Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167871.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_14, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 114000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 32 of 125
Found at i:6404805 original size:50 final size:51
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Indices: 6404682--6404838 Score: 158
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6404672 TATTTCCTTG
* * * * * * *
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1 TTTTGAAATTTCTAAATTTTTCACAATTTGGGCTTATTTAGAA-ATTCTTT-T
***
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1 TTTTGAAATTTCTAAATTTTTCACAATTTGGGCTT-ATTTAGAAATTCTTTT
**
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1 TTTTGAAATTTCTAAATTTTTCACAATTTGGGCTTATTTAGAAATTCTTTT
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TTTTGAAATTTCTAAATTTTTCACAATTTGGGCTTATTTAGAAATTCTTTT
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6405221 TTTTAAATTA
*
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*
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TACAAAAAAATAAAAAAAAAAAAGAG
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6406104 CCTATTATCC
*
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1 TAA
6406167 CAAACATCTA
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TAAAA
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6406105 CTATTATCCT
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1 AAAATAA-AATAA-AATA
6406150 AAAATAAAATAAAATA
1 AAAATAAAATAAAATA
6406166 A
1 A
6406167 CAAACATCTA
Statistics
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AAAATAAAATAAAATA
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6406652 TCTTATTCGA
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1 ATTTTGGAGATTCTC
* * **
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1 ATTTTGGAGATTCTC
6406706 ATT
1 ATT
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Statistics
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ATTTTGGAGATTCTC
Found at i:6408286 original size:20 final size:21
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6408243 TTGAGTCTTC
*
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*
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*
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1 TTTTTTCTTTTTTCTCCATCT
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1 TTTTTT
6408320 ATCCATTGTT
Statistics
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Consensus pattern (21 bp):
TTTTTTCTTTTTTCTCCATCT
Found at i:6409191 original size:57 final size:57
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6409087 TTGTACAGAA
* * * * ** *
6409097 AAAATTGATACTTTCAACTTCTCCCCAAAATATTTTTTAGAAACTTTAATTTCGAGG
1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAATTTTTTAGAAAATTTAATTTTAAAG
*
6409154 AAAATTGATACTTTCAATTTTTCCTCAAAAAAATTTTTTTTTTTA-AAAATTT-ATTCTTAAAG
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*
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1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAA--TTTTTTAGAAAATTTAATTTTAAAG
* *
6409273 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAACCTTTTTTA-AAAATTTATTTTTAAGG
1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAA--TTTTTTAGAAAATTTAATTTTAAAG
* * * * *
6409331 AAAATTAATACTTTCAACCTTTCC-CTAAAAATATTTTTTGGAAACTTTAATTTCGAAA-
1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTC-AAAAA-ATTTTTTAGAAAATTTAATTT-TAAAG
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6409420 TATATATTTT
Statistics
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AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAATTTTTTAGAAAATTTAATTTTAAAG
Found at i:6409304 original size:58 final size:56
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6409087 TTGTACAGAA
* * * * * *
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* * *
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* *
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1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAA-ATTTTTTGAAAATTTATTTTGAAG
* * *
6409273 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAACCTTTTTTAAAAATTTATTTTTAAGG
1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAA-ATTTTTTGAAAATTTATTTTGAA-G
* * * * * *
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1 AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAA
6409420 TATATATTTT
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AAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAAATTTTTTGAAAATTTATTTTGAAG
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1 AAATAAAGATAAAAATT
*
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1 AAATAAAGATAAAAAT
6409494 AAAAGAATAT
Statistics
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AAATAAAGATAAAAATT
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6409914 TTAGATAAAT
*
6409924 AAAAGAAATAGATAAATAATAATAA
1 AAAAAAAATAGATAAATAATAAT-A
6409949 AAAATAAAATCAGATAAATAATAA-A
1 AAAA-AAAAT-AGATAAATAATAATA
* **
6409974 AATATTAATAGATAAA-AA-AATA
1 AAAAAAAATAGATAAATAATAATA
6409996 AAA
1 AAA
6409999 TATATATATT
Statistics
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21 2 0.05
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AAAAAAAATAGATAAATAATAATA
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6409919 TAAATAAAAG
*
6409929 AAATAGATAAATAATAATAAAAAATA
1 AAATAGATAAA-AA-AATAAAATATA
*
6409955 AAATCAGAT-AAATAATAAAA-ATA
1 AAAT-AGATAAAAAAATAAAATATA
*
6409978 TTAATAGATAAAAAAATAAAATATA
1 -AAATAGATAAAAAAATAAAATATA
6410003 TATATTAAAT
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 3, Indels: 9
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23 7 0.17
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AAATAGATAAAAAAATAAAATATA
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* * *
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*
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1 -AAAATAAAATAGATAAA
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1 -AA-AATAAAATAGATAAA
*
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* *
6409974 AATAT-TAATAGATAAA
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1 AAAATAAAATA
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AAAATAAAATAGATAAA
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1 TTTT-TTTTTTTT
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13 1 0.04
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TTTTTTTTTTTTG
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Indices: 6410225--6410262 Score: 69
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1 TTTTGTTTTTGTTTTTTTT
6410263 TTTGTTAAAA
Statistics
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TTTTGTTTTTGTTTTTTTTA
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6410319 CATAAACAAA
* * *
6410329 GCTCCTTTAATCAAAGGCTCAACGACTTTTGAAAAATAAATG
1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
* * * *
6410371 GCTCCTCTAATTAGAGGCTCAATGACTTTGGAAAAATAAATG
1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
*
6410413 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAAC-TTTGAAAAGTAAATG
1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
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1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
* ** * * *
6410496 ACTTTTCTAATCAGAGGCT-TA--TCTTTTGGAAAA-TAAATT
1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTT-GAAAAGTAAATG
* * * * *
6410535 GCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAAC-TTTGAAAAGTAAATT
1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
* * * * ** * * *
6410576 GCTCCTTTAAACAGAGACACCTCAACTTTTGGAAAGTAAATT
1 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
* * * *
6410618 GCTCCTCTAAAT-AGAGGCACCATGAC-TTTGAAAAGTAAATT
1 GCTCCTCT-AATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
6410659 GCTCCTCTAAAT-AGAGGC
1 GCTCCTCT-AATCAGAGGC
6410677 AACCATGACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
39 24 0.09
40 11 0.04
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GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATG
Found at i:6410458 original size:41 final size:41
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Indices: 6410286--6410676 Score: 315
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* * * **
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* * *
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1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGAC-TTTGAAAAGTAAATGGC
* * *
6410373 TCCTCTAATTAGAGGCTCAATGACTTTGGAAAAATAAATGGC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTT-GAAAAGTAAATGGC
*
6410415 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAGTAAATGGC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAGTAAATGGC
*
6410456 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATGAC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGAC-TTTGAAAAGTAAATGGC
** * * * *
6410498 TTTTCTAATCAGAGGCTTATC--TTTTGGAAAA-TAAATTGC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTT-GAAAAGTAAATGGC
* * * * *
6410537 TCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAGTAAATTGC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAGTAAATGGC
* * * * ** * * *
6410578 TCCTTTAAACAGAGACACCTCAACTTTTGGAAAGTAAATTGC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGAC-TTTGAAAAGTAAATGGC
* * * *
6410620 TCCTCTAAAT-AGAGGCACCATGACTTTGAAAAGTAAATTGC
1 TCCTCT-AATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAGTAAATGGC
6410661 TCCTCTAAAT-AGAGGC
1 TCCTCT-AATCAGAGGC
6410677 AACCATGACT
Statistics
Matches: 295, Mismatches: 42, Indels: 22
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
39 23 0.08
40 10 0.03
41 103 0.35
42 125 0.42
43 4 0.01
44 2 0.01
45 23 0.08
46 5 0.02
ACGTcount: A:0.36, C:0.20, G:0.16, T:0.27
Consensus pattern (41 bp):
TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAGTAAATGGC
Found at i:6410470 original size:83 final size:83
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Indices: 6410286--6410676 Score: 337
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6410276 TGATCAAAGT
* * * ** * *
6410286 TCCTCTAAGCAGAGGCTTAACGACTTTGAGAAACATAAACAAAGCTCCTTTAATCAAAGGCTCAA
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGA-AAA-GT-AA-ATGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAA
* *
6410351 CGACTTTTGAAAAATAAATGGC
62 CAACTTTTGAAAAGTAAATGGC
* * *
6410373 TCCTCTAATTAGAGGCTCAATGACTTTGGAAAAATAAATGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAA
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTT-GAAAAGTAAATGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAA
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65 CTTTTGAAAAGTAAATGGC
* ** * *
6410456 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTTGAAAAGTAAATGACTTTTCTAATCAGAGGCT---TAT
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGAC-TTTGAAAAGTAAATGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAA
*
6410518 CTTTTGGAAAA-TAAATTGC
65 CTTTT-GAAAAGTAAATGGC
* * * * * * * * * **
6410537 TCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAGTAAATTGCTCCTTTAAACAGAGACACCTCAAC
1 TCCTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAGTAAATGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAAC
* *
6410602 TTTTGGAAAGTAAATTGC
66 TTTTGAAAAGTAAATGGC
* * * *
6410620 TCCTCTAAAT-AGAGGCACCATGACTTTGAAAAGTAAATTGCTCCTCTAAAT-AGAGGC
1 TCCTCT-AATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAGTAAATGGCTCCTCT-AATCAGAGGC
6410677 AACCATGACT
Statistics
Matches: 254, Mismatches: 40, Indels: 24
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Matches are distributed among these distances:
80 28 0.11
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* * * *
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* * *
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*
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*
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*
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*
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** * *
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*
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6422925 ATAAACCATA
* *
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** *
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*
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*
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*
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AATATATAATAATGCAAATAAT
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* * * *
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* * *
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* * ** *
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*
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*
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1 AT
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*
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* *
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*
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* **
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*
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*
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1 A
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* * * **
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* * ** * * *
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* * *
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* * *
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* *
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**
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* * * *
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*
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** * * * *
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* *
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1 T
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* **
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* * *
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*
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* *
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* * *
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* *
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* *
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*
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* *
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1 ATTGCATGATTATATATTTAATTGCA
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* * * * *
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1 CATGTTTTATATTGTTAATTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTTATATTGTTAATTGCAT
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* *
6432404 CATGTTTTATATTGTTAATTGCATGATTATATGTTTAATTGCATGTTTTATATTATTAATTGCAT
1 CATGTTTTATATTGTTAATTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTTATATTGTTAATTGCAT
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66 GATAATATATATTTT
* *
6432484 CATGTTTTATATTGTTAATTGCATGATTATATATTTATTTGCATGTTTTACA-TGTTAATTGCAT
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*
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66 GATAATATAT
6432558 TTAATTGCAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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GATAATATATATTTT
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* * * *
6432300 ATTGCATGATTATATATTTAATGGCATGTTTTACATTGTTAATTGCTTGATTATATATTGACTTG
1 ATTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTTACATTATTAATTGCATGATAATATA-T-ACTTG
* * *
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* * * *
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*
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66 TGTTTTATATTGTTAATTGCATGATTATATATATATTTGCATGTTTTACATGTTA
6432541 ATTGCATGATTATATATTTAATTGCA
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ATTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTTACATTATTAATTGCATGATAATATATACTTGCA
TGTTTTATATTGTTAATTGCATGATTATATATATATTTGCATGTTTTACATGTTA
Found at i:6432672 original size:19 final size:19
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* *
6432650 TTATTACATGATTTTATAT
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*
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1 T-TATTA
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Statistics
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TTATTACATGATATAATAT
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6432824 ATTAATATAT
* *
6432834 TTGCATGACATTC
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*
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*
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Statistics
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TTGCATGATATTA
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* * *
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* *
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* * * * *
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131 AAAAGGATGAATTTTTATAAGTCAATGGATGCTACTAGACTCTACTTAGTCCCTGATGTAGTAAT
* *
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196 TCCACAAAAACTTAAAGTTTCAAATCTTGA
*
6435345 TAATCCTATACAAGTTCCAAATCTTGATGATCCTAAAGAGTAAGAAAAGTTAAAGATTGGCC-CT
1 TAATCCTACACAAGTTCCAAATCTTGATGATCCTAAAGAGTAAGAAAAGTTAAAGATTGGCCTC-
**
6435409 GTTGAAATTAAATAAAATTTTGAAACCTAAAAGATGGATATTATTGAAGAAAGGCTTAAAGCCAT
65 GTTGAAATTAAATAAAATTTCAAAACCTAAAAGATGGATATTATTGAAGAAAGGCTTAAAGCCAT
* * * * *
6435474 CGAAGGGATGAATTTTTATAAGTTAATGGATGCTACTAGACTCTATTTAGTCCCTGATGTAGTGA
130 CAAAAGGATGAATTTTTATAAGTCAATGGATGCTACTAGACTCTACTTAGTCCCTGATGTAGTAA
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Statistics
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TAATCCTACACAAGTTCCAAATCTTGATGATCCTAAAGAGTAAGAAAAGTTAAAGATTGGCCTCG
TTGAAATTAAATAAAATTTCAAAACCTAAAAGATGGATATTATTGAAGAAAGGCTTAAAGCCATC
AAAAGGATGAATTTTTATAAGTCAATGGATGCTACTAGACTCTACTTAGTCCCTGATGTAGTAAT
TCCACAAAAACTTAAAGTTTCAAATCTTGA
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6437821 CTTACCTTAG
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1 TTTAGGGTCTAGGAATTATGGTTTAGGGTCTTAAGGT
* *
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1 TTTAGGGTC-TAGGAATTATGGTTTAGGGTCTTAAGGT
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1 TT
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Statistics
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TTTAGGGTCTAGGAATTATGGTTTAGGGTCTTAAGGT
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6437843 GAATTATGGT
*
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*
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1 TTAGGG
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
21 7 0.28
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TTAGGGATTAAGGTTTAGGGTC
Found at i:6438350 original size:8 final size:7
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Period size: 7 Copynumber: 76.7 Consensus size: 7
6437820 CCTTACCTTA
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
** *
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
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1 GTTT-AGG
*
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
* *
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
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**
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*
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1 GTTT-AGG
*
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* **
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1 GTTT-AGG
* *
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1 GTTTAGG
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1 GTTT-AGG
*
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1 GTTTAGG
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*
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*
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1 GTTTAGG
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* *
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*
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*
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*
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
* *
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
**
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1 GTTTAGG
*
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***
6438070 GTTTTCT
1 GTTTAGG
* *
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1 GTTTAGG
* *
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1 -GTTTAGG
*
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1 GTTT-AGG
*
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
**
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
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1 GTTTAG-G
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1 GTTTAGG
*
6438172 GGTTAGG
1 GTTTAGG
**
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
6438193 GTTTAGG
1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
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1 GTTTA-GG
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1 GTTTAGG
* *
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTAGG
* *
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1 GTTTAGG
* *
6438250 GTTCAAG
1 GTTTAGG
* *
6438257 GTTCAAG
1 GTTTAGG
* *
6438264 GTTCAAG
1 GTTTAGG
* *
6438271 GTTCAAG
1 GTTTAGG
6438278 GTTTAGG
1 GTTTAGG
*
6438285 GGTTAGGG
1 GTTTA-GG
*
6438293 GGTTAGG
1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
*
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1 GTTTA-GG
*
6438315 GTCTAGG
1 GTTTAGG
* *
6438322 GTCTAAG
1 GTTTAGG
*
6438329 GTCTAGG
1 GTTTAGG
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1 GTTTAGG
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1 G-TTTAGG
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1 GTTT-AGG
*
6438359 TTTTAGG
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1 GTTTAGG
6438373 GTTTA
1 GTTTA
6438378 AGGAAACGGG
Statistics
Matches: 423, Mismatches: 96, Indels: 44
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
5 6 0.01
6 16 0.04
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GTTTAGG
Found at i:6440756 original size:22 final size:22
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Indices: 6440713--6440757 Score: 56
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6440703 CAAGCTTGTC
* *
6440713 AAGAAAAAATTAGAAGCTGAAA
1 AAGAAAAAATAAGAAGCAGAAA
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1 AAGAA-AAAATAAGAAGCAGAAA
6440757 A
1 A
6440758 CTTAAGATTT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
22 10 0.50
23 10 0.50
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AAGAAAAAATAAGAAGCAGAAA
Found at i:6449896 original size:48 final size:48
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Indices: 6449799--6450406 Score: 585
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6449789 TTTCAAGAAT
*
6449799 AGATGAGATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTATTGAGAGGAG-CTTTTTTA
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*
6449848 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGAAGCCTTTTTTA
1 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* *
6449896 AAATGGATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAG-CTTTTTTA
1 AGAT-GAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* *
6449944 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGTGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTCA
1 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* * * *
6449992 AGATGAATTTTAAAGTTATTAAGCCTCT-GTTA-AGGAGCCTTTTTTA
1 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* * ** * * *
6450038 AGATGGATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTTTGTTGAAATGAG-CTTTTTCA
1 AGAT-GAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* ** *
6450086 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTATTGAGATAAGCCTTTTTCA
1 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* * *
6450134 AGATGAGATTTTTAAAATTATTGAGCCTCTATTGAGAGGAG-CTTTTTTA
1 AGATGA-A-TTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
6450183 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCC-TTTTT-
1 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* ** * * *
6450229 A-A--AATTTCAAAGTCATTGAGCCTCTGCTTAGAGGAG-CTTTTTCA
1 AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* * * * * *
6450273 AGATGGATTTTTAAAGTTTTTGAGCCTTTGCTTAAAGGAGCC-TTTTTA
1 AGAT-GAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
* ** * * **
6450321 A-AT---TTTCAAAAGTCATTGAGCCTCTACTTAAAAAAGCC-TTTTTA
1 AGATGAATTT-TAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
*
6450365 A-AT---TTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTCAGAGGAGCCTTTT
1 AGATGAATTTT-AAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTT
6450407 AAATTTTCAA
Statistics
Matches: 476, Mismatches: 63, Indels: 44
0.82 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
42 1 0.00
43 36 0.08
44 61 0.13
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ACGTcount: A:0.28, C:0.12, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (48 bp):
AGATGAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTTA
Found at i:6449931 original size:96 final size:94
Alignment explanation
Indices: 6449805--6450406 Score: 575
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6449795 GAATAGATGA
* *
6449805 GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTATTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTTTAAAGTTGTTGA
1 GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTTTAAAGTTATTGA
* * *
6449870 GCCTCTACTGAGAGAAGCCTTTTTTAAAAT
66 GCCTCTACTGAGAGGAG-CTTTTTCAAGAT
*
6449900 GGATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTTTAAAGTTGTTG
1 -GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTTTAAAGTTATTG
*
6449965 TGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTCAAGAT
65 AGCCTCTACTGAGAGGAG-CTTTTTCAAGAT
* * * * * * *
6449996 GAATTTTAAAGTTATTAAGCCTCT-GTTA-AGGAGCCTTTTTTAAGATGGATTTTTAAAGTTGTT
1 GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAG-CTTTTTTAAGAT-GAATTTTAAAGTTATT
* ** * *
6450059 GAGCCTTTGTTGAAATGAGCTTTTTCAAGAT
64 GAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTCAAGAT
* * ** * *
6450090 GAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTATTGAGATAAGCCTTTTTCAAGATGAGATTTTTAAAATTAT
1 GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAG-CTTTTTTAAGATGA-A-TTTTAAAGTTAT
* *
6450155 TGAGCCTCTATTGAGAGGAGCTTTTTTAAGAT
63 TGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTCAAGAT
* * * *
6450187 GAATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTT-A-A--AATTTCAAAGTCATTGA
1 GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTTTAAAGTTATTGA
* *
6450248 GCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTCAAGAT
66 GCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTCAAGAT
* * * * * * * *
6450277 GGATTTTTAAAGTTTTTGAGCCTTTGCTTAAAGGAGCCTTTTTAA-AT---TTTCAAAAGTCATT
1 -GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTT-TAAAGTTATT
* * **
6450338 GAGCCTCTACTTAAAAAAGCCTTTTT-AA-AT
64 GAGCCTCTACTGAGAGGAG-CTTTTTCAAGAT
* * *
6450368 --TTTTAAAAGTTGTTGAGCCTCTACTCAGAGGAGCCTTTT
1 GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTT
6450407 AAATTTTCAA
Statistics
Matches: 434, Mismatches: 61, Indels: 30
0.83 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
88 33 0.08
90 37 0.09
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ACGTcount: A:0.28, C:0.12, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (94 bp):
GATTTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTTTAAAGTTATTGA
GCCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTCAAGAT
Found at i:6450351 original size:44 final size:44
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Indices: 6450153--6450418 Score: 218
Period size: 44 Copynumber: 5.9 Consensus size: 44
6450143 TTTTAAAATT
* * *
6450153 ATTGAGCCTCTA-TTGAGAGGAGCTTTTTTAAGATGAATTT-TAAAGTT
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* * *
6450200 GTTGAGCCTCTACTGAGAGGAGCCTTTTTAAAATTTC-AAAGTC
1 ATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCCTTTTTAAATTTTCAAAAGTC
* ** *
6450243 ATTGAGCCTCTGCTTAGAGGAG-CTTTTTCAAGATGGATTTTTAAAGTT
1 ATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCCTTTTT-AA-AT---TTTCAAAAGTC
* * * *
6450291 TTTGAGCCTTTGCTTAAAGGAGCCTTTTTAAATTTTCAAAAGTC
1 ATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCCTTTTTAAATTTTCAAAAGTC
* ** * *
6450335 ATTGAGCCTCTACTTAAAAAAGCCTTTTTAAATTTTTAAAAGTT
1 ATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCCTTTTTAAATTTTCAAAAGTC
* *
6450379 GTTGAGCCTCTACTCAGAGGAGCC-TTTTAAATTTTCAAAA
1 ATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCCTTTTTAAATTTTCAAAA
6450419 ATGTTGTTGA
Statistics
Matches: 180, Mismatches: 30, Indels: 22
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
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43 44 0.24
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47 31 0.17
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49 6 0.03
ACGTcount: A:0.29, C:0.15, G:0.18, T:0.38
Consensus pattern (44 bp):
ATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCCTTTTTAAATTTTCAAAAGTC
Found at i:6450629 original size:14 final size:15
Alignment explanation
Indices: 6450610--6450644 Score: 54
Period size: 14 Copynumber: 2.4 Consensus size: 15
6450600 TTTTTTTTTC
6450610 TCTTTTTCTTTC-TT
1 TCTTTTTCTTTCTTT
*
6450624 TCTTTTTTTTTCTTT
1 TCTTTTTCTTTCTTT
6450639 TCTTTT
1 TCTTTT
6450645 CAATTTAGCT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
14 11 0.58
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TCTTTTTCTTTCTTT
Found at i:6450807 original size:23 final size:23
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6450762 TTTTAGATTG
* *
6450772 AAAATATGGGATTTGAATCTCAA
1 AAAATATGAGATTTGAATCCCAA
*
6450795 AAAATCTGAGATTTGAATCCCAA
1 AAAATATGAGATTTGAATCCCAA
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1 AAA
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AAAATATGAGATTTGAATCCCAA
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6451593 CCGGTTCAGG
*
6451603 TAAAA-ATTTTTTTT
1 TAAAATATTTTTTAT
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1 TAAAATATT-TTTTAT
*
6451633 TAATAT-TTTTGTATAT
1 TAAAATATTTT-T-TAT
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1 TAAAATATTT
6451659 ATATTTGTTA
Statistics
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TAAAATATTTTTTAT
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6452772 ATTAAGACAA
* * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * **
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* ** *
6452911 TAAAAGATTTAAAAAAT-AAT-TACGTTTACTGAGTAAGTTCAAATAGTTATAAT
130 --AGA-ATTTAAAAAATAAATCTAC--TTACT-AAAAAGTTCAAATAGTTAT-GT
* * * *
6452964 -TGTTTGAACAATTAT-TCATTTAAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * *
6453027 CTATTCACACAAGTTTATTCAGAATAAAAATAATACTGATTTATTAATATTCTGAAAAGTAATAG
65 CTGTTCACACAAACTTATTCAGAAT-AAAATAATACTGATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAA
* *
6453092 GCAGGCAATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGT
129 G-A-G-AATTTAAAAAATAAATCTACTTACTAAA-AAGTTCAAATAGTTATGT
* * * * *
6453145 CCATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAACTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * * * * *
6453209 TTGTTCATGCAAAATTTTTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
65 CTGTTCACACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTGATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAG
* * *
6453274 AG-ATTTAAAAACTAAATCTATTTACTAAAACAGTTCAAATAGTTATGA
130 AGAATTTAAAAAATAAATCTACTTACTAAAA-AGTTCAAATAGTTATGT
* * * *
6453322 CTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
6453385 CTTTTCATACAAACTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTC-CAAAACTTAATAA
65 CTGTTCACACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTGATTTATTAATATTCTGAAAA-TTAATAA
6453449 GAG-ATTTAAAAAATAA
129 GAGAATTTAAAAAATAA
6453465 TTGTGTTAGC
Statistics
Matches: 415, Mismatches: 71, Indels: 36
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 4 0.01
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Consensus pattern (177 bp):
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
TGTTCACACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTGATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGA
GAATTTAAAAAATAAATCTACTTACTAAAAAGTTCAAATAGTTATGT
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6453524 TAGTTATGAC
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1 TATTT-AAATAATTAT
6453566 GACCTTTTGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (16 bp):
TATTTAAATAATTATT
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6453511 AAACACATTT
* * **
6453521 AAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * * * *
6453586 ACCAATTGTTTCTGTTCATACATGCATATTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTCATATTCCAA
66 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAA
* ** * *
6453651 AAATTAATAAGTACAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAGCAAGTTT
131 AAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC
* * * *
6453703 AAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
6453768 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAA
66 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAA
* *
6453833 AAATTAATAGGTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGTTC
131 AAATTAATA----AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC
* * *
6453884 AAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * * *
6453949 AATAATTATTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTTATCTATTAATATTTTGA
66 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAA
* * * *
6454014 AAATTAATAAGACATTTAAAAATTAAATCTATTTTCCAAA-ATAGTTC
131 AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-AGTTC
* * *
6454061 AAATAGTTATGACTATTATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTTGCA
1 AAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-T-CA
* * * * * *
6454126 TAACA-AATAT-TTT-TGTTCATATAAGTTTGTT-AGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACAT
63 TAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * *
6454187 TTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC
126 TCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC
* * ** *
6454239 AATTAGTTATAAGAATTTGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGA-CTATTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATA
*
6454303 AAAGAATTGTTTCTATT
65 AAACAATTGTTTCTATT
6454320 GATGCAGCTT
Statistics
Matches: 529, Mismatches: 73, Indels: 35
0.83 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 7 0.01
176 10 0.02
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179 7 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAA
AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC
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Indices: 6453521--6454305 Score: 797
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6453511 AAACACATTT
* * * **
6453521 AAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * * * ***
6453586 ACCAAT-TGTTTCTGTTCATACATGCATATTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTCATATTCCA
66 AACAATAT-TTT-TATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTG
* * ** *
6453650 AAAATTAATAAGTACAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAGCAAGTTT
129 AAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAAAAGTTC
* * * * *
6453703 AAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *
6453768 AACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTA
66 AACAATAT-TTT-TATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTG
* *
6453832 AAAATTAATAGGTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGTTC
129 AAAATTAATA----AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTC
* *
6453884 AAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * *
6453949 AATAATTATTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTTATCTATTAATATTTTGA
66 AACAA-TATTTTTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA
* * * *
6454014 AAATTAATAAGACATTTAAAAATTAAATCTATTTTCCAAAATAGTTC
130 AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAA-AGTTC
* *
6454061 AAATAGTTATGACTATTATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTTGCA
1 AAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-T-CA
* * * * * *
6454126 TAACA-AATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTT
63 TAAAACAATATTTTTATTCATACAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
*
6454189 TGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC
127 TGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTC
* * ** * *
6454239 AATTAGTTATAAGAATTTGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGA-CTATTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATA
6454303 AAA
65 AAA
6454306 GAATTGTTTC
Statistics
Matches: 516, Mismatches: 73, Indels: 35
0.83 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.01
176 4 0.01
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179 3 0.01
180 7 0.01
181 140 0.27
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183 1 0.00
186 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (175 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATATTTTTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAA
AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAGTTC
Found at i:6454729 original size:181 final size:177
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Indices: 6454508--6454948 Score: 485
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6454498 ACATCATTTT
*
6454508 AATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAACAA
1 AATTTATTAATATT-CAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTATTGAACAA
* * * *
6454573 GTTTAAATGGTTATGACTATTTTAACAA-TTACATATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTCGT
63 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTT-CATATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTCGT
* * * *
6454637 AATAAAATAATT-TTTTCTATTCATAGAAGCTTATTTCAATTAAAATAATAC
127 AATAAAATAATTGTTTT-TACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAC
* * * * *
6454688 AATTTATTAATCTTCAAACCATTAAAAAGTAAAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATA
1 AATTTATTAATATTCAAA--ATTAATAAGTAAAA-GATTT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAACA
* * * ** * * *
6454753 GGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAACTTTTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
62 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTTCATATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTCGT
* * *
6454818 CATAAAATAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAT
127 AATAAAATAATTGTTTTTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAC
* * * *
6454869 AAATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTTTGAACAC
1 AATTTATTAATA-TTC-AAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAA
6454933 G-TTAAATAGTTATGAC
63 GTTTAAATAGTTATGAC
6454949 CTTTTGCTTT
Statistics
Matches: 217, Mismatches: 35, Indels: 20
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 14 0.06
179 25 0.12
180 27 0.12
181 134 0.62
182 14 0.06
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
AATTTATTAATATTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTT
TAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTTCATATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTCGTAATA
AAATAATTGTTTTTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAC
Found at i:6454987 original size:143 final size:145
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Indices: 6454799--6455062 Score: 399
Period size: 143 Copynumber: 1.8 Consensus size: 145
6454789 TTTCAAATCA
* * * *
6454799 TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAAT
1 TTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGCATATTCCAAATAAAAT
* * *
6454864 AATA-TAAATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTTT
66 AATACTAAATTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAATAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTTT
6454927 GAACACGTTAAATAG
131 GAACACGTTAAATAG
* * *
6454942 TTATGACCTTTTGCTTTGTCAT-AAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCGAAATAAAA
1 TTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCTACTCATACAAGCATATTCCAAATAAAA
*
6455006 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAATAAAAAATTTTAAAAATAAAT
65 TAATACTAAATTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAATAAAAAATTTTAAAAATAAAT
6455063 TTGTTCACCG
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 11, Indels: 4
0.88 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
142 4 0.04
143 57 0.53
144 27 0.25
145 19 0.18
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (145 bp):
TTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGCATATTCCAAATAAAAT
AATACTAAATTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAATAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTTT
GAACACGTTAAATAG
Found at i:6455389 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 6454942--6460519 Score: 3451
Period size: 180 Copynumber: 31.1 Consensus size: 180
6454932 CGTTAAATAG
* * * * *
6454942 TTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCGAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * *
6455007 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAATAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTCACC
66 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
** * ** * * * * *
6455072 GAGTAAGTTAAAATAGTTATGGTTGTTTTAA-TATTATTTTTATTTTAAAT-A
130 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA--TCTATTTCAAATCA
* * * *
6455123 GTTATAATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTCATT-AGAAATAA
1 -TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCA-AAATAA
* * * *
6455186 AATAATATTAATTTACTAATATTCTAAAAATTAAAAGGTAGGAGATTTAAAACATAAATCTGTTT
63 AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * *
6455251 ATCGAATAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA
127 ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * **
6455305 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTAGTCAAAATAAGTT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * ** *
6455370 AATACTGATATATTAATATTTTGAAAATT--CA-TAAGAGATTTAAAATCTAAATCTGTTTA-CC
66 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCG
* * * *
6455431 AAAACAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTA-TCCAAAAT-A
131 AACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCA
* * * * ** *
6455481 GTTACGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-TTACATACAAGCTTATTCGGATTAAA
1 -TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT-CATACAAGCTTATTCAAAATAAA
** * * * * * *
6455544 ATAATGTTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTG
64 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA-AAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * * *
6455609 CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTAATTGAAATCA
128 TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * ** *
6455662 TTCTGACCTTTTTGTTTAGTCATAAAATGATTATTTAAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
1 TTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * ** * * *
6455727 TAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAGTGAGCAAAAGATTTTTAAAAAAAAAATCTGTTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA-AAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * *
6455792 -GCTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGATTGA-TTGAACAATTATCCATTT-AAAGTCA
127 ATC-GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCA
* * * * * *
6455846 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAATCTTATT-AGAATACAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * *
6455910 AATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTT
66 AATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
* ** * ** *
6455974 TGAACCGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATGAATCTCAAATCA
129 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * **
6456026 TTATGATC-TTTATTTTCTCATGAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCAAACA-AAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAA-ATAAAA
* * * * *
6456089 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT--CA-TAAGAGATTT--AAAATAAATGTGTTT-GC
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* * ** * *
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130 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TT-CAAAATAAA
* * * * *
6456265 ACAATACTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTT
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* * * * *
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126 TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * **
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64 ATAATACTA-ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * **
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126 TATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *** * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
*
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66 AATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTAT
* * * **
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129 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * * * *
6456742 TTATAATATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTGGTT-ATATAAACTTATTCAGAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * *
6456806 TAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * *
6456870 TCAAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTA-TT----TCA
128 TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * * * ** ** *
6456918 --A-G----TTT-ATTCGAAATAAAACAATTATTTCAACTCATACA-AGCTTATTCAGAAT-AAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT---CT-GTTCATA-C--AAGCTTATTCAAA
* * * * * * * * ***
6456973 ATAAAACTAATTCATTAATATT-TCAAAATTTTGTAAGAGATTTAGAG-AATA-ATTCTATTTTA
59 ATAAAA-TAA-T-ACTAAT-TTAT--TAATATTCTAA-AAATTAAAAGTAAGAGATT-TA-AAAA
* * * * * * * * * *
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115 ATAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCA-AA-TAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
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176 AATCA
* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAA
* * **
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* * * * * * * * **
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* * * * * * ** *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * ** * * ** *
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65 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
* * * * ** * *
6457398 TGAATC-GGTTCAAATAGTTAAGACTATGTGAATGATTATCTATTGCAAATCG
129 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * *
6457450 TTATGACATTTTCTTTTATCGTAAAACAATTATTT-TGTTCGTAAAAGCCTATTCAGATTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * *
6457514 AATACTAATTTAATAATATT-TCAACAACT--AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTATT
66 AATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * *
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130 GAA-CAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * ** * *
6457627 TTTTGATCTTCTATTTAGTCTTAAAATAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * *
6457692 AATATTAATTTATTAACATT-TGGAAAATCAATAAGAAAAAGATTTAAAAAAATAAAAT-TGTTT
66 AATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATCTGTTT
* * * * * *
6457755 A-CTGAAAAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCG
127 ATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
** * * *
6457874 TAATACTAATTCCTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAT-AATTTGTATA
65 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * ** *
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128 TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * *
6457989 TGATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAATGTTT-TAGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *** * *
6458053 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT--AA-TAAGTGATTTAAAAAGGGAATATGTTTACC
65 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * * * * *
6458115 AAATC-AGTTTAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTCTCTATTTCAAATCA
130 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * **
6458166 TTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACAACCTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * *
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* *** * *
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* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
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* * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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** * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * ** * * *
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66 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-
* * * *
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130 GAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
6460131 TTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* *
6460195 TAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAATAAAAAATAAATCTGTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA-AAGTAAGAGATT--TAAAAAATAAATCTGTT
* * * * *
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* * * * * * * * **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * * * *
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66 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT-TAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * * *
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130 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* *
6460495 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
6460520 GCACTTATTT
Statistics
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** * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * **
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* * * * **
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* * * *
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** * ** *
6455499 TCATAAAACAATTATTTCTTTACATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATGTTAATTTAATAATA
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* * * ** * **
6455564 TTCCAAAAATTAGTATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTT
259 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
6455629 AAGACTATTAGAACAATTATTTAATTGAAATCA
324 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * ** * *
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1 TTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAA
* ** * * *
6455727 TAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAGTGAGCAAAAGATTTTTAAAAAAAAAATCTGTTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA---A-TAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTT
* ** * * * *
6455792 -GCTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGATTGA-TTGAACAATTATCCATTT-AAAGTCATTATGAC
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* * * * * *
6455853 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAATCTTATT-AGAATACAATAATACTA
185 C-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTC-TTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * ***
6455917 CTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCGG
248 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAG
* ** *
6455982 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATGAATCTCAAATCA
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* * * * ** *
6456026 TTATGATC-TTTATTTTCTCATGAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCAAACA-AAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAA-ATAAAA
* ** * * * **
6456089 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTCATAAGAGATTT--AAAATAAATGTGTTT-GCTGA
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA
* ** * * * *
6456151 ACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTT-TGTT
130 AC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGATCTTTAT-TT
* * * * * * * *
6456215 TAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTGATACAAGCTTATTTGGAAAAAAAAACAATACTAATTTAT
193 T-GTCATAAAACAATTATTTC-TTTCATACAAGCTTA-TT-CAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
6456280 TAACT-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAAAAATTCA
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* *
6456344 AATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
317 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
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* * **
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63 AATAATACTA-ATTTATTAATATTTT-AAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
*** * * * * * * ** * * *
6456510 TTATTGAATC-GATTGAAATAATTTTGGCCATTTGAACAACAATCTATTTC-AAATCATTCTTAC
122 TTACCAAAACAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGAT
* *
6456573 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TT-TTTCAACGTACAAGCTTATTCAAAATAAAGTAA-AC
185 C-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTC-A--TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * *
6456635 TAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTATTGAAT
246 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCGAAT
* * **
6456695 CAA-TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACACTTATCTATTTCAAATTG
310 -AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * * *
6456742 TTATAATATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTGGTT-ATATAAACTTATTCAGAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAA
* * * * **
6456806 TAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * *
6456871 CAAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTC-----A--A-G---TTTA-
126 CAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGATCTTTAT
* ** ** * * *
6456924 TTCGAAATAAAACAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTCATT
191 TTTGTCATAAAACAATTATTTC-TTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * *
6456989 AATATTTC-AAAATT--T-TGTAAGAGATTTAGAGAATAATTCTATTTTATTGAATCAA-CTCAA
255 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAAT-AAGTTCAA
* * *
6457049 ATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCA
318 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * **
6457088 TTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGA-TCAAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTT-ATTCAAAATAAAA
* *
6457152 AAATACAAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATCCGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAA----TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
** * * * * * * * * * *
6457216 CCAATCCATTTTAAATAGTTTTGACTATTGGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
125 CCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGATC-TTT
* * * * ** *
6457281 ATTTTGTCATCAAATAATTGGTTT-TATTCATACTATTTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTT
189 ATTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCT-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * ** * * ** * * **
6457345 AATAATATTCTGAAACTCAATAACAAAAAAATTTAAAAAATAAATCTAATTGTTGAATCGGTTCA
252 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCA
* * ** * *
6457410 AATAGTTAAGACTATGTGAATGATTATCTATTGCAAATCG
317 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * *
6457450 TTATGACATTTTCTTTTATCGTAAAACAATTATTT-TGTTCGTA-AAAGCCTATTCAGATTAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAA-CTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * ***
6457513 TAATACTAATTTAATAATATTTCAACAACTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAA
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA
* * * * * *
6457578 TCAGTTCAAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTTTGATCTTCTATT
130 ACAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATCTT-TATT
* * * * * * * *
6457642 TAGTCTTAAAATAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATATTAATTTATTA
192 TTGTCATAAAACAATTATTTC-TTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *** * * * *
6457707 ACATTTGGAAAATCAATAAGAAAAAGATTTAAAAAAATAAAAT-TGTTTA-CTGAAAAAGTTCAA
256 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATCTGTTTATC-GAATAAGTTCAA
* * * * *
6457770 ATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCG
318 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
6457809 TTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAAATTGTTTCGGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAA-CTTATTCAAAATAAA
** * * *
6457873 ATAATACTAATTCCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAT-AATTTGTATAC
64 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* ** * *
6457937 CGAACAA-A-TTTAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCATGATGACCTT
126 C-AA-AACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATCTT
* *
6457999 T-TGTTTCATCATAAAACAAATGT-TTTAGTTT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
188 TAT-TTT-GTCATAAAAC-AAT-TATTT-CTTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *** * * * *
6458061 ATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGGGAATATGTTTACCAAATCAG
248 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAG
* * * * * *
6458122 TTTAAATAATTATGGCAATTTCAACAATTCTCTATTTCAAATCA
313 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * **
6458166 TTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACAACCTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
6458231 AATACTAATTTATTAAT-TTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTAC
66 AATACTAATTTATTAATATTTT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * *
6458294 CAAACCAGTTCAAATTGTTATGACTATTT-AAGCAATTATATACTTC-AAATCATTATAATGTTT
126 CAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATCTTT
* * *
6458357 -TGTTCTATCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAGTAGTAA
189 AT-TT-TGTCATAAAACAATTA-TTTCT-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
6458419 TCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTTTTA-CTGAACCAA
249 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAA-TAA
* ** * * * *
6458482 -TTCAAATTGTTAAAACTATATGAATAATTATATATTTCAAATCG
312 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* *** * * *
6458526 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAAATCATACTAGCTTATTCAGAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
6458591 AA-AATGGATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTTTTAC
66 AATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * *** * *
6458654 CTAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCCATAACCTTT-T
126 CAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGATCTTTAT
* * ** * *** * *
6458718 GTTTCATGATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAAGAAAATAGTA-TAGATTT
191 -TTT-GTCATAAAACAATTATTTCT-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTT
* * * *
6458782 ATTAATATT--AAGGCAATTAATACA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT
252 ATTAATATTCCAA--AAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGT
* * * * * **
6458844 TTAAATCA-TTTTGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTG
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* *** * * * ** *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * **
6458952 AATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTTATATGTAAAAGATTTAAAATATATATATGTTT-TT
66 AATACTAATTTATTAATATTTTAA-AAATTA-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
** * * * * *
6459016 TGAGCAAGTTCAAATAGTCATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTT
127 AAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATC-TTT
* * * * ** * *
6459080 GTTTTGTAATAAAACAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAACAATATTAATTTT
189 ATTTTGTCATAAAACAATTATTTC-TTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTT
* * * * * * * * * * *
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252 ATTAATATTCCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTC
*
6459209 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AA--A
316 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *** *
6459247 --A-CACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAACT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
* ** * * * * * * ***
6459309 AATA-TAAATTATTAATATTCCAAAAATTAACAATAAAATTTTGAAAAATAAAGCTATTTTTTGA
66 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-GAGA-TTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCA
* * * * * *
6459373 ATAC-CTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-TAAGTCATTATGA-CAATTTG
128 AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATC--TTTA
* * * * *
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190 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
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* * *
6459561 AAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA
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* * * * ** *
6459602 TTATGATCTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGTTTATTCAGAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
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** * * * * * * * * *
6459730 TGAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACTATTATATATTTC-AGATCATTATGACCTTTT
127 AAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATC-TTT
* * * ** * * * * *
6459794 GTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAACTAATAATAGTTTA
189 ATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
** * * * * * **
6459859 TTTCTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATC--TTAACCAAACCAGTTCAA
253 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAA
* * * * *
6459918 ATAATTATGACTATTTAAACAATTACCTATCTCAAATTA
318 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
6459957 TTATGATC-TTTGTTTTATCCTAAAACATTTGTTTCTGTTCATACGAGCTTATTCAAAGTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
* * * ** * * * * ** *
6460021 ATTGCTAAATTAACAATATTCTAAAAATTAATGAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAT
66 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAA
* * * * * *
6460084 CTAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT-TCTATTGC-AAATCATTTTGACCTTTTATTT
131 C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATC-TTTATTT
* * *
6460147 AGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
193 TGTCATAAAACAATTATTTCT--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
** * * *
6460211 ATATTTAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAATAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAA
256 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT--TAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAA
* * *
6460276 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAATTAAAATCA
319 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * **
6460314 TTGTGACTTTTTATTTTATCATAAAACAGTTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * *
6460379 AATATTACTTTATTAACATTTTAAAAATCGATAAGTTAGAGATTTAAAACATAAATCAGTTAATC
66 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT---TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * * *
6460444 GAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAACTTTTA
127 AAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATC-TTTA
* *
6460508 TTTTGTCATAAAGCACTTATTT
190 TTTTGTCATAAAACAATTATTT
6460530 TTGAAATATT
Statistics
Matches: 4072, Mismatches: 925, Indels: 455
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
344 44 0.01
345 47 0.01
346 183 0.04
347 3 0.00
348 1 0.00
349 88 0.02
350 42 0.01
351 4 0.00
352 71 0.02
353 45 0.01
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355 83 0.02
356 97 0.02
357 629 0.15
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360 454 0.11
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362 352 0.09
363 266 0.07
364 241 0.06
365 54 0.01
366 71 0.02
367 8 0.00
368 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (356 bp):
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAA
CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGATCTTTATTTTGT
CATAAAACAATTATTTCTTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
Found at i:6456818 original size:540 final size:535
Alignment explanation
Indices: 6454942--6460492 Score: 3752
Period size: 539 Copynumber: 10.3 Consensus size: 535
6454932 CGTTAAATAG
* * * * * * *
6454942 TTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAATCAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTCGAAATAAAA
1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * *
6455006 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAGAAATAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTCAC
65 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT----AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** * ** * * * * * *
6455071 CGAGTAAGTTAAAATAGTTATGGTTGTTTTAA-TATTATTTTTATTTTAAA-TAGTTATAATCTT
126 CGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA--TCTATTTCAAATTA-TTATAACCTT
* * *
6455134 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTCATTAGAAATAAAATAATATTAAT
187 TTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATT-CAAATAAAATAATACTAAT
* * ** * * *
6455198 TTACTAATATTCTAAAAATTAA-AAGGTAGGAGATTTAAAACATAAATCTGTTTA-TCGAATAAG
249 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAA-GCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAG
* * *
6455261 TTCAAATAGTCATGTCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
311 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * * ** * *
6455326 TAAAAAAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTAGTCAAAATAAGTTAATACTGATATATTAATATTT
376 TAAAACAATTATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * ** * *** * * *
6455391 TGAAAA-T--TCA-TAAGAGATTTAAAATCTAAATCTGTTTACCAAAAC-AGTTTAAATAGTTAT
440 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATCAAGTTCAAATAATTAT
* *
6455451 GATTATTTGAACAATTATCTA-TCCAAA--A
505 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * ** *
6455479 -TAGTTACGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTT-TACATACAAGCTTATTCGGATTA
1 TTA-TTAC-CT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTCAACATACAAGCTTATTCAAAATA
** * * *
6455542 AAATAATGTTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
62 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA--A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * * * * *
6455607 TGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTAATTGAAATCATTCTGACCTT
123 TACCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACC-T
** * ** *
6455672 TTTGTTTAGTCATAAAATGATTATTTAAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
186 TTTGTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
6455737 TTATTAACATTCGAAAAATTAGTGAGCAAAAGATTTTTAAAAAAAAAATCTGTTTGCTGAACAAG
249 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGA--TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAG
* *
6455802 TTCAAATAGATT-TGATTGA-TTGAACAATTATCCATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTG
311 TTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
6455864 TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAATCTTATT-AGAATACAATAATACTACTTTATTAATA
373 TCATAAAACAATTATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** *
6455928 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAA-CCGGTTCAAATAGT
437 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATCAAGTTCAAATAAT
* ** *
6455992 TATGACTATTTGAACAAATATGAATCTCAAATCA
502 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
6456026 TTATGATC-TTTATTTTCTCATGAAACAATTGTTTCT-AATCATACAAGCTTATTCAAACA-AAA
1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAA-CATACAAGCTTATTCAAA-ATAAA
* * * * * *
6456088 ATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTCATAAGAGATTT--AAAATAAATGTGTTTGCTGA
64 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* * ** * * *
6456151 ACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGTTT
129 AC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTT
* * * * * * *
6456216 AGTCATATAATAATTGTTTCAGTTGATACAAGCTTATTTGGAAAAAAAAACAATACTAATTTATT
193 A-TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TT--CAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * *
6456281 AACT-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAAAAATTCAA
254 AA-TATTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAA
* * * *
6456345 ATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAA
316 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * *
6456410 CAATTGCTTTAGTTTCGTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATGCTACA-ATATTAATTTTTCAA
381 CAATT-ATTTAG-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
6456474 AAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTGAATCGA-TTGAAATAATTTTGGC
443 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATCAAGTTCAAATAATTATGAC
* **
6456538 CATTTGAACAACAATCTATTTCAAATCA
508 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
6456566 TTCTTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCAACGTACAAGCTTATTCAAAATAAAGT
1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* **
6456631 AA-ACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTATTGAA
66 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAA
* * * **
6456694 TCAATTCAAATAGCTATGACTATTTGAACACTTATCTATTTCAAATTGTTATAATATTTTGTTCT
130 -CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTT-T
* * *
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193 ATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * * * *
6456823 TATTTTGAAAATTAATAA-CTTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TTCAAACCAGTTCAAAC
256 TA-TTCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * **
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318 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * *
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383 ATTATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
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*
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511 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * *
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1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-CAACATACAAGCTT-ATTCAAAATAAA
* *
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* * * * * * *
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* * * * * * **
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187 TT-GTTTATCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * ** ** *
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249 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAG
* * ** * * * * * *
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311 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
6457471 TAAAACAATTATTTTGTTCGTAAAAGCCTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC
376 TAAAACAATTATTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * ** ** *
6457536 -AACA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAATC-AGTTCAAAATGGTTAA
441 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATCAAGTTC-AAATAATTAT
* *
6457596 GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
505 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
6457627 TT-TTGATCTTCTATTTAGTCTTAAAATAA-T-TTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
1 TTATT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * ** *
6457689 ATTAATATTAATTTATTAACATTTGGAAAATCAATAAGAAAAAGATTTAAAAAAATAAAAT-TGT
63 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAAT-AAATCTGT
* * * * * * **
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122 TTACCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCT
* * * * *
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186 TTTG-TTTATCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
** * * * *
6457883 TTCCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAT-AATTTGTATACCGAACAAAT
248 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGT
* ** * * **
6457946 TTAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATGATGACCTTTTGTTTCATCAT
312 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
6458011 AAAACAAATGT-TTTAGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
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*** * * *** *
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440 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATCAAGTTCAAATAATTAT
* * * *
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505 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * **
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1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
*
6458231 AATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACC
66 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * **
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127 GAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTG
* * *
6458359 TTCTATCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAGTAGTAATCTA
190 TT-TATCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
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* ** * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * *
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* **
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** * ** * ** * *** *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * ** ** * * *
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*
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* * * * * * *** *
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* * * * * * * * ***
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * *
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1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * * * * * * **
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1 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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ATCTATTTCAAATCA
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*
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**
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6461397 CTTATATTAA
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:6461846 original size:181 final size:180
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * *** **
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* * * * * * *
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* * * * * * ****
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* * *
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** *
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* * * * * * *
6462352 TTATGAATTGAAACAATTATTATATGACT-ATCAAAAGGTCAAAATGATTTGA
128 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * *** * *
6462404 AATAGATAATTAATCTAATAATCTTAACTATTTAAATTGGTTCATTAAACACATTTATTTTCTAA
1 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* *
6462469 A--TC-TCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGT
66 ATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTTGT
* ** * *
6462530 ATG-ATAAAAAACAA-TGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-A
130 ATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * ** *
6462578 AGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGCTTGGAAAATAGTTTTAGTTTTTA
1 A-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * ****
6462643 AATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAA-CTTT
65 AATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC-TT
* * * *
6462707 TTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGA-TGAAACAAAAAGTTATAACGACTTT-A
128 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGA
* * * *
6462760 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGATAAAC-AATTTTTTTTTTA
1 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA
* ** * *** *
6462823 AATCTCTTGCTCATTGCTTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGGTT
65 AATCTCTT-CTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * * * * * * *
6462886 ATATAAACT-GAAATAATTGTTTTATGCCTAAATAAAATGTCAGAACAATTTGA
128 GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * ** *
6462939 AATAGATAATTATTCTAAA-AGTCTTAACTACTTGAACTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTA
1 AATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * *
6463003 AATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTT
65 AATCTCTT-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * * **
6463068 GTATGAA-AAAAATCAATTGTTTTAT-AATGAAA-TAAAGACCATAACGATTTGA
128 GTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * ** * *
6463120 GATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTA-TTCCAGTAAATAGATTT-TGTTTTT
1 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGGTAAACAAATTTAT-TTTTT
** * * *
6463183 AAA--TC-TCTTATTAATTTTCAAAATAGTAATAGATCAGTATTATTTTATT
64 AAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
6463232 TTGAATAATT
Statistics
Matches: 1231, Mismatches: 264, Indels: 113
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
175 77 0.06
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183 9 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
ATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
Found at i:6462406 original size:540 final size:538
Alignment explanation
Indices: 6461503--6463192 Score: 1668
Period size: 540 Copynumber: 3.1 Consensus size: 538
6461493 AATAATAATA
* ** * * * *
6461503 ATAGATAGTTGTTCAAATAGTAATAATTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGA-ATTA-TTTTCTA
1 ATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGATTGGAAAATA-ATTTTAGTTTT-TA
* * * * * * * * * *
6461566 AATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAATCAATTAGTTTTGTTCTA-TTTCGATTAAGCTT
64 AATCTCTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGA-TAAGCTT
* * * * * * * *
6461630 GTAT-AAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
128 TTATGAA-CTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATT
* * * * * * * *
6461694 ATTTATATAGTCCTAACTGTTTGAACTAGTTTGGTAAACGGATTTA-TTTTTGAAATCTCTTAGC
192 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AATTTATTTTTTCAAATCTCTT-GC
** ** ** *
6461758 -TATTAATTTTTAAAATAATCCTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATAG
255 TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTA-TATGAATTG
* * * * * * *
6461821 AAACAATTGTTTTATGATTAAACAAAAGGTTATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGT
319 AAACAATTGTTTTATGACTAATCAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * *
6461886 CATAACTATTTCAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAAT
384 CTTAACTATTTAAACTGGTTTGATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAT
* *** * * * *
6461951 ATTAGTAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGCCTGTTGAAAAATAATTATTTTATGA
449 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATATCCAAATAAGCTTGCATGATAAAAAACAA-TATTTTATGA
*
6462015 CAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA-
513 CAAAAC-AAAGATAATAATGATTT-AAG
* * * * * *
6462042 ATAGATAGTTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACTAA-TTTATTTTTTT
1 ATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGATT--GGAAAATAATTTTA-GTTTTT
* *
6462105 AAATCTTTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTATTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT
63 AAATCTCTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT
*
6462170 TTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTG
128 TTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTG
*
6462235 TTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTT
193 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTT
* * *
6462300 ATTAATTTTTTGAACGTTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAA
257 ATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGAAA
* * ** * * *
6462365 CAATTATTATATGACT-ATCAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTAATCTAATAATCTT
322 CAATTGTTTTATGACTAATCAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTT
* * *
6462429 AACTATTTAAATTGG-TTCATTAAACACATTTATTTTCTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATAT
387 AACTATTTAAACTGGTTTGA-TAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * *
6462493 TATTAAATTAATATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATGTTTTATGAGAA
451 TATTAAATTAGTATTATTTTATATCCAAATAAGCTTGCATGATAAAAAACAATATTTTATGACAA
*
6462557 AACAAAGATCATAATGATTTAAG
516 AACAAAGATAATAATGATTTAAG
* * * * * *
6462580 ATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGCTTGGAAAATAGTTTTAGTTTTTAAA
1 ATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGATTGGAAAATAATTTTAGTTTTTAAA
* * * * *
6462645 TCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAA-CTTTTT
66 TCTCTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGC-TTTT
* * * * *
6462709 ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAT-GAAACAAAAAGTTATAACGACTTTAAATAGATAATTGT
130 ATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAG-AACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGT
* * *
6462773 TCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGATAAACAATTT-TTTTTTTAAATCTCTTGCTCA
194 TCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTA
** *** * * * *
6462836 TTGCTTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGGTTATATAAACTGAAAT
258 TTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGAAAC
* * *
6462900 AATTGTTTTATGCCTAAAT-AAAATGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAAA-AGTCT
323 AATTGTTTTATGACT-AATCAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCT
* * *
6462963 TAACTACTTGAACTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGA
386 TAACTATTTAAACTGGTTTGATAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTTTGA
* *
6463028 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATCCAAATAAGCTTGTATGA-AAAAAATCAATTGTTTT
446 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATATCCAAATAAGCTTGCATGATAAAAAA-CAA-TATTTT
* ** * ** * *
6463091 ATAATGAAATAAAGACCATAACGATTTGAG
509 ATGACAAAACAAAGATAATAATGATTTAAG
* ** * *
6463121 ATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACT--ATTCCAGTAAATAGATTTT-GTTTTT
1 ATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGATT--GGAAAATA-ATTTTAGTTTTT
6463183 AAATCTCTTA
63 AAATCTCTTA
6463193 TTAATTTTCA
Statistics
Matches: 956, Mismatches: 163, Indels: 62
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
534 36 0.04
535 115 0.12
536 16 0.02
537 159 0.17
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540 325 0.34
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542 5 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (538 bp):
ATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGATTGGAAAATAATTTTAGTTTTTAAA
TCTCTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTA
TGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTC
AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTA
ATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAAT
TGTTTTATGACTAATCAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACT
ATTTAAACTGGTTTGATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
AATTAGTATTATTTTATATCCAAATAAGCTTGCATGATAAAAAACAATATTTTATGACAAAACAA
AGATAATAATGATTTAAG
Found at i:6463045 original size:716 final size:715
Alignment explanation
Indices: 6461758--6463074 Score: 1608
Period size: 716 Copynumber: 1.8 Consensus size: 715
6461748 ATCTCTTAGC
* * *
6461758 TATTAATTTTTAAAATAATCCTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTTAAAATAATACTAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATAAAA
** * * *
6461823 ACAATTGTTTTATGATTAAACAAAAGGTTATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCA
66 ACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
6461888 TAACTATTTCAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATAT
131 TAACTATTTCAACTAGCTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATAT
* * *
6461953 TAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCCTGTTGAAAAATAATTATTTTATGACAA
196 TAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT--CTGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAA
* * * *
6462018 AACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATT
259 AACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATT
* * *
6462083 CAGTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTATTAAAGTAGTA
324 CAGTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTA
* * * *
6462148 TTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCAT
389 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCAG
** * * * * **
6462213 AATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAAATT
454 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTCAACTGGTTTGACAAACAAATT
* * * *
6462278 TATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAACGTTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCA
519 TATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCA
*
6462343 AATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTATATGACTATCAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATA
584 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTATATGACTATCAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATA
6462408 GATAATTAATCTAATAATCTTAACTATTTAAATTGGTTCATTAAACACATTTATTTTCTAAATCT
649 GATAATTAATCTAATAATCTTAACTATTTAAATTGGTTCATTAAACACATTTATTTTCTAAATCT
6462473 CT
714 CT
* * * *
6462475 TATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATG-ATAAA
1 TATTAATTTTTAAAATAATACTAAATTAATATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTAGTATGAAT-AA
** * * *
6462538 AAACAA-TGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTAAGATTGATATTTGTTCAAATAG
64 AAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAAATTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
6462600 TCATAACTATTTGAACTAGCTTGGAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
128 TCATAACTATTTCAACTAGCTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTT
* * * *
6462665 GAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAA-CTT-TTTATGAATTGAAACAATTGTT
189 GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTGT-TGAA---AAACAATTATT
** * * *
6462728 TTATGATGAAACAAAAAGTTATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTAT
250 TTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAAT-TAT
* * * * * **
6462791 TTGAACTTGTTTGA-TAAAC-AATTT-TTTTTTTAAATCTCTTGCTCATT-GCTTTTTTG-AATG
313 TTGAA-TTGATTCAGTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAC--TTTCGAAAAA
* * * * *
6462851 TTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGGTTATATAAACTGAAATAATTGTTTTATGCCT
375 TTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATG-AT
* * * *
6462915 A-AATAAAATGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAAA-AGTCTTAACTACTTGAACTG
439 AGAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACTACTTCAACTG
* * * *
6462978 GTTTGACAAACACATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAATATTATTAAATT
503 GTTTGACAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AACATTAATAAATT
6463042 AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA
567 AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA
6463075 AAAAATCAAT
Statistics
Matches: 502, Mismatches: 79, Indels: 39
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
714 5 0.01
715 91 0.18
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720 9 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (715 bp):
TATTAATTTTTAAAATAATACTAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATAAAA
ACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTCAACTAGCTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATAT
TAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAA
CAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTCA
GTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTATT
ATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCAGAA
CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTCAACTGGTTTGACAAACAAATTTA
TTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAA
TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTATATGACTATCAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGA
TAATTAATCTAATAATCTTAACTATTTAAATTGGTTCATTAAACACATTTATTTTCTAAATCTCT
Found at i:6463119 original size:716 final size:714
Alignment explanation
Indices: 6461758--6463231 Score: 1599
Period size: 716 Copynumber: 2.1 Consensus size: 714
6461748 ATCTCTTAGC
* * *
6461758 TATTAATTTTTAAAATAATCCTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTTAAAATAATACTAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATAAAA
** * * *
6461823 ACAATTGTTTTATGATTAAACAAAAGGTTATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCA
66 ACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
6461888 TAACTATTTCAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATAT
131 TAACTATTTCAACTAGCTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATAT
* * *
6461953 TAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCCTGTTGAAAAATAATTATTTTATGACAA
196 TAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT--CTGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAA
* * * *
6462018 AACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATT
259 AACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATT
* * *
6462083 CAGTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTCGAAAAATTATTAAAGTAGTA
324 CAGTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAACTTTCGAAAAATTAATAAAGTAGTA
* * * *
6462148 TTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCAT
389 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCAG
** * * * * **
6462213 AATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAAATT
454 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTCAACTGGTTTGACAAACAAATT
* * * *
6462278 TATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAACGTTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCA
519 TATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCA
* ** * ** *
6462343 AATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTATATGACTATCAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATA
584 AATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTATATGACAAT-AAAAGACCAAAACGATTTGAAATA
* * * * *
6462408 GATAATTAATCTAATAATCTTAACTATTTAAATTGGTT-CATTAAACACATTTAT-TTTCTAAAT
648 GATAATTAATCAAATAATCATAACTATTTAAACT-ATTCCAGTAAACACATTT-TGTTTCTAAAT
6462471 CTCT
711 CTCT
* * * *
6462475 TATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATG-ATAAA
1 TATTAATTTTTAAAATAATACTAAATTAATATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTAGTATGAAT-AA
** * * *
6462538 AAACAA-TGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTAAGATTGATATTTGTTCAAATAG
64 AAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAAATTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
6462600 TCATAACTATTTGAACTAGCTTGGAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
128 TCATAACTATTTCAACTAGCTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTT
* * * *
6462665 GAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAA-CTT-TTTATGAATTGAAACAATTGTT
189 GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTGT-TGAA---AAACAATTATT
** * * *
6462728 TTATGATGAAACAAAAAGTTATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTAT
250 TTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAAT-TAT
* * * * * **
6462791 TTGAACTTGTTTGA-TAAAC-AATTT-TTTTTTTAAATCTCTTGCTCATT-GCTTTTTTG-AATG
313 TTGAA-TTGATTCAGTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAC--TTTCGAAAAA
* * * * *
6462851 TTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGGTTATATAAACTGAAATAATTGTTTTATGCCT
375 TTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATG-AT
* * * *
6462915 A-AATAAAATGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAAA-AGTCTTAACTACTTGAACTG
439 AGAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACTACTTCAACTG
* * * *
6462978 GTTTGACAAACACATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAATATTATTAAATT
503 GTTTGACAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AACATTAATAAATT
*
6463042 AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-AAAAATCAATTGTTTTATAATGA-AAT-AAA
567 AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-CAA-T-TATTAT-ATGACAATAAAA
* * * *
6463104 GACCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTATTCCAGTAAA
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* * *
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* * * * *
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** * * **** * * * * *
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* *** * *** ** * * *
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179 TG
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* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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1 TTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACT
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTA
* * * * **
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*
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* * * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *** * * * * *
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* * **
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* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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** * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
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*
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* * * ** * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** * * * *
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* * *
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* * ** * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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** * * *
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* *
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* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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* ** *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTA
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** * * * *
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* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-G-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * * * * *
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* ** * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTA
* *** * * ** * *
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* * * * *
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* *** * ** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
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66 TTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTA
* * * * * * * * * * *
6481719 TTAATTTAGAAATATTTTA-CTCTAAATATGTTTGTATCAACAGAAGCAGTTG
129 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * * * * * *
6481771 TTTTATTACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGCTT-AAATAGCCATAAGTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * ** * *
6481834 TTTAAACTAGTTCGATAAATAGATTTAATACTTAAA--T-AT-CTTATTAATTTTTGAAATATTA
65 TTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTA
** * **
6481895 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATAAATAGAAACAATCA
129 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * *** * *
6481947 TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAACAATTCAAATAGACATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** *
6482012 TTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTATTAGAATATTAA
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** *
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* **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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TA
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** * * **
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* *
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*
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* * * *
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* * *
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AAATAAA
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* * * *
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** * *
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* *
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** * * *
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*
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* * * * * * * *
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* * * *** * *
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* * * * ** * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * ** * * * *
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254 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAAT
* ** * * * *
6477190 AGTTATTGCTATTTG-AACTGGATTAG-TAAACAAATTTTTTTTTTT
318 AGTCATAACTATTTGAAACT-G-TTCGATAAATAGA--TTTATTTTT
* * * ** **
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1 TAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * * * * * ** *
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65 TGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * * * * * * * **
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128 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *
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192 CTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TA
* * * * * * * *
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255 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
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320 TCATAACTATTTGAA--ACTGTTCG-ATAAATAGATTTATTTTT
* * * * * *
6477593 TAAATCTCTTAGC-TATTAGTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAACC
1 TAAAT-TTTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * ** ** * * * * * *
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* * * * * *
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128 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTA
* * * * *
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192 CTTATTAA--TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAT-
* * * ** *
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254 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
6477901 GCCATAATTATTTG-AAC----C---AATTTGATGTATTTTT
319 GTCATAACTATTTGAAACTGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* * * * ** * * * *
6477935 TAAATCTCTAATATATCAAAATTTGAAGTATTAATAAAGTAATATTATTTTA-TTCTAGATAAGC
1 TAAATTTTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGC
* * * * * * *
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64 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* ** * * * * **
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* ** * *
6478125 TTATTAATTTTATAA-ATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-
193 TTATTAATTTTAGAATAT--TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TA
* * * * * * * *
6478188 GAAA-ATACTATTTTATGA-TAAGCAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATA
255 GAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * *
6478251 TTCTTAACTATTTG-AATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTT
319 GTCATAACTATTTGAAACT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* ** * * * *
6478293 TAAA--TCT-CTTATTAATTTTT-AGAATATTGTTAATTTA-TCAATATTTTACTCCAAATAAGC
1 TAAATTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * *
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64 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * * * * * **
6478416 TTATTCAAAAAAATCATAATTATTTGAA-TTGGTTTGATATATAGA-TTAAGTTTTAAA--TCTT
128 TTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** ** ** *
6478477 --TTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTAAAATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
191 ACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATA
* * * * * * *
6478540 GAAACAATTTTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGATATAGATAATAGTTCAAATTG
255 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
6478605 AT-ATGACTATTTG-AGCTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTT
320 -TCATAACTATTTGAAAC-TGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
*** *
6478646 TAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC
1 TAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * *
6478710 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAGAAGATTATAATGATTTGAAATAAATAAT
64 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * ** * *
6478775 TGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGCTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATATTTTAC
129 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAC
* * * *
6478840 TTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATAGA
193 TTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGA
** * * *
6478905 AATGATTGGTTTATGACCAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
257 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
6478970 ATAACCATTTGAAAGTGTTCAAAAAATATATTTA-TTTT
322 ATAACTATTTGAAACTGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* ** *
6479008 TAAATTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTTATTATTTTATTTGAAATAAGCTT
1 TAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * * * * *
6479073 GCATTAGTAGAACCAGA-TGTTTTATGAGAAAACAAAATGTCATAATGTTTTAAAATTAAATAAT
66 GTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAAATAAT
* * * *
6479137 TGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAA-TATGTTCGGT-AACAAGATTCATTTTTTAATTCTCTTT
129 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* *
6479200 CTCATTAATTTCTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTA
192 CTTATTAATTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TA
* * * ** *
6479265 -AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATAATTCATATAG
255 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * **
6479329 TCATAACCATTTG-AACATGTTCGGTAACA-AGATTCCTTTTT
320 TCATAACTATTTGAAAC-TGTTCGATAA-ATAGATTTATTTTT
* * * *
6479370 T-AATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGC
1 TAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * *
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64 TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * * * * * *
6479498 TTATTCAAATAGTTATGACTAGTTAAACTTGTTGGGAAAACATATTTATTTTTTAAATGT-TCTA
128 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TA
* * * * * * * * * * *
6479562 C-TATTAATTGTCGAAATATTAAAAAATAAATATT-TTGTGA-ATCGGAATAAACATGTATG-AT
192 CTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTC-AAATAAGCTTATATGAAT
* * * * * * * * *
6479623 AGAAATAATTATTTTACGACAAAACAAAAAGTCATATCAATTTCAAATAAATAATTTTTCAAATA
254 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * *
6479688 GTCATAAAGATTTGAAATTGTTTGATAAATATATTTATTTTT
319 GTCATAACTATTTGAAACTGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
6479730 TAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAAGTT-GTATTATTTTA-TTCAAAATA
1 TAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATA
* * * ** * * * *
6479791 AACATGTATGAACAGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTAATTTCG-AATAGA
61 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-GAAATAAA
* * * ** *
6479854 TAATTG-TCAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTCGACAAACAGATTCATTTTTTAAATCTC
125 TAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * ** * *
6479918 TTAATTATTAATTTTCATAATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTACATGAA
189 TTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA
* * * * * *
6479983 TTGAAATAATT-TTTTAAGACAAAACAAAATGTCATAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
253 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
6480047 AGTCATGACTATTTG-ATCTAGTTC-AGT-AATCATATTTACTTTT
318 AGTCATAACTATTTGAAACT-GTTCGA-TAAAT-AGATTTATTTTT
* * * * ** * *
6480090 TAAATTAATTACTTATCAATTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAACTCGAATAAGCG
1 TAAATT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * *
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65 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * * *
6480218 TGCTCAAATAATCAAAACTATTTGAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
129 TGTTCAAATAGT-----C-A--T-AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
6480283 --TC-T-CTTATTAATTTTTGAGATATTAATATATTAATATTACTTTATTCCGAACACA-CTTAT
185 TCTCTTACTTATTAATTTTAGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTAT
* * * *
6480343 ATGAATAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
248 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * * *
6480408 CAAATAATCATAATTACTTG-AACTAGTTAGGTAAACATAATTGTTTTT
313 CAAATAGTCATAACTATTTGAAACT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTT
*
6480456 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TT-TTTTAATTTCAAATAAG
1 TAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTT-ATTTCAAATAAG
* ** * *
6480518 CTAGTATGAATTCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATA
63 CTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATA
* * * * * * * * * *
6480581 ATTATTCATATAGTCTTTAAATATTTAAACTAT-TTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTTTCT
127 ATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * *
6480645 TAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGCATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATGAA
190 TACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * * *
6480709 CAAAAATAATTGTTTTATG--AGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGT-TACAATTGTTCAAAT
253 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
*
6480771 AGTCAT-A-TATTT-AAACTAGTTC-AGTAAATAAATTTATTTTT
318 AGTCATAACTATTTGAAACT-GTTCGA-TAAATAGATTTATTTTT
* * * *
6480812 TAAA--TCT-CTTGTTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTG
1 TAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * * * **
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66 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-G-AAATAAATAAT
* * * * ** * * * *
6480937 TGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGTTTTAGCAAATAGGTTTATTTTTTTAATCTCCTT-
129 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTA
* * * * * * * * *
6481000 GTTATCAATTTCAAAATAATATTAAATTTGTATAATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTA-
192 CTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAG
* * * * * *
6481064 AAACAATT-ATTTATAACAGAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTT---A-A--
256 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
6481122 -A-AA--A----AAACTAGTTC-AGTAAACAAAATTATTTTT
321 CATAACTATTTGAAACT-GTTCGA-TAAATAGATTTATTTTT
* ** * * ** *
6481155 TAAACCTCCTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAGGCT
1 TAAA-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * * ** * ** *
6481220 TGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTGTGACAATTTGAAATAATTAA-
65 TGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * * *** * * *
6481283 -G-T----GA-CCATAATTATTTAAACCAATTTGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCT-TTAA
129 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTT-A
** * * * * * *
6481339 CTTATTGGTTTTTGAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTA
192 CTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TA
* * *** *
6481404 -AGACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAATTGTTTAAATA
255 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
6481467 GTTATGACAATTTGAAATTGTTCAATAAATAGATTTATTTTT
319 GTCATAACTATTTGAAACTGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
** * * *
6481509 TAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTGTTATTTTATCTT-GAATAA
1 T-AAATTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAA
* * * * * * * *
6481572 GCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATAAGAACGATTTGAAATAGAT
62 GCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * * *
6481636 AATTGTTCTAATAGTCTTAAGTATTTGAA-TTAGTTCGGTAAACAAATTTATTATTTTAAATCTC
126 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATT-TTTTAAATCTC
* * * * * * * * *
6481700 TT--TT-TT--TTTTAGAATATTATTAATTTAGAAATATTTTA-CTCTAAATATGTTTGTATCAA
189 TTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * *
6481759 CAGAAGCAGTTGTTTTATTACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGCTT-AAA
253 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAA
* * * **
6481822 TAGCCATAAGTATTT-AAACTAGTTCGATAAATAGATTTAATACT
317 TAGTCATAACTATTTGAAACT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* **
6481866 TAAA--TAT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTT
1 TAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCT
* ** * * **
6481927 TGTATAAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAACA
65 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* * * * * ** *
6481992 ATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCT
130 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
** *
6482057 ATTAATTATTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAA
195 ATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * **
6482122 CAATTATTTTATGACAAAAC-AAA----AT---GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGGGTCAT
259 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *
6482179 AACTATTTG-AACTCGCTCGGTAAATAGATATATTTTT
324 AACTATTTGAAACT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* * *
6482216 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTATATAAGC
1 TAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGC
* * * ** * *
6482280 TTTTATGAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATGAT
64 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * * * ** * * * *
6482345 TATTCAAATAGTTATAATTATTTAAACGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACT
129 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
6482409 TATTAACTATTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACA-A
194 TATTAA-TTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGA
* * * * *
6482472 AACCAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGT
257 AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* *
6482537 CATAACTATTT-AAACATGTTCTG-TAAATAGATTAACTTTT
321 CATAACTATTTGAAAC-TGTTC-GATAAATAGATTTATTTTT
*
6482577 T-AATTCTCTTACTCATTAATTTTT-ATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
1 TAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
* * * * * *
6482640 CTTATATGAACT-GAAATAATTGTTTTATTA-AAAA-AAATGGTCACAATGATTTGAAATAATTA
63 CTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATA
* * * * * * *
6482702 ATTATTCAAATATTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTAAAAGT-TTTT
127 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTT
* * * * *
6482766 ACTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATT-TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAT
191 ACTTATTAATTT-T-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAT
* ** *
6482829 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
254 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * *
6482894 AGTCATAAAGATTTG-AACTTGTTTGGTATATAGATTTA-TTTT
318 AGTCATAACTATTTGAAAC-TGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
*
6482936 TAGATCTTTTACTTATTAATTGTATT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATA
1 TAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATA
* * ** * * * ** * *
6482997 AGTTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATAAAAAAACAAAAGGTAATAGCGATTTCAAATAGA
61 AGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAA
* * * * ** * *
6483062 TAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCATTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCT
125 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * *
6483127 TAATTATTAAGTTTTAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAAC
190 TACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-
* * * *
6483192 T-GAAATAATTTTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
253 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * ** * *
6483255 AGTCATGATTATTTG-ATCTAGTTCGATAAGCATATTTA-CTTT
318 AGTCATAACTATTTGAAACT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* * * * *
6483297 TAATATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAAATGGTATTATTTTA-ATCGAATAAGC
1 TAA-A-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * **
6483361 ATGTATGAACAAAAACTATTGTTTTATAATAGAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAA
64 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * * *
6483424 TTGCTCAAATAGTCATAGCTATTTAAAC-TGATTTGATGAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-
128 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * *
6483484 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTCTTTTATTTCGAACAACCTTATATGAACAA
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * ** * * * **
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* * *
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** * * * * ** * * *
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* * ** * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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*
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Statistics
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* * * *
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* * * * * * * *
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* ** * ** * * *
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* * * * * * ** ** * *
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* ** * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * ** ** ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * *
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** * * * ***
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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*
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* * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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255 TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-T-ACTATTAATTTTCGA-AATATTAATAAATTAA
* * * *
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* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * * *
6481604 TAAACAAAAGATAAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCT-TAAGTATTTGAA-TT
190 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTT
* * * ** * * *
6481667 AGTTCGGTAAACAAATTTATTATTTTAAA--TCT-CTTTTTTTTTTAG-AATATTATTAATTTAG
254 -GTTCGATAAACAGATTTATT-TTTTAAATTTCTACTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTA-
* * * *** * * * * * *
6481728 A-AATATTTTACTCTAAATATGTTTGTATCAACAGAAGCAGTTG
316 ATATTATTTTATTC-GAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTA
* * * * * * * * *
6481771 TTTTATTACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGCTT-AAATAGCCATAAGTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTA
* * * ** *
6481834 TTT-AAACTAGTTCGATAAATAGATTTAATACTTAAA---TAT-CTTATTAATTTTTGAAATATT
65 TTTGAAA-TTGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATT
** * **
6481894 AATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATAAATAGAAACAATCATTTTATGACAA
128 AATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * *** ** *
6481958 AACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAACAATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTT
192 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * * * *
6482023 TGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTATTAG-AATATTAATAAATTAGTA
257 CGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTA-CTATTAATT-TTCGAAATATTAATAAATTAATA
* * *
6482087 TTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTA
319 TTATTTTA-TTCGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTA
* * **
6482128 TTTTATGACAAAAC--AA----A-AT-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGGGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
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66 TTGAAATTGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAA
* * * *
6482250 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCTATATAAGCTTTTATGAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAA
130 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * * * * * * *
6482314 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATGATTATTCAAATAGTTATAATTATTTAAACGTGTTTA
194 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTC
* * * * * *
6482379 GA-AAACATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAACTATTAG-AATATTAATAAATTTATATT
258 GATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTAC-TATTAA-TTTTCGAAATATTAATAAATTAATATT
* * * *
6482442 ATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACA-AAACCAATTT
321 ATTTTATTCG-AATAAACTTATATGAATAGAAA-CAATTA
* * * *
6482481 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-GTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-ATCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * * *
6482545 TTT-AAACATGTTCTG-TAAATAGATTAACTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTATAATAT
65 TTTGAAA-TTGTTC-GATAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATAT
* * *
6482608 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAATAATTGTTTTATTA-A
127 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * *
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191 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT-ATAACTATTTGAACTTG
* * * *
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* * * * *
6482798 TATT-TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
317 TATTATTTT-ATTCGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTA
* *** * * **
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1 TTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
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* * ** * *
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* ** * * * * * * *
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190 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG
* * * * *
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255 TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-T-ACTATTAA-TTTTCGAAATATTAATAAATTA
* * * *
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316 ATATTATTTTA-TTCGAATAAACTTATATGAA-TAGAAACAATTA
* *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-ATCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
** * ** * * *
6483266 TTTGATCTAGTTCGATAAGCATATTTA-CTTTTAATATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATT
65 TTTGAAATTGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAA-ATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATT
* * * * * * * * * *
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** * * * *
6483394 AA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAGCTATTTAAAC-TGAT
192 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-T
* * * * * *
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256 TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *** * * * * * * *
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* ** * * *
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130 TAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAA
** * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
6483978 TT-AAATTGTT-TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTTAGAGATTA
66 TTGAAATTGTTCGA-TAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTA
* * * * * * *
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** * * * ** * * *
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* * * **
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255 TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-TAC-TATTAATTTTCGA-AATATTAATAAATTAA
* * * * * *
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6484268 TTTTATGACAAAAACAAAAGGTCATA
1 TTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATA
6484294 ATGATTTTNN
Statistics
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ATTCGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTA
Found at i:6481913 original size:534 final size:532
Alignment explanation
Indices: 6476520--6484300 Score: 3646
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* ** * * *
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* * * * * *** *
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* * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * *
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441 TATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCAT-AAGTATT
* * ** *
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504 TAAACTGA-TTTGATAAACAGATTTA-TTTT
* * * *
6477053 TAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
1 TAA--AT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * * * * *** * **
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* ** * * * * * *
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* **
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188 ACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAA-
* * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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310 AAATAGTCATAACTATTTGAATTAG-TTCGATAAACATATTTA-TT-TT--TTAAATTCTTATTA
* * * * * *
6477432 ATTTT-TAGAA-ATTAATAAATTA-ATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTCTATGAACTGAAACA
370 TTTTTGTAGAATATTAATAAATTAGA-AATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA
* * * * * * * * * * *
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434 ATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATA
* * ** *
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* * * * *
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1 TAAA--T-TTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * ** * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * ***
6477773 CTTATTAATTTTTTA-AATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGA
189 CTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACT
* * ** * * *
6477837 AAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGCTTGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGG
253 AAAACAATTATTTTATG-AAAAACAAAAG-ATCAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** * * * **
6477902 CCATAATTATTTGAACCAATT---T-----GATGTATTTTTTAAATCTCTAATATATCAAAATTT
316 TCATAACTATTTGAATTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCT--TAT-T--ATTTTT
* * * * * * **
6477959 G-A-AGTATTAATAAAGTA-ATATTATTTTATTCTAGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGT
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* *** * * * *
6478021 TTTATGA-TAAAAAAA-G-CATATTTATTTTAAATAGATAATTG-TTCAAATATTCATAACTATT
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* * * * *
6478082 TGAACTTG-TTCGAAAAATAAATTTATTTTT
504 TAAAC-TGATTTGATAAACAGATTTA-TTTT
** ** **
6478112 TAAAATTTGTTGTTTATTAATTTTAT-AAATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
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* * * * * * * *** *
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60 CTTTTATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTTGAAATAGATA
* * * * ** * * *
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124 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTT
** * * * * * *
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188 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAAC
* ** * * * * *
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252 TAAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAAT
* * * * * * * ** *
6478427 AATCATAATTATTTGAATTGGTTTGATATATAGA-TTAAGTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTG-
314 AGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTATT-ATTTTTGT
* * * * ** * *
6478490 A-AATACTAATAAATTA-AAATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTTTTT
377 AGAATATTAATAAATTAGAAA-TATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
6478553 TACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGATATAGATAATAG-TTCAAATTGAT-ATGACTATT
441 TATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAG-TCATAAGTATT
* * * * *
6478616 TGAGCTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTT
504 TAAAC-TGATTTGATAAACAGATTTA-TTTT
* *
6478646 TAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC
1 TAAAT-T--TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * * * * *
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61 TTTTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTTGAAATAGATAA
* * * * * *
6478774 TTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGCTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATATT-TT
125 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAAT-TTCTT
* * * * *
6478838 ACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAA-T
188 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACT
** ** * * *
6478902 AGAAATGATTGGTTTATGACCAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
253 A-AAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
6478967 GTCATAACCATTTGAAAGT-GTTCAAAAAATATATTTA-TTTTTAAATTTTTACTCATTAATTTT
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*** * * * * ** *
6479030 TG-A-AATATTAATAAATTTTTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGCATTAGTAGAACCAGA-T
374 TGTAGAATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-ATT
* * *** * * *
6479091 GTTTTATGAGAAAACAAAATGTCATAATGTTTTAAAATTAAATAATTG-TTCAGATAGTCATAAC
437 GTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAG
* * *
6479155 TATTTGAATA-TG-TTCGGT-AACAAGATTCATTTT
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* * *
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* * * * * *
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** * * * * * **
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* * * * *
6479380 TCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT
188 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACT
* * * * * *
6479445 GAAACGATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
253 AAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
6479510 TTATGACTAGTTAAACTT-GTTGGGA-AAACATATTTATTTTTTAAATGT-TCTACTATTAATTG
316 TCATAACTATTTGAA-TTAGTT-CGATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCT-TATTATT-TTTG
* * ** * * * *
6479572 TCGAAATATTAA-AAA--ATAAATATTTTGTGAATCGGAATAAACATGTATG-ATAGAAATAATT
376 TAG-AATATTAATAAATTAGAAATA-TTT-T-AATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
* * * * * *
6479633 ATTTTACGACAAAACAAAAAGTCATATCAATTTCAAATAAATAATT-TTTCAAATAGTCATAAAG
437 GTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCAT-AAG
* * *
6479697 -ATTTGAAATTG-TTTGATAAATATATTTATTTTT
500 TATTT-AAACTGATTTGATAAACAGATTTA-TTTT
*
6479730 TAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAAGTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAA
1 TAAA---TTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTC-AAATAA
* * * * * *
6479792 ACATGTATGAAC-AGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTAATTTCG-AATAGA
59 GCTTTTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTT-GAAATAGA
* * * * * *
6479854 TAATTG-TCAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTC-GACAAACAGATTCATTTTTTAAATCT
122 TAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATTT
* * * * * ** * * *
6479917 CTTAATTATTAATTTTCATAATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTACATGA
185 CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGA
* * * * **
6479982 ATTGAAATAATT-TTTTAAGACAAAACAAAATG-TCATAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
250 ACTAAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAA-GATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * *
6480045 ATAGTCATGACTATTTG-ATCTAGTTC-AGTAATCATATTTACTTTTTAAATTAATTACTTATCA
312 ATAGTCATAACTATTTGAAT-TAGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATT-CTTA-TTAT-T
* * * * * * *
6480108 ATTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-CTCGAATAAGCGTGTATGAATAGAAACAA
372 TTTGTAG-AATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
* ** * *
6480172 TTTTTTTAT-AGCAGAACAAAAA-GTCATAATGATTTG-AATAAATAATTGC-TCAAATAATCAA
435 TTGTTTTATGA-CA-AA-AAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCAT
* * *
6480233 AACTATTTGAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTT
497 AAGTATTT-AA--A-CTG-A----TTTGATAAACAGATTTA-TTTT
* * * * * * * *
6480279 TAAATCT-CTTATTAATTTTTGAGATATTAATATATTAATATTACTTTATTCCGAACACA-CTTA
1 TAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTT
* * *
6480342 TATGAA-TAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
64 TATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * * * *
6480406 TTCAAATAATCATAATTACTTGAACTAGTT-AGGTAAACATAATTGTTTTTTAAATCTCTTACTT
128 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTT
*
6480470 ATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCA-T-TT-TTTTAATTTCAAATAAGC-TAGTATGAATT
192 ATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCATA-TATGAACT
* *
6480530 CAAAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATA
253 -AAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * *
6480593 GTCTTTAAATATTTAAACTATTTC-AGCAAACAAATTTATTTTTTAATTTTCTTAGTTATTAATT
315 GTC-ATAACTATTTGAATTAGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAA-ATTCTTA-TTATT--TT
* * * * * * * * * * *
6480657 TTTGGAATATTATTAGATTAGCATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGT
374 TGTAGAATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * * ** * * *
6480722 TTTATGA-GAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGT-TACAATTG-TTCAAATAGTCAT-A-TATT
439 TTTATGACAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAGTATT
* * * *
6480782 TAAACT-AGTTCAGTAAATAAATTTATTTTT
504 TAAACTGATTTGA-TAAACAGATTTA-TTTT
* * * ***
6480812 TAAATCT-CTTGTTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTGGA
1 TAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTT
* * * * * ** *
6480876 ATG-A-TAAAAAAAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGCCATAATT-TTTAGTAAGCAAATAATT
65 ATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTT-G-AAATAGATAATT
* * * * * * * * * * *
6480938 GTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGTTTTAGCAAATAGGTTTATTTTTTTAATCTCCTT-G
127 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAC
* * * * * * * * *
6481001 TTATCAA-TTTCAAAATAATATTAAATTTGTATAATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTAA
190 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACTAA
* * ** * *
6481065 AACAATTA-TTTAT-AACAGAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTT--AA-A--
255 AACAATTATTTTATGAA-A-AACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
6481123 -A-AA--A----AACTAGTTC-AGTAAACAAAATTATTTTTTAAACCTCCTACTTTTTAATTTTT
317 CATAACTATTTGAATTAGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAA--T--T-CTTATT-ATTTTT
* * * * * * * ** * *
6481179 G-A-AATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTT
375 GTAGAATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* ** * * *
6481242 TTATGACAAAACAAAAGTTTGTGACAATTTGAAATAATTAAGTGAC--C--ATA---AT---TAT
440 TTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG-CTTCAAATAGTCATAAGTAT
** *
6481297 TTAAACCAATTTGATAAACTA-ACTTATTTTT
503 TTAAACTGATTTGATAAAC-AGATTTA-TTTT
** * * *
6481328 TAAATCTTTAACTTATTGGTTTTTGAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCT
1 TAAA--TTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * * *
6481393 TTTATGAACTAAGACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAAT
62 TTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATT-TGAAATAGATAAT
* * * * * *
6481457 TGTTTAAATAGTTATGACAATTTGAAA-TTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTG
126 TGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATTTCTTA
* * * * * *
6481521 TTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTGTTATTTTATCTT-GAATAAGCATGTATGAACT
189 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCATATATGAACT
* * * * *
6481585 AAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATAAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
253 AAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
6481650 TCTTAAGTATTTGAATTAGTTCGGTAAACAAATTTATTATTTTAAATCTCTT-TT-TTTTT-TAG
316 TCATAACTATTTGAATTAGTTCGATAAACATATTTATT-TTTTAAAT-TCTTATTATTTTTGTAG
* * * * * * * *
6481712 AATATTATTAATTTAGAAATATTTTACTCTAAATATGTTTGTATCAACAGAAGCAGTTGTTTTAT
379 AATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
6481777 TACAAAATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGCTT-AAATAGCCATAAGTATTTAAAC
444 GACAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAGTATTTAAAC
* * **
6481841 T-AGTTCGATAAATAGATTTAATACT
509 TGA-TTTGATAAACAGATTT-ATTTT
* *
6481866 TAAATAT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAA-TTTT
1 TAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTT
* * * * * **
6481928 GTAT-AAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAACA
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* * * * ** * * * ** *
6481992 ATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCT
127 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTT
* * *
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192 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCA-TATATGAACTA-A
* * * **
6482120 AACAATTATTTTATG----ACAAAACA--AAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGGGTCAT
255 AACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGATCAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * * *
6482179 AACTATTTGAACTCGCTCGGTAAATAGATATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
320 AACTATTTGAATTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTA-TTATT--TTTGTAGAA
* * * * * * * * *
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381 TATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
6482309 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATGATT-ATTCAAATAGTTATAATTATTTAAACG
446 CAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAGTATTTAAAC-
*
6482373 TG-TTTAGA-AAACATATTTATTTT
509 TGATTT-GATAAACAGATTTATTTT
* * * *
6482396 TAAAATTTTTACTTATTAACTATT-AGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAAC
1 T-AAA--TTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * *
6482460 TTGTATGAAC-AAAACCAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGT-TTTGAAATAGATA
61 TTTTATGAACTAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGT-TATTTGAAATAGATA
* * * * *
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124 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATT-TCTT
* * *
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188 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACT
* * * * * * *
6482652 GAAATAATTGTTTTATTAAAAA-AAATGGTCACAATGATTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATAT
253 AAAACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAG
* * *
6482715 TCATGACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACATATTTATTTTTAAAAGTTTTTACTTATTATTTGT
316 TCATAACTATTTGAA-TTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA-TTCTTA-TTATT-TTTGT
* * * * *
6482779 CAAAATATTAATAAATTA-ATATTTTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
377 -AGAATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
*
6482843 TATGACAAAAAAAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGTCATAAAG-AT
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* * * *
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503 TTAAAC-TGATTTGATAAACAGATTTATTTT
*
6482936 TAGATCTTTTACTTATTAATTGTATT--AATATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTCAAAATAA
1 TA-A--ATTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTC-AAATAA
* * * * * ** *
6482998 G-TTTGTATGAA-TAGAAAAAAATCATTTTATAAAAAAACAAAAGGTAATAGCGATTTCAAATAG
59 GCTTT-TATGAACT--AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTTGAAATAG
* * * * *
6483061 ATAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCATTAAATAGATTTATTTTTTAAATATC
121 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC
* * * * *
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186 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAA
* * * *
6483191 CTGAAATAATTTTTTTATGAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
251 CTAAAACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGATCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
6483256 GTCATGATTATTTG-ATCTAGTTCGATAAGCATATTTA-CTTTTAATATTTTTTACTTATTAATT
315 GTCATAACTATTTGAAT-TAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAA-A-TTCTTA-TTATT-TTT
* * * * * * * * *
6483319 GTTGAAATATTAATAAAATGGTATTATTTTAATC-GAATAAGCATGTATGAACAAAAACTATTGT
375 GTAG-AATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* *
6483383 TTTATAATAGAAAAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGC-TCAAATAGTCAT-AGCTA
439 TTTATGACA-AAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAG-TA
*
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502 TTTAAACTGATTTGATAAACAGATTTA-TTTT
* * * * * * *
6483477 TAAATCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTCTTTTATTTCGAACAACCTTAT
1 TAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTT
* * * * * *
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65 ATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** * ** *
6483606 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTT-AGGTAAACGGAATTATTTTTTAAACCTCTTACATAT
130 CAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTAT
** * * * ** * * *
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194 TAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATA-TATGAACT-AAA
** * * * * *
6483733 A-TTTTGTTTTATG----ACAAAA-A--AAATGATTTGAAATAAATAA-CAGTTCATATAGTCTT
256 ACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGATCAAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
6483789 AACCTATTTAAACTAGTT-TAGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTG
320 AA-CTATTTGAATTAGTTCGA-TAAACATATTTA-TTTTTTAAAT-TCTTA-TTATT--TTTGTA
** * * * * * * *
6483853 GAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTA
378 GAATATTAATAAATTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * * *
6483918 TAACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAGTATACAACT-ATTCAAATAGTCATAATTATTTAA
443 TGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAGTATTTAA
* *
6483982 ATTG-TTT-AGTAAATAGATTTATTTTT
507 ACTGATTTGA-TAAACAGATTTA-TTTT
* * * * * * * *
6484008 TAAATCT-CTTATTAATTTTTTAGAGATTAATAAAATACTATTATTTTA-TTCGAAACAAACTTG
1 TAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTT
* * * ***
6484071 TAT-AA-TAAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGT-AGTAACAATTTGAAATAGATAAT
64 TATGAACT--AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAGTTATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * ** * * **
6484133 TGTTGAAATGGCCACAATTATTT-GAGTTGATTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCACTTAC
126 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAC
* ** * * * *
6484197 TTATTAA-TTTCAGAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGAATTGA
190 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACTAA
* *
6484260 AACAATTGTTTTATGACAAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
255 AACAATTATTTTATG--AAAAACAAAAGATCA-AATGATTT
6484301 TNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 5681, Mismatches: 1142, Indels: 844
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (532 bp):
TAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTA
TGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTTATTTGAAATAGATAATTGTTC
AAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTA
ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACTAAAACAAT
TATTTTATGAAAAACAAAAGATCAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAATTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATTCTTATTATTTTTGTAGAATATTAATAAA
TTAGAAATATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAG
GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTCAAATAGTCATAAGTATTTAAACTGATTTGATAAA
CAGATTTATTTT
Found at i:6486500 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 6485302--6487757 Score: 914
Period size: 181 Copynumber: 13.7 Consensus size: 176
6485292 NNNNNNNNNN
* * * * ** * * *
6485302 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATACACAGTTGTTCAAATAGTCATTAGTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAA-AGTAATAATTATTT
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6485367 GAACTGGTTTTATAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATA
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*** * * *
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* * ** * * **
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** * * * * * * * * **
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* * * *
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** * * * * ** * * *
6485662 TTATGACAAAATGAAAGGTCAT-ACGATTTTAAATAGACAGTTGTTCAAAAAGTCATAACTATCT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTC-AAAAGTAATAATTATTT
* * * * * ** *
6485726 AAATTTG-TTCACTAAACAAATTTCTTTTTTTAAACTT-TTC-T-TT-ATTT-TGAACCATTAAG
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* * * * * *
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126 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAAAATTGTT
* * * ** ** *
6485836 TTATGCCAAAACAAAATGTCATAATGATTAT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAAATATT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATCATTCAAA-AGTAATAATTATT
* * * * ** *
6485900 TAAACTTG-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTA
64 TAAA-TTGATTC-GTAAATAGATTTATTTTTT-AAA--TTCTTCTTATTAATTTGTAAAATATTA
* ** * * *
6485964 ATAAATT-TTGATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATAAGATA-TGAAACAAA-TGTT
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* * ** * * * ** *
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* * * * * * * ** *
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**** ** * * * *
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** * ** ** * * * ** * ** * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCA-AAAGTAATAATTATTT
* * * * * * * * *
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* * *
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* * **
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAAA-GTAATAATTATTT
* ** * * *
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65 AAATTGATTC-GTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TTCTT-CTTATTAATTTGTAAAATATTAATA
* * * *
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* * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAA-AGTAATAATTATTT
* * * * * ** *
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65 AAA-TTGATTCGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATTC-TTCTTATTAATTTGTAAAATATTAATA
* * *
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127 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAATTGTT
* * * * * * ** *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTC-AAAAGTAATAATTATTT
* * * * *
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65 AAATTGATTCG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATTCTTCTTATTAATTTGT-AAAATATTAATAA
* * *
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128 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-AATTG-TT
* * ** *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCA-AAAGTAATAATTATTT
* * * * * * * **
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65 AAATTGA-TT-CGTAAATAGATTTATTTTTTAA-ATTCTT--CTTATTAA-TTTGTAAAATATTA
* * * ** ** * *
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124 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AA-AAATTGTT
* * * * * * * *
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1 TTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAA-AGT-AATAATTAT
* * * ** * * * *
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63 TT-AAATTGATTCGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TCTTCTT-ATTAA-TTTGTAAAATATTA
* * * ** * ** **
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124 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT--AAA-AAATTGTT
* * * * * * * ** * * **
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAA-AGTAATAATTATTT
* * * * *
6487333 GAATTGATTCGGTAAATTGATTTATTTTTTGAA-TCTATACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
65 AAATTGATTC-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATTCT-T-CTTATTAATTTGTAAAATATTAATA
* * * *
6487397 AAGTAGTATTATTTTA-TTTGGATATGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTT
127 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-AATTGTT
* * ** * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAA-AGTAATAATTATTT
* * * * ** *
6487510 AAACTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAA
65 AAA-TTGATTCG-TAAATAGATTTATTTTTT-AAAT-TC-TTCTTATTAATTTGTAAAATATTAA
* * * *
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125 TAAATT-AGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAAAATTGTT
* * * * * * ** ** *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTC-AAAAGTAATAATTATTT
* * * * * * * * *
6487692 GAACTAGTTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAA-AC-TCTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAA
65 -AAATTGATTCGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTCTTCTTATTAATTTGTAAAATATTAATAAA
6487755 TTA
129 TTA
6487758 ATTTTGATAA
Statistics
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* * *
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* * * * * * * *
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383 CGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTT-
* * ** * * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* ** * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * ** *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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575 ATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTT
* *
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703 AAAAATTGTT
* * * * * *
6486734 TTATGACTAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAGTTATTCTAATAGTTTTAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* **
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* * * *
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* * * * * *
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*** * * * * * * * * *
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259 ACAGATTTATTTTTAAATCTAC-T-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * * * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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386 TTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTT
* * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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703 AAA-AATTGTT
* * *** * * *
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* * * * *
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66 GAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTT-AAA-CTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATT-A
* * * * * *
6487574 TT-AATTCA-TGA-TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGACTA
126 TTAAATT-AGT-ATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
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188 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
* * * * *
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253 TGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
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317 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * **
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382 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTT
* * * * * *
6487866 AGTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAA
446 ATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCAA
** * * * *
6487931 TAAAATTTTTTGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAACGACTTT-AAATA
507 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATA
* *
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571 AATAATTATTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAAT
* * *
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*
6488123 TGAACTGAAATAATTG-T
696 TGAACT-AAAAAATTGTT
** * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACT-ATT
* * ** * * *
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* * * *
6488263 AATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAG-TGTGTATGAAAAGAAACAATAGTTTTATGAC-TAA-A
129 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCT-TGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
6488325 AAAGGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTATTTTTG
192 AAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGG
* * * ** *
6488390 TAAACATATTTGGTTTTTAAATCT--T--TTATT-AGTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTAT
256 TAAACAGATTT-ATTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
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320 TTTATTTCGAATAAGCTTGT-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
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384 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA-ATTTA
* * * *
6488577 TTTTTTAAATTTTCTACCTATTAATTTT---CA-TAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAA
447 TTTTTTAAATTTT-TACTTATTAATTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AATAA
* * *
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510 GCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT
* * * * * * * *
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574 AATTA-TTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * *
6488765 TACTTATTAGTTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATATGATTGTATGAAC
638 T-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAAC
*
6488830 -AGAAACAATTGGT
701 TA-AAA-AATTGTT
* * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * ** * *
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65 TGAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
* * * *
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129 AA-TTAGTAT-TATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * **
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191 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGG
* * ** * * *
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256 TAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * **
6489148 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAAC-
320 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * ** * *
6489212 ATTTTGAAATAGACAATTATTCAAGCAGTTATGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTTT
385 A-TTTGAAATAGATAATTATTCAA-AAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTAT
* *
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* * * * *
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507 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAA
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* * * *
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637 TT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGA
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ** *
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501 TTT-CAATA-AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTA-TAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * *
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563 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAGATTTATTT
* ** ** * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CTTAACTATT
* ** * * * * * *
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* * * *
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127 TAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAG-CTTGTATGA--ACAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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317 TATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * **
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381 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATT
* * * * * * * ** ***
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445 TATT-TTTTAAATTTT-TACTTA--TTAAT-TTTAAATATTAATA-AATTAATATTATTTTATTT
* ** ** * * ** * * *
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* ** * * * * * * * ** * *
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567 AATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATT-ATTTGAACTTGTT-CGGTAAAT-AGATT-T-ATTT
* * * * * * * * ** ** *
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627 TTTA-AATCTTTTCTTATTAATT-TTTTGAA-TA--TTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTA-A
* ** * * *
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685 AT-AAGCTTGTATGAACTAAAAAATTGTT
* * ** * * * * *
6490961 TT-TGAAATAAATAATTGTTC-TAAT-AGTCTT-AACGAT-TATAACTTCG-GCAAACA--CATT
1 TTATGACA-AAACAAAAGGTCAAAATGA-T-TTGAA--ATAGATAA-TT-GTTCAAATAGTC-TT
* * * * * * ** * **
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58 AACTATT-TGAA-CTGTTCGATAAATAAATTTA-TTTTTTAAACTCTTA-CTTATTAAT-TTTTG
* * * * * * * * ** * * ** * *** **
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118 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAA-GCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTA
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182 -TGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAG--ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * * ** ** ** * *
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243 TG-AACTA-ATTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTACT-ACTTATTAAT-TTTTGAAATATT
* * * * * * * ** * *
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304 A-ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAAT---AA-GCTTGTATGAAC-A-AAAAC-AATTGTTT
* * *** * * * * * * * *
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360 TATGACAA-AACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAGTCAT-AACTATT
* * * * *
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422 TGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTTA-AATATTAAT
* * * * **
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** * * * * * * * *
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548 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGT-TCGG
* * * *
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* *
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* ** * **
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1 TTATGACAAAA-CAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTAT
* * ** * * *
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* * * * *
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128 AAA-TTAGTATTATTTTAATTCA-AATAAGCTTGTATGAACAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
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190 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTG
* * * *
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* * * * * * * * *
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317 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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506 ATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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696 TGAACT--AAAAAATTGTT
* * * ** * * * * * *
6492361 TTATGACAAATCAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTTTTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * ** * * * *
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* * ** * * * * * *
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128 AA-ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
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191 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTAATTTG
* * * ** * * ** *
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255 -GTA-A-ACAGATT-TATTT-T--TAAATCTACTA-CTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTAA-TA-
* * * * ***** *
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308 --AATTAGT-AT---TATTT-TA--T-TTC-G-AATA-AGCTTGTATGAACAAAAACA-AT-TGT
* ** ** * ** * * *
6492738 TATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTAT-ATTATTTTATTCAA-A-ATAAGCTTGCA-TGAAT
358 T-TT-A-TGAC--AA-AACAA-AAGGTCATAACGATTTGA---AATAGATAA--TT--ATTCAAA
** * * ** * * ** * * *
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409 AGTCATAA-C-TATT-TG----AAC--TTG-TT-CAG-TA-AACAAAT---TTATTTTTTAAAT-
** * * *** ** * * * * *
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457 -TTTTACTTA-TTAATTTTAAATATT-AATAAATT-AATATT--A-TT-TTATTTCAATAAGCTT
* * * * ** * * ** * *
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514 GTATG-A-ACTGA-AAC---A-ATTGTTTTATAAC-AA-AA-C--AAAAG-GTCATAACGATTTG
*** * * * *
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566 AAATA-AATAATTATTC-AAA--TAGT--C-A-TA----------ATTATT----T-G--A--AC
* * * * *
6493052 TATTTGATCTAGTTTGGTAAGT-GTATTTATTTTTTAAATTTTTTACATATTAA-TTGTTGAAAT
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* * * *** *
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* * * * * ** * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * *
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66 GAACT-GTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAA
* * * * * * * *
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* * * * *
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259 ACAGATTTA-TTTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATT
* * * ** ** *
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* * * * **
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385 ATTTGAAATAGATAATTA-TTCA-AAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTAT
* * * * ** * * *
6493611 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
448 TTTTTAAAT-TTTTACTTA-TTAATTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AATA
** * * * * * * * * * * *
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* * * * *
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574 AATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * ** * *
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702 AAAA-AATTGTT
* * * ** * * * *
6493875 TTATAACCAAACAAAAGGT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTATGGAAATGGCCATAATTATT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAA-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * * * * * *
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65 TGAACTG-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTATT
* ** * * *
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128 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * ** * ** **
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* * ** *
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257 AAACAGATTTA--TTTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *** *
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319 TTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * * * *
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382 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTT
* * * * * ** *
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446 ATTTTTT-AAAT-TTTTACTTATTAA--TTTTAAATATTAATAAATTAAT-ATTATTTTATTTC-
* * * * * * * ** * * *
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505 AATAAGCTTGTATGAA-CTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * ** * * * * * *
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569 -TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * *** *
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633 TCTTTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAAGCTTGTA
* *
6494573 TGATC-AGAAATAATTATT
696 TGAACTA-AAA-AATTGTT
* * ** * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * * * * **
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65 TGAACT-GTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT
* ** * *
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128 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGA--ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
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191 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAATTT
* * ** * *
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254 GGTAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * *** * * *
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* * * * ** *
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380 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAA
* * ** * *
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* * ** * * * ** * *
6495100 TTT-TTTGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAATATCAGAATGA
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* * * * * * *
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562 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCGGTAAA-TAGATTTAT
* *** * * **
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625 TTTTTAAATCT-TTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATA
**
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* * ** * * ** ** *
6495316 TTACGGCAAAAGGAAAGGTTACAACAATTTGAAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * ** ** *
6495381 TGAACTAGTTC-AGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCT-AAATATTA
65 TGAACT-GTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAA-ACTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTA
* * ** ** * * * *
6495444 TTAAATTAGTATTA-TTTCATTCTGAATAAAATAATATGAATAGAACTAATTCTTTGATGACAAA
126 TTAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAC-AATTGTTTTATGACAAA
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6495508 ATAAAAAGGTTATAATGATTTGAAACAAATAATTATCCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTT
189 A-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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*
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* * *
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* * * * * * * * * * *
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** * * * * ** *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * *
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385 ATTTGAAATAGATAATTATTC-AAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATT
* * * * ** * * * *
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* * * * *
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510 GCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAAA
* ** * * * * *
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573 TAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT
* **
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637 TTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAA
*
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* * * * * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * ** ** * * *
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66 GAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAA-ACTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTATT
* * * * *
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128 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-CA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * * * ** *** *
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191 AAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTG
* ** * * *
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255 GTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * * * *
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319 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * *** * * *
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384 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTAT
* * **
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* * * * * * * * * *
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509 AGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATA-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAA
* * * * * * *
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572 ATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-
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636 TTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGA
* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * ** *
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66 GAAC-TGTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT
** ** * * * * * ***
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192 AAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAATT--
* * ** * * * * **
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* ** * ** * * * * * *
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* * * * * * * ** * * **
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486 ATTA-AT-ATTATT-TTAT-TTCAATAAGC--TTGTA-TGA-ACTG-AAAC-AATTGT-TTTATA
** * *** * * ** * * * * ** **
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* * * * * * ** *** * **
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* ** ** * * ** *
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657 ATTA-ATAAATTAG-T-AT-TA-TTTTATTTAAAT-AAGCTTGTAT-G-AACTA-A-AAAATTGT
6498196 T
712 T
* ** ** * * * * * *
6498197 AATT-T-TCTTGATTATTAAGTTTCGAAAT-ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAA
1 --TTATGAC-AAAACA-AAAG-GTCAAAATGATT-TGAAA-TAG-A-TA----A-T-TG-TTCAA
* * **** * * * * *
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* * * * *
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100 CTTACT----TA-T--TAA-TTTTTGAAAT-ATTAT--TAAATTAGTA-TTA--TTTT-AA-TTC
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149 --A--AA-TAAGCTTGTATGAACA--AA-ACAATT-GTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAAT
* ** * * * * * **
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204 GATTTGAAATAGA-TA-ATTAT-TC---A-AATA-GTCATAAC---------T--AT--TTGAAC
* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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355 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACT
* * * * *
6498702 ATTTGAA-TTGGTTTAGTAAATATATTTACTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATGCTTTAAATATT
419 ATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAAT--TTTAAATATT
* * * ** * * *
6498763 AATGAATTAATAATATTTTATTTTTAATAAGCTTGTATGTTC-AAAAGCAATTATTTTA-AGAAA
481 AATAAATTAATATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATA-ACA
* * * * * * *
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543 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT-TG
* * * *
6498890 TTTGGTAAACTA-ATCTATTTTTTAAATC---TCTTGTTAA-CTTTTGAAATATTAATAAATTAG
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* *
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* * ** * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * ** *
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** * *
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* * * * * * * * *
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317 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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633 TCTTTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGT
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* * * * *
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1 TTATGA-CAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * * *
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* * * ** * * * * * **
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126 TTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * ** **
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* ** * * ** *
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* * * * * *
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*
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* * ** * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** **
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* *
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* * * * * * * *
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* * *** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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255 GTAAACAGATTTATTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
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320 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAAC
* * * ** *
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* * *
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445 TATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTA-ATTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAA
* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* ** * * * * *
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*
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** * * ** * ** *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * *
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* * * * * * *
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128 AAATTAGTATTATTTTAAT-TCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * *
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191 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGG
* * * * *
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256 TAAACAGATTT-ATTTTTAAATCTACT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** ** * * *
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319 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * *
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383 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA
* * * * *
6501571 TTTTTT-AATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
447 TTTTTTAAATTT-TTACTTATTAA--TTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCAAT
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508 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAA
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573 TAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG-GTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCT
* * * * **
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636 TTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATG-
*
6501823 ATACCAATTATTTTGAATAACTAGTATTATT
698 A-A-C--------T-AA-AA--A--ATTGTT
* * ** ** * * * * **
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * *
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66 GAAC-TGTTCGA-TAAA-TAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAT
* * ** * * * *
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127 TAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAAT-AAGCTTGTA-TGA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAA
** * * * * ***
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188 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
* * ** * *
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253 TGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTA
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316 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * *
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* * * * *
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442 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
* * * * * * *
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505 --AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * ** * * * **
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568 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATT-TTTTAA
* * * *** * *
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632 ATCTTTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTA
* * *
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696 TGAACTAAAAAATTG-TT
* * ** * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * * * * *
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66 G-AACTGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
* * ** * * *
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129 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * ** *
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193 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGGTA
* ** *
6502810 AACAAATTTATTTTTAAAAT-TGTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTA
258 AACAGATTTATTTTT-AAATCT-ACTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** * *
6502872 TTTTATTT-AAATAAGCTTGCATGAATAGATGA-AATCT-TTTTATAACAAAACAAAAGGTTATA
319 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
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382 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATT
* * * * * * *
6502997 TCATTTTTTAAATCTCTTAATTACTATTTTTTGGAATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTTG
445 T-ATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTA-ATTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTC
* * * * * * * * *
6503062 AATAAGCTTATATGAACTTAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAA--TTAAAAAGAGTT----T
505 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* *
6503121 -AAT--TT-TT-AAA-A-TC-T-TTTA-TT-AA-TT-TTGGAAGTATTAATAGATTTGTATTATT
570 AAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG--GTA--AATAGA-TT-TATT-TT
*** * * * * ** *
6503173 TT--ATGCTAAAC--A--AACTTATATG-A-A-CAA-AAA-T-GT-TTGTTTTATGACAAAACAA
628 TTAAAT-CTTTTCTTATTAA-TTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT---TTAA-AT
* * *** * *
6503225 AAGGTTGTA--ATAGTTTGAAATAGATAA
687 AAGCTTGTATGA-ACTAAAAAATTG-T-T
* *** * * * * * * * *
6503252 TTAT-TCAAATATTCATAATTATTAGAATTGGTTAGGTAAATAGA-ATTCTTTTTAAAT-CTCTT
1 TTATGACAAA-A--CA-AAAGGTCA-AAATGATT-TG-AAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCTT
* * * * * * * * *
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58 A---ACT-A--TTTGAACTGTTCGATAAA-TAAATTTA--TT-TTTT--A-AA-CT--C-TTACT
* * * ** ** ** * * ** **
6503378 TGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGTAGTAAGAATTTTAAATTGATATTTGCTCATAT-
106 T--ATTAATT-TTTGA-AATATTATTAAAT-TAGT-ATTATTTT-AATTCAAATAAGCTTGTATG
* ** *** * ** * ** *
6503442 AGTCTTAACAATTTGAACTAGTTCGAC-AAACAATTTAA-TTTTTAA--ATCTCTTATTTA-TTA
164 A-ACAAAACAA-TTGTTTTA--T-GACAAAACAA---AAGGTCATAATGAT-T-TGAAATAGATA
* * * * * * * ** * *** * **
6503502 ATTTTTGAAATA-TTATTA-GATTTGTA-TGATTT--TATTTCA-A-ATAAGCTTATATGAACAT
219 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGGTA-AACAGATTTATTTTTAAATCTAC-T
* * * * * * *
6503560 AAATAATT-ATTTTCT--AACA-TAACAAA--AGGT-TTA-TTT-TGT-AAATAA--TTGATTTG
282 -ACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG-TATG
** * * ** * * * * *
6503613 AA-GTATACAATTCTTCAAATAGTCATAAC--TA--T-TTGAACTGATTCGATAA-ACTGATTTA
343 AACAAAAACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTCAT-AAC-GATTTGA-AATA--GA--TA
* * ** * * * * * * *
6503671 CTT-TTTAAATCTC-TTACT-TATT-AA-TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTATTTT--GT
399 ATTATTCAAAAGTCATAACTAT-TTGAACTTGTT--CAG-TAAACAAATT--TATT-TTTTAAAT
* * * ** * ** * * *
6503729 TTTGA---A-TAAGCTTCTATGATAAAAAAAAAAAAACATT-TGTTGTATGACTAAACAA-AAGG
457 TTTTACTTATTAA--TTTTA-AATATTAATAAATTAATATTAT-TT-TAT---T--TCAATAAGC
*** * ** * ** * *** * *
6503788 TAACAACGATTTGAAATAGATAATTATT-GAA-ATGGCAATAA--TTATTTGAATTGATTTGGTA
512 T-TGTATGAACTGAAACA-ATTGTT-TTATAACAAAACAA-AAGGTCA--T-AA-CGATTT-G-A
* * * * * * * * **
6503849 AACAGATTCATTTTTTAAATCA-CCTATTAATTTTTTGAA--TATT-AATAAATTAG---TATTA
567 AATA-AATAATTATTCAAAT-AGTC-A-TAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-TAGATTTATT-
* * * ** * * *** *
6503907 TTTT--A---TTTC-AAATAAGTTTGTATGAACTA--AAGCAATT-GT-TT-TATAACAGAACAA
626 TTTTAAATCTTTTCTTATTAA-TTT-TTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAA-AT
* * * * *
6503961 AAGTCATAATGATTTCAAATAGACAATTGTT
687 AAG-C-T--TG-TATGAACTAAAAAATTGTT
** * * * * ** * * * * * * * **
6503992 CAAATAGTCATAAC--TA-TTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTCCAA-A-TCTTTCG
1 -TTAT-GACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTC-TTAA
** * ** *
6504052 CT-TATT-AA-T-TT-TTTAAAT--ATTAATAAATTTAGA---TTA-TT-TT-A-TTTTG--A-A
60 CTAT-TTGAACTGTTCGATAAATAAATTTAT-TTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
** ** * * * *** * * * * ** *
6504100 -TA--AGCTT-GTAAGATATGAAAT-AAATATTTTATGAATTAACAAAA-TATTAGATCGATTTA
123 TTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCT-TGTATGAACAAAACAATT-GTTTTA-TGA
* * * * * ** * * **
6504159 -AAATAGATAATTA-TTC-TAATGGTTTTAACTATTTGAATTGATTCCACA-AG-CACATTTTAT
185 CAAA-ACA-AA--AGGTCATAATGATTTGAAATAGAT-AATT-ATT-CAAATAGTCATA-ACTAT
** * * * ** * * * * *
6504219 TT--TTTAAATCT-CT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTT--AA-
242 TTGAACT-AATTTGGTAAACAGATTTATTTTT-AAAT-CTACT-ACTTA-T-TAATTTTTGAAAT
*** * ** ** *** * * * *
6504277 CCGAATAAGCTTA-TAAGA-TCAAAAAC-AAT-TGTTTG-ATG-AC-AAAACAA-AGATCTTAAT
301 ATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-T-TTTAT
**** * * * * * ** * ** * *
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363 GACAAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTGAAATAG--ATAATTA-TTCAA-AAG-TC-AT-AAC-T
* * * * * ** * *
6504393 ATTT--A-TT-TT---TCAA-AATTTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTA
419 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAAT--TTTAAATATTA
* * * *** * * * * * * ** * *
6504449 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAT-AAAAAACAATTGTTTTATG-AC-AAAATAAAAG-ATAA
482 -ATAAATT--AATATTATTTTAT-TTCAATAAGC--TTG---TATGAACTGAAACAATTGTTTTA
*** * ** * * *
6504510 TAACGATTTCAAATA-G--ATAATC-A-TT----CAAATGGTCA-T--AAT--T-AT-TTTAATT
538 TAAC-AAAACAAA-AGGTCATAA-CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
* ***
6504559 G-A--T-TT-GGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTCTTACATATTAATTTTAAAAATATTAAT
600 GAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAAT
* ** * * *
6504617 AAATTAGCATTATTTTATTCTATCTAAGCTTATACT-AACTGAAACAATTATT
663 AAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTA-TGAACT-AAAAAATTGTT
* * * * * * * **
6504669 TTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * ** * * ** *
6504734 GAACTTATTTGGTAAATGGA-TT-TTTTTTACATCTTTTTTTGTTATTAATTTTTTG-AATGTTA
66 GAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTA-AAC--TCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTA
* * * ** * * * * *
6504796 ATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGGTTGTATGAACTAAAGCAATTATTTTATAACTAAA
126 TTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
6504861 CAAAAGGTCA-AA-GCAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAATTGATT
190 CAAAAGGTCATAATG--ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
*** * *
6504924 TAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTACTAAATTAGTA
253 TGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * ** ** *
6504988 TTATTTTAATCCGAATAAGTTTGCACAAACAACAAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAAGTC
316 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-A-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * ** * * * * * ** *
6505053 GTAAC-AATTGAAAATAGATAATGGTTCATATAGTCTTTACTATTTGAACTAGTTCAGCAATTAG
379 ATAACGATTTG-AAATAGATAATTATTCA-AAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * ** * *
6505117 ATTTATTTGTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAA-TAGTATTATTTTATTC
442 ATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-
* ** * * * * * * * * *
6505181 TAAATAAAATAT-TATGAACAGAACCAATTATTTGATGACAAAATAAAATGTTATAATGATTTGA
503 TCAATAAGCT-TGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * *
6505245 AATAGATAATTATTCAAAATAGTCAAAAATATTTGAAATAGTTTGGTAAGTAGATTTACTTTTTA
567 AATAAATAATTATTC-AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTA
* * * * * * * * *
6505310 AATATCATACTAATTAATTTTCT-ACATATTAATAAATTAGTATTGTTTTCTTTCAAACAAACTT
631 AATCT-TTTCTTATTAATTTTTTGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTT
* * * *
6505374 ATATTAAC-AAAAACAATATT
693 GTATGAACTAAAAA-ATTGTT
*
6505394 TTATGACAAAACATAAA-GT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAATTA
1 TTATGACAAAACA-AAAGGTCAA-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTA
* *
6505456 TTTGAA-TGGTTC-AGTAAATAGAA-TTATTTTCTAAA-TCATTTACTTATAAATTTTTGAAATA
63 TTTGAACT-GTTCGA-TAAATA-AATTTATTTTTTAAACTC--TTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
6505517 TTA-AAAATTATTTTTATTCT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGAT
123 TTATTAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGAC
* ** * * * ** *
6505580 AAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAAATAATTATTCATATCA-TTTTAACTGTTTGAACTA
186 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTA
* * ** * * ** *
6505644 GTTTGGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCT-CTTAATTATTAATATTCAAAATATTACTAAATTA
250 ATTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * * * *
6505708 TTATTATTATATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATTATAGAACAAAA-GT
313 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * ** * * *
6505772 TATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TTAGTT-TGATAAAA
378 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAAC
* * * *
6505835 AAATTTATTTTTTCAA--TGT-CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATT
440 AAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATT-TT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * *
6505897 TAAAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT
503 T-CAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * *
6505960 GAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACT-GATTTATTTT
565 GAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCGGTAAA-TAGATTTATTTT
* * ** *
6506023 TTAAATCTTTTACTTATTAA-GTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTGGATAAGA
628 TTAAATCTTTT-CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGC
6506087 TT-TATGAACTAAAATAATTGTT
691 TTGTATGAACTAAAA-AATTGTT
* ** * * * * *
6506109 TTATGACAAAATAAATTGTAATAAAT-ATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGT-TAGAATTAT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTAT
* * * * * * *
6506172 TTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAA-TCTCACGCTTATTACTTTTTTG-AATGT
64 TTGAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTT-AAACTCTTA--CTTATTA-ATTTTTGAAATAT
* * * * * *
6506235 TAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTGTATGACT
124 TATTAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACA
* ** * * * * **
6506299 AAATAAAAGGTCA-AGCGATTTGAAATAGATAATTA-TCTAATAGTCTTAACAATTTGAATTGGT
187 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAAT
* ** * * * *
6506362 TCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCT-C--C-TATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATA
252 TTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * ** * *
6506423 TTATTTTTATTT-GAATAAGCTTATATGATCAGAAACAATTAATTTATGAGAAAAC-AAAGATCA
316 TTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* ** * * * * * * *
6506486 TAATGATTTGAGTTTGATATTTGTTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTGGCTT-AGAAAACAAT
380 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAAAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAA
* * * * *
6506550 TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTCTGAAATATTAAAAAAGTACA-ATTATTTTATTT
443 TTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTT-T-AAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTT
* * * * *
6506614 TAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-A
504 CA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGA
* * * * *
6506678 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
567 AATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTA
** * * * * * *
6506742 AATCTCTTAATCATTAATTTTTTGAATGTTTATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTG
631 AATCT-TTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTG
*
6506807 TATGAACTAAAATAAATGTT
694 TATGAACTAAAA-AATTGTT
* * * * * * * *
6506827 TTATGACCAAACAAATGGTTAGAACT-ATTTGCAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * * * * *
6506891 TGAATTGGTTC-AGCAAACACATGTATTTTTTAAA-TC-T-CTTACTAATTTTTGGAATATTATT
65 TGAACT-GTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT
* * * * *
6506952 -AATTAGTTTTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-T
128 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* ** * * * ** *
6507015 AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAA-TTGTTTCGA
192 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTT-GG
* * * * * * *
6507079 TAAATAGATTTAGTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAA-TTTTCACACTATTGATAGATCAATATTA
256 TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * *** * * ** * * * * *
6507139 TTTTA-TTCTGAATAATTTTGCATTAATAGGGACAACTATTCAAATAGACATATC--TA-TTTA-
319 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** * * ** ** * *
6507199 AACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTATCTATTACATTTTAGAAT-ATTAAT
381 AAC--GATTT-G-AAATAGA-TAATTATTCAAAAGTCATAACTATTTGAACTT-G-TTCAGTAA-
* * * * * * ** * ** * ***
6507262 A-AAATAGTATATTTT--ATTATGAC-TA--AACTTGTATGAAGAGAAATAAGTTTTTATGACAA
438 ACAAAT-TTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAA-TT-T-TAAATATTAATAAATTAATATTATTT
* *** * * * * * * * * * ***
6507321 AATGAAAGATCATA-ATTATTTGAAAT-AAATAATTG-TTCA-AGC-AATCATAATAACATGAAC
499 TATTTCA-AT-A-AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCAT-AAC
* * * ** * * * ** * **
6507381 TTGCTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTTCCTATTAATT-TTTGGAA--TATT-AATA
560 --GAT--TTGAA-ATAAATAATTATTCAAA--TAGT-C-A-TAATTATTT-GAACTTGTTCGGT-
*** ** * * * * *
6507442 AAATAG---TATTATTTT--AT-TTTGAATA-TGCTTGTATGAACA--AAAACAATTGGT-TTA-
613 AAATAGATTTATT-TTTTAAATCTTTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATA-AATTAGTATTAT
* *** * * * * * *
6507496 -TGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATACATAATTGTT
676 TTTATTTAA-ATAA-G-C-T---TGTATGAACTAAAAAATTGTT
** * * * ** * * * * * * *
6507539 CAAATAGTCATAAC--TATTTGAACAT--TTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT--T-TTTA
1 -TTAT-GACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTT---GAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCTTAA
* * *
6507597 CT-TATT-AA-T-TTC--TGGAAT--A-TTA----ATAAA-T-TTA--TATTATTTTATTTG-AA
60 CTAT-TTGAACTGTTCGAT-AAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTA-ATT-TTTGAAA
** * *** * * * * * *
6507644 -A-TA--AGCTT-GTATGAACATAA-AC-AATTA--TTTTATGAAACAACAA-AA-AG--TCATA
121 TATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATG-AACAA-AACAATTGTTTTATG
* ** * * * * ** * * * * *
6507696 ACGATTCGAAA-TTGATAAT--TGTTGAAGTAGTCATAACCAATTGAACTTGTCTAGTAAACAAA
184 ACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAG--ATAA-TTATTCAAATAGTC-A-T-AACTAT
* * * ** ** * * * *
6507758 TTCATATTTTAAATCTCTTATTC--ATTAATTTTTGGAATAT-TAATAAATTAGT-ATTGTTT--
242 TTGA-A--CT-AATTTGGTAAACAGATTTATTTTT--AA-ATCTACT-ACTTATTAATT-TTTGA
* * ** * ** * * * * *
6507817 CATTTTGAATAAGCCTA-TATGA-ACTAATAC-AAT-TG-TTTTATGAAGAAACAA-AAGGTCAT
298 AATATT-AATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAA-AACAA--T--T
* * * * * *
6507876 AACGATTTTAAAT-AAATAATTATTCTAATA-GTTATGA-GACTTGAAATAGGTAATTATTCAAC
356 ---G-TTTT--ATGACA-AA--A--C-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA-
* * * * * ** * * * * *
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408 AAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATT-
* * * * * * * *
6507999 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATATGAACAAGCTTATATGAAC-AAAACAATTGCTT
472 T-TAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
6508063 TATGATAAAACAAAAAGTCACT-ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATACTTATAACTATTT
536 TATAACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
* * * * * * * * *
6508127 AAACTTTTTTGGTAAATAGATTTATGTTTTAAATATTTTACTTATTAGTTGTCTAAATATTAATA
600 GAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATA
* * * * *
6508192 AATTTGTATTATTTTAATTAAAATGAGCTTTTATGAA-TGGAAAAAATTATT
664 AATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAACT--AAAAAATTGTT
* * * * *
6508243 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * * *
6508308 GAACTTGTTCGATAAACAGATTCATTTCTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
66 GAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAA
* * * ** * * ** * * * *
6508370 ATTAGAATTATGTTATTTGTAATCAGCTTGTATGAATAGAATGAGTTGTTTTGTGATAAAATAAA
130 ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * * * * * ** * **
6508435 AGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGTACTGGTTAGGCCA
194 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGGTAA
* * ** * * *
6508500 ATAGATTCTTTTTTTAAATCTGTTACTTATTAAATTTT-AGAATATT-A-ACA--A--ATTACTT
259 ACAGATT-TATTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * * * * * *
6508558 TATTCCTAATATGATTGTGTTAATAGAAACAATTGTTTTATGGC-AAACAAATGGTAATAACAAC
322 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * **
6508622 TTGAAAT-GAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATCGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTT
387 TTGAAATAG-ATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTT
** * * *
6508686 ACTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAAG
450 TTTAAATTTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCAAT-AAG
* * ** * * * ** **
6508748 -TTATATAAACAAAAACATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCAGAGTGATTTGAAATAGGTAA
511 CTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAA
* * * * ** * * * * * * *
6508812 TTCTTCTAATAATCTTAACAATTTGAAATGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTATTAC
576 TTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTC
* * * * * ** * *
6508877 TTACTAATTCTTGGAATATTATTAAGTTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTGTGAA-AAG
640 TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAACTA-
6508941 AAACAATTGTT
703 AAA-AATTGTT
* * * ** * * *
6508952 TTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCGAATAGTCATAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * ** * *
6509016 GAACAGTTTCGGTAAATAAATTTAGTTTTTAAA-TC--ACTTATTACTTTTCAAAATATTAATAG
66 GAACTG-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAA
* ** ** * *
6509078 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA
130 ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * * * * * * * ** *
6509143 AAATCATAATGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATGGAT-ATGATTATTTGAGCTTGTTCGGTA
194 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAATTTGGTA
* * * * * *
6509207 AACATATTTATTTTCGAAATCTCCTACCTATTAATTTTAG-AATATTAACAAATTAGTATTATTT
258 AACAGATTTATTTT-TAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * *
6509271 TATTTTGAATAAACTTGTATTAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAT
322 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * *
6509336 TTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAA-TAATATGAACTTGCTT-GGTAAACAGATTTATT
387 TTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACT-ATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATT
* * *
6509399 TTTTAAACTTTTTACTTATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTTGAATAT
449 TTTTAAA-TTTTTACTTATTAATTTTA--AATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTCAATAA
* * * * * * *
6509464 GCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGGTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATATCTATTTGAAAGAGAT
510 GCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT
* * * *** **
6509527 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCAAAAAATAGATTTATTTCGTAAAT-TTTT
574 AATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* *
6509591 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGGA
639 -CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTA-AATAAGCTTGTATGAA
* * *
6509654 CAAAAACAATTATG
700 CTAAAA-AATTGTT
* * * *
6509668 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* ** * * * * * *
6509733 GAACTTTTTTAGTAAACAAATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATA
66 GAACTGTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
* * * * ** * *
6509798 CATTAGTATTATTTTATTTTAAAAAAGCTCATATGAACTAATACAATTGTTTTATGGCAAAATAA
129 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTAT-G----ACAA
6509863 AAGGTCATACCAATTTGAAATAGATAATTATCCAATAGTTATGAGATTTGAAATAGATAATTATT
188 AA---CA-A--AA---G-----G-------T-C-ATA---AT--GATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * **
6509928 CAAATAGT-ATGACTATTTGAACTTATTCT-ATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTAT
225 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT-TGGTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTACTACTTAT
* * * * *
6509991 TAATTGTTGAAATATTAATAACTTAATATTATTTTA-ATCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACA
288 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * * * * * * *
6510055 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATATGAAATAAATAATTCTTAAAATAGTCTTAA
353 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAA
* * * *
6510120 TTATTTGAAATTATTC-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-TTAAGTTGTCTAAA
417 CTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TT-T-TAAA
* ** * * *
6510183 TATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAA-T-ACAAAAATTATTTTATG
477 TATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCAATAAGCTTGTATGAACTGA-AACAATTGTTTTATA
* ** * * * * * * * * ** *
6510246 AC-AAATATTATG-AATTA-GCTTGTAGGAACAGAATCAATTGTTTTGTAACA-AAACAAAAGGT
540 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-T-GAAATA-AAT-AA-T-TATT-CAA-ATAGTCATAA--T
* * * * ** * * *
6510307 TA--T-AACAAT-TT--G-AAATAGA-TAATTGTTCAAA-C---AGTTA-TAACTATTTGCACTA
595 TATTTGAAC-TTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTCTTATTAATTTTTTG-AATA
*** * **
6510359 GTTAGGCCAA-TAG-ATT-TCTTT-TTTAAAT---C-TGT-T--ACTTATTAA--GTT
658 -TTA-ATAAATTAGTATTAT-TTTATTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAATTGTT
** * * ** * ** * ****
6510404 TTA-GA-AAATTAATAA-ATTAGTATTACTTT-ATTTAGAATAAGATTGTAT-TAATAGAAACAA
1 TTATGACAAAACAA-AAGGTCAAAATGA-TTTGAAATAG-AT-A-ATTGT-TCAAATAGTCTTAA
* * * * * * *
6510464 TTATTTTATGACAAAACAAATGATC-ATAATGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATTATTATAA
60 CTA--TT-TG----AAC---TGTTCGAT-A--AA-T-AAAT---TTATTTTTTAAACT-CT-T-A
* ** ** * * ***
6510528 CTAATTGAACGATTTGGTAAACAGATTTATTTATTAAATCTCTTATTAATTT--TTAAAATATTA
104 CTTATT--A--ATTT--TTGA-A-A--TA-TTATTAAAT-TAGTATTATTTTAATTCAAATAAGC
* ** * * *
6510591 ATAAATTAATTTTATCTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAATATTTGTTTTATGACAAAA
157 TTGTATGAA---CAA-----------------------AAC----A-A-TTGTTTTATGACAAAA
* * ** * * * *
6510656 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAACCTTAACTATTTGAATTAGTTAG
190 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTG
* * * * * * * *
6510721 GCAACCAAATTTACTTTTTAAATCT-CTTAGTTTTTAA-TTTTCATAATATTAGTAAATTAATAT
255 GTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * *
6510784 T-TATTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAAGATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATTAT
317 TAT-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * ** ** *
6510848 AATGATTTGAAATATG-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAGTATAT
381 AACGATTTGAAATA-GATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAAT
** * * * *
6510912 TTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTCTTCTG
444 TTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAT-TTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TC
* * * * *
6510977 AATAGGCTTGTTTG-A-TGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAA
505 AATAAGCTTGTATGAACTG-AAA-CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * ** * * *
6511040 ATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTAAACTAATTTGATAAACTA-ATTCATTTTTTAA
568 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAA
* * * ** *
6511104 ATC---TCTTATTAA--CTTTGAAATAATAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTT
632 ATCTTTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGT
6511164 ATGAACTAAAACAATTGTT
695 ATGAACTAAAA-AATTGTT
* * *
6511183 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* ** * * * *
6511247 TGAACTTGTT-TAGTAAGCAAATTAATTTTTTCAGATCTCTTGCTTATTAATTTTTCG-AATGTT
65 TGAAC-TGTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTT-A-AACTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATT
** * ** * * * *
6511310 AAGAAATTAGAATTA-TTTAATTCCAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTATTATATAACTAA
125 ATTAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * ** * ** * ** * **
6511374 ACAAAAGATTAGAACAATTTGAAATATATAATTGGTCTAATAGTTTTATCTATTTGAACTGGTTT
189 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTT
*** ** * *
6511439 AACAAACTCATTTATTTTTTAAATCT--T--TTATAAATTTTTGAAATA-TATTTAAATTAG---
254 GGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTAT
* *
6511496 TA--TTA--T-G-A-AA------A-G-A-AAAAAC---TGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATA
317 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** *
6511541 AAGATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATACCTATTT-AAATTGTTTTGGTAAACAGATT
382 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATT
* * ** * * *
6511605 TAGTTTTTAAA--TCT-CTTATT--TTCAAAATATTAATAAAAGTAGTATTATTTTATTCTGAAT
445 TATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTAAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTATT-TCAAT
** * ** * * * * *
6511665 AATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACGAATTAAAATAGA
508 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAA
* * * * * * * *
6511730 TAATTGTTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC---
573 TAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * *
6511792 TCCTACCT-A----TT--A-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTGGTAT-AAA
638 TCTTA-TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAAC
6511848 TAGAAATAATTGTT
701 TA-AAA-AATTGTT
* * * * * * *
6511862 TTACGACAAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATATTTGCTT-AAACAAG-CATAACT
1 TTATGAC-AAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAA-TAGTCTTAACT
* * * * * *
6511924 ATTTGAACTTGCTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTAATAATTTTTGGAATAT
62 ATTTGAAC-TG-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * *
6511988 TAATAAACTAGTATTA-TTTATTTCGAAA-ACA-CTTGTATGAATAGAAATAATTGGTTTATGAC
124 TATTAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATA-AGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGAC
* * *
6512050 AAAACAAAAGGTCATAACT-TTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-A
186 AAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * * * * **
6512113 TGTTTAGAAAATAGATGTATGTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA
250 -ATTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTA
* * * * * **
6512177 -TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATAT
313 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * ***
6512241 CATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATTG
378 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * * *
6512306 ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTCTTT
442 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATT
* * * * * ** *
6512371 TGAATAAGC--ATATGAACTGATATAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
503 TCAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* ** * * * ** * * *
6512434 ATAGATAATTATTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTAAAA
568 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * *** * **
6512499 TTTTTTATTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA
633 TCTTTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTA
*
6512564 TGAAC-AAAAACA--ATT
696 TGAACTAAAAA-ATTGTT
* * * * * * *
6512579 TTATGACAAAAGAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTCCTAATTATT
1 TTATGACAAAA-CAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATT
* * * * * * * * *
6512644 TGAATTTATTTGATAAACAAAGTTATTTTTTAAAATATTTTACATATTGATTATTTG-AATATTA
65 TGAA-CTGTTCGATAAATAAATTTATTTTTT-AAA-CTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTA
* * * * * * *
6512708 ATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAATTATTTTATGATAAAA
126 TTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * * ** **
6512773 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTTGTTCA
190 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTG
* * * *
6512838 ATAAACAAATTCAATTTTTAAATCT--T--TTATTAATTTTTGACATATTAATAAATTAG-A--A
255 GTAAACAGATT-TATTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * ***
6512896 --TTA--T-G-CT-A---T-TATG----AATA-AATTATTTTATGGCAAAACAAATTATCATAAC
319 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * **
6512945 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATTGAAC-TGTTTTAGTACACTGATTT
384 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTAT-TTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTT
* *
6513008 ATTTATTAAATCTCTT--TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAA
446 ATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AA
* * * * * * * * * *
6513070 CAAACTTATATGAAC-AAAGACATTTGTTATATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATA
507 TAAGCTTGTATGAACTGAA-ACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * * *** *
6513134 CATAATTATCCATATTGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
571 AATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
** * * * * *
6513199 CTTAGTTATTAATTTTCAT-AATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGTTTGTATG
636 -TTTCTTATTAATTTT-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATG
* *
6513263 AAGATAAATAATTGTT
698 AA-CTAAAAAATTGTT
* * * * * * * * *
6513279 TTATGATAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATATACAATTGTTCAAATAGT-TATGACTGTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATT
* * * * *
6513343 TGAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATATCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
65 TGAACT-GTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT
* * * * *
6513408 AAATTAGTATGATTTTATTTCAAAT-AGTCTAGCATGATGA-AAAACAATTGTTTTATAACAAAA
128 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAG-CTTGTATGA--ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
6513471 TAAAAGTTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGATCTGATTTG
190 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTG
* * * * * *
6513536 ATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAACAAAGTAATAT
255 GTAAAC-AGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * *** *
6513599 TATTTTATTT-GGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
317 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
6513663 ATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCACTTGAACTTGTTCGGTAAACAGACTT
382 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTT
* * * * * * *
6513728 ATTTTTTAAAATTTCTTGCCTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATGATATTATTTTATTTTGA
446 ATTTTTT-AAATTT-TTACTTATTAA--TTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCA
* * * * * * *
6513793 ATAAGCATGTATAAATTGAAACAATTATTTTATTACTAAACAAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
506 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * * *
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* * * * * *** *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * **** * * * * * **
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* * * * * ***
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* * * * * * *
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* * * * * *
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256 TAAACAGATTTA-TTTTT-AAATCTACTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
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318 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATA
* *** * *
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* * * * * *
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572 ATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT
* *
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* *
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* * * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * * * * * *
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191 -AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTG
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255 GTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* *
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* * * * * *
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382 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATT
* * * ** *
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445 TATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-CA
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506 ATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * ** * * *
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* * * * * ** *
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635 TTTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATG
* *
6516924 AACTAAAACAAATCTT
698 AACTAAAA-AATTGTT
* * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * * * * * *
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66 GAACT-GTTCGATAAATAAATTTATTTTTT-AAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
* * * ** * * * * **
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129 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* ** * * * *
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193 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGGTA
* ** * *
6517200 AATAGATTTAGTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATT-GCTATTACT
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* * * * * * * **
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* ** * *
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447 -TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AA
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507 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-GTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAAT
* * * ** * * * *
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570 AAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAA--
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632 ATCTTTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA-AATAAGCTTGTA
* *
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696 TGAACTA-AAA-AATTGTT
* * * * * * ** * * * * ** * *
6517660 TTGTGGCAGAA-AAAAGTTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGTTAAAATAACCATAATTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * *
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66 GAACT-GTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAA
* * * ** * *
6517786 ATTAGTATTAGTTT-ATTGTAAATGAGCTTAAATGATA-AAAGA-AATTTGTTATATGACCAAAC
130 ATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGA-ACAAA-ACAA-TTGTTTTATGACAAAAC
* * ** * * * * * * *
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191 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGG
* * * * ** * * *
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256 TAAACAGATTTATTTTTAAATCTA-CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** ** *
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320 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * *
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385 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTAT
** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *** * * *
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636 TTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGA
** *
6518360 ACTGAAGCAATTATT
699 ACT-AAAAAATTGTT
* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** ** * ** *
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*** * ** ** *
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** *
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254 GGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTAC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
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318 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
6518753 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAC-TGATTC-GATAAACAAA
381 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAA
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443 TTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTT--AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
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505 A-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTAT-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
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* * *
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630 AAATCT-TTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTT
* * * *
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* * *
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193 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGGTA
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* ** * * * * * * *
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510 GCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAAAT
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* *
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* * * *
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** * * * * *
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* *** *
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316 TTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * **
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380 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAAT
* * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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569 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
* * ** * * *
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634 CTTTT-CTTATTAATTTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTA
*
6521200 TGAACAAAAATAATTGTT
696 TGAACTAAAA-AATTGTT
* * * * * ** *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCTTAACTAT
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* ** * *** * * *** * * * *
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123 TTATTAAATTAGTATTAT-TTTAATTCAAAT-A-AGCTTG-TATGAACA-AAACAATTGTTTTA-
* * *** ** * * * * * * * * *
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182 T-GACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTC--A-TAACTA
** * * * ** ** *
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241 TTT-GAACTAATTTGGTAAAC-AG-ATT-TATT-TTT-AAATCTACTACT-T--AT-----TAAT
** * * * * ** * *
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292 T--TTTGAAATATTA-ATAA-ATTAGT-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-A---
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348 A-AAC-AATTGTTTTA-T--GACAA-AACAAAAGGTCAT-AA--CGATT--TGA--AATAGATA-
* * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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508 AAGCTTGTATGAACTGAAAC-AATTGT-TTT-ATAACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * ** * ** *
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569 TAAATAATTATTCAAATAGTCA-TA-ATTATT---TG--AACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTT
** * * * ** ** * * *
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627 --T-TTAAATCTT---TTCTTATTAATTT--TTTGAAT-ATTAAT-AAATTAGT-ATTATTTTAT
* *
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* * *** * * * * * ** *
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1 TTATGACAAAAC-AAAAGGTCAA--AATGATTTGAAATA--GA-TAATTGTTCAAATAGTCTTAA
* *** * *** ** *
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* * * * * *
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113 -TTTTGAAATATTATTA-AATTAG-T-AT-TA--TTTTA--ATTCAAA-TAAGCTT-GTATGAAC
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* * ** * * * * * **
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223 TT-CAAAT-AG--T-CAT-AAC-TATTTGAACTA-ATT-TGGTA-AA-C--AGATTTATTTTTAA
* * * * * * * * ** * *
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275 ATCT-ACTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATT-ATT-T-TATTTC-GAATA
* * **** * * * * * *
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388 TGAAATAGATAA-T-TAT--TCAAAAGTCATA-ACTATT-TG----AAC--TTGTTCAGTA-AA-
* * * * **** * * * *
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* * *
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* * * ** *
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636 T-TT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATG
* *
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698 AACT-AAAAAATTGTT
* ** * * * *
6522776 TTATGACTAAGTAAAAGGTTAAAATCATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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130 ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * *
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194 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTGGTAA
* *
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259 ACAGATTTA-TTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * ** ** *
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323 ATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * *** * * *
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387 TTGAAATAGATAATTA-TTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATT
* * * * *
6523217 TTCTAAATCTTTAACTTATTAATTCTTAGAACATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCGAATAA
449 TTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-TTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AATAA
* * * * * *
6523282 GCTTGTA-CAAATAGAAATAATTGTTTTATGATATAACAAAA---C-T----ATTTGAAATAAAT
510 GCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT
* * * * * * *
6523338 AATTGTTTAAGTAGTCACT-ATAATTTGAACTCGCTT-AGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTT
574 AATTATTCAAATAGTCA-TAATTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT
** * * ** *
6523400 TTACTTATTAA-TTTTACAATATTAATAAGTTAGTATTA-TTTATTTTGAATAATATTGTTTGAA
637 TT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAA
*
6523463 -TAGAAATAATTGGT
700 CTA-AAA-AATTGTT
* * * * * *
6523477 TTAAGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * * *
6523542 GAACATATT--A-AAAAAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
66 GAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAA
* *
6523604 ATTTA-TATTATTTTAA-TCAAAATAAGCTTGCATAAACAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACA
130 A-TTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * **
6523667 AAATGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTTAA-TCA
192 AAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAATTTG
* * * * ** * * *
6523730 GTAAATAGGTTCATTTTTTTAATTCTTTTACTCT-TTAATTTTTGGAATACTAATCAATTAGTAT
255 GTAAACAGATT--TATTTTTAAATCTACTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
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317 TATTTTATTTCGAATAAGCTTG-TATGAACAAAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * *
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380 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAA
* * * *
6523920 TTTATTTTTTAAATCATTTACTTACTAATTGTTGAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAATCT
443 TTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-TT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTT
* * * * * * *
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504 CAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAA
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568 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * *
6524113 TCTTTTACTTCTTAATTGTTTCAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTA
633 TCTTTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTA
* **
6524178 TGAACAGAAAAAATCATT
696 TGAAC-TAAAAAATTGTT
* * * * * * *
6524196 TTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTCGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT-TATAATTATT
1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATT
* * * * * * *
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65 TGAAC-TGTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * ** * * * * * *
6524323 ATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATCAGTTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGACAAAA
126 TTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
6524388 CAAAATGTCATCA-CATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCAATGACTATTTGATCTAGTTC
190 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAATTT
* * ** * *
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254 GGTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTACTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * ** * * *
6524516 ATTTTA-ATCTGCATAAGCTTATATGAACAAAAATTATTGTTTTATAACAAAGCAAAAAGTCATA
318 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
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382 ACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAA-AAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAAT
* * * * *
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444 TTATTTTTTAAAT-TTTTACTTA-TTAATTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-A
* * ** * * *
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506 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * *
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570 AAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * **
6524833 TCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAAAAATTCA-TTTTATTTTATTCTAAATAATCTAATA
635 T-TTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTA
*
6524896 TGAATTGAAAAAATTGTT
696 TGAACT-AAAAAATTGTT
* * * ** * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * **
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193 AAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT-TGG
* * ** * * *
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* * *
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* * * * * * ** *
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383 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAA--GTCATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAAATT
* * * ** *
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445 TATTTTTTAAATTTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AA
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6525423 TAAGCGTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACCAAAAAGTCATAACAATTTTAAATA
507 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
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6525488 GACAATTGTTCAAATAGTTGTAATTATTTGAATTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAA-CT
571 AATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
* * **
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* *
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* * * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
* * * * * * * *
6525697 AAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAA-TCATTTGCTTATTATTTTTTTG-AATGTTA
66 GAAC-TGTTCGATAAATAAATTTATTTTTT-AAACTC--TTACTTATTA-ATTTTTGAAATATTA
* * * * * ** * *
6525760 ATAAATTTGGGATTATTTTACTTCCAAATAAACCTTGTCA-GATATGAAACAAATATTTTATGAC
126 TTAAA-TTAGTATTATTTTAATT-CAAAT-AAGCTTGT-ATGA-ACAAAACAATTGTTTTATGAC
* * ** * * * **
6525824 TAAACAAAAGGTCAAAACAAATTTGAAATAGATAA-CATTCTAACAGTTTTTAACTA-TTGAACT
186 AAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT
** ** * * * *
6525887 GGTTTCGACAAACCGACATTTATTTTTAAATAT-CTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTATTAA
249 AATTT-GGTAAA-C-AGATTTATTTTTAAATCTAC-TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAA
** * ** * * *
6525951 ATTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTTTTTTATGAC-AAA-AT
309 ATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * * * * *
6526013 AAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTTATGACTATTGGAA-TTGGTTC-GA
373 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-
* * * *
6526076 TAAATAAATTTATTTTTTAAACTTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTAT
435 TAAACAAATTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAATATTAT
* * * ** *
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** * * * **
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* * * * * * *
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** *
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* * * * * * *
6490025 AAATATTAGTAAATTAATATTAT-TTTATTTAGAATATA-CTTATATGAACAAAAACATTTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAATATTATATTAATTTA-AATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTT
* * * ** *
6490088 TACT-ACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTT
64 TA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
* * * * * * * * * *** *
6490151 GAA-TTGGTTCGGCAAACAAATTT-TTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATATTCATAATATTATT
128 GAACTT-ATTCAGTAAATAGATTTATTTTT-AAATCTTTTACTTATTAGTTTTTGGAATATTAAT
* * * ** * * * * ** * *
6490214 ATATTGGTATTATTTGATTTTGAATAAACTGGTATGAATATAAATGATTGTTTCATGACAAAATA
191 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
6490279 AAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTATTGAAATAGT-ACTAATTATTTAAAC-TAGTTCA
256 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACGT-GTTCA
* * * *
6490342 GTAAGCATATT-TATTTTTTAATTCTCCTACTTGTTAATTTTGG
318 GAAAACATATTCTA--TTTTAATT-T-ATA-TTATT-A--TT-G
* * * * * *
6490385 AAATATTAATAAATTAGTATCAT-TTTATTTCAAAT-AGTCTTGTACG-ATGAAAAACAATTGTT
1 AAATATTAATAAATTAATATTATATTAATTT-AAATAAG-CTTGTATGAAT-AGAAACAATTATT
* * * * *** *
6490447 TTATGATAAAACAAAAGTTCATAA-TGATTTGAAATACATAATCATTCAAATCGCCATAATTATT
63 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATT
* *** * * * *
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127 TGAACTT-ATTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTTTTGGAATATTAA
* * * *** * * *
6490570 TATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
190 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC-TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* *
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254 CAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
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AAATATTAATAAATTAATATTATATTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA
CTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTTTTGGAATATTAATAAATT
AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
TCATAACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAACAT
ATTCTATTTTAATTTATATTATTATTG
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-TAATTATTTTA-TTCCAATAAGCTTGTATGAACAA
* * ** * * **
6489176 ATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAGACAATTATTCAAGCAG
64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * ** ** * *
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* * * **
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1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATA-ATTATTTT-ATTCCAATAAGCTTGTATGAACAA
* ** *
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* * * * *
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* * ** *
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1 TTATTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTATA-ATTATTTT-ATTCCAATAAGCTTGTATGAACA
* * * *
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* * *
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126 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTAC
* *
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1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATAATTATTTTATTCCAA-T-AAGCTTGTATGAACAA
* * * * * * * *
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64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * *
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129 CATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAATAAATTCATTTTTAAATCT-C-TTAC
* * * * * * ***
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1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAT-AATTATTTTATTCC-AATAAGCTTGTATGAACAA
* * * * *
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64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* ** * * *
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129 CATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAATAAATTCATTTTTAAATCTCTTAC
* *** * ** *
6490012 TTATTAACTTTCAAAATATTAGTAAATTA-ATATTATTTTATTTAGAATATA-CTTATATGAACA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATA-ATTATTTTA-TTCCAATA-AGCTTGTATGAACA
* * * *
6490075 AAAACATTTGTTTTACT-ACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATA
63 AAAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
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127 GTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAATAAATTCATTTTT-AAATCTCTTAC
* *** * * * * ** * * * *
6490191 TTATTAATATTCATAATATTATTATATTGGT-ATTATTTGATTTTGAATAAACTGGTATGAATAT
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-ATAATTATTTTA-TTCCAATAAGCTTGTATGAACAA
** * * * * * * *
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64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * * * *
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129 CA-TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTAC
* * * * **
6490372 TTGTTAA-TTTTGGAAATATTAATAAATTAGT-ATCATTTTATTTCAA-ATAGTCTTGTACGATG
1 TTATTAATTTTTGG-AATATTAATAAATTA-TAATTATTTTATTCCAATA-AG-CTTGTATGAAC
* * * * * *
6490434 AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATACATAATCATTCAAATC
62 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * **
6490499 GCCATAATTATTTGAA-TTG---A-TAAACT-AATTTATTTTTTAAATCTCCAAC
127 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-TAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTAC
* * * * * *** * *
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1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATA-ATTATTTTA-TTCCAATAAGC-TTGTATGAACA
* * * * *
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128 TCATAACTATTTGAA
6490692 ATTATTAATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATAATTATTTTATTCCAATAAGCTTGTATGAACAAAA
ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAAATTCATTTTTAAATCTCTTAC
Found at i:6490315 original size:16 final size:18
Alignment explanation
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1 TTGAAATAGTACTAATTA
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1 TT
6490330 TAAACTAGTT
Statistics
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TTGAAATAGTACTAATTA
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Alignment explanation
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6488923 ACGTATCTAT
* * * * * * *
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1 TTATTAATTTTGGAAATAGTAATAAA-TTAGTATCATGTTATTCCAAATAGA-CTTGTACGAACA
* * * * ** * * * *
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* * * *
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129 TCATAACTATTTGAACTTAGTCAGCAAACAAATTCATATTTTAAATCCGTTACTCATTAATTTTT
* * * * * * *
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* * * * *
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** *
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*
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386 AATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* *
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451 AAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCGTAACTATTTGAACTTATTCAGCAA
* * * * *
6489449 ATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTA
516 ACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTGATATTATTTGA
* *
6489514 ATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATAAATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGAGATTT
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* * * *
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645 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGATAAACAGATTCAGTTTCT
*
6489644 AAATCTCTTAC
710 AAATCTCCTAC
* * *
6489655 TTATTAATTTTTGG-AATAGTAATAAATTA-TAATTATGTTATTCCAAGTCA-ACTTGTATGAAC
1 TTATTAA-TTTTGGAAATAGTAATAAATTAGT-ATCATGTTATTCCAAAT-AGACTTGTACGAAC
* * *
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63 AAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAC
* * * * * * *
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127 AATCATAACTATTTGAACTTAGTC-AGCAAACAAATTCATATTTTAAATCCGTTACTCATTAATT
* * *
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191 TTTAGAATATCAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGATTATATCAACT--AATACAATT
* * * **
6489908 GTTTTATGACAG-AACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAAC
254 GTTTTATGA-AGAAACAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAAACAATTATTCAAACAGTTATAAC
6489971 TATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACATA-TTTATTTTTA-AATC-T-CTTATTAACTT-TCAAAATA
317 TATTTGAACTT-GTTTGGTAAACATATTTTATTTTTACAATCTTACTTATTAA-TTATCAAAATA
* *
6490030 TTAGTAAATTAATATTATTTT-ATTTAGAATATA-CTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACT-
380 TTAGTAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATA-AGCTTATATGAAC-AAAACAATTATTTTA-TG
* * * * *
6490092 ACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAA-T
441 ACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCGTAACTATTTGAACT
* * * * *
6490155 TGGTTCGGCAAACAAATTT-TTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATAT-TC-ATAATATTATTATA
506 T-ATTCAGCAAACAAATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAAT-TGTCTA-AATATTAATAAA
* * * * * *
6490217 TTGGTATTATTTGATTTTG-AATAAACTGGTATGAAT-ATAAATGATTGTTTCATGACAAAATAA
567 TTGATATTATTTGA-ATTGAAATAAACTGGTATGAATAAAAAATAAAT-TTT-ATGACAAAACAA
* * * *
6490280 AAGGTTATA-ACGATTTGAAATATATAATTATTGAAATAGT-ACTAATTATTTAAACTAGTTC-A
629 AAGGTAATAGA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTATTTAAACTAGTTCGA
* * * * * *
6490342 GTAAGCATATTTATTTTTTAATTCTCCTAC
692 -TAAACAGATTCAGTTTCTAAATCTCCTAC
* * * * * **
6490372 TTGTTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAGTCTTGTACGATGAAA
1 TTATTAATTTTGGAAATAGTAATAAATTAGTATCATGTTATTCCAAATAGACTTGTACGAACAAA
* * * *
6490437 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATACATAATCATTCAAA
66 AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
6490497 TCGCCATAAT
Statistics
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0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (720 bp):
TTATTAATTTTGGAAATAGTAATAAATTAGTATCATGTTATTCCAAATAGACTTGTACGAACAAA
AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAATC
ATAACTATTTGAACTTAGTCAGCAAACAAATTCATATTTTAAATCCGTTACTCATTAATTTTTAG
AATATCAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGATTATATCAACTAATACAATTGTTTTAT
GAAGAAACAAAAGGTCATAACATTTTGAAATAAACAATTATTCAAACAGTTATAACTATTTGAAC
TTGTTTGGTAAACATATTTTATTTTTACAATCTTACTTATTAATTATCAAAATATTAGTAAATTA
ATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTC
ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCGTAACTATTTGAACTTATTCAGCAAACAAA
TTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTGATATTATTTGAATTGA
AATAAACTGGTATGAATAAAAAATAAATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGAGATTTGAAATA
GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGATAAACAGATTCAGTTTCTAAATCT
CCTAC
Found at i:6490714 original size:130 final size:130
Alignment explanation
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Period size: 130 Copynumber: 2.1 Consensus size: 130
6490547 CTTCTCAATT
6490557 TTTGAAA-TATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGAAACAATT
1 TTTGAAATTATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGAAACAATT
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66 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
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1 TTTGAAATTATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGAAACAATT
6490751 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
66 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
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1 TTTGAAATTATT
6490828 TGGTAAATAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTGAAATTATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGAAACAATT
GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
Found at i:6491023 original size:307 final size:305
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6490426 GTACGATGAA
* *
6490436 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATACATAATCATTCAAATCGC
1 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATCATTCAAATAGC
* * * *
6490501 CATAATTATTTGAATTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAATA
66 CATAACTATTTGAATTGATAAACTAATTTATGTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTCTGAAATA
* * * * *
6490566 TTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGAAACAATTGTTTTATGAT
131 TTAATATAGTAATATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTG-TTGAACTAAAAAAATTGTTTTATAAT
* * * * *
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** *
6490696 TTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTG
260 GCAATACAG-AATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTG
* * ** *
6490743 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATCATTCAAATAGC
* * ** *
6490808 CATAACTATTTGAAATTATTTGGTAAA-TAGATTT-TGTTTTAAATTTCTTACTTATTAACTTTC
66 CATAACTATTTG--A--A-TTGATAAACTA-ATTTATGTTTTAAATCTCCAACTTATCAA-TTTC
* ** *
6490871 T-AAATGTTAATAATA-TTGTATTATTTTATTTAGAATTAGCTTATG-TGAACTAAAAAAAATT-
124 TGAAATATTAAT-ATAGTAATATTATTTTATTTAGAATAAGCTT-TGTTGAACT-AAAAAAATTG
* *
6490932 TTTTATAATAAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACGAT
186 TTTTATAATAAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGAT
6490997 T
251 T
6490998 ATAACTTCGG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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309 1 0.00
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312 20 0.09
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (305 bp):
AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATCATTCAAATAGC
CATAACTATTTGAATTGATAAACTAATTTATGTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTCTGAAATA
TTAATATAGTAATATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTGTTGAACTAAAAAAATTGTTTTATAATA
AAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGAAATTAG
CAATACAGAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTG
Found at i:6491524 original size:843 final size:839
Alignment explanation
Indices: 6489899--6491531 Score: 1821
Period size: 843 Copynumber: 1.9 Consensus size: 839
6489889 TGTATCAATG
* * *
6489899 GAAACAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
* * *
6489964 TTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAAT
66 TCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAAT
* * *
6490029 ATTAGTAAATTAATATTATTTTATTTAGAATATACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACTAC
131 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTAGAATATACTTATATGAACAAAAAAATTTGTTTTAATAC
* * * *
6490094 AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGT
196 AAAAAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGCCTTAACGATTTGAA-T-CT
* * * *
6490159 TCGGCAAACAAATTTTTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATATTCATAATATTATTATATTGGTAT
259 TCGGCAAACAAATTTTTTTTAAAATCTCTTAGTTATT-ATATTCAGAATATTATTATATTAGCAA
* * * * * * *
6490224 TATTTGATTTTGAATAAACTGGTATGAATATAAATGATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTTATA
323 TATTTGACTCTGAATAAACTGGTATGAATAGAAATGATTATTTCATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * *
6490289 ACGATTTGAAATATATAATTATTGAAATAGTACTAATTATTTAAACTAGTTCAGTAAGCATATTT
388 ACGATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTACTAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTT
* * * * *
6490354 ATTTTTTAATTCTCCTACTTGTTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAA
453 AGTTATCAA-TATCCTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAA
* * ** * **
6490419 TAGTCTTGTACGATGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAC
517 TAGTCTTGTACAATGAAAAACAATTGTTTAACAACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAC
* *
6490484 ATAATCATTCAAATCGCCATAATTATTTGAATTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
582 ATAATCATTCAAATCGACATAACTATTTGAATTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
* * * * * ** *
6490549 TCTCAATTTTTGAAATATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACTGA
647 TATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAATAAACTTTGCATGAACAGA
* * * * *
6490614 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
712 AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
6490679 ATAACTATTTGAAATTATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACT
777 ATAACTATTTGAAATTATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACT
* * * *
6490742 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
*
6490807 TCATAACTATTTGAAATT-ATTTGGTAAATAGATTT-TGTTTTAAATTTCTTACTTATTAACTTT
66 TCATAACTATTTG-AATTGATTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTT
* * * *
6490870 CTAAATGTTAATAATATT-GTATTATTTTATTTAGAAT-TAGCTTATGTGAACTAAAAAAAATTT
125 CAAAATATTAATAA-ATTAATATTATTTTATTTAGAATATA-CTTATATGAAC--AAAAAAATTT
* * *
6490933 -TTTATAATA-AAACAAAAA-GTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC-TAATAGTCTTAAC
186 GTTT-TAATACAAA-AAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAT-ATAGCCTTAAC
* *
6490994 GATTAT-AA-CTTCGGCAAACACATTTATTTTCT-AAATCTCTTA-TTAATT-T-TT-AGAATTT
248 GATT-TGAATCTTCGGCAAACAAATTT-TTTT-TAAAATCTCTTAGTT-ATTATATTCAGAATAT
* * * *
6491052 TATTAGT-TTAGCAATATTTTACTCTGAATAAAAGCTTGTATGAATAGAGA-GAATTATTTTATG
309 TATTA-TATTAGCAATATTTGACTCTGAAT-AAA-CTGGTATGAATAGAAATG-ATTATTTCATG
** * *
6491115 ACAAAACAAAA-ATCATATTGATTTGAGATAGATAATTGTTAAAATAGT-CATAACTATTTAAAC
370 ACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTAC-TAACTATTTAAAC
** * *
6491178 TAGTTTGGTAAATATATTTAGTTATCAA-AT-CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
434 TAGTTCAGTAAACATATTTAGTTATCAATATCCTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTA
* * *** * * *
6491240 GTTTTATTTTATTTTGCATATTTTTGT-CTAAAT-AAAAATAATTGTTTAACAACAAAACAAAA-
499 GTATCATTTTATTTCAAATAGTCTTGTAC--AATGAAAAACAATTGTTTAACAACAAAACAAAAG
* * *
6491302 TGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT-AGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACATGTTTGATAA
562 T-TCATAACAATTTGAAATACATAATCA-TTCAAATCGACATAACTATTTG-A-A---TTGATAA
* * * * * *
6491366 AC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AGACTATTAATAAATTAGTATTTTT
620 ACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATT
* * *
6491429 TTATTTCGAATAAAC-TTGCATGAAGAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATTATAATG
683 TTATTTCGAATAAACTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATG
6491493 ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
748 ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
6491532 AAACTTTCTT
Statistics
Matches: 656, Mismatches: 101, Indels: 66
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
838 3 0.00
839 111 0.17
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849 19 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (839 bp):
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
TCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAAT
ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTAGAATATACTTATATGAACAAAAAAATTTGTTTTAATAC
AAAAAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGCCTTAACGATTTGAATCTTC
GGCAAACAAATTTTTTTTAAAATCTCTTAGTTATTATATTCAGAATATTATTATATTAGCAATAT
TTGACTCTGAATAAACTGGTATGAATAGAAATGATTATTTCATGACAAAACAAAAGATCATAACG
ATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTACTAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTAGT
TATCAATATCCTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAGT
CTTGTACAATGAAAAACAATTGTTTAACAACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATACATAA
TCATTCAAATCGACATAACTATTTGAATTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATC
AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAATAAACTTTGCATGAACAGAAACA
ATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAAATTATTAATATAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTGTTTGAACT
Found at i:6491711 original size:182 final size:176
Alignment explanation
Indices: 6490742--6492513 Score: 721
Period size: 181 Copynumber: 9.9 Consensus size: 176
6490732 TGTTTGAACT
** * * ** *
6490742 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTG-TTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
6490807 TCATAACTATTTGAAATTATTTGGTAAATAGATTT-TGTTTT-AAATTTCTTACTTATTAACTTT
65 TCATAACTATTT-AAACTGTTTGATAAATAGATTTAT-TTTTCAAA--TCTTTCTTATTAA-TTT
* * * * * *
6490870 CTAAATGTTAATAATATT-GTATTA-TTTTATTTAGAATTAGCTTATGT-GAACTA
125 TTAGATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTTATTTCGAA-TAACTTTTGTAG-A-TA
* * * * * * * ** * *
6490923 AAAAAAATTTTTTATAATAAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGT
1 GAAACAATTGTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * *
6490988 CTTAACGA-TTATAAC--TTCGGCAAACACATTTA-TTTTCTAAATC--TCTTATTAATTTTTAG
66 CATAACTATTTA-AACTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTC-AAATCTTTCTTATTAATTTTTAG
* * ** * * * ***
6491047 AATTTTATTAGTTTAGCAATA-TTTTA-CTCTGAATAAAAGCTTGTATGAATA
129 -ATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTC-GAAT-AACTTTTGTA-G-ATA
* * * ** * *** * *
6491098 GAGAGAATTATTTTATGACAAAACAAAA-ATCATATTGATTTGAGATAGATAATTGTTAAAATAG
1 GAAACAATT-GTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
6491162 TCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAATATATTTAGTTATCAAATC--TCTTATTAATTTTTGA
65 TCATAACTATTTAAACT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTCAAATCTTTCTTATTAATTTTT-A
* * * * * *
6491225 AATATTAATAAATTAGTTTTA-TTTTATTTTGCAT-ATTTTTGTCTAAATA
128 GATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAACTTTTG--TAGATA
* * * *
6491274 AAAATAATTGTTTAACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGG
1 GAAACAATTGTTT-ACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
6491339 ACATGACTATTTGAACATGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTAAAC-TGTTTGATAAATAGATTTATTTTTCAAATCT-T-TCTTATTAATTTTT
* *
6491404 AGACTATTAATAAATTAGTATT-TTTTTATTTCGAATAAAC--TTGCATGAAGA
127 AGA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAAT-AACTTTTGTA-G-ATA
* * * ** * *
6491455 GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATTATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTG-TTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *
6491520 TCATAACTATTTAAACTTTCTTGTTAAATAGATTTATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTAAACTGT-TTGATAAATAGATTTATTTTTCAAATC-TTT-CTTATTAATTTTT
*
6491585 AGTATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTTTGTAGATA
127 AG-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAA-CTTTTGTAGATA
* *** *
6491637 GAAACAATAAGTTTACGGTAAAATC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 GAAACAAT-TGTTTACAACAAAA-CAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
6491701 GTTATAACTATTTAAACATGTTCAGA-AAA-A-A--CA-TATT---ATTTTTCTTATTAATTTTT
64 GTCATAACTATTTAAAC-TGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTCAAATCTTTCTTATTAATTTTT
* * *
6491757 GGAATATTAATAAATTTA-AATTA-TTTTA-TTCAGAATAAGC--TTGCATG-TA
127 AG-ATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTTATTTC-GAATAA-CTTTTGTA-GATA
* * * *** *
6491806 CAAAGCCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGAT
1 GAAA--CAATTG-TTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
6491871 AGTCATAACTATTTAAAATTTTTGGTAAATAGATTCT-TTCTT-AAATTCTCTTACTCATTAATT
63 AGTCATAACTATTTAAACTGTTTGATAAATAGATT-TATTTTTCAAA-TCT-TT-CTTATTAATT
* * *
6491934 TTTGGATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTACTTCAAATAAACTTATATG-A-ACTA
124 TTTAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAAT-AACTT-T-TGTAGA-TA
** * * * * ** *
6491988 -AAACAATTGTTTTATTATAAAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 GAAACAATTG-TTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * * * * * *
6492052 ACATGGCTATTTGAACT-TGTTCAGTGAACATATTTATTTTTTTTAATAT-TTTACTTA-TCATT
65 TCATAACTATTTAAACTGT-TTGA-TAAATAGATTTA--TTTTTCAA-ATCTTT-CTTATTAATT
* * * * *
6492114 GTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAACATGTATG-AGCAT-
124 -TTTAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAAT-AAC-T-TTTGTAG-ATA
* * * *
6492169 -AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAGA-GTCATAACAAGTTGAAATAGATAATTGTACAAATA
1 GAAACAATT-GTTTACAACAAAACAAA-ATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * * * *
6492232 GTCATAA-TGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTG
64 GTCATAACT-ATTTAAAC-TGTTTGATAAATAGATTTATTTTTCAAAT-CTTT-CTTATTAATT-
* * * * **
6492296 TCTTA-ATATTGATAAATTTGTATGA-TATTATTT-GAAATAA-GATTGTATGAATA
124 T-TTAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCG-AATAACTTTTGTA-G-ATA
* * ** * * * * * * * *
6492349 GAAAAAATTCTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAG
1 GAAACAATT-GTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
6492414 TCATAATTTTTTAAACT-TATTCAATAAACTA-ATTCATTTTTTAATTTCTTTATTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTAAACTGT-TT-GATAAA-TAGATTTATTTTTCAA-ATCTTTCTTATTAATTTT
* * * *
6492477 TGGATTACTAA-AAGACTAGTATTA-TTTTATTTTGAAT
126 TAGA-TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTTATTTCGAAT
6492514 TAGTTTATAT
Statistics
Matches: 1226, Mismatches: 254, Indels: 223
0.72 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
169 10 0.01
170 12 0.01
171 76 0.06
172 29 0.02
173 15 0.01
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175 53 0.04
176 53 0.04
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184 5 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
GAAACAATTGTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTAAACTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTCAAATCTTTCTTATTAATTTTTAGAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAACTTTTGTAGATA
Found at i:6492696 original size:92 final size:90
Alignment explanation
Indices: 6492532--6492697 Score: 224
Period size: 92 Copynumber: 1.8 Consensus size: 90
6492522 ATGAACTGAA
* * ** * *
6492532 ACAATTTTTTTATGATAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAATCATA
1 ACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTATTCAAAAAATCATA
**
6492597 ATTATTTGATCCTGTATGAATAGAG
66 AAGATTTGATCCTGTATGAATAGAG
* *
6492622 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGA-AAAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTATTCAAAAAATCA
6492687 TAAAGATTTGA
64 TAAAGATTTGA
6492698 ACTTGTTCGG
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 10, Indels: 2
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (90 bp):
ACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTATTCAAAAAATCATA
AAGATTTGATCCTGTATGAATAGAG
Found at i:6493000 original size:451 final size:452
Alignment explanation
Indices: 6492171--6493060 Score: 1191
Period size: 451 Copynumber: 2.0 Consensus size: 452
6492161 ATGAGCATAA
* * *
6492171 ACAATTATTTTATAACAAAACAAAGAGTCATAACAAGTTGAAATAGATAATTGTACAAATAGTCA
1 ACAATTATTTTATAACAAAACAAAGAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAACTATACAAATAGTCA
* *
6492236 TAATGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTCTTA
66 TAAAGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATTATACTTATTAATTGTCTTA
* * ** *
6492301 ATATTGATAAATTTGTATGATATTATTTGAAATAAGATTGTATGAATAGAAAAAATTCTTTTATG
131 ATATTAATAAATTTATATGATATTATTCAAAATAAGATTGCATGAATAGAAAAAATTCTTTTATG
* * * * *
6492366 ACAAATCAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTTTTTAAACT
196 ACAAAACAAAAGATTATAGCGACTTCAAATAGATAACTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAACT
* * * *
6492431 TATTCAATAAACTAATTCATTTTTTAATTTCTTTATTATTAATTTTTGGATTACTAAAAGACTAG
261 TATTCAATAAACTAATTCATTTTTAAATTTCTTTATTATTAATTTTTAGAATACTAAAAGACTAA
* * * **
6492496 TATTATTTTATTTTGAATTAGTTTATATGAACTGAAACAATTTTTTTATGATAAAA-AAAGGTCA
326 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACCAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAGGTCA
* *
6492560 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAATCATAATTATTTGATCCTGTATGAATAGAG
391 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAATCATAACTATTTGATCCTGTATGAATAGAG
* * * *
6492622 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATAACAAAACAAAGA-GTCATAACAAGTTGAAATAAATAACTATACAAATAGTC
* * * *
6492686 ATAAAGATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCA-TATATTTATTAATTGTCT
65 ATAAAGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT-ATTATACTTATTAATTGTCT
* * *
6492750 TAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAAAA-TCATTTT
129 TAATATTAATAAATTTATATGATATTATTCAAAATAAGATTGCATGAATAGAAAAAATTC-TTTT
* * *
6492814 ATGACAAAACAAAAGATTATAGCGACTTCAAATAGATAACTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAA
193 ATGACAAAACAAAAGATTATAGCGACTTCAAATAGATAACTATTCAAACAGTCATAATTATTTAA
* * * * * * *
6492879 ATTTGTTTATTAAA-TGGATTCATTTTTAAATTTC-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-
258 ACTTATTCAATAAACT-AATTCATTTTTAAATTTCTTTA-TTATTAATTTTTAGAATACTAAAAG
**
6492941 ACTTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACCAAAATGATTTTTTTATGATAAAACGA
321 AC-TAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACCAAAACAATTTTTTTATGATAAAAC-A
* * * *
6493006 AAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATC
384 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAATCATAACTATTTGATC
6493061 TAGTTTGGTA
Statistics
Matches: 378, Mismatches: 53, Indels: 14
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
450 9 0.02
451 318 0.84
452 1 0.00
453 50 0.13
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (452 bp):
ACAATTATTTTATAACAAAACAAAGAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAACTATACAAATAGTCA
TAAAGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATTATACTTATTAATTGTCTTA
ATATTAATAAATTTATATGATATTATTCAAAATAAGATTGCATGAATAGAAAAAATTCTTTTATG
ACAAAACAAAAGATTATAGCGACTTCAAATAGATAACTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAACT
TATTCAATAAACTAATTCATTTTTAAATTTCTTTATTATTAATTTTTAGAATACTAAAAGACTAA
TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACCAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAGGTCA
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * * * * *
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1 AATAGAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* ** * * * ** *
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* * ** * *
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* * * * ** * * * *
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** * * * * * *
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*** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * *** * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * * * *
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* *** * * * *
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* * * * * *
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** * ** * * * ** * * * * **
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* * * ** * * *
6494882 ATTTTAGGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAACAA
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* * * * ** * * * ** *
6494947 TTGTTTTATGACAAATCAAAAGTTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTACAAATAGAAATAAC
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* * * * ** ** * **
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* * * * * *** * * *
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* * * * * * * *
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1 AATAGAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * ** * * * * *
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** * * * * * ** *
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* * * ** * * ** * * *
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* * * ** * * * * * *** * *
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254 ACTATTTGAACTTGTTAAGAAAACAAACTAATTTTTAAAATTTC-AACTCATTAA-TTTTTAAAT
* * ** * *** *
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* * * * * * * * *
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1 AATAGAAAC-AATTGTTTTAAGACAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * * ** * * *
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* *** * * * * *
6495610 AATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAA
127 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * * * * * *
6495675 TTATTTTATGGCAAAATAAAAAGTAATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAT
191 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATGAC
* ** * * * * *
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* * * * * * *
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** * * ** ** * *
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1 AATAGAAACAATTGTTTTA-AGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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189 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATG
* * * ** * * * * * * *
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254 ACTATTTGAACTT-GTTAAG-AAAACAAACTAATTTTTAAAATTTCAACTCATTAATT-TTTAAA
* * * * *
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** * * * * * * *
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*** * ** * *** * * *
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* * * ** * * ** * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* ** ** * *
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1 AATAGAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * ** * * * *
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* ** *
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* * * * * *
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* * *
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* * **
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* * * *
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1 AATAGAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCA
* *
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* * *
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** * * *
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* *** * * * ** * *
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** *
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* * * * * * * *
6497274 AATAGAACCAATTGTTTTAAGATAACACAGAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAG
1 AATAGAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * ** * * *
6497339 ATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTT-TTTTTTAATTCTCTTACTTATTAAT
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* * * ** ** * *
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* *
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* ** * * ** * **
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321 ATAAATTA
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TTAGTATTATTTTATTCAAAATAAACTCGCATA
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** * * * *
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* * * *
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* ** * * * * * * *
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* * ** ** *
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257 CATAACTATTTGAAA--GGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAA-TT-TTACTTATTAATTTTTG
* * * ** ** *
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318 A-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTT
* * * * * *
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380 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * ** * * * * *
6493057 GATCTAGTTTGGT-AAGTGTATTTATTTTTTAAATTTTTTACATATTAATTGTTGAAATATTAGT
445 GAACTTGTTTGGTAAACAG-ATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
*
6493121 AAATTAGTATCATTTTAATTT-GAATAAGCT
508 AAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCT
* ** * * * * * *
6493151 TGTATGAATAGAAGCTTTTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA-TAAATAAT
1 TGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAAT
* *
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* * * * * * *
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130 TATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAA
* * * * * ** * *
6493341 -AATTTTTTTTATGACAACACGAAGGGTCATAGTAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTA
195 CAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
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259 TAACTATTTGAA-AGGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGAA
* * * ** * ** * ** * *
6493469 ATATGAATAAATTCATTTTATTTTATTCCCAATAAGATAATATGAATTTAAAAAATTGTTTTATT
320 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** *
6493534 ACAAAAC--AA----A-AACGATTTGAAATAGATAACAGTTCATATAGTCT-TAACTATTTGAAC
385 ATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAAC
* * * * ** *
6493591 TAGTTTGGTAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTTGGAATATTTTTATATT
449 TTGTTTGGTAAACAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* *
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513 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
* * * * * * * * * *
6493680 TGTACAAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTG-AAGTATACAAT
1 TGTA-TAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAAT
* * *
6493744 TATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATC---T-CT
65 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* ** * *
6493805 TATTAATTGTTGAAAGATTAATAAATTTCTATTATTTTATTCTAAATAAACATGTAT-AATA-AA
130 TATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * ** * ** * *
6493868 ACAATTG--TTATAACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATGGAAATGGCCA
194 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
6493931 TAATTATTTGAACTGCTTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TCACTTATTAA-TTTTAAGAA
259 TAACTATTTGAA-AGGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * *
6493993 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATG
321 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
6494057 ACAAAAAAAAAGGTCATAGTGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATGGTTGTAACTATTTGAATT
385 ATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT
** * * ** *
6494122 TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAATT
450 TGTTTGGTAAACAGA-TT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
*
6494186 AGTATTATTTTAGTTT-GGATAAGCT
513 AGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCT
* * * * ** * *
6494211 TTTATGAATTGAAACAATTGTTTTAT-ATCAAAAC-AAAGGTGATATTGATTTCAAA-TAAATAA
1 TGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAA
* * * * *** *
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64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTA
* * * ** * *
6494338 CTAATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATT-TTGATTATTGAATTCCAAATAAGA-TTGCA-AAA
128 CTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCCAAATAA-ACTTGTATGAA
* * * *** * * * ** * * *
6494399 TATGTAACAAATATTTTCCAACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTT-AAACTATATAATTATTCTA
189 TA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAA
** * * * *
6494463 ATAGTTTTAAATATTTGAACTA-GTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TCACTTATTAATT
252 ATAGTCATAACTATTTGAA--AGGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTTACTTATTAATT
* * * * * * *
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314 TTTGAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATT
* * * * * * * * * * *
6494588 ATTTTATGACAAAAC-CAAGATCTTAACGATGTGAGATTA-ATAACTGCTCAAATAGTCATAACT
377 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACT
*
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441 ATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* *
6494715 TAACAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
504 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
* * * * * **
6494749 TGGATGATTAAAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATTGATTTGAAA-TAGATAA-
1 TGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAAT
* * * * *
6494812 TATTTCAAAT-GTTCATAATTATTTTAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATCTTTTAAAT-TTCT
65 TA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-T
** * ** * *
6494874 TACAAATT-ATTTTAGGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAA
126 TACTTATTAATTTT--GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA
* * * * *
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189 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** ** * *
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254 AGTCATAACTATTTGAA-AGGTTTGGTAAACAGATTTATT-TTT-AAAT---TTTACTTATTAA-
* * * * * * * * *
6495067 TTTTTG-GATGTTAACAAAATTGGAAT-TAATTTATTTTTTGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAAT
312 TTTTTGAAATATTAA-TAAATT--AATATTATTT-TATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAC
** * * * *
6495130 AATTGTTTTATGACT-AAACAAAATATCAGAATGATTTCAAATATATAATTATTC-AATAGTCT-
373 AATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TA
* ** **
6495192 TAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACCA-ATTAACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA
436 TAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-CAGATT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
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* * * * * ** * * * *
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1 TGTATAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAAT
* * * * ** * * * **
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65 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTAC
* * ** * **
6495423 TTATTAAGTTTCT-AAATATTATTAAATTAGTATTATTTCATTCTGAATAAAATAATATGAATAG
129 TTATTAA-TTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAG
* * * ** * * * *
6495487 -AACTAATTCTTTGATGACAAAATAAAAAGGTTATAATGATTTGAAACAAATAATTATCCAAATA
192 AAAC-AATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *
6495551 GTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAACA-ATTTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTT
255 GTCATAACTATTTGAAA-GGTTTGGTAAACAGA-TTTA-TTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTT
* * * * * * * * * *
6495615 TTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTATT
315 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTT
** * * * * *
6495680 TTATGGCAAAATAAAAAGTAATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTT
380 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * *
6495745 -AAATTAGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAA-CTC---C-TATAAATTTTTCAAATATTAAT
445 GAACTT-GTTTGGTAAACAG-ATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
6495804 AAATTAGTTTTACTCTATTCCAAATAAGCT
508 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
* * * ** * * * *
6495834 TGTATGAGCT-GAAATAATTATTTTATAACAAAATGAAAGATCATAACAATTTGATA-TAAATAA
1 TGTAT-A-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAA
* * * * * ** *
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64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TT
* * * * * * * *
6495960 AATTATTAATTTTCAGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTCCAAATAAGCTTATATAAACA
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* * * * * *
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191 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
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* * * ** *
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* * * * * * ** * *
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381 TATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * ** * * * *
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446 AACTTGTTTGGTAAACAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
** * * * *
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510 ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
* * * ** * *
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* * * ** * * * *
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64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * * *
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* * *
6496564 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC--AAGGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAG
192 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * ** *
6496627 TTATAACAATTTGAGCTA-GTCTAGTAAGTAGATTTAGTTTTTAAA-TCT-CTTATTAATTTTTG
256 TCATAACTATTTGA--AAGGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTG
** * * *
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318 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * * ** * *
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383 TGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * * ** * * * ** * *
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*
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* * ** * *
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1 TGTATAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAAT
* * * ** * * *
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* *
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130 TATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-CAAATAAACTTGTATGAATAGA
* * **
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* ** * *
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258 ATAACTATTTGAAAG-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTT-AAA-TTTTACTTATTAATTTTTGAA
* ** * * * * *
6497230 ATATTCATAAATTTTTATTATTTTATTCAAAATAAGCTCGCATAAATAGAACCAATTGTTTTAAG
320 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
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385 ATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT
** * *
6497360 TGTTCAGTAAATAGATTTTTTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
450 TGTTTGGTAAACAGATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * *
6497425 TTTTATTTTACTTCAAATAGGCT
515 TATTATTTTATTTCGAATAAGCT
** * * * * *
6497448 CATATGAATTGAAACAACTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAAT
1 TGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTAGATAAT
* ** * * * *
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** ** ** * * **
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130 TATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* *** * * * * *
6497642 AAAAAAATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAAGTTT-AAATAAATAATTGCTCAAATAGTT
194 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
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258 ATAACT-ATTTGAA
6497719 CTTATTAATT
Statistics
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ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
ATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAAAGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
ATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTG
GTAAACAGATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTTCGAATAAGCT
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* * ** *
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1 AATTGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAA
* * * *
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** **
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*
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* * * * *
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* * *
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* *** * ** * * *
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128 AATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAATTTAATCCGAATAAGCATGTATGAATAGAAAAAA
** *
6497917 ATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCA
193 AAATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
6497943 AAATGATTTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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271 161 0.89
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ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.10, T:0.38
Consensus pattern (271 bp):
AATTGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAA
ATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTAAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATTCTTTACTTATTAAT
TGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAATTTAATCCGAATAAGCATGTATGAATAGAAAAAAAAA
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAGTTTAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAATGAT
TTGAACTTATT
Found at i:6497951 original size:452 final size:450
Alignment explanation
Indices: 6497321--6498172 Score: 1081
Period size: 452 Copynumber: 1.9 Consensus size: 450
6497311 TAATGTTTTG
* * * *
6497321 AAATAGATAATTGTTTAGATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTTTTTTTAA
1 AAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTTTTTTTAA
* * * *
6497386 TTCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTACTTCAAATAGGCTCAT
66 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTACTTCAAATAAGCTCAT
* * * * *
6497451 ATGAATTGAAACAACTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
131 ATGAATAGAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * *
6497516 CAAATAGTCATGACTATTTGAACTTG-TTAAGCAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTAT
196 CAAATAGTCATAACCATTTGAA-TTGATTAAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
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*
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* ** * * ** * *
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* *** * * * * * *
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Found at i:6498034 original size:181 final size:180
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* * * * * * *
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* * * * * *
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1 G---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
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* * * *
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Statistics
Matches: 1778, Mismatches: 356, Indels: 162
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Matches are distributed among these distances:
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Done.