Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168271.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_50, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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Warning! 1000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 2
Found at i:5286 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 4272--6020 Score: 1049
Period size: 181 Copynumber: 9.9 Consensus size: 181
4262 ATAAATAAAT
* *** ***
4272 AATCTCCTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-TGGCT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCT
* * * ** * * *
4335 TGTGTG-ATGAAAAACAGTTGCTTTATGACAAAACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAAT
65 T-TATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * ***
4399 TGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAATTGATTTATTTTTTA
128 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * * * *
4453 AATCTCCAACTTCTCAATTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATATACTTT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTT
** * * *
4517 TATGAA-ATGAAACAATT-TTTTATGATAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATAGATATTTG
66 TATGAATA-GAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* *
4580 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTA
130 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTA
* * * ** **
4633 AAT-TCCTTACTTATTAATTTTCT-GAATGTTAATCAAA-TATTATTATTTTATTTCAAATAAGT
1 AATCTCC-AACTTATTAATTTT-TAGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAC
* * * *
4695 ATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAGATA
63 CTTTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * ** * ** ***
4758 ATTGTTCCAACAGTCTTAAC-ATTTG-ACTGGTTGGGCAAATGCATTTATTTTTTA
126 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
** * ** * * * * *
4812 AA-CTTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTCGAAT-AAGCT
1 AATC-TCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCT
* * * * *
4875 TATAAGAATAGAAACAATTATTTTATGAGAAAACAATA-ATCATACCGATTTGAAATAGATAACT
65 T-TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* ** * * *
4939 GTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTTAGTTTTTG
129 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
** * * * * * * * * **
4992 AA--T--ATTTTATTAATTTTCAAAATATCAATAAAATAGTACTATTTTATTCTAAAT-GATTTT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTT
* * **
5052 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACCAAACAAAATG-TCCA-AACGATTTGAAATAGATAAT
66 -TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAA-GAT-CATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * *
5115 AGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATATTTATTATTTA
128 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
*
5169 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTTGAATAAACCTT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTT
* * * * *
5234 TATGAATAGAAACTATTATTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTAT
66 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** *
5299 TTAAGTAGTCATAGCTCTTTGAATTTGCTAGATAAACAAATTTATTTTTTA
131 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
** * ** * * * *
5350 AATCTTTAAGTTATTAATTTTTTTAATTTTAATAAATTAATATT-TTTTATTCTGAATAAGCCTT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTT
* *
5414 TATGAATAGAAACAATT-GTTTATGAT-AAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAAT--ATAACTAT
66 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA-T-T
* * * * * * * * **
5474 -TTGAACGT-GT-TTAGA-AAATAG-ATTTATTT--T-TA-AAATTT-TTACTT-
129 GTTCAA-ATAGTCATA-ACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
*** * * * * * *
5518 -A-CT--AA--TA-T--TTGGAATATTAG---TAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCAT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAACCT
* * * * *
5569 GTATGAAT-GTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
65 TTATGAATAG-AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * *
5633 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTT-GTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTA
129 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTA
** * * * * * *
5686 AATCTCCTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAGTTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGCCTA
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTT
* * * * * * *
5751 AATGAATTGATACAATT-TTTTATGATGAAACAAAAGATCAAAAAGATTTGAAATAGATAATTAT
66 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * *
5815 TTAAATAGTTATTGCTATTTGAATTTGTTTGATAAACATATTTATGTTTTTA
131 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTAT-TTTTTA
*** * * * * * *** ** *
5867 AATCTTTTACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCAAAATATGCTT
1 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGAATAAACCT
* * * * * * * * *
5931 TTATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTA
65 TTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
5996 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
130 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
6021 ATGTTCGGTA
Statistics
Matches: 1201, Mismatches: 292, Indels: 149
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
155 7 0.01
156 35 0.03
157 7 0.01
158 3 0.00
159 29 0.02
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164 3 0.00
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169 5 0.00
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174 7 0.01
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182 122 0.10
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTT
TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTA
Found at i:5380 original size:23 final size:24
Alignment explanation
Indices: 5336--5398 Score: 67
Period size: 24 Copynumber: 2.6 Consensus size: 24
5326 CTAGATAAAC
* *
5336 AAATTTATTTTTTAAATCTTTAAGT
1 AAATTAATTTTTTTAATCTTTAA-T
*
5361 -TATTAATTTTTTTAAT-TTTAAT
1 AAATTAATTTTTTTAATCTTTAAT
5383 AAATTAATATTTTTTA
1 AAATTAAT-TTTTTTA
5399 TTCTGAATAA
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 4, Indels: 5
0.78 0.10 0.12
Matches are distributed among these distances:
22 1 0.03
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Consensus pattern (24 bp):
AAATTAATTTTTTTAATCTTTAAT
Found at i:5407 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 5362--5408 Score: 60
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 23
5352 TCTTTAAGTT
*
5362 ATTAATTTTTTTAATTTTAATAA
1 ATTAATTTTTTTAATTTGAATAA
5385 ATTAATATTTTTT-ATTCTGAATAA
1 ATTAAT-TTTTTTAATT-TGAATAA
5409 GCCTTTATGA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 1, Indels: 3
0.84 0.04 0.12
Matches are distributed among these distances:
23 9 0.43
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ACGTcount: A:0.38, C:0.02, G:0.02, T:0.57
Consensus pattern (23 bp):
ATTAATTTTTTTAATTTGAATAA
Found at i:5784 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 5466--6039 Score: 580
Period size: 180 Copynumber: 3.2 Consensus size: 178
5456 GATTTGAAAT
* * * * * * *
5466 ATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATATTTGG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG
* *
5530 AATATTAGTAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAGCATGTATGAATGTAAACAATTGTTTTATG
66 AATATTAATAAATTATATTATTTTATTCG-AATAAGCATATATGAATG-AAACAATTGTTTTATG
*
5595 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
129 ACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * ** * *
5645 ATAACTATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTGCTTATTAATTTTTTG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG
* * * * *
5710 AATATTAATAAGTTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGCCTAAATGAATTGATACAATT-TTTTAT
66 AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAATAAGCATATATGAA-TGAAACAATTGTTTTAT
** * * * *
5774 GATGAAACAAAAGATCAAAAAGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTT
128 GACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
** * * * * * * *
5825 ATTGCTATTTGAATTTGTT-TGATAAACATATTTATGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTGTC
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * * ** *
5889 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCAAAATATGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTT
64 AGAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-ATTC-GAATAAGCATATATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * *
5953 TATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
125 TATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* *
6007 ATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAATAGATTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTT
6040 GAAATAAGCT
Statistics
Matches: 314, Mismatches: 70, Indels: 19
0.78 0.17 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 39 0.12
180 104 0.33
181 90 0.29
182 80 0.25
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG
AATATTAATAAATTATATTATTTTATTCGAATAAGCATATATGAATGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
Found at i:5868 original size:517 final size:521
Alignment explanation
Indices: 5051--5987 Score: 1246
Period size: 517 Copynumber: 1.8 Consensus size: 521
5041 TAAATGATTT
* *
5051 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACCAAACAAAATGTCCAAACGATTTGAAATAGATAATA
1 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCCAAACGATTTGAAATAGATAATA
* * ** * *
5116 GTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATATTTATTATTTAAATCTCCAACTT
66 GTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTCATTATTTAAATCTCCAACTT
* **
5181 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTTGAATAAACCTTTATGAATAGAAA
131 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTCGAATAAACCTAAATGAATAGAAA
* * * *
5246 CTATTATTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAGTAGTCAT
196 CAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAAAAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCAT
* * * * ***
5311 AGCTCTTTGAATTTGCTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTAAGTTATTAATTTTTTTAA
261 AGCTATTTGAATTTGCTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAACTGTCAAAA
* ** * * *
5376 TTTTAATAAATTAATATT-TTTT-ATTCTGAATAAGCCTTTATGAATAGAAACAATTG-TTTATG
326 TATTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCAAAATAAGCCTTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATA
*
5438 A-TAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAGATTTAT
390 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAGATTTAT
5501 TTTTAAAATTTTTACTTACTAATATTTGGAATATTAGTAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAG
455 TTTTAAAATTTTTACTTACTAATATTTGGAATATTAGTAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAG
5566 CA
520 CA
* *
5568 TGTATGAAT-GTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAATGATTTGAAATAGATAA
1 TGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCCA-AACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * **
5631 TTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTG
64 -TAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTCATTATTTAAATCTCCAA
* * * * * *
5695 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAGTTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGCCTAAATGAATTG
128 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTCGAATAAACCTAAATGAATAG
* * *
5760 ATACAATT-TTTTATGATGAAACAAAAGATCA-AAAAGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG
193 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAAAA-ATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAG
* * * * * *
5823 TTATTGCTATTTGAATTTGTTTGATAAACATATTTATGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTGT
257 TCATAGCTATTTGAATTTGCTAGATAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTTTAACTTATTAACTGT
* * *
5888 CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGATCAAAATATGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTT
321 CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGATCAAAATAAGCCTTTATGAACAAAAACAATTGTTT
5953 TATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
386 TATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
5988 AATAATTATT
Statistics
Matches: 354, Mismatches: 56, Indels: 16
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
515 3 0.01
516 80 0.23
517 206 0.58
518 31 0.09
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520 3 0.01
521 24 0.07
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (521 bp):
TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCCAAACGATTTGAAATAGATAATA
GTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTCATTATTTAAATCTCCAACTT
ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTCGAATAAACCTAAATGAATAGAAA
CAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAAAAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCAT
AGCTATTTGAATTTGCTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAACTGTCAAAA
TATTAATAAATTAATATTATTTTGATCAAAATAAGCCTTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATAA
CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAGATTTATT
TTTAAAATTTTTACTTACTAATATTTGGAATATTAGTAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAGC
A
Found at i:7006 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 6717--10234 Score: 826
Period size: 181 Copynumber: 19.4 Consensus size: 178
6707 GAGCTAAAAA
** * * * * * * *
6717 AATTGTTTTACAATAAAATAAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCT-
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TTA
* ** * * * *
6781 TAACTATTTGAAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCATAGTTATTAATTGTCAAA
64 TAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTATAAATT-TTAAA
*
6846 ATATTATTTGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
128 ATATTA-TTAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
* * * * * *
6899 AATT-TTTTATGACAGAATAAAAGGTTATAACAAATTGAAATATATAACTGTTCAAATAGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* ** * * * *
6963 ATTATTTGAACTGGTTCAATAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCGTACTTATAAAATTTTGAAAT
66 ACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTAT-AAATTTTAAAAT
* * * * **
7028 ATTAATAAATTAGTTTTATTTTGTTATGAATAAGCTTGGATGAGCT-GAAAT
130 ATT-ATTAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAAT
* * * ** * * *
7079 AATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGTCT-T
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TAT
* * * * * *
7143 AACTATTTGAATTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAA
65 AACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTAT-AAATTTTAAAA
* ** * * *
7208 TA-TATTAACTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTTATATGAACAGAAAT
129 TATTATTAA-TTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
*
7259 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATA-TTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTGAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
** * * *
7323 AACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTACT-AATTCTTGAA
65 AACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTA-TAAATT-TTAAA
* * * ** * *
7383 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT-GTTCAAAAAC
128 ATATT-ATTAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAAT
* * * * * ** *
7436 AATTCTTTTATGAAAAAAC-AAAAGGTACTAATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATCTTGAAA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTA-TAACAATTTGAAAT-AGATAA--TTGT-TC------
* * * ** * ** * * * *
7500 AACAATTGTTTTATGACAAAATGAA-AGGTAACAACGATTTAAAATAGA-TAATTGTTCAAATGG
55 -A-AATAG--TTATAACTATTTGAACTGGT----TTGA--T-AAATAAATTTATTTTTTAAAT--
* * ** * * * **
7563 C-CATAATTATTTAAACTAATTCAGTAAACTGATTTATTTTTTA-AATCT-CTTAATTTTCATAA
107 CTCATAGTTA--TAAA-T--TT---TAAAAT-A-TTATTAATTAGTAT-TATTTTATTTGAATAA
** * * *
7625 TATT-AATAAAAGTAGTATT
161 GCTTGTAT-AAA-TAGAAAT
* * * ** ***
7644 ATTTTATTTTGGATAAACTTTTGTGAACTGAAACAA-TTATTTTATTACAA-AACAAA-AGATCA
1 A-ATTGTTTT--AT-GAC-----AAAAC--AAA-AAGTTA---TA--ACAATTTGAAATAGAT-A
* * * * * *
7706 TAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGA
48 -ATTG--TTCAAAT-----A--G------T--T-ATAACTATTTGAACTGGTTTGA-TAAATAAA
* * * * *
7770 TTTATTTTTTCAAATATC-TTGCTTATTAATTTTTCAAAAGT-TAATAAATTAGTATTATTTTAT
93 TTTATTTTTT-AAATCTCATAG-TTA-TAAATTTT-AAAA-TATTATTAATTAGTATTATTTTAT
* * *
7833 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
153 TT-GAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAAT
* * * * * * * * *
7860 AACTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCT-T
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TAT
** ** * * *
7924 AACTATTTGAACTAATTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATATCTCAT--TTATTAATTTTTAA
65 AACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTT-AA-ATCTCATAGTTA-TAAATTTTAA
* *
7987 AATATTATTAGATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTAT-GATCAGAAAT
127 AATATTATTA-ATTAGTATTA-TTTTATTTGAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAAT
* * ** * * *
8041 AATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
** ** ** * ** * * * * *
8105 ACTATTAAAACTACTTCAAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAAT
66 ACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTT-ATAAATTTTAAAAT
* * * * * * * * * *
8170 ATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATATGTTTTTATTAATTGAAAA
130 ATT-ATTAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
* * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * * ** * * * * **
8285 TCTATTTGAAATTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTC-TTGCTTATTAATTTTTTGA
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* * *
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128 ATATT-ATTAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAAT
** * * ** * * *
8402 AATTGTTTTATGATTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCT-T
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TAT
** * **
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65 AACTATTTGAACTGGTTTGA-TAA-ATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTA-TAAATTTTAA
* * * * * *
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127 AATATTA-TTAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
* * * * * * ** * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT-TATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
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65 AACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTATAAATTTT-AAAA
* * * ** * * *
8703 TATTAATAAATCACTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACAGAAAC
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* * ** * * ** *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* ** * * * * * ** * *
8820 ACTATTTGCACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTCCTACCTATTAATTTACAAAAT
66 ACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTATAAATTT-TAAAAT
* * * * *
8885 ATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAAC
130 ATT-ATTAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
* * * * * *
8936 AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACTATTTGAAATAAAAAATTGTTCAAACAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
*** * * * * ** * * * **
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* * * ** * * *
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* * * * * **
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1 AA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
* ** * * * ** * * * **
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65 AACTATTTGAAC-TGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTA-TAAATTTTAAA
* ** ** * *
9242 ATATTAATAAATT--TAATTATTTTATTAACAATAAGCTTGTATGGACAGAAAC
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* * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTCAA-ATAGTT-
* * * ** ** * * ** *
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* * * *
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127 -AATATTATTAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
* ** *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * * ** * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * **
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
9753 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATGTGAATAAACTTTTATGAAGAAAAAC
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* * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* ** * * ** * * * *
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66 ACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTATAAATT-T-TAAAA
* * * *
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* * * *** *
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1 A-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* *
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* *
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127 TTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAGTGGTTTGACAAACAAATTTATTT
* * * * *
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192 TTCAAATCTCATAGTTATGAATTGTCAAAATATTATTTAA-TTAGTATTATTTTATTCT-AAATA
* * * *
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* * ***
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* * *
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64 TTCAAA
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AAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAGTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTCA
AATCTCATAGTTATGAATTGTCAAAATATTATTTAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTA
TATAAACAGAAATAATTTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAAATTGAAATAGATAACTGTT
CAAATAGTGATAACTATTTGAACTGATTCAATAAAT
Found at i:7474 original size:67 final size:67
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*
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7467 TA
66 TA
* * * * **
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ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATCTTCAAAAACAATTCTTTTATGAAAAAACAAAAGGTACTAA
TA
Found at i:8052 original size:181 final size:180
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7459 GGTACTAATA
** ** * * ** * * *
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* * * * * * ** *
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* * *
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* * * * * * * *
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* *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA
** *
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** * * * * * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
** * * * * ** ** * *
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* * *
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* *
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* * * * ** ** ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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** * *
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* * * * * * * *
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* ** *
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*
8902 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
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* * * ** * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * **
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*** * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
9549 CATTTTTT-AAATCTATTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAATTTAGTAAT
129 TATTTTTTAAAATC--TCACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * *
9602 ATTTTATTTAGAATAAGCCCGTATGAAT-TGATACAAGTATTTTATGACAAAACAATAGGTCATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
*
9666 ATGATTTGAAATAGATAA----T----T-G--ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTT
* *
9720 A--TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
130 ATTTTTTAAAATC--TCACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * ** * * *
9771 ATTTTAATGTGAATAAACTTTTATGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAAACAAAA-AGTCATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATA
** * * * * * *
9835 ACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATT-TGATAAACAGATT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATT
* * * *
9899 TATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAGTTATCTT--AATATTAATAAATTTGTATA
129 TATTTTTTAAAATC--TCACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
9952 ATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAA-ATTTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTA
1 ATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATG-ATCAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * * * ** *
10014 TAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAATTAGTTGTATTTGTTTGGTAAATAGAT
63 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGAT
* * * *
10078 TTATTTTTT-AAATCT--CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGAAAT
128 TTATTTTTTAAAATCTCACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * * *
10128 ATGTTATTTCAAATAAGCTTGTACAGA-CAAAAACAATTGTTTTGTGATAAAATAAAAGGTTATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * *
10192 CTGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTG
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
10235 CATTGGTCAT
Statistics
Matches: 2052, Mismatches: 423, Indels: 230
0.76 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
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163 2 0.00
164 4 0.00
165 2 0.00
166 4 0.00
167 1 0.00
168 8 0.00
169 103 0.05
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184 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA
TTTTTTAAAATCTCACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:8310 original size:542 final size:535
Alignment explanation
Indices: 7543--10119 Score: 1728
Period size: 542 Copynumber: 4.9 Consensus size: 535
7533 ACGATTTAAA
*** * * * * * *
7543 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAACTAATTCAGTAAACT-GATTTATTTTTTAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAAAACTACTTCA-AAAAATAGATTTAGTTTTTAA
* * * * ** *
7607 ATC-TCT--TAATTTTCATAATATTAATAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTGTG
65 ATCTTTTAATAATTTTAAAAATATTAAT-AAAGTAGCATTATTTTATTTTGGAT-ATTTTTTATG
* *
7669 AACTGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGATCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAA
128 AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTC-A
* *
7734 ATAGTCATAAT-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATATCTTGCTTATTA
191 ATAGTCATAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTA
* *
7798 ATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAC
256 ATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * *
7863 TATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACT
321 TGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACT
* * **
7928 ATTTGAACTAATTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATATCTCATTTATTAATTTTTAAAATATT
386 ATTTGAACTAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTCA-TTATTAATTTTTGGAATATT
* * * *
7993 ATTAGATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTATG-ATCAGAAATAATTGTTTTATGACAA
450 ATTAAATTAGTATTATTTTTAT-TGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTATTGTATAACAA
8057 AACAAAGATCATAATGATTTGAG
513 AACAAAGATCATAATGATTTGAG
* * * * *
8080 ATTGATATTTGTTCAAATAGTTATAACTATTAAAACTACTTCAAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAAAACTACTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAA
**
8145 TCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATATGTTTTTA
66 --TCTT--TTAATAATTTTAAAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAT-TTTTTA
* * * * * * *
8210 TTAATTGAAAAAATTGTTTCATGACAAAA-AAAATGTCAAAATAATTTTAAATAGATAATTGTTC
126 TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTC
* * * *
8274 AAGTAGTTAT-ATCTATTTGAAATTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAT
190 AA-TAGTCATAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTAT
** * * *
8338 TAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATA
254 TAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * **
8403 ATTGTTTTATGATTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAA
319 ATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAA
** ** * * *
8468 CTATTTGAACTGGTTCAACTAACATATTTATTTTTT-AA-ATCTC-TTACTAATTTTTGGAATAT
384 CTATTTGAACTAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTCATTATTAATTTTTGGAATAT
* * * * *
8530 TAGTAAATTAGTATCATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGGACTAATTATTGTATAACAA
449 TATTAAATTAGTATTATTTTTATT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTGTATAACAA
* * *
8595 AATAAAGATCTTTATGATTTGAG
513 AACAAAGATCATAATGATTTGAG
* ** * ***
8618 ATAGATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAAAACTACTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAA
* * * *
8683 TCTTTTATTACTTTTAAAAATATTAATAAA-TCA-CTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATG
66 TCTTTTAATAATTTTAAAAATATTAATAAAGT-AGC-ATTATTTTATTTTGGAT-ATTTTTTATG
* *
8746 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
128 AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCA-
* * * * * * * * * *
8811 ATGGACATGA-CTATTTGCACTTATTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTCCTACCTATTA
191 ATAGTCATAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTA
* * * * *
8874 A-TTTACAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACA
256 ATTTTTCAAAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACA
* * * * * * * * *
8937 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAAAAATTGTTCAAACAGTCATAA
319 ATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAA
* * * * * * *
9002 CTATTT-AAGCTTACTCGGTAAACAAATCTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTTTGGAAT
384 CTATTTGAA-CTAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTCA-TTATTAATTTTTGGAAT
* * * * * * * * ** * *
9065 ATTATTAAATCAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGGACAAAAACAACTCGTT-TGTCA
447 ATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA-TTATTGTATAA
* * * *
9129 CAAAAAAAAGGTTATAACT-ATTTGAA
510 CAAAACAAAGATCATAA-TGATTTGAG
* * * * *
9155 ATAGATAATTGTTCAAATAGA-CATAACTATTTAAAC-ATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTA
1 ATAGATAATTGTTCAAATA-ATCATAACTATTAAAACTA-CTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTA
* *** * **** **
9218 AAT-TTTTAATTATTACAGTTTGGAATATTAATAAATTTA--ATTATTTTATTAACAATAAGCTT
64 AATCTTTTAATAATT----TTAAAAATATTAATAAA-GTAGCATTATTTTATTTTGGAT-ATTTT
* * * * * *
9280 GTATGGACAGAAACAATTGGTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATT
123 TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA-TGATTTCAAATAGATAATT
* * * * **
9344 GTT---T-G----AA-C-------A--TGTTCAGAAAAGAAATTTATTTTTT-AAAT-TTTTATT
186 GTTCAATAGTCATAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCT
** * *
9389 TATTAAATTTTGGAATA-TTAATAAATT--TAATTATTTTA-TTCATAATAAGCTTGTATGAA-T
251 TATT-AATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
9449 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAAA-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
313 A-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTC-AAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAAT
* * * ** *** * * * * *
9513 AGTCATAAATATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTATTACTCATTAATTT
376 AGTCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTCA-TTATTAATTT
* * * * ** * * * *
9578 TTAGAATATTAATAATTTAGTAATA-TTTTATTTAGAATAAGCCCGTATGAATTGATACAAGTAT
440 TTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA-TT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTAT
* * * *
9642 TTTATGACAAAACAATAGGTCATAATGATTTGAA
503 TGTATAACAAAACAA-AGATCATAATGATTTGAG
* ** ** * * *
9676 ATAGATAATTG-----ATAA-C-T-A-T-TT-GAACTTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTAAAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAAAACTACTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAA
* * ** * * * **
9729 TCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATGTGAATAAACTTTTA
66 TCTTTTA---A-TAATTTTAAAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGAT-ATTTTTTA
*** * * ** * * * *
9794 TGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTC
126 TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTC
* * * *
9859 AAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTATT-TGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTA
190 -AATAGTCATAATCTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTA
* * * *
9921 TTAGTTATCTT-AATA-TTAATAAATTTGTATAATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
253 TTAATT-T-TTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACTA-
* * * * * *** * *
9982 AAA-ATTTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAG
314 AAACA-ATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAG
* * * * * ** * * * * *
10045 TCATAATTAGTTGTATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AA-ATCTC-TTATTAATTTTTA
378 TCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTCATTATTAATTTTTG
*
10107 GAATATTAATAAA
443 GAATATTATTAAA
10120 ATAGAAATAT
Statistics
Matches: 1646, Mismatches: 303, Indels: 193
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
509 11 0.01
510 38 0.02
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512 5 0.00
513 2 0.00
514 5 0.00
515 3 0.00
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518 4 0.00
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527 1 0.00
528 3 0.00
529 27 0.02
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532 3 0.00
533 10 0.01
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542 230 0.14
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544 16 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (535 bp):
ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAAAACTACTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAA
TCTTTTAATAATTTTAAAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATATTTTTTATGAAC
TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAATAGT
CATAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
TCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
TATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTG
AACTAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTCATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAA
TTAGTATTATTTTTATTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTGTATAACAAAACAAAGA
TCATAATGATTTGAG
Found at i:9355 original size:161 final size:161
Alignment explanation
Indices: 9188--9507 Score: 505
Period size: 161 Copynumber: 2.0 Consensus size: 161
9178 TAACTATTTA
*
9188 AACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAATTATTACAGTTTGGAATATTAATAAA
1 AACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAATTATTAAAGTTTGGAATATTAATAAA
* *
9253 TTTAATTATTTTATTAACAATAAGCTTGTATGGACAGAAACAATTGGTTTATTACAAAACAAAAG
66 TTTAATTATTTTATTAACAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG
**
9318 GTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTTG
131 GTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTTG
* * * * *
9349 AACATGTTCAGAAAAGAAATTTATTTTTTAAATTTTTATTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAA
1 AACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAATTATTAAAGTTTGGAATATTAATAAA
* * * *
9414 TTTAATTATTTTATTCATAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
66 TTTAATTATTTTATTAACAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG
*
9479 GTCGTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTT
131 GTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTT
9508 CAAATAGTCA
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 15, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
161 144 1.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (161 bp):
AACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAATTATTAAAGTTTGGAATATTAATAAA
TTTAATTATTTTATTAACAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG
GTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTTG
Found at i:9388 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 9368--9399 Score: 55
Period size: 15 Copynumber: 2.1 Consensus size: 15
9358 AGAAAAGAAA
*
9368 TTTATTTTTTAAATT
1 TTTATTTATTAAATT
9383 TTTATTTATTAAATT
1 TTTATTTATTAAATT
9398 TT
1 TT
9400 GGAATATTAA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 16 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.00, G:0.00, T:0.72
Consensus pattern (15 bp):
TTTATTTATTAAATT
Found at i:9576 original size:700 final size:692
Alignment explanation
Indices: 8739--10038 Score: 1528
Period size: 700 Copynumber: 1.9 Consensus size: 692
8729 TTGAATAATT
*
8739 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
1 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT
* * * * ** ** * * * *
8804 TGTTCATATGGACATGACTATTTGCACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTCCTACC
66 TGTTCAAATAGACATAAATATTTAAACTTATTCAATAAACAAATTCATTTTTAAAATCTACTACC
* * **
8869 TATTAATTTACAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAA
131 TATTAATTTACAAAATATTAATAAAGTAGTAATATTTTATTTAGAATAAACCCGTATGAATAGAA
* *
8934 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAAAAATTGTTCAAACAGTC
196 ACAAGTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAAAAAA---TT------G--
* * *
8998 ATAACTATTT-AAGCTTACTCGGTAAACAAATCTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTTTG
249 ATAACTATTTGAA-CTTACTCAGTAAACAAATCTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
9061 GAATATTATTAAATCAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGGACAAAAACAACTCGT-TT
312 AAATATTAATAAATCAATATTATTTTAATGTGAATAAACTAGTATGAACAAAAACAA-TCGTGTC
* * * * * * *
9125 GTCACAAAA-AAAAGGTTATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAA
376 ATCACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTAA
*
9189 ACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAAT-TTTTAATTATTACAGTT-T-GGAATATTAATA
441 ACATATTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATCTTTTAATTATT--AGTTATCGGAATATTAATA
* * * *
9251 AATTT-AATTATTTTA-TTAACAATAAGCTTGTATGGACAGAAACA-ATTGGTTTATTACAAAAC
504 AATTTGAATAATTTTATTTAA-AATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATATTAGTTTATGACAAAAC
9313 AAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTTGAACATGTTCAGAAAAGAAATTTATTTTT
567 AAAAGGTCAT-ACTGATTTGAAATAGATAATTGTTTGAACATGTTCAGAAAAGAAATTTATTTTT
9377 TAAATTTTTATTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTAATTATTTTATTCATAATAAGC
631 TAAATTTTTATTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTAATTATTTTATTCATAATAAGC
* *
9439 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAAAGATTTGAAATAGATAAT
1 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT
* * * *
9504 TGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTATTA-C
66 TGTTCAAATAGACATAAATATTTAAACTTATTCAATAAACAAATTCATTTTTAAAATCTACTACC
** * ** * *
9568 TCATTAATTTTTAGAATATTAATAATTTAGTAATATTTTATTTAGAATAAGCCCGTATGAATTGA
131 T-ATTAATTTACAAAATATTAATAAAGTAGTAATATTTTATTTAGAATAAACCCGTATGAATAGA
* * * * *
9633 TACAAGTATTTTATGACAAAACAATAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGATAACTATTTG
195 AACAAGTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAAAAATTGATAACTATTTG
** * *
9698 AACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
260 AACTTACTCAGTAAACAAATCTATTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* ** * * *
9763 TTAATATTATTTTAATGTGAATAAACTTTTATGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAAACAAAA
325 TCAATATTATTTTAATGTGAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATCGTGTCATCACAAAACAAAA
* * * * ** *
9828 AGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTTGATAAA
390 AGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTAAACATATTCAAAAAA
* * * ** *
9893 CAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATCTTAATATTAATAAATTTGTATAATTTTA
455 CAAATTTACTTTTTAAATCTTTTAATTATTAGTTATCGGAATATTAATAAATTTGAATAATTTTA
* * * * * *
9958 TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATTTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTT
520 TTTAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAATATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATACTGATTT
10023 GAAATAGATAATTGTT
585 GAAATAGATAATTGTT
10039 CAATAGTCAT
Statistics
Matches: 499, Mismatches: 88, Indels: 34
0.80 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
688 23 0.05
689 91 0.18
690 74 0.15
691 29 0.06
692 71 0.14
693 3 0.01
697 2 0.00
699 3 0.01
700 203 0.41
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (692 bp):
TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT
TGTTCAAATAGACATAAATATTTAAACTTATTCAATAAACAAATTCATTTTTAAAATCTACTACC
TATTAATTTACAAAATATTAATAAAGTAGTAATATTTTATTTAGAATAAACCCGTATGAATAGAA
ACAAGTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAAAAATTGATAACTATTTGA
ACTTACTCAGTAAACAAATCTATTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
CAATATTATTTTAATGTGAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATCGTGTCATCACAAAACAAAAA
GTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTAAACATATTCAAAAAAC
AAATTTACTTTTTAAATCTTTTAATTATTAGTTATCGGAATATTAATAAATTTGAATAATTTTAT
TTAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAATATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATACTGATTTG
AAATAGATAATTGTTTGAACATGTTCAGAAAAGAAATTTATTTTTTAAATTTTTATTTATTAAAT
TTTGGAATATTAATAAATTTAATTATTTTATTCATAATAAGC
Found at i:10211 original size:176 final size:179
Alignment explanation
Indices: 9814--10227 Score: 429
Period size: 176 Copynumber: 2.3 Consensus size: 179
9804 CAATTGTGTC
* * * * * *
9814 ATGACAAAACAAAAAGTCATAAC-AATTTGAAAA-AAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
1 ATGACAAAACAAAAGGTTAT-ACTGATTT-AAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAGTT
*
9877 GAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATCTTAATATTAATA
64 GAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TTACTTATTAATTATCTTAATATTAATA
* * * * *
9942 AATTTGTATAATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATTTTATTTT
127 AAATAGTATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAAGAATAGAAAATATTATTTT
* * *
9995 ATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAATTAGTTGT
1 ATGACAAAACAAAAGGTTATACTGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAGTTGA
* * * *
10059 ATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAA
66 ACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTATCTT--AATATTAATAAA
*
10120 ATAG-A-AATATGTTATTTCAAATAAGCTTGTACAGACA-A-AAACA-ATTGTTTT
129 ATAGTATAAT-T-TTATTTCAAATAAGCTTGTA-AGA-ATAGAAA-ATATTATTTT
* * * *
10171 GTGATAAAATAAAAGGTTATACTGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAA
1 ATGACAAAACAAAAGGTTATACTGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
10228 CTATTTGCAT
Statistics
Matches: 197, Mismatches: 26, Indels: 24
0.80 0.11 0.10
Matches are distributed among these distances:
174 5 0.03
175 3 0.02
176 91 0.46
177 15 0.08
178 1 0.01
180 50 0.25
181 32 0.16
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
ATGACAAAACAAAAGGTTATACTGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAGTTGA
ACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTATCTTAATATTAATAAAAT
AGTATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAAGAATAGAAAATATTATTTT
Found at i:10659 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 10638--10668 Score: 53
Period size: 16 Copynumber: 1.9 Consensus size: 16
10628 TAGTTATGAC
10638 TATTTAAATAATTATT
1 TATTTAAATAATTATT
*
10654 TATTTAAATCATTAT
1 TATTTAAATAATTAT
10669 GATCTTTTGT
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 1, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
16 14 1.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.03, G:0.00, T:0.55
Consensus pattern (16 bp):
TATTTAAATAATTATT
Found at i:10759 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 10260--10764 Score: 507
Period size: 180 Copynumber: 2.8 Consensus size: 178
10250 AATTATTTTT
* * * * *
10260 GTTCAAATAATTTTGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTTGTTTTGC
1 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGT
* * * *
10324 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTACTAGTA
64 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * * *
10388 TTCCAAAGATGAATAAGTAAAAATATATAAAATAAATTTGTTTTCTGAACAC
127 TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATATAAAAAATAAATTTATTTACTCAACAC
* * * *
10440 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTC
1 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
10505 ACAAACCAATTGTTCCTATACGTA-AAAGCTTATTTGAAATTAAATAATACTAATTTATTAAAAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAA-CTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
10569 TCCCAAAATTATTAAGCAAAATATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-CAAGTGA-
128 TCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATATAAAAAATAAATTTATTTACTCAA--CAC
* * * * *
10621 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTAA
1 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * *
10686 TAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
*
10751 TAAAAATTAATAAG
130 CAAAAATTAATAAG
10765 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 262, Mismatches: 54, Indels: 18
0.78 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 5 0.02
180 199 0.76
181 57 0.22
182 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
AAAAATTAATAAGCAAAAATATAAAAAATAAATTTATTTACTCAACAC
Found at i:11198 original size:35 final size:36
Alignment explanation
Indices: 11155--11227 Score: 130
Period size: 36 Copynumber: 2.1 Consensus size: 36
11145 ATTCAAAATA
*
11155 AAATAATATTAC-TTATTAATATTTCAAAAATTGAG
1 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAG
11190 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAG
1 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAG
11226 AA
1 AA
11228 GTTGGAGATT
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 1, Indels: 1
0.95 0.03 0.03
Matches are distributed among these distances:
35 12 0.33
36 24 0.67
ACGTcount: A:0.51, C:0.05, G:0.04, T:0.40
Consensus pattern (36 bp):
AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAG
Found at i:11741 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 11190--12521 Score: 909
Period size: 181 Copynumber: 7.5 Consensus size: 179
11180 AAAAATTGAG
* * * * ** * **
11190 AAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTAAAACATAAATCAGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTAT--GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * *
11254 TTATCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAAC
64 TTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-ACC
* ** *
11318 TTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTAATT-AGAATA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATA
* * * *
11371 AAATAATACTAATTTATTAATGTT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGA--T------T--ATCTGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTAT--GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * *
11425 TTA-CTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAGACAATTATATATTTCAAGTCATTATA-ATG
64 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATACCT-
* * * *
11488 TTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCAT--AAGCTTATTCAAAAGA
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * *
11537 AAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAATTTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
*** * * * * * * **
11602 TGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATATTTTT
65 TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA-CCTT
* * * * *
11667 TTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAGAATA
129 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* *
11718 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
* * * * * * * * * *
11780 ACCAAACTAGTTCAATTAGTTTTAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGACCCTT
66 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-ACCTTT
* * * * * * * * *
11845 TGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTATTGATA-TAGTCTTATTCGGATTA
130 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATA
* * * * * * * * *
11895 AAGTTATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAGATAAATCTG-T
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTAT-GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * *
11959 TAGCCTG-ACCA-TTGCCAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATGAC
65 TA-CC-GAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AC
* * **
12021 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTGGGAATA
126 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * * * * * *
12075 ACATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAATTGAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTATG-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * * * *
12140 TATTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATTTACCTATTTCAAATTGCCA-TA-ACC
65 TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-T--CATTATACC
* * * * * * *
12203 TTTTATTTTGTCATAAAATAAAAT-TTTCTATTCCTACAAGCTTATTTCA-ATTA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATA
* * *
12256 AAATAATACCAACTTATT-ATCATTCA-GACAATTAATAAGTGAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
1 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-ATGA-AATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * *
12318 GTTTACCAAATAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTAATTCAAATCATTATGGC
62 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AC
* * * *
12383 TTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTGTTC-GATTA
126 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * * * * ** * *
12436 AAATAATATTAGTATAATAATATTTTGACGGTTAATAAGT-AGAAGATTTTAAAAATAAATATGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTATGA-AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGT
*
12500 TTATCGAACAAGTTCAAATAGT
64 TTACCGAACAAGTTCAAATAGT
12522 CATAACTGTA
Statistics
Matches: 903, Mismatches: 194, Indels: 109
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
165 8 0.01
166 41 0.05
167 1 0.00
168 28 0.03
169 4 0.00
170 44 0.05
171 8 0.01
173 1 0.00
174 1 0.00
176 9 0.01
177 173 0.19
178 14 0.02
179 31 0.03
180 222 0.25
181 308 0.34
182 7 0.01
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATACCTTTT
GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
Found at i:12291 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 11203--12527 Score: 919
Period size: 361 Copynumber: 3.7 Consensus size: 357
11193 TAATATTACT
* * * * * *
11203 TTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAGTTG-GAGATTTAAAACATAAATCAGTTTATCAAATC-A
1 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAA
* * * * *
11265 GTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAAC-TTTCGTTTTGT
63 GTTC-AATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTTTGT
** * * *
11329 CATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTAATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATG
126 CATAAAACAATTGTTTTTGTTAATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * * * * * *
11393 TT-TCAAAAATTAATAAG-----TAGGAGAT-TATCTGTTTA-CTAACTAGTTCAAATAATTATG
190 TTCT-GAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATA
* * ** * *** ** * * *
11450 ACTATTTAGACAATTATATATTTCAAGTCATTATAA-TGTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTT
254 ACAATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCCTTTATTTTATCATAAAATAAATATTT
* * * ** *
11513 ATGTTCAT-AAG-CTTATTCAAAAGAAAATAATACTAA-
319 CTATTCATAAAGTCTTATTCGAATTAAAATAATACCAAC
* * * * * * * **** *
11549 TCTAATAATATTATGAAATTTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAG
1 T-TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * *
11613 TTCAAATAGTTAAGGCTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCTTTAT-ATTTTTTTGTTTTGTC
64 TTC-AATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTC
* * * *
11677 ATAAAACAAATGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
127 ATAAAACAATTGTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
11742 TTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTTTAACA
192 CTGAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATAACA
** * ** * * *
11807 ATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTA
257 ATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCCTTTATTTTATCATAAAATAAATATTTCTA
* * * * * * * *
11872 TTGATATAGTCTTATTCGGATTAAAGTTATGCTAAT
322 TTCATAAAGTCTTATTCGAATTAAAATAATACCAAC
* ** *
11908 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AACAAATTTAAAAGATAAATCTG-TTAGCCTGACCA-
1 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAAG
* *
11970 TTGCCAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTATTTTGTC
64 TT--CAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTC
* ** * *
12034 ATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTGGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT
127 ATAAAACAATTGTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ***
12099 CTGAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAATTGAATTTGTTTATTGAACAAATTCAAATAGTTAT
192 CTGAAAA-T--T-AATAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
12164 GACTATTTGAACATTTACCTATTTCAAATTGCCATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAA-ATT
253 AACAATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCCTTTATTTTATCATAAAATAAATA-T
*
12228 TTCTATTCCTACAAG-CTTATTTC-AATTAAAATAATACCAAC
317 TTCTATTCATA-AAGTCTTA-TTCGAATTAAAATAATACCAAC
* * *
12269 TTATT-ATCATTC-AGACAATTAATAAGTGAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAG
1 TTATTAAT-ATTCTA-AAAATTAATAAGTGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
12332 TTCATATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTAATTCAAATCATTATGGCTTTTTGTTTTGTTA
64 TTCA-ATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
12397 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTGTTC-GATTAAAATAATATTAGTATAATAATATTT
128 TAAAACAATTGTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
*** * * * * * *
12461 TGACGGTTAATAAGTAGAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATA
193 TGAAAATTAAT-A--AGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATA
12526 AC
254 AC
12528 TGTAGATACC
Statistics
Matches: 772, Mismatches: 163, Indels: 73
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
345 2 0.00
346 5 0.01
347 160 0.21
348 2 0.00
352 5 0.01
353 8 0.01
354 46 0.06
355 3 0.00
356 25 0.03
357 86 0.11
358 101 0.13
359 3 0.00
360 12 0.02
361 254 0.33
362 60 0.08
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (357 bp):
TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTT
CAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGA
AAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATAACAATTT
AAACAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCCTTTATTTTATCATAAAATAAATATTTCTATTCA
TAAAGTCTTATTCGAATTAAAATAATACCAAC
Found at i:12642 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 12634--12689 Score: 67
Period size: 3 Copynumber: 18.0 Consensus size: 3
12624 AATATTTTTC
* *
12634 ATT ATT ATT ATG ATT ATT ATT ATT ATT GTT ATT ATT ATT ACTT ATCT
1 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT A-TT AT-T
*
12681 ATT AAT ATT
1 ATT ATT ATT
12690 TTTTATTTAT
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 6, Indels: 4
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
3 39 0.87
4 6 0.13
ACGTcount: A:0.32, C:0.04, G:0.04, T:0.61
Consensus pattern (3 bp):
ATT
Found at i:13489 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 13483--13585 Score: 138
Period size: 3 Copynumber: 34.0 Consensus size: 3
13473 TTCTTATTTC
* * *
13483 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TT- TCTT TTA TTA CTA TTA TTA TTA TCA
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA T-TA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA
13528 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA CTTA
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA -TTA
13574 TTGA TTA -TA TTA
1 TT-A TTA TTA TTA
13586 GAATTATTTA
Statistics
Matches: 90, Mismatches: 5, Indels: 10
0.86 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
2 3 0.03
3 80 0.89
4 7 0.08
ACGTcount: A:0.31, C:0.04, G:0.01, T:0.64
Consensus pattern (3 bp):
TTA
Found at i:13880 original size:16 final size:18
Alignment explanation
Indices: 13853--13885 Score: 52
Period size: 17 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
13843 TAAAGTTGAA
13853 TCATTATTATTT-TTTTT
1 TCATTATTATTTCTTTTT
13870 TCATT-TTATTTCTTTT
1 TCATTATTATTTCTTTT
13886 CTTTTTGAAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
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Consensus pattern (18 bp):
TCATTATTATTTCTTTTT
Found at i:13885 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 13853--13885 Score: 50
Period size: 16 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
13843 TAAAGTTGAA
13853 TCATTATTATTTTTTTT
1 TCATTATTATTTTTTTT
*
13870 TCATT-TTATTTCTTTT
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* **
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* * *
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*
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*
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* * * * *
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25777 TTTTTCTTAT
*
25787 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TT- TCTT TTA TTA TTA TTA TTA TTA
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*
25832 TTA TTA TCA TTA TTA TTA TTA TTA TTA CTTA TTGA TTA
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* * * * *
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** * * ** *
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* *
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130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * *
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* *
26856 CTATTCATACAAGCTTATACTAAACAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
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* * * * * *
26920 ATAA-AAATTTTAAAAATAAAT---TTTTTTTAACACGTTCAAATAGTTATG
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* * * * * * **
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
27033 TTGTTCATACAAG-TGTA-T-T---T----GAATA-T--TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
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* * ** * * *
27085 GTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATA
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
27137 ATTGTTTGAATAATTATTTATTTTAAATAGTTAT---CTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
27199 CTATTCACACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTGATAG
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* * * * * * * *
27263 GTAAGAGATTTATAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTCCTAATAGTCATG
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * *
27315 TCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
* ** * ** ***
27380 T-TATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAAATAAGAGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--T
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* *
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128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCT-AACA-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
27494 ACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * *
27558 CTTTTCATACTTGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * *
27619 -TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTG-TGTT-TGCTAA-ATAGCTCAAATAGTTAAG
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGAT-TTAT-CTAACA-AGTTCAAATAGTTATG
*** * * * * * * *
27669 ACTATTTTTTC-ATAAAAC-ACATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTTATTTCA-AA
1 ACTATTTGAACAAT-TATCTA-TTTCAAATCGTTATGAC--CTT------TTGTTT-TGTCATAA
** * * * ** ** * *
27731 TAGTTATGATCT-TTTGCTTTGTCATA-AAAC-AATT-T-TTTCTATTCATAC-AAGTTTATTCA
55 -A---ACAAT-TGTTT-CTAT-TCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAA-TTTATT-A
* * * * * * ** * * * *
27790 A-AAT-AAAATAATAGTAATTTATTAATA-TTTTAAAATTTAATAGGTAGGA--GATTTAA-AAA
111 ATATTCCAAA-AAT--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAA---AATAAAT-CGATTTATCTAACAAG
* *
27849 AT-AAATCTATTTACTG
168 TTCAAA--TAGTTA-TG
* * * * * * * * **
27865 AACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTATTACGACCTTTTGT
1 -ACTA-TTTGAACAAT--TATCTATTT---CAA--ATCGT-TATGACCTT-TT--G---TTTTG-
* * ** * * *
27929 TTTATTATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTTATTTATT
49 ----TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATT
*** * * *
27994 AATATTTTGAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAACTAAATCTA-TTGTCTGAA-ATAGTTCAA
110 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCT-AACA-AGTTCAA
28053 ATAGTTATG
173 ATAGTTATG
* * * *
28062 ACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
28125 TCTTTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTACTTTAATAATATTCCAAAAATTAATAA
65 TCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * * *
28190 GTAAAAAATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAG
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCG-ATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * *
28242 GCTATTAGAATAATTATCTGTTTCAAATCATTCTGACCTATTGTTTAGTAATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * *
28307 C-AGTTCATACAAGCTT-TTTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATG
66 CTA-TTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * * * * *
28370 AGCAAGAAATTCAAAAAAATAAATTTG-TTTACCGAATAAGTTCAAATA-TATTTC
129 AGTAAGAGATT-TAAAAAATAAA-TCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGT-TATG
* * * * * *
28424 ACTATTTGAACAATCGATCTAACTATTTAAAGTCATTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAATAAT
1 ACTATTTGAACAAT-TATCT-A-T-TTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * ***
28489 TG-TT-TAGTTCATAGAAGCTTATTCGAAATAAAACAATACTACTTTACTAATATTTTGAAAATT
61 TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * *
28552 AATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA---A-TTATTTAA-ATCGATTCAAATAATTAT-
125 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACA-AG-TTCAAATAGTTATG
* * **
28605 AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** * * *
28670 TTTA-TCGTATATA-CCCATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAACATTTAT
65 TCTATTCATACA-AGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* **
28732 AAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTA-C---C--G---AACCAG-T-T-
128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
28774 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * ***
28839 CAATTCGTA-TAGTCTTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTATGAAAATTAATA
66 CTATTCATACAAG-C-TTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * *
28903 ACTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTG-TTT-GCCAA-AATTGTTCAAACAGTTAAG
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTATCTAACAA--GTTCAAATAGTTATG
* * ** * * * *
28955 ATTATATGATTAATTTTCT-TTGTGAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
29019 TC-AGTTCAAACCAGCTTATT-TGAAATAAAATAAAACT-ATTTATTAATATTCC-TAAATT--T
65 TCTA-TTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* * *
29078 AA-TAAGTGATTTAAAAAATGAATCTG-TTTA-CTGAATC-AGTTCAAATAATTATG
128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTATCT-AA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * * * *
29131 GCT-TTGTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTCATAATATAAGAATTATA
1 ACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-
* * * * * *
29195 TT-TGA-ACATTCAAGCTT-TTTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTCTTTCAAAAACTA
64 TTCT-ATTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCCAAAAATTA
*
29257 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTA-CTAAACTAA-TTTAAATAGTTATG
126 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTATCT-AAC-AAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * * * *
29313 ACTATTTGAACATTTGTAAACTTT-AAATTCG-TATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTAT
1 ACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
29376 TTTTGTTCATAAAAGTTTATTC-AGAATAAAATAACACTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAAT
64 TTCTATTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* * * * * * * **
29440 AACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTG-TTTACCGAACCAGTTCAAATATTTAAA
128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
29494 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTGTTTTATCATAAAATAGGTTTGT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGT
** * ** * *
29559 TTGAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T
64 TTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* ** * * *
29620 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTAT-G-CTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATT
128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAA--ATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
29673 ACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
29738 TTATTCATATAAGTTTGTT-TGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * *
29799 G-AAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATA
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
29850 ACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *** *
29915 CTATTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
29979 GTAAAAAATTTTAAAAATAAATATG-TTTA-CTAAACTAGATCAAATAATCATG
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGATTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * **
30031 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAGAATAATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
30096 CAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-
66 CTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * *
30160 TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTGAACAAATTTAAATAATTATG
131 T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
30212 ACTATTTGAATAATTAGCTATTTGAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTCTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
30277 -TATGCTCATCCAAGCTTATT-TCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AAGATAATTA
66 CTAT--TCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTA
* * * * *
30338 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAATTTCAAATCA-TTATG
126 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAAT-AGTTATG
* * * * * *
30394 ACTATTT---C-A-TATGTA----AACTTGTTATGACTTTTTGTTGAT-TCATAAAAGAA-TGAT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTG-T
* * * * * *** *
30448 TTCTATTTATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGATAATTAAT
64 TTCTATTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* ** *
30512 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATG
128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
30566 ATTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATACTTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * ** * *
30631 -TGGTTCTTATAAGCTTATT-TGAAGTAAGTTAGTACTAGTTTATTAATA-TCTCAAAAATTAAT
66 CT-ATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-CAAAAATTAAT
* * * * * * * *
30693 GAGTAAGAGAATTCATAAAAA-GAAT-AAGTTTACCAAATAAGTTCAAAAAGTTATG
128 AAGTAAGAG-ATTTA-AAAAATAAATCGA-TTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * ** *
30748 ATTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAATGAATTGGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
30813 CTATTCATCCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTTATTTTCCAAAAATTAATAA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * *
30877 ATAA-A-ATTTTTAAAAATAAAT--ATGTTTTTTGAACATGTTCAAATATTTATG
130 GTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCGAT-TTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
30928 ACTATTTGAAGAATGATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
* * * * * *
30993 T-TGTTCATAAAAGTTTTTTCGAAACAAAATAATACTAATTTATTGAA-ATTCCAAAAATTAATA
65 TCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTCCAAAAATTAATA
* * *
31056 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTA-CTAAGTAAGTTCAAATAGTTATG
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGATTTATCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** *
31109 ACTATCTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * *
31174 CTATTCATACAATTTTATT-TGAAATAAAAAAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
** * * * *
31238 GTTTGATATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATG
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * **
31290 TCCATTTGAACTATTA-CTTATTTCAAATCGTAATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *** *
31354 TCCATTCATGTATAA--TTATTC-AGAATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAA
65 TCTATTCA--TACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * *
31416 T-A--AA-AGATTTAAAAACA-AAATCTATTTACCAAAACAA-TTAAAATATTTATG
127 TAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCGATTTATC-TAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * *
31467 ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATATTTATGACC-ATTATTTTGTCCTAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * ** **
31531 CTTTTCATACAAGCTTATACGGATTAAAATAATACTAATTTAACAATATTCCAAAAATTTGTAAG
66 CTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * ** * * *
31596 TAAGATATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAG
131 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCG-ATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** *
31647 ACTATTAGAACAATTATC-ATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAATCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
31711 -TAGCTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATA
66 CTA-TTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * *
31774 AGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTAAAATAGATT-TG
129 AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAG-TTATG
** *
31828 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCATGTCGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
31893 C-AGTTCATAAAAACTCA-TCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAGAATTAATA
66 CTA-TTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * *
31956 AGTATGAGATTTAAAAACTGAAGCTG-TTT-TCTGGATC-ACTTCAAATAGTTATG
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTATCT--AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
32009 ACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAACACAATCGCTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
* * ** * * ***
32073 TTTA-TCATACAAGCATATT-TGGATAAAAATAATACTAACTTAATAATATTTTGAAAA-T--TA
65 TCTATTCATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * *
32133 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAG
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCG-ATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * *
32185 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCTTTAGTTTAGTCATATAATAATTATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * *
32250 C-AGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAGTTATTGACATTCAAAAAATTAATAA
66 CTA-TTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * *
32314 GCATGAGATTTGAAAAAATAAATCCATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATG
130 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
32367 ACTATTTCAACAAGTTATC-ATTTAAAATCATTATGACCATATATTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
32431 T-TAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAACAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
65 TCTA-TTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * *
32495 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCAAACAA-TGCAAATAATCATG
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGA-TTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * *
32547 GCCATTT-AGACAACTATCTATTTTAAATCATTATTA-CTTATGTTTTGTTACAAAATAATTGTT
1 ACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * * *
32610 TTTCA-AGATACAAGCTTTTTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAGAA-T--T
65 TCT-ATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA-AATTAAT
* * * * *
32670 AA-TAAGAGATTTAAAAAAGAAATCTG-TTTGT-TGAACCAGTTTAAGTAGTTATG
128 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
32723 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-CTGTTATAACC-TTTGTTCT-ACATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
32785 TCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAACTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAA
65 TCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * ** * *
32850 CTATGAGATTTAAAAAATAAATTCG-TTTGCCTAACCAGTTCAAATAGTTAAG
130 GTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * * * *
32902 ACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATAACCCTTTGCTTTGTCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
32967 C
66 C
32968 AACTCGTTCG
Statistics
Matches: 4770, Mismatches: 1048, Indels: 718
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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208 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
CTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
TAAGAGATTTAAAAAATAAATCGATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATG
Found at i:27511 original size:179 final size:175
Alignment explanation
Indices: 27059--27675 Score: 607
Period size: 178 Copynumber: 3.5 Consensus size: 175
27049 ATTTGAATAT
* * * *
27059 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCAAATAAG
1 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAA-CAG
* * * * * *
27123 TTCAAATAGTTATAATTGTTTGAATAATTATTTATTTTAAATAGTTAT--CTTTTGTTTTGTCAT
61 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTGTTTTGTCAT
* * *
27186 AAAGCAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
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* * *
27237 TTTATTAATATTCTAAAAATTGATAGGTAAGAGATTTATAAAATAAATCTACTTAC-CAAACAAG
1 TTTATTAATATTCCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAAC-AG
* * * * * *
27301 TCCTAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTGTTTTGTCA
61 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTT-TGTTTTGTCA
* * * **
27366 TAAAACAATTGCTTT-TATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAAATAAGAGA
124 TAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGATTATTCAGAATAAAAT-AATACTA-A
*** * *
27420 TTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACTGAAACAGTTCAA
1 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAGTTCAA
* * *
27485 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTCATAAAAT
66 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * *
27550 AATTGTTTCTTTTCATACTTGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAA
130 AATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
27596 TTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTGTGTTTGCT-AAATAGCTCAA
1 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAGTTCAA
*
27660 ATAGTTAAGACTATTT
66 ATAGTTATGACTATTT
27676 TTTCATAAAA
Statistics
Matches: 359, Mismatches: 65, Indels: 33
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 24 0.07
176 45 0.13
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178 121 0.34
179 75 0.21
180 7 0.02
181 46 0.13
182 13 0.04
183 20 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (175 bp):
TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTGTTTTGTCATAAAACA
ATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAA
Found at i:30084 original size:718 final size:712
Alignment explanation
Indices: 26610--32967 Score: 4104
Period size: 718 Copynumber: 8.8 Consensus size: 712
26600 TATGACAATA
* * * *
26610 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTAT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-T
*** * * *
26675 CGGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTT-GAAAATTAATGA
65 TAATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATT-A--A
* * * * * * *
26739 GTAACAGATTTAAAAAATGAATCGAT-TTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
125 -TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TATGTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * *
26803 AATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA
188 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAA
* * * * * * *
26868 GCTTATACT-AAACAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAAATTTT
253 GTTTAT-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---GATTTA
** * *
26931 AAAAATAAAT-T-TTT-TTTAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAATAATTATCTATTTC
313 AAAAATAAATCTGTTTATCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * ** * *
26992 AAATAGTTATGACATTTAGTTTTGTTATAAGCCAATTGTTTTTGTTCATACAAG-TGTATT----
377 AAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCAAA
* ** * * *
27052 -T----GAATA-T--TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTT
441 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * * * *
27109 ATTTA-TCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATAATTGTTTGAATAATTATTTATTTTAAATAGTTAT-
506 GTTTACT-AAACT-AGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * *
27171 --CTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAC
569 ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* * * * ** * *
27234 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTGATAGGTAAGAGATTTATAAAATAAATCTACTTACCAAACA
633 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * *
27299 AGTCCTAATAGTCATG
697 AGTTCAAATAGTTATG
* * *
27315 TCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
* * ** * ** **
27380 TTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAAATAAGAGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
65 TAATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAAT-AATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * *
27445 AGAGATTTAAAAACTAAATCTAT-TTACTGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
127 AGAGATTTAAAAAATAAAT-TATGTTAC-CAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * **
27508 TATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTT-TTCATACTTG
190 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTATTCATACAAG
* * * * * * *
27571 CTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
254 TTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAAT
* * *
27636 AATTGTGTTTGCTAAATAGCTCAAATAGTTAAGACTATTTTTTCATAAAACACATTCAAATAGTT
319 AAATCTG--T--T---TA--TC----------GA--A------C-T-----A-GTTCAAATAGTT
* * * *
27701 ATGACTAGTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TCTTTTGCTT-TGTCATAAAACAAT
350 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTG-TTCTATCATAAAACAAT
* * *
27764 TTTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTT-AAAATTT
413 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TT
* * * * * * * * * * *
27828 AATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTG
477 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * *
27893 AACAATTATCTATTTCAAATTATTACGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
542 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
* * * *** *
27958 GCAAAA--TTATTCAAAATAAAATAATATTTATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAATAAGAAA
606 --AAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAGAGA
* * * **
28018 TTTAAAAACTAAATCTATTGT-CTGAAATAGTTCAAATAGTTATG
669 TTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
28062 ACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * *
28125 TCTTTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTACTTTAATAATATTCCAAAAATTAATAA
65 T-AATTCATACAAGCTTATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** * * * * * * *
28190 GTAAAAAATTTAAAAAATAAA-TGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATTAGAATA
128 G----AGATTTAAAAAATAAATTATG-TTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
28254 ATTATCTGTTTCAAATCATTCTGACCTATTGTTTAGTAATAAAAC-AAT-TATTTCAGTTCATAC
188 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT-TTTTA-TTCATAC
* ** **
28317 AAGCTTT-TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAAAT
251 AAG-TTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGTGAT
* * * * * *
28380 TCAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATA-TATTTCACTATTTGAACAATCGATC
310 T-TAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACT-AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAAT-TATC
* * * * *
28443 TAACTATTTAAAGTCATTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTG-TT-TAGTTCATAGAAG
371 T-A-T-TTCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * *
28506 CTTATTCGAAATAAAACAATACTACTTTACTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
431 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * *
28571 AACTAAA-AT-TATT--TAAA-TCGATTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTC
496 AAATAAATATGT-TTACTAAACTAGA-TCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * **
28630 AAATTGTTATGAA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCGTATATA-CCCATTCAG
558 AAATTGTTAT-AACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAG
* * * *
28692 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAACATTTATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATC
620 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
28757 TGTTTACCGAA-C----C----AG-T-T-
684 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
28774 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
28839 CAATTCGTA-TAGTCTTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTATGAAAATTAATA
66 -AATTCATACAAG-C-TTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTA
* * * * * * * * **
28903 ACTAAGAGATTT-AAAAATAAATT-TGTTTGCCAAAATTGTTCAAACAGTTAAGATTATATGATT
124 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTATG-TTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* * * * *
28966 AATTTTCT-TTGTGAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATCG-TTTCAGTTCAA
187 AATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-GTTTTTA-TTCAT
* * * * * * *
29028 ACCAGCTTATTTGAAATAAAATAAAACT-ATTTATTAATATTCCTAAATTTAATAAGTGATTTAA
249 ACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAA
* * * *
29092 AAAATGAATCTGTTTA-CTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCT-TTGTCAACAATTATCTATTT
314 AAAATAAATCTGTTTATC-GAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * *
29154 CAAATCGTTATTACCTTTTGTT-TCATAATATAAGAATTATATT-TGA-ACATTCAAGCTTTTTT
376 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTCT-ATCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTC
* * *
29216 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TCTTTCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
438 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTT-GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * **
29280 AATCTGTTTACTAAACTA-ATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACATTTGTAAACTTT-AAATTC
501 AATATGTTTACTAAACTAGA-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATT-
* * * *
29343 G-TATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAGAATAAAA
563 GTTATAACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAA
* * * *
29407 TAACACTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTAC
627 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* **
29472 CGAACCAGTTCAAATATTTAAA
691 CGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
29494 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTGTTTTATCATAAAATAGGTTTGT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGT
* *
29559 TTGAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
64 TT-AATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * *
29623 AAGAGATTTAAAAAAT-AATTATGCTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATTACTATTTGAACAAT
126 AAGAGATTTAAAAAATAAATTATG-TTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
29687 TATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGT
190 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAGT
* ** * * *
29752 TTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTGATTTAAAAAATA
255 TTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATA
* * * * *
29817 AATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTT
320 AATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * *** *
29882 ATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA
385 ATGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * *
29947 TACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAA
450 TACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAA
* * * * *
30012 ACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTC
515 ACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTT-
* * * * *
30077 TGTCATAAAAGAATAATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
579 TGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * *
30142 TAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAATTTAAATAA
644 TATTCCAAAAATTAATAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAG
30207 TTATG
708 TTATG
* * * * * * * *
30212 ACTATTTGAATAATTAGCTATTTGAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTCTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
30277 TATGCTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAAT
66 AAT--TCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAAT
* * *
30340 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACCAAACAATTTCAAATCATTATGACTATTT---
126 AAG----AGATTTAAAAAATAAAT-TATGTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * * * * *
30401 C-A-TATGTA----AACTTGTTATGACTTTTTGTTGAT-TCATAAAA-GAATGATTTCTATTTAT
186 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAAATG-TTTTTATTCAT
* * * * * ** *
30458 ACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGAT
249 ACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GAT
* * * * * * *
30523 TTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCCAT
310 TTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * * *
30587 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATACTTGTTT-TGGTTCTTATAAGCTTATTT
374 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC
* * ** * * * ** * * *
30651 GAAGTAAGTTAGTACTAGTTTATTAATATCTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCATAAAAA-G
438 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTA-AAAAATA
* * * * * * * ***
30715 AATAAGTTTACCAAA-TAAGTTCAAAAAGTTATGATTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACAT
501 AATATGTTTACTAAACT-AGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
** ** ** **
30779 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAATGAATTGGTTCTATTCATCCAAGCTTATTTTGAATAAAATA
565 TATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * **
30844 AT-TTAAATTTATTTATTTTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTTTAAAAATAAATATGTTTTT
629 ATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* *
30906 TGAA-CATGTTCAAATATTTATG
691 CGAACCA-GTTCAAATAGTTATG
* * * * *
30928 ACTATTTGAAGAATGATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
** * * * * *
30993 TTGTTCATAAAAGTTTTTTCGAAACAAAATAATACTAATTTATTGAA-ATTCCAAAAATTAATAA
65 TAATTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
31057 GTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTA-CTAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAAT
128 G----AGATTTAAAAAATAAATTATG-TTACCAAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* ** * * *
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187 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACA
* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
31375 AGAATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAACA-AA
438 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAA
* * * * * *
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502 ATATGTTTA-CTAAACTAGA-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TG
* * * * * * * * *
31497 TTATGACCATTAT-TTTGTCCTAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATACGGATTAAAAT
564 TTATAACC-TTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAAT
** ** * * *
31561 AATACTAATTTAACAATATTCCAAAAATTTGTAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCC
628 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* *
31626 AAACCAGTTCAAATAGTTAAG
692 GAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT
** * *
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* * *
31775 GCAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCAAACAAGTTAAAATAGATT-TGACTATTTGAA
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** * * *
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186 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATA
* ** * * * *
31902 AAAACTCATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGTATGAGATT
250 CAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--T--GATT
* * * * * * *
31967 TAAAAACTGAAGCTGTTT-TCTGGA-TCACTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAAT
311 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
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*** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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566 ATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * * **
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629 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC
* **
32346 AAATAAGTTCAAATAGTTATG
692 GAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
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1 ACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
** * * * * *
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64 TTAATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT--
* * * * * *
32496 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTACCAAAC-AATGCAAATAATCATGGCCATTT-AGAC
126 --AAGAGATTTAAAAAATAAATTATG-TTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA-AC
* * * * * * * * * **
32558 AACTATCTATTTTAAATCATTATTA-CTTATGTTTTGTTACAAAATAATTGTTTTTCA-AGATAC
187 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT-ATTCATAC
** *
32621 AAGCTTT-TTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAGAATTAATAAGAGATTTAA
251 AAG-TTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTGATTTAA
* * * * * * *
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314 AAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* *
32749 A-CTGTTATAAC-CTTTGTTCTA-CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
379 ATC-GTTATGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * * *
32811 AAAATAATAATAACTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAAT-TCG
443 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-G
* * * * * * *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** * ** * *
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** * * * * * * * **
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*** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * **
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* *** * *
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*
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* * * *
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* * * ** * * ** *
28819 CTATTATAAAATAATTGTTTCAATTCGTA-TAGTCTTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAA
63 -TGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAG-C-TTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA
* * * * * ***
28883 TAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGCCAAAATTGTTCAAA
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
29073 AATTTAATAAG--T--GATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGC
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* * ** * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 AAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATC-TCAAATT-TTATGA-CTTTT
* * * * * * * *
29355 GTTCTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAGAATAAAATAACACTAATCTA
61 -TT-TGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
29420 TTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAA
123 ATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAA
* * * * * * *
29485 ATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTGTTTTATCATAAAA
188 ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * * *
29550 TAGGTTTGTTTGAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TC
253 TA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-
* * * * * * * *
29613 AAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATAATTATGCTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATTA
314 AAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
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379 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT
* ** * * * *
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443 TATTCATTATAA--TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAA
* *
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506 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
* * * * * *
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1 AAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-TTTATGAC-TTTT-T
* * * * * *
29894 TCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATT
62 T-TGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * * * * * *
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125 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAAT
* * * * *
30024 AATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAGA
190 AGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
** * * * * *
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255 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * ** * * *
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320 TAATAAGT-ATGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
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384 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT--T
* * *
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447 CAT-TATA-ATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AA-T--TAA-T
30344 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
503 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
* *
30373 AAACAATTTCAAATCA-TTATGACTATTT---C-A-TATGTA----AACTTGTTATGACTTTTTG
1 AAACAA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATT-TTATGACTTTTT-
* * * *
30428 TTGATTCATAAAAGAA-TGATTTCTATTT-ATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTT
62 TTG--TCATAAAACAATTG-TTT-T-TTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTT
* * * * * ** *
30491 -ATAAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTC
122 AAT-AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTC
* * * * * * *
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186 AAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * ** * *
30620 AATACTTGTTT-TGGTTCTTATAAGCTTATTTGAAGTAAGTTAGTACTAGTTTATTAATA-TCTC
251 AATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-
* * * * ** * *
30683 AAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCATAAAAA-GAATAAGTTTACCAAATAAGTTCAAAAAGTTAT
314 AAAAATTAATAAGTATGAG-ATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * **
30747 GATTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAATGAATTGGT
377 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT
* * * ** * *
30812 TCTATTCATCCA-AGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTTAT-TTTCCAAAAATTAA
441 TTTATTCAT-TATA-ATTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-CAAAAATTAA
* * * * ***
30874 TAAATAAAATTTTTAAAAATAAATATGTTTTTT
502 T-AA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACC
* * * * * * *
30907 GAACATGTTCAAATATTTATGACTATTTGAAGAATGATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
1 AAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATT-TTATGA-C-TTT-T
* * * * * * ** *
30972 TTTGTCATAAACCAATTGCTTTTGTTCATAAAAGTTTTTTCGAAACAAAATAATACTAATTTATT
61 TTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* * * ***
31037 GAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAGTAAGTTCAAA
125 -AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAA
* * * **
31101 TAGTTATGACTATCTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAT
189 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
** * * *
31166 AATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAAATAAAAAAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAA
254 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * * *
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319 TTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** *
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* * ** *
31360 CATGTATAATTATTCAGAATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAATAAAAGATT
447 CAT-TATAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATT
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511 TAAAAA-ATAAATCTATTTACC
* * *
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1 -AAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-TTTATGA-C-TTTTT
* * *
31511 TTGTCCTAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATACGGATTAAAATAATACTAATTTAACA
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* ** * * *
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126 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATA
* * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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507 GATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACC
* * * * * * * * * *
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* * * *** * ** * *
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* * **** * *
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126 ATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAAT
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAA
ATCTATTTACC
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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*
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** * * * ***
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* * *
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* * *
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* * * ** * * * * *
33405 ATTTTATTTTGAATAAGC-TTATATTAATTAATACAATT-TTTTATGA-AAAAACAAAAGATTAT
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** * * * *
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130 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAGAACGTATTTAGA-AAACATA
* *
33530 TTTATTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAAT-TATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
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* * * * *
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAGAACGTATTTAGAAAACATATT
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Found at i:34850 original size:176 final size:174
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* * * ** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * **
34291 GTTTAGTCATATAATAATTATTTCAGTT--CATACAAGCTTATTCGGAAT
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT---TTAAGATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * **
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* * * * * * * *
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* * **
34521 AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TCAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * * * * * **
34586 TTACCAAATCAATTCAAATAATCATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTTAAATCATTATTACTT
62 TT-GCTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCA
* * **
34651 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAAGATACAAGCTTTTTCTTAAT
126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-AAGATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
34701 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATCACAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC
* *
34766 TGAACCAATTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCATTGT
66 T-AACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTGT
* * * **
34831 TCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-AGATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
34877 AAAATAATAATAACTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT--C-A-GAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * **
34941 TTTGCCTAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATAACC
61 TTTG-CTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
* * *
35006 TTTTGTTTCGTCATAAAATAATT
125 -ATTGTTTTGTCATAAAACAATT
35029 ATTTCAACTC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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178 4 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.38
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AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC
TAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTTTAAGATACAAGCTTATTCAAAAT
Found at i:35379 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 35045--35758 Score: 783
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35035 ACTCATTCGG
* * *
35045 TAAACA-ATTTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACATA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
35109 TTTTATTTTGAATAAACATTTATGAACAAAAACAATTGGTTTACGATACAAAA-AAAGGTCATAA
65 TTTTATTTTGAATAAGC-TTTATGAACAAAAACAATT-TTTTATG--ACAAAACAAAGGTCATAA
** *
35173 CAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTAATTTGAATGTGTTTAGA
126 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAT-TGTTT-GA
* *
35228 -AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATCTTTGAAATATTAGTAAATTTA-TATTA
1 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* *
35289 TTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAAT
65 TTTTATTTTGAATAAGCTT-TATGAACAAAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAAT
* *
35354 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTTGTTCGA
127 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTTGA
* * * * *
35406 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTAT
1 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * ** *
35471 TTTATTTTGAATAAGTCTATACGAATTAATACAATTTTTTATGACGAAACAAAAAATTATAATGA
66 TTTATTTTGAATAAG-CTTTATGAACAAAAACAATTTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGA
* * * * * *
35536 TTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTTTTTAAACTTATTTGA
129 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTTGA
* * * **
35586 TAAACATATTTGTTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACATATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** *
35651 TTTTAATTCAAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTTTTTTATGACAAAACGAAAGGTCATAAT
65 TTTTATTTTGAATAAGC-TTTATGAACAAAAACAA-TTTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAAT
* * *
35716 GATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
127 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
35759 CTTATTCAAT
Statistics
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0.81 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
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TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTTTGAATAAGCTTTATGAACAAAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATT
TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTGA
Found at i:35717 original size:362 final size:360
Alignment explanation
Indices: 35040--35758 Score: 873
Period size: 362 Copynumber: 2.0 Consensus size: 360
35030 TTTCAACTCA
* * * * * *
35040 TTCGGTAAACAATTTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGT
1 TTCGATAAACAATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
* * *
35105 ATTATTTTATTTTGAATAAACATTTATGAACAAAAACAATTGGTTTACGATACAAAAAAAGGTCA
66 ATTATTTTATTTTGAATAAACATATACGAACAAAAACAATTGGTTTACGAAACAAAAAAA-GTCA
* * *
35170 TAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTAATTTGAATGTGTTTAGAAAACATA
130 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTTAAATGTATTTAGAAAACATA
** * * **
35235 TTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTTGAAATATTAGTAAATTTATATTATTTTATTTGGA
195 TTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTCAA
*
35300 ATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATA
260 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATA
*
35365 GATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTTG
325 AATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTTG
*
35401 TTCGATAAAC-ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAG
1 TTCGATAAACAAT-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* ** * **
35465 TATTATTTTATTTTGAATAAGTC-TATACGAATTAATACAATTTTTTATGACGAAAC-AAAAAA-
65 TATTATTTTATTTTGAATAA-ACATATACGAACAAAAACAATTGGTT-T-ACGAAACAAAAAAAG
* ** * * * *
35527 TTATAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTTATTACT-TTTTAAACT-TATTT-GATAA
127 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTTAAA-TGTATTTAGA-AA
* *
35589 ACATATTTGTTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAAT-TATCAAAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
190 ACATA-TT-TATTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATCT-TCAAAATATTAATAAATTTA-TATTAT
* * *
35652 TTTAATTCAAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTTTTTTATGACAAAACGAAA-GGTCATAAT
250 TTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGGTCATAAT
* * *
35716 GATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
314 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
35759 CTTATTCAAT
Statistics
Matches: 304, Mismatches: 42, Indels: 23
0.82 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
358 2 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (360 bp):
TTCGATAAACAATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
ATTATTTTATTTTGAATAAACATATACGAACAAAAACAATTGGTTTACGAAACAAAAAAAGTCAT
AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTTAAATGTATTTAGAAAACATAT
TTATTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTCAAA
TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAA
ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTTG
Found at i:35794 original size:119 final size:119
Alignment explanation
Indices: 35660--35893 Score: 319
Period size: 119 Copynumber: 2.0 Consensus size: 119
35650 ATTTTAATTC
* * * ** *
35660 AAATAAGCTTTTATGAACA-AAAATAATTTTTTTATGACAAAACGAA-AGGTCATAATGATTTTA
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35723 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGTTTG
64 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGTTTG
* * * *
35779 AAATAAGCTTGTATGAATAGATAAAATTGTTTTATAACAAAACAACAGGTTATAACAATTTGGAA
1 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAACAGGTCATAACAATTTGAAA
* * *
35844 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAG
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35894 ATTCATTTTT
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 13, Indels: 4
0.85 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
118 2 0.02
119 95 0.95
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ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.12, T:0.35
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AAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAACAGGTCATAACAATTTGAAA
TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGTTTG
Found at i:36091 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 35780--37275 Score: 752
Period size: 181 Copynumber: 8.3 Consensus size: 180
35770 AATAGTTTGA
* * * * * *
35780 AATAAGCTTGTATGAATAGATAA-AATTGTTTTATAACAAAACAACAGGTTATAACAATTTGGAA
1 AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * *
35844 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACAGATACATTTTTTAAAT
* * *
35909 CCCTTAGTTGTTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCG
130 CCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTAT-TTATTCCG
* *
35961 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * *
36026 AGATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTATTTGCACTAG-TCAGGCCAACAGATACATTTTCTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GCAAACAGATACATTTTTTAAAT
* * *
36090 CCATTAC---TT-A---TT--AAT-TT--TAAATTAGCATTACTTTATTCCAAAT
130 CCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTATTCC---G
* *
36133 AATAAGAC-TGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAA
1 AATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACAATTTGAA
* * * ** **
36196 ATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACT-GATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAA
64 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGCAAACAGATACATTTTTTAA
* * *
36260 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCTAG
128 ATCCCTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAATTAGA-ATTA-TTTATTC-CG
* * ** * * * * * *
36315 ACA-AA-TTTATATGAACAAAAACTTTTCTTTTATGAGAAAATAAAAAGTAATAACAATTTAAAA
1 A-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * *
36378 TAGATAATTGTTCAAATATTCATAATTATTTGAACTAGTTTAGCTAATA-AAAT-TATTTTTTAA
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGC-AA-ACAGATACATTTTTTAA
* * **
36441 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-ATTTATTTTATTTTG
128 ATCCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGAATTA-TTTATTCCG
*** * * ** * * * * * *
36495 AATAAG-TTAGTAAGTGTTGAAAAAAAATT-ATTTACAAGAAAATAAAATGTCATACCTATTTAA
1 AATAAGCTT-GT-A-TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * * * * ** * * * *
36558 AATAGATAATTGTTCATAGAGCCTTAATTATTTGTAGT-GATTTGGTAAA-AAAAATTATTTTTT
63 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGCAAACAGATA-CATTTTTT
* * * ** * * * * *
36621 AAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTACATTAGTATTTTTTTTATTCTG
126 AAATCCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-A-ATTATTTATTCCG
* * * ** * * * * * *
36678 AATAAACTTATATGAACATAATTAATTATTTTATGATAGAATAAAAGGTGATAACATTTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * * * * **
36743 ATATAATTGGTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTTTA-TAAATAAATTTATTTTTTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGCAAACAGATACATTTTTTAAAT
* * * * ** *
36807 CTCTTACTTA-TAAATTTTGAAAAATTAATTAATTAGTTTTATTTTATTACG
130 CCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTATTCCG
* * * * * ** * * ** * *
36858 AACAAACTCGGATGAGCTGAAATAATTGTTTTATAACAAAATGAAATGTCATAACGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * **
36923 AGATAATTATT-AATATAGTCTTAACTGTTTGAAGTAATTC-GACAAACAAATTTATTTTTTTAA
66 AGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-CAAACAGATACA-TTTTTTAA
* * * * * * *
36986 ATCTCTTAGTTATGAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGTATTATTTTATTCCA
128 ATCCCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGAATTA-TTTATTCCG
** * * * * * * * *
37040 AATAAATTTATATGAATAGAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA-
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * ** * * ** *
37104 ACGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTT-AATTTA-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTGAA
66 A-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGCAAACAGATACATTTTTTAAA
* * * * * * *
37167 T--CTT--GTACTAATTCTTGAAATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTTCA
129 TCCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTATTCCG
* ** * **
37216 AATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGT-ACTAACAATTT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTT
37276 TATTTTAAAT
Statistics
Matches: 1028, Mismatches: 227, Indels: 125
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
169 19 0.02
170 1 0.00
171 3 0.00
172 113 0.11
173 3 0.00
174 2 0.00
175 3 0.00
176 83 0.08
177 2 0.00
178 7 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACAGATACATTTTTTAAATC
CCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTATTCCG
Found at i:36198 original size:172 final size:172
Alignment explanation
Indices: 35961--36279 Score: 430
Period size: 172 Copynumber: 1.9 Consensus size: 172
35951 TGTTATTCCG
*
35961 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAAT
* * * *
36026 AGATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTATTTGCACT-AGTCAGGCCAACAGATACATTTTCTAAAT
66 AAATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTAATTGAACTGA-TCAGGCAAACAGATACATTTTCTAAAT
36090 C-CATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTACTTTATTCCAAAT
130 CTC-TTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTACTTTATTCCAAAT
* * *
36133 AATAAGAC-TGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAA
1 AATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACAAATTGAA
* * * ** ** *
36196 ATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAA
64 ATAAATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTAATTGAACTGATCAGGCAAACAGATACATTTTCTAAA
36261 TCTCTTACTTATTAATTTT
129 TCTCTTACTTATTAATTTT
36280 CAAGATATTA
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 16, Indels: 8
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
172 123 0.97
173 4 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.12, G:0.10, T:0.35
Consensus pattern (172 bp):
AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAAT
AAATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTAATTGAACTGATCAGGCAAACAGATACATTTTCTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTACTTTATTCCAAAT
Found at i:36452 original size:353 final size:353
Alignment explanation
Indices: 35803--36460 Score: 785
Period size: 353 Copynumber: 1.9 Consensus size: 353
35793 GAATAGATAA
* * * *
35803 AATTGTTTTATAACAAAACAACAGGTTATAACAATTTGGAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATAACAAAACAACAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * **
35868 ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCCCTTAGTTGTTAATTTTTGGAAT
66 ACTAATTGAACTTGTTCAGCAAACAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTAAGAAT
* * * *
35933 ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGAC
131 ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCAGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTATGAC
* * * *
35998 AAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTATTTGCACTAG
196 AAAACAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTATTTGAACTAG
* *
36063 TCAGGCCAACAGATACATTTTCTAAATCCATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTACTTTATTC
261 TCAGGCCAAAAAATACATTTTCTAAATCCATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTACTTTATTC
36128 CAAATAATAAGACTGTATGAACAAAAAT
326 CAAATAATAAGACTGTATGAACAAAAAT
* * *
36156 AATTGTTTTATGATAAAACAA-ATAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT
1 AATTGTTTTATAACAAAACAACA-AGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * *
36220 AACTAATTGAAC-TGATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAG
65 AACTAATTGAACTTG-TTCAGCAAACAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTT-AAG
* * **
36284 -ATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCTAGACA-AA-TTTATATGAACAAAAACTTTTCTTT
128 AATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTC-AGA-ATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTCTTT
* * * * * * *
36345 TATGAGAAAATAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAATTATTTG
190 TATGACAAAACAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTATTTG
* * * *
36410 AACTAGTTTA-GCTAATAAAAT-TATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT
255 AACTAG-TCAGGCCAA-AAAATACATTTTCTAAATC-CATTACTTATTAATTTT
36461 TGAAATATTA
Statistics
Matches: 253, Mismatches: 43, Indels: 18
0.81 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
352 4 0.02
353 237 0.94
354 11 0.04
355 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (353 bp):
AATTGTTTTATAACAAAACAACAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTAATTGAACTTGTTCAGCAAACAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTAAGAAT
ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCAGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTATGAC
AAAACAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCAAAACTATTTGAACTAG
TCAGGCCAAAAAATACATTTTCTAAATCCATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTACTTTATTC
CAAATAATAAGACTGTATGAACAAAAAT
Found at i:36723 original size:182 final size:179
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Period size: 182 Copynumber: 6.1 Consensus size: 179
36133 AATAAGACTG
* * *
36143 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAAA-ACAAATAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAACAAAAATAATTATTTTATGATAAATA-AAAT-GTCATAACAATTTAAAATAGATAATTG
* * * ** *
36207 TTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
64 TTCAAATAGCT-TAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * *
36272 TTAATTTTCAAGATATTAATAAATTAATA-TTATTTTATTCT-AGACAAATTTA
128 TTAATTTTCAAAATATT-ATTAATTAGTATTTATTTTATTCTGA-ATAAACTTA
* * * * *
36324 TATGAACAAAAACT-TTTCTTTTATGAGAAAATAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATAATTG
1 TATGAACAAAAA-TAATTATTTTATGA-TAAATAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTG
* * *
36388 TTCAAATATTCATAATTATTTGAACT-AGTTTAGCTAATA-AAA-TTATTTTTTAAATCTCTTAC
64 TTCAAATA-GCTTAATTATTTGAACTGA-TTT-GATAA-ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
** * * *
36450 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA--ATTTATTTTATTTTGAAT-AAGTTA
125 TTATTAATTTTCAAAATATT-ATTAATT-AGTATTTATTTTATTCTGAATAAACTTA
*** * * * * *
36504 GTAAGTGTTGAAAAAAAATTATTTACAAGA-AAATAAAATGTCATACCTATTTAAAATAGATAAT
1 -T-A-TGAACAAAAATAATTATTT-TATGATAAATAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAAT
* * * * * * * *
36568 TGTTCATAGAGCCTTAATTATTTGTAGTGATTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGT
62 TGTTCAAATAG-CTTAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* *
36633 TATTAATTGTCAAAATATTATTACATTAGTATTTTTTTTATTCTGAATAAACTTA
126 TATTAATTTTCAAAATATTATTA-ATTAGTATTTATTTTATTCTGAATAAACTTA
* * * * * * * *
36688 TATGAACATAATTAATTATTTTATGATAGAATAAAAGGTGATAACATTTTGAAATATATAATTGG
1 TATGAACAAAAATAATTATTTTATGATA-AATAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGT
* * * * *
36753 TCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTTTATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
65 TCAAATAGCT-TAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * **
36818 AAATTTTGAAAA-ATTAATTAATTAGT-TTTATTTTATTAC-GAACAAACTCG
129 TAATTTTCAAAATATT-ATTAATTAGTATTTATTTTATT-CTGAATAAACTTA
* * ** * * * * * * *
36868 GATGAGCTGAAATAATTGTTTTATAACAAAATGAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAACAAAAATAATTATTTTATGA-TAAATAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
36933 T-AATATAGTCTTAACTGTTTGAAGTAATTCGACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTT
65 TCAA-ATAG-CTTAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * ** *
36997 ATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTA-TTATTTTATTCCAAATAAATTTA
127 ATTAATTTTCAAAATATTATTAA-TTAGTATTTATTTTATTCTGAATAAACTTA
* * * * * * *
37050 TATGAATAGAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAA-CGATAATTG
1 TATGAACAAAAATAATTATTTTATGATA-AATAAAATGTCATAACAATTT-AAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
37114 TTCAAATAGTCATAAGTATTT-AATTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTGAATCT-TGTAC--
64 TTCAAATAG-CTTAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTT
* * *
37175 --TAATTCTT-GAAATATTAATTAATTAGTA-TTATTTTATT-TCAAATAAACTTG
127 ATTAATT-TTCAAAATATT-ATTAATTAGTATTTATTTTATTCT-GAATAAACTTA
** *
37226 TATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATGAACAAAAATAATTATTTTATGA
37252 CAAAATGAAA
Statistics
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TATGAACAAAAATAATTATTTTATGATAAATAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTT
CAAATAGCTTAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
ATTTTCAAAATATTATTAATTAGTATTTATTTTATTCTGAATAAACTTA
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37195 AATTAGTATT
* * *
37205 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTACTAA
1 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAACAAATGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAA
37270 CA
66 CA
* * * * * *
37272 ATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGTTGAAAAGCAAATGTTTTATTACAAAATGAAAGGTAATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAACAAATGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAA
37337 CA
66 CA
37339 ATTT
1 ATTT
37343 GAAATAGATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAACAAATGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAA
CA
Found at i:37675 original size:425 final size:425
Alignment explanation
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36874 CTGAAATAAT
* * * *
36884 TGTTTTATAACAAAATGAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTAATATAGTCTTAACT
1 TGTTTTATAACAAAATGAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTAATATAGGCTTAACT
* * * * *
36949 GTTTGAAGTAATTCGACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATAT
66 ATTTGAACTAATTCAACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATGAATTTTCAGAATAT
* ** * * * * *
37014 TATTAATTTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTATATGAATAGAAATAATTTTTTTATGATAG
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* * *
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* *
37144 GGTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTTGTACTAATTCTTGAAATATTAATTAATTAGTATTATTT
261 AGTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTTGTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * *** * *
37209 TATTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTACTAACAAT
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37274 TTTATTTTAAATAAGCTTTTATGTTGAAAAGCAAA
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* *
37309 TGTTTTATTACAAAATGAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA-A-CGGCTATAA
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* * * *** * **
37372 TTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTA-TTTTTTGAATCTCTTACTTATTCATTTTCA-AAT
64 CTATTTGAACTAATTCAACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATGAATTTTCAGAAT
**** *
37435 ATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGGATAAACTTT-TGTGAATAGAAACAATTATTTTATGA
129 ATTAATAAAATAATATTATTTTATTCCAAATAAA-TTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
* *
37499 CAAAACAAAA-GTTCATAACAATTTTAAATA-GATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAAT
193 CAAAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAAA-ACGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAT
* * * *
37562 TTGTTCAAG-AAATAGA-TT-TTTTTT-AATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAA
255 TTATT-AAGTAAATAGATTTATTTTTTGAA--TCTTG--TACTAA-TTCTTGAAATATTAATAAA
* * **
37622 TTAGTATTATTTTCTCTCAAATAAGCTTATATAAACTGAAACAATTATTTTATGAC
314 TTAGTATTATTTTATCTCAAATAAACTTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGAC
37678 TAAACAAAAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTTGAACTAATTCAACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATGAATTTTCAGAATAT
TAATAAAATAATATTATTTTATTCCAAATAAATTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAA
AACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAACGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAATTTATTA
AGTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTTGTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATCTCAAATAAACTTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATGAAAGGTACTAACAAT
TTTATTTTAAATAAGCTTTTATGTTGAAAAGCAAA
Found at i:37855 original size:180 final size:179
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Period size: 181 Copynumber: 27.4 Consensus size: 179
37262 GGTACTAACA
** * * * * ** *
37272 ATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATG-TTGAAAAGCAAATGTTTTATTACAAAATGAAAGGTAATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
37336 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-CGGCTATAATTATTTGAACTGATTCAATAAA-TTGAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGATTC-ATAAACTAGAT
* * * * *
37399 TTATTTTTTGAATCTCTTACTTATTCATTTTCAAATATTAATAAAATAATATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
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1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
37517 CAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAATTTG-TTCA-AGAAATAGA-T
65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGATTCATA-AACTAGATT
* * *
37579 T-TTTTTT-AATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATT
128 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
37630 ATTTTCTCTCAAATAAGCTTATAT-AAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * *
37694 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATTTTAACTATTTGAACTGATTCACAAACTTG-TTT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCATAAACTAGATTT
*
37758 ATTTTTTAGATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATT-ATGAAATTAGTATT
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* * * * * **
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1 ATTTTAT-TTCGAAT-AAGCTTGTATGAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * *
37873 AATGATTT-AACATTGACATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTGCTTTGGA-AAAC-A-
63 AACGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-ATT-CATAAACTAG
* * * *
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125 A-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
37991 ATTTTATTTCAAAAAAGTTTTTATTAATTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-TGATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
38056 CAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAAATTATTCAATAAAC-AGATTT
65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTC-ATAAACTAGATTT
* ** *
38120 ATTTTTTTAAATCTCTTA-TTAATT--TTTT-GAATGCTAAT-AATTAGTACT
129 A-TTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
38168 ATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGA
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * *
38232 ACGATTTGGAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAC--GTAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATTCATAAACTAG-AT
* * *
38295 CTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATC
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
38348 ATTTTA-ATCTGAATAAGCATGTATGAAGAGAAACAACTGTTGTATGACAAAA-TAAAGATCATT
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * *
38411 ATAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTGAACTGGTTCGATAAAC-AGATT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTC-ATAAACTAGATT
* * *
38475 TAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATATT
128 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * ** *
38524 ATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACAGAAATAATTGTATTACAACAAAACAAAAGGTCTTAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * * **
38589 CAATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGACATGACTATTTGAAGTTGTTTGGTAAAC-AGATTT
65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGATTCATAAACTAGATTT
* * * * * * *
38653 ATTTTTTAGATCTCCTGCCTATCAATTTGTAGAATATTAATAAAGTAGTATT
129 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * **
38705 ATTTTGTTTCGAATAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATA
1 ATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
38770 ACTATTTGAAATAAAAAATTATTCAAACAATAATAATTATTTGAGCTTACTCAGTAAA-TAGATT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCA-TAAACTAGATT
* **
38834 TATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
128 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * *
38888 ATTTTTATTTCAAATAAGCTT-TATAGATAGAAACAATTAG-TTTATCACAAAACAAAAGGTCAA
1 A-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * *
38951 AACTATTTGAAAAAGAGAATTATTCAAATAGTTAGAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATAAAT
63 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-ATTCATAAACTAGAT
* * ** *
39015 TTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAAATTTGGAATATGAATAAA-T-GTAATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTAAAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * *
39067 ATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
39131 AAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAACTTATTTAGTAAAC-AGATT
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* * * * *
39195 CATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTCATTTTAGAATATTACTAAATTAGTGA-T
128 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * * * *
39248 ATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTA-ATACAATTGTTTTATGACAAAATAATAGGTAATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-A-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
39312 ACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAAGAGTTATGACTATTTGAACTTG-TTCGATAAAC-ATAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTC-ATAAACTAGAT
* * * *
39375 TTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAGTTAATATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
39428 ATTTTAATTT-GAATAGGCTTGTATGA-AGAAAACAATTGTGTCATGACAAAAAAAAAAGTCATA
1 ATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
39491 ACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTTATTTGATAAAC-AAATT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCATAAACTAGATT
* * * ** * *
39554 TATTTTTTTAATCTTTTACTTATTAGTTGTTTGAATATTAATAAATTTGTATA
128 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
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1 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCAT
** * * * * *
39671 AGTGATTTTAAATAGATAATCATTCAAATAGTCATAATTATTTGTACTCATTCGATAAA-TAGAT
63 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTC-ATAAACTAGAT
* * * * *
39735 TCATTTTTTAAATTTCTTACTTATT-ATTTCTAGAATATTAATAAAATAGAATT
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* * * * * * **
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1 ATTTTATTTCGAATAAGCT--T--GTATGATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
** * * * **
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62 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCA--TAAACTAG
* * * *
39916 ATTCACTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA-AAATTAGTATT
125 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** *
39971 AATTTT-TTCCAAATAAGAGTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAATGGTCATA
1 -ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
40034 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTATAACTAGTCGAACTGGTTTAGTAAAC-ATAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGATTCA-TAAACTAGAT
* * *
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127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * ** *
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1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TA
* * * * * * **
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64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT-G---ATTCAT-AAACT
* * * * *
40268 AGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGCAAACATAATTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTT
123 AG--AT--TTATTT----T--TTA---AATC-T-CTTACTTATT-AAT-T-TTA--AAAT-A---
40333 TTGAAATATTAATAAATATGCT-TT
164 TT--AATA--AAT---TA-G-TATT
* * * * *
40357 ATTTTATTTCGAACT-AG-TTATTAAGAACTA-AAAGAATTGTTTTACGACAAAATAAAAGGTCA
1 ATTTTATTTCGAA-TAAGCTT-GTATG-A-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
40538 A-TTTA----GAATAAACTTGTGTGAACAGAAATAATTATTTTATGAGATAACAAAAGGTTATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
40598 CAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTAGAACTATTTAAACTGGTTCGGTAAA-TAGATTA
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* * *
40662 ACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTACTATT
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** * * *
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1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * *
40777 ATAATTTGAAATAAATAATTCTTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTTGATTAACTA-AT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGA-TTCATAAACTAGAT
* * * * * ** * *
40840 TTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAGTTTTTGAAATATTAATAAAGAAATAGT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *** * *
40894 ATTTTATTTCAAATAAACTTTTATG-TACTGACATGTTTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
40958 ACGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAATTATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAA-TAGA--
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCA-TAAACTAGATT
* ** * *
41020 T-TTTTTT-AATTTCTTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTGTT
128 TATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
41072 ATTATATTTCGAATAAGCATGTAT-AAACTGAAACAATTATTTTTTGACTAAACAAAAGATCAAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * *
41136 ATAATTTGGAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGA-AAAC-AAAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATT-CATAAACTAGAT
* * * * *
41199 TTA-TTTTTAAATC-CTTA-TTA--ATTTTTGAAATAATAATGAATTGGTATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * *
41247 ATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * * * * * * *
41312 CAATTCAAAATAGATAA-CAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG-CTCAGCAAAC-ATAT
65 CGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCA-TAAACTAGAT
* * * *
41374 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATAATAATAAATTAATATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
41428 ATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
41493 CAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTG-CTCATTAAAC-AGATT
65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCA-TAAACTAGATT
* * *
41556 TATTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATTAATTAGTATT
128 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * * **
41609 ATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAA-AAAATTATCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATA
* * * * *
41673 ACAATTTGAAATTGATAATTGTT--AATAGTCATAACTATTTGAACGTG-TTCAGAAAAC-ATAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCA-TAAACTAGAT
* * * * *
41734 TTATCTTTTAAATTTC-TACTTAATAATTTTTGAAATTTTAATAAATTTA-TATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * *
41787 A-TTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGA-ACAAATTCAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCAT
1 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGATAGAAA--CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
41849 AATGTTTTAAAATAGAAAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAAC-AGA
63 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTC-ATAAACTAGA
* * *** *
41912 TTCATTTTTTTAAT-TC-T-CTTATTAATTTTTAGTCTATTAATAAATTAGAATT
126 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * *
41964 ATTTTATTTCAAATAATATTATATTAACTA-AAACAATTGTTATATTG-CAAAACTATAGGTCAC
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-TGA-TAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * ** *
42027 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA--ATA-
63 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCATAAACTAGAT
* * * *
42089 TT-TGTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATT
* * *
42142 ATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
*
42206 CAATTT
65 CGATTT
42212 TATTTGCAAA
Statistics
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Consensus pattern (179 bp):
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TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:38428 original size:179 final size:178
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 16.1 Consensus size: 178
37299 GAAAAGCAAA
* * * ** * * *
37309 TGTTTTATTACAAAATGAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-CGGCTATAAT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAAC
** * * * *
37373 TATTTGAACT-GATTCAATAAATTGATTTATTTTTTGAATCTCTTACTTATTCATTTTCA-AATA
64 TATTTGAACTAG-TTTGATAAA-CGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * *
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* * ** * *
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* * ** * * * *
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* ** * *
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* * * * * * **
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1 TGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * *
37732 ATTTGAACT-GATTCACAAACTTG-TTTATTTTTTAGATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATAT
65 ATTTGAACTAGTTTGATAAAC--GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
*** * *
37795 T-ATGAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAA-CTTATATG-ATCGGAAACAAT
128 TAAT-AAATTAGTATTA-TTTTATTTGAAT-AAGCTTGTATGAAT-AGAAACAAT
* ** * * * *
37847 TTTTTTATGACAAAACAAAAGAACATAATGATTT-AACATTGACATTTGTTCAAATAGTCATAAC
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * *
37911 TATTAGAACT-GCTTTGGA-AAACAACTTTAATTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTT-GAAA
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* * * * * * * *
37973 TATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGTTTTTATTAATTGAAATAAT
125 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* ** * * *
38028 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* ** * *
38093 ATTTGAAATTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTTGAATG
65 ATTTG-AACTAGTTTGATAAAC-GATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * *
38153 CTAAT-AATTAGTACTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAAT
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* * * * * **
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1 TGTTTTATGAC-AAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* *
38269 TATTTGAACTAGTTTGATAAACGTATCTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
64 TATTTGAACTAGTTTGATAAACG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
* * * * * *
38333 TATTAAATTAGTATCATTTTAATCTGAATAAGCATGTATGAAGAGAAACAAC
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* * * * * *
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1 TGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
38450 CTTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTA
66 TTTGAACTAGTTTGATAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * ** * *
38511 ATAAATCAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACAGAAATAAT
130 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* ** * ** * * * * * *
38561 TGTATTACAACAAAACAAAAGGTCTTAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGACATGACT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * * *
38626 ATTTGAAGTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAGATCTCCTGCCTATCAATTTGTAGAATATT
65 ATTTGAACTAGTTTGATAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * *
38691 AATAAAGTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAAACTTGTATGAATAGAAACAAT
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
** * * * * * *
38743 TGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAAAAAATTATTCAAACAATAATAAT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * ** * * *
38807 TATTTGAGCTTACTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT
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*
38871 ATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTT-TAT-AGATAGAAACAAT
126 ATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAAT
* * * * * *
38925 TAG-TTTATCACAAAACAAAAGGTCAAAACT-ATTTGAAAAAGAGAATTATTCAAATAGTTAGAA
1 T-GTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
** * ** *
38988 CTATTTGAA-T-GTGTTCAGA-AAATAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAAATTTGGA
63 CTATTTGAACTAGT-TT--GATAAA-CGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGA
* **
39049 ATATGAATAAA-T-GTAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
124 ATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * *
39104 TGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATTACT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * *
39169 ATTTGAACTTA-TTT-AGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTCA-TTTTAGAAT
65 ATTTGAAC-TAGTTTGA-TAAAC-GATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAT
* * * *
39231 ATTACTAAATTAGTGA-TATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTA-ATACAAT
126 ATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAAT
* * * * * * *
39285 TGTTTTATGACAAAATAATAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAAGAGTTATGACT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * *
39350 ATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
65 ATTTGAACTAGTTTGATAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * *
39414 AATAAGTTAATATTATTTTAATTTGAATAGGCTTGTATGAAGA-AAACAAT
129 AATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * *
39464 TGTGTCATGACAAAAAAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AACT
1 TGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * *
39528 ATTTGAACTTA-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTTAATCTTTTACTTATTAGTTGTTT-GAATA
65 ATTTGAAC-TAGTTTGATAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAATA
* * * *
39591 TTAATAAATTTGTATAATTTTATTAGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAT
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * *
39644 TATTTTATGACAAAAAAAAAAGGTTATAGTGATTTTAAATAGATAATCATTCAAATAGTCATAAT
1 TGTTTTATGAC--AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * *
39709 TATTTGTACTCA-TTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATTTCTTACTTATT-ATTTCTAGAATA
64 TATTTGAACT-AGTTTGATAAA-CGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * *
39772 TTAATAAAATAGAATTATGTTATTTCAAATAAGCTGGTACGAATGAAAAAAACAAT
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAT---AGAAACAAT
* ** * *
39828 TGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACT
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * ** ** * * *
39893 ATTTGCACTGGTCAGGCCAATA-GATTCACTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
65 ATTTGAACTAGT-TTGATAA-ACGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
** **
39957 TAA-AAATTAGTATTAATTTT-TTCCAAATAAGAGTGTATGAATAGAAACAAT
128 TAATAAATTAGTATT-ATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * *
40008 TGTTTTATGA-AAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTATAAC
1 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAAC
* * * * * * * *
40071 TAGTCGAACTGGTTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTTTTAATTTTCAAAATA
64 TATTTGAACTAGTTTGA-TAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * *
40135 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATT
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
40188 TGTTTTATGAC
1 TGTTTTATGAC
40199 TGAACAAAAA
Statistics
Matches: 2153, Mismatches: 435, Indels: 243
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 9 0.00
176 74 0.03
177 199 0.09
178 196 0.09
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185 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
TTTGAACTAGTTTGATAAACGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
TAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
Found at i:38707 original size:714 final size:716
Alignment explanation
Indices: 37272--42211 Score: 3536
Period size: 714 Copynumber: 6.8 Consensus size: 716
37262 GGTACTAACA
* * * * * ** *
37272 ATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATG--TTGAAAAGCAAATGTTTTATTACAAAATGAAAGGTAAT
1 ATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTATGAATTGAAAA--AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * **
37335 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-CGGCTATAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGAT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGAT
* * * ** * * *
37399 TTATTTTTTGAATCTCTTACTTATTCA-TTTTCAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTG
128 TTATTTTTTTAA-ATC-TACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * * * *
37463 GATAAACTTTTGTGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTTAAA
191 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAA
* * * * ** * * *
37527 TAGATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAAGAAATAGA-TT-TTTTTT-AAT
255 TAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
37589 CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAA-AGTTAATAAATTAGTATTATTTTCTCTCAAATAAGCTTATA
320 -TCTTACTTATTAATTTTTAGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTAAATAAGCTTGTA
* * * * **
37653 TAAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACA-AAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTAT
382 TGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTAT
* * ** * * * * *
37716 TCTAATAATTTTAACTATTTGAACTGATTC-ACAAACTTG-TTTATTTTTTAGATCTCTTACTTA
444 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAAC-AGATTTACTTTTTA-A-ATCTTACTTA
* * * *
37779 TTAATTTTCAAAATATT-ATGAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATCAA-CTTATATG-ATCGG
506 TTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTAT-TCCAAAT-AAGCTTGTATGAAT-AG
* ** ** ** * * *
37840 AAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGAACATAATGATTT-AACATTGACATTTGTTCAAATAG
567 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA-ATAAATAATTATTCAAATAG
* * *
37904 TCATAACTATTAGAAC-TGCTTTGGA-AAACA-ACTTTAATTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGT
631 TCATAACTATTTGAACTTG-TTT-GATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T
*
37966 TTT-GAAATATTAATAAAGTAGTATT
692 TTTAG-AATATTAATAAAGTAATATT
* * * * *
37991 ATTTTATTTCAAAAAAGTTTTTATTAATTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAA
1 ATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
38056 CAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAAATTATTCAATAAACAGATTTA
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTA
** *
38121 TTTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTTGAATGCTAAT-AATTAGTACTATTTTA-TTCTGAATA
131 TTTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* * * * * *
38183 AGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACGATTTGGAATAGAT
195 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGAT
** ** *
38248 AATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACGTATCTA-TTTTTAAATCTCTT
260 AATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TCTT
* * * * * * *
38312 ACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTAATCTGAATAAGCATGTATGAAGA
324 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
38377 GAAACAACTGTTGTATGACAAAATAAAGATCATTATAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGT
388 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * *
38442 CATAACTACTTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTCAAA
453 CATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTACTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTAAA
* *** ** * * * **
38505 ATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACAGAAATAATTGTATTACA
518 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
38570 ACAAAACAAAAGGTCTTAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGACATGACTATTTGAAGT
583 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
38635 TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAGATCTCCTGCCTATCAATTTGTAGAATATTAATAAAGTA
648 TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TAGAATATTAATAAAGTA
*
38700 GTATT
712 ATATT
* * * **
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1 ATTTTATTTC-AA-AAAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * * * * *
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*
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129 TATTTTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTC
* * * * * * *
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* * * * * *
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254 ATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TT--GATAAACAAATTTATTTTTT
* ** * * *
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* *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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*
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695 AGAATATTAATAAAG-TAATATT
* * * * * * *
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1 ATTTT-ATTTCAAAAAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* ** *
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64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATT
* * * * *
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* * * * ** *
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191 -AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * *
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254 ATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
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* * * * *
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* * *** * *
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442 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GATAAACAGATTTACTTTTTAAATC--TTACT
* * **
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504 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT-ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* ** *
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568 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * *
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* *
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695 AGAATATTAATAAAGTAATATT
* *
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* * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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** ** * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * *
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* * * * **
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* ** * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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T
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* ** * * *
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507 A-TTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAT
* * * ** * * * * ** * *
38556 ATAATTGTATTACAACAAAACAAAAGGTCTTAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGACA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGACA
* * ** * * * * * * *
38621 TGACTATTTGAAGTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAGATCTCCT-GCCTATCAATTTGTAG
66 TGACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATC-GCTAACTTATCAATTTTTAG
* * * * * * * *
38685 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
130 AATAATAATAAAGAAATAGTATTTTATTCCAAAT-AAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * * * *
38750 TGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAATAAAAAATTATTCAAACAATAATAATTATTTGAG
194 TGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTATTAGAA
* * * *
38815 CTTACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
259 CTTACTCAGTAAACAGATTTA-TTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAA
* * * * * *
38880 TTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGC-TTTATAGATAGAAACAATTAGTTTATCACAAAACAAA
323 TTAGTATTA-TTATATTTCGAATAAGCATGTATAAATAGAAAAAATTAGTTTATGACAAAA-AAA
* * * * * * * * *
38944 A-GGTCAAAACTATTTGAAAAAGAGAATTATTCAAATAGTTAGAACTATTTGAATGTGTTCAGAA
386 ATGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT--AATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTCAGAA
* * * * ** *
39008 AATAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAAAATTTGGAAT-ATGAATAAA-TG-TAATTATT
449 AACAAATTTATCTTTTAAA--TTCACTTAATAATTTTTGAAATAAT-AATAAATTGAT-ATTA-T
* * *
39070 TTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAA-
509 TTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAT
* * * * ** ** * *
39099 ACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACA-ATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGAC
* ** * * * * * * *
39163 ATTACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTC-A-TTTT
65 ATGACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACATATTTA-TTTTTTAAATCGCTAACTTA-TCAATTTTT
* * ** * * * * * * *
39226 AGAATATTACTAAATTAGT-GATATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTA-ATACAATTGTT
128 AGAATAATAATAAAGAAATAG-TATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTT
* * * * * * * * * * * * *
39289 TTATGACAAAATAATAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAAGAGTTATGACTATTT
191 TTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTATTA
** * *
39354 GAACTTGTTC-GATAAACATATTTATT-TTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAA
256 GAACTTACTCAG-TAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAA
* * * * * * *
39416 TAAGTTAATATTATTTTAATTT-GAATAGGCTTGTAT-GA-AGAAAACAATT-GTGTCATGACAA
319 TAAATTAGTATTATTAT-ATTTCGAATAAGCATGTATAAATAGAAAA-AATTAGT-TTATGACAA
* * * * * * *
39477 AAAAAA-AAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTTAT
381 AAAAAATGA-TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT--AATAGTCATAACTATTTAAACGTGT
* * * * * * *
39540 T-TGATAAACAAATTTATTTTTTTAATCTTTTACTTATTAGTTGTTTG-AATATTAATAAATTTG
443 TCAGA-AAACAAATTTA-TCTTTTAA--ATTCACTTAATAATT-TTTGAAATAATAATAAA-TTG
* * * *
39603 -TATAATTTTATTAGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA-
502 ATATTA-TTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAT
* * * * *** ** * *
39639 AAAATTATTTTATGACAAAAAAAAAAGGTTATAGTGATTTTAAATAGATAATCA-TTCAAATAGT
1 ACAATTATTTTATGAC-AAAACAAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAA-CAGTTCAAATGGA
* * * *** * * * * ** * * *
39703 CATAATTATTTGTACTCATTC-GATAAATAGATTCATTTTTTAAATTTCTTACTTAT-TATTTCT
64 CATGACTATTTGAACTTGCTCAG-CAAACATATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAATTTTT
* * * * * ** * *
39766 AGAATATTAATAAA-ATAGA-ATTATGTTATTTCAAATAAGCTGGTACGAATGAAAAAAACAATT
128 AGAATAATAATAAAGA-A-ATAGTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAAT---AGAAACAATT
* * * * *
39829 GTTTTATGATAAAACAAAATATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTA
188 GTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTA
* * ** ** * * *
39894 TTTGCAC-TGGTCAGGCCAATAGATTCACTT-TTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAG-AATA
253 TTAGAACTTACTCA-GTAAACAGATTTA-TTATTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATA
* * *
39956 TTAA-AAATTAGTATTAATT-T-TTTCCAAATAAG-AGTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTAT
315 TTAATAAATTAGTATT-ATTATATTT-CGAATAAGCA-TGTATAAATAGAAAAAATTAG-TTTAT
* * * ** * * **
40016 GA-AAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTATAACTAGTCGAA
376 GACAAAAAAAATGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT--AATAGTC-ATAACTATTTAAA
* * * * ** ** *
40079 C-TGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTTTTAATTTTCAAAATATTAATAAA
438 CGT-GTTCAGAAAACAAATTTATCTTTTAAA-TTC--ACTTAATAATTTTTGAAATAATAATAAA
* * * *
40143 TTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACTGAACAAAA
499 TTGATATTA-TTTA-TTCG---AAA--TA-A-G--------C--TTG------CA-TGAACAAAT
* * ** ** ** * *
40208 ACACTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGACA
* * * * * * * * * *
40273 TAATTATTTGAACTAG-TTAGGCAAACATAATTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTT-G
66 TGACTATTTGAACTTGCTCA-GCAAACATATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAATTTTTAG
* * ** * * * * * *
40336 AAATATTAATAAATATGCT-TTATTTTATTTCGAACT--AGTTATTAAGAACTA-AAAGAATTGT
130 -AATAATAATAAAGA-AATAGTATTTTA-TTCCAAATAAACTT-TTATGAA-TAGAAACAATTGT
* * * * * * * * * ** *
40397 TTTACGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAACTGTTCATATAGCCTTAACTATT
190 TTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTA-T
* * * * * *
40462 TA-AAC-TAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAG-AATATT
254 TAGAACTTA-CTCAGTAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATT
* * * * * * * * * *
40524 ATTACATTAGTATTATT-TA----GAATAAACTTGTGTGAACAGAAATAATTATTTTATGAGATA
317 AATAAATTAGTATTATTATATTTCGAATAAGCATGTATAAATAGAAAAAATTAGTTTATGACA-A
* * * * * * *
40584 ACAAAA-GGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTAGAACTATTTAAAC-TGGT
381 AAAAAATGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT--AATAGTCATAACTATTTAAACGT-GT
* * * * * * * * *
40647 TCGGTAAATAGA-TTAACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATT-AC
443 TCAGAAAACAAATTTATC-TTTTAAAT-TC--ACTTAATAATTTTTGAAATAATAATAAATTGA-
** * **
40710 TATTATTTTATTCTG-AATTGGCTTGTATGATGAAA-
503 TATTA-TTTATTC-GAAATAAGCTTGCATGAACAAAT
* * * * * * ** * ***
40745 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATAATTTGAAATAAATAATTCTTCAAATGG-CT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGAC-
* * * * ** *
40809 ATAATTATTTGAACTAAT-TTGA-TTAAC-TAATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAGTTTT
65 ATGACTATTTGAACT--TGCTCAGCAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAATTTT
* * * * ***
40871 T-GAAATATTAATAAAGAAATAGTATTTTATTTCAAATAAACTTTTATGTACT-GACATGTTTGT
127 TAG-AATAATAATAAAGAAATAGTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATG-AATAGAAACAATTGT
* * * * *
40934 TTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAATTATAACTATT
190 TTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTATT
* * * * * * *
40999 TGAACTTATTTAGTAAATAGA-TT-TT-TTT-AATTTCTTTACTTATTAATTTTTTG-AATGTTA
255 AGAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTATTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTA
* * * *
41059 ATAAATTAGTGTTATTATATTTCGAATAAGCATGTATAAACT-GAAACAATTATTTTTTGACTAA
318 ATAAATTAGTATTATTATATTTCGAATAAGCATGTATAAA-TAGAAAAAATTAGTTTATGAC-AA
* * * * *
41123 ACAAAA-GATCAAAATAATTTGGAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TGGT
381 AAAAAATGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATT-GT-TAATAGTCATAACTATTTAAACGT-GT
** * * *
41186 TTGGAAAACAAATTTAT-TTTTAAA-TC-CTTATTAATTTTTGAAATAATAATGAATTGGTATTA
443 TCAGAAAACAAATTTATCTTTTAAATTCACTTAATAATTTTTGAAATAATAATAAATTGATATTA
* ** * *
41248 TTTTATTTTG-AATAATTTTGTATGAATAGAA-
508 -TTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAT
41279 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACAATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGAC
1 ACAATTATTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGAC
* *
41343 ATGACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAG
65 ATGACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAATTTTTAG
** *
41408 AATAATAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
130 AATAATAATAAAGAAATAGTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
*
41473 GATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTAGAAC
195 GATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTATTAGAAC
* * *
41538 TTGCTCATTAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATTAATT
260 TTACTCAGTAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATT
* * * * * *
41603 AGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAAAAAATTA
325 AGTATTATTATATTTCGAATAAGCATGTATAAATAGAAAAAATTAGTTTATGACAAAAAAAATGA
* * * *
41668 TCATAACAATTTGAAATTGATAATTGTTAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAACATA
390 TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAA
** *
41733 TTTATCTTTTAAATTTCTACTTAATAATTTTTGAAATTTTAATAAATTTATATTATTTATTCGAA
455 TTTATCTTTTAAA-TTC-ACTTAATAATTTTTGAAATAATAATAAATTGATATTATTTATTCGAA
41798 ATAAGCTTGCATGAACAAAT
518 ATAAGCTTGCATGAACAAAT
* *** * * * * * * *
41818 TCAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTAAAATAGAAAATTA-TTTAGATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAA-CAGTTCAAATGGAC
* * * * * * * * *
41882 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTCATTTTTTTAAT-TCT--CTTATTAATTTTTAG
65 ATGACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAATTTTTAG
** * * * * *
41944 TCTATTAATAAATTAGAAT--TATTTTATTTCAAATAATA-TTATATTAACTA-AAACAATTGTT
130 AATAATAATAAA-GA-AATAGTATTTTATTCCAAATAA-ACTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTT
* * * * * * ** * * *
42005 ATATTG-CAAAACTATAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
191 TTA-TGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTATT
* ** ** * * *
42069 TGAACTTGTTTGGTAAA-ATATTT-GT-TTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA-AAATATTAA
255 AGAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-AGAAATATTAA
* * * * * * * *
42130 TAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAA
319 TAAATTAGTATTATTATATTTCGAATAAGCATGTATAAATAGAAAAAATTAG-TTTATGACAAAA
*
42194 CAAAA-G-TCATAACAATTT
383 -AAAATGATCAAAACAATTT
42212 TATTTGCAAA
Statistics
Matches: 3324, Mismatches: 639, Indels: 457
0.75 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
531 1 0.00
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535 57 0.02
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570 8 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (537 bp):
ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTCAAAATAGATAACAGTTCAAATGGACA
TGACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCGCTAACTTATCAATTTTTAGA
ATAATAATAAAGAAATAGTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
ATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAATCATAACTATTAGAACT
TACTCAGTAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTA
GTATTATTATATTTCGAATAAGCATGTATAAATAGAAAAAATTAGTTTATGACAAAAAAAATGAT
CAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAAT
TTATCTTTTAAATTCACTTAATAATTTTTGAAATAATAATAAATTGATATTATTTATTCGAAATA
AGCTTGCATGAACAAAT
Found at i:42786 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 42453--42860 Score: 430
Period size: 181 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
42443 TTTAAATCCA
* ** * * *
42453 TTTGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTCTGTTCATACAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAAT
1 TTTGTTTTATCACAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAGAAATGCTAAT
* * * * * *
42518 TTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAACGAATTCAGAAAATGTAGCTATTAGCCTGACCAGTG
66 TTATTAAAATTCCAAAAATTAATAACTAACGAATTCAAAAAATGAAGCTATTAGCCTGAACAGAG
* *
42583 TAAACAATTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCT
131 TAAAAAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCT
** *
42634 TTTGTTTTATCACAAAAAAATTGTTTCTATTTGTACAAGCTTATTTGGAATAACA-AAATTCTAA
1 TTTGTTTTATCACAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAA-AGAAATGCTAA
* * *
42698 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAA-GAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CC-GAACA
65 TTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAACTAACGA-ATTCAAAAAATGAAGCTA-TTAGCCTGAACA
** * * * * *
42760 -AGTAAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCT
128 GAGTAAAAA-A-TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCT
* * * * * * *
42815 TTTATATTGTTATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
1 TTTGTTTTATCACAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
42861 CAAATTTGTT
Statistics
Matches: 186, Mismatches: 36, Indels: 10
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
179 6 0.03
180 7 0.04
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ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTTGTTTTATCACAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAGAAATGCTAAT
TTATTAAAATTCCAAAAATTAATAACTAACGAATTCAAAAAATGAAGCTATTAGCCTGAACAGAG
TAAAAAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCT
Found at i:43153 original size:304 final size:301
Alignment explanation
Indices: 42590--43163 Score: 659
Period size: 304 Copynumber: 1.9 Consensus size: 301
42580 GTGTAAACAA
* * * *
42590 TTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTTATCACAAAAAAAT
1 TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCACAAAAAAAT
** ** *
42655 TGTTTCTATTTGTACAAGCTTATTTGGAATAACAAAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
66 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * **
42720 ATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTAAAAATAGTTATGGCTATTTGA
131 ATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTAAAAATAGTAATAACTATTTGA
* * * * * * * *
42785 ACAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCTTTTATATTGTTATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
196 ACAAGTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATATTATCATAAAACAATTGTATCAATTCATA
42850 CAAGCTTATTTCAAATTTGTTTACCGAATAATTTCAAATAG
261 CAAGCTTATTTCAAATTTGTTTACCGAATAATTTCAAATAG
* * * * * * *
42891 TTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAACAT
1 TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTG-TTTTATCACAAAAAAA
* * * * * *
42956 TTGTTTTTGTTCATACTAGCTTATTCAG-ATAAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCTACAA
65 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAA-AAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * **
43019 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTAATAACTA
128 TTAATAACTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTAAAAATAGTAATAACTA
* * * * *
43084 TTTGAATAAGTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTCATCATAAAATAATTGTATCAA
191 TTTGAACAAGTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATATT-ATCATAAAACAATTGTATCAA
*
43148 TTCATATAAGCTTATT
255 TTCATACAAGCTTATT
43164 CGAAATAAAA
Statistics
Matches: 221, Mismatches: 46, Indels: 9
0.80 0.17 0.03
Matches are distributed among these distances:
301 47 0.21
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ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (301 bp):
TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCACAAAAAAAT
TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
ATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTAAAAATAGTAATAACTATTTGA
ACAAGTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATATTATCATAAAACAATTGTATCAATTCATA
CAAGCTTATTTCAAATTTGTTTACCGAATAATTTCAAATAG
Found at i:43281 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 42862--45977 Score: 2307
Period size: 181 Copynumber: 17.2 Consensus size: 181
42852 AGCTTATTTC
* * * * * * * **
42862 AAATTTGTTTACCGAATAATTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTAT
1 AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * *
42927 TATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACTAGCTTATTC-AGATAAAAA
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* * * *
42991 TAATATTAATTTATTAATATTTCTACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAAT
129 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAAT
* * * * * *
43046 AAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAAGTATCTATTTCAAATCGT
1 AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
** * * * *
43111 TATGACCTTTTGTTTCATCATAAAATAATTGTATCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATA
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * *
43176 ATACTAACTTATTACTATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAT
131 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* *
43227 GAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
1 AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * *
43292 TATGACATTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCCAAATAAAATA
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * *
43357 ATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTGATAAATAA-AAATTT-AAAAAT
131 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * *
43406 AAATATGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCGT
1 AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
** * * *
43471 TATGACCTTTTG-TTTGTCATAAATTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATA
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* * * *
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*
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* *
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* * *
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** * *
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** * * *
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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*
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*
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** * *
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** * * *
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** * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * *
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**
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*
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* * * * *
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* * *
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** ** * * * *
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* *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * *
59004 AGATGAGATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTGCTGAGAAGAGCTTTTTTA
1 A-AT----TTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAAGAGCTTTTTTA
* * * * **
59053 AATTTTCAAAAGTCGTTGAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTCCA
1 AATTTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAAGAGCTTTTTTA
* * *
59097 AGATGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCTTTTTCA
1 A-AT--T---TTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAAGAGCTTTTTTA
* * *
59147 AGATGGATTTTTAAAGTTTTTGAGCCTCTACTTA-AAGGAGCCTTTTTA
1 A-AT---TTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAA-GAGCTTTTTTA
* ** * * *
59195 AATTTTCAAAAGTCATTGAGCTTCTACTTAGAAGAGCCTCTTTA
1 AATTTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAAGAGCTTTTTTA
* * *
59239 AATTTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCT-GTTCAGATGAGC-CTTTTA
1 AATTTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTT-AGAAGAGCTTTTTTA
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AATTTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTAGAAGAGCTTTTTTA
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59456 TTATTATTAT
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TTTTTC
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59458 ATTATTATTT
59468 TTTCTTTTCTCTTTTTC
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* *
59485 TTTCTTTTTTTTTTTTC
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59502 TTT
1 TTT
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TTTCTTTTCTCTTTTTC
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*
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AAAATAAATTTAAAAATAA
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61614 CATTAAGATA
* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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1 ACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * ** ** *
61869 TCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAGTAATAG
65 TTTGTTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATA-
* * * * * *
61934 GC-AGGCA-ATTTAAAAAATAAATTTGCTTAC-CAAACAAGTTGAAATAGTCATG
129 ACTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * ** * **
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATC-TTTTATTTTATCATAAAATAATTGT
* * * * **
62049 TTTTGTTCATGCAAAATT-TTTCAGAATAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTGAAAA-T--T
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* *
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128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAGTTCAAATAGTTATG
* *
62163 ACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * *
62226 TCTT-TTCATACAAACTTATTT-GGAT-TAA-AATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAACTTAAT
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* * *
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128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAAAC-AGTTCAAATAGTT-ATG
* * * * * *
62340 ATTATTTTG-TC-ATAAACACATTT-AAATAGTTATGA------ATTTT-T-A-AACAATTATT-
1 ACTA-TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAA-AATAATTG
*** * * * ** ** ** *
62392 TATTTCAAATAGTT-ATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTAATACATGCAT
63 T-TTT----T-GTTCAT-ACAAACTTATTTAG-AATAAAATAA-TACTAAT-TTATTA-AT--AT
* * ** * * * * ** * * * * * *
62455 ATT-CGAAATAAAATAA-TACTAG-TTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAA
115 -TTCCAAAAT-TAATAACTAAGAGATTTA--AAAAAT---AAATTTGTTTACTGAAACAGTTCAA
*
62517 A-A--AAT-
173 ATAGTTATG
* *** * * * * * * * *
62522 A-AATTTGTTTACTGAGCAAGTTT-AAATAGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * ** * * * * *
62585 TCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAACA
65 TTTGTTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-CAAAATTAATA
** * * * *
62649 GGTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTCATG
129 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
62702 TCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTT
** * * * * * **
62767 TTGTTCATGTGAAA-TTATTCAAAATAAAATAATATTTATCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA
66 TTGTTCAT-ACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAA
* * * * * * ** *
62828 -GAAGACATTTTAAAAATTAAATCTATTTTCCAAAATAGTTCAAATAGTTATG
130 CTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * ** * * * *
62880 ACTATTATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTTGTATAACAAATATT
1 ACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * * * **
62945 TTTGTTCATA-TAAGTT-TGTTAGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTGAAAA-T--T
65 TTTGTTCATACAAACTTAT-TTA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAAT
* * * *
63005 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACCAGTTCAATTAGTTATA
128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAA-CAGTTCAAATAGTTATG
** * * * * * * * *
63058 AGAATTTGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTT
* * * * * * * * *
63123 CTATTGATGC-AGCTCTA-TTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT
66 TTGTTCATACAAACT-TATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-CAAAATTAAT
* * * * ** * * *
63185 AAGTAACGA-AATTAAAAAATGAATCTGTTGGCCT-TACCAATGT-AAATAGTTATG
128 AACTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TACTGAAACAGT-TCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * *
63239 ACTAATTGTACAATAATCTATTTTAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTATT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * ** * * * * * * * **
63303 TCTATTTGTACTAGCATGTTCAAAATAACATAATTTTAATTTATTAATA-TTCCAAAAGTTAATA
65 TTTGTTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAA-TTAATA
* * * * * *
63367 AGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTG-AACAAGTTTAAATGGTTATG
129 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * **
63420 ACTATTTTAACAATTA-CATATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATT-TT
1 ACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * * * *
63483 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAC-AATTTATTAAT-CTTCAAACAATTAA
65 TT-TGTTCATACAAACTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAA-AATTAA
* * * *
63545 AAAGTAAAAGCATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATA-AGTTCAAAGAGTTATG
127 TAACTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAA-ACAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
63601 ACTATTTGAACAATTATTTATATT-AAATCA-TTTTGA-CATTTTCTTTTGTCATAAAACAATTA
1 ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-AGTTATGATC-TTTTATTTTATCATAAAATAATTG
* * * * * * *
63663 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-GATAACTAAT
63 TTTTTGTTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAAT
* * * * * * *
63727 AAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTA-TCG-AACAAGTTCATATAGTCATA
128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
63781 ACTACTTGAATACTTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTA
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTT
* * * ** * *
63845 TTAGCTT-AGATAGGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGT-AAAAATTAA
65 TTTG-TTCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCCAAAATTAA
* * *
63907 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATG
127 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
63962 ACTATTTGAATAATTTTTTATTTCAAATCA-TTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATC-TTTTATTTTATCATAAAATAATTGT
* * * * * *
64025 TTTTGCTCGTACAAGCTTATTCCA-AATAAAATAATA-TAAATTATTAATATTTCAAAAATTAAT
64 TTTTGTTCATACAAACTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAAT
* *
64088 AAGTAA-AAATTTAAAAAATAA
128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAA
64109 TCTATTTTTT
Statistics
Matches: 1766, Mismatches: 393, Indels: 292
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
168 4 0.00
169 9 0.01
170 1 0.00
171 5 0.00
172 7 0.00
173 22 0.01
174 8 0.00
175 8 0.00
176 79 0.04
177 205 0.12
178 101 0.06
179 139 0.08
180 225 0.13
181 808 0.46
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183 20 0.01
184 6 0.00
185 12 0.01
186 17 0.01
187 5 0.00
188 4 0.00
189 1 0.00
190 8 0.00
191 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTT
TTGTTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAC
TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAGTTCAAATAGTTATG
Found at i:62666 original size:147 final size:146
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62385 AATTATTTAT
* * * * *
62395 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTAATACATGCATATTCG
1 TTCAAATAGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCATATTCA
* * *
62460 AAATAAAATAATACTAGTTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAA
* ** *
62525 TTTGTTTACTGAGCAAG
130 TTTGCTTACCAAACAAG
* * * **
62542 TTTAAATAGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCATATTCA
* * * * *
62607 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAGGTGAGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
62672 TTGCTTACCAAACAAG
131 TTGCTTACCAAACAAG
62688 TTCAAATAGT
1 TTCAAATAGT
62698 CATGTCTATT
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 23, Indels: 1
0.85 0.15 0.01
Matches are distributed among these distances:
146 35 0.26
147 98 0.74
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (146 bp):
TTCAAATAGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCATATTCA
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
TTGCTTACCAAACAAG
Found at i:63864 original size:361 final size:358
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Indices: 62542--64104 Score: 1184
Period size: 361 Copynumber: 4.3 Consensus size: 358
62532 ACTGAGCAAG
* * * * * *
62542 TTTAAAT-AGTTATGATCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT
1 TTTAAATCA-TTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCGTACAAGCTTATT
* * * *
62605 CAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAGGTGAGAGATTTAAAAAATAA
64 C-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
* * * * ** * ***
62670 ATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTT
126 ATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTA-CATATTTCAAATCACT
* * ** * * * ** * *
62734 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGTGAA-ATTATTCAAAATAAAATA
190 ATAACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCA-GACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * *** * * * * * *
62798 ATATTTATCTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAG--ACA-TTTTAAAAATTAAATCTATTTTCC-
254 ATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCG
* * * *
62859 AAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTATGAATAATTATCTA
319 AACA-AGTTCAAAGAGTTATGACTATT-TGAACAATTATTTA
** * * ** * * * * * * *
62901 TTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTTGTATAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-
1 TTT-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCGTACAAGCTTATTC
* *
62965 AGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAA
65 A--AATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
* * * * * * ** * *** ***
63026 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAAGAATTTGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTA
126 ATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTACATATTTCAAATCACTA
* * * ** * * * *
63091 TGACCATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCTATTGATG-C-AGCTCTATTCGAAATAAAGTA
191 TAACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCA-GACAAGCT-TATTCGAAATAAAATA
* * * * * **
63154 ATGCTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAACGAA-A-TTAAAAAATGAATCTGTTGG
254 ATACTAATTTATTAATATTGC-AAAAATTAAAAAGTAA--AAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA
* * * * * * *
63216 CCTTACCAA-TGT-AAATAGTTATGACTAATTGTACAATAATCTA
316 CC-GAACAAGT-TCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * * * * * * *
63259 TTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTATTTCTATTTGTACTAGCATGTTC
1 -TTTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCGTACAAGCTTATTC
* * * * *
63324 AAAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA
65 -AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAA
* * * * * * * * *
63389 TCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATGGTTATGACTATTTTAACAATTACATATTTCAAATCGCTAT
127 TATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTACATATTTCAAATCACTAT
* * * * * * *
63454 AACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAAT
192 AACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCAGACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAAT
* * *
63518 AC-AATTTATTAATCTT-CAAACAATTAAAAAGTAAAAGCATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCG
256 ACTAATTTATTAATATTGCAAA-AATTAAAAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACCG
*
63581 AATAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
319 AACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * *
63621 TATTAAATCATTTTGACATTTTCTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC
1 T-TTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCGTACAAGCTTATTC
* * * *
63686 AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTGATAACTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAAT
65 A-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAT
* * * *
63751 ATGTTTATCGAACAAGTTCATATAGTCATAACTACTTGAATACTTATC-TATTTCAAATCATTAT
128 ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTA-CATATTTCAAATCACTAT
* *
63815 AACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTAT-TAGCTT-AGATAGGCTTATTCGAAATAAAATAA
192 AACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTA--TTCAGACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * *
63878 TACTAATTTATTAATATTGTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGA
255 TACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGA
* * *
63943 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTTTA
320 ACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* *
63982 TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGCTCGTACAAGCTTATTC
1 TTT-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCGTACAAGCTTATT-
*
64047 CAAATAAAATAATA-TAAATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAA
64 CAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
64105 ATAATCTATT
Statistics
Matches: 971, Mismatches: 186, Indels: 94
0.78 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
354 1 0.00
355 1 0.00
356 144 0.15
357 2 0.00
358 89 0.09
359 48 0.05
360 114 0.12
361 301 0.31
362 261 0.27
363 10 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
TTTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCA
AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATG
TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTACATATTTCAAATCACTATAACC
TTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCAGACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTGCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACAAGT
TCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
Found at i:64152 original size:142 final size:143
Alignment explanation
Indices: 63992--64252 Score: 377
Period size: 142 Copynumber: 1.8 Consensus size: 143
63982 TTTCAAATCA
* * * *
63992 TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTTTGCTCGTACAAGCTTATTCCAAATAAAA
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64 TAATACTAAATTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAATCTATTTTT
64118 TGAACACGTTAAATAG
128 TGAACACGTTAAATAG
* * *
64134 TTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAATCAAATTTTTCTGTTCATACAAGCATATTCGAAATAAAAT
1 TTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAT-AAATTTTTCTGCTCATACAAGCATATTCCAAATAAAAT
* *
64199 AATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAA
65 AATACTAAATTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAA
64253 ATTTGTTCAT
Statistics
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TTATGACATTTTGCTTTGTCATAAATAAATTTTTCTGCTCATACAAGCATATTCCAAATAAAATA
ATACTAAATTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAATCTATTTTTTGA
ACACGTTAAATAG
Found at i:64339 original size:181 final size:180
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64116 TTTGAACACG
*
64126 TTAAATAGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAATCAAATT-TTTCTGTTCATACAAGCATATTCG
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-CAAATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTCG
*
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64 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAA-TTTAAAATATAAA
* * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** *
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64 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAAAAATTTAAAATATAAA
* * *
64435 TCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATGTCGATTTGAACAATTATCTATT
128 TCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
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1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAAATTGTTTCTGTTCATACAAGA-TATTCGA
* * * * * * *
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65 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAAATC
* * * * **** *
64614 TGTTTACCGAA-ACAGTTTAAATAGTTATGATTTTTTGAACAATTATCTATC
130 TATTCACCGAATA-AGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
** * * * *
64665 CAAAATAGTTACGATC-TTTATTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT-TTCCATACAAGCTTATTC
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTT-CATACAAG-ATATTC
* * * * * * * * * * *
64727 GGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTATGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
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* * * * ** * * * * * *
64792 TATGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTA-GGACTATTAGAACAATTATTTAAT
128 TCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGG-CGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ** *
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1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * * * * * * *
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63 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-AATTTAAAATATAA
* ** * * * * ** *
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127 ATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAG-TCATG-GCGATTTGAACAATTATCTATT
* * **
65025 TTAAAGTCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTATTT-TAGTTCATAAAATCTTAT
1 TTAAA-T-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCT-GTTCATACAA-GATAT
* * * * *
65087 TAG-AATACAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AC
61 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATA-
* *** * * * * * * ** *
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* * * * ** *
65206 TCAAATCA-TTATGATC-TTTATTTTCTCATGAAAC-AATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTC
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * *
65268 -ATATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTCATAAGAGATTTAAAATAAATGTGT
63 GAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-A-AG---T-AAA-AAAT-T-T
** * * ** * * * * * * * ** *
65332 -TTA-ATAAATGTGTTTGCTGAACT-ACTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATT
118 AAAATATAAATCTATTCACCGAA-TAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
65393 TCAAATTA-TTCTAACCTGTTGTTTAGTCATATAA-TAATTGTTTCAGTTGATACAAGCTTATTT
1 TTAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AACAAATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATA-TT
* * * * * *
65456 GGAAAAAAAACAATACTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATTAATAAG---CAGA---AAAA-ATA
62 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATA
* * ** * * * * * * *
65513 AATCTGTTTATTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATT
126 AATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
65568 TAAAATCA-TTATGATCATTTGTTTTATCATAAA-ACAATTGTTT-TAGTTTCGTAAAAGTTTAT
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCT-G-TTCATACAAG-ATAT
* * * * * * * * * *
65630 CCAAAATAAAATAATGCTACTATATTAAT-TTTTCAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAT
61 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATAT
* * ** * * * ** * **
65694 AAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAACAATCTATT
125 AAATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *** *
65750 TCAAATCA-TTCTTACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTC
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * * *
65813 AAAATAAAGTAA-ACTAATTTATTAATATT-TCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAA
63 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAA
* * * ** * * * * * *
65872 ATTTGTTTATTGAATCAGTTCAAATAG-CTATGACTATTTGAATATTTATCTATT
127 ATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTC-ATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * ** *
65926 TCAAATTGTTATAACATTTTGTTCTATCATAAA-ACAATTGTTTCTGGTCATATAACTTATTCAA
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAGATATTCGA
* * * * * * *
65990 AATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTTAAAGATTTAAAAAATAAATT
65 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAAA-T
* * ** * * * * * * *
66055 CGT-TT-GCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATT
129 C-TATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * ** * ** *
66106 TCAAGCTTATTTGAAATAGAACAATTATTTCAACTCAT--AC-AA--G---C--TT-ATTCAA-A
1 TTAA--ATAGTT---AT-GACCTTTTGTTT--TGTCATAAACAAATTGTTTCTGTTCATACAAGA
* * * * *
66159 -A-TAG-AATAAAACTAATTCATTAATATT-TCAAAATT-T---TA-TAA-AAG------ATTTA
58 TATTCGAAATAAAA-TAA-T-ACTAAT-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTA
* * * ** * * * ** *
66208 GAGA-ATAATTCTATTTATTGAATCAACTT-AAATAATTATAACAATTTGAACAATTATCTATT
119 -AAATATAAATCTATTCACCGAAT-AAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
66270 TGAAATCA-TTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTTTGTTAATATAAG-TTTGAT
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAGATAT--T
* * * * ** ** *
66332 CAAAATAAAAAAAAAACTAATTTATTTATATT-TAGAAAATTAATCCGTAAATGATTTAAAAAAT
62 CGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATAT
* * * * ** * * ** * * * *
66396 AAATATGTTTACCAAACCATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATT
125 AAATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *** *
66452 TCAAATTGTTATAATCTTTTATTTTGTCATCAAA-TAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCA
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATTGTTTCTGTTCATAC-AAGATATTCG
* * * * * **
66516 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTCAATAACCAAAAAATTTTAAAA-ATAAA
64 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAA-TTTAAAATATAAA
*** * * * * * * * **
66580 TCTAATT-GTTGAACCAA-TTTAAATAGTTAAGACTATGTGAATGATTATCTATT
128 TCT-ATTCACCGAA-TAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * * *
66633 TCAAATCA-TTATAACATTTTCTTTTATCGTAAA-ATAATTATTT-TGTTCGTAAAAGCTTATTC
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * * * * * *
66695 GGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAACAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
63 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAA
* * ** * * * * * * *
66759 ATTTGCTT-ATTGAATCAATTTAAAATGGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATT
127 ATCT-ATTCACCGAAT-AAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * ** *
66813 TCAAATCA-TTTTGATCTTCTGTTTAGTCTTAAA-ATAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * * * *
66876 -AGAATAAATTAATATTAATTTATTAACATT-TGTAAAATCAATAAG-AAAAAGATTTAAAAAAA
63 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAA-ATTT-AAAATA
* * * * * * **** *
66938 TAAATTTGTTTA-CGAAAAAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATT
124 TAAATCTATTCACCG-AATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
66995 TAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCA
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAAATTGTTTCT-GTTCATACAAG-ATATTCG
** * * * * *
67059 AAATAAAATAATACTAATTCCTTAATATT-TCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTAAAAAAAT-AA
64 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAAA
* * * * * * * * *** *
67121 TTTGTGT-ACCAAACAAATTTAAATAATTACAACTATTTGAACAATTATCTATT
128 TCTAT-TCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
67174 TAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAAA-TGTTT-TAGTTTATACAAGCTTATT
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATTGTTTCT-GTTCATACAAG-ATATT
* * * * **
67236 TGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAA-AGGG
62 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATA-TA
* * * * * * * * *
67296 AATCTGTTTACCAAATCAGTTTAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTATCTATT
126 AATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
67351 TCAAATCA-TTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAAC-AATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTT
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AACAAATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * * * * * * *
67414 GAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
63 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAAA
* * * ** * * * * * * * * *
67479 TTTTTTTACTAAACCAA-TTCAAATTGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATT
128 TCTATTCACCGAA-TAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * *** * * *
67532 TCAAATCGTTATGACC-TTT-TTTT-TCATAAAAACAATTGTTT-AAATCATACTAGCTTATTTG
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTCG
* *
67593 -AATAAAATATATGTA-TAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGAATTTAAAA-ATA
64 AAATAAAATA-A--TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATA
* * * * * * * * ** *
67651 ATTGTGTTTA-CTAAT-AGTTTAAATAATTAAT--ATATTTGAACAATTA-ATA-T
126 AATCTATTCACCGAATAAGTTAAAAT-AGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * ** * * * * * * * *
67701 TTAATTA-CTA-AACCTTTT-ATTCATAATAAATATATTATAATCT-ATAATAC---A-ATTAGA
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAAATTGT-TTCTGTTCATACAAGATATTCGA
* *
67758 AATAAAATAATA--AATTTATTAATA-T-TAAGAAATTAAT-ACTAAAAGATTTAAAA-AGT---
65 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATA-TAAA
* * * * * *
67814 T-TA-T----GAACAAGTTATAAATA-TTAT-ACTATTT-AATAATTATTTATT
128 TCTATTCACCGAATAAGTTA-AAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
67859 TCAAATTG-T-TGA-CTTTTATTTTGTTTAACATAAATATAATTGTTT-T-TATCATACAAGCTT
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG--T--CATAAACA-AATTGTTTCTGT-TCATACAAG-AT
** * * * *
67919 ATTCGAAATTAAAATAAT-CTTAATTTATTAATATTTCTGGACATTTATACGTAAAAGATTTAAA
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* * * * * *
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121 ATATA-A-ATCTATTCA-CCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
68041 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAA-ACAATTATTTCAGTTCATATAA-ACTTATT
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAGA--TATT
* * * * * * *
68103 TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTACA-GAGTAGGAGAA-TAAAAAAAT
62 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA-ATAAGTA-AAAAATTTAAAATAT
* * * ** * * * * *
68166 GAATATGCTT-ACTAAACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
125 AAATCT-ATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
68222 TCAAA-ACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTT
1 TTAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATA-TT
* * * *
68285 CG-AATAAAATAATA-TAAATTATTAATATTCCAAAAATTAACAA-T-AAAATTTTGAAAA-ATA
62 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAATATA
* ** * * ** * * ** * *
68345 AAGCTATTTTCTGAACACTTTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATT
126 AATCTATTCACCGAATA-AGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
** * * * *
68401 TTAAATCA-TTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTATTTC-
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAAATTGTTTCTGTTCATACAAGATA-TTCG
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* * * * * ** * * *
68527 AAT-TATTTACTGAGTGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATT
126 AATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
68581 TCAAATCA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCTATTTATACAAGTTTATTC
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * ** * * *
68644 -AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGTAAAATTTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTA
63 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAA
* * * * * * * * * * *
68708 TTCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAACTACTATATATT
127 ATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
68762 TCAGATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATT-
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAGA-TATTC
* * * * * * *
68824 TAGAATAAAATAATAATAGTTTATTACTATT-TCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAA-ACTA
63 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATA-TA
* * * * * * * * * * *
68884 AATC--TTAACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTACCTATC
126 AATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
68937 TCAAATTA-TTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAA-ACATTTGTTTCTGTTCATACGAGCTTATTC
1 TTAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATATTC
* * * ** * *
68999 -AAAGTAAAATATTGCTAAATTAACAATATTCTAAAAATTAAT--G---AGAATTTAAAAAATAA
63 GAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATAA
* * ** * * * * * * * *
69058 ATATGTTTGCTGATCTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT-TCTATT
127 ATCTATTCACCGA-ATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * **
69111 TCAAATCA-TTTTG-CCTTTTATTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTCGGTTCATACATACTTATTC
1 TTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCTGTTCATACA-AGATATTC
* * * * * *
69173 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAATAAAAAATA
63 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATT--TAAAATATA
* * * * * * * * * *
69238 AATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
126 AATCTATTCACCGAATAAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ** *
69293 TAAAATTA-TTGTGACTTTTTATTTTATCATAAA-ACTGTTGTTT-TAGTTCATA-AAAACTTAT
1 TTAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AATTGTTTCT-GTTCATACAAGA--TAT
* * * * * * ** * * * *
69354 TTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAACATTTTAAGAATCGATAAGTTAGAGATTTAAAACATA
61 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAATATA
* ** * * * * *
69419 AATC-AGTTAATTGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATT
126 AATCTA-TTCACCGAAT-AAGTTAAAATAGTCATGGCGATTTGAACAATTATCTATT
* * *
69474 TCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAA
1 TTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
69507 ACAATTATTT
Statistics
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* * * *
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*
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* * * *
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* * ** * *
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* * ** **
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* ** *
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* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAA
* * * * ****
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64 ATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT-A-AG---T-AAA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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186 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTAG-AATAAAATAATA
* * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * ** *
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* * * * ** * *
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* **** * *
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193 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
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* * * **
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* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* ** * * *
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65 TAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA
** * * * *
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128 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* ** * * * ** * * * *
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193 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * *
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257 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CCAGTTCA
* * * *
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* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAAT-AAA
* * * * ** * *
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64 ATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
** * * * * * * ** * *
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128 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * ** *
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193 GTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * ** * * * * ** ** * *
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256 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGTTCA
* * **
66601 AATAGTTAAGACTATGTGAATGATTATCTATTTCAAATCA
321 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * ** *
66641 TTATAACATTTTCTTTTATCGTAAAATAATTATTTT-GTTCGTAAAAGCTTATTCGGATTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * *
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66 AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * *
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130 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
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* ** * * * * **
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257 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTG-AACCAGTTC
* * * * *
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320 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
67003 TTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
** * * * * * *
67068 AATACTAATTCCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTAAAAAAAT-AATTTGTGTACC
66 AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * ** *
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130 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
67196 TTCGTCATAAAACAAATGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAAT
195 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAG-AATAAAATAATACTAATTTATT
* *** * ** * *
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259 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGTTCAAAT
* * * *
67322 AATTATGGCAATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA
324 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * **
67359 TTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * *
67424 AATAGTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACT
66 AATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * *
67489 AAACCAA-TTCAAATTGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTT-
130 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * *
67551 TTTT-TCATAAAAACAATTG-TTTAAATCATACTAGCTTATTTGAATAAAATATATGTA-TAA-T
194 TTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAGAATAAAATA-A--TACTAATT
* * * * *
67612 TATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-ATTT-AAAAATAATTGTGTTTACT-AA-TAGTTT
255 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGTTC
* * *
67671 AAATAATTAAT-A-TATTTGAACAATTA-ATATTT--AATTA
320 AAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * *
67708 CTA-AACC--TT-TTAT-TCATAATA-AATATATTATA-ATCTATA-ATA-C-AATT-AGAAATA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTAGTTC-ATACA-AGCTTATTCA-AAATA
*
67762 AAATAATA--AATTTATTAATATT-AAGAAATTAAT-ACTAAAAGATTT----AA-AAA---GTT
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* * *
67815 TA-TGAACAAGTTATAAATA-TTAT-ACTATTT-AATAATTATTTATTTCAAAT--TGT-TGA-C
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* * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * ** * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * **
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* * *
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** * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAA
* * *
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*** * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * *
68770 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * *
68834 TAATAATAGTTTATTACTATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATC--TTAAC
65 TAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** * * * * * *
68893 CAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTACCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTG
129 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
68957 TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCT-GTTCATACGAGCTTATTCA-AAGTAAAATATTGCTAAATT
194 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-AGAA-TAAAATAATACTAATTT
** * * * *
69020 AACAATA-TTCTAAAAATTAAT--G--AGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGATCTAATTC
256 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGTTC
* *
69079 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT-TCTATTTCAAATCA
320 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAA
* * *
69182 TAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTAATAAAAAATAAATATGTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATT--TAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * *
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126 TACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * ** * * * * *
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190 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAG-AATAAAATAATACTAAT
* * * ** * * * * * *
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254 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTGAACCAGT
* * * * *
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318 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* *
69482 TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
69518 TGAAATATTA
Statistics
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Consensus pattern (360 bp):
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1 AATAAATGTGTTT
65347 GCTGAACTAC
Statistics
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AATAAATGTGTTT
Found at i:66821 original size:180 final size:179
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Indices: 66140--69517 Score: 1888
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66130 TTATTTCAAC
* * * * * * *
66140 TCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAAAACTAATTCATTAATATTTCAAAATT--TTA-TAAAA
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * *
66202 GATTTAGAGAAT-AATTCTATTTATTGAATCAACTTAAATAATTATA-ACAATTTGAACAATTAT
66 GATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CGAAACAATTTAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
66265 CTATTTGAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
128 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * * * * * * * **
66317 TAATATAAGTTTGA-TCAAAATAAAAAAAAAACTAATTTATTTATATTTAGAAAATTAATCCGTA
1 TCATACAAGCTT-ATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-CAAAATTAATAAGTA
* * * ** *
66381 A-ATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATT
63 AGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAA-CAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* ** * * * * *
66445 ATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTA-T
126 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGT
* ** * * * * ** *
66499 TCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTCAATAACCAAA
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAG
* * ** * * * **
66564 AAATTTTAAAAATAAATCTAATTGT-TGAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATGTGAATGATTAT
65 AGATTTAAAAAATAAAT-TTGTT-TACGAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
66628 CTATTTCAAATCATTATAACATTTTCTTTTATCGTAAAATAATTATTTT-GT
128 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * * *
66679 TCGTAAAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAACAATTAATTAGTAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAG
* * * * *
66744 AGATTTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAATCAATTTAAAATGGTTAAGACTA-TTGAATAATTAT
65 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAAACAATTT-AAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
66808 CTATTTCAAATCATTTTGATCTTCTGTTTAGTCTTAAAATAATT-TTTTCAAT
128 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGT
* * * * * * *
66860 TCATACAAGCTTATTC-AGAATAAATTAATATTAATTTATTAACATTTGTAAAATCAATAAGAAA
1 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-CAAAATTAATAAGTAA
* * * ** * *
66924 AAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACGAAAAAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTG
64 GAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACGAAACAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA
* * * *
66989 TCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGT
127 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * *** *
67042 TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTCCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAG
* * * *
67107 AG-TTAAAAAAAT-AATTTGTGTACCAAACAAATTTAAATAATTACA-ACTATTTGAACAATTAT
65 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAAC-AATTTAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
67169 CTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAAATGTTTTAGT
128 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * *
67221 TTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT---
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAG
*** * * * * * * * *
67283 -GATTTAAAAAGGGAATCTGTTTACCAAATCAGTTTAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTATC
65 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAA-CAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
67347 TATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA
129 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * * * *
67398 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
67463 AGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTAAACCAATTCAAATTGTTAAGACTATATGAATAATTATC
65 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAA-CAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC
* * **
67528 TATTTCAAATCGTTATGACC-TTT-TTTT-TCATAAAAACAATTG-TTTAAA
129 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTAGT
* * * *
67576 TCATACTAGCTTATTTG-AATAAAATATATGTA-TAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA-A--TACTAATTTAATAATA-TTTCAAAATTAATAAGT
* * * * *
67637 -AGA-ATTT-AAAAAT-AATTGTGTTTAC-TAATAGTTTAAATAATTAATA-TATTTGAACAATT
62 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACGAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
67696 A-ATATTT--AATTACTA-AACC--TT-TTAT-TCATAATA-AATATATTATA-A
126 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTAGT
* * * * *
67741 TCTATA-ATA-C-AATTAGAAATAAAATAATA--AATTTATTAATA-TTAAGAAATTAAT-ACTA
1 TC-ATACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAATTAATAAGTA
* * * *
67799 AAAGATTT----AA-AAA---GTTTATG-AACAAGTTATAAATA-TT-ATACTATTT-AATAATT
63 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAACAA-TT-TAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* * * *
67852 ATTTATTTCAAAT--TGT-TGA-CTTTTATTTTGTTTAACATAAATATAATTGTTTT--T
126 ATCTATTTCAAATCAT-TATAACCTTTTGTTTTG--T--CATAAA-ACAATTGTTTTAGT
* * * * *
67906 ATCATACAAGCTTATTCGAAATTAAAATAAT-CTTAATTTATTAATATTTCTGGACATTTATACG
1 -TCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATAC-TAATTTAATAATATTTC--AAAATTAATAAG
* * * * ** ** * * * * * *
67970 TAAAAGATTTAAAATATATATATGTTT-TTAGCCAAGTTCAATAGTCATGGCTATTTGAATAATT
61 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* * * *
68034 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTCAGT
126 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * * * * * *
68088 TCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTACA-GAGTAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAATTA-ATAAGTAA
* * * * * * * *
68152 GAGAATAAAAAAATGAATATGCTTACTAAACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
64 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAACAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
68217 CTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-T
128 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGT
* * * * *
68269 TCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTATTAATATTCCAAAAATTAACAA-TAA
1 TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA
* ** * * * *
68331 -A-ATTTTGAAAAATAAAGCTATTTTCTG-AACACTTTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAA
64 GAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAAACA-ATTT-AAATAGTTA-AGACTATTTGAACAA
* * ** *
68392 TTATCTATTTTAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-T
124 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT
* *
68448 TCAAACAAGC-TATTTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA
1 TCATACAAGCTTA-TTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTA
* * * * * *** * * **
68510 AAAAATTTTAAAAATAAAATTATTTACTGAGTGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTA
63 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA
* * *
68575 TTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
127 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT
* * *
68628 TTATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGT-AAAATTTAATAAGT-
1 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAA-TTAATAAGTA
* * * * * * * * * *
68690 TGAAGATTTAAAAAAT-TATTCTATTTACTG-AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAACTA
63 AG-AGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTAC-GAAACAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAA
* * * *
68753 CTATATATTTCAGATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
124 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT
** * * * * *
68809 TCATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAATAATAGTTTATTACTATTTCAAAATT--TAA-TAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
68870 AGATTTAAAAACTAAA--TCTTAACCAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAC
65 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAACAAT-TT-AAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
68932 CTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCT-GT
128 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT
* * * * * *
68983 TCATACGAGCTTATTC-AAAGTAAAATATTGCTAAATTAACAATATTCTAAAAATTAAT--G--A
1 TCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
69043 GA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTG-ATCTAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT-
64 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAAAC-AATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA
** * * **
69105 TCTATTTCAAATCATT-TTGCCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCGGT
127 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * *
69157 TCATACATA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCA
1 TCATACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC--AAAATTAATAAGTA
* * * * * *
69220 AGAAATTAATAAAAAATAAATATGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
63 AGAGATT--TAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAAACAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAA
* * * * * * * **
69284 TTATCTATTTAAAATTATTGTGACTTTTTATTTTATCATAAAACTGTTGTTTTAGT
124 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
* * * * * * * * ** *
69340 TCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAACATTTTAAGAATCGATAAGTTAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAG
* ** * * * * * * * * *
69405 AGATTTAAAACATAAATCAGTTAATTGAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATC
65 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC
* *
69470 TATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT
129 TATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
69518 TGAAATATTA
Statistics
Matches: 2506, Mismatches: 516, Indels: 354
0.74 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
156 18 0.01
157 15 0.01
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159 5 0.00
160 12 0.00
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185 10 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGA
GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAAACAATTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
Found at i:69402 original size:712 final size:718
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Indices: 64148--69516 Score: 2264
Period size: 719 Copynumber: 7.5 Consensus size: 718
64138 GACCTTTTGC
* * *
64148 TTTGTCATAAATCAAATT-TTTCTG-TTCATACAAGC-ATATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTC-GATTCAAACAAGCTAT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * *
64210 ATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTCA-TCGAGTAAGTTA
63 ATTAACATTC-AAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAAATTATTTACT-AAATAAGTTC
* * * * * * * * *
64274 AAATAGTTATGGCTGTTTTAATAATTTTTTATTTTAAAT-AGTTATAATCTTTTGTTTTATCATA
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATGATCTTTTATTTTATCATA
* * * * * *
64338 AAACAATTGTTTCTGTTCAT-ACAAGTTCATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTC
190 AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTT-ATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTG
* * * *
64401 TAAAAATT-AA-AAGGTAGGAGATTTAAAATATAAATCTA-TTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGT
253 T-AAAATTCAATAAGTTA-GAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGT
* * * * *
64462 CATGTCGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
315 CATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * * * * * *
64527 GTTT-ATGTTCATGCAAAATTAGTCAAAATAAATTAATACTGATATATTAATATTTTGAAAATT-
380 ATTTCA-GTTCATACAAAATTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * ** * * * * * * *
64590 -A-A-TAAGAGATTTAAAATCTAAATCTGTTTACCGAAAC-AGTTTAAATAGTTATGATTTTTTG
444 CAGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATATGCTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * *
64651 AACAATTATCTATC-CAAAATAGTTACGA-TCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCC
508 AACAATTACCTATCTCAAAACA-TTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATT-C
* * * * * *
64713 ATACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTATGCAAGA
571 ATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT-ATAAATTAACAATATTCCAAAAATTA-AAT--AA-A
**
64777 GA-TTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTGAAC-CAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTA
630 -ATTTTAAAAAATAAACTAT-TTT-CTGAACACA-TTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTA
* * * * ** *
64839 TTTAATTGAAATCATTCTGACCTTTTGT
691 TCTATTTCAAATCATTATGACAATTTAT
* ** * * *
64867 TTAGTCATAAAATGATTATTT-AAGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCGA-TTCAAACAAGCTAT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
64930 TTAACATTCGAAAATTAGTGAGCAAAAGATTTTAAAAAA-AAAATCTGTTTGCTGAACAAGTTCA
64 TTAACATTCAAAAATTAATAAGCAAAA-AATTTAAAAAATAAAAT-TATTTACTAAATAAGTTCA
* * * * * * *
64994 AATAGATT-TGATTGTTTGAACAATTATCCATTTAAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
127 AATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTTTATCATAA
* * * * *
65058 AACAATTATTT-TAGTTCATAAAATCTTATT-AGAATACAATAATACTACTTTATTAATATT-TC
191 AACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTGT-
* * * * ** *
65120 AAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTC-GAATC-AGTTCAAATAGTTA
254 -AAAATTCAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGTCA
* * * * ** * * * * * *
65182 TGACTATTTGAACAAATATGAATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTCTCATGAAACAATTGT
317 TGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* ** * * * * *
65246 TTCTA-ATCATACAAGCTTA-TTCATATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-C
382 TTC-AGTTCATACAAAATTATTTGAAAT-AAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAC
* * * ** * * *
65308 --A-TAAGAGATTTAAAATAAATGTGTTTAATAAATGTGTTTGCTGAACTACTTCAAATAGTTAA
445 AGAGTAAGAGA-ATAAAA-AAA--TG---AAT--A--TGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * ** * * * * * *
65370 GACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTAAC-CTGTTGTTTAGTCATATAATAATTGT
499 GACTATTTAAACAATTACCTATCTCAAAACATTATGACTCT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGG
* * * * * ** *
65434 TTC-AGTTGATACAAGCTTATTTGGAAAAAAAACAATACTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATT-
563 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTT-CAAATAAAATAATA-TAAATTAACAA-TATTCCAAAAATTA
* * * * *
65496 AATAAGCA---GAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAA-AAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-A
624 AATAA-AATTTTAAAAAATAAA-CTATTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTTATAACTA-TTAGA
* * *
65555 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGATC-ATTTGT
684 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CAATTTAT
* * * * * * *
65590 TTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTTCGTAA-AAG-T-TTATCCAAAATAAAATAATGCTACTA
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTTCGATTC-AAACAAGCTATT-T-CAAAATAAAATAATACTAATT
** ** * * * * * *
65652 TATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAT-AAATCAATTTATTGAATCAGTT
62 TATTAA-CATTCAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAAAT-TATTTACTAAATAAGTT
* * * * ** * * * * * *
65716 CAAATAATTTTGGCCATTTGAACAACAATCTATTTCAAATCATTCTTACCTTTTGTTTTGTCATA
125 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTTTATCATA
* * * * * * * *
65781 AAACAATTATTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAGTAA-ACTAATTTATTAATATT-T
190 AAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTGT
** * *
65843 CAAGAATT-AAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATC-AGTTCAAATAG-CT
254 -AA-AATTCAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGTC-
* * * ** * * * * *
65901 ATGACTATTTGAATATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTG
316 ATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * ** * * * *
65966 TTTCTGGTCATA-TAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTA-A
381 TTTCAGTTCATACAAAATTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTACA
* * * * * * * * * * *
66029 TAACTTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG
446 -GA-GTAAGAGAATAAAAAAATGAATAT-GCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* ** * ** * ** * *
66092 AACAATTA--T-T-T------ATT-TCAAGC-TT-ATTTGAAATAGAACAATTATTTCAACTCAT
508 AACAATTACCTATCTCAAAACATTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCAT
* * ** * ** *
66144 ACAAGCTTA-TTCAAAATAGAATAAAACT-AATTCATTAATATTTC-AAAATTTTATAAAAGATT
573 ACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATT-AACAATATTCCAAAAATTAAATAAAA-TTT
* * * * * *
66206 TAGAGAATAATTCTATTTAT-TGAATCA-ACTT-AAATAATTATAACAATTTGAACAATTATCTA
634 TAAAAAATAA-ACTATTT-TCTGAA-CACA-TTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTATCTA
* * ** *
66268 TTTGAAATCATTATTACTTTTTGT
695 TTTCAAATCATTATGACAATTTAT
* * * *
66292 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG-TT-AATATAAG-T-TTGATCAAAATAAAAAAAAAACTAAT
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTTCGATTCAA-ACAAGCTATT--TCAAAAT-AAAATAATACTAAT
* * * ** * ** * * ** *
66353 TTATTTATATTTAGAAAATTAATCCGTAAATGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACCAAACCATT
61 TTATTAACATTCA-AAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAAAT-TATTTACTAAATAAGT
* * * * * ** * *
66417 TTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTATTTTGTCAT
124 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTTTATCAT
* * * ** ** * * * *
66482 CAAATAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTT
189 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTGT
* * *** * * * * ** * * * *
66547 GAAACTCAATAACCAAAAAATTTTAAAAATAAATCTAATT-GTTGAACCAA-TTTAAATAGTTAA
254 AAAATTCAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * * *
66610 GACTATGTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTCTTTTATCGTAAAATAATTATT
318 GGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * * * *
66675 T-TGTTCGTA-AAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAACAATTA-A
383 TCAGTTCATACAAA-ATTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCT-AAAAATTACA
* * * * * ** * * * * * *
66736 TTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAATCAATTTAAAATGGTTAAGACTA-TTGA
446 -GAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATATGCTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAA
* * * * * * * * ** *
66800 ATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-TCTTCTGTTTAGTCTTAAAATAATTTTTTCAATTCAT
509 ACAATTACCTATCTCAAAACATTATGACTCTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCAT
* ** * *
66864 ACAAGCTTA-TTCAGAATAAATTAATATTAATTTATTAAC-AT-TTGTAAAATCAATAAGAAAAA
573 ACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAA---ATTAACAATATTCCAAAA--ATTAA-ATAAA
* * * * * * * *
66926 GATTTAAAAAAATAAA-TTTGTTTAC-GAAAAAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTG
630 -ATTTTAAAAAATAAACTAT-TTT-CTGAACACA-TTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTA
* * * **
66989 TCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGA-
691 TCTATTTCAAATCATTATGACAATTT-AT
* * * *
67017 TTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATAA-AAGCT-TATCCAAAATAAAATAATACTAATTC
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCGA-TTCA-AACAAGCTAT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * * * * *
67079 CTTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGTTAAAAAAAT-AATTTGTGTACCAAACAAATTTA
63 ATTAACA-TTCAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAAATTATTTACTAAATAAGTTCA
* ** * * **
67142 AATAATTACAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAA
127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTTTATCATAAA
* * * * * * * **
67207 ACAAATGTTT-TAGTTTATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA
192 ACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-GT
*** * * ** * * *
67270 AAAATT-AATAAG-T---GATTTAAAAAGGGAATCTGTTTACCAAATC-AGTTTAAATAATTATG
254 AAAATTCAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGTCATG
* * * * * * *
67329 GCAATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT
319 GCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
** * ** * * * * * * *
67394 TTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAAC
384 CAGTTCATACAAAATTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTACAGAG
* * * * ** * * * * * *
67459 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTAAACCAA-TTCAAATTGTTAAGACTATATGAATAA
449 TAAGAGAATAAAAAAATGAATATGCTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA
* * * * * *
67523 TTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTT-TTTT-TCATAAAAACAATT-GTT-TAAATCATACT
513 TTACCTATCTCAAAACATTATGACTCTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGGTTCT-ATTCATACA
* * ** ** *
67583 AGCTTATTT-GAATAAAATATATGTATAATTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAGAGAATTT-A
576 AGCTTATTTCAAATAAAATA-ATATA-AATTAACAATATTCCAAAAATTAAATAA-A-ATTTTAA
* * * * * * * *
67645 AAAAT-AATTGTGTTTACT-AATA-GTTTAAATAATTA-ATA-TATTTGAACAATTA-ATATTT-
637 AAAATAAACTAT-TTT-CTGAACACATTCAAATAGTTATA-ACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * **
67703 -AATTACTA--A-ACCTT-T
699 AAATCATTATGACAATTTAT
* * * * * *
67718 TAT-TCATAATA-AATATATTAT--AATCTATAA-TA-C-AATT-AGAAATAAAATAATA--AAT
1 TTTGTCATAAAACAAT-TGTT-TCGATTC-A-AACAAGCTATTTCA-AAATAAAATAATACTAAT
* * * ** * *
67773 TTATTAATATT-AAGAAATTAAT-A-CTAAAAGATTTAAAAAGT----TTATGAAC-AAGTTA--
61 TTATTAACATTCAA-AAATTAATAAGC-AAAAAATTTAAAAAATAAAATTATTTACTAAATAAGT
* * *
67828 T-AAATA-TTAT-ACTATTT-AATAATTATTTATTTCAAAT--TGT-TGA-CTTTTATTTTGTTT
124 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT-TATGATCTTTTA---T-TTT
* * * * *
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184 ATCATAAA-ACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAG-AA-TAAAATAATAC-TAATTTAT
* * * * * * * * * * * * **
67947 TAATATTTCTGGACATT-TATACGTAAAAGATTTAAAATATATAT-ATGTT--TTTAGCCAAGTT
245 TAACA-TTGT-AAAATTCAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTAACTGAATCAAGTT
* *
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307 CAAATAGTCATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * *
68072 AAACAATTATTTCAGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTA
372 AAACAATTATTTCAGTTCATACAAAATTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTA
* * *
68137 AAAATTACAGAGTAGGAGAATAAAAAAATGAATATGCTTACTAAACAAGTTGAAATAGTTATGAC
437 AAAATTACAGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
68202 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCT
502 TATTTAAACAATTACCTATCTCAAAACATTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCT
* * **
68267 ATTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTATTAATATTCCAAAAATTAACAATAAA
567 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTAACAATATTCCAAAAATT-A-AATAAA
* * * *
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630 ATTTTAAAAAATAAA-CTATTTTCTGAACAC-ATTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTATC
* *
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693 TATTTCAAATCATTATGACAATTTAT
* * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCAAACAAGCTATTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
68488 AATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAATTATTTACTGAGTGAGTTCAAATA
66 AACATTCAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAAATTATTTACTAAATAAGTTCAAATA
* * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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387 TTCATACAAAATTATTTGA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTACAGAGTA
* * * *
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451 AGAGAATAAAAAAATGAATATGCTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT
** * * * * *
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515 ACCTATCTCAAAACATTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCT
* * * *
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*
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* **
69117 CATTTTG-CCTTTTAT
703 CATTATGACAATTTAT
* * *
69132 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCGGTTCATACATA-CT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCAAACA-AGCTAT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* *
69195 TTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAATAAAAAAT-AAATATGTTTA-TCAAATAAGT
64 TTAACATTC-AAAAATTAATAAGCAAAAAATT--TAAAAAATAAAAT-TATTTACT-AAATAAGT
* * *
69258 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTATTGTGA-CTTTTTATTTTATCA
124 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATC-TTTTATTTTATCA
** * * *
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188 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * * *
69385 TTTAAGAA-TCGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATCAGTTAATTGAATCAA-TTCAAATAAT
251 TGTAA-AATTCAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGT
* * *
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315 CATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
69513 ATTT
380 ATTT
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GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTTTATCATAAAACAA
TTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTGTAAAATTC
AATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTAACTGAATCAAGTTCAAATAGTCATGGCCATTT
GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCA
TACAAAATTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTACAGAGTAAGAGA
ATAAAAAAATGAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTACCTAT
CTCAAAACATTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTATTTC
AAATAAAATAATATAAATTAACAATATTCCAAAAATTAAATAAAATTTTAAAAAATAAACTATTT
TCTGAACACATTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAATT
TAT
Found at i:70019 original size:23 final size:22
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* *
69967 AAATTTATTTTTTAAATTTATT
1 AAATTAATTTTTGAAATTTATT
*
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1 AAATTA
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AAATTAATTTTTGAAATTTATT
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* * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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*** * * * ** * **
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* * ** ** * * *
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* * ** * **
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* * * * * *
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* * * *
70367 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTCTTAT
65 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
70431 GATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTTAAATAGATA
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70467 GTTATTGAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (179 bp):
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TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTTAATAGTCTT
Found at i:71214 original size:182 final size:177
Alignment explanation
Indices: 70509--72235 Score: 1001
Period size: 180 Copynumber: 9.6 Consensus size: 177
70499 TAATAATGAT
* * * * ** * * *
70509 AATAGATAGTTGTTCAAATAGTAATAATTATTTGAACT-AGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTA
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* * * * * * * * * * * * *
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* * **
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128 TATGAA-CTAAAACAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAATGATTT-A
* * * * * * * ** * *
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1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAAC-AATTTATTTTTTAA
* * ** * * **
70754 ATCTCTTAGC-TATTAATTTTTAAAATAATCCTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTAG
65 ATCT-TTTGCTTATTAATTTTTGAAAT-ATTATAAAGTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTT
* * * * * ** *
70818 TATGAA-TAGAAACAGTTGTTTTATGGTTAAAGAAAAGGTTATAACAAATTGA
128 TATGAACTA-AAACAATTATTTTAT-GATAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTA
* * * * *
70870 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTAGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTA
1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACA-ATTTATTTTTTA
* * ** *
70934 AA---TTT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTG
64 AATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTA-TAAAGTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTT
** **** * * *
70995 CCTGTTGAAAAATAATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTAATAATGATTTGA
128 TATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAA-CAAAAGGTCATAATGATTT-A
* * * * *
71047 AATAGATAGTTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTCAGTAAACTAATTTATTTTTTAA
1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAAC-AATTTATTTTTT-A
* * * ****
71112 AATCTTTTAG-TTATTAACTTTTGAAAAATTATCAAAGGAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT
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*
71176 TTATGAACTAAAACAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAATGATTTTA
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* * **
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* * ** *
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* * * *
71357 TTTATGAATTGAAACAATTATTATATGACT-AACAAAAGGTCAAAATGATTTGA
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** * * * * * *
71410 AATAGATAATTAATCTAATAATCTTAACTATTTAAACT-AGTTCAGTAAACACATTTATTTTCTA
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* *
71474 AATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCCAAATAAGCTT
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* * * * * *
71534 GTATGATCAAAAACAA-TGTTTTATGAGAAA-ACAAAGATCATAATGATTTA
127 TTATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAACA-AAAGGTCATAATGATTTA
* * * ** * * * *
71584 AGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGCTC-GGAAAGTAGTTTTAGTTTTT
1 A-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAA-CA-ATTTATTTTTT
* **** **
71648 AAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAATTT
63 AAATCTT-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAAGTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCT
* * * * *
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* * *
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1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACAATTTATTTTTTA
* * * * * ** *
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* * * * * * * *
71892 ATATGAACTGAAATAATTGTTTTATGCTTAAATAAAAGGTCAGAACGATTTGA
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* * * * * * * *
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1 AATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAG-TAAACA-ATTTATTTTTT
* * *
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* * * * * * * ** *
72073 GTATGAA-AAAAATTAATTGTTTTATAACGAAA-TAAAGACCATAACGATTTGA
127 TTATGAACTAAAA-CAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAATGATTT-A
* * * * *
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1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATT-CAGTAAACA-ATTTATTTTTTA
** * * *
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GAACTAAAACAATTATTTTATGATAAACAAAAGGTCATAATGATTTA
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AATTTTTTATGACTGAAAC
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70499 TAATAATGAT
* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* ** **
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** * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * ** *
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* * *
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* * * * *
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1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTGGTTTGATAAACAGATTTATGTTTT-A
* * **
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* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * ** ** *
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* * * **** **
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63 TAAATTT-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCT
* *** * * *
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* * **
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* **
72139 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTCCAATAAACAGA-TTTAGTTTTAAATCTC-T--TATTA
192 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTATT-CAATAAACACATTTTTTTTTTAAATCTCTTAGTATTA
* ** * *
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256 CTTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
72236 TTGAATAATT
Statistics
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TGAAAAAAACAATTATTTTATGACGAAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
TAGTCATAACTATTTGAACTATTCAATAAACACATTTTTTTTTTAAATCTCTTAGTATTACTTTT
TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTT
TTATGATAAAAAAAGGTCATAACGATTTGA
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**
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1 ATA
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ATACCAATTGTTAAAG
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TTTAAAAATAT
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80068 CATGAACATG
* * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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*
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* * *
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*
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* *
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* *
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1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
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** * * *
80925 AATATTAATAAATTAACATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTTTGAATAAA
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* * *
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1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGT
* * * * * *
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*
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* * * * * * * *
81151 AA-AA---TTATATTA-AACACATAA-GTCTTAGTCGATTTGAAAT--ATTATTGTT-ATAT-GT
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* * * * * *
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65 CATAACTATTTGAACTGT-TTGGAAAACAAATT-TATTTTT-TAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * * * *
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* * *
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* * * *
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** * * * *
81427 TTTATT-CTATATT-ATAAATTA-TATTGA-ATTA--TCGAATATGACTAT-AAT-CATAG-
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*** * * * * ** * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *** * *** *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * *
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* ** * * * * *** *
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* * * ** * * * *
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*** ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *** * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * *** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*
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* *
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* *
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* ** * * *
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* ** ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *** ** * * ** * *
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* * * * ***
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* * ** * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * ** * * *
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** * * * **
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* * * *** * *
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254 T-AT-A-ACTATTTGAACTGGT-TCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
*** * * *
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315 T-TGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCAAATAAG-CTTGT
*** * * * * ** *
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1 ATGAA-C-TGA-AACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
81723 T-TAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACCAATTTATTTTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATTTT
254 TATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
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* * * *
81832 ATGAACAT-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATTATGATTTGAAATATATAATTAT
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* *
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**
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* * * *
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* * * ** * ** *
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* * *** *
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** * * *
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1 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* ** * * * *
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* * * * * *
82322 TAATTTTCTG-AATGTTAATAAAATATTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTAT-TAACT-GAA
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* * * * ** * *
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190 ACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAAAT-G
* * * ** * *
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252 GCTATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * *
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*
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* * * * * * * * ** *
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256 TAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-A
* ** *
82866 ATATTAATAAATTAGTATTATTTAATTTCAAATAAAATAGT
320 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * ** * * *
82907 ATGAACAGAACCAATTGTTTGATGGCAAAATGAAGGGTTATAATGATTTGAAATCGATAATTATT
1 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * * *
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66 CAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-AT
** * * *
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* * * * *
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* * * *
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*
83228 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGT
320 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* ** * * *
83269 ATCAGTTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
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* * * * *** *
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66 CAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTCGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTA
* * * * * * *
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* * * * * * ** * * *
83460 ATAATTGCTTTATGATAGAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAG-T
190 ACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGGCT
* *
83523 CATAACTATTT-AACTAGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTCTTG
255 -ATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTG
* * * *
83583 AAATATCAAT--A--A-TATTATTTTGTTTCAAATAAGTTTAT
318 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * ** *
83621 ATG--TTGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAATGATTTTATTTCAAATAAGC
1 ATGAACTG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAA--
* * * * ** * * * * *
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*** * * * * **
83747 ATTGTACAAAAGGC-CATAACTATTTGAACTTATTCAGAGAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTT
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* ** *** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
* ** * * * * * * * *
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65 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TAT
* * * * ** *
84180 TAATTTTTGAAATACTATTAAATTAGTATT-TTTTTTATTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAAC
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAATTTATATGAT-AAAAAC
* * * * * * * * * *
84244 AA-TGTTTTATGACAAAAC--AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTTGT
192 AATTGTTTTACGACAAAACAAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGGCTAT
* * * ** * * *
84306 AACTAGTTGAACTGATTTGGA-AACCAACTTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAA
257 AACTATTTGAACTG-GTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAA
* * * *
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320 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * * *
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* * * ** * * *
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190 ACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAAAT-GG
* * * * * * * *
84665 CTTAACAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATTTCTTACGTAT
253 C-T---A----TAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * *
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* * ** * * * * * ** * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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** * * * * *
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** ** * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * * * * * *
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**** * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * ** * * ** *
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* * *** * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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*
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* * *
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* **
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*
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* * * **
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* * **
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* * ** * **
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* * *
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*
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* * *
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** * * * * * * *
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** * * * *
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** * ** * * * * * * * * ** *
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* * * * *
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** * * ** * * * *
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***** * * * ** * *
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* * * * * * * **** * * ** *
85731 AAATAG-T-CAAGTATTTGAATTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
378 TAATAGTTGTAACTACTTAAACTAATTCAACAAACACATTTATTTTCTAAATCACTTACGTATTA
* * * * * * *
85794 ATTGTTTG-AATATTAATAAATTTGTATTGTTTT-ATTTGAAATCAGCTT-CTATGAATAAAAAA
443 ATT-TTTGAAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCG-AATAAACTTGC-ATGAA-AAAAAA
* * * *
85856 -AAT-TATTTAATGGCAAAACAAATGGTTATAACA
504 CAATGT-TTT-ATGACAAAACAAA-GATCAAAACA
* ** * * *
85889 ATTTGAAATGCATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGACTCAT
1 ATTTGAGATATATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGG-AAATA-ATTTAT
* * *
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62 TTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATTTTAG-ATA
* * * * * * * * * * *
86014 AGTTTGTA-CAAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAAGATCATAACAATTTAAAATAG
125 ATTTTTTATGAACT-GAAACAATTG-TTT-T-ACACAACAAAACGTTCAAAACAATTTTAAATAG
* * *
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186 ATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG
86107 CACTAGTCAA
Statistics
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TAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAGTATTATTTTATTTTAGATAATTTTT
TATGAACTGAAACAATTGTTTTACACAACAAAACGTTCAAAACAATTTTAAATAGATAATTGTTC
AAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATATATTTTTTCAAATCTTATGCTTATT
AATTTTTTGAATGTTAACAAATTAGCATTATTTTATCTTGAATAAACTTGTATGAACTAAAACAA
TTATTTGATAACTAAACAAAAGGCTAGAACGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTGTAAC
TACTTAAACTAATTCAACAAACACATTTATTTTCTAAATCACTTACGTATTAATTTTTGAAATAC
TATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAACTTGCATGAAAAAAAACAATGTTTTATGACAAA
ACAAAGATCAAAACA
Found at i:85276 original size:165 final size:168
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84993 GGTCATAATG
* * * * **
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*
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* *
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* * * *
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* * ** * * * *
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66 TTTTAAATATCCTACCTATTAATTTCTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATA
* * *
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130 AGCTTATATGAATAGAAACAATCGGTTTATGAAAAAA
85334 TAAAAGGTCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTAAATATCCTACCTATTAATTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
GCTTATATGAATAGAAACAATCGGTTTATGAAAAAACT
Found at i:85544 original size:180 final size:177
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Indices: 85169--87302 Score: 990
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85159 TGAAAAAACT
* * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTATTCGATAAATAGATTTATT
* *
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* * * * * * *
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127 AGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATCAC-AAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TATTCGATAAATAGATTTATT
* * ***
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* * *
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* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTATT
** * * ***** * * * * **
85594 TTTAAAAACTTTTATTTATTAATTGCCAAAATATGAAGAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAA
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* * **
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* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTATT
* * *
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65 TTTTTAAT-TTTTACTTATTAATT-TTTGGAATATTAAT-AATTTATATTATTTTATTTTG-AAT
* * * * * * *
85836 CAGCTTCTATGAATAAAAAAAATTATTTAATGGCA-AAACAAATGGTTATAACA
126 AAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTAT--CACAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * *
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1 ATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTAT
* * * * *
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* ** * * * * *
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128 GCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATCA-CAAA-CAAAAGGTCATAACA
* * * * * * *** * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATTCGATAAATAGATTTATTT
* * * * * ***
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* * * * * * *
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127 AGCTTGTA-TGAATAAAAACAATTGTTTTATCACAAACAA-AAGGTCATAACA
* * ** *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCA--AATAGTCATAACTATTTG-AATT--A-T--TCGA-TAAATA
* * * * * * *
86303 AATTGA-TTTCTTAA-TTTTGC-----AATTTTT-CAAAATATAATAA---ATA--AATTTATTT
57 GATTTATTTTTTTAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT-TAATAATTTATATTATTTTATTT
* * *
86355 TGAA-AATC-T-TATGAA-ACAAAATAATTGTTTTATGACAAATACAAAA-GTCTATAACA
121 TGAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTGTTTTATCAC-AA-ACAAAAGGTC-ATAACA
* * * * * ** *
86411 ATTTGAAATA-TTAATTGTTCAAATAGTTAATAA-TATTT-AACTGTTTGGCAAATAGAATTA-T
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAATTATTCGATAAATAGATTTATT
* * * * **
86472 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTGCGAATAA
65 TTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTTATATTATTTTATTTTGAATAA
* * ** * * **
86537 -CTTAGTAAGAATTGAAAA-TTTTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
128 GCTT-GTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATCAC-AAACAAAAGGTCATAACA
* * * ** * * *
86588 ATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAACCTTAACTA-TTAAACTAGTTCAGCA-AACA-AG-TTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTA-TTC-G-ATAA-ATAGATTT
* * * ** * *** * *
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62 ATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAATTTA-TATTATTTTATTTTGAA
* * * * * * * * * *
86714 TAAGCTTATATGGACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATA
125 TAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATCACA-AACAAAAGGTCATAACA
* * * *
86768 ATTTGAAATATG-TAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGT-TTAG-TAAACAAATTT
1 ATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T--TATTCGATAAATAGATTT
** * * *
86830 A-TTTTTTAGATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCTGA
62 ATTTTTTTA-AT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAATTTA-TATTATTTTATTTTGA
* * * *
86893 ATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACA
124 ATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATCAC-AAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * *
86948 ATTTGAAATAGATATTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATAAACCA-ATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAA-TAGATTTAT
* * * * * * * *
87012 TTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTTG-AT
64 TTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTTATATTATTTTA-TTTTGAAT
* ** * * * * * * **
87076 AAGCCTTTTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAAAGTTATAATG
126 AAG-CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATCA-CAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * *
87130 ATTTTAAATAGATAATTGTTCGAAT-GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTATACTA-ATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATA-AATAGATTTAT
* * * *
87193 TTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
64 TTTTTTAATTT-TTACTTATTAATTTT-TGGAATATTAATAATTTA-TATTATTTTATTTTGAAT
* * ** * * *
87257 AAGCATGTATAAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACTAAAGGT
126 AAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATCAC-AAACAAAAGGT
87303 TTGAATGAGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
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TTTTAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAATTTATATTATTTTATTTTGAATAAGCT
TGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATCACAAACAAAAGGTCATAACA
Found at i:87660 original size:179 final size:177
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87340 TTTTAAATAT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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* * * ** * * * *
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130 TAACTATTTGAACTGA-TTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
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* * * * * *
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62 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * ** * *
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* * * *
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1 CTT-ATTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-AGAATA-AGCTTGTA-TA
* * *
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* * * *
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123 ATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAACA-AATTTATTTTT-AAATCTCTTA
* * * * *
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1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTATAA-C-A
* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-AGAATAAGCTTGT--ATAACA
* * * * * * *
88312 AAATAATTGTCTTATGATAAAACAAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* *
88377 CATAACTATTTGAACT-AGTAT-AGTAAACATATTTCTTTTTTAAA--TC-T-
128 CATAACTATTTGAACTGA-T-TCAGTAAACAAATTT-ATTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
88424 CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTCGTATGATGA-
1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTAT-A--AC
* * * * * *
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62 AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
88664 AAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAAAGATAATTATTCAAATAG
62 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
88729 TCATAACTATTTAAACTTG-TTCAATAAACAAATTTA-TTTCAAATCTCTTG
127 TCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTA
* * * * **
88779 CTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTACTATTTTGTTCCGAATAAGCTTGTATGAATTG
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* * * * ** * * * * * **
88844 AAATAATTATTATATGACTAATTAAAAGGTCAAAATGATTTGAATTAGAAAATTATTTTAATAGT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * ** *
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128 CATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAAATTT-ATTTTTAAATCTCTTA
* ** * * **
88956 CTTATTGATTTTTGGAACATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCGAATAAGCTTGTATAATCAG
1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTAGAATAAGCTTGTATAA-CA-
* * * * * * * *
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63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
89084 TCATAATTATCTGAACT-AGTTCAAAAAACAACTTTGGTTTTTAAATCTCTTG
127 TCATAACTATTTGAACTGA-TTCAGTAAACAAATTT-ATTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * *
89136 CATATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA--AGCA--GTGTT-TT-GAACAAGTTTTTATGAACTAA
1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGAATAAGCTTGTAT-AAC-AA
* *
89194 AATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * *
89258 TA-AATCTATTTG-A--G-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTA
128 CATAA-CTATTTGAACTGATTCAGTAAACAAATTTA--TTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
89306 CTTACTAATTTTTCGAATGTTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAA-ATT
1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTATAACA--
* * * * * *
89370 GAAATAATAGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAATTAGATAATTGTT-ATAATA
63 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATA
** * *
89434 GTTTTAACTATTTGAACTG-----G----CACATTTATTTTTTTAAATATCTTA
126 GTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAAATTTA--TTTTTAAATCTCTTA
* * * * * ** *
89479 CTGATTAACTTTT-ATAATATTATTAAATTAGTATTATTATAATTCGAATAAGCTTATGTGGAAA
1 CTTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTAGAATAAGC-T-TGTATAAC
* * * * * *
89543 AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA--TCTTAACAATATGCAATAGATAATTATTCAAATAG
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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62 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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62 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
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127 TCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTA
** * * *
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1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTAT-AAC-A
* * *
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*
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*
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*
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*
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTTAA
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** ** * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * ** *
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* * * * * *
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* ** * * * * ** * *
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**
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * ** * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAT-ATTTATTTTTTA
* * * * * *
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* * * *
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* * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* ** *
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66 TCTCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAT-AAC-TT
* * * * * * *
98911 -TATGGATTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAA
128 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
98964 ATAGATAATTGTTCTAATAGT-ATTAACTATTTGAA-TTGGATTGGCAACCACAATTATTTTTTA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * *
99027 AATC-CTTACTTATTAA-TTTTAAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTCCAAATAAGCT
64 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAATAA-CT
* * * * * * *
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127 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA
* * * ** * *
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1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * * *
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65 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAATAA-CTTG
* * *
99265 TATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAA
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* * * * * *
99318 ATAGATAATAGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTAATTTTTTAAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
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66 TCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAT-AACTTG
* *
99446 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAA-TGATTTGAA
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* * * ** * * * *
99499 ATAAATATTTGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTCACTTTGGTTAATATCTTAATTGTTCTT
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGG-TAA-A-CATATTTATTTTT
* *** * *
99564 TAAATCTTTTACTTTATTAA-TTTCGGAATATTTACATAAATTAGTATTATATTA-TTCTAAATA
62 TAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTAAAATA-TTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAATA
* * * * ** *
99627 TGCTTGTTTGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATTGTCAT-AGTGATTTGAA
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* * ** ** * *
99686 ATAGATAATTGTTTATATAGTCATAACTATTTGAACGAG-TT-CAAAACATAGCTTTATTTCTAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATA--TTTATTTTTTA
* * *
99749 TAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTCATAAATTTAATATTATTTTATTT-GAAATAAGC
64 -AATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAAATAA-C
* * * * * *
99811 TTGTCATGAATAGAACCTAATTCTTTTTATGAC-AAACAATCAGTTATATAAAT-TTTG-A
126 TTGT-ATGAATAGAAAC-AATT-GTTTTATGACAAAACAA-AAGGT-CATAACTATTTGAA
* * * * * * *
99869 ATAGATAATTATTTAGATAGTCATTAAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAGC-TGATTCATTTTTT
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-T-AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAT-ATTTA-TTTTT
* * ** *
99933 TAATTCATTTTACTCT-TTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAATTATTTTATTTC-AAGT
62 TAAATC-TCTTACT-TATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCGAAAT
* * ** * * *
99996 AAGTCTATATGAAGCGGAAA-ACATTGTTTTATTA-AACA-AAAAGGTCACAA-TGATTTGAA
123 AACT-TGTATGAA-TAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAA
* * * * * *
100055 ATAGATAATTATTCAAATGGTCATTACTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
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* * * * * * *
100120 TCTTTTACTTATAAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-CAATAAACTTGT
66 TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAT-AACTTGT
* * *
100184 ATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TAATTTGAA
130 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAA
* * * *** * * *
100236 ATATATAATTGTTCAAATAGTTATAA-TAATTTGAAGTTGTTCAATAAATAGATTTATTGTTTAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * * *
100300 ACCTTTTACTTATTAATTTTCT-TAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTT
65 ATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAATAA-CTT
* * * * * *
100363 GTATGAACA-AAAAAATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTCAA
128 GTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * *
100417 ATAAATAAATGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTGATCGGTAAACATATTCATTTTTTAAA
1 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* *
100482 TCTCTTAATTATTACA-TTTTAAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTC-AAATAA
66 TCTCTTACTTATTA-ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAATAA
100540 GCTTATACAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (181 bp):
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAATAACTTGTA
TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA
Found at i:101186 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 100731--101473 Score: 560
Period size: 180 Copynumber: 4.1 Consensus size: 176
100721 GTTTGTTCAA
* ** * *
100731 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTGGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGAAAGAGATTAAAAAAGTAAAT
* * * * *
100795 CTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATA
65 CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * ** *
100860 ACTTTTTATTTTATCTTCAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCGA
129 AC-CTTT-TTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATAC-AGCTTATTCGG
* * * * * *
100912 AATAAAATAATACTAATTCAATAATATTCTGC--AACTTAATAACCAAAAAAATTTAAAAA-TAA
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-T-CAAAAATTAATAA-GAAAGAGATTAAAAAAGTAA
** ** * * * *
100974 ATCTAATTGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTA
63 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * *
101039 TGACCTATTGTATTGTCGTAAAAGAACTATTTTATTCATACAGGCTTATTCGG
127 TGACCT-TT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACA-GCTTATTCGG
* * * *
101092 ATTAAAATAATTCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAGTAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTAAAAAAGTAAATC
* * * * * *
101157 TGTTTACCAAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAAAAATTATCTATTTTAAATAGTTTTGA
66 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATT-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* **
101222 CCTTTTTTTGGCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAAG
130 CCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATAC-AGCTTATTCGG
* * * * *
101271 AATAAATTAATACCAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAAAAGAAAGAGATTTAAAAAACTAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGA-TTAAAAAAGTAAA
* * ** * * ** * * * *
101335 TATGTTTACTAAATAAATTCAAATAATTATTACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATTGTTAT
64 TCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * *****
101400 AACCTTTTGATTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAAAA
128 GACCTTTT--TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATAC-AGCTTATTCGG
101453 AATAAAATAATACTAATTTAA
1 AATAAAATAATACTAATTTAA
101474 GAAATAAGTC
Statistics
Matches: 443, Mismatches: 100, Indels: 37
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 22 0.05
179 70 0.16
180 179 0.40
181 106 0.24
182 65 0.15
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (176 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTAAAAAAGTAAATC
TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
CTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAGCTTATTCGG
Found at i:101507 original size:147 final size:146
Alignment explanation
Indices: 101355--101618 Score: 350
Period size: 147 Copynumber: 1.8 Consensus size: 146
101345 AAATAAATTC
* * * * *
101355 AAATAATTATTACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTATCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCTACTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTATCATAA
101420 AAC-AATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAAAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAAATAAGTC
66 AACAAATT-TTTCAA-TAATACAAGCTTAGAAAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAAATAAGTC
101484 TATTTACCAAATCAGTTA
129 TATTTACCAAATCAGTTA
* * * * *
101502 AAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCTACTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTATCATAA
** * ****
101567 AACAAATTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
66 AACAAATTTTTCAATAATACAAGCTTAGAAAAAATAAAATAATACTAATTTA
101619 TTAATATTTC
Statistics
Matches: 99, Mismatches: 17, Indels: 3
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
146 33 0.33
147 62 0.63
148 4 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (146 bp):
AAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCTACTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTATCATAA
AACAAATTTTTCAATAATACAAGCTTAGAAAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAAATAAGTCTA
TTTACCAAATCAGTTA
Found at i:102220 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 101771--103323 Score: 1212
Period size: 181 Copynumber: 8.6 Consensus size: 181
101761 TATTTGGTTA
* * * * * *
101771 AAAATAATATTAA-TTAATAATA-TTCCAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* ** * * * * *
101834 TTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCTAATCATTTTGA-
65 TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
101897 CTTTT-TTGTT-TACTTAAAA-ATATTTGTTTCA-TATCTTATC-AGCTTATTTAGAAT
129 CTTTTATT-TTGT-CATAAAACA-A-TTGTTTTAGT-TCATA-CAAGCTTATTCAAAAT
* * *** * *
101951 AAAATAAT-CTAAATTTTTTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCT
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTT
* * * *
102015 CTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCGTTATGAC
64 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * *
102080 CTTTTATTTTGACATCAAAGAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTGTCCAAAAT
129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
102133 TAAATAATGCTAATTTCTTAATATTTTCAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTG
* * * * *
102197 TTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATTGTTATGACA
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-
* * * * * * *
102262 TTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAAGCTTATCCACAAT
129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT-ACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
102316 AAAATAATACTACTTTATTAATATTTTTAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATGAATTAGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
** * * * * *
102377 TTACCAAATC-AGATT-AAATAATTAT-AGCCATTCGAACAA-TATCTATTTCGAATCATTACTG
66 TTACTGAA-CAAG-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TG
* **
102438 -CCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--TTAACATACAAGCTTATTTGAAAT
127 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTT--CATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
102492 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * *
102552 TTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* *
102617 TTCTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTCATACAAAG-TTATTCAAAAT
130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAAT
* * * **
102669 AAAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAATTCAA-AA-CTAAGAGATTTAGGAAATAAATTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATT-AATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * * * * * *
102732 GCTTGCTGAACTAGTTCAAACAATTAAGATTATATGTATAATTATATATTTCAAATTGTTATGAC
64 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-
* * * * **
102797 TCGTTCTAACATTTCATTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT-GGAAT
128 -C---CT----TTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *** * *
102859 AAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAAATAAATCTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTG
* * *
102920 TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTA-GTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * *
102984 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATACAAAAT
129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* *
103036 AAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTCTAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAACATAAATTT
1 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
** * * * * * * *
103100 GTTTACTGAATTAGCTAAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
64 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
103165 C-TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAAT
129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
103217 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TATCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAGAAATATG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
*
103281 TTTA-TCGAACCAA-TTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
65 TTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
103324 AAATAATACA
Statistics
Matches: 1093, Mismatches: 213, Indels: 134
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
175 11 0.01
176 111 0.10
177 121 0.11
178 56 0.05
179 48 0.04
180 118 0.11
181 261 0.24
182 157 0.14
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184 3 0.00
185 1 0.00
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190 38 0.03
191 29 0.03
192 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
Found at i:102851 original size:368 final size:358
Alignment explanation
Indices: 102129--103323 Score: 949
Period size: 368 Copynumber: 3.3 Consensus size: 358
102119 AGCTTGTCCA
* * * * *
102129 AAATTAAATAATGCTAATTTCTTAATATTTTC-AAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAGTAAG--AGA-TTTAAAAAAGTAAA
* * * * * **
102193 TTTTTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATTGTTAT
62 TCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * * * * * * *
102258 GACATTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAAGCTTATCCACAAT-AAAATA
125 AAC-CTTCTATTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTTAGTTAAT-ACAAGCTTATACAAAATAAAAATA
* * * ** * * * * *
102322 ATACTACTTTATTAATATTTTTAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATGAATTAGTTTAC-C
187 ATACAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAACATAAATTTGCTTACTG
* * * * * * * * *
102382 AAATCAGATTAAATAATTATAG-CCAT-TCGAACAA-TATCTATTTCGAATCATTACTG-CC---
252 AACT-AGCTAAAACAATTA-AGACCATAT-AAATAATTATATATTTCAAATCGTTA-TGACCTTT
* *
102440 -TTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTAACATACAAGCTTATTTG
313 ATTTCATTTAGTCAT-AAACAATTGTTTATT--CATACAAGCTTATTTG
*
102488 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAGAGATTT-AAAAAGTAAATCTG
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTG
* * * * **
102552 TTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
66 TTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACC
* * *
102617 TTCTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTCATACAAAG-TTATTCAAAAT-AAAATAATAC
129 TTCTATTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTT-AGTTAATAC-AAGCTTATACAAAATAAAAATAATAC
* * *
102679 TAATTTAATAATATTAT-AAAAATTCAA-AA-CTAAGAGATTTAGGAA-ATAAATTTGCTTGCTG
191 AAATTTAATAATATT-TCAAAAATT-AATAAGC-AAGAGATTTA-AAACATAAATTTGCTTACTG
* * ** ** *
102740 AACTAGTTCAAACAATTAAGATTATATGTATAATTATATATTTCAAATTGTTATGACTCGTTCTA
252 AACTAGCTAAAACAATTAAGACCATATAAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGAC-C-TT-T-
102805 ACATTTCATTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTG
313 --ATTTCATTTAGTCATAA-ACAATTGTTT--ATTCATACAAGCTTATTTG
* * * ** * * *
102855 GAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTG
*
102920 TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTAGTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
66 TTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTA-TACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACC
* *
102985 TTTTGTTTTGTCATAAAACATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATACAAAATAAAAATAATACAAA
129 TTCTATTTTGTCATAAAACATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATACAAAATAAAAATAATACAAA
* * * *
103050 TTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAACATAAATTTGTTTACTGAATTAGC
194 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAACATAAATTTGCTTACTGAACTAGC
* * * * * *
103115 TAAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGTTT--TGTTA
259 TAAAACAATTAAGACCATATAAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTATTTCAT-TTA
* *
103178 -T-A-AAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCG
323 GTCATAAACAATTGTTTAT--TCATACAAGCTTATTTG
* *
103213 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAG-AAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAA
* *
103277 TATGTTTATCGAACCAA-TTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
62 TCTGTTTAT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTA
103324 AAATAATACA
Statistics
Matches: 683, Mismatches: 105, Indels: 94
0.77 0.12 0.11
Matches are distributed among these distances:
353 42 0.06
354 32 0.05
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359 37 0.05
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365 1 0.00
366 5 0.01
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369 2 0.00
370 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (358 bp):
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTG
TTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTT
CTATTTTGTCATAAAACATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATACAAAATAAAAATAATACAAATT
TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAACATAAATTTGCTTACTGAACTAGCTA
AAACAATTAAGACCATATAAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTATTTCATTTAGTC
ATAAACAATTGTTTATTCATACAAGCTTATTTG
Found at i:103417 original size:101 final size:105
Alignment explanation
Indices: 103216--103424 Score: 293
Period size: 101 Copynumber: 2.0 Consensus size: 105
103206 TTATTCGAAA
*
103216 TAAAATAATACTAATTTATTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAGAAATATG
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATATCAAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAGAAATATG
* * *
103281 TTTATCGAACCAATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
65 TTTATCCAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
103322 TAAAATAATACAAATTTATTAATAT-TCAAACA-ACTAA-TAAGAGATTT-AAAAGGAAATATGT
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATATCAAAAATAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAGAAATATGT
*
103383 TTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
66 TTATCCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
103423 TA
1 TA
103425 TTTATTTCAA
Statistics
Matches: 94, Mismatches: 8, Indels: 7
0.86 0.07 0.06
Matches are distributed among these distances:
100 6 0.06
101 44 0.47
102 10 0.11
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105 6 0.06
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ACGTcount: A:0.49, C:0.08, G:0.10, T:0.33
Consensus pattern (105 bp):
TAAAATAATACAAATTTATTAATATATCAAAAATAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAGAAATATGT
TTATCCAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
Found at i:103560 original size:280 final size:284
Alignment explanation
Indices: 103037--103603 Score: 655
Period size: 280 Copynumber: 2.0 Consensus size: 284
103027 ATACAAAATA
* *
103037 AAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAACATAAATTTGT
1 AAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAA-TAATAAGCAAGAGATTTAAAACAGAAATATGT
** ** *
103102 TTACTGAATTAGCTAAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
65 TTACCAAACAAGCTAAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* **
103167 TTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
130 TTATTTTGCCATAAAACAA-TGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
103232 TATTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAGAAATATGTTTATCGAACCAA-TT
194 TATTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTGAAAAAGAAATATGCTTA-CCAAACAAGTT
* * *
103296 CGAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
258 CAAATAGTCATAACTATTTGAACAATT
* * *
103323 AAAATAATACAAATTTATTAATA-TTC-AAACA-ACTAA-TAAGAGATTTAAAA-GGAAATATGT
1 AAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAA-ATAATAAGCAAGAGATTTAAAACAGAAATATGT
* * * * * * *
103383 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTT
65 TTACCAAACAAGCTAAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-C
* * * * *
103448 TTTATTTTGCCATAGAATAA-GTTTTTGTTCATACAAGGTTATTC-AAATTAAAATAATATTAAT
129 TTTATTTTGCCATAAAACAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAAT
* ** * * * *
103511 TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAACATAAATATGCTTACCAAACAAGTT
193 TTATTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTGAAAAAGAAATATGCTTACCAAACAAGTT
*
103576 CAAATAGTCATAACTATTTGAATAATT
258 CAAATAGTCATAACTATTTGAACAATT
103603 A
1 A
103604 TCTATTTTAA
Statistics
Matches: 236, Mismatches: 41, Indels: 14
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
279 9 0.04
280 106 0.45
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282 28 0.12
283 4 0.02
284 3 0.01
285 4 0.02
286 23 0.10
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (284 bp):
AAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATAATAAGCAAGAGATTTAAAACAGAAATATGTT
TACCAAACAAGCTAAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
TATTTTGCCATAAAACAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
TTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTGAAAAAGAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAACAATT
Found at i:104070 original size:820 final size:825
Alignment explanation
Indices: 102491--104077 Score: 1856
Period size: 820 Copynumber: 1.9 Consensus size: 825
102481 TTATTTGAAA
* * * * * *
102491 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAACAACTAATAAGAGATTTAAAAAGGAAATATGTTTA
* * * *
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* *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * ** * *
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321 AGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTGATTAAC
* **
102881 ATTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTAG
386 ATTAAAAAAATTAATAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAG
* * * *
102946 TACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTGTTT
450 TACTATTTAAACAATTATATACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTT
*
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* * * *
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* * *
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*
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1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTC-AACAACTAATAAGAGATTTAAAAAGGAAATATGTTT
* * * * * *
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65 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTC
* * * * *
103450 TATTTTGCCATAGAATAA-GTTTT-TGTTCATACAAGGTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTT
130 TATTTTGCCATAAAACAATGTTTTCTGTTCATACAAAGTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
103513 ATTAATATTTTGACAATT-AATAAGTAAAAAATTTTA-AACATAAATATGCTTACCAAACAAGTT
195 AATAATATTATAAAAATTCAA-AACTAAAAAA-TTTAGAA-ATAAATATGCTTACCAAACAAGTT
* * * * * *
103576 CAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGAC-C-TT-TTAC-TTC-
257 CAAACAATCA-AGACTATATGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACTCGTTCTAACATTCT
* * * * *
103635 A-TCATAAAATAATTGTATCAGTTTATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTGATTAA
321 AGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTGATTAA
* * * * ** *
103699 TATTCCAAAAAGTATTGAGTAAAAGATTT-AAAATTTGATC-AGTTTACCGAATAAGTTCAAATA
385 CATT--AAAAA-AATT-AATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * *
103762 GTTTG-ACTATTTAAACAATTATATACTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAATAA
445 GTTAGTACTATTTAAACAATTATATACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
* * * *
103826 TTG-TTTATGTTCATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAA
509 TTGTTTTA-GTTAATACAAGCTTATACAAAATAAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * *
103889 TTAATAAGCAAAA-AGTTTAAAA-ATAAATTTGTGTTTTTGAA-CACGTTCAAATAATTAT-GAC
573 TTAATAAGCAAAAGA-TTTAAAACATAAATTTGT-TTACTGAATCA-GCTAAAATAATTATGGAC
** * *
103950 ATTTGGACAATTATTTATTTCAAAAGC-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATT-TTTTC
635 ATTTAAACAATTATCTATTTC-AAAGCGTTATGACC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-
* * * * * *
104013 TGTTCATGCAAGCATATTTGAAATAAATTAATATTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATTGATAAG
697 TGATCATACAAGCATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATAT-CAAAAATTAATAAG
104077 T
761 T
104078 TAAAAATTTT
Statistics
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CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTCT
ATTTTGCCATAAAACAATGTTTTCTGTTCATACAAAGTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
ATAATATTATAAAAATTCAAAACTAAAAAATTTAGAAATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAA
CAATCAAGACTATATGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACTCGTTCTAACATTCTAGTCA
TAAAACAATTGTATCAATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTGATTAACATTAA
AAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAGTACTAT
TTAAACAATTATATACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTTTAGTTA
ATACAAGCTTATACAAAATAAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAA
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ATTTCAAAGCGTTATGACCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCATATTC
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TATGTTTATCGAACCAATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
Found at i:104716 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 104094--115237 Score: 7325
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104084 TTTTTAAAAA
* * * * * *
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** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * *
104450 TTA-CAAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-AGTTACGA-
1 TTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* * * * * *
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * *
104873 TTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTCCAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCAT-ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * *
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* * * * * * **
104990 TT-TCTGAACCAGTTTAAATAGTTTTGAATATTTGAACAAATATCAATTTCAAATTGTTATGA--
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
105052 TATTTGTTTTCTCATAAAA-AATTGTTTC-TAATCATACAAG-TCCATTTG-GATAAAAATAATA
65 T-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCT-TATTCGAAAT-AAAATAATA
* *
105113 CTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
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* * * ** * * * * *
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * *
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66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* ** * * *
105295 TTATTAGCATT-TGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATATGT
131 TTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGT
* * *
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACC
* * * * * * * * *
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* **
105476 CTT--T-AT-TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAAT
130 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * * *
105523 TTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAACTATCTATTTTAAATCATTATTATC
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * *
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* * * * *
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128 AATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * *
105699 TT-TCTGAACCAGTTCAAATTGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTTCAAATTC-TTATAA
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAA-TCATTATGA
* * *
105762 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTGTT--TGGTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * * * * * **
105825 TTAATTTAATAATATTTTGAAAATTGATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCAT
126 CTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * **
105881 TTACCGAATCAA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTTTTATGACC
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * ** * * * * *
105945 TCTTGCTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATAAAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAACTAA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
106010 TTT-ATAATATT-TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTAT
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** * * * * * * **
106061 TTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATTT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * *
106126 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAA
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * * **
106190 TTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTAC
130 TTTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
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1 TTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* *** ** ** ** *
106305 ---T-TTTTG----AATAGTTTTGACT-A-TTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
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* * ** * * * **
106360 TTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAATAAAATTAAAAAATAAATCTAA
130 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * ** *
106412 TTA-CTAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
1 TTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
106475 CTTTTCTTTTGTCATAGAATAATTGTTT--TGTTCATATAAGCTTATTCAGTATTAAAATAATAT
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* * * * * *
106538 TATTTTAATAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAACTTTGT
127 TAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * ** * *
106593 TTATCGAATC-AGTTCAAATGGTTA-AACTATTGGAATATTTATATATTGCAAATTGTTCTAACC
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * *
106656 TTTTGCTTAGTCATAAAACAACTATTTCAATTT-ATACAAGCTTAGTCAAAATAAATTAATACTA
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* * * * *
106720 ATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGT
129 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * * *
106774 TTACCAAACAATTTTAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATAACCT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * *
106839 TTTGATTTT-TCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATAGAAGCTTCTTTGGATTAAAATAATACTAA
66 TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
106903 TTTAATAAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTG-
130 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGT
** * * * ** ** *
106955 TTCGCCAAGCTAGTTCAAATATTTAAAACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACC
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * *
107019 TATTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATTTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAA
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* * * * *
107084 TTTAATAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAACA-AAATCTGT
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* * * * * *
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAC
* * * * *
107198 CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTCCATAAAAACTTA-TCTGAAATAAAATAATACT
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* * * * * *
107262 -ATTCTATTAATATTTCT-AAAATTAATAAGCAAGGGATTTAAAAACTAAAGCTATT
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* * * * * **
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * *
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* *
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** * * * * * * * * *
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCAT-ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * **
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* ** ** ** *
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1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * ** *
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65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-T-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* ** * * *
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* * * ** * * **
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1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * *
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* * * * *
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129 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
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1 TTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGA
** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 TTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * *
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* * * *
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129 ATTTAATAATA-TT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * ** * * * *
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1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *
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65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * *
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129 ATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * ** *
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1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAC
* * *
109530 C-TTTGTTTTGTCATTAAAA-AATTGTTTC-TGATCATAGAAGCTTATTC-AATTAAAAATAATA
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* * *
109591 CTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAA-AAATGTGT
126 CTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * ** * * * * *
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1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* ** * * * * * * * *
109710 CTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTTCCA-ATCTTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCAAA
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
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130 TTTAATAATATTCTAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGT
* * * * * * *
109827 CTA-CTGAACAAGTTAAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACC
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * *
109891 TTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT-A-A-T-A
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
109952 -TTAAT--T-TT-TTAATATT--TAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAAAATTTGT
130 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * *
109996 TTA-CTGAACAAATTCAAATAGTTACT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGAT
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
110059 CTTTTATTCTG-CTATAAAATAATTGTTTAAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACT
64 CTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * * *
110123 AA-TTATTAATATT-TCAAAATTAAT-A--AA-TGATTT-AAAAATGAATATGT
128 AATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * *
110170 TTA-CCAATC-AGTTCAAATAATTAT-ATCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTA-GTA
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-A
* * * * * *
110231 CCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGTTT-TTTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAGTATT
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * *
110294 AATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
128 AATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * ** * *
110348 TTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATACTTCAAATTGTTATAACA
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
** * * * * * * * *
110412 TTTTGTTAGGTCATGAAGCAATTATTT-TTGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAATA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * *** * *
110476 ATCTAATAAAATAAAAAAAATTAATAACTAAAAGATTT-AAAAA-AAAT-TGT
129 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * **
110526 TT-GCTAAACCTAGTTCAAATAGTTAAGACT-TGTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
1 TTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
** * * * * * *
110589 AATTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAACTT-ATAGAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
110653 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTTATAAGCAAGAGATTTAGAAAAT-AATTTCAT
128 AATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GT
* * * * * * * *
110707 TTA-CAGAATC-AGTTCAAATAATTATAACTATTTAAATAACTATCTGTTTCAAATCGTTATTAC
1 TTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * *
110770 TTTTTGTTTTGTTATAAAGCAATTGTTT--TTGGTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATAC
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATT--TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * **
110833 TAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATCAA-TAAGAAATTTAAAAAGTAAATC-AC
127 TAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * ** * * * *
110887 TTAACAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * * * *
110952 TTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTT-TTGTTCATATAAGCTTATT-TAGATTAAAATAATACTA
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTA
* * * * * * *
111015 ATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAAATAAATATGT
129 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
111070 GTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
** * * * * * *
111135 TTTGTTTTGAAATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAG
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
111200 CT-ATAATATTCCAAAAATTAATAATTTAA-AGATGTAAAAAACAATTCTAT
131 TTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
111250 TTATTGAACAAGTTTC-AATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAGCACTATAATC
1 TTATCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * ** ** *
111314 TTTTGCTTTGTCATTAAATGATT-TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT
* * ** * *
111377 AATTTATTAGTA-TGAAGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
128 AATTTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * ** *
111431 TTA-CTAAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACT
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *
111495 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTA-TCTG-ATTAAAATAATATT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACT
* * * * * *
111557 TATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAGTAA-AAACTTTTAAAAAATAAATATAT
128 AATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * *
111612 TTATTGGAACAAGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACC
1 TTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * *
111677 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTTTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
111742 TTTATTTATATTTTGAAAATTAA-AAGGTAAGATAATTAAAAAAATGAATTTGT
130 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * ** * *
111795 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG-CATATCT-AAAAAAAATCTATTTCAAAACATTATGACT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* *
111858 TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGGTTT--TGTTCATGCAAGCTTATTTC-CAATAAAATAATA-
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAT-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAC
* * * ** *
111918 TAAATTTATTAATATT-TCAAAAAGTAATAAGTAA-AAATTTTTAAAATAAATCTAT
127 T-AATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* *
111973 TT-TCTAA-ATTCA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGA
1 TTATCGAACA---AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * *
112035 CCATTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TGTTC-TATTGAAACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * *
112098 CTAATTTATTAATA--CTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTGT
126 CTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * *
112152 TTA-CCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACC
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * *
112216 ATTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TGTTC-TATTCAAACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * *
112279 AATTTATTAATACTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGT
128 AATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * ** *
112332 TT-TCCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGATC
1 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
112396 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGTTTATTTGGAATTAAATAATACTA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
** * * *
112460 ATTTGTTATTATTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTGT
129 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * ** * * * * *
112513 TTA-CTAAACAAATTCAAATAATCATTTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTAAGACA
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * ** * *
112577 TTTTGTTTTATCTTAAAACAGTTGTTTC-TATTCATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAACACT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT
* * ** * * *
112640 AATTTATTACTATT-TTGAAA--AATAA-T--GACATTTAAAAACTAAATCTCT
128 AATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** * ** * *
112688 TTATCGAACCGGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATCACATATCGTTATGA---
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * *
112750 --T-TTTTGTCCTAAAAC-ATTGCTTTC-TATTCATACAAGTTTATTTTG-AGTAAAATATTGCT
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAT-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT
* * * *
112809 AAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATGAATGTAT
128 AATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
112862 TT-GCCAAGCCAA-TGCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTTGAAATCATTTTGG
1 TTATCGAA--CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGA
* * * * * * *
112925 CTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTGCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * *
112990 AATTT-ATGAACATT-TAGAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAGAAAAATAAATCTGT
128 AATTTAAT-AATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGT
* * * * *
113045 TTACCAAACAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * * *
113110 TTTATTTTATCATAAAATATTTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTAC
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
113174 TTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATCAGT
130 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* ** * * * * * * **
113226 TTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAAAT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * *
113291 TTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTT--TTCATCATACAAG-TCTATTTGGAATAAAATAATACT
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATT--TCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACT
* * *
113353 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAGTAAATCTGT
128 AATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * *
113407 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTAT-ATCC
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CC
* * * * *
113471 TTTTGTTCTATCATAAAAAAAATTATTTC-TATTCATACAAGCTTATTCGAAAT--AATAATGCT
65 TTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
** * * *
113533 AACATAATAATATTAC-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
128 AATTTAATAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* ** * * * * *
113587 TT-GCTGAATTAGTTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGAC
1 TTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * ** * * * * * * * * **
113650 CTTTTATTCTATTGTAAAATAATTTTTTTAATTCTTACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAAAA
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * *
113714 AATTTATTAGTACTT-GAAAAATTAATTAGAAAGAAATTTGAAAAATAATTCTGA
128 AATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** * * *
113768 TTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * *
113833 TTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTGTTCAAATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATATTA
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTA
* * * * *
113896 ATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-A-TTAAAAAATAAATTTGT
129 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * *
113945 TTA-CTAAAATAGTT-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGA-
1 TTATCGAACA-AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * *
114007 TTGTTTGTTTTGTGATAAAACAA-TGTTTC-TGTTCTTAC-AGTCTTATTC-AGAATAAAGTAAT
64 CT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAAT
* * * *
114068 GCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAAAAAATAAATCTAT
125 ACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** * * * * * **
114125 TGGCTTGACCAA-TTGAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATTTGA-TTCAAATCATTAAAAC
1 T-TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGAC
** * * * * ** * * * * *
114188 CTTTTGTTTCATCACAAAAAAAATGTTT-TTGTTTGTACAAGCTTATCCAAAACAATATAATTCT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
114252 AATTT-ATGAATATTCTGAAATTTAATACGTAATAGATTTAAAAAATGAATTTGT
128 AATTTAAT-AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * ** * *
114306 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACAT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * *
114371 TTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-TACTCATACAAGCTTATTTC-ATATAAAATAATACAA
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTA
* * *
114434 ATTTATTAATATT-TAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
129 ATTTAATAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
114487 TTATCGAATAAGTAT-AAACAATTATGATTAATTATTTTAACAATTGTTTATTTTAAATCATTAT
1 TTATCGAACAAGT-TCAAATAGTTATG----ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
114551 GA-CTTTTAGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAA
61 GACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * * *
114614 TATTAATTTATTAATATT-TCGACAATTAATAAGAAAAAGAATTT-AAAAATAAATATGT
124 TACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * ** ** **
114672 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTAACAACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * *
114737 TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* ** * * *
114802 TTATTAATATTCCCAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
131 TTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * *
114853 TTATTGTACAAGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
1 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
** * * *
114918 TTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTT-TTGTTCATTCAAGCTTATTTC-AAA-AAAA-AATA--A
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTA
* * * *
114977 ATTTATTAATATTTTAAAAATTACTAAGT-AGAAATTTAAAAAAT-AATCTGT
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* **
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Statistics
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* *** * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * ** *
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* * * * *
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** * * *
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* * **
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * *** *
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* *
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* * * * *
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* * * * * **
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*
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* *
105254 TTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTTGAAAAATTAATA
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** * * *
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* * * *
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*
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* *
105508 AAAAAATAAATCAATTTAT-TG
509 AAAAACTAAATCTATTT-TCTG
* * * * * * * * * * *
105529 AATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAACTATCTATTTTAAATCA-TTATTATCTTTTGT
1 AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAAT-AGTTATGAT-ATTTGT
* *
105593 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAA-CATACAAGCTTATTT-GA-AATAAGATAATCCTAATTT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AATCATACAAGCTTATTTGGATAA-AA-ATAATACTAATTT
* * * * * *
105655 ATTAACATTTC-AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTTCTGAACCAGTTCAAATT
126 AATAAAATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTC-GAA-CAGTTCAAATA
** * *
105719 GTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTTCAAATTCTTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAC
189 GTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTA-TTTCAAA-TCTTATAACCTATTG-TTTAGTCAT-AAAC
* * * * *
105783 AATTGTGTT-TGGTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTTG-AA
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* *** * * *
105846 AATTGATAA-CTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCCATTTACCGAATCAA-TTCAAATAATTAAGA
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* * * ** * * ** * *
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* **** * * * *
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* * *
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501 -AAG-GATTTA-AAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * * * *
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* * ** * * ** *
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* * * * * * ** * *
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126 AATAAAATTCCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTTC-GAACAGTTC
** * *
106257 AAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATAA-C--TT-TTT-G--A-AT
184 AAATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCATAA
*** ** ** ** * * **
106314 AGTTTTGACT-A-TTCATATTATTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAA
247 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAA
* * * * ** ** * *
106376 AACTTAATAACCAATAA-AATT-AAAAAATAAATCTAATTACTAAACCAA-TTCAAATAGTTAAG
311 AAATTAATAAGCAA-AAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAACAGTTATG
* * * * * * *
106438 ACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAGAATAATTGTTT
374 ACTATTTGAA--ATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT
* * * * * * * * * *
106503 T-GTTCAT-ATAAGCTTATTCAGTATTAAAATAATATTATTTTAATAATATTTTAAAACTTAATA
437 TAATTCATGA-AAACTTATCCA-AAATAAAATAATACTA-TCTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * *
106566 AGTAAGATATTTAAAAAATAACTTTGTTTATC-G
499 AG-AAG-GATTTAAAAACTAAATCTATTT-TCTG
* * * * * ** * * * * * *
106599 AATCAGTTCAAATGGTTA-AACTATTGGAATATTTATATATTGCAAATTGTTCTAACCT-TTTGC
1 AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATAGTTATGA--TATTTGT
* * * * * * *
106662 TTAGTCATAAAACAACTATTTC-AATTTATACAAGCTTA-GT-CAAAATAAATTAATACTAATTT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAA-TCATACAAGCTTATTTGGATAA-AAA-TAATACTAATTT
* * * * * * * * *
106724 ATTGACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAATTTT
126 AATAAAATTCCAAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATGTGTTT-TCGAAC-AGTTC
** * * * * * * *
106789 AAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTT-TTCATA
184 AAATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTG-TTTAGTCAT-
** * * * * * * * **
106853 AAACAATTGTTTCTTTTCATAGAAGCTTCTTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCCA
245 AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGA
* * * * * ** * * * **
106918 AAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTCGCC-AAGCTAGTTCAAATATTTAAA
310 AAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAACAGTTATG
* * * * * * * *
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374 ACTATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT
* * ** * * * * * *
107046 CATTTCAT-ATAGGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAATTTAATAACA-TTCAAAAAATTAATG
437 TAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * * * *
107109 AGTAAAAGATTTTAAAACAAAATCTGTTTACCG
499 AG--AAGGATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * * **
107142 -AACAAATTTAAATAGATT-TGACTA-TTGAATAATTATCTATTT-AAAGCCGTTATGACCT-TT
1 AAAC-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAA-TAGTTATGA--TATT
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * * **
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * ***
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* * * **
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* * * * *** *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * ** *
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * * * *
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** * * * ** * *
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* * ** * * * * *
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187 TAGTTAAGACTATT-GAATAATTATCTATT-TCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCAT-AAA
* * * * **
109010 CAACTAG-TTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAATTGATACTAATTTATTAACATTCAAA
248 CAA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAA
* * * * * *
109073 AAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAAAAAATTTGTTTATC-ATAC-A-TTCAAATAGTTATT
311 AAATTAATAAGCAAA-AGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGA-ACAAGTTCAAACAGTTATG
* * * * * * *
109134 ATTATTTGAACAATTGTCTATTT-ATATCGTTATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAATAATTGTT
374 ACTATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTT-ATTTTGTCATAAAAAAATTATT
* * * * ***** * * **
109197 TCAGTTAAT-ACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTCATATTTCCTAAATTAATA
436 TTAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * *
109261 AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
499 AG-AAG-GATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * * * ** * * * * *
109294 AATA-AATTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTACTGCAAATCGTTATGACATTTTGT
1 AA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATAGTTATGATA-TTTGT
* * * *
109358 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTT-GA-AATAAATAATACTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATAA-AAATAATACTAATTTAA
* * * * * * *
109421 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAAAAAAT-TGTTTACCAAATCAGTTTAAA
128 TAAAATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAA-CAGTTCAAA
* * * * * * * * *
109485 AAGTTATGATTATTTGAACAACTATCAATCTT-AAATCGTTAAAATCT-TTGTTTTGTCATTAAA
187 TAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTAT-TTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCA-TAAA
* * * * * * * * *
109548 AAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATT-CAATTAAAAATAATACTAATGTAATAATATTCT-AA
248 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACATT-TGAA
* * * * * * * * **
109611 AAATTAATAAGTAAGAGATTT--TAAAA-AAATGTGTTTACCGACCTAGTTTAAATAGTTAAAAC
311 AAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAACAGTTATGAC
* * * * * * * * * ** * * * *
109673 TATTAGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTCTAACCTCTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTTCC
376 TATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT-T
* * *** * * * *
109738 AA-TC-TTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCAAATTTATTAA-AATTCAAAAACTTAATAA
438 AATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATAC-TATCTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAA
* * *
109800 GCAAAAGG-TTTGAAAAAATAAATCTATCTACTG
500 G---AAGGATTT-AAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * * * * *
109833 -AACAAGTTAAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCT-TTT
1 AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAAT-AGTTATGA--TATTT
* * * *** * *
109895 GTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATATTAATT
62 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATT
* * * * * * *
109958 T--T----TT--AATATTTAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAA
125 TAATAAAATTCCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTC-GAAC-AGTTCAAA
** * * * * *
110014 TAGTTACTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTCT-G-CTATAAA
187 TAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTT-TAGTC-AT-AA
* * * * * *
110077 ATAATTGTTTAAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTT-CAA
247 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAA
* * * *
110140 AATTAAT----AAATGATTT--AAAAATGAATATGTTTACC-AATC-AGTTCAAATAATTAT-AT
312 AATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAACAGTTATGA-
* * * * * * * * *
110196 CCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTA-GTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATGT-TT
375 CTATTT-GA-AATTATCTATTTAAAATCGTTATG-ACATTTTATTTTGTCATAAAAAAAT-TATT
** * * * * * *
110259 TT--TTCAT-ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATA
436 TTAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * *
110321 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-C
499 AG-AAG-GATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * * * * * *
110353 AAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATACTTCAAATTGTTATAACATTTTGT
1 AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATAGTTATGATA-TTTGT
** * * * * ** * * ** * * *
110418 TAGGTCATGAAGCAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATAATAATCTAA
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATTTAA
*** * * *
110482 TAAAATAAAAAAAATTAATAACTAAAAGATTT-AAAAA-AAAT-TGTTTGCTAAACCTAGTTCAA
128 TAAAATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTC-GAA-C-AGTTCAA
* * * *
110544 ATAGTTAAGACT-TGTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CAATTTGTTTTGTCATAAA
186 ATAGTTAAGACTAT-TGAATAATTATCTATTTCAAA-TCTTATAACCTA-TTGTTTAGTCAT-AA
* * * * * * * * *
110607 ACAATTTTTTCAACTT-ATAGAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAA
247 ACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAA
* * * * * * * * *
110671 AAATTTATAAGCAAGAGATTT-AGAAAAT-AATTTCATTTACAGAATC-AGTTCAAATAATTATA
311 AAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAA-CAAGTTCAAACAGTTATG
* * * * * * ** *
110733 ACTATTT-AAATAACTATCTGTTTCAAATCGTTATTACTTTTTGTTTTGTTATAAAGCAATTGTT
374 ACTATTTGAAAT---TATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATT
*** * ** * * * *
110797 TTTGGTAAT-ATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATC
436 TTAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-
* * * **
110861 AATAAGAAATTTAAAAAGTAAATC-ACTTAAC--
498 AAGAAG-GATTTAAAAACTAAATCTA-TTTTCTG
* ** * * * *
110892 AAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTCTTTCAAATTA-TTATGACTTTTTG
1 AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAA-TAGTTATGA-TATTTG
* * * * * * ** * * * *
110956 TTCTATTATAAAATAATAGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAA
* *** * * * ** * *
111021 TAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTGTACCAAACTAGATCA
128 TAAAATTCCAAAAATTAATAAG----AGA-TTT-AAAAAATAAATGTGT-TTTCGAAC-AGTTCA
* * * * * **
111086 AATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGAAATAAA
185 AATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCAT-AA
* * * * ** * **
111151 AAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGCTA-TAATATTCCAAA
247 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAA
*** * * * * * ** *
111215 AATTAATAATTTAAAGATGT-AAAAAACAATTCTATTTATTGAACAAGTTTCAATA-A-TTATAA
312 AATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAG-TTCAA-ACAGTTATGA
* * ** * ** * ** *
111277 CTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAGCACTATAATC-TTTTGCTTTGTCATTAAATGATTTTTT
375 CTATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGA-CATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT
** * * * * * * **
111341 TTGTTCAT-ACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACAAATTTATTAGTA-TGAAGAAAATTAAT
437 TAATTCATGA-AAACTTA-TCCAAAATAAAATAATAC-TATCTATTAATATTTCA-AAAATTAAT
* * *
111403 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-
498 AAG--AAGGATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * * * *
111436 AAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT
1 AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATAGTTATGA-TATTTGT
* * * * * * *
111501 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATCT-GATTAAAATAATATTTATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * * * *
111565 AATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAACTTTTAAAAAATAAATATATTTATTGGAACAAGTTCAA
129 AAAATTCCAAAAATTAATAAG---AGA--TTTAAAAAATAAATGT-GTT-TTCGAAC-AGTTCAA
* * * * * * * *
111630 ATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA
186 ATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCAT-AAA
* * * * * *
111695 CAATTTTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTTATATTTTG-AA
248 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTTGAAA
** * * * *
111759 AATTAA-AAG-GTAAGATAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG-
312 AATTAATAAGCAAAAGAT--TTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAACAGTTATGA
** ** * * * * *
111821 CATATCTAAAAAAAATCTATTTCAAAA-CATTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGGTT
375 C-TAT-TTGAAATTATCTATTT-AAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATT-ATT
* * * * *
111884 TT-GTTCATGCAAGCTTATTTCC--AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAA
436 TTAATTCATGAAAACTTA--TCCAAAATAAAATAATACT--ATCTATTAATATTTCAAAAATTAA
** *
111945 TAAGTAAAAATTTTTAAAA-TAAATCTATTTTCT-
497 TAAG-AAGGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * *
111978 AAATTCA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCA-TTATGACCATTT
1 AAA--CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-TATTT
* * * * * ** *
112041 GTTTTGTCATAAACCAATT-TGTTCTATTGAAACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATT
62 GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATT
* * * * * * * * *
112104 TATTAATACT-AAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTCA
125 TAATAAAATTCCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCGAA-C-AGTTCA
* * * * *
112168 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACC-ATTTGTTTTGTCATAA
185 AATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTA-TTGTTTAGTCATAA
* * * * * *
112232 ACCAATT-TGTTCTA-TTCAAACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTC
247 A-CAATTGT-TTC-AGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTG
* * * * * *
112294 AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTTCC-AAGCGAGTTCAAATAGTTAT
309 AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAACAGTTAT
* * * * * * * * *
112357 GACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGATC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
373 GACTATTT-GA-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGA-CATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTAT
** **** * * * *
112421 TTCT-ATTCAT-ACAAGTTTATTTGGAATTAAATAATACTAATTTGTTATTA-TTCTAAAAATTA
435 TT-TAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * *
112483 ATAAGTTGAA-GATTTAAAAAATTAATCTGTTTACT-
496 ATAA---GAAGGATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * ** * * * * * *
112518 AAACAAATTCAAATAATCATTTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCA-TTAAGACATTTTG
1 AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAAT-AGTTATGATA-TTTG
* * * * ** * *
112582 TTTTATCTTAAAACAGTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGA-ATAAAATAACACTAATTTA
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATTTA
* * * ** * * * * *
112646 TTACTATTTTGAAAAA-TAAT--GACATTTAAAAACTAAATCTCTTTATCGAACCGGTTCAAATA
127 ATA-AAATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAA-CAGTTCAAATA
* * * ** * * *
112708 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATCACATATCGTTAT----GATT-TTT-GTCCTAAA-ACA
189 GTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCATAAACA-A
* * * * * * * *
112766 TTGCTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTTG-AGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCT-AAA
251 TTG-TTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TGAAA
* * * * * * * * *
112828 AATTAATAAGTAAGA-ATTT-AAAAAATGAATGTATTTGCC-AAGCCAA-TGCAAATAGTTAAGA
312 AATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAA--CAAGTTCAAACAGTTATGA
* * * * * * * * * * *
112889 CTATTAGAACAATTATCTATTTTGAAATCATTTTGGCTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTG
375 CTATTTG-A-AATTATCTA-TTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT
* * ** * * * *
112954 CAGTTCAT-ACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAACATTT-AGAAAATTAATA
437 TAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCA-AAAATTAATA
** * * * *
113017 AGCAAAAAATTTAGAAAAATAAATCTGTTTAC-C
499 AG--AAGGATTTA-AAAACTAAATCTATTTTCTG
* * * *
113050 AAACAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATAACCT-TTT
1 AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAAT-AGTTATGA--TATTT
* * * * * * * * * *
113113 ATTTTATCATAAAATATTTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCT-GAAATAAAATAATATTACTT
62 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATT
* * ** * * ** * *
113176 TATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTC
125 TAATAAAATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAA-CAGTTC
* * * * ** * * * * **
113241 AAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAA-ATTTTGTTTTTTCATA
184 AAATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTAT-AACCTATTGTTTAGTCAT-
* * * *
113305 AAATAATTGTTTTTCA--TCATACAAG-TCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
245 AAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCT-TATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
* * ** * * * * *
113367 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA
307 TGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAACAGTTA
* * * ** * * * *
113431 TGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTAT-ATCCTTTTGTTCTATCATAAAAAAAATT
372 TGACTATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGA-CATTTTATTTTGTCAT-AAAAAAATT
* * * * * * * *
113495 ATTTCT-ATTCAT-ACAAGCTTATTCGAAAT--AATAATGCTAACATAATAATATTACGAAAATT
433 ATTT-TAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACTATC-TATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
113556 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTG
495 AATAA-GAAG-GATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
** * * * * * * *
113593 AATTAGTTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTA
1 AAACAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATAGTTATGA--TATTTG
* * ** * * * * **
113656 TTCTATTGTAAAATAATT-TTTTTAATTCTTACTAA-CTTATTTGGA-ATAAAATAAAAAAAATT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAA-TCATAC-AAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATT
* * * * * * * * ** *
113718 TATTAGTACTT-GAAAAATTAATTAGAAAGAAATTTGAAAAATAATTCTGATTGCCAAACTAGTT
125 TAATA-AAATTCCAAAAATTAA-T---AAGAGATTTAAAAAATAAATGTG-TTTTCGAAC-AGTT
* * * * * *
113782 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
183 CAAATAGTTAAGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCAT-
* ** * * * * *
113847 AAACAAATGTTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTT
245 AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTT
* * * * *
113911 G-AAAATTAATAAG----AGAATT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAAATAGTTTAATA-AGTT
308 GAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA-AGTTCAA-ACAGTT
* * * ** * * * *
113968 ATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGA-TTGTTTGTTTTGTGATAAAACAATG
371 ATGACTATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACAT-TTTATTTTGTCATAAAAAAAT-
* * * ** * * * * * *
114032 T-TTCT-GTTC-TTACAGTCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
432 TATTTTAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCAAAAATT
* * **
114094 AATAAGTAACGAATTTAAAAAATAAATCTATTGGCTTG
495 AATAAG-AA-GGATTTAAAAACTAAATCTATTTTC-TG
* * * * * * **
114132 -ACCAATTGAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATTTGA-TTCAAATCA-TTAAAACCT-TTT
1 AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGA--TATTT
** * * * * ** ** ** * *
114193 GTTTCATCACAAAAAAAATGTTTTTGTTTGTACAAGCTTA--TCCAAAACAATATAATTCTAATT
62 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTGGATAA-AA-ATAATACTAATT
* ** * * * * *
114256 T-ATGAATATTCTGAAATTTAATACGTAATAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTT
125 TAAT-AAAATTCCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAAC-AGTT
* * * * * * *
114320 CAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACATTTTATTTTGTCATA
183 CAAATAGTTAAGACTAT-TGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTTAGTCAT-
* * ** * * *
114385 AAACAATTTTTTCTA-CTCATACAAGCTTATTTCATATAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-
245 AAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTG
* * * * * *
114448 AAACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTAT-AAACAATTA
309 AAA-AATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGT-TCAAACAGTTA
* * * * * * * *
114511 TGATTAATTATTTTAACAATTGTTTATTTTAAATCATTATGAC-TTTTAGTTTTCTCATAAAACA
372 TG----ACTA-TTTGA-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTA-TTTTGTCATAAAAAA
* ** ** * ** * * * * *
114575 ATTGTTTTTGTTCAT-ACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAA
430 ATTATTTTAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
114639 TTAATAAGAAAAAGAATTTAAAAA-TAAATATGTTTAC-C
493 TTAATAAG---AAGGATTTAAAAACTAAATCTATTTTCTG
* ** ** * *
114677 AAACAAGTTCAAATAGTAACAACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTG
1 AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATAGTTATGA--TATTTG
* * * * * *
114741 TTTTGCCATAAAACAATTGTATC-AATTCATATAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAA-TCATACAAGCTTATTTGGATA-AAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
114804 ATTAATATTCCCAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATTGTACAAGTTCA
126 AATAAAATTCCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAAC-AGTTCA
* * *
114869 AATAGTTATA-ACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCA-TCATA
185 AATAGTTA-AGACT-ATTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTATTGTTT-AGTCAT-
* ** * ** * *
114932 AAATAATTGTTTTTGTTCATTCAAGCTTATTTCAAA-AAAA-AATA--AATTTATTAATATTTTA
245 AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGA
* * * * *** * *
114993 AAAATTACTAAGTAGAA-ATTT-AAAAAAT-AATCTGTTTTTTGAACACA-TTCAAATAGTTATA
310 AAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA-AGTTCAAACAGTTATG
* * * * * * ** *
115054 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGCTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAACCAATTGTTT
374 ACTATTTG-A-AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT
* * * *
115119 CT-ATTCAT-ACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATA
437 -TAATTCATGA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA
** * *
115182 AGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCGATTTATCATG
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CTATTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTATAACCTATTGTTTAGTCATAAACAATTGTTTCAGT
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ATTTAAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAATTCATGAAAACTTATC
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* * * ****
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* * * * * *
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* * * * * **
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*** * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * * ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * **
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* * * ** * ***
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* * * * **
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* * * * * * **
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* * * ***
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* * *
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* * * * * ** * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * * * *
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193 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT
* * * * * *
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257 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTG
* * * *
105422 TCATAAAACAACTATTT-TAATTCATAAAAGCTTATCCAAAA
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* * * *
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*** * * * * * * * * * * *
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* *** * *
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* * * * ** *
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196 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTT
* * * * * *
105713 CAAATTGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTTCAAATTC-TTATAACCTTTTGTTTTATCA
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**
105777 TAAAACAATTGTGTT-TGGTCATACAAGCTTATT-AGAAA
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* * * * * * *
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* * * * * * * * **
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* * * * *** * * * *
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* * * * *
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* * **
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * ** ** **
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130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * ** * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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323 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AAA
* * * * * * * *
106527 TAAAATAATATTATTTTAATAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAACTTTG
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* * * * * * * * * * ** * *
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65 TTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * ** * * ** *
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130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
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* * * * * * * * *
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258 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGT
* * * *** *
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* * * * *
106889 TAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCT
* ** * * ** ** *
106954 GTTCGCC-AAGCTAGTTCAAATATTTAAAACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGA
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* * * * * ** *
107017 CCTATTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAT-TTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATACTAC
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * * * * **
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* * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ***
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** * * ** * *
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* * ** *** ** *
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256 T-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
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* * * *
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**** * * * ** *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * * * ** *
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257 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
108812 CTTTTCTTTTGTCATAGAACAATTATTT-TGTTCATATAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTA
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* ** * * * **
108876 ATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAACTTTGTTTACTGAA-TCA
194 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-A
* * * * * * ** *
108940 GTTCAAATGGTTA-AGACTATTGGAAT-ATTATATATTAT-AAATCGTTCTAACCTTTTCCTTAG
258 GTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
109002 TCATAAAACAACTAG-TTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAA
321 TCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
109043 TAAATTGATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAAAAAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCT
* * * * * * * * *
109108 GTTTATC-ATACA-TTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTT-ATATCGTTATAAC
64 ATTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * ** *
109170 CTTTTGATTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTA
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* ** * * **
109235 ATTTATTCATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TAA
194 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-A
* * * ** * * * * * *
109299 ATTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTACTGCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTC
258 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * **
109364 ATAAAACAATTATTT-TTTATCATACAAGCTTATTTGAAA
323 ATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
109403 T-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAAAAAAT-TG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * ** *
109466 TTTACCAAATCAGTTTAAAAAGTTATGATTATTTGAACAACTATCAATCTT-AAATCGTTAAAAT
65 TTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAC
* * * *
109530 C-TTTGTTTTGTCATTAAAA-AATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTA-TTCAATTAAAAATAATAC
129 CTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATAC
* * * * * *
109592 TAATGTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAA-AAATGTGTTTACCGACC
192 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * * * * * **
109654 TAGTTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTCTAACCTCTTGTTTAA
256 TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * **
109719 TCATAAAATATTTGTTTCCAATCTTATAAGCTTATTTGAAA
321 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
109760 TAAAATAATCCAAATTTATTAAAATTCAAAAACTTAATAAGCAAAAGGTTTGAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCT
* ** * * * * * *
109825 ATCTA-CTGAACAAGTTAAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGA
64 ATTTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * ***
109889 CCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT-A-A-
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * * ** *
109950 T-ATTAATT--T-TTT--AATATT--TAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAAAATTTGTTTACTGAACA
192 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT
* * * * *
110006 AATTCAAATAGTTACT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTATTCTG
257 AGTTCAAATAGTTA-TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **
110070 -CTATAAAATAATTGTTT-AAGTTCATACAAACTTATTTGAAA
321 TC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
110111 TAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAATTAAT-A--AA-TGATTT-AAAAATGAATATGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * *
110170 TTACC-AATCAGTTCAAATAATTAT-ATCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTA-GTAC
66 TTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-AC
* * * * * * *
110232 CTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGTTT-TTTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAGTATTA
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * *
110295 ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAA
194 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAG
* * * ** * * **
110360 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATACTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTAGGTCA
259 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
110425 TGAAGCAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTCAAAA
324 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * ** * * *
110463 TAAAATAATAATAATCTAATAAAATAAAAAAAATTAATAACTAAAAGATTT-AAAAA-AAAT-TG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * **
110525 TTTGCTAAACCTAGTTCAAATAGTTAAGACT-TGTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
65 TTTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
** * ** * * * * *
110589 AATTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAACTT-ATAGAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * *
110653 AATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGCAAGAGATTTAGAAAAT-AATTTCATTTA-CAGAA-
193 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCA-AAC
* * * * * * *
110715 TCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAATAACTATCTGTTTCAAATCGTTATTACTTTTTGTTTT
256 T-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** * * * *
110780 GTTATAAAGCAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTTCAAAA
320 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* *
110822 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAA-TAAGAAATTTAAAAAGTAAATC-
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * ** * * *
110885 ACTTAACAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTCTTTCAAATTATTATGAC
64 ATTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * * *
110950 TTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT
** * * * * *
111014 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTGTACCAAAC
193 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * *
111079 TAGATCAAATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
256 TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * **
111144 AAATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAA
321 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAA
** * * * * *
111185 TAAAATAATACTAAGCTA-TAATATTCCAAAAATTAATAATTTAA-AGATGTAAAAAACAATTCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
*** * * * * * *
111248 ATTTA-TTGAACAAGTTTC-AATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAGCACTATA
64 ATTTACCAAAAC-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * ** * *
111311 ATCTTTTGCTTTGTCATTAAATGATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATA
* * ** * * *
111375 CAAATTTATTAGTA-TGAAGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA
191 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA
* * * * ** *
111439 CAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTT
255 CTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* ** *
111504 ATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TCTGAT
320 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
111545 TAAAATAATATTTATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAA-AAACTTTTAAAAAATAAATA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATC
**** * * * *
111609 TATTTATTGGAACAAGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTG
63 TATTTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
111674 ACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT-TTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
* ** * * * * *
111738 CTAATTTATTTATATTTTGAAAATTAA-AAGGTAAGATAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGA
191 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
* * * * ** * *
111802 ACAAGTTCAAATAGTTAT-GCATATCT-AAAAAAAATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTT
254 ACTAGTTCAAATAGTTATAAC-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
111865 TTGTCAT-AAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTC-CAA
318 TTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAA
* * **
111908 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAA-AAATTTTTAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
111971 ATTTTCTAAATTCA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGA
64 ATTTACCAAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * * **
112035 CCATTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TGTTCTATTGAAACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAC
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * * *
112099 TAATTTATTAATA-CTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCG
192 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT
* * * *
112162 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGT
257 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
112227 CATAAACCAATT-TGTTCTATTCAAACAAGTTTATTCGAAA
322 CATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
112267 TAAAATAATACTAATTTATTAATACTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * ** *
112332 TTTCC-AAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGATC
66 TTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
112396 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATTAAATAATACTAA
130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
112461 TTTGTTATTA-TTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTAAACAA
195 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA
* * * ** * * * * *
112524 ATTCAAATAATCATTTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTTAAATCATTAAGACATTTTGTTTTAT
258 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
112588 CTTAAAACAGTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAA
322 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * ** * * *
112628 TAAAATAACACTAATTTATTACTATTTTGAAA--AATAA-T--GACATTTAAAAACTAAATCTCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * ** * *
112688 TTATCGAACCGGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATCACATATCGTTATGA---
66 TTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * *
112750 --T-TTTTGTCCTAAAAC-ATTGCTTTCTATTCATACAAGTTTATTTTG-AGTAAAATATTGCTA
131 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
112810 AATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATGAATGTATTTGCCAAGCCA
194 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA
* * * * * * * * *
112873 ATGCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTTGAAATCATTTTGGCTTTTTGTTTAG
258 GTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
112937 TCATAAAATAATTGTTGC-AGTTCATACATGCTTATTCAAAA
321 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
112978 TAAAATAATACTAATTTATGAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAGAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCT
* * * *
113043 GTTTACC-AAACAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAA
64 ATTTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * * * *
113107 CCTTTTATTTTATCATAAAATATTTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATT
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * *** *
113172 ACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATCAGTTTATTGAATTA
193 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA
* ** * ** * * ** *
113237 GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAAATTTTGTTTTTTC
258 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ***
113302 ATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAG-TCTATTTGGAA
323 ATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT-TATTCAAAA
* * *
113341 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAGTAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * *
113406 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTAT-ATC
65 TTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C
* * * * * * *
113470 CTTTTGTTCTATCATAAAAAAAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAAT--AATAATGCT
129 CTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
** * * * * * * ** *
113533 AACATAATAATATTACGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAATTA
193 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA
* * * * * * * *
113598 GTTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTCTAT
258 GTTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * ***
113662 TGTAAAATAATT-TTTTTAATTCTTACTAA-CTTATTTGGAA
322 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC-AAGCTTATTCAAAA
* ** * * * * * * *
113702 TAAAATAAAAAAAATTTATTAGTACTTGAAAAATTAATTAGAAAGAAATTTGAAAAATAATTCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-
* *
113767 A-TTGCC-AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
64 ATTTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * *
113830 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAAATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAATAATA
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TTGA-AATAAAATAATA
* * ** * * *
113893 TTAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-A-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAA
191 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * * *
113954 TAGTT-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGA-TTGTTTGTTT
256 TAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTT
* * * *
114017 TGTGATAAAACAA-TGTTTCTGTTCTTAC-AGTCTTATTCAGAA
319 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAA
* *
114059 TAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCT
** *** * * * * * **
114123 ATTGGCTTGACCAATTGAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATTTGA-TTCAAATCATTAAAA
64 ATTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGA
** * * * * ** *** * * *
114187 CCTTTTGTTTCATCACAAAAAAAATGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATCCAAAACAATATAATTCT
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * *
114252 AATTTATGAATA-TTCTGAAATTTAATACGTAATAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACA
193 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT
* * * ** * * *
114316 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACATTTTATTTTGT
257 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
114381 CATAAAACAATTTTTTCTACTCATACAAGCTTATTTC-ATA
322 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAA
* *
114421 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * * *
114486 TTTATCGAATA-AGTAT-AAACAATTATGATTAATTATTTTAACAATTGTTTATTTTAAATCATT
65 TTTA-CCAAAACAGT-TCAAATAGTTATG----ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * *
114549 ATGA-CTTTTAGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATA
124 ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * * *
114613 ATATTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGAAAAAGAATTT-AAAAATAAATATGTTTACC
188 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * **
114677 AAACAAGTTCAAATAGTAACAACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
252 AAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
114742 TTTGCCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAAACTTATTCGAAA
317 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
** * *
114787 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCCAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
**** * *
114852 TTTA-TTGTACAAGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
65 TTTACCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
** * * * *
114916 CTTTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATTCAAGCTTATTTCAAA-AAAA-AATA--A
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * ***
114977 ATTTATTAATATTTTAAAAATTACTAAGT-AGAAATTTAAAAAAT-AATCTGTTTTTTGAACAC-
194 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAA-ACT
*
115039 A-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGCTATGACCTTTTGTTTTG
257 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
115102 TCAGAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCGAAA
321 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
115143 TAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCGA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
115208 TTTA
65 TTTA
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Statistics
Matches: 9067, Mismatches: 2032, Indels: 871
0.76 0.17 0.07
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TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
TTACCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTT
CAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
Found at i:108442 original size:16 final size:17
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108400 AACCAATTCA
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1 AATAATTAT-ACTATTTG
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1 AATAATTATACTATTT
108443 CAAATCATTA
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AATAATTATACTATTTG
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109818 TAAATCTATC
* * * *
109828 TACTGAACAAGTTAAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTT
1 TACTGAACAAATTAAAATAGTTACTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT
* * * *
109893 TTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATT
66 TTATTCTGACATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA-T
*
109958 TTTTAATATTTAAGCAAGAGTTTAAAAAAAAAATTTGTT
130 TATTAATATTTAAGCAAGAGTTTAAAAAAAAAATTTGTT
* *
109997 TACTGAACAAATTCAAATAGTTACTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTT
1 TACTGAACAAATTAAAATAGTTACTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT
* ***
110062 TTATTCTG-CTATAAAATAATTGTTTAAGTTCATACAAA-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
66 TTATTCTGAC-ATAAAACAATTGTTTAAGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA
110125 TTATTAATATTT
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110137 CAAAATTAAT
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TACTGAACAAATTAAAATAGTTACTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT
TTATTCTGACATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATT
ATTAATATTTAAGCAAGAGTTTAAAAAAAAAATTTGTT
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110451 GTTTATTCAA
* *
110461 AATAAAATAATAATAATCT
1 AATAAAATAAAAAAAAT-T
110480 AATAAAATAAAAAAAATT
1 AATAAAATAAAAAAAATT
110498 AATAA
1 AATAA
110503 CTAAAAGATT
Statistics
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AATAAAATAAAAAAAATT
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110449 AAGTTTATTC
*
110459 AAAAT-AAAATAA-TAATAATCTAA
1 AAAATAAAAAAAATTAATAATCTAA
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1 -AAAATAAAAAAAATTAATAATCTAA
*
110507 AAGATTTAAAAAAAATT
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110524 GTTTGCTAAA
Statistics
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AAAATAAAAAAAATTAATAATCTAA
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115231 TATGACTCCT
* *
115241 TGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTAAAATATA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
1 TGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
115305 CTTATTTGGTAAACAAATTCATTTTTTAAA-TCATTTACCTATTAGTTGTCTGAATATTAATAAA
65 C-T-TGT-GCAAACAAATTCATTTTTTAAATTCA-TTACTTATTA-TTTTTTGAATATTAATAAA
* * *
115369 TTTGTATTATTTTAATT--GAAACAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATATTTTA
125 TTAGAATTA-TTT-ATTCCGAAACAAGCTTGTATGAATACAAAAAAATATTTTA
* * * * * *
115421 TAACAAAACAAAATATTATAGTGATTTGAAATAAGTAACTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAA
1 TGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
115486 CTTGTTCGATAA-ATAGATTTAGTTTTTAAATCTC-TGACTTATTAATTTTTGTAATATTAATAA
65 CTTGTGC-A-AACA-A-ATTCATTTTTTAAAT-TCATTACTTATTATTTTTTG-AATATTAATAA
* * * * *
115549 ATTAGAATTATGTTATTCCTAATC-ATCTTGTATG-A-ACAAAAACA-ATTTTG
124 ATTAGAATTAT-TTATTCCGAAACAAGCTTGTATGAATACAAAAAAATATTTTA
* * * * *
115599 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGGTAATTGCTCAAACAGTTATAACTATTTGTA
1 TGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* *
115664 CTCGTGCCAACAAATTCATTTTTTAAATTCATTACTTATTATTTTTTAGAATATTAATAAATTAG
65 CTTGTGCAAACAAATTCATTTTTTAAATTCATTACTTATTATTTTTT-GAATATTAATAAATTAG
* * * * * * ** *
115729 CATTACTTTATTCC-AAATAGGATTGTATCAATA-GAAAATTTGTTTTA
129 AATTA-TTTATTCCGAAACAAGCTTGTATGAATACAAAAAAATATTTTA
115776 TGACAAAACAAA
1 TGACAAAACAAA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
174 4 0.01
175 60 0.21
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182 3 0.01
183 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (176 bp):
TGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
TTGTGCAAACAAATTCATTTTTTAAATTCATTACTTATTATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAA
TTATTTATTCCGAAACAAGCTTGTATGAATACAAAAAAATATTTTA
Found at i:115792 original size:12 final size:12
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Indices: 115775--115801 Score: 54
Period size: 12 Copynumber: 2.2 Consensus size: 12
115765 AATTTGTTTT
115775 ATGACAAAACAA
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115787 ATGACAAAACAA
1 ATGACAAAACAA
115799 ATG
1 ATG
115802 GTTATAACAA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (12 bp):
ATGACAAAACAA
Found at i:116143 original size:17 final size:18
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Indices: 116121--116169 Score: 57
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 18
116111 AACAAAAGGT
116121 TATAATTATTTGAAATA-
1 TATAATTATTTGAAATAC
*
116138 TATAATTGTTT-AAATAGC
1 TATAATTATTTGAAATA-C
*
116156 CATAATTATTTGAA
1 TATAATTATTTGAA
116170 CTAGTTTGGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (18 bp):
TATAATTATTTGAAATAC
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Indices: 116041--116467 Score: 512
Period size: 181 Copynumber: 2.4 Consensus size: 181
116031 TAATTTTCCT
* * * *
116041 AATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAGCATAAATAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAGCATAAACAATTATTTTAT
* * *
116106 GACAAAACAAAAGGTTATAATTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAAC
66 AACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAAC
* * *
116171 T-AGTTTGGTAAGCA-T-ATTTATTTTTTAAAT-TTCATACTTATAAATTTTTGA
131 TGA-TTCGATAA--ATTGATTTATTTTTTAAATCTCCA-ACTTATAAATTTTTGA
**
116222 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATTGGCTTGTATGATG-A-AGAACAATTATTTT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-GCATA-AACAATTATTTT
* * *
116285 ATAACAAAACAAAA-GTTCATAATGGTTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTG
64 ATAACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTG
* *
116349 AACTGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGA
128 AACTGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATAAATTTTTGA
* * * * *
116403 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATGT-TGGATAAGCTAT-TATGAACAAAAACAATTGTTTT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TCTGAATAAGCT-TGTATGAGCATAAACAATTATTTT
116466 AT
64 AT
116468 GATAAAATAA
Statistics
Matches: 212, Mismatches: 23, Indels: 22
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Matches are distributed among these distances:
179 1 0.00
180 5 0.02
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182 8 0.04
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Consensus pattern (181 bp):
AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAGCATAAACAATTATTTTAT
AACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAAC
TGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATAAATTTTTGA
Found at i:116874 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 116486--117314 Score: 697
Period size: 180 Copynumber: 4.7 Consensus size: 177
116476 AATTGTTTGA
* ** * * *
116486 TAAATAGATTTATTTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAACTAGTATT
1 TAAACAGATTTA-TTTTTT-AAA-TTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATT
* * * *
116551 ATTTTATTTCAAATAAG-TATGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATA
62 ATTTTATTCCAAATAAGCT-TGTATGAACAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATA
* * *
116615 ACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTC-G
124 ACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG
* * ** ** *
116668 ACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTGTTATTTTAGCAATA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTA
* * *
116733 TTTTACTCCAAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTTTTTTTATGACAAAACAAAAAT-ATAAT
63 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA--TTTTTTATGACAAAACAAAAATCATAAC
* *
116797 GATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAGGTTCAG
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* * * * *
116849 TAAGCAGATTTACTTTTTAAA-TC-TCTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATTCTTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTATTT
* ** * *
116912 TATTCTAAATAATTTTGTATGAATA-ATAACAA----TT-TG--TAAAC-AAAAT-ATAACGATT
66 TATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA-AACAATTTTTTATGACAAAACAAAAATCATAACGATT
* * * * * * *
116967 TGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTCAG
130 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG
* *
117015 TAAATAGATTTATTTTTTAAATT-TTCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATTCTT---CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTA
* * * ** *
117079 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACATATGCTTTATGACAAAACAAGAGATCATAAC
63 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-ATTTTTTATGACAAAACAA-AAATCATAAC
* * * * *
117144 AATTTG-AATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTTAACTCGCT-AGG
126 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-G
* * * * ** * *
117195 CAAATAGATTTATTTTTAAAAGTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTAT
* * * * * *
117260 TTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGATAAAACAAAA
64 TTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAA
117315 GGTAATAACT
Statistics
Matches: 527, Mismatches: 90, Indels: 62
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 68 0.13
167 7 0.01
169 2 0.00
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171 2 0.00
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Consensus pattern (177 bp):
TAAACAGATTTATTTTTTAAATTCTTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTATTT
TATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAAATCATAACGATTT
GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG
Done.