Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168381.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_6, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 64000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 51 of 130
Found at i:11323385 original size:13 final size:14
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11323357 AATATTTAGA
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1 TAATTAATTAATAT
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1 TAATTAATTAATAT
*
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1 TAATTAAT
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TAATTAATTAATAT
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1 AATTAAATATTATTATTT
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1 AAT
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AATTAAATATTATTATTT
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11323507 TTATTAGACA
*
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1 AATATATAT
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AATATATATAATAAT
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11323721 AATATATTTA
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1 TTAATATTTATTAATT
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TTAATATTTATTAATT
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11323716 GAATAAATAT
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*
11323744 ATTT-TAA
1 ATTTATTA
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1 ATTTATTA
*
11323759 ATTAATTA
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11323776 ATT
1 ATT
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ATTTATTA
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11323806 AAATCAATTT
*
11323816 ATTAT-TAAATAATTTTAATATATTA
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11323841 ATTATATAAATAATTATATATATTA
1 ATTATATAAATAATTATATATATTA
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1 A
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ATTATATAAATAATTATATATATTA
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11324294 AGGCTTAATG
* *
11324304 ACTTTGAAAAATAAAAGACTCCTCTAAATAGAGGCACCACA
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* * *
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* *
11324385 ACTTTGACAAATAAAGGCTC
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11324405 ATCGACTTTA
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ACTTTGAAAAATAAAAGCTCCTCTAAAAAGAGGCACAACA
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11324890 ATATAATAAA
* *
11324900 ATAA-TTCAATTATATAT
1 ATAATTTCAAATAAATAT
11324917 ATAATTTCAAATAAATAT
1 ATAATTTCAAATAAATAT
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1 ATAATT
11324941 ATTCTATATA
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ATAATTTCAAATAAATAT
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11325382 TTAGAATATT
*
11325392 ATTAGATTATTATTATTTTATTA
1 ATTAGATTATTATTATTTAATTA
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11325439 A
1 A
11325440 CTATATATAA
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ATTAGATTATTATTATTTAATTA
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11325431 TTCAATTAAC
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11325453 TATATATAATATAA
1 TATATATAATATAA
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1 TATATATAATAT
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TATATATAATATAA
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11326112 TTATGACAAT
*
11326122 TATTATACTATATAATAT-TTTA
1 TATTATAATAT-TAATATATTTA
*
11326144 TATTATAATATTAATTTATTTA
1 TATTATAATATTAATATATTTA
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1 TATTAT
11326172 TAAATAATTA
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TATTATAATATTAATATATTTA
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11326130 TATATAATAT
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1 TTTATATTATAATATTAA
*
11326158 TTTAT-TTATATTATTAA
1 TTTATATTATAATATTAA
11326175 ATAATTATTA
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TTTATATTATAATATTAA
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11326138 ATTTTATATT
* *
11326148 ATAATATTAATTTATTTATATTATTAA
1 ATAATATTAATTTATTTATAATAATAA
*
11326175 ATAATTATTAATATTGTTTATAATAATAA
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1 A-TAATA
11326211 ATTTGTTAAT
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ATAATATTAATTTATTTATAATAATAA
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11327231 TTTTTTTTAC
*
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1 TAATATATTATATAGAATTATTAAATATTAATTATATTAATATAA
*
11327286 TAATA-ATTATATA-ATTTATT-AAT-TTAAGTTATATTAATA
1 TAATATATTATATAGAATTATTAAATATTAA-TTATATTAATA
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TAATATATTATATAGAATTATTAAATATTAATTATATTAATATAA
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11327325 ACATTTATAT
*
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1 TAATATTATA-AATAA
11327351 TAATAATTATAAATAA
1 TAAT-ATTATAAATAA
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1 TAATATTAT
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*
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*
11327489 ATAATTAATAGTAATAATT
1 ATAATTAATAGCAATAATT
11327508 ATTAAACTCA
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AAATAGCATAACTATTC
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1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAAC-AATTTGAAATAGATAACTA
* * *
11327640 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTCTGGTAAACATATTTAGTTTTTAAATC--T--CTTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTA
* * * * * **
11327701 TTAGTTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTATGAATAATTTTG
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* * *
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1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAACTA-
* * * * * **
11327817 TTTAAAT-GAACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTATTTAGATCTCCAACTT
65 TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTAACTT
*
11327881 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTTGAATAAACTTG
129 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTG
* * * * *
11327934 TATGAATAGAAACTATTGTTTTATGA-AAAATCAAAATATCATAACAATTTGAAATAAAACAATT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAATATCATAACAATTTGAAAT-AGATAACT
* * * * * * * * *
11327998 ATTTAAGTAGTCATAACTATTT-AAATTCGCTCGATAAATACATTTATTTTTTAAATCTTTAAGT
64 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTAACT
* * * * *
11328062 TATTAATTTTTTGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCCTT-
128 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-ACTTG
** * ** * * * *
11328116 TATGAATAGAAACAATTGGTGTATGAC-AAA-AAAAGGTCGTAATAATTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAACTAT
* * * * * *
11328179 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTAT
** * * *
11328243 TAATCCTTAGAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTG
131 TAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAACTTG
* *
11328294 TTTAAAT-GTAAACAATTATTTTA
1 TATGAATAG-AAACAATTATTTTA
11328317 CAATTGTTTC
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Consensus pattern (181 bp):
TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAACTAT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTAT
TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTG
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11329270 TACTTAAATC
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1 ATTATAATAATTA
*
11329293 A-TATAATTATTA
1 ATTATAATAATTA
11329305 ATTATAAT
1 ATTATAAT
11329313 TACTTTAAAT
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ATTATAATAATTA
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11329291 TAATATAATT
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11329321 ATTAATTATAATTACTTTAA
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11329341 ATTAATTAT
1 ATTAATTAT
11329350 TTATAAATAG
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* * *
11329273 TTAAATCATTATAATAATTAAT
1 TTAAATTATTATTATAATTACT
*
11329295 AT-AATTATTAATTATAATTACT
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1 TTAAATTATTATTATAATTACT
* *
11329337 TTAAATTAATTATTTATAAATAGT
1 TTAAATT-ATTA-TTATAATTACT
*
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* **
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** * ** *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * ***
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*
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*
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * ** * * * ** *
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* * * *
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* * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* * *
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*
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125 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * *
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* * * **** * ** * *
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* * * * * * *
11332198 TTATTCGATAAATAAAATTT-TCTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTT-TTGGAATATTAATAAA
129 TTGTTCGGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT--AATATTAATAAA
* * * * *
11332261 TTAGTATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAACTAAAATAATTCTTTTATTACAAAAGAAAA
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* * * * * *
11332326 GGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAAGTTGTTTGGTAAA
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* * *
11332391 CATATTTAGTTTTT-GAATCT-TTCACTTATTAA-A-A-
320 CAGATTCA-TTTTTAAAATCTCTTCA-TTATTAATAGAT
*
11332425 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTCTTTTATGA
* * * *
11332490 TAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAGTAAAATAATTGCTCAAATAATCATAACAATTTGAACT
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* * * * * * *
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*
11332748 AGATTCATTTTTAAAATCTCTTTATTATTAATTTTTAGAT
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* * * *
11332788 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTCTTTTATGA
** ** * * * * * *
11332853 CAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTT-AA-TA
66 CAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-
* * * * *
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130 T-GTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TCTTA-ATATTAATAAAT
* * * * * * *
11332980 TAGAATTAGTTTAATCCAAATAAGCATGTATGAA-T-AGATTATT-TTATT-TCGA-ATAAGCGT
192 TAGTATTA-TTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATT-TTAT-GACA-AAAC--
* * ** *** * * * *
11333040 ATATGAACTAAAACAA-TTCTTTTATGATAA--A-ACAAAAAATCATAA-TGATTTGAAA-TAGA
251 AAAAGGTC-AAAACAATTTCAAATA-GATAATTATTCAAACAGTCATAACT-ATTT-AAACTTG-
* * * *
11333099 TAATTAATCAAATAGTCATGATT-ATTTGATCTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTACTTAAT
311 T--TTAGT--AA-A--CA-GATTCATTT--T-TA----A--AATC-TCTTCA----TTA-TTAAT
11333163 AATTGTTGAT
353 -A-----GAT
* * * * * * * *
11333173 ATATTAATAAATTAGTATTAGTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATA
1 -TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTCTTTTATG
* * * ** * * * *
11333238 ATAGAAA-AAAAAGTCATAACAATTTGAGATAAATAATTGTTGAAATAGTAACAACTATTTGAAC
65 ACA-AAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAATCATAACTATTTGAAC
* * * * ** *
11333302 TAGTTTGCTAAATAGTTTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAGAT
129 TTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT--AATATTAATAAAT
* * * * * * * * * * *
11333362 TAGTATTACTTTATCCCCCAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAA
192 TAGTATTATTTTAT--TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAAC--AA
* *** * * * * * *
11333427 ACATTTGTTTTAACAATTTGAATTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTA
253 A-A--GGTCAAAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTA
* * * * *
11333491 GATAAATAGAATT-ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAGTTTTTGAAA
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* * * * * *
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1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAATAAACTTA-TATGAA--CAGAAACAA-TTCTTT
* * * * * * * * * * *
11333600 TATAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAACAGATAATTATTGATATAGTCTTAAATATTTG
61 TATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAATCATAACTATTTG
* * * * *
11333665 AA-TTGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAATTATTAATTT-TTGGAATATTATT
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** * * * *
11333728 AGAA-TAACATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTTTTTTATGATAGAAC
188 A-AATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * * * *
11333792 AAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTG-CAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTCA
251 AAAAGGTCAAAACAATTTCAA-ATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTA
* * * *
11333855 GTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCTT-ATTAATT-TTTGAAG
315 GTAAACAGATTCATTTTTAAAATCTCTTCATT-ATTAATAG-AT
* * * * ** * * *
11333896 GATTAAGAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGA-ATGTTCAAAAACAATTGTTATAT
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAATAAACTT-ATATGAACAGAAACAATTCTTTTAT
* * * * * * * * *** *
11333959 -AGCCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTGACATGGCCATAATTATTT-AA
64 GA-CAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAATCATAACTATTTGAA
* ** * * * **
11334022 ATTGGTTCAATAAATAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAA
128 CTT-GTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT--AATATTAATAA
* * * * * *
11334086 ATTAGTATTATTTTATTTCCAGTAAGCTTGTATGAACTTAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAA
190 ATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA
* ** * * * * ** * ** * * *
11334151 AGATCGTAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATTGTCTTAACTGCTTGAAC-TGCTTCGTCA
254 AGGTCAAAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGT-A
* * * * *
11334215 AATAGATTAATTTTTTAAATCTCTT-AGTTATTAATTTTTGAAA
318 AACAGATTCATTTTTAAAATCTCTTCA-TTATTAA---TAG-AT
* * * * * *
11334258 TATTATTAAATTAGTACTATTTT-ATTCCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTCTTTTATG
* * * * * * * *
11334322 ACAGAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAA-T--T---GT--TCA-AAC---TGGAACT
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* ** * * * * *** *
11334375 AGTTTAGTAAATAGATTTGTTTTTAAAATCTCAAATTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATT
130 TGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT--AATATTAATAAATT
* * * * * *
11334439 AGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATG--GTGACAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAA
193 AGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACT-A-AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA
** * * ** * * * **
11334502 ATTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TCAATTT-GATA
255 GGTCAAAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACT-TGTTTAG-TA
** * *
11334565 AATTGACTT-ATTTTTTAAAACTCAACTTATCAATTTTTAA-A-A-
318 AACAGA-TTCA-TTTTTAAAA-TC-TC-T-TC-ATTATTAATAGAT
* * * * ** * * * * *
11334607 TATTATTAAAGTAATGTTATTTTATTTCGGATTAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTATTTTACG
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACTTATATGAAC-AGAAACAATTCTTTTATG
* * *** * ** * *
11334671 ATAAAACAAAAGGTCATATTTA-TTGTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCACAATTATTTGAAC
65 ACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTG-AAATAAATAATTACTCAAATAATCATAACTATTTGAAC
** * *
11334735 TTGTTCGGTAAA-AAGATTTATTTTTTTTAAAT-TTCTTGTTTATTAATTTTTTTAATGTTAATA
129 TTGTTCGGTAAACAA-ATTTA--TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTCTTAATATTAATA
* ** * * *
11334798 AATTACTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAA-T---AGAATGA---TAT-----AA-AA
189 AATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * * * * ** * * *
11334850 TA-G---ATA-ATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGC-TCGAC-A---AACACATT-T
253 AAGGTCAAAACAAT-TTCAAATAG--ATAATTATTCAAACAGTCAT-AACTATTTAA-AC-TTGT
* *** * * *
11334904 TT-TTAAATCTCCTAC-TTATT--AA--T-TT--TT-TGAAT--AT
312 TTAGTAAA-CAGATTCATTTTTAAAATCTCTTCATTATTAATAGAT
** * * ** * * * *
11334938 TATTAAT---TTAGCAATATTTT-AGTCTGGATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTCTTTTATG
* * * * * * * *
11334999 ATAAAACAAAAAATAATAAC-ACTTTAAGATAGATAATTA-TGTAAATAGTCATAACTATTTGAA
65 ACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAA-ATAAATAATTACT-CAAATAATCATAACTATTTGAA
* * *
11335062 -TTGGTTCGATAAACAAATTTACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAA
128 CTT-GTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT-AATATTAATAAA
* * ** * * * * *
11335122 TTAGTATTATTTTATTCCTAATGATTTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAA
191 TTAGTATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * ** * * * * *
11335186 ATGTCACAATGATTTGAAATAGATAA-TAGGTCAAA-TGTCATAACGATTTGAACTTGTTTTA-T
254 AGGTCAAAACAATTTCAAATAGATAATTA-TTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTTAGT
* * * * * *
11335248 AAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTGC-TTATTAATTGTCATT
317 AAACAGATTCATTTTTAAAATCTCTT-CATTATTAATAG--A-T
* * * * * * * *
11335291 ATATTGATAAATTTATATTATTGT-ATTCGAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAAATTATTTTA
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* * * *** * * * ** * *
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* * * *
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* ** * * * * ** * * **
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* * * * * * *
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** * * * * * * *
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* ** **
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * ** * *
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* * *
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* * * * * * ** * *
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* * ** * ** * * * *
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* * * * * * * * **
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* * ** *
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* * * * * * * * *
11336232 AGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGTTCTATTATTCATATAGTCAAAACTATTTGAAA-TG
254 AGGTCAAAACAATTTCAA--AT---A--GAT-AATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAACTT
* * * * *
11336296 GTTTGGTAAAC-GTATTTATTTTCT-AAATTTCTTACA-TATTAATTTTTGAAA
310 GTTTAGTAAACAG-ATTCATTTT-TAAAATCTCTT-CATTATTAA---TAG-AT
* * * * * * * * * *
11336347 GATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGA-ATGATAAAAAAACATTTGTTATAT
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACTT-ATATGA-ACAGAAACAATTCTTTTAT
* * * * * ** * *** *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * * *
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* ** * * * *** * * * * **
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* * * * *
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315 GTAAACAGATTCATTTTTAAAATCTCTTCA-TTATTAA---TAG-AT
* * * * ** * * *
11336711 TATTATTATATTAGTATTATTTT-ATTCTTAATAGGCTTGTATGAA-ATGAAATAATTATTTTAT
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAATAAACTTATATGAACA-GAAACAATTCTTTTAT
* * * * ** * ** *
11336774 AACAAAACAAAAGGTTATGATGATTTGAAATAGGTAA-T--TC---T--TCA-AA-TA--GGAAC
64 GACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAATCATAACTATTTGAAC
* * *
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129 TTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT--AATATTAATAAAT
*** * * ** * * *
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192 TAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA
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* * * * ** * *
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318 AACAGATTCA--TTTTTAAAATCTC---TTCATT-ATTAATAGAT
* * ** * * * * * *
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1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAATAAACTTATATGA-ACAGAAACAATTCTTTTAT
* * * * * ** * * * * * *
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** ** * * * *
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* * ** ** * *
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252 AAAGGTCAAAACAATTTCA-AATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAG
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * ***
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * ** * *
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* * * ** * * * * ** **
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** * * * *
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* ** * * * ** * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * ** * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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* *
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* *
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* * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * *
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* * **
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
11333532 TTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTACTTT-ATTCCAAATAAGC-TATTATGAATTCAAAA
124 ATCATATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTA-TATGAACT-GAAA
* * * * * * * *
11333590 AAACTTATTTTATAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAACAGATAATTATTGATATAGTCT
1 CAA-TTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * * * * *
11333655 TAAATATTTGAA-TTGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAATTATTAATTTTTGG
65 TAACTATTTAAACTT-GTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTAT-C
* ** * **
11333719 A-ATATTATTAGAA-TAACATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
127 ATATATTAATA-AATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAA
* * * * * * * * *
11333772 TAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTG-CAATTGTTCAAATAGTCA
1 CAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * *
11333836 TAA-TATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTTTGA-
65 TAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTATCAT
* * ** **
11333894 AGGATTAAGAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGA-ATGTTCAAAAA
129 A-TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTT-ATATGAACTGAAA
* * * * * * * *
11333947 CAATTGTTATAT-AGCCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTGACATGGCCA
1 CAATTCTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * ** * *
11334011 TAATTATTTAAA-TTGGTTCAATAAATAAATTCACTTTTT-AAATCACTTACTTATTAATTTTTG
65 TAACTATTTAAACTT-GTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTATC
* * * * * *
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127 ATATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAA
* * * * * * * * *
11334128 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCGTAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATTGTCTT
1 CAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * * * * * * *
11334193 AACTGCTTGAAC-TGCTTC-GTCAAATAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGA
66 AACTATTTAAACTTG-TTCAGT-AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTATCA
* * * *
11334256 AATATTATTAAATTAGTACTATTTT-ATTCCAAATAAACTTATATGAACTGAAA
128 TATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTATATGAACTGAAA
* * * * * *
11334309 CAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACT-G---
1 CAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCA
* * * * * *** * * * *
11334370 GAAC----T--A---GTTTAGTAAATAGATTTGTTTTTAAAATCTCAAATTTATTAATTTTTGAA
65 TAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTATCAT
* * * * *
11334426 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATG--GTGACAAA
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAACTG--AAA
* * ** * *
11334478 CAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAATTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCAT
1 CAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * ** * *
11334543 AATTATTTGAATCAAT-TTGA-TAAA-TTGACTTATTTTTTAAAA-C-TCAACTTATCAATTTTT
66 AACTATTT-AAAC-TTGTTCAGTAAACAT-ATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTAT
* * * * * * * ** * * *
11334603 AAAATATTATTAAAGTAATGTTATTTTATTTCGGATTAGCTTTTATGAACTAAAA
126 CATATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAA
* * * *** * *
11334658 CAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCATATTTA-TTGTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA
1 CAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * *
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11334760 TTTAAATTTC
Statistics
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AACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTATCATAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAA
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11334051 AATCACTTAC
* * *
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*
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* * * **
11334190 CTTAACTGCTTGAACTGCTTCGTCAAATAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAG
121 C-AAACTG--TGAACTGCTTAGTCAAATAGATTAATTTTTAAAATCTCAAAG
* * * *
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* * * * *
11334307 AACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTT-ATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACTG-
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* ** *
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* *
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* *
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11334536 TGGCCATAAT
Statistics
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Consensus pattern (169 bp):
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ACTGCTTAGTCAAATAGATTAATTTTTAAAATCTCAAAG
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11334051 AATCACTTAC
* *
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* * * * * * *
11334126 AACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCGTAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATTGTC
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* * * * * * *
11334191 TTAACTGCTTGAACTGCTTCGTCAAATAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGA
130 ATAACTACTTGAACTGCTTCGTCAAATAGATTAATTTTTTAAAACTC-AACTTATCAATTTTTAA
* * * *
11334256 AATATTATTAAATTAGTACTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTATTTTAT
194 AATATTATTAAAGTAATACTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTATTTTAC
* *
11334321 AACAGAACAAAAGGTTATAGCAATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAACTGGAACTAGTTTAGTAA
259 AACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTGT-AAATAGATAATTGTTCAAACTGGAACTAGTTTAGTAA
11334385 ATAGATTTGTTTTTAAAATCTCAAAT
323 ATAGATTTGTTTTTAAAATCTCAAAT
* *
11334411 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGGTGAC-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAACTTGTAT-G-AACT
11334475 AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAATTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGG
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGG
* * * *
11334539 CCATAATTATTTGAA-T-CAATTTGAT-AAATTGACTT-ATTTTTTAAAACTCAACTTATCAATT
128 CCATAACTACTTGAACTGC--TTCG-TCAAATAGA-TTAATTTTTTAAAACTCAACTTATCAATT
** * ** * * *
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189 TTTAAAATATTATTAAAGTAATACTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTAT
* * ***
11334665 TTTACGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTGTAAATAGATAATTGTTCAAA
254 TTTACAACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTGTAAATAGATAATTGTTCAAA
11334716 TAATCACAAT
Statistics
Matches: 256, Mismatches: 41, Indels: 17
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (348 bp):
TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAACTTGTATGAACTAA
ACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCA
TAACTACTTGAACTGCTTCGTCAAATAGATTAATTTTTTAAAACTCAACTTATCAATTTTTAAAA
TATTATTAAAGTAATACTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTATTTTACAA
CAAAACAAAAGGTCATAGCAATTGTAAATAGATAATTGTTCAAACTGGAACTAGTTTAGTAAATA
GATTTGTTTTTAAAATCTCAAAT
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Indices: 11334902--11335920 Score: 641
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11334892 ACAAACACAT
* * * * * * * **
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* * * * * * * * *
11334966 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAATAATAA-CACTTTAAGATA
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* * * *
11335030 GATAATTATGT-AAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAA-ATTTA
126 GATAATT-T-TCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAA-AATATTTA
* * * *
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* ** * * * ** * * *
11335144 GATTTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGA
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** * * * *
11335209 TAATAGGTCAAAT-GTCATAACGATTTGAACTTGTTTTATAAACAA-ATTTA
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* * ** * * ** * *
11335259 TTTTTTAAGTCTTTTGCTTATTAATTGTCATTATATTGATAAATTTA-TATTATTGTA-TTCGAA
1 TTTTTTAAAT-TCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AA-TTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * * * * * * * * *
11335322 ATAAGCTTGTATAAACAAAAACAAATTATTTTATGATAAAACAAAACGTTATAGTGATTTCAAAT
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* * * * * *
11335387 AGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAAAATATTCA
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* *
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1 TTTTTTAAAT-TCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * *
11335506 AAACTTATATCAACT-GAAACAATTCTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
64 AAACTTATATCAA-TAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTT-AAATAG
* ** * * *
11335570 AAAATTATTCAAATAATCATGGCTATTTGATCAAGTTTGATAAACATATTTA
127 ATAATT-TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAAATATTTA
* * * * * * * *
11335622 TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATCCATTAGTATTATTTTAATTCGAAT
1 TTTTTTAAA-TTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * * ** *
11335687 AACCTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAGATAAA
64 AAACTTATATCAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAA-ATAGA
** * * *
11335752 TAATTTGTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTA
128 TAATTT-TCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAAATATTTA
* *
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1 TTTTTTAAATTCTTAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * * * * ** *
11335864 AAACTTATATGAACAAAAATATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
64 AAACTTATATCAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTT
11335921 GAATTAGTTT
Statistics
Matches: 664, Mismatches: 148, Indels: 56
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
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179 8 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
TTTTTTAAATTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
ACTTATATCAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAATAGATAA
TTTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAAATATTTA
Found at i:11337330 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 11335946--11339327 Score: 1774
Period size: 181 Copynumber: 18.7 Consensus size: 178
11335936 ACAAAATTAT
* *
11335946 TTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATT-TTATTTTATTCCGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTATTATTATTTT-TACCGAA
* ** * * * *
11336010 TAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGCTATATGACAAAATAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAAATA
64 TAAGCTTGTA-GAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAACGA-TTTGAAATA
* * * * * * * *
11336074 GATAATTTTTCATATAGT-TTAAATATTTGAATTGGTTC-AGCAAATAAATTTA
126 GATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAGATTTA
* * * * ** * * *
11336126 -ATTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGTTTAGTATTATTTTATTCCAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-TACCGAAT
* * ** * * * * * *
11336190 AAGCTTGTACGAATAGAAATAATTGTTTTATGGTAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATA
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* ** * * * *
11336255 CAATTGTTCTATTATTCATATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAAC-GTATTTA
128 TAATTGTTC----A---A-ATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAG-ATTTA
* * * * * **
11336314 TTTTCTAAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-TACCGAAT
* * * * *
11336379 AAGCTTGAATG-ATAAAAAAACATTTGTTATATGACCAAACAAA-AGGCAATAAC-AGTTTGGAA
65 AAGCTTGTA-GAATAAAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TC-ATAACGA-TTTGAAA
* * * * * * * * * *
11336441 TAGATAACTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAAT-GATTCGATAAATAAATTCA
124 TAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTA
* * * * **
11336496 CTTTTTAAGTCAT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATT-TGTATTATTTTATTTCGA
1 TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTT-TACCGA
* *** ** * * * *
11336559 ATAAGCTCGTACGAACCGAAATGATTGTTTTTTGATAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
63 ATAAGCTTGTA-GAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC--AAAGATCATAACGATTTGAAAT
* ** * * *
11336624 GGATAATTGCTT-ATGTAATCTTAATTATTTGAACT-GCTTCGGTAAACAGATTTA
125 AGATAATTG-TTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTA
* * * * * * **
11336678 TTTTTTAAATCTCTTAGTTACTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTCTTAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-TACCGAAT
* * * * * * * * *
11336743 AGGCTTGTATGAA-ATGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATGATGATTTGAAATAG
65 AAGCTTGTA-GAATA-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
11336807 GTAATTCTTCAAATAG------------GAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
127 ATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * * *** *
11336847 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTTTGCAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-TACCGAAT
* * ** * * * * * *
11336912 AAG-TTTTATGAATTGAAACGATTTTTTTTTTGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-A
65 AAGCTTGTA-GAA-TAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * ** ** * *
11336975 GTAATTGTTTAACTAATCATAAGAATTTGAGTTTGTTC-AGTAAATAGATTTA
128 -TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAGATTTA
** * * * ** *
11337027 TTTTTTTCAAATCTCTTGTTTATTGATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCCG
1 -TTTTTT-AAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-TACCG
* * * * * * * * *
11337091 AATAAGCTTGTATGATATGAAACAAA-TATTTTATGCCTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAA
62 AATAAGCTTGTA-GA-ATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
11337155 TAGATAATTATTCTAATAG-CTTTAACTATTTGAACAAGTTCGACAAATACATTTA
124 TAGATAATTGTTCAAATAGTC-TTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* *
11337210 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTATTAAATTATTATTATTTTTCACCGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTT-ACCGAAT
* * * * *
11337275 AAGCTTCTACAATAAAAAAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTT-ATGATTG
65 AAGCTTGTAGAATAAAAAAA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGA-AATAG
* * * *
11337339 ATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTA
127 ATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * ** **
11337391 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTCAATCTAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTTA-CCGAAT
* * * * * *
11337456 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAA
65 AAGCTTGTA-GAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGA
11337521 TAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACT-GATTC-AGTAAACAGATTTA
128 TAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAG-TTCGA-TAAACAGATTTA
* * * *
11337572 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTT-TAATATTATTAAATT-TGTATTACTTTATT--TG
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAT-TATTA-TTT-TTACCG
* * *
11337633 AAACAAGCTTGTCTGAAT-AAAAAAATTAG-TTTATGACAAAACTAAAGATCGTAACGATTTGAA
62 -AATAAGCTTGT-AGAATAAAAAAAATT-GTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAA
* * * * * * * *
11337696 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTACGGTAAACATATTCA
123 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * **
11337752 TTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-TATATTATTTTATTTCGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTT-TACCGAA
* * * * * ** * *
11337816 TAAGCCTATATA-AACT-GATACAATTATTTTATGATGAAATAAAGGGTCATAACGATTTGAAAT
64 TAAG-CT-TGTAGAA-TAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GATCATAACGATTTGAAAT
* * * * * **
11337879 AGATAATTATTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACTTGTTAGGTAAACTTATTTA
125 AGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * * * * * *
11337933 TTTTTAAAATAGT-TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAA
1 TTTTTTAAAT-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTTA-CCGAA
* * * * * * * * * * *
11337997 TAAGCTTGTATCAACAAAGACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCACAATGATTTAAAATAA
64 TAAGCTTGTA-GAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAG
* * *
11338062 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGAAAAACAAATTTA
127 ATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACAGATTTA
* * *
11338114 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTT-TAATATTAATAAATT-TGTATTACTTTATT--TG
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAT-TATTA-TTT-TTACCG
* * * * *
11338175 AAATAAGCTTGTAAGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTCAAA
62 -AATAAGCTTGT-AGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAACGATTTGAAA
* * * *
11338240 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATACCTATTTGAACTTGTTCGATAAACGGATTTA
124 TAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * * * ** *
11338295 TTTTCTAAATCTATTACTTATTAACTTTT-AGAATTTTAATAAATTAAAATTATGTTATT-TCGA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTATTATTAT-TT-TTACCGA
* * * * * * * * * * *
11338358 ATAAGTTTATATGCATAGAAACAATTATTTTGTAATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTTG-AAT
63 ATAAGCTTGTA-GAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGA-TTTGAAAT
* * * ** * *
11338422 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-ACACT-GGTCAAGCCAACAAATTCA
125 AGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGA-ACTAGTTCGA-TAAACAGATTTA
* * * ** *
11338476 TTTTTTAAATTTGTTACTTATTTATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATT-CCAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTATTATTA-TTT-TTACCGA
* * ** * * * * * *
11338539 ATAAGAC-TATATGAATAGAAGCAATTATTTTATGATAAAA-AAATGGTCATAGCAATTTGAAAG
63 ATAAG-CTTGTA-GAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GATCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
11338602 AAATAATTGTTCAAACACT-TATAACTA-ATGAAACTAGTT-TAGTAAATAGATTTA
125 AGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTG-AACTAGTTCGA-TAAACAGATTTA
* ** * * *
11338656 -TTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATTAATTAATATTATTCTATTA-TGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATT-T-TTACCGAA
* * * * * * * * * * *
11338719 CAA-CTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTAGGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
64 TAAGCTT-GTAGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * ** * *
11338783 ATAATTGTTCAAATAGTCGTAATTATTTTAACTGGTTTGGCAAATAGAATTA
127 ATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * * *
11338835 TTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATT-TTATTTTATTCCAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTATTATTATTTT-TACCGAA
* * *
11338899 TAAG-TTAGTAAGAATTAAAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAA-AGTCATAATGATTTGAAATA
64 TAAGCTT-GT-AGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATA
* * * ** * * * *
11338962 AAGAATTGTTCATATAACCTTAATTATTTAAACTAGTT-TAGTAAACAAATTTA
126 GATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAGATTTA
* * * * * * * *
11339015 -TTTTTAAATCTTTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGTA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTATTATTATTTT-TACCGAA
* * * * * *
11339078 TAAGCTTGATA-AACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGAT-ATAACAATTTAAAATA
64 TAAGCTTG-TAGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA-GATCATAACGATTTGAAATA
* * * *
11339141 TATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
126 GATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
* * *
11339194 CTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTCCGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTTA--CCGAA
* * ** * *
11339259 TAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAA-ATTTCATAATGATTAGAAAT
64 TAAGCTTGTA-GAAT-AAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAACGATTTGAAAT
11339322 AGATAA
125 AGATAA
11339328 ACTAATTTAT
Statistics
Matches: 2488, Mismatches: 548, Indels: 330
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
168 39 0.02
169 96 0.04
170 1 0.00
177 1 0.00
178 61 0.02
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTTACCGAATA
AGCTTGTAGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
TTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTA
Found at i:11337818 original size:542 final size:540
Alignment explanation
Indices: 11335946--11339327 Score: 2384
Period size: 542 Copynumber: 6.2 Consensus size: 540
11335936 ACAAAATTAT
* * * * **
11335946 TTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCCGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-TAATATTAATAAA-TTAGTATTACTTTATTATGAA
* * * * * *
11336010 TAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATT-GCTATATGACAAAATAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAAAT
64 CAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTAGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGA-TTTGAAAT
* * * * * * *
11336073 AGATAATTTTTCATATAGT-TTAAATATTTG-AATTGGTTC-AGCAAATAAATTTA-ATTTTAAT
127 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATT-GTTCGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * *
11336134 TCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATT-ATTAGTTTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGT
190 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCGAATAAGCTTCT
* * ** * * * * * * *
11336198 ACGAATAGAAATA-ATTGTTTTATGGTAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGT
254 AC-AATAAAAAAATATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * ** *
11336262 TCTATTATTCATATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAACGTATTTATTTTCTAAAT-TT
317 TC----A---A-ATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT
* * * *
11336326 CTTACATATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGAATG
374 -TTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATG
* * * ** * ** * *
11336390 ATAAAAAAACATTTGTTATATGACCAAAC-AAAAGGCAATAAC-AGTTTGGAATAGATAACTGTT
436 A-ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTC-ATAACGA-TTTAAAATAAATAATTGTT
* * * * * * * *
11336453 GAAATGGCCATAATTATTTGAAATGATTC-GATAAATAAATTCA
498 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAG-TAAACAGATTTA
* * * * * *
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1 TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTT-TAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTAT-GA
* * * ** ** * * * * *
11336559 ATAAGCTCGTACGAACCGAAATGATT-GTTTTTTGATAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
63 ACAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTAGTTTTATGACAAAA-TAAAAGGTTATAACGATTTGAAA
* * ** * * * * ** *
11336623 TGGATAATTGCTT-ATGTAATCTTAATTATTTG-AACTGCTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAA
126 TAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTG-TTCGACAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * ** * *
11336686 ATCTCTTAGTTACTAATTTTTGAAATATTATTATA-TTAGTATTATTTTATTCTTAATAGGCTTG
189 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCGAATAAGCTTC
** ** * * * * * * * *
11336750 TATGA-AATGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATGATGATTTGAAATAGGTAATTC
253 TACAATAAAAAAAT-ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
11336814 TTCAAATAG------------GAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
316 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * ** * ***
11336867 TTAATTTTTGAAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTTTGCATAAG-TTTTATGAATTGAAAC
381 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC
* * * * * * * * * * *
11336931 GATTTTTTTTTTGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTTAAATAAGTAATTGTTTAACTAATCAT
445 -AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
** ** *
11336995 AAGAATTTGAGTTTG-TTCAGTAAATAGATTTA
509 AACTATTTGA-ACTGATTCAGTAAACAGATTTA
** * * * * * **
11337027 TTTTTTTCAAATCTCTTGTTTATTGATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCCGA
1 -TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTT-AATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTATGA
* * * * * * *
11337092 ATAAGCTTGTATGATATGAAACAAA-TA-TTTTATGCCTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAA
63 ACAAGCTTGTATGA-AT-AAAAAAATTAGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAA
* * * * *
11337155 TAGATAATTATTCTAATAG-CTTTAACTATTTGAACA-AGTTCGACAAATACATTTATTTTTTAA
126 TAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-ATTGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAA
* * *
11337218 ATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTATTAAA-TTATTATTATTTT-TCACCGAATAAGCTT
189 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAT-TCCGAATAAGCTT
* * *
11337281 CTACAATAAAAAAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTT-ATGATTGATAATT
252 CTACAATAAAAAAAT-ATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGA-AATAGATAATT
* *
11337345 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
315 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
11337410 ATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTCAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
380 ATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
* * *
11337475 CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT
444 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
11337540 AACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTTA
509 AACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTTA
* * *
11337572 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTTTAATATTATTAAATTTGTATTACTTTATT-TGAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTTAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTATG-AA
* * **
11337636 CAAGCTTGTCTGAATAAAAAAATTAG-TTTATGACAAAACT-AAAGATCGTAACGATTTGAAATA
64 CAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTAGTTTTATGACAAAA-TAAAAGGTTATAACGATTTGAAATA
* ** * *
11337699 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTACGGTAAACATATTCATTTTTTAAATCT
128 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
11337764 CTTGCTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCGAATAAGC--CTA-TA
193 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTCTACAA
* * ** * * *
11337826 TAAACTGATACA-ATTATTTTATGATGAAATAAAGGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
258 TAAA---A-AAATATTGTTTTATGACAAAACAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** * **
11337890 CAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTAGGTAAACTTATTTATTTTTAAAATAGTTTACTTATT
318 CAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * *
11337955 AATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATCAACAAAGACA
383 AATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * *
11338019 ATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCACAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
446 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * *
11338084 CTATTTGAACTTATTC-GAAAAACAAATTTA
511 CTATTTGAACTGATTCAG-TAAACAGATTTA
* *
11338114 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTTAATATTAATAAATTTGTATTACTTTATT-TGAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTTAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTATG-AA
* * *
11338178 TAAGCTTGTAAGAATAGAAAAAATT-GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTCAAATA
64 CAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTAGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATA
* * * * ** *
11338242 GATAATTGTTCAAATAGTCATACCTATTTGAACTTGTTCGATAAACGGATTTATTTTCTAAATCT
128 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * * *
11338307 ATTACTTATTAACTTTT-AGAATTTTAATAAATTAAAATTATGTTATTTCGAATAAGTTTATATG
193 CTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTCTA--
* * * * * * * *
11338371 C-ATAGAAACA-ATTATTTTGTAATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTTG-AATAGATAATTGTT
255 CAATAAAAAAATATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTT
* * *** ** *
11338433 CAAATAGTCATAACTATTT-ACACTGGTCAAGCCAACAAATTCATTTTTTAAAT-TTGTTACTTA
318 CAAATAGTTATAACTATTTGA-ACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTA
* * * * * * * * *
11338496 TTTATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TATATGAATAGAAG
381 TTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATGAACAAAAA
* ** * * * * * * *
11338560 CAATTATTTTATGATAAAA-AAATGGTCATAGCAATTTGAAAGAAATAATTGTTCAAACACTTAT
444 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *
11338624 AACTA-ATGAAACT-AGTTTAGTAAATAGATTTA
509 AACTATTTG-AACTGA-TTCAGTAAACAGATTTA
* ** * *
11338656 -TTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATTAATTAATATTA-TTCTATTATGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TTAATATTAATAAATTAGTATTACTT-TATTATGAA
* * * * * * *
11338719 CAA-CTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTAGGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
64 CAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTAGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
11338783 ATAATTGTTCAAATAGTCGTAATTATTTTAACTGGTTTGGCAAATAGAA-TTATTTTTTAAATCT
129 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCGACAAACA-AATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
11338847 TTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTAAG
193 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCGAATAAGCTT-CT-AC
* * * * *
11338911 AATTAAAAAA-ATTGTTTTACGACAAAACAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCA
256 AATAAAAAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* ** * * * *
11338974 TATAACCT-TAATTATTTAAACTAGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTAGTTATTA
320 AAT-AGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * *** * *
11339037 ATTTTCAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGTATAAGCTTG-ATAAACAAAAATAAT
384 ATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * * *
11339101 TGTTTTATGATAGAACAAAATGAT-ATAACAATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
448 TGTTTTATGATAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* *
11339165 TATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
512 TATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTTA
* ** * **
11339194 CTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTCCGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTTAATATTAATAAATTAGTATTA-CTTTATTATGAA
* * ** * * * *
11339259 TAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATT-GTTTTACAACAAAACAAAA-TTTCATAATGATTAGAAA
64 CAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATTAGTTTTATGACAAAATAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAA
11339321 TAGATAA
126 TAGATAA
11339328 ACTAATTTAT
Statistics
Matches: 2274, Mismatches: 445, Indels: 235
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
531 55 0.02
532 183 0.08
533 166 0.07
534 8 0.00
537 24 0.01
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539 113 0.05
540 181 0.08
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542 497 0.22
543 352 0.15
544 116 0.05
545 78 0.03
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547 4 0.00
549 3 0.00
550 80 0.04
551 36 0.02
552 29 0.01
553 101 0.04
554 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (540 bp):
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTATGAACA
AGCTTGTATGAATAAAAAAATTAGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGAT
AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTCTACAATAA
AAAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
TATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
GATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
TGATTCAGTAAACAGATTTA
Found at i:11339466 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 11339439--11339483 Score: 58
Period size: 17 Copynumber: 2.6 Consensus size: 18
11339429 AATAAAAGGT
*
11339439 TATAATGATTTTAAATAG
1 TATAATTATTTTAAATAG
11339457 -ATAATTA-TTTAAATAG
1 TATAATTATTTTAAATAG
*
11339473 TCTAATTATTT
1 TATAATTATTT
11339484 AAACATGTTT
Statistics
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Consensus pattern (18 bp):
TATAATTATTTTAAATAG
Found at i:11339469 original size:16 final size:17
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11339438 TTATAATGAT
11339448 TTTAAATAG-ATAATTA
1 TTTAAATAGTATAATTA
*
11339464 TTTAAATAGTCTAATTA
1 TTTAAATAGTATAATTA
11339481 TTTAAA
1 TTTAAA
11339487 CATGTTTGAT
Statistics
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TTTAAATAGTATAATTA
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Indices: 11339381--11340533 Score: 1053
Period size: 180 Copynumber: 6.4 Consensus size: 181
11339371 ATTAAGAAAG
* * * *
11339381 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAAT
1 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *
11339445 GATTTTAAATAGATAATTATTTAAATAGTC-TAATTATTTAAACATGT-TTGA-TAAACATATTT
65 GATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T-TATTCAGTAAATAGATTT
** *
11339507 ATTTTTTTAAAATTTTGGACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAT
128 A-TTTTTT-AAATTTTCTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
11339563 TTTATTTTGAATAGGCATTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGGT-AGAA
1 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAA
* * * * *
11339626 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGATTCGGTAAAGAGATTT
64 TGATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTT
* * * *
11339690 AGTTTTTAAA---TGT-CTTATTAACTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTAT
128 ATTTTTTAAATTTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* **
11339740 TTTATTTTGAATAA-TTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAAT
1 TTTATTTTGAATAAGCTTT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * ** * * * ** *
11339804 GATTTAAAATAGATAATGGTTTAAAGGGACATGACTATTTCAACTTATTTGGTAAATAGATTAAT
65 GATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTTAT
* * * *
11339869 TTTTTAGATCTTCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTATTATTAT
130 TTTTTAAATTTTCTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * **
11339921 TTTATTTTGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGATAAAA-AAAAGATCATAACA
1 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * *** * *
11339985 ACTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAATCGTAACTATTTGAACTCCCTCAGTAAACAAATTTATT
66 ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTTATT
* * *
11340050 TTTAAAATTTTTTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
131 TTTTAAA-TTTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * *
11340101 TTTATTCCAAATAAGCTTCTT-TCAATAG-AACAAATTGGTTTATGACAAAACATATGGTCATAA
1 TTTATTTTGAATAAGCTT-TTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* **
11340164 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TACGTTCAAAAAATAGATT
64 TGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA--TTCAGTAAATAGATT
*
11340227 TATTTTTTAAATTTT-TACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTAT
127 TATTTTTTAAATTTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
*** * ** *
11340281 TTTATTCAAAATAAGGTTGCATCAATA-AAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
1 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * ** * *
11340345 GTTTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATATATTTAT
65 GATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTTAT
*
11340410 TTTTT-AATTTTCTTACTCT-TTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTAT
130 TTTTTAAATTTTC-TACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * *
11340462 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GTAATAATTGTTTTATTAGAAAACAAAAGGTCACAAT
1 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
11340526 GATTTGAA
65 GATTTGAA
11340534 TGGATAATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (181 bp):
TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTTATT
TTTTAAATTTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
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Alignment explanation
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Period size: 361 Copynumber: 3.2 Consensus size: 356
11339381 TTTATTTTGG
* * * * *
11339391 ATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAATGATTTTAAAT
1 ATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * *
11339455 AGATAATTATTTAAATAGTC-TAATTATTTAAACATGTTTGATAAACATATTTATTTTTTTAAAA
65 AGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATA-GTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTT-AAA
* * *
11339519 TTTTGGACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGGCATT
127 TTTT-AACTTATTAA-ATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGG--TT
* * * *
11339582 TATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGGT-AGAATGATTTGAAATAGATAATTG
188 TATGAA-TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT-
* * * * * * *
11339646 TTCT-AATAGTCT-TAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAATGTCTTA-
250 TTTTAAATAGT-TGTAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAATTTTCTTAC
* **
11339707 --TTAACTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
313 TTTTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
** * ** *
11339750 ATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTAAAATA
1 ATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* ** * * * * * *
11339815 GATAATGGTTTAAAGGGACATGACTATTTCAACTTA-TTTGGTAAATAGATTAATTTTTTAGATC
66 GATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AA-ATAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAAT-
* * * **
11339879 TTCAACTTATT-AATTTTTAGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAACTTTTAT
128 TTTAACTTATTAAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGGTTTAT
* * * ** * * *
11339943 GAATAGAAACAATTTTTTTATGATAAAA-AAAAGATCATAACAACTTGAAATAAATAATTGTTAA
191 GAATA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTTA
* * *** * *
11340007 AATAATCGTAACTATTTGAACTCCCTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTTACTTATTA
255 AATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTT-TAATTTTCTTACTT-TTA
* *
11340072 ATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAA
318 ATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * *
11340111 ATAAGCTTCTTTCAATAG-AACAAATTGGTTTATGACAAAACATATGGTCATAATGATTTGAAAT
1 ATAAGCTTATATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** *
11340175 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATACGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATT
65 AGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATA-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATT
* *** * *
11340240 TTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGGTTGCATC
129 TTAACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGGTT-TATG
* *
11340304 AATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTTTTTAA
192 AATAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTTAA
* *
11340369 ATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAATTTTCTTACTCTTTAAT
256 ATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAATTTTCTTACT-TTTAA-
*
11340434 TTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
319 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * *
11340472 ATAAGCTTATATGAACT-GTAATAATTGTTTTATTAGAAAACAAAAGGTCACAATGATTTG-AAT
1 ATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
*
11340535 GGATAATT
65 AGATAATT
11340543 AGGTCATGAT
Statistics
Matches: 631, Mismatches: 131, Indels: 61
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
356 7 0.01
357 59 0.09
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360 108 0.17
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362 8 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (356 bp):
ATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
GATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTT
AACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGGTTTATGAATA
AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGT
TGTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAATTTTCTTACTTTTAATTTTGAA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
Found at i:11341353 original size:25 final size:25
Alignment explanation
Indices: 11341304--11341355 Score: 77
Period size: 25 Copynumber: 2.1 Consensus size: 25
11341294 AATTTATATG
**
11341304 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAA
1 AACAAAAACATTTGTTTTAAAACAA
*
11341329 AACAAAAACTTTTGTTTTAAAACAA
1 AACAAAAACATTTGTTTTAAAACAA
11341354 AA
1 AA
11341356 GGTCATAATG
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 3, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (25 bp):
AACAAAAACATTTGTTTTAAAACAA
Found at i:11341928 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 11341909--11341948 Score: 55
Period size: 16 Copynumber: 2.3 Consensus size: 17
11341899 GTAATAATAT
11341909 TTGAAATAG-ATAATTA
1 TTGAAATAGCATAATTA
11341925 TTGAAATAGCTATAATTA
1 TTGAAATAGC-ATAATTA
11341943 TGTGAA
1 T-TGAA
11341949 CTAATTCAGT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 0, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
16 9 0.43
18 8 0.38
19 4 0.19
ACGTcount: A:0.45, C:0.03, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (17 bp):
TTGAAATAGCATAATTA
Found at i:11342025 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 11341349--11342012 Score: 766
Period size: 361 Copynumber: 1.8 Consensus size: 360
11341339 TTTGTTTTAA
* * *
11341349 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATGTGAACTGGTT
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATGTGAACTAGTT
* * * * *
11341414 AGGAAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAATCAATTCGTTT
66 AGGAAAACAAAATTATTTTTTAAATCACTTTCTTAGTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTCT
* * ** *
11341479 TATTTATTTTTTGAATAAGCTAGTGAATTGAAAAAATTGTCTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
131 TATTTATATTTCGAATAAGCTAGTGAATCAAAAAAATTGTCTTATGACAAAACAAAAAGTAATAA
* * * ** ** *
11341544 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTA
196 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATGTGAACTAATTCAGTAAACAAATTCA
* * * * *
11341609 TTTTTTAAACCTTTTAATTATTAATTTTCATAATTTTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCGAAT
261 CTTTTTAAACCTTTTAATTATGAATATTAATAAATTTATTA-ATTAGTATTATTTTATTCCGAAT
11341674 AAATTTGTGTGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAG
325 AAATTTGTGTGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAG
* * * * *
11341710 AACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATGTGAACTAGTT
* * * *** *
11341775 CGGTAAATAGGTTTATTTTTTAAATCACTTAT-TTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTC
66 AGGAAAACAAAATTATTTTTTAAATCACTT-TCTTAGTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTC
* **
11341839 TTATTT-TATTTCGAATAAGCTTGT-ATGATCAAAAACAATTGT-TATATGACAAAACAAATGGT
130 TTATTTATATTTCGAATAAGCTAGTGA--ATCAAAAA-AATTGTCT-TATGACAAAACAAAAAGT
* * *
11341901 AATAA-TATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAG-CTATAATTATGTGAACTAATTCAGTAAACA
191 AATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATGTGAACTAATTCAGTAAACA
*
11341964 GATTCACTTTTTAAATCACTTATTAACTT-TAGAATATTAATAAATTTAT
255 AATTCACTTTTTAAA-C-CTT-TTAA-TTAT-GAATATTAATAAATTTAT
11342013 ATTATTTTAT
Statistics
Matches: 247, Mismatches: 45, Indels: 18
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
359 1 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATGTGAACTAGTT
AGGAAAACAAAATTATTTTTTAAATCACTTTCTTAGTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTCT
TATTTATATTTCGAATAAGCTAGTGAATCAAAAAAATTGTCTTATGACAAAACAAAAAGTAATAA
CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATGTGAACTAATTCAGTAAACAAATTCA
CTTTTTAAACCTTTTAATTATGAATATTAATAAATTTATTAATTAGTATTATTTTATTCCGAATA
AATTTGTGTGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAG
Found at i:11342440 original size:183 final size:178
Alignment explanation
Indices: 11341348--11342928 Score: 678
Period size: 181 Copynumber: 8.8 Consensus size: 178
11341338 TTTTGTTTTA
* * * * * * *
11341348 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATGTGAACTGGT
1 AAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTCTTC-AATAGTAATAACTATTTGAAATTGT
* * * * * * * * * * *
11341413 TAGGAAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAATCAATTCGTT
65 TTGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA
* *** * * * *
11341478 TTATTTATTTTTTGAATAAGCTAGTGA-ATTGAAA-AAAT-TGTCTTATGAC
129 TTATTT-TATTACAAATAAGCTTGTAAGATAGAAACAAATAT-TTTTATGAC
* * ** * *
11341527 AAAACAAAAAGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTG
1 -AAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTCTTCA-ATAGTAATAACTATTTGAAATT
* ** * * *** * * *
11341591 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAACCTTTTAATTATTAATTTTCATAATTTTATTAGATTAG
63 GTTTGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* * ** ** * *
11341656 TATTATTTTATTCCGAATAAATTTGTGTGAATAGAAA-TAAT-TGTTTTATGAT
127 TATTATTTTATTACAAATAAGCTTGTAAG-ATAGAAACAAATAT-TTTTATGAC
* * * * * * * * *
11341708 AGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
1 A-AACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTCTTC-AATAGTAATAACTATTTGAAATTG
* * * * *
11341773 TTCGGTAAATAGGTTTATTTTTTAAATCA-CTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAG
64 TTTGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAAT-ATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
11341837 TCTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAAC-AAT-TGTTATATGAC
127 TATTATTTTATTACAAATAAGCTTGTAAGAT-AGAAACAAATAT-TTTTATGAC
* * * * * * * * *
11341889 AAAACAAATGGTAAT-AATATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGCT-ATAATTATGTGAACTA
1 -AAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTCTT-CAATAG-TAATAACTATTTGAAATT
* ** * * * *
11341952 ATTCAGTAAACAGATTCACTTTTT-AA-ATC--ACTTATTAA-CTTTAGAATATTAATAAATTTA
63 GTTTGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTA
*** * * ** *
11342012 -TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAACT-GAAATAGTTA-TTTTATGAT
126 GTATTATTTTATTACAAATAAGCTTGTA-AGA-TAGAAACAAATATTTTTATGAC
* * * * * *
11342064 AAA-AGAGAAGGTCATAATA-ATTTTAAATA-ACT-ATTATTTAAATAGTAGTAACTATTTCAAT
1 AAACA-A-AAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGA-TAATT-CTTCAATAGTAATAACTATTTGAAA
* * * * * * *
11342125 TTGTTCGATAAACA-ATTTTATTTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTATTTTTTGAAATATTAAGAA
61 TTGTTTGGTAAA-AGA-TTTA--TTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
* * **** *** *
11342188 ATTAGCATT-TCCTTATTTTGGATAAGCTT-TAATGA-ACTGAAGTGATTA-TTTTATGTTA-
122 ATTAGTATTAT-TTTATTACAAATAAGCTTGTAA-GATA--GAAACAAATATTTTTATG--AC
* * * *
11342246 AAATAAAAAGGTCATAAAGATTTTAAATAAATAATTCTTCAGATAGTCATAACTATTTGAAATTG
1 AAA-CAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTCTTCA-ATAGTAATAACTATTTGAAATTG
* * * * *
11342311 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATATTTTGCTTCTTAATTTTTGGAATACTAATAAATTTG
64 TTTGGTAAA-AGATTTATTTTTT-AAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* *
11342376 GATTATTTTATTACAAATAAGCTAGTAAGATATGAAACAAATATTTTTATGAC
127 TATTATTTTATTACAAATAAGCTTGTAAGATA-GAAACAAATATTTTTATGAC
* * **
11342429 TAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATTTTAACTATTTG-AATT
1 -AAACAAAAGGTCATAAA-GATTTGAAATAGATAATTCTTC-AATAGTAATAACTATTTGAAATT
* * * * *
11342492 GGTTTGGT-AAACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAG
63 -GTTTGGTAAAAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
11342556 TATTATTTT-TAACCAAATAACCTTCTAAGATCAGAAATAATTA-TTTTATGGC
127 TATTATTTTATTA-CAAATAAGCTTGTAAGAT-AGAAACAAATATTTTTATGAC
* ** * * *
11342608 AAA-ATAAAGATTTTAACA-ATTTGATATTGATAATTGC-TCAAATAGTAATAATTATTT-AAAC
1 AAACA-AAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATT-CTTC-AATAGTAATAACTATTTGAAA-
* ** * * *
11342669 TGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATGTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
61 TTGTTTGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
* * * *
11342734 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAAT-TGTTTTATGAC
125 AGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTGTAAGATAGAAACA-AATAT-TTTTATGAC
* * * ** * ** * * *
11342788 AAAACAAAA-GACAATAATGACTTGAAATAGATAATAATTCAAATGGCCATAATTATTT-TAACT
1 -AAACAAAAGGTC-ATAAAGATTTGAAATAGATAATTCTTC-AATAGTAATAACTATTTGAAATT
**** * *
11342851 GATTCAACAAATAGATTTATTTTTTAAA-ATTTTTACTTATTAA-TTTAGGAAATATTAATAAAT
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124 TAGTATTATTTTATT
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*
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* **
11342929 CCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATTTTTTTTACTTATTAATT
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** * * * * * *
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* * *
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* **
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * *
11343402 AAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATC-ATTGATATA
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* * * ** ** ** * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
11343582 AAAACCAATTCTTTGATGACAAAATAAAAGCTTATAACGATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAAT
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11343646 A
126 A
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TAACCATTTGAACTAATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
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* * *
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* * * * * * * **
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* * * * *
11343794 GATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTATTCTTCAAATCT
125 GATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
11343859 CTTACTTATTAATCTTTGAAATATTAACAAATTCA-TTTTATTTTATTTTTAAAAAGCTAGTATG
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* * * * *
11343923 AATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAATAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGCTC-A
254 AATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* *
11343987 TAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTT-TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
319 TAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
11344051 AAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTATTTTGAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTGTTTT
384 AAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT
* * *
11344116 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
448 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* *
11344181 A-TTGATTAGGTAAATAGAATTATT
513 ACTTG-TTAGGTAAACAGATTTATT
* * *
11344205 TTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTTGAATAA
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* *
11344270 -TTAGTATAAATTAAAAAAAAACTTATTTTAATG-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
65 CTT-GTATGAA-T-AAAAAAAA-TTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * *
11344333 GATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAATTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCT
125 GATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCT
* *
11344398 CTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGAATAA--TTAGTAT
190 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTAT
* * * *
11344460 AAATTAAAAAAAAAACTTATTTTAATG-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
253 GAATT---GAAAAAA-TTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * ** ** *
11344524 GTTCATATAGTCTTAAATATTTGAATTGGTTTGACAAACAAATTTATACTTTAATTCTCTTAGTT
313 GTTCA-ATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA---
* * * * * * *
11344589 GTTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTTTTTTTATTCTAAATAAGCCTGTATGAACAAAA
374 -TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAA
* * * * * * * ** * ** ** *
11344654 ATAATTGGTTTATGATAGAACTAAGGGTTATAATGATTTGAAGTTTATAATTGCTCAAATATTCA
437 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
** * *
11344719 TAACTATTTGAACTACTTCA-ATAAATAGATTTATT
502 TAACTATTTGAACTTGTT-AGGTAAACAGATTTATT
* * *
11344754 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGATTATTATTTCATTTCGAATAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAA
* * * ** * * * * **
11344819 GCTTGAATG-TTCAAATATGATTGTTATATGACCAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGAT
65 -CTTGTATGAAT-AAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * * * *
11344883 AATTGTTGATATGGCCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAACAG-ATTCACTTTTTAAA--TC-
128 AATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAATT-ATTTTTTAAATCTCT
** * * * *
11344944 -ACTTATTAAAATTTGAAATATTAATGAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
192 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * *
11345008 TGAAATAATTGTTTTATGATAAAAC-AAGGGTCATAACAATTTGAGATATATAATTGTTCATATA
257 TGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATA
* * * * * *
11345072 GTCTTAATTGTTTGAAAT-GCTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTT
321 GTCTTAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTT
** * * ** *
11345136 TCAAAATATTATTAAATTTA-TTTTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTAT
381 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGT
* * * * * *
11345200 TTTATAACAAAATAAAA-GTTATAATGAA-TTGAAATAGATAATTGTTC--A-AG---T-A--A-
445 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * ** *
11345253 --GAACTGGTTCGATAAATGGCTTTATT
509 TTGAACTTGTTAGGTAAACAGATTTATT
* * *
11345279 TTTTAAATCT-TGTACTTACTAATTTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGGA
1 TTTTAAATCTCT-TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTC-GAA
* ** * * * * *
11345342 TAGGCTTGTAT-AGGGAAAGATAATTGTTTTATGACAAAATACAA-GTCCCTAACAATTTG-AAT
62 TA-ACTTGTATGA-ATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACAATTTGAAAT
* * * * *** * * *
11345404 ACATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACCAATTCGATAAACT-GACTTATTTTTTAAAT
124 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAA-TAGAATTATTTTTTAAAT
** * * * *
11345468 CTCCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TAT
188 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * * *** * * * *
11345532 GAAGTGAAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAAGGTTATATTTATTTTAATTAAACAATTGTTCA
253 GAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-
* * *** * * *
11345595 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCCATAAACATATGTT-TTTCTTAAATCTTTTACTT-ATT
317 AATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAAT-TTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATT
* * * * * *
11345658 ATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAACTTGTATAAACAGAAACAT
380 -TTTG---AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAA
* * *
11345723 TTGTTTTATGACCAAACAACAA-GTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTCATAA
441 TTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
** * *
11345787 AGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATT
505 CTATTTGAACTTGTTAGGTAAACAGATTTATT
* * * * *
11345819 TTCTAAATCTTTTA-TGTATTAATTGTCTT--AATATTAATACATTTGTTTTATTTTA-TTCGAA
1 TTTTAAATCTCTTACT-TATTAATT-T-TTGAAATATTAATA-AATTATATTATTTTATTTCG-A
* * * * * * * * *
11345880 ATAAGATTGTATGAATAGAAAAAATTCATTTCATGAGAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAAAT
61 ATAA-CTTGTATGAATAAAAAAAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * *
11345945 AGATAATTATTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAG-ATCCATTTTTTAAAT
124 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAAT-TATTTTTTAAAT
* * * * *
11346009 CTTTTGA-TTATTAATTTTT-AGAATATTAATAACTTAGTATTGTTTTACTTTGAATAAGCTTAT
188 CTCTT-ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT
* * * * *
11346072 GTGAATTGAAAAACTT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATATTTATT
251 ATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * *
11346136 CAAATAGTCATGACTATTT-AATCTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTAATT-A
316 C-AATAGTCTTAACTATTTGAA-CTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATTAA
* * * * ** * *
11346199 TTAATTATCAAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC
378 TT--TT-T-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * * * * **
11346264 TATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTAATTACAATTT-AAAGAAATAATTGCTCAAATAGTCATA
439 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
11346328 ACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATC
504 ACTATTTGAACTTGTTAGGTAAACAGATTTATT
** * * * *
11346361 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGTTTAGT-TTTTTTTATTCCAAACAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAA-TA
* * * * **
11346421 ACTTATAT-AA-ACAAAAACATTGTTTTATGACAAAAGAAAAATGTTTTAACAATTTGAAATAGA
64 ACTTGTATGAATA-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * *
11346484 TAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGCCAACTA-AATTATTTTTTGAATCTC
127 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGG-TAAATAGAATTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * *
11346548 TTCCATATAAATTTTTTAAATATTAATAAATTCA-TTTTA-TTTATTTCTGAATAAGCTAGAATG
191 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT-TGAATAAGCTTGTATG
***
11346611 AATTGAAAAAATTGTTTTATGACAGGGCAAAA----AT---GATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
254 AATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-
* * ** *
11346669 ATAGTCTTAACTA-TTGAAATTAGTTCGACAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTAATTATTAA
318 ATAGTCTTAACTATTTG-AACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAA
* ** * * * * * *
11346733 TTTTTTAAATATTGTTATATTAATATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAATAAT
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* * * * * * * * *
11346797 TGTTTTATGATAGAACGAAAGGTTAAAACGATTTGAACTATATAATTATTCATATAGTCATAACT
442 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACT
** * * * *
11346862 ATTCAAACTAGTTCGGTAAATATATTTATT
507 ATTTGAACTTGTTAGGTAAACAGATTTATT
* * * * * *
11346892 CTTTAAA--AC-T-CTTATTAA-TTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAAT-A
* * * * ** * *
11346952 ACTT-CATTGATTAAAAATAAA-TGTTATATGACCAAACAAAAAATAATAACAATTTGAAATAAA
64 ACTTGTA-TGAATAAAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * ** ** * *
11347015 TAATTATTGAAACAGCCATAATTATTTTTACTAATTCA-ATAAATAG-ATTCATTTTTTAAATCA
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* ** * ** **
11347078 CTTATTTACCAAATTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
190 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
11347143 ACTGAAACAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AGTAATTGTTCAT
255 ATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCA-
* * * *
11347207 ATAGTCTTAACTATTTAAACTACTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAAT
318 ATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAAT
* * ** * ** * *
11347272 TTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTTATTCTGAATAGGCTTATAAAAACTAAAACAATTA
379 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTG
* * * ** * * *
11347337 TTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG----GA--A-
444 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* *
11347395 TT--A---GTTCGGTAAATAGATTTATT
509 TTGAACTTGTTAGGTAAACAGATTTATT
*
11347418 TTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-T-TAGTA--TTA-TTCTGAATA
1 TTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTC-GAATA
* * * * * * *
11347476 GGCTTGTGTG-ATGAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCCTAACGATTTGATATAGA
64 -ACTTGTATGAAT-AAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* *** * * * *
11347540 TAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACCAATTCGATAAATTGACTTATTTTTTAAATCTCT
127 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * *
11347605 AACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTCTATTTCGGATAA-CTAT-T-TAAA
192 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAA
** * * * * * * **
11347667 TTGAAATGATTGTTTTATTATAAAAGAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGGT-ATAATT--AT-
256 TTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATA
* * * * *
11347728 -T-TGAAC----TG-ACTCAG--TAG-ATA-GAA-TTATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTT
321 GTCTTAACTATTTGAACT-AGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTT
* * * **** * *
11347781 TTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTT-TCCTAAATAAACTTGTATGAGTTGAAATAATTTT
381 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGT
* * * *
11347845 TTTGTGACAAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTATT
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * ***
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * **
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** * * * ** *
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*** * * ** *
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* * * * * ** * ****
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** * ** *
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*
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* * * * * *
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** * ** * * * *
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* * * **
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* *
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Statistics
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* *
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* * *
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* *
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* * * * *
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** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * *
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** * ** *
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257 TTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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130 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * *
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195 ACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAAT
** * * * * * *
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* * *
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TAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATT
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* **
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* * * ***
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* * * *
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* ** * * *
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* *
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*
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* *
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* *** ** * *
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*
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1 CAAATTGATTTA
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*
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1 ATAACTATT
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*
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1 ATAATGGTTTCAAATAG
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Statistics
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ATAATGGTTTCAAATAG
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* * ** * * *
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* * * ** *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** ** * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* ** ** ** ** * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
11343917 AGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGGCAAAATAAAATG-TCATAACGATTTAAAATAGATAA
256 TGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * ** * * *
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319 TTGTTTA-AATACTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAGTAACAT-GATTTATTTTTTAAATATTT
* * * * * * *
11344036 T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTATTTTGAACAAACTTATATAAA
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* * * * * *
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445 TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * *
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510 AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * *
11344227 TTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGAATAA--TTAGTATAAATTAAAAAAA
572 TTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA-TATGAACT--GAAAC
* * *
11344289 AACTTATTTTAATG-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT
633 AA-TTATTTT-ATGAC-AAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-T
* * *
11344353 -TAAATATTTGAA-TTGGTT-AGGTAAATAGA
694 ATAACTATTTGAACTT-GTTCA-GCAAACA-A
* * * * ** *
11344382 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
*** * * * *
11344445 TTGAATAA--TTAGTATAAATTAAAAAAAAAACTTATTTTAATG-CAAAACAAAAGGTCATAACA
65 CCAAATAAGCTT-GTAT-GA--ACAAAAACAA-TTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * ** *
11344507 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAA-TTGGTTTGACAAACAAATTTAT
124 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACATATTTAT
** * * * ** * * * * *
11344571 ACTTTAATTC-TCTTAGTTGTTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTTTTTTTATTCTAAA
188 TTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATATTTTAT-TTC-GAA
* * * * * * * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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315 ATAATTGTTTAAATACTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAGTAACAT-GATTTATTTTTTAAATA
* * * * * * * *
11344763 TCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGATTATTATTTCATTTCGAATAAGCTTGAATG
379 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTGTATG
* * * * * * * * *
11344828 -TTCA-AATATGATTGTTATATGACCAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTG
443 AAT-AGAA-ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * ** * * *
11344891 ATATGGCCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTA
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** * * * * *
11344952 AAATTTGAAATATTAATGAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAAT
571 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAT
* * * * * * * * *
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* * * *
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* * ** * *
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1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
** * ** * * * * *
11345168 CTGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAA-GTTATAATGAA-TTG
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* * * * ****
11345231 AAATAGATAATTGTTC--A-AG---T-A--A---GAACTGGTTCGATAAATGGCTTTATTTTTTA
129 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
* * * **
11345284 AATCTTGTACTTACTAATTTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGGATAGGCT
194 AATCTTCTACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTC-GAATAAACT
** * * * * * ** * *
11345348 TGTAT-AGGGAAAGATAATTGTTTTATGACAAAATACAAG-TCCCTAACAATTTG-AATACATAG
256 TGTATGA-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT-CATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * *** * * *
11345410 TTGTTCAAATGGC-CATAATTATTTGAAC-CAATTC-GATAA-ACTGACTTATTTTTTAAATCTC
319 TTGTTTAAAT-ACTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAG-TAACA-TGATTTATTTTTTAAATATT
** * * * * *
11345471 CAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TATGAA
381 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTGTATGAA
* * * * *** * * * * *
11345535 GT-GAAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAAGGTTATATTTATTTTAATTAAACAATTGTTCAAA
445 -TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * *
11345597 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCCA-TAAACATATGTT-TTTCTTAAATCTTTTACTTATT-A
509 TAGTCATAACTATTTGAACTTATT-CAGTAAACAAAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
*** * * * * * * * *
11345659 TTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAAATAAACTTGTATAAACAGAAACAT
572 TTT-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA
* * * * *
11345723 TTGTTTTATGACCAAACAACAAG-TCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTCATAA
635 TTATTTTATGA-CAAACAA-AAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA
** ** *
11345787 AGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
698 CTATTTGAACTTGTTCAGCAAACAA
* * ** * * *
11345812 ATTTATTTTCT-AAATCTTTTAT-GTATTAATTGTCTTAATATTAATACATTTGTTTTATTTTAT
1 ATTTATTTT-TAAAATCTTTT-TCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *
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64 TCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
* * * * * * * * **
11345939 TTAAATAGATAATTATTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATCCATTTTT
127 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTT
* * * * *
11346004 TAAATCTTTTGA-TTATTAATTTTTAGAATATTAATAACTTAGTATTGTTTTACTTT-GAATAAG
192 TAAATCTTCT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTA-TTTCGAATAAA
* * * **
11346067 CTTATGTGAATTGAAAAAC--TT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
254 CTTGTATGAA-T-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * * * *
11346129 ATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTA-ATCTAG-TTC-GATAAACAT-ATTTATTTTTAAAATT
317 AATTGTTTAAATACTAATAATTA-TTAGAACTTGCTTCAG-T-AACATGATTTATTTTTTAAATA
* * *** * * * *** *
11346190 TTTTAATTATTAATTATCAAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTAATCCAAATAAACTTGTATG
379 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGTTGTATG
* * * * * * * **
11346255 AATAGAAACT-ATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTAATTACAATTT-AAAGAAATAATTGCTCA
443 AATAGAAA-TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* *
11346318 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTT-TGATAAACAAATTTATCTTTTAAA--TC-T-CTTATT
507 AATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* ** * * * * * * **
11346377 AATTTTTGAAATATTAATAGTTTAGT-TTTTTTTATTCCAAACAAACTTATATAAACAAAAAC-A
570 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA
* * ** *
11346440 TTGTTTTATGACAAA-AGAAAAATGTTTTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
635 TTATTTTATGACAAACA-AAAGA--TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATA
* * *
11346504 ATTATTTGAACTAGTT-AGGCCAACTAA
697 ACTATTTGAACTTGTTCA-GCAAAC-AA
** * * * * ** *
11346531 A-TTATTTTTTGAATCTCTTCCATATAAATTTTTTAAATATTAATAAATTCA-TTTTA-TTTATT
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTA-T
** * * ** *** *
11346593 TCTGAATAAGCTAGAATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAGGGCAAAA----AT---GATTT
64 TCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * ** * *
11346650 GAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTA-TTGAAATTAGTTCGACAAACAAATTTAGTTTT
128 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACATATTTATTTTT
* * ** * * * *
11346714 TAAATC-TCTTAATTATTAATTTTTTAAATATTGTTATATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGC
192 TAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCGAATAAAC
* * * * * * * * * * * *
11346778 TTGTATAAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACGAAAGGTTAAAACGATTTGAACTATATAAT
255 TTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * * * *
11346843 TATTCATATAGTCATAACTATTCA-AACTAG-TTCGGTAA-ATATATTTATTCTTTAAA-A--CT
320 TGTTTAAATACTAATAATTATT-AGAACTTGCTTCAGTAACAT-GATTTATTTTTTAAATATTTT
** * *** * * *
11346902 -CTTATTAA-TTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTT-CATTGATT
383 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGTTGTA-TGAAT
* * * * ** * * * * *
11346964 AAAAATAAATGTTATATGACCAAACAAAAAATAATAACAATTTGAAATAAATAATTATTGAAACA
446 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * ** * * * * * * * ** *
11347029 GCCATAATTATTTTTACTAATTCAATAAATAGATTCATTTTTTAAATCACTTATTTACCAAATTT
511 GTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
*** * * *
11347094 CAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
576 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTT
* * * * *
11347159 CATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AGTAATTGTTCATATAGTCT-TAACTATT
641 TATGAC-AAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGT-TATAACTATT
* ** * * *
11347222 TAAACTACTTTAGTAAACAG
703 TGAACTTGTTCAGCAAACAA
* * ** ** * *
11347242 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * ** * * * * * **
11347307 TGAATAGGCTTATAAAAACTAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAA
66 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * *
11347372 ATAGATAATTGTTCAAATAG----GA--A-TT--A---GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
131 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* ** *
11347425 TCTTCTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG--TA--TTA-TTCTGAATAGGCTTGTG
196 TCTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATATTTTATTTC-GAATAAACTTGTA
* * * * * *
11347484 TG-ATGAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCCTAACGATTTGATATAGATAATTGTT
260 TGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * *** * * * *
11347548 CAAATAGC-CATAATTATTTGAAC-CAATTC-GATAA-ATTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACT
324 TAAATA-CTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAG-TAACA-TGATTTATTTTTTAAATATTTTACT
* * * * * * * * * *
11347609 TATCAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTCTATTTCGGATAACTAT-T-TAAATTGAA
386 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGT-TGTATGAATAGAA
* * * * * *
11347672 ATGATTGTTTTATTATAAAAGAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAG---------------GT-A
450 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
11347721 TAATTATTTGAACTGACTCAGTAGATAGAA-TTATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
515 TAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG
* * * * * * ** * * *
11347785 AATATTAATAAATTAGTTTTATTCT-TTCCTAAATAAACTTGTATGAGTTGAAATAATTTTTTTG
579 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTA
* * * *
11347849 TGACAAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCT-TAACTATTTCA
643 TGAC-AAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGA
* *
11347913 ACTAGTTCAGCAAACAG
706 ACTTGTTCAGCAAACAA
** * *
11347930 ATTTATTTTTTAAATATCTTAGT-TT-TTAATTTTCAAAA-ATTTACTAAATTAATATTATTTTA
1 ATTTA-TTTTTAAA-ATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * ** * * * * *
11347992 ATCCAAATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATTGTTTTGTGATAGAACAAAAGGTTAAAACAATTT
63 TTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* ** *
11348057 GAAAT-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT
128 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTT
*
11348121 CAAA---TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACT
193 -AAATCTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCGAATAAACT
* * * * * *
11348182 TGTATG-TTGAAAAACAAATGTTTTATGACAAAACACAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGT
256 TGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * *
11348246 TGTTTAAATGGC-CATAATTATTCA-AA-TTGATTTAGCAA-ATTGATTTATTTTTTAGATATCT
320 TGTTTAAAT-ACTAATAATTATT-AGAACTTGCTTCAGTAACA-TGATTTATTTTTTAAATATTT
* * * * * *
11348307 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTACGAAC
382 TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGTTGTATGAA-
* * * *
11348372 TA-AAATAATTGTTTTATGCCAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTTAAATAAATAATTATTCAAAT
445 TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* *
11348436 AGTCATAATTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATT
510 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * *
11348501 TTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTATAAACTGAAAGAATTAT
574 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTAT
* * * * *
11348566 TATATGACCAAACAAAATATCAAAACAATTTTAAATAGATAATTATTCTAATAGTT-TAACTATT
639 TTTATGA-CAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATT
*
11348630 TGAACTGGTTCAGCAAACAA
703 TGAACTTGTTCAGCAAACAA
* ** *
11348650 ATTTAATTTTT-AAATC----TGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TA
1 ATTT-ATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-
* * *
11348709 TCCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAATAA--TCATAACAATTT
64 TCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACAATTT
* ** * * * ** * * *
11348772 GACATTTATAGTTGTTCAAATAGTAACAA-TATTTGAACTAATTCT-GAAAACATCTTTAGTTTT
128 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAACATATTTATTTTT
* * * * * **
11348835 TAAATC-TCTTACTTATTAATTTTCAAACTATTAATAAAATAGCATTATTTT-TTT-GGATAAGT
192 TAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCGAATAAAC
* * ** ** * ** * *
11348897 TTTTATGAGTTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTCATAACAACTTGAAATTGATAAA
255 TTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGAT-AA
* * * * * *
11348962 TTATTCAAATAGTAA-AATATATTTGAACTTG-TTTAGTAAACATG-TTTATTTTTTTAAATCTT
319 TTGTTTAAATACTAATAAT-TATTAGAACTTGCTTCAGT-AACATGATTTA-TTTTTTAAATATT
* * * * *
11349024 TTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAACAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
381 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTGTATGAA
* ** * * * * *
11349089 TTGAAATAATTGTTTTATGAGTAAACAAAATGTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTCTAAT
445 TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * ** * * * *
11349154 AATCTTAACTATTTGAACTGGTTC-GACAAACACATTTATTTTTTTAATCTCTTATTTATTAATT
510 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * **
11349218 TTTGGAATATTAGTAAATTAG------------T--AATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTAT
574 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTAT
* * * * *
11349269 TTTATGACAAA-ATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCATAGCTATT
639 TTTATGACAAACA-AAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATT
* * ** * * *
11349333 T-AAATTATTTTGGGACACAT
703 TGAACTT-GTTCAGCAAACAA
* *
11349353 ATTTATTTTTTAAATC----TCTTATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TC
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * *
11349413 CTAAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAACGGGCATAACAATTTGA
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* ** * * * *
11349478 AATAAACAATTACTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAT-TTTATTTTTTAA
130 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * *
11349542 ATCTTCTACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATATTTTATTTTGAACAAACTTGTA
195 ATCTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATATTTTATTTCGAATAAACTTGTA
* * *
11349607 TGAATAAAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAACTGTT
260 TGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
11349671 TAAATACTAATAACTATTAGAATTTGCTTCA-TAACTTAGATTGATTTTTAAAATTTTTTACTAA
324 TAAATACTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAGTAACAT-GATTTATTTTTTAAATATTTTACTTA
*
11349735 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTAGAATAAGTTGTATGAATAGAAAT
388 TTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTGTATGAATAGAAAT
* * * * * * * * *
11349799 AATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGATCATAATGGTTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATA
452 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** * * **
11349864 ACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTT-TTTTAAAAATCCCTTACTCATTAATTTTCAGAAT
517 ACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAAT
* * * * *
11349928 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGACCTGATACAATTGTTTTATGAC
582 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATGAC
* * **
11349993 -AACAGAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGT
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** * *
11350057 TTGGTAAACAT
712 TCAGCAAACAA
* * * *
11350068 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAGTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * *
11350133 CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAA
66 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * *
11350198 ATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATATATATTTTTTAAA
131 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* ** *
11350263 TCTTTTACTTATTAATTGCCT-AAATATTAATAAATTAGTAT-TATTTATTTCGTAATAAACTTT
196 TCTTCTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATAT-TTTATTTCG-AATAAACTTG
* * * * * *
11350326 TATGAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACATATGAT-TTAAATGATTTGAAATAGATAATTA
258 TATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** *
11350390 TTTAAATAATCATAATTATTTGAACTCAC-TCAGTAA-ATAGATTTATTTTTTTAATCATTTTAC
322 TTTAAATACTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAGTAACAT-GATTTATTTTTTAAAT-ATTTTAC
* * * * * * *
11350453 TTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATATATTTTTATGAACAAA
385 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGTTGTATGAATAGA
* * *
11350518 AACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAATTAGTC
449 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * ** * * * *
11350582 A-AACTATCTGAACATGTTCAAAAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTTATTTATTAA---TTGG
514 ATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG
* * * * *
11350642 AATGTTAATAATTTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
579 AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTT
** * * *
11350705 ATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAATTATTTG
642 ATGAC-AAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * *
11350769 AACATGTTCAGTAAATAA
705 AACTTGTTCAGCAAACAA
** * * * * * * * *
11350787 ATTCCTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * *** * ** *
11350852 CAAATAAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
66 CAAAT-AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * * * * *
11350917 AGTAGATAATTATTCAAACAGTTATTATTATTTGAACTTGTTAGGTAAACATATTTA-TTTTTAA
130 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * * * * *
11350981 ATCTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGT
195 ATCTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCGAATAAACTTGT
* * * * * *
11351046 ATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTGATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
259 ATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
*
11351110 TCAAATA
323 TTAAATA
11351117 ATCATAACGA
Statistics
Matches: 5813, Mismatches: 1270, Indels: 727
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
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ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
TCTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT
GAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTA
AATACTAATAATTATTAGAACTTGCTTCAGTAACATGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTA
ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTGTATGAATAGAAATAATT
GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
TTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAC
AAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAG
CAAACAA
Found at i:11351725 original size:180 final size:180
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11351261 TAAATCGATT
* **
11351271 CATTTT-TAAATCTC-TTACTTCTTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCA
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* *
11351399 GATAATTGTTTAAACAGTCATAATTGTTTGCATTAGTCAGGCCAACAGATA
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*
11351450 CATTTTCTAAATCCGTTACTTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAAAATTATGTTATTCCAA
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*
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* *
11351580 ATAATTGTTCAAACTGTCATAATTGTTTGCATTGGTCAAGCCAACAGATA
131 ATAATTGTTCAAACAGTCATAATTGTTTGCATTAGTCAAGCCAACAGATA
*
11351630 CATTTTCTAAATCCGTTACTTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAGTATTACT-TTATTCCA
1 CATTTTCTAAATCCGTTACTTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAGAATTA-TGTTATTCCA
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65 AATAAG
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ATAAGTTTGTACGAATAGAAACAATTATTTTGGGACAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAG
ATAATTGTTCAAACAGTCATAATTGTTTGCATTAGTCAAGCCAACAGATA
Found at i:11351857 original size:181 final size:181
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* * * * * *
11351178 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAGCAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGC-CA-
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* * * * ** * * ***
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* * * ** * * * *
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** * * ** * * * *
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1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTTATA
* * * * ** * * * ** *
11351421 ATTGTTTGCATTAGTCAGGCCAACAGATACATTTTCTAAATC-CGTTACTTATTAATTTT-AAGA
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** * * ** * * * *
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* *** * **
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1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACT-T-A
* * * * * *** * * * ** *
11351599 TAATTGTTTGCATTGGTCAAGCCAACAGATACATTTTCTAAATC-CGTTACTTATTAATTTT-AA
64 TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTCAA
* *
11351662 GAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGACTGTATA-AGTATAAAT
128 -AATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTACGAATAA-ACTGTATAGAGTATAAAT
* * ** * *
11351717 AATTATTTTATGATAAAACCAATGGTCATAATGA-TTGAAAATAAATAAATGTTCAAATACTTAT
1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATACTTAT
* * * *
11351781 AACTAATTGAACTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTCAAAA
65 AACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAA
* * *** * ** * *
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* * * **
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1 AATTATTTTATGATAAAAC-----A-A-AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * *
11351963 AGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
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** * * *** *
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* * * * ** * * *
11352086 AATTGTTTTATAACAAAATAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGCCT-T
1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-CTTAT
* * * * * * *
11352150 AACTATTTGTAGTGGTTTGGCAAA-AAATTTATTTATTAAAATCTGTTAATTATTAATTGTCAAA
65 AACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA
* * * * * ** ** *
11352214 ATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTA-AGAACAAAAAT
129 ATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTACGAATAAAC-TGTATAGAGTATAAAT
* * * * * * *
11352267 AATTATTTTATGATAGAATAAAAAGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTTATA
1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTTATA
* * *** * * **
11352332 ATTATTTAAACTAGTTTGATGAATAGAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGAAA
66 ACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAA
* *
11352396 TATTAATAAATTAGT-TTAACTTTATTATGAATAAACTTGGAT-GAGT-TAAAAT
130 TATTAATAAATTAGTATT-ACTTTATTACGAATAAAC-TGTATAGAGTAT-AAAT
* * * *
11352448 AATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCATATAATCTTA
1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-A-CTTA
* * * ** * * * *
11352513 -AA-TGTTTGAACTGGTTTGACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATGAATTTTCATA
64 TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA
* * * * * ** *
11352576 ATATTATTAATTTAGTATTATTTTGTTCCGAATAAACT-TATATGAACAGAAAT
129 ATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTACGAATAAACTGTATA-GAGTATAAAT
* * * * * *
11352629 AATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATA
1 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTTATA
* * * ** * *
11352694 ACTATTTGAATTAGTTTAGTAAGCAAATTTATTTTTTGAATCTCGTACT
66 ACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
11352743 GATTCATGAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTTATA
ACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAAT
ATTAATAAATTAGTATTACTTTATTACGAATAAACTGTATAGAGTATAAAT
Found at i:11352333 original size:18 final size:19
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
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*
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11352328 TATAATTATTTAAACTAGT
1 TATAATTATTTAAACTAGT
11352347 T
1 T
11352348 TGATGAATAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (19 bp):
TATAATTATTTAAACTAGT
Found at i:11352728 original size:362 final size:356
Alignment explanation
Indices: 11351631--11352768 Score: 1159
Period size: 362 Copynumber: 3.1 Consensus size: 356
11351621 CAACAGATAC
* * ***
11351631 ATTTTCTAAATC-CGTTACTTATTAA-TTTTAAGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCA
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* * * * * *
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* * * *
11351756 AATAAATAAATGTTCAAAT-ACTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTA
125 AATAGATAATTGTTCATATAACTTA-AA-TATTTGAACTGGTTTGGCAAA-AAATTTATTTTTTA
* * * * ** *
11351820 AATATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTTAACAAACTTA
187 AATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATT-ATTAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTA
* * * * * **
11351885 TACGAACAAAAACATTTGTTTTATGATAAAACAAAAAACAGAAGGTAATAATGATTTGAAATAGA
251 TAAGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAAC-----A-A-AAGGTTATAACAATTTGAAATAGA
* *
11351950 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAGAATT
309 TAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTT-G-TAATAGAATT
*
11352000 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGATTTACTTTATTATGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TTTACTTTATTATGAA
** * * * **
11352065 T-AGGTTAGTAAGAGTTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAATAAAATATCATAACGATTTGAAAT
65 TAAACTT-GTATGAGTT-AAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
11352128 AGATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGTAGTGGTTTGGCAAAAAATTTATTTATTAAAATC
128 AGATAATTGTTCATATA-ACTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAAAAATTTATTT-TTTAAATC
* * ** *
11352193 TGTTAATTATTAATTGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTAAG
191 TCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTATTA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATAAG
* * * *
11352258 AACAAAAATAATTATTTTATGATAGAATAAAAAGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAA
255 AACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAA
* *
11352323 ATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTTGATGAATAGAATT
320 ATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTG-T-AATAGAATT
* *
11352362 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTAACTTTATTATGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTT-ACTTTATTATGAA
* *
11352427 TAAACTTGGATGAGTTAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
65 TAAACTTGTATGAGTTAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * ** *
11352492 ATAATTCTTCATATAATCTTAAATGTTTGAACTGGTTTGACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTT
130 ATAATTGTTCATATAA-CTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * *
11352557 TTAGTTATGAATTTTCATAATATTATTAATTTAGTATTATTTTGTTCCGAATAAACTTATATGAA
193 TTAATTATTAATTTTCAAAATATTATTAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATAAGAA
*
11352622 CAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
257 CAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
* * *
11352687 AGTCATAACTATTTGAATTAGTTTAGTAAGCA-AATTT
322 AGTCATAATTATTTGAACTAGTTT-GTAA-TAGAA-TT
* * * *
11352724 ATTTTTTGAATCTCGTACTGATTCA----TGAAATATTAATAAATTAGT
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
11352769 GTTATTTGAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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363 13 0.02
364 1 0.00
368 15 0.02
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370 15 0.02
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (356 bp):
ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTACTTTATTATGAAT
AAACTTGTATGAGTTAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
TAATTGTTCATATAACTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
ATTATTAATTTTCAAAATATTATTAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATAAGAACAAA
AATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
ATAATTATTTGAACTAGTTTGTAATAGAATT
Found at i:11352896 original size:67 final size:67
Alignment explanation
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Period size: 67 Copynumber: 2.1 Consensus size: 67
11352762 AATTAGTGTT
* * * *
11352772 ATTTGATTTCAAAAAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTGTTTTATGACACAACGAAAGATACTAA
1 ATTTGATTTCAAAAAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTCTTCTATGACAAAACGAAAGATAATAA
11352837 TG
66 TG
* * * * * *
11352839 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTCTTCTATGACAAAATGAAAGGTAATAA
1 ATTTGATTTCAAAAAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTCTTCTATGACAAAACGAAAGATAATAA
11352904 TG
66 TG
11352906 ATTTGA
1 ATTTGA
11352912 AATAGATAAT
Statistics
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TG
Found at i:11354600 original size:15 final size:15
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Indices: 11354580--11354611 Score: 55
Period size: 15 Copynumber: 2.1 Consensus size: 15
11354570 AGAAAATAAA
*
11354580 TTTATTTTTTAAATT
1 TTTATTTATTAAATT
11354595 TTTATTTATTAAATT
1 TTTATTTATTAAATT
11354610 TT
1 TT
11354612 GAAATATTAA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 0
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Consensus pattern (15 bp):
TTTATTTATTAAATT
Found at i:11355022 original size:363 final size:360
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Indices: 11352956--11355375 Score: 882
Period size: 363 Copynumber: 6.7 Consensus size: 360
11352946 AACTGATTTG
* * * ** * *
11352956 GTAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATT-ATAAAGTAGTATTA
1 GTAAACAAATATATTTTTTAAATTTCTTACCAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTA
**** * * * * * * * *
11353020 TTTTATTTTGGATAAACTTTTGTGAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTCATAA
66 TTTTATTCCAAACAAACCTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAA
* * * * * * * * * *
11353084 CGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTAAACTTGTTCGGTAATCAGATTTA
130 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACATGTTCAGAAAACA-AATTC
* * * * * ** * *
11353148 ATTTTTCAAATCTTTCACTTATTAATTGTTTGAAA-GTTAATATATTTGTATTATTTTCTTTCAA
194 ATTTTTTAAATCGTT-ACTTATTAAAT-TTTGAAATATTAATAAATTTACATTACTTTATTTCAA
* ** ** * * *
11353212 ATAAG-CTTATATGAATTGAAACAATTA-TTTTAT-AACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAA
257 ATAAGAC-TGTATGAACAGAAACAA-TAGTTTTATGAAAAAAACAAATGGTCA-TA-GATTTGAA
* * * * * * * * ** * *
11353274 ATAGATAATTATTCTAATAGTCTTGACTATTTGAATTGATTC-
318 ATAAAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTAAACCGCTACA
* * * * ** ** * **
11353316 G-ACATAAACAT-TTTTTTAAA-ATCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTGGTATTA
1 GTAAACAAATATATTTTTTAAATTTCTTACCAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTA
* * * * * * * * * *
11353376 TTTT-TATCCAAATC-AGCTTGTATGATCAGAAATAATTGTTTTATGAAAAAACAATTA--TCAT
66 TTTTAT-TCCAAA-CAAACCTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCAT
* * * * * * * *
11353437 AACGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGGTTCAGAAAATAACT
128 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACAT-GTTCAGAAAACAAAT
* * * * * * * ** *
11353501 TCA-GTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAA-GTAGTATTGTTTTATTTT
192 TCATTTTTTAAATC-GTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTTA-CATTACTTTATTTC
** ** * * * * * * * *
11353564 GGATAAGGTTTTATGAACTA-AAATAATTGTCTTATGACAAAAAA-AAAAGATCAAAATGATTTT
255 AAATAAGACTGTATGAAC-AGAAACAATAGTTTTATGA-AAAAAACAAATGGTC-ATA-GATTTG
* ** * * * *
11353627 AAATAGATTATTGTT-AAATAGTCATATCTAATTGAACTTG-TTCA
316 AAATAAAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTAAAC-CGCTACA
* * * * * * ** *** * *
11353671 ATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTATTATT
1 GTAAACAAATATATTTTTT-AAATTTCTTACCAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * ** * * * * * * *
11353736 ATTTTATATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAATATTTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTAA
65 A-TTT-TATTCCAAACAAACCTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * *
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*** * *** * * * * ** *
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* * * * * * ** * * * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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316 AAATAAAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTAAACCGC-TAC-A
* * * * ** * **
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1 G-TAAACAAATATATTTTTTAAAT-TTCTTACCAATTAATTT-TCAAAATATTAATAAATTAA-T
* *** * * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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191 TTCATTTTTTAAATCGTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTTACATTACTTTATTTCA
** * *
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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1 GTAAACAAA---TATATTTTTTAAATTTCTTACCAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAAT-
* * * *** * *
11354814 A-TATTTTATTTCAAATAAGCCTATATAAATGGATATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
62 ATTATTTTATTCCAAACAAACCTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * **
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127 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACAT-GTTCA-GAAAACAA
*
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190 ATTCATTTTTTAAAT-CGTTACTTATTAAATTTTGAA-ATATTAATAAATTTA-CATTACTTTAT
* *
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252 TTCAAATAAGACTGTATGAACAGAAACAATAGTTTTATGAAAAAAACAAATGGTCAT-A-GATTT
* * * **
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315 GAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTAAACCGCTACA
***
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1 GTAAACAAATATATTTTTTAAATTTCTTACCAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTA
* * * * * *
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* *
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* * * * *** *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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** ** * ** *
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* * * * * ** * *
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** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *** * * *
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* ** *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * ** *
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* * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * ** *
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * ** * * * * *
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** * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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*
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* **
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*
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128 CATAACTATTTGAACT
11355814 AATTTGATAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AACTATTTGAACTGGTTTAATAAGAAA
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
11355852 ATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTTTTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAATTGAAA
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* * *
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* * ** * **
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* *** ** * * * *
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1 ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAA
* * * * * * * ** * *
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* * * *
11356162 TAACTATTTAAACTGGTTCG-TCAAACA-A-TT-TTTTTAAAAT-C-T--TT
130 TAACTATTTGAACT-GTTTGAT-AAATAGATTTATTTTTTAAATACTTACTT
* ** ** * *
11356206 ATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTTTGAATAGAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA
*** * * * *
11356271 CAATTGTTTTGCAACAAAAAAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACA
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCA
* * * * *
11356335 TGACTACTTGAACTCGCTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAAT-CTTTTACTT
130 TAACTATTTGAACT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATAC--TTACTT
* * * * * * * * *
11356387 ATTAATTTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTAGTATTTCATTCTGAATATGCTTTTATGAACAT-A
1 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TTGA
* * * **
11356451 AACAAGTGGTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * **
11356516 CATAAACTATTTGAA-TGTGT-ACAGGAAGTAGATTTATTTTTTAAAATTTTTACTT
128 CAT-AACTATTTGAACTGTTTGATA--AA-TAGATTTATTTTTT-AAATACTTACTT
* * * * *
11356571 ATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTTATATTATATTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATTGAA
* * * * * * * *
11356635 TCAATTGTGTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGAGAGTCA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * ** *
11356700 TAACTATTTAAACT-TGTTCAGTAAATAGATTCGTA-TTTTTAGTTCACTTACTC
130 TAACTATTTGAACTGT-TTGA-TAAATAGATT--TATTTTTTAAAT-ACTTACTT
** * * ** * * * *
11356753 ATTAATTTTTGTTATATTAATAAATTAATGTTTTTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAACTAAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA
* * * *
11356818 CAATTGTTGTA-GTACAAACCAAAAGGTTACAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
66 CAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * *
11356881 TGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAATATTTGTTTTTTAAATATTTTACTT
130 TAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATA-CTTACTT
* * * * * *
11356933 ATTAATTGTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTAATTGGAATAAGCATGTATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA
*
11356998 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
11357030 CAATTCTGTT
Statistics
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ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAACTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATACTTACTT
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* * * * * *
11355671 ATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAGGCTTGTATG-A-TGAC
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* * * * * * *
11355733 AAACAATTGTGTTGTGACAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCATATGGC
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* ** * * * * *
11355798 CATAATTATTTGAACTAATTTGAT-AAACTGATTTATTTTTTAAATCACTAACTTATCAATTTTT
128 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAT-ATTTATTTTTTAAA--ATTTACTTATTAATTTTT
* * * *
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* * * * *
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* * * **
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319 AACTTGTTC-GTAAATAAATTTA--TTTTTATTCTCTTACTT
* * * * *
11356033 ATTAATTTTCTG-AATGTTAATAAATTAGCGTTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGGACTAAA
1 ATTAATTTT-TGTAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAA
* * * * * * ** * *
11356097 ATAATTATTTTTTGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAATCT
65 ACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * *
11356162 TAACTATTTAAAC-TGGTTCGTCAAACA-A--T-TTTTTTAAAATCT--TTATTAATTTTTGAAA
130 TAACTATTTGAACTTGTTTGGT-AAAAATATTTATTTTTTAAAATTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** * ** * ***
11356220 TACTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTGCAA
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* * * * * *
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259 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-GAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
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323 TGTTCG-TAAATAAATTTA-TTTTT-ATTCTCTTACTT
* * * * *
11356387 ATTAATTTTT-TAGAATTTTAATAAATTAGTAG-TATTTCA-TTCTGAATATGCTTTTATGAAC-
1 ATTAATTTTTGT--AATATTAATAAATTAGT-GTTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAACT
* * * **
11356448 ATAAACAAGTGGTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAATAGATAATTATTCAAAT
62 A-AAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTG-AAATAGATAATTATTCAAAT
** ** *
11356513 AGTCATAAACTATTTGAA-TGTGTACAGG-AAGTAGATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAA
125 AGTCAT-AACTATTTGAACT-TGT-TTGGTAAAAATATTTATTTTTTAAAA--TTTACTTATTAA
* * * * * * *
11356576 TTTTTGAAATTTTAATAAATTTATATTATATTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAATCAATT
185 TTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * * * *
11356641 GTGTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGAGAGTCATAACTA
250 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTA
* * * *
11356706 TTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCGTATTTTTAGTTCACTTACTC
315 TTTGAACTTGTTC-GTAAATAAATT--TATTTTTA-TTCTCTTACTT
* * * *
11356753 ATTAATTTTTGTTATATTAATAAATTAATGTTTTTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAACTAAAA
1 ATTAATTTTTGTAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAA
* * *
11356818 CAATTGTTGTAGT-ACAAACCAAAAGGTTACAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
66 CAATTGTT-TTGTGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
11356881 TGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAATATTTGTTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTTGAA
130 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAATATTTATTTTTTAAA-A-TTTACTTATTAATTTTTGAA
* *
11356946 ATATTAATAAAGTAATATTATTTTAATTGGAATAAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
193 ATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
*
11357011 ACAAAACAAAAAGTCATAA
258 ACAAAACAAAAGGTCATAA
11357030 CAATTCTGTT
Statistics
Matches: 786, Mismatches: 169, Indels: 84
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
ATTAATTTTTGTAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAA
CAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAATATTTATTTTTTAAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAAGTAATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTTGT
TCGTAAATAAATTTATTTTTATTCTCTTACTT
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11357496 GTAATGAATC
11357506 ATTATTGAACAAAATA
1 ATTATTGAACAAAATA
11357522 ATTATTGAACAAAATA
1 ATTATTGAACAAAATA
11357538 ATT
1 ATT
11357541 GTCACAAAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTATTGAACAAAATA
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Indices: 11357735--11358460 Score: 581
Period size: 181 Copynumber: 4.1 Consensus size: 177
11357725 TTCAAATCTA
* * *
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1 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGATGTTATGACC
**** * * *
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66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATACAAG-TCAT-AAAG-TTATTCAATGAAAATAATATAAAT
* * *
11357865 TTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATATG
128 TTACTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * *
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1 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGATGTTATGACC
* *
11357979 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATACAAG-C-T-TA-TTA-TGAA-GAAAATAATATAAATTTA
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATACAAGTCATAAAGTTATTCAATGAAAATAATATAAATTTA
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131 CTAATATTCCAACA-ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * *
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1 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGAT-GTTATGAC
* * * * * * * *
11358148 CTTTTGTTTTATCATAAAAAAAATTGTTTCTATTCATAAAGCTAATTTAGAAT-AAAATAATACT
65 CTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-ATACAAGTCATAAAG-TTA-TT-CAATGAAAATAATA-T
* * * * * *
11358212 -AATTTATTAAAATTTCAA-AACTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTA
124 AAATTTACTAATATTCCAACAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
**** * * * * * * *
11358265 TTTACTGGGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAA-ATCATTATGAT
1 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGAT-GTTATGAC
* * * *
11358329 CTTTTGTTTTGTAATAAAACAA-TAGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCAAAAT-AAAATAATAC
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA--TACAAGTCATA-AAG-TTATTC--AATGAAAATAATA-
* * * *
11358392 T-AATTTATTAATATTTTCAA-AATTAATAAGTTAAAA-ATTTTAAAAATAAAAATG
123 TAAATTTACTAATA-TTCCAACAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* *
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1 TTTACCAAATAAGTT
11358461 AAACAGTCAT
Statistics
Matches: 450, Mismatches: 72, Indels: 47
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGATGTTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATACAAGTCATAAAGTTATTCAATGAAAATAATATAAATTTA
CTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
Found at i:11358739 original size:176 final size:176
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Indices: 11358021--11358772 Score: 603
Period size: 181 Copynumber: 4.2 Consensus size: 176
11358011 TATTATGAAG
* ** * * *
11358021 AAAATAATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGT
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AAGATTT-AAAAATAAATCTGT
* * * * *
11358085 TTTCT-AAATATGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
62 TTACTGAACTA-GTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATGATC
* * * * *
11358149 TTTTGTTTTATCATAAAAAAAATTGTTTCTATTCATA-AAGCTAATTTAGAAT
125 TTTTGTTTTATCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
* * * * *
11358201 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAACTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AAGATTT-AAAAATAAATCTGT
** * * * *
11358266 TTACTG-GGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATC
62 TTACTGAACT-AGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATGATC
* * * * **
11358330 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATAGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCAAAAT
125 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
* * **
11358382 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGTTAAAAATTTTAAAAATAAAAATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AAGA-TTTAAAAATAAATCTGT
* * * * * * *** * *
11358447 TTACCGAACAAGTTAAACAGTCATGTCAATTTGAATTTTTATCTATTTCAAAT-TGT-T-ATAAT
62 TTACTGAACTAGTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATGAT-CT
** * *
11358509 TTT-TTTTATTGTAAAACAACTATTTCTATTCATACAAA-TTATTCAAAAT
126 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
*
11358558 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AGATTCAAAAACTAAATCTGTTTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTA
* * *
11358622 CTGAACCTA-TTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTAT-TATCTCAAATTAGAATGATC-T
65 CTGAA-CTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCAGTATGATCTT
* * * ** *
11358684 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCAAACAAACTTATTCGGAGT
127 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
* * ** * *
11358734 AAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
11358773 CATTTATGAC
Statistics
Matches: 462, Mismatches: 93, Indels: 38
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (176 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTAC
TGAACTAGTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATGATCTTTTGT
TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
Found at i:11359285 original size:181 final size:182
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 16.0 Consensus size: 182
11358879 GCTAAACCAA
* *
11358889 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACTAGTTCAA
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * *
11358953 ATAGTTAAGACTATTAGAAC-ATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA
65 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** * *
11359017 TAATTG-TTCA-GTTCATACATGCTTATTAAAAATAAAATAATTCTATTTTAT
130 CAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * *
11359068 TAACATTAAAAAAATTAATAAAGAAAGA-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAACAAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
* ** * * * * * *
11359132 AATAGTTATAACTATTCAAACAATTATCTATTTAAAATTATTGTGGCCTTTTTTTTTATCATAAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* *** * *
11359197 ACAATTGTTTCAT-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTAT
129 ACAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * *
11359250 TAATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAAAAAAT-TAGTTTATCAAATCAA-TTC
1 TAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAA-CAAGTTC
* * * * * * * * *
11359312 AAATTGTTATGGCCATTTGAACAGTTATCTATTTGAAATCATTTTGAACTTTTATTCTGTCATAA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
11359377 AACAATTGGTGTTCA---TCTTACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
128 AACAATT-GT-TTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *** *
11359431 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA--T------T--ATCTATTTATTGAACCAGTTCAAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * * *
11359486 TAATTTTGACTATTTGAACAATTATATATTTTAAGTCATTATAATCTTTTGTTTTATCATAAACC
66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
11359551 AATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAA
131 AATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
11359602 TAATATTAT-GAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TTCA
1 TAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCA
* * * * ** *** *
11359665 AATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATC-GCATGTTATTTTGTTTTGTTATAAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
11359729 ACAAATGTTT-TTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTAT
129 ACAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
11359782 TAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAATCCAGTTCAAT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * * *
11359843 TAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCATATCGTTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAAT
66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * *
11359908 AATTGTTTC-TATTGATACAATCTTATTTGGAATAAAGTATTGCTAATTTAT
131 AATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * * * *
11360201 ATAGTCATAACTCTTTGAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATCACCCTTTTGTTTTGTCATAAA
65 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
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129 ACAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
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1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * *
11360383 TAGTTATGACTATTTCAACAAATATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTTT-TCATAAAAC
66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** *
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* **** *
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* * * * *
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128 AACAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *** *
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* * * * * *
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66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** *
11360805 CAATTGTTTC-TATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAT
130 CAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * **** *
11360857 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT-AGTAAATTTAAAAAATGAATTTGTTTATTGGACAAGTTGA
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * * * *
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* * * ** * *
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** * ** *
11361037 TAATATTTTGAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTGAAAGCTAGATCTATTTACCATAAC-AG-TCAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAA
* * * * *
11361096 ATAG-TAGTGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGA
65 ATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
11361159 ACAATTATTTC-T-TTCCATAAAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTT-T
129 ACAATTGTTTCATGTT-CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** **
11361211 ATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCGGTTCA
1 -TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
* * * * *
11361276 AAT-GATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCCA-A
64 AATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CATA
* * *
11361339 AAACAATTATTTCA-GTTCATACAAGATTATTTGAAATAAAA-AATTACTACTTTAT
127 AAACAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TACTAATTTAT
* * * * * ** * *
11361394 TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAACTAAAACTATTTTCTGAACTAGTTCAAG
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * ** * * *
11361459 TAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCCCAAATCATTATGATC-TTTGATTTCTCATAAAAC
66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
11361523 AATTATTTCTTG-TCATCCAAGCTTATTTG-GATAAAAATAATACTAATGTAC
131 AATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
11361574 TACTATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTTAAAAAAT--ATATGTTTACCGAACTAGTTCAAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * ** * ** * *
11361634 TAGTTAAGACTATTAT-AATAGTTATCTGTTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTCATTATATAA
66 TAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
11361698 TAATTATTTTA-ATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATCTAT
130 CAATTGTTTCATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
*
11361750 TAACATTT
1 TAATATTT
11361758 TTTTATTTCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
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Found at i:11360354 original size:359 final size:359
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* * * * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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** * * ** * **
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* * * **** * *
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* *** ** * *
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* **** * * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * **
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319 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATACCCT
* * * * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
* * *** * * * * ** **
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66 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATTCATTACCT-AA-CAAGT
* ** * * * * *** *
11359662 TCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCG-CATGTTATTTTGTTTTGTTAT
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* * * *
11359726 AAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
194 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
* * *
11359791 AAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAATCCAGTTCAATTAGTTATAAC
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* * * * *
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* * * * * *
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1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
** ** * * * *
11359955 TTATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATTCGTTGGCCTAACTAGTG
66 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATTCATT-ACCTAACAAGTT
* *
11360020 CAAATAGTTATGATTGTTTGAA-TATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
130 CAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
11360084 AAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTCATTTATTAATATTTTG
195 AAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTA
* * * * *
11360149 ATAGTTGATAAGTAAAGGATTTTAAAAATAAA-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACT
260 AAAATTAATAAGTAAA-GATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT
* *
11360213 CTTTGAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATCACCCT
324 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCCT
* * * * ** *
11360250 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATCAATTCAT-TAGGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
* * * *
11360314 TTATTAACATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATGAA-TCTATTTACCGAACAAAT
66 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATTC-A-TTACCTAACAAGT
* * * * *
11360378 TCAAATAGTTATGACTATTTCAACAAATATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTTT-TCAT
129 TCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
11360442 AAAACAAACGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-G-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTC
194 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
* * **** * *
11360505 AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAGCACA-TTCAAATAGTTATGA
259 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATAA
* * *
11360569 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT
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* * * * *
11360608 TTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTTGGAATAAATTAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
11360673 TTATTATTATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAACAAATAAATTTATTTA-TTGAACAAGT
66 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATTCA-TTACCT-AACAAGT
* * * * * *
11360737 TCAATTAGTTATGATTGTTT-AACAACTATTTATTTAAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCAT
129 TCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * ** *
11360801 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCT
194 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
* **** * *
11360866 AAAAATTAATAAGTAGTAA-ATTTAAAAAATGAATTTGTTTATTGGACAAGTTGAAATAGTT-TG
259 AAAAATTAATAAGTA--AAGATTTAAAAAAT-AAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA
* * *
11360929 TCCATTTGAATAATTATCAATTTCAAATCGTTATGA-CCT
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* * * * * ** * *
11360968 TCTATTTTGTTATAAAACAATTGTTACTATTCATGCAAAATTATTTAGAATTAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
* *** * * **
11361033 CTATTAATATTTTGAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTGAAAGCT-AGA-TCTATTTACCATAAC-A
66 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGA-ATTC-A-TTACC-TAACAA
* * * * * * *
11361091 G-TCAAATAG-TAGTGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGT
127 GTTCAAATAGTTA-TGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
11361153 CATAGAACAATTATTTCTT-TCCATAAAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTT-TATAAT
191 CATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAT-TAAT
** * * ** **
11361216 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCGGTTCAAAT-G
254 ATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * *
11361280 ATTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGA-CCT
316 -TTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCCT
* * * *
11361325 TTTGTTTAGTCCA-AAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGATTATTTGAAATAAAA-AATTACT
1 TTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA-TACT
* * * * ** **
11361387 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAACT-AAAACTATTTTCTGAAC
63 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATGAATTC-ATTACCT-AAC
* * * * * * ** * * * *
11361450 TAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCCCAAATCATTATGATC-TTTGATTTC
125 AAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
11361514 TCATAAAACAATTATTTCTTG-TCATCCAAGCTTATTTG-GATAAAAATAATACTAATGTACTAC
190 TCATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAA
* * * *
11361577 TATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTTAAAAAATATA-TGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGT
253 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
11361638 TA-AGACTATTAT-AATAGTTATCTGTTTCAAATTGTTTTGA-CCT
317 TATA-ACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ACCCT
** * * * * *
11361681 TTTGTTTCATTATATAATAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
*
11361745 TCTATTAA
65 TTTATTAA
11361753 CATTTTTTTA
Statistics
Matches: 2040, Mismatches: 445, Indels: 179
0.77 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
347 3 0.00
348 2 0.00
351 83 0.04
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353 4 0.00
354 9 0.00
355 107 0.05
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357 382 0.19
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364 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATTCATTACCTAACAAGTTC
AAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAA
AAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT
TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATACCCT
Found at i:11361916 original size:158 final size:158
Alignment explanation
Indices: 11361627--11361916 Score: 370
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11361617 TACCGAACTA
* * * *
11361627 GTTCAAATAGTTAAGACTATTATAATAGTTATCTGTTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTCATT
1 GTTCAAACAGTTAAGACTATTATAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATC
* * * * * *
11361692 ATATAATAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAACATT
66 ATAAAATAACTATTTCAACTCACACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAATAATCTATTAACATT
11361757 TTTTTATTTCAATTTGTTATGACTTTTT
131 TTTTTATTTCAATTTGTTATGACTTTTT
* **
11361785 GTTCAAACAGTTAAGACTA-TATGAATAGTTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAACAGTTAAGACTATTAT-AATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCAT
* * * * *
11361849 CATAAAATAACTATTTCAGCTCACACAAG-TGTATTTCGAATAGAATAA-AATGAATTTATTAAT
65 CATAAAATAACTATTTCAACTCACACAAGCT-TATTTAGAATAAAATAATAAT-AATCTATTAAC
11361912 ATTTT
128 ATTTT
11361917 AAAAATTTAT
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 18, Indels: 6
0.82 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
157 6 0.05
158 105 0.95
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.09, T:0.46
Consensus pattern (158 bp):
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ATAAAATAACTATTTCAACTCACACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAATAATCTATTAACATT
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AAAATTATTTCAAATAAAAT
Found at i:11364849 original size:15 final size:16
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11364819 AAGTTTAAAT
11364829 AATTATGA-CTATTTG
1 AATTATGATCTATTTG
*
11364844 AATTATTATCTATTTG
1 AATTATGATCTATTTG
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1 AA
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AATTATGATCTATTTG
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11364730 AAATTATTTG
* *
11364740 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAAATTTAAAAAAATGAA
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* * ** * *
11364805 TCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATTATTATCTATTTGAAATTGCTAT
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* * *
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* * * *
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** * * * * * **
11365000 AAGTTCAAATCTTTATGAT-TATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGATTTTTTGTTTT
260 AAGTTCAAATAGTCATG-TCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** ** * *
11365064 GTTATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATACAAGCCTATTTGGATTAAAATAATATTAAT-TTATTA
324 GATATAAAACAATTGTTAT-TGTTCATACAAAACTATTCAGATTAAAATAATACT-ATGCTATTA
*
11365127 ATATTTCT-ATAAA-TAATAAGTAAAATTTTTTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTC
387 ATATTT-TGA-AAATTAATAAG--AAA----TTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAA-ATAGTTC
* *
11365189 AAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTC-AAATCACTATGACCATTTGTTTTGTAATA
442 AAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAAAT-ACTATGACC--TTATTTTGTAATA
* * * **
11365253 AAACAATTG-T-TTTCATTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATT
504 AAACAATTGCTCCTT--TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * *
11365315 CTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATACATCTGTTTACCCAAA-TGTTCAAATAG-TAA
566 CCAAAAAATAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATATATATA-CCAAACTGTTCAAATAGTTAA
* ** * * * *
11365378 TACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGT
630 GACTA-TT-AA-AACAAT-TATTTCAAAACATTTAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-AT
* * * *
11365443 TT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
690 TTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAAT
11365506 AAATAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTATAAACACATTCAAATAGTTATGACAATTTGAATA
754 AAATAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTATAAACACATTCAAATAGTTATGACAATTTGAATA
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884 GTTTATTCA
*
11365645 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAA-AAGATTT-AAAAAA-AA
1 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAA-ATTTAAAAAAAGAA
** * * * *
11365707 TCAATTTA-CAGTGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTA
65 TCAATTTACCA-AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTACTA
* * * * * **
11365771 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAT-ATTTATTCAATTTTA-TTCAAAATAAAATA
129 TAACCTATTGTTTTGGCATAAAATAATT-TTTATGATTTATACAACCTTATTTC-AAATAAAATA
* * *
11365834 ATACT-AATTTATTAATATTCTAA-A-AATTATTAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATATATCTA
192 ATA-TAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATCTA
* *
11365896 TCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATGGCCTTTT
254 TCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * *
11365961 GTTTTGATATAAAATAATTGTTATTGTTCATGCAAAATTATTCAGATTAAAATAATACTATGCTA
319 GTTTTGATATAAAACAATTGTTATTGTTCATACAAAACTATTCAGATTAAAATAATACTATGCTA
* * * *
11366026 TTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAATATGTTTTCCAAAATAGTTTAAATAGT
384 TTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAATATGTTTACCAAAATAGTTCAAATAGT
* * ** * * *
11366091 TATGACTATTTAAATAATTATTTATCTCAAAATGTTATGATCTTATTTTGTCATAAAAGAATTGC
449 CATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAAATACTATGACCTTATTTTGTAATAAAACAATTGC
*
11366156 TCCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAATAATA
514 TCCTTTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAATAATA
* **
11366221 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATATATTAAACTGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAA
579 AGTAAGAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACTGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAA
* *
11366286 TTATTTCAAATCGTTTAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
644 TTATTTCAAAACATTTAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* *
11366351 TTTAGAATAAAATATTACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAAT
709 TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAAT
11366396 GAGCAAGAGA
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AAATAAAATAATACTAAGTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAAAAGAAT
CAATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTACTATA
ACCTATTGTTTTGGCATAAAATAATTTTTATGATTTATACAACCTTATTTCAAATAAAATAATAT
AAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATCTATCGAACA
AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGA
TATAAAACAATTGTTATTGTTCATACAAAACTATTCAGATTAAAATAATACTATGCTATTAATAT
TTTGAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAATATGTTTACCAAAATAGTTCAAATAGTCATGACT
ATTTAAATAATTATCTATCTCAAAATACTATGACCTTATTTTGTAATAAAACAATTGCTCCTTTT
CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAATAATAAGTAAGA
GAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACTGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATTTC
AAAACATTTAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAATAAAAATTTAAAAAATAAATATGT
TTTATAAACACATTCAAATAGTTATGACAATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATAACTT
TTTGTTTTCTCAAAAACCAATTGTTTCTGTTCACAAAAGTTTATTCA
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11366900 TAATACTAAT
11366910 TTATTAACACTTATTTATTTCAAA
1 TTATTAACACTT-TTTA-TTCAAA
11366934 TTATTATA-ACTTTTTATTCAAA
1 TTATTA-ACACTTTTTATTCAAA
11366956 CAATTAAGAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATTAACACTTTTTATTCAAA
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11366908 ATTTATTAAC
**
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1 ACTTATTTATTTCAAACAATTATA
11366942 ACTT-TTTA-TTCAAACAATTA
1 ACTTATTTATTTCAAACAATTA
11366962 AGACTATGTG
Statistics
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11367036 AGGATAAAAT
* * * * * * * *
11367046 TAATTTATTAATATTTTAAAATT--TTA-TAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTATCAAACCA
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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1 TAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * * * * * *
11367287 CATTTTAAATAGTTTTGATTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATT-TAATCTTTTATTTTG
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* * ** *
11367351 TCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATA-ATATTTTA-TTCAAATAAAATAATAC
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* * ** * * ** *
11367402 TAATTTAATAATATTTTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAACA-AAATCTAATTGCCGAAC
1 TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAAC
** * * * * * * * * *
11367466 TGATTCAAGTAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTTAAA-CTGTTGTAACCTTTTCTTTT
64 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
11367530 GTCGTAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGTTTATTTTG-ATTAAAATAATAC
128 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATAC
* * * *
11367582 TAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC
1 TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * * *
11367646 AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTGAAATTATTTTGACCTTTTGTTTAG
65 AATTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
11367710 TCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAATTAATAA
129 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATAC
** * * * *
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1 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * * *
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65 AA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * ** *
11367891 TCATAAAACAATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTACATGAAATAAAATAATAT
129 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * * *
11367943 TAATTTATTAATATTTCTTAAAA--AATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT
1 TAATTTATTAATA-TT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * * * *
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* * * **
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* * * *
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1 TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * *
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* * * * *
11368247 CATAAAACAATTATTTCTGATCATAGAAGCTTATTCG-ATTAAAAATAATAC
130 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATAC
* * * * * * * *
11368298 TAATTTAATAATATTTAAAAA--AATTAGTAAGAGATTTAATAAAGAAATTTGTTTATCAAACTA
1 TAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA
* * ** * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * * * *
11368476 AAATTTATTAACATTAGAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
1 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * * *
11368541 AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTATTATAACCTTTTGTTTT-
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* * * * ***
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* * * * ** *
11368658 TAATTTCTTGATATTTCAAAAATTAATCAA-TAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTTTTTATTGGA
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** * ** ** * *
11368721 TAAATTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTAAAAATTGTTATGGCATTTTGTTTT
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* * * * **
11368786 CTCACAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAC
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* * * * * * ** * **
11368839 TAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGATTCTACTTACCAAATT
1 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * * *
11368904 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTG-CCTTTTGTTTGG
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* * * * *
11368968 TCGTATAAA-AATTGTTTTTGATCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAC
129 TCATA-AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * ** * * * **
11369020 TAATTTATTAATTTTTCAAAGATTAATAAG--AGA-TTTTTCAAAATAAATCTATTTATCAAATT
1 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * * * * * * *
11369082 ATTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTTTACTTCAAGTCATTATAACTTTTTGTTCTAT
65 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
11369147 CACAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATAC
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* * * * * * * * * *
11369198 TAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAATTTTGCTTGCTGAACT
1 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * ** * * * *
11369262 AGTTCAAATAGTTAAGACTATCCGAACAATTATCAATTTTAAGTC---AT----TTTTGTTTTGC
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* *** ** ** *
11369320 CACAAAACAAAAATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AA
130 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * *
11369370 TGATTTTATTAATATTTCAAAATTTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAAC
1 T-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * ** *
11369435 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTGTTG
64 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * * * * * * *
11369500 TTGTGAAATAAATGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTCGGAATAAAAAAAATGC
129 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATAC
* * * *
11369553 TAATCTATTAACATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACC
1 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * ** * * *
11369614 AGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AAGGAATTATTTATTTC-AATTGTTATAACTTTTTGTTCTA
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* * * * * *
11369677 AT-ATAAAACAATAGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATAC
128 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATAC
* * * * * *
11369729 TAATTTATTAATATTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA
1 TAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA
* * * * * * ** * *
11369794 GA-TCAAATAGTCATTATTATTTTAATAAATATCTATTTCAAATTGTCATGACCTTTTGTTTTGC
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* * ** * * **
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* * * * * * * * * * **
11369973 AAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAATAATTATATATTTGAAATCACTATAACCTTTTGATTCA
65 AA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * * *
11370038 TCATAAAATGATT-TCTTCTATTTATATAGGTTTATTTTG-AATAAAATAATA-
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11370089 TAAATTTATTAATATTCAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAA
1 T-AATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
** * * * ** *
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64 CAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
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* * * *
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* * * *
11371893 AATCTATTTACCAACCTTG-TTC--CTA--T-----T-TA--AACAATTATCTATTTCAAA-TCA
373 AATCTAATTACCAAAC-TGATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACT-A
* * * **
11371944 TTATAACCT-TT-TTCT-GTTAT-AAATAATT-GTTTTCAAATTTATATACAA-CTTATTTCAAA
436 TTCTAACCTCTTCTT-TAGTCATAAAATAATTAG-TTT---A-TT-CATACAAGCTTATTT-GGA
* * * * **
11372003 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA-AAAATTAATGACAAAGTTATTTAAAAAATAAATC
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* * * * ** * * **
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* * * * * * * *
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620 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAA
** * * * * * * **
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** * * * * ** * * *
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750 AATTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCT
* * * * * * * ** *
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815 CACAAAACAATTGTTTAAGTTA--AAAAAAGCTTA-CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
11372383 CTTTC-AAAAATTAATAAGT
877 ATTTCTAAAAA--AATAAGC
* * ** * * ** * *
11372402 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAA-CAGTTTGAATAATTATGACTATTTGAACAATT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * * * * *
11372466 GTATACTTCAAAACATTATAACCTTTTGATCTATTATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGTT
* * * * * * *
11372531 TATTTGAAACAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACCAAAAGA-TTTAAAA
131 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGAGAGTTT-AAA
* * *** * ** * * * * * * *
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193 AATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATCATCA
* * * * * * * * *
11372658 AT-CAT-TTTTGTTTTGCCATAAAATAAATT--TTC-AATTCATACTAG-TTCATTCGGATTAAA
258 TTAAATCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTAGTTCTGA-TCATAATAGCTT-ATTC-AAATAAA
* * ** * * *
11372717 ATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAACTAA-AAAA-T----A-AATATGT--TTA
319 ATAATACTAATTTAATAATATTTT-AAAACAAATAACCAAGAAAATTAAAAACAAAATCTAATTA
** * * ** * * * * * * * *
11372773 CTGAACTAGA-TCAAATAATCATGACGATTTGAATAAATATCCATTTCAAA-TCGTTGTGACCTT
383 CCAAACT-GATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACT-ATTCTAACCTC
* * ** * * * *
11372836 TTCTTTTGTCATAAAAGAATTA-TTTCAGTAAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAG
446 TTCTTTAGTCATAAAATAATTAGTTT-A-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACAAAT
* * * * *
11372900 TTATTAATATTTCA-AAAATTAATAATTAAAAGAA-TTAAAAAATGAAT-TGTTTACC-AAACAA
509 TTAATAACATTT-AGAAAATTAATAA-CAAAA-AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAACAA
* * * * ** *
11372961 GTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTC
571 -TTCAAATAGTTAAGACTATTATAACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTGTTTAGTC
** * ** * *
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635 ATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAGCA
* * * *
11373087 TATT-AAGATAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAGTAAGTTCAAA
698 T-TTCAA-A-AATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAATTCAAA
* * * * * ** * * * * *
11373149 TTGTTATGGCTATTTTAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
758 TAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCTCACAAAAC
** * * * * ** * *
11373214 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTAATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-TGACA
823 AATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTA-CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-A-A
* *
11373278 AATAATAAGT
885 AAAAATAAGC
* ** * * * * * * *
11373288 AA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTACTTGAATAA
1 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAA
* * * * * * * ** *
11373351 TTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAAATG-GTTCAATTCATATAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACAA
*** * * * * *
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128 GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT-AATAAGAGAGTTTA
* * * * * * *
11373480 AAAATAAAATATGTTTA-CTGAA-TATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTT
191 AAAAT-AAATCTATTTATC-AAACTAT-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATAT
* * * * * * * *
11373543 CAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATGAAACAATTGGTTCT-ATTCATGCA-AGTTTATTTC
253 C--ATCATTA-AATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTGA-TCAT-AATAGCTTA-TTC
* * * ** * *
11373606 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAGTAAATAA-AAATTTTAAAAATAG
312 AAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAAA-ATTAAAAACA-
* * * * ** * *
11373668 ATATGT--TTTCTAAACATG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAA-TC
372 AAATCTAATTACCAAAC-TGATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACT-
* * * * * * * **
11373729 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATCAATTA-TTTATGTTTATAAAAGCTTATTCAGAATAA
435 ATTCTAACCTCTTCTTTAGTCATAAAAT-AATTAGTTTA--TTCATACAAGCTTATTTGGAATAA
** * * * * *
11373793 AATAATATTAATTTATTAAAATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
497 AATAATACAAATTTAATAACATTT-AGAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * *
11373857 TATC-AAACAAGTTTAAATATTTATGACTATT-TGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTATGAC
560 TACCGAAACAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTA-TCTATTTAAAATTATTATAAC
* * ** * * * * * **
11373920 ATTTTATTTTTTCGTAAAACAATTATTTCTA-TTCATATAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATGC
622 CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-GTTCCAGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAA
* ** * *
11373983 TAATTTTTTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAATTAAATCT-TTT-T------
685 TAATTTATTAGCATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA
* *
11374036 -A-TCAAACA---A-G---A--T---C-ATTAT-GA-T----ATC----T---ATTTTG-----T
750 AATTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCT
* ** * *** * * * * * *
11374068 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCAGGTAAGTTTATTCAG-AGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA
815 CACAAAACAATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTA--CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
11374132 -TTCT-AAAAATTAA-T
878 TTTCTAAAAAAATAAGC
* * * ** * * * * * * * *
11374146 AAGAGATTTAAAATATAAATGTGTTTGCTAAATCATTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
* * * * *** *
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66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTTTGATCATACA-A
* * * * *
11374275 -TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAACATTCAAAAAATTAATAGATAAGA-A-ATTA
128 GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATA-ATAAGAGAGTTTA
* ** * * * * *
11374337 AAAAAAAAT-TGATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTA
191 AAAATAAATCT-ATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATCA
** * ** * * * * * *
11374400 AAATAAATATGACCCTT-TTTTATTATAAAACAATT-GTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCGAAA
255 TCATTAA-AT--CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTT-CTGATCATAATAGCTTATTC-AAA
* * * * * * *** * * * *
11374463 TTAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAA-ATTGATAAGTTAGAGATTTAAAATA-TAAGT-
315 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAAAATTAAAA-ACAAAATC
* * * * * * *** * * * * *
11374525 TAGTTATCAAA-TTAGTTTAAACAATTATGGCCATTTGAACAATTTTCTATTTCAAA-TCATTAT
377 TAATTACCAAACTGA-TTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACT-ATTCT
* * * * * * * * **
11374588 GAA-ATTTTGTTTTA-TCATAAAACAATT-GTTTTTATCATGCATGC-CATTTCAAAATAAAATA
440 -AACCTCTT-CTTTAGTCATAAAATAATTAGTTTAT-TCATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATA
* * * * * * **** *
11374649 ATACTAATTTATTAATATTTCA-AACATTTATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
501 ATACAAATTTAATAACATTT-AGAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
* * * * * *
11374713 G-AAC----C----GGTT----CTATT-TAAATAATTATCTATATCAAATCATTATAACATTTTG
564 GAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTG
* * * * * ** * * * *
11374764 TTCTA-TTATAAAATAATTATTTCAATTTGTATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-
628 TT-TAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATTTA
** * * * * *
11374827 TATA--ATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTAA-AGTAG
692 T-TAGCAT-TTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA--AA
** * * * * * * * * *
11374888 TTCAAATAGTTAAAAACTATATAAACAATTATCTACTT-CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
752 TTCAAATAGTT-ATGACCATTTGAACAATTATCTA-TTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCT
* * ** * * *** ** *
11374952 CATAAAAAAATAATTTCAGTTCATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATA-
815 CACAAAACAATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTA-CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** *
11375016 TTC-ATAAATTTAA-T
879 TTCTAAAAAAATAAGC
** * * * ** * * * * *
11375030 AAGTGATTTAAATAGTGAATTTGTTTACCAAATCATTTCAAATAATTATGGCCATGTCAATAGTT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
* * * ** * * * * * *
11375095 ATCTATTTCAAATCATTGTTACCTTTTGTTTCATCATATAAGAAGTGTATTTGAACATTA-AAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCA-TACAAGT
* * * *
11375159 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA
130 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAA-TAAGAGAGTTT-AA
* * * *
11375223 AAATAAGTCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATGACTACTTCAAATAGTTAAGACTATTTG
192 AAATAAATCTATTTATCAAAC-------------TAT---T--TT-AAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * ** * * * *
11375288 AACAATTGTAAAATTTAAATTGTTTTAATCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTA-TTTTTATTCA
238 AACAATTAT-CTATAT-CA-TCATTAAATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTGA-TCA
* * * * ** *
11375352 TACA-AGTTTATTTGAAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAA-ATTAATAACAAAGA
299 TA-ATAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGA
* * ** * * * *
11375415 GAATTAAAAA-ATAAATTTGTTTACCAAAC-CAGTTCAAATATTTAAAACTATATAAACAATTAT
360 AAATTAAAAACA-AAATCTAATTACCAAACTGA-TTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTAT
* * * * * * * * * **
11375478 CTATTTTAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAGGTTTTGTTGAATTCATACTGGC
423 CTATTTCAAACT-ATTCTAACCTCTTCTTTAGTCATAAAATA--ATTAGTT-TATTCATACAAGC
* * * * ** * ** * *
11375542 TTTTTTGGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATGTTCTA-AAAATTAATAAGTACGAGATTTAAC
484 TTATTTGGAATAAAATAATACAAATTTAATAACATT-TAGAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAAA
* * * ** * * * * *
11375606 AAATAATTTTGTTTACTTAACCAA-TCAAATAATTATGACTATT-TGAACAATTATATATTTTAA
547 AAATAAATCTATTTACCGAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAA
* * * * * **** * * * * *
11375669 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTTTTCATATAAGTTTGTTCGAAATA
611 ATTATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATA
* * * ** * * * *
11375734 AATTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAACATAATTATGTT
676 AAATAATAATAATTTATTAGCATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * ** * ** * *
11375795 TATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAATATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATCAC-T
741 TATCGAACAAATTCAAATAGTTATGACCATTTGAA-CAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACAT
* * * * * * ** * * * * *
11375858 TTTTATTCTATTATAAAATAATAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-ATTAAAATAATACTA
805 TTTGATT-TCTCACAAAACAATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTA--CAGAAATAAAATAATACTA
*
11375922 ATTTATTAATATTTC-AATAATTAATAAGC
867 ATTTATTAATATTTCTAA-AA-AAATAAGC
* * ** * * * *
11375951 AA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CTAGA-TCAAATAATAATGACTATTTGAATA
1 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATC-A-ATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACA
* * * * * *
11376013 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAA
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAA
* * * **
11376078 GCTCATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAA-AGAGATTTA
128 GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAATAAGAGAG-TTTA
* ** * * *
11376142 CAAAATGAATCTATTTATTGAAC-ATATTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTG
191 -AAAATAAATCTATTTATCAAACTAT-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATAT-
* * * * ** * * * *
11376206 AAAT-AGGTATAA-CCTTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATT-TTTTTCCATTCATCCA-AGCTTATT
253 -CATCA-TTA-AATCTTTTA-TTTTGTCATAAAACAATTAGTTCT-GA-TCAT-AATAGCTTA-T
* * ** *
11376267 TCAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAATA--TTAAGACGATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAA
310 TCAAATAAAATAATACTAA-TTTAATAATATTTTAAAAC-A--AATAACCAAGAA-AATTAAAAA
** * ** * * ** *
11376328 -ATAAATCTGTTTACCAAA-TAAGTTCAAATCA-TTTTATCTATTTGAGCAATTATTTATTTC-A
370 CA-AAATCTAATTACCAAACTGA-TTCAAAT-AGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * ** *
11376389 ACTTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATT
432 AC-TATTCTAACCTCTTCTTTAGTCATAAAATAATTAGTT-TATTCATACAAGCTTATTTGGAAT
** * ** * * * *
11376454 AAAATAATATTAATTT-ATAAAATTTTA-CCAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATATA
495 AAAATAATACAAATTTAATAACA-TTTAGAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
11376517 TTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTCATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
558 TTTACCGAAACAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAAATTATTATAA
* * * ** * * *** * * *
11376580 CCTTTTCTTTTGTAATAAAA-AACTTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATAC
621 CCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-TTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAA
* * *
11376644 TAATTTATTA--ATGTTCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTACAAAATGAATCTATTTA-CTGA
685 TAATTTATTAGCAT-TT-CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GA
* * * *** ** * * * * *
11376706 ACATATTTAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTAGTTT
747 ACAAATTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATT
* * ** * *** * *** *** *
11376771 TGTCAAAAAAGGATTTTTTTTCTACTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATT
812 TCTCACAAAACAATTGTTTAAGT--TAAAAAAAGCTTA-CAGAAATAAAATAATACTAATTTATT
*** ** *
11376836 AATATTAAGACAATTAATAAGT
874 AATATTTCTA-AAAAAATAAGC
** * * ** * *
11376858 AA-AATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT-AAGTTTAAATCATTATATCTATTTGAGCAA
1 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAA
* * ** * * *
11376921 TTATTTATTTCAATTTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-ATTCATACAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACAA
* * * ** *
11376985 GTTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTTA-TAAAATTTTACCAATTAATAAGTAAAAGA-TTT
128 GTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA-TAAGAGAGTTT
* * * * * * * * * *
11377047 AAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
190 -AAAAATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATC
* * ** ** * *
11377112 AAATTATTATGACA-C-TTTCTTTTGAAATAAAAC-ATTTTTTTTAATTCAT-ATAAGCTTATTT
254 --ATCATTA--A-ATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTGA-TCATAAT-AGCTTA-TT
**** * * * ** * * ** * *
11377173 GTTGTAAGATAATACTAATTTATTAATGTTCCAAAAATAAATGAGTAAGAGAATTAAAAA-AGAA
311 CAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TTAAAACAAATAACCAAGAAAATTAAAAACAAAA
* * * * * * ** * *
11377237 TATATTTATCGAATA-AGCTT-AGATAGTTATGATTATTTGAATAA-T-TCTATTTCAAA--A--
375 TCTAATTA-CCAA-ACTGATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACTATT
* * * * *
11377294 C--A-----T-TAT-GAC-T---TTAA--A-TTTA-T-GT--AAGCTTATTTTGAATAAAA-AAT
438 CTAACCTCTTCTTTAGTCATAAAATAATTAGTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
** * * * ** ** * * *
11377338 TTAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTTCTAA-GTAAAATTTAAAAAAAATAAATAT-TTTTCTG
503 ACAAATTTAATAACATT-TAGAAAATTAATAACAAAAAATTT--AAAAAATAAATCTATTTACCG
** * * * * * *
11377400 AATA-TGTTCAAATAATTATGACTATT-TGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
565 AA-ACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTG
* * * *** * *
11377463 TTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTTTTTGAAACAAAATAATACTAATTT
628 TTTAGTCATAAAAC-AATTG-TTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATTT
** * * * * * *
11377526 ATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTC
691 ATTAGCATTTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTC
* * * ** ** * * * * **
11377590 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGATATTTTGCTTTGTCATGA
755 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCTCACAA
* * * * * ** * * *
11377655 AATACTTGTATCT-A-TTCAGACAATTTTATTCA-AAATAAAATAATGCTAATTTATTAGT-GTT
820 AACAATTGT-T-TAAGTTAAAAAAAGCTTA--CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
*
11377716 CTAAAAATTAATAAGT
881 CTAAAAA--AATAAGC
** * * * * * * * ** * *
11377732 TTGAGATTTAAAAAA-AAAATTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATATCCATTTAAACTAT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAT
* * * ** ** * * *
11377795 TATCTATTTCAATTCATAATGATATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTGTTCA-AGCAAA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATA-CAAG
** * * **
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129 TTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAA-TAATAAGAGAGTTTAA
* * * * * *
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192 AAAT-AAATCTATTTA-TCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATC-
* * * * * ** ** * * **
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** * ** * * * *
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315 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAAAATTAAAAACA-AAATC
** * * * * * * * * * *
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* * * *
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440 AACCTCTTCTTTAGTCATAAAATAATTAGTTT-A-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
* * * * * * * *
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503 ACAAATTTAATAACATTTAGAAA-ATTAAT-AACAAAAAATTT--AAAAAATAAATCTATTTACC
* * * * * *
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* * * ** * *
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625 TTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATT
** * * * * * * * *
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690 TATTAGCATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTATC-GAACAAAT
* * * * * * * * *
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753 TCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTAT-TAAAAATCGTTATAACAT-TTTGATTTCTC
* * * * * ** **
11378550 ACAAAATAATTATTT--TTTATCATACAAGCTTATTGGGATAAAAATAATACTAATTTCA-TAAT
816 ACAAAACAATTGTTTAAGTTA--AAAAAAGCTTACAGAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAAT
* * *
11378612 ATTT-T-GAAAATTAA-T
877 ATTTCTAAAAAAATAAGC
* * * ** * * * * * * * ** *
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1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
* * * * * * * ** * *
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* * * * * * *
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130 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGAGAGTTT--A
* * * * * * * * * **
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191 AAAATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA--TATC
* * * * * * *
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254 ATCATTA-AATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCT-GATCATA-ATAGCTTATTC-AAA
* * * * * * *
11378948 TAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAA-ATAAATC
315 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAAAATTAAAAACA-AAATC
* * * * * * * * * * * *
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377 TAATTACCAAACTGATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACT-ATTCTA
* * * * * * *
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441 ACCTCTTCTTTAGTCATAAAATAATTAGTTTATT---CATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAA
* * * * * * * * * *
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* * * * *
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565 AAAC-AATTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTG
* * *
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628 TT-TAGTCATAAAACAATTG-TTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATTT
* ** * * * *
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691 ATTAGCAT-TTC-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATC-GAACAAA
* * ** * * ** * * * *
11379365 TTCAAATAGTTAAGACTATACGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTA-ATACCTTTTGTTTTGTC
752 TTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATA-ACATTTTGATTTCTC
* * * * * * * * * * * *
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816 ACAAAACAATTGTTT-AAGTTAAAAAAAG-CT-TACAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*
11379492 -TT-TAAAAAATTTATAAGT
878 TTTCTAAAAAA---ATAAGC
* * * * * * ** * *
11379510 AAGAGATTTAGAAAAT-AATCCTATTTACGAAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGCACAAT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAAT-TTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAT
* ** * * * * * *
11379574 TATCTATTTCAAATCGTTATTATTTTTTGTTTTATCATGACA-AATTGTTTTTGTTAATATAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGT
* * * * *
11379638 TTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAATTAATCAATAAGATATTTTAAAA
130 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAAT-AATAAGAGAGTTTAAAA
* * ** ** * * * *
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194 ATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATCATCAT
11379763 -AAATC----A---T-T-AT---AC---TA-TT-T--T-AT--T--C--A---AAATAAAATAAT
259 TAAATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTGATCATAATAGCTTATTCAAATAAAATAAT
* * ** * * * ** *
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324 ACTAATTTAATAATATTTTAAAAC-AAATAACCAAGAAAATTAAAAACAAAATCTAATTACCAAA
* * ** * * * * * *
11379861 -TCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAATCTTTATCTATTTTAAA-TCGTTATGACATTTTCTT
388 CT-GATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACT-ATTCTAACCTCTTCTT
* * * ** * ** *
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451 TAGTCATAAAATAATTAG-TTTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACAAATTTAAT
* * * * * * * ** *
11379987 AATATTTCAAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATC-ATTCCA
514 AACATTT-AGAAAATTAATAA-CAAAAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAAACAATT-CA
* * * * * * * * *
11380051 AAT-GATTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTTATAA
575 AATAG-TTAAGACTATTATAACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAA
* * * * * * * * *
11380115 AACAATTGCTT-CAATTCACACAAGCTTAT-TAAGAA-AAAATTAACACTACTTTATTAACATTC
639 AACAATTG-TTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA-AATAAAA-TAATAATAATTTATTAGCATTT
* * * * *
11380177 CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTA-G
701 CAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTCAAATAGTTATG
** * * * * * * * * *
11380241 TATTATTTGAACAATTGTCCATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTTATAAAATAATTTTT
766 -ACCATTTGAACAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCTCACAAAACAATTGTT
* * * * *
11380306 TTAGTTAATACAAGCTTAGATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCT---AAATTAA
830 TAAGTTAAAAAAAGCTTACA-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCTAAAAAAATAA
*
11380368 -T
893 GC
* * * ** * * * * **
11380369 AAGAATTTTGAAAAATAAATCTGTTTATCAAATCAATTAAAATAATTATGGTCGTTTGAATGATT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
* * * * * * *
11380434 ATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGATCATATAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGTT
* * *
11380499 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACAGA-TTTAAAC
131 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA-TAAGAGAGTTTAAA-
* * * * *
11380563 AATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGT-TAATCTCAAA
193 AATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATATC--A
** * * * ****
11380627 TTGTTTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATAGA-AGCTTATTTGGTTA
255 -TCATT-AAATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTGATCATA-ATAGCTTATTCAAATA
* ** * * * *
11380690 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATGTG
317 AAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAAAATTAAAAACA-AAATCTA
* * * * * * *
11380753 TTTGCTAAAC-CAGTCCAATAGTTAAAACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTC-AG
379 ATTACCAAACTGATTCAAATAGTTAAAACTATAT-GAATAATTATCTATTTCAAACT-ATTCTA-
* * * * * **
11380814 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-ACTTTGTTTCATGTCTTACAAGCTTA-TCAGAATAAAATAAT-
441 ACCTCTTCTTTAGTCATAAAATAATTAGTTT-AT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * *
11380876 CTAAATTT-ATGAACATTT-GAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGACAAAATAAATCTATTTATC
504 C-AAATTTAAT-AACATTTAG-AAAATTAATAA-CAAAAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTACC
* ** * * * * *
11380939 G-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTGGAATAGTTATTTATGTAAAATTGTTATAACCTTTTG
564 GAAACAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTATAACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTG
* * * * * * *
11381003 TTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGCTCATAAAAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTC
628 TTTAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCAT-AAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATTTA
** ** * * * * * * * *
11381068 TTAATATTTTGAAAAGTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAATTTTGTTTATTGAAAAAATTAA
692 TTAGCATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTCA
* * * * * * * * *
11381132 AATAGTTATGACAATTTGAACAATT-GCTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
756 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATC-TATTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCTCACAA
* *** * ** *
11381196 AACAATTGTTTCAGTTCTTACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATTTTGATTTATTAATATTT-T
820 AACAATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTA--CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT
**
11381259 AAAAACTAATAATT
883 AAAAA--AATAAGC
** * * * * **** * * *
11381273 AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTGTTGAATCAGTTCAAATAATTATGGTCATTTCAACAATT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
* * * * * * *
11381338 ATCTATTTCAAATCGTTATCACTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATGCAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGTT
* * * * * * * *
11381403 TATTTGGAATAAAATAGTGCTAATTTACTAATCTTTCAAACATTAATGAGTAAGAG-GTTTAAAA
131 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-AATAAGAGAGTTT-AAA
* * * * *
11381467 AATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATATAGT-TCAAA
193 AATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TATC--A
** * * * **
11381531 TTGTTATAA-CATTTT-TGTTATGTTATAAAATAATTATTTCT-ATTCATACA-AGCTTACACAA
255 TCATTA-AATC-TTTTAT-TT-TGTCATAAAACAATTAGTTCTGA-TCATA-ATAGCTTATTC-A
* * ** * * * * *
11381592 AATAAAATAATACTACTCTAATAATATTCCAAAA-ATTAAAAACTAAGAGATTTAAAAA-ATAAC
313 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAAAATTAAAAACA-AAA
* ** ** ** * * * * *
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375 TCTAATTACCAAACTGATTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACTATTCT
* * * * * ** ***
11381720 GACCTTTTGTCTT-GTCATAAAACAATT--TTCACAATTCATATTAGCTTATTCATAATAAAATA
440 AACCTCTTCT-TTAGTCATAAAATAATTAGTT---TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATA
** * * * * * * *
11381782 A-AGTGAATTTATTGATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAA-AATTCTATTTAC
501 ATA-CAAATTTAATAACATTT-AGAAAATTAATAA-CAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * * * * * * ** *
11381843 CTAACCAGTTCAAATAATTATGACCATT-TAAATAATTAACTATTTCAAATCATTACGATCTTTT
563 CGAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTT
* * * *** * * * * * * * *
11381907 GTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTTATAGAAGTTTGTTCAGAAT-AAATAATACTAATCTA
627 GTTTAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATTTA
** * * * * *
11381971 TTAATATTTCAAAAATCAAT----AAGAGATTTAAAAAATATATATATTTATCGAACTAGTTCAA
692 TTAGCATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTCAA
* * ** * * * ** ** * * *
11382032 ATAATTATAAATATTT-AAGTAGTTATTTATTTCAAATTATTATGAC-TCTTTG-TTCTCTTATA
757 ATAGTTATGACCATTTGAA-CAATTATCTATTAAAAATCGTTATAACAT-TTTGATT-TCTCACA
* * ** * * * * * *
11382094 AAATAATAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-ATTAAAATAATACTAATTTATGAATATTT-
819 AAACAATTGTTTAAGTTAAAAAAAGCTTA--CAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
**
11382157 TGACAATTAATAAG-
882 T-A-AAAAAATAAGC
* * * ** ** * * * * * *
11382171 AAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CTAATTCAATTAGTCATGACTATTTGAATAAT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATC-AATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAT
* * * * * * * ** * * *
11382235 GATATATTTTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAGCTCATATAAGG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGT
* * *
11382300 TTATTCGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTTGAAAACTAATAATTAGAGA-TTTAAA
130 TTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATA-TTTAAAAATTAATAATAAGAGAGTTT-AA
* * * * * * * *
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192 AAATAAATCTATTTATCAAACT-ATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATAT--
* * * * * * ** ** * **
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253 CATCATT-AAATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGT-TCTGATCATA-ATAGCTTA-TTCAA
** * * * * *
11382490 ATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAA
314 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACAAATAACCAAG--AAA-A-TTAAAAACA-AA
* * * * * * ** * * * * * *
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374 ATCTAATTACCAAACTGA-TTCAAATAGTTAAAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAACTATT
* * * * * * * * ** ** * *
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* ** * * * * * * *
11382680 AGTATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGGAAAATATTTTAAAAAAT--A--TGTTTAT
500 AATACAAATTTAATAACATTTAGAAAATTAATAA-CAAAA-AATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * * * *
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* * * ** *** *
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** * * * * *
11382867 ATTATTA-TTCCAAAATTTA-AAGAACAAGAGAATTAAAAAAATAAATCCATTTA-CTGAACAAG
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* * * * * * * * * *
11382929 TTCAAATAGTGATGACTATCTGAATAATTTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTAT
752 TTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAA-TTATCTA-TTAAAAATCGTTATAACATTTTGATTTCT
* * * * *** ****
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* * *
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877 ATTTCTAAAAA--AATAAGC
* **** * * * * *
11383075 AA-AAATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAA-CACGTTTAAATAGTTATGGCTATTTGAATAAT
1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCA-ATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAT
* ** ** ** * *
11383138 TATCTATTTCAAATTGTTATGACAATTTGTTTTGTTGTAAACCAATTGTTTCT-ATTCCA-AAAA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGA-T-CATACAA
** * ** * *
11383201 CCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCACAATTAATAAGTAAAAGAGTTTAA
128 GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAA-TAAGAGAGTTTAA
* * * * * * *
11383266 AAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT-TATTTCAA
192 AAATAAATCTATTTATC-AAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATC-A
** * * * *
11383329 TTTGTTATGATCCTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCT-ATTCATACA-AGTTTATTCGAA
255 -TCATTA-AATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAG-TTCTGA-TCATA-ATAGCTTATTC-AA
* *** * *
11383391 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA-ATTAATAA-GTTGAAGATTTAAAAA-AATAT
314 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACA--AATAACCAAGAA-AATTAAAAACAA-AA
* * * * * *** *
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* * * * * ** ** *
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* * * * * * *
11383579 AATACTAAGTT-ATTACTATTTCA-AAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTAC
500 AATACAAATTTAATAAC-ATTT-AGAAAATTAATAACAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * ** * * *
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563 CGAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTT
* * * * * *** * **** * * * *
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627 GTTTAGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATAATTTA
* ** * * * * * * ** *
11383766 ATAATATTTTAAACATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GCTGAATTAGTTCA
692 TTAGCATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAATTCA
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11383829 AATAGTTAAGACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-ATTTAGTCATAA
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* * * * * * ** * * *
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*
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* * * * * * * *
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1 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAT
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** ** * *
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** *** ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * *
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** * * * * * * * * * *
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* * ** * * * * ** *
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* ** * * * * *** * **
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819 AAACAATTG-TTTAAGTTAAAAAAAGCTT-ACAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
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882 TAAAAAAATAAGC
* * ** * * ***
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* * * ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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191 AAAATAAATCTATTTATCAAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TAT-C
* * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * * ** ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * * * *
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* ** *
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* * * * * * * * * *
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179 AA
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * **
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* ** *
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* * * * *
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** * ** * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * ** ** * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * ** * ** * * *
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* *** * * *** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* ** * * *
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1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAATAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * * * ***
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** * * * * * *
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* *
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* ** * * *
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1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAAT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
11373176 ATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTAATT
64 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * *
11373241 TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
129 TGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAA-TAAAAGATTTAAAAAATA
* * *
11373305 AATATGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
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* * ** *
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* *
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* * * *
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1 -ATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACTAAATA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
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* * *
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* * *
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AAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
GTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTCAATTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATATTA
ATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
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* * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * ** ** ** * * *
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* ** * * **
11375562 TAAATTTATTAAT-GTTCTAAAAATTAATAAGTACGAGATTTAACAAATAATTTTGTTTACTTAA
64 T-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAATAAATATGTTTACCAAA
* * * *
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126 CTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
11375680 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-ATGTTTTTTTTCATATAAG-TT-TGTTCGAAATAAATTAATA
1 CTTTTATTTTGTCATAAAATAATA-GTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTAG-AATAAAATAATA
* * *
11375742 CTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAACATAATTATGTTTATCAAAC
63 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAATATGTTTACCAAAC
* * * *
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127 TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
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1 CTTTTATTTTGTCATAAAATAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
* *
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66 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG
* * *
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* * * * * *
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1 CTTTTATTTTGTCATAAAATAATAGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT
* * * * * ***
11376102 AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTACAAAATGAATCTATTTATTGAACA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTA-AAAATAAATATGTTTACCAAAC-
* * * * *
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127 TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * ** * *
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1 CTTTTA-TTTTGTCATAAAA-TAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATA
* *
11376282 C-AATTTTATTAATA-TT-AAGACGATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
63 CTAA-TTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCA
* * * * * *
11376344 AA-TAAGTTCAAATCATT-TTATCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTATTATGAC
124 AACT-AGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
11376401 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATT
1 CTTTTATTTTGTCATAAAATAA-TAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT
* * ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 CTTTTATTTTGTCATAAAATAA-TAGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATA
* * * * * **
11376643 CTAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTACAAAATGAATCTATTTACTGAA
63 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTA-AAAATAAATATGTTTACCAAA
* * * * * *
11376707 CATA-TTTAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAAT-AGGTATAAC
126 C-TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * ** * *
11376762 C-TTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATTTTTTTTCTACTCATCCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAAT
1 CTTTTA-TTTTGTCATAAAA-TA-ATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAAT
* * *
11376825 ACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA
62 ACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCA
* * * * * *
11376888 AA-TAAGTTTAAATCATTAT-ATCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAATTTATTATGAC
124 AACT-AGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
11376945 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATT
1 CTTTTATTTTGTCATAAAATAA-TAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT
* * ** * *
11377009 AATTTA-TAAAATTTTACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACTA
* * * *
11377073 GTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
129 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* ** * ** * * ** *
11377125 AC-TTTCTTTTGAAATAAAA-CATTTTTTTTAATTCATATAAGCTTATTT-GTTGTAAGATAATA
1 -CTTTTATTTTGTCATAAAATAATAGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA
* * * * * * * * *
11377187 CTAATTTATTAATGTTCCAAAAATAAATGAGTAAGAGAATTAAAAA-AGAATATATTTATCGAA-
63 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AATATGTTTACCAAAC
* * * * *
11377250 TAAGCTT-AGATAGTTATGATTATTTGAATAA-T-TCTATTTCAAAACATTATGAC
127 T-AG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
11377303 TTTAAATTTA
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CTTTTATTTTGTCATAAAATAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGT
TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
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*
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Statistics
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TATTTAAATAATTATC
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11375307 TTGTTTTAAT
* * * *
11375317 CTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAACACTA
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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* * * ** * **
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* ** * * * * **
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** ** *
11375869 TATAAAATAATAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
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* * * *
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* *
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* * * * *
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1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * **
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65 ATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTA-AAAATAAATATATTTATCAAACATA
* * * * *
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129 GTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
11376232 AAAAAAGGATTTTTTTCCATTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAATTTTATTAATAT
193 AAAAAA-GATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAA-TTTATTAATAT
* * *
11376297 TAAGACGATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATCATTT
256 TAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTT
* * * * *
11376362 TATCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTATTATGAC
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* * * * * *
11376401 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATATT
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT
** ** * *
11376465 AATTTA-TAA-AATTTTACCAATTAATAAGTAAA-AGATTTAGAAAATAAATATATTTACCGAAC
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* * * * *
11376527 A-AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTCTTTT
126 ATAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
11376591 GT-AATAAAAAACTTGTTTT-AATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTA
190 GTCAA-AAAAGA-TTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTA
* * * * * * *
11376654 ATGTTCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTACAAAATGAATCTATTTACTGAACAT-A-TTTAA
252 ATATT--AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAA-ATAAGTTCAA
* * * *
11376716 ATAATTATGAT-TGTTTGAACAATTATCTATTTGAAAT-AGGTATAAC
312 ATAATT-TGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * * *
11376762 C-TTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATTTTTTTTCTACTCATCCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT
1 CTTTTA-TTTTGTCATAAAA-CA-ATTTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAAT
* * * * * *
11376825 ACAAATTTATTAAT-AT-TAAGACAATTAATAAGTAAA-ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
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* * * * * * * *
11376887 AAATA-AGTTTAAATCATTAT-ATCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAATTTATTATGACTTTTT
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* * * * * * * *
11376950 GTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTT
185 GTTTTGTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-CAATTT
* * ** * *
11377014 ATAAAATTTTACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAA
248 AT-TAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAA
* * * *
11377079 ATAGTCATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
312 ATAAT-TTGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* ** * * * *** *
11377125 AC-TTTCTTTTGAAATAAAACATTTTTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGTTGTAAGATAATACT
1 -CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
** * * * * *
11377189 AATTTATTAATGTTCCAAAAATAAATGAGT-AAGAGAATTAAAAA-AGAATATATTTATCGAATA
64 AATTTATTAATAATCCAAAAATTAAT-AATAAAGAGATTTAAAAATA-AATATATTTATCAAACA
* * * * * *
11377252 -AGCTT-AGATAGTTATGATTATTTGAATAA-T-TCTATTTCAAAACATTATGA-C-------TT
127 TAG-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATATTATGACCTTTTGTTTT
* **
11377305 -T-----AA-A----TTT--A-T-GT--AAGCTTATTTTGAATAAAA-AATTTA-AATTTATTAA
190 GTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAA--TACAATTTATTAA
** * ** *
11377351 TATTCCAAAAATTTCTAAGT-AAA-ATTTAAAAAAAATAAATAT-TTTTCTGAATATGTTCAAAT
253 TATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAAT
*
11377413 AATTATGA-CTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
314 AATT-TGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
11377457 CTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTTTTTGAAACAAAATAATACT
1 CTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * * *
11377521 AATTTATTAA-AATTCCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAGC
64 AATTTATTAATAA-TCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAA-TAAATATATTTATCAAAC
* * * * ** *
11377584 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGATATTTTGCTTT
126 ATAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
** * * * * * * ** * *
11377648 GTCATGAAATACTTGTATCTATTCAGACAATTTTA-TTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAG
190 GTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAA
* *** * * * * * *
11377712 TGTTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAAAAAAT-TATTTATCGAACAAGTTCAAATAG
253 T-AT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAA
* * * * * * *
11377776 TCAT-ATCCATTTAAACTATTATCTATTTCAATTCATAATGAT
316 T-TTGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * ** * *
11377818 ATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTGTTCA-AGCAAAAC-TATTC-AGAATAAAATAATA
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATA-C-AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATA
* * * *** * * * *
11377880 CTGATCTATTAATATTTTGATAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAATGAAATCTATTCATTAAAA
62 CTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAT-AAATATATTTA-TCAAA
* * * * * * *
11377941 CA-A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATCTCAAATCTTTATGATC-TTT-ATT
125 CATAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTT
* * ** * * ** *
11378002 TGTCAAAAAATAGTTTTTTCTTTTCATACAAACTTATTTGAGTTAAAATAATACTAATTTAATAA
189 TGTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAA
* * * * * *
11378067 TATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAGATGTGTTTGCCGAAGT-AGTTCAAATA
253 TATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAATAAGTTCAAATA
* * ** * ** * *
11378131 GTTAAGA-CTATTAAAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTAAC
315 ATT-TGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
11378174 CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACT
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT
* * * * ** * *
11378238 AATTTACTAA-CATTCAAAATATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
64 AATTTATTAATAATCCAAAA-ATTAATAATAAAGAGATTT---AAAAATAAATATATTTATCAAA
* *
11378302 CA-AGTTGAAATAGATT-TGACTATTTAAATC-ATTATCTATTT-AAAGTCATTATGACATTTTG
125 CATAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTAAA-CAATTATCTATTTCAAA-T-ATTATGACCTTTTG
* ** * * * * * * * *
11378363 TTTTGTCATAAATCAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAGTTTAT
186 TTTTGTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-CAATTTAT
** * * * * ** *
11378428 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGAATTAAAAACTAAAGT-TGTTTTCTAAACCACTTCAA
250 TAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAATAAGTTCAA
* * * * * *
11378492 ATAGCTATGA-CTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGAT
312 ATA-ATTTGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* ** * * **
11378538 C-TTTGTTTTCCCACAAAATAATTATTTTT-TATCATACAAGCTTATT-GGGATAAAAATAATAC
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATAC
* *** * * * **
11378600 TAATTTCA-TAATATTTTGAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAAATACATGTGTTTGCCAAA-
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11378659 TTAGTTCAAATAGTTAAGAC-AATCAGAATAATTATCGATTTTAAATCATTTTGACGTTTTGTTT
126 ATAGTTCAAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * ** *
11378723 AGTCATATAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGA
189 TGTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAA
* * ** * ** *
11378788 CATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAAT-
253 TATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATA
* * *
11378852 ATTT-ATGGCTTTTTCAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
315 ATTTGAT--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
11378896 CATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAGAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * * **
11378961 CTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTT--AAA-AAATA-A---ATC--A-AT--
65 ATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAATAAATATATTTATCAAACATAG
* * * * * * *
11379014 TT-AAATAATCATGGCCATTTAAACAACTATCAATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCA
130 TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
11379078 CAAAACA-ATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTT-TTTCGAAAAAAAATAATGCTAATTTATTAAT
194 -AAAA-AGATT-TTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAAT
* * * * * * *
11379139 ATTTAAGAATTGATAAG----AGATTTAAAAAAGAAATTTG-TTAGCTGAACT-AGTTCAAATAG
254 A-TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-C-CAAATAAGTTCAAATAA
** *
11379198 TTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AA
316 TT-TGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
11379239 CATTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAT-A-A-TA
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * * *
11379300 ATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACT-ATGAGATTTAAAAAATAAAT-TCATTT-GCTAAAC
65 ATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAAATAAATAT-ATTTATC-AAAC
* * * *** * * * *
11379362 -TAATTCAAATAGTTAAGACTATACGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTAAT-ACCTTTTGTTT
126 ATAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TATT-ATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * * * *
11379425 TGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCCTA-TTCGGAATAGAATAAAATTAATTTATTA
189 TGTCAAAAAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-CAATTTATTA
* * * * * * *
11379489 ATATTTAAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATCCTATTTACGAAACCAA-TTCAAA
252 ATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAA-TAAGTTCAAA
* * * * *
11379552 TAATTAT-AACTATTTGCACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTAT
313 TAATT-TGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * * * * *
11379597 TTTTTGTTTTATCATGACA-AATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTA
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
** * * * * ** **
11379661 ATTTATTAAT-ATTTAGAAATTAATCAAT-AAGATATTTTAAAAGTAAATTTGCTTGCCAAACCA
65 ATTTATTAATAATCCAAAAATTAAT-AATAAAGAGA-TTTAAAAATAAATATATTTATCAAA-CA
* * * *
11379724 T--TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
127 TAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTAT
11379773 ACTATTTTAT
Statistics
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TTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAATAAATATATTTATCAAACATAGT
TCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAA
AAAGATTTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAATTTATTAATATTAAAA
ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTTGATCTAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
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11375307 TTGTTTTAAT
* * * * *
11375317 CTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAACACT
1 CTTTTATTCTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-ATTAAAATAATACT
* * * * * * *
11375381 AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAA-CAAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
65 AAT-TTATAAAATTTCAACAATTAATAAGCAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * ** * * * * *
11375445 AGTTCAAATATTTAAAACTATATAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
128 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGT
* * * * * *
11375510 CATAAAATAGGTT-TTGTTGAATTCATACT-GGCTTTTTTGGAA-TAAAATAA-AATAAATTTAT
193 AATAAAAGA-ATTGTT-TT-AATTCATA-TAAGCTTATTT-GAAGTAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * * *
11375571 TAATGTTCTAAAAATTAATAAGTACGAGATTTAACAAAT-AATTTTGTTTACTTAACCA-A-TCA
252 TAATGTTCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAA-AAATGAA-TCTATTTACTGAA-CATATTTA
* * * * *
11375633 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTTAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
313 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAT-AGGTATAACCTTTAGTTTTGTCA-AA
* * ** * * *
11375697 AATA-AATGTTTTTT-T-TCATATAAG-TT-TGTTCGAAATAAATTAATACTAATCTATTAATAT
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* *
11375757 TTCAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAACAT-AATTATGTTTATCAAACT-AGTTCAAAT-
437 TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAA-TAAGTTCAAATC
* * * *
11375813 AGTTATGA-ATATTTAAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATCAC
499 A-TTAT-ATCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * * *
11375857 TTTTTATTCTATTATAAAATAA-TAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACT
1 CTTTTATTCTGTCATAAAATAATTA-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACT
* * * *
11375921 AATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTA
65 AATTTA-TAAAATTTCAACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAA
* * * * *
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129 GTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTA
* * ** * **
11376051 ATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTCATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT
194 ATAAAAGAATTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATGTT
*
11376116 CCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTACAAAATGAATCTATTTATTGAACATATTTAAATAATTAT
259 CCAAAAATTAATAAT-AAGAGATTTA-AAAATGAATCTATTTACTGAACATATTTAAATAATTAT
*
11376181 GACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTAGTTTTGTCAAAAAAGGA-TTTT
322 GACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATTTTT
* * *
11376245 TTTCCATTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAATTTTATTAATATTAAGACGATTAAT
387 TTTCTA-TCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAT
* *
11376310 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATCATTTTATCTATTTGAGC
451 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATCATTATATCTATTTGAGC
*
11376375 AATTATTTATTTCAACTTATTATGAC
516 AATTATTTATTTCAAATTATTATGAC
* * *
11376401 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTA
1 CTTTTATTCTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTA
* * * * * *
11376466 ATTTATAAAATTTTACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATATATTTACCGAACAAGT
66 ATTTATAAAATTTCAACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
*
11376531 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT
131 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT
*
11376596 AAAA-AACTTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATGTTC
196 AAAAGAA-TTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATGTTC
11376660 CAAAAATTAATAATAAAGAGATTTACAAAATGAATCTATTTACTGAACATATTTAAATAATTATG
260 CAAAAATTAATAAT-AAGAGATTTA-AAAATGAATCTATTTACTGAACATATTTAAATAATTATG
* *
11376725 ATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATTTTTT
323 ACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATTTTTT
11376790 TTCTACTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATA
388 TTCTA-TCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATA
* *
11376855 AGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAATCATTATATCTATTTGAGCA
452 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATCATTATATCTATTTGAGCA
*
11376920 ATTATTTATTTCAATTTATTATGAC
517 ATTATTTATTTCAAATTATTATGAC
* * * *
11376945 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTA
1 CTTTTATTCTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTA
* * * *
11377010 ATTTATAAAATTTTACCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGT
66 ATTTATAAAATTTCAACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
* *
11377075 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACAC-TTTCTTTTGAAA
131 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTCTTTTGTAA
* * * ** *
11377139 TAAAACATTTTTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGTTGTAAGATAATACTAATTTATTAATGTTC
195 TAAAAGAATTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATGTTC
* * * * *
11377204 CAAAAATAAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAGAATATATTTA
260 CAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAATGAATCTATTTA
11377245 TCGAATAAGC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (541 bp):
CTTTTATTCTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTA
ATTTATAAAATTTCAACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT
AAAAGAATTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCC
AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAATGAATCTATTTACTGAACATATTTAAATAATTATGACT
ATTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTAGTTTTGTCAAAAAAGGATTTTTTTTC
TATCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTA
AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATCATTATATCTATTTGAGCAATTA
TTTATTTCAAATTATTATGAC
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Period size: 181 Copynumber: 13.8 Consensus size: 180
11377306 AAATTTATGT
* * **
11377316 AAGCTTATTTTG-AATAAAA-AAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTTCTAAGTAA-A-AT
1 AAGCTT-TTTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * *
11377376 TTAAAAAAAATAAATAT-TTTTCTGAATATGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTATCTA
64 TT--AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* *
11377440 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAA
126 TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
11377495 AAGCTTTTTTGAAACAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * *
11377560 AAAAAGTAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTC
66 AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
11377625 AAATTATTATGATATTTTGCTTTGTCATGAAA-TACTTGTATCTATTCAGAC
130 AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * **
11377676 AA--TTTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAGTGTTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGAT
1 AAGCTTTT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * *
11377739 TTAAAAAAAAAATTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTAAACTATTATCTATT
64 TTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * *
11377803 TCAATTCATAATGATATTTTGTTTTGTTGTAAAAC-AATTGTTTTTGTTCA-AGC
128 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATA-C
* * ** * * * * *
11377856 AAAACTATTCAG-AATAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTGATAA-T--TAA-TAAGAGATT
1 -AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** *
11377916 T-AAAAATGAAATCTATTCATTAAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
65 TAAAAAAT-AAAT-TGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
11377979 CTCAAATCTTTATG--ATCTTT-ATTTGTCAAAAAATAGTTTTTTCTTTTCATAC
127 TTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAC
* * ** * * *
11378031 AAACTTATTTGAGTTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** * ** *
11378096 AAAAAATAGATGTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATATATTTC
66 AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * *
11378161 AAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AATTATTTC-AGTTCATAC
130 AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * *
11378212 AAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTC-AAAATATTAATGAGCAAGAGAT
1 AAGCTTTTTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-ATTAATAAGTAAGAGAT
* *
11378275 TTAAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTAAATC-ATTATC
64 TT--AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAA-CAATTATC
*
11378338 TATTT-AAAGTCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA-TCAATTGTTTC-AGTTCATAA
124 TATTTCAAA-TCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACT-AATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * *
11378395 AAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGAAT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
11378459 TAAAAACTAAAGTTGTTTTCTAAACCACTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAAATATCAATCT
65 TAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * *
11378524 CAAATCATTATG--ATCTTTGTTTTCCCACAAAATAATTATTT-TTTATCATAC
129 CAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTAT-TCATAC
* ** * *
11378575 AAGC-TTATTGGGATAAAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
1 AAGCTTTTTTGAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * * ** * *
11378634 TTAAAAAATACATGTGTTTGCCAAATTAGTTCAAATAGTTAAGACAATCAGAATAATTATCGATT
64 TTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
11378699 TTAAATCATTTTGACGTTTTGTTTAGTCATATAA-TAATTGTTTCAATTCATAA
128 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATA-AACTAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * * * *
11378752 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
** * * * *
11378817 GAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATATTTATGGCTTTTTCAACAATTATCTATTT
66 -AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
11378882 AAAATCATTATGACCA-TTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTT-TAGTTTATAG
129 CAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATAC
* *** * * *
11378934 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGCAAGAGATT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
11378998 TAAAAAATAAA-----T------CAA-TTTAAATAATCATGGCCATTTAAACAACTATCAATTTT
65 TAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
11379051 AAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCACAAAAC-AATTGTTTTTCA-ACATAC
130 AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCA-TAAACTAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * *
11379102 AAGCTTTTTCGAAAAAAAATAATGCTAATTTATTAATATT-TAAGAA-T--TGA-TAAGAGATTT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** *
11379162 AAAAAAGAAATT-TGTTAGCTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
66 AAAAAATAAATTGT-TTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * *
11379226 CAAATTGTTATAACA-TTTGTTCTATCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATAC
129 CAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
11379277 AAGC-TTATTCAAATAAAAT-A-A-TAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTATGAGATTT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * ** * *
11379338 AAAAAATAAATTCATTTGCTAAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATACGAATAATTATTTATTT
66 AAAAAATAAATT-GTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * * * * *
11379402 TAAATTGTTAAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATAC
129 CAAATCATT-ATGACATTTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * * * * *
11379454 AAGCCTATTCGGAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTTATAAGTAAGAGATT
1 AAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
11379518 TAGAAAAT-AATCCTATTTACGAAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGCACAATTATCTAT
65 TAAAAAATAAAT--TGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * * * * * * *
11379581 TTCAAATCGTTATTATTTTTTGTTTTATCAT-GACAAATTGTTTTTGTTAATAT
127 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAC
** * *
11379634 AAG-TTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATCAA-TAAGATAT
1 AAGCTTT-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AAGTAAGAGAT
* * * * * * * *
11379696 TTTAAAAGTAAATTTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATT
64 TTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
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AATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAC
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1 CTATTTAAAGTCATTAT
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** * * * * *
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* * * * * * * * *
11377471 TAAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTTTTTGAAACAAAATAATACTAATTTATTAAAATTC
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** * * * * * *
11377536 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATG
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* * * * * * * *
11377601 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGATA-TTTTGCTTT-GTCATGAAATACTTGT
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* * * ** * * * * *** *
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** * * * * * ** * *
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* * * * ** **
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* * * * * ** *
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438 AAAGCTTATCTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
*
11377915 TT-AAAAATGAAATCTATTCATTAAAACAA
502 TTAAAAAAT-AAATC-A---ATT--TA-AA
* * ** * * *
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* * * * * **
11378009 AAATAGTTTTTTCTTTTCATACAAACTTATTTGAGTTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA
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* *
11378074 AAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAGATGTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAGTTAAGAC
126 AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * *
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187 TATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAA-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * *
11378204 GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAATATTAATGAGCA
251 ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAATAAGCA
* * * * *
11378269 AGAGATTTAAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTAAATC-
316 TGAGATTT--AAAAAATAAAT-TATTTACCAAACAAGTTCAAATA-ATTATGACTTTTTCAA-CA
* *
11378332 ATTATCTATTTAAAGTCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCAGTTCATAAA
376 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAA
* * *
11378396 AGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGAATTA
440 AGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* ***
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505 AAAAATAAA--TCAATT-T-AA--A
11378486 CTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTCCCA
1 -TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTT--CA
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63 CAAAATAATT-TTTTTTATCATACAAGCTTATT-GGATAAAAATAATACTAATTT-ATAATATTT
* * * *
11378616 TGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATACATGTGTTTGCCAAATTAGTTCAAATAGTTAAGACAA
125 T-AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA
* * * * ** * * *
11378681 TCAGAATAATTATCGATTTTAAATCATTTTGACGTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAAT
189 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAAC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAAT
* * * *
11378746 TCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGCATG
253 TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATG
* * *
11378811 AGATTTGAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATATTTATGGCTTTTTCAACAATTAT
318 AGATTT-AAAAAATAAAT-TATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTTTTTCAACAATTAT
* * * *
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** * * * *
11378941 TCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAT
446 TCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
11379006 AAATCAATTTAAA
511 AAATCAATTTAAA
* * * * * * * *
11379019 -T--AAT--C-ATGGCCATTTAAACAACTATCAATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTG-TTT-TCA
* * * * * * *
11379078 CAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTTTTCGAAAAAAAATAATGCTAATTTATTAATA-TT
63 CAAAATAATT-TTTTTTATCATACAAGCTTATT-GGATAAAAATAATACTAATTTA-TAATATTT
* * * * * *
11379142 TAAGAATTGATAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTAGCTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
125 TAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA
* * * *
11379207 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACATTTGTTCTA-TCATAAAACAATTGTTTCTAT
189 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAAT
* * * *
11379271 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAAT-A-A-TAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAT
253 TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAATAAGC-AT
* * * * * * *
11379331 GAGATTTAAAAAATAAATTCATTTGCTAAACTAA-TTCAAATAGTTAAGAC-TATACGAATAATT
317 GAGATTTAAAAAATAAATT-ATTTACCAAAC-AAGTTCAAATAATTATGACTTTTTC-AACAATT
* * ** * * * ** *
11379394 ATTTATTTTAAATTGTTAAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGC
379 ATCTATTTAAAATCATT-ATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGC
* * * * * * *
11379458 CTAT-TCGGAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGA
443 TTATCT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
11379522 AAATAA
507 AAATAA
11379528 TCCTATTTAC
Statistics
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TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTCACAA
AATAATTTTTTTTATCATACAAGCTTATTGGATAAAAATAATACTAATTTATAATATTTTAAAAT
TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC
AATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAA
AAAATAAATTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTTTTTCAACAATTATCTATTTAAAA
TCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCTGAAATAA
AATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTT
AAA
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11379227 AAATTGTTAT
*
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1 AACAATTGTTTCTATTCATA
11379276 CAAGCTTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AACAATTGTTTCTATTCATAA
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * *
11379964 AATTAAAATAATATTAATTTCA-TAATATTTCAAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATA
1 AA-TAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATA
* * * * * * * *
11380028 AATTTGTTTATTGAA-TCA-TTCCAAAT-GATTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATT
62 AATCTATTTATCGAACT-AGTT-CAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* ** * * * * * *
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* * * * *
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1 AATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * *
11380328 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAG--A-A-TTTTGAAAAATAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * ** **
11380388 TCTGTTTATC-AAATCAATTAAAATAATTATG-GTCGTTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATT
64 TCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * *
11380451 ATGACAT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGA-TCATATAAGCTTATTTG
127 -TAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
11380505 AAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* *
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* * *
11380634 AAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATAGAAGCTTATTTG
129 AAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
** * *
11380686 GTTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** * ** *
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* * * * * **
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* * * * * *
11380865 AATAAAATAAT-CTAAATTTATGAACATTTGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGACAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * *
11380929 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTGGAATAGTTATTTATGTAAAATTG-TTA
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* * * * * * ***
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129 AAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT-ACAAGCTTAT-TTG
* ** * * *
11381048 AATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAAAAGTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * ** * * * * *
11381112 TTGTTTATTGAAAAAATTAAAATAGTTATGACAATTTGAACAATT-GCTTATTTAAAATTG-TTA
65 CTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTTA
** * * **
11381175 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCTTACAAGCTTATTCAA
129 AAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TG
** * * * * * * *
11381229 AATAAAATAATTTTGATTTATTAATATTTTAAAAACTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
11381294 TATTTGTTGAA-TCAGTTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTA
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* * * * * * *
11381356 TCACTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATGCAAGCTTATTTGG
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* * * * * * *
11381410 AATAAAATAGTGCTAATTTACTAATCTTTCAAACATTAATGAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
11381475 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATATAGTTCAAATTGTTATAA
66 TATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT-TAA
* * * * * * ****
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* * * * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** * * **
11381657 TGTTTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTAATTCAAATTG-TTATG
66 TATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTAAA
* * * * **
11381721 ACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATT-TTCACAATTCATATTAGCTTATTCAT-
131 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTATTCATACAAGCTTATT--TG
* * *
11381773 AATAAAATAA-AGTGAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAA-AATT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * ** *
11381835 CTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACCATTTAAATAATTAACTATTTCAAA-TCATTAC
65 CTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTAA
* * * * * * * * * *
11381899 GATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTTATAGAAGTTTGTTCAG
130 AATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TG
* * * *
11381952 AAT-AAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--CAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
11382012 TATTTATCGAACTAGTTCAAATAATTATAAATATTT-AAGTAGTTATTTATTTCAAATT-ATTAT
66 TATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTTA-
* * * * * * * *
11382075 GACTCTTTGTTCTCTTATAAAATAATAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG
129 AAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-G
* * ** * * * * *
11382128 ATTAAAATAATACTAATTTATGAATATTTTGACAATTAATAAG-AAAAAATTTTAAAAATAAATA
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* * * * * * * * *
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* * * * * ***
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* * * *
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** * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * *
11383873 GACCT-TTTATTTAGTCATAAAATAATTGCTT-TAGCTCATACATGCTTATTTG
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * *
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Statistics
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* * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * * *
11380203 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTAGT-ATTATTTGAACAATTGTCCATTTAA
63 AAAAT-AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTA-TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * **
11380267 AATCGTTATAACCTTTTGATTTGTTATAAAATAATTTTTTTAGTTAATACAAGCTTAGATGAAAT
126 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * *
11380332 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAG-AA-TTTTGAAAAATAAATCTGTT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * ** *
11380394 TATCAAATCAA-TTAAAATAATTATG-GTCGTTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACA
255 TACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACC
* * *
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317 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGC
* * * *
11380498 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAC
1 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * *
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65 AAT-AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAA
** * ** * * **
11380627 TTGTT-TAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAA-TCATAGAAGCTTATTTG-GTT
128 TCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* *
11380689 AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * ** *
11380754 TTGCTAAACCAG-TCCAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCA-GACC
254 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TT-ATGACC
* * * *
11380817 TTTTGTTTAGTCATAAAA-ACTTTGTTTC-ATGTCTTACAAGC
317 TTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTATTTCTAT-TCATACAAGC
* * * * *
11380858 TTA-TCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATGAACATTTGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAC
1 TTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA
* * * * * * * *
11380921 AAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTGGAATAGTTATTTATGTAAA
63 AAAAT-AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * ** * * ***
11380986 ATTGTTATAACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGCTCATAAAAACCTTATCCAAAAT
127 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT-ACAAGCTTATTTGAAAT
* ** * * * *
11381051 AAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAAAAGTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAATTTTGT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGT
** * * * * * *
11381116 TTATTGAAA-AAATTAAAATAGTTATGACAATTTGAACAATT-GCTTATTTAAAATTGTTATGAC
254 TTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAA-TCTTATGAC
* *
11381179 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCTTACAAGC
316 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGC
** * * * **
11381221 TTATTCAAAATAAAATAATTTTGATTTATTAATATTTTAAAAACTAATAATTAAGTGATTTAAAA
1 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * ** *
11381286 AGTGAATCTATTTGTTGAATC-AGTTCAAATAATTAT-GGTCATTTCAACAATTATCTATTTCAA
65 AAT-AATCTATTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** * *
11381349 ATCGTTATCACTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATGCAAGCTTATTTGGAAT
127 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * * * * * *
11381413 AAAATAGTGCTAATTTACTAATCTTTCAAACATTAATGAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATCTAT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA--TTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
11381478 TTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATATAGTTCAAATTGTTATAACAT
254 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATGAC-C
* * *
11381543 TTTTGTTATGTTATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGC
317 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
** * * * ** * * *
11381584 TTACACAAAATAAAATAATACTACTCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTTAAAA
1 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
11381649 AATAACTTTGTTTGTCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTAATTCAAA
65 AATAA-TCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * ** *
11381713 TTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATT-TTCACAATTCATATTAGCTTA-TTCATAAT
128 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAATTCATACAAGCTTATTTGA-AAT
* * * * *
11381776 AAAATAA-AGTGAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAA-AATTCTAT
191 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * *
11381839 TTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACCATTTAAATAATTAACTATTTCAAATCATTACGATCT
254 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCT
* * * * * * * *
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318 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
* * * *
11381944 TTGTTCAGAAT-AAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATCAATAAG----AGATTTAAAA
1 TTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * * *
11382004 AATATATATATTTATCGAACTAGTTCAAATAATTATAAATATTT-AAGTAGTTATTTATTTCAAA
65 AATA-ATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * ** *
11382068 TTATTATGA-CTCTTTGTTCTCTTATAAAATAATAGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-AGATT
128 TCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGA-AAT
* ** * * * * *
11382131 AAAATAATACTAATTTATGAATATTTTGACAATTAATAAGAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
** * * * * * * * *
11382196 TACTGAACTAA-TTCAATTAGTCATGACTATTTGAATAATGATATATTTTAAATTGTTATGACAT
255 TACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATGACCT
* * * *
11382260 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC-AGCTCATATAAGG
318 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGC
* * * *
11382300 TTATTCGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTTGAAAACTAATAA-TTAGAGATTTAAA
1 TTATTC-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * * * **
11382363 AAATAAATCTTTTTACCGAATAAGTTTAAATAATTATGACCATTTAAACAATTAT-TAATTTGGA
64 AAAT-AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAA
* * * * ** * **
11382427 ATCGTTGTAACCTTTTAG-TATGTCATAAAATGATTTTTGTCTGTTCATACAAGCTTATTTTG-A
127 ATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAATTCATACAAGCTTA-TTTGAA
**
11382490 ATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAA
189 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT--AAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * *
11382553 TTTATTTATCGAACAAGTTCAAATCGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTAT
249 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTAT
* * * * * **
11382618 GACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTCCATATGAGC
313 GAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
* * * * * * *
11382664 TTATTCAGATTAACATAGTATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGGAAAATATTTTAAA
1 TTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAA
* * * * *
11382729 AAAT-A--TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAGT
64 AAATAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * *
11382791 CATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-ATTCA-GCAAGCTTATTTGAAATAAA
129 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * ** * **
11382854 ATAATACTAATTTATTATTATTCCAAAATTTAAAGAACAAGAGAATTAAAAAAATAAATCCATTT
194 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTA-AG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** * * * *
11382919 ACTGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATCTGAATAATTTATCTATTTCAAAACATTATGACCTT
256 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTT
* * * *
11382984 TTGTTTTATCATAAAATAATTGGTTT-TATTCATGCAAGC
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* * **
11383023 TTTTTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAA
1 -TTATTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * ** * * ** *
11383086 AAATAAATTTATTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
64 AAAT-AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** ** ** * * * * * *
11383151 TTGTTATGACAATTTGTTTTGTTGTAAACCAATTGTTTCTATTCCA-AAAACCTTATTCGGAATA
128 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT-CATACAAGCTTATTTGAAATA
* *
11383215 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCACAATTAATAAGTAAAAGAGTTT-AAAAATAAATCTGT
192 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGA-TTTAAAAAATAAATCTGT
** * * *
11383278 TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT-TATTTCAATTTGTTATGATCC
254 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCTTATGA-CC
* *
11383342 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGT
317 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
**
11383382 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAA
1 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAA
* * * * * ** *
11383447 AAATATTCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATCATGTCTATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT
64 AAATAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * ** *
11383512 -AGTTCTGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTCAAATAA
129 CA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * *
11383576 AAAAATACTAAGTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTAC
193 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * *
11383639 CGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAT-ATC-ATT
258 C-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTT
* * ** * * * *
11383701 ATTCTACCCTAAAACATTTATTTTTGTTCATACAAGC
321 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
** * * * * *
11383738 TTATTTGGAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTTTAAACATTAATAAGT-AAAGATTTAAAA
1 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * ** * * *
11383802 AATAAATGTGTTT-GCTGAATTAGTTCAAATAGTTA-AGACAATTAGAATAATTATCTATTTCAA
65 AAT-AATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * ** *
11383865 ATCATTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGCTTT-AGCTCATACATGCTTATTTGAAAT
127 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * * * * **
11383929 AAAATTATACTAATTTATTAACATTAC-AAAATTAATAAGTAGAAAATT--AAAA-AAATCTAAT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * *
11383990 TACCGAGCAAGTTCAAATAATTTTGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCTCTATGATCTT
255 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCT-TATGACCTT
* * * *
11384054 TTATTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGC
319 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGC
* * * * * * * **
11384093 TTACTTGAAATATAATAATATTACTTTATTAATATTATAAAAATTGATAAGTTAGCGA-TTAAAA
1 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * ** * *
11384157 ACATAAAT-TAGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATAATCTATTTCA
65 A-AT-AATCTA-TTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * **
11384220 AATCATTATTAACTTTTGTTTTGTCATTAAACAATTATTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTCAAA
126 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAA
* * *
11384283 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAATATTAATAAGTAGGAAATTTAAAAAATAAATCT
189 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA--AGATTTAAAAAATAAATCT
*** * * * *
11384348 GTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAAC
252 GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATGAC
* * *
11384413 CTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATAAAAGC
316 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
* * * * * * *
11384455 TTATTTGAAATAAAAT-A-A-T-ATGTAATAATGTTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
1 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* ** * * * *
11384516 AATAAATTTATTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGCTA-AGGCTATATGAACAA-TAT-TTTATTCA
65 AAT-AATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCA
** * * * **
11384577 AATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCTTACTAA-CTTATTCAAAA
126 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC-AAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
11384641 TAAAATAAAACAAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGATTTTAAAAATAATTTTGTT
190 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* ** * * * *
11384706 TGCTGATCGAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT
255 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATGACCTT
** * * * *
11384771 TTGTTTTAACATAAAACAAATGT-TTTTTGTTCATATAAGT
319 TTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TATTTCTATTCATACAAGC
* ** ** * * * *
11384811 TTGTTTGGAATAAAATAATACTAAGATATTAATATTTTGAAAATTTATAAG--ATA-TTTTAAAA
1 TT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* *
11384873 AATAAATCTGTTTATCAAATC-A-TTCAAATAGTTATGAA-TATTT-AAGCAATTATTTATTTCA
65 AAT-AATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCA
* ** * * * ** * *
11384934 AATCATTACGAGTTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATAGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTT-AGAT
126 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGA-AA
** * * * * *
11384998 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATGAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATGT
190 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * *
11385063 TTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCT
254 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCT
* * * * *
11385128 ATTT-TTCT-TCATAAAAAAATTTATTTCCATTCATATAAGG
318 -TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTCTATTCATACAAGC
* * *
11385168 TTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTCTGAAATAA-TAATAATTAAGAGATTTA
1 TTATTC-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT-TTAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * ** *
11385231 AAAAATGAATCTATTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATAGATTTG
62 AAAAAT-AATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * ** * ** * * *
11385295 GAGTCGCTATAACCTTTTAG-TTTGTCATAAAATGATTGTTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTCA
125 AAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTGA
*
11385359 AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
188 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT--AAGATTTAAAAAATAAA
** * *
11385422 TCTACTTACCAAACAAGTTCAAATCA-TTGTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTA
249 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTA
* * * * * *
11385486 TGACTTTTTTGTTTTGCCACAAAACAATTATTGCTATCCATACGAGC
312 TGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
* * *
11385533 TTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
1 TTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * *
11385598 AAT-ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTACTTGAAATC
65 AATAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * ** *
11385662 ATTGTGACCTTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCAATTCATGTAATCTTATTTGAAATAAAA
130 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
*
11385727 TAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AGAGTAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTAC
195 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAC
*
11385791 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTG
258 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTG
* *** *
11385856 TTTTGTCATAAAATAATTGGATCTATTCATGCAAGC
322 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
** **
11385892 TTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATGCTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAA
1 TTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
** * *
11385955 AAATAAATCTATCTT-TTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
64 AAAT-AATCTAT-TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * ** * * * * *
11386019 ATCGTTATAACCATTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTAAAAAAACCTTATTCGAAAT
127 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * * ** * *
11386083 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAATAAAATATTTTTAAAATAAATTTAT
191 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTTAAAAAATAAATCTGT
*** ** * * * *
11386147 TTATTGAATGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAATCC
254 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATGA-CC
* * * * *
11386212 -TTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTCTATTTATACAAGT
317 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
* ** *
11386252 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTTGAAGGTTTAAAA
1 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* ** * * * * * *
11386317 AATTAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATCA-TCCTATCCATTAGAACTACTATCTATTTTAAA
65 AA-TAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** ** * *
11386381 TCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-ATATTCATACAAAATTA-CT--CATA
128 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
11386442 ATAA-AATACTAATTTATTACTTTTTCAAAAATTAATAA--AAGATTTAAAAACTAAATCTCTTT
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* * * * * * * *
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126 TGAACAT-AAA-AAATATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAT-ACAATTTGAAATAA
* * * * * * ****
11388452 ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TTGGTCCGACAAACAAATTTGGGTTTTAAA--T
1 ATAATTGTTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAACTT-GTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCT
* * * *
11388514 C-T-CTTATTAATTTTTGAAGTATTAATAAATTAGTGTTATTTT-ATTCTAAATAA-TTTCGTAT
64 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTT-ATAT
* ** * * * *
11388575 GAATA-AAAATAATTATTTTACAACAAAACAAAATGTCATA-ATGATCTGAAATAG
127 GAACATAAAA-AA-TATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATACA--ATTTGAAATAA
** * * * * * * * *
11388629 ATAATAATTCAAATGGACATAAGACTCTTTGAACTTGTT-TAGTAAACAAATTAATTTTTTAAGT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCAT---ACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAATAGATTCATTTTTTAAAT
* * * * ** * * *
11388693 CTATAACTCATTAA-TTTT-ATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAACTTGTA
62 CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATA
* * * * * * * *
11388756 TTAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATTATA-ACATTT-AAACTAA
126 TGAACATAAA-AAATATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATACA-ATTTGAAA-TAA
* * * * * *
11388810 ATAATTG------T--TCA-A--ATTTGAACTCGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * *
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66 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTATATGAA
* * * * * *
11388928 TAGAAAGAAT-TGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATA-ATGATTTGAAATAG
130 CATAAAAAATAT--TTTATGACAAAAGAAAAGGTCATACA--ATTTGAAATAA
* * * * * * * *
11388979 GTAATTGTTCAAATAATCAAAACTATTTGAACGTGTTAAGA-AAACATATTTATTTTTTAAA-CT
1 ATAATTGTTCAAATAGTC-ATACTATTTGAACTTGTT-CGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCT
* * *
11389042 TTTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATAAATGTA-TATTATTTT-A-T----T---CTTGTATG
64 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATG
* * * * * * *
11389097 AATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATATTTTGAAATAG
128 AACATAA-AAAATATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATACA-A-TTTGAAATAA
* * * * * *
11389150 ATAATTGTTTAGATTGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATGAATAGATTCTTTTTTTTAATTCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTC-ATTTTTTAAATCT
* ** * *
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64 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGA
* * * * * * *
11389280 AC-TGAAACCATTATTTTATTACAAAAGACAAGGTCCTAATAATTTGAAATAG
129 ACAT-AAA-AAATATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAT-ACAATTTGAAATAA
* * * * * * * *
11389332 ATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTCAACAAACATATTTATTTTTTAAATCTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTC
* ** ** ** *
11389397 TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA
65 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAA
* * * * * *
11389462 CAAAAAAAATATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATTACAAGTTGAACTAA
130 CATAAAAAATATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCA-TACAATTTGAAATAA
* * * *
11389512 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGGACTTGTTCGGT-AATA-A--AATTTTTTAAAAATC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTT--AAATC
* * * *
11389573 TGTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAACTTTGTATTATTTT-ATTCGAAATAAGCTTGT
63 TCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTAT
* *
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125 ATGAACATAAAAAAT-ATTTTATGACAAAA-GAAAAGGTCATA-CAATTTGAAATAA
* * * * * * *
11389692 ATAATTGCTAAAATATTCATATTTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTC
* * *
11389757 TTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA
65 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAA
* *
11389822 CATAAATAATTTTTTATGA
130 CATAAAAAATATTTTATGA
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ATAAAAAATATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATACAATTTGAAATAA
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* * * *
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* *
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66 CGATAAATAGATTCTATTTTTTAATTCTCTTA-TCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* ** * * * * * * *
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130 TTATTTT-CTTCAAACAAACTTATATGAACTAAAAACATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
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* * *
11389382 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATTTGA
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** * * *
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* * * **
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* * *
11389573 TGTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATA-ACTTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGT
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* * * *
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* * ** * ** * *
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* * *
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*
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* *
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* *
11390100 TATTATTTT-TTCAAACAAACTTATATGAAC-AAAAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
128 TATTATTTTCTTCAAACAAACTTATATGAACTAAAAACA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
11390163 ATAACGATTTGAAATAGATAACTT-TTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-TAGTT-AGATAAAT
192 ATAACAATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTCA-ACAAAC
* ** * * **
11390225 ACAATTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTCATTTTATTTT-A
254 ACAATTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAA
** * * * *
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* * * * * * **
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* **
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* ** * * ** *
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512 TATGAACAAAAATAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTCAAATAAACAATTAC
* * * *
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*
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11390663 GAATGTTCAA
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Consensus pattern (852 bp):
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TATTTTCTTCAAACAAACTTATATGAACTAAAAACATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAACAAACACAATTA
CTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAAT
AAGCTAATATGAATCAAAAAAAATATTTTATAATAAAAAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAAT
AATTGTTCAAATAGTATAAACGATTTGAACTAGTTTAGCAAATAAAATTATTTTAAAAATCTCTT
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AAATAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTCAAATAAACAATTACTAAAACAGT
CATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAA
AAGATTAATGAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACATAAATAATTTTTTATG
ATAAACCAAAAGGCCATAACGATTTGATCTAGTTTGATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTA
CTTATTAATTATTGAAATTTTAGTAAATTACTATTATTTTAACCCGAATAAGCTTGTATGAACAT
ATAATAG
Found at i:11390346 original size:180 final size:180
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTAG-
* * * * * ** *
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* * ** *
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129 ATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATGAAAA-AATTATTTTATAACAA
* * ** * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * *
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66 -AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
** * * * * * * *
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* * * * ** * * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAG-
* * * ** *
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64 TT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* ** *
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128 TATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATGAAAAAATTATTTTATAACAA
* * * * *
11390873 AACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATAA-AGTCTTAATTGTTTGAACT-GC
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAG-
* * * *
11390936 TTCAGCA-AAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTCATTTTTAAAATATTACTAAATTA
64 TT-AG-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * *
11390999 GTATTATTTTATTTTAAAAAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTATTTTATAATGAAA
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* * * * *
11391056 TAAAAAAAGGTTATAA-CATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAAG--AT--CTA---G---T--
1 -AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTAG
* * *
11391108 TCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATATAC-TACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAG
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* * * * *
11391171 TATTATTTTATTCTGAATATGCTTGTATG-ATGAAAAATAAGTATTTTATGATAA
128 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATG-AAAA-AATTATTTTATAACAA
* * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-T
* * * * * *
11391288 TTGATAAACTA-ACTTA-TTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAAT
65 TAGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
11391351 ATTATTTTATT-TCAAATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAA
129 ATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAAAATTATTTTATAACAA
* * * * * *
11391404 AACAAAATGTCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * * * *
11391469 TGGTAAACGGATTTAATTTTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAAT
66 AGATAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * *
11391533 ATTATTTTATT-TGGAATAAGCATGTATGAACTGAAAAAATTATTTTATGACTA
129 ATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAAAATTATTTTATAACAA
* * * * ** ** *
11391586 AAGAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAATT
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * * * * *
11391651 CA-ACAAACATATTTATTGTTTAAA--TC-T-CTTATCAATTTTT-ATTATGTTATTAATTTAGT
66 -AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT
* * * * *** *
11391710 AATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTCTGAGCAAAAACAATTATTTTATGACAA
129 ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATGAAAA-AATTATTTTATAACAA
* *
11391763 AACAAAA-ATTATAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAGT
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * *
11391825 TCGATAAATAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
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** * * * *
11391886 TTATTTTATTCTAAATAATTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAA
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* * * * * * *
11391938 AACAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTA-T
1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGT
* * * * ** *
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65 TAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT
* * * ** **
11392065 ATTTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAGCAATTATTTTACGACAA
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* * * * * *
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* * * * ** *
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** * *
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* * *
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* * * * * ***
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* * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * * ** * *
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* * * * * * * *
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128 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAAAATTATTTTATA-ACAA
** * * * * *
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* * *
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* * *
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11393029 A
180 A
* * * * * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * * ** * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * * * * * ** *
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* * * ** * *
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* ** * * **
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * *
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66 AGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * ** * * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-T
* * * * *
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* * * *
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* *
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60 CTAGTT-AGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
11395818 TATTCAAATA
Statistics
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* * * *
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* * *
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* * ** * *
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* * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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256 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * *
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* * * *
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1 -AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTAG
* *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* *** * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * ** ** * ** *
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* * ** * * * * * * *
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* * *
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* * ** *
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* * * *
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** * * * * ** *
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* * * * ** *
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** * *
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* * * * * * *
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* * * ** **
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* * * * * *
11392314 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAAGT-GTTAAGATAAA-AGAT
195 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTAGTTCAG-TAAACAAAT
* * ** *
11392377 TTA-TTTTTAGAAT-TTTTGCTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTTA-TATTAATTTA-TT
258 TTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * ** * ** **
11392438 CAAAATAAGCTTGCATGAATGAAAACGATTAATTTGGGACAA
321 C-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
11392480 AGCAAAAGGTCATAA-TATTTTAAATGGATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTGAA-TATGG
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GT
* ** * * * *
11392543 TTGGTAAATAGATACATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTCAGACTATTAATAAATTAGT
65 TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
11392607 ATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATTTGAACTAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCAT
129 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
11392672 AATGATTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATTGTCATGACTATTTCAACTTGTTCAGTAAACATAT
194 AACGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAAT
* * * * ** *
11392736 TTATTTTTTAAATCT-TTAACTAATTAATTGTCAAAAAATTAATAAATTAACATTATTTTA-ATC
258 TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * *
11392799 TGAATAACCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAAGGCAA
322 -GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
** * * * *
11392840 AACAAAAATTCATAACAATTTGAAATAAATGAAATAAATAATTTTTCAAATAATCATAACAATTT
1 AACAAAAGGTCATAACAA-TT----T--A--AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* *** * *
11392905 GAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTA
57 GAACTAGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTA
* * * * *
11392968 ATAAACTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAACTATTTTATGATAAAA
119 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTATTTTATGACAAAA
* * ** * * * * * *
11393032 TAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TCATAATTATTTAAACTTG-TC
183 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC
* * * * * *
11393095 TGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAAT-TTGATAATTTGGTA
247 -AGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
** * * ** * *
11393159 TTATTTTATTTTTAATAAACTTATATGAACTGAAGCAATTCTTTTATGACAA
310 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * * * * *
11393211 AGCCAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGATTAATTGATCTAGTT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * * * * ** *
11393276 CGGTATACATATTTATTTTTTGAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAGTAAATTAGTAT
66 TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
11393341 TATTTTAATTT-GAGTAAGCTTATATGAACAAAAAGAAATTATTTTAT-AGCAGAACAAAAAGTC
131 TATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAA-AAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTC
* * * * ** * *
11393404 ATAACAATTTGAAATAAATAATT-TGTTAAATAGTCACAACTATTTGAACCGGTT-TGATAAATA
192 ATAACGATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACA
* * * *
11393467 GATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAGTTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATT
255 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * *
11393528 TCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAA
320 TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* ** * * * * * *
11393570 AACAACAGGTCATAATGATTTAAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTTAATTGGTT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * *
11393635 AGGTAAACAAAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-TTT
66 TGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* ** * * ** ** * * *
11393699 TTAATAAATTCCAAATAAGCTGGTATGAATTGAAAATTTTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCAT
130 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * *
11393764 AAC-ATTTTGAAATAGATAATTGTT-ATTATAGTCTTAAATATTTGAAATGGTTCAGCAAAGAAA
194 AACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAA
* * ** * *
11393827 TTTA--TTTTAAATTCTTTTAGTTATTAATTTTT-GGATATTATTATATTAGTATTATTTTATTT
257 TTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * * *
11393889 CGAATAAGTTTCAATCAACAAAAATAATTGTTTTATGATAG
321 CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
11393930 AACAAAAGATTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * *
11393995 TGGTAAATATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAGTTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTAT
66 TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * **
11394056 AATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGAATGATCAAAAACATT-TGTTATATGACCAAACAAAAGGAAA
131 TATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTAT-TT-TATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * ** *
11394119 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGC-AATGGCCATGATTATTTG-AC-ATGATTTGGTAAATA
193 TAACGATTTGAAATAGATAATTATT-CAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-G-TTCAGTAAACA
* * * * ** * * * * *
11394181 GATTCACTTTTTAAA-ATC--AAATATTAAATTTTGAAATATTACTAAATTTGTATTAATTTATT
255 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * ** *
11394243 TCGAATAAGCTTGTATGGACTAAAATGATTGTTTGATGACAA
320 TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * ** * * *
11394285 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAACAGATAACTGTTCATGTAGTCTTAATTGTTTGAACT-GCT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-T
* * * *
11394349 TTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTA
65 TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
** ** ** * * * * *
11394414 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACTATAATTTTATAAAAAAATAAAAGGTTAT
130 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
11394479 AACGATTTGAGATAGGTAATTACTCAAATAG---GAAC----TG--C---TTCGGTAAATAGATT
194 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATT
* * *
11394532 TATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA
259 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
**
11394593 ATAAGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAA
324 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * * * *
11394631 AA-TAAAGTTCATAACACTTTGAAATAGATAATTGTTAAAATTGCCAAAATTATTTGAAAT-GAT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-T
** * * * ** * * *
11394694 TCAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATGACTTACTTATTAA-TTTTCAGAATATTAAAAAAATTAT
65 TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT-AATAAATTAG
* * ** * *
11394758 TATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
128 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
11394823 ATAACTATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCA-TAAAACAA
192 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGT-AAACAA
* *
11394887 ATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
256 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * ** *
11394952 TGGATAAGCTTTTTTGAACTAAAATGACTGTTTTATGACAA
321 CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * ** *
11394993 AACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGCGCTTGT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * * * *
11395057 TTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTCG
65 TTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
11395121 AATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGATATGAGACAAA-TAATTTATGATTAAAA-AAAAG
128 TATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-A-CAAAAAAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAG
* * * * ** * * **
11395183 ATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTAGTTTAACAAAC
189 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAC
* * * * * * *
11395248 ACATTTATTTTTTACATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTATTCAATTAGCATTATTTT-T
254 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * *
11395312 AACCAAATAAGCTTTTATGATCAGAAACAATTATTTTATGACAA
319 -TTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * ** *
11395356 AA-TAAAGATCATAACAATTTGAGAAT-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTGGT
1 AACAAAAGGTCATAACAATTT-AAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * * * *
11395419 TCGATATATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
65 TTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
11395484 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATCATCAAAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCA
129 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * *
11395549 TAACGATTTAAAATAAATAATGTA--CAAGTGGCCATAATTATTTTAACT-GATTCAGTAAACAA
193 TAACGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAACAA
* * *
11395611 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAA-TTTTAGAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATT
256 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * *
11395675 TC-TATAAGCTTGTATTACCTAAAACAATTGTTTTATGACAA
320 TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * **
11395716 AACAAAAGGTAATAGGCATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGGAATAACTATTTGAA
1 AACAAAAGG---T---CATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* *** *
11395781 CTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTT
60 CTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
11395818 TATTCAAATA
Statistics
Matches: 4311, Mismatches: 960, Indels: 417
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
344 5 0.00
345 82 0.02
346 160 0.04
347 40 0.01
348 25 0.01
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350 80 0.02
351 123 0.03
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353 5 0.00
354 18 0.00
355 192 0.04
356 214 0.05
357 70 0.02
358 201 0.05
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360 610 0.14
361 640 0.15
362 475 0.11
363 356 0.08
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366 15 0.00
367 65 0.02
370 46 0.01
371 200 0.05
372 34 0.01
373 3 0.00
374 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (361 bp):
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TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTA
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
Found at i:11390821 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 11390068--11392456 Score: 555
Period size: 180 Copynumber: 13.3 Consensus size: 180
11390058 TTTTAATTCT
* * * *
11390068 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGATTAGTATTATTTT-TT-CAAACAAACTT-ATATGAAC
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* * * * * ** * * *
11390130 AAAAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACTTTTCAA-AT
64 AAAAA-AATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATT-AACAA
* * * *
11390194 AGTCATAATTATTTAAA-CTAGTT-AG-ATAAATACAATT-ACTTTTTAAATCTCTTA
127 AGCCATAATTATTTAAACCGA-TTCAGCA-AAA-A-GATTCACATTTTAAATCTCTTA
* * * * ** *
11390248 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTCA-TTTTATTTTATGCTGAATAAGC-TAATATGAAT
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAA-
* * * * ** * * * * *
11390311 TTAAAAAAATGTTTTATAAT-A-AAAA-AAA-TGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAT
63 -CAAAAAAAT-TATTAT-ATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATTAAC
* ** * * * * * **
11390372 ATAG-TTTAAACTATTTGAA-CTAGTTTAGCAAATAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
125 AAAGCCAT-AATTATTTAAACCGA-TTCAGCAAA-AAGATTCACATTTTAAATCTCTTA
* ** ** * * * * *
11390428 GTTATTAATTTTTGGAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACAA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAA
* * * * * * ** * * *
11390493 AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTATTCAA-ACAG
66 AAA-AATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATT-AACAAAG
* * * * * * *
11390557 TCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAACAA-ATTTA-TTTTTAAATCTCTTA
129 CCATAATTATTTAAACCGA-TTCAGCAAA-AAGATTCACATTTTAAATCTCTTA
* * * **
11390608 CTTATTAATTTTTAAAAGATTAATGAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGAATGTTCAA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAA
* * * * **
11390673 AAACAATTGTTATATGACCAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAGCTGTTAACATGGC
66 AAA-AATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATTAACAAAGC
* * *
11390738 CATAATTATTTAAACCGATTCAGCAAACATATTCACATTTTAAATCACTTA
130 CATAATTATTTAAACCGATTCAGCAAAAAGATTCACATTTTAAATCTCTTA
* * * * *
11390789 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGAACCA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAA
* * * * * * * * *
11390854 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATAAAGTC
66 AAAAATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATTAACAAAGCC
* * * * * * **
11390919 TTAATTGTTTGAACTGCTTCAGCAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
131 ATAATTATTTAAACCGATTCAGCAAAAAGATTCACATTTTAAATCTCTTA
* * * ** * *
11390969 ATTATTCATTTTTAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAAAAGCTTGTATGAACTA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAAC-A
* * * * * *
11391034 AAACAATTATTTTATAATGA-AATAAAAAAAGGTTATAA-CATTTAAAATAGATAATTATT--C-
65 AAAAAATTA--TTAT-ATGACAA-AACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATTAACA
* * * * * ** *
11391094 AA---ATAA-GATCT--A--G-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATAC-TA
126 AAGCCATAATTATTTAAACCGATTCAGCAAAAAGATTCACATTTTAAATCT-CTTA
* * ** * * **
11391140 CTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTGTATGATGAA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAA
* * * * * * * * * *
11391205 AAATAAGTATTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAG-TAATTGTT--CAAATG
66 AAA-AATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATTAACAAA--
* ** * * *
11391267 GCCATAATTATTTGAATTGATT-TG-ATAAACTA-ACTT-A-TTTTTAAATCTCTAA
128 GCCATAATTATTTAAACCGATTCAGCA-AAA--AGA-TTCACATTTTAAATCTCTTA
* * * * * * ** *
11391319 CTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAAC-A
* * * ** * * * * ** * *
11391384 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTCAA-ATAG
65 AAAAAATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATT-AACAAAG
* * * * ** * ** * * *
11391448 TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACGGATTTA-ATTTTTTTAATTTCTTA
129 CCATAATTATTTAAAC-CGATTCAGCAAAAAGATTCACA--TTTTAAATCTCTTA
** * * *** * * *
11391501 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTGGAATAAGCATGTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAAC-A
* * * * * * ** * * * * *
11391566 AAAAAATTATTTTATGACTAAAGAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTTA-ATAG
65 AAAAAATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACT-ATTAACAAAG
*** * * ** * * * * *
11391630 TTTTAACTATTTGAACTAATTCAACAAACATATTTA-TTGTTTAAA--TC-T-
129 CCATAATTATTTAAACCGATTCAGCAAAAAGATTCACAT-TTTAAATCTCTTA
* ** * * * * * ** *
11391678 CTTATCAATTTTTATTATGTTATTAATTTAGTAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTCTGAGCAA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAA
* ** * * * * * *
11391743 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AATTATAATGATTTAAGATAGATAATTGTTCAA-ATAG
66 AAA-AATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATT-AACAAAG
* * * * * *
11391806 TCA-AACTATTTGAA-CTAGTTC-G-ATAAATAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-
129 CCATAATTATTTAAACCGA-TTCAGCA-AAA-AGATTCACATTTTAAATCTCTTA
* * * * *
11391853 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA-TTTTATATGAATA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAACA
* * * ** ** * **
11391917 GAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAA-TAGTT--CAAA
65 -AAAAAATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTA-TTAACAAA
* * * * ** ** * * * ** **
11391979 TGGACATGACTATTTGAACTTATTTGGTGAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAA
128 --GCCATAATTATTTAAACCGATTCAG-CAAAAAGATTCACATTTTAAATCTCTTA
* * *** *
11392034 CTTATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAG-ATTTATTTTATTTTGAATAAGCTT-ATATGAAT
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAAC
** * * * * * * * * * *
11392097 AGAAGCAATTATTTTACGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAA-AT
64 A-AAAAAATTATTATATGACAAAACAAACGGTAATAATAATTTAAAATAGATAACTATT-AACA-
* * * ** * * * * ** *
11392161 AA-TCATAACTATTTGAACTCG-TTTGGTAAACAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTA
126 AAGCCATAATTATTTAAAC-CGATTCAGCAAAAAGATTCACATTTTAAATCTCTTA
** * * ** *
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*
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*
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* ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* ** * *
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* * *
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* *
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* * *
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*
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* **
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*
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* * * *
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* * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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* **
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* *
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*
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* * *
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * ** ** *
11395546 TCATAACGATTTAAAATAAATAAT-GTACAAGTGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTCAGTAAAC
188 TCATAACAATTTAAAATAAATAATAGTTCAAATGAACATAACAATTTGAACTTG-TTCAGTAAAC
** * * *
11395609 AAATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTTTAGAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTAT
252 AAATTTATTTTTTAAATCTACTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAT
**
11395674 TTCTATAAGCTTGTAT
314 TTGAATAAGCTTGTAT
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TTTAATCTAAATAACCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACA
ATTTAAAATAAATAATAGTTCAAATGAACATAACAATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATT
TTTTAAATCTACTACTTATTAATTTTTAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTGAATAAGCTT
GTATGAATAGAAAAACTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
TCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTAT
TAATTTTCGAAATTTAATAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAAT
TATTTTATGACAAAACAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
TTTGAAACTGTTAGGTAAAAGATTTATTTTTTGAATTTTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAAT
AAATTTATATTATTTTATTAGAATAAGCTTGTATGAATGAAAAGATTAATTTAAGACAAAGCAAA
AGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAATAGTCATAACTATTTGAATATGGTTGATAAAT
AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
GAAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
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* * * *
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* * * * *
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* ** *
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* ** * * ** *
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1 AATCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * ****
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* * * * ** **
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1 AATCAATTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
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* * * *
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127 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCA
* * * * * *
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1 AATC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
11396651 TTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAAATTTAT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACT-AATTTAT
* * ** * * * * * * *
11396715 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGTGATTTAAGAAGTCAATTTATTTATCG
128 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * * * * * * *
11396768 AATTAGTTCAAATAGTCT-TGTCCAATTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTAT
1 AATCAATTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
* * ** * *
11396832 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTAAAAATAAAAAATACTAATTTATTA
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAATTTATTA
* ** * ** * * * *
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130 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * *
11396949 AA-CAAGTTCAAATAATTATG---ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCCTTATGAACTTTTGT
1 AATCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
11397010 TTTGTCATAAAATAATTGTTTC-GAT-ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATC
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* * *
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129 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * * *
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1 AATCA-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGT
* *
11397189 TTTGTCATAAAACAATTTTTTCCA--ACATACAAGCTTATT--AAATAAA
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11397235 ATCGTTATTA
Statistics
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AATCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAATTTATTAA
TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * ** * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
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66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * *
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* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* **
11396301 ATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTGA-CGAAATAAAAT-A-A-T-A-TTATTAATATT
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* ** * **** **
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* * * ** ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
11396658 TAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
** * * * * * * * **
11396721 TCCAAAAATTAATAA-CTAAGTGATTTAAGAAGTCAATTTATTTATCGAATTAG
129 TCC-AAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * *
11396774 TTCAAATAGTCT-TGTCCAATTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** *
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65 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * *
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* * * *
11396955 TTCAAATAATTATG---ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCCTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
11397017 TAAAATAATTGTTTC-GAT-ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATCAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
11397080 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACAAAATC-AG
130 CCAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAG
* * * * * * *
11397131 ATCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
11397196 TAAAACAATTTTTTCCA--ACATACAAGCTTATT-AAATAAAAT
66 TAAAACAATTGTTT-CAGTTCATACAAGCTTATTAAAATAAAAT
11397237 CGTTATTACC
Statistics
Matches: 941, Mismatches: 197, Indels: 84
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 22 0.02
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Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
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CAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
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* * * *
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* * * *
11397453 TCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAATTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
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* ** *
11397518 GTTTGAAAATTCATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGTGGAACT
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* ** *
11397570 AGTTCAAATTGTTAAG-CTTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTTTGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-TTTTGTTTTG
* * * * *
11397634 TCATAAAACAATTATTTTTGATCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTATTTATGATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * *
11397699 -TTT-AGAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTG-TT-TACCAAAT
129 GTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGT-CCAAAT
* * *
11397748 CATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-TTAACCTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT-ACTTTTGTTTTG
* * * * * * *
11397812 TCATCAAACAATTGGTTCTAT--TCATACTATTTTATTCTAAAA-AATAATTATGGC-CATTTGA
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* * * ** *** ** * ** *
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*
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176 CAA--AT
* ** * * * * ** ** **
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* * * * * * *
11398000 TT-T-AAAAAATAAATATGTTTACCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAAAA
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* * ** * * * * * ** *
11398063 TAATACAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAATCTATTTA
110 TAATACTAATTTAATAATAGTTTGAA-AATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTG
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174 TCCAAAT
* * * * * *
11398133 AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATTTATTTC-AATCGTTATGACTTTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-TTTTGTTTTG
* * * *** * *
11398197 TTATAAAACAATTGTTT-TCATTCATAC-AATCTTATT-TGGATAAAAATAATATTAATTTATTA
64 TCATAAAACAATTATTTATGA-TCATACAAAT-TTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAATA
* * * * * * * **
11398259 ATATTTTGACAA-TAAGTAAGTATA-ATATTTTAAAAATAAATATG-TT-TACTGAAT
126 ATAGTTTGAAAATTAA-TAACTA-AGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGT-CCAAAT
** * * * * * * *
11398313 AAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCA
1 -AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA-CTTTTGTTT-T
* * * * * * *** *
11398378 G-CAAAAAACAATT-GTAACAGTTCATATAGCCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTGAATAA
63 GTCATAAAACAATTATTTA-TGATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAA
** * * * * * * * *
11398441 TA-TTCCAAAAATTATTGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTG-TT-TACCAAACA
127 TAGTT-TGAAAATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGT-CCAAA-T
* * * ** *
11398495 AGTTCAAATAGTTCTGACTATTTGAATAATTATCTATGTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-TTTTGTTTTGT
* * * ** * * *
11398560 CATAAAATAATTATTTCT-ATTCATATAAGCTTATTTCGAAA-AGAATAA-A-T--TTT-TTAAT
65 CATAAAACAATTATTTATGA-TCATACAAATTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
** * * * * * * * * *
11398618 TTTTTAAAAATTAATAA-GAAAAAATTTAAAAAATAAATTT-ATTTTCTGAACAC
128 AGTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGTC-CAA-AT
* * *
11398671 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTCATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTA-CTTTTGTTTTG
* * * * * * *** *
11398734 TCATAAACCAAATGTTTTTGTTCATACTAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTATTTATGATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
** * * * * * * *
11398799 -TTCCAAAAATTAATAAGTGAA-A-ATTTTAAAAAATAAA-TCGTTTATCGAGCA-
129 GTT-TGAAAATTAATAACT-AAGAGA-GTTAAAAAATAAATTTGCTTGTCCA-AAT
* * * * * * * *
11398850 AGTTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTCCATAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTA-CTTTTGTTTTG
* * * * *** * * *
11398914 TGATAAAATAATGT-TTCTAT--TCAAACAAGTTTATTTGGAATAAAAAAAAACTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAAT-TATT-TATGATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* ** * ** * * *
11398976 TA-TTCTAAAAATTAATATGTAGGAGAACTAAAAAATAAATATT-TTTATCGAACA-
127 TAGTT-TGAAAATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAAT-TTGCTTGTCCAA-AT
** * * * *
11399030 AGTTCAAATAGTCATGTCCATCTG---AATCAT-TA--T--AA-C----TT--TTTTGTTTTGTC
1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
11399080 ATAAAACAACTGTTTCT-ATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTGATAT-ATCAAGA
66 ATAAAACAATTATTTATGA-TCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATA
* * * * * * *
11399143 TTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAAAT
129 GTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGTCCAAAT
* * ** * *
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1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACT-TTTGTTTTGT
* * ** *** *
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* * * * * * * ** **
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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63 GTCATAAAACAATTATTTAT-GATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* ** * * * * * * *
11399497 CA-TTCAAAAAATTAATGAGC-AAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA-
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* * * *
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* * * * * *** *
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* * * * ** ** ** * * ***
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* *** * * * * * * *
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* * * ** * * *
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65 CATAAAACAATTATTTATGATCATACAAATTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * *
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129 GTTTG-AAAATTAATAACTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGCTTGTCCAAA-T
* * ** * ** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-TTTTGTTTTGT
* * * * ** *** * * *
11399974 CATATAATAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTATTAACA
65 CATAAAACAATTATTT-ATGATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * *
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129 GTTTG-AAAATTAATAA-CTAAGAGAGTT-AAAAAATAAATTTGCT-TGTCCAA-AT
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-TTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
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65 CATAAAACAATTATTTAT-GATCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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1 -AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA-CTTTTGTTTTG
* * * * * * ** ** * *
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*
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* * * *
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* **
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* * * *
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*
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TCATACAAGCTTATTCTAAAAAATAATTATGGCC
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* * * * *
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* *
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* * *
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* *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * ***
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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127 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
*
11398775 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGAAAATTTTAAAAAATAAATCGT
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* * * * * * * *
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* * * * * ***
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129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA--A-AATTTAAAAAATAAAT-
** * * * * **
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61 CGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * **
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* * * * ** * *
11399119 TAAAATAATACTGATATATCAAGATTTTGAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAACTAAATCTGTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATC-GTT
* * *
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* * * * *** *
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129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAAT-CG
* * * * ** * * * * *
11399359 TTTTTTGAACCATTTCAAATCTTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCTAATCGTTTTGACC
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* ** * * *
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128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
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* *
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* * * *
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*** * * * ** * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATC-G
* * * * ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
11399836 TAAAAATAATATTAATTTAATAATATTGCAAAAATTAATAAGT--GATTTAAAAAATAAATGTGT
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAAT-CGT
* * * * * ** * * *
11399899 TTGTCAAACCAA-TTCAAATAATTAAGAATATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAAC
64 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC
* * * * * ***
11399962 ATTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAA
127 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
11400014 TAAAATAATGCTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--TAAAATTT-AAAAAATAAAT-C
* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * *** **
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* * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATC-GTT
* * * * * ** * *
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* * * * * * ***
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* * *
11400553 TAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTCCAAAAATTAAT-AGATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
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11400616 CATTTGCCAA
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* * * * ** * *
11399054 AATCATTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTA-TTCATGCAAAATTATTCAAA
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* * * * * ** * *
11399118 ATAAAATAATACTGATATATCAAGATTTTGAAAATTAAT--AAGAGATTTAAAAACTAAATCTGT
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** * * * ** *
11399181 TTATCGAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-
126 TTATCGAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * ** * *
11399245 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATAAAAGCTTTTTTGGATTAAAATAATACTAAT
191 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
11399310 TTAATAAAATTTCAAAAATTAGTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAACCATTT
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** * * *
11399374 CAAATCTTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCT
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* * * * * ** *
11399411 AATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATAATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTAGAAC
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* *
11399476 AAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTG
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* *
11399541 TTTATCGAA-CAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGCCATTATG
125 TTTATCGAACCAA-TTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATG
* ***
11399603 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATAC
187 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
*** * * ** *
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* * * * *
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* * *
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* ** *
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* * * * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * **
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* * *
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* * * * * * ** *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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316 AGTT-CAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCAATTTCA
** * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * *
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** * **
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* * * * * * **
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* * * *
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** * * *
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* *
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*
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** * *
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** * * *
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* * *
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*
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* * * * *
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* **
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* *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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190 ATAAAAAAATTGTTTCTCATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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TATATTAATATTTTAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACTATTTTTCGATCAGTTCC
AATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATCTCAAATCATTATAATCTTTGTTTTCTCATAAAA
AAATTGTTTCTCATCATACAAGCTTATTTGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA
TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCAAACCAATTCAAATAATTAAGAATATTAGAAT
AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACA
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AAAATAAATATGTCTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAA
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1 ATA
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*
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1 AAAA
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*
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1 TATTTTTAT
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1 TATT
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** * **
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*
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*
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63 TCGAGATCCAAACTTGAGTAACCAGGAAT
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* * *
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*
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* *
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66 ATCTCT
11419010 ATCCATGAAA
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ATCTCTT
Done.