAT
*** * * **
19838714 AAGTA-TGAAAAA-AAATCTATTTATTGAACAAGTTTAAACAGTTTTGACTATTT-CATTATTAT
248 AAGTATTGAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAACAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
19838776 CTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTATTA
313 CTATCTAAAA-TGTTATGA--TCTTTATTTTATCA
*
19838811 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTGTATTAATATTA
1 TAAAACAATTGTTTTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAT-TATTAATATT-
* * * *
19838876 TAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATCAGTTTATCGAATCGGTTCAAATAATTATG
63 TAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-AGTTTATCGAA-CAGTTCAAATAGTTATG
* * *
19838941 GTGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATT
126 CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGCTT
* * * * *
19839005 TTTCATCATACCAGCCTATTTAGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
188 CTAC-TCATA-CAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CTTTCAAAAATTAATA
19839069 AGTA
249 AGTA
19839073 GGTGAATTAA
Statistics
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TAAAACAATTGTTTTATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTATTAATATTTAA
AAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATAGTTTATCGAACAGTTCAAATAGTTATGCTATT
TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGCTTCTACTCAT
ACAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACTTTCAAAAATTAATAAGTATTGAAAAA
TAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAACAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTAAAATGT
TATGATCTTTATTTTATCA
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Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 12.9 Consensus size: 181
19839994 GTTTCAACTC
* * * *
19840004 ATACAAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGTA-A-TTAAAAAAGTGAATATGTTTA
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* * * * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * * * * *
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* * * *
19840315 CTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
131 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * **
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1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * *
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* * * * **
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130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATA
* *
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1 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTA
* * * * **
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* ** * * * * * * * ** *
19840666 TGTTTTATTGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATGAAA-A
127 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* ** * * *
19840720 ATACTAATCTATTAATATTTC-AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAA-AAAACTATTTATCA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * * **
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66 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * *
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131 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * *
19840895 ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * * * * *
19840960 AACTAGATCAAATAGTCAAGGCCATTTGATTAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
66 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** ** *
19841025 TTGTCATAAAA-AATTATTTC-ATTTCATATAAAATTATTTGAAATAGAATA
131 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * *
19841075 ATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTAACTG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * * * * *
19841140 AACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAATAATTATCAATTTGAAAT--TCTATAACCTTTTGT
66 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGT
** * * *
19841203 TTTGTCATAAAATGATTTTTTTTATTTATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATA
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* * * * *
19841255 ATACAAATTTATTAATA-TT-AAGAAATAAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
* ** * * * ** *
19841318 GAACAAGTTCAAATCCTTAT-ACTATTTGAACAATT-TGTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTG
65 GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT-CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * *
19841381 TTTTGCCATAAAACATTTGTTTCTGATT-ATACATGATTATTCAAACTAAAATA
129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * ***
19841434 ATATTAATTTATTAATATTTC-GACA--AATAA-T-----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * * * *
19841490 AACAAGTTCAAAAAGTCATGACTATGCT-AATAATTATTTATTTTAAATC-TATGTGACCTTTTG
66 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTG
* *
19841553 TTTTG-CAATAAAATAATTGTTTC-AGTTTC-TATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
129 TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * **
19841606 GTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTGTCG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * *
19841671 AAC-ATGTTCAAATAGTTTTGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTG
66 AACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTG
* * * * *
19841734 TTTTGTGATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTTTTC-GAATAAAATA
129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * ***
19841786 ATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAGATATGTTTTTT
1 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
* * * *
19841849 GAAC-ACGTTCAAATGGTTATGATTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTT
65 GAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTT
* * * * *
19841913 CTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAATAAAATA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * *
19841967 ATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
* * * * *
19842032 AGCGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTCT
66 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGT
* * * *
19842097 TTTGTCATAAATCAATTGTTTCCATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATA
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* *
19842149 ATACTAATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC
1 ATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
* * * * ** *
19842213 GAACGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTATGATTTTTTGC
65 GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
*
19842278 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCA
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19842306 CTAAAAATTT
Statistics
Matches: 1718, Mismatches: 329, Indels: 148
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
170 1 0.00
171 39 0.02
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173 9 0.01
174 231 0.13
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177 8 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG
AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
Found at i:19840853 original size:355 final size:355
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Indices: 19840075--19842310 Score: 1838
Period size: 355 Copynumber: 6.3 Consensus size: 355
19840065 ACCAAATCAA
* * * * * * * *
19840075 TTCAAATAGTTATGGCAATTTCAATAGTTATCTATTTTAAATTGTTATTA-TCTTTTGTTTGGTT
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* * * * * * *
19840139 ATATAACAATTGTTTTTAATCGTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * ** *
19840204 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGCAAAATAAATCTGTTTACCAAATTAGTTTAAATAGTTAT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
19840269 GACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACATTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTT
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* * * * *
19840334 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAATATAATAATATTTCAAAAACTAATAA
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** * * *
19840399 CTAAGAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAG
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* * * *
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* * * * *
19840494 ATAAAACAATTTTTTCAACTCATAATAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATAT
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* * *
19840558 TTCAAAAATTAATATA-TAAGAGACTTT-AAAAATAATTTTGTTTACCCAATC-AGTTCAAATAA
128 TTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * ** *
19840620 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATTGTAAAATAAA
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* * * * * *
19840685 TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATGAAA-AATACTAATCTATTAATATTTC-AAAATTA
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* *
19840748 ATAAGAGATTTAAAAAAAAAACTATTTATCAAACTAG
320 ATAAGAGATTTAAAAAAAAAA-TATTTATCGAACAAG
* * * * * * *
19840785 TTCAAATAGTTATAAGTATTTGAAGAATTATTTATTTCAAATTATTATGATTTTTTGTTCTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTA
* * * *
19840850 TAAAATAATAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * *
19840915 TAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCAAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * *
19840980 GCCATTTGATTAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
19841044 CAT-TTCATATAAAATTATTTGAAATAGAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
260 C-TGTTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA
** *
19841108 TTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTAACTGAACAAG
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* * * * * * * * * *
19841146 TTTAAATAATTATAACTATTTCAATAATTATCAATTTGAAATT-CTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTA
** * * * *
19841210 TAAAATGATTTTTTTTATTTATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * **
19841273 T-AAGAAATAAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATCCTTA
129 TCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
19841337 T-ACTATTTGAACAATT-TGTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACATTTG
193 TGACTATTTGAACAATTAT-CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * *
19841400 TTTCTGATT-ATACATGATTA-TTCAAACTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAAA-T
257 TTTCTG-TTCATACAAGATTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * *
19841462 AAT-----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGT-AAACAAG
319 AATAAGAGATTTAAAAAA-AAA-ATATTTA-TCGAACAAG
* * * * * * * *
19841496 TTCAAAAAGTCATGACTATGCT-AATAATTATTTATTTTAAATCTA-TGTGACCTTTTGTTTTGC
1 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TATTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * *
19841559 AATAAAATAATTGTTTC-AGTTTC-TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATTTATTAAT
64 TATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATA-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** *
19841622 ATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTGTCGAACATGTTCAAATAGT
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
19841687 TTTGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAACAAT
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* * * *
19841751 TGGTTCTATTCATGCAAGCTT-TTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
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* * * * * * *
19841813 TAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAGATATGTTTTTTGAACACG
318 TAATAAG---AGA-TTTAAAAA-AAAAATATTTATCGAACAAG
* * * ** * *
19841856 TTCAAATGGTTATGATTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTTGTTTTGTT
* * *
19841921 ATAAATCAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
19841986 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAGCGAGTTTAAATAGTTAT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
19842051 GACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTCAT-AAATCAATTG
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTG
** * * *
19842115 TTTCCATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAA
257 TTTCTGTTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAA
* * *
19842179 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACGAG
321 TAAG----AGATTTAAAAAA-AAA-ATATTTATCGAACAAG
* * * * * *
19842220 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTATGATTTTTTGCTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTA
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TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
TGTTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGA
GATTTAAAAAAAAAATATTTATCGAACAAG
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* * ** * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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*
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AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGACAAATAAT
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** *
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*** **
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129 CTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGT
* * * * * *
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** ** *
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129 CTAAAAATTAATAAG
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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** ** * * *
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** * ** *
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*
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* * * * * * * ** * * *
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1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
* * * * * * * ***
19844021 CAAAATAACACTAATTTAATAATATTCCTAAGATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCA
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* * * * * * ** * *
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* ** * * * *
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1 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG-TTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * * * *
19844200 AATAAAATAAAAGTAATTTATTAATACTCCAAAATTTAATAAGT---GATTTAAAAAGTGAATAT
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * *
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* * ** * * * ** * *
19844314 AAATCGTTATTACCTTTTGTTTCATCATATAAGAATT-TTATTTGAACATTCAAGCTT-TTTGGG
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATACAAGCTTATTT-AG
* * *
19844377 AATAAAATAATA-TTATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATA
* * * ** *
19844441 TATTTACCAAACTAATTCAAATAGTTATGACTAATTGAATAATTATAAACTTC
128 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * * * *
19844494 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
* * * * * * *
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66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAA-AGATTTAAAAAATAAATAT
* * * ** * *
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129 GTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * *** * *
19844674 TAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAGGTTTGTTTGAATTCATACTAGCTTATTTG
1 -AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTA
* * * *
19844739 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAT
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* * * * * *
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126 TATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * * * *
19844858 AAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTATTCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
* * * * * *
19844923 TAAAGTAATACTAATCTATTAATGTTTCAAAAATTAATAAGT---GATTTAAAAATTAAATCTAT
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
* ** *
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131 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * *
19845035 AAATCATTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAG
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
* * ** * * **
19845100 TAAAATAATTCTAATTTATCAATATTTTGACAATTAATAAGTAAATATTTTTAAAATAAATATGT
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
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131 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
19845215 AAATCCTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGTTTCAGTTTATATAAGCTTATTCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
19845280 TAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAA
66 TAAAATAATACTAATTTA-T--TAA--TA-T--T--T-CAAAAATTAATAAGT-AA-AGATTTAA
* * *** * * * * * * * *
19845344 AAAATGAATCTGTTTATTGAACAAATTTAAATAATTAGGATTGTTTGAATAATTATCTATTTG
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* * * * * *
19845407 AAAT-AGGTATAACC-TTTGTTTTGTCAAAAAAGAATTTTTTTTGTTCAT-CTAAGCTTATTTCA
1 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AAGCTTATTT-A
* * * *
19845469 -AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACTATTAACAAGAAAAGATTTAAAAAATAAA
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** * * * * *
19845531 TATGTTTTGCAAACAAGTTCAAATCGTTATGGCTATTT-AAGCAATTATTTA-TTC
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * *** * *
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* * * **
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* * ** *
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** * *** * * *
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* ** * ** *
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* * * ** * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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**** * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * *
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65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGAT-TTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* **** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * *
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** * * * * * * * * * ** *
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* * * *** *
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* *
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* * * * *
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** * *** *
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* * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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*
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** * * * *
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* * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * *
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192 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATAC
* * * * * * * **
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* ** *
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* * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * ** * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * *
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** * * * ** * *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATAT
* * *
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* * * *
19845954 CTTTTGTTTTGT-AGAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAATATAAT-TT
194 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACT
* * * *
19846016 AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTTAAGAAATAAATTTGTTTTTCTGAAC
257 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAAC
* * * *
19846080 ACGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAAAAATTATCTATTTC
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* * * * * * *
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* * * * * *
19846186 TAAAATAATGCTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
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* ** * * * *
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130 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * ** *
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* * *** *
19846381 TTTATTAGT-GTTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAA
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*** * * * *
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322 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * ** *
19846483 AAAT-AGTAACAACATTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAGA
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* * * ** * *
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64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATA
* * * * * * *
19846606 TATTTGCC------GATCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTA----AAATCTTTATGA
128 TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * *
19846661 TC-TTTATTTTGTCATAAAACAAGTGTTTCTTTTCA-ACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACT
193 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACT
* * * * * * * * *
19846724 AATATAATAATATTCCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAATAAATAAATATGTTTGTTGAACCA
257 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * *
19846785 GTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
322 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * * *
19846824 AAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTATTTTCAGTTCATGCAAGCTTATTAGAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * * *
19846889 TAAAATAATACTAATTTATCAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATGTAAAAAAATAAATT
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATA
* * * * * * * *
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128 TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTAT
* * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *** * *
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1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19847251 TAAAAATAGTACTAATTTAATAATA-TTCTTATAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATG
65 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * ** *
19847311 TGTTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTG
128 TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** * * * * *
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* * * * * ** * *
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255 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-GA
* * * * *
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318 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ***
19847546 AAATCATTATGACCATTTG---T-T--T-AAACAATTGTTTTAGTTCATA-ATAGTTTATCCAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA-AGCTTAT-TTGA
* * **
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* * * * * * * * ** * *
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* * *** * *
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* * * ** *
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*
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320 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * *** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * *
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65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * ** * * * **
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* * * * * * ** * *
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* * * ** * * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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255 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGA
*
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* * ** * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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321 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** ** * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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** * * * *
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*
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * ** *
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127 AGCTTATTTTAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAT
* * * * *
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* * ** * * * * * * *
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65 TATATAATTCAAATTATTATGACCTTTTATT-TATGTCATAAAACAAT-TTTTC-AGCTCATATA
* * * ** * *
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* * * * * *
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** * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
19850072 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
195 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGA
* * *
19850137 ACAATTCTATACTTCAAACATTATAACCTTTTTTTATGTCATAAAACAATTATTTCCGTTCATAT
260 ACAATTCTATACTTCAAACATTATAACCTTTTTTTATGTCATAAAACAATTATCTCCATTCATAC
* * ***
19850202 AAGCTTATTTTAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGGGATTT
325 AAGCTTATTTCAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAAAAATTT
* * * *
19850267 AAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGTTAATACTATATGAACAATTATCAAATTC
390 AAAAAATAAATATGTTTCTCAAACTAGATCAAATAGTTAATACTATATGAACAATTATCAAATTC
19850332 AAATTGTTATGACCTTTTGTCTCATGATAAAAGAATTTTCTCAACTCATACTAGCTTATTTAGGA
455 AAATTGTTATGACCTTTTGTCTCATGATAAAAGAATTTTCTCAACTCATACTAGCTTATTTAGGA
19850397 TAAAATAAAATG
520 TAAAATAAAATG
* *
19850409 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAATTCTATTTACCTAAACAGT
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATT--AAAAAACTCTATTTACCGAAACAGT
* * *
19850474 TCAAATAATTATGACT-ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCA
60 TCAAATAATTATG-CTCATTTAAACAATTATCTATTCCAAATTATTATCACCTTTTATTTGGTCA
* * * * *
19850538 TA-AGACAAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTC-AA-AATAA-AATAATACTAATCTATTAAT
124 TATA-ACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCGAATAA-AATAATAATAATAATCTATTAAT
* * *
19850599 ATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTATCAATCCAGTTC-AATAGTTATG
187 -CTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
19850663 AATATTT-AACCAATT-TTTATTTCAAATCGTTGTGACTTTTTGTTCTAT-T-ATAAAACAA-TA
251 AATATTTGAA-CAATTCTATACTTCAAA-CATTATAACCTTTT-TT-TATGTCATAAAACAATTA
* * * * * *** *
19850723 GTCTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGATTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATT
312 -TCTCCATTCATACAAGCTTATTTCA-A-ATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATT
* *
19850787 AACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACTAGATCAAATAGT
374 AACAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-CTCAAACTAGATCAAATAGT
19850840 CAATTTATTA
Statistics
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0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
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539 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (531 bp):
AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTAAAAAACTCTATTTACCGAAACAGTTCAAAT
AATTATGCTCATTTAAACAATTATCTATTCCAAATTATTATCACCTTTTATTTGGTCATATAACA
AATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCGAATAAAATAATAATAATAATCTATTAATCTTTAAAAA
TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAA
CAATTCTATACTTCAAACATTATAACCTTTTTTTATGTCATAAAACAATTATCTCCATTCATACA
AGCTTATTTCAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAAAAATTTA
AAAAATAAATATGTTTCTCAAACTAGATCAAATAGTTAATACTATATGAACAATTATCAAATTCA
AATTGTTATGACCTTTTGTCTCATGATAAAAGAATTTTCTCAACTCATACTAGCTTATTTAGGAT
AAAATAAAATG
Found at i:19850852 original size:77 final size:77
Alignment explanation
Indices: 19850764--19850918 Score: 310
Period size: 77 Copynumber: 2.0 Consensus size: 77
19850754 AAATAATACT
19850764 AATTTATTAATATTTTGACAATTAACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA
1 AATTTATTAATATTTTGACAATTAACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA
19850829 GATCAAATAGTC
66 GATCAAATAGTC
19850841 AATTTATTAATATTTTGACAATTAACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA
1 AATTTATTAATATTTTGACAATTAACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA
19850906 GATCAAATAGTC
66 GATCAAATAGTC
19850918 A
1 A
19850919 TGACTATTTG
Statistics
Matches: 78, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (77 bp):
AATTTATTAATATTTTGACAATTAACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA
GATCAAATAGTC
Found at i:19851543 original size:360 final size:359
Alignment explanation
Indices: 19850843--19851561 Score: 788
Period size: 360 Copynumber: 2.0 Consensus size: 359
19850833 AAATAGTCAA
** ** * * *
19850843 TTTATTAATATTTTGACAATTAACAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTAGA
1 TTTATTAATATTAAGACAAGCAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGA
* *
19850908 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGGTCAT
66 TCAAATAGTCATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGGTCAT
* * *
19850973 AAAAAATTATTTCAATTCATATAAGGTTATTCGAAATAAAATAATACTATGTTATTAATATTCCA
131 AAAAAATTATTTCAATCCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTATGTTATTAATATTCCA
* * * * * * *
19851038 AATATTAATAATTAAGAGATTTAAAAATGAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAATTATGGCC
196 AATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAT-AATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACC
* ** * * ** ***
19851103 ATTTGAACTATTATCGATTTGGAATCGCTATAACCTTTTGGTTTATCATAAAATTATTTTATTTG
260 ATTTGAACTATTATCGACTTCAAATCACTATAACCTTTTGGTTTATAATAAAACAATTTTATCAA
19851168 TTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAG
325 TTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAG
* * * *
19851203 TTTATTAATATTAAGACAAGCAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
1 TTTATTAATATTAAGACAAGCAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGA
* * * * *
19851268 TCAAATCGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGGCCTTTTTGTTTTGTC
66 TCAAATAGTCATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACC-TTTTGTTTGGTC
* * * * * *
19851332 ATAAATTAATTGTTTCTATCCATCCAAGCTTATTC-AGATTAAAATAATATTAAT-TTATTAATA
129 ATAAA-AAATTATTTCAATCCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-ATGTTATTAATA
*
19851395 TTTCAACA-ATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA-AATATATTTTACCAAACAAGTTCAAATAATC
191 TTCCAA-ATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAATATA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAATC
* * * * * * * *
19851457 ATGACTATTTGAA-TAATTGTCTACTTCAAATCATTGTAACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT
254 ATGACCATTTGAACT-ATTATCGACTTCAAATCACTATAACCTTTTGGTTTATAATAAAACAATT
* * *
19851521 GTT-TCAATTCATGTAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACAA
318 -TTATCAATTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAA
19851562 TTATGGCCAT
Statistics
Matches: 294, Mismatches: 56, Indels: 18
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
359 6 0.02
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
TTTATTAATATTAAGACAAGCAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGA
TCAAATAGTCATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGGTCAT
AAAAAATTATTTCAATCCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTATGTTATTAATATTCCA
AATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACCA
TTTGAACTATTATCGACTTCAAATCACTATAACCTTTTGGTTTATAATAAAACAATTTTATCAAT
TCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAG
Found at i:19851657 original size:107 final size:106
Alignment explanation
Indices: 19851463--19851666 Score: 241
Period size: 107 Copynumber: 1.9 Consensus size: 106
19851453 AATCATGACT
* * * *
19851463 ATTTGAATAATTGTCTACTTCAAATCATTGTAACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
** * * **
19851528 TTCATGTAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACAATTATGGCC
66 -TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACAATTATGGCC
** *
19851570 ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG--TTT
19851634 CAA-CATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAC
63 CAATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAC
19851667 TAGTTTATTA
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 13, Indels: 6
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (106 bp):
ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACAATTATGGCC
Found at i:19851844 original size:287 final size:286
Alignment explanation
Indices: 19851284--19851848 Score: 656
Period size: 287 Copynumber: 2.0 Consensus size: 286
19851274 CGTTATGACT
* * ** **
19851284 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTCTTATGGCCTTTTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTTCT
1 ATTTAAACAATTATCTAATTCAAATTCTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * *
19851349 ATCCATCCAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
66 ATCCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
19851414 AAAGATTTAAAAAATATATTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTGTCT
131 AAAGATTTAAAAAATATATTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATAT
* * ** ** *
19851479 ACTTCAAATCATTGTAACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATGTAGGCTTATT
196 ACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAATTCAATTCATACAAGCTTATT
*
19851544 TGAAATAAAATAATACAATTATGGCC
261 GGAAATAAAATAATACAATTATGGCC
* *
19851570 ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
1 ATTTAAACAATTATCTAATTCAAATTCTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
*
19851633 -TCAACATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAAAATTT-AAAATATTAATAA
66 ATC--CATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAA-ATTAATAA
** * * * * * *
19851696 GTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
128 GTAAAAGATTTAAAAAAT--ATAT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAA
* ** * *
19851760 TTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAA
190 TTATATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAATTCA-ATTCATACAA
*
19851824 GCTTATTGGGAATAAAATAATACAA
254 GCTTATTGGAAATAAAATAATACAA
19851849 ATGCAATAAT
Statistics
Matches: 231, Mismatches: 41, Indels: 13
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
283 2 0.01
284 4 0.02
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ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (286 bp):
ATTTAAACAATTATCTAATTCAAATTCTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
ATCCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTA
AAAGATTTAAAAAATATATTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATAT
ACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAATTCAATTCATACAAGCTTATT
GGAAATAAAATAATACAATTATGGCC
Found at i:19851874 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 19851570--19852893 Score: 1179
Period size: 181 Copynumber: 7.4 Consensus size: 179
19851560 AATTATGGCC
* * *
19851570 ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTG
** * * * * *
19851635 AACATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAAAATTTAAAATATTAATAAGTAG
65 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAA-ATTAATAAGTAA
* * *
19851700 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCA-TTCAAATAGTTATGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
19851750 ATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAATTATG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTG
** * ** * *
19851815 TTCATACAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAA
65 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * ** ** * * * *
19851880 AAAATTTTTTAAAA-AAATTTATTTGTCGAGCCAGTTTAAATAGTTAAGGCT
129 GAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
19851931 ATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATTTTTAGC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGT
* * *
19851996 TCTTACTAA-CTTATT-TGAAATAAAATAA-ATCAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAA-
66 TCATAC-AAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-AAG
* * * *
19852057 TAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTGCCGAACCAGTTCAAATAATTATAACT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
19852111 GTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAGACAAATGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTG
* * * * *
19852176 TTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAA
65 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
19852237 GAGATTT-AAAAATAAATATATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTACGAAT
129 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
19852287 ATTT-AGGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGGCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATAGTTTTT
1 ATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTT
* * * ** * * * *
19852351 GTTCATTCAAGCTTATTTAGATTAATTTAATACTAATTTATGAATATTTTGACAATTAATATGTA
64 GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
19852416 AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
19852468 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAAA-AATTATTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATT-TTTTT
* * * * * * * * *
19852532 GTTCATATAAGGTTAGTC-GAAATAAAATAATA-TTATGTTAGTAATATTCCAATAGTTAATAAT
64 GTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG
* * * * *
19852595 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGACC
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
19852649 ATTTGAACAATTATCAATTTGGAATCGCTATAACCTTTTGGTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTTG
** * *
19852714 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAACATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTA
65 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTA
* * *
19852778 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATCA-TTATGACT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAAT-AGTTATGACT
* * *
19852830 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
19852894 TGTTATGACA
Statistics
Matches: 910, Mismatches: 199, Indels: 69
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 4 0.00
176 126 0.14
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178 1 0.00
179 14 0.02
180 267 0.29
181 452 0.50
182 33 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGT
TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGA
GATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
Found at i:19853291 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19852954--19854513 Score: 1267
Period size: 181 Copynumber: 8.7 Consensus size: 180
19852944 CTGCCTAATG
* * * * * * * *
19852954 CAAATATTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATGTTATCACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
* * * * * * * ** *
19853019 AATCACTTGTTTCTATTCAGACAAGTTTATTTGAAATAATATAATTCTAGCTTATTAATATTCCA
66 AAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TA
* * * *
19853084 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAATAAGTT
130 AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTT
* * * * * *
19853135 AAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCCTTTATTTTGTCACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
* * * *
19853200 AAACAATT-TTTGCTATTTATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAACACGAATTTAATAATATTTA
66 AAACAATTGTTT-CTATTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA
* * * *
19853264 AACAATTAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-TCGAATAACTT
130 AA-AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAATAAGTT
* * * * * * * *
19853316 CGAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATAACTTTTTGTTTT-TTATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
* * * * * *
19853380 AAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
66 AAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT
* * * * * * * *
19853444 GACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTC
129 -AAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTT
* * * * * ** ** *
19853496 CAAATAGTCATAACTATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATC-ATATGACCTTTCCTTTCAT-TTG
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT-
* * * * ** *
19853559 AAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATAATC
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT-
* * * * *
19853623 CT-AAAATTAATGAATAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTACCGAA-ATAGTT
127 TTAAAAATTAATAAATAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAATA-AGTT
* * * * * * *
19853677 TAAATAGTTATTACTATTTGAATAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTCTTTTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT
* * *
19853742 AAAATAATTGTTT-T-TGT-T-CAAGC-TATTTCG-AATAAAATAACA-TAAATTTATTAATATT
65 AAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * *
19853800 TCAAAAATCAATAAGTAGAA-A-TTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAATACGTT
128 T-AAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTT
* *
19853852 CAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
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* * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTATTTTGTCAT
* * * * * *
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** *** * ** *
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* * * * * *
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* * *
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66 AAACAATTGTTTCTATT--TATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * ** *
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* * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTATTTTGTCAT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * *
19856201 GTCAAACAATTGACTTT--GTTGAGACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 ATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * ** * *
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* * * * ** * * * * *
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* ** * * *
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** * * * *
19856446 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAG
128 TCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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127 -TTCAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* ** * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
19856741 TAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGTTTATACGGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTT
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* * * * * *
19856806 CTAAAATTAAT-AACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AG
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* * * * * * * *
19856857 TT-AAACAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* *** *
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* * * * ** * *
19856986 TTCAAAAATTTATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAG
127 TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
** ** * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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*** * * * * * * *
19857527 TTCCAAAAATTAATATGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTCACCGAATCAA-
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* ** * * *
19857581 TTCAAATAATTATGGTTATTTCAACAATTACCTA-TTCAAATCGTTATGAA-TATTGTTTTGTCA
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* * * ** * * *
19857644 TAAAACAATTGTTT--TTTCA-ACAATTACCTATTCAAATCATTATGA-AC-AATGTTTTGTCAT
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** *** * * ** * ** * * * *
19857704 AAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA-AAATACTAATTAATTAA-TAT
126 -ATTCAA---AAATTAAT-AAACAAG-AGA-TT--AAAAAAATAAAT-CTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * ** *
19857766 TTTAAA-ACTTAATAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA--G-TA-G--CTCCT-AT
1 TTCAAATAGTT-AT--GACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATCGTTATGAACTTTTGTT
* * * * ** * * * * * **
19857822 TTG-AATAATTAC--CTATTTCAAATCATTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAATAATTGTTTCA
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* * * ** ** * * * * * *** *
19857884 GTTCATAGAAGCTTCTTTGAAATAAAATAATAC--TA-ATT-TAATAAT-ATTCTGAAAATTAAC
116 ATTTAT-TAATATTC--AAAAAT-TAATAA-ACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACT-A-
19857944 AACTAAAGG
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* ** * * * * * * ** *
19857953 ATTTAAA-AAATA-AATCTGTTTGCCAAAGCAATTTAAAC-AGTT-AAGATACATGAAAAATTAT
1 -TTCAAATAGTTATGA-CTATTTG---AA-CAA-TT-ATCTATTTCAA-AT-CGTTATGAACT-T
* ** * ** * * * * **
19858014 TTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTT-TG-TCATTAAGCAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT
55 TTGTTT--TGTCA-TA-AAACAATTGTTTCAGTTCA-T-A-CAA--G-CTTA-TTCAAATAA-AA
* * ** * * * * * * * * *
19858077 TATTTGAAGTAAAATAATACAAATTCATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGA
108 TA-AT--ACTAATTTATTA-ATATTCA--AAAATT-----AATAAACAAGAGATTAAAAAAATAA
* *
19858142 ATCTGTTTACTGAATC-AT
162 ATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * *
19858160 TTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTT-TTTTGGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTT-GTC
* ** * * * * ** * * *
19858224 ATATAACAAATT-TTTTTGATCTTTCAAGCCTATTTGGAATACAATTATACTAATTTATTAATCT
65 ATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-A
* * ** ** * * *
19858288 TTCAAAAATTTATGAGTAACTGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACTAA-
127 TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AAG
* * *
19858341 TTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-A--ATC-A--T-ATA-C-TT-T-AA--ATTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
19858393 CAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATCTAACAATAATC
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * *
19858458 TAAAAATTAAT-AACTAAGAGAATT--AAAAATAAATTTGTTTGAC-GAACTAG
130 -AAAAATTAATAAAC-AAGAG-ATTAAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACAAG
* * * * *
19858508 TTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTC
* * * * * ** *
19858572 ATAAAGCAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTAATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-
* ** * *
19858635 TTCAAAAATTAAT----AAGATATTTAAAAAAATATTTTTGTTTACCTAACCAA-
127 TTCAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAG
* * * *
19858685 TTCAAATAATTATGACTAATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TTTTTGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTC
* ** * * * * *
19858749 ATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * *
19858813 TCAAAAATTAAT--A-AA-AGATTTAAAATATAAATCTATCTATTAAACCAG
128 TCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT-T-TTG
* * ** * * *
19858923 TTATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTCTTTAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
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** * ** * * * * ** *
19858988 TTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACTAG
127 -TTCAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * *
19859107 TAAAAGATTTGTTTCAGTTCATATAAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * *
19859171 CCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAA-GAATCTATTTACTAAGCAAG
129 -CAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * ** *
19859223 TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCCCTAT-AACCTTTTGTTTTGAC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTC
* * *
19859287 ATAAAATAATTTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAAATTT-TTAAT
65 ATAAAACAA-TTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAAT
* ** * * * *
19859350 ACT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAACAAATCTTTTTA-TCGAACAAG
126 ATTCAA-A-AATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * *
19859405 TTCAAAT-GTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTCTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACT-TTTGTTTTGTC
* * ** * * *
19859468 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGGTTATTTGGATTAAAATAATATTAA-ATATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
** * ** * * * * * *
19859532 TTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAATTATGTTTACCAAACAAG
128 TCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
** * * * * * * *
19859584 TTGTAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
19859649 TAAAACAACTATTTGAATTCAAATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* ** **
19859714 TAAAAATTAATGAGTAAGAGAATT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG
130 -AAAAATTAATAAACAAGAG-ATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * *
19859765 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATTACCTTTTCTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
19859830 TAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAACAAAATAATA-TAAATTGATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* ** * * * * *
19859894 AAAAAAATTAATAAGTAA-A-ACTTTAAAAAATAAATTTGTTTTTCTTAACATG
129 -CAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTG-TTTACTAAACAAG
* * * *
19859946 TTCAAATAGTT-T-ATCTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
19860009 ATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * ***
19860074 CCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAGTGAG
129 -CAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
19860127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTATTTTAAAT-GATTATGACCTTTTGTCTTCTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGAACTTTTGTTTTGTC
* * *
19860191 ATAAAACACTTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAATTAATACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*** * * *
19860255 TCTAAAAATTAAT-AAGTTGCAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAG
128 TC-AAAAATTAATAAACAAG-AGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * ** ** ** * * *
19860308 TTCAAATAATCAAGTTTATTCAAACTGTTAGCTATTTCAAATCATTATG-ACATTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTC
* **
19860372 GTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
** * * * ** * * *
19860436 TTTGAAAATGAAT----AAGACATTTAAAAACGAAATCTATTTA-TCGAACCA-
127 TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * *
19860484 TTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATCTAAAATTGTTATGAACTCTT-TTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * *
19860548 TAAAGTAATTGGTTGT-A-TTAATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATAT
66 TAAAACAATT-GTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * **
19860611 TCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCGG
128 TC-AAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * ** * * * *
19860663 CTCAAATAGTTAAGACT-TTAAAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTCT-AACTTTT-TATTTAGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT-TTT-GT
* * * * ** * ** * * *
19860725 CATAAAATAATTTTTTCAATTTATACAATTATCTATTTAAAGTTATTATAA-CCT-TTTGTTTTA
64 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA-GCT-TATTCAAA--TAAAATAATACTAATT-TATTA
* * ** ** * * *
19860788 ACA-TAAAATAATTGTTTCAGTTCATA-AAATCTTACCCAAAATAAAATAATAT-TACTTTATTA
124 ATATTCAAA-AATT-AAT-A-AACA-AGAGA--TT-----AAA-AAAATAA-ATCT-GTTTACTA
*
19860850 ATATTTCAAAAA
174 A-A---C--AAG
* * * * * *
19860862 TTGAAA-AGTT-GGA-GATTTGAAAAATAAATC-AGTTTGTCAAATCAGTTATG-AC---T-ATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTA--TT-TCAAATC-GTTATGAACTTTTGTTT
** * * ** * * * ** *** *
19860918 TG--A-ACAATTATTTATTTCAAATCGTA-ATGACTT-TTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGT-T
61 TGTCATA-AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG-CTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT-TAT
* * * * *** * *
19860976 T-TTGTTCACACAAGTTTATTTGGATTAAA-ATA-ATATTAATTTATTAATAT-T-TTGACTATT
122 TAATATTCA-A-AA----A-TT--AATAAACA-AGAGATTAAAAAAATAA-ATCTGTTTACTA--
19861036 AA-AGAG
174 AACA-AG
* * * * * * * * *
19861042 -TAAAATATTTTCAAAATAAATATGTTTACCGAA-TA---AGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTG
1 TTCAAATA-GTT----ATGACTAT-TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACT-TTTG
** * * * * * * * ** * ***
19861101 AAAACTTATCTATTTCAAATCTCATAACTATTTGA-ATAAT-TTATC-TATTTCAAAT-TGCT-A
58 ---TTTTGTC-A--T-AAA----ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAA
* * * ** *
19861161 TGACCT--TTTGTTTCATCA-TAAAACAATTGTACTGATTTATATAG-GCTTATTCGAAATAAAA
111 T-A-CTAATTT-ATTAAT-ATTCAAA-AA-T-TA---ATAAACA-AGAG---ATT--AAA-AAAA
* ** * *
19861222 TAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAA
159 TAA-ATCTGTTTACTAA-A---C--AAG
** * ** * * * * *
19861250 TT-AATGAGTAAGAGATAAAAAATATGAATCGATTTATCAGACAAGTTCAAATGGTTATG-ACTA
1 TTCAA--A-T-AGTTAT-GACTATTTGAA-C-AATTAT----CTATTTCAAATCGTTATGAACT-
** * *** * * * *
19861313 TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTT--T---TG-TTGTGTC--ATAAAATAAT
54 TTTG---TTTTGTCATAAAAC-AATTGTT-TCA-GTTCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAATAA-
** * * * * *** **
19861369 TGTTTATTTCATACAAGTTTATTTCGAATAAAATAATATA-AATTTATTAATATTCTAA-AAAT-
111 TACTAATTT-AT-TAA---TA-TTC-AA-AAATTAATAAACAAGAGATTAA-A--AAAATAAATC
** *
19861431 TAATAAGC-AAA-AA-
165 TGTTTA-CTAAACAAG
* ** * * ** * * * * *
19861444 TTTAAA-AAATA-AATCTGTTT-TTC--TGAAC-A-TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
19861502 ATAAACCAATT-TTTCTGTTCATATAAACATATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * **
19861566 CCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGGAAG
129 -CAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * *
19861618 TTCATATTGTTATGACTGTTTGAATAACTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTAGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * *
19861683 TAAAAC-A-------A-TT--TACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATACTATTTTATTAATATT-
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
*** * * * *
19861736 ATGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAG
130 A--AAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
19861788 TTTAAATA-TATTTGACTATTTTGAATAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTG
1 TTCAAATAGT-TATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAACTTTTGTTTTG
* * * * * *
19861851 TCATAAAACAATTGTTT-TGATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATAATACCTTT-TTAA
63 TCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
* * * * * * * *
19861914 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCCAAACTAG
125 TA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
19861970 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
19862034 TAAAACAATTATTTTTA-ATCATATAAGCTTATTTAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 TAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * ** * *
19862098 TCAATAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTGTTGAACTAG
128 TCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * *
19862146 ATCAGATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGGTCT-AACCTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * *
19862210 AGACAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATACTACTAATTTATTAACATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *** * * *
19862275 AAAAAAATTAATACGTATGAGATTAGAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACAAG
129 -CAAAAATTAATAAACAAGAGATTA-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * *
19862328 -TCAAGTAGCTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCATTAT-AACCATTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
19862391 ATTAAACAGTTGTTTTAGTTCATAAAATCTTA-TCAAAATAAAATACTACTACTTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* ** * * * *
19862455 TCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTACCAAATC-AG
128 TCAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAA-CAAG
* * * * * * * *
19862507 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * *
19862572 TAAAACAATTATTTTTCAG--CATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* *** * * * **
19862635 TTAAAAAATTAATTTGCAAGAGA-T-AAAAAGTAAATATGCTTA-TCAAA-TTG
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* * * *
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1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGT
* * * * *
19862749 CATAAAAAAATTGGTTCTA-TTCATACTA-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
64 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * *
19862812 TTTCGAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTAATTGCTGAACCAA-
127 -TTCAAAAATTAATAAACAAG-AGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * ** * ** *
19862866 TCCAAATAGTCAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAGATTATTAT-AACCTTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTC
* * ** ** * * * * *
19862930 GTAAAACAATTGTTTTA-TTTGTACAAGCTTATTGGGATTTAAATAATACTCATTCAATAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
** * *
19862994 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATGT-AAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAATAAG
128 TCAAAAATTAATAAACAAGAGAT-TAAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * * * *
19863046 TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTGGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* ** * * *
19863111 TAAAAAAAATT-TTTCAACTCATACAAGC-TATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATCAACATT
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* * *
19863174 CAAAAAATTAATAACAAAAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTATACTGAACAAG
129 C-AAAAATTAAT-A-AACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTT-TACTAAACAAG
* * * * * * * * *
19863230 TTCACATAGTTATTACTATTTGAGCAATTGTTTATTTAAAATTGTTAT-AACCATTTGATTTGTC
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* * * *
19863294 ATAAAACAACTATTTCAGTT-AGTACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-TACAAGCTTA-TTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * ** * ** *
19863357 TTTTTGAAATCAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTACTAAATC-AG
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* * * * ** * * *
19863411 TTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCA
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** *
19863476 TAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
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* * * *
19863541 AAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAG
129 CAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
19863588 TTCAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTTTCAATCTCAAATTGTTAAGATC-TTTGTTTTGTC
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* ** * * * * *
19863651 ATTAAACAATTGTTT-TTTATCATAGAAGCTTATTCGGATTAAAAATAATTCTAATTTAATAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTC-AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * **
19863715 TTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTGCTTGC-AGAACTGG
127 TT-CAAAAATTAATAAACAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTACTA-AACAAG
* ** * * * * * * *
19863769 TTCAAATAATTAAAACCATTAGAATAAATATCTATTTCAAATTGTTCTG-ACATTTTGTTTAGTC
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* * * * * *
19863833 ATAAAATATTTATTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATTTATTAACAT
65 ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
19863897 TTAGAAAATTAATGAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG
128 TCA-AAAATTAATAAACAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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** * **
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* * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * **
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*
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* * * * *
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** * * * * * **
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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1 AATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAAT-CTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
* * * *
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** * * *
19857480 AGTTTATTA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAA
124 AGTACA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * ** * ***
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* * * * * *
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* * *
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** * * * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-TAA
* * * *
19859342 TTT-TTAATA--CTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAACAAATCTTTTTATCGAACAA
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* * *
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* * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *** * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* *
19859703 TATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
66 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTT
* * *
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129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * *
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* ** * * * * ** *
19859882 TTGATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAACTTTAAAAAATAAATTTGTTTTTCTTAACATGT
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* * *
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* * * *
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* * ** ***
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* * *
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129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTT
* * * * * * * *
19860181 TTGTCTTCTTATAAAACACTTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAATTAATACTAATT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
** * * * *
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* * * ** ** ** * * *
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130 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
** * ** *
19860362 TTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAAT
* * * * ** * *
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* * * * * *
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130 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* ** * * * * * * * * *
19860538 TT-TTTTCTCATAAAGTAATTGGTTGTATTAATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAAT
* * * * * ** *
19860601 TTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTACTGAACCGGCT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTT
* ** * * * * * *
19860665 CAAATAGTTAAGACT-TTAAAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTCTAACTTT
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * ** * ** ** *
19860716 TTATTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTTATACAATTATCTATTT-AAAGTTATTATAA-CCT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA-GCT-TATTTGAAA--TAAAATAATACT
* * * * ** *
19860779 -TTTGTTTTAACA-T-AAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAATCTTACCCAAAATAAAATAATATT
62 AATT-TATTAATATTCTAAA-AATT-AATAAG-T-A-AAAAT-TT------AA-AAAATAA-A-T
* * * * * * *
19860841 ACTTTATTAATATTTC-AA-AAATTGAAA-AGTT-GGA-GATTTGAAAAATAAATC-AGTTTGTC
111 -C--TATT--TA--CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTA--TT-TC
19860900 AAATCAGTTATGA-CTAT
165 AAATC-GTTATGACCT-T
* * * * * *
19860917 TTGAACAATTATT-T-ATTTCAAATCGTAATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
1 TTG-----TT-TTGTCA--T-AAAAC--AAT---TGTTT-CTGT-TCAT---ACAA--GCTTAT-
* * * ** * * * * **
19860980 TTCACACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAAT-TTATTAATATTTTGACTATTAAAG-AGT
44 TTGAAATAA-AATA-AT--ACT--AAT-TTATTAATATT-CTAA-AAATT-A--A-T-AAGTA--
** * * * * *
19861043 AAAATATTTTCAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-AACT
93 AAA--ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T
* *
19861107 TATCTATTTCAAATC-TCAT-AACTAT
155 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-T
* *** * * * * *** * * * **
19861132 TTGAATAATTTATC-TATTTCAAATTG-CTATG-ACCT-TTTGTTTCATCAT-AAA-ACAATTGT
1 TTG--T--TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-AT-TTGAAATAAAATAAT
* * * **
19861191 ACTGATTTATATAGGCTTATTCGAAATAA--AATAA-TACCAATTTATTAATATTCCAA-AAAT-
59 ACTAATTTAT-TA---ATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAAAATTTA--AA-A----AATAAATC
* * * * ** * * * * * *
19861251 TAATGA--GTAA-GAGAT-AAA-AAATATGAATCGATTT-ATC-A-GA-CAAGTTCAAATGGTTA
112 TATTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATG-A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
19861307 TGA-C--
174 TGACCTT
* * ** * *** * **
19861311 -T-ATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATTGTT-ATGAC-CTTTTGTTGTGTCATAAAATAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTC----TGTTCAT-ACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAA-
** * * * * *
19861369 TGTTTATTTCATACAAGTTTATTTCGAATAA--AATAA-TATAAATTTATTAATATTCTAA-AAA
58 TACTAATTT-AT-TAA---TA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA--AA-A----AATAAA
* * * * * ** * * ** * * *
19861430 T-TAATAAGC-AA-AAATTTAAA-AAATA-AATCTGTTT-TTC--TGAAC-A-TTCAAATAGTTA
110 TCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
19861485 TGACCTT
174 TGACCTT
* * * * * *
19861492 TTATTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTGTTCATATAAACATATTTGAAATAAAATAATACTATTT
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* * **
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* * * * *
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66 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACCGAACTAGTTCA
* * * *
19858512 AATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAA
128 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATGTTATGACCTTTT-CTTTGTCATAAA
* * * * * * * *
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* ** *
19858639 AAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAAAATATTTTTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATG
254 AAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAATTATG
* * * *
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* * * * * *
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381 TCTATTCATACAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATACAAAT-TATTAATA-TTAAGAAAATTAA
* * * ** *
19858821 TAA-TAAAAGATTTAAAATATAAATCTATCTATTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-A
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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129 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTCT-TTGTCATAAAA
* * * *
19859112 GATTTGTTTCAGTTCATATAAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAA
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* *
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256 AATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAATTATGAC
* ** * * * *
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* * *
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383 TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AAATTATTAATATTAAGAAAATTAATAAGT
* * *
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447 AAAAGATTTAAAAAACAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *
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512 ATCTATTTCAAATTGTTATGACTCTTTA
* * * * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * * * **
19859525 TAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAATTATGTTTACCAAACAAGTTGTAA
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* * * * * *
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130 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTT-CTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
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193 AATTGTTTCAATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * * * *
19859720 TTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
258 TTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * *
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323 TGAACAATTATCTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * *
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387 CATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATT-ATTAATATTAAGAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * *
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451 GATTTAAAAAACAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTAT
* **
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514 CTATTTCAAATTGTTATGACTC-TTTA
* * * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * ** *
19860067 TAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTG-AGTGAGTTCA
66 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCA
* * * * * * *
19860131 AATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTATTTTAAATGATTATGACCTTTTGTCTTCTTATAAA
128 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATG-TTATGACCTTTTCT-TTGTCATAAA
* * * * *
19860196 ACACTTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
191 ACAATTGTTTCAATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * *
19860261 AATTAATAAGTT--GCAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAATCAAGT
256 AATTAATAA-TTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCT-AACAAGTTCAAATAATTATGA
* ** ** * * * **
19860323 TTATTCAAACTGTTAGCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTC
318 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
** * ** *
19860388 TATTCATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATGAATAAG
383 TATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATAC-AAATTATTAATATTAAGAAAATTAATAAG
* * *
19860452 ----ACATTT-AAAAACGAAATCTATTTATCGAACCA-TTCAAATAGTTATGACTATATGAACAA
446 TAAAAGATTTAAAAAAC-AAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *
19860511 TTATCTATCTAAAATTGTTATGAACTC-TT-
510 TTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTCTTTA
* ** * * * * * * * ** *
19860540 TTTTCTCATAAAGTAATTGGTTGTATTAATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATATTAATTTA
* * * * ** *
19860604 ATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTACTGAACCGGCTCAA
65 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAA
* ** * * * * *
19860668 ATAGTTAAGACT-TTAAAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTATTTAGTCATAAAA
129 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTCTTT-GTCATAAAA
* * * * * * ** * * * *
19860732 TAATTTTTTCAATTTATACAATTATCTATT-TAAAGTTATTATAA-CCT-TTTGTTTTAACA-T-
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* ** * * * * * * *
19860792 AAAATAATTGTTTCAGTTCATA-AAATCTTACCCAAAATAAAATAAT-ATTACTTTATTA-ATAT
252 CAAA-AATT-AAT-AATT-A-AGAGAT-TTA--AAAAAT-AAAT-CTGTTTAC-CTA--ACA-AG
* * * *
19860854 TTCAAA-AATTGAAAAGTTGGA-GATTTGAAAAATAAATC-AGTTTGTCAAATCAGTTATGA-CT
303 TTCAAATAATT----A--T-GACTATTTGAACAAT-TATCTA--TT-TAAAATCA-TTATGACCT
* * *
19860915 ATTTGAACAATTATT-T-ATTTCAAATCGTAA-TGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
356 -TTTG-----TT-TTGTCA--T-AAAAC--AATTG--TTTCTA---T-TCAT---ACAA--GCTT
* * ** * **
19860977 TTGTTCACACAAGTTTATTTGGATTA-AAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACTATTAA-AG
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* ** * * * * * * *
19861040 AGTAAAATATTTTCAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-A
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*
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* * * * * *
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* * * * * *
19861228 CAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA--TAAAAAATATGAAT-CGATTTATC-A
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* * * *
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* * *
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* ** * **
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244 TAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCT-AACAAGTTCAA
* ** * * * *
19861478 ATAGTTATGACCT-TTT--A-TTTTGTC-A--T-AAACCA--AT----TTTT-CTGT-TCATATA
308 ATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-A
* ** * * * * * * * * * * *
19861527 AAC-A-TATTTGAAATAAAATAATAC-TATTT--TAT-TAATATTCCAAA-AATTAATAAGT-A-
371 AACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTATTAAT-ATTAAG
* ** * *
19861583 AAAATT--T---T--AA-A------AAATAAATCTATTTA-CTGAGGAAGTTCATATTGTTATGA
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* * * * *
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* * * * *
19861673 TGTTTAGTTATAAAACAA---------TT--TACAAGTTTATTT-AGATTAAAATAATACTATTT
1 T-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATATTAATT
* * * * * * *
19861726 TATTAATATTATGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAATAAGTT
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* * *
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** * ** * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* ** * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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** * * ** * ** *
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* ** * **
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* * * * * ** * *
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* * ** * * ** * * * * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * ** * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
19863667 TTATCATAGAAGCTTA-TTCGGATTAAAAATAATTCTAATTTAATAATATTACA-AAAATTAATA
384 AT-TCATACAAGCTTATTTC-AAAT-AAAATAATAC-AAATTATTAATATTA-AGAAAATTAATA
* ** * ** * ** * ** * * *
19863730 AGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTGCTT-GCAGAACTGGTTCAAATAATTAAAACCATTAGAAT
444 AGTAAAAGATTTAAAAAACAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
19863794 AAATATCTATTTCAAATTGTTCTGACAT-TTTG
508 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-TCTTTA
* * * * * * ** **
19863826 TTTAGTCATAAAATATTTATTTCAT-ATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATTTA
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* * * * * *
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* * ** * * * ** *
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* *
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Statistics
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TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAAT
AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGTTATGACCTTTTCTTTGTCATAAAACAAT
TGTTTCAATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
ATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
CAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTATTAATATTAAGAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
AAAAAACAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
AAATTGTTATGACTCTTTA
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*
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*
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Statistics
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TTCAAATACTCATAACTATTTGAATAACTTATCTAT
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*
19861088 TCATAACTATTTGAAAAC
1 TCATAACTATTTCAAAAC
* *
19861106 T--TATCTATTTCAAATC
1 TCATAACTATTTCAAAAC
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1 TCATAACTATTT
19861134 GAATAATTTA
Statistics
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TCATAACTATTTCAAAAC
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* * * ***
19861330 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTAT-TTCATACAAGTTTATTTC
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTGTGTCATAAAACAATT-TTTATGTTCATACAAACATATTT-
*
19861394 G-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAA-TTTAAAAAATAA
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128 ATCTGTTTTTCTGAACA
* * * *
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* *
19861538 AATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATC
66 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATTTTAAAAAATAAATC
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131 T
19861604 ATTTACTGAG
Statistics
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TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTGTGTCATAAAACAATTTTTATGTTCATACAAACATATTTGA
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATTTTAAAAAATAAATC
TGTTTTTCTGAACA
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19861700 TTATTTAGAT
* * * * **
19861710 TAAAATAATACTATTTTATTAATA-TTATGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCT
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** * * * * * * *
19861774 GTTTACCAAATAAGTTTAAATA-TATTTGACTATTTTGAATAATTATCTATTTAAAGTTGTTATG
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* * * * *
19861838 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGATTCATAAAAACTTATCCA-AAATAAAATAAT
126 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGC-TAT--AGTAA-AAAATAAT
* * * * * * ** * *
19861901 AATACCTTT-TTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCT-ATTTTCCA
186 ACTA-ATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTAT-CA
* * * * * * * **
19861964 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAAATATCAATCTCAAATTGTTATG--ATCTTT
249 AA-TAAGTTCAAATAATTAAGACCA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAT-TTT
* * * * * * * *
19862025 GTTTTCTCATAAAACAATTATTT-TTAATCATATAAGCTTATT-TAGA
311 GTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCATACTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
19862071 TAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAATAATTAAT--AAGAGATTTAAAAAATTAATGTGT
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATACAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** * * * * * * * * * *
19862134 TTGTTGAACTAGATCAGATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGGTCTAACCT
65 TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAACCT
* * * * * * * *
19862199 TTTGTTTAGTCAGACAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATACTACTAAT
130 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC-TA-TAGTAA-AAAATAATACTAAT
* * * * * * * * ** * *
19862264 TTATTAACATTAAAAAAATTAATACGTATGAGATTAGAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG-
192 TTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAGTAAATTTGCTTATCAAATAAGT
* ** * * * *
19862328 TCAAGTAGCTATGACTATTTA-AATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCA-TTTGTTTTGTC
256 TCAAATAATTAAGACCA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTC
* * * * * *
19862391 ATTAAACAGTTGTTT--TAGTTCATAAAATCTTA-TCAAAA
319 ATAAAAAAATTGTTTCATA-CTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
19862429 TAAAATACTACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGT-TA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAT-A-CAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-
** * * * * * * * ** *
19862493 GTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTA
63 GTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAA
* * * *
19862557 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCAG--CATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATA
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGC-TA-TAGTAA-AAAATAATA
* ** * *
19862620 CTAATTTATTAATATTTA-AAAAATTAATTTGCAAGAGA--TAAAAAGTAAATATGCTTATCAAA
187 CTAATTTAATAATA-TTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTATCAAA
* * * * * * * *
19862682 T-TGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACAGTTTATTT
251 TAAG-TTCAAATAATTAAGACCATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTT
* * * *
19862746 TGTCATAAAAAAATTGGTTC-TATTCATACTA-TTTATTCAAAA
315 TGTCATAAAAAAATTGTTTCATACTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * ** * *
19862788 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCGAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAT-A-CAA-AAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * ** * * * *
19862852 AATTGCTGAACCAA-TCCAAATAGTCAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAGATTATTATAA
63 GTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAA
** * ** * * **
19862916 CCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTA-TTTGTACAAGCTTATTGGGATTTAAATAATACT
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC-TA-TAGTA-AAAAATAATACT
* * * * * *
19862980 CATTCAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATGTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAA
189 AATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTATCAAATAA
** * * * * *
19863045 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTGGTT
254 GTTCAAATAATTAAGACCATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTC
19863110 ATAAAAAAAATT-TTTCA-ACTCATACAAGC-TATTCAAAA
319 AT-AAAAAAATTGTTTCATACTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * *
19863148 TAAATTAATACTAATTTATCAACATTCAAAAAATTAATAACAAAAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAT-AC--AAA-AGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * *
19863213 GTGTTATACTGAACAAGTTCACATAGTTATTACTATTTGAGCAATTGTTTATTTAAAATTGTTAT
61 CTGTT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTAT
* * * *
19863278 AACCATTTGATTTGTCATAAAACAACTATTTCAGTT-AGTACAAGCT-TAGATAGAATAAAATAA
125 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-TACAAGCTATAG-T--AA-AAAATAA
* **** * * *
19863341 TACTAATTTAGTAATATTTTTGAAATCAATAAGTAAGAAATTTTAAAAA-TAAATTTGTTTA-CT
185 TACTAATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATTTGCTTATC-
* * * * * * * **
19863404 AAATCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGAGC-TTTTG
248 AAATAAGTTCAAATAATTAAGACCATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTG
* * *
19863468 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGA-TCATACAAGCTTATTCGAAA
312 TTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCAT-ACTCATACAAGCTTATTCAAAA
* *
19863514 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT--AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATACAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
** * * * * *
19863577 TACCAAACCAGTTCAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATT-TTCAATCTCAAATTGTTA-AGAT
66 TACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTAAAATTGTTATA-AC
* ** * * * *
19863639 C-TTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTT-TTTATCATAGAAGCTTATTCGGATTAAAAATAATTC
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGC-TA-T-AG-TAAAAAATAATAC
* *
19863702 TAATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTGCTT-GCAGAAC
188 TAATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTATCA-AA-
* * * ** * *
19863766 T-GGTTCAAATAATTAAAACCATTAGAATAAATATCTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTA
251 TAAGTTCAAATAATTAAGACCATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT
* * * *
19863830 GTCATAAAATATTTATTTCATA-TCTTACAAGCTTATTCAAAA
316 GTCATAAAAAAATTGTTTCATACTCATACAAGCTTATTCAAAA
* *
19863872 TAAAATAATCCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATGAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAT-A-CAAAAGATTT-AAAAAATAAATCT
* *
19863937 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTATAAC
63 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAAC
* * *
19864002 CTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCATATCCA-AAATAAAATAATACT
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC-TAT--AGTAA-AAAATAATACT
** ** * *
19864066 AATTTCTTAAT-TTTTAGAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTG
189 AATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAGTAAATTTG
19864118 TTCATATAAG
Statistics
Matches: 1609, Mismatches: 347, Indels: 181
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
356 4 0.00
357 225 0.14
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365 130 0.08
366 51 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (358 bp):
TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATACAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAACCTT
TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTATAGTAAAAAATAATACTAATTTAA
TAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTATCAAATAAGTTCAAA
TAATTAAGACCATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAA
AATTGTTTCATACTCATACAAGCTTATTCAAAA
Found at i:19864368 original size:262 final size:264
Alignment explanation
Indices: 19863865--19864370 Score: 571
Period size: 262 Copynumber: 1.9 Consensus size: 264
19863855 TACAAGCTTA
* * *
19863865 TTCAAAATAAAATAATCCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATGAGCAAAAGATTTGAAAAAA
1 TTCAAAATAAAATAATACAAATCTATTAACATTTAGAAAATTAAT--G-AAAAGATTTGAAAAAA
* * * * * *
19863930 TAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTG
63 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAATTATTTAAAATCG
* * * *
19863995 TTATAACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAAT
128 TTATAACCTTTTGTTTTCACATAAAACAAATGTCTCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAAC
* * * *
19864060 AATACTAATTTCTTAATTTTTAGAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTCATAT
193 AATACTAATTTATTAATTATTAGAAATTAATAAGTAAAACTTTAAAAAAATAAATTTGTTCATAT
19864125 AAGTTTG
258 AAGTTTG
* *
19864132 TTCAAAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGAGATTT-AAAAAATA
1 TTCAAAATAAAATAATACAAATCTATTAACATTT-AGAAAATTAATGAAAAGATTTGAAAAAATA
* * *
19864194 AATCTTTTTA-TCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTAATTATTTTAAATCG
65 AATCTGTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAATTATTTAAAATCG
* * * ** ** * * *
19864257 TTTTGACTTTTTGTTTTCTTATAAAACATAAT-TCT-A-TTCATAAAAGGTTATTCAGATTAAAA
128 TTATAACCTTTTGTTTTCACATAAAACA-AATGTCTCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAA
19864319 CAATACTAATTTATT-ATTATTATGACAATTAATAAGTAAAAACTTTAAAAAA
192 CAATACTAATTTATTAATTATTA-GA-AATTAATAAGT-AAAACTTTAAAAAA
19864371 TTATATGCTT
Statistics
Matches: 200, Mismatches: 32, Indels: 19
0.80 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
259 6 0.03
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ACGTcount: A:0.45, C:0.08, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (264 bp):
TTCAAAATAAAATAATACAAATCTATTAACATTTAGAAAATTAATGAAAAGATTTGAAAAAATAA
ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAATTATTTAAAATCGTTA
TAACCTTTTGTTTTCACATAAAACAAATGTCTCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAACAAT
ACTAATTTATTAATTATTAGAAATTAATAAGTAAAACTTTAAAAAAATAAATTTGTTCATATAAG
TTTG
Found at i:19864777 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 19864137--19869188 Score: 1878
Period size: 181 Copynumber: 27.7 Consensus size: 177
19864127 GTTTGTTCAA
* *
19864137 AATAAAATAATACAAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * *
19864199 TTTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTTAAATCGTTTTG
64 ATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * ** * * *
19864262 ACTTTTTGTTTTCTTATAAAACA-TAATTCTATTCATAAAAGGTTA-TTCAG
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC-G
* * * * * * *
19864312 ATTAAAACAATACTAATTTATTATTATTATGACAATTAATAAGTAAAAACTTTAAAAAAT-TATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTA--AAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATC
** * * * * * * * *
19864376 TGCTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATGA
63 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * *
19864441 -CTTTTGGTTTGTCATAAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTT-G
128 CCTTTTGTTTTGTCAT--AAAAAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG
* * ** * * * *
19864491 AAATCAAATAATACTAAGTGGTTAACATTCTAAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * *
19864556 CTGTTTACCAAACTAGTTTAAATAATTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTGGAATCGCTATA
62 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* *
19864620 ACCTTTTGTTTTATCATAAAAAGATT-TCATCTGTTCATACAAGCTTATTTCG
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA-ATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG
* *
19864672 GATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * ** **
19864737 ATTCACCAAACGAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC----A---A---CAAATTATTATGAC
64 ATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * *
19864792 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTCA-TTCA
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * *
19864841 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGGAAAAGATTTAAAAAA-ATAT
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * **
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* * * *
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*
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** * * * *
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* *
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*** * * ** ** * * *
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*
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* * * * * *
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* * * * *
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1 --AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * ** * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * *
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* * * * *
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* ** ** * * * * * *
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* *
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** * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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*
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* *
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* * * * * **
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62 -GCAAACCAGTTCAAATAG-TTAAGACTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATT-TTACCT
* * * * *
19867403 TTTGTTTTA-TCATAAAACATTTGTTTCAGTACATAAAAACTTATCCCA-AATAAAATAATACTA
122 TTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT--TAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
19867466 CTTTACTAATATTTC-AAAAATAATAAACAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTT-CAAACCAG
184 ATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTACAAACAAG
* * * * * * *
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* * *
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* *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA--TTTAAAAATAAATATGTTTGC
* *
19867697 AAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTACAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG
64 -AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTTT-ACCTTTTG
* * * *
19867762 TTTAGTCATATAATAATTGCTTCAGTTTATACAAGCTTAGTTAGAATAAAATAATA-TCAATTTA
126 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACT-AATTTA
* *
19867826 TTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTTTTTACAGAATAAGTTC
189 TTAATATTTC-AAAAAATAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTTTTTACA-AACAAGTTC
* *
19867890 AAATAGTTACGACTATTTGAA-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
251 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
19867954 AACCATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATA
316 AACAATTGTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
** *
19867991 AAATAATACTGCTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAAT-
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAAT--ATG
** * * * * * * ** *
19868055 TTATG-AAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAGCTACCTATTTCAAATCATTATTA-C
59 TT-TGCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTACC
* * * * * *
19868118 TTATTGTTTTGTCTTAAAACAATTATTTTTCA--ACATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
121 TT-TTGTTTAGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAG-AATAAAATAATAC
* * * * *
19868181 TAATTTATTAATATTTC-AAGAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACC
182 TAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAAACA
* * * *
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246 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TG
* * * * *
19868306 TCATAAAACAATTATTTTT-GTTCATATAGGCTTATTTAGAATA
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* *
19868349 AAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCAAAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAA-ACTA
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATAAATA-TG
* * * * * * ** *
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59 TTTG-CAAACCAG-TTCAAATAGTTAAGACTAT-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTAC
* * * ** *
19868476 CTTTTGCTTT-GTCATAAAATAATTATTT-AGCTCATGTAAGCTTA-TACCAA-AAAATAATAAT
120 CTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTA-GAATAAAATAAT-A-
* * * ** * **
19868537 GTTACTTTGTTAATATTTCAAAAGTTAATAAGCAAGGGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAAA
181 -CTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAAA
* * * * * * * *
19868602 -ATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTT
244 CA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * **
19868666 TGTCTTAAAACAATTGTTTTTCA--ACGTACAAGCTTATTTGAAATA
308 TGTCATAAAACAATTGTTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * *
19868711 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTACT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTGC-
* * * * *
19868776 AAATCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCGATTTCAAA--ATGTTATAGCCTTAT
64 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TT-TA-CCTT-T
* * *
19868839 T-TTCTA-TCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
124 TGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATT
* * ** *
19868902 TAGTAATA-TTCTAAAAAATTAATAA-CTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAG
187 TATTAATATTTC-AAAAAA-TAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTACAAACAAG
* ** * * * * *
19868965 TTCAAACAGTTAAAACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTAA
248 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ***
19869030 TAAAATAATT-ATTTTAGCTT-ATACAAGCTTATTTGGAATA
313 TAAAACAATTGTTTTTAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * * *
19869070 GAATAAAACTAATTTATGAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAAATTTAGAAAATAATTCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTA-AAAATAAATATGTT
* * * * *
19869135 TACCGACCCAGTTCAAAT-GATTATA-ACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTGTTAC
61 T-GCAAACCAGTTCAAATAG-TTA-AGACTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTAC
19869197 TAATTTATTA
Statistics
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353 1 0.00
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TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
Found at i:19868248 original size:539 final size:536
Alignment explanation
Indices: 19866561--19895217 Score: 5214
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* * * * *
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* * * * ** ***
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* * * * * **
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* ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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*** * * *
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* * * * * *
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* *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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509 TTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAAT-A
* * *
19867633 AAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTTTAAAAA-AAATATGTTTGC
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * *
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* * ** * *
19867762 TT-TAGTCATATAATAATTGCTTCAGTTTATACAAGCTTAGTT-AGAATAAAATAATA-TCAATT
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* *
19867824 TATTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTTTTTACAGAATAAGTT
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* * *
19867889 CAAATAGTTACGACTATTTGAA-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
256 CAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* *
19867953 AAACCATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTGCTTTATTAATATTTCA
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* * * * * *
19868018 AAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATGAAAATAGTTCAAATAATTATGGC
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* * * * * * *
19868083 CATTTGAATAGCTACCTATTTCAAATCATTATTACTTATTGTTTTGTCTTAAAACAATTATTTTT
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*
19868148 CAACATACTAGCTTATTTGAAATA
513 CAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19868172 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-C
* * * * ** * * *
19868237 -GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATGTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTT
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** * * * *
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130 TTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAG
* * *** *
19868366 TAATATTCAAAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT-AAAAATAAAACTATTGGCCA-AAC-CGATT
195 TAACATTCAAAAAAA-TAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTACAGAACAAG-TT
* * * * * *
19868427 CATACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATA
256 CAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** ** *
19868492 AAATAA-TTATTTAGCTCATGTAAGCTTATACCAAAA-AATAATAATGTTACTTTGTTAATATTT
321 AAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATA-CAAAATAA-AATAATACTACTTTATTAATATTT
* ** * *
19868555 CAAAAGTTAATAAGCAAGGGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCAAAATAGTTCAAATAATTAT
383 CAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAAACAGTTCAAATAATTAT
* * * * *
19868619 GGCCATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTT
447 GACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTT
*
19868684 TTTCAACGTACAAGCTTATTTGAAATA
510 TTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19868711 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTACT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACA
* * * ** *
19868776 AAATCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCGATTTCAAA--ATGTTAT-AGCCTTA
66 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TT-TGA-CCTT-
*
19868838 TT-TTCTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
127 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * ** *
19868902 TAGTAATATTCTAAAAAATTAATAA-CTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCA-AACTAG
192 TAGTAACATTC-AAAAAAATAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTACAGAACAAG
* * * * * *
19868965 TTCAAACAGTTAAAACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTAA
254 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * **** * * * *
19869030 TAAAATAATTATTTTAGCTT-ATACAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAACTAATTTATGAATATT
319 TAAAA-AATTTTTTTAG-TTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT
* * * * * * ** *
19869094 TCAAAAATTTATAAGTAAGAA-ATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGACCCAGTTCAAATGATTA
382 TCAAAAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAATTA
* * * * * * * * **
19869158 TAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTGTTACTAATTTATTAATATTTAGCAAATAAA
446 TGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCA---TTA-TGA-TT-TT-GT-TTT--CTCATAAA
* * ** * * * ** **
19869223 TCAATAAGAGATTTAAAAAGTA-AATCTGT-TTACCAAACC
501 ACAAT-TG-TTTTTCAACA-TACAAGCT-TATT-TGAAATA
** * * * * *** * * ** **
19869262 ATTTCAA-A-TAGTTT--TGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCT-TTTAT
1 AAAT-AATACTAATTTAAT-AATATTTCAAAAATTA---ATAAGAGAT--TTAAAAAATAAATAT
* **** * * * * * *
19869322 TTTGTCATCAAATA--A-TTGGTTTTGTTGATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATACAAATTT
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* ** * * ** * ** * ** ** ** * *
19869384 AATAAT-ATTTAAAACTTAAT-AACCAAGA-AAATTAAAATATAAATCAAAT-ACCCAAAC-AAG
110 CA-AATCATTTTGACCTT-TTGTTCTATCATAAA--ACAAT-TATTTCAGTTCATACAAGCTTA-
* * * * * *** * * ** ***
19869444 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAA-TTATTTA-TTTC-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTG
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*** * * ** ** * *
19869506 TCGTAAAACAATTGTTTTGTTTGTACTAG--CTTA-TTCGGATTTAAATAATACTAATTT-AATA
225 T--TAAAA-AATAAATCT-TTT-TAC-AGAAC-AAGTTC--AAATAGTTAAGACT-ATTTGAACA
* *** * * * * *
19869567 A-TAGTTCAAAAATAAATAAG-TAAGA------G-ATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC
280 ATTA-TTTATTTA-AAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTT-TTT------T-
* * * ** *
19869622 AGTTCA-AATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTT-TGT-TT
333 AGTTCATAA-----AAG-C--TTA-TACAA--A---A--TAAAATAATACT-A-CTTTAT-TAAT
* * ** * * * *
19869684 AGTCATAAAACAATTGTTTCAATCTATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTAT--T
379 A-T-TTCAAA-AATT-AAT-AAGC-A-A-AAG---ATT-TAAA-AAATAAAT-CT-ATTTATCAA
* * ** * * * * * * *
19869747 AACA-TTTAAAAAATTAATGAGAAAGAGATTTAAAAAAAATAAATCTATTTAGCGAA-CAAGT-T
429 AACAGTTCAAATAATT-AT--G--A-CCATTT-GAACAACT--ACCTATCT--CAAATC-ATTAT
* ** * * ** * * * *
19869809 CAAATAGTTTTAC-AATTTGAACAATTGTTTATTTAGAGGCTTTAAAACCTTTTAATTTGTTAGA
482 GATTTTGTTTT-CTCA-TAAAACAATTGTTT-TTCA-A--C-ATACAAGC--TT-ATTTG--A-A
*
19869873 AAA
534 ATA
* * * * * * * *
19869876 AAATTAT-TTTAGTTAATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAAGAC
1 AAATAATACTAATTTAAT--AA---TA-TTT-CA-AAAATTA-AT-AA--GA--GAT-TT-A-A-
* * ** * * * ***
19869940 AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATATATATGTTTACTGAATAAGTTCAA-ATTGTTATGGTT
48 AA--AATAAAT--ATG-TTT-ACAAA-A-CCA-G-TT-C-AAAT-AGTT-AAGACTATTA-GAAC
* * ** * * *
19870004 ATTTGAGCAATTATTT-ATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-A
98 AATT-ATC---TATTTCAAATC-A--T-TT-TGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCA
* *** * ** * * * * *
19870067 TGTTCATACAAACTTATTTGGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATATTTC-GATAATTAATAAG
154 -GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAG
* * * * * * * * *
19870131 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAATAAT
217 CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAAT
* * ** * * * * * * **
19870196 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATGAGC
282 TATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGC
*** * * * * *
19870261 TTATTTGAAGTAAAATAATAGTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTGAGAAA-A-TTAA
346 TTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-CA-AAAGATTTAA
* ** * * * * * * *
19870324 GAAAA-GAATCTATTTA-CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCC-ATTT
409 -AAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAACTA-CCTATCT
* * * * * * *
19870386 CAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAACAATTGGTTGT-ATTCATGCAAGCTTTTTTT
471 C-AAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGC-TTATTT
19870449 G-AATA
531 GAAATA
* * * *
19870454 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATCAATAAGTAAAATTTTTAAAAAAT--CTAT-T
1 AAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA--TTTAAAAAATAAATATGT
*** * * * *
19870515 TT-TTTAACTTA-TTCATAAT--TTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
61 TTACAAAAC-CAGTTCA-AATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA
* * * * * ** *
19870575 CCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCCA-TTCATACAAGTTTATTCGTAATAAAATAATAG
123 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTT-CAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * *** ** * * * **
19870639 TAATTTATTAAAATTCTCGAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAGT
187 TAATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACAGAAC
* * * * ** **
19870703 AAGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCATTAT-A--AATT-TTTT
251 AAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
19870763 GTCATACAACAGTTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAA
315 GTCATA-AAAAATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
* * *** * * * * **
19870827 TA--TAATAAAATTAATGA-CTTGGAGACTTAAAAAATTAATATGTTTA-CCGAACAAGTTCAAA
378 TATTTCA-AAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAA
* * * * * * *
19870888 TAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCTAAA-CATTATGACATTTTAGTTTGTCT-A-AA
440 TAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTC-AAATCATTATG--ATTTT-GTTT-TCTCATAA
* **
19870950 AACAATTGTTTTT-ATTCATACAAAATTATTT-AGAATA
500 AACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* * * * * * *
19870987 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTGACT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACA
* * * * * * * * * *
19871052 AGACCGGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAAGTATCTATCTCAAATCATTAT-A-ATTTTGT
66 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGT
* * * * * ** ** * * * ** *
19871115 TTTGTCAAAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTTCTAAACTAAT
131 TCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGT
* * * * * * * * *
19871180 AATATT-ATAAAAATAATAAGCAATAGATTTAAAAAAATAAGTGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAA
196 AACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *
19871244 TAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT
260 TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-
* * * * * * *
19871309 AATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACA-TTCAATAA
324 AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAA-AA
* * * * * * *
19871373 ATTAACAAGCAAGAA-ATTTTAGAAAATAAATATGTTTA-CCAAACAAATTCAAATAGTTATGAC
388 ATTAATAAGCAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTATGAC
* * * * * ** * *
19871436 TATTTGAATAATTATCTAT-TTAACATTGTTATGACCTTTT-TTTGTATAATAAAACAATTGTTT
450 CATTTGAACAACTACCTATCTCAA-ATCATTATGA--TTTTGTTT-TCTCATAAAACAATTGTTT
***** * ** *
19871499 AAGTTCATAAAAGCTTAACTAAAATA
511 TTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * ** *
19871525 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-AT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGT
* * * * ** * * * * * ** * *
19871589 TTATC-GAATCAATTCAAAAAAATATG-GTCATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGAA
61 TTA-CAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC
* * * * * * * *
19871652 CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCA--TCATATAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAGT
124 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATT-ATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * ** * * * * *
19871715 AATTTATTAATATTTC-AAAAGTTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAACTCTATTTAGCA-AAC
188 AATTTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAAC
* * * * * * * ** * *
19871778 TAGTTCAAGTAGTTATGACGATTTGAAATTTAACTATTATAAATTTCAAATCATTATAACTTTTT
251 AAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG-AA--CAATTATT-T--ATTTAAAATTGTTATGACCTTTT
* * * * * *
19871843 GTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTATGTTCATACAAGCTTGTTCAAAATATAATAATACTACTCT
310 GTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTA-GTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTT
* * ** * * * * * *
19871907 AATAATATTAT-GAAAATTAATAA-CTATGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTT-GCCAAACTAAT
373 ATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGT
* * * * * * * * *
19871969 TCGAATAATCATGGCTATATGAATAATTATCC-ATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
435 TCAAATAATTATGACCATTTGAACAACTA-CCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCA
* * * *** * ** * **
19872033 TGAAAGAAATGTTTTTGTTCATATAAATTTGTTCAAAATA
497 TAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19872073 AAATAATATTAATTTATTAATATTGT-AAAAATTATTAAGAGAGTTAAAATATAAATATGTTTAC
1 AAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * * * * * *
19872137 CAAACCAGTTCAATTAGTTATA-ACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCATTT
65 AAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT
* * * * * ** **
19872201 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTGATAC-AGTTTTATTTGAAATAAAATAATGTTAATT
129 GTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
** * * * * * * ** ** * * *
19872264 TCTTAATACTC-TAAAAAT--T-AG-TAGCGATTTAAAAAATGAATCCATTGGCTG-ACCAGTGC
192 TAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAGTTC
* * * * * * *
19872323 AAATAGTTATA-ACTGTTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATAACCTTTTGTTTTGTCACA
257 AAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * ** ** * *
19872387 AAACAATCGTTTCTA-TGCATACAAA-CTTATTCGGAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTT
321 AAA-AAT-TTTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTT
* * * * * *
19872450 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCCATTTATCAAATA-AATTCAAATAGTTAT
383 CAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-ACAGTTCAAATAATTAT
*** * * * * * *
19872514 GATTTTTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TT
447 GACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTT
* * *
19872577 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTA
510 TTTC-A-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19872606 AAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATTAACAAAAGATTTAAAAAA-AAACTATG
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC--A-AA--AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATG
* ** * * * * * **
19872669 TTTACCAAATAAATTGAAATAGTTGTA-ACTAATT-GAACAATTATTTATTTCCAATCATTAGGA
60 TTTACAAAACCAGTTCAAATAGTT-AAGACT-ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA
* * * * * ** * * *
19872732 CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATATT
123 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * *** * * * * * * *
19872797 AATTAATTAACATTTTGACAATTAATAAGCAACAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTA-AACA
188 AATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAACA
* * * * * * *
19872861 AGGTT-AAATAGTCATA-ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTC
252 A-GTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * *** *** * * *
19872924 GTCATAAAACAGTTATATTAGTTCATATGGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTGTTAAT
315 GTCATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* * * * ** *
19872989 A-TTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-GCCTAACAAGTGCAAATA
379 ATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATA
* * * ** * ** * *
19873052 ATTATG----TATAAACAATTTTCTATTTCAAATTGTTATGATACTTTGTTTTGTCATAAAATAA
442 ATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT--TTTGTTTTCTCATAAAACAA
* ** * *
19873113 TTGTTTCTCTTCATACAAGCTTATTTCAACTA
505 TTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19873145 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAAGTAAAATTTAAAAAATAAATATGTTT
1 AAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* ** * * * *
19873209 TCTGAACACA-TTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATAATTATGACCT
63 ACAAAAC-CAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT
* * * *
19873272 TTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTATTTCTA-TTTATACAAGCATATTCAAAAT-AAATAATACTA
126 TTTGTTCTATCATAAAAC-AATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * * * *
19873334 GTTTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTA-AGCAA
189 ATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAACAA
* ** * * * * * *
19873398 GTTCAAATAGTTATGTTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTATT
253 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * *
19873463 GTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATGGAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
318 ATAAAA-AATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT
* * ** * ** *
19873526 TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTA-CCGAACAAGTTCAAATAGT
381 TTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAAT
* * * * * * * * * *
19873590 CATG-CCTATATGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
444 TATGACC-ATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
* * * **
19873654 TGTTTCT-ATTCATGCAA-CATTATTCAAAATA
506 TGTTTTTCA-ACATACAAGC-TTATTTGAAATA
** ** * ** * * *
19873685 AAATAATACTGGTTTTTTAGTATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-C
** * ** * * ** *
19873750 GGAA-CAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA--TATTT
65 AAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT-TTT
* * * * * ** *** *
19873812 ATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCCTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTA
129 GTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * *
19873877 ATAATATTC-TAAAAAT--TAA-TAAGAG-TTTGAAAAATATATATATTTGCTGAA-ATCAGTTC
194 GTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACA--AGTTC
* * * * * ** *
19873936 AAATAATTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTAGTCATA
257 AAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATA
* * * * * ** * * * *
19874000 AAACAAGTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACA-TTCA
321 AAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-
* *
19874064 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATATAAATCTATTTATCAAATA-AGTTCAAATAGATT
384 AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAA-A-ATAAATCTATTTATCAAA-ACAGTTCAAATA-ATT
* * * * ** * * *
19874128 -TGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
445 ATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAA-TCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATT
* * * *
19874191 G--TTTCATTTCATAAAAACTTATTCGAAATA
507 GTTTTTCA--ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * *
19874221 AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGT
* *** * * * * * * *
19874284 TTTCTGGACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC
61 TTACAAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * *** * *
19874348 TTTGTTTTCT-T-ATAAAACAATAATTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGAACA-AAAATAATAC
125 TTT-TGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGT-TCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * * *
19874410 TAATTTAATAATATTCTAAAAATTAGT--G-AA-AGATTTAGAAAACAAATGTATTTGT-CA-AA
187 TAATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT-TACAGAA
* * * * * * ** * * * *
19874469 CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTCTAACC-TTTATTTA
250 CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * * *
19874533 GTCCTATAATAA-TTGTCTAGTTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
315 GTCATA-AAAAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* ** * * ** *
19874597 A-TTCTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAGGTAAATTTGTTTA-CCGAACAAGTTCAAAG
379 ATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAAT
** * * * * * * ** * *
19874660 AATTATGATTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
441 AATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACA
* * *** *
19874725 ATTGTTTAATT--TCATAAAAGCTTATCCAAAAGA
504 ATTGTTT--TTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19874758 AAATAATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAA-TAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAACCA--
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAA---AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATG
* * ** ** * * * * * * *
19874820 ATTGCTGAATAAGATCAACTA--T--GACCATTTGAATAACTATCTA-TTCAAAT-GTTATT-AC
60 TTTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGAC
* * * **** * * * * **
19874878 CTTTTGTT-TGTAATAAAACAATTGTTTTTCAAAAAATA-AA-TTTGTTTACCAAATCAGTTCAA
124 CTTTTGTTCTATCATAAAACAA-T-TATTTCAGTTCATACAAGCTT-ATT-CAAAATAAAAT-AA
* ** * * * ** * * * ** *
19874940 -A-T-AGTT-GTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-A-TTGTTATAACAT-TTTGTTCTAT
184 TACTAATTTAGTAAC-ATTCAAAAAAATA-ATA-AGCAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTT-T-T
* * * * * * * *
19874998 AATAAAACAATTGTTTCTATTCA--TACA-ATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAA
243 TACAGAACAA--G-TTCAAAT-AGTTA-AGA-C-TATTT-G-A-ACAAT--TATTTATTTA--AA
* ** ** * * ***
19875060 TATTTTGAAATTAAT-AAC-TAAGAGATT-TAAAAAAAAATTTCGTTTGCTAAACCAATTCAAAC
294 -A--TTG---TT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAAAATTT--TTT--TAGTTC-A-T-AAA-
* * * * ** * ** ** *
19875122 AG-TTAAGACTATATGAATAATTATTTATCTCAAATTGTT-ATGACTTT-TTATTTGTCATAA--
343 AGCTT-ATACAAAAT-AA-AA-TA-ATA-CT-ACTTTATTAAT-A-TTTCAAAAAT-TAATAAGC
* **** * * * ** * **
19875182 AACAATTATTTTAGCTCATAAAAGCT-TAT-TCAAAATAGAGCAAAACTAATTTATTAATATTT-
398 AA-AA-GA-TTTAAAAAAT-AAATCTATTTATCAAAACAGTTC-AAA-TAA-TTATGACCATTTG
* * *
19875244 ATCAA--ACC-AGT-TTAAAT-AGTTATGACTATTTAAGCAATTATTTATTTCA-AATTGTTATG
456 AACAACTACCTA-TCTCAAATCA-TTATGA-T-TTT--G------TTT-TCTCATAA-----A--
** * * * * * * **
19875303 ACTTTTGTTCTGTTATAAAATA-ATAGTTTCTGTTCATACC
501 ACAATTGTT-T-TT-CAACATACA-AGCTTAT-TTGAAATA
** * * * * ** * * * * * *
19875343 AGCTTAT-TTGGA-TTAA-AATAATATCAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAAAAAA
1 AAATAATACT-AATTTAATAAT-ATTTCAA-AAATTAATA----AGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * ** *
19875404 ATTAAAACATAAA-TATGCTTAACAAACTTGATCAAATAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTA
59 GTT--TACA-AAACCA-G-TT--CAAA-TAG-T--TA-AGAC-T-ATTA-GA--ACAATTATCTA
** * * * * * * * *
19875468 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAAAATCATTT-TGATTCATATAAGCTTATT
107 TTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAG-TTCATACAAGCTTATT
* * * * * * **
19875532 CGAAATAAAATAATA-TGAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-TTAGAGATTT---AAA-A
171 CAAAATAAAATAATACT-AATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATA
* * ** * * * * **
19875591 AA------T---GAATAAGTTTAAATAACTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCATT
235 AATCTTTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTT
* * * *
19875647 ATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAA
300 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA--TTTTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TACAAAATAAA
* * * * * *
19875710 ATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGGCAATTAATACA-TAAAAGATCTAACAAATAAATCTAT
360 ATAATACTACTTTATTAATATTTCAA--AAATTAATA-AGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
** ** * ** * **
19875772 TTA-CTGAACAAGTTCAAATCTTTATGACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC
422 TTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--
* * * * ** * *
19875836 TTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAATTTATTTGGACTA
484 TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19875889 AAA-AAAATTAATTCATTAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AAATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * * *
19875952 TTATC-GAACAAGTTTAAATGGTTATGAGTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC
61 TTA-CAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * * * **
19876016 TTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATACTA
125 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTA
* * * * ** * * * * *
19876081 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAACGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACAGAACATG
189 ATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAG
* * * * **
19876146 TTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTGTC
254 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * ** * *
19876210 ATAAAACAATCGGTTCT-GTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
318 ATAAAA-AAT-TTTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TACAAAATAAAATAATACT--A---CTT--T
* * * * *
19876272 ATTTCAAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACACG
373 A-TT--AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACA-G
* * * * * ** *
19876335 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
434 TTCAAATAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCA
* **** * *
19876400 T-AAACAAATTGTTTCTGTTTATAAAACCTTATTT-AGAATA
497 TAAAAC-AATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* * * * *
19876440 AAATAATACTAATTTATTAAAATTTGAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA-A--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
** *** * ** * * * *
19876505 TACCGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACCCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT
* * * * * ** **
19876570 TTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
127 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** * * *
19876634 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA-AACAAAT
191 TTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTAC-AGAACAAGT
* * ** * ** *
19876698 TCAAATAGTCATA-TCTATTTGAATTATTATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGATTAATTG
255 TCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTG-TT--TTG
* * * ** *
19876762 T-A-AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
316 TCATAAAAAATT-TTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* * * ** * *
19876823 ATTTCAAAAATTAAT----AAAAGATTTAAGAATTAAATCTATTTATCGAGCCAGTTTAAATACT
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAAT
* * ** * * * * * *
19876884 TATGACTATTTGAATAGTTATCTACCTCATATCATTATGATCTTTGTTTTGTAATAAAACAATTA
444 TATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTG
* * * * * *
19876949 CTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAGTA
508 TTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19876978 AAATATTACTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * *
19877043 TACCAAACTAGTTCAAATAGTAAAGACTATTAGAACAATTGTCTATTTCAAATCGTTCTT-ACCT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCT
* * * * *
19877107 TTT-TT-TAGTTATAAAAC-ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAACAAAATAATAGTAA
126 TTTGTTCTA-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *
19877169 TTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGCAAGAGATTGAAATAAAATAAATCTATTTATCA-AACA
190 TTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATT-TAA-AAAATAAATCTTTTTA-CAGAACA
* * * * *
19877233 AGTTCAAATAGATTTA-ACTATTTGAATAATTCTTTATTTAAAGTTGTTATGACATTTTGTTTTG
252 AGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *** *
19877297 TCATAAAACAATTGTTTCATTTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAGTACTACTTTATTAATA
316 TCATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
* * * * **
19877362 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGTTT-CCTGAACTAGTTCAAATAA
380 TTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAA
* * * *
19877424 TTATGACTATTTGAACAAATA-TTAATCTCAAATCATTAGGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
443 TTATGACCATTTGAACAACTACCT-ATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAACAAT
* * *
19877488 TGTTTCTGATCATA-AAGC-----T----T-
506 TGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19877508 --AT--T-C-AGA-GTAA-AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAGAAAATAAATCTATTTAT
1 AAATAATACTA-ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-
* *** * ** * ** * *
19877565 C-AAACAAGTTCAAATAGTTTTTACTATTTGAGTAATTATGTATTTCAAATTGTTATGACTTTTT
64 CAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT
* ** * * ****
19877629 GTTCTGTTGTAAAATAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCGGGTTAAAATAATACTAATTT
129 GTTCTATCATAAAACAATTATTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * * * * * ** * **
19877693 ATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAGTAAATATGTTTATTGAACTAGAGCA
193 AGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAGTTCA
** * * * * ** ** *
19877758 AATAGACATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAACTCATTATGATATTTTGTTTTCTCATAAA
258 AATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * ** *
19877823 AAATTATTTTAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTAT-GAA
323 AAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAA
* ** * * * * * *
19877887 AATTCATAATTAAGAGATTT-AAAAATGAATCTGTTTGTC-GAACAAGATT-AAATAATTTTGAC
387 AATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AG-TTCAAATAATTATGAC
* * * * * * **
19877949 TATTTCG-ACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTCTCATAAAATGATT-TTTC
450 CATTT-GAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-
*
19878012 CTAT-TA-ATACAAGCTTATTTTG-AATA
511 -T-TCAACATACAAGCTTA-TTTGAAATA
* * * * * * *
19878038 AAATAATACAAATTTATTAATATTAT-GACAATTAATAAGCAAAAGGTTTAAAAAATAAATCTAT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * ** * * * * *
19878102 TTACCAAACAATTTCAAATCTTTATGACTA-TATGAAAAATTATTTATTTCAAATTGA-TATGAC
61 TTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTTTGAC
* * * * * * *** * *
19878165 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTG-TAATATGTGCTTATTTC-AATTAACAA-AATAT
124 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAA-AATAATAC
* * *** * * * * *
19878227 TAATTTATTAATATTTTCACAATTAATAAG-TAGA-ACGTTTAAAAAATAAATATGTTTTTC-GA
187 TAATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCT-TTTTACAGA
* * * * * * * *
19878289 ACAAGTTCAACTAGTCACA-ACTAGTTGAATAATTATCTAATTCAAATTATTATGA-CTTTTGTT
249 ACAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * ** *
19878352 TTGTAATAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
313 TTGTCATAAAAAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
* * * **
19878417 TATTCCAAAAATTAATGAG-AAAGAGAATTAAAAAA-AGAATCT-TATTA-CCGAACATGTTCAA
378 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAA-AGATTTAAAAAATA-AATCTAT-TTATCAAAACA-GTTCAA
* * * * * * * * *
19878478 ATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA
439 ATAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAA
** *
19878543 CAATTGTTTTAGTTTATATA-AA-CTTATTTGAAATA
502 CAATTGTTTT--TCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19878578 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATGAATTTG-
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
19878641 TTACAAAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATGT-GAACAATTATTTATTTTAAAACATTATGAC
61 TTACAAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC
* * * * ** * ***
19878704 ATTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-T
124 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * ** * *
19878767 AAATTTATTAATATTTCACATATTTCAAAAATTAATAAATAA-AAATTT-AAAAATAAATATATT
188 -AATTTAGTAACA-TT--CA-A----AAAAA-TAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TT
** ** ** * *
19878830 TT-TTGAACACTTTCAAATAGTTCTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC-
242 TTACAGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCT
* **** *
19878893 TTTGTCTTGTCAT-----A-------A--TCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT
307 TTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTT
* * * *
19878944 TATTAAAATTTTAAAAATTAAT-------A-A-TTAAAAAATAAAATCTATTTA-CCAAGCGAGT
372 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTATCAAAAC-AGT
* * ** * * ** * * *
19878999 TTAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATTTAAT-TCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTT
435 TCAAATAATTATGACCATTTGAACAACTACCT-ATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTT-CTC
* * * * * **
19879063 ATAAAATAATT-TTTAAT-ATTCTTACAAGTTTATTCAAAATA
496 ATAAAACAATTGTTT-TTCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19879104 AAATAATACTAATATATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * *
19879168 TCACCAAACTAGCTT-AAATAGTTACGTCTATTTGAACTAA-TATCTATATCAAATCATTATGAT
61 TTACAAAACCAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC
* * * ** * ** **
19879231 ATTTTGTTTTGTTGTAAAACAGTTATTTCTA-TTCATACAAAATTATTCACTATAAAATAATACT
124 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* ** * * * * * *
19879295 AATTTATTAGTATTTC--AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTTAATCTTTATATAGAACC
188 AATTTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACA
* * * * * * * *
19879355 AGTTCAAATAATTATGATTGTTTAAACAATT-TTCTATATCAAATTATTATGA--TATTTGTTTT
252 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATT-TATTTAAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTT
* * **** * ** ** *
19879417 GTCATAAAGCAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATCTTGA-TAAATTAATA
315 GTCATAAA-AAATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAAT-ACTACTTTATTA
* * * ** *
19879480 ATA-TTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAAT
377 ATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
19879540 AATTAAGACTATTAT-ATCAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCTTTT-ATTTGTCAT--AA-
441 AATTATGACCATT-TGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAAC
* * **
19879600 AATGGTATTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATA
503 AATTGT-TTTTCAA--CATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * ** * * *
19879637 AAATACTTCTAATTTACTAGCATTT-AGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTG
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAAT----AAGAGA-TTTAAAAAATAAATATG
* * * * * **
19879701 TCTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTAAAAT-A-AATGA
60 TTTA-CAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA
* * * * *
19879762 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATA-AAACATTA-TCTAAAATAAAATAATA
123 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGC-TTATTC-AAAATAAAATAATA
* * * ** * * *
19879825 TTACTTTATTGATAC-TTC-AAAATTTGAT--GTATTAGAGATTTAAAAAAT-AAGCTAGTTTTA
186 CTAATTTAGT-A-ACATTCAAAAAAATAATAAGCA--AGAGATTTAAAAAATAAATCT--TTTTA
*** * * * * * * ** ** *
19879885 TC-GAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTT
245 -CAGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTT
* * * * * * *
19879949 TGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTGTTCAAAATAAAATAATATTAAT
309 TGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTT-AGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACT
* * * * ** * * **
19880012 TTATCAAAATTT-TAAAAGTAATAA-CTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAAC---
371 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGT
* * * * ** * * *
19880071 -C-GAT--TCT-T----ATTTGAACAA-TGATCTATTTTAAATTGTTATAGCCTTTTGTTCTATC
435 TCAAATAAT-TATGACCATTTGAACAACT-ACCTATCTCAAATCATTAT-G-ATTTTGTTTTCTC
* * * *
19880126 GTAAAATAATTG--TTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATA
496 ATAAAACAATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTTGAAATA
*
19880167 AAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* ** ** * * * ** *
19880231 TGCTGAAGTAGTTCAAACAATTAAGACTATGT-GAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT
* * *
19880295 ATTT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-ATAGCTTATTCAAAATAAAATAATGCTA
126 -TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * ** * * *
19880357 ATTTATTAATATTTC--AAAAAT--TAA-TATGTTATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCA-AATC
189 ATTTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAA-C
* * * * *** * * * * *
19880416 -AGTTCAAATAATTACGGCCATGCCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTG
251 AAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** ** * ** * *
19880480 TCATATAACAATTGTATTT-GAACATTCACGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
316 TCATA-AAAAATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* * * ** *
19880544 CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-TGAACTAGTTTAAAT-A
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAA
** * * * ** * ** * * *
19880607 GCA-GCAACTATTTAAATAA-T-TGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA
443 TTATG--ACCATTTGAACAACTACCT-ATC-TCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAA
* *** * *
19880669 CAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCGAAATA
502 CAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19880704 AAATAATACTAATCTAATAATGTTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * * * *
19880769 TGCCAAACCAGTTTAAATATTTAAGACTA-TATGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTATGATCT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT
* * * * * * * ** *
19880833 TTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTGTTGAATTCATA-ATAGCTTATACGGAATAAAATAA-AAT
126 TTTGTTCTATCATAAAACAA-TTAT-TTCAGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * * **
19880896 GAATTTATTAATATTTC-AAAAATTACTAAGTAAGAGATTTGAAAAATAATTCTATTTGCCTAAC
188 -AATTTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAAC
* * * * * * ** *
19880960 CAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTG
251 AAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **** * * * *
19881025 TCATAAAACAAATTTTTTT-GTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAGTACTAATATATTAAT
316 TCAT-AAA-AAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* * **
19881089 ATTTCAAATATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTTTCAAATTAGTTCAAATAAT
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAAT
* * * ** ** * * *
19881150 TATGACTATTTGAGCAATTATTTAT-TCAAATTGTTATGACTCTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT
444 TATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA-T-TTTGTTTTCTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
19881214 ATTTCT-ATTCATACATGTTTA-ATCAGATTA
507 GTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* * ** * *
19881244 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAGCAGTTGATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * * * * * * * * *
19881309 TACCAAACTAGATCAAGTAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT
* * * * * * * *
19881374 TTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATT
127 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* *** * * ** * * **
19881439 TATTTGTAATC-CAAAAATCAATAATAAAGAAATTTAAAAAAATGAATCTGCTTACTA-AACAAG
192 TAGTAACATTCAAAAAAAT-AATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTTTTTAC-AGAACAAG
* * * * * ***
19881502 TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTAT-ACCTTTTGTTTTGTCA
254 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * * *
19881566 TAAAATTTTTTTTTTA-TTAATACAATCTTATTTC-AAATAATATAA-ATCAAATTTATTAATA-
319 TAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TACAAAATAAAATAATA-CTACTTTATTAATAT
* * * * ** *
19881627 TT-AAGACAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAAAGTAAAGT-TGTTTA-CCGAACAAGTTCAAATC
381 TTCAA-A-AATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATA
* * ** * ** * * ** * * *
19881689 GTTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCTTTTTATTTTGTCATAAAACAA
442 ATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTAT-G-ATTTTGTTTTCTCATAAAACAA
*** * *
19881754 TT-TTTTTTGTCATACAAGTTTA-TTCAAATTA
505 TTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAA-TA
* * *
19881785 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATATGT
* * * * * * * *
19881850 TTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
61 TTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT
* * * * ** *
19881915 TTT-TT-TAT-AGTAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAA
126 TTTGTTCTATCA-TAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *** *
19881977 TTTATTAATAATCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACCAAAAAA-AGAAT-TTGTTTACCA-AATA
190 TTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTT-TTTA-CAGAACA
** * ** * * * **
19882039 AGTTTTAATAGTTATGACTACCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-TATTATGACCTTTCATTTTG
252 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * **** * *
19882103 CCACAAAACAATTGGTTTT-GTTCATGCAATCTTGTTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAA
316 TCATAAAA-AATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAA
* * * *
19882166 TATTCCATAAATTAAT------AAG----AAAAAAT--A--TGTTT-TCTAAACATGTTCAAATA
378 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACA-GTTCAAATA
* * * * * * *
19882216 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTA
442 ATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAAC-A
*** * * * *
19882279 ATTGTTTTTGTTCGTAAAAGCTTACTCGAAATA
504 ATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * * *
19882312 AAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAAATTAGTAAGGAAAATATTTAAAAAATAAATCTAT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAA-G---AGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * *
19882376 TTA-AAAAGCAAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATC
61 TTACAAAA-CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * * *
19882440 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTA
125 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * *** * * * *
19882504 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAG
189 ATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAG
* * * * * * * * ** *
19882569 TTCAACTAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT-A
254 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * *
19882633 GTAAAAAAATTATTTTTA-TTCA-AGAAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
319 -T-AAAAAATT-TTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
* * * *
19882696 TTTCAAAAATTAAT-----ATAGATTTAAAAACA-AAATAC-GTTTA-CCAAACTAGTTTAAATA
380 TTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAA-ATAAAT-CTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATA
* * * * * * * * *
19882753 GTTATGACTATTTTAATAATTATCTATCTCAAAT-AGTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
442 ATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAACAAT
* * *
19882817 TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT-AGAGTA
506 TGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* ** *
19882848 AAATAATGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCATGATATTTAAAAAATAAATGTGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAG-A-G--ATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
19882912 TTGTC-CAACCAGTT-ATAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGAC
61 TT-ACAAAACCAGTTCA-AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC
* * * *** * * **
19882975 CTTTTCTTTTGTCATAAAATTTTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATTTGAAATAAAATAATA-T
124 CTTTTGTTCTATCATAAAA-CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * *
19883039 AATTTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAATAAATTTAAAAAAAATAAATCTTTTTACTA-A
188 AA-TTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTTTTTAC-AGA
* * **
19883103 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT
249 ACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
19883168 TATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAATA-CTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTA
314 TGTCATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAA-AGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTA
*** * * *
19883232 ATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTGAAGATTTAAAAAATTAAT-TAGTTTTTCAAATCAGTTCAAA
377 ATATTTCAAAAATT-AATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAAACAGTTCAAA
* * * * * * * *
19883295 TAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTCTTATAAAAT
440 TAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATG-A-TTTTGTTTTCTCATAAAAC
* *
19883360 AATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTTAAAATA
503 AATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * **
19883394 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAGGAGAATT-AAAAATAAATATACT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * ** * ** * * * *
19883458 TACTAGACTAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATGATTATATA-TTCAAATCGTTATAACCTT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT
* ** * ***
19883522 TTGTTTTATTGTAAAACAAATATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
127 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * *
19883586 CTAATAATATT-ATGAAAATTAATAA-CTAGGAGATTTAAAGAATAAAT-TTGTTTGCTGAACCA
191 TTAGTAACATTCA-AAAAAATAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACAGAA-CA
* * * * * * * *
19883648 A-TTCAAATATTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGT
252 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * **** *
19883712 CGTAAAACAACTATTTTT-GTTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-TCAATTTATTAAT
317 CATAAAA-AA-TTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAAT
* * * ** * *
19883775 ATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAACTCAAGTAGT
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAAT
* * * * * ** * * *
19883836 TATAACAATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT
444 TATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATT
* **** *
19883901 GTTTGTGTTGATACAATCTTATTT-AGAATA
507 GTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* * * * * *
19883931 AAGTAATGCTAATTTATTGATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTT-AAAAATGAATCTGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAATATGT
** ** * * * * * * *
19883994 TGGCCTAACCAGTACAAATAGTTATA-ATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCACTATGACC
61 TTACAAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * * * * * * * * *
19884058 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAG-TTGACT-AGGAATAACATAATTCT
125 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTT-ATTCA-AAATAAAATAATACT
* * * * * * **
19884121 AATTTATTAATATTC-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TTGTTTATTGAACA
188 AATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACAGAACA
* * * * * * * **
19884184 AGTTAAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAAGATTTTGTTTTGT
252 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * **
19884249 CATAAAATATTTTTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATGC-AAATTATTAAT
317 CATAAAA-AATTTTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* * * * * * * * * * *
19884311 ATTT-GACAACTAATAAGTAAAA-TTTTTAAAAATAAATTTATTTACCGAATA-AGTTTAAATAG
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAAACAGTTCAAATAA
* * * * ** * * *
19884373 TTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
443 TTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
**** * * *
19884438 TGTTTTTGTTTATACAAGTTTATTTGGATTA
506 TGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19884469 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTATTAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAAACGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * * * *
19884533 TTCCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTACTT-GAATAATTATCTATTTCAAGTCGTTATGACC
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * * * * *
19884596 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
125 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * * *
19884661 TTTATTAATATT-ACAAAACTTAATGAGTAAAAGATTTAAAATATGAATCTTTTTACTA-AAC-A
190 TTTAGTAACATTCA-AAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTAC-AGAACAA
* * * *
19884723 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTC
253 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
19884788 ATAAAATAATTGTTTCTA-CTCATACAAGCTTATTTCAAAA-AAAGTAATA-TAAATTTATTAAT
318 ATAAAA-AATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TACAAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAAT
* * * * *** * *
19884850 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TTTGAACACGATCAAATAG
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACA-GTTCAAATAA
* * * * * * * * * *
19884913 TTATGACTATTTAAATAATTATCTAT-TTAAAT-AGTTGTGACCTTTTGATTTGTCATAAACCAA
443 TTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCA-TTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAA
* ** * * *
19884976 TTGTTTCTCTTCATACAAACATATTCGAAATA
505 TTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * * * * *
19885008 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATGGGTAAAAAATGTAAAAAGTAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA----TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* ** * * * * * * * * * * * **
19885073 TACTATGCAAGTTTAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTTATAT-AGTTATGATGT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGACCT
* * * * ***
19885137 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
126 TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
19885201 TATATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCA-AACAAG
190 TTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAACAAG
* * * * * * * * * **
19885265 TTCAAATACTCATGTCCATTTGAACAACTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-A
254 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * *
19885329 GTAAAACAATTATTTCTA-TTCATGCAAAA--TTGTTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
319 -TAAAA-AATT-TTTTTAGTTCAT--AAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
** * * * * * * *
19885391 ATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TCTAAACCAATTCAATTAG
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAAACAGTTCAAATAA
* ** * * * *
19885455 TTATAACTGTTTGAATAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATT
443 TTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAACAATT
* * * * * * *
19885520 GGTTCTGATCATACAAACTTATTCG-GATAA
507 GTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAAT-A
* * *
19885550 AAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTATAAAATAAATTTGTTTGC
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * ** * *
19885614 CAAACCAATTCAAATAATT-A-ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC-TTTG
65 AAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG
* * * * * * ***
19885676 -TATAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTTATACAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTA
130 TTCTA-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * * *
19885740 TTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATTAGATTTGAAAAAATTAAT-TTGTTTACTGAATAAGTTT
194 GTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTT-TTTACAGAACAAGTTC
* * * ** * *
19885804 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATCA
257 AAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-A
* * * * * * **
19885869 AACAATTGTTCTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTACTATTTTTA
321 AAAAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAA
* * * * * * *
19885934 AAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAATCAGCTCAAATAATCATG-G
386 AAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAAACAGTTCAAATAATTATGAC
* * * * * * * * * * *
19885997 CTTTTAAACAGCCATCTGTTTCAATTCATTATTACCTTTT-TTGTTATCATAAAATAATTGTTTT
450 CATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTT-TTCTCATAAAACAATTGTTTT
*
19886061 TCAACATGCAAGCATT-TTTGAAATA
512 TCAACATACAAGC-TTATTTGAAATA
* * * * *
19886086 AAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * *** * * * *
19886150 TACCAAACCATTTAAAATATTTTTTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT
* * * * ** * * ** * *
19886214 TTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGAAAAAAAAATAATACTAA-
127 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * ** * * ** * *
19886278 TTAATAATATTTC-AAAACTTAAT-AGCCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTACCGAGCCAA
191 TTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAG-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGA-ACAA
* * * * ** * *
19886341 -TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTT
253 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * ** *
19886405 GTAAAACAATTGTTTT-GTTCGTACAAGCTTATTCGGATTAAAAT-A-A-TAC-----T-A-A--
318 ATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT
* * * * ** *
19886457 TC----ATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAGTTCAAATGGTTAA
382 TCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * **
19886514 GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
447 GACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTAT--GATTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTT
***** *
19886579 TTAGTTTATATAAGCTTATTT-AGAATA
510 TTTCAACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* * * *
19886606 AATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATT-ATAAGAGATTTACAAAAATAAATTTGTTTA
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTTA-AAAAATAAATATGTTTA
* * * * * * * * *
19886669 CCAAACAAGTTCAAATAGTT---A-T-TT-GAATAGTTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTT
64 CAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT
* * * * ** *
19886728 GATT-TATCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATAAAAGCTTAGAT-GGAACAAAATAATACTAATT
129 G-TTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * ** * * * * ** **
19886791 TATTAATATTTC-CTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAGAT-TTGTTTACCTAATTAGT
192 TAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACAGAACAAGT
* * * * * ** * ** * * *
19886854 TAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTATGTTTTATCGT
255 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *** * *
19886919 AAAACAATTCTTTTT--TATGATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATT
320 AAAA-AATT-TTTTTAGT-TCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT
* * * * * * *
19886982 T--TAAATTAATATGTAATAGATTTAAATAATAAATCTATTTA-CCAAACTAGTTCAAATAGTTA
382 TCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTA
* * * * * * ** * *
19887044 TGACTAATTGAACAAATATCAATCTCAGATCATTAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
446 TGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTT
* * **
19887109 TGT---CATATAAGCTTATTTG-GTTAA
510 TTTCAACATACAAGCTTATTTGAAAT-A
* *
19887133 AAATAACACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAATAAATATGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * ** * *
19887197 TTATC-GAACTAATTCAAAT-GTTTAAAATTGTTAGAATAATTATCCATTTCAAATTGTTCTAAC
61 TTA-CAAAACCAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC
** * * * **
19887260 CTTTACTT-TAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATTTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-C
124 CTTTTGTTCTA-TCATAAAACAATTATTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* *** * * * * * *
19887322 TAAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGAAAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
187 T-AATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTTTTTACAGAA
* * **
19887387 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
250 CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
19887452 GACATAAACAATTGTTTCAGTTCATTAAAGCTTAT-C-CAA-AAAATAATACTATTTTCTTAATA
315 GTCATAAAAAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
* * * * * * *
19887514 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAACAA-AGTT--ACTAG
380 TTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AA-AACAGTTCAAATAA
** * * ** * * * *
19887575 TTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGA-TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
443 TTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAA-TCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAA
* * *
19887639 -T-TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATA
505 TTGTTTTTCA--ACATACAAGCTTATTTGAAATA
** * *
19887671 AAATAATACTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAATATGTT
*** * * * ** *
19887736 TATGGAACCAATTCAAATAATTATCG-CTATTTCAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATT-AC
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TT-TTGAC
* * ** * *
19887798 CTTTTGTT-TGGTCATATAACAATT-TTTTTGATCATATAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
124 CTTTTGTTCT-ATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* ** * * *
19887861 TAATTTATTAATC-TT-TTAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA-AA
187 TAATTTAGTAA-CATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAA
* * * * * * * * * * *
19887920 CAAGTTTAAATA-ATAATAACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCATTTGTTC
250 CAAGTTCAAATAGTTAA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
19887984 TGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCGTGCAAA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAT
314 TGTCATAAAA-AATT-TTTTTAGTTCAT-AAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATT
* * * * * * *
19888047 AATATTTCAAAAACTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACCAGTTCAAA
376 AATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAA
* * * * * ** * * * *
19888111 TAGTTAAG-CTATATGAACAATTATTTATTTCGAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAT
440 TAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAAC
* **
19888175 AA-T-TTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAAAATA
503 AATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19888209 AAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAATAATTTTGTT
1 AAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATATGTT
** * * * * * *
19888273 TACCTAACCAATTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT
* * * ** * * * * *
19888337 TTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAAAAATATTAAC
126 TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * ** * * **
19888402 CTATTAATGC-TT--TGAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA-AATTA
191 TTAGTAA--CATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAACAA
* ** * * * * *
19888460 TTTCAAATAGTTGTGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAA-TCTTATGACTTTTTGTTCTAT
253 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA-CAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * *** * *
19888523 TATAAAAAAAATAGCTTTT-GTTCACACAAA-TTTATTTGAATTAAAATATTACTACTTTATTAA
317 CAT--AAAAAAT-TTTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
** * * * * * * * *
19888586 TATTTTGACAATTAATAAGAAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATC-GAACTAGATCAAATA
378 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATA
* * * * * * * * *
19888650 GTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
442 ATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATG--ATTTTGTTTTCTCATAAAACAA
* * **
19888714 AT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
505 TTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19888747 AAATAATACT-ATGCTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTGAGAGATTTAAAAAATGAATCTGT
1 AAATAATACTAAT-TTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATATGT
** * * * * * * *
19888811 TTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAT--TTCTATAAC
61 TTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-T-TGAC
* * * ** * ***
19888874 CTTTTCTTTTGTCATAAAATGATT-TATTCTA-TTCATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAC
124 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTAT-TTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * * * *
19888937 AAATTTATTAATATT-AATACAATTAATAAATG-AA-AGATTTAAACAATAAATATGTTTACTGA
187 TAATTTAGTAACATTCAA-AAAAATAAT-AA-GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGA
* * * * *
19888999 ACAAGTTCAACTCA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTTTT
249 ACAAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* ** **** * * * *
19889063 TTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTGTT
313 TTGTCATAAAA-AATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATT
** * * *
19889127 AATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATATGTTTGCCGAACAATTTATTAATAT
376 AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT--AAAAA-A----T-----A-AATCTATT--TA-
* * * * ** * * *
19889192 TCCAAAA-A-TT--AATGAGTAAGAGCATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAA-
425 T-CAAAACAGTTCAAATAATTATGACCATT---TGAA-CAA-C----TACCTATC----TCAAAT
* * * ** * *
19889252 AAGTTATGACTATCTAAACAATTATATATTC-CAAGACATTATTACCTTTGTTTCGTCATA-AAA
476 CA-TTATG---AT-T------TTGT-T-TTCTC-ATA-A--A--ACAATTGTTT-TTCA-ACATA
* * *
19889315 CAATTGGTTCGATTCATGCAAGA
520 CAA--GCTT--ATT--TGAAATA
* * * *
19889338 ATAATTCGAATA-AAATATT-ATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAA
1 A-AA-T--AATACTAAT-TTAAT-AA--TA------TTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAA
* ** * * * *
19889401 AATAAATATGTTTTCTGAA-CATGTTCAAATATTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAA
50 AATAAATATGTTTACAAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * *
19889465 TGGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCA-ATCAAGCTTATTCGAAAT
114 TCATTTTGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAAT
* * *
19889528 AAAATAATACTAATTTATTAACATTTC--AAAATTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAATAAAT-T
177 AAAATAATACTAATTTAGTAACA-TTCAAAAAAATAATAAGCAAGA-GATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * **
19889589 TGTTTACCGAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCATTATGA
240 T-TTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGA
* * * *** *
19889654 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-TTTATTTTAAACAAAATAATA
304 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATACAAAATAAAATAATA
* * * *** * * **
19889717 CTAATTTATTAATA-TTCTAAATATTAATATGTTGAAGATTTAACAAATTAATCTATTTATC-GC
366 CTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA
* * * * ** * ** * *
19889780 ACAAGTTCAACTAGTCATGTCCATTTGAATTATTATGTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTT
430 AC-AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATG--ATTTTGTTT
* * * * **
19889845 TGCT-GTAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAAATTATTT-AGAATA
492 T-CTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGA-AATA
* * * * * * * * *
19889890 AAATAATACCAATTTATTATTATTTTAAAAATTATTAAGAGATTT-AAAAGTAAATCTCTTTACC
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACA
* * * * * * * *
19889954 GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-
66 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTT-TG
* * * * * * * * * * *
19890018 TT-TGTCCTAAAACATTTGTTTCTA-TTCATACAACCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTA
130 TTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
** * * * ** * * *
19890081 AAAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGT-C-GAACCAGTTT
194 GTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT-TACAGAACAAGTTC
* * * * ** * * *
19890143 AAATAGTTAATACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTGTTTAGTCATAA
257 AAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
19890208 AATAATTGTTTTAGTTCAT-AATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AT
322 AA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA-
* * * * *
19890271 AAAATTAATAGGCAAGAA-ATTAAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTGATG
385 AAAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTATG
* * * * * * *
19890334 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTG-TT
448 ACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT
*
19890398 TT-AATTCATAAAAGC----TTG--A-A
511 TTCAA--CATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * * * ** * * * *
19890418 CAATTAT-CT-ATTTCA-AAT-TGTT-ATGAACTT--T-TG-TTTTCTCATAAAATAATTGTTTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATAT-TTCA-AAAATTAATAAGAGATT-T-AAAAAATAAAT-ATGT
* * * * * * ***
19890474 TTATCATATAAGCCTATTTGAAATA--AAATAATACTA-ATTTATTA-CTATTTCAAAAATCA--
61 TTA-CA-A-AA-CC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC--AAATCATT
* * *** ** ** * ** ** * ** *
19890533 AT-ACGTAGGAGATTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAGCAGTTCAAATACTTATGAATATTTG
119 TTGACCT-TTTG-TT-CTATCATAAAAC-AATTA-T--TTCAGTTC--ATAC--AAGCTTA-TTC
* * * * * * ******** * * * * *****
19890597 AACAATTATATATTTCAAATTGTTA-TAACCTTTTGTTCTGTCATAAACCAATTA-TTTTTGTTC
172 AA-AATAAAATAATACTAA-T-TTAGTAACATTCAAAAAAATAAT-AAGCAA-GAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
19890660 ATACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATGCTAAT-G-TAATAATATTCAGAA-AAGTAAGAACTA
232 ATA-AATCTTTTTACAGAA-CAAGT--T-CAAATAGTTAAGACTATT-TGAACAA-T------T-
*** ** * * * ** * *
19890721 AGAAAAATAAATTTGTTTGCTGAGCCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTT
283 ATTTATTTAAAATTG-TT-ATGA-CC--TT----TTGTTTTGTC-ATA--AA-AAAT-TTT-TTT
** * ** * * *** * * * * *
19890786 CAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTGAATTAAACAATATTTTTAGTAC-TTACTAACTTATTTGGA
333 -AGTTC-ATAAAAGC--TT-ATACAAAAT-AA-AATA---ATACTACTTTATTAA--TATTT-CA
* ** * ** * * * * * * *
19890850 ATAAAATAA-AA-C-AAATTTATTAATATTTCAAA--AATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATA
385 A-AAATTAATAAGCAAAAGAT-TTAAAAAAT-AAATCTATTTATCA-AAACAG-TTCAAATAATT
* * * ** * *
19890910 ATTA-TATTTGCTAAACCAATTTAAATAAT-T-ATAA-CTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAA
445 ATGACCATTTG---AA-CAA-CTACCT-ATCTCA-AATC-ATTATG----ATTTTGT-TTTC---
* ** * * * * *
19890970 TCGTTATGACGTATTGTTTTATCATAAACAAATGTTTTTATTCAAATAAGTTTGTTCGGAATA
494 TC-ATAAAAC-AATTGTTTT-TC---AAC--A------TA--C-AA---GCTTATTTGAAATA
* * * * * * *
19891033 AAGTAATATTAATTTATTAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * * * ** * *
19891098 TACTAAACCAGTTTAATTAATTTA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCAT
62 TACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT
* * * * ** * *
19891162 TTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATA-TAGTCTTATTCTGAATAAAGTAATGCTAA
127 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * ** * *
19891225 TTTATTAATACTCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA
190 TTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTAC-AGAACAA
* * * * * * ** * *
19891289 -TGCAAATAGTTATGA-T-TGTTAAACAATTATGTACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
253 GTTCAAATAGTTAAGACTAT-TTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * *** * *
19891351 CACAAAACAA-TTGGTTATGTTCGTACAAGTTTATTTGAAATAACATAAGT-CTAAC-ATATTAA
317 CATAAAA-AATTTTTTTA-GTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAA-TACT-ACTTTATTAA
* * * * * * * * *
19891413 TA-TTCTGAAACTTAATAAGCAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTAACTTAATA-AGTTCAAAT
378 TATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAAACAGTTCAAAT
* * * * *** * * * * *
19891476 AGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGCTTTGTGATAAAATA
441 AATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACA
* *
19891541 A-T-TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATA
504 ATTGTTTTTC-A-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19891574 AAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTA
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATATG
* * * * * ** *
19891638 TTTATCGAATA--AGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATG
60 TTTA-C-AAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTG
* * * * * *** *
19891700 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-GGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA
122 ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATT-ATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * ** ** * * * * ** *
19891764 TTAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAAT
186 CTAATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAAC
* * * * * * ** * ** *
19891829 AAGTCCAAATAGTCATA-ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTC
251 AAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * * * * *
19891893 ATTATAAAACAATTGTATCAGTTCATATAAGCTTATTCGAAACAAAATAATATTAATTTATTGAT
315 GTCATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
* * * * * * * *
19891958 A-TCCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTATTTATC-GAACAAGTTTAAATA
379 ATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
19892021 GTTATGACTATCTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAATGTTTGTTTTGTCGT-AAACAA
442 ATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATG-AT-TTTGTTTTCTCATAAAACAA
* * * ** *
19892085 TTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTTTAACA
505 TTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19892117 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAGAAATTAAAAAAAATAAATCTAT
1 AAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AG--ATT-TAAAAAATAAA--TAT
* ** * ** *
19892181 TTTTTGAACA-C-GTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTTTGA
59 GTTTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGA
* * * * *
19892243 CCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
123 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * * * * ** *
19892307 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAAATGTGTTTATTGAATA
187 TAATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACA
* * * * * * * *
19892372 AGCTCGAATAGTTATGA-TAGTTTAAATAATTATTTATTTTGAAA-TGTTATGATCTTTTATTTT
252 AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTTGAACAATTATTTA-TTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
19892435 ATCATAAAAAATTGTTTATA-TTCATACAAA-TTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
315 GTCATAAAAAATT-TTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
* * ** * * *
19892498 TATTGT-AAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAAT
378 TATT-TCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
19892561 AGTAAT-ATCCAATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTAATAGAAT
441 AATTATGA-CC-ATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAAC
** * *
19892625 AATTGTTTCTT-TTCATATAAGCTTATTTTG-ATTA
503 AATTGTTT-TTCAACATACAAGCTTA-TTTGAAATA
* * **
19892659 AGATAATACTAATTTAAT-A-A--T--AAAA--AAT-A-A-ATGT----GCT---T-TG--T-C-
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACA
* * * * * * * *
19892701 GAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATTCGAATAACTATCTGTTTCAAATCATTTTGACCTTTTAT
66 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGT
* * * * *
19892766 T-TAGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
131 TCTA-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAG
* * * * * * *
19892830 TAACATTCAAAAAATTAATAAG--AGA-TTTTAAAAAATACATATGTTCACCGAACAA-TCTCAA
195 TAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACAGAACAAGT-TCAA
* * * * * * *
19892891 ATAGATATGACTATTTGACCAATTATCTATTTAAAATCGTTATGGCCTTCTGTTTTGTCATAAAA
259 ATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * ***
19892956 CAA-TTGTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTTTGAA
324 -AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * *
19893020 ATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTC-ATACTAGTTCAAATAGTTATGATCA
388 ATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTATGACCA
* * * * * * * * * *
19893084 TTTGAAAAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTATGAT
452 TTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGAT-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCAA
*
19893149 CATACAAGCTTATTCG-AATA
516 CATACAAGCTTATTTGAAATA
* * *
19893169 ACAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAGATTT-AAAAATAAATGTAT
1 A-AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * *
19893233 TTGTC-GAATCAGTTCAAATGGTTAAAACTATT-GAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATAAC
61 TT-ACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC
* * * * * *
19893296 CTTTTGTT-TATTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTAGTCGAAATAAATTAATGCT
124 CTTTTGTTCTA-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * **
19893360 AATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGCAAGCGATTTAAGAAAGTAAAAT-TGTTTATTGAAC
188 AATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAA-AAAAT-AAATCTTTTTACAGAAC
* * * * ** *
19893424 AAGTTAAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAACGTTATGAACTTTTGTTTTG
251 AAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
19893489 TCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATATTACTA-TTTCTGTAAT
316 TCATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTAT-TAAT
* * * *
19893553 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATC-AGTTTA-CTGAATCAGTTCAAAT
379 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTA-TTTATC-AAAACAGTTCAAAT
* * * * * ** *
19893616 AGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTG-TTTCATCATAAAAC
441 AATTATGACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTC-TCATAAAAC
19893680 AATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
503 AATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * * * *
19893714 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATATGCT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACA
* * * * * * * ** * * *
19893779 GAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGT
66 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGT
* * * * * * *
19893844 TCTATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTAATT-AGAATTAAAT-ACACTAATTTAA
131 TCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAG
* *** * * * * * * * **
19893907 TAATATTTTGAAAATTCATGA-CTAAAAAATTAAAAAAATAAATATGTTTGCCA-AACCAA-TTC
195 TAACATTCAAAAAAATAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTACAGAA-CAAGTTC
* * * ** * **
19893969 AAACT-GTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTGTTGTTGTA
257 AAA-TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *** * * * *
19894033 AAACAATTATTTCAGCTT-ATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAAAAATAATTTGTTAATATTTC
321 AAA-AATTTTTTTAG-TTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC
* * * * * * * * * *
19894097 AAAATTTTATAGGTAAGAGATTTGAAAAATAATTCTATTTA-CAGAACTAATTCAAATAATTATA
384 AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAAC-AGTTCAAATAATTATG
* * * ** * ** * * * * *
19894161 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTGTTTTATCACAAAACGATTATTT
448 ACCATTTGAACAACTACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT
*** * * ** *
19894226 TTGTTCATATAAGTTTGCTCGAAATA
511 TTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * **
19894252 AAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGTAAGCGATTTAAAAGGTAAAT-TAGT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GT
* * * * ** * * * * **
19894316 TTACCAAACTATTTCAAATAATTTTGACTATTTGTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAAAA
61 TTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * * * ** * * * ** * *
19894381 TTTTATT-TGGTCATCAAATAATTGGTTCTGTTTATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTA
125 TTTTGTTCT-ATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *** ** * * * * * *
19894445 ATCTAATAATATTTTGAAACTTAACAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C-GAACC
189 ATTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT--TTTTACAGAACA
* * * * ** * **
19894508 AGTTCAACTAGTTAAAACTATATGAACGATTATCAATTTGAAATCATTATGACCTTTTG--TTGT
252 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
19894571 CATAAAATAATCTTTTT-G----T----G--GAT------TAAAATAATGCAAATTTAATAATAT
317 CATAAAA-AATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT
* * * * * * * * * **
19894619 TTTAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCATATGGTTA
381 TTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAATTA
* * * ** * * * * **
19894684 AGACTATTAGAACAA-TGATATATTTCTAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
446 TGACCATTTGAACAACT-ACCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTG
**** * * *
19894748 TTTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATA
508 TTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
19894777 AGATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGATATTTAAAAGAATAAATCTT
1 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAA-AATAAATATG
** ** * * *** * * * * *
19894841 TTTACTGAATAAATTCAAGTAGTTATTTCTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTATTATGACC
60 TTTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC
* * * * * * **
19894906 TTTTGTTTTGTCA-AAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTATACTAAATAAAATAATTGTAA
125 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
19894970 TTTA-T----TTC-TAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCA-AATC-A
190 TTTAGTAACATTCAAAAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CAGAA-CAA
* * * * * * ** *
19895027 GTTAAAATAATTATG-GTGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTTGTTTTG
253 GTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATG-ACCTTTTGTTTTG
* * * *
19895091 TTATAAAACAATTGTTTTT--TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
316 TCATAAAA-AATT-TTTTTAGT-TCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
* * * * * * *
19895154 TATTTCAAAAATTAATAAGTACATGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCTAACCAGTTCAAATA
378 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATA
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TCTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGT
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AGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
TTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATT
AATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAACAGTTCAAATAATTATGACCATTTG
AACAACTACCTATCTCAAATCATTATGATTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATAC
AAGCTTATTTGAAATA
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19868707 AATAAAATAA
* * * * *
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* * *
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* *
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* * * *** ** *
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* * *
19868977 AAACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTAT
261 AAACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAT
* * **
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326 TTTAGCTTATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATGAATAGTTCAAAAATAAATA
* * * *
19869107 AGTAAGAAATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGACCCAGTTCAAATGATTATAACTATTTGAACA
391 AGTAAGAAATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATGATTATAACTATTAGAACA
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456 ATTATCAATTTCAAATCATTGT
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1 TACTAATTTATTAATATTT--C-AA-AAATCAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAA
* * * *
19869259 ACCA-TTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCCAAATCATTATAACCTT-TTA
62 ACCAGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAAAT-ATTATAACCTTATT-
* * * * * * * ** ***
19869321 TTTTGTCATCAAATAATTGGTTT-TGTTGATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATACAAATTTA
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* *
19869385 ATAATATT-T-AAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAATATAAATCAAATACCCAAACAAGTTCA
188 ATAATATTCTAAAAAATTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCAAATACCCAAACAAGTTCA
* * * * **
19869448 AATAGTTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAA
253 AACAGTTAAAACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAA
* * * * * *
19869513 ACAATTGTTTT-GTTTGTACTAGCTTATTCGGATTTA-AATAATACTAATTTAAT-AATAGTTCA
318 ACAATTATTTTAGCTTATACAAGCTTATTCGGA-ATAGAATAAAACTAATTT-ATGAATAGTTCA
* * * *
19869575 AAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAATCAGTTCAAATGGTTA-AG
381 AAAATAAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATGATTATA-
*
19869638 ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
444 ACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATCATT
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TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATCAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCA
GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAAATATTATAACCTTATTTTCTATC
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AAACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAT
TTTAGCTTATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATGAATAGTTCAAAAATAAATA
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ATTATCAATTTCAAATCATTGT
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * ** *** *
19869326 TCATCAAATAATTGGTTT-TGTTGATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATAC
128 TCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * ** * * * ** **
19869378 AAATTTAATAATATTTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAATATAAATCA--AATACCCAAAC
1 TAATTTATTAATA-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CTGAAC
* * * * * *
19869441 AAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * ** * * *
19869506 TCGTAAAACAATTGTTT-TGTTTGTACTAGCTTATTCGGATTTAAATAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * **
19869557 TAATTTAATAATAGTTCAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-C
* * * * *
19869622 -AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
19869686 TCATAAAACAATTGTTTC-AATCTATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
19869738 TAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATGAGAAAGAGATTTAAAAAAAATAAATCTATTTAGC-GA
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATATGTTTA-CTGA
* * * * ** * ** **
19869802 ACAAGTTCAAATAGTT-TTACAATTTGAACAATTGTTTATTT-AGAGGCTTTAAAACCTTTTAAT
61 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * ***
19869865 TTGTTAGAAAAAAATTATTT-TAGTTAATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT
125 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
19869920 AAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATATATATGTTTACTGAATA
1 TAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* ** * * * ** * *
19869985 AGTTCAAATTGTTATGGTTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTAT
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* * * *** * *
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* * * * *
19870101 TAATTTATTAATATTTCGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACA
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * *
19870166 AGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTAT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** ** * *
19870231 AATAAAATAATTGTTTCAATTCATATGAGCTTATTTGAAGTAAAATAATAG
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * * *
19870282 TAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTGAGAAAATTAAGAAAA-GAATCTATTTACCGAAC
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATATGTTTACTGAAC
* * * *
19870346 AAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCCATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * ***
19870410 ATCCTAAAACAATTGGTTGTATTCATGCAAGCTTTTTTTGAATAAAATAATAT
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * ** * * *
19870463 AAATTTATTAATATTTCAAAAATCAATAAGTAAAATTTTTAAAAAAT--CTAT-TTT-TTTAACT
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC-
* * *
19870524 TA-TTCATAAT--TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
63 AAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** *
19870586 GTCATAAACCAATTGTTTCCATTCATACAAGTTTATTCGTAATAAAATAATAG
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* ** * * * * **
19870639 TAATTTATTAAAATTCTCGAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAGTA
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * **
19870704 AGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCATTAT-A--AATT-TTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
19870765 CATACAACAGTTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAT
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * ** * * *
19870816 TAATTTATTAATATAATAAAATTAATGACTTGGAGACTTAAAAAATTAATATGTTTACCGAACAA
1 TAATTTATTAATATTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* * * * *
19870881 GTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCTAAA-CATTATGACATTTTAG-TTTG
65 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTT-GTTTTG
* ** * * *
19870944 TC-TAAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATAC
128 TCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
** * * * * * * **
19870996 TAATTTATTAATATTTCAAA--AATTACTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTGACT-AGACCG
1 TAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGA-ACAA
* * * * *
19871058 GTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAAGTATCTATCTCAAATCATTAT-A-ATTTTGTTTTGTC
65 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * *
19871121 AAAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAAT-ATTT
130 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
** * * * * * * * *
19871170 CTAAACTAATAATATTATAAAAATAATAAGCAATAGATTTAAAAAAATAAGTGTGTTTGCCGAAC
1 -TAATTTATTAATATTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAAC
* ** * * * * *
19871235 TAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
19871300 TCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * **
19871352 TATTTTATTAACATTCAATAAATTAACAAGCAAGAAATTTTAGAAAATAAATATGTTTACCAAAC
1 TAATTTATTAATATT-AA-AAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC
* * **
19871417 AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AACATTGTTATGACCTTTT-TTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTT-
* * * * *
19871480 TATAATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATAAAAGCTTA-ACTAAAATAAAATAATAT
126 TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATAT
* * * ** *
19871534 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTA-TCGAA
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACT-GAA
* ** * * * ** *
19871597 TCAA-TTCAAAAAAATATG-GTCATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTT
62 -CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
19871660 TTGTTATAAAACAATTGTTT-TCA-TCATATAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAG
125 TTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * *
19871714 TAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAACTCTATTTAGC-AAAC
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAAC
* * * * ** * *
19871778 TAGTTCAAGTAGTTATGACGATTTGAAATTTAACTATTATAAATTTCAAATCATTATAACTTTTT
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG------AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * *
19871843 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTGTTCAAAATATAATAATAC
122 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * * **
19871901 TACTCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTGCCAAACT
1 TAATTTATTAATATTA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC-
* * * * * * * *
19871966 AA-TTCGAATAATCATGGCTATATGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * ** *
19872030 TCATGAAAGAAATGTTTTTGTTCATATAAATTTGTTCAAAATAAAATAATAT
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * ** *
19872082 TAATTTATTAATATTGTAAAAATT-AT---TAAGAGAGTTAAAATATAAATATGTTTACCAAACC
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* * * * * * *
19872143 AGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCATTTGTTTTGT
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* * ** *
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129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * *** ** *
19872259 TAATTTCTTAATACTCTAAAAA-T--T-AGT-AGCGATTTAAAAAATGAATCCATTGGCTG-ACC
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * ** * *
19872318 AGTGCAAATAGTTATAACTGTTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATAACCTTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** **
19872383 CACAAAACAATCGTTTCTATGCATACAAACTTATTCGGAATAGCATAAT-T
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* *** *
19872433 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCCATTTA-TCAAA
1 -TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAA
* * * * * * *
19872497 TAAATTCAAATAGTTATGATTTTTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTT
62 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
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127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT
* * * * **
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1 TAATTTATTAATATT-A-AAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTGAA
* * * * * * * * * *
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62 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
19872743 GTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATAT
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * * *
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1 TAATTTATT-A-ATATTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * *
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64 A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *** **
19872925 TCATAAAACAGTTATAT-TAGTTCATATGGGCTTATTTGAAATAAAATAATAT
128 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * *
19872977 TAATTTGTTAATATTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCCT-AAC
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACTGAAC
* * * * ** *
19873041 AAGTGCAAATAATTATG--TA--TAAACAATTTTCTATTTCAAATTGTTATGATAC-TTTGTTTT
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * *
19873101 GTCATAAAATAATTGTTTCTCTTCATACAAGCTTATTTC-AACTAAAATAATAT
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT
* * *
19873154 AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
1 TAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * *
19873217 CA-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
64 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
19873281 TCAT-AAACTAATTATTTCTATTTATACAAGCATATTCAAAAT-AAATAATAC
128 TCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
19873332 TAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTAAGC
1 TAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-C
** * * *
19873396 AAGTTCAAATAGTTATGTTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTT
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* ** ** * * *
19873460 ATTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATGGAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAC
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * *
19873513 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * *
19873578 AGTTCAAATAGTCATGCCTATATGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
19873643 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAA-CATTATTCAAAATAAAATAATAC
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATAT
** * * * * * *
19873694 TGGTTTTTTAGTATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGGAAC
1 TAATTTATTA--ATATTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC
* * * ** *
19873755 -AGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA--TATTTATTTT
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTT
* *** * *
19873817 GTCATAAAATAATTGTTTCCT-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAC
127 GTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
19873870 TAATTTAATAATATTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAG-TTTGAAAAATATATATATTTGCTGAA-A
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* ** * *
19873929 TCAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTT
64 --AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
19873993 AGTCATAAAACAAGTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAG
127 -GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * *
19874047 TAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATATAAATCTATTTA-TCAA
1 TAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-A-ATAAATATGTTTACT-GA
* ** *
19874111 ATAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGT
61 ACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
19874174 TTTGTCATAAAATAATTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATAC
124 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* ** * * *
19874230 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGTTTTCTGGAC
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTGAAC
* * * * * * *
19874293 TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTC
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
19874357 TTATAAAACAATAATTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAACA-AAAATAATAC
128 TCATAAAACAAT--TGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * *
19874410 TAATTTAATAATATTCTAAAAATTAGT--G-AA-AGATTTAGAAAACAAATGTATTT-GTCAAAC
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC
* * * * * * * * *
19874470 TAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTCTAACC-TTTATTTAG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
19874534 TCCTATAATAATTG--TCTAGTTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * ** * *
19874585 TAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAGGTAAATTTGTTTACCGAAC
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAAC
* * * * * * ** *
19874650 AAGTTCAAAGAATTATGATTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
19874715 TCATAAAACAATTGTTT-AATTTCATAAAAGCTTATCCAAAAGAAAATAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * * *
19874767 TACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAACCA--ATTGCTGAAT
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTGAAC
* * * * * * *
19874830 AAGATC--A-A-CTATGACCATTTGAATAACTATCTA-TTCAAAT-GTTATTACCTTTTG-TTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *** * * * * **
19874888 TAATAAAACAATTGTTTTTCAAAAAATA-AA-TTTGTTTACCAAATCAGTTCAA-A-
128 TCATAAAACAATTG--TTTCTATTCATACAAGCTT-ATT-CAAAATAAAAT-AATAT
* * * * ** * * * *
19874941 TAGTTGTA--ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-A-TTGTTATAACAT---TTTGTTCTATA
1 TAATT-TATTAATA-TT-AAAAATTA-ATAAGT-AAGAGAT-TTAAAAAATAAATATG-T-T-TA
* * * * ** * *
19874999 ATAAAACAATTGTTTCTATTCA--TACAATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-AGTAAT
57 CT-GAACAA--G-TTCAAAT-AGTTATGA-C-TATTT-G-A-ACAATTAT-CT-ATTTCA--AAT
* ** *** ** ** *** **
19875061 -ATTTTGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA-AAAAATTTCGT-TTGC-TA-AA-CCAATTCAA
108 CATTATGACCTT--TTGTTTTGTCA--TAAAACAATTGTTTC-TATT-CATACAAGCTTATTCAA
*
19875120 ACAGTTAAGACT-ATAT
167 A-A--TAA-AATAATAT
* * * * ** *** * * * *
19875136 GAATAATTATT--TATCTCAAATTGTTATGACTTTTTA-TTTGTCATAAAACAATTAT-TTTAGC
1 TAAT--TTATTAATAT-TAAAAAT-TAAT-AAGTAAGAGATT-T-AAAAAATAAATATGTTTA-C
* * ** ** ** * *
19875197 TCATAAAAGCTTATTCAAAATAGAGCAAAACTAATTT-ATTAA-TAT-T-TATCAAACCAGTT-T
58 TGA-ACAAG----TTC-AAATAG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTAT
** * * * * * * * ** * * ***
19875257 -A--AATAGTTATGACTATTTAAGCAATTATTTAT-TTCAAATTGTTATGACTTTTGTTCTGTTA
114 GACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCTATTC--A-T-ACAAG-C--TTATTC-AAAA
19875318 TAAAATAATAGT
169 TAAAATAATA-T
** * * * * * *
19875330 TTCTGTTCA-TACCAGCTTATTTGGATTAAAATAATATCAATTTATTA-ATATTTCAACAATTAA
1 TAAT-TT-ATTA--A---TA-TT--A--AAAATTA-AT-AA-GTA--AGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * ** * * * *
19875393 TAAGTAAAAAAATTAA-AACAT-AAATATGCTTA--ACAAACTTGATCAAATAGTCATAATTATT
49 TATGT---TTACTGAACAAGTTCAAATA-G-TTATGAC-TATTTGAACAATTA-TC-T-A-T-TT
** * *** * * * ** * * * ** * *
19875454 TGAATAATTAT---CTATTTCAAATTGTTAT-GACCTTTTATTT-T-GTCATAAAAAAATCATTT
103 CAAATCATTATGACCT-TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAAGCTTATTC
** * * *
19875513 TGATTCATATAAGCTTAT
165 AAAATAAAATAA---TAT
** * * ** ** * * * * * * *
19875531 TCGAAATAAAATAATATGAAGTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAATTAGAGAT-TTAAAAAA
1 T---AATTTATTAATATTAA-AAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT---TAC
* * ** * * * *
19875593 TGAATAAGTTTAAATAACTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCATTATAACTTTTTG
58 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * *
19875658 TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC
123 TTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * *
19875717 AAATTTATTAATATTAAGGCAATTAATACA-TAAAAGATCTAACAAATAAATCTATTTACTGAAC
1 TAATTTATTAATATTAA--AAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC
** * * ** *
19875781 AAGTTCAAATCTTTATGACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGGTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** *** * *
19875846 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTTGGACTAAAA-AAAAT
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
*
19875897 TAATTCATTAATATTTCAACAAA-TAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGA
1 TAATTTATTAATA-TT-AA-AAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GA
* * * * *
19875959 ACAAGTTTAAATGGTTATGAGTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
61 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * ** *
19876024 TATAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATAC
126 TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATAT
** * * * * *
19876079 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACAGAACA
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * *
19876144 TGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
19876209 CATAAAACAATCGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAAT
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT-A-AT--AT
* * * *
19876264 TTATTAATATTTCAAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCT
1 TAATT--TA-TT--AATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
* * **
19876328 AAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
59 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
19876393 TTTGTCAT-AAACAAATTGTTTCTGTTTATAAAACCTTATTTAGAATAAAATAATAC
124 TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * ***
19876449 TAATTTATTAAAATTTGAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAGTG
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
** * * * *
19876514 AGTTCAAATAGTTATGACCCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** ** *
19876579 TATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATAC
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* *
19876630 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * ** * * * **
19876695 AATTCAAATAGTCAT-ATCTATTTGAATTATTATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGATTAA
64 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** ** * * *
19876759 TTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * *
19876811 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAGAATTAAATCTATTTA-TCGAGC
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC
* * * * * ** * *
19876871 CAGTTTAAATACTTATGACTATTTGAATAGTTATCTACCTCATATCATTATGATC-TTTGTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** ** * * *
19876935 TAATAAAACAATTACTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTAC
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * ** *
19876987 TAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAACT
1 TAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * * * *
19877052 AGTTCAAATAGTAAAGACTATTAGAACAATTGTCTATTTCAAATCGTTCTTACCTTTT-TTTAGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
19877116 TATAAAAC-ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAACAAAATAATAG
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * *
19877166 TAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGCAAGAGATTGAAATAAAATAAATCTATTTA-TCAA
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAA-AAAATAAATATGTTTACT-GA
* * * * ** *
19877230 ACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAATAATTCTTTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGT
61 ACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGT
* * ** * *
19877293 TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAGTAC
124 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * *
19877349 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGTTTCCTGAAC
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTGAAC
* * * * * *
19877412 TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAATAT-TAATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTT
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
19877475 CTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATA-AAGCTTATTC-----AGAGT-A-A-
127 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
19877519 -AA--TA-T--T-TCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAGAAAATAAATCTATTTA-TCAAACAA
1 TAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAA
* * ** * ** * * *
19877572 GTTCAAATAGTTTTTACTATTTGAGTAATTATGTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTGTT
65 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **** *
19877637 GTAAAATAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGGTTAAAATAATAC
130 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * *
19877687 TAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAGTAAATATGTTTATTGAACT
1 TAATTTATTAATA-TTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
** ** * * * ** *
19877752 AGAGCAAATAGACATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAACTCATTATGATATTTTGTTTTCT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
19877817 CATAAAA-AATTATTT-TAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
129 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * *
19877867 TAAGTTATTAATATTATGAAAATTCATAATTAAGAGATTT-AAAAATGAATCTGTTT-GTCGAAC
1 TAATTTATTAATATTA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC
* * * *
19877930 AAGATT-AAATAATTTTGACTATTTCG-ACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTT
63 AAG-TTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* ** * *** *
19877993 TCTCATAAAATGATT-TTTCCTATTAATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAC
126 TGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * **
19878047 AAATTTATTAATATTATGACAATTAATAAGCAAAAGGTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
1 TAATTTATTAATATTA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* ** * * * * *
19878112 ATTTCAAATCTTTATGACTATATGAAAAATTATTTATTTCAAATTGA-TATGACTTTTTGTTTTG
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *** *
19878176 TCATAAAATAATTATTTCT-GTAATATGTGCTTATTTC-AATTAACAA-AATAT
128 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAA-AATAATAT
* * *
19878227 TAATTTATTAATATTTTCACAATTAATAAGT-AGA-ACGTTTAAAAAATAAATATGTTT-TTCGA
1 TAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GA
* * ** * * * *
19878289 ACAAGTTCAACTAGTCACAACTAGTTGAATAATTATCTAATTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTT
61 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * *
19878353 TGTAAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATAC
126 TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
19878406 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAA-AGAATCT-TATTACCGAA
1 TAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATATGT-TTACTGAA
* * *
19878469 CATGTTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTT
62 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * ** *
19878534 GTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATAC
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * **
19878587 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATGAATTTG-TTACAAAACA
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * *
19878651 TGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTTAAAACATTATGACATTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ***
19878716 CATAAAACATTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAAT
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-A-AT--AT
* * * * **
19878771 TTATTAATATTTCACATATTTCAAAAATTAATAAATAA-AAATTT-AAAAATAAATATATTTTTT
1 TAATT--TA-TT-A-ATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
** * * *
19878834 GAACACTTTCAAATAGTTCTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGT
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* *** *
19878898 CTTGTCAT-----AA-----TC-A-T-A-A-AAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
124 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * *
19878939 TAATTTATTAAAATT-----TTAAAAATTAATA-A-TTAAAAAATAAAATCTATTTAC-CAAGCG
1 TAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACTGAA-CA
* * * * * * *
19878996 AGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATTTAATTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-
* * * * * *
19879061 TTATAAAATAATT-TTTAATATTCTTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAC
128 TCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * ** * * ** *
19879113 TAATATATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACT
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * **
19879178 AGCTT-AAATAGTTACGTCTATTTGAACTAA-TATCTATATCAAATCATTATGATATTTTGTTTT
64 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
** * * ** ** *
19879241 GTTGTAAAACAGTTATTTCTATTCATACAAAATTATTCACTATAAAATAATAC
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * *
19879294 TAATTTATTAGTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTTAATCT-TTATA-TAGAA
1 TAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TACT-GAA
* * * * * * * *
19879353 CCAGTTCAAATAATTATGATTGTTTAAACAATTTTCTATATCAAATTATTATGA--TATTTGTTT
62 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTT
* * * *** * **
19879416 TGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATCTTGA-
126 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-AT
* * * * * ** *
19879470 TAAATTAATAATATTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACC
1 TAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * *
19879531 AGTTCAAATAATTAAGACTATTAT-ATCAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCTTTT-ATTTG
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
*** * * *
19879594 TCATAAAATGGTAT-TTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATACT-T
128 TCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* ** * * * *
19879645 CTAATTTACTAGCAT-TTAGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTCTA-TCG
1 -TAATTTATTA--ATATTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACT-G
* * *
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60 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
19879771 TTATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATA-AAACATTA-TCTAAAATAAAATAATAT
125 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC-TTATTC-AAAATAAAATAATAT
* * * * *
19879826 TACTTTATTGATACTTCAAAATT--TGATGTATTAGAGATTTAAAAAATAAGCTA-GTTTTA-TC
1 TAATTTATTAATA-TTAAAAATTAAT-AAGTA--AGAGATTTAAAAAATAA-ATATG-TTTACT-
*** * * * ** *
19879887 GAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTGT
59 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
19879952 TTTTTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTGTTCAAAATAAAATAATAT
124 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * *
19880008 TAATTTATCAAAATTTTAAAAGTAATAACTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC--
1 TAATTTATTAATA-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* * * * ** * *
19880071 ---C---GA-TTCT---TATTTGAACAATGATCTATTTTAAATTGTTAT-AGCCTTTTGTTCTAT
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* * * * *** *
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* * * **
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**
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* * * * * * *
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** * * * * ** *
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* * * **
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* * *
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* * **
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* * * *
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** ** * **
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* * * * * * ***
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*
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* *
19877838 ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATT
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * *
19878129 CTATATGAAAAATTATTTATTTCAAATTGATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTC
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* *** * *
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* * ** *
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* * * ** * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
19878428 TTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAA-AGAATCT-TATTACCGAACATGTTCAAATAGTTGTGACTA
192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGT-TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
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* * * *
19878556 TTATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
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* * * * * *
19878596 AATA-TTCTAAAAATTAATGAG-AAAGAGAATTAAAAAATGAATTTG-TTACAAAACATGTTCAA
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* * * * * *
19878658 ATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTTAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA
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* * *
19878723 CATTTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAC
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* * * * **** **
19878786 ATATTTCAAAAATTAATAAATAA-AAATTT-AAAAATAAATATATTTTTTGAACACTTTCAAATA
181 ATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* * *
19878849 GTTCTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGTCTTGTCAT-----AA
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* **
19878908 ----------TCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
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* * * * * * * *
19878948 AAAATTTTAAAAATTAATAATTAAAA-A---ATAAAAT--CTA--TTTACCAAGCGAGTTTAAAT
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* * * * * * * * *
19879005 AGTTATGAATATTTGAATAATTATTTAATTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTTATAAAAT
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTG-TCATAAAAC
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129 AATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
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255 TTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTG
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191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
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* * * *
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320 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
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250 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
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315 TTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * ** **
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1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
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129 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA
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*
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322 ATACA-AGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
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1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAA
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65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAAC
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129 AATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAA
* *** * * *
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191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG--ACT
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19880616 ATTTAAATAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG
254 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTG
* * *
19880681 TTCATACTAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAAT
319 TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * *
19880722 AATGTTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
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66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACA
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19880852 AGTTTTGTTGAATTCATA-ATAGCTTATACGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA
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* * * * * * * * *
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189 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
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254 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTG
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* * * ** **
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* * ** * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * * * * * * *
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192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
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257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTC
* *
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322 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
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19881443 TGTAATCCAAAAATCAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAAATGAATCTGCTTACTAAACAAGTTTAA
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
* *
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64 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAA
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* * * * *
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** * * * * * *
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253 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTT
* *
19881762 G-TCATACAAGTTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATT
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*
19881803 AATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAA
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* * * *
19881868 TAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TTTTAT-AGTAAAAT
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCA-TAAAAC
* * *
19881931 AATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAA
129 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAA
* *** * * ** *
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192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * ** * * **
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256 TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGT
* * * ** *
19882124 TCATGCAATCTTGTTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATT
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* * * * *
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1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * *
19882215 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACT
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAAC-
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* * * * * *
19882343 TTAGTAAGGAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTA-AAAAGCAAGTTCAAATAGTT-TAGACTA
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* * * * *
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255 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGT
*
19882471 TCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
320 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
*** * * *
19882511 AATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAGTTCAAC
1 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * *
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* * * * ** *
19882639 AAATTATTTTTA-TTCA-AGAAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
128 CAATT-GTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAA
* *
19882702 AAATTAAT-A-T---AGATTTAAAAACA-AAATAC-GTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGA
189 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAAT-CTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
19882760 CTATTTTAATAATTATCTATCTCAAATAG-TATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC
252 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
* * * * ** *
19882823 TATTCATACAAGCTTATTTAGAGTAAAATAATGCTAAACTAAT
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* ** * * * *
19882866 AATA-TTCTAAAAATTAATAAGCATGATATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCC-AACCAGTT-AT
1 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACCAAACAAGTTCA-
* * * * * *
19882928 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAA
63 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAA
*** * * * *
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* * * * *
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188 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
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251 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
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19883187 CAGTTCATA-AATACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
316 TTGTTCATACAA-GCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
** * **
19883231 AATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTGAAGATTTAAAAAATTAAT-TAGTTTTTCAAATC-AGTTCA
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19883293 AATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTCTTATAAA
63 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTGTTTTGTCATAAA
* *
19883358 ATAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
127 ACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCA
* * * * ** * * * * *
19883421 AAAATTAAAAAGTAGGAGAATT-AAAAATAAATATACTTACTAGACTAGTTTAAATAGTTATTAC
188 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
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19883485 TATTTGAATGATTATATA-TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATTGTAAAACAAATATTTAT
253 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTT
** * *
19883549 GTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAAT
318 GTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** * * * * *
19883591 AATATTAT-GAAAATTAATAACTAGGAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TTCAA
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* * * * * * * *
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* * ** * * * *
19883719 CAACTATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTTTAAA
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* * * * *
19883783 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAA-CTCAAGTAGTTATAACA
190 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
19883843 ATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTG
254 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTG
* * * * *
19883908 TTGATACAATCTTATTTAGAATAAAGTAATGCTAATTTATT
319 TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * ** * * *
19883949 GATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTT-AAAAATGAATCTGTTGGCCTAACCAGTACAAA
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19884012 TAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCACTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAC
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* * ** * * *
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* * *** *
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192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * ** * *
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257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT-TGTT
* * * *
19884270 CATGCAAGCTTATTTCAATTAAAATAATGC-AAATTATT
321 CATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * * *
19884308 AATATTT-GACAACTAATAAGTAAAA-TTTTTAAAAATAAATTTATTTACCGAATAAGTTTAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
19884371 AGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * * * *
19884436 ATTGTTTTTGTTTATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAAT
130 ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * * * * * *
19884501 TATTAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAAAC-GTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACT
193 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * **
19884564 TGAATAATTATCTATTTCAAGTCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATATCAGTTC
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* *
19884629 ATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
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* * * * * * * *
19884667 AATATTACAAAACTTAATGAGTAAAAGATTTAAAATATGAATCTTTTTACTAAAC-AGTTCAAAT
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* ** * *
19884731 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAATA
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
19884796 ATTGTTTCTA-CTCATACAAGCTTATTTCAAAAAAAGTAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA
130 ATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAA-TAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * **** * *
19884859 ATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGATCAAATAGTTATGACTAT
191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
19884923 TTAAATAATTATCTATTT-AAATAGTTGTGACCTTTTGATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTCTT
256 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTT
* *
19884987 CATACAAACATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
321 CATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** * * * * * ** *
19885026 AATATTCCAAAAACTAATGGGTAAAAAATGTAAAAAGTAAATTTGTTTACTATGCAAGTTTAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * **
19885091 AATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTTATAT-AGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAAC
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* *
19885155 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAA
129 AATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * * * * * * *
19885219 ATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACAAGTTCAAATACTCATGTCCAT
191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
19885284 TTGAACAACTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-AGTAAAACAATTATTTCTAT
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* ** * *
19885348 TCATGCAAAATTGTTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
320 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * *
19885388 AATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTAT-TTT-CTAAACCAA-TTCA
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACCAAA-CAAGTTCA
* * * * * * * * * *
19885450 ATTAGTTATAACTGTTTGAATAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAA
63 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
19885515 CAATTGGTTCTGATCATACAAACTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAA
128 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * * *
19885580 A-T--TAA-TAAGAGATTTATAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAATTA--ACTA
191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * * **
19885638 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC-TTTGTATAGTCATATAATAATTGTTTCAGT
255 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGT
* * **
19885702 TTATACAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
320 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** * * ** * *
19885742 AACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATTAGATTTGAAAAAATTAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAA
1 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * *
19885806 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATCAAA
64 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAA
* *** * * * **
19885871 CAATTG-TTCTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTACTATTTTTAA
128 CAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * *
19885935 AATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAATC-AGCTCAAATAATCATGGC
190 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *** * * * * * * *
19885998 T-TTTAAACAGCCATCTGTTTCAATTCATTATTACCTTTT-TTGTTATCATAAAATAATTGTTTT
253 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTTTTTT
*** * * * *
19886061 TCAACATGCAAGCATTTTTGAAATAAAGTAATACTAATTTATT
317 TGTTCATACAAGC-TTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * *
19886104 AATATTTCAAGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACCATTTAAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
19886168 ATTTTTTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTATTTTGTCATCAAACAA
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * *
19886233 TTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGAAAAAAAAATAATACTAA-TTAATAATATTTCAAAACT
131 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG--AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * * ** ** *
19886297 TAAT-AGCCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTACCGAGCCAA-TTCAAATAGTTAAGACTAT
193 TAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * ** *
19886360 ATGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTGTAAAACAA-TTGTTTTGTT
256 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTT
* * *
19886424 CGTACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATAC--------T
321 CATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
19886455 -A-A--TC----ATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCAAA
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAA
** * * * * ** *
19886507 TGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTAGTCATAAAAC
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
19886572 AATTGTTTTAGTTTATATAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTC-AAAA-
129 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAT
* *
19886635 -AATTA-TAAGAGATTTACAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG---T---TATT
193 TAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * ** *
19886692 TGAATAGTTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTA
257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTC
* * ** *
19886757 ATAAAAGCTTAGATGGAACAAAATAATACTAATTTATT
322 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * ** *
19886795 AATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAGATTTGTTTACCTAATTAGTTAAAA
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAA
* * ** * * *
19886859 TAATTATGGCCATTTGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTATGTTTTATCGTAAAAC
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * **
19886924 AATTCTTT-TTTATGATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATT-TTAAA
129 AATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA
* * * * * *
19886987 TTAATATGTAATAGATTTAAATAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAAT
192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * ** * * *
19887052 TGAACAAATATCAATCTCAGATCATTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTGTTTG-TC
257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTC
* **** * *
19887113 ATATAAGCTTATTTGGTTAAAAATAACACTAATTTAAT
322 ATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATT
* * * *
19887151 AATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAA-TTCAA
1 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AAGTTCAA
** ** * * * * * ** * * * *
19887214 ATGTTTAAAATTGTTAGAATAATTATCCATTTCAAATTGTTCTAACCTTTACTTTAGTCATAAAA
64 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-GTTTTGTCATAAAA
* * ** ** * **
19887279 TATTTGTTTCA-TATTTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTTGGA
128 CAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAA
* * * * *
19887342 AAATTAATAAGAAAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
189 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * **
19887407 TATATGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACAT-AAACAATTGTTTCA
253 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTT
* * *
19887471 GTTCATTA-AAGCTTA-TCCAA-AAAATAATACTATTTTCTT
318 GTTCA-TACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
19887510 AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAACAAAGTT--AC
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AAGTTCAAA
* ** * * * *
19887572 TAGTTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGA-TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *
19887636 CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTCAAAA
128 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * ** * *
19887701 ATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATGGAACCAA-TTCAAATAATTATCG-CT
191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT
* * * * * *
19887764 ATTTCAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TTTTTTTG
254 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTG
* *
19887828 ATCATATAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
319 TTCATA-CAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
19887870 AATCTTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
19887931 AATAATAACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCATTTGTTCTGTCATAAAATA
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * ** * *
19887996 ATTATTTCTA-TTCGTGCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAA
130 ATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * ** * * * *
19888060 CTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAG-CTATA
192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * ***
19888124 TGAACAATTATTTATTTCGAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCAATTC
257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTC
* *
19888189 ATACTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATT
322 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * *
19888227 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAA-TTCAAA
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAA
* * * *
19888290 TAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * ** * **
19888355 AAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAAAAATATTAACCTATTAATGCTTTGAAAA
129 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAA
* * ** * *
19888420 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATTATTTCAAATAGTTGTGACTATT
192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * ***
19888481 T-AAGCAATTATTTATTTCAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAAAAAATAGCTTTTGT
257 TGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTTTTTTTGT
* ** * * * *
19888544 TCACACAAATTTATTTGAATTAAAATATTACTACTTTATT
320 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * * * * * *
19888584 AATATTTTGACAATTAATAAGAAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
19888649 AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAA
66 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** *
19888714 ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATATTCCAAAAA
130 ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT-CAAAAA
* * * ** * *
19888778 TTAATAATTGAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATT
192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * ** * * *
19888843 TGAACAATTATCTATTTGAAAT-TTCTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATGATTTATTCTATT
257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTT
* ** *
19888907 CATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATT
321 CATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * **
19888946 AATA-TT-AATACAATTAATAAATGAAAGATTTAAACAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAA
1 AATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * ** * *
19889009 CTCATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTTTTTTGTCATAAAA
64 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * ** *
19889074 CAATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTTGACA
128 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * * * *
19889139 ATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAA-AAATATGTTTGCCGAACAATTTATTAATATTCCAAAAAT
191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-GT-TCAA-A-T-----AGT
* ** * * *
19889201 TAATGAGTAAGAGCATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAAAAGTTATGA-CTAT
247 T-ATGACT------ATTTGAACAAT-TATCTATTT--C--A-AA--TC-----GTTATGACCT-T
* ****** * *
19889265 CTAAACAATTATATATTCCAAGACATTATTACCTTTGTTTCG-TCATAAAACAATTGGTTCGATT
291 TTGTTTTGT--CATA----AA-ACA--ATT---TTT-TTT-GTTCAT--A-CAA--GCTT--ATT
*** * * *
19889329 CATGCAAGAATAATTCGAA--TA-A
335 CAAATAA-AATAATACTAATTTATT
* ** * * * ** *
19889351 AATATTAT-AAATTTATTAATATTTCAAAA-A-TTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAATAAATATG
1 AATATT-TCAAA--AATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-ACA-A-G
*** * **
19889411 TT-TTCTGAACATGTTCAAATATTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATGGTTATGAC
59 TTCAAAT--A-A---T----TA--T--GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* *
19889475 CATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCA-ATCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
110 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-CAAGCTTATTTG-AATAAAATAATAC
* * *
19889538 TAATTTATTAACATTTC-AAAATTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC
171 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * * *
19889601 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTG
234 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * *
19889666 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTTTAAACAAAATAATACTAATTTATT
299 TCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** * * * * * ** *
19889727 AATA-TTCTAAATATTAATATGTTGAAGATTTAACAAATTAATCTATTTATCGCACAAGTTCAAC
1 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * ** * * * *
19889791 TAGTCATGTCCATTTGAATTATTATGTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTG-CTGTAAAA
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTC-ATAAAA
* ** * * *
19889855 TAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTATTATTTTAAA
128 CAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * *
19889919 AATT-AT---TAAGAGATTT-AAAAGTAAATCTCTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA
190 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * *
19889979 TTTGGATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCCTAAAAC-ATTTGTTTCTA
255 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTTTG
* * * * * * **
19890042 TTCATACAACCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAAA
319 TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * * ** * * *
19890083 AATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTTAAAT
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * *
19890147 AGTTAAT-ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTGTTTAGTCATAAAAT
66 AATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * *
19890211 AATTGTTTTAGTTCATA-ATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTATAAAA
129 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAA
* * * * * *
19890275 TTAATAGGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATT
192 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * **
19890340 TGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTAATTC
257 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTC
* * * ** * * * *
19890405 ATAAAAGCTTGA-AC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATG
322 ATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAA-T-TTATT
* *
19890443 AACTTTTGTTTTCTCATAAAA-TAATTGTTTTTTATCA-TATAAGCCTATTTGAAATAAAATAAT
1 AA------TATT-TCA-AAAATTAA--------TA--AGTAAAAG---ATTT--AA-AAAATAA-
* * ** ** ** * * * * *
19890506 ACTAATTTATTACTATTTCAAAAATC-AATACGTAGGA-GA-TTGAAAAAATAAATCTGTTTACT
41 A-T-ATGT-TTACCA-AAC-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTG-AACAAT-TATCTATTT-C-
* * * * * ** * * ** * *
19890568 GAAGCAGTTCAAAT-A-CTTATGAATATT-TGA-ACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTT
97 AAATCA-TT---ATGACCTT-TG--TTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTC-AGTTCATACAAGC--
* * ** * ** *
19890629 TTGTTCTGTCATAAACCAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATG
151 TTATT-TG-AATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAA---TATTC------AAA-AAT--TAA--
* * * * * ** * *
19890694 TAATAATATTCAGAAAAGTAAGAACTAAGAAAAATAAATTTGTTTGCTGAGCCAGTTCAAATAGT
196 T-A-AGTA---AG---A----G-ATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
19890759 TAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTG-AATTAAACAATA
247 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * *
19890823 TTTTTAGTACTTACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATT
312 TTTTTTGTTCATAC-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
19890871 AATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATATTTGCTAAACCAA-TTTAAA
1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAA
* * * *
19890935 TAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACGTATTGTTTTATCAT-AAAC
65 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * * * *
19890999 AAATGTTTTTA-TTCAAATAAGTTTGTTCGGAATAAAGTAATATTAATTTATTAGTATTTTAAAA
129 AATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * * * * *
19891063 ATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTTAATTAATT-TAACTAT
191 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
19891127 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTATT
256 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTT
* * * *
19891192 CATA-TAGTCTTATTCTGAATAAAGTAATGCTAATTTATT
321 CATACAAG-CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * ** ** * *
19891231 AATA-CTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAA
1 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAACAAGTTCAA
* * * * * * *
19891294 ATAGTTATGA-T-TGTTAAACAATTATGTACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCACAAA
64 ATAATTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * ** *
19891357 ACAATTGGTT-ATGTTCGTACAAGTTTATTTGAAATAACATAAGT-CTAACATATTAATATTCTG
127 ACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTC-A
* * * * * ** *
19891420 AAACTTAATAAGCAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTAACTTAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
188 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
19891485 CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGCTTTGTGATAAAATAATTTTTTCT
253 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTT
* *
19891550 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATT
318 GTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
19891592 AATA-TTCAACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTTAA
1 AATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * ** *
19891656 ATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
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* * * *
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* * * *** * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * *
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* * * * **** * *
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* * * * * *
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*
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* * * *** * * *
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1 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
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* ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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Statistics
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * ***
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* *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * **
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * *** * *
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66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
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* * * * *
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*
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* * * *
19884780 GTTTTTTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGCTTATTTCAAAA-AAAGTAATA-TAAATT
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* * **
19884843 TATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTTTT
128 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTAC
* * * * * * *
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1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
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19884960 ATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTCTTCATACAAACATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
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* * * * * * * *
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* * * **
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* * * *
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* * * * * * ***
19885675 GTATAGTCATATAATAATTGTTTC-AGTTTATACAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
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129 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAC
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* * * * * *
19885857 GTTTTATCATCAAACAATTG-TTCTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTT
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19885921 ATTACTATTTTTAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATC
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19885975 GAATC-AGCTCAAATA-ATCATGGCT-TTTAAACAGCCATCTGTTTCAATTCATTATTACCTTTT
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19886037 -TTGTTATCATAAAATAATTGTTTTTCA-ACATGCAAGCATT-TTTGAAATAAAGTAATACTAAT
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19886099 TTATTAATATT-TCAAGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACC
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* * * * ** * *
19886217 TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGAAAAAAAAATAATACTAA-TTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * **
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130 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
** * * * *
19886334 GAGCCAA-TTCAAATAG-TTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
1 -AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* ** * * ** * *
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65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* *** *** *
19886460 TTAATA----AGAAATTTAA-AA--AATAA-ATTTATTTACCGAATCAG-TT-C
130 TTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** * * * * * * **
19886504 AAA-TGGTT-AAGACTA--TTA-GAATAATT-ATC---TA--T-TTC-AAATCATTATAATATTT
1 AAACAAGTTCAA-A-TAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * * *
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64 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * *
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128 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * *
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1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * ** *
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66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* *
19886792 ATTAATATTTCCT--AAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAGATTTGTTTACC
129 ATTAATA-TT-CTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* ** * * * * ** * * *
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1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * ** *
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66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
19886974 TTAATATT-T-TAAATTAATATGTAATAGATTTAAATAATAAATCTATTTACC
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * * ** *
19887025 AAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTAATTGAACAAATATCAATCTCAGATCATTAAAATC-TTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * **** *
19887088 TTTTGTCATAAAATAATTG-TT-T-GTCATATAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAACACTAATTTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTA
* * * * *
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130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* ** * * * * * * * * *
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1 AAAC-AAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * *
19887265 CTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATT-TTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAAATT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATT
* * * * *
19887328 TATTAACATT-TGGAAAATTAATAAGAAAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACC
128 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * *
19887384 GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATATGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * *
19887448 TTTTGACAT-AAACAATTGTTTC-AGTTCATTA-AAGCTTA-TC-CAA-AAAATAATACTATTTT
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
19887507 CTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTCACC
129 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * ** * * * * *
19887560 GAACAAAGTT--ACTAG-TTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGATATGACTTTTT
1 AAAC-AAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* *
19887622 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * *
19887686 GTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATGG
129 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--C
* * * * * *
19887741 AACCAA-TTCAAATA-ATTATCG-CTATTTCAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATTACCTTTT
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * *
19887803 GTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTGA-TCATATAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * *
19887866 TATTAATCTTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC
128 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * * * *
19887917 AAACAAGTTTAAATA-ATAATAACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCATTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * * *
19887981 TTCTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCGTGCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
19888046 TAATATT-TCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTC
131 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC
* * * * * * *
19888098 GAACCAGTTCAAATAG-TTAAG-CTATATGAACAATTATTTATTTCGAATCATTATGACCTTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
19888161 TTTTATCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTA
* * *
19888225 TTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATAATTTTGTTTACC
130 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * *
19888277 TAACCAA-TTCAAATA-ATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
1 -AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * * * * **
19888340 GTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAAAAATATTAACCTA
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * *
19888405 TTAATGCTT-TGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
130 TTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
** * * * *
19888454 AAATTATTTCAAATAG-TTGTGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATC-TTATGACTTTTT
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * * * ** ** * * *
19888516 GTTCTATTATAAAAAAAATAGCTTT-TGTTCACACAAATTTATTTGAATTAAAATATTACTACTT
65 GTTTTGTCAT-AAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * *
19888580 TATTAATATTTTGACAATTAATAAGAAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATC
128 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * ** *
19888635 GAACTAGATCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACATTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * *
19888699 TTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGCTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTA
* * * * *
19888763 TTAATATTCCAAAAATTAATAATTGAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAC
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * *
19888815 TGAACAAGTTTAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAT-TTCTATAACCTTT
1 -AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT-TATGACCTTT
* ** * *** *
19888878 TCTTTTGTCATAAAATGATT-TATTCTATTCATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATT
64 TGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
19888942 TATTAATA-T-TAATACAATTAATAAATGAAAGATTTAAACAATAAATATGTTTAC
128 TATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * *
19888996 TGAACAAGTTCAACTCA--TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTT
1 -AAACAAGTTCAAAT-AGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * *** * *
19889059 TTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTT
64 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * ** * ***
19889124 GTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATATGTTTGCCGAAC
129 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTG-TTTAC
* * * ** * * *
19889179 AATTTATTAATATTCCAAA-AATTAATGAGTAAGAGC-ATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA
1 AA---A-CAA-GTT-CAAATAGTT--T-A-T--GA-CTATTTGAACAAT-TATCTATTT--CAAA
** ** * ** * * * ** ** * *
19889242 -CAAGTTCAAAAAGTTATG-ACTATC-T-AAACAATTATATATTCCAAGACATTATTACCTTTGT
50 TC--GTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGT-TT-CTATTCA-TACAAGC-TT-A
*** * ** * ** *
19889303 TTCGTCATAAAACAATTGGTTCGATTCATGCAAGAATAATTCGAATAAAATATT-ATAAATTTAT
105 TTCAAAATAAAATAA-T-ACT-AATT--T--ATTAAT-ATTC---TAAAA-ATTAAT-AA-GTA-
* * * * ** *
19889367 TAATATTTCAAAAATTAATAAG--TAA
155 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* ** * * *
19889392 AAATTTAAAAAT-AAATATGTTTTCTGAAC-ATGTTCAA-ATATTTATGACTGTTTGAACAATTA
1 AAA---CAAGTTCAAATA-G-TTTATG-ACTAT-TTGAACA-A-TTAT--CTATTT---CAA--A
* * ** * ** * * **** * *
19889454 TC-TATTTCAAATGGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA-AACCAATTGT-TTCTATTCAATCAAG
50 TCGT-TATGACCT--TT-TG----TTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATAC-A---AG
* * * *
19889516 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TCAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAA
101 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
*
19889580 AAATAAATTTGTTTACC
166 AAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * *
19889597 GAACGAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
** ** *
19889661 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTTTAAACAAAATAATACTAATTTAT
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * *
19889726 TAATATTCTAAATATTAATATGTTGAAGATTTAACAAATTAATCTATTTATC
131 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
** * * * * ** * *
19889778 GCACAAGTTCAACTAG-TCATGTCCATTTGAATTATTATGTATTTCAAATCGTTATGACATTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * ** * * *
19889842 TTTTG-CTGTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTA
66 TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
19889906 TTATTATTTTAAAAATT-AT---TAAGAGATTT-AAAAGTAAATCTCTTTACC
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * * *
19889954 GAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGGATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTA
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * * * * *
19890017 TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAACCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
19890082 AAATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTC
131 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC
* * * * * * * *
19890133 GAACCAGTTTAAATAGTTAAT-ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * *
19890197 TTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-ATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
19890260 TTAACATT-TATAAAATTAATAGGCAAGAA-ATTAAAAAAATAAATCTGTTTATC
130 TTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * *
19890313 AAACAAGTTCAAATAG-TGATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTA
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * ** * * *
19890377 TTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAGCTTGA---ACAATTATCTATTTCAAATTG
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAA-T-
* **** * * ** * ** * ** * *
19890438 TTATGAACT-TT-T-GTTTTCTCATAAAATAATTGTTTTTTATCATATAAGCCTATTT-G
127 TTATTAA-TATTCTAAAAAT-TAAT-AAGTAAAAG--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* ** * * * * * * * ***
19890494 AAATAAAAT-AATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATCAATACGTAGGAGATTGAAA-AAATA-
1 AAACAAGTTCAA-A-TAGTTTATGACTATTTGAACAAT-TAT-C-T---A-TTTCAAATCGTTAT
* * * ** * * * * * *** * ** * *
19890556 AATCTGTT-TACTGAAGCAGTTCAAATACTTATGAATATTTGA-ACAATTATATATTTCAAATTG
57 GACCTTTTGTTTTG--TCA--TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GCT-TA-TTCAAAATA
** * * * * * ** * ** *
19890619 TTATAA-CCT--TTTGTT-CT-GTCATAAACCAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT
114 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAA--AATTA-ATAAG-T-A-A-AAGATT-TAAAAAAT
* * * *
19890679 AAAATAATGCTAATG
170 -AAAT-CTGTTTA-C
* * * * * * * * * * * **
19890694 TAATAATATTCAGAAAAG--TAAGAACTA--AGAAAAATAAATTTGTTTGCTGAGCCAGTTCA--
1 AAACAA-GTTCA-AATAGTTTATG-ACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATC-GTT-ATG
* * ** * * * * * * * ** *
19890753 A---ATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTAT-TTCAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTGAAT
58 ACCTTTTGTTTTGTC-ATA-AAACAATTGTTTCTATTC--AT-AC-A--AGC--TT-ATTCAAAA
* ** * * * * * * *
19890814 TAAACAATATTTTTAGTACTTACTAACTTATT-TGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTT
112 T-AA-AATAATACTA--ATTTATTAA--TATTCT---A-AAAAT-TAA-TAA-GTA-AAAGATTT
* *
19890878 CAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTA-
163 AAAAAATAAATC--T----G-TTTAC
* * * * *
19890903 AAA-AA--T-AATTATA-TTTGCTAAACCAATTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTA
1 AAACAAGTTCAA--ATAGTTT-AT-GA-CTATTTGAACAATTAT--CTATT--------------
* * * * * * * * *
19890963 TTTCAAATCGTTATGACGTATTGTTTTATCAT-AAACAAATGTTTTTATTCAAATAAGTTTGTTC
45 --TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
** * * * * * *
19891027 GGAATAAAGTAATATTAATTTATTAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAA
108 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
*
19891092 TTTGTTTAC
173 TCTGTTTAC
* * * * * * *
19891101 TAAACCAGTTTAATTAATTTA--ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTT
1 -AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * ** * *
19891164 GTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATA-TAGTCTTATTCTGAATAAAGTAATGCTAATTT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * **
19891228 ATTAATACTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGC
129 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * * *
19891281 TTGACCAA-TGCAAATAG-TTATGA-T-TGTTAAACAATTATGTACTTCAAATCATTATAACCTT
1 --AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * * ** * *
19891342 TTGTTTTATCACAAAACAATTGGTTATGTTCGTACAAGTTTATTTGAAATAACATAAGT-CTAAC
63 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTAAT
* * * * * * * *
19891406 ATATTAATATTCTGAAACTTAATAAGCAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTAAC
127 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * *
19891461 TTAATAAGTTCAAATAG-TTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTT
1 -AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * *
19891525 GCTTTGTGATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* *
19891589 ATTAATATTC-AACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATC
129 ATTAATATTCTAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * * *
19891644 GAATAAGTTTAAATAG-TTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
** *** * *
19891708 TTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-GGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
19891772 TTAATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATT
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * * * * **
19891825 GAATAAGTCCAAATAG-TCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
** * * * * * *
19891889 TTTCATTATAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAAGCTTATTCGAAACAAAATAATATTAATTTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * *
19891953 TTGATATCCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTATTTATC
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * *
19892006 GAACAAGTTTAAATAG-TTATGACTATCTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-ATGTTT
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTT
* * *** *
19892069 GTTTTGTCGT-AAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTTTAACAAAATAATA-TAAATTT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * **
19892132 ATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAGAA-ATTAAAAAAAATAAATCTATTTTTT
129 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAAAAAATAAATCT-GTTTAC
* * * *
19892186 GAACACGTTCAAATAGTTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTG
1 AAACAAGTTCAAATAGTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* *
19892250 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
19892315 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAAATGTGTTTATT
131 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * * * *
19892367 GAATAAGCTCGAATAG-TTATGA-TAGTTTAAATAATTATTTATTTTGAAAT-GTTATGATCTTT
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* * * * * *
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* ** * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * **
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* * * ** * * *
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* *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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** * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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** * *
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* * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* ** *
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* * **
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* * * ** * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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129 TTAGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAATTTAAAAATAAATA
* *
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* * * * *
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* * **
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* * *
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* ** *
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* * *
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*
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TTTACCGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACC
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ATTAAAAACATTCCAAAATTAATAAATAAATGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACCAGTT
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AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAACTTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAACATTTATA
AAATTAATAGGCAAGAA
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*
19891863 CTATTTCAAATCATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
19891880 AATATTTTGT
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19890406 TAAAAGCTTG
* * * *
19890416 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTC-TCATAAAATAATTGT-TTTTTAT
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* * * * * * **
19890478 CATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATCAATACGTAGGA
63 CATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * *
19890543 GATTGAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAAGC-AGTTCAAATACTTATGAA-TATTTGAACAATTA
126 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-CAAGTTTAAATAGTTAT-AACTATCTGAAAAATTA
* ** * *
19890605 TATATTTCAAATTGTTAT-AACCT-TTTGTTCTGTCATAAACCAATT-ATTTTTG-TTCATACAA
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** * * * * * *
19890666 GCTTATTCAGAATAAAATAATGCT-AATGTAATAATATT-C---A--GAA-AAGTAAG-AACTAA
249 GCTTATTTGGAACAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGAAATTAA
* * ** * * * * *
19890722 GAAAAATAAATTTGTTTGCTGAGCCAGTTCAAATAGT--TAAGGCTATATG
313 -AAAAATAAATATATTTATTGAACAAGTCCAAATAGTCATAA--CTATTTA
* * * * * * * * * *
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* ** * * * * *
19890832 CTTACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAG
63 CATA-TAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
19890896 AGATTTAAAAAATAATTATATTT-GCTAAACCAA-TTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTA
125 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-CAAGTTTAAATAGTTATAACTATCTGAAAAATTA
* * * * * * * * *
19890959 TCTATTTCAAATCGTTATG-ACGTATTGTTTTATCAT-AAACAAATGTTTTTATTCAAATAAGTT
188 TCTATTTCAAATCATTATGAATGT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTTGATTCATACAAGCT
* * * * * * ** *
19891022 TGTTCGGAATAAAGTAATATTAATTTATTAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATT-AAAA
252 TATTTGGAACAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGA-AATTAAAAA
* * * * * ** * * * *
19891086 AATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTTAATTAAT-TTAACTATTTG
316 AATAAATATATTTATTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTA
* * * * * *
19891130 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCA-TTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTATTCA
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* * * * **
19891194 TAT-AGTCTTATTCTGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATACTCTAAAAATTAATAAGTAATGG
65 TATAAG-CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCCAAAAATTAATAAGTAAAAG
* * ** * * ** * * * *
19891258 ATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTTATGA-T-TGTTAAACAATTATG
127 ATTTAAAAAATAAATCTATT-TATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATCTGAAA-AATTATC
* * * * * *
19891320 TACTTCAAATCATTAT-AACCT-TTTGTTTTATCACAAAACAATTGGTTATG-TTCGTACAAGTT
190 TATTTCAAATCATTATGAA--TGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATT-TGATTCATACAAGCT
* * * * ** * * *
19891382 TATTTGAAATAACATAAGTCTAACA--TATTAATATTCTGAAACTTAATAAGCAAGAGATTAAAA
252 TATTTGGAACAAAATAA-TATAA-ATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGAAATTAAAA
* * * * * * * * * *
19891445 AAATGAATCTGTTAACTT-AATAAGTTCAAATAGTTATGACCATTTG
315 AAATAAATATATTTA-TTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTA
* * * * * * * *
19891491 AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGCTTT-GTGATAAAATAATTTTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACATTTTG-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCA
* * * *
19891555 TACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAACCAATTAATAAGTAAAAGA
65 TATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCCAA-AAATTAATAAGTAAAAGA
* * * *
19891620 TTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTA
128 TTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATCTGAAAAATTATCTA
* ** * * * *
19891685 TTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTGGTTCATACAAGCTTATTT
192 TTTCAAATCATTATGAATGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTTGATTCATACAAGCTTATTT
** * ** * **
19891750 GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAA
257 GGAACAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAA
* *
19891815 TATGTTTATTGAATAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTA
322 TATATTTATTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTA
* * *
19891854 AATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAATATTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATC-AGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTC
* * * * *
19891917 ATATAAGCTTATTCGAAACAAAATAATATTAATTTATTGATATCCTAAAAATTAATGAGTAAGAG
64 ATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCC-AAAAATTAATAAGTAAAAG
* * *
19891982 ATTTAAAAAATGAATTTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAAAAATTATCTA
127 ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATCTGAAAAATTATCTA
* * *
19892047 TTTCAAATCATTTTGAATGTTTGTTTTGTCGT-AAACAATT-ATTTCTATTCATACAAGCTTATT
192 TTTCAAATCATTATGAATGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT-GATTCATACAAGCTTATT
**
19892110 TTTAACAAAATAATATAAATTTATTAATATTCC-AAATATTAATAAGT-AGAAATTAAAAAAAAT
256 TGGAACAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAT-TTAATAAGTAAGAAATT-AAAAAAAT
* * * * ** * *
19892173 AAATCTATTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTG
319 AAATATATTTATTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTA
* * * ** * *
19892215 AACAATTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCAT
19892280 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
66 ATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * ** * * *
19892345 TTAAAACATAAATGTGTTTATTGAATAAGCTCGAATAGTTATGA-TAGT-TTAAATAATTATTTA
129 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTA-TCTGAAA-AATTATCTA
* * * * * * **
19892408 TTTTGAAAT-GTTATG-ATCTTTTATTTTATCATAAAA-AATTG-TTTATATTCATACAAATTTA
192 -TTTCAAATCATTATGAAT-GTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT-GATTCATACAAGCTTA
* * * ** * * * * *
19892469 TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTGTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAA
254 TTTGGAACAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGAAATTAAAAAAA
* * * * * * * * *
19892533 TAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTAATATCCAATTTG
318 TAAATATATTTATTGAACAAGTCCAAATAGTCATA-ACTATTTA
* * * * * * * * *
19892577 AACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTAT-TTT-GTAATAGAATAATTGTTTCTTTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-AACATTT-TGTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTC
** * * *
19892639 ATATAAGCTTATTTTGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
64 ATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
19892681 AAAAATAAAT
Statistics
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Consensus pattern (360 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCAT
ATAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATCTGAAAAATTATCTATTTC
AAATCATTATGAATGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTTGATTCATACAAGCTTATTTGGAA
CAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAATATA
TTTATTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTA
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* *
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* * ** * *
19892858 TAAAAAATACATATGTTCACCGAACAATCTCAAATAGA-TATGACTATTTGACCAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAGT-TCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * * *
19892922 TAAAATCGTTATGGCCTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATAAAAACTTATTCAA
64 TCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGA
* *** *
19892986 AATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTTTGAAATTATTAAGTAAGAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT
* * * * * * *
19893038 TAAAAACTAAA-ACTATTT-TTCATACTAGTTCAAATAGTTATGA-TCATTTGAAAAAATATCAA
1 TAAAAAATAAATA-TGTTTATTGA-AC-AGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTA
* * *
19893100 TCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT--ATGATCATACAAGCTTAT
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* *
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125 TCGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATT
* * * * ** ** * *
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1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTG-AACAATTATCTATT
* * * * * *
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* * * * *
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127 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT
* * * *
19893398 TAAGAAAGTAAA-ATTGTTTATTGAACAAGTTAAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTAT
1 TAA-AAAATAAATA-TGTTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
19893462 TTAAAAACGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA
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* *
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* * * *
19893580 TAAAAAAATAAATCA-GTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTAT
1 T-AAAAAATAAAT-ATGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * **
19893644 TTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATT
63 TTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATACAAGCTTATT
* *
19893707 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGT---AAGAGATT
126 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATT
* * * ** * *
19893758 TAAAAAATAAATCTATATGCTGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGGACAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** * *
19893823 CAAATTGTTAT-AACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTAATTAG
65 CAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTT-ATTCG
* * * ** * ** * *
19893887 -AATTAAAT-ACACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTCATGACTAAAAAATT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGAAGAGATT
* **** * * * *
19893938 AAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACCAATTCAAACT-GTTAAGACTATATGAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAGTTCAAA-TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * * * *
19894002 TCAAATCATTATGACCTTTTGTGTTGTTGTAAAACAATTATTTCAGCTT-ATACAAGTTTATTTG
64 TCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
19894066 AAATAAAATAAAAATAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAGGTAAGAGATT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT
* * * * ** * * * *
19894119 TGAAAAATAATTCTATTTACAGAACTAATTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * ** * * * * *** * * **
19894184 CAAATTGTTATTATTTTTTGTTTTATCACAAAACGATTATTTTTGTTCATATAAGTTTGCTCGAA
65 CAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAA
* * * *
19894249 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGTAAGCGATT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT
** *** * * *
19894300 TAAAAGGTAAAT-TAGTTTACCAAACTATTTCAAATAATTTTGACTATTTGTAATAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATAT-GTTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTG-AACAATTATCTAT
* * * * * * * * ** * * ** *
19894364 TTCAAATCATTATAAAATTTTATTTGGTCATCAAATAATTGGTTCTGTTTATACTATTTTATT-T
63 TTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCG
* * ** * * * * *
19894428 AGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGAAACTTAACAACCAAGAAAAT
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATT
* ** * * * * ** * * *
19894482 TAAAAAATAAATCTAATTGTCGAACCAGTTCAACTAGTTAAAACTATATGAACGATTATCAATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
19894547 GAAATCATTATGACCTTTTG--TTGTCATAAAATAA-----TC--TT--T------TT-GT-GGA
65 CAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAA
* * * * * *
19894593 TTAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAGGTAAGAGATT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT
* * ** * ** * * * *
19894644 TAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCATATGGTTAAGACTATTAGAACAATGATATATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
19894709 CTAATCATTCT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTCGA
65 CAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGA
* * *
19894773 AATAAGATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGATATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATT
* * * * * * * ** *
19894825 TAAAAGAATAAATCTTTTTACTGAATAAATTCAAGTAGTTATTTCTATTTGAACAATTGTCTATT
1 TAAAA-AATAAATATGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * * *
19894890 TAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-AAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTATACTA
64 TCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGA
* * * *
19894954 AATAAAATAAT--T--GTAATT--TATTTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT
* * *** * *
19895000 TAAAAAATAAATTTTTTTACCAAATCAGTTAAAATAATTATG-GTGATTTGAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATT
* * **
19895064 TCAAATCATTATGAACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTC
64 TCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT-TCATACAAGCTTATTC
* * *
19895128 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACATGATT
127 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGA-GATT
*
19895182 TAAAAAATAAATGTGTTTATCT-AACCAGTTCAAATA
1 TAAAAAATAAATATGTTTAT-TGAA-CAGTTCAAATA
19895218 GTTTAAAATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (179 bp):
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TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATT
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* * * * * * * *
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* * * * *
19892760 TTTTATTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
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* *
19892825 TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAGATTTTAAAAAATACATATGTTCACCGAACAATCTCA
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* * **
19892890 AATAGATATGACTATTTGACCAATTATCTATTTAAAATCGTTATGGCCTTCTGTTTTGTCATAAA
193 AATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAACGTTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAA
* * ***
19892955 ACAATTGTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTTTGAA
258 ACAATTGTTTAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
19893020 ATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTCATACTAGTTCAAATAGTTATGATCAT
323 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTAGTTTACATAATAGTTCAAATAGTTATGACCAT
* ** * *
19893085 TTGAAAAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTATGATC
388 TTGAAAAAATATCAATCTCAAATCGTTATGACCTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTTTATCAAC
*
19893150 ATACAAGCTTATTCGAATAACAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAG
453 ATACAAGCTTATTCGAATAACAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT-ATAAGGAAGAG
* *
19893215 ATTTAAAAATAAATGTATT
517 ATTTAAAAATAAATCTATA
** * *
19893234 TGTCGAATCAGTTCAAATGGTTAAAACTATTGAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATAACCTT
1 TGTCGAATCAGTTCAAATAATTAAAACTATTGAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* *
19893299 TTGTTTATTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTAGTCGAAATAAATTAATGCTAATT
66 TTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTAGTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * **
19893364 TATTAACATTTAAAAAATTAATAAGCAAGCGA-TTTAAGAAAGTAAA-ATTGTTTATTGAACAAG
130 TATTAACATTCAAAAAATTAATAAG--A--GATTTTAA-AAAATAAATA-TGTTCACCGAACAA-
* * *
19893427 T-TAAAATA-ATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAACGTTATGAACTTTTGTTTTGT
188 TCTAAAATAGA-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAACGTTATGAACTTCTGTTTTGT
* * * *
19893490 CATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATATTACTA-TTTCTGTAATA
252 CATAAAACAATTGTTT-AATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAGTTTAT-TAATA
*
19893554 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATC-AGTTTAC-TGAATCAGTTCAAATA
315 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAACTAGTTTACAT-AAT-AGTTCAAATA
* * * * * * * *
19893617 GTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA
377 GTTATGACCATTTGAAAAAATATCAATCTCAAATCGTTATGACC-TTTGTTTCATCATAAAAAAA
* * *
19893682 TTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-
441 TTGTTTATCAACATACAAGCTTATTCG-AATAACAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
*
19893745 T-T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATA
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* ** * **
19893775 TG-CTGAA-CTAGTTTAAATAATTATGACTATTTG-GACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
1 TGTC-GAATC-AGTTCAAATAATTAAAACTA-TTGAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
*
19893837 TTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCT-GTTCATACAAG
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19893878 TTTAATTAGA
Statistics
Matches: 544, Mismatches: 77, Indels: 42
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (535 bp):
TGTCGAATCAGTTCAAATAATTAAAACTATTGAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
TTGTTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTAGTCGAAATAAAATAATACTAATTT
ATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAGATTTTAAAAAATAAATATGTTCACCGAACAATCTAAAAT
AGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAACGTTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACA
ATTGTTTAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATT
AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTAGTTTACATAATAGTTCAAATAGTTATGACCATTTG
AAAAAATATCAATCTCAAATCGTTATGACCTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTTTATCAACATA
CAAGCTTATTCGAATAACAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTATAAGGAAGAGATTT
AAAAATAAATCTATA
Found at i:19894181 original size:720 final size:709
Alignment explanation
Indices: 19892759--19895193 Score: 2108
Period size: 720 Copynumber: 3.4 Consensus size: 709
19892749 TCATTTTGAC
* * * * *
19892759 CTTTTATTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATCCGAAATAAAATAATACTA
* * * *
19892824 ATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAG--AGA-TTTTAAAAAATACA-TATGTTCACCGAA-C
66 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACCGAATC
* * * * ** *
19892883 AATCTCAAATAGA-TATGACTATTTGACCAATTATCTATTTAAAATCGTTATGGCCTTCTGTTTT
129 AGT-TCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
*
19892947 GTCATAAAACAATTGTTTAGTTCATA-A-A-AA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATT
192 GTCATAAAACAATTGTTT--TTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
19893008 AATATTTTTGAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTCATACTAGTTCAAAT
254 AATA-TTTTCAAATAATT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATATGTGA-ACTAGTTCAAAT
* * * * *
19893073 AGTTATGA-TCATTTGAAAAAATATCAATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAAA
316 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTGTCATAAAAT
* * *
19893136 AATTGTTTATGATCATACAAGCTTATTCGAATAACAATA-ATGCTAATTTAATAATATTTCAAAA
379 AATT-TTT-TG-TCATACAAG-TTATTAGAATTA-AATACA--CTAATTTAATAATATTTTAAAA
* * * * * *
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* * * *
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501 G-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTGTT-ATAAAACAATTATTTTAGTTC
* * * * * *
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564 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAG
* * * * *
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**
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* * * * * *
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1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATCCGAAATAAAATAATACTA
* * *
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66 ATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTAGTTTACCGAATC
* * * ** * **
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**
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * ** *
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* * * ** *
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* * * ** * *
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* * * * **** * ** * * * *
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* ** ** * * * *
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** * * * * *
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* * *
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* * * *
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446 AAGAGA-TTAAAAAATAAATATATTTGCCGAACCAGTTCAAATGGTTAAGACTATT-GAACAATT
* * * * * * *
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* *
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* * * ** * *
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* *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * *
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* * *
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*
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ATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTGTCATAAAATAATTTTTTGTCA
TACAAGTTATTAGAATTAAATACACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTAA
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** * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* *
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** *
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* * * ** * *
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19896272 GAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
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* * * * *
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* ** * * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * * *
19897056 ATCATAACTATTTGAACTCGCTT-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTT-TACGTATTAATT
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* * * *
19897119 TTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCAAATAAGCTTTTATGAACA
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
19897300 TGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTGTTCAAAATAAGCTTGCATGAATA
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19897352 G-AACTAATTCTTTCATGGCAAAACAAAATGTCATAATTTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATA
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* ** * * * *
19897416 ATCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTCT-TTTTTT-AATTCTCTTACTCATTAATT
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* * * * * *
19897479 TTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAGTTC-AAACAAACTTATATGAACT
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* * * *
19897662 TTGAAATATTAATAAATTAGTGA-TATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATA
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*
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* * * * * ** * * *
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* * * ** *
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66 TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATT-TATTTTTTAAATTT-TCTACTTATTAATTT
* * * ** * * **
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* * *
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* * * * * * *
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1 AAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * *
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* * * *
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*
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* *
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* * * *
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** *
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* * * * * *
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1 AAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
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* ** * *
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* * * *
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193 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTG
* ** * * *
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*** ** *
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*
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * *** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 AAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
19897599 CATGACCATCTGAACTTG-TT-TAGCAAATATATTTATTTTTTAAAATCT-TTCACTTATTAATT
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* * *
19897661 GTTGAAATATTAATAAATTAGTGA-TATTTTAATCC-AAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATT
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* * * * * * * * * *
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* * * *
19897788 ATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTATATCTTT-TACTTATTAATTGTCTT--AAT
252 ATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATTAATT-T-TTGAAAT
* ** * *
19897850 ATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAG
314 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAA-TG
* * * ** * *
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1 -AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
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65 CATAACTATTTGAA-TTGATTCTGA-AAACAAATT-TATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT
* * * * * * * *
19898022 TTCAGATTATTAATAAATTAATATTATTTTATTCC-CAATGAGCTTATATGAATTGAAATAATTC
126 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTG
*
19898086 TTTTATGACAAAATAAAAGGTCA
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
19898109 AGATTATTTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (359 bp):
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GTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATG
Found at i:19896500 original size:543 final size:543
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * ** *
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* * * * * * *
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* * ** *
19895623 CTATTTGAATT-AGTTTGGTAAA-TAGATTTACATTTTAAA--TCC-CTTATTAATTTTTAAAAT
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* * * * * * * * *
19895683 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTGTTTTACGAT
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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** * *
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*
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* * * * *
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* * *
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* * * **
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*
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* * * * * *
19896453 TGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
1 TGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
19896518 GTCTTAACAATTTGAATTGGTTCAGTAAACACATTAACTTTTT-AAATCTCT-TACCTATTAATT
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* * ** * * * *
19896581 TTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCTAATAAGCTTGTATGAATAG-AAATAATTG
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* * * *
19896645 TTTTATGACAAAAC-GAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
196 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-
* ** * *
19896709 TTTGAATTGATTTTG-TAAACAAATTT-TGTTTTTCAATCT---CTTATTAA-TTTTCAACATAT
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* * * *
19896768 TAATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAA-TTTTGAATGAA-TAAAAACAGTTGTTTTATGAC
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* * * *
19896830 AAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTT
384 AAAACAAAAGATCATAA-GATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT
* * ** ** *
19896894 ATTCTG-TAAAAAAATTATTTAATTAAATCTCAAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
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* * * *
19896958 GTATTATTTTATTTCAAATAAACCTGTACGAA-
511 GTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
* * * * *
19896990 TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAATTTGAAATA-AGTAATTGTTTAAA
1 T-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAA
* * * * * * *
19897054 TAATCATAACTATTTGAACTCGCTT-GGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTT-TACGTATTA
64 TAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCAGTAAACATATTTACTTTTTAAAATCTTTCTACTTATTA
* * * * *
19897116 ATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCAAATAAGCTTTTATGAACAG-AAACAA
128 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATAA
* * *
19897179 TGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAA
193 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * ** * *
19897243 TTATATGAATGTGTTCA-GA-AAACTTATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTCTTGGAAT
257 CTATTTGAAT-TGAT-ATGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCACTTATTAATTTTTGAAAT
* *** * *
19897306 ATTAATAAATTTAA-ATTATTTTGTTCAAAATAAGCTTGC-ATGAA-TAGAACTAATTCTTTCAT
320 ATTAATAAA-TTAATATTATTTTATTTTGAATAA-CTT-CTATGAACTAAAAC-AATTCTTTTAT
* ** * * *
19897368 GGCAAAACAAAATG-TCATAATTTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAATCATAACTATTTGAA
381 GACAAAACAAAA-GATCATAA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * * * * * *
19897432 CTTATTCGGTAAATAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAAT
444 CTTGTTCGATAAATAAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT
* * *
19897497 TAGTATTATTTTAGTTCAAACAAACTTATATGAAC
509 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
* * * * *
19897532 TGAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
1 TGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * *
19897597 GTCATGACCATCTGAACTTGTTTAGCAAATATATTTATTTTTTAAAATCTTTC-ACTTATTAATT
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* * * *
19897661 GTTGAAATATTAATAAATTAGTGA-TATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATA-AAAACAATT
131 TTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATAATT
* * * * * * * *
19897724 GTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACA-AGTTAAAATAAATAACTGCAT-AAATAATCATAAC
195 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAAC
* * **
19897787 GATTTGAACTT-AT-TCGATAAACAT-ATTTATTTTTTATATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--
258 TATTTGAA-TTGATAT-GATAAAC-TGATTTATTTTTTAAATC-TCCACTTATTAATT-T-TTGA
** * *
19897847 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTCTTTT
317 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAA-CTTCTATGAACTA-AAACAATTCTTTT
* * * * * *
19897910 ATAACAAAACAAAA-AGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTA
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* * * * *
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504 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
* *
19898075 TGAAATAATTCTTTTATGACAAAATAAAAGGTCA
1 TGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
19898109 AGATTATTTG
Statistics
Matches: 1765, Mismatches: 345, Indels: 174
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
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540 244 0.14
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545 4 0.00
546 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (543 bp):
TGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTACTTTTTAAAATCTTTCTACTTATTAATT
TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATAATTG
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAATTGATATGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
AAATTAATATTATTTTATTTTGAATAACTTCTATGAACTAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAA
AAGATCATAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAA
ATAAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
ATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
Found at i:19897119 original size:900 final size:898
Alignment explanation
Indices: 19895548--19897957 Score: 1995
Period size: 900 Copynumber: 2.7 Consensus size: 898
19895538 AATTTGTACA
* * * * * * * *
19895548 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCA
1 AATAGAAATAATTATTTCATGACAAAACAAAAT-GTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* ** * * ** * * * * *
19895612 AATTGTTATAACTATTTGAA-TTAGTTTGGTAAATAGATTTACATTTTAAATC-C---CTTATTA
65 GATAATCATAACAATTTGAACTTA-TTCAGTAAACACATTAACTTTTTAAATCTCTTACTCATTA
* ** * * *** * ** *
19895672 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAACAAACTTATATAAACAAAAACATT
129 ATTTTTAAAATATTAGTAAATTAGCAATATTTTACTCCAAACAAACTTATATGAACTGAAACAAT
* * * * * * ** *
19895737 TGTTTTACGATAAAATAAA-ACGTCATAAT-AGTTTGAAATAGATAATTACTCATACAACCTTAA
194 TGTTTTATGACAAAAGAAAGA--TCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * *
19895800 CTA-TTTAAATTGATTCTGCAAAAAAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATA
256 CTATTTTGAATTGATTTTG-TAAACAAATTT-TGTTTTTCAATCTC----TTATTAATTTTCATA
* * * * *
19895863 ATATTATTAGATTAGTATTATTATATCCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATG
315 ATATTAATAAATTAGTATTATTATATCCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
19895928 ATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATGATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
380 ACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATAACTATTTAAACT
* * * * * * *
19895993 GGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
445 GATTCGGTAAGAAAAATTATTTTTAAAATTCTCAAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
** * * * *
19896058 GTATTATTTTATTCAAAATAGGCTTATATGATGGAAAATAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAAAT
510 GTATTATTTTATTCAAAATAAACCTATACGATAGAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAT
* * *
19896123 CATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCAATAATTATTTGAATTGATATGATAAACTG
575 CATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAATCGATATGATAAACTG
* * *
19896188 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT
640 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACGTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTC
*** * * * * * *
19896253 TGGATAA-CTTCTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCAAAACGATTTTAA
704 CAAATAAGCTTCTATGAACAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAA
*
19896317 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTC-GATAAA-TAGATTTATTTTTT
769 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATATGAA-TGTGTTCAGA-AAACT-GATTTA--TTTT
* * * * *
19896379 TAAACTTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA-AAAGTATTATTTTATTTC-AAATAAG
829 TAAAATTCTTACTTATTAATTCTTGGAATATTAATAAATAAA--ATTATTTT-GTTCAAAATAAG
*
19896442 CATATATG
891 CATACATG
* *
19896450 AACT-GAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT
1 AA-TAGAAATAATTATTTCATGACAAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-
* * *
19896514 A-ATAGTCTTAACAATTTGAA-TTGGTTCAGTAAACACATTAACTTTTTAAATCTCTTAC-CTAT
64 AGATAATCATAACAATTTGAACTT-ATTCAGTAAACACATTAACTTTTTAAATCTCTTACTC-AT
* ** * * * * *
19896576 TAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCTAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAT
127 TAATTTTTAAAATATTAGTAAATTAGCAATATTTTACTCCAAACAAACTTATATGAACT-GAAAC
* *
19896640 AATTGTTTTATGACAAAACG-AAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
191 AATTGTTTTATGACAAAA-GAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
19896704 ACTATTTTGAATTGATTTTGTAAACAAATTTTGTTTTTCAATCTCTTATTAATTTTCA-ACATAT
255 ACTATTTTGAATTGATTTTGTAAACAAATTTTGTTTTTCAATCTCTTATTAATTTTCATA-ATAT
** ** * *
19896768 TAATAAATTAGTATTATT-TATTTTGAATAATTTTGAATGAATAAAAACAGTTGTTTTATGACAA
319 TAATAAATTAGTATTATTATATCCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
19896832 AACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTATT
384 AACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATT
*
19896897 CTGTAA-AAAAATTATTTAATT-AAA-TCTCAAAATTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTA
449 CGGTAAGAAAAATTATTT--TTAAAATTCTC-AAATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA
* *
19896958 GTATTATTTTATTTC-AAATAAACCTGTACGAATAG-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
510 GTATTATTTTA-TTCAAAATAAACCTATACG-ATAGAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
* * * * *
19897021 ATTATAACA-ATTTGAAATA-AGTAATTGTTTAAATAATC-ATAACTATTTGAACTCGCT-TGGT
573 ATCATAA-AGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAAT-AGCAATAACTATTTGAA-TCGATATGAT
*** * * * *
19897082 AAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACGTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTAT
634 AAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCCAACGTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTAT
* * * *
19897146 TTTTTCCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
698 TTTTTCCAAATAAGCTTCTATGAACAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAA
* * * *
19897211 TTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATATGAATGTGTTCAGAAAACTTATTTATTT
763 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATATGAATGTGTTCAGAAAACTGATTTATTT
* *
19897276 TTAAAATTTTTACTTATTAATTCTTGGAATATTAATAAATTTAAATTATTTTGTTCAAAATAAGC
828 TTAAAATTCTTACTTATTAATTCTTGGAATATTAATAAA-TAAAATTATTTTGTTCAAAATAAGC
* *
19897341 TTGCATG
892 ATACATG
* * * * **
19897348 AATAGAACTAATTCTTTCATGGCAAAACAAAATGTCATAATTTTTTGAAATAGATAATTATTCAG
1 AATAGAAATAATTATTTCATGACAAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAG
* * * * *** *
19897413 ATAATCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAAT
66 ATAATCATAACAATTTGAACTTATTCAGTAAACACATTAACTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAT
** * * * *
19897478 TTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAGTTCAAACAAACTTATATGAACTGAAACAATTG
131 TTTTAAAATATTAGTAAATTAGCAATATTTTACTCCAAACAAACTTATATGAACTGAAACAATTG
* * * * *
19897543 TTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACCA-
196 TTTTATGACAAAAG-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
19897607 TCTGAACTTG-TTTAGCAAATATATTTAT-TTTTTAAAATCTTTCACTTATTAATTGTTGA-AAT
260 TTTGAA-TTGATTTTGTAAACAAATTT-TGTTTTT-CAATC--T--CTTATTAATT-TTCATAAT
* * * * *
19897669 ATTAATAAATTAGTGA-TATTTTAATCC-AAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG
317 ATTAATAAATTAGT-ATTATTAT-ATCCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
19897732 ATAAAACAAAA-AGTCATAACAAGTTAAAATAAATAACT-GCAT-AAATA-ATCATAACGATTTG
380 ACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAGC-TCAAATAGA-CATAACTATTTA
* * * * * * ** *
19897793 AACTTATTCGATAA-ACATATTTATTTTTTATA-TCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTA
441 AACTGATTCGGTAAGA-AAAATTATTTTTAAAATTC-TCAAATTATTAATT-T-TTGAAATATTA
* ** * * * * * * *
19897854 ATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTCTTTTATAACAAA
502 ATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAACCTATACG-ATAGAAAATAATTGTTTTATGACAAA
* * ** * *
19897918 ACAAAAAGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTATTCAAA
566 ACAAAAAATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
19897958 CAGTCATAAT
Statistics
Matches: 1216, Mismatches: 227, Indels: 128
0.77 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
897 6 0.00
898 242 0.20
899 75 0.06
900 364 0.30
901 50 0.04
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907 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (898 bp):
AATAGAAATAATTATTTCATGACAAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAG
ATAATCATAACAATTTGAACTTATTCAGTAAACACATTAACTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAT
TTTTAAAATATTAGTAAATTAGCAATATTTTACTCCAAACAAACTTATATGAACTGAAACAATTG
TTTTATGACAAAAGAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
TTGAATTGATTTTGTAAACAAATTTTGTTTTTCAATCTCTTATTAATTTTCATAATATTAATAAA
TTAGTATTATTATATCCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
GATCATAACGATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGGTAAG
AAAAATTATTTTTAAAATTCTCAAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
TTCAAAATAAACCTATACGATAGAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAAAGATTT
GAAATAGATAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAATCGATATGATAAACTGATTTATTTTTT
AAATCTCCAACGTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTTTCCAAATAAGCTTC
TATGAACAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTAT
TCAAATAGTCATAACTATATGAATGTGTTCAGAAAACTGATTTATTTTTAAAATTCTTACTTATT
AATTCTTGGAATATTAATAAATAAAATTATTTTGTTCAAAATAAGCATACATG
Found at i:19898552 original size:175 final size:178
Alignment explanation
Indices: 19898245--19898691 Score: 456
Period size: 175 Copynumber: 2.5 Consensus size: 178
19898235 ATAAGAAAAA
* * ** *
19898245 CAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTC-AATAGTCATAACTATTTAAACTAATTTG
1 CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGGTTAG
* * * * * * *
19898309 ATAAATATATTTATTTTTTAAATATTTTATTAATATTCAAAATATTAATAGATTAGTATTAATTT
66 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATATTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTT
* * * * *
19898374 ATTCCAAACAAACTTA-TATGAA-CAAACACATTTGTTTTATCAC-AA-
131 ATTCCAAACAAAC-TAGTATGAATCAAAAAAACTTATTTAATCACAAAG
* * * * *
19898419 TAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTAATAATTATTTAAACCGGTGAG
1 CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGGTTAG
* * *** * * *
19898484 GTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTGTTTTATTTT
66 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATATTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTT
* ** *
19898549 ATTCCAAATAGGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTAATGACAAAG
131 ATTCCAAACAAACTAGTATGAA-TCAAAAAAACTTATTTAATCACAAAG
* * * * * *
19898598 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTAG
1 CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGGTTAG
*
19898663 GCAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTCTTA
66 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTCTTA
19898692 GTTATTAATT
Statistics
Matches: 220, Mismatches: 46, Indels: 9
0.80 0.17 0.03
Matches are distributed among these distances:
174 36 0.16
175 87 0.40
177 15 0.07
178 10 0.05
179 72 0.33
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGGTTAG
GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATATTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTT
ATTCCAAACAAACTAGTATGAATCAAAAAAACTTATTTAATCACAAAG
Found at i:19898906 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19898113--19899363 Score: 764
Period size: 181 Copynumber: 7.0 Consensus size: 180
19898103 AGGTCAAGAT
* * * * ** * * * * * *
19898113 TATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTAAAAATTTTTTACTTAATAAATGTTGAAATAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * **** * * * *
19898178 TAATCAATTAGTATTGTTTTA-ACCAAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAAGAA
66 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTAT--GAC
* * * ** * *
19898242 AAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCA-ATAGTCATAAC
129 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAA
* ** * * * * **
19898293 TATTTAAACTAATTTGATAAATATATTTATTTTTTAAA--TATT--TTATTAATATTCAAAATAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * *** * * * * * * *
19898354 TAATAGATTAGTATTAATTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAACACATTTGTTTTATCAC-A
66 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * ** * ** *
19898418 ATAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTAATAAT
131 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAA
* *** ** * * * *
19898468 TATTTAAACCGGTGAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA-CTA--ATTTTTTG-AATAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * *** * * * *
19898529 TAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAGGCTAGTATGAATTCAAAAA-AACTTATTTAATGA
66 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAAACAA-TTGTTTTATGA
*
19898593 CAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAA
128 CAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAA
** *
19898647 TATTTGAACTGGTTAGGCAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTCTTAGTTATTAATTTTTGA-AAT
** *
19898710 ATTATTGGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGAC
64 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * ** * * *
19898775 ATTACAAAGGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTATTCAAATAGTCATAAAA
129 A-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTC-TTAAA
* * * * * * *
19898829 TATTTGAACTAATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATAATTATCAATTTTTGAAAGAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
*** * * * * *
19898894 TATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATG-TTCAAATACAATTATTATATGACC
66 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGA-C
* * * * * * * * * *
19898958 AAACAAAAGGTAATAATGGTATGAAGTAGATAATTATTGACATGGCCATAAT
129 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAA
* ** * *
19899010 TATTTGAACTAATTTGGTAAACTGATTTACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * *
19899071 TAATAAATTCTTATTATTATTTTATTTTGAATGAGCTTGTATAAACT-AAAACAATTGTTTTAAG
66 TATTAAA---TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATG
* * *
19899135 ACAAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCATATAGT-TTAAC
127 AC--AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAA
* * ** * * *
19899190 TGTTTGAATTGCTTCGGCAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATAT
1 TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
*** * * * * *
19899255 TATTAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGTTTATATGAACT-AAAACAATTATTTTATAATA
66 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACA
* ** * * *
19899319 GAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATTATTGTTCAAATAG
130 -AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAG
19899364 GAACTGGTTT
Statistics
Matches: 835, Mismatches: 201, Indels: 70
0.75 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 37 0.04
175 77 0.09
176 35 0.04
177 68 0.08
178 15 0.02
179 76 0.09
180 140 0.17
181 170 0.20
182 144 0.17
183 48 0.06
184 25 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TATTTGAACTAATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAA
ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAA
Found at i:19899840 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 19899530--19907821 Score: 2980
Period size: 181 Copynumber: 45.8 Consensus size: 179
19899520 AACTGACTTA
* * * * * *
19899530 TTTTTTAAATGTCTAACTTATCAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTACTTTAG-
1 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGA
* * * * **** *
19899593 ATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATGTTTATTTTAAATA
63 ATAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
*
19899658 GATAATTGTTCAAATAG-CTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
127 GATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
** * *
19899711 TTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * *
19899776 AAATATATATGAACTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGA
65 AACT-TATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
** * * * * * *
19899841 TAATTATTTTAATAGTCTTAATTATTTGAACTAG-CT--CAACAA-ATTCATT
129 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATT-A-T
* * * * * * **
19899890 TATCTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATATTTTGCTTCGAA
1 T-T-TTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * *
19899952 TAAGCTTGTATGAA-TATAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGATTATAACGATTT-AAGAT
64 TAA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA-AT
* * *
19900015 AGATAATTATTCAAATAATCA-AACTATTAGAA-TTGGTTTGATAAAAAGATT-T
126 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * * *
19900067 AGTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTTTGAA
1 -TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * *
19900128 TAATTTTGTATGAACAGAAACAATTTTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAG
64 TAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * *
19900193 ATAA-TAGCTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTCGGTGAACAA-ATT-T
128 ATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT-AAAAAGATTAT
*** * * * *
19900244 ATTTTTTAAATATCCAACTTATTAATTTTTAGACTATTAATAAATTATTAGTATTTTATTTCAAA
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* * ** *** *
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64 TAA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-----AAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * *
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122 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * * *
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64 TAA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-GAAAT
* * ** * *
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126 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGAT-TAT
* *
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** * * * * *
19900672 ATAAGCTTGCATGAGC--AAAGCCAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATATTTTGAAA
63 ATAA-CTTATATGAACTGAAA--CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* ** * * * *
19900735 TAAATAATTGCTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAT
125 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATT-AT
* * *
19900791 TTTTTT-AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
1 TTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* ** *
19900855 TAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAG
64 T-AACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * *
19900920 ATAATTATTCAAATAGTTAAAGACTATTTGAACTTG-TT--AAAAAAGCA-TAT
128 ATAATTATTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAG-ATTAT
* * * * * *
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1 T-TTT-TTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTCG
* * * *
19901034 AATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAGAATTTTAAAT
62 AATAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * *
19901099 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-AACTTGAACTTGTTTGGTAAACAA-ATT-T
126 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-AAGATTAT
* * *
19901151 ATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTCTT-TAA-GTTAATAAATTTGTATTATTTTATTT-G
1 -TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* ** * ** * * * *
19901213 AAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGATAAAA-AAAAGGTTATAGCAATTTCAAA
62 -AATAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * ** *
19901277 -ATGATAATTATTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGACAAACAGATTCA-
125 TA-GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATT-AT
* * * * * *
19901332 TTTTTTAAA--TCT-CTTATTAAATTTTATAATATTAATAACTTAGTATTATTCTATTTTGAATA
1 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * *
19901394 AGCCTATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTG---TACAT
66 A-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * ** * *
19901456 AATTATTCAAATAGTAATGACTATTT-AATCTAGTTCAGT--AAACATTTT
130 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * * *
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1 T-TTTTT-AAA-TTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * * * *
19901568 ACTAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAGTTGTTTTATAACAAAACTATTTTAA--TCCT-ACTAAGC
62 AATAA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-A---AAAGGTCATAAC-AA-T
* * * **
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119 TTG-A--AATAG--ATAA-----TTAT-TC---A-AAT-AGTCATAACT-ATTTGAACT---TGT
* * *
19901693 TTGCTCAAATAG-TCATAA
164 TTGGT-AAAAAGAT--TAT
* * * * * * ** *
19901711 CTATTTGAATTCGTTTAATAAATAGATTTATT----T-TT--TAAATCTCTTATTA-ATT-TTT-
1 TTTTTTAAATT--TTTACTTATTA-ATTT-TTAGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTC
* ** ** * * **
19901766 G-A-AA--TAT-T-AA-TAGATTAGTATTACTTTAT-TCCAAACAAACTTATATGAACATAA-AC
61 GAATAACTTATATGAACT-GA-AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AA---A-A-GGTCATAACA-
**** * * * * * * *
19901822 ATTTTTTTTATGACAA--A-ACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGT
117 ATTTGAAATA-GATAATTATTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACT---TGTTTGGT-AAAAAG-
*
19901883 CATAAT
175 -ATTAT
* * * ** ** * ** * *
19901889 TATTTGAACTAGTTAGGTA--AA----TGGAATTATTTTTTAAATT--TCTTACTTATTAATTTT
1 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAA-TA-TTAATAAATTAGTATTA-TT-TT-ATTTC
* * * ** * * *
19901946 TAA-AA--TAT-T-AA-T-AAATTCATTTTATTTTATTCCAAATA-AACTA-GT-AT--GAATTA
61 GAATAACTTATATGAACTGAAA--CA-ATTGTTTTATGACAAA-ACAA-AAGGTCATAACAATTT
* * * * * * * * * * *
19901999 AAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCATAT
121 GAAATAGA--TA-ATTAT-TC---A-AATA-GTCATAACTATTTGAACTTG-T--TTGGT-AAAA
* *
19902063 AGTTTTAAA
173 AG-ATT-AT
* * * *** ** ** * *
19902072 TATTTGAACTGGTTCGGCACACAAATTTATT----T-TT--TAATTCTCGTAGTTATTAGTT-TT
1 TTTTTTAAAT--TTTTACTTATTAATTT-TTAGAATATTAATAAAT-TAGTA-TTATT--TTATT
* * * * * * ***
19902129 TAGAATATTA-TTATATTAGTATTATTTAATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAA-ATATTTGT
59 TCGAATA--ACTTATA-T-G-A--ACTGAA-AC--AAT-TG-TTTTATG-ACAAAACA-AAAGGT
** ** **** * * * *
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* *
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157 AACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * **
19902279 ATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT-GAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTTA
1 -TTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * * * *** *
19902343 ATAGGCTTGA-ATG-A-TAAAAAAATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGCCGTAATTTTTTATAA
63 ATA-ACTT-ATATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-GAA
* * * * *
19902405 ATAGATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTTGAA-TTGCTTTGATAAACAA-ATT-T
124 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-AAGATTAT
* * * * * * * *
19902460 ATTTTTTGAATCTCTTAGTTATCAATTTTTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
1 -TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * * * **
19902525 TAAGCTTATAGGAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
64 TAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* *
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*
19902629 ATTTTT-AATTCTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTG
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* * * * * ** ** *
19902691 AATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTTGTAATGACTTGAA
62 AATA-ACTTATATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * ** *
19902754 CTAGAAAATTGTTTAAAT-GGCTATAATTATTTGAAGC--GATTTGACAAACTAA-CTTA-
124 ATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-CTTG-TTTGGTAAA--AAGATTAT
* * *
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* * * ** * * *
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64 TAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT-TT-GAAAT
* ** * * ** *
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126 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * * * * * * * *
19902988 TTTTTTAATTTTTTATTTATTAATTTGTCGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTCGATTA
1 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * ** *
19903053 AGCTTGTATCAACAGAAACAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGAT
66 A-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * *
19903117 AATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATT-T
130 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * *
19903166 AGTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
1 -TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * ** * * *
19903227 TAATTTTTTAT-AAATAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTTATAACTATTTGAAATA
64 TAA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * *
19903291 GATAA-TAGCTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTGAACAGATCTA-
127 GATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGAT-TAT
* * * * *
19903344 TTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTATTTCAAAT
1 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * *
19903409 AAAATTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAA
65 -AACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* *** * *
19903473 ATAATTGTTCAAGA-AGTCATAACTATTTGAACTCACTTAGTAAATAGATTTAT
128 ATAATTATTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGA-TTAT
* * * * *
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1 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * **
19903591 AAGCTTTTATGGA-TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAG
65 AA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * ** * *
19903655 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTAAACATGTTCAG-AAAACATATTAA
128 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAA-AGATTAT
* *
19903706 TTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAA
1 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AA
* * * ***
19903769 TAAGCTTGCT-TGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATA
64 TAA-CTT-ATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * *
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127 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * * * * *
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1 TTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * ** * *
19903950 TAAGCTTATCTAAATTGAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAAGGATTAGAAATAA
64 TAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * ** * *
19904015 ATAATTATTCAAATAATCA-AGATTATTTGAACTTATTCAGTAAACATATTTAT
128 ATAATTATTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGA-TTAT
* * * * *
19904068 TTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTTGAAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATTCGA
1 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTT-TT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * *
19904132 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAGAAA-GTCCTAACAATTTGAAA
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* * * * ** * * *
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* * *
19904249 ATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAA-TTGTCGTAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTT-GA
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* * ** * * *
19904311 AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATCATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTCAAA
62 AATAA-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * *
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125 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATT-AT
* * * * * * *
19904430 TTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTAATAACTTAGTAAT-TTTTATTTCAAAT
1 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * **
19904494 AAGCTAATATGAACTAAAATAATTTTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-A
65 AA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * ** * * *
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129 TAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGA-TTAT
* * * * * * *
19904611 TTTTTAAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTAGTAATGGTTT-TATCT
1 TTTTT-TAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA-TTAT--TTTATTTC-
* * ** * * ** * *
19904675 GAATAAACTTTTATGAGCAT-AAATTATTGTTTTGTAACAAAACAAAAAATCATAAGAATTTAAA
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* * * * ** * *
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* * **
19904794 ATTTTTTAAA--TCTA-TTATTAATTTTT-GAAATATTAATATATTTTTATTATTTTA-TTCTGA
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* * * *** * *** *
19904854 ACAAACTAATTTGAAGAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACGAAAA-GTCATAGTGATTTGAAAA
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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1 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * ** * *
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66 A-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * *
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130 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-AAGA-TTAT
* * * * *
19905687 TTTTTTAGATCATTT-CTATATTTATTTTTTGAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCTG
1 TTTTTTAAAT-TTTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-G
* * * * * *
19905749 AATAAGCATGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTTCAT-ACAATTTGAA
62 AATAA-CTTATATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACAATTTGAA
* * * * * *
19905812 ATAGATAATTATTCTAATAG-CTTTAACTATTTGAA-TTGGCTCGGTAAACACATT-T
124 ATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * ** *
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* * * * * * * * * *
19905931 ATAAGCTTCTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGATATAAC-AAAGATCTTAACGATTTGAGATT
63 ATAA-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * ** *
19905995 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAACCATATT-T
127 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAAAGATTAT
* * * *
19906047 ATATTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAA
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* *** * *
19906108 TAAGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAAT
64 TAA-CTTATATG--AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
** * * * ** * *
19906173 AGATAATCGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTTAACTAATTTGGTAAACAGATTTT
126 AGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATTAT
* * *
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* * * * * * * ** *
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* * *** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *** **
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* * * * **
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* *
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*
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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*** ** * *
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* * * * *
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* *
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** * * * ** *
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** *
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* * * * *
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* * *
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* * ** * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * * * **
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65 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * ** * * * * *
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* * * * * * *
19903963 ATTGAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAAGGATTAGAAATAAATAATTATTCAAA
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * **
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* * * ** * * * *
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* * * * **
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* ** * * ** *
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194 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
19904391 TAGTCATAATTATTTAAACTTATTTGGTAAACATATTCATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATT
259 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *
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** * * *
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* * * * ** * * *
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* ** * ** * * ** * *
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** * * ** * * *
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* ** *
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** * * * * * *
19904857 -AA-CTAATTTGAAGAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACGAAAA-GTCATAGTGATTTGAAAAA
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65 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
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19904984 CTTACATATTAATTTGTGAAATATTAATATATTCA-TTTTATTTTAATCTAGATAAGCTAATATG
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* * * * * *
19905048 AATTGAAA-ATTTTGTTTCATGAAAAAACAAAA----A-CA--ATTTAAAATAGATAATTGTTCA
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19905170 -TTTTAGGAATAGTT-TTATATTAGTATTATTTTATTTTGAA
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* * * * * *
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* * * * * * *
19905340 CTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATG-
129 TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
19905404 ATAAAAATCAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAA
194 ATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * ** * * * * * *
19905469 ATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCGGTAAATAGATTCACTTTTT-AA-GTC--ACCTATTAAT
258 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * ** *
19905530 TTTCAGAATAGTGATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAC
323 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
** * * *
19905569 TAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAG
1 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
19905634 ACAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAGATCA
66 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT
* * ** *
19905699 TTT-CTATATTTATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCTGAATAAGCATGTA
129 TTTACT-TA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * * *
19905761 AG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTTCATACA--ATTTGAAATAGATAATTA
191 TGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
19905823 TTCTAATAG-CTTTAACTATTTGAA-TTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAGTCTCTTACT
253 TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* **
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* * * * * * * *
19905932 TAAGCTTCTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGATATAAC-AAAGATCTTAACGATTTGAGATT
1 TAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *
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65 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* *
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129 TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG-
* * * * ** *
19906121 TAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCA
193 -AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * ** * *
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* * **
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* * * * * *
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1 TAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
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* * *
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128 T-TTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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1 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
**** * * * * * ** *
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** * * * * *** ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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257 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * *
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* * * * * * * ** *
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1 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * *
19907082 ATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTT-AAATCGGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-
66 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
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129 TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
19907205 CATTGAAAAGTAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAGTTGTTT
193 AATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *** *
19907270 AAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATACAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
256 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * **
19907334 AACTTTT-GAAATATCAATACAA-CAGTATTATTTTATTTTTAA
320 AATTTTTAG-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* *
19907376 TAAGCTAT-TATGAACTA-AAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGACATAATGATTTTAAAT
1 TAAGCT-TGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * ** * * * * *
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* * * * * * *
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127 CTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* ** * * * * * * *
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191 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGT
* ** * ** * *
19907630 TCTAATAGTTTTAACAATTTGAACCGGTTTGCTAAA-TGCATTTATTTTTTAAATCTCTTAC---
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* *
19907691 -TAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAA
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* * * * * ** *
19907734 TAAGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTTTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATGATGATTTGTGATT
1 TAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
*
19907797 GATATTTGTTCAAATAGTCATAACT
65 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
19907822 TGCTTTTTAA
Statistics
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19902597 TTCAAATAGA
* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* ** *
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* * * * * *
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1 AACT-AGTTGGTAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
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64 AATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * ** * * ** *
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1 AACTA-G-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTG
* * *
19904044 AACTTA-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTTGAAAATATTT
1 AAC-TAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTT-TTG-AAATATTA
* *
19904107 ATAAATTAATATTATTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAA
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* ** * * * ** *
19904171 ACAGAAA-GTCCTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTTATAAAGATGTG
125 ACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
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1 AACTAG-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * ** *
19904292 ATTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTGTGACAAAACAA
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* ** * * *
19904355 AAGGTTATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTA
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
19904407 AACTTATTTGGTAAACATATTCATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATA
1 AAC-TAGTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA
* * * * ** * * *
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* * * *
19904534 AAAGGTCATAATGATTTGAAATA-ATATTTATTCAAATAGTCATGGACTATATG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTG
** * * * * **
19904587 ATTTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT
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* * * * * ** * ** * *
19904651 AAATTATTAGTAATGGTTT-TATCTGAATAAACTTTTATGAGCATAAATTATTGTTTTGTAACAA
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** * * ** * *
19904715 AACAAAAAATCATAA-GAATTTAAAATAAATAATTACTCAAATAGTCCTAACTTTTTG
124 AACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
19904772 AACTAATTTGTTAAAAAAATTTATTTTTTAAATC---TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAT
1 AACT-AGTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
** * * * ** * * * *
19904833 ATTTTTATTATTTTATTCTGAACAAACTAATTTGAAGAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACGAA
65 ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AA
* * * ** * * *
19904898 AA-GTCATAGTGATTTGAAAAAGAGAATTACTCAAATAGTAATAATTATTTA
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
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19904949 AAATGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTGTGAAATATTAATAT
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
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19905014 ATTCA-TTTTATTTTAAT-CTAGATAAGCTAATATGAATTGAAA-ATTTTGTTTCATGAAAAAAC
65 ATT-AGTATTATTTTATTCCGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAAC
* * ** *
19905076 AAAA----A-CA--ATTTAAAATAGATAATTGTTCATGTAGTCTTAACTATTTG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
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19905123 AACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATTAATTTTAGGAATAGTT-TT
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* ** *
19905186 ATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACA
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128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
19905304 AATTGGTTCCGTAAATAGATTTATATTTTAAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATA
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* * * * * * * * *
19905369 AATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATG-ATAAAAATCAATTGTTATATGACCAAACA
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* * * * *
19905433 AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTG
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** * ** *
19905546 AATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGATAAAACAA
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19905663 AACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAGATCATTT-CTATATTTATTTTTTG-AATGTTAA
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* * * * * *
19905726 TAAATTTAG-ATTATTTTATTCTGAATAAGCATGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAA
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* * *
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* * * * * * *
19905845 AATTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTA
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* * * * *
19905909 AATTAGTATTATTTT-TGACCAAATAAGCTTCTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGATATAAC
64 AATTAGTATTATTTTAT-TCCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
19905972 -AAAGATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
19906025 AATTGGTTCGGTAACCATATTTATATTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * *
19906086 ATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA
65 ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATG--AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* ** * * * *
19906151 AAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTT
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTG
* * *
19906204 AACTAATTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAGT-TTCTTACTTATT-ATTTTAGTAAATATTAA
1 AACT-AGTTGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAA
* * * * *
19906267 TAAATTAGTATTATTTAATTCC-ATCTAAGTTTGTAT-TATCTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
62 TAAATTAGTATTATTTTATTCCGA-ATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
19906330 TCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTG
125 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * *
19906386 AACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* ** *
19906449 TAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACCAAA
62 TAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * ** * * * * *
19906513 CAAAAGGTTAAAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAACCATTTG
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * ** * ** *
19906568 AATTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCGTACTTATTAATCTTCAAAATATTATTA
1 AACT-AGTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
19906633 AATTAGCATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTACGATAAAAGAA
64 AATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CA
** * **** * *
19906697 AAAGG-CATAACAATTTGGAATAGATAATCAACCATATAGTCTTAACTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * ** * * *
19906749 AACTAGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTTAAT-TTACTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATT
1 AACTAG-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT--TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** ** * * * * * * * *
19906813 AAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATTAATAGGACCAATAGTTTGATAACAAAATA
63 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * *
19906878 AAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAATATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
19906931 AAATGGTTTAGTAAACAGATTTAATTTTTAAAT-TTATTACTAATTAATTTTCTAAAATATTACT
1 AACTAG-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAAT
* * * * * * *
19906995 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAATAG-AA-AATTGTCTTATGATAGAATA
63 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* ** * *
19907058 AAAGGTTATAACAATATGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTT-
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * * *
19907110 AAATCGGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTCTTCAAACATTAATA
1 AACT-AGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * *
19907171 AATTAGTATTATTTTTATTTCAAACAAGCTTCTA--CATTGAAAAGTAATTGTTTTATGAGAAAA
64 AATTAGTATTA-TTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
19907234 CAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTG
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * *
19907289 AACT-GATACAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATCAATA
1 AACTAG-T-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* ***
19907353 CAA-CAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCTAT-TATGAACTA-AAACAATTG-TTTATGACAAAA
64 -AATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCT-TGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * ** *
19907414 CAAAAGGACATAATGATTTTAAATTGATAATTATTCAAATAAACATAGCTATTTG
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *** * * * *
19907469 AACTTGCTCAATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAAT
1 AACTAG-TTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * ** * * *
19907533 AACTTAGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTTATATAAACGGAAACAATTATTATATGAC-TAACT
63 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-
* * * * * ** *
19907597 AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATTA-AAAATTATTCTAATAGTTTTAACAATTTG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * *
19907651 AACCGGTTTGCTAAA-TGCATTTATTTTTTAAATC---T-CTTACTAATTTTT-AGAATATTATT
1 AACTAG-TTGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * *
19907710 AAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTTTTTTATGAGAAAA
63 AAATTAGTATTATTTTAT-TCCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * ** * * * *
19907773 C-AAAGATCATGATGATTTGTGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTTGCTTTTT
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-T--ATTTG
* * * * * * ** ** * * * ** *
19907830 AA-T-TTTTG-AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCCGGA-TAAGTTTTT-ATAA-ACTG
1 AACTAGTTGGTAAACA-GATTTATTTTTTA-AATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGA-AATA-TT
* *** *** * * * **
19907889 AA-ACAATTA-TTTTATGGCAAAAC-AA-AATGTCTAATGACTTTAAATA-AAATAATTGTTCAA
60 AATA-AATTAGTATTATTTTATTCCGAATAA-G-CT--TG--TATGAATAGAAACAATTGTT-TT
* * * ** * * * * * * *
19907949 ATAGTCAAATC--TATTTGA-ACTTG-TTCGGTAAATAGAT-TTTTTTTAAATCTCTTGTTCATT
117 AT-GACAAAACAAAAGGTCATA-ATGATT-TG-AAATAGATAATTGTTCAAA----TAG-TCA-T
* * *
19908009 AAATTTTTT
172 AACTATTTG
** * * * *
19908018 AA-T-GTTAATAAATTAG-TATTATTTTATTCTGAATTAACTTGTATGAATTAAAATAATTATTT
1 AACTAGTTGGTAAA-CAGAT-TTA-TTT-TT-T-AA--ATCTT-T-T-ACTT--ATTAATT-TTT
* * * * * * * ** * ** * * * *
19908080 TAAGACCA-AAAGAAGGTCAGAACAATTTGAAACAG-ATAA--TTGT-TCTAATAGTCTTAACTA
52 GAA-A-TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTAT-GAATAG---AAACAA
* * * ** ** ** * * ** * * *
19908140 TCTGAACTGGTT-CGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCACTT-ACTTA-TTAATTTTTGAAATA
110 T-TG---T-TTTATGACAAA-ACA-AAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *
19908202 -TTATTAA--ATTAG
167 GTCA-TAACTATTTG
* * * * * **** * * *** *
19908214 TATTA-TT-TTAATC-CATTTA-TGAAAAGAAACAATTGTT--TTA-TGATGAAAT-AAAGATCA
1 AACTAGTTGGTAAACAGATTTATTTTTTA-AATC--TT-TTACTTATTAAT-TTTTGAAATAT--
* * * * * * *
19908271 TAATGATTTGAG-ATAGATAATTCTTCAC-ATAGTCAAAACTAT-T-TAAACTATTTTGGTAAAC
59 TAATAAATT-AGTAT-TAT-TTTATTC-CGA-A-T--AAGCT-TGTATGAA-TA-----G-AAAC
** *** * *
19908332 AAATTTAGTTTT-T-A-AATCTCTTATTAATTTTCAAAAT-A-TT--AATAGACTAGTATTATT-
108 -AA-TT-GTTTTATGACAA-AAC--A--AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TA--ATTGTTC
* * *
19908389 --TTATTC-TAAATATTTTG
162 AAATAGTCATAACTA-TTTG
* * * * * *** * * ** *
19908406 CA-T-GAATAG-AAACA-ATTGT-TTTATTCAAAAAC-AAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGA
1 AACTAG-TTGGTAAACAGATT-TATTT-TT-TAAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAATA-T
* ** *** * * * *** *
19908464 TAATTATTCAAATAG-ACAAGACTATT-TGAACT-TG-TT-TAGTAAATAG-ATTTATT-TTTAA
59 TAA-TA---AATTAGTATTATTTTATTCCGAA-TAAGCTTGTA-TGAATAGAAACAATTGTTT-T
** *** * * * * * ** * *
19908522 ATCTCCTACCTCTTAATGTTCAGAAT-ATTAAT-AAATTAGTATTATT-TT-ATTTTG-AATAA-
117 AT-GAC-AAAAC-AAAAGGTCATAATGATT--TGAAA-TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
*
19908581 -ACTTG
175 TATTTG
* * * * ** * * * * * *
19908586 TATTA-ATAG-AAACA-ATTGT-TTTATGACAAAAC-ATAAGATCA-TAACTTTTTGAAATAAAT
1 AACTAGTTGGTAAACAGATT-TATTT-T-TTAAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATT
* * * * ** * ***
19908645 AATTGTTCAAA-CAGGCATAATAATTATT-TAAACT-TGCTTGGTA--AATAG-ATTTATT-TTT
60 AA----T-AAATTA-GTATTAT-TTTATTCCGAA-TAAGCTT-GTATGAATAGAAACAATTGTTT
** ** ** *** *** * ** *
19908703 TAAAATC-TTATTAATTTTTGGAAT-ATTAAT-AAACTAGTATTATT-TT---ATTTTAAATACA
116 TATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATT--TGAAA-TAG-ATAATTGTTCAAATAGT-CATA-A
19908761 CT-TGTATG
174 CTAT-T-TG
* * * * *** * *
19908769 AAC-A----G-AAACA-ATTGATTTATGATAAAAC---AAAAGATCAAACTATTTGAAATACATT
1 AACTAGTTGGTAAACAGATTTATTT-T-TTAAATCTTTTACTTAT-TAA-TTTTTGAAAT--ATT
* * * * * *** * *
19908824 ATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAGAAAATAGATT-TATTTTTAAAAATTTT
60 A---AT-AAATTAGT-AT---TATTT-----TATTCCGAATA-AGCTTGTATGAATAGAAA---C
* * * ** ** * * * ** * *
19908887 TATT-TTTTTTGGA-ATATTAATAAATTTAT-ATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAAA-A
108 AATTGTTTTAT-GACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAA--TTGT-TCAAATA
** * *
19908948 GAAACAATTATTTTATG
167 GTCATAACTA--TT-TG
* ** * ** *** ** * **
19908965 ACAAAACAAAAT-GTCATAA-TGATTTGAAATAAAAAAT-TGTTTAAATAGTCACAACAATTTGA
1 ----AACTAGTTGGT-A-AACAGATTT-ATTTTTTAAATCT-TTTACTTA-T--TAA-TTTTTGA
* * * * * *
19909027 ACTTGTTCAGTAAA-TAG-ATTCATTTTTTAAATGTCTTGCTCATTAA-CTTTCAGAATATTAAT
54 A-ATATT-AATAAATTAGTATT-A--TTTT--AT-TC---C-GAATAAGC-TT--G--TATGAAT
* * * * * * * * * * ** *
19909089 A-AAGTAGTATCATT-TTATTTTGA-ATAAGCCTATATG-AACTAATACAATTG--TTTTATGA-
102 AGAA--A-CA--ATTGTT-TTATGACA-AA-ACAAAAGGTCA-TAAT-GATTTGAAATAGATAAT
**
19909147 TGAAACAAA-AGATCATAA-TGATTTG
157 TG-TTCAAATAG-TCATAACT-ATTTG
* ** * * * * * * *
19909172 AAATAGATAATTATTCAAATAG-TTATGACTATTTAAATTTATTCGGTAAATATATTTATTTTTA
1 AACTAG----TTGGT-AAACAGATT-T-ATTTTTTAAATCT-TT---T-ACT-TATTAATTTTTG
* * * * * * *** ** * * * ** *
19909236 AAATCTT--TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAA--
53 AAATATTAATAAATTAGT-ATTATT---TTATT-CCGAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* ** *
19909297 GCTTCTATGAACAAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGAGTCATAACCATTTGAAATAAATAA
112 G-TTTTATG------ACAA-------A--AC---A-AAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAA
19909362 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-
156 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** *
19909386 AATTTA-TTCGGTAAATAGAGTTGGTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAA
1 AA-CTAGTT-GGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAA
* *
19909449 TAAATTTA-TATTATTTTATT--GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAA
62 TAAA-TTAGTATTATTTTATTCCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * *** * * * *
19909511 ATAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATCGCTCAAATAGTCATAACTATTTA
125 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * *
19909567 AATTTA-TTCAATAAATAGATATAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAAT
1 AA-CTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* ** * * * * * *
19909630 AAATTAGAATTAAGTTATTCCAAATAAGCTTGTAGGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAATA
63 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * *
19909695 AATA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTT-
128 AA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * *
19909747 ACACTAGTTAGG-CCA-AGATTCATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAAT
1 A-ACTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * * * *
19909809 TAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAAAAAATTATTTTATGAAAAAA
63 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAG-CTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
19909873 CAAATGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACCAATTG
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * **
19909928 AACTAGTTTGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA
1 AACTAGTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * ** * * * * * * *
19909989 TAAATATTTTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAACAA
66 TTAGTA--TTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * * *
19910054 AACGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGCCTTAATTAATGG
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
19910106 AACTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATT-ATA
1 AACTAG-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA
** * * *
19910169 AGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAACA
64 A-ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * * *
19910234 AAAGATTATTACGATTTG-AA-ACATAATTGTTCCAATTGCCATAATTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * ***
19910285 AACT-GATTCGATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAAT
1 AACTAG-TT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAAT
* * ** * * *
19910348 AAATTAATATTAGTTTATTTTG-ATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTATAAAAC
63 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
19910411 AAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTA
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
19910465 AATTTA-TTCGGTAAACAGATTTATTTCTTTAAAT-TTCTTGCTTATTAGTTTTTTG-AATATTA
1 AA-CTAGTT-GGTAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTT-TTACTTATTA-ATTTTTGAAATATTA
* * * * * *
19910527 ATAAAATAATATTATTTTA-TCTCAAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTA
61 ATAAATTAGTATTATTTTATTC-CGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
19910590 AACAAAAAGTTAGAATGGTTTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGTCTTAACTATTTG
124 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * * * *
19910647 AACTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTAG-AATATTATTAG
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * **
19910711 CTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAATGC-AA
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* *
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130 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *** * * * * * *
19910826 AACTAATCCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAACTATTAGTAA
1 AACTAGT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* ** * * *
19910891 AGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
65 ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* ** * *
19910955 AAGATCATAACAACTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTG
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTG
* * * * * * * *
19911006 AATTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTAAATGTTAATA
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
*** * * * * *
19911071 AATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAGTTG-AACTAATTGTTTTACGTCGAAACA
64 AATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * *
19911135 AAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGCCTTAACTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
19911187 AATTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAA
1 AACTAG-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* ** * * *
19911252 ATTAGTATTACTTTCA-TCTAAATAAGCTTGTACGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TA
65 ATTAGTATTA-TTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * *
19911315 AAGATCATAATAATTT-AAGATATATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTG
129 AAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * **
19911367 AAATATTTTTGTGAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT-A
1 AACTA-GTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * ** *
19911427 GTTCAGTATTATTTTAGTCTAAATAA--TT-T-TGAAT-G-AACAATTTGTTTTATGATAAAACA
65 ATT-AGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACA
** * * * * *
19911486 AAAGGTCATAGCGATTTCAAATATATAATTGTTCAAATGGACATAAGTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * ** * **
19911539 AACTTGTTCGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * * * *
19911604 ATTAGTA-TATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAA
65 ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * *
19911668 AGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
130 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** *
19911719 AA-TTGTTTAGGTAAACGAGA-TTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAAT
1 AACTAG-TT-GGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * ** * * * * *
19911782 AAATTTA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTACTGTGAATTGAAAAAATTATTTTATGTCAAAAC
63 AAA-TTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
19911846 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGGTCATATGGTCTTAACTATTTT
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * * * *
19911900 AACTAGTTCGGCAAAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAG
1 AACTAGTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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*** * *
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* * * *
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** * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * ***
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * ***
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*
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* * * * * *** * * *
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* * * *** *
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129 -AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
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19909966 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATAAATATTTTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAA
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * **
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * ** * * * ***
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** *
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** * ** * * *
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* * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * ** * * * *
19911464 CAATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAGCGATTTCAAATATATAATTGTTCAAATGGACA
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* * * * *
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* * *** * * * * *
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* * * * ** *
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* * *
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130 ACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *** ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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*
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *** * * * * *
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* * *** *
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* * * *
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* * * *
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19913687 ATAATAACAA
Statistics
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* * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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** * *
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**
19909406 TTGGTTTTTTAAATCTTTTACTTA
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* *
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* * *** * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * ** * * * * *
19909813 TAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAAAAAATTATTTTATGAAAAAACAAA
386 TAGTATTATTTTATTTTAAATAAG-CTTGTAT-GA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * *
19909877 TGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACCAATTGAAC-TAGTT-TGTA
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*
19909940 AATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTA
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* * * * * * * *
19909966 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATAAATATTTTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACA-AA
1 TTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTA--TTATTTTATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * *
19910030 AACATT-TGCTTTATGACAAAACAAAACGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGC
63 AAAATTAT--TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * ** * * * *
19910094 CTTAATTAATGGAACTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA
126 CATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
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191 GAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * * * * * *
19910222 TATGACAAAACAAAAGATTATTACGATTTG-AA-ACATAATTGTTCCAATTGCCATAATTATTTG
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* * ** * **
19910285 AACTGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAATA
319 AACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * *
19910349 AATTAATATTAGTTTATTTT-GATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAACAA
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* * * * * *
19910413 AAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAATTTATTCGGTA
447 AA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTA
*
19910478 AACAGATTTATTTCTTTAAAT-TTCTTGCTTA
511 AACAGATTTATTT-TTTAAATCTT-TTACTTA
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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64 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
19910638 AACTATTTGAACTAGTTC-GACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAA-TTTTAGA
129 AACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGA
* ** * * * *
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193 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTAT
** *
19910765 GACAATGC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
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* * ** * * * * * *
19910829 TAATCCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAACTATTAGTAAAGT
322 TTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
** * * *
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387 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-
** * * * *
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450 TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTATTCGGTAAAC
* * *
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* * * * * **
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* * * * * * * * *
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** * *
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* * * *
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193 ATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTA
* * * *
19911305 TGACAAAA-TAAAGATCATAATAATTT-AAGATATATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
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* ** * * **
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* * * ** *
19911427 GTTCAGTATTATTTTAGTCTAAATAA--TT-T-TGAA-TGAACAATTTGTTTTATGATAAAACAA
384 ATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * * * *
19911487 AAGGTCATAGCGATTTCAAATATATAATTGTTCAAATGGACATAAGTATTTGAACTTGTTCGGTA
447 AA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTA
* * ** *
19911552 AATATATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTA
511 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * *
19911582 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACA-AAAA
1 TTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA
* * ** *
19911645 CATTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
65 -AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
19911710 AATTATTTGAA-TTGTTTAGGTAAACGAGA-TTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAACTTTT-G
129 AACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG
* * ** * * *
19911772 AAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTACTGTGAATTGAAAA-AATTATTT
192 -AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
19911835 TATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGGTCATATGGTCTTAACTATTTT
254 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
19911900 AAC-TAGTTCGGCAAAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTA
319 AACTTA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * *
19911964 GATTAGTATCATTTTATTTCAAGTAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAA
383 AATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-A
* * * ** * * * * * * * ** * *
19912029 AAAGTTATAATAATTTCAAGCATACAATTGTTTAAATTGTCAAAACTCTTTAAACTGGTTTGGCA
446 AAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTA
* *
19912094 AACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
511 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* *
19912124 TTAATTTT-TGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-ATTAAGCTTGTATG-ATCA-A
1 TTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGA
* * * * * *
19912185 AAACAATTATTATATGTAC-AAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATGGATAATTGTTGAAATGG
62 AAA-AATTATTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
19912249 CCATAATTATTTGAGC-TGATTTAGTAAACAAATGTACTTTTTAAAT-TATTTACTTATTAATTT
125 TCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTT
* * * * *
19912312 TTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGCATGAATTGAAACAATTGTT
188 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTT
* * * * *
19912377 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTA-AACTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
19912441 GAATTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAAG
318 GAACTTATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
** * ** * * *
19912505 AAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCAAAATA
382 AAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * ** **
19912570 CAAGGTTATAATGATTTTAAATAAATAATTG-TCAAAATAGTCATAACTATTT-AACTTGCTCAA
446 -AAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGG
* *
19912633 TAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTA
509 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTA
* * * ** * * * *
19912666 ATAATTTTTTGAA-GCTAATAAATTCGGATTATTTATTTCTG-AATAAGCTTGTAAG-ATATGAA
1 TTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TAT-TGAAATAAGCTTGTATGAATA-GAA
* * * * * * ** * *
19912728 ACAAA-TATTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAATGGTTAGAAATAGATAATTATTTTAGTAGTT
63 A-AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
19912792 TTAACTATTTGAA-TTGGTTC-GATAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT
127 ATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
19912855 -GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAATCTAAA-AAGCTTTTATGATCAAAAACAA-TCTT
190 AG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTT
*
19912917 TTATGACAAAAC-AAAGAT-ATTAATTATTT-AAGACTA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
253 TTATGACAAAACAAAAGATCA-TAATGATTTGAA-A-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *
19912978 TTTGAACTGATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTA
315 TTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
19913043 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAA
380 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * * *
19913108 CAAAAGGTCATAATGATTTCAAATCGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTCG
444 CAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCG
* * * *
19913173 ATAAACATATTTATTTTTTAATTTTTTTACTTA
508 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
*** ** *
19913206 TTAATTTAAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-TCTAAGCTTGTATTAACT-GAA
1 TTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T-TGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* * * * * * * * * * *
19913269 ACAATTATTTAATGACAAATCAAAAGATTATAAGGATTCT-AAATAGACAATTGGTCACATAATA
63 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
19913333 ATAACTATTTGACCTTGTTCGGTAAACAGGTTT-TTTTTTAAATCCCTTTCTTATTAATTTTTTG
127 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG
* * * * * * *
19913397 AATGTTAATAAATTAGTATCAATTTATTCTGAATAAGCATGTATGAACTGAAAAAAATTATTTTA
192 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTA
*** * * * * * * *
19913462 TG-CTGGACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAA
256 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* *** * *
19913526 CTGATTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAAT
321 CTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * *
19913591 TATTATTATTATT-TTAATTCGAATAAGCTTGTACGAACAAAATAATTGTTTTACGACAAAACAA
386 TAGTATTATT-TTATT--TT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *** ***
19913655 AGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATA-ACAATTATTATATGATAAAACAAAA
447 A-AGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCA-AATAGTC-ATAACTATTTG--AACTTATTC
* * * *
19913718 AGTAATA-ACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATCATTTAAA
507 GGTAA-ACA-GATTT---AT---T--TT-TT-AAAT---C-T-TTTACTT--A
* ** * ** *
19913770 TTGATTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTT-TTGAAAT-A--TT-AA
1 TTAATTTTCTAAA-T-A-TTA----ATAAAT-TAGTA-TTATT---TTATTGAAATAAGCTTGTA
* * *
19913830 TAAAGTAGCATTTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
54 TGAA-TAG-A---A---AAA---------------AT----T---A------TTTTATGACAAAA
* * * * * **
19913895 CAAAAGGGCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTTG
83 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* * * *
19913960 GTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATAAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
148 GTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * * * *
19914025 ATTTTATTATGACTAAGCTTGTATGAATTGAAACATTTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAA
212 ATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * * * * ** * * *
19914090 AGATTTGAAATAGATAAATATTCTAATAGTCCTAACTACTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTA
277 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
19914155 TTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCTGAA
342 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAAA
* * * * *
19914215 TACA-CTTGTATGATAAAAAACAATTGCTTTATGAGAATAC-AAAGATCATAACT-ATTTGAGAT
406 TA-AGCTTGTATGA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAAT
** * * ** ** * *
19914277 TGATATTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTC-CAAAACA-ACTTTAGTTTCTAAAT
467 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAAT
* * *
19914340 ATCTTGCTTA
531 CTTTTACTTA
* * * * * *
19914350 TTAATTTT-TGAAATATTAGTAAAATAGTATTATTTTATTTTG-TATAAGTTTTTATGAATTGAA
1 TTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * *
19914413 ACAATTGTTTCATTACAAAATAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGAAAATTGTTCAAATAGTC
63 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
19914477 A-AATCTATTTAAAATTTTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTTT
127 ATAA-CTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
19914541 TCA-AATGTTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTT
189 T-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTT
* * * * * * * * * *
19914605 TTATAACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAACTGTTCCAACATTCTTAACTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*** * * *
19914670 GAAC-TAGTTCAACAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAT
318 GAACTTA-TTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * ** * *
19914734 TAAATTATTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTATTATTTGAACT
381 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTT-TTA--TG-AC-
* * * * * * * * ** * *
19914799 TATTCAGAA-AATAGT-TTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTGGAATATTAATAAA
440 -A---A-AACAAAAGTCATAATGATTTGAAA-----TA---AATAATTGTTCAAATAGTCAT-AA
* ** * * * * * * ** * **
19914861 TTAGTATT-ATTTTATTTTGAATAAGCCTA-AATGAATTGATACAATTGTCTTATGACGAAA
491 CTA-T-TTGAACTTA-TTCG-GTAA-AC-AGATTTATTTTTTA-AA---TCTT-TTAC-TTA
* *** * * * *
19914921 TAAAAGGTCAAAACGATT-TTAAA-TAGATAATTACTCAAATAGTTA-TGACTATTTAA-CTTGT
1 TTAATTTTCTAAA-TATTAATAAATTAG-T-ATTA-T----T--TTATTGA--A-ATAAGCTTGT
* * * ** *** ** *
19914982 -TCG-GTA-AACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAAT-A-TT-AAA-A-
53 AT-GAATAGAA-AAAATTA-TTTTATGA-C-AAAAC--A--AAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
** * ** * ** * *
19915039 A-AATTAAT--ATTA-TTTTAATCCAAAT-AAGCTTGTATGGAGAAAAACA-ATTGT-TTTATGA
109 ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-CTTGT-T-CAG-TAAACAGATT-TATTT-T--
** * * *
19915097 CAAAAAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTA-AATAGTT-AT-AACTA-T-TTCA
165 ----TTAAATCTC-TTAC---TT---AT---TAATT-TTTAGAATA-TTAATAAATTAGTATT-A
** * ** * * * * * * ** *
19915157 GCTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATCAATTGTCTAAATTA-ATAAATT
213 TTTTATTC--TAAA-TAA--GCTTGTATGAA---CTA--AAACAATTGT-TTTATGACA-AAA--
* * ** * * * * ** * * *
19915221 TGTATAATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATTTTGTT-TTAT-GACAAAACAAAA
264 --CAAAAGATCA--T--AATGA-TTTG-A--AATAGATAA--TTGTTCAAATAGTCATAAC--TA
** * * * * * * * * * * *
19915284 GGTCATAATGATT-TG-AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTCAG
315 TTTGA-ACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTC-TTACTTA-TT-AA-TT-TT-TG
* * **
19915345 AAAATAGTTTCAGTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTAAGAATGTTAATAAATTAGATTTATG
372 -AAATA--TT-A----ATAAA----TTAGT-ATTATTTT----AT-TT--TAAA-TA-AGCT-TG
* * * **
19915410 TTATTTCGACTAAGCTTTTGCGAATAGGAACAACTGCTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAA
414 -TA--T-G---AA-------C--A-A--AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGA
* * ** ** * *
19915475 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGTGC-TGGTCAAGG-CAACAGATTCAT
459 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC--GGTAAACAGATTTAT
**
19915538 TTTTTAAATCCGTTACTTA
522 TTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * * *
19915557 TGAATTTTCAAAATATTAATACATTAGCATT-TCTTTATTCCGAAA-AAGAC-TGTATGGACATA
1 TTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATT--GAAATAAG-CTTGTATGAATAGA
* * * * * * * * * *
19915619 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAACGGACATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTTAAATAGTT
62 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
19915684 ATAACTAATTGAACTAGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTCAA
127 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG
** * * * * * * * * *
19915749 AATAAAAATAGAA-TAATATTATTTTATTATGAACAAACTTATATCAACAAAAACATTTGTTTTA
192 AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * ** *
19915813 TGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTTTTAATTATTTGAA
256 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* ** *
19915878 C-TAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
321 CTTA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * ** * * * * ** *
19915942 TTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTACTAAGAACTGAAAAAAATTATTTTACAACAAAAAAA
385 TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT-GTATGAAC--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * *** * * * *
19916006 AAGGTTATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTTTTATAGCCTTAACTATTTGAAC-TAGTTTGGC
447 AA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGT
* * * * *
19916070 AAATAAATTTATGTTTTAAATCTCTTAGTTA
510 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* ** * *
19916101 TTAATTTT-TAGAATATTATTACAA-TAGTATTATTTTATTTTTAATAAACTTGCATGAATAGAA
1 TTAATTTTCTA-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTA-TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* ** * * ** * **
19916164 ATAATTGCTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTT
63 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
19916229 TAAGTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTT-GA
128 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-
** * * * * ***
19916293 AATATTGGTAAATTAGTTTTATTTTAATT-TGAATAGGCTTGTAGGATGAAAAACAATTGTTTTA
192 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
19916357 TGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATGGTCATAATTATTTGAA
256 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
19916422 CTGATTTGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCT-TTAACTTATCATTTTTTGAAATATTAAT-A
321 CTTATTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * ** * *
19916484 AGTAATATTATTTTATCTCAAGTAAGCTTTTATGCATTAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAA
384 ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATG-AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * **
19916549 AGGTCATAACGATTTTAAATATATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCAATAA
448 A-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAA
* * *
19916614 ACTGATTTATGTTTTTTAAT-TTCTTTCTTA
512 ACAGATTTAT-TTTTTAAATCTT-TTACTTA
* * ** * * *
19916644 TTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATTGGCATGTCTGAGCT-GAA
1 TTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-GAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAA
* * * ** * *
19916707 ACAATTATTTTATGACTAAACCAAAA-GTCAAAACAAGTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTC
63 AAAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
19916771 TTAACTATTTGAA-TTGATTC-GACAAACACATTTATTTTTGAAA--TC-T--TTATTAATTTTT
127 ATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
19916829 -GAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAA-CTTTGTATGAATACCAATTACACTA
190 AG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC-TTGTATG-A-A-C---T--A--A
* * * * * *
19916892 AATAATTGGTATTATTTTACGACAAAATAAAATATCATAATGATTTAAAATAGATAATAGTTC-A
243 AACAATT-G-----TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* ** * ** * ** *
19916956 ATTGAAAATTACTATTTGAACTTGCTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAATTTATTAA
302 ATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * *
19917021 TTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAAT
366 TTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAAT
* * * * * *
19917085 TATTTTATGACCAAAGAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGTTATAATT
429 TGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
*** * * *
19917150 ATTTGAACTCGCTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
493 ATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * *
19917198 TTAATTTT-TCAAATTTTAATGAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
1 TTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * ** * *
19917262 CAATTGA-TTTATCACAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTC
64 AAATT-ATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * * * * *
19917324 ATAATTATTTAAACGTGTTCGGAAACACAAATTTATTGTTTAAGT-TATTATTTATTAATGTTGA
127 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * *
19917388 -AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTT-TCATGAAC-AAATCCAACTGCT
191 GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT-ATGAACTAAA-ACAATTG-T
* * *
19917449 CTTTA--ACAAAA-TAAAGAGTCATAATG-TGTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAATT
252 -TTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** * * * * **
19917510 ATTTAAACTTTTTTAGTAAAAAAATTCATTTTTTTTAATTCTCTTACCCATTAATTTTTGAAATA
314 ATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATT--TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * *
19917575 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAACTAAAACAATTGTTTTATTACA
377 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
19917640 AAACAAAAGGTC-CAATGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTTGT
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** *
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* * * * *
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* * ** ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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* *
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* *
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TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTA
TTTTTTAAATCTTTTACTTA
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * **
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* ** *** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
19914476 CA-AATCTATTTAAAATT-TTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATT
65 CATAA-CTATTTGAACTTATTT-GGTAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
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* * * * * * * * *
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* **** *
19914660 TTAACTATTTGAAC-TAGTTCAACAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
66 ATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * **
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19914777 AACAATT
1 AACAATT
19914784 ATTATTATTT
Statistics
Matches: 727, Mismatches: 153, Indels: 60
0.77 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.00
175 19 0.03
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177 60 0.08
178 6 0.01
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGA
Done.