Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168293.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_52, whole genome shotgun sequence
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*
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ATTAATTAATTATAATT
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* *
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TATTATATAATAAATTAATAAATTATA
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2507 ATGATAGTTT
* * *
2517 TTAA TTTA TT-A TATAA TAAA TTAA TAAA TT-A -TATA TTAA TATAA -TATA
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2590 AGAATATATA
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3963 AATTAACATT
**
3973 ATAATAATTTAATTACTA
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*
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4276 TCATAACTAT
*
4286 TTATAAT-ATAATTAA
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1 TT-ATAATAATATTTAA
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1 TTATAAT
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1 AAT
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*
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6589 ATAATAATTC
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*
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1 A
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6589 ATAATAATTC
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* * * *
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1 TATTTAATATTAACTATATAT-AATAATATTAAT-TATAATAATTATATAAATATTAATAATTAT
6790 TAAA
64 TAAA
* *
6794 TATTTAATATTCACTATATATAATAATATTAATTATAATATTTATATAAATATTAATAATTA
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TATTTAATATTAACTATATATAATAATATTAATTATAATAATTATATAAATATTAATAATTATTA
AA
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6752 ATATTATCTA
6762 TAATAATTATGTAAATAT
1 TAATAATTAT-TAAATAT
*
6780 TATTAATTATTAAATATT
1 TAATAATTATTAAATA-T
* *
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1 TAATAATT-ATTAAATAT
*
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1 TAATAATTATTAAATAT
*
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1 TAATAATTA
6856 AGTATTAATA
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1 TTATATTTTAATAAT
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7752 TAATAAATTAATATACAATTATTTAT-T
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1 TAATAATT
7814 CTTAGTTATA
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* * * * * **
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* ** * ** * * *
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* * * * * ** *
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* * ** *
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*
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* * *
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* * *
8270 ATTAATAATAATTTATTCACATTCAAAAAATTAATGAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTT
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63 TA
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8414 CTTAGATGGG
* * *
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1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAAATA
* * * * ** *
8488 TGTTTATCAAATCAATTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTATCTA-TTTCAAATTGTTATG
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* * * * *
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128 A-TCTTTGTTTTATCACT-AAACAATTATATCTT-ATCATACAAGCTTATTCG-A
* *
8603 ATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATATG
1 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAATAAATATG
* * * * *
8668 TTTATTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTAGTCTCAAATCATTAAGATC
66 TTTATCAAACCAATTAAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATTAGTCTCAAATCATTAAGATC
* *
8733 TTTGTTTTATCACTAAACAATTATATCTTATCATAGAAGCTTATTCGG
131 TTTGTTTTATCACTAAACAATTATATCTTATCATACAAGCTTATTCGA
* * *
8781 TTAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
1 AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
8824 GGATCTAAAA
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TTTGTTTTATCACTAAACAATTATATCTTATCATACAAGCTTATTCGA
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9075 TAAAATCATA
* * * * * * * *
9085 CATAAAACAATTGTTTCATTTTATAAAAGATTATCCAAAATGAAATAATACTAATTTCTTAATAT
1 CATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
9150 TTCAAAAATTAATAAAAAAGAG-TTTAAAAAAATAATTTTTTTTACCGATCAAATTCAAATAGTT
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* * * * *
9214 ATGACTATTTGAACAATTGTCTA-TTGAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTTT
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* * * * * *
9265 CACAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTTTTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATA-
1 CATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
9329 TTCTAAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCAAATCAA-TTCAAATAAT
65 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * ** * *
9393 TATG-GTCATTTCAATAGTTATCT-TTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGT
128 TATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
9445 CATATAACAATTGTTTTTAATCGTACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCT
1 CATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** *
9510 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTACAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTTAAATAGTTA
65 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
9575 TGACCATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTT-TTTTGT
130 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
9625 CATAAAACAATTATTTCTGTTCATGCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATAT
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* * * * ** * * *
9690 TCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTTTAAACAA-AAAT-TACTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTT
65 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* *
9753 AAGACTATATGAATAATTATCTACTTT-AAATC---AT----TTTTGTTTT-T
129 ATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
9797 CTATAAAACAATT-TTTTCAATTCATA-ATAGTTTATTAAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
1 C-ATAAAACAATTGTTTT--ATTCATACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* *
9859 ATATTTCAAAAATTAATATA-TAAGAGATTT-AAAAAT---TCTGTTTACCTAACCAGTTCAAAT
61 ATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * ** * *
9919 AATTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTCTTTTGT
125 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * * * * *
9975 TGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACTAATCTATTAATA
1 CATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
10040 TTTCAAAAATTAAT-AG---GAGATTAAAAAAAAAAACCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTT
64 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * ** * ** * * *
10101 ATAAGTATTTGAGGAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTAT
129 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * *
10153 TATAAAACAATAG----ATTC-TGTTAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
1 CATAAAACAATTGTTTTATTCAT-ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * *
10213 TTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCA
65 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * *
10276 TGACTATTTGATTAAATATCTATTGCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
130 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * *
10327 CATCAAAA-AATTATTTCATTTCACATAAAATTATTTGAAATAGAATAATACTAAGTTATTAATA
1 CAT-AAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * * *
10391 TTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTATTGAATAAGTTTAAATAATT
64 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *** * * *
10456 ATAACTATTTCAACAATTATCAATTTGAAATTGCTATAACCTTCTGTTTTGG
129 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
10508 CATAAAATGATTTTTTTCTATTTATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTA--AA-
1 CATAAAA-CAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
10569 AATT-AAGACAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATC
63 ATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * * ** ** *
10633 TTTATGACTATTTGAACAATT-TTTATTTTAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGC
126 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
10687 CATAAAACATTTTTTTCTGATT-ATACAAGCTTATTC-AGATTAAAAT-ATATTAATTTATGAAT
1 CATAAAACAATTGTTT-T-ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * **
10749 ATTTCGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAG
63 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
*** * * *
10813 TTATGACTATGCAAATAATTAACTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGT
127 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
10867 AATAAAATAATTGTTTTAGTAT-ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
1 CATAAAACAATTGTTTTA-T-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * *
10931 TTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACATGTTTAAATAGTT
64 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* *
10996 ATGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGT
129 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
11048 CCTAAACCAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
1 CATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * * * *
11111 ATTCCAAAAATTAATATGTAA-AAATTAAAAAAATAGATATGTTTTCTGAACACA-TTCAAATAG
63 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAG
* * * * * *
11174 TTATGACTATTTGAAGAACTATTTATTTCAAATCATTACGACCTTTTTCTTTTAT
127 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGT
* * * * * *
11229 CGTAAATCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
1 CATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
11294 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAGCGAGTTTAAATAGTT
65 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * **
11358 ATGACTATTTGAACATTTTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGT
129 ATGACTATTTGAATA-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** ** *
11411 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATAT
1 CATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * *
11476 TTTAAAAATTAATAAGTTGGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTG
65 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * ** * *
11541 TG--TATTTGAACT-ATCATCTACTTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGT
130 TGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * *
11590 CATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATT-AAGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATA
1 CATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
11654 TTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATCGTT
64 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
11715 ATGA-TATTT
129 ATGACTATTT
11724 ATTTTGTCAT
Statistics
Matches: 1953, Mismatches: 413, Indels: 190
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 4 0.00
170 41 0.02
171 5 0.00
172 47 0.02
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183 27 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
CATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
Found at i:11733 original size:141 final size:142
Alignment explanation
Indices: 11562--11828 Score: 344
Period size: 141 Copynumber: 1.9 Consensus size: 142
11552 TATCATCTAC
* * * *
11562 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATTA-
1 TTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTCTATTCACACAAAATTATTAG
** *
11626 AGAATAAAATAATACTA-ATTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATC
66 A-AATAAAATAATACTAGA-TTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
11689 TGTTTATCGAACTAG
128 TGTTTATCGAACTAG
* * * ** *
11704 TTCAAATCGTTATGATA-TTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTCTGTTCGCACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTCTATTCACACAAAATTATTAG
* *
11768 AAATAAAATATTGCTAGATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAGATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
11829 GTATTTGCCA
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 15, Indels: 7
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
141 89 0.83
142 18 0.17
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (142 bp):
TTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTCTATTCACACAAAATTATTAG
AAATAAAATAATACTAGATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
TTATCGAACTAG
Found at i:12057 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 11704--12764 Score: 784
Period size: 181 Copynumber: 6.0 Consensus size: 179
11694 ATCGAACTAG
* * * * * **
11704 TTCAAATCGTTATGA-TATTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTCTGTTCGCACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
11768 AAATAAAATATTGCTAGA-TTAATAATA-TTCTAAAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAATAAA
66 AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * ** * *
11828 TGTATTTGCC-AATCCAGTTCAAATAGTTAAAACTACTAT-AATAATTATCTAT
129 TCTGTTTACCAAAT--AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
11880 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGCTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
*
11945 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TT-AAGAAATTAATACACAAGAAATTTTAAAAAATAA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATA-ACAAGAAA-TTTAAAAAATAA
*
12008 ATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACCAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* *** ** * * *
12061 TTAAAATAAATATGACCCTTTGTTTTA-TCATAAAACAATAGTTTCAGTTCATAAAAGTTTATTC
1 TTCAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * **
12125 AAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAA-ATTAACTATTT-AAAAAT-A
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACAAGAA--ATTTAAAAAATAA
* ** * * *
12187 AGCTAGTTTATTAAATCAGTTCAAATAATTATG-GTCATTTGAACAGTTATCTAT
128 ATCT-GTTTACCAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
12241 TTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATTAAACAATTATCTTTCA--TCATACAAGCCTAT
1 TTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT
* * * *
12303 TCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATTCAAGAGATTTAAAAAATA
63 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-ACAAGAAATTTAAAAAATA
* *
12368 AATCTGTTTA-C---TAG----ACTA---AT-CCTTATTTGAACAATTATCTAT
127 AATCTGTTTACCAAATAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTAT
* * * * ** * * *
12410 TTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCT-GTTATAAATTAATTATTTCAGTTCATATAAGTTTATTC
1 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * *
12474 -AGAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAACATAA
65 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAC-AAGAAATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
12538 ATCTATTTGTCGAAGTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTT-ACCAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
12591 TTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTCAGTTCATACAAGATTATGCG
1 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * ** * *
12656 AAAGAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-CAAGAAATTTAAAAAATAAAT
** * * * * *
12720 CCATTTACCAAATTTGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATT
130 CTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
12765 CAAACTAACT
Statistics
Matches: 695, Mismatches: 140, Indels: 96
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 6 0.01
168 4 0.01
169 120 0.17
170 2 0.00
172 3 0.00
174 3 0.00
175 2 0.00
176 26 0.04
177 60 0.09
178 2 0.00
179 11 0.02
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182 30 0.04
183 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACAAGAAATTTAAAAAATAAATC
TGTTTACCAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:12481 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 12223--12541 Score: 421
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168
12213 AATTATGGTC
* * *
12223 ATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATTAAACAATTATCTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTCTGTCATTAAACAATTA-CTTTC
* * * * * *
12288 ATCATACAAGCCTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-ATTCA
65 ATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAACT-A
12352 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAGACTAATCCTT
129 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAGACTAATCCTT
* *
12392 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTATTCTGTTA-TAAATTAATTA-TTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTCTGTCATTAAA-CAATTACTTT
* **
12454 CAGTTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAAC
64 CA--TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAAC
*
12519 TAAGAGATTTAAAACATAAATCT
127 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
12542 ATTTGTCGAA
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 15, Indels: 10
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
167 5 0.04
168 6 0.05
169 117 0.90
170 2 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (168 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTCTGTCATTAAACAATTACTTTCA
TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG
AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAGACTAATCCTT
Found at i:13671 original size:539 final size:541
Alignment explanation
Indices: 12997--14116 Score: 1282
Period size: 539 Copynumber: 2.1 Consensus size: 541
12987 TGCAAAAATT
* * * *
12997 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTGAATATGTATAACTATTTGAGCA
1 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTCAATATGTATAACTATTTGAACA
* * *
13062 ATTATTTCTTTTAAATTGTTATGACTTTTTGCTCTACTATAAAACGATAGTTTCTATTCATACAA
66 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGCTCTACTATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAA
* * *
13127 GCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAACTAAAAAATTTTA
131 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAACTAAAAAA-TTTA
*** *
13192 AAAAATAAATATGTTTATCGATTTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTCA
195 AAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCA
* * * *
13257 AAACCTTATGA-CTTTTTGTTCTATCATTAAAAAAA-TATTTCAGTTTACATAAGCTTATTCGAA
260 AAACATTATAAGC-TTTTGTTCTAT-AATAAAAAAATTA-TTCAGTTCACATAAGCTTATTCGAA
* *
13320 AT-AAAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A-T-GAGATTTAAAAAAGGAATCT
322 ATAAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTGGAGATTTAAAAAAGAAATCT
* * * * * *
13381 GTTTACTGAATAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAACAATTACCTATTTGAATTTGCTATAAC
387 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATAACCATTTCAACAATCACCTATTTGAAATTGCTATAAC
* * ** * * *
13446 CTTTTGTTTTGTTGTAAAATGATT-TCTTCTATTCATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATAC
452 ATTTTGTTTT-ATGTAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAAATCA-TTCAAAATAAAATAATAC
13509 AAATTTATGGATATTAGGATAATTAATA
514 AAATTTATGGATATTAGGATAATTAATA
* * * *
13537 AGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTTATTTA-CAGAACAAG-TTCAA-ACTTTATGACTATTTGAA
1 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA-AACAAGTTTCAATA-TGTATAACTATTTGAA
* * * * * **
13599 CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG-TTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTGTA
64 CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGCTCTACT-ATAAAACAATAGTTTCTATTCATA
* ** * *
13663 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATT
128 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAACTAAAAAATT
* * *
13728 TAAAAAATAAATATGTTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTT
193 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAAATATCTATTT
* * * * * * *
13793 CAAATCATTGTAAGCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGATTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAA
258 CAAAACATTATAAGCTTTTGTTCTATAATAAAAAAATT-ATTCAGTTCACATAAGCTTATTCGAA
* * *
13858 ATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATT
322 ATAAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-TGGAGATTTAAAAAAGAAATC
* * * * * * * * *
13923 TGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATATCCATTTGAACTATCATCTATTTTAAATTGTTATGA
386 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATAACCATTTCAACAATCACCTATTTGAAATTGCTATAA
*
13988 CATTTTGTTTTATGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATCATTCAAAATAAAATAATACTA
451 CATTTTGTTTTATGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATCATTCAAAATAAAATAATACAA
* ** *** *
14053 ATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATA
516 ATTTATGGATATTAGGATAATTAATA
* * *
14079 AG----AGATTTAAAAACTAAATATATTTATCAAACCAGTTT
1 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTT
14117 AAATTGTTAT
Statistics
Matches: 482, Mismatches: 83, Indels: 31
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
537 8 0.02
538 134 0.28
539 164 0.34
540 33 0.07
541 3 0.01
542 63 0.13
543 77 0.16
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (541 bp):
AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTCAATATGTATAACTATTTGAACA
ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGCTCTACTATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAA
GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAACTAAAAAATTTAA
AAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCAA
AACATTATAAGCTTTTGTTCTATAATAAAAAAATTATTCAGTTCACATAAGCTTATTCGAAATAA
AAATAATACTAAGTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTGGAGATTTAAAAAAGAAATCTGTTT
ACTGAACAAGTTCAAATAATCATAACCATTTCAACAATCACCTATTTGAAATTGCTATAACATTT
TGTTTTATGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATCATTCAAAATAAAATAATACAAATTTA
TGGATATTAGGATAATTAATA
Found at i:13938 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 12782--14105 Score: 855
Period size: 182 Copynumber: 7.4 Consensus size: 180
12772 ACTTATTCAG
* * * * *
12782 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAGAAATTAATATGTAAAGGATTTAAAAAATAATT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* *** * * * * * * **
12846 TTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATATCAAATCATTATT
64 ATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA-T
* * ** * *
12911 G-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAAAT-ACTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCA
128 GACTTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGA-TTCAGTTCATACAAGCTTAT-TTGA
* * * * *
12962 AA-AAAA-AATATTAATCTAATAATATTGCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* ** * ** * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *** * * * ***
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* * * * * * *
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* * ** *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * * * * * * * *
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65 TGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * ** ** ** *
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* ** * *
13496 AATAAAATAATACAAATTTATGGATATT-AGGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * *
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64 ATGTTTATTGAACAAGTTCAAA-TAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * ** **
13623 GACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTTGA
128 GACTTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGATTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* ** *
13676 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
** * *
13741 TGTTT-TTCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTA
65 TGTTTATT-GAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* *
13805 AGC-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGATTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA
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***
13857 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
13922 TTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACT-ATCATCTATTTTAAATTGTTA
64 ATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGA-CTATTT-AAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * ** * **
13985 TGACATTTTGTTTTAT-GTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATCATTCAA
127 TGACTTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGATTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGA
* *
14038 AATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
*
14099 TATTTAT
65 TGTTTAT
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Statistics
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* * * * *
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* * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* ** * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** * *
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*** *
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* * * * * * *
15072 TAAAAATAATATATTAATA-TTCCAAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTA-TTTA
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* * *
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* ** ** * * ** ** * * *
15185 TTATTACCTTTCATTTCATCATATAAGAATT-TTATTTGAACATTCAAGCCTT-TTTGGAATAAA
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* * * * **
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* * * * * ** * *
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* * * * * *** * *
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* * * * * * * ** *
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* * * ** * * *
15542 TTA-GTTCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCG-AATAAAG
1 TTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
*
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* * * *
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129 TCGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAA
* ** * * * *
15781 ATAATACTAATATATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT-ATGTTT
64 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTT
* * * * * * * * * **
15845 A-CCAAACTAGATCAAATAATCATGACAACTTGAATAATTATATGTTTCAAATTG
128 ATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * * *** *
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66 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAA-AAATAAATCAGTTT-
* * * ** * * * * * * *
16028 AAT-AATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAAT-TTTTTCTATTC
128 -ATCGA--ATC-AGTTCAAATAATTATGA-C---T-ATTTG---AACAATTATCTATTTCAAATC
16091 A
181 A
* * **** *** * * * * *
16092 TCTAAG-CTTATTTCAAATAAAATAATACAA--ATTT-A-TTAATATTAAGAC-TATT---AA-C
1 T-TATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAG-CTTATTCGAAATA
* * ** * * *** * * * * *
16147 AACTAATA--GATTTATTAA-AAAT-AAATATGT-TTACCAAACA-AGTT--CAAAT-CATTATG
62 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-G
** * * * * ** * * * * * *
16203 GCTATTGGAGCAATT-ATTTATTTCA--ACTTGTTATG-AC-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
125 TTTATCGAATCAGTTCAAATAATT-ATGAC-TATT-TGAACAATTATCTATT-TC--AAATC-A
* *** *
16262 TTAT----TTTTG---T-TCAT---ACAA--GTTT-A-TTCGGATTAAAATAATATT--AATTTA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC--A-TACAAGCTTATTCGAA-ATA
** * ** ** * * * * * *
16310 TAAAT-ATTTTGA-CAATTAATAAGT-AAAATGTTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTT
62 -AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA--ATTAATAAGT-AAGAGATTTA---AA-AA-AT
* ** * *
16372 CAAAT-AG-TCAT-GGCT-A-TTCAAATAATTAT--CTATTTCAA-ATCATTATGACCT-TTTCT
118 -AAATCAGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA--ATTAT---CTATTTCA
** *
16428 TTTGTA
177 AAT-CA
* ** * * * * ** * *
16434 ATAAAACAC--TTGTTTTAGTTCATCTAAGC--TTATTTGAAGTAAGATA-ATA-CTAATT---T
1 TTATGAC-CTTTTGTTTT-G-TCAT-AAAACAATTGTTT-CAGT-TCATACA-AGCTTATTCGAA
* ** * * * * * **** **
16490 AT-TAAT-ATTTTGAA--AATTAATGA-GTAAGAAAATTAA-AA-AAAGA-ATATGTTTACCAAA
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* * * * **** ** *
16547 TAAG--T-TC-AAACAGTT---ATGACTAT--CTAAACAATTA----TCTATTTCAAAACA
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* * * *
16595 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAA
* * *
16658 ATAGT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAAT-ATGT
64 ATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCA-GT
* * * * *
16719 TTTTCTGAAT-ACGTTCAAATAAATATGACTATTTAAAAAATTATCTTTTTCAAATCA
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* * * * * *
16776 TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTTTTCAAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * *
16841 AATAATAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAC
66 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTAT
* * * * *
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* * * ** *
16956 TTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTA-TTCATA-AATTTTTAATTTGAAATAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAA-GCTT-ATTCGAAATAA
* * * ** *
17019 AAAAATACTAATTTATTAGT-GTTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGACTTAAAAAAT-AA--A--T
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** * * *
17078 T-T-G--T---TT--AATAAACATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT-A
127 TATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * **
17123 GTAATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAAATTATTC-ATAATAAA
1 -TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAA
* * * ** * * *
17187 ATAATATTGATCTATTAATATTTGGATAA-T--TAA-TAAGACA-TTAAAAAACAAAATCTA-TT
64 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATC-AGTT
* * * * *
17246 TATTGAAACAGTTCAAATATTTATGCCTATTTGAACAATTATCTA----AAATCT
127 TATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * ** * *
17297 TTATGA-TTTTTATTTTGTCATAAAACAAGTGTTTCTTTTCATGCAAGCTTATTC-AGATTAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAA
* * * * **
17360 TAATACTAATATAATAATATTGCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGAGTTTGC
65 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTAT
* * * ** * * **
17421 CAAATTAGTTTAAATAATTAAAACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTG
130 CGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
17473 TTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAA
* * *
17537 TAATACTAATTTATCAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-ATGTT
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* * * *
17600 TA-CCAAACAAGTTGAAATAGATT-TAACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCA
127 TATCGAATC-AGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCA
* * *
17655 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAACCTTA-TCTGAAATAAAA
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* * * * * * * *
17719 TAATACTACTTTATTAATACTTCAAAAATTAATATGGAAGATATTTAAAAACTAAATCTGTTTTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTAT
* * * * * * * * * *
17784 TGAACCATTTTAAATAGTTATGAGTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCG
130 CGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
17836 TTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTT--TTATCATACAAGCTGATT-TAGATAAA
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63 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTT
* * * ** * * *
17958 A-CTGAATCAGTTCAAACAGTTAAGACTATTAAAATAATTATTTATTTCAAATCG
128 ATC-GAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * * * * *
18012 TTGTGACCTTTTTTTTTAGTCATATGATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
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* * *
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* * ** * * *
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* * * ** ** * *
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* * * * *
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* **
18502 GATAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
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* ** * ** *
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* * * * * * *
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18680 CCAAACTAGTTCAAATGGTTAAGACTATATGAAAAATTATTTATTTTAAATTG
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* * * * * * * *
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66 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTAT
* * * *
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* * ** * * * *
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** * * ** * * * *
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128 ATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * ** *
19091 TTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTTATACGATTTTATTTGAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * ** * ** * * * **
19155 TAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGC
65 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTA
* * * * * **
19220 T-GAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATAT-AGATGATTATCTATTTCAAATCA
129 TCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * ** *
19272 TTTTGACCTTGTTCTTTTATCATAAAATAATTATTT-TGTTTGTACAAGCTTATTC-ATATTAAA
1 TTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAA
* * **
19335 ATAATACTAATTTCA-TAATATTTAAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTT
64 ATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTT
* ** * * * * * **
19398 A-CTGAATCATTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATTG
128 ATC-GAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
19452 TTTTGGCCATTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATT-GAGAATAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAA
* * *
19516 TAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTT
65 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCAGTTT
* * * * * *
19580 ATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTTTCTATTTAAAATCG
128 ATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * *
19634 TTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATATAAGCTTA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA
19686 GACGGAATAA
Statistics
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Consensus pattern (181 bp):
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATC
GAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
Found at i:14991 original size:349 final size:345
Alignment explanation
Indices: 14449--15142 Score: 768
Period size: 349 Copynumber: 2.0 Consensus size: 345
14439 ATAGTTATGA
* * * *
14449 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTC
* * ** * * * *
14514 AATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGT
66 AATTCATAAAAGCTTATCCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT
* * * * * * **
14579 TAGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAATCAATTCAAATAATTATGGCCGTTTGAACAATT
131 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATCAATTCAAACAATTAAGACCGTACGAACAATT
* * *** * * *
14644 ATCTATTT-TAAATTGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCATACACGC
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* * * * *
14707 CTATTTGGAATAAAATAATACTAAT-TAATTAATATTTCAAACATTT-ATAAGTAGGAGATTTAA
259 CTATTCGAAATAAAATAAAAATAATAT-ATTAATATTCCAAA-ATTTAATAAGT----GATTTAA
14770 AAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
318 AAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
* *** * * *
14798 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTATTCTATTATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
14863 AGTTCATATAAGCTTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCTAAAATTAATAACT
66 AATTCATAAAAGCTTATCCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT
** * * *
14928 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAAAT-AGTTCAAACATTTAAGACTGTACGAACAAT
131 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCG-AATCAATTCAAACAATTAAGACCGTACGAACAAT
**
14992 TACCTATTTCTAATAGTTATGACCTTTAACTTTGTCATAAAACAATCGTTTCAGTTCATACAAGC
195 TACCTATTTCTAATAGTTATGAAATTTAACTTTGTCATAAAACAATCGTTTCAG-TCATACAAGC
* * *
15057 TTATTCGAAATAAAATAAAAATAATATATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTGATTTAAAAAGTG
259 CTATTCGAAATAAAATAAAAATAATATATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTGATTTAAAAAATA
*
15122 AATCTATTTATCGAATCAGTT
324 AATCTATTTATCGAACCAGTT
15143 TAAATAATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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351 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (345 bp):
CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTC
AATTCATAAAAGCTTATCCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT
AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATCAATTCAAACAATTAAGACCGTACGAACAATT
ACCTATTTCTAATAGTTATGAAATTTAACTTTGTCATAAAACAATCGTTTCAGTCATACAAGCCT
ATTCGAAATAAAATAAAAATAATATATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTGATTTAAAAAATAAA
TCTATTTATCGAACCAGTTC
Found at i:18142 original size:540 final size:535
Alignment explanation
Indices: 17097--19685 Score: 1918
Period size: 539 Copynumber: 4.8 Consensus size: 535
17087 AAACATGTCC
* * * *
17097 ATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT-AGTAATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * * ** *
17161 -GTTCATACAAA-ATTAT-TCATAATAAAATAATATTGATCTATTAATATTTGGATAATTAATAA
63 AGTTCATA-AAAGCTTATCTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
17223 G---ACA-TTAAAAAACAAAATCTATTTATTGAAACAGTTCAAATATTTATGCCTATTTGAAC--
126 GAAAATATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTATTG-AACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
17282 A-AT-TATCTAAAATCTTTATGAT-TTTTATTTTGTCATAAAACAAGTGTTTCTTTTCATGCAAG
189 ATATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATCATACAAG
* * * * *
17344 CTTATTCAGATTAAAATAATACTAATATAATAATATTGCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAT
253 CTTATTTAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
** * * * * * ** * * *
17409 AAATGAGTTTGCCAAATTAGTTTAAATAATTAAAACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
318 AAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * **
17474 TTTAACC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
383 TATGACCTTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * * *
17538 AATACTAATTTATCAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAC
448 AATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAC
*
17603 CAAACAAGTTGAAATAGATTTAACT
512 CAAACAAGTTCAAATAG-TTTAACT
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG
* * * * *
17693 TTCATAAAACCTTATCTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATACTTCAAAAATTAATATGGAA
65 TTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGAA
* * * * * * *
17758 GATATTTAAAAACTAAATCTGTTTTTTGAACCATTTTAAATAGTTATGAGTATTTGAACAAATAT
129 AATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAATAT
* * * *
17823 CAATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTTATCATACAAGCTGA
193 CTATCTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTATCATACAAGCTTA
** *
17887 TTTAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGATAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
257 TTTAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
17952 GTGTTTACTGAATCAGTTCAAACAGTTAAGACTATTAAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTGTG
322 CTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** * * * *
18017 ACCTTTTTTTTTAGTCATATGATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAGA
387 ACCTTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * **
18082 CTAATTTATTGACATTTAAAAACTTATTAAGCATGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA
452 CTAATTTATTAATATTTAAAAA-TTAATAAGCATGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
* *
18147 CATGTTCAAATAGTTATGACT
516 CAAGTTCAAATAGTT-TAACT
* * *
18168 ATTTCAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG
** * * * **
18233 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATCAATATTTTGAAAATTAATAAGCAA
65 TTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA
* * * * * * ** *
18298 AAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAATCAATTCAAATAATCATGGCCATTAAAACAACTA
129 AATATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAATA
* * * * *
18362 TCTATTTTAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGAACATACAAGCTT
192 TCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATCATACAAGCTT
* * * * * *
18427 TTTCTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATATGAGATTTAAAAAAGAA
256 ATT-TAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAA
*** * * *
18491 ATCTGTTTGTTGATAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
320 ATCTGTTTACCGA-ATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * ** *
18555 AT-AAC-TTTTGTTCAGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
384 ATGACCTTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATA
* * * * *** *
18618 ATAATAATTTAGTAATATTTCAAAAATTAATAA-CTATGAAATTT-AAAAATTAAATCCATTTGC
449 ATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGC-ATGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAC
* * *
18681 CAAACTAGTTCAAATGGTTAAGACT
512 CAAACAAGTTCAAATAGTTTA-ACT
* * * ** * * *
18706 ATATGAAAAATTATTTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTAAG
1 ATTTGAACAATTATCTA-TTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG
* * * * * * *
18771 CTCATAGAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAG---
65 TTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAA
* * * * * * * *
18833 AGATTTAGAAAATAATTCTATTTA-TGAAACTAGTTCAAATAATTATTACTTTTTGCACAATTAT
130 ATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTG-AAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAATAT
* * * * * *
18897 CTATTTCAAATCATTATTA-CTTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAG-TT
193 CTATCTCAAATCATTATGATCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATCATACAAGCTT
* * * *
18960 -TGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGATATTTAAA
256 AT-TTAGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAA
* ** * * * ** * * *
19023 AAGTAAATCTACTTGCCAAACCTTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAA
314 AAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * ** *
19088 TCATTATAACCTTTTATTTT-GTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTTATACGATTTTATTTGAAAT
379 TCGTTATGACCTTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT
* * * * * * * * * * *
19151 AAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTA
443 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAAAATAAATATG
* * * * *
19215 ATTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACT
507 TTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTTA-ACT
* ** * * * * *
19245 ATAT-AGATGATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTGTTCTTTTATCATAAAATAATTATTTT
1 ATTTGA-ACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
** * * * * *
19309 -GTTTGTACAAGCTTAT-TCATATTAAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTAAAAAATT-ATAA
63 AGTTCATAAAAGCTTATCTGA-AATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * ** * * *
19370 GTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAATCATTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAA
126 G-AAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* * ** * ** * * ** *
19435 TTATATA-CTTCAAATTGTTTTGGCCATTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAA
189 ATATCTATC-TCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCATACAA
* * * *
19499 GCTTATTGAGA-ATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT
252 GCTTATTTAGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGATTT
* * * * * *
19562 AAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTTTCTATT
311 -AAAAAATAAATCTGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATT
* * ** * * *
19626 TAAAATCGTTATAACCTTTTAATTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATATAAGCTTA
374 TCAAATCGTTATGACCTTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA
19686 GACGGAATAA
Statistics
Matches: 1649, Mismatches: 334, Indels: 138
0.78 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
530 7 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT
TCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAA
TATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAATATCTA
TCTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATCATACAAGCTTATTTA
GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
TTACCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
TTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
TCAAATAGTTTAACT
Found at i:19771 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 19739--19771 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
19729 AATCAATTAA
19739 AATAATTATGGCTATTTG
1 AATAATTAT-GCTATTTG
19757 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATGCTATTT
19772 CAAATTATTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
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AATAATTATGCTATTTG
Found at i:20119 original size:175 final size:178
Alignment explanation
Indices: 19750--20202 Score: 477
Period size: 175 Copynumber: 2.5 Consensus size: 178
19740 ATAATTATGG
* * * *
19750 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAATTTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA-AA-ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * * * *
19815 TTTATCATACAAGCTTATTTGCAATAGAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAGG
64 CTAATCATACAAGCTTATTCGCAATAAAATAATACTAATTGAATAATATTTCAAAAATTAAT--G
* **
19880 TAACAGATTTAAACAATAAATCTGTTTACCGAAGTAGTTCAAATAATTATGA
127 TAACAGATTTAAACAATAAATCTGTTTACCGAAATAGTTCAAATAATTAAAA
* * * *
19932 CTATTTGAATAATTATCAATCTCAAATTGTTAAAATCTTTGTTTTGTGATAAAACAATTGTTTCT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
* ** * * *
19997 AATCATAGAAGCTTATTCG-GTTAAAATAATATTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-TAA-
66 AATCATACAAGCTTATTCGCAATAAAATAATACTAATTGAATAATATTTCAAAAATTAATGTAAC
* * * *
20059 AGATTTAAACAATAATTGTGTTT-GCTAAATCAGTTCAAATAATTAAAA
131 AGATTTAAACAATAAATCTGTTTACCGAAAT-AGTTCAAATAATTAAAA
* * * * * **
20107 CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCAAACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TTTTATTTC
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* * *
20171 -ATGTCCTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
65 TA-ATCATACAAGCTTATTCGCAATAAAATAAT
20203 TCAAATTTAT
Statistics
Matches: 225, Mismatches: 42, Indels: 14
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
174 5 0.02
175 88 0.39
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179 33 0.15
180 41 0.18
181 2 0.01
182 29 0.13
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
AATCATACAAGCTTATTCGCAATAAAATAATACTAATTGAATAATATTTCAAAAATTAATGTAAC
AGATTTAAACAATAAATCTGTTTACCGAAATAGTTCAAATAATTAAAA
Found at i:20548 original size:158 final size:159
Alignment explanation
Indices: 20222--20538 Score: 399
Period size: 158 Copynumber: 2.0 Consensus size: 159
20212 TGAATACTTG
* * * *
20222 AAAAATTAATAAACAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAATTTAAATAGTTATG
* *
20287 ACTATTTGAACAATTAATTATATAAAACCATTATGACTTGTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTT
66 ACAATTTGAACAATTAATTATATAAAACCATTATAACTTGTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTT
*
20352 CAATTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA
131 CAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA
* * *
20381 AAAAATTAATAAGCAAGA-ATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAATTCT-GATAGTTAT
1 AAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAATT-TAAATAGTTAT
* * * * * * *
20444 GGCAATTTGAACAATT-GTATATTTAAAATCGTTATAACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTG
65 GACAATTTGAACAATTAAT-TATATAAAACCATTATAA-CTTGTTGTTTTGACATAAAAAAATTG
* * *
20507 TTTCAATTCGTACAAGCTTGTCCAAAATAAAA
128 TTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA
20539 TAATTTTAAT
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 20, Indels: 7
0.83 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
157 1 0.01
158 114 0.84
159 20 0.15
ACGTcount: A:0.45, C:0.09, G:0.10, T:0.35
Consensus pattern (159 bp):
AAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAATTTAAATAGTTATG
ACAATTTGAACAATTAATTATATAAAACCATTATAACTTGTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTT
CAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA
Found at i:21177 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 21145--21197 Score: 64
Period size: 18 Copynumber: 3.0 Consensus size: 20
21135 TTACCTAAAC
21145 ATTTCAAAT-AATTATGACT
1 ATTTCAAATCAATTATGACT
21164 ATTT-AAA-CAATTAT--CT
1 ATTTCAAATCAATTATGACT
21180 ATTTCAAATC-ATTATGAC
1 ATTTCAAATCAATTATGAC
21198 CTTTTGTTTT
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 0, Indels: 10
0.74 0.00 0.26
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.21
17 8 0.28
18 10 0.34
19 5 0.17
ACGTcount: A:0.42, C:0.13, G:0.04, T:0.42
Consensus pattern (20 bp):
ATTTCAAATCAATTATGACT
Found at i:21604 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 20381--22393 Score: 1696
Period size: 181 Copynumber: 11.2 Consensus size: 181
20371 CAAAATAAAA
* * * * * * **
20381 AAAAATTAATAAGCAAGA-ATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAATTCTGATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
20445 GCAATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * ** * *
20510 CAATTCGTACAAGCTTGTCCAAAATAAAATAATTTTAATTCATTAATATTCC
130 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
** * * * * * *
20562 AAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGACTA--TTTACCAAATTAGTTCAAATAATTGTG-
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
20624 GTCATTTTAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATCACCTTCTGTTTGGTCATATAACTATTGTTT
66 CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
20689 -TA-TCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTC
130 CTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
20739 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCGAATTAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
20804 CTATTTGAACAATTCTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTTAT-AAACAATTATTTC
66 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
20868 TATTCATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATGTAATAACATTCC
131 TATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** **
20919 AAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAT-TGGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTGA-
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTT-AT
* * * * ** *
20982 GACTATATGAACAATTATCTAATTCAAATCGTTATGACATTTTGTCTCATCATAAAAGAATT-TT
64 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
21046 CTCAATTC--ACATAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC
129 -TCTATTCATACA-AGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * * * * * * *
21099 AAACATTAATATGTAATAGA-TTAAAAAAT-ATTCTATTTACCTAAAC-ATTTCAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACTAGTTCAAATAGTTATG
* *
21161 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
21226 TTACTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTT
130 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* *
21278 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * * * *
21339 ATATTT-AAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTGTGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTT
66 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
21403 CTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
130 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * *
21455 GACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGATCAAATAGTCATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
21520 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC
66 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
21585 AATTCATACAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACTTCA-TTATTAATATTCC
131 TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
21636 AAAAATTAAT-AGTTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * * **
21700 GCCATTTGAACAATTATCGATTTGGAATCGCTATAACCTTTTAG-TTTGTCATAAAATGATT-TT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
21763 ATTTGTTCATATAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-
129 -TCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
21815 AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGCTCAAATCGTTAT
1 AA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
21880 GACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTTTTATTTTTTCATAAAACAATTG
64 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * *
21944 TTTCTATCCATCCAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC
127 TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** * * * *
21999 AACAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA-AAATATTTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * * *
22063 CTATTTGAATAAATGTCTACTTCAAATCATTGTAACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC
66 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** * *
22128 AATTCATGTAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
131 TATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * *** *
22179 AAAAATTAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAAAATAAATTTATTTATTGAA-TAAGCTCAAATAGTTA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAG-ATT-TAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTA
* * * *
22243 TGA-TGATCTT-AACAATTATATATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
63 TGACT-AT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * *
22306 GGTTCTATTCA-ACAAGCTTTTTTCA-AATAAAAAAATA-TAAATTTATTAAT-GTGC
126 GTTTCTATTCATACAAGC-TTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* *
22360 AAAAAATTAATAAGGAAAA-ATTTTAAAAATAAAT
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
22394 TTATTTAAAA
Statistics
Matches: 1460, Mismatches: 311, Indels: 124
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 15 0.01
177 199 0.14
178 84 0.06
179 213 0.15
180 281 0.19
181 434 0.30
182 141 0.10
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184 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
Found at i:25744 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 24867--26599 Score: 1388
Period size: 181 Copynumber: 9.6 Consensus size: 180
24857 CATTAATAAG
* * * * * * *
24867 GATTTAAAAAGTAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTATCT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * **** * *
24932 ATTTCAAAT-GTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGCTTGAACTCATACATGCTTGT
66 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* * * * *
24995 TCGAAATAAGATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTATTAAGTAAGAA
130 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-AA
* * * * * *
25048 -A-TTAGAAAAA-AAA--TATTTACCTAA-CAATTCAAATAGTTTTGACAATTTGAACAATTATC
1 GATTTA-AAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * ** *
25107 TATTTAAAATCATTATGACCTTATATGTTACCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTAT
65 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
*** * * * ** * *
25172 CCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA-TTATAAGATGGATAAGTTAGA
130 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAAA
* * *** * * * * *
25223 GATTTAAAACATCAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTAAACAATTATC
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATC
* * ** ** *
25287 TATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTCAAT-ATACAAGCCTA
65 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTA
*
25351 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGA
129 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAA
* *
25404 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CTGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATAT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * ** *
25468 ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATT
66 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
* * * ** * *
25533 GGGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAA
131 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * * * *
25584 GATTTAAAAAATAAATTTATTTGTCGAGCCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTCTTT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
25649 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTTTTTTTAGCTT-TTACTAA-CTT
66 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-G-TTCATAC-AAGCTT
* * *
25712 ATTTGAAATAAAATAAAAC-AATTTATTAATATTTCAAAATTTAATCAA-TAAGA
128 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-AAGTAAAA
* * * * * *
25765 GATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * ** *
25830 ATTTCAAATCGTTATGACGTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCGTATAAATTTGTT
66 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
* *
25895 T-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----A
131 TGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * *
25942 GATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTATGAATATTT-AGGCAATTATT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATC
* * * * *
26006 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-
65 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
26070 TTCAGATTAATATAATGCTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAA
130 TTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * * * * * *
26123 AATTTTAAAAATAAATATGTATACCGAACTAGATCAAATAGTCATTACTATTTAAATAATTATCT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * ** * *
26188 ATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGGTTATT
66 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
** * * *
26253 CAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTCTGAAAGTTAATAATTAAAA
131 TGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * ** * * * *
26304 GATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTGAATAATTATGACCATTTGAACAATTGTCG
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * **
26369 ATTT-AGAATCGCTTA--ACCTTTTGGTTTGTCATAAAATGATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTA
66 ATTTCA-AATCG-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* *
26430 TTTCG-AATAACATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAA
129 TTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAAA
* * * *
26483 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTGTTT
1 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
26548 ATTTCAATTC-TTATGA-CTTTTGCGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
66 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTT---GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
26600 ATGACAAAAC
Statistics
Matches: 1229, Mismatches: 271, Indels: 103
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.00
176 57 0.05
177 220 0.18
178 10 0.01
179 134 0.11
180 305 0.25
181 454 0.37
182 43 0.03
183 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAA
Found at i:26162 original size:358 final size:357
Alignment explanation
Indices: 24846--26599 Score: 1366
Period size: 358 Copynumber: 4.9 Consensus size: 357
24836 GCTAAATTAA
* * * * * * * * *
24846 TAATATTC-GAACATTAA-T-AAGGATTTAAAAAGTAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAA
1 TAATATTCTGAAAATTAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACCAATTCAAATAG
* * * * * *
24908 TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-
66 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTT-GTCATAAAACAAT
** * * * * * * *
24971 TTGCTTGAACTCATACATGCTTGTTCGAAATAAGATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT
130 TTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATT
* * * * * *
25036 ATTAAGTAAGAA-A-TTAGAAAAA-AAA--TATTTACCTAAC-AATTCAAATAGTTTTGACAATT
192 AATAAGTAA-AAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * **
25095 TGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTATATGTTACCATAAAACAATTATTTCAGTTC
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTC
* * * * * *
25160 ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACT-TTAT
320 ATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGCTAT
* * * * * * * * * *
25197 TAATATTAT-AAGATGGATAAGTTAGAGATTTAAAACATCAATCA-ATTTATTGAATCAGTTCAA
1 TAATATTCTGAAAAT---TAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCGAACCAATTCAA
* * * * * *
25260 ATAATTAT-AGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTGCCATAA
62 ATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTG-TTTGTCATAA
** * * *
25323 AACAATTGTTTTTCAAT-ATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA
124 AACAATT-TTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAG
* *
25387 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-GTTCAAATAGTTATGAC
186 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * ** *
25451 TATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTAATTAT
251 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTT
* ** * *
25516 GTTCATACAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACAAATGC-AA
316 GTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGCTAT
* * * * *
25557 TAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTCGAGCCAGTTCAAA
1 TAATATTCTGAAAA-T--TAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACCAATTCAAA
* * * * * * * *
25622 TAGTTAAGGCTATATGAATAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAAC
63 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTGTCATAAAAC
* * *
25687 AATTTTTTTTAGCTT-TTACTAA-CTTATTTGAAATAAAATAAAAC-AATTTATTAATATTTCA-
127 AA-TTTTTTT-G-TTCATAC-AAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AG
* * * * * *
25748 AAATTTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATAA
186 AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGA
*
25812 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACGTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTT
250 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTT
* ** * *
25877 TGTTCGTATAAATTTGTTTAGAATAAAATAATACTAAT-CTAT
315 TGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGCTAT
* * *
25919 TAATATTTTGAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAATTCAAATAG
1 TAATATTCTGAAAATTAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACCAATTCAAATAG
* * * * *
25983 TTATGAATATTT-AGGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTATTATAAAACAA
66 TTATGACTATTTGA-ACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTT-TGTCATAAAACAA
* * * * * *
26047 TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAATATAATGCTAATTTATTAATATTTTGACAATT
129 T-TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATT
* * * * * * * *
26112 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTATACCGAACTAGATCAAATAGTCATTACTATTTA
192 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
26177 AATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAA-AAAT-TATTTCAGTTC
257 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGT-TTT-TGTTC
* * *
26240 ATATAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGTTAT
320 ATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGCTAT
* * * * * **
26277 TAATATTCTGAAAGTTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAA-CAAGTTTGA
1 TAATATTCTGAAA---ATTAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACCAA-TTCAA
* * * ** *
26341 ATAATTATGACCATTTGAACAATTGTCGATTT-AGAATCGCTTA--ACCTTTTGGTTTGTCATAA
62 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA-AATCG-TTATGA-CTTTTTGTTTGTCATAA
** * * * *
26403 AATGATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAACATAATACAAATTTATTAATATTAAGAC
124 AACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAA
* * *
26468 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATCGTTATGACTA
188 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
26533 TTTGAACAATTGTTTATTTCAATTC-TTATGA-CTTTTGCGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT---GTTTTATCATAAAACAAATGTTTT
26596 TGTT
315 TGTT
26600 ATGACAAAAC
Statistics
Matches: 1125, Mismatches: 218, Indels: 110
0.77 0.15 0.08
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354 3 0.00
355 2 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
TAATATTCTGAAAATTAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACCAATTCAAATAG
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TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATA
AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAA
GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGCTAT
Found at i:26279 original size:539 final size:532
Alignment explanation
Indices: 25100--51803 Score: 5408
Period size: 539 Copynumber: 49.5 Consensus size: 532
25090 CAATTTGAAC
* * * * * * *
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* * * ** *
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66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-TTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * ** * *
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129 AAAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *
25293 AAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTT-TTCAATATACAAGCCTATTTGAA
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*
25357 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
253 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
** * * * *
25422 GTTTATCGAACTGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACC
314 GTTTATCGAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT
* **
25487 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACAAA
379 TTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAA
* * * ** * *
25552 TGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTCGAGCCAGT
444 TGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAGA
* * *
25617 TCAAATAGTTAAGGCTATATGAAT
509 TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * * *
25641 AATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTTTTTTTAGCTT-TTA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAATTATTTCAG-TTCATA
** * *
25705 CTAA-CTTATTTGAAATAAAATAAAACAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATCAA-TAAGAGAT
64 -TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTATTAATATTTCAAAA-TTAAT-AAGTAAGAGAT
* * * *
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126 TTAAAAAATCAA-TCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
25832 TTCAAATCGTTATGACGTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCGTATAAATTTGTTTA
190 TTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTGTTCATATAAACTTATTT-
* * * *
25897 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATAT
251 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * *
25962 TTATCAAACCAATTCAAATAGTTATGAATATTT-AGGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT
316 TTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT
* * * * * * *
26026 TTTTATTCTATTATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAATATAATGCTA
379 TTTTATTCTATCATAAAACAATTA-ATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAA
** * * * * * * * *
26090 ATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTATACCGAACTAG
443 ATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAG
** *
26155 ATCAAATAGTCATTACTATTTAAAT
508 ATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* *
26180 AATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* * * * *
26245 AGGTTATTCAAAATAAAATAATACTATGTTATTAATATTCTGAAAGTTAATAATTAAAAGATTTA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAT-TTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * ** * * *
26310 AAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTGAATAATTATGACCATTTGAACAATTGTCGATTT-A
129 AAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
26374 GAATCGCTTA--ACCTTTTGGTTTGTCATAAAATGATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAA
194 -AATCG-TTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTGTTCATATAAACTTATTT-GAA
* * * *
26437 TAACATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
254 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTG
* * *
26502 TTTATCGAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTCAATTC-TTATGACT
315 TTTATCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT
** * * ** * * *
26566 TTTGCGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT-ATGACAA----A---ACAA-AAGAT--TA-
379 TTT--TATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCAT-ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* * ** * * * * **** * ** * ** * **
26619 TAACGGTA-AATATT-T--TATTCTATTAGCCT-GCCCAGTGCAAATATTTATGAT-TGT-TTGA
441 AAATGCAATAATATTCTAAAAAT-TAATA-ACTAAAAAATTTAAAAAATAAAT-ATATATACCGA
* ** * *
26677 A-CA-ATTATCTATTTCAAGTCGT-TATAACAT
503 ACCAGATCAAATA-GTCAAGAC-TATATAA-AT
* * * ** * *
26707 --TT-TGTGTTATCACAAATC---A--A----TTGTTTCTATTCAT-ACAAGTTTATTTGAAATA
1 AATTATCTATT-T-A-AAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TA-TCATAAAAAAATTATTT-CAGT-
* * * * ** * * * * *
26759 ACATAATTCTAGCTTATT-AATATTCCAAA-AAT--TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
59 TCAT-A-T-AAGCTTATTCAA-AAT-AAAATAATACT-ATTTATTA-ATATTT-CAAAATTAATA
* * * * * ** * * * **
26820 TGTTTACTAAACAACTTAAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGCTATAA
116 AG--TA--AGA-GATTTAAAAAATCAAT--CTATTT-ACCGA--A-CTAGTTCAAATAATTATAA
* ** * * * **
26885 CCTTTTG---TTTTGTC-A--T-AAAAC---A--A-TTTT-TTCTAT-TCATACAA-GGTTATTT
170 CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTT-T-TGTCATAAAACAATT-TTT
** * * ** * * *** *
26934 TAAATAAAATAAACCAAATTT--AT-TAAT-ATTC-AAACAATTAA-A---A-AAAA-TAAA---
232 T-GTTCATATAAA-CTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG
* * *
26985 AGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTTTCAAATAACTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
295 AGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTATCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
27050 TTATTTTAAATCGTTATAACTTTTTATT-T-TTATAAAATAATTATTTTTATTTATACAAGCTTA
358 TTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTA
* * ** ** * * * * * *
27113 TTCAGATTAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA
423 TTCAGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAA
* * * ** * *
27177 TAAATATGTTTATCGAATAAG-TCCAAATAGTCATA-ACTATTTGAAT
487 TAAATATATATACCGAACCAGAT-CAAATAGTCA-AGACTATATAAAT
* * * ** * *
27223 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTT-TTTCATTTTAAAACAATTGTATT-AGTTCATA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAAAAATTAT-TTCAGTTCATA
** * * **
27285 TGGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAACGAGTAAGAGATT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * * * * * *
27350 TAAAAAATTGTATTTGTTTACCGAAATAGTTTAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATCTATT
127 TAAAAAA-TCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
27415 TCAAATCATTTTCACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTATTTCTATTCACACAAGCTTATTTCG
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTT-G
*
27480 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCA-AAAACTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAAT
252 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG-AG--ATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
27543 ATATTT-TCAGAACACGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAATAATTA-TTA-TTCTGAATAGTTA
312 TTGTTTATC-GAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC-AAATCGTTA
* * * * ** *
27605 TGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
374 TGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* ** * * * * * *
27670 ACTAATTTATTAGTATTCCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-A
439 ACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGA
* * * * *
27733 AGCAAGCTCAAATAGT-ATGACCATTTAAAT
503 A-CCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * ** * * * * *
27763 AATTTTTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATAT
* * * *
27827 AAGTTTATT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTTGAA-A-A
65 AAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG-T-AAGAGA
* * ** * * *** * *
27889 TTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTCAGGTCCGTTTGAATAATTATCTA
125 -TTTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTA
* *
27954 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAGAA-TTATT
189 TTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATA-AACTTATT
* * * * *
28018 TAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCT
250 T-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* ** * * *
28083 ATTTA-CTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATGTT-AAATTGTTATG
314 GTTTATC-GAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATCGTTATG
* * * ** * * * * * *
28146 A-TCTTTATTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATATGCTTTTTC-G-----GAT--T--
376 ACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* * * * * *
28200 -AA-G--ATAATA--CT--AATTTAATAA-TAAAAAA--T---AAAT--ATGT-TTTGCTGATCC
441 AAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACC
* * *
28248 AGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAAC
506 AGATCAAATAGTCAAGACTATATA-AAT
* * * * * * *
28275 AATTATTTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAG
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* ** * *
28339 AAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATCAATAAGCAAGAGATT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * * * * ** * *
28403 TTAAAAAATTAATATGTTTACCTAACAAGTTGAAATAGGTATGACTATTTGAACAATTATCTA-T
126 TTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
28467 TCAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAATTTATTCG
191 TC-AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTG
* * * * * ** *
28532 AAATAAAATAGTACTACTTCATTAATATTTCA-AAATTATCAAGCAAGAGATTTAAGCAATAAAG
252 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** * *
28596 CTATTT-TCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGCTAT
312 TTGTTTATC-GAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * * * *
28660 GATCTTTGT-TT-TGTCATAAAAAAATTGTTTCT-TATCATACATGCTTATTCGGATTAAAATAA
375 GA-CTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* ** * * * * * * * * *
28722 TACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTG
438 TACAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCG
* ** * * * *
28786 AATCATTTTAAATGGTTAAG-GT-TACTAGAAT
502 AACCAGATCAAATAGTCAAGACTATA-TA-AAT
* * * * * * * * *
28817 AATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTG-TTTAGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* * * * * * * *
28881 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTCATTTCTTAACATTTAAAAAACTAATAAGCAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * **
28946 GAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTT
128 -AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * * * * * ***
29011 AAAATTATTCTAAACTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCAGTTTATA-AAAGCTTATCCAA
192 CAAATCGTTAT-GACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAA-CTTAT-TTG
* * ** *
29075 AATAAAATAATGCTATTTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
252 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** * * * * * * *
29140 AATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATTA
313 TGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
* ** * *** * *
29205 TCTTTTGT-TT-TATCATAACACAATTCTTTTTCAACATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATTAT
377 -CTTTT-TATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT
* ** * * * * * * * * * *
29267 ACTAATTTATTAATATT-TCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATCT-AAAAATAAATCTGTTTACCAA
439 ACAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGA
** * * * * * *
29326 AATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAT
503 ACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * ** *
29356 AATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTCTTCATACA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* * * * * * *
29420 AGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * * * *
29485 AAAAATAAATCCATTTGCC-AACCAATTCAAACAATTA-AGACTATATGAACAATTGTCTATTTT
129 AAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATA-ACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * ** *
29548 AAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGAAA
193 AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTG-AA
* *
29613 TAAAATAA-ATCTAATTCATTAATATTTCA-AAATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATT
254 TAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTT-AGAAA--AT-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * *
29675 CTATTTA-CAGAACCAATTCAAATAATTATAAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATTTTATT
313 -TGTTTATC-GAA-CAATTC-----------AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TTTATT
* * * ** * * * * *
29739 TCAAATCATTATTG-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-T
363 TCAAATCGTTA-TGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCA
* ** * * * * *
29802 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
427 G-AATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCTA-AAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAA
** * ** ***
29866 ATCAGT-T-TACAAAATCATTTCAAATAGTTTTGACTATATAAAT
490 AT-A-TATATACCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * ** * ** * ** * * *
29909 AACTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTTGTCAAGCAGTTGGTTCTA-TTGAGAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATAT
** *** * ** * *
29973 AATTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** * * * ** * * * *
30038 AAAAGATAAATCTAATTGTCGAACCAGTTCTAATAGTTA-AGATAATATGAGCGATTAACTATTT
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATA-ACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * ** *
30102 CAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAATAAATTTTTTTGTTCGTACAAGTTTATTCGAA
192 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAA-TTTTTTGTTCATATAAACTTATTTGAA
* *
30167 TTAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
254 -TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * *
30231 TTGTTTACCAAACCAGTTTATAT-GATTAAT-ACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATTGTT
312 TTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAG-TT-ATGACTATT-TGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * * ** * * *
30293 TTTACTTTTTGTT-TAGTCATAAAGCAATTGTTTCA-ATACATACAAGCTTATTC-GAAATAAAT
373 ATGACTTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA
* * * * * * * * * *
30355 TAATACTAACT-TATTAAGATTCAAAAAATTAATAA-GAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTTTT
435 TAATAC-AAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAA-AAATTTAA-AAAATAAATATATA
* * * * * * *
30418 TATCGAA-CAAATTTAAAATAGTTATA-ACTATTTGAAC
497 TACCGAACCAGA--TCAAATAGTCA-AGACTATATAAAT
* * * * * * * * * * *
30455 AATTGTTTATTTAAAATTGCTAAGACCTTTT-TTCTTTTTATAAAACAATTGTTTCAGTTAATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* * * *
30519 AAGTTTATACATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * ** *
30584 AAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TCAGTT-AAATAGTTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTT
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
30647 CAAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTTTTGTCATATAAGCTTATTCA
192 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T--TTTTTGT-TCATATAAACTTATT-T
* * *
30712 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTTATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
251 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * ** ** ** * * * * *
30776 TTTGTTGAACCGGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAACTATTTATTTCAAATCGTTCTAACA
315 TTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT
* * ** * * * * * *
30841 TTTT-TT-TAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTAATTCGGCATAAAATAATCCT
379 TTTTATTCTA-TCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACA
** * * * * * * * * *
30903 AATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGC-AAGAAATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGTAT
442 AATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAAAAAATTT-AAAAAATAAATATATATACCGAAC
* * * * * * * *
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505 CAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * ** * *
30995 AATTAAT-TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTTATAA
1 AATT-ATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCAT-A
* * * * * *
31059 AAAGGTTATCCAAAATAAAATAATGCTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* *** * * * * * * * * *
31123 TAAAAAAATAAATGC-ATTTTTTGAACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTAAACAATTGTATAT
127 T-AAAAAATCAAT-CTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
31187 TTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCAGTTTAT-TAAAGCTTATTT
190 TTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAA-CTTATTT
* * ** * * *
31251 GAAATAAACTAATAATAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATATGTAAGTGATTTAAAAAGTGAA
251 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** * * ** * *
31315 TCTGTTCACCGAATCAATTCAAATAATTATGGTTGTTTCAACAATTACCTA-TACAAATCATTAT
311 TTTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * ** * ** *
31379 GAACATTGT-TT-TGTCATAAAACAATTTTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAACTAAT
375 G-ACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* ** * * * * * * *
31442 ACTAATTTATTAATAATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG-
439 ACAAATGCAATAAT-ATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGA
* * *
31505 A--AG-T--AGT--TC----CTATTTGAAT
503 ACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * ** * *
31524 AATTACCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTAT-AAGTAATTGTTTCA-TTCATAGA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* * * * * *
31587 AGCTTTTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTGAAAATTAACAACTAAG-GATTTA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
31651 AAAAATAAATTTGTTTACTGAAGC-AGTTTAAATAATTA-AGATACA--TGAAGAATTATCTATT
129 AAAAATCAATCTATTTACCGAA-CTAGTTCAAATAATTATA-A-CCATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * *
31712 TCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGA
191 TCAAATCGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTG-
* * * * * *
31777 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTGATTTGAAAAGTGAATTTGT
252 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * * * *
31841 TTACCGAATCATTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCT
316 TTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTT
* * * * ** * * * ** * * *
31906 TTTGTT-TGGTCATATAACAAATGTTTATGATCTTTCAAGCTTATTTGGAATACAATTATACTAA
380 TTTATTCT-ATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAA
** * * * * *** * * * *
31970 TTTATTAATCTT-TCAAAAATTTATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCA-
444 TGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAG
* * * * * *
32033 ATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
508 A-TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * ** *
32059 AATTGTATACTTCAAA----T-TG---TTTTG-----TCACAAAACAATTATTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
*** * * * * *
32111 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAATT-
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
32175 AAAAATAAATTTGTTTGA-TGAACTAGTTCAAATATTTA-AGACTATATGAACAATTAT-TAATT
129 AAAAATCAATCTATTT-ACCGAACTAGTTCAAATAATTATA-ACCATTTGAACAATTATCT-ATT
* * *** * ** *
32237 TCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAAATTTTCAATTCATGCT-AGTTTATTCG
191 TC-AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTGTTCAT-ATAAACTTATT-T
* *
32300 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAT
251 GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
32363 TTTTGTTTACCTAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTT
310 ATTTGTTTATCGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * * * * *
32428 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGT-CTT-TGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAA
374 TGACTTTTTATTCTATCATAAAACAAT-TAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * * * *
32491 TACTAAT-CTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTGTA-
438 TACAAATGC-AATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAA--TATATATAC
* * * * *
32550 --AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACA-
500 CGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATAT-AAAT
* * * ** * * * *
32581 AATTAT-TGATTTTAAATTGTTATGACATTTTGTCCTATTATAAAAAATTTGTTT-ATATTCATA
1 AATTATCT-ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCA-GTTCATA
* * * * * * * * *
32644 CAAGTTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAAT-AGAAATT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * * * * * * *
32708 TTAAAAAATAAATATATTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATT
126 TTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * ** *
32773 TTAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTGTCATAAGAGATTTGTTTTAGTTCATGTAAGGTTATTCGG
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT-GTTCATATAAACTTATT-TG
*
32838 GATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAGTTAAGAGATTTAGAAAAA-AA
252 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATT-A-A--TAAGAGATTTA-AAAAATAA
* * * ** *
32900 ATCTGTTTA-CAGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTG-A-AATT-GCTA--T--AA-CCTT
310 ATTTGTTTATC-GAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * ** * *
32956 TTG--TTTTGA----A--ATAAAATAATTTTTTTCTGTTCATAAAAGCTTATATC-GAATAAAAT
373 ATGACTTTTTATTCTATCATAAAACAA-TTAATTATGTTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAAT
* * * * * * * *
33012 AATACAAAAT-TATTAATATT-AAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
436 AATAC-AAATGCAATAATATTCTAAA-AATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATA
* * * * * * * * *
33075 TCAAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAAC
499 CCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * *
33108 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTCTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTCTA-TTCATA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATA
* * *** * * *
33170 CAAGGTTATT-TGGAT-TAA-AATA--A--TATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAGATTT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * ** * * * ** * * *
33228 AAAACATAAATATGTTTATCGAACAAGTTGTAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTACTTC
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *** * * *
33293 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAACTGTTTCAATTCAAATAAGCTTGTTTGAAA
193 AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTGTTCATATAAACTTATTTG-AA
* * *
33358 CAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATAT
254 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * *
33422 GTTTATCGAACAAGCTCAAATAGTTATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGGC
314 GTTTATCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-GA
* * * ** * *
33487 CTTTTCTTTTGT-TC-TAAAGCAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA
377 CTTTT-TATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATA
* * ** * * * ** *
33549 TAAATTG-ATTAATATTAAAAAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCTAA
440 CAAA-TGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAA
* * * ** * * *
33612 ACATGTTCAAATAGTTATA-TTTATTTGAAC
504 CCA-GATCAAATAGTCA-AGACTATATAAAT
* * * * * ** * ** *
33642 AATTATCCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* * * *
33707 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTT
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* ** * * * * * *
33772 AAAAAAT-ATATCTGTTTATTG-AGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
128 AAAAAATCA-ATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * ** *
33835 TTAAATCGTTATGATCTTTTGTCTTCTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAA
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTGTTCATATAAACTTATTT-G
* * *
33900 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAACTTAATAAGTTAAAAATTTTAAAAATAAAT
252 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * ** * * ** *
33964 CTGCTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGGCAAGTTTATTCGAACTATTAGCTATTTCAAATCATTAT
312 TTGTTTATC-GAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT
* * * * ** * * * **
34028 GACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTCAGAATAAAATAATA
375 GACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
* ** * * * * * * *
34093 C-TATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAA
440 CAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAA
* * * * * *
34152 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATGA-GAAC
504 CCAGATCAAATAGTCAAGACTAT-ATAAAT
* * * ** * * *
34181 AATTATCTATCTAAAATCGTTATGATC-TTT-TTTTCTCATAAAGTAATTGTTTGTA-TTCATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTT-CAGTTCATAT
* * * * * * * * *
34243 AAGCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
34308 -AAAAATAAATGTGTTTACCAAACCAGCTT-AAATAGTTA-ACACTATTAGAATAATTAGCTATT
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAG-TTCAAATAATTATA-ACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** *
34370 TCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAAATT-ATATAATTATTTATT
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT--TGTTCATATAA--ACTTATT
* *** ** ** * *** * * **
34434 TAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTAACATAAAATAATTGT-TTCAATTCATAAAATCTTATCCA
250 T-GAAT-AAAATAA--TACTAATTT---AT-TAAT-ATT-TAGAAAATTAATAAGAGATT-T---
* * * * * * *
34498 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTGAAA-AG-TAGGA-GATTTAAAAAAA
301 -AA-AAAAT-A-A--A-TTTGTT--TA--TCGAACAATTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAA
* * * * ** * *
34559 TAAATCAGTTTGTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCTTTACGACTT
354 TTATTTA--TT-TCAAATC-GTTATGACTTTTTATTC---TA-TCA--T-AAA-----AC-AATT
* * * * * * ** * * * **
34624 -TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCACACAAGTTTATTCGGACTAAAATAATATTAA
402 AATTA-TGT-TCAT---ACAA--G--CTTATT--CAGAA-TAAAAT---A--ATA-CAA-ATGCA
* * * * * ** * * * **
34688 TTTATTAATATTTTGACAAA-TAAAAAGTAAAATATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAATAAG
448 ---A-TAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAG
* * * * *
34752 TTTAAATAGTCATAG-CTATTTGAGT
508 ATCAAATAGTCA-AGACTATATAAAT
* * * * * * * *
34777 AATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATT-AATTTATAT
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTAT-TTCAGTTCATAT
* ** * * *
34841 AGGCTTATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATAT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** * * *
34905 AAAATATGAATCGATTTACC-AGA-TAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGA-ACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * ** *
34968 TGAAATTGTTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCGTACAAGTTTAATTCG
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTT-ATTTG
*
35033 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAA
252 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAA
* ** * * *
35096 TATGTTT-TCTGAACATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATCTGTTTCAAATAGTTA
311 TTTGTTTATC-GAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * ** * * * *
35160 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATATAAACTTATT-TGAAATAAAATAA
374 TGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* ** * * * * * * * **
35224 TAC-TATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAAATAAATCTATTTATTGA
438 TACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGA
* * * * * * * * * * *
35288 GCAAGTTCATATCA-TTATGATTGTTTGAAC
503 ACCAGATCAAAT-AGTCAAGACTATATAAAT
* * * ** * * * *
35318 AATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATAT
* * * * * * * *
35382 AAGTTTATTTAGATTAAAATAATACTATTTTACTAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-TTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
35447 AAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAATAAGTTTAAGTAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTAT
128 -AAAAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATA-ATTATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
35510 TT-AAAGTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCC
190 TTCAAA-TCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTAT-T
** * * * *
35574 AAAATAAAATAATACTACTTTTTTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAAACTAA
250 TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * **
35638 AGTTATTT-TCCAAACTAGTTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAA--A--TAACTCAAATCGTT
310 ATTTGTTTAT-CGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
** * * * *
35698 ATGATCTTTGTT-TTC--TCATAAAA-AATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTTAG-ATAAAAA
373 ATGA-CTTT-TTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAA
* ** * * * * * * * *
35758 TAATACTAATTTAATAATATT-TCAGAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTG
435 TAATACAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATA
* * * *
35818 CCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTAT-TATAAT
499 CCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATA-AAT
* * ** * * * * * * *
35852 AACTATCTATTTCAAATCACTCTGACCTTTTG-TTTAGTCACACAATAATTGTTTCAATTCATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* *** * * **
35916 AACCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAGCATTAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
35980 GAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAGTAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
128 -AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * **
36045 AAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTAGTTCATA-AAATCTTATTCAA
192 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT-GTTCATATAAA-CTTATTTGA
* * *
36109 ATAAAATACTACTACTTTATTAATATTTCA-AAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
253 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * * * *
36173 AGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTA
313 TGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * ***
36238 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTTTTCAGCATAC-AGCTTATTC-GAAATAAAATAATAC
377 CTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATAC
* ** * * * * * * * * *
36300 TAATTTATTAATATT-TCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATCTGTTTACCAAAC
441 AAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAAC
* * * * *
36360 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
505 CAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * *
36388 AATTATCTATCTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-A---GT-TC
** ** * *
36453 AATTAACATAAGCTTATTTGACGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGT
61 -A-T---ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT
** * * * * * * * * * *
36518 AAGAGAACTAGAAAAATGAATCTATGTACCAAACAACTTCAAAGAGTTATGACTATCT-AGACAA
119 AAGAGATTTA-AAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGA-ACAA
* * * * * **
36582 ATATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTGTTCATCCAA
182 TTATCTATTTC-AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTGTTCATATAA
* * * * * * * *
36646 GCTAATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTAATTAATATTCCA-AAAGTTAATAAGCAAAACTTTC
243 ACTTATTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG--AGA-TTTA
* * * * * * *
36709 ATAAATAAATTTGTTT-TCTGAACACGTTCCAATAATTATGACCATTTGAAGAATTATCTATTTC
302 AAAAATAAATTTGTTTATC-GAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
** * * * ** * *
36773 AAATCGTTATGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA
365 AAATCGTTATGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAA
* * ** * * * * * * *
36838 TAAAACAATACTAATTTATTAAAATTCCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTT
430 TAAAATAATACAAATGCAATAATATT-CTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATAT
* * * ** * * * * *
36903 TTTTA-CAAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
494 ATATACCGAA-CCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * ** * * * *
36942 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATAT
** *** * * * *
37006 AATTTTATTTGGAATAAAATAATAATATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTAAGTTAGAGATTTA
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * ** * * **
37071 AAAAATAAATATATTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTACCATCTATTTC
129 AAAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
37135 GAACCGTTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCAG
193 AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-CAA-T-TT-----T--TT-G--TTCAT
* * ** * * *
37200 ACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAAC-AATTTGTTACTATTTCA-AAAATTAATAAGA-ATTA
239 ATAAACTTATT-TGAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGAGATTT
* ** * * * * ** *
37262 AAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAACAATTATCTATTTC
301 AAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
* * * * * * ** * *
37327 AAATTGTT-TCAACCTTTTGTT-TAGTCAAAAAATAATTGTTTCA-GTTCATACATGCTTACTTG
365 AAATCGTTAT-GACTTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAAGCTTA-TTC
* ** * ** * * *
37389 A-AATAAAATAATACTAATTTATTACCATTCAAAAAATTAATAAGC-AAGAAATTAAAAAAATAA
426 AGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAAAAAATTTAAAAAAT-A
* * ** ** * * * *
37452 AATATGTTTACATAATAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAAT
489 AATATATATACCGAACCAGATCAAATAGTCA-AGACTATATAAAT
* * * * * **
37496 AATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTAAATA-
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* * * * *
37560 AAGGCATATCCAAAATAAAATAATATTACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGATTT
65 AA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * **** ** * * * ** *
37625 AAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-TCAGTTCAAATTGCAACGACTATTTGAATAATTGTAAACT
128 AAAAAATCAATCTA-TTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
37688 TCAAATTGTTAT-ATCCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
191 TCAAATCGTTATGA--CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTGTTCATATAAACTTATTTG
* * * * * *
37752 AAATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCA-AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAGTAAA
252 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * * * * * *
37816 TTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTACTTCAAATCATTAT
311 TTTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * **
37881 GATCTTTTGT-TT-TTTCATAAAATAAGTT-TTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAA
375 GA-CTTTT-TATTCTATCATAAAACAA-TTAATTAT-GTTCATACA-AGCTTATTCAGAATAAAA
* ** ** * * * * * * *
37942 TAAAATGAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA
435 TAATACAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATA
* * * * * * * * *
38006 CCTAACCAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAAC
499 CCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * *
38040 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT-TTT-TGTTCATA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAAT-TATTTCAGTTCATA
* * * * * *
38103 TAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTC-AAA-TATTAA-TAAGAGATTT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** * * * * * *
38165 AAAAAATAAATCTATTTTTCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * ** * *
38230 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTCGATT
193 AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTGAAT
* * * * * *
38295 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-ATAGTTGATAGGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATG
255 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * *
38359 TTTA-CGAACTAGA-T-AAACTAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGG
315 TTTATCGAAC-A-ATTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
* * * ** * * ** * * **
38421 CCTTTTGTTTTGCCATAAAAGAAATGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGT
377 CTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* ** * ** * * * *
38485 TAATTTATTTGTAATTC-AAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA
441 AAATGCAATAAT-ATTCTAAAAATTAATAACTAAA-AAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAA
* * * * * * * * * * *
38548 -TAAATTTAAAAAATTATGATTGTTTGAAT
504 CCAGA-TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* ** * * * ** * * * *
38577 AATAATCTATTTGGAATTGCTATAACC-TTTGTTTTGCCAT-AAAAATTTTTTTCTA-TTAATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATAT
* ** * * * *
38639 AATCTTATTTC-AAATAATTTAA-ATCAAATTTATCAATA-TT-AAGGCAATTATTAAGTAAAAG
65 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-C-TATTTATTAATATTTCAA---AATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * ** *
38700 ATTTGAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATCATTATGACTATTTGTGCAATTATTT
124 ATTTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCT
* * * * * **
38764 ATTTCAACTTGTTATGGCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGTTTATTT
188 ATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTGTTCATATAAACTTATTT
* * * * * *
38829 AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAATAAAAGATATAAAAAAAATA
251 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-AGAA--AATTAATAAGAGAT-T-TAAAAAATA
* * * * * * *
38894 AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
309 AATTTGTTTATCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * * * ** * * *
38959 ATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAT-TTCATATAAGTTTATT-TGAAGTAAAAT
373 ATGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAAT
* ** * * * * * * * *
39022 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAA-CTAAAAAA-AGAATATGTTTA
436 AATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAA-AAAATTTAAAAAATA-AATATATATA
* * ** * * * * ** *
39085 TCAAATAAGTTCTAATAGTTATGACTACCTGAAT
499 CCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * ** * * * * *
39119 AATTATTTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTCGTTTTGCCACAAAACAATTGGTTT-TGTTCATG
1 AATTATCTATTT-AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATA
* * *** * *
39182 CAAGCTTGTTTTGAATAAAATAATTTA-AATTTATTAATATTCCAGAAA-T--TAA-T-A-AGA-
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAA--TACTATTTATTAATATTTCA-AAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *
39239 --AAAAAAT--ATGT-CTT-CTGAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
126 TTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTA-GTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTAT
*
39297 TTCAAATC-ATATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTATTTTTGTTCATA-AAAGCTTATT
190 TTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA-T-TTTTTGTTCATATAAA-CTTATT
* * * *
39359 CGGAATAAAATTAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
250 -TGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATA
* * * * *
39424 AATCTATTTAGC-AAGCAAGTTCAAATAGTTTTAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
309 AATTTGTTTATCGAA-CAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
* ** * * *
39488 TATGATCTTTTCT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAGTTTATTC-GAAATAAA
372 TATGA-CTTTT-TATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAA
* ** * * *** * * * *
39550 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTG
434 ATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATA
* * ** * ** * * * * *
39615 CTGAACAATTTCCAGCAGTCATGTCCATTTGAACT
499 CCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATAT-AAAT
* * * ** ** * * *
39650 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATTGTAAAACGATTGTTTTTAG-TCATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATAT
** * * *
39713 AAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA--AATTAGT-AGAGATTTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * * *
39774 AAAACTTAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCA
129 AAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCA
* ** * * * * * **
39839 AATAG-TATGA-TCATGTTTTGTCATAAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAATCAAAGT
194 AATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTGAA-T
* ** * * *
39902 AAAATAATGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
255 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * *
39967 TT-GCTGAATCAGTT-ATAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGAC
316 TTATC-GAA-CAATTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC
* * ** * * *
40030 TTTTTATTTTGTCAT-AAA-AATTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATT-TGAAATAAAATAATA
378 TTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTAT--GTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* * ** * * * * *
40092 TAATTTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGC-AAGAAATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACC
440 CAAATGCAATAATATTCTA-AAAATTAATAA-CTAA-AAA-ATTTAAAAAATAAATATATATACC
* * * * * * * *
40155 -AAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
501 GAACCAGA-TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * *
40187 AATTATCTATTTAAAATCATTACT-ACCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* * *
40250 AAACTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGT-TGAAGAT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-TTTATTAATATTTC-AAAATT-AATAAGTAAG-AGAT
* * * ** *
40313 TTAAAAAATTAAT-TAGTTTATCGAAC-AATTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTAT
126 TTAAAAAATCAATCTA-TTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * *
40376 TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTT-TTCATCATACAAGCTTATTT
190 TTCAAATCGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTGTTCAT-ATA-AA-CTTATTT
* * *
40440 GGAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAAAAGTAGGAGAATTAAAAAATAA
251 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * * * *
40504 ATATACTTATCGGACTAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTA
310 ATTTGTTTATCGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA
* * * * *
40569 TAACCCTTTT-TT-TGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
374 TGA-CTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
** * * * * * * * * * **
40632 TATTAAT-CTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTGCTA
438 TACAAATGC-AATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCG
* * * * *
40696 AACCA-ATTCAAATATTTAAGGCTATATGATT
502 AACCAGA-TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * *
40727 AATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAAATGT-TTT-TGTTCATA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAAT-TATTTCAGTTCATA
* * *** * * *
40790 TAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-TTT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * * *
40852 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAGTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTT
127 TAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** *
40917 CAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCCTATTGATATAGTCTTATTCAGA
192 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TT-TTGTTCATATAAACTTATT-TGA
* * * * *
40982 ATAAAGTAATGCTAATTTATTGATATTCTA-AAAATTAATAAGTTCAGATTTAAAAAATGAATAT
253 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * * *
41046 G-TTAGCCTGACCAGTAT-AAATAGTTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATA
314 GTTTA-TC-GAACAAT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * ** * * * * * * * *
41109 ACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATGCATATAAGCTGACT-AGGAATAACATAATT
376 ACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATA
* ** * * * * * * * **
41173 CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATCTATTTGTCGAAC
440 CAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAAC
* * * * * * * * *
41238 AAGTTAAAACAATTATGACTATTTGAAT
505 CAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* ** * ** * * * * *
41266 AATTATCTATTTTAAATCACTATAAGATTTTGTTTTGTCAT---AAAATTTTTTTATATTCATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCA-GTTCATAT
* * * *
41328 AAGCTTATTTC-AATTAAAGTAATACAAATTTATTAATA-TTCAAACAACTAATAAGTAA-A-AT
65 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAC-TATTTATTAATATTTC-AA-AATTAATAAGTAAGAGA-
* * * * * * * * * *
41389 TTTTAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAATAATTATTTA
125 TTTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTA
* * * **
41452 TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGTTTATTC
189 TTTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTTTTTGTTCATATAAACTTATT-
* * * *
41517 GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-ACAATTATTAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
250 TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGA-AA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * ** * * * *
41580 ATATGTTT-TCTGAACAAGTTCAGCTCGTCGTAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
310 ATTTGTTTATC-GAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * * * * * *
41644 ATGACCTTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTATCA-ATTCATATAAGCTTAATCAAAATAAAAT
373 ATGA-CTTTTTATTCTATCATAAAACAATT-AATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
* ** * * * * * * * * * * * *
41707 AATACTAATTTATTAATATTAC-AAAACTTAATGAGTAAGAGATTGAAAATATGAATCTATTTAT
436 AATACAAATGCAATAATATT-CTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATAC
* * * * * *
41771 CGAACAAGTTCAAATAG-CTATA-ACGATTTGAAC
500 CGAACCAGATCAAATAGTC-A-AGACTATATAAAT
* * * *
41804 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCATAAAATAAT
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC--------A-
* *
41869 TGTTTCTACTCATACAAGTTTATTC-AAATAAAGTAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
57 -G-TTC-A-T-AT--AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT--ATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * * * * * * * *
41932 AATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTGAAC-ACGATCAAATAGTTATAACTATTT
112 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTA-GTTCAAATAATTATAACCATTT
* * * * * * * * * *
41995 AAATAATTATCTATTTTAAATAGTTGTTACCTTTTGATTTGTCACAAACCAATTGTTTCTATTCA
176 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCA
* * * * * *
42060 TACAAACATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATGAGTAAAAA
238 TATAAACTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATT-A--A-TAAGAG
* * * * *
42124 ATATAAAAAGTAAATATGTTTA-CTGAGCAAGTTC-AA-A--TA--AC-AATT-----A-T-TTT
297 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTT
* * * * * ** * * *
42174 ATTTCATATAGTTATGATGTTTTGTTTTCT-T-ATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA
360 ATTTCAAATCGTTATGA-CTTTT-TATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTA
** * ** * ** ** *
42237 TTTGGAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGTAGATTTAAAAAAT
423 TTCAGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAAT
* * ** * * * * * * * * *
42302 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATACTCATGTCCATTTGAAC
488 AAATATATATACCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * *
42347 AACTATCTATTTCATATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TAGTTTCTA-TTCATG
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTA-TTTC-AGTTCATA
* ** * * *
42410 CAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AG---GAGTTT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * * * * * * *
42471 TGAAAGCTAAATCTATTTACCAAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATC
127 TAAAAAATCAATCTATTTACC-GAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * **
42535 TCAAAT-ATTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAA
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTGA
* * *
42598 AT-CAA-AATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAGTAAGTAAGAGATTT--TAAA-AAA-T
253 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** * ** * * * * *
42656 TGTTTGCCAAACCAATTCATGTCGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGA
313 TGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
* ** * * * *
42720 CTTTTGT-TTAGTAAAAAAAAAAAAACAACT-ATTTTAGTTCA-ACGAA-CTTATTCAAAATAAA
377 CTTTT-TATT-CT----ATCATAAAACAATTAATTAT-GTTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAA
* ** * * * * * * * * * *
42781 ATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT-GCGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTT
434 ATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAAC-TAAAAAATTT-AAAAAATAAATATATA
* * * * ** * * *
42845 TACAGGACAAGTTCAAATAGAT-TTGACTATTTGAAC
497 TACCGAACCAGATCAAATAG-TCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * *
42881 AACTATGTATTTAAAGTCGTTATGACATTTTGTTTTATCCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
** * * **
42946 AATTTA-TCTGAAA-AAAATAATACTAATTTAGTAAT-TTTCAAAAATTAATAACCAAGAGATTT
66 AGCTTATTC-AAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * * *** * * * *
43008 AAAAACTAAAACTGTTTTCCAAACCAATTCAACTAGTTATAATTGTTTGAATAAATATCAATCTC
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
43073 AAATCATTATGA-TCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATATAAGCTTATTCGGAT
193 AAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTGAAT
* * *
43137 AAAAATAAAACTAATTTAATAATA-TTATGAAAATTAATAAGAGATTTATAAAATAAATTTGTTT
255 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-GAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
* ** * * * * * *
43201 GTCGAACCGGTTCAAATAGTTA--ACTATTAGAATAATGATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTT
318 ATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTT
* * * ** * * *
43264 TGTT-TAGTCATATAATAATTGTTTCA-GTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
382 TATTCTA-TCATAAAACAATTAATT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAAT
** * * * ** * * * * * *
43327 TTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGC-ATTAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAG
445 GCAATAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAAAAAATTT-AAAAAATAAATATATATACCGAACCAG
* * * * * * *
43391 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC
508 ATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * *
43416 AATTATCTACTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTGT-AGTTCATAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATT-TCAGTTCATAT
* * * * *
43480 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTAAGATATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-TTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** ** * * *
43545 AAAAAATAAATC-AGTTTATTGAA-TCAGTTCAAATAATTAT-GGCTTTTAAACAACTATCTATT
128 AAAAAATCAATCTA-TTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * **
43607 TCAATTCATTATTACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTCAACATGCATGCTT-TTTCA
191 TCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTGTTC-ATAT--AAACTTATTT--
* * * * * *
43670 AAATAAAGTAATACTAATTTATGAATATTTCAAGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAA-
251 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AGAA--AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
43734 TTGCTTACCAAACCATTTCAAATATTTTTTACTATTTGAATAATTATCTATATCAAATCATTA-G
312 TTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
* * * * ** * * ** * *
43798 AACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTAAAAATAAAATAATA
376 -ACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
* ** * * * * * **
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440 CAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAA-AAAATTTAAAAAATAAATATATA-TACCGA
* * *
43926 ACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATATGAAC
503 ACCAGA-TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
** * * * * * * * * **
43956 GTTTATCTATTTTAAATCTTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCGTACG
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* ** * * * *
44020 AGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA--AGTAA-TAAGAAATTTAA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * ** * * * *
44082 AAAATAAATTTATTTACC-AAATCAATTTAAATGGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATATC
130 AAAATCAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATA-ACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *
44145 AAATCATTATGATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAGAA
193 AAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT-GTTCATATAAACTTATTT-GAA
* * * *
44210 TAAATTAATACTAATTTATTAAACATTCTA-AAAATTAGAAGAAAAGATTTAAAAAAGTAAATTT
254 TAAAATAATACTAATTTATT-AATATT-TAGAAAATT--AATAAGAGATTTAAAAAA-TAAATTT
* * * * * * ***
44274 GTTT-TACTAAAGCAAGTTTAAATAG-TATTCAATAGTTTTATC---TATTT-TAAAAAATCGTT
314 GTTTAT-C-GAA-CAA-TTCAAATAGTTA-TGACTA-TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * * * * *
44333 TTAAACGCTTTTTGATT-TGTCATAAAACAATTGTATT-TAGTTAATAAAAGCTTAGAT-AGAAT
373 AT-GA--CTTTTT-ATTCTATCATAAAACAATT-AATTAT-GTTCATACAAGCTTA-TTCAGAAT
* ** * * ** * * *
44395 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCTAAA-T--TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAGATCTAT
431 AAAATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATAT
* * * * * * * * * * * *
44456 TTATCGAATCAGTTTAAAATAATTATGGCCATTTGAAT
496 ATACCGAACCAG-ATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * ** * *
44494 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTCTTT-TTTATGATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGT-TCATAT
* ** * *
44558 AAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTGGTTAATATTTCAAAAATTAATACGTAATAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
44623 ---AAA-CAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAAATATCAATCTC
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * **
44684 AAATCGTTA-AAATCTTTGTTTTGGCTTAAAACAATTGTTTG-TCATATAAGCTTATTTGGTTAA
193 AAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTGTTCATATAAACTTATTTGAAT-A
* ** *
44747 AAATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAGATATCTAAAAAATAAATGTGTT
256 AAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG--AGAT-T-TAAAAAATAAATTTGTT
* * * ** * * * * * *
44811 TATCGAATTAGTTCAAATATTTAAAACTATTAGAATAATTATATATTTCAAATCGTTCTAACCTT
317 TATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTT
* * * * ** *
44876 TCATT-TAGGCATAAAATATTTGTTTCATAGTT--TACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATCCA
381 TTATTCTA-TCATAAAACAATTAATT-AT-GTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACA
** * * * ** * * * * *
44937 AATTTATTAACATT-TGGAAAATTAAT-AGGAAAAATATTTACAAAAATAAATTTGTTTATCAAA
442 AATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAA-ATTTA-AAAAATAAATATATATACCGAA
** * * * * *
45000 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAC
504 CCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * *
45029 AATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA-CAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* * * * *
45092 AAACTTA-TC-CAA-AAAATATTA-T-TTTCTTAATATTTCAATAATTAATAAGCAAGAG-TTTA
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * * ** *
45151 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAAGTT-AGATAGTTATGACTGTTTGAACAATTGTCTATT
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACT--AGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
45214 TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTTATACAAGCTTATTCGA
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT-GTTCATATAAACTTATTTG-
*
45279 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAATGAAT
252 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
45342 CTGTTTATGGAACCAATTCAAATAATTAT-AGTCATTTTTAACAATTAGTCTATTTC-AATTGTT
312 TTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACT-A-TTTGAACAATTA-TTTATTTCAAATCGTT
* * * * * ** * * * *
45405 ATTACCTTTTGTT-TGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAAT
373 ATGACTTTTTATTCT-ATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAAT
* * * * * * * * * *
45469 AATACTAACT-TATTAATCTT-TAAAAATTAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
436 AATAC-AAATGCAATAATATTCTAAAAATT-AATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATA
** * *
45532 CAAAACCAGTTCAAAATAGT-AACGACTATTTGAAA-
499 CCGAACCAGATC-AAATAGTCAA-GACTATAT-AAAT
* * * * * * * * * * *
45567 ACTTGTATACTTCAACAATCAATTATAAACCATTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCA
1 AATTATCTA-TTTAA-AATC-GTTAT-GACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCA
* * * * *
45632 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGA
62 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGA
* * ** * * * * * *
45697 TTTAAAAAAT-AATTTTTTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATTT
125 TTTAAAAAATCAA-TCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATA-ACCATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
45760 ATTTCAAATCATTATGCTCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTTAATTCATATTAGCTTATT
188 ATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTT-GTTCATATAAACTTATT
* *
45825 CAT-AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAT
250 --TGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAAT
* * * * * *
45887 -AATTCTGTTTACCTAACTAATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
308 AAATT-TGTTTATCGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCG
* * * ** * * * * *
45951 TTATAGCCTTTTGATT-TATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGGAATGAAA
371 TTAT-GACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
* * * * * * * * *
46015 TAATACTAA-CCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
435 TAATACAAATGC-AATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATA
* * ** ** * * * * **
46075 ACAAATTATTTCAACTAGTTATGACTATTTAAGC
499 CCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * ** *
46109 AATTATTTATTTCAAATC-TTATGA-CTCTTTGTTCTGTTATAAAATAA-TAGTTTTTGTTCACA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAAAAATTA-TTTCAGTTCATA
* * * * * * * * *
46171 CAAGCTTATTCGAATTAAAATATTATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAAAT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * * * *
46235 TAGAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGATT-AAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCCAT
127 TA-AAAAATCAATCTATTTACCGAACTAG-TTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTAT
** * * ** * *
46299 TTCAAATAATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCA
190 TTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATT-T
* * * *
46364 AAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATA-TTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGA
251 GAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTA-GAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
46427 ATCTG-TTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTA
310 ATTTGTTTATCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTA
* * * * * *
46491 TAACATTTTGTTTTGTCAT-----AA--AATGAT-TT-AT--AA---TA--CA-AAT----T--T
374 TGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * * * * * * *
46533 ----AT----TAATA-TC-AAGACAATTACTAAGTGAAAGATTTAAACAATAAATTTGT-TACCA
439 ACAAATGCAATAATATTCTAA-A-AATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCG
* * * * * * * *
46587 AACAAGTTCAACTCGTTATGACTATTTGAAT
502 AACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * **
46618 AATTTTTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT-T
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
*** * * * * * * *
46682 CAAGCTTATTTGGATTAAAATTATATTAATTTGTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATT
65 -AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * ** **
46747 TAAAAAATAAATATGTTTACTGAATAATTTATTAATATTCCAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAA
127 TAAAAAATCAATCTATTTACCG----A---ACT-A-GTT-C-AAA-TAAT---TATAACCATTTG
* * * ** * * ** * *
46812 AAAAATGAATCTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAAAAGTTATG-ACTATC-T-GAACAATTATATAT
177 AACAAT-TATCTATTT-C-AAATC--GTT--ATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T-T-T
* * * * * * * * * ** * *
46873 TCCAAG-ACATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-C-AGTTCTGTT--CATGCACAAGA
232 T----GTTCA-TATAAAC--TT-ATTTG-AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTAGAAAA
** * * **
46933 TTAATTCGA-A--TAAAATATTATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATT--AATAAG-TA--AAA
287 TTAATAAGAGATTTAAAA-A--ATAAATTTGTT--TA--TCGAACAATTCAAAT-AGTTATGACT
* ** *
46989 ATTTAAACAATAAATATGTTTTCTAAACATGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
344 ATTTGAACAAT---TA----TT-T----AT-TTCAAATCGTTATGACT-TTT----TA-T-TCTA
* * * * * * * * * *
47054 T-TTCAAACGGTTATGACCATT-TGTTTTATCATAAACTAATTGTTTCTGTTAA-AACAAGCTTA
389 TCATAAAAC---AATTA--ATTATG-TTCAT-ACAAGC---TT-ATTCAG--AATAA-AA--TAA
* ** * * * *
47116 TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAATAATTTAAAATATA
438 TAC-AAATGCAAT-A-A-T-----ATT-CTA----AAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATA
* * * ** * * * * * * * *
47181 TATATGTTTATAGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
489 AATATATATACCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * * * *
47225 AACTATTTATTTCAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATAT
** ** * * *
47289 AAATTTATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAG-AGATT
* * * * * * * ** * * * *
47353 TAAAAAATTAATCTGTTTACCGCACAAGTTCAACTAGTCATGTCTATTTGAACTATTTTATATTT
127 TAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
47418 CAAATCATTATGAATTCTATTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAA
192 CAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTT-GAA
* * * * *
47483 TAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTGAAAATTATTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTCTTTA
254 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
* * * * * *
47547 -CTGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TATT
319 TC-GAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTT
* * * * ** * * * * * * *
47610 TGTTTTATCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAACCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAAT-
382 TATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC-AAATG
* * * ** * * * * * * *
47674 TAATAACATTCT-AAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAACAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTT
446 CAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAGATC
* * *
47737 AAATAGTTAATACTAT-TAGAAC
511 AAATAGTCAAGACTATATA-AAT
* * * * * * * *
47759 AATTATCAATTTCAAATCATTTTGACCATTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATA-
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* * * * * * ** *
47822 ATGCTTATTCGAAAT-AAAT--T--TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTAT-TAA-TATTTCAAA-A-TTA--A-TAAGT-AAG
* ** * * *
47882 A-ATCATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCA-TA
122 AGAT--T-TA--AAAAATCA--AT---C---TA-TTTA-C--CGAAC--TAG-TTCAAATAATTA
* * * * **
47945 AAAGC--TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTCT-ATAAAATGATTGT
167 TAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T
* * * *
48007 TTTTTATCATATAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT
230 TTTGT-TCATATAAACTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAAT
* * * * * * * * *
48071 ACATAGGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGCAGTTTAAATAGTTATGAATATTTAAAC
292 --A-A-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * *
48136 AATTATATATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTC-ATTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAC
352 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTAATTATGTTCATAC
* * * * *
48200 CAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAAGAACT----AA---
416 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTT
* * * * * ** * * * *
48258 GAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCA-ATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAAC
481 AAAAAATAAATATATATACCGAACCAGA-TCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * * *
48310 AATTCTTTATTTCAAATCGCTATGACCTTTT-TTTTTTAATTAAACAACTT-TTTTAGTACATAC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA-TAAAAAAATTATTTCAGTTCATA-
* * * * *
48373 TAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATTAGTAAAAGGTT
64 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC-TATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
48437 TAAAAAAT-AATTATATTTGCCAAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
127 TAAAAAATCAA-TCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * ** * *
48501 TCAAATCATTATGACCTATTGTTTTATCAT-ACACAAATATTTTTATTCAAATAAGTTTGTTCGA
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTGTTCATATAAACTTATTTG-
* * * *
48565 AATAAAATAATATTAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTAACAGAATTAAAAAATAAATT
252 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * *
48630 TGTTTA-CTAAACCAATTTAATTAATT-TAACTATTTGAACAATTACTTATGTT-AAATTGTTAT
313 TGTTTATC-GAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATCGTTAT
** * * * * ** * * * * * *
48692 GACCATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATAC-AGTCATATTCTGACTAAAGTAAT
375 GACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAAT
* * ** * * * *** * * * ** *
48756 GCTAATTTATTAATACTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCTGT-TGGTCTA
439 ACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATAT-ACCGA
* * * * *
48820 ACCAG-TGCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
503 ACCAGAT-CAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * *
48850 AATTATGTACTAAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTGTTCATATA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* * * * * *
48915 AGCTTATTCGAAATAACATAAGT-CTAACTTATTAATATTTTGAAACTTAATAAGCAAGAGA-TT
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACT-ATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * * * *
48978 AGAAAAATGAATCTATTAACTTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTT
128 A-AAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
49043 CAAATTGCTATAACCTTTCGCTTTGTGATAAAATAATTTTTT-TTCTATTCATACAAGCTTATTT
192 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTGTTC-A-T-ATA-AA-CTTATTT
* *
49107 CAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCA-AACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
251 -GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAGAA-AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
49170 AATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTT
309 AATTTGTTTATCGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * ** * ** *
49235 ATGATTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA
373 ATGACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
** ** * * * ** * * * * * **
49300 TATTAATTTATTAATATTTTTATGATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGA
438 TACAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGA
* * *
49365 ACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTAAAT
503 ACCAGATCAAATAGTCA-AGACTATATAAAT
* * * * ** * * * *
49395 AATTATCTGTTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATT-AGTTCATAT
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTAT-TTCAGTTCATAT
* ** * * * *
49459 AGGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTGATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
49524 AAAAAATGAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AGATTATCTATTT
128 AAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACA-ATTATCTATTT
* * * * * * * *
49588 TAGATCATTTTGACTATTTGTTTTGTCAT-GAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGA
192 CAAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTA-TTTGA
* * *
49652 ACAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCA-AATATTAATAAGTAGAAATTTTAAAAAATAAAT
253 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG-AG--A-TTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
49715 CTGTTTTTTGAACATGTTCAAATAATTTTGACTATTTAAACAATTA-CTATTTCAAATAGTTTTG
312 TTGTTTATCGAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * *
49779 ACCTTTTGTTTTGTCACAAACCAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATA
376 ACTTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* ** * * * * * * * ** *
49843 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAT
440 CAAATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAAC
* * * * * * * * *
49908 AAGCTCAAATAGTTATGATTGTTTGAAC
505 CAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
** * * * *
49936 AATTA-CTTATTTGGAATAGTTAT---CTTTTGTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCAT
1 AATTATC-TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTATCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCAT
* ** * * * *
49996 AAAAATTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGAT
63 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * * * * ** *
50061 TTAAAAAAT-AAGTTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCAATTTGAACAATTATCCA
126 TTAAAAAATCAA-TCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACC-ATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
50125 TCTCAAATTGTTATGA-TCTTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTT
189 TTTCAAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTA-TT
* * ** **
50189 TGATTAAGATAATACTAA--T-TT-A-A--T----AA-TAA-AA-A-A--T-AAATGT-GCTTTG
250 TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * *
50235 -TTA---AACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATTAGAACAACTATTTATTTCAAATCGTT-TCGAC
315 TTTATCGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-GAC
* * * * *
50295 CTTTTATT-TAGTCATAAAACAATT-ATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAACAAAATAATAC
378 TTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTAATTAT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* ** * * * * * * * *
50358 TAATTTATTAACATT-TGAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAAATATATATGTTTATCGAA
441 AAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAAATTT-AAAAAATAAATATATATACCGAA
* * * * * * *
50418 CAAGCTCACATAGAT-ATGACTATTTGACT
504 CCAGATCAAATAG-TCAAGACTATATAAAT
* * * * * *
50447 AATTATCTATTTAATATCATTTATGGCCTTTTGGTTTATCATAAAACAATTATTT-AGTTCATAA
1 AATTATCTATTTAAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATAT
* *
50511 AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATACTTT-AGAAATTATTAAGTAAGAGATT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-TTTATTAATA-TTTCA-AAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** * * * * * * * * *
50575 TAAAAAGTAAAACTATTTTTCGTACCAGTTCAAATAGTTATGATCATTAGAACAAATATCAATCT
127 TAAAAAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * **
50640 CAAATCGTTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTATGATCATACAAGCTTATTCAAA
192 CAAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TGTTCATATAAACTTATTTGAA
* * *
50704 TAAAAATATTACTAATTTAATAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
254 T-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * * * * *
50768 TATTTGTCGAATCAGTTTAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATT-TTCTATTTCAAATCATTCTA
313 TGTTTATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * *
50832 ACCTTTTGTT-TAGTCATAAAATAATT-GTTTTAGTTCATACAAGC-TAGGTCGGAATAAATTAA
376 ACTTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTAATTAT-GTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA
* * ** * * * * * *
50894 AACTAATTTATTAACATT-TAAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAAAATAAA-ATTGTTT
438 TACAAATGCAATAATATTCT-AAAAATTAATAA-CTAAAAAATTT--AAAAAATAAATA-TATAT
* * * * * * * * * *
50956 ATCGAACAAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAAC
498 ACCGAACCAGATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * * * * *
50991 AATTATTTATTTAAAAACATTATGAACTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTC-GTTCATAA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATAT
* * * *
51055 AAGCTTATCCAAAATAAAATATTACTTTTTCTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTT-ATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * **
51120 AAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATT
128 -AAAAAATCAATCTA-TTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
51184 TCAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTCAACATACAAGCTTATTTG
191 TCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTGTTC-ATATA-AA-CTTATTTG
* * * *
51248 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AGAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTA
252 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * * *
51311 TTT-GCTGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
315 TTTATC-GAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * *
51375 TTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTA
378 TTTTTATTCTATCATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAA
** * * * * * * * * * *
51440 ATTTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCAG
443 ATGCAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAG
* * * *
51505 TTCAAACAGTTAAGACTATATAAAC
508 ATCAAATAGTCAAGACTATATAAAT
* * * * * ** * * * *
51530 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTGTTGTTGTAAAACAATTATTTTAGCTCATACA
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
* ** * * * *
51595 AGTTTATTTGAAATAAAATAA-AATAATTTCTTAATATTTAAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * *
51659 AAAAAT-AATTCTATTTACAGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTC
129 AAAAATCAA-TCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** * *
51723 AAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCACAAAACGATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAA
193 AAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTGTTCATATAAACTTATTTG-AA
*
51788 TAAAATAATATTAATT
254 TAAAATAATACTAATT
51804 ATTCATAAAA
Statistics
Matches: 20046, Mismatches: 4411, Indels: 3416
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Matches are distributed among these distances:
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AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATA
AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
AAATCAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
TCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTGTTCATATAAACTTATTTGAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA
ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTCTATC
ATAAAACAATTAATTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATGCAATAATATT
CTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATATACCGAACCAGATCAAATAGTCAA
GACTATATAAAT
Found at i:26961 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 26656--28222 Score: 1201
Period size: 180 Copynumber: 8.7 Consensus size: 181
26646 CTGCCCAGTG
* * * * * * * * * *
26656 CAAATATTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAGTCGTTATAACATTTTGTGTTATCACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * **
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* *
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131 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAACTT
* * * *
26837 AAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
26902 AAACAATTTTTTCTATTCATACAAGGTTATTTTAAATAAAATAA-ACCAAATTTATTAATATT-C
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCC
* * * * * *
26965 AAACAATTAAAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAAATTTGTTT-TTCAAATAACTT
130 AAA-AATT--AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACT-AAACAACTT
* * * * * *
27021 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATAACTTTTTATTTT-T-ATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
27084 AAATAATTATTTTTATTTATACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTT
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * *
27148 GACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAATAAGTC
129 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAACTT
* * * ** **
27200 CAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA--TATGACCATTTT-TTTCATTT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCA
* *** *
27262 TAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATGGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** ** * * * *
27326 CCTAAAATTAACGAGTAAGAGATTTAAAAAATTGTATTTGTTTACCGAAA-TAGTT
128 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTA-CTAAACAACTT
* * * * * *
27381 TAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTCACCTTTTGTTTTGTCAA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
27445 AAAAAAATTATTTCTATTCACACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * *
27508 TCAAAAACTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATATATTTTC-AGAAC-ACGTT
128 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA-AACAAC-TT
* * * * *
27561 CAAATAGTTATAACTAATTGAATAATTAT-TA-TTCTGAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** *
27624 AAACCAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
* * * *
27689 AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAGCAAGC-T
130 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAA-CTT
* * * * * ** *
27741 CAAATAG-TATGACCATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
27805 AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * * * * *
27870 AAAATTAATAGGTTGAA-A-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAAAGTT
131 AAAATTAATAAG-T-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAACTT
* * * ** * *
27922 CAAATAGTCAGGTCCGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCGT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
27986 AAAACAATTGTTTCTGTTCATA-TAGAATTATTT-AGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*** * * * * **
28049 TTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACTGAATC-GGTT
128 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAACTT
* * *
28099 CAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATGTT-AAATTGTTATGATCTTTAT-TTTT-TCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATAGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCA
* * * * * * *
28161 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATATATGCTT-TTTCGGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
28223 AAAAATAAAT
Statistics
Matches: 1113, Mismatches: 217, Indels: 117
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 49 0.04
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178 19 0.02
179 173 0.16
180 249 0.22
181 225 0.20
182 222 0.20
183 32 0.03
184 70 0.06
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAACTT
Found at i:27809 original size:541 final size:538
Alignment explanation
Indices: 26679--51803 Score: 6067
Period size: 541 Copynumber: 46.5 Consensus size: 538
26669 TTGTTTGAAC
* * * * * *
26679 AATTATCTATTTCAAGTCGTTAT-AACATTTTGTGTT-ATCACAAATCAATTGTTTCTATTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTT-T-TTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA
* * * * * ** * *
26742 CAAGTTTATTTGAAATAACATAATTCTAGCTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGATT
* * * * *
26807 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAACTTAAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
127 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
26872 CAAAT-AGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGGTTATTTTA
192 CAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTA-TTTA
* * * *
26936 -AATAAAATAA-ACCAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAAAAAAAATAAAAGATTTAAAAAAT
255 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAA-AATT--AATAAGTAGAA-ATTTAAAAAAT
* * * *
26998 AAAATTTGTTTTTCA-AATAAC-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAAT
315 -AAATAT-ATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTA-TTA-TTTAAAT
* * * * * * *
27061 CGTTATAACTTTTTATTTTT-ATAAAATAATTATTTTTATTTATACAAGCTTATTCAGATTAAAA
376 AGTTATGACCTTTTATTTTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAA
* * ** * * *
27125 TAAAATTAATTTATTAATATTTTGACAAATAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTAT
441 TAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT
* * * *
27190 CGAATAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
506 CCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
** **
27223 AATTATCTATTTCAAATCATATGACCATTTTTTTCATTTTAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATG
1 AATTATCTATTTCAAATCATATGACCATTTTTTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCATAAA
* * *
27287 GGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAACGAGTAAGAGATTTA
65 AGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGATTTA
** * * * * *
27352 AAAAATTGTATTTGTTTACCGAAATAGTTTAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATCTATTTC
129 AAAAA-TAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
27417 AAATCATTTTCACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTATTTCTATTCACACAAGCTTATTTCGAA
193 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAGAA
*
27482 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATATAT
258 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATATAT
* * *
27547 TTTCAGAA-CACGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAATAATTATTATTCTGAATAGTTATGACCT
323 TTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATTATT-TAAATAGTTATGACCT
* * * *
27611 TTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
387 TTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAAT
*
27676 TTATTAGTA-TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAGCAAG
451 TTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCCAA-CAAG
*
27739 -CTCAAATAGT-ATGACCATTTAAAT
514 TC-CAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * ** *
27763 AATTTTTTATTTCAAAT-AGTTATGA-TATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA--TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA
* * *
27826 AAAGTTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAGGTTGAA-A-
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAG-T-AAGAG
* * * * ** *
27888 ATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTCAGGT-CCGTTTGAATAATTATC
124 A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTA-TTACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
27952 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-TAGAATTA
187 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-ATTA
** ** *
28016 TTTAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-AG--ATTTAAAAACTA
251 TTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * *
28078 AATCTATTTACTGAATC-GGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATGTTAAATTGT
316 AATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TAT-TTAAATAGT
* * * * * * * *
28142 TATGATC-TTTATTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATATGCTTTTTCGGATTAAGATA
379 TATGACCTTTTA-TTTTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATA
* * * * *
28206 ATACTAA--T-TTAATA-AT---AAAA-AAT-----AAATATGT------T---T-TGCTGAT-C
443 ATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCC
* * * *
28247 --C-AGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAAC
508 AACAAGTCCAAATAGTCATA-ACCATTTA-AAT
* * * *
28275 AATTATTTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTTGTTT-AGTCATAAAACAATTAT-TTTAGTTCAT
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCA-TCATAAAACAATTGTATCTA-TTCAT
* ** * *
28337 AGAAA-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATCAATAAGCAAGAGA
62 A-AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGA
* * * * * * *
28401 TTTTAAAAAATTAATATGTTTACCTAACAAGTTGAAATAGGTATGACTATTTGAACAATTATCTA
125 -TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
** * * *
28466 -TTCAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAATT-T
189 TTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTAT
* * * * * * **
28527 ATTCGAAATAAAATAGTACT-ACTTCATTAATATTTC-AAAATT-ATCAAGCAAGAGATTTAAGC
252 -TTAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAG-TAGAAATTTAAAA
** * * * * * * *
28589 AATAAAGCTATTTTCTGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAA
312 AATAAATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TAT-TTAAA
* * * * * * * *
28653 TCGCTATGATCTTTGT-TTTGTCATAAAAAAATTGTTTCT-TATCATACATGCTTATTCGGATTA
375 TAGTTATGACCTTT-TATTTTTCATAAAACAATTGTTTATAT-TCATACAAGCTTATTCAGATTA
* ** * *
28716 AAATAATACTAATTTAATAATATTT-CAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
438 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * ** * **
28780 TT-GCTGAATC-ATTTTAAATGGT--TAA-GGTTACTAGAAT
502 TTATC-CAA-CAAGTCCAAATAGTCATAACCATT--TA-AAT
** * * * * * *
28817 AATTATCTATTTCAAATTGT-TCTAAC-TTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTC-AGTTCAT
1 AATTATCTATTTCAAATCATAT-GACCATTTTT-TTCA-TCATAAAACAATTGTATCTA-TTCAT
* * * * * *** * *
28879 ACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATATTCATTTCTTAACATTTAAAAAACTAATAAGCAAGAGA
62 AAAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGA
* ** * * * *
28943 TTTGAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTA
125 TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * * *
29008 TTTAAAATTATTCTAAACTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTC-AGTTTATAAAAGCTTATC
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTATT
* * * * * *
29072 CAAAATAAAATAATGCT-ATTTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
253 TAGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATA
* * * * * *
29136 AATCA-ATTTAT-TGAATCA-GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATC
316 AAT-ATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATA
* * * * * * * * *
29198 GTTATTATCTTTTGTTTTATCATAACACAATTCTTTTTCA-ACATACAAGCTTATT-TGAAATAA
377 GTTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTAT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAA
* * * * * *
29261 AATTATACTAATTTATTAATATTT-CAAGAAT--T-AGTAAGAGATCT-AAAAATAAATCTGTTT
439 AATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* ** * * * *
29321 A-CCAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAT
504 ATCCAACA-AGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
** * * * * * *
29356 AATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AAC-TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTCTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAA-TCATATGACCATTTTTTTC-ATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * *
29419 AAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-CTAAAAATTCATAACTAAGAGAT
64 AAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATT-AAAAGTAAGAGAT
** * ** * * * ** * *
29482 TTAAAAAATAAATCCATTTGCCAACCAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACAATTGTCTATT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * * * * *
29546 TTAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AGCTCATACAAGTTTA-TTC
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTATTTA
* * * * *
29609 GAAATAAAATAA-ATCTAATTCATTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
255 G-AATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAA
* * * ** * * * *
29673 TTCTATTTACAGAACCAATTCAAATAATTATAAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATTTTAT
317 ATATATTTTCAG----AA-TC----ACGT-TCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTA--TTAT
* * * * * * *
29738 TTCAAATCA-TTATTG-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT
370 TT-AAAT-AGTTA-TGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATT
* * ** * * * *
29801 -TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATA
431 CAG-ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATA
* * * ** * * *
29865 AATCA-GTTTA--CAAAATCATTTCAAATAGTTTTGACTATATAAAT
495 AAT-ATGTTTATCCAACA--AGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * ** ** * * * * *
29909 AACTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTTTGTTGTCAAGCAGTTGGT-TCTATTGAGA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATT-GTATCTATTCATA
* ** * * * * ** * *
29972 CAATTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAACTTAATAACCAAGAAAA
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAA-TTAA-AAGTAAGAGAT
* ** ** * ** ** ** * * * *
30036 TTAAAAGATAAATCTAATTGTCGAACCAGTTCTAATAGTTAAGA-TAATATGAGCGATTAACTAT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACT-ATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
30100 TTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTGTTCGTACAAGTTTA-TT
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTT
* * * *
30163 CGAATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATA
254 AGAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTT-AAAAAATA
* * * * * * *
30228 AATTTGTTTACCA-AACCA-GTTTATAT-GATTAAT-ACT-ATTATAACAATTATCTATTTCAAA
316 AATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAG-TT-ATGACTAATT-GAACAATTAT-TATTT-AAA
* * * * * * * * *
30288 TTGTTTTTACTTTTTGTTTAGTCATAAAGCAATTGTTTCA-ATACATACAAGCTTATTC-GAAAT
375 TAGTTATGACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTCAG-ATT
* * * * *
30351 AAATTAATACTAACTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAGAAAATAAATC
437 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAA-AGATTTAA-AAAATAAATA
* * * ** * * * *
30414 TTTTTATCGAACAAATTTAAAATAGTTATAACTATTTGAAC
499 TGTTTATCCAAC-AAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * ** * * *
30455 AATTGTTTATTTAAAATTGC-TAAGACC-TTTTTTCTTTTTATAAAACAATTGTTTC-AGTTAAT
1 AATTATCTATTTCAAA-T-CATATGACCATTTTTT-TCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCAT
* * * **
30517 ACAAGTTTA-TACATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGA
62 AAAAGCTTATTAGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGA
* * * ** ** *
30581 TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTT-AAATAGTTATGGCAATTTGAACAATTATCTAT
125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * * *
30645 TTCAAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTTTTGTCATATAAGCTTATT
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTAT-TCATACAAGATTATT
* * *
30710 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAG-AG--ATTTAAAAAATAA
253 TAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAA
* * * ** * * * *
30771 ATGTGTTTGT-TGAA-C-CGGTTCAAATAGTTAAAACT-ATAAGAATAACTATTTATTTCAAATC
317 ATATATTT-TCAGAATCAC-GTTCAAATAGTTATGACTAAT-TGAACAATTA-TTATTT-AAATA
* * * * * * * *
30832 GTTCTAACATTTT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATA-TCATACAAGCTAATTCGGCA-TAA
377 GTTATGACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAA
* * * * *
30894 AATAATCCTAATATATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTGAAAAAATAAATCTG
439 AATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAA-AAGATTT-AAAAAATAAATATG
* * * * * * * *
30957 TTTA-CCGTATAAG-CTCAAATGGTTATGACTATTTGAAC
501 TTTATCC-AACAAGTC-CAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** ** * *
30995 AATTAAT-TATTTAAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCT-T-AAGTTTA
1 AATT-ATCTATTTCAAA-TCATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTG-TATCTA-TTCA
* * * * *
31056 TAAAAAGGTTATCCA-AAATAAAATAATGCTAATTTA-TAATATT-TTAAAAATTAATAAGCAAG
61 T-AAAAGCTTAT-TAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAG
*** * * * * *
31118 AGATTTAAAAAAATAAATGCAT-TTTTTGAACAAA-TTCAAATAGTTGTGACTATTTAAACAATT
122 AGATTT-AAAAAATAAAT-C-TGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATT
* * * ** * * * * * *
31181 GTATATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTC-AGTTTATTA-AAG
184 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCA-TACAAG
* * * * **
31244 CTTATTT-GAAATAAACTAATA-ATAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATATGTAAGTGATTTA
247 ATTATTTAG-AATAAAATAATATA-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTA
* * * * ** * * * ** ** * * **
31306 AAAAGTGAATCTGTTCACCGAATCA-ATTCAAATAATTATGGTTGTTTCAACAATTACCTATACA
309 AAAAATAAATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTA-TTATTTA
* * * * * * **
31370 AATCA-TTATGAACATTGT-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGA
373 AAT-AGTTATG-ACCTTTTATTTTTCATAAAACAATTGTTTAT-ATTCATACAAGCTTATTCAGA
* * * * * *
31432 ATAAACTAATACTAATTTATTAATAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
435 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* * * *
31496 T-ATT-T---AC---T-GAAGTAGT--T--CCTATTTGAAT
499 TGTTTATCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACC-ATTTAAAT
* * * * * ** * *
31524 AATTACCAATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTCTATTAT-AAGTAATTGTTTC-ATTCATAG
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTTTTTC-ATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * *
31586 AAGCTTTTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-CTGAAAATTAACAACTAAG-GATT
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGATT
* ** ** * * ** ** *
31649 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAGCAGTTTAAATAATTAAGA-TACATGAAGAATTATCTATTT
127 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
31713 CAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTT-G
192 CAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
* * * * * *
31776 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-G--ATTTGAAAAGTGAATT
256 -AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * * * * * * *
31838 TGTTTACCGAATCA-TTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
320 TATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATAGTTATG
* * * * * * ** * * *
31902 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTATGA-TCTTTCAAGCTTATTTGGAATACAATTATA
383 ACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTTAT-ATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA
* * * ** * *
31966 CTAATTTATTAATCTTT-CAAAAATTTATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA
446 CTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCCAA
* * * * * * *
32030 CCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
510 -CAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * * * * * *
32059 AATTGTATACTTC-AA--AT-TG-----TTTTGTCA-C--AAAACAATTATTTTTGTTCATACAA
1 AATTATCTATTTCAAATCATATGACCATTTTTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAAAA
* * * * * * *
32112 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-TTGAAAATTAATAACTAAGAGAATT-
66 GCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGATTTA
* ** ** * * ** *
32175 AAAAATAAATTTGTTTGA-TGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTAT-TAATTT
129 AAAAATAAATCTGTTT-ACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCT-ATTT
* * * * * * * * * **
32238 CAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAAAT-TTTCAATTCATGCTAGTTTATTCGG
192 C-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
* * * ** *
32301 AATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATATTTT
256 AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATA
* * ** * * * ** *
32366 TGTTTACCTAA-CTA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTTT
320 TATTTTCAGAATC-ACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATAGTTAT
* * * * * * * * *
32429 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTCTT-TGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAAT
382 GACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGT-TTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAAT
* * ** * * *
32492 ACTAATCTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAACCTATTTGT-AA
445 ACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCCA
* * * * * *
32551 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACA-
509 ACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTT-AAAT
* ** * * * * *
32581 AATTAT-TGATTTTAAATTGTTATGA-CATTTTGTCCTATTATAAAA-AATTTGTTTATATTCAT
1 AATTATCT-ATTTCAAA-TCATATGACCATTTTTTTC-ATCATAAAACAA-TTGTATCTATTCAT
* * * * * * * * *
32643 ACAAGTTTATTCA-TATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TTGACAATTAATAAAT-AGAA
62 AAAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAG
* * ** ** * * * * *
32705 ATTTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT
124 A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * * * ** *
32770 ATTTTAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTGTCATAAGAGATTTGTTT-TAGTTCATGTAAGGTTAT
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTAT
** * * *
32834 TCGGGATAAAATAATATCAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT-AGTTAAGAGATTTAGAAAA
252 TTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-T-AGAAATTTA-AAAA
* * * * * * *
32897 A-AAATCTGTTTACAGAA-CAAGTTTAAATA---AT---T-A-TG-AC---TA-T-TTGAAATTG
313 ATAAATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATTATTTAAATAG
* * * ** * * * * * *
32946 CTATAACCTTTTGTTTTGAAATAAAATAATTTTTTTCTGTTCATAAAAGCTTATATC-GAATAAA
378 TTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAA-TTGTTTATATTCATACAAGCTTAT-TCAGATTAAA
* * * * *
33010 ATAATACAAAATTATTAATA-TT-AAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAA-AA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * * *
33073 TATCAAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAAC
503 TATCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** * *
33108 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTC-TTTGTTTT-GTCATAAAATAATTGT-TCTATTCATA
1 AATTATCTATTTCAAA-TCATATGAC-CATTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA
* * * * * * *
33170 CAAGGTTATTTG-GAT----TAA-AATAA--TATTAATATT-TTAACAATTAATAAGTAAAAGAT
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAA-AATTAA-AAGTAAGAGAT
* * * * * ** * * * * * *
33226 TTAAAACATAAATATGTTTATCGAACAAGTTGTAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTACT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * * *
33291 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAACTGTTTCAATTCAAATAAGCTTGTTT-G
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
* *
33355 AAACAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAATA
256 -AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGA-AATTTAAAAAATA
* * * * *
33417 AATATGTTTATC-GAA-CAAGCTCAAATAGTTATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-AC
316 AATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATA-
* * * * * * *
33479 ATTATGGCCTTTTCTTTTGTTC-TAAAGCAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATA
377 GTTATGACCTTTT-ATTT-TTCATAAAACAATT-GTTTATATTCATACAAGCTTA-TTCAGATTA
* ** *
33541 AAATAATA-TAAATTGATTAATA-TTAAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATG
438 AAATAATACT-AATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * *** * *
33603 TTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATATTTATTTGAAC
501 TTTATC-CAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * ** * * * *
33642 AATTATCCATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * *
33706 AAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATGTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
64 AAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGA-T
* *** *** * * *
33770 TTAAAAAATATATCTGTTTATTGAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
33835 TTAAATCGTTATGATCTTTTGTCTTCTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAA
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
* * *
33900 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAACTTAATAAGTTAAAAATTTTAAAAATAAA
256 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAGAAATTTAAAAAATAAA
* ** * * * ** * * * * *
33963 TCTGCTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGGCAAG-TTTATTCGAACTATTAGCTATTTCAAATCA-T
318 TATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATT-GAACAATTA-TTATTT-AAAT-AGT
* * * * * ** *
34025 TATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTCAGAATAAAATA
379 TATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATA
* * * * *
34090 ATACT-ATTTATTAATATTT-CAAAAAT--TAA-TAATAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATCG
443 ATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCC
* * * * * * *
34150 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTA-TGAGAAC
508 AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTA-AAT
* * * * ** * * *
34181 AATTATCTATCTAAAATCGTTATGATC-TTTTTTTC-TCATAAAGTAATTGTTTGTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTTTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAAA
* * * * * *
34244 AGCTTATTTAG-AGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATT-CTAAAAATTAATATGTAAGAGATT
65 AGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGATT
* ** ** * * *
34307 T-AAAAATAAATGTGTTTACCAAACCAGCTT-AAATAGTTAACACTATTAGAATAATTAGCTATT
127 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAG-TTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
34370 TCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAAATT-ATA-TA-ATTATTTA
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-TATTCATACAAGATTATTTA
** ** * * * * ** * *
34432 -TTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTAACA--TAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAATCTTA
255 GAATAAAAT-AATATAA---ATT-TATTAATATTTCAAA-AATT-AAT-AAGT-A-GAAAT-TTA
* * * * * * ** *
34494 TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT-A-TTTCAAA-AATTGAAAAGTAGGAGATTTAAAA
309 --AAAAAT-AAAT-ATATT--TTCA-GAATCACGTTCAAATAGTT---ATG-ACTA-A-TT-GAA
* * *
34556 AAATAAATCAGTTTGTCAAATCAGTTATGA-CTATTTAAACAATTATTT-ATTTCAAATCTTTAC
360 CAAT-TATTA--TT-T-AAAT-AGTTATGACCT-TTT-----ATT-TTTCA--T-AAA-----AC
* * * ** * ** * * *
34619 GACTT-TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTG-TTCACACAAGTTTATTCGGACTAAAATAA
404 -AATTGTTTA-TAT-TCATACAA-GCTT-ATTCAGATT-A-A-AA---TAAT---ACT-AATTTA
** * * * * ** *
34682 TATTAATTTATTAATATTTTGACAAATAAAAAGTAAAATATTTTCAAAATAAATATGTTTA-CTG
454 T----------TAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-C
* ** * * * *
34746 AATAAGTTTAAATAGTCATAGCTATTTGAGT
508 AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
*
34777 AATTATCTATTTCAAATTGC-TATGACC-TTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTAT-TAATTTAT
1 AATTATCTATTTCAAA-T-CATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCT-ATTCAT
* * * * *
34839 ATAGGCTTATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAT
62 AAAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGAT
* * * * * * * * *
34903 ATAAAATATGAATC-GATTTACCAGATAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT
126 TTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * * * * *
34967 TTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCGTACAAGTTTAATTC
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTA
* *
35032 GAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAA
255 GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAGAAATTTAAAAAATAAA
* * ** * ** *
35096 TATGTTTTCTGAA-CATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATCTGTTTCAAATAGTTA
318 TATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATAGTTA
* * * * * * * * *
35160 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATATAAACTTATT-TGAAATAAAATAA
381 TGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAAAATAA
* * * * *
35224 TACT-ATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTTAAAAATAAATCTATTTATT
444 TACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATC
* * * * * * *** * *
35286 GAGCAAGTTCATATCA-TTATGATTGTTTGAAC
507 CAACAAGTCCAAAT-AGTCATAACCATTTAAAT
* * ** * * *
35318 AATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA--TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA
* * * * * * *
35381 CAAGTTTATTTAG-ATTAAAATAATACTATTTTACTAATATT-CTGAAAATTAATAGGTAGGAGA
63 AAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGA
* * * * *
35444 TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAGTAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCT
125 TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAG-TTATTACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * *
35508 ATTT-AAAGTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAACTT
188 ATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGA-TT
** * * * * *
35570 ATCCAAAATAAAATAATACT-ACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAAA
250 ATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAA
* * * * * *
35634 CTAAAGT-TATTTTCCA-AA-CTA-GTTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAA--ATAACTCAAA
313 ATAAA-TATATTTT-CAGAATC-ACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATTATTTAAA
* * * * * * *
35693 TCGTTATGATCTTTGT-TTTCTCATAAAA-AATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTTAGATAA
375 TAGTTATGACCTTT-TATTTTTCATAAAACAATTGTTTAT-ATTCATACAAGCTTATTCAGATTA
* * * *
35755 AAATAATACTAATTTAATAATATTT-CAGAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATTAATGTGT
438 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCCA-AAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * *
35815 TT-GCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTA-TTATAAT
502 TTATCC-AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTA-AAT
* * * * * * *
35852 AACTATCTATTTCAAATCACTCTGACC-TTTTGTTT-AGTCACACAATAATTGTTTCAATTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCA-TCATAAAACAATTGTATCTATTCATA
* * * * * * * **
35915 CAACCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-CAAAAATTAATAAGCATTAGATT
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGATT
* * * * * * *
35979 TGAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAGTAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
127 T-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ** *
36044 TAAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTT-TAGTTCATAAAATCTTATTCA
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTATTTA
* * * *
36108 -AATAAAATACTACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
255 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAA
* * * * *
36171 T-TAGTTTACCA-AATCA-GTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCA-
318 TATA-TTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAAT-AG
* * * * *
36232 TTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTTTTCA-GCATAC-AGCTTATTC-GAAATAAA
378 TTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTAT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAAA
* * *
36293 ATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATATATCTGTTT
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAA-AAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* * * * *
36353 A-CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
504 ATCC-AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** * * * *
36388 AATTATCTATCTCAAATTGTTATAAAC-TTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAT
1 AATTATCTATTTCAAA-TCATATGACCATTTTTTTC-ATCATAAAACAATTGTATC---T-AT-T
* ** * *
36452 CAATTAACATAAGCTTATTTGACGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAG
59 C-A-T-A-A-AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAG
** * * * * * * * * *
36517 TAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTATGTACCAAACAACTTCAAAGAGTTATGACTATCT-AGACA
118 TAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGA-ACA
* * * * ** * *
36581 AATATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTGTTCATCCA
181 ATTATCTATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACA
* * * * * *
36645 AGCTAATTTCA-AATAAAATAATATAAATTAATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGCA-AAACTTT
245 AGATTATTT-AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAA-TTT
* * * * * * * * * *
36708 CATAAATAAATTTGTTTTCTGAA-CACGTTCCAATAATTATGACCATTTGAAGAATTATCTATTT
308 AAAAAATAAATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT
* * * *
36772 CAAATCGTTATGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGA
372 -AAATAGTTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGA
* * * * * * *
36837 ATAAAACAATACTAATTTATTAAAATTCCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTT
435 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* * ** * * * * *
36902 TTTTTA-CAAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
499 TGTTTATCCAA-CAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * ** *
36942 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAA
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
** * * * * *
37006 AATTTTATTTGGAATAAAATAATAAT-ATTTATTAATATT-CTAAAAATTAGTAAGTTAGAGATT
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTA-AAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * **
37069 TAAAAAATAAATATATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTCATGT-CTATTTGAACTACCATCTATT
127 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTAT-TACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * ** * *
37133 TCGAACCGTTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTC
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-C-A--ATT----AT--TT-CTATTC
* * * * * *
37198 AGACAAAATTATTCAAAATAAAATAATA-ACAATTTGTTACTATTTCAAAAATTAAT-A--AG-A
240 ATACAAGATTATTTAGAATAAAATAATATA-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA
* * * * * * * *
37258 ATTAAAAAAATAAATGTGTTTGCCA-AACCA-GTTCAAATAGTTAAGCCT-ATGAGAACAATTAT
304 ATTTAAAAAATAAATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAAT-TGAACAATTAT
* * * * * * * *
37320 CTATTTCAAATTGTT-TCAACCTTTTGTTTAGTCAAAAAATAATTGTTTCA-GTTCATACATGCT
367 -TATTT-AAATAGTTAT-GACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCT
* * ** * *
37383 TACTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTACCA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTAAA
427 TA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAA-AAGATTTAA
* * * * * *
37445 AAAATAAAATATGTTTA-CATAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAT
489 AAAAT-AAATATGTTTATC-CAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** * * * **
37496 AATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTTATCATAAAACAATTGT-TTTAGTAAATA
1 AATTATCTATTTCAAA-TCATATGACCATTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCATA
* * * * * * * *
37560 AAGGCATATCCA-AAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGAT
63 AAAGCTTAT-TAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATT-AAAAGTAAGAGAT
* * ** * * ** ** * * ** *
37623 TTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAATCAGTTCAAATTGCAACGACTATTTGAATAATTGTAAAC
126 TTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * *
37687 TTCAAATTGTTATATCCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTA
* * * * * *
37751 GAAATAAAATAATGCT-AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAA-TTAAAAAGTA
255 G-AATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGA-AATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
37814 AATTTGTTTGCCA-AACCA-GTTTAAATATTTAAGACT-ATATGAACAATTATCTACTTCAAATC
316 AATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAAT-TGAACAATTAT-TA-TTTAAAT-
* * * * ** *
37876 A-TTATGATCTTTTGTTTTTTCATAAAATAAGTT-TTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAAT
376 AGTTATGACCTTTT-ATTTTTCATAAAACAA-TTGTTTAT-ATTCATACA-AGCTTATTCAGATT
* * * * *
37938 AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
437 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * ** * *
38001 ATTTA-CCTAACCAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAAC
500 GTTTATCC-AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** * * * * *
38040 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAT
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * * *
38104 AAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTC-AAATATT--AA-TAAGAGATTT
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAA-ATTAAAAGTAAGAGATTT
* ** ** * * * *
38165 AAAAAATAAATCTATTTTTCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC
128 AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * ** * * * * * *
38230 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATACATGCTTA-TTCGAT
193 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAGAA
* * * * * *
38294 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAATAGTTGATAGGTAAAAAATTTTAAAAATAAATAT
258 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * ** * *
38358 GTTTAC-GAA-CTA-GAT-AAACTAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
321 ATTTTCAGAATC-ACGTTCAAA-TAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATAGTTAT
* * * * * * * * *
38419 GGCCTTTTGTTTTGCCATAAAAGAAATGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
382 GACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAAT
** ** * * * *
38483 GTTAATTTATTTGTAATT-CAAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CT
445 ACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-
* * * ** * * * * *** *
38545 GAATAAATTTAAAAAATTATGATTGTTTGAAT
507 CAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * * * * *
38577 AATAATCTATTTGGAATTGC-TATAACC-TTTGTTTTGC--CATAAAA-ATTTTTTTCTATTAAT
1 AATTATCTATTT-CAAAT-CATATGACCATTT-TTTT-CATCATAAAACAATTGTATCTATTCAT
* * ** ** * * ***** * *
38637 ACAATCTTATTTCAAATAATTTAA-ATCAAATTTATCAATATTAAGGCAATTATTAAGTAAAAGA
62 AAAAGCTTATTAGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCCTAAAATTA-AAAGTAAGAGA
* * ** * * * ** *
38701 TTTGAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTA
125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAAT-AGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
* ** ** * * * * *
38765 TTTCAACTTGTTATGGCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTT
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTT
* * ** * * * *
38829 AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAATAAAAGATATAAAAAAAATA
254 AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA-AT-T-TAAAAAATA
* * * * * *
38894 AATATGTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
316 AATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAAT-A
* * * * * * *
38957 -TTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAT-TTCATATAAGTTTATT-TGAAGTAA
377 GTTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAA
* * * **
39019 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAA-AGAATATGT
439 AATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGT
* * * * * * * ** *
39082 TTATCAAATAAGTTCTAATAGTTATGACTACCTGAAT
502 TTATCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * *
39119 AATTATTTATTTCAAAACATTATGACC-TTTCGTTTTGC--CACAAAACAATTGGT-TTTGTTCA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTT--TTTT-CATCATAAAACAATT-GTATCTATTCA
** * * *
39180 TGCAAGCTTGTTTTG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCC-AGAAATT--AA-T-A-A
61 TAAAAGCTT-ATTAGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCTA-AAATTAAAAGTAAGA
** * * * *
39237 GA---AAAAAAT--A--TGTCTT-CTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
123 GATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
39294 TATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTATTTTTGTTCATAAAAGCTTA
187 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTTCTATTCATACAAGATTA
** * *
39357 TTCGGAATAAAATTAATACT-AATTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
251 TTTAGAATAAAA-TAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAA
* * * * * *
39420 AATAAATCTA-TTT-AGCAAGCAAGTTCAAATAGTTTTAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
312 AATAAATATATTTTCAG-AATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTA-TTATTT-AA
* * * * * * *
39483 ATCGTTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAGTTTATTC-GAAAT
374 ATAGTTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAG-ATT
* ****
39547 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATG
437 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * ** ** *
39611 TTT-GCTGAACAATTTCC-AGCAGTCATGTCCATTTGAACT
501 TTTATC-CAACAA-GTCCAAATAGTCATAACCATTT-AAAT
* ** * * * *
39650 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTATTGTAAAACGATTGTTTTTAGTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA-
* * *
39713 AAA-ATTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AGT-AGAGATT
63 AAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAAAAGTAAGAGATT
* * * * ** * * * *
39772 TTAAAACTTAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATCT
127 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * ** * * * * *
39837 CAAAT-AGTATGA--TCATGTTTTGTCATAAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAATCA-
192 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
* * * * *
39898 AAGTAAAATAATGCTAAA-CTAATAATA-TTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
256 AA-TAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAA
* * * * * *
39961 ATGTGTTTGCTGAATCA-GTT-ATAATAGTTAAGACT-ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
317 ATATATTTTCAGAATCACGTTCA-AATAGTTATGACTAATT-GAACAATTAT-TATTT-AAAT-A
* * * * * * *
40023 -TTCTGACTTTTTATTTTGTCAT-AAA-AATTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATT-TGAAATA
377 GTTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTAT-A-TTCATACAAGCTTATTCAG-ATTA
* ** * *
40084 AAATAATA-TAATTTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTTTAAAAAATAAATC
438 AAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAA-AAGA--TTTAAAAAATAAATA
* * * * * * * * *
40147 TATTTA-CCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
499 TGTTTATCC-AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * *
40187 AATTATCTATTTAAAATCATTACT-ACC-TTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTC-AGTTCAT
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TA-TGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCAT
* * * * *
40249 AAAA-CTTATTCA-AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAAAAGT-TGAAG
62 AAAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATT-AAAAGTAAG-AG
* * * * * * **
40311 ATTTAAAAAATTAAT-TAGTTTATCGAACAA-TTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCT
124 ATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCT
* * *
40374 ATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGCTTA
188 ATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGATTA
* * *
40437 TTTGGAATAAAACAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAGGAGAA-TTAAAAA
251 TTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-GA-AATTTAAAAA
* * * * * * *
40500 ATAAATATACTTATCGGACT-A-GTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAA
313 ATAAATATA-TTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAA
* * * * * * *
40563 TCGTTATAACCCTTTT-TTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
375 TAGTTATGA-CCTTTTATTTTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAA
* * * * * * * *
40627 AATAATATTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAGAATAAATTTGT
439 AATAATACTAATTTATTAATATT-TCCAAAAATAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * *
40690 TT-GCTAAACCAA-TTCAAATA-T-TTAAGGCTATATGATT
502 TTATC-CAA-CAAGTCCAAATAGTCATAA--CCATTTAAAT
* * ** * * * * *
40727 AATTATCTATTTTAAATCGTTATGACC-TTTTCTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAT
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * *
40791 AAGTTTGTTTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TTGAAAATT--AA-TAAGAGATT
64 AAGCTT-ATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAAAAGTAAGAGA-T
* * * * * * *
40851 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAGTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTAT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
40915 TTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCCTATTGATA-TAGTCTTATTC
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-ATTATTT
* * * ** * *
40979 AGAATAAAGTAATGCT-AATTTATTGATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTCAGATTTAAAAAATGA
254 AGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAA
* ** * * * * * *
41042 ATATGTTAGCCTG-ACCA-GTAT-AAATAGTTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-AGC
317 ATATATT-TTCAGAATCACGT-TCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTTAAATAG-
* * * * * * * * * * *
41103 ATTATAACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATGCATATAAGCTGACT-AGGAATAAC
378 -TTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCA-GATTAAA
* * * * * * * *
41167 ATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATCTATTT
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* * ** * * * * * *
41231 GTCGAACAAGTTAAAACAATTATGACTATTTGAAT
504 ATCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** ** * * * * *
41266 AATTATCTATTTTAAATCACTAT-AAGATTTTGTTTTGTCAT-AAA-ATTTTTTTATATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
** * * * * *
41328 AAGCTTATTTCAATTAAAGTAATACAAATTTATTAATATT-CAAACAACTAATAAGTAA-A-ATT
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAA-AATTAA-AAGTAAGAGA-T
* * * * * * * * *
41390 TTTAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAATAATTATTTATT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * **
41454 TCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGTTTATTCGG
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
* * * * *
41519 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTATTAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATA
256 AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATA
* * * ** * ** * * * *
41583 TGTTTTCTGAA-CAAGTTCAGCTCGTCGTAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
320 TATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATAGTTATG
* * * * * *
41647 ACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTATCA-ATTCATATAAGCTTAATCAAAATAAAATAATA
383 ACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGT-TTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA
* * * * * * * * * * *
41711 CTAATTTATTAATA-TTACAAAACTTAATGAGTAAGAGATTGAAAATATGAATCTATTTATCGAA
446 CTAATTTATTAATATTTCCAAAA-ATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCCAA
* * * *
41775 CAAGTTCAAATAG-CTATAACGATTTGAAC
510 CAAGTCCAAATAGTC-ATAACCATTTAAAT
* * *
41804 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCATAAAATAAT
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACC-ATT-TTTT-TC--------A-----TCATAAAACAAT
* * * * * * * *
41869 TGTTTCTACTCATACAAGTTTATT-CAAATAAAGTAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
49 TGTATCTATTCATAAAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCTAAAATT
* * * * ** * * * * * *
41932 AATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACACGATCAAATAGTTATAACTATTTA
113 AA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTG
* * * * * * * *
41996 AATAATTATCTATTTTAAAT-AGTTGTTACCTTTTGATTTGTCACAAACCAATTGTTTCTATTCA
177 AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA
* * * * *
42060 TACAA-A-CATATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAA
241 TACAAGATTAT-TTAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG
* * * * * * *
42122 AAATATAAAAAGTAAATATGTTTACTG-AGCAAGTTC-AA-A--TA--AC-AATT-----ATT-T
302 AAATTTAAAAAATAAATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT
* ** * * * * *
42173 TATTTCATATAGTTATGATGTTTTGTTTTCTTATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAT
367 TATTT-AAATAGTTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTAT
** * * * * * **
42238 TTGGAATAAAATAATACTAATATATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGTAGATTTAAAAAAT
430 TCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * ** * *
42302 AAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATACTCATGTCCATTTGAAC
494 AAATATGTTTATC-CAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * ** * * *
42347 AACTATCTATTTCATATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAGTTTCTATTCATGC
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCAT--
* * * *
42411 AAAA--TTATTCAG-AATAAAATAATACTGATTTATTAATATT-TTGAAAATT--AA-TAGGAGT
62 AAAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAAAAGTAAGAGA
* ** * * * *
42469 TTTGAAAGCTAAATCTATTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA
125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAA-AAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
42533 TCTCAAAT-ATTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTC
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTT
* * * *
42596 A-AATCAAAAT-A-CT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTTAAAAAAT-
254 AGAAT-AAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGA-AATTTAAAAAATA
* ** * * ** * *
42656 --TGT-TTGCCA-AACCA-ATTCATGTCGTTAAGACT-ATTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-
316 AATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAAT-AG
* * ** * * * *
42714 TTCTGA-CTTTTGTTTAGTAAAAAAAAAAAAACAACTATTT-TAGTTCA-ACGAA-CTTATTCAA
378 TTATGACCTTTTATTT--T-----TCATAAAACAATTGTTTATA-TTCATAC-AAGCTTATTCAG
* * * ** *
42775 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGCGCAAGAGATTTAAAAAAATAAA
434 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * *
42839 TCTGTTTA--CAGGACAAGTTCAAATAGAT-TTGACTATTTGAAC
497 TATGTTTATCCA--ACAAGTCCAAATAG-TCATAACCATTTAAAT
* * * * * *
42881 AACTATGTATTT-AAAGTCGTTATGA-CATTTTGTTTTATCCTAAAACAATTGT-TTTAGTTCAT
1 AATTATCTATTTCAAA-TC-ATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCAT
** * * * **
42943 AAAAATTTATCT-GAAA-AAAATAATACTAATTTAGTAAT-TTTCAAAAATTAATAACCAAGAGA
62 AAAAGCTTAT-TAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGA
* * * * * * * * * * * *
43005 TTTAAAAACTAAAACTGTTTTCCAAACCAA-TTCAACTAGTTATAATTGTTTGAATAAATATCAA
125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
43069 TCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATATAAGCTTA-T
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGATTATT
* * * * * *
43131 TCGGATAAAAATAAAACT-AATTTAATAATATTAT-GAAAATTAATAAG-AG--ATTTATAAAAT
253 TAGAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAAT
* * * *
43191 AAATTTGTTTGTC-GAA-C-CGGTTCAAATAGTTA--ACT-ATTAGAATAATGATCTATTTCAAA
315 AAATATATTT-TCAGAATCAC-GTTCAAATAGTTATGACTAATT-GAACAATTAT-TATTT-AAA
* * * * * * * *
43250 TCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGT-TT-ATACAAGCTTATTCAAAAT
375 TAGTTATGACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTT-A-TATTCATACAAGCTTATTCAGATT
* * ** *
43313 AAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATTAGATTTGAAAAAATAAATTT
437 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAATAT
* ** * * * * *
43377 GTTTA-CTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC
500 GTTTATC-CAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * * *
43416 AATTATCTACTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTT-GTCATCAAACAATTGT-TGTAGTTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCATA
* * * * * *
43479 AAAGCTTATCCA-AAATAAAATAATAATACTTTATTACTATT-TTGAAAATTAATAAGTAAGATA
63 AAAGCTTAT-TAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGA
* *** ** * * ** * *
43542 TTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCT-TTTAAACAACTATCTAT
125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
43606 TTCAATTCATTATTA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATGCATGCTT-TTT
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGATTATTT
* * * * * * *
43668 CAAAATAAAGTAATACT-AATTTATGAATATTTCAAGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTA
254 -AGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATA
* ** * * * * * * * *
43732 AAT-TGCTTACCA-AACCA-TTTCAAATATTTTTTACTATTTGAATAATTATCTATATCAAATCA
316 AATAT-ATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TAT-TTAAAT-A
* * * * * ** * * *
43794 -TTA-GAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTAAAAATAAA
377 GTTATG-ACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAA
* * * * **
43857 ATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAACTTAAT-AGCCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAA
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAA-ATAATAAG-CAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * *
43919 CTGTCGAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATATGAAC
502 TTATCCAA-CAAGTCCAAATAGTCATA-ACCATTTAAAT
** * * ** * * * *
43956 GTTTATCTATTTTAAATCTTTATGACC-TTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGTTCGTAC
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * * * * * * *
44019 GAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAGT--AA-TAAGAAATTTA
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAAAAGTAAGAGATTTA
* * * * * ** * * *
44081 AAAAATAAATTTATTTACCAAATCAA-TTTAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATATC
129 AAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * *
44145 AAATCATTATGATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAGA
193 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTATTTAGA
* * * *
44209 ATAAATTAATACT-AATTTATTAA-ACATTCTAAAAATT-AGAAG-AAAAGATTTAAAAAAGTAA
257 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTTC-AAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAA-TAA
* * * * * * * * * * * ** *
44270 ATTTGTTTTACTA-AAGCAAGTTTAAATAG-TATTCAATAGTTTTATCTATT-TTA-AAAAATCG
317 ATATATTTT-C-AGAATCACGTTCAAATAGTTA-TGACTA-ATTGAACAATTATTATTTAAATAG
* * * * * * *
44331 TTTTAAACGCTTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTATT-TAGTTAATAAAAGCTTAGAT-AGAA
378 TTAT-GAC-C-TTTT-ATTTTTCATAAAACAATTGT-TTATA-TTCATACAAGCTTA-TTCAGAT
* * * * * *
44394 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCTAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAGATCTA
436 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* ** * * ** *
44455 TTTATCGAATC-AGTTTAAAATAATTATGGCCATTTGAAT
501 TTTATCCAA-CAAG-TCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * * *
44494 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTCT-TTTTTATGATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTAT-TCATA
* * ** * * * *
44557 CAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTGGTTAATATTTCAAAAATTAATACGTAATAGAT
63 AAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGAT
* * ** * * * * * *
44621 TT---AAA-CAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAAATATCAATC
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
44682 TCAAATCGTTAAAATC-TTTGTTTTGGCTTAAAACAATT-GTT-T-GTCATATAAGCTTATTT-G
191 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAG
** * * * *
44742 GTTAAAAATAATACT-AATTTAATAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAGATATCTAAAAAATAAA
256 AAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * ** * *
44805 TGTGTTTATC-GAATTA-GTTCAAATATTTAAAACT-ATTAGAATAATTATATATTTCAAATCGT
318 TATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATT-GAACAATTAT-TATTT-AAATAGT
* * * ** * * *
44867 TCTAACCTTTCATTTAGGCATAAAATATTTGTTTCATAGTT--TACAAGCTTATTCTA-AATAAA
379 TATGACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTT-ATA-TTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAA
* * * ** * * * * *
44929 ATAATCCAAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAGGAAAAATATTTACAAAAATAAATTTGTTT
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTA-AAAAATAAATATGTTT
* * * * * * * * *
44994 ATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAC
504 ATCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * *
45029 AATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA-CAT-AAACAATTGT-TTTAGTTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCATA
* ** * * * *
45091 AAAACTTA-T-CCAA-AAAAT-AT--TATTTTCTTAATATTTC-AATAATTAATAAGCAAGAG-T
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAA-AATTAA-AAGTAAGAGAT
* * * * * *
45148 TTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAAGTT-AGATAGTTATGACTGTTTGAACAATTGTCTA
126 TT-AAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * * *
45212 TTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTTATACAAGCTTA-T
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGATTATT
* **
45275 TCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAAT
253 TAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * * *
45338 GAATCTGTTTAT-GGAACCA-ATTCAAATAATTAT-AGTCATTTTTAACAATTAGTCTATTTCAA
315 AAATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACT-A-ATTGAACAATTA-T-TATTTAAA
* * * * * * * * *
45400 TTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAAAT
375 TAGTTATGACCTTTTATTT-TTCATAAAACAATTGTTTAT-ATTCATACAAGCTTATTC-AGATT
* * * * *
45464 AAAATAATACTAACTTATTAATCTTT--AAAAATTAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
437 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-T-AATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * ** *
45527 GTTTA-CAAAACCAGTTCAAAATAGTAACGACTATTTGAAA-
500 GTTTATC-CAACAAG-TCCAAATAGTCATAACCATTT-AAAT
* * * * * * * * * *
45567 ACTTGTATACTTCAACAATCAATTATAAACCA-TTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
1 AATTATCTATTTC-A-AATC-A-TAT-GACCATTTTTTTC-ATCATAAAACAATTGTATCTATTC
* * * * * * *
45631 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAG
60 ATAAAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAG
* * * ** ** * ** * *
45696 ATTTAAAAAATAATTTTTTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTA
124 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
* * * ** *
45761 TTTCAAATCATTAT-GCTCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTTTTAATTCATATTAGCTTAT
189 TTTCAAATCATTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGATTAT
* * * * *
45824 TCATAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATA
252 TTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATA
* * * * ** * * *
45888 ATTCTGTTTACCTAA-CTA-ATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
316 AATATATTTTCAGAATC-ACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAAT-A
* * * * * * * * *
45951 -TTAT-AGCCTTTTGATTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGGAATGAA
377 GTTATGA-CCTTTT-ATTTTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAA
** ** * * *
46014 ATAATACTAACCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* * ** * * * * * * **
46075 ACAAATTATTTCAACTAGTTATGACTATTTAAGC
505 TCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * * * * * * * * * *
46109 AATTATTTATTTCAAATCTTATGA-C-TCTTTGTTCTGTTATAAAATAATAGTTTTTGTTCACAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATATGACCAT-TTTTTTC-ATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * * * * *
46172 AAGCTTATTCGAATTAAAATATTATTAATTTATTAATATT-TTGACAATTAATAAGTAA-AAAAT
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGATT
* * * ** * * * *
46235 TAGAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGATT-AAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCCAT
127 TA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAG-TTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
46299 TTCAAATAATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCA
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTA
* * * * * *
46364 AAATAAAATAATACT--ATGCTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGA
255 GAATAAAATAATA-TAAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAA
* * ** * * * * * *
46427 ATCTGTTACCA-AA-CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCT
317 ATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAATAGTT
* * * *
46490 ATAACATTTTGTTTTGTCAT--AA-AA-TG---AT-TT-AT--AA---TA--CAAATT----T-A
380 ATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAA
* * * * ** * *
46534 T--TAA--TATCAAGA----C--AATTACTAAGTGAAAGATTTAAACAATAAATTTG-TTA-CCA
444 TACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCC-
* * * * * * *
46587 AACAAGTTCAACTCGTTATGACTATTTGAAT
508 AACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * * ** * ** * * * **
46618 AATTTTTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATTC
1 AATTATCTATTTCAAA-TCATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * * * * * *
46683 AAGCTTATTTGGATTAAAATTATATTAATTTGTTAATATT-TTGACAATTAATAAGTAAAAGATT
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGATT
* ** * * * *
46747 TAAAAAATAAATATGTTTACTGAATAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATGAGTAAAAGAATTA
127 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTA-AAATAGTT-----ATTACT-A-T-------TT-
* * * * * ** * ** * * *
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* * * * * * ** *
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235 TATT-C-ATACA--A-GA----TTATTTAG-AATAAAATAAT-A-TAAAT-TT-AT----TA-A-
* * * * * * *
46934 TAATTCGAATAAAATATTATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTT-A-AA-
280 TATTTC--A-AAAAT-TAAT-AA-GTA-GAA-ATTT--AAAA--AATAAAT-ATATTTTCAGAAT
* * * ** * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * * * * ** *
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445 ACTAATT---TAT-TAATATTTCCAA--AAATAATAAGCAAAAGATT--TAA--AAA--------
** * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA-
* ** * *
47289 AAA-TTTATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATT-CTAAAAATTAATAAGT-TGAAGA
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAG-AGA
* ** * * * * * * *
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125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTAT-TACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
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189 TTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATT
* ** *
47478 TAGAATAAAATAATACT-AATTTATTACTATTTTGAAAATTATTAAG-AG--ATTT-AAAAATAA
253 TAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * *
47538 ATCTCTTTACTGAACCA-GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTT
317 ATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TAT-TTAAATAGTT
* * * * * * *
47602 ATGA--TATTTGTTTTATCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAACCTTATTCGGAGTAAAATA
380 ATGACCT-TTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATA
* * * * * * * * * * * *
47665 TTGCTAAATTAATAACA-TTCTAAAATTAATAAG-TAAGGATTTAAAAAACAAATGTGTTT-GCC
443 ATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCC
* ** * * *
47727 GAACCAGTTTAAATAGTTA-ATACTA-TTAGAAC
508 -AACAAGTCCAAATAGTCATA-ACCATTTA-AAT
* * * * * *
47759 AATTATCAATTTCAAATCATTTTGACCATTTGTTT-AGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCAT-A
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTTTTTCA-TCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * ** * ** * * *
47822 ATGCTTATTCGAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA-
64 AAGCTTATTAGAAATAAA-AT-AATA-CTAATTTA-TT--AATA-TTCCT-A-AAATT-AA-AAG
* *** * * * * ** * *
47884 TCATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAAT--TCA-TAA
118 TAAGAGATTTAAAA--A--ATAA--ATCT-GTTTA-C-CAAAA-AA--GTTAAAATAGTTATTAC
* * ** * ** *
47946 AAGCTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-CTTTTGTTTTCT-ATAAAATGATTGTTT
171 TA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * ** *
48009 -TTTATCATATAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
234 CTAT-TCATACAAGATTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * *
48072 CA-TAGGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTACCA-AAGCA-GTTTAAATAGTTATGAATATTTAA
297 -AGTA-GAAATTTAAAAAATAAATATATTT-TCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGA
* * * * * * *
48134 ACAATTATATATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCATTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATA
359 ACAATTAT-TA-TTTAAATAGTTATGACCTTTTATT-TTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATA
* * * * * *
48199 CCAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAAAT--TAAG-AACTAAG-
421 CAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAA--AAGA
* * * * * * * *
48259 ----AAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAA-TTCAAATAGT--TAAGGCTATATGAAC
484 TTTAAAAAATAAATATGTTTATC-CAA-CAAGTCCAAATAGTCATAA--CCATTTAAAT
* * * ** * * * *
48310 AATTCTTTATTTCAAATCGCTATGACC-TTTTTTTTTTAATTAAACAACTT-T-TTTAGTACATA
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTTTTTCATCATAAAACAA-TTGTATCTA-TTCATA
* * * * * * * *
48372 CTAA-CTTATTCA-AAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATTAGTAAAAGG
63 -AAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAA-AAGTAAGAGA
* * * * ** * * * *
48435 TTTAAAAAATAATTATATTTGCCAAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
125 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
48500 TTCAAATCATTATGACCTATTGTTTTATCAT-ACACAAATATTTTTATTCAAATAAG-TT-TGTT
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTAT-TT
* * * ** *
48562 CGAAATAAAATAATATTAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTA-ACAGAATTAAAAAATA
254 AG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-A-ATTTAAAAAATA
* * * * * * * * * * *
48626 AATTTGTTTACTA-AACCA-ATTTAATTAATT-TAACTATTTGAACAATTACTTATGTTAAATTG
316 AATATATTTTC-AGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTA-TTAT-TTAAATAG
* * * * * * * *
48688 TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATAC-AGTCATATTCTGACTAAAG
378 TTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAG-CTTATTCAGATTAAAA
* * * * ** * * **
48752 TAATGCTAATTTATTAATA-CTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCTGTTGG
441 TAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* * * * * * * *
48816 TCTAACCAGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
505 TCCAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* * ** * * * * * * * *
48850 AATTATGTACTAAAAATCGTTATAACC-TTTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTGTTCATAT
1 AATTATCTATTTCAAATC-ATATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAA
* * * * * *
48914 AAGCTTATTCGAAATAACATAAGT-CTAACTTATTAATATT-TTGAAACTTAATAAGCAAGAGA-
64 AAGCTTATTAGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGAT
* * * ** * * * *
48976 TTAGAAAAATGAATCTATTAACTTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTAT
126 TTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTAT
*** * * * * * *
49041 TTCAAATTGCTATAACCTTTCGCTTTGTGATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTATTTCTATTCATACAAGATTATT
*
49106 TCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
253 T-AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAAT
* * * * * * *
49169 AAATCTATTTACCGAAT-AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTG
315 AAATATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTA-TTA-TTTAAATAG
** * * * **
49233 TTATGATTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAAT
378 TTATGACCTTTTATTTT-TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAAT
* ** ** * * * *
49298 AATATTAATTTATTAATATTTTTATGATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATT
442 AATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC
* * *
49363 GAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT
507 CAACAAGTCCAAATAGTCATAACCATTTAAAT
* ** *
49395 AATTATCTGTTTCAAATCATTAT-AATATTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTAT-TAGTTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCA-TATGACCATTTT-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCATA
* * * * * *
49458 TAGGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTGATATT-CTAAAAATTAATGAGTAAGAGAT
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGAT
* * * * * * *
49522 TTAAAAAATGAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AGATTATCTAT
126 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACA-ATTATCTAT
* * * * * * *
49586 TTTAGATCATTTTGA-CTATTTGTTTTGTCAT-GAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
190 TTCAAATCATTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTT
* * * *
49649 TGAACAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAGAAATTTTAAAAAATAAA
254 AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAA-TTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * * *
49714 TCTGTTTTTTGAA-CATGTTCAAATAATTTTGACTATTTAAACAATTACTATTTCAAATAGTTTT
318 TATATTTTCAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATTATTT-AAATAGTTAT
* * * * * * *
49778 GACCTTTTGTTTTGTCACAAACCAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAAT
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* * **
49842 ACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGA
445 ACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCCA
* * * *** * *
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** * * ** * *
49936 AATTA-CTTATTTGGAAT-AGT-T-ATCTTTTGTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATA
1 AATTATC-TATTTCAAATCA-TATGACCATTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATA
** * * *
49997 AAAATTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAGGTAGGAGAT
63 AAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCT-AAAATTAA-AAGTAAGAGAT
* * * * * * * * *
50061 TTAAAAAATAAGTTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCAATTTGAACAATTATCCAT
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* ** * * * * * * * * *
50126 CTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTT
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* * ** **
50190 G-AT----TAAGAT-AA--TACT-A-ATTT----AA-TAATAA--A-AAA--T-AAATGT-GCT-
255 GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATA
* * * * *
50232 T-TGTT-A-AA-CTA-GTTCAAATAGTTAAGGCT-ATTAGAACAACTATTTATTTCAAATCGTT-
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* * * * **
50290 TCGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAACAAAATA
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* * *
50354 ATACTAATTTATTAACATTT-GAAAAATTAATAAG----AGATTTGAAAAAATATATATGTTTAT
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* * * * * *
50414 CGAACAAG-CTCACATAGAT-ATGACTATTTGACT
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* *
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* * *
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* * * ** ** ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
50821 AAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGC-TAGGTCG
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* * * * * *
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433 GATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTT--AAAAAATA
* * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * ** *
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** * * * * * * *
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* *
51244 TTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAG-AG--ATTTAAAAAA
251 TTTAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAA
* * * * * * *
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314 TAAATATATTTTCAGAATC-ACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTAT-TATTT-AAAT
* * * * * * * * * * * *
51366 TGTTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAA
376 AGTTATGACCTTTTATT-TTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAA
* ** * * * *
51431 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTCATAA-CTAAGAA-TTTTAAAAAATAAATCTGTT
440 ATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAAATAATAAGC-AA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
51719 TTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCACAAAACGATTGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGT
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* *
51782 TCGAAATAAAATAATATTAATT
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Statistics
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Consensus pattern (538 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATATGACCATTTTTTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCATAAAA
GCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAATTAAAAGTAAGAGATTTAAA
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TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTATTTAGAATAA
AATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTT
CAGAATCACGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATTATTTAAATAGTTATGACCTTTTA
TTTTTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTCCAAAAATAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCCAACAAGTCCAAAT
AGTCATAACCATTTAAAT
Found at i:28537 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 28221--32062 Score: 2616
Period size: 182 Copynumber: 21.3 Consensus size: 180
28211 AATTTAATAA
** * * * * *
28221 TAAAAAATAAATATGTTTTGCTGATCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
28286 TCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAGAAACTTATTTGA
65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* *
28351 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATCAATAAGCAAGAGATTT
130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * *
28404 TAAAAAATTAATATGTTTACCTAACAAGTTGAAATAGGTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * **
28468 CAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAATTTATTCGA
66 C-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * * *
28533 AATAAAATAGTACTACTTCATTAATATTTC-AAAATT-ATCAAGCAAGAGATT
130 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATT
** * * * *
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1 TAAAAAATAAA--TATGTTTACCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
28646 TCTCAAATCGCTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC-TTATCATACATGCTTATT
63 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATT
* * * *
28709 CGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTGAGAGATT
127 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * ** * * *
28764 TAAAAAATAAATGTGTTT-GCTGAATC-ATTTTAAATGGTTAAGGTTACTAGAATAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCT-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
28827 TTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-T
64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * * *
28891 AGAATAAAATAATATTCATTTCTTAACATTTAAAAAACTAATAAGCAAGAGATT
129 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
28945 TGAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTAT
1 T-AAAAAATAAATATGTTTACCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * * * *
29009 TTAAAATTATTCTAAACTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATCCA
64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * *
29074 AAATAAAATAATGCTATTTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
29127 TAAAAAATAAATCA-ATTTA-TTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATA
1 TAAAAAATAAAT-ATGTTTACCT-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
29189 TTTCAAATCGTTATTATCTTTTGTTTTATCATAACACAATTCTTTTTCA--ACATACAAGCTTAT
63 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT
* * * *
29252 TTGAAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATC
126 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
29304 T-AAAAATAAATCTGTTTACC-AAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ** * *
29367 TCAAATTGTTAT-AACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTCTTCATACAAGTTTATT-TA
65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * *
29430 GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATT
130 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
*** * * * * * *
29483 TAAAAAATAAATCCATTTGCC-AACCAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACAATTGTCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
29546 TTAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGA
65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * *
29611 AATAAAATAA-ATCTAATTCATTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATT
130 AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
29663 TAAAAAATAATTCTATTTACAGAACCAATTCAAATAATTATAAAATAATTATAACTATTTGAACA
1 TAAAAAATAAATATGTTT-----ACC---T--AACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** *
29728 ATTATTTTATTTCAAATCATTATTG-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT
55 ATTA-TCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAC
* * * * *
29792 AAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATT
118 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * * * *
29856 TAAAAAATAAATCA-GTTTACAAAATC-ATTTCAAATAGTTTTGACTATATAAATAACTATCTAT
1 TAAAAAATAAAT-ATGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * ** * * * * * * ** *
29919 TTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTTGTCAAGCAGTTGGTTCTA-TTGAGACAATTTTATTT
64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTC
* * * ** * *
29983 GGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAAT
128 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** ** * * * * * * * *
30037 TAAAAGATAAATCTAATTGTCGAACCAGTTCTAATAGTTAAGA-TAATATGAGCGATTAACTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * *
30101 TCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTGTTCGTACAAGTTTATTCG
65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * *
30165 AATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
30218 TAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTATAT-GATTAAT-ACTATTAT-AACAATTATCT
1 T-AAAAAATAAATATGTTTACCTAACAAGTTCAAATAG-TT-ATGACTATT-TGAACAATTATCT
* * * * * * * *
30280 ATTTCAAATTGTTTTTACTTTTTGTTTAGTCATAAAGCAATTGTTTCAATACATACAAGCTTATT
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* * * *
30345 CGAAATAAATTAATACTAACTTATTAAGATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATT
127 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
30400 TAAGAAAATAAATCTTTTTATCGAACAAATTTAAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTGTTTAT
1 TAA-AAAATAAATATGTTTACCTAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
30465 TTAAAATTGCTAAGACCTTTT-TTCTTTTTATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATAC
64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
**
30529 -ATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATT
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* * * * *
30583 TAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGTT-AAATAGTTATGGCAATTTGAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *** *
30646 TCAAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTTTTGTCATATAAGCTTATTC
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*
30711 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAGAGATT
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* ** ** ** ** * * *
30761 TAAAAAATAAATGTGTTT-GTTGAACCGGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAACTATTTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
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** * * * * *
30888 GCATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
30941 TGAAAAAATAAATCTGTTTACCGT-ATAAGCTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTAAT-TA
1 T-AAAAAATAAATATGTTTACC-TAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTA
* * * * * * * *
31004 TTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTTATAAAAAGGTTATC
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* * * *
31069 CAAAATAAAATAATGCTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
127 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
31123 TAAAAAAATAAATGCAT-TTT--TTGAACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTAAACAATTGTAT
1 T-AAAAAATAAAT--ATGTTTACCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
31185 ATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCAGTTTATTA-AAGCTTAT
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* * * * * *
31249 TTGAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTCCAAAATTAATATGTAAGTGATT
126 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * ** * * *
31304 TAAAAAGTGAATCTGTTCACCGAATCAA-TTCAAATAATTATGGTTGTTTCAACAATTACCTA-T
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
31367 ACAAATCATTATGAAC-ATTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTT
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* *
31429 GGAATAAACTAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
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* * * * * * *
31483 TAAAAAATAAATCTATTTA-CT-----G---AAGTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCAATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** * *
31536 CAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTAT-AAGTAATTGTTTCA-TTCATAGAAGCTTTTTCGAA
66 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAA
* * * *
31599 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTGAAAATTAACAACTAAG-GATT
131 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** *
31649 TAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAAGC-AGTTTAAATAATTAAGA-TACATGAAGAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCT-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
31711 TTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
64 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
*
31776 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * * * *
31825 TGAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATC-ATTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
31889 TCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTT-ATGATCTTTCAAGCTTATTTG
65 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
31953 GAATACAATTATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTTATAAGTAAGCGATT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
32006 TAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
1 TAAAAAATAAATATGTTTACCTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
32063 GTATACTTCA
Statistics
Matches: 2872, Mismatches: 638, Indels: 300
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
166 34 0.01
167 64 0.02
168 19 0.01
169 10 0.00
170 4 0.00
172 1 0.00
173 5 0.00
174 5 0.00
175 71 0.02
176 141 0.05
177 160 0.06
178 120 0.04
179 265 0.09
180 358 0.12
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182 647 0.23
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185 2 0.00
188 2 0.00
190 2 0.00
191 3 0.00
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194 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
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CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAA
ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
Found at i:28889 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 28221--46513 Score: 8043
Period size: 181 Copynumber: 100.5 Consensus size: 180
28211 AATTTAATAA
* * * * * *
28221 TAAAAAATAAATATGTTTTGCTGATCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATT
1 TAAAAAATAAATCTG-TTTACTGA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
28286 TCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAGAAACTTATTTGA
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* *
28351 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATCAATAAGCAAGAGATTT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * **
28467 TCAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAATTTATTCG
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* * * *
28532 AAATAAAATAGTACTACTTCATTAATATTTC-AAAATT-ATCAAGCAAGAGATT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATT
** * * * * * * *
28584 TAAGCAATAAAGCTATTTTCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAATCT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
28649 CAAATCGCTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC-TTATCATACATGCTTATTCGG
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* * *
28712 ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTGAGAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * ** * * *
28764 TAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAATCATTTTAAATGGTTAAGGTTACTAGAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
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65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-
* * * * * * *
28893 AATAAAATAATATTCATTTCTTAACATTTAAAAAACTAATAAGCAAGAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
28945 TGAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATT
1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * * * * * *
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64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * *
29075 AATAAAATAATGCTATTTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * * *
29127 TAAAAAATAAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
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* * *
29255 AAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATC
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * *
29304 T-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** * *
29368 CAAATTGTTAT-AACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTCTTCATACAAGTTTATT-TAG
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-
* * *
29431 AATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * * * * * *
29483 TAAAAAATAAATCCATTTGC-CAACCAATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAATTGTCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
29547 TAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGAA
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAA
* * *
29612 ATAAAATAA-ATCTAATTCATTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATT
130 ATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
29663 TAAAAAATAATTCTATTTACAGAACCAATTCAAATAATTATAAAATAATTATAACTATTTGAACA
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTC-----------AAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** *
29728 ATTATTTTATTTCAAATCATTATTG-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT
54 ATTA-TCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAC
* * * *
29792 AAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTAGTAAGAGATT
117 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * * * * *
29856 TAAAAAATAAATCAGTTTACAAAATCATTTCAAATAGTTTTGACTATATAAATAACTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * ** * * * * * * ** * *
29921 CAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTTGTCAAGCAGTTGGTTCTA-TTGAGACAATTTTATTTGG
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * ** * *
29985 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAAT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
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* * * ** * *
30099 TTTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTGTTCGTACAAGTTTATT
62 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * *
30163 CGAATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
126 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * *
30218 TAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTATAT-GATTAAT-ACTATTAT-AACAATTATCT
1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAG-TT-ATGACTATT-TGAACAATTATCT
* * * * * * * *
30280 ATTTCAAATTGTTTTTACTTTTTGTTTAGTCATAAAGCAATTGTTTCAATACATACAAGCTTATT
61 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * * *
30345 CGAAATAAATTAATACTAACTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATT
126 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
30400 TAAGAAAATAAATCTTTTTA-TCGAACAAATTTAAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTGTTTA
1 TAA-AAAATAAATCTGTTTACT-GAAC--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * *
30464 TTTAAAATTGCTAAGACCTTTT-TTCTTTTTATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATA
62 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
**
30528 C-ATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATT
126 CGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
30583 TAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATCAGTT-AAATAGTTATGGCAATTTGAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *** *
30646 TCAAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTTTTGTCATATAAGCTTATTC
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTC
*
30711 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAGAGATT
127 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * ** ** * * *
30761 TAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCGGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAACTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
30826 CAAATCGTTCTAACATTTT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTAATTCGG
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCGA
* * * * * *
30889 CATAAAATAATCCTAATATATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
30941 TGAAAAAATAAATCTGTTTACCGTATA-AGCTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTAAT-TA
1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTG-A-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTA
* * * * * * * *
31004 TTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTTATAAAAAGGTTATC
62 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT-ACAAGCTTATT
* * * *
31069 CAAAATAAAATAATGCTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
126 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
31123 TAAAAAAATAAATGCAT-TTT-TTGAACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTAAACAATTGTATA
1 T-AAAAAATAAAT-C-TGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
31186 TTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCAGTTTATTA-AAGCTTATT
62 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-TACAAGCTTATT
* * * * * *
31250 TGAAATAAACTAATAATAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATATGTAAGTGATT
126 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * ** * * * *
31304 TAAAAAGTGAATCTGTTCACCGAATCAATTCAAATAATTATGGTTGTTTCAACAATTACCTA-TA
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
31368 CAAATCATTATGAAC-ATTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTG
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * *
31430 GAATAAACTAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
31483 TAAAAAATAAATCTATTTACTG-A-AG------TAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCAATTTC
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** * *
31537 AAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTAT-AAGTAATTGTTTCA-TTCATAGAAGCTTTTTCGAAA
66 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA
* * * *
31600 TAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTGAAAATTAACAACTAAG-GATT
131 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** *
31649 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAGCAGTTTAAATAATTAAGA-TACATGAAGAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
31713 CAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAA
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAA
* *
31778 ATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * * * *
31825 TGAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATCATTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
31890 CAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTT-ATGATCTTTCAAGCTTATTTGG
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCGA
* * * * *
31954 AATACAATTATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTTATAAGTAAGCGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
32006 TAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATACT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ** * ** *
32070 TCAAATTGTTTTGTCACAAAACAATTAT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
64 TCAAATCGTTATG--AC----C--TTTTGTTTTG-TCATA-AAAC--AATT-GTTTCAGTTCATA
* * * * ** ***** *
32134 CTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGA-GAA-TTAAAAATAAATTTGTTTGATGAA
116 C-AAGC---T--TA-TTCG-AAA-TAA-AA-TAATACTAATTTATTAAT--ATTTCAAAAATTAA
*
32197 CT-AGTTCAA-ATATT
168 -TAAG-T-AAGAGATT
* * ** * * *
32211 TAAGACTATATGAA-C-AATTA-T-TA-ATTTCAAA-ATGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATA-A
1 TAA-A--AAATAAATCTGTTTACTGAACAGTTCAAATA-GTTATGA-C---T-ATTTG--A-ACA
* ** * * * ** * * *
32269 AATAAAT-TTTC-AAT--TCATG--CTAGTTT-ATTCGGAATAAAATAAAATGAATTT-A-TTAA
54 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT--TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTG--TTTCAGTTCA
** ** * * ** * *
32325 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATATTTTTGTTTACCTAACTAATTCAAATAA
114 TA---C-AAGCTT-ATTCG-AA-ATA---AAATAATA--CTAATTTA-TTAA-TATTTCAAA-AA
** *
32390 TTATGACTATTTGAACA-A-T
164 TTA--A-TAAGT-AAGAGATT
** ** * **** *** * ** *
32409 TATCTATTTCAAATCTTTTTGACCTTTTGTTTTG-TCATAA-AAAAATG--TCTTTGTTCATATA
1 TA-AAAAAT-AAATCTGTTT-A-C---TGAACAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACA-ATT
* * * ** * * * **
32470 AGT-T-TGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGAGATTT-A
57 A-TCTAT-TTC-AAAT--CGT--TA-TGACCT-TTTGT-TTTGTCATAA--AACAATTG-TTTCA
**** * * ** ** * * * *
32531 AAAAATA-AA-CCTATTTGTAAACCAGTTCAA-A-T-AGTTATGACTATTTGACAAATTATTGAT
109 GTTCATACAAGCTTATTCG-AAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTT--CAAA-AATT-A-
* * *
32591 TTTAAATTGTTATGACATTTTGT
167 -AT-AA--G-TAAGAGA---T-T
* * * * * * *
32614 CCTATTATAAA-AAATTTGTTTA-T-ATTCA-TACAAGT--TTAT-TC-ATATT-AA-AA-TA-A
1 --TA--AAAAATAAATCTGTTTACTGA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATC
* ** *** * * * ****
32667 TA-TT--AAT--TTATTAATATTTTGACAAT-TAATAAATAGAAAT-TTT-AAAAAATA-AA--T
60 TATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTG-TTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT
* * * * * * * * * ** *
32721 ATATTTACTGAACT-AGATCAA-A-T-AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTA-A-ATC
122 -TA-TT-C-GAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAGAGAT-
32780 GT
180 -T
* *** * * * **** * * *
32782 TATGACCCT--TTCT-TTTGTCAT-AAGAGATTTGTTTTAGTTCATGTAAGGTTATTCGGGATAA
1 TA-AAAAATAAATCTGTTT-AC-TGAACAG--TTCAAATAGTT-ATG--A--CTATT--TGA-AC
* * * * ** * ** * * *
32843 AATAATATCAATTT-ATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAGTTAAGAGATTTAGAAAAAAAATCTGT
53 AAT--TATCTATTTCA--AATCGTTAT-GACCTT--TTGTT--TTG--TCA-TAAAACAAT-TGT
* * * *
32906 TTACAG---A-ACAAG--T-TT--AAATAATTATGACTATTTGAAATTGCTA-TAACCTTTTGTT
105 TT-CAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAA-AAT-AATA-CT--AATT--TATTAA---TAT-TT
*** * * ******
32961 TTGAAATAAAATAATTTTTTTCTGT
158 CAAAAAT-TAATAAGTAAGAGAT-T
* * ** * * * * * * ** *
32986 TCATAAAAGCTTATATC-GAATA--AAATAATACAAA-A-TTATTAATATTAAAACAATTA-ATA
1 T-A-AAAA--ATAAATCTGTTTACTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * *** ** ** * * * * *
33045 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTATCA-AACAAGTTCAAATGTTATGACTATTTGA-A
62 TTTCAAATCGTTATGACCT---TTTGTTTTGTCATAA-AA---CAATTGTT-T--C-AGTTCATA
** ** * * * * * * * ** * *
33107 CAATTATTTATTTC-AAAT--TGTTATGACT-CTTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGTTCTATTC
116 CAA--GCTTA-TTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATAT-TTCAAA-AATTAAT-AAGT-
*
33167 ATACAAGGTTATT
173 A-A-GA-G--ATT
* * * * * * ** *
33180 TGGATTAAAATAATAT-TAATATT--TTAACAATT--AATAAGTAAAAGA-T-TTAAAACATAAA
1 T--A-AAAAATAA-ATCT-GT-TTACTGAACAGTTCAAAT-AGT-TATGACTATTTGAAC--AAT
* * * * * ** * ** * ** **
33238 TATGT-TTATCGAACAAGTTGTAATAGTCATGAT-TATTTG-AAT-AATTAACTACTTCAAATCA
56 TATCTATT-TC--A-AA-TCGTTAT-GACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA
** * * * * ** * * *
33299 TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAACTGTTTCAATTCAAATAAGCTTGTTTGAAACAAAAT
114 -TACAAGC--TT-ATTCGAAATAAAATAA-T-ACT-AATT-TATTAA---TATTT----CAAAA-
* * * *
33364 AATACTAATTTATTA-ATATT
163 ATTAATAA-GTA--AGAGATT
* ** ** * * * ** * ** *
33384 CT-AAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAT-AAATATGTTTATCGAACAAGCTCAA-ATAGT
1 -TAAAAAATAAATCTGT---TTACTGAACAGTTCAAATA-G-TTAT-G-ACTATTTGAACA-A-T
* * * *
33446 TATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTCTTTTGTTC-TAAAGCAAT
56 TA--TCTATTT---C-A--A---A--T-----CGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAAT
* * * **
33510 TGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTAAAAAAA
102 T-GTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
*
33572 TTAATAAGTAA-AAATT
164 TTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
33588 TAAAAAATAAATATGTTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTAT-ATTTATTTGAACAATTATCCAT
1 TAAAAAATAAATCTG-TTTACTGAACA-GTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTAT
* * * ** *
33652 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTC-
63 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * *
33716 AGAATAAAATAATACTAATGTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * ** * *
33771 TAAAAAATATATCTGTTTATTGAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * **
33836 TAAATCGTTATGATCTTTTGTCTTCTCATAAAACAACTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAA
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGA
* *
33900 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAACTTAATAAGTTAA-AAATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATT
* * ** * ** * * *
33952 TTAAAAATAAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGGCAAGTTTATTCGAACTATTAGCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * **
34017 CAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAAATTATTC-A
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
34080 GAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATT
129 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** *
34128 TAAAAAGTAAATTTGTTTA-TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATGAGAACAATTATCTATC
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * *
34192 TAAAATCGTTATGATC-TTT-TTTTCTCATAAAGTAATTGTTTGTA-TTCATACAAGCTTATT-T
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
34253 AGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATT
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** ** * * *
34307 T-AAAAATAAATGTGTTTACCAAACCAGCTT-AAATAGTTAACACTATTAGAATAATTAGCTATT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
34370 TCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAAATT-ATATAA--TTATT-T
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCG
** * * * * * * * **
34431 ATTTAAAATCGTTATAACCT-TTTGTTTTAACA--TAAAATAATTGTTTCAATTCA-TAAAATCT
128 AAATAAAA---TAAT-A-CTAATT-TATTAATATTTCAAA-AA----TT-AA-TAAGTAAGAGAT
34492 T
180 T
* * * ** ** ** * * * * *
34493 ATCCAAAATAAAATAATAT-TACTTTA-TTAATA-TTTCAA-AAAT-TGAAAAGTAGGAGATTTA
1 -T----AA-AAAATAA-ATCT-GTTTACTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
*** ** * ** ** * * * * * *
34553 AAAAAAT-AAATCAGTT-TGTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAATTATTT-ATTTCAAATCT
58 TCTATTTCAAATC-GTTATGAC-CTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-C-
* * ** ** * * *
34615 TTACGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTTGTTCACACAAGTTTATTCGGACTAAAA
117 --AAG-C---TTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT-----AA-TAT-TTC--A--AAAA
* * *
34679 TAATATTAATTTATTA-ATATTT
164 T--TAATAA-GTA--AGAGA-TT
* * * * * * *
34701 TGACAAATAAAAAGTAAAATAT-TTTCAAAATAAATATGTTTACTGAATAAGTT-TAAATAGTCA
1 T-----A-AAAAA-T-AAATCTGTTT---ACTGAACA-G-TT-C-AAAT-AGTTATGACTA-T--
* * * * * **
34764 TAGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGT
47 TTG-AAC------AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
34829 ATT-AATTTATATAGGCTTATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
105 -TTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* *
34892 GAGTAAGAGATA
169 AAGTAAGAGATT
* * * * *
34904 TAAAATATGAATC-GATTTACCAGATA-AGTTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATCTG-TTTA-CTGA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
34967 TTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTT-ATATTCGTACAAGTTTAATT
63 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTT-ATT
* * *
35031 CG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCAAAAAATT
126 CGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** *
35085 TAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATCTGTTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * ** * * *
35150 CAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATATAAACTTATTTGAA
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAA
* *
35215 ATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * * * * * * *
35265 TTAAAAATAAATCTATTTATTGAGCAAGTTCATATCA-TTATGATTGTTTGAACAATTATTTATT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * *
35329 TCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGTTTATT-T
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
35392 AGATTAAAATAATACTATTTTACTAATA-TTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATT
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * *
35446 TAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAGTAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTAT
1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
35510 TT-AAAGTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCC
63 TTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * *
35574 AAAATAAAATAATACTACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATA
127 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** * **
35628 TAAAAACTAAAGT-TATTTTCCAAACTAGTTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAA--A--TAAC
1 TAAAAAATAAA-TCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * * *
35688 TCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAA-AATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATT-TA
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * *
35750 GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAGAAA-T--TAA-TAAGAGATT
129 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** * *
35799 TAAAAAATTAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAT-AATAACTATCTATT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATT
** * * * * * * * * *
35863 TCAAATCACTCTGACCTTTTGTTTAGTCACACAATAATTGTTTCAATTCATACAACCTTATTTGG
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * **
35928 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAGCATTAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * * *
35979 TGAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAGTAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
36044 TAAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTAGTTCATAAAATCTTATTC-A
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * * *
36108 AATAAAATACTACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * *
36160 TAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAACTATCTATT
1 TAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
36224 TCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTTCAG--CATAC-AGCTTATTCG
64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
*
36286 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * *
36335 TAAAAAATATATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
36400 CAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATCAATTAACATAAG
65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-A---GT-TC-A-T-AC--AAG
* ** * * **
36465 CTTATTTGACGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAAC
120 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
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177 GATT
* * * ** * * **
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
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* * * * *
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1 TAAAAAAT-AAATCTGTTTAC-TGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * ** * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
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* *
37934 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
128 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * * *
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* * *
38116 AATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTC--AAA-TATTAA-TAAGAGATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * *
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* * * * * * *
38292 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAGTTGATAGGTAAAAAATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
38344 TTAAAAATAAATATGTTTAC-GAACTAGAT-AAACTAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
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** ** * *
38472 AATAAAATAATGTTAATTTATTTGTAATTCAAAAATTAATAA-TAAAGAAATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATT
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * ** *
38703 TGAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * *
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1 TAAAAAATA-AATCTGTTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
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* * * *
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*
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* * *
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* * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AA-C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
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129 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
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65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCG
* ** * *
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* * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
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* * *
40079 AAATAAAATAATA-TAATTTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTT
128 AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA--TT
* ** * *
40134 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
40199 AAAATCATTACT-ACCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-AAACTTATTCAA
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
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64 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * ** * * * *
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* ** *
40803 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-TTT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
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* * * **
40979 AGAATAAAGTAATGCTAATTTATTGATA-TTCTAAAAATTAATAAGT-TCAGATT
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTA--CTGAACAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * ** * * *
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* * * *
41339 -AATTAAAGTAATACAAATTTATTAATA-TTCAAACAACTAATAAGTAA-A-ATTT
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * ** * ** * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
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* * *
41700 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAACTTAATGAGTAAGAGATT
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* * * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * *
41815 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-TAAAATA-ATTGTTTCTAC
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* ** * * *
41878 TCATACAAGTTTATTCAAATAAAGTAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A
125 TC-GA-AA-TAAAAT--AAT--ACTAATT------TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
*
41942 AATT
177 GATT
* * * * * * *
41946 TTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACACGATCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
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* * * * *
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129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * ** * * * * * *
42178 CATATAGTTATGATGTTTTGTTTTCTTATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGG
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* *
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129 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATT
* * * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * **
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* ** *
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* ** * ** * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * **
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* * *
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* * ** * ** * *
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* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * *
42827 TAAAAAAATAAATCTGTTTACAGGACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAACTATGTAT
1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
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* **
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* * * ** * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
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* * **
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* * *
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1 T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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1 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * ** **
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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65 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-
* * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*
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*
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** *
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* * *
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* * * *
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** *
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Found at i:35243 original size:361 final size:358
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** * * *
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* *
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* * * * **
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * *
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* * * *
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* * * * * **
33730 CTAATGTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATATATCTGTTTA-TTGA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAGA
** * * * * *
33794 GTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATCTTTTGTCT
128 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * **
33859 TCTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
33924 TATTCTAAAACTTAATAAGTTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATA
256 TATT-TAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
** * ** * *
33988 GGCAAGTTTATTCGAACT-ATTAGCTATTTCAAATCATTATG
319 GTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * * **
34029 ACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTC-AGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATA
* * * *
34093 CT-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATC-GAA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAG-A
* ** * * *
34152 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATGAGAACAATTATCTATCTAAAATCGTTATGATC-TTT-TTTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** * * * * * * *
34215 CTCATAAAGTAATTGTTTGTATTCATACAAGCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAAT
193 GTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
34280 ATTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTACCAAACCAGCTT-AAATAG
257 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAG
** * * * *
34343 TTAACACTATTAGAATAATTAGCTATTTCAAATCGTTTTG
320 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * ** * * ** *
34383 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAAATT-ATATAA--TTATT-TATTTAAAATCGTT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA---TA
* * * * ** * * *
34444 ATAACCT-TTTGTTTTAACA-T-AAAATAATTGTTTCAATTCATA-AAATCTTATCCAAAATAAA
62 AT-A-CTAATT-TATTAATATTCCAAA-AATT-AAT-AAGT-A-AGAGAT-TTA--AAAAAT-AA
** * * * * * * * *
34505 ATAATATTACTTTATTA-ATATTTCAAAAATTGAAAAG-TAGGA-GATTTAAAAAAATAAATC-A
115 ATCGT-TTAC--CA-GACA-AGTTC--AAA-T----AGTTATGACTATTT-GAACAAT-TATCTA
* * * * *
34566 GTTTGTCAAATCAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA-AATCTTTACGACTT-TTTAT
166 --TT-TCAAATC-GTTATGAC--CTT------TTGTTT-TGTCATAA----AAC-AATTGTTT-T
* * * * * ** * * * * ** * **
34629 TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTC-ACACAAGTTTATTCGGACTAAAATAATA-TTAATTTA
212 TAT-TCAT---ACAA--G--CTTATTCGA-ATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTAA-AAA
** * * * ** * *
34692 TTAATATTTTGACAA-A--TAAAAAGTAAAATAT-TTT-CAAAATAAATATGTTTACTGAATAAG
266 TTAATA-AGT-AAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTAC-CGA-ACA-A-G-TT-C-AAAT-AG
* * *
34752 TTTAAATAGTCATAGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAAT-TGCTATG
320 -TT--AT-GAC-TA--TTT--GAATAATTATCTATTTCAAATAT--TATG
** * * * *
34801 ACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTAAT-TT-ATATAGGCTTATTTGAAA-AAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TT-CTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* * * *
34863 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATATAAAATATGAATCGATTTACCAGA
64 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCG-TTTACCAGA
* * * * * *
34928 TAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTGT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
34993 GTCATAAAATAATTGTTTATATTCGTACAAGTTTAATTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
193 GTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTT-ATTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * *
35057 TATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATA-TTCAAATA
256 TATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATA
* * *
35121 GTTATGACTATTTGAGTAATTATCTGTTTCAAATAGTTATA
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-TTATG
* * * * *
35162 ACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * **
35227 T-ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTTAAAAATAAATCTATTTA-TTGAG
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAGA-
* * * * * **
35289 CAAGTTCATATCA-TTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTT
128 CAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
35353 TGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATACTATTTTACTA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * ** * * * * *
35417 ATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAGT
255 ATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
* *
35482 AGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATG
318 AG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA--TATTATG
* * * * * * *
35524 ACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * ** * * *
35589 TACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAAACTAAAGTTATTTTCCAAACT
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAGACA
* ** * *
35654 AGTTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAA--A--TAACTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCT
130 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
35714 CATAAAA-AATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATT-TAGATAAAAATAATACTAATTTAATAAT
195 CATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCGA-AT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
35776 ATTTCAGAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATTAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGT
257 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
** * * *
35837 TAAAACTATTAT-AATAACTATCTATTTCAAATCACTCTG
321 TATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * ** * * *
35876 ACCTTTTGTTTAGTCACACAATAATTGTTTCAATTCATACAACCTTATTTGGAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * ** * *
35941 TAATTTATTAACATT-CAAAAATTAATAAGCATTAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-CGTTTACCAGAC
* * * * * * * *
36005 AAGTTTAAGTAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
36070 TCATAAAACAGTTG-TTTTAGTTCATAAAATCTTATTCAAATAAAATACTACTACTTTATTAATA
194 TCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
36134 TTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAA
258 TTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * *
36197 TTATGGCTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATT
320 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * *
36237 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTTCAG--CATAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * * *
36299 CTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATCTGTTTACCAAAC
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAGAC
* * * * * * * * *
36360 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTA
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* *
36425 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATCAATTAACATAAGCTTATTTGACGTAAAATAATACTAA
194 TCATAAAACAATTG-TT-T-TT-AT-TC-A-T-AC--AAGCTTATTCGA-ATAAAATAATACTAA
* * * ** * * * * *
36490 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTATGTACCAAACAAC
248 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG
* *
36555 TTCAAAGAGTTATGACTATCTAGACA-AA-TATCTATTTCAAAATATTATG
311 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGA-ATAATTATCTATTTC-AAATATTATG
* * * * *
36604 ACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTGTTCATCCAAGCTAATTTC-AAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA
* * * * * * * *
36668 -TAAATTAATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGCAA-A-ACTTTCATAAATAAATTTGTTT-TCTG
65 CT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAG
* * * * * * *
36729 AACACGTTCCAATAATTATGACCATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTATT
127 -ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *
36794 TTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTA
191 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * **
36859 AAATTCCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTA-CAAAGTGAGTTCAAA
255 ATATT--TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAA
* *
36923 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
317 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
** * * ** * * *
36966 ATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAATTTTATTTGGAATAAAATAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * ** * *
37031 T-ATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-GAAT
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGTTTACCAG-AC
* * * ** * * **
37094 AAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTACCATCTATTTCGAACCGTTATGATATTTTGTTTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** *
37159 TAATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCAGACAAAATTATTCAAAATAAAATAA
194 TCAT---A-AA-A-CAATT-GT-----T--TT--TATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAA
* * * * * *
37224 TAAC-AATTTGTTACTATTTCAAAAATTAATAAG----A-ATTAAAAAAATAAATGTGTTTGCCA
242 T-ACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG
* * * ** * * *
37283 AACCAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTTCA
305 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAT-TAT-G
* * * * *
37338 ACCTTTTGTTTAGTCAAAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTACTT-GAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA
** * * * * * *
37402 CTAATTTATTACCATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAAATATGTTTA-CATA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAAT-CGTTTACCA-G
* * * * * *
37466 ATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTT
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTT
* ** * * * * *
37531 TTATCATAAAACAATTG-TTTTAGTAAATA-AAGGCATATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTAT
191 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAA-GCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
37593 TAATATTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAATC-AGTTCA
253 TAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTTCA
* ** * * ** * *
37656 AATTGCAACGACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATTGTTAT-
315 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATG
* * * * *
37700 ATCCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATG
1 A-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * * * * * * *
37765 CTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAGTAAATTTGTTTGCCAAAC
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAGAC
* * * * * * * * *
37830 CAGTTTAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTACTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTT
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
37895 TCATAAAATAAGTT-TTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATT
194 TCATAAAACAA-TTGTTTTT-ATTCATACA-AGCTTA-TTCGAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * *
37957 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAAT
254 AATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * *
38022 AATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTG
318 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
38064 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * ** * *
38129 TAATATATTAATATTTC--AAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTTCAAACT
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAGACA
* * *
38190 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
130 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * *
38255 TGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTCGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
195 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * * * * *
38320 TCAATAGTTGATAGGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CGAACTAGAT-AAACTAATCA
260 T-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAA-TAGTTA
* * *
38383 TGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
323 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * * * **
38420 GCCTTTTGTTTTGCCATAAAAGAAATGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
** * * *
38485 TAATTTATTTGTAATT-CAAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGA
66 TAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAG-
* * * * * * * * * ** * * *
38547 ATAAATTTAAAAAATTATGATTGTTTGAATAATAATCTATTTGGAATTGCTATAACC-TTTGTTT
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * ** * *
38611 TGCCAT-AAA-AATTTTTTTCTATTAATACAATCTTATTTCAAATAATTTAA-ATCAAATTTATC
192 TGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATA-CTAATTTATT
* * * * * *
38673 AATA-TTAAGGCAATTATTAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAA
254 AATATTTAA--AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAA
*** * * *
38737 TCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATG
317 T-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA-ATATTATG
* * * * * *
38780 GCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATT-TAGATTAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATA
* *** * * * * * *
38843 TTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAATAAAAGATATAAAAAAAATAAATATGTTTACCAA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-T-TAAAAAATAAAT-CGTTTACCAG
* * * *
38908 ACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTT
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
38973 TATAATAAAATAATTG-TTTCATTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTA
* * * ** * * * * *
39037 ATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAA-AGAATATGTTTATCAAATAAGTTCTAAT
255 ATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
** * *
39101 AGTTATGACTACCTGAATAATTATTTATTTCAAAACATTATG
318 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATATTATG
* * * * * *
39143 ACCTTTCGTTTTGCCACAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTGTTTTG-AATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAAT
* * *
39206 -TTAAATTTATTAATATTCCAGAAA-T--TAA-T-A-AGA---AAAAAAT--AT-GTCTT--CTG
64 ACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGT-TTACCAG
* * * *
39256 AACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATATGATCTTTTGTT
127 -ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *
39320 TTGTCAT-AAACTAATTATTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATTAATACTAATTTAT
191 TTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAA-TAATACTAATTTAT
* * * *
39384 TAAAATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAGCAAGTTCAA
253 TAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAA
* * * * *
39448 ATAGTTTTAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
316 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * *
39492 ATCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* ** * * *
39557 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAAC
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGTTTACCAG-AC
* * ** * * * * * * *
39621 AATTTCCAGCAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTA
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * * **
39686 TTGTAAAACGATTGTTTTTAGTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
194 TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
39751 TTTCAAAAA-T--T-AGT-AGAGATTTTAAAACTTAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTT
258 TTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
39811 ATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCAAATAGTATG
322 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATATTATG
** * * *
39848 A--TCATGTTTTGTCATAAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAATC-AAAGTAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAAT
* ** * * * ** *
39910 GCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTGCTGA
64 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGT-TTACCAGA
* * * * * * *
39974 -ATCAGTT-ATAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACTTTTTAT
128 CA--AGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * *
40037 TTTGTCAT-AAA-AATTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATTTGAAATAAAATAATA-TAATTTT
190 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-A-TTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAA-TTT
* * * * *
40099 ATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAAT
251 ATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAA-AAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGT
* * *
40163 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACT-
312 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTA-TG
* * * * * *
40211 ACCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAATAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * *
40275 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATTAGTTTATC-GA
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATT-AATAAGTAAG-AGATTTAAAAAA-TAAATCGTTTACCAG-
* * * *
40337 ACAA-TTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTT
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * *
40401 TGTTATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAACAATACTAATTTATTA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * * ** * * * *
40465 ATATTTCAAAAATTAAAAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTATCGGACTAGTTTAAATA
255 ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * *
40530 GTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATA
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * *
40571 ACCCTTT-TTTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATA
* * * *** * * * * * *
40634 TTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTGCTAAAC
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAGA-
* * * * ** * *
40699 CAA-TTCAAATATTTAAGGCTATATGATTAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTCTTTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
40763 GTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
193 GTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTT-ATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
40828 ATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAGTA
257 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATA
* * * *
40888 GTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
40929 ACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCCTATTGATA-TAGTCTTATTC-AGAATAAAGTAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAAT
* * * ** *
40992 GCTAATTTATTGATATTCTAAAAATTAATAAGT-TCAGATTTAAAAAATGAATAT-G-TTAGCCT
64 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA-ATCGTTTA-CCA
* * * * * *
41054 GACCAGTAT-AAATAGTTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGT
126 GACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * ** * *
41118 TTTGTTACAAAACAATTGTTTCTATGCATATAAGCTGACTAGGAATAACATAATTCTAATTTATT
190 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * ** * *
41183 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATCTATTTGTCGAACAAGTTAAAAC
254 AATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * *
41248 AATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCACTATA
318 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
** * * * * * *
41290 AGATTTTGTTTTGTCAT-AAA-ATTTTTTTATATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAGTAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA
* * * *
41352 CAAATTTATTAATATT-CAAACAACTAATAAGTAA-A-ATTTTTAAAAATAAATTTGTTTACC-G
65 CTAATTTATTAATATTCCAAA-AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAG
* * * * * *
41413 AATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTT
127 -ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * *
41477 TTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTA
191 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * ** *
41542 ATATTTCAACAATTATTAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTTCTGAACAAGTTCAGCTC
255 ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
** * * *
41606 GTCGTAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * ** * * *
41647 ACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAAGCTTAATCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * * * *
41712 TAATTTATTAATATTACAAAACTTAATGAGTAAGAGATTGAAAATATGAATCTATTTATC-GAAC
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAG-AC
* * *
41776 AAGTTCAAATAGCTATAACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
41841 TCATAAAATAATTGTTTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGTTTATTCAAATAAAGTAAT
194 TCATAAAACAATTGTTT--T----T-A-------T--TCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAAT
* * * *
41906 A-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTGA
243 ACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* * * * * * *
41969 ACACGATCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATAGTTGTT
306 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-TTATG
* * * * * *
42023 ACCTTTTGATTTGTCACAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAACATATTCGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
42088 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAAATATAAAAAGTAAATATGTTTA-CTGAGC
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGTTTACCAGA-C
* * * ** *
42152 AAGTTC-AA-A--TA--AC-AATT-----ATT-T-TATTTCATATAGTTATGATGTTTTGTTTTC
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
42203 TTATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATATATTAATA
194 TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * ** * *
42268 TTCTAAAAATTAATAGGTAGTAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATACTC
258 TT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
42333 ATGTCCATTTGAACAACTATCTATTTCATATCATTATG
322 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * **
42371 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAGTTTCTATTCATGCAAAATTATTC-AGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATA
* *** * * ** * *
42435 CTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AG---GAGTTTTGAAAGCTAAATCTATTTACCAAAA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACC-AGA
* * * *
42496 CAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAAT-ATTATGATCTTTT-TTTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
42558 GTCATAAAATAATTATTTCTT-TTCATACAAGCTTATTCAAAT-CAA-AATACTAATTTAATAAT
193 GTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** *
42620 ATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTT--TAAA-AAAT-TGTTTGCCAAACCAA-TTCATGTCG
257 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * *
42680 TTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTG
320 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
42719 A-CTTTTGTTTAGTAAAAAAAAAAAAACAACTATTT-TAGTTCA-ACGAA-CTTATTCAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGT------CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATAC-AAGCTTATTCGAAATAA
* * ** *
42780 AATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGCGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTT
58 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC-GTT
* *
42845 TA-CAGGACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAACTATGTATTT-AAAGTCGTTATGAC
121 TACCA-GACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAC
* * * * ** *
42907 ATTTTGTTTTATCCTAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAATTTA-TCTGAAAAAAATAATACT
183 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACT
* ** * * * * *
42970 AATTTAGTAAT-TTTCAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAACTAAAACTGTTTTCCAAACCA
246 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CA
* * * * * * *
43034 A-TTCAACTAGTTATAATTGTTTGAATAAATATCAATCTCAAATCATTATG
309 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
43084 ATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATATAAGCTTATTCG-GATAAAAATAAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATA
* *** * * **
43147 CTAATTTAATAATATTATGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTATAAAATAAATTTGTTTGTC-GAA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCGTTTACCAG-A
** * * * * *
43207 CCGGTTCAAATAGTTA--ACTATTAGAATAATGATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTA
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
43270 GTCATATAATAATTG-TTTCAGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
193 GTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** * * *
43334 CATTCAAAAAATTAATAAGCATTAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTTAAATA
256 TATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * *
43399 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATCATTATA
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
43440 ACCATTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTGT-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * * *** * **
43504 ATACTTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TTGA-
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAGAC
* * * * * * *
43567 ATCAGTTCAAATAATTATGGCT-TTTAAACAACTATCTATTTCAATTCATTATTA-CTTTTGTTT
129 A--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
43630 TGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATGCATGCTTTTTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATGA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * *
43694 ATATTTCAAGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACCATTTCAAATA
255 ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * *
43758 TTTTTTACTATTTGAATAATTATCTATATCAAATCATTA-G
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * ** **
43798 AACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTAAAAATAAAATAATA
1 -ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * * * * *
43863 CTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAAT-AGCCAAGAAAATTAAAAAATAAATC--TAACTGTC-
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCGTTTAC---CA
* * ** * * *
43924 GAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGTTTATCTATTTTAAATCTTTATGACCTTTTC
126 G-A-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
43988 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCGTACGAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAA
189 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
44052 TAATATTTCAAAAAGTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCAA-TTTAA
253 TAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAA
* * * *
44112 ATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATATCAAATCATTATG
316 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
** * * * *
44156 ATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATT-TAGAATAAATTAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT
* * * * * *
44219 ACTAATTTATTAAACATTCTAAAAATT-AGAAG-AAAAGATTTAAAAAAGTAAATTTGTTTTACT
64 ACTAATTTATT-AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAA-TCG-TTTACC
* * * * * * * ** * *
44282 AAAGCAAGTTTAAATAG-TATTCAATAGTTTTATCTATT-T-TA--AAAAATCGTTTTAAACGCT
125 AGA-CAAGTTCAAATAGTTA-TGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GAC-C-
* * * * * *
44342 TTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTATTTAGTTAATAAAAGCTTAGATAGAATAAAATAATACTA
184 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTA
** * * *
44407 ATTTATTAATATTTTCTAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAGATCTATTTATCGAATC-A
247 ATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAA
* * * *
44467 GTTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
310 G-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * * * *
44518 ACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTCTTT-TTTATGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
** * * * * * * * *
44582 CTAATTGGTTAATATTTCAAAAATTAATACGTAATAGATTTAAACAAT--CT-ATTTACCAAACT
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGTTTACCAGACA
* * * * ** * *
44644 AGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTAAAATC-TTTGTTTTGG
130 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** *
44708 CTTAAAACAATTG--TTT-GTCATATAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATAT
195 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * ** * *
44770 TCCAAAATTAATAAGTAAGATATCTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAATTAGTTCAAATATTTAA
259 TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
44835 AACTATTAGAATAATTATATATTTCAAATCGTTCTA
324 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
** * * * * *
44871 ACCTTTCATTTAGGCATAAAATATTTGTTTCATAGTT--TACAAGCTTATTCTAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-T-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* * * *** * * * * * * *
44934 CCAAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAGGAAAAATATTTACAAAAATAAATTTGTTTATCAA
64 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAA-TCGTTTACCAG
* * * * *
44999 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
45064 TGACAT-AAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAACTTA-TCCAA-AAAAT-AT--TATTTTCTTAA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
45122 TATTTCAATAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAAGTT-AGAT
256 TATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * *
45185 AGTTATGACTGTTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATG
318 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATG
* *
45227 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * * **
45291 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAATGAATCTGTTTA-TGGAA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAG-A
* * * * *
45354 CCAA-TTCAAATAATTAT-AGTCATTTTTAACAATTAGTCTATTTC-AATTGTTATTACCTTTTG
128 -CAAGTTCAAATAGTTATGACT-A-TTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * *
45416 TTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACTT
189 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTC--GAATAAAATAATACTAATTT
* * ** *
45480 ATTAATCTTTAAAAATTAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAACCAGTTCA
251 ATTAATATTTAAAAATT-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTC-
* * * * * *
45545 AAATAGTAACGACTATTTGAA-AACTTGTATACTTCAACAATCAATTATAA
314 AAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTC-A-AAT--ATTAT-G
* * *
45595 ACCATTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * ** ** * *
45660 TAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTGTCAAACC
66 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCGTTTACCAGACA
* * * * *
45725 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG-CTCTTTTGTTTTA
130 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTG
** * *
45789 TCATAAAACAATT-TTTTTAATTCATATTAGCTTATTCATAATAAAATAA-AATGAATTTATTAA
194 TCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * *
45852 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAACTAA-TTCAAATA
256 TATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATA
* * *
45915 ATTATGACTAGTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-
319 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * * * *
45955 AGCCTTTTGATTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGGAATGAAATAATA
1 A-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
** *** * * * *
46020 CTAACCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACAAAT
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-GTTTACCAGAC
* * * * *
46081 TATTTCAACTAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATC-TTATGA-CTCTTTGTTC
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTT
* * * * * * *
46143 TGTTATAAAATAATAGTTTTTGTTCACACAAGCTTATTCGAATTAAAATATTATTAATTTATTAA
192 TGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * **
46208 TATTTTGACAATTAATAAGTAAAA-AATTAGAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGATT-AAAT
256 TA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG-TTCAAAT
* * *
46271 AGTCATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATAATTATA
318 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * ** * *
46313 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * *
46378 T-ATGCTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATC-TGTTACCAAAC
66 TAAT-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGT-TTACCAGAC
* * * * * *
46441 AAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACATTTTGTTTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
46506 TCAT--AA-AA-TG-ATTTA-TAATACAA----A-T----T----T-AT--TAA--TA-TCA-A-
194 TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
46544 --GACAATTACTAAGTGAAAGATTTAAACAATAAATTTG-TTACCAAACAAGTTCAACTCGTTAT
259 TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
46606 GACTATTTGAATAATTTTTTATTTTAAATTGTTATG
324 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATG
* * * * * *
46642 ACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATTCAAGCTTATTTGGATTAAAATTATA
1 ACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * *** * * * *
46707 TTAATTTGTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAA
65 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CGTTTACCAG-A
* * * * * ** * * *
46771 TAATTTATTAATATTCCAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAAATGAATCTGTTTACTAAA-C
128 CAA-GT-TCAA-A-T----AGTT-ATGACT------ATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATC
** ** * ** * * * * ** ** * *
46835 AAGTTCAAAAAGTTATG-ACTATC-T-GAACAATTATATATTCCAAGACATTATTACCTTTTGTT
175 --GTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-T-TT--TATTCA-TACAAGC--TT-AT
* * * * * * ** * *
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** * * * *** * * * * * * * *
46957 TTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAG-T-AAAAATTTA-AAC-A-ATAAATATGTTTTCTAAA
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344 -AT-TTCAAATA-TTATG
** * * ** * * *
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1 ACCT-TTTG---TTTTGTC-A--TAAAAC-AAT-TG----TTT-CTGT-TCAT--AC-AA--GCT
* ** * ** * * * * * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** ** * **
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* * * * * * *
47354 AAAAAATTAATCTGTTTACCGCACAAGTTCAACTAGTCATGTCTATTTGAACT-ATTTTATATTT
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348 CAAAT-ATTATG
* * * * * * ** *
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATA
* *** * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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192 TGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * **
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA-AT-AAT
* ** ** ** * * * ***
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64 A-CTAATTTA-TT--AATA-TT-CCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAA--A--ATAA---
* ** * * * ** *
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* * * ** * *
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172 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTC-GAAT
** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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*
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* * * * * * * * * * * *
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* *** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* ** * *** * * *
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* * * ** * *
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* * * * *
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-TA
* *** * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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*** ** * * * **
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* * * * * * * ** **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * ***
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* * * * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * **
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* * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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256 TA
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TT
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* * * * * * * *
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* ** *
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* * * * ** * * *
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* ** * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * ** * * *
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499 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * * * ** ** * * ** * * **
28790 ATTTTAAATGGTTAAGGTTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTT-TAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCT-G
* * * ** * * * * *
28854 TAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTCATTTCTTAACA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
* * * * * * * *
28919 TTTAAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGCTCAAATAG
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-TAGATTAAATAG
* * * * * * *
28983 TTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTCTAAACTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
29048 TGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATGCTATTTTATTAATATTTCCAAAATTA
252 TATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** ** * * * *
29113 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGA
316 ATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
29178 ACAATTATATATTTCAAATCGTTATTATCTTTTGTTTTATCATAACACAATTCTTTTTCAACATA
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATA
* ** * ** * * *
29243 CAAGCTTATT-TGAAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T-T-AGTAAGAGATC
442 TAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTT-AAAAATTATAAGTAAGAGATT
*
29304 T-AAAAATAAATCTGTTTACCAAA-A
506 TAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * ** * * *
29328 TAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACTTTTGTTCTA
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTG
* * * * * *
29392 TCATAAAACAATTA-TTTCTCTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
64 TCATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTAAT
* * * *** * * * *
29456 A-TTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTT-GCCAACCA-ATTCAAACA
126 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT-AAATA
* * * * * ** * * *
29518 ATTAAGACTATATGAACAATTGTCTATTTTAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAA
187 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * *
29583 TTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAA-ATCTAATTCATTAATATTTCAAAATT
251 TTATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* *
29647 TTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTA-CAGAACCAATTCAAATAATTATAAAATA
314 TAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAA-TCTGTTTACCA-AA-CAATTC-----------AAATA
* * * * * *
29710 ATTATAACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATCATTATTGCTTTTTGTTTTATCATAAAACA
364 ATTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTA-TACCTTTTG-TTTGTCATAAAACA
* * * * ** ** *
29775 ATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAA
426 AATGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTTA-AAAA
* * *
29839 TTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTT-ACAAAATC
490 TT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * * * * * * ** *
29882 ATTTCAAATAGTTTTGACTATATAAATAACTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
** * * * * * * * * * ** * * *
29947 TGTCAAGCAGTTGGTTCTATTGAGACAATTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTAATAT
* ** * * * ** * * *
30012 TTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAGATAAATCTAATTGTCGAACCAG-TTCTAATAGTT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT-AAATAGTT
* * * * * ** * * *
30076 AAGA-TAATATGAGCGATTAACTATTTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAATAAAT
190 ATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT
** * * * * * *
30140 T-TTTTTGTTCGTACAAGTTTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
252 TATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
30204 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTATATGATTAAT-ACTATTA
316 ATAAGTAAGAGA-TT-AAAAAATGAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATT-ATGACTATT-
* * * * * **
30268 T-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACTTTTTGTTTAGTCATAAAGCAATTG-TTTCAATA
376 TGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGAT-
* * * * ** * *
30331 CATACAAGCTTATTC-GAAATAAATTAATACTAACTTATTAAGATTCAAAAAATTAATAAGAAAG
438 CATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAATT-ATAAGTAAG
* *
30395 AGATTTAAGAAAATAAATCTTTTTATCGAACA-A
501 AGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTAAC-AA-ATA
* * * * * *** * * *
30428 ATTTAAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATTGCTAAGACC-TTTTTTCTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTC-TG
* * ** * * * * *
30492 TTATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATACATAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
** *
30557 TTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAG-TTAAATAGTT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT-AGATTAAATAGTT
* * *** * *
30621 ATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTA
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
**
30686 GTTTTTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-
254 -TTTTAAT-TCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *** * ** * ** **
30750 -T-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCGGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGA
316 ATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTT-ACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * ** *
30812 ATAACTATTTATTTCAAATCGTTCTAACATTTT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCAT
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTT-TTGATCAT
* * *** * ** * * *
30875 ACAAGCTAATTC-GGCATAAAATAATCCTAATATATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA
441 ATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATC-TT-TAAAAATT-ATAAGTAAGAG
* **
30938 ATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGTATA
503 ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * ** * *
30968 AGCTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTAATTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * ** * * * * * **
31033 CATAAAACAATTGCTTAAGTTTATAAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATGCTAATTTA-TAATA
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCAT-ACAAGCTTATTC-GAATAAAAT-ATTATAATTTATTAATA
* * * *** * * * *
31097 TTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGCATTTTTTGAACAAATTCAAATAGT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGATT-AAATAGT
* * * * * ** * * *
31162 TGTGACTATTTAAACAATTGTATATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAGTT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
31227 GTTTCAGTTTAT-TAAAGCTTATTTGAAATAAACTAATAATAATTTATTAATA-TTCCAAAATTA
253 ATTTTAATTCATAT-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * ** * *
31290 ATATGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTCACCGAATCAATTCAAATAATTATGGTTGTTTCA
316 ATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACC-AAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
31355 ACAATTACCTA-TACAAATCATTATGAAC-ATTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCATCATA
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATA
* * *** * ** * *
31418 CAAGCCTATT-TGGAATAAACTAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
442 TAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATT-ATAAGTAAGAGAT
*
31482 TTAAAAAATAAATCTATTT-AC---T-
505 TTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * *** * * *
31504 -G---AAGTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* ** * ** * * * *
31562 TAT-AAGTAATTG-TTTCATTCATAGAAGCTTTTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATATTA-TAATTTATTAATAT
* * * ** * * *
31624 TTCTGAAAATTAACAACTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAAGCAGTTTAAATAATT
128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-TAGATTAAATAGTT
* ** * ** * * *
31688 AAGA-TACATGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTA
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * *
31752 TTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
254 TTTTAATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * * *
31817 AAGT--GA-TTTGAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATCATTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACA
318 AAGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTACC-AAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * *
31879 ATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTATGATC-TTTCA
382 ATTATCTATTTCAAATCGTTA-TACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATAT-A
*** * * ** *
31943 AGCTTATT-TGGAATACAATTATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTTATAAGTAAGCGATTT
444 AGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTT-AAAAA-TTATAAGTAAGAGATTT
* **
32007 AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCA
507 AAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * * *
32033 A-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTC-AA--A-T-TG------T-TT-TGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * *
32084 CACAAAACAATTA-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
65 CATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
** *
32148 TTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAA-TT-AAAAATAAATTTGTTTGAT-GAACTAG-TTCAAATA
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATCGAA-TAGATT-AAATA
* * * * * *
32209 TTTAAGACTATATGAACAATTAT-TAATTTCAAA-ATGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAAT
187 GTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATA-ATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
32272 AA--ATTTTCAATTCATGCT-AGTTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA
249 AATTATTTT-AATTCAT-ATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA
* * * *
32333 AAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAT-ATTTTTGTTTACCTAACTAATTCAAATAATTATGAC
310 AAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGA-ATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGAC
* * *
32397 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTCTTT
372 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTT
* * * * * *
32461 GTTCATATAAGTTTGTTC-AAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T-TAA-TA
435 GATCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATTATAAGTA
* * ** **
32522 AGAGATTTAAAAAATAAACCTATTT-GTAAACC
499 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * ** * *
32554 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACAAATTATTGATTTTAAATTGTTATGA-CATTTTGTCCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAC-AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTCTG
* * * * * *
32618 TTATAAAA-AATTTGTTTATATTCATACAAGTTTATTC-ATATTAAAATAATATTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-A-TAAAATATTA-TAATTTATTAA
** * * * * * *
32681 TATTTTGACAATTAATAAATAGAAATTTTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAACTAGATCAAATA
125 TATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-TAGATTAAATA
* * * ** * * * * *
32745 GTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTGTCATAAGAGAT
187 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * **
32810 TTGTTTTAGTTCATGTAAGGTTATTCGGGATAAAATAATA-TCAATTTATTAATA-TTCTAAAAA
251 TTATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAA
* *
32873 TTAAT-AGTTAAGAGATTTAGAAAAA-AAATCTGTTTA-CAGAACAAGTTTAAATAATTATGACT
313 TTAATAAG-TAAGAGA-TTA-AAAAATGAATCTGTTTACCA-AACAA-TTCAAATAATTATGACT
* ** * * *
32935 ATTTG-A-AATT-GC----T---A----TA-ACCTTTTGTTTTGAAATAAAATAATTTTTTTCTG
373 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TG
* * * * ** * *
32985 TTCATAAAAGCTTATATC--GAATAAAATAATACAAAATTATTAATATTAAAACAATTAATAAGT
436 ATCATATAAGCTTAT-TCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTTAAA-AATT-ATAAGT
* * *
33048 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACA
498 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
** *
33082 AGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTC-TTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC-CATTTGTTCTG
* * * * * * * *
33145 TCATAAAATAATTG-TTCTATTCATACAAGGTTATTTGGAT-TAA-A--ATAA--TATTAATATT
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATATTATAATTTATTAATATT
* * * * * * *
33203 TTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTATCGAACA-AGTTGTAATAGTCA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGA-TT-AAATAGTTA
* * * * * * * * *
33267 TGATTATTTGAATAATTAACTACTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAACTGT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * * *
33332 TTCAATTCAAATAAGCTTGTTTGAAACAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT
255 TTTAATTCATATAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * * * * * * *
33396 GAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGCTCAAATAGTTATGTCTATTTGAAC
318 AAGTAAGAG-ATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * * **
33461 AATTATCTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTCTTTTGTTC-TAAAGCAATTGGTTTTGTTCATGC
381 AATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTT-GTTTG-TCATAAAACAAATGTTTTTGATCATAT
** * * *
33525 AAGCTTATTTC--AAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAA-AAA
443 AAGCTTA-TTCAAAAATAAAATAATACTAACCT-ATTAATCTT-TAAAAATT-ATAAGTAAGAGA
* ** *
33586 TTTAAAAAATAAATATGTTTTTCTAAACA
504 TTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * ** * * *
33615 TGTTCAAATAGTTAT-ATTTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTG
* * * * * *
33679 TCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTATTAAAA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
* * * * *
33744 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATATATCTGTTTATTGAGTGAGTTTAAATAGT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT-AGATTAAATAGT
* * ** * * * *
33809 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATCTTTTGTCTTCTCATAAAACAACT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
33874 ATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAACTT
253 ATTT-TAATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * * * ** *** * ** *
33937 AATAAGTTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGGCAAGTTTATTC
315 AATAAG-TAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * * *
34001 GAACTATTAGCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTTT-ATTC
377 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGA-TC
** * ** * *
34065 ATATAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAATAG
439 ATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTT-AAAAATTATAAGTAAGAG
* * * *
34125 ATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATCGAACT-
503 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
** * * * * * * *
34154 AGTTCAAATAGTTATGACTATGAGAACAATTATCTATCTAAAATCGTTATGATC-TTT-TTTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
** * * * * * * * *
34217 CATAAAGTAATTGTTTGTATTCATACAAGCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATT-ATAATTTATTAATAT
* * * * * * *
34281 TTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTACCAAACCAGCTTAAATAGTT
128 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATTAAATAGTT
** * * * ** * * *
34345 AACACTATTAGAATAATTAGCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTA
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * ** ** * *
34410 TTTCAAATT-ATATAA--TTATTTATTTAAAATCGTTA-TAACCTT-TT-GT-TTTAACATAAAA
254 TTT-TAATTCATATAAGCTTATTCAAATAAAAT-AATACTAA-TTTATTAATATTT--CA-AAAA
* *** * * * * *
34468 -TAAT-TGTTTCA-ATT-CATAA--AATCT-TAT-CC-AA-AA-TAAAATAA-TATTAC--TTT-
313 TTAATAAGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTG
* ** * ** *** * * * * **
34518 ----ATTA-ATATTTCAAA-AATTGAAAAGTAGGAGATT-TAAAAAAATAAATCAGTTTGTCAAA
378 AACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATACCT-TTTGTTTGTCATAAAACAAAT--GTTT-T-TGA
* * ** * * * *
34576 TCAGT-TATGAC-TATTTAAACAATTATTTATTTCAA-ATCTTTACGACTTTTTATTTTGTCATA
437 TCA-TATAAG-CTTATTCAAA-AA-TA---AAAT-AATA-C-TAAC--CTATTAATCTT-T-A-A
* * **** * ** * * * ** *
34638 AAATAAT-TGTTTTTG-TTCACACAAGTTTATTCGGACTAAAATAATA
487 AAATTATAAGTAAGAGATTTA-A-AAAATAAATCTGTTTAACA-AATA
* * * ** * * ** * * *
34684 TTAATTTATTAATA-TTTTGAC-AAATAAAAAGTAAAATATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGA
1 --AGTTCA--AATAGTTATGACTATTTAACAA-TTATTTA-TTTC-AAATCATTATG---AC--C
** * * * * * *
34747 ATAAGTTTAAATAGTCAT--AGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCA-A-ATTGCTATGACCTTTT
54 ATTTG-TT--CT-GTCATAAAAC-A-AT-AGT--TT-T-T-GTTCATACA-AGCT-T-A---TTC
** ** ** * *** ** ** * *
34808 GTTTCATCATAAAACAATTGTATTAAT-TTAT-ATAGGCTT-ATTTG-AAAAAAAT-AATACT-A
101 GAAT-AAAATATTATAATT-TATTAATATT-TCA-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
34867 ATTTATTAATATTCCAA-AAATT-AATGAG-TAAGA-GATAT-AA-AATATGAATCGATTTACCA
162 ATTTGTT--TA-TCGAATAGATTAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAAT-T--ATCTATTT--CA
* * *** * * * ** * *
34926 GATAAGT-T-CAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTG
218 AATAATTATACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTA--T-TTT--AATTCATATAAGC--TT-
* *** ** * * *
34989 TTGTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCGTA-CAAGTTTAATTCGAATAAAATAAT-A-TAA-AT
273 AT-TCAAATAAAATAA-T-ACTA-ATT--TATTAA---TATTTC-AA-AAATTAATAAGTAAGA-
* ** * * * * * *
35050 TTATTAATATTCTAAA--AAT-TAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAATATG--TTTTCTGAAC
326 -GATTAA-A----AAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TT--CAAATAATTATGACTATT-TGAAC
** * * * *** ** *
35110 ATATTCAAATAGTTATGACTAT--TTGAGTA-ATTATCTGTTTCAAATAGTTATAAC-CTTTTGT
381 A-ATT-ATCTA-TT-TCA-AATCGTT-A-TACCTT-T-TGTTTGTCATA---A-AACAAATGT-T
* * * * **
35171 TTTG-TCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTATT
432 TTTGATCAT--A-TAA--G--CTTATTCA-A-AAA--TA----AAAT--AATACTA--ACCTATT
* * * * * *** **
35235 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTTAAAAATAAATCTATTTATTGAGCA
478 AATCTT-TAAAAATT-ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * *
35291 AGTTCATATCA-TTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-TATTTTGTTT
1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCA-TTTGTTC
* * * * * * * * *
35353 TGTCATAAAATAAT-TTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATACTATTTTACTA
62 TGTCATAAAACAATAGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTA
* * * * * * * *
35417 ATA-TTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAG
124 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT-AGATTAAA
** * *
35481 TAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAA
185 TAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * *
35544 ACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTAATATTTCAAA
247 ACAATTATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
35609 AATTAATAAGTAAGAGATATAAAAACTAAAGT-TATTTTCCAAACTAGTTCAAACAGTTATGACT
311 AATTAATAAGTAAGAGAT-TAAAAAATGAA-TCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACT
** * * *
35673 ATTTGAACAA--A--TAACTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAA-AATTGTTTTTG
373 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * ** * * *
35732 ATCATATAAGCTTATTTAGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAGAAA-T-TAA-TAA
436 ATCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTT-AAAAATTATAAGTAA
* * ** *
35793 GAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTGCCGAACT-
500 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
** * * * * * *
35825 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTATAATAACTATCTATTTCAAATCACTCTGACCTTTTGTT-TAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCT-G
* * * * *** * * * *
35889 TCACACAATAATTGTTTCAATTCATACAACCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
* * * * * * * * * *
35954 -TTCAAAAATTAATAAGCATTAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAGTAAT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATTAAATAGT
* * * * *
36018 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
36083 GTTTTAGTTCATAAAATCTTATTCAAATAAAATACTACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAAT
253 ATTTTAATTCATATAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * *
36148 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAA
318 AAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCT-GTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * * *
36212 CAACTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTTTTTTCAGCATA-
380 CAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATAT
* * ** * *
36275 CAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T-TAA-TAAGAGATTT
443 AAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTT-AAAAATTATAAGTAAGAGATTT
* *
36336 AAAAAATATATCTGTTTACCAAACT-
507 AAAAAATAAATCTGTTTAACAAA-TA
* * * ** * * * *
36361 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * *
36426 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATATCAATTAACATAAGCTTATTTGACGTAAAATAATACTAAT
65 CATAAAACAATAG-TT-T-TT-GT-TC-A-T-AC--AAGCTTATTCGA-ATAAAATATTA-TAAT
* * * * * * * * * *
36491 TTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAA-CTAGAAAAATGAATCTATGTACCAAACA-A
118 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTA-AAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGA
* * *
36554 CTTCAAAGAGTTATGACTATCT-AGACAAATATCTATTTCAAA-ATATTATGACCTTTTGTTTTG
180 -TT-AAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATA-ATTAT-ACCTTTTGTTTTG
* * * * * ** * *
36617 TCAAAAAATAATTGGTTCT-GTTCATCCAAGCTAATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTAATTAA
240 TCATAAAACAATT-ATTTTAATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * ** * * * * * ** * *
36680 TATTCCAAAAGTTAATAAGCAAAACTTTCATAAATAAATTTGTTTTCTGAACACGTTCCAATAAT
302 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAAT
* * * *
36745 TATGACCATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTAT-TTTGTCATAAAGCAAT
366 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACC-TTT-TGTTTGTCATAAAACAAA
* * * * ** ** *
36809 TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAACAATACTAATTTATTAAAATTCCCAAAAA
428 TGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT--TAAAAA
* * * * *
36872 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTTTTTTACAAAGTG
490 TT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAA-TA
* * * *
36915 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-TATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTCTG
* * * * ** * *
36979 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAATTTTATTTGGAATAAAATAATA-ATATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATATTATA-ATTTATTAATA
* * * * *
37043 -TTCTAAAAATTAGTAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAATA-AGTTCAAATAG
127 TTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGA-TT-AAATAG
* * * ** * *** ** *
37106 TCATGTCTATTTGAACTACCATCTATTTCGAACCGTTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAATAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-
* ** * *
37171 ACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCAGACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAAC-AATTTGT
247 A-CAATTATT----TTAATTCATA-TAAG-C----TTATTC-AAATAAAATAAT-ACTAATTTAT
* * * * *
37235 TACTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGA-ATTAAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAA
299 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-AAAAAATGAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAA
* * * ** * *
37295 TAGTTAAGCCTATGAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT-TCAACCTTTTGTTTAGTCAAAAAA
362 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT--ACCTTTTGTTT-GTCATAAAA
* * ** * * * * ** **
37359 TAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTACTT--GAAATAAAATAATACTAATTTATTACCAT-TCAA
424 CAAATGTTTTTGATCATATAAGCTTA-TTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTA--ATCTTTA
* * * *
37421 AAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAAATATGTTT-ACATAATA
486 AAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTAACA-AATA
* * * * ** * * * *
37469 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTT-GTTCTG
* * ** * * * * * *
37534 TCATAAAACAATTGTTTTAGTAAATA-AAGGCATATCCAAAATAAAATAATATTACTTATTAATA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAA-GCTTATTC-GAATAAAATATTATAATTTATTAATA
* * * * *
37598 TTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAATCAG-TTCAAATTGC
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT-AGATT-AAATAGT
* * * * ** * ** *
37662 AACGACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATTGTTATATCCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * * * *
37727 ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAA
253 ATTTTAATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * * * * *
37792 TAACTAAGAGAATTAAAAAGTAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATATTTAAGACTATATGAA
317 TAAGTAAGAG-ATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * * * * *
37857 CAATTATCTACTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTTTCATAAAATAAGTTTTTTTAATTCATA
380 CAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGA-TCATA
*** * ** *
37922 -ATAGCTTATT-TGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
442 TA-AGCTTATTCAAAAATAAAATAATACT-AACCTATTAATCTTT-AAAAATT-ATAAGTAAGAG
* * * * **
37984 ATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACC
503 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * *
38013 AGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * * *
38078 CATAAAACAA-ATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATATATTAATA
65 CATAAAACAATA-GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
* * * * * *
38142 TTTCAAATATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTTTCAAACTAG-TTCAAATAGTT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT-AAATAGTT
* * ** ** *
38203 ATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTG
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * * * *
38268 TTTCT-GTTCATACATGCTTATTCGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAGTTGAT
254 TTT-TAATTCATATAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * * *
38332 AGGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CGAACTAGA-T-AAACTAATCATGATTTTTTGA
318 AAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAAC-A-ATTCAAA-TAATTATGACTATTTGA
* * * * ** *
38394 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGGCCTTTTGTTTTGCCATAAAAGAAATGTTTCAGTTCATA
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATA
** ** ** * * *
38459 TAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATGTTAATTTATTTGTAATTCAAAAATTAATAA-TAAAGAAA
442 TAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATT-ATAAGT-AAGAGA
* *
38522 TTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACTGAATA
504 TTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * * * * * * * * ** *** * * *
38550 AATTTAAAAAATTATGATTGTTTGAATAATAATCTATTTGGAATTGCTATAACC-TTTGTTTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
** * * * * * *
38614 CAT-AAA-AATTTTTTTCTATTAATACAATCTTATTTCAAATAATTTAA-ATCA-AATTTATCAA
65 CATAAAACAATAGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAA---AATATTATAATTTATTAA
* * *
38675 TA-TT-AAGGCAATTATTAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATA-AGTTCAA
125 TATTTCAA--AAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAATAGA-TT-AA
** * * ** * * *
38736 ATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCTTTTTATTTTGTCATAAA
184 AT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * ** *
38800 ACAATTGTTTT-GTTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAC
247 ACAATTATTTTAATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
38864 AATTAATAAATAAAAGATATAAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATGAC
311 AATTAATAAGTAAGAGAT-T--AAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGAC
* * * * * * *
38929 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGTTTCA
372 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAAATGTTT--
* ** * ** * * *
38994 TT--TCATATAAGTTTATT-TGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGA
433 TTGATCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAATT-ATAA
** * *
39056 GTAAGAGAACTAAAAAA-AGAATATGTTTATCAAATA
496 GTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTAACAAATA
* * * * * *
39092 AGTTCTAATAGTTATGACTACCTGAATAATTATTTATTTCAAAACATTATGACC-TTTCGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTT-GTTCTG
* * * * * * *
39156 CCACAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTGTTTTGAATAAAATAATT-TAAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAATAAAAT-ATTAT-AATTTATTAAT
* * * * *
39220 ATTCCAGAAATTAATAAG-----A---AAAAAAT--A--TGTCT-TCTGAACATGTTTAAATAGT
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAATA-GATTAAATAGT
* *
39272 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAAT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT
** * * *
39335 TATTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATTAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAAAT
252 TATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * * * * * *
39399 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAGCAAGTTCAAATAGTTTTAACTATTT
314 TAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * **
39464 GAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCA
377 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCA
* * * ** * **
39529 TACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAG
440 TATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAATT-ATAAGTAAGAG
* * * *
39593 ATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAACA
503 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * ** * * * * * * *
39622 ATTTCCAGCAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTCTG
** * * ** *
39686 TTGTAAAACGATTGTTTTTAG-TCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATAGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAAT
* * * * * * * * * *
39750 ATTTCAAAAA-T--T-AGTAGAGATTTTAAAACTTAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTT
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATTAAATAGTT
* * * ** *
39811 ATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCAAAT-AGTATGA--TCATGTTTTGTCATAAAAAAAATT
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT
* * * * ** *
39873 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTAATCAAAGTAAAATAATGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATT
253 ATTT-TAATTCATATAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * * * * * * * * *
39936 ATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAATCAGTT-ATAATAGTTAAGACTATTA
315 AATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTAC-CAAACAATTCA-AATAATTATGACTATTT
* * * * * * * *
40000 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACTTTTTATTTTGTCAT-AAA-AATTTTTTTTCAGTT
377 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT--GAT
* * ** ** *
40063 CATACAAGCTAATT-TGAAATAAAATAATA-TAATTTTATTAA-CATTTAGAAAATTAATAAGCA
438 CATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAA-CCTATTAATC-TTTA-AAAATT-ATAAGTA
* * * *
40125 AGAAATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
499 AGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * * *
40160 AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACT-ACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTA-TGACCATTTGTTCTG
* * ** * * * *
40224 TTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
* * * * * *
40288 TTTCAAAAATTGAA-AAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATTAGTTTATCGAACA-ATTCAAATAAT
127 TTTCAAAAATT-AATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGATT-AAATAGT
* * * *
40351 TATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** *
40416 ATTTTTCA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
253 A-TTTTAATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * ** * ** * * * *
40480 AAAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTATCGGACTAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGA
316 ATAAGTAAGAG-ATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * *
40545 ATAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCCTTTT-TTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATA
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-A-CCTTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATA
* * * * * * * *
40609 CAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGAT
442 TAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAATT-ATAAGTAAGAGAT
* * * *
40673 TTAAAGAATAAATTTGTTT-GCTAAACCA
505 TTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAA-TA
* * * * ** * * * * * *
40701 A-TTCAAATATTTAAGGCTATATGATTAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * *
40765 CATAAAACAA-ATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATA-GTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAATAAAATATTA-TAATTTATTAATA
** * * * * * *
40829 TTTTGAAAATTAATAAG--AGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCA-ATTCAAGTAGTT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT-AAATAGTT
* * * * * *
40891 ATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * *
40956 TTCCT-ATTGATAT-AGTCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTTATTGATA-TTCTAAAAATT
254 TT-TTAATTCATATAAG-CTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * * * * * * * *
41018 AATAAGTTCAGA-TTTAAAAAATGAATATG-TTAGCCTGACCAGTAT-AAATAGTTATAATTATT
315 AATAAG-TAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTA-CC-AAACAAT-TCAAATAATTATGACTATT
* * * * * *
41080 TGAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCT-ATG
376 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGAT-
* * ** * * ** *
41144 CATATAAGCTGACT-AGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
438 CATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAATT-ATAAGTAAG
* * * ** * *
41208 ATATTTAAAAACTAAATCTATTTGTCGAACA
501 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * * * ** *
41239 AGTTAAAACAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCACTAT-AAGATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTCTG
** * * * *
41303 TCAT--AA-AATTTTTTTATATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAGTAATACAAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATAGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCGAA-TAAAATATTA-TAATTTATTAA
* * * *
41364 TA-TTCAAACAACTAATAAGTAAAATTTTTAAAAATAAATTTGTTTACCGAATA-AGTTCAAATA
125 TATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGA-TT-AAATA
* * * ** *
41427 GTT-TGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
187 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
41491 TTTTTTTTATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATT
251 TTATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * ** ** ** ** * *
41556 ATTAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAAGTTCAGCTCGTCGTAACTACTTGA
315 AATAAGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * **
41621 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTG-TATCAATTCAT
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACC-TTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGA-TCAT
* ** * *
41685 ATAAGCTTAATC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTACAAAACTTAATGAGTAAGAG
441 ATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTTA-AAAA-TT-ATAAGTAAGAG
* * * * * * *
41748 ATTGAAAATATGAATCTATTTATCGAACA
503 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * * *
41777 AGTTCAAATAGCTATAACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * * *
41842 CATAAAATAATTGTTTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGTTTATTCAAATAAAGTAATA
65 CAT--AA-AA------C----AATAGTT-TTTGT--TCATACAAGCTTATTCGAATAAAATATTA
* * *
41907 TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTGAAC
114 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAT
* * * * * * * *
41971 ACGATCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATAGTTGTTACCTTTTGATTTG
177 A-GATTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATT-ATACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
42036 TCACAAACCAATTGTTTCT-ATTCATACAAACATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
240 TCATAAAACAATTATTT-TAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * ** *
42100 ATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAAATATAAAAAGTAAATATGTTTACTGAGCAAGTTC--A-AA-
303 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAAT
* * * **
42161 TA--AC-AATT-----ATT-T-TATTTCATATAGTTATGATGTTTTGTTT-TCTTATAAAA-AAA
366 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTGTC--ATAAAACAAA
* * * *** ** *
42214 TTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATT-TGGAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAA
428 -TGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAA
* * *
42277 TTAATAGGT-AGTAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTAAACA
490 TT-ATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * * * * * * ** *
42320 AGTTCAAATACTCATGTCCATTTGAACAACTATCTATTTCATATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * ** * *
42385 CATAAAATAATAGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTGATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAATAT
** * ** * ** * * * * *
42450 TTTGAAAATTAAT-AG--GAGTTTTGAAAGCTAAATCTATTTA-CCAAAACAATTCAAATAGTTA
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATA-GATT-AAATAGTTA
* * * *
42511 TGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAAT-ATTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTAT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * * *
42574 TTCT-TTTCATACAAGCTTATTCAAAT-CAA-AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTA
255 TT-TAATTCATATAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
** * ** ** *
42636 AGTAAGAGATTTTAAAA--AAT-TGTTTGCCAAACCAATTCATGTCGTTAAGACTA-TTGAACAA
319 AGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
42697 TTATCTATTTCAAATCATTCTGA-CTTTTGTTTAGTAAAAAAAAAAAAACAACTATTTTAGTTCA
383 TTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTT-GT------CATAAAACAAATGTTTTTGATCA
* ** * ** *
42761 -ACGAA-CTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATGCGCAAG
440 TA-TAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATC-TT-TAAAAATT-ATAAGTAAG
* *
42822 AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTT-ACAGGACA
501 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAACA-AATA
* * * *
42854 AGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAACTATGTATTT-AAAGTCGTTATGA-CATTTTGTTT
1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGACCA-TTTGTTC
* * * * * ** * * *
42916 TATCCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAATTTA-TCTGAAAAAAATAATACTAATTTAGTAA
62 TGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAA
** * * ** * * *
42980 T-TTTCAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAACTAAAACTGTTT-TCCAA-ACCAATTCAACT
125 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATA--GATT-AAAT
* * * * * * * * * *
43042 AGTTATAATTGTTTGAATAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACA
186 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * * *
43106 ATTGTTTCTGA-TCATATAAGCTTATTCGGATAAAAATAAAACTAATTTAATAATATTAT-GAAA
250 ATTATTT-TAATTCATATAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
* * * * * * * ** *
43169 ATTAATAAG--AGA-TTTATAAAATAAATTTGTTTGTCGAACCGGTTCAAATAGTTA--ACTATT
312 ATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTT-ACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * * ** * *
43229 AGAATAATGATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTT
376 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGATC
* ** * * **
43294 ATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAGCATT
439 ATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATC-TT-TAAAAATT-ATAAGTAAG
* * *
43357 AGATTTGAAAAAATAAATTTGTTT-ACTGAACA
501 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * * * * *
43389 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * * * * * * *
43454 CATCAAACAATTGTTGTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTACTAT
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAAT-ATTATAATTTATTAATAT
** * ** * *
43519 TTTGAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAG-TTCAAATAATT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT-AGATT-AAATAGTT
* * * * *
43583 ATGGCT-TTTAAACAACTATCTATTTCAATTCATTATTA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTA-TACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-
* ** * * * * *
43646 TTTTTCAA--CATGCATGCTTTTTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATGAATATTTCAAGAATTA
253 ATTTT-AATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * *
43709 ATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACCATTTCAAATATTTTTTACTATTTGA
316 ATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * * * *
43773 ATAATTATCTATATCAAATCATTAGAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATA
379 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATA
** ** * * * * * *
43838 CT-ATTTTATT-AAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTA-ATAGCCAAGAA
442 -TAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTT-TAAAAATTATA-AG-TAAGAG
* *** ** **
43900 AATTAAAAAATAAATCTAACTGTCGAACCA
503 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AAATA
* * ** * * * * * *
43930 A-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGTTTATCTATTTTAAATCTTTATGACCTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * * * *
43994 CATAAAACAATTG-TTTTGTTCGTACGAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAATAT
* * * * *
44058 TTCAAAAAGTAATAAG---AAATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCA-ATTTAAATGGTTA
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT-AGA-TTAAATAGTTA
* * * * * ** * *
44119 AGACTATTAGAATAATTATCTATATCAAATCATTATGATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * *
44184 TTTAGTTCATATAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAA-ACATTCTAAAAATT-A
255 TTTAATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC-AAAAATTAA
* * * * * * * * *
44247 GAAG-AAAAGATTTAAAAAAGTAAATTTGTTTTACTAAAGCAAGTTTAAAT-AGTATTCAATAGT
317 TAAGTAAGAGA-TTAAAAAA-TGAATCTG-TTTACCAAA-CAA-TTCAAATAATTA-TGACTA-T
* * * ** * *
44310 TTTATCTATT-T-TA--AAAAATCGTTTTAAACGCTTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTATTT
375 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCG--TTATAC-C-TTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGT-TTT
* * * * * * ** * **
44371 AGTTAATAAAAGCTTA--GATAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCTAAA-T-TAA-
434 TGATCATATAAGCTTATTCA-AAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATTATAAG
* * * * * *
44431 TAAGAAATTTAAAAAATAGATCTATTTATCGAATC
497 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * * *
44466 AGTTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTT
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTCT
* * ** * * * * **
44530 ATCGTAAAACAATTCTTTTT-TATGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTGGTTAA
63 GTCATAAAACAATAGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATATTA-TAATTTATTAA
* * * * * * *
44594 TATTTCAAAAATTAATACGTAATAGATTT---AAA-CAATCTATTTACCAAACTAG-TTCAAATA
125 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT-AAATA
* * * * ** ** * *
44654 GTTATGACTAATTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTA-AAATCTTTGTTTTGGCTTAAAACAA
187 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * **** * *
44718 TT-GTTT--GTCATATAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAATT
251 TTATTTTAATTCATATAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * ** * * ** *
44779 AATAAGTAAGATATCTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAATTAGTTCAAATATTTAAAACTATTAG
315 AATAAGTAAGAGAT-TAAAAAATGAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * ** * * ** *
44844 AATAATTATATATTTCAAATCGTTCTAACCTTTCATTTAGGCATAAAATATTTGTTTCAT-AGT-
378 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTT-TTGA-TC
* * * * * ** * * * *
44907 TTACAAGCTTATTC-TAAATAAAATAATCCAAATTTATTAA-CATTTGGAAAATTAATAGGAAAA
439 ATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATC-TTT-AAAAATT-ATAAGTAAG
* * *
44970 ATATTTACAAAAATAAATTTGTTTATCAAATA
501 AGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * *
45002 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * * *
45067 CAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTA-TCCAA-AAAATATTAT--TTTCTTAATATTT
65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATATTATAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
45127 CAATAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAAGTTAGATAGTTATG
130 CAAAAATTAATAAGTAAAAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAGA-TTAAATAGTTATG
* * * **
45192 ACTGTTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
193 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * *
45257 TAGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
257 TAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** * * *
45322 TAAGTGATTTAAAAATGAATCTGTTTATGGAACCAATTCAAATAATTAT-AGTCATTTTTAACAA
321 TAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAATTATGACT-A-TTTGAACAA
* * *
45386 TTAGTCTATTTC-AATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATAA
383 TTA-TCTATTTCAAATCGTTA-TACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATATAA
*
45450 GCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATCTTTAAAAATTAAATAAGTAAGAGATTTA
445 GCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTTAAAAATT--ATAAGTAAGAGATTTA
45515 AAAAATAAATCTGTTT-ACAAA-A
508 AAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * *
45537 CCAGTTCAAAATAGTAACGACTATTTGAA-AACTTGTATACTTCAACAATCAATTATAAACCATT
1 --AGTTC-AAATAGTTATGACTATTT-AACAA-TTATTTATTTC-A-AATC-ATTAT-GACCATT
* * *
45601 TGTTCTGTCATAAAACAATTA-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATC
57 TGTTCTGTCATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATATTA-TAATT
* * * * * * * *
45665 TAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTGTCAAACCAG-TT
119 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT
* * * * * *
45729 CAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGCTCTTTTGTTTTATCATA
182 -AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATAC-CTTTTGTTTTGTCATA
* * *
45794 AAACAATTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTCATAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC
245 AAACAATTATTTTAATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
*
45858 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAT-AATTCTGTTTACCTAACTAATTCAAATAATTATGA
308 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAATGAA-TCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAATTATGA
* * *
45922 CTAGTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAGCCTTTTGATTTATCATAAAACAAATGTTTT
371 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATA-CCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTT
* * ** * * *
45987 TGTTCATATAAGTTTATTC-GGAATGAAATAATACTAACCTATTAATATTTTGAAAA-T-TAA-T
434 TGATCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATTATAAGT
* *
46048 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACAAATT
498 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* *
46082 ATTTCAACTAGTTATGACTATTTAAGCAATTATTTATTTCAAATC-TTATGACTC-TTTGTTCTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAA-CAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC-CATTTGTTCTG
* * *
46145 TTATAAAATAATAGTTTTTGTTCACACAAGCTTATTCGAATTAAAATATTATTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAA-TAAAATATTA-TAATTTATTAATA
** * * * *
46210 TTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTAGAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGATTAAATAGTC
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA-AAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATTAAATAGTT
* * *
46275 ATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATAATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTA
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * *
46340 TTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATATTACAAAAATTAA
254 TTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAA
* *
46404 TAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTG-TTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAA
317 TAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * *
46468 CAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACATTTTGTTTTGTCAT---A-AAA------TGAT-TTAT
380 CAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATAT
* * * *
46522 AA---TA--C--AAAT----T--TATTAA--TATCAA-----GACAATTACTAAGTGAA-AGATT
443 AAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAATCTTTAAAAATTA-TAAGT-AAGAGATT
* * * *
46566 TAAACAATAAATTTG-TTACCAAACA
506 TAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * ** * *
46591 AGTTCAACTCGTTATGACTATTTGAATAATTTTTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC-ATTTGTTCTG
* * * * *
46656 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATTCAAGCTTATTTGGATTAAAAT-TATATTAATTTGTTAAT
64 TCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAT-TA-TAATTTATTAAT
** * * *
46720 ATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAATAATTTATTAATA
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAT-A--GATTAA-A
* * ** * * * * * **
46784 TTCCAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAAAGTT
185 -T----AGTT-ATGACT------ATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATAA-TT--ATACCTT
* ** * * ** * * * *** *
46849 ATG-ACTATC-T-GAACAATTATATATTCCAAGACATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
232 TTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-T-TT--AATTCA-TATAAGC---T-TATTCAAATAAAATAA
* * * * * * * * * * * * *
46911 T-C-AGTTCTGTT--CA-TGCACAAGATTAATTCGAA-TAAAATATTATAAATTTATTAATATTT
288 TACTAATT-TATTAATATTTCA-AAAATTAA-T--AAGTAAGAGATTAAAAAATGAAT-CTGTTT
* ** * *
46970 --CAAA-AATT--AATAAGTA--AAAATTTAAACAATAAATATGTTTTCTAAACATGTTCAAATA
347 ACCAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT---TA-----TCT----AT-TTCAAATC
* * * *** * * * * * *
47028 TTTATGA-CTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAACGGTTATGACCAT-T-TG-TTTTATCATAA
399 GTTAT-ACCT-TTTG----TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATATAAGCTTAT-TCA-AA
* * ** * * * * ** * * ** **
47088 ACT-AATTGTTTCTGTTAAAACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTCC
456 AATAAAATAATAC---T-AACCTA--TTAATC--TTTAAAA-ATTA-TAA-GTAAGAGAT-TTAA
* ** * * *
47151 AAAATTAATAAG-TAAATAATTTAA
509 AAAATAAATCTGTTTAACAA-AT-A
* * * * * * *
47175 AATAT-ATATATGTTTATAGAGCGAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAACTATTTATTTC
1 AGT-TCAAATA-G-TTAT-GA-CTA-TTTAACA-A-TTAT--TTATTTCAA-ATC-A-TTA--T-
* * * ** * * * * * * ** ** *
47238 AAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGT-TTCTATTTATA-CAAATTTATTTT
50 -GACCATT-TG---TTCTG--TCATAAAACAATAGTTTTTGTTC-ATACA-AGCTTA-----TTC
* * * * * *
47300 AAATAAAATAATACTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAA
101 GAATAAAATATTA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
47364 TCTGTTTACCGCACA-AG-TTCAACTAGTCATGTCTATTTGAACTATTTTATATTTCAAATCATT
163 TTTGTTTATCG-A-ATAGATT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATT
* * * * * * * ** *
47427 ATGA-ATTCTATTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATA
225 AT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATA
* ** * * * *
47490 ATACTAATTTATTACTATTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAAATAAATCTCTTTACTGA
287 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAATGAATCTGTTTAC-CA
* * * * * *
47551 ACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--TATTTGTT
351 AACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCT-TTTG-T
* * ** * * * ** * * * ** *
47614 TTATCCTAAAACATTTGTTTCT-ATTCATACAACCTTATTC-GGAGTAAAATATTGCTAAATTAA
413 TTGTCATAAAACAAATGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTAT
* * ** * **
47677 TAA-CATTCT-AAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAACAAATGTGTTTGCCGAACC
477 TAATC-TT-TAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * ** *
47732 AGTTTAAATAGTTAAT-ACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATCATTTTGACCATTTGTT-TA
1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATT-TAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCT-
* * *** * * * * *
47795 GTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATA-ATGCTTATTCGAA-ATAA-ATT-T-GTTTATCGAACA
63 GTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATATTATAATTTAT-TAA-T
* * * * * *
47855 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTATTTTAT
126 ATTTCAAA-AATTA--A-TA--AGTA-AA--A---ATTTAAAA--A--ATAA--ATTT-GTTTAT
* * * *** * ** * ** *
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172 C-GAATA-GATTAAAT-AGTT-ATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCT
* ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * ** ** * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * ** *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * *
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* * *
48666 AACAATTA-CTTATGTT-AAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCT-AT
378 AACAATTATC-TAT-TTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAA-TGTTTTTGA-
* * ** * * * ** *
48727 TCATA-CAGTCATATTC-TGACTAAAGTAATGCTAATTTATTAATACTCTAAAAATTAATAAGTA
437 TCATATAAG-CTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATT-ATAAGTA
* *** * **
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499 A-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * ** * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTCTGT
* * * * * * * * *
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65 CATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAAT-ATTATAATTTATTAATAT
** * * * * * * * * *
48953 TTTGAAACTTAATAAGCAAGAGA-TTAGAAAAATGAATCT-ATTAACTTAACA-AGTTCAAATAG
128 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTA-AAAAATAAATTTGTTTATC-GAATAGA-TT-AAATAG
* *** * * * *
49015 TTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTCGCTTTGTGATAAAATAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
* * *
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* * * * * * *
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312 ATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * ** * * *
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375 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGAT
* *** * * ** * * ** *
49273 CATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTTATGATTAATAAGTAAA
438 CATATAAGCTTATTCAAAAATAAAATAATACTAACCTATTAAT-CTTTAAAAATT-ATAAGTAAG
* * *** *
49337 AGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACA
501 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATA
* * * * * **
49368 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTGTTTCAAATCATTAT-AATATTTTGTTTCA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTG-TTC-
* * * * * * * *
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* * * * *
49495 TA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTATCGAACA-AGTTCAAAT
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * **** * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * ***
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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126 ATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-TAGATTAAATA
* * * * * ** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* **
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAC-AATTATTTATTTCAA-ATCA-TTATGACCATTT-GTTC
* * * * * * *
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* * * * ** * * **
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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374 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGA
* * ** * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TAGATT-AAATA
* * * ** * *
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* * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * * *
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** **
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* * * * * *
51503 AGTTCAAACAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTGT-TG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGT-TCTG
** * * * * ** *
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* * * * *
51631 TTTAAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTA-CAGAACCA-ATTCAAATA
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATC-GAA-TAGATT-AAATA
* * * * * * * * *
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* ** * * *
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251 TTATTTTAATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
51804 ATTCATAAAA
Statistics
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TCATATAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
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TTTAACAAATA
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* * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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128 CAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * ** * * * *
47842 T-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT-AT--G--ACTATTTGAACAAT-CATCTATTTA--AAA
1 TAATTTAT-TAA-TA-TTCAAA-AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* ** ** * * * * * *
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62 -CAAGTTCA-AA--TAGTTATGACTAT--TTGAACAATTATCT-ATTTC--AAACGTTATG-ACC
* ** * ** * * * * * * **** * *
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117 ATT-TGT-TTT---ATCATAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAA-GCTTATTCGAAATAAAATAA
**
48021 GCC
175 TAC
* * * ** ** * * *
48024 T-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATACATAGGAGAT-TGAA
1 TAATT---TAT-TAAT-ATTC-AA-AAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATA--A-ATCTG-T
** * * * * * * *
48086 AAAATAAATCTATTTACCAAAGCAGTTTAAATAGTTATGAATATTTAAACAATTATATATTTTAA
54 TTACTAAA-CAAGTT--C-AA--A--T-----AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * *
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106 A-CGTTATGACCATTTGTTTTA-TCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAAT
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168 AAAATAATAC
* * * * * * *
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1 TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CA
* * * * * * * *
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* * * *
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128 CA-TAAACAA-TTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * * * * *
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1 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* * * *
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* * * * * * * * *
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* ** *
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1 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-
* * * * *
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62 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TAT-TTCAAA-CGTTATGACCATTTGTT
* * * * * *
48703 TTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATAC-AGTCATATTCTG-ACTAAAGTAATGC
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* ** *
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1 TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTT--TACTAAA
* * * * ** * *
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* * *
48886 ATTACA-AAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAACATAAGT-C
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* ** * * * * * * *
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1 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * * *
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* * * *
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126 ATCAT-AAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAC
* ** *
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1 T-AATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * * ***
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63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CGTTATGACCATTTGTTTTA
* * * * * *
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** ** * * * *
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1 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* * * * * * ** *
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* * * * * *
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127 TCAT-AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * * * *
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1 TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC
* * * * *
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* * * *
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126 ATCATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAC
* * ** *
49663 TAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTTTTGAAC
1 T-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * * * * * *
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63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CGTTATGACCATTTGTTTTA
* * *
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* * * *
49844 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATA
1 TAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* * * * *
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* * * **
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* * * * *
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1 TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* * * * * * * * * *
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64 AGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CGTTATGACCATTTGTTTTA
* * * * *
50152 TCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTTG-ATTAAGATAATAC
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*
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1 TAATTTATTAATA
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * **
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*
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * ** * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTC
* * * * * * * *
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65 AAATCGTTATAACCT-TTTGTTTTATTACA-AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCG
* ** * *
49651 -AACAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGT-AGAAATTTTA
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* * * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
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65 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA
** *
49833 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
130 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAGGATTTA
* * * * *
49885 AAAAATAAATTTGTTTAT-TGAATAAGCTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTA-CTTATTT
1 AAAAATAAATCTGTTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTT
** * * * * * **
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* * *
50009 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTA
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTA
* * * * * * * *
50064 AAAAATAAGTTTGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCAATTTGAACAATTATCCATCT
1 AAAAATAAATCTGTTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * * *
50128 CAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTTG-
64 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGA
* * *
50191 ATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
50217 AAAAATAAAT
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AAAAATAAATCTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
AATCGTTATAACCTTTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTA
Found at i:50755 original size:180 final size:179
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
50371 TTTGAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAAATATATA-TGTTTATCGAACA
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* * * * ** *
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* * * * * * *
50482 TTATCATAAAACAATTATTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAA
62 TTGTCATAAAATAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
50547 TACTTTAGAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAACTATTTTTCGTACC
126 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTATCGAACC
* * * *
50601 AGTTCAAATAGTTATGA-TCATTAGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAATTATGACT-ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTG
* * * *
50664 TCATAAAAAAATTGTTTATGATCATACAAGCTTATTCAAATAAAAATATTACTAATTTAATAATA
65 TCATAAAATAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
50729 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TATTTGTCGAATC
128 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ACTATTTATCGAACC
* ** * * * * * * * *
50781 AGTTTAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * *
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66 CATAAAATAATTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATA
* * * **
51093 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-ATAAATTAGTTTATCAAATT
128 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAACTA-TTTATCGAACC
* * * * * * *
51146 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* *
51211 CATAAAATAATTGTTTT-TCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAATAATTGTTTTGT--TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
51275 TTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTT-GCTGAACT
128 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTATC-GAACC
* * * *
51322 AGTTTAAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACTTTTTGTTCT
1 AGTTCAAATAATTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTTGTTTT
* * * * *
51385 ATCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
64 GTCATAAAATAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** *
51450 ATTTTGAAAATTCATAACTAAGA-ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACC
127 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAACTATTTATCGAACC
* * * * *
51503 AGTTCAAACAGTTAAGACTATATA-AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTGTTG
1 AGTTCAAATAATTATGACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTG
** * * * * * * *
51567 TTGTAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAA-AATAATTTCTTAATA
65 TCATAAAATAATTGTTTT-GTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * **
51631 TTTAAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-CAGAACC
128 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTATC-GAACC
* * * * * * * *
51683 AATTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATTA-CTTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTTGTTTTG
* ** * * * *
51747 TCACAAAACGATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATT
65 TCATAAAATAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
51804 ATTCATAAAA
Statistics
Matches: 1113, Mismatches: 213, Indels: 113
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.01
176 111 0.10
177 15 0.01
178 96 0.09
179 63 0.06
180 287 0.26
181 247 0.22
182 144 0.13
183 142 0.13
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
CATAAAATAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTATCGAACC
Found at i:51347 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 51319--51354 Score: 56
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 19
51309 TATTTGCTGA
*
51319 ACTAGTTTAAATAATTATG
1 ACTAGTTTAAACAATTATG
51338 ACTA-TTTAAACAATTAT
1 ACTAGTTTAAACAATTAT
51355 CTATTTCAAA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
18 12 0.75
19 4 0.25
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.06, T:0.42
Consensus pattern (19 bp):
ACTAGTTTAAACAATTATG
Found at i:51793 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 50244--51803 Score: 1266
Period size: 361 Copynumber: 4.3 Consensus size: 357
50234 GTTAAACTAG
* * * * * * * * * *
50244 TTCAAATAGTTAAGGCTATTAGAACAACTATTTATTTCAAATCGTT-TCGACCTTTT-ATTTAGT
1 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTTTA-T
* * * * * * *
50307 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAACAT
64 CATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * * * * *
50372 TTGAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAAATATATATGTTTATCGAA-CAAGCTCACATAGA
128 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTCAAATC-AGTTCAAATAGT
* ** * * ** *
50432 TATGACTATTTGACTAATTATCTATTT-AATATCATTTATGGCCTTTTGGTTTATCATAAAACAA
191 TAAGACTATTAAAC-AATTATTTATTTCAA-ATC-GTTATAACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
50496 TTA-TTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATACTTT-AGAAAT
252 TTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTTAAAAAAT
* * * * *
50559 TATTAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAACTATTTTTCGTACCAG
316 TA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACGAACCAA
* * * * * * * * *
50603 TTCAAATAGTTATGA-TCATTAGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTATC
* * * *
50666 ATAAAAAAATTGTTTATGATCATACAAGCTTATTCAAATAAAAATATTACTAATTTAATAATATT
65 ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * *
50731 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTGTCGAATCAGTTTAAATGGTTA
129 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTCAAATCAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
50795 AGACTATTAGAATAATT-TTCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG
193 AGACTATTA-AACAATTATT-TATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTA
* * * * *
50859 TTTTAGTTCATACAAGC-TAGGTCGGAATAAATTAA-AACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTA
255 TTTTAGCTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATT-
* *
50922 ATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAATAAAAT-TGTTTATCGAA-CAA
317 ATAAGTAAGAGATTT--AAAAAAT-AAATCTATTTA-CGAACCAA
* * * * * *
50965 GTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAACATTATGAAC-TCTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTTTAT
* * * * * **
51029 CATAAAATAATTGTTTTCGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATATTACT-TTTTCTTTAATA
64 CATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT-AATAATA
* * * * *
51093 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTAGTTTATCAAATTAGTTCAAATAAT
127 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATT-GTTTGTCAAATCAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
51158 TATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT
191 TAAGACTA-TTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
51223 GTTTT-TCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T-
254 ATTTTAGC-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTAAAAAATTA
* * *
51285 T-AGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTGCTGAACTAG
318 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAA
* * ** *
51324 TTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTATCA
* * *
51389 TAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
66 TAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* * * * * *
51454 TGAAAATTCATAACTAAGA-ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCAGTTCAAACAGTTAA
130 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTCAAATCAGTTCAAATAGTTAA
* * **
51518 GACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTGTTGTTGTAAAACAATTATT
194 GACTAT-TAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGT-TTGTCATAAAACAATTATT
* * *
51583 TTAGCTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAA-AATAATTTCTTAATATTTAAAAAATTTATAA
257 TTAGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTAAAAAA-TTATAA
*
51647 GTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACAGAACCAA
321 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAA
* * * *
51685 TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTATCA
* ** * * * *
51750 CAAAACGATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATT
66 TAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
51804 ATTCATAAAA
Statistics
Matches: 959, Mismatches: 190, Indels: 102
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
356 22 0.02
357 123 0.13
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359 60 0.06
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365 123 0.13
366 9 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTATCA
TAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTT
AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATTGTTTGTCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGA
CTATTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTTAG
CTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTAAAAAATTATAAGTAAG
AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGAACCAA
Found at i:51823 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 51805--51836 Score: 64
Period size: 13 Copynumber: 2.5 Consensus size: 13
51795 ATATTAATTA
51805 TTCATAAAACAAG
1 TTCATAAAACAAG
51818 TTCATAAAACAAG
1 TTCATAAAACAAG
51831 TTCATA
1 TTCATA
51837 CAAGCTTATT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 19 1.00
ACGTcount: A:0.50, C:0.16, G:0.06, T:0.28
Consensus pattern (13 bp):
TTCATAAAACAAG
Found at i:52208 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 51832--52501 Score: 684
Period size: 181 Copynumber: 3.7 Consensus size: 182
51822 TAAAACAAGT
* * ** *
51832 TCATACAAGCTTATTTCGAACAAGATAATACTAATTTATTACCATTCAAAAAATTAATAAGAAAG
1 TCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAG
* * ** * *
51897 ATATTTAAAAAAATAAATCTATTTGCCGAATAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAATAATTGT
66 AGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTAT
* * * * *
51962 CTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTATCAAAAAATAATTGTTTCAATTA
131 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT--ATTA
*
52016 --ATACAAGCTTATATT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-TAAAATTAATAAGTA
1 TCATACAAGCTTAT-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * * ** * *
52077 AGCGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAATTGGTTAAAATAATTATGGCGATTTGAACAATT
64 AGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATT
* * * *
52141 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTTA
129 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATTA
* *
52195 TCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAACTTAATAAGTA
1 TCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
52258 CGAGATTT-AAAAAATAAATGTATTTATCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAAT
64 AGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAAT
* * * *
52321 TATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTT-TTTAGTCATAAAATATTTCTTTCA-TA
128 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-ATTA
* * * *
52375 TCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATCCT-A-CTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAA
1 TCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
52437 GAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
65 GAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTA
52502 CTTTGAAAAA
Statistics
Matches: 401, Mismatches: 74, Indels: 27
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
177 3 0.01
178 30 0.07
179 51 0.13
180 48 0.12
181 210 0.52
182 54 0.13
183 5 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (182 bp):
TCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAG
AGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTAT
CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATTA
Found at i:52218 original size:427 final size:425
Alignment explanation
Indices: 51405--52230 Score: 942
Period size: 427 Copynumber: 1.9 Consensus size: 425
51395 AATTATTTTT
* * * *** * *
51405 GTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTA
1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATAACAA
* * * *
51470 AGAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATAAACAATTA
66 AGAATTTAAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAACAGTTAACACTATATAAACAATTA
* * * * *** * * * *
51535 TTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTGTTGTTGTAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGTTT
131 TCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTGTTATCAAAAAACAATTATTTCAACTAATACAAGCTT
* *
51600 ATTTGAAATAAAATAAAATAATTTCTTAATATTTAAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
196 ATTTGAAATAAAATAAAATAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * *
51665 AATTCTATTTACAGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAT
261 AATTCTATTTACAGAACCAATTAAAATAATTATAACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * *
51730 TATTACTTTTTGTTTTATCACAAAACGATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATA
326 TATGACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
*
51795 ATATTAATTATTCATAAAACAAGTTCATAAAACAA
391 ATACTAATTATTCATAAAACAAGTTCATAAAACAA
* * * * *
51830 GTTCATACAAGCTTATTTCGAACAAGATAATACTAATTTATTACCATTCAAAAAATTAATAAGAA
1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATAACAA
* * * * * * *
51895 AGATATTTAAAAAAATAAATCTATTTGCCGAATAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAATAATT
66 AGA-ATTTAAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAACAGTTAACACTATATAAACAATT
* * * *
51960 GTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCT-TTATCAAAAAATAATTGTTTCAATTAATACAAGC
130 ATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG-TGTTATCAAAAAACAATTATTTCAACTAATACAAGC
* ** *
52024 TTATATTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGCGATTTAAA
194 TTAT-TTGAAATAAAATAA-AATAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* **** **
52088 AAATAAATT-TGTTTATCA-AATTGGTTAAAATAATTATGGCGATTTGAACAATTATCTATTTCA
257 AAAT-AATTCTATTTA-CAGAACCAATTAAAATAATTATAACGATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * *
52151 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTT-TATCATACAAGCTTATTCAAAA
320 AATCATTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTATTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAA
52215 TAAAATAATACTAATT
384 TAAAATAATACTAATT
52231 TATTAATATT
Statistics
Matches: 326, Mismatches: 68, Indels: 12
0.80 0.17 0.03
Matches are distributed among these distances:
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426 112 0.34
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ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (425 bp):
GTTCATACAAGCTTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATAACAA
AGAATTTAAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAAGTTCAAACAGTTAACACTATATAAACAATTA
TCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTGTTATCAAAAAACAATTATTTCAACTAATACAAGCTT
ATTTGAAATAAAATAAAATAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
AATTCTATTTACAGAACCAATTAAAATAATTATAACGATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
TATGACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
ATACTAATTATTCATAAAACAAGTTCATAAAACAA
Found at i:52810 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 52607--53352 Score: 447
Period size: 180 Copynumber: 4.2 Consensus size: 181
52597 ATAGATTTAG
* *
52607 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA-ATATTAATAAATTAG-ATTTA-TGTTATTCCG
1 TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT--AAGATATTAACAAATTAGCA-TTACT-TTATTCCG
* * *** * *
52669 AGTTAGTTTGTACAAATAGAAA-AATTGTTTTGTAACAAAACAAAAAGTTATAATGCTTTGAAAT
62 AATAAGACCGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAAT
*
52733 AGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGATCAGGTCAACAAATTCAT
127 AAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGATCAGGTCAACAAATTCAT
* *
52788 TTTTTAAATCTGTTATTTATTAATTTTTAAGATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATA
1 TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAAGATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTCCGAATA
* * * **
52853 AGACCGTACCAATAGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAAT
66 AGACCGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAAT
* * * ** * * * *
52918 AATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACT-AGTTTGGTAAATAAATTTAC
131 AATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGA-TCAGGTCAACAAATTCAT
* * ** * * * *
52969 TTTTTAAATC---T-CTTATT-ATTTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAC
1 TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT-AAGATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTCCGAAT
* * * * * * * * * *
53029 AA-A-CTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGATAAAATAAAACA-TCATAATGGTTTGAAAT
65 AAGACCGTACA--AATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTTATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * *
53091 AGATAATTACTCATATAGCCT-TAACTATTTGAATTGATTATG-CAAAAAAATT-AT
127 AAATAATTATTCAAATAG-TTATAACTATTTGTACTGATCAGGTC-AACAAATTCAT
* * * ** * * **
53145 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATA-ATATTATTAGATTAGTATTA-TTGTATTATGAA
1 TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTA-AGATATTAACAAATTAGCATTACTT-TATTCCGAA
* ** * * * * * * * ** *
53208 TAAG-CTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAAAAAATTTAAAATA
64 TAAGAC-CGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * *
53272 TATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTC--GACAAGCATATTTA-
128 AATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGTACT-GATCAGGTCAA-CAAATTCAT
*
53325 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
1 TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT
53353 GAAATAGGCT
Statistics
Matches: 443, Mismatches: 94, Indels: 57
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.01
176 18 0.04
177 114 0.26
178 3 0.01
179 9 0.02
180 167 0.38
181 126 0.28
182 3 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAAGATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTCCGAATA
AGACCGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAAT
AATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGATCAGGTCAACAAATTCAT
Found at i:53091 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 52693--53345 Score: 478
Period size: 180 Copynumber: 3.6 Consensus size: 176
52683 AATAGAAAAA
* * * * * *
52693 TTGTTTTGTAACAAAACAAAAAGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
* ** * * * * * *
52758 TATTTGTACT-GATCAGGTCAACAAATTCATTTTTTAAATCTGTTATTTATTAATTTTTAAGATA
66 TATTTGAACTAG-TTTGG-CAAAAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTA-T--TTTTCAAAATA
* ** * * ** ** * *
52822 TTAACAAATTAGCATTACTT-TATT-TCGAATAAGAC-CGTACCAATAGAAACAT
125 TTAATAAATTAATATTA-TTGTATTAT-AAACAA-ACTTATATGAACAAAAACAT
* *
52874 TTGTTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
*
52939 TATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTATTTTTCAAAATATTAA
66 TATTTGAACTAGTTTGGCAAA-AAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTTTTCAAAATATTAA
*
53003 TAAATTAATATTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAT
129 TAAATTAATATTATTGTATTAT-AAACAAACTTATATGAACAAAAACAT
* * ** * * * ** * *
53051 TTGTTTTATGATAAAATAAAACATCATAATGGTTTGAAATAGATAATTACTCATATAGCCT-TAA
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TTATAA
* * * *
53115 CTATTTGAA-TTGATTAT-GCAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAAT
65 CTATTTGAACTAG-TT-TGGCAAAAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTA-T--TTTTCAAAAT
* * * * * * * * * *
53178 ATTATTAGATTAGTATTATTGTATTATGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAA
124 ATTAATAAATTAATATTATTGTATTATAAACAAACTTATATGAACAAAAACAT
* * ** * *
53231 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAAAAAATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
* * * *
53296 TATTTGAACTAGTTCGACAAGCATATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATT
66 TATTTGAACTAGTTTGGCAA-AAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATT
53346 AATTTTTGAA
Statistics
Matches: 375, Mismatches: 81, Indels: 36
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 27 0.07
177 112 0.30
178 3 0.01
179 3 0.01
180 132 0.35
181 97 0.26
182 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
TATTTGAACTAGTTTGGCAAAAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTTTTCAAAATATTAATA
AATTAATATTATTGTATTATAAACAAACTTATATGAACAAAAACAT
Found at i:53243 original size:357 final size:356
Alignment explanation
Indices: 52506--53345 Score: 838
Period size: 357 Copynumber: 2.3 Consensus size: 356
52496 CAATTACTTT
* * * * *
52506 GAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAAGAG
1 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
52570 TCATAACTATTTAAAATTGATTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
66 TTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAAATTTA-TTTTTAAATC---T-CTTATT-ATTTTT
** * *** ** * *
52635 GGAAATATTAATAAATTAGATTTATGTTATTCCGAGTTAGTTTGTACAAATAGAAAAATTGTTTT
125 CAAAATATTAATAAATTAGATTTATGTTATTCCAAACAAACTTATACAAACAGAAAAATTGTTTT
* * * * *
52700 GTAACAAAACAAAAAGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGT
190 ATAACAAAACAAAAAGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGCTATAACTATTTGA
* * * *
52765 ACTGATCAGGTCAACAAATTCATTTTTTAAATCTGTTATTTATTAATTTTTAAGATATTAACAAA
255 ACTGATCAGGTCAAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAGATATTAACAAA
*
52830 TTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGACCGTACCAATA
320 TTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGACCGTACCAACA
* * * *
52867 GAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTG
1 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
*
52932 TTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTACTTTTTAAATCTCTTATTATTTTTCAAAA
66 TTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTATTTTTCAAAA
* * **
52997 TATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACA-AAAACATTTGTTTTAT
130 TATTAATAAATTAGAT-TTATGTTATTCCAAACAAACTTATACAAACAGAAAA-A-TTGTTTTAT
* * * * *
53060 GATAAAATAAAACA-TCATAATGGTTTGAAATAGATAATTACTCATATAGCCT-TAACTATTTGA
192 AACAAAACAAAA-AGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTACTCAAATAG-CTATAACTATTTGA
* * * **
53123 ATTGATTATG-CAAAAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATA-ATATTATTA
255 ACTGATCAGGTC-AAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA-AGATATTAACA
* * * **
53185 GATTAGTATTA-TTGTATTAT-GAATAAG-CTTGTATGAACA
318 AATTAGCATTACTT-TATT-TCGAATAAGAC-CGTACCAACA
* * * ** * *
53224 TAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAAAAAATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * ** *
53289 TTATAACTATTTGAACTAGTTCGACAAGCATATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATT
66 TTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAAATTTATTTTTAAATCTCTTA-TTATT
53346 AATTTTTGAA
Statistics
Matches: 394, Mismatches: 73, Indels: 28
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
356 24 0.06
357 193 0.49
358 80 0.20
359 3 0.01
361 4 0.01
362 90 0.23
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
TTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAAATTTATTTTTAAATCTCTTATTATTTTTCAAAAT
ATTAATAAATTAGATTTATGTTATTCCAAACAAACTTATACAAACAGAAAAATTGTTTTATAACA
AAACAAAAAGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGCTATAACTATTTGAACTGAT
CAGGTCAAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAGATATTAACAAATTAGCA
TTACTTTATTTCGAATAAGACCGTACCAACA
Found at i:53298 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 52510--53305 Score: 629
Period size: 181 Copynumber: 4.4 Consensus size: 179
52500 TACTTTGAAA
* * * * * *
52510 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAAGAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * * * * * *
52575 ACTATTTAAAATTGATTGAT--AAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGA
66 ACTATTT-GAACTGATT-ATGCAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAA-TTTT-CA
* * * * *
52638 AATATTAATAAATTAG-ATT-TATGTTATTCCGAGTTAGTTTGTA-CAA-ATAGAAA
126 AATATTAATAAATTAGTATTAT-TG-TATTTCGAATAAGCTTGTATCAACATA-AAC
* * * * *
52691 AATTGTTTTGTAACAAAACAAAAAGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * * * * *
52756 ACTATTTGTACTGATCAGGTC-AA-CAAATTCATTTTTTAAATCTGTTATTTATTAATTTTTAAG
66 ACTATTTGAACTGATTATG-CAAATAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTCAA-
* * * * * *
52819 ATATTAACAAATTAGCATTACTT-TATTTCGAATAAGAC-CGTACCAATAGAAAC
127 ATATTAATAAATTAGTATTA-TTGTATTTCGAATAAG-CTTGTATCAACATAAAC
* * * *
52872 ATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * *
52937 ACTATTTGAACT-AGTT-TGGTAAATAAATTTACTTTTTAAATCTCTTATTA-T--TTTTCAAAA
66 ACTATTTGAACTGA-TTAT-GCAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTC-AAA
* * * * * * * *
52997 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAAC
128 TATTAATAAATTAGTATTATTGTATTTCGAATAAGCTTGTATCAACATAAAC
* * * ** * * ** * *
53049 ATTTGTTTTATGATAAAATAAAACATCATAATGGTTTGAAATAGATAATTACTCATATAGCCT-T
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TTAT
*
53113 AACTATTTGAATTGATTATGCAAA-AAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
65 AACTATTTGAACTGATTATGCAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTCA-AA
* * * *
53177 TATTATTAGATTAGTATTATTGTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAAT
128 TATTAATAAATTAGTATTATTGTATT-TCGAATAAGCTTGTATCAACATAAAC
* * ** * *
53229 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAAAAAATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
53294 ACTATTTGAACT
66 ACTATTTGAACT
53306 AGTTCGACAA
Statistics
Matches: 481, Mismatches: 106, Indels: 57
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
176 24 0.05
177 110 0.23
178 6 0.01
179 6 0.01
180 147 0.31
181 180 0.37
182 7 0.01
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
ACTATTTGAACTGATTATGCAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTCAAATAT
TAATAAATTAGTATTATTGTATTTCGAATAAGCTTGTATCAACATAAAC
Found at i:55098 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 53361--55162 Score: 1431
Period size: 181 Copynumber: 10.0 Consensus size: 180
53351 TTGAAATAGG
* * *
53361 CTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAAAGATTTGAAATAGATA
1 CTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATA
** * * ** *
53425 ATTGTTCAAAT-GGCAATAATTATTTGAA-TTGATATGA-TAAATTGATTTATTTTTTAAATCTC
65 ATTGTTCAAATAATC-ATAACTATTTGAACTT-AT-TCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT
** * * * * ****
53487 CAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATATAAGTAATATTATTTTATTTTGGAT-AA
127 TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* ** * * * * *
53542 CTTTTATGAAT-TGAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATAA
1 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * ** * *
53606 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAACTTCTTA
66 TTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTA
* ** *** *
53671 CTTTTTAATTTTTTGAATATTAATAAAAGAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
130 CTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * * * * * *
53723 CATATATGAACT-AAAATAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATA
1 CTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * * *
53787 ATTATT-ATAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACACATTGACTTTTTAAATTTTT
65 ATTGTTCA-AATAATCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * * * * *
53850 TACCTATTAATTTTTAAAATATT-ATTAGTGTAGCAATATTTTACTCCTAATAAG
128 TACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * * *
53904 GTTCTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAA
1 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
53968 TAGTGCAAATGGA-CATAACTATTTAAACTTATTCTGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAA
66 TTGTTCAAAT-AATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * *
54032 ATTATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA
130 CTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * *
54084 CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAATTTGAAATAAATAA
1 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * *
54149 TTGTTTAAATAATCATAGCTATTTGAACTCACTCTA-TAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTTA
66 TTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * *
54213 CTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATAGTATTTTATTCCAAATAAG
130 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * ** * *
54265 CTTTTATGAACAGAAACAACAGGTTTATGACAAAATAAAATG-TCATAACGATTTGAAATAGATA
1 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
54329 ATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACTGATTTA-TTTTTAAAACTTTT
65 ATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-TATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * *
54392 ACTTATTAATTCTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTGTTCAAAATAAG
129 ACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * * * *
54445 CTTGCATG-A-ACAAACTAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATGA-TATTTTGAAATAGAT
1 CTTGTATGAATAAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGA-TTTGAAATAGAT
* * * * *
54507 AATTGTTTAGATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTCT-TTTTTTAATTCTCT
64 AATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTTT
* * *
54571 TACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAGTT-CAAACAAA
128 TACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAA
* ** * * * * * * *
54625 CTTATATGAATTGAAACATTTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATTATGATTTGAAATATATAA
1 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * * * *
54690 TTATTCAAATAGTCATGACGATCTGAACTTGTTCGGTAAACATAGTTATTTTTTAAAATCTTTCA
66 TTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTA
* * *
54755 CTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAA
130 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * ** * * *
54807 CTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAATCATAATAAGTTAAAATAAATAA
1 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
*** * * * *
54872 TTACACAAATAATCATAACGATTTGAACTTAATCGGTAAACAGATTTATTTTTTTATATCTTTTA
66 TTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTA
* *** *
54937 CTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGGAATAAG
130 CTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * * * * *
54989 CTTGTATGAACAAAAAAAAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGATTATAACGATTTCAAATAGATG
1 CTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
55054 ATTGTTCAAACAATCATAATTTTTTAAACTTGTTCAGT-AACAGATTCATTTTTTAAATTTCTTT
65 ATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTT
* *
55118 A-TTATTAATTTTTAGATTATTAATAAATTAATATTATTTTATTCC
129 ACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
55163 CCATGAGCTT
Statistics
Matches: 1287, Mismatches: 284, Indels: 100
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 7 0.01
179 81 0.06
180 368 0.29
181 440 0.34
182 316 0.25
183 74 0.06
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
TTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
TTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
Found at i:55581 original size:175 final size:176
Alignment explanation
Indices: 55316--55641 Score: 474
Period size: 175 Copynumber: 1.8 Consensus size: 176
55306 CCTGAATAAG
*
55316 CTTATATGAACATAAACAATTGTTTTATAAGAAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATA
1 CTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAT-A-AAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATA
* ** * * *
55381 ATTGCTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTAATTTGATAAATATATTTATTTTTTAAATATCTTA
64 ATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAATGAGATAAACACAATTATTTTTTAAATATCTTA
*
55446 TTAATATTCAAAATATTAATAGATTAGTATTAATTTATTTCGACCAAA
129 CTAATATTCAAAATATTAATAGATTAGTATTAATTTATTTCGACCAAA
* * *
55494 CTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAT-AACAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
1 CTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAAAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAAT
* * * *
55558 TGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGATGAGGTAAACACAATTATTTTTTAAATCTCTTACT
66 TGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAATGAGATAAACACAATTATTTTTTAAATATCTTACT
* *
55623 AATTTTTAAAATATTAATA
131 AATATTCAAAATATTAATA
55642 AATTTATTCT
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 17, Indels: 3
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
175 105 0.80
178 26 0.20
ACGTcount: A:0.45, C:0.08, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (176 bp):
CTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAAAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAAT
TGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAATGAGATAAACACAATTATTTTTTAAATATCTTACT
AATATTCAAAATATTAATAGATTAGTATTAATTTATTTCGACCAAA
Found at i:56625 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 56604--56636 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
56594 TAATGATTTG
56604 AAATAG-ATAATTATTC
1 AAATAGCATAATTATTC
56620 AAATAGCCATAATTATT
1 AAATAG-CATAATTATT
56637 TGAACCAATT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.48, C:0.09, G:0.06, T:0.36
Consensus pattern (17 bp):
AAATAGCATAATTATTC
Found at i:57524 original size:535 final size:534
Alignment explanation
Indices: 56488--57675 Score: 1254
Period size: 535 Copynumber: 2.2 Consensus size: 534
56478 ATATTTATTT
* * * *
56488 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAGGCTT
1 TTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * * * *
56553 GTATG-ATGAAAAACAGTTGTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
66 ATATGAAT-AAAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * ** *
56617 TTCAAATAGCCATAATTATTTGAACCAATTCGATAACTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTAT
129 TTCAAATAACCATAATTATTAGAACCAATTCGATAACAAACTTAGTTTTTAAA-CTCT-ACTTAT
* *
56682 CAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACA
192 CAAATTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACA
* * *** * * * * *
56747 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGCTATAA
257 ATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATAGCTCAAACAGATATAA
* * * * ***** **
56812 CTTTTTGAACTTGTTTCGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTATTAATTTTTTTAAT
322 CTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATATCCAACTTATTAATTTTTAGAAT
*
56877 GTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTGAAAAAACTATTTTATGAC
387 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-CATGTATGAACTGAAAAAACTATTTTATGAC
* * * * * * * *
56942 TAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAATTATCTAAACTGG
451 AAAACAAAAAGACAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTCG
57007 CTTGACAAATAC-ATTTATC
516 CTTGACAAAT-CGATTTATC
* * * * * * *
57026 TTTTCAATCTTTTATTAATTTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTT
1 TTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * *
57091 ATATGAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGT
66 ATATGAATAAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
**** *
57156 TCAAATAACCA-AATCTATTAGAATTGGTTTGATAAACAAA-TCTAGTTTTTAAA-TCT-CTTAT
130 TCAAATAACCATAAT-TATTAGAACCAATTCGAT-AACAAACT-TAGTTTTTAAACTCTACTTAT
* * ** *
57217 -TAATTTTCAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAA-TTTTGTATGAA-TAGAA
192 CAAATTTT-AAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTT-TATGAACTA-AA
* * * *
57279 ACAATTTTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTTGAAATAAATAATAGCTCAAACGGAT
254 ACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTT-AAATAAACAATAGCTCAAACAGAT
* *
57344 ATGACTATTTGAACTTG-TTAGATGAACAAATTTATTTTTT-AAATATCCAACTTATTAATTTTT
318 ATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAAATATCCAACTTATTAATTTTT
* * * *
57407 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ATTTATGTTAA-TAGAAACAATTGTT
382 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAACATGTATG--AACT-GAAAAAACTATT
*
57470 TTATGACAAAAC-AAAAGAACATAGA-GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
444 TTATGACAAAACAAAAAG-ACA-AAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
57533 TTGAACTCGCTTGGCAAATCGATTTATT
507 CTAAACTCGCTTGACAAATCGATTTATC
* *
57561 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
1 TTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* ** *
57626 GCTTTTATGAATAGGAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
62 GCTTATATGAATAAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAA-TCATAAC
57676 TGTCATAACA
Statistics
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0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
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540 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (534 bp):
TTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
ATATGAATAAAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
CAAATAACCATAATTATTAGAACCAATTCGATAACAAACTTAGTTTTTAAACTCTACTTATCAAA
TTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG
TTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATAGCTCAAACAGATATAACTAT
TTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATATCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTA
ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAACATGTATGAACTGAAAAAACTATTTTATGACAAAAC
AAAAAGACAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTCGCTTGA
CAAATCGATTTATC
Found at i:57625 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 56474--57675 Score: 861
Period size: 182 Copynumber: 6.7 Consensus size: 177
56464 TTGGTTCAGC
* ** *
56474 AAACATATTTATTTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * *
56536 TTATTCCAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAGTTG-TTTATAACAAAACAAAAGTTCATAATG
65 TTATTTCAAATA-AATT-TATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACG
* * ** *
56599 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC-CAATTCG
127 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGG
** * * * * * * *
56649 ATAACTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTAT
1 A-AACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * **
56714 TTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATT
64 TTTATTTCAAATAA--ATTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * * * * * *
56778 TATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAG-CTATAACTTTTTGAACTTGTTTCGT
126 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTCGCTT-GG
* * ** ** *
56831 AAATAAATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAAATTTATTTTTT-AAATCT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
56896 TTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACT-GAAAAAACTATTTTATGACTAAACAAAA-AGTCAAAA
64 TTTATTTCAAATAA--ATTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
* * * * * * * *
56959 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAATTATCTAAACTGGCTTGAC
125 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTG-G
* * * * * * * * * *
57013 AAATACATTTATCTTTTCAATC-TT--TTATTAATTTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATATTT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
57075 TACTCCAAATAAGCTTATATGAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACGAT
66 TATTTCAAATAA-ATT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGAT
* * ** * * * * *
57139 TTGAGATAGATAATTGTTCAAATAACCA-AATCTATTAGAATTGGTTTGAT
129 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTCGCTTG-G
* * * *
57189 AAACAAATCTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTGGTATTATTT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
57251 TATTTCAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTACGACAAAACAAAATG-TCATAACAA
66 TATTTCAAATAA-ATT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGA
* * ** * * *
57315 TTTTGAAATAAATAA-TAGCTCAAACGGAT-ATGACTATTTGAACTTG-TTAG
128 -TTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTCGCTTGG
* ** *
57365 ATGAACAAATTTATTTTTTAAATATCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 A--AACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
*
57430 TTTTATTTCAAATAAATTTATGTTAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAACATAGA
63 TTTTATTTCAAATAAATTTATG--AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA-A
*
57495 -GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGG
125 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGG
* *
57547 CAAATC-GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTA
1 -AAA-CAAATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
57611 TTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGGAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAA
63 TTTTATTTCAAATAA--ATTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
57675 C
125 C
57676 TGTCATAACA
Statistics
Matches: 809, Mismatches: 170, Indels: 90
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTCAAATAAATTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT
GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGG
Found at i:58608 original size:196 final size:196
Alignment explanation
Indices: 58260--58624 Score: 451
Period size: 196 Copynumber: 1.9 Consensus size: 196
58250 ATAATATGAC
* * *
58260 AATTATTTTTATTGAGATTTCATTTAAATTATTCCACAATTTGGGACAAATTTAAAGAAATTTCT
1 AATTATTATTATTGAAATTTCATCTAAATTATTCCACAATTTGGGACAAATTTAAAGAAATTTCT
*
58325 CACCTAGAGATTTCTTAGAAAATTTACCATTTGAAATTTTTAAGAATCTCATCCTTAAATAATTA
66 CACCTAGAGATTTCTTAGAAAATTTACCATTTGAAATTTTTAAGAATCTCATCATTAAATAATTA
* * ** *
58390 TCAAATATTTTGAACCCAAATTTTTATTTTTTATT-TTTTAAGTTTTTTGGATTGAAAATAAATA
131 TCAAATATTCTAAAAACAAATTTAT-TTTTTTATTCTTTTAAGTTTTTTGGATTGAAAATAAATA
58454 TT
195 TT
*
58456 AATTATTATTATTGAAAATTT-ATCTAAATTATTCCACCATTTGGGACAAATTTAGACA-AAATT
1 AATTATTATTATTG-AAATTTCATCTAAATTATTCCACAATTTGGGACAAATTTA-A-AGAAATT
* * *
58519 TCTCACTTA-AGAATTT-TATA-AAAATTTACCATTTGAAATTTCTATA-AAT-TCCATCATTAG
63 TCTCACCTAGAG-ATTTCT-TAGAAAATTTACCATTTGAAATTTTTA-AGAATCT-CATCATTAA
**
58579 ATAATTAAT-ACTTATTCTAAAAACAAATTTATTTTTTTATTCTTTT
124 ATAATT-ATCAAATATTCTAAAAACAAATTTATTTTTTTATTCTTTT
58625 TCTAAATTTA
Statistics
Matches: 145, Mismatches: 15, Indels: 18
0.81 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
195 10 0.07
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ACGTcount: A:0.38, C:0.11, G:0.07, T:0.45
Consensus pattern (196 bp):
AATTATTATTATTGAAATTTCATCTAAATTATTCCACAATTTGGGACAAATTTAAAGAAATTTCT
CACCTAGAGATTTCTTAGAAAATTTACCATTTGAAATTTTTAAGAATCTCATCATTAAATAATTA
TCAAATATTCTAAAAACAAATTTATTTTTTTATTCTTTTAAGTTTTTTGGATTGAAAATAAATAT
T
Found at i:60245 original size:41 final size:41
Alignment explanation
Indices: 60156--60745 Score: 684
Period size: 42 Copynumber: 14.1 Consensus size: 41
60146 AAGTAAACAA
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1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTG-AAAAATAAAT
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1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* *
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1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTT-GAAAAATAAAT
* * **
60281 TACTCCTCTAAATAGAGGCACCATGACTTTGAAAAGATAAAT
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAA-ATAAAT
* * * *
60323 TACTCCTCTAAATAGAGGCACTACAACTTTGGAAAATAAA-
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* * * *
60363 TGCTCTTCTAAATAGAAGCACCACAACTTTG-AAAATAAAA
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* *
60403 TGCTCCCCTAAACAGAGGCAACCACAACTTTAGGAAAAATAAAA
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGC-ACCACAACTTT--GAAAAATAAAT
* *
60447 TGCTCCTCTAAACAAAGGCAACCACAACTTTGAAAAATAAAA
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGC-ACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* *
60489 TGCTCCTCTAAATAGAGGCAACCACAACTTTATGAAAAATAAAA
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGC-ACCACAAC-TT-TGAAAAATAAAT
* * *
60533 TGCTCCTCTAAATAGAGGCAACCACAACTTTGGAAAATAAAA
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGC-ACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* *
60575 TGCTCCTCTAAA-TGAGGCAACCACAACTTTGGAAAA-AAAT
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGC-ACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* * ** * *
60615 TACTCCTCTAAACAGAGGTAATTATAACTTTAAGAAAAATAAAA
1 TGCTCCTCTAAACAGAGG-CACCACAACTTT--GAAAAATAAAT
* * *
60659 TGCTCCTCTAAATAAAGGCAACCACAACTTTGGAAAATAAAT
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGC-ACCACAACTTTGAAAAATAAAT
* *
60701 TGCTCTTCTAAACAGAGACACCACAACTTTGAAAAATAAAT
1 TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAATAAAT
60742 TGCT
1 TGCT
60746 TCTTAACAAT
Statistics
Matches: 484, Mismatches: 49, Indels: 31
0.86 0.09 0.05
Matches are distributed among these distances:
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TGCTCCTCTAAACAGAGGCACCACAACTTTGAAAAATAAAT
Found at i:61274 original size:58 final size:59
Alignment explanation
Indices: 61178--61318 Score: 212
Period size: 58 Copynumber: 2.4 Consensus size: 59
61168 TTATTTGAAA
* * *
61178 CTCAAAGATTCTTATTTAAGTTCAGAAGATTCATATTCGATAAATTTTGGGTTTCACAC
1 CTCAAAGATTCTCATTTAAGTTCAGAAGATTCACATTCGACAAATTTTGGGTTTCACAC
* * *
61237 CTTAAAGATTCTCATTTGAGTT-TGAAGATTCACATTCGACAAATTTTGGGTTTCACAC
1 CTCAAAGATTCTCATTTAAGTTCAGAAGATTCACATTCGACAAATTTTGGGTTTCACAC
*
61295 CTCAAAGATTTTCATTTAAGTTCA
1 CTCAAAGATTCTCATTTAAGTTCA
61319 AAAATTCTCA
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 10, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (59 bp):
CTCAAAGATTCTCATTTAAGTTCAGAAGATTCACATTCGACAAATTTTGGGTTTCACAC
Found at i:61681 original size:23 final size:22
Alignment explanation
Indices: 61651--61694 Score: 54
Period size: 23 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
61641 TTGGAATAAG
*
61651 TTTTATCAAC-TGATCATCATTA
1 TTTTATC-ACTTGATCACCATTA
61673 TTTTCATCACTTGATCACCATT
1 TTTT-ATCACTTGATCACCATT
61695 TGAAGGCTTC
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
22 6 0.32
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Consensus pattern (22 bp):
TTTTATCACTTGATCACCATTA
Found at i:62538 original size:8 final size:8
Alignment explanation
Indices: 62503--62550 Score: 53
Period size: 9 Copynumber: 5.8 Consensus size: 8
62493 TTTTCTTTCC
*
62503 TTTTCATC
1 TTTTCATT
62511 TTTTCTATT
1 TTTTC-ATT
62520 TTTTCA-T
1 TTTTCATT
62527 TTTTCATTT
1 TTTTCA-TT
62536 TTTTCCATT
1 TTTT-CATT
62545 TTTTCA
1 TTTTCA
62551 CCATTTTTTT
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 1, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTCATT
Found at i:62539 original size:17 final size:16
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Indices: 62503--62538 Score: 56
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62493 TTTTCTTTCC
62503 TTTTCATCTTTTCTATT
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62520 TTTTCATTTTTC-ATT
1 TTTTCATTTTTCTATT
62535 TTTT
1 TTTT
62539 TCCATTTTTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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62920 TTGTTTGTGG
* *
62930 CATTTTTCTTTTCTCTTTTTCTTT
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1 CATTTTACTTTTCTCTT-TCTCTTT
62978 GAGACCTTTT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 2
0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.06, C:0.21, G:0.02, T:0.71
Consensus pattern (24 bp):
CATTTTACTTTTCTCTTTCTCTTT
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Indices: 67274--80306 Score: 4542
Period size: 181 Copynumber: 72.1 Consensus size: 178
67264 AATGATTTCA
* * *** **
67274 AAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTCTAAAAACTTATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
* * *
67339 AGT-TTTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTTAAATAAGCTT
64 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * * *
67401 GTATGAA-TAGAACTAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATATTTTC
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* * * *
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* * * * * *
67518 ATTTTTTTACTCATTAATTTTGGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTA
64 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * * * * *
67583 TATGAACTAAAACAATAGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAACGATTTA
129 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTG
* * *
67634 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATTTGAAC--TT-GTTAAAAAAGTATATTTATTT
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTGTTCGGTAAACAA--AT-TTT-TTT
* ** * * *
67695 CTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTAATTT-GAATAA
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* * * * * * *
67759 ACTTGTATGAAC-AGAAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAAGAATTTT
124 GCTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTG
* * * ** * *
67815 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-GACTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTGA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
* * * * * *
67879 AATGTTTTACTTATTAATTGTCTT--TATGTTAACAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAAC
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* * * ** * ** *
67941 TTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGATAAAACAAAAGGTTGTAGCA-ATTTC
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* * * * * * ** *
67995 AAAAAGATAATTATTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCGACAAACATATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
* * * * **
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64 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * *
68125 TATGAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
129 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTG
* * * * *
68176 AAATACATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT-AATCTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-GTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTT
* * * * * * **
68240 AATTTTTTTACTTATTAACTATTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTA-ATCCTATGAAGCT
63 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCT
* *
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* * * * * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTAA
* * * * * *
68421 ATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTTTTATTTTATTCCAAACAAACTTAT
65 ATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT
* * * *
68482 ATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTG
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* * *
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*
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* * * *
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* * *
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* * ** * * * * *
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* *
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* * * * *
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* *
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* ** * ** * ** *
74399 ACAAAATGTCTAATG-ACTTTAAATA-AATAATTGT-T--CAAATAGTCAAATATAT-TTAA-AC
120 ATAAGCT-TAT-ATGAAC--TAAA-ACAATTGTTTTATGACAAA-A--CAAA-AGGTCATAATA-
74457 TTGTTCG
175 -T-TT-G
* * * * * * * ** * *
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* * * * * *
74526 ATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAATTAAAATAATTATTTTAGGACTA--AACAAA--AGGTC
56 -TTTT-TT-T--A-AATC-TTT-T-ACTT--ATTAA-T-TTTT-GAAATATTAATAAATTA-GT-
* * * * * * ** * * *** * * * ***
74587 A-GA-ATGATTTGAAAT-AGATAAT-TGTTCCAATAGTCTTAATTATCTGAACTAGTTCGGTAAA
105 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATT-GTTTTATG-AC-AAAAC---AAA
* ** * *
74648 CA-CTTTTACT-TTTT
164 -AGGTCATAATATTTG
** * ** * * *** ** * * **
74662 AAATCTCTTATTAATTTTTGGAATA-TTATTAAATTAGTATTGTTTTAATCCGTATA-AGCTTTT
1 AAA--T-AGA-TAATTGTTCAAATAGTCA-T-AACTA-T-TTGAACTGTTCGGTAAACAAATTTT
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74725 ATGAGAAGAAACAATTGTT--TTA-TGATGAAAT-AAAGATCATAACAATTTGAG-ATAGATAAT
58 -TTTTTA-AATC--TT-TTACTTATTAAT-TTTTGAAATAT--TAATAAATT-AGTAT-TAT-TT
* * * * **
74785 T-CTTCACATACTCAAAC-TATTTAAACTATTTCGGTAAACAAATTTAGTTTT-T-A-AATCTCT
112 TATTTCA-A-A-T-AAGCTTATATGAACTA-------AAAC-AA-TT-GTTTTATGACAA-AAC-
*** *
74845 TATTAATTTTCAAAATA-TT-
161 -A--AAAGGTCATAATATTTG
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**** * ** * * **
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62 TAAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAATA-TTAA----T-AAAT-----T-AGTA-TT-ATT
* * * * * * * * * * * * **
74984 TTGTTTGGTAAA-CAGATTTATTTTTAAATCTCCAACCTATTAATGTTCA-GA-ATATTAATTAA
111 TTATTT--CAAATAAG-CTTA--TATGAA-CT-AAAACAATT-GT-TTTATGACAAAACAA--AA
* *
75046 --TTAGTATTATTT-
165 GGTCA-TAATATTTG
* * * * ** * * **** * * *
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1 AAAT--AGAT-AA-TTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGA--ACTGTTCGGTAA-A-C-AAATT
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* ** * * **
75183 TTTATTTT-TTTAAATCTTATTAATTTTTGGAATATTAA-T-AAACTAGTATTATTTTATTTCGA
106 -TTATTTTATTTCAA----A-TAA-GCTT---ATATGAACTAAAAC-A--ATTGTTTTATGAC-A
* *** * ***
75245 ATAC-ACTTGT-ATGAACA-AAA
157 AAACAAAAGGTCAT-AATATTTG
* * * * * * * * * *
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1 A-AATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAA-CT-ATTTGAACTGTTCGGTAAACAAATTTTTTTT
* * * * * * * ** ** ** *
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62 TAAAT-CT-TTTACTTA-TT--A-ATTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATT-TCA
* **** * ** * * ** * **
75382 TTATTTTTTTGAATATTAA-TAAATTTATATTATTTTATTTG-GAGTA-AGATTGT-ATGAATA-
119 -AATAAGCTT--ATATGAACTAAA-ACA-ATTGTTTTA--TGACAAAACAAAAGGTCAT-AATAT
75442 --G
176 TTG
* * * * * * * * *** *
75443 AAACA-ATTATT-TTCTGACAA-A-ACA-AA--ATGTCATAATGATT-TG-AAATAAAAAATTAT
1 AAATAGATAATTGTTC--A-AATAGTCATAACTATTTGA-ACTG-TTCGGTAAACAAATTTTTTT
* ** * ** * * *
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61 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATT-AATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCAAATA
* * * * *** *** * *
75554 TCTTGCTCATTGACTTTTGGAA-TATTAATA-AATTAGTATCATTTTATTTCAAATAAG-CCT-A
123 ---AG--C-TT-A--TAT-GAACTA--AA-ACAATT-GTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAA
75615 TA--TG
173 TATTTG
* * ** * * ** * * **
75619 AACT-GATACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAAG-A-T-TT--G-AAATAGATAATT
1 AAATAGAT--AATTG-TTCA-AAT-AGTCATAA-CT-ATTTGAACTGTTCGGTAAACAAATTTTT
* * * * * * * *
75677 TTTAAAATCTTTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAGTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAA
59 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
* * * * *
75742 GCTTCTATGAACAAAAACAATTATTTCATGATAAAAC-AAAGAGTCATAACTATTTG
124 GCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAA-TATTTG
* * * * * * * **
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAACA-AATTTTTTTTTA
* * *
75863 AATCTTTTACTTATTAATTATCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTT
64 AATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * *
75927 GTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAGG-CTATAGTGATTTG
128 ATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAAT-ATTTG
* *** * * * * * **
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAACAAATT-TTTTTTTA
* * ** * **
76044 AATC---T-CTTATTAATTTGT-AGAATATTAATAAATTAGAATTAAGTTATTCCAAATAAGCAC
64 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * * * * *
76104 GTAGGAAC-AGAAACAATTATTTTGTGACAAAATAAAAAGTCAAAACGATTTG
128 ATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTG
** * * * * * * *
76156 AAATATTTAATTGTTCAAACAGTTAAAACTATTTGCATTGGTCAGGCT--A-AGATTTATTTTTT
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTC-GG-TAAACAAATTT-TTTTTT
* * * *
76218 AAATCTATTACTTATTAATTTTT-AGAATATT-A-AAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC
63 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-C
* * * *
76280 TGTAGCAATAGAA--AAAAAAATTGTTTTATGAC-AAA-AAATGGTCATAACGATTTG
126 T-TA--TAT-GAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTG
* * * * * *
76334 AAATAAATAATTGTT-AAATTA-TTATAACTAATTGAACTAGTTTC-ATAAATAGATTTATTTTT
1 AAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCGGTAAACAAATTT-TTTTT
* * * ** * *
76396 TAAATC---T-CTTATTAA-TTTTCAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACT
62 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* *
76456 T-TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAATGATTTG
127 TATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTG
* * * * * * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
* * * * *
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* * * * * **
76636 GTATGAAC-ACAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATTACGATTTG
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* * * * *
76688 AAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
** * * *
76753 AATCTCCTACTCACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA
64 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
*** * * * *
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* * * * *** *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
*** *** * *** *
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* * * * *
76999 TATGAATTAAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAAGTCATAACGATTT-
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* * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTT-
** * * *
77113 AAAT-TTCTTGTTTATTAGTTTTTTG-AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAGTAAGC
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* * * * * * * * * **
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* * * * * *** * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATT-TTTTTTTA
* * * * ** * * * *
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* * *
77359 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAATAC-AAAGATCATAATGATTTG
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* * * * * ** * **
77409 AGATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTTTTTGAACTAATCCAATAAACATATGTAGTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAAT-TTTTTTTTA
* * * * *** * *
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* **
77538 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATGACA-ACTTT-
129 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-A-ATA-TTTG
* * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-CTGTTCGGTAAACA-AATT-TTTTTT
* * * * * * *
77653 TAAATCTCTTGCTCATCAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCT
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* * * * * *
77718 TATATGAACTGAAATAATTATTTTATGCCTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTG
127 TATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTG
* ** * * * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACA-AATT-TTTTTTT
* * * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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1 AA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGGTA--AACAAATTT-TTTTT
** * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
** *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * **
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATTT-TTTTTTA
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* * * * * * ** *
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* **
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* * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAACAAA-TT-TTTTTTT
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* * * * * * * * *
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* * * **
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* ** * * *
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* * ** * *
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** * * * * *
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* * *
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* ** *
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62 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * *
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* * ** * * * * * ** *
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* ** **** *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAA-ATTTTTTTTTA
* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*
80292 AAATAGATATTTGTT
1 AAATAGATAATTGTT
80307 ATAATAATAA
Statistics
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TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATA
TGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATATTTG
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Alignment explanation
Indices: 68956--73915 Score: 658
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* * * *
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* * * ** *
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** *
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128 CATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTGAAAGCTAAATAACTGAGTA
* * *
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1 TTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGT
* * *
69190 ATTATTTTATTCTAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGT-TT
65 ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGATG-AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTATC
* * * * **
69254 GTAACAATTTGGAGTAGAAAATTGTTTAAATGGCTAAATTATTTGAAGTGA
129 ATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTGAAA--GCTAAA-TAACTG-AGT-A
* * *
69305 TTCGATAAACTAACTTATTTTTTAAATCT-TTAACTT-TTCAATTTTTGAATATTAATAAAGTAA
1 TTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATT-AATTTTTGAATATTAATAAATTAG
* ** * *
69368 TATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-AAAACAATCGTTTTATGATAAAACAAAAGGT
64 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATG-A-TGAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GT
* * * * * * * ** * *
69432 -T-AT-AC-TTCTTATAAATAGATAATTATTCAAATAGTTGTAACTATTTGAACTTG
126 ATCATAACAAT-TT-GAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG--CTAAATAACTG-A-GTA
* * * * ** ** * * *
69485 TTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTTATACTATTAATTTAGC
1 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAG-
* * * * ** *
69549 TA-TATTTTACTTC-GAATAACCTTGTATCAACAGAAACAATTTTTTTATGACT-AAAC-AAAG-
64 TATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTATATGATGA-AAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGT
** * * * ** * *
69609 ATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAATTATTTGAACTGG
126 ATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTG-AA-AGCTA-AA-TAACTG-AGT-A
* * * *
69664 TTTGATAAA-TAGATTTA-GTTTCAGA--T-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
1 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAG
* * ** * * * * * *
69723 TATTATTTTATTTTGAATAATTTTTTATAAAT-AGAAATAATT-TTTT-TCAACAAAACTAAATG
64 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATAT-GATGA-AAACAATTGTTTTAT-GATAAAAC-AAAAG
* * * * * * * ** * *
69785 T-T-ATAACTATTTAAAATAGAAAATAGCTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG
125 TATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTGAAA--G-C-TAAATAACTG-A-GTA
* * * *
69839 TTTGGTGAAC-AGATTTATTTTTTAAATCT-TTAATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
1 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTA
* ** *
69902 GCATTATTTTATT-TCAAATAAAATTATATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
63 GTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTATATG-ATGA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
* * * ** *
69965 -ATCATAACGATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTCA
125 TATCATAACAATTTGAAATAGAA-AATTGTT-GAA-AG-C-TAAATAACTG-AGT-A
* * * * *
70020 GTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTTCAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTA
1 TTCGA-TAAACTAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTA
* * * * *
70084 GTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATTAATAGAAATA-AA-TGGTTTATGACAAAACAAAAG
63 GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATA-TGAT-GAAA-ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
* ** * * * * ** * *
70147 -ATCACAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATG
125 TATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG-C-TAAATAACTG-A-GTA
70202 TTCAGA-AAAC-ATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
1 TTC-GATAAACTA-ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA-T
* ** * *
70263 TA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCT-TGAACAGAACCAATTGTTTTATGA-CAAACAAA
61 TAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTT-ATATGATGA-AAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AA
* ** * ** * * ** * **
70324 AAG-GTCAT-A-TTTTTAAAAATAGATCATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACA
122 AAGTATCATAACAATTT-GAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG-C-TAAATAACTGAGTA
* * * * ** * ** *
70379 TTGTTGGTAAA-TAAGTTAAATTTTTACTTCTCTTACTCATTAATTTTCAAAAATTAATAAA-TA
1 -T-TCGATAAACTAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTA
*
70442 GTATCTA-TTTGTT-T--ATAATGCTTATAATGAAACTG-AAACAATTGTTTTAT--TACAAACA
63 GTAT-TATTTTATTCTAAATAA-GCTTAT-ATG--A-TGAAAACAATTGTTTTATGATA-AAAC-
* ** * * * * * * * *
70500 AAAAG-GTC-TAATGATTTGAAATAAATAAAATATTCAATA-ATCAGAAT-TCTTTGAATTG
120 AAAAGTATCATAACAATTTGAAATAGA-AAATTGTTGAA-AGCT-A-AATAAC--TG-AGTA
* *
70558 TTC-AGTAAAC-ATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTATTGAAATATTTATAAATT
1 TTCGA-TAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTG-AATATTAATAAATT
* * * * * **
70619 AATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGGAACAATTGTTTTATGGCAAAACAGAAA
62 AGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATG-ATGA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACA-AAA
* * * * ** * *
70683 G--TCCTAACAATTTGAAATA-AATAATTATTCAATTAGTCATAAAGATTTGAACTTG
124 GTATCATAACAATTTGAAATAGAA-AATTGTTGAA--AG-C-TAAATAACTG-A-GTA
* * * * *
70738 TTTGGTAAAC-ATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACCTGTTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTA
1 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTA
* ** ** **
70800 -TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGA-ATGAACAGAAA-AATCATTTGGTGATAAAACAAAAGG
63 GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT-ATATGATGA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-G
*** * * * * ** * *
70862 T-T-ATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTA
125 TATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG-C-TAAATAACT-GA-GTA
* * * ** *
70916 TTTGGTAAAC-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAACTTAG
1 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
70980 TAATATTTTATT-TCAAATAAGCTAATATGAACT-AAAATAATT-TTTTATAACAAAACAAATG-
64 TATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTATATG-A-TGAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGT
* * ** * * * * * * ** * * *
71041 GTCACAATGATTTGAAATA-ATAGTTATTCAAATAGTCATGACTATTTCATTTTG
126 ATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG-C-TAAATAACTGA--GTA
* * * ***
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1 TTCGA-TAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAAT-AA--A
* * * ** ** * **
71158 TTAGTATTATTTTTATT-TGAATAAGCTTTTAT-AAGTAGAAATTATTGTTTCGTAATTGAACAA
60 TTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTATATGATG-A-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAA
* * * * * ** *
71221 AA-AAGCATAAGAATTTAAAATA-AATAATTACTCAAATAGTCATAACTTTTTGAACTG-GT-
122 AAGTATCATAACAATTTGAAATAGAA-AATT-GTTGAA-AG-C-TAA----AT-AACTGAGTA
* * *
71280 TT-GTTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGT
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* * * * * *
71340 ATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAATACAAAAG-ATC
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* * * * * * ** * * *
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* * * * *
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1 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAA-TTA
* * * * *
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* * * * ** *
71579 -A--AT---GATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTA
125 TATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTGA-A-AG-C-TAAATAACTG-AGTA
* * * * ** *
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1 -TTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAG
* * * ** * * **
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** * * * * * *
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*
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* * * * ** *
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* * ** **
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* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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** * * * * * ** * * *
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* * * * *
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1 TTCGATAAACTAATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA-TT
* * * * *
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* * * * * * **
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** * *
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* * * * *
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* * * * *
72474 AG-ATCTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTG-GT-
123 AGTATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG-C-TAA--A--T-AACTGAGTA
* * * * *
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* * * *
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** * * * * ** * *
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * *
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* *
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* *
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* * * * * * * ** * *
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* ** * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * ** * *
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** * * * ** * *
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1 TTCGATAAACTA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTA
* * ** ** * * *
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* * * * **
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124 GTATCATAACAA-TTTGAAATAGAAAATTGTT-GAA-AG-CTAAA-TAACTG--A--GTA
* * * ** * * * *
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1 TTCGATAAACTAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-T-GAATATTAATAAATTA
* * * *
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63 GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATG-ATGA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-G
* * * * * ** * *
73562 T-T-ATAACAATATGATATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG
125 TATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTG-TTGAA-AG-C-TAAATAACTG-AGT-A
* * ** *
73616 TTCGGTAAACAAATTT-TTTTCTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTCAAACATTAATAAATTAG
1 TTCGATAAACTAATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAG
* * * *
73676 TATTATTTGTATT-TCAAATAAGCTTCTA-CATTGAAAAGCAATTGTTTTATGAGAAAAAAAAAA
64 TATTATTT-TATTCT-AAATAAGCTTATATGA-TGAAAA-CAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAA
** * * * ** *
73739 GGTA--ATAACAATTTGAAATAGGTAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAACTGA
124 -GTATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTGAAA--G-C-TAAATAACTG-AGT-A
* * * * *
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1 TTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATA-AATTAG
* ** * * *
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* *
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* ** *
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*
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* * *
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* * *
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** * *
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* * * * **
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** * * **
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** *
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Matches are distributed among these distances:
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488 58 0.16
489 76 0.21
490 6 0.02
493 48 0.13
494 138 0.38
495 39 0.11
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (489 bp):
TTAACTTTTTGAAATATTAATACAATAGTATTATTTTATTTCGGATAAGCTTTTATAAACTAAAG
CAATTGTTTATGACAAAAAAAAGGACATAATGACTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
ATATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTCTCTTCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAA
ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTATTGGACTAAACAAA
AGGTCAAAATAATTTGAAATAGAAAATTATTCCAATAGTCTTAACAATCTGAACTAGTTCGCCAA
ACACATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTAATC
CAAATAAGCTTGTATGAGAAGAAACAATTGTTTTATGATGAAAACAAAATTCACAATGATTTGAG
ATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTTGCTTT
Found at i:74846 original size:175 final size:174
Alignment explanation
Indices: 74328--75599 Score: 669
Period size: 180 Copynumber: 7.1 Consensus size: 174
74318 TAATTTTTGA
* * ** ** * *
74328 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATAAACT-GAAACAATTATTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCCTATAAACTTTTATGAA-TAGAAATAATTATTTTA
* * * * * * *
74392 TGACAAAACAAAATG-TC-TAATGACTTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCA-AATATATT
64 TGATAAAA-AAAA-GATCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCACAT-GCTCATAA-CTATT
* * * **
74452 TAAACTTGTTCGATAAATAGATTT-TTTTAAAATCTCTTGCTCATTAAATTTT-TT
124 TAAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTC-T--T-ATT-AATTTTCAG
* * *
74506 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTTTATGAATTA-AAATAATTATTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCT--ATAAACTTTTATGAA-TAGAAATAATTATTTT
* * * * ** * * * *
74569 AGGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-CAATAG-TCTTAATTATCT
63 ATGA-TAAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAC-AT-GCTCATAACTATTT
* * ** **
74632 GAACTAGTTCGGTAAACACTTTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGG
125 AAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAG
* * * * *
74683 AATATTATTAAATTAGTATTGTTTTAATCCGTATAAGCTTTTATGAGA-AGAAACAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC-TATAAACTTTTATGA-ATAGAAATAATTATTTTA
* * * * *
74747 TGATGAAATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTCTTCACATACTCA-AACTATTTAAAC
64 TGATAAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCACATGCTCATAACTATTTAAAC
* *
74811 TAT-TTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAA
129 T-TGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAG
* *
74858 AATATTAATAGATTAGTATTATTTT-ATTCTA-AATA-TTTTGCATGAATAGAAATAATTATTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCTATAA-ACTTTT--ATGAATAGAAATAATTATTTT
* * * * ** * *
74920 AT--TAAAAAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAA
63 ATGATAAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCACATGCTCATAACTATTTAAA
* * *
74983 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCCAACCTATTAATGTTCAG
128 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCT----CTTATTAATTTTCAG
* * * * *
75034 AATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTAC
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC-TATAAACTTTTATGAATAGAAATAATTATTTTAT
* * * ** * * *
75099 GACAAAACATAAGATCGTAACTTTTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGGCATAATAACTATTTA
65 GATAAAA-AAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC--ACATGC-TCATAACTATTTA
**
75164 AACTTGCTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA--TCTTATTAATTTTTGG
126 AACTTG-TTCGGTAAACAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAG
* * ** * * * * *
75213 AATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAATACACTTGTATGAACAAAAACAATTGA-TTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCCTATAAACTTTTATGAATAGAAATAATT-ATTTTA
* * * * * * *
75277 TGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATTATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGA
64 TGATAAAA-AAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCACAT-GCTCATAACTATTTAA
* **** * * * **
75341 ACATGTTTAAAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTTCTTATTATTTTTTTG
127 ACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTT-AAA---TCTCTTATTAATTTTCAG
* *** * *
75393 AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAGTAAGA-TTGTATGAATAGAAACAATTATTTT
1 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCCTA-TAA-ACTTTTATGAATAGAAATAATTATTTT
* * ** * * * *
75456 CTGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAG-TCATAACAATTT
63 ATGATAAAA-AAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCACAT-GCTCATAACTATTT
* * * * * * *
75519 GAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATATCTTGCTCATTGACTTTT-GG
125 AAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTT-AA-ATC-T-CTTATT-AATTTTCAG
*
75574 AATATTAATAAATTAGTATCATTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
75600 TTTCAAATAA
Statistics
Matches: 875, Mismatches: 156, Indels: 123
0.76 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
172 57 0.07
173 29 0.03
174 27 0.03
175 75 0.09
176 104 0.12
177 81 0.09
178 69 0.08
179 163 0.19
180 171 0.20
181 50 0.06
182 9 0.01
183 30 0.03
184 2 0.00
185 8 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (174 bp):
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCTATAAACTTTTATGAATAGAAATAATTATTTTATG
ATAAAAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCACATGCTCATAACTATTTAAACTT
GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAG
Found at i:75362 original size:359 final size:354
Alignment explanation
Indices: 74799--75676 Score: 848
Period size: 359 Copynumber: 2.5 Consensus size: 354
74789 CACATACTCA
* * ***
74799 AACTATTTAAACTAT-TTCGGTAAACAAATTTA-GTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATA
1 AACTATTTAAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA--TCTTATTAATTTTTGGAATA
* ** * * *
74862 TTAATAGATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATATTTTGCATGAATAGAAATAATT-ATTT-TATTA
63 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTATA-TA
* * * * * *
74924 AAA-AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGT
126 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACATGT
*** *
74988 TTGGTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCCAACCTATTAATGTTCAGAATATTAATTAA-TTAGT
191 TTAAAAAACAGATTTATTTTTAAAAT-TCCAACCTATTAATGTTCAGAATATTAATAAATTTA-T
* *
75051 ATTATTTTATTCCAAATAA-ACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTAC-GACAAAACATAA-GA
254 ATTATTTTATTCCAAATAAGA-TTGTATGAATAGAAACAATTATTTT-CTGACAAAACAAAATG-
* * *
75113 TCGTAACT-TTTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGGCATAAT
316 TCATAA-TGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAACA-G--TAAT
75155 AACTATTTAAACTTGCTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTATTAATTTTTGGAATATT
1 AACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTATTAATTTTTGGAATATT
* * * *
75219 AATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAATACACTTGTATGAACAAAAACAATTGATTTATGACAAA
65 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-ACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTAT-ATAAA
* * *
75284 ACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATTATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTT
128 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACATGTTT
* **** * * * **
75349 AAAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTTCTTATTATTTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTA
193 AAAAAACAGATTTATTTTTAAAATTCCAACCTATTAATGTTCAGAATATTAATAAATTTATATTA
*** *
75414 TTTTATTTGGAGTAAGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAAT
258 TTTTATTCCAAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAAT
* *
75479 GATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAT
323 GATTTGAAATAAAAAATTATTCAAACAGTAAT
* * * * * * * *
75511 AACAATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATATCTTGCTCATTGACTTTTGGAA
1 AACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAA-ATC-T--T-ATTAATTTTTGGAA
* * * * * *
75576 TATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAA
61 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-CTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTAT-A
* * *
75641 TGAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAATAGATAATT
124 TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
75677 TTTAAAATCT
Statistics
Matches: 428, Mismatches: 72, Indels: 40
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
355 44 0.10
356 80 0.19
357 17 0.04
358 9 0.02
359 171 0.40
360 26 0.06
361 81 0.19
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (354 bp):
AACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTATTAATTTTTGGAATATTA
ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTATATAAAACA
AAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACATGTTTAAA
AAACAGATTTATTTTTAAAATTCCAACCTATTAATGTTCAGAATATTAATAAATTTATATTATTT
TATTCCAAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAATGAT
TTGAAATAAAAAATTATTCAAACAGTAAT
Found at i:75923 original size:313 final size:313
Alignment explanation
Indices: 75352--75933 Score: 712
Period size: 313 Copynumber: 1.9 Consensus size: 313
75342 CATGTTTAAA
* ** * * ** *
75352 AAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTTCTTATTATTTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTT
1 AAATAGATTAATTTTTAAAATTTTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTT
* *** * * * *
75417 TATTTGGAGTAAGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAATGAT
66 TAATCCAAATAAGATTCTATGAACAAAAACAATTATTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAATGAT
* *
75482 TTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTT
131 TTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTCAGTTT
* * *
75547 TTAAATATCTTGCTCATTGACTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAAGC
196 TTAAATATCTTACTCATTGAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAAGC
75612 CTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAAGATTTG
261 CTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAAGATTTG
*
75665 AAATAGA-TAATTTTTAAAATCTTTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAGTAAATTAATATTATT
1 AAATAGATTAATTTTTAAAAT-TTTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATATTATT
* *
75729 TTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACAAAAACAATTA-TTTCATGATAAAACAAAGA-GTCATAAC
65 TTAATCCAAATAAGATTCTATGAACAAAAACAATTATTTTC-TGACAAAACAAA-ATGTCATAA-
* * *
75792 T-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTC-GATAAATAGAGTT
127 TGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCAG-TAAATAGA-TT
* * * * * * *
75855 -GGTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTATCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTG
190 CAGTTTTTAAATATCTTACTCATTGAATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTC
* *
75917 AAATAAGCTTGTATGAA
253 AAATAAGCCTATATGAA
75934 TAGAAAAAAT
Statistics
Matches: 225, Mismatches: 36, Indels: 16
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
312 20 0.09
313 200 0.89
314 5 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (313 bp):
AAATAGATTAATTTTTAAAATTTTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTT
TAATCCAAATAAGATTCTATGAACAAAAACAATTATTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAATGAT
TTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTCAGTTT
TTAAATATCTTACTCATTGAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAAGC
CTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAAGATTTG
Found at i:77194 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 75674--81966 Score: 3562
Period size: 181 Copynumber: 34.8 Consensus size: 180
75664 GAAATAGATA
* * * * * * *
75674 ATTTTTAAAATCT-TTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAGTAAATTAATATTATTTTAATCCAA
1 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* ** * * * *
75738 ATAAGCTTCTATGAACAAAAACAATTATTTCATGATAAAACAAAGAGTCATAACT-ATTTGAAAT
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAAT
* * * * * * *
75802 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTCGATAAATAGAGTT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
** * * * *
75855 GGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-CA
* * * * *
75919 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAA-TAAAAGGCTATAGTGATTTGAAA
64 ATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTC-ATAATGATTTGAAA
* *** * * * * *
75982 TAGGTAATCACTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTCGATAAATAGATTC
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * * ** *
76036 AGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTGT-AGAATATTAATAAATTAGAATTAAGTTATTCCAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
** * * * * * * *
76096 ATAAGCACGTAGGAACAGAAACAATTATTTTGTGACAAAATAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATA
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
** * * * * * *
76161 TTTAATTGTTCAAACAGTTAAAACTATTTGCATTG-GTCAGGCT--A-AGATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTC-GG-TAAACAGATTT
* * * *
76211 ATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-AGAATATT-A-AAATTAGCATTACTTTATTCCAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* ** *
76273 ATAAGAC-TGTA-GCAA-TAGAAAAAAAAATTGTTTTATGAC-AAA-AAATGGTCATAACGATTT
64 ATAAG-CTTGTATG-AACT-G---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTT
* * * * * *
76333 GAAATAAATAATTGTT-AAATTA-TTATAACTAATTGAACTAGTTTC-ATAAATAGATTT
123 GAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-GATTCGGTAAACAGATTT
* * * *
76390 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* * ** * *
76450 CAAACTT-TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * *
76513 ATAATTATTCATATAGCCTTAACTAATTGAACT-AGTTTGGCAAACAGATTT
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTT
* * * *
76564 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
** * * * * *
76628 ATAAGCTTGTATGAACACAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGATTATTACGATTTGAAAT
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAAT
* * * *
76692 ATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGATAAATAGATTT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTT
* * *
76745 ATTTTTTAAATCTCCTACTCACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * * **
76810 TAAGCTTATATG-A-TGAAAAACAATTGTCTTATGACAAAAC-AAATGTTCATAACAATTTGAAA
65 TAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAA
* * * * **
76872 TAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAATTGATTT
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* ** *** * **
76926 ATTTTTTCAATCTCCAACTTGCCAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* * * * * *
76991 TAAGCTTTTATGAATTAAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAAGTCATAACGATTT-AAATAG
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * *
77055 ATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAATTCATTCGGTAAACA-ATTT
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* ** * *
77105 ATTTTTTAAAATTTCTTGTTTATTAGTTTTTTG-AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCA
1 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * *
77169 AGTAAGCATGTATGAGCTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACGGTTTGAAAT
64 A-TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * *** * *
77234 GGATACTTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACT-AGTTCAACAAACACATTA
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTT
* * * ** * * *
77287 ATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGTAATATTTTACTCCAAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * * *
77351 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAATACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATA
65 TAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * ** * *
77414 -AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTTTTTGAACTAATCCAATAAACATATGT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * * * **
77465 AGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* * * * ** *
77530 TAAGTTTCTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATGACAACTTT-ATATA
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA-TTTGAAATA
* *
77594 GATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAATTTG-TTCAGTAAACAGATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-CTGATTCGGTAAACAGATTT
* * * * * *
77646 ATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATCAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCA
* * * * * * *
77711 ATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATGCCTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATA
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* ** * * * * *
77776 AATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTTTGGCAAACACATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTT
* * * * *
77828 ATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTACTTTAATCTGA
1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCA
* ** * * *
77893 ATAAGCTTGTACGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TTATAATGATTT-AAGAT
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA-AT
* * *** * *
77956 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGTTTTTATGAACATATTT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* ** * * *
78009 AGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA
* * * *** *
78070 TAA--TTGTTTGAA-TGAAA-AATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTCAAATA
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
78131 GATAATTGTTCAAATGGACATGAGTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATATATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTT
* * *
78183 ATTTTGTAAATCTCCTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCA
* * * *** * * ** *
78247 ACAAACTTATATGAAAAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATA
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * *
78312 GAAAACTATTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAAGA-TT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAAC-AGATTT
* *
78364 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-A
* * * * * *
78428 ATAAGCTAGTGTGGATTGAAAAAATTGTTTTATGTCAAAAC-AAAAGATCATAATGATTTGAAAT
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAAT
* * * * * ** * * *
78492 AGATAATTAG-TCATATGGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGACAAAAAAAAATT
128 AGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCG-GTAAACAGATTT
* * * * * * *
78546 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATCATTTTATTTTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* ** * * * * * * * *
78611 TAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTATTAAGACAGAACAAAAAGTTATAATGATTTCAAGTAT
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * **
78676 ACAATTGTTTAAATTGTCAAAACTATTTAAACTGGTTTGGCGAACAGATTT
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* *
78727 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCAAT
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-
* ** * * *
78792 TAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTATATGATC-AAACAAAAAGTAATAATAATTTGAAATA
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * *
78856 GATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAGCTGATTCGATAAACAGGTTC
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
*
78908 ATTTTTTAAATCAT-TTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 ATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTC
* * *
78971 AATAAGCTT-TCATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT-AAAAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTTA
63 AATAAGCTTGT-ATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTGA
* * * *
79033 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAATTTATTTGGTAAACAAATTT
125 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * * **
79088 ATTTTTTTAAA-CTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTGTTATTTTATTTTGG
1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCA
* * * * * * * *
79152 ACAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAAAGTTATAACGATTTTAAATA
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * ** *
79217 AATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTT-AACTTG-CTCAATAAACAAATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTT
* * ** * * *
79268 ATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AA-GCTAATAAATTTGGATTATTTTATTCCA
1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
* * * * * * *
79331 AATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTAGAAA
63 AATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
* * ** * * * * *
79395 TAGATAATTATTTC-GATAGTTTTAACTATTT-AAATTAGTTTGATAAACACATTT
127 TAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTT
* * * **
79449 ATGTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTTA-ACCGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC--A
* * ** * ** * * *
79509 AAAAGATTCCATGATCAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGA-TCTTAATGATTT-AAGAC
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA-A-
* * * *
79572 TA-ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACCGGTTCGGTAAACATATTT
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
*
79625 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* ** * * * *
79690 TAAACTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAACTC
65 TAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
** * * * * * ** *
79754 GATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAATAAACATATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * ** ***
79806 ATTTTTT--ATTTTTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTC
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* * * * * * *
79869 TAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTATGACAAATCGAAAGGTTATAACGATTCT-AAATA
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATT-TGAAATA
* * * * *
79933 AACAATTGTTCACATAGTAATAACCATTTGAACTTG-TTCGGTAAACA-AGTTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGA-TTT
* * * * * *
79985 TTTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCA
* * * * * * * *
80049 ATAGGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTAAGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATA
64 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
80114 GATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCAGTAAACAAATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* *
80166 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTATTATTATTATT-TTAATC
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATT--T-
* * * * * * * *
80230 CGAATAAACTTGTACGAAC-AAAATAATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAA
62 C-AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
* * * * * ** *
80294 ATAGATATTTGTT-ATAATA---ATAATTGTTATAAAAC-AAAACAAAAAGTAATA-ATGATTT
126 ATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATT-T-GAACTGATTC----GGTAA-ACA-GATTT
*** * * * ** * * * *
80352 AAAATATATAGT-TGTT-CAAATGGCCATAATCATTTT-AACTGATTTGATAAACTGATTTATT-
1 ATTTTTTA-AATCTCTTACTTAT-----TAAT--TTTTGAAAT-A-TTAATAAA-TTA-GTATTA
* * * * * * *** *****
80413 TTTTAAATCTCTTACTTATTAGCTT-T-TGAAAT-ATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGA
54 TTTT--A--T-TT-C-AATAAGCTTGTATGAACTGA--AA-CAA-TTGTTTTATGACA-AAACAA
* * * ** * * ** * * * * *
80475 TAAG-CTTTTATGAACTAAAACAG-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAAT
107 AAAGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCATAACTATTTGAACT
*** * *
80538 AGATAATTATTCAAATAG-TCATA
163 -GAT--TCGGT-AAACAGAT--TT
* * * * * * * * ** *
80561 ACTATTTGAACTTAT-TCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCGCTTGCT-TATTA--ATT-TT
1 A-TTTTTTAA---ATCTC--TTACT-TA-TTAATTTTTGAAAT--ATTAATAAATTAGTATTATT
* * * *
80621 TTGAATGTT-AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATT
56 TT--AT-TTCAAT--A--AG----CTTGTA--T----GAA-C----------TGAAACAATTGTT
* * * * * * * * *
80685 ATATGACTAAACAAAAGGTCAGAAAGAATTGAAATAGATGAA-TATTCTAATAGTCTTAACTATT
93 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
80749 TAAACTGGTTCGGTAAACACATTT
157 TGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * *
80773 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAA
* * ** * * * * * * *
80834 TAAGCTTATATGATCAAAAACAATTGTTTTATGAGAATACAAAGA-TCATACCT-ATTTTAGATT
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA-ATGATTTGAAATA
* * * * ** * *
80897 GATATTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACCGGTTC-AAAAATAGCTTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * * * * * **
80948 AGTTTCTAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAATAGTATTATTTTATTTTGTA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAA
* * * * * * * * *
81013 TAAGTTTTTATAAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCATAATTACTTT-AAATG
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA-TTTGAAATA
* * * * * *
81077 GAAAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAAATTG-TTCAGTACACAAAGTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTG-AACTGATTCGGTAAACAGATTT
* * * *
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1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAT
* * * * * *
81193 AAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTAGAATAATTTGAAATAGA
66 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * ** *
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131 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
* *
81308 ATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
1 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* ** * *
81373 ATAAGCTTGTATGGAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAA-TCATAACGAGTTGAAAT
64 ATAAGCTTGTAT-GAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAT
* * *
81436 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-ATTTTC-GTAAATAGATTT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA--TTCGGTAAACAGATTT
* * * * *
81489 AGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA
* * * * ** *
81550 TAA--TT-T-TGCA-TG-AACAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCTTAACAATTTCAAATA
65 TAAGCTTGTATGAACTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *
81609 GATAATTGTTCAAATGGACATGAC-ATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTT
*
81660 ATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTA--TT-TTT---
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
81718 T--G-TTG-A--AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACT-ATTTGAAA
65 TAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAA
* * * * * *
81774 TAAATAATTGTTTAAGTAGCCATAACTATTTGAACTTACAT-GGTAAACAGATTT
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTT
* * * * * ** *
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1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* ** * *
81893 TACA-CTTATATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAAT
65 TA-AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAAT
81956 AGATAATTGTT
128 AGATAATTGTT
81967 AAGTCTAAGG
Statistics
Matches: 4717, Mismatches: 1066, Indels: 658
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 6 0.00
167 54 0.01
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191 3 0.00
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210 16 0.00
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213 5 0.00
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AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGA
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTT
Found at i:79718 original size:717 final size:719
Alignment explanation
Indices: 75675--81966 Score: 3791
Period size: 717 Copynumber: 8.7 Consensus size: 719
75665 AAATAGATAA
* ** * ** * * * **
75675 TTTTTAAAATCTTTAACTTATTAATTGTTAAAATATTAGTAAATTAATATTATTTTAATCCAAAT
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* ** * * * *
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66 AAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACAAACA-AAAG-GTTAGAA-TGATTTGAAATA
* * ** * * * * * **
75803 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTCGATAAATAGAGTTGGTTTTTAAATC
127 GATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTT-AAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA-C
* * * * **
75867 TTTTACTTATTAATTATCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT
190 -TCTACTTATTAATT-TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * ***
75931 GAAT-AGAAAA-AATTATTTTATGACAAAATAAA-AGGCTATAGTGATTTGAAATAGGTAATCAC
253 G-ATCA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
75993 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAA--TC-T-CTTA
314 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * ** *** *** * *
76053 TTAATTTGT-AGAATATTAATAAATTAGAATTAAGTTATTCCAAATAAGCACGTAGGAACAGAAA
378 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-AAAAA
* * * * * * * ** * * *
76117 CAATTATTTTGTGACAAAATAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATATTTAATTGTTCAAACAGTTAA
441 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
76182 AACTATTTGCATTG-GTCAGGCT--A-AGATTTA-TTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-
506 AATTATTTGAATTGATTC-GG-TAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ** * * *
76241 AGAATATT-A-AAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTA-GCAATAGAAAAAAAAATT
568 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAG-CTTGTATG-AATTG---AAACAATT
* * ** * *
76302 GTTTTATGAC-AAA-AAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTT-AAATTA-TTATAACT
627 ATTTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACT
* * * * *
76363 AATTGAACTAGTTTC-ATAAATAGATTTA-
691 ATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTAT
** * * * *
76391 TTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTTCAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAAC
1 TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* ** * * * *
76451 AAACTT-TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
66 AAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * *
76515 AATTATTCATATAGCCTTAACTAATTGAACTAGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
130 AATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA-CTC-T
* * * * *
76580 AGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
193 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATC
* * * * * *
76644 ACAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATTACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
257 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
76709 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCACTAATTTT
321 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
76774 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATGAAAAACAATTGTCT
386 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-AAAAAACAATTGTTT
* * * * *
76839 TATGACAAAACAAATGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTTG
450 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * *** * * ** ***
76904 AACTGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAACTTGCCAATTTTTGAAATATTAATAA
515 AATTGATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * *
76969 ATTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTAAAACAATTGTTTTAT-TATAAAACAA
580 ATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGT-CAAAACAA
* * * *
77033 AAAGTCATAACGA-TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA-TTCATTCGGT
644 AAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGT
77096 AAAC-AATTTAT
708 AAACAAATTTAT
* * * * *
77107 TTTTTAAAAT-TTCTTGTTTATTAGTTTTTTGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCAA
1 TTTTTTAAATCTT-TTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA
* * * * * *
77170 GTAAGCATGTATGAGCTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACGGTTTGAAATG
65 -TAAGCTTGTATGA-ATGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATA
* * * ** *
77235 GATACTTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCAACAAACACATTAATTTTTTAAATCT
127 GATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA-CT
* ** * *
77300 CTCACTTATTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGTAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGA
191 CT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG-
* * * * *
77364 AT-AGAAACAATTGTTTTATGATAATACAAAGATCATAATGATTTGAGATA-AAAATTGTTCAAA
254 ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
77427 TAGTCATAACTTTTTGAACTAATCCAATAAACATATGTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT
319 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * **
77492 TTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTCTATGAACTGAAACAATTGT
384 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-AAAAACAATTGT
** * * *
77557 TTTATGACAAAACAAAAAATCATGACAACTTTATATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTAT
448 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TAT
* * * * * * *
77621 TTGAATTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATCAATTTTTCAAATGTT
512 TTGAA-TTGATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * *
77685 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATGCCTAA
575 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCAAA
* * * * ** *
77750 ACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTT
640 ACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT
* * *
77814 TGGCAAACACATTTAT
704 CGGTAAACAAATTTAT
* * * * * *
77830 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTACTTTAATCTGAA
1 TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA
* * * * *
77894 TAAGCTTGTACGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-ATAAAGATTATAATGATTT-AAGATA
65 TAAGCTTGTATG-AATGAAACAATTATTTTATGACAAACA-AAAGGTTAGAATGATTTGAA-ATA
* * * ** * *
77957 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAA-T-GTTTTTATGAACATATTTAGTTTTTAAA-
127 GATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTT-AAACTAG-TTTGACAAACACATTTATTTTTTAAAC
** * * * ** *
78019 TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTGAATAA--TTGTTTGA
190 TCTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG-
* * * * *** *
78081 AT-GAAAA-ATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAA
254 ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * * *
78144 ATGGACATGAGTATTTGAACTTGTTCGGTAAATATATTTATTTTGTAAATCTCCTACTTATTAAT
318 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * *
78209 TTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAAAAAAAACATTT
383 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG-AAAAAAACAATT
* * * *
78273 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGAAAACTATTCAAATAATCATAATTA
446 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA
* * *
78338 TTTGAACTGGTTAGGTAAACAAGA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
511 TTTGAATTGATTCGGTAAACAA-ATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* ** * * * * * *
78401 TAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTGTGGATTGAAAAAATTGTTTTATGTCA
574 TAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCA
* * * * * * * *
78465 AAAC-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTAG-TCATATGGTCTTAACTATTTAAACTG
638 AAACAAAAAG-TCATAACGATTTTAAATAAATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
** * *
78528 GTTCGACAAAAAAAAATTA-
701 GTTCG-GTAAACAAATTTAT
* * * * * * *
78547 TTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAGTTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATCATTTTATTTTGAA
1 TTTTTTAAATCT-TTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA
* ** * * * * * * * * *
78611 TAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTATTAAGACAGAACAAAAAGTTATAATGATTTCAAGTAT
65 TAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACA-AACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAG
* * * * ** * * * *
78676 ACAATTGTTTAAATTGTCAAAACTATTTAAACTGGTTTGGCGAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
128 ATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA-CTC
* * * * *
78741 TTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCAATTAAGCTTGTATGAT
192 -TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAT
* * * * *
78806 CAAAAACAATTGTTATATGATC-AAACAAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAA
256 CAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * ** *
78870 TGGCCATAATTATTTGAGCT-GATTCGATAAACAGGTTCATTTTTTAAATCAT-TTACTTATTAA
319 TAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAA
*
78933 TTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-TCATGAATAGAAACAA
382 TTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAT-ATGAA-AAAAACAA
* * * ** *
78996 TTGTTTTATAAAAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AAC
444 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* * *
79060 TATTTGAATTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATAT
509 TATTTGAATTGATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * *
79125 TAAGAAATTAGTGTTATTTTATTTTGGACAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCAA
574 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCAA
* * *
79190 AACAAAAAGTTATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTT-AACTTGCT
639 AACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
**
79254 CAATAAACAAATTTAT
704 CGGTAAACAAATTTAT
** * * **
79270 TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAA-GCTAATAAATTTGGATTATTTTATTCCAAAT
1 TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* * * *
79334 AAGCTTGTAAGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTAGAAATAGA
66 AAGCTTGTATGA-ATGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGA
* * * * *
79399 TAATTATTTC-GATAGTTTTAACTATTTAAATTAGTTTGATAAACACATTTATGTTTTAAA-TCT
129 TAATTA-TTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAACTCT
* * * * **
79462 -CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTTA-ACCGAAAAAAGATTCCATGATC
193 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCC-AAATAAGCTTGTATGATC
* * *
79525 AAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGATCTTAATGATTT-AAGACTA-ATAATTGTTTAAAT
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** *
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* * *
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** * * * ** * *
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* ** * ** * **
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* * * * * *
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* * * * * * *
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*
79975 AAACAAGTTT-T
708 AAACAAATTTAT
* * *
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1 TTTTTTAAATCT-TTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA
* * *
80050 TAGGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTAAGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAG
65 TAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAG
* * * * * * *
80115 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACT-GATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
128 ATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGA-CAAACACATTTATTTTTTAAA-CT
* * * *
80179 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTATTATTATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTA
191 C-TACTTATTAATTTTTGAAATATTATT-AA--ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
80244 CGAAC-AAAATAATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATATTTGTTA
252 TGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-T-
* * **** ** * * * *
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* * * ** *
80371 ATGGC-CATAATCATT-TTAACTGATTTGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
366 AT--CTC-TTA-C-TTATTAA-T-TTTTG--AAA-T-A-TTA----ATAAAT-TAGTA-TTATTT
** ** ** * * * ** * **
80434 GCTTTTGAA-ATA--TTA-AT-AAAGTAGTATTATT-TTATTTTGGA-TAAGCTTTTATGAACTA
413 TATTTTGAATA-AGCTTATATGAAA--AAAACAATTGTT-TTAT-GACAAAAC--AAAAGGTC-A
* * * * ** *
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* * * * * *
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* * *
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564 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTAT
* * * * * * * * * * * *
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629 TTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
80748 TTAAACTGGTTCGGTAAACACATTTA-
693 TTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTAT
*
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1 TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGA
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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125 TAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAAACA-CATTTATTTTTTAAA
* * * * **** * *
80958 TATCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAATAGTATTATTTTATTTTGTATAAGTTTTTA
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* * ** * * * * * * *
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252 TGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * ** *
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507 ATTATTTGAATTGATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
81343 TATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATTCGAATAAGCTTGTATGGAA-AGAAACAATTGTTTTAT
571 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTAT-GAATTGAAACAATTATTTTAT
* ** * * * * *
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634 GTCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
81470 TATTTTC-GTAAATAGATTTA-
699 T-TGTTCGGTAAACAAATTTAT
* ** * *
81490 GTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTGAAT
1 TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* * * * ** *
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* * * * * * * * * *
81610 ATAATTGTTCAAATGGACATGAC-ATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTC
128 ATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA-CT-
* *
81674 CTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TT-----T--G-TTG-A-AA
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* * *
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255 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * ** * * * * * *
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318 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* ** * **
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382 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTATATGAA-AAAAACAAT
* * *
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81967 AAGTCTAAGG
Statistics
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Consensus pattern (719 bp):
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TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAAAAAACAATTGTTTTATGAC
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TAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAAT
TTAT
Found at i:80651 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 80399--81963 Score: 1316
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* * *
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* *
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* * * *
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** * * * * * *
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64 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
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* *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
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65 TTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * **
80886 TATTTTAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACCGGTTCA-
129 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * * * * * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * *
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* * * * *
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* *
81648 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
*
81713 ---T-TTTT---T--G-TTG-A--AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * *
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65 TTTATTTTGAATA-AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
*
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* * * * *
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* **
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* * *
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* * * * *
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* * *
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*
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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128 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTC-ACAAA-ATAGTTTATTTTTTAAAT
* *
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190 CTCTTGCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
* * * ** * * * *
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* * * ** * *
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* * * ** *
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* * * * *
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123 AAATAGATAATT
81964 GTTAAGTCTA
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TAACTATTTAAACTTGTTCGTAAACAA
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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*
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* *
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82303 A
1 A
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ATTAATATTTATAATAATT
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* *
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* *
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*
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*
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*
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* * *
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*
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89148 TAATAAATTA
*
89158 TAAATTATTAGTAATTATTTATAT
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*
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TAAATTATTAAAATTATTATAT
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AATTATTTATATTAATTTAA
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*
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*
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TTATAATTAATAAATAATTTAATAATATTAATACTATAA
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*
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*
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* * *
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1 TA
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TATATTTTAATTAATTA
Done.