Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168342.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_564, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Found at i:718 original size:75 final size:74
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Period size: 75 Copynumber: 2.0 Consensus size: 74
564 TTTTTTAGTC
574 ATAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT
1 ATAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT
639 GAAAAATTA
66 GAAAAATTA
648 ATAAAACAATTATCTT-AGTTTATGCAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
1 ATAAAACAATTAT-TTCAGTTTATGCAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
712 TTGAAAAATTA
64 TTGAAAAATTA
723 AT
1 AT
725 GACCAAGAGA
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 0, Indels: 3
0.96 0.00 0.04
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74 32 0.43
75 43 0.57
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Consensus pattern (74 bp):
ATAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT
GAAAAATTA
Found at i:1075 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 672--4129 Score: 2496
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662 TTAGTTTATG
* * * * **
672 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGACCAAGAGATT
1 CAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * *
737 TTAAAACATAAATCTATTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTTTCT
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * **
799 ATTT-AAAGACATTACGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTC-AGTTTGTA
126 ATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * ** * * *
854 AAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
919 TAAAAACTAAATCTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
984 CAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCAAA
130 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * ** * *
1034 CAAGCTTATTTGACGTAAAATATTGGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAAGAGA
1 CAAGCTTATTTGA-ATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * ** * * * * * * *
1098 TTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCCGTTCAAACAATTAAGACCATTAGAACAATTATCTAT
63 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* **
1163 TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA
128 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * ** *
1216 CAAGCCTATTTGAACTAAAATACTACTATTTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAAT
1 CAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-
* * * * *
1280 TTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAAACAAATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
63 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * * **
1344 TTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATAAT-AAACAATTGTTTC-AGTTTTTA
127 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * *** * * * * **
1397 AAAGTTTATCCAAAATAACATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTGAGAAGTTGGAGATT
1 CAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
1461 TAAAAAATAAATCAATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGC-AGTTTAAACAATTATGTATT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATT
* * * *
1525 TCAAATCATTATGAACATTTATTTTGCCATAAAACAATTG-TT-T-TTCATTA
129 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TA
* * *
1575 CAAAGCCTATTTGGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGAT
1 C-AAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
1639 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATCATATAT
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
1703 TTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATA
128 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * ** * * **
1757 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTAT-GAAAATTAGTATCTAAGAGAT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * * * * * * *
1821 TTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAA-CTAGTTAAAATAATTAAGGCTATATGAATAATTGTCTAT
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
1885 TTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATA
128 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * **
1938 TAAGTTTGTTCAT-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--G--AGAGAT
1 CAAGCTTATT--TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * *
1998 TTAAAAAAT-AATCTATTTACCAAACCAGTTCAATTACTTATAACAATTTGAACAATTATTTATT
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * * *
2062 GCAAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAATAATTTTTTCTATTAATA
129 TC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * *
2115 C-AGTCTTATTTAGAATAAAGA-AATGCTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATAG
1 CAAG-CTTATTT-GAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *** * * * * * * * *
2177 ATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCCTAACCAATGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACATTTATCT
62 ATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
2242 ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT--AACAATTGTTTCTATTCCTA
126 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * *
2295 TAAGCTTATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *** *
2355 TT-AAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATT
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* *** * * * *
2419 TTAAATTGCTATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATA
129 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * *
2471 CAAGCTTATTT-AATTAAAACAATACAAATTTATTAATA-TTCTGACAATTAATAAGTAAAAGAT
1 CAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * ** *
2534 TTAAAAAACAACTCTATTTA-CTG-ATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATTATTATTTAT
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
2597 TTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTTTTTTTGTTCATA
128 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * * * *
2649 GAAGATTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAGTAAAAGATT
1 CAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
2713 TTAAAAATAAATATGTTTACCGTA-CAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** ** * * * * *
2777 TCAAATCGTTATGATATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAAGA
129 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * ** * * *
2829 TAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * *
2894 TAAAAAATGAATCTATTTATCGAA-CAAGTTTGAATAGTTATGACCATTTGAACAATTTTTTATT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
2958 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAATAATTG-TTCTGTTTATA
129 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* ** * * *
3009 TAAGCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATGTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAA-AAA
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
3072 TTTTAAATATAAATCTATTT-TCTAAACACATTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTA
63 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** *
3136 TTTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTTTTTCTATTCATA
127 TTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * *
3190 CAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATCAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGA-TTT
1 CAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
3250 TAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAACAATTATTT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
3314 ATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATA
126 ATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * ** * * *
3369 TACGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAGGTAGGAGATT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
3433 T--AAAGTAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
3495 TCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGA
129 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-A
** * * * **
3548 -AAAATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
1 CAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
3608 TAAAAACTAAATTTGTTTA-CAGAAAT-AGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTAT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATC-G-AATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * *
3671 CTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTCATCATAAAAAAATTGTTTCTTTTCATA
128 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * * *
3723 TAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
3784 TAAAAAATAAATGTATTTACCGAATC-GATTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATTATCTACT
65 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
3848 TCAAATCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTT-TAATTCATA
129 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA
* * * * * *
3900 CAAGCTTATTCAGAATGAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGAT
1 CAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
3964 TTAAAAAA-AAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCGAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTG
64 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * *
4026 TTT-AAAGTCATCA-AACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA
127 TTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * *** *
4079 AAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAAAATTAA
1 CAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
4130 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 2595, Mismatches: 560, Indels: 246
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 68 0.03
175 44 0.02
176 249 0.10
177 219 0.08
178 235 0.09
179 468 0.18
180 389 0.15
181 549 0.21
182 325 0.13
183 49 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
CAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
AAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
Found at i:1507 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 1486--1520 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
1476 TTTATCAAAT
*
1486 CAGTTCAAATAATTATGG
1 CAGTTCAAACAATTATGG
*
1504 CAGTTTAAACAATTATG
1 CAGTTCAAACAATTATG
1521 TATTTCAAAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 2, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 15 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.14, T:0.34
Consensus pattern (18 bp):
CAGTTCAAACAATTATGG
Found at i:1886 original size:540 final size:538
Alignment explanation
Indices: 648--4129 Score: 2745
Period size: 540 Copynumber: 6.5 Consensus size: 538
638 TGAAAAATTA
* * * * * *
648 ATAAAACAATTATCTT-AGTTTATGCAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
1 ATAAAACAATTAT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
712 T-TGAAAAATTAATGACCAAGAGATTTTAAAACATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGA
65 TCTG-AAAATTAATGACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG-
* * * * *
776 TT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTT-AAAGACATTACGAACTTTTGTTTTGTCAA-AAAATA
127 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGT-AATAAAACA
* * * *
838 ATTGTTTCAGTTTGTAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAAT
190 ATTGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAT
* * * *
903 TAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
254 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
968 AAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCA-
319 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-T-T-CAT
* * * ** * *
1032 -AACAAGCTTATTT-GACGTAAAATATTGGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAA
380 TAACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AGTAA
* * ** * * * * * *
1094 GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCCGTTCAAACAATTAAGACCATTAGAACAATTAT
441 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTAT
* *
1159 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAATC
506 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * * *
1192 ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCCTATT-TGAACTAAAATACTACTATTTTATTAACA
1 ATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** *
1255 TT-TAGAAAATTAATAAAC-AAGAAATTTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACAAATTCAAATA
64 TTCT-GAAAATTAAT-GACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * ** *
1318 TTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATAAT-AAACAA
126 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
* * * * * *
1382 TTGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTG
191 TTGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTA
* ** * * * *
1447 AGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGC-AGTTTA
256 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTG
* * *
1511 AACAATTATGTATTTCAAATCATTATGAACATTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTCATT-A
320 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATTAA
* *
1575 CAAAGCCTATTTGGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGAT
383 C-AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGAT
* * * * *
1639 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATCATATATT
446 TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATT
* * *
1704 TCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTC
511 TCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTAGTC
* * **
1733 ATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATT
1 ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
1798 ATGAAAATTAGT-ATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTAAAATAATTA
66 CTGAAAATTAATGA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
1862 AGGCTATATGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGT
130 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
** * * * * * * *
1927 TTTTGTTCATATAAGTTTGTTCATAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-
195 TTCAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATA
* * * * * *
1991 -G--AGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCAAACCAGTTCAATTACTTATAACAATTTGAACA
259 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * ** * *
2052 ATTATTTATTGCAAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAATAA-TTTTTTCTATTAATAC
324 ATTATCTATTTC-AAATCATTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-ATTAACA-
* * * *
2116 AGTCTTATTTAGAATAAAGA-AATGCTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATAGAT
385 AG-CTTATTTGGAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AGTAAGAGAT
* * ** * * * * *
2179 TTAAAAAAATGAATCTGTTGGCCTAACCAA-TGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAAC-ATTTATCT
446 TT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTA-TTATCT
* *
2242 ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTC
508 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * * * *
2273 AT--AACAATTGTTTCTATTCCTATAAGCTTATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
2336 CTAAAAATT-A--A-TAAGAGATTT-AAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTAT
66 CTGAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *** * * * * *
2396 GACTATTTGAGTGATTACCTATTTTAAATTGCTATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTTTT
131 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * * * * * *
2461 TCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAATTAAAACAATACAAATTTATTAATATTCTGACAATTAATA
196 TC-AGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATA
* * * ** * * **
2524 AGTAAAAGATTTAAAAAACAACTCTATTTA-CTGATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATT
259 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** *
2588 ATTATTTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTTTTTTTGTTCATAGAA
324 ATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCATT-A-ACAA
* * * * * *
2652 GATTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTA
386 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAA
* * *
2716 AAAATAAATATGTTTACCGTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCA
450 AAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCA
* **
2780 AATCGTTATGATATTTTGTTTCA-TC
514 AATCATTATGACCTTTTGTTT-AGTC
* * * * * *
2805 ATAAAACAATTATATCTGTTAAGATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * **
2870 CCAAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTTGAATAGTTA
66 CTGAAAATTAATGA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
2934 TGACCATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAATAATTG-
130 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
* * * * *
2998 TTCTGTTTATATAAGCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATGTATTAATATTCCAAAAAATTAA
195 TTCAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC--AAAATTAA
* * * * * *
3062 TAAGTAA-AAATTTTAAATATAAATCTATTT-TCTAAA-CACATTTAAATAGTTATGACTACTTG
257 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* **
3124 AACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAA-TTTTTTCTATTC
320 AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-ATT-
* * * * *
3187 ATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATCAATATTTCAAAAATT-A-A-TAAGA-T
381 A-ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAAGAGA
* * *
3248 TTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAACAATTAT
445 TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAACTATTAT
* * *
3312 TTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCGTC
506 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * * * *
3345 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATATACGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
3410 CT-AAAATTAAT-AGGTAGGAGATTT--AAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCA
66 CTGAAAATTAATGA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
3471 TGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGT
130 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
* * * * * * * * *
3536 TTCTGTTCATGAAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAA-T--T
195 TTCAGTTTAT-AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAAT
* * * * *
3597 AA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAGAAAT-AGTTTAAATAGTTATGACTATGTGA
258 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC--AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** *
3659 ACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATCTTTATTTCATCATAAAAAAATTGTTTCTT--TTCA
321 ACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTCATT-A
* * ** * * *
3721 TATAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-A-A-TAAGAGAT
382 -ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAAGAGAT
* * * * *
3783 TTAAAAAATAAATGTATTTACCGAATCGA-TTCAAATAGTTAGGACTATTAGAA-TAATTATCTA
446 TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT-ATTATCTA
* * * * *
3846 CTTCAAATCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTT
509 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * *
3876 ATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAGAATGAAACAATACTAATTTATTAACAT
1 ATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *
3940 TCAAAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAAAA-AAATCTATTTATCGAACAAGTTCGAATAGAT
65 TCTGAAAATTAATGA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG-T
* * * * * * *
4003 T-TGACTATTTAAACAATTATCTGTTT-AAAGTCATCA-AACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
128 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
* * * * *
4065 TGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAAAATTA
192 TGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTA
4129 A
256 A
4130 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 2358, Mismatches: 473, Indels: 224
0.77 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
530 4 0.00
531 109 0.05
532 182 0.08
533 245 0.10
534 205 0.09
535 35 0.01
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539 162 0.07
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544 138 0.06
545 6 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (538 bp):
ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
CTGAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
TCAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAG
TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCATTAACAAGCTTA
TTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATA
AATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATT
ATGACCTTTTGTTTAGTC
Found at i:3566 original size:357 final size:354
Alignment explanation
Indices: 672--4129 Score: 2338
Period size: 361 Copynumber: 9.6 Consensus size: 354
662 TTAGTTTATG
* * *
672 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGACCAAGAGATT
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGA-T
* * * * * * *
737 TTAAAACATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAG-ATT-TGACTATTTGAATAATTTTCTA
61 TTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * ** * **
800 TTT-AAAGACATTACGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTCAGTTTGTAAAAACTTATT
125 TTTCAAA-TCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATT
* * * * *
864 CAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAA
188 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAAT-AG-TAGAGATTTAAAAA-TAA
* * * * * *
929 ATCTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCGTT
249 ATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTT
* * * * *
993 ATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCAAA
313 ATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* * * ** *
1034 CAAGCTTATTT-GACGTAAAATATTGGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAAGAG
1 CAAGCTTATTTAGA-ATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--T-AATAAGAG
* * ** * * * * * *
1097 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCCGTTCAAACA--ATTAAGACCATTAGAACAATTATC
59 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * **
1160 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCCTA
123 TATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATATAAGTTTA
* * * * ** *
1224 TT-TGAACTAAAATACTACTATTTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAA
186 TTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAAT--AGTAGAGA-TTT-AAA
* * * * * *
1287 AATAAATATATTTACAAAACAAATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
244 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * **
1352 -TGTTATGACCTTTTGTTTTATAAT-AAACAATTGTTTC-AGTTTTTA
309 CT-TTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATA
* * ** * * * **
1397 AAAGTTTATCCAAAATAACATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTGAGAAGTTGGAGATT
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATT
** * * * * * *
1461 TAAAAAATAAATCAATTTATCAA-ATCAGTTCAAATA--ATTATGGC-AGTTTAAACAATTATGT
62 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAACA--AGTTTAAATAGTTTTATGACTA-TTTGAACAATTATCT
* * * * **
1522 ATTTCAAATCATTATGAACATTTATTTTGCCATAAAACAATTG-TT-T-TTCATTACAAAGCCTA
124 ATTTCAAATCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TA-TAAGTTTA
** *
1584 TTTGGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAAT
186 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAAT-AGTA-GAGATTT-AAAAAT
* * * * * * *
1648 AAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT-ATCATATATTTCAAATCA
247 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCT
* * * *
1712 TTATAACCTTTT-TATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATA
311 TTATGACCTTTTGT-TTTT-TCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* * ** *
1757 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTAT-GAAAATTAGTATCTAAGAGAT
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTA--A--TAAGAGAT
* * * * * * * * * *
1821 TTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTAAAATA--ATTAAGGCTATATGAATAATTGTCTA
61 TTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * *
1884 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTC
125 TTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTC
* * *
1949 ATAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-G-AGAGATTTAAAAA-ATAATC
189 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAGTAGAGATTTAAAAATA-AATC
* * * * * * * * *
2011 TATTTACCAAACCAGTTCAATTACTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTGCAAAATCATTATG
252 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCTTTATG
* ** * *
2076 ACCATTTGTTTCATCATAAAATAATTTTTTCTATTAATA
316 ACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* *
2115 C-AGTCTTATTTAGAATAAAGA-AATGCTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATAG
1 CAAG-CTTATTTAGAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AG
* ** ** * * *
2177 ATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCCTAACCAA-TGCAAATAG-TTT-TGATTGTTTGAACATTTA
59 ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC-AA-CAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
2239 TCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT--AACAATTGTTTCTATTCCTATAAGCTT
121 TCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTT
* * * * *
2302 ATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA--AGAGATTTAAAACTGA
185 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAGTAGAGATTTAAAAATAA
* * *** * * * * * *
2365 ATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTTAAAT-TGCT
249 ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TT
* * * *
2429 ATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATA
313 ATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* * * * *
2471 CAAGCTTATTTA-ATTAAAACAATACAAATTTATTAATATTCTGACAATTAA-TAAGTAAAAGAT
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T--CAA-AAATTAA-TAAGAGAT
* * * ** * * * ** *
2534 TTAAAAAACAACTCTATTTACTGATAAATTCAAATAG--TTATGACTATTTGAATTATTATTTAT
61 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
2597 TTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTTTTTTTGTTCATAGAAGATTATTTGG
126 TTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTCAG
* * *
2662 ATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATT-TCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAAT
191 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAAT-AGT-AGAGA-TTTAAAAATAAAT
* * ** * * *
2725 ATGTTTACCGTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
251 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATG
** ** * * * * *
2790 ATATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAAGA
316 ACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* * * * *
2829 TAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATT
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATT
* * * * * * *
2894 TAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTTGAATAG--TTATGACCATTTGAACAATTTTTTAT
62 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
2957 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAATAATTG-TTCTGTTTATATAAGCTTATTCC
126 TTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATT-C
* * * * *
3021 A-AATAAAATAATA-TAAATGTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAATATAA
189 AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-C-TAAAATTAAT-AGTAGAGA-TTTAAAAATAA
* * * * * **
3084 ATCTATTTTCTAAACACA-TTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTT
249 ATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTT
* * **
3148 ATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTTTTTCTATTCATA
313 ATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
* * * *
3190 CAAGCATATTT-GAAATAAAATAATACTAGTTTATCAATATTTCAAAAATTAATAAGA-TTTTAA
1 CAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * *
3253 AAAATAAATATGTTTACCAAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAACAATTATTTATTT
65 AAAATAAATCTGTTTACCAA-CAAGTTTAAATAGTT-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
3318 CAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATACGTTTATTCAA
128 CAAATCA-TTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTCAG
*
3382 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAGTAAATCTA
191 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATA-GTA-GAGATTTAAAAATAAATCTA
* * * *
3446 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACC
254 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACC
* * *
3511 TTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGA
319 TTTTGTTTTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCAT-A
** * * * **
3548 -AAAATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAA
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
* * * *
3612 AACTAAATTTGTTTA-CAGAAATAGTTTAAATAG--TTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTT
66 AAATAAATCTGTTTACCA-ACA-AGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TT
* ** * *
3674 -AAATCATTATGA-TCTTTATTTCATCATAAAAAAATTGTTTCTTTTCATATAAGTTTATTCAGA
128 CAAATCATTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTCAGA
* * * *
3737 TTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATA--AGAGATTTAAAAAATAAATGTAT
192 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAGTAGAGATTT-AAAAATAAATCTAT
* * * * *
3800 TTACCGAATCGA-TTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATTATCTACTTCAAATCGTTT-TGAC
255 TTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTTATGAC
* * *
3863 CTGTTGTTTAGTT-ATAAAACAATTATTTT-AATTCATA
318 CTTTTGTTT-TTTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATA
* * * *
3900 CAAGCTTATTCAGAATGAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGAT
1 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGAT
* * ** * * *
3964 TTAAAAAA-AAATCTATTTATCGAACAAGTTCGAATAG-ATT-TGACTATTTAAACAATTATCTG
61 TTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * **
4026 TTT-AAAGTCATCA-AACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTAT
125 TTTCAAA-TCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATATAAGTTTAT
* * * * *
4088 CCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTCAAAAATTAA
187 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAA
4130 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 2445, Mismatches: 501, Indels: 307
0.75 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
351 7 0.00
352 24 0.01
353 183 0.07
354 134 0.05
355 93 0.04
356 197 0.08
357 284 0.12
358 346 0.14
359 247 0.10
360 197 0.08
361 368 0.15
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366 1 0.00
367 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (354 bp):
CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
AAATAAATCTGTTTACCAACAAGTTTAAATAGTTTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
ATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTCAGAATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAGTAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCA
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTT
TTTTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA
Found at i:5099 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 4668--9319 Score: 2979
Period size: 181 Copynumber: 26.1 Consensus size: 180
4658 AATTATGGCC
* * * * * * * **
4668 ATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTCTCCTGAAACAATTGCTT--T
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCGT
* * * *
4731 TCAATATAGAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAATTAATAA-T
66 TC-ATAT--AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
**
4795 -AG--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
128 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
4845 ATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCG
* * * * *
4909 TTCATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATCAATAACTAA
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
4974 GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT
130 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
*** * * *
5025 GCATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTCTCATAAAACAATTATCTTCG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCG
* * *
5090 TTAATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAA-T
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAAT-AAGT
* * * * * *
5154 AAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACT
128 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * * * *
5207 ATTTTAATAACTATCTATTTCTAATCATTAT-AACTTCTTATTTTGTCATCAAACAATT-TGTCC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTC
** ** * * *
5270 TGTTCATACT-ATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAACTTAATAAC
64 -GTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * *
5334 CAAGAAAATTT-AAAAATAAATCTAATTGT-C-AAACCAG-TCAAATAGTTAAGACT
127 TAAG-AAATTTAAAAAATAAATCT-GTT-TACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * **
5387 ATATGAAAAATTATCTGTTTCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCG
* * *** * * * * *
5452 TTCATACAAGCTTTTTTTTATTAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAATAA
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * ** ** * * * * *
5517 GATATTTAAAAAAT-AAT-TTTTTTGTCGAATTAATTGAAATGGTTAAGATT
130 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * * *
5567 ATTACAACAATTATCTATTTGAAATTGTTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* * * * * * *
5632 TTCA-ACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTAAAAAATTGATAAG-AA
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
5694 AAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAGC-AAACAAGTTCAAATAGTTATTACT
130 GAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
5745 ATTTGAACAAATGTCAATTTAAAACTGTTATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* ** * * ** *
5810 TTAATGCAGGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTTACTAAAA-TAATAAG
65 TTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA--AAAATTAATAAG
* * * ** * * *
5872 TAAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCC
127 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * ** * * **
5926 GTTTGAA-AGATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCG
* * * *
5990 TATCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
65 T-TCATATAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
** *
6054 AA-AAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
128 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** *
6107 ATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAGTTGTTAAGA--TATTTGTTTTGGAAAAAAACAATTGATTT
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTT
* * * * ** * *
6169 -TTATCATAGAAGCCTATT-TAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
63 CGT-TCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
6232 GTAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTTACTTAGCTAATTCAAATAGTTA-AAGCT
126 GTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * * * * * * * *
6287 ATTAGAATAATTAT-TAATTTCGAATCGTTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAATATTTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCG
* * * *
6351 TATCTTACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAG
65 T-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAA-TTAATAAG
* * * * *
6413 GAA-ATGATTTGGAAAAACAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
127 TAAGA-AATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * * *
6468 ATTTGAACAATTATTTGTTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAACGATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* * * * * *
6533 TTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAA
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * *
6598 G-AGTTT--AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATTGTTATGACT
130 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * *
6646 ATTTGAACAATTGTCTGTTT-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTATTT-GA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCG-
* * * ** *
6709 ATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCA
65 -TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
** * * * * ** * *
6774 AGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAATGTC-
129 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGACT
* * * * * * *
6826 ATTTCAAAAATTATCAATTGCAAATCGTT-TG----TTTG----GTCATATAAA-AATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATT-ATTTC
* * ** * * *
6881 GATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
64 G-TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * *
6945 AAGAGATTTAAAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
128 AAGAAATTT---AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * * *
7001 ATTTGAATAATT-GCATAATGAAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTT
1 ATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTC
* * * ** ** *
7065 GTTCGTATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTA
64 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
7130 AGAGATTTAAAAAAGAAATTTATTTGCCT-AACTAGTTCAAATAATTAAGACT
129 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
7182 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATTG---T----TTTTATTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* * * *
7240 TTC--ATAAG---AAT-AAAATAAAAT--GAC---TTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAA
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
7294 GAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTGCCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACT
130 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* **** * * *
7345 ATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAACACTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCG
* * * * * *
7410 TCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-A
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
7473 G--ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACCATTTCAAAAAGTTATGACT
130 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * * *
7522 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTTACAAAACAATAATTTATG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-CG
* * * * * * * *
7587 TTCATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATTCTATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAC
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA-
* * * * * *
7652 A-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATAATT
129 AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * **
7703 ATTT-ATATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATTATTTT
1 ATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTA-TTT
* * * * * *
7766 AGTTCATATAAGCCTATTCAAAGTAAAATAATTA-TAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAT
63 CGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * * *
7830 TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAACAAGTTTAAATAATTATGACT
127 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TATTTC-
* *** *
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* ** * **
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* **
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCGT
* * * * *
8121 TCATAAAAGCTTATTC--AATAAAATAATATTAATATATAAATA-TTTCAAAA-TAATAAGTAA-
66 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
8181 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAGCAAGTTCAAATAGTT-TGACT
131 AA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TATTTC
** * *
8293 GTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTA
64 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
*
8357 AGAGAA-TTAAAAAATTAATCT-TTTACTGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACT
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* * *** **
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1 ATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* ** **
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* * * * * *
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127 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCA-GTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** * *
8584 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGATTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATT-ATTTC
* * **
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64 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
8713 A-AAGATTTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAGTAGTTATGACT
129 AGAA-A---TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* * ** * * **
8833 TTTATGTAATTTTATTTAAAGATAGAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-
65 TTCATATAAGCTTATTCAAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* ** * * * *
8897 TGAAGATTT-----AT---T-T-CAT-C-GAACAAGTTCAAATAGTCATGTCC
129 AGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* ** * * *
9003 TTCATACAAAATTATTCAACATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG--A
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
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* * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-G
* * * * * * * *
9179 TTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTACAAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
65 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
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130 GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* *
9295 ATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
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Statistics
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* *
5490 AATAATATTTTAAAAATTAATA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATAAGATTTTAAAAAATAATA
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*
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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** * *
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* *
7334 TAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAACACTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
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* * * * * *
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* *
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1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
7493 TTATCAAACCATTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTT
65 TTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TT
* * * * * *
7558 TTTCTTTTGTTACAAAACAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATTCTATT
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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*
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381 TCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAATTA
* *** * * ** ** *
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* * * **
7944 TTTCTGTTCACATAAGCTTATTTT
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* *
7968 GAATAAAATAATATAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAA-A-AATT-A-A--TAATAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** *
8031 TTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTAT-ACTAATTG-A-AATTAT-TATTTCAAATT-TTAT
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* *
8091 GACTTTTGTTTTGTCATAAAAC---TATTTTATTCATAAAAGCTTATTCA-ATAAAATAATAT-T
125 GATTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGATAAAATAAT-TCT
* *
8151 AATATATAAATATTTC-AAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AGCAA
189 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAA
* * * *
8213 GTTCAAATAGTTTGACTATTTGAATAATTATCT-TTTCAAATCATTGTGACTTTTGTTTTATAAT
254 GTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTAAT
* * *
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* * * * *
8341 TAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTTTTA-CTGAACATGTTCAAATAGTTATG
383 TAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-TAATCTTTTATC-GAACAAGTTCAAATAATTATG
* * * * * * **
8405 ACTATCT-AGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGATA-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGGT
446 ACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATT
*
8467 TCTATTCATGCAAGCTTATTC-
510 TCTATTCATACAAGCTTATTCA
* *
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* * * * * * * ** *
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* * * * *
8616 ATTTTTTGTTTTGTCA-TAAACTAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
126 A-TTTTTGTTTTGTCACAAAAC-AATT-ATTTTATTCATAAAAGCTTATTC-AGATAAAATAATT
* * * *
8680 CTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCG
187 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA---TTTAAAAAATAAATATGTTTACCG
* * * * * **
8745 AGCGAGTTCAAGTAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTACAATCTTTTGTT
249 AGCAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTT
* * * ** *
8810 TTGTTATAAAACAATTATTTCTA-TTTATGTAATTTTATTTAAAGATAGAATAATACTAATTTAT
312 TTGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAG-TAAAATAATACTAATTTAT
* * *
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375 TAATATTCTAAAAATTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATAATCTTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * **** *
8928 AGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAATATTTTGTTTTGTCATAAAACA
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* **
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* * * * * *
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1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * *
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65 TTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTT
* * * *
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* * * * *
9214 ATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAG
191 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAG
* * * *
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255 TTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTAAT
* * * * * *
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* ** * * * * * *
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383 TAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * *
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445 GACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCA-AA-ACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * *
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507 ATTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TCA
** * *
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1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATA-AT--AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
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61 AT-GTTTATCAAACCAG-TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* ** ** * * * *
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** * * * * *
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184 ATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG
* * * * ** * * *
9792 -G-AA--CCAAAT-TTCTG-TTA-TAAAATAATTGTTTTAGTTC--AT-A-TAAG-C--TT-TTT
249 AGCAAGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATT-ATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTT
* * * * * **
9842 TGGAATAAAATAATAATAATTTA-ATAATATTCCAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAA-AATA
313 TGTAATAAAACAAT--TATTTTAGTTCATA-T--AAGCTT-AT--TTAA-AG---TAAAATAATA
* * * * *** * * * * * **
9905 --AATCTGTT--T-GTCGAAGTGGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAA
366 CTAATTTATTAATATTCTAA-AAATT--AATAATTAAGA-GATTTAAAAAATAATCT-TTTATCG
* * *** ** * * * * ***
9965 AAAAATTATGGCCTTTTGTT-TGA-TCATAT-AACAATT-T-T-TTT--TATCA-T-TCA-AGCC
426 AACAAGT-T--CAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTT
* ** * * * *
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487 TGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-A
* * ** ** *** ** * **
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1 AAA-TAA-AA-TAATATAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTA-ATAA-TAGATTTAAA-AAATAA
* * * * * * *
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59 ATATGTTTATCAA----ACCAGTTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT-TCAA
** * * *
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117 ATTGTTATGATTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGATAAAA
* * * * * * *
10212 TAATACTAATCTAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAAT-TTTTTA
182 TAATTCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* * * * * ** * * *
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246 CCGAGCAAGTTCAAATA-GTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT
** * * * * * * *
10340 GTTTTAG-CGTAAAATGAGTTTTTTTGAATTTATACT-AGCTTATTTGGAA-TAAAATAA-AATG
309 GTTTT-GTAATAAAA-CAATTATTTT-AGTTCATA-TAAGCTTATTT-AAAGTAAAATAATACT-
* * * * *
10401 AATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAAAGAATTCTATTTACCTAACT
368 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA-TCT-TTTATCGAACA
* ** *
10461 AGTTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATATC-TTTTGTTTTG
430 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-ACACTATAACATTTTGTTTTG
* * * * ** * **
10524 TCATAAAAAAAATATTTTTGTTCATATAAATTTGTTTG
494 TCATAAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
10562 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-ACTA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATA-TG
* ** * * * * * * *
10626 TTTATGAAATGAATTGAAATACTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATAGTTATGACT
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** * * * * *
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128 TTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTATTCAGA-TAAAATAATTCTAA
* * * * ** * *
10756 TTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAACTATGTTTATTGAACTAAA
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGC-AAG
* * * *
10821 TT-AAATAGTAATGACTATTTGAAAAATTATTTACTTCAAATCGTTATGAC----CTTTTG----
255 TTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTAAT
* * *
10877 ----------TTTT-G-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA---GTT--TA--C-
319 AAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT
* * * *
10922 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTC-AAGCAACTTTAAATAATTATG
384 AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAATTATG
* * * * * *** * * * ** * *
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446 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTT
* * **
11051 TTGTTCATACAATTTTATTGC-
511 CTATTCATACAAGCTTATT-CA
* * * *
11072 GAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--T-AAAGACACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATA
1 AAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-TT-A-A--TAATAGATTTAAAAAATA
* * ** * * * *
11134 AATATGTTTACCGAATAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTCTT
58 AATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * * * *
11198 ATAACTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAA
123 ATGA-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTATTCAGA-TAAAATAA
** * ** **
11263 TAT-TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAATATGTTTTTTC
185 T-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTACC
* * * * *
11327 GAAG-AAGTTCAAATAGTTCTAACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATTATTGTGACCTTTT-
248 G-AGCAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
*
11389 TTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACCAATTTA
310 TTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTT-AAAGTAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * *
11453 TTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACATGTTTAA
374 TTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * * * * *
11518 ATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAATATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA
437 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** **
11583 TAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTC-
502 CAAATATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
* * *
11613 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTGAAAAATCAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATA
1 AAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTAAAAAATAAATA
* ** * *
11678 TGATTTTTTGAA-CACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
62 TG-TTTATCAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * ** *
11742 GACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
125 GA-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTATTCAG-ATAAAATAATT
* * * *
11807 CTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACCAAG
187 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAG
* **
11871 CGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTGTTTT
251 CAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
11936 GTCATGAAACAATTGTTTCCA-TTCGTATAAGTTTATGTGAAA-TAAATTAATACTAACTTATTA
314 GTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTAT-TTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTA
* *
11999 ATATTCTTAAAATTAATAAGTT-GGAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTCATCGAACAAGTTCAAA
377 ATATTCTAAAAATTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTT-TT-ATCGAACAAGTTCAAA
* * * * * * ** * *
12062 TAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAA
438 TAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * **
12126 TAGTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCA
502 CAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* ** * * *
12156 AAATAAAATAATAAAAATTT-TTCAATATTTTGAAAATTAAGAAGAGA-TTAAAAAACTAAATCT
1 AAATAAAATAAT-ATAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAA-TAAATAT
* * * * * * **
12219 ATTTATCGAACCCGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATGAT
63 GTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAT
* * * * *
12284 TTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTTCAG-T-AAATTATTGCT
128 TTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTA--TTCAGATAAAATAATT-CT
** * * * * * *
12347 AAACTAATAGTA-TTCTAAAAATT-A-AA--AATAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACC
189 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AGC
* * * * * *
12407 AA-TTCAAATGATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
252 AAGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTG
* * * * * * *
12471 TCATAAAATAATT-TTTTCAGTTGATACATGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAA
315 TAATAAAACAATTATTTT-AGTTCATATAAGCTTATT-TAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * * *
12534 CATTC-AAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
378 TATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
12598 GTTATGGCTATTTGAACAATGAT-TTTTTTATTATAA-A-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
440 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA--A-AACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
12660 CAATTGTTTC-AGTTCATA-AATGCTTATCCG
502 CAAATATTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTCA
* * *
12690 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGT
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--T--AGATTTAAAAAATAAAT
** *** * * * *
12755 -TAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATT-TTAGTCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTA
61 AT-GTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * * * * *
12818 CGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATT-ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAA
124 TG-ATTTTTGTTTTGTCACAAAACAATT-ATTTT-ATTCATAAAAGCTTATTC-AGATAAAATAA
* * * * *
12882 TAT-TAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-
185 T-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG
* * * * * * ** * *
12945 A--AA---C-CA-A--CT-CCTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTC
249 AGCAAGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTT
* * * * * * * *
13000 TGTCATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAA
313 TGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
13065 TATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAA-TTCAAACA
378 TATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-TAATCT-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATA
* * * * * * *
13129 ATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTA-AGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
440 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATA-ACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *
13193 ATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCA
504 AATATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA
* ** * ** *
13221 AAATAAAATAATAATAA-TTATTAATGTTTTGAAAATTAATAAGT-GATTTAAAAAGTAAACCTA
1 AAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAGATTTAAAAAATAAATATG
* * ** * * *** * * * *
13284 TTTACCGAATTAGTTCAAAATAATTAT-AGCCATGCCAACAGTTATCTATTTCAAATCGGTATTA
64 TTTATCAAACCAGTTC-AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * ** * ** ** ** *
13348 CTTTTT-TTTGGTCATATAGTAGTTATATTTGA-AAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
127 -TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTAT-TTT-ATTCATAAAAGCTTATTCAG-ATAAAATAATTC
* * * * ** * * ***
13411 TACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTGAATT
188 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCA
* * * * * ** * * * ** *
13476 A-TCTTAAATACTTATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTAATA
253 AGT-TCAAATA-GTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTG
* * * * * **
13540 TCATAAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATCTAACAA
315 TAAT-AAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTA-AAGTAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ** ** *
13604 TATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAA-AATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATT
378 TATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATCT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAAT
* * **** * * * * *
13668 TAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATT
442 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * ** **
13732 TTTTTTGAATTCATATTAGCTTATTTG
507 ATTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * *
13759 GAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-TATTTAAAAAATAATTTTA
1 AAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * ** *
13823 TTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
64 TTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-T
* * * * * * * * *
13888 TTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGT-TTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATAC-A
128 TTTTGTTTTGTCACAAAAC-AAT-TATTTTATTCATAAAAGCTTATTCAG-ATAAAATAATTCTA
* * * * * * *
13951 ATTCTATTAATATTTC--AAA-TATTAA-TCAAAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTATCAAACT
190 ATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAGCA
* ** ** * * *
14011 AGTTTAAATAGTTAAAACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTAT
253 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
14076 TATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATAT
316 AATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * ** * ** * * *
14141 TC-AGATTATAAAT-ATGTTTGCCGAACTAAATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTA
381 TCTA-AAAATTAATAAT-TAAG-AGATTTAAA--AAATAATC-T-TTTA-TCG---AA-CA---A
* * * ** * * * * **
14204 TTTCAAATCATTATGACTTTTTG---TTTTGTC-A--T-AAAAGAATTGTTCCAGTTCATATAAG
431 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-CACTATAACA-TT--T-T--G
** * * * * *
14262 CTTATTGGGAATAAAA-TAATA---CTAATTTAT-TAA--TAATCCAA
489 -TT-TT-GTCATAAAACAAATATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-A
* ** * *** * *
14303 AAATTAATAATAA-AGAGATTTA--AA-AAATGAATCTGTTTATTGAACATG-TTTAAATAATTA
1 AAA-TAA-AATAATATA-ATTTATTAATATTTCAA--AAATTAAT-AATA-GATTTAAA-AA--A
* * * * * * * * * * *
14363 TGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCT-TTTG-----TT-T-TGTTAT-A
56 TAAATATGTTTATCAA--A-CCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT-TCA
* * * *** * * *
14418 AA-----A-GAATTTT-TTTTGTTCATACAAGC--TTATT-TAAGAAAAAAAACAAATTTATTAA
116 AATTGTTATGATTTTTGTTTTG-TCACA-AAACAATTATTTTATTCATAAAAGC----TTATTCA
* * * * * * * * * ** * ** * **
14473 TATTAAGACAATTAATAA-GTA-AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA---ATAAGTTCA
175 GA-TAAAATAATT-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * * * * ** * * * * * **
14533 AATCAT-TATAACTA-TATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTT-TTTGTTT--TGTC
236 AAT-ATGTTTACCGAGCAAGTTCAAATA-GTATGACTATTTG-AAT-AATTATTTATTTCAAATC
** ** * * * * * * * *
14593 A-TAAAACAATTG-TTTGTATTCATACAAGTT-TATTCAGATTAAAATAATACTAATTT--A-T-
297 ATTATGACTTTTGTTTTGTAATAAAACAA-TTAT-TTTAG-TTCATATAA-GCTTATTTAAAGTA
* * * ** ** * * *
14651 TAATATTTC-AA-CAATTAATA-AGTAAAAGATT-TTAA--AA-A-A-ATAAA---T-AT-GTTT
358 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATCTTTT
* * * * * *
14702 ATAGTAA-AAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TAATGACTT
422 ATCG-AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACT-ATAAC--
* * * * * ** * * *
14765 TTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATGTAAGTTTGCTT-G
483 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTCA
* * * * *
14814 AACTAAAATAATACTAATTTACTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAATAGATTTAAAAAATA-A
* * ** * * * * * * ***
14877 ATCTATTTA-CTAAAAAAGTTCAATTAGTTTTGATTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATT
59 ATATGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* ** * * * **
14941 ATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATA
123 ATGA-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATT-ATTTTATTCATAAAAGCTTA-TTCAG-ATAAAATA
* * * * * * * *
15005 ATT-TAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCT
184 ATTCT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC
* * * * *
15068 GAACACA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTG
248 GAGCA-AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTG
* * * * *
15132 TTTTGTCATAAACCCATTGATTTT-GTTCACAAAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTT
310 TTTTGTAATAAAACAATT-ATTTTAGTTCATATAAGCTTATTT-AAAGTAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
15195 ATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTT
373 ATTAATA-TT-CTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTT
* * ** * ** *
15259 CAAATAGTTATGATTATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATC-TTTTGTTTTGTCAT
434 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAA-CATTTTGTTTTGTCAT
* * * * **
15323 AAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTG
498 AAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* *
15357 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAATTTTAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA---T-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * * * * * * *
15422 CTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTGAAATTGTTATG
61 ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * *
15487 ACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAAAATAAT
126 A-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATT-ATTTTATTCAT--AAAAGCTTATTC-AGATAAAATAAT
* * * * ** *
15550 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAA
186 TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAG
** * * * *
15611 TTAG-TCAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGA-TCTTTGTTT
251 CAAGTTC-AAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTTT
* * * * * * * ** *
15674 TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATA
313 TGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
15738 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTAAACCAA-TTGAAA
377 ATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATC-GAA-CAAGTTCAAA
* * * * * * * * * * ** *
15801 TAGTTAAGACTATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAAT
438 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * **
15866 AATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTTG
503 AAATATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA
* ** * *
15895 AAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAGAAATAA
1 AAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA--TAG-A-TTTAAA-AAATAA
* * * * * * *
15959 ATCTGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAACTGTTA
59 ATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * * * * * *
16024 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTTTAATTCACAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAAT
124 TGA-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTT-ATTCATAAAAGCTTATTC-AGATAAAATAAT
* * * * **
16089 AT-TACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATTG
186 -TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCG
* * * * *
16152 AAGC-AGTTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTG
249 -AGCAAGTTCAAAT-AGTA-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * ** * * * *
16215 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATACAAGCCTATTTCGAA-TAAAATAATGCTAATT
310 TTTTGTAATAAAACAATT-ATTTTAGT-TCATATAAGCTTATTT-AAAGTAAAATAATACTAATT
* * * * * *
16279 TATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTCA-CAGAACTAGT
372 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATC-GAACAAGT
* * * * *
16342 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
433 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCAT
* * * *
16407 AAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCG
498 AAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
16441 GAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * ***
16504 TTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTAT
60 TATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * ** * ** * * * *
16569 GACCTTTTGTTTCGTCTTAAAAAAATGT-TTTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA
125 GA-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAAT-TATTTTATTCATAAAAGCTTATTC-AGATAAAATAAT-
* * * * * * *
16633 T-TAATTTATTGATATTTTAAAAACTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAA
186 TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-GA
* * * * * * * *
16693 TCAA-TTCAAATAGTTATAACAATGTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTT
250 GCAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTT
* * * * * * * * *
16757 TGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTGATACT-ATCTTATTCGAAA-TAAAGTAATGCTAATTTGT
313 TGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATA-TAAGCTTATT-TAAAGTAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * *
16819 TAATATCCTAAAAATTAACAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAAT-TTGTTGGCCTGACCAA-TAC
375 TAATATTCTAAAAATTAATAATTAA-GAGATTTAAAAAAT-AATCTT-TT-ATC-GAACAAGTTC
* * * * *** * * *
16881 AAATAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAA
435 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
16945 AACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTGACTT-G
500 AACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
* * * *
16977 GAATAACATAAATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT
1 AAATAAAAT-AATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAAT
* * *** * * * ** *
17042 TTGTTTATCGATTAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATTACTATA
61 ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * *
17107 ACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATA
126 A-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTA-TTCAGA-TAAAATAATT
* * * * * * * *
17171 CAAATTTATTAATATTT-AGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA
187 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAG
* * * * ** *
17235 TAAGTTTAAATAGCTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATTTTTTGTTTT
251 CAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
17300 GTCATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAA
314 GTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *** * * * * * * * *
17365 ATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGATCGAATAAGTTCTAATACT
379 ATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAAT
* * * * *** * * ** * *
17430 TATAACTACTTGAATAATTAT-TGACTTC-AAATGTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAAT
442 TATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * *
17493 TGTATCAATTCATATAGGCTTATTCA
506 TATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * *
17519 AAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAAAATATAAAT
1 AAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAT-AG--ATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
17583 CTATTTA-CTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTAT
61 ATGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * * *
17647 GATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATA
125 GAT-TTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTA-TTCAGATAAAATAATT
* ** * * *
17712 CTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
187 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAG
* * * * * *
17776 TAAATTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
251 CAAGTTCAAATAGT-ATGACT-ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTT
** * * * * * * *
17840 TGTCGTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAGAATTATTTAGCA-TAAAATAATGCTGATTCAT
313 TGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAG-CTTATTTA-AAGTAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * **
17902 TAAGATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAG-TATTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAA
375 TAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGAT-TTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * * ** * * *
17962 ATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCA-T-TATGATCCTTATTTTGTCATAGA
437 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACAT-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
18025 ACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCCTATCCA
501 ACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * ***
18056 GATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAAA-T-A-AAT-GAGTTT-----GCCAA-A--
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGA-TTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * * * *
18105 -CTATCAAACAAGCTCAAATAGATATG-GTCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTAC
64 TTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAT
* * *** * * * * * * * * **
18168 TTTTGTTTAGTAATTTAAGAATT-TTTTTTATCGTACACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAA
128 TTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTAT-TCATAAAAGCTTATTC-AGATAAAATAATTCTAA
* * * * * * *
18232 TTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGT
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGT
* * * * *
18297 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTT
256 TCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC----A--T--T---AT-GA-CTT
* * * * * *
18362 TTGTTCTATCATAAAACAATTA-TTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATAGTAA
307 TTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTA-GTTCATATAAGCTTATTT-AAAGTAAAATAATACTAA
* * * * * * ** *
18425 TCTAATAATATTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACCAGT
370 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAACAAGT
* * * * * * ** * * *
18490 TTAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCAT
433 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCAT
* * * *
18555 AAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCA
498 AAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
18589 GAATAAAGTAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAATT
1 AAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * ** *
18654 CTATTTACCTAACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAAC-ATTATCAATTTGAAATCATTATC
61 ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * * ** *
18718 ACCTATGGTTTTGTCATAAAACAAATGATTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGC
126 A-TTTTTGTTTTGTCACAAAAC-AATTATTTTATTCATAAAAGCTTATTCAG-ATAAAATAATTC
* * * * *
18783 TAATATATTAATATTACAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATC-A--A
188 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCA
* * * ** *
18841 A---C--AT-GT-T--C------AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
253 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTA
* * * * * * *
18891 AT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATCA-AGT--TGTATTAATATT
317 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
18952 TTAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-CTGAATC-AGTTCAAATAATT
382 CTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATC-TTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAATT
* * * * **** * * * *
19015 ATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATC-TTTTGTTTTCTCATAAAACAATT
443 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACT-ATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * *
19079 CCTTT-TCAAT-ATAGAAGCTTATTCG
507 -ATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
19104 AAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAAATCTA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAAT-AAATATG
* * *
19169 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAAC
64 TTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-
* * * * * * * * * * *
19233 CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTTGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
127 TTTTTGTTTTGTCACAAAACAA-T-TATTTTATTCATAAAAGCTTA-TTCAGATAAAATAATTCT
* * * *** * * * *
19298 AATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGCTGAACT
189 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCA
* * *
19362 AGTTCAAATAGT-TAAACTATATGAA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTG
253 AGTTCAAATAGTAT-GACTATTTGAATAA-TTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTG
* * ** * * * * *
19425 TCATAAAACAATTGCTTTTTCTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
315 TAATAAAACAATT-ATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
19490 ATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCTATTT-GCTAAGCCATTTCAAATA
379 ATTCTA-AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATA
* * * * * * *
19554 GTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACA
440 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-CACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * * **
19619 ATTGGTCCTATTCATACTATTTTATAT-A
504 AATATTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCA
* * * * * *
19647 GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAGGAAAATTCAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TA-G---ATTTAAAAAATAAA
** * * ** * * * * *
19712 TATAATTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACGATTATTTATTCCAAACTGTTAT
60 TATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* ** * * * * ** *
19777 GACCTTTTTCTTTTGTCGTAAACCAATTGTTTTATTTATACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATG
125 GA--TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGA-TAAAATAATT
* * * * ** *
19842 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAAT
187 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AG
* * * * * * * * * *
19907 C-AGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTGTTTA
251 CAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTT
* * ** * * * * *
19971 GTCATAAAACAATTGTTGCAATTCATACAAACTTATTCAGAA-TAAATTAATACTAATTTATTAA
314 GTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTA-AAGTAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** * * * *
20035 CATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATA
378 TATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAA-AT-AATCT-TTTATCGAACAAGTTCAAATA
* * * * * ** * * * *
20100 ATTATTACTATTTTAACAAATGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACA
440 ATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * * * *
20163 TTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-G
504 AATATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
* * * * *
20191 GATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAA-T-AG--ATTTAAAAAATAAA
** ** * * * * *
20255 TCA-GTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTATT
60 T-ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * *
20318 ATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTT-TTTATCACATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
123 ATGA-TTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTATTCAT-A-A-AAGCTTATTC-AGATAAAAT
* * *
20382 GATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT
183 AAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
*** * * * * * * *
20446 CGAATTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTAATCTCAAATCGTTAAGA-TCTATG
247 CGAGCAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT-TTTG
* * * * * * * * * * *
20510 TTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGATCATAGAAACTTATTT--CGTTAAAAATAAAACTAATCT
310 TTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAG-T-AAAATAATACTAATTT
* * * * * *
20573 AATAATATT-TCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-T
373 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATCT-TTTATCGA-ACAAGT
** * ** * * * * * * * *
20636 TTGAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGAC-CTTTGTTTTGTCAT
433 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * **
20700 AAAATATTTGTTTCATATT-TTACAAGTTTATTTG
498 AAAACAAATATTTC-TATTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
20734 GAATAAAATAATCA-AATTTATTAACA-TTCAAAAATTAAAAAGGAAATGATTTGAAAAAAATAA
1 AAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATA--ATA-GATTT--AAAAAAT-A
* * * * * * * * * **
20797 AATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTATTATTTATTTAAAATCATT
58 AATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
*** * * * * * *
20862 ATGACCAGTTGTTTTGACATAATAAACATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT
123 ATGA-TTTTTGTTTTGTCA-CA-AAACAATTATTTTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AGATAAAAT
* * * * * *
20927 AATACTAATTTCTTAATAATTC-AAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACC
183 AATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC
* * * * * * *
20988 GAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
248 GAGCAAGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT
* * * * * * * *
21053 TTTGTCATAAAATAATTGTTTGAATTCATA-CAGCTTAGTTAAAAT-AAATAATACTAATTTATT
311 TTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
21116 AATATT-TCAATAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAAG-TCA
376 AATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATCGAA-C-AAGTTCA
* * * * * * * * * *
21178 AATAATTTATGGCCATTTCAACAATTATATATTTCAAATCATTCATTAC-CTTTATTTGGTCATA
436 AATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACT-ATAACATTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
21242 TATAC--ATTTTTTTAAATCATATTATGTTTATTCCA
499 -AAACAAATATTTCT-ATTCATA-CAAGCTTATT-CA
*
21277 AAATAAAAATAATAGTAATTTATTCAAT-CTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
1 AAAT-AAAATAATA-TAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAA
* * ** * * * * *
21341 ATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATGAACTATTTAAACAATT-TATAGCTTCAAATCGT
59 ATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGT
** * * * * * * *
21405 TAT-ACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCCATACAAGGTTATTTGAAATAAAATA
122 TATGATTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATT-CATAAAAGCTTA-TTCAGATAAAATA
* * * * * * * * *
21469 ATACTAATATAAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAGAAAGAAATTTG-TT--
184 ATTCTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * * ** * *
21531 CAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTAGATGAACAATTATCTATTTCAAAT--TGT-T---TTTTG
247 CGAGCAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAT-TATGACTTTTG
* * * * *
21590 TTTTGTCAT-AAACAATT-TTTCACTTCATACT-AGCTTATTCAGAA-TAAAATAA-AATAAATT
310 TTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATA-TAAGCTTATTTA-AAGTAAAATAATACT-AATT
* * * * *
21650 TATTAACATT-TCAAAATTAAT-ATGTAAGAGACTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAA-T
372 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAT-TAAGAGATTTAAAAAATAA-TCT-TTTATCGAA-CAAGT
* *** * * *
21712 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTAT
433 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
21777 AAAAC-AATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCA
498 AAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
21810 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGGATTTTAAAAATAAATTTGT
1 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * **
21874 TTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTT
65 TTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TT
* * * * ** * *
21939 TTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTATTCATATTAAAATAATACTAAT
129 TTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATAAAAGCTTATTCAGA-TAAAATAATTCTAAT
* * * * * * * *
22004 TTATTAATATTTCGACAATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAATAAATCA--TTTACCAAACTAGA
192 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAGCAAGT
* * * * *
22066 TCAAATAGTTATGACTATTCGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTAT
256 TCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTAAT
* * * *
22131 AAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTT
319 AAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTA-AAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* *
22194 TGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTGAACAAGTTTAAATAATTAT
383 TAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCT-TTTATC-GAACAAGTTCAAATAATTAT
* * *** * ** ** * *
22258 GACTATTTGAATAATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTT
445 GACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATAT
22322 TTCTATTCATACAAGCTTATT-A
509 TTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * *
22344 CGAATAAAATAATACAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAA
1 -AAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAA-A-AATT-A-A--TAATAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * *
22407 ATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTCTTTCAAATTG-T
59 ATATGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * * *
22470 ATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATCATACAAGGCTTATTCATATTAAAATAA
123 ATGATTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTT-TATTCATA-AAAGCTTATTCAGA-TAAAATAA
* *** **
22535 TAT-TAATTTATAAATATTTCAATAGGCTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTATT
185 T-TCTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC
* * * *
22598 GAACGAAGTTCAAATAGTCTTGTCTATTTG-A-AATTAATTCTATTTCAAATCGCATTGTGACCT
248 GAGC-AAGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATT-ATT-TATTTCAAAT--CATTATGA-CT
* * * * *
22661 TTTGGTTTGT-ATAAAACACTTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTATGAAAATAAAAATAATACT
306 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATT-T-AAAGT-AAAATAATACT
* * * ** * *
22725 AATTCCATCGAATATTCT--AAATTAATGAGCAAGAGAATTAAATAAATTAAATTTTGTTTATCG
368 AATT-TAT-TAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAA-AAA-T-AA-TCT-TTTATCG
* * * * * * * * *
22788 AACCATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGT
426 AACAAGTT-CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGT
22853 TTTGTCATAAAA
490 TTTGTCATAAAA
22865 ACAATTGGT
Statistics
Matches: 11685, Mismatches: 2722, Indels: 2038
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
485 28 0.00
486 34 0.00
488 1 0.00
489 4 0.00
490 11 0.00
491 17 0.00
492 18 0.00
493 19 0.00
494 11 0.00
495 2 0.00
496 8 0.00
497 8 0.00
498 6 0.00
499 25 0.00
500 25 0.00
501 11 0.00
502 29 0.00
503 30 0.00
504 7 0.00
505 47 0.00
506 38 0.00
507 35 0.00
508 14 0.00
509 87 0.01
510 93 0.01
511 30 0.00
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529 80 0.01
530 174 0.01
531 377 0.03
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545 192 0.02
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548 55 0.00
549 18 0.00
550 102 0.01
551 3 0.00
552 19 0.00
553 36 0.00
554 51 0.00
555 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (531 bp):
AAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATATGTT
TATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTT
TGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGATAAAATAATTCTAATTTAT
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAAA
TAGTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
TTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
AATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATCTTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
CAATTATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTATTCATAC
AAGCTTATTCA
Found at i:9820 original size:124 final size:125
Alignment explanation
Indices: 9685--9919 Score: 301
Period size: 125 Copynumber: 1.9 Consensus size: 125
9675 GATTTTGTCT
* * * *
9685 TAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAAT-AAATAATAGTAATTTATTAATATTT
1 TAAAACAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
*
9749 CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTATCGAACCAAATTTCTGTTA
66 CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAAATTTCTGTTA
* ** * * * ***
9809 TAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
1 TAAAACAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
* * * *
9874 CAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA
66 CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
9920 GTGGTTCAAA
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 18, Indels: 1
0.83 0.16 0.01
Matches are distributed among these distances:
124 29 0.32
125 63 0.68
ACGTcount: A:0.45, C:0.08, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (125 bp):
TAAAACAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAAATTTCTGTTA
Found at i:10590 original size:358 final size:359
Alignment explanation
Indices: 9820--10604 Score: 874
Period size: 358 Copynumber: 2.2 Consensus size: 359
9810 AAAATAATTG
* * * * * *
9820 TTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC-CAAAATTGAT
1 TTTTTGTTCATATAA-ATTTTTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAAT
* * * * *** *
9884 AATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAAGTGGTTCAAATAATTAAGACTATATGAAC
65 AACTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAAC
* * * * * *
9949 AATTATCTGTTTATAAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGATCATATAACAATTTTTTTTATCATTC
130 AATTATCTGATTATAAAAAAATTATGACCTTTTGTTTGAGCATAAAACAATTTTTTTAATCATAC
* * *
10014 AAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
195 AAGCCTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGCAAGAGATTT
* * *
10079 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATACGTAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAA
259 AAAAAAGAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATACGTAACTATTTGAACAATTATAAACTTCAA
* * *
10144 ATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTA
324 ATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAAATA
* ***
10180 ATTTTGTTCATAT-AATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAA
1 TTTTTGTTCATATAAAT-TT-TTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAA
* *
10244 TAACTAAGAGAATTAAAAAATAAAT-TTTTTATCAAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAA
64 TAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAA
* ** * * * * *
10308 CAATTATCT-ATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAGCGTAAAATGAGTTTTTTTGAATTT
129 CAATTATCTGATTATAAAAAAATTATGACCTTTTGTTTGAGCATAAAA-CAATTTTTTT-AA-TC
* *
10371 ATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-CAAGAG
191 ATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGCAAGAG
* * **
10432 ATTTAAAAAAGAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAAC-TATGACTATTTGAACAATTATCT
255 ATTTAAAAAAGAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAAT-ACGTA--ACTATTTGAACAATTATAA
* * * *
10496 ATTTCAAAT-AGTTAT-ATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATA
317 ACTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAAATA
* *
10538 TTTTTGTTCATATAAATTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAAT
1 TTTTTGTTCATATAAATTT-TTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAAT
10603 AA
65 AA
10605 GAGATTTAAA
Statistics
Matches: 353, Mismatches: 60, Indels: 26
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
357 41 0.12
358 110 0.31
359 44 0.12
360 84 0.24
361 74 0.21
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
TTTTTGTTCATATAAATTTTTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATA
ACTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAACA
ATTATCTGATTATAAAAAAATTATGACCTTTTGTTTGAGCATAAAACAATTTTTTTAATCATACA
AGCCTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGCAAGAGATTTAA
AAAAGAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATACGTAACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAAT
CATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAAATA
Found at i:10880 original size:181 final size:175
Alignment explanation
Indices: 10026--10886 Score: 477
Period size: 176 Copynumber: 4.8 Consensus size: 175
10016 GCCTATTTGG
* *
10026 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAA-C
* * * * * * ** *
10091 TGTTTACCGAACT-AGTTCAAATACGT-A--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCA-TTA
61 TATTTA-TGAAATAAATTGAAATAC-TAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTA
* * * * * * * * *
10151 TAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTAATTT-TGTTCATATAATCTT-ATTCAA
123 TGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAAT-ATTTCTATTCATACAAACTTGATTC-A
*
10205 AATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAA-TTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGA-AATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * * * *
10268 TTTTTTATCAAACCAGTTCAAATATTTAA-AACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA
60 CTATTTATGAAATAAATTGAAATA-CTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTA
* ** * * * * * * **
10331 TGACCTTTTGTTTTAG-CGTAAAATGAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTT-ATTTGG
123 TGA-CTTTTGTTTT-GTCATAAAAAAAATATTTCT--ATTCATACAAACTTGA-TTCA
* * * * * *
10387 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAAAGAATTCTAT
1 AATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAA-ACTAT
* * * *
10451 TTACCT-AACT-AGTTCAAATAACT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-A
64 TTA--TGAAATAAATTGAAAT-ACTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * **
10512 TCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATATTTTTGTTCATATAAATTTGTTTGG
126 -CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATATTTCTATTCATACAAACTTGATTCA
* *
10563 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATT
1 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAAT-AAACTATT
* * * * *
10628 TATGAAATGAATTGAAATACTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATAGTTATGACTAC
65 TATGAAATAAATTGAAATACTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACT-T
* * * * *
10693 TTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCA
129 TTGTTTTGTCATAAAAAAAATATTTCTATTCATACAAACTTGATTCA
* * * *
10739 AATTAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAT-AAC
1 AA-TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AAATTTAAAAAATAAAC
* * * * *
10803 TATGTTTATTGAACTAAATT-AAATAGTAATGACTATTTGAAAAATTATTTACTTCAAATCGTTA
61 TA--TTTA-TGAAATAAATTGAAATACTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTA
10867 TGACCTTTTGTTTTGTCATA
123 TGA-CTTTTGTTTTGTCATA
10887 TAAGCTTATT
Statistics
Matches: 542, Mismatches: 99, Indels: 80
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.00
175 6 0.01
176 114 0.21
177 78 0.14
178 59 0.11
179 98 0.18
180 54 0.10
181 74 0.14
182 49 0.09
183 9 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAACTATTT
ATGAAATAAATTGAAATACTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACTTTT
GTTTTGTCATAAAAAAAATATTTCTATTCATACAAACTTGATTCA
Found at i:11213 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 10921--22871 Score: 4539
Period size: 181 Copynumber: 66.7 Consensus size: 179
10911 ACTAAGTTTA
* * * * * *
10921 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTC-AAGCAACTTTAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * ** * * ** *
10985 GACTATTTCAATAATTTTCTTTTTTAAATTGCTATATCTTTTTGTTTTGGCATAAAATGATTTTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * *
11050 TTTGTTCATACAATTTTATTGCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-T
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * *
11100 -AAAGACACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAAT-CTT
1 CAAA-A-A-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* *
11163 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTCTTATAACTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTG
* **
11228 TTTCTGTTCATACAAGCTTATT-CAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAA-TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
** * ** * * *
11282 TGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAATATGTTTTTTCGAAGAAGTTCAAATAGTTCT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
11347 AACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATTATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTATT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* *
11410 T-TAGTTCATATAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATT
129 TCT-GTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * * * * *
11461 CCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACATGTTTAAATAGTTAT
1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
11526 GACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAATATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * *
11591 TCTATTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
11643 GAAAAATCAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGATTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
11707 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
11772 TCTGTTCATAAAAGCTTATTTG-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * *
11823 CCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAAGCGAGTTCAAATAGTT
1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* *** * *
11886 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATGAAACAATTG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * * * *
11951 TTTCCATTCGTATAAGTTTATGTG-AAATAAATTAATACTAACTTATTAATATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* *** * * * *
12004 CTTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCATCGAACAAGTTCAAATAGTCAT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * * * *
12069 -ATCCATTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAGTTG
65 GA-CTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* ** *
12132 TTTCTATTCATACAAAATTATT-CAAAATAAAATAATAAAAATTT-TTCAATATTT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATT-AATA-TT
** * * * ** *
12186 TGAAAA-T--TAAG-AAGAGA-TTAAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCCGTTCTAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *** * * *
12246 GATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATGATTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * * * *
12311 ATATTCATACAAGCTTATTTTC-AGTAAATTATTGCTAAA-CTAATAGTATT
130 CTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATAC-AAATTTATTAATATT
* * **
12361 CTAAAAATT-A-AA--AATAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTCAAAT-GATT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAG-TT
* * ** * * * *
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63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** *
12485 TTTCAGTTGATACATGCTTATT-CGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
** * *
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1 CAAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
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64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** *
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127 TTTCTGTTCATACAA-GCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
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1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
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65 GACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA-TAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * **
12848 TTTTCATT-ATACAAGCCTATT-CAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
128 TTCT-GTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * * *
12901 CAAAACTTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C---CAA--AC-CA-A---CT-
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
12954 CCTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTG
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* * * * *
13019 T-AGTTCATATAAACTTATT-CAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * *
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1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
13133 AGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTA-AGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATA-A-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* *
13197 TTTCAGTTCATACAAGCTTATT-CAAAATAAAATAATA-ATAA-TTATTAATGTTT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACA-AATTTATTAAT-ATT
** * ** * * ** *
13250 TGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTC-AAATAGTTAT
* *** * * *** * * ** * *
13311 -AGCCATGCCAACAGTTATCTATTTCAAATCGGTATTACTTTT-TTTTGGTCATATAGTAGTTAT
65 GA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT
*** * * * * *
13374 ATT-TGAAAATTCAAGCTTATTTG-GAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTT
128 -TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATT
* * ** * ** * *
13427 CAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTA-CTGAATTA-TCTTAAATACTTA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGT-TCAAATAGTTA
* * * ** * ** ** * *
13490 TAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTAATATCATAAAAACAATTA
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTG
* * * **
13555 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTAG-AAATAAAATAATACTAATCTAACAATATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATT-GCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * ** ** * *
13608 CCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAA
1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
13671 GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATTTTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * * **
13735 TTTGAATTCATATTAGCTTATTTG-GAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTT
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* * * * * * * *
13789 CAAAAATTAATAAGT----TATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
13850 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTT
66 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
13915 TTGTTCATATAAGTTTGTT-CAGAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTT
130 CTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATT-TATTAATA-TT
* * * * * * *
13966 C--AAA-TATTAA-TCAAAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** * * ** * * *
14026 AACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
14091 TTTGTTTATACAAGCTTATT-CAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
** * * **** ** * * * *
14142 CAGATTATAAATATGTTTGCCGAACTAAATCAAAT-AATCATGATTATTTGAATAATTATTTATT
1 CA-AAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAA--AAATAAAT-ATGTTTA-TCG---AA-CA---AGT
* * * *** * * **
14206 TCAAATCA-TTATGACTTTTTG--T-TTTGTC-ATAAAAGAATTGTTCCAGT-TCATATAAGCTT
53 TCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATTATT--A-TAAC-T-TTTG-TT
** * ** ** * * * *
14265 ATTGGGAATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAA---TAATCCAAA-AATTAATAATAAAGAGAT
110 -TT-GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAA--AATAATACA-A-AT
* *
14322 TTA--AAAAAT
169 TTATTAATATT
* *** * * * * ** * **
14331 GAATCTGTTTAT-TG-AACATG-TTT---AAATAATTATGACTATTTGAACAA-TT-ATCTA-TT
1 CAA-AAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * ** * * * *
14387 -TGA--AATCGCTATAACCTT-T-TGTTT--TGTTATAAAAGAATTTT-TTTTGTTCATACAAGC
63 ATGACTATTTG-AATAA--TTATCTATTTCAAATTATTATA-ACTTTTGTTTTG-TCATA-AAAC
* ** *** * ** * * *
14444 --TTATTTAAGAAAAAAAACAAATTTATT---AAT--ATTAAGAC-AA-TTAATAAGTA--
122 AATTGTTTCTG--TTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAA-TATT
* * * * * * ** *
14494 -AAAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACTGAATAAGTTCAA-ATCATTAT--AACTATATGTGC
1 CAAA-AATTAATAAGTAAA--AGATTTA---AA-AA-ATAAATATGTTTATCGAAC-A-A-GTTC
* * * ** * * * * **** * * **
14554 GATTATTTATTTCAACTTG--TTATGA-CT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGT-ATT
55 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTAT--TATAACTTTTGTTTTGTCA-T
* * * * * * * * * * * * * *
14613 CATACAAGTT-TATTCAGATTAAAATAATACTAATT---TAT-TAATATTTCAACAATTAATAAG
117 AAAACAA-TTGT-TTCTG-TTCATACAA-GCTTATTGCAAATAAAATAATACAA-ATTTATTAA-
14673 TA--
176 TATT
* * * * * *
14675 -AAAGATTTTAAAAAAATAAATATG-TTTATAGTAAAAGTTCAAATA-G-TCAT-G-ACTA-TTT
1 CAAA-A-ATT-AATAAGTAAA-A-GATTTA-A--AAAA--T-AAATATGTTTATCGAACAAGTTC
* * * * * *
14733 GAATAATTAT--CTATTT---CAA--ATC-A--T--AATGACTT-T---TTTTCTTTTGTAATAA
55 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTATAACTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * * * *
14782 AACAATTGTTTCAGTTCATGTAAGTTTGCTTG-AACTAAAATAATACTAATTTACTAATATT
119 AACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
14843 CTGAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTA-CTAAAAAAGTTCAATTAGTT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * ** * * *
14906 TTGATTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * ** *
14971 GTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATTTAAATTTACTAATATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * *
15024 CCAAAAATTAGTAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTT
1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACA-AGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
15086 ATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * *
15151 ATTT-TGTTCACAAAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTT
127 -TTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * *
15204 CCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTA
1 -C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* ** * * *
15269 TGATTATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
15334 TTCTATTCATACAAGTTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATT
* * ** * * * * * * *
15387 TAAAAATTAATAATTTTAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
15452 TCCATTTGAACT-ATTATCTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
66 ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** *
15516 TTTATTCATGCAAAATTATT-CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * *
15568 CAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTATA-C-AA-AATTAGTCAAAATAGTT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT--TC-AAATAGTT
* * * **
15626 ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
15690 TTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAGAGTAAAATATTGCTAAA-CTAATAATATTT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATAC-AAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
15744 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTAAACCAA-TTGAAATAGTTA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * ** *
15807 AGACTATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *** *
15872 TTCAGTTCATACATGCTTATTTG-AAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACATT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * *
15924 CAAAAAATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAGAAATAAATCTGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTT
1 C-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAA-AAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
15988 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAACTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ** *
16053 TTT-TAATTCACAAAAGCCTA-TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
127 TTTCT-GTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * *
16107 CAAAAATTGAGAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATTGAAGC-AGTTCAAATAATTA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * *
16170 TTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCT-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
64 -TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
16233 GTTTTTTTTATCATACAAGCCTATTTCGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTT
126 G-TTTCTGT-TCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
** * * *
16290 CAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTCA-CAGAACTAGTTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
16354 GACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
16419 TATGTTCATACAAGCTTATT-CGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * *
16470 -ATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTTTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTT
1 CA--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * ** * * * *
16532 AAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTCGTCTTAAAA-AAATG
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ** *
16596 TTTTTGCTCATATAAGTTTGTT-CAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * *
16650 TAAAAACTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATCAA-TTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * * *
16710 AACAATGTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * * *
16775 TCTATTGATACTATCTTATT-CGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATC
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* ** * * *** * *
16826 CTAAAAATTAACAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAA-TACAAATAGTTA
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
16890 TAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAACAATTGT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
16954 TTTTGTTCGTACAAGCTGACTTG-GAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATA-CAAATTTATTAATA-TT
* * * **
17007 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGATTAAGTTCAAATAGTTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
17072 ACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTT
66 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *
17137 CTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT
130 CTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
17187 TAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCTT-
1 CA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTA
* * *** ** * *
17251 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTAT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * ** *
17316 TTTTGTTCATACAAGCTTATT-CAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
**** * * * * * *
17369 TTCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGATCGAATAAGTTCTAATACTTATA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * *
17434 ACTACTTGAATAATTAT-TGACTTCAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAATTGTA
66 ACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * *
17497 TCAATTCATATAGGCTTATT-CAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * *
17548 CAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAAAATATAAATCTATTTA-CTGAACAAGCTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
17612 GACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATGATA-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTAT-A-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * *
17675 TTTCTATTCATACAAGTTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* ** * * * * * *
17728 CTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCAT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * *
17793 G-TTCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGT
65 GACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** * *
17857 TTCTATTCATAC-AGAATTATTTAGC--ATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTT
128 TTCTGTTCATACAAG-CTTA-TT-GCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
** * * * **
17910 TGAAAATTAATAAG----AG-TATTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
17970 GACTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGA-TCCTTATTTTGTCATAGAACAATTGTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * *
18034 TCTTTTCATATAAGCCTA-TCCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA--
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * * **
18083 -AAAAATAAATGAGTTTGCCAAA-CTATCAAACAAGCTCAAATA-G-ATAT-GGTC-A-TCTCAA
1 CAAAAATTAATAAG--T--AAAAGAT-TTAAA-AA-AT-AAATATGTTTATCGAACAAGT-TCAA
* ** * * * * *
18141 CA-A-TTAT--CTATTTCAAATTGTTATTACTTTTGTTTAGTAATT-TAAGAA-TTTT-TTTTAT
57 -ATAGTTATGACTATTT-GAATAATTA-T-C-TAT-TTCA--AATTATTATAACTTTTGTTTTGT
* * * * ** * *
18199 CGT---AC-A-CG-GT-TGTTCA-A-AA---TA----AAATAACACTAATTGATTAATCT-TTCA
114 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAA-AATAA-T-ACAAATTTATTAA
18247 -A--
176 TATT
* * *
18248 -AA--ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * *
18310 ACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTTTTGTTCTATCATA
66 ACTATTTGAATAA-T-TAT-C-T-ATTTCAA--A-TT-AT----TATAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * *
18375 AAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATT
118 AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * ** * * *
18437 CTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTAA
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** * * *
18502 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * **
18567 TCAATTCATACTAGCTTATT-CAGAATAAAGTAAAATGAATTTATTAATATTT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * * * *
18619 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAATTCTATTTACCTAACCAA-TTCTAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
18683 GACTATTTGAA-CATTATCAATTTGAAATCATTATCACCTATGGTTTTGTCATAAAACAAATGAT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
* * * * * * * *
18747 TT-TATTCATATAAGTTTGTTTG-GAATAAAATAATGCTAATATATTAATATT
128 TTCTGTTCATACAAGCTT-ATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * *
18798 ACAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACATGTTCAACA-A-TTA
1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAA-ATAGTTA
* * *
18857 T--CTATTT---T-A--A---A-TT---GTTA-T-GACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
18904 T-TAGTTCATAAAAGCTTA-T-C---TAAAATAAAATCAAGTTGTATTAATATTT
129 TCT-GTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATA-CAAATT-TATTAATA-TT
* * * * *
18953 TAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTA-CTGAATC-AGTTCAAATAATT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
19015 ATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTC
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATT-ATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-
* ** * * *
19080 CTTT-TCAAT-ATAGAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT
126 GTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
19134 CAAGAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
19195 GACTA-TTGAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGT
65 GACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-
* * * * *
19259 TTTTTGTTTATATAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * ** *
19312 CTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCAT-TTGCT-GAACTAGTTCAAATAGTT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT--ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
19375 A-AACTATATGAA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
63 ATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * ** * *
19438 GCTTTTTCTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTT
126 G-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * * * * * * *
19494 TAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCTATTT-GCTAAGCCATTTCAAATAGTTT
1 CA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * *
19558 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTG
64 TGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * ** * *
19623 GTCCTATTCATACTATTTTATAT--AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* ** * ** * * *
19676 CCAAAACTTAATAACCAGGAAA-ATTCAAAAAATAAATATAATTGTCAAACTAGTTCAAATAGTT
1 -CAAAAATTAATAAGTA--AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
** * ** * * * * * * * *
19740 AAAACTATATGAACGATTATTTATTCCAAACTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAACCAATT
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *** * * * *
19805 GTTT-TATTTATACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTT
126 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
19859 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAATC-AGTTCAAATGGTTAA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * ** * * *
19923 GATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * * * *
19988 GCAATTCATACAAACTTATT-CAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * *
20039 CAAAAAATTAATAAG-AAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAA-ATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * ** * * * *
20103 ATTACTATTTTAACAAATGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACATTT
63 ATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * * *
20166 GTTTCAATTAATACAAGCTTAGATG-GATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTT
126 GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * ** * *
20221 ACTAAAA-TAATAAGTAAGAA-ACTTAAAAAATAAATCA-GTTTATTGAATTAGTTAAAATAATT
1 -CAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * *
20283 AT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
63 ATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * **
20347 ATTTTTTTATCACATAAGCTTATT-CAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTT
126 GTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* ** *
20403 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGCTCAAATAGTTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * * *
20468 ACTATTTAAATAATTAT-TAATCTCAAATCGTTA-AGA-TCTATGTTTTATCATAAAATAATTGT
66 ACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATTATTATA-ACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * ** * * * *
20530 TTTTGATCATAGAAACTTATTTC-GTTAAAAATAAAACTAATCTAATAATATTT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAAT-AAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * **
20583 CAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTTGAATAGTTA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTA
** * * * * * * * *
20647 AAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTGTTTTGTCATAAAATATTTGTT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
20712 TCATATT-TTACAAGTTTATTTG-GAATAAAATAAT-CAAATTTATTAACATT
129 TC-TGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
20762 CAAAAATTAAAAAGGAAATGATTTGAAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAAT-AAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * ** * *
20827 ATGACTATTTAAACT-ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAATAAACAT
63 ATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCAT-A-AAACAA
* * * *
20891 TTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATT
124 TTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTGC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATT
* * * * * *
20948 C-AAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
21009 ACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
66 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
*** * *
21074 GAATTCATAC-AGCTTAGTT-AAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTT
130 CTGTTCATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* ** * * * *
21123 CAATAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAAG-TCAAATAATTT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-C-AAGTTCAAAT-AGTT
* * * * * * * * * * *
21186 ATGGCCATTTCAACAATTATATATTTCAAATCATTCATTACCTTTATTTGGTCATATATAC-ATT
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATT-ATAACTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATT
* ** * * * * ** *
21250 -TTTTTAAATCATATTATGTTTATTCCAAAATAAAAATAATAGTAATTTATTCAATCTT
126 GTTTCT-GTTCATA-CAAGCTTATTGC-AAAT-AAAATAATACAAATTTATT-AATATT
* * * * ** *
21308 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * * *
21373 AACTATTTAAACAATT-TATAGCTTCAAATCGTTAT-ACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTATT
66 -ACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
21436 TCTATTCCATACAAGGTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATATAAATAATATT
129 TCTGTT-CATACAAGCTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAAT-TTATTAATATT
* * * * * * * *
21489 CCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAGAAAGAAAT-T-TGT-TCAAACTAGTACAAATAGTTA
1 -CAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* ** * *
21551 AGACTAGATGAACAATTATCTATTTCAAATT-GT-T---TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATT-TT
64 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * *
21609 TCACTTCATACTAGCTTATT-CAGAATAAAATAAAATAAATTTATTAACATTT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * * * *
21661 C-AAAATTAATATGTAAGAGACTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * *
21724 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TGTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
21788 TTTATTCATATAAGTTTGTT-CAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * * * * *
21839 CAAAAATTAATAA-T---GGATTTTAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * **
21900 ACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTT
66 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * *
21965 CTATTCATAAAAATTTATT-CATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
130 CTGTTCATACAAGCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * * *
22016 CGACAATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAATAAATCA--TTTACCAAACTAGATCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
22078 GACTATTCGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATT
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* * *
22143 T-TAGTTCATATAAGCTTATTAG-AAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTT
129 TCT-GTTCATACAAGCTTATT-GCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
** * * * * * * *
22194 TGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTGAACAAGTTTAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** ** ** *
22258 GACTATTTGAATAATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTT
65 GACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * *
22322 TTCTATTCATACAAGCTTATTACGAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * * **
22373 -AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATCCTT
1 CAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
22436 ATGACTAATTGAACAATTATTTCTTTCAAATT-GTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
63 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * ** *
22500 TTCTAATCATACAAGGCTTATT-CATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTT
128 TTCTGTTCATACAA-GCTTATTGCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
*** *
22554 CAATAGGCTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTATTGAACGAAGTTCAAATAGTCT
1 CAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGT-T
* * * * *
22618 -TGTCTATTTG-A-AATTAATTCTATTTCAAATCGCATTGTGACCTTTTGGTTTGT-ATAAAACA
63 ATGACTATTTGAATAATT-A-TCTATTTCAAAT--TATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
22679 CTTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTATGAAAATAAAAATAATACTAATTCCATCGAATATT
123 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-T-TGCAAAT-AAAATAATACAAATT-TAT-TAATATT
* * * * * * * *
22741 C-TAAATTAATGAGCAAGAGAATTAAATAAATTAAATTTTGTTTATCGAACCATTTCCAAATAGT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA-AAA-TAAA-TATGTTTATCGAACAAGTT-CAAATAGT
* * * ** * *
22805 TATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAACAAT
62 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT
22870 TG
125 TG
22872 GT
Statistics
Matches: 9023, Mismatches: 2019, Indels: 1450
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
152 8 0.00
153 3 0.00
154 20 0.00
155 3 0.00
156 8 0.00
157 23 0.00
158 50 0.01
159 15 0.00
160 11 0.00
161 14 0.00
162 12 0.00
163 29 0.00
164 27 0.00
165 37 0.00
166 24 0.00
167 39 0.00
168 24 0.00
169 145 0.02
170 37 0.00
171 28 0.00
172 100 0.01
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174 39 0.00
175 167 0.02
176 534 0.06
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178 320 0.04
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181 2689 0.30
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188 36 0.00
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191 18 0.00
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193 69 0.01
194 5 0.00
195 8 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
TGTTCATACAAGCTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT
Found at i:11903 original size:362 final size:358
Alignment explanation
Indices: 10921--22864 Score: 5589
Period size: 362 Copynumber: 33.3 Consensus size: 358
10911 ACTAAGTTTA
* * * *
10921 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTT-GTCAAGCAACTTTAAATAATTA
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-C-AGTTCAAATAATTA
* * * * * * * * * *
10984 TGACTATTTCAATAATTTTCTTTTTTAAATTGCTAT-ATCTTTTTGTTTTGGCATAAAATGATTT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* ** **
11048 TTTTTGTTCATACAATTTTATTGCG-AATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--T-AAAGACACT
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-T
* * * *
11109 TAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAA-TAAGTTCAAAT-CTTATGACTAT
188 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACC-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
11171 TTGAATAATTATTTATTTCAAATTCTTATAACTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
250 TTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* *
11236 CATACAAGCTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTT
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** * ** * * * * *
11282 TGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAATATG-TTTTTTCGAAGAAGTTCAAATAGTTC
1 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATT-GAA-CAGTTCAAATAATTA
* ** * * * *
11346 TAACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATTATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTAT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * *
11409 TT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAAT
128 TTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * ** * * *
11473 GAGTAAGAGAATAAAAAAATGAAT-TTGTTTATTGAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATCTAA
192 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * *
11536 ATAATTATCTATTTCAAAATATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATG
254 ACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
11601 TAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
318 TAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTT
* * * * * * *
11643 GAAAAATCAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGATTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATG
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAACA-GTTCAAATAATTATG
* **
11708 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTT
65 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
11773 CTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAG
130 CTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* *
11838 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
195 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
11903 TATTTATTTC-AAATCGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCCATTCGTATAAG
259 TATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAG
* * * * *
11967 TTTATGTGAAATAAATTAATACTAACTTATTAATA-TT
322 CTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* ** * * * * *
12004 CTTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTCATCGAACAAGTTCAAATAGTCA
1 C-AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTA
* * * * *
12068 T-ATCCATTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAGTT
63 TGA-CTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** * ** **
12131 GTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAAAAATTT-TTCAATATTTTGAAAA-T-
126 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTA
* * * ** * *
12193 -TAAG-AAGAGA-TTAAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCCGTTCTAATAGTTATGATTATTTG
190 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATCTAGTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
12255 AACAATTATCTATCTCAAAACGTTATGATTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATA
253 AACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * * ** * *
12320 CAAGCTTATTTTC-AGTAAATTATTGCTAAACTAATAGTA-TT
318 TAAGCTTA-TTTCAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT
* * *** * * *
12361 CTAAAAATTAA-AA--ATAGATTTAAAAAATAAATGTG-TTTGCCGAACCAATTCAAATGATTAA
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTAT
* * *
12422 GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * *
12487 TCAGTTGATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAA
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
** * * *
12551 ACAACAA-ATTTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAA
194 GTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTAG-TTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * ** ** *
12614 CAATGAT-TTTTTTATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCAT
255 CAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
* *
12677 A-AATGCTTA-TCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
317 ATAA-GCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * **
12720 CAAAAATTGATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGT-T-AGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATT-
1 CAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTGA-TTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTA
* * * * * * * *
12782 TTAGTCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTG
63 TGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * * *
12847 TTTTTCATT-ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAA
127 TTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * *
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* * * * * *
12965 ATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTG-TTGTAGTTCATAT
256 AATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAT
* * *
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319 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
13070 CAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTG-TTTATCGAAGCAATTCAAACAATTAA
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTAT
* * * * *
13134 GACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * **
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129 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * ***
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194 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACC-AACTAGTTC-AAATAGTTATGA-CTATTTGAAC
* * * * ** * * **
13323 AGTTATCTATTTC-AAATCGGTATTACTTTT-TTTTGGTCATATAGTAGTTATATT-TGA-AAAT
256 AATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCAT
** * *
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317 AT-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * * * *
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1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGT-TCAAATAATTA
* * * ** * * * ** * * *
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63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTG
* * * ** *
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127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * *
13620 AACTAAGAGAATT-AAAAA-AAAT-TTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAA
192 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
13682 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATTTTTTTTGAATTCAT
255 CAATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCAT
* ** *
13746 ATTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTT
317 ATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTT
* * * *
13789 CAAAAATTAATAAGT---TATTTAAAAAAT-AATTTTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTA-TTGAAC-AGTTCAAATAATTAT
* * * * ** *
13849 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * *
13914 TTTGTTCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTC--AAA-TATT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * ** *
13974 AA-TCAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAAACTATTTGAGC
192 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * *
14038 AATCATTTATTTC-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATAC
256 AATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAT
* *
14102 AAGCTTA-TTCAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATA-TT
319 AAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
** * * *** ** * *
14142 CAGATTATAAATATGTTTGCCGAACTAAATCAAAT-AATCATGA-TTATTTGAATAATTATTTAT
1 CA-AAAATTAATAAG--TAAAGATTTAAA--AAATAAATC-TGATTTA-TTG----A--A--CAG
* * * * *** * * * **
14205 TTCAAATCATTATGACTTTTTG--T-TTTGTC-ATAAAAGAATTGTTCCA-GTTCATATAAGCTT
51 TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCGTT--ATG-ACCT-TTTG-TT
** ** ** * * * * *
14265 ATTGGGAATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAA---TAATC-CAA-AAATTAATAATAA---A-
110 -TT-GTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** * * * *
14317 -GAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACATG-TTTAAATAAT-TATGACTATTTGAACAAT
173 TAATATTTCAAAAATTAATAAG--TA---AA-A-GATTTAAAAAATAAAT--CTAGTT--ACCA-
* * * * * *
14379 TATCTATTTGAAATCGCTATAACCT-TTTG-----TT-T-TGTTAT-AAAA-G--A--A-TTTT-
226 -A-CTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAAATGTTATGACTTTTG
* * *** * * * ** * * * *
14428 TTTTGTTCATACAAGC--TT-ATT-TAAGAAAAAAAACAAATTT--ATTAATATTAAGACAA-TT
287 TTTTG-TCATA-AAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTCAAATAA-AATAATATAATTT
*
14486 AATAAGTA---
349 ATTAA-TATTT
* * * * *
14494 -AAAGATT--TAA--AAA-A--T---AAAT---T-TG-TTTACTGAATAAGTTCAAATCATTATA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATG
* **** * * * * *
14543 ACTATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
14608 GTATTCATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAA
130 CTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** *
14672 GTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATAT-GTTTA-TAGTAAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGA
194 GTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATCTAG-TTACCA--ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
14735 ATAATTATCTATTTC-AAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTT
254 ACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGAC---TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * ** * * *
14798 CATGTAAGTTTGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATA-TT
314 CATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * ** * * *
14843 CTGAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCT-ATTTACTAAAAAAGTTCAATTAGTT
1 C-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATA-AATCTGATTTA-TTGAACAGTTCAAATAATT
* * * * * * * * * *
14906 TTGATTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTG
62 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * *
14971 GTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTA
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * *
15034 GTAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAAC-ACATTCAAATAGTTATGATTATTTG
190 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTAC-CAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
15097 AACAATAATCTATTTC-AAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATTT-TGTTC
253 AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTC
* * * *
15160 ACAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTC
315 ATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTT
* ** * *
15205 CAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTA
1 C-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTA
* ** * * ** * *
15269 TGATTATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * *
15334 TTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATA
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* ** * * * * * *
15399 ATTTTAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAATTTAAATAGTCATGTCCATTTGAAC
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACC-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * **
15463 TATTATCTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCA
256 AATTATCTATTTCAAAATGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATA
**
15528 AAATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
320 AGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * *** * *
15568 CAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTG-TATACAAAATTAG-TCAAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTC-AAATAATTAT
* * * * * *
15628 GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * ** * *
15692 TCTATTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATA
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
15756 AGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGT-GTTTACTAAACCAATTGAAATAGTTAAGACTATTAGAAT
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * ** *
15820 AATTACCTATTTC-AAATCATTCTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATA
256 AATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * ** *
15883 CATGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTCTTTTATTAACA-TT
318 TAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT
* ** * *
15924 CAAAAAATTAATAAG-CAAGAAGTTTAAAGAAATAAATCTG-TTTATCAAACAAATTCAAATAGT
1 C-AAAAATTAATAAGTAAAG-A-TTTAAA-AAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAAT
* * * * * *
15987 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAACTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATT
61 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * * * *
16051 TGTTT-TAATTCACAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATT
125 TGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * ** * *
16115 GAGAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAAGC-AGTTCAAATAATTATTG-CCAT
189 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAA-CTAGTTCAAATAGTTA-TGACTAT
* * *
16177 TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTT
250 TTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
* * * *
16241 TATCATACAAGCCTATTTCGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTT
312 T-TCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT
* * * * ** *
16290 CAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATG-CTCACAGAACTAGTTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTAT
* * * * * *
16354 GACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * *
16419 TATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATA
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA
* * * ** * * * * * *
16483 ACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATA
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
*** * * * * **
16547 ATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTCGTCTTAAAA-AAATGTTTTTGCTCATATAA
257 ATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAA
*
16611 G-TT-TGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTT
321 GCTTAT-TTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * *** * * *
16650 TAAAAACTAATAAG---AGATTTAAAAAGTAAATCT-ATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATA
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTATG
* * * * * * * * *
16711 ACAATGTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTT
65 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * * * * *
16776 CTATTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAACAA
130 CTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
** * * * * * * * * * *
16840 GTAACGGATTTAAAAAATGAAT-TTGTTGGCCTGACCAATACAAATAGTTATAATTGTTTGAACA
194 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTT-ACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
16904 ATTATCTATTTCAAAATGTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAA
257 ATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAA
* * ** * *
16968 GCTGACTTGGAATAACATAAATCTAATTTATTAATATTT
321 GCTTATTTCAAATAAAAT-AATATAATTTATTAATATTT
* * * *
17007 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTG-TTTATCGATTA-AGTTCAAATAGTTA
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGA--ACAGTTCAAATAATTA
* * *** * * *
17070 TGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * *
17135 TTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACTAA
128 TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAA
* * * * *
17198 TTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCTT-TGACTATTTG
191 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACCAACT-AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTG
* * * * * * *
17261 AACAATTATTTATTTC-AAATCGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTATTTTTGTTCA
253 AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * *
17325 TACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTT
316 TATAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
**** * * * * * * *
17369 TTCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATG-TTGATCGAATAAGTTCTAATACTTAT
1 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTAT
* * * ** * *
17433 AACTACTTGAATAATTAT-TGACTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAATTGT
64 GACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* ** * * * * *
17496 ATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATG
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * *
17560 AGTAAGATATTTAAAATATAAATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAATA
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
17625 ATTATTTATTTC-AAATAGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
257 ATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATA
* *
17689 AGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
320 AGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * * *** * * * *
17728 CTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATATG-TTTACCAAATAAATTCAAATAGTCA
1 C-AAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTA
* * * *
17792 TG-TTCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTG
63 TGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * * * * * **
17856 TTTCTATTCATAC-AGAATTATT-TAGCATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTTTGAAAATTA
127 TTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * *
17919 ATAAG----AG-TATTAAAAACTAAATCT-GTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTTTTT
190 ATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
17978 GAACAATTATATATCTC-AAATCATTATGA-TCCTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTC
252 GAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * * *
18041 ATATAAGCCTA-TCCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA---
315 ATATAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* *** * *
18083 -AAAAA-T-A-AA-T-GAG-TTT----GCCAAA-CT-A-TCA---AACAAGCTCAAATAGA-TAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATA-ATTAT
* * * * * * * * * * * ** *
18130 G-GTCATCTCAACAATTATCTAT-TT-CAAATTGTTATTA-CTTTTGTTTAGTAATTTAAGAATT
64 GACT-ATTTGAA-TAAT-TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * * * * * *
18191 -TTT-TTTATCGTACACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTA
126 GTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *
18254 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
190 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * *
18318 AACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATT
253 AACAA-T-TAT-C-T-ATTTCAA-AATGT--T---AT-GA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
18383 ATTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATA-TT
305 GTTTCTATTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * * *** * *
18437 CTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTG-TTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTA
1 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTA
* * * * *
18501 AGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
** * * *
18566 TTCAATTCATACTAGCTTATTC-AGAATAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * * *
18629 TAAGTAAGAGATTTAAAAACTAATTCTATTTACCTAACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAA
191 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
18694 C-ATTATCAATTT-GAAATCATTATCACCTATGGTTTTGTCATAAAACAAATGATTT-TATTCAT
255 CAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCAT
* * ** * * *
18756 ATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATATTAATATTA
317 ATAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT
*
18799 CAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATC---TTT-TT----A--TC--A-AA-CATG-
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAACAGTTCAAATAATTATGA
* * * * *
18846 ----TTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-
66 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * *
18905 TAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAA-ATAA-AAT-C-AAGTTGTATTAATATTTTAAAAGTTAATA
131 T-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TT-TATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * *
18965 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAAC
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTAC-CAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * *
19029 AACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTCCTTT-TCAAT-ATA
256 AATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCT-ATTCATA
* *
19092 GAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT
318 TAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* *** *
19134 CAAGAATTAAT-A--AAAGATTTAAAAAATAAAATCT-ATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * *
19195 GACTA-TTGAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGT
64 GACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-
* * * * *
19259 TTTTTGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAA
127 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
* * * * * * * *
19323 TAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAA
191 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
19387 -AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTCTTAAT
255 CAA-TTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCAT
* * * *
19451 ATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTT
317 ATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * * ** * *
19494 TAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCT-ATTTGCT-AAGCCATTTCAAATAGTT
1 CA-AAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA--CAGTTCAAATAATT
* * * * * * *
19557 TTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATT
62 ATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * ** * * * *
19622 GGTCCTATTCATACTATTTTATATAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTA
126 GTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** * * * * * ** *
19686 ATAACCAGGAAA-ATTCAAAAAATAAATATAATTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATAT
190 ATAAGTA--AAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTT-ACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
19750 GAACGATTATTTATTCCAAACTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAACCAATTGTTT-TATTT
252 GAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-C-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* ** * * *
19814 ATACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTT
315 ATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT
* ** *
19859 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTTAA
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * *
19923 GATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* ** * * *
19988 GCAATTCATACAAACTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAT
129 TCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * * * * *
20051 AAG-AAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTATTACTATTTTA
192 AAGTAAA-AGATTTAAAAA-ATAAATCTAGTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
20115 ACAAATGT-TAATTT--AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACATTTGTTTCAATTAA
254 ACAATTATCT-ATTTCAAAAT-GTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* ** ** * *
20177 TACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTA
316 TATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTT
* * * * * *
20222 CTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAG-TTTATTGAATTAGTTAAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAA-CAGTTCAAATAATTAT
* ** ** * * * *
20285 -AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAT
64 GA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * * *
20349 TTTTTTATCACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
128 TTCTGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
20414 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATCGAATTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAA
192 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
20478 TAATTAT-TAATCTC-AAATCGTTAAGA-TCTATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCA
255 CAATTATCT-ATTTCAAAAT-GTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA
* * ** * * *
20539 TAGAAACTTATTTC-GTTAAAAATAAAACTAATCTAATAATATTT
316 TATAAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * * * * ** *
20583 CAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTG-TTTGTCGAGTCAATTTGAATAGTTA
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTGATTTATTGA-ACAGTTCAAATAATTA
** * * * * *
20647 AAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACC-TTTGTTTTGTCATAAAATATTTGT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * * * *
20711 TTCATATT-TTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-CAAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAAA
128 TTC-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * *
20773 AAGGAAATGATTTGAAAAAAATAAAAT-TTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTT
192 AAGTAAAAGATTT--AAAAAAT-AAATCTAG-TTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * ** * *
20837 AAACTATTATTTATTT-AAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAATAAACATTTGTTT-TAG
252 GAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CTTTTGTTTTGTCAT-A-AAACAATTGTTTCTA-
* * * *
20900 TTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATT
312 TTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * ** *
20948 C-AAAATTAATAAG-CAAGAGTTT--AAAATAAATTTG-TTTACCGAACAAATTCAAATAATTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTAT
* * * * *
21008 GACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
*** * *
21073 TGAATTCATAC-AGCTTAGTT-AAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATA
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** * * * * * * *
21135 AGTAAGTGATTT-AAAAGTAAAT-TTGTTTACCGAATCAAAG-TCAAATAATTTATGGCCATTTC
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACC-AA-C-TAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * *
21197 AACAATTATATATTTCAAATCAT-TCATTACCTTTATTTGGTCATATATAC-ATT-TTTTTAAAT
253 AACAATTATCTATTTCAAA--ATGTTATGACTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCT-ATT
* * * *
21259 CATATTATGTTTATTCCAAAATAAAAATAATAGTAATTTATTCAAT-CTT
314 CATA-TAAGCTTATTTC-AAAT-AAAATAATA-TAATTTATT-AATATTT
* *** * * *
21308 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * *
21372 GAACTATTTAAACAATT-TATAGCTTCAAATCGTTAT-ACC-TTTGTTCTATCATAAAACAATTA
64 G-ACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * * *
21434 TTTCTATTCCATACAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAATAATATTCCAAAAATTA
127 TTTCTGTT-CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * * **
21499 ATAACTAAGAGATTTTAAGAAAGAAAT-TTGTT-CAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTAGATGA
190 ATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
*
21562 ACAATTATCTATTTCAAATTG-T-T---TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATT-TTTC-ACTTCATA
254 ACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* *
21619 CT-AGCTTA-TTCAGAATAAAATAAAATAAATTTATTAACATTT
318 -TAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTT
* * * * *
21661 C-AAAATTAATATGTAAGAGACTTAAAAAATAATTCT-ATTTACCT-AACCAATTCAAATAATTA
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGATTTA-TTGAA-CAGTTCAAATAATTA
* * * * * *
21723 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TGT
63 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * *
21787 TTTTATTCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
128 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
21850 AA-T---GGATTTTAAAAATAAAT-TTGTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAA
192 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * * * * * **
21910 TAATTATTTATTT-AAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATA
255 CAATTATCTATTTCAAAA-TGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* ** *
21974 AAAATTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
318 TAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
* * * *** * *
22016 CGACAATTAATAAGCAAA-ATTTTAAAAAATAAATC--ATTTACCAAACTAGATCAAATAGTTAT
1 CAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * *
22078 GACTATTCGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATTATT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * **
22143 T-TAGTTCATATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTTTGAAAATTAATA
129 TCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * *
22206 ATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
193 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** ** * *
22271 ATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACA
257 ATTATCTA-TTTCAAAATGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATA
* * *
22335 AGCTTATTACGAATAAAATAATACAATTTATTAATA-TT
320 AGCTTATTTCAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTT
* * * * **
22373 -AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACTAAACAAGTTCAAATCCTT
1 CAA-A-AATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGATTTATTGAAC-AGTTCAAATAATT
* * * * *
22436 ATGACTAATTGAACAATTATTTCTTTCAAATTG-TATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
62 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
** * * * ***
22499 TTTCTAATCATACAAGGCTTATTC-ATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAATAGGCT
127 TTTCTGTTCATACAA-GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATT
* ** * *
22563 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTATTGAACGAAGTTCAAATAGTCT-TGTCTATT
189 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTA-CCAAC-TAGTTCAAATAGT-TATGACTATT
* * *
22626 TG-A-AATTAATTCTATTTC-AAATCGCATTGTGACCTTTTGGTTTGT-ATAAAACACTTGTTTC
251 TGAACAATT-A-TCTATTTCAAAAT-G--TTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
22687 -AGTTCATATAAGCTTATTATGAAAATAAAAATAATACTAATTCCATCGAATA-TT
310 TA-TTCATATAAGCTTATT-T-CAAAT-AAAATAATA-TAATT-TAT-TAATATTT
* * * * * * * *
22741 C-TAAATTAATGAGCAAGAGAATTAAATAAATTAAATTTTG-TTTATCGAACCATTTCCAAATAG
1 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAA-AAA-TAAA-TCTGATTTATTGAA-CAGTT-CAAATAA
* * * * * *
22804 TTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
60 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
22865 ACAATTGGT
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** * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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182 AAACTAATAATATTCCAAAAATTAACAAC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA
* * * * * *
10283 GTTCAAATATTTAAAACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAG
246 ATTCAAACAATTAAGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-G
* * * * * * * * *
10347 -CGTAAAATGAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
309 TCATAAAAT-A-ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAAT-AATTTATTA
* * * * * * *
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371 AAATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
** * * ** * * *
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* * ** * ** * * *
10533 AAATATTTTTGTTCATATAAAT--TTGTTTGGAATAAAATAATACTAA-TCTATTAATATTTTAA
499 AATTGTTTCAGTTC--ATAAATGCTTATCCGAAATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTCAA
** * * * * *
10595 AAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAACTA-TTTAT-GAA-ATGAATTGAAATACTTAT-
561 AAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAAT-AAGTTAGTTCATCGAACA--AGTTCAAATAATCATA
* * * * * * * * *
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*
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* *** * * * *
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* * *** * ** ** * * * * * ****
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** * ** * * *
10863 -GT--TATGAC-CTT-TTGTTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AAGT--T-
127 TGTCATAAAACAATTGTTGTAAT-TCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAAACTAATA
* * ** * * *
10919 -TA---CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTC-AAGCAACTTTAAAT
191 ATATTCCAAAAATTAACAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCAAAC
* ** * * * * * * *
10979 AATTATGACTATTTCAATAATTTTCTTTTTTAAATTGCTAT-ATCTTTTTGTTTTGGCATAAAAT
254 AATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * ** ** * *
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*** * * *
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* * *** * *
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* * * ** *
11230 TCTGTTCATACAA-GCTTATTC-AAATTACAATAATATTAA-TTTATTAATATTTTGACAATTAA
506 TCAGTTCATA-AATGCTTATCCGAAA-TAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* ** * ** * * *
11292 TAAGTAAAAGATTTAAGTAATAA-ATATGTTTTTTCGAAGAAGTTCAAATAGTTC-TA-ACTATT
568 TAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTTA-G-TTCATCGAACAAGTTCAAATA-ATCATAGTC-ATT
* ** ** * * * *
11354 TGAATAATTATCTATTT-AAATTATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTATTT-T-AGT
629 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCA-T
* * **
11415 TCATA-TAAGCTTATTTGA
693 T-ATACAAAAC-TATTCAA
** * ** * *
11433 AATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATT
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAACTTAA--AGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA--
* * * * ** * * * * * ** *
11498 TGTTTATTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAATATTATGA
61 -ATCTATTTACCA-----AACCA--AAT-ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATAA
* * * * * ** *
11563 CATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGTTCT-ATTCATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA
117 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-GTTGTAATTCATACAAACTTA-TTCAAAATAAAATAATA
* * ** * * * * * ***
11626 -TAAATTTATTAATATTTGAAAAATCAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGATTTTTTGA
180 CTAAA-CTAATAATATTCCAAAAATTAACAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCGA
* * * * * * *
11689 A-CACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
242 ACCA-ATTCAAACAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** * * * * *
11753 TTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA
306 TTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTA
** *
11818 AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACC-AAGCGAGTTCAAA
371 AAATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAA-CAAGTTCAAA
* * *** * * *
11881 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCA-AATCGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATGAAA
434 TAGTTATGACTATTTGAACAATGATTT-TTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* * ** *
11945 CAATTGTTTCCA-TTCGTATAA-GTTTATGTGAAATAAATTAATACTAAC-TTATTAATA-TTCT
498 CAATTGTTT-CAGTTCATA-AATGCTTATCCGAAATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTC-
* ** * *
12006 TAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTCATCGAACAAGTTCAAATAGTCATA
559 AAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAAT-AAGTTAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAATCATA
* * * * *
12070 -TCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAGTTGT
623 GT-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
*
12133 TTCT-ATTCATACAAAATTATTCAA
686 TTCTCATT-ATACAAAACTATTCAA
*
12157 AATAAAATAATAAAAATTT-TTCAATATTTTGAAAA-TT-AAG-AAGAGA-TTAAAAAACTAAAT
1 AATAAAATAATAAAAATTTATT-AATA-TTTCAAAACTTAAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAAT
* * * *
12217 CTATTTATCGAACCCGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATG
63 CTATTTA-CCAA-AC---C--A-A---AT-ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATA
* * *** * * *
12282 A-TTTTTGCTT-TGTCATAAAACAATTGTT-TATATTCATACAAGCTTATTTTCAGTAAATTATT
116 ACCTTTTG-TTCTGTCATAAAACAATTGTTGTA-ATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * *
12344 GCTAAACTAATAGTATTCTAAAAATT-A-AA-AATAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAAC
179 ACTAAACTAATAATATTCCAAAAATTAACAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
** *
12406 CAATTCAAATGATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
244 CAATTCAAACAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
12471 TCATAAAATAATTTTTTCAGTTGATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA
309 TCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAAA
*
12536 TT-CAAAAATTAATAAACAACAA-ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
374 TTCCAAAAATTAATAAACAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * *
12599 TTATGGCTATTTGAACAATGATTTTTTTATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
437 TTATGACTATTTGAACAATGATTTTTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* *
12664 TGTTTCAGTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTG
502 TGTTTCAGTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *** **
12729 ATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTTTAGTCATTTGA
567 ATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAATCATAGTCATTTGA
* * * *
12794 ACAATTATCTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATTATA
632 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCATTATA
**
12859 CAAGCCTATTCAA
697 CAAAACTATTCAA
**
12872 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAACTT--AAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * **
12937 TATTTACCAAACCAACTCCTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTG
64 TATTTACCAAACCAAATACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATAACCTTTTGTTCTG
* * * **
13002 TCATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
129 TCATAAAACAATTGTTGTAATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAAACTAATAATA
* * *
13067 TTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAATTCAAACAATT
194 TTCCAAAAATTAACAAC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAACAATT
* * * *
13132 AAGACTA-TATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
258 AAGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** ***
13196 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAA-TTATTAATGTTTTGAAAATTAA
322 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAA
** * * ** * * **
13260 T----AAGTGATTTAAAAAGTAAACCTA-TTTACCGAATTAGTTCAAAATAATTAT-AGCCATGC
387 TAAACAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACCGAACAAGTTC-AAATAGTTATGA-CTATTT
* * * * *** * * * ** * * * *
13319 CAACAGTTATCTATTTCA-AATCGGTATTA-CTTTT-TTTTGGTCATATAGTAGTTATATT-TGA
449 GAACAATGAT-TTTTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGT-TTCAGT
** * ** * * *
13380 AAATTCAA-GCTTATTTGGAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAA-CT
511 TCA-TAAATGCTTATCCGAAATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTT
** * ** * * * *
13442 AAGAGATTTAAAAAATAAACCTA-TTTA-CTGAATTA-TCTTAAATACTTATA-ACTATTTGAAC
574 AA-AGATTTAAAAAAT-AAGTTAGTTCATC-GAACAAGT-TCAAATAATCATAGTC-ATTTGAAC
* ** * * * ** * * * **
13503 AATTGTAAACTTCAAATCCTTA-TAACCTTTTGTAATATCATAAAAACAATTATTT-TTGTTCAT
634 AATTATCTATTTCAAATCGTTACGAA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCTCATT-AT
*
13566 AC-AAGCTTATT-AGA
696 ACAAAAC-TATTCA-A
** * ** * * * * *
13580 AATAAAATAATACTAATCTAACAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAA-AAATT
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAACTT-A-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** *
13643 TGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
64 TATTTACC-AA--A---CCAA-A--T---ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATAA
* * * * * * ** * *** *
13708 CCTTTTATTTTGTCATAAAATATTTTTTTTGAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AA
117 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTGTTGT-AATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAC
** * * * ** * * * * *
13772 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AATAAGTTATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACT
181 T-AAACTAATAATATTCCAAAAATTAACAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * *
13834 AGTTCAAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTG
245 AATTCAAACAATTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * ** * * * * *
13898 TCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAGTAAT-ACAATTCTATTAA
309 TCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAATAATT-TATTAA
* * * * * * * * *
13961 TATTTCAAATATTAAT---C-AAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAACTAGTTTAAATAG
372 AATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
** * * *** * *
14022 TTAAAACTATTTGAGCAATCATTTATTTCA-AATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAA
437 TTATGACTATTTGAACAATGATTT-TTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
** * * * * *
14086 TTGTTTTTGTTTATACAA-GCTTATTC-AGATTAAAACAATACTAA-TTTATTAATA-TTC--AG
501 TTGTTTCAGTTCATA-AATGCTTATCCGA-AATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTCAAAA
* * *
14145 A-T--T-A--T-AA-A--T-----AT--GTT--TGC--CGAACTAA-ATCAAATAATCAT-GATT
563 ATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTCATCGAAC-AAGTTCAAATAATCATAG-TC
* * * * *
14187 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG-TTC-
626 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * ***
14249 CAGTTCATA-TAAGCTTATTGGG
690 CA-TT-ATACAAAAC-TATTCAA
** * * * * *
14271 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATC
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAACTTAA-AGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * ** * * * *
14336 TGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAA
64 ----TATTTACCA-----AACCAA--AT-ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATAA
* * * * * ** * * *
14401 CCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAGA-AAAA-AA-AC-
117 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTGTTGTAATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
14462 AAATTTATTAATATT--AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA
182 AAA-CTAATAATATTCCAA-A-AATTAACAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA
* **** * * * *
14525 -TAAGTTCAAATC-ATTATA-ACTA-TATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTG
243 CCAA-TTCAAA-CAATTA-AGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * *
14586 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTA-TTCATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTT
304 TTTTGTCATAAAATAATTGTTT-CAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAATAATTT
* * * ** **
14649 ATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAA-TATGTTTATAGTAA-AAG
367 ATTAAAATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATTA-GTTTACCG-AACAAG
* * * * * * *
14712 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AAT-CATAATGACTTTTTTTCTTTT
428 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATGAT-TTTTTCATAATAAAT-ATGAC--CTTTTGTTTT
* * * * * *
14775 GTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGTAA-G-TT-TGCTTGAACTAAAATAATACTAA-TTTAC
489 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT-AAATGCTTAT-C-CGAAATAAAATAATA-TAACTTTAT
* * * * * * * *
14836 TAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTA-TTTA-CTAAAAAAGTT
550 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATA-AGT-TAGTTCATC-GAACAAGTT
* * * * * * * * * * * * *
14897 CAATTAGT-TTTGATTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG-ACTTTTTGTTTTATCG
611 CAAATAATCATAG-TCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAAC-TTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
14960 TAAAACAATTGGTTCT-GTTCATGC-AAGCTTATTTC-G
674 TAAAATAATTGTTTCTCATT-ATACAAAAC-TA-TTCAA
** * * * * *
14996 AATAAAATAATTTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAACTTA--AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
15060 TATTTTCTGAACACATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGA
64 TATTTAC-CAA-AC---C--A-A---AT-ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATAA
* * * * ** * **
15125 CTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATT-TTGTTCACA-AAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
117 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTG-TTGTAATTCATACAAA-CTTATTCAAAATAAAATAATA
** * * * * * *
15188 CTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGA
180 CTAAACTAATAATA-TTCC-AAAAATTAACAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* * * * * * * * * ** * *
15252 GCGAGTTCAAATAGTTATGATTATTCA-AACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTT
242 ACCAATTCAAACAATTAAGACTATT-AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *
15316 TTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
306 TTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATT
** ** **** * * *
15380 AATGTTTTAAAAATTAATAATTTTAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAATAAATTTAAA
370 AAAATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *** * * *
15444 TAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTGA-AATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA
434 TAGTTATGACTATTTGAACAATGAT-TTTTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* * * *
15508 CAATTGTTTTTA-TTCATGCAAA--ATTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTC
498 CAATTG-TTTCAGTTCAT--AAATGCTTATCCGAAATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTC
* * * * * *
15569 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTG-T-ATAC-AA-AATTAGTCAAAATAGTT
559 AAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTCAT-CGAACAAGT--TC-AAATAATC
* * * * * *
15626 AT-GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
620 ATAGTC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* *
15689 GTTTCT-ATTCATAC-AAGCTTATTCAG
684 GTTTCTCATT-ATACAAAAC-TATTCAA
* * ** * * * * *
15715 AGTAAAATATTGCTAAA-CTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAAT
1 AATAAAATAAT-AAAAATTTATTAATATTTCAAAACTT-A-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
15779 GTGTTTACTAAACCAATTGAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTG
63 CTATTTACCAAACC------AA-A--T---ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATA
* * * ** **
15844 ACCTTTTGTT-TAATCATAAAATAATTGTT-TCAGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAAT
116 ACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTGTTGT-AATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAAT
* **** * * * * * *
15907 GCTCTTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAGAAATAAATCTGTTTATCA
179 ACTAAACTAATAATATTCCAAAAATTAACAA-CAAGAGA-TTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCG
* * * * * *
15971 AACAAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAACTGTTATAACCTTTTG
241 AACCAATTCAAACAATTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTG
* * * * * * * * * * * *
16034 TTTTATCATAAAACATTTGTTTTAATTCACAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTAT
304 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAT
* * * * *** * **
16099 TAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAAGC-AGTTCAA
369 TAAAATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAA-CAAGTTCAA
* * * * *** * *
16163 ATAATTATTG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCTTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
433 ATAGTTA-TGACTATTTGAACAATGAT-TTTTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAA
*** * * *
16226 AACAATTGTTTTTTTTATCATACAA-GCCTATTTCG-AATAAAATAATGCTAA-TTTATTAATAT
496 AACAATTG-TTTCAGT-TCATA-AATGCTTA-TCCGAAATAAAATAAT-ATAACTTTATTAATAT
* * * * *
16288 TTCAAAAATTAATAAG-TAGGAGATTTAAAAAATAA-ATATGCTCA-CAGAACTAGTTCAAATAG
556 TTCAAAAATTAATAAGTTA-AAGATTTAAAAAATAAGTTA-GTTCATC-GAACAAGTTCAAATAA
* * * * * *
16350 TTAT-GACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
618 TCATAGTC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * **
16413 ATTATTTAT-GTTCATAC-AAGCTTATTCGG
681 ATTGTTTCTCATT-ATACAAAAC-TATTCAA
* ** * * * *
16442 AATACAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAAT
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATT-TCAAAACTT-A-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
16505 TTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATG
63 CTATTTACCAAA-C----C-AA-A--T-A--CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATA
* * * *** * ** *
16570 ACCTTTTGTT-TCGTCTTAAAA-AAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA
116 ACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTGTTGTAATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATA
* ** * * ** * * * * * *
16633 TTAATTTATTGATATTTTAAAAACT---AATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATC
180 CTAAACTAATAATATTCCAAAAATTAACAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * * * * *
16695 AATTCAAATAGTTATA-ACAATGT-GAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTT
245 AATTCAAACAATTA-AGACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** *
16758 GTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAA
308 GTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAA
* * ** ** * * ** * *
16822 TA-TCCTAAAAATTAACAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAA-TACAAAT
372 AATTCC-AAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * ** * *
16885 AGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAACCTTTTGTTTGT-T-ACAAAA
435 AGTTATGACTATTTGAACAATGAT-TTTTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTT-TATCATAAAA
** * * * * * *
16947 CAATTGTTTTTGTTCGTACAA-GCTGA-CTTGGAATAACATAAATCTAA-TTTATTAATATTTCA
498 CAATTGTTTCAGTTCATA-AATGCTTATC-CGAAATAAAAT-AATATAACTTTATTAATATTTCA
* * * * ** * *
17009 AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGATTAAGTTCAAATAGTTATGA
560 AAAATTAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTTAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAATCAT-A
* * * *** * * *
17073 CTC-TTTGAATAATTATTTATTTCAAATTACTA-TAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTT
623 GTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
*
17136 TCT-ATTCATAC-AAGCTTATTTC-A
687 TCTCATT-ATACAAAAC-TA-TTCAA
* * *
17159 ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAAC-TAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCA-A-AACTTAA--AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * *
17222 TTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGCTAT
62 TCTATTTA-C-CA-AA---CCAA-A----T-ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTAT
* ** * * * * ** * * *
17287 GATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA
115 AACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTGTTGTAATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATA
* ** * * ***** * * * * * * *
17352 TTAATTTATTAAAATTTTTCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGATCGAA-
180 CTAAACTAATAATATTCCAAAAATTAACAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * * *
17416 TAAGTTCTAATACTTATA-ACTACTT-GAATAATTAT-TGACTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGT
244 CAA-TTCAAACAATTA-AGACTA-TTAGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
** * * * * * * * **
17477 TTCATCATTAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATT
305 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATT
* * ** * * * * *
17542 AATATT-CAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAAAATATAAATCTA-TTTACTGAACAAGCTCAAA
370 AAAATTCCAAAAATTAATAAACAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACAAGTTCAAA
* * * ** ** * *
17605 TAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCA-AATAGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAA
434 TAGTTATGACTATTTGAACAATGATTT-TTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* **
17669 CAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA-TTCT
498 CAATTGTTTC-AGTTCATA-AATGCTTATCCGAAATAAAATAATA-TAACTTTATTAATATTTC-
* * * * * * * * * *
17730 AAAAATTAAT-AGGTAGGAGACTTAAAAAATAA-ATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCAT
559 AAAAATTAATAAGTTA-AAGATTTAAAAAATAAGTTA-GTTCATCGAACAAGTTCAAATAATCAT
* * * * *
17793 -GTTCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGT
622 AG-TCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
17857 TTCT-ATTCATACA
686 TTCTCATT-ATACA
17870 GAATTATTTA
Statistics
Matches: 5529, Mismatches: 1154, Indels: 885
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
683 3 0.00
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731 1 0.00
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Consensus pattern (709 bp):
AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAACTTAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACCAAACCAAATACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACGTTATAACCTTTTGTTCTGTC
ATAAAACAATTGTTGTAATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAAACTAATAATATT
CCAAAAATTAACAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAACAATTAAG
ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
CAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAA
CAAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
GATTTTTTCATAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAATGC
TTATCCGAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAA
AATAAGTTAGTTCATCGAACAAGTTCAAATAATCATAGTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
CGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCATTATACAAAACTATTCAA
Found at i:13866 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 13831--13886 Score: 61
Period size: 18 Copynumber: 3.1 Consensus size: 20
13821 TATTTACCTA
*
13831 ACTAGTTCAAAT-AATTATG
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
13850 ACTATTT-AAA-CAATTAT-
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
13867 -CTATTTCAAATC-ATTATG
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
13885 AC
1 AC
13887 CTTTTATTTT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 1, Indels: 10
0.74 0.02 0.24
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.19
17 8 0.26
18 10 0.32
19 7 0.23
ACGTcount: A:0.41, C:0.14, G:0.05, T:0.39
Consensus pattern (20 bp):
ACTATTTCAAATCAATTATG
Found at i:20645 original size:906 final size:890
Alignment explanation
Indices: 18211--22728 Score: 2979
Period size: 906 Copynumber: 5.0 Consensus size: 890
18201 TACACGGTTG
* * * * *
18211 TTCAAAATAAAATAACACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
1 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAAT-A--AATAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
18276 AAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAA
62 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGT-TAATT-TAA--AA
** * * *
18341 TTATTTAATAAAATATACCTTTTG-TTCTATCATAAAACAATTATTT-ATGTTTATACAAGCTTA
123 -T-CGT--T---ATA-ACCTTTTGTTTCT-T-ATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTA
** * * * * * *
18404 TTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATA-TTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAT
177 GATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
** * * * * * * * *
18468 TAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATC
241 TAAA-TCATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAG-CCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC
* * * ** *
18532 GTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCAATTCATACT-AGCTTATTCAGAATA
304 ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTTTA-TCATA-TAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * *
18594 AAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAATTCTAT
367 AAATAATACT-AAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATAT
* * * * * * * * * * * * *
18658 TTACCTAACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAA-CATTATCAATTTGAAATCATTATCACCT
431 TTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTAATCTCAAATCGTTA-AATCT
* * * * ** * *
18722 ATGGTTTTGTCATAAAACAAATGATTT-TATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAA
494 -TTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAACTTATTT-GAATAAAATAATACTAA
* * *
18786 TATATTAATATTACAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCT-TTT-T-A-TCAA-
556 TATAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTCAGTCAAT
*
18841 -ACAT-GTT----C------AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
621 TA-ATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
18894 AACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATCAAG-T--TGTATTAATATTTTAA
684 AACAATTGTTTTACTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAT-AAGCTAATTTATTAACATTTCAA
* ** * *
18956 AAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCC
748 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * * *
19021 ATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTCCTTTTC
813 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--GTTTC
*
19086 AA-T-ATAGAAGCTTA
876 AATTCATA-AAACTTA
* *
19100 TTC-GAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAA-AGATTTAAAAAATAA
1 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAGATTTAAAAAAT-A
* * * * *
19163 AATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAAACAATTCTCT-ATTTCAAATTG
63 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG-AACAATTGT-TAATTTAAAATCG
*** * * **
19226 TTATAACCTTTTG-TTCTATCATAAAACAATTGTTTTTTGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAA
126 TTATAACCTTTTGTTTCT-T-ATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTAGATGAAATAAA
* * *
19290 ATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTT
188 ATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT-CATTT
* * * * * * *
19354 GCTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AACTATATGAA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTT
251 ACCGAACTAGTTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAA-TTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * *
19417 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTCTTA--ATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTA
315 TTGTTTTATCATAAAACAATT-ATTTTT-TTATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
19480 AGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCTAAGCCA
378 AGTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACGAA-CTA
* * * * * * * * *
19545 TTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGT
441 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT-TAATCTCAAATCGTTA-AA-TCTTTGTTTTAT
* * * * ** * *
19610 CATCAAACAATTGGTCCTATTCATACTATTTTATATAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
503 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTAT-TTGAATAAAATAATACTAATATAATAATAT
* * * * * * ** ** *
19675 TCCAAAACTTAATAACCAGGAAAATTCAAAAAATAAATATAATTGTCAAACTAGTTCAAATAGTT
567 TCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTCAGTC-AATT--AATAGTT
* * * * *
19740 AAAACTATATGAACGATTATTTATTCCAAACTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAACCAATT
629 AAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAA-CAATT
* * * * *
19805 GTTTTA-TTTATACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA
691 GTTTTACTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA-GCTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAA
* ** * *
19869 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTTAAGATTA-TTAGA
755 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTA-A
* * * * *
19933 ACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTGCAATTCATA
819 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
19998 CAAACTTA
884 -AAACTTA
* *
20006 TTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAGA
1 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT---AAATAGATTTAAAAA-A
* * * *
20071 TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTATTACTATTTTAACAAATGTTAATTT-AAATCG
61 TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTTAATTTAAAATCG
* * * * *
20135 TTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAAT
126 TTATAACCTTTTG-TTTCTTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAGATGAAATAAAAT
* * *
20200 AATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTAT
190 AATACTAATTTATTAATA-TTTCTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCA-TTTAC
* * * * * * *
20264 TGAATTAGTTAAAATAATTATAGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTG
253 CGAACTAGTTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * *
20329 TTTTATCATAAAACAATTATTTTTTTATCACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTA
318 TTTTATCATAAAACAATTATTTTTTTATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTA
* * *
20394 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGCTCAA
383 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CGAACTAGTTCAA
* *
20459 ATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTAATCTCAAATCGTTAAGATCTATGTTTTATCATAAAAT
447 ATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTAATCTCAAATCGTTAA-ATCTTTGTTTTATCATAAAAC
* * * * * *
20524 AATTGTTTTTGA-TCATAGAAACTTATTTCG-TTAAAAATAAAACTAATCTAATAATATTTCAAA
511 AATTGTTTCT-ATTCATACAAACTTATTT-GAAT-AAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAA
* * *
20587 ATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAATTTGAATAGTTAAAACT
573 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTC-AGTCAA-TT-AATAGTTAAAACT
* * * *
20652 AT-TAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACC-TTTGTTTTGTCATAAA-ATATTTGTTTC
635 ATAT-GAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-A-TTGTTT-
* * * * * *
20714 ATA-TT-TTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATCAAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAAAAAG
695 -TACTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAGCTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAG
* ** * * * *
20776 GAA-ATGATTTGAAAAAAATAAAATTTGCTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAA
759 TAAGA-GATTT--AAAAAAT-AAATTTATTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTAA
* * * * ** * * * *
20839 ACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAATAAACATTTGTTTTAGTTCA
819 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-A-AAACAATTGTTTCAATTCA
20904 TAAAAGCTTA
882 TAAAA-CTTA
* * *
20914 TCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTC-AAAATTAATAAGCA-AGAGTTT--AAAAT
1 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAA--ATAGA-TTTAAAAAAT
* * * * *
20975 AAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTG-TATATTTAAAATCA
62 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTTA-ATTTAAAATCG
* * * * *
21039 TTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAATAATTGTTTGAATTCATAC-AGCTTAGTTAAAAT-AAA
126 TTATAACCTTTTGTTTCT-T-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAGATGAAATAAAA
** * **
21101 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AATAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAGTAAATTTGTTTA
189 TAATACTAATTTATTAATATTTCTAA-AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAA-TCATTTA
* * * * *
21164 CCGAATCAAAG-TCAAATAATTTATGGCCATTTCAACAATTATATATTTCAAATCATTCATTACC
252 CCGAA-C-TAGTTCAAATAA-TTATAGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATT-ATGACC
* ** * ** * *
21228 -TTTATTTGGTCATATATAC-ATT-TTTTTAAATCATATTATGTTTATTCCAAAATAAAAATAAT
313 TTTTGTTTTATCATA-AAACAATTATTTTTTTATCATA-TAAGCTTATT-CAAAAT-AAAATAAT
* * * *
21290 AGTAATTTATTCAAT-CTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAA
374 ACTAAGTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CGA
* * * * * *
21354 ACTGGTTTAAATAGTTATGAACTATTTAAACAA-T-TTATAGCTTCAAATCGTTATACCTTTGTT
437 ACTAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTAAATAATTATTA-ATC-TCAAATCGTTAAATCTTTGTT
* * **
21417 CTATCATAAAACAATTATTTCTATTCCATACAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAA
499 TTATCATAAAACAATTGTTTCTATT-CATACAAACTTATTTG-AATAAAATAATACTAATAT-AA
* * * * ***
21482 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAGAAAGAAATTTGTTCAAACTAGT-ACA--A
561 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTT-TGTC-AGTCA-ATTA
* *
21544 ATAGTTAAGACTAGATGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGT-T----TTTTGTTTTGTCATAAAC
623 ATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATGT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAC
* * * **
21603 AATT-TTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAATAAATTTATTAACATTTC-AAAA
687 AATTGTTTTACTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAGCT-AATTTATTAACATTTCAAAAA
* * * *
21666 TTAATATGTAAGAGACTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCT-AACCAATTCAAATAATTATGACTA
751 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTA-CTGAATCAGTTCAAATAATTATGACTA
* * * * * **
21729 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TGTTTTTAT
814 TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT
** *
21793 TCATATAAGTTTG
879 TCATA-AAACTTA
* * *
21806 TTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTCAAAAATTAAT-AATGGATTTTAAAAATAAAT
1 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAATAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
21870 TTGTTTATCAAACTAGTTTAAA-AAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTAC
66 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTGTTAATTTAAAATCGTTAT
** * * ** * * ** * * *
21934 AATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTA-TTCATATTAAAATAAT
130 AACCTTTTGTT-TCTTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAGATGA-AATAAAATAAT
* * * * *
21998 ACTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGCAA-AATTTTAAAAAATAAATCATTTACCAAAC
193 ACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCATTTACCGAAC
* * * * * * *
22062 TAGATCAAATAGTTAT-GACTATTCGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
258 TAGTTCAAATAATTATAG-CCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * **
22126 ATTATAAAAAAATTATTTTAGT-TCATATAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TA
322 ATCATAAAACAATTATTTTTTTATCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAAGTTATTA
** * * * * *
22188 ATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATA
386 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC-GAACTAGTTCAAATA
* * * * * * * * * * ** **
22253 ATTATGACTATTTGAATAATTATCATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGA
450 GTTATGACTATTTAAATAATTATTAATCTCAAATCG-T-TAAATCTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * * * *
22318 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTACGAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT--AAGACAA
513 TTGTTTCTATTCATACAAACTTATT-TGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAA-A-AA
** * * * ** ** **
22380 TTAATAGGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTA
575 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTC-AGTCAA-TT--AATAGTTAAAACTA
* * *
22443 -ATTGAACAATTATTTCTTTCAAAT-TGTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
636 TA-TGAACAATTATCTATTTCAAATGT-TATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TA
* * * * ** * * ***
22505 -ATCATACAAGGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAATAGGCTAATAAG
697 CTTCATACAA-GCTTATTTAGAATAAAATAA-GCTAATTTATTAACATTTCAA-AAATTAATAAG
* * * * *
22569 TAAAAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTATTGAA-CGAAGTTCAAATAGTCT-TGTCTATTT-GA
759 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTAT-TTACTGAATC--AGTTCAAATAAT-TATGACTATTTAAA
* * * *
22629 -AATTAATTCTATTTCAAATCGCATTGTGACCTTTTGGTTTGT-ATAAAACACTTGTTTCAGTTC
820 CAATT-A-TCTATTTCAAATCG--TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
*
22692 ATATAAGCTTA
881 ATA-AAACTTA
22703 TT-ATGAAAATAAAAATAATACTAATT
1 TTCA-G--AAT-AAAATAATACTAATT
22729 CCATCGAATA
Statistics
Matches: 2903, Mismatches: 527, Indels: 387
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
873 2 0.00
874 79 0.03
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876 61 0.02
877 11 0.00
878 80 0.03
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880 2 0.00
881 9 0.00
882 11 0.00
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911 8 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (890 bp):
TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAATAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTTAATTTAAAATCGTTATA
ACCTTTTGTTTCTTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAGATGAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCATTTACCGAACTAG
TTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA
TAAAACAATTATTTTTTTATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACGAACTAGTTCAAATAGTTATG
ACTATTTAAATAATTATTAATCTCAAATCGTTAAATCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
ATTCATACAAACTTATTTGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
GAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTCAGTCAATTAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCT
ATTTCAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTACTTCATACAAGCTTATTTA
GAATAAAATAAGCTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
TATTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAACTTA
Done.