Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168339.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_561, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 22953
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Found at i:425 original size:177 final size:178
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Indices: 44--447 Score: 447
Period size: 177 Copynumber: 2.3 Consensus size: 178
34 ATAAAAAGTC
* *
44 ATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTCGATAAACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGA
* * * **** * *
109 TTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTAATTGTTTGAATATCAATAAATTTTCGTTATTTTATTTG
66 TTCATTTTTTAAATCTCTTA---TTTAATTGTTTGAATATCAATAAACTAGAATTATGTTATTTC
* * * *
174 AAATAAGCTTGTATGAATAGCAAAAATTCTTTTATAACAAAATAAAATGAT
128 AAATAAACTTGTATGAATAGCAAAAATTCATTTATAACAAAACAAAAGGAT
* * *
225 ATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-ATTTTAACTTGTTC-AGTAAACAT
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACA-
* * *
288 GATTCATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATTTTTTGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCA
64 GATTCATTTTTTAAATCTCTTATTTAATTGTTTGAATATCAATAAACTAGAATTATGTTATTTCA
* * * * * *
352 AATAAACTTGTATGAATAG-AAACAATTGATTTGTGATAACACAAAAGGTT
129 AATAAACTTGTATGAATAGCAAA-AATTCATTTATAACAAAACAAAAGGAT
* * * *
402 ATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
448 CATTGGGTAG
Statistics
Matches: 186, Mismatches: 33, Indels: 11
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
176 3 0.02
177 103 0.55
178 4 0.02
179 1 0.01
180 18 0.10
181 57 0.31
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGA
TTCATTTTTTAAATCTCTTATTTAATTGTTTGAATATCAATAAACTAGAATTATGTTATTTCAAA
TAAACTTGTATGAATAGCAAAAATTCATTTATAACAAAACAAAAGGAT
Found at i:1279 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 985--1503 Score: 401
Period size: 178 Copynumber: 2.9 Consensus size: 179
975 ACCCTTAACT
* * * * *
985 ATTTGAATTGGTTTCAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAATATTATT
1 ATTTGAACTGGTTTCAAACAAATTTATTGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAATATTAAT
* * * * *
1050 ATATTAGGGTTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTACGAACATAAATAATTGTTTTATGATAGAACA
66 ATATTAGGATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* *
1115 CAAGGTT-ATAACAATTTGAAATATATAATTATTCCAAGTAGTCATATCC
131 -AAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCCAAGTAGTCATATCC
* *
1164 ATTTGAACTGGTTTCAGTAACAGATTTATT-TTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTACATATTA
1 ATTTGAACTGGTTTCA--AACAAATTTATTGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAATATTA
** * * * * **
1227 ATA-ATTATTATTATTTTA-TTCTAAATAGGTTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
64 ATATATTAGGATTATTTTATTTC-AAAAAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
1290 ACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATGGCCATAAT-T
128 ACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCCAAGTAGTCAT-ATCC
* * * * * *
1341 ATTTAAACT-GATTCGATAA-ATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTAAAATA
1 ATTTGAACTGGTTTC-A-AACA--AATTTATTGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTT-AAATA
* * ** ** * *** * *
1404 TTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAATTAAGCTAT-TATGAATTGAAACAATTGTTTTATAAT
61 TTAATATATTAGGATTATTTTATTTCAAAAAAGCT-TGTACGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * *** *
1468 AAAATAAAAGGTCATAATGGTTTTAAATAGATAATT
125 AAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
1504 GTTCAAATAC
Statistics
Matches: 277, Mismatches: 49, Indels: 26
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 7 0.03
177 33 0.12
178 90 0.32
179 32 0.12
180 29 0.10
181 81 0.29
182 4 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (179 bp):
ATTTGAACTGGTTTCAAACAAATTTATTGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAATATTAAT
ATATTAGGATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
AAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCCAAGTAGTCATATCC
Found at i:1463 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 17--1687 Score: 700
Period size: 181 Copynumber: 9.3 Consensus size: 179
7 GAACAAAAAT
* * * *
17 AATTGTTTTATGAA-AAAATAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTAT-AATAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCAT
* * * ** * * * *
81 AACTATTTGAACTTTTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTAATTGTTTGAA
64 AACTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATT-TTTAAA
* ** * * *
146 TATCAAT-AAATTTTCGTTATTTTATTTGAAATAAGCT-TGTATGAATAGCAAA-
128 TATTAATAAAATAAT-ATTATTTTATTT-CAATAAGCTATGTATGAATTG-AAAC
* * * * *
198 AATTCTTTTATAACAAAATAAAATGAT-ATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATAATAAAA-AAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCAT
* * * * * *
262 AAC-ATTTTAACTTGTTC-AGTAAACATGATTCATTTTTTAAATCTCTTA--T-TAATTTTTTGA
64 AACTATTTAAACTTGTTCGA-TAAATA-GATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTTAA
** * * *
322 ATATTAATAAGCTAGA-ATTATGTTATTTCAAATAAACT-TGTATGAATAGAAAC
127 ATATTAATAAAATA-ATATTATTTTATTTC-AATAAGCTATGTATGAATTGAAAC
* * * * * * * *
375 AATTGATTTGTGATAACACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATCATA
1 AATTGTTTTATAATAA-AAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATA
* ** ** * * * * *
440 AATATTTGCA-TTGGGTAGGCT-AACAGATTCATTTTTTAAAT-TCATTAGTTATTAAA-TTTTA
65 ACTATTTAAACTT--GTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-CTACTTA-TAAATTTTTA
* ** * * * * * *
501 GAATATTAATAAATTAGCATTACTATATTCCGAATAAGAT-TGTATGACTAGAAAC
126 -AATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTC-AATAAGCTATGTATGAATTGAAAC
** * ** * * * *
556 ATATTCGTTTTATGACCAAACACTAGGTCATAAC-AATTGGAATAACATAATTGTTCAAATAAGT
1 A-ATT-GTTTTAT-AATAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAAT-ACT
* * * * * * * * *
620 TA-AACTATTTGAGCTAAT-TTAG-TAAACAAATTTTATTTTTTAACCTCTCTTAC-TATTAATT
61 CATAACTATTTAAACT--TGTTCGATAAATAGA-TTTATTTTTTAA-ATCTCCTACTTATAAATT
* * * * * * *
681 TTCAAAATAGTAAT-AAATTATATTATTTTATTCTGAACAA---ATGTATTTGAA--AAAAA
122 TT-TAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATT-TCAATAAGCTATGTA--TGAATTGAAAC
* * * * * *
737 AATT-TTATTTTAGACAAAACAACAAGGACATAACGGTTTGAAATCGATAATTGTTCCAAATAGT
1 AATTGTT-TTATA-ATAAAA-AA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATACT
* ** * * * * * * *
801 CATAAGTATTT--GGTGGTTC-AGCAAATGGAATTA-TTTTTAAATAT-CT-TTTACTAATTTTT
61 CATAACTATTTAAACTTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTA-TAA-ATTT
** * * * * * * * *
860 TTAAATATTAATACGAT-TTGTTTTATTTACTTTGAATAAG-T-TGACTAAGAACTAAAAA
123 TTAAATATTAATAAAATAATATTAT-TTTA-TTTCAATAAGCTATG--TATGAATTGAAAC
* * * * * * * *
918 AATTGTTTTATAATAAAACAAATGTCGTAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATACCCTTAA
1 AATTGTTTTATAATAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAA
* * * * * *
983 CTATTTGAA-TTGGTT---TCAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAT
66 CTATTTAAACTT-GTTCGAT-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTTAAAT
* * * *** * * * *
1044 ATTATTATATTAGGGTTATTTTATTTCAAAAAAGCT-TGTACGAACAT-AAAT
129 ATTAATAAAATAATATTATTTTATTTC-AATAAGCTATGTATGAA-TTGAAAC
* * * * * * * * *
1095 AATTGTTTTATGATAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTATTCCAAGTAGTCAT
1 AATTGTTTTATAATA-AAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATACTCAT
* * * * * * *
1160 ATCCATTTGAACTGGTTTC-AGT-AACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTAC
64 AACTATTTAAACTTG-TTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTTAA
* * * * *
1221 ATATTAAT-AATTATTATTATTTTATTCTAAAT-AGGTTTGTATG-A-TGAAAAAC
127 ATATTAATAAAATAATATTATTTTATT-TCAATAAGCTATGTATGAATTG--AAAC
* * * *
1273 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGC-CAT
1 AATTGTTTTATAATAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-ACTCAT
* * * *
1337 AATTATTTAAAC-TGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTAAA
64 AACTATTTAAACTTG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTT-AA
*
1401 ATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAATTAAGCTAT-TATGAATTGAAAC
127 ATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAA-TAAGCTATGTATGAATTGAAAC
* * *
1454 AATTGTTTTATAATAAAATAAAAGGTCATAATGGTTTTAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATA
1 AATTGTTTTATAATAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATA
* * * * * ** *
1519 ACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCGTGGTTATTAAATTTTTGAAT
65 ACTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTA-TAAATTTTTAAAT
* * * *
1584 GTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-ATGTATGAACTTAAAAC
129 ATTAATAAAATAATATTATTTTA-TTTCAATAAGCTATGTATGAA-TTGAAAC
* * * *
1636 AATTATTTTATAATTAAAAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATATATAATTGTT
1 AATTGTTTTATAATAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
1688 TTAATAGTCT
Statistics
Matches: 1129, Mismatches: 258, Indels: 206
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 15 0.01
177 205 0.18
178 217 0.19
179 72 0.06
180 80 0.07
181 356 0.32
182 74 0.07
183 71 0.06
184 30 0.03
185 5 0.00
186 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AATTGTTTTATAATAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAA
CTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTTAAATAT
TAATAAAATAATATTATTTTATTTCAATAAGCTATGTATGAATTGAAAC
Found at i:2226 original size:181 final size:173
Alignment explanation
Indices: 1744--2244 Score: 449
Period size: 181 Copynumber: 2.8 Consensus size: 173
1734 TTAAATCGTT
* * * *
1744 AAATACTACATTTATTAATCTTTTCAAAATTAATAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAATCTATTTA
1 AAATAATA-ATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTA
* * * * * * *
1809 CCAAACCAATTTAAGTAGTTATGATTATTTAAATATTGTATACCTTGAAATCATTATAACCTTTT
64 CCAAACTAATTCAAATAGTTATGATTATTTAAA-ATTATATA-TTTAAAATCATTATGACCTTTT
* **
1874 GTTTCGTA-AT-AAACAATTATTTTGTTCATACTAGCTTATTCAAAAA
127 GTTTTG-ACATAAAACAATTATTTAATTCATACTAGCTTATTCAAAAA
* * * * * *
1920 AAATACTAATCTAATAATATTCCTAAAATTAATACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-T-TTTAT
1 AAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTAC
* * * * * * *
1983 CGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
65 CAAACTAATTCAAATAGTTATGATTAT-TTAA-AATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
*
2048 TTTTGACATAAAACAACTT-TTTCAATTTATACTAGCTTATTCGGAATAAA
128 TTTTGACATAAAACAA-TTATTT-AATTCATACTAGCTTATTC--AA-AAA
2098 ATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATT
1 A-AATAAT-AATTTATTAATATTTCAAAA-TTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATT
* * * * **
2161 TACCTAACTACTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTT
62 TACCAAACTAATTCAAATAGTTATGATTATTT-AA-AATTATATATTTAAAATCATTATGACCTT
* * *
2226 TTATTTTGTCATATAACAA
125 TTGTTTTGACATAAAACAA
2245 ATGTTTTTGA
Statistics
Matches: 263, Mismatches: 45, Indels: 29
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
172 1 0.00
173 50 0.19
174 22 0.08
175 57 0.22
176 8 0.03
177 2 0.01
178 10 0.04
179 24 0.09
180 20 0.08
181 69 0.26
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (173 bp):
AAATAATAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTACC
AAACTAATTCAAATAGTTATGATTATTTAAAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT
TGACATAAAACAATTATTTAATTCATACTAGCTTATTCAAAAA
Found at i:2269 original size:84 final size:84
Alignment explanation
Indices: 2170--2336 Score: 316
Period size: 84 Copynumber: 2.0 Consensus size: 84
2160 TTACCTAACT
2170 ACTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
1 ACTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
2235 CATATAACAAATGTTTTTG
66 CATATAACAAATGTTTTTG
*
2254 ACTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAGTTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
1 ACTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
*
2319 CATATAACAACTGTTTTT
66 CATATAACAAATGTTTTT
2337 ATTCATATAA
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 2, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
84 81 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.09, G:0.08, T:0.49
Consensus pattern (84 bp):
ACTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
CATATAACAAATGTTTTTG
Found at i:2817 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 2256--6518 Score: 3081
Period size: 181 Copynumber: 23.8 Consensus size: 180
2246 TGTTTTTGAC
* * * * * * *
2256 TTCAAATAATTATGATTATTTGAACAGTTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
2321 TATAACAACTGTTT-TTATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTTACATT
66 TAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*** * * * * *
2384 TTGAAAATTAAT-AGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG
129 CCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * * *
2436 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
2501 CAAAACAATCTG-TTC-ATT-A-A-AA-ATTATTTAGACTAAAATAATACTGATCTATTAATATT
66 TAAAACAAT-TGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * * *
2560 -TTAGAA--ACTCA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTCA-CGAAAGCAA-
129 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCG-AA-CAAG
* * * * * *
2608 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATATCAAATGGTTATGATC-TTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
2672 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * **
2737 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAATAAGTGGT-TTTGTTGAATTAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAAT-CTATTTATCGAACAAG
* * ** * * *
2789 TTTAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTT-TTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTC
* * * *
2853 ATAAAACAATTATTTCAGTTT-ATGCAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTC-TTTTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * **
2917 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAGTGGT-TTTGTTGAATTAG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTATCGAACAAG
* * ** * * *
2970 TTTAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTT-TTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTC
* * * * *
3034 ATAAAACAATTATTTCAGTTT-ATGCAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
65 ATAAAACAATTGTTTC-TTTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *
3098 TTAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAACATAAATCTATTTA-CTGAACAAG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTATC-GAACAAG
* * * * **
3152 TTCAAATAGGTT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-ATAGA-CATTACGAATTTTTGTTTTG
1 TTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-A-ATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * *
3214 TCAAAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATA
63 TCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
3279 TTTCAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAG
127 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * *
3333 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATAGTTATGATC-TTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * ** *
3397 TAAAACAATTGTTT-TTGTCCATACAATCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
3461 -CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCCG
129 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * **
3512 TTCAAATAGTTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTATTTAATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * *
3577 TAAAATAATTGATTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAAAATT
66 TAAAACAATTG-TTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
3641 -TATAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAA
129 CCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * *
3694 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
3759 TAAAACAATTGTTTCAGTTTT--TAAAAGTTTATCCAAAATAACATAATATTAGTTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTC--TTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * *
3822 TTCAAAAATTGAGAAGTTGGACATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATC-AG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAG
* * * * * * * * * *
3875 TTCAAATAATTATGGCAATTTAAATAATTATCTGTTTCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGCCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** *
3940 TAAAACAA-T-TTT-TTTTCATTATAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCA-TA-CAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
4002 TTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * *
4055 TTCAAATAGTTATGACTATTTTAACTATTATATATTTAAAATCGTTA-CACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
4119 TAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTA
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
** * ** * * * *
4184 TGAAAATTAGTATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * *
4235 TTCAAATAATTAAGGA-TA--TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTC
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
4297 ATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATATAAGTTTGTTAAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*** * * *
4361 TTTGAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * *
4410 TTCAATTAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTATTGCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** * * *
4475 TAAAATAATTTTTTCTATTAATACGATATTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTAATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * *** * *
4540 TAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAATGAATATGTTGGCCTAACCAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * * *
4591 TGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTC-
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * *
4655 -ACAACAATTGTTTCTATTCCTATAAGCTTATTTGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT-
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * *
4718 C-TAAA--AATAA-T-AGAGATTTAAAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
*** * * * *
4764 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTA-CTATCTT-AAATTGCTATAACCTTTGGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
4827 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTAATTAAAAAAATACAAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * * *
4892 -CAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACAACGCTATTTATTGAATAAA
129 CCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * ** *
4944 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAGTTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *
5009 AAAAACAAATT-TTT-TTGTTCGTAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATAT
66 TAAAAC-AATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
5071 TTCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGTACAAG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * * **
5124 TTCGAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
5189 TAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * *
5254 CAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAA
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
** * * * * *
5305 TTTGAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
5370 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCCAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * *
5434 CCAAAAAATTAATATGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACACA-
129 CC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACA-AG
* *
5486 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * *
5551 TAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * *
5616 TAAAAA-T--TAA-T-A-AGATTTAAAACAATAAATCTATTTACCGAGCAAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * *
5662 TTTAAATAGTTCTTATGCCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTG
1 TTCAAATAG---TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
5727 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATATGTTTACTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
63 TCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
5792 TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAG
127 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * * * * *
5845 TTTAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * * *
5910 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
** * * * * *
5975 TGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAAAAATAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACA-AG
* * * * * **
6023 TTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTCATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
6086 ATAAAACAATTGTTTCCTTTCATATAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
6151 CCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTA-CCAA-AATCG
129 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA--G
* * * * * * * * *
6199 ATTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATTATCTACTTCAAATTGTTTTGACCTGTTGTTTAGTT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
6264 ATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAGAATGAAACAATACTAATTTATTAACAT
65 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
6328 TCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AATATATATTTATCGAACAAG
128 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTATTTATCGAACAAG
* * * * * *
6381 TTCGAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAAGTCATCA-AACCTTTTGTTTTAT
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * *
6443 CATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACCACTTTATTAAT-T
64 CATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
6507 TTCAAAAATTAA
128 TCCAAAAATTAA
6519 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 3273, Mismatches: 675, Indels: 271
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
170 2 0.00
171 22 0.01
172 94 0.03
173 56 0.02
174 62 0.02
175 79 0.02
176 85 0.03
177 259 0.08
178 138 0.04
179 371 0.11
180 745 0.23
181 889 0.27
182 413 0.13
183 45 0.01
184 7 0.00
185 6 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
Found at i:3606 original size:542 final size:536
Alignment explanation
Indices: 2256--22809 Score: 7329
Period size: 542 Copynumber: 38.5 Consensus size: 536
2246 TGTTTTTGAC
* * * * * ** *
2256 TTCAAATAATTATGATTATTTGAACAGTTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * * * * * * * * *
2321 TATAACAACTGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTTACATTT
65 TAAAACAA-TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * * * * *
2385 TGAAAATTAAT-AGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT
129 T-AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAA
* * * * * *
2449 GTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTGTTTTA-TCACAAAAC-A--AT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTAT
* ** * * * * * * * *
2510 CT-GTTCATTA-AAAATTATT-TAGACTAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTAGAAACTCAT
256 TTAGTTCA-TACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT
* * * * *
2572 ---AAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTCAC-GAAAGCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAA
319 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG-AA-CAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAA
* ** * ** * * * * *
2632 CAATTACCTATATCAAATGGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATAT
381 TAATTTTCTAT-TTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAA
* * *
2696 AAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTA
445 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-
* * * * ** **
2761 AAAAAAATAAGTGGT-TTTGTTGAATTAG
509 TAAAAAATAAAT-CTATTTATCAAACCAG
* * ** * * * *
2789 TTTAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTATTTT-GTCA
** * * *
2854 TAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * *** * *
2918 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAGTG-GTTTTGTTGAATTAGTTTAAATAGTTA
128 -CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG-TTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
** * * * *
2982 AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTAT
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTAT
* * ** *
3047 TTCAGTTTATGCAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATG
256 TT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-
3112 AGCAAGAGATTTAAAAACATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGGTTTGACTATTTGAAT
319 AGCAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATA-GTTTGACTATTTGAAT
* * * **
3177 AATTTTCTATTTATAGA-CATTACGAATTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTCAATTCATAA
382 AATTTTCTATTTA-A-ATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAA
* * * * *
3241 AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTT
445 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* *
3306 AAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAG
510 AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * *
3333 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAAT-AGTTATGATCTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATCTTTATTTTGTCA
* * * * * * **
3397 TAAAACAATTGTTTTTGTCCATACAATCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTC
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
** * **
3462 TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCCGTTCAAATAGTTAAGA
129 TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *
3527 CCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTATTTAATCATAAAATAATTGATTT
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-ATTT
* * * * *
3592 AGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAAAATTTATAAAATTAATAAGC
258 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AGC
* ** * *
3657 AAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
322 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATAAT
* * * * * * **
3722 TATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTAT-AATAAAACAATTGTTTCAGTTTTTAAAAG
385 TTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAA-AAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAG
* * * * * * * ** *
3786 TTTATCCAAAATAACATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGACATTTAAA
448 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* *
3851 AAATAAATCAATTTATCAAATCAG
513 AAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * * * *
3875 TTCAAATAATTATGGCAATTTAAATAATTATCTGTTTCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGCCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * *
3940 TAAAACAA-TTTTTT-TTCATTATAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTTTTTTGTTCA-TA-CAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-T
* * * * * *
4003 TCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAT
127 TCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAA
* * * * * * * *
4068 GACTATTTTAACTATTATATATTTAAAATCGTTA-CACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATT
* * ** * *
4132 TATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATA-TTATGAAAATTAGTA
257 TA-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAAATTAATA
* * * * * * * ** *
4196 TCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GTCGAACTAGTTCAAATA-ATTAAGGATATGAATA
320 GC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAATA
* * * * * * *
4259 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAA
383 ATTTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAA
* * * **
4324 GTTTGTT-AAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--G--AGAGATTTA
447 GCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* *
4384 AAAAATAAATCTATTTACCAAACTAG
511 AAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * *
4410 TTCAATTAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTATTGCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * ** * * *
4475 TAAAATAATTTTTTCTATTAATACGATATTATTCAGAATAAAGTAATGCTAA-TTAATTAATATT
65 TAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAA-TAATATT
* * * * ** * * * **
4539 CTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAATGAATATGTTGGCCTAACCAGTGCAAATAGTTTT
128 CT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAA
* * * * * * * *
4604 GATTGTTTGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTC--ACAACAATTGTT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-AT
* * * * * *
4667 TCTA-TTCCTATAAGCTTATTTGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCT-AAAAA-TAAT
256 T-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAAT
* * * * * * * *
4729 ----AGAGATTTAAAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTG
319 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATA
* *** * * * * * *
4790 A-TTACTATCTTAAATTGCTAT-AACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACA
383 ATTTTCTAT-TTAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAA
** * * * * *
4853 AGCTTATTTTAATTAAAAAAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTT
446 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** ** ** *
4917 AAAAAACAACGCTATTTATTGAATAAA
510 AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* *
4944 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAGTTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTCA
* * * * * * *
5009 AAAAACAAATTTTTTTGTTCGTAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATT-
65 TAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * * * * * * *
5072 TCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGTACAAGTTCGAATAGTCAT
129 T-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA-
* * *
5137 A-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTCA-TCATAAAACAATTA
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-AGTCATAAAACAATTA
* * * * **
5200 TATCT-GTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
255 T-T-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAA
* * * * **
5264 TGAGCAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAATTTGAATAGTTATGACTATTTGAA
318 T-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAA
* * *
5329 TAATTTTTTATTTCAAATCATTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATA
381 TAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * *
5393 TAAGCTTATTCCAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATATGTAA-AAA
444 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
*
5456 TTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACACA-
507 TTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAAC-CAG
* *
5486 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTATTTTGTC
** * * ** * *
5550 ATAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * * *
5615 TTAAAA--ATTAA-T-A-AGATTTAAAACAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTCT
128 CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG---T
* * * * * * *
5675 TATGCCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
189 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * *
5740 GTTTCTA-TTCATATATGTTTACTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
254 -ATT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATT
* * * ** * * * *
5803 AATAGGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTG
316 AATA-GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGT-TTGACTATTTG
* * *
5867 AATAATTATT-TATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTT-TTAATAAAACAATTGTTTCTGTTC
379 AATAATT-TTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAA-AAAACAATTGTTTCTGTTC
* * * * * **
5930 ATGCAAAA--TTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAA-T--TAA-TAAG
441 AT--AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * **
5989 AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAAAAATAG
504 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC--AAACCAG
* * **
6023 TTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATCTTTATTTCATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCA
* *
6087 TAAAACAATTGTTTCCT-TTCATATAAGCTTATTC-GAATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 TAAAACAATT-TTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * * *
6150 TCCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAAATCGATTCAAATAGTTA
127 TCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAG-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
6212 GGACTATTAGAATAATTATCTACTTCAAATTGTTTTGACCTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTAT
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTA-
* * * * *
6277 TTTAATTCATACAAGCTTATTC-AGAATGAAACAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT
255 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT
* * *
6341 GAGCAAGAGATTTAAAAAA-AATATATATTTA-TCGAACAAGTTCGAATAGATTTGACTATTTAA
319 -AGCAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTTGACTATTTGA
* * * * *
6404 ACAATTATCTATTTAAAGTCATCA--AACCTTTTGTTTTATCATAAAAA-AATTGTTTCAGTTCA
380 ATAATTTTCTATTTAAA-TCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCA-AAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * *
6466 TAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACCACTTTATTAAT-TTTCAAAAATTAAAAAGCAAGTTA
442 TAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG--A
** * * * *
6530 TGACTATT--TGAATAAATGTCA-ATATTAAATCA-
505 -GA-T-TTAAAAAATAAATCT-ATTTATCAAACCAG
* * * * * * * * ** * **
6562 TT-ATGAT-CTT-TGTCT-TCTCATAAAATAAT-TATTTCTAATCA-TACAAGC-TTATTCAGAT
1 TTCA-AATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTATTTTG-T
* * * * * * ** * * *
6620 AAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TA-AAACTCAATAAGAGACTTAAAAAAATA--AATGT
63 ---CATAAAAC-AATTT-TT-TTGTTCATACAAGCT-TATTCG-GA-ATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
6681 -GT--T-TGCTGAACCAGTTCAA-ATAGTTAAGA-CTATT--AGAAT-AAT-T-TTT----AA-T
119 AATAATATTCT-AA--AATT-AATA-AG-TAAGAGAT-TTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACT
* * * * * ** * ** *
6730 --TTCAAATCATTTTAA-CCTTTTATTTAGTCATAGAATAAT-TGTTTCAGTTC-ATACAAGCTT
177 AGTTCAAAT-A-GTTAAGAC---TATTT-G--A-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
** ** * * * ** **
6790 ACTTGGAATA-AAATAACACTAATTTATTAACATTCA-A-AAAATTAATAAGCAAGATATTTGAA
233 --TT-GTTTAGTCATAAAAC-AA-TTATTTA-GTTCATACAAGCTT-ATTCG-AA-ATA----AA
* * ** * * * * * * *
6852 AAAATA--AATTTGTT--TATCGAACAAATTTGAATAGTTATGATGATTTGAACAAT-TATCAAT
285 ATAATACTAATTTATTAATATTTAA-AAAATT-AATAG-CAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTAT
* *** * * * **
6912 TTA--AAATC-A-TT-ATAACCTTTTG--T-TTTGCCATAAACAATTGC--TTTAGTTCA-TA--
346 TTACTGAA-CAAGTTCA-AATAGTTTGACTATTTG--A-ATA-ATTTTCTATTTAAATCATTATG
* * * ** * * * *
6964 AA--ATT-TTAT-CCAAAATAA-AA-TAATACTATT-GTATTAA---TATTTCAAAAGT----TA
405 AACTTTTGTTTTGTCAAAA-AACAATTGTTTCTGTTCATA-AAAGCTTA-TTCAAAA-TAAAATA
** ** * * *
7015 ATAGGAGATTTA--AA-AAAT-AAATCAATTCGAATAATTATG-GCCATTTAAACAACT--ATCT
466 ATACTA-ATTTATTAATATTTCAAA--AATT--AATAAGTAAGAG--ATTTAAA-AAATAAATCT
**
7073 A-TT-TCAAA-TTG
523 ATTTATCAAACCAG
* * * * * * * *
7084 TT--ATTACTTTTTG-TTTTCTCCTGAAACAATT-GCT-TTTC-AAT-A-TA-GAAGC-CTA-TT
1 TTCAAATA-GTTATGACTAT-T--TG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ATCTTTATTT
**** * ** ** * * * * *
7138 CAAAATAAAATAATACTAAT-TT-A-ATAA---TATTTCAAGAAT-TAATAATA--GATTTAAAA
60 TGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTC-GGAATAAAATAATACTAATTT-AAT
* ** ** ** * * * * * * * *
7194 AATAAATCT--GTTTACCAA--ACCAG-TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATATCTATTT
122 AAT-ATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG--TGTTT-ACCGA-A-CTAGTT
* ** *** * * * * ** **
7253 CAAATTGTTATA-ACCT-TTTGTTC---TATC-ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTA
181 CAAATAGTTA-AGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCG-TTATG-ACCT-TTTGTTTA
* * * * * * *
7312 TTCA-AAATAAAATAATACTAATTTAGTA-ATA--TT-TT-GAAAATCAATAACTAAGA--AATT
240 GTCATAAA-ACAATTAT-TTAGTTCA-TACA-AGCTTATTCG-AAAT-AA-AA-TAATACTAATT
* * * * * ** ** *
7369 TA--AA-A---AATAAATCTATTTGCTAA-ACTAGTTCAAATAGTTAAGA-CTACATGAACAATT
297 TATTAATATTTAAAAAAT-TAATAGC-AAGA-GA-TTTAAA-AAATAA-ATCT--ATTTAC--TG
*** * * * ***
7426 ATTTATTTCAAATTGTTATGATCT-TTTG-----TTTTCTCA--TAAAACAATTATCTTCATTAA
352 AACAAGTTCAAATAGTT-TGA-CTATTTGAATAATTTTCT-ATTTAAATC-ATTATGAAC-TT--
** * * * * * *
7483 TATAAGTTTAT-TCAAAATAA-AA-TAATACTAATTTATTAATA--TT-TTAGAAAAT-TAATCA
410 T-T--GTTT-TGTCAAAA-AACAATTGTTTCT-GTTCA-TAAAAGCTTATT-CAAAATAAAAT-A
* ** * * ** * *
7541 GTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTAAACCATTTCAA-ATAGTTTTGACTATTTTAATA
466 ATACTA-ATTT----A-TTAA--TATTT-C-AAA--AATT-AATA-AG-TAAGA-GA-TTTAAAA
* * *
7605 ACT--ATCTA-TT-TCTAATCA-
514 AATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * ***
7623 TT-ATA-ACTTCTTA-T-TTTGTCATCAA--A-CAATTTGTCCTGTTCA-TACT-AT-TTTA-TT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTG--AACAATTATCTA-TT-T-CAAATCATTA-TGATCTTTATTT
**** * ** ** * * ** * *
7677 CAAAATAAAATAATACTAAT-TT-A-AGAA---TATTC-TAA-AACTTAATAACCAA--GAA-AA
60 TGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT-ACTAATTTAATAA
* * * * * * * * ** * * *
7731 T-TT-AAAAATAAATCTAATTGTCAA-ACCAGTCAAATAGTTAA-GACTATA-TGAAC-AATT-A
124 TATTCTAAAATTAA--TAA--GT-AAGA-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCA
** * * ** * * * * ** *
7789 TCT-GTTTCAA-ATTGTTATG-ACCTTTTTCT-TTT---GTCG-TA-AAACAATTGTTTTATTCA
183 AATAG-TT-AAGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCA
* * * * * * ** * ** *
7845 TACAAGC-TTTTTTTAATT-A-A-AA--TAATGC-AAATTTAATAATATTTTAA-AAATTAATAA
244 TA-AAACAATTATTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA--CTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
7902 ATAAGATATTTAA-A-AAATA-ATTT------T---T-T-TGT-C-GAATTAA-TTGAAATGGTT
306 TTAA-AAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * ** * * * * *
7950 AAGATTATTACAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
369 -TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATT
* * * * * * * *
8014 GTTTCAGTTCA-ACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTAAAAAATTAA
431 GTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * *
8077 TAAGAAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAGCGAACAAG
496 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * * * *
8117 TTCAAATAATTATTACTATTTGAACAAATGTCAATTT-AAAACTATTATAACCTTT-TGATTAGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGATCTTTAT--TTTGT
** * ** * * *
8180 CATAAAACAATTGTTTCAGTTAATGTAGGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
63 CATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * * *
8244 CTTGCTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATTAGTTAAAATAAT
126 -TT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGT
** * * * *
8308 TATAG-CCGTTTGAA-AGATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
189 TA-AGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* ** * *
8371 TTGTTTTTTATCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
252 TTATTTAGT-TCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAT
* * ** * * *
8435 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
315 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTT
* * * * ** * **
8500 GAACAATTATT-AATCTCAAGTTGTTAAG-A-TATTTGTTTTGGAAAAAAACAATTGATTT-T-T
378 GAATAATT-TTCTAT-TTAAATCATTATGAACT-TTTGTTTTGTCAAAAAACAATTG-TTTCTGT
* * * ** *
8560 ATCATAGAAGCCTATT-TAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
439 -TCATAAAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
8624 AGAAATTTACAAAATAAATGTGTTTA-CTTAGCTAA
502 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAG
* * * * * * * *
8659 TTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTCGAATCGTTTTGACCTTT-TGTGTAG
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGATCTTTAT-T-TTG
* ** * ** *
8721 TCATAAAA-TATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAAT-CTAAATTTATTAA
62 TCATAAAACAATTT-TTTTGT-TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAA
* * * * * * * *
8783 AATTCAAAAATTTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAACAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
124 TATTCTAAAA-TTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAAT
* * * * * * * *
8847 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTGTTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAACA
186 AGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
* * * * * * * *
8912 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAAT
251 ATTATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAT
* * * * *
8977 TAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTT
315 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTT
* * * * * * * * ***
9039 GAACAATTCTCTGTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTATTTGAATTCAT
378 GAATAATTTTCTATTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * * *
9104 ACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGTGA
443 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * **
9168 TTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATTAG
507 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * * *
9198 TTCAAATAATTAATGTC-ATTTCAAAAATAATCAATTTCAAATC-----G---TTTGTTTGGTCA
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCA
* * * * * * * *
9254 TATAAA-AATTGTTTTTTGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATC
65 TA-AAACAA-T-TTTTTTG-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * *
9317 TCTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAG
126 T-TCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG
* * * * ** * *
9382 TTATGACTATTTGAATAATT-GCATAATGAAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA-TCATAAAACA
188 TTAAGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACA
* * * * ** **
9445 ATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAAT
251 ATTA-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAT
** * * * ** * * * *
9510 TAATAATTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATAT
315 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTT
* * * * * * * * **
9575 GAACAATTATCTATTTCAA--A-T-TG--TTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCAT
378 GAATAATTTTCTATTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * *
9634 --AAG---AAT-AAAAT--AA-AAT--GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTGAGAGAT
443 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * *
9688 TTAAAAAATAATTCTGTTTGCCTAACTAG
508 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * *
9717 TTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGA-CATTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTATTTTGTC
* * * * * ** * * *
9781 ATAAAACAAATATTTTTGTCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATT
64 ATAAAAC-AATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-T
* * * * * * *
9846 TCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTAT
127 TCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAA
* * * * * ** * * *** *
9907 GACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGGTATTATTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAATAATT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATT
* * * * * ** *
9972 TATGTTCATAAAAACTTATTCGAATTAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCGACAATTAATAA
257 TA-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-A
* * * * * * * * * *
10037 GTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATA-TTCATGATTATTTGTATA
320 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT--TGACTATTTGAATA
* * * *
10101 AGTATT-TATTTCTAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA-AATTATTT-TAGTTCATA
383 A-TTTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCA-AAAAACAATTGTTTCT-GTTCATA
** * * * * *
10163 TCAGCCTATTCAAAATAAAATATTAATAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGAT
444 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
10227 TTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAG
508 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * *** * * *
10256 TTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
** ** * * *
10321 CCAAATGATCTTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT
65 TAAAACAAT-TTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * * **
10384 -AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTA
128 CTA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * *
10448 TA-ACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATT
191 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATT
* * * *
10511 ATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-ACAT----TAA-AATAA--TATTAATATAT-AAATATT-
254 A-TT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA
* * * * *** * * *
10565 -T-TC---AG----AAATAATAAGT-TAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTTTAGTCATTTGA
317 ATAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTGACT-ATTTGA
* * ** ** * * * * *
10620 ACAATTATCTATTTTAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATT-AT
380 ATAATTTTCTA-TTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCT-GTTCAT
* * * * *
10684 ACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGTAAGAGAT
443 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
*
10749 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-C--
508 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * ** * *
10775 --C--A-A---CT-CCTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT-TGTTCTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTAT-TT-TGTC
* * * * * *
10830 ATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * * * * *
10895 CCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAAATTAATTTGTTTATCC-AAGC-AATTTAAACAAT
128 -CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTGTTTA-CCGAA-CTAGTTCAAATAGT
* * * * * *
10958 TAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
189 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
11023 GTTTTAGTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTCATTAATGTTTTAAAAATTAA
254 -ATTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAA
* * * * ** * * ***
11088 T---AAGTGATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAT-AGCCATGCCAA
318 TAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGA-CTATTTGAA
* * *** * * * * * * ***
11149 CAATTATCTATTTCAAATTGGTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAGTTATATT-TGAAAAT
381 TAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTT-GTCAAAAAACAATTGT-TTCTGTTCAT
** *** * * *
11212 TCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAT
443 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
11277 TTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACTA-
508 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* ** * * *
11305 TCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTT-TGTATTG
1 T-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGATCTTTAT-T-TTG
* * * *
11368 TTAT-AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATA
62 TCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * * *
11432 TTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTT
126 TT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
11495 AAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATATTTT
190 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA-ATT
* * ** * * * *
11560 TTTTGAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
254 ATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAAAATTA
* * * * * *
11624 AT---AAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAA
317 ATAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGA
* * * * * * * *
11685 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATA
380 ATAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * * *
11750 TAAGTTTGTTC-GAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTC--AAA-TATTAA-TCAGAGAT
444 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
*
11809 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG
508 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* ** * * * * * * *
11838 TTTAAATAGTTAACACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTCA
* * * * * * *
11903 TAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTACTCAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTT
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * * * ** ** * * *
11968 TAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTGTCGAACTAAATCAAATAATCATG
129 TAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAG
* * * * * * *
12033 ATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTC
193 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATT-
* * * * ** *
12098 TAGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAT
257 TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AG
* * * * * *
12163 AAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAACATGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
321 CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATAAT
* ** * * * * * *
12228 TATCTATTTGAAATCGCTAT-AACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAG
385 TTTCTATTT-AAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAG
* * * *
12292 CTTATTTAAAA-AAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAACTAATAAGTAAAAGATTTA
448 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * *
12354 AAAAATAAATTTCTTTACTGAATA--AG
511 AAAAATAAATCTATTTA-TCAA-ACCAG
* * ** * * * ** * *
12380 TTCAAATCA-TTATAACTATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTC
* * * * * *
12444 ATAAAACAATTGTTTGTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * ** *
12509 -TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTATAGTAA-AAGTTCAAATAG
128 CT-AA-AATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATGTGTTTACCG-AACTAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
12572 TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACA
188 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC--CTTTTGTTTAGTCATAAAACA
* ** * * * * *
12637 ATTGTTTCAGTTCATGTAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCT-GAAA
251 ATTATTT-AGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAA
* * * * * * *
12700 ATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAATTAGTTTTGATTA
313 ATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTTGACTA
* * * * * ** *
12764 TCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG-ACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTCTG
375 TTTGAATAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTG
** * * * * *
12828 TTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGT
438 TTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
12891 AA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACACA-
501 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAAC-CAG
* * * *
12926 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTCA
* * * * * * * *
12991 TAAACCCATTGATTTTGTTCACAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTT
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TT
* * * * * *
13055 CCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTA
128 -C-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * ** * ** * * * * *
13120 TGATTATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-A
* * * *
13185 TTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAAT
255 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT
**** * * * * * * *
13249 AATTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATGTCCATTTGAAC
319 -AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGT-TTGACTATTTGAA-
* ** * * * *
13314 T-ATTATCTATTTGAAATTGTTATG-ACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATG
381 TAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-
*
13377 CAAAA--TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
443 -AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * **
13436 TTTAAAAACTAAAT-T-TGTATACAAAATTAG
507 TTTAAAAAATAAATCTATTTAT-C-AAACCAG
* * * *
13466 TTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATCTTTGTTTTGTCAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCAT
* * * * * * ** *
13531 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTT
66 AAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT
* ** * * *
13596 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACAAATTGAAATAGTTAAGA
130 -AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * *
13661 CTATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTC
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-
* * * ** * *
13726 AGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGC
258 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AGC
* * * *
13791 AAGA-AGTTTAAAGAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATA
322 AAGAGA-TTTAAA-AAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATA
* * * * * * *
13854 ATTATCTATTTAAAAC-TGTCAT-AACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTT-TAATTCACA
383 ATTTTCTATTTAAATCAT-T-ATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCT-GTTCATA
* * * * ** *
13916 AAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATGGAGAAGTTAA-AGAT
444 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGAT
** *
13980 TTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAAGCAG
508 TTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACCAG
* ** * * * *
14009 TTCAAATAATTATTTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * *
14074 TAAAACAATTGTTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCTGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAT
65 TAAAACAA-T-TTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
* * * * * *
14139 TTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTCACAGAACTAGTTCAAATAGTTA
126 TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
14204 TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTAT
* * * * *
14269 TTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATA-TTATGAAAATTAAT
256 TTA-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAAATTAAT
* * * * ** * * *
14333 AACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAA
319 AGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAA
* * * ** * * *
14397 TAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTCATCTTAAAAA-AA-TGTTTTTGCTCATA
381 TAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTC-AAAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * *
14460 AAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTT-TAAAA--ACTAA-TAAGAGATT
444 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
14521 TAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATCAA
509 TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * *
14549 TTCAAATAGTTATAACAATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * * * * * ** *
14614 TAAAATAATTTTTTCTATTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCC
65 TAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * * ** * * *
14679 TAAAAATTAACAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACCAATACAAATAGTTA
129 T-AAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACC-GAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
14742 TA-ATTGTTTGAATATTTATCTATTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTT-GTTACAAAATAATT
191 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * ** * * * *
14804 GTTTTTGTTTGTACAAGCTGACTT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
254 -ATTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTAAAAAATT
* * * * * ** *
14867 AATAAGTAAAAGATTT----ACTAAATTTGTTTA-TCGATTAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTT
316 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTT
* * * * * * *
14927 GAACAATTATT-TATTTCAAATTACTAT-AACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTATT
378 GAATAATT-TTCTATTT-AAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTT
* * * * * *
14990 CATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACTAATTAGTAA
440 CATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA
* * * **
15053 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAG
503 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * ** * *
15087 TTTAAATAGCTT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAACCGCTATGATTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTC
* * * * * *
15151 ATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAGCCTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* ** * * * * * *
15216 TTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGACCGAA-TAAGTTCTAATACTTA
128 CT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTA
* * *
15280 TA-ACTACTTGAATAATTAT-TGATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCA-TCATTAAACAAT
191 -AGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-AGTCATAAAACAAT
* * * * * * * *
15341 TGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTA
253 TAT-TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA
* * * *
15405 ATGAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGA
317 AT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGA
* * *
15470 ATAATTATT-TATTTCAAAT-AGTTATGATA-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
380 ATAATT-TTCTATTT-AAATCA-TTATGA-ACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * ** * *
15532 ATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGA
441 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * ** *
15596 GACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAA
505 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * *
15628 TTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTC
* * * ** * * * * * *
15692 GTAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AGAATTATTTAGCATAAAATAATGCTGATTCATTAAGAT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * ** *
15756 TTTGAAAATTAATAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTA
127 TCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
15817 TGATTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTT-GTCATAGAACAATTG
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTAGTCATAAAACAATTA
** * * * * * *
15880 TTTCTTTTCATATAAGCCTATCCG-ATTAAGATAATACTAA--T-TTAATA-ATAAAAAA-T-A-
255 TTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT
* **** * * * * * * *
15937 A--ATGAG-TTT---TGCCAAA-CTA--T-C-AAACAAGCTCAAATAGATATG-GTCATCTCAAC
319 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTTGACT-ATTTGAAT
* ** * * ** * * *
15990 AATTATCTATTTCAAATTGTTAT-TACTTTTTGTTTAGT-AATTTAAGAATT-TTT-TTTATCGT
382 AATTTTCTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAA-AAAACAATTGTTTCTGT-TCAT
* * * * * * * *
16051 ACACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGAT
443 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
16116 TTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAG
508 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * *
16145 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTA--TGAT---CTTTA--T
* * * * *
16210 TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAAT
58 TTTG-----TCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
16275 CTAATAATATTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAAT-TGGTTTGCCGAACCAGT
117 TTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTACCGAACTAGT
* * * * * *
16339 TTAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTCTTTTGTCAT
180 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCAT
* * * * *
16404 AAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTC-AGAATAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATT
245 AAAACAATTATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * *
16467 T-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAA-TTCTAATAATT
307 TAAAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
16529 ATGACTATTTGAA-CATTATCAATTTGAAATCATTAT-CACCTATG----GT-ATAAAACAAATG
369 -TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTG
* * * * * *** * * *
16587 TTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATATTAATATTACAAAAA-T--T
432 TTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
*
16649 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATC-AA--A-
497 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* ** * *
16684 --C--AT-G-T-T--C------AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * *
16734 T-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCCTA-TC----TAAAATAA-AATCAAGTTGTATTAATA
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AA-TT-TAATAATA
* ** * *
16792 TTTTAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTGAA-TCAGTTCAAATAAT
126 TTCTAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * **
16856 TATGGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
189 TA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
** * * * *
16921 TCCTT--TTCAATATAGAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAAT
253 TATTTAGTTC---ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAT
* ** *
16984 TAATA--AA-AGATTTAAAAAATAAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT
315 TAATAGCAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTT
* * ** * * * *
17045 GAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTGTGT
378 G-AATAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTG-TTTCTGT
* * ** * *
17109 TTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAA
439 TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * *
17173 GAGATTT-AAAAATAAATCCATTT-GCTGAACTAG
503 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAG
* * * * * *
17206 TTCAAATAGTTA-AACTATATGAA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTC
* * * * * *** * *
17269 ATAAAACAATTGCTTTTTCTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATAT
64 ATAAAACAATT--TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * * * * * * *
17334 TTTAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCTATTT-GCTAAGCCATTTCAAATAGT
127 TCT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAGT
** * * * * * * *
17398 TTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAAT
189 TAAGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * * ** * * * *
17463 TGGTCCTA-TTCATACTATTTTATATAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACT
253 T-AT-TTAGTTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAT
* * * * * * **
17526 TAATAACCAAGAAAATTCAAAAAATAAATATAATTGT-C-AAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTA
315 TAAT-AGCAAG-AGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTA
* ** * * * * ** *
17589 TATGAACGATTATT-TATTCCAAA-CTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCATTAACCAATTGTTT-
375 TTTGAATAATT-TTCTATT-TAAATC-ATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTC
* * * *** * * *
17651 TATTTATACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGT
436 TGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* ** *
17716 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAATCAG
501 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * *
17752 TTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTT-TGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTT-GTC
*** * * * * *
17816 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAGAAT-AATTAATACTAATTTATTAACATT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * * * * *
17880 CAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTA
128 C-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
** * * * * * * * *
17945 TTACTATTTTAACAAATGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTT-CTTATAAAACATTT
191 AGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
18007 GTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-T
254 ATTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAAATT
* * * * ** * * *
18070 AATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATT
316 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGA-CTATT
** * * * * * *
18133 TGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTTA
377 TGAATAATTTTCTATTT-AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGT-
* * * *
18197 TCACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
439 TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * **
18262 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAG
504 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * *
18295 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGAT-TTATGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGATCTT-TATTTTGTC
* * * * *
18358 ATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAACTTATTTC-G--T----TAATACTAATCTAATAATAT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
** * * **
18416 T-TCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGTCG-AGTCAATTTGAATA
127 TCT-AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATGTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATA
* * * * ** * *
18479 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
187 GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* ** * * * * * *
18543 TTTGTTTCA-TATTTTACAAGTTTATTCGGAATAAAATAAT-CAAAATTTATTAACATTCAGAAA
252 -TTATTT-AGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTAAAAA
* * * ** ** *
18606 ATTAAAAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGAC
313 ATT-AATAGCAAGA-GATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGT-TTGAC
* * ** * * *
18670 TATTTAAACT-ATTATT-TATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTT
373 TATTTGAA-TAATT-TTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTT
* * *
18733 -TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAA
435 CT-GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * *
18797 GCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAA
499 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * *
18832 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * ** *
18897 TAAAATAA-TTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 TAAAACAATTTTTTTG--TTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * *
18960 T-TCAATAATTAATAAGT----GATTT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAAT
127 TCT-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * **
19018 TATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATGTAACAATT
189 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-T
* * * * * * * * *
19083 GTTTTTA-ATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTA
253 -TATTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA
* * ** ** * *
19147 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTA
317 AT-AGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTG
* * * * * * * *
19212 AACAATTTTATACTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCA
379 AATAATTTTCTA-TTTAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* ** * ** * *
19276 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGA
442 TAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
19341 TTTAAGAAAA-AAATTTGTTTGTCAAACTAG
507 TTTAA-AAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * *
19371 TACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG-TTTTTGTTTTGTCAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCAT
** * * * *
19430 AAAACAATTTTTTCACTTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTT
66 AAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATA-TT
* * * * * * * * * * *
19494 CAAAAATTAATATGTAATAGACTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATG
128 CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAG
* * * * * *
19559 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTT
193 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AAT-TAT
* * * * *
19624 TTA-TTCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA
256 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATA
* * * * * * * *
19687 --ATG-GATTTTAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAATA
320 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATA
** * * * * * * ** *
19748 ATTATT-TATTTAAAATTGTTA-CAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAA
383 ATT-TTCTATTT-AAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAA
** * * * *
19811 AAATTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-A-ATTT
445 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* *
19874 TAAAAAATAAATC-ATTTACCAAACTAG
509 TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * * * * *
19901 ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * * * *
19966 TAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAAGTT-ATAATATTT
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * * * * * * *
20030 TGAAAATTAAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAAATA-ATA
129 T-AAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAG-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * * ** ** *
20094 TGACTATTTGAATAATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTT
191 AGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTA
*
20158 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTAC-AAAT-AAATAATAC-AATTTATTAATA-TTAAGACAATTA
255 TT-TAGTTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-AAAATTA
* * * * * * ** * *
20218 ATAGGTAAAAGATTTAGAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTATGACTAATTGAA
317 ATA-GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAA
* ** * **
20283 CAATTATT-TATTTCAAATTGTTATG-ACTTTT-TGTTTGTCAACAAAATAATTGTTTCTAATCA
381 TAATT-TTCTATTT-AAATCATTATGAACTTTTGT-TTTGTCAA-AAAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * * ** *
20345 TACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAATAGCTAATAAGTAAAAGA
442 TAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * ** *
20410 TTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAG
507 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * *
20440 TTCAAATAGTCT-TGTCTATTTTGAATAATTATCTTATTTCAAATCATTGTGACCTTT-TGTTTG
1 TTCAAATAGT-TATGACTA-TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTG
* * * * * *
20503 T-AAAAAAC-ATTGTTTTAGTTCAATA-AAGCTTATTTGAAAT-AAATAATACTAA-TTCATGA-
62 TCATAAAACAATT-TTTTTGTTC-ATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * * *
20562 ATTCTAAAATTAA-GAGAAAAGAGAATTTAAAAAAT-AATTTGTTTATCAAAC-ATTTCAAATAG
125 ATTCTAAAATTAATAAG-TAAGAG-ATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
20624 TTATGA-AATCT-AACAATTATCTTTTTCAAAACATTGTGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
188 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* *
20686 TGTTCTA-TTTATACAAGCTTATTTCG-AAT-AAATAATA-TAATTTATTAAT-TATT-AAAAAT
253 TATT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAAAT
* * * * * * *
20745 TAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTT-CTTAACACA-TTTAAATAGTTATTGA-TT
315 TAAT-AGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA-AGTTCAAATAG-T-TTGACTA
* * * * * * * *
20806 TTTGAA-CATTTATCTATTTCAAATCGTTTTATG-AC-TTCG-TTTGTGATAAATCAATTATTTA
375 TTTGAATAATTT-TCTATTT-AAATC--ATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
20867 TATT-AT-AAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAA-ATTTC-AAAATTAATAAAT
436 TGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
20928 AA-A-ATTTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAG
501 AAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG
* * * * * *
20964 TTTAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTAAGATCTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTATTTTGTC
* * * ** * * * *
21028 AT-AAACAATTGTTTCTATTCATATAATTTTATTTGAAAGAAAAT-ATACTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
** * * ** * * *
21091 CTAAAAATTAATGAA-TTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATGCACCAAACAAGTTCAAATAGTCA
128 CT-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * *** * * *
21155 TGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAATAGTTATGA--TATTTGTTTTGTCGTAAAACAATTA
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTAGTCATAAAACAATTA
* * * *
21218 --T--TTC-TATAAG---A----ATA-AAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-
255 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATA
* * * * * *
21269 G-AAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTA-TCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAATA
320 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATA
* * * * * *
21332 ATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACA
383 ATTTTCTAT-TTAAATCATTATGAACTTTTGTTTT-GTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAA
* * * * *
21395 AGCTTATTCAAATTAAAATATTACGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
446 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * **
21459 ACAAAAATAAATGTGTTTGTTGAA-CAGG
510 A-AAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-G
* * * * * * * *
21487 TTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTTTAGTCT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTT-ATTTTGTCA
* * * * * * * * *
21552 TAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGGTCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTATTATTC
65 TAAAACAATTTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * ** *
21617 AAAAATT-ATAA--ACAGA-ATTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC-AGTTTAAATAGTTA
129 TAAAATTAATAAGTA-AGAGA-TTT-AAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* ** * *
21677 TGA-TATTTGAACAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACGAT
191 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAAT
* * * * * * * *
21738 TGTTTCAATTCATAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTA
253 TATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA
* * * * * * ** * *
21803 AAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAATTAATTGAA-TTGCTTCAAATAATTATTG-CCATTT
317 ATAG-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAG-TTCAAAT-AGT-TTGACTATTT
* * * ** * * * * * * **
21865 AAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTACGAACTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCATC
378 GAATAATTTTCTA-TTTAAA-TCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * ** * * * *
21930 ATACAAGCCTATTCGGAGTAAAGTAATATTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
441 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *
21995 ATTTTCAAAAATAAATTTATTTA-CTGAACCAG
506 A-TTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAG
* * * * * *
22027 -T----T--TT-T-A-TA--TGAACAATTATCTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * ** * * * *
22080 TGAAATAATTGTTTCAGCTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAAATTTAATAATATT
65 TAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATT
* * * * * * * * * * *
22145 CCAAAAATTGATAACTAACAGATGTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAACAATTA
128 -CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAGTTA
* * * *** * *
22209 AGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTCATGT-AT-AAACAA
191 AGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-A-GTCATAAAACAA
* * * * * ** *
22272 TTGATTT-TTATCATTCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAACCTTTCAAAAAT
252 TT-ATTTAGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAAT
* * * * * *
22336 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTAGTAAACTAA-TTCAAATA-TATAACTATT
315 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTTGACTA-T
* * ** * * * * * * *
22399 TTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTTATTTTTG
376 TTGAATAATTTTCTA-TTTAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA-TTGTTTCTG
* * *
22463 TTCATACAAGC-TA-TCAAAATAAAAT-ATACTAATTCTAATAATATTTCAAAAA-TAAT-ACTA
438 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** *
22523 AGGAGAATT-AAAAAT-AATTTGTTCTGCGCGAACCAG
502 A-GAGATTTAAAAAATAAATCTATT-T-ATCAAACCAG
* * * * * * *
22559 TTCAAACATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
* * * * *
22624 TAAATA-AGTTTTTTCTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAA
65 TAAA-ACAATTTTTT-T--GTTCATAC-AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAA
* * * * * * * *
22686 TATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTT--AAAATAATTTTATTTACCTAACCAGTTTAAATAA
124 TATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG
* ** *
22745 TTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTT-GTCATAAAACAA
188 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTAGTCATAAAACAA
22809 T
252 T
22810 GTTTTTGTTT
Statistics
Matches: 15231, Mismatches: 3502, Indels: 2572
0.71 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
489 4 0.00
490 3 0.00
491 5 0.00
492 3 0.00
493 8 0.00
494 6 0.00
495 3 0.00
496 15 0.00
497 5 0.00
498 11 0.00
499 4 0.00
500 11 0.00
501 6 0.00
502 14 0.00
503 5 0.00
504 2 0.00
505 7 0.00
506 52 0.00
507 92 0.01
508 95 0.01
509 136 0.01
510 108 0.01
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514 30 0.00
515 62 0.00
516 14 0.00
517 168 0.01
518 163 0.01
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521 261 0.02
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530 320 0.02
531 132 0.01
532 390 0.03
533 637 0.04
534 486 0.03
535 650 0.04
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551 4 0.00
552 21 0.00
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554 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (536 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCAT
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AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTAGT
TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAGCAAGA
GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAATAATTTTCTA
TTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCA
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTATCAAACCAG
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Alignment explanation
Indices: 7057--15929 Score: 5681
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7047 AATTATGGCC
* * * * * * * *
7057 ATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTCTCCTGAAACAATTGCTTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTT
** * * * *
7122 AAT-ATAGAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAATTAATAA-T-
65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
** *
7184 AG--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
7234 ATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTG
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* * ** * *
7298 TTCATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATCAATAACTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
7363 GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * * **
7414 ACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATCTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * *
7479 TTAATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
7544 AGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * * * **
7596 ATTTTAATAACTATCTATTTCTAATCATTAT-AACTTCTTATTTTGTCATCAAACAATT-TGTCC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTT
** ** *
7659 TGTTCATACT-ATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATA-TTCTAAAACTTAATAA
64 TGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
** * * * *
7722 CCAAGAAAATTT-AAAAATAAATCTAATTGT-C-AAACCAG-TCAAATAGTTAAGACT
127 GTAAG-AAATTTAAAAAATAAATCT-GTT-TACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
7776 ATATGAACAATTATCTGTTTCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTG-TTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * * * * * *
7840 ATTCATACAAGCTTTTTTTAATTAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAATA
65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * * * *
7905 AGATATTTAAAAAAT-AAT-TTTTTTGTCGAATTAATTGAAATGGTTAAGATT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * * **
7956 ATTACAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * *
8021 TTCA-ACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTAAAAAATTAATAAG-AA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
8083 AAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAGC-GAACAAGTTCAAATAATTATTACT
131 GAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * **
8134 ATTTGAACAAATGTCAATTTAAAACTATTATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * ** * *
8199 TTAATGTAGGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTGCTAAAA-TAATAAGT
66 TTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
8262 AAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCC
129 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * ** *
8315 GTTTGAA-AGATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * *
8379 -TATCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
65 GT-TCATATAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * *
8442 TAA-AAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
128 TAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** *
8496 ATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAGTTGTTAAGA--TATTTGTTTTGGAAAAAAACAATTGATTT
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT
* * * * ** *
8558 TT-ATCATAGAAGCCTATT-TAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
63 TTGTTCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
8621 GTAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTTACTTAGCTAATTCAAATAGTTA-AAGCT
127 GTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * * * * * * *
8676 ATTAGAATAATTAT-TAATTTCGAATCGTTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAATATTTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * *
8740 T-ATCTTACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAAT-CTAAATTTATTAA-AATTCAAAAATTTAATAA
64 TGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAA
* * * * *
8801 GGAA-ATGATTTGGAAAAACAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
127 GTAAGA-AATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * ***
8857 ATTTGAACAATTATTTGTTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * *
8922 TTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
8987 G-AGTTT--AAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATTGTTATGACT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * ***
9035 ATTTGAACAATTCTCTGTTT-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTATTTGAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * *
9099 TTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
** * * * * * * *
9163 AGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAATGTC-
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACT
* * * * *
9215 ATTTCAAAAATAATCAATTTCAAATCGTT-TG----TTTG----GTCATATAAA-AATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTG-TTTT
* * ** * * *
9270 TGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAG
64 TG-TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
9334 TAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAGTTATGACT
128 TAAGAAATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * *
9390 ATTTGAATAATT-GCATAATGAAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTT
1 ATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* ** * *
9454 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTA
65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * *
9519 AGAGATTTAAAAAAGAAATTTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
9571 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATTG---T----TTTTATTTTGTCATAAAGCAA----TTTT-
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * *
9624 TTCA-AT----TCA-T-AAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGT
66 TTCATATAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
9681 GAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTGCCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACT
129 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* *** * * *
9734 ATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * *
9799 TCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-A
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
9862 G--ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACCAGTTCAAAAAGTTATGACT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * *** ** *
9911 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGGTATTATTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAATAATTTATG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * * *
9976 TTCATAAAAACTTATTCGAATTAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
10041 AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATA-TTCATGATT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACT
* * * * * ** * * *
10092 ATTTGTATAAGTATTTATTTCTAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * *
10157 TTCATATCAGCCTATTCAAAATAAAATATTAATAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
10221 AGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAACAAGTTTAAATAATTATGATT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** ** *
10273 ATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATCT-TTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTT
* *
10337 GTTCATATAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAG
65 GTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* ** * ** *
10398 GTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATAACT
127 GTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
10453 AATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * * *
10517 ATTCATACAAGCTTATTCACATTAAAATAATATTAATATATAAATATTTTCAGAAA-TAATAAGT
65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* ** * **** * * * *
10581 TAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAAT-TTTA--G-TC-ATTTGAACA-A-TTAT--CT
129 AAG-AAATTTAA-AAAAT-AAAT-CTGTTTACTGAACTAGTTCAA-ATAGTTATGACT
* * *** **** * ** * * *
10630 ATTTTAA-ATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTT-TCATTATACAA-----
1 ATTTGAACA--ATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
10688 ---G--C-------C-TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAA
62 TTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
10740 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAA--A---C-CA-A---CT-CCT
127 GTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
10783 ATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTGTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * *
10848 TTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
10913 GAGATTTAAAAAAATTAATTTGTTTA-TCCAAGC-AATTTAAACAATTAAGACT
131 GAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * *
10965 ATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * *
11030 TTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTCATTAATGTTTTAAAAATTAATAAGT--
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
11093 G--ATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAT-AGCC
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CT
*** * * * * * *
11142 ATGCCAACAATTATCTATTTCAAATTGGTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAGTTATATTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTT
*** *** * * *
11206 GAAAAT-TCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACT
65 GTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
11270 AAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACTA-TCTCAAATAGTTATAACT
129 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGT-TCAAATAGTTATGACT
** ** * * * *
11323 ATTTGAACAATTATAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTTAT-AAACAATTATTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * *
11386 GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTCCAAAAATTAATAACTA
65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
11451 AGAGAA-TT-AAAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACT
130 AGA-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
11501 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATTTTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* *** *
11565 AATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
66 --TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
11629 T--G--ATTTAAAAAATAATTTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACT
128 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * *
11679 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * *
11744 TTCATATAAGTTTGTTC-GAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTCAAATATTAATCAG--
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * **
11805 AG--ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACTAGTTTAAATAGTTAACACT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * *
11855 ATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * * *
11920 TTTATACAAGCTTACTCAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** * * *
11985 AAAATTTTAAAAATAAATATGTTT-GTCGAACTAAATCAAATAATCATGATT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
12036 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTCTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
*** * *
12101 TTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A
* * *
12165 AGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAC-ATGTTCAAATAATTATGACT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
12217 ATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * *
12282 TTCATACAAGCTTATTTAAAA-AAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAACTAATAAGT
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT
* * *
12344 AA-AAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTGAA-TAAGTTCAAATCA-TTATAACT
129 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAAT-AGTTATGACT
* ** * * * * * *
12397 ATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * *
12462 TTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
12527 -AAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTA-TAGTAA-AAGTTCAAATAGTCATGACT
131 GAA-A-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-G-AACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * *
12580 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC--CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * * * *
12645 AGTTCATGTAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATA-TTCTGAAAATTAATGA
64 TGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * ** * * *
12708 GTAA-AAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAATTAGTTTTGATT
127 GTAAGAA-ATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *** * * * * *
12763 ATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTCTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
** * * * * *
12828 TTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGT
66 TTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
12891 AA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAAC-ACATTCAAATAGTTATGATT
129 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
12943 ATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * ** *
13008 TTCACAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGT
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * *
13072 AA-AAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATT
129 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * * * *
13125 ATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * ** * * * **
13190 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAATTTT
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
13255 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAATTTAAATAGTCATGTCC
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
13306 ATTTGAACTATTATCTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
** ** *
13371 TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * ** * *
13434 G--ATTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTAAAATAGTTATGACT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
13483 ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * ** * *
13547 TTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
13612 GAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACAAATTGAAATAGTTAAGACT
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * ** * **
13663 ATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * ** * ** * *
13728 TTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * *
13792 AGAAGTTTAAAGAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATAGTTATAACT
130 AGAAATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * **
13845 ATTTGAATAATTATCTATTTAAAACTGTCATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTTTAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * ** *
13910 TTCACAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATGGAGAAGTTA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TA
* * * * ** *
13975 A-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAAGC-AGTTCAAATAATTATTTCC
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACT
* *
14026 ATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCT-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT
* * * ** *
14090 TTTATCATACAAGCCTATTCTGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
64 TGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
14155 TAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTCACAGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
128 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * *
14209 ATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* ** * * * * *
14274 TTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** * * * *
14338 AGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *** ** * *
14390 ATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTCATCTTAAAA-AAATGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * * *
14454 CTCATAAAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTTTAAAAACTAATAAG--A
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
14517 G--ATTTAAAAAGTAAATCTATTTAC-CAAATCAATTCAAATAGTTATAACA
131 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * *
14566 ATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * * * * * * * *
14630 ATTGATACT-ATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAACAAG
65 GTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * ** * * * * *
14693 TAATG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACCAATACAAATAGTTATAATT
128 TAA-GAAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
14747 GTTTGAATATTTATCTATTTCAAAGTGTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAATAATTGTTTTTG
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** * * ** *
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * ** * *
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* * ** * * * ****
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* * * * * * *
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* * ** * * **
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* * * *
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65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
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130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * ** *
15529 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
15593 GGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAATAAATTCAAATAGTCATG-TT
130 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
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1 -ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * * * * **
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65 GTTCATATAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
15772 -AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTA-TGGAATTAGTTCAAATAGTTATGATT
129 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TT
* ** * * *
15886 -TTCATATAAGCCTA-TCCGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
65 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
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Statistics
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** * **
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* * *
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*
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * ***
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*
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*
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* * * *
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** * * * *
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* * ** * ** * * * * * **
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* * * * * * * * * * * *
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* * * ** * * *
8039 AATAAATTAATACTAATTTATTAACATT-AAAAAATTAATAA-GAAAAAGATTT-AAAAATAAAT
256 AATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAA-ATTTAAAAAATAAAT
** * * * ** **
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* * * * * * * * * ** *
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** * ** ** * *
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* * * ** * * **
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* * * * * * * * * *
8329 CTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTTTATCATACAAGCTT
186 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGT-TCATATAAGCCT
* * * * * **
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** ** ** * * **
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* * * * *** * *
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* * ** *
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* * * * ** * * * * * *
8627 AATTTACAAAATAAATGTGTTTACTTAGCTAATTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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249 TATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAGTAATATTCTGAAAA-TCAATAACCAAGA-AATTT-A
* * ** * * * **
8814 AAAAACAAATCT-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
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* * * ** ** *
8862 AACAATTATTTGTTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * * * * *
8927 AAAAGCATATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-T
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGAT
* * * * * * *
8991 TT--AAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAAT-TCTCTGT
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* * * * * * * * *
9053 TTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTATT--TGAATTCATACAAGCTTAGTC
191 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTG--TTCATATAAGCCTATTC
* * ** * * ** * *
9116 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGTGATTTAAAAAGTGAA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAA
* ** * ** ** * * ** *
9181 TATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAATGTC-ATTTC
319 TCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAA-GACTACATG
* * * * *
9220 AAAAATAATCAATTTCAAATCGTT-TG----TTTG----GTCATATAAA-AATTGTTTTTTGATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATA-AAACAATTG--TTTT-ATT
* * ** * * * * *
9275 ATATATG-TTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAAGA
62 ATACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGA
* * * * * *
9339 GATTTAAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT-TG
124 GATTT--AAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAT-
* ** ** * * ** *
9403 CATAATGAAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTT
186 C-TATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCT
* ** ** * ** *
9468 ATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA
250 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAA
* * * * * * *
9533 GAAATTTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATG
315 TAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * *
9576 AACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTATTTTGTCATAAAGCAA----TTT-TT-T-C
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** * * * *
9627 AA--TTCAT-AAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTGAGAGAT
66 AAGCTTTTTCAA-AATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTAAAAATTAATA--TAAGAGAT
* * * * * * *
9688 TTAAAAAATAATTCTGTTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATT
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATT
* * * * * * * * ** * ** *
9753 TCAAATCACTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTCCATATAAGTTTGTTCAA
191 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCAA
* * * * * *
9818 AATAAAATAAAACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA--TAG--ATTTAAAAAATAAAT
256 AATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * **
9878 AT-GTTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTG
320 CTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * * * * * *** ** *
9916 AGCAATTATTTATTTCAAATTGGTATTATTTTTTCTTTTGTTGCAAAACAATAATTTATGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * * * * * ** * * *
9981 AAAAACTTATTCGAATTAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAAAAAAT
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGAT
* * * ** * * * * * *
10046 TTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATA-TTCATGATTATTTGTATAAGTATTTAT
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA-TATCTAT
* * * * * * * * *
10110 TTCTAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATT-TTAGTTCATATCAGCCTATTC
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCT-GTTCATATAAGCCTATTC
* * * * * * ** * *
10174 AAAATAAAATATTAATAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAA
** * * * * * * **
10239 TCT-ATTTATCGAACAAGTTTAAATAATTATGATTATTTG
319 TCTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * * * ** ** *
10278 AACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATCT-TTTCTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAAT-TGTTT-TATT-A
* * * *
10342 TATAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAGGTAAA
63 TACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAA-A-AATTAATA--TAAG
* * * ** * * *
10403 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATAACTAATTGAACAATTATT
123 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATC
** * * * * * * * *
10468 TATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA
187 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTA-TTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTA
* * * * * *
10532 TTCACATTAAAATAATATTAATATA-TAAATATTTTCAGAAAT-AAT----AAG----TT----A
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGT-AATATTCTGA-AAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAA
* *** * * * **
10583 GT---T-T-ATTG---AATTGGTTCAAATAATTTTAGTC-ATTTG
314 ATAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAAT-AGTTAAGACTACATG
* ** * * *
10619 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTACAAAC-TTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATTA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTG-TTTT-ATTA
* * * * * * *
10683 TACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGTAAGAGA
63 TACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATT-AATA-TAAGAGA
* * *
10748 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-C----C--A-A---CT-CCTATTTGAACATTTATCTAT
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATATCTAT
** * * * * * *
10801 TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTT-GTAGTTCATATAAACTTATTC
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCT-GTTCATATAAGCCTATTC
* * ** * * * * *
10865 AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAAATTA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTT-AAAAAATAA
** ** * * * * * * *
10930 AT-TTGTTTATCCAAGCAATTTAAACAATTAAGACTATATG
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* ** * * * *
10970 AACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTA-TT-AT
* * * * * * *
11035 ACAATCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTCATTAATGTTTTAAAAATT-A-ATAAGTGATTT
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* * * ** * * ***
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*** * * * * * * * *** * *
11162 CAAATTGGTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAGTTATAT-TTGAAAAT-TCAAGCTTATTT
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** * * * * * * *
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11288 ACCTATTTACCGAACTA-TCTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
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** ** * * * * * * *
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126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTAT
** * * * * * ** * *
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190 TTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTG--TTCATATAAGCCTATT
*** * * * * * **
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253 CAAAATAAAATAATACT-AATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATA
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11643 ATTTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTA
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** * * * * * *
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* * * * * * *
11749 ATAAG-TTTGTTC-GAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTCAAATATT-A-ATCAGAGAT
64 ACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATT-TAATAATATTTTAAAAATTAATATAAGAGAT
* * * ** * *
11809 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAACACTATTTGAGCAATCATTTATT
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-ATCTATT
* * * * * ** * * * * *
11874 TCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTACTCAG
191 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCAA
* * * * * ** * *
11939 ATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TTAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
256 AATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAA-AATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* ** * * ** * * * * **
12003 ATGTTTG-TCGAACTAAATCAAATAATCATGATTATTTG
320 CTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * * * *
12041 AATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTCTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTA-TT-AT
* * *** * * **
12106 ATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGAT
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-AT-AAGAGAT
* * ** *
12171 TTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAA-CATGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTAT
* ** * * * * * * ** * * *
12235 TTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTA
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCA
* * ** * **
12300 AAA-AAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAA-CTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAA
255 AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATC-AATAACCAAGAA-ATTTAAAAAATAA
* ** * * ** *
12362 ATTTCTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATA-ACTATATG
318 ATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAAT-AGTTA-AGACTACATG
** * * * *
12402 TGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * * *
12467 ACAAG-TTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGA
64 ACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA
* * * * * *
12531 TTTTAAAAAAATAAATATGTTTA-TAGTAA-AAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
126 -TTT-AAAAAATAAATCTATTTACCA--AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TAT
* * * * * * * * *
12594 CTATTTCAAATCATAATGA-CTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGTAAGT
186 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTC---TATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGC
* * * * * * * ** *
12658 TTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAA-AAGAATTAA
248 CT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAA-ATTTAA
* * ** * ** * *
12721 AAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAATTAGTTTTGATTATC-TA
311 AAAATA-AATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-CATG
* *** * * * *
12768 AATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTCTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATT-GTTTTATT-AT
* * * * ** * *
12833 GCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AA
64 ACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAG
* * ** *
12895 ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCT
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-ATCT
* * * * * * * * * * *
12959 ATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATT-TTGTTCACAAAAGCTTAT
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTG-TTCCTGTTCATATAAGCCTAT
** * ** * **
13023 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAA
252 TCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TT-CTGAAAATCAATAACCAAGAA-ATTTAAAAA
* * * ** * * * *
13086 ATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATTATTCA--
314 ATAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA--CATG
* * * * *
13130 AACAATTATTTATTTCAAATTATTAT-AATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-A
** * * **
13194 TACAAG-TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAATTTTGAG
63 TACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAG
* ** * * * * * *
13258 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTA
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATATCTA
* ** * * * * ** * ** ***
13323 TTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTC
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTC
* * * * *
13388 AAAATAAAATAATACTAATTTA-TAAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTAGT-AATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAA
** * * ** * * **
13448 AT-TTGTATACAAAATTAGTTAAAATAGTTATGACTATTTG
318 ATCTAAT-TGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* ** * * *
13488 AACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * * **
13552 ACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGAT
* * * * * * * * * * *
13617 TTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACAAATTGAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTACCTATT
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATT
* * * * * * * * * **
13682 TCAAATCATTCTGACCTTTTGTT-TAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTTG
191 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCT-ATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCA
* ** * * ** * * *
13746 AAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAGAAATAAA
255 AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAA-AAATAAA
* ** * * **
13811 TCT-GTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
319 TCTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTACATG
* * * * * * * * *
13850 AATAATTATCTATTTAAAACTGTCATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTTTAATTCAC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTT-ATT-AT
* * * * * * * * *
13915 AAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATGGAGA-AGTTAA-AG
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAAT-TA-ATA--TAAGAG
*** * * ** *
13978 ATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAAGCAGTTCAAATAATTATTTCCATTTGAACAATTATCT
125 ATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCT
* * * * * * * ** * *
14042 ATTTGAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATACAAGCCTA
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTG-TTCCTGT-TCATATAAGCCTA
** * * * * ** * *
14107 TTCTGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAA
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAA
* ** ** * * **
14171 TAAATATGCTCAC-AGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
315 TAAATCTAATTGCTA-AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* ** * * * * *
14214 AACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* ** * * * *
14279 ACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGAT
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGAT
* * * * * * * *
14344 TTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATT
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATT
* * * * * ** * * ** *
14409 TCAAACCATTATGACCTTTTGTT-TCATCTTAAAA-AAATGTTTTTGCTCATAAAAGTTTGTTCA
191 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCT-ATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCA
* * * * * * * *
14472 AAATAAAATAATATTAATTTATTGATATT-TTAAAA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
255 AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
14533 CTATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATA-ACAATGTG
320 CTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTACATG
* ** * ** * * *
14571 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTGAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * * * ** ** *
14636 ACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAACAAGTAATG-GA
64 ACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAA-TA-TAA-GAGA
* * * ** ** * * * * * * *
14700 TTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAATACAAATAGTTATAATTGTTTGAATATTTATCTAT
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATATCTAT
* * * * * * ** ** *
14765 TTCAAAGT-GTTATAACCTTTTGTT-TGTTACAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAG-CTGACT
190 TTCAAA-TCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCT-A-T
** * * * * ** **
14827 T-GGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTACTAA
252 TCAAAATAAAATAATA-CTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAA-ATTTAAAAA
*** * * * * * *
14888 ATTTGT-TTATCGAT-TA--AGTTCAAATAGTTATGACT-CTTTG
314 ATAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAC-ATG
* ** * * * * * *
14928 AACAATTATTTATTTCAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * * *
14993 ACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTAGACAACTAATTAGTAAAAG
64 ACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTA-AAAATTAA-TA-TAAGAG
* * * ** * *
15056 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCTT-TGACTATTTGAACAATTATTT
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAA-TATCT
* ** * ** * * * * * ** *
15120 ATTTCAAACCGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAGCCTATT
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATT
** * * * * * ** * ** *
15185 CGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATA
253 CAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAA-ATTTAAAAAATA
* * ** ** * * *
15249 AATAT-GTTGACCGAATAAGTTCTAATACTTATA-ACTACTTG
317 AATCTAATTG-CTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTACATG
* * * **
15290 AATAATTAT-TGATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTG-TTTCATCATTAAACAATTGTATCAATTC
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTC-TCATAAAACAATTGT-TTTATT-
* * * * * *
15352 ATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATGAGTAAGAG
62 ATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAG
* ** * * * * *
15416 ATTTAAAATATAAATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTA
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTA
* ** * * * * * **
15481 TTTCAAAT-AGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT
189 TTTCAAATCA-TTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATT
** * * * *** * * *
15545 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAA
253 CAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAA
* ** * * ** * * * *
15610 ATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCATG--TTCATTTG
318 ATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACA--TG
* * * * * *
15650 AAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* ** * * * * * *
15715 AC-AGAATTATTT-AGCATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTTTGAAAATT-A-ATAAGAG-T
64 ACAAG-CTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATATAAGAGAT
* * *** ** * * *
15775 ATTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAACAATTATATAT
127 -TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTAT
* * * * * * * * *
15840 CTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCCTA-TCC
190 TTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCA
* * * * * * ****
15903 GATTAAGATAATACTAA-TT--TAATA--AT-AAAA--AATAA--ATG-AGTTT---TGCCAAA-
255 AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
15953 CT-A-T-C-AAACAAGCTCAAATAGATATG-GT-CATCTC
320 CTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACA--TG
* ** * ** * * **
15987 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTAGTAATTTAAGAATTTTTTTTATCGTA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAA-TTGTTTTATTATA
* * * * * * * *
16052 CACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATT
65 CAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATA--TAAGAGATT
* * * * *
16117 TAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TGTATACT
128 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATATCTAT--T
* * ** * *
16181 TCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTATGTTTATAC
191 TCAAATC----A--T--T---ATA-ACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATAT
* ** * * * * * *
16246 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTT
244 AAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTT
* ** ** * *
16311 AAAAATTAAAT-TGGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATG
309 AAAAAATAAATCT-AATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * *
16360 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTCTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTT--ATT-
* * * * * * *
16423 ATACTAGCTTATTCAGAATAAAGTAA-AATGAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGA
62 ATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGA
* * * * * * *
16486 GATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAACATTATCAA
124 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATATCTA
* * ** * ** * ** * *
16551 TTTGAAATCATTATCACC---TA-T-GGT-ATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTT
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTC
** * * * * * *
16610 GGAATAAAATAATGCTAATATATTAATATTAC--AAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATT-CTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAA
* * *
16670 ATCT--TT--T----TA--TCAAACA--T--G--T---TC
318 ATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * *
16691 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTA-TT-AT
* * * * * * * *
16755 AAAAGC-CTATCTAAAATAAAATCA-AGT--TGTATTAATATTTTAAAAGTTAATAAGTAAGAGA
64 ACAAGCTTTTTC-AAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA
** * * * * *
16816 TTTAAAAAATAAATC-AGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGGGCCATTTAAACAACTATCT
126 TTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAA-TATCT
** * * * * * * * *
16880 ATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAA---TTCCTTTTCAATATAGAAGCTT
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTC-ATAT--AAGCCT
* * * *
16942 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATT-TCAAGAATTAATAA--AAG--ATTTAAAAA
250 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAA-AATCAATAACCAAGAAATTTAAAAA
* * * * * *
17002 ATAAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTG
314 AT-AAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * * * *
17046 AAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTGTGTTT
1 -AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTG-TTT-T-ATT
* * * *
17111 ATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGA
62 ATACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGA
* * ** * * * *
17175 GATTT-AAAAATAAATCCATTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAA-AATTTATT
124 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA--TATC
* * * * * ** * * ** *
17237 TATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTCTTAATATAAGTTTG
187 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTG-TTCCTGTTCATATAAGCCTA
* * * * * * ** * *
17302 TTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAG
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAA
* * * ** **
17367 TAAATCTATTTGCTAAGCCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTG
315 TAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * ** * * * **
17410 AATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTATTCA
1 AACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATT-GTTTTATT-A
* * * *
17475 TACTA--TTTTAT-ATAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAG
63 TACAAGCTTTT-TCA-A-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAG
* * * * ** ** * *
17537 AAAATTCAAAAAATAAATATAATTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACGATTAT
123 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATAT
* * * * * * * * * * * * * *
17602 TTATTCCAAA-CTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCATTAACCAATTGTT-TTATTTATACAAGCT
186 CTATTTCAAATC-ATTATAACC-TTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCC
*** * * * * * ** *
17665 TATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
249 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAA
* * ** * * * * *
17729 AATAAATTTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTTAAGATTA-TTAG
313 AATAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACAT-G
* * * ** *
17774 AACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGA-TCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-A
* * * * * * ** * *
17838 TACAAACTTATTCAGAAT-AATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGA
63 TACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA
* * * * * *
17902 TTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTATTACTATTTTAACAA-ATGTTA
126 TTTAAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAT-CT-
* * * * ** * * *
17966 ATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCT-T-ATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTA
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTT-A-TTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTA
* ** * * ** *
18028 GAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACT-AAAAT-AATAAGTAAGAAACTTAAAA
251 -TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TT-CTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAA
* ** * ** * * * **
18090 AATAAATC-AGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTATAG-CCATTTG
313 AATAAATCTA-ATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTACATG
* * * * *
18135 AACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTTATCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTATTAT-A
* * * * *
18200 CATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 C--AAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA
* * * * ** *
18265 TTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT-TAA
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCT-A
* * * * * ** * * * *
18329 TCTCAAATCGTTA-AGA--TTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAACTTAT
189 TTTCAAATCATTATA-ACCTTT-TATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTA-
* * * * * ** *
18391 TTC---GT----TAATACTAATCTAATAATATT-TCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAA-TCAATAACCAAGAAATTT--AAAA
* ** * ** * ** * *
18448 AATAAATGTGTTTG-TCGAGTCAATTTGAATAGTTAAAACTA-TTAG
313 AATAAATCTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACAT-G
* * * * * * *
18493 AATAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTGTTTCATATTT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAA-TTGTTT--TATTA
** * * * *
18557 TACAAG-TTTATTCGGAATAAAATAAT-CAAAATTTATTAACA-TTCAGAAAATTAA-A-AAGGA
63 TACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATAC-TAATTTAATAATATTTTA-AAAATTAATATAA-G-
* ** * * * *
18617 AATGATTTGAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTAT
123 -A-GATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AA
* * * ** * * * * *
18682 TATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGA-CATAAAACATTTGTT-TTAGTTCATAAAA
183 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCT-ATCATAAAACAATTGTTCCT-GTTCATATAA
* * ** * * * *
18745 GCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTC-AAAAATTAATAAGCAAG-AGTTT-
246 GCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT-ATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTA
* ** * ** * * * * **
18807 -AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTG
310 AAAAATAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * ** * * * *
18854 AACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * * *
18919 ACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATT-A-ATAAGTGATT
64 ACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATATAAGAGATT
* * * * * * * * *
18981 T-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATT
128 TAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATT
* * ** ** ** * **
19044 TCAAATCATTATTACCTTTTATT-TGGTCATGTAACAATTGTTTTTAATCATATATGTTTATTCA
191 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCT-ATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCA
* * * * * ** *
19108 AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAA
255 AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTT-AAAAAATAA
* * * * ** * * ** *
19172 ATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTA
318 ATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * ** * * * * *
19212 AACAATTTTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-AT
* * * **
19277 ACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGA
64 ACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA
* * ** * * * *
19341 TTTAAGAAAA-AAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTA
126 TTTAA-AAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTA
* * * * * * ** *
19405 TTTC-AA--ATTGT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCACTTCATACT-AGCTTATT
189 TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATA-TAAGCCTATT
** * * * * * *** * * *
19462 CGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATT-TCAAAAATTAATATGTAATAGACTTAAAAAAT
253 CAAAATAAAATAATACT-AATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAAT
* * * * * **
19525 AATTCTATTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
316 AAATCTAATT-GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * * * *
19567 AACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTG-TTTTATT-AT
* * * * * *
19632 ATAAG-TTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA-ATG-GATT
64 ACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATATAAGAGATT
* * * * * * * * *
19694 TTAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
128 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATTT
* ** * ** * * * ** * * * *** *
19759 AAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTATTCATA
192 CAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCAAA
* * * * ** *
19824 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCGACAATTAATAAGTAA-AATTTTAAAAAATAAATC
257 ATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT-GAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * **
19887 -ATTTACCAAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTG
321 TAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * * ** * * * * * *
19923 AATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTA-TT-AT
* * * *
19988 ATAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAAGTT-ATAATATTTTGAAAATTAAATAATTAAGAG
64 ACAAGCTTTTTCA-AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATT-AAT-A-TAAGAG
* ** * * * *
20051 ATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAAATA-ATATGACTATTTGAATAATTATC-
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCT
* *** * * * * ** ** * * * *
20114 ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATT-TTTCTATTCATACAAGCTTAT
188 A-TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTAT
* ** * * *** *
20178 T-ACAAAT-AAATAATAC-AATTTATTAATATTAAGACAATTAATAGGTAA-AAGATTTAGAAAA
252 TCA-AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAA-ATTTAAAAAA
* ** * * ** *
20239 TAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-CCTATGACTA-ATTG
315 TAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACA-TG
* * * * *
20281 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTGTC-AACAAAATAATTGTTTCTAATCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTT-TCTCATAAAACAATTGTTT-T-ATTA
* * * * * * ** *
20345 TACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTT-ATAAATATTTCAATAGCTAATAAGTAAAAG
63 TACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAG
* * *** * * *
20409 ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGTCTATTTTGAATAATTATC
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTA-TTTGAACAA-TATC
* * * * * * *
20473 TTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTT-TGT-AAAAAAC-ATTGTT-TTAGTTCA-ATAAAGCT
187 -TATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCT-GTTCATAT-AAGCC
** * * * * *
20533 TATTTGAAAT-AAATAATACTAATTCA-TGA-ATTCT-AAAATTAAGAGA-AAAGAGAATTTAAA
249 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATA-ACCAAGA-AATTTAAA
** ** * * *
20593 AAAT-AAT-TTGTTTATCAAA-CATTTCAAATAGTTATGA--A-ATCT
312 AAATAAATCTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACAT-G
* *** * * *
20635 AACAATTATCTTTTTCAAAACATTGTGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTATA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTA-TTATA
* * * *
20699 CAAGCTTATTTC-GAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAT-TATTAAAAATTAATAAGTAA-AAAT
65 CAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA-
* * ** * * *
20759 TTTAAAAAATAAATATGTTT-CTTAACACA-TTTAAATAGTTATTGA-TTTTTGAACATTTATCT
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC-CAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACA-ATATCT
* * ** * * * * ** * *
20821 ATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCGTT-TGTGATAAATCAATTATTTATATT-ATA-AAGCTTA
188 ATTTCAAATC--ATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTA
* * * * * * * ** *
20881 TTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAA-ATT-TCAAAATTAATAAATAA-AATTTTAAAAAAA
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTT-AAAAAA
** * ** * * * * *
20943 TAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACT-CTTTG
315 TAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAC-ATG
* * *
20986 AACAATTATTTATTTCAAA-TGTTAAGATCTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-A
* * ** * * * **
21049 TATAA-TTTTATTTGAAAGAAAAT-ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAATTGGAG
63 TACAAGCTTT-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT--ATAAGAG
** * * * * ** *
21112 ATTTAAAAAATAAATCTATGCACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTA
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATATCTA
* * * * * *
21177 TTTCAAAT-AGTTATGA--TATTTGTTTTGTCGTAAAACAA---TT-AT-TTC-TATAAG-----
189 TTTCAAATCA-TTATAACCT-TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTAT
* * * * * ** * *
21228 --AATA-AAAATAGTACTAATTTATTAATATT-TTAAAA--ATTAATGAAGAGATTTAAAAACTA
252 TCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATA
* ** * * ** *
21287 AAT-TTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTC
317 AATCTAATTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
* * ** * *
21328 AATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTT-CTCATAAAACAATTGTTT-TATT-A
* * * * * *
21391 TACAAGCTTATTCAAATTAAAATATTACGAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
63 TACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-A-TAAGAGA
* * **** * * *
21456 TTTACAAAAATAAATGTGTTTGTTGAA-CAGGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCT
126 TTTA-AAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TATCT
* * ** * * * * * * * *
21520 ATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTT-TAGTCTTAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATG-GTCA
188 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCT-A
* * * * * * * *
21583 TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTATTATTC-AAAAAT-TATAAAC-AGAATTTTAAAAAAA
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTT-AAAAAA
* ** * * * **
21645 TAAATTTGTTTACTAAA-CAGTTTAAATAGTTATGA-TATTTG
315 TAAATCTAATTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
** * * * * *
21686 AACAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCAATTC
1 AACAATTATCTATTTCA-AA-TTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TATT-
* * * * * * * * * *
21749 ATAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGTTAA-AG
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125 ATTTAAAAAATAA
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AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTATTATAC
AAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATATAAGAGATTTAA
AAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATATCTATTTCAAA
TCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTCCTGTTCATATAAGCCTATTCAAAATAA
AATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATCAATAACCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTAATT
GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG
Found at i:7915 original size:23 final size:22
Alignment explanation
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7869 ATGCAAATTT
* *
7879 AATAATATTTTAAAAATTAATA
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AATAAGATTTTAAAAAATAATA
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8211 TAGATGGAAT
* *
8221 AAAATAATACTAATTTATTAATACTTGCTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTA
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* * * * * *
8285 TTTACCGAATTAGTTAAAATAATTATAGCCGTTTGAA-AGATTATCT-ATTTTAAATCATTCTGA
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* * ** *
8348 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAACAATAC
128 CCTTTTGTGTAGTCATAAAACAATTGTTTCATATCATACAAGCTTAT-TCAAAAT-AAACAAT-C
* * * *
8412 T-AATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAAATGTTTATTGA
190 TAAATTTATTAA-AATTCAAAAATTTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAAACAAAAATGTTTATCGA
*
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* * * * *
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** * * * * * * *
8647 TTACTTAGCTAATTCAAATAGTTAAAGCTATTAGAATAATTATTAATTTCGAATCGTTTTGACCT
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* * * *
8712 TTTGTGTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAATAATCTAAATT
131 TTTGTGTAGTCATAAAACAATTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAACAATCTAAATT
* * **
8777 TATTAAAATTCAAAAATTTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAACAAATCTGTTTATCGAACAAGTT
196 TATTAAAATTCAAAAATTTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAAACAAAAATGTTTATCGAACAAGTT
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261 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
8872 TGTTTAAAAT
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TTACCGAACTAATTAAAATAATTAAAGCCATTAGAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCT
TTTGTGTAGTCATAAAACAATTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAACAATCTAAATT
TATTAAAATTCAAAAATTTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAAACAAAAATGTTTATCGAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTAATCTCAAGTTGTTAAGATATTTGTTTTGGAAAAA
AACAATTGATTTTTATCATAGAAGCCTATTTAGTTA
Found at i:10812 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 10614--10925 Score: 448
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10604 AATTTTAGTC
* * *
10614 ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTT-T-T
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTGTAT
* * * * *
10677 TCATTATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGT
66 TCA-TATA-AA-CCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACT
10742 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAACTCCT
128 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAACTCCT
* * *
10783 ATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTGTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTGTA-
* * *
10848 TTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAA
65 TTCATATAAACCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAA
10913 GAGATTTAAAAAA
130 GAGATTTAAAAAA
10926 ATTAATTTGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.06, T:0.40
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ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTGTAT
TCATATAAACCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAG
AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAACTCCT
Found at i:11692 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 11657--11712 Score: 61
Period size: 18 Copynumber: 3.1 Consensus size: 20
11647 TATTTACCTA
*
11657 ACTAGTTCAAAT-AATTATG
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
11676 ACTATTT-AAA-CAATTAT-
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
11693 -CTATTTCAAATC-ATTATG
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
11711 AC
1 AC
11713 CTTTTATTTT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 1, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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ACTATTTCAAATCAATTATG
Found at i:11747 original size:357 final size:357
Alignment explanation
Indices: 10614--22953 Score: 7282
Period size: 357 Copynumber: 34.6 Consensus size: 357
10604 AATTTTAGTC
* ** ** * * *
10614 ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-
* * * * *
10679 ATT-ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGTA
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
10743 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AA--A---C-CA-A---CT-CCTATTTGAACATTTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
10796 TCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAA-TTGTTGTAGTTCATATAAACT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTA-TTCATACAAGCT
** * *
10860 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAG-AGATTTAAAA
258 TATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGTAGATTT-AAA
* * * * * * *
10924 AAATTAATTTGTTTATCC-AAGC-AATTTAAACAATTAAGACT
317 AAATAAATTTATTTA-CCTAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
10965 ATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * *
11029 GTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTCATTAATGTTTTAAAAATTAATAAGT-
66 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * * ***
11093 ---GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAT-AGCCATGCCAACAATT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATT
* * * * * * * ** *
11154 ATCTATTTCAAATTGGTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAGTTATATTTGA-AAATTCAAG
194 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATA-AAAAATT-TTTTTTATTCATACAAG
* * *
11217 CTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAA
256 CTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAAA
** * *
11282 AAATAAACCTATTTACCGAACTA-TCTCAAATAGTTATAACT
317 AAATAAATTTATTTACCTAACTAGT-TCAAATAGTTATGACT
** * * * * *
11323 ATTTGAACAATTATAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTTAT-AAACAATTATTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** * *
11386 GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTCCAAAAATTAATAACTA
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * * *
11451 AGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * **
11514 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATATTTTTTTTGAATTCATATTAGCT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTT--ATTCATACAAGCT
*
11579 TATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-GATTTAAAAAATA
258 TATTTGGAATAAAATAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAATA
* *
11643 ATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACT
322 AATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
11679 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * *
11744 TTCATATAAGTTTGTTCG-AATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTC--AAA-TATTAA-TC
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * *
11803 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAACACTATTTGAGCAATCA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * *
11868 TTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAGCTT
* ** * * * * * *
11933 ACTCAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAA
259 ATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAAAAAA
* * ** * ** * * *
11998 TAAATATGTTTGTCGAACTAAATCAAATAATCATGATT
320 TAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
12036 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG-TTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
12100 GTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TA
66 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-
* * *
12164 AAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAA-CATGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
12228 TATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAGC
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAGC
* * * *
12293 TTATTT-AAAAAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAACTAATAAGTAAAAGATTTAA
257 TTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT---AGATTTAA
* *
12355 AAAATAAATTTCTTTA-CTGAA-TAAGTTCAAATCA-TTATAACT
316 AAAATAAATTTATTTACCT-AACT-AGTTCAAAT-AGTTATGACT
* ** * * * ** * *
12397 ATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * *
12462 TTCATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
66 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * *
12526 AAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTATAGTAA-AAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAA
130 AGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCG-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * **
12590 TTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATGT
192 TTATCTATTTCAAATCGTTATGAC--CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTA-TTCATAC
* ** * * * *
12654 AAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGAA
253 AAGCTTATTTGGAA-TAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT---AGAT
* ** * * *
12717 TTAAAAAA-AGAATCTATTTA-CTAAAAAAGTTCAATTAGTTTTGATT
312 TTAAAAAATA-AATTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * *
12763 ATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTCTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
12828 TTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGT
66 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
12891 AA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAT
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** ** * * *
12954 AATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATTTTGTTCACAAAAGC
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTTTTTTTATTCATACAAGC
* *
13019 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
257 TTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATA-TTTC-AAAAATTAATAAGT---AGATTTAA
* * * *
13083 AAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATT
316 AAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * * *
13125 ATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * **
13190 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAATTTT
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * * * *
13255 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTAT
131 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * **
13320 CTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTA
196 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAGCTTA
*** * *
13385 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAAACTAAA
260 TTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * *
13449 TTTGTATACAAAATTAGTTAAAATAGTTATGACT
324 TTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
13483 ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * ** * *
13547 TTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
66 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * * * *
13611 AGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACAAATTGAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * ** * * *
13676 CCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAA-TTGTTTCAGTTCATACATGCT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTA-TTCATACAAGCT
* * ** * *
13740 TATTTGAAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAG
258 TATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAG-A-TTTAAA-
* * * * * * *
13804 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATAACT
317 AAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
13845 ATTTGAATAATTATCTATTT-AAAAC-TGTCATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-T-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * * * ** *
13908 AATTCACAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATGGAGAAGT
64 TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
* ** * * ** *
13973 TAA-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAAGCAGTTCAAATAATTATTTCCATTTGAACAAT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
14037 TATCTATTTGAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATACAA
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTTAT-TCATACAA
* *
14102 GCCTATTCT-GAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTA
255 GCTTATT-TGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTA
* ** * **
14166 AAAAATAAATATGCTCACAGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
315 AAAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
14209 ATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * *
14274 TTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTA
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
14338 AGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * ** * * *
14403 TCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTCATCTTAAAAAAATGTTTTTGCTCATAAAAGTTTG
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTA
*** * * * * *
14468 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTTTAAAAACTAATAAG-AGATTTAAAAAGTAAA
260 TTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
14532 TCTATTTACC-AAATCAATTCAAATAGTTATAACA
324 TTTATTTACCTAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
14566 ATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * * * * * * *
14630 ATTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAACAAGT
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * ** * * * * * * *
14694 AATG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACCAATACAAATAGTTATAATTGTTTGAATAT
129 AA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * **
14757 TTATCTATTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAA
192 TTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAA
* * *
14820 GCTGACTTGGAATAACATAAATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--
255 GCTTATTTGGAATAAAATAAA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAA
* * * * *
14883 --ACTAAATTTGTTTATC-GATTAAGTTCAAATAGTTATGACT
316 AAAATAAATTTATTTACCTAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
14923 CTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATT-TTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * * * *
14987 ATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACTAATTAG
65 ATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * ** *
15050 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCTT-TGACTATTTGAACAA
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAA
* * * ** * * *
15114 TTATTTATTTCAAACCGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAG
192 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAG
* * * * * **** *
15179 CCTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAA
256 CTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAAA
* * * * * * *
15244 AAATAAATATGTTGACCGAA-TAAGTTCTAATACTTATAACT
317 AAATAAATTTATTTACCTAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * **
15285 ACTTGAATAATTAT-TGATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAATTGTATCA
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
15348 ATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATGAGTA
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
15412 AGAGATTTAAAATATAAATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * *
15477 TTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAGCTT
* * *
15542 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAA
259 ATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA---AGTAGATTTAAAAA
* * * * * *
15606 ATAAATATGTTTACC-AAATAAATTCAAATAGTCATG-TT
319 ATAAATTTATTTACCTAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
15644 CATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCT
1 -ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * * * **
15709 GTTCATAC-AGAATTATT-TAGCATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAG
65 ATTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** ** * *
15772 --AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAACAAT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
15833 TATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTT-TTCATATAAG
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAAATT-TTTTTTATTCATACAAG
* ** * * * * ***
15896 CCTA-TCCGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAAA-TAA-ATG-AG-TTT---TGC
256 CTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
15949 CAAA-CTA--T--CAAACAAGCTCAAATAGATATG-GT
320 TAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * * ** * *
15981 CATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTAGTAATTTAAGAATTTTTTTT
1 -ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * * * *
16046 A-TCGTACACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTA
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
16110 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTG
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * *
16175 TATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTATGT
195 TCTATTTCAAATC------GT--T---AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTAT
* * * * * * *
16240 TTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTAATAACTAA
247 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT--
* ** * * * * *
16304 GAGATTTAAAAATTAAATTGGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACT
308 -AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
16355 ATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * *
16419 ATTCATACTAGCTTATTC-AGAATAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAG
65 ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
16481 TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAAC-AT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
16545 TATCAATTTGAAATCATTATCACC-TATG----GT-ATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGT
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAGC
* * * *
16604 TTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATATTAATATTACAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAAAAT
257 TTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAAT
*
16668 AAATCTT-TTTATC-AA--A---C--AT-G-T-T--C-
321 AAAT-TTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* **
16691 -----AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG-TTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * *
16749 GTTCATAAAAGCCTA-TCTAAA-ATAA-AAT-C-AAGTTGTATTAATATTTTAAAAGTTAATAAG
66 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
16809 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGGGCCATTTAAACAA
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAA
* * * * * * * * * *
16874 CTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTCCTTTTCAAT-ATAGAA
192 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTTATTCATACAA
* * * * *
16938 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAA-AAGATTTAAAAA
255 GCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAA
* * *
17002 ATAAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
319 AT-AAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * *
17042 A-TTGAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTG
1 ATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-
* * * * * *
17106 TGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAAT
64 TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
** * * * * *
17170 TAAGAGATTT-AAAAATAAATCCATTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAA-AAT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-
* ** * * * *
17232 TTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTCTTAATATAA
192 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTTATTCATACAA
* * ** * * *
17297 GTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTA
255 GCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT-AG--ATTTA
* * * * * *
17362 AAAAGTAAATCTATTT-GCTAAGCCATTTCAAATAGTTTTGACT
315 AAAAATAAATTTATTTACCTAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * **
17405 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCT
1 ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* ** * * * **
17470 ATTCATACTATTTTATATAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACC
65 ATTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** ** * ** * *
17534 AAGAAAATTCAAAAAATAAATATAATTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACGAT
129 AAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * *
17599 TATTTATTCCAAA-CTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCATTAACCAA-TTGTTTTATTTATACAA
193 TATCTATTTCAAATC-GTTATGACC-TTTTGTTTTGTCA-TAAAAAATTTTTTTTATTCATACAA
* * * *
17662 GCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
255 GCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAA
* * * *
17727 AAAATAAATTTATTTA-TTGAA-TCAGTTCAAATGGTTAAGATT
316 AAAATAAATTTATTTACCT-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * **
17769 ATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * *
17834 TTCATACAAACTTATTC-AGAAT-AATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGA
66 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
17896 AATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTATTACTATTTTAACAAA
129 AAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * ** *
17961 TGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAG
193 TATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTT-TTTTTATTCATACAAG
** * * * *
18024 CTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAA
256 CTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT-AG--ATTTAA
* * * * * *
18088 AAAATAAA-TCAGTTTA-TTGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCC
316 AAAATAAATTTA-TTTACCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * *
18130 ATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
18195 TATCACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
66 T-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** *
18260 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
18325 T-TAATCTCAAATCGTTAAGA--TTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATAGAAA
195 TCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTTTATTCATACAAG
* * * * *
18386 CTTATTTCG--T-TAAT--ACTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
256 CTTATTTGGAATAAAATAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTT--AA
* * ** * * * ** **
18446 AAAATAAATGTGTTTGTC-GAGTCAATTTGAATAGTTAAAACT
316 AAAATAAATTTATTTACCTAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
18488 ATTAGAATAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT-T
* * * * * *
18552 TATT-TTACAAGTTTATTCGGAATAAAATAAT-CAAAATTTATTAACA-TTCAGAAAATTAAAAA
64 TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAA
* * * * * * *
18614 GGAA-ATGATTTGAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAAA
127 GTAAGA-GATTT-AAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * ** * * * *
18678 CTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTTTAGTTCATAA
189 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTTA-TTCATAC
**** * * *
18743 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT-
253 AAGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAGA-TTTA
* * * * *
18807 -AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACT
315 AAAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * **
18849 ATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* *
18914 TTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGT-
66 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
18977 ---GATTT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * *
19037 ATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATGTAACAATTGTTTTTAATCATATATGTT
194 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAAAATTTTTTTTATTCATACAAGCT
*** * *
19102 TATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
258 TATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTT-AAAA
* * * *
19167 AATAAATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATGACT
318 AATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
19207 ATTTAAACAATTTTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** * *
19272 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * * *
19337 GAGATTTAAGAAAA-AAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTA
131 GAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
19401 TCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTCACTTCATACTAGCT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTA-TTCATACAAGCT
* * * * *
19458 TATTCGGAATAAAATAAAATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATGTAATAGACTTAAAAA
258 TATTTGGAATAAAATAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA---AGTAGATTTAAAAA
* *
19523 AT-AATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACT
319 ATAAATT-TATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* *** * *
19562 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * *
19627 TTCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-
66 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
19689 -G-GATTTTAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAATAATTA
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * ** ** * * * * ** * * **
19752 TTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTT
195 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAGCTT
*** * * * *
19817 ATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAAT
259 ATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGA-TTTAAAAAAT
* * *
19882 AAA-TCATTTACCAAACTAGATCAAATAGTTATGACT
321 AAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
19918 ATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATT-ATTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * ** *
19982 GTTCATATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTTTGAAAATTAAATAATT
66 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGT
* * * * * * *
20046 AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAAATA-ATATGACTATTTGAATAAT
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * ** *
20110 TATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGA-TTTTTCTATTCATACAAG
193 TATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAAAATTTTTTTTATTCATACAAG
*** *
20173 CTTATTACAAAT-AAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTA
256 CTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT---AGATTTA
* * * **
20234 GAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAAT-CCTATGACT
315 AAAAATAAATTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
20276 AATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG-TTTGTCAACAAAATAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * **
20340 AATCATACAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAATAGCTAATAAGT
65 ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * ** * * *
20404 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGTCTATTTTGAATAA
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTA-TTTGAACAA
* * *
20468 TTATCTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTG-TTTGT-A-AAAAACA-TTGTTTTAGTTCAATA-
192 TTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA-ATTTTTTTTA-TTC-ATAC
* * * * *
20528 AAGCTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTCA-TGA-A-TTCTAAAATTAAGAGAAAAG-AGAAT
253 AAGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---A-ATAAGTAG-AT
* * * * *
20588 TTAAAAAAT-AATTTGTTTATCAAAC-ATTTCAAATAGTTATGA-A
312 TTAAAAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
20631 ATCT-AACAATTATCTTTTTCAAAACATTGTGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
*
20693 TTTATACAAGCTTATTTCG-AAT-AAATAATA-TAATTTATTAAT-TATT-AAAAATTAATAAGT
66 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGT
* * ** * *
20753 AA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTT-CTTAACACA-TTTAAATAGTTATTGA-TTTTTGAACA
129 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-CAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACA
* * * * * *
20814 TTTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCG-TTTGTGATAAATCAATTATTTATATT-ATA-
191 ATTATCTATTTCAAATCG--TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTTTTTTTATTCATAC
* * * * *
20874 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAA-ATTTC-AAAATTAATAAATAAAATTTTA
253 AAGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGA-TTT-
* * * * * *
20937 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACT
314 AAAAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
20981 CTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTAAGATCTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* ** * *
21044 ATTCATATAATTTTATTTGAAAGAAAAT-ATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAA-
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAG
** * ** * * * * * ***
21106 TTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATGCACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTAT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
21171 TATCTATTTCAAATAGTTATGA--TATTTGTTTTGTCGTAAAACAA----TTAT-TTC-TATAAG
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTATTCATACAAG
* * *
21228 ---A-AT---A-AAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAAG-AGATTTAAAAA
256 CTTATTTGGAATAAAATA-AACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAGATTTAAAAA
* * * * *
21284 CTAAATTTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
319 ATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
21323 ATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGGTCATAAAA-AATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * *
21386 ATTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATATTACGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAG
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* *** * * *
21449 TAAGAGATTTACAAAAATAAATGTGTTTGTTGAA-CAGGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
128 TAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
21513 ATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTTTAGTCTTAAAATAA-TTTTTTCAGTTCATACA
191 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTA-TTCATACA
* * * * * * * **
21577 TGGTCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTATTA-TTCAAAAATT-ATAAACAGAATTTTAA
254 AGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAG-A-TTT-A
* *
21640 AAAAATAAATTTGTTTA-CTAAAC-AGTTTAAATAGTTATGA-T
315 AAAAATAAATTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * **
21681 ATTTGAACAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
21745 ATTCATAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGTT
65 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T
* ** * ** ** * * *
21809 AA-AGATTTAAAAAATAAGTCAATTAATTGAA-TTGCTTCAAATAATTATTG-CCATTTAAACAA
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAA
* * * * *
21871 TTATCTATTTTAAATTGTTTACGAACTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCA-TCATACA
192 TTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTT-ATTCATACA
* * * * * *
21935 AGCCTATTCGGAGTAAAGTAATATTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTT
254 AGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGA-TTT
* *
22000 CAAAAATAAATTTATTTA-CTGAACCAG-T----T--TT-T-A-T
314 AAAAAATAAATTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
22034 A--TGAACAATTATCTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATGAAATAATTG-TTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * * * * *
22096 GCTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACT
66 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * *
22161 AACAGATGTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAACAATTAAGACTATATGAACAATT
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *** * * * * *
22226 ATCTGTTTATAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTCATGT-ATAAACAATTGATTTTTA-TCATTCA
194 ATCT-ATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT--TGTCATAAAAAATT-TTTTTTATTCATACA
* * * **
22289 AGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAACCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
254 AGCTTATTTGGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AGATTTA
* * *
22354 AAAAATAAATCTGT-TTTA-GTAAACTAATTCAAATA--TATAACT
315 AAAAATAAAT-T-TATTTACCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * *
22396 ATTTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTTATTT
1 A-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT
* * *
22460 TTGTTCATACAAGC-TA-TCAAAATAAAAT-ATACTAATTCTAATAATATTTCAAAAA-TAAT-A
63 TTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
22520 CTAAGGAGAATT-AAAAAT-AATTTGTTCTGCGCGAACCAGTTCAAACATTTAAGACTATATGAA
127 GTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TAC-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
22583 CAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATAAGTTTTTTCTCAATTCAT
189 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTTTTT-T-TATTCAT
*
22648 ACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTT
251 AC-AAGCTTATTTGGAATAAAATAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTT
* * * *
22711 --AAAATAATTTTATTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACT
314 AAAAAATAAATTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** ** * *
22753 ATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAA-TGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * * * * * *
22817 TT-TTATAAG-TTTTTTGGAATAAAGTAATACAAATATATTTTAA-ATATTC--AAATAAATTAG
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-T-TATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAG
* * * **
22877 TAAGAGATTT-AAAAATAAA-CTATTTATCAAATGAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGTC
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA--C
*
22940 AATTATTTATTTCA
190 AATTATCTATTTCA
Statistics
Matches: 9324, Mismatches: 2096, Indels: 1133
0.74 0.17 0.09
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTAT
TTGGAATAAAATAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAATAAATT
TATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
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10638 TTGTTACAAA
* * * * *
10648 CTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATT-ATACAAGCCTA-TTCAAAATAAAATAATAT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
*
10711 TAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC----CA
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
* * * * * ** * * *
10772 A--AC-CA-A---CT-CCTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGT
126 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * *
10829 CATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
191 CATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * ** * * *
10894 TCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAAATTAATTTGTTTATCCAAGCAA-TTTAAACAAT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATAGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
10958 TAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
318 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
11023 GTTTTAGTTCATACAA-TCTTA-TTCAAAATAAAATAATAATAATTCATTAATGTTTTAAAAATT
383 GTTTCAGTTCATACAAGT-TTACTT--GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * ** * * * **
11086 AATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAT-AGCCATGC
445 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAAAAATTCAAATAGTTATGA-CTATTT
* * *** *
11146 CAACAATTATCTATTTCAAATTGGTATTAC
508 AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *** * ** *
11176 CTTTT-TTTTGGTCATATAACAGTTATATTTGAAAATTCAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATAC
1 CTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
11239 TACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACT
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
** * * * *
11304 A-TCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATT
126 AGT-TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTT
* * * * **
11367 GTTAT-AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATCTAACAA
189 GTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *** ** *
11430 TATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATAT
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAG
* * * ** * * *
11493 TTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATATT
317 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-A
* * * ** * * *
11558 TTTTTTGAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAA
381 TTGTTTCAGTTCATACAAGTTTACTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAA
* * ** * *
11621 TTAATAAGT----GATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATT
443 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATT
*
11682 TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
507 TAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
11713 CTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTC-GAATAAAGTAATA-
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
11774 CAATTCTATTAATATTTCAAATATTAATCAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACTAG
65 TAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAG
* * * * * *
11838 TTTAAATAGTTA-ACACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATT
128 TTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * *
11902 ATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTACTCAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT
192 ATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * * *
11967 TTAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTGTCGAACTAA-ATCAAATAATCA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAAC-AAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
12031 TGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG-
320 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
12095 TTCTAGTTCATATAAGCTTA-TTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAA
385 TTC-AGTTCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * ** * *
12159 TAA-TAAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAACATGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
447 TAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAA
* * ** *
12223 ACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAAC
510 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * **
12251 CTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-AAAA-AAAATAATACA
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * * *
12314 AATTTATTAATA-TT-AAGACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTGAAT
66 AATTTATTAATATTTCAA-A-AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* ** * * * **
12377 AAGTTCAAATCA-TTATAACTATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTT
125 AAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTT
* *
12441 GTCATAAAACAATTGTTTGTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT
189 GTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*
12506 ATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTATAGTAA-AAGTTCAAAT
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTATAG-AACAAGTTCAAAT
* * * * *
12570 AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAA
315 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC--CTTTTGTTTTGTCATAAAA
** * * *
12635 CAATTGTTTCAGTTCATGTAAGTTTGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTGAAA
378 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTACTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * *
12700 ATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAATTAGTTTTGATTA
442 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTACTAAAAAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* *
12764 TCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGAC
505 TTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
12797 TTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT-TT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * * * * *
12860 AAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACAC
66 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA-
* * *
12925 A-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
126 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * * *
12989 CATAAACCCATTGATTTTGTTCACAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A
191 CATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * *
13052 CTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAG
254 -TTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAG
* ** * * * * * *
13117 TTATGATTATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
317 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
13182 TGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATT
382 TGTTTC-AGTTCATACAAGTTTACTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* *** * * * * * *
13246 AATAATTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATGTCCATTTG
445 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTT-
* * **
13311 AACT-ATTATCTATTTGAAATTGTTATGAC
508 AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * ** *
13340 ATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * * * * ** ** *
13404 AATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTA
66 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTC
* * * *
13469 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGA-TCTTTGTTTTGTCATAA
131 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * *
13533 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAA
196 AACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
13598 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTA-AACAAATTGAAATAGTTAAGAC
260 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TAGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** *
13662 TATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCA
324 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * * * ** * * *
13727 GTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCA
389 GTTCATACAAGTTTACTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * *
13792 AGAAG-TTTAAAGAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
453 A-AAGATTTAAA-AAATAAATCTATTTACT-AAA-AAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
* *
13855 TTATCTATTT-AAAAC-TGTCATAAC
514 TTATCTATTTCAAATCAT-T-ATGAC
* ** * * * *
13879 CTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTTTAATTCACAAAAGCCTA-TCCAAAATAAAATAATATT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * *
13943 ACTTTATTAATATTTCAAAAATGGAGAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAAG
66 AATTTATTAATATTTCAAAAAT---TAA--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAA-
* ** * * *
14006 C-AGTTCAAATAATTATTTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCTTTATGA-TCTTTTGTTT
124 CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTT
* * * *
14069 TGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCTGAATAAAATAATGCTAATTTATT
188 TGTCATAAAACAATTG--TTTTAT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * *
14134 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTCACAGAACTAGTTCAAAT
250 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAAT
* * *
14199 AGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
315 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
14264 ATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTA-TTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAA
380 ATTGTTTCA-GTTCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * * * * * *
14327 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTAT
442 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-AAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * *
14392 ATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGAC
506 TTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
14424 CTTTTGTTTCATCTTAAAA-AAATGTTTTTGCTCATAAAAG-TT-TGTTCAAAATAAAATAATAT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTCAAAATAAAATAATAT
* * * * **
14486 TAATTTATTGATATTTTAAAAACTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATCAA-T
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGT
* * * * **
14550 TCAAATAGTTATAACAATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCAT
129 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * *
14615 AAAATAATTTTTTCTATTGATACTATCTTATTC-GAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TC
194 AAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * * ** * *
14678 CTAAAAATTAACAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCT-GACCAA-TACAAATAGTT
257 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT--TATAGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
14741 ATAATTGTTTGAATATTTATCTATTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAATAATT
319 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** ** * * *
14804 GTTTTTGTTTGTACAAGCTGACTTGGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
383 GTTTCAGTTCATACAAGTTTACTT-GAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * ** * * *
14867 AATAAGTAAAAGATTT----ACTAAATTTGTTTATCGATTAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTG
445 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * *
14928 AACAATTATTTATTTCAAATTACTATAAC
509 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
14957 CTTTTGTTTTGTCACAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAC
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * * *
15020 AAATTTATTAATATTTAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAAT
65 TAATTTATTAATATTT---CAA-AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* * * * ** *
15084 AAGTTTAAATAGCTT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAACCGCTATGATTTTTTGTTTT
125 AAGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTT
* * * * * * * *
15148 GTCATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAGCCTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAA
189 GTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
**** * * ** * * *
15213 ATTTTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGACCGAATAAGTTCTAATACT
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAGT
* * * ** *
15278 TATAACTACTTGAATAATTAT-TGATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAAT
318 TATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
15341 TGTATCAATTCATATAGGCTTA-TTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTC-AAAAATT
382 TGTTTCAGTTCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * ** * *
15404 AATGAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTG
445 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTA
* *
15469 AATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGAT
509 AATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * * * * * *
15498 ATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAAATAAAATAATACT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * * ** *
15562 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATA
66 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
* * ** * * *
15626 AATTCAAATAGTCAT-GTTCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
126 AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
15690 TCGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AGAATTATTTAGCATAAAATAATGCTGATTCATTAAG
190 TCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * **
15754 ATTTTGAAAATTAATAAG----AG-TATTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAG
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
15814 TTATGATTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAAT
317 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * ** * * * *
15878 TGTTTCTTTTCATATAAGCCTA-TCCGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAAA-T-
382 TGTTTCAGTTCATACAAGTTTACT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* **** ** * * * *
15936 A-AA-T--GAG-TTT---TGCCAAA-CTA--T-C-AAACAAGCTCAAATAGATATG-GTCATCTC
446 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-AAATTCAAATAGTTATGACT-ATTTA
* ** *
15987 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTAC
509 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * ** * * * * * *
16016 TTTTTG-TTTAGTAATTTAAGAATT-TTTTT-TATCGTACACGGTT-GTTCAAAATAAAATAACA
1 CTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATA
* * * * *
16077 CTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAA
64 TTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA
* * * * * *
16141 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATAT
124 CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC----A--T--T---AT-G
* * * * * * *
16206 ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATA
177 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* * * * * * * ***
16270 GTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAAT-TGGTTTGCCGA
240 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATAGA
* * * * * * *
16333 ACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTCTTT
303 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
16398 TGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAGTAA-AATGAATTTATT
368 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * ** *
16461 AATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAATTCTAAT
430 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAAAAATTCAAAT
* * * * * *
16525 AATTATGACTATTTGAA-CATTATCAATTTGAAATCATTATCAC
494 AGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * ** **
16568 C-TATG----GT-ATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTT-GGAATAAAATAATGCT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * *
16626 AATATATTAATATTACAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT--T-ATCAA----
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* * ** *
16683 ACAT-G-T-T--C------AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-A
131 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
16736 AACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCCTA-TCTAAAATAAAATCA-AGT--TGTATTAATATTTTA
196 AACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * *
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* * * * *
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* * ** *
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508 AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
17076 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTGTGTTTATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATAC
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * *
17140 TAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAATAAATCCATTTGCTGAAC
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * * * *
17203 TAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTT
125 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTT
* * * * * * * *
17266 GTCATAAAACAATTGCTTTTTCTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAA
189 GTCATAAAACAATTG--TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * * * * *
17331 TATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCTA-AGCCATTTCAAAT
252 TATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATAGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
17395 AGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAAC
315 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
17460 AATTGGTCCTA-TTCATACTATTTTA-TATAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAA
379 AATTGTTTC-AGTTCATACAAGTTTACT-T-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA
* ** * * * * * **
17522 AACTTAATAACCAAGAAAATTCAAAAAATAAATATAATTGT-C-AAACCAGTTCAAATAGTTAAA
440 AAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACTAAA-AAATTCAAATAGTTATG
* * ** * * *
17585 ACTATATGAACGATTATTTATTCCAAA-CTGTTATGAC
501 ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGAC
* * * * ** * *
17622 CTTTTTCTTTTGTCATTAACCAATTGTTTTAT-TT-ATACAAGCTTATTT-TGATTAAAATAATG
1 C-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATA
* * * *
17684 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAAT
64 TTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-
* * * * * *
17749 C-AGTTCAAATGGTTA-AGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGA-TCTTTTGTT
124 CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTT
* * * *
17811 TAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAGAAT-AATTAATACTAATTTATTA
187 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
17875 ACA-TTCAAAAAATTAATAAG-AAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCG
251 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAA-ATAAATATGTTTA-TAGAACAAGTTCA
* * * * * * * * * * * *
17937 AATAATTATTACTATTTTAACAAATGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAA
312 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
18000 AACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACT
376 AACAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTA-CTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CT
* * ** * * *
18065 -AAAA-TAATAAGTAAGAA-ACTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTAT
438 AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAAAAATTCAAATAGTTAT
* * ** *
18126 -AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
500 GA-CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
18164 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTTATCACATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATGATAT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * *
18228 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAAT
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* * * * * * *
18292 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGA-TTTATGTTTT
125 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTT
* * * * * *
18355 ATCATAAAATAATTGTTTT-TGATCATAGAAACTTATTTC-G--T----TAATACTAATCTAATA
189 GTCATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * **
18412 ATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTTGA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATATGTTTATAGA-ACAAGTTCAA
** * * * *
18476 ATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
313 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
** * *
18541 -AATTTGTTTCA-TATTTTACAAGTTTA-TTCGGAATAAAATAAT-CAAAATTTATTAACATTC-
378 CAA-TTGTTTCAGT-TCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCT
* * * * ** * * *
18601 AGAAAATTAAAAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGA
438 A-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTACTAAA-AAATTCAAATAGTTA
* *
18666 TGACTATTTAAACT-ATTATTTATTTAAAATCATTATGAC
499 TGACTATTTAAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
** * * * * *
18705 CAGTTGTTTTGA-CATAAAACATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATAC
1 CTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
18768 TAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAA
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAA
* * * * * * *
18831 ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * *
18896 ATAAAATAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** *
18960 TTCAATAATTAATAAGT----GATTT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAATT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * **
19019 ATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATGTAACAATTG
319 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * *
19084 TTTTTA-ATCATATATGTTTA-TTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATT
384 -TTTCAGTTCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * *** *
19146 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTT
445 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAA-AAATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
19211 AAACAATTTTATACTTCAAATCATTATAAC
508 AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
19241 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* ** * * * * *
19305 AATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAGAAAA-AAATTTGTTT-GTCAAAC
66 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* * *
19368 TAGTACAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG--TTTTTGTTTT
125 AAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTT
* * *
19425 GTCATAAAACAATT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTA
189 GTCATAAAACAATTGTTTT-A-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * * *** *
19488 ACATTTCAAAAATTAATATGTAATAGACTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATA
* * * *** *
19553 ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA
316 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
19618 ATGTTTTTA-TTCATATAAGTTT-GTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAA
381 TTG-TTTCAGTTCATACAAGTTTACTT--GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * * * *
19680 ATTAATAA-T---GGATTTTAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTA
442 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA-AAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** ** *
19740 TTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAAT
505 TTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * ** * * * ** * * *
19773 TTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTA-TTCATATTAAAATAATACT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * * ** *
19837 AATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATC-ATTTACCAAACTAG
66 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAG
* * * * * * * * *
19901 ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTA
128 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * *
19966 TAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATT
193 TAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * * *
20029 TTGAAAATTAAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACT-GAACAAGTTTAAAATA-A
256 TCAAAAATT-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TAGAACAAG-TTCAAATAGT
* *** * * ** **
20092 TATGACTATTTGAATAATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGAT
318 TATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* *
20156 T-TTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TT-ACAAATAAATAATAC-AATTTATTAATA-T-TAAGACA
382 TGTTTC-AGTTCATACAAGTTTACTTGA-ATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-A
* * * * * ** *
20214 ATTAATAGGTAAAAGATTTAGAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-CCTATGACTAA
442 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-AAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * **
20278 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC
506 TTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * ** * *
20310 TTTTTG-TTTGTCAACAAAATAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATAT
1 CTTTTGTTTTATC-ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * * * *
20373 TAATTTATAAATATTTCAATAGCTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAAC
65 TAATTTATTAATATTTCAA-A---AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
** * * *
20437 AAGTTCAAATAGTCT-TGTCTATTTTGAATAATTATCTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTG-T
125 AAGTTCAAATAGT-TATAACTA-TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTT
* * *
20500 TTGT-AAAAAAC-ATTGTTTTAGTTCAATA-AAGCTTATT-TGAA-ATAAATAATACTAATTCA-
187 TTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTC-ATACAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
20559 TGA-A-TTCTAAAATTAA-GAGAAAAGAGAATTTAAAAAAT-AATTTGTTTATCA-AAC-ATTTC
249 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-AGAACAAGTTC
* * * * * *
20618 AAATAGTTATGA-AATCT-AACAATTATCTTTTTCAAAACATTGTGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
311 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
20680 AACAATTG-TTCTA-TTTATACAAGCTTATTTCGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAT-TAT-T
376 AACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGTTTACTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCT
* * * * *
20739 AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTT-CTTAACACATTTAAATAGTTATT
438 AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAC-TAAAAAATTCAAATAGTTA-T
* * * * *
20802 GA-TTTTTGAACATTTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-
500 GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATC--ATTATGAC
* * * * * * * *
20840 C-TTCG-TTTGTGATAAATCAATTATTTATATT-ATA-AAGCTTATTT-AGAATAAAATAAT-TC
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT-
* * * * * * *
20899 TTATTTATTAA-ATTTC-AAAATTAATAAATAAAATTTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCG
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-GAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
* * * * * *
20962 AGTTTAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTAAGATCTTTTTGTTTTG
126 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTG
* ** * *
21026 TCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATATAATTTTATT-TGAAAGAAAAT-ATACTAATTTATTAAT
190 TCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*** * * ** *
21088 A-TTCTAAAAATTAATGAA-TTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATGCACCA-AACAAGTTCAAAT
253 ATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TAGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
21150 AGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA--TATTTGTTTTGTCGTAAAA
315 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
21212 CAATTATTTC---T-AT--AAG---A-AT--A-AAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAA
378 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTACTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * * *
21264 TTAAT--G-AAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTA-TCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTAT
443 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA-AAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * *
21325 TTCAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAT
506 TTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
21357 C-TTTGTTTTGGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATATTAC
1 CTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * **
21419 GAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTACAAAAATAAATGTGTTTGTTGAA
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTATTTACTGAA
* * * * * *
21483 CAGGTTTAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTTT
124 CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT
* * * * * * *
21547 AGTCTTAAAATAATT-TTTTCAGTTCATACATGGTCATTC-GAAATAAAATAATATTAATTTATT
188 TGTCATAAAACAATTGTTTT-A-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * * *
21610 ATTA-TTCAAAAATT-ATAAACAGAA-TTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTA-AAC-AGTTTAA
250 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTA-TAGAACAAGTTCAA
* ** * * *
21670 ATAGTTATGA-TATTTGAACAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATAACCTTTTGTTTTATCATAAA
313 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * ** * * *
21733 ACGATTGTTTCAATTCATAAAAGCATA-TCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCA
377 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTACT-TG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A
* * * * * **** *
21796 AAAATTAA-AAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTCAATTAATTGAATTGCTTCAAATAATTATTG-
439 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAAAAATTCAAATAGTTA-TGA
* * * ** * *
21859 CCATTTAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTACGAA
502 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAC
* * * * ** * ** * *
21896 CTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCATCATACAAGCCTA-TTCGGAGTAAAGTAATATT
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATATT
* * * *
21960 AATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTCAAAAATAAATTTATTTACTGAACC
66 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
* * * * * *
22025 AG-T----T--TT-T-A-TA--TGAACAATTATCTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTAT
126 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * * * * ** *
22078 TATGAAATAATTGTTTCAGCTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAAATTTAATAATA
191 CATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * * * ** * *
22143 TTCCAAAAATTGATAACTAACAGATGTAAAAAATAAATCTATTTGCCA-AAGC-AGTTCAAACAA
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATAGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * ** * *
22206 TTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTCATGT-AT-AAA
317 TTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTT--TGTCATAAAA
* * ** * *
22269 CAATTGATTT--TTATCATTCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAACCT-TTC-
378 CAATTG-TTTCAGT-TCATACAAGTTTACTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTCT
* * * * *
22330 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTAGTAAACTAATTCAAATA--TATA
438 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACTAAA-AAATTCAAATAGTTATG
* * * ** *
22393 ACTATTTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATC
501 ACTA-TTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C
* * * *
22431 CTTTTGTTCTATCACAAAACAATTTATTTTTGTTCATACAAGC-TA--TCAAAATAAAAT-ATAC
1 CTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAAATAAAATAATAT
* * * * * * *
22492 TAATTCTAATAATATTTCAAAAATAATACTAAGGAGAATT-AAAAAT-AATTTGTTCTGCGCGAA
65 TAATT-TATTAATATTTCAAAAAT--TAATAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TAC-TGAA
* * * * * *
22555 CCAGTTCAAACATTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTT
124 CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT
* * ** *
22619 TGTCATAAATA-AGTTTTTTCTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTT
188 TGTCATAAA-ACAATTGTTT-T--ATTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTT
* * * *** * *
22681 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT--AAAATAATTTTATTTACCTAACCAGTTTA
247 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCA
* * ** *
22740 AATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAA
312 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
** * * * * * *
22805 ACAA-TGTTTTTGTT-TTATAAGTTT-TTTGGAATAAAGTAATACAAATATATTTTAAATATTC-
377 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTACTT-GAATAAAATAATACTAAT-T-TATT-AATATTCT
* * * **
22866 --AAATAAATTAGTAAGAGATTT-AAAAATAAA-CTATTTA-TCAAATGAGTTTCAAATAGTTAT
438 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA--AAATTCAAATAGTTAT
* *
22926 GACTATTTGAAGTCAATTATTTATTTCA
500 GACTATTT-AAAT-AATTATCTATTTCA
Statistics
Matches: 9186, Mismatches: 1939, Indels: 1299
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
506 19 0.00
507 34 0.00
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AACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
TCATACAAGTTTACTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA
GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTA
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
16931 TATAGAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAAT-A--AA-A
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* **
16992 GATTTAAAAAATAAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTA-TTG
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* * * * * * *
17046 AAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTGTGTTT
1 -AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTT
* * * *
17111 ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGA
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* * * *
17175 GATTT-AAAAATAAATCCATTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATG
127 GATTTAAAAAATAAAT-CATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* * * * * *
17227 AA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTCTTA
1 AACAA-TTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTT
* * * * * *
17291 ATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGA
64 ATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
17356 TATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCT-AAGCCATTTCAAATAGTT-TTGACTATTTG
127 GATTTAAAAAATAAATC-ATTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * ** * * * * *
17410 AATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTATTCA
1 AACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* ** * * * ** *
17475 TACTATTTTATATAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAA
65 TACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AG
* * * * * *
17540 ATTCAAAAAATAAAT-ATAATT-GTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATG
128 ATTTAAAAAATAAATCAT--TTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* * * * * * *
17593 AACGATTATTTATTCCAAACTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCATTAACCAATTGTTT-TATTTA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
** * * *
17657 TACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 TACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
17722 TTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTTA-AGATTATTAG
129 TTTAAAAAATAAA-TCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * * * *
17774 AACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGA-TCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* * * * * *
17838 TACAAACTTATTCAGAAT-AATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAATAG
65 TACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
** * * * *
17901 ATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTATTA-CTATTTT
128 ATTTAAAAA-ATAAATC-ATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTA-TAGCTATTTG
* * * * * * * * * *
17955 AACAAATGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACATTTGTTTCAATTAA
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* ** * * * *
18018 TACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAA
65 TACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * *
18082 ACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTATAGCCATTTG
128 ATTTAAAAAATAAATCA-TTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* * *
18135 AACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-T-TTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
* *
18198 CACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
66 -AC--AAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
** *
18263 GATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-TCGAATTAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTA
127 GATTTAAAAAATAAATCA--TTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * * * * * *
18317 AACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGA-TTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGA-TC
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTT
* * *** * * *
18379 ATAGAAACTTATT----T-CGTTAATACTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGA
64 ATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** ** * ** * * *
18439 TTTAAAAAAAATAAAT-GTGTTTGTCGAGTCAATTTGAATAGTTAAAACTATTAG
129 TTT--AAAAAATAAATCAT-TTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* * * * *
18493 AATAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTGTTTCATATTT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTC-TATTT
* ** * * * *
18557 -TACAAGTTTATTCGGAATAAAATAAT-CAAAATTTATTAACA-TTCAGAAAATTAAAAAGGAA-
64 ATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAG
* ** * * *
18618 ATGATTTGAAAAAATAAAAT-TTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGAT-GACTATTTA
126 A-GATTT-AAAAAAT-AAATCAT--TTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * ** *** * * *
18676 AACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTT-TAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTA
* * * * *
18740 TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-
65 TACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * *
18804 TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTAT-GACTATTTG
129 TTTAAAAAATAAA-TCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * ** * * ** *
18854 AACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
*
18919 ACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGT----GAT
66 ACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * * * *
18980 TT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTC
130 TTAAAAAATAAA-TCATTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
** * * * * ** * * *
19030 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATGTAACAATTGTTTTTAATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
* * * * *
19095 ATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** ** * *
19160 TTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTAT-GACTATTTA
130 TT-AAAAAATAAAT-CATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * ** * * * * * *
19212 AACAATTTTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
* * ** * *
19277 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAT
66 ACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * *
19342 TTAAGAAAA-AAAT-TTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTA-AGACTATATG
130 TTAA-AAAATAAATCAT-TTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* *
19393 AACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-ACTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTA
* ** * * * *
19450 TACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATGTAATAG
65 TACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *
19514 ACTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTAT-GACTATTTG
128 ATTTAAAAAATAAATC-ATTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * * * * *
19567 AACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
* * * * *
19632 ATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--G-GAT
66 ACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * *
19693 TTTAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACTAGTTTAAAAAGTTAT-GACTATTTG
130 TTAAAAAATAAA-TCATTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * ** * * * * * ** *
19744 AATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
* ** * * * *
19809 AAAAATTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-A-AT
66 ACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-
** * *
19872 TTTAAAAAATAAATCATTTACCAAACTAGATCAAATAGTTAT-GACTATTTG
129 TTTAAAAAATAAATCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * ** * * * * * * *
19923 AATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATTT-TAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTA
* * ** *
19987 TATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTTTGAAAATTAAATAATTAAGAG
65 TACAAGCTTATTA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAGAG
* * * *
20051 ATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA-A-TAATATGACTATTTG
128 ATTTAAAAAATAAATC-ATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATA-G-CTATTTG
* * * * ** ** *
20104 AATAATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATT-TTTCTATTCA
1 AACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* *
20167 TACAAGCTTATTACAAAT-AAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAA
65 TACAAGCTTATTA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGA
* ** * * ** *
20228 GATTTAGAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-CCTAT-GACTAATTG
127 GATTTAAAAAATAAA-TCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * * * *
20281 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG-TTTGTCAACAAAATAATTGTTTCTAATCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* * * * * ** *
20345 TACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAATAGCTAATAAGTAAAAGA
65 TACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* *
20410 TTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-T-GTCTATTTTG
129 TTTAAAAAATAAATCA--TTTACTGAACCAGTTCAAATAGT-TATAG-CTA-TTTG
* ** * * *
20463 AATAATTATCTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTG-TTTGT-AAAAAAC-ATTGTTT-TAGTTC
1 AACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT-
* * * * * * *
20524 AATA-AAGCTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTCA-TGA-A-TTCTAAAATTAA-GAGAAAAG
63 TATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAG
* ** * * * ** *
20583 AGAATTTAAAAAATAATTTGTTTA-TCAAACATTTCAAATAGTTAT-GAAATCT-
126 AG-ATTTAAAAAATAAATCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* *** *
20635 AACAATTATCTTTTTCAAAACATTGTGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCTATTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
** *
20698 ACAAGCTTATTTCGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAT-TATT-AAAAATTAATAAGTAA-AAA
66 ACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
20758 TTTTAAAAAATAAAT-ATGTTTCTTAACACA-TTTAAATAGTTATTGATTTTTG
129 -TTTAAAAAATAAATCAT-TTACTGAAC-CAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* * * * * * *
20810 AACATTTATCTATTTCAAATCGTTTTATGAC--TTCG-TTTGTGATAAATCAATTATTTATA-TT
1 AACAATTATCTATTTCAAAT--TGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTT
* * * *
20871 ATA-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAA-ATTTC-AAAATTAATAAATAA-A-
64 ATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
20931 ATTTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTAT-GACTCTTTG
128 A-TTT-AAAAAATAAATC-ATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * *
20986 AACAATTATTTATTTCAAA-TGTTAAGATCTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* ** * * **
21049 TATAATTTTATTTGAAAGAAAAT-ATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAA-TTGGA
65 TACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAGA
** ** * * *
21111 GATTTAAAAAATAAATCTATGCACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-GTCCATTTG
127 GATTTAAAAAATAAATC-ATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
*** * * * *
21165 AGTTATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-TATTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTC----TAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
* * *
21225 --AAG------AATA-AAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G-AAGAGATT
66 ACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
21278 TAAAAACTAAATTTATTTA-TCAAACCAGTTTAAATAGTTAT-GACTATTTC
131 TAAAAAATAAA-TCATTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * ** * *
21328 AATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
* * * * *
21391 TACAAGCTTATTCAAATTAAAATATTACGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
65 TACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
** ** * *
21455 ATTTACAAAAATAAATGTGTTTGTTGAA-CAGGTTTAAATAGTTA-AGACTATTAG
128 ATTTA-AAAAATAAAT-CATTTACTGAACCA-GTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
** * * * * * * * *
21509 AACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTTTAGTCTTAAAATAATTTTTTC-AGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTA
* * * * * *
21573 TACATGGTCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTATTA-TTCAAAAATT-ATAA--ACAGA-
65 TACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAG
** * * *
21633 ATTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACAGTTTAAATAGTTAT-GATATTTG
128 A-TTT-AAAAAATAAA-TCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
** * * * * * *
21686 AACAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCAATTC
1 AACAATTATCTATTTCA-AA-TTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTT
* * ** * *
21749 ATAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGTTAA-A
64 ATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGA
* * * ** * * * *
21812 GATTTAAAAAATAAGTCAATTAATTGAA-TTGCTTCAAATAATTATTGCCATTTA
127 GATTTAAAAAATAAATC-ATTTACTGAACCAG-TTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* * * * * *
21866 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTTACGAAC-TTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCA-T
1 AACAATTATCTATTTCAAATTG-TTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATT
* * ** * * * *
21929 CATACAAGCCTATTCGGAGTAAAGTAATATTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
63 TATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* *
21994 GATTTTCAAAAATAAATTTATTTACTGAACCAG-T----T--TT-TA--TA--TG
127 GA-TTTAAAAAATAAA-TCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
* ** * * * * * * * * * *
22037 AACAATTATCTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATGAAATAATTGTTTC-AGCTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTA
* * ** * * * * *
22101 TATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAACAG
65 TACAAGC-TTATTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * * *
22166 ATGTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAACAATTA-AGACTATATG
128 ATTTAAAAAATAAATC-ATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
* * *** * *
22219 AACAATTATCTGTTTATAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTCATGT-AT-AAACAATTGATTTTTA
1 AACAATTATCT-ATT-TCAAATTGTTATGACTTTTTGTTT--TGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
* * * * * **
22282 -TCATTCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAACCTTTCAAAAATTAATAAGTAA
61 TTTATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
22346 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTAGTAAACTAATTCAAATA--TATAACTATTTTG
125 GAGATTTAAAAAATAAATC--ATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTA-TTTG
* ** * ** * * * * * * * *
22402 AACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTTATTTTTGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTT
* * *
22466 ATACAAGC-TATCAAAATAAAAT-ATACTAATTCTAATAATATTTCAAAAA-TAAT-ACTAAGGA
64 ATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GA
* * ** * * * * *
22527 GAATT-AAAAATAATTTGTTCTGCGCGAACCAGTTCAAACATTTA-AGACTATATG
127 GATTTAAAAAATAAATCATT-TAC-TGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
** * * * *
22581 AACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATA-AGTTTTTTCTCAATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT--ATT
* ** *
22645 CATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAA
63 TATAC-AAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
22704 GAGATTT--AAAATAATTTTATTTACCT-AACCAGTTTAAATAATTAT-GACTATTTG
125 GAGATTTAAAAAATAA-ATCATTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATAG-CTATTTG
** * *
22758 AATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAA-TGTTT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
22814 TTGTTTTATA
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Consensus pattern (179 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTAT
ACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAAATAAATCATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATAGCTATTTG
Found at i:18813 original size:719 final size:710
Alignment explanation
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Period size: 719 Copynumber: 2.8 Consensus size: 710
17669 TTGATTAAAA
* * *
17679 TAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT
1 TAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTAT
* * * * * * *
17744 TGAATCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTG
66 CGAATCAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCTTTTG
* *
17809 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAGAATAATTAATACTAATTTATT
131 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAGAATAAATAATACAAATTTATT
* * *
17874 AACATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAA
196 AACATTCAAAAAATTAAAAAGAAATAGATTTAAAAAGATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * *** **
17939 TAATTATTACTATTTTAACAAATGTTAATTTAAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACA
261 TAATGATGACTATTTAAACAAATATTAATTTAAATCATTATAACCAGTTGATTTCACATAAAACA
* *** * * *
18004 TTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA
326 TTTGTTTCAATTAATAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTACAAAAA
* ** ** *
18069 TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATT
391 TAATAAGCAAG-AACTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAACAAATTAAAATAATTATGA-CCATT
* * * * * ***
18133 TGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTTAT
454 TGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTGAAT-T
* * *
18198 CACATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
518 CACACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---
* * * *
18262 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
579 -GATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTAT
18326 TAATCTCAAATCGTTAAGATTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAACTTAT
641 TAATCTCAAATCGTTAAGATTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAACTTAT
18391 TTCGT
706 TTCGT
* *
18396 TAATACTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTT
1 TAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATGTATTT
* * ** * * * *
18461 GTCGAGTCAATTTGAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATTATTTTGACCTTT
64 ATCGAATCAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCTTT
* * ** *
18526 TGTTTTGTCATAAAA-AATTTGTTTCATATT-TTACAAGTTTATTCGGAATAAAATAAT-CAAAA
129 TGTTTAGTCATAAAACAA-TTGTTTCA-ATTCATACAAACTTATTCAGAAT-AAATAATAC-AAA
* * *
18588 TTTATTAACATTCAGAAAATTAAAAAGGAAAT-GATTTGAAAAA-ATAAAATTTGCTTACCAAAC
190 TTTATTAACATTCAAAAAATTAAAAA-GAAATAGATTT-AAAAAGAT-AAATCTACTTACCAAAC
* * * * * * *
18651 AAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTG
252 AAGTTCAAATAATGATGACTATTTAAACAAATATTAATTT-AAATCATTATAACCAGTTGATTTC
* * * ** *
18716 ACATAAAACATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA
316 ACATAAAACATTTGTTTCAATTAATAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** *
18781 ATT-CAAAAATTAATAAGCAAG-AGTT-TAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATT
381 ATTACAAAAA-TAATAAGCAAGAACTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAACAAATTAAAATAATT
* * * *
18843 ATGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
445 ATGACCATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* *
18908 TTTGAATTCATACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAAT
510 TTTGAATTCACACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * *
18973 AAGTGATTTAAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAGTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTA
575 AAGTGATTTAAAAATAAATATGTTTACCGAATCAAGTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTA
* * ** * ** ** * * * ***
19038 TCT-ATTTCAAATCATTATTACCTTT-TATTTGGTCATGTAACAATTGTTTTTAATCATATATGT
640 T-TAATCTCAAATCGTTA--AGATTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAAC
*
19101 TTA-TTCAAAAT
702 TTATTTC---GT
* * * * *
19112 AAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATA
1 ----TAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTA
* * ** * ** * * * * * *
19177 TTTA-CCAAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTTTATACTTCAAATCATTATAA
61 TTTATCGAATC-AATTCAAATAGTTAAAACTA-TTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTGA
* * * *
19240 CCTTTTGTTCTA-TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATA
124 CCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAG-AAT-AAATAATA
* * ** * * * ** * * ** **
19303 CTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAGAAA-A-AAATTTGTTTGTCAA
186 CAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAAAAGAAATAGATTTAA-AAAGATAAATCTACTTACCAA
* * * * * * * * ** *
19366 ACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTT-T------TTGTT
250 ACAAGTTCAAATAATGATGACTATTTAAACAAATAT-TAATTT-AAATCATTATAACCAGTTGAT
** * * ** ** ** *
19423 TTGTCATAAAACAATTT-TTTCACTTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTAT
313 TTCACATAAAAC-ATTTGTTTCAATTAATAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * * * * * * *
19486 TAA-CATTTCAAAAATTAATATGTAATAGACTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCTAACCAGTTCA
376 TAATAATTACAAAAA-TAATAAGCAAGA-ACTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCGAACAAATTAA
* * * *** *
19549 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAA
438 AATAATTATGACCATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * ** * * * * *
19614 ACAAATGTTTTTATTCATATAAG-TTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAA
503 ACAATTATTTGAATTCACACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
*
19678 AAATTAATAA-TGGATTTTAAAAATAAATTTGTTTA
567 AAATTAATAAGT-GA-TTTAAAAATAAATATGTTTA
19713 TCAAACTAGT
Statistics
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0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (710 bp):
TAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTAT
CGAATCAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCTTTTG
TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAGAATAAATAATACAAATTTATT
AACATTCAAAAAATTAAAAAGAAATAGATTTAAAAAGATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAA
TAATGATGACTATTTAAACAAATATTAATTTAAATCATTATAACCAGTTGATTTCACATAAAACA
TTTGTTTCAATTAATAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTACAAAAA
TAATAAGCAAGAACTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAACAAATTAAAATAATTATGACCATTTG
AACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTGAATTCAC
ACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAA
AAATAAATATGTTTACCGAATCAAGTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATTAATCTCAAA
TCGTTAAGATTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAACTTATTTCGT
Found at i:20921 original size:175 final size:176
Alignment explanation
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18121 ATTATAGCCA
* * * *
18131 TTTGAACGATTATCTATTTCAAAT--TATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-TT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGAC--TTCG-TTTGTCATAAAACAATTATTCTA
* * *
18193 TTTATCACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAA
63 TTTAT-AC--AAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAATA-TT-AAAAATTAATAA
* * ** * * *
18257 GTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTA
121 ATAA-A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
* * * * * * * *
18313 TTTAAACAATTAT-TAATCTCAAATCG--TTAAGATTTATGTTTTATCATAAAATAATTGTT-T-
1 TTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTTTATGACTT-CG-TTTGTCATAAAACAATTATTCTA
* * * * * * *
18373 TTGATCATAGAAACTTATTTCG--T---TAATACTAATCTAAT-AATATTTCAAAATTTAATAAG
63 TT--T-ATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATA-TAATTTATTAAATA-TT-AAAAATTAATAAA
* * ** * * ** *
18432 TAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTC-AATTTGAATAGTTAAAACTA
122 TAA-A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGA-ACGAATTTAAATAGTTATGACTC
* * * * *
18489 TTAGAATAATTATCTATTTTAAAT--TATTT-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTGTTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT-TTTATGA-C-TTCG-TTTGTCATAAAACAA-TT-ATT
* ** * *
18550 CATATTT-TACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATCAAAATTTATTAACAT-TCAGAAAATTAA-A
60 C-TATTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAAT-ATAATTTATTAA-ATATTA-AAAATTAATA
** * * * * * * *
18612 AAGGAAATGATTTGAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTGATGACTA
120 AATAAAAT--TTTAAAAAAAT-AAATATGTTTACCGAACGAA-TTTAAATAGTTATGACTC
* * * * * * * * *
18672 TTTAAACTATTATTTATTTAAAATC--ATTATGACCAGTT-GTTTTGACATAAAACATTTGTTTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-C--TTCG-TTTGTCATAAAACAATTATTCT
* * ** * * *
18734 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTT-AATAATTCAAAAATTAATAAG
62 A-TTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAAT-ATT-AAAAATTAATAAA
* * * * * * * *
18798 CAAGAGTTT---AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTA
122 TAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
* * * * * * *
18850 TTTGAACAATTGTATATTTAAAATC--ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT-TG
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCG-TTTGTCATAAAACAATTATTCT-
* * * * *
18912 AATTCATACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCAATAATTAATAAG
62 -ATTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAATA-TT-AAAAATTAATAAA
* * * * * * *
18976 T--GA-TTT--AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATC-AAGTCAAATAATTATGGC-C
122 TAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CGAATTTAAATAGTTATGACTC
* * * ** ** * *
19025 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA--CCTTTTATTTGGTCATGTAACAATTGTTTT
1 -TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTATGAC-TTCGTTT-GTCATAAAACAATT-ATTC
* * * * * * * * *
19088 TAATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATT-AATCTTTCAAAAATTAATAAG
61 TATTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAAT-ATT-AAAAATTAATAAA
* * * *
19152 TAAGAGA-TTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTG-GTTTAAATAGTTATGACTA
122 TAA-A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-GAATTTAAATAGTTATGACTC
* * * * * * * *
19208 TTTAAACAATTTTATACTTCAAATC--ATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCGTT-TGTCATAAAACAATTA-TTCT
* * * *
19271 ATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATATA-AAAATATTCCAAAAATTAATAAC
62 ATTTATACAAGCTTATTTAG-AAT-AAATAATA-TAATTTATTAAATATT--AAAAATTAATAAA
* * ** * * * ** * *
19334 TAAGAGA-TTTAAGAAAA-AAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTA
122 TAA-A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
* * *
19389 TATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTT-TG---T--TTTGTCATAAAACAATT-TTTTCACT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCGTTTGTCATAAAACAATTATTCT-A-T
* * ** * **
19447 TCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAAAATAAATTTATTAACAT-TTCAAAAATTAATATGTAA
64 TTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATAT-AATTTATTAA-ATATT-AAAAATTAATAAATAA
* * * * * * * * * *
19511 TAGA-CTT-AAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTA
125 -A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
* ** * * *
19563 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAT--TGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGT-TTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCG-TTTGTCATAAAAC-AAT-TATTC
* * * * * *
19625 TATTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATT-AATATTTCAAAAATTAAT-AA
61 TATTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAATA-TT-AAAAATTAATAAA
** * * * * * * *
19688 T-GGATTTT--AAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTA
122 TAAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
* * * * ** ** * * * * *
19740 TTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAAT-TTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTATGACTTCGTT-TGTCATAAAACAATTA-TTCTA
* * ** * * * * * *
19804 TTCATAAAAATTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCGACAATTAATAAGTA
63 TTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAATA-TT-AAAAATTAATAAATA
* * * *
19868 AAATTTT-AAAAAATAAATCA--TTTACCAAACTAGA-TCAAATAGTTATGACTA
124 AAATTTTAAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACGA-ATTTAAATAGTTATGACTC
* * * * * * * * * *
19919 TTTGAATAAGTATTTATTTCAAATC--ATTATAACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATTTTA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCG-TTTGTCATAAAACAATTATTCTA
* * * * * *
19982 GTTCATATAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTTTGAAAATTAAATAAT
63 -TTTATACAAGCTTATTTAG-AAT-AAATAATA-TAATTTATTAA-ATATTAAAAATT-AATAAA
* * * * * *
20045 TAAGAGA-TTT-AAAAAATGAATCTATTTACTGAAC-AAGTTTAAAATA-ATATGACTA
122 TAA-A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAA-TTT-AAATAGTTATGACTC
* * ** * * ** ** *
20100 TTTGAATAATTATC-ATTTTGAAAT--TGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTCT
1 TTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTTTATGAC--TTCG-TTTGTCATAAAACAATTATTCT
* * * **
20162 ATTCATACAAGCTTA-TTACAAATAAATAATACAATTTATT-AATATTAAGACAATTAATAGGTA
62 ATTTATACAAGCTTATTTA-GAATAAATAATATAATTTATTAAATATTAA-A-AATTAATAAATA
* * * ** * ** *
20225 AAAGATTT-AGAAAATAAATTTGTTTACTAAAC-AAGTTCAAAT-CCTATGACTA
124 AAA-TTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAA-TTTAAATAGTTATGACTC
* * * * * * *
20277 ATTGAACAATTATTTATTTCAAAT--TGTTATGACTTTTTGTTTGTCAACAAAATAATTGTTTCT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGAC--TTCGTTTGTC-ATAAAACAATT-ATTCT
* * * * * * ** *
20340 AATCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTA-TAAATATTTCAATAGCTAATAAGT
62 ATTTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATA-TAATTTATTAAATA-TT-AAAAATTAATAAAT
* ** * * *
20404 AAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATTGAAC-AAGTTCAAATAGTCT-TGTCTAT
123 AAAA-TTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAA-TTTAAATAGT-TATGACT-C
* * * * * * *
20459 TTTGAATAATTATCTTATTTCAAATC--ATTGTGACCTTTTGTTTGT-AAAAAAC-ATTGTTTTA
1 TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTTTATGA-C-TTCGTTTGTCATAAAACAATTATTCTA
* * * *
20520 GTTCAATA-AAGCTTATTT-GAAATAAATAATACTAATTCA-TGAAT-TCT-AAAATTAAGAGAA
63 -TT-TATACAAGCTTATTTAG-AATAAATAATA-TAATTTATTAAATAT-TAAAAATTAATA-AA
* * * * *
20580 -AAGAGAATTT-AAAAAAT-AATTTGTTTATCAAAC--ATTTCAAATAGTTATGAAATC
122 TAA-A-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTT-AAATAGTTATG-ACTC
* * * * * *
20634 --T-AACAATTATCTTTTTCAAAAC--ATTGTGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTAT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGAC-TTCG-TTTGTCATAAAACAATTATTCTAT
* * *
20694 TTATACAAGCTTATTTCGAATAAATAATATAATTTATTAATTATTAAAAATTAATAAGTAAAAAT
64 TTATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATATAATTTATTAAATATTAAAAATTAATAAAT-AAAAT
** *
20759 TTT-AAAAAATAAATATGTTT-CTTAAC-ACATTTAAATAGTTATTGA-TT
128 TTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGA-ATTTAAATAGTTA-TGACTC
* * *
20806 TTTGAACATTTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCGTTTGTGATAAATCAATTATT-TATAT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCGTTTGTCATAAAACAATTATTCTAT-T
* * *
20870 TATA-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAAAT-TTCAAAATTAATAAATAAAAT
65 TATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA-TATAATTTATTAAATATTAAAAATTAATAAATAAAAT
* * *
20933 TTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTC
128 TTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
*
20982 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
21006 GTTAAGATCT
Statistics
Matches: 2095, Mismatches: 407, Indels: 388
0.72 0.14 0.13
Matches are distributed among these distances:
170 6 0.00
171 30 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (176 bp):
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCGTTTGTCATAAAACAATTATTCTATTT
ATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATATAATTTATTAAATATTAAAAATTAATAAATAAAATTTT
AAAAAAATAAATATGTTTACCGAACGAATTTAAATAGTTATGACTC
Found at i:21002 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 20670--21005 Score: 414
Period size: 175 Copynumber: 1.9 Consensus size: 175
20660 TGACTTTTGT
* * *
20670 TTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTATACAAGCTTATTTCGAATAAATAATATAATTTATTAAT
1 TTTGTCATAAAACAATTATTCTATTTATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATATAATTTATTAAA
* **
20735 TATTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTCTTAACACATTTAAATAGTTA
66 TATTAAAAATTAATAAATAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTCCGAACACATTTAAATAGTTA
* *
20800 TTGATTTTTGAACATTTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCG
131 TTGATCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCG
* * * *
20845 TTTGTGATAAATCAATTATT-TATATTATA-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATT
1 TTTGTCATAAAACAATTATTCTAT-TTATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAA-TATAATTTATT
* * * *
20908 AAAT-TTCAAAATTAATAAAT-AAAATTTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGA-GTTTAAA
63 AAATATTAAAAATTAATAAATAAAAATTTT-AAAAAATAAATATGTTT-CCGAAC-ACATTTAAA
*
20970 TAGTTA-TGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
125 TAGTTATTGA-TCTTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
21006 GTTAAGATCT
Statistics
Matches: 137, Mismatches: 17, Indels: 13
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 25 0.18
175 61 0.45
176 50 0.36
177 1 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (175 bp):
TTTGTCATAAAACAATTATTCTATTTATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATATAATTTATTAAA
TATTAAAAATTAATAAATAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTCCGAACACATTTAAATAGTTA
TTGATCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTATGACTTCG
Found at i:21356 original size:163 final size:163
Alignment explanation
Indices: 21067--21387 Score: 414
Period size: 163 Copynumber: 2.0 Consensus size: 163
21057 TATTTGAAAG
21067 AAAATATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAATTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATG
1 AAAATATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAA-T-GAGATTTAAAAAATAAATCTATG
* * * * *
21132 CACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAATAGTTATGATATT
64 CACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTCAATAATTATCTATCTCAAATAGTTATGATATT
*
21197 TGTTTT-GTCGTAAAACAATTATTTCTATAAGAATA
129 TGTTTTGGTCATAAAA-AATTATTTCTATAAGAATA
* * * **
21232 AAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAA-GAGATTTAAAAACTAAATTTATTT
1 AAAATA-TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAATGAGATTTAAAAAATAAATCTATGC
* * * * * *
21296 ATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGATCTT
65 ACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTCAATAATTATCTATCTCAAAT-AGTTATGATATT
*
21360 TGTTTTGGTCATAAAAAATTGTTTCTAT
129 TGTTTTGGTCATAAAAAATTATTTCTAT
21388 TCATACAAGC
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 18, Indels: 8
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
163 88 0.65
164 9 0.07
165 6 0.04
166 32 0.24
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (163 bp):
AAAATATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAATGAGATTTAAAAAATAAATCTATGCA
CCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTCAATAATTATCTATCTCAAATAGTTATGATATTTG
TTTTGGTCATAAAAAATTATTTCTATAAGAATA
Done.