Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167871.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_14, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 114000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 122 of 125
Found at i:22368427 original size:176 final size:174
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * *
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** *** * * * * * *
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* ** * * *
22368702 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCGTCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTGAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
22368767 TTATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTACCAAA-TAAATCTGTTTAAC-GAACTAGTTCAA
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* * * * * * * * * * * * *
22368830 ATAGTT--GACTATTTGAAAAATTATATATTTCACATTATTTTAACCTTTTA
123 ATAATTAAGAATACTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTG
* * * * * * * * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * * * * * *
22368945 TAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCTGAACCAGTTCAAA
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* ** * * * **
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* * * *
22369062 TTTTGTCATAAAGCAATCT-TTTCAATTCTTACTAACTTATTCAGAATAAAATTAA-A-TAAATT
1 TTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATAC-AACTTATTGA-AATAAAA-TAATACT-AATT
* * * * * ** * *
22369124 TATTAATATTTCAAAAATTAATCTGTAA-GAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGTTGAACCAGTT
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* * * * * * * * *
22369188 CAAATAATTATGACTATTTA-AATAGTTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTG
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* * * * * * * *
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* *** * * * * * * * *
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* * * * * * * ** * *
22369368 TTTA-ACTATTTGGACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTG
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* * * * * *
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* ** * * * * ** * *
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** * * * * * * *
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* ** * * * * ** *
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* * * * * * *
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** * * * * * *** * *
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* * * ** * ** *
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* * ** * * *
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* * * * * * * ** *
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** * ** * ** * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTA--TTGAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * * * *
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* *** * * * *
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* * * * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
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64 TAACATT-CAAAAATTAATAAG-----GAGTTTAAAAACTAAATCTCTTTACTAAACCAA--TTC
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAACT-TATTGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* * * *
22370833 TTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AACTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* *
22370898 T-ACTATTTCAAAAATTAATAA-GAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTA-TCAAACTATTTCAAAT
64 TAAC-A-TTCAAAAATTAATAAGGAG-TTTAAAAACTAAATCTCTTTACT-AAACCAATTCAAAT
* * * * * *
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125 AATTAAGA-ATACTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTG
* * * * * * * *
22371009 TTTTGTCCTAAAACATTTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATAATGCTAAATTAA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTATTGAAA-TAAAATAATACTAATTTAT
*
22371074 TAATATTCTAAAAATTAATAAG
64 TAACATTC-AAAAATTAATAAG
22371096 TAAGAATTTA
Statistics
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*
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1 TTCAAATAGTTATGAC
22369237 CCTTTGTTTT
Statistics
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22369366 ATTTTAACTA
* * * * * *
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* *** *
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*
22369502 TAATA-ATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAGTGGTG
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* ** *
22369543 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AATATTCTATTTTATCATAAATTAATTGTTTCTA
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*
22369607 TTCATATAAGTTTATTCAAAATAACATAATTTTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAA
65 TTCATATAAGTTTATTCAAAATAACATAATTCTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAA
22369672 GAGATTTAAAAAATGAATCTATT
130 GAGATTTAAAAAATGAATCTATT
22369695 TGCTGAACAA
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 17, Indels: 11
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AGATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAGTGGTG
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*
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1 CTATTTCAAATTGTTAT
22370107 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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* * ** * *
22366428 TTATTCCAAATAAAATAACAAAAATTTATTAATATTC-AAACAATTAATTAGTAAAAGATTTAAA
1 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTT---
* ** * * * * *
22366492 AAATAAATCTGTTTTTCAAATAAGTTCAAAT-TTGTATAACT-TTTAGAACAATTATATATTTCA
62 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTT-GAATAATTATCTATTTCA
* * * * * *
22366555 AATCAT-TATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGA
125 AATCATCTATGATC-TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGA
* * * *
22366617 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAAAGAGTAAAATATTTTAAAAATAAAT
188 A-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAA-AGTAGAA-A-TTTAAAAATAAAT
* * * * ** * * **
22366681 ATGTTTACCGAACAAGCCCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
248 CTATTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * ** * * * ** *
22366746 GCATTTTGTTTAATTATAAAACAATTGTATCAGTTCATATAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATA
311 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATA
* * * * *
22366810 TTAATTTATTAATATTCCCAAAATTAATAAGT--AAGAAATTAAAAATAAAT-TGTTTTACTGAA
375 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTTAAAATAAATATG-TTCACT-AA
* * * * * ** * *
22366872 -CAAG-TTCAAATAGTTATGACTCTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTT
438 GCAAGCTT-AAACAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTAGTT
** * ** **
22366935 TTGTCATAAAACAATTGTTTAT-GTTCAAACAAG
502 TAATCATAAAACAATTG--CATCACTCATGCAAG
* * * * *
22366968 CTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATCCCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAA
1 -TTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* * * ** * * * * *
22367031 AAAAATAAATATGTTTTCTGAATATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTA
62 --AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * *
22367096 AAT-AGT-TATGA-CATTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTCTT-TGTTCATACAATCTTATTC-
125 AATCA-TCTATGATC-TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
22367156 GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAA
186 G-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTAGAA-ATTT-AAAAATAA
* * * * * * * * * **
22367220 ATTTGTTTACTTAGCTTGCTT-AAACAGTTATGACTATCTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
246 ATCTATTTTC-GAACATG-TTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
22367284 ATGATCTTTTGTTTTATCATGAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCATAA-TAAAATA
308 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AAGTAAAATA
* * * * * * * * *
22367348 ATACTAATTTATTACTATTCTAAAATTTAACAAGTTAAAG-ATTTAAAAAATTAATTTGTTTACC
372 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTT-TAAAATAAATATGTTCA-C
* * * * * ** * *
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435 TAAGCAAGCTT-AAACAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACC-TTT
* ** ** *
22367475 -GTTCT-ATCACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
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* *
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1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-AGTAAGAG-ATTTA
* * ** * * * * *
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63 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAA
* * * * * * *
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127 TCATCTATGATCTTTTTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAGAAT
* *
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190 AAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGT-AGAAATTTAAA-AATAAATCTA-
* * * * **
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251 TTTTCGAACAT-GTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * *
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314 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATACTA
* * * * * *
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378 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTT-TAAAATAAATATGTTCACT-AAGCA
* ** * * * * *
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441 AGCTT-AAACAGTCATAACT-ATTT-AAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGAC-CTTTAGTT
** * ** * * *
22367993 TTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAA
502 TAATCATAAAACAATTGCATC-ACTCATGC-AAG
* * * * *
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1 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--A
* ** * * * * * *
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63 AA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * ** *
22368151 TTGT-TATGATCTTTGTTTTGTTC-GAAAACATTTATTTCTATTCATATAAGCTTATTTGGAGTA
127 TCATCTATGATCTTTTTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * * * * *
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191 AAATAAT-ATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTAGAAATTTAAA-AATAAATCTATT
* * * * * * * * * *
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253 TTC-GAA-CATGTTCAAATAGTT-ATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * *
22368338 TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATA-CTTATGTGAAA-TAAAATAATACTA
315 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACA-AGCTTAT-TCAAAGTAAAATAATACTA
* * * ** * * * * *
22368401 ATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAA-AATTAAAAAAATAAATCTATTTACAAAACAA
378 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATT-TTAAAATAAATATGTTCACTAAGCAA
* ** * * * * * * ** * *
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442 GCTT-AAACAGTCATAACTATTTAAAT-AATTATCTATTTCAAATAATTATGAC-CTTTAGTTTA
** * * * **
22368526 ATCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAAG
504 ATCATAAAACAATTGCATCA-CTCATGCAAG
* * * * *
22368557 TTTATTCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTTATAAGTTAGAGATTTAAA
1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--A
* * * * * * * *
22368622 ACATAAATCAATTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTGTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAA
63 A-ATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** * **
22368686 ATCAT-TATGAACATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCGTCATACAAGCCTATTTGGAATA
126 ATCATCTATGATCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * * * *
22368750 AAATAATACT-AATTGATTTATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGA-TTACCAAATAAATCTG
191 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTA-GAAATTTA-AAAATAAATCTA
* * * * * * * *
22368812 TTTAACGAAC-TAGTTCAAATAGTT-GACTATTTGAAAAATTATATATTTCACATTATTTTAACC
251 TTT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * ** * ** *
22368875 TTTTATTCTATCATAAAACAATTATTCCTATTCATACAAGCTTATTTGGAAG-AAAATAATAATA
314 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATAATACTA
* * *** * * * * * ** *
22368939 ATGTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTATTTGCTGAA-CC
378 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTT-TAAAATAAATATGTTCACT-AAGCA
* * * * * * * * *
22369002 AG-TTCAAATAGT--TAAGCTTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTTGTT
441 AGCTT-AAACAGTCATAA-C-TATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACC-TTTAGTT
** * ** * * * *
22369064 TTGTCATAAAGCAATCT-TTTCAATTCTTACTAAC
502 TAATCATAAAACAAT-TGCATC-ACTCATGC-AAG
* * **
22369098 TTATTCAGAATAAAATTAA-ATAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATCTGTAAGAGATTTAA
1 TTATTCAAAATAAAA-TAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* * * **** * * * *
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62 -AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * *
22369226 ATCGT-TATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTTAAATAA-CTCTATTC-GAA
126 ATCATCTATGA-TCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCAG-A
* * * ** * * *
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188 ATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTA-AAAGTAGAAATTTAAAAATAAATCTAT
* * * * * **
22369350 TTACTAAACTACT-TT--AAT-TTTA-ACTATTTGGACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC
252 TTTC-GAAC-A-TGTTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * ** * * *
22369410 ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAC-AGTCTTATTTGGAA-TAAAGTATTGCT
314 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAG-CTTA-TTCAAAGTAAAATAATACT
* * * * *
22369473 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA--ATAATAA-TTT--AA-AAA-ATG--AATCTATTG-
377 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTTAAAATAAATATGTTCA-CTA-AGC
* * * ** * * * ** * ** *
22369528 --GCCTGACCAG---T-GGTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATATTCTA-TTTT
440 AAGCTTAAACAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTT-TAGTTTA
** ** * **
22369586 ATCATAAATTAATTGTTTCTATTCATATAAG
504 ATCATAAAACAATTGCATC-ACTCATGCAAG
* * * *
22369617 TTTATTCAAAATAACATAATTTTAACTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* * ** * *
22369681 AAAATGAATCTATTTGCTGAACAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
62 -AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * ** *
22369746 AT--TGCTAT-AACGTTTGTTTTGT-A-AAAA-AA--AATTCTATTCATACAAGCTAATTCCA-A
126 ATCAT-CTATGATC-TTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAGA
* **
22369802 ATAAAATAATACAAATTTATTAATATTC-AAACAATTAAAACGTA-AAATATTTGAAA-AAATCT
188 ATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAAAA-GTAGAAAT-TTAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
22369864 ATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTTTTTAAACAATTA-CTTATTTTAAATCATTGTGG
250 ATTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGA
* * * *
22369928 CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACT
312 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATAATACT
** * * **
22369993 AATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAATTAAAAGAATTTTAAAATAAATATGTTCGTTGAA-C
377 AATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTTAAAATAAATATGTTCACT-AAGC
* * ** *
22370056 AAG-TCTAAATAGTCATAACTATTTGAAAT-TTTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
440 AAGCT-TAAACAGTCATAACTATTT-AAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTAGTTT
* * *
22370119 AATTATAAAACAATTGCATCAGCTCATGTAGG
503 AATCATAAAACAATTGCATCA-CTCATGCAAG
* *
22370151 CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTTAAAATTAATGAGTAAGAGATTGTAA
1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAA
* * *
22370216 ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATTTAAAATC
64 ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* **
22370281 ATCT-TGATCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA
129 ATCTATGATCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
22370345 TAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAGTAGAAATTTAAAAATAAATCTATTTTCTG
194 TAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTAGAAATTTAAAAATAAATCTATTTTC-G
* * * *
22370410 AACATGTTTAAATAGTTATTCTATGTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATT
257 AACATGTTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTT
* * * *
22370474 TTATTATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATT
321 TTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATACTAATTTATT
* *
22370538 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTTAAAAATAAATCTGTTTACTAAGCAAGCTTAAA
385 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTT-AAAATAAATATGTTCACTAAGCAAGCTTAAA
* * * * * * * *
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449 CAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTAGTTTAATCATAAAAC
** * *
22370667 AATTGTTTTATTCATGCAAG
514 AATTGCATCACTCATGCAAG
* * *
22370687 TGTATTCATAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAGT-TGAAGATTAAA
1 T-TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT---
* * * * *
22370751 AAAATTAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACT-ATTATCTATTTCA
61 TAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCA
* * * **
22370815 AATCAT-TGTGATATTTTCTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAA
125 AATCATCTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA
*
22370879 TAAAATAATACT-AATTTATTACTATT-TCAAAAATTAATAAG-AG--ATTTAAAAACTAAATCT
189 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAGAAATTTAAAAA-TAAATCT
* * * * * *
22370939 CTTTATCAAACTAT-TTCAAATAGTTAAGACAATTTGAACAGTTATCTATCTCAAATCATTATGA
250 ATTT-TCGAAC-ATGTTCAAATAGTT-ATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * *
22371003 TC-TTTGTTTTGTCCTAAAACATTTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATAATGCT
312 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATAATACT
* * * * * *
22371067 AAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAGAATTTAAAAATAAATATGTT-AGCAGAACC
377 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTTAAAATAAATATGTTCA-C-TAAGC
*** ** *
22371129 AATGC-TAATTTGT--TAA-TATTTTGAAAATTAATAAGTAATAGATTTAGAAAATGAATATGTT
440 AA-GCTTAAACAGTCATAACTA-TTT--AAA-TAAT---T-ATCTATTT--CAAAT--A-A--TT
* * ** ** ** * ** *
22371190 GGCTGACCAGTGCTAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTTTAACC
489 --ATGACC--T--T--TAGTT-T-AATCATAAAACAA-T-TGCA--TC-ACTCA-TGCAA-G
**** ** * * * ** * * * * ** * *
22371252 TT-TT-GTTTTATCACAA-A-TAAGTTGTTTCTCTTGGTACAAATTTATTCAAAACAACATAATT
1 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-CTA-AAAATTAAT--AAGTAAGA-GATT
* * * * * * *
22371313 CTAACT-TAT-TAATATT-CCAAA-AA-TT--AATAAGTTA-GA-GATTT-ACAAAATGAACCTG
61 -TAAATAAATCT-AT-TTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGA-ATAAT-TATCTA
* ** * * ** * * * * * * *
22371368 TTT-ATAGGA-C-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCACTATA
120 TTTCAAATCATCTATGATC--TTTTTTTTGTC-A--T-AA-AATAAT-TGTTTCTATTCA-TACA
* ** *** * * *
22371430 ACCTT-TT--GTTTTGTCATAAAAT-AATTT-TT-ATATTCATACAAGCTTATTCCAAA-TA-AA
176 AGCTTATTCAG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTC-TA-AA---AATT-AAAAGTAGAA
* ** * * * * * *
22371487 A-TAACACAAATTTAT-TAATATTCAAACA-ATTCAAA-AG-TA-A-AAGTTT-AAAAATAAATC
234 ATTTA-A-AAATAAATCT-ATTTTCGAACATGTTCAAATAGTTATACTA-TTTGAACAAT-TATC
** * * * * ** ** *
22371544 CGTTTACCGAATTAGTT-TAGA----TAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATT-TTAAATTG
294 TATTT--CAAATCA-TTAT-GACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTATTT-TTGTT-CA-T-
** * * *** *** * * * * * *
22371603 TGATGACTT-TTTATTTTGTCATAA-AATAATTGT-TT-TTGTT-CATACAAGCTTATTCAAATT
349 ACAAG-CTTATTCAAAGTAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCCA-A-AA-ATTAAT--AAGT
* * * * * * * * * *
22371663 AAATACTATAATTTATTAAT-ATTTTGATAACTAATAAGTAAAAGATTTTAAA-AAT-ATATATG
407 AAA-A-GA-ATTTTA-AAATAAATATG-T-TC-ACTAAG--CAAG--CTTAAACAGTCATA-A--
* * ** * * * * * *
22371725 TTATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGCTTCATTATAAGACAATTGT
458 CTA---TTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTAGTTTAATCATAAAACAATTGC
* **
22371790 ATCAATTCATATAAG
520 ATC-ACTCATGCAAG
* * * * *
22371805 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATGAGTAACAGATTAAAA
1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT--TA
* * * *** * * *
22371869 AATGAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAA-AGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT
63 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * ** * ** *
22371933 TAT-TTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATACAAGTTTATTTTGAGTAA
128 CATCTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * * * * *
22371997 AAT-TTATAAATTTATTAATATT-TCACAAATTAATAAGTAGTAATTTAAAAAGTAAGTATGTTT
192 AATAATATAAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAGAAATTTAAAAA-TAAATCTATTT
* * *
22372060 TCTAAACATGTTCAAATAGTTCTGACTCTTTG----A--A-CTATTT-AAA-CAATTAT---CTA
254 TC-GAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCT-
*** * ** ** * * * *
22372113 TTTCAAATAGT--TATGACCCTT-TGTTTTGTTTATACAAACTAATTCGAAA-TAAAAT-ATCGC
315 TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAAT-AC
** * * * * * * *
22372173 TAAACTAATAATATTCTAATAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC-CGAA
376 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTT-TAAAATAAATATG-TT-CACTAA
* * * * * * *
22372236 -CTAG-TTCAAATAGTTAAAACTA--T---T-A--ATCTATTTCAAATCATTCT-ACTTTTTTA-
438 GCAAGCTT-AAACAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGAC--CTTTAG
* * * ** * * *
22372289 TTTAGTGATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATG
500 TTTAATCATAAAACAATTGCATC-ACTCATGCAAG
* * * * *
22372324 CTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTCATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTCA
1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* *
22372388 AAAAATAAATCTATTTCCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT---T-ATTA---ATTTAA
62 --AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * * * * * *
22372446 AATTGT-TATGACCTTTTATTTTATCAAAAGAAAACAATTGTTTC-AGTTAATAAAAGCTTATTC
125 AATCATCTATGATCTTTT-TTTTGTC---ATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * *
22372509 AAAAGAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAA
185 AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCT-AAAAATT-AAAAG-TAGAAATTT-AAAAATAA
* * * *
22372573 ATC-AGTTTATCAAAACA-GTTTAAATAATTATAGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
246 ATCTA-TTT-TC-GAACATGTTCAAATAGTTATA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * ** * *
22372636 GATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATAAAAGCTTGTTCGAAA-TAAAAT
307 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAAT
* * *
22372700 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AGGACTTTTAAAAAATAAATATGCTT-
371 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTT--AAAATAAATATG-TTC
* * * * * * * ** *
22372762 ATCAAATCAA--TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCT
433 A-CTAAGCAAGCTT-AAACAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCT
* ** * * **
22372825 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT--ATTTATCTTCATAAAAG
496 TTAGTTTAATCATAAAACAATTGCA-TCA-C-TCATGCAAG
*** * * * * * * *
22372864 CTTATTTGGAATAAAATAATA-TAATCTAATAATATTATGAAATTTAATAACTGAGCA-ATTTAA
1 -TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAA
* * * * * * * *
22372927 A-AAATATATTTGTTTGCTAAACCAA-TTCAAATAATTAAGGCTCTATGAATAATTATCTATTTC
64 ATAAATCTA----TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* ** * * * * * * *
22372990 AAAT-A-GTAACAAC-CTTTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-T-TGT--T-CAAGTTTGTT-TGA
124 AAATCATCTATGATCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAG-
* *
22373046 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG-AG--ATTTAACAAATAAATA
187 AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAGAAATTTAA-AAATAAATC
* * * * * * *
22373107 TGTTTACCAAACCA-GTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATA
249 TATTT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * ** * *
22373171 ACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTAATACAATTTTATTCAAAATAAAGTAATGA
311 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATAAT-A
* * ** * * * * * * *
22373236 -TGATTTATTAATAATGTAAAAAGTAATAAGTAACAG-ATTTAAAAAATGAATCTATT-AGCCTG
375 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTT-TAAAATAAATATGTTCA--CTA
* * * ** ** *
22373298 ACCAA---TACAGATAGTTATAACT-TTGTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTT
437 AGCAAGCTTA-A-ACAGTCATAACTATT-TAAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTA
** * * ** ** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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** * ** *
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* * ** ** ** * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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*
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* *
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* **
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* * ** *
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* * ** **
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * ** * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
22384836 TTA- TTAT TT-T TT-T TTCTT TTAT GTTAAT ATAT ATATT TTAT TTAT
1 TTAT TTAT TTAT TTAT TT-AT TTAT -TT-AT TTAT TTA-T TTAT TTAT
* * * ** * *
22384881 CTAG TTAT ATAT TTA- TTAT TTAT GCAT TTAT ATAT TATAAT TTAT CTA-
1 TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT T-T-AT TTAT TTAT
* *
22384929 TTA- TTA- TTAT TT-T TTAT TTAT CTTGT AATAT TT-T TTAT TTAT CTTA-
1 TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT TTAT -TTAT -TTAT TTAT TTAT TTAT -TTAT
* * * *
22384975 TTAT TT-T TT-T CCTAA TTAT CTAT TAATAT TTTT TTATT TTAT TTAT
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TTAT
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*
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* * ** * *
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**
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* *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* *
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*
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*
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*
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TATTTATTATT
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * ** ** *
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** * *
22386841 ATTAACATTTCAAAAATTAATAAGAAATACATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCA
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* * * *
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* * **
22386970 ATAATTGTTTCTGATCATAAAAGCTTATTCAGTTATAAATAATACTAATTT
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* * * * * ** * * * *
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* ** * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* **
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* * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* ***
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* *** *
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* * * * * * *
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* * * *** *
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* * * * * * *
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** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ***
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* * * * *
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* * **
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* * * * * * * *
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* * * **
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* * *
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*** *
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* * * *
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*
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* * * * * * *
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66 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCTA
* * * * * *
22387422 AAATAAAATAATACAAATTTCA-TAATA-TTCAAAAAATTATTAAGCAAAAGTTTTAAAAAATAA
131 GAATAAAATAATACTACTTT-ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * * * * * * * *
22387485 ATTTGTTTACCAAACAAATTCAATTAGTTACGACTATTTCAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTA
194 ATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * * *
22387550 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTTTTCGAGATAAAAATA
259 TGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGATTATT-AAAAT-AAAATA
* * * *
22387614 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAATTGAATCTATTTATCGAATC
321 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-AGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTATCGAACC
* * * * * * ** *
22387679 TATTCAAATAATTAT--CTACTT-CA-AATTAT-TATTTC----C-TT-T----TGT-TTGGTCA
384 AATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTATTTTTTA
* * * * * * * *
22387728 TATAACAGTTATTTTTTTATCATACAAGCTTA-TTCAGAATCAAATAATACTAATTTATTAATCT
449 TAAAACAATTGTTTATGT-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
22387792 T-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAGAAAACAAGTTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT
512 TCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATATATTTA-CAAACTAGTTCAAATAGTT
* * * ** ** * * *
22387856 ATGTCCATTTGAGCAATTGTATTCTTCAAATCAATTATT-TAAAAAATAAACCTTTTGTTCTA-T
575 ATGACTATTTAAATAA-T-TA-TC-T-ATTTCAA--ATTGT----TAT-GACTTTTTGTT-TAGT
* * * *
22387919 CATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAAAATATTAATCTAATAATAT
627 CATAAAATAATTATTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
22387984 TCTAAAAAGTAATAACTAAGAG
691 TCCAAAAATTAATAACTAAGAA
* * * * *
22388006 ATTTAAAAATTAAATTTATTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAA-TAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * ***
22388071 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTTTTTCAATTCATACTCGCTTATCT
65 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCT
* * * *
22388135 GGAATAAAATAAAATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAT
130 AGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
22388200 TTTGTTTA-CTAAC-TAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTT
195 TCTATTTACCAAACAT-GTTCAAATAATTATGACCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * * ** * * * *
22388262 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATGTAAGTTTGTTTGAAATAGAATAA
258 ATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATT-ATTAAAATAAAATAA
* * * * *
22388327 TTCTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGTCAAACCAA
322 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAA
* * * *
22388392 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTAGTTTTGTTA
386 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTA-TTTT-TTA
** * * * * *
22388457 TAAAACAACAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
449 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * ** *
22388521 TCAATAATTACTAAGTAAAAAATTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTAAATCAAATAATTAT
514 T-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATATATTTA-CAAACTAGTTCAAATAGTTAT
*
22388586 GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTAT-TTT-GTCATAAAAAAATTAT
577 GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTT-TGTTTAGTCATAAAATAATTAT
* * ** * *
22388649 TTCAGCTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAGTATTCCAAAAATT--TA
641 TT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
*
22388712 CACTTAAGAG
705 -AC-TAAGAA
* * * * * * * * *
22388722 ATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTGAACGAGTTTAAATAATTATAATTATTTGAACAGTTATTTA
1 ATTT-AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
22388787 TTTGAAATTATTATAACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCATTTCATAGAAGCTTATT
65 TTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATC
* * * * * *
22388852 TTGAATAGAATAATACAAATTCATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
129 TAGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * ** *
22388916 AATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC----A---A---CAAATTGTT
193 AATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * ** *
22388971 ATGACTTTTTGTTTTGTT-ATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTTGATTAAAATAA
258 ATGACATTTTGTTTT-TTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTAAAATAAAATAA
* * * *
22389035 TATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAA-TAACTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCGA
322 TACTAATTTATTAATA-TTT--CAA-AAATTAA-T-AAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTATCGA
* * * *
22389099 A-CAAGTTTAAATAGTCATGAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACATTT-TTT
381 ACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTATTT
* * * * * *
22389162 TGTAATAACACAATTGTTTAAGTTAATATAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
445 T-TTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
22389227 TATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATGAATCTATTTACCAAGCAAGTTCAAAT
509 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATT-AAAAAAATAAATATATTTA-CAAACTAGTTCAAAT
* *** * ** * * *
22389292 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTCAGTTTTGTCAAAAAAGA
571 AGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAATA
* * * *** * *
22389357 ATTAGTTTTGTTCATGCAACCTTATTTTGAATAGAATGATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAA
636 ATTA-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAA
22389421 TTAATAA--AA-AA
699 TTAATAACTAAGAA
* * * *
22389432 ATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTA
1 A-TTTAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * ** * * *
22389497 TTTCAAATCGTTACGTTCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGGTTATT
65 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATC
* ***
22389561 TAGAATAAAATAATACTAGTTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATA
129 TAGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
** * * *
22389625 AATCTATTTACCAAACATGTTCAAATTGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTACTTCAAATCT-T
193 AATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT-TGT
* * * * *
22389689 TATGACATTTTATTTTTTCGTCAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAACA
257 TATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATT-AAAATAAAATA
* * * * * *
22389754 ACAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGGATTTAAAAATTAAATCTGATTATTGAACCA
321 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTATCGAACCA
*
22389819 ATTTAAATAGTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATCT-AAGATCATTATGATC-TTTATTTTTT
385 ATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGA-CATTTATTTTTT
* * * * * *
22389881 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATAT
448 -ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
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512 TCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATATATTTA-C-AAACTAGTTCAAATAGTT
* * * * *
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575 ATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTA
* ** * *
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640 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-
22390139 AAC-AAGAA
704 AACTAAGAA
* * *
22390147 ATTTTGAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATC
1 A-TTT-AAAAATAAATTTGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
22390211 TATTT-AGAA-CAAATATGATCTTTTGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTCAGTTCATTAAAGCTT
63 TATTTCA-AATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTT
* * * * * *
22390274 ATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAAAGAATTAAAAAA
126 ATCTAGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * * *
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191 TAAATCTA-TTTACCAAACATG-TTCAAATAATTATGACCATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * ** **
22390402 CGTTACGAACTTTTTGTTTTGTCAT-AAATAATTGTTTTTCA-TCAAACAAGCCTATTTGGAATA
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* *
22390465 AAATAATATTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGAAGGTCATTTAAAAAATAAATCTGTT
316 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-AA-G--ATTT-AAAAATAAATCTGTT
* * * * ** * *
22390530 TACCGAA-C----T-AAT--TTCT---TCTTTGAACAATTATTTTATTTTC-AATTGTTATAACG
375 TATCGAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTA-TTTCAAATCATTATGACA
* * * **
22390583 TTT-TGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT
438 TTTAT-TT-T-TTATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
22390646 AATTTAATAATATTC-------TGATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCA-ATATACCGAAGT
499 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAAT-ATATTTA-CAAACT
* * ** * * * * *
22390699 AGTTCAAACAATTAAAACTATATGAAA-AATTATTTATTTACTGAAA-AG-TATGGC-CTTTGTT
562 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAAATAATTATCTATTT-C--AAATTGTTATGACTTTTTGTT
* * * * * * * * *
22390760 TGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATTCAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
623 TAGTCATAAAATAATT-ATTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** *
22390825 ATCTTTTAAAAATTAAT-ACGTAAGAG
687 ATATTCCAAAAATTAATAAC-TAAGAA
* * * * * * * **
22390851 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAGCTAGTTCAAATA--TATGACTATGTGAACAATTGTAAA
1 ATTT-AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * *
22390914 CTTT-AAATTGTTTTAACCTTTTGTTCTT-TCATAAAAACAATTATATT-TGTTCA-AATAAACT
65 -TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCAT-AAAACAATTGT-TTCAGTTCATAA-AAGCT
* * * * * * * * * *
22390975 TATGTGGAATAAAATACTACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAA
125 TATCTAGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
22391039 A-AATTTTGTTTGCTAAAC-TAGTTCAAA-AATTTAAGACTATATGAA-TACTTATCTATTTCAA
190 ATAAATCTATTTACCAAACAT-GTTCAAATAA-TTATGACCATTTGAACTA-TTATCTATTTCAA
* * * * * * * * **
22391100 ATTTTTATGACTTTTTGTTTTGTCATATAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGA
252 ATTGTTATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGATTA-TTAAA
* *
22391164 ATAAAATAA-AATGAATTTATTAATTATTT-AAGAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAATTC
313 ATAAAATAATACT-AATTTATTAA-TATTTCAA-AAAT--TAA-TAA-AGATTTAAAAATAAATC
* * * * * * * *
22391227 TATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
371 TGTTTATCGAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * *
22391292 AATTT-TGTTTTGTCATAAAACAAATGATTT-TGTTCATATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAGTAC
436 CATTTAT-TTTT-T-ATAAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTAT-TTGA-AATAAAATAA
** * *
22391353 TACTAATCCATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA
495 TACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATATATTTA-CA
* * * ** *
22391413 AA-TGAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-TTTTT-T
558 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT
* * * * *
22391475 TCT-GTTATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTTT
622 T-TAGTCATAAAATAATTATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
22391539 TAATATTTCAAAAATTAAT-ATTAAAAA
685 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA
* * * * * * * * *
22391566 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTGTCTA
1 ATTT-AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * *
22391631 TTTCAAATTGTTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTAT-T
65 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCT
* * ** * * * *
22391695 TGAAATAAAATAAAACTAAGTTATTAATATTACAAAAATGAATAA-TCAAGAGATTTAAAAAATG
130 AG-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
22391759 AATCTGTTTGCCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTGAAATTGCT
193 AATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * ** * * *
22391824 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAA
258 ATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTA-TTAAAATAAAATAA
* * *
22391889 TACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTC
322 TACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AA-T--TAA-T-AAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTATC
* * ** * *
22391952 GAA-CATATTCAAATA-TTCATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAAC-TTTT
379 GAACCA-ATTTAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTA
* * *
22392014 TGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT-AATATGAAAATAATATTAAT
442 T-TTTT-T-ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAA-AT-AAAATAATACTAAT
* * * * * *
22392077 TTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAG
502 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-AAAAGATTAAAAAAATAAATATATTTA-CAAACTAG
* * * * * * ** *
22392141 TTCAAATAGTCAAGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACTTTTTGTTTTTTAA
564 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTAGTCA
* * * ** * *
22392206 TAAAACAATTGTTTTAGTTCA-ATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTA
629 TAAAATAATT-ATTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * *
22392270 CAAAAATTAATGAGC-ATGGGA
693 CAAAAATTAAT-AACTA-AGAA
* ** * * * * * * *
22392291 A-TTAAGAAATGAATTCATTTACCAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAGTTATCTA
1 ATTTAA-AAATAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * ** *
22392355 TTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGGTTCTA-TCCATGCAAGCTTATT
65 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATC
* * *
22392419 TTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATA
129 TAGAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * **** ** * * * **
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193 AATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * ***
22392546 TATGACCTTTTGTTTTGTT-ATAAACCAATTGTTTCTGTTTATAAAAGCTCATCGGAATAAAATA
257 TATGACATTTTGTTTT-TTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTAAAATAAAATA
* * * * * *
22392610 ATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATATATTTG-TTAACT
321 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-T-AAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTATCG
** * * * * *
22392674 ATATGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTT-TG
380 A-ACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTAT-
* * * **
22392738 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
443 TTTT-T-ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
*** * *
22392803 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATT------TTAAA-A-A--TA-AATCTA-TTC--AT
506 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAATATATTTACAAACTAGTTCAAAT
* * * * *
22392854 --TGA--AC-A---AACT-ATTATCTATTTTAAATTGTTATGACATTTTGCTTT-GTCATAAAAC
571 AGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG-TTTAGTCATAAAAT
* * ** *** * *
22392909 AATTGTTTCTA-TTCATGCAAAATT-TTTGGAAT--AA-AATACTAATTTATTCATATTTCAAAA
635 AATT-ATT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
*
22392969 A-T--TAA-TAAGAC
698 ATTAATAACTAAGAA
* * * * * *
22392980 ATTTAAAAACTAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTTTAAACAGTTATGATTACTTGAACAATTATC
1 ATTTAAAAA-TAAATTTGTTT-TCTAAACAAG-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
** * * * * ** * *
22393044 TATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATATTTTTTTCCTTTCATACAACCTTA
63 TAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA
* * ** * *
22393107 T-TCA-AAGTAAAATATTGCTAAATGAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAA
127 TCT-AGAA-TAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * * * * * * *
22393165 ATTAAATATGTTTGCCGAACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTC-TTAGAGCAATTATCTATTTAAA
189 AATAAATCTATTTACC-AAACATGTTCAAATAATTATGAC-CATTTGAACTATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
22393228 ATCGTTCTAACCTTTT-TTTATTT-ATAAAATAAATGTTTTTAGTT-ATTACATGCA-TATTCAA
252 ATTGTTATGACATTTTGTTT-TTTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-TACAAG-ATTATT-AA
* * *
22393289 AATAAAATAATACAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTAAAAAATAAAT
312 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-----AAAGATTT-AAAAATAAAT
** ** * * * * *
22393353 CCATTTATCGAA-CAAGTTCCAATAGATATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATAT
370 CTGTTTATCGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
22393417 GATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-ACAGCTTATCTAAAATAAAATAA
434 GA-CATTTATTTT-TTATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATACA-AGCTTATTTGAAATAAAATAA
* ** * * * * *
22393480 TACT-ATCTTATTAATATTTTAAAAATTGTTAAATTAGAGATTTAAGAAAAA-AAGTCA-GTTTA
495 TACTAAT-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAA-AAAAATAAAT-ATATTTA
* * * * * * ** * *
22393542 TCGAATTGGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACT-ATTATCTATCACAAATTGATACGAACTTT
556 -CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTT
* * * *** *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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129 TAGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATA
* * * ** * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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571 AGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTT-TAGTCATAAAAT
* * * * *
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635 AATTA-TT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
*
22394392 ATTAATAAGTAA-AA
698 ATTAATAACTAAGAA
* * * * * *
22394406 GATTTAAAAAATAGATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTA-AGACTATATGAACAATTATC
1 -ATTT-AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * **
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63 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT
* * * * ** * *
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128 CT-AGAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * *
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191 TAAATCTATTTACCAAACAT-GTTCAAATAATTATGACC-ATTTGAACT-ATTATCTA-TTTCAA
* * * * * * * * * *
22394659 ATTGTTATTACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATA
252 ATTGTTATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATT-AAAATA
* * * **
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316 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--ATA-AAGATTTA-AAAATAAATCTGTT
* * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * ** ** * * ** * *
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* * * * ** * * * *
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** * * * * * *** * * * *
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627 CATAAAATAATTATTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
22395108 TCAAAAATTAATAAGTAAGAG
692 CCAAAAATTAATAACTAAGAA
* * * * * *
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1 ATTT--AAAAATAAATTTGTTTTCT-AAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAA-TTA
* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * ** * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* *
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1 ATTT-AAAAATAAATTTGTTTTCTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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** * * * * * * * *
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* * **
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* *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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443 TTTT-T-ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** * * *
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* * ** * *
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* * ** * * *
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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1 ATAAAATAATTGTTTT-AGTTAT-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
** ** * * * * ** *
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** ** * * * *
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* * * * * * *
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1 ATAAAATAATTGTTTTAGTTATTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * ** * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * *
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1 ATAAAATAATT-GTTTTAGTT-ATTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *** * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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127 TATGACTATTTGAAT-A-TTATCTATTTAAAATTAATATGACCTTTTGT-T--TTATC
* * * * * * * *
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1 ATAAAATAATTGTTTTAGTT-ATTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * *
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1 ATAAAATAATTGTTTTAGTTATTACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATA
* ** * * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * *
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1 ATAAAATAATTGTTTTAG-TTATTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * ** * * * *
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* * ** ** * *
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* ** *** * *
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1 ATAAAATAATTGTTTTAG-TTATTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
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** * * ** *
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* ** * * ** * * **
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1 ATAAAATAATTGTTTTAGTTATTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** *
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* * * *
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126 ATATGACT-ATTT-GA-ATATTATCTATTTAAAAT--TAATATGACCTTTTGT-TTTATC
*
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1 -ATAAAATAATTGTTTTAGTT-ATTACAAGCTTATTC--AAAAT-AAAAT-AATACTAATTTATT
* * ** * ** * *
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* *** *
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* * ** *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * * * **
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* * * * ** * * *
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** * ** * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * *
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1 -ATAAAATAATTGTTTTAGTTAT--TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * *
22397938 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGAA-TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAA-TTTAAATA
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* * ** * ** * *
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*
22398054 ATAAAATAATTATTTT
1 ATAAAATAATTGTTTT
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Statistics
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* *** * * *** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * **
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* *
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* **** *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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** *** ** * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * ** * * * *
22394746 TTT-AGAAAATTAACCATAGGAGATTTAGAAAGTAAATCTAATTACCAAGCCATTTCAAATAGTT
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22394874 GGTTCTGTT---CATTCTATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCGAAACC
189 --TTTTTTTAGCCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCCAAAAT
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* * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATACA
** * * *
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65 AGCTTATTTGAAAT-AAATAA-AATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTT
* * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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** * * *
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253 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAAT-AG--GAGATTT--AAAATAAATT
* * * * ** ** *
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* * * * * * * **
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* *
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* ** * ** * * *
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* * * * ***
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* * *
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* * * *** * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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** * * * * **
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* * * * * * * *
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** * ** * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * *
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*
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * *
22401873 GTAAACAATTTTATTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTT-AAA-TC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * *
22401938 TTTTATTTTCG-ATAAGCTT-TAATGAACTAAAACAATTGTTTTATGTTAAAACAAAAAGTCATA
63 TTTTA-TTTCGAATAAGCTTGT-ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
* * * *
22402001 ACGATTTTAAATAAATAGTTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCT
126 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCG
* ** * *
22402053 GTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTATG-AATGGTAATAAATTTGGAT
1 GTAAACAAATTTATTTTTT-AAATC---TACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * *
22402117 TATTTTATTACGAATAAGCTTATAAGAT-AGGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAA
61 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
* * * ** * *
22402181 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTTACTATTTGAATTAGTTCG
125 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * *
22402235 GTAAACATATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** ** * * * *
22402300 TTTT-TAACCGAATAAGCTTCCATAATCAAAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGATTTTAA
63 TTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * * * * *
22402363 CAATTGGAGATTGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATAGTTTG
127 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* *
22402414 GTAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCGTTATTTATTAATTTTTGAAATATTCATAAATTAGTATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TC--TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
22402478 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
63 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
* * * * * * * * *
22402543 AATTTGAAATAGATAA-TATTCGAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCA
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * * ** *
22402593 ATAAACAAGTTTACTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTAAGAAATATTTAATAAATCAGTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA---TCTACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATT
* * * ** ** *
22402658 ATTTTATTTC-ATCTAAGCTTGTGTTAAT-TGAAACAATTAATTTATGACAAATCAAAAGGTTAT
62 ATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGT-ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
* * * * * *
22402721 AACGATTTTAAAGAGACT-ATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAACTT-GTTTG
125 AACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCG
* * * * *
22402775 GTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATGAATTAGTATTAAT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * * *
22402837 TTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATAACTAGACAAAATGTTAGAAT
65 TTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
* * * * * * * *
22402900 GACTTGAAATAGATAAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCA
128 GATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* *
22402952 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * ** * * * *
22403017 ATTTAATCCAAATAAGCTTGTATGA-CCAAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAATGTCATAAT
63 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
** * * *
22403081 GATTTGAAATAGATAATTGTAGATATAGT-TTAATTATTTGAATTGGTTCG
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* ** * * * ** ** * * *
22403131 GCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAGGTTTCGAAATATTATTAATTTAGTATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAA---ATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** ** * * * * * * * * *
22403196 TTTTATTTTAAATAAAATAGAATGAACAGAACCAATTATTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAAT
63 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
* * * *
22403261 GATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGCTT-G
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TTCG
** * * * * * * *
22403312 GTAATTAGATTTACTTTCTAAATCTCCTATGGTTAATTTTCT-AAATTATTTAT-ATTTAGTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACT-T-ATTAATTTT-TGAAA-TATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * *
22403375 ATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATGA-AAAATAAAAAGTAATAA
62 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * *
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127 CGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * ** *
22403490 GTAAAGAAAATTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTCA-TTTT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATT
* * * * * *
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62 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAA--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
* * * * * * *
22403615 AACGATTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTAGTTTG
125 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * *
22403669 GCAAACAAA-TTATTTTTTAAACCTTTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAGATTA-TATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA---TCTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * *
22403731 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAT-AAGAAA-TATT-TTTTATGATAGAACAAAAGGTTATA
62 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
* * * * * * * ** *
22403793 ACGATTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACTATTTTG
126 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
*
22403846 GTAAA-AAATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * *
22403909 TA-TTCAAATAAGCTTGTATGGT-AAAAAAAATTGTTATATGACCAAA-AAAAGG-TATAACGAT
66 TATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGAT
* * * * ** *
22403970 TTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTAATTGAACTAATTCA
131 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-T--TTGAATTGGTTCG
* * * * * * *
22404021 ATAAATAAAGTCACTTTTTAAAT-TACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAATATTT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * ** * * * * *
22404085 TATTTAGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAGCAAT
66 TATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGAT
* ** *
22404150 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATTTGTTCG
131 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * *
22404198 GTAAACAAATTTTTTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAATATTAT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * *
22404263 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGGA-CTGAACCAATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATAA
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* * * * *
22404326 TGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTG
127 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCG
* * * *
22404378 GTAAACAAA--T-TTTTTTAAATCTCCTAATTAATTTTTGAAATGTTAATAAATTAATATTATTT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * *
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** * * * ****
22404503 ATTTGTGATAGATAATAGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACCAATTCG
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * *
22404553 ATAAACTGACTTT-TTTTCTTAAATCT-CTAATTTAACAATTTTTAAAATATTAATAAGA-TAGT
1 GTAAAC-AAATTTATTTT-TTAAATCTACTTA-TT---AATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGT
* * * * * *
22404615 ATTATTTTATTT-TAGATAAGC-TGTTATGAACTAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGAT
59 ATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTG-TATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* *** * * * *
22404678 CATATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATATCTATTGGAACTT-GTTCG
122 TATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCG
* *** * ** * *
22404735 ATAAATGGATTTATTTTTTAAATTTTTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA---TCTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
22404799 ATTTTTATTTTGAATATGCATGTAAT-AACTAAAACATTTATTTTAT-A-ATAAA-AAAAGGTTA
62 A-TTTTATTTCGAATAAGCTTGT-ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTTA
* * * * * *
22404860 GAACGATTTTAAATAGATAATTGCTCTAAGAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCG
124 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * * * * *
22404915 GCAAACATATTTAATTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTCATTTAGCAATA-T
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * *
22404977 TTACTTT-GAATAAGGTTGTATGAAT-AGAAAA-AATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA
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* * * * * * *
22405038 CAATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAGTAATCATAACTGTTTAAAACTGGTTTG
127 CGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAATTGGTTCG
* * * *
22405091 ATAAACAAATTTAGTTTTTAAATGT-CTTATTAATTTTTGAAATATGAATAAATTAG---TATTT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * ** * * * * * *
22405152 TA-TTCCAAAAATTTTGCATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAATGTCATAACAA
66 TATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA
*
22405215 TTTAAAATAGATAAT
130 TTTGAAATAGATAAT
22405230 AGTTTGTTCG
Statistics
Matches: 4286, Mismatches: 944, Indels: 527
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 1 0.00
167 9 0.00
168 3 0.00
169 23 0.01
170 65 0.02
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172 71 0.02
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184 10 0.00
185 19 0.00
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188 4 0.00
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Consensus pattern (178 bp):
GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGAT
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
Found at i:22401944 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 22400736--22410374 Score: 3145
Period size: 180 Copynumber: 54.2 Consensus size: 181
22400726 ATCACCTTTT
* * * * *
22400736 TTTTTTGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTAT
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* * * * ** * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
22400974 ATTT-AAATTGGTTAGATAAA-TGATTTATTTTTT-AAAC-C-T-CTTATTAAGTTTTGAATTAT
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* * * * ** * * *
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* * *
22401086 TTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
22401151 TTGAACTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTT-AAA-TC-T-CTTATTAATTTTTG-AACATTAA
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** * *
22401211 TAAAGTTAGT-TTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATG-ACTGAAAA-AATTA
131 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTG
* ** * * * *
22401261 TTTTATGACAAAACAGAAGGTCATAGTGATTTGAAATAAATAATTGTTTATATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * *
22401326 TTGAAC-CGATTCGACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATTTT
66 TTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* ** *
22401390 ATTGGATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGACTTGTATGAAC-AACAATAATTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAACTAA-AACAATTG
* * * * *
22401443 TTTTATGACAGAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAGTATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
22401508 TTGAA-TTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT--AA-TC--ACTTATTAATTTTTGAAAGATTA
66 TTGAACTT-GTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* ** * * *
22401567 ATAAATTAGTATTATTCTATTCCGAATAAGTTTGTATGATCAAAAACAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * * * * * * * * *
22401619 TTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAACAAATAATTCTTGAAATGGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * *
22401684 TTGAAC-TGATTCAATAAACAAATTCACTTTTT-AAA-TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTA
66 TTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* *
22401744 ATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCTTGCT-TGAACTGAAACAATT-
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG-TATGAACTAAAACAATTG
* * * *
22401795 TTATATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGACT-ATTGTTCAAATTGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
22401859 TTTGAATTTGTTTGGTAAACAATTTTATTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTA
65 TTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
*
22401924 AGAAATTAGTATTATTTTATTTTCG-ATAAGCTT-TAATGAACTAAAACAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGT-ATGAACTAAAACAATTG
** * * * *
22401976 TTTTATGTTAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAGTTG-TCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * **
22402040 TTGAACTTGTTCTGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTATG-AATGGT
66 TTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAAACTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATT
* * ** * * * *
22402104 AATAAATTTGGATTATTTTATTACGAATAAGCTTATAAG-A-TAGGAAACAAATA
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA--AAACAATTG
* * * * * ** *
22402157 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTTACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
22402222 TTGAA-TTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
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* *** ** *
22402286 TTAAATTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAGCTTCCAT-AATCAAAAACAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-CTAAAACAATTG
* * ** * * * * *
22402338 TTTTATGATAAAAC-AAAGATTTTAACAATTGGAGATTGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
22402402 TT-AAATAGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTT-AAATTCGTTATTTATTAATTTTTGAAATATTC
66 TTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
22402464 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATCAAAAACAATTA
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * * * *
22402516 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA-TATTCGAATGGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * * **
22402580 TTTAA-TTGATTCAATAAACAAGTTTA-CTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTAAGAAATATT
66 TTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA-T
* * * * * * * *
22402643 TAATAAATCAGTATTATTTTA-TTTCATCTAAGCTTGTGTTAATTGAAACAATTA
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * * * * * *
22402697 ATTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACT-ATTATTCAAATAATAATAACTA
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* * * *
22402761 TTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT-TTTTTT-AAA-TC-T-CTTATTAATTTTTTG-AATGTT
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* * * * * *
22402820 AATGAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
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* *
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* * * * *** *
22403002 ATTAAATTAATATTAATTTAATCCAAATAAGCTTGTATG-ACCAAAACAATTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
** * * * ** * * *
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* ** * *** * ** ** *
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* * * ** * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
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* *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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22408956 TTAAACTTGTTCTGTAAATATATTTA--TTTTAAATGTTTTAGTAATTTAATTGTCAAAATGGTT
66 TTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTACTTA-TTAATTTTTGAAAT--AT
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* * *
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* * * * * *
22403916 ATAAGCTTGTATGGTAAAAAAAATTGTTATATGACCAAAAAAAGGTATAACGATTTGAAATAGAT
65 ATAAGCTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTAT-AACAAAAAAAGTTATAA-GAATTGAAATAGAT
* * * * * * * *
22403981 -AATTGTTGAAATAGCCATAATTATTAATTGAACTAATTCAATAAATAAAGTCACTTTTTAAA--
128 AAATTATTCAAATAGTCATAATTA-T--TTGAACT-ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATT
* * * *
22404043 -TTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAAT-ATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATG
189 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATTTA-AATAAGCTTGTATG
* * * * *
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253 -ACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * * *
22404171 ATAGTTTTAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAATTTTTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAAT
317 ATAGCTTTAATTATTTGAATTGGTTCGGCAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-
* * * ** * * *
22404235 TTTGGAAATATTAAGAAATTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGGACTGAACCAATTA
380 TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTA
* * * * *
22404300 TTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATA-AATAATTATTCAAATAGTCATAACT
444 -TTTATGA-CAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAATAGTAATAACT
*
22404363 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-
507 ATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
* * * *
22404385 A-AT-TTTTTTAAATCTCCTAATTAATTTTTGAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
* * ** **
22404448 ATAAGCTTGTACGATAAAAGACAATTGTTTTATGATA-AAAGAAAAGTTCGTATCAATTTGTGAT
65 ATAAGCTTGTATGATAAAA-ACAATTGTTTTAT-A-ACAAA-AAAAGTT-ATAAGAA-TTGAAAT
* * * *
22404512 AGAT-AA-TAGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACCAATTC-GATAAACTGACTTT-TTTTCTT
124 AGATAAATTA-TTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-CTATTCAG-TAAAC-AAATTTATTTT-TT
* * ** * * * * *
22404573 AAATCTCTAATTTAACAATTTTTAAAATATTAATAAGA-TAGTATTATTTTATTTTAGATAAGC-
184 AAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAATATTAATTTAATTTAAATAAGCT
* * * * *** *
22404636 TGTTATGAACTAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGATCATATTTATTTTAAATAGATAAT
247 TG-TATG-ACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * ** ** *
22404701 TATTCAAATAG--TCATATCTATTGGAACTT-GTTCGATAAATGGATTTATTTTTTAAATTTTTT
310 TGTTCATATAGCTTTA-AT-TATTTGAA-TTGGTTCGGCAAA-CAATTTATTTTTTAAATCTTTT
** * * * * * *
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371 ACTTATTAA--TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTA-TTTCAATAAGCTTGT-ATGA
* * * * * * ** *
22404826 ACTAAAACATTTATTTTATAATAAA--AAAAGGTTAGAACGATTTTAAATAGA-TAATTGCTCTA
431 ACTGAAACAATTA-TTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAA
* ** * * * *
22404888 AGAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAACAT
495 ATAGTAATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAG
* * * * * * * *
22404923 ATTTAATTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTCATTTAGCAATA-TTTACTT-TG
1 ATTTATTTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTA
* * * * * *
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64 AATAAGCTTGTATG-ATA-AAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAG-TTATAAGAATTGAA-AT
* * * * * * * * *
22405049 AGAT-AATTGTTCAAGTAATCATAACTGTTTAAAACTGGTT-TGATAAACAAATTTAGTTTTTAA
124 AGATAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-GAACT-ATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * ** *
22405112 A-T-GT-CTTATTAATTTTTGAAATATGAATAAATTAGTA-T--TTT-ATTCCAAA-AATTTTGC
186 ATTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATT-TAAATAAGCTTGT
* * * * * *
22405169 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATAG-T
250 ATGACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
** * * ***
22405233 --T-T-G--TT--CGA--TGAA-----T------A-GATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTATTA
314 CATATAGCTTTAATTATTTGAATTGGTTCGGCAAACAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* *
22405276 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACA
379 A--TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACA
* * ** * * * * * * * *
22405339 ATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATA-AATAATTGTTAAAATAGTCATA
440 ATT-ATTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAATAGTAATA
** * * * *
22405403 ACTATTTGAACTCATATAGTAAACAA
504 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
* * * * *
22405429 ATATATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAA---TCTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * * * *
22405494 -CGATGAGCTTTTAT-AAACAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
62 TAAATAAGCTTGTATGATA-A-AAACAATTGTTTTATAAC-AAA-AAAA-GTTATAA-GAATTGA
* * * * * *
22405557 AATGGAT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCA-AAAACATATTTATTTTTTA
121 AATAGATAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-CTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * *
22405620 AATT-TTTCTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTATATT-ATTTTATTCAAAATAAGCTTG
185 AATTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATT-TAAATAAGCTTG
* * * *** *
22405683 CATGGA-TAGAACCAATTGTTTTA-AGACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAACT
249 TAT-GACTA-AAACAATTGTTTTATA-ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * * * * * ** *
22405746 ATTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACAT-GTTTGGTAAATGAATTCATTTCTTAATTCCCATTG
311 GTTCATATAGCT-TTAATTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAA-CAATTTATTTTTTAAAT-CTTTTA
* * * * *
22405809 CTCATTAATTTTTGTAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT-TGAACT-
372 CTTATTAA-TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * ** * * *
22405872 AAACAATTGTTTTATTA-AAA-AAAAAGGTCACAATAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAACAG
435 AAACAATT-ATTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAATAG
** * * * * *
22405934 TCTTGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAT
499 TAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
* * * * *
22405965 ATTTATTTTTTAAATTTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTCAT
1 ATTTATTTTTTAAA----TCTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* * *
22406030 AT-T-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAAGTTATAACAATTT
60 -TCTAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTAT-A-ACAA-AAAAAGTTATAAGAA-TT
* * * * *
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119 GAAATAGATAAATTATTCAAATAGTCAT-AATTATTTGAACTA--TTCAG-TAAACAAATTTATT
* ** *
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180 TTTTAAAT-TCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATTT-AAA
* * ** * * * *
22406216 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAG
241 TAAGCTTGTATGACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * *
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305 ATAATTGTTCATATAGCT-TTAATTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
22406344 TCTTGA-TTATTCATTTTTGTAATATTAATAACTTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATAT
367 T-TTTACTTATT-AATTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTAT
* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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493 AAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
* * ** * *
22406509 ATTTATTTTTAAAATTTTTTTAATATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAA-TCTCCT--TATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
* * * * * *
22406574 -TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAGAAAAAAATCATAACAATTTGAAA
61 CTAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATAACA-AAAAAAGTTATAAGAA-TTGAAA
* ** * * * * *
22406638 TAAAT-AATTGCTCAAATAGTTATAAATATTTGAACTCATT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAA
123 TAGATAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT-ATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAA
** * * * * * * *
22406701 A-TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATGGATTAGTAGTACTTT-ATTCTGAACAAACTTAT
186 ATTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATT-TAAATAAGCTTGT
* * ** *
22406762 ATGAAC-AAAATCATTTGTTTTATGACAAAACAAAATTTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT
250 ATG-ACTAAAA-CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * *
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313 TCATATAGCT-TTAATTATTTGAATTGGTTCGGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
** * * * * *
22406889 TT-ATTTCTTAAATAATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAA
376 TTAATTT-AGAAAT-ATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACT-GA
* * * * ** * * * *
22406952 AAAAACTTATTATATGACAAAACAAAAAGTCATAAAAATTTGAAATAGA-TAAGTATTCATATAG
436 AACAA-TTATT-TATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAATAG
** * * * * * *
22407016 TCTTAAATTTTTGAACTAGTTTAGCAAACA-
499 TAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
* * * * * * *
22407046 A-AT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTAGTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTC---CTTATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * *
22407109 CACATAAGTTTATTTGA-ACAAATATAATTGTTTTTATGAA-AGAACAAAAGGTTAAAACAATT-
62 TAAATAAGCTTGTATGATA-AAA-ACAATTG-TTTTAT-AACA-AA-AAAA-GTTATAAGAATTG
* * * * *
22407171 TAA-AGTTTACAATTGTTCACATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGCTT-GGTAAACAAATTTATTT
120 AAATAG-ATA-AATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTA--TTCAGTAAACAAATTTATTT
* * * * * *
22407232 TTTAAATCTCTTACGTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTCTGAATAA
181 TTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATT-TAAATAA
* * * * * * * * *
22407296 GATTGAATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAAC-AAAGGCCAT-AC-TTTTCAGTAAATAA
244 GCTTGTATGA-CTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT--G-AAATAG
* * * * ** * ***
22407358 ATAATTTTTCATATAGTTTTAATTGTTTGAACTACTTCGGTATATTGATTTATTTTTTAAA----
305 ATAATTGTTCATATAGCTTTAATTATTTGAATTGGTTCGGCA-AACAATTTATTTTTTAAATCTT
* * * * *
22407419 -T-CTT-TT-A-TCAG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAAC
369 TTACTTATTAATTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAAC
* * * ** * * * *
22407478 TGAAACAATTATTTTATAATAGAA-CAAAAGGTTATAACAATTGAAAATAAAATAATTGTTC-AA
433 TGAAACAATTA-TTTATGACA-AATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAA
* * *
22407541 -AG-AAGAA--A-TT--A---GTTCGGTAAACAG
496 TAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
* ** * *
22407565 ATTTATTTTTTAAATGACCTTCTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAATATTCTTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAAT---CTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
22407630 CAAATAGGCTTGTTTGATGAAAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAAGTTCGTAACGATTTGA
62 TAAATAAGCTTGTATGAT-AAAAACAATTGTTTTAT-A-ACAA-AAAAAGTT-ATAA-GAATTGA
* * * * * * *
22407694 AATAAAT-AATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAATCAATTC-GATAAACTAACTTATTTTTT
121 AATAGATAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-CTATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTT
* * * * **
22407757 AAA-TCTTTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCT
184 AAATTC-TT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATTTAAATAAGCT
* * * * * ****
22407821 T-TAATGAACTGAAACAATTGCTTTATGATAAAACAAAAGATCATATTTGTTCT-AAATAGATAA
247 TGT-ATG-ACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAA
* * * * * * ** *
22407884 TTGTTCAAATAG-TCATGACTATTTAAACTT-GTTTGATAAACAAATTTATTTTTCAAAAT-TTC
309 TTGTTCATATAGCT-TTAATTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAAC-AATTTATTTTT-TAAATCTT-
** * * ** * *
22407946 TTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTACATTATTTTGAATAAGCATGTATGA
369 TTACTTATTAA--TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * **
22408010 ACT-AAA-AATTATTTTATGACTAAA-CAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTTT
431 ACTGAAACAATTA-TTTATGAC-AAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCA
** * * * * * *
22408071 AATAGTCTTAACAATTTGAACTAGTTCAGCT-AACAC
494 AATAGTAATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAATAG
* * * * * *
22408107 ATTTATTTTTTAAATCTATTGCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTT
1 ATTTATTTTTTAAATC---TCCTTATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * *
22408172 C-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAA-AAAATAAAGATCATAATG-ATCTT
61 CTAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTAT-AACAAAA-AAAG-TTATAA-GAAT-TG
* * * * * * * * * *
22408234 AGATAGAT-AATTGTTCAAATAGTC-TAACTATTTAAATTGGTTCAATAATCAGATTTAATTTTT
120 AAATAGATAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT-ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * ** * * **
22408297 AAA-TC---CTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTGTTGTTTTATTTTGAATAATTTTG
184 AAATTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATTTAAATAAGCTTG
* * * * * * *
22408358 TATGAATAGAAACAATTGTTTGACGAA-AAAATAAAATGTCATAA-AGATTTGAAGTAGATAATA
249 TATGACTA-AAACAATTGTTTTA-TAACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * ***
22408421 GTTCAAATGGACATGACA--ATTTGAACAT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAA
311 GTTCATATAG-CTTTA-ATTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * *
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372 CTTATTAA--TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAACT
* * * **** * * *
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434 -GAAACAATT-ATTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAAT
* * * * * *
22408610 AGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAACAA
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* * ** * * * * *
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* * ** * * **
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* * * *
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* * * * * *
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*** * * * * * * * *
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247 TGTATGACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
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* * * * * *
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373 TTA-TTAATT-T-AGAAAT--AT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-TAAGCTTGTAT-G
* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 ATTTA--TTTTTTAAATC--TCCTTATTAATT--TTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * *
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181 TTTAAAT-TCTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATTT-AAATA
* * * * *
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* * * * * * * *
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305 ATAATTGTTCATATAGCT-TTAATTATTTGAATTGGTTCGGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
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368 TTTACTTATTAATT-TAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGA
** * * * * * * * * * *
22409591 A-TAGAAACTGTTGTTTTATAACAAAACTAAA--TCATAATGATTTGAAATA-AATAATTACTCA
431 ACT-GAAACAATT-ATTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCA
* ** *
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494 AATAGTAATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAG
* * * *
22409688 ATTTATTTTTTAAATCT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGAATTATTCTATT-TCA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
* * ** * * * * * *
22409750 AACAAACTTACATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
64 AATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATAAC-AAA-AAAA-GTTATAAGAA-TTGAAAT
* *
22409815 AGAT-AATTATTCAAATAGTCATAATTATTAGAACTAGTT-AGTAAACAAAATTATTTTTTAAAT
124 AGATAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTA-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * **
22409878 CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAAT-TTTATTTTATTCCAGATAAGCGAGTA
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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378 A--ATTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAAC
* ** * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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314 CATATAGCT-TTAATTATTTGAATTGGTTCGGCAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * ** *
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* * * * * * * *
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438 CAATT-ATTTATG-ACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAATAGTA
*
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ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTAATTTAAATAAGCTTGTATGACTAAAAC
AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGCTTTA
ATTATTTGAATTGGTTCGGCAAACAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTAGAAATAT
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CAAAAGGTTATAACGATTTTAAAGAGACTAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTT
GGTAAATAG
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* * *
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* *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* **
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* * * * * *
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** * **
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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**** * * *
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* * ** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * ** *
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* ** * * * * ** * *
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* * * * * * *
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1 AAAACAAAAGGTCATATCAATTTTAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
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* * * * *
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128 ATTATTTTATTTTAGATAAGCTT-TATGAACTAAAACAATTGTTTTATAA-T
* * * * * * * * * *
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** * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * ** * * *
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** * ** * * ** * * *
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* ** ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * **
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* * * * ** * *
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* ** ** * * * * *
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* *
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128 ATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTT-TATGAACTAA-AACA-ATTGTTTTATAAT
* * * * * * * * * * * *
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1 AAAACAAAAGGTCATATCAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-T
* * ** *
22403842 -TTTGGTAAAAAATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTA
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* * * * *
22403903 TTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGGTAA--AAAA-AATTGTTATATGAC
129 TTATTTTATTTTAGATAAGCTT-TAT-G-AACTAAAACAATTGTTTTATAAT
* * * * * * * *
22403951 CAAA-AAAAGGT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTAATTGAAC
1 AAAACAAAAGGTCATATCAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-T--TTGAAC
** * * *** * *
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* * *
22404076 GTAATATTTTA-TTTAGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAAC
126 GTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTT-TATGAACTAAAACAATTGTTTTATAAT
* * * ** *
22404129 AGAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATTTG
1 AAAACAAAAGGTCATATCAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* ** * * *
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* * * * *
22404259 TTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGGACTGAACCAATTATTTTAT-AT
129 TTATTTTATTTTAGATAAGC-TTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATAAT
* * *
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* * * ** * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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** *** ** *
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* *
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124 TAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCT-TTATGAACTAAAACAATTGTTTTATAAT
* ** * *
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* * * * *
22404731 TTCGATAAATGGATTTATTTTTTAAATTTTTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTG
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* * * *
22404795 TATTATTTTTATTTT-GAATATGCATGTAAT-AACTAAAACATTTATTTTATAAT
127 TATTA-TTTTATTTTAG-ATAAGC-T-TTATGAACTAAAACAATTGTTTTATAAT
* * * * ** * * *
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*
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** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * *
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** * * * * *
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*** * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* *
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* *
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* * ** *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * **
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* *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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***
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* *
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ATAAAAT
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* *
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* * *
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AATAAATACATAAAATACAAAAGAA
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22413299 ATATATACAT
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22413357 AAA
1 AAA
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AAAATA
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1 A
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* *
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*
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* *
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** * * *
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* *
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*
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* * *
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* * * *
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*
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** *
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* **
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*
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* * *
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TAATCAGAGGCTCAACGACTTTAAAAAAAATAAATAAATAGCTCCTC
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*
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* *
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* *
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* * * *
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*
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TAAATTGCTCCTCTAAACAGAGGCAACAAGACTTTGAAAAG
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22413726 AAATAAATGG
** * *
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66 AACTTTGAAAAGTAAATTA
* *
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66 AACTTTGAAAAGTAAATTA
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22413908 TAACAATCAT
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AACTTTGAAAAGTAAATTA
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*
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*
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1 TTCTTTTTTT
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TTCTTTTTTT
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*
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* *
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* *
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1 TTTCTTTTTT
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*
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1 AA
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AAATAAAATAGAAAAAAATAAAT
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*
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*
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* * *
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1 AAATAAAAAATATTA-AAGAT
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1 AAATAAAAAA
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*
22420702 AATAAAAAAAT-AGATAAATTAT
1 AATAAAAAAATGA-ATAAATAAT
* *
22420724 AATATATAAATGAATAAATAAT
1 AATAAAAAAATGAATAAATAAT
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1 AATAAA
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AATAAAAAAATGAATAAATAAT
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*
22420710 AATAGATAAATTATAATATATAAAT
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* *
22420735 GAATAAAT-AATAATAAATATATAACT
1 -AATAAATAAATTAT-AATATATAAAT
*
22420761 AGATAAATAAAATAT-ATATATAAAT
1 A-ATAAATAAATTATAATATATAAAT
22420786 A
1 A
22420787 TTAACAAAAA
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AATAAATAAATTATAATATATAAAT
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22420658 ATTAGGAAAA
* * * *
22420668 AAAT -AAT AAGAT AAAT AAA- AAAT ATTAC AAGAT AAAT AAAA AAAT AGAT
1 AAAT AAAT AA-AT AAAT AAAT AAAT A-AAT AA-AT AAAT AAAT AAAT AAAT
* * * * *
22420717 AAATT ATAAT ATAT AAAT GAAT AAAT -AAT -AAT AAAT ATAT AACT AGAT
1 AAA-T A-AAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT
* *
22420765 AAAT AAAAT ATAT ATAT AAAT A
1 AAAT -AAAT AAAT AAAT AAAT A
22420787 TTAACAAAAA
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AAAT
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*
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1 A
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AATAATAAATAAATA
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*
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ACGTcount: A:0.76, C:0.02, G:0.00, T:0.22
Consensus pattern (7 bp):
ATAAAAT
Found at i:22420909 original size:25 final size:25
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Indices: 22420858--22420914 Score: 60
Period size: 25 Copynumber: 2.2 Consensus size: 25
22420848 ATAAATAAAT
* *
22420858 AATAAATACATAAGATACAAAGGAA
1 AATAAATACATAAAATACAAAAGAA
* * *
22420883 AATATATACATAAAATATAAAATAAA
1 AATAAATACATAAAATACAAAA-GAA
22420909 AATAAA
1 AATAAA
22420915 AATAATAAAA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 6, Indels: 1
0.78 0.19 0.03
Matches are distributed among these distances:
25 18 0.72
26 7 0.28
ACGTcount: A:0.68, C:0.05, G:0.05, T:0.21
Consensus pattern (25 bp):
AATAAATACATAAAATACAAAAGAA
Found at i:22420912 original size:6 final size:6
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Indices: 22420894--22420944 Score: 54
Period size: 6 Copynumber: 8.5 Consensus size: 6
22420884 ATATATACAT
22420894 AAAATA TAAAATA AAAATA AAAAT- --AATA AAAATA TAAAATA CAAAATA
1 AAAATA -AAAATA AAAATA AAAATA AAAATA AAAATA -AAAATA -AAAATA
22420942 AAA
1 AAA
22420945 GCAAAATTGA
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 1, Indels: 9
0.80 0.02 0.18
Matches are distributed among these distances:
3 3 0.08
6 18 0.46
7 18 0.46
ACGTcount: A:0.78, C:0.02, G:0.00, T:0.20
Consensus pattern (6 bp):
AAAATA
Found at i:22420923 original size:15 final size:16
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Period size: 15 Copynumber: 2.1 Consensus size: 16
22420893 TAAAATATAA
22420903 AATAAAAATA-AAAAT
1 AATAAAAATATAAAAT
22420918 AATAAAAATATAAAAT
1 AATAAAAATATAAAAT
22420934 A
1 A
22420935 CAAAATAAAA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 1
0.94 0.00 0.06
Matches are distributed among these distances:
15 10 0.62
16 6 0.38
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Consensus pattern (16 bp):
AATAAAAATATAAAAT
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Indices: 22420699--22420934 Score: 228
Period size: 112 Copynumber: 2.1 Consensus size: 107
22420689 ATATTACAAG
* * * * *
22420699 ATAAATAAAAAAATAGATAAATTATAATATATAAATGAATAAATAATAATAAATATATAACTAGA
1 ATAAA-AAAAAAATAGATAAAATATAATATATAAATAAATAAATAATAATAAATACATAAATACA
* * *
22420764 TAAATAAAATATATATATAAATATTAACAAAAAAGAAAGAAAA
65 TAAAGAAAATATATACATAAATATTAAAAAAAAAGAAAGAAAA
*
22420807 AGAAAAAAAAAATA-ATAAAGATATACATATAGTAATAATAAATAAATAAATAATAAATACATAA
1 ATAAAAAAAAAATAGATAAA-ATATA-ATATA-T-A-AATAAATAAAT-AATAATAAATACATAA
* * *
22420871 GATACA-AAGGAAAATATATACATAAA-ATATAAAATAAAAATAAA-AATA
60 -ATACATAAAGAAAATATATACATAAATAT-TAAAA-AAAAAGAAAGAAAA
22420919 ATAAAAATATAAAATA
1 ATAAAAA-A-AAAATA
22420935 CAAAATAAAA
Statistics
Matches: 104, Mismatches: 13, Indels: 16
0.78 0.10 0.12
Matches are distributed among these distances:
106 5 0.05
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109 1 0.01
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113 12 0.12
114 6 0.06
ACGTcount: A:0.68, C:0.03, G:0.05, T:0.25
Consensus pattern (107 bp):
ATAAAAAAAAAATAGATAAAATATAATATATAAATAAATAAATAATAATAAATACATAAATACAT
AAAGAAAATATATACATAAATATTAAAAAAAAAGAAAGAAAA
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Indices: 22421177--22421527 Score: 391
Period size: 182 Copynumber: 1.9 Consensus size: 179
22421167 AATATTTTAC
* * * *
22421177 TTATTAATTTCTAAATATTATTAAATTAGTATTATTCCAATCTAAATAAGCTTGTACAAACAAAA
1 TTATTAATTTCAAAATATTATTAAATTAGGATTATTCCAATCCAAATAAGCTAGTACAAACAAAA
* * * * * * **
22421242 CAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTT
66 CAATTGTTTGACAACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAA
* * ** *
22421307 AAGTATTTGAATTAGTTCAGCAATTAGATTTATTTTTTATTTTTTCCCG
131 AACTATTTGAAATAGTTCAGCAAGCAGATTTACTTTTTATTTTTTCCCG
** * **
22421356 TTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGGATTATTTTATTCCAAATAAAG-TAGTATGAACAA
1 TTATTAA-TTTCAAAATATTATTAAATTAGGATTATTCCAATCCAAAT-AAGCTAGTACAAACAA
* *
22421420 AACCAATTGTTTGATAACAAAATAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAAT-TTTCAAATA
64 AA-CAATTGTTTGACAACAAAA-AAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATCATTCAAATA
* ** *
22421484 GTCAAAACTATTTGAAATCGTTTGGTAAGCAGATTTACTTTTTA
126 GTCAAAACTATTTGAAATAGTTCAGCAAGCAGATTTACTTTTTA
22421528 AATCACTTAC
Statistics
Matches: 139, Mismatches: 28, Indels: 7
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
179 7 0.05
180 45 0.32
181 19 0.14
182 65 0.47
183 3 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
TTATTAATTTCAAAATATTATTAAATTAGGATTATTCCAATCCAAATAAGCTAGTACAAACAAAA
CAATTGTTTGACAACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAA
AACTATTTGAAATAGTTCAGCAAGCAGATTTACTTTTTATTTTTTCCCG
Found at i:22423373 original size:173 final size:178
Alignment explanation
Indices: 22421841--22423508 Score: 482
Period size: 180 Copynumber: 9.4 Consensus size: 178
22421831 CGACAAATGG
* * * * * *
22421841 ATTTATTTTTTAAATATCTTGGTTATTAATTTTTAGAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT--CTATTAATTTTCAAAATATTGAA-AAATTAGTATTATTTAATT
** * * ** * * * * * * * *
22421905 ACGTATAAGTTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTG
63 TTGAATAATTTTACATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGATTTG
* * * * *
22421969 AAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTAAACTGGTTTAGTAAACAT
127 AAATAGATAATTATTCAAATGA-T-ATAACTACTTAAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * *
22422022 ATTT-GTTTTTTAAAGCTC-T-TATTAATTCTT-GAAATATT-AATAAATTAGT-GT-TTT--TC
1 ATTTAG-TTTTTAAATCTCTTCTATTAATT-TTCAAAATATTGAA-AAATTAGTATTATTTAATT
* * * ** * **
22422078 TT-AATAAGCTTGTATATG-AAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTGT-ATTAACAATT
63 TTGAATAA--TTTTACATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCA-CAATGATT
* ** * * * * ** *
22422139 TGAAATAGATAGTTATTCAAATGGCCACAATTATTTGAA-TTGATTTTGTAAACTA
125 TGAAATAGATAATTATTCAAAT-GATATAACTACTTAAACTTG-TTCAGTAAACAA
* * * * * *
22422194 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACATTT-GAATTATT-AATAAAGTAGTATTATTTTAT
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT-C-TATTAA-TTTTCAAAATATTGAA-AAATTAGTATTATTTAAT
* * * * ** *
22422257 TTTGGATAAGCTTTT--ATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTGGCAAAACAAATGGTCATAATGA
62 TTTGAATAA--TTTTACATGAA-AAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAATAAAAAGTCACAATGA
* * ** * * * *
22422319 CTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAGGTATTTGAACTTGTTC-GAAAAACTA
123 -TTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GATATAACTACTTAAACTTGTTCAG-TAAACAA
* * * *
22422376 ATTTATTTTTTTTAAATCTCATGCTTATTAATTTTTC-AAATGTT-AATAAATTAGTATTATTTT
1 ATTTA--GTTTTTAAATCTC-TTC-TATTAA-TTTTCAAAATATTGAA-AAATTAGTATTATTTA
** ** ** * * * * * * **
22422439 ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTATATGACTAAA-CAAAAGTCAAAACAAT
60 ATTTTGAATAATTTTACATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGA-
* * * * * * * *
22422502 TTTGAAATCGATAATTATTCTAATAATGTTAACTATTTGAAA-TAGTTCAGGAAACAT
123 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATGAT-ATAACTACTT-AAACTTGTTCAGTAAACAA
** * *
22422559 ATTTA--TTTTAAA--TC-TCTATTAATTTTTGAAATATT-ATTAAATTGGTATTATTT--TTAT
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTTCTATTAATTTTCAAAATATTGA-AAAATTAGTATTATTTAATT-T
* ** ** ** * * * * * *
22422616 CTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATT-TTTTATAAGAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGA
64 -TGAATAATTTTACATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGATTTGA
* * * * * * ** *
22422679 GATTGAT-ATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTCAACTGGTTTGGAAAACAA
128 AATAGATAATTATTCAAATGA-T-ATAACTACTTAAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * * *
22422730 CTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTTATTAATTTTGAAAA-ATT-AATAAGTAGTATTATTTTAA-
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT-C--TATTAATTTTCAAAATATTGAAAAATTAGTATTA-TTTAAT
* ** ** *
22422792 TTTGGATAAGTTCTT--ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAACCAAAAAGTCATAATGACT
62 TTTGAATAA-TT-TTACATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGA-T
* * * * * * *
22422855 TT-AAAAAGATAATTGTTCAAAT-AGTCA-AATCTATTTGAACTTATT-GGTAAACAG
124 TTGAAATAGATAATTATTCAAATGA-T-ATAA-CTACTTAAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * *** *
22422909 ATTTATTTTTTTAAATCTCTGCTAATTTATTTTTTGAATGTT-AATTAAATTAGTATTA-TTATA
1 ATTTA-GTTTTTAAATCTCTTCT-ATTAATTTTCAAAATATTGAA--AAATTAGTATTATTTA-A
** ** ** * * * * * * **
22422972 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAA-CAAAGGTCAAAACAATTT
61 TTTTGAATAATTTTACATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGATTT
* * * * * * * *
22423036 AAAATAGATAAATGTTCTAAT-AGTCTTAACTATTTAAAACTGGCTCA-TCAAAC--
126 GAAATAGATAATTATTCAAATGA-T-ATAACTACTT-AAACTTGTTCAGT-AAACAA
* * *** *
22423089 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATT-ATTAAATTAGTATATATTTTAA
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT-C-TATTAATTTTCAAAATATTGA-AAAATTAGTAT-TA-TTTAA
* * ** ** *
22423153 -TCTCAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TCACAATGATTT
61 TTTTGAATAATTTTACATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGATTT
* * *
22423216 GAGATAGATAATTCTTCAAAT-A-ATAACTATTTAAACTAT-TTCAGTAAACAA
126 GAAATAGATAATTATTCAAATGATATAACTACTTAAACT-TGTTCAGTAAACAA
22423267 ATTTAGTTTTTAAATCTC-T-TATTAATTTTCAAAATATT-AAAAGATTAGTATTATTTAATTTT
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTTCTATTAATTTTCAAAATATTGAAAA-ATTAGTATTATTTAATTTT
* * *
22423329 GAATAATTTTACATGAACAGAAACAATT-TTTTAATGACAAAATAAAAAGTCATAGTGATTTGAA
65 GAATAATTTTACATGAAAAGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAATAAAAAGTCACAATGATTTGAA
* * * *
22423393 ATAGATAATTATTCAAATGGATATGACTACTTGAACTTGTTCAGTAAATAG
129 ATAGATAATTATTCAAAT-GATATAACTACTTAAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * * *
22423444 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTGATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT--CTATTAATTTTCAAAATATTGAAAAATTAGTATTATTTAATTT
22423509 CAAACAAACT
Statistics
Matches: 1155, Mismatches: 231, Indels: 202
0.73 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
170 3 0.00
171 36 0.03
172 111 0.10
173 74 0.06
174 113 0.10
175 6 0.01
176 41 0.04
177 108 0.09
178 56 0.05
179 90 0.08
180 173 0.15
181 129 0.11
182 85 0.07
183 51 0.04
184 78 0.07
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
ATTTAGTTTTTAAATCTCTTCTATTAATTTTCAAAATATTGAAAAATTAGTATTATTTAATTTTG
AATAATTTTACATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCACAATGATTTGAAAT
AGATAATTATTCAAATGATATAACTACTTAAACTTGTTCAGTAAACAA
Found at i:22423499 original size:534 final size:523
Alignment explanation
Indices: 22421816--22424009 Score: 1677
Period size: 534 Copynumber: 4.1 Consensus size: 523
22421806 ATAGTCTTAA
* * * * * **
22421816 CTATTTGAAATAGTTCGACAAATGGATTTA-TTTTTTAAATATCTTGGTTATTAATTTTTAGAAT
1 CTATTTGAACTTGTTCG-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCCTATTAATTTTTAGAAT
* ** * *
22421880 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACGTATAAGTTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGA-
65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGAC
* * * * *
22421944 TAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
130 TA-AAC-AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTG
* * * *
22422009 GTTTAGTAAACATATTTGTTTTTTAAAGCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAG---T
193 GTTCA-TAAAC--ATTT-TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
* * *
22422071 GTTTT-TCTTAATAAGCTTGTAT-ATGAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTGTATTA
254 ATTTTATCTAAATAAGCTTGTATGA--AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA--G-ATCA
* * * * * * * * *
22422133 ACA--ATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGCCACAATTATTTGAATTGATTTTGTAAACTAAT
314 A-ATGATTTGAGATAGATAATTATTCAAAT---AATAACTATTTAAACTGATTTAGTAAACAAAT
* ** * *
22422196 TTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAACATTTGAATTATTAATAA-AGTAGTATTATTTTATTT
375 TTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTAATT----TTCAAAATATTAATAAGA-TAGTATTATTTAATTT
* * **
22422259 TGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTGGCAAAACAAATGGTCATAATGACTTT
434 TGGATAAG-TTTTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAATGACAAAACAAAAAGTCATAATGACTTT
22422323 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAG
497 AAATAGATAATTGTTCAAATAG-TATAG
* * * *
22422351 GTATTTGAACTTGTTCGAAAAACTA-ATTTATTTTTTTTAAATCTCATGCTTATTAATTTTTCA-
1 CTATTTGAACTTGTTCG-TAAA-TAGATTTA-TTTTTTTAAATCTCTTGCCTATTAATTTTT-AG
* *
22422414 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTATA
62 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTA
* * * * *
22422478 TGACTAAACAAAAGTCAAAACAATTTTGAAATCGATAATTATTCTAATAATGTTAACTATTTGAA
126 TGACTAAACAAAGGTCAAAACAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT-AA
* * * *
22422543 A-TAGTTCAGGAAACATATTTATTTTAAATCTC-TATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTGGTA
189 ACTGGTTCA-TAAACAT-TTTTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTA
** * * *
22422606 TTATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATT-TTTTATAAGAAAACAAAGATCATA
252 TTA-TTTTATCTAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCA-A
* * * * * * *
22422670 ATGATTTGAGATTGAT-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTGGTTTGGAAAACAACTTT
315 ATGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATA---ATAACTATTTAAACTGATTTAGTAAACAAATTT
* *
22422734 AGGTTTTAAATCTCTTGCTTTATTAATTTTGAAAA-ATTAATAAG-TAGTATTATTTTAA-TTTG
377 AGTTTTTAAA--TC-T-C-TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAGATAGTATTA-TTTAATTTTG
** *
22422796 GATAAGTTCTTATGAATTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAACCAAAAAGTCATAATGACTTTAAA
436 GATAAGTT-TTATGAACAGAAACAATTGTTTTAATGACAAAACAAAAAGTCATAATGACTTTAAA
* * *
22422860 AAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAT
500 TAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAG
* * * * *
22422885 CTATTTGAACTTATTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTC-TG-CTAATTTATTTTTTGAAT
1 CTATTTGAACTTGTTCGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCCT-ATTAATTTTTAGAAT
* * ** * *
22422948 GTTAATTAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGA
65 ATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
* *
22423013 CTAAACAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAGATAAATGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAACTG
129 CTAAACAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT-AAACTG
* *
22423078 GCTCATCAAACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTA
193 GTTCAT-AAACATTT-TTTTTTAAATCTCTTA--T--TAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTA
* *
22423143 TATATTTTAATCTCAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCAC
252 T-TATTTT-ATCTAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCA-
*
22423208 AATGATTTGAGATAGATAATTCTTCAAATAATAACTATTTAAACT-ATTTCAGTAAACAAATTTA
314 AATGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAATAACTATTTAAACTGATTT-AGTAAACAAATTTA
*
22423272 GTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAA-AAGATTAGTATTATTTAATTTTGAATAA-
378 GTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAGA-TAGTATTATTTAATTTTGGATAAG
* *
22423335 TTTTACATGAACAGAAACAATT-TTTTAATGACAAAATAAAAAGTCATAGTGA-TTTGAAATAGA
442 TTTT--ATGAACAGAAACAATTGTTTTAATGACAAAACAAAAAGTCATAATGACTTT-AAATAGA
* *
22423398 TAATTATTCAAAT-GGATATG
504 TAATTGTTCAAATAGTATA-G
* *
22423418 ACTACTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAA
1 -CTATTTGAACTTGTTC-GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCCTATTAATTTTTAGAA
* * * * **
22423482 TATTGATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTGTGAATAGAAGTAATTATTTTATG-
64 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * *
22423546 ----AC-AA-G----------TTGAAATAAATCATTATTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTTG
129 CTAAACAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TG
* ** * * * *
22423595 CTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
193 GTTCATAAAC--ATTT-TTTTT-TAAA--TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGT
* * * * * * *
22423660 ATT-TTTTATTTCGAATATGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCA
251 ATTATTTTATCT-AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCA
* * * *
22423724 TAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-GTTTTCAGAAAACAT
314 -AA-TGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATA---ATAACTATTTAAACTGATTT-AGTAAACAA
* * * ** *
22423787 ATTTATTTTTTTAATTTTCACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAA-ATTTA-TATTATTT--TA
373 ATTTA-GTTTTTAA--ATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAGA--TAGTATTATTTAATT
* * * * * * * * *
22423847 TTCGAAATAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTATTTT-ATGACAAAGCAAAAGGTCAAAATGA-TT
433 TTGGATA-AG-TTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTAATGACAAAACAAAAAGTCATAATGACTT
* * *
22423910 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
496 TAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAG
* * * * * * * *
22423939 CCATTTGGACTTGTTTGGTAAACAGATTCA-TATTTTAAATCTCTT-ACTCATTAATTTTTAGAG
1 CTATTTGAACTTG-TTCGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCCT-ATTAATTTTTAGAA
*
22424002 CATTAATA
64 TATTAATA
22424010 TTTTATTTCA
Statistics
Matches: 1362, Mismatches: 206, Indels: 197
0.77 0.12 0.11
Matches are distributed among these distances:
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Done.