Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: NW_019167871.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_14, whole genome shotgun sequence

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000

Length: 22631831
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.15, T:0.34

Warning! 114000 characters in sequence are not A, C, G, or T


File 116 of 125

Found at i:21763058 original size:181 final size:179

Alignment explanation

Indices: 21762408--21763060 Score: 539 Period size: 181 Copynumber: 3.6 Consensus size: 179 21762398 TAGGAACTGC * * 21762408 TTCAATAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-G 1 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTATG * * * ** 21762472 TATTATTTTATTCCT-AACAAGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAAC-AATGT 65 -ATTATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACA-AA-TATTTTATGGCAAAACAAAAAT * ** * * 21762534 TCATAACGATTTGAAAT-AGTAA-TAATTGAATAGCCATAATTATTTGAATTTA 126 TCATAACGATTTTAAATAAGTAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTTA * * * * * 21762586 TTCAGTAAACAAATTCACTTTTTAAA----TAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATT 1 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAAT-AA--ATT * * * ** * 21762647 ATTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTT-TAATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAACCAAAA 62 ATGATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGT-ATG-AATGAAACAAATATTTTATGGCAAAACAAAA * * ** * 21762710 CA-TCATAACGATTTTAAATATA-CAATTGTTCAAATAGTCGCAATTATTTGAATTTG 124 -ATTCATAACGATTTTAAATA-AGTAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTTA ** * * * * 21762766 TTCAAAAAAT-GCATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTGTTAATTTTTAAACTATTAAAAAATTAA 1 TTCAGTAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATT-A * * * * * * * 21762830 T-ATTATTTTATTTTGGATAACCTTTTATGAGCTGAAGCAATTATTTTATGGCAAAACAAAAATT 63 TGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATGAAACAAATATTTTATGGCAAAACAAAAATT * * ** 21762894 CATAACAATTTTAAATAAGTAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTA 127 CATAACGATTTTAAATAAGTAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTTA * * * * 21762946 TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAT 1 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAT * * 21763011 GATTGTTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATATGAAACAAATATTTTATG 64 GATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATGAAACAAATATTTTATG 21763061 ACTAAAATTA Statistics Matches: 373, Mismatches: 71, Indels: 59 0.74 0.14 0.12 Matches are distributed among these distances: 174 24 0.06 175 4 0.01 176 1 0.00 177 39 0.10 178 40 0.11 179 9 0.02 180 68 0.18 181 154 0.41 182 11 0.03 183 4 0.01 184 19 0.05 ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.09, T:0.44 Consensus pattern (179 bp): TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTATGA TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACAAATATTTTATGGCAAAACAAAAATTCATA ACGATTTTAAATAAGTAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTTA Found at i:21763511 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21763148--21765580 Score: 1816 Period size: 181 Copynumber: 13.5 Consensus size: 181 21763138 CATTTGATAA * * * * * * 21763148 AAAACAATTGTTTGATAACAAAA-AAAATGGTTATAGCTATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATT 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA ** * * * * * * 21763212 GCCATAATTACTT-AAC-TGATTTGATGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT 65 GTTATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT * * * * 21763274 TTAGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-TAGTATAAACTTTGTATTAACT 129 TTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAAC-TTGTATGAACT * * * * * * * 21763329 AAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAAATAAACAATTATTCAAATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * 21763394 TTATAACTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATAGACTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTT 66 TTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTT * * * 21763459 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-AACT 130 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT ** * * * * * * 21763510 AAAACAATTACTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * * * * 21763575 -TATTAA-TCATATAAACTGGTTCGATAAACA-A-AT-TTTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTT 66 TTA-TAACT-ATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT *** * * * * * * 21763632 TCAAAATATTATTAAATTTGTATTA-TTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACT 129 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * * * ** * 21763684 AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAACTAGATAATAATTCATATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * * * ** * 21763748 TCT-TAACTATTTGAAC-TATTCGGCAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT 66 T-TATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT *** * * * * * 21763811 CAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTAT-AAAT 130 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * * 21763862 AGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATGACTTGAAATAGATAATTATTCATATA 1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * * * * *** * 21763927 GTCAAAACTATATGAAATGGTTTGGTAAACCTATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT 65 GTTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT * * * * * * 21763992 CTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAACAAACTTATATGAACA 130 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAACT * * * 21764044 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAATGATTTGAAATAAATAAATTTTTAAATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGAT-AA----T---T-G * * * * 21764108 TT-ATAATTATTTTATAATTATTTGAAC-TGATTTGGTGAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA 57 TTCA-AA-TA-GTTATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA ** * * * * * 21764171 CTTA-TAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCTGAATAAACTTGTAGGAGCT 118 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * 21764235 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * ** * * * * 21764300 TCT-TAACTGTTTG-ATTTGGTTTGACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAAATT 66 T-TATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT * * * 21764363 TTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAAC- 129 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * * * ** * 21764415 AGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTTACAATAATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATA 1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * * * * 21764480 GTCATAACTATTT-AAATTATTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTAGATCTCTTAC----TAA-TT 65 GTTATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT * * * **** 21764538 CTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGTTGA 129 TTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * * 21764592 AAAAGAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAAGGTAATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATG 1 AAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA ** * * * 21764657 GCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAACT-GATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA-T 65 GTTATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT * * * * * * 21764719 TTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAATT 128 TTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * ** 21764774 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTGTTCAAATA 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * * * * * * 21764838 ATAATAACTATTTGAGCTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTT 65 GTTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT * * * 21764903 TTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGGATGAACT 129 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * * * * 21764956 AAAATAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * 21765021 TCT-TAACTATTTGAA-ATGATTTGGTAAACACATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT 66 T-TATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT ** * * 21765084 TTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATG-A-T 129 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * * 21765135 AAGAACCAATTTTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGAGATTA-ATATTTGTTCAAA 1 AA-AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAA * ** * * ** * * * * 21765198 TGGTCGTAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAA-T 63 TAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT * * ** * * 21765262 TTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATT-TCGGATAAATTTTTATGAACT 128 TTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * 21765317 GAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTGATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * * * 21765382 TCATATCTATTTGAACTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT 66 TTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT * * * 21765447 TTGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATAAACT 130 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAACT * * * * * * * * 21765499 GAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAATGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGG 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG 21765564 TCT-TAACTATTTGAACT 66 T-TATAACTATTTGAACT 21765581 GGATTGGCAA Statistics Matches: 1788, Mismatches: 378, Indels: 171 0.77 0.16 0.07 Matches are distributed among these distances: 172 7 0.00 173 78 0.04 174 39 0.02 175 14 0.01 176 62 0.03 177 71 0.04 178 58 0.03 179 30 0.02 180 228 0.13 181 596 0.33 182 381 0.21 183 70 0.04 184 9 0.01 185 1 0.00 187 1 0.00 188 2 0.00 189 3 0.00 190 9 0.01 191 111 0.06 192 18 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (181 bp): AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG TTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACT Found at i:21765328 original size:543 final size:538 Alignment explanation

Indices: 21763238--21765606 Score: 2090 Period size: 543 Copynumber: 4.4 Consensus size: 538 21763228 TGATTTGATG * * * 21763238 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTTGTATTATT 1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * * ** 21763302 TTATTTAGTATAAACTTTGTATTAACTAAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAGCG 65 TTATTTA-AATAAAC-TTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATG * * * ** * * * * 21763367 ATTTTAAATAAACAATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAGCTTG-TTCGGTAAATAGACTTA 128 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTGA-AATGATTTGGTAAACACATTTA * * * * * 21763430 TTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTT-ATTCTAA 191 -TTT-TTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AA * ** * * * * 21763494 ATAAGCTTGTATAACT-AAAACAATTACTTTATGACTAAACAAAAGGTCAA-AACAATTTGAAAT 252 ATAAGCTTGTATGA-TAAAAACAATTTTTTTATAACAAAAC-AAAGAT-AATAACGATTTGAAAT * * * * * * * * 21763557 AAATAATTGTTCTAATAGT-ATTAATCATATAAACTGGTTCGATAAACA-AATT-TTTTTAAAAT 314 AAATAATTGTTCAAATAGTCA-TAATTATTTGAACTAGTTCGAAAAATAGAATTATTTTTTAAAT ** * * * * * * * 21763619 CTCTTA--T--TAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTA-TTTAATCCAAATAAGCTTATAT 378 CTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTTTAT * * * * * * ** 21763679 GAACT-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAACTAGATAATAATTCA 443 GAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCA * * * 21763743 TATAGTCTTAACTATTTGAAC-TATTCGGCA 508 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGCA ** * * * * * * * * 21763773 ATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTT 1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * * ** * * * 21763838 TATTCCAAATAAAATAGTAT-AAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATGA 66 TATT-TAAATAAACTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATGA * * ** * * 21763902 CTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCAAAACTATATGAAATGGTTTGGTAAAC-CTATTTATT 129 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAC-ATTTA-T * * * * 21763966 TTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAA 192 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAA * * * * * * 21764031 ACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTAATAATGATTTGAAATAAATA 256 GCTTGTATG-ATAAAAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAGA-TAATAACGATTTGAAATAAAT- * * * * * 21764095 AATT-TTTAAATAGTTATAATTATTTTATAATTA-TTTGAACTGATTTGGTGAATAGAATTATTT 318 AATTGTTCAAATAGTCATAATTA-TTT-GAACTAGTTCGAA---A-------AATAGAATTATTT * * * * * 21764158 TTTAAATCTCTTACTT-ATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCTGAATA 371 TTTAAATCTCTTACTTAAT-AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-AAATA * * * * * * 21764221 AACTTGTAGGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGAT 434 AACTTTTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGAT * * * * * * * 21764286 AATTGTTTATATAGTCTTAACTGTTTG-ATTTGGTTTGACA 499 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGCA ** * * * 21764326 AATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATGAAATTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATT 1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * 21764390 TTATTTTAAATAAACTTGTATGAAC-AGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTTACAATA 65 TTA-TTTAAATAAACTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATG * * * * * * * 21764454 ATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTATTTTGATAAATAGATTTAT 128 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGA-TTTGGTAAACACATTTAT * * * * 21764518 TTTTAGATCTCTTAC----TAATTCTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAA 192 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAA * * * * * * 21764579 GCTTGTATGTTGAAAAAGAATTGTTTTATGATAA-AAAAAAAAGGTAATAATGATTTGAAATATA 256 GCTTGTATGAT-AAAAACAATT-TTTT-T-ATAACAAAACAAAGATAATAACGATTTGAAATAAA * * * * * * 21764643 TAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACT-GATTTGATAAACT-GATTTATTTTTTAAATTT 317 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTCGA-AAAATAGAATTATTTTTTAAATCT * * * * 21764706 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGA 380 CTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTTTATGA * * * * 21764771 ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTGTTCAAA 445 ACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAA * * * * 21764836 TAATAATAACTATTTGAGCTTGTTCGGTA 510 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGCA * * * 21764865 AACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATT 1 AACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * * 21764930 TTATTCTGAATAAACTTGGATGAACTAAAATAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAATGT 65 TTATT-TAAATAAACTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATGA * 21764995 TTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACACATTTAGTT 129 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACACATTTA-TT * 21765060 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAG 193 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAG * * * * * * 21765125 CTTGTATGATAAGAACCAATTTTTTTATAACAAAACAAAGATCATAGCGATTTGAGATTAATATT 257 CTTGTATGATAA-AAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAGATAATAACGATTTGAAATAAATAAT * * * ** * * 21765190 TGTTCAAATGGTCGTAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCT 321 TGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGAAAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACT * ** * 21765255 TAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTGAA 386 TAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTTTATGAACTGAA * * ** 21765320 ATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTGATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA 451 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * * 21765385 TATCTATTTGAACTTGTTAGGTA 516 TAACTATTTGAACTTGTTCGGCA * * * * 21765408 AACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTATT 1 AACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * 21765473 TTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAATGGTTAGAATGA 65 TTATTT-AAATAAACTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATGA * * * * * 21765538 TTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGTCTTAACTATTTGAACTGGA-TTGGCAAAGCACATTTAT 129 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAAT-GATTTGGTAAA-CACATTTAT 21765602 TTTTA 192 TTTTA 21765607 TTATTAAATT Statistics Matches: 1493, Mismatches: 267, Indels: 140 0.79 0.14 0.07 Matches are distributed among these distances: 532 6 0.00 533 89 0.06 534 119 0.08 535 60 0.04 536 5 0.00 537 1 0.00 539 153 0.10 540 146 0.10 541 21 0.01 542 9 0.01 543 372 0.25 544 28 0.02 545 59 0.04 546 15 0.01 547 1 0.00 548 59 0.04 549 18 0.01 550 68 0.05 551 22 0.01 552 87 0.06 553 150 0.10 554 5 0.00 ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43 Consensus pattern (538 bp): AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT TATTTAAATAAACTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATGATT TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACACATTTATTTTT AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTG TATGATAAAAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAGATAATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC AAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGAAAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATA ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTTTATGAACTGAAATAAT TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT ATTTGAACTTGTTCGGCA Found at i:21765642 original size:153 final size:152 Alignment explanation

Indices: 21765458--21765732 Score: 340 Period size: 153 Copynumber: 1.8 Consensus size: 152 21765448 TGAATTTTAA * * * * * 21765458 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAA 1 TAAATTAGTATTATTTAATCTCAAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA *** * * * 21765522 CAAATGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TGGTCTTAACTATTTGAACTGGATT 65 CAAA-GACCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAGTAGTCATAACTATTTGAACTGGATT 21765586 GGCAAAGCACATTTATTTTTATTAT 128 GGCAAAGCACATTTATTTTTATTAT * * 21765611 TAAATTAGTATTATCTTAATCT-AAATAAGCTTTTATGAAAAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAA 1 TAAATTAGTATTAT-TTAATCTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA * * * * 21765675 TAAAGACCATAACGATTTGAGATAGATAGTTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACT 65 CAAAGACCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACT 21765733 AATTTAGTAA Statistics Matches: 102, Mismatches: 17, Indels: 7 0.81 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 151 2 0.02 152 42 0.41 153 50 0.49 154 8 0.08 ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.14, T:0.39 Consensus pattern (152 bp): TAAATTAGTATTATTTAATCTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC AAAGACCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACTGGATTGGC AAAGCACATTTATTTTTATTAT Found at i:21766213 original size:182 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21765605--21767413 Score: 1324 Period size: 180 Copynumber: 10.0 Consensus size: 180 21765595 CATTTATTTT * * * * * * * 21765605 TATTATTAAATTAGTATTATCTTA-ATCTAAATAAGCTTTTATGAAAAGAAGCAATTGTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG * ** * * * * 21765669 ACAAAA-TAAAGACCATAACGATTTGAGATAGATAGTTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACT 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT ** * * * * * * * 21765733 AATTTAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTAAT-A--TTCAAAA 129 TGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTAGAA * * * * ** 21765781 TATTAGTAAATCAATATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG * ** * * * 21765845 ACAAAACAAAAGGTCACAAGGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATGACTATTTGAACT 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT ** * * *** 21765910 TGTTTGGGACATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTT--TAATTTTTAGAA 129 TGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTAATAATTTTTAGAA * * * 21765961 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTACGAATAGAAACAATTATTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG ** * * 21766025 ACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTAAGCT 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA-CT * * * 21766090 TGCTCGGTAAATAGATTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAA 129 TGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTAGAA * * * * * * 21766143 TACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGGTTATATGAACAGAAATAATTGGTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA * * * 21766208 CAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATAAAT-ATTGTTCAAA-AGGTCATAACTATTTAA-AT 66 CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTAACTT * ** * 21766270 GTGTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTAATAATTTTT-GAAA 130 GT-TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTAG-AA * 21766321 TATTAAGAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT 1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * * 21766384 GACAAAATAGAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTAATAATTATTTAAAT 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC * * * * * * 21766448 TTGTTCAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTAGGAA 128 TTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTA-GAA * * * * 21766501 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTT-AATGAACTA-ATACAATTGTTTTAA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * * 21766564 AATC-AAACAAAATGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGA 64 GA-CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA * ** * * * * * * 21766628 CTTTTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTT-ATTATTTGTCAAAA 127 CTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTT-TTAGAA * * * * * * 21766682 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT- 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG * * ** * * * 21766745 AAAATAATAAAAAATCATAA-TGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAA 65 ACAA-AACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA * * * ** 21766809 CTTATTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATATTTTTCAATTGTTT-G-A 127 CTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTAAT-AATT-TTTAGAA * * * * 21766864 TATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA-TATTCTTTTAT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTAT * * 21766927 GACAAAACAAAAGGTTAT-AGTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAA 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTAA * * * * * 21766991 CTTATTCAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA 127 CTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTAGAA ** * * * * * * * 21767046 TATTAATAAGCTAGAATAATGTTATTTCAAATGAA-CTTGTATGAATAGAAAGAATTGATTTGTG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG * * * ** * * ** 21767110 ATAACACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGCAATCATAAATACTTGCAC 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTAAC * * * * * * * * * 21767174 TAGGT-AGGCT-AATAGATTCATTTTTTAAAT-TAGTTAGTTATTAAATTTCAAAA 128 TTGTTCA-G-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTAATAATTTTTAGAA * * * * * * 21767227 TATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGATTGTATGACT-GCAAAC-ATTTTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATG * ** * * * * * 21767290 ACAAAACAATTA-GTCATAAAAATTTGAAAAAAAATAATTGTTCACATAGTTA-AACTAATTGAA 65 ACAAAACAA-AAGGTCATAACTATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTAA * * * * * * * * * 21767353 C-TGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTGACTCTCTTACTTATTAATTTTCAAAA 127 CTTG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTAGAA 21767407 TATTAAT 1 TATTAAT 21767414 TTTGAATCAT Statistics Matches: 1309, Mismatches: 258, Indels: 128 0.77 0.15 0.08 Matches are distributed among these distances: 176 60 0.05 177 75 0.06 178 117 0.09 179 54 0.04 180 324 0.25 181 320 0.24 182 322 0.25 183 32 0.02 184 4 0.00 185 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (180 bp): TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAACTTG TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTAGAA Found at i:21766802 original size:540 final size:541 Alignment explanation

Indices: 21765605--21767106 Score: 1530 Period size: 540 Copynumber: 2.8 Consensus size: 541 21765595 CATTTATTTT * * * * ** 21765605 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCTAAATAAGCTTTTATGAA-AAGAAGCAATTGTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTTTATGAACAA-AAATAATTGTTTTATG * * * * * * 21765669 ACAAAAT-AAAGACCATAACGATTTGAGATAGATAGTTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACT 65 ACAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-- * * * * * ** 21765733 AATTTAGTAAACA-A-ATTTAGTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATATTCAAAATATT-AGTAAAT 127 ATTTTA-AAAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAG-AAAT ** ** 21765792 CAATATTATTTTATTCT-AAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA 190 TTATATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA * * ** * * ** * * 21765856 GGTCACAAGGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-ACATGACTATTTGAACTTGTTTGGGAC 254 GGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTA-ATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAA * * ** * 21765920 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAC-CTTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT 318 ACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT * * ** * * 21765984 A-TTCTGAATAAACTTGTACGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTAT 383 ATTTC-AAATAAACTTGAACGAATAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAATATCATAACGAC * * 21766048 TTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTAAGCTTGCTCGGTAAATAGATTTACTTT 447 TTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAGCTTGCTCGGTAAACAGATTTACTTT * *** 21766113 TTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAA 512 TTAAAATCTTTTACTTAATAATTTTCAAAA * * * * * * 21766143 TACTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGGTTATATGAACAGAAATAATTGGTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG * * * 21766207 ACAAAACAAAAGGTTATAACT-ATTTGAAATAAAT-ATTGTTCAAA-AGGTCATAACTATTTAAA 65 ACAAAATAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTAAA * * 21766269 TGTGTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTAATAATTTTTGAAATATTAAGAAATTT 128 T-TTTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTT * * 21766334 ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAGAAGGT 192 ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * * * 21766399 TAAAACAATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTAATAATTATTTAAATTTGTTCAGTAAACAT 257 TAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAG 21766463 ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT 322 ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * 21766527 TCAAATAAGCCTT-AATGAACTA-ATACAATTGTTTTAAAATC-AAACAAAATGTCATAACGACT 386 TCAAATAA-ACTTGAACGAA-TAGAAACAATTATTTTAAAA-CAAAACAAAATATCATAACGACT * * * * * ** * * 21766589 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTT-GGACTTTTTTGGTAAACATATTTA-TTT 448 TGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAG-CTTGCTCGGTAAACAGATTTACTTT * 21766652 TTAAAATCTTTTACTT-ATTATTTGTCAAAA 512 TTAAAATCTTTTACTTAATAATTT-TCAAAA * 21766682 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT-A 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA * * * * 21766746 AAATAATAAAAAATCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACT 66 CAA-AATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-T * * * * * * 21766811 TATTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATATTTTTCAATTGTTTG--ATATTAATAAA 129 T-TTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTA-CTTATT-AATT-TTTGAAATATTAAGAAA * * * * 21766874 TTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA-TATTCTTTTATGACAAAACAAA 189 TTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA * ** * * * * 21766938 AGGTTATAGTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTTATTCAGTAA 253 AGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAA * ** * * * 21767003 ACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAGCTAGAATAATGT 318 ACAGATTCA-TTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * * 21767068 TATTTCAAATGAACTTGTATGAATAGAAAGAATTGATTT 382 TATTTCAAATAAACTTGAACGAATAGAAACAATT-ATTT 21767107 GTGATAACAC Statistics Matches: 795, Mismatches: 129, Indels: 72 0.80 0.13 0.07 Matches are distributed among these distances: 535 5 0.01 536 4 0.01 537 19 0.02 538 84 0.11 539 173 0.22 540 249 0.31 541 37 0.05 542 4 0.01 543 92 0.12 544 51 0.06 545 69 0.09 546 8 0.01 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (541 bp): TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA CAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTT TAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTTATAT TATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAA ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTC ATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA TAAACTTGAACGAATAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAATATCATAACGACTTGAAATAA ATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAGCTTGCTCGGTAAACAGATTTACTTTTTAAAATCT TTTACTTAATAATTTTCAAAA Found at i:21768093 original size:171 final size:171 Alignment explanation

Indices: 21767870--21768177 Score: 422 Period size: 171 Copynumber: 1.8 Consensus size: 171 21767860 AACAAGTTCA * * * 21767870 AATAGTCATAACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAA 1 AATAGTCATAACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATTATTACGACATTTTGTTTCATCATAAA * * * 21767935 ACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAA 66 ACAATTATATCTATTAATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAA 21767999 AAATTAATGAGCAAGGGATTTGAAAAATGAATCTATTTACCG 130 AAATTAATGAGCAAGGGATTTGAAAAATGAATCTATTTACCG * * * * ** * 21768041 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTGTTTC-AATTCATTACGACATTTTGTTTTGTCGTAA 1 AATAGTCATAACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATT-ATTACGACATTTTGTTTCATCATAA * * * * * 21768105 AATAATTCTTTCTATTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTTTTAATATTCCAA 65 AACAATTATATCTATTAATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAA 21768170 AAATTAAT 130 AAATTAAT 21768178 AAGTAAAAAT Statistics Matches: 117, Mismatches: 18, Indels: 4 0.84 0.13 0.03 Matches are distributed among these distances: 170 4 0.03 171 110 0.94 172 3 0.03 ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.08, T:0.43 Consensus pattern (171 bp): AATAGTCATAACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATTATTACGACATTTTGTTTCATCATAAA ACAATTATATCTATTAATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAA AATTAATGAGCAAGGGATTTGAAAAATGAATCTATTTACCG Found at i:21768323 original size:180 final size:175 Alignment explanation

Indices: 21767466--21769247 Score: 1395 Period size: 180 Copynumber: 10.0 Consensus size: 175 21767456 TTTTGTTCCT * * ** ** 21767466 ATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATGA 1 ATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * * * * * * * 21767531 TTATCCATTTCAATTTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAG 65 TTATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG * * * 21767596 CTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-CAGACAATTA 129 CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTA * * * ** * 21767643 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAAAACTCTATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTG 1 ATAAG----AGATTT-AAAAATAAA-TCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG * * * * * * 21767708 AACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACTTTTTATTTTGTCAAAAAATAAATT-TTT-TGTTC 60 AACAATTATCTA-TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTC * *** * * * 21767770 ATAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA 122 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA * * * * * * * * 21767824 ATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA 1 ATAAG----AGA-TTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA * * * * ** * * * * 21767889 ATAATTTTCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATA 61 ACAATTATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA * * * 21767954 TAGGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA 125 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA * * 21768005 ATGAGCAAGGGATTTGAAAAATGAATCTA-TT-T---ACC-G----AATAGTTATGACTATTTGA 1 AT----AAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA * * * * * * * * * 21768060 ACAATTTTTTGTTTCAATTCA-TTACGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTCTTTCTATTCAT 61 ACAATTATCT-ATTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT * * 21768124 ATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTTTTAATATTCCAAAAATTA 124 ACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTA * * 21768176 ATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACGCA-TTCAAATAGTTATGATTATTTG 1 ATAAG---AGA-TTTAAAAATAAATCTATTTATC-GAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG * * * 21768239 AACAATTATCTATTGCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTGAT 60 AACAATTATCTATT-CAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT * * ** 21768304 ACAAGCATATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA 124 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA * * * * 21768356 AT-A-AGATTTAAAAAAGTAAATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGA 1 ATAAGAGATTT-AAAAA-TAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGA * * * * * * 21768419 AAAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATA 61 ACAATTATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA * ** * * 21768484 CAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAAA 125 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT--A * * * * * ** * * * * 21768537 ATGTAGGAGATATAAAAGTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATA 1 A--TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA * ** * * * * 21768602 ATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAA 64 ATTATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA ** * * *** * 21768667 AATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAGTTA 128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA * * * * * ** * * 21768715 ATAAGAGATTTAAAAACCAAATTTTTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAA 1 ATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * * * ** * 21768780 TTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAG 65 TTATCTAT-TCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG ** * * 21768844 CTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTA 129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA * * * * 21768891 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA 1 ATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * * * * * * 21768956 TTATCTACTTCAAATTGTTTTTACCTATTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TATTTCATACAA 65 TTATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA * * 21769020 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAA 128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-A * * 21769069 TGACTAAGAGATTTAAAAAAAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAA 1 --A-TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAA * * * * 21769133 CAATTATCTATTTAAAGTCA-TTA-GACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATA 62 CAATTATCTATTCAAA-T-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA * * * * * * 21769196 AAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTA 125 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA 21769247 A 1 A 21769248 AAAACAAGTT Statistics Matches: 1296, Mismatches: 239, Indels: 141 0.77 0.14 0.08 Matches are distributed among these distances: 167 3 0.00 170 14 0.01 171 117 0.09 172 3 0.00 174 3 0.00 175 11 0.01 176 176 0.14 177 140 0.11 178 4 0.00 179 197 0.15 180 350 0.27 181 153 0.12 182 83 0.06 183 30 0.02 184 4 0.00 185 8 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (175 bp): ATAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT TATCTATTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA Found at i:21768564 original size:359 final size:353 Alignment explanation

Indices: 21767469--21769249 Score: 1436 Period size: 359 Copynumber: 5.0 Consensus size: 353 21767459 TGTTCCTATA * * ** * ** 21767469 AGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATGATTA 1 AGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTT-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTA * * * * * * * * 21767534 TCCATTTCAATTTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTT 64 TCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCAT * * * * 21767599 ATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA 128 A-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAG----AGATTT-AAA * * * * * * 21767662 AAAAAACTCTATTTACCAAATAAATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA 186 AAAAAA-TCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * 21767726 ATCATTATGACTTTTTATTTTGTCAAAAAATAAATT--TTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGATT 250 ATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT * * * 21767789 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT 314 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAA-AAGT * * * * * * * * * * * 21767830 AAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATT 1 -AGAGA-TTTAAAAATAAATCTATTT-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATT * * * ** * * * * * * * 21767895 TTCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCT 63 ATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCA * ** * 21767960 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGCAAGGGATTTGAAAA 127 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAA ** * * * * 21768025 ATGAATCTATTTA-C---C--G----AATAG-TTATGACTATTTGAACAATTTTTTGTTTCAATT 187 AAAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * * 21768079 CATTACGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATT-CTTTCTATTCATATAAGCTTATTTCAAATAA 252 CATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGC-TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA * * 21768143 AATAATA-TAAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATAAGT 316 AATAATACT-AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAA-AAGT * * 21768182 AAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACGCA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATT 1 AGAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTTC-GAAC-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATT * * * 21768246 ATCTATTGCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTGATACAAGCA 63 ATCTATT-CAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCA * 21768311 TATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A-AGATTTAAAAAAGTA 127 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA--A * * * * 21768374 AATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAAT- 190 AATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAG--ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * * 21768438 AGTTATGATC-TTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAA 253 A-TTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA * 21768502 AATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAAAATGT 316 AATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAAAA-GT * * * * ** * * * 21768541 AGGAGATATAAAAGTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATG-TCCATTTGAATAATT 1 A-GAGATTTAAAAATAAATCTATTT-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGAT-TATTTGAACAATT * ** * * * * * 21768605 ATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAA-AA 63 ATCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCA * * * * * 21768669 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAGTTAATAAGAGATTTAAAAACCA 127 -TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-AA * * * * * * ** 21768734 AATTTTTTTA-CCAAAATAGTTTAAATAG-TTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTCAAATTG 190 AATCTATTTATCGAACA-AGTTTAAATAGATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * ** * * * * 21768797 TTATG--ATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAA 254 TTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * 21768860 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATA-- 318 TAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAAAAGT * * * * * 21768894 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTA 1 AGAGATTT-AAAAATAAATCTATTT-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTA * * * * * * * 21768959 TCTACTTCAAATTGTTTTTACCTATTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TATTTCATACAAGCT 64 TCTA-TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCA * ** 21769023 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAA 127 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAA * 21769088 AAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGT 188 AAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T * * * * * *** 21769151 CATTA-GACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAA 252 CATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA * ** * 21769215 ATAATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAAAA 317 ATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAAAA 21769250 AACAAGTTAT Statistics Matches: 1146, Mismatches: 214, Indels: 124 0.77 0.14 0.08 Matches are distributed among these distances: 344 5 0.00 345 5 0.00 346 11 0.01 347 1 0.00 350 8 0.01 351 200 0.17 352 67 0.06 353 126 0.11 354 1 0.00 355 5 0.00 356 200 0.17 357 55 0.05 358 6 0.01 359 249 0.22 360 30 0.03 361 22 0.02 362 142 0.12 363 10 0.01 366 3 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (353 bp): AGAGATTTAAAAATAAATCTATTTTCGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATC TATTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATT CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAATCTA TTTATCGAACAAGTTTAAATAGATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA ATTTATTAAAATTCCAAAAATTAAAAGT Found at i:21769113 original size:533 final size:530 Alignment explanation

Indices: 21767467--21769233 Score: 1706 Period size: 533 Copynumber: 3.3 Consensus size: 530 21767457 TTTGTTCCTA * * * ** 21767467 TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATGAT 1 TAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * *** * * ** 21767532 TATCCATTTCAATTTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGC 65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAA * * * 21767597 TTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA 130 TTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGA-AATTAATAAG---AAGATTT-AAA * * * * 21767662 AAAAAACTCTATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA 190 AAAAAA-TTTTTTTACCAAA-ATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAA * * * * * * 21767727 TCA-TTATGACTTTTTATTTTGTCAAAAAATAAATT-TTT-TGTTCATAGAAGCTTATTTGGATT 252 T-AGTTATGA-TCTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATT * ** 21767789 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGT 314 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGT * * * * * * 21767854 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATTGTTATGACA 375 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC * * * * * 21767918 TTTTGTTTCA-TCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATATTA 440 TTTTGTTT-AGTCATAAAACAATTAT-TCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA * * 21767982 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGC 503 ATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATGA-C * * 21768011 -AAGGGATTTGAAAAATGAATCTATTTA-C---C--G----AATAGTTATGACTATTTGAACAAT 1 TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * * * * ** 21768065 TTTTTGTTTCAATTCATTACGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTCTTTCTATTCATATAAGC 65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAA * ** * 21768130 TTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAA 130 TTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTGAAATTAATAAG--AAGA-TTTAAA * * * *** * 21768194 AATAAATCTATTTT-CTGAACGCATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTGCAAA 190 AAAAAAT-TTTTTTAC-CAAAATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-CAAA * * * * ** * 21768258 TAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTGATACAAGCATATTCAAAATAA 252 TAGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATTAA * * * * 21768323 AATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A-AGATTTAAAAAAGTAAATCTATTTATC 316 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTATC * * * * * * 21768386 GAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTT 380 GAACAAGTTCAAATAGTTA-TA-GACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT * * * ** 21768451 TGTTGT-GTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT 443 TGTT-TAGTCATAAAACAATT-ATTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT * 21768515 TATTAAAATTCTAAAAATTAAAATG-- 506 TATTAAAATTCAAAAAATT--AATGAC * * * * * * * * * * 21768540 TAGGAGATATAAAAGTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATT 1 TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * * 21768605 ATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAAT 66 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAAT * * * 21768670 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAGTTAATAAG-AGATTTAAAAACC 131 TATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAA-TTAATAAGAAGATTTAAAAA-A * * * 21768733 AAATTTTTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTCAAATTGT 193 AAATTTTTTTACCAAAATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TCAAATAGT ** * 21768798 TATGATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAA 256 TATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAA * * * * 21768863 TACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCA 321 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAA * * * * * * 21768928 GTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAATTGTTTTTACCTATTGTTTAGT 386 GTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGT * * 21768992 CATAAAACAATTATTTTATTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT 451 CATAAAACAATTATTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT 21769057 TCAAAAAATTAATGAC 515 TCAAAAAATTAATGAC * 21769073 TAAGAGATTTAAAAAAAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAAT 1 TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAT * * 21769137 TATCTATTT-AAAGTCATTA-GACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATA-AAA 65 TATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAA * * 21769199 ACTTA-TCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT 129 A-TTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT 21769234 TTTTCAAAAA Statistics Matches: 993, Mismatches: 182, Indels: 108 0.77 0.14 0.08 Matches are distributed among these distances: 526 10 0.01 527 26 0.03 528 2 0.00 529 15 0.02 530 114 0.11 531 75 0.08 532 140 0.14 533 284 0.29 534 5 0.01 535 92 0.09 536 81 0.08 537 14 0.01 538 7 0.01 539 104 0.10 540 1 0.00 543 18 0.02 544 5 0.01 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (530 bp): TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAAT TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAATTAATAAGAAGATTTAAAAAAAAA TTTTTTTACCAAAATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTCAAATAGTTATGA TCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTA ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCA AATAGTTATAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAA AACAATTATTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAA AATTAATGAC Found at i:21769661 original size:182 final size:177 Alignment explanation

Indices: 21769254--21769729 Score: 481 Period size: 182 Copynumber: 2.7 Consensus size: 177 21769244 TTAAAAAACA * * * ** * 21769254 AGTTATGACTATTTGAATAAATATCAATCTGAAATCATTATGGTC-TTTGTTTTCTCATAAAATA 1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATA * * * * * * * * 21769318 ATTATTTGTGA-TCATTCAAGCTTATTTG-GATGAAAATAATATTAATTTAATAATATTCTAAAA 65 ATTGTTT-TAATTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAA * * * * * 21769381 ATTAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAAT 128 ATTAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTACTAAACAAATTCAAAT ** * * * * * * * 21769431 AGTTAAAACTATTAGAATAATTTTTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAGAATA 1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AATA * * 21769496 ATTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATTATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAT 65 ATTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAA- * * * * 21769561 TAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCGAAT 129 T--T-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTACTAAACAAATTCAAAT * * * 21769613 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAACAA 1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATAA * * * * * 21769678 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAAGTTAATAA 66 TTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAA 21769730 GAGATTTAAA Statistics Matches: 239, Mismatches: 52, Indels: 12 0.79 0.17 0.04 Matches are distributed among these distances: 177 36 0.15 178 63 0.26 179 3 0.01 181 50 0.21 182 87 0.36 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39 Consensus pattern (177 bp): AGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATAA TTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATT AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTACTAAACAAATTCAAAT Found at i:21770066 original size:505 final size:494 Alignment explanation

Indices: 21768775--21770185 Score: 1540 Period size: 505 Copynumber: 2.8 Consensus size: 494 21768765 TGACTATGTG * * ** * * * ** 21768775 AACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTT-ATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCAT 1 AACAAATATCAATCTCAAATCATTATG-TCTTTGTTTTC-TCATAAAACAATTATTTGTAATCAT * * * 21768839 ACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAA 64 ACAACCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA * * 21768904 AAAATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAA 129 AAAATAAATGTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * 21768969 ATTGTTTTTACCTATTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTATTTCATACAAGCTTATTCAAAATA 194 ATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTT-TTTCATACAAGCTTATTCGAAATA * 21769034 AAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATCTATT 258 AAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT * * * 21769098 TA-TCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTA-GACT 323 TACT-AAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC * * 21769160 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAC 386 TTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAC * * ** * * * * * 21769225 TTTATTAATTTTTCAAAAATTAAAAAACAAGTTATGACTATTTG 451 TTAATAAAGATTTCAAAAAATAAAAAAAAAATTATGACCATTTA * * * * * 21769269 AATAAATATCAATCTGAAATCATTATGGTCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTGTGATCATT 1 AACAAATATCAATCTCAAATCATTAT-GTCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTGTAATCATA * * * * 21769334 CAAGCTTATTTG-GATGAAAATAATATTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAGTAAGAGATTTA 65 CAACCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTT- * * * * * * 21769397 AAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATT-TTTAATTT 127 AAAAAATAAATGTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCT-ATTT ** * * * * 21769461 CAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAGAATAATTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTCGAA 191 CAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTT-TTTCATACAAGCTTATTCGAA * 21769526 ATAAAATTATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTGAAAAAATAAAT 255 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT * * * * * 21769590 TTGTTTACTAAACAAATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATG 318 CTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG * * * 21769655 ACCTTTTGTTTTGCCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAC 383 ACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATAC * * 21769719 TAAGTTAATAAGAGATTT-AAAAAATAAAATCACTTCAAATAATTATGGCCATTTA 448 T-ACTTAATAA-AGATTTCAAAAAATAAAA--A----AAA-AATTATGACCATTTA * * * ** * * 21769774 AACAACTATCTATTTCAAATTGTTAT-TACATTTTGTTTTCTCCTAAAACAATTGCTTT-TCAAT 1 AACAAATATCAATCTCAAATCATTATGT-C--TTTGTTTTCTCATAAAACAATT-ATTTGT-AAT * * * 21769837 -ATAGAACCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATT 61 CATACAACCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATT * * * * * 21769901 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT 126 TAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT * * * * * * 21769966 CAAATTGTTATAAGCTTTTTTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAA 191 CAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATACAAGCTTATTCGAA * * * * 21770031 ATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTT-AAAAATAAATCT 255 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT * * * ** * * ** 21770095 ATTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC 320 ATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC * 21770160 CTTTTGTTTT-CTCATCAAACAATTGT 385 CTTTTGTTTTGC-CATAAAACAATTGT 21770186 CTTTGTTAAT Statistics Matches: 761, Mismatches: 123, Indels: 56 0.81 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 493 3 0.00 494 99 0.13 495 161 0.21 496 9 0.01 497 99 0.13 498 33 0.04 499 4 0.01 500 1 0.00 502 1 0.00 503 77 0.10 504 14 0.02 505 177 0.23 506 73 0.10 507 10 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (494 bp): AACAAATATCAATCTCAAATCATTATGTCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTGTAATCATAC AACCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA AATAAATGTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT TGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA TAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG TTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTAAT AAAGATTTCAAAAAATAAAAAAAAAATTATGACCATTTA Found at i:21770182 original size:180 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21769752--21771217 Score: 1064 Period size: 181 Copynumber: 8.1 Consensus size: 181 21769742 ATAAAATCAC * * * * * * * * * 21769752 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACATTTTGTTTTCTCC 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTCTCA * * * 21769817 TAAAACAATTG--CTT-TTCAATATAGAACCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA 66 TAAAACAATTGTTTTTGTTC-ATATA-AGCC-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * 21769879 TT-TCAAGAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA 128 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG * * * 21769929 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTTTTTTGC-C 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTT-CTC * 21769993 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATT 65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT * * * * 21770058 CTAAAAATTAATAACTAAGAAATTT-AAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAG 130 CTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG * ** * * * 21770109 TTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCA 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTCTCA * * * * ** * * * 21770174 TCAAACAATTGTCTTTGTTAATATATGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGC 66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC * * * * * * 21770239 TGAAAAAATAATCAA-TAAGAGATTTGAAAAGTAAATATGTTTACTAAACCAT 131 T-AAAAATTAAT-AAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG * * * * * * * * 21770291 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTAGCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCA 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTCTCA * ** *** * ** 21770356 TCAAACAATTAG-TCCTGTTCATACT-ATTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAAGAATA 66 TAAAACAATT-GTTTTTGTTCATA-TAAGCCTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA * ** * * 21770418 TTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C-AAACCAG 128 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCT-GTT-TACTAAACCAG * * * * * * * * 21770472 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTGTTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTATC 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC-TTTTGTTTTCTC * * * * * *** * * * 21770537 GTAAAACAATT-ATTTTATTCATAGAAG-CTTTTTTTATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATT 65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT * * * * ** * * * 21770600 TTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTTGTCGAATCAT 130 CTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACCAG * * * * * * * * 21770652 TTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTATCA 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTCTCA * *** * * * * 21770717 TAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCCTATTC-AGAATATATTAATACTAATTTATTAACATT 66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT * * * * * * * 21770781 C-AGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAATGAACAAG 130 CTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG * * * * * * ** 21770833 TTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATTGTTGTAACCTTTT-TATTAGTC 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGT-TTTCTC * *** * * * * * * 21770897 ATAAAACAAATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACAAATTTATTAATAC 65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * * * ** 21770961 TTACT-TAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATTAG 128 TT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG * * ** ** * * * * * 21771014 TTAAAATAATTATTG-CCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTGTTGTC 1 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTCTC ** * * * 21771078 ATAAAACAATTGTTTTTGACCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT 65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT * * * * * 21771143 -TCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTT-GAAAATAAATATGTTTAATGAGCCAG 130 CT-AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG 21771194 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA 1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA 21771218 ATAATTATTA Statistics Matches: 1019, Mismatches: 225, Indels: 87 0.77 0.17 0.07 Matches are distributed among these distances: 177 110 0.11 178 8 0.01 179 33 0.03 180 318 0.31 181 375 0.37 182 168 0.16 183 7 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (181 bp): TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTCTCA TAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC TAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG Found at i:21771574 original size:486 final size:487 Alignment explanation

Indices: 21770808--21771710 Score: 1145 Period size: 486 Copynumber: 1.9 Consensus size: 487 21770798 GAGATTTAAA * * 21770808 AAAATAAATATGTTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAA 1 AAAATAAATATGTTTAATGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAA * * ** 21770873 ATTGTTGTAACCTTTTTATTAGTCATAAAACAAATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGAATA 66 ATTGTTATAACCTTTTTATTAGTCATAAAACAAATATTTCAATTAATACAAGCTTAGATAAAATA ** * 21770938 AAATAATACAAATTTATTAATACTTACTTAAATAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTT 131 AAATAATACAAATTTATTAATACTTACAAAAATAATAAGCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTT ** * * * * * ** * * 21771003 TACTGAATTAGTTAAAATAATTATTGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTT 196 TACCAAATCAATTAAAATAATTAATGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTT 21771068 TTGTGTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGACCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATT 261 TTGTGTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGACCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATT * * * 21771133 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-GAAAATAAATATGTTTAAT-GAGCCAGTT 326 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATCGAACCAATT 21771196 CAAATAGTTATGACTATTTGAAATAATTATTAATCTCAAGTCGTTAAGATATTTGTTTTGTCAGA 390 CAAATAGTTATGACTATTTG-AATAATTATTAATCTCAAGTCGTTAAGATATTTGTTTTGTCAGA 21771261 AAATAATTGTTTCTGATCATAGAAGCAAAAGTTT 454 AAATAATTGTTTCTGATCATAGAAGCAAAAGTTT * * * * ** 21771295 AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAA 1 AAAATAAATATGTTTAATGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAA * * * * * 21771360 ATTGTTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTGAATTCATACAAGCTT-G-TCAAAA 66 ATTGTTATAACCTTTTTA-TTAGTCATAAAACAAATATTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-AAAA * * * ** * * * * 21771422 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGCGAGTGATTTAAAAAGTGAATTT 129 TAAAATAATACAAATTTATTAATACTTACAAAAA-TAATAAGCAAGAAACTTAAAAAATAAATCT * ** * 21771486 GTTTACCAAATCAATTCAAATAATTAATGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATTAC 193 GTTTACCAAATCAATTAAAATAATTAATGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGAC * * ** * * * * * 21771551 CTTTTGT-TTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATTATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGT 258 CTTTTGTGTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTGACCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACT * * * 21771615 AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACC 322 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACC * * 21771680 AATTTAAATTGTTATGACTATTTGAATAATT 386 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT 21771711 GCAAGCTGAA Statistics Matches: 348, Mismatches: 61, Indels: 14 0.82 0.14 0.03 Matches are distributed among these distances: 485 9 0.03 486 192 0.55 487 108 0.31 488 39 0.11 ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40 Consensus pattern (487 bp): AAAATAAATATGTTTAATGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAA ATTGTTATAACCTTTTTATTAGTCATAAAACAAATATTTCAATTAATACAAGCTTAGATAAAATA AAATAATACAAATTTATTAATACTTACAAAAATAATAAGCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTT TACCAAATCAATTAAAATAATTAATGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTT TTGTGTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGACCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATT TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACCAATTC AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTAATCTCAAGTCGTTAAGATATTTGTTTTGTCAGAAA ATAATTGTTTCTGATCATAGAAGCAAAAGTTT Found at i:21771655 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21771295--21780656 Score: 4236 Period size: 181 Copynumber: 51.7 Consensus size: 180 21771285 GCAAAAGTTT * ** ** * * * * 21771295 AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * ** * * * 21771360 ATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTGAATTCATACAAGCTT-GTCAAAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA ** * 21771424 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCGAGTGATTTAA 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21771475 AAAGTGAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAATTAATG-CCATTTCAACAATTATCAATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * * 21771539 AATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-ATATATGTTTATTTGAAA 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAA * * 21771603 TAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA * * * * ** * * * * ** 21771657 AAAATAAATTTGTTTATCGAACCAATTTAAATTGTTATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCA * * * * * 21771721 AATTGTTATAACCTTTT-TTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * ** * * * 21771785 AAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATCTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * 21771837 AAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * 21771902 A---TCAT----TTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATACT-AGCTTATTCGGAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-TAAGCTTATTCGAAAT * * * 21771959 AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAATAGATTTAA 129 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * 21772011 AAGATAATTCTATTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTGAATAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA *** * * * * * * * * * 21772076 ATCACTACGA-CGTTCGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATCCATATAAGTTTGTTC-AATAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAA-AT * * 21772139 AAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * ** * * * * 21772187 AAAATAAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAA-AAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * ** ** * * * ** * * * * * 21772251 AATTATTATGATTTTTTCATCTGTTACAAAACAATAATTTATGTTTACCAAACTAGATCAAATAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATT--CATA-TA-AGC--TTAT * *** * ** * * ** 21772316 TTGGGTTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAA-AAATTTTT 122 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21772374 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAGA-TCAAATAGTTATGACTATTTGTATAAGTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * 21772438 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATCAA-CTTATTCAAA 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAT-AAGCTTATTCGAA * * * 21772501 ATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTGC--AAATTAATAATTAAAAGATTTAA 127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * 21772555 AAAATGAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * ** ** * * * * 21772620 ATTGCTATAACCTTTTGTTTGGTCACCAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAACTTATTTC-AAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCGAAAT * * 21772684 AAAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAATAGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA * ** * * * 21772735 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTGTGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * ** * 21772800 ATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCCCATT 65 ATTGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * * * * * 21772864 AAACTAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21772916 AAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTCT-TGACGATTTGAATAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * * * ** * 21772980 AATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCCAATTTGAAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * * 21773045 AAAATAACACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21773097 AAAATTAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA *** * * ** * * 21773162 AACATTATCACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAATCTTATTCCAAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * * 21773227 AAATAATA-AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * 21773276 AAAACAAATATGTTTTCTAAACACGTTCAAATATTTGTAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * ** * * 21773341 ATCGTTACGATTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * 21773405 AAAATAATACT-ATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AA * * * * * * * 21773458 AAAATAAATCTATTTACTAAGCGAGTTCAAA-ATATTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * ** 21773522 AATCGTTATGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAATTTTATTCGAAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * ** 21773587 AAAATAATACTAATTTATTAAT-GTTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * *** * * * * * * 21773639 AAAGTAAATCTATTCATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * ** * 21773704 ATGGTTATAACATTTT-TTTTGTCATAAAA-AATTATTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * 21773767 AAATAATACTAGTTTACTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * ** * * * * 21773814 AAATTAAATCTATTTATCAAACCGGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * 21773879 ATTGTTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAGA- 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAA-AT * * * 21773942 AAAAT-ATCGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA 129 AAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21773994 AAAATAAATGTGTTGT-CCAAACCAATTCAAATAGTTA-AAATA-AT-AATAATTTAT-TAACAT 1 AAAATAAATCTGTT-TACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-TTATCT-A-TT *** * * ****** * * * 21774054 TCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTT-T-AAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACAAGTTCAAATAG 61 TCAAATTGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TG-TT-T----CTA-TTC--ATA- * * * * * * * 21774117 TTATGAC-TATTTGAACAATTATATATTTATAAGAGGTATGACCTT-TT-GTTTTATCATAAAA- 113 -TAAG-CTTATTCG-A-AA-TA-A-A---ATAATA-CTA--A-TTTATTAATATT-TCA-AAAAT * * *** 21774178 TGATTA-TTTCAG-TTTATA 162 TAATAAGTAAGAGATTTA-A * ** * ** * * * * * * * ** ** 21774196 AAAGTTTATGTGAAATA--AAATAA-T--ATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGA-AAAGAT- 1 AAAATAAATCTG-TTTACCAAACAATTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTC * ** ** * * * * * * ** * * * 21774254 AAAGAT-TTAAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCGCGTCAAATAATTATGGCCATTCAAACAA-- 63 AAA-TTGTTATGACCT---TTTGTTT-T---GT--CATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGC * ** * ** * * * 21774316 TTA-TCTATTTCAAATCGTTACAAACTT-TT-ATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCATCATACA 118 TTATTCGAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATT-TC---AAA-AA-----TT-A--AT--A * * 21774378 AGCCTATTCG-GA-ATAA 167 AG--TA--AGAGATTTAA * * * * * * * 21774394 AATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAA-AATT--AATAAGTAAGA-GATTT-AACAAATAAATC 1 AA-AATA--AATCTGTT--TA--CCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-AAT-TATC * * * ** * * * * 21774454 TATTTACTGAACTAGTTCAAAT-ACATAACT-ATTTG------AACAGTTGTAAACTTCAAATCA 57 TATTT-C--AAATTGTT---ATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT----TTCTATTCA * * ** * * ** * * ** * * 21774511 TTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTAGAATAAAAT 111 -TATAAGC--TTATTC-GAAATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAATATT-TCAAAAAT-TAAT ** * 21774576 AA-TACTA-ATCTAA 166 AAGTAAGAGATTTAA * ** * * * * * 21774589 TAATATTCTAAAAAT-TAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATT-TG--T-TTGTCGAACTAGT 1 -AA-A----ATAAATCTGTTTACCAA-ACAATT--CAAAT-AATTATGACTATT-T-GAAC-A-A ** * * * * * * * * * 21774649 TTAAATATTT-AAGACT-ATATGAACAATTATCTATT-TC--AAATCATTGTGACCTTTTCTTTT 52 TTATCTATTTCAA-ATTGTTATG-AC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TG----TTTCTATT * * * ** * * 21774709 AGCATAAAATAAGTTTTTTTG-AAT-TTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTT-A 109 --CAT---ATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-CTAATTT---AT----T--AAT--ATTTCA * * * * * * * 21774771 TTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTA 157 --AA-AATTAATAA-GTAA-GAGA-TTTAA * * * * * * * 21774801 AAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTTAACAATTATCTTTTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACC-AAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * * 21774866 ATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * * * ** * 21774931 AAGTAATAGTAATATGTTAATATTTTGAAAA-T--T-ACTAAGAGATTTAA 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * 21774978 AAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCA * * * * * * 21775042 AATAGTTATGA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAATAATTGCTTT-TGTTCATACAAGCTTATT-TAG 64 AATTGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATATAAGCTTATTCGA- * * * * * * 21775104 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAACTAATAAGTAAAATATTTTA 126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * *** * * * * * 21775159 AAAATAAATATGTTTATTGAACTATATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAT-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * ** * * * * 21775224 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAA--G-CT-TATTCAAAATAAAATAATACTAAGT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATATAAGCTTATTCGAA-A * * * ** * * * * * 21775282 TATTAATATTA-TGAA--AATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAGTAAATATGTTTGTCGAGC 128 TA-AAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT-AAGA-GATT-T--A-A ** * * ** ** * * * ** * * *** 21775341 AACTTTAA-GTAATTA--TGACTATTCCAATAGTT-TCCCT-TTTG-A-AATT-GCTA-TACCTT 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * * * ** * * * * * * 21775397 TTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAA--GTTTAT-TTCAAATAA---A------ 66 TTGTTATGACCT--TTTG-TTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGA ** * * * * 21775450 -AT--AATAA-A--AATTTATTAATA-TAGAGACACTTAATAAGTAAAACATTTAA 126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * 21775499 AAAATAAATTTATTTACCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * 21775563 ATTCTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAA-T * * * * * 21775627 ACAATAATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAATATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA ** * **** * ** * * * 21775679 GTAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** * * * * * * * * 21775744 ATCATTGTAACATTTTGTTCTGTAATAAAACAACTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * * * 21775808 AAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * *** * * * * 21775860 AAAATGAATTTGTTTATTGAAC-ATGCTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAT--TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * 21775924 AA-TATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTC-AAA 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCGAAA * * * * 21775987 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAA 128 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * **** * * * * 21776039 AAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * 21776104 ATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTAATAAAAGCTTATTTGGAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * 21776168 AAAATAATAATAATTTATTAAAATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21776219 GAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCA 1 -AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * 21776284 AATCGCTATGATCTATTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCGAAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * ** * 21776349 AAAATAATTCTAACTTATTAATA-TTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * * * 21776401 AAAATAAATTTATTCAACGAACAAGTT-ACATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * ** * 21776464 AATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * ** 21776529 AAAATAATACAAATTTATCAATTTTTTGAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * * 21776577 AAACTAAATTTATTTATCGAACTAGTT-ATAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATCTATCTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCA-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * * * 21776641 AATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * * * * * 21776705 AAATTATTGCTAAATTAATAGTA-TTCTAAAAATTACTAA-T---AGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * *** * * * * 21776753 AAAATAAATGTCTTTGTTGAACCAATTCAAATGATTAAGA-TCATTAGAACAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTT-ACCAAACAATTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * * 21776817 AATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCGAAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * ** * * 21776882 AAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAA * * * 21776934 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTTAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-AT 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA- * *** * * * * 21776998 TATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATTTGAAA 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAA-GCTTATTCGAAA * * * * 21777062 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGACAAGTTAA-AGATTTAA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAA * * * **** * * * * 21777115 AAAATAAGTCAGTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * 21777180 ATCGTTACGAACTTTTGTTTCGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTC-AGAA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATATAAGCTTATTCGA-AA * 21777243 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * 21777296 AAAATAAATTTATTTACCAAAC--TGGC---------T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAT-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * 21777349 ATTATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAATAATTG-TTGTAGTTCATATAAACTTATTC-AGAA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGA-AA * * * * 21777412 TAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAATTAACAACTAAGAGATTTAA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * 21777464 AATATTAATTTGTTTATCAAAGCAATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** * * * * * * 21777529 ATCATTAAGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * * 21777593 AAAATAATAATAATAATTTATTAATGTTAT-GAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAA 129 --AA-AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * ** 21777648 AAAGTAAACCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATG-GTCATGCGAACAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * ** * 21777712 AATCGTTATTA-CTTTTTTTTTGGTCATATAACAATTATAGTT-GA-AAAT-TCAAGCTTATTTG 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT--TTCTATTCATAT-AAGCTTATTCG * * * 21777773 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA 125 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * ** * 21777829 AAAATAAACCTATTTATCGAACTATCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAT-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** ** ** * * * 21777894 ATCCTTACAACCTTTTGCATTGTCATAAAACAATTATTT-TGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * * * * * * * 21777958 AAATAATACTGATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGCGAATT-A 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * ** * * * * 21778008 GAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACC-AAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * * 21778072 ATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTTTAATTCATATTACCTTATTTGGA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGTTTCT-ATTCATATAAGCTTATTCGAA * 21778137 ATAAAATAGA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAA 127 ATAAAATA-ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * 21778191 AAAATAATTTTGTTTACGTAAATAGTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** * * * * * * * * * 21778255 ATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATCGGAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * 21778320 AAATAATACT-ATTCTATTAATATTTCAAATATTAAT---CAA-AGATTTAA 130 AAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * * 21778367 AAAATAAAATCTATTTATCTAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCA 1 AAAAT-AAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * * * * * * * 21778432 AATCATTATGA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATT-TAGA 64 AATTGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGA-A * * * * * * * 21778495 TTAAAACAATACGAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTA 127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21778549 AAAATAAATATGTTTACCGAACTAGA-TCAAATAATCACGATTATTTGAATAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * 21778613 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATT-GAGA 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGA-A * * * 21778676 ATAAAAAAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAA 127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAA * *** * * * * * 21778730 AAAATGAATCTGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTAATTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * ** * * * * * * 21778795 ATCGCAATAACCTTTTGTTTTGTTAAAAAAGAAATT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTC-AAA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCGAAA * * 21778858 TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * ** * * * ** * * 21778911 TAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCATTATGACTATATGTGCAATTATTTATTTTAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * 21778976 CTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGATTA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * 21779041 AAATAATACTAATTTATAAATATTTCAATAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAA 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21779092 AAAATAAATATGTTTA-TAGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACCA-AACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * * * * * * 21779156 AATCATAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGTTTGCTT-GAA 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTT-ATTCGAA * * * * * * 21779219 CTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAA 127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21779273 AAAA-AGAATCTATTTACTGAAA-AAGTTTAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTC 1 AAAATA-AATCTGTTTAC-CAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT- *** * * * ** * * 21779336 CAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTTTTTC-C 62 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGC-TTATTCGA * * * * * 21779400 AATAAAATAAT-TTAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTA 126 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * ** * 21779454 AAAATAAATCTATTTTCTGAACATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * * 21779519 ATCGTTATGACTTTTTGATTTGTCATAAACCCATTGGTTT-TGTTCACAAAAGCTTATTTGGAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * 21779583 AAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * 21779636 AAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * ** * * 21779701 ATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCGAA-ATTATTCAAAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ATAAGCTTATTCGAAAT 21779765 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21779813 AAACTAAAAT-TGTTTACAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCA 1 AAAAT-AAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * * * 21779877 AATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAAT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAA- * * ** * * 21779940 TAAAATATTGCTAAAATAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * ** * * * * 21779989 AAAATTAATATGTTTATTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * ** * * * * 21780054 ATCGTTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTTATACATGCTTATTCGAAAT 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * * 21780118 AAAATAATACT-CTTGTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAA 129 AAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AA * * * 21780171 AAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA 1 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * 21780236 ACTGTTATAACCTCTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATA 65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * * * * * 21780301 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGT-TGAAGATTGAA 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAA * ** * * 21780352 AAAATAAAATCAGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTC 1 AAAAT-AAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * * * * 21780416 AAATCT-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCT 63 AAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATATAAGCTTATTCG * * 21780478 TAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAAATTTAA 125 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAA * * * * * * 21780534 AAAATAAATATGCTTATA-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCA 1 AAAATAAATCTG-TT-TACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * * * * * 21780598 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATT 64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATT 21780657 TAATAACTAA Statistics Matches: 7023, Mismatches: 1625, Indels: 1067 0.72 0.17 0.11 Matches are distributed among these distances: 158 5 0.00 159 6 0.00 161 6 0.00 162 17 0.00 163 10 0.00 164 21 0.00 165 22 0.00 166 7 0.00 167 11 0.00 168 45 0.01 169 91 0.01 170 2 0.00 171 1 0.00 172 9 0.00 173 9 0.00 174 152 0.02 175 122 0.02 176 462 0.07 177 431 0.06 178 217 0.03 179 355 0.05 180 1110 0.16 181 2196 0.31 182 837 0.12 183 172 0.02 184 171 0.02 185 5 0.00 186 11 0.00 187 86 0.01 188 8 0.00 189 1 0.00 190 5 0.00 191 1 0.00 192 9 0.00 193 11 0.00 194 5 0.00 195 14 0.00 196 32 0.00 197 22 0.00 198 24 0.00 199 33 0.00 200 43 0.01 201 33 0.00 202 23 0.00 203 19 0.00 204 35 0.00 205 28 0.00 206 23 0.00 207 26 0.00 208 15 0.00 209 7 0.00 210 3 0.00 211 6 0.00 212 8 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (180 bp): AAAATAAATCTGTTTACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAA AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA Found at i:21772801 original size:361 final size:357 Alignment explanation

Indices: 21771295--21774026 Score: 2063 Period size: 361 Copynumber: 7.6 Consensus size: 357 21771285 GCAAAAGTTT ** * * * * * 21771295 AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAA 1 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA * * * * 21771360 ATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTGAATTCATACAAGCTT-GTCAAAATA 66 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATA ** * * * * 21771424 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCGAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGT 130 AAATAATACTAA-TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT * * * * 21771488 TTACCAAATCAA-TTCAAATAATTAATG-CCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATTAC 193 TTACCAAA-CAAGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC * * * *** * * 21771551 CTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGT 256 CTTTTGTTTTGTCATA-AACAATT-TTTTCTATTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATA-C * 21771615 AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA 318 AATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA * * * * * * * ** 21771657 AAAATAAATTTGTTTATCGAACCAA-TTTAAATTGTTATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTGA 1 AAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTC * * * * 21771720 AAATTGTTATAACCTTTT-TTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAA 64 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA-TTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA ** * * * * 21771784 TAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATCTAAAAAATAAATTTG 128 TAAAATAATACTAAT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG * * * * * 21771849 TTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA---TCAT---- 192 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC * * * * * * 21771907 TTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCGGAATAAAATAAAATGA 257 TTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTC-AAATAAAATAATA-CA * * 21771971 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAATAGATTTAA 319 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21772011 AAGAT-AATTCTATTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTGAATAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA *** * * * * * * * * * * 21772075 AATCACTACGA-CGTTCGCTTTGTCATAAAACAAATGT-TTTTATCCATATAAGTTTGTTCAATA 65 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC-AAT-TATTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA * 21772138 TAAAATAAAACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATCT 128 TAAAATAATACTAAT-TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT * ** * * * * * 21772198 ATTTATTAAACCAGTTCAAA-AAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTATTATGA 191 GTTTACCAAACAAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA ** ** * * * * ** **** 21772262 TTTTTTCATCTGTTACA-AAACAATAATTTATGTTTA-CCAAACTAGATCAAATATTTGGGTTAA 255 CCTTTTGTTTTG-T-CATAAACAAT--TTT-T-TCTATTCATAC-A-A--ACTTATTTCAAATAA * ** * * ** 21772325 AATAATACTATTTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAA-AAATTTTT 310 AATAATAC-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21772374 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGTATAAGTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA * * 21772439 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAAAATTATTTTAGTTCATATCAA-CTTATTCAAAAT 66 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAAAAT ** * * * * 21772503 AAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTGCAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTAT 129 AAAATAATACTAA-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT * * * * 21772568 TTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCT 193 TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT * * ** * 21772633 TTTGTTTGGTCACCAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATACAATT 258 TTTGTTTTGTCA-TAAACAATTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATACAATT * * 21772698 TATTAATATT-AAGACAATTAATAGGTAATAGATTTAA 322 TATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA ** * * * * 21772735 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTGTGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA * ** * 21772800 ATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCCCATT 66 ATTGTTATGACCTTTT-GTTTTATCATAAAACAATTATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * * * * * 21772864 AAACTAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG 129 AAAATAATACTAAT-TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG * * * * * ** * 21772928 TTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTCT-TGACGATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGAC 192 TTTACCAAACAAGTTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC * * * * * ** * * 21772992 CTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCCAATTTGAAATAAAATAACACTA 256 CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATAC-A * * * 21773057 ATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAA 319 ATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21773097 AAAATTAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA *** * * * * * * * 21773162 AACATTATCACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAATCTTATTCCAAATA 66 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-ATTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA * * * * * 21773227 AAATAATA-AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAACAAATATGTT 130 AAATAATACTAA-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT * * * * * * * * * ** 21773290 TTCTAAACACGTTCAAATATTTGTAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGATTTT 194 TACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT * * * 21773355 TTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAT 259 TTGTTTTGTCATAAAC-AATTTTTTCTATTCATACAAA-CTTATTTC-AAATAAAATAATACAAT * * 21773418 TTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAA 321 TTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AA * * * * * * * * * 21773458 AAAATAAATCTATTTACTAAGCGAGTTCAAAATA-TTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA * * * * ** * 21773522 AATCGTTATGATCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAATTTTATTCGAAA 65 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAA * ** * * 21773586 TAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCTA 128 TAAAATAATACTAA-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG * *** * * * * * * * * * 21773651 TTCATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACA 192 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC * * * * * 21773716 TTTT-TTTTGTCATAAAAAATTATTTCTATTTATACAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAG 257 TTTTGTTTTGTCATAAACAATTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AA * 21773779 TTTACTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA 320 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * ** * * * * 21773814 AAATTAAATCTATTTATCAAACCGGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAA 1 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA * * * * 21773879 ATTGTTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAGA- 66 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAAT * * * 21773942 AAAAT-ATCGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG 129 AAAATAAT-ACT-AATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG 21774006 TTGT-CCAAACCAA-TTCAAATA 192 TT-TACCAAA-CAAGTTCAAATA 21774027 GTTAAAATAA Statistics Matches: 1882, Mismatches: 395, Indels: 193 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 349 2 0.00 350 59 0.03 353 15 0.01 354 122 0.06 355 179 0.10 356 74 0.04 357 14 0.01 358 11 0.01 359 51 0.03 360 159 0.08 361 468 0.25 362 372 0.20 363 150 0.08 364 107 0.06 365 12 0.01 366 5 0.00 367 1 0.00 368 79 0.04 369 2 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (357 bp): AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA AATAATACTAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA CCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT GTTTTGTCATAAACAATTTTTTCTATTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATACAATTTATT AATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA Found at i:21773205 original size:362 final size:360 Alignment explanation

Indices: 21771295--21780657 Score: 5565 Period size: 362 Copynumber: 25.8 Consensus size: 360 21771285 GCAAAAGTTT * * * * * * * * 21771295 AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * ** * 21771360 ATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTGAATTCATACAAGCTT-GTCAAAATA 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA ** ** * * * 21771424 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCGAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTT 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT * * * * * ** * 21771489 TACCAAATCAA-TTCAAATAATTAATG-CCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATTACC 195 TACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * * * 21771552 TTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTA 258 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA * 21771616 ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA 322 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA * * * * * * * * * * ** 21771657 AAAATAAATTTGTTTATCGAACCAATTTAAATTGTTATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCA * * * * * * * * 21771721 AATTGTTATAACCTTTT-TTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAAT 64 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * ** * * * * * 21771785 AAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATCTAAAAAATAAATTTGT 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT * * * * * * 21771850 TTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----T 194 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT * * * * * * 21771908 TTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATACT-AGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGA 259 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-A * * 21771971 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAATAGATTTAA 322 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21772011 AAGATAATTCTATTTGCCT-AACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTGAATAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTT-ACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * * * * * * * * * * * 21772075 AATCACTACGA-CGTTCGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATCCATATAAGTTTGTTCAATAT 64 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * 21772139 AAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATCTAT 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT *** * * * * * * ** 21772200 TTATTAAACCAGTTCAAAAAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTATTATGATTT 194 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT ** * * * ** * * * * * *** 21772265 TTTCATCTGTTACAAAACAATAATTTATGTTTACCAAACTAGATCAAATATTTGGGTTAAAATAA 259 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATT--CATA-TA-AGC--TTATTTGAAATAAAATAA * * * * ** 21772330 TACTATTTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAA-AAATTTTT 317 TACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21772374 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGTATAAGTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * 21772439 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATCAA-CTTATTCAAAA 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAAAA * * * 21772502 TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTGC--AAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATC 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC * * * * * *** * 21772565 TATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAA 191 TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA * ** ** * * * * * 21772630 CCTTTTGTTTGGTCACCAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATAC- 256 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT * * 21772694 AATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAGGTAATAGATTTAA 321 AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * ** * * * 21772735 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTGTGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * ** * 21772800 ATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCCCATT 65 ATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * * * * * 21772864 AAACTAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG 129 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG * * * * 21772928 TTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTCT-TGACGATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGAC 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC * * ** * 21772992 CTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCCAATTTGAAATAAAATAACACTA 257 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA * * * 21773057 ATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAA 322 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * 21773097 AAAATTAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * 21773162 AACATTATCACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAATCTTATTCCAAATA 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA * * * * 21773227 AAATAATA-AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAACAAATATGTT 130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT * ** * * * * * * * ** 21773290 TTCTAAACACGTTCAAATATTTGTAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGATTTT 195 TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT * * * 21773355 TTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AT 260 TTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT * * * 21773418 TTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAA 324 TTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AA * * * * * 21773458 AAAATAAATCTATTTACTAAGCGAGTTCAAAATA-TTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * ** * 21773522 AATCGTTATGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAATTTTATTCGAAAT 64 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * *** * * 21773587 AAAATAATACTAATTTATTAAT-GTTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCTA 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG * ** * * * * * ** * * 21773651 TTCATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACA 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * ** ** * 21773716 TTTT-TTTTGTCATAAAA-AATTATTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAG 258 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA * 21773779 TTTACTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA 323 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21773814 AAATTAAATCTATTTA-TCAAACCGGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * 21773878 AATTGTTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAGA 64 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAA * * * * * 21773942 -AAAAT-ATCGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG 128 TAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC * * * * * * ** 21774004 TGTTGT-CCAAACCAA-TTCAAATAGTTA-AAATA-AT-AATAATTTAT-TAACATTCAAAAAAT 191 TGTT-TACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCT-A-TTTCAAATCAT * * ****** * * * * 21774063 TAATAAACAAGAAATTT-T-AAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC-T 251 T-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TG-TT-T----CTA-TTC--ATA--TAAG-CTT * * ** * * * 21774125 ATTTGAACAATTATATATTTATAAGAGGTATGACCTTT-TGTTTTATCATAAAATGATTATTTCA 301 ATTTG-A-AA-TA-A-A---ATAATA-CTA--A--TTTAT-TAATAT-TTAAAA--ATTA-ATAA * * 21774189 GTTTATAAAAGTTTATGTGAAA 348 G----TAAGAG---AT-T-TAA * * * * * * * * * 21774211 TAAAATAATAT-TACTTTA-TTAATATTTCAAA-AATTGAAAAGA-TAAAGATTTAAAAAATAAG 1 -AAAATAA-ATCT-GTTTACTAAACAGTTCAAATAGTT---ATGACT----ATTTGAACAATTA- ** * ** ** * * * * * * * * 21774272 T-TAGTTTATCAAATCG-CGTCAAATAAT-TATGGCCATTCAAACAATTATCTATTTCAAATCGT 55 TCTA--TT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAAC-A--AT-TGTTTCTATTC-A * **** * ** * 21774334 TACAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAAT--TTTTTTCATCATACA-AGCCTATTCGGAATAAAA 111 TACAAGC--TTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTT-AT--TA-ATA---T-TTC--AA-AAAT * * * ** * * * * 21774396 TAAT-AGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--TA-AG-A-GATTTAACAAATA--AAT 162 TAATAAGT-A---A--AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT--CAAATAGTTAT * * * * ** ** 21774453 --CTATTT--AC--TGAACTAGTTCAAATACATAACTATTTGAACAGTTGTAAACTTCAAATCAT 219 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CAT---TA--TGACCTTTTGT----TT--TGTCA- * * * * * 21774512 TATAAC-CTTTTGTTCT-GTCATA-AAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTAGAATAAA 271 TAAAACAATTGT-TTCTATTCATATAAGC--TTA--TTTG-----------------A-AATAAA * * * * 21774574 ATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAA 313 ATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21774623 AAAATAAATTTGTTT-GTCGAACTAGTTTAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * * ** 21774687 AATCATTGTGACCTTTTCTTTTAG-CATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTG 64 AATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCA * * * * 21774750 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTT-AAAAATAAT 125 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA * * * ** * * 21774809 TCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTTAACAATTATCTTTTTCAAAT-AGTTA 189 TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA * * * * * * * * * 21774873 TGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAAT 253 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT * * * * * 21774938 AGTAATATGTTAATATTTTGAAAA-T--T-ACTAAGAGATTTAA 318 ACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * 21774978 AAAATAAATCTATTTA-TCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTC 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTC * * * * * * 21775041 AAATAGTTATGA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAATAATTGCTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAG 63 AAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA * * * * * * 21775104 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAACTAATAAGTAAAATATTTTAAAAATAAATA 126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC ** * * * * * 21775169 TGTTTATTGAACTA-TATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATG 191 TGTTTACCGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * 21775233 ACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAA--G---C--TT-AT-T---C--A----AAATAAAATAATAC 255 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC * * 21775277 TAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA 320 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * ** * * 21775319 AAAGTAAATATGTTTGTCGAGCAAC--TTTAAGTAATTATGACTATTCCAATAGTT-TCCCT-TT 1 AAAATAAATCTGTTT-ACTA--AACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT--CTATT * * * ** * * 21775380 TGAAATTGCTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTC- 61 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA ** ** * * * 21775443 AAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TAGAGACACTTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAA 125 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA * * * * 21775507 TTTATTTACCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTA 189 TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA * * * * 21775570 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATTACAATAA 253 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAA * * * * 21775634 TATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAATATTTAA 317 TACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA ** * ** * ** * * * 21775679 GTAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * ** 21775744 ATCATTGTAACATTTTGTTCTGTAATAAAACAACTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * * * * * * 21775808 AAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGT 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT ** * * * * 21775873 TTATTGAACATGCTT-AAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACA 194 TTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * 21775936 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAA 258 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-A * * * 21776000 ATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAA 322 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * ** * * * 21776039 AAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * *** 21776104 ATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTAATAAAAGCTTATTTGGAAT 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * 21776168 AAAATAATAATAATTTATTAAAATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAAATAAATCTG 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAATAAATCTG * * * * * ** * 21776232 TTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATC 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * * 21776297 TATTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATTCTAA 258 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA * * ** * 21776362 CTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAA 323 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * 21776401 AAAATAAATTTATTCAAC-GAACAAGTT-ACATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTC 1 AAAATAAATCTGTT-TACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC * ** 21776463 AAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAA 63 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA * * * ** * * * * 21776528 TAAAATAATACAAATTTATCAATTTTTTGAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATTTA 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG * * * * * * 21776589 TTTATCGAACTAGTT-ATAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA- 193 TTTACCGAACAAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC * * * * * * * * * 21776652 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTA 257 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA * * * * 21776717 AATTAATAGTATTCTAAAAATTACTAA-T---AGATTTAA 322 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * ** * * * * 21776753 AAAATAAATGTCTTTGTTGAACCAATTCAAAT-GATTAAGA-TCATTAGAACAATTATCTATTTC 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTC * * * * * * 21776816 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCGAAA 63 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA * * ** 21776881 TAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAACAA-ATTTTAAAAAATAAATC 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATC * * * * * * * 21776944 TGTTTACCAAACAAATTTAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATG 191 TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATG * * * 21777008 ACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATTTGAAATAAAATAATA 255 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATA * * * * 21777072 TTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGACAAGTTAA-AGATTTAA 319 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAA * * * *** * * * * * 21777115 AAAATAAGTCAGTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * 21777180 ATCGTTACGAACTTTTGTTTCGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTCAGAAT 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * * 21777244 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTAT 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT ** * * * 21777309 TTACC--A-AA---C---T-G-GCT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCT 194 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT * * * * * * * 21777362 TTTATTCTATCATAAAATAATTG-TTGTAGTTCATATAAACTTA-TTCAGAATAAAATAATACTA 259 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTA * ** * * 21777425 ATTTAATAATATTCCAAAATTAACAACTAAGAGATTTAA 322 ATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * * * 21777464 AATATTAATTTGTTTA-TCAAAGCAATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCA 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * 21777528 AATCATTAAGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA 64 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAA * * * ** * 21777592 TAAAATAATAATAATAATTTATTAATGTTAT-GAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAA 128 T--AA-AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA * * * * * ** * 21777656 CCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATG-GTCATGCGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA 189 TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA * * * * * ** * 21777720 TTA-CTTTTTTTTTGGTCATATAACAATTATAGTT-GA-AAAT-TCAAGCTTATTTGGAATAAAA 253 TGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT--TTCTATTCATAT-AAGCTTATTTGAAATAAAA * * 21777781 TAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA 314 TAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * ** * 21777829 AAAATAAACCTATTTA-TCGAACTA-TCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTC 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * ** ** * * * 21777892 AAATCCTTACAACCTTTTGCATTGTCATAAAACAATTATTT-TGTTCATATAAGCTTATTCAAAA 63 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA * * * * * * ** * * * 21777956 TAAAATAATACTGATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGCGAATT-AGAAA-AAATTTG 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG * ** * * * ** * 21778019 TTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * * * * * 21778084 TTTTATTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTTTAATTCATATTACCTTATTTGGAATAAAATAGA-A 258 TTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGTTTCT-ATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATA-ATA * 21778148 -TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAA 319 CT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * 21778191 AAAATAATTTTGTTTACGTAAATAGTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTAC-TAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * * * * ** 21778255 ATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATCGGAATA 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA * * * 21778320 AAATAATACT-ATTCTATTAATATTTC--AAA-TATTAA-TCAAAGATTTAAAAAATAAAATCTA 130 AAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTG * * * * * * * * 21778380 TTTATCTAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGA-C 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * * * * * * 21778444 TTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATTT-AGATTAAAACAATACG 258 TT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT * * * * 21778508 AATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTA 321 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * ** * * * * * * * 21778549 AAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAATAATCACGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * 21778614 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTGAGAAT 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * * 21778678 AAAAAAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTG 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTG ** * * * * * * *** * 21778742 TTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTAATTGAAATCGCAATAACC 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * * * * 21778807 TTTTGTTTTGTTAAAAAAGAAATT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAA 258 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA * 21778871 ATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA 322 ATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * ** * * 21778911 TAAATAAATTTGTTTACTGAATA-AGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCAATTATTTATTTT 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AA-ACAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * * * * ** * 21778974 AACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAT 63 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA * * 21779039 TAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAATAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT 128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT ** * * * * 21779103 GTTTATAGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATAATGAC 192 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC * * * * ** * 21779168 CTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGTTTGCTTGAACTAAAATAATACT 257 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT * * * * * 21779232 AATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAA 321 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * 21779273 AAAA-AGAATCTATTTACTGAAAAAGTTTAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCC 1 AAAATA-AATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-C * * * * * * * * 21779337 AAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTTTTTC-CA 63 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC-TTATTCAAA * * * * 21779401 ATAAAATAAT-TTAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATC 127 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC * * * * 21779464 TATTTTCTGAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG 191 TGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * * 21779528 ACTTTTTGATTTGTCATAAACCCATTGGTTT-TGTTCACAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA 255 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA * * * 21779592 CTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAA 319 CTAATTTATTAATA-TT--TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * ** * * * * * 21779636 AAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * 21779701 ATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCGAA-ATTATTCAAAAT 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTCAAAAT * 21779765 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAAAT-TG 129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTG ** ** * * * * 21779825 TTTACAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC 193 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC * * * * 21779890 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATATTGCTA 258 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTA ** * 21779953 AAATAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA 322 ATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21779989 AAAATTAATATGTTTATTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAA 1 AAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * ** * * * * 21780054 ATCGTTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTTATACATGCTTATTCGAAAT 65 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT * * * 21780118 AAAATAATACT-CTTGTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAATAAAT 129 AAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTT-AAAAAATAAAT * * * * 21780180 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAACTGTTAT 190 CTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTAT * * * * * * *** 21780244 AACCTCTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA 254 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA * * * * * * 21780309 TTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGT-TGAAGATTGAA 319 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAA * * * * * * 21780352 AAAATAAAATCAGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTC 1 AAAAT-AAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * * * ** 21780416 AAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCTT 63 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAA 21780479 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAA-ATTTAAAAAATAAAT 126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAAT * * ** * * * 21780543 ATGCTTATAGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATA 190 CTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * 21780608 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTT 255 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTT 21780658 AATAACTAAG Statistics Matches: 6972, Mismatches: 1536, Indels: 985 0.73 0.16 0.10 Matches are distributed among these distances: 336 2 0.00 337 27 0.00 338 1 0.00 339 54 0.01 340 105 0.02 341 62 0.01 342 7 0.00 344 4 0.00 346 1 0.00 347 4 0.00 348 8 0.00 349 119 0.02 350 150 0.02 351 6 0.00 352 99 0.01 353 304 0.04 354 161 0.02 355 291 0.04 356 158 0.02 357 185 0.03 358 363 0.05 359 415 0.06 360 472 0.07 361 1042 0.15 362 1380 0.20 363 494 0.07 364 353 0.05 365 127 0.02 366 6 0.00 367 4 0.00 368 92 0.01 369 1 0.00 370 2 0.00 371 2 0.00 372 1 0.00 373 1 0.00 376 5 0.00 377 6 0.00 379 10 0.00 380 9 0.00 381 21 0.00 382 8 0.00 383 3 0.00 384 7 0.00 385 1 0.00 386 13 0.00 387 2 0.00 388 8 0.00 390 3 0.00 391 7 0.00 392 20 0.00 394 3 0.00 395 3 0.00 396 4 0.00 397 9 0.00 398 13 0.00 399 22 0.00 400 6 0.00 401 6 0.00 402 18 0.00 403 4 0.00 404 15 0.00 405 24 0.00 406 6 0.00 407 12 0.00 408 2 0.00 409 8 0.00 410 16 0.00 411 14 0.00 412 16 0.00 413 8 0.00 414 7 0.00 415 2 0.00 416 6 0.00 417 12 0.00 418 4 0.00 419 8 0.00 420 12 0.00 421 19 0.00 422 6 0.00 423 7 0.00 424 12 0.00 425 2 0.00 426 18 0.00 427 2 0.00 428 4 0.00 429 6 0.00 430 3 0.00 432 1 0.00 433 1 0.00 434 2 0.00 435 3 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (360 bp): AAAATAAATCTGTTTACTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT ATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA Found at i:21774879 original size:178 final size:175 Alignment explanation

Indices: 21774029--21796079 Score: 6072 Period size: 181 Copynumber: 123.1 Consensus size: 175 21774019 TTCAAATAGT * * 21774029 TAAAATAATAAT-AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--T-AACAAGAGA-TTT-AAAAATAAAT * * * * * * * * 21774092 CTGTTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAGGTAT 58 CTATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATAGTTAT * ** ** * * * * * 21774156 GACCTTTTGTTTTATCATAAAATGATTATTTCAGTTTATAAAAGTTTATGTGAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21774211 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTTAAAAAATAAGT-T 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AACAAG----AGATTT-AAAAATAAATCT * * ** * * 21774274 AGTTTATCAAATCGC-G-TCAAATAATTATGGCCATTCAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAC 60 A-TTTATCAAA-C-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT * * * ** * * 21774337 AAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCATCATACAAGCCTATTCGGAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21774391 TAAAATAATA-GTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCT 1 TAAAATAAAATG-AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAA-AAATAAATCT * * * * ** * 21774455 ATTTA-CTGAACTAGTTCAAATACA-TA--ACTATTTGAACAGTTGTAAACTTCAAATCA-TTAT 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT * * * * 21774515 AACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTAGAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21774570 TAAAATAATACT-AATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAAC-AAGAG-ATTTAAAAATAAATC * * * * * * * * * 21774633 TGTTTGTCGAACTAGTTTAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTGTG 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * * * 21774697 ACCTTTTCTTTTAG-CATAAAATAAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAA 123 ACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA-TTTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21774753 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAATAATTCTATTTAC 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTAT * * * * 21774818 CTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTTAACAATTATCTTTTTCAAATAGTTATGACCTTTTG 66 CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * * 21774883 TTTTGTTATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAA 131 TTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * ** 21774929 TAAAGTAATA-GTAATATGTTAATATTTTGAAAATT-ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT 1 TAAAATAAAATG-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAC-AAGAGATTT-AAAAATAAATCTATT * * * 21774992 TATCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-CT 63 TATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT * * * * * 21775055 TGTTGTTTTGTTATAAAATAATTGCTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAT 127 T-TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21775106 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAATAACTAATAAGTAAAATATTTTAAAAATAAATAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA-AA--ATTAA-CAAGAGA-TTTAAAAATAAATCT * ** * * * * * * 21775170 GTTTATTGAACTA-TATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATGA 60 ATTTATCAAACCAGT-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * ***** * * * * * * 21775234 CCTTTTGTTTTGTCATATAAGC--TTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTT---A 124 CCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATT-TTTTTGTTCATACAA-GCTTATTTGGAA * ** * ** * * * 21775284 T-TAATATTATGAA--AATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAG-----T--AAAT--A--TGTTT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAACAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTT * * * * * * * ** * * ** * * * 21775334 GTCGAGCAACTTTAAGTAATTATGACTATTCCAATAGTTTCCCT-TTTGAAATTGCTAT-ACCTT 64 ATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT ** * * ** 21775397 TTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCAAA 128 TTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * * * * * 21775446 TAAAATAATAA-AAATTTATTAATA-TAGAGACACTTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAACAAG----AGATTT-AAAAATAAATC * * * * * ** 21775509 TATTTACCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTATGA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * * ** 21775573 CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * * 21775625 TTACAATAATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAATATTTAAGTAATAAATAT 1 -TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTTAA-AAATAAATCT * * ** * * ** * * * * * 21775690 GTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCA-TTGTAA 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * * * * * * 21775754 CATTTTGTTCTGTAATAAAACAACTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * ** * * * * 21775807 TAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTC-AAAAAT--T-AACAAGAG-ATTTAAAAATAAATCTA ** * * * 21775872 TTTATTGAA-CATGCTT-AAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAATA-TTATGA 61 TTTATCAAACCA-G-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * * * * ** ** 21775934 CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21775987 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAACAAAAAATTTAAAAAATAAATATGT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCTAT * ** * * * * * 21776052 TTTTTGAA-CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACT 62 TTATCAAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * * * 21776116 TTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTAATAAAAGCTTATTTGGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21776167 TAAAATAATAAT-AATTTATTAAAATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAAATAAATC 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTT-A-AAAATAAATC * * * * * * * * * * * 21776230 TGTTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * * * * * * * * 21776295 TCTATTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCGAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21776348 TAAAAT-AATTCTAACTTATTAATA-TTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAATT 1 TAAAATAAAAT-GAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAACAA----GAGATTT-AAAAATAAATC * * * * * * * * * * * 21776411 TATTCAACGAACAAGTT-ACATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATG 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * ** *** 21776474 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * * ** * * 21776528 TAAAATAATACAAATTTATCAATTTTTTGAAAATTAAGAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA * * * * * * * * 21776593 TCGAACTAGTT-ATAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TTTT 65 TCAAACCAGTTCA-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTT * * * * * 21776656 TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAG 129 TGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * ** * * * 21776704 T-AAAT-TATTG-CTAAATTAATAGTATTCTAAAAATT-ACTAATAGATTTAAAAAATAAATGTC 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATA-T-TTC-AAAAATTAAC-AAGAGATTT-AAAAATAAATCTA * ** * * * * * 21776765 TTTGTTGAACCAATTCAAATGATTAAGA-TCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * ** * * * 21776829 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCGAAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21776881 TAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AACAAGAGA-TTT-AAAAATAAATCT * * * * * * * * ** 21776945 GTTTACCAAACAAATTTAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGA 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATAGTTATGA * * *** * 21777009 CCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATTTGAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAA-GCTTATTTGGAA * * * * * 21777062 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGACAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTC-A 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTT-AAAAATAAATCTA * *** * * * * * * * 21777126 GTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAA 61 -TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * ** * * ** 21777191 CTTTTGTTTCGTTATAAAATAATTGTTTTTCATCATATAAGCCTATTCAGAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21777243 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA * * * * * 21777308 TTTACCAAA-CTG-GC---------T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATAAC 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGAC * * * * * * * * ** 21777360 CTTTTATTCTATCATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21777412 TAAAATAATACT-AATTTAATAATA-TTCCAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAATATTAATTT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AAC-AAGAGATTTAAAA-ATAAATCT * * * * * * * * 21777475 GTTTATCAAAGCAATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCA-TTAAGA 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * * *** 21777539 CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21777592 TAAAATAATAATAATAATTTATTAATGTTAT-GAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAA 1 TAAAATAA-AAT--GAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAACAAG--A--GATTTAAAAA-TAAA * * * ** * ** * 21777656 CCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATG-GTCATGCGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA 57 TCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTA * * * ** *** * 21777720 TTA-CTTTTTTTTTGGTCATATAACAATTATAGTTGAAAATTCAAGCTTATTTGGAA 121 TGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * 21777776 TAAAATAATACT-AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAC-AAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * ** * ** ** 21777840 ATTTATCGAACTA-TCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTACAA 60 ATTTATCAAACCAGT-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA ** * * *** 21777904 CCTTTTGCATTGTCATAAAACAATTATTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * * * 21777956 TAAAATAATACTG-ATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGCGAATTAGAAA-AAATTTG 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AAC-AAGAGATTTAAAAATAAATCTA ** * ** * * * * * 21778019 TTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * * * * ** * 21778084 TTTTATTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTTTAATTCATATTACCTTATTTGGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACA---ATTTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21778138 TAAAATAGAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG--A--GATTT-AAAAATAAATCTA * * 21778203 TTTA-CGTAAA-TAGTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATA 61 TTTATC--AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * * * * * * 21778264 ACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATCGGAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21778318 TAAAATAATACT--ATTCTATTAATATTTCAAATATTAATCAA-AGATTTAAAAAATAAAATCTA 1 TAAAATAA-AATGAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAA-CAAGAGATTT-AAAAAT-AAATCTA * * * * * * * * 21778380 TTTATCTAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCA-TTATGA- 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC * * * * 21778443 CTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGAT 125 CTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * * 21778496 TAAAACAATACGAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGA-TTTAAAAATAAATCTA * * * * * * * * * * * 21778561 TTTACCGAACTAGATCAAATAATCACGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * ** * 21778626 TTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TTGAGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-GAA * * * * 21778677 TAAAA-AAATACT-AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATC 1 TAAAATAAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATC * ** * * * * * ** * 21778740 TGTTTATTGAA-CATGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTAATTGAAATCGCAATA 59 TATTTATCAAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * *** ** 21778804 ACCTTTTGTTTTGTTAAAAAAGAAATTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * * 21778858 TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAATAAATAAATT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAACAAG----AGATTTAA-AAATAAATC * * * * ** * * * * 21778921 TGTTTACTGAATA--AGTTCAAATCATTATGACTATATGTGCAATTATTTATTTTAACTTGTTAT 59 TATTTA-TCAA-ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT * * * * * * 21778984 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAT 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21779039 TAAAATAATACT-AATTTATAAATATTTCAATAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA-AAAT--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * * * * 21779103 GTTTAT-AGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA-TAATG 60 ATTTATCA-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * * ** * * ** 21779166 ACCTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTGCTT-GAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21779219 CTAAAATAATACT-AATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAAAGAATC 1 -TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-CAAGAGATTTAAAAATA-AATC * * * * * * * * 21779283 TATTTACTGAAA-AAGTTTAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCCAAA-ACATTA 59 TATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATA-GTTA * * * * * * * ** 21779346 TGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTTTTTCCAA 121 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA ** * * * * * 21779402 TAAAATAATTTAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTAT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG---AGA-TTTAAAAATAAATCTAT * * * * 21779467 TT-TCTGAA-CATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC 62 TTATC-AAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * * * * * 21779530 TTTTTGATTTGTCATAAACCCATTGGTTTTGTTCACAAAAGCTTATTTGGAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21779582 TAAAATAATACT-AATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATA-TTTC-AAAAATTAACAAG----AGATTT-AAAAATAAAT * * * * * * * * * * * 21779645 CTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATA 58 CTATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * * * *** 21779710 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCGAA-ATTATTCAAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATAC-AAGCTTATTTGGAA * * * 21779764 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAAAT-TGTT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAA-T-AAATCTATT ** * * * * * 21779827 TA-CAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCA-TTAGGATC 63 TATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACC * * ** 21779890 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * * * * * * 21779939 TTAAAAT--ATTGCTAAAATAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATTAATATGT 1 -TAAAATAAAATG--AATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCTAT ** * * * * * * 21780002 TTATTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCT 62 TTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT ** * * * * * * 21780067 TTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTTATACATGCTTATTCGAAA 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21780117 TAAAATAATACT--CTTGTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAAAAATAAA 1 TAAAATAA-AATGAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAACAAG--AG-A-TTT--AAAAATAAA * * * * 21780179 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAACT-GTTA 57 TCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTA * * * * *** * **** 21780243 TAACCTCTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAA 121 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21780299 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGATTGAAAAAATAAAATC- 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAA---G-AGATT-TAAAAAT-AAATCT ** * * * ** 21780363 AGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATG 60 A-TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * ** * * 21780427 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCATCATACAAGCCTATTCT-TAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGGAA * * * 21780481 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAAATTTAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG-AG---ATTT-AAAAATAAATCT ** * * * 21780545 GCTTAT-AGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATA 60 ATTTATCA-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * ** 21780608 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTAATAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GGAA * * * * * * *** * 21780663 CTAAGAGCTTTAAAAAATAAATTT-TT--T-TATCGAACCAATT--CAA-ATAGTTAAGGCTATA 1 -TAA-A-----ATAAAATGAATTTATTAATATTTC-AA-AAATTAACAAGAGATTTAAAAATAAA * * * * * * * * * *** 21780721 T-GAATAAT-TATCTATTTCAAACT-GTTATGACCTTATTT-----TTTATCTTAAAACAAAT-G 57 TCTATTTATCAAACCAGTTCAAA-TAATTATGA-C-TATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAG * ** * * * * * ** 21780777 TTTTTG-CTCATATAAG-TTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA 118 -TTATGAC-C-T-TTTGTTTTG-TC---ATAAAACAAT-TT-TTTTGTTCATA----CAAGCTTA * ** 21780840 ATAAGAGA 169 TTTGGA-A ** * * * * * * * 21780848 TTTAA-AAAGTAAATTTATT--TA--CCAAACCAGTTCA-AATAG-TTATAATAATTTAAA-CAA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAA--AATTAACAAGAGATT-TAA-AA-ATAAATC-- * ** * * * 21780905 TTATTTATTTCAAATCA-TT-ATAACCATT-TG--T-TTTGTCATAAAATAAT-TGTTTC---TA 59 -TATTTA--TCAAACCAGTTCA-AATAATTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATA * * * ** ** ** * ** * 21780960 -TTGAT-ACTCTCTT-ATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTATTAAG 117 GTT-ATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TTTTTTGTTCATA--C--AAGCTTATT-TG * 21781022 TAA 173 GAA * ** ** * * ** * 21781025 TGGATTTAA-AAAATGAATTTATTGGCT-TGACCAGTACAAATAGTTATAACTG-TTTGAACAAT 1 T--A--AAATAAAATGAATTTATT-AATAT-TTCA--A-AAAT--TAACAAGAGATTT-AAAAAT * * ** * * * * * 21781087 -TATCT-GTT-TCAAA-GTGTT---ATAACCTTTTG--T-TTTGTCACAAAATAAT-TTTTTCTA 54 AAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAA--TTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAA * * * ** **** * * * * * * * 21781141 TTCA-TACATG-CTTATTTCAATTAAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGACAA-CTAATTA 114 AT-AGT-TATGACCT-TTT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTT-TT-TTGTTCATACAAGCTTATTT * 21781203 GTAA 172 GGAA * * * * * * * * * 21781207 AAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTT-ATAA-ATATTTGAACAAT 1 TA-A---AATAAAATGAA----TTTAT-TAAT-ATTTCAAA-AATTAACAAGAGATTT-AAAAAT * * * * * * * * 21781270 -TATTTA-TT-TCAAATC-GTT-ATGAT-TTTTTG--T-TTTGTCATAAAATTAT-TGTTT---- 54 AAATCTATTTATCAAACCAGTTCA-AATAATTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAA * *** * * * * * * ** 21781321 TTGTTCAT-ACAAGCTTATTTAG--ATTACAATAATATTAATTTATT-A-A-AA--TT-TTTCCA 115 TAGTT-ATGAC-CTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAAT-TT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGA 21781377 A 175 A * * * ** * * 21781378 T-TAAT-AAGT-AA---A--AGAT-TTT-AAAAA-TAA-ATA-TG-TTTACTGAACAAGTTCTA- 1 TAAAATAAAATGAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTAACA-AGAGATTTA-AAAATAA-ATCTAT * * * * 21781428 ATAGTCATAACTACTT-GAATAATTAT--CTATTT---C-A--A---A--TC-----GTTATGAC 62 TTA-TCA-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * ** * *** * * **** 21781474 CGTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAAAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21781526 TAAAAT-AATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCT 1 TAAAATAAAAT-GAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-CAAGAGATTTAAAA-ATAAATCT * * * * * * * 21781590 ATTTA-CTGAACAAGCTCAAAT-AGT-TGACTGTTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * * * * *** 21781652 TCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21781705 TAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAGTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATA 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAACA---A-GAGATTT-AAAAATAAATC * * ** * * * * * * 21781768 TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA ** * * * * * *** 21781833 CCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTCTGCTCATA-TAGAATTATTCAAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAG-CTTATTTGGAA * * * ** * 21781886 TAAAATAATATCG-ATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAGAG-TATTAAAAACTAAATCTATT 1 TAAAATAAAAT-GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGAT-TTAAAAA-TAAATCTATT * * * * * * * * * 21781949 TATCGAACTAATTCAAATATTTATGACTTTTTGAACAATCATATATCTCAAATCA-TTATGATC- 63 TATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCT * * * * * 21782012 TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTT-TTCATATAAGCTTATTCGGAT 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * **** * * 21782062 TAAGAA-AATACT-AATTTAATAATA----AAAAA-TAA-ATGAG-TTT--TGCCAAA-CCA-GT 1 TAA-AATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTT * * * * * * * * 21782114 -TCAAA-TAATTAAAACT-ATTA-GA--A--TAAT----TATCTATTTTAAATCA-TTCTGACAT 64 ATCAAACCAGTTCAAA-TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCT * * ** * * 21782166 TTTGTTTGGTCAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21782216 TAAAATAATACT-AATTTATTAA-AATTCAAAAGATTAATTAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA-ATT-A--A-CAAGAGATTT--AAAAATAAAT * * * * * * * * * * 21782279 ATGTTTATTAAACAAGCTCAAATAGA-TATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT 58 CTATTTATCAAACCAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT * * * * * * * *** 21782343 TACCTTTTGTTTAGTCATATAAGAATTGTTTTT-TATCATACCAGGTTGTTCAAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21782398 TAAAATAATACT-AATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG--AGA--TTT-AAAAATAAATCT * * * * * ** * * 21782462 GTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTT 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-T-TAT-C-T-ATTTCAAATAGTT * * * * * * 21782527 AAAAAAAATAAACCTTTTGTTCTT-TCTTAAAATAATAATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAA 120 -------AT-GACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAAT-TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGA 21782591 A 175 A * * * * * 21782592 TAAAATAATA-GTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTAATCACTAAGAGATTTAAAAATTAAATT 1 TAAAATAAAATG-AATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--AC-AAGAGATTTAAAAA-TAAATC * ** * * * * * * * 21782655 TGTTTGCCGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * ** * * *** 21782719 ACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCAAACTAGCTTATTCAAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21782773 CAAAGTAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA * * * * * * * * * 21782838 TCTAACCAATTCTAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCAATTTGAAATAATTATGACATTTG 65 TCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT * * * * * 21782903 GTTTTGTTATAAAACAAATTTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAA 130 GTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21782950 T-AAA-ACAATGCTAATCTATTAACATTCCAACAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTT 1 TAAAATAAAATG--AATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATT * * * * 21783013 TATCAAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTT 63 TATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT * * **** 21783078 TTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA 128 TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21783126 TAAAATAAAA-G--TTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T 1 TAAAATAAAATGAATT-TATTAATATTTCAAAA---ATTAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * * * * * 21783187 AGTTTA-CTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTT 60 A-TTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * *** * * * 21783251 ATC-TTTG-TTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAAT-ATAGAAGCTTATTCGAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21783303 TAAAA-AAATACT-AATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTATAAAATAAATCCATT 1 TAAAATAAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATT * * * * * * 21783366 TACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATG-CCAT 63 TATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC-T * * * * *** 21783430 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAA 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21783481 TAAAATAATACT-AAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATC 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-CAAGAGATTTAAAAA-TAAATC * * * * * * * * 21783545 TATTT-GCTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATGTCAAATAATTATA 59 TATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * ** * * ** ** 21783609 ACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTATTCATACTATTTTATTCAGAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21783663 TAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAACGTAGTAACCAAGAAAATTAAAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAA-CAAG-AGATT--TAAAAATAAAT * * * * * * * * 21783727 CTAATTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTCCAAATCGTTAT 58 CTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT * *** * * * * 21783791 GACCTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTTATTCATACAAACTTATTCT-GAT 122 GACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGGAA * * * 21783846 TAAAAT--AATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT 1 TAAAATAAAATG--AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATC * * * * * * * * * 21783909 TATTTA-CTGAATCAGTTCAAATGATTAAGA-TAATTAGAACAATTATCTACTTGAAATTGTTCT 59 TATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT * * * * ** * ** 21783972 GATCGTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21784027 TAAATTAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAGAAATAGATTTAAAAAAAAATCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAACAAG----AGATTTAAAAATAAATCT * * * * * * * * * 21784090 GTTTACCAAACAAGTTCGAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGT-TAATTTAAAATCA-TTATA 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATG * * * ** * ** * 21784153 ACTTTTTGATTTGTCACAAAAC-ATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGAT 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21784207 TAAAATAATACT-AATTTATTAATA-CTCACTAAAATAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAAT- 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA--AAAAT--TAA-CAAGAGA-TTTAAAAATAAATC * * ** * * * * * * 21784269 AAGTTTATCGAATTAATTGAAATAATTATATAC-ATTTGAACGATTATCTATTTTAAATCGTTAT 59 TA-TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT ** * * 21784333 GA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTT-ACCACACAAGCTTATTTGAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21784387 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAACTAAATATGTTT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAA-TAAATCTATTT * * * * * 21784452 ACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TCATCTCAAATCA-TTAAGATC- 64 ATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACCT * * * * * * * 21784514 TATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTGATCATATAAACTTATTTGG-T 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21784563 TAAAAATAATACT-AATCTAATAATATTTCAAAAATTAA-TAGTAGATTTAAAAAATAAATGTGT 1 T-AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG-AGATTT-AAAAATAAATCTAT * * ** * * ** * * * * * * 21784626 TTGTCGAGTCA-ATCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATTGTTCTGACAT 62 TTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT * * * * * * * 21784690 TTTGTTTAGTCATAAAA-TATTTGTTTCATATT-TTACAAGTTTATTCGAAA 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTT--TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21784740 TAAAATAATATAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAAAAAGGAAATTATTTGAAAAAATAAATC 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAACAA-G--A-GATTT--AAAAATAAATC * * * * * * 21784804 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATG 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * ** * * * **** 21784868 ACCATTTGTTCTAAT-ATAAAA-TATTTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA 123 ACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21784922 TAAAATAATACT-AATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT-AAAATAAATTTGT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG--AGA-TTTAAAAATAAATCTAT * * * * * * * 21784985 TTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGGCTATTTGAA-AACTTATCTATTTAAAATCA-TTATGAC 62 TTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC * * * * ** 21785048 CTTTTGTTTTTTCATAAAA-AAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTTAAAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21785100 T-AAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGTGATTTAAAAAGTAAATTTG 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-ACA-AGAGATTTAAAAA-TAAATCTA * * * * * * * 21785163 TTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACC 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * * * * * * *** 21785228 TTTTATTTGGTCATAGAACAATTATTTTT-TATCATATATGTTTATTCAAAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGGAA * * * 21785279 TAAAATAATA-GTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATC 1 TAAAATAAAATG-AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT--AAAAATAAATC * * * * * * * * * * 21785343 TATTTA-CTGAACTAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATA 59 TATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * * * * ** * 21785407 ACCTTTTATTCTATCATAAAACAAGTATTTCTATTCATACAAGCTTATGCGAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * ** * * * * 21785461 TAAAATAATACCAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAGCTAAGAGATTTTAAAAAGAAATTTG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A-C-AAGAGA-TTTAAAAATAAATCTA * * * * * * * 21785526 TTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA-A-TCAT---- 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC ** * ** 21785584 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * 21785635 TAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTC-AAAATGTAATATGTAAGAGATTTTAAAAATAATTCT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT-T-A-A--CAAGAGA-TTTAAAAATAAATCT * * * * * * * 21785699 ATTTACCTATCCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGAC 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * * ** 21785764 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAGTTTGTTAAGAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21785816 TAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTTAAAAATAAATCTATTT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGA-TTTAAAAATAAATCTATTT * * * * ** ** 21785880 ATCAAACTAGTTTAAA-AAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTACAATTT 64 ATCAAACCAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT * * * * * * * * ** * * 21785943 TTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTATTTAGAT 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * * * 21785993 TAAAATAATACT-AATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAAT-TG 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG--AGA-TTT-AAAAATAAATCTA * * * * * * * 21786056 TTTACCAAACTAGATCAAA-AAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCA-TTATGA 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA ** * * * *** 21786119 CCTTTTGTTTTGAGATAAAAAAAATCATTTTAGTTCATATC-AGCTTATTCAAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT-TTTTTTGTTCATA-CAAGCTTATTTGGAA * * * * 21786173 TAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATA 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATC * * * * * * * 21786236 TATTTACCAAA-AAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TCATTTGAAATTGCTATA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATG * ** ** * * 21786299 ACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAA-TTTA-TT--AA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * 21786349 T---AT-TAA-GACA---ATTAATAGGT-AAAAGATTTAA-AA-A-A--T--AAAT---T-TGTT 1 TAAAATAAAATGA-ATTTATTAATATTTCAAAA-A-TTAACAAGAGATTTAAAAATAAATCTATT * * ** * * * * 21786394 TACT-AAACAAGTTAAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT 63 TA-TCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT * * *** * 21786458 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAT 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21786508 TAAAATAATATTAA-TTATTAAATATTTAAAAAACTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATG 1 TAAAATAAAATGAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAACAAG---AGATTT-AAAAATAAATCTA * * * * * * 21786572 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA-TTGTGA 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * * * * 21786635 CCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTGTTTGAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * ** * * * 21786688 TAAAATAATACT-AATTCATGAATA-TTCTAAAGTTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAA---AATTAACAAGAG-ATTTAAAAATAAATCT * * * * * * * 21786751 CA-CTATCGAA-CATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAA-T-TCTATTTCAAA-ACATTAT 60 -ATTTATCAAACCAGTT-CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTAT * * * 21786811 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA ** * * * * * 21786866 TAAAATATTATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATAAATATAGT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG---AGATTTAAAAATAAATCTA-T ** * * * * 21786931 TT-TTTAACACA-TTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC 62 TTATCAAAC-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * * * * * * ** 21786994 TTTCGTTTTGTGATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21787045 TAAAATAATACT-TATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATA-TTTCAAAAA-T--T-AACAAGAGATTT--AAAAATAAAT * * * * * ** * 21787108 CTATTTA-CTGAGCGAGTTCAAATCATTATGACTCTTCAAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTAT 58 CTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT * * * * * ** * 21787171 GATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCACACAATTTTATTTGAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21787226 GAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTTCGAGACTTAAAAAATAAATC 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-CA---AGAGA-TTTAAAAATAAATC * * * * * * * * *** 21787289 TGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAATAGTTATGA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA ** * * * * ** * * 21787354 TATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAGAG 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * 21787407 TAAAA-AAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAACTAAATCAATT 1 TAAAATAAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATT * * * * * * * * 21787470 TCTCAAACCGGTTCAAAT-GTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATCGTTATGA-TTT 63 TATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT * * 21787533 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAA 128 TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA ** ** * * * * 21787581 CTAAAATATTACAAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG 1 -TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATC * * * * ** * * * 21787645 TGTTTATCAAA-TAGGTTCAAATAGTTAAGACTATTACAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTG 59 TATTTATCAAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * ** * * * 21787709 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCGAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21787763 TAAAATAATACT-AATTTATT-ATCA-TTCAGAAATTTAATAAACAAGAAATGTAAAGCAATAAA 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAAT-ATTTC--AAA---AATTAACAAGAGATTTAAA--AATAAA ** * * * * * 21787825 T-T-TGTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAG- 57 TCTAT-TTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TAGT * * * * * 21787886 TATAACGTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATTTTTTGTTTTATCATA-AAACAATTCT 119 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-A--A--T---TTTTTTG---T-TCATACAAGC--TTAT ** 21787950 TTCAATTCA 170 TTGGA---A ** * ** * * *** *** * * * 21787959 TAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTAC-TTTATTGATATTTGAAAAATTAAAAGGTTAAA- 1 TAAAATAAAAT--G-AATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-ACAAG-AGATTTAAAA--ATAAAT * ** ** * * * 21788022 -GATTTA-CAAAATAAGTT-AGTTTATTGAATCG-CTTTAAATAATT-ATTACCATTTAAACAAT 58 CTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATT--AT-GAC--T--AT--TTGA--ACAATTA------- * * * * * ** 21788082 TATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGC 104 --TCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGC * * 21788147 CTATTTAGAA 166 TTATTTGGAA * * * * * * 21788157 TAAAATAATATTAATTTATTGATATTTAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA * * ** 21788222 CCGAACCAG------T--TT-T---TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTAAAACCTTT 65 TCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTT * * * * * * * 21788274 TATTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAA 129 TGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21788322 TAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAATCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAC-AAGAGAT-TTAAAAATAAATCT * * * * * * 21788386 ATTTGCTGAAA-CAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTAT 60 ATTT-ATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATAGTTAT *** * * * * * 21788449 GGTTTTTTGTTTGGTCGTAAAACAATTATTTTT-TATCATTCAAGCCTATTTGAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * 21788504 TAAAATAATACT-AATTTATTAGTCGTTCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * * * ** * * * 21788568 ATTTA-CTGAACTAATTCAAAT-A-TATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAA 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * *** 21788630 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * * 21788683 TAAAATAATATTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAAC-AAGAG-ATTTAAAAATAAATCTA ** * * * * ** * * 21788748 TTTCCCAAACGAGTTCAAATATTTAAGACTCTACGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TCATGAC 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC * * * * 21788812 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTTGAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTT--GTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21788866 T-AAA-AAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATATTTAAAAATCATTCTATTTAC 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTAT * * * * * 21788929 CTAACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTAAACAATTATCCATTTCAAATCA-TTATGACCTTTT 66 CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTT * * * * * * 21788993 GTCTTGTCAT-AAACTAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTTGGAA 130 GTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21789039 TAAAGTAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-ATAATATATTT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAATA-AATCTATTT ** * * * * 21789102 ATCAAATGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGA-CTT 64 ATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTT * * * * *** * * ** * 21789165 TTGGTTTTGTTATAAAATAGTTGGTTCCATTCATACAAGCCTAGTCAGAT 128 TT-GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * * * * 21789215 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAGTAAATATG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGA-TTTAAAAATAAATCTA * * * * * * ** 21789280 TTTA-CTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGAC 61 TTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * * 21789344 CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21789397 TAAAATAATATTAAGTTATTAATATTACAAATATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAA-A--ATTAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA * * ** * * * * * * * 21789462 TTTGTCGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTAT-TTTTTGAAATTGCTATAACC 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC ** * * * 21789526 TTTTGTTTT-TCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAATCTTATTTTGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** ** * * * * 21789576 TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TAAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * * ** 21789640 GTTTA-CTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTACTTCAAATTCTTATG 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATG * * ** 21789702 ACCTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-GTCAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * ** * * * 21789755 TTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATAT 1 -TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTTAA-AAATAAATCT * * ** ** * * * * 21789820 GTTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCA-TTGTG 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * ** * * 21789883 ACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGC---TTTGAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21789934 TAAAATAATACT-AATTTATCAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGGAAA- 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-CAAGAG-ATTTAAAAAT--AAAT * * * ** * * * 21789997 -TGTTTA-CTGAA-CATGTTTAAATAGGTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAA-ACATT 58 CTATTTATC-AAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTT * * * * * * * 21790058 ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAA 120 ATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * ** * *** * * 21790116 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTAAAAATTTTGTTAATAAATATGT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG---AGA-TTTAAAAATAAATCTAT * * * * 21790181 TT-TCTAAA-CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTAGCTATTTCAAGTCA-TTATGA 62 TTATC-AAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * * * * * 21790243 CCTTTTGTTTTGTCATAAACCAAATGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTGGAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21790296 TAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTCCAAAACTTATTAAGTAAAAGGTTTAAAAA-ATAATCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAA-CAAGAGATTTAAAAATA-AATCT * * * * * * * 21790359 GTTTA-CTAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCA-CTATG 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * * * * *** 21790422 ATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCCAAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGGAA * * * * * 21790477 TAAAATAATACT-AATTTACTAATA-TTCTAAAAATTTATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAACAA----GAGATTTAAAAA-TAAATC * * * * * * * * * 21790540 TGTTCA-CGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCTATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATG 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * * * * ** * * 21790603 ACATTATATTTTGTCACAAAAC-ATTTGTTTCTATTCATAAAAAATTATTCGAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** ** * * * * 21790657 TAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA ** * * * * * * 21790722 TCAAACCAGTTTTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAATC-TTT 65 TCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT * * * ** * 21790786 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTATTCATGCAAGCTTATTCAGAG 130 GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA *** * *** * * * * 21790833 TAAAATATTGCTAAAACGA-TAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTT 1 TAAAATA-AAATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATT * * * * * 21790896 TA-CTAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTCTGACC 63 TATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACC * * * *** 21790959 TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21791010 TAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAACAAGTTTTAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--T-AACAA-GAGATTT-AAAAATAAAT * * * * * * 21791073 CTATTTGTCGAACAAATTCAATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAA 58 CTA-TT-T--ATCAAA--CCA---G-TT-C--AA--A--T--AATTA-T--GACTATTTGAACAA * * * * * * * 21791138 TTATCTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATG 101 TTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAG *** 21791203 CTTATTCAAAA 165 CTTATTTGGAA * * * * 21791214 TAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--T-AACAAGAGA-TTT-AAAAATAAAT * * * * * * ** 21791277 CTATTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTT-AAACTAAATAT 58 CTATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTAT * * * ** * * 21791341 GACTTTTTCTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * ** * 21791396 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGATA-AGTTAGAGATTTAAAAAATATGTCA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-ACA---AGAGATTT-AAAAATAAATCT ** *** * * * * * * ** * 21791460 ATTTATTGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCAATTTGAACATTTATCTATTTCAATTCGTTACAAA 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * *** * 21791525 CTTTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTTTCCATCATACAAGCCTATTTGGAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * * 21791577 TAAAATAATATTAATTTGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTAAAAAAATAAATTTG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AACAAGAGATT-TAAAAATAAATCTA * * * * * * * 21791642 TTTACCAAACCAGTTC------------CTATTTAAATAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACT 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * * * * * * *** 21791695 TTTTGTTTTATTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTCAAAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21791746 TAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAC-AAGAGATTT-AAAAATAAATCT ** * * * * * * * * 21791810 ATTTGCCAAAGCAGTTAAAACAGTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * *** 21791875 CCTTTATTTT-TCATAAAAC-ATTTGTTTTCAGTTCATACAAACTTATTCAAAA 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTT--GTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * 21791927 TAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTTCGAAAAGTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAATCT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAA--ATTAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * ** * * * *** * * 21791991 GTTTA-CGAAATAAGTTTAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTAACTATTTCAAATAGTTATTA 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * * ** * ** 21792055 CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAGAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21792108 TAAAAT--AAT--ACTAATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--CAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA * * * * ** * ** * 21792169 TTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACC 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC ** * * * * 21792234 TTTTGTACTATCATAAAACAATTATTTTGTTCATATAAGC-T-TTTGAAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21792282 TAAAATAATACT-AATATAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAAT-T 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA-AA--ATTAAC-AAGAG-ATTTAAAAATAAATCT * * * * ** * 21792345 TTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * * 21792409 CCTTTTG-TTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21792464 TAACAT-AAACGAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--CAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA * * * 21792527 TTTACCTAACCAG-TCTGAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA 61 TTTATCAAACCAGTTC-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * * * * * ** 21792590 TCATTTGTTTTATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAAA 124 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTGGAA * * ** * * * 21792642 AAAAAGTAATACT-AATTTATTAATATTTTGAATATTAATAAGATATTTAAAAAATAAAATCTAT 1 TAAAA-TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTT-AAAAAT-AAATCTAT * * * * * * * * 21792706 TTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTT 62 TTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT * * * * * * 21792771 TTTCTTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAATCTTATTTAGAT 127 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * * 21792821 TTAAACAATACT-AATTTATTAATATTT-AACAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAA-AAA--TGT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG---AGATTTAAAAATAAATCTAT * * * * ** * * 21792881 TTACCAAACTAGATCAAATAATCATGGTTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACC 62 TTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACC * * * * * 21792945 TTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTGGGAA 126 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * 21792996 TAAAATAATACT-AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATC- 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * * * ** * 21793059 ATTTA-CTGAACAAGTTTAAATAATTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCCATA 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * * * ** 21793123 ACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTCAATTCAAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * * * 21793177 TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAA-A-AA-T-TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * ** * ** * * * 21793240 GTTTACCAAATAAGTTCAAATCATTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGAC 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * * * ** * 21793305 TTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAT 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * * 21793357 TAGAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATA 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGA-TTT-AAAAATAAATC * * * * * ** 21793421 TGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-CAAT 59 TATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT * * * * * * 21793484 GACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATAAG-TT-TGTTAGAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTGGAA * * * * * 21793538 CTAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAATGAAT 1 -TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-CAAGAG-ATTTAAAAATAAAT * * ** * * * 21793601 CTATTTACTGAATA--AGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAATTATTTATTTCAAA-ACATT 58 CTATTTA-TCAA-ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTT * * * * * 21793663 ATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCTGTTCATTCAAGCTTATTTTGAA 120 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA ** * * * * * 21793720 -AAATATAATTTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTA 1 TAAA-ATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG---AGA-TTTAAAAATAAATCTA * * * * 21793784 TTT-TCTGAA-CACGTTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG 61 TTTATC-AAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG * * * * * * * 21793846 ACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTCTATTCATAAAATCTTAATTGGAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21793900 TAAAATAATACT-AATTTGTTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAACAATAAATCC 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTTAAA-AATAAATCT * * ** * * * * * * * 21793964 GTTTA-CTGAATGAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAA 60 ATTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA * * * * * 21794028 TCTTTTGTTTTGTCAATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAA 124 CCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * 21794081 TAAAATAATACT-AATTTCTTAATA-TTCTAAAAATTAATAATATGGAGATTTAAAAAATAAATC 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-CA-A--GAGATTT-AAAAATAAATC * ** ** * * * * * * 21794144 TATTTGTTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATG 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * ** * ** ** *** 21794208 ACATTTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGTAAATTTATTCAAAA 123 AC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21794263 TAAAATAACATTAATTCATTAATATTTCAAAAATTAAAAAAAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA * * * * * * * * * 21794328 -CAAAATCATTTCAATTCATTACGACTATTTGATCAATTATCTATCTCAAATCA-CTATGATC-T 65 TC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTT ** * * * * ** 21794390 TCATTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA 128 TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * * * 21794438 GTAAAGT--ATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAATAATCAAT 1 -TAAAATAAAATG--AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAA-AATAAAT * * ** * * * * * * 21794501 GTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACTATTATCTATTTCAAATCA-TTTT 58 CTATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT * * *** * 21794565 GACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATA-CTTATTTGAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACA-AGCTTATTTGGAA * ** * * * * 21794620 TAAAATAATACT-CTTTTATTGACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAAAAAAAATC 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAACAAG--AG-A-TTT-AAAAATAAATC * * * * * 21794683 TATTTACTGAAA-AAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTAT 59 TATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT * * * * * * **** 21794746 GACCCTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAA 122 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * * 21794801 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAAGAAGTTGAAGATTTAAAAATTAGT-TAG 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAA---G-AGATTTAAAAATAAATCTA- * ** * * * * * * ** 21794865 TTTATCGAATTAGTTCGAATAATTATCACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATATTTA-CAAT 61 TTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC * * ** * * * 21794929 TTTTTTATTTGTCATAAAACAAATGTTTTTCATGATACAAGCTTGTTTTGAA 126 TTTTGT-TTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * 21794981 T-AAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT ** * * * * * 21795044 GCTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTAT-A 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA * * 21795107 GCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAA 124 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * * * 21795161 TACAATAATACAAATATAATAATATTAT-AAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAATTTT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * * * * * 21795225 TTTTGTTAAACCAATTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTATTTCAAACTA-TTATG 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATG * * * * * * * * * 21795288 ACCTTTTGTTTTATCGTGAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTTGAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * ** * * * * 21795342 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATGTAATAAGAGATTTAAAAGGTAAGTTTATTT 1 TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAACAAGAGATTTAAAA-ATAAATCTATTT * * ** * * * * *** 21795407 ACCAAACCAGTTCAAATAGTTACAACAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTA-TTATAAGAAT 64 ATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTT * * * * * * * * 21795471 TTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTATTGATACAATCCTATTCGAAA 128 TTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * * * 21795520 TAAAGT--AATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAATGGACTTAAAAAATGAAT 1 TAAAATAAAATG--AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAACAAG--A--GA-TTTAAAAATAAAT * * * ** * * * * * * ** 21795582 TTGTTGGA-CTGACCAATACAAATAGTTATAACTGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAA-ATGACA 58 CTATT-TATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTA * * * * * * * * * * 21795645 TAACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGATGACTTGAAA 121 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * * * 21795701 TAACAT-AAATCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATC 1 TAAAATAAAAT-GAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAA-TAAATC * * * * * * * * * * * 21795764 TGTTTATCGATCAAGTTCATATAGTTACT-ATTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATA 59 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG * * * 21795828 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-CAA 123 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * ** * * ** * 21795881 TTAAAATAATACAAACTTATTAATATTTAGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT 1 -TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTT---CAA-AAATTAACAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * ** * * * * 21795946 ATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCGTTATGAC 60 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC * * * * 21796011 TTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAT 125 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA * * 21796063 TAAAATAATATTAATTT 1 TAAAATAAAATGAATTT 21796080 TATATATATT Statistics Matches: 16559, Mismatches: 3865, Indels: 2891 0.71 0.17 0.12 Matches are distributed among these distances: 142 14 0.00 143 14 0.00 144 3 0.00 145 1 0.00 147 2 0.00 148 5 0.00 149 7 0.00 150 8 0.00 151 5 0.00 152 7 0.00 153 22 0.00 154 70 0.00 155 85 0.01 156 16 0.00 157 16 0.00 158 8 0.00 159 28 0.00 160 50 0.00 161 10 0.00 162 26 0.00 163 29 0.00 164 30 0.00 165 107 0.01 166 18 0.00 167 13 0.00 168 42 0.00 169 258 0.02 170 15 0.00 171 11 0.00 172 14 0.00 173 50 0.00 174 179 0.01 175 492 0.03 176 995 0.06 177 1513 0.09 178 1190 0.07 179 1056 0.06 180 2314 0.14 181 4565 0.28 182 1841 0.11 183 532 0.03 184 220 0.01 185 64 0.00 186 44 0.00 187 29 0.00 188 22 0.00 189 28 0.00 190 9 0.00 191 7 0.00 192 14 0.00 193 23 0.00 194 124 0.01 195 25 0.00 196 25 0.00 197 17 0.00 198 17 0.00 199 8 0.00 200 7 0.00 201 11 0.00 202 7 0.00 203 9 0.00 204 148 0.01 205 1 0.00 206 5 0.00 208 1 0.00 210 1 0.00 212 2 0.00 213 29 0.00 214 1 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (175 bp): TAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTAT CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTG TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA Found at i:21775361 original size:160 final size:158 Alignment explanation

Indices: 21775080--21775409 Score: 362 Period size: 160 Copynumber: 2.1 Consensus size: 158 21775070 AAATAATTGC * * * * 21775080 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAACTAATA 1 TTTTG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAATAACTAATA * * * * ** 21775145 AGTAAAATATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTATATCAAATAGTCATGACTATTTGAATA 65 AGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAATATCAAATAATCATGACTATTCCAATA * 21775210 ATTAT-CTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG 130 ATT-TCCT-TTTGAAATCGCTAT-ACCTTTTG * * * 21775241 TTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTATGAA-AATTAATA 1 TTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT-TCAATAACTAATA * * * * * * 21775305 AGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATATGTTTGTCGAGCAACT-TTAAGTAATTATGACTATTCCAA 65 AGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTATCGAACAA-TATCAAATAATCATGACTATTCCAA * * 21775368 TAGTTTCCCTTTTGAAATTGCTATACCTTTTG 128 TAATTT-CCTTTTGAAATCGCTATACCTTTTG 21775400 TTTTGTCATA 1 TTTTGTCATA 21775410 AAATGATTTT Statistics Matches: 142, Mismatches: 22, Indels: 12 0.81 0.12 0.07 Matches are distributed among these distances: 159 27 0.19 160 104 0.73 161 11 0.08 ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (158 bp): TTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAATAACTAATAA GTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAATATCAAATAATCATGACTATTCCAATAA TTTCCTTTTGAAATCGCTATACCTTTTG Found at i:21780788 original size:142 final size:142 Alignment explanation

Indices: 21780529--21780788 Score: 326 Period size: 142 Copynumber: 1.8 Consensus size: 142 21780519 AAGTAGAAAA * * * 21780529 TTTAAAAAATAAATATGCTTATAGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATAT 1 TTTAAAAAATAAATATGCTTATAGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATAT * * * 21780594 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTA 66 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATATTTATGCTCATACAAGCTTATTTA 21780659 ATAACTAAGAGC 131 ATAACTAAGAGC * ** * * * * 21780671 TTTAAAAAATAAATTTTTTTATCGAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTAT 1 TTTAAAAAATAAATATGCTTATAGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATAT * * * * * 21780736 TTCAAA-CTGTTATGACCTTATT-TTTTATCTTAAAACAAATGTTTTTGCTCATA 66 TTCAAATC-ATTATAACCTT-TTGTTTTATCATAAAACAAATATTTATGCTCATA 21780789 TAAGTTTGTT Statistics Matches: 98, Mismatches: 18, Indels: 4 0.82 0.15 0.03 Matches are distributed among these distances: 141 1 0.01 142 95 0.97 143 2 0.02 ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (142 bp): TTTAAAAAATAAATATGCTTATAGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATAT TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATATTTATGCTCATACAAGCTTATTTA ATAACTAAGAGC Found at i:21781388 original size:364 final size:356 Alignment explanation

Indices: 21780799--21796237 Score: 2837 Period size: 361 Copynumber: 43.0 Consensus size: 356 21780789 TAAGTTTGTT * * * * 21780799 CAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATT 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT * * * * 21780863 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAATAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAA 66 TATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATAAT-ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA * * * * *** * * 21780928 CCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACTCTCTTA-TTCGAAATAAAGTAATGC 129 TCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAA-TAATAC * * * ** * * * 21780992 TAATTTGTTAATATCCTAAAAATTATTAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATTTATTGGCTTG-AC 192 TAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGAC-TGAAC * * ** * * * 21781056 CAGTACAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTT 256 AAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATAACCGTTTGTTTC * * * * * * * 21781120 GTCACAAAATAATTTTTTCTATTCATACATGCTTATTT 320 ATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTA-TA * * * 21781158 C-AATTAAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAAAT 1 CAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-A-AA-TAATTAGTAAGAGATTT-AAAAAAT * * * 21781222 AAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT 61 AAATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * * 21781287 TATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAATTATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTACAATA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATA-AATA * ** *** * * * 21781352 ATATTAATTTATTAAAATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTG 188 ATACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTG * * * * 21781417 AACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCGTTTGTT 253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTT * * 21781482 TCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATA 318 TCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * 21781521 CAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--TAAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * 21781586 ATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTT-GACTGTTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTAT 63 ATTTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT * * * * * * 21781650 GATCTTTTATTTTGTGATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAT 127 GATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAAT * * * * ** * * ** 21781714 ACTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA 190 ACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTGAA * * ** * * * * * * * 21781779 TAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT 255 CAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTTTC * *** * * *** * ** * 21781844 GTTGTAAAATAATTGTTTCTGCTCATATAGAATTATT 320 ATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * ** * * 21781881 CAAAATAAAATAATA-TCGATTCATTAAGATTTTGAA-AATTAATAAGAG-TATTAAAAACTAAA 1 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAA * * * * * * * * * 21781943 TCTATTTATCGAACTAA-TTCAAATATTTATGACTTTTTGAACAATCATATATCTCAAATCATTA 64 TTTATTTA-CGAAC-AAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA * * * * ** * * 21782007 TGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTT-TTCATATAAGCTTATTCGGATTAAGAAAA 126 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAA-ATAA * * * * *** ** ** 21782070 TACTAATTTA--ATAAT--AAAAAATAAATGAGT-TTTG--CCAAACCAGTTCAAATA-ATT-A- 189 TACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA--AAAT-AAATATATTGAC * * * * * * ** * * ** * 21782125 -AAACTATTA-GAATAAT--TATCTA-TT--TTAA--ATC-ATTCTGACAT--TT-T---GTTTG 251 TGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATAACCGTTT *** * * * * * 21782174 GTCAAA-----AAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT 315 GTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * 21782211 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAGATTAATTAGCAAGAGATTTAAAAAAATA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAA-A-TAATTAGTAAGAGATTT-AAAAAATA * * ** * * *** * * * * 21782276 AATATGTTTATTAAACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTT 62 AATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * * * * * 21782341 ATTACCTTTTGTTTAGTCATATAAGAATTGTTTTT-TATCATACCAGGTTGTTCAAAATAAAATA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATA * * * * * * 21782405 ATACTAATTGATT--AATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAAATAAATATGTTTAC 188 ATACTAATTTATTAAAATC-CT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGAC * * * * * * * * * 21782468 CGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAA 251 TGAA-CAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-----GTT----- * * * * * * * 21782532 AAATAAACCTTTTGTTCTTTC-TTAAAATAATAATT-TAT--GTTCATACAAGCTTATT 305 --AT-AACCGTTTG---TTTCATCACAA-AACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * * * * * 21782587 TGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCTGAAAATTAATCACTAAGAGATTTAAAAATTAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * 21782652 ATTTGTTTGCCGAACTAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATT 63 ATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * * * * 21782716 ATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCAATTCAAACTAGCTTATTCAAAACAAAGTA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA-TA * * * * * * 21782780 A-AATGAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAATTCTATTTAT 188 ATACT-AATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGA- * * * * * * * * * ** * * 21782839 CT-AACCAA-TTCTAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCAATTTGAAATAATTATGA-CATT 250 CTGAA-CAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT ** * * * ** * * * * * 21782901 TGGTTTTGTTATAAAACAAATT-TTTTTATTCATATAAGTTTGTT 314 T-GTTTCATCACAAAAC-AATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA *** * * * * ** * * 21782945 TGGAATAAAACAATGCTAATCTATTAACA-TTCCAACAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT- * * * * * * * 21783009 TT-TTTATCAAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATG 65 TTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATAA-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG * * * ** * 21783073 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA-A 128 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA * * * * * * * 21783135 --AGTTGTATTAATAT-TTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTA 191 CTAATT-TATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TTGACTG * * * ** * * * * * * * * 21783196 AATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATC-TTTGT 253 AA-CAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGT * * * * * 21783259 TTC-TCATAAAACAATTGCTTTTCAA-T-ATAGAAGCTTATT 317 TTCATCACAAAACAATTG--TATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * * * * 21783298 CGAAATAAAAAAATACTAATTTACTAATATTT-CAAGAATTAATAAGAGATTTATAAAATAAATC 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT * * * * * * * * * 21783362 CATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATG- 66 TATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA * * * * * * * * * 21783426 CCATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA 129 TC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA * * ** * * * * * 21783491 CTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTG-CTAA 191 CTAATTTATTAAAATCCTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TTGACTGA * * * ** * * * * ** ** 21783555 ACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATGTCAAATAATTATAACTTTTTGTTT 254 ACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTTT ** * * ** * 21783620 TGTCATC-AAACAATTGGT-CCTATTCATACTA-TTTTATT 319 CATCA-CAAAACAATT-GTATCAATTCATAC-AGGCTTATA * * * * * ** * * 21783658 CAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACGTAGTAACCAAGAAAATTAAAAAAAAT 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAA--TAATTAGTAAG-AGATT-TAAAAAAT * * * * * * 21783723 AAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATTTATTCCAAATCG 61 AAATTTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCG * * *** * * * 21783787 TTATGACCTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAACTTATTCT-GATTAAA 123 TTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATT-TAGAAT-AA * * * * * * * 21783850 ATAATGCTAATTTAATAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT 185 ATAATACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTG * * * * * * * * * 21783914 ACTGAATC-AGTTCAAAT-G--ATTAAGATAATTAGAACAATTATCTACTTGAAATTGTTCTGAT 249 ACTGAA-CAAGTACAAATAGTCA-TAA-CTACTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC * * * * * * * * 21783975 CGTTTGTTT-AGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATT 310 CGTTTGTTTCA-TCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * * * 21784022 CAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTTAATAAGAAATAGATTTAAAAAA-AA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAA--TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * * * 21784086 ATCTGTTTACCAAACAAGTTCGAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTTAATTTAAAATCATTA 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTA-TAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA * * * * * ** * ** * * 21784151 T-AACTTTTTGATTTGTCACAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAA 126 TGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * * 21784215 TACTAATTTATTAATACTCACT-AAAA-TAATAAGTAAGAA-ACTTAAAAAATAAATA-AGTTTA 189 TACTAATTTATTAA-AATC-CTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATA-TTGA * ** * * * * * * * 21784276 -TCGAATTAA-TTGAAATAATTATATAC-ATTTGAACGATTATCTATTTTAAATCGTTATGA-CT 250 CT-GAA-CAAGTACAAATAGTCATA-ACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCG ** * * ** * * * * 21784337 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTA-CCACACAAGCTTATT 312 TTTGTTTCATCACAAAACAATTG-TATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * * 21784382 TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAACTAAAT 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAAT * * * * * * * * * * 21784446 ATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTCATCTCAAATCATTAAG 65 TTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * * 21784511 ATC-TATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTGA-TCATATAAACTTATTTGGTTAA-AAATAAT 128 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTTAG--AATAAATAAT * * * * * * * 21784573 ACTAATCTAATAATAT-TTCAAAAATTAAT-AGT---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTC-G 190 ACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTGACTG * * * * * * * * ** 21784632 AGTCAA-T-CAAATAGTTAAAACTA-TTAGAATAATTATCAATTTCAAATTGTTCTGACATTTTG 253 A-ACAAGTACAAATAGTCATAACTACTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTG * * * * * * * * 21784694 TTT-AGTCATAAAATATTTGTTTCATATT-TTACAAGTTTATT 316 TTTCA-TCACAAAACAATTGTATCA-ATTCATACAGGCTTATA * * * ** * 21784735 CGAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTTAGAA-AATTAAAAAGGAAATTATTTGAAAAAA 1 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAA-G--A-GATTT-AAAAAA * * * * * * * 21784798 TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA 60 TAAATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCG * * ** * * * ** * 21784863 TTATGACCATTTGTTCTAAT-ATAAAATATTTG-TTTGAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAA 123 TTATGATCTTTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AA * * * * * * * 21784926 ATAATACTAATTTCTTAATAATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTT 185 ATAATACTAATTTATTAA-AATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTG * * * * ** * * * * * 21784987 ACCGAACAAATTCAAATAGTTATGGCTATTTGAA-AACTTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT 249 ACTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGT ** * * * * * 21785051 TTGTTTTTTCATAAAAAAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGT- 313 TTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTA-TA * * * * * 21785095 TAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAATAGTGATTTAAAAAGTAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGT--A-AGAGATTTAAAAAATAA * * *** * * * 21785158 ATTTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTT 63 ATTTATTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * * * * * * * 21785222 ATTACCTTTTATTTGGTCATAGAACAATTATTTTT-TATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATA * * * * * 21785286 ATAGTAATTTATT--AATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA 188 ATACTAATTTATTAAAATC-CT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTGA ** * * * * * * 21785349 CTGAACTAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACC-TT 250 CTGAAC-AAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT * * * * * * * 21785412 T-TATTCTATCATAAAACAAGTATTTCTATTCATACAAGCTTATG 314 TGT-TTC-ATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * ** * * * 21785456 CGAAATAAAATAATACCAATATAAAAATATTCCAAAAATTAA-TAGCTAAGAGATTTTAAAAAGA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--TAAAA-TAATTAG-TAAGAGATTTAAAAAATA * * * * * * * * 21785520 AATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC-- 62 AATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * * 21785582 ----AT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAAT 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAT * * * * * * * * * * 21785641 AA-AATAAATTTATTAATAT-TTCAAAATGTAATATGTAAGAGATTTTAAAAATAATTCTATTTA 187 AATACT-AATTTATTAAAATCCTAAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGA * * ** * * * * * * * * 21785704 CCT-ATCCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGACCTTT 250 -CTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT ** * * * ** * * * 21785768 TGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAGTTTGTTA 314 TGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTT-ATA * * * * * * * 21785812 -AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAA-AATTAATAATAGATTTTAAAAATAAATC 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT * * * * * * * ** 21785875 TATTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTAAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTACAA 66 TATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA * * * * * * ** * * ** * 21785940 TTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTATTTAGATTAAAATAATACT 129 TCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATACT * * ** * * * * * * ** * 21786005 AATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTA 193 AATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTGAACAA * * * * * * * * * 21786068 G-ATCAAAAAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA 258 GTA-CAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTG-TTT-- * * ** * * * * 21786132 GAT-A-AAAAAAATCATTTTAGTTCATATCA-GCTTATT 319 CATCACAAAACAATTGTATCAATTCATA-CAGGCTTATA * * * 21786168 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * * * * 21786233 ATATATTTACCAAAAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTCATTTGAAATTGCTAT 63 ATTTATTTACGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT * ** * * * * * * 21786298 -AACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATT-TTTTCTATTCATACAA-TTTATTAATATTAAGACAA 127 GATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTAGAATAA-ATAA *** * * * ** * * *** 21786360 T--TAATAGGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTT--AAAATCCTTATGA 189 TACTAATTTATTAAA-ATCCT-AAAAATTAATAAG--TA--AAA-GATTTAAAAAATAAATAT-A * * * * *** * * ** * * * 21786420 CTAATTGAACAATTATTTAT-TTCA-AATTGTTATG-AC--TT-TTTGTTT----T-GTCATAAA 246 TTGACTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AA * ** * * 21786474 ACAATTGTTTCTAT-TC-ATACAA--GCT-T--ATTCAT--A----T-T- 309 CCGTTTGTTTC-ATCACAAAACAATTG-TATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * 21786509 -AAAATAATATTAATTATTAA-ATATTTAA-A---AAACTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAA 1 CAAAATAA-AATAA-TACTAATTTA-TTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * 21786567 ATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATT 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGT-TAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * 21786631 GTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATATAAGCTTGTTT-GAAATAAAAT 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AAT-AAAT * * * * * * * * * * * 21786694 AATACTAATTCATGAATATTCT-AAAGTTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTCACT-A- 187 AATACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTGAC ** * * * * * * * * 21786756 TCGAACATTTCCAAATAGTTATGACTA-TCTAAACAA-T-TCTATTTCAAAACATTATGACCTTT 251 T-GAACAAGTACAAATAGTCATAACTACT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT ** * *** * * * 21786818 TGTTTTGTCATAAAACAATTGGT-TTTGTTCATGCAAGCTTATTT 314 TGTTTCATCACAAAACAATT-GTATCAATTCATACAGGCTTA-TA * * * * * 21786862 C-GAATAAAATATTA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAATA 1 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT--TAAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATA * *** * * * * * 21786923 AATATAGTTTTTTAACACA-TTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT 62 AATTTA-TTTACGAACA-AGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * ** * * * 21786987 TATGACCTTTCGTTTTGTGATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATA * ** * * * 21787052 ATACTTATTTATT-AAATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAC 188 ATACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTGAC * * * * * * * * * * 21787116 TGAGCGAGTTCAAATCA-TTATGACT-CTTCAAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTATGATCTTT 251 TGAACAAGTACAAAT-AGTCATAACTACTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT ** * * * * * *** * 21787178 TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCACACAATTTTATT 314 TGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * ** * 21787221 TGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTTCGAGACTTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * *** * * 21787286 ATCTGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTCAT-GTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAATAGTT 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATAAT--ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * ** * * 21787350 ATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAGAGTAAAAAAA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * ** * * * 21787415 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAACTAAATCA-ATT-TCTC 189 TACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTGACT- * ** * * * * * * * * ** 21787474 AAACCGGTTCAAAT-GTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATCGTTATGA-TTTTTGT 252 GAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGT ** * * * * * 21787537 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT 317 TTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * * * * * 21787577 TGAACTAAAATATTACAAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * 21787642 ATGTGTTTATCAAATAGGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTACAATAATTATCTATTTCAAATCGT 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * * * * 21787705 TCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTCAATTCATACATGCTTA-TTCGAAATAAAA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTAG-AAT-AAA ** * * ** * * * * 21787768 TAATACTAATTTATTATCATTC-AGAAATTTAATAAACAAGAA-ATGTAAAGCAATAAATTTGTT 186 TAATACTAATTTATTAAAATCCTA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAA-AAATAAATATATT * ** * * * * ** 21787831 -ATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TATAA-C 248 GACTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATAACC * * * * *** ** 21787892 GTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATT--TTTTGTTTTAT- 311 G-TTTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * ** ** * 21787936 C---ATAAAACAAT--T--CTT-TCAAT-TCATAAAAGCA-TA-TCCGA-A-ATAAAATAATATT 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAA-AATA-- * * * * * 21787988 ACTTTATTGATATTTGAA-AAATT-AAA-AGGTTA-AAGATTTACAAAATAAGTTAGTTTA-TT- 62 AATTTATT--TA--CGAACAAGTTCAAATA-GTTATAATATTT---AAACAA-TTA-TTTATTTC * ** ** * ** * * * * * 21788047 GAATCGCTT-T-AAATAAT-TATTACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAA-CTT 117 AAATCG-TTATGATCTTTTGTTTTGTCA-TAAAATAATTGT-T-TTT--ATTC-ATAC-AAGC-- * *** ** * * * * * 21788108 TTGTTTTTTCATAAAATAATTGT-TTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAA-TATTAA 172 TT-ATTTAGAAT-AAATAATACTAATTT-AT--TAAAATCCTA---AAAAT-TAATAAGTA--AA * ** * * * * * ** 21788171 TTTATTGATATTTAAAAAATTAATA-AGAGATTTAAAAAATA-AATTTATTTACCGAACCAGTTT 226 ---A--G--ATTTAAAAAATAAATATATTGACTGAACAAGTACAA---A--TA--G--TCA-TAA * * * * * * * * * 21788234 TTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACC-TTT-TATTCTGTTATAAAATAATTGTT 274 CTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGT-TTC-ATCACAAAACAATTGTA * * * * * * 21788297 TTAGTTCATATAAGCTTTTT 337 TCAATTCATACAGGCTTATA *** * * * * * * 21788317 TGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--TAAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * 21788382 ATCTATTTGCTGAA-ACAGTTCAAATAATTA-AGACTATATGAACAATTATCTGT-TTATCAAA- 63 ATTTATTTAC-GAACA-AGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTAAACAATTAT-T-TATT-TCAAAT ** * * * * * * * * 21788443 AATTATGGTTTTTTGTTTGGTCGTAAAACAATTATTTTT-TATCATTCAAGCCTATTT-GAAATA 121 CGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTTAG-AAT- * * * * * * 21788506 AAATAATACTAATTTATT--AGTCGTTCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTA 183 AAATAATACTAATTTATTAAAATC-CT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA * * * * * ** * 21788569 TTTACTGAACTAA-TTCAAATA-T-ATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAAC 246 TTGACTGAAC-AAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC * * * * *** * * 21788631 CTTTTG-TTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATT 310 CGTTTGTTTC-ATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * * 21788678 CAAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAA--TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * * 21788743 ATTTGTTTCCCAAACGAGTTCAAATA-TT-TAAGACTCTACGAGCAATTATCTATTTCAAATCAT 63 ATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATAATA-TTTA--AACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * * 21788806 CATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTTGAATAAA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTTT--ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA * * * * * * * * * 21788870 -AAAATTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAG----ATATTT-AAAAATCATTCTATTTA 186 TAATACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGA * * * * * * * * * * * * 21788928 CCT-AACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTAAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTT 250 -CTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT * * * **** * * * * * 21788992 TGTCTT-GTCA-TAAACTAA-TGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTT 314 TGT-TTCATCACAAAAC-AATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA *** * * * * * 21789034 TGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT * ** * * * * 21789097 TATTTATCAAATGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGA 66 TATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA * * * ** * * * * * 21789162 -CTTTTGGTTTTGTTATAAAATAGTTGGTTCCATTCATACAAGCCTAGTCAGATTAAAATAATAT 129 TCTTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATAC * * ** * * * * * * 21789226 TAATTTATTAATAT-TTCACCAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAGTAAATATGTTTACTAAAC 192 TAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTGAAC * * * * * * * * * 21789290 TAG-ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTT 256 AAGTA-CAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTTTC * * * * * * * * * 21789354 GTCATAAAAAAATTATTTTCAGTTCATATAAGCTTATT 320 ATCACAAAACAATT-GTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * * * * * 21789392 TGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTACAAATATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAA-A-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * * * 21789457 ATCTATTTGTCGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATTT-TTTGAAATTGCTA 63 ATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA * * * * * 21789521 TAACCTTTTGTTTT-TCATAAAATGATT-TTTTCTATTCATACAATCTTATTTTGAATAAAATAA 126 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * ** * * * * * 21789584 TACAAATTTATTAATAT-AAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTG 189 TACTAATTTATTAAAATCCTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTG * * * * * * * 21789648 AACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTACTTCAAATTC-TTATGACC-TCTT 253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATC-TATTTCAAA-TCGTTATAACCGT-TT ** * * *** * 21789709 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAGT- 315 GTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTA-TA * * * * * * * 21789751 CAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-A-AAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA ** * * * * * * * 21789816 ATATGT-TTTTTGAATAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCAT 63 AT-T-TATTTACGAACAAGTTCAAATAGT-TAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * * * * 21789879 TGTGA-CTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGC-T-TTGA-AATAAAA 124 TATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAA * * * * * * 21789939 TAATACTAATTTATCAATATTCC-AAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGGAAATGT-TT 186 TAATACTAATTTATTAA-AATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT--AAATATATT * ** * * * * * * 21790002 -ACTGAACATGTTTAAATAGGT-ATGACTA-TCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACA 248 GACTGAACAAGTACAAATA-GTCATAACTACT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC * ** * * * * * * 21790064 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTGGT-TCTATTCATGCAAGCTTATT 311 GTTTGTTTCATCA-CAAAACAATT-GTATCAATTCATACAGGCTTATA *** * * **** 21790111 TTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAGTAAGTAAAAATTTTGTTAATA 1 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAG---AGATTTAAAAAATA * * * * * * * * ** * * 21790174 AATATGTTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTAGCTATTTCAAGTCATT 62 AATTTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * ** * * * * * 21790239 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAAATGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATAA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * * * * * 21790304 TACTAATTTATTAAAATTCC-AAAACTTATTAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-AATCTGTTTACT- 189 TACTAATTTATTAAAA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTG * * * * * * ** * * * * 21790366 AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTAT 253 AA-CAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGT ** * * * * * * 21790431 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTC 317 TTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTA-TA * * * ** * 21790472 CAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTAAAAATTTATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * 21790537 ATTTGTTCACGAACAAGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTAT 63 ATTTATTTACGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT * * * * * * * ** * 21790602 GA-CATTATATTTTGTCACAAAACATTTGTTTCTATTCATAAAAAATTA-TTCGAAATAAAATAA 127 GATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAG-AAT-AAATAA * * ** * * * * * * 21790665 TACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-TCA 189 TACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACT-G * *** * * * * * * 21790725 AACCAGTTTTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAATC-TTTGTT 253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTT ** * * ** * * * 21790789 TTGTCATAAAACAATTGTTTGTATTCATGCAAGCTTATT 318 TCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * *** * * 21790828 CAGAGTAAAATATTGCTAAAACGA-TAGTATTCT-AAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA 1 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA * * * * * * * ** 21790890 TGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTA-AGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATT 64 TTTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * 21790953 CTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATA * * * ** * * 21791017 ATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTGTC 188 ATACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAA--TATAT-T- * * * 21791082 GAAC-AAATTCAATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTAT 248 G-ACTGAA--CAA---G--TAC-AAA-TAG-TC--ATAACT---AC--TT-GAACAATTATCTAT * * * ** * * * * * * * 21791146 TTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTT-AGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATT 294 TTCAAATCGTTATAACCGTTTGTTTCA-TCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * 21791209 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAA-AATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAAT 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGT----AAGAGA-TTTAAAAAAT * * ** * * ** 21791273 AAATCTATTTGTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTT-AAACTAA 61 AAATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAA-TCG * * * * * * 21791337 ATATGA-CTTTTTCTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTT-GAAATAA 123 TTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AAT-A * * * * * * * * ** 21791399 AATAATATTACTTTATTAATAT-TTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATATGTCA-AT 184 AATAATACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATAT * * *** * * ** ** * * * * * * * 21791462 TTATTGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCAATTTGAACATTTATCTATTTCAATTCGTTACAAACT 247 TGACTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCG ** * * * * * * * 21791527 TTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATT 312 TTTGTTTCATCACAAAACAATTG-TATCAATTCATACAGGCTTATA *** * * * * * * 21791572 TGGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTAAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * ** * 21791637 ATTTGTTTACCAAACCAGTTC--CTA-TT-TAA-A--T----AATTATCAATTTCAAATTGTTAT 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT * * * * * * * 21791691 -AACTTTTTGTTTTATTATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAA 127 GATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * * * * * * 21791754 TACTAATTTAATAATATTCC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTG-CC 189 TACTAATTTATTAA-AATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TTGACT * * * * * * * 21791817 AAAGC-AGTTA-AAACAGTTA-AGACT-GTATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCCT 252 GAA-CAAG-TACAAATAGTCATA-ACTACT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGT * * * * * * ** * 21791878 TTATTT-TTCATAAAACATTTGTTTTCAGTTCATACAAACTTATT 313 TTGTTTCATCACAAAACAATTG-TATCAATTCATACAGGCTTATA * * * 21791922 CAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCGAAAAGTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * *** *** ** * 21791987 ATCTGTTTACGAAATAAGTTTAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTAACTATTTCAAATAGTTA 63 ATTTATTTACG-AACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA * * * * * * * * * 21792052 TTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGA-ACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAA 126 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * * * * * ** 21792116 TACTAATTAATCT----TTC-AAAAATTAATATGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA 189 TACTAATTTAT-TAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTG * * * * * * ** * * * 21792176 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTG-T 253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTT * * * *** * * 21792240 ACTATCATAAAACAATTAT-TTTGTTCATATAAGCTT-T- 318 TC-ATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * * * * * * 21792277 TGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAA-AA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * * 21792342 ATTT-TTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA 63 ATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATAA-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA * * * * * 21792406 TGACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAACAT 126 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTTT--ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAA-AT * * * * * * * * 21792470 AA-ACGAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACC 187 AATACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGA-C * * * * * * * * * * 21792533 T-AACCAGT-CTGAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCATTT 251 TGAACAAGTAC-AAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTT * * * * * *** * * * * * 21792596 GTTTTATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT 315 GTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * 21792638 CAAAA-AAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTTGAAT-ATTAATAAGATATTTAAAAAATAAAA 1 CAAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAA * * * * * * * * 21792701 TCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTAT 64 TTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT * * * * * * * * 21792766 GA-CTTTTTCTTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAATCTTATTTAGATTTAAACAAT 127 GATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGA-ATAAATAAT * * * * * ** 21792830 ACTAATTTATTAATAT-TTAACAATTAATAAGTAAAA-ATTT-TAAAA-AAATGT-TT-ACCAAA 190 ACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTGAA * * *** * * * * * * 21792889 CTAG-ATCAAATAATCATGGTTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT 255 CAAGTA-CAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTTT * * * * * * * * * 21792953 TATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATT 319 CATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA *** ** * * 21792991 GGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAA-TAATAAAGAGATTTAAAAAATG 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT-TTAAAA-TAATTAGT-AAGAGATTTAAAAAATA * * * * * * * * * * 21793055 AA-TCATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGC 62 AATTTATTTAC-GAACAAGTTCAAAT-AGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * * * * 21793119 CATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTCAATTCA-AATAAAA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCT-TATTTAGAAT-AAA * * * * 21793182 TAATACAAATTTATTAATAT--TAAGACAATT-ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT 186 TAATACTAATTTATTAAAATCCTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTG ** * * * * * ** * * * * ** 21793244 ACCAAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTT 249 ACTGAACAAGTACAAAT-AGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGT ** * * * * * * * 21793308 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT 313 TTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * * 21793352 CAGATTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-A-AAATAATTAGTAAGAGA-TTTAAAAAATA * * * * * * * * *** 21793417 AATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACA 62 AATTTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * * * * * * 21793482 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTAGTTCTTATAAG-TT-TGTTAGAACTAAAA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TTAGAA-T-AAA * * * * ** * * * 21793544 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAATGAATCTATTTAC 186 TAATACTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGAC * * * * * * * * * * 21793609 TGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAGC-TAAACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTT 251 TGAACAAGTACAAATAGTCATAACTA-CTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTT * * ** * * * 21793673 GTTTTGA-CATAAAACAATTG-ATTCTGTTCATTCAAGCTTATTT 315 G-TTTCATCACAAAACAATTGTA-TCAATTCATACAGGCTTA-TA ** * * * * * * 21793716 TGAAA-AATATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATA 1 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT--TAAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATA * * * ** * * * 21793778 AATTTATTTTCTGAACACGTTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT 62 AATTTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * *** * * * * * 21793843 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTCTATTCATAAAATCTTAATTGGAATAAAATAA 125 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * *** * 21793908 TACTAATTTGTTAAAATTCC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAACAATAAATCCGTTTACTG 189 TACTAATTTATTAAAA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTG ** * * * * * * * * * 21793972 AATGAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTT 253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTT ** * * * * * * 21794037 TTGTCA-ATAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT 318 TCATCACA-AAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA ** * * * 21794076 TGAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTCTAAAAATTAA-TAATATGGAGATTTAAAAAATA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTA-AGAGATTTAAAAAATA * ** * * ** * * * * 21794140 AATCTATTTGTTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACCAATTAATCTATTATCTATTTCAAATCGTT 62 AATTTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTT * ** * ** ** * * 21794205 ATGA-CATTTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGTAAATTTATTCAAAATAAAAT 125 ATGATC--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAT * * * * * * * * * 21794269 AACATTAATTCATTAATAT-TTCAAAAATT-A-AA--AAAAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTAC 187 AATACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGAC ** * * * * * ** * * 21794329 AAAATC-ATTTC-AAT--TCATTACGACTATTTGATCAATTATCTATCTCAAATCACTATGATC- 251 TGAA-CAAGTACAAATAGTCA-TA--ACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCG * * * * * * 21794389 TTCAT-TTTC-TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT 312 TT--TGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * ** * * * * 21794434 CAAAGTAAAGTATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAATAATCA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * * * 21794499 ATGTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACTATTATCTATTTCAAATCAT 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATA-A-TATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCGT * * * ** 21794562 TTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATA-CTTATTT-GAAATAAAA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACA-AGCTTATTTAG-AAT-AAA ** * * * * * * * 21794625 TAATACTCTTTTATTGACAT-TTAGAAAATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAAAAATCTATTT 186 TAATACTAATTTATTAAAATCCTA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATATTG * * * * * * * * * * 21794688 ACTGAAAAAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCCTT 249 ACTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT * * * * * * * * * * 21794753 TGTTTTATCATAAAAGAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATC 314 TGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * 21794796 CAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAA-AATTAAG-AAGTTGAAGATTT-AAAAAT 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATT-AGTAA---G-AGATTTAAAAAAT * * ** * * ** * * * ** 21794858 -TAGTTAGTTTATCGAATTAGTTCGAATAATTATCACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAT 61 AAATTTA-TTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCG ** * * * * * * 21794922 TTACAAT-TTTTTTATTTGTCATAAAACAAATGTTTTTCA-TGATACAAGCTTGTTTTGAATAAA 123 TTATGATCTTTTGT-TTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA * * * * 21794985 TAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTT- 186 TAATACTAATTTATTAAAATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTG * * * * * * * * * * 21795048 ACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAGCCTTT 249 ACTGAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTT ** * * * * * * 21795113 TGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTATGTTCATACAAGCTTATT 314 TGTTTCATCACAAAACAATTGTATCA-ATTCATACAGGCTTATA ** * * * * * ** 21795156 CGGAATACAATAATACAAATATAATAATATTATAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-AAAA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * *** ** * * * * * 21795221 TTTTTTTTGTTAAACCAA-TTCAAATAGTTAATGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-CTAT 63 ATTTATTT-ACGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATC-GT * * * * * * * * * * 21795284 TATGACCTTTTGTTTTATCGTGAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATA 124 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATA * * ** * ** * * * * 21795349 ATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATGTAATAAG----AGATTTAAAAGGTAAGTTTATTTACC 188 ATACTAATTTATTAAAATCCTAAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACT * * * * * * * * * ** *** 21795410 AAACCAGTTCAAATAGTTACAACAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAAGAATTTGT 252 GAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGT ** * * * * * ** * * 21795475 TTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTATTGATACAATCCTATT 317 TTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA * * * * * * * * 21795515 CGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAATG-GACTTAAAAAATG 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT--TTAAAA-TAATTAGTAA-GAGATTTAAAAAATA * * * * * * 21795579 AATTTGTTGGACTGACCAA-TACAAATAGTTATAACTGTTTGAAA-AATTATCTATTTCAAAAT- 62 AATTTATT-TAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATAA-TATTT-AAACAATTATTTATTTC-AAATC ** * * * * * * * * * * 21795641 GACATAACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGATGACTT-GAAATAAC 122 GTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAA- * * * * * * * * 21795705 ATAA-ATCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTT 185 ATAATA-CTAATTTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTG * * * * 21795769 A-TCGATCAAGTTCATATAGT--T-ACTATTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAAC 249 ACT-GAACAAGTACAAATAGTCATAACTA--C-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC * ** * * * * * * * 21795830 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT 310 CGTTTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTA-TA * * * * * 21795878 C-AATTAAAATAATACAAACTTATTAATATTTAGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAA 1 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-A-AA-TAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * * 21795942 ATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCGTTA 63 ATTTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA * * * * 21796007 TGA-CTTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA 126 TGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA * * ** * * * * * * * 21796071 TATTAATTT-TATATATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTACC 189 TACTAATTTAT-TA-AAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACT * * * * ** * * * * * * 21796135 AAACAAGTTCTAATTGTCATAACTACTTGAGTAATTGTCTGTTTCAAATCATTATGATCTTTTGT 252 GAACAAGTACAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGT * * * * 21796200 TTCGTTATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTA 317 TTCATCACAAAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTA 21796238 CTGAACAAGC Statistics Matches: 11413, Mismatches: 2733, Indels: 1864 0.71 0.17 0.12 Matches are distributed among these distances: 330 48 0.00 331 6 0.00 332 13 0.00 333 14 0.00 334 44 0.00 335 152 0.01 336 75 0.01 337 6 0.00 338 10 0.00 339 10 0.00 340 35 0.00 341 19 0.00 342 13 0.00 343 7 0.00 344 13 0.00 345 14 0.00 346 10 0.00 347 18 0.00 348 27 0.00 349 66 0.01 350 262 0.02 351 214 0.02 352 130 0.01 353 522 0.05 354 205 0.02 355 388 0.03 356 784 0.07 357 806 0.07 358 990 0.09 359 885 0.08 360 1101 0.10 361 1487 0.13 362 1016 0.09 363 634 0.06 364 423 0.04 365 69 0.01 366 69 0.01 367 30 0.00 368 4 0.00 369 16 0.00 370 9 0.00 371 82 0.01 372 10 0.00 373 10 0.00 374 17 0.00 375 122 0.01 376 63 0.01 377 12 0.00 378 48 0.00 379 14 0.00 380 39 0.00 381 68 0.01 382 2 0.00 383 4 0.00 384 10 0.00 385 37 0.00 386 133 0.01 387 5 0.00 388 5 0.00 389 6 0.00 390 9 0.00 391 19 0.00 392 11 0.00 393 24 0.00 394 9 0.00 395 5 0.00 396 5 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (356 bp): CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAATAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT TATTTACGAACAAGTTCAAATAGTTATAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATC TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATACTAAT TTATTAAAATCCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTGACTGAACAAGTA CAAATAGTCATAACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCGTTTGTTTCATCACA AAACAATTGTATCAATTCATACAGGCTTATA Found at i:21781691 original size:360 final size:358 Alignment explanation

Indices: 21781264--21782079 Score: 846 Period size: 360 Copynumber: 2.3 Consensus size: 358 21781254 TAAATATTTG * * * ** * 21781264 AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAATTATTGTTTT-TGTTCA 1 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCA * * * * * * ** 21781328 TACAAGCTTATTTAGATTACAATAATATTAATTTATTAAAATTTTTCCAA-TTAATAAGTAAAAG 65 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA-TTCTAAAAGTTAATAAGTAAAAG * ** * * * 21781392 ATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTA 129 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCACTTGAAAAATTATCTA * ** 21781457 TTTCAAATCGTTATGACCGTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATAC 194 TTTCAAATCGTTATGACCGTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAACTCATATAGAATTATAC * * 21781522 AAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAG-ATTTAAAATA-T 259 AAAATAAAATAATATC-AATTCATTAAGATTCCAAAAATT-A--A-TAAGAGTA-TTAAAA-ACT * 21781584 GAATCTATTTA-CTGAAC-AAGCTCAAATA-GT-TGACTGTTTA 317 AAATCTATTTATC-GAACTAA-CTCAAATATGTATGACTGTTTA * 21781624 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTTTTTCTATTCAT 1 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCAT * * * ** 21781689 ACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTAATAGGTAGGAGAT 66 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAGTTAATAAGTAAAAGAT * ** * 21781754 TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATT 131 TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCACTTGAAAAATTATCTATT * * ** ** * * ** * 21781819 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTCTGCTCATATAGAATTATTCAA 196 TCAAATCGTTATGACCGTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAACTCATATAGAATTATACAA * *** 21781884 AATAAAATAATATCGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTATT 261 AATAAAATAATATCAATTCATTAAGATTCCAAAAATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTATT * * * * 21781949 TATCGAACTAATTCAAATATTTATGACTTTTTG 326 TATCGAACTAACTCAAATATGTATGACTGTTTA * * * * * * 21781982 AACAATCATATATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCA 1 AACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCA * ** * 21782045 TATAAGCTTATTCGGATTAAGAA-AATACTAATTTA 65 TACAAGCTTATTCAAAATAA-AATAATACTAATTTA 21782080 ATAATAAAAA Statistics Matches: 378, Mismatches: 67, Indels: 25 0.80 0.14 0.05 Matches are distributed among these distances: 355 1 0.00 356 34 0.09 357 62 0.16 358 35 0.09 359 11 0.03 360 233 0.62 361 2 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (358 bp): AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCAT ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAGTTAATAAGTAAAAGAT TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCACTTGAAAAATTATCTATT TCAAATCGTTATGACCGTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAACTCATATAGAATTATACAA AATAAAATAATATCAATTCATTAAGATTCCAAAAATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTATT TATCGAACTAACTCAAATATGTATGACTGTTTA Found at i:21782517 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21782084--21786314 Score: 2691 Period size: 177 Copynumber: 23.5 Consensus size: 181 21782074 AATTTAATAA ** * * * * ** * * 21782084 TAAAAAATAAATGAGTTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATT 1 TAAAAAATAAATCTG-TTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * * * * ** * 21782149 TTAAATCATTCTGACATTTTGTTTGGTCAAAAAACAATTATTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCG 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTCA * * * 21782213 AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAGATTAATTAGCAAGAGATTT 129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAG-TTT * * ** * * * * * * * 21782267 AAAAAAATAAATATGTTTA-TTAAACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCTATT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * * * * * 21782331 TCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAAGAATTGTTTTTTATCATACCAGGTTGTTCAA 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAA * * 21782396 AATAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT 130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * 21782448 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * ** * 21782513 CAAATCAATTATTTAAAAAAAATAAACCTTTTGTTCTT-TCTTAAAATAATAATTTATGT-TCAT 66 CAAATC-----GTT-------AT-GACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCAT ** * * * * * * * 21782576 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTAATCACTAAGAGA 116 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGT 21782640 TT 180 TT * * * * * * * * 21782642 TAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * ** * * 21782707 CAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCAATTCAAACTAGCTTATTCAA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAA * * * 21782771 AACAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA--TT 130 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * * * 21782819 TAAAAAATAATTCTATTTATCTAACCAATTCTAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCAATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * ** * * * * * * * *** 21782884 GAAATAATTATGACATTTGGTTTTGTTATAAAACAAAT-TTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGG 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAA * * * * * * 21782948 AATAAAACAATGCTAATCTATTAACATTCCAACAATTAATAAG--AGA--TT 130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * 21782996 TAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * * 21783061 TAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGT-TCATAAAAGCTTATCCAA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTCAA * * * 21783124 AATAAAATAA-A--AGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATT 130 AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT ** * * * * * * * 21783174 TAAAAAATAAAT-TAGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATT 1 TAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * * ** * * 21783238 TCAAATTGTTGTTATC-TTTG-TTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAAT-ATAGAAGCTTATTCG 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTTATCATACAAGCTTATTCA * * * 21783300 AAATAAAAAAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAG--AGA--TT 129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * ** * * * * * 21783349 TATAAAATAAATCCATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * * 21783414 CAAATTGTTATG-CCATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGT-TAATATAAGTTTGTTC 66 CAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTT-TATCATACAAGCTTATTC * * * * 21783477 AAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATT 128 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * ** * * * * 21783532 TAAAAAGTAAATCTATTTGCTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATGT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT ** * * * * ** * ** * 21783597 CAAATAATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTG-GTCCTATTCATACTATTTTATTCAG 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAA * * ** * ** * * 21783661 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACGTAGTAACCAAGAAAATTA 130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG--AGTTT * ** * * * * * * 21783715 AAAAAAATAAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTC 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * *** * * ** 21783780 CAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTTAT-TCATACAAACTTATTCTG 66 CAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAA * * * * 21783844 ATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT 130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * * * 21783896 TAAAAAATAAATTTATTTACTGAATCAGTTCAAAT-GATTAAGA-TAATTAGAACAATTATCTAC 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTAT * * * * * * * * ** * 21783959 TTGAAATTGTTCTGATCGTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGT-TCATATAAGCTTATTC 64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTC * * * * * * 21784023 AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAGAAATAGATT 128 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGTTT * * * * 21784077 TAAAAAA-AAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCGAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGT-TAAT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-AT * * * * * * * * * 21784139 TTAAAATCATTATAACTTTTTGATTTGTCACAAAACATTTGTTTCAATTA--ATACAAGCTTAGA 64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCTTA-T ** * * *** 21784202 T-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACT 126 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGTTT ** * ** * * * * 21784257 TAAAAAATAAATAAGTTTATCGAATTAATTGAAATAATTATATAC-ATTTGAACGATTATCTATT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * ** 21784321 TTAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTACCACACAAGCTTATTTGA 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAA * 21784385 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA--TT 130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * 21784433 TAAAAAACTAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TCAT 1 TAAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-AT * * * * * * * * * * * 21784497 CTCAAATCATTAAGATC-TATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTGATCATATAAACTTATT-T 64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCA *** * * 21784560 GGTTAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAAT-AGT-AGA--TT 129 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * ** ** ** * * * 21784610 TAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * * * ** ** * * 21784674 CAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATTTTACAAGTTTATTCGAA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAA * * * * 21784739 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAAAAAGGAA-ATTATT 131 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGT-TT * * * * 21784790 TGAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTAT 1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT * * * ** * * ** * * 21784854 TTAAAATCATTATGACCATTTGTTCTAAT-ATAAAATATTTGTTTGAGT-TCATAAAAGCTTATC 64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATT * * * 21784917 CAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TT 127 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * 21784971 T--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGGCTATTTGAA-AACTTATCTATT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATT * * * * ** 21785033 TAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAAATTG-TTTGAATTCATACAAGCTTAGTT- 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTA-TTC * * * 21785096 AAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AGTGATT 128 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * * * * 21785148 TAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * * * * * * 21785213 CAAATTGTTATTACCTTTTATTTGGTCATAGAACAATTATTTTTTATCATATATGTTTATTCAAA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAA * * 21785278 ATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT 131 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTT * * * * * * * * 21785330 AAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * * * * 21785395 CAAATCGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAA--GTATTTCTATTCATACAAGCTTATGCG 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTTA-TCATACAAGCTTATTCA * * ** * 21785458 AAATAAAATAATACCAATATAAAAATATTCCAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTT 129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAG-TTT * * ** * * * * * * 21785512 T-AAAAAGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * 21785576 CAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCACTTCATACTAGCTTATTCA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA--TCATACAAGCTTATTCA * * * 21785632 GAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTC-AAAATGTAATATGTAAGAGATTT 129 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAG-TTT * * * * * * * * 21785686 T-AAAAATAATTCTATTTACCTATCCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * * * * 21785750 CAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG-TTTTTATTCATACAAGTTTGTT-AA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAA * 21785813 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-AGA-TTT 130 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * * * 21785863 T-AAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATT * ** ** * * * * ** * * ** * 21785926 TCAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAA-TAATTTCTATTCATAAAAATTTATTTA 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCA * * * ** * * * 21785990 GATTAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-AATTT 129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * * 21786042 TAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGA-TCAAAAAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT * ** * * ** 21786105 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGAGATAAAAAAAAT-CATTTTAGTTCATATC-AGCTTATT 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA--TCATA-CAAGCTTATT * * 21786168 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATT 127 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTT * * * * * * 21786223 TAAAAAATGAATATATTTACC-AA-AAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TCAT 1 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-AT * * * * * 21786285 TTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCA 64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA 21786315 CCAAATGATT Statistics Matches: 3148, Mismatches: 743, Indels: 316 0.75 0.18 0.08 Matches are distributed among these distances: 173 12 0.00 174 147 0.05 175 104 0.03 176 138 0.04 177 598 0.19 178 222 0.07 179 226 0.07 180 341 0.11 181 525 0.17 182 436 0.14 183 231 0.07 184 20 0.01 185 2 0.00 186 2 0.00 189 2 0.00 193 5 0.00 194 134 0.04 195 3 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (181 bp): TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAA ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT Found at i:21782877 original size:18 final size:19 Alignment explanation

Indices: 21782854--21782902 Score: 52 Period size: 18 Copynumber: 2.8 Consensus size: 19 21782844 CAATTCTAAT 21782854 AATTATGACCATTTG-AAC 1 AATTATGACCATTTGAAAC * * 21782872 AATTAT--CAATTTGAAAT 1 AATTATGACCATTTGAAAC 21782889 AATTATGA-CATTTG 1 AATTATGACCATTTG 21782903 GTTTTGTTAT Statistics Matches: 25, Mismatches: 3, Indels: 6 0.74 0.09 0.18 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.24 17 8 0.32 18 11 0.44 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.39 Consensus pattern (19 bp): AATTATGACCATTTGAAAC Found at i:21785445 original size:361 final size:361 Alignment explanation

Indices: 21782571--21796229 Score: 8178 Period size: 361 Copynumber: 38.0 Consensus size: 361 21782561 ATAATTTATG ** * * * * * * 21782571 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTAATCACTA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT- * ** * * * 21782635 AGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCG-AACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * ** * 21782699 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCAAACT-AGC 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATA-TAAGC * * * 21782763 TTATTCAAAACAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * * * * * * * 21782823 AAATAATTCTATTTATCT-AACCAATTCTAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCAATTTGAA 256 AAATAAATCTATTTA-CTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** * * * * 21782887 ATAATTATGACATTTGGTTTTGTTATAAAACAAATT-TTTTTA 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTA * * * *** * * * * * * 21782929 TTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAACAATGCTAATCTATTAACATTCCAACAATTAAT--A-AG 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAG * * 21782991 AGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTATC-AAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTA 66 AGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * 21783054 TCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAA-TTGTTTTAGTTCATAAAAGCT 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATAAGCT * * * 21783117 TATCCAAAATAAAATAA-A--AGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA * * * * * * * 21783179 AATAAAT-TAGTTTACT-AAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAA 257 AATAAATCTA-TTTACTGAACT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * 21783242 ATTGTTGTTATC-TTTG-TTTCTCATAAAACAATTGCTTT-TCA 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-A * * * * * * 21783283 AT-ATAGAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAAT--A-AG 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAG * *** * * * 21783344 AGATTTATAAAATAAATCCATTTA-CCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCT 66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * 21783408 CTATTTCAAATTGTTATG-CCATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTT 130 CTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATATAAGCT * * * * 21783472 TGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA * * * * * * * * 21783537 AGTAAATCTATTTGCTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATGTCAAAT 257 AATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** * * * * * 21783602 AATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTA 322 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * ** * * * ** * 21783642 TTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACGTAGTAACCA- 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AT * * * ** * * * 21783706 AGAAAATTAAAAAAAATAAATCTAATTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAA 64 AG-AGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * * * *** * * 21783770 TTATTTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAA-TTGTTTTATTCATACAA 126 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAA * ** * * * 21783834 ACTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA 190 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * 21783899 AAAATAAATTTATTTACTGAA-TCAGTTCAAAT-GATTAAGA-TAATTAGAACAATTATCTACTT 255 AAAATAAATCTATTTACTGAACT-AATTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTT * * * * * * * * 21783961 GAAATTGTTCTGATCGTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTC-A 317 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * 21784005 GTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAGA 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAA-A * * * * * * 21784069 AATAGATTTAAAAAA-AAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTCGAATAGTTATTACTATTTGAACAAT 63 TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * * ** * * 21784132 TGT-TAATTTAAAATCATTATAACTTTTTGATTTGTCACAAAAC-ATTTGTTTCAATTAATACAA 127 TATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTTTATTCATATAA * ** * * * * 21784195 GCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACT 190 GCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGATT * * * * * * 21784257 TAAAAAATAAAT-AAGTTTA-TCGAATTAATTGAAATAATTATATAC-ATTTGAACGATTATCTA 252 TAAAAAATAAATCTA-TTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTA * * 21784319 TTTTAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTA 314 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA * * ** * 21784367 -CCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT--A-AG 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAG * * 21784428 AGATTTAAAAAACTAAATATGTTTA-CCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA 66 AGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTATCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * * * * * * 21784492 T-TCATCTCAAATCATTAAGATC-TATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTGA-TCATATAAAC 129 TCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATATAAGC **** * * 21784554 TTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAAT-AGT---AGATTTAAA 192 TTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * * * * ** * * * 21784614 AAATAAATGTGTTT-GTCG-AGTCAA-TCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTTCA 256 AAATAAATCTATTTACT-GAACT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * 21784676 AATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TA * * * * 21784720 TT-TTACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAA-AAAG 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAA- * * * * * * * 21784781 GAAATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACA 63 TAGA-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA * * * * ** * * * * 21784845 ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTCTAAT-ATAAAA-TATTTGTTTGAGTTCATAA 125 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATAT * * * * 21784908 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT 188 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT * * * * * 21784972 --AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGGCTATTTGAA-AACTTATCTATTT 253 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTT * * * * ** 21785034 AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAAATTGTTTGAA 317 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA 21785079 TTCATACAAGCTTAGTT-AAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATA 1 TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATA * * * * * * * 21785142 GTGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTAT 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * * 21785207 CTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTGGTCATAGAACAATTATTTTTTA-TCATATATGTTT 130 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATATAAGCTT * * 21785271 ATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA 194 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA * * * * 21785336 ATAAATCTATTTACTGAACTAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATC 258 ATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * * * * * * 21785401 GTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAAGTATTTCTA 323 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * ** * ** 21785440 TTCATACAAGCTTATGCGAAATAAAATAATACCAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAGCTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * * 21785505 GAGATTTTAAAAAGAAATTTGTTTGTC-AAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTA 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * 21785569 TCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTCACTTCATACT-AGC 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATA-TAAGC * * * * 21785625 TTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTC-AAAATGTAATATGTAAGAGATTTTA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * * 21785688 AAAATAATTCTATTTACCT-ATCCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCA 255 AAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * 21785752 AATCGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * 21785795 TTCATACAAGTTTGTT-AAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAT- 1 TTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATA * * * * * 21785857 -AGATTTTAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTT-AAGCAATT 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATT * * ** ** * * * * ** * * ** 21785919 ATTTATTTCAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATT 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCT * * * * ** * * 21785984 TATTTAGATTAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAA * ** * * * * * 21786047 AATAAAT-TGTTTACCAAACTAGA-TCAAAAAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAA 257 AATAAATCTATTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * ** * ** 21786110 TCATTATGACCTTTTGTTTTGAGATAAAAAAAATCATTT-TA 321 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA * 21786151 GTTCATATC-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAT 1 -TTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAA * * * * * * * 21786214 TAAGAGATTTAAAAAATGAATATATTTA-CCAAAAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAAT 63 T-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * ** ** * * 21786278 TAT-TCATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAA- 127 TATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAG * * * * * * * * * ** ** * 21786341 TTTATT-AATATTAAGACAAT--TAATAGGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATTTGT---TTA-CT 191 CTTATTCAA-AATAAAATAATACTAAT--TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT * * * * * * 21786398 AAACAAGTTAAAATC--CTTA-TG-ACTAATTGAACA-A-TTAT--TTATTTCAA-ATTGTTATG 253 AAA-AA-AT-AAATCTATTTACTGAACTAATTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACA--ATTAT- **** * * * * ** * * * 21786454 ACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC--TT-ATTCATA 311 -CTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTT-T-GTCATA-AAACAATTGTTTC-TA *** * * * * * 21786507 TT-A-A-AATAATATT---AAT-TATTAA-A-T-A----TT--TA----AAAAACTAATAAGTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAG * * 21786552 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCG-AACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTA 66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTA * * * * * 21786615 TTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA-TTGTTTTAGTTCATATAAGCT 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATAAGCT * ** * * * * * * 21786679 TGTTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATA-TTCTAAAGTTAATGAGTAAGAGAATTAAAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * * * * * * 21786743 ATTAATTTCA-CTA-TCGAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAA-T-TCTATTTCAA 258 ATAAATCT-ATTTACT-GAACTAATT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * 21786803 AACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TG 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTA * * * * * 21786845 TTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATATTA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT 1 TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT * * * ** * * 21786908 AAAAATTT-AAAAATAAATATAGTTT-TTTAACACA-TTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAAT 64 AGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * 21786970 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCGTTTTGTGATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGC 127 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGC * * * * 21787035 TTATTCAGAATAAAATAATACTTATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA * * * * ** * 21787099 AAAATAAATCTATTTACTGAGCGAGTTCAAATCA-TTATGACTCTTCAAACAATTATTTATTTCA 255 AAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * 21787163 AAT-GTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * ** ** * ** 21787205 TTCACACAATTTTATTTGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTT 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAAT * * * * * * * *** 21787269 CGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTCATCG-AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * ** * * * * * ** 21787333 ATCTATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAAT 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCT * * * * * 21787398 TATTTAGAGTAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * * * *** * * * 21787459 CTAAATCAATTT-CTCAAACCGGTTCAAAT-GTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAAT 258 ATAAATCTATTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * 21787522 CGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA 322 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA ** * * * * * * 21787561 TTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATATTACAAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT- * * * ** * 21787625 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATC-AAATAGGTTCAAATAGTTAAGACTATTACAATAATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * ** * * 21787689 ATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCT 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCT * * ** * * 21787754 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCA-TTCAGAAATTTAATAAACAAGAAATGTAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * * * * 21787817 GCAATAAAT-T-TGTTATTGAAC-AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT- 256 -AAATAAATCTAT-TTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC ** * * * * * 21787878 ATAAGAAG-TATAACGTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATTTTTTGTTT 318 A-AA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC----------TA * * * * * * ** * * 21787933 TATCATA-AAACAATTCTTTCAATTCATAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTG 1 T-TCATACAAGC--TT-ATTCAA--AATAAAA-TA-ATAC-TAATTTATTAATA-T--TTCA--- * * * * * * * * 21787997 ATATTTGAA-AAATTAAAAGGTTAAAGATTTACAAAATAAGTTAGTTTATTGAATC-GCTTTAAA 51 AAAATT-AATAAA-T---A-G----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAG-TTCAAA * * * * * * * * 21788060 TAATTATTACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTTTCATAAAAT 105 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC * * * * * * * 21788125 AATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTT-AAAA 170 AATT-TTTTTTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA * * * * 21788188 A--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAC-----C----AGTT-T--TTAT 234 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTAT * ** * * * * 21788238 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TA 299 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * *** * * * * 21788300 GTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTA 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT- * * * * * * * 21788365 AGAGATGTAAAAAATAAATCTATTT-GCTGAAACAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * ** *** * * 21788429 ATCTGTTTATCAAA-AATTATGGTTTTTTGTTTGGTCGTAAAACAATTATTTTTTA-TCAT-TCA 128 ATCT-ATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATAT-A * ** * ** * 21788491 AGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTCGTTCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTTA 189 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA * * * * ** * 21788556 AAAAACAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATA--TATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCA 254 AAAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * 21788619 AATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTG 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * * 21788662 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * * ** * 21788727 GAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-CCCAAACGAGTTCAAATATTTAAGACTCTACGAGCAATTA 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * 21788791 TCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACT-AG 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTT-TATTCATA-TAAG *** * * 21788855 CTTATTTTGAATAAAA-AA-ATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTT-AA 191 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * * * * * * * 21788913 AAATCATTCTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTAAACAATTATCCATTTCAA 256 AAATAAATCTATTTA-CTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * 21788977 ATCATTATGACCTTTTGTCTTGTCAT-AAACTAA-TGTTTTTG 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTA * * * * *** * * 21789018 CTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT--A-AG 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAG * * * * * 21789080 AGATTTAAAAAAT-AATATATTTATC-AAATGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTAT 66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * ** ** * * 21789143 TTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGGTTTTGTTATAAAATAGTTGGTTCCATTCATACAAGCCT 130 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCTT * * * * ** * * * * 21789207 AGTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAG 194 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * * * * * 21789272 TAAATATGTTTACTAAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC 259 TAAATCTATTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * * * 21789336 TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTT-TCA 323 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A * ** * * * * * 21789375 GTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTACAAATATTAATAATTA 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT- * * * * * * * 21789440 AGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTGTCGAATA-AGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * ** * * * 21789504 AT-TTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTT-TCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAATCT 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCT *** * ** * * * 21789567 TATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TAAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTTAAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA * * * * 21789631 AATAAATTTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTACTTCAA 257 AATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAA * * * 21789693 ATTC-TTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG 320 A-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * ** * * 21789735 TTCATACAAGCTTAGTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * * 21789800 AAGATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAATA-AGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATT 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-ACAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATT * * * * * * * * 21789863 ATCTATTTTAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATAAAAGC 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATAAGC * * * * * 21789927 -T-TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA * * * * * * 21789989 AATGGAAA--TGTTTACTGAAC-ATGTTTAAATAGGTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCA 257 AAT--AAATCTATTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * 21790051 AAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTGGTTCTA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA * *** * * * 21790095 TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATA * * **** * * * 21790159 AAAATTTTGTTAATAAATATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTA 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * * * * * * 21790223 GCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAAATGTTTCTATTCATAAAAACTT 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCTT *** * * * * * * 21790288 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAACTTATTAAGTAAAAGGTTTAAAAAA 194 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * * 21790353 T-AATCTGTTTACT-AAGC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAAT 259 TAAATCTATTTACTGAA-CTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** * * 21790415 CACTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA 322 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * 21790455 TTCATACAAGTTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATA-TTCTAAAAATTTATAAGT 1 TTCATACAAGCTTATT-CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-A * * * * * * 21790519 TGGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTCA-CG-AACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCTATTTGAGCTA 63 TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA * * * * * * 21790581 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTATATTTTGTCACAAAAC-ATTTGTTTCTATTCATAAAA 126 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTTTATTCATATAA ** * * ** 21790645 AATTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAA 190 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * * * * ** * * 21790706 AAACTAAATTTGTTTA-TCAAACCAGTTTTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCA 255 AAAATAAATCTATTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * 21790770 AATCGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * * *** * 21790812 TTCATGCAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAAACGA-TAGTA-TTCTAAAAATTAAT--A- 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT * * * * * * 21790872 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT ** * * * * * 21790936 ATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-TTTTTTTAGTTCATACATGC 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATAAGC * ** * * 21791000 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAACAAGTTTTAA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAA * * 21791064 AAAATAAATCTATTT-GTCGAACAAATTCAATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACT 255 AAAATAAATCTATTTACT-GAAC----T-AA-----TT-C-AAA-TAG-T----T-A-T--GACT * * * * * * * * 21791128 ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTC-A 297 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * 21791192 GTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAAC 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAA- * * * * * * * 21791256 AACAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAA 63 TAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * *** * * * * * * 21791320 TTATATATTT-AAACTAAATATGACTTTTTCTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATAAA 126 TTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATA ** * * * * * 21791383 AGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTTA 189 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA ** * * * ** * * * * * 21791448 AAAAATATGTCAATTTATTGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCAATTTGAACATTTATCTATTTCA 254 AAAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * ** * * * * * 21791513 ATTCGTTACAAACTTTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTTTCCA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA * *** * * * 21791557 -TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * 21791621 GAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAAC----C----AG-T-T-CCTATTTAAATAATTAT 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * * * * 21791674 CAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTATTATAAAATAA-TTGTTTTAGTTCATATAAACTT 130 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATAAGCTT * * * 21791738 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA 194 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * ** * * * * * * * 21791803 TTAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTAAAACAGTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATT 259 TAAATCTATTTACTGAA-CTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * * * 21791867 GTTATGACCCTTTATTTT-TCATAAAACATTTGTTT-TCA 323 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A * * * * * 21791905 GTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCGAAAAGTAATAAGTA 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT- * * * * * * * *** 21791970 AGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAAATAAGTTTAAATAATTATGGCCATGCCAACAATT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * * * 21792034 AACTATTTCAAATAGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGA-ACAT-TCAAG 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATAT-AAG * * * * * 21792097 CTTATTCAGAATAAAATAATACT-A---ATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAAAAATTTAAA 191 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA ** * * ** * 21792158 AAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAA 256 AAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * * ** * * * 21792223 TCCTTATAACCTTTTGTACTATCATAAAACAATTATTT-TG 321 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * * * * 21792263 TTCATATAAGCTT-TT-GAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAATAACTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * ** * 21792326 AAGAATTAAAAAATAAATTT-TTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTAT 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * 21792390 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACT-AG 130 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTTT--ATTCATA-TAAG *** * * * 21792453 CTTATTTGGAATAACATAA-ACGAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAA 191 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * * * * * * 21792516 AAATAATTTTATTTACCT-AAC-CAGTCTGAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA 256 AAATAAATCTATTTA-CTGAACTAATTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * * * 21792579 AATCATTATGATCATTTGTTTTATCATAAAATAAATGTTTTTG 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * ** * 21792622 TTCATATAAGTTTGTTCAAAA-AAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTTGAATATTAAT--A-A 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATA * * * * * * 21792683 GATATTTAAAAAATAAAATCTATTTATC-AAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATT 65 GAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * * * * 21792747 ATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTCTTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAATCT 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCT * * * * * * * * 21792812 TATTTAGATTTAAACAATACTAATTTATTAATATTT-AACAATTAATAAGTAA-AAATTT-TAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * ** * * ** * * 21792874 A-AAA--TGTTTACCAAACTAGA-TCAAATAATCATGGTTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAAT 258 ATAAATCTATTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * 21792935 CATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGTTT-TA 322 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * *** * * * 21792974 GTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAA 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-AT * ** * * * 21793039 AGAGATTTAAAAAATGAA-TCATTTA-CTG-AACAAGTTTAAATAATTTATGACTGTTTGAACAA 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAAC-AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAA * * ** * * * * * 21793101 TTATCTATTTGAAATTGCCATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAG 126 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAG * * * 21793166 CTCAATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATT-ATAAGTAAAAGATTT 191 CT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTT * * * * ** * 21793227 AAAAAATAAATATGTTTAC-CAAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATT 253 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * 21793290 TCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTA 316 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * ** * * 21793336 TTCATACAAGTTTATTCAGATTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * 21793401 AAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATT 65 GAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT *** * * * * * 21793465 ATCTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAA-TTGTTTTAGTTCTTATAAGT 128 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATATAAGC * * * ** 21793529 TTGTT-AGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAA 192 TTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * ** * * 21793592 AAAATGAATCTATTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAATTATTTATTTCA 255 AAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * 21793656 AAACATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCTG 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * ** * * * * 21793699 TTCATTCAAGCTTATTTTGAAA-AATATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT 1 TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT * * * * * * 21793762 AAAAATTTTAAAAATAAATTTATTT-TCTG-AACACGTTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAAT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * * 21793825 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTCTATTCATAAAATC 127 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGC ** * * * * 21793890 TTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTTGTTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA 192 TT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * ** * * * * * 21793954 CAATAAATCCGTTTACTGAA-TGAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAA 256 AAATAAATCTATTTACTGAACT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * 21794018 ATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCAATAAAA-AATTGTTTCTA 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA * ** * 21794060 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA-TTCTAAAAATTAATAATAT 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-AT * * * * * * * * * 21794124 GGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTGAATA-AGTTTAAATAGTTATGACCAATT-AATCTAT 64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAAT * * ** * * * 21794187 TATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGTAAA 127 TATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAG * * * * 21794252 TTTATTCAAAATAAAATAACATTAATTCATTAATATTTCAAAAATTAA-AA--AA-AGATTTAAA 191 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA * * * * * * * * * * 21794313 AACTAAATTTGTTTAC-AAAATCATTTCAATTCA-TTACGACTATTTGATCAATTATCTATCTCA 256 AAATAAATCTATTTACTGAACT-AATTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA ** * ** * * 21794376 AATCACTATGATC-TTCATTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * ** * * * 21794418 TTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAGTATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-A * * * * * * * 21794483 GAGATTTAAATAATCAATGTGTTTATTG-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACTATTA 65 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * * ** * 21794547 TCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATA-CT 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATA-AGCT ** ** * * * 21794611 TATTTGAAATAAAATAATACTCTTTTATTGACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAA 193 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA * * * * 21794674 AAAAAAATCTATTTACTGAA-AAAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA 256 AAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * 21794738 ATCATTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGTTT-TA 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * * * * * * 21794779 GTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAAGAAGTT 1 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATA * * * ** * * * * * 21794844 GAAGATTT-AAAAATTAGTTAGTTTATCGAATTAGTTCGAATAATTATCACCATTTGAATAATTA 65 G-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA ** * ** * * * * * 21794908 TCTATTTCAAATATTTA-CAATTTTTTTATTTGTCATAAAACAAATGTTTTTCA-TGATACAAGC 129 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTTATTCATATAAGC * *** 21794971 TTGTTTTGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA * ** * * * 21795035 AATAAATATGCTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT 257 AATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * * 21795100 CATTAT-AGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATG 322 CGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA ** * * * * 21795140 TTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACAAATATAATAATATTAT-AAAAATTAATAACCA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA--A * * * * * * * 21795204 -AGAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTGT-TAAACCAATTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAA 63 TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAA-CAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA * * * * * * 21795266 TTATCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTTTGTTTTATCGTGAAACAAATGTTTTTATTCATATAA 126 TTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAA * * *** * ** * 21795330 GTTTGTTTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T-GTAA-TAAGAGATTTAA 190 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA ** * * ** * * ** * * * 21795392 AAGGTAAGTTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTACAACAATTTAAACAATTATTTATTTCAA 255 AAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** * *** * 21795457 ATTATTATAAGAATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTA 320 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * * * * * * 21795499 TTGATACAATCCTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTA 1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAATA * * * * * * * * * 21795563 -ATGGACTTAAAAAATGAATTTGTTGGA-CTG-ACCAATACAAATAGTTATAACTGTTTGAAAAA 65 GA--GATTTAAAAAATAAATTTGTT-TATC-GAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA ** * * * * * * * 21795625 TTATCTATTTCAAAAT-GACATAACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAA 126 TTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAA * * * * 21795689 GATGACTT-GAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT 190 GCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT * * * * * * * 21795751 TAAAAACTGAATCTGTTTA-TCGATC-AAGTTCATATAGTTACT-ATTCTTTGAACAATTATCTA 252 TAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAA-TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTA * * * * 21795813 TTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA 314 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA * * * * * * * 21795861 TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAACTTATTAATATTT-AGACAACTAATTATT 1 TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAAT * * * * 21795924 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT 64 -AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * * * 21795988 TATTTTTTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGC 127 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGC *** * * ** * * * 21796053 TTATTTGGATTAAAATAATATTAATTT-TATATATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTA 192 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT-TA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA * * * ** * * * * * ** * * 21796117 AATATAAATATGTTTACCAAAC-AAGTTCTAATTGTCATAACTACTTGAGTAATTGTCTGTTTCA 255 AAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * 21796181 AATCATTATGATCTTTTGTTTCGTTATAAAACAATTGTATCAA 319 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA 21796224 TTCATA 1 TTCATA 21796230 TAGGCTTACT Statistics Matches: 10305, Mismatches: 2351, Indels: 1285 0.74 0.17 0.09 Matches are distributed among these distances: 334 31 0.00 335 77 0.01 336 29 0.00 337 12 0.00 338 11 0.00 339 19 0.00 340 17 0.00 341 12 0.00 342 7 0.00 344 9 0.00 345 5 0.00 346 51 0.00 347 71 0.01 348 19 0.00 349 33 0.00 350 271 0.03 351 209 0.02 352 119 0.01 353 514 0.05 354 200 0.02 355 392 0.04 356 740 0.07 357 746 0.07 358 992 0.10 359 840 0.08 360 917 0.09 361 1537 0.15 362 990 0.10 363 563 0.05 364 170 0.02 365 52 0.01 366 63 0.01 367 29 0.00 368 6 0.00 370 2 0.00 371 4 0.00 372 8 0.00 373 8 0.00 374 3 0.00 375 5 0.00 376 1 0.00 377 6 0.00 378 50 0.00 379 3 0.00 380 44 0.00 381 71 0.01 383 2 0.00 384 2 0.00 385 28 0.00 386 141 0.01 387 7 0.00 389 9 0.00 390 19 0.00 391 5 0.00 393 4 0.00 394 119 0.01 395 11 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (361 bp): TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAG AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATATAAGCTTAT TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA AATCTATTTACTGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA Found at i:21786466 original size:155 final size:152 Alignment explanation

Indices: 21786180--21786512 Score: 405 Period size: 155 Copynumber: 2.1 Consensus size: 152 21786170 AAATAAAATA * * * 21786180 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATATTTACCA 1 ATAC-AATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCA * * * 21786245 AAAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTCATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTT 63 AAAAGTTAAAATAATTATGACTAATTGAACAATTATTCATTTCAAATTGCTATAACTTTTTGTTT * ** * 21786310 TGTCACCAAATGATTTTTTCTATTC 128 TGTCACAAAACAATTGTTTCTATTC * * * * 21786335 ATACAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAA 1 ATACAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAA ** * * * 21786400 ACAAGTTAAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTT 64 A-AAGTTAAAATAATTATGACTAATTGAACAATTATTCATTTCAAATTGCTATAACTTTTTGTTT * 21786465 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC 128 TGTCACAAAACAATTGTTTCTATTC * * 21786490 ATACAAGCTTATTCATATTAAAA 1 ATACAA-TTTATTAATATTAAAA 21786513 TAATATTAAT Statistics Matches: 152, Mismatches: 22, Indels: 9 0.83 0.12 0.05 Matches are distributed among these distances: 152 3 0.02 153 2 0.01 154 49 0.32 155 86 0.57 156 12 0.08 ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42 Consensus pattern (152 bp): ATACAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAAA AGTTAAAATAATTATGACTAATTGAACAATTATTCATTTCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGT CACAAAACAATTGTTTCTATTC Found at i:21787234 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21786335--21796229 Score: 6504 Period size: 181 Copynumber: 54.9 Consensus size: 180 21786325 TTTTCTATTC * * * * 21786335 ATAC-AATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT 1 ATACTAATTTATTAATTTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * ** * * ** * 21786398 AAACAAGTTAAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * 21786463 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * * * * * 21786515 ATATTAA-TTATTAAATATTTAAAAAACTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-T 1 ATACTAATTTATT-AAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * 21786577 CGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTT 64 -GAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT * * * 21786641 GTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTGTTTGAAATAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * * * * * 21786695 ATACTAATTCATGAATATTCTAAAGTTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTCA-CTA-TC 1 ATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACT- * * * * 21786758 GAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAA-T-TCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTG 64 GAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * 21786820 TTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATA * * * * 21786873 TTA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAATAAATATAGTTT-T 1 ATACT-AATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAC * * * * * 21786934 TTAACACA-TTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTC 63 TGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT * * * * 21786998 GTTTTGTGATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * * 21787052 ATACTTATTTATTAAATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACT 1 ATACTAATTTATT-AATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACT * * * ** * * * 21787117 GAGCGAGTTCAAATCA-TTATGACTCTTCAAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTATGATCTTTTG 64 GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * ** * 21787180 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCACACAATTTTATTTGAAAGAAAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * *** * * * 21787233 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTTCGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTCA-TC 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT- * * * *** ** 21787297 GAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTG 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG * * * ** * * 21787361 TTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTT-AGAGTAAAAAA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * * * * 21787414 ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAACTAAATCAATTT-CTC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT- * ** * * * * * 21787474 AAACCGGTTCAAAT-GTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATCGTTATGA-TTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * 21787537 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * * * 21787589 TTACAAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-TC 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * ** * * * 21787653 AA-ATAGGTTCAAATAGTTAAGACTATTACAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG 65 AACA-A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * * 21787717 TTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * ** * * 21787770 ATACTAATTTATT-ATCATTCAGAAATTTAATAAACAAGAA-ATGTAAAGCAATAAAT-T-TGTT 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAA-AAATAAATCTAT-TT * * * ** * * * 21787831 ATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATAACGTT 61 ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTT * * * * * * 21787895 TTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATTTTTTGTTTTATCATA-AAACAATTCTTTCAATTCA 125 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC----------TAT-TCATACAAGC--TTATTTGAA---A * 21787959 TAAAAGCA 174 TAAAA-TA * * ** * * *** * ** * * * 21787967 TATCCGAAATAAAATAATATT-ACTTTATTGATATTTGAAAAATTAAAAGGTTAAAGATTTACAA 1 -ATAC-TAATTTATTAATTTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAA----AAA-A--T---A * * * * * * * 21788031 AATAAGTTAGTTTATTGAATC--GCTTTAAATAATTATTACCATTTAAACAATTATCTATTTCAA 52 AAT---CTA-TTTACTGAA-CAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * 21788094 ATCGTTACGAACTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTT-AGAA 111 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AA 21788157 TAAAATA 174 TAAAATA * * * * * 21788164 ATATTAATTTATTGATATTTAAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * ** * 21788225 AAC-----C----AGTT-T--TTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTATT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * * 21788278 CTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * 21788329 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAATCTATTTGCTG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * *** 21788394 AA-ACAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGTTTTTT 65 AACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCATTATGACCTTTT * * * * * * 21788457 GTTTGGTCGTAAAACAATTATTT-TTTATCATTCAAGCCTATTTGAAATAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * 21788511 ATACTAATTTATTAGTCGTTCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACTG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * ** * * * 21788576 AACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGT 65 AAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * ** 21788638 TCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * * * * ** 21788690 ATATTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTCCCA 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * ** * * 21788755 AACGAGTTCAAATATTTAAGACTCTACGAGCAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * 21788820 TTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTTG-AATAAAA-A 130 TTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATA * * * * 21788872 A-ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----ATATTT-AAAAATCATTCTATTTACCT 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CT * * * * * 21788931 -AACTAGTTCAAATAATTATGAGTATTTAAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * ** * * * * * 21788995 CTTGTCAT-AAACTAA-TGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTA 129 TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * 21789046 ATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAAT-AATATATTTA-TC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * 21789105 AA-ATGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG 65 AACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT- * * * * * * * * * 21789168 GTTTTGTTATAAAATAGTTGGTTCCATTCATACAAGCCTA-GTCAGATTAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * ** * * * * * * 21789222 ATATTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAGTAAATATGTTTACTA 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * * 21789287 AACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * 21789352 TTGTCATAAAAAAATTATTT-TCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * * 21789404 ATATTAAGTTATTAATATTACAAATATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT-GTC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT- * * * * * * *** * 21789468 GAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTAT-TTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT ** * * 21789532 TTT-TCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAATCTTATTTTG-AATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATA * * ** * * * * 21789583 ATACAAATTTATTAATATAAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTG 1 ATACTAATTTATTAATTTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * 21789648 AACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTACTTCAAATTC-TTATGACCTCTTG 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTG * * * * * 21789710 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-GTCAAATTACAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATA * ** * * * * ** 21789763 ATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * 21789828 AATAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACTTTTTGT 65 AACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * 21789892 TTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGC---TTTGAAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * 21789941 ATACTAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGGAAA--TGTTTAC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT--AAATCTATTTAC * * * * * * * 21790004 TGAACATGTTTAAATAGGTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTG 63 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * 21790069 TTTTGTCATAAAAAAAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATA 128 TTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATA * * **** * * * 21790123 ATA-TAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTAAAA-ATTTTGTTAATAAATATGTTTTCT 1 ATACT-AATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * * * 21790186 AAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTAGCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * 21790251 TTTGTCATAAACCAAATGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * 21790303 ATACTAATTTATTAAAATTCCAAAACTTATTAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-AATCTGTTTACT- 1 ATACTAATTTATT-AATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * 21790366 AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTAT 65 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * ** 21790431 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCCAAAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATA * * * *** * * * * 21790484 ATACTAATTTACTAATATTCTAAAAATTTATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTCAC-G 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * * * 21790548 AACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCTATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTATAT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * ** * 21790612 TTTGTCACAAAACATTTGTTTCTATTCATAAAAAATTATTCGAAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * ** * * * 21790664 ATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-TC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT- * * ** * * * * * 21790724 AAACCAGTTTTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAATC-TTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * 21790788 TTTGTCATAAAACAATTGTTTGTATTCATGCAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * * *** * * * * 21790840 TTGCTAAAACGA-TAGTATTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACT 1 ATACT-AATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * * * * * * 21790900 AAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * ** 21790965 TTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA ** ** * 21791017 ATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTGTC 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTA-TT-T- * * * * 21791082 GAAC-AAATTCAATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTAT 61 --ACTGAA--CAA---G-TT-C-AAA-TAGTT---ATGACT---A-T-TT-GAACAATTATCTAT ** * * * * * * * 21791146 TTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATACATGCTTATTC 106 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTT * 21791210 AAAATAAAATA 170 GAAATAAAATA ** ** * 21791221 ATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAA-ATTTTAAAAAATAAATCTATTT-G 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAC * * * * * 21791284 TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTT-AAACTAAATATGACTTTT 63 T-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT * * * 21791348 TCTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATA 126 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * ** * * 21791403 ATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATATGTCAATTTATTG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG *** * * * * * * * ** * 21791468 AATTGGTTCAAATAATTTTGGCAATTTGAACATTTATCTATTTCAATTCGTTACAAACTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * * 21791533 TTGTTACAAAATAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * 21791584 ATATTAATTTGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTAC-- 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG ** * * * * ** * * 21791647 --C-A----AACCAG-T-T-CCTATTTAAATAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * ** 21791702 TTATTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * ** 21791753 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTGCCA 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * ** * * 21791818 AAGC-AGTTAAAACAGTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCCTTTAT 65 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * ** 21791882 TTT-TCATAAAACATTTGTTT-TCAGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * ** * 21791934 ATAATAATTTATTAATATTTCGAAAAGTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-G 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * *** * * 21791998 AAATAAGTTTAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTAACTATTTCAAAT-AGTTATTACCTTTTG 65 -AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG * * * * * 21792062 TTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTA-TTCAGAATAAAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * * ** 21792115 ATACT-A---ATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * ** * * * * 21792176 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTA 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * 21792241 CTATCATAAAACAATTATTT-TGTTCATATAAGC-T-TTTGAAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * ** 21792289 ATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAAT-T-TTTTGTC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT- * * ** * 21792352 GAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG- 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * * * 21792416 TTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAACATA 129 TTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * 21792471 A-ACGAATTTATTAATATTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCT- 1 ATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTG * * * * * 21792534 AACCAG-TCTGAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCATTTGT 65 AACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * * * * 21792598 TTTATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAAAAAAAAGTA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTGAAATAAAA-TA ** * * 21792650 ATACTAATTTATTAATATTTTGAATATTAATAAG----ATATTTAAAAAATAAAATCTATTTA-T 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACT * * * * * * * * * 21792710 CAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTC 64 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * * * 21792775 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAATCTTATTT-AGATTTAAACA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA * * * ** 21792828 ATACTAATTTATTAATATTT-AACAATTAATAAGTAAAA-ATTT-TAAAA-AAA--TGTTTACCA 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * ** * * 21792887 AACTAGATCAAATAATCATGGTTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * 21792952 TTATCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * 21793003 ATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATC-ATTTACT 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * * **** * 21793066 GAACAAGTTTAAATAATTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCCATAACCTTTTG 64 GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * * 21793131 TTTTGTTATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTCAATTCAAATAAAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * 21793184 ATACAAATTTATTAATATT-AAGACAATT-ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC 1 ATACTAATTTATTAATTTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * ** * * ** * 21793247 AAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTG 64 GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * 21793311 TTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGATTAGAATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA ** * * * 21793364 ATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACT 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * ** * 21793429 AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * * * 21793494 TTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTGTTAGAACTAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * ** * 21793546 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAATGAATCTATTTACTG 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * ** * * * 21793611 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * 21793676 TTGACATAAAACAATTGATTCTGTTCATTCAAGCTTATTTTGAAA-AATATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATA * * * * * 21793727 AT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATTTATTTTCT 1 ATACT-AATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * 21793790 GAACACGTTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * * 21793855 TTTGTCATAAACCCATTGTTTCTATTCATAAAATCTTAATTGGAATAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * ** 21793907 ATACTAATTTGTTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAACAATAAATCCGTTTACTG 1 ATACTAATTTATT-AATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG ** * * * * ** * * 21793972 AATGAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * 21794037 TTGTCAATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATA 130 TTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * ** ** 21794088 ATACTAATTTCTTAATATTCTAAAAATTAATAA-TATGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTT 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * * * * * 21794152 GAATAAGTTTAAATAGTTATGACCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTT * ** * ** ** ** 21794216 ATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGTAAATTTATTCAAAATAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * ** 21794270 ACATTAATTCATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAAAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAA 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * * * ** 21794331 AATC-ATTTCAATTCA-TTACGACTATTTGATCAATTATCTATCTCAAATCACTATGATC-TTCA 65 AA-CAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * 21794393 TTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAGTA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATA * * ** * * * * * * * * 21794446 TTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAATAATCAATGTGTTTATTG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * * * * 21794511 AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACTATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * 21794576 TAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATA-CTTATTTGAAATAAAATA 130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGCTTATTTGAAATAAAATA ** * * 21794627 ATACTCTTTTATTGACA-TTT-AGAAAATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAAAAATCTATTTA 1 ATACTAATTTATT-A-ATTTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA * * * * 21794689 CTGAAAAAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCCTTT 62 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT * * * * *** 21794754 GTTTTATCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * ** * * 21794808 ATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAAGAAGTTGAAGATTT-AAAAATTAGT-TAGTTTA-T 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT ** * * * * * * 21794870 CGAATTAGTTCGAATAATTATCACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATT-T-ACAATTTT 64 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC--CTTT * * * * * 21794932 TTTATTTGTCATAAAACAAATGTTTTTCA-TGATACAAGCTTGTTTTG-AAT-AAATA 126 TGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATA * * ** * 21794987 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCG 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG * * 21795052 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTAT-AGCCTTTTGT 65 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGT * * * * * * 21795116 TTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * ** * * * * ** 21795168 ATACAAATATAATAATATTAT-AAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTGTT 1 ATACTAATTTATTAAT-TT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * 21795232 AAACCAA-TTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTT 64 GAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTT * * * * * * * * 21795294 TGTTTTATCGTGAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTTG-AATAAAATA 126 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATA * ** ** * * * 21795349 ATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATGTAATAAG----AGATTTAAAAGGTAAGTTTATTTACC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * ** * * * * * *** 21795410 AAACCAGTTCAAATAGTTACAACAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAAGAATTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * * 21795475 TTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTATTGATACAATCCTATTCGAAATAAAGTA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * ** * * * * * 21795527 ATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAATGGACTTAAAAAATGAATTTGTTGGACT 1 ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACT * * * * * * * * 21795592 GACCAA-TACAAATAGTTATAACTGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAAATGA-CATAACCTTTTG 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTG * * * * * * * 21795655 TTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGATGACTTGAAATAACATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * 21795708 A-ATCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTA-T 1 ATA-CTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * * ** * 21795771 CGATCAAGTTCATATAGTTACT-ATTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTT 64 -GAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT * * * * 21795835 GTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATA 127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * 21795889 ATACAAACTTATTAATATTT-AGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC 1 ATACTAATTTATTAAT-TTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT * * * * * 21795953 GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCGTTATGACTTTTTGT 64 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT * * * * * * 21796018 TTTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATA 129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA * * * * * * * 21796070 ATATTAATTTTATATATATTTT-GACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTAC 1 ATACTAA-TTTAT-TA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC ** * * * * * ** * * * 21796134 CAAACAAGTTCTAATTGTCATAACTACTTGAGTAATTGTCTGTTTCAAATCATTATGATCTTTTG 63 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * 21796199 TTTCGTTATAAAACAATTGTATCAATTCATA 128 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA 21796230 TAGGCTTACT Statistics Matches: 7578, Mismatches: 1711, Indels: 850 0.75 0.17 0.08 Matches are distributed among these distances: 163 1 0.00 164 1 0.00 165 102 0.01 167 2 0.00 168 6 0.00 169 147 0.02 170 1 0.00 171 1 0.00 172 7 0.00 173 20 0.00 174 29 0.00 175 304 0.04 176 416 0.05 177 402 0.05 178 585 0.08 179 510 0.07 180 1258 0.17 181 2465 0.33 182 878 0.12 183 66 0.01 184 8 0.00 185 1 0.00 186 4 0.00 187 5 0.00 188 5 0.00 191 11 0.00 192 14 0.00 193 8 0.00 194 5 0.00 195 12 0.00 196 16 0.00 197 5 0.00 198 24 0.00 199 10 0.00 200 5 0.00 201 6 0.00 202 8 0.00 203 9 0.00 204 139 0.02 205 4 0.00 208 4 0.00 212 2 0.00 213 69 0.01 214 3 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (180 bp): ATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA Found at i:21787929 original size:32 final size:32 Alignment explanation

Indices: 21787893--21787956 Score: 119 Period size: 32 Copynumber: 2.0 Consensus size: 32 21787883 AAGTATAACG 21787893 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATT 1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATT * 21787925 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTCTTTCAATT 1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATT 21787957 CATAAAAGCA Statistics Matches: 31, Mismatches: 1, Indels: 0 0.97 0.03 0.00 Matches are distributed among these distances: 32 31 1.00 ACGTcount: A:0.33, C:0.11, G:0.03, T:0.53 Consensus pattern (32 bp): TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATT Found at i:21788260 original size:165 final size:168 Alignment explanation

Indices: 21788071--21788389 Score: 405 Period size: 165 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168 21788061 AATTATTACC * * * * 21788071 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAA-CTTTTGTT-TTTTCATAAAATAATTGTTTT 1 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-AAACCTTTTATTCTGTT-ATAAAATAATTGTTTT * * * * * 21788134 TCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTGATATT-TAAAAAAT-TAA-TA 64 ACATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAATATAACTA * * 21788196 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTTT 129 AGAGATGTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTTTT * * 21788236 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAG 1 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAC * * * * * * 21788301 TTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAA 66 ATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAAT-ATAACTAA 21788366 GAGATGTAAAAAATAAATCTATTT 130 GAGATGTAAAAAATAAATCTATTT 21788390 GCTGAAACAG Statistics Matches: 129, Mismatches: 19, Indels: 8 0.83 0.12 0.05 Matches are distributed among these distances: 164 2 0.02 165 90 0.70 166 9 0.07 168 3 0.02 169 25 0.19 ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.07, T:0.42 Consensus pattern (168 bp): ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAC ATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAATATAACTAAG AGATGTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTTTT Found at i:21791238 original size:204 final size:204 Alignment explanation

Indices: 21790888--21791297 Score: 766 Period size: 204 Copynumber: 2.0 Consensus size: 204 21790878 TTAAAAAATA * 21790888 AATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATT 1 AATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATT * * 21790953 CTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA 66 CTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA * 21791018 TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCG 131 TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCG 21791083 AACAAATTC 196 AACAAATTC * 21791092 AATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT 1 AATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATT 21791157 CTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA 66 CTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA 21791222 TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCG 131 TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCG * 21791287 AACAAGTTC 196 AACAAATTC 21791296 AA 1 AA 21791298 ATAGTTATGG Statistics Matches: 200, Mismatches: 6, Indels: 0 0.97 0.03 0.00 Matches are distributed among these distances: 204 200 1.00 ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.06, T:0.39 Consensus pattern (204 bp): AATGTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATT CTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCG AACAAATTC Found at i:21792831 original size:25 final size:24 Alignment explanation

Indices: 21792803--21792853 Score: 59 Period size: 25 Copynumber: 2.1 Consensus size: 24 21792793 GTTTATGTTC * 21792803 ATAC-AATCTTATTTAGATTTAAACA 1 ATACTAAT-TTATTAAGATTT-AACA * 21792828 ATACTAATTTATTAATATTTAACA 1 ATACTAATTTATTAAGATTTAACA 21792852 AT 1 AT 21792854 TAATAAGTAA Statistics Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 3 0.82 0.07 0.11 Matches are distributed among these distances: 24 6 0.26 25 14 0.61 26 3 0.13 ACGTcount: A:0.45, C:0.10, G:0.02, T:0.43 Consensus pattern (24 bp): ATACTAATTTATTAAGATTTAACA Found at i:21797050 original size:182 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21796757--21800962 Score: 1265 Period size: 181 Copynumber: 23.3 Consensus size: 179 21796747 TTGTTTAACC ** * * * * * 21796757 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * 21796822 CATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA 66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAA 21796886 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT 130 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAAT * * * * * 21796938 AAGCTCAAATAGATATGACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGTTTTG 1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG * * * * * * * 21797003 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTGTCCGAACTAAAATAAAAGCTACTTTATTAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAA- * * * * 21797068 ATTTCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTAT-ATT-TCGAACT 128 AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAA-TATGTTTATCGAA-T * * * * * ** * * 21797121 AGTTCAATTAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * * 21797185 CGA-AAAA-AATTG-TTCTTGATCATATAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAAT-A 66 C-ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAA * * * * 21797245 TATCTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGTCAAAT 128 AAT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT * * * * * * ** * * * 21797297 GAATTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACTTTTTGTTTAG 1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG * * * * ** * 21797362 T-AGTAAAACTATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT--AAGCAT--TAATTTATTAAC 65 TCA-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA * * * * 21797422 ATTCAAACAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACA 129 ATTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-T * * * * * * 21797476 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACGATTATTTATTTAAAATTATTATGAA-CTTTTGTTTTA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTG * * * * * 21797540 TCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATA-AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA- * * * 21797604 ATTTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCA-GTTTACCAAAT 128 AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAAT * * * 21797653 CAGTTCAAATAATTATCG-CCATTTGAACAA--A---ATTGT----T-A--AT-ACTTTTTGTTT 1 -AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATAACCTTTTGTTT * * * * * ** * 21797704 TGTCACAAAAAAAAATTATTTTTCA--ACATACAAACTTATTTTAAAAAAAATAATACTAATTTA 63 TGT--CATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA * * ** * * 21797767 TTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAATTGATTTAAAAATTAAATTTGTTTA-CTGAACT 124 TTAA-AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-T * * ** * 21797821 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21797886 -ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACCAATGTAATAATA 66 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A * * * * * * * 21797949 TTTTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACC 129 ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-T * * * * * * * * * 21798001 AGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATCATCTATTGCAAATCATTATGACCTTTTATTTTAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * * * * 21798066 CTTAAGACAATTATTTCAGCTCATATAAGTTTACTT-GGAATCAAATAAAACTAATTTGTTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A * * * * * * * * * 21798130 TTTCAAAATTTTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACT 129 ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-T * * * * * 21798182 AGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * 21798247 CATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGA-TCGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAA 66 CATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * * * 21798310 TATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATTTGTTTACCAAACC 128 AATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTATCGAA-T * * 21798365 ATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGTAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG * * * ** * * 21798430 TCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTC-AGAATGAAATAATACTAATTTAATAA 65 TCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * * ** * * * ** 21798493 TATTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAA-ATAATCTAATTA-CTGAAT 128 AATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTATC-GAAT ** * ** * * * * * * 21798546 CAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAA-TGTTATCAATTTTAAATCTTTATGACTTTTTGTTTTA 1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG * * * *** ** * 21798610 TCATAAAACAAAATTTTTTTCCG-T--TA-AAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAAATTTAATA 65 TCATAAAAC--AA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * * 21798671 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACC 127 A-AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-T * * * * * * 21798726 AGTTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACTTTTTTGTTTA 1 AGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC-CTTTTGTTTT * ** * * ** * * ** * * 21798788 GTCATAAAAC-TTTAAGACT-A-TT-AGAACAA--TTA-TCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT 64 GTCATAAAACAATT--GTTTCAGTTCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-A-ATTTA ** * * ** * * * * * 21798846 TGTTTAGTTATAAAACATTTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAATTAATACTAATTT 124 T-TAAAATT-CAAAA-A-TT-AATAAG-T-A-A-GAG---ATT-TAAA-AAATAAATA-T-GTTT 21798911 AAT--AA- 173 -ATCGAAT * * * ** * * * * * 21798916 ATTTTAAA-AATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGATAGGTTCA-AATAA 1 AGTTCAAATAGTT-AT--G--ACTATTT-GAACAAT-TATCTA-TT-TC-A-A--ATCATTATAA * * ** * ** * * ** * ** * *** *** 21798979 TCATTACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTT-TT-GTTTTGTTATAA- 53 CCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCAGTTC-ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT * * * * *** * * * * * 21799038 AATAATTGT-TT-CAGTT-AATACATGCTTAA--ACG-GA-ATAAAATAAT-ATTA-ATTTAT-T 115 ACTAATT-TATTAAAATTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATATGTTTATCG 21799093 AAT 177 AAT * * * * * * * * ** ** 21799096 ATTTCTAAA-A-TTAATAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTAAATCAGTA-AAAATAAT 1 AGTTC-AAATAGTT-AT--GACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATCATTATAACCTTTT * * * ** * * * * * * ** *** 21799157 -TATGGCCATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTTTGACCTT-TT-TATTTTGTTATAA-A 59 GTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CA-----AGCTTATTCGA-AATAAAATAATA * ** * * * * ** * * * * 21799217 CCAATTGT-TTTTAA-TCAGACAAGCTTATTCGAAATAA-A-ATAATACTAATTTATTAAT-ATT 116 CTAATT-TATTAAAATTCA-A-AA-ATTAAT--AAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAAT-ATGTTT * 21799277 -TC-AAA 173 ATCGAAT * * * * ** * ** * 21799282 AGTTAATAAATGTGTTTTTGAATAGTTAAAACTATTAGAATAATCGTCCATTTCAAATTGTT-TG 1 AGTT--CAAAT-AG---TT--AT-G-----ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA * * * * * 21799346 A-CTTTCT-TTTAGTCATCAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT 52 ACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT * * * * * 21799408 CCTAATGTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTGAAAAAATAAATATGTTTA-CTG 115 ACTAATTTATTAAAATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATC-G 21799472 AAT 177 AAT * * * * * 21799475 AAGCTCAAATAGTTAGGATTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT 1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT * * * * * * * * 21799539 ATTATAATACAATTGTTTCAGTTAATAGAAGCTTATACGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAAT 64 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA- * * * * * 21799604 ATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTAAAT 128 AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAAT * * * * * * 21799652 CAGTTAAAATAATTTTAATCT-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT 1 -AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT * * * * * * * 21799716 GTCAAAAAATAGTTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAACAATAATAATAATTT 64 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG-----AAATAA-AATAATACTAATTT * * * * * * * 21799781 ATTAATATTCCTAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAAT 123 ATTAAAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT * * * * * * 21799835 CTGTTCAAATAATTCT-AGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTCTTT 1 -AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTT * * * * * 21799898 TGTCATAAAATAATTGGTTTTCA--TCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT 63 TGTCATAAAACAATT-G-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT * * * 21799961 AATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAA- 126 AA-AATTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT * * * ** * 21800014 A---C---CAG-T-T-CCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATCATCGTAACCTTTTGTTCT- 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG * * * * * * * 21800068 ACTATAAAATAATTGTTTCAATTCACACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAAT 65 TC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA- * * * * * * 21800133 ATTTCAAAAATTAATAACTTAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTT-GCTGAAGT 128 AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-T * * ** * * * * * 21800187 AGTTCAAACATTTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTATCAAATTATTTTGACCTTTTGTTCT 1 AGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT * * * * * 21800252 ATCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAGT 64 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA-A * * * * * 21800316 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-CTAAAT 128 AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAAT * * * * * * ** * * * 21800368 CATTTCAAATAATTAGGGCCAGTTCTACAATTATCTATTTCAAATGATTATTACCTTTTGTTTGG 1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG * * * * * * 21800433 TCATATAACAAATGTTTCTGATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATA 65 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A * * * * * * * 21800498 TTTCAAAAATTGATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACC 129 ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-T * * * * * 21800550 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAATTATTATAACCTTTTGTTATGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * * 21800615 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCACAAAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA 66 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA * ** * * * 21800679 TTCTGAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACT 130 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-T * * * * * * * * * 21800731 AGTTCAAATAGTTAAGGCTATATAAACAATTCTTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGC 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21800796 CATAGAACAA-T-TTTCAATTCTTAGTAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA- * * * * * ** * 21800857 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTCTATTTGCCAAACT 128 AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-T * * * * 21800910 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTGTTTCAAATCGTTATAAC 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC 21800963 ATAAAGCAAA Statistics Matches: 3008, Mismatches: 732, Indels: 571 0.70 0.17 0.13 Matches are distributed among these distances: 165 1 0.00 166 12 0.00 167 52 0.02 168 44 0.01 169 128 0.04 170 30 0.01 171 6 0.00 172 13 0.00 173 9 0.00 174 12 0.00 175 25 0.01 176 103 0.03 177 217 0.07 178 239 0.08 179 292 0.10 180 240 0.08 181 533 0.18 182 338 0.11 183 354 0.12 184 111 0.04 185 11 0.00 186 19 0.01 187 7 0.00 188 3 0.00 189 7 0.00 190 16 0.01 191 34 0.01 192 18 0.01 193 14 0.00 194 8 0.00 195 19 0.01 196 23 0.01 197 9 0.00 198 8 0.00 199 14 0.00 200 6 0.00 201 7 0.00 202 7 0.00 203 10 0.00 204 6 0.00 205 3 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (179 bp): AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT Found at i:21798553 original size:365 final size:360 Alignment explanation

Indices: 21797811--21798769 Score: 985 Period size: 365 Copynumber: 2.6 Consensus size: 360 21797801 TTAAATTTGT * * ** 21797811 TTACTGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT 1 TTACTGAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT * * * * 21797876 TTTATTTTGT-ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACCAAT 66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAAT * * * * ** 21797940 GTAATAATATTTTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACCAGTT 130 TTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCA-TT * * * * * * 21798005 T-AAACAGTTAAGACTATATGAACAATCATCTATTGCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCTT 193 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCTC * * ** 21798069 AAGACAATTATTTCAGCTCATATAAGTTTACTTGGAATCAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTC 258 AAGACAATTAGTTCAGCTCATATAAGTTTACTTAGAATCAAATAAAACTAATTTAATAATATTTC * * ** * * * 21798134 AAAATTTTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTAT 323 AAAACTTAATAACCAAAAAATTAAAAAAATAATTCTAA ** * * * 21798172 TTACCAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCATTATTACCT 1 TTACTGAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT * * 21798237 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTGA-TCGAAATAAAAATAATACTA 66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGTTT-ATTTGAAAT-AAAATAATACAA * * * 21798301 ATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATTTGTTTACCAAACCA 128 ATTTAATAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACCGAACCA ** * * 21798366 TTTCAAATAGTTTTGACTATTTGTAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT 191 TTTCAAATAGTTAAGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAT * * * * * 21798431 CATCAA-ACAATTGGTTCTA-TTCATACT-ATTTTA-TTCAGAATGAAATAATACTAATTTAATA 255 C-TCAAGACAATTAGTTC-AGCTCATA-TAAGTTTACTT-AGAATCAAATAAAACTAATTTAATA 21798492 ATA-TTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAA-TCTAA 316 ATATTTC-AAAACTTAATAACCAA-AAAATTAAAAAAATAATTCTAA * * * ** * * * * * 21798537 TTACTGAA-TCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAA-TGTTATCAATTTTAAATCTTTATGACT 1 TTACTGAACT-AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC * * * * * *** * 21798600 TTTTGTTTTATCATAAAACAAAATTTTTT-TCCGT-TAAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAA 65 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATAT-AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAA * * 21798663 ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAG 128 ATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAT * 21798728 TTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC 192 TTCAAATA-GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC 21798770 GTTTGACTTT Statistics Matches: 496, Mismatches: 83, Indels: 40 0.80 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 359 24 0.05 360 11 0.02 361 86 0.17 362 90 0.18 363 61 0.12 364 79 0.16 365 126 0.25 366 19 0.04 ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.07, T:0.40 Consensus pattern (360 bp): TTACTGAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAATT TAATAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCATTTCA AATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCTCAAG ACAATTAGTTCAGCTCATATAAGTTTACTTAGAATCAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAA ACTTAATAACCAAAAAATTAAAAAAATAATTCTAA Found at i:21799113 original size:180 final size:177 Alignment explanation

Indices: 21798803--21799290 Score: 560 Period size: 178 Copynumber: 2.7 Consensus size: 177 21798793 AAAACTTTAA * * * 21798803 GACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTGTTTAGTTATAAAACATTTGT 1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG- * * * * 21798868 TTTAGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAATTAATACTAATTTAATAA-ATTT-TAAAAATTAAT 65 TTTAGTTAATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTAAT ** ** 21798931 AAGAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAT-AGGTTCAAATAATCAT 129 AAG---AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAATCA-GTAAAAATAATCAT * * * * * 21798983 TACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGT 1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGT * ** * * 21799047 TTCAGTTAATACATGCTTAAACGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATA 66 TT-AGTTAATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATA * * * 21799112 AGAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTAAATCAGTAAAAATAATTAT 130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATCAGTAAAAATAATCAT * * * * 21799160 GGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTATTTTGTTATAAACCAATTGT 1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGT 21799225 TT--TTAATCAGACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAGTTA 66 TTAGTTAAT---ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAA-TTA 21799287 ATAA 127 ATAA 21799291 ATGTGTTTTT Statistics Matches: 260, Mismatches: 38, Indels: 22 0.81 0.12 0.07 Matches are distributed among these distances: 175 5 0.02 176 16 0.06 177 57 0.22 178 74 0.28 179 57 0.22 180 50 0.19 181 1 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (177 bp): GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGT TTAGTTAATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAA GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATCAGTAAAAATAATCAT Found at i:21800791 original size:362 final size:359 Alignment explanation

Indices: 21799386--21800942 Score: 942 Period size: 360 Copynumber: 4.3 Consensus size: 359 21799376 ATATCATACA * ** * * * * * 21799386 AGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATGTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATT 1 AGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATATGTAA-AAGATT * * ** * * * * 21799449 TGAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-TAAGCTCAAATAGTTAGGATTATTTGAACAATTACT-TA 64 T-AAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TATA * * * * * * * * * * * 21799512 TT-TAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATTATAATACAATTGTTTCAGTTAATAGAAGCTTATA 126 TTATCAAATTATTATAACCTTTTGTTATATCATAAAACAA-TATTTCAGTTCACAAAAGCTTATT ** * ** * 21799576 CGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTCTAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAA 190 CGAAATAAAATAATACAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAA * * * * ** * * * 21799637 ATTTATTTACTAAATCAGTTAAAATAATTTTAA--TCTTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT 255 ATCTGTTTACTAAATCAGTTCAAATAA--TTAAGGCCAGTTAAACAATTATCTATTTAAAATCAT * * * * * * * * 21799700 TATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAGTTGTTTTAGTTCATATA- 318 TATGACCTTTTGTTTGGCCATAGAACA-AT-TTTCAATTC-T-TAG * * * * * 21799745 AGCTTATTTGAAATAAAATAACAATAATAATAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGT---- 1 AGCTTATTCG-----AAATAA-AATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAA * * * * * * 21799806 GATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAATCT-GTTCAAATAATTCT-AGCCATTTCAACAATTAT 60 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAA-CTAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTAT * * * * * * * * 21799869 CTATT-TCAAATCATTATGAA-CTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGGTTTTCA--TCATACAAA 123 ATATTATCAAATTATTAT-AACCTTTTGTTATATCATAAAACAA-T--ATTTCAGTTCACA-AAA * * * * * * ** 21799930 -CCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAGAAGATTTA 183 GCTTATTCGAAATAAAATAATACAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAACCAAG-AGATTTA * * * * * * 21799993 AAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC--CT-A-T--------TTGAATAATTA-CTTATTTC 247 AAAAATAAATCTGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTAAGGCCAGTTAAACAATTATC-TATTTA ** * * * * * ** * 21800045 AAATCATCGTAACCTTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTCAATTCACAC 311 AAATCATTATGACCTTTTGTT-TGGCCATAGAACAA-T-TTTCAATTCTTAG * * 21800096 ATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACT-TAGAA-AT 1 A-GCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-TGTAAAAGAT ** * * * ** * * 21800159 TTAAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGTAGTTCAAACATTTTAAAACTATATGAACAATTATCTA 63 TT-AAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATATA * * * * * * * 21800224 TTATCAAATTATTTTGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTT 126 TTATCAAATTATTATAACCTTTTGTTATATCATAAAACAATATTTCAGTTCACAAAAGCTTATTC * * * ** * * 21800289 GAAATAAAATAATACAAATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAA 191 GAAATAAAATAATACAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAA * * ** * * 21800354 TCTGTTTACTAAATCATTTCAAATAATTAGGGCCAGTTCTACAATTATCTATTTCAAATGATTAT 256 TCTGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTAAGGCCAGTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT * * * * 21800419 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTCTGA-TCATTCA- 321 GACCTTTTGTTTGGCCATAGAAC-AAT-TTTC-AATTC-TT-AG * * * 21800461 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTGATATGTAAAAGATTTA 1 AGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTA * * * * * * 21800526 AAAAATAAATATGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATT-TG 66 AAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTATC * * * 21800590 AAATTATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCACAAAAGTTTATTCGGA 131 AAATTATTATAACCTTTTGTTATATCATAAAACAA-TATTTC-AGTTCACAAAAGCTTATTCGAA * * * 21800654 ATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTGAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATT 194 ATAAAATAATACAAATGTAATAATATTTC-AAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATC * * * * * 21800718 TGTTTGCTAAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGGCTA-TATAAACAATTCTTTATTTAAAATCATTAT 258 TGTTTACTAAATC-AGTTCAAATAATTAAGGCCAGT-TAAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT * 21800781 GACCTTTTGTTTTGCCATAGAACAATTTTCAATTCTTAG 321 GACCTTTTGTTTGGCCATAGAACAATTTTCAATTCTTAG * * * * * 21800820 TAACTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT 1 -AGCTTATTCGAAATAAAATAATAAT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATT * * * 21800884 TAAAAAGTAATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT 64 TAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT 21800943 TTGTTTCAAA Statistics Matches: 945, Mismatches: 183, Indels: 139 0.75 0.14 0.11 Matches are distributed among these distances: 346 31 0.03 347 8 0.01 350 11 0.01 351 30 0.03 352 162 0.17 353 32 0.03 354 1 0.00 355 1 0.00 356 1 0.00 358 2 0.00 359 15 0.02 360 230 0.24 361 48 0.05 362 168 0.18 363 36 0.04 364 132 0.14 365 34 0.04 366 3 0.00 ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (359 bp): AGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTA AAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTATC AAATTATTATAACCTTTTGTTATATCATAAAACAATATTTCAGTTCACAAAAGCTTATTCGAAAT AAAATAATACAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT TTACTAAATCAGTTCAAATAATTAAGGCCAGTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT TTTGTTTGGCCATAGAACAATTTTCAATTCTTAG Found at i:21801234 original size:347 final size:346 Alignment explanation

Indices: 21800632--21801306 Score: 772 Period size: 347 Copynumber: 1.9 Consensus size: 346 21800622 CAATTATTTC * * * 21800632 TATTCACAAAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTGAAAATTAATAACC 1 TATTCACAAAAGTTTATTCGAAATAAAATAAGACTAATGTAATAATATTCTGAAAATTAAGAACC * * * * * 21800697 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATAAACAATT 66 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGATTACTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAACAATT * * * * * 21800762 CTTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAGAACAATTTTCAATTCTTAGTAACTTA 131 ATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTCTTTTGCCATAAAACAATTTTCAATGCTTAGT-ACTTA * * 21800827 TTCAAAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA- 195 TTCAAAATAAAATAAAATAAATTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAAC * * * * * 21800890 GTAATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTGTTTCAAATC 260 G-AA-TCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * 21800955 GTTATAACATAAAGCAAATGTTTT 323 ATTATAACATAAAGCAAATGTTTT * * * * * * * ** 21800979 TATTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAAGATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGT 1 TATTCACAAAAGTTTATTCGAAATAAAATAAGACTAATGTAATAATATTCTGAAAATTAAGAACC * * * * 21801044 AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATA-ACTATTTGAATAAT 66 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGATTACTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATATAAACAAT * * * * 21801107 TATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTATGCATATAGT- 130 TATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTCTTTTGCCATAAAACAATT--TTCAATGC-T-TAGTA * * * * 21801171 CTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATGAATA-TTCTGAAAGTTAATAAGTAACA-ATTTA 191 CTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATGAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAACAGATTTA ** * * * * 21801233 AAAAACGAATCTATTGGCCTGACCAGTGCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCA 254 AAAAACGAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA 21801298 AATCATTAT 319 AATCATTAT 21801307 GACCTTTTGT Statistics Matches: 271, Mismatches: 48, Indels: 18 0.80 0.14 0.05 Matches are distributed among these distances: 346 71 0.26 347 135 0.50 348 57 0.21 349 4 0.01 350 4 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39 Consensus pattern (346 bp): TATTCACAAAAGTTTATTCGAAATAAAATAAGACTAATGTAATAATATTCTGAAAATTAAGAACC AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGATTACTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAACAATT ATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTCTTTTGCCATAAAACAATTTTCAATGCTTAGTACTTAT TCAAAATAAAATAAAATAAATTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAACG AATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT ATAACATAAAGCAAATGTTTT Found at i:21801475 original size:182 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21800995--21801482 Score: 475 Period size: 180 Copynumber: 2.7 Consensus size: 181 21800985 TATAAGTTTG * * ** * 21800995 TTCGAAATAAAATAAGATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAAT 1 TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT * * * * * * 21801060 AAATCTA-TTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAT 66 AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT * * * * * * * * 21801124 TATGACCATTTCTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTATGCATA-TAGTCTTA 131 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CATA * * * * 21801175 TTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATGAATA-TTCTGAAAGTTAATAAGTAACA-ATTTAAAAA 1 TTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA ** ** * * * * * 21801237 ACGAATCTATTGGCCTG-ACCAGTGCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAT 64 ATAAATCTATT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * ** * 21801301 CATTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGTTTCTGTTTGTACAAGCACA 128 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATA * * * 21801355 GATCGAAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA 1 -TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * * * * 21801420 TTATTCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTCCAAAT 65 TAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT 21801483 TGCTGTCACT Statistics Matches: 246, Mismatches: 52, Indels: 18 0.78 0.16 0.06 Matches are distributed among these distances: 179 19 0.08 180 120 0.49 181 46 0.19 182 61 0.25 ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.10, T:0.39 Consensus pattern (181 bp): TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATA Found at i:21801951 original size:515 final size:512 Alignment explanation

Indices: 21801031--21802053 Score: 1184 Period size: 515 Copynumber: 2.0 Consensus size: 512 21801021 TAATATTTTG * * * 21801031 AAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACT 1 AAAATTAAGAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATAACT * * 21801096 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCTA 65 ATTTGAATAAATATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTATCATAAAATAATTGCTTCTA * * ** 21801161 TGCATATAGTCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTGAAAGTTAATAAGTAA 130 TGCACACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTGAAAGTTAATAAGTAA * * * * * * * 21801226 CAATTTAAAAAACGAATCTATTGGCCTGACCAGTGCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATC 195 AAATTTAAAAAAC-AATCTATTGACCTGACAAGTGCAAATAGTCATAATTGTTTAAACAATTATC * * * * ** 21801291 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGTTTCTGTTTGTACAAGCACAG 259 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAGTTCATACAAGCACAG * * * 21801356 ATCGAAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT 324 ATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAAT * * * * * * 21801421 TATTCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTCCAAATTGC 389 AAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTCCAAATCGC * * * 21801486 TGTCACTTTTTTATTTTGTCATAAAACAATAT-TTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAC 454 TATCAC-CTTTTATTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAAC * * * * 21801546 AAAATTAATAAGTAAAATAATTAAAAAATAAATCTTTTTACCTAATA-AGTTCAAATAGTTATGA 1 AAAATTAAGAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATC-TATTA-CTAA-ACAGTTCAAATAGTTATAA ** * * 21801610 CTATTTGGAA-AAATATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT 63 CTATTT-GAATAAATATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTATCATAAAATAATTGCTT * * * ** * * * ** 21801674 TTCTTCACACAAACTTATTTGGATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTTGCCA-TTAATAA 127 CTATGCACACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATGAATATTCTGAAAGTTAATAA * * * * * 21801737 GTAAAAGATTTTAAAATA-AATTTATTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTCATAACTT-TTTAAAT 191 GTAAAA-A-TTTAAAAAACAATCTATTGACCTG-ACAAGTGCAAATAGTCATAA-TTGTTTAAAC * * * * 21801799 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATCAGTTCATATA 252 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAGTTCATACA * ** * * * 21801864 GGCTTA-TTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAACGAGTAAGAGATT 317 AGCACAGATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAACAAGTAAGAGATT * * 21801927 TAAGAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAATTAGTTATGATTATTTGAACAATTATATATT 381 TAA-AAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATT * * * * 21801992 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT 445 CCAAATCGCTATCACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT 21802054 CTGAATAAAA Statistics Matches: 423, Mismatches: 73, Indels: 25 0.81 0.14 0.05 Matches are distributed among these distances: 513 4 0.01 514 93 0.22 515 194 0.46 516 116 0.27 517 15 0.04 518 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.09, T:0.40 Consensus pattern (512 bp): AAAATTAAGAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTACTAAACAGTTCAAATAGTTATAACTA TTTGAATAAATATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTATCATAAAATAATTGCTTCTAT GCACACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTGAAAGTTAATAAGTAAA AATTTAAAAAACAATCTATTGACCTGACAAGTGCAAATAGTCATAATTGTTTAAACAATTATCTA TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCACAAAACAATTGTATCAGTTCATACAAGCACAGAT CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA ATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTCCAAATCGCTA TCACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAAC Found at i:21802000 original size:182 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21801546--21804688 Score: 2268 Period size: 181 Copynumber: 17.5 Consensus size: 179 21801536 TATTTCAAAC * * * * * 21801546 AAAATTAATAAGTAAAATAATTAAAAAATAAATCTTTTTACCT-AATAAGTTCAAATAGTTATGA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * 21801610 CTATTTGGAA-AAATATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT 65 CTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT *** * * * * * 21801674 TTCTTCACACAAACTTATTTGGATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTT 129 CAGTTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTA *** * * * * * * * 21801726 GCCATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATTTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAAC 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC * * * ** * * 21801790 TTTTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATCA 66 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA * * 21801855 GTTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA 131 GTTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TA ** ** * * 21801906 AAAATTAACGAGTAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAATTAGTTATGA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA * * * * 21801971 TTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTC 65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * * * * 21802036 TA-TTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATTA-AAATTT-TCAATATTCCA 130 -AGTTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATT-TA * ** * * 21802087 AAAATTAATAAGTCAA-A-A--TAAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACCCA-TTCAAATAATTATG 1 AAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG * * * * 21802147 ACTATTTATCTATTTGAACAATTAGCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACC 64 -------A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC * * 21802212 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA 121 AATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TA * * * * * 21802273 AAAATTAATAAGTTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAGCAAGCTAAAATAGTTATGA 1 AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * 21802337 TTGTTTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT 65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT * * * * * 21802401 CTA-TTTAAACAAGTTTATTTTGAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTCTA 129 C-AGTTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TA * * * * * * * 21802454 CAATTTAAT-GGATAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAATCACA 1 AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGT--TA * * * * * * 21802517 TG-C-ACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTTT 62 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT * * ** * * * * * 21802580 TTCTGTTCGTACAAAATTATTGAAAATAAAATAAAACTGATTTGTTAATATTTTG 127 TTCAGTTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTA * * 21802635 AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA * * * * * 21802695 CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTC 65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC ** * * * * * 21802759 TTTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCA 130 AGTTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-A * * * * * 21802811 GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAC-ATTTGCTGAATCAA-TTCAAATAATTAGG 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG * * * * * * 21802874 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTCTTT 64 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT ** * 21802939 CAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACT-TTCA 129 CAGTTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTA * ** * * * * 21802991 AAAAGTTAGTAACCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAATTCAAATAGATATG 1 AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG * * * * * 21803056 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTT 64 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT * * * * * 21803121 CAGTTCATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTT 129 CAGTTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA ** * * * * * * 21803173 AAAATT--T-TTTAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TTTAACCAA-TTCAAATAGTTACGA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * * ** 21803233 CTATTTAAACAAATA-CAATCTT-GAATCATTATGA--TAATTCTTTTGTCATAAAGTAATTGTT 65 CTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT * * * * * ** * 21803294 TCTGATCATATAAACTGATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA 128 TCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-A * * * ** ** * * * 21803348 AAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATTAGTTTGAATTGTTAAGGC 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC * * * * * * * * * 21803413 TATTAGAATAATTATCTATTCCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTA 66 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA * * 21803478 GTTCAT---AG-------GAAGAAAATAATACTAATTTATTAACT-TTTGA 131 GTTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTT-A * * * * * 21803518 AAAATTAATAAGCAAGAAATTTGAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATAGGTTCAAATAGTTATG 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATG * * * * 21803582 ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAT-A-ATCTTGATTTTGTCATAAAACAATTGTT 64 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTT * * * * * * * ** 21803645 TC-TTCTCATACAAGCATGTTTGGATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCC 128 TCAGT-TCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA * * * ** * * 21803698 AAAA--AATAA-TAAGAGATTT-AGAAATAAATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGAC 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC * * * * * *** * * 21803759 TATTAGGACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGATCTTTCACTTAGTCATAAAACAATTATTTCA 66 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA * * ** * 21803824 ATTTATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAACCTATTAACT-TTCAA 131 GTTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATT-TA * * * * ** * 21803875 AAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAGTTCAAATAAATATAA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA * * ** * * * 21803940 CTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCACTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC 65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * * * * 21804005 AGAT-ATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATTA-TACTTTATTAATATTTCA 130 AGTTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTT-A * * * * * ** * 21804056 AAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAGAGCTATTTTTTGAACCAA-TTCAAATATTTATGA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * * * 21804120 CTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTC 65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * * * *** * * * * 21804184 TGATCATACAAGCTAATTCGGATAAAAATAATACTAATCTAATATTATTTTG 130 AGTTCATACAAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTA ** * 21804236 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGC-GTTTA-TCGAATTAGTTCAAATAGTTAAG 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATG * * * * * 21804299 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTT-TATTTAGTCATAAAATAATTGT 64 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTGT * * 21804363 TTCAATTCATACAAGCTTA-TTAGGAAGAAAATAATACTAATTTATTAACT-TTTGA 127 TTCAGTTCATACAAGCTTATTTA--AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTT-A * * * * 21804418 ATAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAGGTTCAAATAGTTATGAC 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC * * 21804483 TATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC 66 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * ** ** * * * * 21804547 AGTTCATAAAAAATTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTGATATTTTG 130 AGTTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTA * * * * * * * * 21804599 AAGATCAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT-AGTTTATTGAATC-ACTTCAAATAATTAAA 1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTT-AT * * 21804662 GGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAA 63 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA 21804689 TTTGTTATTA Statistics Matches: 2332, Mismatches: 498, Indels: 263 0.75 0.16 0.09 Matches are distributed among these distances: 169 5 0.00 170 70 0.03 171 62 0.03 173 7 0.00 174 59 0.03 175 81 0.03 176 145 0.06 177 131 0.06 178 45 0.02 179 191 0.08 180 309 0.13 181 546 0.23 182 511 0.22 183 15 0.01 184 3 0.00 185 92 0.04 186 25 0.01 187 2 0.00 188 2 0.00 189 31 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40 Consensus pattern (179 bp): AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA GTTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA Found at i:21803656 original size:888 final size:893 Alignment explanation

Indices: 21802607--21804694 Score: 2688 Period size: 888 Copynumber: 2.3 Consensus size: 893 21802597 TATTGAAAAT * * * * * 21802607 AAAATAAAACTGATTTGTTAATATTTTG-AAAATTAATAAG-AG-ATTT-AAAAACTAAATCTGT 1 AAAATAATACTAATTTATTAA-CTTTTGAAAAATTAATAAGAAGAATTTGAAAAAATAAATCTGT * * 21802668 TTATCTAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC 65 TTATCGAA-TAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATAATC * * ** 21802732 TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAATAATGCTAAT 129 TTGATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAATAATATTAAT * 21802797 TTAATAATATTTCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATACATTTGCTGAATCAATT 193 TTAATAATATTTCAGAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA-GTTTGCTGAATCAATT *** 21802862 CAAATAATTAGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATA 256 CAAATAATTAGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTCACTTAGTCATA * * * ** 21802927 AAACAATTCTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACTTTCAA 321 AAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAACCTATTAACTTTCAA * * * * * * 21802992 AAAGTTAGTAACCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAATTCAAATAGATATGA 386 AAAATTAATAACCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAAATATAA * *** * 21803057 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC 451 CTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTC * * * 21803122 AGTTCATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAA-TACTACTTTATTAATATTT-TAAAATT-TT-TT 516 AGAT-ATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATTA-TACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAGT 21803183 AAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTT-AACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTAAACAAAT 579 AAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTAAACAAAT ** * * * 21803247 A-CAATCTTGAATCATTATGATAATTCTTTTGTCATAAAGTAATTGTTTCTGATCATATAAACTG 644 ATCAATCTCAAATCATTATGATAATTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAACTA * * 21803311 ATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA 709 ATTCGGATAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA ** ** * * 21803376 TAAATTTGTTTA-CTGAATTAGTTTGAATTGTTAAGGCTATTAGAATAATTATCTATTCCAAATC 774 TAAATGCGTTTATC-GAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTCCAAATC * 21803440 ATTCTAACC-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG-T-TT-T-AG-TTCA-TAGGAAG 838 ATTCTAACCTTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTATTATAAGCTT-ATTAGGAAG * 21803490 AAAATAATACTAATTTATTAACTTTTGAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTGAAAAAATAAATCTA 1 AAAATAATACTAATTTATTAACTTTTGAAAAATTAATAAG-AAG-AATTTGAAAAAATAAATCTG ** 21803555 TTTATCGAATAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATAATC 64 TTTATCGAATAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATAATC * ** 21803620 TTGATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTCTCATACAAGCATGTTTGGATTAAAATAATATTAAT 129 TTGATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TCATACAAGCATATTCAGATTAAAATAATATTAAT * * ** * * 21803685 TTAATAATATTCCA-AAA-AATAA-TAAGAGATTT-AGAAATAAATATGTTTGCCAAACCAGTTC 193 TTAATAATATTTCAGAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA-GTTTGCTGAATCAATTC * * * * * 21803746 AAATAGTTAGGACTATTAGGACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGATCTTTCACTTAGTCATAA 257 AAATAATTAGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTCACTTAGTCATAA * * 21803811 AACAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAACCTATTAACTTTCAAA 322 AACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAACCTATTAACTTTCAAA * * * * 21803876 AAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAGTTCAAATAAATATAAC 387 AAATTAATAACCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAAATATAAC * * * 21803941 TATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCACTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCA 452 TATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTCA * 21804006 GATATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATTATACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAA 517 GATATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATTATACTTTATTAATATTTCAAAAATTATT-AGTAA * * * 21804071 GAGATTTAAAAACTAGAGCTATTTTTTGAACCAATTCAAATATTTATGACTATTTAAACAAATAT 581 GAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTAAACAAATAT ** * * * 21804136 CAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTAAT 646 CAATCTCAAATCATTATGATAATTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAACTAAT * ** * * 21804201 TCGGATAAAAATAATACTAATCTAATATTATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA 711 TCGGATAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATA * 21804266 AATGCGTTTATCGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATT 776 AATGCGTTTATCGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTCCAAATCATT * 21804331 CTGACCTTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTAGGAAG 841 CTAACCTTTTTATTTAGTCATAAAATAATTG-TT--ATT-AT--AAGCTTATTAGGAAG * 21804390 AAAATAATACTAATTTATTAACTTTTGAATAATTAATAAGTAAGAGATTTG-AAAAATAAATCTG 1 AAAATAATACTAATTTATTAACTTTTGAAAAATTAATAAG-AAGA-ATTTGAAAAAATAAATCTG * 21804454 TTTA-CTGAATAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAAGTTGTTATGA 64 TTTATC-GAATAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAA-TTGTTAT-A * * ** * * * 21804517 ACTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-AAAAATTATCCAAAATAAAATAATA 126 A-TCTTGATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TTTCATACAAGCA-TATTCAGATTAAAATAATA * * * * * ** 21804580 TTACTTTATTGATATTT-TGAAGATCAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATAGTTTATTGAA 188 TTAATTTAATAATATTTCAGAA-AT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATAGTTTGCTGAA * * * 21804644 TCACTTCAAATAATTAAAGG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTT 250 TCAATTCAAATAATT--AGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT 21804695 ATTACTTCAT Statistics Matches: 1035, Mismatches: 125, Indels: 67 0.84 0.10 0.05 Matches are distributed among these distances: 882 46 0.04 883 289 0.28 884 12 0.01 885 7 0.01 886 29 0.03 887 45 0.04 888 312 0.30 889 24 0.02 891 1 0.00 894 2 0.00 896 1 0.00 898 5 0.00 899 70 0.07 900 114 0.11 901 6 0.01 903 5 0.00 904 9 0.01 905 23 0.02 906 32 0.03 907 3 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39 Consensus pattern (893 bp): AAAATAATACTAATTTATTAACTTTTGAAAAATTAATAAGAAGAATTTGAAAAAATAAATCTGTT TATCGAATAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATAATCTT GATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAATAATATTAATTTA ATAATATTTCAGAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAGTTTGCTGAATCAATTCAAAT AATTAGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTCACTTAGTCATAAAACA ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAACCTATTAACTTTCAAAAAAT TAATAACCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAAATATAACTATT TAAACAATTATCTATTTAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAGATA TAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATTATACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAGTAAGAGAT TTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTAAACAAATATCAATC TCAAATCATTATGATAATTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAACTAATTCGGA TAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATGC GTTTATCGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTCCAAATCATTCTAAC CTTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTATTATAAGCTTATTAGGAAG Found at i:21804995 original size:13 final size:13 Alignment explanation

Indices: 21804979--21805003 Score: 50 Period size: 13 Copynumber: 1.9 Consensus size: 13 21804969 AGTTTATTCG 21804979 AATAAAAAATATA 1 AATAAAAAATATA 21804992 AATAAAAAATAT 1 AATAAAAAATAT 21805004 TTTAAAACAA Statistics Matches: 12, Mismatches: 0, Indels: 0 1.00 0.00 0.00 Matches are distributed among these distances: 13 12 1.00 ACGTcount: A:0.76, C:0.00, G:0.00, T:0.24 Consensus pattern (13 bp): AATAAAAAATATA Found at i:21814825 original size:45 final size:44 Alignment explanation

Indices: 21814722--21814842 Score: 111 Period size: 45 Copynumber: 2.7 Consensus size: 44 21814712 AAAAGATGGC * * * * 21814722 CCTTGGTATAGGCAGTTACATCGAACACCATTGGCATATACTAG 1 CCTTGGTGTAGGCAGTTGCCTCGAACACCATTGGCACATACTAG * * * * 21814766 CCATTAGTGTAGGCAGTTGCCTCGATCACCATTGGCACATGCTGGG 1 CC-TTGGTGTAGGCAGTTGCCTCGAACACCATTGGCACATACT-AG * 21814812 CCTTGGTGCAGGCA-TATGCCTC-AACCACCAT 1 CCTTGGTGTAGGCAGT-TGCCTCGAA-CACCAT 21814843 CAGCACTTGA Statistics Matches: 62, Mismatches: 11, Indels: 7 0.77 0.14 0.09 Matches are distributed among these distances: 44 4 0.06 45 55 0.89 46 3 0.05 ACGTcount: A:0.24, C:0.27, G:0.23, T:0.26 Consensus pattern (44 bp): CCTTGGTGTAGGCAGTTGCCTCGAACACCATTGGCACATACTAG Found at i:21820160 original size:15 final size:15 Alignment explanation

Indices: 21820140--21820169 Score: 60 Period size: 15 Copynumber: 2.0 Consensus size: 15 21820130 AATAGTCATA 21820140 ACTATTTGAACTAGT 1 ACTATTTGAACTAGT 21820155 ACTATTTGAACTAGT 1 ACTATTTGAACTAGT 21820170 TCGCTAAATA Statistics Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0 1.00 0.00 0.00 Matches are distributed among these distances: 15 15 1.00 ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.13, T:0.40 Consensus pattern (15 bp): ACTATTTGAACTAGT Found at i:21820496 original size:181 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21820155--21822362 Score: 1593 Period size: 181 Copynumber: 12.2 Consensus size: 179 21820145 TTGAACTAGT * * * * * 21820155 ACTATTTGAACTAGTTCGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTCATTAATTTTTGAAA 1 ACTATTTAAACT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-AACTTATTAATTTTTAAAA * * * 21820219 TATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAGGCTTATATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATG 64 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAAT--AAAACAATTGTTTTATG * ** * * * 21820283 ACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACA 127 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * ** * * * 21820336 ATTATTTAAATTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTCTCAATTTTTAAAAT 1 ACTATTTAAACT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAAT * * * * * * * 21820401 ATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATTAT 65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGAC * 21820466 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA 129 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * ** * 21820517 ACTATTTAAATTTGTTAGGTAAACATATTTATTTTTTTAAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTT-G 1 ACTATTTAAA-CTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTT-AAATCTTC-AACTTATTAATTTTTAA * * * * 21820580 AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCATT-TATGAACTAAAACAATT-ATTT 62 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGC-TTATATGAA-TAAAACAATTGTTTT * * * * ** 21820642 ATAACTAAAA-AAAATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATA-TTTTA 124 ATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * ** * * * * * 21820697 ACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAAT-TT-ATTGCTTATTAA-TTTTAGA 1 ACTATTTAAACT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCA--ACTTATTAATTTTTAAA * ** * * * * 21820759 ATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTAT 63 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTAT * * * * * * 21820823 TAGAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAACAGTCATA 126 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * 21820876 ACAATTTGAACTAG-TCTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAATC-T---CTTATTAATTTTTGAAA 1 ACTATTTAAACT-GTTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAA * ** * * * 21820936 TATTAATATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTTACGA 64 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGA * ** * * * * 21821001 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAACTGGACGA-G 128 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATA * * * * * * ** 21821053 ACTATTTGAACTTGTAT-GGTAAATAGATTAATATTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TTTTATTA 1 ACTATTTAAAC-TGT-TCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAA ** * * 21821116 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA 64 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGA * * * * * * 21821181 CAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATA 128 C-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA ** * ** * * 21821234 ACTATTTAAACTCACTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTTAGAAT 1 ACTATTTAAACT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAAT * * * * * * 21821299 TTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGAC 65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGAC * * 21821364 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA 129 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * **** * * 21821415 A-AATTTTGAACAAGTTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTAACTTATTAATTTTTGAAA 1 ACTA-TTTAAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAA * * * * * 21821478 TATTAATAAATTTA-TATTATTTCATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAACTAGTTGTTTTAAG 64 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATAAAAC-AATTGTTTTATG * * * * 21821542 ATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATA 127 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * * * * * 21821595 ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGA-TTCTTTTTTCAATTTTCTTACTCATTAAGTTTTGAAA 1 ACTATTTAAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-AACTTATTAATTTTTAAAA * * ** * * * 21821659 TATTAATAAATTATTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCATATGAACTGAAACAATTGTTTTATCA 64 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGA * * * 21821724 CAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG 128 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * ** * * ** * * 21821776 ACTATTTGAACTTGTTTGACAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAAT 1 ACTATTTAAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAAT ** * ** * * ** * * * 21821841 ATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCCAAAGAAGTTTGCATGAACAGAAACAATTATTTTATGAT 65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGAC * ** * * * * 21821906 AAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAACAAATAATTGCTCAAATAGTCAT- 129 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * ** * * ** 21821956 AGTGATTTGAACTTATTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-- 1 ACT-ATTTAAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATT-T-TTAA * * * * * * * 21822019 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATTAACTGAAATAAGTATTTTA 62 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTA ** ** ** * * * 21822083 AAACAAGTCAAAAGGTTTTAA-CACTTCT-AAATAGATAATTGTTCAAATTGTAATA 125 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * ** ** 21822138 ACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAATC-TCTTTCTTATTAATTTTTTGA 1 ACTATTTAAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTTC-AACTTATTAATTTTTAAA * * * * * * * 21822202 ATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAGGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAAG 63 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG * * * ** * * * 21822267 CCTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCTTA 127 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * 21822320 ACCATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT 1 ACTATTTAAACTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT 21822363 CTTATTTATT Statistics Matches: 1626, Mismatches: 333, Indels: 135 0.78 0.16 0.06 Matches are distributed among these distances: 175 10 0.01 176 65 0.04 177 69 0.04 178 93 0.06 179 69 0.04 180 229 0.14 181 781 0.48 182 289 0.18 183 21 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (179 bp): ACTATTTAAACTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAAAATA TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAA AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA Found at i:21821368 original size:362 final size:359 Alignment explanation

Indices: 21820155--21822372 Score: 1888 Period size: 362 Copynumber: 6.1 Consensus size: 359 21820145 TTGAACTAGT * * * * * 21820155 ACTATTTGAAC-TAGTTCGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAA 1 ACTATTTAAACTTA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA * * * * * ** * 21820219 TATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAGGCTTATATGATGAAAAACAATTGTTTTATGA 65 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * ** * * * * 21820284 CAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTT-AAATT 130 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--TCAACTATTTGAACTT * * * * * * * 21820348 GGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTA 193 -GTTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTA * ** * * 21820413 ATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGG 256 ATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGG * 21820477 TCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA 320 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * 21820517 ACTATTTAAATTTGTTAGGTAAACATATTTATTTTTTTAAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTG- 1 ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGA * * * * * 21820580 AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCATT-TATGAACTA-AAACAATT-ATT 63 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGC-TTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTT * * * * * * 21820641 TATAACTAAAA-AAAATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATATTTTAACTATTTG 125 TATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCAACTATTTG * * * * ** * * * 21820705 AACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAAT-TTATTGCTTATTAATTTTAGAATATTATTAG 188 AACTTGTTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TAACTTATTAATTTTAAAATATTAATAA * ** * * * * * 21820769 TTTAGCAATATTTTACTT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATTAGAAAACAA 252 ATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAA * * * * 21820833 AA-ATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAACAGTCATA 316 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * * 21820876 ACAATTTGAAC-TAGTCTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAA 1 ACTATTTAAACTTATTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA * * ** * * * * 21820936 TATTAATATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTTACGA 65 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * ** * * * 21821001 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAACTGGACGAGACTATTTGAACTT 130 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-A-ACTATTTGAACTT ** * * * ** * ** * 21821066 GTAT-GGTAAATAGATTAATATTTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTTATTATATTAATAAATTAG 193 GT-TCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAA * * * * 21821130 TATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAACAAAAGTT 257 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGT * * * * * 21821195 TATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATA 321 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * 21821234 ACTATTTAAACTCACTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTT-AGAA 1 ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AA * * * 21821298 TTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA 65 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * ** ** 21821363 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAAATTTTGAACAA 130 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-ACTA-TTTGAACTT ** * * * 21821428 GTTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA 193 GTTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAA * * * * 21821492 TATTATTTCATTCTAAATAAGCTTATATGAATAG-AACTAGTTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGT 257 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT * * * 21821556 CATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATA 321 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * 21821595 ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGA-TTCTTTTTTCAATTTTCTTACTCATTAAGTTTTGAAA 1 ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAA * * * ** * * 21821659 TATTAATAAATTATTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCATATGAACTGAAACAATTGTTTTATCA 65 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * 21821724 CAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTT 130 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA--ACTATTTGAACTT * * * * * 21821789 GTTTGACAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAA 193 GTTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAA * * * * * * * * * 21821854 AATTATTTTAATCCAAAGAAGTTTGCATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTC 257 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTC ** * * * * 21821919 ATAACAAGTTGAAACAAATAATTGCTCAAATAGTCAT- 322 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * ** * 21821956 AGTGATTTGAACTTATTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-- 1 ACT-ATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGA * * * * * * * * 21822019 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAATAAGTATTTTAA 63 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT * ** ** * * * 21822084 AACAAGTCAAAAGGTTTTAA-CACTTCT-AAATAGATAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGA 128 GACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT--CAACTATTTGA * * * * ** * 21822147 ACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTT-TCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATA 189 ACTTGTTCGACAAATAGATTTATTTTTT-AAATCT-TTAACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATA * * * * * * * * 21822211 AATTAGTATTAATTTATTTTGAATAGGTTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTAAGCCT-AAAC 251 AATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG-ATAAAAC * ** * * * 21822274 AAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCTTA 314 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * * * 21822320 ACCATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATT 1 ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT 21822373 TCAAATAAGC Statistics Matches: 1484, Mismatches: 314, Indels: 115 0.78 0.16 0.06 Matches are distributed among these distances: 353 17 0.01 354 49 0.03 355 44 0.03 356 95 0.06 357 15 0.01 358 70 0.05 359 60 0.04 360 80 0.05 361 275 0.19 362 525 0.35 363 222 0.15 364 32 0.02 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (359 bp): ACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAC AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAACTATTTGAACTTGTT CGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAATATT ATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA Found at i:21821560 original size:542 final size:537 Alignment explanation

Indices: 21819668--21822372 Score: 2032 Period size: 542 Copynumber: 5.0 Consensus size: 537 21819658 AATCCGTTAA * ** * ** * * 21819668 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAACATTATTTTATTCCAAATAAAATTGTATCAATAGA 1 TTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAACAGA * * ** * * * * 21819733 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTT 64 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC *** * * ** 21819798 AT-AAA-TTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATATTTTAAATC--T--CTTAATAATTTTCAAA 129 ATAAAATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTGAA * * * ** * * 21819857 ATATTAAGAAATTAATGTTATTTTATTCCGAACAAACTTATATGGACA-AAAAC-A----TTT-- 194 ATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATAT-GA-ATAAAACAATTGTTTTAA * * * * * * * 21819914 G-----A-AAAAGGTCATAACGATTTGAAAAATATAATTATTCATATAGCCTTTACTATTTAAAC 257 GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATAGTCATAACTATTTAAAC * * * * * * * * * * 21819973 TGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTT-AAA--TCTTAGTTATTAATTTTCGTAATATTATTATAT 321 TTGTTAGGTAAACAGATTAATTTTTTAAAATTTCTTACTCATTAATTTT-ATAATATTAATAAAT * * * * * * 21820035 CAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-ATAAATAATTG-TTTATGACAAAACAAAA 385 TAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTT-TATGAACTAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAA ** * 21820098 GGTT-ATAATGATTTGAAATATTTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTACTATTT 448 -GTTCATAATGATTTGAAATAGATAA---TT---AT--TCA-AA-TAGTT--A-TA--ACTATTT * * * 21820162 GAACTAGTTCG-CTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC 497 GAACTCGTTCGAC-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC * * * * * * ** * 21820203 TCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAGGCTTATATGATGAAA 1 TTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAACAGA * * * * 21820268 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCC 64 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC * * * * * * * * * * 21820333 ACAATTATTTAAATTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTCTCAATTTTTAA 129 ATAA-AATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTGA * * * ** * * 21820398 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTAT 193 AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTAA * * * 21820463 TATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT 257 GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTAAAC * * * * * 21820528 TTGTTAGGTAAACATATTTATTTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTT-TGAATGTTAATAAA 321 TTGTTAGGTAAACAGA-TTAATTTTTTAAAATTTCTTACTCATTAATTTTAT-AATATTAATAAA * * * * 21820592 ATAATATTATTTTATTTCGAATAAGCATTTATGAACTA-AAACAATT-ATTTATAACTAAAAAAA 384 TTAATATTATTTTATTCCAAATAAGC-TTTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATAAC-AAAAAAA * * * * * 21820655 A-TGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATA-TTTTAACTATTTGAACTGGTTCGACA 447 AGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGTTCGACA * * * 21820718 AACACATTTACTTTTTAAAT-TTATTGC 511 AACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTAC * ** * * * * 21820745 TTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAA 1 TTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAA * * * ** * * * 21820810 ACAATTATTTTATTAGAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAACAGTCA 65 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA ** * * 21820874 TAACAATTTGAACTAG-TCTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAATC--T--CTTATTAATTTTTGA 130 TAA-AATTTGAACTAGTTC-AATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTGA * * ** * * 21820934 AATATTAATATA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTTA 193 AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAAT-AAAACAATTGTTTTA * * * ** * * * * 21820998 CGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAACTGGACGA-GACTATTTGA 256 AGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-TAGTC-ATAACTATTTAA * * * * ** * 21821062 ACTTG-TATGGTAAATAGATTAATATTTT-AAGTCTCCAACTCATTAATTTTATTATATTAATAA 319 ACTTGTTA-GGTAAACAGATTAATTTTTTAAAATTTCTTACTCATTAATTTTATAATATTAATAA * * * 21821125 ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAACA 383 ATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTT-TATGAACTAGAAACAATTGTTTTATAAC-AAAA-A * * * * ** ** 21821189 AAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTCACTCGGT 445 AAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGTTCGAC 21821254 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC 510 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC * 21821282 TTATTAACTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATAAATAAGCTTGTATGAACAGA 1 TTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAACAGA ** * * 21821347 AACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC 64 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC * * * 21821412 ATAAAATTTTGAACAAGTTAAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTAACTTATTAATTTTTGA 129 ATAAAA-TTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTGA * * * 21821476 AATATTAATAAATTTATATTATTTCATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAACTAGTTGTTTTAA 193 AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAAAAC-AATTGTTTTAA * * 21821541 GATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAAC 257 GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATAGTCATAACTATTTAAAC * * * * * 21821606 TTATTCGGTAAACAGATT-CTTTTTTCAATTTTCTTACTCATTAAGTTTTGA-AATATTAATAAA 321 TTGTTAGGTAAACAGATTAATTTTTTAAAATTTCTTACTCATTAA-TTTT-ATAATATTAATAAA * * * * 21821669 TTATTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATCACAAAAGAAA 384 TTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCT-TTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAA * * * * * 21821733 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGACAA 447 AGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGTTCGACAA * 21821798 ACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC 512 ACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC * * ** ** * * * 21821824 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCCAAAGAAGTTTGCATGAACAGA 1 TTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAACAGA * * * * * * 21821889 AACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAACAAATAATTGCTCAAATAGTC 64 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC ** * * * * 21821954 ATAGTGATTTGAACTTA-TTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT 129 ATA-AAATTTGAAC-TAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATT-T-T * * * * * * * * 21822018 T--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAATAAGTATTT 190 TGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTT * * ** ** * * * 21822081 TAAAACAAGTCAAAAGGTTTTAA-CACTTCT-AAATAGATAATTGTTCAAATTGTAATAACTATT 254 TAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGA-TT-TGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATT * * * * * * * * * 21822144 TGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAA 316 TAAACTTGTTAGGTAAACAGATTAATTTTTTAAAATTTCTTACTCATTAATTTTAT-AATATTAA * * *** * * * 21822209 TAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAGGTTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTA-AGCCTAA 380 TAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTT-TATGAACTAGAAACAATTGTTTTATA-AC-AA * * * ** * * * * 21822272 ACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCT-TAACCATTTGAACT-GAT 442 AAAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTCG-T * ** * * * 21822335 TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAT 505 TCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC 21822368 TTATT 1 TTATT 21822373 TCAAATAAGC Statistics Matches: 1731, Mismatches: 348, Indels: 173 0.77 0.15 0.08 Matches are distributed among these distances: 533 4 0.00 534 66 0.04 535 124 0.07 536 158 0.09 537 52 0.03 538 101 0.06 539 66 0.04 540 64 0.04 541 77 0.04 542 459 0.27 543 206 0.12 544 165 0.10 545 5 0.00 547 5 0.00 548 2 0.00 549 2 0.00 550 2 0.00 552 1 0.00 554 1 0.00 555 60 0.03 556 10 0.01 557 5 0.00 558 74 0.04 559 22 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (537 bp): TTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT AAAATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTGAAAT ATTAATAAATTTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAAAACAATTGTTTTAAGATA AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTT AGGTAAACAGATTAATTTTTTAAAATTTCTTACTCATTAATTTTATAATATTAATAAATTAATAT TATTTTATTCCAAATAAGCTTTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAAGTTCATAA TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGTTCGACAAACAGATTTA TTTTTTAAATCTTTTAC Found at i:21822406 original size:363 final size:361 Alignment explanation

Indices: 21821749--21822407 Score: 745 Period size: 363 Copynumber: 1.8 Consensus size: 361 21821739 TAATGATTTG * * * 21821749 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGACAAACATATTTATTTTTTA 1 AAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTA * 21821814 AATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCCAAAGAAGTTTG 66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAATTTAATCCAAAGAAGTTTG * * 21821879 CATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAACAAATAATTGC 131 CATGAACAGAAACAATTATTTTAAGATAAAACAAAAAGTCAAAACAAGTTGAAACAAATAATTGC * *** * * * 21821944 TCAAATAGTCATAGTGATTTGAACTTATTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT 196 TCAAACAGTCATAACCATTTGAACTGATTCCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT * * * *** 21822009 TAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAATA 261 TAATAGTCTTAATATGAACAAA-TACAATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAATA 21822074 AGTATTTTAAAACAAGTCAAAAGGTTTTAACACTTCT 325 AGTATTTTAAAACAAGTCAAAAGGTTTTAACACTTCT * * * 21822111 AAATAGATAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTA 1 AAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGACAAACAGATTTATTTTTT- * *** * ** * *** * * 21822176 AAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAGGTT 65 AAATCT-TTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAATTTAATCCAAAGAAGTT * * * * * * * 21822240 TGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTAAGCCT-AAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAA 129 TGCATGAAC-AGAAACAATTATTTTAAG-ATAAAACAAAAAGTCAAAACAAGTTGAAACAAATAA * * * *** * 21822303 TTGTTCTAACAGTCTTAACCATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAT 192 TTGCTCAAACAGTCATAACCATTTGAACTGATTCCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC * 21822368 TTATTTCAAATAAG-CTT-GTATGAACAAA-ACAATTATTTTA 257 TTA-TT--AAT-AGTCTTAATATGAACAAATACAATTATTTTA 21822408 CGAGAAAACA Statistics Matches: 239, Mismatches: 50, Indels: 15 0.79 0.16 0.05 Matches are distributed among these distances: 362 58 0.24 363 159 0.67 364 7 0.03 365 8 0.03 366 6 0.03 367 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (361 bp): AAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTA AATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAATTTAATCCAAAGAAGTTTG CATGAACAGAAACAATTATTTTAAGATAAAACAAAAAGTCAAAACAAGTTGAAACAAATAATTGC TCAAACAGTCATAACCATTTGAACTGATTCCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT TAATAGTCTTAATATGAACAAATACAATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAATAA GTATTTTAAAACAAGTCAAAAGGTTTTAACACTTCT Found at i:21822417 original size:143 final size:144 Alignment explanation

Indices: 21822239--21822501 Score: 345 Period size: 143 Copynumber: 1.8 Consensus size: 144 21822229 TTGAATAGGT * * * * 21822239 TTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAAGCCTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAAT 1 TTGTATGAACTAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAAT ** 21822304 TGTTCTA-ACAGTCTTAACCATTTGAAC-TGATTTGG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT 66 CATT-TATACAGTCTTAACCATTTGAACTTG-TTTGGCT-AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT 21822366 ATTTATTTCAAATAAGC 128 ATTTATTTCAAATAAGC * * * * 21822383 TTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAAT 1 TTGTATGAACTAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAAT * * * * 21822447 CATTTATATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCTAATAGATTTATTTTTTAA 66 CATTTATACAGTCTTAACCATTTGAACTTGTTTGGCTAACAAATTTATTTTTTAA 21822502 TTTGCTTGGT Statistics Matches: 102, Mismatches: 14, Indels: 7 0.83 0.11 0.06 Matches are distributed among these distances: 142 2 0.02 143 87 0.85 144 13 0.13 ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.11, T:0.38 Consensus pattern (144 bp): TTGTATGAACTAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAAT CATTTATACAGTCTTAACCATTTGAACTTGTTTGGCTAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATT TATTTCAAATAAGC Found at i:21825423 original size:892 final size:890 Alignment explanation

Indices: 21822791--21842402 Score: 6977 Period size: 897 Copynumber: 21.8 Consensus size: 890 21822781 AAATAAAATT * * * * * * 21822791 ATTTTTTAAATCCCTTACTTATGAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TTATTCTATTCCAAA 1 ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA * * * * * * * 21822855 TAAGCATGTAT-AAGCTGAAATAATTATTTTATGATAAAATAGAAGGTCATAACAAATTGAAATA 65 TAAGCTTGTATGAA--TAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA * * * * * * * 21822919 AATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTCGACAAACATATTTACTTTTTAAAATC 128 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC * * * * * * * 21822984 TCTTAGTTATTAACTTTTAGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAAGAAGCCTGTAT 192 TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTAT * * * * * * ** * * 21823048 GAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAACATG-TTATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTC 256 GAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-A-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC ** * * 21823112 AAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTTGATAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTGTTAATT 319 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTTTTAATT * * * * * 21823176 CTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAATAATT 383 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATT * * * * ** * * * * 21823239 GTTTTAAGAAAAAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATAGCCAT-ACT 446 GTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC- * ** * * * * * * 21823303 TATTTAAACTAT-TTTGGTAAACTAATGTATTTTTTAAATC-C---CATTTTAACTTTT-GAAAC 509 TA-TTGAACT-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAG-AAT * **** * * * * * 21823362 ATT-ATAAAATAATATTATTTT-TTGGGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTATTTTATGA 571 ATTAATAAATTAATATTATTTTATT-CCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTTTATGA * * * * * ** * 21823425 CAAAGCAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTTATATAGTTGTAACTATTT-AAACT 634 CAAAACAAAAGGTCAT-AATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATT * * * * 21823489 GATT-TGAAAAATAAATTTATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTTG-AATATTACTAAATT 698 G-TTCTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATT * * * ** * * * 21823552 AGTATTATTTTA-TTCTGAATTAGCATGTATAAAT-GAAATAATTATTTTATGATAGAATAAAAG 761 AGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * * 21823615 GTTAT-AATAATTTGAAATAGATAATAGTTTAAATAATCATAA-C-ATTTGAAGTGGTTCGGTAA 825 GTCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCTATTTGAACTTGTTCAGTAA * 21823677 ATA 888 ACA * * 21823680 GATTTATTTTTCAA-ATC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT 1 -A-TT-TTTTT-AATCTCTTACTTATTAATT-TTCAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT ** * * * * * 21823742 TTGAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTT- 60 TCAAATAAGCTTGTATGAAT--AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG ** ** * * * ** 21823805 AAGATAGGTAGCTGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAACT-GTTTTGATAAATTGATTTATTTT 123 AA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTATTTT * * * * * * * 21823868 TTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAAGATTAACAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGC 185 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC * ** ** * * * 21823933 TTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAACAGTCATAATAATTTTAAATAGATAAT 250 TTGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAAT * * * * 21823998 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAATAAATAGATTTAATTTTTCAAATCTCTTG 314 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTT-ATTTTT-AAATCT-TT- ** * * * * * * * 21824062 CTTATTAATTTTTTTTAATGTTAATAAATTAATACTATTTTATTCCAATTAAGCTTGCATAAACT 375 -TT-TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-T * * * * * * * * * 21824127 A-AAACCATTATTATATAACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAGTA 436 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA * * * * * * 21824191 GTCTTAACTATTTAAATTGGTT---T-GACAAACATT-TTTTTAAAATCTC-T---TATTAATTT 501 GTCATAACTATTGAACTT-GTTCAGTAAACAAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTT * * * * * 21824247 TT-GAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCTAAA-AAAGTTTGTATGATTAGAAACAATT 564 TTAG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TCCAAATAAA-CTTGTATAACTA-AAACAATT * * * * * * 21824309 GTTTTATGA-GAAA-ATAAGGAACATAACTATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATTACT 625 GTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT * * * * * * * 21824372 ATGTGAACTAGTTC-GAAAAATAGCTTTAGATTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATAT 688 ATTTGAAATTGTTCTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT * * *** * * * * * * * 21824436 TAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAACCTTTTATGAATTGAAACAAATGTTTTATGACAA 752 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAA ** ** * * * 21824501 AGTAAAAGGTCATAACGACTTT-ACATAGATAATTGTTTAAATAATCAAATCTATTTAAACTTGT 817 AACAAAAGGTCATAAATA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAAATCTATTTGAACTTGT * 21824565 TCAGTAAGCA 881 TCAGTAAACA * * * * ** 21824575 ATTTTTTTAATCTCTTGCTCATTATATTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAA 1 ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTA-ATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA * * * ** * * 21824640 TAAGCTTGTATTAACTAAAATAATTATTTTGTGACTTAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAA 65 TAAGCTTGTATGAA-TAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA * * * * * * * 21824705 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC 129 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC * * * * 21824770 TTACTTATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGA 194 TTACTTATTAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA * * * * * * 21824835 AAAAAAACAATTCTTTTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAGACAATTGTTTAAAT 258 AAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT * * * * 21824900 AGTCATAATTGTTTGAAATGT-TTCCATAAACAAATTTAGTTTTTAAA-CTTTTTTTAATTTTTA 323 AGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTTTTAATTTTTG * * ** ** 21824963 AAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTA 387 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA * * 21825028 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGAT-ATAACTATTGAA 452 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTGAA 21825092 CTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT 516 CTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT * * * * * 21825157 TAGTATT-TTTCATTCCCAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAA 581 TAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * 21825220 GTCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAAATTGCTCTG-TAAA 645 GTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCTGATAAA * * * * 21825284 TAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTA 709 TAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA * * * * * 21825349 TTTCAAATATGCTTGTATAAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATATTT 773 TTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATATTT * * * * 21825414 GAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACTT 838 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCTATTTGAACT-TGTTCAGTAAAC-A * * ** * * 21825468 ATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTAAAA 1 ATTTTTT-TAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA * * * * 21825532 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAGCAATTTGATATA 65 TAAGCTTGTATGAAT--AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA * * * * * * * 21825596 GATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTCATTTTCTT-AATC 128 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTT-TTAAATC * * 21825660 TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATT-TTCTTATTT-TAGATAAGCTTGTA 192 TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTCGA-ATAAGCTTGTA * ** *** * * * * * 21825723 -CAAATAAAAACAATTGCTTTGCAATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAACAGATAATTATT 255 TGAAA-AAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT * **** * 21825787 CAAACAGTCATAACTATTT-ACACTAGTCAGGC-T-AACAAATTCATTTTTTAAATCCATTACTT 318 CAAATAGTCATAACTATTTGA-ACT-GTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAAT-C-TT--TT * * * * * * * 21825849 ATTAATTTTT-AGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGGTTGTATGAATAGAA 376 TTTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAA * ** * * * ** * * * 21825913 ACAATTTTTTTATGACAAAACAAATTGTCATCATGATTTGAATTAAATAATGGTTCTAATAATTA 440 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA * * * * * * 21825978 TAACTAATTGAACTAGCTT-AGT--ACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTCTTAATTTTAAA 505 TAACT-ATTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAG * * 21826040 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAAACTTATATGAAC-AAAAGCATTTGTTTT 568 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAAT-AAACTTGTAT-AACTAAAA-CAATTGTTTT * * 21826104 ATGACAAAACAAAAGGTAATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA 630 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * 21826169 CTGGTTC-GACAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAT 695 ATTGTTCTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA- * * * * 21826233 TTA-TTTTATTTTA-TTCTAAATAAG-TTACTA-AGAAGT-GATAA-AATTACTTTACGACAAAA 759 TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-GTATA-AA-TAGA-AATAATTGCTTTATGACAAAA * * * * * * * * * * 21826292 CAAAAGGTCCT-AATGATTTAAAAAAAAAGAATTATCCATATAATCTTAAT-TATTTGAACTGGT 819 CAAAAGGTCATAAAT-ATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAATC-AAATCTATTTGAACTTGT * 21826355 TCGGTAAATACA 881 TCAGT-AA-ACA * * * * 21826367 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTCAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTT 1 ---ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT ** * * * ** * 21826432 CAAATAAATTTTTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAAATTATAACAATTTGAA 61 CAAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA * * * * * 21826497 ATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATATATTTATTTTTTACA 125 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA * ** * * ** * 21826562 TCTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTGTACCGAATAGGCTTGTA 190 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA ** * * * 21826627 TGATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTC 255 TGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC * * * * * * * * 21826692 AAATGGTCATAATTATTTGAACTG-ATTCAATACACTAATTTATTTTTAAATCTCTAACTTATCA 319 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTATTTTTAAATCT-T---TTTTTA * * * * ** * * * 21826756 AATTTTGAAATATTAAT-AAGTAATATTATTTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGTATTGAAACAA 380 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA ** * * ** * * * 21826820 TTGTTTTACAATAAAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATA 444 TTGTTTTATGA-CAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA * * * * * * * * 21826885 ACAATTTTAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTCTA-AA 507 ACTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTT-TAGAA * * * *** * * * * 21826949 TGTTAATAATTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAGCTAAAACAATTATTTTATGA 570 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTTTATGA ** * * ** * * * * 21827014 TTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTCATAGGCTTAACTATTTGAACTG 634 CAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATT * * ** * * * * 21827079 GTT-TAACAACCACATTTATTTTTAAA--TC---CTTATTAATTTTTTAAATAGTAATAAATTGG 698 GTTCTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG * * * * * * 21827138 TATTATTTTATTTTGAATAATTAGTTATGAATACCAATTATTCTAAATAATTGGTATTATTTTAT 763 TATTATTTTA-TTT-CA-AATAAGCT-TGTATA--AA-TA---GAAATAATT-G-----CTTTAT * * *** * * * * * 21827203 GACAAAACAAAATGTCATGACCGTTCGAAATAGATGATAGTTCAAAT-A-GAAATGACTCTTTGA 812 GACAAAACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAAAT--CTATTTGA * 21827266 ACTTATTC-GATAAACAA 875 ACTTGTTCAG-TAAAC-A * * * * 21827283 ATTTATTTTTTAAATAT-TAACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC 1 A--T-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * 21827347 CAAATAAACTTTTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATTACGATTTGAA 61 CAAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA * * * * * * * 21827412 ATAAATAGTTATTCAACTAGTCATAACCATTTGAACTCGCTCGATAAAAAGATTTATTTTTTAAA 125 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA * * * * * 21827477 TCTTTTACTTATGAATTTTTGGAATTTTTATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA 190 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA * * ** * * * 21827542 TGAACAGAAACAATTGGTTAATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTC 255 TGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC * 21827607 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-GTGTT-CAGTAAACAAATTTATTTTTCAAATTTTTGCTTATT 319 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCA-TAAACAAATTTATTTTT-AAATCTTT--TT-TT * * * * * * * 21827670 AACTTTTGGAATGTTAATTAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGGATGAATAGAACCA 379 AATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA * * * * ** 21827734 ATTGTTTTCTGACAAAAGAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGGTAGTCATAA 443 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA * * * ** * 21827799 CTCTTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTCTAGTTCTCTTA-CTCATTAATTTTTGGAA 508 CT-ATTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTT-TAAATCTCTTACCT-ATTAATTTTTAGAA * * * * 21827863 TATTAATAAATTAGTATTATTTTACTT-CAAATAAGCTTATGT-TAACTAAAATAGTTGTTTTAT 570 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCAAATAAAC-T-TGTATAACTAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * 21827926 TACAAAACAAAAGGGCACAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAA 632 GACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAA * * * * * ** * 21827991 TTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAACAAAT 696 TTGTTCTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT * * * * * 21828055 TAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGCTTTATAACAAAACAAAA 760 TAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAA * * * * * * * 21828119 AGTCAT-AATAATT----T-G----TTG-CCAAAATATTCATAAT-GATTTAAACTTGTGT-GGT 824 GGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAATCA-AATCTATTTGAACTTGT-TCAGT * 21828171 GAATAGA 886 -AA-ACA * * * * * * 21828178 TTTATTTTTAAAATCTTTTTA-TTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TC 1 ATT-TTTTT--AATC-TCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * 21828241 CGAAATAGGCTTGTATGAA-CAGATGAAATCTTTTATGACAAAAC-AAAGG----------TT-- 61 C-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAT-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA * * * * * * * * 21828292 -AT-AGTGA-T-TCCAAATAG--ATAATTATTTAAACTTGTTCTATAAATAG-TTTCATTTTTTA 124 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTT-ATTTTTTA * * * 21828350 AATCTCTT-CATTATTAA--TTTGGAATATTAACAACTTAGTATTATTTTATTTC-AATAATCTT 188 AATCTCTTAC-TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT * * ** * ** * 21828411 -T-TTAAAATGAAATTATT-TTTTGTGA-AAAA-AAAG-TCATAACAATTTGAAAAAGATAATTA 252 GTATGAAAA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * * 21828470 TTCAAATAGTCATGACTA-TTGATCTAGT-TT--AGTAAACATA-TTATTTTTAAAAT-TTTTAA 316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTGTTCCA-TAAACAAATTTATTTTT-AAATCTTTT-- * * * * * ** 21828529 CTTATTATTGTTGAAATAATAAT--ATTAATATTATTTTAGTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGA 376 -TT-TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGA * * * * * * ** 21828592 AACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATA-ATTAATTGCTCAAATAGT 439 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGT * * 21828656 CATAACTATTTGAACTGGTT-TGATAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTC-T---TATTAATTTTT 503 CATAACTA-TTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTT * ** *** * * * * * 21828715 -GAAATATTAATAGATTTGTATTATTTTATTATGAACAAACTTATATGAACAAAAATATTTGTTT 566 AG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTT * * * * * * 21828779 TATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTGTTAG 629 TATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * * 21828844 AACTGGTT-AGGTAAACAGAATTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTTATAA 693 AAATTGTTCTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA * * * * * * ** * 21828908 ATTCA-TTTTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTTTGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAGACAA 758 ATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAA ** * * * * * * * * * * 21828972 AAGGTTGTAACA-ATTTGAAATATATAATTGTTTATATAGTCTTAA-CAAATTAAACTAGTT-TG 822 AAGGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATC-AAATCTATTTGAACTTGTTCAG * 21829034 ACAAACAA 885 -TAAAC-A * * * * 21829042 ATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTT 1 A-TT--TTTTT-AATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * * * * * * 21829107 CTAATAACCATGTATGAACATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAATTTTTATTTTGTAAATA 61 CAAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA-----A---GGT-CATA ** * * * * * 21829172 ATTTATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTC-AGTAAACA-A- 115 A-CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAGAT * * * * * 21829234 TT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAAGATCAAGAAATTAGTATTATTTTA-TTCT 178 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC- * * ** * * * * * * * 21829297 AAATATGCTTGTATGCTATAGAACAATTGTTATATGATC-AAACAAAAGGTAACAATGATTTGAA 242 GAATAAGCTTGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGA-CAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAA * * * * ** * * * 21829361 ATAGATAATTATTGAAAT-GGCGATAATTATTTGAACTAAT-TT-GGTAAATATATTCACTTTTT 305 ATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTT ** * * * * 21829423 AAATCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTT-TGAATAAGCTTATA 367 AAATCTTTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTA * ** * * * 21829487 TGAACTA-AAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTT 431 TGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT * * * * * * 21829551 TAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTAT 495 CAAATAGTCATAACTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACCTAT * * * **** *** * * 21829615 TAATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATTTTGGATATGTTTTTATAAACTGAAACA 558 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACA * * * * * * 21829680 ATTGTTTTATGTCAAGACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTC-AATAATCATAA 622 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * * ** 21829744 CTATTTGAACTTGTTCT-CTAAATAGATTT-TTTTTCCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAA 686 CTATTTGAAATTGTTCTGATAAATAGATTTATTTTT--AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA * * * * * * * 21829807 TATTAATAAATTTGGATTATTTTATTCCAAATCAGCTTGTA-AGATATGAAATAAATT-TTTTTT 749 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATA-GAAAT-AATTGCTTTAT * * ** * * * ** ** 21829870 AACTAAACAAAATATCA-AAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAAT-TATTTGA 812 GACAAAACAAAAGGTCATAAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AATCAAATCTATTTGA ** * 21829933 ACCGGTTCCA-CAAGCACA 875 ACTTGTT-CAGTAA--ACA * * * ** * * ** 21829951 TTTTATTTTTTAAATATCCTACTTAGCAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAA 1 ----ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * * 21830015 CTAAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTTAATTACAAAA-AAAA-ATCTTAACGATTTG 61 C-AAATAAGCTTGTATGAAT--AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG * * 21830077 AGATTAAA-AATTGTTCAAATATTCAT-ACTTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTT-TTTTT 123 A-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTT ** * * 21830139 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCT 186 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT ** * * * * * 21830204 TGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAACTCATAATGATTTTAAATAGATAATC 251 TGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATT * * * * ** ** * 21830269 GTTCAAATGGCCATAATTATTTTTA-T-TGATT-CAGTAAACCGATTTATTTTTTTAAT-TTCTT 315 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTG-TTCCA-TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTT-TT * ** * *** * * 21830330 ATTAATTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTCTAAGCTTGCACT-ACCT-GA 376 TTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTA-TGA-ATAGA * * * * * * ** * ** * 21830392 AATAATTGTTGTAGGACAAATCAAATGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGCTCAAATAGTA 439 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * * *** * 21830457 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTTTTGTAACTAATTTT 504 ATAACTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACCT-ATTAATTTT * * * * *** * ** * * 21830522 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTATTT 565 TAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTT * * * * * * * * 21830587 TATAACTAAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTG 629 TATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * * * 21830652 AACTTATTC-AATAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTGA 693 AAATTGTTCTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA ** * * * * * * 21830716 ATTAGTATTATTGAAATCCAAATAAACTTGTATAAACA-AAA-AATTGTTTTACGACAAAACAAA 758 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAA * ** * * * 21830779 AGGTTAT-AATAGTTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAA-CTATTTGAA-TTGGTTCCA 823 AGGTCATAAATA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATC-AAATCTATTTGAACTT-GTT-CA * * 21830841 -CAATTAGA 884 GTAA--ACA * ** * * * * 21830849 TTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTAGTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTACTTTA-TT 1 ---ATTTTTTTAA-TCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * ** * * * * 21830913 CTTAATAA-ATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAATAAAATGTTATAACGAA-TT 61 C-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAAC-AATTT * * * * * * * * 21830976 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGATTTACTTTTT 122 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT * * * * * 21831041 AAATCTCTTACTAATTAATTTTCT--AAGTATTAATAAATTACTATTATTTTCTTTCGAACAAAC 187 AAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC * * * * * ** * 21831104 TTATATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACATAA-AGTAATAACAATTTGAAATAAATAA 250 TTGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAA * * ** * * 21831168 TTATTCAAATAGTTATAATTATTCAAACTAGT-TT-GATAAATAGAA-TTATTTTCTAAATCTCT 313 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTGTTCCATAAACA-AATTTATTTT-TAAATCT-T * * * * * 21831230 TACTAATAAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTCTATT-TCGAATAAGCTTGTAT-AA 374 T--T-TTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA * ** * * * 21831292 GCTA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAACA-GTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCA 435 --TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA * ** * * * *** ** 21831355 TATAGTTTTAATTGTTTGAA-TTGGTTC-GACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATT 497 AATAGTCATAACT-ATTGAACTT-GTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATT * * * * *** * 21831418 AATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACA 559 AATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTA-AAACA * * * ** * * * * 21831482 ATTGTTTTATGATAGAATAAAATATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAA 622 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * * 21831547 CTATTT-AAATTAGTT-TGGTAAACAGATATATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAA 686 CTATTTGAAATT-GTTCTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA ** * * ** * * * 21831606 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATAT-GTTGAAAAACAATTGTTTTATG 749 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAATAATTGCTTTATG * ** * *** 21831670 ACAAAACAAAAGGTAAT-AGGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAAT-TATTTGAAC 813 ACAAAACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCTATTTGAAC * 21831733 -TGATTCGGTAAACTA 877 TTG-TTCAGTAAAC-A * * * * 21831748 ATTTATTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAACTTTTGAAATATTAAT-AA--AGTAGTA--TTATTT 1 A--T-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * ** * 21831808 ----T-A---TG-A--ACTAAAACAACTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCA-AATGATTTTAAA 61 CAAATAAGCTTGTATGAATAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA * * * * * * * * 21831861 TAGATAATTGTTTAAATGGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAA 126 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAA * * ** * * * * 21831926 TCTCATGA-TTAGTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTAT 190 TCTC-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT ** ** * * * *** 21831990 ATGAACTAAAACAATTATTGCATGACTAAACAAAAGTTCAGAGCAATTTGAAATAGATAATTATT 254 ATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT * * * *** * * * * * 21832055 CTAATAGTCTTAACTATTTGAACTG-ATTATGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTATTAAG 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTTTTAAT * * * * * 21832119 TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATAAGCTTATATGACTAGAGACAATT 382 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT * * * * * * 21832183 GTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTA 446 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA * * * ** * * * * 21832247 TTTGAACTGGTTTC-GAAAATAGCTTTAGTTTCTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT-GAAATAT 511 -TTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAG-AATAT * * * * ** ** * 21832310 TAAAAAAATATTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAA 573 TAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTTTATGACAA * * 21832375 AACAAAAAGTCATAATAACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTT-AAACTT 637 AACAAAAGGTCATAAT-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAA-TT * * * * * * 21832437 GTT-TGATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAAT 698 GTTCTGATAAATAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT * * * * * * * 21832501 AGTGTTATTTTAATTT-GAATAAACTTGTATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGGCAAAACAAAA 761 AGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAATA-ATTGCTTTATGACAAAACAAAA * * * * * * * 21832564 GATCATAACTATTTGAAATA-AGTAATTCTTCAAATAGTCATAA-CGATATGAACTTGCTT-GGT 824 GGTCATAAATATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAATCA-AATCTATTTGAACTTG-TTCAGT * 21832626 AAATA 886 AAACA * ** * * 21832631 GATTTATTCTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATATTATTATTTTAT 1 -A-TT-TT-TTT--AATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT * * * * 21832695 TTCAAATACGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACTATTT 59 TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT * * * * * * 21832760 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATCTGAA-TGTGTTCAGA-AAATAGATTTAGTTT 122 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTC-GATAAACAGATTTATTTT * * * * 21832823 TAAAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATCAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAA 185 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAA *** * ** ** 21832885 GCTTGTATGAACCTAAACAATTATTTTATGACACAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATA 248 GCTTGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATA * * * ** * * * * 21832950 ATTGTTCAAATAGTCATAACCATTAGAACT-TG-TCTGGTTAACATATTCATACTTTAAATCTCT 312 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTC-CATAAACAAATTTAT-TTTTAAATCT-T * * ** * * * * 21833013 TACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGCATAAGCCTATAGGAAC 374 T--T-TTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT * * ** *** 21833078 A-AACACATTTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT 436 AGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT * * ** * ** * * * 21833142 AGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTGAAAATCTTTTA-CTTTTAATTG 500 AGTCATAACTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTT * * * * * * * * 21833206 TCAAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTGTGAACAAAAATAATTATT 564 TTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTT * ** * * 21833271 TTATGACAAAATAAAAAATCATAATAATTTGGAATAAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC---- 628 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT ** * 21833332 TG--A---TT-TGATAAACT-GATTTATTTTTTTAAATCTCCAACTTCTTAATTTTTGAAATATT 691 TGAAATTGTTCTGATAAA-TAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT * * *** * * * * ** * ** 21833390 AATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGAATT-TATGAATTGAAACAATTATTTTTTGTTAA 753 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAA * * * * 21833454 AACAAAAGGTCAGAACA-ATTTTAAATAGATAATTGTAT-AAATTGAAACAATTATTTTATAACT 817 AACAAAAGGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAA-T-AATCAA--A-TCTAT---T * * ** * 21833517 AAGCAAAAAGTTAGAACAATTTGAAATAGCTA 872 -TG----AACTT-GTTC-A---GTAA-A-C-A * * * * ** 21833549 ATTGTTCTAATAGTCTTAAC-TATTTGAACTGGTTCAGCAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTT 1 ATTTTTTTAAT-CTCTT-ACTTA-TT-AA-T--TT--TC--A-A-A--TAT-TAATAAA----TT * ** 21833613 ACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAACAATATTTTACTCTGAATAAACTTGTATGAATA 46 A-GTATT-A--TTT----T-------ATTT--CAA-A---TAAGCT---T------GTATGAATA * ** * * * * * 21833678 GAAACAATTACTTTATGA-GAAA-AAAAGATCATAACAATTTTAGATAGATAATTGTTCAAATAG 81 -AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG * * * * * ** * 21833741 TCATAACTATTTAAACTGGTTTGATAGATAGATTTAGCTTTTAAATCTCTTA--T-TT-ATTTGT 145 TCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT ** * ** * 21833802 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTATTTT 210 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAAAAAACAATTATTTT * * * ** * * * 21833867 ATGACAAAACAAA-ATGTTATAACGATTTGAAATAGCTAA-TAGTTTGAATAGACTTGACTATTT 275 ATGACAAAACAAAGA--TCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * 21833930 GAACT-TGTT-TAGTGAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTCT-AGAATATTA 337 GAACTGTGTTCCA-TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT-T---TTTTTAATTTTTGA-AATATTA * * * * * 21833992 ATAAATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAACTTATAT-AAGTAGAAACAATTGTTTTATGAGAA 395 ATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA * * ** * * * * * 21834055 GACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCT 458 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTGAACTTGTT * * * * * * * * * 21834120 CAATACATAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTA 522 CAGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATA * ** * * * * * * * 21834185 TTATTTTATACTGAATAAGCTTTTACGAACAAAAACAATAGGTTTATGACAAAACAAAAGATCAT 586 TTATTTTATTCCAAATAAACTTGTA-TAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * 21834250 AACAATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTGTACA-TG-TCTAGA-AAATA 650 AA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTG-AAATTGTTCT-GATAAATA * * * 21834311 GATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTTAT 711 GATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAT * * * * * * * 21834374 TTGAAATAAGCTTGCATGAATAG-AATCAA-TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-GATGTTT 774 TTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT-AATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAT-ATT * * * * * * * ** 21834436 TAAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAA-CTATTTGAGCTTATTTGGTAAACA 837 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACA * * * * 21834490 GATTTATGTTTTAAGTTTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATT 1 -A-TT-T-TTTTAA-TCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * ** * * * * ** 21834555 TCCAATAAGCTTATTTGAATTGGAACATTTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGA 60 TCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA ** * * * * * * * * 21834620 AATAGTTAATTATTCAAATAATCATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTTC 124 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTA * * *** * * * * * 21834685 AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAAT-ATTTAATATTATTTTAATCCAAAT-AGCCTT 188 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTT * * * * ** * * 21834748 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG 252 GTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * ** * * 21834813 TTCAAACAGTCATAAC-ATTTGAACT-TGTTTTACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT 316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATC-TTT--TT * * * * * * 21834876 ATTAATTGTCTT--AGTATTAATAATTTTGTATTATTTTATTCAAAAT-AG--T-T-CGAACA-A 377 -TTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGA * * * * ** * * 21834933 AA-AATTTTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAG 439 AACAA--TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG * * * * * ** 21834997 TCATAATTATTTAAACTTGTTC-GATAAATAGATTCT-TTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTT 502 TCATAACTA-TTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTT * ** *** * ** * * 21835060 TTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTT 564 TTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTT * * * * * 21835125 TTATGACAAAAGAAAGGGTCATAATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTG 628 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG ** * * * * * ** 21835190 ATCTAGTTC-GGTAAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTAACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT 693 AAATTGTTCTGATAAATAGATTTATTTTT-AAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT * * * * * * * *** 21835252 AAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCATGTATGAATAGAAACAAATGTTTTATAACCGGAC 756 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAAC * ** * * * * 21835316 AAAAAGTCA-AAACGGTTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATAA-CT-TTTTAAATTGGT 820 AAAAGGTCATAAA-TATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAATCA-AATCTATTTGAACTT-GT * * 21835377 T-TGATAAATA 881 TCAG-TAAACA * * * * * * 21835387 GATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAGT--TTTTGAAATATTAATAGATTGGTATTACTTTATTC 1 -A--T-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * * * 21835449 CGAACAAACTTATATGAACAAAA-ACATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGA 61 CAAATAAGCTTGTATGAATAAAATA-ATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA * * * * * * * * ** * 21835512 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAATTGGTTAGGTAAACAAAAATATTTTTTTG 124 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTA * * * * * 21835577 AATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT--TATTTTATTTATTTCGAATCAGCTA 188 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCGAATAAGCTT *** ** * * * 21835640 GTATGAATTGAAA-TTTTGTTTTATGACAAAGCAAA-ATGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAAT 252 GTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAATGA-TTTGAAATAGATAAT * * * * * * * * 21835702 TTTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACT-AGTT-CGTCAAACGAATTTATTTTTAATTCTCTTAG 314 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCAT-AAACAAATTTATTTTTAAATCT-TT-- * * ** * * 21835765 TTATTAATTTTT-AGAATTTTATTATGTTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAG 375 TT-TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG * * * * * ** * * * * 21835829 AAATAATTGTTTTGTGGCAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGT 438 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT * * * * * ** 21835894 CCTAATTAATTGAAC-TGATT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCACTTATTTATTAATTTT 503 CATAACT-ATTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTT * * ** * * 21835957 T-GAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTT-TTCTGAATAAGCTTGAATGATAA--AAAACATTT 565 TAG-AATATTAATAAATTAATATTATT-TTATTCCAAATAAACTTG--T-ATAACTAAAACAATT * * * * * * 21836018 GTTATATGAC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAAATGTTGAAATAGCCATAATTA 625 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * 21836082 TTTGAAA-TGATTCAG-TAAATAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATAT 689 TTTGAAATTG-TTCTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT * * * * * * * 21836141 TAACAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGAACTA-AAATGATTGTTTTATGATA 752 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAATAATTGCTTTATGACA * ** * * * * * 21836205 AAACAAAA-TTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTTTCATATAGTCTTAA-CTATTTAAAC-TG 816 AAACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATC-AAATCTATTTGAACTTG ** * 21836267 CTTCACCAGACA 880 -TTCAGTAAACA * * * 21836279 GATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT 1 -A--T-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * * * * * * * ** 21836344 TTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CATT-TAATTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTG 60 TCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAATAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG ** * * ** 21836407 AAATAGGTAATTATTCAAATAG--A-AAC----TG--C---TTCAATAAATTGATTTATTTTTTA 123 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTA * * * * 21836460 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTG 188 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG ** * * * * * * 21836525 TATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT 253 TATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT * * * * ** * * *** * 21836590 GAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTTATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATAACTTATTAAT 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTTTTAAT * * * * 21836654 TTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATT-TCGAACAAGCTT-TAATGAA-ATGAAA 382 TTTTGAAATATTAAT-AA--ATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGT-ATGAATA-GAAA * * ** ** * * * * * 21836716 CAATTGTTTTATGATAAACCAAAACATCATAACAATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTCGT 441 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT * * * ** *** * * * 21836781 AATTATTTGAATTTGTTTAAAAAATGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTGTTAATTTTTA-A 506 AACTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGA * * * **** * * * * 21836845 ACTATTAAAAAATTAGTATTATTTTTTTTTGGATAACCTTTTATGAGCTAAAGCAATTGTTTTAT 569 A-TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTTTAT * * * * * 21836910 GACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTTAAATA-ATTAATTGTTTAAATAGTCGTAACTATTT-AA 632 GACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * 21836973 GCTTATT-T-AGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA 695 -ATTGTTCTGA-TAAATAGATTTA-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA * * * * ** * ** * 21837035 TATATTAGGATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTAT-GATATGAACCAAATATTTTATGACTAA 755 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAATA-GAAATAATTGCTTTATGACAAA * * * ** * *** * ** * 21837098 A-AATAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTTTTATAGTTTTAA-CTATTTGAACTGGTT 818 ACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ATCAAATCTATTTGAACTTGTT * * 21837161 -TGACAAACA 882 CAG-TAAACA *** * ** ** **** * * * 21837170 CATTTGATAAAAAACAATTGTTTGA-TAACAAAACAAATGGTTATAGCTATTTGAAATAG-ATAA 1 -ATTT--TTTTAATCTCTTACTT-ATTAA-TTTTCAAAT-ATTA-A--TA----AATTAGTATTA * * * ** * 21837233 TTGTTCAAATTGCCATAATTA-CTT-AACTGATTTGATAAACA-AATT-TATTT-T-TTAAATCT 53 TT-TT---ATT-TCA-AATAAGCTTGTA-TGA----ATAAA-ATAATTGT-TTTATGACAAAAC- *** * * * * * * * * ** * * 21837292 CTTA-TTTATTA-ATTTTAGAAATATTAATAAAT-TT-ATATTATTTTATTTCGTA--TAAACTT 104 AAAAGGTCATAACAATTT-GAAATA--AATAATTGTTCA-AATA-GTCATAAC-TATTTGAACTA ** * * **** * * * 21837351 GTATTAACTGAAACA-A-TTATTTTATGAAAGAACAAAAAGTCA-TAGCGATTTTAAATAGACA- 163 GT-TCGA-T-AAACAGATTTATTTT-T-TAA-ATCTCTTACTTATTA---ATTTT---TGGA-AT * ** * * * 21837412 ATTATTCAAA-TAG--TTATAACTATTT-G----AGCTTGT-TCGATAAATAGAC--TTATTTTC 215 ATTAAT-AAATTAGTATTAT-TTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GA-AAAAAAACAATTATTTTA * ** ***** * ** * * * 21837466 TTA-AATCTCTTTCTTCTTAATTTTTTG-AAT-GTTAA-TA---AATTAGT-ATTAATTTATTCT 276 TGACAA-AACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAA-CTATT-T * ** ** *** *** ** 21837523 -AAATAAGCTTGTATGAACTAAA-ACAATTGCTTTATGACTAAA-CAAAAGGTCAAAACAATTTG 337 GAACT--G--TGT-TCCA-TAAACA-AATTTATTT-T---TAAATC---TTTTTTTAA-TTTTTG * * ** ** * * * * * * 21837585 AAATA--GATAATTGTTCTAACAGTATTAATC-ATATAAACTAGT-TCG-AT--AAACAATTTTT 387 AAATATTAATAAAT-TAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAACAATTGTT ** *** *** * * * * * * 21837643 TTAAAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAAT-ATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCCGAATA 449 TT-ATGA-C-AAAAC--A--AAAGGTCATAATGATT-TGAAA-TAG-A-TA-ATT-ATTCAAAT- * ** * * * * 21837707 AGCTTATACAAACTA-AAAAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCATAACGATTTGAACTAGAT 500 AG-TCAT---AACTATTGAACTT-GTTCA-G-T-AAACAAAT--T--T----ATTT----T---T * * * ** * * * * * 21837771 AATAAT-TCATATA-GTCTTAACATTT-GAACTCGTTCGGCAATTAGATTTATCTTTTAATTTTC 542 TA-AATCTC-T-TACCTATTAATTTTTAGAA-T-ATT----AA-TA-AATTA-ATATT-ATTTTA **** * * * * * *** ** * * 21837833 TTGGTTATTAAGTT-TCA-AAATATTATTA-AATTAGTATTAT-TTTATTCCAAA--T-AAAATA 594 TTCCAAATAAACTTGT-ATAACTA--A-AACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA * * ** * * * * 21837891 GTAT-AAATAGACCAATTGTT-TGAT-GACAAAACAAAAAGTT-ATAA-TGATT-TG--AAATAG 654 -TTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAC---TATTTGA-AATTG-TTCTGATAAATAG * * * ** * * * 21837948 A-TAATTGTTTATATAGTCAAAACTATATGAAATGGTTTGGTAAACCTATTTAGTTTTTTAAATC 712 ATTTATT-TTTAAAT-CTC-TTACT-TAT-TAAT--TTTTG-AAA--TA-TTA-----ATAAAT- ** * * * ** * ** * * 21838012 TCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAACAA--ACTTATA 760 TAGTATTATTTTA-TTTC--AA-A-T-A-AGCTT-GTA-TA----AATAGAAATAATTGCTT-TA ** * * *** * * 21838075 TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA-A-ACAAAAGTA-ATAA-TGATTTGAAATAAGTAATAA 811 TG-AC-AAAACAAAAG-GTCAT-A-AATATTTGAAA-TAGATAATTG--TTCAAATAA-TCA-AA ** * 21838136 T-TATTTGAAC-TGATTTGGTAAATAGA 866 TCTATTTGAACTTG-TTCAGT-AA-ACA * * * * 21838162 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTC 1 A-T-TTTTTT-AATCTCTTACTTAT-TAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC * * * * * 21838226 TGAATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAA 62 -AAATAAGCTTGTATGA-ATAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA * * * * * * * * ** 21838291 ATAGATAATTGTTTATATAGTCTTAACTGTTTGAATTGGTTCGACAAATGGATTTATTTTTTAAA 125 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA * * * * * * * 21838356 TCTCTTAGTTATGAAATTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGT 190 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGT * * * * * * * * * 21838420 ATGAACAGAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAACTGTT 254 ATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT * * * * ** * * * * ** 21838485 CAAATAGTCACAACTATTTAAATTAT-TTTGATAAATAGATTTATTTTTAGATCTCTTACTAATT 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTATTTTTAAATCTTTTTTTAATT * * * * 21838549 CTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGAATG--TTGAAAAGAATT 383 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATT * * * * * * * * 21838611 GTTTTATGA-TAAA-AAAAGGTAATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGGCCATAATTA 446 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA * ** * * 21838674 TTTGAACTAAT-TTGA-TAAACTGATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-GAAATA 511 -TTGAACT--TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAG-AATA * * **** * * * * 21838736 TTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTTGATAAGCTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAC 572 TTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAAC-TTGTAT-AACTAAAACAATTGTTTTATGAC * * ** * * ** 21838801 AAAACAAAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAGCTTG 635 AAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTG * * * * * * * * 21838866 -TCCGGTAAACATATTTTTTTTTCAAATCTCCTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTA 699 TTCTGATAAATAGATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA * * * * * ** * * 21838929 GTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGGATGAACTA-AAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAG 762 GTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * * 21838992 GT--TAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAA-CTATTTGAA-ATGATTCGGC 825 GTCATA-AAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATC-AAATCTATTTGAACTTG-TTCAGT 21839053 AAACA 886 AAACA * * 21839058 CATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT 1 -A-TT--TTTTT-AATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT * * * * * * * * 21839123 TT-GAATAAGCTTGTAT-TATAAGAAACAATTTTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTT 59 TTCAAATAAGCTTGTATGAAT-A-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT * * * * * * * * 21839185 GAGATTAATATTTGTTCAAATGGTCGTAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAACAGCTTTAGTTTTT 122 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT * * * * * * ** 21839250 AAATCTCTTTCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAATTT 187 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT * *** * * * * * * 21839315 TTATGAACTCAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTG 252 GTATGAAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * *** * * 21839380 TTCAAATAGTCATATCTATTTCAACT-TGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCT 316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATT--TATTTTTAAATCT-TT--T 21839444 TATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACT- 376 T-TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA-TA * * * * * * 21839506 GAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCCAATGG 437 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG * * * * 21839571 TCTTAACTATTTGAACTGGATT--G---GC------A------AAA-CAC--A-C--TT-A-TTT 502 TCATAACTA-TTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTT * ** * * ** * 21839611 T----TATTATTAAATTAGGATTATCTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA--AAGAAGCAATTGT 565 TAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAA-AA-CAATTGT * * * * * * * 21839670 TTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAGTTGTTCAAGTAGTCATAACTATT 627 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * ** * * * ** 21839734 TGAACTAATT-T-AGTAACA-AAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTGATTAATATTCAAAATATT 691 TGAAATTGTTCTGA-TAA-ATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT * * * ** * * * * 21839792 AGTAAATCAATATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATCGTTTTATGACAA 753 AATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAA * ** * * 21839856 AAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGA-CATGA-CTATTTGAACTTG 817 AACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ATCA-AATCTATTTGAACTTG ** * 21839919 TTTGGTAAATA 880 TTCAGTAAACA ** * 21839930 GATTTATTTTTTAAATCTCCAAC-T-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T 1 -A--T-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * 21839992 TCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTAT-----AAC---A----A-AAC------ 60 TC-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG * * * * * * 21840038 ------------G---AAATA-TCATAACTACTTGAGCTTGCTCGGTAAATAGATTTAATTTTTT 123 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTT-ATTTTTT * * * * * 21840087 AAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCGAATAAGGTT 187 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT * * * * * 21840152 GTATGAACAGAAACAATTGA-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCT-ATTTGAAATAAAT-AT 252 GTATGAAAAAAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATA-ATGATTTGAAATAGATAAT * * ** * * * 21840214 TGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATGTGTTTAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTAC 314 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTT-T-- * * 21840277 TTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAG 375 TT-TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG * * * ** 21840341 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGT 438 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT * * * * * * 21840405 AATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTA-CTCATTAA-TTTT 503 CATAACTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCT-ATTAATTTTT * * * * * 21840468 AGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTT-AATGAACTAATACAATTGTT 566 A-GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAA-ACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTT ** * * * * * * 21840532 TTAAAATC-AAACAAAATGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATT 628 TTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * ** 21840596 TGGACTT-TTTTGGTAAACATATTTATTTTTAGAATCT-TTACTTATT-ATTTGTAAAAATATTA 691 TGAAATTGTTCTGATAAATAGATTTATTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTA * * * * * * * * 21840658 ATAAATTAATATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTT-TCATGAACA-AAACAATTGTTTTAT-AAAA 754 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGT-ATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAA * * * * * * 21840719 TAATAAAAAGTCAT-AATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTT 817 -AACAAAAGGTCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCTATTTGAACTT * * * 21840782 ATT-TGATAAATA 879 GTTCAG-TAAACA * * * ** * * 21840794 GATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTTAATTGTTTGAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTAT 1 -A--T-TTTTTT-AATCTCTTA-CTTATTAATT-TTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT * * * * *** 21840859 TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAAT-ATCGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAGTGATTT 59 TTCAAATAAGCTTGTATGAATA--AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT * * * * 21840923 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTTAACTTA-TTC-AGTAAACAGATTCATTTT 122 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGA-TAAACAGATTTATTTT * ** * * * * * 21840986 TTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAGCTAGAATAATGTTATTTCAAATAAA 185 TT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG * * * * * * * 21841051 CTTGTATGAATAGAAACAATTGA-TTTGTGATAACACAAAAGGTTATAACTGATTTGAAATAGAT 249 CTTGTATGAAAAAAAACAATT-ATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGAT * * * * * ** * * 21841115 AATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCACTAG-GTAGGC-T-AACAGATTCATTTTTTAAAT-T 311 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTGT-TCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT * ** * * * * 21841176 AGTTAGTTATTAAATTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATG 373 --TT--TT-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG * * ** ** * * * 21841241 ACT-GCAAACATTTGTTTTATGACAAAACAATTGGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTGTTCA 433 AATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA * * * * * * 21841305 CATAGTTA-AACTAATTGAAC-TGATTTAGTAAACAAATTTATATTTTAACTCTCTTACTTATTA 497 AATAGTCATAACT-ATTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTA * * * ** * * * ** * 21841368 ATTTTCAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAACATT 560 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAAT * * * * 21841433 TGTTCTATGACAAAACAGAAGGTCATAACGATTTGAAA-AGGATAATTGTTCAAATAGTCATAAG 624 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * ** * * * * 21841497 TATTTGAAGTGGTTC-GGCAAATGGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTAATT--TTTTTGAAATA 687 TATTTGAAATTGTTCTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA * * * * * * * * 21841559 TTAATAGATTTGTTTTATTTTA-TTCTGAATAAG-TTACTA-AGAACTA-AAAAAATTGTTTTAC 751 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-GTATA-AA-TAGAAATAATTGCTTTAT * ** * * * ** 21841620 GATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATACCTTTAA-CTATTTGAA 812 GACAAAACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ATCAAATCTATTTGAA * * ** 21841684 CTGGTTCAAATAAATTT 876 CTTGTTC-AGTAAA-CA * * * * * * 21841701 ATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTGTTATTTTATTTCAAA 1 ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA * * * * * * * 21841766 CAAGCTTCTACT-AACATAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTATAACAATTTTAAATA 65 TAAGCTTGTA-TGAATA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA * * * * * * 21841830 TATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT 128 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT * * * * * * 21841894 C-TACTTATT-ATTTTTTGAGATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAGGATTGTATG 193 CTTACTTATTAATTTTTGGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG * * * * * * * * 21841957 ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAATTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA 257 AAAAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA * * * * *** * * * 21842022 ATGGCCATAATTATTTGAACTGAT-TT-GATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCA 321 ATAGTCATAACTATTTGAACTG-TGTTCCATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT----TTTTTTA * * * * * * * 21842085 ATTTCTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAA 380 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA * * * * * 21842149 TTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAA-CAGTTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA 444 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA ** * * * * * * * * 21842213 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATG 508 CTA-TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATA * * ** *** * * * * * ** * 21842278 TTAATAAAATAGTGCTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTGAAATAATTATTTTAACACT 572 TTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTGTTTTATGACA * * * * 21842343 AAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATACATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA 636 AAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA 21842403 CAGTTCGATA Statistics Matches: 14163, Mismatches: 3290, Indels: 2530 0.71 0.16 0.13 Matches are distributed among these distances: 832 2 0.00 833 29 0.00 834 100 0.01 835 15 0.00 836 64 0.00 837 108 0.01 838 1 0.00 840 1 0.00 843 1 0.00 849 3 0.00 850 2 0.00 852 2 0.00 854 5 0.00 855 96 0.01 856 132 0.01 857 2 0.00 858 2 0.00 859 2 0.00 860 7 0.00 861 73 0.01 862 164 0.01 863 14 0.00 864 132 0.01 865 136 0.01 866 67 0.00 867 61 0.00 868 15 0.00 869 10 0.00 870 66 0.00 871 17 0.00 872 138 0.01 873 39 0.00 874 9 0.00 875 45 0.00 876 60 0.00 877 44 0.00 878 239 0.02 879 73 0.01 880 6 0.00 881 81 0.01 882 152 0.01 883 158 0.01 884 273 0.02 885 125 0.01 886 170 0.01 887 16 0.00 888 9 0.00 889 49 0.00 890 62 0.00 891 448 0.03 892 834 0.06 893 537 0.04 894 230 0.02 895 162 0.01 896 613 0.04 897 1152 0.08 898 830 0.06 899 163 0.01 900 351 0.02 901 543 0.04 902 409 0.03 903 446 0.03 904 522 0.04 905 694 0.05 906 240 0.02 907 173 0.01 908 217 0.02 909 79 0.01 910 21 0.00 911 8 0.00 912 21 0.00 913 87 0.01 914 153 0.01 915 365 0.03 916 53 0.00 917 55 0.00 918 51 0.00 919 34 0.00 920 54 0.00 921 7 0.00 922 17 0.00 923 17 0.00 924 13 0.00 925 35 0.00 926 48 0.00 927 17 0.00 928 18 0.00 929 20 0.00 930 21 0.00 931 17 0.00 932 11 0.00 933 10 0.00 934 18 0.00 935 13 0.00 936 6 0.00 938 7 0.00 939 1 0.00 940 3 0.00 941 1 0.00 942 8 0.00 943 5 0.00 944 7 0.00 945 13 0.00 946 7 0.00 948 4 0.00 949 5 0.00 950 5 0.00 951 1 0.00 952 13 0.00 953 17 0.00 954 21 0.00 955 250 0.02 956 53 0.00 957 109 0.01 958 90 0.01 959 29 0.00 960 31 0.00 961 31 0.00 962 77 0.01 963 63 0.00 964 17 0.00 965 11 0.00 966 5 0.00 967 1 0.00 968 18 0.00 969 31 0.00 970 10 0.00 971 22 0.00 972 12 0.00 974 14 0.00 975 25 0.00 976 19 0.00 977 40 0.00 978 18 0.00 979 26 0.00 980 15 0.00 981 4 0.00 982 7 0.00 983 11 0.00 984 12 0.00 985 11 0.00 986 4 0.00 987 5 0.00 988 11 0.00 989 11 0.00 990 15 0.00 991 9 0.00 992 14 0.00 993 4 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (890 bp): ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT AAGCTTGTATGAATAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAT AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAA AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT CATAACTATTTGAACTGTGTTCCATAAACAAATTTATTTTTAAATCTTTTTTTAATTTTTGAAAT ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTGT TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATA TTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCTGATAAATAGATTT ATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT AAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATATTTGAAATAGA TAATTGTTCAAATAATCAAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACA Found at i:21826225 original size:180 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21822723--21831810 Score: 5379 Period size: 181 Copynumber: 50.7 Consensus size: 179 21822713 TAAATTAGTA * * * * * * ** * 21822723 ATAATAATTTGAAATTGATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTGTACTGATTTAATAAATAAA 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * ** 21822788 ATTATTTTTTAAATCCCTTACTTATGAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TTATTCTATTCC 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * * * * * * * * 21822852 AAATAAGCATGTAT-AAGCTGAAATAATTATTTTATGATAAAATAGAAGGTC 130 GAATAAGCTTGTATGAA-C-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * * * 21822903 ATAACAAATTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTCGACAAACATA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * * 21822968 TTTACTTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAACTTTT-AGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATT 65 ATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * * * * * * * 21823032 ATGAAGAAGCCTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAACATGTT 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * 21823085 ATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACA-A 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * 21823149 ATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTGTTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTT 65 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT ** * * * * * * 21823210 CAAATAAGCTTGTATGTTGA-AAAATAATTGTTTTAAGAAAAAAACAAAAAGTA 129 TGAATAAGCTTGTATG--AACAAAACAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTC * * * * * ** * * 21823263 ATAACAATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATAGCCAT-ACTTATTTAAACTATTTTGGTAAACT- 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTCGATAAA-TA * * * * * 21823326 -AATGTATTTTTTAAATC-C-CA-TT-TTAACTTTTGAAACATT-ATAAAATAATATTATTTT-T 63 GAAT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT ** * * * * * * 21823384 TGGGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTC 127 T-TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * ** * * * * 21823439 ATAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTTATATAGTTGTAACTATTTAAACTGATTTGAAAAATA-A 1 AT-AATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * 21823503 ATT-TATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTTG-AATATTACTAAATTAGTATTATTTTATT 65 ATTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * ** * * * * * * 21823566 CTGAATTAGCATGTATAAATGAAATAATTATTTTATGATAGAATAAAAGGTT 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * 21823618 ATAATAATTTGAAATAGATAATAGTTTAAATAATCATAAC-ATTTGAAGTGGTTCGGTAAATAGA 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * 21823682 TTTATTTTTCAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTT * * * * 21823743 TGAATAAGCTTGTATGTTGA-AAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTA 129 TGAATAAGCTTGTATG--AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * ** * * * * * 21823795 ATAACAATTT-AAGATAGGTAGCTGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTGTTTTGATAAATT 1 ATAA-TATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATA * * * * * 21823858 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAAGATTAACAAAGTAGTATTATTTTATT 63 GAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * 21823923 TTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAACA-GTC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTC * * * 21823976 ATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGA 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * ** * * * 21824041 TTTAATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTTAATGTTAATAAATTAATACTATTTTA-T 65 ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * * * * * * 21824105 TCCAATTAAGCTTGCATAAACTAAAACCATTATTATATAACTAAACAAAAGGTC 128 TTGAA-TAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * * * 21824159 AAAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAGTAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTTGA-CAA-A-C 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * 21824221 A-T-TTTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATC 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TT * * * ** * * * 21824280 TAAAAAAGTTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGA-GAAA-ATAAGGAAC 129 TGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TC * * * * * * * 21824331 ATAACTATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATTACTATGTGAACTAGTTCGAAAAATAGC 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * ** * * * 21824396 TTTAGATTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * * * ** * ** 21824461 GGATAACCTTTTATGAATTGAAACAAATGTTTTATGACAAAGTAAAAGGTC 130 GAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * 21824512 ATAACGACTTT-ACATAGATAATTGTTTAAATAATCA-AATCTATTTAAACTTGTTC-AGT--A- 1 ATAA-TA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTCGA-TAAAT * * * * * 21824571 AGCAA-T-TTTTTT-AATCTCTTGCTCATT-ATATTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTATTTT 62 AG-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT * * * * ** 21824632 ATTTTGAATAAGCTTGTATTAACTAAAATAATTATTTTGTGACTTAACAAAAGGTC 125 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * * 21824688 AAAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTCGGTAAACACA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * * 21824753 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATC 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * 21824818 CGAATAAGCTTGTATGAAAAAAAACAATTCTTTTATGACAAAA-TAAAGATC 129 TGAATAAGCTTGTATG-AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * 21824869 ATAATGATTTGAGATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAATTGTTTGAAATGTTTCCATAAACA-A 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * 21824933 ATTTAGTTTTTAAA-CT-TT--TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTC 65 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * ** ** * 21824993 TAAATAATTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC 129 TGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * 21825045 ATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGAT-ATAACTA-TTGAACTTGTTC-AGTAAACA 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATA * * 21825107 -AATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTCA 63 GAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA *** * * * * 21825169 TTCCCAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTC 126 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * 21825223 ATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAAATTGCTCTG-TAAATAG 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GATAAATAG * * * * * 21825287 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTT 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT ** * * * 21825352 CAAATATGCTTGTATAAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTC 129 TGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * 21825404 ATAAATATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTC-A-GAA-A- 1 AT-AATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGATAAATAG * * * 21825464 ACTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT 64 AATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * * 21825527 TAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTT 128 TTGAATAAGCTTGTATG-A-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * 21825580 ATAGCA-ATTTGATATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA- 1 ATA--ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAG * * 21825643 AATTCATTTTCTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATT-TTCTTA 64 AATT-ATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTA ** * * *** * * 21825706 TTTT-AGATAAGCTTGTACAAATAAAAACAATTGCTTTGCAATAAAACAAAAGGTT 126 TTTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * 21825761 ATAATGATTTAAAACAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-ACACTAG-TCAGGCT-AAC 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGGTTC--GATAAAT * * * 21825823 A-AATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTT-AGAATGTTAATAAATTAGCATTACTT 62 AGAATT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * ** 21825885 TATTTTGAATAAGGTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAATTGTC 124 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * * * 21825942 ATCATGATTTGAATTAAATAATGGTTCTAATAATTATAACTAATTGAACTAGCTTAG-TACA-A- 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCGATAAATAG * * * ** * * 21826004 ATTTATTTTTTAAATCTCATACTTCTTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT ** * * * * 21826069 CAAATAAAACTTATATGAACAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTA 129 TGAAT-AAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * 21826122 ATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCGACAAATAGAA 1 ATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAA * * * 21826187 TTA-TTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCT 66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTT * * * * * ** * 21826250 AAATAAG-TTACTAAGAAGTGATAA-AATTACTTTACGACAAAACAAAAGGTC 130 GAATAAGCTT-GTATGAA--CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * * * * * 21826301 CTAATGATTTAAAAAAAAAGAATTATCCATATAATCTTAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAC 1 ATAAT-ATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAG * * * * * 21826366 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTCAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATT 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** ** * * * ** * 21826431 TCAAATAAATTTTTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAAATT 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * 21826484 ATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATATA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * * *** 21826549 TTTATTTTTTACATCTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTGTACC 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * * * 21826614 GAATAGGCTTGTATGATGA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTC 130 GAATAAGCTTGTATGA--ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * 21826665 ATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTCAATACACTA- 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATA-AATAG * * * * * * 21826729 ATTTA-TTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAAT-AAGTAATATTATTTTTATT 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT * * *** ** * * 21826792 TTGGATAAGCTTTTATGTATTGAAACAATTGTTTTACAATAAAAATAAAAAGGTC 128 TTGAATAAGCTTGTATG-AACAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAA-CAAAAGGTC * * * * * * * ** * * 21826847 ATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAACAATTTTAACTTATTCGGTAAACAGA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * 21826912 TTTATTTTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAATTTAGTATTATTTTATTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * ** 21826976 TGAATAAGCATGTATGAGCTAAAACAATTATTTTATGATTAAACAAAAGGTC 129 TGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * ** * * ** * ** * 21827028 AGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTCATAGGCTTAACTATTTGAACTGGTTTAACAACCACA 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * 21827093 TTTA-TTTTTAAA--TC---CTTATTAATTTTTTAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTATTTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * 21827152 GAATAA--TTAGTTATGAATACCAATTATTCTAAATAATTGGTATTATTTTATGACAAAACAAAA 130 GAATAAGCTT-G-TATG-A-A-C----A----AAACAATT-G-----TTTTATGACAAAACAAAA * 21827215 TGTC 176 GGTC *** * * * ** * * ** * 21827219 ATGACCGTTCGAAATAGATGATAGTTCAAATAGAAATGACTCTTTGAACTTATTCGATAAACA-A 1 AT-AATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * 21827283 ATTTATTTTTTAAATAT-TAACTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT 65 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT *** * * * * * 21827346 CCAAATAAACTTTTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC ** * * * * * * * * 21827399 ATTACGATTTGAAATAAATAGTTATTCAACTAGTCATAACCATTTGAACTCGCTCGATAAAAAGA 1 A-TAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * * * 21827464 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATGAATTTTTGGAATTTTTATAAATTAGTATTATTTTATTTC 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * * * * 21827529 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTAATGACAAAACAAATGGTC 130 GAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * 21827580 ATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-GTGTTC-AGTAAACA 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGA-TAAATA * * * * * * * 21827643 -AATTTATTTTTCAAAT-TTTTGCTTATTAACTTTTGGAATGTTAATTAATTTA-TATTATTTTA 63 GAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTA * * * * * * 21827705 -TTCGAAATAAGCTTGGATGAATAGAACCAATTGTTTTCTGACAAAAGAAAAGGTC 126 TTTTG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * ** * * 21827760 ATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGGTAGTCATAACTCTTTGAACTTGTTC-AGTAAATAG 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAG * ** * * * 21827824 ATTTATTTTTCTAGTTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACT 64 AATTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * * * * * * 21827889 TCAAATAAGCTTATGTTAACTAAAATAGTTGTTTTATTACAAAACAAAAGGGC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * 21827942 ACAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAATTGTTC-AGTAAACAT 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAG * * * ** * * * * 21828006 ATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATA 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * 21828071 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGCTTTATAACAAAACAAAAAGTC 129 TGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * 21828123 ATAATAATT----T-G----TTG-CCAAAATATTCATAA-TGATTTAAACTTGTGT-GGTGAATA 1 ATAATATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGT-TCGATAAATA * * * * 21828176 GATTTATTTTTAAAATCTTTTTA-TTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTT 63 GAATTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT ** * * ** * * 21828238 A-TCCGAAATAGGCTTGTATGAACAGATGAAATCTTTTATGACAAAAC-AAAGGT- 125 ATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * ** 21828291 -T-ATA---G---T-G---A-T-TCCAAATAG--ATAATTATTTAAACTTGTTCTATAAATAGTT 1 ATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAA * * * * 21828340 TCATTTTTTAAATCTCTTCA-TTATTAA--TTTGGAATATTAACAACTTAGTATTATTTTA-TTT 66 TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * * * * * * ** 21828401 CAATAATCTT-T-TTAA-AATGA-AATTATTTTTTGTGAAAA-AAAA-GTC 130 GAATAAGCTTGTATGAACAA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * 21828446 ATAACAATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTA-TTGATCTAGTT-TAGTAAACA- 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAG * * * * * * * 21828508 TATTATTTTTAAAAT-TTTTAACTTATT-ATTGTTGAAATAATAAT--ATTAATATTATTTTAGT 64 AATTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * * * * * 21828569 CCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * 21828622 AAAATGATTTGAAATA-ATTAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAA-A- 1 ATAAT-ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAG * * 21828684 AATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTTGTATTATTTTATT 64 AA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * 21828745 ATGAACAAACTTATATGAACAAAA-ATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACAAAACA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * 21828798 ATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTGTTAGAACTGGTTAGGTAAACAGA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * 21828863 ATTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTTATAAATTCA-TTTTATTTTATTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT ** * * * * * * 21828926 CAAATAAGCTAGTTTGAATTGAAAA-AATTATTTTATGACAAGACAAAAGGTT 129 TGAATAAGCTTGTATGAA--CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * * * * * 21828978 GTAACAATTTGAAATATATAATTGTTTATATAGTCTTAACAAATTAAACTAGTTTGACAAACA-A 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * 21829042 ATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTT 65 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * * * * * 21829107 CT-AATAACCATGTATGAACATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAATTTTTATTTTGTAA 129 -TGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA-----A---GGT-C * * * * * * 21829169 ATAATTTATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTC-AGT-AA-A 1 ATAA--TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATA * * * * * 21829231 CAATT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAAGATCAAGAAATTAGTATTATTTTATT 63 GAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * * * * 21829295 CTAAATATGCTTGTATGCTATAGAACAATTGTTATATGATC-AAACAAAAGGTA 128 TTGAATAAGCTTGTATG-AACAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTC * * * * * ** * * 21829348 ACAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT-GGCGATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAATA- 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAG * * * * 21829411 TATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACT 64 AATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * 21829472 TTGAATAAGCTTATATGAACTAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * 21829525 ATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACA-A 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * 21829589 ATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATT 65 A-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * * * * 21829653 TTGGATATGTTTTTATAAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAGACAAAAGGTC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * ** 21829706 ATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTC-AATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCTCTAAATAG- 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * ** * * 21829769 ATT-TTTTTTCCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAATATTAATAAATTTGGATTATTTTATT 65 ATTATTTTTT--AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT *** * * * * * * ** 21829833 CCAAATCAGCTTGTAAGATATGAAATA-AATT-TTTTTTAACTAAACAAAATATC 128 TTGAATAAGCTTGTATGA-A-CAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * ** * * * * ** * 21829886 AAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTGAACCGGTTCCACAAGCACA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * ** * * 21829951 TTTTATTTTTTAAATATCCTACTTAGCAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAA 65 -ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T * * * * * * 21830015 CTAAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTAATTACAAAA-AAAA-ATC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * 21830066 TTAACGATTTGAGATTA-AAAATTGTTCAAATATTCAT-ACTTATTTGAACTAGTTCGATAAACA 1 ATAA-TATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTCGATAAATA * * * 21830129 G-ATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATT 63 GAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * ** 21830193 TTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAACTC 128 TTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * ** * * ** 21830246 ATAATGATTTTAAATAGATAATCGTTCAAATGGCCATAATTATTTTTATTGATTC-AGTAAACCG 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAG * * ** 21830310 ATTTATTTTTTTAA--T-TT-CTTATTAATTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT ** * * * * * * * * * 21830370 TGTCTAAGCTTGCACT-ACCTGAAATAATTGTTGTAGGACAAATCAAATGGTT 129 TGAATAAGCTTGTA-TGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * 21830422 ATAACAATTTTAAATAGATAATTGCTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * ** * * * 21830487 TTTATTTTTTTAAATTTCTTTTTGTAACTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA 65 ATTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-T-ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA *** * * * * 21830551 TTTTGAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTT 126 TTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * ** * * 21830606 ACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATTCAATAAACA-A 1 ATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * ** * * 21830670 ATT-TATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTGAATTAGTATTATTGAAATC 65 ATTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT ** * * * * 21830734 CAAATAAACTTGTATAAACAAAA-AATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTT 129 TGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC ** * * * * * * 21830784 ATAATAGTTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCCACAATTAGA 1 ATAATA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * ** * * ** * * 21830849 TTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTAGTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTC 65 ATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT- * * * * * * * * 21830914 TT-AATAA-ATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAATAAAATGTT 128 TTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTC * * * * * * ** 21830966 ATAACGAATTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * * 21831031 TTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-AAGTATTAATAAATTACTATTATTTTCTTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * * * * 21831095 CGAACAAACTTATATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACATAAA-GTA 129 TGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTC * * * * * ** * * 21831147 ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTCAAACTAGTTTGATAAATAGA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * * * * * 21831212 ATTATTTTCTAAATCTCTTACTAATAAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTCTATTTC 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * 21831276 GAATAAGCTTGTAT-AAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAACA-GTC 130 GAATAAGCTTGTATGAA-C-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTC * * * * ** * * * * * 21831327 ATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAATTGTTTGAATTGGTTCGACAAATGGA 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * * ** * 21831392 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * * * * ** * 21831457 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAGAATAAAATATT 130 GAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * * * 21831508 ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAATTAGTTTGGTAAACAG- 1 ATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGA * 21831572 ATATATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT 65 AT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * * * 21831633 TGAATAAACTTATATGTTGA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTA 129 TGAATAAGCTTGTATG--AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC ** * * * * * * 21831685 ATAGGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGGTAAACTA-A 1 ATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAA-TAGA * * * * * 21831749 TTTATTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAT 65 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT 21831811 GAACTAAAAC Statistics Matches: 6923, Mismatches: 1575, Indels: 820 0.74 0.17 0.09 Matches are distributed among these distances: 154 2 0.00 155 17 0.00 156 4 0.00 157 4 0.00 158 9 0.00 159 24 0.00 160 4 0.00 161 44 0.01 162 1 0.00 163 5 0.00 164 5 0.00 165 1 0.00 166 3 0.00 167 1 0.00 168 1 0.00 169 24 0.00 170 56 0.01 171 118 0.02 172 59 0.01 173 62 0.01 174 51 0.01 175 196 0.03 176 658 0.10 177 509 0.07 178 426 0.06 179 410 0.06 180 1296 0.19 181 1539 0.22 182 730 0.11 183 255 0.04 184 133 0.02 185 8 0.00 186 8 0.00 187 1 0.00 188 4 0.00 189 78 0.01 190 8 0.00 191 70 0.01 192 47 0.01 194 2 0.00 195 6 0.00 196 42 0.01 198 2 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (179 bp): ATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGAA TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG AATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC Found at i:21826867 original size:34 final size:35 Alignment explanation

Indices: 21826829--21826894 Score: 91 Period size: 35 Copynumber: 1.9 Consensus size: 35 21826819 ATTGTTTTAC 21826829 AATAA-AAAT-AAAAAGGTCATAACAATTTTAAATA 1 AATAATAAATCAAAAA-GTCATAACAATTTTAAATA * * 21826863 AATAATTATTCAAAAAGTCATAACAATTTTAA 1 AATAATAAATCAAAAAGTCATAACAATTTTAA 21826895 CTTATTCGGT Statistics Matches: 28, Mismatches: 2, Indels: 3 0.85 0.06 0.09 Matches are distributed among these distances: 34 5 0.18 35 18 0.64 36 5 0.18 ACGTcount: A:0.58, C:0.08, G:0.05, T:0.30 Consensus pattern (35 bp): AATAATAAATCAAAAAGTCATAACAATTTTAAATA Found at i:21831177 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21828342--21831810 Score: 2133 Period size: 180 Copynumber: 19.3 Consensus size: 180 21828332 AAATAGTTTC ** * * 21828342 ATTTTTTAAATCTCTT-CATTATTAA-TTTGGAATATTAACAACTTAGTATTATTTTATTTC-AA 1 ATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * ** * * ** * * 21828404 TAATCTT-T-TTAA-AATGA-AATTATTTTTTGTGAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAAAAG 65 TAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG * * * * * 21828463 ATAATTATTCAAATAGTCATGACTA-TTGATCTAGTTT-AGTAAACATA-TT 130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGA-TAAACAGATTT * * * * * * * 21828512 ATTTTTAAAAT-TTTTAACTTATT-ATTGTTGAA-A-TAATAATATTAATATTATTTTAGTCCGA 1 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGA * * * * * * * ** 21828573 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCAA-AATGATTTGAAAT 64 ATAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-AATAACAATTTGAAAT * * 21828637 A-ATTAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAA-AAATTT 128 AGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * 21828689 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTTGTATTATTTTATTAT-GA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGA * * * * * * * * * 21828749 ACAAACTTATATGAACAAAAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGATATA 64 ATAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA * * * * * * 21828814 GATAATTGTTCAAATAGTCATAATTGTTAGAACTGGTTAGGTAAACAGAATT 129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * * 21828866 A-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTTATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGA * * * * ** 21828929 ATAAGCTAGT-TTGAATTGAAAA-AATTATTTTATGACAAGACAAAAGGTTGTAACAATTTGAAA 64 ATAAGCTTGTATT-AA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAA * * * * * * * * * * 21828992 TATATAATTGTTTATATAGTCTTAACAAATTAAACTAGTTTGACAAACAAATTT 127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * * * * 21829046 AATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCTAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * * * * * * * ** 21829111 TAACCATGTATGAACATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAATTTTTATTTTGTAAATAATTT 65 TAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA-----A---GGT-AATAA-CA * * * * * * * 21829176 ATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAACA-A-TT 119 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGA-TAAACAGATTT * * * * * 21829236 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAAGATCAAGAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GA * * * * ** 21829299 ATATGCTTGTATGCT-AT-AGAACAATTGTTATATGATC-AAACAAAAGGTAACAATGATTTGAA 64 ATAAGCTTGTAT--TAATAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAA * * * * ** * * * * 21829361 ATAGATAATTATTGAAAT-GGCGATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAATATATTC 126 ATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * 21829416 ACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTT-GA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGA * * * * * 21829476 ATAAGCTTATATGAACT-AAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAAT 64 ATAAGCTTGTATTAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAAT * * * * * * * * 21829540 AAATAATTGTTTAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAATTT 128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * * * * 21829593 ATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATTTTGG 1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA * * * * * * * * * * 21829657 ATATGTTTTTATAAACT-GAAACAATTGTTTTATGTCAAGACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT 64 ATAAGCTTGTATTAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAAT * * * * * 21829721 AAATAATTGTTC-AATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCT-CTAAATAGATTT 128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TGATAAACAGATTT * * * * * * * * 21829773 -TTTTTCCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAATATTAATAAATTTGGATTATTTTATTCCAA 1 ATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA * ** * * * * ** * 21829837 ATCAGCTTGTAAGATATGAAATA-AATT-TTTTTTAACTAAACAAAATATCAA-AACGATTTGAA 64 ATAAGCTTGTATTA-AT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-AATAACAATTTGAA * * * ** * * ** * * * 21829899 ATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTGAACCGGTTCCACAAGCACATTTT 126 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGA-TTT * * ** * ** * 21829955 ATTTTTTAAATATCCTACTTAGCAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GA * * * * ** * * 21830019 ATAAGCTTGTA-TGATCAAAAACAATTGTTTAATTACAAAA-AAAA-ATCTTAACGATTTGAGAT 64 ATAAGCTTGTATTAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGA-AA * * * * 21830081 TA-AAAATTGTTCAAATATTCAT-ACTTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTT 127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * 21830134 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * ** * ** * 21830198 TAAGCTTGTA-TGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAACTCATAATGATTTTAAATA 65 TAAGCTTGTATTAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA * * * * ** * * * * 21830262 GATAATCGTTCAAATGGCCATAATTATTTTTA-TTGATTCAGTAAACCGATTT 129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGA-TAAACAGATTT * * * ** 21830314 ATTTTTTTAA--T-TT-CTTATTAA-TTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTC 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * * * * * * * 21830374 TAAGCTTGCACTACCT-GAAATAATTGTTGTAGGACAAATCAAATGGTTATAACAATTTTAAATA 65 TAAGCTTGTATTA-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA * * * * * * 21830438 GATAATTGCTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTT 129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * ** * * * * * 21830490 ATTTTTTTAAATTTCTTTTTGTAACTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTT 1 A-TTTTTTAAATCTCTTACT-T-ATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC * * ** * * * * * ** 21830555 GAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAA 62 GAATAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAA * * * * ** ** * 21830620 TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTT 127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * ** * * * 21830674 A-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTGAATTAGTATTATTGAAATCCAAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * 21830738 TAAACTTGTA-TAA-ACAAAA-AATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAATAGTTTGAAATA 65 TAAGCTTGTATTAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA ** * * * ** * ** 21830800 GATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCCACAATTAGATTT 129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * ** * ** * * * 21830852 ATTTTTTTAATTTTCTTGGTTAGTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTACTTTA-TTCTT 1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-G * * * * * * * * * 21830916 AATAA-ATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAATAAAATGTTATAACGAA-TTGAA 63 AATAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTAATAAC-AATTTGAA * * * * 21830979 ATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGATTT 126 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * * * * 21831034 ACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAGTATTAATAAATTACTATTATTTTCTTTCGAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * 21831099 CAAACTTATATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACATAAA-GTAATAACAATTTGAAATA 65 TAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTAATAACAATTTGAAATA * * * * ** * * * 21831163 AATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTCAAACTAGTTTGATAAATAGAATT 129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * * * * 21831215 ATTTTCTAAATCTCTTACTAATAAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTCTATTTCGAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * 21831279 TAAGCTTGTA-TAAGCT-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAACA-GTCATAACAATTTAAAA 65 TAAGCTTGTATTAA--TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTAATAACAATTTGAAA * * ** * * * * * ** 21831341 TAAATAATTGTTCATATAGTTTTAATTGTTTGAATTGGTTCGACAAATGGATTT 127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * * * 21831395 ATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * ** * 21831460 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAGAATAAAATATTATAACAATTTGAAATAG 65 TAAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG * * * * * * * 21831525 ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAATTAGTTTGGTAAACAGATAT 130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT * * 21831576 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * ** 21831637 TAAACTTATATGT--TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAAT-AGGATTTGAAAT 65 TAAGCTTGTAT-TAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAAT * * * * * * * 21831699 AGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGGTAAACTA-ATTT 128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAC-AGATTT * * * * 21831752 ATTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAT 1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT 21831811 GAACTAAAAC Statistics Matches: 2550, Mismatches: 604, Indels: 280 0.74 0.18 0.08 Matches are distributed among these distances: 168 5 0.00 169 20 0.01 170 28 0.01 171 2 0.00 172 3 0.00 173 8 0.00 174 16 0.01 175 13 0.01 176 320 0.13 177 260 0.10 178 225 0.09 179 65 0.03 180 619 0.24 181 519 0.20 182 182 0.07 183 12 0.00 184 117 0.05 185 3 0.00 187 1 0.00 188 6 0.00 189 71 0.03 190 7 0.00 191 7 0.00 192 41 0.02 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (180 bp): ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT AAGCTTGTATTAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGA TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAGATTT Found at i:21831187 original size:18 final size:19 Alignment explanation

Indices: 21831164--21831200 Score: 67 Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19 21831154 TTTGAAATAA 21831164 ATAATTATTCAAA-TAGTT 1 ATAATTATTCAAACTAGTT 21831182 ATAATTATTCAAACTAGTT 1 ATAATTATTCAAACTAGTT 21831201 TGATAAATAG Statistics Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 1 0.95 0.00 0.05 Matches are distributed among these distances: 18 13 0.72 19 5 0.28 ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.05, T:0.43 Consensus pattern (19 bp): ATAATTATTCAAACTAGTT Found at i:21832511 original size:182 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21831808--21837174 Score: 2801 Period size: 180 Copynumber: 29.6 Consensus size: 181 21831798 AGTATTATTT * ** * * 21831808 TATGAACTAAAACAACTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCA-AATGATTTTAAATAGATAATTGT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * 21831872 TTAAATGGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGA-TT 66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTC-TTACTT * ** * * * * 21831936 AGTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTA 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * ** * * ** * 21831989 TATGAACTAAAACAATTATTGCATGACTAAAC-AAAAGTTCAGAGCAATTTGAAATAGATAATTA 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * 21832053 TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGATTATG-TAAACAGATTAATTTTTTAAA--TC-T-CT 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT * * * * 21832112 TATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATAAGCTTA 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTG * * * * * * * 21832166 TATG-ACTAGAGACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATTGATATTTG 1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * 21832229 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTCGA-AAATAGCTTTAGTTTCTAAATCTCTTGCTT 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * * * * * * 21832293 ATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAATATTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTT 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * 21832346 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAACTTT-AAATAGATAATTA 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAA-TTTGAAATAGATAATTG * * * * 21832410 TTCAAATAGTCA-AATCTATTTAAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCCTACC 65 TTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT * * * * 21832474 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTAATTT-GAATAAACTTG 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTG * * 21832528 TATGAA-TAGAAA-ATTTTGTTTTATGGCAAAAC-AAAAGATCATAACT-ATTTGAAATA-AGTA 1 TATGAACTA-AAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAA-TAATTTGAAATAGA-TA * * * * * * * * 21832588 ATTCTTCAAATAGTCATAACGATATGAACTTGCTTGGTAAATAGATTTATTCTTTAAAAT-TTTT 61 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATT-TTTTAAATCTCTT * * * * * 21832652 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATATTATTATTTTATTTCAAATACGCTTG 125 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG 21832709 TATGAA-TAGAAACAATTGGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAAT 1 TATGAACTA-AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAAT * * * * * * * * 21832772 TGTTCAAATAATCATAACTATCTGAA-TGTGTTCAGA-AAATAGATTTAGTTTTAAAAT-TTTTG 63 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA * * 21832834 CTTATTAATTTTTGGAATATCAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTG 126 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTG * * * * * 21832890 TATGAACCT-AAACAATTATTTTATGACACAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTG 1 TATGAA-CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * ** * 21832954 TTCAAATAGTCATAACCATTAGAACTTGTCTGGTTAACATATTCATACTTTAAATCTCTTACTCA 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * 21833019 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGCATAAGCCTA 130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * ** * ** * 21833071 TAGGAAC-AAACACATTTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTA 1 TATGAACTAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * ** * 21833135 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTGAAAATCTTTTACTT- 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * ** * * * * * * 21833199 TTAATTGTCAAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTG 130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * * * * * 21833251 TGTGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAAATCATAATAATTTGGAATAAAATAATTG 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAAT-AGATAATTG * ** 21833316 TTCAAATAGTCATAAC----TG-A----TTTGATAAACTGATTTATTTTTTTAAATCTCCAACTT 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT * * * * * * 21833372 CTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGAATT- 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTG * * * * ** * * * * 21833425 TATGAATTGAAACAATTATTTTTTGTTAAAACAAAAGGTCAGAACAATTTTAAATAGATAATTGT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * ** * * * * *** * * *** * 21833490 AT-AAATTGAAACAATTATTTTATAACTAAGCAAAAAGTTAGAACA-ATTTGAAATAGCTAATTG 66 -TCAAATAGTCATAACTA-TTT-GAACT-TG---TTTGATA-AACAGATTT--ATTTTTTAAAT- * * * * * * * * * 21833553 TTCTAATA-GTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGCAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTTACTT 120 CTCT--TACTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATT-A--ATA-A-A-TTA-GTATT--AT-T-TTATTT * * * 21833617 --ATTAA-TTTT 170 CGAATAAGCTTG ** ** * **** * * 21833626 TA-GAA-T---ATTATTAATTTA--ACAATA-TTTTACTC-TGAATAAACTTGTATGAATAGAAA 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-AAT-AATTTG-A--AATAG--A * * * * * * * * * 21833682 CAATTACTTTATGAGAAAAAAAGATCATAACAATTTTAGA-TAGATAATTGTTCAAATAG-TCAT 59 TAA-T--TGT-T----CAAATAG-TCATAACTATTTGA-ACTTG-T--TTGAT-AAACAGAT--T * * * * *** * * * * ** * ** * 21833745 AACTATTTAAA-CTGGTTTGATAGATAGATTTAGCTTTTAAATCTCTTATTTATTTGTAAAATAT 108 TATTTTTTAAATCT-CTTACTTA-TTA-A-TT---TTTGAAATAT-TAATAAATTAGTATTATTT * * * * * 21833809 TA-AT-AAATTAGTATTA 165 TATTTCGAATAAG-CTTG * * ** ** * * * * * * * * 21833825 TTTTATTTTGAATAATT-TTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAA 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATG-A-CAAAACAA--A----AAGTC-ATA-ATAAT-TT-GAA * * * * * * 21833889 CGATTTGA-AATAG--CTAATAGTTTGAATAGACTTGACTATTTGAACTTGTTT-AGTGAACATA 54 --A-TAGATAATTGTTCAAATAG--T-CAT--A----ACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGA * * * 21833950 TTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTCT-AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT 106 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT * * 21834014 CGAATAAACTTA 170 CGAATAAGCTTG * * * * * * 21834026 TAT-AAGTAGAAACAATTGTTTTATGAGAAGAC-AAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATT 1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAGATAATT * * ** * * * 21834089 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCAATACATAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACT 64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACT * * * * 21834154 TATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TACTGAATAAGCTTT 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTG * * * * * * 21834208 TACGAACAAAAACAATAGGTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAATTTGAAATGGATAATTG 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * 21834272 TTCAAATAGAT-ATAACTATTTGTACATGTCTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACT 65 TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGT-TTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT * * 21834334 TATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTG 128 TATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTG * * * * * ** * * 21834388 CATGAA-TAGAATCAA-TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATGATGTTTTAAAATAGATAATTA 1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * * 21834451 TTTAGATAGTCATAACTATTTGAGCTTATTTGGTAAACAGATTTATGTTTTAAGTTTCTTACTCA 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * 21834516 TTAATTTTT-AGAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTA 130 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * ** * * * * * * 21834568 TTTGAATTGGAACATTTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTAT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * * 21834633 TCAAATAATCATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTTCAATCTTTTACTTA 66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTA * ** * * * * * 21834698 TTAATTATCAAAATATTAAT-ATTTAATATTATTTTAATCCAAAT-AGCCTTG 130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTG * * * * 21834749 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG 1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * 21834813 TTCAAACAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTTTACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * 21834877 TTAATTGTCTT--AGTATTAATAATTTTGTATTATTTTA-TTC-AA-AA--TAG 130 TTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * *** * 21834924 T-TCGAAC-AAAA-AATTTTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAGATAAT 1 TAT-GAACTAAAACAA--TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAAT * * * * * * 21834986 TGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTCT-TTTTTAAAATCTCTTAA 63 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTAC * * * * * 21835050 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTA 127 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG ** * * * ** * 21835105 TATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTAT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * * 21835169 TCAAATAATCATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTAACTTA 66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA * ** * * * 21835232 TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCATG 130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTG * * *** * *** * 21835284 TATGAA-TAGAAACAAATGTTTTATAACCGGACAAAAAGTCAAAACGGTTTGAAATAAATAATT- 1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * 21835347 TGTCAAATAGTCATAACT-TTTTAAATTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CT 65 T-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT * * * * * * * * 21835407 TATTAGTTTTTGAAATATTAATAGATTGGTATTACTTTATTCCGAACAAACTTA 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * ** 21835461 TATGAACAAAAACATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * ** * * 21835525 TCAAATAATCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAACAAAAATATTTTTTTGAATATCTTACTT 66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT * * * 21835589 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT--TATTTTATTTATTTCGAATCAGCTAG 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCGAATAAGCTTG * * ** * * * * * 21835641 TATGAATTGAAA-TTTTGTTTTATGACAAAGCAAAATGTCATAACATTTTGAAATAGATAATTTT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * 21835705 TCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTCG-TCAAAC-GAATTTA-TTTTTAATTCTCTTAGTT 66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGAT-AAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * * ** * * 21835767 ATTAATTTTT-AGAATTTTATTATGTTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG 129 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * * * * * * * 21835820 TATGAAC-AGAAATAATTGTTTTGTGGCAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTG 1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * 21835884 TTCAAATAGTCCTAATTAATTGAAC-TGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCACTTATTT 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * * 21835948 ATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGT-TTTCTGAATAAGCTTG 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTG * * * * * * * 21836001 AATGATA-AAAAACATTTGTTATATGAC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAAATG 1 TATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * * 21836064 TTGAAATAGCCATAATTATTTGAA-ATGATTCAGTAAATAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTT 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * * * * 21836124 ATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTG 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG ** * * ** * 21836177 TATGAACTAAAATGATTGTTTTATGATAAAAC-AAAATTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTT 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * * * 21836241 TCATATAGTCTTAACTATTTAAAC-TGCTTCACCAGACAGATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTA 66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * 21836305 TTAA-TTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG 130 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * * * * * * * * 21836357 TATGAACTGAAAC-ATT-TAATTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTA 1 TATGAACTAAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG ** ** 21836420 TTCAAATAG--A-AAC----TG--C---TTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * 21836473 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTG 130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG *** * * ** 21836525 TATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC--AATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * * 21836588 TTGAAATAGTCATAATTATTTGAATTTATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA----TAACTTA 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * 21836649 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTTCGAACAAGCTT- 130 TTAATTTTTGAAATATTAAT-AA--ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * * * * * 21836703 TAATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAACCAAAACA-TCATAACAATTTTAAATATACAATT 1 T-ATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAATAATTTGAAATAGATAATT * * * * * 21836767 GTTCAAATAGTCGTAATTATTTGAATTTGTTT-A-AAAAATGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTG 64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACA-G-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA * * * * * * * 21836830 CTTGTTAATTTTT-AAACTATTAAAAAATTAGTATTATTTTTTTTTGGATAACCTTT 126 CTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG * * * * 21836886 TATGAGCTAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTTAAATA-ATTAATTG 1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGA-TAATTG * * * * 21836950 TTTAAATAGTCGTAACTATTT-AAGCTTATTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGC 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC * * * 21837013 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTG 127 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTG * * * * * * * * * ** * 21837068 TATGATA-TGAACCAAATATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTA 1 TATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG *** ** * * * 21837131 TTTTTATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACACATTT 65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTT 21837175 GATAAAAAAC Statistics Matches: 3937, Mismatches: 942, Indels: 614 0.72 0.17 0.11 Matches are distributed among these distances: 167 3 0.00 168 104 0.03 169 18 0.00 170 2 0.00 171 3 0.00 172 14 0.00 173 34 0.01 174 84 0.02 175 67 0.02 176 349 0.09 177 151 0.04 178 61 0.02 179 311 0.08 180 909 0.23 181 815 0.21 182 631 0.16 183 35 0.01 184 8 0.00 185 20 0.01 187 4 0.00 188 13 0.00 189 8 0.00 190 11 0.00 191 8 0.00 192 12 0.00 193 10 0.00 194 9 0.00 195 1 0.00 196 11 0.00 197 13 0.00 198 1 0.00 199 12 0.00 200 30 0.01 201 24 0.01 202 22 0.01 203 8 0.00 204 19 0.00 205 20 0.01 206 9 0.00 207 25 0.01 208 17 0.00 209 4 0.00 211 2 0.00 212 9 0.00 213 1 0.00 214 4 0.00 215 4 0.00 216 5 0.00 217 2 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (181 bp): TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG Found at i:21833036 original size:362 final size:360 Alignment explanation

Indices: 21831808--21837174 Score: 2324 Period size: 356 Copynumber: 14.8 Consensus size: 360 21831798 AGTATTATTT * * * * * 21831808 TATGAACTAAAACAACTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCA-AATGATTTTAAATAGATAATTGT 1 TATGAACT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * ** * * ** * * 21831872 TTAAATGGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGA-TT 65 TCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTC-TTACTT * ** * * * 21831936 AGTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTAAAA 129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAA * ** * * * * * 21832001 CAATTATTGCATGACTAAAC-AAAAGTTCAGAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT 194 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA * * * * * 21832065 TAACTATTTGAAC-TGATTATGTAAACAGATTAATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAAGTTTTGA 258 TAACTATTTGAACTTG-TTA-GAAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAA * * * 21832125 AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATAAGCTTA 321 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TC-GAATAAACTTG * * * * * 21832166 TATG-ACTAGAGACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTG 1 TATGAACTA-A-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * 21832229 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTCG-AAA-ATAGCTT-TAGTTTCTAAATCTCTTGC 64 TTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACATA-TTTATACTTT-AAAATCTCTTAC * * ** * * 21832291 TTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAATATTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAACTAA 127 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAA * 21832356 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGT 192 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT * * * * * * 21832420 CA-AATCTATTTAAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTT 256 CATAA-CTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAGATTTA-TTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTTT * * * 21832484 TAAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTAATTTGAATAAACTTG 318 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAACTTG * 21832528 TATGAA-TAGAA-AATTTTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATA-AGTAA 1 TATGAACTA-AACAA--TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TAATTTGAAATAGA-TAA * * * * * * 21832589 TTCTTCAAATAGTCATAACGA-TATGAACTTG-CTTGGTAAATAGATTTATTCTTTAAAAT-TTT 61 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTA-GAACTTGTC-TGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCT * * * * 21832651 TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATATTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAA- 124 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC * * 21832715 TAGAAACAATTGGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA 189 TA-AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA * * * * * * 21832780 TAATCATAACTATCTGAA-TGTGTTCAGAAAATAGATTTAGTTTTAAAAT-TTTTGCTTATTAAT 252 TAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT-AGAAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAAT ** * * 21832843 TTTTGGAATATCAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTG 315 TTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCG-AATAAACTTG * * ** * 21832890 TATGAACCTAAACAATTATTTTATGACACAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT 1 TATGAA-CTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * 21832955 TCAAATAGTCATAACCATTAGAACTTGTCTGGTTAACATATTCATACTTT-AAATCTCTTACTCA 65 TCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTACTTA * *** * * 21833019 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGCATAAGCCTATAGGAAC-AAACA 130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAA-A * * ** * * * 21833083 CATTTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT 194 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT * * * * * * * * 21833148 GACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTGAAAATCTTTTACTT-TTAATTGTCAAAA 259 AACTATTTGAACTTG-TTAGAAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAAAA * * * * 21833212 TTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTG 323 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAACTTG * * * * * * * * 21833251 TGTGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAAATCATAATAATTTGGAATAAAATAATTG 1 TATGAAC-TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAAT-AGATAATTG * ** * ** 21833316 TTCAAATAGTCATAAC---T-G-A--T-T-TGATAAAC-TGATTTATTTTTTTAAATCTCCAACT 64 TTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACAT-ATTTATACTTTAAAATCTCTTACT * * * *** * * * 21833371 TCTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGAATT-TATGAATTGA 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTATATGAACTAA * * ** * * * * * * 21833435 AACAATTATTTTTTGTTAAAACAAAAGGTCAGAACAATTTTAAATAGATAATTGTAT-AAATTGA 192 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGT * * * * * * * *** * * * * 21833499 AACAATTATTTTATAACTAAG-CA-AAAAGTTAGAACAATTTGAAATAGCTAATTGTTCTAATAG 256 CATAACTA-TTT-GAACT-TGTTAGAAAA--CAGATTTATTT---TTA---AAATCTTCTACT-- * * * * * * * * * * ** * * * 21833562 TCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGCAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT 308 TATTAA-TTTTTAAAAT-ATT-A--ATA-A-A-TTA-GTATT-ATTTTATT-CGAATAAACTTG ** ** * **** * * * 21833626 TA-GAA-T--ATTATTAATTTA--ACAATATTTTA-CTC-TGAATAAACTTGTATGAATAGAAAC 1 TATGAACTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT-AAT-AATTTG-A--AATAG--AT * * * * * * 21833683 AATTACTTTATGAGAAAAAAAGATCATAACAATTTTAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 59 AA-T--TGT-T----CAAATAG-TCATAAC-----TA-TTAGA-ACTTG-TC---TGGT-A-AAC * * * * * 21833748 -TATTTAAACTGGTTTGATAGATAGATTTAGCTTTTAAATCTCTTATTTATTTGTAAAATATTAA 102 ATATTTATAC----TT--TA-A-A-A--T--CTCTT--A---CTTATTAATTTTTGAAATATTAA * ** ** * * 21833812 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAA 149 TAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAA * * * * ** * * * 21833876 CAAAATGTTATAACGATTTGAAATAGCTAA-TAGTTTGAATAGACTTGACTATTTGAACTTGTTT 213 CAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT ** * * * * * 21833940 AGTGAACATATTTATTTTTTAAATC-TCTAACTTATTAATTTCTAGAATATTAATAAATTAATAT 276 AGAAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT * 21834004 TATTTTATTTCGAATAAACTTA 340 TATTTTA-TTCGAATAAACTTG * * * * * * 21834026 TAT-AAGTAGAAACAATTGTTTTATGAGAAGACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTG 1 TATGAACT--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * 21834090 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG-CT--CAATACATAGATTTA-ATTTTTTAAATCTTTT 64 TTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAA-ACAT--ATTTATA-CTTTAAAATCTCTT * * * * * * * 21834151 ACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TACTGAATAAGCTTTTACGAAC 125 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAAC * * * * * 21834215 AAAAACAATAGGTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTCAAAT 189 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT * * * * * 21834279 AGAT-ATAACTATTTGTACATGTCTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT 253 AG-TCATAACTATTTGAACTTGT-TAGAAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATT ** * * * 21834342 TTTGTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTG 316 TTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCG-AATAAACTTG * * * * ** * * 21834388 CATGAA-TAGAATCAA-TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATGATGTTTTAAAATAGATAATTA 1 TATGAACTA-AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * * * * * 21834451 TTTAGATAGTCATAACTATTTGAGCTTATTTGGTAAACAGATTTAT-GTTTTAAGTTTCTTACTC 64 TTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTACTT * * * * * ** 21834515 ATTAATTTTT-AGAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTATTTGAATTGGA 129 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAA * * * ** * * 21834579 ACATTTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCA 193 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA * * * * * ** * * * 21834644 TGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTTCAATCTTTTACTTATTAATTATCAA 258 TAACTATTTGAACTTGTT-AGAAAACAGATTTA-TTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAA * * * * ** 21834709 AATATTAAT-ATTTAATATTATTTTAATCCAAATAGCCTTG 321 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAACTTG * * * 21834749 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT 1 TATGAACT--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATAATTTGAAATAGATAATT * * * *** * * * * 21834812 GTTCAAACAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTTTACAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACT 63 GTTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTACT * ** * * 21834875 TATTAATTGTCTT--AGTATTAATAATTTTGTATTATTTTA-TTCAAA-ATAG--T-T-CGAAC- 128 TATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTATATGAACT * * * * * * * * 21834931 AAAA-AATTTTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAAT 190 AAAACAA--TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT * * * * * 21834995 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTCT-TTTTTAAAATC-TCTTAATTATTAAT 253 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAGATT-TATTTTTAAAATCTTC-TACTTATTAAT ** * * * 21835058 TTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTA 315 TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAACTTG * * * * * * * 21835105 TATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTAT 1 TATGAA-CTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * 21835169 TCAAATAATCATGACTATTTGATCTAGT-TCGGTAAACATATTTAT-TTTTAAAAT-T-TTAACT 65 TCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCT-GGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTT-ACT * ** * * * * 21835230 TATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCATGTATGAA-TAG 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAACTA- * * *** * ** * 21835293 AAACAAATGTTTTATAACCGGACAAAAAGTCAAAACGGTTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAG 191 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAG * * * * * * 21835357 TCATAACT-TTTTAAATTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAGTTTT 255 TCATAACTATTTGAACTT-GTTAGA-AAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTTT * * * * * * 21835417 TGAAATATTAATAGATTGGTATTACTTTATTCCGAACAAACTTA 318 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAACTTG * * * * ** 21835461 TATGAACAAAAACATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGT 1 TATGAAC-TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * ** ** ** * 21835525 TCAAATAATCATAATTATTTGAA-TTGGT-TAGGTAAACAAAAATATTTTTTTGAATATCTTACT 65 TCAAATAGTCATAACTATTAGAACTT-GTCT-GGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTACT * * * * * * 21835588 TATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAAT-TTATTTTATTTATTTCGAATCAGC-TAGTATGAATTG 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTAT-TTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAACTA ** * * * * * 21835650 AAA-TTTTGTTTTATGACAAAGCAAAATGTCATAACATTTTGAAATAGATAATTTTTCATATAGT 191 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT * * * * * * * 21835714 CTTAAATATTTGAACTAGTTCGTCAAAC-GAATTTATTTTT-AATTC-TCTTAGTTATTAATTTT 256 CATAACTATTTGAACTTGTTAG-AAAACAG-ATTTATTTTTAAAATCTTC-TACTTATTAATTTT * * * ** * * 21835776 TAGAATTTTATTATGTTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG 318 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAACTTG * * * * * * * * * * * 21835820 TATGAACAGAAATAATTGTTTTGTGGCAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGT 1 TATGAAC-TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * * * 21835885 TCAAATAGTCCTAATTAATT-GAAC-TGATTTGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCACTTATT 65 TCAAATAGTCATAACT-ATTAGAACTTG-TCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTACT * * * * * 21835947 TATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGT-TTTCTGAATAAGCTTGA-ATGATA-A 128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-ATATGA-ACT * * * * * * * * 21836009 AAAACATTTGTTATATGAC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAAATGTTGAAATAG 190 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG * * * * * * 21836073 CCATAATTATTTGAA-ATGATTCAGTAAATAGATTCACTTTTT-AAA---TC-ACTTATTAATTT 255 TCATAACTATTTGAACTTG-TT-AGAAAACAGATTTA-TTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTT * * * * ** 21836132 TTGAAATATTAACAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTG 317 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAACTTG * * ** * 21836177 TATGAACTAAA-ATGATTGTTTTATGATAAAACAAAA-TTCATAACGATTTGAAATAGATAATTT 1 TATGAACTAAACA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * 21836240 TTCATATAGTCTTAACTATTTA-AAC-TG-CT--TCACCAGACAGATTTAT-TTTTTAAATCCCT 64 TTCAAATAGTCATAACTA-TTAGAACTTGTCTGGT-A--A-ACATATTTATACTTTAAAATCTCT * * * * ** * 21836299 TAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA 124 TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA * * * * * * * * ** * 21836363 CTGAAAC-ATT-TAATTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAA 188 CTAAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA * ** * 21836426 TAG--A-AAC----TG--C-T-TCA-ATAAATTGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAAT 252 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAGATTTATTTTTAAAATCTTC-TACTTATTAAT * * 21836478 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA-ACAAGCTTG 315 TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATA-AA-CTTG * * * * ** 21836525 TATGATGA-AAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG 1 TATGA--ACTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * * 21836588 TTGAAATAGTCATAATTATTTGAATTTAT-TCGGTAAACAGA-TT-CACTTTTTAAA----TAAC 64 TTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCT-GGTAAACATATTTATAC-TTTAAAATCTCTTAC * * * * 21836646 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTTCGAACAAGCTT-TAATGAA 127 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA--A-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT-ATGAA * * * * * * * * 21836710 ATGAAACAATTGTTTTATGATAAACCAAAACA-TCATAACAATTTTAAATATACAATTGTTCAAA 188 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA * * * * * * 21836774 TAGTCGTAATTATTTGAATTTGTTTA-AAAA-ATGCATTTATTTTTTTAAATC-TCTTGCTTGTT 252 TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTAGAAAACA-G-ATTTA-TTTTTAAAATCTTC-TACTTATT * * * * * * * 21836836 AATTTTTAAACTATTAAAAAATTAGTATTATTTTTTTTTGGATAACCTTT 312 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAATAAACTTG * * * 21836886 TATGAGCTAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTTAAATA-ATTAATT 1 TATGAACTAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATAATTTGAAATAGA-TAATT * * * * * * * ** * * 21836949 GTTTAAATAGTCGTAACTATTTA-AGCTTATTTAGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGC 63 GTTCAAATAGTCATAACTA-TTAGAACTTGTCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTAC * * * * * * 21837013 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGATA- 127 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGA-AC * * * * * * * * * * *** 21837075 TGAACCAAATATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTTTTATA 189 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA ** * * * 21837139 GTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACACATTT 254 GTCATAACTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAGATTT 21837175 GATAAAAAAC Statistics Matches: 3821, Mismatches: 848, Indels: 675 0.72 0.16 0.13 Matches are distributed among these distances: 343 5 0.00 344 33 0.01 345 5 0.00 346 4 0.00 347 48 0.01 348 161 0.04 349 9 0.00 350 2 0.00 351 3 0.00 352 3 0.00 353 18 0.00 354 124 0.03 355 155 0.04 356 519 0.14 357 261 0.07 358 123 0.03 359 120 0.03 360 382 0.10 361 462 0.12 362 498 0.13 363 343 0.09 364 135 0.04 365 17 0.00 366 7 0.00 367 26 0.01 368 24 0.01 370 14 0.00 371 4 0.00 372 5 0.00 373 5 0.00 374 8 0.00 375 14 0.00 376 1 0.00 377 3 0.00 378 3 0.00 379 1 0.00 380 6 0.00 381 13 0.00 384 1 0.00 386 3 0.00 387 3 0.00 388 2 0.00 390 1 0.00 391 1 0.00 393 8 0.00 394 5 0.00 395 1 0.00 397 1 0.00 398 1 0.00 399 2 0.00 400 14 0.00 401 9 0.00 402 12 0.00 403 5 0.00 404 5 0.00 405 10 0.00 406 3 0.00 407 12 0.00 408 7 0.00 409 7 0.00 410 6 0.00 411 4 0.00 412 5 0.00 413 1 0.00 415 3 0.00 417 2 0.00 418 10 0.00 419 9 0.00 420 104 0.03 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (360 bp): TATGAACTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTT CAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTCTGGTAAACATATTTATACTTTAAAATCTCTTACTTAT TAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAACA ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA CTATTTGAACTTGTTAGAAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAAAATAT TAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAACTTG Found at i:21833533 original size:64 final size:64 Alignment explanation

Indices: 21833421--21833553 Score: 162 Period size: 64 Copynumber: 2.1 Consensus size: 64 21833411 TTTGGATAAG * *** * * 21833421 AATT-TATGAATTGAAACAATTATTTTTTGTTAAAACAAAAGGTCAGAACAATTTTAAATAGAT 1 AATTGTATAAATTGAAACAATTATTTTTAACTAAAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAGAT * * * 21833484 AATTGTATAAATTGAAACAATTATTTTATAACT-AAGCAAAAAGTTAGAACAATTTGAAATAGCT 1 AATTGTATAAATTGAAACAATTATTTT-TAACTAAAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAGAT 21833548 AATTGT 1 AATTGT 21833554 TCTAATAGTC Statistics Matches: 59, Mismatches: 9, Indels: 3 0.83 0.13 0.04 Matches are distributed among these distances: 63 4 0.07 64 53 0.90 65 2 0.03 ACGTcount: A:0.47, C:0.07, G:0.11, T:0.35 Consensus pattern (64 bp): AATTGTATAAATTGAAACAATTATTTTTAACTAAAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAGAT Found at i:21835394 original size:716 final size:721 Alignment explanation

Indices: 21833531--21837053 Score: 1684 Period size: 716 Copynumber: 4.9 Consensus size: 721 21833521 AAAAAGTTAG * * * * * * * * 21833531 AACAATTTGAAATAGCTAATTGTTCTAATAG-TCTTAACTATTTGAAC-TGGT-TCAGCAAACAC 1 AACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTAAACAT-GTCT-AGAAAATAG * * * * * * * 21833593 ATTTATGTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAACAATATTTTACT 63 ATTTAT-TTTTAAAAT-TCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTA-T * ** * * * ** 21833657 CTG-AATAAACTTGTATGAATAGAAACAAT-TACTTTATGA-GAAA-AAAAGATCATAACAATTT 125 TTGAAATAAACTTACATGAACAGAAACAATCT--TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT * * * * * * ** * * * * 21833718 TAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTGATAGATAGATTTA-GCTTT 188 AAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAGATTTATG-TTT * * * * * ** *** 21833782 TAAATCTCTTA-T--TTATTTGT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTT 252 TAAATTTCTAACTCATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATCTCAAATAAGCA * * * * * * * * ** 21833843 TGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACGATTTGAAATAGCTAA-T 317 TATATGAATAGAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATT ** * * * * * * * 21833907 AGTTTGAATAGA-CTTGACTATTTGAACTTGTT-TAGTGAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTA 382 A-TTCAAATA-ATCATAACTATTTCAAATTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTA * * * * 21833969 ACTTATTAATTTCTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATAAGTA 444 ACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATATAAGTA * * 21834034 GAAACAATTGTTTTATGAGAAGACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG 509 GAAACAATTGTTTTATGACAAGACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAG * * * 21834099 TCATAACTATTTGAACTCGCTCAATACATAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT 574 TCATAACTATTTGAACTCGCTCAACAAACAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT * ** 21834164 TGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATACTGAATAAGCTTTTACGAACAAAAACAATAGGTT 639 T-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATACAAAATAAG--TTTACGAACAAAAACAATAGGTT 21834229 TATGACAAAACAAAAGATCAT 701 TATGACAAAACAAAAGATCAT * * ** 21834250 AACAATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGTACATGTCTAGAAAATAGATT 1 AACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTAAACATGTCTAGAAAATAGATT * * * * * * 21834315 TATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTATATTATTTTATTTGAAA 66 TATTTTTAAAATTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGAAA * * * * * * * * 21834380 TAAGCTTGCATGAATAGAATCAATGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATGATGTTTTAAAATAGA 131 TAAACTTACATGAACAGAAACAATCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGA * * * * * 21834445 TAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAGCTTATTTGGTAAACAGATTTATGTTTTAAGTTTCT 196 TAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAGATTTATGTTTTAAATTTCT * * * * * * * * 21834510 TACTCATTAATTTTTAGAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTATTTGAAT 261 AACTCATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATCTCAAATAAGCATATATGAAT * * ** * * * * ** 21834575 TGGAACATTTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATA 326 AGAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA * * * * * * * 21834640 ATCATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTTCAATCTTTTACTTATTAATTA 391 ATCATAACTATTTCAAATTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATT- * ** * 21834705 TC-AAAATATTAAT-ATTTAATATTATTTTAATCCAAATAGCCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG 455 TCTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATAT-AAGTAGAAACAATTG * 21834767 TTTTATGACAA-A-ATAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAAC- 519 TTTTATGACAAGACA-AAAGA-TCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACT * * ** * 21834829 ATTTGAACTTGTTTTACAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AGTA 582 ATTTGAACTCGCTCAACAAACAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAATA * * * * * * 21834892 TTAATAATTTTGTATTATTTTATTCAAAAT-AG-TT-CGAACAAAAA-ATTTTA-TTTTATGTCA 645 TTAATAAATTAGTATTATTTTATACAAAATAAGTTTACGAACAAAAACA--ATAGGTTTATGACA * 21834952 AAACAAAATG-TTAT 708 AAACAAAA-GATCAT * * * * * 21834966 AGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATTATTTAAACTTGT-TCGATAAATAGA 1 AACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTAAACATGTCTAGA-AAATAGA * 21835029 TTCT-TTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTT 64 TT-TATTTTTAAAAT-TCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTA-TT * * * * * 21835093 TG-AATAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAAT-ATTTGA 126 TGAAATAAACTTACATGAACAGAAAC-AATCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAA * * * 21835156 AATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTGATC-TAGTTCGGTAAACATATTTAT-TTTTA 190 AATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTTA-TTCGGTAAACAGATTTATGTTTT- * * 21835219 AAATTT-TAACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCA 253 AAATTTCTAACTCATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTAGTATTATTTT-ATCTCAAATAAGCA * *** * 21835282 TGTATGAATAGAAACAAATGTTTTATAACCGGACAAAAAGTCAAAACGGTTTGAAATAAATAATT 317 TATATGAATAGAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATT * * * * 21835347 -TGTCAAATAGTCATAACT-TTTTAAATTGGTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAA--TCT-- 382 AT-TCAAATAATCATAACTATTTCAAATT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTAA * * * * ** * * * * * 21835405 CTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAGATTGGTATTACTTTATTCCGAACAAACTTATATGAA-CA 445 CTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATAT-AAGTA * * * * * * * * * * 21835469 AAAACATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAA 509 GAAACAATTGTTTTATGACAAGACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAG * * * * ** * ** * * * * 21835533 TCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAACAAAAATATTTTTTTGAATATCTTACTTATTAATTT 574 TCATAACTATTTGAACTCGCTCA-ACAAACAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT * * * * * * *** ** * 21835597 TTGAAATATTAATAAATT--TATTTTATTTATTTC-GAATCAGCTAGTATGAATTGAAA-TTTTG 638 TTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTA-TACAAAATAAG-T-TTACGAACAAAAACAATAG * * 21835658 TTTTATGACAAAGCAAAATG-TCAT 698 GTTTATGACAAAACAAAA-GATCAT * * * * * * * * * * 21835682 AACATTTTGAAATAGATAATTTTTCATATAG-TCTTAAATATTTGAAC-TAGT-TCGTCAAA-CG 1 AACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTAAACAT-GTCTAG-AAAATAG * * * * * ** 21835743 AATTTATTTTT-AATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATTTTATTATGTT-AGTATTATTTTAT 63 -ATTTATTTTTAAAAT-TCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTAT ** * ** * * * * * * ** * 21835806 TCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTGTGGCAAAATAAAAGGTTATAACAATTTG 125 TTGAAATAAACTTACATGAACAGAAACAA-TCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTA * * * * * * * * * * * * * 21835871 AAGTATACAATTGTTCAAATAGTCCTAATTAATTGAACTGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTA 189 AAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAGATTTATGTTTTA ** * * * * ** * * * * * 21835936 AATCACTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTTTTCT-GAATAAGCTT 254 AATTTCTAACTCATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTAGTATTATT-TTATCTCAAATAAGCAT * ** * * * ** * 21836000 GA-ATG-ATAAAAAACATTTGTTATATGAC-AAACAAAAGGT-AATAATAATTTGAAATAGATAA 318 -ATATGAAT-AGAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAA-AACGATTTGAAATAAATAA * * * ** * * * * * 21836061 ATGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAAA-TGATTC-AGTAAATAGATTCA-CTTTTTAAA--TC- 380 TTATTCAAATAATCATAACTATTTCAAATTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCT * * * ** * * ** * * 21836120 -ACTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGAAC 443 AACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATAT-AAG ** * * * * * * * * * 21836184 TA-AAATGATTGTTTTATGATAAAACAAAA-TTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTTTCATAT 507 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAGACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAAC * * * * ** * 21836247 AGTCTTAACTATTTAAACT-GCTTCACCAGACAGATTT-ATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAAT 572 AGTCATAACTATTTGAACTCGC-TCAACAAACAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT * **** * ** * 21836310 TTTCAT-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACATTT 636 TTT--TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATACAAAATAAG-TT-TACGAACAAAAACA-AT * * * * * * * 21836374 A--ATTATAATAGAAGAAAAGGTTAT 696 AGGTTTATGACAAAACAAAAGATCAT ** * * * * * 21836398 AATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAG--A-AAC----T--GC-T-TC-A-ATAAATTGAT 1 AACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTAAACATGTCTAGA-AAATAGAT * * * ** 21836450 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCC 65 TTATTTTTAAAAT-TCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTTG * * ** ** * * * * * * * 21836514 AAACAAGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAACGATTTGAAA 128 AAATAAACTTACATGAACAGAAACAA-TCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAA * * * * ** * 21836578 TAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTGAATTTATTCGGTAAACAGATTCACT-TTTTAAA 192 TAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAGATTTA-TGTTTTAAA * * *** * * * * * 21836642 ----TAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTTCGAACAAGC-T 256 TTTCTAACTCATTAATTGTCAAAATATAAAT-AA--ATTAGTATTATTTTATCTCAAATAAGCAT * * * * * * * * * * 21836702 TTAATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGATAAACCAAAACA-TCATAACAATTTTAAATATACAA 318 AT-ATGAATA-GAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTCAAAACGATTTGAAATAAATAA * * * * * * * * 21836765 TTGTTCAAATAGTCGTAATTATTTGAATTTGTT-TA-AAAAATGCATTTATTTTTTTAAATCTCT 380 TTATTCAAATAATCATAACTATTTCAAATTGTTCGATAAACA-G-ATTTATTTTTTTAAATCTCT ** * * * * * ** **** * * * 21836828 TGCTTGTTAATTTTTAAACTATTAAAAAATTAGTATTATTTTTTTTTGGATAACCTTTTATGAGC 443 AACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATATAAG- * * * * * * 21836893 TA-AAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTTAAATAATTAATTGTTTAAA 507 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAGACAAAAGA-TCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAA * * *** * ** * * 21836956 TAGTCGTAACTATTT-AAGCTTATTTAGTAAACAGATTT-ATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTA 571 CAGTCATAACTATTTGAA-CTCGCTCAACAAACAGATTTAATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTA * * * 21837019 ATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTAT 634 A-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT 21837054 TCTGAATAAG Statistics Matches: 2224, Mismatches: 461, Indels: 246 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 700 23 0.01 701 2 0.00 702 10 0.00 703 37 0.02 704 135 0.06 705 97 0.04 707 4 0.00 708 1 0.00 709 75 0.03 710 61 0.03 711 115 0.05 712 66 0.03 713 45 0.02 714 4 0.00 715 153 0.07 716 575 0.26 717 241 0.11 718 101 0.05 719 131 0.06 720 7 0.00 721 55 0.02 722 34 0.02 723 213 0.10 724 37 0.02 725 2 0.00 ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (721 bp): AACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTAAACATGTCTAGAAAATAGATT TATTTTTAAAATTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGAAA TAAACTTACATGAACAGAAACAATCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGA TAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAGATTTATGTTTTAAATTTCT AACTCATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATCTCAAATAAGCATATATGAAT AGAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA ATCATAACTATTTCAAATTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTT CTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATATAAGTAGAAACAATTGTT TTATGACAAGACAAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTT GAACTCGCTCAACAAACAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATA AATTAGTATTATTTTATACAAAATAAGTTTACGAACAAAAACAATAGGTTTATGACAAAACAAAA GATCAT Found at i:21836575 original size:168 final size:168 Alignment explanation

Indices: 21836279--21836596 Score: 394 Period size: 168 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168 21836269 TCACCAGACA * * 21836279 GATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT 1 GATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT *** * * * * 21836344 TTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACATTTAATTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAA 66 CCAAACAAGCTTGTATGAACTGAAACATATAATTATAATAGAAAAAAAGGTTATAACGATTTGAA * 21836409 ATAGGTAATTATTCAAATAGAAACTGCTTCAATAAATT 131 ATAGATAATTATTCAAATAGAAACTGCTTCAATAAATT * * 21836447 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT 1 GATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT * ** * 21836511 TCCAAACAAGCTTGTATG-A-TGAAA-A-ATAATTGTTTTATGACAAAACAATGTTCATAACGAT 65 TCCAAACAAGCTTGTATGAACTGAAACATATAATTATAATA-GA-AAAA-AAGGTT-ATAACGAT * * 21836572 TTGAAATAGATAATTGTTGAAATAG 126 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAG 21836597 TCATAATTAT Statistics Matches: 127, Mismatches: 18, Indels: 10 0.82 0.12 0.06 Matches are distributed among these distances: 164 8 0.06 165 3 0.02 166 8 0.06 167 6 0.05 168 97 0.76 169 5 0.04 ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.11, T:0.43 Consensus pattern (168 bp): GATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT CCAAACAAGCTTGTATGAACTGAAACATATAATTATAATAGAAAAAAAGGTTATAACGATTTGAA ATAGATAATTATTCAAATAGAAACTGCTTCAATAAATT Found at i:21836682 original size:176 final size:178 Alignment explanation

Indices: 21836468--21836794 Score: 430 Period size: 179 Copynumber: 1.8 Consensus size: 178 21836458 TAAATCTCTT 21836468 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA-ATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTGT-ATGA 1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTT-TAATGA * *** * * * 21836530 TGAA-AAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAA 65 --AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAACATCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAA 21836593 ATAGTCATAATTATTTGAATTTATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATA 128 ATAGTCATAATTATTTGAATTTATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATA * * * * 21836644 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTTCGAACAAGCTTTAATGA 1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTTAATGA * * * * 21836709 AATGAAACAATTGTTTTATGATAAACCAAAACATCATAACAATTTTAAATATACAATTGTTCAAA 65 AA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAACATCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAA * 21836774 TAGTCGTAATTATTTGAATTT 129 TAGTCATAATTATTTGAATTT 21836795 GTTTAAAAAA Statistics Matches: 128, Mismatches: 16, Indels: 10 0.83 0.10 0.06 Matches are distributed among these distances: 176 24 0.19 177 4 0.03 178 1 0.01 179 50 0.39 180 49 0.38 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42 Consensus pattern (178 bp): ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTTAATGAA AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAACATCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATA GTCATAATTATTTGAATTTATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATA Found at i:21837503 original size:182 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21837181--21839587 Score: 1873 Period size: 181 Copynumber: 13.4 Consensus size: 180 21837171 ATTTGATAAA * * * * * * * * 21837181 AAACAATTGTTTGATAACAAAACAAATGGTTATAGCTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGC 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * * * 21837246 CATAATTACTT-AAC-TGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTA 66 TATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT * * 21837309 GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCGTATAAACTTGTATTAACTG 130 G-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * * 21837361 AAACAATTATTTTATGA-AAGAACAAAAAGTCATAGCGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAG 1 AAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * 21837425 TTATAACTATTTGAGCTTGTTCGATAAATAGACTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTT 65 TTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT * * * * * 21837490 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA 128 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * * 21837543 AAACAATTGCTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAG- 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * ** 21837607 TATTAA-TCATATAAACTAGTTCGATAAACA-ATTT-TTTTAAAAATCTCTTACTTATTAATTTT 66 TA-TAACT-ATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT ** * * * * * * ** 21837669 CAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATACAAACT- 129 -TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * * ** * 21837721 AAAAAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCATAACGATTTGAACTAGATAATAATTCATATAGT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * ** ** * * * ** * 21837786 CT-TAAC-ATTTGAACTCGTTCGGCAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTC 66 -TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT ** * * * * * * 21837849 AAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTAT-AAAT- 129 TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * * * 21837899 AGACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAG 1 A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * * * ** * 21837964 TCAAAACTATATGAAATGGTTTGGTAAACCTATTTAGTTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT 65 TTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT * ** * * ** 21838029 CTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAACAAACTTATATGAACAA 129 -TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * 21838082 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAATGATTTG--A-A-ATAA--G-T--AATA-- 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * * 21838135 -AT---TATTTGAAC-TGATTTGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTT 66 TATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT * * * 21838195 GAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATGAGCTG 130 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * 21838247 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * ** * * 21838312 CT-TAACTGTTTGAA-TTGGTTCGACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAAATTT 66 -TATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TAATTT * * * * 21838375 TAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAACAG 128 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACTTGTATGAACTG * * * * ** * 21838428 AAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * * * * 21838493 CACAACTATTT-AAATTATTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTAGATCTCTTAC----TAATTCTT 66 TATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT * * * * 21838552 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGAATG--TTG 130 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * 21838602 AAAAGAATTGTTTTATGA-TAAA-AAAAGGTAATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGG 1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG ** * ** * * * 21838665 CCATAATTATTTGAACTAATTTGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT 65 TTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT * * * * * 21838730 GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGCTTTTTATGAATTG 130 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAAC-TTGTATGAACTG * * ** * 21838783 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTGTTCAAATAAT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * * * 21838848 AATAACTATTTGAGCTTGTCCGGTAAACATATTT-TTTTTTCAAATCTCCTGCTTATTAATTTTT 66 TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTT * * * 21838912 TGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGGATGAACTA 129 TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * * * * * 21838964 AAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAAT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * ** * * 21839029 CT-TAACTATTTGAA-ATGATTCGGCAAACACATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT 66 -TATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT * * * * 21839092 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATTATA-AG 129 TG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAACTTGTATGA-ACTG * * * * * * * 21839145 AAACAATTTTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGAGATTA-ATATTTGTTCAAATGG 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAG ** * * * * * * 21839208 TCGTAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAACAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTTCTTAATAATTTTT 65 TTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT * * * * * * 21839273 GAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTC 130 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * * * 21839325 AAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * * * * 21839390 CATATCTATTTCAACTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT 66 TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT * * 21839455 TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG 129 TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG * * * * * * 21839507 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCCAATGGT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT 21839572 CT-TAACTATTTGAACT 66 -TATAACTATTTGAACT 21839588 GGATTGGCAA Statistics Matches: 1765, Mismatches: 376, Indels: 170 0.76 0.16 0.07 Matches are distributed among these distances: 164 3 0.00 165 90 0.05 166 30 0.02 168 1 0.00 169 2 0.00 170 4 0.00 172 4 0.00 173 60 0.03 174 21 0.01 175 25 0.01 176 38 0.02 177 22 0.01 178 106 0.06 179 177 0.10 180 267 0.15 181 494 0.28 182 400 0.23 183 21 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (180 bp): AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTG Found at i:21838130 original size:20 final size:20 Alignment explanation

Indices: 21838107--21838144 Score: 67 Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20 21838097 GACAAAACAA 21838107 AAGTAATAATGATTTGAAAT 1 AAGTAATAATGATTTGAAAT * 21838127 AAGTAATAATTATTTGAA 1 AAGTAATAATGATTTGAA 21838145 CTGATTTGGT Statistics Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0 0.94 0.06 0.00 Matches are distributed among these distances: 20 17 1.00 ACGTcount: A:0.50, C:0.00, G:0.13, T:0.37 Consensus pattern (20 bp): AAGTAATAATGATTTGAAAT Found at i:21840019 original size:179 final size:177 Alignment explanation

Indices: 21839612--21840050 Score: 497 Period size: 179 Copynumber: 2.5 Consensus size: 177 21839602 CACTTATTTT * * * * * * * 21839612 TATTATTAAATTAGGATTATCTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAGCAATTGTTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * * 21839677 CAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAGTTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACTA 66 CAAAAGAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTA ** 21839741 ATTTAGTAACAAAATTTAGTTTTTAAATCTCTGATTAATATTCAAAA 131 ATTTAGTAACAAAATTTAGTTTTTAAATCTCCAATTAATATTCAAAA * * * * ** * 21839788 TATTAGTAAATCAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATCGTTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA * * * 21839853 CAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTT 66 CAAAAGAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTA * * * * * * * 21839918 GTTTGGTAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTTAATTTTTAGAA 131 ATTTAGTAACA-AAATTTAGTTTTTAAATCTCCAA--TTAATATTCAAAA * * 21839967 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA * 21840032 CAAAACG-AAATATCATAAC 66 CAAAA-GAAAAGATCATAAC 21840051 TACTTGAGCT Statistics Matches: 216, Mismatches: 42, Indels: 7 0.82 0.16 0.03 Matches are distributed among these distances: 176 59 0.27 177 75 0.35 179 81 0.38 180 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.39 Consensus pattern (177 bp): TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA CAAAAGAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTA ATTTAGTAACAAAATTTAGTTTTTAAATCTCCAATTAATATTCAAAA Found at i:21840195 original size:147 final size:144 Alignment explanation

Indices: 21839922--21840204 Score: 374 Period size: 147 Copynumber: 1.9 Consensus size: 144 21839912 GAACTTGTTT * * 21839922 GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT 1 GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTTAATTTTTAGAATACTAATAAATTAGTATAAT * * 21839987 TTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACGAAATATCATAACT 66 TTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATAACAAAACGAAAAATCATAACT 21840052 ACTTGAGCTTGCTC 131 ACTTGAGCTTGCTC *** * 21840066 GGTAAATAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTAT 1 GGTAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCCAACTT--TAATTTTTAGAATACTAATAAATTAGTAT ** * 21840131 AATTTTATT-TCGAATAAGGTTGTATGAACAGAAACAATTGA-TTTATGACAAAAC-AAAAAGTC 63 AATTTTATTCT-GAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATT-ATTTTATAACAAAACGAAAAA-TC * * 21840193 ATAGCTATTTGA 125 ATAACTACTTGA 21840205 AATAAATATT Statistics Matches: 120, Mismatches: 13, Indels: 9 0.85 0.09 0.06 Matches are distributed among these distances: 144 13 0.11 145 17 0.14 146 5 0.04 147 84 0.70 148 1 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.11, T:0.40 Consensus pattern (144 bp): GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTTAATTTTTAGAATACTAATAAATTAGTATAAT TTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATAACAAAACGAAAAATCATAACT ACTTGAGCTTGCTC Found at i:21840761 original size:360 final size:360 Alignment explanation

Indices: 21840039--21842403 Score: 1873 Period size: 360 Copynumber: 6.6 Consensus size: 360 21840029 TAACAAAACG * * ** * * * 21840039 AAATA-TCATAACTACTTGAGCTTGCTCGGTAAATAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTAAT 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATT * * * * 21840103 AATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCGAATAAGGTTGTATGAAC-AGAAACA 65 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACTA-AAACA * * * * * * 21840167 ATTGATTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCTATTTGAAATAAAT-ATTGTTCAAATAGTCATAA 129 ATTGTTTTAAGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAA * * ** * * * * ** 21840231 CTATTT-AAATGTGTTTAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTAATAATTTTTGAAAT 193 CTATTTGAACT-TATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAAT * * * * 21840294 ATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC 257 ATTAATAAATTAATATTATTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAA * * * * * 21840359 AAAACAGAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATT-TTC 321 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTC * * * * * 21840398 AAATAGTAATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTA 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * * * * 21840463 ATTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTT-AATGAACTAATACAA 66 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-ATTGTATGAACTAAAACAA * * * * * * 21840527 TTGTTTTAAAATCAAACAAAATGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGAC 130 TTGTTTTAAGA-CAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAC * * * * * 21840592 TATTTGGACTTTTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAGAATCT-TTACTTATT-ATTTGTAAAAAT 194 TATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTT-TCAAAAT * 21840654 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTT-TCATGAACA-AAACAATTGTTTTAT-A 257 ATTAATAAATTAATATTATTTT-ATCTAAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * 21840716 AAATAATAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTC 320 AAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTC * * * * * * 21840758 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTT 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATT * * * * 21840823 AATTGTTT-GAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGCAAA 65 AATT-TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACTA--AAA * * * * * ** * 21840886 -TATCGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT 127 CAATTGTTTTAAG-ACAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT * * * * * * 21840950 AACTATTTTAACTTATTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGA 191 AACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA ** * * * * * * * 21841015 ATATTAATAAGCTAGA-ATAATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGT 255 ATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATCT-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT * * * * 21841079 GATAACACAAAAGGTTATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTC 318 GAAAAAACAAAAGGTCATAAC-GATTTAAAATAGATAATTGTTC * * * * * * * * * 21841123 AAACAATCATAAATATTTGCAC-TAGGTAGGCT-AACAGATTCATTTTTTAAAT-TAGTTAGTTA 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTA * *** * * * * 21841185 TTAAATTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATG-ACTGCAAA 63 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACT-AAAA * * ** * * * 21841249 CATTTGTTTTATGACAAAACAATTGGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTGTTCACATAGTTA- 127 CAATTGTTTTAAGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT * * * * 21841313 AACTAATTGAACTGATTTAGTAAACAAATTTATATTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTCAAAA 191 AACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAA * * * * * * * * * * 21841378 TATTAATAAATAAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAACATTTGTTCTATGA 256 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * 21841443 CAAAACAGAAGGTCATAACGATTTGAAAA-GGATAATTGTTC 320 AAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-AAAATAGATAATTGTTC * * ** * ** * * * 21841484 AAATAGTCATAAGTATTTGAAGTGGTTCGGCAAATGGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTAATT- 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * * * * * * * * 21841548 -TTTTTGAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTA-TTCTGAATAAG-TTACTAAGAACTAAAAAA 66 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGATT-GTATGAACTAAAACA * * * * 21841610 ATTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATACCTT-TA 129 ATTGTTTTAAGA-CAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA-GTTATA ** * * * * 21841674 ACTATTTGAAC-TGGTT--CAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAAT 192 ACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAAT * * * * * * * * * 21841736 ATTATTACATTAGTGTTATTTTATTTCAAACAAGCTTCTACT-AACATAAATAATTGTTTTATGA 257 ATTAATAAATTAATATTATTTTATCT-AAATAAGCTTGTA-TGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * * * 21841800 CAGAACACAAGGTTATAACAATTTTAAATATATAATTATTC 320 AAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTC * * * * 21841841 AAATAGTCATAACCATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTC-TACTTATT 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT * * * * * * 21841903 -ATTTTTTGAGATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAGGATTGTATGATA-AAAAAT 65 AATTTTTGGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGA-ACTAAAAC * * ** * ** 21841966 AATTGTTTTATGACAAAAGAAAAATTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCATA 128 AATTGTTTTAAGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATA * * *** ** * 21842031 ATTATTTGAACTGATTT-GATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAA-TTTCTAAA 192 ACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAA * * * * 21842094 ATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTAT 255 ATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAT * * * 21842158 GATAAAATAAAAGGTCATAAC-AGTTTTAAATAGATAATTGTTC 318 GAAAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTAAAATAGATAATTGTTC * * * * * * 21842201 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTA 1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * * * ** ** * * 21842266 ATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTGCTATTTTATTTTGAATAAGCA-TGTATGAACTGAAATAA 66 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-ATTGTATGAACTAAAACAA * * * * * * 21842330 TTATTTTAACACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATACATAATTGTTCTAATAGTCT-TAA 130 TTGTTTTAAGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-TATAA 21842394 CTATTTGAAC 193 CTATTTGAAC 21842404 AGTTCGATAG Statistics Matches: 1580, Mismatches: 351, Indels: 147 0.76 0.17 0.07 Matches are distributed among these distances: 355 6 0.00 356 26 0.02 357 239 0.15 358 15 0.01 359 258 0.16 360 337 0.21 361 203 0.13 362 210 0.13 363 95 0.06 364 127 0.08 365 63 0.04 366 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (360 bp): AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACTAAAACAAT TGTTTTAAGACAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA TTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA ATAAATTAATATTATTTTATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAC AAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTC Found at i:21842220 original size:181 final size:182 Alignment explanation

Indices: 21840068--21842437 Score: 1824 Period size: 179 Copynumber: 13.2 Consensus size: 182 21840058 GCTTGCTCGG * * ** * * 21840068 TAAATAGATTTAATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATAA 1 TAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA ** * * * * 21840133 TTTTATTTCGAATAAGGTTGTATGAAC-AGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAAGTCATAG 65 TTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * 21840197 C-TATTTGAAATAAAT-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATGTGTTTAA 129 CAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-ATTTGA * * * * 21840249 AAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTA 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTA ** * * * 21840312 TTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTTAAAA 65 TTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * 21840376 CA-ATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTATTCGG 129 CAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * * 21840428 TAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTA 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTA * * * ** * 21840492 TTTTATTTCAAATAAGCCTT-AATGAACTAATACAATTGTTTTAAAATC-AAACAAAATGTCATA 65 TTTTATTTTAAATAAG-CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATA * * * * * ** * 21840555 AC-GACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTTTTTGG 128 ACAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * 21840609 TAAACATATTTA-TTTTTAGAATCT-TTACTTATT-ATTTGTAAAAATATTAATAAATTAATATT 1 TAAATAGATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATT * * * * * * 21840671 ATTTTAATCTGAATAAGCTT-TCATGAAC-AAAACAATTGTTTTAT-AAAATAATAAAAAGTCAT 64 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGT-ATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCAT * * * * * 21840733 AA-TGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA 127 AACAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * * * 21840788 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTTAATTGTTT-GAATATTAATAAATTTGTGTT 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATT * * * * * 21840852 ATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGCAAA-TATCGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTAT 64 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTA--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT ** * * * * 21840915 -AGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTTAACTTA-TTCA 127 AACAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * ** * * 21840969 GTAAACAGATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAGCTAGAATA 1 -TAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * * 21841034 ATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGATTTGTGATAACACAAAAGGTTATA 64 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * * * ** * 21841098 ACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCACTAGGTAGGC 128 ACAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATTTGA * * * * * * * 21841154 T-AACAGATTCATTTTTTAAAT-TAGTTAGTTATTAAATTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTA 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA * ** * * * ** 21841217 CTTTATTCCAAATAAGATTGTATG-ACTGCAAACATTTGTTTTATGACAAAACAATTGGTCATAA 65 TTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * 21841281 CA-ATTTGAAAAAAATAATTGTTCACATAGTTA-AACTAATTGAACTGATTT-A 129 CAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * * * * 21841332 GTAAACAAATTTATATTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATAAATATTA 1 -TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * * ** * * * 21841397 TTTTATTCTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAACATTTGTTCTATGACAAAACAGAAGGTCATAAC 65 TTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * * 21841462 -GATTTGAAA-AGGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAAGTGGTTCGG 130 AGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * * * * * * 21841514 CAAATGGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTAATT--TTTTTGAAATATTAATAGATTTGTTTTAT 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * * 21841577 TTTATTCTGAATAAG-TTACTAAGAACTAAAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAAC 66 TTTATTTTAAATAAGCTT-GTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * * 21841641 -GATTTGAAATAAATAATTGTTCATATA-CCTTTAACTATTTGAACTG-GTT-- 130 AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * * * * * 21841690 CAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTGTTAT 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * * 21841755 TTTATTTCAAACAAGCTTCTACT-AAC-ATAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTATAA 66 TTTATTTTAAATAAGCTTGTA-TGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * * * * 21841818 CA-ATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTAAATTGGTTCGA 129 CAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * * 21841871 TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTC-TACTTATTATTTTTTGAGATATTAATAAATTATTATTAT 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT ** * * * * * ** 21841934 TTTATTCCAAATAGGATTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAATTCATAAC 66 TTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * 21841998 -GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTTGA 130 AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * ** * * * * 21842050 TAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTCTAAAATATTAATAAAGTAATATTAT 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * 21842115 TTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACA 66 TTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA * * 21842180 G-TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGG 131 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTTGA * * * ** * * ** 21842231 TAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTGCTAT 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * ** * * * 21842296 TTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTGAAATAATTATTTTAACACTAAACAAAAGGTCAGAA-T 66 TTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA * * * * * 21842360 GATTTGAAATACATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACAG-TTCGA 131 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA * * * * 21842411 TAGACACATCTATTTTTTAAATC-CTTA 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA 21842438 ATGCTAATTT Statistics Matches: 1737, Mismatches: 380, Indels: 146 0.77 0.17 0.06 Matches are distributed among these distances: 176 27 0.02 177 1 0.00 178 111 0.06 179 480 0.28 180 353 0.20 181 449 0.26 182 241 0.14 183 74 0.04 184 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (182 bp): TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT TTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGA Found at i:21842777 original size:181 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21842436--21847007 Score: 2602 Period size: 181 Copynumber: 25.2 Consensus size: 179 21842426 TTTAAATCCT * * * ** 21842436 TAATGCTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTTG * * * * * * * * * * 21842500 CAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATTTAAACAATTGTATACTTGAAATCGTTATAACCTTTTG 64 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * 21842565 TTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCAAAATAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA ** * * * 21842616 TAATACTAATGCAATAGTATTCCTAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT 1 TAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT * * 21842681 AGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG 65 A-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * ** * * 21842746 TTTTGACATAAAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * 21842797 TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTGTT- 1 TAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTG * * * * * 21842859 TACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTT 64 TA---AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT * * * * * * * ** 21842924 TTATTTTGTCATAAACCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAA 126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * 21842978 TAATACTAA-TTATTTACATTTTGAAAATTAAT-AGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA 1 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTT *** * * * * * ** 21843041 CCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATGACCTTTT 63 GTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT * * * * * 21843106 GTTTTCATCATAAAACAATCT-ATT-TGTTCA-A-AA--TTATTTAGAATACAA 128 GTTTT-GTCATAAAACAAT-TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * * * * 21843154 CAATACTGATCTATTAATATTTTGAAA--ACTCA-TAAGAGATTTAAGAATTAAATTTGTTCATG 1 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TT-TTG * * * * 21843216 -AAAACAGGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCCTCAAATTGTTATGA--TAT 64 TAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCT-T * * * * * * 21843277 TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTGTTTAGATTAAAA 126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * 21843331 TAATACTAATTTAATAATTTTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAATAAGTGTTTGTT 1 TAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAAT-TTTTTT ** * * * * * * 21843396 G--AATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCCTTT 63 GTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT * * * * 21843459 -TTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATGCAAGCTTATTTAAAATAAAA 128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * 21843510 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAAATTAATGAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTT 1 TAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TTTTT ** * * * * * * 21843574 ACTAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-AAAGACGTTACGAACT 62 TGTAAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCT * * * * * 21843637 TTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAA 125 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * * * 21843692 TAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT--TAACTAAATCTGTTTAT 1 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT * * * * 21843755 CAGACCAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTT 65 -AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTT * * * *** * 21843818 GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCTATCCATACAAGTTTATTTGGAGTAAAA 128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * ** * * * * 21843869 TATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTG-T * * * * * * 21843934 GAACGCA-TTCAAATAGTTAAGACTGTTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTG 65 AAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG ** * * * ** * 21843998 TTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTTGAACTAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * 21844049 TAATACTATTTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTA 1 TAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTT ** ** * * * 21844113 CCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT 63 GTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT * * * * ** * * * * 21844178 ATTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACA 128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * ** *** * 21844230 TAATATTACTTTGTTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTAT 1 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT ** * * * ** * * * 21844295 CAAATTAGTTCAAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATGCCAAATCGTTATGAACATTTA 65 -AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * ** * * *** 21844360 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATATAAGCCTATTTGGAATAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * 21844411 TAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT 1 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT * * * * * * 21844476 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACTATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTG 65 -AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * 21844541 TTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * 21844592 TAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAGTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTG- * * * * * * * * 21844657 CAAAGCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG 64 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * * 21844722 CTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAC 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * ** 21844773 TAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTTG * * * * * * * * 21844834 CAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTG 64 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * ** * 21844899 TTTTGTAATAAAATAGTTTTTTCTATTAATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAG 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * 21844950 TAATGCTAATTAATTAATATTCTAAAAATGAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTG- ** * * * * * * * 21845015 TTGACCAATGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTG 64 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * 21845080 TTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCCTATAAGCTTATTCAAAATAACA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * *** * ** ** * * * 21845131 TAATTCTAATTTATTAATTAGTTTTGATTGTTTGAACATTTATCTA-TTTTAAATCATTATGACC 1 TAATACTAATTTATTAA-TA-TTCT-A-AAATT-AATAAGTA-AGAGATTTAAA--A-AAT-A-A * * * *** * * * 21845195 TTTTGTTTTGTCACAAAACAATT-GTTTTGTTCCTATAAGA-GATTTAAAAACTAAATCTGTTTA 55 ATTT-TTTTGT---AAACCAGTTCAAATAG-T--TAT--GACTATTT--GAAC--AA-----TTA * * * * ** 21845258 T-TGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTT 102 TCT--AT---TTCAAATCGTTATGAC-CTTT---TG-TT---T-TGTC--A----TA-AAACAAT * ** * ** 21845322 TGTTT-TG-TCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGA 146 TGTTTCTGTTCAT-ACA-AGCTTATTC-A-AAATA-AA-A * * * * 21845360 TTAT-TTCAATTAAAATAATACAAATT-TATTAATATTCAGACAATTAA-TAAGTAAAAGATTTA 1 TAATACT-AATT----TATTA-ATATTCTA--AA-ATT-----AA-TAAGTAAG---A-GATTTA * *** ** * * 21845422 AAAAA-AAACTCTATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC 47 AAAAATAAA-T-TTTTTTGTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * * * * * * *** * 21845486 AAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCAAAAAATAATT-TTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGAT 110 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA 21845550 TAAAA 175 TAAAA * * * * ** * ** 21845555 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTTG * * * * * * * * 21845620 CAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCGATTTCAAATTGTTATGACATTTTG 64 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG ** * * * * * 21845685 TTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * 21845736 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATAAA-TCTATT-T 1 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT * * * * * * * 21845799 -----A--TCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTGTTTCAATTCATTATGACATTTTGT 65 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT * * * 21845857 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAA 130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAA * * * * 21845907 TAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-TAAAATAAATCTATTT 1 TAATACT-AATTTATTAATATT-C-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTT * * * * 21845969 TCTGAA-CATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT 62 TGTAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT * * * * ** 21846033 TTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTGATACAAGCATATTTGAAATAAAA 126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * ** 21846087 TAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAA--ATTAA-T-A-AGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TTTTTTG ** * * * * * * * 21846147 CGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGATA-AATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCT 64 TAAACCAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT * * * * * ** 21846211 TTTGTTGTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAA 125 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * ** 21846266 TAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAGTTAATATGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTAC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTTG * ** * * * * * * 21846330 CAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTG 64 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * ** * * 21846395 TTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAA 129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * ** 21846446 TAATACTGATCTATTAATATTTTGAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTTTTTACA 1 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGTA ** * * * * * * * 21846508 AAATAGTTTAAATAATTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATT 66 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT * * * * 21846572 TCGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAA 131 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * * * 21846621 TAATACCAATTTAATAATATTCCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATC 1 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGT- * * * * * * 21846683 GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTTTGACCTGTTGT 65 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT * * * * 21846748 TTAGTCATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA 130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * * * 21846798 TAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGACTAAGAGATTT-TAAAA-AAATCTATTTAT 1 TAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TTT-T * * 21846861 TG--AACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCATTA-GACCT 62 TGTAAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCT * * * * 21846921 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAA 125 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA * * * 21846976 TAATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAA 1 TAATACTAATTTATTAA-TATTCTAAAATTAA 21847008 AAAGCAAGTT Statistics Matches: 3375, Mismatches: 807, Indels: 422 0.73 0.18 0.09 Matches are distributed among these distances: 170 10 0.00 171 108 0.03 172 36 0.01 173 68 0.02 174 22 0.01 175 95 0.03 176 183 0.05 177 285 0.08 178 175 0.05 179 348 0.10 180 547 0.16 181 1085 0.32 182 110 0.03 183 42 0.01 184 5 0.00 185 17 0.01 186 1 0.00 187 1 0.00 188 2 0.00 189 3 0.00 190 8 0.00 191 9 0.00 192 3 0.00 193 6 0.00 195 10 0.00 196 7 0.00 197 4 0.00 198 3 0.00 199 8 0.00 200 10 0.00 201 5 0.00 204 1 0.00 205 5 0.00 206 2 0.00 207 3 0.00 208 1 0.00 209 13 0.00 210 3 0.00 211 2 0.00 212 1 0.00 213 2 0.00 214 2 0.00 215 3 0.00 216 15 0.00 217 1 0.00 218 3 0.00 219 2 0.00 220 5 0.00 221 1 0.00 223 3 0.00 224 5 0.00 225 17 0.01 226 1 0.00 227 6 0.00 228 4 0.00 229 12 0.00 230 4 0.00 231 2 0.00 232 12 0.00 233 7 0.00 234 1 0.00 235 5 0.00 236 5 0.00 237 2 0.00 238 2 0.00 240 6 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40 Consensus pattern (179 bp): TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGTA AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA Found at i:21842906 original size:16 final size:17 Alignment explanation

Indices: 21842874--21842906 Score: 50 Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17 21842864 AACTAGTTCA 21842874 AATAATTATGACTATTTG 1 AATAATTAT-ACTATTTG 21842892 AATAATTAT-CTATTT 1 AATAATTATACTATTT 21842907 AAAATTGTTA Statistics Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2 0.88 0.00 0.12 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.40 18 9 0.60 ACGTcount: A:0.39, C:0.06, G:0.06, T:0.48 Consensus pattern (17 bp): AATAATTATACTATTTG Found at i:21844371 original size:362 final size:361 Alignment explanation

Indices: 21842442--21860718 Score: 8052 Period size: 362 Copynumber: 50.5 Consensus size: 361 21842432 TCCTTAATGC * * 21842442 TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTACCAAACC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * * * * * * * * * 21842506 AATTTAAATAGTTAAGACTATTTAAACAATTGTATACTTGAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTCTA 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTTG * ** ** ** * * 21842570 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACT-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGCAATAGT 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * ** 21842634 ATTCCTAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGTA-GAACCAGTTCAAATA 194 ATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATT-TACCAAATAGTTCAAATA * * * 21842697 GTTAAGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAACA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACA * * * * 21842761 ACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAT 320 A-TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * 21842803 GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * 21842868 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT * * ** * * * * 21842933 CATAAACCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTTACAT 131 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT ** * * * 21842997 TTTGAAAATTAAT-AGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGT 196 TTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AA-ATAGTTCAAATAGT * * * * * 21843060 CATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATGACCTTTTGTTTTCATCATAAAACAAT 258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAAT * * * * * 21843125 CTATTT--GTTCA-A-AA--TTATTTAGAATACAACAATAC 322 -TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * ** * * * * * ** * 21843160 TGATCTATTAATATTTTGAAAACT---CA-TAAGAGATTTAAGAATTAAATTTGTTCATGAAAAC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * 21843221 AGGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCCTCAAATTGTTATG-A-TATTTATTT 66 A-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGAACT-TTTATTT ** * * * * 21843283 TGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTGTTT-AGATTAAAATAATACTAATTTAATA 128 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * ** * 21843347 AT-TTTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAATAAGTGT-TTGT-TGAATTAGTTCAAA 192 ATATTT-CAAAAATTAATAAGCAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTATT-TACCAAATAGTTCAAA * * * * * 21843409 TAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACC-CTT-TTTTAGTCATAAAA 254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA * * * * 21843472 CAATTATTTTAGTTCATGCAAGCTTATTTAAAATAAAATAATAC 318 CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * 21843516 TAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATG-AGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * 21843580 CAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-AAAGACGTTACGAACTTTTGTT 64 CCAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAACTTTTATT * * * * ** * * 21843643 TTGTCAAAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTA 127 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * ** * 21843708 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT--TAACTAAATCTGTTTATCAGACCAGTTTAAATA 192 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AATAGTTCAAATA * * * * 21843771 GTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA * * *** * * ** 21843834 ATT-TTTCTA-TCCATACAAGTTTATTTGGAGTAAAATATTGC 320 ATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT ** * * * * * * 21843875 TAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACG 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC- * * * * * * * * 21843939 CA-TTCAAATAGTTAAGACTGTTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCT-AACCTTTTGTTTA 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTT * * * * * * * 21844002 ATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAAC 129 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * 21844067 ATTT-AGAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAATTCAAATAG 194 ATTTCA-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AGTTCAAATAG * ** * * 21844131 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATAATAAAACAAT 257 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT * ** * * * * 21844196 TGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACATAATAT 322 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * ** *** * ** 21844236 TACTTTGTTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * ** * 21844301 AGTTCAAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATGCCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGT 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT * * * 21844366 CATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAT 131 CATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * 21844429 ATTTCAAAAATTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGT 194 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGT * * * * * 21844494 TATGACTATTTAAACTATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT 258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT * * 21844559 ATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC 323 ATTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * 21844598 TAATCTAATAATATTAT-GAAAATT-AGTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA 1 TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAG-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * * * * ** 21844661 GCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTT * ** * * ** * * 21844726 GTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATATTAATTTATTAAT 129 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * 21844791 ATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAATTAGT 194 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGT * * * * * * * * 21844852 TATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTAATAAAATAGTT 258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT * * ** * ** 21844917 TTTTCTA-TTAATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGC 323 ATTTC-AGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * ** *** 21844956 TAATTAATTAATA-TTCTAAAAATGAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCTTGAC 1 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * * * * ** * 21845020 CAATGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTG 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * * * ** * * 21845085 TCACAAAACAATTGTTTCTGTTCCTATAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATT 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-T ** *** *** * ** * * * 21845150 AGTTTTGATTGTT--TGAA-CATTTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAA 194 A-TTTCAAAAATTAAT-AAGCA---AGAGA-TTTAAA--A-AAT-A---AATCTATT-T-ACCAA * * *** * * * 21845212 ACAATT-GTTTTGTTCCTATAAGA-GATTTAAAAACTAAATCTGTTTAT-TGAATAAGTTCAAAT 244 ATAGTTCAAATAG-T--TAT--GACTATTT--GAAC--AA-----TTATCT--AT---TTCAAAT * * * * * * * 21845274 -AGTTATGA-CTATTTGAGTGATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTT-TGTTTTGTCATAAA 290 CA-TTATGACCT-TTT--GT-TTTATC-A--T-AAA--ACAATTA--TTTCAG---T-TCAT-AC ** * ** * 21845336 ATAATTTTTTCTATTCATACAAGATTAT-T 337 A-AGCTTATTC-A-AAATA-AA-ATAATAT * * * * * * * * 21845365 TCAA-TTA-AAATAATACAAATTTATTAA-TATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA 1 T-AATTTATTAATATTTCAAA--AATTAAGAAGTAAGA-GATT--T-A--AAAA-A--T------ * * ** * * * * 21845427 AAACTCTATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCG 48 AAA-TTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG * * ** * * * 21845492 TTATG-ACTTTTTATTTTGTCAAAAAATAATT-TTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAA 112 TTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * ** * * 21845555 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTAC 176 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC * * * * * ** * 21845620 CAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCGATTTCAAATTGTTATGACATTTTG 241 CAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * * 21845685 TTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATAT 305 TTTTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * 21845742 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATG-AGCAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTT------- 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * * * * * 21845799 -A--TCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTGTTTCAATTCATTATG-ACATTTTGTTTT 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTATTTT * * 21845860 GTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTA 129 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA * * * * * * 21845923 ATATTCCAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-TAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCAAA 192 ATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAA-ATAGTTCAAA * * * 21845985 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAC 254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA * * * * ** ** 21846049 CAATTGTTTCTGTTGATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATGC 318 CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * 21846093 TAATTTATTAATATTCCAAAAATT---AA-T-A-AGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * * * 21846152 AAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTG-ATAAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGT 65 CAGTTCAAATA---ATTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTAT * * * * * 21846216 TGTGTCATAAAATAATTGCTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT 126 TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT * * * * * * 21846280 TAA-AATTCTAAAAGTTAATATGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAA 190 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AGTTCAA * * * * * * * * 21846343 ATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAA 253 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA * * * ** * * * 21846408 CAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATAC 318 CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * ** * * * ** 21846452 TGATCTATTAATATTTTGAAAGTT---AA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTTTTTA-CAAAAT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * * * 21846512 AGTTTAAATAATTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTCGT 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT ** * * * * * 21846576 CATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACCAATTTAATAATAT 131 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * ** 21846641 TCCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA 196 TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAATAGTTCAAATAGTTA * * * * * * 21846702 AGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTTTGACCTGTTG-TTTAGTCATAAAACAATTA 260 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTA * * * * 21846766 TTTTAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC 324 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * *** 21846804 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATG-ACTAAGAGATTT-TAAAA-AAATCTATTTATTGAA 1 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-GAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * 21846865 CAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCATTA-GACCTTTTGTT 64 CCAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAACTTTTATT * * *** * 21846927 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTA 127 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * * 21846992 ATTTTTCAAAAATTAAAAAGCAAGTTATGACTATTTGAATAAAT--ATCAATCT--CAAATCA-T 192 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG--A-G---ATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AGT * * * * * * * * ** * 21847052 T-ATGAT-CTT-TG--TTTTCTCATAAAATAAT-TATTTCAGATCATTCAAG-CCTATTTGGATA 249 TCA-AATAGTTATGACTATT-TGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT-TTTGTTTT ** * * ** * * 21847110 AAAATAATACTAATTTAATAAT-A-TTC-TA-AAAATTAGT-AAGAGATTTAAAAAAATAAAT 309 ATCATAAAAC-AA-TT-AT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAA-A-A--TAAAATAAT--AT * * * * * * * ** ** 21847168 GT-ATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAA-AACTATTAGAATAATTTTTAATTTCAAATCATT- 1 -TAATTT-ATTAA-TATTTCAAA-AATTAAGAAGTA--AG-A-GATTTAAAAAAT-AAAT--TTG * * ***** * ** * * * * * 21847230 CTAACCTTTTGTTTAG-TCATAGAATAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTACTCGCAATT-AAA 55 TTTACC---AAACCAGTTC--A-AATAATTATGACTATTTGA-ATAA--TTA-TC-TATTTCAAA **** * * * ** ** * **** * 21847292 AAAATACT-AATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATA-AATTTGT 109 TCGTTA-TGAACTT-TT-A-TTTTG--TCA-TAA-AA-CAATTG-TTTCAGTTCATATAA---GC * ** * * * * * * 21847355 TTA-CTGAACA-AATTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATGTAAAATCATTATGAG 161 TTATTTGAA-ATAAAAT-AATACTAAT--TTA-TT-AA-TATT-TC-A---AAAAT--TAATAAG **** * * * * * * * * ** ** 21847418 CTTTTGTTTTGCCATAAACAATTGT-TTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA 212 CAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTA--CCA-AATAG--T-T-C-AAAT-AGTTATGACTA * * * * * ** *** ** * * 21847482 -TTG---TATTA-ATATTTCAAAAGTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTCAAATAATTA 266 TTTGAACAATTATCTATTTC-AAA-TCATTATGACCTTT---TGTTTTATCA--TAAAACAATTA ** * * * ** * ** 21847542 TGGCCA-TTTAAACAA-C-TA-TCGATTTCAAATTGTTAT 324 T-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATAT ** * * * * * * * 21847578 TACATTT-TGTTTTCTCCTAAAACAATTGCTTTTCAATAGAG-AACCATATTCGAAATAAAATAA 1 TA-ATTTAT-TAATAT-TTCAAA-AA------TT-AAGA-AGTAA-GAGATT--TAA-AAAATAA * ** * * * * * * * * 21847641 TACTAATTTA--ATAA-TATTTCAAGAATTAA-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG 50 -ATTTGTTTACCA-AACCAGTTC-A-AA-TAATTATGACTATTTGAATAAT-TATCTATTT--C- ** * *** * 21847701 AACCAATACAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTAT-ATATTTCAAATTGTTATAACCTGTTA 106 -A--AAT-C-----GTTATGAACT-TTT--A-TTTTGTCATAAAAC-AATTGTT-T---CAG--- * * * * * * ** * * 21847764 TTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAACCT-ATTCGAATAAAATAATACTAATTTAG 150 TTC-AT-AT-AAGC---T-TATTTG---AAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATA-T--TTCA- * * * * * 21847828 TAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAGTTCAAA 200 -AA-AAT-T---AA-T-A-AGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAA * ** * ** * 21847893 TAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAAC 254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC * * * * * * * ** * 21847958 AATTGTCTT-TGTTAATATATGTTTGTTTGAAATAAAATAATAC 319 AATTAT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * ** * * * 21848001 TAATTTATTAATATGTTAAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTAAATTTGTTTACTAAA 1 TAATTTATTAATAT-TT-CAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * 21848066 CCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTATTT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTATTT * * * * ** ** 21848130 TGTCATCAAACAATTGGTCCTGTT-ATACT-ATTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTAAG 128 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-TAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATT * * * * * ** * * 21848192 AATA-TTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACCAATTCAAA 191 AATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAA * ** * * ** * * 21848256 TAGTTAAGACTATAGGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTATCGTAAAA 254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAA * * * * ** * ** 21848321 TAATTATTTTA-TTCATAGATGCTT-TT-TTATTAAAATAATGC 318 CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * ** ** * ** * * 21848362 TAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAATATGTTTTTTTGTCGAATC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * ** * * * * * * * * * 21848427 AGTTTAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCT-AACCTTTTGTTTTA 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTTG * * * * * * * 21848491 TCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAATTAATACTAAGTTATTAAC 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * 21848555 A-TTCAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAACGAACA-AGCTCAAATA 194 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-ACCAA-ATAGTTCAAATA * * * * * * 21848618 GTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTG-ATTAGTCATAAAACA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACA * * * * * ** * 21848682 AATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATAC 320 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * ** * 21848724 TAATTTACTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAT 1 TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * ** * * ** * * 21848788 TAGTTAAAATAATTAT-AGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTT 65 CAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTT * * ** ** * ** 21848852 ATCATAAAACAATTATTTTTGACCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT 129 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * * * 21848917 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-GAAAATAAATATGTTTACTAAGCTAGTTTAAATAGT 194 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA-ATAGTTCAAATAGT * * * * * * * 21848981 TATGACTATTTGAATAATTAT-TAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTTGTTTTGTCAGAAAACAA 258 TATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAA * * * * **** * 21849043 TTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAATAC 321 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATAT * ** * * * * ** * * 21849084 TAATTTAATAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTATTTACTGAGCT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * ** * * * 21849149 AATTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTTGAATCGTTCT-AACCTTTTGTGT 66 AGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTT * * * * * ** * * * * * * 21849211 AGTCATAAAATATTTATGTCACATCTTACATGCTTATTCGGAATAAAATAAT-CTAAATTTACTA 128 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA * * * * * 21849275 ACATTT-AGAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCA 192 ATATTTCA-AAAATTAATAAGCAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTATTTAC-CAA-ATAGTTCA * * * * * 21849337 AATAGTAATGACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGA-CATAA 252 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAA * * * * * 21849401 AATAATTTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAC 316 AACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * ** * 21849447 TAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACTGAACA 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * ** * * * * * * ** 21849509 AATTCAAATTGTTATGACTATTCGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTCAT 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT * * * * * 21849574 CATAAAACAATTATTTGAATTCATATAAGCTTA-GTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA 131 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * * 21849638 TTTCAAAAATTAATAAGCGAGTGATTTAAAAATTGAATTTATTTACCAAATCAGTTCAAATAATT 195 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AGTTCAAATAGTT * * * * * * ** * 21849703 AATG-CCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT 259 -ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT * ** * * * ** * 21849767 GTTTTTGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAG 323 ATTTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * 21849806 TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAGAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * ** * * 21849871 CAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTAAAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTT 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTT * * * ** * * ** 21849934 TATCATAAAACAGTTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAA 128 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA * ** * * * * * * * 21849999 TATTCCAAAAATTAATAATTAAGATATCTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAA 193 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAG * * * * * 21850064 TTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAGCAAG 257 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA- * * * * 21850122 TT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAT 321 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * 21850162 GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAGAT-AATTCTATTTGCCTAAC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAAC * * ** ** 21850226 TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATG-ACTTTTGCTTTG 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * * * * * 21850290 TCATAAAACAAATGTTTTC--TCCATATAAG-TT-TGTTCAATATAAAATAAAACTAATCTATTA 130 TCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTAT-TTGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTA * * ** * 21850351 ATATTTCAAAAGTTAAT----AATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAAAA 192 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATA * * * ** ** **** * * * 21850412 GTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCACCTGTTACAAAACAA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * * * **** * 21850477 TAATTT-ATGTTCATAAAAACTTATTCGGGTTAAAATAATAC 321 TTATTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * ** * * *** * 21850518 TATTTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTGAA-A-ATTTTTTAAATAAATATGTTTACCAAAC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * * * * * * 21850581 TAGATCAAATAGTTATGACCATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * * * * * ** * 21850646 TCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATCAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA *** ** * * * * * 21850711 TTTTGCAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATT 195 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTT * *** * * ** ** * 21850776 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTT 259 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA * * 21850841 TTTCTGTTCGTACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA- 324 TTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT * * * * 21850878 CAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGACCAA 1 TAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACCAA * ** * ** * * * * 21850941 ACAAGTTCAAATCTTTGTGACTAACTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTAGTT 63 ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTA-TT * * * * * * * * 21851005 TTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGCATTAAAATAATATTAATATATA 127 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT * * * * * * * * 21851069 AATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCA-AGTTCAG 191 AATA-TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-A-AATAGTTCAA * * * * * 21851132 ATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCT-TTTCAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTGTAATAAA 253 ATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA * * * * * ** * * 21851195 ACAATTGTTTTAATTCATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAACAC 317 ACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * ** 21851240 TAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATG-AGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTACTGAA 1 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-GAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * * ** 21851303 -CATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCGTTT 64 CCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTT * ** * ** 21851367 TGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAATCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATT 128 TGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATT * * * * * * * * * * * 21851430 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAACAAATATGTTTTCTAGACACGCTCAAAT 191 AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATA-GTTCAAAT * * * ** * 21851494 ATTTGTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTGTCAT-AAACT 255 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC- * * * * *** * * 21851558 AATTGTTTCTGTTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATACTAC 319 AATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * * 21851601 T-ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAACAAATCTATTTACTAAG 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * * * * 21851665 CGAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTT * * ** * * 21851730 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTATACAATTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTCATTAA 129 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * *** * * * ** 21851794 TGTTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATATATTCATTGAACA-AGTTCAAATA 193 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAA-ATAGTTCAAATA * * * * * ** * * * * 21851858 GTCATGTCTGTTTGACCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAAC-G 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * ** * 21851922 TTATTTCTA-TTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAC 321 TTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * 21851963 TAATTTACTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * * * * * 21852024 GGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTAT 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT * * * * * * * 21852088 CATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA 131 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * * * 21852152 -TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCAAAACCAGTTCAAATAGT 195 TTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGT * * * * * ** * * 21852216 TAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCTTTTG-TTTAGAAATAGAATAAT 258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAAT * * * * * 21852280 TTTTTTAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATAA 322 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * ** * * * ** * 21852320 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAA 1 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAGAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * ** * 21852384 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TAT-AACCTTTTGT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGAA-CTTTTAT * * * * * * * * 21852446 TTTATCATAAAACGATTGTTTCAGTTTATAAAAGTTTATGTGAAATAAAATAATATTACTTTATT 126 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT * * * * 21852511 AATATTTCAAAAATTGAA-AAG-ATAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCAAATCACTTCA 191 AATATTTCAAAAATT-AATAAGCA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAAT-AGTTCA * * * * * * * * * 21852573 AATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTATTTTGTCATAAA 252 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA * * * * * 21852638 ATAATTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAG 317 ACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * 21852681 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTACCGAA-C 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * 21852745 ----C-AAT--TT-T---TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTG 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTTG * * * * * * * * 21852798 TTATAAAATAACTGTTTTAGTTCATATATGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * * *** * * 21852863 TTACAAAAATTGATAA-CTAAGAGATTTAGAAAACAAATTTTTTTGTTAAAGTGGTTCAAATAAT 195 TTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGT * * * * ** * ** * 21852927 TAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAAT 258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT * * * * *** * 21852992 TTTTTTA--TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATAC 322 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * 21853030 TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAATAAATCTGTTTACCAAGCT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC ** * * ** * * * * 21853093 AGTTCAAATACGTA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTCTG 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTTG * ** * * * * * 21853155 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAATCTTGTTT-AGAATAAAAT-ATATTAATCTAATAAT 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * * 21853218 A-TTCTAAAAATTAATAA-CTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAGTTTAAATA 194 ATTTC-AAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAAATAGTTCAAATA * * * * * * 21853281 TTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAGCATAAAATAA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * * * * * * *** * 21853346 GTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTTTTTGGAATAAAATAAAAT 321 --TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * 21853389 GAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTT-AAAAAT-AATTCTATTTACCTAAC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAAC * * * * * * * 21853448 CAGTTCAAATAACTATGACTATTTTAACAATTATCTTTTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * * ** * * * * * * * 21853513 TCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATAGTAATCTGTTAATA 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA ** * * * * 21853578 TTTTGAAAATTACT----AAGAGATTTAAAAAATCAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTT 195 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTT * * * * * * 21853639 ATGACTATTTGAGCAATTTTTTATTTCAAAT-AGTTATGA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAATAAT 259 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTT-TTGTTTTATCATAAAACAAT * * * * * * * 21853702 TATTT-TGTTCATATAAGCTAATTTAGATTAAAATAATAC 322 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * *** * 21853741 TAATTTATTAATATTTCAATAACTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATATGTTTATTGAACT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * 21853806 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-AC--CT-TTTTG- 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT ** * 21853866 -----------T-TTT--G-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATAT 131 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * * * * * * 21853916 TAT-GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAGCA-ACTTTAAATAAT 196 T-TCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCA-AATAGTTCAAATAGT ** * * * *** * ** 21853979 TATGACTATTCCAATAGTT-TCCCT-TTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTTGTTTTGTCATAAAATG 258 TATGACTATTTGAACAATTAT--CTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACA * * * *** * 21854041 ATTTTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAA 320 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * 21854083 AAATTTATTAATA--T-AAAGACACTTAATAAGTAA-ATCATTTAAAAAATAAATTTATTTACCA 1 TAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAAGAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA * * * * * ** * 21854144 AACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTTTTATG-ACTTTTTGT 62 AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTAT * * * * * * * 21854207 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCGTACAAGCTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTAT 126 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTAT * * * * *** 21854271 TAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAA-AAATGT-TTTTTGAACA-AGTTC 190 TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAA--AA-AATAAATCTATTTACCAA-ATAGTTC ** * * * * * * 21854333 AAATAGTCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTCTGTAATAA 251 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAA * * * * * ** * 21854398 AACAACTATTTTAGTTTATATAAGCATATTTGAAATAAAATAATAC 316 AACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * *** 21854444 CAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATG-AGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAA- 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * 21854507 CATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG-ACATTT-TTTT 65 CA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTT * * * * 21854569 GTCATAAAATAATTGGTTCTA-TTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTA 129 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA * * * * * * * **** * 21854632 ATCTTTGAAAATTTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTGAACACGTTCAAAT 192 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAATA-GTTCAAAT * ** * * * 21854696 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-AAACCA 255 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA * * * * *** * * 21854760 ATTGTTTCTGTACATAAAAGCTTATTTGGAGTAAAATAATAA 320 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * 21854802 TAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAGAAAATAAATCTGTTTACCAAGC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * * * * * 21854867 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATCGCTATGATCTATTGTTTTG 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * * * * 21854932 TCATGAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATGCTAACTTATTAAT 130 TCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * *** * * 21854996 A-TTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAAGT-TATTCACCGAACA-AGTT-AAAT 194 ATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACC-AA-ATAGTTCAAAT * * * * * * 21855057 AGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA- 255 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC * ** * 21855120 AATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAC 319 AATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * ** * * * * * 21855163 AAATTTATCAATATTTTGAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * ** * * ** * 21855224 AGTT-ATAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATG-TTTTTTGTTTTG 66 AGTTCA-AATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * * * * * * * * * * 21855287 TCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGT 130 TCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * *** ** * 21855351 A-TTCTAAAAATTATTAA-C---AGATTTAAAAAATAAATATCTTTGTTGAACCAATTCAAAT-G 194 ATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAAATAGTTCAAATAG * * * * * * 21855410 ATTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTTATAAAATA 257 -TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACA * * * 21855474 ATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATAT 320 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * ** * * * ** 21855516 TAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAATAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * * * *** * * 21855580 AAGTTCAAATAGTTACGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTT 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGAACTTTTATTTT * * * * 21855644 ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAA 129 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * * * * 21855708 TATTTCAAAAATTGACAAGTTAA-AGATTTAACAAATAAGTC-AGTTTATCGAATTGGTTCAAAT 193 TATTTCAAAAATTAATAAG-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTA-CCAAATAGTTCAAAT * * * * * * * * * * * 21855771 AATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTATTTCATTATAAAATA 255 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA * * * 21855836 ATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAT 320 A-T-TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * 21855878 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTTATTTACCAAACC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * ** * 21855943 -G-GC---------T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTAT-AACATTTTATTCTG 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTATTTTG * * * * 21855995 TCATAAAATAATTGTTGT-AGTTCATATAAACTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAA 130 TCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * * * * * 21856058 TA-TTCCAAAATTAACAA-CTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAGCAATTCAAACA 193 TATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGTTCAAATA * * * * * * * * 21856121 ATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * 21856186 TTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAT 321 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-AT * * * * * ** * * 21856228 AATAATTTATTAATGTTAT-GAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAACCTGTTTATCGA 1 --TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA * * *** * * * 21856292 ATCAGTTCAAATAATTATG-GTCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTT-TT 63 ACCAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATT * * * * * * 21856355 CTGGTCATATAACAA-T-TAT-AGTTGAAAATGCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT 127 -TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT-CATAT--AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT * * * 21856417 ATTAATCTTTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTATCAAACTA-TCT 188 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGT-T * ** * * * ** * 21856480 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGCATTGTCATA 250 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATA ** * * * 21856545 AAACAATTATTTTTGTTCATATAAGATTATTCGAAATAAAATAATAT 315 AAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * ** 21856592 TGATCTAATAATATTTAAAAAATTAACAAG--AGA-A-TT-AAAAA-AAA-TTGTTTGCCGAATT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * ** * * * 21856650 AGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTATTTTG 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTATTTTG * * * * * * * * 21856714 TCATAAAATATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAGA-ATTAATTTATTAA 130 TCATAAAACA-ATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAA * * * * * * ** * * 21856778 TATTTCAAACATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATGTAACTAGTTCAAATAA 193 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAATAGTTCAAATAG * * * * * * * * 21856843 TTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAA 257 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT * ** * * * * * * 21856908 TGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATCGAAATAAAGTAATAC 322 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * 21856948 T-ATTCTATTAATATTTCAAATATT---AA-TCAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA 1 TAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * ** * * * * 21857007 CTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTATTT * ** * * * * 21857071 TGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTT-AGATTAAAAAAATACTAATTTATTA 128 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * * * * * * * 21857135 ATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATA 192 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAATAGTTCAAATA * * * * * * * * 21857200 ATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * * * * * 21857265 TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTGAGAATAAAATAATAC 321 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * *** 21857306 TAATTTATT-A-A--T----AA-T----A--AAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAA-C 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * ** * 21857355 ATGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTAT-AACCTTTTGTTTT 66 A-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTT * * * * * * 21857419 GTTATAAAAGAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAA 129 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * ** 21857483 TA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAAT 193 TATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AGTTCAAAT * * * * ** * 21857546 CA-TTATGACTATATGTGCA-AATTATTTATTTTAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAA 255 -AGTTATGACTAT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA * * * * * 21857609 ACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATAC 317 ACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * ** 21857654 TAATTTATAAATATTTCAGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTT-GTAGA 1 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAGAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-A * * * * * * * 21857717 ACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTCTTT 63 ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTT * * * ** * * 21857782 TGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAA 128 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * ** * 21857847 TATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTAATGAAAAAGTTCAAATA 193 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTT-ACCAAATAGTTCAAATA * * * * * 21857911 GTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * * * * * 21857976 TTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTTTTCCAAATAAAATAAT-T 321 TT-ATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * * * ** 21858016 TAAAATTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAA- 1 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC * * * * 21858079 CATATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTT 65 CA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTATTT * * * *** * * * 21858143 TCTCATAAACCCATTGGTTTTTTTTCATAAAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA 128 TGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * *** 21858208 A-ACATCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAA 192 ATA-TTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAATAGTTCAAA * * * ** * * * 21858272 TAGTT-TGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC 254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC * * ** * 21858336 AATTGTTTCTA-TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATAC 319 AATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT ** * * * 21858379 TAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAACGAAAATTGTTTACAAAATC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * 21858440 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATG-A-TCTTGTTTTGT 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT * * * * * * ** * 21858503 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGATTATTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATA 131 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * ** * 21858567 TTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTT 195 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAATAGTTCAAATAGTT * * * * * 21858628 AAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTC-TTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATT 259 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT * * * * * 21858692 GTTTTAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATAC 323 ATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * * 21858731 T-CTTGTACTAACA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAA 1 TAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAA * * * * * * * * 21858793 ACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT-AACCTCTTGTT 63 ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATT * * * *** * * 21858857 TTATCATAAAA-AATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTA 127 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * ** * *** * 21858921 ATATTTCAAAAATTGAGAAG-TTGAAGATTTAAAAAATAAATC-AGGTTATTGAATCAATTCAAA 192 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAAT-AGTTCAAA * * * * * 21858984 TAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA 254 TAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA * * * * 21859048 CAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCTAAATAAAATAATAC 318 CAA-T-TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * * * * 21859092 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTA-TAGAAT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AAC * * * * * * 21859156 CAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTAT-AATCTTTTGTTTT 65 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTT * * * * ** 21859220 GTCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATACAATAATACTAATCTAACA 129 GTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * *** * * 21859283 GTATTAT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGCTTTAAAAAATAAAAT-TTTTTATTGAATCAATTTAA 192 ATATT-TCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCAAAT-AGTTCAA * * * * ** * * 21859345 ATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTCTTAAAA 253 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA * * * * * 21859409 TAAATGTATTT--GCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATAT 318 -CAAT-TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * 21859453 TAATTTATTAATATTTTAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTATTTACCAAACC 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * * * * 21859514 AGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-AACCATTTGTTTT 66 AGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTT * * ** * ** * 21859577 GTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTGATACT-CTCTTATTTGAAATAAAGTAATGTTAATTTGTTA 129 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * 21859640 ATA-TCCTAAAAATTATTAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTTCACC-AATAG-- 192 ATATTTC-AAAAATTAATAAGCAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTA-T---TT-ACCAAATAGTT * * * * * * * * 21859700 -AAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCAC 250 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT * * * * * 21859763 AAAATAATTTTTTCTA-TTCATACATGCTTATTTC-AATTAAAATAATAC 314 AAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT * * * *** * * * 21859811 AAATTTATTAATATTT-AGACAACTAATTGGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA 1 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAGAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA ** * * * * * 21859875 TAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-AA-TTTT-TTTT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTT * ** *** * * * * 21859937 TTCATAAAATTATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTT-AGATTACAATAATATTAATTTATTAA 129 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * **** * * * * * * * 21860001 AATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATATGTTTATCGAACA-AGTTCTAATA 193 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAA-ATAGTTCAAATA * * * * * * * 21860064 GTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAA 256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA * * * * * * 21860129 TTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAAAATAAAATAAT-T 321 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT * ** * * * *** 21860169 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATG-AGTAAGAGATTT--ATTATGAATCTATTTATTGAA 1 -TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA * * * * * * * * 21860231 CAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTT 64 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTT * * 21860296 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT-TCAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA 129 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAT-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA * * * * * 21860359 ATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAAT 192 ATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AGTTCAAAT * * * * * * 21860423 AGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA 255 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA * * * * 21860488 ATTGTTTCTGCTCATAC-AGAATTATTCAAAATAAAATAATAT 320 ATTATTTCAGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATAT * * * ** * * * * ** * 21860530 CAATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAA--AAG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTACTGAACT 1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC * * * * * * * 21860591 AATTCAAATATTTATGACTTTTTG-ATCAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTG 66 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG * ** * * * 21860654 TCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGAA-AATACTAATTTAATAAT 130 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAAT 21860718 A 194 A 21860719 AAAAATAAAT Statistics Matches: 13722, Mismatches: 3227, Indels: 1938 0.73 0.17 0.10 Matches are distributed among these distances: 337 45 0.00 338 2 0.00 339 2 0.00 340 7 0.00 341 119 0.01 342 85 0.01 343 1 0.00 344 1 0.00 345 13 0.00 346 25 0.00 347 205 0.01 348 248 0.02 349 291 0.02 350 95 0.01 351 311 0.02 352 432 0.03 353 292 0.02 354 101 0.01 355 614 0.04 356 974 0.07 357 914 0.07 358 949 0.07 359 1277 0.09 360 971 0.07 361 1524 0.11 362 1838 0.13 363 942 0.07 364 324 0.02 365 158 0.01 366 24 0.00 367 10 0.00 368 4 0.00 369 3 0.00 370 7 0.00 371 8 0.00 372 2 0.00 373 14 0.00 374 9 0.00 375 6 0.00 376 21 0.00 377 34 0.00 378 22 0.00 379 13 0.00 380 9 0.00 381 8 0.00 382 8 0.00 383 10 0.00 384 3 0.00 385 4 0.00 386 12 0.00 387 6 0.00 388 3 0.00 389 8 0.00 390 19 0.00 391 9 0.00 392 10 0.00 393 11 0.00 394 13 0.00 395 9 0.00 396 23 0.00 397 6 0.00 398 11 0.00 399 6 0.00 400 9 0.00 401 9 0.00 402 2 0.00 403 4 0.00 404 11 0.00 405 3 0.00 406 14 0.00 407 5 0.00 408 14 0.00 409 23 0.00 410 41 0.00 411 39 0.00 412 37 0.00 413 18 0.00 414 10 0.00 415 29 0.00 416 17 0.00 417 16 0.00 418 9 0.00 419 1 0.00 420 9 0.00 421 24 0.00 422 16 0.00 423 32 0.00 424 55 0.00 425 78 0.01 426 19 0.00 427 11 0.00 428 13 0.00 429 4 0.00 430 13 0.00 431 8 0.00 432 4 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (361 bp): TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGT CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAGTTCAAATAGTTAT GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT TCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT Found at i:21845118 original size:539 final size:534 Alignment explanation

Indices: 21842436--21865914 Score: 9868 Period size: 539 Copynumber: 43.4 Consensus size: 534 21842426 TTTAAATCCT * * * 21842436 TAATGCTAATTTATTAATC-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTA 1 TAATACTAATTTATTAA-CATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * * * 21842499 CCAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATTTAAACAATTGTATACTTGAAATCGTTATAACCTTTT 64 CCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * ** * * ** 21842564 GTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGCA 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTA * * * * * * * * 21842629 ATAGTATTCCTAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTTGTAGAACCAGTTCA 193 TTAATATT-TTAAAA--ATTAA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCA-AACCAGTTCA * * * * 21842693 AATAGTTAAGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAA 253 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAA * * * ** * 21842758 ACAACTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAATG--AATTTATTAATATT-TC 318 ACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT--AATGCTAA-TTAATAATATTCT- * * * * 21842820 AAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGA 379 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TTTGTTT-GCTGACTAGTTCAAATAGTTATGA * * ** * * * * * 21842885 CTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAAATGTTTT 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * * * 21842950 TGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAA 507 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * 21842978 TAATACTAA-TTATTTACATTTTGAAAATTAATAGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACA-TTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * ** 21843042 CGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATGACCTTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * 21843107 TTTTCATCATAAAACAA-TCTATTTGTTC--AAAA--TTATTTAGAATACAAC-AATACTGATCT 129 TTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATA-AACTAATACTAATTT * * * * * * * * * * 21843166 ATTAATATTTTGAAAACTCATAAGAGATTTAAGAATTAAATTTGTTCATG-AAAACAGGTT-AAA 192 ATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-GCAAACCA-GTTCAAA * * * * * 21843229 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCCTCAAATTGTTATGA-TATTTATTTTGTCATAAAA 255 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAA * * * * * * * * 21843293 CAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTGTTTAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATTTTCCAAAA 319 CAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTAAAA * * * * * 21843358 ATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAATAA-GTGTTTGTTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT 383 ATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT * * * * * 21843422 TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCCTTT-TTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGT 446 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GT * * 21843485 TCATGCAAGCTTATTTAAAATAAAA 510 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * ** * 21843510 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATTTG-AAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * 21843575 CTAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-AAAGACGTTACGAACTT 64 CCAAAC-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-TCGTTATGACCTT * * * ** ** * * 21843638 TTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTT 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT * * * * * * * * 21843703 TACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT--TAACTAAATCTGTTTATCAGACCAGTTT 191 TATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTC * * 21843766 AAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA * * * * * 21843829 AAACAA-TTTTTCTATCCATACAAGTTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCT- 316 AAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCT-AATTAATAATATTCTA * * * * 21843892 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACGCA-TTCAAATAGTTAAGA 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-AC-TAGTTCAAATAGTTATGA * * * * ** * 21843956 CTGTTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTC 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * * * 21844021 AGTTCATACATGCTTATTTGAACTAAAA 507 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * 21844049 TAATACTATTTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGC-AAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA * * * * 21844113 CCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT 64 CCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * ** ** * * * 21844178 ATTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAAT-AACATAATATTACTTT 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAC-TAATACTAATTT * * * * ** 21844242 GTTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTG-GAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATTAGTTC 192 ATTAATATTTTAAAAATT---AA--TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTC * * * ** * * 21844306 AAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATGCCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGTCATAA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * * * * 21844371 AACAATTGTTTT-TCA-TCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTACTAATATT-T 317 AACAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCT * * * * * ** 21844433 CAAAAATTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATG 379 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTT-GCTGACTAGTTCAAATAGTTATG * * * * 21844498 ACTATTTAAACTATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT 441 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT * * 21844563 ATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA 506 CTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * 21844592 TAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAGTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * * * 21844657 CAAAGCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG 65 CAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * 21844722 CTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATATTAATTTAT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTAT * * * 21844787 TAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAATTAGT 194 TAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAATAGT * * * * * * * 21844852 TATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTAATAAAATAGTT 259 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT * * * * 21844917 TTTTCTATTAATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTAATTAATATTCTAAAAATGA 324 TTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTAA-TAATATTCTAAAAATTA * * * * * * * * 21844981 ATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCTTGACCAATGCAAATAGTTTTGATTGTTTGA 387 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGC-TGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA ** * * 21845046 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCCTA 450 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA * ** * 21845111 TAAGCTTATTCAAAATAACA 515 CAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * 21845131 TAATTCTAATTTATTAATTAGTTTTGATTGTTTGAACATTTATCTATTTTAAATCATTATGACCT 1 TAATACTAATTTATTAA-CA--TTTGA-------AA-A-TTA---A---T-AA-C--TAAGA--- * * * * * * ** 21845196 TTTGTTTTGTCACAAAA-CAATTGTTTTGTTCCTATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATT 41 ---G-ATT-T-AAAAAATAAATT-TGTT-TACC-A-AACAG--TT-----C-AAATAG--TTA-T * * * * * * * ** * 21845260 GAATAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTG 85 GACT-ATTTGAACA-A-TTAT--CTATTTGA---AAT-CGT-TATGACCTT--T-T----GTTT- * ** * * * * * * * * * * 21845324 TTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGATTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTA 132 TATCATAAAACAAT--TGTTTT-TGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAACTAATACTAATTTA * * * * ** * 21845388 TTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-AAACTCTATTTACCAAATAAATTC 193 TTAATATTTTA-AAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTAGCAAACCAGTTC * ** * * 21845451 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCAAAA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * * * * ** * 21845516 AATAATTTTTT-TGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCA 317 AACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCT-A * * ** * * ** * * * 21845579 AAAATTAATAAGAAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAAC 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTT-GCTGACTAGTTCAAATAGTTATGAC * * ** * * ** * * 21845644 TATTTGAATAATTATCGATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCT 443 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT * * * ** 21845709 GTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAA 508 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * * 21845736 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAATATAAATCTATTT- 1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * * * 21845799 ------A--TCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTGTTTCAATTCATTATGACATTTTG 64 CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * * 21845856 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAACTAATACT-AATTT ** * * * * * * 21845919 ATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAATTT-TAAAATAAATCTATTT-TCTGAA-CATATT 192 ATTAATATT-TTAAAAATTAAT--G-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCA-GTT * * * 21845981 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA 251 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA * * * * * * * * 21846046 AACCAATTGTTTCTGTTGATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCCA 316 AAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTA * * * * * * 21846111 AAAA-T--TAA-T-A-AGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTA 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATTTGTTTGCTGA-CTAGTTCAAATAG---TTA * * * * * * 21846170 TGCCTATTTGATA-AATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATT 439 TGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT * * * 21846233 GCTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAA 502 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * ** * * * * 21846266 TAATACTAATTTATTAAAATTCT-AAAAGTTAATATGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAA-TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * * * 21846329 CCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTT 64 CCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * * * * * * * 21846394 GTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAA--TTATTTAGAATAAAATAATACTGATC 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT--AAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT * * * * * * ** * 21846457 TATTAATATTTTGAAAGTTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTTTTTA-CAAAATAGTTTAAAT 191 TATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAAT * * * * * * * 21846521 AATTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTCGTCATAAAACA 256 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACA * * * * * * 21846585 ATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCGAATTAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAA 321 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTAAAAA * * * * 21846649 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-ATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT 384 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCT-G-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT * * * * * * * * * 21846709 TAGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAAT 446 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GT * 21846773 TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAA 510 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA ** * * * * * 21846798 TAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGACTAAGAGATTT-TAAAA-AAATCTATTTAT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC ** * 21846861 TGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCATTA-GACCTTT 65 CAAAC-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-TCGTTATGACCTTT * ** ** * * * 21846923 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTT ** * * ** * * 21846988 ATTAAT-TTTTCAAAAATTAAAAAGCA-AGTT-----AT-GA-CTATTTGAATAAATATCAATCT 192 ATTAATATTTT-AAAAATTAATGAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT--AGCAA-ACCAGT-T * * * * * * * 21847044 CAAATCA-TTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAATAAT-TATTTCAGATCATTCAAG-CCTATTTG 251 CAAAT-AGTTATGA-C----TATT-TGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACC-ATTTG ** **** * * ** ** ** * * * 21847106 GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTC-TA-AAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAAT--AAA 306 TTTTGTCATAAAAC-AATTT-TTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTG-GA-ATAAAATAATGCTAA * * * * * * 21847167 TGT-AT--T-TGCTGAACCAGTTCAA-ATAGTTAA-A-ACTATT--AGAATAATTTTTAATTTC- 366 T-TAATAATATTCT-AA-AAATT-AATA-AG-TAAGAGA-T-TTAAAAAATAATTTGT--TTGCT * * * ** * ** * * * * * * ** * * 21847222 AAATCA-TTCTAA-CCTTTTGTTTA-GTCATAGAATAAT-TGTTTTAGTTCA-TACAAGCTTACT 421 GACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT--T * ** ** * * ** 21847282 CGCAATT-AAAAAAATACTAATT-TATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAG-AGATTTG-AA- 482 TG-TTTTGTCATAAA-AC-AATTGT-TT--C--T-G-----TTCAT-A-CAAGCTTATTTGAAAT 21847342 AAAA 531 AAAA * ** * * * * * 21847346 TAA-ATTTGTTTACTGAACAAATTTGAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCAATGTAAAAT 1 TAATACTAATTTA-TTAAC--ATTTGAA-AATTAATAACTA--AG-A-GATT-T-AA---AAAAT * * **** * *** * 21847409 CATTATGAGCTTTTGTTTTGCCATAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA 53 -A--A--A---TTTG-TTTACC--AAACAGTTCAAATAGTT-AT--GA-C-TAT--TTGA-ACAA * ** * ** * * ** * 21847474 TAATACTA-TTGTATTAATATTTCA-AAAGTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTCAAAT 99 TTAT-CTATTTG-A--AATCGTT-ATGACCTT--T---TG-TTT-TATCATAAA--A---CAATT ** * ** * * *** * * * * * * * 21847537 AATTATGGCCATTTAAACAACTATCGATTTC-AAAT-TGTTATTAC-ATTTTGTT-TTCTCCTAA 147 GTTTTTGTTCA--T-AA-AAGT-T-TA-TTCAAAATAAACTAATACTAATTTATTAATAT-TTTA * * * * * ** * 21847598 AACAATTGCTTTTCAATAGAGAACCATATTCGAAATAAAATAATACTAATT--TAATAATATTTC 204 AA-AA------TT-AAT-GAG-A-GAT-TT--AAAAAATA-AAT-CTATTTAGCAA-ACCAGTTC * * * * * 21847661 AAGA-A-TTAATAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATACAAATAGTTATGAC 252 AA-ATAGTT-AT--GACTATTTGAACAAT-TATCTATTT--C--A--AAT-C-----GTTATGAC * * * * * 21847723 TATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAAC-CTGTTATTCTA-TCATAAAACAATTG-TT 300 CATTTG------T-T-T-TGTC--A----TAAAACAAT-TTTTTCTATTCAT---ACAA--GCTT * ** 21847785 -TTTGTTCATATAAACCTATTCGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAA 344 ATTTG--GA-ATAAA---A-T--AAT--GCTAAT--T-A---A-TAATATTCTAAAAATTAATAA * * * * * * ** 21847849 CTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAA 391 GTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCT-GACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * ** * * * * * 21847914 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTT-TGTTAATATAT 454 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAA * * 21847978 GTTTGTTTGAAATAAAA 518 GCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * 21847995 TAATACTAATTTATTAATATGTTAAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTAAATTTGTTT 1 TAATACTAATTTATTAACAT-TT--GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT * * * * * * * * * 21848060 ACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTT 63 ACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT * * * * ** ** * * * * 21848125 TATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTGTT-ATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTT ** * * * * * * * 21848189 AAGAATATTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-GTCAAACCAATTC 192 ATTAATATTTTAAAAATTAAT----GAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAG-CAAACCAGTTC * ** * * * * * * * 21848253 AAATAGTTAAGACTATAGGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTATCGTA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-ATTTGTTTTGTCATA * * * * * * * 21848318 AAATAATTATTT-TATTCATAGATGCTT-TTT-TATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTA 316 AAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTA ** * * * * * * 21848380 AAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAATATGTTTTTTTG-TCGAATCAGTTTAAATGGTTAAGA 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-ATTTGTTTGCT-GACT-AGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * 21848444 TTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC ** * * 21848509 AATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAT 507 TGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * ** * 21848537 TAATACTAAGTTATTAACA-TTCAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGA-AAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * * * * 21848601 ACGAACAAGCTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTT 64 CCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * *** * * * * ** * 21848666 G-ATTAGTCATAAAACAAATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATT 128 GTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAACTAATACTAATT * * * * * * * * * ** 21848729 TACTAATACTTACTAAAATAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAATTAGTT 191 TATTAATA-TT-TTAAAA-ATTAA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCAGTT * * ** ** * ** * * 21848793 AAAATAATTAT-AGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCAT 251 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCAT * *** * * 21848857 AAAACAATTATTTT-TGA-CCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT 315 AAAACAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATT * * * * * * 21848920 -TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-GAAAATAAATATGTTTACTAAGCTAGTTTAAATAGTTA 377 CT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTGA-CTAGTTCAAATAGTTA * * * * * 21848983 TGACTATTTGAATAATTAT-TAATCTCAAGTCGTTA-AGA--TATTTGTTTTGTCAGAAAACAAT 439 TGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATA-ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT * * ** 21849044 TGTTTCTGATCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAAAA 501 TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAA * * * * * * * * * 21849078 TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTATTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC ** * * * * * * * 21849143 TGAGCTAATTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTTG-AATCGTTCTAACCTT 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-A-TTTGAAATCGTTATGACCTT * * * * * **** * * * * ** * 21849205 TTG-TGTAGTCATAAAATATTTATGTCACATCTTACATGCTTATTCGGAATAAAATAAT-CTAAA 126 TTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACT-AA * * * * * * * 21849268 TTTACTAACA-TTTAGAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACA 189 TTTATTAATATTTTA-AAAATTAAT---GAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACC * * * * * * * * 21849331 AGTTCAAATAGTAATGACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGA 247 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGT * * **** * ** 21849396 CATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA 312 CATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAAT- * * * * * * 21849460 ATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAATA-AATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTT 374 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTT * * * ** * * ** * 21849522 ATGACTATTCGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTA 438 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG *** * * * 21849587 TTTGAATTCATATAAGCTTA-GTCAAATTAAAA 503 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAA * * * * * * * 21849619 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-GAGTGATTTAAAAATTGAATTTATTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * * 21849683 CCAAATCAGTTCAAATAATTAATG-CCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTT 64 CCAAA-CAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT ** * * * ** * * 21849747 TGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT * * * * * * * * 21849811 TATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAGAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTT 191 TATTAATATTTTAAAAA-T--T-AATGAGAGATTTA-AAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTT * * * * * ** * * * * 21849876 TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTAAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCAT 251 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCAT * * * * * * * 21849940 AAAACAGTTATTTT-TGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTC 315 AAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAAT-TAATAATATTC * * * * * ** * * 21850004 CAAAAATTAATAATTAAGATATCTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAG 378 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAATTTGTTTG-CTGACTAGTTCAAATAGTTATG * * * 21850069 ACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAGCAAGTT-TT 441 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTT ** * * 21850126 TCAATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAA 505 TCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * * ** * * 21850156 TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAGAT-AATTCTATTT 1 TAATACT-AATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTT * * * * ** 21850219 GCCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGA-CTTT 63 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT * * * * * * * * * * * 21850283 TGCTTTGTCATAAAACAAATG-TTTTCTCCATATAAGTTTGTTCAATATAAAATAAAACTAATCT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTT * * * * ** * * 21850347 ATTAATATTTCAAAAGTTAATAATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAAAA 192 ATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAATA * * * * *** **** * * 21850412 GTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCACCTGTTACAAAACAA 257 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAA ** * * * * * ** * * * * * * 21850477 TAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCGGGTTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGATAATT 322 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTA-ATTAATAATATTCTAAAAATT *** * * ** * * 21850542 AATAAGTGAA-A-ATTTTTTAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTTATGACCATTT 386 AATAAGT-AAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTT-GCTGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * ** * * * 21850605 GTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTT-TAGTTC 448 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTC * ** 21850669 ATATC-AGCTTACTCAAAATAAAA 512 ATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * * * 21850692 TAATACTAAGTTATTAATATTTTGCAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACA-TTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * 21850757 CAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * ** ** * * * * 21850822 TTTTGTCACCAAATGATT-TTTTCTGTTCGTACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAACTAATACTAATTT * * * * * 21850884 ATTAATA--TTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGACCAAACAAGT 192 ATTAATATTTTAA-A-AATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-AGCAAACCAGT ** * ** * * * * 21850947 TCAAATCTTTGTGACTAACTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCA 250 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTT-GTTTTGTCA * * * * ** 21851011 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGCATTAAAATAATATTAA-TATATAAATATT 314 TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTA-AT-AATATT * * * * * * * * 21851075 TTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAGATAGTCT 377 CT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTGA-CTAGTTCAAATAGT-T * * * * * 21851139 -TGACTATTTGAATAATTATCT-TTTCAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG 438 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG * * * 21851202 TTT-TAATTCATATAAGCCTATTTGAAATAAAA 503 TTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * * * 21851234 TAACACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC ** * * * * * * * 21851299 TGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCG 65 CAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * ** * * 21851364 TTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAA-TCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGT-TTATTCAAAATAAACTAATACT-AATTT ** * * * * * * * * 21851427 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAACAAATATGTTT-TCTAGA-CACGCTC 192 ATTAATATTTTAAAAATTAAT--G-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCA-GTTC * * * * *** 21851490 AAATATTTGTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTGTCAT-A 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * * * * * * * * * 21851554 AACTAATTGTTTCTGTTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATACTACTATTTATTAAAATT-TCA 317 AAC-AATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTAATAATATTCT-A * * * * * * * * 21851618 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAACAAATCTATTTACTAAGCGAGTTTAAATAGTTATG 380 AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAA-TAATTTGTTTGCTGA-CTAGTTCAAATAGTTATG * * * * * 21851683 ACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT 441 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT * * ** * 21851748 CTATTTATACAATTTTATTCGAAATAAAA 506 CTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * ** ** * ** * * * * * 21851777 TAATACTAATTCATTAATGTTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATATATTCAT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC ** * * * * * * * * * 21851842 TGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTGTTTGACCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * * * 21851907 TTTTGTCATAAAAC-GTTATTTCTATTTATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-AAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTA * * * * * ** 21851970 CTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACTGGTTCAAATAG 193 TTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAATAG * * * * * * 21852035 TTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAAAAAT 258 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAAT * * 21852099 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATT 323 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATGCT-AATTAATAATATTCTAAAAATT * * * ** * * * 21852163 AATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAG 386 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGC-TGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG * * * * ** * * * 21852228 AATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCTTTTGTTTAGAAATAGAATAATT-TTTTTAGTTCA 449 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCA * * 21852292 TACATGCTTATTCGAAATAAAA 513 TACAAGCTTATTTGAAATAAAA * ** * * * 21852314 TAATAATAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAAC-AAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAAT-AACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT ** * * ** * 21852378 GTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TATAACCT 63 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGA-AA-TCGTTATGACCT * ** * * * * * 21852441 TTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCAGTTTATAAAAGTTTATGT-GAAATAAAATAATATTAC 125 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTAT-TCAAAATAAACTAATACTAA * * * * * * * 21852505 TTTATTAATATTTCAAAAATTGAAAAGATAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCAAATCAC 189 TTTATTAATATTTTAAAAATT--AATG--AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAGCAAACCAG * * * * * * * * * * 21852569 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTATTTTGTCA 249 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCA * * ** * 21852634 TAAAATAATTTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAG-TAATTTATTAATATT 314 TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-GCTAA-TTAATAATATT * * * * * * 21852696 -TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTACCGA--A---CCAAT--TT-T 377 CT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTGACTAGTTCAAATAGTTAT * * * * 21852752 ---TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAACTGTT 440 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT * * * * 21852814 T-TAGTTCATATATGCTTTTTTGGAATAAAA 505 TCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * ** * * * * ** 21852844 TAATACTAATTTAATAATATTACAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAGAAAACAAATTTTTTTGT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * ** * * * * * *** * 21852909 TAAAGTGGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTT 65 CAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-GAAATCGTTATGACCTTTT ** * * ** ** *** * 21852974 GTTTGGTCATATAACAATT-TTTTT-ATCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTA 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTA * * * * * * 21853037 TTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAATAAATCTGTTTACCAAGCTAGTTCAA 193 TTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAA * ** * * * * * 21853100 ATACG-TA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAA 254 ATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAA * * * * * 21853162 ACAATTATTTT-TGTTCATATAATCTTGTTTAGAATAAAATATAT--TAATCTAATAATATTCTA 318 ACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATA-ATGCTAAT-TAATAATATTCTA * * * * * 21853224 AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTG-TCGAACTAGTTTAAATATTTAAGA 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCT-G-ACTAGTTCAAATAGTTATGA * * * * 21853288 CCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAG-CATAAAATAAGTT-TT 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA-TTGTT * * * * * 21853351 TTTGAATTTATACTAGCTTTTTTGGAATAAAA 505 TCTG--TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * 21853383 TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTT-AAAAAT-AATTCTATTT 1 TAATACT-AATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTT * ** * * * * 21853441 ACCTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTTAACAATTATCTTTTTCAAATAGTTATGACCTTT 63 ACC-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT * * * * * *** * * * 21853506 TGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATAGTAATCT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTT * * * * * * * 21853571 GTTAATATTTTGAAAATTACTAAGAGATTTAAAAAATCAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATA 192 ATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAATA * * * * * * * 21853636 GTTATGACTATTTGAGCAATTTTTTATTTCAAATAGTTATGA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAATA 257 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCAT-TTGTTTTGTCATAAAACA * * * * * * * * * 21853700 ATTATTT-TGTTCATATAAGCTAATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAATAA 321 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCT-AAAAA * * * * * ** * * 21853763 CTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATT 384 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT * ** * 21853828 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC--------T-T--T-------TTGTTT-TG-TC 447 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC * ** 21853873 ATATAAGCTTATTCAAAATAAAA 512 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * ** 21853896 TAATACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * ** * * * * 21853961 CGAGCAACTTTAAATAATTATGACTATTCCAATAGTT-TCCCT-TTTGAAATTGCTAT-AGCCTT 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT--CTATTTGAAATCGTTATGA-CCTT * ** * *** * ** 21854023 TTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAAAAT 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAAT * * * * * 21854087 TTATTAATA---TAAAGACACTTAATAAGTAAATCATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAA 190 TTATTAATATTTTAAA-A-A-TTAAT--G-AGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCA * * * ** ** 21854149 GTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTTTTATGACTTTTTGTTTTGTC 248 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTC * * * ** * ** * 21854213 ATAAAACAATTATTTCTGTTCGTACAAGCTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATAT 313 ATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATGCTAA-TTAATAATAT * * ** ** ** * * 21854277 T-TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAAAATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTC 376 TCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTT * * * * * * * * * 21854341 CTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTCTGTAATAAAACAACTA 438 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG * * * 21854406 TTT-TAGTTTATATAAGCATATTTGAAATAAAA 503 TTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * ** * * * * * * 21854438 TAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTAT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC ** * * * * * * 21854503 TGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CATTT- 65 CAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * ** * * 21854565 TTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAACTAATACT-AATTT * * * * * * * **** 21854628 ATTAATCTTTGAAAATTTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTGAA-CACGTTC 192 ATTAATATTTTAAAAATTAAT--G-AGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTAGCAAACCA-GTTC * * ** 21854692 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-AA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * * * * * * ** * * 21854756 ACCAATTGTTTCTGTACATAAAAGCTTATTTGGAGTAAAATAATAATAATTTATTAAAATT-TCA 317 AACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCT-A * * * * ** * 21854820 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAGAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGA 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATTTGTTTGCTGA-CTAGTTCAAATAGTTATGA * * * * ** * * * * 21854885 CTATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATCGCTATGATCTATTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTC 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC * * * 21854950 TATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAA 507 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * ** * * * * 21854978 TAATGCTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAAGTTATTCAC 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * * * * 21855043 CGAACAAGTT-AAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTT 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * * * * * 21855106 GTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACAAATTT 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-AAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTT * * * * * * 21855169 ATCAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAGTT-ATAAT 192 ATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCA-AAT * * * * * *** 21855233 AGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATG-TTTTTTGTTTTGTCATAAAACA 256 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACA * * * * * * * 21855297 ATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTATTCTAAAAAT 321 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCT-AATTAATAATATTCTAAAAAT * * * * * * * * 21855362 T-AT---TAACAGATTTAAAAAATAAATATCTTTGTTGAACCAATTCAAAT-GATTAAGATTATT 385 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATT * * * * * * * ** 21855422 AGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTTTTTCAATTC 447 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC * ** 21855487 ATACATGCTTATTCAAAATAAAA 512 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * ** * * * 21855510 TAATATTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAAC-AATAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAATTAAT-AACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTA ** * * * *** 21855574 CTGAACAAGTTCAAATAGTTACGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTT 64 CCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGA-AATCGTTATGACCTTT *** * * ** * * * 21855638 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAATGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTT * * * * * * * *** 21855703 ATTAATATTTCAAAAATTGACAAGTTAAAGATTTAACAAATAAGTC-AGTTTATCGAATTGGTTC 192 ATTAATATTTTAAAAATT---AA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAGCAAACCAGTTC * * * * * * * * ** * 21855767 AAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTATTTCATTATAA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * * ** ** * 21855832 AATAATTGTTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-T 317 AACAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCT * * * ** ** * 21855894 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTT-ATT--T-AC-----CAAACCG-GCT-C 379 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTGACTAGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * 21855948 CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTATAACATTTTATTCTGTCATAAAATAATTGTTGT 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-T * * * * 21856013 -AGTTCATATAAACTTA-TTCAGAATAAAA 506 CTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * ** * * * 21856041 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATC 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC * * * * * * * * * * 21856106 AAAGCAATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGT 66 AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTGT * * * * * * * * 21856171 TTTGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTT 130 TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT--AA-ACTAATACTAATTT * * * * * * * * * * 21856236 ATTAATGTTATGAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAACCTGTTTATCGAATCAGTTCA 192 ATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCA * * *** * 21856301 AATAATTATG-GTCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACC-TTT-TTTCTGGTCAT 253 AATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTT-T-GTCAT * * * ** * * * * 21856363 ATAACAATTATAGTT-GA-AAATGCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT 315 AAAACAATT-T-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATT * ** * * ** 21856426 -TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTATCAAACTA-TCTCAAATAGTT 377 CT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTT-GCTGACTAGT-TCAAATAGTT * ** * * ** * 21856489 ATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGCATTGTCATAAAACAATTA 438 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG * * * * 21856554 TTTTTGTTCATATAAGATTATTCGAAATAAAA 503 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * * 21856586 TAATATTGATCTAATAATATTT-AAAA--AATTAAC-AAGAGAATT-AAAAA-AAA-TTGTTTGC 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAATTAA-TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC ** * ** * * * * * 21856644 CGAATTAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTA 65 C-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * ** * *** * * 21856709 TTTTGTCATAAAA-TATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAGA-ATTAATT 129 TTTTATCATAAAACAAT-TGTTTTT-GTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTA-ATACTAATT * * * * * * * * 21856772 TATTAATATTTCAAACATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATG-TAACTAGTT 191 TATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-GCAAACCAGTT * * * * * * * * 21856836 CAAATAATTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATA 251 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA * * * * * * * * * * * * 21856901 AAGCAAATGTTTT-TGTTCATATAAGTTTAATCGAAATAAAGTAATACTATTCTATTAATATT-T 316 AAAC-AATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAAT-TAATAATATTCT * * * * * ** * * 21856964 CAAATATTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAG 379 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTT-GCTGACTAGTTCAAATAGTTATG * * * * * * 21857025 ACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT 441 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT * * * 21857090 TTGTTTATACAAGCTTATTT-AGATTAAAA 506 CTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * * * * * * * * 21857119 AAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTAT 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAA-AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * * * * * * 21857184 CGAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * ** * * * * * 21857249 TTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTAT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTAT * * *** * * 21857314 T-A-A---T---AA-TAA--AGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAA-CATGTTTAAATAA 194 TAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCA-GTTCAAATAG * * ** * * * * 21857367 TTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAAT 258 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAAT ** * * * 21857432 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAAT 323 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTAA-A-AAT * * * 21857495 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATA 385 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTGACT-AGTTCAAAT-AGTTATGACTAT- * * * * ** * * * * 21857559 TGTGCA-AATTATTTATTTTAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAT 446 T-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT * * * 21857623 TCATACAAGTTTA-TTCAGATTAAAA 510 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * * * * * 21857648 TAATACTAATTTATAAATATTTCAGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTT 1 TAATACTAATTTATTAACATTT--GAAAATTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT ** * * * * * 21857712 -GTAGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTT 63 ACCA-AAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTT * * * * ** * * * * * 21857776 TTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAAT 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTT-ATTCAAAATAAACTAATACTAAT * ** * * 21857840 TTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTAATG-AAA-AA 190 TTATTAATATTTTAAAAATTAATGAG----AGATTTAAAAAATA-AATCTATTT-A-GCAAACCA * * * * * ** * 21857902 GTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATC 248 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTC * * * ** * 21857967 ATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTT-TTTCCAAATAAAATAAT-TTAAAATT-ATCAA 313 ATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATGCT--AATTAAT-AA * * * * * * 21858028 TATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCAAATA 373 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-AC-TAGTTCAAATA * ** * * * * * 21858091 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAACCCA 435 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * 21858156 TTGGTTTTTTTTCATAAAATCTTATTTGGAATAAAA 500 TT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA *** * * * * 21858192 TAATACTAATTTATTAAACATCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA 1 TAATACTAATTTATT-AACAT-TTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * * * * 21858257 CCGAGCGAGTTCAAATAGTT-TGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTT 64 CCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * * * 21858321 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAAAATAATACTAATT 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT--AAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT * * * * 21858384 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACGA-AAAT-TGTTTA-CAAAATCAGTTCA 191 TATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAA--ATAAATCTATTTAGC-AAACCAGTTCA * * * * 21858446 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC--TTGTTTTGTCATAAA 253 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAA * * * * * * 21858509 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTA-TTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAA 318 ACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATGCT-AATTAATAATATTCTAA * * * * * 21858573 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACT 381 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTTATGACT * * * ** * 21858634 ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTC-TTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-T 444 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT * * 21858697 AGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAA 508 -GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * ** * 21858725 TAATACT-CTTGTACTAACATTCAAAAATTAATAAGC-AAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTT 1 TAATACTAATT-TATTAACATTTGAAAATTAATAA-CTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTT * * * * * * 21858787 TATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTC 62 TACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTT *** * * * * * 21858852 TTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTT 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT * * *** * * 21858916 TATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGA-AGATTTAAAAAATAAATC-AGGTTATTGAATCAAT 191 TATTAATATTTTAAAAATT---AA--TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAGCAAACCAGT * * * * * 21858979 TCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCA 250 TCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCA * * * * 21859043 TAAAACAATTGTTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA 314 TAAAACAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-TGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATA * * * * * 21859105 TT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTT-ATAGAATCAGTTCAAATAG 375 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCT-GACT-AGTTCAAATAG * * * 21859168 TTATGGCTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT 436 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT * * * 21859233 TATTTATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATACAA 501 TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * ** ** * 21859267 TAATACTAATCTAACAGTATTATGAAAATTAATAACTAAGAGCTTTAAAAAATAAAATTT-TTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTA ** * * * * * * * * * 21859331 TTGAATCAATTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT 64 -CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * * * * * * * * * 21859396 -TTTTGTCTTAAAATAAATGTATTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTA 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTA * * * * 21859460 TTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAG 193 TTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAATAG * * * * * * 21859525 TTAT-AATAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAA 258 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAA * * *** * * * ** * 21859589 TTGTTTCTATTGATACTCTCTTATTTGAAATAAAGTAATGTTAATTTGTTAATATCCTAAAAATT 322 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTAAAAATT * * * * * * * ** * * 21859654 ATTAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTTCACCAATAGAAATAGTTATAACTGTTT 386 AATAAGTAA-GAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGC-TGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * * * * 21859718 GAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTATTC 448 GAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC * * * 21859782 ATACATGCTTATTTCAATTAAAA 512 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * *** * 21859805 TAATACAAATTTATTAATATTTAGACAACTAATTGGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA 1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA * * * * * * 21859870 TCGAATA-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-A-ATTT 64 -CCAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT * ** * * * * * * * 21859932 T-TTTTTTCATAAAATTATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTTAGATTACAA-TAATATTAATT 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATA-AACTAATACTAATT * *** * * * * * * * 21859995 TATTAAAATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTC 191 TATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTC * * * * * ** 21860059 TAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTCATCATAA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * * * * * **** * * * 21860124 AACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAA 317 AACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTAA * ** * * ** * * 21860189 AAATTAATGAGTAAGAGATTT--ATTATGAATCTATTTATTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACT 381 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTTATGACT * * * * * 21860252 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT 444 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT * * * * 21860316 ATTCATTCAAGTTTATTCGAAATAAAA 508 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * ** * * 21860343 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * * 21860408 CAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG 65 CAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * 21860473 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATACAGAA--TTATTCAAAATAAAATAATA-TCAATT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-A-AAGTTTATTCAAAATAAACTAATACT-AATT * * * * * * * * * * 21860535 CATTAAGATTTTGAAAATTAATAAAAG-TATTAAAAACTAAATCTGTTTA-CTGAACTAATTCAA 191 TATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCAGTTCAA * * * * * * * * * 21860598 ATATTTATGACTTTTTGATCAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAA 254 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAA * * * * 21860662 CAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGG-AT----TAA-G------AA-AATA--CT--AAT 319 CAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTAATAATATTCTAAAAA * * * ** * * ** * 21860710 TTAATAA-TAA-A-A---AATAAATGA-GT-TTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATTA 384 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTG-CTGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT *** * * * * * * 21860767 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTCCGACATTTTGTTTAGTAAAAAAAACAATTATTTCAGTTC 448 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTGTTC * 21860832 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAA 512 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * ** * * 21860855 TAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATTAGC-AAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTT 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAA-TAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT * * * * * * * * * * 21860919 ATCAAACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTT 63 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT * * * * * * * 21860984 TG-TTTAGTCATATAAGAATTGTTTTT-TATCATACAAGGTTGTTCGAAATAAAATAATACTAAT 127 TGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAAT * * * * * 21861047 TGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACCAAT 190 TTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCAGT * * * * * 21861111 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTGAAAAAAAATAAACCT 250 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTA-TG-----------ACCA * * * * * * 21861176 TTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTT-GATATAAAATAATAG-TA 302 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAAT-GCTA * * * * * * 21861239 ATCTAATAATATTCTGAAAATTATTCACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACTAG 365 AT-TAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAG * * * * 21861304 TTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCA 427 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA * * * ** * * * 21861369 GAAAATAATTTTTTCAATTCA-AGCTAGCTTATTT-AGAACAAAG 492 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-CAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * * * * 21861412 TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTT 1 TAATACT-AATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTT * * * * * * * * * 21861475 ATCTAACCAATTCTAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCAATTTGAAATCATTATGACCTTT 63 A-CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTT * * * * * * * *** * * 21861540 GGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAAC-AATGCTAATC 127 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT-AAACTAATACTAATT ** * * * * 21861604 TATTAATATTCCAACAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACCAGTTCAAAT 191 TATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAAT * * * * * 21861669 ATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACA 256 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACA * * **** * * * * 21861733 ATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAAAAAATAAAAGTTGTATTAAT-AT-TTC-AAAA 321 ATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT-AATGCT-AATTAATAATATTCTAAAA * * ** * * * * 21861794 GTTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAACTAAATCAGTTTACTGAATTAGTTC-AA-A-TTATGGCCA 383 ATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTA * * ** * * * * 21861855 TTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTT-TC 445 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT- ** * 21861918 AAT-ATAGAAGCTTATTTGAAATAAAAAA 508 GTTCATACAAGCTTATTTGAAAT--AAAA * * * * ** 21861946 AAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAA-AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * * * * 21862007 CAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * * * * * 21862072 TTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTTATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAG 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTAT * * * * * * 21862137 TAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-AAACCAATTT-GCTGAACTAGTTCAA 194 TAATATTTTAAAAA-T--TAA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCAGTTCAA * * * * * 21862200 ATAGTTA-AACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-CCATTTTGTTTTATCATAAA 254 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAA * * * * * *** * * * 21862263 ACAATTGCTTTT-TGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTA 318 ACAATT--TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTA * * * * * * * * * 21862327 GAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCTAAACCATTTCAAATAGTTTTGAC 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCT-GACTAGTTCAAATAGTTATGAC * * * * * * 21862392 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCT 443 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT * * ** * 21862457 ATTCATACTATTTTA-TTCAGAATAAAA 508 GTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA * * ** * * * * 21862484 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATTTAATTG 1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAA-TTAATAACTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTT-GTT- ** * * * * * * ** * 21862549 T-TGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAGTTATTTATTCCAAATTGTTATGACCTTT 62 TACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACC-TT * * ** * * * ** * * * * 21862613 TTCTTTTGTTGTAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATGCTAACT 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT * * * * * 21862677 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTGAATCAGTT 191 TATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCAGTT * * * * * * * * * 21862741 CAAATGGTTAAGA-TAATTAGAACAATTATCTACTTGAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTAAT 251 CAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCAT * * ** * * * ** 21862805 AAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAATTAATCCTAATTTATTAGCATTC 315 AAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTC * * * * * * 21862869 AAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT-ATCGAACAAGTTCGAATAGTTA 378 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATTTGTTTGCT-G-ACTAGTTCAAATAGTTA * * * * * * * * 21862933 TTACTGTTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCACAAAACATTTGT 439 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT ** * ** * * 21862998 TTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAA 504 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * ** 21863029 TAATACTAATTTATTAATACTCACT-AAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATAAGTTT 1 TAATACTAATTTATTAACA-T--TTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT * ** * * * * * * ** 21863092 ATCGAATTAATTGAAATAATTATAAAC-ATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAT-AATTT 63 A-CCAAACAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTT * * * * * * ** * 21863155 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTT-TACCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-TCAA 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACT-AA * * * * * 21863218 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAA 189 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAA * * * * * * * 21863283 ATAGTTATGACTATTTGAACAACTAT-TCATCTCAAATCATTAAGATC-TATGTTTTGTCTTAAA 254 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAA * * * * * * * 21863346 ACAATTGTTTCTAATCGTATAAACTTATTTGGTTAA-AAAA-AATACTAATCTTATAATATT-TC 318 ACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGG--AATAAAATAATGCTAAT-TAATAATATTCT- * * 21863408 AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC---CTAGTCAATCAAATAGTTAA 379 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTGACTAGT---TCAAATAGTTAT * * * * * ** * * * * * * 21863466 AACTATTAGAATAATTATCAATTTTAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTT 440 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT * * * ** 21863531 TCATATT-TTACAAGTTTATTCAAAATAAAA 505 TC-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA ** * * * 21863561 TAATA-TAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAA-AAAGAA-ATTATTTGAAAAAATAAATCTATT 1 TAATACT-AATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATTTGTT * * * * * 21863623 TACC-AA-A---CAAGTAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGA-CTAT 62 TACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCT-T * * * *** * * * 21863682 TTCTTTTGAT-ATAAAATATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAAT 126 TTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAAT * * * * * ** *** * * 21863746 TTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT--AAAATAAATTTGCTTATTGAACAAATTC 190 TTATTAATATTTTAAAAATTAATGAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTC * * * * * 21863809 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTTCATAA 252 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAA * ** * ** * * 21863874 AACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCA 317 AACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCT-A * * * * * * * 21863938 AAAATTAATAAAT-AGTGATTTAAAAAGTAAATTTGTTT-ATCGAATCAATTCAAATAATTATG- 380 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCT-GACT-AGTTCAAATAGTTATGA * * * * * * * * 21864000 GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTATTT 442 CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT * * * * ** 21864065 -TTTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAA 506 CTGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * 21864094 TAATAGTAATTTATTAATC-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTT 1 TAATACTAATTTATTAA-CATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT ** * * * * * 21864158 ACTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAT-TCTTCAAATCGTTATAACCTT 63 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTGAAATCGTTATGACCTT * * * * * * * * * * * 21864222 TTATTCTATCATAAAACCAGTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAGTAATACTAATA 126 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATT ** ** * * * * * * 21864287 TAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTT-GTCAAACTAGTA 191 TATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAG-CAAACCAGTT ** * * 21864351 CAAATAGTTAACACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT-----TTT-TGTTGTCATA 251 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA * ** ** * * 21864407 AAACAATTTTTTC-AGTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTT 316 AAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCT-AA-TTAATAATATTC * * * * * * * 21864470 TAAAAAGTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AATCAGTTTAAATAATTAT 378 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT-TGTTT-GCTGACT-AGTTCAAATAGTTAT * ** * * * 21864534 GATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTT 440 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT * * * 21864599 TTTATTCATACAAG-TT-TGTTAAGAATAAAA 505 TCTGTTCATACAAGCTTAT-TTGA-AATAAAA * * * * * * * 21864629 TAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTTAAAAATAAATCTATTTAT 1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * ** * ** * ** ** 21864690 CAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTCCAAATTGTTACAATTTTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * ** * * * * * * 21864755 TTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTAAT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTAT * * * * * * * * * 21864820 TAATATTTTGACAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGATCAAAA 194 TAATATTTTAAAAATTAATGAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAAT * * * * * * * 21864884 AGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAA-A 256 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACA * * * * * 21864948 ATTATTT-TAGTTCATATC-AGCTTATTCGAAAT-AAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAA 321 ATTTTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTCTAAAA * * * * * * * * 21865010 ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTAT 383 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTGCTG-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT * *** * ** ** * * 21865075 TTGAACAATTAT-TCATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTAT 446 TTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT * 21865139 TCATACAAGCTTATTTCAAATAAAA 510 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * ** * 21865164 TAATAC-AATTTATTGATATTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTAC 1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC * * ** * * ** * * 21865227 TAAACAAGTTAAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACTTTTTG 65 CAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTG * * * ** * * * * * * 21865292 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATCCAAGCTTATTCATATTAAAATGATATTAA-TTAT 129 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTAT * * * * * * * * 21865356 TAAATATTTCAACAACTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAA-AAGTTCAA 194 T-AATATTTTAAAAATTAAT--G-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAACCAGTTCAA * * * * * * * 21865420 ATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTAATAAA 254 ATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAA * * * * * * 21865484 ACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATACTACTAATTCATGAATATTCT-A 318 ACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTAAT-AATATTCTAA * * * * ** * 21865547 AAATTAATGAGTAAGAGAATTCAAAAAATTAATTTCTTTATCAAAC-ATTTCCAAATAGTTATGA 381 AAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAA-TAATTTGTTT-GCTGACTAGTT-CAAATAGTTATGA * * * * * 21865611 CTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT 442 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTT * 21865676 -TGTTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAA 506 CTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAA * * ** * * * * 21865704 TATTA-TAAATTTATTAACGTTCCAGAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTT 1 TAATACT-AATTTATTAACATTTGA-AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA ** * * * 21865767 CTTAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTC 64 CCAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTT * * * * * * * * 21865832 GTTTTGTGATAAATCAATTGTTTAT-TT-ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTTATTTA 128 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTA 21865895 TTAA-ATTTTCAAAAATTAAT 193 TTAATATTTT-AAAAATTAAT 21865915 AAATAAAAGA Statistics Matches: 17695, Mismatches: 3972, Indels: 2543 0.73 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 511 57 0.00 512 81 0.00 513 175 0.01 514 7 0.00 515 6 0.00 516 6 0.00 517 89 0.01 518 124 0.01 519 7 0.00 520 1 0.00 521 64 0.00 522 168 0.01 523 16 0.00 524 178 0.01 525 57 0.00 526 102 0.01 527 116 0.01 528 225 0.01 529 343 0.02 530 953 0.05 531 392 0.02 532 744 0.04 533 868 0.05 534 732 0.04 535 695 0.04 536 511 0.03 537 1128 0.06 538 1343 0.08 539 1461 0.08 540 1148 0.06 541 1048 0.06 542 1443 0.08 543 1143 0.06 544 371 0.02 545 426 0.02 546 19 0.00 547 15 0.00 548 21 0.00 549 24 0.00 550 22 0.00 551 17 0.00 552 74 0.00 553 8 0.00 554 1 0.00 555 11 0.00 556 127 0.01 557 81 0.00 558 61 0.00 559 5 0.00 560 9 0.00 561 4 0.00 563 3 0.00 564 11 0.00 565 3 0.00 566 1 0.00 567 2 0.00 568 7 0.00 569 13 0.00 570 12 0.00 571 8 0.00 572 3 0.00 573 4 0.00 574 2 0.00 575 10 0.00 576 4 0.00 577 3 0.00 578 18 0.00 579 10 0.00 580 1 0.00 581 6 0.00 582 9 0.00 583 6 0.00 584 11 0.00 586 8 0.00 587 2 0.00 588 6 0.00 589 7 0.00 590 10 0.00 591 20 0.00 592 12 0.00 593 11 0.00 594 13 0.00 595 6 0.00 596 6 0.00 597 4 0.00 598 16 0.00 599 16 0.00 600 7 0.00 601 14 0.00 602 53 0.00 603 13 0.00 604 7 0.00 605 176 0.01 606 104 0.01 607 4 0.00 608 7 0.00 609 1 0.00 610 7 0.00 611 6 0.00 612 6 0.00 613 4 0.00 614 4 0.00 615 3 0.00 616 7 0.00 617 8 0.00 618 5 0.00 619 3 0.00 620 9 0.00 621 5 0.00 622 4 0.00 623 14 0.00 624 4 0.00 626 3 0.00 627 1 0.00 628 1 0.00 630 4 0.00 631 10 0.00 632 4 0.00 633 4 0.00 634 1 0.00 635 2 0.00 636 7 0.00 637 2 0.00 638 5 0.00 639 3 0.00 640 9 0.00 641 6 0.00 643 1 0.00 644 1 0.00 645 1 0.00 646 8 0.00 647 8 0.00 648 10 0.00 649 13 0.00 650 16 0.00 651 1 0.00 653 1 0.00 654 1 0.00 656 6 0.00 657 9 0.00 658 14 0.00 659 23 0.00 660 20 0.00 661 8 0.00 662 6 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (534 bp): TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTT TTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTATTA ATATTTTAAAAATTAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTA TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTTT TTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAA GTAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTGCTGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT TATTTGAAATAAAA Found at i:21845677 original size:180 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21845234--21847007 Score: 1571 Period size: 180 Copynumber: 10.0 Consensus size: 180 21845224 TTCCTATAAG * *** * *** * 21845234 AGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACC 1 AGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * * 21845299 TATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGATTAT 65 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT * * * * 21845364 TTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAA 130 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAA * * * * 21845415 AGATTTAAAAAAAAACTCTATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT 1 AGATTTAAAAATAAA-TCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * * * 21845480 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCAAAAAATAATT-TTTTTGTTCATAGAAGCTTAT 65 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT ** * * * 21845544 TTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAA 130 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA * * * * * * 21845595 AGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATC 1 AGA-TTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * ** * * * * * 21845660 GATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTAT 65 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT * * * * * 21845725 TCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGCAAG 130 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA * * * 21845776 AGATTTAAAATATAAATCTATTT--------A--TCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTT 1 AGATTTAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * * 21845831 TGTTTC-AATTCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA 65 TATTTCAAATT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA * * 21845895 TTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAAA 129 TTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA * * ** 21845948 A-ATTTTAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC 1 AGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * 21846011 TATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTGATACAAGCATAT 65 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT * * * 21846076 TTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-T--A 130 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA * * * * 21846121 AGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGATA-AA 1 AGATTT--AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGA-ACAA * * * * * * * 21846185 TTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGCTTCTATTCATACAAG 60 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG * * * * * ** 21846250 TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAGTTAATATGTAGG 125 CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA * * * * * * * 21846306 AGATTTAAAAGTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTT 1 AGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT * * * ** 21846371 ATTTCAAATCT-TTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTAT 66 ATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT * * * ** * 21846435 TTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTGAAAGTTAATAAG---- 130 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA * * * * * 21846482 AGATTTAAAAACTAAATTTTTTTA-CAAA-ATAGTTTAAATAATTATGACTATGTGAACAATTAT 1 AGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * 21846545 CTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTCGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA 64 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA ** * * * * 21846609 TTCGAATTAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG---- 129 TTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA * * * * * * * 21846657 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC 1 AGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * * * 21846722 TACTTCAAATCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTA 65 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTA * * * * * * 21846786 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGACTAAG 129 TTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA * *** 21846838 AGATTTTAAAA-AAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATC 1 AGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATC ** * * * 21846901 TATTT-AAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTA 65 TATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA ** * * 21846964 TCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAA 129 TTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA 21847008 AAAGCAAGTT Statistics Matches: 1305, Mismatches: 233, Indels: 113 0.79 0.14 0.07 Matches are distributed among these distances: 170 17 0.01 171 110 0.08 172 15 0.01 173 3 0.00 174 4 0.00 175 91 0.07 176 142 0.11 177 82 0.06 178 82 0.06 179 166 0.13 180 367 0.28 181 187 0.14 182 2 0.00 183 31 0.02 185 6 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (180 bp): AGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA Found at i:21847471 original size:493 final size:489 Alignment explanation

Indices: 21846523--21847505 Score: 1235 Period size: 498 Copynumber: 2.0 Consensus size: 489 21846513 GTTTAAATAA * * ** 21846523 TTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTTATTTCGTCATAAAACAATT 1 TTATGACTATGTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTCGTCATAAAACAATT * *** * * 21846588 GTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA 66 ATTTCAGATCATACAAGCCTATTCGAATAAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA * * 21846653 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT 131 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAAT * * * 21846718 TATCTACTTCAAATCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGC 196 TATCTACTTCAAATCATTCTAACCTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGC * * * * 21846783 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGACTAAGAGATTTTAAA 261 TTACTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA * * * * * 21846848 AAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCA 326 AAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCAATGTAAAATCA * 21846913 TTAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATA 391 TTAGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCC---A-AAAATA 21846978 ATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAAAAAGCAAG 452 ATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAAAAAGCAAG * * * * 21847016 TTATGACTATTTGAATAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTC-TCATAAAATAAT 1 TTATGACTATGTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTT-ATTTCGTCATAAAACAAT * * * * * 21847080 TATTTCAGATCATTCAAGCCTATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTA 65 TATTTCAGATCATACAAGCCTATTCGAATAAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTA * * * 21847145 GTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTT-GCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAAT 130 ATAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTATTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAAC * * * * * * * 21847209 AATT-TTTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAGAATAATTGTTTTAGTTCATAC 193 AATTATCT-ACTTCAAATCATTCTAACCTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATAC * 21847273 AAGCTTACTC-GCAATTAAAAAAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGC-AAGAGA 257 AAGCTTACTCAG-AA-TAAAAAAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAA-CTAAGAGA * * ** 21847336 TTTGAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTTGAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCA 319 TTT--AAAAA-AAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCA * * * 21847400 ATGTAAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGCCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATC 380 ATGTAAAATCATTA-GACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATC * * 21847464 CAAAATAAAATAATACTA-TTGTATTAATATTTCAAAAGTTAA 444 C---A-AAAATAATACTACTT-TATTAATTTTTCAAAAATTAA 21847506 TAAGAGATTT Statistics Matches: 423, Mismatches: 54, Indels: 21 0.85 0.11 0.04 Matches are distributed among these distances: 493 119 0.28 494 112 0.26 495 46 0.11 496 1 0.00 497 8 0.02 498 121 0.29 499 16 0.04 ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.09, T:0.38 Consensus pattern (489 bp): TTATGACTATGTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTCGTCATAAAACAATT ATTTCAGATCATACAAGCCTATTCGAATAAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAAT TATCTACTTCAAATCATTCTAACCTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGC TTACTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA AAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCAATGTAAAATCA TTAGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAAATAATAC TACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAAAAAGCAAG Found at i:21848293 original size:363 final size:358 Alignment explanation

Indices: 21847629--21848409 Score: 914 Period size: 363 Copynumber: 2.2 Consensus size: 358 21847619 AACCATATTC * * 21847629 GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-CAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT 1 GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT * * ** 21847693 GTTTACCGAACCAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAAC 66 GTTTACCAAACCAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATATATTTCAAATCATTATAAC * ** * 21847758 CTGTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAACCTATTCGAATAAAATAATACTAA 131 CTGTTATTCTATCATAAAACAATTGGTCCTGTTCATATAAACCTATTAGAATAAAATAATACTAA * * * * * 21847823 TTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAGT 196 TTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCTAAACCAAT * * * * * 21847888 TCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTCTCA 261 TCAAATAGTTAAGACTACAGGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTATCA * * * 21847952 TAAAACAATTGTCTTTGTTAATATATG-TTTGTTT 326 TAAAACAATTAT-TTTATTAATAGATGCTTT-TTT * * * 21847986 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTTAAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTA 1 GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT-TTAAAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATA * * * * * * * 21848051 AATTTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATT 61 AATCTGTTTACCAAACCAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATATATTTCAAATCATT * * * * * *** 21848116 ATAACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTGTT-ATACT-ATTTTATTTAGAATAAAATA 126 ATAACCTGTTATTCTATCATAAAACAATTGGTCCTGTTCATA-TAAACCTA-TTAGAATAAAATA * 21848179 ATACTAATTTAAG-AATATTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTG-T 189 ATACTAATTT-AGTAATATTCTAAAAATTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCT * * 21848242 CAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTT 253 -AAACCAATTCAAATAGTTAAGACTACAGGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTT * * * 21848307 CTTTTATCGTAAAATAATTATTTTATTCATAGATGCTTTTTT 317 CTTTTATCATAAAACAATTATTTTATTAATAGATGCTTTTTT * * * * 21848349 --ATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAATA 1 GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTAAAAA--AATTAATAAGAGATTTAAAAAATA 21848410 TGTTTTTTTG Statistics Matches: 355, Mismatches: 54, Indels: 28 0.81 0.12 0.06 Matches are distributed among these distances: 357 28 0.08 358 2 0.01 359 21 0.06 360 2 0.01 361 30 0.08 362 10 0.03 363 237 0.67 364 25 0.07 ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (358 bp): GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT GTTTACCAAACCAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATATATTTCAAATCATTATAAC CTGTTATTCTATCATAAAACAATTGGTCCTGTTCATATAAACCTATTAGAATAAAATAATACTAA TTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCTAAACCAAT TCAAATAGTTAAGACTACAGGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTATCA TAAAACAATTATTTTATTAATAGATGCTTTTTT Found at i:21848484 original size:179 final size:178 Alignment explanation

Indices: 21847633--21848503 Score: 467 Period size: 180 Copynumber: 4.9 Consensus size: 178 21847623 ATATTCGAAA * * * * 21847633 TAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAGAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCT 1 TAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCT-AAAAATTAATAAAAAAGAAAATTAAAAAATAAATCT ** ** * * * ** * * ** 21847693 GTTTACCGAACCAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAAC 65 AATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATAAC * * * * * * * ** * ** * 21847758 CTGTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAACCTATTCGAA 130 CTTTTCTTTTATCATAAAATAATT-ATTTTATTCATA-GATGCTTTTTTAT ** * 21847809 TAAAATAATACTAATTT-AGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCT 1 TAAAATAATACTAATTTAAG-AATATTCTAAAAATTAATAAAAAAGAAAATTAAAAAATAAATCT * * * * * * * ** * 21847873 ATTTG-CTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA 65 AATTGTC-AAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATAA * * * * * * * * 21847937 CCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTTTGTTAATATATG-TTTGTTTGAAA 129 CCTTTTCTTTTATCATAAAATAATTAT-TTTATTCATAGATGCTTT-TTT--AT ** * ** * * * * 21847990 TAAAATAATACTAATTTATTAATATGT-TAAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTAAAT 1 TAAAATAATACTAATTTAAGAATAT-TCT--AAAAATTAATAAAAAAGAAAATTAAAAAATAAAT ** * ** ** * * * 21848054 -TTGTT-TACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTA 63 CTAATTGT-C-AAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACAATTATCTATTCCAAATCATTA * * * * * * ** * * * 21848117 TAACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTGTT-ATACTAT--TTTATTTAGAA 126 TAACCTTTTCTTTTATCATAAAATAATT-ATTTTATTCATA-GATGCTTT-TTT--AT * ** 21848172 TAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA 1 TAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAAATTAATAAAAAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA * ** * 21848237 ATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACC 66 ATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATAACC * 21848302 TTTTTCTTTTATCGTAAAATAATTATTTTATTCATAGATGCTTTTTTAT 131 -TTTTCTTTTATCATAAAATAATTATTTTATTCATAGATGCTTTTTTAT * * * * * ** * * 21848351 TAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAATATGTTTT 1 TAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAAATTAATAAAAAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA * * * * * * * ** * 21848416 TTTGTCGAATCAGTTTAAATGGTTAAGATTATTA-GAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAAC 66 ATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA-TAGGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATAAC * 21848480 CTTTTGTTTTATCATAAAATAATT 130 CTTTTCTTTTATCATAAAATAATT 21848504 GTTTCAATTC Statistics Matches: 548, Mismatches: 120, Indels: 52 0.76 0.17 0.07 Matches are distributed among these distances: 175 1 0.00 176 32 0.06 177 1 0.00 178 23 0.04 179 106 0.19 180 182 0.33 181 54 0.10 182 43 0.08 183 104 0.19 184 2 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (178 bp): TAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAAATTAATAAAAAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA ATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATAACC TTTTCTTTTATCATAAAATAATTATTTTATTCATAGATGCTTTTTTAT Found at i:21848654 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21847528--21860718 Score: 8452 Period size: 181 Copynumber: 73.7 Consensus size: 180 21847518 AAAATAAATC * * * * * * ** * * * 21847528 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCGATTTCAAATTGTTATTACATTTTGTTTTCT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * 21847593 CCTAAAACAATTGCTTT-TCAAT-AGAGAACCATATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTAATAA 66 CATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * * 21847655 TATTTCAAGAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA 128 TA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * ** * * * * * 21847706 A-TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTGTTATTCTAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21847770 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAACCTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT ** * * * * * 21847834 TCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTT-GCTAAACT 131 TC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * ** * ** * 21847885 AGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * 21847950 CATAAAACAATTGTCTT-TGTTAATATATGTTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT 66 CATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * * * 21848013 ATGTTAAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTAAATTTGTTTA-CTAAACC 129 A--TT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * * * * 21848068 ATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * ** * ** 21848133 CATCAAACAATTGGTCCTGTT-ATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAAGAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * ** * * ** * * 21848197 TCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACCA 131 TC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * ** * * ** * * 21848249 A-TTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTG * * * * * ** * * * 21848313 TCGTAAAATAATTATTT-TATTCATAGATGCTT-TT-TTATTAAAATAATGCTAATTTAATAATA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * ** * * * 21848375 TTTTAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAATATGTTTTTTTGTCGAATC- 130 -TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * * * * * 21848427 AGTTTAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * 21848492 CATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAAGTTATTAACAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * 21848557 TCAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAACGAACA 131 TCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * * * 21848608 AGCTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTAGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21848673 CATAAAACAAATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTACTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * ** 21848737 CTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAATT 130 -TT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * ** ** * * * 21848789 AGTTAAAATAATTAT-AGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTA 1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * 21848853 TCATAAAACAATTATTTTTGA-CCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * 21848917 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-GAAAATAAATATGTTTA-CTAAGCT 129 A-TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * * 21848969 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT-TAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTTGTTTT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTT * * * ** * 21849031 GTCAGAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATA 64 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTA * * * * * * * 21849094 ATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTATTTA-CTGAGCTA 127 ATA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAAC-A * * * ** * * * * * 21849150 A-TTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTTGAATCGTTCTAACCTTTTGTGTA 1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT * * * * * * * * * 21849212 GTCATAAAATATTTATGTC-ACATCTTACATGCTTATTCGGAATAAAATAAT-CTAAATTTACTA 64 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA * * * * 21849275 ACATTTAGAAAATTAATAAGGAAA-TGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACA 127 ATATTCA-AAAATTAATAA-GAAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * * * 21849331 AGTTCAAATAGTAATGACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21849396 CATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT- * * 21849460 ATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTA-CTGAACA 129 ATTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * * ** * ** 21849509 AATTCAAATTGTTATGACTATTCGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTCAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * ** * * 21849574 CATAAAACAATTATTTGAATTCATATAAGCTTAGTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA ** * * * * * * * 21849638 TTTCAAAAATTAATAAGCGAGTGATTTAAAAATTGAATTTATTTACCAAATC- 130 -TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * * * * 21849690 AGTTCAAATAATTAATG-CCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGG 1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * 21849754 TCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATATATGTTTATT-TGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAA 65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * * 21849817 TCTTTCAAAAATTAATAA-ATAAGAGATTTAGAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC- 128 T-ATTCAAAAATTAATAAGA-AAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * ** ** * * 21849872 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTAAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * ** 21849936 TCATAAAACAGTTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATATAAAAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT ** * * * * ** * * 21850000 ATTCCAAAAATTAATAATTAAGATATCTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACT 129 ATT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * 21850053 AGTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * 21850111 CATAAAGCAAGTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAT 66 CATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT * * * * * ** * * 21850174 ATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAGATAATTCTATTTGCCTAACT 129 A-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * 21850227 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGA-CTTTTGCTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * * 21850291 CATAAAACAAATGTTT-TCTCCATATAAGTTTGTTCA-ATATAAAATAAAACTAATCTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * ** * 21850354 TTTCAAAAGTTAAT----AATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACT 130 -TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * ** ** **** 21850402 AGTTCAAAAAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCACCTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * ** * * * * * ** * 21850467 TACAAAACAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCGGGTTAAAATAATACTATTTTATTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- ** * * *** * * * * 21850532 TTTGATAATTAATAAGTGAA-A-ATTTTTTAAATAAATATGTTTACCAAACT 130 TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * ** 21850582 AGATCAAATAGTTATGACCATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * 21850647 CATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATC-AGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT *** * * * * * 21850710 ATTTTGCAAATTAATAATTAAA-AGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACA 129 A-TTCAAAAATTAATAA-GAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * *** * 21850763 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT ** ** * * * 21850828 CACCAAATGATTTTTTCTGTTCGTACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATAC-AATTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * 21850891 TT-AAGACAATTAATAGGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGACCAAACA 130 TTCAA-A-AATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCGAACA ** * ** * * ** 21850944 AGTTCAAATCTTTGTGACTAACTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTG * * * * * 21851008 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GCATTAAAATAATATTAATATATAAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * 21851072 ATTTTGACAAA-TAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCA 129 A--TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * 21851125 AGTTCAGATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCT-TTTCAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * 21851188 TAATAAAACAATTGTTT-TAATTCATATAAGCCTATT-TGAAATAAAATAACACTAATTTAGTAA 65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * 21851251 TATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTA-CTGAACA 128 TATTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * * * 21851305 TGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * 21851370 CATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAATCTTATTCCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT * * * 21851433 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAACAAATATGTTT-TCTAGACA 129 ATT-CAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGA-ACA * * * * * ** 21851485 CGCTCAAATATTTGTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * ** * * 21851550 CAT-AAACTAATTGTTTCTGTTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATACTACT-ATTTATTAAAA 66 CATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * 21851613 TTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTTAAAAAAACAAATCTATTTA-CTAAGCG 130 -TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * 21851667 AGTTTAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * ** * * 21851732 CATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAATTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTCATTAATG 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA *** * * * * * 21851796 TTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATATATTCATTGAACA 130 TT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * ** * * 21851848 AGTTCAAATAGTCATGTCTGTTTGACCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * ** * * 21851913 CATAAAAC-GTTATTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * * * * 21851977 TTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACT 130 TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * * 21852024 GGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21852088 CATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * 21852152 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCAAAACC 130 TTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * * * * 21852204 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCTTTTGTTTAGA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * 21852269 AATAGAATAATT-TTTTTAGTTCATACATGCTTATTC-GAAATAAAATAATAATAATTTATTAAC 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * 21852332 ATTCAAAAAATTAATAA-ACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAACA 129 ATTC-AAAAATTAATAAGA-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * ** * * * 21852386 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAGTATAACCTTTTGTTTTA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * 21852450 TCATAAAACGATTGTTTC-AGTTTATAAAAGTTTATGTGA-AATAAAATAATATTACTTTATTAA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * 21852513 TATTTCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCAAATC- 128 TA-TTCAAAAATT-AATAAGA-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAA-CA * * * * * * * * * 21852567 ACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * 21852632 CATAAAATAATTTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * * * * 21852695 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTACCGAAC- 130 TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * 21852745 ----C-AAT--TT-T---TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * ** * 21852799 TATAAAATAACTGTTT-TAGTTCATATATGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * ** * * * * * ** ** 21852863 TTACAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAGAAAACAAATTTTTTTGTTAAAGT 130 TT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * ** * * 21852915 GGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * ** 21852980 TCATATAACAATT-TTTTTA-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATC 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT- * * * * 21853043 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAATAAATCTGTTTA-CCAAGCT 129 ATTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * ** * * * 21853093 AGTTCAAATACG-TA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTG 1 AGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * * * * 21853155 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAATCTTGTTTAGAATAAAAT-ATATTAATCTAATAATA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA ** * * * * 21853219 TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACT 130 TTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * 21853271 AGTTTAAATATTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-G * * * * * ** * 21853336 -CATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTTATACTAGCTTTTTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATT 65 TCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATT * * * * * 21853398 AATATTTCAAAAA-T--TAA-AAAGAGATTT-AAAAATAATTCTATTTACCTAACC 126 AATA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA ** * * 21853449 AGTTCAAATAACTATGACTATTTTAACAATTATCTTTTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * ** * * * * 21853513 TCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATAGTAATCTGTTAATA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA ** * * * * * 21853578 TTTTGAAAATTACT----AAGAGATTTAAAAAATCAATCTATTTATCAAACG 130 -TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * 21853626 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTTTTTATTTCAAAT-AGTTATGA-CTTGTTGTTTT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTT-TTGTTTT * * * * * * * * 21853689 GTTATAAAATAATTATTT-TGTTCATATAAGCTAATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT 64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * * 21853753 ATTTCAATAACTAATAAGTAAA-AAATTTCAAAAATAAATATGTTTATTGAACT 129 A-TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * ** 21853806 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTG * * *** ** * * * * * * 21853871 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAG-TTATTAATATTATGAAAAT--TAATAA-G 65 TCATA-AAAC-AATT--GTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTCAGA--AT-AAAATAATACTAATT ** * * ** *** * ** *** ** * 21853932 TAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGA--GCAACTTTAAA--TAATTAT-G-ACT 122 TATTA-ATATTCAAAAATTAATAAGAAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * ** * 21853986 A-TTCCAATAGTT-TCCCT-TTTG----A--A---ATTGC---T-A-TA-G-CCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT ** * * * ** ** 21854032 CATAAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA- 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT ** * * * * 21854096 T-AAAGACACTTAATAAGTAAA-TCATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACA 131 TCAAA-A-A-TTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * ** * 21854148 AGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTTTTATGACTTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * 21854212 CATAAAACAATTATTTCTGTTCGTACAAGCTTATTCA-AATTACAATAATATTAATTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA * ** ** * * 21854276 TTTCAACAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAGTAATAAAAATGTTTTTTGAACA 130 -TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA ** * * * * 21854328 AGTTCAAATAGTCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTCTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * * 21854393 AATAAAACAACTATTT-TAGTTTATATAAGCATATT-TGAAATAAAATAATACCAATTTATTAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * * 21854456 ATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACA 129 ATT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * 21854509 TGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CATTT-TTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * ** 21854571 CATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT * * * * * * 21854634 CTTTGAAAATTTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTGAACA 129 -ATTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTATCGAACA * * ** * 21854687 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * ** * * * 21854752 CA-AAACCAATTGTTTCTGTACATAAAAGCTTATTTGGAGTAAAATAATAATAATTTATTAAAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * * * 21854816 TTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTGAGAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGCG 130 TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * ** * * 21854868 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATCGCTATGATCTATTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21854933 CATGAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATGCTAACTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA * *** * * * * 21854997 TTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAAGT-TATTCACCGAACA 130 TTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTATCGAACA * * * * * 21855049 AGTT-AAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG ** * * * 21855112 TCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATCAATA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA ** * * * 21855176 TTTTGAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACC 130 -TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * ** ** 21855224 AGTT-ATAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATG-TTTTTTGTTTTG 1 AGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * 21855287 TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAG--TAAATTATTGCTAAATTAATAG 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT-CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * * 21855350 TATTCTAAAAATT-AT---TAACAGATTTAAAAAATAAATATCTTTGTTGAACCA 128 TATTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * 21855401 A-TTCAAAT-GATTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG 1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * * 21855464 TTATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * 21855529 TTCAAAAATTAATAA-ACAATAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACA 130 TTCAAAAATTAATAAGA-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * * * 21855581 AGTTCAAATAGTTACGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * 21855645 TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATT-TGAAATAAAATAATATTACTTTATTAA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * * ** 21855708 TATTTCAAAAATTGACAAGTTAA-AGATTTAACAAATAAGTCAGTTTATCGAATT 128 TA-TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * * * * ** 21855762 GGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTATTTCAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * 21855827 TATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * 21855891 TTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTTAAAAATAAAT-T-TATT-T---AC- 130 -TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTATCGAACA ** ** * * * * * * * 21855937 ----CAAACCG-GCT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTATAACATTTTATTCTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * 21855996 CATAAAATAATTG-TTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * ** * * * 21856060 TTCCAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAGCA 130 TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * * * 21856112 A-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * 21856176 CATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTA 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAAT--AA-AATAATACTAATTTATTA * * * * * 21856240 ATGTT-ATGAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAACCTGTTTATCGAATC- 127 ATATTCA--AAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * *** * * * 21856295 AGTTCAAATAATTATG-GTCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTT-TTCTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TT * * * ** * ** 21856358 GTCATATAACAATTATAGTT-GA-AAATGCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA 64 GTCATAAAACAATTGT--TTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA * ** * * * * 21856421 ATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTATCAAACT 127 AT-ATTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * ** * * * ** 21856476 A-TCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGCATTG 1 AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * * * * 21856540 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGATTATTC-GAAATAAAATAATATTGATCTAATAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * ** ** 21856604 ATTTAAAAAATTAACAAG--AGA-A-TT-AAAAA-AAAT-TGTTTGCCGAATT 129 A-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * ** * ** * * 21856650 AGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * ** ** * 21856715 CATAAAA-TATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAGA-ATTAATTTATTAA 66 CATAAAACAAT-TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATACTAATTTATTAA * * * * * * 21856778 TATTTCAAACATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTGTTTAT-GTAACT 128 TA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCG-AACA * * * * * * 21856832 AGTTCAAATAATTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * * 21856897 CATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATC-GAAATAAAGTAATACT-ATTCTATTAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATT-TATTAAT * * * * * 21856960 ATTTCAAATATTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACT 129 A-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * 21857009 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * 21857074 TATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAAAAATACTAATTTATTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * * * * * 21857139 TTCAACAATTAATAAGTAAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACT 130 TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * * 21857190 AGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * 21857255 CATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACT-A---ATT--TA 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * 21857313 TT----AA-TAAT---AAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACA 130 TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * * 21857356 TGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * 21857421 TATAAAAGAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * 21857485 TT-AAGACAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATA 130 TTCAA-A-AATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * * * * ** * 21857537 AGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCA-AATTATTTATTTTAACTTGTTATGACTTTTTGTTT 1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTAT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT * * * * 21857600 TATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATAAA 63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * 21857665 TATTTCAGCAAA-TAATAAGTAAA-AGATTTTAAAAAATAAATATGTTTGTAGAACA 128 TA-TTCA-AAAATTAATAAG-AAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * 21857720 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTCTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21857785 AATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAG-TT-TGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAA 66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * 21857847 TATTCCAAAAATTAATGAGTAAA-AGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTAAT-GAAAA 128 TATT-CAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTT-ATCGAACA * * * * * * 21857901 AGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21857966 CATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTTTTCCA-AATAAAATAAT-TTAAAATTATCAA 66 CATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA * * 21858028 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACA 128 TATT-CAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA * ** * * 21858081 TA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTC 1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * ** 21858145 TCATAAACCCATTGGTTTTTTTTCATAAAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAA 65 TCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT-AA * * * * * * 21858210 CATCCAAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCG 128 TATTC-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * ** * * 21858264 AGTTCAAATAGTT-TGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * ** * 21858328 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * 21858393 TTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACGA-AAAT-TGTTTA-C-AAAA 130 TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAA--ATAAATCTGTTTATCGAACA * * * 21858438 TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TCTTGTTTT 1 --AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT * * * ** * 21858501 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTC-GAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAA 64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA * * * 21858565 TATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTA-CTGAACCA 128 TA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAA-CA * * * ** 21858616 A-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTC-TTTTGACCTTTTGTTTAA 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * 21858679 TCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTC-GAAATAAAATAATACT-CTTGTACTA 65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATT-TATTA * * * 21858741 ACATTCAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACA 127 ATATTCAAAAATTAATAAGAAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * ** * * * 21858796 AGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTCTTGTTTTAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * 21858861 CATAAAA-AATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- * * ** * * * 21858925 TTCAAAAATTGAGAAG-TTGAAGATTTAAAAAATAAATCAGGTTATTGAATCA 130 TTCAAAAATTAATAAGAAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * 21858977 A-TTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * 21859040 TCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA 65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * 21859103 TATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTATAGAATC- 128 TA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * 21859157 AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAATCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * ** * 21859222 CATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATCTAACAGTAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT ** * * * 21859287 T-ATGAAAATTAATAACTAAGAGCTTTAAAAAATAAAAT-TTTTTATTGAATCA 131 TCA--AAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCGAA-CA * * * * * ** 21859339 A-TTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * ** * * * * * 21859402 CTTAAAATAAATGTATT-TGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA 66 CATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * * * * * * 21859466 TTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAGTAAATTTATTTACCAAACC 130 -TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * 21859514 AGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG * * *** * * ** * 21859578 TCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACTCTCTTATT-TGAAATAAAGTAATGTTAATTTGTTAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * 21859642 ATCCTAAAAATTATTAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCT-TC-ACCA 129 ATTC-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT---TATCGAACA ** * * * * * * 21859696 A-TAGAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG * * * * * * 21859759 TCACAAAATAATTTTTTCTATTCATACATGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * ** * * 21859823 ATTTAGACAACTAATTGGTAAA-AGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATA 129 ATTCA-AAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * 21859877 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-A-ATTTT-TTTTTT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT ** * * * * * * * 21859939 CATAAAATTATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTTAGATTACAATAATATTAATTTATTAAAAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA- **** * * 21860004 TTTTCCAATTAATAAGTAAA-AGATTT-TAAAATAAATATGTTTATCGAACA 130 TTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * * * ** 21860054 AGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTCAT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * * * * * 21860119 CATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATAT 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * ** * * * 21860184 TCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTT--ATTATGAATCTATTTATTGAACA 131 T-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * 21860233 AGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTG 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG * * 21860297 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATTCAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT 65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * * 21860361 ATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATA 129 ATTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA * * * * * 21860414 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT ** * * * * 21860479 CATAAAACAATTGTTTCTGCTCATAC-AGAATTATTCAAAATAAAATAATA-TCAATTCATTAAG 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT ** * * 21860542 ATTTTGAAAATTAAT-A-AAAG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTA-CTGAACTA 129 A-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAAC-A * * * * * * * 21860592 A-TTCAAATATTTATGACTTTTTGATCAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT * * * ** * * 21860655 CATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGAA-AATACTAATTTAATAATA 66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATA 21860719 AAAAATAAAT Statistics Matches: 10244, Mismatches: 2193, Indels: 1154 0.75 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 153 5 0.00 154 5 0.00 155 12 0.00 156 17 0.00 157 5 0.00 158 9 0.00 159 2 0.00 160 20 0.00 161 2 0.00 162 6 0.00 163 11 0.00 164 4 0.00 165 4 0.00 166 119 0.01 167 61 0.01 168 38 0.00 169 167 0.02 170 10 0.00 171 7 0.00 172 4 0.00 173 13 0.00 174 217 0.02 175 395 0.04 176 657 0.06 177 748 0.07 178 471 0.05 179 706 0.07 180 1829 0.18 181 2991 0.29 182 1237 0.12 183 297 0.03 184 129 0.01 185 13 0.00 186 17 0.00 187 10 0.00 188 1 0.00 189 5 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (180 bp): AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT TCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA Found at i:21849492 original size:360 final size:357 Alignment explanation

Indices: 21847631--21865949 Score: 4080 Period size: 362 Copynumber: 51.2 Consensus size: 357 21847621 CCATATTCGA * * * * 21847631 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATC 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAATA * * * * * * * ** ** * 21847692 TGTTTACCGAACCAATACAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATA 63 TGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTA * * * * * *** * * * 21847756 ACCTGTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAACCTATTC-GAATAAAATAATAC 127 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-ATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * * ** * * * * * 21847820 TAATTTAGTAATATTCTA-AAAATTAATAACTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAA 191 TAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAA-AAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTGAA * * ** * ** 21847883 CTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT 254 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT * * * * * * * * 21847948 CTCATAAAACAATTGTCTT-TGTTAATATATGTTTGTTTG 319 GTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * 21847987 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTTAAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTAA 1 -AATAAAATAATACTAATTT-CTAATA-ATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TAA * * * * ** * * ** 21848052 ATTTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTT-TTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATT 60 ATATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATT * * * * * * ** * ** * * ** * 21848116 ATAACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTGTTATACTATTTTATTTAGAATAAAATAAT 124 CTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT ** * * ** * * * * 21848181 ACTAATTTAAGAATATTCTA-AAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C 189 ACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAA-AAGATTTGAAAAATAAATAT-GTT-TAC * * ** * * ** ** 21848243 -AAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATAGGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTT 250 TGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACC-TTT * * * * * * * * ** 21848306 TCTTTTATCGTAAAATAATTATTTTA-TTCATAGATGCTT-TTTT 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * ** * 21848349 ATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAAAAGAGATTT-AAA-AAATATG 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATATG ** * * * * * 21848412 TTTTTTTGTCGAA-TCAGTTTAAATGGTT-AAGATTATTAGAACAATTATCTA-TTTGAAATCAT 65 ---TTTACT-GAACT-AATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTG-AATCAT * * 21848474 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTA 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA * * * 21848539 ATACTAAGTTATTAACATTCAG-AAATTAATAA-GAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAA 187 ATACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAA-AGATTT-GAAAAATAAATATGTTT-A * * * * * * 21848602 C-GAACAAGCTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTT 249 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT * * * * * * * * 21848666 GATTAGTCATAAAACAAATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGG 314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * * * 21848711 AATAAAATAATACTAATTTACTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAAT 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAA-TT-TAAAATAAAT * * * * * ** * * * * * * 21848775 ATGTTTACTGAATTAGTTAAAATAATTATAGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATTATTATG 62 ATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTA * ** * * 21848840 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGACCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC 127 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTA-TTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * * 21848905 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTG-AAAATAAATATGTTTACT-AAG 191 TAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTGAA- * * * * * * * * * 21848967 CTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTTGTTT 254 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCT-TTTGTTT * * * * * 21849030 TGTCAGAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATTTG 318 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG ** * * * 21849070 GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAAATTTACAAAATAAAT 1 AAT-AAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAAT * * * * 21849135 GTATTTACTGAGCTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTTGAATCGTTCT 62 ATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCT-ATTTTGAATCATTCT * * * * * * 21849199 AACCTTTTG-TGTAGTCATAAAATATTTATGTCACATCTTACATGCTTATTCGGAATAAAATAAT 126 AACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * 21849263 -CTAAATTTACTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACTG 189 ACT-AATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTT-GAAAAATAAATATGTTTACTG * * * 21849327 AACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTT 252 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT * * * * * 21849392 TTGACATAAAATAATTTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA 317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT-TAG * * * 21849434 AATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAG-AGTTTAAAATAAATTTG 1 AATAAAATAATACTAATTTC-TAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATATG * * * * * * ** ** * * 21849498 TTTACTGAACAAATTCAAATTGTT-ATGACTATTCGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGAC 65 TTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTAAC * * * * * * 21849562 CTTTTATTTCATCATAAAACAATTATTTGAATTCATATAAGCTTAGTCA-AATTAAAATAATACT 129 CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAA-TCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACT * ** * * * ** 21849626 AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGCG-AGTGATTT-AAAAATTGAATTTATTTACCAAA 192 AATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAG-GAAAAGATTTGAAAAA-TAAATATGTTTACTGAA * * * * ** * * * 21849688 TC-AGTTCAAATAATTAATG-CCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTT 254 -CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT * * ** * * * * 21849751 TGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATATATGTTTATTTG 317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATAAAAGCTTATTAG * * ** * * 21849792 AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAGAAAAATAAA 1 -AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT---AAAATAAA * * * * * * * * *** ** 21849857 TTTGTTTA-TCGAA-TCAGTTTAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATT-GCAAGCTAAAAATTG 61 TATGTTTACT-GAACT-AATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTA-TTTTGAATCA * * * *** * 21849918 TTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAGTTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAA 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTA-TTTCAATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA * ** * * ** * * * * * * * 21849982 TAATACTAATATAAAAATATTCCA-AAAATTAATAATTAAGATATCTAAAAAACAAATTTGTTTG 185 TAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTA ** * * * * * * * 21850046 CCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTT 249 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT * * ** 21850104 GTTTTGTCATAAAGCAAGTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAG 314 GTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * * * 21850149 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAGATAATT 1 AATAAAATAATACT-AATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAA-ATAAAT * * * * * * * * ** * * 21850213 CTATTTGCCT-AACTAGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTA 62 ATGTTT-ACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * * * * 21850276 TGA-CTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGT-TTTC--TCCATATAAGTTTGTTCA-ATATAAAAT 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-TAAT-TATTTCAAT-CATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAAT * * * * * * * * * 21850336 AAAACTAATCTATTAATATTTCA-AAAGTTAAT----AATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT 186 AATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAC * * * * * * ** ** * 21850396 TAAACTAGTTCAAAAAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTC 250 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG *** * * ** * * 21850461 ACCTGTTACAAAACAATAATTT-ATGTTCATAAAAACTTATTCGG 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATT-AG ** * * * ** * * * 21850505 GTTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTGAA-AATTTTTTAAATAAATA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGT-AAGAA-ATTTAAAATAAATA ** * * * * * * ** ** * 21850569 TGTTTACCAAACTAGA-TCAAATAGTT-ATGACCATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTAT 63 TGTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCT * * * * * * * 21850632 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATC-AGCTTACTCAAAATAAAATAAT 126 AACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-ATCATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * * ** * * * * ** 21850696 ACTAAGTTATTAATATTTTGCAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAA 189 ACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTGAA * * * * *** * 21850761 CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTT 254 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT ** ** * * * * 21850826 GTCACCAAATGATTTTTTCTGTTCGTACAAGCTTATTTCA- 319 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TT-AG * * 21850866 AATAAAATAATAC-AATTTATTAAT-ATT-AAGACAATTAATAGGTAA-AAGATTTAAAAAATAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAA-ATTT--AAAATAA * ** * *** * * * ** * 21850927 ATTTGTTTGACCAAAC-AAGTTCAAAT-CTTTGTGACTAACTA-AACAATTATTTATTTCAAATT 60 ATATGTTT-ACTGAACTAA-TTCAAATAGTTAAAG-CT-ATTAGAATAATTATCTATTTTGAATC * * * * * * * 21850989 GTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GCATTAA 121 ATTCTAACCTTTT-GTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAA * * * * * * * 21851052 AATAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT 183 AATAATACTAATTTATTAACATTTAGA-AAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTT * * * * * * * * 21851116 TACCGAGCAAGTTCAGATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCT-TTTCAAATCATTGTGACTT 247 TACTGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCT * * * * * * 21851179 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAATTCATATAAGCCTATTTG 311 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * 21851226 AAATAAAATAACACTAATTTAGTAAT-ATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAA 1 -AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-AATT-TAAAATAAA * * * * ** * 21851290 TTTGTTTACTGAAC-ATGTTCAAATAGTT-ATGACTATCT-GGATAATTATCTATTTCAAAACAT 61 TATGTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTAT-TAGAATAATTATCTATTTTGAATCAT * * * * * ** * * * 21851352 TATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAATCTTATTCCA-AATAAAAT 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAAT * * * * * * 21851416 AATA-TAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAACAAATATGTTTT 186 AATACT-AATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTA * * * * * * * ** 21851478 CT-AGACACGCTCAAATATTTGTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTT 249 CTGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * * * 21851542 TGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTCATAAAAACTTATTTGG 313 TGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * * * 21851588 AATAAAATACTACT-ATTTATTAA-AATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAAAACA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTT---AAAATA * * * * * * * * * * ** * 21851650 AATCTATTTACT-AAGCGAGTTTAAATAGTT-ATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCG 59 AATATGTTTACTGAA-CTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCA * * * * * * * * ** 21851713 TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAATTTTATTC-GAAATAAAA 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA * ** * **** * * 21851777 TAATACTAATTCATTAATGTTCCA-AAAATTAATAAGTTGGAGATTT-AAAAAGTAAATATATTC 185 TAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAA-TAAATATGTTT * * * * * * * * ** * * 21851840 ATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTGTTTGACCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTT 248 ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * * * * * 21851905 TGTTTTGTCATAAAAC-GTTATTTCTA-TTTATACAAA-ATTATTCAA 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATT-AG * * 21851950 AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAATTAAATC 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TAAATA * * ** * * * * ** * * 21852011 TATTTA-TCAAACTGGTTCAAATAGTT-ATGACTACTT-CAACAATTATCTATCTCAAATCGTTA 63 TGTTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTA-TTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * * * * 21852073 TGATC-TTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAGTAAAATAT 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA * * * * * * * * * 21852136 TGCTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCA 188 TACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAA-AAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT * * * * * * * * * 21852199 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCTTTTGT 251 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT * ** * * * * * * * 21852264 TTAGAAATAGAATAATTTTTTTAGTTCATACATGCTTATTCG 316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * ** 21852306 AAATAAAATAATAATAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAA 1 -AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAA-TTT--AAAATAA * * * * * * * ** 21852370 ATCTATTT-GTCGAAC-AAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATATATTTAT-AAGA 60 ATATGTTTACT-GAACTAA-TTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTT-TGAATC * * ** * * * * * * 21852431 AGTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCAGTTTATAAAAGTTTATGTGA-AATAAA 121 ATTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAA * * * * * 21852495 ATAATATTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTGAA-AA-GATAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAG 184 ATAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATT-AATAAGGA-AAAGATTTGAAAAATAAATAT-G * * * * * * * * * * 21852556 TTTA-TCAA-ATCACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGA 245 TTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGA * * * * * * 21852619 ACTTTTATTTTGTCATAAAATAATTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAG 308 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * * 21852668 AATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATC 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-A-AAATAAATA * * * * * ** * 21852733 TATTTACCGAACCAATT----T--TT--A--T-TT-GAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAA 63 TGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTAA * * * * * * * * * ** 21852786 CCTTTTGTTTTGTTATAAAATAACTGTTTTAGTTCATATATGCTTTTTTGGAATAAAATAATACT 128 CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT * * * * ** * * * * ** * * 21852851 AATTTAATAATA-TTACAAAAATTGATAACTAAGAGATTT-AGAAAACAAATTTTTTTGTTAAAG 192 AATTTATTAACATTTA-GAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGA-AAAATAAATATGTTTACTGAAC ** * * * * * ** * * 21852914 TGGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTG 255 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTA-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT * * * ** * * 21852979 GTCATATAACAATTTTTTTA--TCATTCAAGCCTATTTGG 319 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * ** * * 21853017 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAATAAATCTG 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATATG * * * * * ** * ** * 21853082 TTTAC-CAAGCTAGTTCAAATACG-T-AA-CTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAA 65 TTTACTGAA-CTAATTCAAATA-GTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTAA * * * *** * * * * * 21853143 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAATCTTGTTTAGAATAAAAT-ATATT 128 CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTA-TTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT * * * ** * * * * * 21853207 AATCTAATAATATTCTA-AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-GTCGAAC 192 AATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC * * * * * * * * 21853270 TAGTTTAAATATTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA 255 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT- * * * * * ** * * 21853335 G-CATAAAATAAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTTTTTGG 319 GTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATAAAAGC-TTATTAG * * * * * * 21853376 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAATAATTC 1 AATAAAATAATACT-AATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAATAAATA * * * ** * ** * * 21853436 TATTTACCT-AACCAGTTCAAATAACT-ATGACTATTTTAACAATTATCT-TTTTCAAAT-AGTT 63 TGTTTA-CTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTT-GAATCA-TT * * * * * *** * * * ** * 21853497 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAA 124 CTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTA-TTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA * * * * * * * * * * * 21853562 TAGTAATCTGTTAATATTTTGAAAATTACTAA-G---AGATTTAAAAAATCAATCTATTTA-TCA 188 TACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT-G * * * * 21853622 AACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTTTTTATTTCAAAT-AGTTATGA-CTTGTTG 252 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCTT-TTG * * * * * * 21853685 TTTTGTTATAAAATAATTATTT-TGTTCATATAAGCTAATTTAG 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * * * * * * 21853728 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAACTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAATA * * * * ** ** * 21853793 TGTTTATTGAACTAGA-TCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT 63 TGTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCT * * * * * ** * * * 21853856 GACCTTTTTGTTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAG-TTATTAATATTATG 126 AACC-TTTTGTTTTATCATA-AA-ATAATT---ATTTCAATCATAC-AAGCTTATTCAGA--AT- * * * *** * ** 21853920 AAAAT--TAATAA-GTA--AGAGATTT--AAAA--AATAA--ATCTGTTTGTCGAGCAACTTTAA 181 AAAATAATACTAATTTATTA-ACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATT-T-GA--AA-AATAA * * * ** ** 21853974 ATA--ATTA-TG-ACTA-TTCCAATAGTT-TCCCT-TTTG----A--A---A-TT--GCT-A-TA 240 ATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTA ** * * * * * 21854018 -G-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTTG 305 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * * * * 21854070 AATAAAATAATA-AAAATT-TATTAATAT-AAAGACACTTAATAAGTAA-ATCATTTAAAAAATA 1 AATAAAATAATACTAATTTCTAATAAT-TCAAA-A-A-TTAATAAGTAAGA-AATTT--AAAATA * * ** * * * * * * ** ** 21854131 AATTTATTTACCAAAC-AAGTTCAAAT-CTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTT 59 AATATGTTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCA * * * * * ** * * 21854193 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCGTACAAGCTTATTCA-AATTACAA 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAA * * * * * * 21854257 TAATATTAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAGTAATAAAAATGTTT 185 TAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAA-AAATAAATATGTTT ** ** * * * * 21854320 TTTGAACAAGTTCAAATAGTCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTT 248 ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * * * * * * * * * 21854385 TGTTCTGTAATAAAACAACTATTTTAGTTTATATAAGCATATTTG 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * * 21854430 AAATAAAATAATACCAATTTATTAAT-ATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAA 1 -AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGA-AATT-TAAAATAAA * * * * * ** 21854494 TTTGTTTATTGAAC-ATGTTTAAATAGTT-ATGACTATCT-GAATAATTATCTATTTCAAAT-AT 61 TATGTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTAT-TAGAATAATTATCTATTTTGAATCAT * * * * ** * ** 21854555 TATGA-CATTT-TTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCA-AATAAAAT 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAAT * * 21854617 AATA-TAAATTTATTAATC-TTT-GAAAATTTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT 186 AATACT-AATTTATTAA-CATTTAGAAAA-TTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATG-TT ** * * * * ** * 21854678 TTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTT 247 TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTT * * * * 21854743 TTGTTTTGTCA-AAACCAATTGTTTCTGTACATAAAAGCTTATTTGG 312 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * * * 21854789 AGTAAAATAATAATAATTTATTAA-AATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTGAGAAAATAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT---AAAATAA * * * * * * * ** * 21854852 ATCTGTTTAC-CAAGCGAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTA-AATAATTTTTTATTTCAAATCG 60 ATATGTTTACTGAA-CTAATTCAAATAGTTAAAG-CTA-TTAGAATAATTATCTATTTTGAATCA * * * * * * * * * * * * * 21854914 CTATGATCTATTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATT-TGAAATAAAA 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA * * * * ***** * * * 21854978 TAATGCTAACTTATTAATATTCT-TAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAAGT-TATTC 185 TAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAA-TATGTTT * * * * * * * * 21855041 ACCGAACAAGTT-AAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATT 248 ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTT * * 21855104 TTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTA-TTCATACAAA-ATTATTCAA 312 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATT-AG * * * ** * 21855150 AATAAAATAATACAAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAACTAAATC 1 AATAAAATAATACTAATTTCT-AATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TAAATA * * * * * * * ** * ** ** * 21855211 TATTTA-TCGAACCAGTT-ATAATAGTT-ATGATTGTTTGAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTA 63 TGTTTACT-GAACTAATTCA-AATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC *** * * * * 21855273 T-GTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTTGCAG--TAAATT 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-A-TCATACAAGCTTA-TT-CAGAATAAAAT * * * * ** * * * * ** 21855334 ATTGCTAAATTAATAGTATTCTA-AAAATT-AT---TAACAGATTTAAAAAATAAATATCTTTGT 186 AATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAC * * * * * * 21855394 TGAACCAA-TTCAAAT-GATTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT 250 TGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * * * * * * * * 21855457 TGTTTAGTTATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCAA 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * ** * 21855503 AATAAAATAATATTAATTTATTAA-CATTCAAAAATTAATAAACAATAAATTTTAAAAAATAAAT 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAA-TTT--AAAATAAAT * ** * * * * * * 21855567 CTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTACGGCTATTTGAACAATTATCTATTTAT-TATAAATA 62 ATGTTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTT-TGAATCATTC * * * * 21855630 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATT-TGAAATAAAATA 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAA-TCATACAA-GCTTATTCAG-AATAAAATA * * * * * ** * 21855693 ATATTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTGACAAGTTAAAGATTT-AACAAATAAGTCA-GTTTA 187 ATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAA-AAATAAAT-ATGTTTA *** * * * * * * * * * 21855755 -TCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTT 249 CT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * ** * * * * 21855819 TATTTCATTATAAAATAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAG 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * 21855865 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAAT 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTT-AAAATAAAT * * *** * * * * * * * 21855929 TTATTTAC----C--A---AACCGGCT---CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTATA 62 ATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTA * * * * * * * * 21855982 ACATTTTATTCTGTCATAAAATAATTGTTGT-AGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATA 127 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATT-TCA-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * ** * ** * * * * * 21856046 CTAATTTAATAATA-TTCCAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTA-TCAAA 190 CTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT-GAA * * * * * * * * * 21856109 GCAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTT 254 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT * * * * * 21856173 TGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAA 318 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * ** 21856214 AATAAAATAATAATAATAATT-TATTAATGTTATGAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTA 1 AATAAAATAATACTAAT--TTCTAATAAT-TCA--AAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TA ** * * * * *** * ** 21856278 AACCTGTTTA-TCGAA-TCAGTTCAAATAATT-ATGGTCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATC 59 AATATGTTTACT-GAACT-AATTCAAATAGTTAAAGCT-ATTAGAATAATTATCTATTTTGAATC * * * ** * * * * * ** 21856340 GTTATTACCTTTT-TTCTGGTCATATAACAATTATAGTTGAA-AATGCAAGCTTATTTGGAATAA 121 ATTCTAACCTTTTGTT-TTATCATAAAATAATTAT--TTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAA ** * * ** * 21856403 AATAATACTAATTTATTAATC-TTTCA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT 183 AATAATACTAATTTATTAA-CATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGT * * * ** * * * * 21856466 TTA-TCAAACTA-TCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAAC 246 TTACT-GAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGAC ** * ** * * * 21856529 CTTTTGCATTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGATTATTCG 309 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * ** * * * * 21856578 AAATAAAATAATATTGATCTAATAATATTTAAAAAATTAACAAG--AG-AA-TTAAAAAAAAT-T 1 -AATAAAATAATACTAAT-TTCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATAT * * * * * * * ** ** * * 21856638 GTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAAACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA 64 GTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTA-GAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTAA * * * * * * ** ** 21856702 CTTTTTATTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAGA-A 128 CCTTTTGTTTTATCATAAAATA-ATTATTTCAA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATA * * * * ** * * * 21856766 TTAATTTATTAATATTTCA-AACATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTGTTTA-TGTA 190 CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTG-A * * * * * * * * 21856829 ACTAGTTCAAATAATTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTATTT 253 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT * * ** * * * * 21856894 TGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATCG 318 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * 21856934 AAATAAAGTAATACT-ATTCTATTAATATTTCAAATATTAATCA--AAG--ATTTAAAAAATAAA 1 -AATAAAATAATACTAATT-T-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAA * * * * * * ** * * ** 21856994 TCTATTTA-TCAAACTAGTTTAAATAGTT-AAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATT 61 TATGTTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATT * * * * * * * *** * * * * 21857057 ATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAAAAA 124 CTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-ATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA * * * * * 21857122 TACTAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TC 188 TACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT- * * * * * * * * 21857185 GAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGT 251 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT * * 21857250 TTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTGAG 316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * 21857293 AATAAAATAATACTAA--T-T--T-ATT----AA-TAAT-A--AAGAGATTTAAAAAATGAATCT 1 AATAAAATAATACTAATTTCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAATAT * * * * * ** * * * 21857344 GTTTATTGAAC-ATGTTTAAATAATT-ATGACTATTTTAACAATTATCTA-TTTGAAATCACTAT 64 GTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTG-AATCATTCT * * * * * 21857406 AACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAAT 126 AACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT * * * * * * * 21857470 ACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA 189 ACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTGAA * * * * ** * 21857535 TAAGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCA-AATTATTTATTTTAACTTGTTATGACTTTTTGT 254 CAAGTTCAAAT-AGTTATGACTAT-T-TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT * * * 21857598 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAG 316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * 21857641 ATTAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAGCAAA-TAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAAATAA 1 AATAAAATAATACTAATTTCT-AATAATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTT--AAAATAA * * * * ** 21857704 ATATGTTT-GTAGAAC-AAGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA 60 ATATGTTTACT-GAACTAA-TTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCA ** * * * * * * * * * 21857766 TAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAG-TT-TGCTTGAACTAAA 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTATTC-AGAA-TAAA * * * * * * * * * 21857829 ATAATACTAATTTACTAATATTCCA-AAAATTAATGAGTAAAAGAATT-AAAAAAAGAATCTATT 184 ATAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATA-AATATGTT * * * * * * * 21857892 TAATGAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACTT 247 TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATTATGACCT * * ** * 21857956 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTTTTCCA- 311 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT--AG * 21858004 AATAAAATAATTTA-AAATTATC-AAT-ATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAA 1 AATAAAATAA--TACTAATT-TCTAATAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAA-TTT-AAAATAA * * * * * * * ** ** 21858065 ATCTATTTTCTGAAC-ATATTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT 60 ATATGTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCAT * * * * *** * *** * * ** 21858128 TATGACTTTTTGTTTTCTCATAAACCCATTGGTTTTTTTTCATAAAATCTTATTTGGAATAAAAT 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT--ATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT ** * * * * * 21858193 AATACTAATTTATTAAACATCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC 186 AATACTAATTTATT-AACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAC * * * * * * ** * * 21858258 CGAGCGAGTTCAAATAGTT-TGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTG 250 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG * 21858322 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATGCAAAA--TTATTCAA 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCAT--AAAAGCTTATT-AG * * * 21858366 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAA-ACGAAAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATA--AATA * * * * * * ** * 21858426 TTGTTTAC-AAAATCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTA 63 -TGTTTACTGAACT-AATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * * * * * 21858489 TGA--TCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTC-GAAGTAAAATAT 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA * ** * * * * * 21858551 TGCTAAACTAATAATATTTTA-AAAATTAATAA-G---AGATTTAAAAAATTAATGTGTTTACTG 188 TACTAATTTATTAACA-TTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTG * * * * * 21858611 AACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTC-TTTTGACCTTTTG 252 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTG ** * * * * * 21858674 TTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTCG 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * 21858717 AAATAAAATAATACT-CTTGTACTAA-CATTCAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAAAAATAA 1 -AATAAAATAATACTAATT-T-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT---AAAATAA * * * * * ** ** 21858780 ATCTGTTTA-TCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGAG-TATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTG 60 ATATGTTTACT-GAACTAA-TTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCA * * * * * * 21858842 TTATAACCTCTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT * * * * * *** * * 21858906 AATATTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTGAGAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCA-GGTTA 186 AATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAAT-ATGTTTA * * * * * * * 21858969 TTGAATCAA-TTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTT 249 CTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTT * * 21859032 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCTA- 312 TTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATAAAAGCTTA-T-TAG * * * * 21859079 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAATA * * ** * * * ** * 21859144 TGCTTA-TAGAA-TCAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTAT 63 TGTTTACT-GAACT-AATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCT * * * * * * 21859207 AATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATACAATAAT 126 AACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA--ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * ** * * * * * 21859271 ACTAA--T-CTAACAGTATTATGAAAATTAATAACTAAGAGCTTTAAAAAATAAA-ATTTTTTAT 189 ACTAATTTATTAACA-T-TTA-GAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATA-TGTTTAC * * * * * * * ** 21859332 TGAATCAA-TTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT 250 TGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT * * * * * * * * * 21859396 -TTTTGTCTTAAAATAAATGTATT-TGCTCATATAAGTTTGTTCAA 314 GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * * 21859440 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAGTAAATT 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TAAATA * ** * * * * ** * 21859501 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAA--TAATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCATTA 63 TGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTA-AAGCT-A-TTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * * *** * * 21859563 TAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACTCTCTTATT-TGAAATAAAGTAA 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA ** * * * * * ** * * * * ** 21859627 TGTTAATTTGTTAATATCCTA-AAAATTATTAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTT 188 TACTAATTTATTAACAT-TTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAC-T * * ** * * * * * * 21859691 CACCAA-TAGAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG 251 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * ** 21859754 TTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACATGCTTATTTC 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * ** 21859797 AATTAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATTTAGACAACTAATTGGTAA-AAGATTTAAAAAAATA 1 AA-TAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT---AAAATA * * * * ** 21859860 AATTTGTTTA-TCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC 59 AATATGTTTACT-GAACTAA-TTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATC * * * * *** * * * 21859922 ATTATAA--TTTT-TTTTTTCATAAAATTATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTTAGATTACAA 121 ATTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-ATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA * * **** * * 21859984 TAATATTAATTTATTAAAATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATATGTTTA- 185 TAATACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAC * * * * * * * * * 21860047 TCGAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTT 250 T-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT ** * * * * * * 21860112 GTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAA 314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT-TAG * * * * ** * * 21860157 AATAAAATAATTCTAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTATTATGAATCT 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATAT * * * * * * ** * 21860221 ATTTATTGAAC-AAGCTCAAATAGTT-ATGACTATTTA-AACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTA 64 GTTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTAAAG-CTA-TTAGAATAATTATCTATTTTGAATCA-TTC * * * * * * * * * 21860282 TGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATTCAAGTTTATTC-GAAATAAAATAA 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA * ** * * 21860346 TACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC 188 TACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGG-AAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT * * * * * * * * * 21860409 AAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT 251 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT * * * 21860474 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATACAGAA--TTATTCAA 316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-A-AAGCTTATT-AG * * ** * * 21860517 AATAAAATAATA-TCAA-TTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAA--AAG-TATTAAAAACTAAAT 1 AATAAAATAATACT-AATTTC--TAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAA-TAAAT * * * * * * * ** * 21860577 CTGTTTACTGAACTAATTCAAATA-TTTATGACTTTTTG-ATCAATTATATATCTCAAATCATTA 62 ATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAAT-AATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * * * * ** * ** * 21860640 TGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGAA-AA 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAGAATAA-AATAA * * * * ** * * 21860703 TACTAATTTAAT-A-A--TAAAAAATAAATGAGTTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTAAA-ACT 188 TACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAG----G--AAAAGATTTGAAA-AA-TAAATA-T * ** * * * * * * 21860763 -ATTA--GAACAA-TT-ATCTA-TT-TCAAATCATTCCG-ACATTTTGTTTA-GTAAAA--A--A 244 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT-ATT-TGAACA-ATTATTTATTTAAAATCATTA * * * ** * * ** * ** * * * * 21860815 -AACAATTAT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA 305 TGAC-CTTTTGTTTTG-TCATA-AAAC-AATT-G-TTTCAGTTCATA-AAAGCTTATTAG * * * * * * ** * 21860872 AATTCAAAA-AAT--TAATTAGC-AAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCA 1 AA-T-AAAATAATACTAATT-TCTAATA-A-TT-CAAAAATTAATAAG--TA--AGA-AATTTAA * *** * ** * * * * 21860933 AATAGATATGGCCATCTCAAC-AATT-ATCTATTTTAA---ATT-G--TTATTA-C-CTTTTG-- 55 AATAAATATGTTTA-CTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAA * ** * * * 21860986 ---TT-T-A------G--TCAT-ATAAGAATTGTT-TTT-TATCATACAAGGTTGTTC-GAAATA 119 TCATTCTAACCTTTTGTTTTATCATAA-AATAATTATTTCAATCATACAAGCTTATTCAG-AATA * * * * * * * 21861034 AAATAATACTAATTGATTAATC-TTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAAATAAATCTA 182 AAATAATACTAATTTATTAA-CATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATG * * * * * 21861097 TTTACTAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTG 245 TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATC-ATTA-TG * * * * * * 21861161 AAAAAAAATAAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTG 307 -----------ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * * 21861223 ATATAAAATAATAGTAA--TCTAATAATATTCTGAAAATTATTCACTAAGAGATTTAAAAATTAA 1 A-ATAAAATAATACTAATTTCTAAT-A-ATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TAA * * * * * * ** 21861286 ATTTGTTTGCCGAACTAGTTTAAATAGTT-AAGACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCAT 60 ATATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTA-GAATAATTATCTATTTTGAATCAT * * * * * * * * * 21861349 TATAACCTTTTCTTTTGTCAGAAAATAATTTTTTCAATTCA-AGCTAGCTTATTTAGAACAAAGT 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAA-TCATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAAT * * * * * * * * 21861413 AA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA 186 AATACT-AATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTA * * * * ** * 21861476 TCT-AACCAA-TTCTAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCAATTTGAAATCATTATGACCTT 249 -CTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTT * * * * * * * * 21861539 TGGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGTTTGG 312 TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTT-ATTAG * * * 21861586 AATAAAACAATGCTAATCTAT-TAAT-ATTCCAACAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAA 1 AATAAAATAATACTAAT-T-TCTAATAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAA * * * * * * * * * ** 21861645 TCTTTTTA-TCAAACCAGTTCAAATATTTATAA-CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTT 61 TATGTTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATT * * * * * * * * * 21861708 ATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCA-AA-AAAA-AA 124 CTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA * * * * * 21861769 TA-AAAGTTGTATTAATATTTCA-AAAGTTAATAAGTAAATGATTT-AAAAACTAAATCA-GTTT 188 TACTAA-TT-TATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAA-TAAAT-ATGTTT ** * * * * * * ** * * * 21861830 ACTGAATTAGTTC-AA-A-TTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATC-TT 248 ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * * * * 21861891 TGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCA-AT-ATAGAAGCTTATTTG 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * 21861936 AAATAAAAAAAAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAA 1 -AAT--AAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAA ** ** * * * * * * ** ** 21861997 ATCCGTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTT 60 ATATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATT * * * ** * * 21862061 ATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTTATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATA 124 CTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATA * * ** * * * * * 21862125 ATACTAATTTAGTAATATTCTA-AAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAAAAACCA-ATTTGC 187 ATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAA-TATGTTTAC * * * * ** 21862187 TGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-CCATTTT 250 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACC-TTTT * ** * * * * * 21862250 GTTTTATCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAA 314 GTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * * 21862296 AATAAAATAATACTAAGTTAT-TAATATTTTAGAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT 1 AATAAAATAATACTAA-TT-TCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAA-TAAAT * * * * * * ** * ** * * 21862360 CTATTTGCTAAACCATTTCAAATAGTT-TTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTAT 62 ATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCT * * * * ** * * * ** 21862424 AACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTATTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATA 126 AACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * * * ** * ** * ** ** 21862489 CTAATTTAATAATATTCCA-AAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATTTAATTGTTGA 190 CTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAA-AAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTGA * * * * * ** ** * 21862553 ACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAGTTATTTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTT 253 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTT ** * * * 21862618 TTGTTGTAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCTG 317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * ** * * * 21862659 ATTAAAATAATGCTAACTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT 1 AATAAAATAATACTAA-TTTCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAATA * * * * * * * 21862724 TATTTACTGAA-TCAGTTCAAATGGTT-AAGATAATTAGAACAATTATCTA-CTTGAAATCGTTC 63 TGTTTACTGAACT-AATTCAAATAGTTAAAGCT-ATTAGAATAATTATCTATTTTG-AATCATTC * * * * * * * 21862786 TGACCTTTTG-TTTAGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAATTAA 125 TAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA * * * * * * 21862850 TCCTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATAA-GAAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-T 188 TACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAA-AGATTT-GAAAAATAAATATGTTTACT * * * * ** * 21862913 CGAACAAGTTCGAATAGTTATTACTGTTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTG 251 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG * * * * * * * * 21862978 ATTTGTCACAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGG 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTAG * * * * 21863022 ATTAAAATAATACTAATTTATTAAT-ACTCACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCA--AAAATTAATAAGTAAGAAA-TT-TAAAATAAA * * * * * * ** * 21863085 TAAGTTTA-TCGAATTAATTGAAATAATTATAAAC-ATTTA-AACAATTATCTATTTAAAATCGT 61 TATGTTTACT-GAACTAATTCAAATAGTTA-AAGCTA-TTAGAATAATTATCTATTTTGAATCAT * * * * * * ** * * * 21863147 TATAA-TTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTTACCACACAAGCTTATT-TGAAATAAAAT 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-ATTTCAATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAAT * * 21863210 AATA-TCAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAA-G---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA 186 AATACT-AATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTA ** * * * * * * * * 21863269 CCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATTCATCTCAAATCATTAAGATC-TAT 249 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT * * * * 21863333 GTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTA-ATCGTATAAA-CTTATTTG 314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATTAG ** * * * 21863377 GTTAAAAAAAATACTAATCTTATAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAAT 1 AAT-AAAATAATACTAAT-TTCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAAT * * * * * * ** 21863438 GTGTTTGCCT--AGTCAA-TCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTTTAAATTGTTC 62 ATGTTT-ACTGAACT-AATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * ** * * 21863500 TGACATTTTG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATTTTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAA 125 TAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTATTTCA-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA * ** * * 21863564 TA-TAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAA-AAAGAAATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTAC- 188 TACT-AATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTG-AAAAATAAATATGTTTACT * * * * 21863626 ---CAA--ACAAGTAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGA-CTATTTC 251 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCT-TTTG * * * * * 21863685 TTTTGAT-ATAAAATATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAA 315 TTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT-TAG * * * 21863729 AATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAG-AGTTTAAAATAAATTTG 1 AATAAAATAATACTAATTTC-TAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATATG * * * * * * * ** * * 21863793 CTTATTGAACAAATTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGAC 65 TTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTAAC * * * * * 21863857 CTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACT 129 CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAA-TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT * ** * 21863921 AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAA--ATAGTGATTT-AAAAAGTAAATTTGTTTA-TCGA 192 AATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGA-AAAGATTTGAAAAA-TAAATATGTTTACT-GA * * * * * * * * 21863981 ATCAA-TTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTAT 253 A-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT * * * ** * * * * 21864044 TTGGTCATATAACAATTATTT-TTTATCATATATGTTTATTCAA 316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATT-AG * * ** 21864087 AATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAAATAAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT---AAAATAAA * * * * * * * * * * 21864151 TCTATTTACTGAACTAGTTTAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA-T-TGTATTCTTCAAATCGT 61 TATGTTTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATT-TT-GAATCAT * * * ** * ** * 21864213 TATAACCTTTTATTCTATCATAAAACCAGTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAGT 123 TCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAAT * ** * * ** * * * * * 21864277 AATACTAATATAAAAATATTCCA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTT-G 186 AATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAC * * * ** * * * 21864340 TCAAACTAGTACAAATAGTTAACACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTT 250 T-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT * ** 21864398 G--TTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATACTAGCTTATTCAG 314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * * * * * 21864441 AATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTAAAAAGTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATT 1 AATAAAATAATACT-AATTT-CTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAAT * * * * * * * * * ** ** 21864505 CTATTTACCT-AA-TCAGTTTAAATAATT-ATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCT 62 ATGTTTA-CTGAACT-AATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATT * * * * * * * * * * 21864567 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT-TTTTATTCATACAAGTTTGTTAAGAATAAAATA 124 CTAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-TAAT-TATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA * * * * * * 21864631 ATACTAATCTATTAATATTTCA-AAAATTAAT----AATAGATTTTAAAAATAAATCTATTTA-T 187 ATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT * * * * ** ** ** ** ** 21864690 CAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTCCAAATTGTTACAATTTTTTG 251 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG * * * * ** * 21864755 TTCTATTACAAAACAATAATTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAG 315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * ** * * * 21864799 ATTAAAATAATACTAATTAAT-TAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-AATTTTAAAAAATAAAT 1 AATAAAATAATACTAATT--TCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT--AAAATAAAT ** * * * * * * ** * 21864862 -TGTTTACCAAACTAGA-TCAAAAAG-TCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTA 62 ATGTTTACTGAACTA-ATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTC * * * * * 21864924 TGACCTTTTGTTTTGTGATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATC-AGCTTATTC-GAA-ATAAATA 125 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCA-ATCATA-CAAGCTTATTCAGAATA-AAATA * * ** * * * * * * 21864985 ATACTAAGTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACC 187 ATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACT * * * * *** * * 21865049 GAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTCATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGT 251 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT ** ** * * 21865114 TTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA- 316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA-TT-AG * * * * 21865157 AATAAAATAATAC-AATTTATTGAT-ATT-AAGACAATTAATAGGTAA-AAGATTTAAAAAAAAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATAATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAA-ATTT-AAAATAAA * * * ** * * * ** 21865218 TTTGTTTACTAAAC-AAGTTAAAATCCTT-ATGACTAATT-GAACAATTATTTATTTCT-AATTG 61 TATGTTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTAAAG-CT-ATTAGAATAATTATCTATTT-TGAATCA * * * * * * * * * * 21865279 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATCCAAGCTTATTCATATTAAAAT 122 TTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT * * * * * * * 21865344 GATATTAA-TTATTAAATATTTCA-ACAACTAATAA-GTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA 186 AATACTAATTTATT-AACATTT-AGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTA * * * * * 21865406 -TCGAAAAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGATCTT 249 CT-GAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTT * * * * 21865469 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTG 312 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG * * * * * 21865515 AAATAAAATACTACTAA-TTCATGAAT-ATTCTAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCAAAAAATTA 1 -AATAAAATAATACTAATTTC-T-AATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGA-AATT--TAAAATAA * * * * * * ** * 21865578 ATTTCTTTA-TCAAAC-ATTTCCAAATAGTT-ATGACTATCTA-AACAATTATCTATTTCAAAAC 60 ATATGTTTACT-GAACTAATT-CAAATAGTTAAAG-CTAT-TAGAATAATTATCTATTTTGAATC * * * * * * *** * ** 21865639 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAA 121 ATTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-ATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA * * * * * 21865704 TATTA-TAAATTTATTAACGTTCCAG-AAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT 185 TAATACT-AATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTT * * * * * * * 21865766 TCTTAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT 248 ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTT * * * * 21865831 CGTTTTGTGATAAATCAATTGTTT-A-TTTATAAAAGCTTATTCAG 313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-AG * * * * 21865875 AATAAAATAATACTTATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAA-AAGATTTAAAAAATAAA 1 AATAAAATAATACTAATTT-CTAATA-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT--AAAATAAA * 21865938 TCTGTTTACTGA 61 TATGTTTACTGA 21865950 GCGAGTTCAA Statistics Matches: 13851, Mismatches: 2991, Indels: 2238 0.73 0.16 0.12 Matches are distributed among these distances: 333 10 0.00 334 6 0.00 335 18 0.00 336 17 0.00 337 46 0.00 338 24 0.00 339 22 0.00 340 28 0.00 341 84 0.01 342 76 0.01 343 16 0.00 344 3 0.00 345 10 0.00 346 17 0.00 347 219 0.02 348 238 0.02 349 375 0.03 350 163 0.01 351 277 0.02 352 387 0.03 353 482 0.03 354 241 0.02 355 544 0.04 356 1084 0.08 357 980 0.07 358 1115 0.08 359 1162 0.08 360 940 0.07 361 1454 0.10 362 1565 0.11 363 1495 0.11 364 424 0.03 365 183 0.01 366 10 0.00 372 7 0.00 373 8 0.00 374 8 0.00 375 110 0.01 376 3 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (357 bp): AATAAAATAATACTAATTTCTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATAAATATGT TTACTGAACTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATCTATTTTGAATCATTCTAACCT TTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT TATTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTC AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA AACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTAG Found at i:21850155 original size:174 final size:174 Alignment explanation

Indices: 21849956--21850272 Score: 428 Period size: 174 Copynumber: 1.8 Consensus size: 174 21849946 GTTATTTTTG * 21849956 TTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAAT-T 1 TTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATGAATATAAAAATATTCCAAAAATTAAT-ATGT * * * 21850019 AAGATATCTAAAAAACAAATT-TGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAAT 64 AAGAGATCTAAAAAA-AAATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAAT 21850083 TATCTATTTCAAATCATTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAGTTTTTCAA 128 TATCTATTTCAAATCATTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAGTTTTTCAA * ** * 21850130 TTCATACT-AGCTTATTC-AGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGT 1 TTCATA-TAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAAATGAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATATGT * * * * * * 21850193 AAGAGATTTAAAAGATAATTCTATTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT 64 AAGAGATCTAAAAAAAAATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATT 21850258 ATCTATTTCAAATCA 129 ATCTATTTCAAATCA 21850273 CTATGACTTT Statistics Matches: 124, Mismatches: 14, Indels: 10 0.84 0.09 0.07 Matches are distributed among these distances: 173 9 0.07 174 114 0.92 175 1 0.01 ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.07, T:0.38 Consensus pattern (174 bp): TTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATGAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATATGTAA GAGATCTAAAAAAAAATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTAT CTATTTCAAATCATTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAGTTTTTCAA Found at i:21856061 original size:169 final size:168 Alignment explanation

Indices: 21855781--21856108 Score: 416 Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168 21855771 AATTTTGGCC * 21855781 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTATTTCATTATAAAATAATTGTTTTTC 1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTATTTCATTATAAAATAATTGTTTTTC * * * * 21855846 ATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA 66 ATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAACAACTAA * 21855911 AAGATTTTAAAAATAAATTTATTTACCAAACCGGCTCCT 130 AAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCGGCTCCT * * * 21855950 ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTA-TAACATTTTA-TTC-TGTCATAAAATAATTGTTG 1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAAC-TTTTATTTCAT-T-ATAAAATAATTGTT- * * 21856012 TAGTTCAT-ATA-AA-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAATTAACA 62 T--TTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCAAAAATTAACA * * * * 21856074 ACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAA 125 ACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAA 21856109 GCAATTCAAA Statistics Matches: 138, Mismatches: 15, Indels: 13 0.83 0.09 0.08 Matches are distributed among these distances: 167 1 0.01 168 48 0.35 169 78 0.57 170 3 0.02 171 3 0.02 172 5 0.04 ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.06, T:0.40 Consensus pattern (168 bp): ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTATTTCATTATAAAATAATTGTTTTTC ATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCAAAAATTAACAACTAAA AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCGGCTCCT Found at i:21856404 original size:895 final size:882 Alignment explanation

Indices: 21847021--21865945 Score: 6803 Period size: 895 Copynumber: 21.2 Consensus size: 882 21847011 GCAAGTTATG * * * * * * * * * 21847021 ACTATTTGAATAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * * * * * * * * * 21847085 CAGATCAT-TCAAGCCTATTTG-GATAAAAATAATACTAATT-TAATAATATTCTAAAAATTAGT 66 TAGTTCATAT-AAACTTATTCGAAAT-AAAATAATACT-ATTCTACTAATATTC-CAAAATTAAT * * * * * * 21847147 ---AAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTT-GCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAA 127 AACAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA * * * * * * 21847208 TAATT-TTTAATTTCAAATCATTCTA-ACCTTTTG-TTTAGTCATAGAATAATTGTTTTAGTTCA 190 CAATTATCT-ATTTCAAATCATT-AAGACTTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA * * * * * * * 21847270 TACAAGCTTACTCGCAATTAAAA-AA-ATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAG 252 TACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA- * * * ** * * 21847333 AGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAATTTGAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATT 314 AAATTT-TAAAAATAAATCTGTTTATC-GAAC-AATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATT * * * * * * 21847396 ATCAATGTAAAATCATTATGAGC-TTTTGTTTTGCCAT-AAACAATTGTTTTAGTT--CATAAAA 375 ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG---TAGTTAACATACAA **** * * 21847457 GCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATTGTATTAATATTTCAAAAGTTAAT----AAGAGATTTA 436 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT-TATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTA * * * * * ** 21847517 AAAAAT-AA-------AT---C-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCGATTTCAA 499 AAAAATAAATCTGTTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAA ** * * * * * * * * * * * 21847570 ATTGTTATTACATTTTGTTTTCTCCTAAAACAATTGCTTT-TCAAT-AGAGAACCATATTCGAAA 564 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAA * * * 21847633 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTGT 627 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAAAGATTT-AAAAATAAAT-TGT * * * * * 21847695 TTACCGAACCAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTAT-AACC 689 TTA-CGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-C * * * * * * * * * 21847759 TGTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAACCTATTC-GAATAAAATAATACTAA 752 T-TTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAA * * * * * 21847823 TTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAG 816 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAAT-T-TAT--T--A-TA- * * * 21847887 TTCAAATA-GTTAA 871 -CCAAAAAGGCT-A ** * ** * * * * 21847900 GACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTC 1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT- * *** * * * ** 21847965 TTT-GTTAATATATGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATGTTAAAAAAATTA 64 TTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATA--TT-CCAAAATTA ** * * * * * * ** 21848028 ATTAGTAAGAGATTTGAAAAGTAAATTTGTTTA-CTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTG 125 A-TAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG * * * * * ** 21848092 AATAACTATCTATTTCAAATCATTATA-ACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCT-GTT- 188 AACAATTATCTATTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTTAGTTC * ** * * * ** * ** 21848154 ATACTATTTTATTTAGAATAAAAT-A-ATACTAATTTAAGAATATTCTAAAACTTAATAACCAAG 251 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA- * * ** * * * * * ** * 21848217 AAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGACTATAGGAACGATTAT 314 AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTAT * * * * * * * * * * * 21848281 CTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTATCGTAAAATAATTAT-TTTATTCATAGATGCTT 377 CTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTTA-ACATACAAGCTT * * * * * * * 21848345 -TTT-TATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAA 440 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAA ** * * * * * * * * * * 21848408 TATGTTTTTTTGTCGAATC-AGTTTAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATC 504 TAAATCTGTTTAT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATC * * * * * * 21848472 ATTCTAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAA 567 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAA * * * * * * * 21848536 TTAATACTAAGTTATTAACATTCAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA 631 ATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAACAAGTAA-AGATTT--AAAAATAAAT-TGTTT- * * * * * * ** 21848601 ACGAA-CAAGCTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTAT-AACCTT 691 ACGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-CTT * * * * ** * * * * 21848664 TTGATTAGTCATAAAACAAATGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAAT 754 TT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAAT * * * * * * ** 21848728 TTACTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATATGT-TTACTGAATTAG 817 TTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAAT-T-TATTA-T--ACCA- *** 21848791 TTAAAATAATTA 874 --AAAA-GGCTA ** ** * * * * * * * 21848803 TAGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAT 1 -A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT * ** * * * * * 21848868 TTTTGACCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAAT 64 TTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATA-TTCCAAAATTAAT * * * * * * * * * 21848932 AAGTAAAAGATTT-GAAAATAAATATGTTTA-CTAAGCTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA 127 AA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA * * * * * * * * 21848995 TAATTAT-TAATCTCAAGTCGTTAAGA-TATTTGTTTTGTCAGAAAACAATTGTTTCT-GATCAT 190 CAATTATCT-ATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAT * *** * * * * 21849057 AGAAGCTTATT--TGGTTAAA-AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGA 253 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA-A * * * * ** * * 21849119 AA-TTTACAAAATAAATGTATTTA-CTGAGCTAATTCAAATAGTTAAAG-CTATTAGAATAATTA 315 AATTTTA-AAAATAAATCTGTTTATC-GAAC-AATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTA ** * * * * * * * * * 21849181 T-TAATTTTGAATCGTTCTAACCTTTTGTGTAGTCATAAAA-TATT-TATGTCACATCTTACATG 376 TCT-ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTA-GTTA-A-CATACAAG * * * ** 21849243 CTTATTCGGAATAAAATAAT-CTAAATTTACTAACATTTAGAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTG 437 CTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCA-AAAATTAATAAACAAGA-GATTT- * * * * * 21849306 GAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTAAACAATTATTTATTTA 498 AAAAAATAAATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTC * * * * * * *** 21849371 AAATCATTATGACCTTTTCTTTTGACATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAA 562 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAA * * * * 21849435 ATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTT-AAAATAAATTTG 626 ATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAACAAGTAAAGA-TTTAAAAATAAA-TTG * ** * * * * 21849498 TTTACTGAA-CAAATTCAAATTGTTATGACTATTCGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGAC 688 TTTAC-GAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA ** * * ** * * * 21849562 CTTTTATTTCATCATAAAACAATTATTTGAATTCATATAAGCTTAGTCA-AATTAAAATAATACT 751 CTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATATT * ** * 21849626 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCGAGTGA-TTTAAAAATTGAATTTATT-TACCAAAT 814 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAA-TAAATTTATTATACCAAA- * * 21849689 CAGTTCAAATAATTA 876 AAG-GC-------TA * * * * * * * * * * 21849704 ATGCCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGT 1 A--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT * *** * * * * * 21849769 TTTTGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATT-TATTAATCTTTCAAAAATTAA 64 TTTAG-TTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAAT-ATTCCAAAATTAA * * * * * * 21849832 TAAATAAGAGATTTAGAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTG 126 T-AACAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG * * * * ** ** * * * * 21849896 AATAATT-GCAAGCTAAAAATTGTTATA-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAGTTATTTTTGTTC 188 AACAATTATCTA-TTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTC * * ** * * 21849959 ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-A--TAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAA 251 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA * * * * * ** * * * * * * 21850021 GATATCTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTA-AGACTATATGAATAATTA 314 -AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTA * * 21850085 TCTATTTCAAATC------A-TTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAGTT-T--TTCAATTCATACTAG 376 TCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTAGTT-AA--CATACAAG ** * * *** 21850140 CTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAA 437 CTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAA * * * * * * * 21850204 AAGATAATTCTATTTGCCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA 500 AAAATAAATCTGTTT--ATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCA * * * * * * * * * 21850268 AATCACTATGA-CTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TCTCCATATAAG-TT-TGTTCAAT 563 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTGAA- * * * * * 21850329 ATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAA-T--AGATTTAAAAAATAAATCTA 626 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAAAGATTT-AAAAATAAAT-TG ** * * * * 21850391 TTTATTAAACTAGTTCAAA-AAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-A 688 TTTACGAATC-AGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA * * * * ** * * * * * ** * 21850454 -TTTTTTCACCTGTTACAAAACAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCGGGTTAAAATAATAC 751 CTTTTTT---TTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAT * ** * ** * * 21850518 TATTTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTGAAA-ATTTTTTAAATAAATATGTT-TACCAAAC 813 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATTTATTATACCAAA- * * 21850581 TA-GATCA 876 AAGGCT-A * * * ** * * 21850588 AATAGTTATGACCATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA 1 ACTA-TT-TGAACA-----AT---TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAA * * * * * * * * * 21850653 AAAATTATTTTAGTTCATATCAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAAGT-TATTAATATTTTGC 56 ATAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATA--TTCC * * * * * * * 21850717 -AAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGAC 118 AAAATTAATAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGAC * *** * * ** ** 21850781 TATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATA-ACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATT-TTTT 182 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT * * * 21850844 CTGTTCGTACAAGCTTATTTC-AAATAAAAT-A-AT-ACAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAA 246 -AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAA * * * * * * * ** 21850904 TAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGACCAAACAAGTTCAAAT-CTT-TGTGACTAACT 307 TAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTGTTT-ATCGAACAA-TTCAAATAATTATG-GTC-ATTT * * * * * * * 21850967 AAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCTATTC 367 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGT-TA-AC * * * * * * * * * ** * 21851031 ATACAAGCTTATTCGCATTAAAATAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAA 430 ATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA--TTCAAAAATTAATAAACAAGA * * * * * * 21851095 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAGATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATC 493 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATA * * * * * * * 21851159 T-TTTCAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAATTCATATAAGCCTA 556 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTA * * ** * 21851222 TTTGAAATAAAATAACACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAT 620 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AG-ATTTAAAAA- * * * * * *** 21851287 TAATTTGTTTACTGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACA 681 TAAATTGTTTAC-GAATCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG * * * * * * * 21851351 TTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAATCTTATTCCA-AATAAAA 744 TTATGAACTTT-TTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAA * * * * * * 21851415 TAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAACAAATATGTTTTCT 807 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAA-AT-TTAT-T * ** 21851480 AGACACGCTCAAATATTTG-TA 868 --ATA--C-CAAA-A-AGGCTA * ** * * 21851501 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * * * * * * * 21851566 CT-GTTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATACTACTATT-TATTAAAATTTCAAAAATTAATAA 66 -TAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTATTCTACTAATA-TTCCAAAATTAATAA * * * * * * * * 21851629 GTAAAAGATTTTAAAAAAACAAATCTATTTA-CTAAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTGAA 129 -CAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA * * * * * 21851693 CAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTAT 190 CAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACT-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAT ** * * * * * ** * 21851756 ACAATTTTATTCGAAATAAAAT-A-ATACTAATTCATTAATGTTCCAAAAATTAATAAGTTGGAG 253 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAAA * * * * * * * * * 21851819 A-TTTAAAAAGTAAATATATTCATTGAACAAGTTCAAATAGTCAT-GTCTGTTTGACCTATTATC 316 ATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTATCGAACAA-TTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATC * * * * * * 21851882 TATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACGTTATTTCTATTTATACA-A-AA--T 378 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC---AATTGTAGTTA-ACATACAAGCT *** * * 21851943 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAA 439 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAA * * * ** * * * * 21852004 TTAAATCTATTTATCAAACTGGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATC 503 ATAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATC * * * * * * * 21852069 GTTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAA 567 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * * 21852133 TATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTTC 632 TAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAAT-TGTTTAC * * * * * * ** * * * 21852198 AAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCTTTTG 693 -GAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTT- * ** * * * 21852263 TTTAGAAATAGAATAATT-TTTTTAGTTCATACATGCTTATTC-GAAATAAAATAATAATAATTT 756 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTT * ** * * * * 21852326 ATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAACAAGTT 819 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTT-AAAAATAAATTTA-TTAT--ACCAA--- * * 21852390 CAAATAGTTA 875 -AAA-GGCTA * ** * * * ** 21852400 TGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAGTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTG 1 --ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG * * * * * * 21852464 TTTCAGTTTATA-AAAGTTTATGT-GAAATAAAATAATATTACTT-TATTAATATTTCAAAAATT 63 TTTTAGTTCATATAAA-CTTAT-TCGAAATAAAATAATACTA-TTCTACTAATA-TTCCAAAATT * * * * * * * * 21852526 GAA-AAGATAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCAAATC-ACTTCAAATAATTATGGCCAT 124 -AATAACA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGACTAT * * * * * * 21852588 TTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCA- 185 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAG-ACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-AG * * * 21852650 -TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAAT-A-ATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT 248 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT * * * 21852712 AAGAGA-TTTAACAAATAAATCTATTTACCGAAC----C-AAT--TT-T--T-ATTTGAACAATT 312 AA-AAATTTTAA-AAATAAATCTGTTTATCGAACAATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATT * * * * * * * * * 21852765 ATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAACTGTTTTAGTT--CATATATG 375 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA---TTGTAGTTAACATACAAG * * * * * 21852828 CTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAATTGAT-AACTAAGAGATTTAG 437 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-CAAAAATTAATAAAC-AAGAGATTTAA * * * * * * * * * * * * 21852892 AAAACAAATTTTTTTGTTAA-AGTGGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTAT 500 AAAATAAATCTGTTTATGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-C ** ** * * * * * * 21852956 AAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTA-TCATTCAAGCCTATTTGGAA 562 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA * * 21853019 TAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAATAAATCTGT 627 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAA-AGATTTAAAAATAAAT-TGT * * ** * ** * ** 21853083 TTACCAAGCTAGTTCAAATACGTA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-AACC 689 TTACGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-C * * * * * * * * 21853145 TTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAATCTTGTTTAGAATAAAAT-ATATTAA 752 TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAA * * * * * * * * 21853209 TCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAG 816 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATTT-ATTAT---ACCA- ** 21853273 TTTAAATA-TTTAA 874 ---AAA-AGGCT-A * * * * * 21853286 GACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAG-CATAAAATAAGTTT 1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTT-GTCATAAAATAA-TTG * * * * * * * * * 21853350 TTTTGAATTTATACT-AGCTTTTTTGGAATAAAATAA-AATGAATT-TATTAATATTTCAAAAAT 63 TTTT-AGTTCATA-TAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT--ATTCTACTAATA-TTCCAAAAT * * * * ** * * 21853412 T-A-AA-AAGAGATTT-AAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTT 123 TAATAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG * * * * * * * 21853473 AACAATTATCTTTTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCA 188 AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA * * * *** * * * * * * * 21853537 TATAAGTTTGTTTGGAATAAAGT-A-ATAGTAATCTGTTAATATTTTGAAAATTACTAAG---AG 252 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAA * * * * * * * * * * 21853597 ATTTAAAAAATCAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAGCAATTTTTT 316 ATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATCT * * * * * * * * 21853661 ATTTCAAATAGTTATGACTTGTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTTGTT--CATATAAGCTAAT 379 ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTAGTTAACATACAAGCTTAT * * * * * ** * * * 21853724 TTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAACTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATA 442 TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATA * * * * * * ** 21853789 AATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT 506 AATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATT * * ** 21853854 ATGACC---T-TTTTG---T-------TT-TGTC-A-T-AT--AAGCTTATTCAAAATAAAATAA 570 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA * * * * 21853899 TACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCG- 635 TACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAAT-TGTTT-ACGA * * * ** * * * * * 21853963 AGCAACTTTAAATAATTATGACTATTCCAATAGTT-TCCCT-TTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTT 695 ATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT--CTATTTCAAATTGTTATGA-ACTTTT * * * ** ** 21854025 GTTTTGTCATAAAATGATT-TTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTT 756 -TTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTT * * 21854089 ATTAATA--T-AAAGACACTTAATAAGTAAATCATTTAAAAAATAAATTTATT-TACCAAACAAG 819 ATTAATATTTCAAA-A-A-TTAATAAGTAAA-GATTTTAAAAATAAATTTATTATACCAAA-AAG * 21854150 TTCAAATCTTA 879 ------GC-TA * * ** * * * * * 21854161 TGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTTTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT 1 --ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT * * * * * * * 21854226 TTCT-GTTCGTACAAGCTTATTC-AAATTACAATAATATTAATT-TATTAATATTTCAACAATTA 64 TT-TAGTTCATATAAACTTATTCGAAA-TAAAATAATACT-ATTCTACTAATATTCCAA-AATTA * * ** ** * * ** *** 21854288 ATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAAAATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCCTGACTATTTGA 125 ATAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGA * * ** * * * * * * * 21854353 ATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTCTGTAATAAAACAACTATTTTAGTTTATA 189 ACAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA * * ** ** * * * 21854418 TAAGCATATTTGAAATAAAAT-A-ATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGA 254 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-A-A * * * * * * * * * * 21854481 A-TTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACATGTTTAAATAGTTAT-GACTATCTGAATAATTATCT 316 ATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA-ATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATCT * * * * ** 21854544 ATTTCAAAT-ATTATGAC-ATTT-TTTTGTCATAAAATAATTG--GTTCTATTCATGTAAGCTTA 379 ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAG-T-TA-ACATACAAGCTTA ** * * * ** * 21854604 TTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATCTTTGAAAATTTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA 441 TTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-CATTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAA * * * * * * 21854667 TAAATATGTTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATT 504 TAAATCTG--TTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATC * * * * * * * * * * 21854732 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-AAACCAATTGTTTCTGTACATAAAAGCTTATTTGGAGTAAAA 567 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * 21854796 TAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAGAAAATAAATCTGTTTA 632 TAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGT-AAAGATTT-A-AAAATAAAT-TGTTTA * * * * * * * * * * 21854861 CCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATCGCTATGATCTATT 692 CGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACT-TT * * * * * * * ** * 21854926 GTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATGCTAACTT 755 TTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTT * *** * * * * 21854990 ATTAATA-TTCTTAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAAGTTATTCACCGAACAAGTTA 819 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATTTATT-A---TACCA---A * 21855054 AATAGTCATA 875 AA-AGGC-TA * * * * * * * 21855064 TCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * * * * ** 21855128 CTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACAAATT-TA-TCAATATTTTGAAAATTAAT 66 -TAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATAC-TATTCTACT-AATA-TTCCAAAATTAAT * * * * * * * 21855190 ---AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAGTT-ATAATAGTTATGATTGTTTGAGC 127 AACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCA-AATAGTTAAGACTATTTGAAC * ** * * * 21855251 AATTATCTATCTCAAATTGTTATG-TTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATA-TTCATAC 191 AATTATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAC *** * * ** * * * * 21855314 AAGCTTATTTGCAGT-AAATTAT-TGCTAAATTAATAGTATTCTAAAAATT-AT---TAACAGAT 255 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-AAAT * * * * * * * * * * 21855373 TTAAAAAATAAATATCTTTGTTGAACCAATTCAAATGATTAAGATTATTAGAACAATTATCTATT 318 TTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATTATCTATT * * * * * * * 21855438 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATT-T-TTTCAATTCATACATGCTTATTC 382 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTT-AA--CATACAAGCTTATTT ** * * * 21855501 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAACAATAAATTTTAAAAAATAAA 444 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAACAAGAGA-TTTAAAAAATAAA * * * * * * 21855566 TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTACGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATA 508 TCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCA-AATCATTA * * * * 21855630 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATTTGAAATAAAATAA 571 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA-GCTTATTTGAAATAAAATAA * * * * * 21855694 TATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGACAAGTTAAAGATTTAACAAATAAGTCAGTTTATCGA 635 TACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAG-TAAAGATTTAA-AAATAAAT-TGTTTA-CGA ** * * * * * 21855759 ATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTATTT 695 ATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTT-TTT ** * * 21855824 CATTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTA 759 TGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTA ** 21855888 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTTATT-TACCAAACCGGCT- 823 ATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATTTATTATACCAAAAAGGCTA * * * * * * 21855947 CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTATAACATTTTATTCTGTCATAAAATAATTGTTG 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * * 21856012 TAGTTCATATAAACTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATT-TAATAATATTCCAAAATTAACAA 66 TAGTTCATATAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACT-ATTCTACTAATATTCCAAAATTAATAA * * * * * * 21856075 CTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAGCAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACA 129 C-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACA * * * * * 21856139 ACTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAA 192 ATTATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAA * * ** 21856204 GCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATGTTATGAAAATTAATAAGTAAGTGA-T 257 GCTTATTCAAAATAAAATAAT-ATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-AAATT * * *** 21856268 TTAAAAAGTAAACCTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGTCATGCCAACAATTATCTATT 319 TTAAAAA-TAAATCTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATTATCTATT * * * * * * * 21856333 TCAAATCGTTATTACCTTTTT-TCTGGTCATATAACAATTATAGTTGAAAATGCAAGCTTATTTG 382 TCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTT-AACATACAAGCTTATTTG * 21856397 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAA 445 GAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAATTAATAAAC-AAGAGATTTAAAAAATAAA * * * * * * * * 21856461 CCTATTTATCAAACTA-TCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTA 508 TCTGTTTAT-GAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTA ** * * * * * 21856525 TAACCTTTTGCATTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGATTATTCGAAATAAAATAAT 571 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT * * * * * * * 21856590 ATTGATCTAATAATATTTAAAAAATTAACAAG---AGAATTAAAAA-AAATTGTTTGCCGAATTA 636 ACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAAAGATTTAAAAATAAATTGTTT-ACGAATCA * ** * 21856651 GTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTATTTTGT 699 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTT-TTTTGT * ** ** 21856715 CATAAAAT-ATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAGA-ATTAATTTATTAA 762 CATAAAATAAT-TGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATATTAATTTATTAA * * * * * 21856778 TATTTCAAACATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATGTAACTAGTTCAAATAA 824 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAA----ATTTAT-T-A-TA--CCAAA-AA *** 21856843 TTATA 878 GGCTA * * ** * 21856848 ATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * ** * * * * 21856913 TTGTTCATATAAGTTTAATCGAAATAAAGTAATACTATTCTATTAATATTTCAAATATTAAT--C 66 TAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTATTCTACTAATATTCCAAA-ATTAATAAC * * * * 21856976 AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATC 130 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT * * * * * * 21857040 ATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCT 195 ATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT * * * * * 21857105 TATTTAGATTAAAA-AA-ATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAA 260 TATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT-AAAAATTTTAA * * * * * * 21857168 AAATAAATATGTTTATCGAACTAGA-TCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAA 323 AAATAAATCTGTTTATCGAAC-A-ATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * 21857232 ATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTT--CATATAAGCTTA-TTGAGA 386 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--T-AGTTAACATACAAGCTTATTTG-GA * 21857294 ATAAAATAATACTAA--T-TT---ATT----AA-TAAT--A-AAGAGATTTAAAAAATGAATCTG 447 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG * * * * * * * 21857345 TTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACC 512 TTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACC * * * * * 21857410 TTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAA 576 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA * * 21857475 TTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAG 641 TTTATTAATATTTAA-A-AATTAACAAGT-AAAGATTT-AAAAATAAA-TTGTTTAC-GAATCAG * * * * * * 21857539 TTCAAATCATTATGACTATATGTGCA-AATTATTTATTTTAACTTGTTATG-ACTTTTTGTTTTA 700 TTCAAATAATTATGACTAT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTT-TTTTG * * * * * * 21857602 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATAAATA 761 TCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA * * * * 21857667 TTTCAGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTGTAGAACAAGTTCAAATAG 826 TTTCA-AAAATTAATAAGT-AAAGATTTT-AAAAATAAAT-T-TAT-TA-TAC-----CAAAAAG * * 21857731 TCATG 879 GC-TA * * * * * 21857736 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * ** * * 21857801 CAGTTCATATAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATT-TACTAATATTCCAAAAATTAATG 66 TAGTTCATATAAACTT-ATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATATTCC-AAAATTAAT- ** * * * ** * * 21857864 AGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTAATGAAA-AAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAA 127 AACAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA * * * 21857927 CAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTTT-GTTCATG 190 CAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATA * * * * * 21857991 CAAGCTTTTTCCAAATAAAATAATTTAA-AA-TTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAT 254 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAAT * * 21858054 TTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACATATTCAAATAATTAT-GACTATTTGAACAATTATCTA 318 TTTAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA-ATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATCTA * * * * ** ** * * 21858117 TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAACCCATTGGTTTTTTTTCATAAAATCTTATT 380 TTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-G-TAGTTAACATACAAGCTTATT * ** * 21858182 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAACATCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA 443 TGGAATAAAATAATACTAATTTATT-AACATTC-AAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATA * * * * * * * ** 21858247 AATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTT-TGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTT 506 AATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATT * * * ** ** 21858311 ATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAA 570 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA * * * 21858376 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACGAAAATTGTTTACAAAA 635 TACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAAAGATTTAAAAA--TAAATTGTTTAC-GAA * * * ** * * 21858438 TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTGTTTTG 696 TCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTTTTTG * * * * ** ** * 21858502 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTC-GAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAAT 761 TCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAAT * * * * * 21858566 ATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATTAATGTGT-TTACTGAACCAATTCAAATAGT 825 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAAT-T-TATTA-T--ACCAA---AAA-GGC 21858627 TAA 881 T-A * * * * ** 21858630 GACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTC-TTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGT 1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT * ** * * * * 21858694 TTTAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTCTTGTACTAACATTCAAAAATTAATAA 64 TTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTATTCTACTAATATTCCAAAATTAATAA * * * 21858759 GCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAAC 129 -CAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAAC * ** * * * * * 21858823 AATTATCTATTTAAAATTGTTATA-ACCTCTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCAATTCATAA 191 AATTATCTATTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAC * * * * * * 21858886 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATAT--TACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGAT 255 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG-TAAAAAT * * * * * * 21858949 TTAAAAAATAAATCAGGTTATTGAATCAATTCAAATAATTATTGCCATTTGAACAATTATCTATT 318 TTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATTATCTATT * ** * * 21859014 TCAAATCTTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCT 382 TCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTT-AACATACAAGCTTATT-T * * ** * 21859078 -AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAA 444 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAA * * * 21859142 TATGCTTATAGAATC-AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTA 508 TCTGTTTAT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTA * * * * 21859206 TAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATACAATAA 571 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAA * ** * * * * * * * 21859270 TACTAATCTAACAGTATTATGAAAATTAATAACTAAGAGCTTTAAAAAATAAAATTTTTTATTGA 635 TACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AGATTT-AAAAAT-AAATTGTTTA-CGA * * * * * * * * 21859335 ATCAATTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTTTT 695 ATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTTTTT * * * ** * * * * 21859400 GTCTTAAAATAAATGTATTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT 760 GTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT * * 21859465 ATTTTAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAGTAAATTTATT-TACCAAACCAGTTCAAATAG 825 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATTTATTATACC--A--A----AAA-GG * 21859525 TTA 880 CTA * * * * * 21859528 TAATAATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT 1 -ACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT * ** * * ** ** 21859593 TTCTA-TTGATACT-CTCTTATTTGAAATAAAGTAATGTTAATT-TGTTAATA-TCCTAAAAATT 64 TT-TAGTTCATA-TAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATATTCC--AAAATT * * * * ** 21859654 ATTAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCT-TC-ACCAA-TAGAAATAGTTATA-ACT 124 AATAA-CAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATT---TATCAAACAAGTTCAAATAGTTA-AGACT * * * * * * * * * 21859714 GTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATA-ACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTC 183 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT- * * * * * 21859777 TA-TTCATACATGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-CA-AATTTATTAATATTTAGACAACTAAT 245 TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTTA-AAAATTAAT ** * * * * ** 21859838 TGGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGA 308 AAGTAAAA-ATTT-TAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA-TTCAAATAATTATGGTC-ATTTGA * * * ** ** ** 21859902 ACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-AATTTTT-TTTT-TCATAAAATTATTGTTTTTTTTCATA 369 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TAGTTAACATA * * * * * **** ** * 21859964 CAAGCTTATTTAGATTACAATAATATTAATTTATTAAAATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATT 433 CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATT * * * * * * * * 21860029 T-TAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTT 497 TAAAAAATAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT * * * ** * * * * * *** 21860093 CAAATCGTTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAAA 561 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA * * ** ** * * 21860158 ATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTT-ATTATGAATCTA 626 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AGATTTAAAAATAAAT-TG * * * * * * * 21860222 TTTATTGAA-CAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAT 688 TTTA-CGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA * * * * * 21860286 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATTCAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACT 751 CTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATT * * * * * 21860350 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TACCAAAT 814 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATTTATTATACCAAA- * 21860413 AAGTTCAAATA 876 AAG-GC---TA * * * * * * 21860424 GTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA 1 ---A---CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAA * * * * * * ** 21860489 TTGTTTCT-GCTCATACAGAA-TTATTCAAAATAAAATAATATCAATTC-ATTAAGATTTTGAAA 60 TTGTTT-TAGTTCATATA-AACTTATTCGAAATAAAATAATA-CTATTCTACTAATA-TTCCAAA * * * * * * * 21860551 ATTAATAA-AAG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTA-CTGAACTAA-TTCAAATATTTATGACTT 121 ATTAATAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAAC-AAGTTCAAATAGTTAAGACTA * * * * * * * * * 21860611 TTTGATCAATTATATATCTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCT-T 184 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAG * *** * * * * 21860674 TTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGA-AA-ATACTAATTTAATAATA---AAAAA-T-A-AA-T- 248 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTA * * *** * * * * * 21860729 -GAGTTTT---GCCAAACCAG--T-TCAAATAATT--AA-AACTAT--T-A---GAACAATTATC 313 AAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATTATC * ** * * * * * 21860778 TATTTCAAATCATTCCGACATTTTGTTTAGTAAAAAAAACAATTATTTCAGTT--CATACAAGCT 378 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT-CATAAAACAA-T-TGT-AGTTAACATACAAGCT * * * * * 21860841 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATTAGCAAGAGATTTAAAAA 439 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAATTAATAAACAAGAGATTT-AAAA * * * * * * * * * * 21860906 AATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTTAAAT 502 AATAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT ** * * * * * * * * * 21860971 TGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAAGAATTGTTT-TTTATCATACAAGGTTGTTCGAAATAA 566 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAA * * * * * 21861035 AATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAAATAAATCTATTT 630 AATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAAT-TGTTT * * * * ** 21861100 ACTAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTGAAAA 691 AC-GAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-T-TAT-C-T-ATTTCAA--ATTG---- ** * * * * * * * 21861165 AAAATAAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATT-TGATATAA 744 -TTATGAA-CTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAA * * * * * * * * 21861229 AATAATAGTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTATTCACTAAGAGA-TTTAAAAATTAAATTTGT 805 AATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATTTAT * * * 21861292 T-TGCCGAACTAGTTTAAATAGTTAA 867 TATACC--A--A----AAA-GGCT-A * * * 21861317 GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCAGAAAATAATT-TT 1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTT * * * * * * * * 21861381 TTCAATTCA-AGCT-AGCTTATT-TAGAACAAAGTAA-AATGAATT-TATTAATATTTCAAAAAT 65 TT-AGTTCATA--TAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACT--ATTCTACTAATA-TTCCAAAAT * * * * * * * 21861441 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCTAACCAA-TTCTAATAATTATGACCATT 123 TAATAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATT * * * * * * * * * 21861505 TGAATAATTATCAATTTGAAATCATTATGACCTTTGGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTA-TT 186 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTTAGTT * * * *** * ** * * * 21861569 CATATAAGTTTGTTTGGAATAAAA-CA-ATGCTAATCTATTAATATTCCAACAATTAATAAG--- 250 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA * * * * * * ** 21861629 AGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACCAGTTCAAATATTTAT-AACTATTTGAACAATTAT 314 AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTAT * * * * 21861693 CTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTT--CATAAAAGCT 377 CTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG---TAGTTAACATACAAGCT ** * * * * ** 21861755 TA--TCCAA-AAAAAAATA-AAAGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAA-ATGATTTAA 439 TATTTGGAATAAAATAATACTAA-TT-TATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGA-GATTTAA * * ** * * * * * 21861815 AAACTAAATCAGTTTACTGAATTAGTTC-AA-A-TTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAA 500 AAAATAAATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAA ** * * * * * * * 21861877 ATTGTTGTTATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTT-TCAAT-ATAGAAGCTTATTTGAAA 564 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAA * * * * * 21861939 TAAAAAAAAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCC 627 T--AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAAAGATTT-AAAAATAAAT-T * * * * * 21862001 GTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTAT-AA 687 GTTTACGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA * * * * * * * 21862065 CCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTTATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATAC 751 -CTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATAT * * * * * * 21862129 TAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAAAACCAATTTGCTGAACT 813 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-TAAAAATA--AATTT-AT-TA-T * * * 21862193 AGTTCAAATA-GTTAA 870 A--CCAAAAAGGCT-A * * ** * * * * 21862208 ACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GCCATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGCT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-T * * ** * * * * ** 21862272 TTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGT-TATTAATATTTTAGAAATTAAT 64 TTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATATTCCA-AAATTAA- ** * * * * ** 21862336 TAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTT-GCTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAA 126 TAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA * * * * ** 21862400 TAATTATCTATTTCAAATAATTATA-ACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTA-TTCAT 190 CAATTATCTATTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCAT * ** * * * * * ** 21862463 ACTATTTTATTCAGAATAAAAT-A-ATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAA 253 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA-GTA-AA ** * ** * * * * * * * * * * 21862526 AATTAAAAAAATAAATTTAATTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATGAACAGTTATT 315 AATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATC * * * ** * * 21862590 TATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGTAAAACAATTGT-TTTATTCATACAAGCTTA 378 TATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTTA-ACATACAAGCTTA * * * * * ** 21862654 TTCT-GATTAAAATAATGCTAACTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA 441 TT-TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAA * * * * * * * * 21862718 TAAATTTATTTACTGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGA-TAATTAGAACAATTATCTACTTGAAAT 504 TAAATCTGTTTA-TGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATATATTTCAAAT * * * * * * * * 21862781 CGTTCTGACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TTCAGAATA 566 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATA * * ** * * * 21862844 AATTAATCCTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGT 629 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AGATTT--AAAAATAAA-TTGT * * * * * * * ** 21862909 TTATCGAA-CAAGTTCGAATAGTTATTACTGTTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCATTAT-AAC 689 TTA-CGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA- * * * * ** * * * * * 21862972 CTTTTGATTTGTCACAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACT 751 CTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATT * * * * * 21863036 AATTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATAAGTTTATCGAAT 814 AATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAAT--A-AA-TTTAT--TA- ** *** 21863099 TAATTGAAATAATTATAA 869 T-A-CCAAA-AAGGCT-A * * * * * * * 21863117 AC-ATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAA-TTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * * * * * * * 21863180 T--TTACCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATCAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAAT 66 TAGTT--CATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATA-CTATTCTACTAATA-TTCCAAAATTAAT * * * * * 21863242 ---AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA 127 AACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACA * * * * * * * * * 21863304 ACTAT-TCATCTCAAATCATTAAGA-TCTATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTA-ATCGTAT 192 ATTATCT-ATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAC * **** * * * 21863366 AAACTTATT-TGGTTAAAA-AAAATACTAATCTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGAT 255 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATAATAAT-TTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAAT * * ** * * * *** * * * 21863425 TTAAAAAATAAATGTGTTTGCCTAGTCAA-TCAAATAGTTA-AAACTATTAGAATAATTATCAAT 318 TTTAAAAATAAATCTGTTTATCGA-ACAATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATCTAT * * * * * * * ** * 21863488 TTTAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGT--TTCATATTTTACAAGTTTATT 381 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTT-A-A-CATACAAGCTTATT *** * * * 21863551 CAAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAA-AAAGAA-ATTATTTGAAAAAA 443 TGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCA-AAAATTAATAAACAAGA-GATTT-AAAAAA * * * * * * * 21863613 TAAATCT-ATT-T-ACCAA--ACAAGTAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCAT 504 TAAATCTGTTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCAT * * * * * * * *** 21863673 TATGA-CTATTTCTTTTGAT-ATAAAATATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA 569 TATAACCT-TTTGTTTTG-TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA * * * * * * 21863736 TAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTT-AAAATAAATTTGCTTATT 632 TAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAACAAGTAAAGA-TTTAAAAATAAA-TTGTTTA-C * * * * ** * 21863799 GAA-CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG 693 GAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTT- * * ** * * 21863863 TTTTTTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTA 756 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTA * ** * * 21863927 TTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGTGA-TTTAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAATCAATTCAA 820 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATTT-ATTAT---ACCAA---AA *** 21863991 ATAATTA 877 A-GGCTA ** * * * * * * * 21863998 TGGTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTAT 1 -ACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT * *** * * * * * 21864063 TTT-TTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATT-TATTAATCTTTCAAAAATTAA 64 TTTAGT-TCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAAT-ATTCCAAAATTAA * * * * * * 21864126 TAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTG 126 TAA-CAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG * * * * * * * * * 21864190 AACAATTGTAT-TCTTCAAATCGTTATA-ACCTTTTATTCTATCATAAAACCAGTATTTCT-GTT 188 AACAATTATCTAT-TTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTT * * ** * * 21864252 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAGTAATACTAAT-A--TAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTA 250 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA * * * * * * * * * *** * 21864314 AGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTA-ACACTATATGAACAATT 313 A-AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AATTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATT * * 21864378 ATCTATTTCAAATC------A-TTTTTG--TTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTT--CATACTAG 375 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGT-AGTTAACATACAAG ** * * * * *** 21864432 CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTAAAAAGTAATATGTAAGAGATTTAA 437 CTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAA * * * * * * 21864496 AAAATAATTCTATTTACCT-AATC-AGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTC 500 AAAATAAATCTGTTTA--TGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTC ** * * * * * * 21864559 AAATCGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAG-TT-TGTTAAG 562 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTGA- * * 21864622 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTTAAAAATAAATCT 625 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAACAAGTAAAGA-TTTAAAAATAAAT-T * * * ** * * * 21864684 ATTTATC-AAACTAGTTTAAA-AAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTCCAAATTGTTA-C 687 GTTTA-CGAATC-AGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG * * * * * ** * * * * 21864746 AATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGATTAAAATAATA 749 AACTTTTT-TT-TGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * ** * * 21864811 CTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAAA-ATTTTAAAAAATAAATTGT-TTACCAAAC 812 TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTT-AAAAATAAATT-TATT-----A- * * * 21864874 TAGATCAAAAAGTCATG 869 T--ACCAAAAAGGC-TA * * * * * * * 21864891 ACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAA-AATTATTT 1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT * * * * * 21864955 TAGTTCATATCAGCTTATTCGAAAT-AAATAATACTAAGT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAA 66 TAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-ATTCTACTAATATTC-CAAAATTAATAA * * * * * * * 21865018 TTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAA 129 -CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAA * *** * ** ** * 21865083 TTAT-TCATTTGAAATTGCTATA-ACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA-TTCATAC 193 TTATCT-ATTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAC * * * 21865145 AAGCTTATTTC-AAATAAAAT-A-AT-ACAATTTATTGATA-TTAAGACAATTAATAGGTAAAAG 255 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAAA- * * * * ** * * * 21865205 A-TTTAAAAAAAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTAAAATCCTTAT-GACTAATTGAACAATTATT 316 ATTTTAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAA-TTCAAATAATTATGGTC-ATTTGAACAATTATC * * * * * 21865267 TATTTCTAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATCCAAGCTTA 378 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGT-TA-ACATACAAGCTTA *** * * * * * * ** 21865331 TTCATATTAAAATGATATTAA-TTATTAAATATTTCAACAACTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAA 441 TTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT-AACA-TTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAA * * * * 21865394 TAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC 504 TAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATC * * * * * * 21865458 ATTGTGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA 567 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA * * * ** * * * 21865522 ATACTACTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATGAGTAAGAGAATTCAAAAAATTAATTTCTTT 631 ATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAACAAGTAA-AG-ATT-TAAAAA-TAAATTGTTT * * * * * *** 21865586 ATC-AAACATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATG-ACAT 691 A-CGAATCAGTT-CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-T * * * * ** * * 21865649 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATATTATAAAT 753 TTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAAT ** * * * * * * 21865714 TTATTAACGTTCCAGAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTTAACACGTTT 817 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAAT-T-TATT-AT-AC-C---- * * 21865779 AAATA-GTTA 873 AAAAAGGCTA * * ** * 21865788 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCGTTTTGTGAT-AAATCAATTG 1 --ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAAT-AATTG * * * * 21865852 -TTTA-TTTATA-AAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTTATT-TATTAAATTTTCAAAAATT 63 TTTTAGTTCATATAAA-CTTATTCGA-AATAAAATAATAC-TATTCTACT-AATATTCCAAAATT * * * 21865912 AATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA 124 AAT-AACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA 21865946 CTGAGCGAGT Statistics Matches: 13941, Mismatches: 3015, Indels: 2159 0.73 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 867 24 0.00 868 8 0.00 869 4 0.00 870 4 0.00 871 60 0.00 872 62 0.00 873 155 0.01 874 69 0.00 875 62 0.00 876 134 0.01 877 50 0.00 878 16 0.00 879 135 0.01 880 235 0.02 881 179 0.01 882 133 0.01 883 221 0.02 884 213 0.02 885 320 0.02 886 278 0.02 887 424 0.03 888 613 0.04 889 296 0.02 890 242 0.02 891 843 0.06 892 675 0.05 893 497 0.04 894 748 0.05 895 1135 0.08 896 442 0.03 897 281 0.02 898 689 0.05 899 890 0.06 900 609 0.04 901 972 0.07 902 265 0.02 903 511 0.04 904 581 0.04 905 133 0.01 906 210 0.02 907 211 0.02 908 112 0.01 909 49 0.00 910 9 0.00 911 37 0.00 912 32 0.00 913 13 0.00 914 22 0.00 915 3 0.00 916 35 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (882 bp): ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT TAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTATTCTACTAATATTCCAAAATTAATAACA AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA TCTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT ATTCAAAATAAAATAATATAATAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAA TAAATCTGTTTATCGAACAATTCAAATAATTATGGTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTAGTTAACATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA TACTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATGAAC AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA TTTAAAAATTAACAAGTAAAGATTTAAAAATAAATTGTTTACGAATCAGTTCAAATAATTATGAC TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA AGATTTTAAAAATAAATTTATTATACCAAAAAGGCTA Found at i:21860219 original size:538 final size:535 Alignment explanation

Indices: 21853871--21865945 Score: 6996 Period size: 540 Copynumber: 22.5 Consensus size: 535 21853861 TTTTGTTTTG * * 21853871 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTATGAAAATTAATAAGTAA 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-GAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * ** * * 21853935 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAGCAACTTTAAATAATTATGACTATTCCAATAGTT-T 64 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * * * 21853999 CCCT-TTTGAAATTGCTATAGCCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAGTT 129 --CTATTTCAAATCGTTATA--ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT *** ** ** 21854063 TATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA---TAAAGACACTTAATAAGTAAATCATTTAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAA-A-A-TTAATAAGTAAAAGATTT-A * * * * * * * * 21854125 AAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAA 250 AAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA ** ** * * * 21854189 ATTTTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCGTACAAGCTTATTC-AAATT 315 ATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-T * * * * * ** * 21854253 ACAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAAAATG 379 AAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAATAAATCTA ** * ** * * * * 21854317 TTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACC 442 TTGCTTGAACAA-TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACC * * * * 21854382 TTTTGTTCTGTAATAAAACAACTATTT-TAGT 505 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T * * * * * * * * 21854413 TTATATAAGCATATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCA-AAAAATAATGAGTAA 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * * * 21854477 GAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTAT 64 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * ** 21854542 CTATTTCAAAT-ATTATGACA-TTTTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTAT 129 CTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA- * * * * 21854605 TTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATCTTTGAAAATTTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAT 191 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAT * * * * * ** 21854668 AAATATGTTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG 255 AAATATG-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA ** * * * * * * * 21854733 TTATGACTTTTTGTTTTGTCA-AAACCAATTGTTTCTGTACATAAAAGCTTATTTGGAGTAAAAT 319 TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT ** * * * * 21854797 AATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAGAAAATAAATCTGTT--T 384 AATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A-AAAATAAATCTATTGCT ** * * * * * * * * * 21854860 ACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATCGCTATGATCTAT 447 -TGAA-C-AATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTT * 21854925 TGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTAT 508 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * * ** 21854953 TCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATGCTAACTTATTAATATTCT-TAAAATTAATAAGTTG 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA ** * * * * * * * 21855017 GGGATTTAAAAAATAAAGT-TATTCACCGAACAAGTT-AAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATT 64 AAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATT * ** 21855079 ATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAAAT 127 ATCTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT ** * * 21855143 TATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA * * * * * * * * 21855204 CTAAATCTATTTATCGAACCAGTT-ATAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATCTCAAAT 254 -TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCA-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** *** * * * * 21855268 TGTTATG-TTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGT-AA 317 CATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA * * * * * * 21855331 ATTATTGCTAAATTAATAGTATTCTAAAAATT-AT---TAACAGATTTAAAAAATAAATATCT-T 382 ATAATT-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAT-AA-ATCTAT * * * * 21855391 TG-TTGAACCAATTCAAAT-GATTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC 443 TGCTTGAA-CAATACAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACC * * * * * 21855454 TTTTGTTTAGTTATAAAATAATTTTTTCAAT 505 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * ** 21855485 TCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCA-AAAATTAATAAACAAT 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAA- * * * 21855549 AA-ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTACGGCTATTTGAACAATT 64 AAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * *** * * * * 21855612 ATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AATG 127 ATCTATTTCA-AATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-G ** * * * * * 21855675 CTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGACAAGTTAAAGATTTAAC 187 CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA- * *** * * ** * 21855740 AAATAAGTCA-GTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAA 251 AAATAAAT-ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * ** * * * * 21855804 ATCGTTACGAACTTTTATTTCATTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTC-AGAA 315 ATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGA-AA * * * 21855867 TAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTT 378 TAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATCT ** ** * * * * * 21855931 A-T--TT--AC----CAAACCG-GCT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTATAACA 441 ATTGCTTGAACAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACC * * * * 21855985 TTTTATTCTGTCATAAAATAATTG-TTGTAGT 505 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T * * * ** * * * 21856016 TCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAATTAACAACTAAG 1 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAA * * * * * * * * 21856080 AGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAGCAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTAT 65 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * 21856144 CTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTT 129 CTATTTCAAATCGTT-ATA-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT * * * ** 21856208 ATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATGTTATGAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAA 190 ATTCAAAATAAAATAAT-AT--TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA ** * ** *** 21856273 AAGTAAACCTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTAT-GGTCATGCCAACAATTATCTATTTCA 252 AA-TAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * ** * * 21856336 AATCGTTATTACC-TTT-TTTCTGGTCATATAACAATTATAGTT-GA-AAATGCAAGCTTATTTG 314 AATCATTATGACCATTTGTTT-T-GTCATAAAACAATTGT--TTCTATTCATACAAGCTTATTCG * * * * * * 21856397 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAC 375 AAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAAT ** ** * * * ** * * * 21856462 CTATTTATCAAACTATCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATA 439 CTATTGCTTGAACAAT-ACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATG ** * * * 21856527 ACCTTTTGCATTGTCATAAAACAATTATTTTTGT 502 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * * * * 21856561 TCATATAAGATTATTCGAAATAAAATAATATTGATCTAATAATATTTAAAAAATTAACAAG---- 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAA * ** ** * ** * 21856622 AGAATT-AAAAA-AAAT-TGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATC 65 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * ** 21856684 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAAT-ATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTT 130 TATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTCT-ATTCATACAAGCTT *** * * ** 21856748 ATTTGGAATAAAATAGA-ATTAATTTATTAATATTTCAAACATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAA 190 ATTCAAAATAAAATA-ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA * * * * * * 21856812 ATAATTTTGTTTAT-GTAACTAGTTCAAATAATTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT 253 ATAAATATGTTTATCG-AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * * * * * * * * 21856876 CATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTAATCGAAATAAA 317 CATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA * * * * * * 21856941 GTAATACT-ATTCTATTAATATTTCAAATATTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT 382 ATAATTCTAATT-TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTG * ** * ** * * * * * * 21857001 ATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGACTTTT 445 CTTGAAC-AATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTT * * * 21857066 TGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGT 508 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * 21857094 TTATACAAGCTTATTTAGATTAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAA 1 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * * 21857158 AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTAT 64 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * 21857223 TTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTT 129 CTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT * * * 21857287 ATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATT-A-A---T---AA-T-A-AAG----AGATTTAAAAAA 190 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA * * * * * * * * * 21857337 TGAATCTGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCA 254 TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * * * * * * 21857402 CTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAA 319 TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAA * * * * * 21857466 TAATACAAATTTATTAATATT--AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT 383 TAATTCTAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCT-ATT * * * * * * * 21857529 AC-TGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCA-AATTATTTATTTTAACTTGTTATGAC 444 GCTTGAACAA-TACAAAT-AGTTATGACTAT-T-TGAACAATTATCTATTTCAA-ATGTTATGAC * * 21857591 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAT 504 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * 21857623 TCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAGCAAA-TAATAAGTAA 1 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAA * * * * 21857687 AAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTGTAGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA 64 AAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * * * 21857752 TCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGTT 128 TCTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT * * * * * ** * * 21857816 TGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAA 189 T-ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA * * * * * * * * 21857880 AAAGAATCTATTTAAT-GAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAA 253 ATA-AATATGTTT-ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * ** * * * * * 21857944 ACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTTTTCCAAATA 316 TCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATA * * * 21858008 AAATAATT-TAAAATTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTAT 380 AAATAATTCT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATCTAT * * * * 21858071 T-TTCTGAACATATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT 443 TGCT-TGAACA-ATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACC * * * * * 21858135 TTTTGTTTTCTCATAAACCCATTGGTTTTTTT 505 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTAT * * ** * ** * 21858167 TCATAAAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAACATCCAAAAAATTAATAAGTAA 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTAGAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * 21858232 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTT-TGATTATTTAAACAATTAT 64 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * ** 21858296 TTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTA 129 CTATTTCAAATCGTTATAA--TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * 21858361 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACG 191 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-T * * * * 21858422 AAA-ATTGTTTA-C-AAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAAT 255 AAATA-TGTTTATCGAACA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * 21858484 CATTATGATC--TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTCGAAGTAAA 317 CATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA ** * ** * * * 21858547 AT-ATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTT 382 ATAATT-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCT-ATT * * * * * * 21858607 AC-TGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTCTTTTGACCTT 444 GCTTGAA-CAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCTT ** * 21858671 TTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGT 507 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T * * * * * * 21858700 TCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-CTTGTACTAACATTCA-AAAATTAATAAGCAA 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAA * * * 21858763 GAAG-TTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATT 64 -AAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * 21858827 ATCTATTTAAAATTGTTATAACCTCTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCAATTCATAAAAGCT 127 ATCTATTTCAAATCGTTATAA--T-TTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT * * * * * ** 21858891 TATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGATTTAAAAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA * * * ** * 21858956 ATAAATCA-GGTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATTGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA 253 ATAAAT-ATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * * * * * * 21859019 TCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCTAAATA 316 TCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATA * * * 21859083 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAA--TA-T 380 AAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATT * * * * * * * 21859145 GCTTATAGAATCAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAAT 444 GC-T-T-GAA-CAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGAC * * * 21859210 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGT 504 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * ** * * 21859242 TCATACAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATCTAACAGTA-TTATGAAAATTAATAACTAA 1 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-GAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * * * 21859306 GAGCTTTAAAAAATAAA-ATTTTTTATTGAATCAA-TTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATT 64 AAGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * ** * * 21859369 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTTTTGTCTTAAAATAAATGTATT-TGCTCATATAAGTT 127 ATCTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTTTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCTATTCATACAAGCT * 21859433 TGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA * * * * * * * 21859494 GTAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAA-TAATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT 254 -TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * *** * 21859558 CATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACTCTCTTATTTGAAATAAA 317 CATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA * * * * 21859623 GTAATGT-TAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTATTAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTAT 382 ATAAT-TCTAATTTATTAATATTCC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTT-AAAAATAAATCTAT * * * * * * * * 21859685 TGGCTTCACCAATAGAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGTGTTATAACCT 443 T-GCTTGAACAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCT * * * 21859750 TTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTAT 506 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * ** 21859780 TCATACATGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGACAACTAATTGGTAAA 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAA * * * 21859845 AGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT 65 AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * * 21859910 TTATTTCAAATCATTATAATTTTTTTTTTCATAAAATTATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTT 129 CTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC * * * * *** * 21859975 AGATTACAATAATATTAATTTATTAAAATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAATAAAT 194 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAT * * * * * 21860040 ATGTTTATCGAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG 259 ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG ** * * * * * * 21860105 ACCATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATACAAAATAAAATAATTC 324 ACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTC * ** * ** 21860170 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTT-ATTATGAATCTATTTATTGAACAA 389 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTGCTTGAACAA * * * * 21860234 GCT-CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGT 454 --TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGT 21860298 CATAAAACAATTGTTTCTAT 516 CATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * 21860318 TCATTCAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAGGTAG 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * * 21860382 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTAT 64 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * ** * 21860447 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATAC-AGAATT 129 CTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTT * * * * 21860511 ATTCAAAATAAAATAATATCAATTCATTAAGATTTTGAAAA-T--TAA-TAAAAG-TATTAAAAA 190 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAA * * * * * * * 21860571 CTAAATCTGTTTA-CTGAACTAA-TTCAAATATTTATGACTTTTTGATCAATTATATATCTCAAA 254 -TAAATATGTTTATC-GAAC-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * * * * * * * * 21860634 TCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAA 316 TCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAA * * **** * 21860698 GAA-AATACTAATTTAATAATA----AAAAA-T-A-AA-T--GAG-TTT--TGCCAAA-CCA--G 381 -AATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTG * ** * * ** * 21860746 --T------T-CAAATAATTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCCGACATTTT 445 CTTGAACAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGAC-CTTT * ** * * 21860802 GT-TTAGT-AAAAAAAACAATTATTTC-AGT 508 -TGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T * * * * * * 21860830 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATTAGCAAG 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAA * * * * * * * 21860895 AGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTAT 65 AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * * * 21860960 CTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAAGAATTGTTT-TTTATCATACAAGGTT 129 CTATTTCAAATCGTTA-TA-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTT * * * * * * * * 21861024 GTTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAAA 190 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA * * * * * * * 21861089 TAAATCTATTTA-CTAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAAT 254 TAAATATGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * * * * * 21861152 CAATTATTGAAAAAAAATAAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCT 317 C-ATTA-TG-----------ACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT * * ** * * ** * * * 21861217 TATTTGATATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCTGAAAATTATTCACTAAGAGATTTAAAAA 369 TATTCGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * * * * ** * * 21861282 TTAAATTTGTTTGC-CGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT 434 -TAAATCT-ATTGCTTGAAC-AATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * * * * * 21861346 CATTATAACCTTTTCTTTTGTCAGAAAATAATTTTTTCAAT 496 -GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * 21861387 TCA-AGCTAGCTTATTTAGAACAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT 1 TCATA-CAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT * * * * * * * * * 21861449 AAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCTAACCAA-TTCTAATAATTATGACCATTTGAATAAT 62 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * * * * * * 21861513 TATCAATTTGAAATCATTATGACCTTTGGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGT 126 TATCTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTT-TTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGC * *** * ** * ** * 21861578 TTGTTTGGAATAAAACAATGCTAATCTATTAATATTCCAACAATTAATAAG----AGATTTAAAA 188 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAA * * * * * * 21861639 AATAAATCTTTTTATCAAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT 252 AATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** * * * 21861704 TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAA-AA 317 CATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAA ** * * 21861765 AA-AA-TAAAAGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAACTAAATC-A 381 AATAATTCTAA-TT-TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAA-TAAATCTA * * * * * * * * * * 21861826 GTTTAC-TGAATTAGTTC-AA-A-TTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTA 442 --TTGCTTGAA-CAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGA * * * 21861887 TC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTT-TCAA 503 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-AT * * * * * 21861920 T-ATAGAAGCTTATTTGAAATAAAAAAAAATACTAATTTACTAATATTTCA-AGAATTAATAAG- 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAAT--AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT ** * * * * 21861982 ---AGATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT 62 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * * 21862044 CTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTTATATAAGCT 127 ATCTATTTCAAATCGTTATAA--TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT * * * * * * 21862109 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA * * * * * * * 21862174 AAAACCA-ATTT-GCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTATTTATTTCAAAT 254 TAAA-TATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** * * * * * * * * 21862236 TGTTATG-CCATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATA 317 CATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATA * * ** * * 21862300 AAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATT 380 AAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTA-T * * * * * * * * 21862365 TGC-TAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACTT 443 TGCTTGAA-CAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCT * * * 21862429 TTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTAT 506 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * ** * * * ** 21862459 TCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA-AAACTTAATAACCAA 1 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA * * * ** * * * * * * * 21862523 GAAAATTAAAAAAATAAATTTAATTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAGTTA 64 -AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * ** * 21862588 TTTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCT 128 TCTATTTCAAATCGTTAT-A--ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT ** * ** * * * * 21862652 TATTCTGATTAAAATAATGCTAACTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA * * * * * * 21862717 ATAAATTTATTTA-CTGAATC-AGTTCAAATGGTTA-AGA-TAATTAGAACAATTATCTACTTGA 253 ATAAATATGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATA-ACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA * * * * * * 21862778 AATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTC-AGA 314 AATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-A * * ** * * * * 21862841 ATAAATTAATCCTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAAATAAATT 377 ATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATC * ** * * * * * * * * * * 21862906 TGTTTATCGAACAAGTTCGAATAGTTATTACTGTTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAA 440 TATTGCTTGAACAA-TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGA * * * * 21862971 CCTTTTGATTTGTCACAAAACATTTGTTTCAAT 503 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * ** * * * * 21863004 TAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTCACTAAAA-TAATAAGTAA 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-GAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * 21863068 GAA-ACTTAAAAAATAAATAAGTTTATCGAATTAA-TTGAAATAATTATAAAC-ATTTAAACAAT 64 -AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAAT * * * * 21863130 TATCTATTTAAAATCGTTATAATTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-T-TTACCACACAAG 126 TATCTATTTCAAATCGTTATAA-TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATT--CATACAAG ** * * 21863193 CTTATTTGAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAA 187 CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA * * * * * * 21863254 AAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTAT-TCATCTCAA 251 AAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAA * * * * * * * * * * 21863318 ATCATTAAGATC-TATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTAATCGTATAAACTTATTTGGTTAA 315 ATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCG-AAA * * * 21863382 -AAAA-AATACTAATCTTA-TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT 378 TAAAATAATTCTAAT-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * ** * * * * * 21863440 GTTTGCCT-AGTCAAT-CAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTTTAAATTGTTCTGA 441 -ATTGCTTGA-ACAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGA * * * * 21863503 CATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATAT 503 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TAT * * * * 21863537 T-TTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAAAAAG-AA 1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAA ** * * * * * 21863599 ATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTA-C---CAA--ACAAGTAGTGATGACTATTTGAACAATTA 64 AAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * * * * * * 21863658 TTTATTTAAAATCATTATGACTATTTCTTTTGAT-ATAAAATATTTGTTTCAATTCATAAAAGCT 128 TCTATTTCAAATCGTTAT-A--ATTTTTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT * * * * * * * 21863722 TATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT-AAAA 189 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA * * * * * * * 21863785 TAAATTTGCTTATTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCA 254 TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * * ** * 21863850 TTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAA 319 TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAA * * * * * * ** 21863914 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AGTGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTAT 383 TAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTGCT * * * * * * 21863978 CGAATCAATTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTT 447 TGAA-CAATACAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTT * * * * * 21864042 ATTTGGTCATATAACAATTATTT-TTT 509 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * 21864068 ATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAAGTA 1 -TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTA * * * * 21864132 AAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT 63 AAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * ** * * * 21864196 TGTAT-TCTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACCAGTATTTCTGTTCATACAAG 126 TATCTAT-TTCAAATCGTTATAA--TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG * * * * ** ** * * 21864260 CTTATTCGAAATAAAGTAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAA 187 CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA * * * * * * * 21864325 AAAGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTA-ACACTATATGAACAATTATCTATTTCAA 251 AAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * 21864389 ATCA-T-T-----TTTG--TTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATACTAGCTTATTC-AGAA 315 ATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AA * * ** * * * 21864443 TAAAATAAAAT-AAATTTATTAATATTTTAAAAAGTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT 378 TAAAAT-AATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCT * * * ** * * * 21864507 ATTTACCT-AATCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGA 441 A-TTGCTTGAA-CAATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGA * * * 21864571 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTAT 503 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * 21864604 TCATACAAGTTTGTTAAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCA-AAAATTAATAA-T-- 1 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAA * * * * * * * ** 21864665 -AGATTTTAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTAT 64 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * ** * * 21864729 TTATTCCAAATTGTTACAATTTTTTGT-TCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGTTT 129 CTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTTTGTC-A-T--AAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT * * * * * * * * 21864793 ATTCAGATTAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAA 190 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA * * * * * * * * * * 21864857 TAAAT-TGTTTACCAAACTAGATCAAAAAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCA 254 TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * * * 21864921 TTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAA-AATTATTT-TAGTTCATATC-AGCTTATTCGAAAT-AA 319 TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCGAAATAAA * * * * * * 21864982 ATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA 382 ATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTG * ** * * * * * 21865047 C-CGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TCATTTGAAATTGCTATAACTTT 445 CTTGAACAA-TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAA-TGTTATGACCTT ** ** * 21865110 TTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTAT 507 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * 21865139 TCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTGATATTAAGACAATTAATAGGTAAA 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAA * * * ** * 21865203 AGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTAAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTAT 65 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * 21865266 TTATTTCTAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATCCAAGCTTA 129 CTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * * * * 21865331 TTCATATTAAAATGATATTAA-TTATTAAATATTTCAACAACTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAA 191 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT-AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA * * * * 21865394 TAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC 254 TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * * * * * * 21865458 ATTGTGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA 318 ATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA * * * * * * * * * * * 21865522 ATACTACTAATTCATGAATATT-CTAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCAAAAAATTAATTTCTTT 382 ATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATT-TAAAAATAAATCTATTG * ** * * * * ** * 21865586 ATCAAACATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTT 445 CTTGAACA-ATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATGTTATGACCTTT * 21865651 TGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGT 508 TGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTAT * ** * ** * 21865679 TCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATATTA-TAAATTTATTAACGTTCCAG-AAATTAATAAGTA 1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTA * * * 21865742 AAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTTAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT 63 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * 21865805 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCGTTTTGTGAT-AAATCAATTG-TT-TATTTATAAAAGC 127 ATCTATTTCAAATCGTTAT-A-ATTT-TTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCTATTCATACAAGC * * 21865867 TTATTCAGAATAAAATAATACTT-ATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAA 188 TTATTCAAAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-A * 21865930 AAAATAAATCTGTTTA 250 AAAATAAATATGTTTA 21865946 CTGAGCGAGT Statistics Matches: 9085, Mismatches: 1883, Indels: 1132 0.75 0.16 0.09 Matches are distributed among these distances: 511 41 0.00 512 82 0.01 513 132 0.01 514 4 0.00 516 3 0.00 517 61 0.01 518 11 0.00 519 3 0.00 522 2 0.00 523 3 0.00 524 137 0.02 525 11 0.00 526 40 0.00 527 81 0.01 528 164 0.02 529 192 0.02 530 519 0.06 531 240 0.03 532 473 0.05 533 673 0.07 534 343 0.04 535 319 0.04 536 324 0.04 537 697 0.08 538 795 0.09 539 736 0.08 540 850 0.09 541 245 0.03 542 409 0.05 543 429 0.05 544 295 0.03 545 410 0.05 546 34 0.00 547 2 0.00 549 1 0.00 550 2 0.00 551 5 0.00 552 61 0.01 553 1 0.00 555 1 0.00 556 133 0.01 557 78 0.01 558 43 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (535 bp): TCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAAA GATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT ATTTCAAATCGTTATAATTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATAT GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTA ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTGCTTGAACAATA CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA AACAATTGTTTCTAT Found at i:21861512 original size:18 final size:19 Alignment explanation

Indices: 21861489--21861540 Score: 58 Period size: 18 Copynumber: 2.9 Consensus size: 19 21861479 AACCAATTCT 21861489 AATAATTATGACCATTTG- 1 AATAATTATGACCATTTGA * 21861507 AATAATTAT--CAATTTGA 1 AATAATTATGACCATTTGA * 21861524 AATCATTATGACC-TTTG 1 AATAATTATGACCATTTG 21861541 GTTTTGTTAT Statistics Matches: 28, Mismatches: 3, Indels: 6 0.76 0.08 0.16 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.21 17 8 0.29 18 13 0.46 19 1 0.04 ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.10, T:0.40 Consensus pattern (19 bp): AATAATTATGACCATTTGA Found at i:21861946 original size:178 final size:174 Alignment explanation

Indices: 21861419--21862451 Score: 456 Period size: 177 Copynumber: 5.8 Consensus size: 174 21861409 AAGTAAAATG * * 21861419 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTATCT-AAC 1 AATTTACTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAATC-AGTTTA-CTGAAC * * * * * * * ** * * * * 21861482 CAATTCTAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCAATTTGAAATCATTATGACCTTTGGTTTTG 61 TAGTTC--A-AATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA * * * * * * * * * * ** 21861547 TTATAAAACAAATGTTT-TTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAACAATGCT 123 TCATAAAACAATTGTTTCTCAAT-ATAGAAGCTTATTCGAAATAAAAAAAT-AA * * * ** * * 21861600 AATCTATTAATATTCCAACAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-TCAAACCA 1 AATTTACTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAGATTT-AAAAATAAATCAGTTTACT-GAACTA * * * * * * * * 21861661 GTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC 63 GTTC-AA-A-TTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATC * * * 21861726 AT-AAACAATTGTTT-T-AGTTCATAAAAGCTTA-TC-CAA-AAAAAAATAA 125 ATAAAACAATTGTTTCTCA-AT-ATAGAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATAA * * 21861772 AAGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAATGATTTAAAAACTAAATCAGTTTACTGAAT 1 AA-TT-TACTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAA-GATTTAAAAA-TAAATCAGTTTACTGAAC * * * * * * 21861837 TAGTTCAAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATC-TTTGTTTTCTCA 61 TAGTTCAAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCA * * 21861901 TAAAACAATTGCTTT-TCAATATAGAAGCTTATTTGAAATAAAAAAAAATACT 126 TAAAACAATTG-TTTCTCAATATAGAAGCTTATTCGAAAT--AAAAAAATA-A * ** 21861953 AATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCAAACTAG 1 AATTTACTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAGATTT-AAAAATAAATCAGTTTACTGAACTAG * * * * * 21862015 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCA 64 -TTCAA-A-TTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCA * *** * * * 21862080 TAAAATAATTGTTTCTGTTTATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT 126 TAAAACAATTGTTTCTCAATATAGAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATA-A * * * * * * * 21862130 AATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAAAACCAATTTGCTGAACTAG 1 AATTTACTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAATAAATCAGTTTACTGAACTAG * * * * * * * * 21862195 TTCAAA-TAGTTAAACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GCCATTTTGTTTTATC 64 TTCAAATTA--T-GACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTCTATC * * * * * * * 21862258 ATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATAT--AAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACT 125 ATAAAACAATTG---TTTCTCAATATAGAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATA-A * * * * * * * 21862310 AAGTTATTAATATTTTAGAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTA-TTTGCTAAACC 1 AATTTACTAATATTTCA-AAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAA-TAAATC-AGTTTACTGAACT * * * * * * ** * * * 21862374 ATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACTTTTTGTTTTGT 62 AGTTC-AA-A-TTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT * 21862439 CATCAAACAATTG 124 CATAAAACAATTG 21862452 GTCCTATTCA Statistics Matches: 686, Mismatches: 114, Indels: 103 0.76 0.13 0.11 Matches are distributed among these distances: 172 2 0.00 173 10 0.01 174 35 0.05 175 79 0.12 176 45 0.07 177 121 0.18 178 67 0.10 179 120 0.17 180 93 0.14 181 49 0.07 182 61 0.09 183 3 0.00 185 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (174 bp): AATTTACTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAATAAATCAGTTTACTGAACTAGTT CAAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAA CAATTGTTTCTCAATATAGAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATAA Found at i:21862323 original size:180 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21861173--21865974 Score: 3083 Period size: 181 Copynumber: 26.8 Consensus size: 179 21861163 AAAAAATAAA * * * * * * ** * * 21861173 CCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGATATAAAATAATAGT 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT * * * * * * * * * * 21861238 AATCTAATAATATTCTGAAAATTATTCACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACTA 66 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACTA * * * * * 21861303 GTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA 130 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-G * * * * * * * * * 21861354 CCTTTTCTTTTGTCAGAAAATAATT-TTTTCAATTCA-AGCTAGCTTATTTAGAACAAAGTAA-A 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * 21861416 ATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTATCT- 64 CT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTA-CTG * * * * * * * * * 21861479 AACCAATTCTAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCAATTTGAAATCATTATG 125 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * *** * * 21861534 ACCTTTGGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAACAATGC 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * * * 21861599 TAATCTATTAATATTCCAACAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTA-TCAAA 65 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTACT-GAA * * * * * 21861658 CCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATG 127 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * 21861711 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAAAAAATAA-A 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * * * * 21861773 --AGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAACTAAA-TCAGTTTACTG 64 CTAATT-TATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTA-TTTACTG * * * * * * * 21861834 AATTAGTTC-AA-A-TTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGT- 125 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG ** * * * * * * * 21861885 TATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAAT-ATAGAAGCTTATTTGAAATAAAAAAAAA 1 CCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA-ATAAAATAA * * *** ** 21861949 TACTAATTTACTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCAA 62 TACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGA * * * * 21862010 ACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAA 126 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-G * * * * * * * * 21862065 CCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTTATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT * * *** * 21862130 AATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-AAACCAATTTGCTGAACTA 66 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACTA * * * * 21862194 GTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG 130 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * 21862243 CCATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA 1 CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * * * * * * * 21862308 CTAAGTTATTAATATTTTAGAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCTAAAC 64 CTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * * * * ** * 21862373 CATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAA 128 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-G * * * ** * ** * 21862426 CTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTATTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACT 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT * * * ** * * * ** * 21862491 AATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATTTAATTGTTGAACC 66 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACT * * * * * * * 21862556 AGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAGTTATTTATTCCAAATTGTTATG 129 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * ** ** * * 21862607 ACCTTTTTCTTTTGTTGTAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATG 1 -CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * * 21862671 CTAACTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA- 64 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * * * * * * 21862735 TCAGTTCAAATGGTTAAGA-TAATTAGAACAATTATCTACTTGAAATCGTTCTG 128 T-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * * 21862788 ACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAATTAATC 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA ** * * * * 21862852 CTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGA 64 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACT-GA * * * * * * * * * 21862916 ACAAGTTCGAATAGTTATTACTGTTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAA 126 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-G * * * ** * * ** * 21862971 CCTTTTGATTTGTCACAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATAC 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAC * * * * * 21863035 TAATTTATTAATACTCACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAA-TAAGTTTA-TCGA 65 TAATTTATTAATATTTA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTACT-GA * * * * * * * * 21863097 ATTAATTGAAATAATTATAAAC-ATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATA 126 ACTAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG ** * * * ** 21863151 ATTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTT-TACCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA- 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * ** 21863214 TCAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC 65 T-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * * * * * 21863275 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTAT-TCATCTCAAATCATTAAG 128 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATG * * * * * * * * *** 21863327 -ATCTATGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTAATCGTATAAACTTATTTGGTTAA-AAAA-AAT 1 CCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TT-CAAAATAAAATAAT * * 21863389 ACTAATCTTA-TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTT--TG- 63 ACTAAT-TTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGA * ** * * * * * * 21863445 CCTAGTCAATCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTTTAAATTGTTCTG 126 ACTAGT---TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * * 21863502 ACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATT-TTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATA 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * * * * * 21863566 -TAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAAAAAG-AA-ATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTAC-C 64 CT-AATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATTTATTTACTG * * * * * 21863627 AA--A---CAAGTAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATG 125 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * ** * * 21863677 ACTATTTCTTTTGAT-ATAAAATATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA 1 CCT-TTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * * * ** * 21863741 CTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGCTTATTGAAC 64 CTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * * * * * 21863803 AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATG 128 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * ** 21863855 ACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATA 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA * * * * 21863919 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AGTGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTA-TCGAA 64 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAA * * * * * 21863982 -TCAATTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA 127 CT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TG * * * * * * * * 21864036 CCTTTTATTTGGTCATATAACAATTATTTTT-TATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAG 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * * 21864100 TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC 65 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * * * * 21864165 TAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAT-TCTTCAAATCGTTATAA 128 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTAT-G * * * * * * * * * * 21864218 CCTTTTATTCTATCATAAAACCAGTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAGTAATACT 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT * ** * * * * * * 21864283 AATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTT-GTCAAACT 66 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAACT * ** * 21864347 AGTACAAATAGTTAACACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT- 129 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * 21864394 --TTTTG--TTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AA 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * 21864453 TAAATTTATTAATATTTTAAAAAGTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCT-A 65 T-AATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTA-CTGA * * * * 21864516 A-TCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATG 126 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * 21864570 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATACAAGTTTGTT-AAGAATAAAATAATA 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATA * * * * 21864634 CTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTTAAAAATAAATCTATTTA-TCAAA 64 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAA * * ** * * * ** 21864694 CTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTCCAAATTGTTACAA 127 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TG ** * * * * ** * * * * * 21864748 TTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACT 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT * * * * * ** 21864813 AATTAATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACT 66 AATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACT * * * * * * * 21864875 AGATCAAAAAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATG 129 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * 21864926 ACCTTTTGTTTTGTGATAAAA-AATT-ATTTTAGTTCATATC-AGCTTATTCGAAAT-AAATAAT 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT * * * * * 21864987 ACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAA 63 ACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA * * * * * * * 21865052 CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TCATTTGAAATTGCTATAA 127 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTAT-G * ** ** 21865106 CTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA 1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA * * * * * 21865169 C-AATTTATTGATA-TTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTACTAAA 64 CTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA * * ** * * * * 21865231 CAAGTTAAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATG 127 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * * 21865284 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATCCAAGCTTATTCATATTAAAATGATAT 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * * * 21865349 TAA-TTATTAAATATTTCAACAACTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAA 65 TAATTTATT-AATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAA ** * * * * 21865411 AAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTG 127 CTAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * ** * 21865464 ATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATACTA 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA * * * * * * * 21865528 CTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATGAGTAAGAGAATTCAAAAAATTAATTTCTTTA-TCAA 64 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GA * * * * * 21865591 AC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATG 126 ACTAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * *** * 21865645 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATATTA- 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC ** * * * * * * * 21865709 TAAATTTATTAACGTTCCAGAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTTAAC 65 T-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * 21865773 -ACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG 128 TA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG * * * * * * 21865825 ACCTTTCGTTTTGTGATAAATCAATTG--TTTATTTATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC 1 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * * * * * 21865888 TTATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGC 65 TAATTTATTAATA-TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC * * 21865952 GAGTTCAAAT-CTTATGACT-TTTG 128 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG 21865975 NNNNNNNNNN Statistics Matches: 3619, Mismatches: 779, Indels: 450 0.75 0.16 0.09 Matches are distributed among these distances: 171 10 0.00 172 133 0.04 173 7 0.00 174 36 0.01 175 247 0.07 176 236 0.07 177 326 0.09 178 314 0.09 179 428 0.12 180 645 0.18 181 732 0.20 182 471 0.13 183 34 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (179 bp): CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACTAG TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG Found at i:21865060 original size:358 final size:355 Alignment explanation

Indices: 21860813--21865947 Score: 2461 Period size: 358 Copynumber: 14.3 Consensus size: 355 21860803 TTTAGTAAAA * * * 21860813 AAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATT 1 AAAACAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT * * * * * * * 21860876 CAAAAAATTAATTAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGCTCAAATAGAT 65 C-AAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-AAACTAGATTAAAAAGTT * * * * * * * * * * * * 21860940 ATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAAGAATTG 125 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA * * * * * 21861005 TTTTTTATCATACAAGGTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAAT 190 TTTTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-ATTAATATTTCAAAAATTAAT * * * * 21861070 AAGTAAGAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGA 253 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGA ** * * 21861133 ACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTGAAAAAAAATA-AACCTTTTGTTCTA-TC 315 ACAA-T-TAT--TT-ATTTCAA--ATTG-------TTACAACTTTTTGTT-TATTC * * * * ** * * * * 21861187 ATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGATATAAAATAATAGTAATCTAATAATATT 1 --AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT * * * * * ** * * 21861252 CTGAAAATTATTCACTAAG--AGA-TTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTTAAATAGT 64 -TCAAAA--ATT-AATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACTAGATTAAAAAGT * * * * * * * * 21861314 TAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCAGAAAATAATT 124 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT * * * * * * 21861379 -TTTTCAATTCA-AGCTAGCTTATTTAGAACAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT 189 ATTTT--ATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTCAAAAAT * * * * * 21861441 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCTAACCAA-TTCTAATAA-TTATGACCAT 249 TAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTC-AAAAAGTTATGACTAT * ** * ** ** * * * * 21861504 TTGAATAATTATCAATTTGAAATCATTATGACCTTTGGTTTTGTTAT 311 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTG-TTTATT-C * * * * * * *** * * * * 21861551 AAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAACAATGCTAATCTATTAATATTCC 1 AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC * * * * * * * 21861616 AACAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTTTTTA-TCAAACCAG-TTCAAATATTTATA 66 AAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-AAACTAGATT-AAAAAGTTATG * * * * 21861676 ACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT 128 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT * * * * * * 21861740 TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAAAAAATAAAAGT--TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG 193 TA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAA- * * ** * * * 21861803 TAA-ATGATTTAAAAACTAAATCAGTTTA-CTGAATTAGTTC--AAA-TTATGGCCATTTAAACA 255 TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACA * * *** * 21861863 ACTATCTATTTCAAATTGTTGTTA-TCTTTGTTT-TCTC 318 ATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTTTAT-TC * * * * * * * 21861900 ATAAAACAATTGCTTT-TCAAT-ATAGAAGCTTATTTGAAATAAAAAAAAATACTAATTTACTAA 1 --AAAACAATT-ATTTCT-ATTCATAAAAGCTTA-TTCAAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAA * * * * * * 21861963 TATTTCAAGAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCCGTTTACCAAACTAGTTTAAATAGT 60 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTAAACTAGATTAAAAAGT * * * * * * * 21862025 TATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATT 124 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT * * * * * * 21862090 GTTTCTGTTTATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTA 189 ATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAATTA * ** * * * * * 21862154 ATAATTAAGAGATTTAAAAAA-AAACCAATTT-GCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATG 251 ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTG *** * 21862216 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGCCATTTTGTTT-TATC 314 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTTTAT-TC * * * * * * * * 21862258 ATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATAT 1 --AAAACAATT-ATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * * * * * * * 21862323 TTTAGAAATTAATTAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATCTATTTGCTAAACCA-TTTCAAATAGT 63 TTCAAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTAAACTAGATT-AAAAAGT * * * ** * * * 21862386 TTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATT 124 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT * ** * ** * * * * 21862451 GGTCCTATTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAA 189 -ATTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAA * * * * ** * * * * * * * 21862516 TAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATTTAATTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGA 252 TAA-TAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGA * * * * * * * 21862581 ACAGTTATTTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGT 315 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTA-CAACTTTTT-GTTTATT-C * * ** * * * * 21862625 AAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATGCTAACTTAATAATATTTC 1 AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC * * * ** 21862689 AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-TCAG-TTCAAATGGTTA 66 AAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACT-AGATT-AAAAAGTTA * * * * * * * * * 21862751 AGA-TAATTAGAACAATTATCTACTTGAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTG 126 TGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA * * * * * ** 21862815 TTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAATTAATCCTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAA 190 TTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAATTAA * * * * * * * 21862879 TAAGAAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCGAATAGTTATTACTGTTTGA 252 TAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGA * ** * ** * * * * 21862944 ACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCAC 315 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTG-TTTAT-TC * * * * * * ** * * 21862987 AAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-CT 1 AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT * ** * * * 21863050 CACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATAAGTTTA-TCGAATTA-ATTGAAATAA- 65 CA--AAAATTAATAAGCAA-AATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-AAACTAGATT-AAA-AAG * * * * ** * 21863111 TTATAAAC-ATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAT-AATTTTTGTTTTGTAATAAAACAA 123 TTAT-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * ** 21863174 TTGTTTT-TTACCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTTCAAAAA 187 TTATTTTATT--CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTCAAAAA * * * * * 21863237 -T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT 248 TTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTT * * * ** * * 21863299 GAACAACTATTCATCTCAAATCATTA-AGA-TCTATGTTT-TGTC 313 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACA-ACTTTTTGTTTAT-TC * * * *** 21863341 TTAAAACAATTGTTTCTAATCGTATAAA-CTTATTTGGTTAA-AAAA-AATACTAATCTTA-TAA 1 --AAAACAATTATTTCTATTCATA-AAAGCTTA-TT-CAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAA * * ** * * 21863402 TATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCTAGTC-A-ATCAAATAG 60 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAAT-TGTTT-ACTAAACTAGATTAAAAAG ** * * ** * * * * * * * 21863462 TTAAAACTATTAGAATAATTATCAATTTTAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATT 123 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT * * * * 21863527 TGTTTCATATT-TTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTT-AGAAAA 188 TATTT--TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTCA-AAAA * * * * * * * 21863589 TTAAAAAGAA-ATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG-T-----AGTGATGACTAT 248 TTAATAATAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTAT * ** ** 21863647 TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACTATTTCT-TTTGATAT- 311 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACT-TTT-TGTTT-AT-TC * * * * * * * 21863694 AAAATATTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTC 1 AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC * * * * * * * 21863759 AAAAATTAATAAGCAAGAGTTT--AAAATAAATTTGCTTATTGAAC-AAATTCAAATAGTTATGA 66 AAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACTAGATT-AAAAAGTTATGA * * * * * * 21863821 CTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTG 129 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT- * 21863886 AATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA- 193 TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAT * * * * * 21863949 ATAGTGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAA-TTATG-GTCATTTCAAC 256 A-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAA-AAGTTATGACT-ATTTGAAC * * ** * * ** 21864011 AATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTC 317 AATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTTTATTC * * * * * * 21864050 ATATAACAATTATTT-TTTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCT 1 A-A-AACAATTATTTCTAT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * * * 21864114 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTTAAATAGTT 63 TTCAAAAATTAATAAG-CAAA-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTAAACTAGATTAAAAAGTT * * * * * * * * 21864179 ATGACTATTTGAACAATTGTATT-CTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACCAGT 125 ATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT * * * ** * 21864243 ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAGTAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAA 189 ATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAA * * * * * * * ** * 21864308 TAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAACACTATATGAA 252 TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAA * 21864373 CAATTATCTATTTCAAA----T-C-A-TTTTTGTTGTCA-T- 316 CAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTT-T-ATTC * ** * * 21864406 AAAACAATTTTTTC-AGTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATT 1 AAAACAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT * * * * * * * * 21864469 TTAAAAAGTAATATGTAAGAGA-TTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAATC-AGTTTAAATAA-T 64 TCAAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTA-CTAAACTAGATTAAA-AAGT * * * * 21864531 TATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT 124 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT * * 21864596 GT-TTTTATTCATACAAGTTTGTT-AAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATT 188 -TATTTTATTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAAT-TATTAATATTTCAAAAATT * * * * * 21864659 AATAAT---AGATTTTAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGA 250 AATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGA ** * * 21864721 GTAATTATTTATTCCAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTAC 315 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTT-TATT-C * * * * * * 21864764 AAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTAATTAATATTTT 1 AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC * * * * * 21864829 GACAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACTAGATCAAAAAGTCATGACT 66 AAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAATTGTTTACTAAACTAGATTAAAAAGTTATGACT * * * * 21864894 ATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAA-AATTATTTTAG 131 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTA- * 21864958 TTCATATC-AGCTTATTCGAAAT-AAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATT 195 TTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-T * * * * 21865020 AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAA-TTATGACTATTTGAACAAT 256 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * 21865084 TATTCATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTT-TGTC 320 TATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTTTAT-TC ** * * * 21865120 ACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTGATA- 1 A--AAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * ** 21865182 TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTACTAAACAAG-TTAAAATCC 63 TTCAA-A-AATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACTAGATTAAAA-AG * * * * 21865244 TTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT 123 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT * * * * * * * * 21865309 TGTTTCTATTCATCCAAGCTTATTCATATTAAAATGATATTAATTATTAAATATTTCAACAACTA 188 TATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTATT-AATATTTCAAAAATTA * * * 21865374 ATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTG 251 ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGT-TATGACTATTTG * ** ** * * * 21865437 AATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTAAT- 314 AACAATTATTTATTTCAAATTGTT-ACAACTTTT-TGTT-TATTC * * ** * * * 21865481 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATACTACTAATTCATGAATA-TT 1 AAAACAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT * * * * * * * * * 21865544 CTAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCAAAAAATTAATTTCTTTA-TCAAAC-A-TTTCCAAATAGT 65 CAAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAA-TAAATTGTTTACT-AAACTAGATT--AAAAAGT * * * * * * 21865606 TATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT 124 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT * * * *** * ** * * 21865671 GGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATATTA-TAAATTTATTAACGTTCCAGAAATTA 189 -ATTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTCAAAAATTA * * * * * * 21865735 ATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTTAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTG 251 ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTG * * ** * * * 21865798 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCGTTT-TGTG 314 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTTTAT-TC * * * * 21865840 ATAAATCAATT-GTT-TATTTATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTTATTTATTAA-ATT 1 A-AAA-CAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T ** * 21865902 TTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT 63 TTCAAAAATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT 21865948 GAGCGAGTTC Statistics Matches: 3720, Mismatches: 788, Indels: 518 0.74 0.16 0.10 Matches are distributed among these distances: 349 62 0.02 350 54 0.01 351 106 0.03 352 170 0.05 353 381 0.10 354 169 0.05 355 122 0.03 356 193 0.05 357 228 0.06 358 490 0.13 359 216 0.06 360 102 0.03 361 341 0.09 362 324 0.09 363 434 0.12 364 44 0.01 365 15 0.00 366 4 0.00 367 1 0.00 368 2 0.00 370 4 0.00 373 3 0.00 374 8 0.00 375 173 0.05 376 59 0.02 377 6 0.00 378 2 0.00 379 3 0.00 380 4 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (355 bp): AAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC AAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAATTGTTTACTAAACTAGATTAAAAAGTTATGACT ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAT TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAG ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA TTTCAAATTGTTACAACTTTTTGTTTATTC Found at i:21868636 original size:176 final size:175 Alignment explanation

Indices: 21866975--21868912 Score: 1039 Period size: 182 Copynumber: 10.9 Consensus size: 175 21866965 NNNNNNNNNN * * * * * 21866975 AATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTTATTTATTAATATTAT-AAAA 1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAA * * * * * ** * 21867039 TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAGT-TGTTTATCAAACAAGCTT-AAATAGTCATGTCCA 65 TTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTGA-CTAACCAG-TTCAAATAGTTATAACTA * * * * 21867102 TTTAAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCAT-AAAT 123 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * ** * * * * 21867154 CAATTATTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAA 1 -AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAA * * * * * * ** 21867219 ATTAATAAGAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCAAACCAATTTAAATAGTTATGTCTATTTGA 64 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTGA-CTAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA * * * * * 21867284 ACAATTAACTATCTCAAATAATTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAAC 128 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * * ** * * 21867331 AATTGTTTCTGTTAATACAAGCTTATTCAAAGTAACAT-TTTCTAAACTAATAATATTCT-AAAA 1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAA * * * * * 21867394 TTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATGTATTTG-TTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAG 65 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTGACT-AACCAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTG * * * * * * * 21867457 AACAATTATCCATTTGAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGCCTTAAAAT 127 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT ** * * * 21867506 AATTGTTT-TAGTTCATACATTCTTATTCAAAATAAAA-ATATTACTATTTTATTAACATTTAAA 1 AATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATA-ATT-CTAATTTATTAATATTTTAA * ** * * 21867569 AAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATAAGTTCATATAGTTATGACT 62 AAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATCTATTGACT-AACCAGTTCAAATAGTTATAACT * * * * * * * 21867634 ATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCATCATGACCTTGTATTTTATCATAAAAT 122 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * ** * * 21867688 AATTGTTTCAGTTCATTA-AAGCTTAGCCAAAATAAAATAATAT-TACTTTATTAATATTTCAAA 1 AATTGTTTCTGTTCA-TACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTTAAA * * * * * * ** * * * * * 21867751 AATTGAGATACTAAATATTTAAAAGATAAGTC-AGTTTATTGAATGAATTTAAATAATTATAGCC 63 AATT-A-ATA--AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTGACT-AACCAGTTCAAATAGTTATAACT * * 21867815 ATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGAACTTTTGCTTTGTCATAAAAT 122 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * * * * 21867868 AATTGTTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCT-A 1 AATTG-TTTCTGT-TCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTT-TAA * * * * * * 21867932 AAATTAATAAGTACGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAATTCAAATAATTATGACT 62 AAATTAATAAG-A-G--ATTTAAAAAATAAATCTATTGA-CTAACCAGTTCAAATAGTTATAACT * * * * * * * 21867997 ATTTGAACAATTATAT-TTTTAAATCTTTAT-AGCCTTTTATTTTTTCATTAAAC 122 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * * * * * 21868050 AATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATT-ATATTGTGAAA 1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATTCTAAT-TTATTAATATTTTAAAA * * * * * * 21868114 ATTAATAACTAAGAGTTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTA-ATGCTAT 64 ATTAATAA--GAGA-TTTAAAAAATAAATCT-ATTGACTAACCAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT * ** * * * * * 21868178 ATGAGTAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTTATTTTGCCATAAAAC 124 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * ** * * * * * 21868231 AAATGCTTT-TGTTTATATAAATTTGTTCAAAATAAAAAAATAT-TAATTTATTAGTATTTTGAC 1 AATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTTAAA * * * * * * * * * 21868294 TATTAATAAGACATTTAAAATATAAATCTGTTTACAAAACTAGTTCAATTAATTATAA-TAATTT 63 AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTGAC-TAACCAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTT * * * * * * 21868358 GAATAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAGAC 126 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * * * * * 21868408 AATTGTTTCTATTGATACAATG-TTACTCAAAATAAAGTAATGCTATTTTATTAATATTTTGAAA 1 AATTGTTTCTGTTCATACAA-GCTTA-TTAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAA * * * * * 21868472 ATTAATAATAGATTT-AAAAATGAATTTGTTGGACTGACCA-TTACAAATAGTTATAACTATTTG 64 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-GACTAACCAGTT-CAAATAGTTATAACTATTTG * * * 21868535 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAAT 127 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * ** * 21868584 AATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTAATTGAAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAA 1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAA * * ** * * * * * * * 21868649 TGAA-AAGGGATTGCAAAACTAAATCTATTTATTAAACAAGTTCAAGTAGCTATGACTATTTGAA 65 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACT-AACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA * 21868713 C----A---A-TT--AA--ATTA--A--TTTTGTTTTGTTATAAAAT 129 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * * * * * * * 21868744 AATTTTTTCTCTTCATACGAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAACAA 1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAA * * * * * * * 21868809 TTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATT 65 TTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTGA-CTAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATT * * ** 21868873 TCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT 125 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT 21868913 CATCGTAATT Statistics Matches: 1345, Mismatches: 317, Indels: 192 0.73 0.17 0.10 Matches are distributed among these distances: 159 1 0.00 160 72 0.05 161 3 0.00 162 1 0.00 164 41 0.03 165 4 0.00 166 2 0.00 168 3 0.00 169 1 0.00 171 1 0.00 172 3 0.00 174 73 0.05 175 73 0.05 176 209 0.16 177 162 0.12 178 75 0.06 179 50 0.04 180 165 0.12 181 167 0.12 182 229 0.17 183 9 0.01 185 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (175 bp): AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAAT TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACTAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT Found at i:21869057 original size:153 final size:152 Alignment explanation

Indices: 21868788--21869065 Score: 421 Period size: 153 Copynumber: 1.8 Consensus size: 152 21868778 AAATAATACA * * * 21868788 AATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAATAAATATGTTTACCAAACAAG 1 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAG * * 21868853 TTCAAATAGTCATAACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCG 66 TTCAAATAGTCATAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCG 21868918 TAATTCAAAATAATATAATATT 131 TAATTCAAAATAATATAATATT * * * * * * 21868940 AATTTATTAATATTCCAAAAATTCATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTAAACAA 1 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAA * * * 21869005 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT 65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT 21869066 TGTCATAAAA Statistics Matches: 111, Mismatches: 14, Indels: 1 0.88 0.11 0.01 Matches are distributed among these distances: 152 34 0.31 153 77 0.69 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (152 bp): AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAG TTCAAATAGTCATAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCG TAATTCAAAATAATATAATATT Found at i:21869816 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21869242--21870071 Score: 693 Period size: 180 Copynumber: 4.6 Consensus size: 181 21869232 CAGTTAAAAA * * 21869242 TTATGTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCG-ATTTATTTTATTC 1 TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATT- * * * * * * * 21869305 CA-AAATAAG-TTAGTAAGAGCTAAAAAAATTGTTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACT-ATT 63 -ATGAATAAGCTT-GTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA-TAATT * * * * 21869367 TGAAATAGATAATTATTCACATAGCCTTAACTATTTGAAGTGGTTTGGTAAACAAAT 125 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAAT * * * * * * * ** * 21869424 TTATTTTTCAAATCTCATAGTTATTAATTGTCAAATTATTATTTGATTAGTATTATTTTATTTTG 1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATG * * * * * ** 21869489 AATAAGCTTGTATGAG-TAGAAATAATT-TTTTATGACAGAATAAAAAGTTATAACAAACTGAAA 66 AATAAGCTTGTATGAGCTA-AAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAA * * * * ** * * 21869552 TATATAATTGTTCAAATAGT-TATAATTATTTGAACTGGTTCAATAAATAAAA 130 TAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAAT * * * * * 21869604 TTATTTTTTGAATCTCGTACTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTGTTATG 1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATG * * * * * 21869669 AATAAGCTTGGATGAGCTGAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAAT 66 AATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAAT * * 21869734 AGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGACAAACAAAT 131 AGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAAT * * * * * * * 21869785 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATA-TATTAACTTAGCATTATTTTATTTTG 1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATG ** * * * * * 21869849 AATAAATTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATA-TTATAATAATTTGAAA 66 AATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTCATAATAATTTGAAA * * * * * * * 21869913 TAGATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGGTAAATAGAT 130 TAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACAAAT * * * * 21869965 TTATTTTTTAAATCTC-GA---ACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TC 1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT- * * * ** * * * * 21870025 AAATAAACTTATATGTTCAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAA 65 GAATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAA 21870072 GGTACTAACA Statistics Matches: 516, Mismatches: 118, Indels: 33 0.77 0.18 0.05 Matches are distributed among these distances: 176 12 0.02 177 61 0.12 179 2 0.00 180 267 0.52 181 126 0.24 182 47 0.09 183 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (181 bp): TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATG AATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAAT AGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAAT Found at i:21869883 original size:361 final size:359 Alignment explanation

Indices: 21869208--21870027 Score: 955 Period size: 361 Copynumber: 2.3 Consensus size: 359 21869198 ATGACTATTT * * * 21869208 TATTCATACTTATTTGAACTGGTTCAGT-TA-AAAATTATGTTTTTAATCTCTTACTTATTAATT 1 TATTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTAT-TTTTTAATCTCGTACTTA-TAATT * * * 21869271 TTTGAAATATTAATAAATTCGATTTATTTTATTCCAAAATAAGTTAGTAAGAGCTAAAAAAATTG 64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATT-CAAAATAAGTTAGGAAGAGCTAAAAAAATTG * * * 21869336 TTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCACATAGCCTTAACTAT 128 TTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACTATTTAAAATAGATAATTATTCACATAGCCTTAACTAT ** * 21869401 TTGAAGTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCATAGTTATTAATTGTCAAATTATTAT 193 TTGAAGTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCATAGTTATGAATTGTCAAATTATTAT * * * * ** * * * 21869466 TTGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGTAGAAATAATTTTTTATGACAGAATA 258 TTAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTTTTTATGACAAAACA * 21869531 AAA-AGTTATAACAAACTGAAATATATAATTGTTCAAA 323 AAATA-TTATAACAAACTGAAATAGATAATTGTTCAAA * 21869568 TAGTT-ATAATTATTTGAACTGGTTCAATAAATAAAATTATTTTTTGAATCTCGTACTTATAAAT 1 TA-TTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTATTTTTT-AATCTCGTACTTAT-AAT * * * * * * 21869632 TTTTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTGTT-ATGAATAAGCTT-GGATGAGCTGAAATAAT 63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCA-AAATAAG-TTAGGAAGAGCTAAAAAAAT * * * 21869695 TGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAC 126 TGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACT-ATTTAAAATAGATAATTATTCACATAGCCTTAAC * * * * * 21869759 TATTTGAATTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAA-TA 190 TATTTGAAGTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCATAGTTATGAATTGTCA-AATTA * 21869823 -TA-TTAACTTAGCATTATTTTATTTTGAATAAATTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC 254 TTATTTAA-TTAGCATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAATAATT-TTTTATGAC * ** 21869886 AAAACAAAATATTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA 317 AAAACAAAATATTATAACAAACTGAAATAGATAATTGTTCAAA * ** ** * * * * 21869929 TATTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCGAAC---TAATTC 1 TATTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTATTTTTT-AATCTCGTACTTATAATTT * 21869991 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA 65 TTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTA-TTCAAA 21870028 TAAACTTATA Statistics Matches: 389, Mismatches: 56, Indels: 32 0.82 0.12 0.07 Matches are distributed among these distances: 357 31 0.08 358 4 0.01 359 4 0.01 360 68 0.17 361 224 0.58 362 58 0.15 ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43 Consensus pattern (359 bp): TATTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTATTTTTTAATCTCGTACTTATAATTTT TGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCAAAATAAGTTAGGAAGAGCTAAAAAAATTGTTT TACAATAAAACAAAAAGTCATAACTATTTAAAATAGATAATTATTCACATAGCCTTAACTATTTG AAGTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCATAGTTATGAATTGTCAAATTATTATTTA ATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTTTTTATGACAAAACAAAA TATTATAACAAACTGAAATAGATAATTGTTCAAA Found at i:21870090 original size:67 final size:67 Alignment explanation

Indices: 21870015--21870142 Score: 202 Period size: 67 Copynumber: 1.9 Consensus size: 67 21870005 AATTAGTATT 21870015 ATTTTATTTCAAATAAACTTATATGTTCAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTACTAA 1 ATTTTATTTCAAATAAACTTATATGTTCAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTACTAA 21870080 CA 66 CA * * * * ** 21870082 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTA 1 ATTTTATTTCAAATAAACTTATATGTTCAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTA 21870143 ACAATGATTT Statistics Matches: 55, Mismatches: 6, Indels: 0 0.90 0.10 0.00 Matches are distributed among these distances: 67 55 1.00 ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.10, T:0.36 Consensus pattern (67 bp): ATTTTATTTCAAATAAACTTATATGTTCAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTACTAA CA Found at i:21870516 original size:182 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21870082--21872875 Score: 1905 Period size: 181 Copynumber: 15.8 Consensus size: 179 21870072 GGTACTAACA * **** ** * * 21870082 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAACAA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * ** 21870147 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTAAACTAATTCAGTAAAC-TGATTT 66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAT-ATTT * ** * * * 21870211 ATTTTTTAAATCTCTTA---ATT--TTCATAATATTAAAAAAGTAGTATT 130 ATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * * * * * 21870256 ATTTTATTTTGGATAAACTTTTGTGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATAAAAA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * 21870321 TGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA 66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA * 21870386 TTTTTTCAAATATCTTGCTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATT 131 TTTTTT-AAATATCTTACTTATTAATTTTT-AAAA-TTAATAAATTAGTATT * * * * * * 21870438 ATTGTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTCATGACTAAACAAAAGGTCAGAA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * * ** * * 21870503 CGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTGAA-TTAATTTGGCAAACACATTT 66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACATATTT * * * * 21870567 ATTTTTTAAATATCTCATTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTACT 130 ATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTT-AAA-ATTAATAAATTAGTATT * * * * * * 21870619 ATTTT-TATCTGAATCAGCTTATACGATC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCAT 1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * * * * * 21870681 AATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTAAAATTGCTT-TGGAAA-ATAG 64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATA- * * * * 21870743 CTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT 127 -TTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTT-AAA-ATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * * * * 21870799 ATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATTAACTAAAAAAATTGTTTCATGCCAAAACAAAATGTCACAA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * * 21870864 TAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATATCTATTTGAAATTGTTCAATAAACATATTTA 66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA * ** 21870929 TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT 131 -TTTTTTAAATATCTTACTTATTAA-TTTTT-AAAATTAATAAATTAGTATT * * ** * * 21870981 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGATTAAACAAAAGGTTAGAA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * * * 21871046 TGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTTAACTGGTTCAACT-AACATATTT 66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACATATTT * * * * 21871110 ATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTGTC 130 ATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTT--AAAATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * * * * * 21871158 ATTTTAATCCGAATAACCTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTGTATAACAAAA-TAAAGATCTTT 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * 21871221 ATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAAATAGATT 65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACATATT * * * * * 21871285 TAGTTTTTAAATATCTTA-TTAGT--TTTTAAAATATTAATAAATCAATATT 129 TATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAA-ATTAATAAATTAGTATT * ** 21871334 ATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * * ** * * * * 21871398 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTGTTTGCTCTTATTCGGTAAATAGATTT 65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT * * * * ** * 21871463 ATTTTTAAAATCTCCTACCTATTAATTTGCAAAATATTAATAAAGTAGTATT 130 ATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTT-TTAAA-ATTAATAAATTAGTATT * * * * 21871515 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTACGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * ** * * 21871579 ACT-ATTTGAAATAAAAAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTTACTCGGTAAACAAATT 65 A-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATT * * * * * 21871643 TATTTTTTAAATCTTTTACGTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT 129 TATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTT--AAAATTAATAAATTAGTATT * * * * * * 21871696 -TATATATCTT-GAATAAGCTAGTATGGA-TAAAAACAATTGGTTTATCACAAAACAAAAGGTTA 1 AT-TTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA * * ** * 21871758 TAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGAT-AGAACTATTTGAACATGTTCAAAAAACAA 63 TAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAT * * * * * 21871821 ATTTACTTTTTAAAT-TTTTAGTTATTACATTTTGGAATATTAATAAACTTA--ATT 126 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTA-ATTTT-TAAAATTAATAAA-TTAGTATT * * * * * 21871875 ATTTTATTAAC-AATAAGCTTGTATGGA-TAGAAACAATTGGTTTATCACAAAACAAAAAGTCAT 1 ATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * * * *** * 21871938 AACT-ATTTGAAATAGATAATTATTTGAACAT-GTTCAGAA--A--AGAAATT-TATTTTTTAA- 64 AA-TGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAA-ATAG-TCATAACTATTTGAACTTGT-TCAGTAAAC * * ** * 21871995 ATTTTTATTTATTAAAT-T-TT-GGTA-T-A---TT--AA-T-A-AATTTA--ATT 124 ATATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATTAATAAATTAGTATT * * * 21872036 ATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCGT 1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * 21872099 AAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATT 64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATT * * * * 21872164 CATTTTTTAAA-ATCTCTCACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAATTTAGTAAT 129 TATTTTTTAAATATCT-T-ACTTATTAATTTTTA-AA-ATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * * * 21872218 ATTTTATTTAGAATAAGCCTGTATCAATTGATACAAGTATTTTATGACAAAACAATAGGTCATAA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * 21872283 TGATTTGAAATAGATAA----T----T-G--ATAACTATATGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA 66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA * * * 21872337 -TTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT 131 TTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTT-AAA-ATTAATAAATTAGTATT ** * * ** * * * 21872386 ATTTTAAAGT-GAATAAACTTTTATGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAAACAAAAAGTCATA 1 ATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA ** * * * * * * * * 21872450 ACAATTTGAAATAAATAATTATTCCAATAGTCATAATTATTTGAACTTATT-TGATAAATAGATT 65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATT * * * * * * 21872514 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATCTTAATATTAATAAATTTGTATA 129 TATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATT-T-TTAAAATTAATAAATTAGTATT * * 21872567 ATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA 1 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA * * * * * ** * * 21872629 TAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCCAATAGTCATAATTATTTGTATTTGTTTGGTAAATAGAT 63 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATAT * * * 21872694 TTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGAAAT 128 TTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTA-AA-ATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * * * 21872744 ATGTTATTTCAAATAAGCTTGGA-CAAGCAAAAACAATTGTTTTGTGATAAAATAAAAGGTTATA 1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * * * * 21872808 CTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCA-TTGGTCA-TAAA-ATAATT 65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT 21872870 ATTTTT 130 ATTTTT 21872876 GTTCAAATAA Statistics Matches: 2071, Mismatches: 427, Indels: 244 0.76 0.16 0.09 Matches are distributed among these distances: 159 8 0.00 160 6 0.00 161 77 0.04 162 2 0.00 163 9 0.00 164 15 0.01 165 2 0.00 166 1 0.00 168 92 0.04 169 5 0.00 170 10 0.00 171 31 0.01 172 1 0.00 173 4 0.00 174 126 0.06 175 22 0.01 176 146 0.07 177 260 0.13 178 22 0.01 179 119 0.06 180 187 0.09 181 560 0.27 182 349 0.17 183 17 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (179 bp): ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA TTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATTAATAAATTAGTATT Found at i:21870931 original size:27 final size:28 Alignment explanation

Indices: 21870879--21870931 Score: 72 Period size: 27 Copynumber: 1.9 Consensus size: 28 21870869 TTAAATAGAT ** 21870879 AATTGTTCAAGTAGTCATATCTATTTGA 1 AATTGTTCAAGTAAACATATCTATTTGA * 21870907 AATTGTTCAA-TAAACATATTTATTT 1 AATTGTTCAAGTAAACATATCTATTT 21870932 TTTTAAATCT Statistics Matches: 22, Mismatches: 3, Indels: 1 0.85 0.12 0.04 Matches are distributed among these distances: 27 12 0.55 28 10 0.45 ACGTcount: A:0.36, C:0.09, G:0.09, T:0.45 Consensus pattern (28 bp): AATTGTTCAAGTAAACATATCTATTTGA Found at i:21871970 original size:161 final size:161 Alignment explanation

Indices: 21871797--21872119 Score: 486 Period size: 161 Copynumber: 2.0 Consensus size: 161 21871787 TAGATAGAAC * 21871797 TATTTGAACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAGTTATTACATTTTGGAATATT 1 TATTTGAACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAGTTATTAAATTTTGGAATATT * * * 21871862 AATAAACTTAATTATTTTATT-AACAATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGGTTTATCACAAA 66 AATAAACTTAATTATTTTATTCAA-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATCAAAAA ** 21871926 ACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAAT 130 ACAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT * * * * * 21871958 TATTTGAACATGTTCAGAAAAGAAATTTATTTTTTAAATTTTTATTTATTAAATTTTGGTATATT 1 TATTTGAACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAGTTATTAAATTTTGGAATATT * * * 21872023 AATAAATTTAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAA 66 AATAAACTTAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATCAAAAAA * * 21872088 CAAAAGGTCGTAAAGATTTGAAATAGATAAT 131 CAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT 21872119 T 1 T 21872120 GTTCAAATAG Statistics Matches: 145, Mismatches: 16, Indels: 2 0.89 0.10 0.01 Matches are distributed among these distances: 161 143 0.99 162 2 0.01 ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.10, T:0.40 Consensus pattern (161 bp): TATTTGAACATGTTCAAAAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTAGTTATTAAATTTTGGAATATT AATAAACTTAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATCAAAAAA CAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT Found at i:21872003 original size:15 final size:15 Alignment explanation

Indices: 21871983--21872014 Score: 55 Period size: 15 Copynumber: 2.1 Consensus size: 15 21871973 AGAAAAGAAA * 21871983 TTTATTTTTTAAATT 1 TTTATTTATTAAATT 21871998 TTTATTTATTAAATT 1 TTTATTTATTAAATT 21872013 TT 1 TT 21872015 GGTATATTAA Statistics Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 0 0.94 0.06 0.00 Matches are distributed among these distances: 15 16 1.00 ACGTcount: A:0.28, C:0.00, G:0.00, T:0.72 Consensus pattern (15 bp): TTTATTTATTAAATT Found at i:21873093 original size:16 final size:17 Alignment explanation

Indices: 21873061--21873093 Score: 50 Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17 21873051 AACACGTTCA 21873061 AATAATTATGACTATTTG 1 AATAATTAT-ACTATTTG 21873079 AATAATTAT-CTATTT 1 AATAATTATACTATTT 21873094 CAAATCATTA Statistics Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2 0.88 0.00 0.12 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.40 18 9 0.60 ACGTcount: A:0.39, C:0.06, G:0.06, T:0.48 Consensus pattern (17 bp): AATAATTATACTATTTG Found at i:21873377 original size:179 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21872876--21873379 Score: 585 Period size: 180 Copynumber: 2.8 Consensus size: 179 21872866 AATTATTTTT * * * * 21872876 GTTCAAATAATTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTCTTTGTTTTGCC 1 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTTTTGTC * * * * 21872941 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTACTAGTA 65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTACTTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA * * * * * 21873004 TTCCAAAGATGAAGAAGTAAAAATATATAAAATAAATTTGTTTTCTGAACAC 129 TTCCAAA-ATTAATAAGTAAAAATATATAAAATAAATTTATTTACTCAACAC * 21873056 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTC 1 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTC * * * * * 21873121 ACAAACCAATTGTTTCTATTCGTA-AAAGCTTACTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAA 65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAA-CTTACTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA * * 21873184 TTCCCAAAATTAATAAGT-AAAATATTTAAAAATAAATTTATTTAC-CAAGTGA- 129 TT-CCAAAATTAATAAGTAAAAATATAT-AAAATAAATTTATTTACTCAA--CAC * * * * 21873236 GTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTA 1 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTC * * 21873300 ATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT 65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTACTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT ** 21873364 TTTAAACATTAATAAG 130 TCCAAA-ATTAATAAG 21873380 AGATTTAAAA Statistics Matches: 277, Mismatches: 36, Indels: 23 0.82 0.11 0.07 Matches are distributed among these distances: 178 6 0.02 179 111 0.40 180 151 0.55 181 9 0.03 ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (179 bp): GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCA TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTACTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT CCAAAATTAATAAGTAAAAATATATAAAATAAATTTATTTACTCAACAC Found at i:21873727 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21873459--21873792 Score: 406 Period size: 180 Copynumber: 1.9 Consensus size: 180 21873449 TTATAAAAGA * * ** * * 21873459 TTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAT 1 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT * * * * * * * 21873524 TTCAAATCATTTGACATTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTCG 66 TTAAAATCATTTGACATTTTGTTTTA-TCATAAAA-AAATGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA * 21873588 AAATAAAATAATACTATTTTATTAACAGTCAAAAAATTAATAAGCAAAGAAT 129 AAATAAAATAATACTACTTTATTAACAGTCAAAAAATTAATAAGCAAAGAAT * * * 21873640 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATC-AT 1 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA- * * * 21873703 TTTAAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATGTTTCATTTCATAAAAGCTTGTCC 65 TTTAAAATCA-TT-TGACATTTTGTTTTATCATAAAAAAATGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCC * 21873767 AAAATAAAATAATATTACTTTATTAA 128 AAAATAAAATAATACTACTTTATTAA 21873793 TATTTCAAAA Statistics Matches: 128, Mismatches: 21, Indels: 9 0.81 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 179 2 0.02 180 70 0.55 181 52 0.41 182 4 0.03 ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (180 bp): TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT TTAAAATCATTTGACATTTTGTTTTATCATAAAAAAATGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAA ATAAAATAATACTACTTTATTAACAGTCAAAAAATTAATAAGCAAAGAAT Found at i:21873814 original size:36 final size:36 Alignment explanation

Indices: 21873773--21873877 Score: 183 Period size: 36 Copynumber: 2.9 Consensus size: 36 21873763 GTCCAAAATA 21873773 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAG 1 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAG * * 21873809 AAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAG 1 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAG 21873845 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAATAATT 1 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAA-AATT 21873878 AAGAAGTTGG Statistics Matches: 64, Mismatches: 4, Indels: 1 0.93 0.06 0.01 Matches are distributed among these distances: 36 61 0.95 37 3 0.05 ACGTcount: A:0.46, C:0.05, G:0.04, T:0.46 Consensus pattern (36 bp): AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAG Found at i:21874449 original size:176 final size:177 Alignment explanation

Indices: 21873845--21876238 Score: 1506 Period size: 182 Copynumber: 13.5 Consensus size: 177 21873835 AAAAATTGAG * * * * * * * ** 21873845 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAATAATTAAGAAGTTGGAAATTTAAAACATAAATCAGTT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAATTTGTT * * * * * 21873910 TATCAAA-TCAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAACT 62 TACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT * * ** * * 21873974 TTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTAATTAGAATA 126 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * ** * * * * 21874026 AAATAATACTAATTTATT-ATATTTCAAAAATTAAT-A-AG---TAGGAGAT-TATCTGTTTACT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC * * * * * * 21874084 AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAGTCATTATAACC-TTT-T 66 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT * * * 21874147 TTTGTCATAAAA-AATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTT-GAAAGA 131 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATA * * * * 21874193 AAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT **** * * * * * *** 21874258 TGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCTTTAT-TTTTT 62 TACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT * * * * * * * 21874322 TTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTAGAATA 127 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * * 21874373 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC * * * * * * * 21874438 AAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGACCCTTTGT 66 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT * * * * * * ** * 21874503 CTTAT-ATAAAACAATTATTTCTATTGATA-TAGTCTTATTCGGATTA 131 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTTAGAATA * * * * * * * * 21874549 AAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAGATGAATCTGTT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTT * ** * * * * * 21874614 AACCTGACCA-TTGCCAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT 62 TACCAAACTAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-C * * ** 21874678 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTGGGAATA 125 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * * * * 21874731 ACATAATTCTAATTTATTAAT-TTTCTAAAAATTAGTAAATAAGAAATTTAAAAATTAAATTTGT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT * * * * * * ** * 21874795 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATTTACCTATTTCAAATTGCCATAACCT 61 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC- * * * * * * * 21874860 TTTTATTTTGTCATAAAATAAAAT-TTTCTATTCCTACACGCTTATTTCA-ATTA 125 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATA * * ** * * 21874913 AAATAATACCAACTTATT-ATCA-TCCAGACAATTAATAAGTGAAAGATTTAAAAAATAAATCTG 1 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTTA-AAAATTAATAA--G--AGATTTAAAAAATAAATTTG * * * * * * 21874976 TTTACCAAA-TAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTAATTCAAATCATTATGGC 60 TTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * * * 21875040 TTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-GTTCGATTA 124 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * * * * *** * 21875093 AAATAATATTAGTATATTAATATTTTGATGGTTAATAAGTACAAGATTTTAAAAATAAATATT-T 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAT-TTGT * * * * * * * * 21875157 TTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCT 61 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT * * * * * * * 21875222 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATCGGTTTATATAGGCTTATTCAAAATA 126 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * * * * * 21875274 AAATAATACT--TTGA--AA-A--TT---AATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TCGATTTAC 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTAC * * * * * 21875328 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTT 65 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * ** 21875393 TTTTATCCTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATACTA-AGCA 130 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TTAGAATA * * * * * * 21875441 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAAATTTTAAAAATAATTTTTTT 1 AAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--A-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT * * * 21875505 TA--ACAC--GTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT 62 TACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT * ** * * * * 21875566 TTGTTTTGTTATAAGCCAATTGTTTTTGTTTATACAAGCATA-TTCG---- 127 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * ** * 21875612 --A-AAT-GT--TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTT * * * * * ** * * * * * 21875671 TATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATAATTGTTCAAATAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCT 62 TACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT * * * * * 21875735 TTTGTTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCAGAATA 126 TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * * * ** 21875788 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTGATAGGTAAGAGATTTATAAAATAAATCTACT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT * * * * * 21875853 TACCAAA-TAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAT 62 TACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT * * * * ** * * 21875917 TCTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATA 126 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * * * * * *** 21875969 AAATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATAAATTTACT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC- * * * * * * * 21876034 GAAAC-AGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAATAA-TATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTA 65 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG * * * * * 21876095 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTTTTCATTCAAGCTTATTCAGATTA 130 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA * ** 21876143 AAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTGTGT 1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGT *** * * 21876207 TTGTTAAA-TAGCTCAAATAGTTAAGACTATTT 61 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT 21876239 TTTCATAAAA Statistics Matches: 1704, Mismatches: 402, Indels: 217 0.73 0.17 0.09 Matches are distributed among these distances: 162 1 0.00 163 1 0.00 165 24 0.01 166 22 0.01 167 155 0.09 168 23 0.01 169 12 0.01 170 105 0.06 171 48 0.03 172 4 0.00 173 1 0.00 174 76 0.04 175 23 0.01 176 236 0.14 177 67 0.04 178 105 0.06 179 27 0.02 180 279 0.16 181 147 0.09 182 327 0.19 183 9 0.01 184 1 0.00 185 1 0.00 186 10 0.01 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (177 bp): AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA Found at i:21875704 original size:18 final size:18 Alignment explanation

Indices: 21875681--21875729 Score: 57 Period size: 18 Copynumber: 2.8 Consensus size: 18 21875671 TATCGAATAA 21875681 GTTCAAATAGTTATAATT 1 GTTCAAATAGTTATAATT * * 21875699 GTTCAAATAATTATTTATT 1 GTTCAAATAGTTA-TAATT 21875718 -TT-AAATAGTTAT 1 GTTCAAATAGTTAT 21875730 GATCTTTTGT Statistics Matches: 27, Mismatches: 3, Indels: 4 0.79 0.09 0.12 Matches are distributed among these distances: 16 1 0.04 17 8 0.30 18 14 0.52 19 4 0.15 ACGTcount: A:0.39, C:0.04, G:0.08, T:0.49 Consensus pattern (18 bp): GTTCAAATAGTTATAATT Found at i:21875739 original size:170 final size:166 Alignment explanation

Indices: 21875453--21875761 Score: 399 Period size: 170 Copynumber: 1.8 Consensus size: 166 21875443 ATAATATAAA * * * * 21875453 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAAATTTTAAAAATAATTTTTTTTAACACGTTCAAA 1 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAAATTTAAAAAATAATTTTTTTGAACAAGTTCAAA * ** * 21875518 TAGTTATGACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTG-TTTTGTTAT-AAG 66 TAGTTATAACGATTCAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTTGTCATAAAG 21875581 CCAATTGTTTTTGTTTATACAAGCATATTCGAAATGT 131 -CAATTGTTTTTGTTTATACAAGCATATTCGAAATGT * * 21875618 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAATAAGT 1 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAA-ATTTAAAAAAT-AATTT-TTT-T-GAACAAGT * * * * * 21875683 TCAAATAGTTATAATTG-TTCAAATAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTGTC 61 TCAAATAGTTATAA-CGATTCAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTTGTC 21875747 ATAAAGCAATTGTTT 125 ATAAAGCAATTGTTT 21875762 CTATTCACAC Statistics Matches: 121, Mismatches: 15, Indels: 10 0.83 0.10 0.07 Matches are distributed among these distances: 165 30 0.25 166 10 0.08 167 5 0.04 168 3 0.02 169 1 0.01 170 51 0.42 171 18 0.15 172 3 0.02 ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.09, T:0.45 Consensus pattern (166 bp): TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAAATTTAAAAAATAATTTTTTTGAACAAGTTCAAA TAGTTATAACGATTCAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTTGTCATAAAG CAATTGTTTTTGTTTATACAAGCATATTCGAAATGT Found at i:21875869 original size:528 final size:534 Alignment explanation

Indices: 21873845--21876964 Score: 1674 Period size: 528 Copynumber: 5.8 Consensus size: 534 21873835 AAAAATTGAG * * * * * * * * 21873845 AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAATAATTAAGAAGTTG-GAAATTTAAAACATAAATCAGT 1 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-ATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGT * * * * * * * 21873909 TTATCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAAC 65 TTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAATTCAAATCATTATGACC * * ** * * * * 21873973 TTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTAATTAGAATAAAATAATACTAA 129 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCAT-ATTCGAATAATATTATA-T-A * ** * * * 21874038 TTTATTATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA--T------T--ATCTGTTTA-CTAAACTAGT 191 -TTA--ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATTTTTATC-AAACAAGT * * * * * * * * * 21874092 TCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAGTCA-TTAT-AAC-CTT-TTTTTGTC 252 TCAAATAGTCATAACTATTCAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTTGTC * * * * * * 21874153 ATAAAA-AATTATTTATGTTCATACAAGCTTATT-TGAAAGAAAATAATACTAATCTAATAATAT 316 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * * * *** * 21874216 TATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTA 380 TCTAAAAATTGAT-AGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA * * * * * ** * * * 21874281 AGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCTTTAT--TTTTTTTGTTTTATCATAAAACAAATG 443 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTG * * * * * * * 21874344 TTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTAGAATA 507 TTTCTATTCATACAAGCTTATCTA-AATA ** * * * 21874373 AAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AA-G--AGATTTAAAAAATAAATTTAT 1 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGT * * * * * * * * * * * 21874433 TTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGACCC 65 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAATTCAAATCATTATGACCT * * * * * * * * * 21874498 TTTGTCTT-ATATAAAACAATTATTTCTATTGATA-TAGTCTTATTCGGATTAAAGTAATGCTAA 130 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CATATTC-GAAT-AA-T-AT--T-A * ** * * * * * * ** * 21874561 TTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAACAA-ATTTAAAAGATGAATCTGTTAACCTGACCA- 187 TATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATTTTTATCAAACAAG * * * * * 21874624 TTGCCAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTT-TATTTT 251 TT-CAAATAGTCATAACTATTCAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGT-TTTT * ** * * 21874687 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTGGGAATAACATAATTCTAATTTATTAAT 313 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT * * * * * * 21874752 TTTCTAAAAATT-AGTAAATAAGAAATTTAAAAATTAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG 378 ATTCTAAAAATTGA-T-AGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG * * * ** * 21874816 TTATGACTATTTGAACATTTACCTATTTCAAATTGCCATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAA 440 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTT-TTTTGTCATAAAAT-A * * * * * 21874881 AAT-TTTCTATTCCTACACGCTTATTTCAATTA 503 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATCT-AAATA ** * * * * * 21874913 AAATAATACCAACTTATT-ATCA-TCCAGACAATTAATAAGTGAAAGATTTAAAAAATAAATCTG 1 AAATAATATAAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTG * * * * * * 21874976 TTTACCAAATAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTAATTCAAATCATTATGGCT 64 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAATTCAAATCATTATGACC * * 21875041 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTGTTCGATTAAAATAATATTAGT 129 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCG-----AATAATATTA-T *** *** * * 21875106 ATATTAATATTTTGATGGTTAATAAGTACAAGATTTTAAAAATAAATATTTTTATCAAACAAGTT 188 ATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATTTTTATCAAACAAGTT ** * * 21875171 CAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCTTTTG-TTTTGTCAT 253 CAAATAGTCATAACTATTCAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCAT * * * * * * * 21875235 AAAACAATTGTATCGGTTTATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACT--TTGA--AA-A-T-T 318 AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT * * 21875293 ---AA-TG--AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCGATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC 383 AAAAATTGATAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC * * * * 21875352 TATTTGAACAAATATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTTTTTTATCCTAAAATAATTGTTTCT 447 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT ** 21875417 ATTCATACAAGCTTATACTAAGCA 512 ATTCATACAAGCTTAT-CTAAATA * 21875441 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AAAAATTTTAAAAAT-AAT-T-TT 1 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTT *** * * * 21875502 T-TTTAACACGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCT 66 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAATTCAAATCA-TTATGACCT ** * * 21875565 TTTGTTTTGTTATAAGCCAATTGTTTTTGTTTATACAAGCATATTCG-A-AATGTT-T-TATTAA 130 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCGAATAATATTATATATTAA * * 21875626 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTATCGAATAAGTTCAAATA 195 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATT-TTTATCAAACAAGTTCAAATA * * * * * * 21875690 GTTATAATTGTTCAAATAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAGCA 259 GTCATAACTATTCAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACA * * * 21875755 ATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT 324 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT * * * * * * 21875820 TGATAGGTAAGAGATTTATAAAATAAATCTACTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTT 389 TGATA-GTAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * * 21875885 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTCTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCA 452 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCA * ** * 21875950 TGCAAAATTATTCAAAATA 517 TACAAGCTTA-TCTAAATA ** * ** * * *** 21875969 AAATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AA-G--AGATTTAAAAACTAAATAAATT 1 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTT * * * * * 21876030 TACTGAAAC-AGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAA-TAATATAT-ATCTCAAATCATTATGATC 66 TAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAAT-TCAAATCATTATGACC * * * * * * 21876091 -TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTT-TTCATTCAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTA 129 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCATATTC-G-----AATAATA-TT * * * * * * 21876154 ATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTGTGTTTGTTAAATAGC 186 ATATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA--AT-ATT-TT---TA-- * * * 21876219 TCAAA-TAGTT-AAGACTATTTTTTCATAAAACACATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATT 242 TCAAACAAGTTCAA-A-TA----GTCAT--AAC-TATTCAAATA---AT---TA--T---C---T * * * * * 21876282 ATTTGTTTCAAGTAGTTATGATCTTTTGCTTTT-TCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGT 284 ATTT----CAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC * * * * 21876346 TTATTC-GAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAA 345 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTGATA-GTAAGAGATTT-AA * ** * * * * 21876410 AAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA 407 AAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA ** * * * * * ** * 21876475 TTATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTCTATTCATGCAAAATTATTTGAAATAA 472 TCGTTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATCT-AAAT-A * ** ** * * 21876540 AAAAAATATTTATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AA-G--AAATTTAAAAACTAAATCTATT 1 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTT * * * * * * * * 21876601 GT-CTGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATCTTAAATCGTTATGAT 66 -TAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAAT-TCAAATCATTATGAC * * * 21876663 C-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACT 128 CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCATATTCGAA-T--AAT-AT--T * * * * * * * * * 21876726 ACTTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATGTGTTT-GCTGAACC 186 A-TATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATTTTTATC-AAACA * * * * * 21876790 AGCTT-AAATAGT--TAAGGCTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAACCTATTG-T 249 AG-TTCAAATAGTCATAA--CTATTCAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTT * * * ** * 21876850 TTAGTTATAAAACAATTATTTCAATAT-ATACAAGCTT-TTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT 310 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT ** * * * * 21876913 TAGCATT-TGAAAAACTAATGAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTAC 374 TAATATTCT-AAAAATTGAT-AGTAAGAGATTT--AAAAATAAATCTATTTAC 21876965 TGAATACGTT Statistics Matches: 2052, Mismatches: 377, Indels: 315 0.75 0.14 0.11 Matches are distributed among these distances: 512 2 0.00 513 97 0.05 514 49 0.02 516 8 0.00 517 1 0.00 518 2 0.00 519 1 0.00 520 1 0.00 521 1 0.00 522 6 0.00 523 115 0.06 524 100 0.05 525 15 0.01 526 48 0.02 527 43 0.02 528 261 0.13 529 89 0.04 530 8 0.00 532 2 0.00 533 5 0.00 534 54 0.03 535 3 0.00 536 5 0.00 537 62 0.03 538 170 0.08 539 68 0.03 540 61 0.03 541 13 0.01 542 1 0.00 543 55 0.03 544 173 0.08 545 35 0.02 546 11 0.01 547 1 0.00 548 2 0.00 549 3 0.00 550 3 0.00 551 2 0.00 552 2 0.00 553 8 0.00 554 2 0.00 556 4 0.00 557 8 0.00 558 2 0.00 559 2 0.00 560 1 0.00 561 1 0.00 563 1 0.00 564 4 0.00 565 3 0.00 566 5 0.00 567 7 0.00 568 1 0.00 569 4 0.00 570 200 0.10 571 92 0.04 572 23 0.01 573 106 0.05 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (534 bp): AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTT TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACGATTTGAACAAATATCTAATTCAAATCATTATGACCTT TTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCGAATAATATTATATATTAAT ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATTTTTATCAAACAAGTTCAAATAGT CATAACTATTCAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAAT TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTG ATAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA AGCTTATCTAAATA Found at i:21876903 original size:180 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21876317--21876968 Score: 436 Period size: 180 Copynumber: 3.6 Consensus size: 181 21876307 TTGCTTTTTC * * * * * * * * 21876317 ATAAAACAATTGTTTC-TATTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATAT 1 ATAAAACAATTATTTCATA-TCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAACAT ** * * ** * * * * * 21876381 TATAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTC 65 TCCAAAAACTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGCTTAAATAGTT * * * ** * * * * * 21876445 ATGTCCATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTT 130 AAGACTATTAAAATAATTATCTATCTT-AAATCATTATAACC-TTTATTTAGTT ** * ** * * * * * * 21876498 ATAAAACAATTGCTTC-TATTCATGCAAAATTATTTGAAATAAAAAAAATATTTATTTATTAATA 1 ATAAAACAATTATTTCATA-TCATACAAGCTTATTTG-AATTAAAATAATACTAATTTAATAACA *** * * * ** 21876562 TTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAAATTT-AAAAACTAAATCTATTGT-CTGAAATAG-TTCAAATA 64 TTCCAAAAACTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAATAAATCTGTT-TACTGAACCAGCTT-AAATA * ** * * * * 21876620 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTTAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTT 127 GTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATCTTAAATCATTATAACCTTTATTTAGTT * * * * * 21876675 ATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTACTTTAATAATATT 1 ATAAAACAATTATTTCATATCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAACATT * * * * 21876740 CCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-TAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGCTTAAATAGTTA 66 CCAAAAACTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGCTTAAATAGTTA * * * 21876804 AGGCTATTAAAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTCTAACCTATTGTTTAGTT 131 AGACTATTAAAATAATTATCTATCTT-AAATCATTATAACCT-TTATTTAGTT * * 21876856 ATAAAACAATTATTTCAATAT-ATACAAGCTT-TTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAGCA 1 ATAAAACAATTATTTC-ATATCATACAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATACTAATTTAATAACA ** * * 21876918 TTTGAAAAACTAATGAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA 64 TTCCAAAAACTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA 21876969 TACGTTTAAA Statistics Matches: 380, Mismatches: 75, Indels: 32 0.78 0.15 0.07 Matches are distributed among these distances: 176 27 0.07 177 42 0.11 178 68 0.18 179 11 0.03 180 112 0.29 181 89 0.23 182 31 0.08 ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (181 bp): ATAAAACAATTATTTCATATCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAACATT CCAAAAACTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGCTTAAATAGTTA AGACTATTAAAATAATTATCTATCTTAAATCATTATAACCTTTATTTAGTT Found at i:21876980 original size:181 final size:179 Alignment explanation

Indices: 21876256--21876980 Score: 668 Period size: 181 Copynumber: 4.0 Consensus size: 179 21876246 AAACACATTC * * * * * * * 21876256 AAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTTGTTTCAAGT-AGTTATGATCTTTTGCTTTT-TCAT 1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CCTTTG-TTTTGTTAT * * * * 21876319 AAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTAT 63 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T * * * * * 21876384 -AAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTT 127 GAAAAATTAATA-GTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATACGTTT * * * * * 21876437 AAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAA 1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTTATAA * * ** * * * 21876502 AACAATTGCTTCTATTCATGCAAAATTATTTGAAATAAAAAAAATATTTATTTATTAATATTTTG 65 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTG * * * 21876567 -AAAATT-A-A-TAAGAAATTTAAAAACTAAATCTATTGT-CTGAAATA-GTTC 128 AAAAATTAATAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACTG-AATACGTTT * * * 21876615 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATCTTTATTTTGTTATAA 1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTTATAA * * * * ** 21876679 AACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTACTTTAATAATATTCCAA 65 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAA * * * * * * 21876744 AAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCTGAA-CCAGCTT 130 AAATTAAT-AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAC-GTTT * * ** * * * 21876795 AAATAGTTAAGGCTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTATTGTTTAGTTATAA 1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTGTTTTGTTATAA * * ** 21876860 AACAATTATTTCAATAT-ATACAAGCTT-TTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTTG 65 AACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTG * 21876922 AAAAACTAATGAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATACGTTT 128 AAAAATTAAT-AGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAATACGTTT 21876976 AAATA 1 AAATA 21876981 TATTTGACCA Statistics Matches: 439, Mismatches: 82, Indels: 46 0.77 0.14 0.08 Matches are distributed among these distances: 175 2 0.00 176 24 0.05 177 45 0.10 178 66 0.15 179 13 0.03 180 117 0.27 181 140 0.32 182 30 0.07 183 2 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40 Consensus pattern (179 bp): AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTTATAAA ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAA AATTAATAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATACGTTT Found at i:21877495 original size:16 final size:17 Alignment explanation

Indices: 21877474--21877506 Score: 50 Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17 21877464 GAACTAGTTA 21877474 CTATTT-AAATAATTAT 1 CTATTTCAAATAATTAT * 21877490 CTATTTCAAATTATTAT 1 CTATTTCAAATAATTAT 21877507 AATCTTTTGT Statistics Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1 0.88 0.06 0.06 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.40 17 9 0.60 ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.00, T:0.52 Consensus pattern (17 bp): CTATTTCAAATAATTAT Found at i:21877619 original size:168 final size:168 Alignment explanation

Indices: 21877316--21877628 Score: 402 Period size: 168 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168 21877306 CCATTTGAAC * * ** 21877316 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAATTTTGTTCTGTCATAAAACAATTGTTTTTATCGTACAC 1 AATTATCTATTTCAAATTATTATGAAATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATCGTACAC * * * * 21877381 GCCCATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAACATTTATAAGTAGGAGATTTAA 66 GCCCATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAACATTAATAACTAAGAGATTTAA * 21877446 AAAATAAATCTGTTTCTCGAACTAGTTACTATTTAAAT 131 AAAATAAATATGTTTCTCGAACTAGTTACTATTTAAAT * * * * 21877484 AATTATCTATTTCAAATTATTAT-AATCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAATTCGTAT 1 AATTATCTATTTCAAATTATTATGAA-ATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCAA-TCGTAC * * * 21877548 A-GTCTTCTTTC-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTGAAA-ATTAATAACTAAGAGA 64 ACG-C-CCATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAACATTAATAACTAAGAGA 21877610 TTT-AAAAATAAATATGTTT 126 TTTAAAAAATAAATATGTTT 21877629 GCCAAAATAG Statistics Matches: 124, Mismatches: 16, Indels: 10 0.83 0.11 0.07 Matches are distributed among these distances: 167 2 0.02 168 63 0.51 169 51 0.41 170 8 0.06 ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42 Consensus pattern (168 bp): AATTATCTATTTCAAATTATTATGAAATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATCGTACAC GCCCATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAACATTAATAACTAAGAGATTTAA AAAATAAATATGTTTCTCGAACTAGTTACTATTTAAAT Found at i:21878708 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21878098--21881657 Score: 2742 Period size: 181 Copynumber: 19.8 Consensus size: 181 21878088 TTTATTCAGA * * * * * * * * * * 21878098 ATTAATATTCCAAAAATCAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTTTTTA-TCGAACCAATTT 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTC * ** * * 21878162 AAATATTTAAAACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA * ** * * * 21878227 AATAGGTTTGTTTGAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTT 130 AATA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTT * * 21878281 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCT-AACTAGTTC 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTTC * * * * * 21878345 AAATAATTATTACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATA * * * * * ** ** * 21878410 AAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGGTTGGAATAATGTAATACTAATCT 129 AAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * 21878463 ATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACTAGTTC 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTC * * * * * * * * * 21878523 AAATAGTTATAACTATCTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTATTATAA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA * 21878588 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTT 130 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT ** * * * * * * * 21878640 ATTAATATTTTGACAATTAATGAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACTAGATCA 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCA * * * * * 21878705 AATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTATGTCATAAA 66 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA * ** * * ** * 21878770 AGAATAATTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTT 131 ATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * * * * * 21878821 ATTAATAATACAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAATTT 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTC * * * * * * 21878885 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA * * * * ** * 21878950 AAGAATTCTTT-TATGCTCATCCAAGGTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTT 130 AATAATTGTTTCTAT--TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * * 21879003 ATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAATTT 1 ATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTT * * * * * * 21879066 CAAATCA-TTATGACTATTTGAGCAATTAT-T-TAT-GACTTGTTATGACTTTTTGTTGTT-TCA 64 CAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCA * * * *** * * 21879126 TAAAAGAA-TGATTTCTATTTATACAAGTTTATTCATATTAAAATAATATTAATTT 127 TAAAATAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * ** * * * * 21879181 ATAAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTACCGAACAAGTTCA 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTC- * * * * * * * 21879245 AAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA * * * * * 21879310 AATACTTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTT-GAAGTAAGATAGTACTAGTTT 130 AATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTT * * * * ** * 21879362 ATTAATATCTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAATAAAA-AGAATAAGTTTACCGAA-TAAGT 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAATA-AATCTGTTTACTGAACT-AGT * * * * * * * * 21879425 ACAAATAGTTATGATTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTTAT 63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT * * * * 21879490 -AAATGAATTGGTTCTATTCATCCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTT 128 AAAAT-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTT * * * 21879544 ATTTAT-TTTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTTAAAAAATAAATATGTTTTA-TGAAC-ACGT 1 ATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTGAACTA-GT * * * * 21879605 TCAAATATTTATGACTATTTGAAGAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT 63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT ** * * * * * * * 21879670 AAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTTTTTGAAACAAAATAATACTAATTT 128 AAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * 21879724 ATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AGTAAGTTC 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTC * * * ** 21879788 AAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA ** * 21879853 AATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTT-GACATAAAACAATACTAATTT 130 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAATACTAATTT * **** * 21879905 ATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTTTGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAA-TAAGT 1 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACT-AGT * * * * * * * ** 21879967 TCAAATAATCATGTCTATTAGAACTATTACCTATTTCAAATCGTAATGATATTTTGTTTTGTCAT 63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT * * ** * * 21880032 AAAACAATTGTTTCCATTCATGCACAA--TTATTCAGAATAAAATAGTACTAATCT 128 AAAATAATTGTTTCTATTCAT--ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT ** * * * ** * 21880086 ATTAATATTTTGATAATTAAT-A-T--AGGATTTAAAAACA-AAATCTATTTACCAAAAC-AATT 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTT * * * ** * * 21880145 AAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATATTTATGACCTTTTATTTTGTCCTA 64 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA * * * 21880210 AAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTT 129 AAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * * * * * * * 21880263 AATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGC-CAAATCAGTTC 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTC * * * * ** 21880327 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAATCATAA 65 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA * * *** * 21880392 AATAATTATTT-TAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTT 130 AATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * * * * 21880444 ATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACAAGT 1 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGT * * * 21880507 TAAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AATGTCGTTATGAGCTTTTGTTTTGTC 63 TCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC * * * * * ** * ** 21880570 ATAAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTCATCTAAAATAAAATAATATTCCTTT 126 ATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * * * * * * 21880626 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAAGCTGTTTTCTGGACCACTTCA 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCA * * * * * 21880691 AATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTTTTCTCATAA 66 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAA * * * * 21880754 CACAATTGCTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGG-ATAAAAATAATACTAACTT 130 AATAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTT * ** * * * 21880806 AATAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCA 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCA * * * ** * * * * * 21880867 AATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTAACCTTTTATTTAGTCATATA 66 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA * * * 21880932 ATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAGTT 131 ATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * ** ** * 21880983 ATTGACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATCCATTTACCGAA-TAAGT 1 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGT * * * * * * * 21881046 TTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTTATTTTGTCAT 63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT * * * **** * * 21881111 AAAACAATTGTTT-TAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAACAAAATAATACTACTTT 128 AAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * * * * 21881165 ATTATTATTTCAAAAATTAATAA-TCAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTAC-CAAATCAATT 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTT * * * * * * * 21881228 CAAATAATTATGGCAATTTAAACAACTATCTATTTTAAATCGTTATTA-CTTTTGTTTTGTCATA 64 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA * ** * ** 21881292 AAATAATTGTTTTTCA-AGATACAAGCTTTTTTCTAAATAAAATAATACTAATTT 129 AAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATACTAATTT * ** * 21881346 ATTAATATTTCAAGAATTAATAAG----AGATTT-AAAAA-AAATCTGTTTGTTGAACCAGTTCA 1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCA * ** * * * * 21881405 AGTAGTTGCGACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATCATAA 66 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA * *** * * 21881469 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAACTT 130 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT * * * ** * 21881521 AGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACT--GAGATTTAAAAAATAAATTCAT-TTGCCT-AACCAGT 1 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TC-TGTTTACTGAACTAGT * * * * ** * 21881581 TCAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTAT-AACTTTT-TTTTGTCAT 63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT * * 21881644 AAAACAATTATTTC 128 AAAATAATTGTTTC 21881658 AACTTGTTTG Statistics Matches: 2697, Mismatches: 559, Indels: 248 0.77 0.16 0.07 Matches are distributed among these distances: 174 3 0.00 175 77 0.03 176 129 0.05 177 317 0.12 178 187 0.07 179 76 0.03 180 272 0.10 181 925 0.34 182 562 0.21 183 131 0.05 184 17 0.01 185 1 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (181 bp): ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCA AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA ATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT Found at i:21878918 original size:16 final size:17 Alignment explanation

Indices: 21878881--21878921 Score: 57 Period size: 18 Copynumber: 2.4 Consensus size: 17 21878871 TACTGAACAA * 21878881 ATTTAAATAATTATGACT 1 ATTTGAATAATTAT-ACT 21878899 ATTTGAATAATTAT-CT 1 ATTTGAATAATTATACT 21878915 ATTTGAA 1 ATTTGAA 21878922 ATAGCTATAA Statistics Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 2 0.88 0.04 0.08 Matches are distributed among these distances: 16 9 0.41 18 13 0.59 ACGTcount: A:0.41, C:0.05, G:0.07, T:0.46 Consensus pattern (17 bp): ATTTGAATAATTATACT Found at i:21880297 original size:539 final size:539 Alignment explanation

Indices: 21878100--21881652 Score: 2905 Period size: 539 Copynumber: 6.6 Consensus size: 539 21878090 TATTCAGAAT * * * * * * * 21878100 TAATATTCCAAAAATCAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTTTTTA-TCGAACCAA-TTTA 1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAA-CAAGTTCA * * * * * 21878163 AATATTTAAAACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA 64 AATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA * ** * * 21878228 ATAGGTTTGTTTGAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-T 129 ATA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT * * * * * 21878291 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCTAACT-AGTTCAAATAATTAT 190 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAATTAT * * * * 21878355 TACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGT 253 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG- * ** ** * 21878420 TTTTATTCAT-ATAAGTT-TGGTTGGAATAATGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T-- 316 TTTTATTCATCACAAGTTAT--TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA * * * * * 21878480 TAAG-AAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATCTGA 379 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGA * * * * * * * * * 21878543 GCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATA 443 ACAATTATCTATTTCAAAT-TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTTTCATA * * 21878608 CAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAT 506 CAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA ** * * * * * * * * 21878642 TAATATTTTGACAATTAATGAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACTAGATCAAA 1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAA * * * * * * 21878707 TAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTATGTCATAAAAG 66 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT ** * * * * 21878772 AATAATTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAATAC-AAAA 131 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAA * * * * * 21878836 ATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAATTTAAATAATTATGACTA 194 ATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTA * * * * * * 21878900 TTTGAATAATTATCTATTTGAAAT-AGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTCTTTTAT 258 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT * 21878964 GCTCATC-CAAGGTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATA 322 --TCATCACAA-GTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATA * * * 21879025 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAATTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAG 381 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAACAA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAA * * * * * 21879088 CAATTAT-T-TAT-GACTTGTTATGACTTTTTGTTGTT-TCATAAAAGAA-TGATTTCTATTT-A 444 CAATTATCTATTTCAAATT-TTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAATAATTG-TTT-T-TTTCA * ** * 21879147 TACAAGTTTATTCATATTAAAATAATATTAATTT-A 504 TACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA ** * * * * 21879182 TAAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTACCGAACAAGTTCAA 1 T-AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTC-A * * * * * * * 21879246 AATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAA 64 AATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA * * * * * * 21879311 ATACTTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAGTACTAGTTTATTAATA-TCTCA 129 ATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A * * * * * 21879374 AAAATTAATGAGTAAGAGAATTAATAAAA-AGAAT-AAGTTTACCGAATAAGTACAAATAGTTAT 191 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATA-AATCTA-TTTACCGAATAAGTTCAAATAATTAT * * * * * * ** 21879437 GATTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAATGAATTGGT 253 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT * ** * * 21879502 TCTATTCATC-CAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTTAT-TTTCCAAAAATTAA 317 TTTATTCATCACAAG-TTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-CAAAAATTAA * * ** * * * 21879564 TAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTATGAACAC-GTTCAAATATTTATGACTATTTG 379 TAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTG * * ** 21879626 AAGAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCAT 442 AACAATTATCTATTTCAAATT-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-TTCAT * * * * * ** * 21879691 AAAAGTTTTTTTGAAACAAAATAATACTAATTTAT 505 ACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA * * * * ** 21879726 TAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGTAAGTTCAAA 1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAA * * * ** 21879791 TAGTTATGACTATCTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAT 66 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT ** * * * 21879856 AATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGACATAAAACAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAA 131 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA ** * * * * * * 21879921 TTAATAAGTTTGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATCATGTCTATT 195 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATT * * * * * ** * 21879986 AGAACTATTACCTATTTCAAATCGTAATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTC 260 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTC * * ** * 21880051 ATGCACAA-TTATTCAGAATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAAT-A-T-AG- 324 AT-CACAAGTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA * * 21880111 GATTTAAAAACA-AAATCTATTTACCAAAACAATTAAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATC 388 GATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACCAAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * 21880175 TATCTCAAATATTTATGACCTTTTATTTTGTCCTAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTAT 452 TATTTCAAAT-TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTTTCATACAAGCTTAT 21880240 TCGGATTAAAATAATACTAATTTAA 515 TCGGATTAAAATAATACTAATTTAA * * * * ** 21880265 TAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGCCAAATC-AGTTCAA 1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAA * * * * ** 21880329 ATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAATCATAAAA 65 ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA * * * * * * 21880394 TAATTATTT-TAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAAAA 130 TAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA * * * * * 21880458 AATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTAAAATAGATT-TGAC 193 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATA-ATTATGAC * * * * * 21880522 TATTTGAACAATTATCTATTT-AATGTCGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC 256 TATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT * * * * * * ** 21880586 AGTTCATAAAAACTCA-TCTAAAATAAAATAATATTCCTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG 320 A-TTCATCACAAGTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG * * * * * *** * * * 21880650 TAAGAGATTTAAAAACTGAAGCTGTTTTCTGGACCACTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAA 383 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * * * 21880715 TATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTTTTCTCATAACACAATTGCTTTTTATCATACAAG 448 TATCTATTTCAAAT-TTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTTTTCATACAAG * * * 21880778 CTTATTTGGATAAAAATAATACTAACTTAA 510 CTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA ** * * * 21880808 TAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCAAA 1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAA * ** * * * * * 21880869 TAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTAACCTTTTATTTAGTCATATAAT 66 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * * * * 21880934 AATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAGTTATTGACATTCAAAAA 131 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA * * * * * 21880998 ATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATCCATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTA 194 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTA * * * * * * 21881063 TTTCAACAATTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGC 258 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-T * * * * * * 21881128 TCAT-AAAAGCTTATCCAAAACAAAATAATACTACTTTATTATTATTTCAAAAATTAATAA-TCA 322 TCATCACAAG-TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A * * * * * * 21881191 AGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCAATTTAAACAACT 385 AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * *** 21881255 ATCTATTTTAAATCGTTATTA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAAGATACAAGCT 449 ATCTATTTCAAAT-TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-TTCATACAAGC- * ** * * 21881319 TTTTTCTAAATAAAATAATACTAATTTAT 511 TTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA * * ** * * 21881348 TAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAATCTGTTTGTTGAACCAGTTCAAG 1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAA ** * * * * * 21881407 TAGTTGCGACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATCATAAAA 66 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA * * * * * 21881471 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAACTTAGTAATATTCTAAAA 130 TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA * * * ** * * 21881536 ATTAATAACT--GAGATTTAAAAAATAAAT-TCATTTGCCTAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA 194 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTA * * * ** * 21881598 TATAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTAT-AACTTTT-TTTTGTCATAAAACAATT 258 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT 21881653 ATTTCAACTT Statistics Matches: 2451, Mismatches: 455, Indels: 219 0.78 0.15 0.07 Matches are distributed among these distances: 533 18 0.01 534 5 0.00 535 60 0.02 536 7 0.00 538 154 0.06 539 740 0.30 540 408 0.17 541 290 0.12 542 312 0.13 543 307 0.13 544 149 0.06 545 1 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (539 bp): TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAA TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTT GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCAT CACAAGTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT TCAAATTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTCGGAT TAAAATAATACTAATTTAA Found at i:21880572 original size:902 final size:892 Alignment explanation

Indices: 21878190--21881657 Score: 2952 Period size: 902 Copynumber: 3.9 Consensus size: 892 21878180 GAACAATTTT * * * * * ** * 21878190 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAGGTTTGTTTGAATTCATACTAGCT 1 CTATTTCAAATTGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGTTTCCATTCATACAAG-T * * ** * * 21878255 TATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA 62 TATTCAGAATAAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTTGATAATTAATAAGT--AGGATTTAAAA * * * * * * * * * 21878319 AATAATTATGTTTACC-TAACTAGTTCAAATAATTATTACTATTTGAACAATTATATATTTCAAA 123 AATAAATCTATTTACCAAAAC-AATTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * * * * * 21878383 TCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGGTT-GGAAT 187 TCATTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATATAAGCTT-ATTCGAAAT ** * * * * * * 21878447 AATGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAG-AAGTGATTTAAAAAATAAATCTAT 249 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGT * * * * * 21878508 TTATCAAA-CTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATCTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC 314 TTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTA-AGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC * * * * * * * 21878571 TTTTTATTCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACT 377 CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TACTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACT ** * * * * * 21878635 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATGAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACTA 440 AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACAA * * * * 21878700 GATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTATGTC 504 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC * ** * * * * 21878765 ATAAAAGAATAATTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAA- 568 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AAT * * * * * * 21878829 TACAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAATTTAAATAATT 632 TCCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT * * * * * ** * * 21878893 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTC 696 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG * * * * 21878958 TTT-TATGCTCATCCAAGGTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGATAATT 761 TTTCTAT--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATT * * * * * * 21879021 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAATTTCAAATCATTATGACTATTTG 822 AATAAGT--GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAG * * 21879086 AGCAATTA 885 AACTATTA * * * * * 21879094 -T-TTAT-GACTTGTTATGACTTTTTGTTGTT-TCATAAAAGAA-TGATTTCTATTTATACAAGT 1 CTATT-TCAAATTGTTATGA-TTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTG-TTTCCATTCATACAAG- * * * * * 21879154 TTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA 61 TTATTCAGAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGATAATTAATAAGT--AGGATTTAAAA * * * * * 21879219 AATAAAT-TATTTACC-GAACAAGTTCAAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCCATTTCAA 123 AATAAATCTATTTACCAAAACAA-TT-AAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA * * * * * * * 21879282 ATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAATACTTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTA 186 ATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATTCGAAATA * * * * * * * 21879347 AGATAGTACTAGTTTATTAATA-TCTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAATAAAAAGAATAAG 250 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAAAAAATATG * * * * * * * 21879411 TTTACCGAATAAGTACAAATAGTTATGATTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACC 313 TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC * * * * * * * * 21879476 TTTTGTTTTGTTAT-AAATGAATTGGTTCTATTCATCCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTA 378 TTTTGTTTTATCATAAAAT-AATT-GTTTTACTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACT- * * * 21879539 AATTTATTTATTTTCCAAAAATTAATAAGTAAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTT-TATGAACA 440 AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTAT-TAAACA * * * * 21879602 CGTTCAAATATTTATGACTATTTGAAGAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT 503 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT * *** * * * * 21879667 CATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTTTTTGAAACAAAATAATACTAATTTATTAAAAT 567 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT ** 21879732 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGTAAGTTCAAATAGTTA 632 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA * * * * 21879797 TGACTATCTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT 697 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT ** * * * 21879862 TTCTATTCATACAATTTTATTTGACATAAAACAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATA 762 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATA * * * * * 21879927 AGTTTGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATAAGTTCAAATAATCATGTCTATTAGAAC 826 AG--TGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAAC 21879991 TATTA 888 TATTA * * 21879996 CCTATTTCAAATCGTAATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCATGCACAA-T 1 -CTATTTCAAATTGTTATGAT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCAT--ACAAGT * 21880060 TATTCAGAATAAAATAGTACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAAT-A-TAGGATTTAAAAACA 62 TATTCAGAATAAAATAATACTAAT-TATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAGGATTTAAAAA-A * * 21880123 -AAATCTATTTACCAAAACAATTAAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-A 125 TAAATCTATTTACCAAAACAATTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * * * * * * 21880186 TTTATGACCTTTTATTTTGTCCTAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAA 190 -TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAA * * * 21880251 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGC 253 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTAC * 21880316 CAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTT 318 CAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATCTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT * * * * 21880380 GTTTAATCATAAAATAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTA 382 GTTTTATCATAAAATAATTGTTTTA-CTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTA * * * * * * 21880445 TTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTAA 446 TTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACAAGTTCA * 21880510 AATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AATGTCGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATA 509 AATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAT-T-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA * * * * * * ** * * 21880573 AAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTCATCTAAAATAAAATAATATTCCTTTATTAATATTTCA 571 AAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCA * * * * * * * * 21880638 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAAGCTGTTTTCTGGACCACTTCAAATAGTTATGAC 636 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC * * * * * * * 21880703 TATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATA-TTTGTTTTCTCATAACACAATTGCTTTT 701 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTC * * * * 21880767 TA-TCATACAAGCTTATTTG-GATAAAAATAATACTAACTTAATAATATTTTGAAAATTAATAA- 765 TATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG * * * * * 21880829 -GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA-TAATT 828 TGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACT-ATT 21880892 A 892 A * * * * * * * * * 21880893 TCTATTTCAAATTATTTTAACCTTTTATTTAGTCATATAATAATTATTT-CAGTTCATACAAGCT 1 -CTATTTCAAATTGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCA-TTCATACAAG-T * * * *** * * 21880957 TATTCGGAATAAAATAATACTAAGTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAA 62 TATTCAGAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTA-G-GATTT-AAAA * * * * * * 21881022 AATAAATCCATTTACCGAATA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAA 123 AATAAATCTATTTACC-AAAACAATTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA * * * * * * * 21881086 GCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAACAA 187 TCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATATAAGCTTATTCGAAATAA * * * * 21881151 AATAATACTACTTTATTATTATTTCAAAAATTAATAA-TCAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GT 251 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAAAAAAT-ATGT * * * * * * * * * 21881214 TTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCAATTTAAACAACTATCTATTTTAAATCGTTATTA-CT 314 TTACCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCT * * ** * 21881278 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAAGATACAAGCTTTTTTCTAAATAAAATAATACTAA 379 TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAC-TCATACAAGC-TTATTCTAAATAAAATAATACTAA * * * * * 21881343 TTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG---AGA-TTT-AAAAA-AAATCTGTTTGTTGAACCAGT 442 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACAAGT * * ** * * * 21881402 TCAAGTAGTTGCGACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATCA 506 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA * * * * * * * 21881466 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAACTTAGTAATATTC 569 TAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTC * * * ** * 21881531 TAAAAATTAATAACT--GAGATTTAAAAAATAAATTCAT-TTGCCT-AACCAGTTCAAATAGTTA 634 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TC-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA * * * * ** * 21881592 AGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTAT-A-ACTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTA 697 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG 21881654 TTTC 761 TTTC 21881658 AACTTGTTTG Statistics Matches: 2084, Mismatches: 391, Indels: 191 0.78 0.15 0.07 Matches are distributed among these distances: 891 4 0.00 892 17 0.01 893 61 0.03 894 7 0.00 895 121 0.06 896 18 0.01 897 134 0.06 898 16 0.01 899 80 0.04 900 251 0.12 901 259 0.12 902 607 0.29 903 280 0.13 904 142 0.07 905 81 0.04 906 2 0.00 907 4 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (892 bp): CTATTTCAAATTGTTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCATACAAGTTATT CAGAATAAAATAATACTAATTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAGGATTTAAAAAATAAATC TATTTACCAAAACAATTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTACCAAATCAG TTCAAATAGTTAAGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCA TAAAATAATTGTTTTACTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACAAGTTCAAATAATTATGAC TATTTGAACAATTATCTATTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAA TTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT CTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTGAGATTTAAAAAATAAA TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACTATTA Found at i:21882081 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21881652--21882387 Score: 824 Period size: 181 Copynumber: 4.1 Consensus size: 181 21881642 ATAAAACAAT * * * * 21881652 TATTTCAACTTGTTTGGTAAACA-ATTTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTTGGAAT 1 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACATA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA-TAAATTTTTGAAAT * * * * * ** 21881716 TTTAATAAA-TTAGTCTTATTTTATTTCGAATAAACATTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGA 64 ATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTTATGAACATAAACAATTATTTTATGA * ** * 21881780 CAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAAC 128 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * * 21881834 TATTTCGAACATGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATCTTTGAAATA 1 TATTT-GAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGAAATA * * 21881898 TTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGAC 65 TTAATAAATTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-TATGAACATAAACAATTATTTTATGAC * 21881962 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAC 129 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * * 21882015 TATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAATTTTTGGAATAT 1 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGAAATAT * * * * * 21882080 TAAT-AAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATTAA-TTAATACAATT-TTTTATGAC 66 TAATAAATTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTTATGAACATAA-ACAATTATTTTATGAC * * * * * * 21882142 GAAACAAAAGATTATAATGATTT-AAAGTAGATAATTATTCAAATAGTTATTAC 129 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * * * ** 21882195 TATTTAAACTTATTTGATAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTATCAAAATA 1 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGAAATA * * * * * 21882260 TTAATAAA-TTAATATTATTTTACTCCGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC 65 TTAATAAATTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTTATGAACATAAACAATTATTTTATGAC * * * 21882324 AAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 129 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 21882377 TATTTGAACTT 1 TATTTGAACTT 21882388 ATTCAATAAA Statistics Matches: 462, Mismatches: 77, Indels: 30 0.81 0.14 0.05 Matches are distributed among these distances: 179 3 0.01 180 115 0.25 181 230 0.50 182 82 0.18 183 31 0.07 184 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (181 bp): TATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGAAATAT TAATAAATTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAA AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC Found at i:21882377 original size:362 final size:363 Alignment explanation

Indices: 21881652--21882387 Score: 957 Period size: 362 Copynumber: 2.0 Consensus size: 363 21881642 ATAAAACAAT * * * * * * * 21881652 TATTTCAACTTGTTTGGTAAACAATTTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTTGGAATT 1 TATTTGAACTTGTTCGGTAAACAATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTTGGAATA * * 21881717 TTAATAAATTAGTCTTATTTTATTTCGAATAAACATTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACA 66 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACA * * * * 21881782 AAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTCGAACATG 131 AAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTCAAACATA ** * * 21881847 TTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTTGAAATATTAGTAAATTTATA 196 TTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAATTAATA * ** * 21881912 TTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT 261 TTATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * 21881977 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAC 326 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAAC * 21882015 TATTTGAATTTGTTCGGTAAAC-ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCA-TAAATTTTTGGAAT 1 TATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAT-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTTGGAAT * * * * * * * 21882078 ATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATTAATTA-ATACAATT-TTTTATGA 65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACATATATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGA * * * ** * * 21882141 CGAAACAAAAGATTATAATGATTT-AAAGTAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTT-AAAC 129 CAAAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTCAAAC * * 21882204 TTATTT-GATAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAAT-TATCAAAATATTAATAA 193 ATATTTAGA-AAACATATTTA-TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATCT-TCAAAATATTAATAA * * * 21882267 ATTAATATTATTTTACTCCGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAATAAA 254 ATTAATATTATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA * * 21882332 AGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 319 AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAAC 21882377 TATTTGAACTT 1 TATTTGAACTT 21882388 ATTCAATAAA Statistics Matches: 321, Mismatches: 45, Indels: 15 0.84 0.12 0.04 Matches are distributed among these distances: 359 2 0.01 360 21 0.07 361 64 0.20 362 192 0.60 363 42 0.13 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (363 bp): TATTTGAACTTGTTCGGTAAACAATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTTGGAATA TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACA AAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTCAAACATA TTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAATTAATA TTATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAAC Found at i:21882440 original size:120 final size:121 Alignment explanation

Indices: 21882287--21882524 Score: 318 Period size: 121 Copynumber: 2.0 Consensus size: 121 21882277 TTTTACTCCG * * * ** * 21882287 AATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAA-TAAAAGGTCATAATGATTTTAAA 1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATAACAAAAGAAAAAGGTCATAACAATTTGAAA 21882351 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATTTGA 66 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATTTGA * * * * * 21882407 AATAAGCTTGTATGAATAGATAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAGGTTATAACAATTTGGA 1 AATAAGCTTGTATGAACA-AAAATAATTATTTTATAACAAAAGAAAAAGGTCATAACAATTTGAA * * * * 21882471 GTAGATAATTGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATT 65 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATT 21882525 CATTTTTTAA Statistics Matches: 101, Mismatches: 15, Indels: 3 0.85 0.13 0.03 Matches are distributed among these distances: 120 32 0.32 121 69 0.68 ACGTcount: A:0.45, C:0.07, G:0.12, T:0.36 Consensus pattern (121 bp): AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATAACAAAAGAAAAAGGTCATAACAATTTGAAA TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATTTGA Found at i:21882719 original size:181 final size:182 Alignment explanation

Indices: 21882406--21882735 Score: 409 Period size: 181 Copynumber: 1.8 Consensus size: 182 21882396 AATAGATTTG * * * * 21882406 AAATAAGCTTGTATGAATAGATAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAGGTTATAACAATTTGGA 1 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAGGTCATAACAATTTGAA * * * * * * * 21882471 GTAGATAATTGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTCATTTTTTAAA 66 ATAGATAATTGTTCAAACAGTCATTACTATTTGAACTTGGTCAACAAACAGATACATTTTATAAA * * 21882536 TCCCTTACTTGTTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCC 131 TCCATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCC * * * 21882588 AAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTGTGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGAA-TTG 1 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAGGTCATAAC-AATTTG * * * * 21882650 AAATAGATAATTGTTCAAACAGTCA-TAGCTGTTTGCA-TTGGTCAGGCCAACAGATACATTTTA 64 AAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATTA-CTATTTGAACTTGGTCA-ACAAACAGATACATTTTA 21882713 TAAATCCATTACTTATTAATTTT 127 TAAATCCATTACTTATTAATTTT 21882736 AAATTAGCAT Statistics Matches: 124, Mismatches: 20, Indels: 9 0.81 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 180 8 0.06 181 80 0.65 182 36 0.29 ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.13, T:0.37 Consensus pattern (182 bp): AAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAGGTCATAACAATTTGAA ATAGATAATTGTTCAAACAGTCATTACTATTTGAACTTGGTCAACAAACAGATACATTTTATAAA TCCATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCC Found at i:21882793 original size:21 final size:20 Alignment explanation

Indices: 21882768--21882817 Score: 55 Period size: 25 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20 21882758 AATAAGACTG 21882768 TATGAACAAAAATAATTGTTT 1 TATGAACAAAAATAATTG-TT 21882789 TATGATAAAACAAAAATAATTGTT 1 TATG----AACAAAAATAATTGTT 21882813 TATGA 1 TATGA 21882818 TAAAACAAAT Statistics Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 9 0.74 0.00 0.26 Matches are distributed among these distances: 20 1 0.04 21 4 0.16 24 6 0.24 25 14 0.56 ACGTcount: A:0.50, C:0.04, G:0.10, T:0.36 Consensus pattern (20 bp): TATGAACAAAAATAATTGTT Found at i:21882814 original size:24 final size:25 Alignment explanation

Indices: 21882772--21882826 Score: 103 Period size: 24 Copynumber: 2.2 Consensus size: 25 21882762 AGACTGTATG 21882772 AACAAAAATAATTGTTTTATGATAA 1 AACAAAAATAATTGTTTTATGATAA 21882797 AACAAAAATAATTG-TTTATGATAA 1 AACAAAAATAATTGTTTTATGATAA 21882821 AACAAA 1 AACAAA 21882827 TAGTCCCAAC Statistics Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 1 0.97 0.00 0.03 Matches are distributed among these distances: 24 16 0.53 25 14 0.47 ACGTcount: A:0.56, C:0.05, G:0.07, T:0.31 Consensus pattern (25 bp): AACAAAAATAATTGTTTTATGATAA Found at i:21883341 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21882969--21883800 Score: 701 Period size: 181 Copynumber: 4.6 Consensus size: 181 21882959 TGAAAATTAA * ** * * * * 21882969 TAAGAGATTTAAAAAATAAAATGT-GTTTACAAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATA 1 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAAT-TCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA * * * * * * * * 21883033 ATTATCTA-TTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTCAGTTCATACA 64 ATTATCTAGTTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-CTCATACA *** * ** * * 21883097 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAGTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAAG 128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG * * * * * 21883151 CATGAGATTTGAAAAAATAAATCCATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAAC-A 1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATTCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * * * * * * * 21883215 TTAACTA-TTTAAAATCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAAAA 65 TTATCTAGTTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-CTCATACAA * * 21883279 GCTTATCCAAAACAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG 129 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG ** * * * * * 21883332 TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCAGTTTACCAAATCAA-TTCAAATAATCATGGCCATTTAAACA 1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTCA-TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA * * * * ** 21883395 ACTATCTAGTTT-AAATCGTTATTA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAAGATACA 64 ATTATCTAGTTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAC-TCATACA * * * * * 21883458 AGCTTTTTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA- 128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG * ** * * * 21883508 TAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTTTTTATTGAACCAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAAT 1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT * * * * * 21883573 TATCTATTTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG 66 TATCTAGTTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TACTCATACAAG * * ** * 21883637 CTTATTCGAAATAAAATAATAATAAC-TTAGCAATA-TTCTAAAAATTAATAAC 130 CTTATTCAAAATAAAATAAT-ATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG * * * * * 21883689 TATGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTGCCT-AACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATTTGAACAA 1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTT-ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * ** * 21883753 TTATTTA-TTTCAAATTTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT 65 TTATCTAGTTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT 21883801 ATTTCAACTC Statistics Matches: 517, Mismatches: 112, Indels: 43 0.77 0.17 0.06 Matches are distributed among these distances: 175 2 0.00 176 58 0.11 177 73 0.14 178 5 0.01 179 4 0.01 180 126 0.24 181 193 0.37 182 49 0.09 183 7 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (181 bp): TAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT TATCTAGTTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACTCATACAAGC TTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG Found at i:21884513 original size:362 final size:363 Alignment explanation

Indices: 21883847--21884533 Score: 920 Period size: 362 Copynumber: 1.9 Consensus size: 363 21883837 ATTCTTTTAG * * * 21883847 TTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATTTATGAACAAA 1 TTATTAATATTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAACAAA * * * 21883912 AACAATTGGTTTATGATAGAAAAAAAGGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGT 66 AACAATTGGTTTATGATAGAAAAAAAGGATAATAACAATTTGAAATACATAATTATTCAAATAGT * * ** 21883977 CATAACTATTTTGAACGTGTTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTTG 131 CATAACTATTTTAAACGTATTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTCA * * * ** * 21884042 AAATATTAGTAAATTTATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTA 196 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTA * * 21884107 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAA 261 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA 21884172 TTTGTTCATTAAAAATATTTATTTTCTAAATCTCTTAC 326 TTTGTTCATTAAAAATATTTATTTTCTAAATCTCTTAC * * ** 21884210 TTATTAATATTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTC-TATATGAATTA 1 TTATTAATATTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-ACATATATGAACAA * * * * ** * 21884274 ATACAATT-TTTTATGAT-GAAACAAAA-TATTATAATGATTTGAAGTACATAATTATTCAAATA 65 AAACAATTGGTTTATGATAGAAA-AAAAGGATAATAACAATTTGAAATACATAATTATTCAAATA * * * * 21884336 GTTATTACTA-TTTAAACTTATTT-GATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTATTTATTAAT 129 GTCATAACTATTTTAAACGTATTTGGA-AAACATATTTATTTTTT-AAAT-TTTTACTTATTAAT * * 21884399 -TATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATT 191 CT-TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT * * * * 21884463 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA 255 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA 21884528 TTTGAA 320 TTTGAA 21884534 CTTATTCAAT Statistics Matches: 279, Mismatches: 39, Indels: 13 0.84 0.12 0.04 Matches are distributed among these distances: 359 2 0.01 360 27 0.10 361 45 0.16 362 142 0.51 363 62 0.22 364 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (363 bp): TTATTAATATTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAACAAA AACAATTGGTTTATGATAGAAAAAAAGGATAATAACAATTTGAAATACATAATTATTCAAATAGT CATAACTATTTTAAACGTATTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATCTTCA AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTA TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA TTTGTTCATTAAAAATATTTATTTTCTAAATCTCTTAC Found at i:21884519 original size:182 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21883817--21884539 Score: 764 Period size: 181 Copynumber: 4.0 Consensus size: 181 21883807 ACTCGTTCGG * * * * * * 21883817 TAAACA-ATTTTATTTTTTTAATTCTTTTAGTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATT 1 TAAACATA-TTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAATATT * * * * * 21883881 ATTTTATTTTGAATAAACATTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAGAAA-AAAAGGGTAAT 64 ATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAA-GGTCAT * * * * 21883945 AACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTTGAACGTGTTTGGA 127 AATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTTATTT-GA * * 21884002 -AAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATCT-TTGAAATATTAGTAAATTTATATTA 1 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TATTGAAATATTAATAAATTAATATTA * * * * 21884064 TTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT 65 TTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT * * * 21884129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAA-TT-TGTTCA 130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAT-TTGA * * * * * * 21884180 TTAAAAATATTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAA-TATTTGGAATATTAATAAGTTAGTATT 1 -TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTA-TTGAAATATTAATAAATTAATATT * ** * ** ** * 21884244 ATTTTATTTTGAATAAG-TCTATATGAATTAATACAATT-TTTTATGATGAAACAAAATATTATA 64 ATTTTATTTTGAATAAGCT-TTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * * * * 21884307 ATGATTTGAAGTACATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTAAACTTATTTGA 128 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA * ** 21884361 TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTA 1 TAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAATATTA * ** * 21884426 TTTTAATCCGAATAAGCTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT 65 TTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT * * * 21884491 GATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT 130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT 21884540 CAATAAATAG Statistics Matches: 442, Mismatches: 80, Indels: 35 0.79 0.14 0.06 Matches are distributed among these distances: 178 2 0.00 179 4 0.01 180 98 0.22 181 173 0.39 182 145 0.33 183 10 0.02 184 9 0.02 185 1 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.44 Consensus pattern (181 bp): TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAATATTAT TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA Found at i:21885209 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 21884931--21885269 Score: 443 Period size: 181 Copynumber: 1.9 Consensus size: 181 21884921 ATAAAAATAA * * ** * 21884931 TTGTTTTATGATAAAACAAATAGTTGTAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAAC 1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAAC * * * * * * 21884996 TAATTGAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTACTTATTAA-TTTTCAAGATA 66 TAATTGAACTAGTTTGCTAAAGAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAA-ATA 21885060 TTAATAAATT-AATATTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAACAAAAACTT 130 TTAATAAATTCAAT-TTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAACAAAAACTT * * * 21885112 TTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATA-TTCATAA 1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGTT-ATAA * * * ** 21885176 TTATTTGAACTAGTTTAGCTAACGA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTTAAT 65 CTAATTGAACTAGTTT-GCTAAAGAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAAT 21885240 ATTAATAAATTCAATTTATTTTATTTTGAA 129 ATTAATAAATTCAATTTATTTTATTTTGAA 21885270 TAAGTTAGTA Statistics Matches: 135, Mismatches: 19, Indels: 8 0.83 0.12 0.05 Matches are distributed among these distances: 180 2 0.01 181 120 0.89 182 13 0.10 ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.08, T:0.45 Consensus pattern (181 bp): TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAAC TAATTGAACTAGTTTGCTAAAGAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATAT TAATAAATTCAATTTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAACAAAAACTT Found at i:21885225 original size:350 final size:350 Alignment explanation

Indices: 21884579--21885233 Score: 834 Period size: 350 Copynumber: 1.9 Consensus size: 350 21884569 GAATAGATGA * * * 21884579 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGGAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA 1 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATA * * * ** 21884644 ACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTGTTAATTTTTGGAAT 66 ACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTAAGAAT * * * * 21884709 ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGAC 131 ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCGAACAAACTTACATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC * * * * * * 21884774 AAAACAAAAGGTCATAATAAATTGAAATAGATAGTTGTTCAAACAGTCATAATTATTTGCACTAG 196 AAAACAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAACTAG * 21884839 TCAAGCCAACAGATACATTTTCTAAATCCATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTAGTTTATTC 261 TCAAGCCAACAAATACATTTTCTAAATCCATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTAGTTTATTC 21884904 CGAATAAGACTGTATGAATAAAAAT 326 CGAATAAGACTGTATGAATAAAAAT * * * * 21884929 AATTGTTTTATGATAAAACAAATA-GTTGTAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTAT 1 AATTGTTTTATAACAAAACAAA-AGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCAT * * * ** 21884993 AACTAATTGAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTCAAG- 65 AACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTT-AAGA * ** * * ** 21885057 ATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAACAAAAACTTTTGTTTTAT 129 ATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTCCGAACAAACTTACATGAACAAAAACAATTGTTTTAT * * * * 21885121 GACAAAATAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAATTATTTGAAC 193 GACAAAACAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAAC ** * * * 21885186 TAGTTTAGCTAACGAAAT-TATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT 258 TAGTCAAGCCAAC-AAATACATTTTCTAAATC-CATTACTTATTAATTTT 21885234 TTTAATATTA Statistics Matches: 256, Mismatches: 44, Indels: 10 0.83 0.14 0.03 Matches are distributed among these distances: 349 1 0.00 350 249 0.97 351 6 0.02 ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40 Consensus pattern (350 bp): AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATA ACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTAAGAAT ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCGAACAAACTTACATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC AAAACAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAACTAG TCAAGCCAACAAATACATTTTCTAAATCCATTACTTATTAATTTTAAATTAGCATTAGTTTATTC CGAATAAGACTGTATGAATAAAAAT Found at i:21885311 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 21884957--21885336 Score: 394 Period size: 181 Copynumber: 2.1 Consensus size: 180 21884947 CAAATAGTTG * * * * * 21884957 TAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAATAGAT 1 TAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGCTAAAGAGAA * * 21885022 TTATTTTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG 66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG * * * * ** 21885087 AACAAATTTATATGAACAAAAACTTTTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAA 131 AACAAAGTTATAAGAACAAAAAC-ATTATTTTACAACAAAATAAAAAGTAA * * * * * 21885138 TAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATA-TTCATAATTATTTGAACTAGTTTAGCTAACGA- 1 TAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTT-ATAACTAATTGAACTAGTTT-GCTAAAGAG ** 21885201 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTTA-ATATTAATAAATTCAAT-TTATTTTAT 64 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAATT-AATATTATTTTAT * ** * * * 21885264 TTTGAA-TAAGTTAGTAAGAGTTGAAAAA-ATTATTTTACAATAAAATAAAATGTCA 127 TTTGAACAAAGTTA-TAAGA--ACAAAAACATTATTTTACAACAAAATAAAAAGTAA * * 21885319 TACCTATTTGAAATAGAT 1 TAACAATTTGAAATAGAT 21885337 TGTTCAAATA Statistics Matches: 163, Mismatches: 29, Indels: 14 0.79 0.14 0.07 Matches are distributed among these distances: 180 7 0.04 181 138 0.85 182 13 0.08 183 5 0.03 ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.08, T:0.43 Consensus pattern (180 bp): TAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGCTAAAGAGAA TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG AACAAAGTTATAAGAACAAAAACATTATTTTACAACAAAATAAAAAGTAA Done.