Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168305.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_530, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  23862

Tables:   1   

This is table  1  of  1  ( 113 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
439--494
12
4.6
12
76
15
53
19
3
1
75
1.05
1174--1292
23
4.9
23
70
16
71
10
8
2
78
1.04
1173--1293
16
7.5
15
71
22
77
9
9
2
78
1.05
1669--1704
19
1.9
18
88
5
54
16
0
2
80
0.83
1990--2028
11
3.5
11
82
6
51
23
2
0
74
0.94
2074--2114
13
3.2
13
89
6
57
7
7
7
78
1.11
2066--2114
12
4.0
12
84
5
62
8
10
6
75
1.18
2066--2114
25
2.0
25
88
8
73
8
10
6
75
1.18
2456--2520
17
3.8
16
75
17
51
12
6
4
76
1.12
2529--2566
17
2.2
17
90
0
58
10
5
5
78
1.06
2812--2856
23
1.9
24
82
13
58
11
6
4
77
1.09
2896--2931
18
2.0
18
88
0
54
11
22
0
66
1.22
3201--3243
16
2.7
16
82
10
52
13
9
4
72
1.26
3256--3302
18
2.7
17
72
15
51
21
4
0
74
0.99
4344--4433
12
7.7
11
68
19
58
7
8
3
80
1.02
4293--4432
15
9.0
15
70
20
83
9
8
4
77
1.10
4585--4617
16
2.1
16
88
5
50
6
12
6
75
1.16
4714--4754
22
1.9
21
85
5
55
19
2
2
75
1.03
4845--4896
17
2.9
18
75
11
54
19
5
0
75
1.01
5184--5223
12
3.2
13
86
10
57
7
7
7
77
1.13
5176--5223
24
2.0
24
88
8
71
8
10
6
75
1.20
5565--5629
17
3.8
16
75
17
51
12
6
4
76
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5634--5675
18
2.3
18
87
0
57
11
4
7
76
1.15
6204--6263
21
2.8
21
76
20
61
10
6
5
78
1.08
6323--6365
16
2.7
16
82
10
52
13
9
4
72
1.26
6380--6428
19
2.7
18
73
14
55
20
4
0
75
0.96
6153--7328
593
2.0
580
81
10
1368
18
10
5
65
1.41
7356--7398
19
2.2
19
83
8
50
11
11
2
74
1.17
7423--7462
16
2.4
17
83
4
55
12
10
0
77
0.99
7522--7555
18
1.9
18
88
5
52
14
2
0
82
0.79
7423--7566
15
9.0
15
67
22
64
9
8
4
77
1.10
7467--7551
23
3.6
23
71
12
64
9
7
4
78
1.07
7720--7752
16
2.1
16
88
5
50
6
12
6
75
1.16
7849--7889
22
1.9
21
85
5
55
19
2
2
75
1.03
7981--8032
17
2.9
18
75
11
54
19
5
0
75
1.01
8318--8358
13
3.2
13
89
6
57
7
7
7
78
1.11
8310--8358
12
4.0
12
84
5
62
8
10
6
75
1.18
8310--8358
25
2.0
25
88
8
73
8
10
6
75
1.18
8697--8808
9
12.6
8
71
18
55
13
5
6
75
1.18
8906--8963
24
2.6
22
76
10
64
13
10
3
72
1.24
9458--9500
16
2.7
16
82
10
52
13
9
4
72
1.26
9515--9563
19
2.7
18
73
14
55
20
4
0
75
0.96
10489--10531
19
2.2
19
83
8
50
11
11
2
74
1.17
10556--10595
16
2.4
17
83
4
55
12
10
0
77
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10608--10668
22
2.7
21
74
20
52
8
9
4
77
1.13
11040--11091
17
2.9
18
75
11
54
19
5
0
75
1.01
11270--11329
17
3.5
18
77
8
63
23
5
0
71
1.05
11268--11332
30
2.2
30
81
10
82
24
4
0
70
1.06
11379--11419
13
3.2
13
89
6
57
7
7
7
78
1.11
11371--11419
12
4.0
12
84
5
62
8
10
6
75
1.18
11371--11419
25
2.0
25
88
8
73
8
10
6
75
1.18
11758--11869
9
12.6
8
71
18
55
13
5
6
75
1.18
11967--12023
23
2.6
22
76
15
64
14
10
3
71
1.25
12213--12255
15
2.8
16
86
6
54
16
13
0
69
1.19
12384--12443
21
2.8
21
76
20
61
10
6
5
78
1.08
12503--12545
16
2.7
16
82
10
52
13
9
4
72
1.26
12560--12608
19
2.7
18
73
14
55
20
4
0
75
0.96
13534--13577
20
2.1
20
83
8
52
11
11
2
75
1.15
13654--13713
22
2.7
21
76
19
59
8
10
5
76
1.14
13602--13741
15
9.0
15
67
20
67
10
8
4
77
1.12
13736--13779
19
2.3
18
82
17
54
22
4
6
65
1.35
13892--13923
15
2.1
16
88
11
50
6
12
6
75
1.19
13976--14030
20
2.9
19
77
17
60
12
14
0
72
1.12
14381--14428
16
2.9
16
77
14
53
18
6
0
75
1.01
14379--14439
29
2.2
27
82
11
70
21
4
0
73
1.01
14486--14526
13
3.2
13
89
6
57
7
7
7
78
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14478--14526
12
4.0
12
84
5
62
8
10
6
75
1.18
14478--14526
25
2.0
25
88
8
73
8
10
6
75
1.18
14868--14932
17
3.8
16
75
17
51
12
6
4
76
1.12
14937--14978
18
2.3
18
87
0
57
11
4
7
76
1.15
15349--15375
14
1.9
14
100
0
54
14
11
0
74
1.08
15519--15578
21
2.8
21
76
20
61
10
6
5
78
1.08
15638--15680
16
2.7
16
82
10
52
13
9
4
72
1.26
15694--15743
19
2.7
18
74
14
57
22
4
0
74
0.99
16071--16108
12
2.8
14
88
11
53
15
5
2
76
1.08
16164--16217
24
2.2
24
81
9
65
16
5
5
72
1.23
16656--16700
21
2.0
21
83
8
54
11
11
2
75
1.13
16722--16760
16
2.4
17
82
4
53
12
10
0
76
1.01
16765--16867
39
2.7
37
75
12
102
9
7
2
79
1.02
17478--17527
17
2.9
18
82
5
59
22
6
0
72
1.07
17585--17624
12
3.2
13
86
10
57
7
7
7
77
1.13
17577--17624
24
2.0
24
88
8
71
8
10
6
75
1.20
17780--17824
21
2.0
23
87
8
67
73
6
11
8
1.25
17868--17920
16
3.4
16
75
12
56
69
0
7
22
1.13
18237--18317
23
3.4
23
73
20
78
77
2
8
11
1.07
18431--18474
19
2.2
20
84
11
56
65
4
4
25
1.30
18431--18474
20
2.3
18
85
14
54
65
4
4
25
1.30
18476--18565
19
4.8
18
69
16
58
80
4
6
8
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18466--18608
14
10.1
14
68
19
66
78
4
7
9
1.08
18466--18610
24
5.7
25
68
14
82
78
4
7
9
1.07
18499--18557
23
2.6
22
80
15
66
77
5
10
6
1.10
18468--18565
38
2.7
35
72
12
81
80
4
7
8
1.01
18572--18611
16
2.4
17
83
4
55
77
0
10
12
0.99
18992--19034
22
1.9
23
85
4
61
69
0
6
23
1.12
19594--19643
17
3.1
16
77
8
57
76
0
4
20
0.95
19594--19678
27
3.2
28
74
14
81
75
2
7
15
1.12
19802--19843
18
2.3
18
80
15
50
76
4
4
14
1.12
20368--20407
17
2.4
17
87
8
55
75
5
5
15
1.15
20813--20849
10
3.4
11
88
11
58
75
8
8
8
1.19
20813--20858
22
2.1
22
88
8
67
73
6
10
8
1.23
20813--20853
12
3.6
12
81
18
52
73
7
9
9
1.26
20898--20967
17
3.9
18
72
10
56
71
1
5
21
1.15
20897--20959
30
2.2
29
83
13
78
71
0
4
23
1.05
20898--20957
18
3.5
16
76
14
57
71
0
5
23
1.05
21277--21335
12
5.0
12
74
12
50
79
1
5
13
0.97
21274--21335
17
3.5
17
76
8
61
80
1
4
12
0.94
21274--21334
25
2.3
26
84
13
81
81
1
4
11
0.90
21528--21611
22
3.7
22
74
15
64
78
3
9
8
1.07
21525--21612
11
7.7
11
70
13
54
79
3
9
7
1.03
21817--21871
28
2.0
28
82
7
67
67
1
12
18
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22699--22739
15
2.7
15
88
3
55
70
4
9
14
1.30
21753--22907
581
2.0
572
81
9
1355
65
5
10
18
1.41
23386--23472
15
5.6
17
69
20
57
75
5
5
12
1.15

Tables:   1

The End!