Tandem Repeats Finder Program written by: Gary Benson Program in Bioinformatics Boston University Version 4.09 Sequence: NW_019167871.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_14, whole genome shotgun sequence Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Pmatch=0.80,Pindel=0.10 tuple sizes 0,4,5,7 tuple distances 0, 29, 159, 1000 Length: 22631831 ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.15, T:0.34 Warning! 114000 characters in sequence are not A, C, G, or T File 65 of 125 Found at i:12958653 original size:146 final size:146 Alignment explanation
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ATACAATATTATTCAAAATTAAAACAATGTTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATT 66 ATATAAAATTATTCAAAA-TAAAACAAT-TTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATT * * * 12958825 TAAAAACTAAATCTATTTACCAAGCCAGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTCATCT 129 TAAAAA-TAAATATATTTACCAA-CCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTCATTT * * * * * 12958890 CAACTTATTATGATCTTTATTTTGTCATAGAACTATTGTTTCTTTTCATAGAAGCTTATTCAAAT 192 CAAATTGTTATGACCTTT-TTTTGTCATA-AACTATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA- * 12958955 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAACTAAATTTG 254 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAACTAAATTTG * * * * * 12959020 TTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTAATAGAACAATTATCTATTTCATATCATCT-TGAC 318 TTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATCTATGAC * * 12959084 CTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAA 383 CTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA * * * 12959149 TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGGAAGCGATTTGACAA-AATAAATCTATTTATTGAAGAA 446 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* * * * * * 12959984 ATAGTTTTTTTCTCTTCATACAAGCTTATTT-CAATCAAAATTATACAAATTTATTAATATTC-A 574 ACA-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAA-TATACTAATATATTAATATTCTA * * * * * * * * * 12960047 GACACTTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTCAT-A 636 -ACAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAATCATGT 12960111 ACTATT 700 AC-ATT * * * 12960117 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAAA-AATTATTTCAGTT 1 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTGTT * ** ** * *** 12960181 CATTTAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA 65 CATATAAAATTATTCAAAATAAAACAATT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----A * * * * * 12960246 GATTTTAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTA-TC 125 GA-TTTAAAAATAAATATATTTACC-AACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTC * * * * 12960310 TATTTCAAATTGCTA-GAACCTTATGTTTTGTCATAAAATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTA 188 -ATTTCAAATTGTTATG-ACCTT-T-TTTTGTCAT-AAACTATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * * * * * * 12960374 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Indices: 12962708--12963428 Score: 451 Period size: 181 Copynumber: 4.0 Consensus size: 180 12962698 TTATTTCAAC * * * 12962708 TCATACAAGTTTATTCGAAATAAATTAAAACTAATTTATTAATA-TTACAAAA-ATTTA-TAAGA 1 TCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTACAAAATAATTAGTAAGA * * * 12962770 GATTTAAAA-GATAATTCT-ATTA-CTAACTAGTTTAAATAATTATAACTATTTAAAAAATTATC 66 GATTTAAAAGGA-AAATCTGATTACCAAACTAGTTTAAATAATTATAACTACTTAAAAAATTATC * * 12962832 CATTTTAAATCGTTATTA-CTTTTT-TTTTTTCATAAAACAATTGTTTTTGT 130 CATTTCAAATCGTTA-TAGCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT * * * 12962882 TCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAG 1 TCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTACAAAA-TAATTAGTAAG * * * * * * * 12962947 AGATTTAAAAGGAAAATCTGTTTACCAAACTATTTTAAATAGTTTTGACTACTTGAATAATTATC 65 AGATTTAAAAGGAAAATCTGATTACCAAACTAGTTTAAATAATTATAACTACTTAAAAAATTATC * * * * *** 12963012 TATTTCAAATCGTTATAGCTTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCAAT 130 CATTTCAAATCGTTATAGCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT * * * * * * * ** 12963063 TCATACTATTTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTGA-AACATAATAACCA 1 TCATACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATT-T-ACAAAATAATTAGTA * * * * * * * * * ** 12963126 AGAAAATTAAAA-TATAAATCTAATTGCCAAACTAGCTCAAATAGTTA-AGACTA-TATGAACGA 63 AGAGATTTAAAAGGA-AAATCTGATTACCAAACTAGTTTAAATAATTATA-ACTACT-TAAAAAA * * * *** * 12963188 TTATCAATTTCAATTTGTTAT-GACTTTTTGCATTGTCATAAAACAATT-ATTTTGT 125 TTATCCATTTCAAATCGTTATAG-CTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT * *** * * * * ** * 12963243 TCATACAAG-TAATTTGGATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTT--TGAA-AATTAATAAGA 1 TCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTACAAAATAATTAGTAAGA ** * * ** * * * * * 12963304 GATTTAAAAAAATAAATTTGTTTTTCAAACCAGTTCAATTAATTAAAACTA-TTAGAACAATTAT 66 GATTTAAAAGGA-AAATCTGATTACCAAACTAGTTTAAATAATTATAACTACTTA-AAAAATTAT * * * * * 12963368 CTATTTCAAATCATTATAACTGTTTT-TTTAGTCAT-AAACAATTGTTTTTTT 129 CCATTTCAAATCGTTATAGCT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT 12963419 TACATACAAG 1 T-CATACAAG 12963429 CTTAATTGGA Statistics Matches: 428, Mismatches: 95, Indels: 45 0.75 0.17 0.08 Matches are distributed among these distances: 174 40 0.09 175 31 0.07 176 66 0.15 177 17 0.04 178 22 0.05 179 36 0.08 180 64 0.15 181 144 0.34 182 7 0.02 183 1 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41 Consensus pattern (180 bp): TCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTACAAAATAATTAGTAAGA GATTTAAAAGGAAAATCTGATTACCAAACTAGTTTAAATAATTATAACTACTTAAAAAATTATCC ATTTCAAATCGTTATAGCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT Found at i:12963795 original size:159 final size:161 Alignment explanation
Indices: 12963504--12963803 Score: 435 Period size: 159 Copynumber: 1.9 Consensus size: 161 12963494 TAGTTATTAC * * * * 12963504 TATTTGAATAATTATCTATTTAAAGTTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA 1 TATTTGAATAATTATCTATTTAAAGTCGTCATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTA * * * * * 12963569 GTTAATACAAGGATATACGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTCTAAAATTAATAAGTA 66 GATAATACAAGCATATACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA 12963634 AGAGATTTAAATTAGTTAAAATAATTATGGT 131 AGAGATTTAAATTAGTTAAAATAATTATGGT * 12963665 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTCATGACCTTTTGTTTT-TAATAAAATAATTGTTTT 1 TATTTGAATAATTATCTATTT-AAAGTCGTCATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTT * * * * 12963728 -GATCATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT 65 AGATAATACAAGCATATACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT * 12963792 AAGATATTTAAA 130 AAGAGATTTAAA 12963804 AAATAAATCT Statistics Matches: 123, Mismatches: 15, Indels: 4 0.87 0.11 0.03 Matches are distributed among these distances: 159 66 0.54 160 16 0.13 161 38 0.31 162 3 0.02 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (161 bp): TATTTGAATAATTATCTATTTAAAGTCGTCATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTA GATAATACAAGCATATACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA AGAGATTTAAATTAGTTAAAATAATTATGGT Found at i:12964434 original size:181 final size:179 Alignment explanation
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AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTA * * * 12965197 AGAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGAC 130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCTAA-CAAGTTCAAATAGTTA-GAC * * * * * * * ** * * * 12965248 CATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATAATAACTTTTTGTTTTGTCCTAATATAATTCTTTCT 1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC- * * * * * * 12965313 A-TTCATGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACT 65 AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT * * * * ** * * * 12965377 AAAAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATATTTAAGAC 129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTT-AGAC * * * * * * 12965429 TGTATGAGCAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTC 1 TATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC * * * 12965493 AATTCATACTAGCTTATTCAAATTAAAATAA 65 AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA 12965524 AATAATTGTT Statistics Matches: 1304, Mismatches: 274, Indels: 202 0.73 0.15 0.11 Matches are distributed 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AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA--ACTAA-TAAGTGATTT * * * ** * * * * * * * ** 12964857 AAAAAATAAATCTGTTTGCTAAAGCGGTTTAAACAGTTAAGACGACATGAACAATTATCTATTCT 122 -AAAAGTAAATCTATTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATT-T * ** * * * ** 12964922 -AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATCGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA 185 AAAATCATTATGAACTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATAAAAGCTTA-TCAAA ** * * * * * 12964986 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATCCCAAAAATTAATAAGAAAGTGATTTAAAAAGTGAATT 247 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA * ** * * *** * * 12965050 TATTTGTTGATTC-ATTTCAAATAATTATGGCTATT-TCAAT 310 TGTTTGTT-AACCAAATTCAAATAGTTAAAACCATTAT-AAC * * * ** * ** * * 12965090 GATTATCTATTTCAAATCGTTATTAACCTTTTGTTTGGTCTGTAACAAA-TGTTTTTGATCATTC 1 AATTATCTATTTCAAATC--TA-TGA-CTTTTGTTTTGT-AATAAAAAATTGTTTCAGTTCATAC * * * * * * * 12965154 AAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-CT--TTCA--AA-AATT-AATAAGTAA-GAGT--TTTAAAA 61 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTGATTT-AAA * * * * * * * * 12965209 AATAAATCTATTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTGTATACTTCAAAT 125 AGTAAATCTATTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT * * * * * ** * * 12965274 CATAAT-AACTTTTTGTTTTGTCCTAATATAATTCTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTAGAATAA 190 CATTATGAAC-TTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTA-TCAAAATAA * * * * * * 12965338 AATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT 251 AATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT ** * * * * * * 12965403 GCCAAACTAGTTCAAATATTTAAGA-C-TGTATGAGC 315 GTTAACCAAATTCAAATAGTTAAAACCAT-TAT-AAC * * * * * * 12965438 AATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATACT 1 AATTATCTATTTC-AAAT-CTATGA-CTTTTGTTTTGTAATAAA-AAATTGTTTCAGTTCATACA * 12965503 AGCTTATTCAAATTAAAATAA 62 AGCTTATTCAAAATAAAATAA 12965524 AATAATTGTT Statistics Matches: 1176, Mismatches: 235, Indels: 176 0.74 0.15 0.11 Matches are distributed among these distances: 345 2 0.00 346 112 0.10 347 89 0.08 348 276 0.23 349 72 0.06 350 164 0.14 351 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* * 12992615 ATTAACA-TTCAAAAATTAATAACGAAAAGAGATTTAAGAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGT 44 ATTAATATTTCAAAAATTAATAA-G-TAAGAGATTTAA-AAAATAAATATGTTTATCAAACTAGT * * * ** * * * * * 12992679 TCAAATAGCTATTACTATTTTAACAATTGCCTATTTAAAATCATTATAACCATTTGATTTATCAT 106 TCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT * 12992744 AAAAAAATTG 170 AAAACAATTG ** ** * * ** * 12992754 CTTCAATT-AGTACAAGCTTAGACAGAATAAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAACTA 1 -TTTTATTCA-TACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA * * * ** * * * * 12992818 ATGAA-TAA-AAATTTTAAAAATAAATGTGTTTATTGAA-TAAGTTAAAATAATTAAGGCCATTT 63 AT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACT-AGTTCAAAT-ATTATGACTATTT ** * * * * 12992880 GAATTATTATTTATTTGAAATCATTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTG 125 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTG * ** 12992935 TTTTTGATT-GTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA 1 -TTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA * * * * * 12992999 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AAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA * ** 12983511 AATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTGTT-TATTCATACAAAATTA-TTCAAA 322 AATCATTATGAC--CTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AA * * * * 12983574 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATCTT-AAAAATT-A-A-TAAGAGA-TTAAAAAACTAAAAC 383 ATAAAATAATACAAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAGTAAAAAATTTAAAAAA-TAAATC ** * * * * * * 12983634 TGCTTACCAAACAAGTTCAAATA-TTCATAACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATG 446 TATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG * 12983698 A-TCTTTG--TT-TCATAAAACAATTGTATC 510 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TC * * * * ** * * * ** * * 12983725 TAT-TCATTCAATCTTGTTTAGAGTAAAATATTCCTAAAATAATAATA-TTCTAAAATTAATAAG 1 TTTGTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG ** * *** ** * ** * 12983788 TAGGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCGGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAAT 66 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT * * ** * * * 12983853 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* * ** * * 12985037 TTAAAAACTAAATTTCTTTGTC-ATACAAGTTCAAATAATTATATAACTGTTTGAACAATTATCT 254 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAA-T-TATGACTATTTGAACAATTATCT ** * * * * 12985101 ATTTCAAATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT 316 ATTTCAAATCATTATGAC--CTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT * * * * 12985166 TCAATTAAAATAATGCAAATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAGTAAAAAATTTTAAAAATAA 379 TCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAAAAATTTAAAAAATAA * * * 12985231 ATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTACTTATTTCAAATCATTA 443 ATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTA * * * 12985296 TGACTTTTTGCTTTATCATAAAAAAATTGTC 508 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTC * * * * * 12985327 TTTGTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATATTAATTTACTAATATTTCAACAATTAATAAG 1 TTTGTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG * * * ** 12985392 TAAAAGATATT-AAAAAT-AATATGTTTACAGAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGGTAA 66 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** * 12985840 TTTGTTTTGTCATAAATGAATTAT- 514 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTC * * * * * 12985864 TTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT-ATATTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATA 1 TT-T-GTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA * * * * * * 12985928 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA 64 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA * * ** * * 12985993 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TGATTCATACA 129 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAAG-TTCATATA *** * * * ** 12986057 A-CTTTATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATGTT-ATAAAATTAATGAGTTGGAGATTT 193 AGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT * * * * * * * * * 12986120 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCAGTTGAACTATTATTTATTTC 256 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * * * ** * ** * 12986185 AAATCATTATGACATTTTGATTTATTGTAAAACAATTATTT-TCATTCATACAAAATTATCT-AG 321 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* * * ** ** * 12995409 TTGAAATTATTTATAACCTTTTGTTTAATCATAAAGTAATAT-TTTC-AGTTCATACATGCTTAT 318 TTCAAATCA-TTATGACC--TTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT * * * * * * * * 12995472 TTGAAATAAAATAATGCCAATTTATTAACA-TGCATAACATTAATA-CACAAGATATTTAAAATA 378 TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAGTA-AA-AAATTTAAAA-A * * ** * * * * * 12995535 ATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-TGATTTAAACATTTATCTATTTAAAAT 439 ATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT * * * * 12995599 AAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT- 503 CATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTC * * ** * ** * 12995634 TTCAGTTCAT--AAGTTTATTCAAAATAAAA-AATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGATA 1 TT-TG-TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA * * * * * 12995696 AGTTAGAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATC-GAATC-AGTTCAAATAATTATG-GTCATTTG 64 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTA-CAGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG * * * * * 12995757 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTT---TTCAT 125 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431 GTTTTTATTCA-TACAA-CTTTATTCAGAATAAAATAAA-A-TAATTTAATAATATTTCAAAAAT * * * 12992816 TAATGAA-TAA-AAATTTTAAAAATAAATGTGTTTATTG-A 492 TAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TAT-TTGCA * * * * * * ** * * ** * * 12992854 ATA--AGTTAAAATAATTAAGGCCATTTGAATTATTATTTATTTGAAATCATTATGATCATTTGT 1 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT * * * * * * 12992917 TTTGTCATAAAAAATTTGTTTTTGATT-GTACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTA 66 TTTATCATAAAAAA-TT-TTTTTAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAACAAAACTAA--TA * ** 12992980 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAA 126 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAATAGTTCAA * * * * * * * * * * * * 12993045 GTAGTTATGACTATTTGTATAATTTTCAATCTCAAATCGTTAAGATC-ATTGTTTTGTCATAAAA 190 ATAATTATG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAA * * * ** * 12993109 TAATT-TTTTCTGATC-ATCAAAGCTTATT-TAGTTAAAAATAATA-TAATTTAATAATA-TTCA 253 CAATTGTTTTC--ATCAATC-AAGATTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC- * ** * * *** 12993169 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TAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA 360 AAATAGTTTTGACTATTTGAAC-AATTATATATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATTATA * * * * * * * 12994378 AAATAAATTG-TTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATATAAATCTATTAATATTT- 423 AAA-AAATTGTTTTTATTCATACAACTTTATTCAGAATAAAATAAAAT-AATTTAATAATATTTC * * ** * 12994441 AAAAA--ATTAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAAAAT-TTTGTA 486 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCA * * ** * * * * * ** * * ** 12994480 TCAAACTAGTTCAAATAATTATCA-TGTTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATCCTTCTAATTTTTT 1 --AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT * * * * * * * * * 12994544 GTTATGTTAAAAAACAATAGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC-GATTAAAATAACACTAATT 64 GTTTTATCATAAAA-AAT-TTTTTTAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAACAAAACTAA-- * ** * ** ** * * * 12994607 TATTATTATTTTGACAATTAATAAGTAA-ATTTTTTTTAAAA-AAATATGTTTAGCAAACTAGAT 124 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-TAGTT * * * * * * 12994670 CAAAT-A--GT-C-A--TGAATAA-TAGTCTAATTCAAATTGTTATGA-CTTTGGTTTTGTCATA 187 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AATAAATTAGTATTATTTAATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAATATTTGTTATA-GC-AG * * * ** ** ** * 13001459 AACAATTTAAAGTATACAACT-A-TTCAAAT-AGTCA-TAAATATTTA-AACTGGTTCGGTAAAC 441 AAC-A---AAAGT-TATAA-TGATTTAAAATAAGTAATTAAATAAATAGAACTATTTCAATAAAT * 13001519 ATATTTATTTTTTAAATCT 500 AGATTTATTTTTTAAATCT * * 13001538 CTTATTAATTTTTGAAAGATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGAATGATCA 1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGAATGATCA * * * * * 13001602 TAAACATTTGTTATATGACT-AAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATG 65 TAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATT * * * * * 13001666 GCCATTATTATTTGACATGATTCGATAAATAGATTCACTTTTTATATCACTTATTAATTTTTAAA 129 G-CATAATTATTTAACATGATTTGATAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAA * ** * * 13001731 ATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGGACTAAAATGATTATTTGATG 193 ATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATG * * ** * 13001796 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAACAGATAATTATTCATGTAGTCTTAACTGTTTGAACT 258 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* * * * * * * 13002662 -GTGAAAAAAATATTTTATGGCT-AAA-AAATGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTA 63 CAT-AAACAATTGTTTTAT-GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA * ** * * * * * * * * 13002724 ATAGTTTTAACTATTTAA-ACTAATTTAACAAACATATTTA-TTTTTCAAATCTCTTGCTTATTA 126 ATTG-CATAATTATTTAACA-TGATTTGATAAATAGATTCACTTTTT-AAA--TC--ACTTATTA * * ** * * * 13002787 ATTTTCAGAATATT-ATTAA-TTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAGATTCTATG-ATTAGAAAC 184 ATTTTCAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC * * * * * * * 13002848 AATTATTTTATGACAAAA-AAAAGATCATAACAATTCG-ACTTGATAATTGTTCAAATAGT-TAT 246 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-T ** ** ** ** * 13002910 AACTATTCAAACTGGTTTGATAATTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAA 310 AACTATTTGAACTATTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAA * ** * * * * * 13002975 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATTATCAAAAATGATTGTTTTATAA 375 TATTAATAAATTAGTATTATTTAATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAT-ATT-TGTTATAG * * * * * * * 13003040 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Indices: 13002043--13004483 Score: 1697 Period size: 361 Copynumber: 6.8 Consensus size: 358 13002033 CAATAAATAG * * * * 13002043 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTA--ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATT-TG 1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCG * * ** * * ** 13002105 AAATAAGCTTGCATGATGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAA 66 -AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAA * * * * * * * * * * 13002169 ATAGATAATTGTTAAAATTGACATAATTATTTAAAATGATTTGGTAAATAGATTCACTTTTTGAA 129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA * ** * * 13002234 TCAT-TTA--T-T-AATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTGTTTTATTTCGAATAAGCTTGT 193 TC-TCTTAGTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT * * * * * * 13002294 ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTTAAATATACAATTATT 257 ATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT * * * 13002359 CAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTG-TTCAGAAAACAT 321 CAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACAA * * 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-TG--T-------CAGGTC---CATTTGA-ACTACTAT---C---TA--T-TTT-AAATTGTTAT 131 CTGTTTGCCAAACCAGTTCAAACATTTAAGACTA-TATGAACAATTATTTGTTTCAAATCATTAC * * * * ** * * ** * * 13007685 AACATTTTCTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCT-ATTCATATAAAATTATTCAGAATAAAATAAT 195 GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATAATTT-TAATCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAA * * * * * * 13007749 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACTA- 259 ACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATATAAAAAATGAATCTATTTACCGAACCAT * * * * * * *** * 13007813 GTTTAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTA-TAATTTTTGTTTTGTC 324 G-TCAAATAATCATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTGCCTTTTGTTTGGTC * * * * * * * 13007877 ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATATTGCTAA---ATTAATATT 388 ATAAAACAAATGTTTTTGATCATTCAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT * * * * * * **** * 13007939 ATAATAAAAATTGATAAGTAAGATATTTAAACAACTAA-TGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAG 453 -T--CAAAAA---CTAA-TAAGAGATTTAAA-AAATAATTCTATTTACCAAACCAGTT-AAATAG * * * * 13008003 TTAAGACTA-TTAA-AACTATTATTTAT 509 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* * * * * * 13008402 TCATTATAAAATAATTGTTTTAGTTTATAT-AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTAAT 383 TGGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCAT-TCAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTATT * * * * ** * 13008466 AATATTTTAAAAA-TGAATAACAAAGAGATTCAAAAAATAAATT-TGA-TTGCTAATGCAATTCA 447 AATATTTCAAAAACT-AAT----AAGAGATTTAAAAAAT-AATTCT-ATTTACCAAACCAGTT-A * * * 13008528 AACAGTTGA-GAC--TTTATGA-ATAATTATCTAT 504 AATAGTT-ATGACAATTTA--ACA-AATTATATAC * * * * * * * * 13008559 TTCAAATTGTTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCCTATTC 1 TTCAAATTGTTATAACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC * * * * ** * 13008623 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGTGATTTAAAATGTGAA 65 AAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA **** * * * ** * * * * * * * * * * 13008684 TCTGTTTATTGAATCAGTTGAAATAGATATGGCCACATCAATACTTATCTATTTCAAATCATTAT 130 TCTGTTTGCCAAACCAGTTCAAACATTTAAGACTATATGAACAATTATTTGTTTCAAATCATTAC * * * * * ** 13008749 TACCTTTTGTTTGATCATATAACAATTATTTTTGAA--CATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAA 195 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AAATATGTTT-TACGAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATAT-TTCAAATCG * * * * * 13011025 TTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTCTTTGGAGTAAAAT 123 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAT * ** * * * * * * * 13011089 ATTACTAAACTAGTGATA-TTCTAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGCC 188 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC * * * * * * 13011153 GAATCAGTTCAAACAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTT-TTTAAAATCATTCTGACCTTTTA 253 -AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTA * * * 13011217 TTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTT 316 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCT * ** * * * * * * 13011280 ATTAACGTTTAAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTTTAAAAAATA-AATCTATTTACCAAACAAAT 380 AGTAATATTTATAAAATTAATGAGTAAGAGAA--CTAAAAAA-AGAATCTATTTATCGAACAAGT * * * * * * * * 13011343 TCAAATAGTTATGACTA-CTTGAATAATTATCTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATA 442 TAAAAGAGTTATGACAATC-TAAATAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACATTTTGCTTTGTT * * * * 13011406 ACAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAA 505 ATAAAAAAATTAG-TTCTATTCGTACAA * * * * ** 13011433 GCTTATCTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTTGAAGATTTAA 1 G---A-ATAAAAT--AA-AATA-CA-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-AAAAG-TTTAA * * ** ** * 13011498 AAAATAAATCA-G-TTTATCGAATCAATTTAAATAAATATGGCCATTTGAACAATTATATATTTC 55 AAAATAAAT-ATGTTTTA-CGAA-CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTC * * * * * * 13011561 AAATCGTTATGAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTCGGA 117 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGA * * ** * 13011625 GTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTATGAGATTTAAAAAATAAATCT 181 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT * * * * 13011690 GGTTA-CAGAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTA 246 GTTTACCA-AA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA 13011734 TGATTATTTG Statistics Matches: 1090, Mismatches: 207, Indels: 127 0.77 0.15 0.09 Matches are distributed among 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* ** * * * 13010732 TAAAATAATACTAATCTAGTATTA-TT-ATAAAATTAATGAGTTGTAGA-CTAAAAGAATTAATC 65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAA-AATAAATA * * * * * ** 13010794 TATTTATTGAAT-AAGTTAAA-AGAGTCGTATGTCCATTTGAATTATTAT-TATTTCAAATCATT 128 TGTTTATCGAATCAATTTAAATA-A-T--TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT ** * * * * ** * 13010856 ATGATATTTTGTTTTTTCATAAAAAAATTATTTTTA-TTCGTACAAAATTATT-----TAGAATA 189 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA * ** * ** * * 13010915 A-AATAATTTATTAATGCTTCAAAAATTAATAAG---G-GATTTAAAACCTAAATTTGTTTA-TA 253 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA * * * 13010974 GGACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATCTT 318 -AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TT * * * * ** * 13011019 AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTCTTTGGAG 1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTAAAA * ** * * * * * 13011083 TAAAATATTACTAAACTAGTGATA-TTCTAAAATTAAAAAG-TAAGAGATTTAAAAAAAAAATAT 65 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A-GTTTATCGAATCAATTTAAATAAATATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATG 127 ATGTTTATCGAATCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * *** * * ** * 13011572 AACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTCATCATATAAGCCTATTCGGAGTAAAATAATAC 192 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC * * * * 13011637 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTATGAGATTTAAAAAATAAATCTGGTTA-CAGAAC 257 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AAC * * * 13011701 CATTTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATGATTATTTGAACAACTATATATTT 321 AAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTT--GAA-TA--ATTA--T------C----TATTT * * * * * * * * ** 13011759 CAAACCGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-AAGTTCACACAAGTTTATTTCA 1 -AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTAAA * * * * 13011823 A-AAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAAT 64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAAT * * * * * * * * * ** 13011885 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Indices: 13012255--13012592 Score: 411 Period size: 181 Copynumber: 1.9 Consensus size: 182 13012245 GTTGAAAAGA * * * * 13012255 AATTATTTTATGAGAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCTATG 1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCTATA * * * * 13012320 ATTATTTGAACTGATTCAGTAAGCT-GATTTATTTTTT-AAATCTC-TTATTTATTAA-TTTTTG 66 ACTATTTGAACTGATTCAGTAA-ATAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGATTT-TTAATTTTTTG 13012381 AAATAGT-AATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTAAAAC 129 -AAT-GTCAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTAAAAC * * * * * * 13012436 AATTGTTTTATGACAAAATAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTGAAATAG-TCAT 1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCT-AT * * 13012500 AACTATTTGAATTTG-TTCAGTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTTTTAATTTTTTT 65 AACTATTTGAA-CTGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGATTTTTAA-TTTTTT * 13012564 GAATGTCAATAAATTAGTATTATTTTATT 128 GAATGTCAATAAAGTAGTATTATTTTATT 13012593 CCAAATAAGC Statistics Matches: 132, Mismatches: 17, Indels: 14 0.81 0.10 0.09 Matches are distributed among these distances: 180 2 0.02 181 81 0.61 182 15 0.11 183 28 0.21 184 6 0.05 ACGTcount: A:0.38, C:0.06, G:0.12, T:0.45 Consensus pattern (182 bp): AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCTATA ACTATTTGAACTGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGATTTTTAATTTTTTGAA TGTCAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTAAAAC Found at i:13013088 original size:181 final size:181 Alignment explanation
Indices: 13012633--13013091 Score: 530 Period size: 182 Copynumber: 2.5 Consensus size: 181 13012623 ATTATATTAT * * * * * 13012633 TTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTTATATTATATTATTCAAAATAAGCTTGCATG 1 TTTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG * * * * * 13012698 AACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAA 65 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA * ** 13012763 ATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATATTTTTAGTTC 130 ATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAAATTCATATTTTTAAATC ** * * * * * * * 13012815 TCATACTCATTAGTTTTTAGTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATG 1 TTTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG ** * * * 13012880 AATTGAAACATTTGTTTTATTACAAAACAGAA-GGTCACAATGATTTGTAATAGATAATTATTCA 65 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AATGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA * * * 13012944 AATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTCAAG-AAA-AATATTTAT-TTTTTAAATC 129 AATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTC-AGTAAACAA-ATTCATATTTTTAAATC * ** 13012996 TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTACA 1 TTTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG * 13013061 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA 65 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA 13013092 AAGTCATAAC Statistics Matches: 225, Mismatches: 47, Indels: 12 0.79 0.17 0.04 Matches are distributed among these distances: 180 2 0.01 181 88 0.39 182 131 0.58 183 4 0.02 ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (181 bp): TTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA TAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAAATTCATATTTTTAAATC Found at i:13013750 original size:181 final size:178 Alignment explanation
Indices: 13013109--13013751 Score: 560 Period size: 181 Copynumber: 3.6 Consensus size: 178 13013099 AACAATTTTG * * * * * 13013109 TTTACTGAACTAATTCAAATAATTATGTCTATTT-AACAATTATCTATTTC-AATTGTTATTA-C 1 TTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC * * * * * * * 13013171 TTTTGTTTTGTTATAAAATAAATGTTTTTGT-TT-ATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATAT- 66 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAATAAT-TC ** * * * 13013233 TAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAACATAAATTT 127 TAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT * ** * * * * 13013282 GTTTGCCAAACCAATTCAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC 1 -TTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC * * *** ** * 13013347 CATTTG-TTTATCATAAAATTGTTTGTTTCTATTCATACAATATTATTCAGAATAAAGTAATGCT 65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAA-TAATTCT * * * * 13013411 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAGAAAATGT-ATCT 128 AATTTATTAATATTC-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-TAATCT * * * * 13013463 TTTAGCCT-AACCAATGCAAATAGTTATGACTGTTTTAACAATTATCTATTTGAAATTATTATGA 1 TTTA--CTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA ** ** * * * ** * 13013527 TGTTTCATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTTGTACAAGCTTATTCGGAATAACATAATTCT 64 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA-ATAATTCT 13013592 AATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT 128 AATTTATTAATATTCCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT * 13013644 ATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-AGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATA 1 -TTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG * 13013707 ACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCT 63 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCT 13013752 CTCTTTACCA Statistics Matches: 365, Mismatches: 80, Indels: 41 0.75 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 174 28 0.08 175 20 0.05 176 25 0.07 177 40 0.11 178 1 0.00 180 15 0.04 181 218 0.60 182 18 0.05 ACGTcount: A:0.38, C:0.10, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (178 bp): TTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATAATTCTAAT TTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT Found at i:13013852 original size:110 final size:110 Alignment explanation
Indices: 13013655--13013859 Score: 279 Period size: 110 Copynumber: 1.9 Consensus size: 110 13013645 TTTACTGAAC ** 13013655 AAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTG 1 AAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTTG * 13013720 TTATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTCTCTTTACCAAAT 66 TCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTCTCTTTACCAAAT * * * * ** 13013765 AAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAACCATTATCATTTTTTGTTTT 1 AAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTT ** 13013829 GTCATAAAGTAATTATTTT-TATTCATACAAG 65 GTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAG 13013860 TTTATTCGGG Statistics Matches: 82, Mismatches: 11, Indels: 4 0.85 0.11 0.04 Matches are distributed among these distances: 109 1 0.01 110 77 0.94 111 4 0.05 ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.07, T:0.46 Consensus pattern (110 bp): AAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTTG TCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTCTCTTTACCAAAT Found at i:13014137 original size:169 final size:169 Alignment explanation
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Indices: 13014784--13018965 Score: 2031 Period size: 362 Copynumber: 11.7 Consensus size: 360 13014774 AATTAATAAG * * * ** * * 13014784 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTCCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT 1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * ** * 13014848 CAATTTCAAATCGTTCTGACCATTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAATTCATACATGCTTA 65 CTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA * * * ** * * 13014913 TTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAAATAATAAG-GAAAGAATTTTAAAAA 128 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTT-AAAA *** * * * 13014977 ATAAATCCATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC 191 ATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC * * * * * * 13015042 ATTATGAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAACTATTTC-ATTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATA 256 ATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATTA * * * * * * ** 13015104 AAATAAT-TTCACTTTATTAATGTTTC-AAAATTGAGAAGTTGA 319 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13018230 TATTACGTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT-AGTGTAAGTTTGTTTGAAA-TAAAA 258 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACAAGCTTATTTCAAATTAAAA * * * 13018293 TAATACTAATTTATTAATATTTAGAGAATTAATCAA-TAAG 322 TAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAAT-AACTAAA * * * * * ** * * * * * 13018333 AGATTTTAAAAGTAAATCTATTTGCCAAACCATTTCGAATAGTTTTGACTGTTTGAATAATTATC 1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * ** 13018398 TATTTCAAATAGTTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTAT 66 TATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTAT *** * * * * * * 13018463 TTGGAATAAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTCAAAAACTTAACAACTAAGAA-AATTAAAAA 129 TCAAAATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTTTAAAAA-TTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAA * ** * * * * * 13018526 ATAAATCTAATTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTA-ATACTATATT-AACAATTATTTATTTCAA 191 ATAAATATGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAA ** * * * ** * * * 13018588 ATTGTTATGACCTTTTCTTTTCTTGTAAAACAATTGTTT-TGTTCGTACAAGCTTA-TT-ATGAT 253 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AAT * * * * 13018650 TAAGATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA 317 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAACTAA-A * * * * * * 13018696 A-ATGTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAA-TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTAT 1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * * ** ** * 13018759 CTATTTAAAATTGTTTTTACATTTTGTTTAGTCGTAAAATGATTGTCTCAGTTCACACAAGCTTA 65 CTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGTTCATACAAGCTTA * * * * * * 13018824 TT-AAGAATAAATTAGTAATAA-TTATTAACATTTGAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAA 128 TTCAA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-TAAA * * * * * 13018886 AATAAATCA-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACCATTTGAACAATTGTCTATTTAAAA 190 AATAAAT-ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA ** 13018950 TTGTTATAACCTTTTG 254 TCATTATAACCTTTTG 13018966 AGTTGTTTTT Statistics Matches: 2934, Mismatches: 661, Indels: 451 0.73 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 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Indices: 13047995--13049439 Score: 690 Period size: 177 Copynumber: 8.2 Consensus size: 174 13047985 AATCTAATAA * * * * * 13047995 TAAAAAATAAATGTGCTTTGCCAATCTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATT 1 TAAAAAATAAATATG-TTTGCCAAACTAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * * * 13048060 TCAAATCATTCTGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTTATATAAGCTTATTTGA 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGA * * 13048125 AAAAA-AATTCTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAGATT 129 AAAAACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATT * * * 13048170 TAAAAAAATAAATATGTTTGCTAAACAAGTACAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT 1 T-AAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * 13048235 TAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTTGT 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATAAAAGCTTATTTG- * * * 13048300 AATAAAACAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATT 128 AA-AAAACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATT * * * * * * * * 13048348 TAAAAAGTGAATCTATTTACCGAATTAGTTCAAATA-ATTAT-AGCTATTTCAACAATTATCTAT 1 TAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGA-TATGA-CTATTTGAACAATTATCTAT * * * * * * 13048411 TTCAAATCGTTATCAACTTTTATTTTGTCAAAAAATAATTGTTT--TTCATCATACAGCCTATTT 64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCAT-A-AAAGCTTATTT * ** * * 13048474 GAAATAACATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAATTTAGTAAGAGATT 127 GAAA-AA-ACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATT * * * * * * 13048524 TAAAAAATAAATCTATTT-----ACT-G---AAGTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTT 1 TAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTT * ** * * * * * * * * * 13048577 GAAATAATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATCGTTTCAGTTCATACAACCTTATTTGAA 66 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATAAAAGCTTATTTG-A * * * * * 13048642 ATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAATT 129 A-AAAACAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA--ATTAA-TAAGAGATT * * * * ** * ** ** 13048693 T-TAAAA-AAGTTTGTTTGCTAAAGAAGTTCAAACTA-TTAAAACTACATGAACAATTATCTATT 1 TAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAA-TAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT ** * * * * ** * 13048755 TCAAATTATTATGAACTTTT-TTTTGTTATAAAATAATCTTTTTAGTTTGTACAAGCTTATTTGA 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTG- * * * 13048819 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATT 128 AA-AAAACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG--A--GATT * * ** * * * * * * 13048871 TAAAAAAGTGAATCTACTTACCGAA-TCA-TTCTAATA-ATTATGACCATTTCAGCAATTATCTA 1 TAAAAAA-TAAATATGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGA-TATGACTATTTGAACAATTATCTA * * ** * * * ** 13048933 TTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTCAGTCATATAACAAATGTTTTTA-ATCATTCAAGCTTATT 63 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AAT-TGTTTAGTTCATAAAAGCTTATT * * * * * 13048997 TGGATAAAATAGTACTAATTTATTAATGTTTC-AAAAATTAATAGGTTAGTGATT 126 T-GAAAAAACAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAAATTAATA----AGAGATT * * *** * * * * 13049051 TAAAAAATAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAATA-ATTATAACTATTTGAACAATTGTATACT 1 TAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGA-TATGACTATTTGAACAATTATCTATT ** * * * ** * * * 13049115 TCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAAGTAATTCTA-TTTATACAAGATTATTTA 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TTGTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTT- * * * * ** * * * 13049179 GAATAACATAATACTAATCTAATAATATTCTGAAAATTTATAACTCAGA-G 127 GAA-AAAACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAA--GAGATT * * * ** ** * * 13049229 T-AAAAATAAATTTATTTGCTGAAA-TAGTTCAAATATTTAAAATTATGTGAACAATTATCTATT 1 TAAAAAATAAATATGTTTGC-CAAACTAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT * * * * * * * ** * 13049292 TCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTCAATTTATACTAGCTTATTCAG 65 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTAGTTCATAAAAGCTTATT-TG * * 13049356 AATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATT 128 AA-AAAACAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGAGATT * * * * 13049404 TGACAAAAAAAAATTTTGTTTGCCCAACTAATTCAA 1 T-A-AAAAATAAA-TATGTTTGCCAAACTAGTTCAA 13049440 TAATTATGAC Statistics Matches: 981, Mismatches: 216, Indels: 142 0.73 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 164 50 0.05 165 29 0.03 166 10 0.01 167 17 0.02 168 6 0.01 169 9 0.01 170 1 0.00 171 2 0.00 172 1 0.00 173 1 0.00 174 16 0.02 175 107 0.11 176 126 0.13 177 180 0.18 178 114 0.12 179 76 0.08 180 162 0.17 181 62 0.06 182 10 0.01 184 2 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (174 bp): TAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTT CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAA AAACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATT Found at i:13048298 original size:329 final size:327 Alignment explanation
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13055024 TGAT-TATATAAACTTGTTCAAT 505 -AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * ** 13055046 AAATAAATTTACTTTTTAAATCTCCTAC-CTATTAATTTTCAGAAT-ACTAATAAATTAGTATT- 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCT-CTGCTC-ATTAATTTTTTGAATGA-TAATAAATTAGTATTA * * * * 13055108 ATCTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAT-GATC-A 63 AT-TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAG-GCAA * * * ** * * * * * ** * 13055170 TATCTATTTGAAATAAATAATTATTGAAACAGTCATAGCTATTTGAACTTGCTTGATAAACAGAT 125 AAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACAT * * * * * 13055235 TTAGTTTTTAAGTCTTTTACTTTTTAATTTTTGGAATATTAATT-AACTACTATTATTTTATTTC 189 TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT-GAATATT-ATTAAATTAGTATTATTTTA--TC * * * * * * * * * * ** * * 13055299 GAATACGCTTTTATGA-ATAGAAATAGTTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATTACTCTTTCAA 246 CAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAACAATTTGAG * * * * * 13055363 ATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACA-TG-TTCAAAAAGCAGATTTATTTTTTA 309 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CTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAAC * * * * 13056545 T-AAAAACATT-TTTT-TCAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATA 439 TGAAACA-ATTGTTTTAT-GACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTAAAAT--ATAATTATTCAAA * * * * * * 13056607 TAGCCTTAAT-TATTTAAACTAGTTTGGC 499 TAGTC-AAATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * 13056635 AAATAAATTTATTTGTTAAATCTCTTAGCT-ATT-ATTTTCATT-AAT-ATTATTAGATTAGGAT 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-T-GCTCATTAATTTT--TTGAATGA-TAATAAATTAGTAT * * * ** * ** 13056696 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-CAAACATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA-ATGTTA 61 TAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAATA-GGCA * * * * * * * * * * ** * 13056759 TAACGATTTGAAATATAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAATTGGTTCGATAAACAGAT 124 AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACAT * ** * * 13056824 TTATTTTTTAAATTTCCTACTCATTGTTTTTTGAAAAATTA-AAAATTAGTATTATTTTATTCCA 189 TTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TCCA * * * * * * ** * 13056888 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TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGG-CAAAAT * * * * * 13057301 GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGATTCGACAAACACATTTAT 128 GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTAT * * * * * * * 13057366 TTTTTAGATGTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTATT-AGTTAAGCAATATTTTACTTCGAGTA 193 TTTTTA-A-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAATATTATTAAATT-AGTATTATTTTA--TCCAATA * * ** * 13057430 AGCTTGTATGA-ACAGAATCAATTGTTTTATGACAAAACAACA-ATCATAATGATTTGAGATTGA 251 AGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGATCATAACAATTTGAGATAGA ** * * * * * 13057493 TAATTGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAAA-T-AGTCTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCT 314 TAATTATTCAAATTGTCATAACTATTT-AAATTGATTC-A-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT * * * * 13057556 CTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAA-TTTTGTAT-AAA 376 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGTTTT-TATGAAC * ** * * 13057618 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA 439 T-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAA-GTCATAATGATTT-AAA-ATATAATTATTCAAA * * ** ** ** 13057683 TAGTCGTAA-CTATTTGTACTCATTCCAT 499 TAGTC-AAATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * * 13057711 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTCACTTATTAATTTTTAGAA-AATTAATAAATTTA-TATTA 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCT-GCTCATTAATTTTTTGAATGA-TAATAAA-TTAGTATTA * * * * * * * ** 13057774 TTTTATTTTAAATAAGCTTGCATG-----------TTGTTTTATGACAAAACAAA-AGATCATTA 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAG-GCAAAA * * * ** * * * 13057827 TGTTTTGAAATAGATAATTGTT-TAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTC 127 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATT- * * * 13057891 T-TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAA 190 TATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTT--ATCCA * * * * * * 13057955 ATAAGCTTATATGA-ACTAAAACAATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAA 248 ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTA-TGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGA * * * * ** * * 13058018 TAGATAATTACTT-AAATAGTCA-GACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA 310 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ATTCTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTGA-TAGATTCA-TTTTATTTTATTCCTAATA 191 ATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG-AATATT-ATTAAATT-AGTATTATTTTA-TCC-AATA * ** * * * * * 13058492 AGCTAGTATGAATTGAAAAC-TTTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA 251 AGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGA * * * * * * * * * * * 13058556 TAATTGTTTATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT 314 TAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGATTC-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT * ** * * * ** * 13058621 TAGTTATTAATTTTGAAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-T 378 TA-TTA--ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAACT * * * ** * * ** ** * * * 13058685 AGAAATAATTTTTTTATGA-TAGGCAAATGGGT-GTAACAATTTGATGTATACAATTGTTCATAT 440 -GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA--AGTCATAATGATTT-A-AAATATAATTATTCAAAT * * 13058748 AGTC-ATTACTAT-TCAAA-TTGGTTTGGT 500 AGTCAAAT-CTATAT-AAACTT-GTTCGGT * * * * * ** * * 13058775 AAATATA-TT-TTTTTAAAATATCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAAATTAATAAATGAGTATTAT 1 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AAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGG 284 AAAA-CAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGA * * ** * 13060783 TTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTTTTTG-AATTTTACCAAATTAG 348 TTC-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAG * * * * * * * 13060847 TATTA-TTTA---CAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGT 407 TATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GT * ** * * * * * 13060907 TATAACAATTGAAAATTGATAATTATTTAAATAGTCATAA-CTATTTGAAA-TGGTTGGGT 470 CATAATGATTTAAAA-T-ATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATAT-AAACTTGTTCGGT * * * * * * * 13060966 ACATAGA--T-TTGTTTAAATCTCT--T-TTTAA-TTCTTGAAATGATAATAAATTAGGATTATT 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTGCTCATTAATTTTTTG-AATGATAATAAATTAGTATTAAT * * * * * * * * * 13061024 TTATTTTGAATAAGTTTATATG--TTGAAAAACAATTGTTTTTTAACAAAACAAA-AGGTAATAA 65 TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATT--AAAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGGCAA-AA ** * * * * * * **** 13061086 CAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAATTGATTCAATAAACTA-ATT 127 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAAC-ACATT * * * *** 13061149 TATTTTTTTAAATCTCATTCTTATTAATTTTT---TA--AATAAAGTAGTATTATTCTATTTTGG 190 TA-TTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGAATATTATTAAATTAGTATTATT-T-TATCCA * * * * * ** * * 13061209 ACAAGCTTTTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAATGATTTTAAA 248 ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAGATCATAACAATTTGAGA * * * * 13061273 TAGATAATTACTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAA 310 TAGATAATTATTCAAATTGTCATAACT-ATTTAAATTGATTCA-TAAATAGATTTATTTTTT-AA * * ** * * * 13061337 TTCTCATGCTTGTTAATTTTTTG-AA-GCTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-TCTT 372 --ATC-T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGT-TT * * * * * * * * * 13061399 GTATAAACTAAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTA 431 TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT-AAA-ATATAATTA * * * * * * * 13061464 TTCTAATAGTCTTAA-CCATTTGAA-TTGGTTTGGC 493 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* * * 13061873 AATCTTTTGCTCATTCATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCT 371 AATC---T-CTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGTT * * * * * * * 13061936 TGTATGAAATGAAATAATTATTTTATGACTTAAAA-AAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAAT 430 TTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC--AAAACAAAAGTCATAATGATTT-AAA-ATATAAT * ** * * * * * 13062000 TGTTTTATTAGTCTTAA-CTATTTAAACTAGTTCGAT 491 TATTCAAATAGTC-AAATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * * ** * * 13062036 AAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTACTAA-TTTTTGAAATTTTATTAAATTAGCATTA 1 AAATAAATTTA-TTTTTTAAATC-TCTGCTCATTAATTTTTTG-AATGATAATAAATTAGTATTA * * ** ** * * * * * * * * * 13062100 TTTTAATCAAAATAAGCGAGTGTGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAATG-ATAA 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGGCAAAA ** * * * * * ** * * 13062163 CAATTTGAGATAGATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTACTTGAACTGTTTTGATAAATAGATTT 127 TGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTT * * * * * * * * * 13062227 AGTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATATATCAGTATTATTTTATTCTAGATCAT 191 ATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TCCA-ATAAG * * ** * * ** * * 13062292 TTTTTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAA-ATGTCATAATGATTTTAAATAGATA 253 CTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAACAATTTGAGATAGATA * * * * * * * * 13062356 ATTGTTCAAA-TGAACATGACAATTTGAACTTG-CTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCC 316 ATTATTCAAATTG-TCATAACTATTT-AAATTGATTC-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-C * * ** * 13062419 TACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA 377 T---TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAA * ** * * * * 13062482 -TATAAACAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGATCATAACT-ATGTGAAATAACTAATTGTTCAA 438 CT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TGATTTAAAAT-A-TAATTATTCAA * * * ** 13062545 ATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGCTCAAT 498 ATAGTCA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT ** * * * * * 13062574 AAA-CGATTTAATTTTTAAAATTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTA 1 AAATAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTGCTCATTAATTTTTTG-AATGA-TAATAAATTAGTATTA * * * * * * ** * * ** 13062636 TTTTATTTTGAATATGCTTTTATGAA-CAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAA-AGGTCATG 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGG-CAAA * * * * * * * **** * 13062699 A-GTTTTTAAAATAAATAATTGTTCAAATCGTCATAACTATTTGAAC-GTGTTCAAAAAACAAAT 126 ATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTG-GTTTGGCAAACACAT * * * * * ** * 13062762 TTGTTTTTAAAATTTTTTGCTTAATAATTTTTTAAATACAAATAAATTTA-TATTATTTTATTCA 189 TTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAA-TTTTTGAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTA-TC- * * * * * 13062826 AAATAAGCTTGTATGA-ATATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGCA 246 CAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTG-A * * * * * * * * 13062890 -ATAGATAATTATTTAAATAGTCACAAATATTTAAACTT-ATTCGGTAAACAGA-TCATATTTTA 308 GATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAA-TTGATTC-ATAAATAGATTTATTTTTTA * * * * * 13062952 AATCTCTTACTCAATAATTTTTTGGAATATTAATCAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTT 371 AATCTCTTA-T---TAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTT * * * * * ** * * 13063017 ATATGTACTGATATAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTC 431 TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTAAAAT--ATAATTA * * * 13063082 TTCAAATTA-CCATAAT-TAT-TTAAC-TGATTCAGT 493 TTCAAA-TAGTCA-AATCTATATAAACTTG-TTCGGT * * ** * * * * 13063115 AAACAAATTAATGGTTTAAATCTTTTTCTTATTAA-TTTTAGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTA 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATC-TCTGCTCATTAATTTTTTG-AATGA-TAATAAATTAGTATTA * * * * * * * ** * * 13063178 TTTTAATCCGTATAAACTTGTATTAACTT-AAACAATTGCTTTATGA-AAAACCAAA-AGGTCAT 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TTAAAATAATTATTTTATGACTAAA-CAAATAGG-CAA * * * * * ** * ** * ** * * 13063240 AGTGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACCT-TTTGATCTTATTCGATAAATAGAT 125 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-CTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACAT * * * * 13063304 TTATTTATTTAAATCTCTTTCCTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTT 189 TTATTT-TTTAAATCTC--T--TATTAA-TTTTTGAATATTATTAAATTAGTATT-ATTT-TATC * ** * * * * 13063369 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TATATAATTGCTCAAATGGCCATAAGTATTTGAACTAATTCGGTAAACTA-ATTTA-CTTTTAAA 310 TAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGATTC-ATAAA-TAGATTTATTTTTTAAA * * * 13064574 CCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT-TTTTATTTTGGATAAGCTTTTA 373 --TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTA * * * 13064638 TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTC 434 TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGA-TTTAAA-ATATAATTATTC * * * * * 13064703 AAATAATAATAAT-TATTTAAGCTTGTTTGGT 496 AAATAGTCA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * ** * * * 13064734 AAACATATTTATTTTGTCAAATCTCTTATTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAT 1 AAATAAATTTATTTT-TTAAATCTC-TGCTCATTAATTTTTTGAATGATAATAAATTAGTATTAA * * * * *** 13064799 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAA-AGGTTGAATG 64 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGGCAAAATG * * 13064863 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAATTGGTTTGGCAAACACATTTATT 129 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTATT * * * 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* * * * 13065336 TTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAATGAAATAATTATTTTATGACTTAAA-AAAAAGTCAAAAC 64 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGAC-TAAACAAATAGGCAAAAT * * * * * * ** * 13065400 GATTTGAAATAGATAATTGTTTTATTAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCGATAAACATATTTAT 128 GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTA- * * * * 13065465 TTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGAAATTTTATTAAATTAGCATTATTTTAATCAAAAT 192 TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATC-CAAT ** * * * * 13065530 AAGCGAGTGTGA-AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAATGATAACAATTTGAGATAGA 250 AAGCTTGTATGATAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACAATTTGAGATAGA * * * * * * * * * * 13065594 TAATTGTTTAAATAGTCATAACTACTTGAACTGTTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTT 314 TAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTG-ATTCATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT * * * * * * ** 13065659 TATTAATTTTTAAAATATTAATATA-TCAGTATTATTTTA-TTCTAGATCATTTTTTATGAGCAA 378 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGTTTTTATGAACTG * * * * 13065722 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* * * * ** * * * 13066123 AAAATAAATAATTGTTCAAATCGTCATAACTATTTGAACGTG-TTCAAAAAATAAATTTGTTTTT 306 GAGATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTT-AAATTGATTC-ATAAATAGATTTATTTTT * * * * ** * * * 13066187 AAAATTTTTGCTTAATAATTTTTTAAATACAAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGC 369 TAAA--TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-GTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGT * * * * ** * * 13066250 TTGTATGAA-TATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGCAATAGATAA 429 TTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT--AAAATATAA * * * * 13066314 TTATTTAAATAGTCACAA-ATATTTAAACTTATTCGGT 490 TTATTCAAATAGTCA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * * * * 13066351 AAACAGA-TCATATTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTTTTGGAAT-ATTAATCAATTAATATTA 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-TGCTCATTAATTTTTT-GAATGA-TAATAAATTAGTATTA * * * * * * * * * 13066414 TTTTATTTTGAATAAGTTTATATGTACTGATATAATTATTTTATGA-TGAAACAAA-AGGTCATA 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGACT-AAACAAATAGG-CAAA * * * * * * * ** * * 13066477 ATGATTTGAAATGGATAATTCTTCAAATTA-CCATAATTATTT-AACTGATTCAGTAAACAAATT 126 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA-TAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATT * ** * * * 13066540 AATGGTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGT 190 TATTTTTTAAATC----TCTTATTAATTTTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATCC-A * * * * *** * * 13066605 ATAAACTTGTAT--TAACTTAAACAATTGCTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAGTGATTTTAA 248 ATAAGCTTGTATGATAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAA-C-AAAGATCATAACAATTTGAG * * * * * * 13066667 ATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACCT-TTT-GATCTTATTCGATAAATAGATTTATTTATTT 309 ATAGATAATTATTCAAATTGTCATAA-CTATTTAAAT-TGATTC-ATAAATAGATTTATTT-TTT * * * * * 13066730 AAATCTCTTTCCTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCT 370 AAATCTC--T--TATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTT * * * * * * ** * * 13066794 TGTATGAACTGAAATAATTGCTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAAATAACT 430 TTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT-AAA-ATATAATT * * 13066859 ATT-ATAATATTGT-TAATC-ATATAAACTAGTTCGGT 492 ATTCA-AATA--GTCAAATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * * 13066894 AAACAAATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTATTAAATTTGTATTA 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-TGCTCATTAATTTTTTG-AATGA-TAATAAATTAGTATTA * * ** * * * * 13066957 TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAT-GGTCATAA 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGG-CAAAA * * * ** * ** * 13067020 TGATTTGAAATAGATAATCATTC-ATATAGTCTTAACTATTTAAAATGGTTCAGTAATTAGATTT 127 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTT * * * ** * 13067084 ATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA 191 ATTTTTTAA--ATC-T-CTTATTAA-TTTTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA--TCCAA ** * * * * * ** * 13067149 TAAAATAGTAT-A-AACAAAACTAATTGTTTGATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAAT 249 TAAGCTTGTATGATAA-AAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACAATTTGAGAT * * * * * ** * * 13067212 AGATCATTATT-AATATAGTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAAT 311 AGATAATTATTCAA-ATTGTCATAACTATTT-AAATTGATTCATAAATAGATTTATTTTTTAAAT * ** * * * 13067276 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* * * * * * 13067686 TAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAATAATTGTTTTATGACAGAATA-AAAGGTTATAACAATTTG 246 -CAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACA-AA-ACAAAGATCATAACAATTTG * * * * * * 13067749 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACCATTTAAACT-ATTTCGATAAACAGATTTA-TTTTT 307 AGATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGA-TTC-ATAAATAGATTTATTTTTT ** * * * * ** * 13067810 GGATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT 370 AAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTAT * * ** * ** 13067875 G--TTGAAAAACAATTGTTTTATGATATAAATGAAAGGCAATAATGATTTGAAATATATAATTGC 435 GAACTG--AAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGTC-ATAATGATTT-AAA-ATATAATTAT * * * * * ** 13067938 TCAAATGGCCATAA-GTATTTGAACTAATTCGGT 494 TCAAATAGTCA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * 13067971 AAACT-AATTTA-CTTTTAAACCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTAATAAAGTAGTATT 1 AAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTC-TGCTCATTAATTTTTTG-AATGA-TAATAAATTAGTATT * * * * * * * * * * * 13068032 -TTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTTCATA 62 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TTCAAATAGTC-AAATCTATATAAACTT-GTTCGGT * * * * 13072289 ACA-AAA--CA-----T--A--T-T--T-A-T--TTTTTT--AT--TATTAAATGAGTATT-ATC 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTGCTCATTAATTTTTTGAATGATAATAAATTAGTATTAAT- * ** * * * * * * * * * ** 13072330 TTAATCCAAATAAGCTTATATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TCATAACA 65 TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGGCAAAATG * * * * ** * * * * * 13072393 ATTTGAGATAGATAATTGTTC-AAGTAGTCATAACTATTTAAACTAATTCGGTAAGCA-AATTAA 129 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAA-TAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTAT * * * * * 13072456 TTTTT--ATCTCTTATTAA-TTTT-AAAAATATT-AA-TA-TATCAATTCTA---AATAA-TTTG 193 TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAATATTATTAAATTAGTAT-TATTTTATCCAATAAGCTT- * * * * ** * 13072510 GTATGAATAGAAAA-AACTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT 256 GTATG-ATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATT * * * * * * ** * * 13072574 ATTCAAATGGACATGACTATCTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATTTCTAACCT 319 ATTCAAATTGTCATAACTAT-TTAAATTGATTCATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCT--CTT * * * * ** * 13072639 ATTAGTTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAA-TAGA 379 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAACT-GA * * * * 13072702 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGT 442 AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAA-TGATTT-AAA-ATATAATTATTCAAATAGT * * * * * 13072766 CATAA-CTATTTGAGCTTGCTCAGT 503 CA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * 13072790 AAATAGATTTATTTTTT--A---------A--AA-----T--AT--TAATAAATTAGTATTATTT 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTGCTCATTAATTTTTTGAATGATAATAAATTAGTATTAATT * * ** * * 13072833 TGTT-TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAAT 66 TATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTAAACAAATAGG-CAAAAT * * * * ** * * 13072895 TATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTCAGAAAACAAATTTA 128 GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGGTTTGGCAAACACATTTA * * * * 13072959 -TTTTTAAATTTCTACTTGTTACTTTTTGTAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAAT 192 TTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTG-AATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTA-TC-CAAT * * * * ** * 13073022 AAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAG 250 AAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAACAATTTGAGATAG * * * * * 13073085 ATAATTGTTCAAA---T-A-GACT-TGT---TTG-GT-A-AACA-AG-TTCATTTTTTAAATCTC 313 ATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGATTCATAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTC * * * ** * 13073136 TTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAA 377 -T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAA ** ** * * 13073201 CTGATAA-AATTGTTTTAAAATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA 438 CTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT-AAA-ATATAATTATTCAAA * * * ** * 13073265 TAGTTATGA-CTATTTGGACTTGTTCGAT 499 TAGTCA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * * *** * * 13073293 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAAT-ATTAAGAAATTAATATTA 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATC-TCTGCTCATTAATTT-TTTGAATGA-TAATAAATTAGTATTA * * ** ** * * * * * * 13073356 TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTGTTTTATGA-AAACACAAAAAGTCATAA 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTATTTTATGACTAA-ACAAATAGGCAAAA * * * * * * ** * ** * * 13073420 CGATTTCAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATCTGATAAATATATTTA 127 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTA * * * * * ** 13073485 TTTTTTAAA--ACTT-TT-ATTTTTTAAT-TGT-TTGAAAATTTGTGTTATTTTGTTTGAAATAA 192 TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAATAT-TATT--AAATTAGTATTA-TTT-TATCCAATAA * ** * * * * * * 13073544 GCTTGTTTGAATAGCAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAATAGGTTATAGCGATTTGAAATAGAT 252 GCTTGTATG-ATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGATCATAACAATTTGAGATAGAT * * * * 13073608 AATTGTTCAAAATAGTCATAACTATTTAAATTTG-TTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTC 315 AATTATTC-AAATTGTCATAACTATTTAAA-TTGATTCA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC * ** * * * ** * 13073672 TTACTT-ATTAATT-AAATATTAATAGGGTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-T 377 TTA-TTAATT-TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAACT * * * * * * * 13073734 AGAAACAATTGGTTTGTGATAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTAGTAT-AAT 440 -GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTT-AAA-ATATAATTA-T-TCAAA * * * ** 13073798 TATTCAAA-CAATCATAAATATTTGCACTGGCT 499 TAGTCAAATCTAT-AT-AA-ACTTGTTC-GG-T ** * * * * * * 13073830 AGGGTAACCGATTCATTTTTTAAATTTGTTACTTATTAATTTTCAT-AAT-ATTAATAAATTAGT 1 A-AATAA---ATTTATTTTTTAAATCT-CTGCTCATTAATTTT-TTGAATGA-TAATAAATTAGT * * * * * * * * 13073893 ATTACTTTAGTCTGAATAAGATTGTATGAA-TAGAAAGAAATGTTTTATGA-TAAAACAAATTGT 59 ATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACT-AAACAAATAGG * * * * * * * * * * 13073956 CATAATAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGT-TAAACTAATTGAAGTAGTTTGGTAAACAA 122 CAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAC * * * * 13074020 ATTTATTTTTCTAACTCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT 187 ATTTATTTTT-TAA--ATC-T-CTTATTAATTTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-T * * * * * * * ** 13074085 CCAAACAAACTTATTTGAAAAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA 245 CC-AATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGA * * * * * * * * * * * * * * 13074150 AATCGATAATTATTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTGACAGACAAAATT-TTTTTTAA 308 GATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTT-AAATTGATTCATAAATAGATTTATTTTTTAA * * * * * ** 13074214 ATTTCTTATTGATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAGTTAC 372 A--TC-TCTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-GTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTT * * * * * * * * * * 13074278 TAAGATCTAAAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGT 432 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT-AAA-ATATAATTAT ** * * * * * * * 13074343 TCTTATAGCCTTAA-CTATTTGAACTGGTTCAGC 494 TCAAATAGTC-AAATCTATATAAACTTGTTCGGT * * *** * * 13074376 AAATAAATTTATTGTTTAAATCTCT-CAGTTATTAATTTTCAAAAT-ATTATTACATTAGTATTA 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTGC--TCATTAATTTTTTGAATGA-TAATAAATTAGTATTA * * ** ** * * * * 13074439 TTTTGTTCCCAATAAATTTGTATGAA-CAGAAATAATTGTTTTATGA-TAGAACAAA-AGGTTAT 63 ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTATTTTATGACTA-AACAAATAGG-CAA ** * * * * * * ** * * * 13074501 AACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTGGTTCAGTAAATAGATT 125 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* * * 13075690 ATAAGCATGCATGA-ACAAAATCAATTGTTTTATGGCCAAAA-AAATG-TCATAATATTTTGAAA 248 ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAA-GATCATAACAATTTGAGA * * ** * ** * * 13075752 TAGATAATTGTTCAGATAATCAT-A--ATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTTAAT 310 TAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTAAA-TTGATTCATAAATAGATTTA-TTTTTTAAA * * * * 13075814 TCTCTTACTCTTTAATTTTTTG-AATATTAAT-ATGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTGTA 373 TCTCTTA----TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAG-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTT * * * * * * * * 13075877 TATCAATTGAAATAATTATTTTATTATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTAT 432 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT-AAA-ATATAATTAT * * * * 13075942 TCAAATAATCATAA-CTATTTGAACTTCTTCGGT 494 TCAAATAGTCA-AATCTATATAAACTTGTTCGGT * * * * * * *** * * 13075975 AAACATA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAAT-ATTAATAAATTAATATTAT 1 AAATAAATTTATTTTTTAAATC-TCTGCTCATTAATTTTTTGAATGA-TAATAAATTAGTATTAA * * ** * * * * ** 13076038 TTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAAAGTCGTAA 64 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Indices: 13053449--13077867 Score: 2016 Period size: 721 Copynumber: 34.2 Consensus size: 710 13053439 TCAACAAATG * * 13053449 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTT-AT 1 AATTTA-TTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA- * * * * * * * * 13053513 TCCAAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAGTTATTTTATAATAGAATA-AAAGGTTATAACAGTT 60 TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACA-AA-ACAAAGATCATAACAATT * * * * * *** * * 13053576 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATAGATTTAATTTT 122 TAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGG-TTCAAAAATAAATTTACTTTT * * * * * * * * * * 13053641 TAAATCTCTTA-TTA--ATTCTTGA-AATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCA 185 TAAATATCCTACCTACTATT-TTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAACT * * * * * * * * * 13053702 TGTATG-TTGAAAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAGT 249 TGTATGAAT-AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAATAAT * * * * ** * * * * 13053766 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CTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGAT 247 CTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAAT * * ** * * * * * ** 13058023 AATTACTT-AAATAGTCAGA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTT 310 AATTA-TTCAAACAGTCAAAGCTAGCTAAACTTGCTTGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTAC * * * * * * * * * * 13058086 TACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGATCT-GATTATGCTTGTATGAA 374 TACTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAA * * * * * * * * * * * * 13058150 CAAAAACT-ATTGTTTTATAATAGAACAAAATGTCAT-AATGATTTGAAATA-AAAAAATGCTT- 438 TAGAAA-TAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAATA-G-TTC * * * * * * * * 13058211 AAATAGTCATAACTA-TTAGAACTTGTTTGATAAA-TAGATATACTTTCTAAA-T-CT-CTTATT 499 AAATAGTCATAACTATTTA-AACATG-TTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACTACTTATT * * ** * * * * * ** 13058271 AATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTTTTTTTTATTTTGAACAAACTTTTATGGGCAA-AAA 562 AATTTTTGGAATA-TA-TAAATTA-TA--TTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTAT-GAAAAGAAA * * * * * ** * 13058335 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TATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAACAATTTGAAACAAATAATTA * * * * * * * * * * 13058741 TTCATATAGTCATTA-CTA-TTCAAA-TTGGTTTGGTAAATATATTT--TTTTAAAATAT-CTTA 315 TTCAAACAGTCA-AAGCTAGCT-AAACTT-GCTTGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTAC-TA * * * * * * * * 13058800 CTTATTAATTTTTGAAAAATTAA-TAAATGAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG-ATA 376 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAACT-ACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT- * * * * ** * * * * 13058863 AAAAATAATT-GTTAAATGACCAAACAAAAGGTAAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGCTAAAA 439 AGAAATAATTGGTT-TATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAATAGTTCAAA * * *** * * * 13058926 TAGTCATAATTATTTAAA-TTGATTTGTTAAA-CAGATTCACTTTTTAAA-T-C-ACTTATTAAT 502 TAGTCATAACTATTTAAACATG--TTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACTACTTATTAAT * * * * * * ** * 13058986 TTTTGAAACATTAATAAACTAGTATT-ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT 565 TTTTGGAATA-T-ATAAATTA-TATTAATTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATT * * * * * ** 13059050 ATTTTATGATAAAATAAAA-GGTCATAATGATTTTAAATA-A-AATTTTTTTCTAATAGTTGTAA 626 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A-AATTATTCTAATAGTTTTAA-CTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCT 308 ATAATTATTCAAACAG-TCAAAGCTAGCTAAACTTGCTTGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCT * *** * * * * * 13059518 -CTTACTTATTAATTTTCATAATATT-ATTAAATTAGTATT-ATTT-TTAACTGAATGCA-CTTC 372 AC-TACTCATTAATTTTTGGAATATTAATT-AACTACTATTAATTTATT-TC-GAAT-AAGCTTG * * * * * ** * * 13059578 TATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATCGATAATCA 432 TATGAATAGAAATAATTGGTTTATGAC-AAAAGAAAAGGGCATAAATATTTCAAATAGATAAT-A * * * * * * * * * * ** 13059643 -TTCAAGTGGTCAGAATTATTTTAAC-TGAGTCAGTAAA-TATATGTT-TTTTTAAAATTTTTCA 495 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATG-TTCA-AAAAGCACAT-TTATTTTTTAAATTACT-A * * * * * * * * * * * * 13059704 TTTAATAA-TTTAGAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTC-CATCTAAACTTGTATTAAC 556 CTTATTAATTTTTG-GAATA-T-ATAAATT-ATATTAATTTAATCTGA-ATAAGCTTGTATGAAA * ** * * * * ** * * ** 13059767 TGAAATAATTACTTTATGACAAATCAAAA-GGTTATAACAATTTTAAATAGACAATTGCTCAAAT 616 AGAAATAATTGTTTTATGATAAA-AAAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT * * * * 13059831 AATAATAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAA-A 680 AGTCATAACTATTTGAACTT-TTTGGTAAACA * * * * 13059862 AGATTTATTTTTTAAAATCTCGTTCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTACTAATTT- 1 A-ATTTA-TTTTT-AAA--TC--TCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTC * * * * * * * * * * 13059926 ATTCTAAATAAGTTTGTATGA-ACTAAAACAATTATTTTTTAACTAAACAAAAAGGTCATAACTA 59 A-TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAGATCATAACAA * * * * * * * * * * * * * 13059990 TTTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCAGGAAATGAATTTATTT 120 TTTAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGGTTCA-AAAATAAATTTACTT * * * * * * * * * * * 13060055 TTTAAATGTCTTA-TTAAT-TTTTGA-AATATTATTAAATTAATATTAT-TTGAATAT-GAATAA 183 TTTAAATATCCTACCTACTATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTT--ATTTCAAATAA * ** * * * ** * ** * * 13060115 GCTTGTACAAACA-AAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGAT 246 ACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAACAAAT * * * * ** ** * * * * ** * * * 13060178 TATCATTCATATAGTTTTAA-CTATTTGAACTAG-TTCAGCAATTAGATTTA-TTTTTTAATTTT 310 AATTATTCAAACAG-TCAAAGCTAGCTAAACTTGCTTGA-TAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTA ** * * * * * * ** * * 13060240 CTTGGTTATTAAGTTTTGGAATA-TAATAAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAGTATA 373 C-TACTCATTAATTTTTGGAATATTAAT-TAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATG * * * ** * * * 13060304 AACA-AAATCAATT-GTTTGATGATAAAATAAAAGGTTAT-AATGATTTGAAAGAGTTAATTA-T 436 AATAGAAAT-AATTGGTTT-ATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAA-TAGT * * * **** * * * 13060365 TCAAATAGTCAAAACCATTTGAA-ATGGTTTGGTAAGCAGATTTACTTTTTAAATCT-CTTACTG 497 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACAT-GTTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAAT-TAC-TACTT * * ** * * * * * 13060428 ATTAATTTTCT-AAATATTGATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAACAAACTTATATTAACAA-A 559 ATTAATTTT-TGGAATA-T-ATAAATTA-TATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGA * *** * * 13060491 AATAATTGTTTTATGACAAAGTTATATTAAA-AAAAAGAATTGTTTTATGACAAAACAATAAGCA 619 AATAATTGTTTTATGATAAA---A-A--AAATAGTCATAA-TG-ATT-TG-----A-AAT-AG-- ** * * * * 13060555 ATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTTAT-AA-TTATTTGGTTCAATAAA 666 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AATTATTCAAACAGTCA-AAGCTAGCT-AAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCT * * * * * ** * * * * 13060986 -CT--T-TTTAATTCTTGAAATGA-TAATAAATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAGTTTATATG 372 ACTACTCATTAATTTTTGGAAT-ATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATG * * * * * * * ** * * 13061046 -TTGAAAAACAATTGTTTTTTAACAAAACAAAAGGTAATAACA-ATTTGAAATAGATAGTTA-TT 436 AAT-AGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAA-ATATTTCAAATAGATA-ATAGTT * * * * * 13061108 CAAAT-GGCTATAATTATTTGAA-TTGATTCAATAAA-CTA-ATTTATTTTTTTAAATCT-CATT 498 CAAATAGTC-ATAACTATTTAAACATG-TTCAA-AAAGC-ACATTTA-TTTTTTAAAT-TAC-TA * * * * * * * * 13061168 CTTATTAATTTTT----TAAATAAAGTAGTATT-ATTCTATTTTGGACAAGCTTTTATGAACTA- 556 CTTATTAATTTTTGGAATATATAAATTA-TATTAATT-TAATCTGAATAAGCTTGTATGAA-AAG * * * * 13061227 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-AGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTACTCAAATA 618 AAATAATTGTTTTATGATAAAA-AAAATA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA * ** * 13061291 GTCATAACTAATTGAACTTGTTCAGTAAATA 681 GTCATAACTATTTGAACTT-TTTGGTAAACA * * * ** ** 13061322 GATTTATTTTTTCAATTCTCATGCTTGTTAATTTTTTGAA-GCTAATAAATTAGTATTATTTT-A 1 AATTTA-TTTTT-AA--ATC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA * * * * * * * * ** 13061385 TTCCAAATAATCTTGTAT-A-AACTAAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGAT 60 -TCCATATAAGCTTGTATGATAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAAT * * * * * * * * *** * * * 13061448 TTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTT 121 TTAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGG-TTCAAAAATAAATTTACTTT * * * * * * * * * 13061513 TTAAATCT-CT-CATTAAT-TTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTAT-TT-TTATCTGAATAG 184 TTAAATATCCTAC-CTACTATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATT-TC-AAATAA * * * * * * * * *** 13061572 GCTTGTATGATTAAAAATAGTTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATTGATA 246 ACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAATA * * * * * * * * 13061636 TTTGTGT-AAATATTCATAA-CTA-CTTGAA-TTGGTTTGGA-AAATAGTTTTAGTTTTTAAATC 311 ATTAT-TCAAACAGTCA-AAGCTAGC-TAAACTT-GCTT-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAATC * * * * ** * * * * 13061696 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TTCAAAATAAGCTTGTATGA-ATATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATT 60 -TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATT ** * * * * * * * ** * * * 13062886 TGCAATAGATAATTATTTAAATAGTCACAAATATTTAAACTT-ATTCGGTAAACAGA-TCA-TAT 122 TAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAA-TTGGTTC-AAAAATAAATTTACT-T * * * ** * * * * * ** 13062948 TTTAAATCTCTTA-CTCAATAATTTTTTGGAATATTAATCAATTAATATTATTTTATTTTGAATA 183 TTTAAATATCCTACCT-ACT-A-TTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATA ** * * * ** * ** *** 13063012 AGTTTATATGTACT-GATATAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGA 245 AACTTGTATG-AATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAA * * * * * * * * * * * 13063076 TAATTCTTCAAATTA-CCATAA-TTA-TTTAAC-TGATTCAGTAAACA-AATTAATGGTTTAAAT 309 TAATTATTCAAA-CAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTTGA-TAAACAGATTTAGT-TTTTAAAT ** * * * * * * * * * * * * 13063136 CTTTTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGTATAAACTTGTAT 370 CTACTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTAT * * * * * * * * * * 13063201 TAACT-TAAACAATTGCTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCAT-AGTGATTTTAAATAGACAATTGT 435 GAA-TAGAAATAATTGGTTTATGACAAAA-GAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAATAGT * * * * * * * * * 13063263 TCAAATAGTAATAACCT-TTTGATCTTATTCGATAAA-TAGATTTATTTATTTAAATCT-CTTTC 497 TCAAATAGTCATAA-CTATTTAAACATGTTC-AAAAAGCACATTTATTT-TTTAAAT-TAC-TAC * * * * * ** 13063325 CTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA 557 TTATTAATTTTTGGAAT-AT-ATAAATTA-TATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGA * * * * ** * * * 13063390 AATAATTGCTTTATGACTAAATAAAA-GGTCAGAACAATTTGAAATAAATAACTATT-ATAATAT 619 AATAATTGTTTTATGA-TAAAAAAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAG ** * * * * 13063453 TGTTAA-TCATATAAACTAGTTCGGTAAACA 682 TCATAACT-ATTTGAACT-TTTTGGTAAACA * * * * 13063483 AATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAT 1 AATTTAT-TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCAT * * * ** * 13063548 CCAAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTG 61 CCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GATCATAACAATTTA * * * * * * * * 13063611 AAATAGATAA-TCATTCATATAGTCTTAACTATTTAAAATGGTTCAGTAATTAGATTTA-TCTTT 124 AAATAGATAATTC-TTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGGTTCA-AAAATAAATTTACT-TTT * * * *** * * * * * * * * * 13063674 TAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAAT 185 TAAATATCCTACCTACT-ATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAACT * * * * * * * ** * * * 13063739 AGTATAAACA-AAACTAATTGTTTGATAACAAAACAAAA-AGTTATAATGATTTGAAATAGATCA 249 TGTATGAATAGAAA-TAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAACAAATAA * * ** * * * * 13063802 TTATT-AATATAGTCAAAACTATTTGAAA-TAGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCT-CT 312 TTATTCAA-ACAGTCAAAGCTAGCT-AAACTTGCTTGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTAC- * * * * * * ** * ** * 13063864 TATTGATTAATTTTCT-AAATATTAA-TAAATCAGTACT-ATTTATTTTAAACAAATTTATATGA 374 TACTCATTAATTTT-TGGAATATTAATTAACT-ACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA * * * * * * * ** * * 13063926 ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAAT-AATGATTTGAAATAGATGATTA-TTCA 437 ATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGAT-AATAGTTCA * * * 13063989 AATAGTTATAATTATTTAAAC-TGATTTGATAAATAG-A-A-TTA-TTTTTAAATCT-CTTACTT 500 AATAGTCATAACTATTTAAACATG--TTCA-AAA-AGCACATTTATTTTTTAAAT-TAC-TACTT * * * * * * * * ** 13064048 ATTAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCCGAATAAACTTGTATGAGCTA-AA 559 ATTAATTTTTGGAATA-T-ATAAATTA-TATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGA-AAAGAA * * * ** * * * 13064112 ATAATTGTTTTATGACAACACAAAA-GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTC 620 ATAATTGTTTTATGATAA-AAAAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * * *** * 13064176 TTAACTGTTTGAAATGGTTCAATAAACG 684 ATAACTATTTGAACT-TTTTGGTAAACA * * * * * 13064204 AATTTATTTTTTATATCTCTTAATTACGAATTTTCATAATATTATTAAATTAGTGTTATTTT-AT 1 AATTTA-TTTTTAAATCTCTT-ATT---AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA- * * * * * * * * 13064268 TCTAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAACAATTT 60 TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTT * * * * * * ** * * * 13064332 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACCATTTAAACTATTTCGATAAACAGATTTA-TTTTT 123 AAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGGTTC-AAAAATAAATTTACTTTTT ** * * * * * * 13064394 GGATCTCTTA-CTA--ATTCTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT 186 AAATATCCTACCTACTATT-TTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAACTT * * * * * ** * ** * * * 13064455 GTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGATATAAATGAAAG-GCAATAATGATTTGCAATATATAA 250 GTATGAAT-AGAAATAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGATC-ATAACAATTTGAAACAAATAA ** ** * ** * ** * * * 13064518 TTGCTCAAATGGCCATAAG-TATTTGAAC-TAATTCGGTAAACTA-ATTTA-CTTTTAAACCT-C 312 TTATTCAAACAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTT-GATAAAC-AGATTTAGTTTTTAAATCTAC * * * * * * * * * 13064578 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT-TTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA 374 -TACTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA * * * ** * * 13064642 CT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT-AATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAA 438 -TAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAATAGTTCAA * * * * * *** * * * 13064705 ATAATAATAATTATTTAAGCTTGTTTGGTAAA-CATATTTATTTTGTCAAATCT-CTTATTTATT 501 ATAGTCATAACTATTTAAACATG-TTCAAAAAGCACATTTATTTT-TTAAAT-TAC-TACTTATT * * * * ** * 13064768 AATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAA 562 AATTTTTGGAAT-AT-ATAAATTA-TATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAA * * * * * * 13064833 TTATTTTATAACTAAACAAAA-GGT--TGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTA 624 TTGTTTTATGA-TAAAAAAAATAGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA * * 13064895 ACCATTTGAA-TTGGTTTGGCAAACA 687 ACTATTTGAACTT--TTTGGTAAACA * * * * * * 13064920 CATTTATTTTTTAAATCTCTCATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCTGA 1 AATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCATC-CA * * * * * * * * * 13064985 -ATAGGCTTGTATGATTAAAAATAGTTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATT 64 TATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACAATTTAAAATA * * *** * ** ** * * 13065049 GATATTTGTGT-AAATATTCATAACTACTTGAATTGGTTTGGAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATC 129 GATAATTCT-TCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGG-TTCAAAAATAAATTTACTTTTTAAATA * * * * * ** * * ** * * 13065113 TCTTGCTTATTAATTTT-TGAAATACTAATAGGGTAGTATTATTTTATTTTC-GATAAGTTTTTT 191 TCCTACCTACT-ATTTTCAG-AATACTAATAAAGTAGTATTATCTTA-TTTCAAATAAACTTGTA * * * * * * * * * 13065176 TGAACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAACGACTTT-AAATAGATAATTAT 253 TGAA-TAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC-AATTTGAAACAAATAATTAT * * * * * * * ** * 13065239 T-TAATAGTCAAATCTA-TTCGAATTTG-TTCAATAAACAGATTTAGTTTTTTAAATCTTTTGCT 316 TCAAACAGTCAAAGCTAGCT-AAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAG-TTTTTAAATCTACTACT * * * * * * * * 13065301 CATTCATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAA-ATG 378 CATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATA-G ** * * * * ** * 13065364 AAATAATTATTTTATGACTTAAAA-AAAA-GTCA-AAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTTATT 441 AAATAATTGGTTTATGAC--AAAAGAAAAGGGCATAAA-TATTTCAAATAGATAATAGTTCAAAT * * * ** * 13065426 AGTCTTAACTATTTAAAC-TAGTTCGATAAA-CATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTACTAA 503 AGTCATAACTATTTAAACAT-GTTC-AAAAAGCACATTTA-TTTTTTAAAT-TACTACTTATTAA * * * * ** ** * * 13065489 TTTTTGAAATTTTATTAAATTAGCATTATTTTAATCAAAATAAGCGAGTGTGAAAAGAAACAATT 564 TTTTTGGAA-TATA-TAAATTA-TATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATT * * ** * * * 13065554 GTTTTATGACAAAATAAAA-A-TGATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACT 626 GTTTTATGATAAAA-AAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT * * * 13065617 ACTTGAACTGTTTTGATAAATA 690 ATTTGAACT-TTTTGGTAAACA * * * * * 13065639 GATTTAGTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATATATCAGTATTATTTT-ATTCTA 1 AATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA-TCCA * * ** * ** * * ** * 13065703 GATCATTTTTTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAA-ATGTCATAATGATTTTAAA 64 TATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAACAATTTAAAA * * * * * * ** * * * 13065767 TAGATAATTGTTCAAATGAACATGACAATTTGAACTT-GCTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA 127 TAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TT-AAATTGGTTC-AAAAATAAATTTACTTTTTAAA * * * * * 13065831 TCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTATTTCAAATAAACTTGTA 189 TATCCTACCTACT-ATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAACTTGTA * * * ** * * * * * * 13065895 TGAATATAAACAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGATCATAACTATGTGAAATAACTAATTGTTC 253 TGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTC * ** * ** * ** * 13065960 AAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGCTCAATAAAC-GATTTAATTTTTAAAAT-TTTTACTTAT 318 AAACAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTTGATAAACAGATTTAGTTTTT-AAATCTACTACTCAT * * * * * * * * * * 13066022 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATGAACAGAAACA 381 TAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATA * * * * * * * * * 13066087 ATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCATGAGTTTTTAAAATAAATAATTGTTCAAATCGTCATAA 446 ATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAATATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAA * * ** * * * ** * * ** 13066152 CTATTTGAACGTGTTCAAAAAATAAATTTGTTTTTAAAATTTTTGCTTAATAATTTTTTAAATAC 511 CTATTTAAACATGTTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACTACTTATTAATTTTTGGAAT-- * * * ** * * * * * 13066217 AAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTATTTTATGACAA 574 ATATAAA-TTATATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTATGATAA * * ** * * * * * 13066282 AACAAAA-GGTTATAACAATTTGCAATAGATAATTATTTAAATAGTCACAAATATTTAAACTTAT 638 AA-AAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-T * 13066346 TCGGTAAACA 701 TTGGTAAACA * * ** * * 13066356 GA-TCATATTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTTTTGGAATATTAATCAATTAATATTATTTT-A 1 AATTTAT-TTTTAAATCTCTTA-T---TAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA ** * * ** * * * ** * ** 13066419 T-TTTGAATAAGTTTATATG-TACTGATATAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGAT 60 TCCAT--ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAAT * * * * * * * * * * * 13066482 TTGAAATGGATAATTCTTCAAAT-TACCATAATTATTTAACTGATTCAGTAAACAAA-TTAATGG 121 TTAAAATAGATAATTCTTCAAATGGA-CATAACTATTAAATTGGTTCA-AAAATAAATTTACT-T * ** * * * * * * * * ** 13066545 TTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTT-AGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGTATAA 183 TTTAAATATCCTACCTACT-ATTTTCAG-AATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAA * * * ** * *** * * * 13066609 ACTTGTATTAACT-TAAACAATTGCTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAGTGATTTTAAATAGA 246 ACTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAA * * * * * ** * * * * * 13066672 CAATTGTTCAAATAGTAATAACCT-TTTGATCTT-ATTCGATAAATAGATTTATTTATTTAAATC 309 TAATTATTCAAACAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAGTT-TTTAAATC * * * * * * * 13066735 T-CT-TTCCTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTA 371 TACTACT-C-ATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTA * * * * * * * 13066798 TGAACT-GAAATAATTGCTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAACA-ATTTGAAATAAATAACTA- 434 TGAA-TAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAA-ATATTTCAAATAGATAA-TAG * ** * ** * * 13066860 TT-ATAATATTGTTAA-TCATATAAAC-TAGTTCGGTAAA-CAAATTTATATTTTAAATCT-CTT 496 TTCA-AATAGTCATAACT-ATTTAAACAT-GTTC-AAAAAGCACATTTATTTTTTAAAT-TAC-T * * * ** 13066920 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACA 555 ACTTATTAATTTTTGGAATA-TA-TAAA-TTATATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA-A * * * * * * 13066985 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ATTTGAACTT--TTTGGTAAACA ** * * *** 13068512 GTTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATACTAATAGGGTAGTATTATTTT-AT 1 AATTTA-TTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA- * * * * * ** * * * * * 13068576 TTTC-GATAAGTTTTTTTGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAACGACT 60 -TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAAC-AAT * * * * * * * * * 13068639 TT-AAATAGATAATTATT-TAATAGTCA-AATCTATTCGAATTTGTTCAATAAACAGATTTAGTT 121 TTAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAA-CTATT-AAATTGGTTCAA-AAATAAATTTACTT * * ** * ** ** * * 13068701 TTTTAA-ATCTTTTGCTCATTCATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAAT 183 TTTAAATATC-CTACCT-ACT-ATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTC-AAAT * * * * * 13068764 AAGCTTGTATGAA-ATGAAATAATTATTTTATGGCTTAAAA-AAAAG-TCAAAACGATTTGAAAT 244 AAACTTGTATGAATA-GAAATAATTATTTTATGAC--AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAAC * * ** ** * ** * * * 13068826 AGATAATTGTTTTATTAGTCTTAA-CTATTTAAACTAG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTTAA 306 AAATAATTATTCAAACAGTC-AAAGCTAGCTAAACTTGCTT-GATAAACAGATTTA-GTTTTTAA ** * * * * * * * * * 13068889 ATCTTTTACTTACTAATTTTTGAAAT-TTTATTAAATTAGC-ATTATTTTA-ATCAAAATAAGCG 368 ATCTACTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATT-AACTA-CTATTAATTTATTTC-GAATAAGCT * * * * * * ** * * 13068951 AGTGTGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAATG-ATAACA-ATTTGAGATAGATAAT 430 TGTATGAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAA-ATATTTCAAATAGATAAT * * * * * * * * * * 13069014 TGTTTAAATAGTCATAACTACTTGAAC-TGTTTTGATAAA-TAGATTTAGTTTTTAAA-T-CT-T 494 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATG--TTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACTAC ** * * * ** * * 13069074 TTATTAATTTTTAAAATAT-TAATATATCAGTATTATTTTATTCT-AGATCATTTTTTATGAGCA 557 TTATTAATTTTTGGAATATATAA-AT-T-A-TATTAATTTAATCTGA-ATAAGCTTGTATGA-AA * * * * * * 13069137 A-AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT 616 AGAAATAATTGTTTTATGATAAAA-AAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT * * * * * 13069200 -GAACATGACAATTTGAACTTGCTCGGTAAACA 680 AG-TCATAACTATTTGAACTT-TTTGGTAAACA * * 13069232 GATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-AT 1 AATTTA-TTTTTAAATCT-CT---TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA- * * * * * * * 13069295 TTCAAATAAACTTGTATGA-ATATAAACAATTGTTTTATGATGAAATA-AAAGATCATAACTATG 60 TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGA-CAAA-ACAAAGATCATAACAATT * * * * * * ** * 13069358 TGAAATA-ACTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GCTCAATAAA-CGATTTAATT 122 TAAAATAGA-TAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TT-AAATTGGTTCAA-AAATAAATTTACTT ** * * * * * * ** 13069420 TTTAAA-ATTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA 183 TTTAAATA-TCCTACCTACT-ATTTTCAG-AATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATA ** * * * ** * * * *** * * 13069483 TGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCATGAGTTTTTAAAATAAAT 245 AACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAAT * ** * * * * * * 13069548 AATTGTTCAAATC-GTCATAA-CTATTTGAACGTG-TTCAAAAAATAAATTT-GTTTTTAAAAT- 310 AATTATTCAAA-CAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAGTTTTT-AAATC ** * * * ** ** * * * * 13069608 TTTTGCTTAATAATTTTTTAAATACAAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTA 371 TACTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAA-CTACTATTAATTTATTTC-GAATAAGCTTGTA * * * ** * ** 13069671 TGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACA-ATTTGC-AATAGATAATTA- 434 TGAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAA-ATATTT-CAAATAGATAA-TAG * * * * * ** * * * 13069733 TTTAAATAGTCACAAATATTTAAACTTATTCGGTAAA-CAGA-TCATATTTTAAATCT-CTTACT 496 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTC-AAAAAGCACATTTATTTTTTAAAT-TAC-TACT * * * * * * * * * ** 13069795 CAATAATTTTTTGGAATATTAATCAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTTATATGTACTGA 558 TATTAA-TTTTTGGAATA-T-ATAAATT-ATATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGA * * * * * * 13069860 TATAATTATTTTATGATGAAACAAAA-GGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTCTTCAAATTA- 619 AATAATTGTTTTATGAT-AAAAAAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAG * * * ** 13069923 CCATAATTATTT-AACTGATTCAGTAAACA 682 TCATAACTATTTGAACT-TTTTGGTAAACA * * * 13069952 AATTAATGGTTTAAATCTTTTTCTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA 1 AATTTAT-TTTTAAATC----TCTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA * * * * * *** 13070016 TCCGTATAAACTTGTAT--TAACTTAAACAATTGCTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAGTGAT 60 TCCATATAAGCTTGTATGATAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAA-C-AAAGATCATAACAAT * * * * ** ** * * * 13070078 TTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTA-ATAACCT-TTTGATCTTATTCGATAAATAGATTTATT 121 TTAAAATAGATAATTCTTCAAAT-GGACATAA-CTATTAAAT-TGGTTC-AAAAATAAATTTACT * * * * ** ** * ** 13070141 TATTTAAATCTCTTTCCTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAAT-TTATTTTGAAT 182 T-TTTAAATATCCTACCTACT-ATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATT-ATCTTATTTCAAAT * ** * * * * * 13070205 AAGCTTGTATGAACT-GAAATAATTGCTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAA 244 AAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAA * * * * * * * 13070269 ATAACTATT-ATAATATTGT-TAATCATA--TAAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTA-TATTTTA 308 ATAATTATTCA-AACA--GTCAAAGC-TAGCTAAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAGT-TTTTA * * * ** * * * * 13070328 AATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATTAAATTTGTATTATTTTAATCCAAATAAGCT 367 AATCTAC-TACTCATTAATTTTTGGAATATTAATT-AACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCT * * ** * * * * 13070391 TGTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAAT 430 TGTATGAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAAT * * ** ** * * * * * 13070454 CA-TTCATATAGTCTTAACTATTTAAA-ATGGTTCAGTAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTG 494 -AGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACAT-GTTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTAC-TA * * * * * ** * 13070517 GTTATTAAGTTTCGGAATATTATTAAATTAGTATT-ATTTTATTTCGAATAAAAATAGTAT-AAA 556 CTTATTAATTTTTGGAATA-TA-TAAATTA-TATTAATTTAATCT-GAAT-AAGCTTGTATGAAA * * * * * 13070580 CA-AAACTAATTGTTTGATAACAAAACAAAA-AGTTATAATGATTTGAAATAGATCATTATT-AA 616 -AGAAA-TAATTGTTTTATGATAAAA-AAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA * * * 13070642 TATAGTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGGTAAACA 678 -ATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTTGGTAAACA * * * 13070677 GATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATCAGTACTA-TTT-A 1 AATTTA-TTTTTAAATCTC---TT-ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA ** * * ** * * * * ** 13070739 TTTTAAACAAATTTATATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAATAATGATT 60 -TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACAATT * * * * ** * * * * * 13070803 TGAAATAGATGATTATTCAAATAGTTATAATTATTTAAACTGATTTGATAAATAGAA-TTA-TTT 122 TAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTG-GTTCAAAAATA-AATTTACTTT * * * * * * * * * * * * 13070866 TTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGA-AATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCCGAATAAA 184 TTAAATATCCTACCTACT--ATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAA * * * * * * 13070930 CTTGTATGAGCTA-AAATAATTGTTTTATGACAACACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA 247 CTTGTATGA-ATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAATA * * * * * * * * * * 13070994 ATTGTTTATATAGTCTTAA-CT-GTTTGAAA--TGGTTCAATAAAC-GAATTTATTTTTTATATC 311 ATTATTCAAACAGTC-AAAGCTAG-CT-AAACTTGCTT-GATAAACAG-ATTTAGTTTTTAAATC * * ** *** * * * * * * 13071054 T-CTTAATTACGAATTTTCATAATATT-ATTAAATTAGTGTTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGT 371 TAC-TACTCATTAATTTTTGGAATATTAATT-AACTACTATTAATTTATTTC-GAATAAGCTTGT * * * ** * * 13071116 ATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTTATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGT 433 ATGAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAA-ATATTTCAAATAGATAATAGT * * * ** 13071180 TCAAATAGTC--AACCATTTAAACTAT-TTCGATAAA-CAGATTTA-TTTTTGGA-T-CT-CTTA 497 TCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-ATGTTC-AAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACTACTTA * * * * * * * ** 13071237 CTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTGAA-AA 560 TTAATTTTTGGAATA-T-ATAAATTA-TATTAATTTAATCT-GAATAAGCTTGTATG-AAAAGAA * ** * * * ** * * 13071300 ACAATTGTTTTATGATATAAATGAA-AGGCAATAATGATTTGCAATATATAATTGCTCAAATGGC 620 ATAATTGTTTTATGATA-AAAAAAATAGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT * * * * 13071364 CATAAGTATTTGAACTAATTCGGTAAACT 683 CATAACTATTTGAACT-TTTTGGTAAACA * * * 13071393 AATTTACTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT-TTTT-AT- 1 AATTTATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCATC ** * ** * * 13071455 TTTGGATAAGCTTTTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTT 62 CAT--ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTT * * * * * * * *** * * 13071519 TAAATAGATAATTGTTCAAAT-AATAATAATTATTTAAGCTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTT 123 AAAATAGATAATTCTTCAAATGGA-CATAACTA-TTAA-ATTGGTTCAAAAATAAATTTACTTTT * * ** * ** ** * * 13071582 GTCAAATCTCTTATTTATTAATTTTTTGAATGTTAAT-AAGTTAGTATTATTTTA-TTCTGAATA 185 -T-AAATATCCTACCTACT-ATTTTCAGAATACTAATAAAG-TAGTATTATCTTATTTC-AAATA * * * * * ** * * 13071645 AGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGT--TGAATGATTTGAAATAG 245 AACTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAT-AACAATTTGAAACAA * * * * ** * * * * * * * 13071707 ATAATTATTCTAATAGTCTTAA-CCATTTGAA-TTGATTCAGCAAGCACATTTATTTTTTAAATC 308 ATAATTATTCAAACAGTC-AAAGCTAGCTAAACTTGCTTGA-TAAACAGATTTAGTTTTTAAATC * * * * * * * 13071770 T-CTTGCTTATTAATTTTTGAAAAATT-ATTAAATTAGTATTATTTTTATTT-GAATAAGCTTGT 371 TAC-TACTCATTAATTTTTGGAATATTAATT-AACTACTATTA-ATTTATTTCGAATAAGCTTGT * * ** ** *** * * * * * 13071832 ATG-TTCAAAAATAATTTTTTTATGACAAAATG--AAGATCATAGGGATTTGAGATTGATATTTG 433 ATGAAT-AGAAATAATTGGTTTATGACAAAA-GAAAAGGGCATAAATATTTCAAATAGATAATAG * ** * * * * * 13071894 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TTAAAATAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGGTTC-A-AAAATAAATTTACTT * * * 13072304 TTT---T-T--TA--T--TA---T-----TA--AAT---G-AGTATTATCTTAATCCAAATAAGC 183 TTTAAATATCCTACCTACTATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAAC * * * * * * * * 13072345 TTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAAT 248 TTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAATAAT * ** ** ** * * * * 13072409 TGTTCAAGTAGTCATAA-CTATTTAAAC-TAATTCGGTAAGCA-AATTAATTTTT--ATCT-CT- 313 TATTCAAACAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTACTA * * * * 13072467 -T-ATTAA-TTTT--AAAAAT-ATTAA-TA-TATCAATTCTA-----AATAA-TTTGGTATGAAT 376 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATT-TATTTCGAATAAGCTT-GTATGAAT * * * * * * * 13072518 AGAAAAAACTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAA 439 AGAAATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAAT-ATTTCAAATAGATAA-TAGTTCAAA * * * * * * *** * * * * * 13072581 TGGACATGACTATCTGAACTTGTTTGGTAAA-TAAATTTATTTTTTAAATTTCTAACCTATTAGT 502 TAGTCATAACTATTTAAACATG-TTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACT-ACTTATTAAT * * * * * * * * 13072645 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAGAAACAATT 565 TTTTGGAATA-T-ATAAATTA-TATTAATTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATT * * * * * 13072709 GTTTTATGACAAAACAAAA-AATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAAC 626 GTTTTATGATAAAA-AAAATAGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC * * 13072772 TATTTGAGC---TTGCT---C- 689 TATTTGAACTTTTTGGTAAACA * ** * ** * 13072787 -A-GTA--AATAGA--T-TTA-T--TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGA- 1 AATTTATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-CATCCAT * * * ** * 13072841 ATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTGAAAT 65 ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTAAAAT * * * * * 13072905 AGATAGTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACA-T-GTTCAGAAAACAAATTTA-TTTTTAAA 128 AGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TT-AA-ATTGGTTCA-AAAATAAATTTACTTTTTAAA * * ** * * * * * 13072967 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ATTTTATGACT-AAACAAAT-GATTAGAACAATTTGAAATACATAATTATTCTAATAGTCTTAAC 626 GTTTTATGA-TAAAAAAAATAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC * * 13074894 TACTTGAA-TTGTTTGGCAAACA 689 TATTTGAACTT-TTTGGTAAACA * * * * * * * * 13074916 CATTTATTTTTTAAATC-CTTATTAATTTTTAGAATACT-ATAATTTAGCAATATTTTACTTCGA 1 AATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-CATCCA * * * * * * 13074979 -ATAAGCTTCTATGAATAGAAATA-AA-TGTTTTAGGACAAAACAAAGATCATACCAATTTTAGA 64 TATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACAATTTAAAA * * * * * * * * 13075041 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAAA-AGAA-TTAGTTTTTAA 127 TAGATAATTCTTCAAATGGACATAACTA-TTAAATTGGTTC-A-AAAATA-AATTTACTTTTTAA * * * * * * * * * * * ** 13075104 ATCTCTTA-TTAAT-TTTTGA-AATAGTAATAAATTAGTATTTTTTTA-AT-GAATAATTTTGTA 188 ATATCCTACCTACTATTTTCAGAATACTAATAAAGTAGTATTATCTTATTTCAAATAAACTTGTA * * * 13075164 TGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAAACATATAA-TAGT 253 TGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAACAAATAATTA-T ** * * ** * * * * * * 13075227 TCAAATGGAC-ATGACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTAATTTTTTAAATCTTA-AAC-C 316 TCAAACAGTCAAAG-CTAGCTAAACTTGCTTGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATC-TACTACTC * * * * * 13075289 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATCAA-CTTGTATGAATAGA 379 -ATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAATAGA * * * ** ** * * * * 13075353 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTC 442 AATAATTGGTTTATGACAAAAGAAAAGGGCATAAATATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATAGTC * * * *** * * 13075418 ATAA-TAATTTGAACCCTTTTGGTAAA-CAAATTTA-TTTTTAAATT--TACGTATTAATTTTT- 507 ATAACT-ATTT-AAACATGTTCAAAAAGCACATTTATTTTTTAAATTACTACTTATTAATTTTTG * * * * * 13075477 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTTTGAAAAGAAACAATTGGTTTA 570 GAATA-T-ATAAATTA-TATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTA * * * ** * 13075542 TAATAAAACAAATGGTCATAACCATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAA 632 TGATAAAAAAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * 13075607 CATCTTTAGAAAATA 697 C-TTTTTGGTAAACA * * * ** 13075622 GATTTATTTTTAAAATTTTTTCCTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-AT 1 AATTTATTTTT-AAA---TCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTCA- ** * * * * * * * 13075685 TTGAAATAAGCATGCATGA-ACAAAATCAATTGTTTTATGGCCAAAA-AAATG-TCATAATATTT 60 TCCATATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAA-GATCATAACAATT * * * * * *** * * * 13075747 TGAAATAGATAATTGTTCAGAT-AATCATAA-T-TTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTT 122 TAAAATAGATAATTCTTCAAATGGA-CATAACTATTAAA-TTGGTTCAAAAATAAATTTACTTTT * * ** * * * 13075809 TTAAT-TCTCTTACTCT-TTAATTTTTTGAATATTAAT-ATGTTAGTATTATTTTATTTCAAAT- 185 TAAATATC-C-TAC-CTACT-ATTTTCAGAATACTAATAAAG-TAGTATTATCTTATTTCAAATA * * * * * * * * ** * * 13075870 AAGTGTATATCAATTGAAATAATTATTTTATTATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGA 245 AACT-TGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAACAAA * * ** * * * * 13075935 TAATTATTCAAATAATCATAA-CTATTTGAACTT-CTTCGGTAAACATA-TTATTTTTTAAATCT 309 TAATTATTCAAACAGTCA-AAGCTAGCTAAACTTGCTT-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCT ** * * *** * * * * * * 13075997 TTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGA 372 ACTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATTAACTACTATTAATTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA * * * * * * * * * * * * 13076062 ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAAGTCGTAACA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCA 437 ATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAA-GAAAAGGGCATAA-ATATTTCAAATAGATAATAGTTCA * * * ** * ** * * ** 13076126 AATAGTTATAACGATTTGAATTTATTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA 500 AATAGTCATAACTATTTAAACATGTTC-AAAAAGCACATTTATTTTTTAAAT-TACTACTTATTA * * * * * ** * * 13076190 ATTGTCT-CAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAA 563 ATT-TTTGGAATA-T-ATAAA-TTATATTAATTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAA ** * * * ** * *** * * * * 13076254 TCATTTTATAACAAAACAAACGGTTATAGCCATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAT 624 TTGTTTTATGATAAAAAAAATAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC * * * 13076319 TATTTAAACTTGTTCGGTAAATA 689 TATTTGAACTT-TTTGGTAAACA * * * * 13076342 GATTAATTTTTGAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAACA-TAGTATTAGTTT-A 1 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C-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATG * *** * * * * * 13060485 AACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAGTTATA-TTAAAAAAA 316 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAAT * *** * ** * * * * * * 13060526 AGAATTGTTTTATGACAA---AAC-AATAAG-CAATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAAT 1 A-ATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAAT-AGTC-ATAACTATTTGAACT-GGT--TCGGT-AAAC *** * * * 13060586 AGTTATAATTATTTGGTTCAATAAATAGAATTA-TTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGA 58 A--TAT--TTATTT--TT---TAAAT-CTCTTACTTAT-T-AA--T-TT--TT-GAAA-TATT-A * * * * 13060650 A-ATATTAATAATTTAGTTTTATTCTATTCCTAATAAGCTTGTATGAGCTAAAA-TAATTGTTTT 103 ATAAATTAAT-A-TTA-TTTTATTC---T--GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACT-ATTGTTTT * * * * * * * 13060713 ATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG-TTCATATAGTCTTAACTATTTG 159 ATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATTAG * * * * * * ** 13060777 AACTGGTTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTTTTTG-AATTTTACCA 222 AACTTGTTTGATAAACAGA-TTACTTTTTAAATCTC----TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA ** * * * * * * * 13060841 AATTAGTATTA-TTTA---CAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAA 281 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA * * 13060902 AAGGTTATAAC 346 AAGGTCATAAT * * * * * * 13060913 AA-TTGAAAATTGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTGGGT--ACATA--GA 1 AATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTA * ** * 13060973 TTTGTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTCTTGAAATGA-TAATAAATTAGGATTATTTTATTTTGA 65 TTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGA * * *** * * * ** 13061033 ATAAGTTTATATGTTGAAAAACAATTGTTTTTTAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA 128 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATA * * * * * ** * 13061098 GATAGTT-ATTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAA-TTGATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTTA 192 GATAATTGCTT-AAATAGTC-ATAACTATTAGAACTTG-TTTGATAAAC-AGA-TTA-CTTTTTA * * * * * * 13061159 AATCTCATTCTTATTAATTTTT----TA--AATAAAGTAGTATTATTCTATTTTGGACAAGCTTT 251 AA--TC--TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTG * * 13061218 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TTTTTAAAATTTTTTGCTTAATAATTTTTTAAATACAAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAAT 65 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAAT * * * * * * ** * 13062830 AAGCTTGTATGAATATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGCAATAGA 130 AAGCTTGTATGAACAAAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGA ** * * * * * * 13062895 TAATTATTTAAATAGTCACAAATATTTA-AACTTATTCGGTAAACAGATCA-TATTTTAAATCTC 194 TAATTGCTTAAATAGTCATAACTA-TTAGAACTTGTTTGATAAACAGATTACT-TTTTAAATCTC * * * ** * * 13062958 TTACTCAATAATTTTTTGGAATATTAATCAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTTATATGT 257 TTA-T---TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGA ** * * * ** 13063023 ACTGATATAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAAT 317 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT * * * * * * * * * 13063063 GATTTGAAATGGATAATTCTTCAAATTA-CCATAATTATTT-AACTGATTCAGTAAACAAATTAA 1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTA ** * * * * * * * 13063126 TGGTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGTAT 65 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAAT * * ** * * * * * 13063191 AAACTTGTATTAACTTAAACAATTGCTTTATGAA-AAACCAAAAGGTCATAGTGATTTTAAATAG 130 AAGCTTGTATGAACAAAAACTATTGTTTTAT-AACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAG * * * * * * * * 13063255 ACAATTG-TTCAAATAGTAATAACCT-TTTGATCTTATTCGATAAATAGATTTATTTATTTAAAT 193 ATAATTGCTT-AAATAGTCATAA-CTATTAGAACTTGTTTGATAAACAGA-TTACTT-TTTAAAT * * * 13063318 CTCTTTCCTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTA 254 CTC--T--TATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTA ** * * * * * * 13063382 TGAACTGAAATAATTGCTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAAC 314 TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT * * * * ** * * * * 13063425 AATTTGAAATAAATAACTATT-ATAATATTGTTAA-TCATATAAACTAGTTCGGTAAACAAATTT 1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTT * * ** * ** 13063488 ATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCCAAA 64 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAA * * * * 13063553 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* * ** * * 13066298 AATTTGCAATAGATAATTATTTAAATAGTCACAAATATTTAAACTTATTCGGTAAACAGA-TCAT 1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTAT * * * * * * 13066362 ATTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTTTTGGAATATTAATCAATTAATATTATTTTATTTTGAAT 66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAAT * * * ** * * * ** * 13066427 AAGTTTATATGTACTGATA-TAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGG 130 AAGCTTGTATGAACAAAAACT-ATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAG * * * * * * * * 13066491 ATAATT-CTTCAAATTA-CCATAATTATT-TAAC-TGATTCAGTAAACAAATTAATGGTTTAAAT 193 ATAATTGCTT-AAA-TAGTCATAACTATTAGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTACT-TTTTAAAT * * ** * 13066552 CTTTTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGTATAAACTTGTAT 254 C----TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT * ** * * 13066617 TAACTTAAACAATTGCTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAGT 315 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAAT * * * * * ** * * * 13066659 GATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACCT-TTTGATCTTATTCGATAAATAGATTTA 1 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* * * 13074460 ATGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAAC 313 ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT * * * * * * 13074504 AATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTGGTTCAGTAAATAGATTTA- 1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTAT * * 13074568 TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAAT 66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-GAAT * * * * * 13074632 AGGATTGTATG-ATAAAAA-TAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAG 130 AAGCTTGTATGAACAAAAACT-ATTGTTTTATAACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAG * ** * * ** * * 13074695 AT-AGTAATTCAAATGGTCATAATTATTTCAAC-TGATTTGATAAATAGATTTA-TTTCTTTAAT 193 ATAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATTAGAACTTG-TTTGATAAACAGA-TTACTTT-TTAAAT * * * * * * * * 13074757 TTCTTGCTT-ATTATTT-AAATGTTAATAAAATAATATTA-TTTATTTTGAATAAGCATGTATAA 254 CTCTT-ATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGA *** * * * * * * * 13074819 ATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAATGATTAGAAC 317 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A-AATTATTCTAATAGTTC-TAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAATAAATTTAT * * * * 13072121 TTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT 1 TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT * * * * * * * * 13072186 AAGCTTGTATAAACTAAAATAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATGG 66 AAGCTTGTATGAACTGAAACAAATATTTTATGA-TAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAAT-- * 13072250 ATAATTATTCTAATAGT 128 AAAATTATTCTAATAGT 13072267 CTTAATTATT Statistics Matches: 12120, Mismatches: 2739, Indels: 1872 0.72 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 169 13 0.00 170 105 0.01 171 22 0.00 172 6 0.00 173 12 0.00 174 291 0.02 175 311 0.03 176 781 0.06 177 821 0.07 178 352 0.03 179 868 0.07 180 3307 0.27 181 3154 0.26 182 1545 0.13 183 276 0.02 184 25 0.00 185 33 0.00 186 37 0.00 187 22 0.00 188 16 0.00 189 25 0.00 190 7 0.00 191 11 0.00 193 1 0.00 194 1 0.00 196 7 0.00 197 3 0.00 198 11 0.00 199 2 0.00 200 12 0.00 201 5 0.00 202 17 0.00 203 11 0.00 204 4 0.00 205 4 0.00 206 2 0.00 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* * * * * * * 13060881 AATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAA-CAATTGAAAATTGATAATTATTTAAATAGTCAT 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * * * 13060945 AACTATTTGAAATGGTTGGGTACATAGA-TT-TGTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTCTTGAAAT 65 AACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT * * * * * * * * * 13061004 GA-TAATAAATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAGTTTATATG-TTGAAAAACAATTGTTTTTTA 130 -ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATG * * * * * * 13061067 ACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAA- 193 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAAC * * 13061130 TTGATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTTAAATCTCATT-CTTATTAATTTTT----TA--AATA 257 TT-ATTCGATAAAC-AGA-TTA-TATTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA * * * * * * * 13061187 AAGTAGTATTATTCTATTTTGGACAAGCTTTTATGAACTAAAAC 317 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * ** 13061231 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTACTCAAATAGTCAT 1 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AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC 317 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * * * 13064831 AATTATTTTATAACT-AAACAAAAGGT--TGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT 1 AATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * * * 13064893 TAACCATTTGAATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC-T-C--ATTAATTTTTGAA 64 TAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA * * * * * * * 13064954 ATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATAGGCTTGTATGATTAAAAATAGTTGTTTTAT 128 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * 13065018 GAGAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATTGATATTTGTGT-AAATATTCATAACTACTTGAA 192 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * 13065081 -TTGGTTTGGA-AAATAG-TTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATACTAATA 256 CTT--ATTCGATAAACAGATTATA--TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA *** * * * * 13065143 GGGTAGTATTATTTTATTTTCG-ATAAGTTTTTTTGAACTGAAAC 317 AATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * * * 13065187 AATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAACGACTTT-AAATAGATAATTATT-TAATAGTCA- 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * ** * * * * 13065249 AATCTATTCGAATTTG-TTCAATAAACAGATTTAGTTTTTTAAATCTTTTGCTCATTCATTTTTT 65 AA-CTATTTGAA-CTGATTCGGTAAACAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTT * * * 13065313 G-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-ATGAAATAATTATTT 125 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTT * ** * * 13065376 TATGACTTAAAA-AAAA-GTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTTATTAGTCTTAACTATT 189 TATGAC--AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * 13065439 TAAAC-TAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGAAATTTTA 252 TGAACTTA-TTCGATAAACAGA-TTA-TATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA * * * ** ** * ** 13065503 TTAAATTAGCATTATTTTAATCAAAATAAGCGAGTGTGAAAAGAAAC 314 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * * ** * * 13065550 AATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATGATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATA 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * * 13065614 ACTACTTGAACTGTTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAAAAT 66 ACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT * * * * ** * ** * * * 13065675 ATTAATATATCAGTATTATTTTATTCTAGATCATTTTTTATGAGCAAAAACAATTATTTTATAAC 130 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC * * * * * * 13065740 AAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-GAACATGACAATTTGAACTT 195 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTT ** * * * * 13065804 GCTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTA 259 ATTCGATAAACAGA-TTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA * * * 13065868 GTATTA-TTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAA-TATAAAC 322 GTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAC * * * * 13065906 AATTGTTTTATGATGAAATAAAAGATCATAACT-ATGTGAAATA-ACTAATTGTTCAAATAGTCA 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCA * ** * 13065969 TAACTATTTGAACTTG-CTCAATAAAC-GATTTAATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG 64 TAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTT-ATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * * 13066031 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTA 126 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA * * * * * * 13066096 TGACAAAATAAAAGGTCATGA-GTTTTTAAAATAAATAATTGTTCAAATCGTCATAACTATTTGA 191 TGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * * * * * * ** 13066160 ACGTGTTCAAAAAATAAATT-TGTTTTTAAAAT-TTTTGCTTAATAATTTTTTAAATACAAATAA 255 ACTTATTCGATAAACAGATTAT-ATTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA ** * 13066223 ATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAA-TATAAAC 318 A-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAC * * * ** * * * * 13066266 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGCAATAGATAATTATTTAAATAGTCACA 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * * * 13066331 AATATTTAAACTTATTCGGTAAACAGA-TCATATTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTTTTGGAA 66 ACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAA * * * * * * * * * * 13066395 TATTAATCAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTTATATGTACT-GATATAATTATTTTATG 129 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTGTTTTATG ** * * * * * 13066459 ATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTCTTCAAATTA-CCATAATTATTT-AAC 193 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAAC * * * * * 13066522 TGATTC-AGTAAACAAATTA-ATGGTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAA 257 TTATTCGA-TAAACAGATTATAT--TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA * * * * * * 13066585 TTAGTATTATTTTAATCCGTATAAACTTGTATTAACTTAAAC 319 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * * * 13066627 AATTGCTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAGTGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAAT 1 AATTGTTTTATGATAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * * 13066691 AACCT-TTTGATCTTATTCGATAAATAGATTTATTTATTTAAATCTCTTTCCTATTAATTTTTTG 65 AA-CTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTA-TT-TTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTG * * * * * * 13066755 -AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAATAATTGCTTT 126 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTT * * * * * * * * ** * 13066818 ATGACTAAATAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAAATAACTATT-ATAATATTGTTAA-TCATAT 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACT-ATTT * * * * 13066881 AAAC-TAGTTCGGTAAACAAATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT 253 GAACTTA-TTCGATAAACAGA-TTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT * * ** * * 13066945 AAATTTGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAA 316 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * ** * * 13066989 AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTA 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * ** * * ** * * * 13067054 ACTATTTAAAATGGTTCAGTAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCGGAAT 66 ACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT * * ** * * * * * 13067119 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAAATAGTATAAACA-AAACTAATTGTTTGATA 130 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATG * * * * * * 13067182 ACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATCATTATT-AATATAGTCAAAACTATTTGAA- 193 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAAC * * * 13067245 ATAGTTTGGTAAACAGATT-TACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAATA 257 TTA-TTCGATAAACAGATTATA--TTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATA * * * * * ** * ** 13067307 AATCAGTACTA-TTTATTTTAAACAAATTTATATGAACAAAAAC 317 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * * * * 13067350 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATGATTATTCAAATAGTTATA 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * * * 13067415 ATTATTTAAACTGATTTGATAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATA 66 ACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA * * ** * * * 13067480 TTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCCGAATAAACTTGTATGAGCTA-AAATAATTGTTTTATGAC 131 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGAC * * * * * * * ** 13067544 AACACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTCTTAACTGTTTGAAATGG 195 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA * * * * ** * * 13067609 TTCAATAAAC-GAATTTATTTTTTATATCTCTTAATTACGAA-TTTTCATAATATTATTAAATTA 260 TTCGATAAACAG-A-TTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA * * * * 13067672 GTGTTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAAT 322 GTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAC * * * * ** 13067711 AATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--A 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * ** * 13067774 ACCATTTAAACT-ATTTCGATAAACAGATTTATTTTTGGATCTCTTAC----TAATTCTTGAAAT 66 ACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT * * * 13067834 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATG 130 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATG * ** * * * * * * 13067897 ATATAAATGAAAGG-CAATAATGATTTGAAATATATAATTGCTCAAATGGCCATAAGTATTTGAA 193 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TAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-T * * * * ** * * * 13070713 -AAATATTAATAAATCAGTACTA-TTTATTTTAAACAAATTTATATGAACAAAAACAATTGTTTT 125 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT * * * * * * * * * 13070776 ATGATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATGATTATTCAAATAGTTATAATTATTTAA 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * 13070841 ACTGATTTGATAAATAGAATTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAACAAA 255 ACTTATTCGATAAACAG-ATTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA * * * * * * 13070905 TTAGTTTTATTTTATTCCGAATAAACTTGTATGAGCTAAAAT 319 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC * * ** * * * 13070947 AATTGTTTTATGACAACACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTCTTA 1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * ** * * ** * 13071012 ACTGTTTGAAATGGTTCAATAAAC-GAATTTATTTTTTATATCTCTTAATTACGAA-TTTTCATA 66 ACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAG-ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-A * * * * 13071075 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Indices: 13083939--13084140 Score: 81 Period size: 28 Copynumber: 7.4 Consensus size: 28 13083929 GTATCTTATG * * 13083939 TATTTATTATTTATTTATTTATTATTAC 1 TATTTATTATATATATATTTATTATTAC * ** 13083967 TATTTATTA-ATATATATTTATTTTTTT 1 TATTTATTATATATATATTTATTATTAC * 13083994 TATTTTATCTGT-TA-ATATTTA-TA-TA- 1 TA-TTTAT-TATATATATATTTATTATTAC * 13084019 TATTTATCTAT-T-TATA--TATTATTAA 1 TATTTAT-TATATATATATTTATTATTAC * * * 13084044 AATTTA-TATATATTTATCTATT-TATA- 1 TATTTATTATATATATATTTATTAT-TAC * * * 13084070 TATTATAATATATATGTATTTATTATTATT 1 TATT-TATTATATATATATTTATTATTA-C * * 13084100 TATCTATTTATATATTATAATTTATCTATTAT 1 TATTTA-TTATATA-TAT-ATTTAT-TATTAC 13084132 TATTT-TTAT 1 TATTTATTAT 13084141 TTATCTGTTA Statistics Matches: 135, Mismatches: 18, Indels: 40 0.70 0.09 0.21 Matches are distributed among these distances: 22 2 0.01 23 5 0.04 24 15 0.11 25 10 0.07 26 5 0.04 27 24 0.18 28 37 0.27 29 6 0.04 30 13 0.10 31 2 0.01 32 11 0.08 33 5 0.04 ACGTcount: A:0.33, C:0.03, G:0.01, T:0.63 Consensus pattern (28 bp): TATTTATTATATATATATTTATTATTAC Found at i:13084017 original size:36 final size:36 Alignment explanation
Indices: 13083900--13084156 Score: 91 Period size: 35 Copynumber: 7.2 Consensus size: 36 13083890 TTTGTATTTT * * * 13083900 ATATTTATAT-TTATATTTTATTTTATTTTGTATCTTA 1 ATATTTATATATT-TATTTT-TTTTATTTTATCTATTA * * 13083937 TGTATTTAT-TATTTA-TTTATTTATTATTA-CTATT- 1 -ATATTTATATATTTATTTTTTTTATT-TTATCTATTA * 13083971 -TATTAATATATATTTATTTTTTTTATTTTATCTGTTA 1 ATATT--TATATATTTATTTTTTTTATTTTATCTATTA * 13084008 ATATTTATATA--TATTTATCTATTTA-TATAT-TATTA 1 ATATTTATATATTTATTT-T-T-TTTATTTTATCTATTA * * 13084043 AAATTTATATA--TATTTATCTATTTA-TATAT-TA-TA 1 ATATTTATATATTTATTT-T-T-TTTATTTTATCTATTA * * * * 13084077 ATATATATGTATTTATTATTATTTATCTATTTATATATT- 1 ATATTTATATATTTATT-TT-TTT-TAT-TTTATCTATTA * * * 13084116 ATAATTTATCTA-TTATTATTTTTA-TTTATCTGTTA 1 AT-ATTTATATATTTATTTTTTTTATTTTATCTATTA 13084151 ATATTT 1 ATATTT 13084157 TATTTATCTA Statistics Matches: 175, Mismatches: 22, Indels: 48 0.71 0.09 0.20 Matches are distributed among these distances: 32 4 0.02 34 30 0.17 35 58 0.33 36 37 0.21 37 11 0.06 38 18 0.10 39 9 0.05 40 8 0.05 ACGTcount: A:0.32, C:0.03, G:0.02, T:0.63 Consensus pattern (36 bp): ATATTTATATATTTATTTTTTTTATTTTATCTATTA Found at i:13084031 original size:42 final size:39 Alignment explanation
Indices: 13083939--13084117 Score: 102 Period size: 42 Copynumber: 4.5 Consensus size: 39 13083929 GTATCTTATG * 13083939 TATTTATTA-TTTATTTATTTATTATTACTATTTATTAA 1 TATTTATTATTTTATTTATTTATTATTAATATTTATTAA * * * 13083977 TATATATTTATTTTTTTTATTTTATCTGTTAATATTTA-T-A 1 TATTTA-TTATTTTATTTA-TTTAT-TATTAATATTTATTAA * * * * 13084017 TATAT-TTA-TCTATTTATATATTATTAAAATTTA-TATA 1 TATTTATTATTTTATTTATTTATTATTAATATTTATTA-A * * * * 13084054 TATTTATCTA-TTTATATATTATAATATATATGTATTTATTAT 1 TATTTAT-TATTTTATTTATT-TATTAT-TA-ATATTTATTAA 13084096 TATTTATCTATTTATATATTAT 1 TATTTAT-TATTT-TAT-TTAT 13084118 AATTTATCTA Statistics Matches: 108, Mismatches: 18, Indels: 23 0.72 0.12 0.15 Matches are distributed among these distances: 35 11 0.10 36 4 0.04 37 11 0.10 38 9 0.08 39 12 0.11 40 18 0.17 41 8 0.07 42 25 0.23 43 4 0.04 44 3 0.03 45 3 0.03 ACGTcount: A:0.34, C:0.03, G:0.01, T:0.63 Consensus pattern (39 bp): TATTTATTATTTTATTTATTTATTATTAATATTTATTAA Found at i:13084066 original size:77 final size:77 Alignment explanation
Indices: 13083945--13084117 Score: 174 Period size: 77 Copynumber: 2.2 Consensus size: 77 13083935 TATGTATTTA * * ** * * ** * * 13083945 TTATTTATTTATTTATTATTACTATTTATTAATATATATTTATTT-T-TTTTATTTTATCTGTTA 1 TTATCTATTTATATATTATTAAAATTTATTAATATATATCTATTTATATATTATAATATAT-AT- 13084008 ATATTTA-TATATAT 64 ATATTTATTAT-TAT * * 13084022 TTATCTATTTATATATTATTAAAATTTA-TATATATTTATCTATTTATATATTATAATATATATG 1 TTATCTATTTATATATTATTAAAATTTATTA-ATATATATCTATTTATATATTATAATATATATA 13084086 TATTTATTATTAT 65 TATTTATTATTAT 13084099 TTATCTATTTATATATTAT 1 TTATCTATTTATATATTAT 13084118 AATTTATCTA Statistics Matches: 80, Mismatches: 12, Indels: 8 0.80 0.12 0.08 Matches are distributed among these distances: 76 2 0.03 77 64 0.80 78 5 0.06 79 9 0.11 ACGTcount: A:0.34, C:0.03, G:0.01, T:0.62 Consensus pattern (77 bp): TTATCTATTTATATATTATTAAAATTTATTAATATATATCTATTTATATATTATAATATATATAT ATTTATTATTAT Found at i:13084118 original size:42 final size:40 Alignment explanation
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Indices: 13083907--13084144 Score: 62 Period size: 4 Copynumber: 56.8 Consensus size: 4 13083897 TTTATATTTA * * * 13083907 TATT TATA T-TT TATTT TATT T-TG TATCT TATG TATT TA-T TATT TATT 1 TATT TATT TATT TA-TT TATT TATT TAT-T TATT TATT TATT TATT TATT * * * 13083954 TATT TA-T TATT ACTATT TATT AATATA TATT TATTT TTTT TATTT TATC 1 TATT TATT TATT --TATT TATT --TATT TATT TA-TT TATT TA-TT TATT * * * * 13084003 TGTT AATATT TATAT ATATT TATC TATT TATA TA-T TATT AAAATT TATAT 1 TATT --TATT TAT-T -TATT TATT TATT TATT TATT TATT --TATT TAT-T * * * * * 13084053 ATATT TATC TATT TATA TA-T TATAA TATA TATG TATT TA-T TA-T TATT 1 -TATT TATT TATT TATT TATT TAT-T TATT TATT TATT TATT TATT TATT * * * * 13084100 TATC TATT TATA TATT ATAATT TATC TA-T TATT ATTTT TATT TAT 1 TATT TATT TATT TATT -T-ATT TATT TATT TATT -TATT TATT TAT 13084145 CTGTTAATAT Statistics Matches: 171, Mismatches: 35, Indels: 56 0.65 0.13 0.21 Matches are distributed among these distances: 3 22 0.13 4 101 0.59 5 26 0.15 6 22 0.13 ACGTcount: A:0.32, C:0.03, G:0.02, T:0.64 Consensus pattern (4 bp): TATT Found at i:13084198 original size:41 final size:39 Alignment explanation
Indices: 13084119--13084198 Score: 99 Period size: 41 Copynumber: 2.0 Consensus size: 39 13084109 ATATATTATA * * * 13084119 ATTTATCTATTATTATTTTTATTTATCTGTTAATATTTT 1 ATTTATCTATTATTATTTTTAATTATCTATTAACATTTT 13084158 ATTTATCTAATTATT-TTCCTTTAATTATCTATTAACATTTT 1 ATTTATCT-ATTATTATT--TTTAATTATCTATTAACATTTT 13084199 TTATTTGATT Statistics Matches: 35, Mismatches: 3, Indels: 4 0.83 0.07 0.10 Matches are distributed among these distances: 39 10 0.29 40 6 0.17 41 19 0.54 ACGTcount: A:0.28, C:0.09, G:0.01, T:0.62 Consensus pattern (39 bp): ATTTATCTATTATTATTTTTAATTATCTATTAACATTTT Found at i:13085102 original size:6 final size:6 Alignment explanation
Indices: 13085063--13085095 Score: 52 Period size: 6 Copynumber: 5.8 Consensus size: 6 13085053 TGTTTAATAC 13085063 TTTTTA -TTTTA -TTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTT 1 TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTT 13085096 TTATTTTCTT Statistics Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 2 0.93 0.00 0.07 Matches are distributed among these distances: 5 10 0.38 6 16 0.62 ACGTcount: A:0.15, C:0.00, G:0.00, T:0.85 Consensus pattern (6 bp): TTTTTA Found at i:13085170 original size:58 final size:58 Alignment explanation
Indices: 13085107--13085332 Score: 226 Period size: 58 Copynumber: 3.9 Consensus size: 58 13085097 TATTTTCTTT * * * 13085107 AAATAAAATTCCAAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAAATTTCCTTGG 1 AAATAAATTTCCAAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAG * * * * * * 13085165 AAATAAGCTTTCTAAAAAATTATTTTT-AGGGAAAAGTTGAAAGTACCAATTTTTCTTAA 1 AAATAA-ATTTCCAAAAAAATATTTTTGA-GGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAG * * *** * 13085224 AAATAAGTTTTCAAAAATGGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC-TCG 1 AAATAAATTTCCAAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAG * * * 13085281 AAATTAAAGTTT-CTAAATAATA-TTTTGGGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTT 1 AAA-TAAA-TTTCCAAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTT 13085333 TTCTGTACAA Statistics Matches: 137, Mismatches: 26, Indels: 11 0.79 0.15 0.06 Matches are distributed among these distances: 57 33 0.24 58 53 0.39 59 51 0.37 ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.15, T:0.35 Consensus pattern (58 bp): AAATAAATTTCCAAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAG Found at i:13085182 original size:59 final size:58 Alignment explanation
Indices: 13085119--13085332 Score: 242 Period size: 59 Copynumber: 3.7 Consensus size: 58 13085109 ATAAAATTCC * * 13085119 AAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAAATTTCCTTGGAAATAAGCTTTCT 1 AAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAGAAATAAG-TTTCT * * * * 13085178 AAAAAATTATTTTT-AGGGAAAAGTTGAAAGTACCAATTTTTCTTAAAAATAAGTTT-T 1 AAAAAAATATTTTTGA-GGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAGAAATAAGTTTCT * * 13085235 -CAAAAATGGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC-TCGAAATTAAAGTTTCT 1 AAAAAAAT--ATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAGAAA-T-AAGTTTCT * * 13085295 -AAATAATA-TTTTGGGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTT 1 AAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTT 13085333 TTCTGTACAA Statistics Matches: 133, Mismatches: 15, Indels: 16 0.81 0.09 0.10 Matches are distributed among these distances: 56 5 0.04 57 34 0.26 58 36 0.27 59 52 0.39 60 6 0.05 ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.15, T:0.36 Consensus pattern (58 bp): AAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAGAAATAAGTTTCT Found at i:13085228 original size:117 final size:114 Alignment explanation
Indices: 13085099--13085333 Score: 303 Period size: 117 Copynumber: 2.0 Consensus size: 114 13085089 TATTTTTTTA * * * 13085099 TTTTCTTTAAATAAAATTCCAAAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAAATTTCCTTG 1 TTTTCTTAAAATAAAATTCCAAAAAAAGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAAATTTCC-TC 13085164 GAAA-T-AAGCTTTCTAAAAAATTATTTTTAGGGAAAAGTTGAAAGTACCAAT 65 GAAATTAAAG-TTTCTAAAAAA-TA-TTTTAGGGAAAAGTTGAAAGTACCAAT ** * ** * 13085215 TTTTCTTAAAAATAAGTTTTCAAAAATGGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTC 1 TTTTCTT-AAAATAAAATTCCAAAAAAAGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAAATTTCCTC * * * 13085280 GAAATTAAAGTTTCTAAATAATATTTTGGGGAAAAGTTGAAAGTATCAAT 65 GAAATTAAAGTTTCTAAAAAATATTTTAGGGAAAAGTTGAAAGTACCAAT 13085330 TTTT 1 TTTT 13085334 TCTGTACAAA Statistics Matches: 104, Mismatches: 12, Indels: 7 0.85 0.10 0.06 Matches are distributed among these distances: 115 29 0.28 116 14 0.13 117 58 0.56 118 3 0.03 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.14, T:0.37 Consensus pattern (114 bp): TTTTCTTAAAATAAAATTCCAAAAAAAGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAAATTTCCTCG AAATTAAAGTTTCTAAAAAATATTTTAGGGAAAAGTTGAAAGTACCAAT Done.