Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167871.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_14, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 22631831
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.15, T:0.34
Warning! 114000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 101 of 125
Found at i:19565879 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 19565495--19566162 Score: 651
Period size: 177 Copynumber: 3.7 Consensus size: 181
19565485 TACAAATAGT
* * * * *
19565495 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
19565560 TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA-T-TTTTATGAGAAAACAAAAGGTTATAACAA
65 TTTATTTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAA
* * * *
19565623 ATTAAAAT-AT--ATAATTGTTCAAATAGGT-ATAATTATTTGAAGTGGTTCCA
130 TTTAAAATAATAGATAATTATTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTGGTT-CA
* *
19565673 TAAATAACA-TTATTTTTTAAATCTCTTA-TA-AAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTTTTAT
1 TAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
19565734 TTTATTATGAATAAACTTGGATGAGTTGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACG
65 TTTATT-TAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACA
* *
19565799 ATTTAAAATAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGA
129 ATTTAAAATAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-A
* * * * * *
19565853 CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
19565918 TTTATTCCAAATAAATTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTT-TAACA
65 TTTATT-TAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACA
* * **
19565982 ATTT--GA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGTTTGAACTTATTCA
129 ATTTAAAATAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTCA
* * * *
19566033 GTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTC--A-TACT-AATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTA-TAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* *
19566094 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATG-TTCA-AAATTATTGTTTTATGACAAAACGAAAA-G-TACT
64 TTTTATTT-AAATAAACTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTA-T
19566155 AACAATTT
125 AACAATTT
19566163 TATTTCAATA
Statistics
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175 28 0.07
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Consensus pattern (181 bp):
TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAAT
TTAAAATAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA
Found at i:19566167 original size:66 final size:66
Alignment explanation
Indices: 19566093--19566228 Score: 184
Period size: 66 Copynumber: 2.1 Consensus size: 66
19566083 AATTAGTATT
* ** *
19566093 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTT-CAAAATTATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTACTAA
1 ATTTTATTTC-AATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAA
19566157 CA
65 CA
* * *
19566159 ATTTTATTTCAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAAC
1 ATTTTATTTCAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAAC
*
19566224 G
66 A
19566225 ATTT
1 ATTT
19566229 GAAATAGATA
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 8, Indels: 2
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
65 15 0.25
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ATTTTATTTCAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAAC
A
Found at i:19566357 original size:82 final size:85
Alignment explanation
Indices: 19566199--19566361 Score: 190
Period size: 82 Copynumber: 2.0 Consensus size: 85
19566189 AACAATTGTT
* *
19566199 TTATGACAAAATGAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATATCCATAATTATTT
1 TTATGACAAAATGAAAGATAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATCCATAATTATTT
**
19566264 AAATTGATTCAGTAAACTAA
66 AAACCGATTCAGTAAACTAA
* * * * *
19566284 TTATGAC-AAAT-AAAGATCATTACGATTTGAGATAGAT-ATTGTTCAAATAGT-TATAATTATT
1 TTATGACAAAATGAAAGATAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TCCATAATTATT
* *
19566345 TGAACCGGTTCAGTAAA
65 TAAACCGATTCAGTAAA
19566362 TAGATTTAGT
Statistics
Matches: 66, Mismatches: 11, Indels: 5
0.80 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
82 32 0.48
83 23 0.35
84 4 0.06
85 7 0.11
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.13, T:0.36
Consensus pattern (85 bp):
TTATGACAAAATGAAAGATAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATCCATAATTATTT
AAACCGATTCAGTAAACTAA
Found at i:19574978 original size:18 final size:18
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Indices: 19574955--19574992 Score: 67
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19574945 AGAAACATTG
*
19574955 GTATGAAAATTTGATGAT
1 GTATGAAAATCTGATGAT
19574973 GTATGAAAATCTGATGAT
1 GTATGAAAATCTGATGAT
19574991 GT
1 GT
19574993 TTTGATATTG
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 19 1.00
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Consensus pattern (18 bp):
GTATGAAAATCTGATGAT
Found at i:19575632 original size:20 final size:21
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Indices: 19575607--19575659 Score: 83
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19575597 ATTTTCCAGA
19575607 AAAGGGATCGATCCCCTT-TT
1 AAAGGGATCGATCCCCTTCTT
19575627 AAAGGGATCGAT-CCCTTCTT
1 AAAGGGATCGATCCCCTTCTT
*
19575647 AAAGGGATTGATC
1 AAAGGGATCGATC
19575660 GGTTGTTCAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 1, Indels: 3
0.88 0.03 0.09
Matches are distributed among these distances:
19 5 0.17
20 25 0.83
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Consensus pattern (21 bp):
AAAGGGATCGATCCCCTTCTT
Found at i:19576881 original size:181 final size:181
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Indices: 19576563--19579890 Score: 2128
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19576553 ATATAAGTTT
* *** * *
19576563 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGT-AAGAGATTTCAAAAATAAATT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * *
19576627 TGTTTACTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTATTTACTTT-AAAT-CTTGAT
65 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATAGTT-AT
* * * * *
19576690 GA-CTATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTTGTTCATACAATCTTATTTGGA
128 GACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * * * *
19576744 ATAAAGTAATGCTAATTTATTAACATTCTAAAATTTAAAAAGTAAAGGATTTAAAAAATTAATTT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
* * * *
19576809 G-TTAGCCTG-ACCAGTGCAAATAAG-TATGACTGCTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
66 GTTTA--CTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT
* * *** * * *
19576871 GACCATTTGTTTTATTGCAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATCTAAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* ** * *
19576925 ATAAGATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-CAAGAGATTTAAAAAATGAATT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAATT
* * * * *
19576989 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATATCAAATTGCTATAA
65 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
19577054 CTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAA
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * *
19577105 ATAAAATAATAC-AATTTTTTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAA--AATT-AAAAA-AAAGT
1 ATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATT
* *
19577165 T-TTT--TGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
65 TGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* *
19577226 ACCTTTTATTTTGTCA-AAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCCTATTTGAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * *
19577279 ATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAA-AATTTTAAAAATAAATTT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * *
19577343 GTTTA-TCGAGCAACTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAATAGTTATGA
66 GTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
19577407 TCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTGGGA
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19577459 ATTAAA-AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGT-AGGAGATTTAAAAAATAAATC
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAATT
* ** * * *
19577522 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAA
65 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* ** **
19577587 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTGTGA-AAAATTATTT-AGA
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAAGCTTATTTGA-A
* * *** * *
19577639 ATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---A-GATTTAAAAACTAAATAT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * *
19577700 GTTTA-TGGAA-ACAGTTCAAACATTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTT-AAATAATTAT
66 GTTTACT-GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
19577762 GATC-TTTATTTTATCATAAAATAGTTTGTTTCTTTTTATACAAGCTTA-TTCAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * *
19577815 ATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT-A--AAA-GATTTAAAAAATAAATG
1 A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * * * *
19577876 TGTTT-GTCAAACCAA-TTCAAA-AGTTAAGACTATTAGAGCAATTGTTTATTTCAAATTGTTTT
65 TGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT
** * * **
19577938 GACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATAC-AGCCTTATTCAAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG-CTTATTTGAA
* * ** *
19577992 ACAAAATAATAGC-AATTTATTAACATTTGAAAAATTAATCAGT-AAGAGA-TT--AAAA-AAA-
1 ATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
19578050 -TGTTTA-TCAAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAAGTAATT
64 TTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTT
* * * * * * * *
19578111 ACGACATTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTTCAATTCAAAAAAACTTATTCGAA
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * *** * ** * * **
19578167 ATCAAATAATACTACTTCACTAATATTTTGAAAATTAGT-AGGCAAGAGACTTAAAAACTAAAGC
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAATT
* * * * * *
19578231 TGTTT-TTCACACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATCAATCTT-AAATAGTTA
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* * * *
19578293 TGATCC--TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAAG-TTTTTTG-G
127 TGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTGAA
* * * *
19578346 ATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG---A-GATTT-TAAAA-AAATA
1 AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATT
* * * ** * * * * *
19578405 TGTTT-GTCAA-ACAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCGAATCGTTTTG
65 TGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * * * **
19578468 ACC-TTTGATTTAGTCATATAATAATTGCTTC-AGTTTATACAAGCTTAATCAAA
129 ACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19578521 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAATTAAATC
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTT-AAAAAATAAATT
* * * * *
19578586 TGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGA
65 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
19578651 CCTTTTTATTTTGTCATAAAACCATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCTAAA
130 CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * **
19578704 ATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG---A-GATTTAAAAAATAAATCA
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * ** * * *
19578765 ATTTAC-CAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCGTTATTG
66 GTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTA-TG
* * * * * * *
19578829 -CTTTTTATTTTGTCTTAAAAAAATTGTTTTTCAAT-ATACAATCTTATTTGAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * ** *
19578881 ATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCACTAATTAAT-A--AAA-GATTTAAAAAATAAATCT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * *
19578942 ATTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
66 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
19579007 CTATTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATA-TAGACTTATTT-AGA
131 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGA-A
*
19579058 ATAAAATAATACTAATTTAGTAATATT-CATAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAATAAAT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAAT
** ** ** * * * * * * **
19579120 CGGTTTACCCAATTAGTTCAAGTAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATG
64 TTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * ***
19579185 ACCTTTTGCTTTATTATAAAATAATTATTTCAACTCATATAAGCTTATCCCAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19579238 A-AAAAGTAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG----GGATTTAAAAAATAAATC
1 ATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATT
* * * ** * * * * *
19579298 AGTTTACCGAA-ATAGTTCAAATACG-TATGGCCATTTGAACAACTACCTACTTCGAATCGTTAT
65 TGTTTACTGAACA-AGTTCAAATA-GTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
19579361 TACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAGTTGTTTTTCA-ACATTCAAGCTTATTTGAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19579415 ATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG---A-GATTTAAAAAGTAAATCT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
* ** * * * * *
19579476 ATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
66 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
19579541 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCCTACAGGCTT-TCTCGAA
131 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTGAA
* * * *
19579592 ATAAAATAATACTAATTTAGTAGTATTCTAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTTAAAAAATAAAT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GA-TTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * * *** * * *
19579656 CTATTTGCCAAACTAGTTCAAACAATTAAGACTACATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
64 TTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
** * *
19579721 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAGTAATTATTTC-AGCTT-ATACAAGCTTATTCGAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * ** *
19579774 ATAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTC-AAAATT--T-TGT-AAGAGATTTAGGAAATAATT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAAT
* * * *
19579833 TTATTTACTGAACCAGTTCAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT
64 TTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
19579891 CATTAGTACT
Statistics
Matches: 2504, Mismatches: 504, Indels: 282
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
171 1 0.00
172 9 0.00
173 112 0.04
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175 114 0.05
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATTT
GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
Found at i:19577744 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 19577717--19577764 Score: 57
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19577707 GAAACAGTTC
*
19577717 AAACATTTATGATTAT-TT
1 AAACAATTATGATTATCTT
19577735 AAACAATTAT--TTATCTT
1 AAACAATTATGATTATCTT
*
19577752 AAATAATTATGAT
1 AAACAATTATGAT
19577765 CTTTATTTTA
Statistics
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Consensus pattern (19 bp):
AAACAATTATGATTATCTT
Found at i:19579276 original size:534 final size:532
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19576810 TTAGCCTGAC
* ** * *
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*** * * * ** * * * ** *
19576884 ATTGCAAAACAATTGTTTCTATTCGTACA-AGCTTATCTAAAATAAGATAATTTTAATTTATTAA
64 ATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAA
* * * ** *
19576948 TATTCCA-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
128 TATT-CATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
19577012 GTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATATCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAA
192 GTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGATTT-TTATAAAATAA
* * * * *** * * * * *
19577077 TTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAATTTTTTTAATATTCCAAAAATT
256 TTATTTCAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTT
* * * *** * * * *
19577141 AATAAGTAAAAATTAAAAAA-AAGT---TTTTTGAACACA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGA
321 AATAAG--AGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAATAGTTCAAATAAG-TATGGCCATTTGA
* * * * * * * * *
19577200 TCAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTC-AAAAACCAATTGTTTCT-ATTCA
383 ACAACTACCTACTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAA-CAATTGTTTTTCAAT-A
* * * * * * *
19577263 TACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAAT
446 TACAAACTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGAT
* * * * * *
19577328 TTTAAAAATAAATTTGTTTATCGAG
508 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
* * * * * * * * *
19577353 CAACTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAATAGTTATGATCTTTTGTTTT
1 C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTGTTTT
* * * * ** * *
19577418 GTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACA-AGTTTATTGGGAATTAAA-AATACTAATTTATTAA
64 ATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAA
* * ** *
19577481 TATTC-TAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
128 TATTCAT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
19577545 GTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAATCTTTTG-TTTTGTCATAAAACA
192 GTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGATTTT-T-ATAAAATA
* * ** * ** * * * * *
19577609 ATTGTTTCTA-TTTGTGAAAA-ATTATTTAGAATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGAAA
255 ATTATTTC-AGCTCAT-AAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA-TTTCAAA
* * *** * * ** ***
19577672 A-TTAATAAGAGATTTAAAAACTAAAT-ATGTTTATGGAAACAGTTCAAACATTTATGATTATTT
317 AGTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACCAAAATAGTTCAAATAAGTATGGCCATTT
* * ** ** * * * * * * *
19577735 AAACAATTATTTATCTT-AAATAATTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAGTTTGTTTCTT-T
381 GAACAACTACCTA-CTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACA-ATTGTTT-TTCA
* * * * * * * *
19577797 TTATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAAGA
443 ATATACAAACTTATTTGAAA-TAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * **
19577861 TTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAA
507 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
* * * ** * * * * *
19577887 CCAATTCAAA-AGTTAAGACTATTAGAGCAATTGTTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTA
1 -CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTTT
* * * * * *
19577951 ATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAGCCTTATTCAAAACAAAATAATAGC-AATTTATTA
64 ATCATAAAATAATTATTTCT-GTTTATACAGACTTATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTAGTA
* * * * * *
19578014 ACATTTGA-AAAATTAATCAGTAAGAGA-TT--AAAA-AAA--TGTTTATCAAACAAGTTGAAAT
127 ATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAAT
* * * * ** * *
19578072 AGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAAGTAATTACGACATTTTG-TTTTGTCATAAA
191 AG-TTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGATTTT-T-ATAAA
* * * ** * * * * * * * *
19578134 ACATTTGTTTCAATTCAAAAAAACTTATTCGAAATCAAATAATACTACTTCACTAATATTTTGAA
252 ATAATTATTTCAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA-TTTCAA
* * * * ** ** * ** * **
19578199 AA-TTAGTAGGCAAGAGACTTAAAAACTAAAGCTGTTTTTCACACCAATTCAAAT-AGTTATAAC
316 AAGTTA--A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAATAGTTCAAATAAG-TATGGC
* * * * * * *
19578262 TATTTGAACAAATATCAATCTT-AAATAGTTATGATCC--TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
376 CATTTGAACAACTACCTA-CTTCAAATCGTTATTA-CCTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
19578324 CT-AATCATACAAAGTTTTTTG-GATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATA
439 TTCAAT-ATACAAACTTATTTGAAAT-AAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * **
19578387 AGAGATTT-TAAAA-AAATATGTTTGTCAAA
502 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
* * * * * * * *
19578416 CAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCGAATCGTTTTGACCTTTGATTTAG
1 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTGTTTTA-
* ** * * * * *
19578481 TCATATAATAATTGCTTCAGTTTATACA-AGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT
* * * * * * *
19578545 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAATTAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAG
129 ATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAG
* * * * * * **
19578610 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAACCA
193 TTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGATTTT-T-ATAAAATAA
* * * * *
19578675 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAGTT
256 TTATTTCAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTT
*
19578740 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACA
321 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAATAGTTCAAATAAGTATGGCCATTTGAACA
* * * *
19578805 ACTACCTATTTCAAATCGTTATTGCTTTTTATTTTGTCTTAAAAAAATTGTTTTTCAATATACAA
386 ACTACCTACTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAATATACAA
* ** *
19578870 TCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCACTAATTAATAAAAGATTTAAAAAA
451 ACTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
*
19578935 TAAATCTATTTACCGAA
516 TAAATCTATTTACCAAA
*
19578952 CTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTTT
1 C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT-TTGTTTT
*
19579017 ATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATATAGACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT
64 ATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT
* * * *
19579082 ATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCGGTTTACCCAATTAGTTCAAGTAGT
129 ATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGT
* * *
19579146 TAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGCTTTATTATAAAATAATT
194 TAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGATTT-TTATAAAATAATT
* * * *
19579211 ATTTCAACTCATATAAGCTTATCCCAAAA-AAAGTAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTA
258 ATTTCAGCTCATAAAAGCTTAT-CCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTA
* * * *
19579275 ATAAGGGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAAATAGTTCAAATACGTATGGCCATTTGAACAA
322 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAATAGTTCAAATAAGTATGGCCATTTGAACAA
* * * * * * *
19579340 CTACCTACTTCGAATCGTTATTACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAGTTGTTTTTCAACATTCAAG
387 CTACCTACTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAATATACAAA
* *
19579405 CTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGT
452 CTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
19579470 AAATCTATTTACCAAA
517 AAATCTATTTACCAAA
* *
19579486 CAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCT
1 C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTTT
* ** * * * *
19579551 ATCATAAAACAATTATTTCTGTTCCTACAGGCTT-TCTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAG
64 ATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAGTAA
* * * *
19579615 TATTC-TAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAGTTCAAAC
128 TATTCAT-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAAT
* * * *
19579679 AATTAAGACTACATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAGT
191 AGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGATTTT-T-ATAAAAT
* * * * * * *
19579743 AATTATTTCAGCTTATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTCAAAA
254 AATTATTTCAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT-TTCAAAA
* **
19579807 TTTTGTAAGAGATTTA
318 GTTAATAAGAGATTTA
19579823 GGAAATAATT
Statistics
Matches: 2006, Mismatches: 382, Indels: 161
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
527 8 0.00
528 132 0.07
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530 13 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (532 bp):
CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTGTTTTAT
CATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAT
TCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTA
AGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGATTTTTATAAAATAATTATT
TCAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAA
GAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAATAGTTCAAATAAGTATGGCCATTTGAACAACTAC
CTACTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAATATACAAACTTA
TTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTACCAAA
Found at i:19581086 original size:181 final size:179
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Indices: 19579897--19596459 Score: 4889
Period size: 181 Copynumber: 91.6 Consensus size: 179
19579887 AAATCATTAG
* * * ** * * *
19579897 TACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTATGTGTATTTACC
1 TACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAAT-AAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC
** * * * * * * * * * *
19579960 AAACCATTTTAAATAGTTTTAACTATTTGAATAATTATTTATTCCAAATCATTATAACTTTTTAT
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * **
19580025 TTTGTCA-ACAAACAATTGGTTCTGTTGATACTATTTTATTTGAAATAAAATAA
129 TTTGTCATA-AAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * ** ** *
19580078 TAATAATTT-TATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCT-AATAGCC
1 TACTAATTTAT-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTA-TC
* * ** ** * *
19580141 AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTAAATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGG
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * ** * *
19580206 TTTCTCGTAAAATAATTATTTTGTTTGTACAAGCTTAATCGAATTAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAA
* * * * * * * *
19580258 TACTAATTTAATAATAGTTCAAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * * * ** *
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* * ** * * *
19580384 AGTCATAAAACAATTGTTACAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAACTAA
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* * ** * * *
19580435 TATTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * ** * * ** *
19580500 AACAAGTTCAAATAGTTATTACAATTTGAACAACTGCCTATTT-AGAAGCTTTAAAACCTTTTGA
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
19580564 CTTGCCATAAAACAA-TTTTTCAGTTAATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * *
19580616 TA-TAAATTTATTAATA--TTAAGATAATTAATTAGTCAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
1 TACT-AATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGT-AAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * * *
19580677 CCGAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTATTATGACTTTTT
62 TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * *
19580742 CTTTTATCATAAAATAA---TTGT-TTC-T----G-TTAATTTAGATTAAAATAA
127 GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTT-ATTT-GAATAAAATAA
** * * * * *
19580787 TTTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* ** * * *
19580851 AACAAGTTCAAATAGCCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTCTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * **
19580916 TTGTAATAAAATAATTTTTTTAGTTCATATGAGCTTATTTGAAGTAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAA
* * * **
19580968 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTGAGTAAGAAAATTGAAAAAGGAATCTGTTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * *
19581033 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTACCTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTGTTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * **
19581098 TATCTTAAAACAATTGGTTTTGTTCATGTAAGCTTATTTCGAATAAAATAA
131 TGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * *
19581149 TA-TAAATTTATTAATATTTTAGAAATTAATCAGTTA-ATATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCT
1 TACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-
* * * * * * * *
19581211 TAACT-TGTTTAAAAATTTATGACTTTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCCTTTG
64 -AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* *
19581275 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-AATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT--TGAATAAAATAA
* * * * * * * *
19581329 TATTAATTTATTAAAATTTCAAAAGTTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAA-ATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * *
19581393 GACAAGTT-AAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-T
* * *
19581457 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
** * ** * * * * *
19581510 TACTAATTTATTAATATAAT-AAAATTAATGAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATCTGTTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * *
19581574 ATAAGTTCAAATA-TTAT--C----T-----A-T-T-TATTTCAACTTATTATGACTTTTTGTTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
19581624 TATCATAAAATAATTGTTTATGTTCATTCAAACTTATTTAGATTAAAATAA
131 TGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
** * * * *
19581675 TTTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAAATTTTAAAAAATAAATATGCTTA-C
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAA--TTAAAAAATAAATCTGTTTATC
** * * *
19581738 CGATCAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
64 AAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * ***
19581803 TTTTATAATAAAAC-ATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATTT-TTT-TATTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAA
* ** * * * * ** ** **
19581857 TATTACCTTATTAATATTTTAAAAATTGAGAAGT-TGGAGTTTAAAAAATAAATCAATTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * ** * *
19581921 ATCAGTTCAAATAGTTGTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * *
19581986 TGTCATAAAACAATTTTTTT-TCGTCATATAAGCCTATTCAGAATGAAATAA
131 TGTCATAAAACAATTTTTTTAT--TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * * * * *
19582037 TAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTAAGCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * * * * *
19582102 ACT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACATTTTCTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * **
19582166 TTGTTATATAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * * * * * **
19582218 TACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTGCCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
*** * * * * * * * *
19582282 AACCGGTTCAAATAGTAAAGGCTGTCTGAATAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACC--TTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
19582345 TTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAA
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* * * * * *
19582397 TA-TAAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACCA
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* * * * * * *
19582457 AACT-AGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCATTTGT
65 AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * **
19582521 TTTGTCATTAAACAATTATTTCTATTGATACAATTTTATTTGGAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * ** *
19582574 TGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AATATTTAAAAAA-GAATCTGTTGGCTT
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTT-TATC
* ** * * * *
19582637 GACCAA-TGCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTA
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * * **
19582700 TTTTGTCACCAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAGCATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * * **
19582754 TTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * * * *
19582819 ACAAGTTCAAACAATTACGATTATTTGAACAATTACCTATTTCAAAT-AGCTATAACCTTTTGTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
19582883 TTGTCATAGAATAATTTTTCTATTCATACAACCTTAATTCAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAA
* * * * * * *
19582933 TACAAATTTATTAATA-TTCAGATAATTAATAA-TAA-AATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTACC
1 TACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTA-T
* * * * *
19582994 CGAATAA-TTC-AATAGTTGTGACTATTTGAACAATTTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTT
63 CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTA-TCTATTTCAAATCATTATGAC-CTT
* * **
19583057 TTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAA
125 TTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAA
* * * * * **
19583113 TATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATAG---ATTTAAAAATAAA-ATGTTTATTG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA-AGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * ** * *
19583174 AACAAGTTTC-GATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTCAAATTGTTATGAGCTTTTA
65 AATAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * ** * * * *
19583238 TTTCATCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTAATTT-AAAATAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAATA-AAATAA
* * * * * * * *
19583291 TACTAA-TTATTAATATTTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTACC
1 TACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGTAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * * * * * * *
19583355 AAACAAGTTCCAATTGTTATGGCTGTATAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGA--TATTT-
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTG
* * * * *
19583417 TTTTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
** ** * *
19583471 TA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AATTTTTAAAAATAAAATATGTTT-TC
1 TACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAAT-AAATCTGTTTATC
* * * * * *
19583533 TAAATACA-TTCAAATAGTTATGATTATCTGAATAA-TATTTTATTTTAAATAATTATGACCTTT
64 -AAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * *
19583596 TGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTA-TTCAA-AATAAGTAA
126 TGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCT-TATTTGAATAA-AA-TAA
* * ** * * * * *
19583651 TGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
** * * * *
19583715 GCAAATTCAAATAGTTATG-CTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGT
* * * * *
19583778 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTA-TTCAA-AATAA-AA
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAATAA-AATAA
* * * * * * * *
19583828 TAATAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * *
19583893 ATAAGTTCAAATAGTCAT-ATCTATATGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * ** **
19583957 TTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * * *
19584009 TAGTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAATACTAAATCTATTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * ** * * *
19584070 A-ATAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATGATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--TGTTTAT
66 ATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGT
* *
19584132 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * ** * * * *
19584185 TACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG--AG--CTTTGAAAAATAAATATGTTTGTTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCA
* * * * * * *
19584246 ACT-AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTGAAATCATTCTTACCTTTTAT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * *
19584309 TTAT-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
129 TT-TGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
** ** * * * * * *
19584362 TTGTAATTTATTAATATTCAAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAGTATAAATTTATTTAT
1 TACTAATTTATTAATATT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAA--ATAAATCTGTTTAT
* * * *
19584427 CAAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCGTTATGACTTTT
63 CAAATAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT
* * * * *
19584490 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAA
126 TGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * ** * * * *
19584546 TACTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAACAA-AAGATTTAAAACTAAAGT-TGTTTTTTT
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAA-TCTG--TTTAT
* * * * * *
19584609 GAACT-AGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTT
63 CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTT
* * * *
19584671 GTTTTCTCATAAAACAATCTTTTTT-TATCATACAAGCTTATATGGACAAAATAA
127 GTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAA
* * * * * * * *
19584725 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--T-AGTGAGAGATTTAAAAAATAAATATATTT-GC--
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
** * * * * *
19584783 -T--G---AACCAG-T-T--C-A----AATAATTATCTATTTCAAATAATTCTAACCTTTTATTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
19584833 AGTCCTATAATAATTTTTTTAGTTTATACACGCTTATTCGGAATAAAATAA
131 TGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * ** * * * *
19584884 TGCTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAG-ACATTCGAAAAGATAAATGTGTTTATC
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATT--AAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * *
19584948 GAATAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * *** *
19585013 TTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAGAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAA
* * ** * * * * * *
19585065 TACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAACTAAG-AGATTCAAAAATAAATCAGTTGA-CTA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * * * * * *
19585128 GATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTA-CTTATTTCAAATTATTATTACCTTTTG-
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
*** * ** ** *
19585191 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAAAAAATA-AATCTT-TTT-ACCAAACCAG
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAA
* * * * * ** * * *** ** * * *
19585241 TTCAAATAGTTA-TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCATATTGTTATAACATTTTATTCT-AT
1 TACTAAT--TTATTAA-TATTTTAAAAATTA-ATAAGTAAGAAAATTA-AA-AAATAAATCTGTT
* * * * * ** * * * *
19585304 AATAAAACAATTGTTTCTATTCA--TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAACTAATTT-AGTAAT
60 TATCAAATAA--G-TTCAAAT-AGTTATGA-C-TATTTG--A-ACAATTATCT-ATTTCA--AAT
** ** * * * *
19585366 -ATTATGAAAATTAATAACTAAGAAATT-T-AAAAAATAAATATTTTGCTGAACCAATTCAAACA
113 CATTATG-ACCTT--T---T--G-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TTTT--T-----TATTCATAC-
* * * *
19585428 GTTAAGAC-TATATGAA-CAATTATT
159 ---AAG-CTTATTTGAATAAAATA-A
* * **** * * ** ** **** *
19585452 TAACTCAAATTGTT-ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGCTTGTAGAAAT-T
1 T-ACT-AATTTATTAAT-A--TTTTAAAAAT-TAAT-AAGTAAGAAAATTA--AAAAATAAATCT
** * * * * * * **
19585514 -TATT-TGGAATAAAG-TAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAAAGATTT-AGAA-
57 GT-TTATCAAAT-AAGTTCAAA-T-AGTTATGACTATTTGAACAA-TTAT---CTATTTCA-AAT
* * * * *** * * * *** * * * *
19585574 AATAAT--TCTATT-TACAGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAA--TTATCT-ATT
113 CATTATGACCTTTTGTTTTG--TCA--TAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTGA-A
* *
19585633 TCAAATCAT
172 TAAAAT-AA
* ** * * ******* ** * * * *
19585642 TATTACCTT-TT-AT-TTTGTAATAA--AACAA-TCTTTTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCA--
1 TACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGTAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTGTTTATC
** * * * * * *
19585699 AAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTT-ATCAA--A-CCAGTTCAAAT-AGTTATGA-CTA
64 AAATAAGTTCAA-A-T-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-
* * * * * * *
19585757 TTTGAGCATTTAT-TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTGTGTTATA-AAACAATAGTTTCT
124 TTT--G--TTT-TGTCA--T-AAA-----A-CAATTTTT-TTAT-TCATACAAGC-TTA--TT-T
* * * *
19585820 G-TTCATACAA
169 GAATAAAATAA
* * * ** * ** *
19585830 -GCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAACTAAAAAATTTA
1 TACTAATTT--ATTAATATTTTA--AA--AATTAATAAGT-AAGAA--AAT---TAAAAAA--TA
* * * * * * *
19585894 AAACAAAATATTCTTACCGAACT-AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
52 AATC----T-GT-TTATC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *** * **
19585958 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATCATTTCGGTTCATATAAGCTTATTCAAAAT
110 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAAT
19586023 AAAATAA
173 AAAATAA
* * * * * * * * * * * *
19586030 TATTAAGTTATCAATATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAACGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * * *
19586095 ACAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGTTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * *
19586160 TATCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAA
131 TGTCATAAAA-CA-ATTTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAA
* *
19586213 TACAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTAA-AAGATCT----AATAAATC----TAC
1 TACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAAAAT-TAAAAAATAAATCTGTTTA-
* * ** ** * ** *
19586267 CCGACCAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTT
62 TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* *
19586332 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA-AA
127 GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * ** * * * * *
19586386 TATTAATTTATTAATATTTCAACTAGTAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * *
19586450 AACAAGTTTAAATGGTCATGAGTATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
19586514 TTTGTAAAAAAATAATTATTTCAGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * * * *
19586567 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTA-CCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * *
19586631 ATCATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTT
66 AT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
19586696 TTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAA
* * * *
19586748 TA-TAATTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTT-TCT
1 TACTAA-TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-
* * * * * ** * * *
19586810 GAACACA-CTCAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTGACGACCTTTAG
64 AAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * * * **
19586874 TTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCATTCATAAAAGCTTACTCAGAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAA
* * *
19586927 TACTAATTTATTAA-ATTTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C
1 TACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* ** * * ** * * * *
19586989 TGAACGAGTTCGAATAGTTATGACCATTCAAACAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTAG
64 -AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* ** *
19587054 TTTTGTCATAAAA-ATTTTTTTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACA-ATTTTTT-TATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* ** * * * *
19587108 TACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTA-CTA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * ** * *
19587171 AACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCTTTATGACATTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
** * ** *
19587236 TTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * * *
19587288 TATTAGTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAAATTTAAGAATTAAATCTGTTTATCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
** * * * *
19587349 ACCAA-TTCAAATACTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGA--TATTTGT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGT
* ** * * ** *
19587411 TTTGTAATAAAACAAATGCTTCTGTTCATACAAATTTATTAT-AAGTAAAATAT
129 TTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAA-TAAAATAA
* * * ** ** * * * *
19587464 TGCTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG--AG--CTTTGAAAAATAAATGTGTTAATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCA
** * * * * * * *
19587525 ACCAA-TTAAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTTACCTTTTATT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
19587589 TAT-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
130 T-TGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
** ** * * * * *
19587641 TTGTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATC
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATT-AA-AAAATAAATCTGTTTATC
* * ** *
19587706 AAACAAGTTCAAATAAATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTT
64 AAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTT
* * * * *
19587769 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAA
127 GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * * * * *
19587824 TACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AGATTTAAAACTAAAGT-TATTT-TCT
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAA-TCTGTTTATC-
* * * * *
19587886 GAACT-AGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAAATATC-ATTCTCAAATCTTTATGA-TTTTT
64 -AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTT
* *
19587948 GTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGAATAAAAATAA
127 GTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTATTCATACAAGCTTATTTGAAT-AAAATAA
* * * * * * * * **
19588003 TATTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAGT--G-AA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * ** * * * *
19588064 ACT-AGTTCAAATAGTTAAGACCATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * ***** * * * * ** ***
19588128 AATAT-TTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTA-AAAAG-TAAAATTGTTTACCAAACCCT
130 --T-TGTCATAAAA-CAAT---TTTTTTATTCATACAAGCT-TATTTGAATA--AAA-TAA
* * * * * * * *** * **** * * *
19588186 TTCAAATAGTT-TTGACTATTTGAATAATT-ATCTATTCCAATTCATTCTAACCTTTTATTTTG-
1 TACTAAT--TTATT-AATATTTTAAAAATTAAT-AAGT--AAGAAAAT-TAAAAAATAAATCTGT
* * * * *
19588248 TCATCAAACAATTGGTTC---TA-TTCAT-ACTATTAGTCAA-AATAAAATAATAATAATTTAAT
59 TTATCAAATAA---GTTCAAATAGTT-ATGACTATT--TGAACAAT----T-AT-CT-ATTTCA-
* ****** ** ** *** *
19588307 AAT-ATTTTGACACTTAATAACCAAGAAAATTAAAA-AATAAATCAAATTGC-TA-AA-C-CATT
110 AATCATTATGAC-CTT--TTGTTTTG-TCA-TAAAACAAT-TTTTTTATT-CATACAAGCTTATT
* *
19588366 TCAAATAGTAAGATTA
168 T-GAATA--AA-ATAA
* * * * ** ** *** * * * * * *
19588382 TA-TGAA-TGATTACCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT
1 TACT-AATTTATTA-ATATTTTAAA-AATTAAT-A-AGTAAG-AAAATTAAAAAATAAAT-CTGT
* * ** * * * * *
19588444 TTATCATACAAGCTTATTCGAAATA-AAAT-AATA-CT-AACTTATTA-ATATTTCAAA-AATTA
59 TTATCAAATAAG----TTC-AAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATT-
** *** * *** * * * * * * *
19588503 AT-AAGTAAGAGATTTAAAAT-ATA-AATATGTTTA--C---CGAA--TTAGTTCAA-ATAATTA
117 ATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATAC-AAGCTTATTTGAATAAAATAA
** * ** * ** ** *** * * * *
19588557 TGACT-ATTTGAGCAATTATCATTCCAAATCGTTAAGATCTTTG-TTCTGTCATAAAACAATTGT
1 T-ACTAATTT-ATTAA-TAT--TT-TAAA-AATTAATAAGTAAGAAAAT-T-AAAAAATAAATCT
* * ** ** * * * *
19588620 TTTTGATCATA-AAGCTT-ATTTAGTTAAAAATA-AT--ACTAATTTAATAATATTTCAAA-AAT
57 GTTT-ATCAAATAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AA-TT-AT-CTATTTCAAATCAT
** ** ** * * * * * * *
19588679 TAAT-A-AGTAAGAGATT-T-AAAAAATAAATGTGTTT-GTCGA-ACCAG-TTCAAATAGTTAAA
116 T-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTTATTC-ATACAAGCTT---AT--TT-GA
19588737 ACTATTAGAATAA
171 A-TA--A-AATAA
* *** ** * * * * **
19588750 TTA-TATATTT-TTAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTTAGAAAATATTTGTTTCATATCTCACA
1 -TACTA-ATTTATTAAT-ATTTTAA-AAATTAATAAGTAAG-AAA-A-----TTAAAAAAT-A-A
* * * * * ****
19588813 ATCT-TAT-TCGAAATAAAATAATCTAAAT--TTATTAAC-ATTTGAAAAATTA-ATAAAAAAAA
53 ATCTGTTTATC-AAAT-AAGT--TC-AAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** ** * * * * ** * *
19588872 GT--TTAAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGA-ATAA--T
112 -TCATT-ATGACCT---TTTGTTT-T-G-TC-A--TAAAACAATT-TTTTTA-TTCATACAAGCT
*
19588932 TATTT-ATTTAAAATCATTA
164 TATTTGA-ATAAAAT-A--A
* * * * * * * * *
19588951 TGACCT--TTTGTT-TTGATATAAAACAATTATTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAG
1 T-A-CTAATTTATTAAT-ATTTTAAA-AATTA-ATAAG-TAAGAAAA---T-T--AAAA-AATA-
** * * * * * * *
19589013 AATACTAATT-TCTTAAT-ATTTCAAA-AATTAATAAGCAATAGTTTTAAAAAATAAAT-TAGTT
52 AAT-CTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTT-AT--G-ACTA--TTTGAACAAT-TATCTA-TT
* * *** * * * ** * ** *
19589074 TACCAAA-CA-AAT-TCAAATAGTTATGCTTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGAC
107 T--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCA-TAAAACAATT-T-T-TTT--ATTCA-TACAAG
* * *
19589136 CTTTCGTTTTGTCATAAAAGAA
162 C-TT--ATTTG-AATAAAATAA
** * * * * * *
19589158 TTGTTTCAATTCA-TAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAAT
1 -T-ACT-AATTTATTAATA--TT-TTAAAAAT-TAAT-A-AGTAA--GA--AA-A-TT--AAAA-
* * * * ** * *
19589222 TAATAAATAAGC-GATT-T-AAA-AAG-T-AAATCGGTTTACGAAATCAGTTCAAATAATTGTGG
48 -AATAAAT---CTGTTTATCAAATAAGTTCAAAT-AG-TTATG-ACT-A-TTTGAACAATTAT--
* * *** * * * * *
19589281 CCATTTC-AA-CAATTAT---CTATT-TTAAATCGTTATAAC-CTTTTGTTTGGTTATATAACAA
102 CTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTTT-TTT-ATT-CAT-ACAA
*
19589339 TTG-TT-TTTTATTATACAAAGTTTATTCA
161 --GCTTATTTGA--ATA-AAA---TA---A
* * ** * * * ** * * * *
19589367 AAATAAAATAATAGAAATTTATTAATCTCTCAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTAT
1 TACTAATTTATTA-ATATTT-TAAAAAT-T-AATAAGTAAGAA-A-A-TTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * *
19589431 TTACTCGAACT-AGTTTAAATAG-T-TGACTACTTGAATAAATGTATACTTCAAAT-AGTTATAA
59 TTA-TC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA
* * * **
19589492 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
121 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* ** ** * * * * * * *
19589553 TACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTGAGAGATTTAGAAAATAAATTTGTTT-GCTA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * **
19589617 AACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACCTTTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGT
65 AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* *
19589674 TTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATAC-AAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * * * * * * * * * *
19589727 -AATGAATTTATTCATA-CTAAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAGTAATTCTATTTACCT
1 TACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
** * * * *
19589790 AACCAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAAT-AGCTATGACCTTTTGT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGT
* * * * ** * ** * *
19589854 TCTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATGTAAGTTTGCTCGAAATAAAAGAA
129 TTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * *
19589907 TACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---G-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * ** *
19589968 ACT-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTT
66 A-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
19590032 CTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * *
19590084 TACCAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA-AAAATTTCAAAAAATAAATATGCTTACT
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAA-TT-AAAAAATAAATCTGTTTA-T
* * * * * * * *
19590148 GAACT-AGATCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGGCCTTTTG
63 CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * *** *
19590212 TTTTGTCATAAAAAAATCATTTCGGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
** * * * * * * **
19590266 TACTAAGCTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAAGAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * *** * *
19590331 AAAATTTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTCTTT
66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * *
19590396 TGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAA
131 TGTCATAAAA-CAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * *
19590448 TACAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAATAAATTTGTTTACC
1 TACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * ** * **
19590510 GAACAAGTTCAAATCA-TTATGATTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-
64 AAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
19590573 TTTTGTTATAAGACAATAGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGGATGAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAT-AAAATAA
* * * * * * *
19590627 TACCAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * ** * *
19590691 ACT-AGATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTATTTCAAATGGTTATGACATTTTCT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* ** *
19590754 TTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTACTTGAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * * * *
19590807 TACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAG-AGATTAAAAAAATGAATCTGTTTGTCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * *
19590871 AACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
** *
19590935 TTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAA
* * ** *
19590988 TACAAATTTATTAATA--TTAAGCCAATTAATAAGTAA-AAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTAT
1 TACTAATTTATTAATATTTTAA--AAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTAT
* * ** * * ***
19591050 TAAACAA-TATCAAATCTTTATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGTATGA-CTTTT
63 CAAATAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * *
19591113 GTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TCATACATGTTTATTTCGATTAACAA-AA
127 GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAA-AATAA
* * * * * * **
19591167 TATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGT-AGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * *
19591231 AACAAGTTCAACTAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
19591296 TTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* ** * * * ** * *
19591348 TACTAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTACCT
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGT-TTATCA
* * * ** *
19591412 AACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
19591477 TTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * * * *
19591529 TACTAATTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-TGTTACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGT-TTATCA
* * * *
19591593 AACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACATTTTGT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
19591657 TTTCTCATAAAAC-ATTTGGTTCTATTCATGCAAGCATATTTCTAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTT--TTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
** * * * *
19591710 TAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AAAATTTAAAAATAAATATATTT-TCTA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* ** * * * * ** *
19591772 AACATTTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
19591837 TTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATGAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * ** * * * *
19591889 TACTAACTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
** * *
19591953 AGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
19592018 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
* * * * *
19592070 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-TGAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAA-TTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * ** * ** * **
19592134 AACAAGCTT-AAATAGTCATGTCCATTTGAACTGTTATCTATATCAAATTGTTATTATATTTTGT
65 AATAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * ** **
19592198 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * *
19592251 TACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AAG--ATTTAAAAACTAAATCT-TTCTATTG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTT-TA-TC
** * * * * *
19592311 AACCAA-TTCAAATAATTATGATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--TATTT-
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTG
* * * *
19592372 TTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATAT
128 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * * **
19592426 TGA-TAAATTAATAATA--TT-----CTAATAA--AAG--ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCA
1 T-ACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * ** * * * *
19592479 AACTAA-TTCAAATAGATAAGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGC
65 AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * **
19592543 TTT-TCATAAAATAGTATTTTCAGTTCGTGCATGCTTATTCAAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
** * ** * * *
19592595 TACTAATTTATTAGCA-TTCAGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATC
1 TACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAAA-ATTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * *
19592659 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGT
64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * **
19592724 TTTATCATAAAA-AATTTTTTCAATTTATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAA
* * * * * * * *
19592776 TATTAATTTATTAATACTTCAAAAATTGATATA-TTAGAGATTTAAAAAATACATC-G------A
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * ** *
19592833 ACT-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTACAAACTTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
19592897 TCT-TCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCATATTTGGAATAAAATAG
130 T-TGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * * * * * *
19592949 TATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAGGAAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTA-C--
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * ** * *
19593011 -T--G----AATCAG-T-T-CCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTT
66 ATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * ** * *
19593066 CTATCGTAAAATAATTATTTCAATTCATATAAGATTATTTGGAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* *** * * * * * *
19593118 TACTAATTTAATAATATTCCCAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCA
* * * * * *
19593183 AGT-AGCTT-AAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCATTTGT
65 AATAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * **
19593246 TTTATCATAAAACAATTGTTTCAGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
** ** * * * *
19593299 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * ** *
19593364 ATCAA-TTCAAATAATTATGA-TCATGTT-ATCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTG
66 AT-AAGTTCAAATAGTTATGACT-AT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * ** * *
19593426 TTTTGTCGTATAACAATTGTATTTGA-GCATTCAATTTTATTCAGAATACAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATT-T-TTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * * *
19593480 TACT-ATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * ** * ** * *
19593544 ACT-AGTTCAAACA-TCAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCTTTTGT
65 AATAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * *
19593607 TTTGTCATAAAACAATTATTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA
** * * * * * * * *
19593659 TACTAACATAATAATATTATGAAAATTAA-AAGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCG
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * * *
19593723 AATCAGTTCCAATATTTAAGACTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
19593788 TTGTCATAAAATAAGGTTTTTTGAATTCATA-ATAGCTTACTTGGAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAA--TTTTTT-TATTCATACA-AGCTTA-TTTGAATAAAATAA
* * * * * * * * *
19593842 -AATGAATTTATAAATATTTGAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-CT
1 TACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * *
19593905 TATCCAA-TTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTT-
65 AAT--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * * ** * *
19593968 TTTTGTCATAAAACAAATGCTTTTGTTCATATAAATTTGTTCGGAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * *
19594022 TACTAATCTATTAATATTTCAAATATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * *
19594083 ACT-AGTTCAACTAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTT
66 A-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
19594146 CTATTATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTTGGAACTAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAA-TAAAATAA
* ** * * * *
19594199 TACTAATTTATTAATATTTCAGCAATTGATAAGT-A-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCA
* * * * * * *
19594262 ACT-AGATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
65 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * **
19594326 TTGTCATAAAAGAAATGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA
* * * * *
19594378 TACTAATTTATTAGTAATTCAAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAGATGAATCTGTTTA-C
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAGAAAATTAAAAA-ATAAATCTGTTTATC
* * * * * * ** *
19594441 TAAAAAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTG
64 -AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
19594506 TTTTTGTCACAAAAGAATTTTATCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAA
128 -TTTTGTCATAAAACAATTTT-TTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * *
19594561 TTCAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAAAAATGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAA-GTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * *** * * ** *
19594623 CCAAACAAGTTCAAATCA-TTATCACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTAT-AGCTTT
62 TCAAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTT
* * * * *
19594686 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAA
125 TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* ** * * * *
19594743 TATTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTC
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-AATT-AAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * * * *
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64 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
19594872 TTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGATGTAAAATAA
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** * * * ** *
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1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA-AA-ATTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * *
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* * * * * *
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* ** * * * *
19595105 T-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAAAAAAAATGTTTTCTGAACACATTCAAAT-
1 TACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAA-----T-T-AA-AAAAT-AAATC
* *** * * * * ** *
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* * * * *
19595224 ATAAACTAATTGTTTTTGCTCAT-AAA-AA----CTTATTC--AGAA---TA---G----AAATA
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19595271 A
179 A
* * * * ** * * *
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* * *** * * * **
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* * * *
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* * * * * * ** *
19595452 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATTAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * * *
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** * ** * * *
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* * * ** *
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1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
** * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * * * * * **
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1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
** * * * * *
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*** *
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* * ** * *
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1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAA-ATTAAAAAATAAATCTGTTTATC-
* * * * * *
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* * * ***
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* * * * * ** * * * *
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1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * * *
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66 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTT
* *
19596295 TTGTTATAAAAC-ATTGTTTTTCA-TCATACAAGGTTATTTGGAATAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAA
* * * * * * ** * **
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1 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * *
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* ** * *
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* * * * ** * * ** **
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * *
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* * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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** * ** * * *
19581512 CTAATTTATTAATATAAT-AAAATTAATGAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATCTGTTTACCGAA-
1 -TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAAC
* * *
19581575 TAAGTTCAAATA-TTAT--C----T-----A-T-T-TATTTCAACTTATTATGACTTTTTGTTTT
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* * * * * * * * *
19581625 ATCATAAAATAATTGTTTATGTTCATTCAAACTTATTTAGATTAAAATAATTT
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAA-TA
* * * * ** *
19581678 TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAATAAATATGCTTACCGATC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAAGA-TTTAAAAAATAAATCTG-TTTTCGAAC
* * * * *
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* * * * * *
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** * * ** ** *
19581859 TTACCTTATTAATATTTTAAAAATTGAGAAGT-TGGAGTTTAAAAAATAAATCAATTTATTGAA-
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* * * ** * *
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* * ** * * *
19581987 GTCATAAAACAATTTTTTTTCGTCATATAAGCCTATTCAGAATGAAATAATA
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* * * **
19582039 GTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTAAGCGAA
1 -TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA--AAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TTCGAA
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
19582220 CTAATCTAATAATATTATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTGCCAAA
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** * * * * * * * *
19582284 CCGGTTCAAATAGTAAAGGCTGTCTGAATAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACC--TTGTTTT
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* * * * * *
19582347 GTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATA
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* * * * * *
19582399 TAAATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAG---AGATTTAAAATATAAATTTGTTTACCAAACT
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* * * * * * *
19582461 AGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCATTTGTTTTGT
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* * * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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** ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
19582997 A-TAATTC-AATAGTTGTGACTATTTGAACAATTTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTTG
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* * * *
19583060 TTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATA
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* * * * * *
19583115 TTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATAGATTT-AAAAATAAA-ATGTTTATTGAACA
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* * * * ** * * *
19583178 AGTTTC-GATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTCAAATTGTTATGAGCTTTTATTTC
64 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* ** * * ** * *
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*** * * * * * * *
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*** * * * * ** ** ** * *
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* * * * * * * * *
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* *** * ** ***
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*** **** * *** * * ** * * *
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Statistics
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* *
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498 TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATA-AACAATTATTTATATT
* * *
19582191 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ATGAAAATTAAT-AGCTAA
562 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGCTAA
* * * *** * * * * *
19582254 GAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTAAAGGCTGTCTGAATAATTAT
626 AAGATTT-AAAAAAAAATTTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTATAGACTATTTGAACAATTAT
*
19582319 CTATTTCGAATCG
690 CTATTTCAAATCG
* * **
19582332 TTATGAC-CTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATA
1 TTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAGTTT-TTTAAAATAAAATA
* *
19582396 ATATAAATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACCAAACT
65 ATAT-AATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAGAGATTTAAAA-ATAAATATGTTTACCGAACT
* * * *
19582461 AGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCATTTGTTTTGT
128 AGTTCAA-TAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** **
19582526 CATTAAACAATTATTTCTATTGATACAATTTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAT
192 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAT
* * *
19582591 TCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAGAATCTGTTGGCTTGACCAATGCAAATAGTTAT
257 TCTAAAAATTAATAAG--AAAGATTTAAAAAA-AATCTATT--CTT-AACAATGCAAATAGTTAT
** **
19582656 ATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTATTTTGTCACCAAACAATTGTT
316 -TCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATT-TATTTTGTCATAAAACAATT-TT
* * ** *
19582721 TCTAT-TCATACAAGCTTATTCGGAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
378 T-TTTGTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * * * ** * *
19582785 AGTAAGAAATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAACAATTACGATTATTTGAACA
442 AGT-AGAAATTTAAAAAATAAATATG-TTAGCGAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTAGAACA
* * * *
19582850 ATTACCTATTTCAAAT-AGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAGAATAATT-TTTCTATTCATACA
505 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATA-AACAATTATTTATATTCATACA
* * * * *
19582913 ACCTTAATTC--AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGATAATTAATAA--TAAAATATT
568 AGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCTAAAAGATT
* * * * * * * *
19582974 TAAAAAATACTATGTTTACCCGAA-TAATTC-AATAGT-TGTGACTATTTGAACAATTTATTTTA
632 TAAAAAAAAATTTATTTA-CCAAACAAATTCAAATAGTAT-AGACTATTTGAACAA-TTA-TCTA
*
19583036 TTTCAAATCA
693 TTTCAAATCG
* * * * * * *
19583046 ATATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAA
1 TTATGAC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAG-TTTTTTAAAATAAAA
* * **
19583110 TAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATAGATTTAAAAATAAA-ATGTTTATTG
63 TAATA-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAG---AGATTTAAAAATAAATATGTTTACCG
* * ** * *
19583174 AACAAGTTTCGATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTCAAATTGTTATGAGCTTTTAT
124 AACTAG-TTCAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTT-AAATCATTATGACCTTTTGT
** * * * *** * *
19583239 TTCATCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTAATTTAAAAT-AAATAATACTAA-TTATT
187 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATGCTAATTTATT
* * * ** * *
19583302 AATATTTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCCA
252 AATA-TTCTAAAAATTAATAAG-AA-AGATTT--AAAAA-AAATCTA-TT-CTTAACAA-TGCAA
* * * * * * * * * *
19583367 ATTGTTATGGCTGTATAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGATATTT-TTTTATCATAAAAT
308 ATAGTTAT-TCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTATTTTGTCATAAAAC
* * *
19583431 AATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAA
372 AATTTTTTTTG-TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* ** * * * * *
19583494 AATTAATAAGTA-AAATTTTTAAAAATAAAATATGTTTTCTAAATACATTCAAATAGTTATGATT
434 AATTAATAAGTAGAAA-TTTAAAAAAT-AAATATGTTAGCGAACTA-GTTCAAATAGTTATAACT
* * * * * * *
19583558 ATCT-GAATAA-TATTTTATTTTAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTC
496 AT-TAGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTATTTA
* * * *
19583621 TATTCATACAAG-TGTATTCAAAAT-AAGTAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
558 TATTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG
* * * * *
19583684 -TAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAATTCAAATAGT-TATG-CTTGTTTGAACA
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* *
19583746 ATTATTTATTTCAAATAG
685 ATTATCTATTTCAAATCG
* * * * *
19583764 TTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAAAT
1 TTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAGTTT-TTTAAAATAAAAT
* * *
19583829 -A-ATAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG
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* * * *
19583892 AA-TAAGTTCAAATAGTCATATCTATATGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGT
124 AACT-AGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
19583956 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATAG-TAATTTAT
187 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAAT-GCTAATTTAT
* * * *
19584020 TAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGATTTAAATACTAAATCTATT-TATCAA-AATAGTTTAAA
251 TAATATTCTAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAA-A-AAAATCTATTCT-T-AACAAT-G--CAAA
** * *
19584081 TAGTTATTACTATTTGAATGATTATCTATCTCAAATCGTTATGATGTTTATTTTGTCATAAAACA
309 TAGTTATT-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTATTTTGTCATAAAACA
* *
19584146 ATTGTTTCTTT-TCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA
373 ATT-TTT-TTTGTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *
19584209 ATTAATAAG-AG--CTTTGAAAAATAAATATGTTTGTTGAACTAGTTTAAATAGTTA-AGACTAT
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* * * * * *
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* ** *
19584333 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTGTAATTTATTAATATTCAAAAAAATTAATGAGC-
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* * * *
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* * * * * **
19584479 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAA
1 TTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCAT-ACAAGTTTTTTAAAATAAAA
* ** * * * *
19584543 TAATACTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAACTAAAGT-TGTTTTT
63 TAATA-TAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAAATAAA-TATG-TTTA
** * * * * * *
19584607 TTGAACTAGTTCAAATAGTTATGAA-TATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA--TAT
121 CCGAACTAGTTC-AATAGTCAT-AACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCT-T
* * * ** * ** * *
19584669 TTGTTTTCTCATAAAACAATCTTTTTTTA-TCATACAAGCTTATAT-GGACAAAATAATACTAAT
183 TTGTTTTGTCATAAAACAAT-TATTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATGCTAAT
* * * * * * *
19584732 TTAATAATATT-TCAAAAATTAGT--GAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTGCTGAACCAGTTC
247 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGAAAGATTT-AAAAA-AAATCTA-TT-CTTAA-CAATGC
* * * * * *
19584794 AAATAATTA-TCTATTT---CAA--A--TAATTCTAA-CCTT-T--TATTTA----GTCCTATAA
306 AAATAGTTATTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTATTTTGTCATAAAA
* * * * * * * *
19584843 TAATTTTTTTAGTTTATACACGCTTATTCGGAATAAAATAATGCTAATTTATTAACATTCCAAAA
371 CAATTTTTTTTG-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
19584908 ATTAATAAGCAAGACATTCGAAAAGATAAATGTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAAAAGTTATGACT
435 ATTAATAAG-TAGAAATT-TAAAAAATAAATATG-TTAGCGAACT-AGTTCAAATAGTTATAACT
* * * * *
19584972 ATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTT-TAG
496 ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTATTTATA-
* * * * * * *
19585036 TTCATAAAAGCTTATCCAAAAGAAAATAATACTACTTTATTATTATTTC-GAAAGTTAATAA-CT
560 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCT
* * *
19585099 AAGAGATTCAAAAATAAAT
624 AAAAGATTTAAAAAAAAAT
19585118 CAGTTGACTA
Statistics
Matches: 2192, Mismatches: 447, Indels: 319
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Matches are distributed among these distances:
697 2 0.00
698 3 0.00
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TATAATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGT
TCAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTA
AAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAAAATCTATTCTTAACAATGCAAATAGTTATTCTATTTGAA
CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTCATACAA
GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAA
AAATAAATATGTTAGCGAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT
CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
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Indices: 19579971--19596456 Score: 3392
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* * * * * * * *
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** ** * * ** ** * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * ** * * *
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* *** * * * *** *
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* * * * *
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* **
19580478 AAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAG-TTC
508 --AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * ** * * ** * **
19580509 AAATAGTTATTACAATTTGAACAACTGCCTATTT-AGAAGCTTTAAAACCTTTTGA-CTTGCCAT
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* * *
19580572 AAAACAATT-TTTCAGTTAATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-T
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* * * * * * **
19580633 T-AAGATAATTAATTAGTCAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATCGT
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* * * * * * * *
19580696 TATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTATTATGACTTTTTCTTTTATCATAAAATAATT
189 TATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAA-ATACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * *** ** *
19580761 GTTTCT-GT--T---AA--T-TT-AGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAA
253 GTTTCTATTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAA
* * * * **
19580816 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACA-A-GTTCAAATAGCCATGACTATTTG
317 TAA-TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATC-AAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
19580879 AATAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACATTTTCTTTTGTAATAAAATAATT-TTTTTAGTTC
378 AATAATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT--TTC
** ** * * * *
19580942 ATATGAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTGAGTAAGAA
441 ATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG--
* ** * ** *
19581007 AATTGAAAAAGGAATCTGTTTATCAAATAAG-TTC
504 -ATTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * * * * *
19581041 AAATAGTTATGACTATCTAAACAATTACCTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTGTTTTATCTTAA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* ** ** *
19581106 AACAATTGGTTT-TGTTCATGTAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
65 AACAATT-ATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * * ** * * * * ** ** *
19581168 -TAGAAATTAATCAGTTA-ATATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTTAACTTGTTTAAA-AATTTA
127 CAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAA-TTA
* * * * * **
19581230 TGACTTTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGT
191 TGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* ** * *
19581295 TTCTATTCATACAAGCTTATTCATAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCA-AAAGTTAAT
255 TTCTATTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAAT
* * * * * * * *
19581359 AAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAGACA-A-GTTAAATAGTTATAACTATTTGA
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* * * *
19581421 ATAATTA-TTTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTC
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* ** ** * *
19581484 ATACAAGTTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATAAT-AAAATTAATGAGTTGGA
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* * * ** *
19581547 GACTTAAAAAATTAATCTGTTTACCGAATAAG-TTC
503 GA-TTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * *
19581582 AAATA-TTAT--CTATTT-----ATT-TCAACTT---A---TTATGACTTTTTGTTTTATCATAA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * * * * * * * ** *
19581632 AATAATTGTTT-ATGTTCATTCAAACTTATTTAGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATATTT-T
65 AACAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * * ** * * * *
19581695 GACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAATAAATATGCTTACCGATCAAATTCAAATAGTTATG
129 AAAAATTAATGAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATG
* * * * * * * *
19581760 ACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACATTTGTTT
193 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * ** ** * * *
19581825 CAATTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACCTTATTAATATTTTA-AAAATTGAGA
257 CTATTCATACAAA-CTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAATA
*** * * * ** * * *
19581888 AGTTGGA-GTTTAAAAAATA-AATCAATTTAT-TGAAT-CAGTTCAAATAGTTGTGGCCATTTGA
319 A-TAAAATATTTAAAAAATACTAT--GTTTATCAAAATACA-TTC-AATAGTTATGACTATTTGA
* * *** *
19581949 ACAATTA-TCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTCGTC
379 ATAATTATTTTATTTCAAATCAATATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTT--TC
* * * * *
19582011 ATATAAGCCTATTCAGAA-TGAAATAATAGTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAGG
441 ATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA--
* * * ** *
19582074 AAATTTAAAAAATAAATTTGTTAAGCGAACTAG-TTC
502 AGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * * * * *
19582110 AAATAGTTATAACTATTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACATTTTCTTTTGTTATAT
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* * *
19582175 AACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TT-A
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* * * * ** * * *
19582237 TGAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTAAA
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* * * * * * *
19582301 GGCTGTCTGAATAATTATCTATTTCGAAT-CGTTATGACC--TTGTTTTGTCATAAAACAAATGT
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* * ** * ** * **
19582363 TTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AT-
255 TTCTATTCATACAAACTT-ATTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
19582426 -TAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACCAAACTA-GTTCAATTAGTTATAACAATTTGAATA
319 ATAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATCAAAATACATTCAA-TAGTTATGACTATTTGAATA
* * ** * * * *
19582489 ATTA-TTTATTTTAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATTAAACAATTATTTCTATTGATACA
382 ATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACA
** ** * *
19582553 ATTTTATTTGGAA-TAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTT
446 AGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAGATTT
* ** * *
19582617 AAAAA-AGAATCTGTTGGCTTGACCAA--TGC
508 AAAAATA-AATATGTT-TATTGAACAAGTTTC
* * * **
19582646 AAATAGTTATATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTATTTTGTCACCA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * ** ** *
19582711 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTTC-A
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *** * * *
19582775 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAACAATTACGAT
130 AAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGAC
* * * *
19582840 TATTTGAACAATTACCTATTTCAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAGAATAATT-TTTCT
195 TATATGAACAATTATCTATTTCAAATA-CTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* *
19582904 ATTCATACAACCTTAATTC-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGATAATTAATAATAA
259 ATTCATACAAACTT-ATTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATAATAA
* ** * *
19582968 AATATTTAAAAAATACTATGTTTACCCGAATA-ATTCAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTTAT
323 AATATTTAAAAAATACTATGTTTATCAAAATACATTCAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TTAT
*
19583032 TTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTGTTCATACAAGCT
387 TTTATTTCAAATCAATATGAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATACAAGCT
* * * *
19583096 TATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATAGATTTAAAAAT
450 TATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA-AGATTTAAAAAT
19583161 AAA-ATGTTTATTGAACAAGTTTC
514 AAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * *
19583184 GATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTCAAATTGTTATGAGCTTTTATTTCATCATAA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * * * *
19583249 AACAATTATATCAATTCATATAGGCTAATTTAAAAT-AAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAA
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* ** *
19583312 AAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCCAATTGTTATGG
130 AAAATTAATGAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * *
19583377 CTGTATAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGA--TATTT-TTTTATCATAAAATAATTATTT
194 CTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
19583439 TTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAA
257 CTATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-CAGAAAATTAATAA
* * * * * *
19583503 GTAAAATTTTTAAAAATAAAATATGTTT-TCTAAATACATTCAAATAGTTATGATTATCTGAATA
320 -TAAAATATTTAAAAA-ATACTATGTTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * *
19583567 A-TATTTTATTTTAAAT-AATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAC
382 ATTATTTTATTTCAAATCAA-TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATAC
* * * * *
19583630 AAG-TGTATTCAAAAT-AAGTAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
445 AAGCT-TATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAGATT
* * ** * *
19583693 TAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAA-ATTC
507 TAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * *
19583723 AAATAGTTAT-GCTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTATCATA
1 -AATAGTTATAAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATA
* * * * *
19583787 AAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAAAT-A-A-TAATTTATTAATATTT-T
64 AAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * * * *
19583848 TAAAATTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCAT-
129 AAAAATTAATGA-GCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATG
*
19583911 ATCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
193 A-CTATATGAACAATTATCTATTTCAAATAC--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * ** **
19583975 TTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
255 TTCTATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATA
* * * ** * *
19584040 A-GAGAT-TTAAATACTAAAT-CTA--TTTATCAAAATAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAAT
319 ATAAAATATTTAA-A--AAATACTATGTTTATCAAAATACATTCAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * ** * *
19584100 GATTA-TCTATCTCAAATCGTTATGA-TGTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATAC
381 AATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATAC
* * *
19584163 AAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG--AGCTTTGA
445 AAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTT-A
* * *
19584226 AAAATAAATATGTTTGTTGAACTAGTTTA
509 AAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * *
19584255 AATAGTTA-AGACTATTAT-AACAATTATCTATTTGAAATCATTCTTACCTTTTA-TTTATTCAT
1 AATAGTTATA-ACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTA-TCAT
* * **
19584317 AAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTGTAATTTATTAATA-TTC
63 AAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*
19584381 AAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAGTATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATATAT
128 -AAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAA--ATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATA-AT
* * *
19584446 T-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGT-CGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
189 TATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TAC--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * *
19584508 TTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTAAAAAAT
251 TTGTTTCTA-TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAAT
* * * * ** * * *
19584572 TAATAAACAAAAGATTTAAAACTAA-AGT-TGTTTTTTTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGAATA
314 TAAT-AATAAAATATTTAAAA--AATACTATG-TTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTA
* * ** * * * *
19584634 TTTGAACAAATA-TCAATCTCAAATCATTATGA-TATTTGTTTTCTCATAAAACAATCT-TTTTT
374 TTTGAATAATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTT
** * * * *
19584696 TATCATACAAGCTTATAT-GGA-CAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAGTGAG
438 T-TCATACAAGCTTAT-TCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* ** *
19584758 --AGATTTAAAAAATAAATATATTTGCTGAACCAG-TTC
500 TAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * *
19584794 AAATAATTAT--CTATTT---C-A--A---A--T-AATTC--TA--ACCTTTTA-TTTAGTCCTA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTA-TCATA
* * * * * * * ** * * *
19584840 TAATAATTTTTTTAGTTTATACACGCTTATTCGGAATAAAATAATGCTAATTTATTAACA-TTCC
64 AAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * * * *
19584904 AAAAATTAATAAGCAAGACATTCGAAAAGATAAATGTGTTTATCGAATAAGTTCAAA-AAGTTAT
129 AAAAATTAATGAGCAAGAGATT-TAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAA-TTAT
* * * * *
19584968 GACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTT
192 GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * *
19585032 T-TAGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAAGAAAATAATACTACTTTATTATTATTTC-GAAAGTTAA
256 TCTA-TTCATACAAA-CTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAA
* * * * * * * * * *
19585094 TAACTAAGAGA-TTCAAAAATA-AATCAGTTGA-CTAGATA-AGTTCAAATAATTATGGCCATTT
317 TAA-TAAAATATTTAAAAAATACTAT--GTTTATCAAAATACA-TTC-AATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * **
19585155 AAACAACTA-CTTATTTCAAATTATTATTACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAAAA
377 GAATAATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT--TT
* * * * * *
19585218 AATA-AATCTTTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATT-TCA
440 CATACAAGCTTATT--C-AA--A-TT-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTCTAA
* * * * *** * *
19585280 TATTGTTATAACATTTTATTCTATAATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
489 AAAT-TAATAA-GTAAGATT-TA-AA-AATA-AATATG-TT-TATTGA-ACAAG--T-TTC
** ** ** * * *** *
19585340 GAAATA-AAATAAACTAATTT-AGTAA-TAT-TA-TGAAAAT--TAAT-AACTAAGAAATTTA--
1 --AATAGTTAT-AACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTATTTTATC
* * * * ** *
19585395 A-AAAATAAATATTT---TGC-T-GAA-CCAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAAC-AA-TTAT
61 ATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAA-A--TAA-AATA-AT--ACTAATTTAT
** *** * **** * * *
19585451 T--TAACTCAAATTGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGCTTGTA-GAAA
119 TAATATTTCAAAAAATTAATGAGCAAGAG-ATT-T-AAAAAATAA--A-TTTA--TT-TACCAAA
** * ** * ** * * * *** * * * **
19585512 TTTATTTGGAATAAAGTAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTT-ATAAAAGATTTAGAAAA
175 -CAAGTTCAAAT-AATTATGACT-A--TATGAACAATT-ATCTATTTCA-AATA-CTAT-G-ACC
* * * * * ** * * ** *
19585576 TAATTCTATTTACAGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAAC-AA-TTA-TCTATTTCAAA
230 T--TT-TGTTT--TG--TCA--TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAA
* ** ** * * * * * * **** * * * * *
19585638 TCATTATTACCTT-TTATTTTGTAATAAAA-CAAT-CTTTTTTTTGTTAATATA-AGTTTGTTCA
285 T-AATACAAATTTATTAATAT-TCAGAAAATTAATAATAAAATAT-TTAAAAAATACTATGTT--
* * * * * * ** * **
19585699 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGC
345 -TAT-CAA-AATAC--A--T-TCAATAGTTAT--GACTA-TTTGAATAATTAT-TTTATTT---C
* * * * *
19585764 ATTTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTGTGTTATAAAACAATAGTTTCTGTTCATACA
395 A---A---A--TC-AA-TAT---GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACA
*** * * * *
19585829 AGCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAACTAAAAAATTT
446 AGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT--AAGATTT
** * *
19585893 AAAACA-AAATAT-TCTTACCGAACTAG-ATC
508 AAAA-ATAAATATGT-TTATTGAACAAGTTTC
* * * * * *
19585922 AAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * ** * * * *
19585987 AAAAATCATTTCGGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATCAATA-TT-AT
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-
* * ** * * * * *
19586050 GAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAACGAACAAGTTTAAATAATTATGA
129 AAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * *
19586115 CTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAAT-CGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATGATTTTTT
194 CTATATGAACAATTATCTATTTCAAATAC--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-A-ATTGT
* ** * *
19586179 TTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATA
255 TTCTATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATA
* * * **** * * * ** *
19586244 AGTAAAAGATCTAATAAAT-CTA-CCCGA-CCAAGTTCA---AATCTTTATGACTATTTGAACAA
319 A-TAAAATATTTAAAAAATACTATGTTTATCAAAATACATTCAATAGTTATGACTATTTGAATAA
*** * *
19586303 TTA-TTTATTTCAAATTGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACA
383 TTATTTTATTTCAAATCAATATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACA
*** * ** *
19586366 AGCTTATTTGGATTAAAA-AATATTAATTTATTAATATT-TCAACTAGTAATAAGTTAAAGATTT
446 AGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-T-AAGATTT
* *
19586429 AAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTTA
508 -AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * * * * * * *
19586460 AATGGTCATGAGTATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAAAAA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * * * ** *
19586524 AATAATTATTTCAGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTA
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * *
19586588 AAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCAATCATGTTCAAATAGTTATGAC
130 AAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGAC
* * *
19586653 TATCTGAACAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTC
195 TATATGAACAATTATCTATTTCAAATAC--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * ** * *
19586717 TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAATTTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAG
258 TATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTC-AGAAAATTAATAA-
* * ** * * * * *
19586781 TAAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTT-TCTGAACACACTCAAATAGTTATGGCTATTTAAACAA
320 TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** * * * ** ** *
19586844 TTA-TCTATTTCAAAT-TGTGACGACCTTTAGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCATTCATAAAA
383 TTATTTTATTTCAAATCAAT-ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTCATACAA
* *
19586907 GCTTACTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
447 GCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT--AAGATTT
* * *
19586970 AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACGAG-TTC
508 -AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * ** * * * * *
19587000 GAATAGTTATGACCATTCAAACAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATC-TTTAGTTTTGTCATA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTA-TTTTATCATA
* * * ** *
19587064 AAA-ATTTTTTTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
64 AAACA-ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *** * ** * * *
19587127 -TAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATG
128 AAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATG
* * ** * *
19587191 TCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAAT-CTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTT
193 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATAC--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* ** *
19587255 TCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-
256 TCTATTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAATA
* * * * * * ** * * *
19587318 A-AGAA-ATTTAAGAATTAAATCTGTTTATCGAACCA-ATTCAAATACTTATGGCTATTTGAACA
319 ATAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * * * *
19587380 ATTA-TCTATCTCAAATTATTATGA-TATTTGTTTTGTAATAAAACAAATGCTTCTGTTCATACA
382 ATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTTTCATACA
** * * * * * * *
19587443 AATTTATT-ATAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG--AGCTTTGA
446 AGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTT-A
* * **
19587505 AAAATAAATGTGTTAATTGAACCAA-TTAA
509 AAAATAAATATGTTTATTGAA-CAAGTTTC
* * * * *
19587534 AATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTTACCTTTTA-TTTATTCATA
1 AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTA-TCATA
* * **
19587597 AAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTGTAATTTATTAATA-TTCA
64 AAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
19587661 AAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAAATT-
129 AAAAATTAATGAGCAAGAGATTT-AA-AAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAAT-AATTA
* ** * *
19587725 TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
191 TGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA--TACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * *
19587789 TTTC-ATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTA
254 TTTCTA-TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTA
* * * * * * * * *
19587852 ATAAGCAAGAGATTTAAAACTAA-AGT-TATTT-TCTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGAGTATT
316 ATAA-TAAAATATTTAAAA--AATACTATGTTTATC-AAAATACATTC-AATAGTTATGACTATT
* * * ** * **
19587913 TGAACAA--ATATCATTCTCAAATCTTTATGA-TTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGA
376 TGAATAATTATTTTATT-TCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTT
** * * * * *
19587975 TCATACAAGCTTATTTGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAGT--GAAAG
439 TCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
* * *** *
19588038 ATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCGAACTAG-TTC
504 ATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* ** * * * * * *
19588072 AAATAGTTA-AGACCATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TT
1 -AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATT-TTATCAT
* * * * * * * **
19588135 AGAA-AATTA-ATC-AGT-A-A-GAG---ATTTAAAA-AGTAA-AAT--T-GTTTACCAA-ACCC
63 AAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATA---
* * * * * * * * *
19588185 TTTCAAATAGTT-TTGA-C----TATTTGAATAAT-TATCTA-TT-CCAATTC-A-TTCTAACCT
124 TTTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAA-ACAAGTTC-AA---
* * * * * * *** **** ** *
19588239 TTTATTTTGTC-ATCA--AACAATTGGTTCTA-TTC--ATACTATTAGTCAAAATAAAATAATAA
184 ATAATTATGACTAT-ATGAACAATT--ATCTATTTCAAATACTA-T-GAC-CTTTTGTTTTGTCA
* ** *
19588298 TAATTTAATAATAT-TTTGAC-ACTTAATAACCAAGA-AAATT--AA-AAAATAA-ATCAAATTG
243 TAA---AATAAT-TGTTT--CTA-TTCAT-A-CAA-ACTTATTCAAATAAAATAATA-CAAATTT
* * * * ** * *
19588356 CTAAACCATTTCAAATAGTAAGATTATATGAATGATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
297 ATTAA-TA-TTC----AG-AAAATTA-AT-AAT-A--AAATATTT-AAA--A-AAT-A-C-TATG
* * * * ** ** *
19588421 TTTTATCATAA-A-A--CAATTGTT-T---T-TTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT-AAT
343 -TTTATCAAAATACATTCAATAGTTATGACTATT-TGA-ATAA--TTATTTTATTTCAAATCAAT
* ** * * *** * * *
19588476 ACTAACTTATTAATATT-TCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAT-ATAAATATGTTTA-C
403 A-TGACTT-TTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT---T----G-TTT-TTTTCATACA-A-GCTTATT
* ** * * * ** **
19588537 CGAATTAGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAGCAAT-TATCATTCCAAATCGTTAAGATCTTTG
454 C-AA--A-TTAAAATAA-TACT-A--ATTT-ATTAATAT-TC--T-AAAAA--TTAATAAGTAAG
* * * *
19588600 TTCTGTCATAAAA-CAAT-TGTTT-TTGATCATAAAGCTT-
504 AT-T-T-A-AAAATAAATATGTTTATTGA--A-CAAGTTTC
* * * * * ** ** *** *
19588637 ATTTAGTTAAAAATA-AT--ACTAATTTAATAATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTAAGAGATTTA
1 A-ATAGTTATAACTATTTGAAC-AA-TT-AT-CTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTA-TTTTA
* * * * *
19588697 --A-AAAATAAATGTGTTTGTCGAA-CCAGTTCAA--ATAGTT-AAAACTATTAGAATAATTA-T
59 TCATAAAA-CAAT-T-ATT-TC-AATTCA-TACAAGCTTA-TTCAAAA-TA--A-AATAA-TACT
**** * * * * * * **
19588754 ATATTT-TTAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAGTTAG-AAAATATTTGTTTCATATCTCACAATC
112 A-ATTTATTAAT-ATTTC-AA----AAAATTAATGAGCAAGAGA----TTTAAAAAAT-A-AAT-
* * * * * * **
19588816 TTA-TT-CGAAATAAAATAATCTAAAT--TTATTAAC-ATTTGAAAAATTAATAAAAAAAAGTTT
163 TTATTTACCAAA-CAAGT--TC-AAATAATTA-TGACTATATGAACAATT-AT-----CTA-TTT
* * * * * * * * *
19588876 AAAAAAGTA--A--ATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATT--TGA-ATAA-TT
216 CAAATACTATGACCTTTTGTTT-T-G-TC-A--TAAAATAATTGTTTCTATTCAT-ACA-AACTT
* ** *** * * * *
19588933 ATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGATA-T-AAAACAATTATTTTAGTTTATAAAAG
273 ATTCAAATAAAAT-A--AT-ACAAATT-TATTAATATTCAGAA-AATTA----A--TAATAAAA-
* * ** * * * *
19588996 CTTATCCAAAATAAAAGAATACTA--ATT-TCTTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGCAATAGTTT
325 --TAT-----TTAAAA-AATACTATGTTTATCAAAATACATTCAATAGTT-AT--G-ACTA--TT
* * *** * **
19589057 TAAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGCTTATTTGAACAATTGTCTATTT
376 T---GAAT-AATTATTTTA--TTTCAAA-TC-AATA-TGA--CTT-TTTG---TTTTGTC-A--T
*
19589122 AAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAA
423 AAAA-C---A--A---TT-G-TTT-T--T----------------TTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
19589187 ATAAAATAATACTAATTTACTAATATT-TCAAAAATTAATAAATAAGCGATTTAAAAAGTAAATC
458 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA--GATTTAAAAA-TAAATA
* *
19589251 GGTTTA-CGAA-ATCAG-TTC
519 TGTTTATTGAACA--AGTTTC
* * ** * * * * * ** * *
19589269 AAATAATTGTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTGGTTATAT
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* ** * ** * *
19589334 AACAATTGTTTTTTATT-ATACAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGAAATTTATTAATCTCTC
65 AACAATT-ATTTCAATTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
19589398 --AAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACTAGTTTAAAT-AGT-T
128 AAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * * *
19589455 GACTACT-TGAATAAATGTATACTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTAT
192 GACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATA-CTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * **
19589519 TTCTATTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCA-AAAATTAAT
255 TTCTATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-CAGAAAATTAAT
* * * * * * * * * * *
19589583 AACTGAGAGATTTAGAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACTA-GTTCAAATAGTTAAGACTATATGA
318 AA-TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATC-AAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGA
*** * *
19589646 ACCTTTA-TCTATTTCAAATC------A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCA
379 ATAATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--TTTCA
* ** * * * *
19589702 CACTAA-CTTATTTGGAA-TAAAATAA-AATGAATTTATTCATA--CTAAAAAATTAATATGCAA
442 TAC-AAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TA
* * * * * *
19589762 GAGATTTAAAAAGTAATTCTATTTACCT-AACCAGTTTA
502 -AGATTTAAAAA-TAAATATGTTTA-TTGAACAAGTTTC
* * * * * * *
19589800 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATAGCTATGACCTTTTGTTCTATCATAAA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAA
* * *** ** * ** * * *
19589865 ACAAATGTTTTTGTTCATGTAAGTTTGCTCGAAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTC-AA
66 ACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
19589929 AAATTAAT----AAGGGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGATT
131 AAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACT
* * * ** * * * * * * * *
19589990 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTG
196 ATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* ** * * *
19590055 TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTA
260 TTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAATAA-TA
* * * * * * *
19590119 AAAAATTTCAAAAAATAAATATGCTTA-CTGAACTAGA-TCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAA
322 AAATATTT-AAAAAAT-ACTATGTTTATC-AAAATACATTCAA-TAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** * * * ** ** *
19590182 TTA-TCTATTTCAAATCGTTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATCATTTCGGTTCATATAA
383 TTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAA
* ** *
19590246 GCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAAGCTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTA
447 GCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-AGATTT-
* * * * * * *
19590310 AAAAATGAATCTATTTA-AGAAAAAATTTAA
508 AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTT-C
* * * * * * * *
19590340 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAA
* * * * * * *
19590405 ATGATTTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-A
66 A-CAATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * * *
19590467 AGACAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATCATTATG
129 A-AAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATG
* * ** * ** * * * *
19590531 ATTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTTATAAGACAATAGTTT
193 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *** * *
19590595 TTGTTCATATAAGCTTATTTGGATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAA
257 CTATTCATACAAACTTATTCAAAT-AAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAATAA
* * * * * * * *
19590659 GTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGACTA
320 -TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAATA
* *** * * * * **
19590722 ATTA-TCTATTTCAAATGGTTATGACATTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACA
382 ATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACA
* * * *
19590786 AGCTTACTTGAAA-TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAGAGATTA
446 AGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-AGATT-
* * * * ** *
19590850 AAAAAATGAATCTGTTTGTCAAACAAGTTTA
507 TAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * ** * * *
19590881 AATAATTTTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AATAGTTATAACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
** * ** *** *
19590945 AATGATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AA
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
** * * * * * ** **
19591008 GCCAATTAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACAA-TATCAAATCTTTATG
130 -AAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGT-TCAAATAATTATG
* * * ** *
19591072 ACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT
193 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
*** * * ** ** *
19591136 CTA-TCATACATGTTTATTTCGATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAA
257 CTATTCATACAAACTTA-TTCAAATAA-AATAATACAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATAA
* * * * * * * * *
19591199 GTAGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACA-A-GTTCAACTAGTCATAATTATTTGAAT
320 -TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATG-TTTATCAAAATACATTCAA-TAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * *
19591262 AATTA-TCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATAT
381 AATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTTCATAC
* * * * * *
19591326 AAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAAT
445 AAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TA-AGATT
* * *
19591390 TAAAAA-AGGAATCT-TGTTACCT-AACATG-TTC
507 TAAAAATA--AATATGT-TTA-TTGAACAAGTTTC
* * ** * * * * *
19591421 AAATAGTTATGACTATCTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * * * ** *
19591486 AACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTA
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
19591550 GAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTT-GTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGA
130 AAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * * *
19591614 CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAATATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAACATTTGGTTC
194 CTATATGAACAATTATCTA-TTTCAAATACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * *
19591679 TATTCATGCAAGCATATTTCTAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
258 TATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAATAA-
* * * * ** * *
19591743 TAAAA-ATTT-AAAAATAAATATATTT-TCTAAACATTTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAG
320 TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *** * * *
19591805 TTA-TCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAA
383 TTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATACAA
* * * * *
19591869 GCTTATTTGAAA-TGAAATAATACTAACTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
447 GCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAGATTT-
* * * *
19591933 AAAAATAAATTTGTTTGTCGAGCAAG-TTC
508 AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * *
19591962 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
1 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * * * *
19592027 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TA
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * *
19592091 AAAATTAATAAGTTGAA-A-ATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGCTT-AAATAGTCAT
130 AAAATTAATGAG--CAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAG-TTCAAATAATTAT
* * * ** * ** * **
19592153 GTCCATTTGAACTGTTATCTATATCAAATTGTTATTATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
192 GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* *
19592218 TCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCA-AAAA-T--TA
256 TCTATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAATA
* * * * ** ** * * * *
19592279 ATAAAAGATTTAAAAACTA-AATCTTTCTATTGAACCA-ATTCAAATAATTATGATTTTTTGAAC
319 ATAAAATATTTAAAAAATACTAT-GTT-TATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * *
19592342 AATTA-TCTATCTCAAATCGTTATGA-TATTT-TTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATAC
381 AATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATAC
*** * * * *
19592404 AAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATATTC-------TAATAA--AAGATTTA
445 AAGCTTATTCAAATTAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTT-
* ****
19592459 AAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA--TTC
508 AAAAATAAATATGTTTATTGAAC-AAGTTTC
* ** * * **
19592488 AAATAGATA-AGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGCTTT-TCATA
1 -AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATA
* * * * * * **
19592551 AAA-TAGTATTTTCAGTTCGTGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTC
64 AAACAATTA-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * *
19592614 AGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
128 AAAAAATTAATGAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * *
19592679 GACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTTTT
192 GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * ** *
19592743 TCAATTTATA-AAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATACTTCA-AAAATTGAT
256 TCTATTCATACAAA-CTTAT-TCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAAT
* * * * * * * * * *
19592806 ATATTAGAGATTTAAAAAATAC-------ATCGAACTA-GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAC
318 A-ATAAAATATTTAAAAAATACTATGTTTATCAAAATACATTC-AATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * *
19592863 AATTA-TATATTTCAAATCATTACAAAC-TTTTGTTTCT-TCATAAAATAATTGTTTTTCATCAT
381 AATTATTTTATTTCAAATCAATA-TGACTTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCAT
* ** * * * * *
19592925 ACAAGCATATTTGGAA-TAAAATAGTATTAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAGGAAAGAG
443 ACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TA-AG
* * * *
19592988 ATTT--AAA-AAATATATCTATT-TAC-----TG
504 ATTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * * * * *
19593013 AATCAG-T-T-CCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCGTAA
1 AAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * * *** * **
19593075 AATAATTATTTCAATTCATATAAGATTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCCC
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * ** ** * * *
19593139 AAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAAGTAGCTT-AAACAGTTAAG
130 AAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAG-TTCAAATAATTATG
* * * * *
19593202 ACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
193 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * *
19593267 C-AGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATA
257 CTA-TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-CAGAAAATTAATA
** * * * * *
19593330 AGTAAGTTATTTAAAAAGTGAATCTATTTATC-AAAT-CAATTCAAATAATTATGA-TCATGTT-
319 A-TAAAATATTTAAAAAAT-ACTATGTTTATCAAAATAC-ATTC-AATAGTTATGACT-AT-TTG
*** * * * * ***
19593391 -ATCAATTA-TTTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCGTATAACAATTGTATTTGAGC
378 AAT-AATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTTTC
* ** * * *
19593454 ATTCAATTTTATTCAGAA-TACAATAATACT-ATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGA
441 ATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-A
* * ** *
19593517 GATTTAAAAATTAAATCTATTTACCGAACTAG-TTC
503 GATTTAAAAA-TAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * ** * * * * * *
19593552 AA-ACATCAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCTTTTGTTTTGTCATA
1 AATA-GT-TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATA
** * ** *
19593616 AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAACATAATAATA-TT-A
64 AAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * *
19593678 TGAAAATTAA-AAGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCCAATATTTA
129 -AAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAATTA
* * * * *
19593741 AGACTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTT
191 TGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TT
* ** * ** * ** * * *
19593806 TTTTGAATTCATA-ATAGCTTACTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATAAATATT-TGAAAAATA
253 GTTTCTATTCATACA-AACTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAG-AAAATT
* * * * * * *
19593869 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTATC-CAAT---TTAAATAATTATGATTA
315 AATAA-TAAAATATTTAAAAAAT-A--CTATGT--TTATCAAAATACATTCAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
19593930 TTTGAACAATTA-TCTATTCCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGCTTTTG
374 TTTGAATAATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTT
* ** * * * *
19593993 TTCATATAAATTTGTTCGGAA-TAAAATAATACTAATCTATTAATATT-TCAAATATTAATAAG-
438 TTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT
* * ** *
19594055 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG-TTC
501 AAGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* * * * * * * * *
19594091 AACTAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTATTATAA
1 AA-TAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * ** * ** *
19594155 AATAATTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTTGGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
65 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
** * * * * * *** * * *
19594219 AGCAATTGATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAATCATGA
129 AAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * *
19594282 TTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTTC
194 CTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-ACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * *
19594347 -AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTAATTCA-AAAATTAATAA
258 TA-TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATTCAGAAAATTAATAA
* * * * ** * * *
19594410 TAAAGAAATTTAAAAAGATGAATCTGTTTA-CTAAAAAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAAT
320 TAAA-ATATTTAAAAA-AT-ACTATGTTTATC-AAAATACATTCAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * * * * *
19594474 AATTA-TCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTTGTCACAAAAGAATT-TTATCTATTCAT
381 AATTATTTTATTTCAAATCAATATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTT-T-TTTTCAT
* * * * *
19594537 ACAATCTTATTTCAAA-TAATATAATTCAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAAAAATGTAAA
443 ACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAA-GT--A
* ***
19594599 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG-TTC
502 AGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTC
* *** * * * * *
19594635 AAATCA-TTATCACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTAT-AGCTTTTTGTTTTATCAT
1 -AAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTATTTTATCAT
* ** * * * * *
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** *
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** * * *
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* * **
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* * *
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* **
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* *
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*
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19588456 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
60 -TT-TT-GTCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATA---C-AAGCTT-AT---T-TG-GA-TTAAA
* * ** * * ** *
19588521 AT-ATAAATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCATTCCAAA
110 ATAAT-ATTA-ATTTA-TTAA-TATTTCAAA-AATTA--A-TA----AGTAA--AAGATT-TAAA
*** * ** **** * * *
19588585 TCGTTAAGATCTTTGTTCTGTCATAAAACAA-TTGTTTTTGATCATAAAGCTTATTTAGTTAAAA
160 -AAATAA-A--TATG-T-T-T-ATCGAACAAGTTCAAATAG-TCAT-GA-C-TATTT-G--AACA
* * * **** ** ** * * ** **
19588649 ATAATACTAATTTAATAAT-ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTT
210 ATTAT-CT-ATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATA-A---AAAAATTATTTCAGTT
** * * * * * ** *
19588712 TGT-CGAA-C-CAGTTCAAATAGTTAAAACTATTA-GAA-TAATTATATATTTTTAATCATT-CT
268 CATAC-AAGCTTA-TTCAAA-A--TAAAA-TAATACTAATTTATTA-ATA-TTATAAAAATTAAT
* ** ** * *** * * * * *
19588771 AACCTTTTGTTTAGTTAGAAAATATTTGTTTCATATCTCACAATCTTA-TTCGAAATAA-AATAA
325 AA--GTAAG-AGATTTA-AAAA-A--TAAATC-TAT-TTACAAAC-AAGTTC-AAATAATTATGA
* * *** * ** * **
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379 -CT--A-TT-TGAACAATT-ATCTATT--T--CAAATCG-TT-ATAACCT---TTTGTTT-T-G-
* * * * * * * **
19588899 ACAAGTTCAAATAGTTATTACTATT--TGA-ATAA-TTA-TTT-ATTTAAAATCATTATGAC-CT
426 TC-A--TAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACA-AACTTATTTTGA-ATAAAAT-A--AT-ACAAA
* * * * * * *
19588957 TTTGTT-TTGATATAAAACAATTATTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTAA
481 TTTATTAAT-ATTTCAAA-AATTA-ATAAG----TAAAAGATT-T---AAAT---A-AAT--T-A
** *
19589021 TTTCTTAA-T
528 -TTCCGAACA
* * * * * * *
19589030 ATTTCAAA-AATTAATAAGCAATAGTTTTAAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAAATTCAAATAG
1 AGTTCAAATAGTT-AT--G-ACTA--TTT---GAA-CAATTA-TTT--------ATTTCAAATTG
* ** * * * *
19589094 TTATGCT-TATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAAGAA
47 TTATGATCT-TTTG---TTTTGTC-A--TAAAA-CAAT-TG---TTTC--TAT-TCATACAAG-C
* ** * ** * * * ** * **
19589158 TTGTTTCAATTCATAAA-AGCTTATTCAAAATA-AAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAA-
96 TTATTTGGATT-A-AAATA--ATATT-AATTTATTAATATTTC-AA-AAATTAATAAGT-AAAAG
* ** * ** * *
19589220 A-TTAATAAATAAGCGAT-TTAAAAAGTAA-ATCGGTTTACGAAATCAGTTCA--AATAATTGTG
153 ATTTAAAAAATAA-ATATGTT-TATCG-AACA--AG-TT-C-AAAT-AG-TCATGACT-ATT-T-
* * * * * * * * *
19589280 GCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTT
205 G--A--ACAA---TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATA-AAAAAAT-TAT
* * ** * * *
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261 TTCAGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT
* * * * * *
19589404 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACTAGTTTAAAT-AGT-TGACTACTTGAA
325 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA--CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
19589466 TAAATGTATACTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCTATTTATAC
388 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* *** * * ** * * * *
19589531 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTGAGAGATTT
453 AAACTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* ** *
19589596 AGAAAATAAATTTGTTTGCTAAACT
518 ---AAATAAA-TT-ATT-CCGAACA
* * ** * *
19589621 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACCTTTATCTATTTC-AA-----ATCAT-TTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
19589679 CATAAAACAATTTTTTCAATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTCATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * * * * * * * * * *
19589743 -CTAAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAGTAATTCTATTTACCTAACCAGTTTAAATAATT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTC
* * * * *
19589807 ATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAAT-AGCTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAAAT
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA-AAAT
* ** * ** * * *
19589871 GT-TTT-TGTTCATGTAAGTTTGCTCGAAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAAT
258 -TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAAT
* * * *
19589933 TAATAAG---G-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGATTATTT
321 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * * * * * * *
19589994 GAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCA
385 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * * *
19590059 TACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAA
450 TACAAACTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* * *
19590124 TTTCAAAAAATAAATATGCTTACTGAACT
515 TTT----AAATAAAT-T-ATT-CCGAACA
* * * * * * **
19590153 AGATCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGGCCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* ** ** * * * * **
19590218 CATAAAAAAATCATTTCGGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGCTATTAATA-
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * * *
19590282 TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-AGAAAAAATTTAAAATAAT
131 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCG-AACAAGTTCAAATAGT
* * *** * * * * *
19590346 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATGATT
194 CATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA-AAAT
* * * * *
19590411 TTTTTCTA-TTCATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTA-AGACAA
258 TATTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATA-AAAA
* * * * * * *
19590473 TTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATCATTATGATTATT
320 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
** * * * * * * * *
19590537 TGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTTATAAGACAATAGTTTTTGTTC
384 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * * *
19590601 ATATAAGCTTA-TTTGGATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAA
449 ATACAAACTTATTTTGAAT-AAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* *
19590665 -ATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACT
513 GATTT---AAATAAAT-T-ATT-CCGAACA
* * * * *
19590694 AGATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTATTTCAAATGGTTATGA-CATTTTCTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTT
* * * * * * * *
19590757 GTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTACTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
19590822 ATTAT-GAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTTGTCAAACAAGTTTAAATAA
129 ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG
** * * * * **
19590886 TTTTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGA
193 TCATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAA
* * *** * **
19590950 TTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTA-AGCCAAT
257 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATA-AAAAT
* * * **
19591014 TAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACAA-TATCAAATCTTTATGACTATT
321 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGT-TCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * *
19591078 TGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TC
384 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
*** * * ** ** * *
19591141 ATACATGTTTATTTCGATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAGAA
449 ATACAAACTTATTTTGAATAA-AATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * **
19591205 TATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACA
513 GATTT---AAAT-AA-AT-TATTCCGAACA
* * * * * * ** * *
19591235 AGTTCAACTAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
19591300 AATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * ** * * * *
19591364 TTCCAAAAATTAATGAG-AAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTACCTAACATGTTCAAATAG
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGT-TTATCGAACAAGTTCAAATAG
* * ** * *
19591427 TTATGACTATCTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
193 TCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAAT
* * * ** * *
19591492 TGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAGAAATTA
258 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTA
* * * * *
19591557 ATGAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-TGTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
323 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTA-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * * * *
19591621 AACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAACATTTGGTTCTATTCA
386 AACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * *
19591685 TGCAAGCATATTTCT-AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-
450 TACAAACTTATTT-TGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
**
19591748 ATTTAAAAATAAATATATTTTCTAAACA
514 ATTT--AAATAAAT-TA--TTCCGAACA
** * * * * *
19591776 TTTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTG
* * * * * * * * * *
19591840 TCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATGAAATAATACTAACTTATTAAAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * *
19591905 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAGCAAGTTCAAATAGTT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTC
* * * * *
19591970 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTA
* * *
19592035 TTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
260 TTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAA
* * * * * * * *
19592099 TAAGTTGAA-A-ATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGCTT-AAATAGTCATGTCCATTT
324 TAAG-T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAG-TTCAAATAATTATGACTATTT
** * * * ** *
19592161 GAACTGTTATCTATATCAAATTGTTATTATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCA
385 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* *** *
19592226 TACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGA
450 TACAAACTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
*
19592287 TTTAAAAACTAAATCT-TTCTATTGAACCA
515 TTT--AAA-TAAAT-TATTC---CGAA-CA
* * * * * * *
19592316 A-TTCAAATAATTATGATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT-ATTT-TTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * *
19592378 CATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAA---ATT-A-A
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAAT-ATTAATTTATTAATA
* * * ** *
19592437 --T--AATATT-CTAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-TTCAAATAGA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAG-
* ** * * * * * * *
19592495 T-AAGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGCTTT-TCAT-AAAATAG
193 TCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAAT
* * * ** *
19592557 TATTTTCAGTTCGTGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTCA-GAAAAT
258 TA-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-ATAAAAAT
** * * * * *
19592621 TAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
321 TAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* *** * * * * *
19592686 TGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTTTTTCAATTT
384 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* ** ** * * * *
19592750 ATA-AAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATACTTCAAAAATTGATATA-TTAG
449 ATACAAA-CTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAA
* *
19592813 AGATTTAAA-AAA-TACAT-CGAACT
512 AGATTTAAATAAATTA-TTCCGAACA
* * * * ** ** *
19592836 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTCT-
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTT-TG
* * * * * *
19592900 TCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCATATTTGGAATAAAATAGTATTAATTTATTAAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * *
19592964 ATTTCAAAAATTAAT-AGGAAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTA-CTG---AA--TC----A
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATA
* * * ** * * * * ** *
19593018 GT--T-CCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCGTAAAATAA
192 GTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAA
* * * *** * ***
19593080 TTATTTCAATTCATATAAGATTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCCAAAATT
257 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATT
* * * * * ** * * * *
19593145 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAAGTAGCTT-AAACAGTTAAGACTATAT
322 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-AAACAAG-TTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * *
19593209 GAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGGTC
385 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * *** * * ***
19593273 ATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTT
449 ATACAAACTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
* * *
19593338 ATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCAAATCA
514 ATTT--AAA-TAAAT-TA-TT-CCGAA-CA
* * * *
19593368 A-TTCAAATAATTATGA-TCATGTT-ATCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-AT-TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTT
* * * * ** ** * * *
19593430 GTCGTATAACAATTGTATT-TGA-GCATTCAATTTTATTCAGAATACAATAATACT-ATTTATTA
64 GTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTA
* * * * * * * * *
19593492 ATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAACA
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATA
** * ** * * * *
19593557 -TCAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
192 GTC-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAA
* * ** * *
19593621 ATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAACATAATAATATTATGAAAAT
256 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAAT
* * * * * *
19593685 TAA-AAGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCCAATATTTAAGACTAT
321 TAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * * **
19593748 ATGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTTTTTTGAA
383 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTA
* * * * ** * * *
19593813 TTCATA-ATAGCTTACTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATAAATATTTGAAAAATAAATAAGTA
446 TTCATACA-AACTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** *
19593877 AGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTATCCA
510 AAAGATTT---AAATAAAT-TA-TT-CCGA-ACA
* * * * * ** *
19593911 A-TTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * * * *
19593974 CATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAATTTGTTCGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATA
66 CATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * *
19594038 TTTCAAATATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAACTAGTT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * * *
19594099 TTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTG
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTA
* * ** * ** *
19594163 TTTCTGTTCATACATGCTTATTTGGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAGCAATTG
260 TTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTA
* * ** * * * * *
19594227 ATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAATCATGATTTTTTGA
323 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * *
19594290 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTTC-AGTTCAT
387 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
* * *** * * * *
19594354 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTAATTCAAAAATTAATAA-TAAAGAAA
451 ACAAACTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGA
* * ** *
19594418 TTTAAAAAGATGAATCTGTTTACTAAAAA
515 TTT---AA-ATAAAT-T-ATT-CCGAACA
* * * * * * * * * *
19594447 AGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTG-TTTTG
* * * ** * * *
19594512 TCACAAAAGAATT-TTATCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAAT-TCAAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTGTT-TCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAT-TAATTTATTAA
* * * *
19594575 TA-TT-AAGACAATTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAA
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* * *** * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * *
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* ** * * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** *
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*
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128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACA-AGTTCAAAT
* * * * ** * **
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* ** * * * * * *
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256 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAA
* * * * * * * *
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* * * ** *
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384 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
** * * * * *
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*
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512 AGATTT---AAATAAAT-T-ATT-CCGAACA
* * * * * ** *
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1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTT
** ** ** * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *** * * ** * *
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258 TATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTATAAAAAT
* * * ** * * *
19595833 TAATGAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGCTTGT-TGAACCAGTT-ATAATAGTTAAGACTAT
321 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACAAACAAGTTCA-AATAATTATGACTAT
* * * * * * ** * *
19595895 TAGAAAAATTTGTCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT--TAGAAA-TTTTTTTTTTA
383 TTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTA
* * * * *
19595957 GTTCATACAAGC-TAATTTGAAATAAAATAATA-TAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAAG
446 -TTCATACAAACTTATTTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * *
19596019 CAAGAA-ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATA
508 TAA-AAGA-TTT---AAATAAAT-T-ATT-CCGAACA
* * * * *
19596055 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TTATTT-AAAATGTTATAAACTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * **** * *
19596118 CATAAAACAATTATTT-TAGTTAATACAA-CTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * *** ** *
19596181 TTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGAATTAGTTCAAATAAT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
19596245 TATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTATTTTGTTATAAAACATT
194 CATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAAT
* * *** * *
19596310 GTTTTTCA--TCATACAAGGTTATTTGGAATAAAATAATA-TTATTTATTAATATT-TCAAAAAC
258 -TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAAT
* * * * ** * * * *
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321 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* *
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Statistics
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* * * ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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**
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* * * *
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* ** * * * ** * * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * **
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
19589516 TATTTCTATTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTA
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* * * * * ** * * *
19589581 ATAACTGAGAGATTTAGAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGA
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** * * ** *
19589646 ACCTTTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCACA
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* *
19589704 CTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAA
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* * * * * * *
19589798 TAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATAGCTATGACCTTTTGTTCTATCATA
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19589863 AAACAAATGTTTT-TGTTCATGTAAG-TT-TGCTCGAAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATT
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** * * * *
19589925 TCAA-AAATTAATAAG----GGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTA
192 T-AAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * ** * * * * *
19589985 TGATTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGT
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* * * * * *
19590115 AGTAAAAAATTTCAAAAAATAAATATGCTTACTGAACTAGATCAAGTAGTCATGACTATTTGAAT
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* * * *
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448 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTCATACA
19590245 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
513 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * * *
19590272 GCTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAAGAAAAAATT
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19590337 TAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTCTTTTGTCAT
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* * *
19590402 AAAATGATTTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTA
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19590467 AGACAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATCA-TTAT
194 AGA-AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTAT
* ** * ** * * *
19590530 GATTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTTATAAGACAATAGTT
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* * *** * *
19590594 TTTGTTCATATAAGCTTATTTGGATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAA
322 TCTGTTCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * *
19590659 GTAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAA
386 GTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AA
* * * **
19590723 TTATCTATTTCAAATGGTTATGACATTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAG
450 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTCATACAAG
*
19590788 CTTACTTGAAATAAAATAATACTAA
515 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
19590813 GTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTTGTC-AAACAAG
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAAACAAG
* * * **
19590877 TTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTC
64 TTCAAATAATTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
19590941 ATAAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
128 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * *** **
19591006 AAGCCAATTAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACAA-TATCAAATCTTTA
193 AAG-AAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGT-TCAAATAGTTA
* * *** * *
19591070 TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT
256 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** * * ** *
19591134 TTCT-ATCATACATGTTTATTTCGATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAAT
321 TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* *** * * * * * * *
19591197 AAGTAGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAACTAGTCATAATTATTTGAAT
384 AAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
19591262 AATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATAT
448 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCT-GTTCATAC
19591326 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
512 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** ** *
19591354 TTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTACCTAACATG
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACGAAACAAG
* * ** * * * *
19591418 TTCAAATAGTTATGACTATCTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAA
64 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
19591483 TAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
129 TAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
19591546 TCTAGAAATTAATGAG-AAAGAGAA-TTAAAAAATAAATCTTG-TTACCAAACATGTTCAAATAG
192 T-AAGAAATTAATAAGTAAA-A-AATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * *
19591608 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAACAT
253 TTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** **
19591672 TTGGTTCTATTCATGCAAGCATATTTCTAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
317 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * ** ** *
19591737 AATAAGTAAAAATTT-AAAAATAAATATATTTTCTAAAC-ATTTTCAAATAGTTATGACTATTTA
381 AATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA-GATCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * ** * *
19591800 AATAGTTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCAT
445 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTCAT
* *
19591865 AAAAGCTTATTTGAAATGAAATAATACTAA
510 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
19591895 CTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCG-AGCAAG
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAAACAAG
* * * * *
19591959 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
64 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
19592024 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
129 TAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA--
** * * * *
19592088 TTAA-AAATTAATAAGTTGAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGCTT-AAATAGTC
191 TTAAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTT
* * ** * ** * ** *
19592151 ATGTCCATTTGAACTGTTATCTATATCAAATTGTTATTATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
255 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* ** *
19592216 TTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
320 TTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * ** * * * *
19592281 -A--AAAGATTTAAAAACTAAATCT-TTCTATTGAACCA-ATTCAAATAATTATGATTTTTTGAA
384 AAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TACCGAACTAGA-TCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* ** * *
19592341 CAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--TATTT-TTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATA
447 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTCATA
* * *
19592403 CAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAA
511 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAA
* * * * * *
19592432 ---ATT-A-A--T-AATATT-CTAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-T
1 TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAAAC-AAGT
* ** * * * *
19592486 TCAAATAGA-TAAGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGCTTT-TCA
65 TCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * **
19592549 TAAAATAGTATTTTC-AGTTCGTGCATGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCAT
129 TAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * *
19592612 TCAGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT
192 TAAG-AAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
19592677 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTT
255 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * * *
19592741 TTTCAATTTATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATACTTCAAAAATTGAT
320 TTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * *
19592806 ATATTAGAGATTTAAAAAAT--ACA----T--CGAACTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAC
384 A-AGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * * * * **
19592863 AATTATATATTTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTCT-TCATAAAATAATTGTTTTTCATCATAC
448 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTCATAC
* * * *
19592927 AAGCATATTTGGAATAAAATAGTATTAA
512 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
19592955 TTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAGGAAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACTGAATC-AG
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAAACAAG
* * * * * * *
19593019 TTC------------CTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCG
64 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
19593072 TAAAATAATTATTTCAATTCATATAAGATTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
129 TAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * * ** *
19593137 CCA-AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAAGTAGCTT-AAACAGTTA
193 -AAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTA
* * * * *
19593200 AGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
256 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
19593265 TTCAGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
321 TTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * *
19593330 AGT-AAGTTATTTAAAAAGTGAATCTATTTATC-AAATCA-ATTCAAATAATTATGA-TCATGTT
385 AGTAAAG--ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGA-TCAAATAGTTATGACT-AT-TT
* * * * * * * * **
19593391 -ATCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCGTATAACAATTGTATT-TGAGC
444 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTAT-TTCTGTTC
* ** * *
19593454 ATTCAATTTTA-TTCAGAATACAATAATACT-A
508 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA
* * * *
19593485 TTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCG-AACTAG
1 TTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAAACAAG
* * ** * * *
19593549 TTCAAA-CATCAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCTTTTGTTTTGTC
64 TTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** *
19593613 ATAAAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAACATAATAATAT
128 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
19593676 TATGAAAATTAA-AAGCTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCCAATAT
192 TAAG-AAATTAATAAG-TAA-AAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
19593738 TTAAGACTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAG
253 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
** * * *
19593803 GTT-TTT-TGAATTCATA-ATAGCTTACTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATAAATATTTGAA
317 -TTGTTTCTG--TTCATACA-AGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA
* * * * ** * * * * *
19593864 AAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTATCCA-ATTTAAATAATTATGAT
376 AAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGA-TCAAATAGTTATGAC
* * **
19593928 TATTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGCTTT-
439 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTATTTC
* ** * * *
19593991 TGTTCATATAAATTTGTTCGGAATAAAATAATACTAA
503 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
19594028 TCTATTAATATTT-CAAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGT
1 TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAAACAAGT
* * * * * * * * * * *
19594089 TCAACTAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTATTAT
65 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
19594153 AAAATAATTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTTGGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
130 AAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * * ** * * * *
19594218 CAGCAATTGATAAGT--AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAATCATG
193 AAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
19594281 ATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTT
258 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
19594346 CAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTAATTCAAAAATTAATAA-
323 CTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** ** * * * * *
19594410 TAAAGAAATTTAAAAAGATGAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAATA
387 TAAAG--ATTTAAAAA-ATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
19594475 ATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTTGTCACAAAAGAATT-TTATCTATTCATAC
449 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAAAAATTATT-TCTGTTCATAC
* * * * *
19594539 AATCTTATTTCAAATAATATAATTCAAA
512 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
19594567 TTTATTAATA-TTAAGACAATTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA
1 TTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAAACAA
* * *** * * * * * *
19594631 GTTCAAATCATTATCACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATAGCTTTTTGTTTTATC
63 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
19594696 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
128 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * ** * * *
19594761 TCGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTCAAATAAGTTCAAATAGTCA
193 AAGA-AATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
19594826 TGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGT
256 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * ** * *
19594891 TTCAGTTCATATAAGTTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATG
321 TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
** * * *** * * * *
19594956 AGTAAGAGAACATAGAAAA-GAATCCATTTACC-AAATAAGTTCAAATACTTATGACTATATGAA
385 AGTAA-AG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGATCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* **
19595019 CAATTATCTATTTTAAA-AATTATGACCTTTTGTTTTG-C-TACAAAATAATTGATTT-TGTTCA
447 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAA-AATT-ATTTCTGTTCA
* ** *
19595080 TGCAAGCTTATTTTTAATAAAATAAT-TTAAA
509 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AA
* *
19595111 TTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-T-A-AG-----AAAAA-AAA--TGTTTTCTG-AACACA
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAAACA-A
* * * * * * **
19595161 -TTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATATGATCTTTTATTTCATC
63 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
19595224 ATAAACTAATTGTTTT-TGCTCATAAAAACTTA-TTCAGAATAGAAATAATACTAATTTATTAAA
128 ATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATA-AAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
19595287 ATTCTAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTAACGAGCGAGTTCAAATAG
190 A-T-TAAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * ** *
19595351 TTATGAATAGTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTTG-TTTGTGATAAAACAAT
253 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
19595415 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATT
318 TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * * * * *
19595479 AATAAATTAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAAC-AAATTCAAATAGTCAT-ATCCATT
381 AAT-AAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGA-TCAAATAGTTATGA-CTATT
* * * * ** * * *
19595542 TGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGGCATTTTGTTTT-TTGTAAAACAATTGTTT-TATTC
443 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTC
** * * *
19595605 ATACAAAATTA-TTCAGAATCAAGTAATACTAA
508 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA
* ** * *
19595637 TTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAGCTAAATCTGTTTACCAAACCAGT
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAAACAAGT
* * * * * * * *
19595698 TTAAATAGTTATGACAATTTCAACAATTACCTA-TTCAAATAG-TATGATC-TTTGTTTTGTCAT
65 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * ** *
19595760 AAAACAAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTGTTTTGAATAAAATATGTGCTAAACTAATAATATT
130 AAAA-TAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * *** *
19595825 CTAA-AAATTAATGAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGCTTGTTGAACCAGTT-ATAATAGTT
192 -TAAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCA-AATAGTT
* * * * * **
19595887 AAGACTATTAGAAAAATTTGTCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT--TAGAAA-TTT
255 ATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAAT
* * * * * *
19595949 TTTTTTTAGTTCATACAAGCTAATTTGAAATAAAATAATA-TAATTTATTGACA-TTCAAAAAAT
318 TGTTTCT-GTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * * * *
19596012 TAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGACTAT
380 TAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGATCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
19596076 TTGAACAATTAT-TATTTAAAAT-GTTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TAGT
442 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCT-GT
* *** * *
19596138 TAATACAA-CTTATCCAAAATAAAATAATATTAC
506 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * ** * **
19596171 TTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCG-AATTAG
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAAACAAG
* * * * *
19596235 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTATTTTGTT
64 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
19596300 ATAAAACATTGTTTTTC-A-TCATACAAGGTTATTTGGAATAAAATAATA-TTATTTATTAATAT
128 ATAAAATAAT-TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * ** * * *
19596362 TTCAA-AAACTAATAAGTAGGAGAA-TTAAAAAATAAATATACTTACCGGACCAGTTTAAATAGT
191 TT-AAGAAATTAATAAGTA-AAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
19596425 TATTACTATTTGAATAATTATATA-TT----TCA--A--A------------TCATAAAATAATT
254 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * * * * *
19596469 ATTTATGTTCACACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTTATCTAATAATATTAT-GAAAATCA
319 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTA
** * * *
19596533 ATAACGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTCGAACTA-ATTCAAATAGTTAAGGCTATAT
382 ATAA-GTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGA-TCAAATAGTTATGACTATTT
* * *
19596596 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAAAAA-TATTTTCTGTTC
444 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTA-TTTCTGTTC
* * * * *
19596660 ATATAAG-TTGGTTTTG-AATAAAATAACATTTTA
508 ATACAAGCTT--ATTTGAAATAAAATAATA-CTAA
* * * ** * * *
19596693 TTTTTTAATATTTTGAAAATTATTAAG--AGATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGT
1 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAAACAAGT
* * * * * * *
19596756 TCAAGGTAGTT-TTACCAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATGTTGTTTTGT
65 TCAA-ATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC-TTTTGTTTTGT
* * * * * * *
19596820 CATAAAACAATTATTTCTATT--GACATAGTCTTATTTAGAATAAAGT-ATGCTAATTTATTGAT
127 CATAAAATAATTTTTTCTATTCATACA-AG-CTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ***
19596882 ATTCTAA-AAATTAATAAATAACGGATTTAAAAAAT
190 A-T-TAAGAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAT
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ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATT
TGAAATAAAATAATACTAA
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19591781 AAATAGTTATGACTATTT-
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1 AAATAGTTATGACTATTTA
*
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * ** *
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*
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TCAAAAATTAATAGATAAGAGATTTAAAAAATACATCGAACT
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*
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* * * * * *
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* * * * * * ** * ** * * *
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129 TTCAAATA-ATAATGATC-ATGTTAACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * *
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* * * * *
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* * * * ** ** * *
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* * * * *
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* * ** * ** * * * *
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129 TTCAAATAATAATGATC-ATGTT-AACAATTATAAACTTCAAAT-TGTAATAACCT
* * * * * ** * **
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TGAGCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAA
** * * * ** *
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* * * * ** * ** * *
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128 -ATTCAAATAATAATGATCATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTGAG--CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
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63 ATTTATTAAT-ATTATAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACCGAAA
* * * * ** * * *
19594445 -AAAGTTTAAATAATTATGA-C-TGTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCT-ATAACCT
125 TCAA-TTCAAATAATAATGATCATG-TT-AACAATTATAAACTTCAAATTG-TAATAACCT
* * * * * *
19594502 TTTGTTTTTGTCACAAAAGAATT-TTATCT-ATTCATACAATCTTATTTCA-AATAATATAATTC
1 TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTATT-T-TGA-GCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATAC
* * * * * *
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* * * *** ** * * * * *
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124 ATCAA-TTCAAATAATAATGATC-ATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * ** * * * *
19594685 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TGAGCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * **
19594750 TTATTAATATT-TCGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTC-AAAT-A
65 TTATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAAATCA
* * * ** * ** * * *
19594812 AGTTCAAATAGTCATGA-CTAT-TTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTT
128 A-TTCAAATAATAATGATC-ATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * * * * * * *
19594867 TTTCTTTTGTAATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATATAAGTTTATT-TGATGTAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGAG--CATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTA
** * ** * * *
19594930 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACATAGAAAA-GAATCCATTTACC-AAAT-
63 ATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATC
* * * * * ** * * *
19594992 AAGTTCAAATACTTATGA-CTATATGAACAATTATCTATTTTAAAAAT-T-ATGACCT
127 AA-TTCAAATAATAATGATC-ATGTTAACAATTAT-AAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * ** * *** *
19595047 TTTGTTTTG-CTACAAAATAATTGATTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTTAATAAAATAAT-TTAA
1 TTTGTTTTGTC-ATAAAACAATT-ATTTTGAGCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-A
** * *
19595110 ATTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-T-A-AG-----AAAAA-AAATGT-TTT-CTG-AA-CA
63 ATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATCA
* * * ** * ** * *
19595159 CATTCAAATAGTTATG-GCTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-ATGATCT
128 -ATTCAAATAATAATGATC-ATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* ** * ** * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATT-ATTTTGAGCATACAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTA
* * * * * *
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63 ATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATC-
* * * ** * ** * * **
19595340 AGTTCAAATAGTTATGA--ATAGTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATAT
127 AATTCAAATAATAATGATCAT-GTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TGA-GCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTA
* * * * * *
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63 ATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATC-
* * * ** * ** * ** *
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127 AATTCAAATAATAATGAT-CATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
** * * ** * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGA-GCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* ** * * *
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65 TTATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATCAA
* * * *** * * *
19595697 TTTAAATAGTTATGA-CAAT-TTCAACAATTACCTA-TTCAAATAGT-ATGATC-
129 TTCAAATAATAATGATC-ATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * * * ** * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTT-TGA-GCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATACT
** * * * * ** *** *
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* * * * * ** * ** ** *
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127 AATTCA-AATA-ATAATGATC-ATGT-TAACAA-TTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
** * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATA-AAACAATTATTTTGAG--CATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACT
* * * * * *
19595990 AATTTATTGACATTCA-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AA
62 AATTTATTAATATT-ATAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAA
* * * * * * * *
19596053 T-AAGTTTAAATAGTTATGA-CTAT-TTGAACAATTAT-TA-TTTAAAATGTTATAAACT
125 TCAA-TTCAAATAATAATGATC-ATGTT-AACAATTATAAACTTCAAATTGTAATAACCT
* * * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGAG--CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * ** * *
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* * ** ** * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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*** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
19593688 AAGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAGTTCCAATATTTAAGA
127 AAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAAAAGTTCAAATA-TTATGA
* * * ** * * * * * *
19593744 CTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTTTTT
1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACAA--TTGTT
** * * * * * * * * *
19593809 TGAATTCATA-ATAGCTTACTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATAAATATT-TGAAAAATAAAT
64 TCTATTCATACA-AGTTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAA-
* * * * * *** *
19593872 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTATCCAA-TTTAAATAATTATGA
127 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAAAAAGTTCAAAT-ATTATGA
* * * * ** * * * *
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* * * * ** * * * **
19593991 -TGTTCATATAAATTTGTTCGGAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATT---TCAAATATTAA
65 CTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAAAA
* * * * ** * *
19594051 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAACTAGTTTTGA
129 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAAAAGTTCAAATA-TTATGA
** * * * * * * * *
19594103 CTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTC
* * * * * * *
19594167 TGTTCATACATGCTTATTTGGAACTAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAG-CAATTGATA
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*** ** * *
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* * * ** * * * * *
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1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
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66 TA-TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-ATT-AAGACAATTAAA
* * * * *
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127 AAGTAAA-AGATTTAAAAA-ATAAATATGTTTACCAAAAAAGTTCAAAT-ATTATGA
* * * * *
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1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTG-TTTTATCACAAAACAATTGTT-
*
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64 TCTATTCATACAAGT-TTATTT-AGAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTAAGACAATTAA
* * *
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126 AAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAAAAGTTCAAAT-ATTATGA
** * * * * * *
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1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTC
* * * ** *
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66 TATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAAAAGT
** * *
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131 AAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAAAAAGTTCAAATA-TTATGA
* ** * * * * * *
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1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTC
* *
19594894 -AGTTCATATAAGTTTATTT-GATGTAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAA
66 TA-TTCATACAAGTTTATTTAGA-ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT--AAGACAATTAA
** * ** * * *** *
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126 AAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAAAAGTTCAAATA-TTATGA
* * * * *** * * *
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1 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATC-ACAAAACAATTG-TT
* * * ** *
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** * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * **
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** * *
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* ** * *
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* * * * *
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* * * ** * * ** *
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* * * ***
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* *
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* ** ** * * *
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CAAATCATAAAATAATTATTTATGTTCAC
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* * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * *** * *
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* * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA--TAT-AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * *
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* * * **
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128 -ATTTAAAATAATAGATAATTATTC-AATAGTCTTAAC-TATTTGAACTGGTTCA
* * * * *
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** * * *
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TAAAATAATAGATAATTATTCAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCA
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* * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *** * *
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63 TTATT-TCAAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACA
* * *
19597258 ATTTAAAATAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGAC
127 ATTT-AAATAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGAC
* * *
19597313 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTATT
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* * * * *
19597378 TTATTCCAAATAAATTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTT-TAACAA
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* * * *
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128 TTTAAATAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGATTCGA-C
* * *
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** *
19597556 TATTTCAAATAAACTTGTATGTTCA-AAATTATTGTTTTATGACAAAACGAAAA-G-TACTAACA
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127 ATTT
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AAATAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGAC
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* ** *
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1 ATTTTATTTC-AATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAA
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65 CA
* * *
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1 ATTTTATTTCAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAAC
*
19597683 G
66 A
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A
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* *
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1 TTATGACAAAATGAAAGATAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATCCATAATTATTT
**
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* * * * *
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* *
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Consensus pattern (85 bp):
TTATGACAAAATGAAAGATAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATCCATAATTATTT
AAACCGATTCAGTAAACTAA
Found at i:19601656 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19600962--19602646 Score: 1211
Period size: 181 Copynumber: 9.4 Consensus size: 180
19600952 AAATAAATAG
* * * * ** * *
19600962 ATAA-TATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TTTTAT
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * *
19601025 TATATTAATAAATTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTA-TTTAT
66 AATATTAATAAATTATATTATTTTATT-CAAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTTAT
* * *
19601088 GACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTT
130 GAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
19601140 ATAACTA-TTAAACTTGTCTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATTT-TTACTTATTAACTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * **
19601202 AATTTTAATAAATTAATATTATTTTATT-ATGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGGTTT
66 AATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTCA--AATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTT
* * *
19601265 ATGAC-AAAC-AAAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
19601316 ATAAATTTTTAAAC-AAGTTAAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATAT-TAACTGATTAATTTCT
1 ATAACTATTTGAACTTA-TT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
19601378 AAAATATTAATAAATTTATATTA-TTTATTCGAAATAAGCTTACATGAAC-AGAACCAATTGTTT
64 AAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTT
* * * * ** * * *
19601441 TAAGATAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTC
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
** * * * *
19601495 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCACTAATTTTTAA
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAA
*
19601560 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGCTCATATGAACTA-AAACAATTATTTTA
66 AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTTA
* * * *
19601624 TTACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
** * * * * * *
19601676 ATGGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATGAATTGTCA
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTA
* * *
19601740 AAATATTAATAAATTA-A-AATTATT-TT--AAT---CTGA-ATTAA-TAGAAACAATTATTTTA
65 AAATATTAATAAATTATATTATT-TTATTCAAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTTA
* * * * **
19601795 TGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * *
19601847 ATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TGACTAATTAATTATCT
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATT-T-T
* * *
19601911 T--AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACT-GAAA-ATATTGT
63 TAAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAACTAGAAACA-ATTAT
* ** ** * * *** * * *
19601972 TTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTA
125 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * *
19602028 ATAACTATTTGAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTT
1 ATAACTATTTG-AACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * *
19602093 GAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACT-GTAACAATTGTTTT
65 AAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTT
* * ** * *
19602157 ATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
19602210 TTAACCATTTTAGCTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTTATTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * ** *
19602271 ACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACAAAC-A-AAATAATTATTTTA
66 AATATTAATAAATTA-TATTATTTT-ATTCAAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTTA
* * * **
19602334 TGAGAAACCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * ** * ** * *
19602386 TTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT-ATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCA
1 ATAACTATTTGAACTTATTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTA
** * * *
19602450 AAATATT-ATAAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAA-AATAGTATCAAC-AGAACCAATTGTT
65 AAATATTAAT-AAATTA-TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTA-TATGAACTAGAAACAATTATT
* * * *
19602512 TGT-TGACAAAATAAAAAG-CTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATAGTT
126 T-TATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * ** * * ** * *
19602567 AAAACTATTTAAAATGGTTT-AGTAAATACACATACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTC
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTT-ATTAATTTT-
19602630 T-AAATATTAATAAATTA
63 TAAAATATTAATAAATTA
19602647 GTACTAATGA
Statistics
Matches: 1185, Mismatches: 255, Indels: 131
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
170 2 0.00
171 125 0.11
172 6 0.01
173 4 0.00
174 5 0.00
175 3 0.00
176 132 0.11
177 137 0.12
178 119 0.10
179 90 0.08
180 85 0.07
181 333 0.28
182 143 0.12
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAA
AATATTAATAAATTATATTATTTTATTCAAATAAGCTTATATGAACTAGAAACAATTATTTTATG
ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
Found at i:19601845 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 19601610--19601937 Score: 458
Period size: 171 Copynumber: 1.9 Consensus size: 171
19601600 ATATGAACTA
* * * * * * *
19601610 AAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGT
** * * * * *
19601675 CATGGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAATTGTCA
66 CATAACGATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATGAATTATCA
19601740 AAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATTAATAG
131 AAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATTAATAG
* *
19601781 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGT
* * *
19601846 CATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATTAATTATCT
66 CATAACGATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATGAATTATCA
* * *
19601911 TAATATTAATAAATTTATATTATTTTA
131 AAATATTAATAAATTAAAATTATTTTA
19601938 TTCGAAATAA
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 22, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
171 135 1.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (171 bp):
AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGT
CATAACGATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATGAATTATCA
AAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATTAATAG
Found at i:19601859 original size:352 final size:349
Alignment explanation
Indices: 19601066--19601950 Score: 842
Period size: 352 Copynumber: 2.5 Consensus size: 349
19601056 ATAAACTTGT
* * *
19601066 ATGAATAGAAACAATTA-TTTATGACAAAA-ACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTA
1 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACA-AAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * *
19601129 TTCAAATAGTTATAACTA-TTAAACTTGTCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTACTTATT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTAATTTTTAATTTTTTACTAATT
* * **
19601193 AACTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATT-ATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
129 AA-TTTTTAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTCA--AATAAGCTCATATGAATAGAAACA
* * * *
19601257 ATTGGTTTATGACAAACAAAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAAT
190 ATTAGTTTATGACAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAAAT
* *
19601322 TTTTAAACAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATATTAACTGATTAATTTCTAAAATATTA
255 ATTTAAACAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATATTAACTGATGAATTTCTAAAATATTA
* * *
19601387 ATAAATTTATATTATTTATTCGAAATAAGCTTAC
320 ATAAATTAAAATTATTTATT--AAAT-A-CTGAC
* * * * * * * **
19601421 ATGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTT
1 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
* * * * ** * *
19601486 TAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCACT
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTAATTTTT-AATTTT-TTACTAATT
19601551 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGCTCATATGAACTA-AAACA
129 AATTTTT-AAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTCATATGAA-TAGAAACA
* * * * * **
19601615 ATTATTTTATTACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGG
190 ATTAGTTTATGAC-AAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAA
* * ** * * * * *
19601680 CTATTTGAACTTGTT-CGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAATTGTC-AAAA
253 ATATTTAAACAAGTTAAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAT-ATTAACTGATGAATT-TCTAAAA
19601743 TATTAATAAATTAAAATTA-TT-TT-AAT-CTGA-
315 TATTAATAAATTAAAATTATTTATTAAATACTGAC
* * * *
19601773 ATTAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCT
1 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
* * * * * *
19601838 CAAATAGTCATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATT
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACA-AATTAATTTTT-AATTTTTTACTAATT
19601903 AATTATCTT-AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCT
129 AATT-T-TTAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTC-AAATAAGCT
19601951 TGTATTAACT
Statistics
Matches: 429, Mismatches: 81, Indels: 43
0.78 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
351 3 0.01
352 125 0.29
353 19 0.04
354 2 0.00
355 49 0.11
356 41 0.10
357 11 0.03
358 62 0.14
359 11 0.03
360 72 0.17
361 32 0.07
362 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (349 bp):
ATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTAATTTTTAATTTTTTACTAATTAA
TTTTTAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTCAAATAAGCTCATATGAATAGAAACAATTAGT
TTATGACAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAAATATTTAA
ACAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATATTAACTGATGAATTTCTAAAATATTAATAAAT
TAAAATTATTTATTAAATACTGAC
Found at i:19602122 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 19601831--19602159 Score: 425
Period size: 182 Copynumber: 1.8 Consensus size: 181
19601821 TGAAATAAAT
* * *
19601831 AATTGCTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTG
1 AATTGCTCAAATAGTAATAACGATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTG
* * *
19601896 ACTAATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATTAAC
66 ACTAATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTATATTAATTTATTCTG-AATAAGCTTATATGAAC
19601960 TG-AAAATATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCTAAATAGGC
130 TGTAAAA-ATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCTAAATAGGC
* * * * *
19602012 AATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
1 AATTGCTCAAATAGTAATAACGATTTG-AACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-T
* * * *
19602077 T-TCTTATTAATT-TTTTGAATGTTAATAAA-TTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATG
64 TGACTAATTAATTATCTT-AATATTAATAAATTTA-TATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATG
*
19602139 AACTGTAACAATTGTTTTATG
127 AACTGTAAAAATTGTTTTATG
19602160 ACTAAACAAA
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 16, Indels: 11
0.82 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
181 29 0.23
182 91 0.72
183 6 0.05
ACGTcount: A:0.36, C:0.09, G:0.11, T:0.45
Consensus pattern (181 bp):
AATTGCTCAAATAGTAATAACGATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTG
ACTAATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTATATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACT
GTAAAAATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCTAAATAGGC
Found at i:19602245 original size:534 final size:532
Alignment explanation
Indices: 19600962--19602264 Score: 1368
Period size: 534 Copynumber: 2.4 Consensus size: 532
19600952 AAATAAATAG
* * **
19600962 ATAA-TATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTTATT
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTT-TT
* * *
19601026 -ATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTAT
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTTTTTAT
* * *
19601088 GACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT-TATAACTA-TTAA
128 GAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTAA
* * ** *
19601151 ACTTGTCTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAACTTTTGAAATTTTAATAAA
191 ACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAACTTTCAAAATATTAATAAA
* * * *
19601214 TTAATATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAACAAAGG
256 TTAATA-TA-TTTATTAT--ATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTAGTTTATGAAAAACAAAAG
* * * **
19601279 TCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGAAAACA
317 TCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAAAAGTCATAAAGATTTAAACAAGTTAAGAAAACA
*
19601344 GATTTATTTTTTAAATATTAACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTATTCG
382 GATTTATTTTTTAAATATTAACTAATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTATTCG
* * * *
19601409 AAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAA
447 AAATAAGCTTACATGAACAGAACAAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGCCATAAAGTTCTGAAA
* * * *
19601474 TAGGTAATTGTTTAGATAGTC
512 TAGGCAATTGTTCAAATAGTA
** * * * * *
19601495 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCACTAATTTTTAA
1 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTT-T
* *
19601560 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGCTCATATGAACTAAAACAATTATTTTAT
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATT-TTTTAT
* * * * ** *
19601625 TACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGGCTATTTGAAC
128 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAAC
* * *
19601690 TTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAA-TTGTCAAAATATTAATAAAT
193 TTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAACTT-TCAAAATATTAATAAAT
* * *
19601754 TAA-A-A-TTATT-T-TAATC-TGAATTAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCA
257 TAATATATTTATTATATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTAGTTTATGA-AAAAC-AAAAGTCA
* * * * ** * *
19601813 TAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATA
320 TAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAAAAGTCATAAAGATTTAAAC-AAGTTAAGAAAACAGA
* * *
19601877 TTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATTAATTATCT-TAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC
384 TTTATTTTTTAAAT-ATTAACTAATTAATT-TCTAAAATATTAATAAATTTATATTA-TTTATTC
** * * * * ** ***
19601941 GAAATAAGCTTGTATTAACTGAA-AATATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-
446 GAAATAAGCTTACATGAACAGAACAA-ATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGCCATAAAG-TTCTG
*
19602004 AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTA
509 AAATAGGCAATTGTTCAAATAGTA
* * * *
19602028 ATAACTATTTGAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTT
1 ATAACTATTTG-AACTTATTTGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTT
* * * *
19602093 GAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACTGTAACAATTGTTTTA
65 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATT-TTTTA
* * ** * * * *
19602158 TGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTTAG
127 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAA
* *
19602223 C-TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTAT
192 CTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
19602265 TTTTGAACTA
Statistics
Matches: 633, Mismatches: 113, Indels: 47
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
529 24 0.04
530 8 0.01
531 70 0.11
532 35 0.06
533 93 0.15
534 237 0.37
535 14 0.02
536 80 0.13
537 31 0.05
538 12 0.02
539 29 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (532 bp):
ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTTG
TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAACTTTCAAAATATTAATAAATTAAT
ATATTTATTATATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTAGTTTATGAAAAACAAAAGTCATAATAA
GTTGAAATAAATAATTGCTCAAAAAGTCATAAAGATTTAAACAAGTTAAGAAAACAGATTTATTT
TTTAAATATTAACTAATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTATTCGAAATAAGCT
TACATGAACAGAACAAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGCCATAAAGTTCTGAAATAGGCAATT
GTTCAAATAGTA
Found at i:19602453 original size:710 final size:705
Alignment explanation
Indices: 19601069--19602476 Score: 1492
Period size: 710 Copynumber: 2.0 Consensus size: 705
19601059 AACTTGTATG
* * * *
19601069 AATAGAAACAATTATTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAA
1 AATAGAAACAATTATTTATGACAAAAACAAAAGTTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTCAA
* * * *
19601134 ATAGTTATAACTATTAAACTTGTCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAACTTT
66 ATAGTCATAACGATTAAACTTGTCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATTTTGACTAATTAACTTT
* *
19601199 TGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTT
131 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTACGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTT
** * * *
19601264 TATGACAAACAAAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAA
196 TATGACAAACAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAAAAGTAATAAATTTTGAAA
19601329 CAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATATTAACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATT
261 CAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATATTAACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATT
19601394 TATATTATTTATTCGAAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGC
326 TATATTATTTATTCGAAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGC
* *** * * * * *
19601459 CATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAG
391 CAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACCATTTGAACTGATTTGATAAACAA
* * * *
19601524 ATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTT
456 ATTCATTTTTCAAATCTCTTACT--CTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
** * * *
19601589 CAAATAAGCTCATATGAACTAAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAA
519 CAAATAAGCTCATACAAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * ** *
19601654 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATGGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
584 ATAAATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA
19601719 TCTTTTACTTATGAATTGTCAAAATATTA-ATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATT
649 TCTTTTACTTATGAATTGTCAAAATATTATA-AAATTAAAATTATTTTAATCTGAATT
* *
19601776 AATAGAAACAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAAG-TCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTC
1 AATAGAAACAATTA-TTTATGACAAAAAC-AAAAGTTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTC
* * *
19601839 AAATAGTCATAACGATTTGAACTTAT-TCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATT
64 AAATAGTCATAACGA-TTAAACTTGTCT-GGTAAACAAATTTA-TTTTTAAAT-TTTGACTAATT
* * *
19601903 AA-TTATCT-TAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT-CGAAATAAGCTTGTATTAACT-GAA
125 AACTT-T-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTACG-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* * * ** * ** **
19601964 A-ATATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGT
186 ACA-ATTGGTTTATGACAA-AC-AAAGGTCATAAAGATT-TGAAATAAACAATTGTTCAAAAAGT
* ** * * ** * *
19602027 AATAACTATTTGAAACTTGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTT
247 AATAAAT-TTTGAAACAAGTTAAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATAT-TAACTGATTAATTTC
** * * *
19602091 TTGAATGTTAATAAA-TTAGTATTAATTTATTCTG-AATAAGCTTATATGAACTGTAA-CAATTG
309 TAAAATATTAATAAATTTA-TATT-ATTTATTC-GAAATAAGCTTACATGAACAG-AACCAATTG
* * *
19602153 TTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAACC
370 TTTTAAGA-TAAAACAAAAGGCCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAGATAGTCATAACC
* * * * * * * * *
19602216 ATTTTAGCTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-T-TTATTTTTGAACTATTAT
433 ATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTCTAATTTTTAAAATATTAA
* ** * * *
19602279 TAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACAAAC-AAAATAATTATTTTATGAGAAACC
498 TAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTCATACAAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
** * *
19602343 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGG
563 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCG
* ** * ** * **
19602408 CT-ATTAGATTTATTTTTT-AATTTTCTTGGTTATTAAGTT-TCAAAATATTATAAAATTATTAT
627 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATGAA-TTGTCAAAATATTATAAAATTAAAAT
19602470 TATTTTA
690 TATTTTA
19602477 TTTCAAATAA
Statistics
Matches: 573, Mismatches: 101, Indels: 51
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
707 57 0.10
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713 36 0.06
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716 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (705 bp):
AATAGAAACAATTATTTATGACAAAAACAAAAGTTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTCAA
ATAGTCATAACGATTAAACTTGTCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATTTTGACTAATTAACTTT
TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTACGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTT
TATGACAAACAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAAAAGTAATAAATTTTGAAA
CAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATATTAACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATT
TATATTATTTATTCGAAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGC
CAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACCATTTGAACTGATTTGATAAACAA
ATTCATTTTTCAAATCTCTTACTCTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCA
AATAAGCTCATACAAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
AAATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC
TTTTACTTATGAATTGTCAAAATATTATAAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATT
Found at i:19602455 original size:891 final size:873
Alignment explanation
Indices: 19600710--19602565 Score: 1925
Period size: 891 Copynumber: 2.1 Consensus size: 873
19600700 TTTATTTTGG
* * * * * * * *
19600710 ATAAGCTTTTATGAATTGAAACAAATGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATT
1 ATAAGC-TATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * *
19600775 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTTGATCTGTAAGCATATTTTTTTAAAAAATTT
65 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGATCTGTAAACATATTTTTTTAAAAAATTC
*
19600840 TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATAAGTTTGAATG
130 TTTTACTTATGAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTG-A-AAG-TTGAAT-
*
19600905 AACATAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAGATAATATT
191 -A-AGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAGATAATATT
* * *
19600970 TGAACTTATTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTTATTATATTAATA
254 TGAACTTATTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCCAACTAATTAATTATATTATATTAATA
19601035 AATTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTATGACAAAAACAAA
319 AATTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTATGACAAAAACAAA
* * * *
19601100 AGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTAAACTTGTCTGGTAAA
384 AGTTTATAAAGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTAAACTTGTCTGATAAA
* *
19601165 CAAATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAACTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATT
449 CAAATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAACTTTTGAAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATT
* * **
19601230 ATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAACAAAGGTCATAATTATTTGAAA
514 ATGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAACAAAGGTCAAAACAATTTGAAA
* *
19601295 TAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGAAAACAGATTTATTTTTTAAAT
579 TAAATAATTATTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAT
*
19601360 ATTAACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTATTCGAAATAAGCTTACATGA
644 ACT-ACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTATTCGAAATAAGCTTACA-GA
* * * * ** ** *
19601425 ACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGA
707 ACAGAAACAATTATTTTAAGAGAAAACAAAAGGCCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCAGA
* *
19601490 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCACTAATT
772 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTCATTTTTCAATTTTCTTACTCACTAAGT
*
19601555 TTTAAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTACTTCAA
837 TTCAAAATATTATA-AAATTAGTATTATTTTACTTCAA
* * *
19601592 ATAAGCTCATATGAACTAAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
1 ATAAGCT-ATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
** * * **
19601657 GATAATTATTCAAATAGTCATGGCTATTTGAACTTGTTC-GATAAACATATTTATTTT-TTAAA-
65 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGATCTG-TAAACATATTT-TTTTAAAAAAT
19601719 TCTTTTACTTATGAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTG-AA-TT-AAT-A
128 TCTTTTACTTATGAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAAAGTTGAATAA
19601780 GAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAG
193 GAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAAT-A--G-----ATA-
* * * *** *
19601845 TCATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATTAATTATC
249 --AT----ATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCCAACTAATTAATTATA
* * * *
19601910 TTAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACT-GAAA-ATATTGTT
308 TT-ATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACA-ATT-AT
* ** * ** * *
19601973 TTATGGC-AAGTCAAAAGGTTT-TAAAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTAATAACTA
368 TTATGACAAAAACAAAA-GTTTATAAAGATT-TGAAATAAACAATTATTCAAATAGTAATAACTA
* * *
19602035 TTTGAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTG-AATG
431 -TT-AAACTTGTCTGATAAACAAATTTA-TTTTTAAAT-T-TTTACTTATTAA-CTTTTGAAATG
* * * *
19602098 TTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACT-GTAACAATTGTTTTATGAC
490 TTAATAAATTAATATTAATTTATTATGAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGAC
* * * * *
19602162 TAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCA-TTTT-AGC-
554 -AAAC-AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAA--ATTTTTAAACA
* ** * * * * * * *
19602224 TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CT-CTTATTTATTTTTGAACTATTATTAAA-TTA
615 AG-TTAAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATACTACTGATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTA
* * *
19602286 GTATTATTTTAATTCG-AATAAGCTTGTACA-AACA-AAATAATTATTTTATGAGAAACCAAAAG
679 -TATTA-TTT-ATTCGAAATAAGC-T-TACAGAACAGAAACAATTATTTTAAGAGAAAACAAAAG
* ** * * * *
19602348 GTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT-AT
739 GCCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTT-GATAAA
* * * ** * * *
19602412 TAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATAAAATTATTATTATTTTA
803 CAGATTCATTTTTCAATTTTCTTACTCACTAAGTTTCAAAATATTATAAAATTAGTATTATTTTA
*
19602477 TTTCAA
868 CTTCAA
** * * * * *
19602483 ATAAAATAGTATCAAC-AGAACCAATTGTTTGT-TGACAAAATAAAAAG-CTATAATGATTTGGA
1 ATAAGCTA-TATGAACTA-AAACAATTGTTT-TATTACAAAACAAAAAGTC-ATAATGATTTGAA
*
19602545 ATAAATAATTATTCAAATAGT
62 ATAGATAATTATTCAAATAGT
19602566 TAAAACTATT
Statistics
Matches: 806, Mismatches: 120, Indels: 87
0.80 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
871 51 0.06
872 1 0.00
874 1 0.00
875 3 0.00
876 2 0.00
878 2 0.00
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895 4 0.00
896 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (873 bp):
ATAAGCTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
ATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGATCTGTAAACATATTTTTTTAAAAAATTCT
TTTACTTATGAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAAAGTTGAATAAGAA
ACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAGATAATATTTGAACTT
ATTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCCAACTAATTAATTATATTATATTAATAAATTATA
TTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTATGACAAAAACAAAAGTTTAT
AAAGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTAAACTTGTCTGATAAACAAATTT
ATTTTTAAATTTTTACTTATTAACTTTTGAAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTATGAATA
AGCTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAACAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAA
TTATTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATACTACTG
ATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTATTCGAAATAAGCTTACAGAACAGAAACA
ATTATTTTAAGAGAAAACAAAAGGCCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCAGATAGTCATAA
CTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTCATTTTTCAATTTTCTTACTCACTAAGTTTCAAAATA
TTATAAAATTAGTATTATTTTACTTCAA
Found at i:19603544 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 19602656--19605885 Score: 2159
Period size: 177 Copynumber: 18.0 Consensus size: 179
19602646 AGTACTAATG
* * * * *
19602656 ATTTGAAATTA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TCATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTA
1 ATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA
** * * * * *
19602719 TTTCCTAAATCTCTTAC--A--AAATTTTGAACACTTAATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAAT
* * *
19602780 AAGCTTGTAT-AAGCTGAAATAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
127 AAGCTTGTATGAA-CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* ** ** * * * * * * *
19602833 ATTTGAAATAAATAATTGCACATGTAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTTGGCAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
* * * *
19602898 TTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAGA-
66 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT--AAAT
* * * * * * * *
19602962 AAGCCTGTAGGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAGCA
127 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * *
19603015 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTACT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
* *
19603080 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAA
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAA
* *** * * * * * *
19603141 GCTTGAATGTTGAAAAACAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTAATAACG
129 GCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
** * * * * ** *
19603192 ATTCAAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCATATGTATTTGAACTAT-TTCGGTAAACTGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTAT
* * * **
19603256 TTTTTAAATC-C---CTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTACTTTT-TTTGGGAT
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTT-AAAT
* * * * * * * * *
19603316 AAGCTTATATGAGCTGAAATAATTATTTTATAATAAAGCAAAAGGTTATAAAA
127 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * ** * *
19603369 ATTTGAAATAAATAATTGTTTATATAGTCTTAACTACTTGAACTAATTGGGTAAACCGATTTA-T
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
*
19603433 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTATGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAA
* * * * *
19603498 G-TCTGTATAAACAGAAATAATTATTTTATGATAAAACAATAGGTTATAACA
129 GCT-TGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * ** **
19603549 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAATTGAACTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-T
* * * * * *
19603614 TTGGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAATAGTGTTAT
65 TT--T---TT-A--AATCTCTT--A---CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** *
19603679 TTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAATAATGGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAA
116 TTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAA
*
19603743 CG
178 CA
* * ** *
19603745 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATATAAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT-TTAT
* * * * * *
19603810 TTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGATTA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATA
* * * * * * * *
19603875 AGCTTGTATAAACTGAAGCAATTATTATATGACTAAACCAAAGGTCAAAACG
128 AGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * *** *
19603927 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGTCTTAATTATTTGAAC-TGTTCAACAAACATATTT-TT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
** * * * *
19603990 TTAAAAATCTCTTA-TTGA-T--TTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTTATCTAAA-AA
66 TTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAA
* ** * * *
19604050 ACTTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAGGATCATAACT
129 GC-TTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACA
* * ** *
19604101 ATTT-AAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTGT-GAAAAACAGCTTT
1 ATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GT-TCGGTAAACAGATTT
* * * * ** * * * * *
19604163 AGTTTTTAAATCTCTTGCCTACTAATTTTCAAAATATTAGTGAAGTAGTATTATTTGATTTCGAA
63 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAA
* * * ** * * * * *
19604228 TAAGTTTTTTTGAATTGAAACAAATGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCGTAATGA
126 TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CA
* * * * *
19604283 CTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTGATAAAC--A-TT-T
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT
* * * * *
19604342 TTTTT-AATCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATT-GCTATTATTTTGTTTTGAAT
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG-TATTATTTT-ATTTAAAT
* * *
19604405 AAGGC-TGTATGAACTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACA
127 AA-GCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * ** *
19604458 ATTTGAAATAAACAATTGCTCTAATAGTCTTAACT-TTTGAA-TTGGTTTGACAAACACATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTAT
* * *
19604521 TTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATTTGAATA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATA
* * * * * * **
19604582 AGCTTGTATAAAAAGAAACAAACTATTTTATGATAAAA-TAAAGATCATAATT
128 AGCTTGTATGAACAGAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * ** *
19604634 ATTT-AAGATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTGTTTGAAC-TGTTTCCATAAACATATTTA
1 ATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTA
* ** * *
19604697 GTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTACTATTTTATTCTAAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
** * * * * * * *
19604758 AATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACG
127 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT
* * * **
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65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATA
* * * * *
19604939 AACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT
128 AGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
* * * * *
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* * * *
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* * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTAT
* * * * *
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65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
* * * * * *
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127 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
* * ** * *
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66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAG
* * *** * *
19605475 CTTGTTACGAATAGAAACAATTATTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAACA
130 CTTG-TATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
** * * * * *
19605526 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGCAGTCAT-ACTTATTTGCAC-TGGTCAAGCT-AACAAATTA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTC--GGTAAACAGATTT
* * * * *
19605588 ATTTTTTAAATC-CTTTACTTTTTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAA
63 ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAA
* * *
19605652 ATAAGAC-TGTATGAACAGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAATA-GTCATCACG
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* * * * * ** *
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1 ATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT
* ** * *
19605771 TTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATA
* * * * * *
19605836 AACTTATATGAACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACACAAGGTAATAA
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* ** * * * * ** *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *** * * *** **
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * ** * * **
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * * * *
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** * *
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** * * * * * * *
19604755 AATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGATTTTAAAT
63 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT-TGACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * *
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* ***
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* * * *
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* * *
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* *
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* * *
19605117 TAGGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTTTGACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAG
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* *
19605182 ATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCA-AAA-A-ACTT-TTTTTAAAAT-TT
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* * * *
19605241 TTA-CTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAAATT-GTATTATTTTATTAAAAATAAGCTTGTATG
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* * * * *
19605304 AATA-AAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAA-AGTTATAGCAATTTGATATAGATAATTGTTCA
255 AATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAAACAATTGTTCA
*
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* * * ** * * *
19605407 ATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAAAATTATCTTATTTTAGAT
1 ATTTTTAAAATCTCTTACTTATCAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* *
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** * * * * *
19605535 AGATAATTGTTCAAGCAGTCAT-ACTTATTTGCAC-TGGTCAAGCTAACA-AATTAATTTTTTAA
127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTC-AG-AAACAGACTT-ATTTTTAAA
* * * * * * **
19605597 ATC-CTTTACTTTTTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTT-ATTCCAAATAAGAC-
188 ATCTC-CTACCTATTAATTTTTAGAATATTAAAAAATTAGTATT--TTTAATTAAAAATAA-ACT
* * * * * * *
19605659 TGTATGAACAGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAATAG-TCATCACGATTT-AAAGTAAATAA
249 TGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAA-AGATCATAACAATTTGAAA-TAAACAA
* * * * * * * * *
19605722 TGGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTTAGTAAACAAATTT
312 TTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGCTCAGTAAACAAATTC
* * * ** * *
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1 ATTTTTAAAATCTCTTACTTATCAATTTT-GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * *
19605834 TAAACTTATATGAACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAA
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19605873 CACAAGGTAA
Statistics
Matches: 1500, Mismatches: 275, Indels: 216
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
ATTTTTAAAATCTCTTACTTATCAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTGACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGAAACAGACTTATTTTTAAAATCTCCTA
CCTATTAATTTTTAGAATATTAAAAAATTAGTATTTTTAATTAAAAATAAACTTGTATGAATAGA
AAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAACAATTGTTCAAACAATC
ATAACTATTTGAACTTGCTCAGTAAACAAATTC
Found at i:19605539 original size:181 final size:181
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Indices: 19603625--19605828 Score: 1476
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19603615 TGGTAAATTG
* * * *
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* ** * * *
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66 TAGATAAGCTTGTTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATAAC-AAA-ACAAAGGTCATAACAATTT
* * * *
19603749 TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAG
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* * * *
19603803 ATATAATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-
1 AT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
19603866 TTTCGATTAAGCTTG-TATAAACT-GAAGCAATTATTATATGACTAAACCAAAGGTCAAAACGAT
64 TTTAGA-TAAGCTTGTTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATAAC-AAAACAAAGGTCATAACAAT
* * * * * **
19603929 TTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGTCTTAATTATTTGAAC-TGTTCAACAAAC--
126 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* ** * * * *
19603982 ATAT-TTTTTTAAAAATC-T-CTTATTGATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* * * * * * * *
19604043 CTA-AAAAACTT-TGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAGGATCATAACTATTT
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* * * * *
19604105 -AAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTGTGA-AAAACAG
128 GAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GT-TCAGTAAACAA
* * * * * * * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * * *
19604223 TCGAATAAG-TTTTTTTGAATTGAAACAAATGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCGTAATGACTTT
66 TAG-ATAAGCTTGTTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAA-CAAAGGTCATAA-CAATTT
* * *
19604287 -AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTT-TGATAAAC--
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAA
* * *
19604338 A-TT-TTTTTT-AATCTCTTACTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATT-GCTATTATTTTGT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTAT
* * * *
19604398 TTT-GAATAAGGC-TG-TATGAACTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAA
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* * * * * * * *
19604459 TTTGAAATAAACAATTGCTCTAATAGTCTTAACT-TTTGAA-TTGGTT-TGACAAACAC
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAA
* * *
19604515 ATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * **
19604576 T-GAATAAGCTTG-TATAAAAAGAAACAAACTATTTTATGATAAAATAAAGATCATAATTATTT-
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* * * * *
19604638 AAGATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTGTTTGAAC-TGTTTCCA-TAAACAT
129 AA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT-CAGTAAACAA
* * * * * *
19604692 ATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTACTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * * * * * * *
19604753 TAAATAATTTTG-CATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGATTTTA
66 TAGATAAGCTTGTTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTGA
* *
19604817 AATAGATAATTGTTCAAAT-GAACATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
130 AATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * *
19604869 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTAATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
** * * * * * *
19604933 CCA-ATAAACTTG-TATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTT
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * *
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** * * * * *
19605287 AAAAATAAGCTTG-TATGAATA-AAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAGCAATTTG
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* * *
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* * * ** *
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* ** *
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** * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* *
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* *
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* * *
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*
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* *
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* *
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* ** * ****
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * * *
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*
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* * * *
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1 GAGC
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* * * * * **
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* * * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * * * * * *
19658029 GTCATAAAACCATTG-TTTT-AGTTCATAAAGCTTATCCAAAATAAAATAACACTATTTTATTAA
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*
19658092 TATTTCAAAAGTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACCAAAAT
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* * * ** * * *
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* ** *
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* * * *
19658272 TTTACTAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT
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* ** * *
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* * * ** * * * * *
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* *
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129 ATTTC--AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAT
* * * * * * **
19658499 AGTTCAAGTAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTTAAATTGTTA-TGACCTTTTGCTTTA
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * * * ** * *
19658676 AATTCAAATACG-TATGGCCATTTGAATAACTA-CTTATTTCGAATCATTATTACCTTTT-GTTT
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* * ** *
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*
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* * * ** * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTGCCTTTTATTTTAT
* * * * ** * * * * * *
19658917 CATAAAATAATTATTTAT-GTTCCTACAGGCTTCTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAGTA
66 CTTAAAACAATTGTTTTTCAATAC-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATA
* * *
19658981 TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACT
130 TT-TCAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAT
* * * * * * * * *
19659034 AGTTCAAACAGTTAAGACTATATGTACAATTGTTTATTTCAAATTGTTA-TGATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTG-CCTTTTATTTTA
* * * * *
19659098 TCATAAAGCAA-T-TATTTCAGATTATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAAAACTAATTTATTAA
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** * * * ** **
19659161 T-TGTTCAAAATTTTGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACTGAACC
128 TAT-TTCAAAA-TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAT
*
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19659255 CATTATTACT
Statistics
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* * * * * * * **
19657713 AAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTTTAAAA-AAATATGTTTGT
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* * * * * * * * *
19657777 TGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTGG
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* ** ** * *
19657842 TTTAGTCATATAATAATTGCTTCAATTTATACA-AGCTTA-ATCGAAATAAAATAATACTAATTT
130 TTTA-TCATAAAATAATTATTTCTGTTTATACAGA-CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * *
19657905 ATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAATTAAATCTGTTTACTAAACAAGTTT
192 AGTAATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTC
* * * *
19657970 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTGTCATA
256 AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGATTTT-T-ATA
* * * * *
19658035 AAACCATTGTTTTAGTTCATAAAGCTTATCCAAAATAAAATAACACTATTTTATTAATATTTCAA
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*
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* * * *
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* * *
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* * *
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*
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**
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*
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** *
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* ** *
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*** * * * * * **
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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* * * * *
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** * * * * ** *
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* * * * *
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* *** * * *
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* * ** * * ** ** *
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* * *
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*
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* * * * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * * * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 -TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATTAGT--AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGA-
* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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** * ** * * *
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191 ATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATA
* * * * *
19660955 GTCA-CA-TCATTTGAACTATTATCTATTTCAAA-CATTATGACAC--TTGTTTAGTCGTAAGAA
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** *
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* * * * *
19661055 CTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TA--AGAGATTTAAAAACT-AATCTGTTAACGCAAA
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* *
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* * * * ** * * * *
19661176 TTTGTTATAACAAACAATTGTTTCTAAATCCATACAAGA-TTA-TGGAAGTAAAATATTGCTAAA
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** * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
19661416 TTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCG
1 -TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATTAG-TAAAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCG
* * * *
19661480 AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
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* * * * * * *
19661545 TTATAATAAAACATTTGTTTCAATTCA-TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
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* * * ** * *
19661609 AATATTTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAACAAATCAATTTATCGAATC-AGTTCAAA
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* * * * * *
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*** * * *
19661737 CAATTGTTTTTCATCATATAAGCCTATTCGAAATGAAATAATA
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* * * * *
19661780 CTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAA-AAA-ATTTTTAAGCAAA
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* * * *
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63 -TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** ** *
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** * * * * * * * *
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* * * *
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*
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** * * * ** *
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1 -TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATTAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAT
*** * ** * ** ** *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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*** * * * *
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* * ** *
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* * * *
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** *
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* ** ** *
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* * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* *
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* * * * * *** *
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* * * * * *
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* * **
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* *
19663930 CTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAAT
1 -TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
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Statistics
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* * * ** * * *
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** * * *
19659456 TATTTTGAAACTTA-ATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA-ATAGCCAAACAAGTTCAAAT
189 TATTTAAAAAATTATATAA--AAG-ATA-T-AAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAAT
* * * ** * * * * *
19659519 AGTTAAGACTAA-ATAAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGGTTTCTCATAAAAT
248 AGTT-ATACTAATTTGAACAATTA-TTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** ** * * * * * *
19659583 AATTATTT-TGTTTGTACAAGCTTATTCG-AAT--TAAAATAATACTAAT-TTAATAATAGTTCA
311 AATTATTTCTATTCATACAATTTTATTTGAAATAATAAAAT-TTATTAATATTCAGAA-AATT-A
* * * *** * * *
19659643 A-AA--AAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAGCCCAAATGGTTAAGACTATTAG
373 ATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * **
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* * * * * *** *
19659769 TATAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGA
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* ** * * * * * **
19659834 TTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACAATTTGAACAATTGCCTA
563 TTT--AAAAACAAATCAATTTATCGAAC-AGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * ** * * *
19659899 TTT-AGAA-GCTT-TAAAACCTTTTGA-CTTGCCATAAAACAAATT-TTCAGTTAATACAAGCTT
625 TTTCAAAATG-TTAT-GAA-CTTTT-ATTTTGTCATAAAAC-AATTGTT-TTTTCATATAAGCCT
* *
19659959 ATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATTAGTCA-AAGATTTAA
684 A-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATGAGT-AGAAGATTTAA
* * * * * ** *
19660020 AAAATAAATATGCTTACCGAA-TAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCA
744 AAAATAAAT-T-TTTAGCAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AATAATTATATATTTCA
* * * * * * * * * * *
19660084 ACTTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCAT-TCAAACTTATTCAGAT
805 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTATGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAA
*
19660148 TAAAATAATTT
869 TAAAATAA-TA
* * * * * * *
19660159 TAATTTATTAATATTTTGACAACTAATAAGTAAAAGACTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAAC
1 TAATTTATTAATA-TTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAAAAAAT-TGTTTATCAAAC
* * * * *
19660223 AAGTTCAAATATTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG
64 AA-TTCAAATAGTAATGACTATATGAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * *
19660288 TAATAAAATAACTGTTTTAGTTT-ATATGAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATCAAT
127 TCATAAAACAATTG-TTTA-TTTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * *
19660352 ATTTTAAAAATTTATGAGTATGAAA-AT-TGAAAAAGGAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATA
190 A-TTTAAAAAATTAT-A-TA--AAAGATAT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
19660415 GTTATGACT-ATCTAAACAATTACCTATTTCAAAACATTATTG-CCTTTTGTTTTATCTTAAAAC
249 GTTAT-ACTAATTTGAACAATTA-TTATTTCAAATCGTTA-TGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * ** ** *
19660478 AATTGGTTATGTTCATGTAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTTAG-AA
311 AATTATTTCTATTCATACAATTTTATTT-G----AAATAATA-AAATTTATTAATA-TTCAGAAA
* * * * ** ** * * * *
19660542 ATTAATCAGTTAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTTAACT-TGTTTAAAAATTTATGACTT
369 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-TAAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** *
19660605 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGGCCCTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTAT
433 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAT
* * * * *
19660670 TCATAGAAGCTTATTCATAATAAAATACTATTAATTTATTAA-AATTTCAAAAGTTAGTAAGTAA
497 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTA--AAGT-A
* * * * * *** * * *
19660734 AAAAACTTGAAAATAAATTTGTTTA-CCAGACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAGTTA
558 AGAGATTTAAAAACAAATCAATTTATCGA-AC-AGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTA
* * * * * * *
19660798 TTTATTTC-AAATCATTATAAACTTTTATTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGT
621 TCTATTTCAAAAT-GTTATGAACTTTTA-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TTCATATAAGC
* * * * * *
19660862 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA--TAATAAAATTAATGAGTTGGAGACTT-AA
682 CTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAA
* * * * * *
19660924 AAATTAATCTATTTA-CGAA-TAAGTTCAAATAGTCACATC-ATTTGAACT-ATTATCTATTTCA
745 AAATAAAT-T-TTTAGCAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AA-TAATTATATATTTCA
* ** * * * **
19660985 AA-CATTATGACAC--TTGTTTAGTCGTAAGAACAATTGTTT-TATTCAT-CAATATTA-TCAAA
805 AATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTTATAA-AACAATTATTTATGTTCATATAAGCTTATTCAAA
19661044 ATAAAATAATA
868 ATAAAATAATA
* * ** * *
19661055 CTAAATTTATTAATATTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTT--AAAAACTAATCTGTTAACGCAA
1 -T-AATTTATTAATATTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAAAAAAT-TGTTTA-TCAA
* * * * * * *
19661115 ACTAGTTCAAAT--TATTTGACTATTTGAACAATTTATCTATCTCAAA-CATTATGATC-TTTGT
62 AC-AATTCAAATAGTA-ATGACTATATGAATAA-TTATCTAT-TTAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * * **
19661176 TTTGTTATAACAAACAATTGTTTCTAAATCCATACAAGATTA-TGGAAGTAAAATATTGCTAAAC
123 TTTGTCAT-A-AAACAATTG-TT-T-ATTTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * *
19661240 AAATCATATTCT--AAAATTA-ATAAGCAATAGATTTAAAAAAAGTAAATGGT-TTGT-CGAATC
183 TATTAATATT-TAAAAAATTATAT-A--AA-AGA--TATAAAAA-TAAAT-CTATT-TACCAAAC
* *
19661300 -AGTTCAAAATAGTTA-A-GAATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCATTTGTT
238 AAGTTC-AAATAGTTATACTAAT-TT-GAACAATTAT-TATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTT
* * * * *
19661362 TAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAC-ATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTATTTTAT
299 TTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAT-TTTATTTGAAAT--AATAA-A--A-TTTAT
* * * * *
19661425 TAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCA
356 TAATATTCAGAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAATTCA
* * * *
19661490 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAA
419 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
19661555 A-CATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAA
484 ATAATTT-TTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA
** * * ** *
19661619 AAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAACAAATCAATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTGTGGCC
547 AAATT-A-AAGTAAGAGATTT-AAAAACAAATCAATTTATCGAA-CAGTTTAAATAGTTATAACT
*
19661684 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
608 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAATGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-
* *
19661749 ATCATATAAGCCTATTCGAAATGAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAG
672 -TCATATAAGCCTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAG
* *
19661814 AAGATTTAAAAAAAAAATTTTTAAGCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATA
735 AAGATTTAAAAAATAAATTTTT-AGCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AATAATTATA
* * * * *
19661879 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTTATATAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTAT
798 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTATGTTCATATAAGCTTAT
19661944 TCAAAATAAAATAATA
863 TCAAAATAAAATAATA
* * **
19661960 CTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAAAAAATTGTTTGCCAAAC
1 -TAATTTATTAATATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAAAAAATTGTTTATCAAA-
* * *
19662025 CAATTCAAATAGTAAAGGCTGTATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
63 CAATTCAAATAGTAATGACTATATGAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
19662090 TCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
127 TCATAAAACAATTGTTTAT-TTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
19662155 TTTTAAAAATTAT-TAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATA
191 TTTAAAAAATTATATAAAAGATATAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-
* *
19662219 AC-AATTTGAATAATTATTATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
254 ACTAATTTGAACAATTATTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * * *
19662283 CTATTGATACAATTTTATTTGGAATAATACAAATTTATTAATATTCAGATAATTAATAAATAAAA
319 CTATTCATACAATTTTATTTGAAATAATA-AAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATAAGTAAAA
* * * *
19662348 GATTTAAAAAATAACTATGTTTACTGAATAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATTT
383 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
19662413 ATTTCAAATCATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
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* * * * *
19662478 CGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAACAGATTTTAAAAATAA
512 CAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-A-AAGTAAGAGA-TTTAAAAACAA
* * ** * * ***
19662543 AT-ATGTTTATTGAACAAGTTTTGATAGTCACAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAGTTTGTT
574 ATCA-ATTTATCGAAC-AGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAATGTT
* * * ** *
19662607 ATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATATAAGTTCATATACG-CTAATTCAAAATAAAATA
637 ATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT-T-TTTTCATATAAGCCT-ATTC-AAATAAAATA
* * *
19662671 ATACTAATTTATTAATATTTTAGAAATTAATGAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC
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* * * ** * * * **
19662735 AAACAAGTTCCAATTGTTATGGCTATATAAATAATTTTTTATTTCAAATCATTATGATATTTTGT
760 AAACTAGTTCAAATAGTTATAACTAT-TTAATAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
19662800 TTTATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA
824 TTTGTTATAAAACAATTATTTATGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA
** * * * *
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* * * * * **
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61 A-ACAATTCAAATAGTAATGACTATATGAATAATTATCTA-TTTAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * ** * * *
19662982 TTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAGTGTATTCAAAAT-AAGTAATGCTAGTTTATT
124 TTGTCATAAAAC-AATTGTTTAT-TTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * *
19663045 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATATAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAATA
187 AATATTTAAAAAATT-AT-A-TAAAAGATATAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATA
* ** * * *
19663110 GTTATGCTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TATTTTGTTTTATCATAAAACA
249 GTTATACTAATTTGAACAATTA-TTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * **
19663174 ACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAAT
312 ATTATTTCTATTCATACAATTTTATT-----TGAAATAATA-AAATTTATTAATATTCAGAAAAT
* ** * * **
19663239 TAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCAT-ATCTACA
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** * *
19663303 TGATTAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATT
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* ** *
19663366 CATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AA-TAAGAGA
498 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAGTAAGAGA
* * * * * *
19663429 TTTAAATACTAAATCTATTTACCGAAACAATTTAAATAGTTATTACTATTTGAATGATTATCTAT
563 TTTAAAAAC-AAATCAATTTATCG-AACAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * *
19663494 CTC-AAATCGTTATG-A-TGTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTTTGATACAAGCTTATTC
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* * * *
19663556 AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A--AG-AGCTTTGAAAAATAAA
688 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAA
** * * * *
19663617 TGTGTTT-GTTGAA-TGAGTTTAAATAGTTA-AGACTATTATAATAATTATCTATTTCGAATCGT
752 T-T-TTTAG-CAAACT-AGTTCAAATAGTTATA-ACTATT-TAATAATTATATATTTCAAATCAT
* * *
19663679 TATGACCTTTTGATTAGTTATAAAACAATTATTTCA-GTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAAT
811 TATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTT-ATGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
*
19663743 AATTG
875 AA-TA
* * * *
19663748 TAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAAAATATAAATTTATTTATCAA
1 TAATTTATTAATATTTG-AAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAA-A-AAAATTGTTTATCAA
* * * *
19663812 ACAAGTTCAAATAG-ATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCGTTATGTCCTTTTGTT
62 ACAA-TTCAAATAGTA-ATGACTATATGAATAATTATCTATTTAAA-TCGTTATGACCTTTTGTT
** *
19663876 TTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATAAAACCTTATTTGAAATAAAATAATACTACTTTATTA
124 TTGTCATAAAACAATTGTTT-ATTTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
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188 ATATTTAAAAAATTATATAAA
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TGAACAATTATTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA
TACAATTTTATTTGAAATAATAAAATTTATTAATATTCAGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
AAATAAATATGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
ATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAGTAAGAGATTTAAAAACAAATCAATTTATCG
AACAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAATGTTATGAACTTTTATTT
TGTCATAAAACAATTGTTTTTTCATATAAGCCTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
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TGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * **
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* *
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* *
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* * * * * ** * ** **
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * ** * *
19664816 T-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGACTTC
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* * * * * *
19664880 AAATAGGTAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAACTAG
129 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAT
* * * ** *
19664933 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT--ATA--AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
19664994 CAAATAAGCTTGTACGAATAGAAACAATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
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* * * * *** ** *
19665059 ATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGCACTAGTCAAGCCAATAG
131 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAT
* * * *
19665110 ATTCATTTTTTAAAT-TCATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-TTACATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
19665174 CCAAATAAAAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTG
65 TCGAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * *
19665238 AAATAAATAATTATTCTATTTGTTA-AACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAT
129 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAT
*
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Statistics
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CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAT
Found at i:19664539 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 19664507--19664539 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (17 bp):
ATAATAATTTGAAATAG
Found at i:19665121 original size:358 final size:353
Alignment explanation
Indices: 19664032--19665310 Score: 1111
Period size: 358 Copynumber: 3.6 Consensus size: 353
19664022 GTAAACAAAT
* **
19664032 TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCG
** *
19664096 AAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGGATCATAGCTACTTGAA
66 AAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAG-TACTTGAA
* * * * * * * *
19664160 ATAAATAATTGTTCAAACAAGCATAATTATTTGAACTTGCTCGGTAAATATATTTACTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAACTATATTTACTTTTTAAA
* ** * * * *
19664225 TCTTTTACATATTAATTTTTCGAATATTAATAAACTAGTAA-TATTTATTTTGAATATGCTTATA
194 TCTCTT--ATA--AATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-AATTATTTA-TTCGAATAAGCTTGTA
** * **
19664289 TGAATAGAAACAATTGGTTTATGTTAAAACAAAATGTCATAATTATTT-AAGATAGATAATTATT
253 TGAATAGAAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTATT
* * * * *
19664353 CAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAA
316 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTAGCAAATAGA
* * * * *
19664392 TT-TATTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTTTGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTC
1 TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * ** * ** * *
19664456 G-AATAAGCCTATATGAACT-GATATAATTGTTTTATAATGAAATAAAACATCATAATAATTTGA
65 GAAATAAACTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGT-ACTTGA
* * * * * ** *
19664519 AATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTTAATAAAC-ATATTTATTTTTTA
128 AATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGAT-AACTATATTTACTTTTTA
* * * *
19664583 AATCTGTTACTTATTAATTGTTAAAATGTTACTAAATTA-ATATTATTTTAATTCGAATAAGCTT
192 AATC---T-CTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGA-ATTA-TTT-ATTCGAATAAGCTT
* * * * *
19664647 GTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATATTTA
250 GTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA
* * *
19664712 TTTAAATAGTCACAACTATTTGAATCTA-TTTGCTAAAT-GTA
314 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTAGC-AAATAG-A
* * * *
19664753 GTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAA-TTATATGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT
1 -TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* * * * * *
19664817 -GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGACTTCA
64 CGAAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGT-ACTTGA
* * *
19664881 AATAGGTAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAACTAGATTTAGTTTTTAA
128 AATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAACTATATTTACTTTTTAA
* * *
19664946 ATCTCTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTCCAAATAAGCTTGTACGA
193 ATCTCTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT-TTATT-CGAATAAGCTTGTATGA
* * *
19665011 ATAGAAACAATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
256 ATAGAAACAATTGT-TTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * *
19665076 TAGTTATAACTATTTGCACTAGTCAAGCCAATAGA
320 TAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TAGCAAATAGA
* *
19665111 TTCATTTTTTAAAT-TCATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAGTAGCATTATTTT-ATT
1 TT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* * * *
19665174 CCAAATAAAAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACG-ATTT
64 CGAAAT-AAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-A-GTACTT
* * * ** * * * * *
19665237 GAAATAAATAATTATTCTATTTGTTA-AACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATATATTTA-TATTT
126 GAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAACTATATTTACT-TTT
19665300 TAAATCTCTTA
190 TAAATCTCTTA
19665311 ATGTTAGCCT
Statistics
Matches: 730, Mismatches: 149, Indels: 83
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
356 1 0.00
357 55 0.08
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359 16 0.02
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363 2 0.00
364 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (353 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCG
AAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTACTTGAAAT
AGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAACTATATTTACTTTTTAAATC
TCTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA
AACAATTGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTAGTTAGCAAATAGA
Found at i:19667318 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19666865--19669605 Score: 1975
Period size: 181 Copynumber: 15.2 Consensus size: 180
19666855 AAAAGCTAAC
* ** * * * * * *
19666865 ACTTAATAATTTTCAAAATATTAAAAAATTAATTTTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGA-AC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-
* * * *
19666929 AAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACA
65 AAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
19666994 GCCTTTACTATTTGAAC-AGGTTTGGC-AAACAAAATTATTTTTTGAATCTTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTA-GTTT-GCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * *
19667046 AGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGA-
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAT
* * * * *
19667108 ACATAAATAAATGTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAA
64 A-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
*
19667173 TAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
19667226 ACTCATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCGAATAGGCTTATATGATGA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAT-A
* * * *
19667291 AAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGG
65 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * **
19667356 CCATAATTATTTGAACT-GATT-CAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCA
130 TCATAACTATTTGAACTAGTTTGC--TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
19667407 ACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTTGAATAAGCTTTTATGA-AC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-
* * * * * *
19667470 TAAAACATTTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTCCAAATA
65 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * *
19667535 GTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTTAATTTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * *
19667587 GCTTATTAGTTTTTTG-AATGTTACTAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TA-CA-
1 ACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAT
* * * * * * * *
19667648 AACTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
64 AA---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
19667713 ATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGAC-AAACACATTTACTTTTTAAATCTATT
126 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTG-CTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * *
19667768 ACTTATTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTT-TCTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATG-AT
* * * ** *
19667831 AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCA-ATTGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATA
64 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
19667894 GTCATAACAATTTGAACTAGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * **
19667943 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATA
* * * * * * ** *
19668007 AAAATATTTTTTTTTAGGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAGAATAATTCAAATG
65 AAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * **
19668072 GACGTGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTAATTTCTTAAGTCTCCA
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
19668124 ACTCATTAA-TTTT-ATTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AT
* * * * * * *
19668187 AGAAACAACTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
64 AAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
19668252 AGTTATAACTATTTAAACTCA-CTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
128 AGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * *
19668305 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATG-AT
* *
19668369 AGAAAA-AATTGGTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
64 A-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
19668432 AGTCATAA-AATTTTGAACAAATTAAG-AAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-T-TA
128 AGTCATAACTA-TTTGAACTAGTT-TGCTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
* **
19668484 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-TATTCGATATAATCTTACATGA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAT-TTCGA-ATAAGCTTGTATGA
** * * * * * *
19668547 -ACAGAGCCAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAG
63 TA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * ** * ** *
19668611 ATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTCGGTAAATAGATTCCTTTTTCAGTTTTCTT
126 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * ** *
19668666 ACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTCCAAACAAGCTCATATGAATT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATA
** * * * * *
19668731 GGAATAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
65 AAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
19668796 GTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGC-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * * *
19668848 ACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTTA-TATTAATTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATTAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTA-TGA
** * * * * * * * *
19668911 TTGAAACATTTATTTTATAACAAATCAAAAGG-CTTTAAAGCTTCT-AAATAGACAATTGTTCAA
63 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
19668974 ATTGTAATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTT
126 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT
** * * * * *
19669030 TTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTGA-TTCTGAGTAGGCTTGTATGA-
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAT
* * ** *
19669092 ACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA
64 A--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * *
19669157 TAGTCTTAACCATTTGAAATAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
19669211 ACTTATTTATTTTTTAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA-CAAAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-
* * * * * * * * *
19669275 AAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAACAATCGTTCATATAG
65 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
19669340 TCTTAGCTATTTGAACTTGTTTGGC-CATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
130 TCATAACTATTTGAACTAGTTT-GCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * ** * * * *
19669391 GGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ATTAGTATCAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTAT-GAT
* * ** * * * * *
19669455 AGAACCAATTGTTAGATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGGAATAGATAATTATACAAATA
64 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
19669520 GTCAAAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
19669572 A-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTA
1 ACTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTA
19669606 ATAATAATTT
Statistics
Matches: 2002, Mismatches: 467, Indels: 182
0.76 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 13 0.01
175 43 0.02
176 17 0.01
177 6 0.00
178 126 0.06
179 55 0.03
180 591 0.30
181 756 0.38
182 382 0.19
183 13 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
Found at i:19669603 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 19666865--19669605 Score: 2244
Period size: 361 Copynumber: 7.6 Consensus size: 358
19666855 AAAAGCTAAC
* ** * * * * *
19666865 ACTTAATAATTTTCAAAATATTAAAAAATTAATTTTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAACTTATATGAATA
* * *
19666930 -AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACA
65 GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * * * *
19666994 GCCTTTACTATTTGAACAGGTTTGGCAAACAAAATTATTTTTTGAATCTTTTAGTTATTAATTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
19667059 CATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAAATGTTT
194 TA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTT
* * * * *
19667124 TATTACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
257 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
19667189 AACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCCTT
322 AACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTCTT
* * * *
19667226 ACTCATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCGAATAGGCTTATATG-ATG
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-ACTTATATGAAT-
* * * * * *
19667290 AAAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *** ** ** * *
19667355 GCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
19667420 TAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTTTTTGAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACATTTGTTT
194 T-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTT
* * * *
19667484 TATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTCCAAATAGTCATAACTATTTG
257 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** *
19667549 AATTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTTAATTTCTT
322 AACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAATTTCTT
* * * * * * * **
19667587 GCTTATTAGTTTTTTG-AATGTTACTAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TACAAA
1 ACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-C-TTATATGAA
* * * * * * *
19667650 CT-GAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA
63 -TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * ** * * *
19667714 TATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTACTTATTAA-T
127 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* ** * * * *
19667778 TTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTTCTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT
192 TTTA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTAT
* * * *
19667843 TTTATGACAAAAC-AAAGATCA-ATTGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
255 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
19667906 TGAACTAGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAA-ATC-T
320 TGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTCTT
* * * *
19667943 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATATGAATA
* * * * * * * * *
19668007 AAAATATTTTTTTTTAGGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAGAATAATTCAAATG
65 GAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * * ** *
19668072 GACGTGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTAATTTCTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TTT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
19668136 TATTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAACTATTT
194 TA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTT
* * * *
19668201 TATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
257 TATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* *** *
19668266 AAACTCACTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TT
321 GAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAT-TTCTT
* * * *
19668305 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAA-CTTATATGAAT
* * * *
19668369 AGAAAAAATTGGTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* *** ** * * *
19668433 GTCATAA-AATTTTGAACAAATTAAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-T-TAACTTATTAATT
129 GTCATAACTA-TTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* ** **
19668495 TTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTTATTCGATATAATCTTACATGAACAGAGCCAATT
192 TTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTA-TTTTATTCGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
* * * * * *
19668559 GTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTA
253 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * ** * *
19668624 TTTAAACTTATTCGGTAAATAGATTCCTTTTTCAGTTTTCTT
318 TTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTA-ATTTCTT
* * * * * * * *
19668666 ACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTCCAAACAAGCTCATATGAATT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATATGAATA
* * * * *
19668731 GGAATAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
19668796 GTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
** * * * ** *
19668861 CAAAATATTAATAAATTTA-TATTAATTTATTCAAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACATTTATT
193 TTAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATT
* * * * * * * * *
19668925 TTATAACAAATCAAAAGG-CTTTAAAGCTTCT-AAATAGACAATTGTTCAAATTGTAATAATTAT
256 TTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
19668988 TTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTT
319 TTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTT-AATTTCTT
** * * * * * *
19669030 TTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTGA-TTCTGAGTAGGCTTGTATGAA
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA-ACTTATATGAA
* * ** * *
19669093 CTA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA
63 -TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * ** * * *
19669157 TAGTCTTAACCATTTGAAATAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTTATT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTAAT
* * **
19669222 TTTTAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACAAACA-AAACAATTAT
191 TTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTAT
* * ** * * * * * * *
19669286 TTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAACAATCGTTCATATAGTCTTAGCTATT
255 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** *
19669351 TGAACTTGTTTGGCCATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
320 TGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAA-TTTCTT
** * ** * * * *
19669391 GGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTAGTATCAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACTTA-TATGAATA
* ** * * * *
19669456 GAACCAATTGTTAGATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGGAATAGATAATTATACAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
19669521 TCAAAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT
19669585 CTAAATATTAATAAATTAGTA
194 -TAAATATTAATAAATTAGTA
19669606 ATAATAATTT
Statistics
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACTTATATGAATAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATG
ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTCTT
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19669484 GGTTATAACG
* * * * *
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* * *
19669559 TTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTAATAATA
66 TTTTAAATCCCTTAATGATAAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTAATAATA
* * * * * *
19669612 ATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAATTA-T
1 ATTTGAAATAGATAATTATACAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAATTACT
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66 TTT-TAAATCCCTTA-ATGATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
19669723 TTTATTCTAT
Statistics
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Consensus pattern (118 bp):
ATTTGAAATAGATAATTATACAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAATTACT
TTTTAAATCCCTTAATGATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAATAATA
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Indices: 19669129--19670054 Score: 1108
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19669119 AAAAGGTCAG
* * *
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* * ** * * * *
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*
19669259 ATAAGCTTGTACAAACAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAA
131 ATAAGCGTGTACAAACAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAA
* * * * *** * ** * *
19669324 ACAATCGTTCATATAGTCTTAGCTATTTGAACTTGTTTGGCCATTAGATTTATTTTTTAATTTTC
196 ACAATCATTCATATAGTCTTAACTAGTTGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTC
* * * * * *
19669389 TTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTAGTATCAA
261 TTAGTTATTAACTTTCAAAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAACTAGTATCAA
* * * * *
19669454 TAGAACCAATTGTTAGATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGGAATAGATAATTATACAAAT
326 TAGAAACAATTGTTAGACGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATACAAAT
* * *
19669519 AGTCAAAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTT
391 AGTCAAAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATATCTTATTGATTAATTT
19669584 TCTAAATATTAATAAATTAGTAAT
456 TCTAAATATTAATAAATTAGTAAT
* ** * ** *
19669608 AATAATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGT-TATAATTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAA
1 AATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACCATTTGAAATAATTCGATAAACA-AA
*
19669672 -TT-ATTTTCTAAATCCCTTACATATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCT-ATT
64 TTTAATTTT-TAAATCCCTTACATATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTAATT
* * * * * * * *
19669734 CCGAATAAGCGTGTATAAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
128 -CGAATAAGCGTGTACAAAC-AAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAA
* * *
19669799 AATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGGTTGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAA
191 AATAAACAATCATTCATATAGTCTTAACTAGTTGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTT-A
* * ** *
19669864 AATTTCTTAGTTATTAACTTTTAGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAGAAGCCT-
255 AATTTCTTAGTTATTAACTTTCAAAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAA-ACTA
* * ** * * *
19669928 GTATGAATAGAAATAATTGTTTTACGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTT-AAATAGATAATTG
319 GTATCAATAGAAACAATTGTTAGACGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTA
* *
19669992 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATATCTTATT
384 TACAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATATCTTATT
19670055 AATTCTTGAA
Statistics
Matches: 369, Mismatches: 71, Indels: 13
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AATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACCATTTGAAATAATTCGATAAACAAATT
TAATTTTTAAATCCCTTACATATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTAATTCGA
ATAAGCGTGTACAAACAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAA
ACAATCATTCATATAGTCTTAACTAGTTGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTC
TTAGTTATTAACTTTCAAAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAACTAGTATCAA
TAGAAACAATTGTTAGACGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATACAAAT
AGTCAAAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATATCTTATTGATTAATTT
TCTAAATATTAATAAATTAGTAAT
Found at i:19670549 original size:357 final size:358
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Indices: 19669606--19673449 Score: 2749
Period size: 357 Copynumber: 10.7 Consensus size: 358
19669596 TAAATTAGTA
* * * * * *
19669606 ATAATAATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA
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* * * * * * * *
19669671 ATTATTTTCTAAATCCCTTACATATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCC
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * *
19669736 GAATAAGCGTGTATAAGCT-GAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
130 GAATAAGCTTGTATAA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * ** * **
19669800 ATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGGTTGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAA
194 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AA
** * * * * * *
19669865 ATTTCTTAGTTATTAACTTTT-AGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAAGAAGCCT
258 A--TC-TCCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTACGAATAAGCTT
* * * * * *
19669928 GTATGAATAGAAATAATTGTTTTACGATAGAACAAAAGGTT
318 GTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
*
19669969 ATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGA
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAGA
* * * *
19670033 TTTACTTTTTAAA--T-AT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATT-T
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
** * * * *
19670093 CGAATAAGCTTGTAT-GTTGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAA-GTAATAAAAATTTGA
130 -GAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * **
19670156 AATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCAT-ACTTATTTGAACTATTTCAGTAAACTGATTTATTTTTTA
193 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * *
19670220 AATC-CCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTTTTAGGGATAAGCTTATAT
257 AATCTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTACGAATAAGCTTGTAT
* * *
19670284 -AAGTTGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAAGGTC
322 GAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
19670321 ATAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTGTTTAAACTGATTTGGCAAACAGA
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGGTAAACAGA
* * * *
19670386 TTTA-TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTACTAATTTAGTATTATTTTATTCT
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * * *
19670450 GAATTAGCCTGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
130 GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* *
19670515 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-GGTAAACAAATTTATTTTTT--A
195 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * *
19670577 TCT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGTTTGTATG
259 TCTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-TTACGAATAAGCTTGTATG
* *
19670641 --TTGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGT-
323 AATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * ** * * * * * **
19670676 AGTAACGATTTGAGATACG-TAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAATT
1 A-TAACAATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACA
*
19670740 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAAT-AATGTAGTATTATTTTAT
63 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTAT
* * * * * *
19670804 TTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTT
127 TCTGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * *
19670868 AAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTT-AGTAAATAGATTTAATTTT
191 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTTCAGTAAACAAATTT-ATTTT
* * * * *
19670932 TCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATT-CCAATTAA
254 TTAAATCTC---CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTACGAA-TAA
* * * * * *
19670995 GCTTGTATAAACTGAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTC
314 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** * ** * * * **
19671040 AAAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAGTAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCGACAAAC--A
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAGA
* * * * *
19671103 TATATTTTTTAAA--TCTT--TTATAAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATC
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TC
* * * * * * *
19671163 TAAAAAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGA-GAAAC-TAAGGATCATAACTATTTGA
129 TGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACAATTTGA
* * * * * * ** *
19671226 GATTGATATTTGTTCAAATAGTCATTACTATGTGAATTGGTTC-G-AAA-AATAGCTTTAGTTTT
193 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGTAAACAA-A--TTTATTTTT
* * * *
19671288 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATT-TTTTTTTATTTTGGATAA
255 TAAATCTC---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTA---CGAATAA
* * * * * *
19671352 GTTTTTATG-ATCTAAAACAAATGTTTTATGAAAAAATAAAAGGTC
314 GCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
19671397 ATAACGACTTT-ACATTGATAATTATTTAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCA
1 ATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACA
* * * * * * * *
19671460 -A--T-TTTTTT-AATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTGTTGTCTT
63 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *** * * **
19671520 TTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTTTACAAAAGGTTAGAATGATTTGA
128 CTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * ** * * *
19671585 AATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAA
193 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * **
19671650 ATCTCTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAATA-TATTTTAAT-CTGAATAAGCTT
258 ATCTC---CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTAC-GAATAAGCTT
** * * *
19671713 GTATGAAAAGAAAC-ATTTTTTTATGACAAAA-TAAAGATC
318 GTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * * * * * * ** * *
19671752 ATAATGATTTGAGATAGACAATTATTTAAATAGTCACAACTGTTTAAAATGTTTCCATAAATAAA
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGGTAAACAGA
* ** * *
19671817 TTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCT
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* ** * * * * * *
19671878 AAATAATTTTGCACAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGGCATAACGATTTCAAA
130 GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * *
19671943 TAGATAATTGTTCAAATGGAT-ATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAA
195 TAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAT-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * *
19672006 ATCTCCTATCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTTATTCCCAATAAACTT
258 ATCTCC--T-TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-TTACGAATAAGCTT
*
19672070 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
318 GTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * * * *
19672111 ATAATTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGCTCGATAAAC-GA
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTGTTCGGTAAACAG-
* * *
19672175 ATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTTG-AATATTAATAAACTAGTATTATTTTATT
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
19672238 -TCAAATATGCTTATATAAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-ATATTT
128 CT-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTT
* * *
19672301 AAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCA-TAAGAC----TTATATT
191 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTCAGTAA-ACAAATTTAT-TT
* * * * * * * *
19672360 TTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTGTATTATTTTACTTA-AAATAAA
253 TTTAAA--TCTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTACGAATAAG
* * * *
19672424 CTTGTATGAATGGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
315 CTTGTATGAATTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
19672469 ATAGCAATTTGATATAGATAACTATTCAAACAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGGTAAACAAA
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAGA
* * * *
19672534 TTCATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATT-T
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * * *
19672598 TAGATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAGGGCCATAACGATTTGAA
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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317 TGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * *
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1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCGGTAAACAG
* ** *
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64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * * * **
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129 TGAATAAGCTTGTATAAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * *
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* * * *
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256 AAATCTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTT-TT-TACGAATAAGCTT
* * * * *
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318 -GTATGAATTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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128 CTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * *
19673381 AATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-AATAAATAGATTTATTTTTTA
193 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTA
*
19673445 CATCT
257 AATCT
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* *
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* *
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** * * * * * * *
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* *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * ** *
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* * * ** *
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383 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAATTTATTTTTTAAATCTTTTATAAATTTTTGGA
* * * * * *
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* * * **
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * *
19671730 TTTTTATGACAAAATAAAGA-TCATAATG
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* * * * * * * * * *
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** * * *
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** * *
19671884 --TTTTGCACAAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGGCATAACG-ATTTCAAATA
130 GCTTTT--ATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATA
* * * * *
19671945 GATAATTGTTCAAATGGAT-ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATC
191 GATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAA-CAATTTA-TTTTTAAATC
* * *
19672009 TCCTAT-C-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTTATTCCCAATAAACTTGT
253 T-CT-TGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATT-CGAATAAGCTTGT
* * * * ** * * *
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* * * *
19672137 CAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGCTCGATAAACGAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATC
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* * * * * **
19672201 AATTTTTTGAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTTATTTCAAATATGCTTATATAAATAGAAAA-
438 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GTTA-AAAAC
* * *
19672264 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAT
501 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAAG
* * * *
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* * * * * **
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65 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-TAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * *
19672421 AAACTTGTATGAA-TGGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTAT-AGCAATTTGATAT
128 AAGCTTTTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAG-AATTTGAAAT
* * * * * * *
19672484 AGATAACTATTCAAACAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTCATTTTTTAAACC
190 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAAC-AATTTA-TTTTTAAATC
* * * ** *
19672549 TCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTAGATAAGCTTGTAC
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* * * * * *
19672613 AAATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAGGGCCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
316 AAATAGAAATAATTATTTTATGAT-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * *
19672678 AACAATCATAACTATTTGCACTGG-TCAGGCT-AACAAATTTATTTTTTAAATCCATTACTTATT
380 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GG-TAAAC-AATTTATTTTTTAAAT-C-TT--TTATA
* * * * * * * * * * *
19672741 AATTTTTAGATTGTTAATAAATTAGCATTA-CTTTATTCCAAACAAGAC-TATATGAATAGAAAC
438 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATG-TTAAAAAC
* * * ** * *
19672804 AATTCTTTAATGACGAAACAAATGGTCATCACG
501 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAAG
* * * * * * * * *
19672837 ATTTGA-AGTAAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAATTGGCTTAG-TAAACAAATTTA
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* ** * ***
19672900 TTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * *
19672965 AAACTTATATGAA-TAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATG-ATTTGAAATA
128 AAGCTTTTATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATA
* * * * *
19673028 -AGTAATTGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAAC-TAGTTC-GACAAACAAAATTATTTTTAAA-
191 GA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAG-TAAAC-AATTTATTTTTAAAT
* * * * *
19673089 -TC-T-CTTACTAATTTTT-GCATTATTAATAAAATTA-TTTTATTTTATTCTAAATAAG-TTAT
252 CTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGT
* * * * * * * * *
19673148 -TAAGAATTGATAA-AATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCCTAATGATTTAAAATAAAAAATT
314 AT-A-AATAGA-AATAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
19673211 ATTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
375 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACA-ATTTATTTTTTAAA--TCTT--TT
* *** * * * * ***
19673276 ATTAATTTTCATAATATTATTACAA-TAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAACTTTTATAAACAAA
435 ATAAATTTTTGGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GTTAAA
* * *
19673339 AATAATTGTTTTATGACATAACAAAAAGTTATAACA-
498 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-AG
* * *
19673375 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-AATAAATAGATTTAT
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*
19673439 TTTTTACATCT
65 TTTTTAAATCT
19673450 TGTTAGATTA
Statistics
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AATTATTTTATGATAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAATTTATTTTTTAAATCTTTTATAAATTTTTGGAATATTAAT
AAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
AAAAGTCATAAAG
Found at i:19673439 original size:181 final size:180
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Indices: 19669606--19673449 Score: 2804
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* * * * * * *
19669606 ATAATAATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA
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* * * * * * * **
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* * * *
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* * * * ** *** *
19669787 ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGGTTGAACTAGTTCAACAAACAAA
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* * * *
19669852 TTTATTTTTTAAAATTTCTTAGTTATTAACTTTT-AGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATT
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* * * * * * * *
19669916 TTGAAGAAGCCTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTACGATAGAACAAAAGGTT
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* *
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* * * *
19670033 TTTACTTTTTAAA--T-AT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTC
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** * * *
19670094 GAATAAGCTTGTAT-GTTGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAA-GTA
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* * * * * * * *
19670144 ATAAAAATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCAT-ACTTATTTGAACTATTTCAGTAAACTG
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* *
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* * * * * * * *
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129 -TGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
19670321 ATAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTGTTTAAACT-GATTTGGCAAACAG
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* * * * *
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* * * * * * *
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129 TGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
19670501 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAA
1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGA
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* * ** * * *
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129 TGAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * ** * * * * * **
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1 A-TAACAATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACA
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* * * *
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* * ** *
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* * * *
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** * * * *
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* ** * ** * * * **
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1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGA
* * * * * *
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* * * * * *
19671163 TAAAAAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGA-GAAAC-TAAGGATC
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* * * * * * * * ** * *
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1 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGA
* * * *
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66 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTA--TTATTTTATT
* * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *** *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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*** * *
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* * *
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** * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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*** * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * *
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** * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
19673136 TAAATAAG-TTAT-TAAGAATTGATAA-AATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTC
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* * *
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* * * * * * * *
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129 TGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* *** *
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*
19673434 TTTATTTTTTACATCT
66 TTTATTTTTTAAATCT
19673450 TGTTAGATTA
Statistics
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*
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* * * * * * * * *
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* * * *
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1 TAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * *
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* * * * **
19675850 TAAGCTTGTATGAA-T-AAA-AACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAA
1 TAAGCTTATATGAACTGAAATAA-T-TT-TTTTATGACA-AA-AAAAAGTCATAACAATTTGAAA
** * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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1 TAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGA-CAAA-AAAAA-GTCATAACAATTTGAAATA
* * * *
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* * * * * *
19676140 ATC---T-CTTATTAATT-TTGAAATATCT-ATAAAATCATTTTAATTTTATTTCCAAA
124 ATCTTTTAATTATTAATTGTTGAAATAT-TAATAAACTAATATT-ATTTTAATTGCAAA
* * * * * **
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1 TAAGCTTA-TATGAACTGAAATAATTT-TTTTATGACA-AAAAAAAGTCATAACAATTTG-AAAT
* * * * * * * * * ***
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* * * * * * ***
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* * * *** *
19676376 TAAACATGTATGAACAT-AAATAATTATTTTATAATAGAACAAAATGTTTATTTTGTAAATAATT
1 TAAGCTTATATGAAC-TGAAATAATT-TTTT-T-AT-G-ACAAAA-----A-AAAGT-CATAA--
* * * * * * * * *
19676440 C-ATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATAATCATAACTATTTCAATTGGTTCAGTAAACA-AATT-
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* * * * * * * *
19676502 TTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATT-ATGAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAA
116 TTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTGTTGAAATATTAAT-AAACTAATATTATTTTAATTGCAA
19676565 A
180 A
* * * * * * * * * * * **
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* * * * * ** * * *
19676630 GATAATTATTGAAAT-GACGATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATC
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* * * * * *
19676694 ----ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAA
127 TTTTAATTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATTGCAAA
* * * * * *
19676743 TAAGCTTGTATGAAC-AAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATA
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* * ** * * *
19676807 AATAATTATTTAAATAGTTGTAACTATTTAAATTTGTTC-GATAAACAAATTTACTTTTTTAAA-
63 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAG-TAAACATATTTA-TTTTTTAAAT
* ** * * * * * * *
19676870 CTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATTTTG--GA
126 CTTTTAATTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTA-ATTGCAAA
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19676924 TATGCTTTTATGCAA-TGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATA
1 TAAGCTTATATG-AACTGAAATAATTTTTTTATGACAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATA
* * * * ** * * *
19676988 AATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTTTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATC
63 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATC
** * ** * * *** * *
19677053 TTTTGCTTATTAATT-TTCCAAATGCTACTAAATTTGGATTATTTT-ACTCCAAA
127 TTTTAATTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATTGCAAA
* * * * *
19677106 TAAGCTTGTAAGATA-TGAAATAAATATTTTTT-TAACTAAACAAAA-T-ATTAAAATGATTTGA
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* * ** * * * * * *
19677167 AATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTGAACTGATTTC-GCAAGCACATTTATTTTTTA
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** * * * * * * *
19677231 AATCTCCTACTTAGTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA--CCAAA
123 AATCTTTTAATTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTA-TTTTAATTGCAAA
* ** * * * * * * * *
19677288 TAAGCTTCTATGATA-AAAAATAATTGTTTAACGACAAAACAAAAATCTTAACGATTTGAGATTG
1 TAAGCTTATATGA-ACTGAAATAATTTTTTTATGACAAAA-AAAAGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * *
19677352 -TAAATTGTTCAAATATTCATACCTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTGTTTAAATCT
64 AT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
19677416 CTTACTTATTAAATT-TTCAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTG--AA
128 TTTAATTATT-AATTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTA-ATTGCAAA
* * ** * * * ** *
19677468 TAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGCCTATAATGATTTCAAATAG
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* * * *
19677596 TTTATTTATTAATT-TAT-AAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGTC---
128 TTTAATTATTAATTGT-TGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTA-ATTG-CAAA
* * * * ** * ** *
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19677773 TCTTT-TTGTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTG--AT
127 T-TTTAAT-TATTAA-TTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTA-ATTGCAAA
* * * * * * * * * **
19677827 TAAGCTTGTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATAACTAAATGAAAGGCCAAAATGATTTGAAATAG
1 TAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGAC-AAA-AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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128 TTTA-ATTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATTGCAAA
* * * * * * *
19678008 TAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAG
1 TAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGACAAA--AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * *
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AATTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATTGCAAA
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1 TTGAAATGACGATAATTA
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TTGAAATGACGATAATTA
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*
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 AATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCT
* ** ** * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * **
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* *
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* * ** * ** * * *
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* * ****
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** * * * * *
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** ** * * *
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** * * ** *
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** * * * * ** * *
19677840 GCTGAAACAATTGTTTTATAACTAAATGAAAGGCCAAAATGATTTGAAATAGAT
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* * *
19677894 AATTATTCAAATAGTCT-TAACCATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
1 AATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * *
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* * * * **
19678022 CAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGAT
130 TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * ** * * * *
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1 AATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
** *** *
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* * *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
19676746 GCTTGTATGAACAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTTAAATAAAT
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* * * * * *
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* ** *
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* **** * * ** * * * * * *
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* * ** *
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* ** * * * * ***
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188 TTTTT--AATTTTCTTAG-TTATTAA-TTT-CAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * * * * ***
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* *
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* * * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATT-AATTAGTATTA-
* * * * *
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63 TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGA-ACAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-TATAA
* * * * *
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* * * *
19677403 ATTGTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTCAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAA
188 -TT-TTTAATTTTCTTAGTTATT-AA-TTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * *
19677468 TAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGCCTATAATGATTTCAAATAG
249 TAAGCTTGTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGCCTAAAATGATTTGAAATAG
* * * ** *
19677533 ATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTTACTGA-TTCA
314 ATAATTATTCAAATGGTCTTAATTATTTGAACTGATTTGA
* * * * * *
19677572 GTAAACAGATTTATTTTTTTAAT-TTTTATTTATTAATTTATAAATATTAATAATTAGTATTATT
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTATTAATTAGTATTATT
* ***** * * * * *
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* * * *
19677700 ATTTTAAATAGATAATTGCTCAATAGCAATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAATATC-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGA--T-TTT
* ** * * *
19677765 TTTTAATCTCTT-TTTG-TATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGATT
189 TTTTAAT-T-TTCTTAGTTATTAA--TTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
** * ** *
19677828 AAGCTTGTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATAACTAAATGAAAGGCC-AAAATGATTTGAAATAG
250 AAGCTTGTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAAC-AAAACAAAAGCCTAAAATGATTTGAAATAG
* ** *
19677892 ATAATTATTCAAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATTTGA
314 ATAATTATTCAAATGGTCTTAATTATTTGAACTGATTTGA
*
19677932 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTATTGAATTAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATT-AATTAGTATTAT
* * * * *
19677997 TTAAATCCAAATAAACTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACAA
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** *
19678062 TTTGAAATAGATAATCATTCATATATCTTAACTATTTGAACTAGTTC-G-ACAATTAGATTGTTT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTA-AA-TAGATT-TTT
* * *
19678125 TTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAAATATTATTAAA-TAGTATTATTTTATTCTGAATAA
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** * * * *
19678189 AATAGTATGA--ATAGAACAA-T-TGTT-TGACAAAA-AAAA---T---A--A-TTG---T---T
252 GCTTGTATGAGCA-AAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGCCTAAAATGATTTGAAATAGAT
* * * * *
19678233 --CTA--C---TAGTCTTAACTATTTGAACTG-GTTCA
316 AATTATTCAAATGGTCTTAATTATTTGAACTGATTTGA
* * * * * *
19678263 GCAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATA
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTATTAA-TTAGTATTA
* ** * * * * ** * * *
19678328 TTTTACTCTGAACAAACTTGTATGAGCAGAAACAATTACTTTATGA-GAAA-AAAAGATCATAAC
63 TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
* * *
19678391 GATTTTAGATAGATAATTGTTCAAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTC-GATAAATAGATTT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTC--AATA-TCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAATAGATTT
* * * *
19678455 AGTTTTAAATCTCTTA--T-TTATTTTCAAAATATTAATAAATTAG----A----A---T-AAT-
188 -TTTTTAATTTTCTTAGTTATTAATTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
** * * * * *
19678504 ---TTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTC-ATAACGATTTGAAATAGT
251 AGCTTGTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAA-GCCTAAAATGATTTGAAATAGA
* ** * * * * * *
19678565 TAATAATTTGAATAGACTTGACTATTTAAATTTG-TTT-A
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* * * * * *
19678603 GTGAATAGA-TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAATTAATATTAT
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTATTAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * *
19678667 TTTATTTCAAATAAACTTGTAT-AAGTAGAAATAATTATTTTATGAGAAGACAAAAGATCATAAT
64 TTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-CA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
* * *
19678731 GATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCA-CTCAGTAAATAGATTTT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATA-TCATAACTATTTGAACT-AGTTCAGTAAATAGA--TT
* * ** * **
19678795 ATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATACTGA
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* * * * *
19678859 ATAAGCTT-TAT--G-AACAA-AA--A---TA-AA-AGATC---A---TAACA--ATTTGAAATG
248 ATAAGCTTGTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGCCTAAAATGATTTGAAATA
* * * * * *
19678904 GATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTCAACGTGTTTTAGA
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* * * *
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* * ** * ** * * *
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* * * * * * *
19679071 TGTTTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAGATTT
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATA-TCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAATAGA-TT
* * * * **
19679135 ATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
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* * **** * * * * * * * *
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* ** * * * * *
19679264 TAGTTAATTAATTCAAATAATCATGACTATTTCAACT--TGTTCA
311 TAGATAATT-ATTCAAATGGTCTTAATTATTTGAACTGAT-TTGA
* * * ** * *
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* * * *
19679371 ATTTTTAATCCGAAT-AGCCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAGA-GTCAT
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* * * * * *
19679434 AGCAATTCG-AATAAATAATTGTTCATATAGTCATAAAC-ATTTGAACTTGTTCGATTAAACATA
124 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATA-TCAT-AACTATTTGAACTAGTTC-AGT-AA-ATA
* * * * *
19679497 -ATTTATTTTTTAATCTT-TTACTTATTAATTTTCTTAGTATTAAT-AATTTGTATTATTTTATT
183 GA-TT-TTTTTTAATTTTCTTAGTTATTAA-TTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
*** * ** * * *
19679559 CAAAAT-AG-TT-T-TG-GACAAAAA-ATTTATTTTATGTCAAAACAAAATG-TTATAGTGATTT
244 TTGAATAAGCTTGTATGAG-CAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAA-GCCTAAAATGATTT
* * * * * *
19679617 -CAATAATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT-AACTTATTT-A
307 GAAAT-AGATAATTATTCAAATGGTCTTAATTATTTGAACTGATTTGA
* * *
19679662 GTAAACAGA-TT-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTA--AATT-GTATTAT
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * * * *
19679722 TTTATTTCGAATAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATG
64 TTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACG
* * * ** * * *
19679787 ATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAATCATGACTATTTGGTCTGGTT-GGTAAATATATTTATT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAT-ATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTT-TT
* * * * *
19679851 TTTAAATTT-TTACTTATTAATTACAAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTCTGAATAAGC
190 TTTAATTTTCTTAGTTATTAATTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
19679915 CCCCAGTGTA
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TAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATT
TGAAATAGATAATTGTTCAATATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTTTTTTAAT
TTTCTTAGTTATTAATTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
AGCAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGCCTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
ATGGTCTTAATTATTTGAACTGATTTGA
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* * ** * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * **
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* * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
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* * * ** * *
19679358 TAATAATT-AATATATTTTTAATCCGAATAGCCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
126 T-A-AATTGTAT-TA-TTTT-ATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAAATGT
* *** * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTAT
* * *
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65 TTGAACTTGTTCG-GTAAACAT-ATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTT-TTAG-AATA
* * * * * * *
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125 TTAAATTGTATTATTTTATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAA-ATGT
* * * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * *
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* * *
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* * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
** * * ** *
19679825 TGGTCTGGTT-GGTAAATATATTTATTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTACAAAATATTAATA
66 TGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATA-T--TA
* * * * * ** * * *
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128 AATT-GTATTATTTTATTC-AAATAA----AC-TTATATGAACAGAAACAAATGT
* ** * * ** * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT--TCAAATAGTCATAACTA
* * * *
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* * * * **
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* * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGA-TA-ATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * *
19680178 ATTTGAA-TTGGTTAGGTCAACAAAATATTT-TTTTAAAATATCTTACTTATTAATTTTT-GAAA
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123 TATTAA
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Statistics
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TGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAAT
TGTATTATTTTATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAAATGT
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* * * * * *
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** * * *
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* * ** * ** *
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* *
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* ** * *
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* * ** * *
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* * ** *
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* *
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* * * *
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* *
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*
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130 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACCGAAACAAAT-TGTCTTATGACAAAACAGA
* *** *
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194 A-GGTCATAATGATTTTGAAATAGATAATTAATTCAAATAATCATGACTATTTCAACTGGTTCAG
* *
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* * * * * **
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322 -TTTTAATCCGAAT-AG---CC-GTGTACAAACAGAAACAACTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGT
* *
19679961 CAAAACAATTTGAAATAAATAATTTGCCCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTGGTTTGA-T-AA
380 CAAAACAATTCG-AATAAATAA-TTGCCCAAATAGTCATAAAC-ATTTGAACTGGTTCGATTAAA
*
19680023 TAT-ATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTT-TGAAATATT-ATAGATGAGTATTACTTTA
442 CATAATTTATTTTTT-AATCTTACTTATTAATTTTCT-AAATATTAATA-ATGAGTATTACTTTA
* *
19680083 TTTCGAACAA-ACTTATATGAACAAAACATTTG
504 -TTC-AA-AATACTT-T-TGAACAAAAAATTTA
*
19680115 TTTTA-GACAAAACAAAATGTTATAATGATTCTAAATAGATTATATT-TTTAAATAGTCATAATT
1 TTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATT-TAAATAGA-TATATTATTCAAATAGTCATAATT
* * * * *
19680178 ATTTGAA-TTGGTTAGGTCAACAAAATATTTTTTTAAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
64 ATTT-AACTTGTTTA-GTAAAC-AGAT-TTTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
19680242 TTAA
124 TTAA
19680246 TAAATTCATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTAAATAGATATATTATTCAAATAGTCATAATTAT
TTAACTTGTTTAGTAAACAGATTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAATT
AGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACCGAAACAAATTGTCTTATGACAAAACAGAAG
GTCATAATGATTTTGAAATAGATAATTAATTCAAATAATCATGACTATTTCAACTGGTTCAGTAA
ACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAATTAATATATTTTT
AATCCGAATAGCCGTGTACAAACAGAAACAACTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCAAAACAATTC
GAATAAATAATTGCCCAAATAGTCATAAACATTTGAACTGGTTCGATTAAACATAATTTATTTTT
TAATCTTACTTATTAATTTTCTAAATATTAATAATGAGTATTACTTTATTCAAAATACTTTTGAA
CAAAAAATTTA
Found at i:19681787 original size:21 final size:21
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Period size: 21 Copynumber: 4.2 Consensus size: 21
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* * * * **
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*
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19681823 GATCGATCCCCTCACATAGGA
1 GATCGATCCCCTCACATAGGA
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1 GATC
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Statistics
Matches: 49, Mismatches: 12, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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19 2 0.04
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GATCGATCCCCTCACATAGGA
Found at i:19681857 original size:62 final size:63
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* *
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* *
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19681894 GGGTAAGGCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAGGGATCGATCCCCTCACATAGGAGATCAATCACCTAAAAGAACAGATCAATCCCCTCAAGC
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* * *
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*
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66 TATGTAGAGTATCATACAACTCTC
19702166 GTTAGGATGT
Statistics
Matches: 85, Mismatches: 4, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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GGCCCTAAGCTTCTCAAATTCTCTCTAAAAGACACTCAAGGCAACTCTGGTCTCCTCACCCAATC
TATGTAGAGTATCATACAACTCTCATTGGGCTCATTTA
Found at i:19705514 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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19704919 NNNNNNNNAG
* * ** * * * * * * *
19704929 AGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAATTTGTTAAGACTATATAAACAATT-AT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
** * ** * *
19704993 CTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTG-CTATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTT
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*
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* * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
* * * * * * * * *
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* * * * *
19705232 GTTT-AGAATAAAATAACACAAATCTATTAATATTAC-AAAAATTCATAAG----
129 ATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * **
19705281 AGATTTTAAAAATAAACT-T-TTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTAA
1 AGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAA
* * * *
19705344 TTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTTCGTTATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAAGCCTA
65 TTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
19705409 TTT-AAATTAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTAAA
130 TTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
19705461 AAATTTAAAACATAAATATGTGTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATT-AT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
* * * *
19705525 CTATTTCAAATTATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAGAA-AATTA-TTTC-AGTTCATATAAGG
66 -TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAA-AACAA-TAGTTTCTA-TTCATACAAGC
* * * * *
19705586 TTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAG
127 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * * * *
19705641 AGATTTAAAAAATAAA-ACTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATT-A
1 AGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAA
** *** * * * *
19705704 TCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGAT--TTCATCTATTTATACAAG
65 T-TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACA-ATAGTT--TCTATTCATACAAG
* * * * * * *
19705766 CCTATTTCAGATAAAATAATTCAAATTTATTACTA-GC-AAGATAATTAATAAGTAAA
126 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAA
* * * * **
19705822 ATATTTAAAAAATAAATATGTTCACCACAA-AAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAACAAA
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAA
* * * *
19705886 TT-TTT-ATAA--A--AT---TTTAT-TTT-GTCATAAAATAATTA-TTTATGTTCATACAAGCT
65 TTATTTCA-AATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACAA-TAGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * * * *
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* * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
* * * * * * * *
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* * * *
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** * * ** * * * * *
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1 AGATTTA-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAA
* * * * * *
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* * * * *
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128 TATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *** * * * *
19706351 AG-TTTGAAAAATGAATTTTTTTATTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAGTTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
** * * * *
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66 TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * *
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* * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
** * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTAA
** * * ** *
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* ** * *
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175 AAGTAAA
* ** * * * * ** *
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1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
* * * * * * * *
19706968 CTATTTCAAATCGTTCTCACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAATGT-ATACATGC-
66 -TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACAATAGTTTCT-AT-TCATACAAGCT
** * *
19707030 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGCAAGA
128 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAA-A
* * * * *
19707085 A-ATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATCACCATTTGAACAATT-AT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
* * ** ** * * *
19707147 CTATTTAAAATTATTATGACCTTTTAT-TTTTATTGTAAAACAATTGTTTC-AGTACATAAAAGC
66 -TATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TGTTTCGTCATAAAACAATAGTTTCTA-TTCATACAAGC
*** * * * * * *
19707210 TTATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATT-TCAAAATTTGATAAGTTAG
127 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *
19707264 AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATT
1 AGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * ** * * *
19707326 -ATCAATTT-AAATCATTATGAATTTTTATTTTATCATAAAATAGTTA-TTTTTCA-TCATACAA
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* * * * * * **
19707387 GCCTATTCGATATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTCAAAATTAATAAGTAGG
125 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * ** * *
19707444 AGATGTAAAAAATTGATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATT-A
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTAA
** * ** * * * * *
19707507 TATATTT-AAATTGTTATAAGC-TTTTG-TTAATCATAAAATAATTA-TTTTTGTTCATAAAAGT
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** * * * *
19707568 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG
127 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * **
19707623 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTCTT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAT
* * ** *
19707687 TATTTTAAATCATTAGGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAAT
66 TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACAAT
19707729 TTTTTTAGTT
Statistics
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* * * *
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* *
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* * * * * ** * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * * * *
19705820 AAATATTTAAAAAATAAATATGTTCAC-CACAAAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAA-C
1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * *
19705883 A--AATTT----TTA-TA-AAATTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCT
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* * *** * *
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* * * * * *
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1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * * * *
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* *
19706120 ATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTA
130 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
** * * * * * *
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1 AGAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
19706349 AAAG-TTTGAAAAATGAATTTTTTTATTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAGTTA
1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
19706413 TTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGCT
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* * * *
19706477 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGCA
129 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * *
19706529 AAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTAC-CAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
1 AGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
19706592 TATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TCCATAAAAG
64 TATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAG
* * * *
19706656 -TATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTT
127 CT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* ** * * *
19706710 AGAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACT-ATC
1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATT
** * * * *
19706774 ATCTATTTTGAACTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAATACCAATTATTCAAAACAATT
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** * * *
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116 -G--TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
19706900 A-TA
177 AGTA
* * * * * ** *
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1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
** * * * * * * * *
19706967 TCTATTTCAAATCGTTCTCACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAATGT-ATACATGC-
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** * * *
19707030 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGCA
129 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
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* * * ** * * *
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*** * * * * * *
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* * * * * * *
19707325 TATCAATTT-AAATCATTATGAATTTTTATTTTATCATAAAATAGTTATTTTTCA--TCATACAA
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* * * * *
19707387 GCCTATTCGATATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTC-AAAATTAATAAGTA
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* * ** * *
19707442 GGAGATGTAAAAAATTGATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATT
1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * ** * ** * *
19707506 ATATATTT-AAATTGTTATAAGCTTTTG-TTAATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATAAAAGTT
65 ATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCT
** * * * *
19707569 TATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTA
129 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * * *
19707621 AGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTC
1 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * * ** *
19707685 TTTATTTTAAATCATTAGGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTTTTTTAGTTTTTAGTAA-CT
66 TCTATTTCAAATTATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATA-CAAGCT
* * * * * * *
19707749 TA-TTCAGAGTAAAAAAAAACAAATTCATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTA
129 TATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
19707797 AGAGATTT-AAAACT-AATTATGTTT-GTCGAATAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
1 AGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
*
19707859 TATCTATTTCAAATCATTAT
64 TATCTATTTCAAATTATTAT
19707879 TGTTGGCCTT
Statistics
Matches: 2172, Mismatches: 471, Indels: 265
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Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 5 0.00
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173 5 0.00
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TCTATTTCAAATTATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
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* ** *
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* * * * ** * **
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*
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*
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** * * *
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*
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* * *
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** * *
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* *
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* *
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* * *
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* * **
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*
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* * * **
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**** * * *
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* **
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* ** * * ** * *
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* *** * * * * * ** * * *
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* * *
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* * ** * * * *
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* * ** * *
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* ** * *
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* * *
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* * *
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*** * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * ** * ** * *
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* * * * * * ** *
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* *
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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** *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * * ** *
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1 TTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
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* * * * *
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* * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACT
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126 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGT-ATGAATAGAAACAATTG
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAAT-AGTC-A-T-A
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* *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
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66 TTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATT
* * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-A
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65 TTTGA-AC-TAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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66 TTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
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* * * * * * * * *
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130 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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* * * **
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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* *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * **
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*
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130 ATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
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* * * * *
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64 ATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
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* * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
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* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** * * *
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* * *
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* * * * * * * ** **
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTC-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
** *
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* * * *
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130 ATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATG---AATAGAAACAATTG
* ** ** * * * * * *
19824952 TTTTATAATGAAACAAATGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
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* ** * * * * * * **
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127 TTAATAAAT-TAGTA-TTAT-TTTATTTAAATAA--GCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * ** * * ** * *
19825136 -GTCAT-AGCAATTC-TAAA-T-A-GACAA-TTG---TTCA-AA----T--AGT--T-ATAACTG
1 TTTTATGA-CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
19825181 TTTGAACT-TTTTGGTAAATAAATTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTTTTG-AATGT
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* * *
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128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
* * * *
19825298 CTTTTATGACAAAA-TAAAAGATCAAAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGT-ATTAA-
1 -TTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAAC
* * * *
19825360 TCATATAAACT-GGTTGGATAAAC-AA--T-TTTTTT-GATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAAT
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* * * * *
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** * ** * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** ** * * * * * ** * *
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** * * *
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131 TAAATTAGTATTATTTTATTT--AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * * ** * * * * *
19825655 TTTGATGACAAAGCAAAAAGTTATAATGATTTGCAATAGATAATTATTCATATTGTCAAAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
19825720 TTGAAATAGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
19825785 TAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAAGAAACTTATATGAACAAAAACAATTG
131 TAAATTAGTATTA-TTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* ** * * * * *
19825837 TTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTCAAATCGTTATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-
* * * * * * *
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** * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *** * * * *
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65 TTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
19826157 TTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
** * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * * ** **
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* * * * * * ** ** ** *
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121 GAAAT-A--TTA-A---TAAATTAGT-ATTATTTTAT--TTAAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAA
* *
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175 CAATTG
* * * * * * * * * *
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1 TTTTATGACAAA--ACA-AAAAGTCAT-AA-CAATT-TG--AAA-TAGA-TAATTGTTCAAA--T
* * * * ** * * ** * *
19826460 -CTTACTAA-TTTTTGAAATA--TTAATAAAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT
54 AGTCA-TAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA-CA--AATTTATTTTTTA-AATC-TCT-T--ACT
* ** * * * * * * * * ** *
19826521 GAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGTCGTAATAATTTTAAATAGATAA--TTGTTCAAAT
110 -TATTAATT-TTTGA-AATATTAA-TAAATTAGT-ATTATTTTATTTAAATAAGCTTG-T---AT
*
19826583 -AATA-ATAACTATTGAG
166 GAATAGA-AACAATT--G
** *** ** * * ** *
19826599 CTTGTT-TG-GTAAACATATTATTTTCA-AATC--TCTTG-CTTA-TTAATTTTTTGAAT-GTTA
1 -TT-TTATGACAAAACA-A--AAAGTCATAA-CAAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TC
* * * ** * * * * *** *
19826656 ATAA--ATTAGTATTA-TTT--TATTCTAAA-TAAGCTTGTATGAA-CTGAAAC-AATT-ATTTT
58 ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAAC-AAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * ** * * * ****
19826712 ATGACTAA-A-TAA-AAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAA--TTAT-TCTAATAGTCTTAA--
120 -TGA--AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAACAATT
*
19826769 C
180 G
* * ** * * *** * *
19826770 TATT-TG----AACTAGATCGGCAAAACACATTT---ATTTTTAATTATT-AAATTAGT-ATTAT
1 TTTTATGACAAAAC-AAAAAGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA-TAA
* * * * * * * *** ***
19826825 CTTAATGGAA-TAAGCTTATATGAAAAGAAA-TAATTGTTTTATGA-CAAAATAAAGATCATAAC
62 C-TATTTGAACT-AG-TT-T-GGTAAACAAATTTATT-TTTTA-AATC-TCTTACTTAT--TAA-
** * * ** * * * * *
19826887 AATTTGAGATA--AAT-AATT-GT-TCA-AGTAGTCATAACT-A-TTTGAATTGATTTAGTAAAC
116 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T-TTAAATAAGCTTGTA-TGA-ATAG-AAAC
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176 A-A-TT-G
** * * ** * ** *
19826952 TTTT-T-A-AATCTCTAATTAATTTTTAAAACATTAAT-AAATTAGTATTCTTTTATTCTAAATA
1 TTTTATGACAA-AAC-AA-AAAGTCATAACA-ATT--TGAAA-TAG-A-T-AATTGTTC-AAATA
* ** * *** * * *** * ** * **
19827013 ATTTTGTA-TAAAGAGAAACAATTGTTT--TATGACAAAAACAATCTGATAATGAT-T-TGAAAT
55 GTCAT-AACT-ATTTG-AAC--TAGTTTGGTA-AAC-AAATTTATTTTTTAA--ATCTCTTACTT
* * *** * * * ** ** * * *
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** * * *
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168 A--TAGAAACAATT-G
* * *** * *
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* * ** * ** * * * * * *
19827208 A-AAC-AATTG---T-TTTATGACAAAACAAA---ATATCATAACTAT-TTGAAATAAATAATTA
58 ATAACTATTTGAACTAGTT-TG-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT--ACTTATTAATTT
* *** * * * ** * * * ***
19827263 TTCAAACGGTCAT-AACTA-T-TTGAGTTTGCTCAATAAACAGATT-TATTTTTTA-AATCTTTT
119 TTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTAA-ATA-AGCTTGTA-TGAATAGAA------
* *
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174 AC-AATTG
* ** * ** * ** * * * **
19827331 ATTT-TGGGAAAACTAATAAA-TTAGTATTATTTTG-TTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC
1 TTTTATGACAAAAC-AA-AAAGTCA-TAACAATTTGAAATAG-ATAA--TTGT-TCAA-ATAGTC
*** ** *** * * *
19827393 AATTGGT-TTATGACAAAACGAAAGGTCATAAC-TATTTGAATGTGTTTAGAAAATAGAT-TTAT
58 -ATAACTATT-TGA-ACTA-GTTTGGT-A-AACAAATTT--AT-T-TTT--TAAAT--CTCTTA-
* * *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* ** * * * *
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* *
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*** * * *
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66 TT
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* ** ** ** * * *
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* * ** * * *
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312 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTGTA
* * ** * * * **
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* * * * * *
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* *** * * * * * ** * *
19820375 CTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAATTTTTTA-TTATTAATTGTCAAAATAATAATAAAT
192 CTGGTGCCGCAAACAAATTT-T-TTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAAT
* * * * * * * * * *
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* ** * ** *
19820504 GTCAAAATGATTTGAAATAATTAATTGCTCAAATAGTTATA
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* * * **
19820545 ACTATTTGAACTAGTTT-GATAAA-ATGATTTA-TTTTTAAAATCTC---C-TATGAATTTTTGT
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* * * * * * * ** *
19820603 AATA-TAATAGATTTGTGTTATTTTA-TTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAAC-A-TATTTTA
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* * * * * * *
19820664 TGACAAAACAAAAGGTTATAACATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCGTAATTATTAGAA
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* *** * * *
19820729 CTAGTTAGGTAAACATAATTATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATT
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* * * ** * *
19820791 CATTTTA-TTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTAT-AGCAAAACAAA
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* * * * *
19820853 AAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTCT-TA
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* * * * * * * * *
19820896 ACAAATTGAACTAGTTT-GACAAACAAATTTA-ATTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAA
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* * * * * * ** * * * *
19820959 ATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACATAAATAATTATTTTATA
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* * ** * * ** * *
19821024 ATAGAACAAAAGGTTTATTTTGTAA-ATAATTGATTTGAAGCATACAATTCTTCAAATAGTCATA
129 ACAAAACAAAA-G---A--TCATAACA-ATTTCAAAT--AG-AT--AATTATTCAAATGGTCATA
* * * * * * *
19821088 ACTATTTGAACTGATTCAGTAAATAAATTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGAT
182 ATTATTTGAACTGGTGCCGCAAACAAATTTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* *
19821153 TAAGAAATTAGTAT-TATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGATATAAAACAATTGTTATATGACC
246 TAAGAAATTAGTATAT-TTTTATT-TGAATAAGCTTTTATGATA-AAAACAATTGTTATATGACA
* * * * * * **
19821217 AAACAAAAGGTAACAACGATTTGAAGTAGATAATTATTGAAAT-GGCGATA
308 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTG-TA
* * * * **
19821267 ATTATTTGAACTAATTTGGTAAACATATTCA-CTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAA
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* * * * *
19821327 TATTAATAAATTA-GTATATTTTATTTCGAATAAGCTTATAGGAACT-GAAGCAATTGTTTTATG
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* * * * * *
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* * ** * *
19821520 T-TGTTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTATATGTCAAAACGAAAGGTCA
259 TAT-TTTTA-TTTGAATAAGCTTTTATG-ATAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * *
19821584 TAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATTATA
321 TAACAATTTGAAATAAA-AATTATTCAAATAGTTGTA
* * * * * * *
19821621 ACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATC-CTTTGCTTTTTAATTTTCCAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTCAA
* * *
19821685 ATGTTAATAAATT-TGGATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATATGAAATA-AATAT-TTT
65 ATATTAATAAATTAT-G-TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGAT-T-AAAAACAAT-TGTTT
** * * * ** * **
19821747 T-TGACTTAACAAAATATCAAAACAATCTGTAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTG
125 TATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTG
* * * **
19821811 AACTGGTGCCGCAAGCACATTTAATTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAA
190 AACTGGTGCCGCAAACAAATTT--TTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAA
*
19821873 TTAGTAGTATTTTTAATTGAATAAGCTTTTATGATCAAAAACAATTGTT-TAATGACAAAAC-AA
253 TTAGTA-TATTTTTATTTGAATAAGCTTTTATGAT-AAAAACAATTGTTAT-ATGACAAAACAAA
* * *
19821936 AGATCTTAACAATTTGAGATTGAAAAATTATTCAAATAGTTGTA
315 AGGTCATAACAATTTGA-AAT-AAAAATTATTCAAATAGTTGTA
** *
19821980 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAA
*
19822045 TATTAATAAATTATTGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGTTTTATGA
66 TATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * **
19822110 CAAAACAAAAGCTCATAACGATTTCAAATAGATAATCT-TTCAAATGGCCATAATTATTTTTACT
130 CAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAAT-TATTCAAATGGTCATAATTATTTGAACT
* * * * ** *
19822174 GATGCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA-TTTCAAAATTATTAATAAATT
194 GGTGCCGCAAACAAA-TT-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAAGAAATT
* ** * * * * * * *
19822238 AATAT-TATTTTATTTTGTTTAA--ATTTGTGCTAATTGAAACAATTATTTTATGACAAATCAAG
255 AGTATAT-TTTTA-TTTGAATAAGCTTTTATGATAA---AAACAATTGTTATATGACAAAACAAA
* * ** * * *
19822300 TGGTTATAATGATTT-AAATAGACAATTGTGCTAACTGAAACAAG-TGT-
315 AGGTCATAACAATTTGAAATA-AAAATTAT--T--C--AAA-TAGTTGTA
** * * ** ** * * * * *
19822347 TTTATTTCAATTTGTTCGGTAAATATATTTATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAA-TTGTCAAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTC-AA
* * * * * * ** *
19822411 ATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATCCGTATAACCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATG
65 ATATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
19822475 ACAAAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CATTTGAAC
129 ACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC
* ** * * * *
19822538 TTGT-TTGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAA-TA
193 TGGTGCCG-CAAACA-AATT-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAAGAA
* ** * * * * *
19822599 ATT-TTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAAAAATTATTTTATGTCAAAAC
252 ATTAGTATA-T-TTTTATT-TGAATAAGCTTTTATGATA-A-AAACAATTGTTATATGACAAAAC
* * * * * * **
19822662 AAAATGTTATAGCGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
312 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAA-AATTATTCAAATAGTTGTA
* * * * * *
19822708 A-TCATTT-AGACTTATTT-GATAAACA-AATT-CTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTGTTG
1 ACT-ATTTGA-ACTAATTTAG-TAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTC
* *** * ** * * **** * *
19822768 GAATATTAATAAACCGGTATTATTTTATTTCGAATAAAATTATATGAACCGAAACAAATCTTTTA
63 AAATATTAATAAA-TTATGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *** * ** *
19822833 TGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAATCATGACCATTTGAT
127 TGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAA
* * * * * * * ** *
19822898 TTAGT-TCGATAAACATATTTGTTTTTTAACATTTTTACTTATTAATGGTTGAAATATTAATAAA
192 CTGGTGCCG-CAAACA-AATT-TTTTTTAA-ACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAA
* * * * * * * * * * **
19822962 TTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCATATATGA-ACAAAAAAAATGTTTTATAATAGGACAAAA
253 TTAGTA-TATTTTTATTTGAATAAGCTTTTATGATA-AAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAA
* * * **
19823026 AGTCAGAACGATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATA
316 GGTCATAACAATTTGAAATAAA-AATTAT-TCAAATAGTTGTA
* ** * * *
19823068 ACTAGTTGAACTGGTTT-GATAAATAGATTTA-TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAG-TAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAA
* * * * * * * ** *
19823127 ATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTAT-GAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAT
65 ATATTAATAAATTA-TGTTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTAT
* * ** * * * *
19823191 GACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAT
128 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC
*** * * * * *
19823256 TGGTTAGGTAAACAAAAATATATTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAAT
193 TGGTGCCGCAAAC--AAAT-TTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAAT
* * * * ** ** ** *
19823321 TCATTGTA-TTTTATTTCAAATCAGCTAGTATGAATTGAAA-TTTTGTTTTATGACAAAACAAAA
254 T-AGTATATTTTTATTT-GAATAAGCTTTTATG-ATAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAA
* * * *
19823384 GGTCATAACATTTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TA
316 GGTCATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGT-TGTA
* * * * * *
19823426 AATATTTAAACTAGTTT-GTCAAACAAATTTA--TTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTT-AG
1 ACTATTTGAACTAATTTAGT-AAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCA-
* * * * * * * *
19823487 AATATTATTATATT-TGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAATAATTG-TTTG
64 AATATTAATAAATTATG--TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
19823550 TGACAAAACAAAATG-TTATAACAATTTGAAGTATACAA-TGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
127 TGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGA
* * * * * * *
19823613 ACTAGTTTGCTG--AACAGATTTATTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATAAATA
191 ACT-G-GTGCCGCAAACA-AATT-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGA
* * ** * * *
19823676 AATTAGTAT-TATTGTATTCTAAATAAGCTTGAATGATCAAAAACACTTGTTATATGACCATACA
251 AATTAGTATAT-TTTTATT-TGAATAAGCTTTTATGAT-AAAAACAATTGTTATATGACAAAACA
* *** * * * ***
19823740 AAAGGTAATAATGGTTTGAAATAGATAAA-TGTTGAAATGGCCATA
313 AAAGGTCATAACAATTTGAAATA-A-AAATTATTCAAATAGTTGTA
* * * * * * * * **
19823785 ATTATTTGAAATGATTCAGTAAATAGATTCA-CTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAA
* * * * * *
19823845 TGTTAATAAATT-TGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGAACT-AAAACAATTGTTTTAG
66 TATTAATAAATTATG--TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAG-ATTAAAAACAATTGTTTTAT
* ** * * ** * * * *
19823908 GATAAAACAAAATTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCGTATTGTCTTAACTATTTAAAC
128 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC
** * * **
19823973 TACT-TCGACAAACAAA----TTTT--A---TT--TT-TTAA-TTTTCATAATATTATTAAATTA
193 TGGTGCCG-CAAACAAATTTTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAGAAATTA
* * * * *
19824024 GTAT-TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTATT-TA-GA-ATAGAATAAA
256 GTATAT-TTTTATTT-GAATAAGCTTTTATGATA--AAAACAATTGTTATATGACA-A-AACAAA
* * ** ** *
19824084 AAGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA--AG-A
315 AGGTCATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTGTA
** * * * *
19824124 AC----TG--CT--TCGA-TAAATAGATTTA--TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAA
* * * * * * * *
19824178 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATAA
66 TATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTATGA
* * ** * * * * * *
19824243 C-AAA-AAATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTG
130 CAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTG
* *** * * * * * *
19824306 ATTTGGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAT
195 GTGCCGCAAACAAATT--TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTA-
* ** * * * **
19824371 TGT-TA-TTTTATTTCGAATAAGCTTTAATGAATTGAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAATA
256 -GTATATTTTTATTT-GAATAAGCTTTTATG-ATAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGG
** * * * ***
19824434 TCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTCACA
318 TCATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTGTA
* * * * * *
19824474 ACTATTTGAATTTATTTAGAAAACACATTTATCTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAA
* * * * * * * * *
19824539 TATTAAAAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTTTATGAATT-GAAGCAATTGTTTTATG
66 TATTAATAAATT-ATGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAG-ATTAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
19824603 ACAAAACAAAAGATCATAACGATTTTAAATA-TTAATCT-TTCAAGTAGTCATAACTACTTGAGC
129 ACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAAT-TATTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC
** * * * * * * * *
19824666 TTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATATAT
193 TGGTGCCGCAAACAAA-TT-TTTTTT-AAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAAT
* * * * * * *
19824731 TAGGATTATTTTGT-TCTAAATAAGCTTGTATGATATGAAACAA-----ATAT--CTAAA-AATA
254 TAGTA-TATTTT-TATTTGAATAAGCTTTTATGATA-AAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAA
* * * ** *
19824787 GG-CTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTATAGTTTTA
316 GGTC-ATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTGTA
* * * *
19824829 ACTATTTGAACTAGTTT-GACAAACACATTTA-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAG-TAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAA
* * * *
19824891 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAAACAATTTTTTT
65 ATATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGAT---TAAAAACAATTGTTTT
* ** * * * * * * * * *
19824956 ATAATGAAACAAATGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGCCATAATTATTT-A
126 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGA
** * *
19825020 ACTAAT-TCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA----T-AAAT-TT--G--
191 ACTGGTGCCG-CAAACAAA-TT-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAA
** * * * * *
19825074 --TA-T-TA-TTTTATTCCATATAAACTTATATTA-ACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAA
252 ATTAGTATATTTTTATTTGA-ATAAGCTTTTATGATA--AAAACAATTGTTATATGACAAAACAA
* * * *
19825133 AAGGTCATAGCAATTCT-AAATAGACAATTGTTCAAATAGTTATA
314 AAGGTCATAACAATT-TGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTGTA
* * * * * * * * **
19825177 ACTGTTTGAACT-TTTTGGTAAATAAATTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTTTTGAA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAA
* * * * * *
19825241 TGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTC-AAGTAAGCTTGTATAAACT-GAAACAATTGCTTTTA
66 TATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTA-AGATTAAAAACAATTG-TTTTA
* * * * * * * * *
19825304 TGACAAAATAAAAGATCAAAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGT-ATTAATCATATAA
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* * * **
19825368 ACTGGTTG--GATAAAC-AA-TTTTTTTGATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAAT
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* ** * * * * *
19825428 TTA-TATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTACGA-ACAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAT
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* * * * *
19825491 GGTCATAACTATTTGAAATAGATAATCATTGATATAGTCT-TA
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** * * * * * * ** * *
19825533 ACTATTTGAACTCGTTT-G-ACAATTAGATTTA-TCTTTTAATTTTGTTGGTTATTAAGTTTTGA
1 ACTATTTGAACTAATTTAGTA-AA-CATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCA
* * * ** * * ** * * *
19825595 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCCAAATAAAATAGTATGAACAGAACCAATTGTTTGA
64 AATATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTT-CGAATAAGCTTGTAAGATTAAAAACAATTGTTTTA
* * ** * * * *
19825660 TGACAAAGCAAAA-AGTTATAATGATTTGC-AATAGATAATTATTCATATTGTCAAAACTATTTG
127 TGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTT-CAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTG
* * *** * * * * *
19825723 AAATAGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAA
190 AACTGGTGCCGCAAACAAA-TT-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAA
* * * * * *
19825788 ATTAGTATTATTTTTATTTCAAAGAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
252 ATTAGTA-TATTTTTATTT-GAATAAGCTTTTATG-ATAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAA
* * ** ** * *
19825853 AAAGTAATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTCAAATCGTTATA
314 AAGGTCATAACAATTTGAAATAAA-AATTATTCAAATAGTTGTA
* * * *
19825897 ATTATTTTATAATTATTTTAACTGATTCAGTAA-ATAGTATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAT
1 ACTA-TTT-GAACTAATTT-A--G--T-A--AACATA-T-TTATTTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * *
19825960 AAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATCAG-TT-GAA
54 TAATTTTTCAAATATTAATAAATTA-TGTTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTA--AGATTAAAA
* * * ** * * * * * *
19826022 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTACATAGTCT
115 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTCA
* * **** * * * *
19826087 TAATTGTTTGAATTGGTTTAACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTAG-A
180 TAATTATTTGAACTGGTGCCGCAAACA-AATT-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAA
** * * * * * *
19826151 ATATTATTAAATTAGTAT-TATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT
242 ATATTAAGAAATTAGTATAT-TTTTATT-TGAATAAGCTTTTATG-ATAAAAACAATTGTTATAT
* * * * * **
19826215 GACAAAACAAATGGTTATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTCAAATAGTCATA
304 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATAGTTGTA
19826269 ACTATTT
1 ACTATTT
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Statistics
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ATTTGAAATAAAAATTATTCAAATAGTTGTA
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19824882 ATTTTTGAAA
* * *
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* * * * * *
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* * **
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* ** *
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* * * * *
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*
19825226 TCTTAAT
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19825233 TTTTTGAATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TAATAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGACAAATGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
CTATTCGATAAACAAATTTATTTTCTTAAATCTCTTACT
Found at i:19825782 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 19825060--19826275 Score: 893
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19825050 ATCTCTTACT
* * * * * *
19825060 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCATATAAACTTATATTAACTAAAACAATTGTTTTATGA
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* * *** * * * *
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* * *
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** * * * **** * *
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* * * * * *
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* *
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** ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* ** *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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** *** * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
19829171 ACAAAAGTTCATAAC-ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATG
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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** * * *
19830770 TTATGACAAAACAAAAAAATCACAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-ATAACGATT
130 TTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
19830834 CGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTT-CAATATTAA
194 TGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAA
** * * *
19830898 TAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAA-AAGTCATTTTATAACAA
258 TAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGA-TTTATGACAA
* * * * *
19830960 AACAAAAAGTTATAGCGATTCCAAATAGATAATTATTTAATTAGTCATAATTATTTAAATA
320 AAC---AA---A-AG-G--T-C--ATA-ACAA-T-TTGAAATAG--ATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
19831021 GTCATAATTATTTAAACTTGTTC-GATAAACAAATTCATTTTTCAAATC-TCTTAATTATTAA-T
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATT
* * * * *
19831083 TTTCATAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGTTTATATGAACT-GAAA-TA
64 TTTGA-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA
** * * *
19831144 TT-TTTT-TCGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATTA
125 TTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* ** ** * *
19831206 CAATTTGATGTAGTTCGGTAAACTTATTTATTTTTTAAGAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAAT
189 CTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * *
19831270 TTTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTAT-A
253 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATGA
* ** * * *
19831333 GCAAAACAAAA-ATCCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAGATA
317 -CAAAACAAAAGGT-CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
*
19831380 GTCATAACTATTTGAACTTGCTT-TGATAAATAGATTTA-TTTTTAAA---TCT-CTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT
* * * * * * * **
19831439 TTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTAT-TGAACATAAACCTTTGT
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * *
19831503 TTTATGACAAAACAAAAGTTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCACATAGTCATAATTATT
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** *
19831568 TGAACT-GATTAGGTAAATAGAA-TTATTTTTTTTATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTA
194 TGAACTAG-TTCGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
19831631 ATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTTAATAAGCTAGTATGAAATGAAA-ATTATTGTTTTATGACA
257 ATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACA--ATTGATTTATGACA
* *
19831694 AGACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATA
319 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
19831738 GTCTTAACTATTT-AA-TGGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TCTAAGTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCT-ACTTATTAATT
* * * * * * * * *
19831800 TTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTGTATAAATATAAATAATTAT
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * * *
19831865 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAATCATAACTATT
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * *
19831930 TGAATTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--AA-TTTTGAAAGATTAAT
194 TGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * *
19831991 AAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGATAAAAAAATAATTG-TTATATGACCAAA
259 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-AAAGAAACAATTGATT-TATGACAAAA
* * * * *
19832054 CAAAAAGTAATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTGAAATG
322 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
19832095 GCCATAATTATTTAAAC-TGATTTTA-TAAATAGATTCACTTTTTAAA---TC-ACTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG--TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT
* * * * * *
19832154 TTTGGAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATT-TCAAGTAAGCTTATATGAACTA-AAACAATT
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA-TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATT
* * *
19832217 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
19832282 TTTGAAATTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
192 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * ** * * * *
19832346 AAGAAATTAGTATTATTTTAATT-TGGATAAGCTT-TAATGAACTGGAATAATTGTTTTATGTCA
256 AATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGT-ATGAAAAGAAACAATTGATTTATGACA
* * * * *
19832409 AAACAAAGGGTTATAACAATTTTAAATAAATAATTG-TCTAAGTA
319 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATA
* ** * * *
19832453 GTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAGCAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTAGTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTTCTACTTATTAATTT
* * * ** * * *
19832518 TTTAAATGTCAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGATATA-AAACAAATA
65 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTG
* * * * * * **
19832581 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTTTTAACTAT
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
19832646 TTGAACTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAT
193 TTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* ** ** *
19832711 TAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGC-TGCTATGATTAGAAACAACT-ATTTTATGACAA
258 TAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTG-TATGAAAAGAAACAATTGA-TTTATGACAA
* ** * *
19832773 AA-TAAAGGTTTTAATC-ATTTGAGATTGACT-ATTGTTCAAATA
320 AACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* * *
19832815 GTCATAACTATTT-AAATCGATTC-GATAAATAGATTTATTATTTAAATCTAT-TACTTATTAAT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAAT
* * *
19832877 TTTTGAAATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATT
63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATT
* * ** * * *
19832941 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGAAAATCATTCAAATGGCCATAATTA
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * ** * * **
19833006 TTTTAACTAATTCGGTAAATC-GGTTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAATTTAGGAAATATT
192 TTTGAACTAGTTCGGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * ** *
19833070 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-ATCTAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATGACAA
* * ** * * *
19833134 ATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTCTTAAAATA
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
19833177 ATAATAATTATTTGAACTTATTCAGCAAATAGATTTATTTTTT-AATCACTT-T-CTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT--CTTCTACTTATTAATT
** * * *
19833239 TTCCAAATGTTAATAAATTAGTATTACTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTG
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
** * * * ** * *
19833303 -TTT-TGACTCAATAAAAGGTCGA-AACGATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAGTCTTAACCA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * *
19833365 TTTGAACTAATTCGATAAACAAGTTTA-TTTTTAAATCTCATACTTAATAATTTTTAAAATATTT
192 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
19833429 TTAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTA-CAAACA-AAACAATTGTTTTACGACAA
257 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGATTTATGACAA
* ** * *
19833491 AAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATA
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * * * ** *
19833534 GTCTTAACTATTTGAACTAGTTGGGCAATTAGATTTATTTTTT-AATTTTCTTGGTTATTAAGTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTT
* * ** * * * *
19833598 TTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAAATAGTATAAATAGAACCAATTCT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
** * ** * *
19833662 TTGCTGAC-AAACTAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTAT
129 TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
19833726 TTGAACTAGTTTGGCAAGCAGATTTA---CTTATATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATGA
193 TTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTA
** * * ** * *
19833787 ATAAATTAGTACAATTTTATT-TCAAACAAATTTATATTAACAA-AAACAATT-ATTTTATGACA
257 ATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGA-TTTATGACA
* * * *
19833849 AAACAAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATTA
319 AAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * * *
19833894 GTTATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAATAGAATTATTTTCTAAA---TCT-CTTATAAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT
* * * * * * * * *
19833955 AGAAA-ATTAATAAACTAATTTTATTCTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTATTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * *
19834019 TATGACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAGCTATTTG
131 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * * * * *
19834083 AACTGGTTTGACAAACATATTCATTTTTTAAA--TCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTATTAA
196 AACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * *
19834146 ATTAGTA-TATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAAATT--TTTATAATAGAAA-A
261 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAAC-AATTGATTTATGACA-AAACA
*
19834207 AAAGAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
324 AAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
19834247 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAA---TGT-CTTATTAATTCT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT
*
19834308 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AGTTTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * * *
19834372 TGATGATAAAAC-AAAGTGTCATAACTATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGAT-ATGACTAT
130 TTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTAT
* * * **
19834435 TTGAACTTGCTT-TGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATT
193 TTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT
** * *** * *
19834498 AATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAATTTGTATTATTGGAAACAACTGTTTTATGACAA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATGACAA
** * *
19834562 AACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * *
19834605 GTCATAACTATTTGAAC-TCCT-AGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTT
*** * * * * *
19834668 TTGGTCTTTTAAGAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGA
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * *
19834732 TTTATGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* **** * * *
19834797 TGAA-TGTGTTAAAAAAACATACTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
194 TGAACT-AGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* ** *
19834860 TAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGAACGGAACCAATTGATTTATGACAAA
258 TAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATGACAAA
* *** * *
19834923 ACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
321 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
19834965 GTCATAACTATTTAAACATGTTCAGTAAACATATTCATTTTTTAATTC-TCTTACTCATTAA-TT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTT
* * * * * *
19835028 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAGATAAGCTTATATGAGTTGAAACAATCGT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * * *
19835092 TTTACT-ACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATGACTAT
129 TTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
19835156 TTGAATTTA-TTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTA
193 TTGAA-CTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** *
19835220 ATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
257 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGATTTATGACAAA
* * *
19835284 ACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
321 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** ** ** * * *
19835326 GTTATAAAGATTTGAACTTGTTTGGCGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT-T
* * * * * *
19835391 CTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-AGAAAAAAGCTTGTATGAACAGAAA-AAATC
65 -TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * * * * * *
19835452 ATTT-TGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCACAATTAT
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
19835516 TTAAACTTGTTCAGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAA
193 TTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * ** * **
19835581 TAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAC
258 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATGACAAAAC
* * * * *
19835646 CAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATATTTATTCAAATA
323 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * ** * *
19835686 GTCATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTACTTTTGAAAAT-TTTTACTTATTAATTG
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTT
* * * * *
19835750 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGTTTTTATGAATAGAAACTATTATT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* * * *
19835815 TTATAACAGAAA-AAAA--TCATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATT
130 TTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
19835877 TGAACT-GTTTTGGTAAATAGATTTATTTTCTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATCAA
194 TGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * * *
19835937 TAGATTAGTATTTTTTTTATTCTGAACAAACTTATAT-AAACA-AAA-ATATTTATTTTATGATA
258 TAAATTAGTA-TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACA-ATTGA-TTTATGACA
* **
19835999 AAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
319 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
19836043 GTCATAATTATTTGAAC-TGATT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATC-TCTTACATATTAAA
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAAT
* * * *
19836105 TTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATT
63 TTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* *
19836169 GTTTTATGACAAAAC--AA----A-AACAATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCTTAATT
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACT
* *** * **
19836226 ATTAGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATT
191 ATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * * * *
19836291 ATTATATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAG
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATGACAA
* ** * * * *
19836355 AACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTGTTTAAATA
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
19836398 GTCATAATTATTT-AAATTGGTTCAG----T--A---A------ACATC-T-T--TTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTT
* ** ** *
19836443 TTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTGTAT-AATAAAAAAACAATTG
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT--AGAAACAATTG
* * * * ** * * * * * * *
19836507 TTATATAACCAAACAAAAGGTAATAATGATTCGAAATACATAATTATTGAAATGGCCATAATTAT
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
19836572 TTAAACT-GATAT-AGTAAACAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATT
193 TTGAACTAG-T-TCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * **
19836631 AATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-ATTT-TGTAACA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGATTTATG--ACA
** *
19836694 AAACAAAAGGTCATAACAATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATA
319 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * * *
19836738 GTCATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAAAAAATTTAATTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT
* * * * *
19836802 TGAAATATTAAGAAATTAGTACTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTT
* ** * * *
19836866 TTAT-ATTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTT
130 TTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
19836930 TAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAACCT-TTAGCTTATTAATTTTTTG-AATGTT
194 TGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAATATT
* * * * * * *
19836993 AATAAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGATATGAAACAAAT-ATTTTATGACTA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGA-TTTATGACAA
* * * * *
19837057 AACAAAAGGT-AAAAAATGATTTGAAAAAGATAATTATTCTAATA
320 AACAAAAGGTCATAACA--ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
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19836423 TAAACATCTT
* *** ** * **
19836433 TTATTAA-TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTGTATAATAAA
1 TTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACT
* * * * * * * * * * *
19836497 AAAACAATTGTTATATAACCAAACAAAAGGT-AATAATGATTCGAAATACATAATTATTGAAATG
64 GAAACAATTATTTTAT-ACTAAACAAAAGGTAAAAAATGATT-TAAAAAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
19836561 GCCATAATTATTTAAAC-TGATATAGTAAACAGATTTACT-TTTTAAA-TCT-C
127 GTCATAACTATTTAAACTTG-TTTAGTAAATAAATTTA-TATTTTAAACTTTAC
* *
19836611 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
1 TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* * * * * *
19836676 AACAATTATTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAACAAT--TTTCAATAGACAATTGTTCAAATAG
66 AACAATTATTTTAT-ACTAAACAAAAGGT-A-AAAAATGATTTAAAAAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
19836739 TCATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAAAAAATTTA-ATTTTTAAACTTTTAC
128 TCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAATAAATTTATA-TTTTAAAC-TTTAC
* * * *
19836791 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTACTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
1 TTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * *
19836855 AAACAATTGTTTTATATTAAAACAAAAGGT-CATAATGATTTTAAATAA-ATAATTGTTCAAATA
65 AAACAATTATTTTATACT-AAACAAAAGGTAAAAAATGA-TTTAAA-AAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
19836918 GTCATAACTGTTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAACCTTTAGC
127 GTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAATAAATTTATATTTT-AAA-CTTTA-C
* * * * *
19836973 TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGATA-TG
1 TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACTG
* * *
19837037 AAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAAAAATGATTTGAAAAAGATAATTATTCTAATAG
65 AAACAATTATTTTAT-ACTAAACAAAAGGTAAAAAATGATTT-AAAAAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
19837102 -CTTTAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAATACATTTATATTATAAATCTCTTAC
128 TC-ATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAATAAATTTATATTTTAAA-CT-TTAC
* * * * * * *
19837155 TTAATAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATATTTA-ATTGAATAACCTTTTATGATC-
1 TTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
*
19837217 AAAATCAATTATTTTAT
64 GAAA-CAATTATTTTAT
19837234 TACAATACAA
Statistics
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TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
AACAATTATTTTATACTAAACAAAAGGTAAAAAATGATTTAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAATAAATTTATATTTTAAACTTTAC
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19837949 TTATTAATTT
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1 TTAAAATATTA
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1 TTAAAATATTA
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1 TTA
19837984 TTTTATCCAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTAAAATATTA
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* ** * *
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** * * * * ** * * * * * *
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* * * *
19837918 GTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATA
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* * * * * * * * * *
19837967 TTATTAAAATATTATTATTTTA-TCCAAATAAGCATG-AT-CA-A-AAACAATTATTTTAAGAGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAA
* ** * * * **
19838027 AAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGAAT-GATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTAA
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*
19838090 TTCGA-AAA-ATAGTTTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATA
130 TTC-ATAAACATAG--TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATA
* * ** ** * * *
19838142 TTAGTAAAGTAGTATTATTTTATT-TCGGATAAGTTTCTATGAGCTA-AAAC-ATTATTTTATGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGA
*** * * * * * *
19838204 TGGAAGAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGTTAGATTGATTGTTCAAATAGTCCA-ATCTATTT
64 AAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAA-A--TAGA-TAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTT
* * * * *
19838268 AAACTTG-TTCAATAAACA-ATTTATCTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATG
123 GAA-TTGTTTC-ATAAACATAGTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * **
19838327 TTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTGCTTTATGATT
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAA
* * * ** *
19838392 AAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTGTTAACTATTTGAATTGGT
66 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTT
* *
19838457 TCAGCAAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GTAATA
131 TCA-TAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATA
* ** * * *
19838508 TTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-TAAATAAGGTTTTATTAAAAGAAACAATTGTTTTAT-AA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAA
* * * * *
19838571 AGAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG
65 A-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG
* * * *
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129 TTTCATAAACATAG-TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * ** * * *
19838683 TTAATAGATAAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTAT-AAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAA
* * * *
19838747 AAACAAAAAGGTCATAACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG
66 AAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* * * * *
19838812 TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATA
129 TTTCATAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * *
19838864 TTAATAAATTAGTATTCTTTTATTCCAAATAGACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAA
* * * * *** *
19838929 AAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATACTTGTTCATCCAGTCATAACTATTTGAACTT-A
66 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGT
* * * * * *
19838993 CTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
130 TTCA-TAAACATAGTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * * * * * *
19839047 TGAATAAAGTAGCATTATTTTATT-TCGAATACACATGTTTGAACATAAACAATTGGTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAA
* * * * * * *
19839111 AAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTTAACTAATAATAACTATTTGAATGTG
65 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TG
* * * * ** ** * *
19839176 TTTTATGACAAAATAGTCTTAACTATTTGAGTT-AGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTA-AATC
129 TTTCAT-A-AACATAG--TT-A-T-TTT---TTAAATCT--CTTACTTA-TTAATTTTTAGAATA
* ** * * * * * * * * ** * * **
19839239 TCTTATTTATTA--ATT-TTTGAAATATTATTAAA-TTACTATTATTTTAATCTGAATAAGCTAG
1 T-TAATAAATTAGTATTATTT-TATTCTAAATAAACTT-GTATGAATAGAAAC--AAT-TG-TTT
** ** * * * ** * *
19839300 TACAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAA-AGCATAA-TGATTTAAGATAGATAATTA
59 TA-TGAAA-AAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTG-TTCAA-ATAG----TCA
* * * * ** *
19839363 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTAGTAA-ATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTT
114 -T-AACTA-T-TTGA--A-TTG---TTTCATA--AACATAG--TTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* *
19839423 ATTAATTTTCAAAATA
165 ATTAATTTTTAGAATA
* * * * ** * *
19839439 TTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAA
* * * * * * * * *
19839504 AAATAAAAGATCATAACAATTTGAAACAGATAATTATTCAAATGGACATGATTCTTTGAACTTG-
66 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGT
* * * * *
19839568 TTCGATAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATA
130 TTC-ATAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * *
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* * * * *
19839680 AGAC---A----A-AACAA-TTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT-A
66 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGT
** * * * * *
19839735 CGCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATA
130 TTC-ATAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATA
* ** * * * *
19839787 TTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGAT
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAA
* * *
19839851 AAAACAACAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGT
65 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGT
* * * *
19839915 GTTCAGAAA-ATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
130 -TTCATAAACATAG--TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * *
19839967 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC-AATATAAGCTTGTATGAACA-AAAGCAATTATTTTATG
1 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAA-ATAAACTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATG
* *
19840029 ACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
63 AAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-
* * * *
19840093 TTG-TTCGGT-AA-ATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTAGAGTA
126 TTGTTTC-ATAAACATAG-TT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * **
19840148 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTG-TTTATGATG
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAA
* * * * * *
19840212 AAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATTATTATTCAAATAATTATAACTATTTAAACTTGT
66 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGT
* * * * * * *
19840277 TT-AGTAAACATATTTAGTTTTAAAATCT-TATACTTATTAACTGTCAAAATA
130 TTCA-TAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * ** * * * * **
19840328 TTAATAAACTAATATTATTTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGGC
1 TTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAA
** * * * *
19840393 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA
65 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
** * * * * * *
19840458 TTTGGTAAACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCT-GAATGA
129 TTTCATAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAAT-A
* * * * * * *
19840511 -TAATAACTTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTATAAGAATAGCAAA-AATTATTTTATGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAACTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGA
* * * ** * *
19840573 TAAAATAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCCATAACTATTT-AAAT
64 AAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAATT
* * *
19840637 -TTTCA-AAA-A-AATTATTATTTAAAT-TCTTA-TTATTAAATTTTA-AATA
128 GTTTCATAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
19840683 TTAATAAAT
1 TTAATAAAT
19840692 AAATTATTTA
Statistics
Matches: 2068, Mismatches: 491, Indels: 336
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Matches are distributed among these distances:
166 2 0.00
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TCATAAACATAGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
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** * * *
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* ** * * *
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* *
19837914 ACTGGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAA
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* * *
19837975 ATATTATTATTTT-ATCCAAATAAGCATGATCAAAAACAATTATTTTAAGAGAAAACAAAGATCA
194 ATAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCATGATAAAAAACAATTATTTTAAAAGAAAACAAAGATCA
* * * * * *
19838039 TAATGATTTGAGAATGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTAATTCGAAAAATAGTT
259 TAACGATTTGAGAATGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTAATTCAAAAAATAGAT
* ** * * *
19838104 TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTCG
324 TTAAGTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCA
* ** *** * **
19838169 GATAAGTTTCTATGAGCTAAAACATTATTTTATGATGGAAGAAAAGGTCATAATGACTTTAAATA
388 AATAAGTTTCTATGAAATAAAACATTATTTTATGAACAAAAAAAAGGTCATAACAACTTTAAATA
* **
19838234 GTTAGATTGATTGTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTAAACTTGTTCAATAAAC-AATTTATCTTTT
453 G-TAGATTAATTGTTCAAAT-GGACATA-CTATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATTTAT-TTTT
* * * *
19838297 TAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG
514 TAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAG
* *
19838323 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTGCTTTAT
1 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTGATTTAT
* * *
19838388 GATTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTGTTAACTATTTGAAT
66 GATTAAACAAAAGATTAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAT
* * *
19838453 TGGTTCAGCAAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGTAATATTATTAAATT
131 TGGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAAAT
** ** * * *
19838518 AGTATTATTTTAATTTAAATAAGGTTTTATTAAAAGAAACAATTGTTTTATAAAG-AAATAAAGA
196 AGTATTATTTTAATCCAAATAA-GCATGA-T-AAA-AAACAATTATTTTA-AAAGAAAACAAAGA
* **
19838582 TCATAACGATTTGAG-ATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTCAAAAAAT
256 TCATAACGATTTGAGAAT-GATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTAATTCAAAAAAT
*
19838646 AGATTT-AGTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGA-TAAATATTATTTTA-
320 AGATTTAAGTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGT-AATATTATTTTAT
* *
19838705 TTCTAAATAATTTTGC-AT-AAATAGAAACAATTGTTTTAT-AACAAACAAAAAGGTCATAACAA
384 TTC-AAATAAGTTT-CTATGAAATA-AAAC-ATTATTTTATGAACAAA-AAAAAGGTCATAACAA
* * **
19838767 C-TTGAA-A-TAGA-TAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTT
444 CTTTAAATAGTAGATTAATTGTTCAAATGGACAT-ACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATTT
19838828 ATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAG
508 ATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAG
* * ** * * *
19838860 AATATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTCCAAATAGACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTAT
1 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTGATTTAT
** * * * * * *
19838925 GACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATACTTGTTC--ATCCAGTCATAACTATTTGA
66 GATTAAACAAAAGATTAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT--AGTCTTAACTATTTGA
** * * * * * *
19838988 ACTT-ACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATGAAT
129 A-TTGGTTCAGCAAACATATTTA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT
* *
19839052 AAAGTAGCATTATTTTA
191 AAAATAGTATTATTTTA
19839069 TTTCGAATAC
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GATTAAACAAAAGATTAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAT
TGGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAAAT
AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCATGATAAAAAACAATTATTTTAAAAGAAAACAAAGATCATA
ACGATTTGAGAATGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTAATTCAAAAAATAGATTT
AAGTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAAT
AAGTTTCTATGAAATAAAACATTATTTTATGAACAAAAAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGTA
GATTAATTGTTCAAATGGACATACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
CCTACCTATTAATTTTTAG
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19838814 TGATAAACAA
* * * *
19838824 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTC
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* * * * *
19838889 CAAATAGACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAA
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* * * * *
19838954 ATAAATACTTGTTCATCCAGTCATAACTATTTGAACTTACTCAGTAAATAG
131 ATAAATAATTATTCAACCAATAATAACTATTTGAACTTACTCAGTAAATAG
** * *
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1 ATTTA-TTTTTT-AAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATGAATAAAGTAGCATTATTTTAT
* * * * *
19839070 TTCGAATACACATGTTTGAACATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTG
64 TCCAAATACACATGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTG
* *
19839135 AAATAAATAATTATTTAACTAATAATAACTATTTGAA
129 AAATAAATAATTATTCAACCAATAATAACTATTTGAA
19839172 TGTGTTTTAT
Statistics
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CAAATACACATGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAA
ATAAATAATTATTCAACCAATAATAACTATTTGAACTTACTCAGTAAATAG
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19838422 TAATTGTTCT
* * * ** * * * *
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1 AATAGTCTTAAATATTTGAATTAGTTTGGCAAAAACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * ** **
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66 TTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTACAAAAAGAAACAATT
* *
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131 GTTTTATAAAGAAATAAAGAGCATAACGATTTAAGATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTAT
*
19838627 TTGAATTGTTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAT
196 TTGAACTGTTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAT
19838692 AAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAACAAAAAG
261 AAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAACAAAAAG
* * * *
19838757 GTCATAACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAAC
326 ATCATAACAACTTGAAACAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAAC
* *
19838822 AAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTCTTTTAT
391 AAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTAT
* * * *
19838887 TCCAAATAGACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTG
456 TCCAAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTCTTAT-A-AAAACAAAAGATC--AAC-ATTTG
** *
19838952 AAATAAATACTTGTTCATCCAGTCATAACTATTTGAACTTACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTT
516 AAATAAATACTTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTACGCAGTAAATAGATTTATTTTTTT
* * *
19839017 AAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATGAATAAAGTAGCATTATTTTATTTCGAATACACA
581 AAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATGAATAAAATAGCATTATTTTATTTCAAATACACA
* * *
19839082 TGTTTGAACATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATT
646 TGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
* * * *
19839147 ATTTAACTAATAATAACTATTTGAATGTGTTTTATGACAA
711 ATTCAAATAATAATAACTATTTGAATGTGTTTCATGAAAA
* * * *
19839187 AATAGTCTTAACTATTTGAGTTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAA
1 AATAGTCTTAAATATTTGAATTAGTTTGGCAAAAACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
*
19839252 TTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATTTTAATCTGAATAAGCTAGTACAAAAAGAAACAATT
66 TTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTACAAAAAGAAACAATT
* *
19839317 GTTTTATGACA-AAATGAAA-AGCATAATGATTTAAGATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAAC
131 GTTTTAT-AAAGAAAT-AAAGAGCATAACGATTTAAGATAGATAA-TAGTTCAAATAGTCATAAC
* ** *
19839379 TATTTGAACTGTTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAGT
193 TATTTGAACTGTTTCAAAAAATAGATTTAG-TTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * * * * *
19839444 AGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-AT
257 AGATAAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAACA-
* * *
19839508 AAAAGATCATAACAATTTGAAACAGATAATTATTCAAATGGACATGATTCTTTGAACTTGTTCGA
321 AAAAGATCATAACAACTTGAAACAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGA
*
19839573 TAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTAT
386 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTAT
*** * *
19839638 TTTATTTTGAATAAACTTATGTGAATAGAAACAATTG-CTT-T-AAGAC-AAA-A-C-A-A-TTG
451 TTTATTCCAAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTCTTATAAAAACAAAAGATCAACATTTG
* * *
19839694 AAATAAATGA-TTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTACGCGGTAAATAGATTTA-TTTTT
516 AAATAAAT-ACTTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTACGCAGTAAATAGATTTATTTTTT
* * *
19839757 T-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATACGC
580 TAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATGAATAAAATAGCATTATTTTATTTCAAATACAC
* * * * *
19839821 TTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAACAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAAT
645 ATGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAAT
* *
19839886 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTG-TTCA-GAAAA
710 TATTCAAATAATAATAACTATTTGAATGTGTTTCATGAAAA
19839925 TAGATTTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATAGTCTTAAATATTTGAATTAGTTTGGCAAAAACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
TTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTACAAAAAGAAACAATT
GTTTTATAAAGAAATAAAGAGCATAACGATTTAAGATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTGTTTCAAAAAATAGATTTAGTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAT
AAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAACAAAAAG
ATCATAACAACTTGAAACAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAAC
AAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTAT
TCCAAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTCTTATAAAAACAAAAGATCAACATTTGAAATA
AATACTTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTACGCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAAT
CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATGAATAAAATAGCATTATTTTATTTCAAATACACATGTAT
GAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCA
AATAATAATAACTATTTGAATGTGTTTCATGAAAA
Found at i:19840055 original size:180 final size:178
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Period size: 180 Copynumber: 5.6 Consensus size: 178
19839676 TTTAAGACAA
* * * * *** *
19839686 AACAA-TTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTACGCGGTAAATAGATT
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* *
19839750 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-ATAGTATTATTTTATTTCA
66 TATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCA
* ** *
19839814 AATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAACAGGTCAT
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* *
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*
19839930 TTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA
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*
19839994 TATAAGCTTGTATGAACAAAAGCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
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* *
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* * * *
19840110 TCATTTTTTAAATCTCTTT-CTCATTAATTTTTAGAGTATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
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* * * ** * * *
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126 CAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * *
19840226 AGCAATTTGAAATAGATTATTATTCAAATAATTATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACATATT
1 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATT
* * * ** * * * *
19840291 TAGTTTTAAAATCTTATACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTTAATCCG
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**
19840356 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCAT
128 AATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
** * * * ** *
19840408 AATGATTTGAAATAAATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATT
1 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATT
* * * * * * *
19840473 TATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTGAATGA-TAATAACTTTGTATTATTTTAATTGA
66 TATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAAT-ATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTCA
* * * * *
19840537 AATAAGCTTATAAGAATAGCAAA-AATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTAT
128 AATAAGCTTGTATGAACA--AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
** * * * *
19840589 GGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCCATAACTATTT-AAATT-TTCA--AAA-A-AA
1 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* *
19840648 TTATTATTT-AAAT-TCTTA-TTATTAAATTTTAAATATTAATAAAT
65 TTATT-TTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAAT
19840692 AAATTATTTA
Statistics
Matches: 679, Mismatches: 119, Indels: 63
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
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TATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAT
AAGCTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
Found at i:19840202 original size:528 final size:529
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Indices: 19839217--19840690 Score: 1487
Period size: 528 Copynumber: 2.8 Consensus size: 529
19839207 TTAGTTTGGC
* * * * * *
19839217 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATT
* * * * * *
19839282 TTAATCTGAATAAGCTAGTA-CAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAG-CATAATG
66 TTATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATG
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128 ATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTAGTAAATAGATTTA-
* ** * * **
19839409 TTTTTAAA--TCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAGTAGA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
191 TTTTTAAATTTTTCTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAATAA
** * * * *
19839471 TTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACAATTTGAAACAGATA
253 GCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
19839536 ATTATTCAAATGGACATGATTCTTTGAACTTGTTCGATAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCTA
318 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTA
* * *
19839601 CCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGTGAATAG
383 CCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACCTATATGAATAG
* *
19839666 AAACAATTGCTTTA-A-G-AC-AA-A-A-CAA-TTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAAC
448 AAACAATTG-TTTAGATGAACAAAGATAGCAATTTGAAATAAATGATTATTCAAATAATTATAAC
* *
19839723 TATTTGAACTTACGCGGT
512 TATTTAAACTTACGCAGT
* *
19839741 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATT
* * * * * **
19839806 TTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAACAGGTCATGACAA
66 TTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGGTCATAATGA
* *
19839871 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATAGATTTATT
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19839935 TTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAATATAAG
193 TTT-AAATTTTT-CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA-ATAAG
* * *
19840000 CTTGTATGAACA-AAAGCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA
254 CTTGTATGAATAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-
* * *
19840064 AATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCT-CT
317 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCT
** * * *
19840127 TTCTCATTAATTTTTAGAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAAT
382 ACCT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACCTATATGAAT
* * * *
19840192 TGATACAATTGTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATTATTATTCAAATAA
446 AGAAACAATTGTTTA-GATG-AAC-AAA-G--ATAGCAATTTGAAATAAATGATTATTCAAATAA
****
19840257 TTATAACTATTTAAACTTGTTTAGT
505 TTATAACTATTTAAACTTACGCAGT
* * * * * * ** *
19840282 AAACATATTTAGTTTTAAAATCTTATACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAACTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTA-T
* * *
19840347 TTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATG
65 TTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATG
* * * *
19840412 ATTTGAAATAAATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTTGGTAAACAGATTTAT
128 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTTAGTAAATAGATTTAT
* * * *
19840476 TTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTGAATGA-TAATAACTTTGTATTATTTTAATTGAAAT
192 TTTT-AAAT-TTTT-CTTATTAATT-TTTGAAT-ATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTCAAAT
* * * * **
19840540 AAGCTTATAAGAATAGCAAA-AATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAG
251 AAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * *
19840604 GTAATTGTTCAAATAGTCCATAACTATTT-AAATT-TTC-A-AAA-AAATT-ATTATTTAAAT-T
315 ATAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAATCT
* * *
19840662 CTTA-TTATTAAATTTTA-AATATTAATAAA
379 CCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
19840691 TAAATTATTT
Statistics
Matches: 786, Mismatches: 121, Indels: 75
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
523 2 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (529 bp):
AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATT
TTATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATT
TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTAGTAAATAGATTTATTTTT
AAATTTTTCTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTAT
GAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAA
TTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACCTATATGAATAGAAACAATT
GTTTAGATGAACAAAGATAGCAATTTGAAATAAATGATTATTCAAATAATTATAACTATTTAAAC
TTACGCAGT
Found at i:19841528 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 19841491--19841528 Score: 51
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
19841481 TATTTTTGAT
*
19841491 AATTTTTATGAAATGAAAC
1 AATTTTTATG-AATAAAAC
19841510 AATTTTTATG-ATAAAAC
1 AATTTTTATGAATAAAAC
19841527 AA
1 AA
19841529 AAGGTCATAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
17 8 0.44
19 10 0.56
ACGTcount: A:0.50, C:0.05, G:0.08, T:0.37
Consensus pattern (18 bp):
AATTTTTATGAATAAAAC
Done.