Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167871.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_14, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 22631831
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.15, T:0.34
Warning! 114000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 121 of 125
Found at i:22265909 original size:145 final size:147
Alignment explanation
Indices: 22265724--22265998 Score: 371
Period size: 145 Copynumber: 1.9 Consensus size: 147
22265714 AATTATCTAT
* * * *
22265724 TTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTTATACGAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATCACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTC
* * * *
22265789 TAAATAAAACAAT-ATAAATTTGTTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAACA-ATTTAAAAACTAA
66 AAAATAAAACAATAAT-AATTTATTAATATACAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAA
22265852 ATATGTTTTTCTGAACACA
129 ATATGTTTTTCTGAACACA
* *
22265871 TTCAAAT-AGTTATCACC-TTTTA-TTTGTCATAAACTAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATT
1 TTCAAATCA-TTATCACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATT
* * *
22265933 CAAAATAAAATAATAATATTTTATTAATATACCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA
65 CAAAATAAAACAATAATAATTTATTAATATACAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA
22265998 T
130 T
22265999 TTATTTATTG
Statistics
Matches: 112, Mismatches: 13, Indels: 8
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
145 81 0.72
146 17 0.15
147 14 0.12
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (147 bp):
TTCAAATCATTATCACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTC
AAAATAAAACAATAATAATTTATTAATATACAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAT
ATGTTTTTCTGAACACA
Found at i:22266171 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 22265871--22266755 Score: 827
Period size: 179 Copynumber: 4.9 Consensus size: 180
22265861 TCTGAACACA
* *
22265871 TTCAAATAGTTATCACCTTTTA-TTTGTCATAAACTAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAC-AATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTCA
* *
22265935 AAATAAAATAATAATATTTTATTAATATACCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATT
65 AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATT
*
22266000 TATTTATTGAGTAAGTTCAAATAGTTATAACTGA-TTCAACAATTATTTAT
130 TATTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTTCAACAATTATTTAT
* *
22266050 TTCAAATAGTTATCACCTTTTA-TTTGTCATAAACTAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAC-AATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTCA
* *
22266114 AAATAAAATAATAATATTTTATTAATATACCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATT
65 AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATT
*
22266179 TATTTATTGAGTAAGTTCAAATAGTTATAACTGA-TTCAACAATTATTTAT
130 TATTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTTCAACAATTATTTAT
* * * * * * **
22266229 TTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAGCATTTG-ATCTATTCACATAAGTTTATTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAA-CAATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTCA
* * * * **
22266293 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT-ATTAGTTAGGAGATTTAAAAAATAAA
65 AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTT-AAAAATAAA
* ** * * ** * * *
22266357 TATGCTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTC-CATTTGAATAATTATTTAT
128 TTTATTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTTCAACAATTATTTAT
* *
22266409 TTCAAATATTTCTTCCAAATTGTTATGACCTTCTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 TTC-AA-A-----T----A--GTTATGACCTTTTATTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * ** ***
22266474 GCAA-AATTATTCAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATATTTTGAAAATTAATAA-T---AGA
52 ACAAGCA-TATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* * * * *
22266534 TTTAAAAACTAAATCTATTTACT-AAAATAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTCAATAATTATCT
116 TTTAAAAA-TAAATTTATTTATTGAATA-AGTTCAAATAGTTATAACTGATTTCAACAATTATTT
22266597 AT
179 AT
* * * *
22266599 CTCAAATCA-TTATGA-TTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATT
1 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCA-TAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCATATT
* * * * *
22266661 -ACTATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
63 CA-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATA
* * **
22266725 AATGTATTTGTCAAACT-AGTTCAAATAGTTA
126 AATTTATTTATTGAA-TAAGTTCAAATAGTTA
22266756 AGGCTTTTTT
Statistics
Matches: 593, Mismatches: 77, Indels: 71
0.80 0.10 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 70 0.12
177 8 0.01
178 4 0.01
179 257 0.43
180 97 0.16
181 10 0.02
182 1 0.00
183 1 0.00
187 1 0.00
188 1 0.00
189 10 0.02
190 49 0.08
191 1 0.00
193 27 0.05
194 52 0.09
195 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTCAA
AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATTT
ATTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTTCAACAATTATTTAT
Found at i:22266692 original size:370 final size:370
Alignment explanation
Indices: 22266043--22266755 Score: 843
Period size: 370 Copynumber: 1.9 Consensus size: 370
22266033 ATTCAACAAT
* * * * *
22266043 TATTTATTTCAAATAGTTATCACCTTTTATTTGTCATAAACTAATTGTTTTTGTTCATACAAGCA
1 TATTTATTCCAAATAGTTATCACCTTCTATTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATACAAGAA
***
22266108 TATTCAAAATAAAATAATAATATTTTATTAATATACCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
66 TATTCAAAATAAAATAATAATAACCTATTAATATACCAAAAATTAATAAGT--AAGATTTAAAAA
* ** * * *
22266173 TAAATTTATTTATTGAGTAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTCAACAATTATTTATTTCAAATAG
129 TAAATCTATTTATAAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTCAACAATTATCTATCTCAAATAG
* * * * *
22266238 TTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAGCATTTGATCTATTCACATAAGTTTATTCAGAATAAAATA
194 TTATGATCTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGATCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * *
22266303 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT-ATTAGTTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTATC
259 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATACTTATC
*
22266367 GAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
323 AAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
* * * *
22266415 TATTTCTTCCAAATTGTTATGACCTTCTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATGCAA-
1 TATTTATTCCAAATAGTTATCACCTTCTA-TTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ****
22266478 AATTATTCAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATATTTTGAAAATTAATAA-T-AGATTTAAAA
64 AA-TATTCAAAATAAAATAATAATAACCTATTAATATACCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAA
*
22266541 ACTAAATCTATTTACTAAAAT-AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTCAATAATTATCTATCTCAA
128 A-TAAATCTATTTA-TAAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGA-TTCAACAATTATCTATCTCAA
* * * * *
22266604 ATCA-TTATGAT-TTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATT-ACTAT
190 AT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCACAAAACAATTG-ATCTATTCACACAAGCTTATTCA-GAA
* *
22266666 TAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTA
252 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATA
* * *
22266731 TTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTA
317 CTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTA
22266756 AGGCTTTTTT
Statistics
Matches: 286, Mismatches: 45, Indels: 22
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
369 34 0.12
370 148 0.52
371 8 0.03
372 26 0.09
373 66 0.23
374 4 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (370 bp):
TATTTATTCCAAATAGTTATCACCTTCTATTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATACAAGAA
TATTCAAAATAAAATAATAATAACCTATTAATATACCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAATA
AATCTATTTATAAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTGATTCAACAATTATCTATCTCAAATAGTT
ATGATCTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGATCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
ACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATACTTATCAAA
CAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
Found at i:22267176 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 22266859--22267488 Score: 690
Period size: 180 Copynumber: 3.5 Consensus size: 178
22266849 TTAAATCTCT
* * * ** *** **
22266859 TATTAATTTTCAAAATATTAATAGATAAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAG-A
* * * * **
22266924 ATAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATCTATAATTGTTCAAA-GGACA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACA
*
22266988 TAACTATTTGAACTTTTTTTATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
130 TAACTATTT-AAC-TTCTTTATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
22267039 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * *
22267104 CAATTATTTTAGGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATGGACAT
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACAT
* *
22267169 GACTATTTAAACTTGC-TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
131 AACTATTT-AACTT-CTTTA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
* *
22267219 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTTTATTATTTTATTCCAAAAAAACTTGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * * * * *
22267284 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGAGCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAACTAGTCAT
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACAT
* *** ** *
22267349 AACTATTTATACCTGCTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
131 AACTATTTA-A-CTTCTTTATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
** * * *** ** *
22267399 TATTAATTTTGGGAATATGAATAAA-CTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCATGTATGAATAGA
1 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAG-
**
22267463 AACAATTGGCTTATGACAAAACAAAA
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
22267489 GGTTATAATC
Statistics
Matches: 382, Mismatches: 60, Indels: 15
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
179 58 0.15
180 299 0.78
181 25 0.07
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACAT
AACTATTTAACTTCTTTATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
Found at i:22268460 original size:183 final size:180
Alignment explanation
Indices: 22268086--22269948 Score: 503
Period size: 182 Copynumber: 10.3 Consensus size: 180
22268076 ATACAAGCAC
* * ** * *
22268086 ATTTGGAATAGAATAAAACTAA-TTATTAATATTGCAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAGAAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAAA
22268150 TAATTCTACTTACCAAACCAGTACAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
66 TAATTCTACTTACCAAACCAGTACAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * * *
22268215 TATTACTTTTTGTTTTCTTATAAAACAATTTTTTTTGTTAATATAAGTTT
131 TATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTTGTTCTGTTAATATAAGTTT
* *** * *
22268265 GTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATCAGTAAGAGATTTA-AAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAAA
* * * * * * * *
22268329 GTGAA-TCTAGTTACCAAACCAATTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAA
66 -T-AATTCTACTTACCAAACC-A-GTAC-AATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * *
22268393 ATTGTTATAACATTTTATTTTATCATCAAACAATTTGTTCTGTTTATACT-ATTTT
126 ATCGTTATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTTGTTCTGTTAATA-TAAGTTT
* * ** * * * * *
22268448 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTGAAAACTTAATATCCAAGAAAATTAAAAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAAA
* * * * * * * *
22268513 TAAATT-TAATTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATATGAATAATTATATATTTCAAAT
66 T-AATTCTACTTACCAAACCAGTAC-AATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * ** * *
22268576 CGTGATGACCTTTTCTTTT-TCCGTAAAAGAATTTTTTTTTGTTTGTAGAAGCTT
128 CGTTATAACATTTTATTTTAT-CATAAAACAA-TTTGTTCTGTTAATATAAGTTT
* * * * ** * * *
22268630 ATTCT-GATTAAAATATTAGTAATTTATTGATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
1 ATT-TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAA
** * * * * * *** * *
22268694 ATAAATT-TGTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTA-ATACTATCAAAACAATTATCTATATGAAA
65 AT-AATTCTACTTACCAAACCAGTAC-AATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * * * ** *
22268757 TCCTTTTGACCTTTT-GTCTAGTCTTAAAAC-AGTTGTTTTAGTTTGTACAAGTTT
127 TCGTTATAACATTTTATTTTA-TCATAAAACAATTTGTTCT-GTTAATATAAGTTT
** * * * * ** *
22268811 ATTCAGAATAAATTAATACTAATTTTACTAATATTAAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTATAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTA-GAA
* * ** ** * * * * * *
22268876 AATAAATGTGTTTACTGAACAAGTTA-AATAGTTATTACTATTTGAACTATTCTCTATTTAAAAT
64 AATAATTCTACTTACCAAACCAG-TACAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
22268940 CATTATAAC-CTTTAGATTTGTCATAAAACAATTAT-TT-TAGTTAATACAAGCTT
128 CGTTATAACATTTTA-TTTTATCATAAAACAATT-TGTTCT-GTTAATATAAGTTT
** *
22268993 AGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAAA
* * ** ** * * *
22269053 TAAAATCT-TTTACTGAACTGGTTTA-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAAT
66 T-AATTCTACTTACCAAACCAG--TACAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
22269116 CATTA-AGA-TTTTTGTTTTGTTATAAAATAA-TTGTTTTTGATCATAAAAGGTT
128 CGTTATA-ACATTTTATTTTATCATAAAACAATTTG-TTCTGTTAATATAAGTTT
* * * ** * *
22269168 ATTTGG-TTAAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAA
1 ATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAA
* * ** * * * * * * * *
22269231 TATAAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
65 -AT-AATTCTACTTACCAAACCAGTAC-AATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * * *
22269296 TTGTTCTGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAA-TATTTATTTCATGTCT--TACAAGCTT
127 TCGTTATAACATTTTATTTTA-TCATAAAACAATTT-GTTC-TGT-TAATATAAGTTT
** * * * * * * *
22269350 ATTCAGAATAAAATAAT-CCAATTTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTGAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAA-CTAAGAGATTT-AGA
* * ** *** * * * * *
22269413 AAAGAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTA-AATAACTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAA
63 AAATAATTCTACTTACCAAACCAG--TACAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
22269477 ATCATTATGACATCTTGTTTGA-CATAAAACAA-TTGTTTCAG-TACATAAAAGCTT
126 ATCGTTATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTTG-TTCTGTTA-ATATAAGTTT
**** * * * *
22269531 ATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAG-TTAAGAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAA-CTAAGAGATTTAGAAA
** * * * * * * * **
22269594 CATAAATT-TTTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGGAAA
65 -AT-AATTCTACTTACCAAACCAGTAC-AATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * ** * * *
22269658 TCGTTAGGAC-TGTTGTTTTGTTACAAAACAATTAT-TTCAATTTATACAAGCTT
127 TCGTTATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATT-TGTTCTGTTAATATAAGTTT
*** * * * * * **
22269711 ATTCAAAATAAAATGATACTAATTTATTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTTATTTA-AAAA
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAAA
** * * * ** * *
22269775 GTGAA-TCTTTTTAGCAAATCAGTTTA-AAAAATTAT-GGTCATTTCAACAGTTATCTATTTCAA
66 -T-AATTCTACTTACCAAACCAG--TACAATAATTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * * * * * *
22269837 ATCATTATTATGTTTT-GTTTAGTCATATAACAA-TTGTTTTTGATCATACAAGTTT
126 ATCGTTATAACATTTTATTTTA-TCATAAAACAATTTG-TTCTGTTAATATAAGTTT
* * * * *
22269892 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
1 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGAT
22269949 GTTTACTGAA
Statistics
Matches: 1283, Mismatches: 317, Indels: 166
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 2 0.00
175 70 0.05
176 65 0.05
177 4 0.00
178 2 0.00
179 43 0.03
180 251 0.20
181 300 0.23
182 367 0.29
183 165 0.13
184 13 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAGAAAA
TAATTCTACTTACCAAACCAGTACAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
TATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTTGTTCTGTTAATATAAGTTT
Found at i:22268694 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 22267913--22280254 Score: 3966
Period size: 181 Copynumber: 68.8 Consensus size: 180
22267903 CTTATTCCAC
* * * * **
22267913 ATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAAGT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
** **** ** * * * * * * *
22267978 GCTTTTTGAACCAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGAT
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* * * * *
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* * *** **
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*
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* * * * * *
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* **
22269538 ATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAG--TTAAGAAACATAAA
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* * ** * ** * *
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129 ACCTTTT-TTT-TTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
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* * ** ** * *
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* * * * * * * *
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131 CTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
* * * *
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* * * *
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130 CCTTTT-TTTT-TCCATAAAACA-ATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTA-TTCTGA
** ** * * *
22270956 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGGCAATCAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAA-
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* * * * * *
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128 AACCTTTTTTTTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCT-GA
* * * * *
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** **** * * * * * *
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65 TAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
* * * * * *
22271248 CCTTTTATTTTGT-AAT-AAACAATTGTTCTAGTTTATATAAGCTTATT-TGAA
130 CCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
* * * * * *
22271299 ATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
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22271364 GTTTACTAAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGG
66 AATTACCAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
** * * * * * *
22271428 CCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGA
130 CCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
*** * * * *
22271480 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-GAA-AAAATTAAAAAATAAATA
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** **** * ** * *
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129 ACCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
* *** * *
22271659 ATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTCAA-AGATTTAAAAAATAAACT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAATT
*** * * * * * * * *
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65 TAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
* * * * * **
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130 CCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
* * * * * ** *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * * *
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66 AATT-ACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATA
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129 ACCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
* *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATT
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65 TAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATA
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129 ACCTTT-TTTTTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCT-GA
* * * * * ** * * * *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
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*** * * * * *
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* * * *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA-ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
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22272441 TATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA
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* * ** * * *
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130 CCTTTTT-TTTTC-CATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
* * ** ** * * * *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * * * *
22272623 ATTTATCGAATCAGTACAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA
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22272688 -CTTTTGTTTTAT-CACAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATT-TGAA
130 CCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
* ** * **
22272739 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
** *** * * * *
22272804 GTTTA-TTGA--A--TC--A-A-TT---CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAA-
66 AATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * *** * * ** **
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* *** *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * ** * * * * * *
22272973 ATTTACCGAAGTAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAATCATTATGAC
66 AATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * * * * * **
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131 -C-TTTTTTTTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
** * ** * * *
22273089 ATAAACCAAAACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATT--TAA-TAAGCGATTTAAAAAGTGAATTT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
** * * * * * * * * * * * *
22273150 GTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTA-
66 AATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* ** * * * *** * *
22273214 CATTTTGCTTCATCATATAACAATTGTATTTGAACATTCAAGCTTATT-TGAA
131 CTTTTTTTTTC--CATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
* * * * *
22273266 ATAAAATAATACTAA-CT-TT--CA-----AAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
** * * ** * ** * * *
22273322 GTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAGCAATTGTAAACTTAAAATTGTTATAA
66 AATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
* * * * * *
22273386 CCTTTTGTACTAT-CACAAAACAATTATCTTTGTTCATACAAGTTTATT-TGGA
130 CCTTTT-T-TTTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCT-GA
* * * * *** * *
22273438 ATAAAATAACATTAATCTAATAATATTGCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** * * * * * * * *
22273503 TCTTTATCGAACCAGATT-AAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATG
65 TAATTACCAAACCAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATA
** * * * * *
22273567 ACCTTTTGTTTTGGCTTAAAATAAGTTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATT-TGGA
129 ACCTTTT-TTTTTCCATAAAACAA-TTTTTTTTG--TTTATACAAGTTTATTCT-GA
* ** * **
22273623 ATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTTAAAAAAT-AATT
1 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* ** * * * *
22273686 CTATTTATGTAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTAT
65 -TAATTA-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * * * * **
22273750 GACCTTTTGTTCTGT-CATAAAACAAATGCTTTGGTTCATATAAGTTTGTTCAAA
128 AACCTTTT-TT-TTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
* * * * * *
22273804 ATAAATTAATACTAATCTATTAATA-TTTCAAAA--ATTAA-TAAGTGATTTAAAAAATAAATCT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * ** * * *
22273865 ATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-
66 AATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * **** **
22273929 CTTTTTGTTCTAT-TATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTT-TTCAAA
131 CTTTTT-TT-T-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAG-TTTATTCTGA
* * * *
22273981 ATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTCAAGAAGT-A-AA--AAGACATTT-AAAAA-AAATT
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAA-AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** ** ** * * *
22274039 TGTTTACTGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAA
65 TAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
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22274104 CCCTTTTTTTCTAT-TATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAA
130 -CCTTTTTTT-T-TCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
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* * * * *
22277593 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAATAAATA
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65 TAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
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130 CCTTTTTTTTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTG-A
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130 CC-TTT-TTTTTTCCATAAAACAATTTTTTTTGTTTATACAAGTTTATTCTGA
* * * * * * *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAATAACTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT
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64 TTAATT-ACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * *
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* *
22280230 CATTTTATTTTGT-TATAAAACAATT
130 CCTTTT-TTTT-TCCATAAAACAATT
22280255 ATATCTATTC
Statistics
Matches: 9410, Mismatches: 2227, Indels: 1049
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
161 1 0.00
162 2 0.00
163 105 0.01
164 7 0.00
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703 CTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
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* ** *
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* * * ** * * * * *
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** * * * * * * * * ** *
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* * * *** * * * **
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252 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * *
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317 TACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * ** * * * *
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381 TTTGTTTTT-CATAAAATAA-TTATTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAA
* ***
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*** * * * * * * *
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508 TCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * *
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572 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATT
** * *
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636 TCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTA
* *
22268910 TTACTATTTGAACTATT
700 TGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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195 TGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAAT
* * * * * * *
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* ** ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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449 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGTTCAA
** * * * * * *
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* * * * * *
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577 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
22269571 ATTAATAAGCAAGAG--TTAAGAAACATAAATTTTTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTATGACT
642 ATTAATAAGAAAGAGATTTAA-AAA-ATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
22269634 ATTTGAACAATT
705 ATTTGAACAATT
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1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCT
** * *
22269710 TATTCAAAATAAAATGATACTAATTTATTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTTATTTAAAAA
66 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAA
* * * * * * * * * *
22269775 GTGAATCTTTTTA--GCAAATCAGTTTAAAAAATTATG-GTCATTTCAACAGTTATCTATTTCAA
126 ATAAATCTATTTACTG-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * *
22269837 ATCATTATTATGTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACAAGTTTATTTGAAATA
188 ATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATA
*
22269902 AAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATGTT------T--A-CTG-
252 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * *
22269957 ------AATCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TAGTATACTTCAAATCATTGTAACA
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* ** *
22270015 TTTTGTTCTATCATAAAGCAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
380 TTTTGTT-TTTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAA
* * * * * *
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443 T-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-
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22270142 AGTTCTAATAATTAAGACT-TTATTAATAATTATCTATTTTAAATC---AT----TTGTGTTTCG
505 AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * *
22270199 TCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTGAT
569 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* ** * * ** *
22270263 ATTTCAAAAATTAATATGTTAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AACCTGTTCAAATAA
633 ATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAG
* *
22270327 TTATGACTATTTAAATAATT
697 TTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
22270347 ATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCA
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACC--------TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAA
* * * * * * * *
22270412 TATACGTTTATTCGAAATAAAAAAATACTAATCTATTAGTATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTA
58 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGAGATTTA
** * * * * *
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122 AAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * *** * * * * *
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187 AATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTT-GAAA
* ** * * * * *
22270606 TAAATTAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATATG
250 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * *
22270671 TTTATCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCATTATGACC
315 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* ** * * *
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380 TTTTGTTTT-TCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
22270792 -TAATACTATTCCAAAAATGAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATCTGTTTATCGAA-CAAGT
444 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGT
* * * * ** *
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508 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCA
* *
22270919 TAAAA-AGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
572 TAAAACA-ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * ** * *
22270980 A-TT-AAGGCAATCAATAAGTAAA-A-ATTTTAAAAAATAAATCCATTCACCAAACAAGTTCAAA
633 ATTTCAA--AAATTAATAAG-AAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAA
**
22271041 TCTTTATGACTATTTGAACAATT
694 TAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *
22271064 ATTTA-TT----TC---A--A---TTTG---T-T-ATAAAGCAATTGTTTCTA-TTTATACAAGC
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAGC
* * * * *
22271110 TTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAATGATTTATAA
65 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG---A-GATTTAAAA
* * * * * *
22271175 AATAAATATGCTTT-TTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
125 AATAAATCT-ATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * *
22271239 TCATTGTGACCTTTTATTTTGTAAT-AAACAATTGTTCTAGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAA
189 TCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * * *
22271303 AATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTT
253 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * *
22271367 TACTAAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATCTA-AACAATTATCTATTTCAAAACATTATGGCC
317 TACCAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* ** * *
22271430 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAA
380 TTTTGTTTT-TCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATACT-A
* * * * *
22271494 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-AA-AAAATTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAC
442 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCA-
* * * * *
22271556 ATTCAAATAGTTAAGGCTATTTGAGCAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
506 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
22271621 ATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA
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* * *
22271684 TTCCAAAAATTAATAAGTCAA-AGATTTAAAAAATAAA-CTCGTTTACTAAACGAGTTCAAATAG
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22271747 TTATGACTATTTGAACAATT
697 TTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
22271767 ATTTACTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTTCTA--TACATACAAG
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTA-ATACAAG
* * *
22271830 TTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATCATTTGGAGATTTAAA
64 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAA
* * * * * * * *
22271895 AAATAAATCTGTTCACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTAATTGAACTATTATCTATTTCAAA
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* * * * *
22271960 T-AGTTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAAAC-TA-TTAAGA
189 TCA-TTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATAC-AAGCTTATTTGA-A
*
22272021 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAATC
249 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATC
* * * * * * *
22272081 TATTTATCGAACCAATT-AAATAGTTATGAGTATT-TAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATG
313 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATG
* * * * * * *
22272143 ATCTTTAT-TTTGTCATAAAATAATTATTCCTGCTT-ATAAAAGCTTATTTAGAGTAAAATATTG
377 ACCTTT-TGTTTTTCATAAAATAATTATTTCTG-TTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA
* * ** ** * * * *
22272206 CTAAATTAATGCTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAAT
439 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT
* * * * * * ***
22272271 TAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTACAG
504 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
22272336 TCATAAAATAATTTTTTTCAGTTCATATATA-CTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
569 TCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACA-AGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
22272399 ATATTT-AGAAAAGTAATACA-CAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA
631 ATATTTCA-AAAATTAATA-AGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAA
* *
22272462 TAGTTATGACAATTTAAACAATT
694 TAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
22272485 ATCTATTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTAAGTTAATAAAAGCT
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCT
* * *
22272550 TATTTGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAATTGTTAAGTTAGAGATTTAAAAA
66 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA---TTAA-TAAGAGATTTAAAAA
* * * * *
22272615 ATAAGTCTATTTA-TCGAA-TCAGTACAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
126 ATAAATCTATTTACT-GAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
22272678 TCGTTATGAACTTTTGTTTTATCACAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTTGAAATAA
189 TCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * ** *
22272743 AATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
253 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
*** * * * * ** *
22272808 A-TTGA--A--TC--A-A--T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTAT-AACTTA
318 ACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-
* * ** * * **
22272860 TTATTCTGTT-ATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
382 TTGTT-T-TTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
22272924 TTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAGT-AGT
444 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TCAGT
** * * * *
22272988 TCAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAATCATTATGA-CTCATTGTTTTGTCA
508 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCA
* ** *
22273052 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAACCAAAACTAATTTATTAATA-TT
572 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * *
22273116 CCAAAATT--TAA-TAAGCGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTAT
637 CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
22273177 GGCTATGTCAACAATT
701 GACTATTTGAACAATT
* * * * ** * * *
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1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTAGTTA-ATACAAG
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* * * * * ** * * **
22273316 AAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTGTAAACTTAAAATTGT
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193 TATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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384 GTTTT-TCATAAAATAA-TTATTTCTG--TTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT-AA
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* * * *
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506 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
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571 ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
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636 TCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTA
*
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700 TGACTATTTGAACAATT
* ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * **
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192 TTATGA--CTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * *
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254 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* ** * * * * * * ** *
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318 ACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * * *
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382 TTGTTTT-TCATAAAATAATTAT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAAT
** * * * * * *
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444 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCGAATC-AG
* * * * * * ** *
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507 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
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572 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
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637 CA-AAAATTAAT-AAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTA
* *
22274608 TGACTTTTTGAATAATT
700 TGACTATTTGAACAATT
* * * * ** * **
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1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTAATACAAGC
* * * * * *
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65 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAA
* * * * * *
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125 AATAAATCT-ATT-TACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * *
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188 ATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAA-T
* * * * * * *
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251 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** * * * * * * * *
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316 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* ** * * * * * *
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381 TTTGTT-TTTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
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444 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGT
* * * * * * * * * * *
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508 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
22275202 AAAATAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAAAT-GGAGTAAAATAATACTAATTTATTATTCTTT
573 AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * ** * * ** ** *
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637 CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTAT
** **
22275330 GGTTATTTGAATTATT
701 GACTATTTGAACAATT
* * * * * *
22275346 ATCTATTTCAAATTATGATGACCTTTT-TCTTTGTCAAAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGC
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGC
* * * * *
22275410 TTAATCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAATAGATTTAAAT
65 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * *
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125 AATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * * * * * **
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190 CATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAA
* * * * * *
22275604 ATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAAATAAATGTGCTTG
254 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * *
22275665 TCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AATTTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTT
319 CCAAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * * * * *
22275729 TGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATT-TTACATGCTTATTTGGAATAAAATAATCCAAATT
383 TGTTT-TTCATAAAATAATTATTTC-TGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
22275793 TATAAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAGTT
445 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTT
* * * * * *
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509 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
22275923 AAACAATTGTTTCAATTCAT-CAAAGCTTATCCA-AATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTT
574 AAACAATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
22275986 CAAAAACTAATAAAACTAATAAACAAGAGTTTAAAAAAATAAGTTTGTTTACCAAACAAATTCAA
637 CAAAAA-T--T--AA-TAAGAAA-GAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAA
*
22276051 ATAATTATGACTATTTGAACAATT
693 ATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
22276075 GTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCT
* * *
22276140 TATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAA
66 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAA
* * * * * * *
22276205 ATGAATCTGTTTACAGAA-TCAATTCAAATAAG-CATGCCTATTTCAACAATTATCTATTTCAAA
126 ATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
22276268 TCGTTATTAACTTTTGTTTAGTCATATAACAATTATTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGTGAAT
189 TCATTA-TGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTGATCATACAAGCTTATTTG-AAAT
* * * * *
22276333 AAAATAATATTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAAAG-TTTAAAAAATAAATTTGT
251 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
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316 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * **
22276462 TTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
381 TTTGTT-TTTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *
22276527 CTAATAATATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAGT
444 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAATCAGT
* * * * *
22276591 TTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT
508 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** ** * * *
22276656 AAAACAATTTTTTTCAACTCATATTAGCTTATTTAGAATAAAATAA-AATGAATTTTTTAATATT
573 AAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * * * *
22276720 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTAAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAGTTTAAATAATTA
636 TCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTA
*
22276784 TGACTATTTGAATAATT
700 TGACTATTTGAACAATT
* * ** * ** * *
22276801 ATCTATTTAAAATCATTATAAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACAAAGGTTTT-GTTCATATAAG-T
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCT
* * *
22276864 TCGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAT
66 T-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAAAT
* * * * * * * *
22276929 AAATATGTTTA-TCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACGATTATTTATTTCAAATCG
128 AAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
** * * * * *
22276993 CCATGACTTTTTGTTTTGTTAT-AAACAATAGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA--TGGATTAAAA
192 TTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* ** * * * *
22277054 TAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAA-TAACTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA
255 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * *
22277118 CCAAACAAGATCAAATAGTTAAGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
319 CCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * **
22277183 GTTTTGTCATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATAAACTTGTTCAAAATAAAATAATACT-ATGT
384 GTTTT-TCATAAAATAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAAT-T
* * * * * * * *
22277246 TATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTTAGAAATGAATCTATTTATTGAA-CAAGTT
445 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGTT
* * * * ** * *
22277310 TAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTACCTATTTGGAATCATTAT-ACCCTTTTGTTTTGTTAT
509 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * * * *
22277374 AAAATGATT-TTTTCTGTTCATATAGGTTTGTTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAAT-GT
573 AAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
22277436 TGAGACAATTAAGAAGTAAA-AGATTTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCGT
636 TCA-AAAATTAATAAG-AAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGT
22277500 TATGACTATTTGAACAATT
698 TATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * * * *
22277519 ATTTATTTCAAATTGTTATCACTTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGC
1 ATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGC
* * * * * *
22277584 TTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAATGATTTAAAA
65 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG---A-GATTTAAAA
* * * * ** * * * *
22277649 AATAAATATGTTTATTGGAGAAGTTCAAATAGTCATGACTATATGAATAATTATCTATTTTAAAT
125 AATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * ** * *
22277714 CATTGTGAC-CTT-TTTCGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAA
190 CATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * * *
22277777 TAATACTAATTGATTAGTATTCCAAAAATTAA-AGATTAAAAGAATTGAAAAAAATGAATCTATT
255 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAG-ATT-TAAAAAATAAATCTGTT
* * * * *
22277841 TATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACA
317 TACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACC
* * *
22277904 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTT-TGTTTATGCAAGCTTATTTGAATAAAATAATA-TAA
380 TTTTGTTTT-TCATAAAATAATT-ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACT-A
* * * * *
22277967 ATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAAT-A
442 A-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCA
* * * *
22278030 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTAGT
506 -GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
22278095 CATTAACCAATTGTTTCTA-TTCAAACAAGCTCATTC-GATATAAAATAATACTAATTTATTAAT
570 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
22278158 A-TTCTAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAATAAATCTATTTACTGAGCGAGTTCAAATTG
633 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG
**
22278220 CAATGACTATTTGAACAATT
697 TTATGACTATTTGAACAATT
* * * *** **
22278240 ATTTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTACATCATAAAACAATTGTTTGTA-TTCTTACAAGT
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAG-
* * * *
22278304 TTTATTT-AGAATAAAATACTACTAATTTATTAATGTTCTAAGAATTAATAAGTTGAAGATTTAA
64 CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA---G-AGATTTAA
* * * * * * * *
22278368 AAAATTAATCTATTTACT-AGACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTACTTCA
123 AAAATAAATCTATTTACTGA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * ** *
22278432 AATCGTTATGACATTTTG-TTTGTCGTAAAACAATTATTTCT-ATTCATATAAAATTA-TTAACA
187 AATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTTGA-A
* ** *
22278494 AAAAAATAATACTAATTTATTTTTATTTCAAAAATTAAT-A-T--GAGATTT-AAAACTAAATCT
249 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *** *
22278554 CTTTACCAAATCAATTC-AA-A-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGGTATGAT
314 GTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * *
22278616 C-TTTGTTTTGTCTTAAAACATTTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTA
379 CTTTTGTTTT-TCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
22278680 AATTAATAGTATTCTAAAAATT-AT---TAAG-GATTTAAAAAATAAATGTGTCTACCCAAT-AG
442 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAG
* ** * * * *
22278739 TTCAAATAGATATGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATGGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCA
507 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** * *
22278804 TAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTAATTCAAAATAAAATAATACTCTTTTGTTAACA-TT
572 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
22278868 CAAAAAATTAAAAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAATTAT
637 C-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTAT
*
22278933 GACTATTTGAATAATT
701 GACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
22278949 ATCCATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCAA-AAAAGC
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTT-AATACAAGC
*** * * *
22279013 TTATCCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTTAAAAATTTATAAGTTAGAGATTTAAAA
65 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTAAAA
* * ** * * *
22279078 AATAAATC-AGTTTA-TCGAA-TCAGCTCAAATAATTACCACCATTCGAATAATTATCTATTTCA
125 AATAAATCTA-TTTACT-GAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
22279140 AATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCACCATACAA-TTCTATTTGGAA
187 AATCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCT-TATTTGAAA
* * * **
22279203 TAGAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATCCA
250 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * ** *
22279267 TTTACCAAACCAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACC
315 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
*
22279332 TTTTGTTCTATT-ATAAAATAATTATTTCTGTTCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
380 TTTTGTT-T-TTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTA
* * *** * * * * * * *
22279396 ATGTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAACAATTAATTTATTT-GCTAAACCA
442 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAATCA
* * * * * * *
22279460 GTTTAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
506 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
22279525 GTAAAACAATT-TTTTCAGTTCTTAGTAA-CTTAGTT-AGAATAAAATAAAACAAATTTATTAAT
571 ATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATA-CAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * *
22279587 ATTTCAAAAATTAATTAGTAAGAGAATTAAAAAATAATTCTGTTTGTTGAACAAGTTCAAATAAT
633 ATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGT
*
22279652 TATGACTATTTAAACAATT
698 TATGACTATTTGAACAATT
* *** * * *
22279671 ATCGATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAT-TTTT--TT-ATATAA-CT
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCT
* * *
22279731 T-TGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAAAGTTAAA
66 TAT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAA
* * ** * * * *
22279795 AAATAAATCTATTTATTAAACTAGTTCACTTAGTT-TAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAA
124 AAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AA
* * * * *
22279859 AT-ATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTGTTCATACAACCTTA-TTCAGAAT
188 ATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGA-AAT
* * * * * *
22279922 ATAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTTAAAAAGTAACGA-ATTTAAAAAATGAATCT
251 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * * *
22279985 GTTGGCCTAACCAGTACAAATAGTTACGGCTATTTGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTATAAC
314 GTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * ** *
22280050 ATTTTGTGTTATCA-CAAATAAGTTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATATCATAATTCT
379 CTTTTGT-TTTTCATAAAATAA-TTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACT
** * * * * *
22280114 AGCTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAAACA
441 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-
* * * * * * * *
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505 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
22280243 TATAAAACAATTATATCTA-TTCATACAAGCTTACTTCA-AAAAAATATAACACAAATTTATTAA
570 CATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAA-ATAATACTAATTTATTAA
*
22280306 TA-TTCAAACAA-T--T-A-AAA-A-A--T---AAAT---T-TGTTTA-TCAAATAAGTTCAAAT
632 TATTTCAAA-AATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAAT
*
22280353 AGTTATGACT-TTT-----TTT
695 AGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
22280369 TTC-A--T-AAAACA--AT----TTTT-TTGT-TCATACAAGC--CT-ATTCAG--AATA-AA--
1 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGC
** * * * * * *
22280414 TTAATATT--AATTTATTAATACT--TTGA-CAA-A--TAATAAGT-A-AA-AGATTTTAAAAAT
65 TT-AT-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * * *
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** ** ** * ** * * * * **
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193 TATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
22280728 TTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATACAATAATA-TAAATTTATT
387 TT-TCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * *
22280792 AAAATTCCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAA-CACATTCAA
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * * * *
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1 A-TCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAA
* *
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* * ** * * * *
22281185 AAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGCCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTTA
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* * * * **
22281250 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTTGTTTCT-ATTCATACAAAATTATTT-AG
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* * *
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TCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
GACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACC
AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTC
ATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATG
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
T
Found at i:22270344 original size:18 final size:19
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1 AAATAATTATGACTATTTT
*
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AAATAATTATGACTATTTT
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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*
22270952 TCTAATAAAATAATA
130 TCAAATAAAATAATA
22270967 TAAATTTATT
Statistics
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TTTCAAATCACTATCACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTT
CAAATAAAATAATACTATTCCAAAAATGAATAATTAAGAG
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* * * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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*
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1 TTTGTCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * **
22271498 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-AA-AAAATTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACA-TTC
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* * * * *
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* * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
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* * *
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* * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** *
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* * * * *
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* * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATAC-AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
22272039 ATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAATCTATTTATCGAACCAATT-
63 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTA-CTAAACAGTTC
* * *
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* * * * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTT-CTAG-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * * *
22272213 AATGCTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAATTAATTCA
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* * ** *
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*** * * * *
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* * * * * *
22272396 TTAATATT-TAGAAAAGTAATACA-CAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTT
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* * * *
22272459 AAATAGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACTTTTTGT
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
22272514 TTTCTCATAAAATAATTGTT-TAAGTTAATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTATTTTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * * * *
22272578 TAATATT-TCAAAAATTGTTAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCTATTTATCGAATCAGTACAA
65 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAA
* * * * *
22272642 ATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *** * *
22272695 TTTATCACAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * **
22272760 AATATT-TAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TTGA-A--TC--A-
66 AATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAGTTCAAAT
* * ** * *
22272817 A--T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTAT-AACTTATTAT
130 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGT
* * * * * * ** *
22272864 TCTGTTATAAAATAATTGTT-TCAATTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * **
22272928 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAGTAGTTCAAA
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** * * *
22272993 TAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAATCATTATGA-CTCATTGT
129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGT
* ** ** *
22273045 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAACCAAAACTAATTTATT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
22273110 AATATTC-CAAAATT--TAA-TAAGCGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAAT
66 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAAT
* * * * * * * *
22273171 AATTATGGCTATGTCAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACATTTTGC
130 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
** * * ** *
22273222 TTCATCATATAACAATTGTAT-TTGAACATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-----TA-
1 TTTGTCATAAAACAATTGT-TCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
22273280 -ACT-TTC-AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAA
65 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAA
* * * ** * * ** *
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129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
** * * * * * * * * * *
22273394 ACTATCACAAAACAATT-ATCTTTGTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACATTAATCTAA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTC-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
22273458 TAATATTGCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTTATCGAACCAGATT-A
65 TAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAG-TTCA
* * * *
22273522 AATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGT
127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
22273576 TTTGGCTTAAAATAAGTTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATAAATT
1 TTTGTCATAAAACAA--TTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATT
** * * *
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62 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTT
* *
22273704 CAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
125 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * ** * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
*
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65 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCA
* * ** *
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127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * **** * *
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* * * * **
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65 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAA
* *** *
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128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGT
* * **
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1 TT-TGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTC-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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65 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAA
* * * * * * * **
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129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * ** *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
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66 AATATTCTA-AAAATTAAT-AAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCA
* * * * * *
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127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * ** *
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1 TTTGTCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * * * * *
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65 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT-TACTAAACAGTTCAA
* * * * ** *
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128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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65 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAA
* * * * * * * * * *
22274963 TGGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTAATTCAAATCGTTCTAACCTTGTGT
129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
** * * *
22275015 TGAGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AA-CTTATTT-AGAATAAATTAACACTAAATTA
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * * ** *
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64 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAA
* * * * * * * * * *
22275141 ATTGTTGTTATTATTTTAACGATTATCTGTTTAAAATCATTATAACCTTTTGA
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * ** * *
22275194 TTTGTCATAAAATAATTGTT-TCAGTTAATACAAGCTTAAATGGAGTAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * **
22275258 TATTCTTTCCT--AAATTAGTAAGTGAGAAATTTAAAAAATAAA-CTTGTTTACCAAATTAGTAA
65 TAAT-ATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACTAAA-CAGTTC
* ** ** * *
22275320 AAATAATTATGGTTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATTATGATGACCTTTT-T
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
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1 -TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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65 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAA
* * * ** *
22275503 ATTGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTAAAACC-TTTAT
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * **
22275555 TTTGTCATTAAACAACTGTTTCTA-ATCGTACAAGCTTA-TTCAGTTAAAAATAATACTAATTTA
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
22275618 ATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAAATAAATGTGCTTGT-CGAACCAGTTCA
64 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-TACTAAACAGTTCA
* * * *
22275678 AATAGTTA--AATTTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGT
127 AATAGTTATGACTAT-TT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
22275732 TTAGTCATAAAATATTTGTTTCATA-TT-TTACATGCTTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTA
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTC-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
22275795 TAAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATA-AGTTC
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* * * * * *
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126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * **
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATAC-AAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTT
* * * * *
22275976 CTTAATATT-TCAAAAACTAATAAAACTAA-TAAACAAGAGTTTAAAAAAATAAGTTTGTTTACC
63 ATTAATATTCT-AAAAA-T--T--AA-TAAGT-AA-GAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * *
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117 AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
22276168 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAC-AGAATCAATTCAA
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* * * * * *
22276232 ATAAG-CATGCCTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTAACTTTTGT
128 AT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * ** * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGT-TCATACAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * *
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64 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCA
* * * * * *
22276413 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGT
127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * ** * *
22276467 TCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
22276532 AATATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTTAAAT
66 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAAT
* *
22276597 AGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
130 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * ** ** *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * * *
22276711 TTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTAAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTT
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* * * * **
22276775 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAAAATTTTGT
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* ** * * * * *
22276830 TTTGTCGTAAAACAAAGGTT-TTGTTCATATAAG-TTCGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
22276893 TAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAATTAGTTC
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* * * *** *
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126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
22277007 TTTGTTAT-AAACAATAGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA--TGGATTAAAATAATACTAAGTTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
22277068 TAATATTTTGAAAA-TAACTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGATCAA
65 TAATATTCTAAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAA
* * *
22277132 ATAGTTAAGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * **
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TTAT
* * * * * * * *
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65 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAA
* * * **
22277314 TAATTATGGCTATTTGAACAATTACCTATTTGGAATCATTAT-ACCCTTTTGT
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* * * * * * * * * *
22277366 TTTGTTATAAAATGATTTTTTCT-GTTCATATAGGTTTGTTTCAAATAAAATAATACAAATTTAT
1 TTTGTCATAAAA-CAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
22277430 TAATGTT-GAGACAATTAAGAAGTAAAAGATTTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
65 TAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCA
* * ** * *
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127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGT
* * * * * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
22277614 AATATTTTGACAATTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGGAGA-AGTTCAA
66 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT--AAACAGTTCAA
* * * * *
22277677 ATAGTCATGACTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACC--TT-T
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
22277727 TTCGTAATAAAATAATTGTT-TCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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* * *
22277854 CAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACATTTTGT
125 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AA-TTT
* * * **
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* ** *
22278035 AAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGT
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
22278154 TAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACTGAGCGAGTTCAAA
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* ** * * *
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129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
*** * * * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTCTAGTTCATACAAG-CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
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* * * * * * *
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126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * ** * *
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1 TTTGTCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
** * * * *
22278513 TTTTTATT-TCAAAAATTAAT-A-T--GAGATTT-AAAACTAAATCTCTTTACCAAATCAATTC-
64 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCA
*** *
22278571 AA-A-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGGTATGATC-TTTGT
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* * * * * * * * * *
22278622 TTTGTCTTAAAACATTTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAATTAA
1 TTTGTCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** *
22278686 TAGTATTCTAAAAATT-AT---TAAG-GATTTAAAAAATAAATGTGTCTACCCAATAGTTCAAAT
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* ** ** * *
22278746 AGATATGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATGGTTTTAACCTTTTGT
130 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * ** ** *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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* * * * *
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129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *** * *
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1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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65 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAA
* ** * * * *
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129 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
22279159 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA--CCATACAA-TTCTATTTGGAATAGAATAATACTAATTTA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** *
22279221 TTAACATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATCCATTTACCAAACCAGTTCA
64 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCA
* * * ** *
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127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
22279338 TCTATTATAAAATAATTATTTCT-GTTCATTCAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATGTA
1 TTTGTCATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * *
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* * * * * *
22279466 ATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
22279519 TTTATCGTAAAACAATT-TTTTCAGTTCTTAGTAA-CTTAGTT-AGAATAAAATAAAACAAATTT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATA-CAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * ** *
22279581 ATTAATATT-TCAAAAATTAATTAGTAAGAGAATTAAAAAATAATTCTGTTTGTTGAACAAGTTC
63 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTC
* * * ***
22279645 AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCGATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGT
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * *
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1 TTTGTCATAAAA-CAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTAT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
22279758 ATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAAAGTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACTAGTTCA
63 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCA
** * * * * *
22279823 CTTAGTT-TAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAAAT-ATTATGACCATTTGT
127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
22279876 TTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTGTTCATACAACCTTA-TTCAGAATATAGTAATGCTAATTTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * *
22279940 TAATATTCTAAAATTTAAAAAGTAACGA-ATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCCTAACCAGTACAA
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* * * * * *
22280004 ATAGTTACGGCTATTTGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTATAACATTTTGT
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* * * * * * ** * **
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* * * *
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* * * * * * *
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128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * *
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*** * * * * * * * *
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** * * * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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** * * ** * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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*** * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGT
* * * *
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* * * **
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*
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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258 TAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAGACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
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* *
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387 CTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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** ** * * * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * *
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * ** * * * *
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* * ** * ***
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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** * * * * * * *
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*
22272658 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTT
508 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * *
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*** * **
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* * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * *
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** ** * *
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** * * * * * * * *
22273127 TAAG---CGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAAT-CAGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAA
446 TAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
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511 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* ** * * * *
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* * * ** * * ** * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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383 GTTTCTG--TTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
** * *
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444 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCG-AATACAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* *
22273722 TGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
507 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * ** * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* *
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65 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAG
* * ** * * * *
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* * * *
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193 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
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* *** * * *
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** * * *
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381 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * ** * * * * * * *
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444 AATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * *
22274255 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTT
508 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *
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65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTT
* * * * * * * ** *
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130 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
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195 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
* * * * * * * *
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260 -AAAATTAAT-AAGTAA--AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAGACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
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321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * ** * ** * *
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386 TCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
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449 GTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* *
22274803 ATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTT
513 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * *
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65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTT
* * * * * * * * * * **
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130 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
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195 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
* * * * * *
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260 AAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAG-ACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
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323 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * * *
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388 TGTTCATACAAGCTT-ATTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * ** * ** **
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450 T-AAAAATTTAAAAAATAAATC-TATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** *
22275343 ATTATCTATTTCAAATTATGATGACCTT
513 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * *
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1 TTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
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64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAG
* * * ** *
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128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
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193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
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257 CTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACTAGACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
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320 TGACTAT-TT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
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383 GTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAAT--ATAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * *
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444 AATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *
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507 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * *
22275910 TTATTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATTCAT-CAAAGCTTA-TCCAAATTAAAATAATACTAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAA
* * *
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64 TTTATTAATATTCT-AAAAA-T--T--AA-TAAGT-AA-AAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * *
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118 ACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * *
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183 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATT
* * * *
22276165 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAC-AGAATCAA-T
247 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAG-A-CAAGT
* * * * * * *
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309 TCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
22276292 TATAACAATTATTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATCT
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* * * * * * * *
22276357 TTCAAAAATTAATAAATAAAAGTTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCCAA-ACCAATTCAAATAGTT
434 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATA-CAGTTCAAATAGTT
* * * * *
22276420 ATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCTT
498 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * * *
22276463 TTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATC
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * * *
22276528 TAATAATATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTT
66 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTC
* * *
22276593 AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAA
131 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * *
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196 AACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT
* * * * * *
22276721 CAAAAATTAATAAGTAAGAGACTAAAAAAATAATTCTATTTACCTA-ACCAGTTTAAATAATTAT
259 -AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAGACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** * **
22276785 GACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACAAAGGTT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
22276850 T-TGTTCATATAAG-TTCGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA
386 TCTGTTCATACAAGCTT-ATTT-GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * *
22276913 AG---AGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCAAAT-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAC
448 AGTAAAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** *
22276974 GATTATTTATTTCAAATCGCCATGACTTT
512 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * *
22277003 TTGTTTTGTTAT-AAACAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTA-T-GGATTAAAATAATACTAAGT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * *
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66 TATTAATATTCTAAAAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTT
* * *
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130 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
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195 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTC
* * * * * * *
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258 TAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAG-ACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * ** *
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321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * * *
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385 TTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAAT
* * *
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447 AAGTAAAA-A-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
22277512 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATCACTTTT
509 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTT
* * * * * * *
22277545 TTGTTTTGCCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * ** **
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* * * * * * *
22277675 AAATAGTCATGACTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACC--TT-TTTCGTAATAA
131 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
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* * * *
22277800 AAAAATTAA-AGATTAAAAGAATTGAAAAAAATGAATCTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTT
259 AAAAATTAATA-AGT-AAAG-ATT-TAAAAAATAAATCTATTTACT-AGACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
22277863 ATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *
22277927 GGTTT-TGTTTATGCAAGCTTATTTGAATAAAATAATATAAATTTTATTAATATTCCAAAAATTA
383 -GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATAT-AA-TTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * *
22277991 ATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAATAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTTA
445 ATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* *
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510 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
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* ** * * * ***
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131 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
22278279 AACAATTGTTTGTATTCTTACAAGTTTTATTTAGAATAAAATACTACTAATTTATTAATGTTCTA
196 AACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
* * * * * *
22278344 AGAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTAGACAAATTCAAATAGTCATGTC
260 AAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAGACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
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* * ** ** * ** *
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389 GTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
22278535 GAGATTT-AAAACTAAATCTCTTTACCAAAT-CAATTC-AA-A-TTATGACTATTTGAACAATTA
452 AAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
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517 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * * *
22278618 TTGTTTTGTCTTAAAACATTTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * **
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131 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
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196 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * *
22278872 AAATTAAAAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAATTATGAC
261 AAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAG-ACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
22278936 TATTTGAATAATTATCCATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAAAATTGTTTCA
324 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *** * ** *
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389 GTTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-T
* * * * ** * * *
22279066 AGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCGAAT-CAGCTCAAATAATTACCACCATTCGAATAAT
451 AAAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *
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515 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * *
22279155 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TCA-CCATACAA-TTCTATTTGGAATAGAATAATACTAA
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* ** ** * *
22279217 TTTATTAACATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATCCATTTACCAAACCAG
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAG
* * * ** * * * *
22279280 TTCAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
22279345 TAAAATAATTATTTCTGTTCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * * * * *
22279410 TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAACAATTAATTTATTTGCTAAACCAGTTTAAATAGTTAAG
258 TAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAGACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
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322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
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387 CTGTTCATA-CAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * * *
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449 GTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
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512 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * *
22279696 TTGTTTTGTCATAAAATAAAT-TTT-T-TT-ATATAA-CTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC-TTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
22279756 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAA-AGTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACTAGT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGT
** * * * * *
22279820 TCACTTAGTT-TAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAAAT-ATTATGACCATTTGTTTTGTCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
22279883 TAAAACAGTTGTTTTTGTTCATACAACCTTATTCAGAATATAGTAATGCTAATTTATTAATATTC
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * ** * * *
22279948 TAAAATTTAAAAAGTAACGAATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCCTA-ACCAGTACAAATAGTTAC
258 TAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTAGACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
22280012 GGCTATTTGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTATAACATTTTGTGTTATCACAAATA-AGTTGT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGT
* * * ** * **
22280076 TTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATATCATAATTCTAGCTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
385 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * *
22280141 AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAA-ACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAA
448 AGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
22280204 CAATTATATATTTCAAATCTTTGTAACATT
511 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * *
22280234 TTATTTTGTTATAAAACAATTATATCTATTCATACAAGCTTACTTC-AAAAAAATATAACACAAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAA-ATAATACTAA
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TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTC
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
AAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAGACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
TCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAA
TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
TTTCAAATCGTTATGACCTT
Found at i:22281090 original size:361 final size:357
Alignment explanation
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22280336 ATCAAATAAG
* * * *
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* ** * * *
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* *
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** ** ** ** * * * * *
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* * * * * * *
22280602 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTACAAAATGAATTTGTTTGCTAAACA
255 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* *
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320 AACTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* *
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62 TAGAATA-AATAATAT-AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * *
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125 TATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTA
* *
22280896 TGA-CTTTTGTTTTGTAATAAATTAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAAT
189 TGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGATTATTT-AAATAAAATAAT
* * * *
22280960 ACTAATTTATTAATATTGCAAAGATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAG
253 ATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA
* * * * *
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* * * * *
22281065 TTCAAATAGTTATGATCTCTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTCTATTTATATAAGTTTATT-T
1 TTCAAATAGTTATGA-CT-TTGTTTTATCATAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * * *
22281129 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTTGGAGATTTAAAAAATAAA
63 AGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAG-TAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
22281194 TCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGCCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTAT
125 TATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTAT
* * * *
22281259 GACCTTTTGTTTTGTCAA-AAAAAAATTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAA
190 GACCTTTTGTTTTGT-AATAAAATAA-TTGTTTTTGTTCATACAAGATTATTTA-AATAAAATAA
* **
22281323 TATTGATTTTATTAATATTTTAAAAATT
252 TATT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
22281351 GAAATAGATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
TTCAAATAGTTATGACTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTAGA
ATAAATAATATAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATATGTT
TACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT
TTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGATTATTTAAATAAAATAATATTAATTT
ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAACTCA
AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
Found at i:22281145 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 22280346--22281350 Score: 951
Period size: 181 Copynumber: 5.6 Consensus size: 181
22280336 ATCAAATAAG
* * * * *
22280346 TTCAAATAGTTATGACTTTT-TTTT-TCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCCTATTCAG
1 TTCAAATAGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* ** * *
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* * * *
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130 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTTTT
** ** ** ** * *
22280523 TTCAAATCA-TTATGACCTTTTAATTCATTTTAAAATAATTGAAT-TAGTTCATATAGGCTTATT
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* * * * * *
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* * * * * * * *
22280651 ATTTGTTTGCTAAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
128 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTTTT
* *
22280705 TT-AAATCA-TTCTGAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
1 TTCAAAT-AGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-
* * * *
22280768 TA-AATACAATAATATAAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAA
63 TAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* ** * * *
22280831 ATATGTTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTAT
128 ATATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTTTT
* * * * *
22280884 TTCAAATAGTTATGACTTTTGTTTTGTAATAAATTAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTT-G
1 TTCAAATAGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
22280948 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCAAAGATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAAT
66 -AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
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130 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTTTT
* * * * * * *
22281065 TTCAAATAGTTATGATCTCTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTCTATTTATATAAGTTTATTTA
1 TTCAAATAGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
* * * ***
22281130 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
65 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * *
22281195 CTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGCCATGTCCATTTGAATAATTATCTATT
130 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTTTT
* * * **
22281247 TT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* **
22281311 AGAATAAAATAATATTGATTTTATTAATATTTTAAAAATT
64 AGAATAAAATAATATT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
22281351 GAAATAGATA
Statistics
Matches: 678, Mismatches: 127, Indels: 40
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTCAAATAGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTTTT
Found at i:22281884 original size:348 final size:344
Alignment explanation
Indices: 22281349--22282355 Score: 903
Period size: 348 Copynumber: 2.8 Consensus size: 344
22281339 ATTTTAAAAA
* * * * *
22281349 TTGAAATAGATAATTAG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATATATTTAGTT
1 TTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTAGGTAAACAGAATTATTT
* * * * * * *
22281413 TTTATATCTTTTACTTATTAATTATAAAAATAGTAATAAATTAATACTATTTTAATTCAAATATA
64 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-ATTCTAATA-A
* * * *
22281478 -CTTGTATGAATAAAAACTATTGTTTTATAACATAACAAAAAGTCATAGCGATTTGAAATAAATA
126 GCTTGTAT-AATAAAAA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATA
*
22281542 ATTGCTCAAGTAGTCATAATTATTTAAACTGTTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA
188 ATTGTTCAA-TAGTCATAATTATTTAAACTG-TTTGATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
*
22281607 TTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTT-ATATG-A-ACAAA
250 TTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTGA-ATGAATACAAA
* *
22281669 TACTTTTGTT-T-T-AAAAGGTTGTAATAAT
314 TAATTTTGTTATATAAAAAGGTTATAATAAT
* * *
22281697 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGATTTGATTAGGTAAACAGAATTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTAGGTAAACAGAATTATTTT
*
22281762 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTCCTAATAAGC
65 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATT-CTAATAAGC
* * * *
22281827 TAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTTACGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATGA
128 TTGTAT-AA-T-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * *
22281891 TTGTTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAGTA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
189 TTGTTCA-ATAGTCATAATTATTTAAACT-GTTTGATA-AACAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-
* * * * ** *
22281955 TTATTAATTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGAATGAATAGAA
250 TTA--ATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTGAATGAATACAA
* **
22282020 ATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGTT
313 ATAATTTTGTTAT-AT---A-AAAAGGTTATAATAAT
* * * *
22282057 TTG--ATACACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCA-ATAAAC-GAAGTTATT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTT-AGGTAAACAGAA-TTATT
* *
22282118 TTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAAAA
63 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCT-AATAA
* * * *
22282182 GCTTGTATGATAAAAACCAATTGTTGTATGATC-AAACAAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGA
126 GCTTGTATAAT-AAAA--AATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
22282246 TAAATGTTGAAATGGTCATAATTATTTAAACTGATTAAGTAAACAAATTCACTTTTTAGATTTCC
186 TAATTGTT-CAATAGTCATAATTATTTAAACTGTTTGA-TAAAC-AATTTATTTTTTA-A-AT-C
*
22282311 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
245 T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATT
22282356 TTGAATAAGC
Statistics
Matches: 534, Mismatches: 83, Indels: 72
0.78 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
347 34 0.06
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349 4 0.01
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351 2 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (344 bp):
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTAGGTAAACAGAATTATTTTT
TAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTCTAATAAGCTTG
TATAATAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
ATAGTCATAATTATTTAAACTGTTTGATAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTGAATGAATACAAATAATTTTGTTAT
ATAAAAAGGTTATAATAAT
Found at i:22282044 original size:179 final size:176
Alignment explanation
Indices: 22281755--22282355 Score: 478
Period size: 179 Copynumber: 3.3 Consensus size: 176
22281745 GTAAACAGAA
22281755 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCC
* * *
22281819 TAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAA-GTTCATAACAATTTGAA
63 AAATAAGCTAGAATAAATAGAAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTT-ATAACAATTTG--
* ** * * * * * *
22281883 ATAGATGATTGTTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAGTA-AAT
125 ATACACAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTGGTTCAACA-AACAAG
* * *
22281935 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * * * * ***
22282000 ATAAGTTTGAATGAATAGAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGTTTTGATACA
65 ATAAGCTAGAATAAATAGAAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGATACA
* * *
22282065 CAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAACGAAG
130 CAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAAC-AAG
* * *
22282113 TTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * * * **
22282178 AAAAGCTTGTAT-GATA-AAAACCAATTGTTGTATGATC-AAACAAAAAGGTAATAATGATTTGA
65 ATAAGCTAGAATAAATAGAAAA--AATTGTTTTACGA-CAAAAC-AAAAGGTTATAACAATTTG-
* * * * ** * * * *
22282240 AATAGATAAATGTTGAAATGGTCATAATTATTTAAACTGATT-AAGTAAACAAA
125 -ATACACAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTGGTTCAA-CAAACAAG
* * * *
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*
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131 G
* *
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*
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TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTGGTAGTAACTATTTGAATTTGTTT
G
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * * * * *
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** * * * * * * **
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* * * * * * *
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* ** * * * * * *
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** *
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* ** * *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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*
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* * ** * ** * *
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* * ** ** * * *
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* * * * * *** * ** *
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* * * * * * * * *
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* * ** * **
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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** * * * * * **
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** **
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* * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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*** * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * ** **
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* * * ** * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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Matches are distributed among these distances:
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* * *
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* * *
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** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * ** * *
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* * * * ** * *
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** * * ** * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * ** * *
22284638 TGTATGAACTA-AAACAATTATTATAC-GACTA-AACAAAGGGTCAGAATGATTTT
125 TG-ATGAAATAGAAACAATTGTT-TTCTGAC-AGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
* * * * ** * * *
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1 AAATAAATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAATTA-TTTTTA
* ** * * * ** *
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* * * ** *
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** * * * **** **
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* * *** * * *
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* * ** * * * * * * *
22285225 AAATAGATAATTGTTTTAATAGTTTTAAGTATTTGAAATGATTCGGCAAACACATTTATTTTTTA
1 AAATAAATAATTATTCAAATAG-TTTAACTATTTG-AATGGTTTGGTAAATAGAATTA-TTTTTA
* ** * * * * * *
22285290 AATCTCTTACTTACTAATTTTTTGAATTTTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
63 AA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCCTG
* * * * * * * *
22285355 TATGAAA-AAAAATACTTGTTTTATAACAAAAT-AAAGATCATAACAATTTG
127 -ATGAAATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
* * * ** * *
22285405 AGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAG
1 AAATAAATAATTATTCAAATAG---T---T-TAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAATTA-
* * * * * ** *
22285470 TTTTTAAA-TC-T-GTTATTAATTTTCAAAATATTAATATATTTGTATTATTTTATTCTGAATAA
57 TTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAA
*** * * * * * ** *
22285532 TTTTGCATG-AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATTATTTG
122 GCCTG-ATGAAATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
* * * ** * * * * * * * *
22285588 AAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAATTTGATCGATAAAAATATTTATCTTTTA
1 AAATAAATAATTATTCAAATAG-TTTAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAATTAT-TTTTA
* * * * * * *
22285653 AATCTCCTACTTATTGATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTCCAAATAAACTTG
63 AA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCCTG
* * * * * * * * *
22285717 TATG-AATAGAAACAATTATTTTATCACAAAACAAAAGATCATAACTATTTA
127 -ATGAAATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
** * * * * * * *
22285768 AAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAACTAATTAAACTTGCTCGGTAAAT-G-ATATATTTTTT
1 AAATAAATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAAT-TA-TTTTT
* * * * * *** * * *
22285831 AAATTTTTTACTTATTAA-ATTTGAAATATTAAT-AAATCAGTATCATTTTATTTTGAATATGCT
62 AAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAAT-AGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCC
** * *
22285894 TGTATGAACAAAAATAGTTGGTTTAGAACAAAAACAGTTGGTT-TGTA-ACAAAACAAAAGGTCA
125 TG-ATG-----AAATA----G---A-AAC---AATTGTT--TTCTG-ACA--GAATAAAAGGTCA
* * *
22285957 TGACTATTTG
168 TAACAAGTTG
* * * ** * *
22285967 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACGTGTT--CAAA-AAAATTTATTTTTT
1 AAATAAATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTGAATGGT-TTGGTAAATAGAA-TTA-TTTTT
* * * * ** * * * *
22286028 AAA-TTTGTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTTATTATTTTCTTCTAAATAAGCTT
62 AAACTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCCT
* * * * * ** * * ** *
22286092 ATATG-AATAGAATCAATTATTTTATGACAAAACCAAATGTGATAATGATTTG
126 -GATGAAATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
* * * * * * *
22286144 ACATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-CGATTTATATTTTA
1 AAATAAATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAATTAT-TTTTA
* ** * ** * * * * * * *
22286208 AATCTCTCACCCAATAATTTTTGGAATATTATTCAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGGCTA
63 AA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCCT-
* * * * * * * * *
22286273 TATGAACTA-ATACAATTATTTTTTGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
126 GATGAAATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
* * * * ** * * * *
22286324 AAATAAATAATTATTCAAATAATTATGACTATTTAAATTTGTTCAGTAAACATATTTAGTTTTAA
1 AAATAAATAATTATTCAAATAGTT-TAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAATTA-TTTTTA
* * * * * * * * *
22286389 AATATTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
63 AA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCCTG
* * * * * *
22286454 TATG-AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTG
127 -ATGAAATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
* * * * ** * * *
22286505 AAATAAATAATTGTTCCAATAGTCATCACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTCTTTTTTA
1 AAATAAATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTGAA-TGGTTTGGTAAATAGAATT-ATTTTTA
* * * * *
22286570 AATCTTTTACTTATTAATTGTT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTA
63 AA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTA
22286619 ATTGCTCAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
AAATAAATAATTATTCAAATAGTTTAACTATTTGAATGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTTAAAC
TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAGAAGCCTGATGA
AATAGAAACAATTGTTTTCTGACAGAATAAAAGGTCATAACAAGTTG
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Alignment explanation
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22284395 AATCTCTTAC
* * ** *
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* * * * *
22284467 A-AAACAATTG-TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATA
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * **
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* ** * * * * ** * * ** * *
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254 TTTTATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAACTAT
* * ** ** * *
22284717 AACTATTTAAATTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCAT-
319 AACTATTTGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC-TG
*** * * * * * * *
22284762 TTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTATTATTATTATTATT-TGAGTAAGCTTGTATGATCAA
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* * * * * * * *
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** * * * *
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129 ACATAACTATTTGAATAT-GATCGACAAAAACA--TTTA-TCTTTTAAATCTCCTACTTACTAAT
*** * * * * ***
22284946 TTTT-GAAATATTAATAGGGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTTATGAATTGAAACAAT
190 TTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT-TTTTAATCCAAATAAAC-TTGTATGAAAAAAAACAAT
* * *** * * * *
22285010 TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGGCTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTC--AA-
252 TATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAA-CAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAAC
* * * *
22285071 -AT--CTATTTCAACT-TGTTCAGG-AAATAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTG
316 TATAACTATTTGAACTAT-TT-TGGTAAACAGATTTA-GTTTTTAAATC---TG
* ** * * **
22285120 CTCATT-ATTTT-TTAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGAATTG
1 -TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGCAAGAACAG
* * * **
22285183 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAA-TATTTTAAAATAGATAATTGTTTTAATAG
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATTA-TTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG
*** * * * * *
22285247 TTTTAAGTATTTGAA-ATGATTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTT
129 ACATAACTATTTGAATATGA-TCGACAAAAACATTTATCTTTTAAATCTCCTACTTACTAATTTT
* * * * * * *
22285311 TTGAATTTTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAAAAATACTTGTTT
193 TAGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAAAAAAACAATTATTT
* * * * * *
22285376 TATAACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATAAC
257 TATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAACTATAAC
22285440 TATTTGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTG
322 TATTTGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTG
* * ** *
22285482 TTATTAATTTTCAAAATATTAATATATTTGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATGAACAGA
1 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGCAAGAACAGA
* * * *
22285547 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGAC
66 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATTATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGAC
* * * * * *
22285612 ATGACTATTTGAATTTGATCGATAAAAATATTTATCTTTTAAATCTCCTACTTATTGATTTTTAG
131 ATAACTATTTGAATATGATCGACAAAAACATTTATCTTTTAAATCTCCTACTTACTAATTTTTAG
* * * *
22285677 AATATTAATAAATTAGTATTTTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATC
196 AATATTAATAAATTAGTATTTTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATA
*
22285742 ACAAAACAAAAGATCATAACTATTTAAAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAACTA
261 ACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAACTA
22285799 ATTAAACTTG
Statistics
Matches: 818, Mismatches: 164, Indels: 104
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
352 1 0.00
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367 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (363 bp):
TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGCAAGAACAGA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATTATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGAC
ATAACTATTTGAATATGATCGACAAAAACATTTATCTTTTAAATCTCCTACTTACTAATTTTTAG
AATATTAATAAATTAGTATTTTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAAAAAAACAATTATTTTATA
ACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAACAGTCATAACTATAACTATT
TGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTG
Found at i:22285948 original size:19 final size:20
Alignment explanation
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22285889 ATGCTTGTAT
*
22285899 GAACAAAAATAGTTGGTTTA
1 GAACAAAAACAGTTGGTTTA
22285919 GAACAAAAACAGTTGGTTT-
1 GAACAAAAACAGTTGGTTTA
22285938 GTAACAAAA
1 G-AACAAAA
22285947 CAAAAGGTCA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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GAACAAAAACAGTTGGTTTA
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Alignment explanation
Indices: 22285941--22286620 Score: 683
Period size: 181 Copynumber: 3.8 Consensus size: 180
22285931 TTGGTTTGTA
* * * * *
22285941 ACAAAACAAAAGGTCATGACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACG
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* * *
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* ** * * *
22286067 TTATTATTTTCTTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAATCAATTATTTTATG
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* * * ** * * *
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* * * * * ** * * * * *
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66 TGTTC-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * *
22286247 GTATTATTTTATTTCGAATAAGGC-TATATGAACT-AATACAATTATTTTTTG
130 GTATTATTTTAATCCAAATAA-GCTTATATGAA-TAAAAACAATTATTTTATG
* * * * *
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1 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * * **
22286363 TGTTCAGTAAACATATTTAGTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA
66 TGTTCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTA
* * *
22286428 ATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG
130 GTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTATTTTATG
* * * * *
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1 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * * * * *
22286544 TATTTGATAAATAGATTTCTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTG-AATATTAATAAATTT
66 T-GTTCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTA
22286608 GTATTATTTTAAT
130 GTATTATTTTAAT
22286621 TGCTCAAATA
Statistics
Matches: 401, Mismatches: 90, Indels: 21
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Matches are distributed among these distances:
177 60 0.15
179 18 0.04
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182 3 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
TGTTCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAG
TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTATTTTATG
Found at i:22287473 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 22286818--22287475 Score: 595
Period size: 181 Copynumber: 3.6 Consensus size: 177
22286808 AATGGCCATA
** * * * * ** * * *
22286818 ATTATTTTATTCGGAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTTA
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* * * *
22286883 AAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGAA-AACTATTTGAAATGATTTAGTAAACAAA
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* *
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128 TTTATTTTTTAAATCTCTTATT-ATAAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
22286999 ATTATTTTA-TTTCAGACAAACTTATATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATAATA
1 ATTATTTTATTTTGA-ACAAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAT-GTT
* * * * * * * *
22287063 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTTGGAAAATAGA
64 ATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGATTTAG-TAA-CGA
*** * * * *
22287128 ATTT-TTTAAAAAATCTCTTCCTTATAAAATTTTGAAATATTAACAATTTAGT
127 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATTAT-AAATTTTCAAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
22287180 TTTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCA
1 ATTATTTTATTTTGAACAAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAT-AAATGTTA
* * * * * * *
22287245 TAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGGT-TTAACTATTTGAACTAATTCAGCTAACGGA
65 TAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTAATAACTATTTGAACTGATTTAG-TAACGAA
* * *
22287309 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTCAGACTATTATTAAATTAGT
128 TTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATAAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGT
* * * *
22287361 ATTATTTTATTTTGAACAAATTTGTGTGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATAGAATGTTA
1 ATTATTTTATTTTGAACAAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATA-AATGTTA
* *
22287426 TAATAATTTGAAATAGATGATTGTTTAAATAGTAATAACTATTTGAACTG
65 TAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTG
22287476 GTCATAACTA
Statistics
Matches: 377, Mismatches: 85, Indels: 30
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
180 21 0.06
181 333 0.88
182 23 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
ATTATTTTATTTTGAACAAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAATGTTAT
AATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGATTTAGTAACGAATTT
ATTTTTTAAATCTCTTATTATAAATTTTCAAATATTAATAAATTAGT
Found at i:22287937 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 22287484--22289392 Score: 1297
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22287474 TGGTCATAAC
* ** * * * *
22287484 TATTAA-AGAATTAGTATTATTTTATATCAAATAAGCTTGTAT-ACTGAAAAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
22287547 GACAAA-ATGAAATGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-GGCCATAATTATTTGAT
64 GACAAACA--AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** *** *
22287610 CTAATTTGGTAAATTGATTGATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-GAAA
127 CTTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * * *
22287660 TATTAATAAAGTAGTGTTATTTTATTTTGGATAGGCTTTTAT-ACT-GAAACAAATGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * *
22287723 CAAAACAAAAGTTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT
66 C-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
*
22287788 GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTTCAAATCTCTTGCTTACTAATTTTTAGAA
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* * * *
22287841 TGTTAATAAATTAGTATTTTTTTATTTTGAAT-AGTTTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATG
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* * * * *
22287905 ACAAACAAAAGGTCGTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAAC-T
65 ACAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
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130 G-TTTG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTGCTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
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1 TATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * ** * *
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64 G-ACAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
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128 TTGTT-TGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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1 TATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAATA-GAAACAATTGTTTTAT
* * * * **
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* ** *
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128 TTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAA
* * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
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* * * * * *
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129 TGTTTG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTGCTTATTAATTTTTAG-AA
** ** * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
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** * * * *
22288846 AATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA--TTTAGGAAA
129 TGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA-G-AA
* * * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGTTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* ** * * * * *
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64 GACAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
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128 TTGTTT-GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
22289080 TATT-ATTAATTAGTATTAATTTATTTTCAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
22289143 ACTAAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT-ATTAACCATTTAAAC
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** * * * *
22289207 TAATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTGTTT-GAAA
128 TTGTT-TGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AA
* * ** * ** * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAA-T-TGTTTTAT
* * * * *
22289324 -A-AAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT
64 GACAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
*
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129 TGTTTG
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Statistics
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TTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAA
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* * * * *
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* ** * *
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* *** *
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* * * * **
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* ** *
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* *
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130 AAAAAATAAATCTATTTATTGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTCTA-T-G
* * *
22289969 AATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTATTTGGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT
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* * *
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* * *
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22290139 GTGATTTAAA
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ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTGATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT
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AAAAATAAATCTATTTATTGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTCTATG
Found at i:22291409 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 22290198--22293097 Score: 2172
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22290188 CCAATTTAAT
** * * * ** * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * ** *
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* *
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* *
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* * * *
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** * * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAC
* * * *
22290805 GAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAG---AA-AT
65 AAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAGAAATTAATAAGTAAAAGAT
* ** * * *
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127 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-C
* * * * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * *
22290980 AGTTTA-TTCGGATTAAAATAATACAAATTTATTAATAATT-TGACAATTAATAAGTAAAAAATG
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* * * *
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* ** * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * *
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66 AGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAGAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * *
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128 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * ** * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATAC
* **
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* * *
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* * ** * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* ** *
22291522 AGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTGATAAGTAAAAGATTT
66 AGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAGA-AATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * * *
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* * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * * **
22291701 TAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTGATTAATATTTTGAAAATTAA-AGAGTAAAAGAA
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* * * ** * * * *
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126 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAC
* * ** * * *
22291884 TAGCATATTTTGAGTAAAATAGT--TAAATTTATTAATATTGCAA-AAATTAATAAGTAAAA-TT
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* ** * * * *
22291945 TTAGAAAATAAAGCTATTTTCTTAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
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* * *
22291999 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAAACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
22292064 AGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAATTTACAGGTAAAAGATTT
66 AGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAGAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * *** * *
22292127 AAAAAATAAATTTATTTTCTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGGCTGTTTGAAC
129 AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
22292179 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* ** * * **
22292244 AGTTTATTTGGAGTAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAA-AAATTAATAAGTTGAAGATTT
66 AGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAGAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* ** * * * *
22292308 AAAAAATTAATCAGTTTACTTAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTAAAC
129 AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAC
* ** *
22292360 TATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * *
22292425 AAATTATTT-ATGAT-AAATAATACTAATTTATTACTATTTCAA-AAATTAATAAG----AGATT
66 AGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAGAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * ** * * * *
22292483 TGAAGACCAAATCTCTTTACCGAACCAA-TT-AAATAGTTATGACTATTTAAAC
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * * * * *
22292535 AATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * * * *
22292599 AGCTTA-TACGGAGTAAAATATTGCTAAGTTAATAGTATTTTAA-AAATTAATAAGT-AAGGATT
66 AGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTA--ATATTAAGAAATTAATAAGTAAAAGATT
** * * * * *
22292661 TAAAAAATAAATGCGTTTA-TCGATCCAGTTCAAATAGTTAAGACTGTTAGAAC
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
22292714 AATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATAGTTTCAATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * *
22292779 TGTTTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATT
66 AGCTTATTTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAGAAATTAATAAGTAA-AAGA-T
* * * *
22292843 TTAAAAAATAAGTCTATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
127 TTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * * * *
22292897 AATTATCTATCTAAAATCATTATGACCTTTT-ATTTATCATAAAACAATTATGTCAAATAATAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
*** * * * *
22292961 AGCTTACCCCAAATAAAATAATATTACTTT-TATAATATTTTAA-AAATTGATAAGTTAAAGATT
66 AGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATA--TTAAGAAATTAATAAGTAAAAGATT
** ** * * *
22293024 TAAAGCATAAATCAGTTTA-TCGAATC-AGTT-AAATAATTATGTCCATTTGAAC
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
*
22293076 ATTTATCTATTTCAAATCATTA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTA
22293098 AAATAATTGT
Statistics
Matches: 2168, Mismatches: 452, Indels: 201
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Matches are distributed among these distances:
173 4 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
AGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAGAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
Found at i:22292646 original size:175 final size:176
Alignment explanation
Indices: 22290275--22296236 Score: 1772
Period size: 181 Copynumber: 33.6 Consensus size: 176
22290265 TTATTCATAA
* * * * **
22290275 TAAAAAAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--A-AGATTTAAAAAACAAATCAC
* * * * ** * * * *
22290340 TTTACC-ATGCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTGTACACTTCAAATTGTTATAAC
63 TTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAT
* * ** * * * *
22290404 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTGCTGTTCAAACAAGCTTATTCA-AAG
127 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGATTA-T-AGGAG
* * * * *
22290456 TAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAATAAAAT-T
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA--GA-AGATTTAAAAAA-CAAATCA
* * * * ** * * * * * *
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* * * *
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1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAG--ATTTAAAAAACAAATC-
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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60 CACTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
* * * **
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* ** * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* *
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* * ** *
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127 -CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGATTA--TAGGAG
* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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* * * ** *
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1 TAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTTAAAAATTAATAAG---AAGATTTAAAAAACAAATCA
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* * * * *
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* * * * * * * ***
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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61 -ACTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
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* * *
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** * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * **
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * ** ** **
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126 TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGATTA--TAGGAG
* * *
22295955 TAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT--
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--A-AGATTTAAAAAACAAATCA
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAGA-TTT-AAAAAACAAATC-A
* **
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Statistics
Matches: 4466, Mismatches: 961, Indels: 710
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150 6 0.00
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* * * * *
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*
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*
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * **
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322 CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * ** * *
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* * * ** * *
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452 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACTGAACAAGTTCA
* * * *
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* * * ** * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACA
* * * ** * *
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* * * *
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125 AAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA
* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * *
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251 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* *** * * * *
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* * * *
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* * *
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* * *
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** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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195 TTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * * * *
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260 ATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCT
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* * * * *
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389 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * *
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453 TAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAGAAGA-TTTAAAAAATTAA-TC-AGTTTACT-GAACAAGT
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* * * * * * * * * *
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1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* *** * * * * *
22292961 AGCTTACCCCAAATAAAATAATATTACTTT-TATAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAAAGATTT
65 AGATTA-TTTAGATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT
** * * * * * * * *
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124 AAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT
* * * * *
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* ** **
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252 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TT
* * * * * * *
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316 GTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * * *
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381 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * * * ** *
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445 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACTGAAC
* * * * * *
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* * * * ** * * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC-
* * * *
22293471 AA-CTTATTCAGAATAAAAGAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATCAATAAGAGATT
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* * * ** * * * * *
22293534 TGACAAATAATTCTATTTACTAAACTAGTTGAAATAATTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTT
123 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT
* * ** * * * * * **
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188 CAAATTGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA
* * * *
22293654 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGAATTAAAAAATAAATCTA
253 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TG
* * * * * * * *
22293715 TTTA-CTTAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTTAAATCGTTATGA-
317 TTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* *** * ** * *
22293778 CTATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAGTAATGCT
382 CT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* ** * **
22293843 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA-ATGGATTTAAAAAAAGAATCTGTTGGCCT-AAC
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* * *
22293906 CAGTGT-AAATAGTTATGACTATTCGAACA
509 AAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * * * * * **
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * *** * * * *
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** ** * * * * *
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* *** * *** *
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* *
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* * * * * ** * *
22294471 AACTATCTACTTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTCGTTATAAAACATTTGTGCCAATTCATAT
1 -ATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
22294535 AGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATT
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* * * * * ** * *
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123 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT
*** * * * **
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* ** * *
22294729 AATAAAATAATA-TAAATTGATTAATA-TTCCAAAATGTATTAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAA
251 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
** * *
22294791 TCTGTTT-TCT-AAATATGTTAAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATT
314 T-TGTTTATCTGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T
** * * **
22294852 TATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-A
376 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * * * * ** *
22294916 ATATTAATTTATTAATTTTCCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTA-TC
441 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACTG
* * * * *
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506 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* **
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1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * **
22295077 AGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAGGAGATTTA
65 AGATTATTTAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTT-
* * * * * * * * * *
22295142 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCACGTCCATTTAAACAATTATCTATTTC
124 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTC
* * * ** * * * ** *
22295207 AAATCGTTATGA-CAATTGATTTTATTGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTTAGA
189 AAATTGTTATGATC-TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGA
* * * *
22295271 ATAAAATAATATTGATTTATTCATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAACTAAATCT
252 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-T
* * * * * * * *
22295331 ATTTA-CTGAATCAATT-AAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATCTCGAATTATTATGA
316 GTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * * * * * * * *
22295394 TC-TTTGTTTTATGATATAACAATTATTT--TTTTATATAAACTTATTCGAATTAAGATAATACT
381 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * ** *
22295456 AATTTA--AA-A--AT-AAAA--AAT-A--A-ATG-TGT------TT--T--G----CCAAACCA
446 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACTGAACAA
* *
22295494 GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA-T
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** * * * * ** *
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1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * **
22295584 TAGCTTATTTGGAATAAAA-AA-ATTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
64 AAGATTATTTAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
* * * * * * * *
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124 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTC
** * * * * *
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* ** * * * *
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252 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TT
* * * * * * * *
22295841 GTTTTTC-AAACCAGTTTAAACAGTTATAACTATTTGAACAAATATCAATCTT-AAATCAATATG
316 GTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATG
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22295904 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGCTTCTAA-TCATACAAGCTTATTT-AGATAAAAATAAT
380 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAAT
* * *
22295965 ACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAAT--GTGTTAGT
443 ACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATTAATCAGT-TTACT
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * * ** * * *
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* * * * * * * * **
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273 AATATTTTGAAAAT--TAATAA-GTA-AAAGATTT-AAAA---AATAAAT-TGTTTATCTGAACC
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** * * * * **
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* * * * * * **
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** * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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64 AAGATTATTTAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
* * * * * **
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124 -AAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATT
* * ** * *
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187 TCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA
* * * ** * *
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250 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
** ** ** * * * * * * *
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315 -TGTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
** * **** * **
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379 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
* * *
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444 CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACTGAA
* * *
22297678 C-A----AACTAG-T-T-CCTATTT-AAGT
508 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * * *
22297699 AATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATAGTTTC-AGTTCATAC
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * *
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64 AAGATTATTTAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
* * * * * * * * ** * *
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124 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTC
* ** * *
22297891 AAATTGTTATGATCTTTGTTTTGTCATCAAACAATCATTT-TAGTCCATACAAGCTTATT-TGAA
189 AAATTGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-A
* ** *** **
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252 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * *
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316 GTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * ** * *
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381 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * *
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445 TAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATC-AGTTTACTGAA
** ** *
22298189 CCGGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAACA
508 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * ** * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * ** * *
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66 GATTATT-TAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
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126 AAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATTTATTTCA
* * * * * * *
22298412 AAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACCAA--ATTTCAATTCATACTAGCTTATTCAAAA
190 AATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA
* * ** *
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253 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA-ATAA--
* * * * * * **
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313 ATTGTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * *** ** * * ** *
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378 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* * * * *
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443 ACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATC-AGTTTACT-
* * *
22298725 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAA
505 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-T
* ** * *** * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * ** * * *
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65 AGATTATTTAG-A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA---AGAGATTT-
* * * * ** * * * * * * *
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124 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTC
* * * * * *
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189 AAATTGTTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTCAG
* * * *
22299013 AAATAAAATAATAAC-AATTTATCAATATTTTGAAATTTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGA
251 -AATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAAT-A
* * * * * * * * * * *
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312 AATTGTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * ** * *
22299140 TATAACCTTTTGTTTTATTATAAAATAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAAGA
376 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * **
22299205 ATA-TAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTA
441 ATACT-AATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATCAGTTTA
* * * *
22299267 -TCAAACAAGTTCAAATCA-TTATGATTATCTGAACA
503 CT-GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACT
* *** * * *
22299302 ATTATTTATTTCAAATTGCTATGA-CTTCTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * *
22299366 AGGTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTCGACAATTAATAAGTAGAAGATTTA
65 AGATTATTTAGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AG-AGATTTA
* * * * * * * * **
22299431 AAAAATAAATATGTTTATCGAACCAGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTATTTCA
125 AAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA
** * * * * * * * * *
22299496 AATCATTATGACCTTTTGTCTTATAATAAAACAATTGATT-AAGTTCAAATAAGCTTATT-TGAA
190 AATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-A
*** * ** * * *
22299559 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTATGAGAATT-AACAATGAATCT
252 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-T
* * * * *
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316 GTTTATCTGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
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380 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAAT
* * * * *
22299749 A-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTA-AAAATTGT-AAAAATAAATCTGTTTTCTT
443 ACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGAAGATT-TAAAAAATTAATCAGTTTAC-T
**
22299811 G-ACATTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-T
505 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
** * * * * *
22299842 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACAATTTGTTTTCTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAA
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * *
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65 AGATTATTTAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTA
* * * * * * * * * *
22299972 AAAAATAAATCTGTCTATCGAGCAAGTTCAAATAGTTATTACTAATTGAATAATTGTTTATTTCA
125 AAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA
** * * * *
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190 AATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AA
* ***
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253 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TT
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22300165 GTTCA-CCAAACAAGTTCAAAT-GTCATGTCCT-TTTGATCTATTATCTCTTTTAAATCATTATG
316 GTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * ** * *
22300227 ACATTTTATTTTG-CTGTAAAACAATTGTTTCTATCCATATAAAATTA-TTCAGAATAAAATGAT
380 ACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAAT
* * *
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443 ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATC-AGTTTACT-G
* * *
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506 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * *
22300379 ATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TTTTTGTGTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * * * *
22300443 GCTTGTCTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATAAT-AAAAATTGATAAGTAAGAGATTTA
66 GATTATTTAGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
* * * *** * * ** * * *
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125 AAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA
** * * ** * * * *
22300572 AATCATTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCCA-A
190 AATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAGA
* * * *
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252 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-T
* * * *
22300697 ATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTA--ACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATAAATATGA
316 GTTTATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * *** *
22300758 CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATT
381 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
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446 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TAGAAGATTTAAAAAATTAA-TCAGTTTACTGAA
* * * *
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* * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* *
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65 AG-ATTATT-TAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AG---ATTT
* ** * * * * *
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22301094 AAA-CATTAT-AACATTTTGTTTCT-TTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTT-TTTT
189 AAATTGTTATGATC--TTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * *
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250 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
22301219 TCTGTTTGTC-GAAACAGTTCAAATAGTTATGACT-TTATGAATAACTATCTATTTCAAAAT-GT
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376 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * ** * * *
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441 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACT
** * * * *
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505 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACT
* * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * *
22301506 AGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA
65 AGATTATT-TAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA
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129 ATAAATCTATTTACCGA-ACCAGTTCAAATAG-TTATGA-C---T-ATTT---A-AACAATTATT
* * * * ** * * *
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22301798 TTCATAAAACAAATTTTTTAAT-TCATAGTAGTTAT-TCA-AAATAAAATAAAATGAATTTAT-T
360 ATC-TATTTCAAA-TCATT-ATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCAATTCATAC
* * ** ** ** **
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420 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA-ATTT-ATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAGA--A
* * * * * ** * * *
22301912 -ACTCAAATAATT-ATGACTATT--TGAACAA-TT-ATCTA-TT-TCAAATCATTATGACCT
480 GATTTAAAAAATTAATCAGT-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT-ATT-TGAACT
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22301966 -TT-TGT-TTT---ATCATAAAATGA--ATGT-TTTTGTTCAT---ATAA--GTTTAT-TTGAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCAT--TATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * ** * * * * *
22302016 CAA-AATA-ATA-CT--ATTCCTATTAATATT-TTAAAAATTAATA--------AGAGATTTAAA
63 CAAGATTATTTAGATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
* * * * *
22302067 AAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTGCTTGAAA-AATTTATTTATTTCA
127 AAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTAAACAA-TTATTTATTTCA
** * * * * * **
22302131 AATCATTATGA-C--T-TTTTGT--T----CTA-T-TATATGTTCATACAAGCTTAATT-GGGTT
190 AATTGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAGAAT
* ***
22302183 AAAATAATACTAATTTACTAA-ATTTTGTCCATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAATATG
254 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAAT-TG
** * * ** * **
22302246 TTTAT-TGAAGTAGATCAAATCGTTATGACCT-TTTG---GTTTGTC-A-TAAAAAT-ATTAT--
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* * * * * * **
22302301 --TTATG---T-TCATATAAGC--TTATTTAAAATAAAATAATAATAAG-TTA-TCCAAA-AATT
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** ** * ** * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** *
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255 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTT
* ** * * * * *
22302742 T-GCCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCT
319 TATCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * * * *
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** * *
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* * * *
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511 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * * * * ** *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
*
22303023 G-------A-ATAAAATAATA-TACATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGTTTAAA
66 GATTATTTAGATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAA
* * * * * * *
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127 AAATAAATCTATTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * *
22303142 ATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATACAAACTTATTCAAAATA
191 ATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* ** * *
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255 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTT
* ** ** *
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* * * **
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381 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * * ** *
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* * * *
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511 GTTCAAATAGT--TATGACTATTTGAACT
* ** * * * *
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* * *
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66 GATTATTTAG-ATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA
** * * ** * * * * *
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128 AATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT
* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * **
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* *
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* ** * * *
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* * * **
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 -ATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * ** *
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128 AATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT
* * * * *
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* * ** *
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255 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATTGTT
*** * * ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * ** * * *
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* * ** *
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* ** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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** * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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Statistics
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TATTCTAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
TTATGACTATTTGAACT
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** * * * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * *** ** * * *
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* * * *
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** * * * *
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* ** * * ** * * *
22290979 AAGTTTATTCGGATTAAAATAATACAAATTTATTAATAATTTGACAATTAATAAGTAAAAAATGT
65 AAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT
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* * * *
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* * * *
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** * * * * *
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* * * ** * *
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65 AAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAA-AT
* * *
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126 TTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
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190 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * * *
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255 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * *
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320 A-GTTTATCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * ** *
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* * ** * ** * * * * *
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125 TTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
*** * * * * * * **
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189 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
* * * ** *
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254 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGA-TTTAAAAAATAA
* *
22291956 AGCTA-TTT-TCTTAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
317 ATC-AGTTTATC-GAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* ** *
22291999 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAAACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
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66 AGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTA
* * *** * * *
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129 AAAAATAAATCTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *** *
22292193 AATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGTTTATTTGGAGT
193 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
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258 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCAGT
* * * *
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* ** * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA
** * * *
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66 AGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTA
* ** * * * *
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* * * * * * **
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192 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * * *
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256 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAAT-C
* * * *
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320 AGTTTATCGA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
22292714 AATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATAGTTTCAATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
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66 AGCTTATTT-AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAA-TT
* * *
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127 TAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * * * * * * ** *
22292909 AAAATCATTATGACCTTTT-ATTTATCATAAAACAATTATGTCAAATAATAAAAGCTTACCCCAA
191 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * **
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256 ATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * *
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*
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * *
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65 AAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT
* * * *
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128 AAAAAATAAATCTATTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
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191 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * * *
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255 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * *
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* * * * ** * * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * *
22293470 TAA-CTTATTCAGAATAAAAGAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATCAA-TAAGAGA
65 -AAGCTTATTTA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAAA
* * * * * * * * *
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* * * * ** * * * **
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* * *
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254 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
22293712 CTA-TTTA-CTTAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTAAAT
319 C-AGTTTATC-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * *
22293753 AATTATTTATTTTAAATCGTTATGA-CTATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
22293817 AATCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATT
65 AAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAAATT
* ** * * *
22293881 TAAAAAA-AGAATCTGTTGGCCTAACCAGTGT-AAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATCTAT
127 TAAAAAATA-AATCTATT-TACGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * ** *
22293944 TTAAAATTATTATAACCATTTATTTTATCACAAAACAATTATTTCTATTCGCACAAGCTTATTCG
189 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
22294009 AAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATGAAT
254 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
22294070 -ATGTTCA-CTGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAAT
319 CA-GTTTATC-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
22294111 AATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTCTATTCATAGA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * *
22294176 AGCTTACTTAAAATAAAATAATACAAATTTGTTAATATTCAAAAAATTAATAACTAAAAAATTTT
66 AGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTA
* * * * * *
22294241 AAAAAT-AATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTGTTTATTTTA
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* * * *** * *****
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* * * * * *
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258 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCA-G
* * * *
22294433 TTTA-CTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
322 TTTATC-GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * ** * *
22294471 AACTATCTACTTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTCGTTATAAAACATTTGTGCCAATTCATAT
1 AATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
22294535 AGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTT
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* * * * *
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128 AAAAAATAAATCTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
*** * * ***
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192 AAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAA
* ** *
22294729 AATAAAATAATA-TAAATTGATTAATA-TTCCAAAATGTATTAAG-TAGAA-ATTTAAAAAATAA
255 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAAT-TAATAAGTTA-AAGATTTAAAAAATAA
* * * * *
22294790 ATCTGTTT-TCTAAATATGTTAAAATA-TTATGACTATTTGAAT
317 ATCAGTTTATC-GAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
** **
22294832 AATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAACCAATTGTTTCTATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
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65 AAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATT
* * * * * * * *
22294959 TAAGAAATAAATTTGTTTATC-AAGCAAGCTCAAATAGTTATGATTGTTTAAACAATTATTTATT
127 TAAAAAATAAATCTATTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * *
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190 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAA
* *
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255 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTA-AAGATTT-AAAAAATAAA
** * * * * * * * *
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318 TCAGTTTATCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* ** * ** * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
** * * * **
22295258 AAAATTATTTAGAATAAAATAATATTGATTTATTCATATTTTGAAAATTAATAAG--AG--ATTT
65 AAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT
* * * *
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128 AAAAAATAAATCTATTTAC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * * *
22295381 CGAATTATTATGATC-TTTGTTTTATGATATAACAATTATTT--TTTTATATAAACTTATTCGAA
191 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAA
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256 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCA
* * * *
22295489 ----A---ACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAT
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** * * * * * *
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* * * * * *
22295584 TAGCTTATTTGGAATAAAA-AA-ATTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * **
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257 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATCA
* * * * *
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321 GTTTATCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
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* * *
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65 AAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT
* * * * *
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** * * * * * * *
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190 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
* ** * * *
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254 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAGA-TTT-AAAAAATAA
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317 ATC-AGTTTATCGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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** * ** * * * * **
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193 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAA-T-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAA
** * * ** * * ** **
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255 AAT-AAAATAATACTA-ATTTAT-TAATAT-TTTAAA-AA---TTAAT-AAGTTA-AAG---ATT
* * * * * * * *
22296543 TGAAATAAA-ATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAGAAATAG-TAAGA-GATTTAAAA
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* * * * * * *
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* ** * * ** ** ** ** *
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** * * * ** *
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109 ATT-AATAAG-TAAGA-AA--TT-T--AAAA-AATA-AAT-CT-ATTTACGAACAAGTTC-AAAT
* * * * * * * * *
22296784 A-TTAATAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAATTAAAACAATTATGGCCATTT
161 AGTT-AT--GACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C---A--AATT------GTTATGACCTTTT
* * * ** **
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210 G--T--TT-TGTCA--T-AAAACA--ATTA--TTTC----AAT-TCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
22296911 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAA-CTAAGATATTTAAAAAAATAAATCT
258 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTT-AAAAAATAAATC-
**
22296975 A-TTTATC-AAGCTAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAAC
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* * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATAC
** * * *
22297077 AAGCTTATTTAGTTAAAAATAATTCTAATTGAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AAGATT
65 AAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATT
* * *** * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ***
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22293614 ----CTTTGT--TAATA-AA-TGTTTTTGTTCAAATAAG-TT-TTTGGAATAAAATAATATTAAT
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* * * * *
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* * ***
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* * * * *
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* *
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** * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* *
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* * * * *
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* ** ** * *
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* *
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** ** ** * * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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* * * * * * ** *
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** * * *
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* * **
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* * * * * **
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* * * * *
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* ** * * * * * * * * *
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*
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* * * * ** *
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* * ** **
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*** * * * * *
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* * * * * * **
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* * * **
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAAT-ACT
* * * * * * **
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * * *** *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA
* * * ***
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* ** * * * * **
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*
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* * * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * **
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* ** * * *
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66 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACCTAACAAGTT
* * * * *
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* * * * ** * * *
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1 -TTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * *
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* * * **
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* * * * ** * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * ** *
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* *** * * *
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** * * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * *
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65 TTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAAAAATCTGTTTACCTAACAAGTT
* * * *
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129 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA
* * * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
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65 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TA-AGGATTTAAAAAAAAATCT-GTTTACCTAA-CA
* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * **
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1 -TTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * ** *
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* * *
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125 AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCA
* *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *** * **
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65 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GGATTTAAAA-AAAAATCTGTTTACCT-AACAAG
* * * * * *
22301416 TTAAAATAATTATGGCTATGTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
127 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA
* * * * * * *
22301469 TTTGTTTGGTCACATAACAATTGTTTTTGA-ACATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* *
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65 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACC
22301586 ATAAACTTCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAAAAATCTGTTTACCTAACAAGTTCA
AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA
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* * * * *
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* * * *
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* *
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130 GATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAATTT
* *
22296218 GAATAGTTATCTATTTAAAATCATTATGAA-CTTTTGATTT-GTCATAAAATAATTATGTCAATT
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* * *
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*
22296346 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
22296370 TGAATAGTTC
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ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG
ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAATTT
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22296644 AAAATTTATT
* * *
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*
22296681 TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGT
1 TATTTAAAATCGTTATCACCTTTTGT
22296707 TTTGTCATAA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 4, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (27 bp):
TATTTAAAATCGTTATCACCTTTTGTC
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Alignment explanation
Indices: 22296483--22296867 Score: 497
Period size: 204 Copynumber: 1.9 Consensus size: 202
22296473 ATTTGAAATA
* * * ***
22296483 AAAATGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCAACCTATAAGCTTATTTGAAA
1 AAAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTGCAA-CTACAAGCTTATACAAAA
* *
22296548 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAGAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * *
22296613 CCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTTATTTATTTCAAATTGTTATCATCTTT
130 CCAAATCAATTAAAACAATTATGACCATTTGAATAA-TTATTTATTTCAAATTGTTATCATCTTT
22296677 TGTCTATTT
194 TGTCTATTT
* *
22296686 AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTAGCTAA-TACAAGCTTATACAA
1 AAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-GC-AACTACAAGCTTATACAA
* * *
22296750 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCTAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
63 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTC-AAGAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
** *
22296814 TTACTGAATCAATTAAAACAATTATGGCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
127 TTACCAAATCAATTAAAACAATTATGACCATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
22296868 CATTATGACC
Statistics
Matches: 155, Mismatches: 22, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
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206 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (202 bp):
AAAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTGCAACTACAAGCTTATACAAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAGAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
CAAATCAATTAAAACAATTATGACCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATCATCTTTTG
TCTATTT
Found at i:22297978 original size:507 final size:509
Alignment explanation
Indices: 22297169--22298443 Score: 1253
Period size: 519 Copynumber: 2.5 Consensus size: 509
22297159 TAAACTAGTT
* * * *
22297169 CAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTT-TT-TATCATA
1 CAAATAGTT-ACACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATA
* * * * * * * * *
22297232 AAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAGAATCAAATAATCCAAATATATTAACATTTAA
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* * * * * * *
22297297 AAAAGTAATAAGTAAAACATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGCTTAAATAGTTATGA
129 AAAATTAATAACTAAGAGATTT--AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGCTCAAACAGTTAAGA
** *
22297362 CTATTTGAACAATTGCTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTTT
192 CTACATGAACAATTACTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTTT
* * *
22297427 AGTTCAAAAAAGCTTATCAAAACTAAAATAATCTGAAAATTAATAACT-AAGTGATTTAAAAAGT
257 AGTCCAAAAAAGCTTATCAAAACTAAAATAATC-GAAAATTAATAACTCAA--AAATTAAAAAGT
* * *
22297491 GAATCCATTTACCAAATGA-GTTCAAATAATTATGGCAATTTTAACAATTATCTATTTTAAAGCG
319 GAATCCATTTACCAAATGATG-TCAAATAATCATGGCAATTTCAACAATTATCTATTTCAAAGCG
* * * * *
22297555 TTATGAATTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCG-TGATACAAGC-T-TTCAAAATAAAA
383 TTATGAACTTTT-GTTTGGCATAAAACAAATGTTTTT-GATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* *
22297617 TAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-A
446 TAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCAA
* * * * *
22297680 -AACTAGTT-C-CTATTT-AAGTAATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATA
1 CAAATAGTTACACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATA
* * *
22297741 AAATAATAGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATATTAATTTAATAATATTTCA
65 AAATAATAGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTCA
* * * *
22297806 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAACAATAAATTTGTTTATCGAAGC-ATC-CAAACAGTTAAGAC
129 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGCTCAAACAGTTAAGAC
* * * * *
22297869 TACATGAACAATTATTTGTTTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATCAAACAATCATTTTA
193 TACATGAACAATTACTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTTTA
* * ** ** *
22297933 GTCCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATAC-AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
258 GTCCAAAAAAGCTTA-TCAAAACTAAAATAAT-CGAAA---ATTAATAACTCAAAAATTAAAAAG
* * * * *
22297996 TGAATCTATTTACCAAATTATGTCAAATAATCATGGCCATTTCAGCAATTATCTATTTCAAATCG
318 TGAATCCATTTACCAAATGATGTCAAATAATCATGGCAATTTCAACAATTATCTATTTCAAAGCG
* * * * ** *
22298061 TTATTACCTTTTGTTTGGCATATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATT
383 TTATGAACTTTTGTTTGGCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * *
22298126 ATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTCAAGAAATAAATCTATTTACCGAA
448 ATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACC-AA
* * * * *
22298189 CCGGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCT
1 ------CAAATAGTTAC-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCT
* * * *
22298254 ATCATAAAACAATTA-TTTCTATTCATAGAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATCTAACA
59 ATCATAAAATAA-TAGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATATAATA
* * * * * * * *
22298317 GTATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAT
121 ATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGCTCAAACAG
* * *
22298382 TTAAGACTATAAT-AATAATTA-TCTATTTCAAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
186 TTAAGACTA-CATGAACAATTACT-TATTT-AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
22298444 CAAATTTCAA
Statistics
Matches: 618, Mismatches: 109, Indels: 64
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
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508 8 0.01
509 75 0.12
510 8 0.01
516 7 0.01
517 1 0.00
518 5 0.01
519 128 0.21
520 39 0.06
521 21 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.12, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (509 bp):
CAAATAGTTACACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAA
AATAATAGTTTCATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTCAAA
AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGCTCAAACAGTTAAGACTAC
ATGAACAATTACTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTTTAGTC
CAAAAAAGCTTATCAAAACTAAAATAATCGAAAATTAATAACTCAAAAATTAAAAAGTGAATCCA
TTTACCAAATGATGTCAAATAATCATGGCAATTTCAACAATTATCTATTTCAAAGCGTTATGAAC
TTTTGTTTGGCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCAA
Found at i:22298356 original size:519 final size:513
Alignment explanation
Indices: 22297482--22298849 Score: 1307
Period size: 539 Copynumber: 2.6 Consensus size: 513
22297472 ACTAAGTGAT
* * * *
22297482 TTAAAAAGTGAATCCATTTACCAAATGA-GTTCAAATAATTATGGCAATTTTAACAATTATCTAT
1 TTAATAAGTGAATCTATTTACCAAATTATGTTCAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTATCTAT
* ** * * * *
22297546 TTTAAAGCGTTATGAATTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCGTGATACAAGC-TTTCAA
66 TTTAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT-GTCATTCAAGCTTTTCAA
* * *
22297610 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * ** **
22297675 TACC-A-----AACTAGTT-C-CTATTTAAGTAATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
194 TACCAACGTTCAAATAGTTACACTATTTAA-CAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGT
* * * * * *
22297732 TCTGTTATAAAATAA-TAGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAAAAATATTAATTTA
258 TCTATCATAAAACAATTA-TTTCA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTA
* * * * * * *
22297795 ATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAACAATAAATTTGTTTATCGAAGCA-TCCAAA
320 ACAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAGTCCAAA
* * * * * * *
22297859 CAGTTAAGACTA-CATGAACAATTATTTGTTTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATCAAA
385 CAGTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* * ** * *
22297922 -CAATCATTTTAGTCCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAA
449 CCAA--ATTTCAATCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAAAACAAATTTATTAATATTTCAAA
22297986 AA
512 AA
* * *
22297988 TTAATAAGTGAATCTATTTACCAAATTATG-TCAAATAATCATGGCCATTTCAGCAATTATCTAT
1 TTAATAAGTGAATCTATTTACCAAATTATGTTCAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTATCTAT
* * * * **
22298052 TTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGCATATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTTGA
66 TTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG-TCATTCAAGCTT-TTCAA
* * *
22298117 AATAAAATTATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTCAAGAAATAAATCTATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* *
22298182 TACCGAACCGGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTT
194 TACC-AA-C-GTTCAAATAGTTAC-ACTATTT-AACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTT
*
22298247 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAGAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATC
254 TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTC-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATC
* * *
22298312 TAACAGTATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTATTTGCCAAACCAGTTCA
318 TAACAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAGTCCA
* * *
22298377 AATATTTAAGACTATAATAATAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
383 AACAGTTAAGACTATAATAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * **
22298442 ACCAAATTTCAATTCATACTAGCTTATTCAAAATAAAACAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAA
448 ACCAAATTTCAATCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAA
22298507 A
513 A
* *** * ** *
22298508 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACATAATTATGGTTTCCTAACCAATTCAAATAATTATTACTA
1 TTAATAAGT--GA-ATCTATTTACCA-AATTAT-G------------TTCAAATAATTATGGCAA
* * **
22298573 TTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACGATTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGT
49 TTTCAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG-
* * * * * *
22298638 TCATTTAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAA-CATTTCGAAAACTAATAAGAGA
112 TCATTCAAGCTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATC-TTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * *
22298702 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAACAAATTATTTAT
175 TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAC--GTTCAAATAGTTA-CACTATTTAAC-AATTATATAT
* * * * * *
22298767 TTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTC-AACTATAAAACAATTGTTTCCATTCATATAAGCTGATTC
235 TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATC-ATAAAACAATTATTT-CATTCATACAAGCTTATTC
*
22298831 GAATTAAAATAATACTAAT
298 GAAATAAAATAATACTAAT
22298850 TTATTAATAT
Statistics
Matches: 697, Mismatches: 115, Indels: 67
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
504 1 0.00
505 28 0.04
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509 1 0.00
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540 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (513 bp):
TTAATAAGTGAATCTATTTACCAAATTATGTTCAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTATCTAT
TTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTCATTCAAGCTTTTCAAAA
TAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
CCAACGTTCAAATAGTTACACTATTTAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCT
ATCATAAAACAATTATTTCATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATA
TTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAGTCCAAACAGTTA
AGACTATAATAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACCAAATT
TCAATCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAA
Found at i:22301183 original size:168 final size:168
Alignment explanation
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Period size: 168 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168
22300895 AATTATGGGC
* *
22300905 ATTTGAACAATTACTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCA
1 ATTTGAACAATTACTATGTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTACA
* * *
22300970 TCATACAAGCATATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG
66 TCATACAAGCATATTAAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATGAATAACTGAG
22301034 CAAATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGCTTCT
131 -AAATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGCTTCT
* *
22301073 ATTTGAATAATTATCTATGTCAAA-CATTAT-AACATTTTGTTTCT-TTATAAAATAATTGTTTT
1 ATTTGAACAATTA-CTATGTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTT-TATCATAAAATAATTGTTTT
** * * * ** *
22301135 AGTTCATATAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATGAATAACT
63 ACATCATACAAGCATATTAAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATGAATAACT
*
22301200 GAGAGATTTAAAAAATAAAT
128 GAGAAATTTAAAAAATAAAT
22301220 CTGTTTGTCG
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 16, Indels: 8
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
167 3 0.02
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169 12 0.09
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (168 bp):
ATTTGAACAATTACTATGTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTACA
TCATACAAGCATATTAAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATGAATAACTGAG
AAATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGCTTCT
Found at i:22302098 original size:178 final size:174
Alignment explanation
Indices: 22301592--22302150 Score: 599
Period size: 178 Copynumber: 3.1 Consensus size: 174
22301582 TACCATAAAC
* * * *
22301592 TTCAAATGATTATAACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTATTTCTATTCATACTAGCTTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAAAAATT-TTT-TATTCATACTAG-TTTATTC
* * **
22301657 AAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
62 AAAATAAAATAATACTATTCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
22301722 TTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATAT-AAATAATTATCTAT
123 TTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAA-AATTATCTAT
* *
22301774 TTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTTCATAAAACAAATTTTTTAATTCATAGTAG-TTATTCAA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAA-AAATTTTTT-ATTCATACTAGTTTATTCAA
* * *
22301837 AATAAAATAA-AATGAATT-TATTAATATTTTAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAATTTTG
64 AATAAAATAATACT--ATTCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* ** * *
22301900 TTTACCTAACCAACTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
127 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
* * *
22301948 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATGAATGTTTTTGTTCATA-TAAGTTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAA-AAAT-TTTTTATTCATACT-AGTTTATTC
* * *
22302012 GAAACAAAATAATACTATTCCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
62 AAAATAAAATAATACTATT-CTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * ** *
22302077 ATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTGCTTGAAAAATTTATTTAT
126 GTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAA-TTATCTAT
*
22302127 TTCAAATCATTATGACTTTTTGTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
22302151 CTATTATATG
Statistics
Matches: 319, Mismatches: 44, Indels: 31
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 79 0.25
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (174 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAAAAATTTTTTATTCATACTAGTTTATTCAAAA
TAAAATAATACTATTCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
CCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
Found at i:22302587 original size:174 final size:171
Alignment explanation
Indices: 22302282--22302794 Score: 431
Period size: 174 Copynumber: 2.9 Consensus size: 171
22302272 GACCTTTTGG
* * ** *
22302282 TTTGTCATAAAAATATTATTTATGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATAATAAGTTATC
1 TTTGTCATAAAAATATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAA-AATTTAT-
* * * * * * *
22302347 CAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGATTCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATG
64 -TAATATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATG
*
22302412 ACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTGCT-ATAACCTTTCAT
128 ACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTG-TAATAACCTTTCAT
* *
22302456 TTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACAAATTTA
1 TTTGTCATAAAA--ATATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-AAATTTA
* * * * **
22302521 TTAATATTAAGACAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCGAATATGTTCAAATTGTTAT
63 TTAATATTAAGA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * **
22302585 GACTATTTGAACAATTATTTATTTTAACTTGTAATGACTTTTTGT
127 GACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATAACCTTTCAT
* * * *
22302630 TTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATTTTAATTTA
1 TTTGTCATAAAA-ATATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAA---TAA--AA
* * * * * * *
22302693 TTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACAAGTTTAA
59 TT--TA--TTAAT-ATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * *
22302758 ATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
119 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAAT
22302795 CATTTTGACC
Statistics
Matches: 273, Mismatches: 49, Indels: 27
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
171 3 0.01
172 31 0.11
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177 1 0.00
178 2 0.01
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181 67 0.25
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (171 bp):
TTTGTCATAAAAATATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAATTTATTA
ATATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACT
ATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATAACCTTTCAT
Found at i:22303111 original size:170 final size:176
Alignment explanation
Indices: 22302571--22304128 Score: 652
Period size: 180 Copynumber: 8.8 Consensus size: 176
22302561 TAGCGAATAT
* * * * ** * *
22302571 GTTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAACTTGTAATGACTTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * * * * * *
22302636 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATATT
66 ATAAAATAAATGCGTC-ACTCGTATAAGCCTA-TAGAACTAAAATAA-TATAATTTATTAATA-T
* * *
22302701 TTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACAA
127 TTCAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAA
* * * * * *
22302752 GTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTCTTTTGTA
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
22302817 ATAAAATAATTGCTTCCATTCGTATAAGCCTATTTGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 ATAAAATAAATGCGT-CACTCGTATAAGCCTA-TAGAACTAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
** ** *
22302882 TCAAAAATTAATGTGTAGGAGAA-TTTAAAAAA-ATCTAT-TTATT--GAACAA
128 TC-AAAATTAATAAGTA--A-AAGTTTAAAAAATAAATATGTT-TTCCAAACAA
* * * *
22302931 GTTCAAATAGTTATGACAATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * **
22302996 ATAACATAAATG-GT-ACT-GTTTGTG-C-A-AGAA-TAAAATAATATACATTTATTAATATTTC
66 ATAAAATAAATGCGTCACTCGTATAAGCCTATAGAACTAAAATAATATA-ATTTATTAATATTTC
* *
22303054 AAAATTAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACAC
130 AAAATTAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAA
* * *
22303101 GTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * ** * ** * * * * *
22303166 ATAAACCAATTGTTTCTATTTATACAAACTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
66 ATAAAATAAATGCGTC-ACTCGTATAAGCCTA-T-AGAACTAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * ***
22303230 TCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAGTATGTTTACCAAGTGA
127 TTCAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAA
** * *
22303281 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTAGTTT-AAATTGTTATAATCTTTTGTTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * ** * *
22303344 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTATT
64 TCATAAAATAAATGCGTC-ACTCGTATAAGCCTA-T-AGAACTAAAATAATA-TAATTTATTAAT
* * *** * * * * ** *
22303408 GTTAT-AAAATTAATGAGTTGTAGACTTAAAAAATTAATTTGTTTACTGAACTA
125 ATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAA
* * * ** * **
22303461 GTTCAAAGAGTCATATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTCATTTTG
1 GTTCAAATAGT--TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * * *** *
22303526 TCGTAAAATAATTAT-TTTTATTCATACAAAATTATTTAGAA-TAAAATAACATAAATTTATTAA
64 TCATAAAATAA--ATGCGTCACTCGTATAAGCCTA--TAGAACTAAAATAATAT-AATTTATTAA
* *** * * * **
22303589 TACTTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAGCCTAAATCTAGTTAT-CGAATTA
124 TA-TTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATAT-GTTTTCCAAACAA
* * * * *
22303641 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * * * ** *
22303705 AT--AGT---TTC-T-ATTCATAAAAACTTCT-TTGGAGTAAAATATTACAAAACTAATAATATT
66 ATAAAATAAATGCGTCACTCGTATAAGC--CTATAGAACTAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * ** * * *
22303762 TTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATACAATTGTCGAACCAA
128 TCAAAATTAATAAGTAA-AAGTTTAAAAAATAAATA-TGTTTTCCAAACAA
* * * * * * * *
22303813 -TTCAAATAGTTAAGATTA-TTGAACAATTATCTTTTTAAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** ** * * * * *
22303876 ATAAAATAATTGTTTTCGTTCATA-AATGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTATTTTATTAACA
66 ATAAAATAAATG-CGTCACTCGTATAA-GCCTA-T-AGAACTAAAATAATA-TAATTTATTAATA
** * * * *
22303939 TTAAGAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAA
126 TT-TCAAAATTAATAAGT-A-AAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAA
* * ** * *
22303993 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATA
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * * *
22304058 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATCTA-AAATAAAATAATATAACTTTATTAATAT
66 ATAAAATAAATGCGTC-ACTCGTATAAGCCTA--TAGAACTAAAATAATATAA-TTTATTAATAT
22304122 TTCAAAA
127 TTCAAAA
22304129 ATTGAGAAGT
Statistics
Matches: 1061, Mismatches: 242, Indels: 148
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 2 0.00
167 22 0.02
168 12 0.01
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170 123 0.12
171 45 0.04
172 2 0.00
173 5 0.00
174 2 0.00
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184 14 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (176 bp):
GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAATAAATGCGTCACTCGTATAAGCCTATAGAACTAAAATAATATAATTTATTAATATTTCA
AAATTAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAA
Found at i:22303339 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 22303024--22305761 Score: 1195
Period size: 180 Copynumber: 15.1 Consensus size: 178
22303014 TTTGTGCAAG
* *
22303024 AATAAAATAATA-TACATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTA-ATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAAT
* * *
22303086 ATGTTTTCCTAACACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTGTG
65 ATGTTTACC-AA-A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * *
22303151 ACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATACAAACTTATTCAA
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
*
22303203 AATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAGTA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATA
*
22303267 TGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTAGTTT-AAATTGTTAT
66 TGTTTACCAA---AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TA-TTTCAAATTATTAT
* * *
22303330 AATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAA
126 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
** ** * *** *
22303383 AATAAAATAATACTAATTTATT-ATTGTTATAAAATTAATGAGTTGTAGACTT-AAAAAATTAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAAATAAAT
* * * * * ** *
22303446 TTGTTTACTGAACTAGTTCAAAGAGTCATATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTA
65 ATGTTTAC-CAA--AGTTCAAATAGT--TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* ** * * * * ** * *
22303511 TGACATTTCATTTTGTCGTAAAATAATTATTTTTATTCATACAAAATTATTTAG
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * ***
22303565 AATAAAATAACA-TAAATTTATTAATACTTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAGCCTAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-ATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAA
* * * * * **
22303625 TCTAG-TTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTA
64 TAT-GTTTA-CCAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * ***
22303689 TGATC-TTTGTTTTGTCAT------A--GTTTCTATTCATAAAAACTTCTTTGG
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * ** * ** *
22303734 AGTAAAATATTACAAAACTAATAAT-ATTTTAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAA-AAGATTAAAAAAATAAAT
** * * * * * *
22303797 ACAATTGTCGAACC-AA-TTCAAATAGTTAAGATTA-TTGAACAATTATCTTTTTAAAATCATTC
65 ---A-TGT-TTACCAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * *
22303859 TAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TCGTTCATA-AATGCTTATTCAA
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA-GCTTATTCAA
* * ** *
22303913 AATAAAATAATACTATTTTATTAA-CATTAAGAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTTAAAAAATAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-CCAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTAAAAAAATAA
* * * * * *
22303976 ATCTATTTGCCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTA
63 ATATGTTTACC--A-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * *
22304041 TGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TCTAA
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AA
* * * * *** *
22304095 AATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAAT
* ** ** * *
22304159 CA-ATTTATTGAATCAGTTCAAATAG--AT-A--A--AAAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
65 -ATGTTTA-CCAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * * * *
22304216 GAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCTTTATTCAG
126 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGC-TTATTCAA
* * * ** * * ** * *
22304270 AATAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTTAAAAATTAATGACTAGGAGATT-TAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATA
** * * * * *
22304334 CATTTACAGAAATAATTGAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATGATTATTTGAACAACTATA
66 TGTTTAC--CAA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT--CTATTT---CAA--AT-
* * * * * * *
22304399 TATTTCAAACTGTTATAACATTTTATTTTATCTTAAAACAATTATTT-AAGTTCATACAAGTTTA
120 TA-TT---A-TG-----ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA
**
22304463 TTTGA
174 TTCAA
* * ** * * *
22304468 AATAAAATAATACTAATCTAATAAT-ATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-CCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
22304532 TTGTTTGCCAACCAATTCAAATA-ATAAGGCTATATGAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTATA
65 ATGTTTACCAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTATTATG
* * ** * * * * * * * * * *
22304595 ACTTTTTATTTTGTTGTAAAACAAATATTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTTAG
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * ** * *
22304647 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGAG-TT-AAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATA
* * * * * * * * *
22304708 TATTTACCAAATTAGTTCAATTATTTATAACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTACGA
66 TGTTTACC-AA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * *
22304773 CCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTAATA-TAGTCTTATTCGA
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAA
* * * ** ** * * *
22304824 AATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATA
* ** * * *
22304889 TGTTGGCCTGACC-AA-TTCAAATAATTACTGTTTGTTTGGACAATTATCTATTTCAAATCATTA
66 TGTT----T-ACCAAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* **
22304952 TGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * ** * * * **
22305006 AATAACATAATTCTAATTTGTTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAATTGAAGC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATA
** * * * *
22305067 TGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTA-AA
66 TGTTTA--CCA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* ** * * *
22305131 CCTTTTTTTTTGTCATAAAGGAATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC-A
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAA
* * ** * * * *
22305183 ATTAGAATAATAAAAATTTATTAAT-ATTCAAACAATTAATAAGTAAAATATTTAGAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAA-AATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAAT
* * * *
22305247 TTGTTTACTGAGTAAGTTAAAATAGTTATGACTATTTTAA-ATAGTTATGACTATTTGAGCAATT
65 ATGTTTAC-CA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-A-TTAT--CTATTT---C-A--
* * * * * * *
22305311 ATTTATTTCAAATCGTAATGACTTTTTGTTATGTCATAAAATAATTCTTTTTGTTCATACAAGTT
117 A---A-TT---AT--T-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
22305376 TATT---
172 TATTCAA
** * * * ** * *
22305380 --TGGATTAA-AATAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGT-AAAGATGT-TAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TAAAAAAATAAAT
* * * * *
22305440 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
65 ATGTTTACC--A-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* ** * * * *
22305505 GCCTTTTGTTTCATCGA-AAAACAATTG-AT-TACTTCATATAGGCTTATTCGA
127 ACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * *
22305556 AATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTATTGAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCC-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTAAAAAAATAAA
* * * *
22305619 TCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
64 TATGTTTACC--A-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * * * * *
22305683 GACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAACTTATTCCA
126 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
22305736 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
22305762 TTTCAATAGT
Statistics
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Consensus pattern (178 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATA
TGTTTACCAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCT
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
Found at i:22303910 original size:710 final size:703
Alignment explanation
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22302531 GACAGTAAAG
* * * * * *
22302541 ATTT-AAAAAATAAATCTATTTAGCGAATATGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATTT
1 ATTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TT
* *
22302605 ATTTTAACTTGTAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
65 A-TTTAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
** * * * * *
22302670 CGGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
128 CAAAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAA
* * * * *
22302735 ATATGTTTGCCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTT
192 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAGAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * ** *
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* * *
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322 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA---GTAAGAGAATTTAAAAAAATCTAGTTATCGAACA
* *
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*** * * ** *
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449 CATAACATAAATAAAACTGTTTGTG--AGAATAAAATAATACAAAACTAATAATATTTCAAAATT
* ** * * * **
22303060 AATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGA
512 AATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAAATTGTCCGAACACATTCAAATAGTTAAGACTATTTGA
* * * * * * * *
22303125 ACAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATA
577 ACAATTATCTATTTAAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
*
22303190 CAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-CCAAAATTAATAAGTAA-AA
642 CAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAACAAAATTAATAAGTAAGAA
* * ***
22303250 GA-TTAAAAAAATAAGTATGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACT
1 -ATTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-T
* *
22303314 TAGTTTAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAT
64 TA-TTTAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * *** *
22303379 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTATTGTTAT-AAAATTAATGAGTTGTAGACTTAAAAAATT
127 TCAAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATA
* ** * * *
22303443 AATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAAGAGTCATATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCA
191 AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAGAGTC--ATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
** * ** *
22303508 TTATGA-CATTTCATTTTGTCGTAAAATAATTATTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAA-TAAA
254 TTATGACCATTTC-TTTTGTAATAAAATAATTACTTCCATTCATACAAAACTATTT-GAACTAAA
*
22303571 ATAACA-TAAATTTATTAATACTTTCAAAAATTAA-TAAGAG-ATTTAAAGCCTAAATCTAGTTA
317 ATAACACT-AATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAAGTAAGAGAATTTAAA---AAAATCTAGTTA
** * * * * * * *
22303633 TCGAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTT
377 TCGAACAAGTTCAAATAATTATGACAATCTAAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGACCTTTT
* ** * *
22303697 GTTTTGTCATAGTTTCTATTCATAAAAACT-TCTT-TG-GAGTAAAATATTACAAAACTAATAAT
442 GTTTTGTCATA---AC-ATAAAT-AAAACTGT-TTGTGAGAATAAAATAATACAAAACTAATAAT
*
22303759 ATTTTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATACAATTGT-CGAAC-CAATTCAAATAG
501 ATTTCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATA-AATTGTCCGAACAC-ATTCAAATAG
* * *
22303822 TTAAGATTA-TTGAACAATTATCTTTTTAAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAAT
563 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAAT
* * * * *
22303886 TGTTT-TCGTTCATA-AATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTAAGAAAAT
628 TGTTTCT-ATTCATACAA-ACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAACAAAAT
22303949 TAATAAGTAAGAA
691 TAATAAGTAAGAA
* * * *
22303962 ATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
1 ATTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-T
* * *
22304027 ATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-T
65 ATTT-AAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
22304091 CTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATT
128 C-AAAATAAAATAATATAA-TTTATTAATATT
22304123 TCAAAAATTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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713 7 0.01
714 5 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (703 bp):
ATTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTA
TTTAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
AATAAAATAATATAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATAT
GTTTACCAAACAAGTTCAAAGAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
CATTTCTTTTGTAATAAAATAATTACTTCCATTCATACAAAACTATTTGAACTAAAATAACACTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGAATTTAAAAAAATCTAGTTATCGAACAAGTTCAA
ATAATTATGACAATCTAAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAACA
TAAATAAAACTGTTTGTGAGAATAAAATAATACAAAACTAATAATATTTCAAAATTAATAAGTAA
AAATTTAAAAAATAAATAAATTGTCCGAACACATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC
TATTTAAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTAT
TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAACAAAATTAATAAGTAAGAA
Found at i:22304071 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 22303755--22305764 Score: 1180
Period size: 182 Copynumber: 11.0 Consensus size: 181
22303745 ACAAAACTAA
* * * * *
22303755 TAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATACAATTGT-CGAACCAA-TTCA
1 TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATT-TACCAAACAAGTTCA
* * * * * * * * *
22303817 AATAGTTAAGATTA-TTGAACAATTATCTTTTTAAAATCATTCTAACCTTTT-ATTTAGTCATAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAA
* *
22303880 AATAATTGTTTTCGTTCATA-AATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTAT
128 AACAATTGTTTTCGTTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
22303934 TAACATTAAGAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAAGTTTAA
1 TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * *
22303999 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAA
65 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* *
22304064 CAATTG-TTTCTATTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATA-TAACTTTAT
130 CAATTGTTTTC-GTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAA-TTTAT
* * ** * ** *
22304116 TAATATTTCA-AAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTGAATC-AGTTCA
1 TAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCA
** * * *
22304179 AATAG--AT-A--A--AAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCATAAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * *
22304237 ACAATTGTTTTTC-ATCATATAAGCTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAT
129 ACAATTG-TTTTCGTTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
22304291 TAGTATTTTA-AAAATTAATGACTAGGAGATTT-AAAAATAAATCCATTTACAGAAATAA-TTGA
1 TAATA-TTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCA
* *
22304353 AATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATGATTATTTGAACAACTATATATTTCAAACTGTTATAAC
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT--CTATTT---CAA--AT-TA-TT---A-TG-----AC
* * * * ** * **
22304418 ATTTTATTTTATCTTAAAACAATTATTTAAGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
111 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *
22304483 ATCTAA
176 ATTTAT
* * * * *
22304489 TAATA-TTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAACCAA-TTCAA
1 TAATATTTA-GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * * * * * * **
22304552 ATA-ATAAGGCTATATGAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTTGTAAA
65 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * * * * * * * *
22304615 ACAAATATTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATATTAATTTAT
129 ACAATTGTTTTCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** *
22304668 TAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGAG--TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAT
1 TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *
22304729 TATTTATAACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTACGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC
66 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
* * * * * * *
22304794 AATTGTTTCCATTAATA-TAGTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTAT
131 AATTGTTTTCGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** * *
22304845 TAATATTTTGAAAATTAATAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAA-TTCA
1 TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCA
* ** * * * * * *
22304908 AATAATTACTGTTTGTTTGGACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAA
64 AATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAA
* ** * * *
22304973 AACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTGT
128 AACAATTGTTTTC-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * ***
22305027 TAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTGAAGCTGTTTATTGAACAAGTTCAAA
1 TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * **
22305088 TAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTA-AACCTTTTTTTTTGTCATAAAGG
66 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
* * * * **
22305152 AATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC-AATTAGAATAATAAAAATTTAT
131 AA-TTGTTTTCGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * ** ** *
22305204 TAATATTCA-AACAATTAATAAGTAAAATATTTAGAAAATAAATTTGTTTACTGAGTAAGTTAAA
1 TAATATTTAGAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* *
22305268 ATAGTTATGACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTAATGAC
65 ATAGTTATGACTA-TTTGAATAATTAT--CTATTT---C-A--A---A-TT---AT--T-ATGAC
* * * * * * * ** * *
22305333 TTTTTGTTATGTCATAAAATAATTCTTTTTGTTCATACAAGTTTATT-----TGGATTAA-AATA
111 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
22305392 ATTTAT
176 ATTTAT
* * * *
22305398 TAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AGATGTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
1 TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * * *
22305461 ATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTTTCATCGA-AAA
65 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATC-ATAAA
* * * * * *
22305525 ACAATTGATTAC-TTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAT
129 ACAATTGTTTTCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
22305577 TAATATTCCA-AAAATTATTGAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAATTCA
1 TAATATT-TAGAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
* *
22305640 AATAGTT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTTTCATAAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * *
22305704 ACAATTATTTAT-GTTCATACAAACTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTAT
129 ACAATTGTTT-TCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
22305757 TAATATTT
1 TAATATTT
22305765 CAATAGTCAT
Statistics
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TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
AATTGTTTTCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
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22304009 CTATTTGAAC
** * *
22304019 AATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
1 AATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
* * *
22304084 AGCTTATCTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTA
66 AGCTTATCTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAACTAGGAGATTTA
22304149 AAAAATAAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAGATAAAAAAT
131 AAAAATAAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAGATAAAAAAT
* * * *
22304193 AATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATAT
1 AATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAA
* * *
22304257 AAGCTTTAT-TCAGAATAAAATAATATTAA-TTTATTAGTATTTTAAAAATTAATG-ACTAGGAG
65 AAGC-TTATCT-AAAATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAACTAGGAG
*
22304319 ATTT-AAAAATAAATCCATTTA
126 ATTTAAAAAATAAATCAATTTA
22304340 CAGAAATAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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176 4 0.03
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.07, T:0.40
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AATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
AGCTTATCTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAACTAGGAGATTTA
AAAAATAAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAGATAAAAAAT
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Period size: 359 Copynumber: 1.9 Consensus size: 356
22304450 TCATACAAGT
*
22304460 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
1 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* *
22304525 AATAAATTTGTTTGCCAACCAATTCAAATAATAAGGCTATATGAATAATTATTAATTTCAAATCA
66 AATAAATTTGTTGGCCAACCAATTCAAATAATAAGGCTATATGAACAATTATTAATTTCAAATCA
* *** * * * * *
22304590 TTATAACTTTTTATTTTGTTGTAAAACAAATATTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTTAGAATAAAAT
131 TTATAACCTTTTATTTTGTCACAAAACAAATATTTCTATTCAAACAAGCTTATTTAGAATAAAAT
* *
22304655 AATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT
196 AATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAAGCTATTTACCAAAC
* * * * **
22304720 TAGTTCAATTATTTATAACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTACGACCATTTGTTTTG
261 AAGTTCAAATAGTTATAACGATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTACGACCATTTGTTTTG
22304785 TCATAAAACAATTGTTTCCATTAATATAGTC
326 TCATAAAACAATTGTTTCCATTAATATAGTC
* * * * * *
22304816 TTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAACG-GATTTAAA
1 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAA-GAGATTTAAA
* * * ** * * *
22304880 AAATGAATTTGTTGGCCTGACCAATTCAAATAATTACTGTTTGTTTGGACAATTATCT-ATTTCA
65 AAATAAATTTGTTGGCC-AACCAATTCAAATAA-TA-AGGCTATATGAACAATTAT-TAATTTCA
* * * * *
22304944 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAA
126 AATCATTATAACCTTTTATTTTGTCACAAAACAAATATTTCTATTCAAACAAGCTTATTTAG-AA
* * * * * *
22305008 TAACATAAT-TCTAATTTGTTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTGAAGCTGTTT
190 TAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAAGCTATTT
*** * *
22305072 ATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAAT
254 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACGATTTGAACAATTACCTATTTCAAAT
22305124 CACTAAACCT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
TTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
AATAAATTTGTTGGCCAACCAATTCAAATAATAAGGCTATATGAACAATTATTAATTTCAAATCA
TTATAACCTTTTATTTTGTCACAAAACAAATATTTCTATTCAAACAAGCTTATTTAGAATAAAAT
AATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAAGCTATTTACCAAAC
AAGTTCAAATAGTTATAACGATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTACGACCATTTGTTTTG
TCATAAAACAATTGTTTCCATTAATATAGTC
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Period size: 177 Copynumber: 4.1 Consensus size: 180
22304439 ATTATTTAAG
* * * * * * *
22304449 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAA
1 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA-GAA
* * ** * * * * * *
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65 -CGATTTAAAAAATGAAGCTGTTGGACTGAA-CAATTCAAATAATTACTGACTATTTGAACAATT
* * * * *** * * * *
22304575 A-TTAATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTTGTAAAACAAATATTTTTG
128 ACCT-ATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * **
22304628 TTCAAATAAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-A
1 TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAA
* * * * * ** * * * * * * *
22304691 -GAGTTAAAAAATAAATCTATT-TACCAAATTAGTTCAATTATTTA-TAACGATTTGAATAATTA
65 CGATTTAAAAAATGAAGCTGTTGGACTGAA-CAATTCAAATAATTACTGACTATTTGAACAATTA
** *** ** * * *
22304753 TTTATTTCAAATTGTTACGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCA
129 CCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * *
22304805 TTAATA-TAGTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTA
1 TTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-A
** * * ** * *
22304869 ACGGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAATTCAAATAATTACTGTTTGTTTGGACAATT
64 AC-GATTTAAAAAATGAAGCTGTTGGACTGAACAATTCAAATAATTACTGACTATTTGAACAATT
* * *
22304934 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
128 ACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* *
22304987 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAACA-TAATTCTAATTTGTTAATATTTTGAAAATTAATAAG-A
1 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAA-AGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAA
* * * *
22305050 -GATTTAAAAATTGAAGCTGTT-TATTGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTA
65 CGATTTAAAAAATGAAGCTGTTGGACTGAACAA-TTCAAATAATTACTGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * *
22305112 CCTATTTCAAATCACTA-AACCTTTTTTTTTGTCATAAAGGAATTTTTTTTTG
129 CCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAA-TTGTTTCTA
22305164 TTCATACAAGCTTATTT
1 TTCATACAAGCTTATTT
22305181 CAATTAGAAT
Statistics
Matches: 436, Mismatches: 100, Indels: 36
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
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176 32 0.07
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAC
GATTTAAAAAATGAAGCTGTTGGACTGAACAATTCAAATAATTACTGACTATTTGAACAATTACC
TATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
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22305256 GAGTAAGTTA
22305266 AAATAGTTATGACTATTTT
1 AAATAGTTATGACTATTTT
22305285 AAATAGTTATGACTATTT
1 AAATAGTTATGACTATTT
22305303 GAGCAATTAT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.05, G:0.11, T:0.46
Consensus pattern (19 bp):
AAATAGTTATGACTATTTT
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Period size: 200 Copynumber: 1.8 Consensus size: 193
22305075 GAACAAGTTC
*
22305085 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTAAACCTTTTTTTTTGTCATAAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTAAACCTTTTTTTATGTCATAAA
* *
22305150 GGAATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAATTAGAATAATAAAAATTTATTAATATTCAAA
66 AGAATTTCTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAATT--AA-AAT---AATTTATTAATATTCAAA
* *
22305215 CAATTAATAAGTAAA-ATATTTAGAAAATAAATTTGTTTACTGAGTAAGTTAAAATAGTTATGAC
125 CAATTAATAAGTAAAGAT-GTTA-AAAATAAATATGTTTACTGAGTAAGTTAAAATAGTTATGAC
22305279 TATTTT
188 TATTTT
* ** *
22305285 AAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATC-GTAATGA-CTTTTTGTTATGTCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTAA--ACCTTTTT-TTATGTCAT
* * ** ***
22305348 AAAATAA-TTCTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATTTATTAATATTTTGACAA
63 AAAAGAATTTCTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTTATTAATATTCAAACAA
22305412 TTAATAAGTAAAGATGTTAAAAATAAATATGTTTAC
128 TTAATAAGTAAAGATGTTAAAAATAAATATGTTTAC
22305448 CAAACAAGTT
Statistics
Matches: 143, Mismatches: 16, Indels: 15
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Matches are distributed among these distances:
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198 2 0.01
199 3 0.02
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201 14 0.10
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (193 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTAAACCTTTTTTTATGTCATAAA
AGAATTTCTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTTATTAATATTCAAACAATTA
ATAAGTAAAGATGTTAAAAATAAATATGTTTACTGAGTAAGTTAAAATAGTTATGACTATTTT
Found at i:22306252 original size:180 final size:180
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Period size: 180 Copynumber: 8.1 Consensus size: 180
22305756 TTAATATTTC
* ** * * * *
22305766 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAGAGA-TTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTA
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
22306008 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAGTAAACGTGTATGGATAGAAACAAT
66 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * *
22306073 TGTTTTATGACAAAACAAAGGATGATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTA
130 TGTTTTATGACAAAACAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
22306125 AATAGTCATAACTATTTAAACTCACTCGATAAACA-ATTTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTA
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* * * * * *
22306189 A-TTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGGTTTTTTCAACAAAAACAAT
66 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * *
22306253 TGGTTTATGATAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
130 TGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * *
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** * * * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *
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1 AATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAGATTT-TATTTTTTAAATCTTTTACT-TAT
** ** *** *
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64 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * * * * *
22306613 ATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGGTTTGAAGTAGATAATTATTCA
128 ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
22306667 AATAGTCATGACTATTTTAACTTATTTGGTAAAC--A-TATATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-
1 AATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * *
22306728 -TTGTCAAAATATTACTAGATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGGACAAAAATAAT
66 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * * *
22306792 TGTTTTATGGCAAAACAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTATTCA
130 TGTTTTATGACAAAAC--AAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
22306845 AACAGTCACAACAATTTAAACTTATTC-AGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 AATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGA-TAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * *
22306908 AATTGTCTT--AATATTCATAAATTTGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGAATGGACAAAAATA
65 AATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
** * * *** **
22306971 ATCATTTTATGAC-AAGCTAAAAGGTTATAGCAATTCCAAATCA-ATAATTGTTCA
128 ATTGTTTTATGACAAAAC--AAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCA
* * * * * *
22307025 AATAGTCATAATTATTTAAACTTATTTGATAAATAGA-TTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * ***
22307089 ATTTTTAGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTTATATGAA-TTGAACTAA
66 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC-AA
* * * *
22307153 TTTTTTTATGATAAAACAATAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCA
129 TTGTTTTATGACAAAACAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
*
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1 AATAGTCAT
22307215 GACTGTTTGA
Statistics
Matches: 1016, Mismatches: 210, Indels: 88
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
AATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
GTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
Found at i:22306582 original size:362 final size:359
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Period size: 362 Copynumber: 4.1 Consensus size: 359
22305756 TTAATATTTC
** * * *
22305766 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * *
22305827 TTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTAATATTTTATTGTGAATAA-TTTTGTATGAATATATACAAT
66 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTT-TATGAACAAAAACAAT
* * * * * * * *
22305891 TGTTTTACGATAAAATAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACT
129 TATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** * * * *
22305956 ATTTAAATTTATTCGGTAAATAGATTTTCTTTTTTGAATCTTTAACTTATTAATTTTTAAAATAT
194 ATTTAAACTTATTTGAAAAATATA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
* * * *
22306021 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAGTAAACGTGTATGGATAGAAAC-AATTGTTTTATGACA
258 TAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAG-AACTAATTGTTTTATGACA
* * *
22306085 AAACAAAGGATGATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTA
321 AAACAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA
* * * * *
22306125 AATAGTCATAACTATTTAAACTCACTCGATAAACA-ATTTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
22306189 A-TTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGGTTTTTTCAACAAAAACAAT
65 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAAT
** * * * *
22306253 TGGTTTATGATAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT
129 TATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * ** *
22306318 ATTTAAACGTGTTT-AAAAATATATTTATTTTTTTAAT-TTTTTCTTATTAATTTTTGGAACATT
194 ATTTAAACTTATTTGAAAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
*
22306381 AATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACTAATTGTTTTATGACAA
259 AATAAA-TTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTTATGACAA
* * * *
22306445 AATAGAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTTA
322 AACA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA
* * * * *
22306484 GATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-T
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACT-TAT
* ** ** *** *
22306548 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTAAAATAAGCTTACATGAATTGAAACC
63 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACA
* * * * * * * *
22306613 ATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGGTTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATGA
127 ATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* ** * * *
22306678 CTATTTTAACTTATTTGGTAAACATA--TATTTTTTAAATCTTTTACTTATT--TTGTCAAAATA
192 CTATTTAAACTTATTTGAAAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* * * * * * * *
22306739 TTACTAGATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGGACAAAAATAATTGTTTTATGGCA
257 TTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTTATGACA
*
22306804 AAACAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTATTCA
321 AAAC--AAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAAATAATTATTCA
* * * * * * *
22306845 AACAGTCACAACAATTTAAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * ** * *
22306910 TTGTCTT--AATATTCATAAATTTGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGAATGGACAAAAATAAT
66 TT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAAT
* * * * * * **
22306973 CATTTTATGA-CAAGCTAAAAGGTTATAGCAATTCCAAATCA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA
129 TATTTTATGATAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * *
22307036 TTATTTAAACTTATTTGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATA
192 CTATTTAAACTTATTTGAAAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* * * * * * *
22307101 TTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTTATATGAATTGAACTAATTTTTTTATGATA
257 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTTATGACA
*
22307166 AAACAATAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCA
321 AAACAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA
* * *
22307206 ACTAGTCATGACTGTTTGAAC
1 AATAGTCATAACTATTTGAAC
22307227 AAATTTATAT
Statistics
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Consensus pattern (359 bp):
AATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTA
TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTAAACTTATTTGAAAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
TAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTTATGACAAAACA
AAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA
Found at i:22306714 original size:541 final size:539
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Period size: 541 Copynumber: 2.6 Consensus size: 539
22305808 TTTTTAAATC
* * ** *
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* * * *
22305882 ATATAC-AATTGTTTTACGATAAAATAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAA
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* * * * * *
22305945 TGGACATGACTATTTAAATTTATTCGGTAAATAGATTT-TCTTTTTTGAATCT-TTAACTTATTA
126 TAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTAT-TTTTTTTAATCTCTT-ACTTATTA
** * * * * *
22306008 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAGTAAACGTGTATGGATAGAAACAAT
189 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-AAAATAAACTTATATGAATTGAAACAAT
* * * * *
22306073 TGTTTTATGACAAAAC-AAAGGATGATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAC
253 TATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGAC
* **
22306137 TATTTAAACTCACTCGATAAACAATTTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATT-TTGAAATAT
317 TATTTAAACTCACTCGATAAACAATTATATTTTT-AAATCTTTTACTTATT--TTGTCAAAATAT
* * * * *
22306201 TAATA-ACTTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGGTTTTTTCAACAAAAACAATTGGTTTATGAT
379 TAATAGA-TTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTTATGAC
** * * * * * **
22306264 AAAAC-AAATGGTTATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACG
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* * * * *
22306327 TGTTTA-AAAATATATTTATTTTTTTAAT-TTTT
506 TATTCAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* *
22306359 TCTTATTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATA
1 TCTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGAATGAATA
* * * * * *
22306424 GAACTAATTGTTTTATGACAAAATAGAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAG
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* ** * *
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129 TCATAACTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTTAA-TCTCTTACT-TATTAATT
* * *
22306553 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTAAAATAAGCTTACATGAATTGAAACCATTAT
192 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTAT
* * * * *
22306618 TTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGGTTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
256 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
* * * * * *
22306683 TTAACTTATTTGGTAAAC-A-TATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTTTGTCAAAATATTACTAG
321 TAAACTCACTCGATAAACAATTATA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTTTGTCAAAATATTAATAG
** * * *
22306746 ATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGGACAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAACAAA
385 ATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAA
* *
22306811 AAAGTCATAAGAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCACAACAATTTAAACTTATTCAGTA
450 AAAGTCATAAGAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCACAACAATTTAAACGTATTCAGAA
22306876 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
515 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * *
22306901 ACTTATTAATTGTCTT-AATATTCATAAATTTGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGAATGGACA
1 TCTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAATAAGCTTGAATGAATA
* ** ** * * * ** *
22306965 AAAATAATCATTTTATGACAAGCTAAAAGGTTATAGCAATTCCAAATCA-ATAATTGTTCAAATA
64 AAACTAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATA
* * * * *
22307029 GTCATAATTATTTAAACTTATTTGATAAATAGATTCA-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTT
128 GTCATAACTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
22307093 TTAGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTTATATGAATTG-AACTAATTTT
193 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAAAATAAACTTATATGAATTGAAAC-AATTAT
* * * *
22307157 TTTATGATAAAACAATAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAACTAGTCATGACT
256 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGACT
22307219 GTTTGAACAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (539 bp):
TCTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAATAAGCTTGAATGAATAAA
ACTAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
ATAACTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTAT
GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAAC
TCACTCGATAAACAATTATATTTTTAAATCTTTTACTTATTTTGTCAAAATATTAATAGATTAAT
ATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAAGTC
ATAAGAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCACAACAATTTAAACGTATTCAGAAAACAGA
TTTATTTTTTAAATCTTTT
Found at i:22308491 original size:20 final size:20
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Indices: 22308466--22308511 Score: 69
Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 20
22308456 TATTTTATTT
22308466 GAAACAATT-TTTTATGAATA
1 GAAACAATTGTTTTATG-ATA
22308486 GAAACAATTGTTTTATGATA
1 GAAACAATTGTTTTATGATA
22308506 -AAACAA
1 GAAACAA
22308512 AATGTCATAA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
19 6 0.24
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ACGTcount: A:0.48, C:0.07, G:0.11, T:0.35
Consensus pattern (20 bp):
GAAACAATTGTTTTATGATA
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Indices: 22307244--22312294 Score: 3349
Period size: 181 Copynumber: 28.2 Consensus size: 181
22307234 TATAAACAAA
* * * * *
22307244 TTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTAAAATAGTCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** * * * *
22307309 TGCACTGGTTCAACAAACAGAATTATTTTTTAAATC-TCTTACTAATTAATTTTTTA-AATAGTA
66 TGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAA-TTTTTAGAATATTA
* ** * * *
22307372 ATAAATTTA-TTTTATTTTATTTCAAATAAG-TTAGTAAGAACT-GAAAAAATTAT
129 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGT
* * * * * * * *
22307425 TTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AATAAAGAATTCTTCATATAGTCTTAGCTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * *
22307489 TGAAATGGTTCGGCAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TCCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAT
66 TGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* *** * * *
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* * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * *
22307670 TGAACTAATTCAAT-AATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
66 TGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * *
22307734 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-ATGACAAATAATTGT
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* * * * * * * *
22307785 TTTATGACAAAA-TAAAGTTAATAAAGACTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-GGCTAGAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTAT
** * *
22307848 TTGAAC-TGATTTGGTAAACTA-ATTTATGTTTTAAATC-TCTAACTTATTAATTTTTATAATAT
65 TTGAACTTG-TTCAGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTCT-ACTTATTAATTTTTAGAATAT
* * ** *
22307910 TAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGT
127 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGT
* * * *
22307965 TTTATGATAAAATAAAAGGTCAGT---GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * *
22308027 TTGAACTTCTTTGGTAAAAAGATTTA--TTTT-AAT-TTCTTACTTATTAATTTTCTA-AATGTT
65 TTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTT-TAGAATATT
* * * * * *
22308087 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAACATGTATG-ATCTGAAGCAATTAT
128 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGT
* * * * * * **
22308142 TTTATAACTAAACAAAATGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * * * * *
22308207 TGAACTAATTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TACTTATTAATGTTTATAATATTATT
66 TGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * *** * *
22308271 AATTTAGCAATATTTTACCCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATGT
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* * * * * * * *
22308322 TTTAGGATAGAA-GAAAGAT-ATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
22308385 TGAA-TTGGTT-AGGTAAAGAGATTTATTTTTTAAATC-T-T--TTATTAATTTTCAAAATATTA
66 TGAACTT-GTTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * ** *
22308444 ACAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAACAATTTTTTATGAATAGAAACAATTGT
129 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * * *
22308497 TTTATGATAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGCTAATAGTTCAAATGGACATGACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
22308562 TGAACTTGCTCAGTAAATAGATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
66 TGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * *
22308627 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTAT
131 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * *
22308678 TTTATGACAAAAC-AAAGAATCATAACGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
22308742 TTGAACTTGTTCGGTAAATAAACTTA-TTTTTAAAGTCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
65 TTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * *
22308805 ATAAATTAGCATTATTTTATTCTT-AATAAGGTTTTTTGAACAGAAACAATTGG
129 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
** * * * * *
22308858 TTTACAACAAAACAAGTA-GTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAACTAT
1 TTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** ** * * *
22308922 TTGAA-TGTGTGT-AAAAAATAGATTTATTTTAAAAAT-TTTTCCTTATTAATTTTT-GAAACAT
65 TTGAACT-TGT-TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAG-AATAT
* *
22308983 TAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGT
127 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGT
* * * *
22309038 TTTATAACAAAACAAAAGGTCAT-A-GTATTTTCAAATAGATAATTGTTCAGATAGTAATAACTA
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
22309101 TTTGAACTTGTTTAGTAAACATATATT-TTTTTTAATTC-TCTTGCTCT-TTAATTTTTGGAATA
64 TTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTTC-TACT-TATTAATTTTTAGAATA
* * ** ** *
22309163 ATAATAAATTAGTCTTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTGAAACAATTGT
126 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * * * * * *
22309219 TTTGTTACAGAACAGAAGGTCATAATGATTTGAAGTAAATAATTCTTCAAATAGTCATGACTATA
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * * *
22309284 T-AACTTGTTTGGT--A-AGCATTT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA
66 TGAACTTGTTCAGTAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * ** * ** *
22309344 TAAATTAATATTATGTTAATTCAAATAAACTCATATTGACA-A-AAATAATTGT
130 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGA-ATAGAAACAATTGT
* ** * * * *
22309396 TTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACGAT
1 TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
22309461 TTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTCT-TAATAT
65 TTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTTCTACTTATTAATTTT-TAGAATAT
* * * * * **
22309524 TAATAAATTTGTATTATCTTA-TTTGAAATAATCTTGTATGAACAGAAAAAATCAT
127 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * * * *
22309579 TTTATGATAAACCAAAAGGTTATAAC-ATTTCCAACTTGATAATTGTTC-AATGGTCATAATTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
22309642 CTAAACTTGTTCAGTAAATACATTCATTTTTTTAAATC-TCTTAATTATTAATTTTCAGAATATT
65 TTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * * *
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128 AATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * **
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
*
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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*** *
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* * * * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * **
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* * ** * * * * * *
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** * ** * * * *
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* * ** *
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* * ** * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** ** * ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** ** * * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * ** * * *
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* * * * ** ** * *
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128 AATAAATTAGTATTATTTTATT-TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * *
22312259 TTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
22312295 GGTTTGGCAA
Statistics
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * * * * ** * * *
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** ** * * *
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256 T-TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TT
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* * * * * *
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1 TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
22309461 TTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTCT-TAATAT
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* * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * *** * * *
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* * * * **
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* *
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* * * * * * *
22310241 AA-ATATTTCA-TTTTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAGAA-AATTGTTTT-T--G
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22310300 ACAAGATAAAATGTGATAACAATTTCAATTAGATAGTTGTTCATATA-GTCTTAACTATTTGAAC
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22310364 TGGTTCAACAAATAAATTAATATTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGAGT
253 TTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-AAT
* * ***
22310429 T-GTATTATTTTATTTCGTATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGT
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * **
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* * * ** * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* ** * * * *
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** * * *
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* ** * * *
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* ** ** * * * * **
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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320 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGT
** ** * * * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * *
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66 TGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
*** * * * * *
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130 T-AAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTATTTTATAAGACA
* * * *** * * *
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* * * * ** * * * * * *
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* ** ** * * **
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* * *
22312259 TTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
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22312295 GGTTTGGCAA
Statistics
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22312296 GTTTGGCAAG
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** * *
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* * * * ***
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* * *
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** * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * ***
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * * ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * * ***
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* * * * * *
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** * * *****
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* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * *
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* * ** * * * ***
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* * * * ****
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* ** ** *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * ** * * ** * *
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*** *
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* ** * * * *
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* * * *
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* *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * ** * *
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* * * ** * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * ** * *
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* * *
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* * * *
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* * ** * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * *
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* ** * * ** *
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* * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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46 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
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109 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCG
* *
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* * ** * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * *
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* ** * * * * * *
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129 AA-TAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCGA-TAAACAT
* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * * * * *
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* * *
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* *** * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * *
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124 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCGATAAACAT
* * * * * * * * *
22317126 ATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGACTATTATTAATTTAGCAATATTATA-C
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * *
22317189 TCTGAATAAGCTTGTCTAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAACA--TCATAATGA-TT
64 TC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTT
* * * * * * * * * *
22317251 GGAATTGGT--TCGAT-AAACAGAT-TTAACT-TTTAAATCTCTT--AT-TA-AT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAA-CTTTTCGATAAACAT
* ** * *** * * * * *
22317297 TTTTGAAATATTAAAAAATTAGCATTATT-TTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAGAAACAAT
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* * * * * * * * * * * * * * *
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22317471 T
179 T
* * * * *** * * * * *
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* ** * * * * * * *** *
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22317645 -T
178 AT
* * * *
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* * *
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131 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T-TTTCGATAAACAT
* ** *
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1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
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65 CG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * *
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128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTTTCGATAAACAT
* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * ** * * **
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64 TCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTG
* * * *
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128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TTTCGATAAACAT
* * *
22318171 ATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATT-ATTTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
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64 TCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** * * *
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCGATAAACAT
* * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** * * *
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** * * * * * * * *
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126 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCGATAAACAT
* * * * * **
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* * * * * *
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64 TCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * ** * *
22318662 AATAGATATTTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATTTAGTTTAG-CAAACAT
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TTTCGATAAACAT
* ** ** *
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1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * *
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66 -GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * *
22318836 GA-AAATAATTGCTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-GATAAACAA
130 -ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TTTCGATAAACAT
* * * * *
22318887 ATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTTTTAAGTTTTGAAATATTAATAGATTAGTA-T-CTTT-TTT-
1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * * ** *
22318945 -AACAAACGTATATGAACA-AATGCATTTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAATAACTTGAA
66 GAATAAGCTTGTATGAATAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * *
22319008 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTAGGTAAACAA
130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCGATAAACAT
* ** * * * *
22319059 AATTATTTTTTAAATCCCTCACATATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-T
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * * * *
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64 TC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * ** *
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128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTT--TTCGATAAACAT
** * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * * * *
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** * * * * * *
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130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-TTTCGATAAACAT
* ** * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** ** * * * * *
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65 CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * **
22319537 AATAGATTATTGTTGAAAT-GTCCATAATTATTTGCACTAATTT-GGTAAACGG
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* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * **
22319653 TGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAACAATTATTTTATGAAAAAATAAAAAGTCATAATAATTTGA
65 CGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * ** * * * * *
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCGA-TAAACAT
* * * * *
22319769 ATTTATTTTTAAAATTTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTA-TT
1 ATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * ** *
22319833 CTAAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTATTTTATAATAGAATAAAA-GTTATAATTATTTA
65 C-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
** * * * *
22319896 AAATAGATAATTGTTCGGATAG---GAAC------AA-GTTT-GGTAAACAG
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTCGATAAACAT
** *
22319937 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
22320002 TGAATAGGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAA
65 CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * *
22320066 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTT-GATAAAC-T
130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TTTCGATAAACAT
* * * * * ** *
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1 -ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * *** *
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* * * *
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCGATAAACAT
* *
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1 ATTTATTTTTT-AAATTT-TTACT-TATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * ** * * *
22320361 TTTCAAATAAGCATGTATGAACTA-AAAAAATTAATTTATGACTAAACAAAAAGTAATAACGATT
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* * * *
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126 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT--TTCGA-TAAACAT
* * *** ** *
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1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * * * * * *
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64 TCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
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129 AA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTTTCGATAAACAT
* * * * * *** * * * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTA--ATT-TTTGAAATATTAATAA--AT-TAGTATTATTT
* * * * ** *
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* * * * * * * *
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*** *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * ** *
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* * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * ** * * * * *
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** * * *
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* *
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1 ATTTATTTTTTAAATTT--TTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
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* * * * *
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*
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * **
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* * * ** * * *
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* *
22321715 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTGTCTT--AATTTTAATAAATTTA-TATTATTTTA
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
* * ** * * * **
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
** * * * * * *
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63 TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
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* * * *
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1 ATTTATTTTTT-AAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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1 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTT
* * * * * * * * ** * * *
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65 CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * *
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCGATAAACAT
* * * * * *
22322427 AATTATATTTTAAATCTCTTACATATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * *** * *
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* *
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT-TTTCGATAAACAT
* * * * *
22322599 AAATTTATTTTTTATATCTCTTT-GTTATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTA
1 --ATTTATTTTTTAAAT-T-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * *
22322663 TTTCGAATAAACTTATATGAACAG-AATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGTTTT
62 TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
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127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TTTCGATAAACAT
* * * * *
22322781 ATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATCTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT--TTTCGATAAACAT
* ** *
22322962 ATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
22323026 TTGAATAAACTTGTACGAACTA-AAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTT
64 TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * *
22323090 CAATAGACAATTGTTAAAATAGTGATAACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-AA
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCGATAAACAT
* * * * * *
22323142 AATTATTTTTTTAAACTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATGTTATTT
1 ATTTA-TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
22323207 TGGATAAGTTTTTATGTACTA-AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTA
65 CGAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
22323271 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAATTTGTTTGGTAAATAG
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCGATAAACAT
* * * * *
22323323 ATTTATTTTTTGAAATGTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGACTATTTTAT
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* * * * * * * ** *
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* * *
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* *
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* * * *
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130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCGATAAACAT
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
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1 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
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* * * *
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1 ATTTA-TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT--TTCGATAAACAT
* * *
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1 ATT-TATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
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* *
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* * * **
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** * * * * * * * **
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* * * * * ** * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * *
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*** * * * * *
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* * ** * ** * *
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** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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435 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAA-A-ATAATTG
*
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* * * *
22317795 AT-GTTTAGA-AAAC-ATTCTATTTTTTAAATTCATACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT
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* * * * *
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** * * *
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* * *
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* ** * *
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* * *
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300 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTAGTTTGGCAAACAAATTTATT
* *
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* * *
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* **
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** * * * * * *
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* *
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* ** ** * * * *
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* * * * *
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180 TAAACAAAATT-ATTTTTTAATTCTCTTACA-TATTAATTTTGGAAATATTAATAAATT-ATATT
* * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* *
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*
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*
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* *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * ** * * * * *
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*
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** * *
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* * * *
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* * * * * * * * ** * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * * *** * *
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300 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTAGTTTGGCAAACAAATTTATT
* * * * * * * *
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* * * * * **
22319839 AAGCTTATATGAACTA-AAACAATTATTTTATAATAGAA-TAAAAGTTATAATTATTT-AAAATA
428 AAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAA-A
* ** *
22319901 GATAATTGTTCGGATAG---GAAC------AA-
491 -ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
22319924 --GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-T
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** * * *
22319986 TAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
61 TAGTATTA--TT-TTTTGAA-AAACGTATATGA-ACAAATC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * *
22320050 TTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACT-GATTTGATAAA
120 GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAG-TTAGGTAAA
** * * * * * * * **
22320114 CTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTATTAAAGCAATATTATTTTA
184 CAAAATTATTTTTTAATTCTCTTACATATTAATTTTGGAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTA
** * * * * * *
22320179 TTTTGCATAAACTTTTATGAATTGAAACAATTGTTGTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTT
248 -TTTAAATAAGC-TATATGAATTGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAA----A-A-TGATTT
* * * * ** *
22320244 TAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTA-TTCT-ATAAACAGATTTATTTT
304 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT-AAATTAGTT-TGGCAAACAAATTTATTTT
* * ** *
22320307 TTAAAAT-TTCTTA-TGTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGCATTATTTT-ATTTCAAA
367 TT-AAATCTT-TTACT-TATTAA-TTTTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAA
* * * ** * * * *
22320368 TAAGCATGTATGAACTA-AAAAAATTAATTTATGACTAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATA
427 TAAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA-A
* * * * * *
22320432 GATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATATGAAT
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* * * *
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TTATTTTTTGAAAAACGTATATGAACAAATCATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAAT
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AC
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* * * *
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* * * * * * *
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* *
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
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** * *
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** * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* ** ** * * * * *
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*
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* * * * * * * *
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1 AATAATTTTTATGAATAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
* * * *
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* * *
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*** * * ** * * * *
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* **
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** * * * * *
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1 AATAA---T-TTTTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAA
* * * * * * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * *
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* * ** * * ** * ** *
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1 -AATAA-TTTTTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA
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* ** * * * * * * *
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* * * ** * * ** * *
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* ***
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* * * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 AATAA-TTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * *
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64 AAATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AAATTGTTC-GAAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * **
22325252 ATAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTA-TATTTTATAATAAA
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* * ** ** * * * ** * * * **
22325295 ACAAAAGCTCATAACAACTTCAAATAGTTAGAATGATTGTTCAAAA-AGTTAAATCTTTTTGAAC
1 A-ATAA-TTTTTATGAA--TAAAACAATT-GTTTTA-TG-ACAAAACA---AAAT-GTCAT-AA-
** * * * * * * * *
22325359 TTTTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAT-CTCTTG-CTCA-TT-AATTTTTCG---A-ATGT
53 TGATTT-G-AAATA-A-ATAATTGTTCAAATAGTCATGACT-ATTTAAATTGTTCGAAAACATAT
* *** * * * * * *
22325416 TAATAAATTAATATCTTTT--TT-TCTAA--ATAAGCTTATATGAACTAAAATA--ATTACTTTA
113 TTATTTTTTAA-ATCTTTTACTTAT-TAATTTTTAG--AATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * *** * *** * **
22325474 -T-GACTAA-A-TAAAAG-GTCA-AAACAATT-TAAAATAGATAATTGTTTTAATAG-TCTTAAC
173 TTCGAATAAGATTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTAT-GACAA----AAAAAAAGATAATAAC
* * * * * * * * *
22325531 TACTTGAACT-AGT--TT-AGCAAA-GAT-ATTTA-TTTTTTAAA-TCTC--T-TAC---TT-A-
232 GACTTGAAATAAATAATTAATCAAATAATCA-TAACTATTTAAAATTCTCAATAAACAGATTCAT
** * * * * ** *
22325580 --TT--AAT-TTTT--GGAAT-ATTATT--AA-ATTAGTATTATT-GTA--ATTCGAAT---
296 TTTTCAAATCTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCCA
** * * * * *
22325625 AA--GCTTGTATGAA-AAGGAACAATTATTTTATGACAAAA-TAAA-GATCATAA-CATTTTGAG
1 AATAATTTTTATGAATAA--AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGA-TTTGAA
* * * * *
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124 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGATTGTA
* * * * * * * * * * *
22325809 TGAACT-GTAACAATTATTTTATG-TAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAA-TAGT
189 TGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTA-A
* * * * * * * * * * *
22325871 TCAAATGGA-CATCACTATTTGAAGTTGTTCAGTAAAAAGATTTC-TTTTTTAAATCTCTAACTT
252 TCAAAT-AATCATAACTATTTAAAATT-CTCAATAAACAGA-TTCATTTTTCAAATCTTTTACTC
* *
22325934 ATTAATTTTT-AGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
314 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * * *
22325977 AATAAAATTATATGAATAGAAACTATTGTTTTATGATAAAA-AAAA-GATCATAACGATTTGAAA
1 AAT-AATTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAA
** * * * * * * *
22326040 TAAATAATTGTTCAAATAGTCACAATTATTTGAACTCGCTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAT
63 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AAATTGTTCGA-AAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
22326105 ATTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCTGGATAAGCTTTTAT
126 CTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGATTGTAT
* ** ** * * * * * *
22326169 GAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAACCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
190 GAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTAATCA
* ** * * * *
22326234 AATAGTCATAACTATTTGAACGTGT-TCAGA-AAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATT
255 AATAATCATAACTATTT-AAAAT-TCTCA-ATAAACAGATTCATTTTTCAAATCTTTTACTCATT
* * **
22326296 AATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTTTATTTGA
317 AATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCA
* ** * * * *
22326336 AATAAGCTTGCATGAACAGAACCAATTGTCTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAAT
1 AATAA-TTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * *
22326401 AGATAATTGTTCAAATA-TTATTACTATTTGAACATCT-TTGGTAAAGAGATTCATTTTTTAATT
64 AAATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AA-AT-TGTTCGAAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
22326464 CTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATAT
126 CTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGATTGTAT
* * * * *** * * *
22326529 GAATGGAAACAATTGTTTTATTG-CAAAACAAAAGGTCGCAATGATTTGAAATAGATAATT-ATA
190 GAATAGAAACAATTATTTTA-TGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTAAT-
* * * * * * * * *
22326592 CAAATAGTCATGACTATTT-AAA--CTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACTTATT
253 CAAATAATCATAACTATTTAAAATTCTCAATAAACAGATTCA-TTTTTCAAATCTTTTACTCATT
* * * *
22326654 -ATTTGTAGTAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCA
317 AATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * *
22326694 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATAATTTAAAAT
1 AATAA-TTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* ** * * ** *
22326759 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTTAGTGAACATATTTATTTCTTAAATC
64 AAATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AAATTG-TTCGAAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * *
22326824 TTTTACTTATTAATTGCCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTTTTTTTATTTGAAATAAGGTTG
127 TTTTACTTATTAATT--TTTAGAATATTAATAAA-TTAGTA-TTATTTTATTCG-AATAAGATTG
* * * * * * * * * * * * *
22326886 TATGAACAAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATATATAATTG
187 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTA
* * * * * * * * * *
22326951 TTC-AATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
251 ATCAAATAATCATAACTATTTAAAATT-CTCAATAAACAGATTCATTTTTCAAATCTTTTACTCA
* * ***
22327015 TTAATTTTTTG-AATATTAATAACTTAGTATTATTTTGTTTTG
315 TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * * **
22327057 AATAATTTTATATTAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAA
1 AATAATTTT-TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAA
* * * *
22327121 TAGATATTTAG-TCAAATAGTCATGACTATTT-GATCTAGTTCGATAAGCATATTTATTTTTTAA
63 TAAATAATT-GTTCAAATAGTCATGACTATTTAAAT-T-GTTCGA-AAACATATTTATTTTTTAA
* * * * * * * *
22327184 ATTTTTTACTTATTAATTGTT-GAAATTTTACTAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTT
124 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGATTG
* * * * * * *
22327248 TATGAACATAAACTATTGTTTTATAACAAAAAAAAATCATAAT-A--ATTTGAAATAAATAATTA
187 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAA-GATAATAACGACTTGAAATAAATAATTA
* * * * * ** * * *
22327310 CTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TTGATAAATAGATTTAATTTTT-AAATGC---CA-
251 ATCAAATAATCATAACTATTTAAAAT--TCTCAATAAACAGA-TTCATTTTTCAAAT-CTTTTAC
* **
22327369 T-ATTAA-TTTTGAAATATTAATAGATTAGTATT-TTTTATTTAAA
312 TCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCA
* * * * * *
22327412 AAAAACTTATATGAACAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAACGATTTGAAAT
1 AATAATTTTTATGAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * ** **
22327476 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAA-ATA-GAATTTTTTAAAAAT
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* * * *
22327539 CTTTTACATATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTACTCCAAATAAG-TTAG
126 CTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGATT-G
* * * * * * * *
22327601 TATAAATTGAAA-ATATTGTTTTATG--ATAAAACAA-A-AAT---GATTTGAAATAGATAATTG
187 TATGAATAGAAACA-ATTATTTTATGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTA
* * * * * * * * * *
22327658 TTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAA-T-TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
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* * * * ***
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* * * * * * * * * * * *
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* * * *
22327829 TATACAATTGTTC-AA-A-T-A--ACTATTTAAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
63 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAA-TTGTTC-GAAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * * * *
22327888 CTCTTACTTATTAA-TATTGGACTAATTAATAAATTAGTATCACTTTATTCCAA-ATGAATT-TG
126 CTTTTACTTATTAATTTTTAGAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAG-ATTGTA
* * * * * * * * * * * * * *
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189 TG-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTAAT
* ** * ** * * ** *
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* * * ***
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* * * * * * * * * * ** **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* ** * * * * * * * *
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* * ** ** * * * *
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* * * ** * *
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* * ** ** * * * ** * *
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* * * ** * * * * *
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* * ***
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317 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
** * * * ** *
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* ** * * * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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126 CTT-TTACTTATTAATTTTTA-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-ATAAGATTG
* * *** * * * * * * * *
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* ** * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ***
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* ** * ** * * * * * * * * * *
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190 -GAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGATAATAACGACTTGAAATAAATAATTAATC
* * * ** * ** *** ** * * * * *
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* ** **
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* *** * * * * * *
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1 AAT-AATTTTTATGAATAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *** * *
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* * * * * *
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* * * **
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*
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* *** * * *
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** ** * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * *
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** ** * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * **
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*
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* * * *
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** * ** **
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* * * * *
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*** * * * *
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** * * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGA-ATAA-AATAATACTAATTTATTAAAA
* * *
22332485 TTTTCAAAAATTTACAAGTAACAGATTTA
127 TTTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
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TAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTT
AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
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AATAATTATACTATTTG
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** * * * * *
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* * * * * * *
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65 TAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *** *
22330872 CAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GGGCAAGTTCAAATAGTTA
129 C-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAACCAA-TTCAAATAATTA
* * * * *
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* * * * *
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256 TTTTTCA-ACATACAAGTTTATTT-GAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
** *
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* ** * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTGTTTT-GTC
* * * * *
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64 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** *
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128 TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATC-TGTTTAAC-AAACCAA-TTCAAATA-
* ** * * * * *
22331296 ATT-TTACTATTTGAATAATTTATCAATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACA
188 ATTATGACTATTTGAATAA-TTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** ** * * *
22331360 A-T-TAATTCAATTCATGA-AAACTTATCTGAAATAAAATAATACCATTTTATTAATATTTTAAA
252 ATTGTTTTTCAA--CAT-ACAAGTTTATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
* * * *
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313 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA-ATGTATTTACCAA-C-G
* * * ** ** * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
22331533 TAAAACAATTGA-TTT-GATCATATAAGCTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
65 TAAAACAATT-ATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * *
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128 TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAACCAATTCAAATAATTAT
* * * * * * *
22331657 GACTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCATT-TTGATCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTG-
193 GACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
22331720 --TTCAATTCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAA
257 TTTTCAA--CATACAAGTTTATTT-GAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* *
22331783 TAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAA-G
319 TAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTATTTACCAACG
* * *
22331821 TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCTTAATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
22331886 TAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGTTTATCCACAATTAAATAATACTACTTTATTAATATTT
65 TAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** ** *
22331951 CAAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATCAATTTAACAAATTAATTCGAATAATTATG
129 CAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAACCAATTCAAATAATTATG
* * * * *
22332016 ACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTGTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTT
194 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
22332081 TTCAACATACAAGTTTATTTGAAAAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTTAAGAATTAAT-A-T
259 TTCAACATACAAGTTTATTTGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * *
22332144 --GAGATTTAAAAAATAACTTTGTTTACTGAACTGG
324 AAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTAC-CAAC--G
* * * * *
22332178 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTTTAACCTTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
22332243 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTT
65 TAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
*** * * * *
22332308 TGGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTT-GCTGAACCAATTGAAATAATTA
129 CAAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAACCAATTCAAATAATTA
* * * * * *
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192 TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
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257 TTT-TCAACATACAAGTTTATTTGAA-AAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * *
22332499 CAAGTAACAGATTT-ATAAATAATTTTATTTACCAAACCAG
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACC-AA-C-G
* * *
22332539 TTC--A-A---AT-A--A-TTG------TAACTATTTCAAATCATTATGGCC-TTT-TTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
22332586 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TT
65 TAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
22332650 CTGAGAATAAATGAGTAAGATAATTAAAAAA-AGAATC--TTT----------TGC-------TA
129 C-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTAACAAACCAATTCAAATAATTA
* * * * * * * *
22332695 TGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGG
192 TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
22332760 TTTTGATCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAGAAATTCAA
257 TTTTCAACATACAAGTTTA-TTTGAAAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATT-AA
* * * ***
22332824 -AAGTAA-AAATTAAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACATG
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTA-TTTACCAAC--G
* * * *
22332863 TTTAAATAG-T-T-A-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * *
22332924 TAAGCCATTTATTTCT-GTTCATACAATCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTATT--TATT
65 TAAAACAATTATTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** * * *
22332986 CCACAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAGCGAGTTCAAATAATTA
128 TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAACAAACCAATTCAAATAATTA
* * * * * *
22333051 TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTTTCATAAAACAAATGT
192 TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
22333116 TTCT-ATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTAT-AAAATTAAT
257 TTTTCA-ACATACAAGTTTATTT-GAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* *
22333179 GAGT-TGAAGATTT-----AT---TG-A---A-CAA-G
320 AAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAACG
** * * * *
22333202 TTCAAATAGCCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
22333267 GAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTATTTTAGTTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
22333331 TC--AAA--AAT---TAAGATACTTAAAAATTAAATCTATTT-ACAGATCCAATTTAAATAGTTA
128 TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACA-AACCAATTCAAATAATTA
* * * * * * * * * *
22333388 TGAATATATGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAACTTTTTTTTTATCGTAAAAGAAATGT
192 TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
22333453 TTT
257 TTT
22333456 GTTCATAATA
Statistics
Matches: 1837, Mismatches: 383, Indels: 287
0.73 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
322 1 0.00
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326 1 0.00
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Consensus pattern (356 bp):
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AAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAACCAATTCAAATAATTATGAC
TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
CAACATACAAGTTTATTTGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
GAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAACG
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* * * * * *
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* * * * *
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** *
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* **
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*
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* *
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* * * * **
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1 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACATTT
* *
22333114 GTTTCTATTCATACAAGT-TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTCTTA-A-T------ATT--
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** ** * * * *
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* * * * * * *
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1 -TATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAT
* ** * *
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* * * * * * *
22333340 ---AAG--ATACTT-AAAAATTAAATCTATTTACA-GATCCAATTTAAAT-AG
126 CAAAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTA-ATGAACGAGTTCAAATAAG
* * * * * * * * **
22333385 TTATGAATATATGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAACTTTTTTTTTATCGTAAAAGAAA
1 -TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACATT
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64 TGTTTCTGTTCATA
22333463 ATAAAATATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
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TTTCTGTTCATACAATCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTATATTCCACAAATTCAAAA
GTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAACGAGTTCAAATAAG
Found at i:22333145 original size:180 final size:176
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Indices: 22332693--22333462 Score: 507
Period size: 176 Copynumber: 4.4 Consensus size: 176
22332683 AATCTTTTGC
* * * * * *
22332693 TATGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
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* * *
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** *
22332820 TCAAAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACATGTTTAAATAG
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* ** *
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1 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *
22332934 ATTTCTGTTCATACAA-TCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTATT-TATTCCACAAATT-A
65 GTTTCTATTCATACAAGT-TTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTATATTCCACAAATTCA
* *
22332996 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAGCGA-GTTCAAATAAT
128 A-AAGTAAAA-A-TTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAAC-ATGTTCAAAT-AG
* * * * *
22333049 TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTTTCATAAAACAAAT
1 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
*
22333114 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTCTTA-A-T------ATT---
65 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTATATTCCACAAATTCAA
** ** * * * *
22333168 -A-T-AAAATTAATGAGTTGAA--GATTTATTGAACAAGTTCAAATAG
129 AAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAACATGTTCAAATAG
* * * * * *
22333211 CCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAGAAAATAA
1 -TATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * *
22333275 TTGTTTTTGTTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
63 TTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATT-ATATTCCACAAATT
* * * *
22333340 ---AAG--ATACTT-AAAAATTAAATCTATTTACA-GATCCAAT-TT-AAATAG
126 CAAAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTA-ATGA-AC-ATGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
22333385 TTATGAATATATGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAACTTTTTTTTTATCGTAAAAGAAA
1 -TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
*
22333450 TGTTT-TGTTCATA
64 TGTTTCTATTCATA
22333463 ATAAAATATA
Statistics
Matches: 471, Mismatches: 80, Indels: 86
0.74 0.13 0.14
Matches are distributed among these distances:
162 3 0.01
163 110 0.23
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165 9 0.02
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172 9 0.02
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GTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAACATGTTCAAATAG
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22332002 TTCGAATAAT
* * * * * *
22332012 TATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTGTGTTTTGTCATAAAACATTT
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* * * * *
22332077 GTTTTTCAACATACAAGTTTATTTGAAAAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTTAAGAATTAAT
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* * * * * *
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131 ATAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
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* **** *
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261 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTCCACAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAA
* ** *
22332337 AATAAATCTGTTTGCTGAACCAATTGAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAAT
326 AATAAATCTATTTAATGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAAT
* *
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391 TGTTATGAGCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATATTTTAGCTCATACAAGTTTATTCAACAAAGA
* * * * * **
22332467 ATAAAACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTTACAAGTAACAGATTTATAAATAATTTTATTTACC
456 ATAAAACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAACAAGTAACAGATTTATAAACAAGTTCAAATACC
* *
22332532 AAACCAGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTTTTGTAATAAAACAATTG
521 AAACCAGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTGTAAGAAAACAATTG
* ** * *
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586 TTTTAGTTCATACAAAATTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAGAATAAAT
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651 GAGTAAGATAATTAAAAAAAGAATCTTTTGC
* * * *
22332693 TATGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
1 TATGACTATATAAACAACTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTGTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *
22332758 GGTTTTGATCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCT-AGAAATT
66 GGTTTTCAACATACAAGCTTA-TTTGAAAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAG-AATT
** *
22332821 CAAAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACAT-GTTTAAATAG-T-T-A-TATTTG
128 -AAAA-T-AAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC-TGGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** *
22332881 AATAATTATCTATTTCAAA-TC-GTTACGACATTTTGTTTTGTCATAAGCCATTTATTTCT-GTT
189 AACAATTATCTATTTCAAATTCTGTTA--ACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTT-TAGTT
* * ** *
22332943 CATACAATCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTA-T-TTATTCCACAAATTAATAAGTAAAA
251 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTCCACAAATTAATAACTAAAA
* * * * *
22333006 GATTTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAGCGAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATT
316 GATTTAAAAAAATAAATCTATTTAATGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATT
* * * *
22333071 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTTTCATAAAACAAATGTTTCTA-TTCATACAAGTTTA
381 TATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATATTT-TAGCTCATACAAGTTTA
* * * ** * *
22333135 TTTAGA-ATAA-AATAATACTAATTTCTTAATATT-ATAAAATTAATGAGTTGA-AGATTTATTG
445 TTCA-ACA-AAGAATAAAACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAACAAG-TAACAGATTTA-TA
** * * * * *
22333196 AACAAGTTCAAATAGCCATGTCCATTTGAACT-A-T-TATCTATTTCAAATCATTATGACATTTT
505 AACAAGTTCAAATA-CCA-AACCAGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAAATCATTATGAC-CTTT
* * *
22333258 GTTTTGTCAGAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAAATTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTT
567 -TTTTGTAAGAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAAATTATTTA-AAGTAAAATAATACTAATTT
22333322 ATTAATATT
630 ATTAATATT
22333331 TCAAAAATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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686 1 0.00
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TATGACTATATAAACAACTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTGTGTTTTGTCATAAAACAATT
GGTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAGAATTAAA
ATAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
ATCTATTTCAAATTCTGTTAACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCT
TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTCCACAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAA
AATAAATCTATTTAATGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAAT
TGTTATGAGCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATATTTTAGCTCATACAAGTTTATTCAACAAAGA
ATAAAACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAACAAGTAACAGATTTATAAACAAGTTCAAATACC
AAACCAGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTGTAAGAAAACAATTG
TTTTAGTTCATACAAAATTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAGAATAAAT
GAGTAAGATAATTAAAAAAAGAATCTTTTGC
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*
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1 TTTGAAATAG-CATAACTA
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1 TTTGAA
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Statistics
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TTTGAAATAGCATAACTA
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*
22333940 ATAATTATTTGAA-TAGTC
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1 ATAACTATTTGAACTAGT
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Statistics
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ATAACTATTTGAACTAGTC
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22334015 AATTAGTATT
* *
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* *
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1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAGGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAGATGAAAGGAAATA
*
22334156 ATG
66 ACG
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1 ATTT
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ACG
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* * * ** *
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1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTATTTTATGACAAA-ACAAAAGGTTA
* * * * *
22334154 TAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAAGTATTTGAACTAATTTCG-TAAACTA
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* * * *
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* * * * * *
22334264 ATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAA-GTTCATA
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* * * * * *
22334328 ATGATTCTAAATAGATAATTGTTGAAATAATCATAACTATTTGAAC-ATGTTCGGTAAACAGATT
65 ATGATT-TAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTA-GTTCGATAAACACATT
* ** * *
22334392 TATTTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
128 TATTTTTTAAAATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * *
22334442 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTAGGACTAAACAAAAGGTTAAAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * *
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66 TGATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACACATTTA
* *
22334572 TTTTTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAATATT
130 TTTTTTAAAA-TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
* *
22334623 ATTTT-TATTCGAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAACTT-TTTTATGACAAAACAAATA--TC
1 ATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTT
** * * * * * * *
22334683 ATAATGATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGT-TGCAACTATTTGAATTAGTTCAAAAAATAG
62 ATAATGATTTAA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-
* * * * * * * *
22334747 C-TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATCTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT
124 CATTTATTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * *
22334803 ATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * * * * * *
22334868 TGATTTTAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATAGATATAT
66 TGATTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACACATTTA-
** *
22334933 TTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTCTAATGTTAATAAA-TAAGTATT
130 TTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAA-TATT
* * * * *
22334984 ATTTTATTTCGCATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGGTTAGAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
** * * * * *
22335048 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTTAACTATTTGAATTGGTTTGACAAAACACATT
66 TGATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-TTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACACATT
22335113 TATTTTTTA
128 TATTTTTTA
22335122 TTATTAAATT
Statistics
Matches: 688, Mismatches: 127, Indels: 77
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Matches are distributed among these distances:
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170 6 0.01
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ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
TGATTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACACATTTAT
TTTTTAAAATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
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* * * * ** *
22334092 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAGATGAAAGGTAATA
1 TTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATT-TTTTATGACAAA-A-CAAAAATCATA
* * * * * *
22334156 ATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAAGTATTTGAACTAATTTCG--TAAACTA-
61 ATGATTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAA-TTAGTTCGAAAAAAC-AG
* * *
22334217 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT--CA-A--AAT--A-TAGTACTATTTTATTTT
123 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * *
22334274 GGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGTTCATAATGATTCTAAA
188 GGATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TAAA
* * * * * *
22334339 TAGATAATTGTTGAAATAATCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA
251 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATATA-TTTTTTAAA
** * *
22334404 --TC-T-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA
315 TCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
* * * * *
22334465 TGAATTGAAACAATTATTTTAGGACTAAACAAAAGGTTAAAATGGTTTGAAATAAATAATTATTC
380 TGAA-TGAAACAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * **
22334530 CAATAGTCT-TAACCATTTGAACTAATTCGATAAACACATTTATTTTTTAAAACTTTTACTTATT
443 AAATAGTCTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACA-ATTTATTTTTTAAAACTTTTACTTATT
*
22334594 AATTTTTAAAATATTATTAAATTAATATTAT
507 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTAT
* *
22334625 TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAACTTTTTTATGACAAAACAAATATCATAATGA
1 TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTTTTTATGACAAAACAAAAATCATAATGA
* * * *** * * *
22334690 TTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTTGCAACTATTTGAATTAGTTC-AAAAAATAGCTTTAGT
65 TTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGAAAAAACAGATTTATT
* * *
22334754 TTTTAAATCTCTTGCTTAATAATCTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAA
130 TTTTAAATCTCTTACTTAATAAT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAA
* * * *
22334819 GTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAATAAATAA
194 GCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAATAGATAA
* * * *
22334884 TTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATAGATATATTTTTTTAAATATCTTA
258 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATATA-TTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
22334949 CTTATTAATTTTTCTAATGTTAATAAATAAGTATTATTTTATTTCGCATAAGTTTGTATGAACTG
322 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * *
22335014 AAATAATTATTTTATGACTAAACAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTC
386 AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
22335079 TTTAACTATTTGAA-TTG---G-T------TTGA-----CAAAAC----AC--ATTTATTTTT--
451 TATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAATTTATTTTTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTTAA
* *
22335120 --TATTATTAAATTAGTATTAT
516 AATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * * * * * *
22335140 CTTAATCCGAATAAGCTTATATGAGGAAAAAAACAATTGTTCTATGACAAAATAAAGATCATAAT
1 TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGA--ATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAATCATAAT
* * * * **
22335205 GATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TAGTAAACAGATTTA
63 GATTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGAAAAAACAGATTTA
* ** * *
22335269 TTTTTTAAATCTCTTA-TCAAT--TTTCAAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATA
128 TTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATA
* * * * * *
22335331 A-TTCTATATGAATAGAAGCTATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGA
193 AGCT-TGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-AAATAGA
* * * *
22335395 TAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCC
255 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATATATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * *
22335460 TACCTATTACTTTTCCAAAATATCAATAAATTAGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGAATGAA
320 TACTTATTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * * ** *
22335525 TATAAACAACTATTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATATGTATTTGTTC-AAT
384 T-GAAACAATTATTTTATGACTAAA-CAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
22335589 AAAT-TATAACTATTTGAGCTTGCTCGATAAATAAATGTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
447 -AGTCTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAA-CAATTTATTTTTTAAAACTTTTACTTATTAAT
*
22335653 TTTTAAAATATTAATAAACTAATATTA-
510 TTTTAAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * * *
22335680 TTTTATTTTGAATAAGTTTCTATGACTAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGCTCATAG
1 TTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAA--TCATAA
* * * * * *
22335745 TTATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--CGTGTCTAGAAAACAAAT
62 TGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGT-TCGAAAAAACAGAT
* * * *
22335807 TTATTTTTTAAATTTC-AACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTT
125 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAA-TTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTT
* *
22335869 GGAATAAGCTTGTATGAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-CTATAACGATTTGAA
188 GG-ATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTT-AA
*
22335933 ATAGATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT-TCATTTTTTAA
250 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATAT-ATTTTTTAA
* * * * *
22335997 ATCTCTTACTCT-TTAATTTTT-AGAATATTAATAGATTTGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCCT
314 ATCTCTTACT-TATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* ** * * * * *
22336060 ATATGAACTGGTACAATCATTTTAT-AATGAAACAAAAGTTCATAGCTG-TTTGAAATAGATAAT
377 GTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAGGTT-ATAAC-GATTTGAAATAAATAAT
* * * *
22336123 TATTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTA-TTTTAAAAATCATTTA
438 TGTTCAAATAGTCTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACA-ATTTATTTTTTAAAA-CTTTTA
* *
22336186 GTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTAT
501 CTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * *
22336223 TTTAATCCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATG
1 TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAA-TCATAATG
* * * ** *
22336288 ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTA-TTCG-GTAAACATATTTA
64 ATTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCGAAAAAACAGATTTA
* * * * * * * * ***
22336351 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAATTTTGTATTATTTTATCTAAAAT
128 TTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGAT
* * * * ** *
22336416 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTAAATTTGA
192 AAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAA-TAGA
* * * *
22336481 TAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTGAACAGA-ACCA-TTTTTAAATCTC
255 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATA-TATTTTTTAAATCTC
* * * *
22336544 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TAATTATGTTATTACAAATAAGCTTGTATGA
319 TTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA
* * ** *
22336608 ATAGAAACAATTGTTTTGTGA-TAAAACAAAATATTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
383 AT-GAAACAATTATTTTATGACT-AAAC-AAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
* * * * * * * **
22336672 ATGGTC-ACAACTATTTGCA-TTGGTC-ATGCTAACAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATT
445 ATAGTCTATAACTATTTGAACTTGTTCGAT--AAACA-ATTTATTTTTTAAAACTTTTACTTATT
* **
22336734 AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA-
507 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * *
22336764 CTTTATTCTGAATAAGAC-TGTATGAACAAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAATGATCATAA
1 TTTTATTC-GAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAA-TTTTTTATGACAAAACAAA-AATCATAA
*
22336828 TGATTTGAA-ATAAATAATTGTTCAAA
62 TGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAA
22336854 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1800, Mismatches: 315, Indels: 219
0.77 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
512 3 0.00
513 106 0.06
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519 10 0.01
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529 6 0.00
530 73 0.04
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544 36 0.02
545 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (537 bp):
TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAAATCATAATGAT
TTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGAAAAAACAGATTTATTT
TTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGC
TTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAATAGATAATTG
TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTACTTA
TTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATGAAACA
ATTATTTTATGACTAAACAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTATAA
CTATTTGAACTTGTTCGATAAACAATTTATTTTTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
TAATAAATTAATATTAT
Found at i:22335830 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 22335120--22336853 Score: 1512
Period size: 181 Copynumber: 9.6 Consensus size: 181
22335110 ATTTATTTTT
* * * ** * * * *
22335120 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCCGAATAAGCTTATATGAGGAAAAAAACAATTGTTCTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA--ATAGAAACAATTGTTTTAT
* * *
22335185 GAC-AAA-ATAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
64 GACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
22335248 CTGGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATCAATTTTCAAAA
129 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAA
* * * * *
22335298 TATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAA-TTCTATATGAATAGAAGCTATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
22335362 AGAAAAC-AAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTGAAC
65 ACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
22335426 TTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTACTTTTCCAAAA
130 TTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTT-TAAAA
* * ** * * * * *
22335480 TATCAATAAATTAGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGAATGAATATAAACAACTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
22335545 CAAAA-TAAAAGATCATAACTATTTGAAATATG-TATTTGTTC-AATAAATTATAACTATTTGAG
66 CAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * *
22335607 CTTGCTCGATAAATAAATGTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAA
129 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTAAAA
* * * * * *
22335661 TATTAATAAACTAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTTCTATGACTAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* *** * *
22335726 CAAAACAAAAAGCTCATAGTTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACG
66 CAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * **
22335791 TGTCTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCAACTTATTAATTTTTGGAA
131 TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAA
*
22335842 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
22335905 ACAAAACAAAAGGCT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAAC
65 ACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
22335969 TTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCT-TTAATTTTTAGAA
130 TTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACT-TATTAATTTTTAAAA
* * * * * ** ** *
22336022 TATTAATAGATTTGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GGTACAATCATTTTATA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
** * * * * *
22336086 ATGAAAC-AAAAGTTCATAGCTG-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
65 ACAAAACAAAAAGATCATAAC-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * ** * *
22336149 CTTGTTCGATAAACATATTTATTTTAAAAATCATT-TAGTTATTAATTGTCT-AAA
129 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT--TTCTACTTATTAATT-TTTAAAA
* * *** * *
22336203 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
22336268 CAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
66 CAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * **
22336332 TATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGGAA
131 TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTTCTACTTATTAATTTTTAAAA
* * * ** * *
22336384 TATTAATAATTTTGTATTATTTTATCTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
22336449 TAAAAC-AAAAGGTTATAGCGATTT-AAATTTGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC
66 CAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* *** * *
22336512 TTGTTTGGTGAACAGAACCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
130 TTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTAAAA
* *** *
22336564 TATTAATAAATTA-TAATTATGTTATTACAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTG
1 TATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
22336628 ATAAAAC-AAAATATTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCACAACTATTTGCA-
65 ACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
22336691 TTGGTCATGCT-AACAGATTCATTTTTTAAA-TCCATTACTTATTAATTTTTAGAA
130 TT-GT-TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC--TACTTATTAATTTTTAAAA
* * * * * *
22336745 TATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGAC-TGTATGAACAAAAACAATTTTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * *
22336809 ATAAAAC-AAATGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
65 ACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
22336854 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1261, Mismatches: 251, Indels: 85
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
176 16 0.01
177 81 0.06
178 35 0.03
179 76 0.06
180 242 0.19
181 590 0.47
182 215 0.17
183 6 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAA
Found at i:22335996 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 22335120--22336853 Score: 1668
Period size: 361 Copynumber: 4.8 Consensus size: 361
22335110 ATTTATTTTT
* * * * * * * * *
22335120 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCCGAATAAGCTTATATGAGGAAAAAAACAATTGTTCTAT
1 TATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA--ATAGAAACAATTGTTTTAT
* * *
22335185 GACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
63 GACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * *
22335249 TGGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATCAATTTTCAAAATATTAATAAATT
128 TTGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
* * * * * *
22335310 AGTGTTATTTTATTTTGAATAA-TTCTATATGAATAGAAGCTATTGTTTTATGAGAAAACAAAAG
193 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TATATGACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
* * * * * *
22335374 GTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT
257 GTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGAAAAC
* * * * **
22335439 AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTACTTTTCCAAAA
322 AAATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT-TGAAA
* * * * * * *
22335480 TATCAATAAATTAGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGAATGAATATAAACAACTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
22335545 CAAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATATG-TATTTGTTC-AATAAATTATAACTATTTGAGC
65 CAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
22335608 TTGCTCGATAAATAAATGT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAC
128 TTGTTTGGTAAACAGAT-TCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT
* * * * *
22335672 TAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTTCTATGACTAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAA
192 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAA
* * * * * *
22335737 GCTCATAGTTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTCTAGAAAA
256 GGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGAAAA
* *
22335802 CAAATTTATTTTTTAAAT-TTCAACTTATTAATTTTTGGAA
321 CAAATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
**
22335842 TATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* *
22335906 CAAAACAAAAG-GCTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACT
65 CAAAACAAAAGATC-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * *
22335970 TGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCT-TTAATTTTTAGAATATTAATAGATT
129 TGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
* * * ** ** * *
22336034 TGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GGTACAATCATTTTATAATGAAACAAAAG
193 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG-ACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
* * * * *
22336098 TTCATAGCTG-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTG-TTCGATAA
257 GTCATAG-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGA-AA
* ** * *
22336161 ACATATTTATTTTAAAAATCATT-TAGTTATTAATTGTCT-AAA
320 ACAAATTTATTTTTTAAATC-TTCTACTTATTAATT-TTTGAAA
* * * *
22336203 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATAA
1 TATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
22336268 CAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
65 CAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * * * *
22336332 TATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAATTTT
129 TGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
* ** * * * *
22336397 GTATTATTTTATCTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGT
194 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT
* * * * **
22336462 TATAGCGATTT-AAATTTGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTGAACA
259 CATAGTGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACA
**
22336526 GAA-CCA-TTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAA
323 -AATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
22336564 TATTAATAAATTATAATTATGTTATTACAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGA
1 TATTAATAAATTAT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
22336629 TAAAACAAAATATTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCACAACTATTTGCA-TT
65 CAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * **
22336693 GGTCATGCT-AACAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
130 -GT-TTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
* * * * * * *
22336757 AGCATTACTTTATTCTGAATAAGAC-TGTATGAAC-AAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAT
193 AGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTATATG-ACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
* * *
22336820 GATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
256 GGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
22336854 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1116, Mismatches: 216, Indels: 83
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
358 24 0.02
359 69 0.06
360 118 0.11
361 460 0.41
362 274 0.25
363 95 0.09
364 76 0.07
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (361 bp):
TATTAATAAATTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
TTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
TAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAAAT
TTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
Found at i:22338299 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 22337855--22338431 Score: 585
Period size: 180 Copynumber: 3.2 Consensus size: 177
22337845 NNNNNNNNNG
** * * * *
22337855 TTTTATGACAAAACAATTGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAACTAGTCATAACTA-
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
22337919 TTGAACTCATTTGGTTAACA-ATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA-AA
66 TTGAACTTATTTGGTAAATAGA-TTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATAA
* * * *
22337982 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAATTAAGA-TTGTATGAATGGAAACAATTG
129 TAAATTA-TATTATTTTATT-TAA-AAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTA
* * * * *
22338033 GTTTATGACAAATCAAAAGGTCGTAATGATCTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** * *
22338098 TTGAACATGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAACACTAAT
66 TTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA-TAAT
* * *
22338163 AAATTTATATTATTTTATTTGAAAAAAACTTGCATGAATAGAATCAACTA
130 AAA-TTATATTATTTTATTT-AAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTA
* *
22338213 TTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** * *
22338278 TTAAACTTATTTGGTAAATAGATGCT-TTTTTT-AATTCTCTTACCCATTAATTCTTGTAATATT
66 TTGAACTTATTTGGTAAATAGAT-TTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATA-T
* * * * * *
22338341 AATAAATTCTATTATTTCACTTCAAATAAACTTATATGAACTA-AAAAAATTA
127 AATAAATTATATTATTTTA-TTTAAAAAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTA
*
22338393 TTTTATTACCAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
1 TTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
22338432 TTATAATTAT
Statistics
Matches: 327, Mismatches: 59, Indels: 24
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 76 0.23
179 34 0.10
180 180 0.55
181 37 0.11
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATAATA
AATTATATTATTTTATTTAAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTA
Found at i:22338791 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 22338548--22339059 Score: 513
Period size: 181 Copynumber: 2.9 Consensus size: 177
22338538 GTGTGGAAAT
* * * * *
22338548 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGT-CCTAACAATTTGAAATATATAATTATTCATATAGTCAT
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAAC-AA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
22338612 AACTATTTGAACTAGTAGGGTAGACAGACTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTCAAAA
64 AACTATTTGAATTAGTA-GGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAAATTT-AAAA
*
22338677 ATTTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAA-C
126 ATTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG--TAGAAAAGC
* * * * * *
22338729 AATTATTTTGTGATATAACAAAAGGTTACAATAATTTGGAATAGATAACTATTCAAATAGTCATA
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
22338794 ACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATT---TTT-GAAAT
65 ACTATTTGAATTAG-TAGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATT-ATTAAATTTAAAAAT
* *
22338855 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAGC
128 -TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGTAGAAAAGC
* * *
22338906 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAAATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAAT-GATCATA
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAAAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATA
* * * * *
22338970 ATTATATGAATTGATTCA-GTAAACTA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAAATTTTAAA
65 ACTATTTGAATT-AGT-AGGTAAAC-AGAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAAATTTAAAA
*
22339033 ATATTAATAAAATAGTATTATTTTATT
126 AT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATT
22339060 TTGGACAAAA
Statistics
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AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAAAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAATTAGTAGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAAATTTAAAAATTTA
ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGTAGAAAAGC
Found at i:22339376 original size:182 final size:180
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22338470 TTCTAAGTCT
* * * * * *
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* * * *
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* *** * * * *
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* *** * ** * *
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1 CTTA-TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGTAAATAAGCTTATATGAGCT
* * * * * * * * * * *
22338723 AGAAACAATTATTTTGTGATATAACAAAAGGTTACAATAATTTGGAATAGATAACTATTCAAATA
65 -GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
* * *
22338788 GTCATAACTATTTGAATTGGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
129 GTCATAACTATTTGAATT-GTTCAG-TAAACTGAATTATTTTTTAAATCTCTTA
* *
22338841 --T-T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTAT--GTT
1 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGT-AAATAAGCTTATATGAGCT
* * * * * *
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65 G-AAA-TAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * *
22338963 -GATCATAATTATATGAATTGATTCAGTAAACTAAATTATTTTTTAAATCTCTTA
128 AG-TCATAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACTGAATTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
22339017 CATATTAAA-TTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGGACAA-AA-C-AAAAAGA
1 CTTA-TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTGTA-AATAAGCTTATATGA
* ** ** * **** * * *
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62 GC-TGAAATAATTATTTTATGACAA--AACAAAAT-GTCATAACAATTTGAA-ATAAAT-A-ATT
* * * * * * * * *
22339137 AATAAAATAGTTATAATTATTTGAATGGGCTCGGTAAA-TATAATTATTTTCTAAATCTCTTA
120 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TGTTCAGTAAACT-GAATTATTTTTTAAATCTCTTA
*
22339199 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGGT-TTATTTTATTGTAAATAAGCTTTTATGAGCT
1 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTGTAAATAAGCTTATATGAGCT
* * *
22339263 GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTATATAG
65 GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
22339328 TCTTAACTATTTGAACTTGTTTAGCAAATTGACTTATTTTTTTAAATCTCTAA
130 TCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACTGAATTA-TTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
22339381 GTTATTAATTTTT-AGAATTTTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTATATGA-AT
1 CTTATAAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGTAAATAAGCTTATATGAGCT
* * * * * * * * * *
22339444 AGAAACATTTGTTTTATGATAGAACAAAGGAT-T-ATAATAACTTAAAATAGATAATTGTTCAAA
65 -GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA--ATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * * *
22339507 TAATCATAAATTTTTGAACTGGTTCAGTAAA-T-ATATT-TATTTTTAAATCTCTTA
127 TAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACTGA-ATTAT-TTTTTAAATCTCTTA
** * * * ** * *
22339561 --T-T-AATTCCTAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTT-TT-TCGAATAAGC-T-TGCGTGTT
1 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGT-AAATAAGCTTATATGAGCT
* * *
22339618 GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATAATAACAATTTGAAATAAAT-ATTATTCAAAT
65 G-AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * *
22339681 GGCCATAATTATTTG
128 AGTCATAACTATTTG
22339696 GATTAAAATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGTAAATAAGCTTATATGAGCTG
AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
CATAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACTGAATTATTTTTTAAATCTCTTA
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22339766 TACTAAACAT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
22339906 TAAAATAATTGGTTTTAT-TT-ATGCAACCTTAATTCA-AATAAAATATTA-TAAA
128 TAAAACAATT-G-TTTATGTTCATACAAACTT-ATT-AGAATAAAATAATACT-AA
* * ** * * * *
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* *
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* * *
22340085 TAAACCAATTGTTTATGTTCAAACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
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* * *
22340137 TTTACTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTATCAAGCGAGTT
1 TTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAA-CAAGTT
* * *
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65 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
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130 AAACAATTGTTTATGTTCATACAAACTTATTAG-AATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
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* * * * * * * ** * * *
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* * * *
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129 AAAACAATTGTTTATGTTCATACAAACTTA-TTAGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
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1 TTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AACAAGT
* ** * * *
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64 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
22340623 AAAACATTTGTTTCTGTCCATACAACCTTATTTAGAGTAAAATATTTTCTAA
129 AAAACAATTGTTTATGTTCATACAAACTTA-TTAGAATAAAATA-ATACTAA
* * * * * *
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1 TTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AA-CAAG
* * * * * * * *
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63 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** *
22340799 ATAAAAAAATTGTTTCA-GTTCACACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
127 ATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAACTTATTAG-AATAAAATAATACTAA
* * * *
22340852 TTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAGGCAAGAA-ATTT--AAAA-AAATTTGTTTACCGAACAA
1 TTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AACAA
* * * * *
22340912 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGCATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATC
62 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
*
22340977 ATAAAACAATTCTTTCA-GTTCATA
127 ATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATA
22341001 AAAGCTTGAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (178 bp):
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AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTATGTTCATACAAACTTATTAGAATAAAATAATACTAA
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Period size: 181 Copynumber: 6.8 Consensus size: 178
22339766 TACTAAACAT
* * * * *
22339776 TTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATATGTTTATCGAACAAG
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* * * * * * *
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62 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
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127 TAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAACTT-ATTTAGAATAAAATAATACT-AA
* * ** * * * *
22339958 TATATTAATATTCCAAAAAACAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACATGTT
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-AAAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTATGAACAAGTT
*
22340023 CAAATA-TATATGA-TATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCA
64 CAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
22340085 TAAACCAATTGTTTATGTTCAAACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
127 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAA
* * * * *
22340137 TTTACTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTATCAAGCGAGT
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG--AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATGAA-CAAGT
* *
22340201 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCA
63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCA
*
22340265 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTT-GAAATAAAATAATACTAA
127 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAA
* * * *
22340317 TTTACTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAAAAGT
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG--AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TGAACAAGT
* * * * * * * ** * *
22340382 TCAACTAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATATATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCTT
63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT
* *
22340447 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAAGAATACTAA
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* * * * * * * * * *
22340498 TTTATTACTATTTTAAAAGTTATTAAG--AGAATTAAAAATTAAATCTCTTTATCAAACTAGTTC
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-GAACAAGTTC
* ** * *
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* * * * * * *
22340624 AAACATTTGTTTCTGTCCATACAACCTTATTTAGAGTAAAATATTTTCTAA
129 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATA-ATACTAA
* * * * *
22340675 ATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG---GATTTAAAAAACAAATGTGTTTGTCGAATCAA-TT
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-GAA-CAAGTT
* * * * * * *
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64 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT
* * **
22340801 AAAAAAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAA
128 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAA
* * * * *
22340852 TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAGGCAAGAAATTT--AAAA-AAATTTGTTTACCGAACAAGT
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TGAACAAGT
* * * * * *
22340914 TCAAATAGTTATGACTATTTGCATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCAT
63 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT
*
22340979 AAAACAATTCTTTC-AGTTCATA
128 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
22341001 AAAGCTTGAA
Statistics
Matches: 847, Mismatches: 164, Indels: 68
0.78 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
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176 103 0.12
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182 34 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATGAACAAGTTCA
AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAA
Found at i:22340690 original size:358 final size:360
Alignment explanation
Indices: 22339776--22340992 Score: 953
Period size: 359 Copynumber: 3.4 Consensus size: 360
22339766 TACTAAACAT
* * * * * * * * *
22339776 TTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATATGTTTATCGAACAAG
1 TTTACTAATATTTC-AAAATTAATAAG-AAAAG-ATTAAAAAAATAAATCTCTTTATCAAACGAG
* * * * * * * * *
22339841 TTCAAACAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATTACCTTTTGTTTTGTCA
63 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTCA
* ** * * * * * *
22339906 TAAAATAATTGGTTT-TATTTATGCAACCTTAATTCAAATAAAATATTA-TAAATATATTAATAT
128 TAAAACAATT-GTTTCTATCCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAAAT-TAATAATAT
* ** * * * * ** * * * *
22339969 TCCAAAAAACAATAAG-TAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACATGTTCAAATA-TAT
191 TCTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAAAAGTTCAACTAGT-C
* *
22340032 ATGAT--ATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATT
255 ATG-TCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATT
* ** *
22340095 GTTTATGTTCAAACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
319 GTTTATATTCAAACAAAATTATTCAGAATAAAAGAATACTAA
* * *
22340137 TTTACTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTATCAAGCGAGTT
1 TTTACTAATATTTCAAAATTAATAAG-AAAAGATTAAAAAAATAAATCTCTTTATCAAACGAGTT
* * * *
22340202 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATA
65 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTCATA
* * * *
22340267 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTA
130 AAACAATTGTTTCTATCCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCTA
22340332 AAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAAAAGTTCAACTAGTCATGTC
195 AAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAAAAGTTCAACTAGTCATGTC
* * ** * *
22340397 CATTTGAGCTATTATATATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTTC
260 CATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTA
* *
22340461 TATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAAGAATACTAA
324 TATTCAAACAAAATTATTCAGAATAAAAGAATACTAA
* * * * * * *
22340498 TTTATTACTATTTTAAAAGTTATTAAG-AGA-ATT-AAAAATTAAATCTCTTTATCAAACTAGTT
1 TTTACTAATATTTCAAAA-TTAATAAGAAAAGATTAAAAAAATAAATCTCTTTATCAAACGAGTT
** *
22340560 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCCTA
65 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTCATA
* * * * * *
22340624 AAACATTTGTTTCTGTCCATACAACCTTATTT-AGAGTAAAATATTTTCTAAATTAATAATATTC
130 AAACAATTGTTTCTATCCATACAAACTTATTTGA-AATAAAATA-ATACTAAATTAATAATATTC
** * * * * *
22340688 TAAAAATTAATAAG-----GATTTAAAAAACAAATGTGTTT-GTCGAATCAA-TTCAAATAGTTA
193 TAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACT-GAA-AAAGTTCAACTAGTCA
* * * * * * * * *
22340746 AGACTATTAGAACAATTATCTATTGCAAAATTATTCTGA-CATTTAG-TTTAGTCATAAAAAAAT
256 TGTCCATTTGAACAATTATATATTTC-AAATCATTATGACCATTT-GTTTTA-TCATAAAACAAT
* * *** * *
22340809 TGTTTCA-GTTCACACATGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAA
318 TGTTT-ATATTCAAACAAAATTATTCAG-AATAAAAGAATACTAA
* * * * * * *
22340852 TTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAGGCAAGAA-ATTTAAAAAAAT---T-TGTTTACCGAACA
1 TTTACTAATATTTC--AAAATTAATAAG-AA-AAGA-TTAAAAAAATAAATCTCTTTATCAAACG
* * * * * *
22340911 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGCATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTAT
61 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGT
*
22340976 CATAAAACAATTCTTTC
126 CATAAAACAATTGTTTC
22340993 AGTTCATAAA
Statistics
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TTTACTAATATTTCAAAATTAATAAGAAAAGATTAAAAAAATAAATCTCTTTATCAAACGAGTTC
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATCCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCTAA
AAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAAAAGTTCAACTAGTCATGTCC
ATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATA
TTCAAACAAAATTATTCAGAATAAAAGAATACTAA
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22340663 AATATTTTCT
*
22340673 AAATTAATAATATTCTAA
1 AAATTAATAAGATTCTAA
22340691 AAATTAATAAGGATT-TAA
1 AAATTAATAA-GATTCTAA
22340709 AAA
1 AAA
22340712 ACAAATGTGT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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19 3 0.16
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AAATTAATAAGATTCTAA
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22341238 ATTATTTTTC
* * * * *
22341248 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATATCTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAAGTAAGAACCAA
22341313 GAGATTTCTA
66 GAGATTTCTA
* * * * *
22341323 TTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATGCTGATGTAATAATATTCTAAAAAGTAAGAACCA
1 TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAAGTAAGAACCA
22341387 AGAGATTT
65 AGAGATTT
22341395 AAAAAATAAA
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 10, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAAGTAAGAACCAA
GAGATTTCTA
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22341307 ATCTAAGAGA
* * * * * *
22341317 TTTCTATTCATATAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATGCTGATGTAATAATATTCTAAAAAGTAA
1 TTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* ** * * * * *
22341381 GAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTCAAACTATTTCAA-ATAG-TTAAGGCTATATG
66 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTCT-AAACTAGTTCAATA-AGTTTAA--CTATTTG
* * * * *
22341444 AACAATTCTTTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTT
127 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * ** *
22341498 TTTC-AGTTCTTACTAA--CTTATTTAGAACAAAATAA--AAAATTTTATTAATATTTCAAAAAT
1 TTTCTA-TTCATA-TAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAA-TTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * *
22341558 TAATTAGTAAGAG-ATTTAAAAATAATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTTTGACTATTT
63 TAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTT-CTAAACTAGTTC-AATAAGTTTAACTATTT
* * *
22341622 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCAT-AAGCAAATG
126 GAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ** * *
22341676 TTTTTGTTTAAATAAGT-TTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTTCAAAATTAA
1 TTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
*
22341740 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACTAGTTCAATAAGTTTAACTATTTGAAC
66 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTT-CTAAACTAGTTCAATAAGTTTAACTATTTGAAC
* **
22341805 AATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
130 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* *
22341856 TTTCTATCCATAT-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
1 TTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * * * * * * *
22341920 TAAGTAATAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCT-GACCAGTGCAAAAGAGTTTTAACTGTCTA
66 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATT--TCTAAACTAGTTCAATA-AG-TTTAACTATTTG
* * * * *
22341984 AACAATTATGTACTTC-AAT-A-TA--ACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTG
127 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ** * * **
22342033 TTTTTGTTCATA-CAGGCTTATTCAAAATAACATAAT-CTAACCTATTAATATTCTGAAGCTTAA
1 TTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * * * *
22342096 TAAGTAAGATATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACAAGTTGAA-ATACTTATGACTATTTGA
66 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTT-CTAAACTAGTTCAATA-AGTT-TAACTATTTGA
*
22342160 ACAATTATCTATTTCAAA
128 ACAATTATTTATTTCAAA
22342178 ACACTTCATA
Statistics
Matches: 530, Mismatches: 124, Indels: 57
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Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
175 23 0.04
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTCTAAACTAGTTCAATAAGTTTAACTATTTGAACA
ATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
Found at i:22342554 original size:180 final size:178
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Indices: 22342251--22343883 Score: 910
Period size: 181 Copynumber: 9.2 Consensus size: 178
22342241 AAGTAAAATA
* * * ** * *
22342251 TTCAAATAGTTTTGACCCTTAGTTTTATCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTACTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTACTCA
* * * *
22342316 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATATAT
65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT-AATAGT-AGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
22342381 CTGTTTACTGAATAAGCTCTAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTAT
128 CTGTTTACTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* *
22342432 TTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTATTCATACATATTTA-TCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA-ATTTACTCA
*
22342496 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-GTA-GAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
22342561 ATGTTTACTAAAAAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAAATATCTAT
128 CTGTTTACTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * * * *
22342612 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAGAATTATTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA-ATTTACTCA
* * *
22342677 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA--AGAGATTTAAAAACTAAATCT
65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGTAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** *
22342740 TTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATTTAT
130 GTTTACTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * * * ** * * * * * *
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1 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTACTC
* * * * * * * *** *
22342850 GAACTAAGATAATACTAA---ATTAATA--ATAAAAAATAA-A-TA-TGTTTTGCCAAA-CAA--
64 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGTAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * *
22342904 -G-TT-C--AGATAGTT-AAGACTA-TTA-GAAC-AATT-ATC-------TAT
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* * * *
22342940 TTCAAATCA-TTTTGACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTTACATA-AACTTA
1 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTCTA--TT-CATACAATTTA
* * * * * *
22343001 TTTAGAATAAAATAATACTAAGTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAA
61 CTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGT-AGAGA-TTTAAAAAA
* * * * * * *
22343066 TAAATATATTTA-TCGAAAAAGCTCTAATAGATATGACTATTTGAATAATTATCTAT
123 TAAATCTGTTTACT-GAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * * * * **
22343122 TTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTT-TAATTTAGTAGAACGTA-T
1 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCA-TACAATTTACT
* * * * *
22343184 CTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAGAAATTATTAAGAAAGAGATTTAAAAACT
63 C-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AG-TAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * **
22343248 AAAGT-TATTT-TTCATACTAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATAAAT
124 AAA-TCTGTTTACTGA-AAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * ** * * * **
22343303 CTCAAATCGTTATGTTC-TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTAATCATACAAGCTTA-TTT
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTACTCA
** * * * *
22343365 GGATAAAAAAATACTAATTTAATAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGACTTAAAAAATAAAT
65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGT-AGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * * *
22343429 GTGTTTGCCGAATCAGTTCAAATGGCTAAGACTATTAGAATAATT-TTCTAT
128 CTGTTTACTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-TAT
* *
22343480 TTCAAATCA-TTAT-ATCCTTTTATTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AATGCTT-
1 TTCAAAT-AGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAT--TTA
* * * * *
22343540 -T-GAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAA
61 CTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AG-TAGAGATTT-AAAAAA
* * *
22343603 TAAATTTGTTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTAT
123 TAAATCTGTTTA-CTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * * * * *
22343659 TT-ACAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA-T
1 TTCA-AATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAA-TTTACT
* * * **
22343721 CCAAAATATAATAATACTACTTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGGAAAAT
63 -CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AGT-AGAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
22343785 AAATCAGTTTACAGAAATAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTAT
124 AAATCTGTTTACTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTAT
* * ** * * *
22343840 TTCAAATTGTTATTACCTTTCATTTTGTAATAAAACAATTGTTT
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT
22343884 TCCAACATAT
Statistics
Matches: 1119, Mismatches: 241, Indels: 184
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
151 21 0.02
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153 4 0.00
154 20 0.02
155 4 0.00
156 3 0.00
157 6 0.01
158 1 0.00
159 14 0.01
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163 3 0.00
164 1 0.00
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167 2 0.00
168 7 0.01
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171 7 0.01
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173 11 0.01
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175 4 0.00
176 19 0.02
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
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TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTACTCAA
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGTAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
TTTACTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
Found at i:22343238 original size:182 final size:178
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Indices: 22342876--22343884 Score: 839
Period size: 182 Copynumber: 5.6 Consensus size: 178
22342866 AAATTAATAA
* * * * *
22342876 TAAAAAATAAATATGTTT-TGCCAAACAAGTTCAGATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATGTTTAT-CGAAA-AAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
22342940 TTCAAATCATTTTGACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTTACATAAACTTATTT
64 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAATAATTGTTTTAG-TT-CATAAACTTA-TT
* * *
22343004 AGAATAAAATAATACTAAGTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
125 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * * *
22343059 TAAAAAATAAATATATTTATCGAAAAAGCTCTAATAGATATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
22343124 AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTAATTTAGTAGAACGTATCTAAA
66 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCA-TA-AACTTAT-TAAA
* * * *
22343189 ATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAGAAATTATTAAGAAAGAGATT
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* ** * * * **
22343240 TAAAAACTAAAGTTAT-TTT-TC-ATACTAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATAAA
1 TAAAAAATAAA--TATGTTTATCGA-AAAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * ** *
22343302 TCTCAAATCGTTATGTTC-TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTATT
63 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AA-CTTATT
*** * * *
22343364 TGGATAAAAAAATACTAATTTAATAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGACT
125 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** ** * * * * * *
22343417 TAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATCAGTTCAAATGGCTAAGACTATTAGAATAATTTTCTATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** *
22343482 CAAATCATTAT-ATCCTTTTATTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAA-TGCT-TTGAA
66 CAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAACT--TATTAAA
* * * *
22343544 ATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
128 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
22343595 TGAAAAAATAAATTTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATT
1 T-AAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * *
22343660 T-ACAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA
65 TCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCAT-AAA-CTTAT-TA
* * *
22343724 AAATATAATAATACTACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
126 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * *
22343777 TGGAAAATAAATCA-GTTTA-CAGAAATAGTTCAAATA-ATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCT
1 TAAAAAATAAAT-ATGTTTATC-GAAAAAGTTCAAATAGA-TATGA-CTATTTGAACAATTATCT
** * ** * *
22343838 ATTTCAAATTGTTATTACCTTTCATTTTGTAATAAAACAATTGTTTT
62 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
22343885 CCAACATATA
Statistics
Matches: 655, Mismatches: 137, Indels: 70
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.00
176 4 0.01
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179 115 0.18
180 27 0.04
181 143 0.22
182 166 0.25
183 31 0.05
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAACTTATTAAAATA
AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
Found at i:22343972 original size:67 final size:65
Alignment explanation
Indices: 22343849--22343980 Score: 185
Period size: 67 Copynumber: 2.0 Consensus size: 65
22343839 TTTCAAATTG
22343849 TTATTACCTTTCATTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCCAACATATAAGTGTTTTTGAAATAAAAT
1 TTATTACCTTTCATTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCCAACATAT-A-TGTTTTTGAAATAAAAT
22343914 CA
64 CA
* * *
22343916 TTATTACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCAACATACT-TGCTTATTTGAAATAAAA
1 TTATTACCTTTCATTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCCAACATA-TATG-TT-TTTGAAATAAAA
22343980 T
63 T
22343981 AATGATAATT
Statistics
Matches: 59, Mismatches: 3, Indels: 6
0.87 0.04 0.09
Matches are distributed among these distances:
65 2 0.03
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ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.06, T:0.45
Consensus pattern (65 bp):
TTATTACCTTTCATTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCCAACATATATGTTTTTGAAATAAAATCA
Found at i:22344237 original size:181 final size:177
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Indices: 22344013--22350656 Score: 2590
Period size: 181 Copynumber: 37.1 Consensus size: 177
22344003 CAAGAATTAG
* *
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* * * *
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* * * * ** * * **
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* * * ** * * *
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* ** * * * ** * ** * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * *
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* * ** *
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* **** ** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * * **** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-CG-TTTACCT-AAT-AGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAAT
* * * * * * *
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60 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATAC
* * * * * ** * *
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123 AAGTTTA-TTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * * * * * * *
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1 TAAGA-GATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCTAAT-AGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * **
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125 GTTTATTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * *
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* * * * * * * * * * *
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65 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTT
* *
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* * * ** * * ** *
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* * ** * **
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* * * ** * *
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126 TTTA-TTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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123 AAGTTTATTC-A-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * *
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* ** * * *
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* * *
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126 TTTATTCA-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCGT-TTACCT-AA-TAGTTTAAATAGTTAGA-CTATTTG-A-AT
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60 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAA-TTATTTCTGTTCATA-
* * * * ** *
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122 CAAGTTTATTCA-ATATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * ** * * * * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCGTTTACCTAA-TAGTTTAAATAGTT-AGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * * *
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63 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTT
* * * * * *
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128 T-ATTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCT-AA-TAGTTTAAAT-AGTTA-GACTATTTGAATA
* * * * ** * * * *
22347286 ATGATTTATTTCTATTCATTACGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATA-TA
61 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAA
* * * *
22347350 GTCTTATTCAGA-ATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATTAAG
125 GT-TTATTCA-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAA-TAAC
* * ** ** ** * *
22347405 TAACG-GATTTAAAAAATTAATC-TGTTAGTCTGACGAGTGCAAATAGTTATGGTTGTTTGAACA
1 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATCGT-TTA-CCT-AATAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATA
* * * * * * *
22347468 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCTGATT-GTACA
61 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTG-TTCATACA
* * * * * * *
22347532 AGCTTATTTGAA-ATAACATAATTCTAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAAG
124 AGTTTA-TTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * *
22347586 TATGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCC-AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCTAA--TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * * **
22347650 TTATCTATTTCAAATCACTATAACGTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTACTCATACAAG
62 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* * * * * * *
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126 --T--TTA-TTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * *
22347770 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTGAATAAGGTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCT-AAT-AGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * * * * * *
22347834 TTATTTATTTCAAACCCA-TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAA
62 TTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAA
* * * ** * *
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125 GTTTATTCA-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * *
22347951 TAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGTTTACCT-AA-TAGTTTAAATAGT--TAGACTATTTGAATA
* * * * * * *
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* * * * ***
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* * * * * *
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1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATC-GTTTACCTAA-TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATA-
*
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61 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAA
* ** * ** *
22348260 GCTTATTTTGA-ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
125 GTTTA-TTCAATATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * *** * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC--GTTTACCTA-ATAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * * * *
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* * ** *
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125 GTTTATTC-AATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * ** * * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCTA--ATAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * *** * * *
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62 TTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAA
** * * * **
22348620 GTTTATTTGGA-ATAAAATTATACTAATTTATTAATATTCTT-CAAATTAATAGG
125 GTTTA-TTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TTGAAAATTAATAAC
* * * * * * * ** * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCTAA-TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAAT
* * * * * * * * *
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63 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG-
* * * * * *
22348801 ATTATTCAAAATAAAAAAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-
126 TTTATTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * * * *
22348849 TAAGGGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCTAATA-GTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAAT
** * * * *
22348914 TATCTATCTT-AAATTGTTATAATCTTTAT-TTTGTCATAAAATAATTTTTTCTTTTCATACAAG
63 TATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTT-TGTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* * *** *
22348977 TATATTCAGAT-TAAAATAATACTCATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
126 TTTATTCA-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * * **
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1 TAAG-AGATTTAAAAAATAA-ATCGTTTACCT-AA-TAGTTT-AAATAGTT-AGACTATTTGAAT
* * * * * *
22349092 AATTATTTATTT----T-GTTCTAAGCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACC
60 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACA
* ** * *
22349152 AGCTTATTTGGA-ATAAAATAATACTAATTT-ATAA-ACATTTGAAAAATTAATAAA
124 AGTTTA-TTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTTG-AAAATTAATAAC
* ** * * * *
22349206 TTAGAGATTT-AAAAA-AAATTATTT-GCTGAACAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCGTTTACCT-AA-TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAAT
* * * * * ** * * * * **
22349268 TATCTATTTAAAATCATTATGACATTTAGTTTCATTGTAAAGCAATTGTTTCGGTTCATAAAAAC
63 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGT
* * * * * * * *
22349333 TTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA-TTTCAAAACTTATTAAG
127 TTATTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAA-TTAATAAC
* * * * * *
22349384 TAAGACATTTAAAAATTAAAGTTGTTT-TCTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCT-AA-TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
** ** * * ** * * * * *
22349448 AGATGAATATGAAAT-AGTTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGATT-AGACA
62 TTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTG-TTCATACA
* * **
22349510 AGCTAATTCAGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-
124 AGTTTATTCA-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
*** *
22349562 -AA-AGATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTTTTGAATTAGTTTAAATAGTTATGACTATTAGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCGT-TTACCT-AA-TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * * * * * ** *
22349624 TTATCTATTTAAAATTATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTAAGTTCATGCAAG
62 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* * ***
22349689 CTTATTCTAA-A-AAAATTAATACTAATTTATTAACT-TTCCAAAAATTAATAAGC
126 TTTATTC-AATATAAAA-TAATACTAATTTAATAA-TATTTTGAAAATTAATAA-C
* * * * *
22349742 -AAGAGATTTAAAAAGGTAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAA-ATAAATC-GTTTACCTAAT-AGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAA
* * * * *
22349806 TTATCTATTTAAAATCGTTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAA
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** * * * * *
22349870 AACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
124 AGTTTATTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAC
* * * ** * * *
22349924 TAAGAGATTT---AAATCAAT--TTT--TTGAATCAATTCCAATAATTATCG-CCATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCGTTTACCT-AAT-AGTTTAAATAGTTA--GACTATTTGAATAA
* * * *
22349981 TTATCTATTTCAAATCATTTTTACCTTTTGTTTTGTCATTAAATAATTATTT-T-TTAACATACA
62 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTT--CATACA
* * * * * * *
22350044 AGCTTATTCAA-ATAAAGTAATATTGATTTATTAATA-TTTAAAGAATTAGT-A-
124 AGTTTATTCAATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAA-AATTAATAAC
* * * * *
22350095 T--GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAATTCACATAGTTATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCTAA-TAGTTTAAATAGTTA-GACTATTTGAATAAT
* ** * * * *
22350158 TATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATT-TTTTTGTTCATATAAGT
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *** *
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62 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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62 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* * * * * * * * * *
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*
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* * * * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * *
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* ** * * * **
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* * * * *
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* * * * * * * * ***
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* * *
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* **
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* ** * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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1 -CTATTTGAACA--ATTATCTATTTCAAATTC-ATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTC-ATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
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* * *
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* *
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** * * * * *
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* * * * *
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* ** *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTC-ATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * * ***
22348066 CAGTTTATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAA
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* ** *
22348131 -TAAGAGATTTAAAAAAATTAATCTGTTTACCAAACAAGATCAAATAGTTATGA
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* *
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* ** **
22348247 TCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
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* * * ** *
22348311 AGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTTTGTACATA-TTCAAATAGTTATGA
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
22348364 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGC-TGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * **
22348428 CTGTTCATATAAGGTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
65 TTGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
* * * * * * * *
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* * * * *** ** *
22348545 TTGTTTGAACAATTATTTATTTCGAATAGTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * ** * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * * *
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65 TTGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
* *
22348852 G---G-GATTTAAAAACTAAATCTGTTTA-TCGAACATGTTCAAATAGTTATGA
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** * * * *
22348901 CTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATAATC-TTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTT
1 CTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * ***
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* * * * ** *
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* ** * * ** * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * ** * * *
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* * * *
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* * * * ** ** *
22349255 CTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAATCATTATGACATTTAGTTTCATTGTAAAGCAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * * * * * *
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65 TTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAATAA
* * * *
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* * ** ** * * *** * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * **
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* ** ** *
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* * * * * * * *
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** * ***
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* * * * *
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* * *
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** * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
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* ** *
22350092 GTATGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA-TTCACATAGTTATGA
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * * *
22350145 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATT-TTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
22350209 TGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTTGAAAATTCATAACT
66 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT
* * * ** * *
22350274 AAGATATTTAAAAAATAAAT-TCATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGA
131 AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
22350325 CTATATT-AAGAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACATTTATT
1 CTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTCA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
**** * * * * * *
22350388 TCAACTCATCCAAGTTTATTC-GAAATAAAATAAAACTAATTTATTTATA-TTTCAAGAATTTAT
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* * * * * * * * *
22350451 AAGTAAGATATTTAAAAAATTAATTTTATTTACCGACCTAGTTCAAATAATTATAA
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
22350507 CTATTTGAACAATTATATATTTCAAATT-ATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAATAATTATTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTCA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * * * * * * * * * *
22350571 CTATTGATATAGGCTTATTCGGAATAAAATAGTGCAAATCTAATAAGATTCTGACAATTAATTAC
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* *
22350636 TAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTT
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Statistics
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* * * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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*** * * *
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* * * ** * * * ** * * *
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* * *
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* * * * * * * ** ** * ** *** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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374 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAATAAGA
* * * * * * * *
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438 -GATTTAAAAAAG-AAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
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* * * * * * * * * * *
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1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAA-TATT
* *
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65 TCAAAATTAATAAGTAAG-AGATTT-AAAAATAAATCTGTTT-TCTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
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* * * **
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190 TTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * *
22346324 AATAACTAAGAGATTT-AAACATAAATCTATTT-GTCGAA-ATAGTTTAAACAGTTAAAACTA-C
252 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACA-AGTTCAAATAGTTAAGACTATT
* * ** * ** *
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** * * * *
22346449 TTGTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTGTTAATATTTCAAAAA-T--T-AATAAG
373 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAATAAG
* * * * * * * * * * *
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* * * * **
22346574 TGTATTTTAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGTCA
500 TCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
* *** *** ** * * * * * *
22346609 TATAACAAACATTTTTTTATCATTCAAGCTTATCTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAATA--
1 TAAAACAATTGTTTCGGT-TCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT
* * *
22346672 T-----TT--TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAATTAGTTCAAATAGTTATG
65 TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTTCTGAACTAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
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129 ACTATTTAAACAATTATCTATATCAAATAGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
* * * * * * * *
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193 CTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAA
* * * * * * *
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** * * * * * * * * *
22346922 ATTTTTTTTTATTTCAAAACGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCAGTTCTT
318 ATAATTATCTATTT-----TGTTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCAT
* ** * * * *
22346987 AGTAA-CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAG
377 A-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAATAAGAG
* * * * *
22347050 ATTTAAAAAATAATTTTATTTGCCGAACCAA-TTCAAATAATTAAT-ACTATTTGAACAATTATC
439 ATTTAAAAAAGAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
22347113 AATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTGT-T-A
502 TATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
* ** * ** * * * *
22347144 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTC-AAATAAACTAATATTAATTTATTAATATT
1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAACTT-ATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA-T
* * * * * * * * *
22347208 TTGAAAATTAAGAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTAAACTAGTT-TAATCGGTTA
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* ** * * * * * * * * *
22347272 TAACTATTGGAACAATGATTTATTTCTATTCA-TTACGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
127 TGACTATTTAAACAATTATCTATATCAAAT-AGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTT
* * * * * * **
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190 TTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA
** * * * * * ** * *
22347400 TTAAGTAACGGATTTAAAAAATTAATCTG-TTAGTCTG-ACGAGTGCAAATAGTTATGGTTGTTT
254 -TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA--CTGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA
* * * * * * *
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316 GAATAATTATCTATTT----T-GTTCTAACCTTTT-ATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TT
* * * * * * * *
22347527 -GTACAAGCTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTATGA
374 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAATAAGA
* * *
22347591 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCC-AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
438 GATTTAAAAAAGAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
22347655 TATTTCAAATCACTATAACGTTTTGTTTTGTCA
502 TATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
* *** ** * * **
22347688 TAAAACAATTTTTTCTACTCATACAAGCTTGCTTATTTC-AAATAAAATTATACAAAC-TTATTA
1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATA-AA---AACTTA-TCCAAAATAAAATAATA-TTACTTTATTA
* * * *
22347751 ATA-TTCTACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAA-TAAGGTCAAA
60 ATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTT-TCTGAACT-AGTTCAAA
* * * **** *
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* * * ** ** *
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185 AATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
*
22347942 ATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTA
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* * * * * *
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* * *** * * * *
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373 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAATAAG
* * * *
22348135 AGATTTAAAAAA-ATTAATCTGTTTACCAAACAAGATCAAATAGTTATGACTATGTGAA-ATATT
437 AGATTTAAAAAAGA--AATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATT
* * *
22348198 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
499 ATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
* * * * **** * *
22348234 TAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
* * * *
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66 C-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTTCTGAAC-TAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
22348362 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGCTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATT
128 GACTATTTAAACAATTATCTATATCAAATAGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
* * * * *
22348427 TCTGTTCATATAAGGTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
192 TCTATTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * * * * *
22348491 AGTAAAAGATTTAATAAGTAAATTTATTTACCGAGCAAGCTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACA
256 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATA
* * *** * * *
22348556 ATTATTTATTTCGAATAGTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTA-TTTATACA
321 ATTATCTATTT----T-GTTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACA
* * * ** ** *
22348619 AGTTTATTTGGAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTCTTCAAATTAATAGGTAGGAGATTTA
380 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAATAAGAGATTTA
* * * ** * * *
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444 AAAAAGAAATCT-ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
* * *
22348748 AAAGCATTATGACCTTTCGTTTTATCA
508 AAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
* ** * * * *
22348775 TAAAA-AAATGTTTCTATGCATATAGAA-TTATTCAAAATAAAAAAATATTGA-TTTATTAATAT
1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATA-AAAACTTATCCAAAATAAAATAATATT-ACTTTATTAATA-
*
22348837 TTTGAAAATTAATAAG---G-GATTTAAAAACTAAATCTGTTTATC-GAAC-ATGTTCAAATAGT
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* * * * * * *
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* * *
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* * * ** * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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446 AAAGAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
* * **
22349281 TCATTATGACATTTAGTTTCATTG
511 TCATTATGACATTTTGTTTTATCA
*
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1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
* *
22349370 CAAAACTTATTAAGTAAGACATTTAAAAATTAAAGT-TGTTTTCTGAACTAGTTCAAATAGTTAT
66 CAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAA-TCTGTTTTCTGAACTAGTTCAAATAGTTAT
* ** ** * * * *
22349434 GACTATTTAAATAAAGATGAATATGAAATAGTTACGATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
128 GACTATTTAAACAATTATCTATATCAAATAGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
* * * *
22349499 ATGATT-AGACAAGCTAATTCAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA
193 CT-ATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
* ** ** * *
22349560 -TAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAATTAGTTTAAATAGTTATGACTATTAGAATAA
257 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAA
* * * *
22349624 TTATCTATTTAAAATTATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTAAGTTCATGCAAG
322 TTATCTA-TT----TTGTTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG
* **
22349689 CTTATTCT--AAAAAAATTAATACTAATTTATTAAC-TTTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT
382 CTTATT-TGGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAACATTT--AAAAATTAATAAATAAGAGATTT
* *
22349751 AAAAAGGTAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
443 AAAAAAG-AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* *
22349816 AAAATCGTTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCA
507 AAAATC-ATTATGACA-TTTTGTTTTATCA
*
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1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA-TT
* * * * *
22349910 TGAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAATCAA--T-TTTT-TGAA-TCAATTCCAATAATTATC
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* * * * * * * *
22349968 G-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTTACCTTTTGTTTTGTCATTAAATAATTAT
128 GACTATTTAAACAATTATCTATATCAAAT-AGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T
* * * * * * *
22350031 TTTTTA-ACATACAAGCTTATTCA-AATAAAGTAATATTGATTTATTAATATTT-AAAGAA-T--
190 TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA-AATTAA
** * ** * * *
22350090 T-AGTATGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA-TTCACATAGTTATGACTATTTGA
254 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGA
* * * * **
22350153 ATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA-TCATAAAATAATT-TTTTTGTTCAT
318 ATAATTATCTA-TT----TTGTTCTAACCTTTTATT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT
* * *** * * * * * * *
22350216 ATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGATAT
377 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTTAAAAATTAATAAATAAGAGAT
* * * * * *
22350281 TTAAAAAATAAAT-TCATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATT-AAGAATTATCTA
441 TTAAAAAAGAAATCT-ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTA
* * * *
22350344 TTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
504 TTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
* * *** ** ** * * * * * *
22350375 TAAAACATTTATTTCAACTCATCCAAGTTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTTATATTT
1 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
* * * * * * *
22350440 CAAGAATTTATAAGTAAGATATTTAAAAAATTAAT-TTTATTTACCGACCTAGTTCAAATAATTA
66 CAA-AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGT-TTT-CTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
22350504 TAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTA-TTATAACCTTT-TATTCTATCATAAAATAATT
127 TGACTATTTAAACAATTATCTATATCAAA-TAGTTATGATCTTTGT-TT-TGTCATAAAACAATT
* * * * * * * * * * * * *
22350567 ATTTCTATTGATATAGGCTTATTCGGAATAAAATAGTGCAAATCTAATAAGA-TTCTGACAATTA
189 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTA
* * * * * * ** * *
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253 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAAG
22350687 GCAATTTCAA
Statistics
Matches: 4100, Mismatches: 812, Indels: 465
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
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519 2 0.00
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CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
TATTTAAACAATTATCTATATCAAATAGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA
TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT
CTATTTTGTTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGG
AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATCT
ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
ATTTTGTTTTATCA
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * **
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128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGTA-ACG
* * * * * *
22351223 AAATAATTGCTTTAT-AAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTACATATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *** * * *
22351287 CTTAACTGTTTGAACTGGTTCGACAAATGGATTTACTTTTTAAATATCTTAGTTA-TGAA-TTTT
66 CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACATATTTA-TTTTTTAA-A-CTCAATTACT-AATTTTT
* * * * *
22351350 GAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATG-AATAG
127 G-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAA-CG
* * *
22351403 AAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
22351468 CATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAACATATTTAATTTTTAAA-TCAATTACTAATTTTTGAAA
66 CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAACTCAATTACTAATTTTTGAAA
* * *
22351532 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGTTAA-A
131 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-TAACG
** * ** * * *
22351580 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATAATAACAAAGTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
22351645 CATAATTATTTGAACTGATT-TAGTAAAC-TACTTTATTTTTTAAA-T-ATCTTACTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAATTGGTTCGA-TAAACATA-TTTATTTTTTAAACTCA-ATTACTAATTTTTG
* * *
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128 AAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAAC-G
* * * * * *
22351757 AAACAGTTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAACAATTTAAAATAAAATAATTGTTCAAATAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** *
22351822 TCATAACTATTTAGACTT-GTTTGGTAAACA-ATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTT-GAATTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA-CTC--AATTACTAA-TTT
* * * *
22351885 TTG-GATGTTAATAACTTAGTATTATTTT-TTTCGAATAAGCTTGTAT-TAACT
125 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAACG
* * * * * * *
22351936 AAA-AATTGTTTTATGACTAAACGAAAGCTTAGAACAACTTT-AAATAGATAATTATTCTAAT-G
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
22351998 TCTTAA-TCATTTTAATTGATTTGATAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
65 TCATAACT-ATTTGAATTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA-CTC--AATTACTAATTTT
* * *
22352062 TGAAATATTATTAAATTAGTATTACTTTTA-TTC-AAGTAAGCTTATATG-ATCAG
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* * * ** * * *
22352115 AAGCAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
** ** * * *
22352178 TTGTAACTATTTGAGCTGGTTTGGA-AAACAGT-TTTAGTTTTTAAATCTCATACTTAATAATTT
65 TCATAACTATTTGAATTGG-TTCGATAAACA-TATTTATTTTTTAAA-CTCA-A-TTACTAATTT
* * * *
22352241 TTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGTTTTTATG-AACTG
125 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAAC-G
* ** * * *
22352295 AAACAATCGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATATTTGTTCAAATCGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** *
22352360 CATATCTATTTGAGCTT-GTTCGATAAACATATTTATTTTTTTAACTCTCTTGCTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGA-ATTGGTTCGATAAACATATTTA-TTTTTTAA-ACTC--AATTACTAATTTT
** * * * * *
22352424 TTCAATTTTAATAAGTTAGTATTATTTTA-TTCTGAATATGTTTGTATG-GACTG
126 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGTAAC-G
* * * * *
22352477 AAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAA
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22352522 ATAGTCTTAA
Statistics
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TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAACG
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* ** * * * *
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* ** *
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* **
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*
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* * * * * * *
22352942 TTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAGACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAAC
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* * * * * *
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** * * * *** *
22353056 AAAAATAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAGAAATTAGTATTA
1 GTAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTCCTACT-ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * **
22353121 TTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAA-TTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAA
64 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * ** *
22353185 CGATTTGATATAGATAATTATTCAAGTAGTTATGACTATTAAAACTTGTTCA
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* * * * ** * *
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1 GTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCCTAC-TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * *
22353302 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAA
64 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAA
22353367 TAATTGTTCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.40
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GTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCCTACTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACATGACTATTTAAACTTGTTCA
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22353694 ATTATGACCT
* *
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* * * *
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*
22353834 AATAATTATGACCATTTGAA-CAATTACTGATTTGAAATTGCTAAT-A-CC
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* * * *
22353882 TTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCCTATTTAGCATAAAATAATAC-AAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTT-TATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAAG
*
22353946 TTATTAAGATT-AAGATAATTAATACA-TAA-A-TTACTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
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** * * * * **
22354007 AGTTCAAATTGTTATGACTATTTAAGCAATTACTTATTTCAACTTGTTATGATTT
123 AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAGCAATTACTGATTTCAAATTGTAATGATCC
* *
22354062 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAAT
22354118 TTGGCAATTA
Statistics
Matches: 197, Mismatches: 27, Indels: 22
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Matches are distributed among these distances:
177 4 0.02
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181 3 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAAGTTA
TTAAGATTCAAATATTAATAATTAAGAGTTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAA
TAATTATGACCATTTAAGCAATTACTGATTTCAAATTGTAATGATCC
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Period size: 69 Copynumber: 2.0 Consensus size: 69
22354452 TACATTTATT
*
22354462 AATATTTCAAAAATAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTTAACACATTCAAATAG
1 AATATTTCAAAAATAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACACATTCAAATAG
22354527 TTTC
66 TTTC
*
22354531 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTTAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACACATTCAAATA
1 AATATTTCAAAAA-TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACACATTCAAATA
22354595 GTT
65 GTT
22354598 ATGACTATTT
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 2, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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AATATTTCAAAAATAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACACATTCAAATAG
TTTC
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22354952 AATAGTTATG
22354962 TCTATTTGAATAATTA
1 TCTATTTGAATAATTA
*
22354978 TCTATTTAAAATAAATATAATTA
1 TCTATTT-GAAT--A-AT---TA
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1 TCTATTTGAATAATTA
22355017 TCTATTT
1 TCTATTT
22355024 AAAATAAATA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 2, Indels: 14
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Matches are distributed among these distances:
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TCTATTTGAATAATTA
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22355106 TATGAAATTA
* * * * * * **
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* * *
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* *
22355245 AAAAAAAAATA-TAACTTTA-TTAATATATCAAAAATTGAGAAGT-T-GTAGATTT
129 AAAAAAAAATACT-A-TTTATTTAATATATCAAAAATT-A-AAGTGTAGGAGATTC
* * *
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1 AAAAAATAAATTAGTTTA-CAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *** * * ***
22355360 CAAATCATTATGAACTTTTATTCTATCTTAAAACAATTGTTTTACATCATATAAGCCTATTTGAA
65 CAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCAAAA
* * * * *
22355425 ATAAAATAATACTATTTATTTAATTTTTCAAAAATTAATGTGTAGGAGATTC
129 AAAAAAAAATACTATTTATTTAATATATCAAAAATTAAAGTGTAGGAGATTC
* * * * *
22355477 AAAAAATAAATTTGTTTACAGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATATATTTC
1 AAAAAATAAATTAGTTTACAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
22355542 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTC-AAA
66 AAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TCAAAA
* * * * * ** * *
22355606 ATAAAATAATACTAATCTA-ATAATATTAT-GAAAATTAATA-ACTAAGAGATTT
129 AAAAAAAAATACT-ATTTATTTAATA-TATCAAAAATTAA-AGTGTAGGAGATTC
* * * * * * *
22355658 AAAAAATAAATTTGTTTGCCA-AACTAGTTCAAAT-AGTAAGGCTATATG---AA-TA-C---TT
1 AAAAAATAAATTAGTTT-ACAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
22355713 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTCTTCAAATAAAA--TTGTTC-
65 CAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC--ATAAAAGCTT-ATCA
* * * * * ** * *
22355775 AAAATAAAATAATATTAATTT-TTTCAT-TTTTTAAAATT-AA---TAAGAGATTT
126 AAAAAAAAAAAATACT-ATTTATTTAATATATCAAAAATTAAAGTGTAGGAGATTC
* * * * * * * *
22355825 AAAAAATAAATCTA-CTTACCA-AACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTTAATAATTATTTATT
1 AAAAAATAAAT-TAGTTTA-CAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
22355888 TCAAATCCTTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGAT-ATAGTCTTATTC-
64 TCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAG-CTTA-TCA
* * * * * * * *
22355951 AGAATAAAATAATGCTAATTTA-TTAATAT-TCTTAAAATTAATAAGT-AATG-GATTT
126 AAAAAAAAAAAATACT-ATTTATTTAATATATC-AAAAATT-A-AAGTGTAGGAGATTC
* ** * * * * * * * *
22356006 AAAAAACAAATCTA-TTGGCCTG-ACCATTTCAAATAGTTATGACTACTCGAACAATTATTTATT
1 AAAAAATAAAT-TAGTT-TACAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * ** *
22356069 TCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTCACAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTC-A
64 TCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TCAA
* *** * *** ** *
22356132 AAATAATGTAATCCTAGTTTA-TTAATAT-TCTAAAAATTAAAAAATAAAAGATTT
127 AAAAAAAAAAATACTA-TTTATTTAATATATC-AAAAATTAAAGTGTAGGAGATTC
* * * * *
22356186 AAAAACTAAAGTT--TTTATCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATT
1 AAAAAATAAA-TTAGTTTA-CAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ***
22356248 TCAAATCGCTA-AACCTTTTGTTTTTTCATAAAAGAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC
64 TCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTATCAA
** * * * * ** *
22356311 AATTAAAATAATACAAATTTA-TTAATAT-TTAAACAATTAATA-AGTAAAAGATTT
127 AAAAAAAAAAATAC-TATTTATTTAATATATCAAA-AATTAA-AGTGTAGGAGATTC
* ** * * * *
22356365 AGAAAATAAATTTTTTTACTA-AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATT
1 AAAAAATAAATTAGTTTAC-AGAACT-AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATT
22356428 TCAAATC
64 TCAAATC
22356435 ATAATACAAG
Statistics
Matches: 882, Mismatches: 190, Indels: 133
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
AAAAAATAAATTAGTTTACAGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTC
AAATCGTTATAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCAAAAAA
AAAAAAATACTATTTATTTAATATATCAAAAATTAAAGTGTAGGAGATTC
Found at i:22355542 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 22355038--22356434 Score: 930
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22355028 TAAATAACTA
* * * * * * * *
22355038 TTTTAGTTCATACATGTTTATTCAAAACAAAATAATACTATTTTATTAACAT-TAAAAAAATTAA
1 TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATAT-CAAAAATTAA
* * * * * * **
22355102 TAAGTATGAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTCCCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTAAAA
65 TAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCACAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * *
22355167 CAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACATTTTGTTTTATAATAAAACAATTG
130 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * *
22355219 TTTTTGTTCATAAAAGCTTATCAAAAAAAAAAAAATA-TAACTTTATTAATATATCAAAAATTGA
1 TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATATCAAAAATTAA
* * * * * * * * **
22355283 GAAGTTGTAGATTTAAAAACTAAATTAGTTT-ATCGAA-TAGTTCAAATAATTATGGCCCTTTGA
65 TAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCA-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
22355346 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTATTCTATCTTAAAACAATTG
129 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
** * * ** * *
22355399 TTTTACATCATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTATTTAATTTTTCAAAAATTAA
1 TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATATCAAAAATTAA
** *
22355463 TGTGTAGGAGATTCAAAAAATAAATTTGTTT-ACAGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
65 TAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCACA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * *
22355527 ACAACTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-
129 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * * * *
22355579 ATTTATGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTA
1 TTTTA-GTTCATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TATCAAAAATTA
* * * * *
22355643 ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC-CAAACTAGTTCAAATAG-TAAGGCTATATG
64 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CACAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
22355706 ---AA-TA-C---TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
128 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
** * * * * * * **
22355752 TTTTTCTTCAAATAAAA--TTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTTTTCAT-TTTTTAAAATTA
1 TTTTAGTTC--ATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATATCAAAAATTA
* ** * * * * *
22355814 AT-A--A-GAGATTTAAAAAATAAATCTACTT-ACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTT
64 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCA-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
22355874 AATAATTATTTATTTCAAATCCTTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
128 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * * *
22355928 TTTCTA-TTGAT-ATAGTCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAT-TCTTAAAATT
1 TTT-TAGTTCATAAAAG-CTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATATC-AAAAATT
* * * * * ** * * *
22355990 AATAAGTAATG-GATTTAAAAAACAAATCTATTGGC-CTGACCATTTCAAATAGTTATGACTACT
63 AATAAGT-AGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TCACAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
22356053 CGAACAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTCACAAAATAATTG
126 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* ** * * ** * *
22356108 TTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCAAAATAATGTAATCCTAGTTTATTAATAT-TCTAAAAATTAA
1 TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATATC-AAAAATTAA
* * ** * * *
22356172 AAAATAAAAGATTTAAAAACTAAAGTT-TTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
65 TAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCA-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
22356235 ACAATTACCTATTTCAAATCGCTA-AACCTTTTGTTTTTTCATAAAAGAATTT
129 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* ** * * *
22356287 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATAT-TTAAACAATTA
1 TTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATATCAAA-AATTA
** * *
22356350 ATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATTT-TTTTACTAAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
64 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCAC-AAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* *
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127 GAACAATTATCTATTTCAAATC
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Statistics
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AAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCACAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
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22354521 AAATAGTTTC
* * * *
22354531 AATATTCAAAAATTAATAAGTTAA-AATTTAAAAAATAAATATGTTTTCCTAACACA-TTCAAAT
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* * *
22354594 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTTG-C-CATAAAC
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* * * * * * * * * * **
22354656 -TAT-TTGTTTCAATTTAAACAAACTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAGTATAATAA
124 AAATGTT-TTTC--TTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTCTAA
* * * * * *
22354719 AAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACC
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* * * * * * * *
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* *
22354847 CAGTTCATACATGCTTATTCCAAATAAAATAATACTAATTTATT
307 TA-TTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
22354891 AATATTCAAAAATTTAATATA-TAAGAAATTAAAAAAAAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAAT
1 AATATTTAAAAA-TTAATA-AGTAAGGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCCTAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
22354955 AGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATAATTATCTATTTGAATAATTATCT
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* * * * * *** * *
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117 A--CAAAACAAAT--GT-TTTT-CTTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * * * * *
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176 AA-TTTCTAAAAATTAATAA--A--AGATTTAAAAAATAAA-TTATTT-ACAAACTAGTTCAAAT
** * * * * * *
22355150 AGTTATGACTATTAAAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACATTTTGTTTTATAATAAAACA
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* * * * * *
22355215 ATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TCAAAAAAAAAAAAATA-TAACTTTATT
299 ATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATACTAA-TTTATT
* * * * * ** * *
22355266 AATATATCAAAAATTGAGAAGT-TGTAGATTTAAAAACTAAATTAGTTTATCGAA-TAGTTCAAA
1 AATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAG--GATTTAAAAAATAAATTA-TTTGCCTAACAAGTTCAAA
* * * * * * * * **
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62 TAGTTAT-G-ACTATGAA-AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAAC
* * * * * *** ** *
22355394 AATTGTTTTACATCATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTATTTAATTTTTCAAAA
124 AAATGTTTTTCTTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATTTCT-AAAA
** * *
22355458 ATTAATGTGTAGGAGATTCAAAAAATAAATTTGTTTACAGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
187 ATTAA----TAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTACA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
22355523 TTGAACAACTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTATGTT
246 TTGAACAATTATATATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATT
* * *
22355588 CATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAT
311 CATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
22355627 AATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAAT
1 AATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAA-TTATTTGCCTAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
22355692 AG-TAAGGCTAT----ATGA-ATACTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
63 AGTTATGACTATGAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAAT
* * * * * * *
22355751 GTTTTTCTTCAAATAAAATTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTTTTCATTTTTTAAAATTAAT
128 GTTTTTCTTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTCTAAAAATTAAT
* * * * * * * *
22355816 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTTAATAATT
193 AAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTA-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
22355881 ATTTATTTCAAATC-CTTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATA-TAGT
256 ATATATTTCAAATCGC-TATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-
*
22355944 CTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATT
319 CTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
22355975 AATATTCTTAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCTGACCATTTCAAAT
1 AATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-GGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCCTAACAAGTTCAAAT
* *
22356040 AGTTATGACTACTCGAACAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTCACAAAATA
63 AGTTATGACTA-T-GAA-AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACA
* * *** ** ** * *
22356104 ATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCAAAATAATGTAATCCTAGTTTATTAATATTCTAAAAAT
125 AATGTTTTTCTTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTCTAAAAAT
* *
22356169 TAAAAAATAAAAGATTTAAAAACTAAAGTT-TTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
189 T----AATAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTA-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
** * * *
22356233 GAACAATTACCTATTTCAAATCGCTA-AACCTTTTGTTTTTTCATAAAAGAATTTTTTCTATTCA
248 GAACAATTATATATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCA
* *
22356297 TACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATT
313 TACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * ** *
22356334 AATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATTTTTTTACTAAATAAGTTCAAAT
1 AATATTTAAA-AATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATAAATTATTTGCCT-AACAAGTTCAAAT
22356399 AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAT
63 AGTTATGACTA--TGAA-AATTATTTATTTCAAATCAT
22356437 AATACAAGCT
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Matches are distributed among these distances:
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AATATTTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTATTTGCCTAACAAGTTCAAATAGT
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TTTCTTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTCTAAAAATTAATAAA
AGATTTAAAAAATAAATTATTTACAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATA
TTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC
AAATAAAATAATACTAATTTATT
Found at i:22356568 original size:136 final size:139
Alignment explanation
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Period size: 136 Copynumber: 2.0 Consensus size: 139
22356286 TTTTCTATTC
22356296 ATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAG--AAAG
* * * * * *
22356361 ATTTAGAAAATAAATTTTTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTA
64 A-TTAGAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTA
22356426 TTTCAAATCATA
128 TTTCAAATCATA
** ** ** *
22356438 ATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAG-ATG-T
1 ATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGAAAGAT
22356501 TA-AAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATT
66 TAGAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATT
22356564 TCAAAT
130 TCAAAT
22356570 TGTTATGACC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGAAAGAT
TAGAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTT
CAAATCATA
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Period size: 176 Copynumber: 3.6 Consensus size: 174
22356428 TCAAATCATA
* * * * * *
22356438 ATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACA-ATTAAT-A-AGATG
1 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TC-AAATATTAGTAAGAGAT-
* * * *
22356500 TT-AAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAATAATTATCTA
62 TTAAAAAAT-AATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAA-TATTTGAACAATTATCTA
* * * **
22356562 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAGTTC
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* * *
22356613 ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATCCAATATTCAGTAAGAGATTTA
1 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCAAATATT-AGTAAGAGATTTA
* *
22356678 AAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTAAACAATTTTCTATTTC-
65 AAAAAT-AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
22356742 AATCGTTATGACATTTTGTTTTACCATAAAAACATTTATTTTTGTTC
129 AATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * * *
22356789 ATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-TAAAAAAATTAATAAGTGAAAA
1 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-CAAATATTAGTAA--G-AGA
* * * *
22356852 TTTAAAAAATAAACTTGTTTTCTAAACACA-TTC-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
61 TTTAAAAAATAATC-TATTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTA
* * * ** *
22356915 TTTCAAATAGTCATGACCTTTTATTTTGTCATAAGCCAATTGTTTTTATTC
124 TTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * *
22356966 ATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TC--AAA-T-ATTAGTAAGAG
* *
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60 ATTTAAAAAAT-AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
22357077 TCTTTTGTTT
Statistics
Matches: 373, Mismatches: 64, Indels: 48
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (174 bp):
ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCAAATATTAGTAAGAGATTTAA
AAAATAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
TAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
Found at i:22356969 original size:177 final size:178
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Indices: 22356502--22357076 Score: 596
Period size: 176 Copynumber: 3.2 Consensus size: 178
22356492 ATAAGATGTT
* * *
22356502 AAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
22356566 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTG-TATCAGTTCATATAAGCTTATTCGAA
65 AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA
* * * * *
22356630 ATAAAATAAAACTAATTTATTAA-TATCCAATATTCAGTAA--G-AGATTTA
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATTA-CAAAAATT-AATAAGTGAAAATTTA
* * * * * * *
22356678 AAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTAAACAATTTTCTATTTC-
1 AAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
22356742 AATCGTTATGACATTTTGTTTTACCATAAAAACATTTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCCAAA
66 AATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAA
*
22356807 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATTAAAAAAATTAATAAGTGAAAATTTA
130 TAAAATAATACT-AATTTATTAATTACAAAAATTAATAAGTGAAAATTTA
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1 AAAAATAAA-TATGTTTTCTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * ** *
22356918 CAAATAGTCATGACCTTTTATTTTGTCATAAGCCAATTGTTTTTATTCATACAAGCGTATTCGAA
64 CAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAA
* * *
22356983 ATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
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* * ** *
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Statistics
Matches: 327, Mismatches: 54, Indels: 31
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Matches are distributed among these distances:
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AAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
AATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATTACAAAAATTAATAAGTGAAAATTTA
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* * ** *
22355779 TAAAATAATATTAATTTTTTCATTTTTTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTAC
1 TAAAATAATATTAATTTATTAATTTTCGAAAATTAATAAGAGA-TTAAAAAATAAATATACTTAC
* * * * * *
22355844 CAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTTAATAATTATTTATTTCAAATCCTTATAACCATTTG
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** * * **
22355909 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATATAGTCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTAT
130 TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATATAGTCTTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTAT
* * * * *
22355974 TAATATTCTTAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCTGACCATTTCAAA
195 TAATATTCTCAAAATTAATAAG-AA-GGATTTAAAAAACAAATCTATTGGACTAACAAGTTCAAA
* * * * **
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258 TAGTTATGAATACTCAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTTTTTACCACAAAATA
* ** ** * * **
22356104 ATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCAAAATAATGTAATCCTAGTTTATTAATATTCTAAAAAT
323 ATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCATAATTTATTAATATTAAAAAAAT
* *
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* * * *
22356234 AACAATTACCTATTTCAAATCGCTAAACCTTTTGTTTTTTCATAAAAGAATTTTTTCTATTCATA
453 AACAATTACCTATTTCAAATAGCTAAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* *
22356299 CAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAGATT
518 CAAGCGTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
22356364 TAGAAAATAAATTTTTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
583 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
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648 CAAATCATAATACAAGCTTATTTGGAT
* **
22356456 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGATG-TT-AAAAATAAATATGTTTA
1 TAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTCGAAAATTAATAAGA-GATTAAAAAATAAATATACTTA
* * ** * *
22356519 TCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
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129 GTTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCATAT-AGTCTTATTCAG-AATAAAATAAAACTAAT
* * ** *
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* * * *
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*
22356769 AAAA-ACATTTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAAT-ATAAATTTATT-A-AT
317 AAAATA-A-TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCAT-AATTTATTAATAT
* * *
22356830 TAAAAAAATTAATAAGTGAAA-ATTTAAAAAATAAACTTGTTT-TCTAAACACA-TTC-AATAGT
379 TAAAAAAATTAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAACTT-TTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGT
* * **
22356891 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TCATGACCTTTTATTTTGTCATAAGCCAAT
441 TATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATAGCT-A-AACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT
* *
22356955 TGTTTT-TATTCATACAAGCGTA-TTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAA-AA
504 T-TTTTCTATTCATACAAGCGTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AAACAA
* *
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566 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C---
* * ** * * * * *** *
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* * ** * * *
22357130 TAAAATAATACTAATTCATTAAAATTCTAGAAATTAATAGGTAGTAGATTTAAAAAAATTAATCT
1 TAAAATAATATTAATTTATTAATTTTCGA-AAATTAATA---AG-AGA-TT-AAAAAATAAATAT
* ** * *** * * *
22357195 ATTTACTGAACAAGTTCAAATAATCACGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
59 ACTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCCTTATAAC
* ** * * * *** * * *
22357260 CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTG
124 CATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATATAGTCTTATTCAGAATAAAATAAAACTA
* * * * * *
22357324 ATATATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-A-GATTT-AAAAACTAAATCTGTT-TATCGAAACAA
189 ATTTATTAATATTCTCAAAATTAATAAGAAGGATTTAAAAAAC-AAATCTATTGGA-C-TAACAA
* **** * * * * * **
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251 GTTCAAATAGTTATGAATACTCAAACAATTATTTAT-TTCAAATCATTATGA-CATTTTTTTTAC
* * * * ** * * *
22357446 CATAAAACAATTGGTTGTT-TTCATATGAGCTTATTCAGATTAAAATAATGC-TAATTTAATAAT
314 CACAAAATAATT-ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CATAATTTATTAAT
** ** * * *
22357509 ATTCCAAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTTATT-TGCTGAACTAGTTCAAATA
377 ATTAAAAAAATTAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAACTTT-TTAT-C-AAACAAGTTCAAATA
* ** * * *
22357572 -TTTTAGAC-ATTAT-AACAATTATATATTTCAAATCATTCT-GACCTTTTTGTTTTGTCATGAA
439 GTTAT-GACTATT-TGAACAATTACCTATTTCAAAT-A-GCTAAACC-TTTTATTTTGTCAT-AA
* * * * * * *
22357633 AA-AACTATTTC-ACTTTATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGA
498 AACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCGTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-A
** * * * *
22357696 AA-AATTAATGGGCAAGAGATTTTAAAAAATTAAATCTGTTTAGC-GAACAAGTTCAAATAGATT
561 AACAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAA-TAAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATAG-TT
*
22357759 -TGACTATTTGAATAATTATCTATTT
622 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
22357784 AAAGCAGTAT
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TAAAATAATATTAATTTATTAATTTTCGAAAATTAATAAGAGATTAAAAAATAAATATACTTACC
AAACAAGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCCTTATAACCATTTGT
TTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATATAGTCTTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTATT
AATATTCTCAAAATTAATAAGAAGGATTTAAAAAACAAATCTATTGGACTAACAAGTTCAAATAG
TTATGAATACTCAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTTTTTACCACAAAATAATT
ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCATAATTTATTAATATTAAAAAAATTAA
AAAATAAAAGATTTAAAAAATAAACTTTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
AATTACCTATTTCAAATAGCTAAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAA
GCGTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
AAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAA
ATCATAATACAAGCTTATTTGGAT
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** * * *
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* * *
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*
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* * * **
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* * ** *
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66 AAATAAAATAATACTAATTCATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAAAATAATACTAATTCATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAA
TCTATTTACTGAACAAG
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* * *
22357062 TTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATT
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * **
22357244 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTA
* * * ** *
22357308 GAATAAAATAATACTGATATATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
*
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131 CTGTTTATCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *** ** *
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1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
22357482 AGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
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* * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * ** *
22357662 TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGGGCAAGAGATTTTAAAAAATT
64 TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAA-T
* *
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* * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * ** *
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65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *** * *
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** * * * *
22357962 TTCAAATTGTTA-GAAACTTTTG--TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--CCATAGAAGCTCAT
1 TTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTAT
*** * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
22358129 TTCAATTCATTATAACCTTTTATTCTAGT-ATAAAATAATTGTTTCAGTCCATATAAGATTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * *
22358193 AAAATAAAATATTACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-TTAGAAGATTTAAAAAATAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAA
* * * *
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129 ATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
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1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * *
22358374 AAAATAAAATAA-ATCTAATTTATTAATA-TTCCAAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGA
65 AAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
22358434 AT-TGTTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCTAT
129 ATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * ** * *
22358486 TTCAAATCATTA--A----TTGTTTGGTCATATAATAATTGTATT-TGAACATTCAAGCTTATAT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTT
** * * * * * *
22358544 GGAGTGAAATAATACTCATTTATTAATATTTC-AAAA--AGTAA-TAAGAGATGTAAGAAATAAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** *
22358605 TCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAAC
130 TCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * ** *
22358657 TTCTAATCATTATTACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTA
* * * * *
22358722 AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAATAAAAT---
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAA
* * * * *
22358784 T-TGTTTGTTGAAGC-AGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTAT
130 TCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
22358835 TTCAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTCTTAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACTAA-CTT
1 TTC-AAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATAC-AAGCTT
** * * * * *
22358899 ATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTT-TTATTATTTAAAAAATTAATATGTAAGAGATTAAAAAA
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* * * * * * * * * *
22358962 ATAATTTTGTTTACCTATCCAGTTAAAATAATTATCACTATTTGAAGAATTATCTAT
125 ATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * ** * * *
22359019 TTCAAATTGTTTTTACCTTTTGTCTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTA
* * * * *
22359084 AAATTAAAAAAAAAAACTAATCTATTAATATTTC-AAAA--AATAA-TAAGATATTTTAAAAATA
66 AAA-T--AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
** * * * * * ** *
22359145 AATCCATTTATCAAACCAGTTCAAATAATAATGACCATTTGAGTAATTATTTAT
128 AATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * *
22359199 TTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * ** * * * **
22359263 ATAATCAAATAATGCTAACTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTTTTAAAATAAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
22359328 TATATTTA-CTGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTCAATAAATATTTAT
130 TCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * * *
22359380 TTCAAATCATTACAACCTTTTATTTTGTCAGAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTA
* * * * * * *
22359445 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAGAATTATTAATTAAGATATTTAAAAAATGAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
22359510 CTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTTTCTAT
131 CTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
*** * * ** * * * *
22359561 TTCAAATTGCTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATAAAAGCTGATTT
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* *
22359626 CAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAAATAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
65 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA-A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * *
22359688 AAAAT-TATTTACCTAACAAGTTCAAATCTTTTATGACTATTTGAACAAGTATTTAT
127 -AAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** ** * * * *
22359744 TTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTGGTTA-AAAATAATTGCTTTTA-TTCATACAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTA-TT
** * * * * ** * *
22359807 TGGATTAAAATAATATTATTTTACTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
64 TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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Statistics
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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** ** *
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** * *
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*
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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258 GTTCAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAATACTATAACCTTTTATTTTGTC
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** * * * *
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* * * * * * **
22361139 ATAAGTTCAAATAGTAATGATTATTTGAACAATTATATATTT-AAAATTGT-TAGGACC-TTT-T
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* * * ** * * * * * * *
22361200 GTT-T-ATAAAACAAATGTTTCAATTCATAAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATATTACTTTT
317 TTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTCCATGAAAA-CATATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTA
* * * * * * *
22361262 TTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGACTTAAAAAATAAATCAGTTTAC-AGAATCAA-TTC
380 TTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAAAAAAT--GTTTTCTA-AA-CAAGTTC
* * * * * * * ***
22361325 AAATAATTATGGCCACTTGAACAATTATTAATTTCAAATCACTATGAAC-TTTTGTTT-TATCAT
440 AAATAGTTATGACTATTTAAACAAGTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTGT-T-AT
* ** * **
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* * ** ** *
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** * * * * * * * *
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66 TATTTA-CTAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTA-AA
* * * * * * *
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129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCA-ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * ** * * * * * *
22361617 TAATCTAATAATATTATGAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAACATTAATTTGTTTACCGAAC
193 TAATTTATTAATATT-CCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATGAATATGTTTACC-AAA
* * * * * * * * *
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* * * * *** * ** * * * * *
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318 TTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTCCATGAAAACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTA
* * * * * * * * *
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383 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAAAAATGTTTTC-TAA-A-CAAGTTCAAATA
* *** * * ** ** * *
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445 GTTATGACT-ATTT-AAACAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTGTT-ATAAAAC
* *
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* * * * ** * *
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1 AATAAAA-TAATACTAATTTACTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * * * * **
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* ** * * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * **
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317 TTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTCCATGA-AAACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTTAT
* * * * *
22362337 TAATA-TTCAAACAACTAATAAGTAAATGATTT-AAAAAAAATTGTTTATC-GAATAAGTTCAAA
381 TAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAA-AATTTAAAAAAAAAATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAA
* * * * * *
22362399 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTCTTGTCATAAAAT
443 TAGTTATGACTATTTAAACAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT-TTGTTATAAAAC
* * *
22362464 AATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTA-TTTGG
507 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGG
* *
22362494 ------AT--TA--AA--T--TAATATTTTGATAATTAATAAATAAAAGATTTTTTACAAAAA-A
1 AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGA---TTTA-AAAAATA
* * * *
22362544 AA-A-ACTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AG
62 AATATA-TTTACT-AACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA-
* * ** * * * * *
22362606 TTATGACTTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAAT
124 TTA-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * ** * * * * *
22362671 TATACTAATTTATAAATATTCCAAAAATTAATGTGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTGCT
188 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTACC
* * * * * * * * * ** * *
22362736 GAACAACTTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGT
252 AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAATACTATAACCTTTTAT
* * * *** ** *
22362800 TTTGTCATAAAATAATT-TTTCTGTTCAT-ACAAGTTTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTA
317 TTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTCCATGA-AA-ACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTTA
* * * * * * * *
22362863 TTAATATTTCAAAAGTTGATAATTAAAAA-TTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACATGTTCAAA
380 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA-AAA-ATGTTTTCTAAACAAGTTCAAA
22362927 TAGTTAT
443 TAGTTAT
22362934 TATTGTTTGC
Statistics
Matches: 3234, Mismatches: 777, Indels: 400
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Matches are distributed among these distances:
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521 3 0.00
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TTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTACCAAACAAGTT
CAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAATACTATAACCTTTTATTTTGTCATA
AAACAATTGGTTCTGTCCATGAAAACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCA
AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAAAAATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
TTAAACAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTC
ATACAAGCTTATTTTGG
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * *
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* * *
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503 GTTCAAATCAGTTAT-GACTATTTA-AACAAGTATCTAT
* * * * * * *
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** * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * ***
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* * *** * * * * * *
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310 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTAT
* * *** ***
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374 G-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATCA-AA-CAT-ATTTCAAATAAAATA
* * * * * *
22358035 ATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTAGAGGATTTTAAAAATAAATTTATTTA-T
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
22358314 AATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTT-AAAA
186 AATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAATTCATATAA-CTTTTTTCAAAA
* * * *
22358378 TAAAATAA-ATCTAATTTATTAATATTCC-AAAATT-TAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAAT-TG
249 TAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAGGAAGAGATTTAAAAAATGAATATG
* *** * *
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* * * ** * * * ** * *
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376 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCA-TCAAACATATTTCAAATAAAATAATA-
* * * * * *
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438 TAAATTTTTTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT-TATTTA-CTAA
* * * * ** *
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500 CAAGTTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAAGTATCTAT
* * * ** * * *
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** * * * * * * *
22358719 TCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAATAAAAT
63 TCGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAAT
* * * * * * * * * *
22358784 ---T-TGTTTGTTGAAGC-AGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAATC
127 AAATATATTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTC-AAATC
* * * **
22358844 ATTATGACCTTTTTGTTTTGTCTTAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACTAACTTATTT-GGAAT
190 ATTATG-CC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTATTTT-AATTCATA-TAACTTTTTTCAAAAT
* * ** * * * *
22358908 AAAATAA-AATGAATTT-TTATTATTTAAAAAATTAATATGTAAGAGATTAAAAAAAT-AATTTT
250 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGGAAGAGATTTAAAAAATGAA-TAT
* * * * * * * * * * * * *
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* * * ** * * * * *
22359035 CTTTTGTCTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCAT-ATAAGTTTGTTTAAAATTAAAAAAAAAA
377 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATCA-AA-CATATTTCAAA-TAAAATAATAT
* * * * * * * *
22359099 ACTAATCTATTAATATTTCAAAA--AATAA-TAAGATATTTTAAAAAT-AAATCCATTTATCAAA
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* * * * * ** * *
22359160 CCAGTTCAAAT-AATAATGACCATTTGAGTAATTATTTAT
500 CAAGTTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAAGTATCTAT
* * * * * * *
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** * * * * * * * * * **
22359261 TCATAATCAAATAATGCTAACTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTTTTAAAATA
63 TCGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
22359326 AATATATTTA-CTGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTCAATAAATATTTATTTCAAATCAT
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** * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * ** * *
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** * * *
22359584 TTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATAAAAGC-TGATTTCAAATAAAATAATATAAATTTA
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** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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66 GAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
22359874 ATATTTTTCAAACAAGTTCAAATAGTCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGATTATG
131 ATATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * * * * * *
22359939 ACATTTTGTTTTCTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCTTATGAGCTTATTT-GAAATAAAATAAGA
196 -CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAATTCATAT-AACTTTTTTCAAAATAAAATAATA
* * *
22360003 CTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAAAGAGGAAGAGAATTAAAAAATGAATATGTTTACCGAAC
259 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAA-AGGAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTACCAAAC
* *
22360068 ATGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTTG
323 AAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
22360133 TCATAAAACAATTGGTTCTGTCCATGCAAACATATTTCTAATAAAATAATATAAATTTTTTAATA
388 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-CAAACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTTTTTAATA
* ** *
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**
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* * * *
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22360346 TCGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
63 TCGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-
* * *** ** * *
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127 AAATATATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAT
* *
22360476 TATGCTCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTATTCATATAATTTTTTTCAAAATAAAATA
192 TATGC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAATTCATATAACTTTTTTCAAAATAAAATA
* * * * * *
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256 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAG-GAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTACC
* * **
22360605 AAACAAGTTCAAATAG-TCTG-TCCATTTAAATTATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTT
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* * * *
22360730 TTTTTAATATTTTAAAAATTAATAAG----ATATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAAACAA-T
443 TTTTTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTATTTA-C-TAACAAGT
* * * * *
22360790 TCAAAT-AGTTATTACTATTTGAATAATTATTTAT
505 TCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAAGTATCTAT
* * * * *** * **
22360824 CTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTG-TCAAAAAGAAATTG-TTTCTATTGGTACAAGCACATT
1 TTCAAATCGTTATGACT-TTTGGTTTGATCAAAAA-CAATTGCTTT-TATTCACAAAAGCTTATT
* * * * ** * ** *
22360886 T-GGAGTAAAATATTGCAAAACTAATAATGTTATAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAAT-
63 TCGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * ** * * * * ** * * * *
22360945 -ATGTGTTTGCCAAACCAGTTTATATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTT-TTTAAAATCGT
128 AATATATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT-TTATTTCAAATCAT
* * * * * * * **
22361008 TCTAACCTTTT-TTTAGTCATCAAATAATTGTTTCAATTCATACATGTTATTCTTC---ATAAAA
192 TAT-GCCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAATTCATATAACTT-TT-TTCAAAATAAAA
* * * * * * * * * *
22361069 TAATATTATTTTATTAACATT-AAAAGAATTAATCAGCAAGAAATTTAAAAAAAATAAATCTATT
254 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAA-AATTAA-AAGGAAGAGATTT--AAAAAATGAATATGTT
* * * * * * *
22361133 TATCAAATAAGTTCAAATAGTAATGATTATTTGAACAATTATATATTT-AAAATTGTTAGGACCT
315 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAA-TATTATGACCT
* ** * * * *
22361197 TTTG--TT-T-ATAAAACAAATGTTTCAATTCATAAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATATTA
379 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-CAAA-CATATTTC-AAATAAAATAATATAA
* * * ** * * *
22361257 CTTTTTTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGACTTAAAAAAT-AAATCAGTTTACAGAATCA
441 ATTTTTTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTA-TTTAC-TAA-CA
* * * * * *
22361321 A-TTCAAAT-AATTATGGCCACTTGAACAATTAT-TAAT
502 AGTTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAAGTATCT-AT
** * * ** * * *
22361357 TTCAAATCACTATGAACTTTT-GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCGTCATACAAGCCTA-TT
1 TTCAAATCGTTATG-ACTTTTGGTTTGATCA-AAAACAATTGCTTTTATTCACAAAAGCTTATTT
** * * * ** *
22361420 AAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATATAAAAAATA
64 CGGAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
** * * * * *
22361484 AATATGCTTATCAAACAAGTTTATATAGTTATGACTATTTAAATAATTATGTATTTCAAATCATT
128 AATATATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
22361549 ATGACCTTTTGTTTAGTCATAGAACAATTA-TTTATCTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAAT
193 ATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTA-ATTCATATAA-CTTTTTTCAAAATAAAAT
* * *** * ** * *
22361612 AATACTAATCTAATAATATTATGAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAACATTAATTTGTTTAC
255 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGGAAGAGATTTAAAAA-ATGAATATGTTTAC
* * ** * * * * * * *
22361677 CGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATAATCTATTTC-TAATCGTTATAACCTTT
318 C-AAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTT
* * * ** * ** * * * * *
22361740 TG-TTTATCGTAAAACAAATGTTT-TGTTTGTGTATGCTTGTTTGAAATAAACTAATATTAATTT
381 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-CAAACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTT
* * * * * *
22361803 ATTAATATTTTAGAAATTATTATGT----GATTTAAAAAAT-AAATCTATTCACAATATCAA-TT
445 TTTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT-TATTTAC--TAACAAGTT
* ***
22361862 CAAAT-AGTTAT-AATAATTTGAAATTTTGT-T-TAT
506 CAAATCAGTTATGACT-ATTT-AAA-CAAGTATCTAT
* * * ** * *
22361895 TTTAAATCATTATGACCATTT-GTTTTTTCATAAAATAATTG-TTTCTATT-A-ATACAGTCTTA
1 TTCAAATCGTTATGA-CTTTTGGTTTGATCA-AAAACAATTGCTTT-TATTCACA-AAAG-CTTA
* * * * ** *
22361956 -TTC-GAAAAAAAGTAATGCTAA-TTATTAATATTCT-AAAA-TAA-AAGT-ATGGA-TT-GAAA
61 TTTCGGAATAAAA-TAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * ** ** * * * * * * * *
22362012 ATGAATCT-GTTGGCTTGACTAGTAT-AAATAGTTATAATTGTTT-ATACAAGTATCTATTTCAA
125 ATAAATATATTTATC-AAACAAGT-TCAAATAGTCATGACTATTTGA-ATAATTATTTATTTCAA
** ** * * * * * ** *
22362074 AGT-GGTATGACCTTTTGTTTCATTACAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGC-TAATTCGAA
187 A-TCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TAATTCATATAA-CTTTTTTCAAA
* ** * * * * *
22362136 ATAACATAATTTTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAACTGAATCT
248 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAGGAAGAGATTTAAAAAATGAATAT
* * * * * *
22362201 GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTACCTATTTC-AAATCACTAT-A
312 GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA
* * * * * * * *
22362263 TCCTTTTTTTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATG
376 -CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-CAAACATATTTCAAATAAAATAATA
* * * * * * * *
22362328 CAAATTTATTAATATTCAAACAACTAATAAGTAAATGATTT--AAAA-AAAATTGTTTATCGAAT
438 TAAATTTTTTAATATTTAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTATTTA-CTAAC
* * * *
22362390 AAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTAT
501 AAGTTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAAGTATCTAT
* * * * * * * * *
22362428 TTTAAATTGTTATGACTTTTTGTCTTG-TCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTT
1 TTCAAATCGTTATGACTTTTGGT-TTGATCA-AAAACAATTGCTTTTATTCACAAAAGCTTATTT
* * ***
22362492 -GGATTAAATTAATA-T--TTTGA-T--AA-T-TAATAAA-TAA-AAG---ATTTTTTACAAAAA
64 CGGAATAAAATAATACTAATTT-ACTAAAATTCTAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAA
* * * *
22362543 -AAA-A-ACTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
126 TAAATATA-TTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
* ** * * * * * * *
22362604 -AGTTATGACTTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATATAGGC-TTATTCGAAATA
189 CA-TTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAATTCATATA-ACTTTTTTCAAAATA
* * * * * *
22362667 AAATTATACTAATTTATAAATATTCCAAAAATT-AATGTGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTAT
251 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAG-G-AAGAGATTTAAAAAATGAATATGT
* ** * * * * * * *
22362731 TTGCTGAACAACTTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGA-CT
314 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCT
* *** ** *
22362795 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTCTGTTCATACAAGTTTTATTTTGAATAAAATAATACAAA
379 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-CAA-ACATATTTCAAATAAAATAATATAAA
* * * * ** *
22362859 TTTATTAATATTTCAAAAGTTGATAATTAAAA-A-TTAAAAAAT-AAATCTATTTTTTGAACATG
442 TTTTTTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT-TATTTACT-AACAAG
22362921 TTCAAAT-AGTTAT
504 TTCAAATCAGTTAT
22362934 TATTGTTTGC
Statistics
Matches: 4110, Mismatches: 921, Indels: 618
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
515 3 0.00
516 15 0.00
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TTCAAATCGTTATGACTTTTGGTTTGATCAAAAACAATTGCTTTTATTCACAAAAGCTTATTTCG
GAATAAAATAATACTAATTTACTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
ATATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAATTCATATAACTTTTTTCAAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAGGAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTACCAAACAAG
TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTCTGTTCATCAAACATATTTCAAATAAAATAATATAAATTTTTTAATATTTA
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTATTTACTAACAAGTTCAAATCAGTTATGAC
TATTTAAACAAGTATCTAT
Found at i:22361533 original size:18 final size:19
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22361502 GTTTATATAG
22361512 TTATGACTATTT-AAATAA
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*
22361530 TTATG--TATTTCAAATCA
1 TTATGACTATTTCAAATAA
22361547 TTATGAC
1 TTATGAC
22361554 CTTTTGTTTA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 5
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TTATGACTATTTCAAATAA
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22362198 TCTGTTTATC
* * * *
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** * * * * * *
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* * * *
22362338 AATATT-CAAACAACTAATAAGTAA-ATGATTTAAAA-A-AAAT-TGTTT-ATCGAATAAGTTCA
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* * *
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193 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTCTTGTCATAAA
* * *
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321 AAGATTTTTTACAAAAAAAAAACTTTACT
* * * *
22362555 GAACAAGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGT-TATGACTTTTT
1 GAACAAGTTCAAATAGTCATAA-CATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTATAT-ACTTTTT
* * * *
22362618 GTTTCATCATAAAACAATTATATC-AGTTCATATAGGCTTA-TTCGAAATAAAATTATACTAATT
64 GTTTCATCATAAAACAATTATATCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATT
* ** * *
22362681 TATAAATATTCCAAAAATTAATGTGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTGCTGAACAACTTT
127 TATAAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTGCTGAACAACTTC
* * *
22362746 AAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA
192 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTCTTGTCATAAA
*
22362811 ATAATTTTTCTGTTCATACAAGTTTTATTTTGAATAAAATAATA
257 ATAATTTTTCTGTTCATACAAGTTTTATTTGGAATAAAATAATA
22362855 CAAATTTATT
Statistics
Matches: 250, Mismatches: 39, Indels: 20
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (349 bp):
GAACAAGTTCAAATAGTCATAACATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTATATACTTTTTGT
TTCATCATAAAACAATTATATCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATA
AATATTCCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTGCTGAACAACTTCAAAT
AGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTCTTGTCATAAAATAA
TTTTTCTGTTCATACAAGTTTTATTTGGAATAAAATAATATTTTGATAATTAATAAATAAAAGAT
TTTTTACAAAAAAAAAACTTTACT
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Indices: 22363431--22366199 Score: 1062
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22363421 TTATAACTAT
* * ** *
22363431 TTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGTTTATTCA
1 TTTAAATCATTATGACCTTTT-GTTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTT-TT-A
* * * * *
22363496 -AATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCAAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTT-AAAAA-AA
63 GAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
22363558 ATGTGTTT-GTCAAACTAGTTTAAACAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA
127 ATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
22363610 TTTGAAAT-GTTTTGACCTTTCGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTT
1 TTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-TT-TTT
* * *
22363674 AGAATTAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACCAAGAGATTTTAAAAAATAA
62 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
*
22363739 ATCTATTTACTAAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTA
127 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTA
*
22363791 TTTAAAGTCATTATGACCTTTTGATTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAATGTTTCT
1 TTTAAA-TCATTATGACCTTTTG-TTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT-AAAA-GTTTTT
* * ** * * *
22363856 AAAATAAAATAATATTTCTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAACGAGAGA-TTTAAAAACTA
62 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATA
* * * * * *
22363919 AAGCTATTTTCCTAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATAACAA
126 AATCTA-TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * * * *
22363972 GCTCAAATCGTTA-CA-ATCTT-TCT--CATAAAACAATTGCTTCTGA-TCATACAAGTTTATTT
1 -TTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGCATAAAACAATTGTTTC-AATTCATAAAAGTTT-TTA
* * * * *
22364031 GAATAAAAATAAAAGTAATTTAATAATATTCTAAAAATT-A-AA--AAGATA-TTTAAAAAATAA
63 GAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
* * * * * *
22364091 TTGTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAATG-CTA-TTGAAATAATTATCTA
127 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTG-AACAATTATCTA
* * * * * * *
22364143 TTTCAAATCATTTTGACCTTTGGTTTAGTCATATAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT
1 TTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-TT-TTT
* * * *
22364208 AGAATAAAATAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATTAA
62 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
* * * * *
22364273 ATCTATTTACCAAAGAAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAACTATCTA
127 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * **
22364325 TTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCAT-----AATTGTTT-AGTTCATAAAAGCTTATCC
1 TTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTTTAG
* * * * * *
22364384 AA-AATA-AATACTACTTTATTAATATTTC-AAAACTTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAAAAAAA
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
22364445 T-TAGTTTACTGAATC-AGTTTAAATAATCATGGCCATTTAAACAACTATCTA
128 TCTA-TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * *
22364496 --T---T--TT-TG---TTTTG-TT---ATAAAACAATTGTTTTC-A-GCATACAAAATTTTTTG
1 TTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATA-AAAGTTTTTAG
* *
22364544 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTGC-AAGAATTAAT----AAGAGATTTTAAAAAATAA
64 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
*
22364604 ATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAG---T---TA--T----AA--ATCTA
127 ATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * *
22364642 TTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTT
1 TTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AAAGTT-TTT
* * * * *
22364707 AGAATAAACTAATTCTAATTTATTACTATTTC-ACAAATTAAT----AAGAG--TTTAAAAACTA
62 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATA
** * * * *
22364765 AATCTCCTTACTGAGCTAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTA
126 AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * ** * * * *** * * *
22364818 TCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTTTCCTAAAACATTTATTTGTGTTCATATAAGCTTATTC
1 T-TTAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-TTTTTA
* * * * * *
22364882 GAAGT-AAATATTGCCAAATTAATAATATTCTAAAAATTAAT----AA-AGA-TTTAAAAAATAA
63 GAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
* * * * * * * * ** *
22364940 ATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTGAAGACTAGTAAAAAAATTATCTA
127 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * ** *
22364992 TTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCACACATGCTTAATC
1 TTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-TTTTTA
* * * **
22365057 GAAATAAAAAAATGCTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AA-AGAAATT-AAAAA-AA
63 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAA
* * *
22365118 ATCTATTTA-TAAAACAAGTT-AAGTAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTA
127 ATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * * * *
22365169 TTTAAAATTGTTATGACTTTTTATTTTACCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCAT-AAAGCTTCTCT
1 TTT-AAATCATTATGACCTTTT-GTTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-TT-TTT
* * ** * ** *
22365233 -GAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGA-TTTAAAACATA
62 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATA
* * * * * *
22365296 AATC-AGTTTATTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTA
126 AATCTA-TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * ** * * * *
22365349 TTTTAAATCATTACAAACTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTC-A-TCATACAAGCCTAT
1 -TTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAA-T-TGTTTCAATTCATAAAAG--TTT
* * * *
22365412 TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATACGTAGGAGA-TTTAACAA
60 TTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAA
* * * * * *
22365474 ATAAATATGTTT-TTCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACCAATTATATA
123 ATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTA
** * * * * * ** *
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1 -TTTAAATCATTATGACCTTTT-GTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-TT-TT
* * * * * * *
22365594 T-GTAAGAAAATAATACTAATATAATAATAGTCTAAAAATTAATAA-CTAATAGA-TTTAGAAAA
61 TAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTTAAAAAA
* * * * * * * *
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124 TAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTA
* * ** * * * * *
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1 TTT-AAATCATTATGACC--TTTTGTTTAG-CATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATA-AAAGTT-
* * * * * ** * *
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* * * * * * *
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121 AAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * ***
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1 TTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAA-AAG-TT-TT
* * *** *
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61 TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATA
* * * * * *
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** * * * ** *
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1 -TTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG--TT-TT
* * * * * *
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61 TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGCAA-GAGATTTTAAAAAA
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* * * * * *
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*
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* ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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TTCAAAAAATTAATAACAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGAT
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TTTCAATTCATAAAAATGTTTCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT
AAACAAGAGATTTGAAAAACTAAAGCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAA
CAAATAACAAGCTCAAATCGTTACAATCTTTC
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22364487 AACTATCTAT
* *
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*
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* * *
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* * * * * * * *
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127 CAAATAGTTAT
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1 AAA
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * ** ** *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * * * * **
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* * * * *
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* * * * * *
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130 TGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-CAAAA
* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * *
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* *
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* *
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* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTC-AAAA
* ** * * *
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64 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTC-GAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATAAC
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1 -AATTGTT-T--CTG-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAA--TTTAT-TAATAT
* ** ** * * * * * *
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** * * * ***
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* * *
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164 T----T-GTTTTGTC-A-TAAAAC
* * * * * * ** *
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1 AATTGTTTCTGTTC--AT-AC---AAGC--TT-ATTCGAAATAAAATAATATTAATT-TATTAAT
** * * ** ** * *
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* * ** * * * * * **
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**
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* * * * ** * * ** * ** *
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* * * * * * *
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168 TTTGTCATAAAAC
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCAAAAAT
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* ** * *
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1 -AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTCAAAA
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64 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTC-AAAA
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* * * * * * *
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* *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
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65 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * *
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129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * *
22372843 AATTATTTATCTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA-TAATCTAATAATATT-ATGAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCA--AAA
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* * * * **
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* * * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
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* * * *
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130 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ATTAATTTATTAAT-AT-TCAAA
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* * * * * *
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128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT-TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCA-AAA
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTG--T--TTTGTC-A--T-AAAAC
* * * * * * * * ** *
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1 AATTGT----TTCTG-TTCATACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATAT-TA---ATTT---AT-
* * * * * * * ** *
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*
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175 TAAAA-C
* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * ** ** * *
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** ** * * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
22369961 TCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAATTA
192 TCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* ** * * * * *
22370024 AAAGAATTTTAAAATAAATATGTT-CGTTGAACAAG-TCTAAATAGTCATAACTATTTGAA-ATT
255 AGA-AATTAAAAAATAAATTTTTTAC--TGAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACA-A
** ** *
22370086 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAATTATAAAAC
315 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * ** * ** * *
22370130 AATTGCATCAGCTCATGTAGGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTTAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
22370194 ATTAATGAGTAAGAGATTGT--AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGAA-TA
64 ATTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-AACTA
* * ** * *
22370256 TTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATCT-TGATC-TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTT-A
127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT-TATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCA
* * * *
22370317 TATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAG
190 -GTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * *
22370381 T-AGAAATTTAAAAATAAATCTATTTT-CTGAACATGTTTAAATAGTTAT-TCTATGTGAACAAT
253 TAAGAAATTAAAAAATAAAT-T-TTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
22370443 TATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTATTATAAACC
316 TATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
22370486 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
22370551 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAGCAAGCTT-AAACAGTTATGACTA
65 TTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAG-TTCAAATAGTTATAACTA
* * * ** * * * * *
22370614 TTTAAATAATTATTTATTTCAAATAATTATGATC-TTTAGTTTTATCGTGAACCAATTGTTTTA-
127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAG
* *
22370677 TTCATGCAAG-TGTATTC-ATAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAGT
191 TTCATACAAGCT-TATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
* * ** * * *
22370740 -TGAAGATTAAAAAAATTAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
254 AAGAA-ATT-AAAAAATAAATTT-TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * *
22370804 TATCTATTTCAAATCATTGTGATATTTTCTTTTGTCGTAAAAT
316 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * *
22370847 AATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * *
22370912 TT--AA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTCTTTATCAAACTATTTCAAATAGTTA-AGACAAT
65 TTAAAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT
* * ** * * * * *
22370972 TTGAACAGTTATCTATCTCAAATCATTATG--ATCTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTATTTTTA-
128 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACAT-TTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCAG
** * *
22371034 TTCATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
191 TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
22371098 AG-AATTTAAAAATAAATATGTTAGCAGAACCAA-TGCTAATTTGTTA--A-TATTTTGAA-AAT
255 AGAAATTAAAAAATAAATTTTTTA-CTGAA-CAAGTTC-AAATAGTTATGACTA-TTTGAACAAT
* ** * ** * * * * ***
22371157 TA-ATAAGT--AATAGATT-TAGAAAATGAATATG-TTGGCTGACCAGTGC
316 TATCTATTTCAAAT-CATTAT-G-ACCT---TTTGTTTTG-TCA-TAAAAC
* * * * * ** **
22371203 TAATAGTTATGACTGTTTGA-ACAA--TTATTT-ATTTCAAATCATTTTAACCTTT-TGTTTTAT
1 -AATTGTT-T--CTG-TTCATACAAGCTTATTTGA-ATAAAATAATACTAA--TTTAT-TAATAT
** **** * * * * * ** **
22371263 CACAAATAAGTTGTTTCTCTTGGTACAAA-TTTATTCAAAACAACATAAT-TCTAACTTATTAAT
57 TTCAAA-AA------T-TAAAAGTA-AAAGATT-TTAAAAATAA-AT-CTGT-TTACCGAACAA-
* * * * * * * ** * **
22371326 ATTCCAAA-AATTAATAA--GTTAG-AGATTTA-CAAAATGAACCTGTTTATAGGACATGTTCAA
108 GTT-CAAATAGTT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG-TTAT--GACAT-TT---
* * * ** * * *** ***
22371386 ATAGTTATGA-CTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCACTATAACCTT-TT-GTTTTGTCATA
164 -T-GTT-TTATC-A-TAAAAC-A--AT-TGTTTCAGTTCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* ** * * * *
22371448 A-AATAATTT-TT-ATATTCATACAAGCTTATTCCAAAT-A-AAA-T--AACACAAATTTATTAA
219 ATATTAATTTATTAATATTC-TA-AAAATTAAT--AAGTAAGAAATTAAAAAATAAATTT-TT--
* * * * * ** * *
22371505 TATTCAAACAA-TTCAAA-AG-TA--A-AAGTTT-AAAAATAAATCCGTTTACCGAATTAGTT-T
277 TACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAAT-TATCTATTT--CAAATCA-TTAT
* * ** **
22371562 AGA----TAGTTATAACTATTTGAAC
336 -GACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAAC
* * * * ** * * ** * *
22371584 AATTATTTATTTTAAATTGTGATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTTGTTCATAC
1 AATTGTTTCTGTT-CA-T-ACAAG-C---TTA-TTTG-AATAAAATAATACTAATTTATT-A-A-
* * * * ** ** *
22371648 AAGCTTATTC--AAATTAAATACTATAA-TTTATTAATATTTTGATAA-CT-AATA-AGTAA-AA
54 TA---T-TTCAAAAATTAAA-AGTAAAAGATT-TTAA-A-AAT-A-AATCTGTTTACCG-AACAA
* * * * * *
22371706 GATTTTAAAAATA-TATATGTTATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
108 G---TT-CAAATAGT-TA--TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTG
* * * * * * * *
22371770 CTTCATTATAAGACAATTGTATCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
166 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * *
22371835 TAATATTCT-AAAATTAATGAGTAACAGATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAA-
231 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTAAAAAATAAATTT-TTTACTGAACAAGTTCAAAT
* * * *
22371898 AGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
295 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * *
22371962 AATTATTTTTGCTCATACAAGTTTATTTTGAGTAAAAT-TTA-TAAATTTATTAATATTTCACAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
** * * * ** * * * *
22372025 ATTAATAAGTAGTA-A-TTTAAAAAGTAAGTATGTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTCTGACTC
64 ATTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* ** * ** ** * * * ** *
22372088 TTTGAAC---TATTTA-AAC-AATTATCTATTTCAAATAG---T-T-AT-GACCCTTTGTTT-TG
127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT-TATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * ** ** * *
22372141 TTTATACAAACTAATTCGAAATAAAAT-ATCGCTAAACTAATAATATTCTAATAATTAATAAGTA
191 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * **
22372205 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTA-TT-----A--A
255 AGA-AATTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
22372262 TCTATTTCAAATCATTCT-A-CTTTTTTATTTAGTGATAAAAT
318 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAAC
** * ** *
22372303 AATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTCATTAACA-TTCAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTC-AAA
* * * * * *
22372366 AATTAATAAGCAAGAA-ATTTCAAAAAATAAATCTATTTCCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
63 AATTAA-AAGTAA-AAGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
* * * * *
22372430 TATTT----TATTA---ATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCAAAAGAAAACAATTGTT
125 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATC---ATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
22372488 TCAGTTAATAAAAGCTTATTCAAAAGAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGA
187 TCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATA
** * ** * * * * *
22372552 AGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCAAAACAGTTTAAATAATTAT-AGCCATTTGAA
251 AGTAAGA-AATTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA
* *
22372615 CAATTATCTATTTCAAATCATGATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAC
312 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * *
22372662 AATTGTTTTTCATCATAAAAGCTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
22372727 TTAATAAGT--AGGACTTTTAAAAAATAAATATGCTTATCAAATCAA-TTCAAATAGTTATGACT
65 TTAA-AAGTAAAAGA-TTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACT
* * * * * * * *
22372789 ATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-AT
126 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCA-
* * * * * * * * * * *
22372853 CTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA-TAATCTAATAATATTATGAAATTTAATAACTG
190 GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * * *
22372917 AGCAATTTAAAAAATATATTTGTTTGCTAAACCAA-TTCAAATAATTAAGGCTCTATGAATAATT
255 AG-AAATTAAAAAATAAATTT-TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* **
22372981 ATCTATTTCAAAT-AGTAACAACC--TT-TTTTGTCATAAAAC
317 ATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
22373020 AAATGTTTTTG-T--T-CAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
22373081 TT--AA-TAAGAGA-TTTAACAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATT
65 TTAAAAGTAAAAGATTTTAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * * *
22373142 TGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCA-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-T
129 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGT
* ** * * * * * *
22373205 TAATACAATTTTATTCAAAATAAAGTAATGA-TGATTTATTAATAATGTAAAAAGTAATAAGTAA
192 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * * *
22373269 CAGATTTAAAAAATGAATCTATTAGCCTGACCAA-TACAGATAGTTATAACT-TTGTAAATAATT
256 GA-AATTAAAAAATAAATTTTTTA--CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATT
** **
22373332 ATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAC
317 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * ** * *
22373374 AGTCGTTTCTGTTCGTACAAGCTGATTCCAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * *
22373439 AGTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAACTGAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATCACTA
64 ATTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * *
22373503 TTTGAATAATTACCTATTTCAAATT-TCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA
127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT-TATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-A
* ** * * *
22373567 -TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTC-ATACAACTATTAAG
190 GTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
22373629 TACA-AGATTTAAAAAAAAAATCTATTTACCGAATAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAATAA
253 TA-AGA-AATTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
22373693 TTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTTATAAAAT
315 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * * *
22373737 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTTAAACAATATTACTTTATTAATATTT-GACAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
22373801 TTAATAAGGAAAAGATTTTAAAAA-ATATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
65 TTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * *
22373865 TGAATAATTATCTATTTCAAATCTCATAACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATAAC
129 TGAACAATTATCTATTTCAAAT-T-GT---TA--TG-A-CATTTTGT-TTT---ATCA-TA-AAA
** * * ** ** * *
22373930 CTTTTGTTTCA--TCATAACATAACTATATTAGTTCAT-ATCTACTTATTTGAAATAAAATATTA
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** * * * * * * ** * *
22373992 ATGCTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTACCAAACAAGTCCAAATG
233 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATA
* * * *
22374057 GTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
296 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-C
* * *
22374121 AATTTTTTTTGTTCATACAAGC-TATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAA
* ** * * * * *
22374183 AATTAATAAGTGAAA-ATTAAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-AACGTTTAAATAGTTATGACT
63 AATTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAA-GTTCAAATAGTTATAACT
* * * * *
22374246 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA
126 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-A
* * * *
22374311 -TTCATACAAGCATATTCGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTA
190 GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * * *
22374374 A-AAATTTTTAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAGCAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAAT
255 AGAAA--TTAAAAAATAAATTT-TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
22374437 GATTTA-TT----TC---A--A-C-------TTGTCATAAAAT
316 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * * * * *
22374462 AATTACTTCTATTCACACAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATCAATA-TTCTAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * * * *
22374526 ATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAGTAGTCATATCCAT
64 ATTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT
* *** * * * *
22374591 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATGACTTTTTATTTTGTCATTAAAA-AATTGTTTCTGT
128 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCA-TAAAACAATTGTTTCAGT
** ** * * * * *
22374655 TCATGTAAAATTATTCAAAATTAAATAATACTAATCTT-TTAATATTTTGAAAATTAATAAG--A
192 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAAT-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
22374717 G-ATTTAAAAACTAAATTTGTTTACTGAA-ATAGTTTAAATAGTTAT---TATTTGAAGAATTAT
256 GAAATTAAAAAATAAATTT-TTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
22374777 CTATCTCAAATCATTGTGATC-TTTATTTTGTCATAAAAC
319 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
22374816 AATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTGAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
22374880 ATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA--TGTTTGA-TGAGCCAGTTTAAATAGTTA-AGACT
64 ATTA-AAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACT
* * * * * *
22374941 ATTAGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTATTTCA
126 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCA
* * * * * * * * *
22375005 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATATAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATAAATTAGCA
190 GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * ** *
22375070 AGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAAT
255 AGA-AATT-AAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAT
* * *
22375134 TATCT-TTTTAAAGTCATTATGACTTTTTGGTTTGTCATAAAAC
316 TATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * *** * *
22375177 AATTGTTTCAATTCATA-AGAACTCATCCAAATTAAAATAATACTACTTTATTAATTTTTCAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACA-AGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
22375241 ATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAACCTAAAGT-TGTTTTCCAAACCAGTTGAAATAGTTATGACT
64 ATTAA-AAGTAAAAGATTTTAAAA-ATAAA-TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACT
* * * ** * * * *
22375304 ATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATG--ATCTTTGTTTTCTTATAAAAAAATTATTTCT
126 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACAT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-
* * * ** *
22375367 A-ATCATACAAGCTTATT-TAGATAAAAATAATACCAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAA
189 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA
* * * * * * ** * * *
22375429 G--AG--ATTTAAAAATAAATATGTTTCCTAAACTATTTCAAATAGTTAACATTATTAGAATAAT
252 GTAAGAAATTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * *
22375490 TATCGATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATATAAT
316 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* *
22375533 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAA
1 AATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * ** **
22375597 ATTAATAAGCATGAGATTTAAAAAAAATAAAT-TAGTTTTTCGAACAAGTTCAAATACCTATAAC
64 ATTAA-AAGTAAAAGATTT--TAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
* ** ** *
22375661 TATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTT
125 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * **
22375725 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAATTC-AAATGTTAATAAG
189 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAG
* * ** * * * * *
22375789 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACAAAATCAA-TTCAAATAATTGTGGCCATTTGAATAA
253 TAAGA-AATTAAAAAATAAATT-TTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** ** *
22375853 CTATCTATTTCAAATTGTTAAT-ACAATTTGTATTGTCATAAAAC
315 TTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* *
22375897 AATTGTTT-T-TTCATATACAAGCTTA-TT-AA-AAAA-AACACTAATTTATTAATATTTCAAGA
1 AATTGTTTCTGTTC--ATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * ** * * *
22375956 ATT--AA-TAAGAGCTTTAAAAAACAAATATGTTTACTAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATT
64 ATTAAAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * *
22376018 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TT
129 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTT
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22377026 GTAGACACCC
Statistics
Matches: 7938, Mismatches: 1816, Indels: 1369
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
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Done.