Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168383.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_600, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 21833
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Found at i:663 original size:356 final size:353
Alignment explanation
Indices: 4--2369 Score: 1108
Period size: 352 Copynumber: 6.8 Consensus size: 353
1 TAT
* * * *
4 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA-AA-
* * * *
69 AAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTATTTCG
64 AAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTTAAATTAGTTCG
*
133 ATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
129 ATAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* *** * *
198 TTTCAAATCAACTTGTTGTTGAAAAAGAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGACTTG
194 TTTCAAATAAACTTGTTGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGACTTG
* * * * * * ** *
263 AAATATATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAATTGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTA
259 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAAATGATTCG-CAAACACATTTAGTTTTTA
328 AA-TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
323 AACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
356 TAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAA
** * * * ** *
421 AAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTTTTTAAATAATAATAACTATTTGAGCTT-GTTCGG
66 AAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTT-AAATTAGTTCGA
* * * *
485 TAAACATATTTATTTTTTCAAATCTTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTA
130 TAAACAGATTTA-TTTTT-AAATC---TCTTACTAA-TTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
549 TTTTA-TTCTGAATAAACTTGTTGAACTAAAACAATTATTTTATGACT-AAGCAAAAGGTTAA-A
189 TTTTATTTC-AAATAAACTTGTTGAACAAAAACAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAGG-TAATA
* * * * *
611 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTGTTCGAAATGATTCGCAAACACATTTA
251 ACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAAATGATTCGCAAACACATTTA
*
676 GTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAT
316 GTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
715 TAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATG-ATAAGAAACAATTTTTTTATAACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * ** * * *
779 CAAAGATCATAGTAA-TT----T-G---AC-A---AAA-CA-AA-AA-TATTTGAACTAGTTCAG
65 AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTTAAATTAGTTC-G
* * * *
827 A-AAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAA-TAGTATT
129 ATAAACAGATTTA-TTTTTAAA--TC-T-CTTACTAATTCTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATT
** * * ** * * * *
890 ATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAA
188 ATTTTATTTCAAATAAACTTGT-TGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAA
* * * * * * * * * * *
954 TGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAACTTG-TTAGTAAACATATTAA
252 CGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAA-ATGATTCGCAAACACATTTA
* *
1018 TTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAA
316 -GTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* *
1058 TAAATTAG---TA--TTATT-T---T----TTG-A--AAT------AATTATTTTATGACTAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAA
* ** * * * ** * * *
1101 AAAAG-TCAGAATTATTTGAAATAGATAATTGTTCCAATAATCTTAACTATTTGAACT-GATTGG
65 AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTTAAATTAG-TTCG
* * *
1164 CA-AAACACATTTATTTTT--A-----T--T-A---TT--AA-ATTAGT--ATTA-TCTTA----
129 -ATAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * *
1205 ATCT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGAT
193 ATTTCAAATAAACTTGT-TGAACAA-AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGAC
** * * * * * * *
1267 TTGAGCTAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAATAGATTTAGTTT
256 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAAATGATTC-GCAAACACATTTAGTTT
* * * *
1332 TTAAA-TC-T-CTAATTAATTTTTAAAATGTTAG
320 TTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * ** * * *
1363 TAAATCAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTACGACAAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-
*** * * * * * *
1428 AAAA-TGTCATAATGGTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGA-CATGACTATTTGAATTTGTTT
65 AAAAGT-TCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATA-ATAATAACTATTTAAATTAGTTC
* * **
1491 GGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACCATTAATT-TT-AGAATATTAAT-AATTAGTATT
128 GATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-C--TAATTCTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
1552 ATTTTA-TTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAA-AATA--TCATAA
188 ATTTTATTTCAAATAAACTTGT-TGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAA
* * * ** * * ** * *
1613 CTA-TTCGAAATAAATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAGCTTGCTCCATAAATAGATTT
252 CGACTT-GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGA-AATGATTCGCAAACACATTT
* * * * * *
1676 ATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAACACTAA
315 AGTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * * *
1716 TAAATTAGTAGTATTTTTTTC-AAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGGTTTATGACGAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAA
* * * * * * * * *
1780 AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAATGT-GTTCA
65 AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTTAAAT-TAGTTC-
* * *
1844 GA-AAATAGATTTATTTTTAAAATTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATT
128 GATAAACAGATTTATTTTT-AAA--TCT-CTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * ** * *
1907 ATTTTA-TTCGAAATAAGCTTCTATGAACAGGAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCAA-
188 ATTTTATTTC-AAATAAACTTGT-TGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGT-AAT
* * * * * ** *
1970 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATGACTATT-TAAACTTG-TTCAGTTAACAGA
250 AACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAAA--TGATTC-GCAAACACA
* * * * *
2033 TTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTAGGAATA-T--
312 TTTAGTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * **
2073 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAAAAGCCTATATGAACTA-ATACAATTGTTTTAAAATCAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAA
* * * * * * * * * * *
2136 CAAAAGGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTT-TTTC
64 AAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTT-AAATTAGTTC
* * * * *
2200 -AGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTATTTGTCAAAGTATTAATAAATTAATAT
128 GA-TAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCTTACTAATT-CTTG--AAA-TATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * *
2264 TATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTGTGAACAAAAATAATTGTTTTATGAAAAAATAAAAAGTCAT
187 TATTTTATTTC-AAATAAACTTGT-TGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAAT
* * * *
2328 AACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
250 AACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
2370 TGAACTTTCA
Statistics
Matches: 1577, Mismatches: 283, Indels: 302
0.73 0.13 0.14
Matches are distributed among these distances:
304 5 0.00
305 19 0.01
306 1 0.00
307 2 0.00
308 4 0.00
309 88 0.06
310 21 0.01
311 1 0.00
314 6 0.00
315 2 0.00
317 5 0.00
318 5 0.00
319 1 0.00
320 2 0.00
321 20 0.01
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323 1 0.00
324 1 0.00
326 5 0.00
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330 5 0.00
334 3 0.00
335 2 0.00
337 10 0.01
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341 15 0.01
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345 3 0.00
346 8 0.01
347 4 0.00
348 4 0.00
349 38 0.02
350 34 0.02
351 56 0.04
352 193 0.12
353 57 0.04
354 19 0.01
355 47 0.03
356 155 0.10
357 138 0.09
358 111 0.07
359 113 0.07
360 55 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (353 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAA
AAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATAATAACTATTTAAATTAGTTCGAT
AAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TCAAATAAACTTGTTGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGACTTGAA
ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAAATGATTCGCAAACACATTTAGTTTTTAAAC
TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
Found at i:721 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 4--771 Score: 750
Period size: 176 Copynumber: 4.3 Consensus size: 179
1 TAT
* *
4 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATA-AAC
* * *
69 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTATTTCG
64 AAAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGA-TTCG
* *
133 ATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTAC----TAATTCTTGAAATATTAA
128 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * *
180 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATCAACTTGT-TG-TTGAAAAAGAATTGTTTTATGATAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAACTTGTATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGAT-AA
* * * * * *
242 ACAAAAGG-TAATAACGACTTGAAATATATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAATTGATT
62 ACAAAAGGTTAA-AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATT
*
306 CGATAAACTGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
126 CGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * * *
356 TAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAA-A
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAACA
* * ** * * * * **
420 AAAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTTTTTAAATAATAATAACTATTTGAGCTTG-TTCG
65 AAAGGTT-AAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-AATGATTCG
* * * *
484 GTAAACATATTTATTTTTTCAAATCT-TTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA
128 ATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* *
536 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGT-TGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAGC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAC
** * * * *
600 AAAAGGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTGTTCGAAATGATTCG-
64 AAAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGA
* * * *
664 CAAACACATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAT
129 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
715 TAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATG-ATAAGAAACAATTTTTTTAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAAT-A-AAACAATTGTTTTAT
772 AACAAAACAA
Statistics
Matches: 482, Mismatches: 78, Indels: 60
0.78 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
172 1 0.00
173 1 0.00
174 5 0.01
175 86 0.18
176 146 0.30
177 26 0.05
178 13 0.03
179 91 0.19
180 100 0.21
181 13 0.03
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (179 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGATAAACAA
AAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATA
AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
Found at i:1954 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1181--2373 Score: 1116
Period size: 177 Copynumber: 6.7 Consensus size: 180
1171 CATTTATTTT
* * * *
1181 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCTG-AATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * *
1245 ACAAAAT-AAAGATCATAA-TGATTTGAGCTAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAAC
65 ACAAAATAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
* *
1308 TGATTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATC-TCTA---ATTAATTTTTAAAA
129 TG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * ** * *
1357 TGTTAGTAAATCAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTACGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
1422 CAAAATAAAATGTCATAA-TGGTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATGACTATTTGAATT
66 CAAAATAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T
** * * * *
1486 TGTTTGGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAAC-CATTAATTTTAG-AA
129 TGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
1535 TATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTCG-AATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
1598 TAAAA-AATA--TCATAACTATTCGAAATAAATAATTATTCAAA-AGTCATAACTATTTGAGCTT
66 CAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATT
* * * *
1659 GCTCCA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAA
130 G-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * *
1710 CACTAATAAATTAGTAGTATTTTTTTC-AAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
1774 CGAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAATGT
66 CAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-T
* *
1839 GTTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTGAAA
130 GTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
1889 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTCTATGAACAGGAACAATTATTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
1953 ACAAAATAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATGACTATTTAAACT
65 ACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T
* * * * * *
2018 TGTTCAGTTAACAGATTCATTTTTTAAATC-TCTTACTCATTAATTTTAGGAA
129 TGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTGAAA
* * * *
2070 TA-T--TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAA-AAGCCTATATGAACTA-ATACAATTGTTTTAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * *
2129 AATC-AAACAAAAGGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGA
64 GA-CAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GA
* * * * * * * *
2193 CTTTTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAA
127 ATTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
2246 GTATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTG-AATAAGCTTGTGTGAACAAAAATAATTGTTTTAT
1 -TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
2310 GAAAAAATAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
64 GACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
2374 CTTTCAAACA
Statistics
Matches: 828, Mismatches: 149, Indels: 76
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
172 23 0.03
173 47 0.06
174 10 0.01
175 10 0.01
176 164 0.20
177 191 0.23
178 31 0.04
179 86 0.10
180 174 0.21
181 92 0.11
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG
TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAA
Found at i:2836 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 2519--2852 Score: 401
Period size: 181 Copynumber: 1.8 Consensus size: 182
2509 TTGTTCAGTA
* * *
2519 AACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAGCTAGAATTATG
1 AACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTAGAATATTAATAAACTAGAATTATG
* * * ** *
2584 TTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGTGATAGCACAAAAGGTTATAACAA
66 TTATTTCAAATAAACTTGTATGAAGAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* *
2649 TTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCATTGGGCAGGCT
131 TTTGAAATAAATAATTCTTCAAACAATCATAAATATTTGCATTGGGCAGGCT
* * *
2701 AACAGATTCA-TTTTTTAAAT-TCATTAGTTATTAAATTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTAC
1 AACAGATTCATTTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAAATTTTAGAATATTAATAAACTAGAATTA-
* * * * *
2764 T-TTA-TTCTGAATAAGA-TTGTATGACGAGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAACTA-GTCAT
64 TGTTATTTC-AAATAA-ACTTGTATGAAGAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAA-AAGGTCAT
*
2825 AACAGTTTGAAATAAATAATTCTTCAAA
126 AACAATTTGAAATAAATAATTCTTCAAA
2853 TAGTTAAACT
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 20, Indels: 11
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
180 5 0.04
181 109 0.86
182 13 0.10
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (182 bp):
AACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTAGAATATTAATAAACTAGAATTATG
TTATTTCAAATAAACTTGTATGAAGAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
TTTGAAATAAATAATTCTTCAAACAATCATAAATATTTGCATTGGGCAGGCT
Found at i:3483 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 2475--3847 Score: 874
Period size: 179 Copynumber: 7.6 Consensus size: 180
2465 GGATATAGCA
* * * * * * *
2475 AAATAACTCTTCAAA-AGTCATAACAATTTTTAACTT-GTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTTAA
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAA
** * * * *
2538 ATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGT
63 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT
* * * * ** *
2603 ATGAATAGAAACAATTGATTTGTGATAGCACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
127 ATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * ** * *
2657 ATATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCATTGG-GCAGGCT-AACAGATTCATTTTTTAAA
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTA-G-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * *
2720 T-TCATTAGTTATTAAATTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTA-TTCTGAATAAGATTG
64 TCTC-TTACTTATT-AATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTG
* * * * *
2783 TATG-ACGAGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAACTA-GTCATAACAGTTTGAAAT
126 TATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAA-AAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * ** *
2838 AAATAATTCTTCAAATAGTTA-AACTAATTGAGTTAATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAACTC
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
** * * * * * * *
2902 TCTTACTTATTAATTTTCAAAATAGTAATAAATGAATATTATTTTATTT-GAACAAACTTATTTG
66 TCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * **
2966 AA-A-AAAAAATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
130 AACAGAAAAAA-TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
** * * ** * * **
3016 CGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTGTTTGAGCTGGTTCAGCAAATGGAA-TTATTTTTTAAAT
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * *
3080 CTCTTACTAATT-TTTTTTGAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTA
65 CTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTA
* ** * *
3143 AGAACTA-AAAAAATT-TTTTACAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
128 TGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * ** * * * * *
3195 AAAGAATTGTTCATATACCCTTAACTATTTGAATTAG-TT--CAAATAAATTTATTGTTTAAATC
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
3257 CCTTAGTTATTAATTTTTAAGATATTATTATATTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTACG
66 TCTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * *
3322 AACATAAATAATT-TTTTATGATAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAAT
130 AACAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * *
3372 ATATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATC
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *
3436 TCCTACTTATTAACTTTTGACATATTAATAAATTACTATTATTTTATTCCAAAT-AGAATTGTAT
66 TCTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTAT
** * * * *
3500 GATGA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAATCGATTTGAAAT
129 GAACAGAAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAAT
* * * * * ** * ***
3553 AGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTTATTTGAACTGAATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAA
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAATTGGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
** * * * * * *
3618 TCTCCAACTTATCAATTTTTTAAAATATTAATAAAGTAATA-TATTTTATATCAGCATAAGCTAT
64 TCTCTTACTTATTAA-TTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCT-T
* * * * *** *
3682 -TATGAACTGAAACAATTGTTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAATGGTTTTAAAT
125 GTATGAACAGAAAAAATTG-TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * *
3738 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTTAA
1 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA
* * * * *
3802 TTTCGTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTT
64 TCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
3848 AAAAAAATAA
Statistics
Matches: 918, Mismatches: 224, Indels: 96
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.00
176 27 0.03
177 112 0.12
178 90 0.10
179 185 0.20
180 98 0.11
181 155 0.17
182 43 0.05
183 44 0.05
184 69 0.08
185 63 0.07
186 30 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA
ACAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
Found at i:3665 original size:184 final size:182
Alignment explanation
Indices: 3421--3753 Score: 410
Period size: 185 Copynumber: 1.8 Consensus size: 182
3411 TAGTAAACAA
* * * * * *
3421 ATTTATTTTTAAATCTCCTACTTATTAACTTTTGACATATTAATAAATTACTATTATTTTAT-TC
1 ATTTATTTTTAAATCTCCAACTTATCAACTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATAT-
3485 CA-AATAGAATTG-TATGATGAA-AAACAATTG-TTTTATGACAAAATAAAA-GTTCATAATCGA
65 CAGAAT--AA--GCTATGATGAACAAACAATTGTTTTTATGACAAAATAAAAGGTT-ATAAT-GA
3545 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTTATTTGAACTGAATTCGATAAATTG
124 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTTATTTGAACTGAATTCGATAAATTG
*
3604 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTTAAAATATTAATAAAGTAATA-TATTTTATA
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCCAACTTATCAA-CTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATA
* * * *
3668 TCAGCATAAGCTATTATGAACTGAAACAATTGTTTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAATGGTTT
64 TCAGAATAAGCTATGATGAAC--AAACAATTGTTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTT
*
3733 TAAATAGATAATTGTTCAAAT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAAT
3754 AGTCATAACT
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 12, Indels: 18
0.81 0.08 0.11
Matches are distributed among these distances:
181 1 0.01
182 8 0.06
183 7 0.05
184 31 0.24
185 56 0.44
186 22 0.17
187 3 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (182 bp):
ATTTATTTTTAAATCTCCAACTTATCAACTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATATC
AGAATAAGCTATGATGAACAAACAATTGTTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTTATTTGAACTGAATTCGATAAATTG
Found at i:4470 original size:178 final size:176
Alignment explanation
Indices: 3874--4564 Score: 527
Period size: 178 Copynumber: 3.9 Consensus size: 176
3864 TTACCAAACC
* * * * *
3874 AATTCAATTAGTTATAACAATTGTGAACAATTATTTATTACAAAT-ATTATGACTATTTGTTTTG
1 AATTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTTTTG
* * * * * * *
3938 TCATAAAATACATTTTTTCTATTAAT-ACAGTCTTATTCGGAA-TAAAGTAATGCTAATTAATTA
64 TCAAAAAATA-A-TTTTT-TATTCATAAAAG-CTTATT-TGAATTAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * **
4001 ATATTCTAAAAATTAAT-AGTAACAGATTT--AAAATGAATATGTTTGGGCCTTG-ACC
124 ATATTC--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACGAATCTATTT---AC-TGAATA
* * * *
4056 AGTTGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
1 AATT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
4121 TCACAACAAT--TGTTTCTATTCCTATAAGCTTATTCGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATA
64 TCA-AAAAATAAT-TTTTTATTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
4184 TTCTAAAA--ATTAA-TAAAAGATTT-AAAAACTGAATTTGTTTATTGAATA
127 TTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAC-GAATCTATTTACTGAATA
* *** * * * *
4232 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTTAAA-C-TGCTATAACCTTTGTTTTG
1 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT--TATGACTTTTGTTTTG
* * *
4295 TCATAAAATAATTTTTTATTCATAAAAGCTTATTTTAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT
64 TCAAAAAATAATTTTTTATTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
4360 CAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAC-AACTCTATTTACTGAATA
129 CA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACGAA-TCTATTTACTGAATA
*
4410 AATTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGT
* ** * *
4474 CAAAAAATAATTTTTTTGTTCATTGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATT
65 CAAAAAATAA-TTTTTTATTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
*
4538 TCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTAA
128 TCAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAA
4565 TAAATATGTT
Statistics
Matches: 408, Mismatches: 74, Indels: 58
0.76 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
173 6 0.01
174 60 0.15
175 40 0.10
176 5 0.01
177 38 0.09
178 99 0.24
179 60 0.15
180 35 0.09
181 5 0.01
182 23 0.06
183 31 0.08
184 6 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTC
AAAAAATAATTTTTTATTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA
AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACGAATCTATTTACTGAATA
Found at i:4953 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 4618--6041 Score: 1291
Period size: 181 Copynumber: 8.0 Consensus size: 179
4608 AATTAGTAAA
* * * ** * * *
4618 AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCTTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * * * *
4683 TATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTAT
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTAT
*
4748 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTTGCAAG
131 TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-TTG-AAG
* ** * * *
4799 AGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACTATTTTT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** *
4864 TATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTAT
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTAT
* * *
4929 TCCAAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAGTAAGTAA-
131 TCCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCC-AAAAATTAAT-TG-AAG
* * * ** *
4980 AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * *
5044 CTATTTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCTATTCATACAAGCAT
65 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTT
* * * *
5108 ATTCTAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCACAAATTAA-T-AAG
129 ATTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTGAAG
* * * * * * *
5157 A-TTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTCTTTGAACAATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
5221 ATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGT
63 ATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGC
* * * *
5285 TTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGG
127 TTATTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-TG-AAG
* * * * * * * *
5339 AGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * ** **
5403 TATTTCAAATCTTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTA
66 TATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTA
* * * * ***
5468 TTCAAAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAATTAA-T-AAG
130 TTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTGAAG
* * * * * * *
5516 AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAGAA-ATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATCAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** *
5580 CTATCTT-AAATCATTATGA-ATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCT
65 CTAT-TTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCT
* * *
5643 TATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA-T-AAG
128 TATTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTGAAG
* ** * *
5693 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCGAACCGGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
5758 TACTTCAAATCATTTTGACCTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTA
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATATAAGCTTA
* * * * *
5822 TT-CAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACATT-CAAAAAATAATGAGCAAA
130 TTCCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-TG-AAG
* * ** *
5873 AGATTT-AAAAA-AAATCTATTTATCAAACAAGTTTGAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
5935 CTATTT-AAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTT
65 CTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTT
* *
5998 A-TCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAAAATTAA
129 ATTCC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
6042 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 1003, Mismatches: 202, Indels: 80
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 48 0.05
177 287 0.29
178 132 0.13
179 119 0.12
180 66 0.07
181 303 0.30
182 44 0.04
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTAT
TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTGAAG
Found at i:5626 original size:177 final size:172
Alignment explanation
Indices: 4648--6041 Score: 887
Period size: 177 Copynumber: 7.8 Consensus size: 172
4638 TTTACCTTAC
* * * * * *
4648 AAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTC
1 AAGTTTAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGAC-CTTTGTTT-
* * * * *** *
4712 ATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
62 ATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * *
4777 ATTCCAAAAATTAATTTGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAA
127 ATTTCAAAAATTAA--T--AAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACAGAA
* * * * **
4828 CAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACTATTTTTTAT-TTCAAATCATTATGATATTTTGTTT
1 -AAGTTTAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGA-CCTTTG-TT
* * * ** * *
4892 TGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCCAAATAAAAAAATA-TAAATTTATTA
61 TATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * *
4956 ATATTCCAAAAAATTAGTAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTA-AA
125 AAATTTC-AAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAATAAATCTATTTAC-AGAA
* * *
5009 CACA-TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGT
1 -A-AGTTTAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATCTT-AAATCA-TTATGA-CCTTTG-
* ** * * * *
5071 TTTGTCATAAGCCAATTGTTTCTATTCATACAAGCA-TATTCTAAATAAAATAATACTAGTTTAT
59 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA-AATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
5135 TAATATTTCACAAATTAATAAGA-TTTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAGC
123 TAAAATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA-CAGA-A
* * * *
5186 AAGTTTAAATAGTTATTATGCCTCTTTGAACAATTATTTAT-TTCAAAT-AGTTATGATCTTTTG
1 AAGTTTAAATAG---TTATGACT-ATTGAACAATTATCTATCTT-AAATCA-TTATGA-CCTTTG
* * * * ** *
5249 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAT
59 -TTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
5313 TAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAGTAAATCTATTTACCA-AA
123 TAAAATTTC-AAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA
* * * * * * * *
5367 CAAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTAT-TTCAAATCTTTTATGACCTTTTGTT
1 -AAGTTTAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATCTT-AAATC-ATTATGACC-TTTG-T
* * * * *
5431 TTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTGATCTATTA
60 TTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
** * *
5496 AAATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAGAA
125 AAATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACAGAA
* * *
5545 ATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATCATCTATCTTAAATCATTATGAATCTTTATTTC
1 A-AGTTTAAATAGTTATGACTAT-TGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATG-ACCTTTGTTT-
* * ** * * * *
5610 ATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
62 ATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * *
5675 ATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCGAA
127 ATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACAGAA
** * * *
5722 CCGGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTATCTA-CTTCAAATCATTTTGACCTGTTGTTT
1 -AAGTTTAAATAGTTATGACTATT-GAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGACCT-TTGTTT
* * * ** * *
5786 AGTTATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTA
62 A-TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
5850 ACA-TTCAAAAAATAATGAGCAAAAGATTTAAAAA-AAATCTATTTATCA-AA
125 AAATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA
* *
5900 CAAGTTTGAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTAAAGTCATTA-GACCTTTTGTT
1 -AAGTTTAAATAG-TTATGACTA-TTGAACAATTATCTATCTTAAA-TCATTATGACC-TTTG-T
* * *
5962 TTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-AAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATT
60 TTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAA-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
*
6026 -AATTTTCAAAAATTAA
124 AAAATTTCAAAAATTAA
6042 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 981, Mismatches: 167, Indels: 134
0.77 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 4 0.00
176 51 0.05
177 281 0.29
178 137 0.14
179 120 0.12
180 69 0.07
181 269 0.27
182 47 0.05
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (172 bp):
AAGTTTAAATAGTTATGACTATTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGACCTTTGTTTATCA
TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTT
CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACAGAA
Found at i:5972 original size:354 final size:354
Alignment explanation
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4598 TAACTATTTG
* * * * ** * *
4608 AATTAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCTTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
1 AATTAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGACTATTTG
* * * * * *
4673 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTCA-TCATAAAACAATTATATCTGTTAA
66 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-AGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA
* * * * * *
4737 TATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTTGCAAGAGA
130 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAA--T-AAAAAGA
* * * * * * *
4802 TTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACTATTTTTTAT
192 TTT-AAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
4867 TTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCC
256 TTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCG
*
4932 AAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAA
321 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCC-AAA
* * * * * **
4967 AATTAGTAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACACATTCAAATAGTTTTGACTAT
1 AATTAATAAG---AGATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGACTAT
* * ** *
5032 TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCTAT
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* * * * *
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* * * * *
5158 TTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTCTTTGAACAATTAT
192 -TTT-AAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTAAATAG---TTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
5223 TTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGTTT
252 CTATTTCAAATCA-TTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTT
*
5287 ATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
316 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
* * *
5325 AATTAATAGGTAGGAGA-TTTAAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGTCCA
1 AATTAATA---A-GAGATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGACTA
* * * ** * * *
5389 TTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTG
62 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCTA
* ** * * * ** * *
5454 TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAATTAAT-AAGAG
126 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAAAAG
* * * *
5518 ATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAGAA-ATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATCATC
191 ATTTAAAAA-TAAATCTATTTATCA-AACA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
5581 TATCTT-AAATCATTATGA-ATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTT
253 TAT-TTCAAATCATTATGATAT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTT
* *
5644 ATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA
316 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * *** * * *
5683 AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCGAACCGGTTCAAATAGTTAGGACTATTAG
1 AATTAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGACTATTTG
* * * *
5748 AACAATTATCTACTTCAAATCATTTTGACCTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTT-TAATTCA
66 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCA
* * *
5812 TACAAGCTTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATAATGAGCAAAAGA
130 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAAT-A--AAAAGA
* *
5876 TTTAAAAA-AAATCTATTTATCAAACAAGTTTGAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTATCTAT
192 TTTAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * *
5939 TT-AAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCC
256 TTCAAA-TCATTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTC
* * *
6002 AAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAA
320 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
6036 AATTAA
1 AATTAA
6042 AAAGCAAGTT
Statistics
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Consensus pattern (354 bp):
AATTAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGACTATTTG
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAAAAGATTTA
AAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
ATCATTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATA
AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
Found at i:6162 original size:137 final size:137
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5906 TGAATAGATT
* * * *
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* * *
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131 CAAGTTA
* * * *
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1 TGACTATTTGAATAAATATCAAT-TTAAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTA
* * * * *
6116 TTTCTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
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6175 CTTAGTAAGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (137 bp):
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TCAGATCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAAAAAG
CAAGTTA
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6038 TTAAAAAGCA
* * * * ** * *
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1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 AGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
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64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * **
6353 ATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTTGAAT
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* * *
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1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* **
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*
6533 AGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AA-------AT----C-AATTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * ** * * * *
6570 AATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTCTCCTAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
6635 ATTGCTTTTCA-AT-ATAGAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGA
66 ATTG-TTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * *
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127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
** * * *
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1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
6808 ATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTGAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAAT
* * * * * * * * *
6873 TAATAACTAAGAAATTTAAAACATCAATCTATTT-GCTAAACTAGTTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
* ** * ** * *
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1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
6989 ATTGTCTTCGTTAATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAATAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCA-AAA
* * * * *
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* * * * * * *
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1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** * **
7172 AATTG-GTCATGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAA
65 AATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* ** * * ** * * *
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127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * ** * * **
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1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * * **
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65 -AATTGTTTTAGTTCATACAAGC-TTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * * *
7418 ATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATTTTTTTTGTCGAATC-AATTGAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * * * * * * ** * * * *
7472 GGTTAAGATTATTAGAATAATTATTTGTTTGAAATTGTTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
7537 ATTGTTTCAGTTCATACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA-T
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATT
* * *
7601 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAACGAACAAGTTCAAAT
130 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * * * *
7648 AGTTATTACTATTTGAAAAAAATGTCTATTTAAAATCGTTATCACCTTTTGATTAGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * *
7713 AATTGTTTCAGTTAATAAAAGCTTAGATGGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATACCTACTAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCAAAA
* * * * ** * *
7778 A-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATTAGTTAAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* ** ** * ** * *
7831 AATTAT-AGCCGTTTGAATGATTATCTACTTT-AAGTCATCCTGA-CTTTTGATTTATCATAAAA
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
*
7893 CAATTTTTTTA--TCATACAAGCTTATATGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* ** * *
7956 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAATTCAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * *
8010 AGTTATGACTATTTGAGCAATTAT-TAATCTCAAGTCATTAAGA--TATTTGTTTTGTCAAAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
8072 CAATTGATTTT--TATCATAGAGGCTTACTTGGTTAA-AAAA-AATACTAATTTAATAATATTTA
64 CAATTG-TTTTAGT-TCATACAAGCTTA-TT-G-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-
* * * * * * *
8133 AAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTTCT-GAGCTAATTCAAAT
122 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * *
8190 AGTTAACG-CTATTCGAATAATTAT-TAATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAA
1 AGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
8253 TATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAAA
64 CAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAAA
* * * ** *
8316 AACTTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTATCAAACATGTTAAAAT
126 AA-TTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * *
8372 AGTGATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGACATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * **
8437 AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAA
* * * * *
8502 TTAATAAGCAAGAG-TTT--AACATAAATTTGTTTA-CTAAATAAATTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
* * * * ** *
8551 TGTTATAACTATTTGAACAATTGTTTATTT-AAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * ** * *
8615 ATTATCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAAT
* * * * * * *
8680 TAATAAGCAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATC-AGTTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * * * * *
8731 AATTAATGTC-ATTTCAACAATTATCAATTTCAAATC-----G----TTTGTTTGGTTATATAAC
1 AGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * *
8786 AATTGTTTTTTA-TT-ATATATGTTTATTTGAAAGAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTGAAA
65 AATTG--TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAA
* * * * *
8849 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAAATTTGTTTATCGAACCAGTTTAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * *** * * * *
8905 AGTTATAACTATTTGAATAATT-GCATACTGAAAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
8969 CAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCTAAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * * * * * ** * * *
9034 ATTAACAATTAACAGATTTAAAAAACAAATTTGTCTGCCAAACTAGTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * **
9087 AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAACGCA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
9145 ATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAA
* * ** * *
9208 ATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTGCCTAAC-TATTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * *
9260 AATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *
9325 AATGTTTTCA-TCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * * *
9389 TTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAAA
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * ** * ** * * *
9437 AGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTTACAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * * * *
9502 ATAATTTGT-GTTCATAAAAACTTATTCGAATTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAACAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * *
9566 TTAATAAGTTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGA-TCAAAT
128 TTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AAATTCAAAT
* * * * * * * *
9618 AGTCATGATTATTTGTATAAGTGTTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-A
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
9682 AATATTTTAGTTCATATC-AGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATA-CAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
* * * * *
9746 TTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * *** * ** **
9798 AATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATG
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *
9863 ATCT-TTTCT-GTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT-AAGAC
66 AT-TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-
* * * * * *
9924 AATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATTAAT-TTTTTA-CAAAACAAGTTCAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
** * * * ** ** * *
9977 CTTTATAACTAATTGAACAATTATTTATTTCAGGTTGTTATGA-CTTTTAGTTTTTTCGTAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * * *
10041 AATTATTTCTA-TTCATACAAGATTATTTAGATTAAAACAATATTAATATATAAATATTTTGACA
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* * * * *
10105 AA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAAAT
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* * * *
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* * *
10222 AATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAT
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
* * * * * **
10287 TTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTATTTA-CTGAACATGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
* * * * **
10339 AGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
10404 ATTGGTTTT-GTTCATGCAAGCTTATTGTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAA
66 ATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTG-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAAAAA
* * * * * *
10467 TTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATTTTTTTCAAACACATTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * ** ** *
10518 ATTTATCACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTATCAT-AAACT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-
* * * * *
10582 AATTATTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA
* * * * * * * *
10647 TTAATAAGTAAAATATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAGT
128 TTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * *
10701 AGTTATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** * *
10766 ATTATTTCTA-TTTACACAATTTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA
** * * *
10830 TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCATCGAACAAGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * ** * *
10882 AGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * * *
10947 ATTATTTATA-TTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAG
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAT
* * ** * * *
11011 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACCAGTTTAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * ** * *
11059 AGTTATGCCTACTTCAACAATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTTTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * * *
11123 ATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAGCAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
* * * * *
11187 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GCTAAGCCAATTTAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * * * * * * *
11239 AGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACATTTTGTTTAGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
11304 ATT-TTTTCTGTTCACACATGCTTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
** * * * *
11368 ATTAATAAACAAAAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAAAAAGTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAA-TTCAAAT
* * ** * * * *
11422 AGTTATGACTATTTGAGCAATTATATATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTGTTTTATGATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * **
11486 GATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* **
11551 TTGAA-AAGATAA-AGATTTAAAAAAT---T-AGTTTATCGAATC-GCTTCAAAT
128 TT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * * * * * *
11599 AATTATGGCCATTT-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
*** * * *
11663 ATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * *
11728 TAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTAT----CAAA--CCAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * *
11773 --TT-T---TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATCAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
11832 ATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCGAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGC-TTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAAT
* * * * ****
11897 TGATAATTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTGTCGAAGTGGTTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * * *
11948 AATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** *
12012 CAATTGTTTT--TATCATTCAAGCCTATTTGGCATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAA
64 CAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAA
* * *
12075 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTTCAGAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
* ** * * *
12129 ACG-TA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
1 A-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
12191 AATTATTTTTA-TTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAA
65 AATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * * * * * *
12255 ATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTTGTCGAACTAGTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* ** * ** ** *
12308 ATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAACATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
12373 AGTTTTTTTTTTTAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC
66 A-----TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC
* * * * * *
12437 AAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAAA-AAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAAT
123 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
*** *
12490 AACCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * ** *
12554 AAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCAATTAATATTTTAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * *
12619 TTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-GAA-ATGAGTTGAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA--AATTCAAAT
** * *
12667 AGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
12730 CAATTGTTTCTA-TTCACACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAT
64 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * **
12794 AATTAATAAGTAAAAAATTTTACAAATAAATATGTTTATTAAACTAAATT-AAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AAATTCAAAT
* * * * *
12848 AGTAATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATATAAGC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAC
* *** * ** * **
12913 TTATTCAAAATAAAATAATACTAAG-TTATT-AATATTACAAA-AAT--TAA--TAAGAGAT-TT
65 -AATT--GTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTGAA-A-TA-AAATAATACTAATTTATTA-ATATT
* * * * * *
12970 AAAAAATAAATCTATTTGT-CGAGCAACTTT---AAAT-AAT-TG----T--AAC-TATTCCAAT
122 CAAAAATTAA--TA--AGTAAGAG--A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * *
13022 AATT-T-TCTTTTTG-A-AATT-GCTA-TA------------ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATG
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-C
* * *
13069 AATT-TTTTTGTTCATACAAGTTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-AAAGAC
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-A-
* * * * * * *
13131 ACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAAT
127 A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * *
13185 -CTTAGGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCT-ATTTGTCATAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAA
* * * * ** *
13246 CAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTACTATTTTGAC
64 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* ** * * * *
13310 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAATATGTTTTTCAAACAAGTTCAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * *
13364 AGTTCTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
13429 ATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAAT
* * * * * ** *
13494 TAATTGAGTAAGAGA-ATAAAAAATGAATTTGTTTATTGAACATGTTTAAAT
129 TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * *
13545 AGTTATGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * *
13610 ATTGGTTCTA-TTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAA
66 ATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * * **
13673 ATCAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATGT-TTTTTTGAACACGTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* ** *
13724 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
13789 ATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
* *
13853 TTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTA-CCAAGCAAGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * ** *
13904 AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACTATGGTCTTTTGTTTTGTCATGAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
13969 ATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATGATACTAACTTATTAATATTCTTAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
** * * * * * *
14033 TTAATAAGTTGGATATTTAAAAAATAAATTTATTCACCGAACAAGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * * *
14085 AGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAAT
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * * * **
14149 AATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATA-AAAATTATCAATATTTTGAAA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * ** *
14212 A-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAATC-CGTTCTAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * * *
14261 AGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGA-TTTTTGTTTTGCCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * * *
14325 ATTGTTTATA-TTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTATTC-TAAA-
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAT
* * ** * *
14387 T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAATTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * *
14435 -GATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT
1 AG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
14499 AATT-TTTTCAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCAAAAA
65 AATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA
** * * * **
14563 TTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACACGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * *
14616 AGTTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
14680 AATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTATCCGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * ****
14744 ATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGAT-AGTTTATTGAATTGGTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * ** * * * *
14797 AATT-TTAGCCATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAAT
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * *
14861 AATTGTTTT-TTGTCATACAAGCCAATTCAGAATAAAATAATATTAATTTA--AATATTTCAAAC
65 AATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * *
14923 ATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C---TAAA--C-CA-
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * ** * * *
14968 A---CT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
15029 ATTGTTGTAGTTCATACAAACTAATTTAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGA-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAA-AA
* * * *
15094 ATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGC-AATTCAAAC
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAATTCAAAT
* * * * * * * *
15147 AATTAAGACTATATGAATAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCCTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * **
15212 TTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTACTAATGTTTTGAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAAT
* * * * ** *
15277 TAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * *** * * * *
15324 AATTAT-AGCCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATAACCTTTTTTTTTGGTCATATAA
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAA
* * * *** * * *
15388 TAGTTCTATTT-GAAAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAA
64 CAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * *
15452 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTA-CTGAAC-TATCTCAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAAT-TCAAAT
* * * ** * * *
15506 AGTTATAACTATTTGTACAATTGTAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
15570 AATTACTTTT-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-CT-A-A-CCAAAAA
65 AATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA
* * * * ** *
15628 TTAATAACTAAGAGAATT-AAAAAT-AATTTGTTTGTCGAATTAGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * ** * *
15678 ATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** * * *
15743 TGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
66 -ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * * * * *
15808 TTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * *
15860 AATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * ** * ** *
15925 AATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGGAATAAAGCAATAC-AATTCTATTAAGATTTTGAATA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA-TTCAAAAA
* * * * * *
15989 TTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * ** * * *
16037 AGTTAAGACTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
16102 ATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * * * ** *
16167 TAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTCCCAAACTAAA-TCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AAATTCAAAT
* * * * *
16218 AATCATGA-TCATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TTTTGGTCATAAAG
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAA
* ** * * * *
16280 GAATTGTTCCAATTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAA
* * * * ** *
16345 AATATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACATGTTTAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * *** * * *
16397 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
16462 ATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TAA-AAAA-AATACAAATTTATTAATATT-AAGACAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AAT
* * * * * *
16522 TAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAGATTTGTTTA-CTGAATAAGTTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
* ** * * * ** *
16573 CA-TTATGACTATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
1 -AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
16637 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * *
16701 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAACAAGTGCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAAT
* * * *
16755 AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TAGTGACCTATTTTCTTTTGTAATAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACC--TTTTGTTTTGTCATAAA
** * * * **
16819 ACAATTGTTTTCAGTTCATGTAAGTTTAATTGTACTAAAATAATACTAATTTACAAATATTCCAA
63 ACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTT-ATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAA
* * * * * *
16884 AAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTA-CTAAAAAAGTTCAAAT
125 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATCGAACAAA-TTCAAAT
* * * * * * * * *
16939 AGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGATAACTTTTTATTTTATCATAAAACA
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* *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* *
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* * *
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*
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*** * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * * **
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** * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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254 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATA-AATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * ** *
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* ** * * * * * * *
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* * * *
7010 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAATAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAA
445 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A-AAAATTAATAATTAAGAGATTTAA
** * *
7075 AAAAGTAAATCTATTTACTAAACCATTTCAAAT
508 AAAA-TAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
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* ** **
7172 AATTG-GTCATGTTCATACT-ATTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAA
65 AATTGTTTC-TGTTCATA-TAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AA
* ** * * * *
7234 AACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGT-CG-AACTAGTTCAAATAGTTAAG
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* * * * **
7296 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTTCTTTTGTCGCAAAACGAATTGT
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* *** * * * * *
7361 TT-TATTCATACAAGCTTTTTTTTATTAAAACAATGCAAATTTA-ATAATATTTTGAAAATTAAT
249 TTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATA-AATATTTTAAAAATTAAT
* * * * * * * * * * * * *
7424 AAATAAGATATTTAAAAAATAAATTTTTTTTGTCGAATCAA-TTGAAATGGTTAAGATTATTAGA
313 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** * * * *
7488 ATAATTATTTGTTTGAAATTGTTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTCAGTTCAT
376 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATAT-TTT-AGTTCAT
* * *
7552 A-CAAGCCTATTT-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAG
439 ATC-AGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAG
* * *
7610 ATTTAAAAAATAAATATGTTTAACGAACAAGTTCAAAT
502 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
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1 AGTTATGACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * ** ** * * *
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65 AATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCAAAA
* * * ** * *
7778 A-TAATAAGTAAGAA-ACTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATTAGTTAAAATAATTAT-AGC
128 ATTAAT-AGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C
** ** * * ** ** * * *
7840 CGTTTGAATGATTATCTACTTT-AAGTCATCCTGACTTTTGATTTATCATAAAACAATT-TTTTT
189 TATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
7903 A-TCATACAAGCTTATATGA-AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
253 ATTCATACAAGCTTAT-TCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAG
* ** * **
7966 TAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAA
316 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *
8030 TTAT-TAATCTCAAGTCATTAAGA--TATTTGTTTTGTCA-AAAAACAATTGATTTT--TATCAT
380 TTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAAA-AA-T-ATTTTAGT-TCAT
* * * * *
8089 A-GAGGCTTACTTGGTTAA-AAAA-AATACTAATTTAATAATATT-TAAAAAAATTAATAAGTAA
439 ATCA-GCTTA-TTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAAATTAATAATTAA
* * * * * *
8150 GAAATTTACAAAATAAATGTGTTT-CTGAGCTAA-TTCAAAT
499 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC-AAGTTCAAAT
* * * * * * *
8190 AGTTAACG-CTATTCGAATAATTAT-TAATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAA
1 AGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
8253 TATTTGTTTCAT-ATCTTACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAA
64 TAATTGTTTC-TGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAA
* * * * * * *
8315 AAACTTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACATGTTAAAATAGTGATG
126 AAA-TTAAT-AGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTTTTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * *
8379 ACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGACATAAAATAATTGTT
187 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-C-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
8444 TC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATA
250 TCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
8508 AGCAAGAG-TTT--AACATAAATTTGTTTACTAAATAAATTCAAATTGTTATAACTATTTGAACA
314 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * ** * * * * *
8570 ATTGTTTATTT-AAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATCTGAATTCATA-CA
379 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATATTTTAGTTCATATC-
* ** * * * ** *
8633 AGCTTAGTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGTGATTTA
442 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTA
* * * *
8698 AAAAGTGAATATGTTTACCGAATC-AGTTCAAAT
507 AAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
8731 AATTAATGTC-ATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTT-TG----TTTG----GTTATATAAC
1 AGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * * * * *
8786 AATTGTTT-TTTATTATATATGTTTATTTGAAAGAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTGAAAA
65 AATTGTTTCTGT-TCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAA
* * * * *
8850 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAAAT-TTGTTTATCG-AACCAGTTTAAATAGTTATAA
128 ATTAAT-AGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATCTT-TTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* *** *** * * * * *
8913 CTATTTGAATAATTGCATACTGAAAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTT
188 CTATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
8978 TTGTTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATATA-ATAATATTCTAAAAATTAACA
251 CTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATA-AATATTTTAAAAATTAATA
* * * * * * * * * * *
9041 ATTAACAGATTTAAAAAACAAATTTGTCTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACA
314 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* *** * *
9106 ATTATCTATTTC-AA--A-T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAACGCAATTTTTTCAATTCATA-CT
379 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATATTTT-AGTTCATATC-
* * * **
9163 AGCTTA-TTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATACGTAAGAGATT
442 AGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATT
* * * * *
9226 TAAAAAATAATTCTGTTTGCCTAACTA-TTCAAAT
505 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* ** ** *
9260 AATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * *
9325 AATGTTT-TCATCCATATAAG-TT-TGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAA
66 ATTGTTTCT-GTTCATATAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *
9387 AATT-A-A-TAATAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-AAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTA
127 AATTAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * ** * *
9448 TTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTTACAAAACAATAATTTGTGT
191 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * *
9513 TCATAAAAACTTATTC-GAATTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTTA
255 TCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAG-TA
*** * * * * * * *
9577 AAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGATTATTTGTATAAGTG
318 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * *
9641 TTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAAAATATTTTAGTTCATATCAGCCTA
383 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATATTTTAGTTCATATCAGCTTA
* *
9706 TTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT
448 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT
* * *
9771 GAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAAT
513 AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * ** *
9798 AATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATG
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
9863 ATCT-TTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT-AAGACA
66 AT-TGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-A
* * ** * *
9925 ATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATTAAT-TTTTTACAAAACAAGTTCAAATCTTTATAACTAA
128 ATTAATA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * * *
9989 TTGAACAATTATTTATTTCAGGTTGTTATGACTTTTAGTTTTTTCGTAAAACAATTATTTCTATT
192 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * *
10054 CATACAAGATTATTTAGATTAAAACAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAA
256 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTT-AAAAATTAATAAGTAAA
* *
10118 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTAT
320 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * *
10182 CTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTA
384 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATATTTTAGTTCATATCAGCTTA
* * * * *
10247 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAATTTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAT
448 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * *
10312 TAATTTATTTACTGAACATGTTCAAAT
513 AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * ** *
10339 AGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
** * *
10404 ATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTGT-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAA
66 ATT-GTTTCTGTTCATATAAGCTTATT-TCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAAAA
* * * *
10466 ATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATTTTTTTC-AAACACA-TTCAAATATTTATCACT
128 ATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-CTTTTTACGAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
10528 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTATCAT-AAACTAATTATTTTT
190 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT
* * * **
10592 GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA-ATTCCAAAAATTAATAAGT
253 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA-TAAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * *
10656 AAAATATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAGTAGTTATGACTCTTTAAACAA
317 AAAAGA--TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * *
10721 TTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCTA-TTTACA-CA
380 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATATTT-TAGTTCATATC-
** * ** *
10784 ATTTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTT-GGAGATTT
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* *
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506 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
10882 AGTCATGTCCATTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * **
10946 AATTATTTATATTTATACAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
65 AATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAA
* * * * ** * * * *
11010 GTT-A-A-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACCAGTTTAAATAGTTATGCCTACT
128 ATTAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
11072 TCAACAATTATTTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
193 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * * * *
11136 ATACAAGCTTATTC-GAAGCAAAATATTGCTAAATTA-ATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
257 ATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATA-AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
11199 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAGCCAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT
320 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * * *
11263 CTATTTCAAATCGTTCTAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCTGTTCACA-CATGCTT
384 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATATTTT-AGTTCATATCA-GCTT
* * ** * *
11327 ATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTTAAAA
447 ATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAA
* * *
11392 AATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTCAAAT
510 AATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
** * ** * *
11422 AGTTATGACTATTTGAGCAATTATATATTT-ATAAGAAG-TATGACCTTTTGTTTTATGATAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * **
11485 TGATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAA
64 TAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * * * * *
11550 ATTGAAAAG-ATAAAGATTTAAAAAAT-TA-GTTTAT-CGAATC--GCTTCAAATAATTATGGCC
128 ATT-AATAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
11609 ATTT-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTC
190 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * * *
11673 A-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
253 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
11737 AGAGATTTAATAAATAAATCTATTTATCAAAC-----C-AAT--TT-T---TATTTAAACAATTA
318 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * *
11790 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATCAAATAAT-TGTTTCAGTTCATATAAGCT
383 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATAT-TTT-AGTTCATATCAGCT
* * * ** *
11854 TTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCGAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAA
446 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAA
* * ** ***
11919 ACAAATCTGTTTGTCGAAGTGGTTCAAAT
511 ATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * ** * * *
11948 AATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *** *
12012 CAATTGTTT-T-TATCAT-TCAAGCCTATTTGGCATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAA
64 TAATTGTTTCTGT-TCATAT-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAA
* * * *
12074 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AACTAGTTCAGATACG-TA--A
126 AAATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTAC-GAAACAAGTTCAAATA-GTTATGA
* ** * ** * * * *
12135 CTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTT
188 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
12200 TATTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTA-ATAATATTCTAAAAATTAATAAC
252 TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATA-AATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * ** * *
12264 TAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTTGTCGAACTAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAAT
316 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** ** * * ** *
12329 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAACATAAAATAAGTTTTTTTTTTTAATTTATA
381 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-ATATTTTAGTTCA--TAT-
* * *
12394 CTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-CAAGAGA
441 C-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGA
* *
12453 TTTAAAAAA-AAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAAT
503 TTTAAAAAATAAA-TCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
*** * * * *
12490 AACCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * ** ** *
12555 AATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCAATTAATATTTTAAAAAT
66 ATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * ** *
12620 T-A-A-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATGAAATGAGTTGAAATAGTTATGACTATTTG
130 TAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * *
12682 AGTAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCAC
195 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * *
12747 ACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAAT
259 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * ** * * *
12812 TTTACAAATAAATATGTTTATTAAACTAAATT-AAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATTTAT
324 TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
*
12876 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT------ATA----AG--C-T-T-A--TTCA----
388 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATATTTTAGTTCATATCAGCTT-ATTTG
*
12920 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTAC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
452 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * *
12980 TCTATTTGTCGAGCAACTTTAAAT
516 TCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * ** * * * * * *
13004 AATTGTAACTATTCCAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATG
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-
* * * * *
13069 AATT-TTTTTGTTCATACAAGTTTATTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-AAAGAC
65 AATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-A-
* * * *
13131 ACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCG-AATAAGTTCAAAT-CTTAGGAC
128 A-TTAATA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
13193 TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTCTTATGACTTTCT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
189 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * *
13257 GTTCATACAAGCTTATTCA-AATTACAATAATATTAATTTATTACTATTTTGACAATTAATAAGT
253 ATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAGT
** ** * *
13321 AAAAGATTTAAGTAATAAATATGTTTTTCAAACAAGTTCAAATAGTTCTAACTATTTGAATAATT
317 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * *
13386 ATCTATTTTAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCT
382 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATATTTTAGTTCATATCAGCT
* * * * * *
13451 TATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATTGAGTAAGAGA-ATAAAA
446 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-TAATTAAGAGATTTAAAA
* * * ** * *
13515 AATGAATTTGTTTATTGAACATGTTTAAAT
510 AATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
13545 AGTTATGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * *
13610 ATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAA
66 ATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * ** *
13674 TCAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATGTTTTTTTG-AACACGTTCAAATAGTTATGACTATT
129 TTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *
13737 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTC
193 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* ** **
13802 ATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAA-ATTCAAAAAATTAATAAGT-AAA
257 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA-TAAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAA
* * *
13865 GATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT
321 GATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* ** * * * * *
13929 TATTTCAAATCACTATGGTCTTTTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTA
385 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAAAAATATTT-TAGTTCATATCAGCTTA
** * * * * *
13993 TTCAAAATAAAATGATACTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTT-GGATATTTAAAAAA
448 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAA
* *
14057 TAAATTTATTCACCGAACAAGTTCAAAT
512 TAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
14085 AGTCAT-ATCCATTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAA
1 AGTTATGA-CTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** * * * **
14148 TAATTGTTTCTATTCATACAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATA-AAAATTATCAATATTTTGAA
64 TAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * *
14211 AATT-A-AG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAATC-CGTTCTAATAGTTATGATTA
127 AATTAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * *** * * *
14272 TTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGATTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTATATT
191 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * *
14337 CATACAAGCTTATTTGCAG--TAAATTATTGCTAAATTA-ATAGTATTCT--AAA-T--TAA-TA
256 CATACAAGCTTA-TT-CAGAATAAAATAATACTAATTTATA-AATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
14393 ACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAAT-GATTAAGACTATTAGAATAAT
318 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAAT
* * * *
14456 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATA-CATG
381 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATATTTT-AGTTCATATCA-G
* * * ** * *
14520 CTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTC-AAAAATTAATAAACAACAAATTTTAA
444 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAA
* *
14584 AAAATAAATCTGTTTACCGAACACGTTCAAAT
508 AAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * *** * *
14616 AGTTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
** * * *
14680 AATTGTTTCAATTCATA-AATGCTTA-TCCGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAA
65 AATTGTTTCTGTTCATATAA-GCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *** * *
14743 AATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGATAGTTTATT--G-AATTGGTTCAAATAATT-TTA
127 AATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAA-AT-CTTT-TTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
14804 GCCATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT
188 -CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * * * *
14869 -TTTGTCATACAAGCCAATTCAGAATAAAATAATATTAA-TT-TAAATATTTCAAACATTAAAAA
251 CTAT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
14931 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC-----C--A-A---CT-CCTATTTGAACAA
315 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
** * * *
14984 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAT-TGTTGTAGTTCATA-CA
380 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATAT-TT-TAGTTCATATC-
* * * * ** * *
15047 AACTAATTT-AGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTAACAACTAAGAGAT
442 AGCTTATTTGA-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAATTAATAATTAAGAGAT
* * * *
15111 TTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAA-TTCAAAC
504 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * *
15147 AATTAAGACTATATGAATAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCCTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * * **
15212 TTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAATAATTTACTAATGTTTTGAAAA
66 ATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAA
* * * ** * *
15276 TTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCG-AATTAGTTCAAATAATTAT-AGCCA
129 TTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTA
*** * * * * * * * *
15335 TGCCAACAATTATCTATTTCAAATCAG-TATAACCTTTTTTTTTGGTCATATAATAGTTCTATT-
191 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGA-CTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT-TTC
** * ** * * * *
15398 TGA-AAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAC
252 T-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAG
* ** * ** * * * *
15462 TAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTGAACTA-TCTCAAATAGTTATAACTATTTGTACAA
316 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** * * * * *
15526 TTGTAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTACTTTT-GTTCATATA
380 TTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATA-TTTTAGTTCATATC
** * * * *
15589 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-CT-A-A--CCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-
442 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTA
* * ** **
15646 AAAAAT-AATTTGTTTGTCGAATTAGTTCAAAT
507 AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
15678 ATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAT-
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * ** * *
15742 ATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAA
66 AT-TGTTTCT-GTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
** * ** * *
15807 ATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAAT-AATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTA
128 ATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * * * *
15871 TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGT
191 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * ** * * * * *
15936 TCATATAAGTTTGTTCGGAATAAAGCAATAC-AATTCTATTAAGATTTT--GAA-TATTAA-TCA
255 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT-TATAAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * ** *
15996 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTGTTTGAGCAATCAT
319 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* ** * * * * * * *
16061 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATA-CAAGCTT
384 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATATTTTAGTTCATATC-AGCTT
* * * * * * *
16125 A-TTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAA
447 ATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAA
* * * * *
16188 AATAAATATGTTTCCCAAACTAA-ATCAAAT
510 AATAAATCTATTTACCGAAC-AAGTTCAAAT
* * * * * *
16218 AATCATGA-TCATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TTTTGGTCATAAAG
1 AGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAA
* * ** *** *
16280 GAATTGTTCCAATTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAA
64 TAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAA
* * * * * * * * * *
16345 AATATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTG-AACATGTTTAAATAATTATGACTAT
128 ATTAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
16409 TTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTTTGTT
192 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * *
16473 CATACAAGCTTATT--TAA-AAAA-AATACAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAGGTAA
256 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAA
* * ** * * ****
16532 AAGATTTAAAAAATAGATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCGATTA
319 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * ** * * *
16596 TTTATTTCAACTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGT
383 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATATTT-TAGTTCATATC-AGC
* * * * * * *
16659 TTATTCGGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAA
445 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAA
* * * *
16723 AAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTGCAAAT
508 AAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * *
16755 AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATAGTGACCTATTTTCTTTTGTAATAAA
1 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACC--TTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * ** * **
16819 ACAATTGTTTTCAGTTCATGTAAGTTTAATTGTACTAAAATAATACTAATTTACAAATATTCCAA
63 ATAATTG-TTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAA
* * * * *
16884 AAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGAC
126 AAATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *** * * * * *
16948 TATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGGTTCT
189 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * ** *
17013 GTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT--TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGT
253 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * ** *
17076 AAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAA
317 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
17135 CAATAATTAT
Statistics
Matches: 8259, Mismatches: 1768, Indels: 1053
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
511 3 0.00
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Consensus pattern (539 bp):
AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
ATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATT
AATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATATTTTAGTTCATATCAGCTTATTTGAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
TTACCGAACAAGTTCAAAT
Found at i:11871 original size:169 final size:167
Alignment explanation
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11599 AATTATGGCC
* * *
11609 ATTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCA
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* * *
11674 TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
65 TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG
* *
11739 AGATTTAATAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTTTT
130 AGATTTAAAAAACAAATCTATTTATCAAACCAATTTTT
* * * *
11777 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTAT-TATCAAATAATTG-TTTC
1 ATTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTATTCTATCT-TAAAACAATTGTTTTC
* * * ** * * *
11840 AGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCGAAAATTGATAATT
64 A--TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
11905 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTGTCGAAGTGGTTCAAATAATTAAGACT
127 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTATC-AA-----ACCAAT--TT----TT
* * * *** * * * *
11958 ATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGCCTTTTGTT-TGGTCATATAACAATTGTTT
1 AT-TTAACAATTATCT-ATT-TCAAATCATTATAAACTTTTATTCT-ATCTTAAAACAATTGTTT
* * ** * * * *
12021 TTATCATTCAAGCCTATTTGGCATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
62 TCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* * * * **
12086 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAGATACGTAACT
127 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTA-TCAA--A--CCA-AT---T-TTT
* ** * * * * * * *
12137 ATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTA
1 ATTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTATTCTATCTTAAAACAATTGTTTTCA
* * * * * *
12202 TTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAA
65 -TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* *
12267 GAGAATTAAAAAATAAAT
129 GAGATTTAAAAAACAAAT
12285 TTCTTTGTCG
Statistics
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ATTTAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTATTCTATCTTAAAACAATTGTTTTCAT
CATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA
GATTTAAAAAACAAATCTATTTATCAAACCAATTTTT
Found at i:12296 original size:360 final size:360
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6553 AATAAATCAA
* * * * * * * * * *
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* * * ** *
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66 TAAAACAATTG-TTTT-TATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * *
6692 TCAAGAATTAATAA-T---AGATTT-AAAAA-AAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA-
* ** * * * *
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193 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * *
6814 TTTGTTCATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTGAAAATTAATAA
258 TTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
6879 CTAAGAAATTTAAAACATCAATCTATTT-GCTAAACTAG
323 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACTAG
* ** * * * *
6917 TTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
6982 TAAAACAATTGTCTTCGTTA--ATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGT-TT--TTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * *
7045 TTTAATAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTATTTACTAAACCATTTCAAATAG
127 TTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
7110 TTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCTAATCATTAT-AACTTCTTATTTTGTCATCAAACAA
190 -TTAGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAA
** ** * * ** * ** *
7174 TTGGTCATGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAACTT
253 TTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
** * * ** *
7239 AATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCGAACTAG
318 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * *
7282 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTTCTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTC
** * ** * * * * *
7347 GCAAAACGAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTTTTTTTATTAAAACAATGCAAATTTAATAATAT
65 ATAAAAC-AATTGTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * ** * * *
7411 TTTGAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATTTTTTTTGTCGAA-TCAATTGAAATGGT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACT-AGTTCAAATAGT
* * * * * ** * * * *
7475 TAAGATTATTAGAATAATTATTTGTTTGAAATTGTTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
191 T-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
7540 -GTTTCAGTTCATACAAGCCTATT-TAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAA-T
255 ATTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * *
7601 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAACGAACAAG
318 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * * * *
7641 TTCAAATAGTTATTACTATTTGAAAAAAATGTCTATTTAAAATCGTTATCACCTTTTGATTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
7706 ATAAAACAATTGTTTCAGTTA--ATAAAAGCTTAGATGGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTT---TTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** * * *
7769 CCTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATTAGTTAAAATAA
127 -TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAG
* ** ** * * ** * *
7833 TTATAGCCGTTTGAATGATTATCTACTTT-AAGTCATCCTGA-CTTTTGATTTATCATAAAACAA
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7896 TT-TTTTTA-TCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
253 TTATTTTTATTCATACAAGCTTAT-TCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* ** * * *
7957 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAA
315 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * *
8003 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTAT-TAATCTCAAGTCATTAAGA--TATTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGT
* * * * * *
8065 CAAAAAACAATTGATTTTTATCATAGAGGCTTACTTGGTTAA-AAAA-AATACTAATTTAATAAT
64 CATAAAACAATTG-TTTTTATCATACAAGCTTA-TTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
8128 ATTTAAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTT-CTGAGCTAATTCAAATAG
126 ATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
8192 TTA-ACGCTATTCGAATAATTATTAATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAA-TA
190 TTAGA--CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
8255 TT-TGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTC-AAAA
253 TTAT-TTTTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAA
* * *
8317 ACTTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-ATG
315 A-TTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTA-G
* * * * * * *
8365 TTAAAATAGTGATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGAC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTC
* * * *** *
8430 ATAAAATAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAA
65 ATAAAACAATTGTTTTTA--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
8494 TTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AACATAAATTTGTTTACT-AAATAAATTCAAATTGTT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTT
* * ** *
8555 ATAACTATTTGAACAATTGTTTATTT-AAATCGCTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTA
192 A-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* ** * * * * *
8619 TCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAAT
256 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* * * * * *
8684 AAGCAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAA-TCAG
321 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACT-AG
* * * * *
8724 TTCAAATAATTAATGTC-ATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTT-TG----TTTG----GTT
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
8779 ATATAACAATTGTTTTTTATTATATATGTTTATTTGAAAGAAAATAATAGTAATTTATTAATCTT
65 ATAAAACAATTG-TTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
8844 TGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAAATTTGTTTA-TCGAACCAGTTTAAATAGT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGT
* * *** *** * * * *
8908 TATAACTATTTGAATAATTGCATACTGAAAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAAT
191 TA-GACTATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
8973 TATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCTAAAAATTA
254 TATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * * ** *
9038 ACAATTAACAGATTTAAAAAACAAATTTGTCTGCCAAACTAG
319 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * *
9080 TTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * *
9138 TAACGCAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATA
66 TAAAACAATTGTTTT-TA-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
9200 TTTTAAAAATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTGCCT-AACTA-TTCAAATAAT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAACTAGTTCAAATAGT
* * * *
9263 TATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
191 TA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * * *
9328 GTTTTCATCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTA
255 ATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTA
* * *
9392 ATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAG
319 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * ** * *
9430 TTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * * *
9495 CAAAACAATAATTTGTGT-TCATAAAAACTTATTCGAATTAAAATAATACTATTTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTT-T-TATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
9559 TCAACAATTAATAAGTTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCA
129 TCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
9623 TGATTATTTGTATAAGTGTTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AAATA-
193 -GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* *
9686 TTTTAGTTCATATC-AGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAA
257 TTTTA-TTCATA-CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * *
9750 TAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAG
320 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * * *
9791 TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** * *
9856 CCAAATGATCT-TTTCTGT-TCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-
66 TAAAACAAT-TGTTT-T-TATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * **
9917 TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATTAAT-TTTTTACAAAACAAGTTCAAATCTT
128 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGT
* * ** ** * *
9980 TATAACTAATTGAACAATTATTTATTTCAGGTTGTTATGA-CTTTTAGTTTTTTCGTAAAACAAT
191 TA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * * *
10044 TATTTCTATTCATACAAGATTATT-TAGATTAAAACAATATTAATATATAAATATTTTGACAAA-
254 TATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * * * *
10107 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAG
317 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * *
10151 TTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTATA
1 TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
10215 ATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-
65 ATAAAACAATTGTTTTTA--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
10278 TTCTAAAATTTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTATTTACTGAAC-ATGTTCAAATAGT
128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGT
* * * * * **
10342 TATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
191 TA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * *
10407 GGTTTTGTTCATGCAAGCTTATT-GTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-CAAAATT
255 ATTTTTATTCATACAAGCTTATTCG-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * *
10469 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATTTTTTTCAAAC-ACA
318 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTA-G
* * * * ** *
10511 TTCAAATATTTATCACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
10576 T-AAACTAATTATTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
66 TAAAAC-AATTGTTTTT-ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
10640 CCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAGTAGTT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTT
* * * * *
10705 ATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTA
192 A-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * ** * * **
10770 TTTCTATTTACACAATTTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAAT
256 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
** * * *
10835 AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCATCGAACAAG
321 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * * * *
10875 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** **
10940 TAAAACAATTATTTATATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
66 TAAAACAATTGTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
11004 CCAAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACCAGTTTAAATAGTTATG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA-G
* * * * ** * * *
11066 CCTACTTCAACAATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTT
194 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * ** * * * *
11130 CTGTTCATACAAGCTTATTCGAAGCAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG
259 TTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * *
11195 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GCTAAGCCAA
324 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CTAG
* * * * * * * *
11232 TTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACATTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
11297 TAAAATAATT-TTTTCTGTTCACACATGCTTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAACA-
66 TAAAACAATTGTTTT-T-ATCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * ** **
11360 TTCAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTCAAATAGT
128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGT
* * ** * * * **
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254 TATTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAA
* *
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* * * * * *
11591 CTTCAAATAATTATGGCCATTT-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
11655 TTAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTA-TTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTTT-ATCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
11719 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTA-TCAA--A---CCAAT--TT-
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
11775 --TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATCAAATAATT-GT
193 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * ** *
11837 TTCAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCGAAAATTGATA
258 TTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* * * * *
11902 ATTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTGTCGAAGTGG
322 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * ** * *
11941 TTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTGGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *
12005 CATATAACAATTGTTTTTATCATTCAAGCCTATTTGGCATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT
64 CATAAAACAATTGTTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*
12070 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAGATACG-TA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATA-GTTA
* ** * * *
12134 -ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
193 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * *
12198 TTTATTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAA
258 TTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * * * *
12263 CTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTTGTCGAACTAG
323 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* ** * * **
12301 TTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAACA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
12366 TAAAATAAGTTTTTTTTTTTAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
66 TAAAACAA----TTGTTTTT-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * *
12430 ATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAAA-AAATTCTATTTACCT-AACCAGTTCAAA
124 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTA-CTGAACTAGTTCAAA
*** * *
12489 TAACCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA
187 TAGTTA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * ** *
12553 CAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCAATTAATATTTTAAAA
250 CAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* *
12618 ATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-GAAATGAG
315 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACT-AG
* ** * * *
12660 TTGAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-CTTGTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTC
* * * *
12724 ATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * * *
12788 TTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTACAAATAAATATGTTTATTAAACTAAATT-AAATAGTA
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTT
* *
12852 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG---T----C-----
192 A-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* *
12905 -----A-T-AT--AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTAC-AAAAATTAA
256 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAA
* * * * *
12960 TAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAGCAAC
320 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * ** * * * * * * *
12997 TTTAAATAATTGTAACTATTCCAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
13062 TAAAATGAATT-TTTTTGTTCATACAAGTTTA-TTGCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-
66 TAAAA-CAATTGTTTTT-ATCATACAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
13124 -T-AAAGACACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAAT-
128 TTCAAA-A-A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATA
* * *
13185 CTTAGGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCT-ATTTGTCATAAAAC
189 GTTA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
13247 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATTACAATAATATTAATTTATTACTATTTTGACA
251 AATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* ** * * * *
13311 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAGTAATAAATATGTTTTTCAAACAAG
315 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * * * *
13357 TTCAAATAGTTCTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
13422 TAAAACAATT-ATTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTA--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
13486 CCAAAAAATAATTGAGTAAGAGA-ATAAAAAATGAATTTGTTTATTGAAC-ATGTTTAAATAGTT
129 TCAAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
13549 ATGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
192 A-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * ** *
13614 GTTCTATTCATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TGAAAAATC
256 TTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * *
13676 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATGT-TTTTTTGAAC-ACG
318 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTA-G
* *
13717 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
13782 TAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATT
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* *
13846 CAAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTAC-CAAGCAAGTTCAAATAGTT
130 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTT
* * ** * *
13908 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACTATGGTCTTTTGTTTTGTCATGAAACAATTG
192 A-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * * *
13973 TTTCTATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATGATACTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAAT
256 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
** * * * * * *
14038 AAGTTGGATATTTAAAAAATAAATTTATTCACCGAACAAG
321 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * *
14078 TTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** ** * * *
14142 GTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATA-AAAATTATCAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * *
14206 TTGAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCGAA-TCCGTTCTAATAGTT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACT-AGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
14265 ATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGA-TTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTG
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* * * * * * * * * *
14329 TTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTATTCT--AAA-T--T
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* * ** * * *
14389 AA-TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA
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* * * *
14428 TTCAAAT-GATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
14492 ATAAAATAATT-TTTTCAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-
65 ATAAAACAATTGTTTTTA--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * *
14555 TTCAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-ACGTTCAAATAGT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGT
* * * * * * *
14619 TATGGCTATTTGAATAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
191 TA-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* ** * * *
14683 TGTTTCAATTCATA-AATGCTTATCCGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATT-TCAAAAAT
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* * * * * *
14746 TGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGAT-AGTTTATTGAATTGG
317 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * * * * *
14790 TTCAAATAATT-TTAGCCATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
14854 ATAAAATAATTGTTTTTTGTCATACAAGC-CAATTCAGAATAAAATAATATTAATTTA--AATAT
65 ATAAAACAATTG-TTTTTATCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
14916 TTCAAACATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AA--A---C-CA-A-CT-
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * ** * * * *
14971 -CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-GT
193 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * **
15034 TGTAGTTCATACAAACTAATT-TAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTA
258 TTTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAATTA
* * * *
15098 ACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGC-AA
319 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CTAG
* * * * * * * * *
15140 TTCAAACAATTAAGACTATATGAATAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCCTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
15205 TAAAATATTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTACTAATGTTT
66 TAAAACAATTGTTTTT-ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * * *
15270 TGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATA
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAGA
* *** * * * * * * * *
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195 -CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTAT-
* ** * * * *
15396 TTTGA-AAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT
257 TTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT
* * *
15459 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTA-CTGAACTA-
321 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACTAG
* * * ** * * *
15498 TCTCAAATAGTTATAACTATTTGTACAATTGTAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGT
1 T-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** *
15562 CATAAAACAATTACTTTTGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-CT-A-A
64 CATAAAACAATT-GTTTT-TATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
15621 --CCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAAT-AATTTGTTT-GTCGAATTAGTTCAAATATT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGT
* * * ** * *
15681 TAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATG
191 T-AGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-
* ** * * * *
15745 TTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATTAATTTATTAATATT-TCAAAAAT
254 TATTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * * * * *
15809 TAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAG
317 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * *
15853 TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * ** *
15918 TAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGGAATAAAGCAATAC-AATTCTATTAAGATT
66 TAAAACAATTGTTTTT-ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT
** * * * * *
15982 TTGAATATTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACTAGTTTAAATAGTTA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTT-
* * * ** * * * *
16042 AGACTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGT
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* * * *
16107 TTTTGTTTATACAAGCTTATTC-AAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAA
257 TTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAA
* * * * ** * *
16170 TAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTCCCAAACTAA
320 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * * * *
16211 ATCAAATAATCATGA-TCATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TTTTGGT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GT
** *** * * * *
16273 CATAAAGGAATTGTTCCAATTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAA
64 CATAAAACAATTGTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
16338 TCCAAAAAATATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAAC-ATGTTTAAATAATT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTT
* * *** * * *
16401 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-
192 A-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * *
16465 TTTTTGTTCATACAAGCTTATT--TAA-AAAA-AATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTA
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* * * *
16524 ATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAGATTTGTTTA-CTGAA-TAAG
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* ** * * * *
16566 TTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
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* * * * * * *
16630 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
16695 TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTGCAAATAGTCA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * *
16760 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TAGTGACCTATTTTCTTTTGTAATAAAACAAT
193 -GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTA-TGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * ** * * * ** *
16824 TGTTTTCAGTTCATGTAAGTTTAATT-GTACTAAAATAATACTAATTTACAAATATTCCAAAAAT
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* * * * * **
16888 TAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTA-CTAAAAAAG
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* * * * * * * * * *
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* *
16997 TAAAACAATTGGTTCTGT-TCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT--TAAATTTATTAATA
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* * * * * * *
17058 TTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAAC-ACATTCAAATAGT
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*
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* ** * *
14871 TGTCATACAAGCCAATTCAGAAT-AAAATAATATTAATTT-A-AATATTTCAA-ACATTAAAAAG
66 T-TCATACAAACCAATTCAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTAAAAAC
14932 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAACTCCT
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAACTCCT
*
14974 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTGTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACGAA-CTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTGTA
* * *
15038 GTTCATACAAACTAATTTAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTAACAAC
65 GTTCATACAAACCAATTCAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTAAAAAC
* *
15103 TAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTA
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
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*
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1 AC
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ACTATTTCAAATCAATTATG
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13310 AATTAATAAG
** * * * * * **
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* * * ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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128 GCTTA-TTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAA-TAAGTAA-AAAATT
* * ** ** ** * * *
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* * * * * * * *
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** ** * * *
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318 -TTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAA-TAAGAGATTTAAAAAA
* * ** * * * * **
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* * * * * * * * *
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* *
13825 TAATACTAATT-TATTAAAATTCAA-AAAATTAA
507 -AATAC-AATTCTATTAAGATT-AAGAATATTAA
* * * * * **
13857 TAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
1 T-A--AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAGC
* *** ** * * *
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* * ** * * *** *
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127 AGCTTATTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * ***
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191 TAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAATGCAAATAATCATGA-CTATTTGAAAAATTATCTATT
* * * ** * * * **
14114 TCAAATCGTTA-TGA-C-ATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTT-CTATTCATACAAAATTAT
255 TCAAATC-ATAGTGACCTATTTTCTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCCAATTCATATAAGCTTAT
** * * * *** * * *
14175 TCAAAATAAAATAATA-AAAATTATCAATATT-TTGAAA--ATTAAGAAGAGATTTAAAAACTAA
319 T-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAATAAGAGATTTAAAAAATGA
* * * * * * * * *
14236 ATCTATTTATCGAATC-CGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATT
383 ATCTATTTA-CTAA-CATGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACT
* * * * * * * * **
14300 ATGA-TTTTTGTTTTGCCATAAA-ACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTA
446 ATAACCTTTTATTTTGTCATAAAGA-AA-TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAGAA
* * * * **
14363 TTGCTAAAT-TAAT-AGTATT-CTAA-ATTAA
508 ATAC-AATTCTATTAAG-ATTAAGAATATTAA
* * * ** * **
14391 TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAATTCAAAT-GATTAAGACTAT-TAGAATA
1 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-CAGTTCAAATAG-TTAAGACTATAT-GAGCA
* * * * *
14454 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATAC
63 ATCATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * ** *
14517 ATGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAACAAATT
126 AAGCTTATTC-AAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATT
* * ** * * * * *
14580 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACACGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTATCTATT
190 TTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAATGCAAATAATCATGACTATTTGAAAAATTATCTATT
* * * *
14645 T-ATTATAAATA-TGACCT-TTTGT-TTT-ATCATAAAACAATTGTTT-CAATTCATA-AATGCT
255 TCA-AAT-CATAGTGACCTATTT-TCTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCCAATTCATATAA-GCT
* * * * * *
14703 TATCCGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAATTGA-TAAGTTAGAGATTTAAAA
316 TAT-TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATTAA-TAAGAGATTTAAAA
** * * * * * * *
14767 AAT-AAGATAGTTTATTGAA-TTGGTTCAAATAATT-TTAGCCATTTGAACAATTATTTATTTTA
378 AATGAATCTA-TTTACT-AACAT-GTTCAAATAATTATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCA
*** * * * **
14829 AATTGTTACGAA-CTTTTGTTTTGTTATAAA-ATAATTGTTTTT-TGTCATACAAGCCAATTCAG
439 AATCACTA-TAACCTTTTATTTTGTCATAAAGA-AA-TGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTC-G
* * **
14891 AATAAA-ATAATATTAATT-TA--AATATTTCAA-ACATTAAAAA
499 AATAAAGA-AATA-CAATTCTATTAAGA-TT-AAGA-A-TATTAA
* * * * *
14931 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAAC----C--A-A-CT---CCTATTTGAACAA
1 -TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAGCAA
* * * * * * *
14984 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTGTAGTTCATACAA
64 TCATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * * * * ** * * * * *
15048 ACTAATTTAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTAACAACTAAGAGA-TT
128 GCTTATTCA-AATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAA-CAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * *
15112 TAAAAAATTAATCTGTTTATC-GAAGC-AATTCAAACAATTAAGACTATATGAATAACTATCTAT
191 TAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAA-CAAATGCAAATAATCATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
* * * * * *** *
15175 TTCAAATCATTA-AGACCCT-TTGT-TTT-GTCATAAAATATTTGTTT-TTGTTCATACAAGCTT
254 TTCAAATCA-TAGTGA-CCTATTTTCTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCCAATTCATATAAGCTT
** * * * *** * *
15235 ATTCAAAATAAAATAATAATAATTTACTAATGTT-TTGAAA--ATTAATAAGTGATTTAAAAAGT
317 ATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * ***
15297 AAACCTATTTACCGAA-TTAGTTCAAATAATTAT-AGCCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATC
381 GAATCTATTTA-CTAACAT-GTTCAAATAATTATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * ** * * *** * *
15360 AGTATAACCTTTTTTTTTGGTCATATAATAGTTCTATTTGAAAATTCAAGCTTATTTGGAATAAA
443 ACTATAACCTTTTATTTT-GTCATA-AAGAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAA
* * * *
15425 -ATAATACTACTT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAA
505 GA-AATAC-AATTCTATTAAGA-TT-AAGAA-TATTAA
* * * *
15461 CTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTA-CTGAACTA-TCTCAAATAGTTATA-ACTATTTGTA
1 -TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAAC-AGT-TCAAATAGTTA-AGACTATATG-A
** ** ** * * * * *
15523 -CAATTGTAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTACTTT-TGTTCA
60 GCAATCATTTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCTATTCA
* * * * * * * *
15585 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-CT-A-A--CCAAAAATTAATAACTAAGAGA
123 TACAAGCTTATTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA-AAA
* * ** * * * * * * *
15643 A--TT-AAAAAT-AATTTGTTTGTC-GAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATC
187 ATTTTAAAAAATAAATATGTTT-ACAGAACAAATGCAAATAATCATGACTATTTGAAAAATTATC
* ** * * * ** *
15703 TATTCCAAATTGTTA-TGACCT-TTTAT-TTT-GTCATAAAA-TATGTTTTTTTAATTCATATTA
251 TATTTCAAA-TCATAGTGACCTATTT-TCTTTGGTAATAAAACAAT-TGTTTCCAATTCATATAA
* * * * *
15763 GCTTATTTGGAATAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAA
313 GCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAA-TAAGAGATTTAA
*
15828 AAAAT-AATTTTATTTACCTAAC-TAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
376 AAAATGAA-TCTATTTA-CTAACAT-GTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * *
15891 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGGAA
438 AAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAG-AAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAA
* **
15956 TAAAGCAATACAATTCTATTAAGATTTTGAATATTAA
501 TAAAGAAATACAATTCTATTAAGATTAAGAATATTAA
* * * *
15993 TCAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTGTTTGAGCAAT
1 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAGCAAT
* * * * *
16058 CATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGC
65 CATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
16123 TTATTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTT-AA
130 TTATTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAA
* *
16187 AAATAAATATGTTTCCCA-AACTAAAT-CAAATAATCATGA-TCATTTGAAAAATTATTTATTTC
195 AAATAAATATGTTT-ACAGAAC-AAATGCAAATAATCATGACT-ATTTGAAAAATTATCTATTTC
* **
16249 AAATCATTA-TGA-CT-TTTT-TTTGGTCATAAAGGAATTG-TTCCAATTCATATAAGCTTATTG
257 AAATCA-TAGTGACCTATTTTCTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCCAATTCATATAAGCTTATT-
* *
16309 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAAATATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAAT
320 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAAT
* * * * * **
16374 CTGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATA
385 CTATTTACT-AACATGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACTATA
* * * *
16439 ACCTTTTGTTTTGTTATAAA-AGAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TAA-AAA-AAATACA
449 ACCTTTTATTTTGTCATAAAGA-AATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAGAAATAC-
*
16500 AATT-TATTAATATTAAGACA-ATTAATA
512 AATTCTATTAAGATTAAGA-ATATT-A-A
* * * * * *
16527 GGTAAAAGATTTAAAAAATAGATTTGTTTACTGAATA-AGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTG
1 --TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-ACAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATATGAG
* * * * *
16590 CGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
61 CAATCATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * * *
16655 AAGTTTATTCGGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTT
126 AAGCTTATTCAAATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * *
16720 TAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTGCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
191 TAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAATGCAAATAATCATGACTATTTGAAAAATTATCTATTT
* * * * *
16785 CAAATCATAGTGACCTATTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAGTTCATGTAAGTTTAATT
256 CAAATCATAGTGACCTATTTTCTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCCAATTCATATAAGCTT-ATT
* * ** * * * * *
16850 GTACTAAAATAATACTAATTTACAAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAAAGAA
320 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAA
* * * * * *
16915 TCTATTTACTAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACA-TGA
384 TCTATTTACT-AACATGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACT-A
* * * * * *
16979 TAACTTTTTATTTTATCATAAA-ACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAA-ATA
447 TAACCTTTTATTTTGTCATAAAGA-AA-TGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAGA-A
* * *
17042 ATTA-AATT-TATTAATATTCCAAAAATTAGTAA
508 A-TACAATTCTATTAAGATT--AAGAA-TATTAA
*
17074 GTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTTA
1 -TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC--AA-ACAGTTCAAATAGTTA
17123 TGATTATTTG
Statistics
Matches: 2553, Mismatches: 523, Indels: 372
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
526 2 0.00
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AATAAATATGTTTACAGAACAAATGCAAATAATCATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAAT
CATAGTGACCTATTTTCTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCCAATTCATATAAGCTTATTGGAATA
AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT
ACTAACATGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTT
ATTTTGTCATAAAGAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAGAAATACAATTCTATT
AAGATTAAGAATATTAA
Found at i:16786 original size:182 final size:181
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14962 AAACCAACTC
* * * *
14972 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTG
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* * ** * * ** *
15036 TAGTTCATACAAACTAATTTAGAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTAAAATAAATTAACA
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* * * * * *
15101 ACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATC-GAAGCAA-TTCAAACAATTAAGA
128 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA-CAAGTTCAAATAATTATGA
* * * ** * * * *
15155 CTATATGAATAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCCTTTGTTTTGTCATAAAATATTTGTTTT
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* * * **
15285 ----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAT-A
131 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* *** * * * * * * *
15331 GCCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCAG-TATAACCTTTTTTTTTGGTCATATAATAGTTCT
1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT
* ** * * *
15395 ATTTGA-AAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
63 -TTTTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * *
15459 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTGAACTA-TCTCAAATAGTTATAA
127 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACAAGT-TCAAATAATTATGA
* * ** ** * * **
15514 CTATTTGTACAATTGTAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTACTT
1 CTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * * *
15578 TTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-CT-A-A--CCAAAAATTAATAAC
65 TTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * ** * *
15636 TAAGAGAATT-AAAAAT-AATTTGTTTGTC-GAATTAGTTCAAATATTTAAGA
130 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * *
15686 CTATATGAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATGTTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTT
** * * *
15750 TTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
65 TT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
** * * ** *
15815 GTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGA
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* ** * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * ** * ** *
15933 TGTTCATATAAGTTTGTTCGGAATAAAGCAATAC-AATTCTATTAAGATTT--TGAA-TATTAA-
66 TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
15993 TCAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA-AACTAGTTTAAATAGTTAAGA
130 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
16174 TAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTCCCA-AACTAA-ATCAAATAATCATGA
130 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAGAAC-AAGTTCAAATAATTATGA
* * ** **
16226 -TCATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TTTTGGTCATAAAGGAATTGTT
1 CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTT
*** * * * * * *
16288 CCAATTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAAATATTAA
64 TTTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * ** * *
16353 -TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGA
129 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * *
16405 CTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * *
16469 TGTTCATACAAGCTTATT--TAA-AAAA-AATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAG
66 TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* * * * * *
16528 GTAAAAGATTTAAAAAATAGATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCATTATGA
129 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* ** * * * * *
16581 CTATATGTGCGATTATTTATTTCAACTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * *
16646 TATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT
66 TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
16711 AAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTGCAAATAGTCATGA
131 AAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* ** * *
16763 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATAGTGACCTATTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * * * ** *
16827 TTTCAGTTCATGTAAGTTTAATT-GTACTAAAATAATACTAATTTACAAATATTCCAAAAATTAA
63 TTTTA-TTCATACAAGCTT-ATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * *
16891 TGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTA-AAAAAGTTCAAATAGTTTTGA
126 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTAC-AGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * *** * * * * * * *
16947 CTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGGTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * ** * *
17012 TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT--TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAG
66 TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
17075 TAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGA
130 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACA-AGTTCAAATAATTATGA
*
17126 TTATTTGAACAAT
1 CTATTTGAACAAT
17139 AATTATTGGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
171 4 0.00
172 68 0.04
173 39 0.03
174 25 0.02
175 24 0.02
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186 3 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAATTATGA
Found at i:16965 original size:184 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15773--17100 Score: 602
Period size: 177 Copynumber: 7.4 Consensus size: 179
15763 GCTTATTTGG
* ** *
15773 AATAAAATAAAAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGA-TTTAAAAAATAAT
1 AATAAAAT--AATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAA-AAA
* ** ** * * * * * *
15836 TTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
63 TCTATTTACAGAAAAAGTGCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGAT
* * * * ** ** * *
15901 GACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGG
128 AACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGCAAGTTTATT-GT
** * *** * *
15954 AATAAAGCAATAC-AATTCTATTAAGATT--TTGAA-TATTAA-TCAAAGA-TTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAAT-CTAATT-TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAA-AAA
** ** * * * * * * * * *** *
16013 TCTATTTATCA-AACTAGTTTAAATAGTTAAGACTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAATTGTTA
63 TCTATTTA-CAGAAAAAGTGCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGA
* * * * ** * * * **
16077 TGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCA
127 TAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGCAAGTTTATTGT
* * * * *
16130 AATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
1 AA-TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAAAAT
* * * * * * *
16195 ATGTTTCCCA-AACTAAA-T-CAAATAATCATGA-TCATTTGAAA-AATTATTTATTTCAAATCA
64 CTATTT-ACAGAA--AAAGTGCAAATAGTCATGACT-ATCT-AAACAATTATCTATTTCAAAACA
* * * ** * * ** * *
16255 TTATGACTTTTT-TTTGGTCATAAAGGAATTGTTCCAATTCATATAAGCTTATTGGG
124 TGATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGCAAGTTTATT-GT
* * * * *
16311 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAAATATTAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAA-AAAT
* ** * * ** * * * * * *
16374 CTGTTTATTGAACATGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-GAAA-TTGCTA
64 CTATTTACAGAAAAAGTGCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATG--A
* * * * ** * *
16437 TAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATT-T
127 TAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGCAAGTTTATTGT
* * *
16488 AA-AAAA-AATACAAATTTATTAATATT--AAGACAATTAATAGGTAAAAGA-TTTAAAAAATAG
1 AATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAA-AA
* * * * * * * *** * * *
16548 ATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCGATTATTTATTTC--AACTTG
62 ATCTATTTACAGAAAAAGTGCAAAT-AGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATG
* * * * * *
16610 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGG
126 --ATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATGCAAGTTTATT-GT
* * *
16667 ATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAA-AAAT
* * * * * * *
16732 ATGTTTACAGAACAAGTGCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-AGT
64 CTATTTACAGAAAAAGTGCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGA-T
* * * *
16796 GACCTATTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAGTTCATGTAAGTTTAATTGT
128 -AACT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATGCAAGTTT-ATTGT
* ** * *
16852 ACTAAAATAATACTAATTTACAAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGA-ATTAAAAAAAGAAT
1 AATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAA-AAT
* **
16916 CTATTTACTA-AAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGAT
64 CTATTTAC-AGAAAAAGTGCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGAT
* * * * *
16980 AACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTT
128 AACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGCAAGTTTATTGT
* *
17032 GAATAAAATAAT-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATCT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAAAAT
17095 CTATTT
64 CTATTT
17101 TCTGAACACA
Statistics
Matches: 896, Mismatches: 195, Indels: 114
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 2 0.00
174 1 0.00
175 26 0.03
176 95 0.11
177 149 0.17
178 23 0.03
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186 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AATAAAATAATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAAAATCT
ATTTACAGAAAAAGTGCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATGATAAC
TTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATGCAAGTTTATTGT
Found at i:17596 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 17559--17597 Score: 51
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
17549 CACCTAAGGC
*
17559 AAGGGATCGATCCTTTTTTA
1 AAGGGATCGATCCGTTTTTA
* *
17579 AAGGGATTGATCGGTTTTT
1 AAGGGATCGATCCGTTTTT
17598 CAAACAGAAT
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 3, Indels: 0
0.84 0.16 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 16 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.10, G:0.26, T:0.41
Consensus pattern (20 bp):
AAGGGATCGATCCGTTTTTA
Done.