Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167882.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_15, whole genome shotgun sequence
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Warning! 61000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 84 of 106
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* *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * *
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AATTATAAAAA
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* *
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*
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* *
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* *
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** * * * *
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* * ** *
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*
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* *
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* * * **
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1 TTTT
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1 ATTTTATTTTATATAAATAAA
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1 A
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* *
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*
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* *
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * ** **
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* * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * ** * * * * *
17067870 TTT-TTTT-AACAAACTTATACGAACAAAAGCATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * ***
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* * * * * * *
17068222 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTTTATGATAGATCAAGAGGTTATAATG
66 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAATA
* * * * * * *
17068287 ATTTGAAGTATACAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTAAACTAGTTCAA
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGTTCAA
* ** *
17068338 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAAGATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** ** * * * * * *
17068403 TTTATTTCAAATAAAATTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTATATGA-CAAACAAAATGTAATAAC
66 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAAT
* * * * * * ***
17068466 GATTTGAAATAGACT-ATTATTGAAATGGCCATAATTATTTGCACT-GATTTGG
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* *
17068518 TAAACAGATTCATTTTTTAAAT-TACTTACTTTTTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTA
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* * * * * * *
17068581 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAACAATTATTCTATGACAAAATAAAAAGTCATAAC
65 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAAT
* * * * ** * *
17068646 AATTTGAAATAGATAATTGTCCATATAGTCTTAACTGGTTAAACTACTTCAA
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* * * *
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* * * ***
17068826 AATTTAAAATAGATAATTATTC----AG--AT-A--A---GAACAAGTTTTG
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGTTCAA
* * * * *
17068866 TAAATAGATTTATTTTTTCAATCTCCTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * *
17068931 TTTATTCTGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAA
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17068994 TGATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATT-AGA
129 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAG-TTCA-A
* * * * * * * * *
17069047 TAAAAAGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTACTAAAGTAATATTAT
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* * * * * * ** *
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* * * *
17069176 TATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGA
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* * * * * * * *
17069228 TAAATAAATTTATTTTTTAAAATTTCTT-GTGTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGCATT
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * *** * *
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** * * *
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* * ** *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * * *
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*** * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * * **
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** * * * * * ** * * ***
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* * * * * *
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** * * * * * **** * * *
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* * * * * * *
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* * ** * ** *
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* * * * *
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* * ** ** * * * * * * *
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* * * **
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* ** * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* *
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* ** * * * *
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* * * ** * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * ** *
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* ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * ***
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* * * * * * *
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** *
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* ** * ** * * * *
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* * * * ***
17069716 AACTTGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATGTCCAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
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* * *
17069781 ATTAGTATT-TTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA
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* * ** * *
17069845 AGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAAATTGTTCAATAA
254 AGGTTATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAA
* * * * * *
17069910 ATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATGAACTGGCATTATTTT
319 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*
17069975 ATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAAAAACAATTGATTTACGAAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
384 ATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAAAAACAATTGATTTACGAAAAACAAAAAGGCCATAATGATT
* *
17070040 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTT
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* * * *
17070105 TAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATATATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGATT
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* * * * * * *
17070170 GCTTGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGACAATT
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* *
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* *
17070300 GTTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTAGTTTATTTCAAATAAACTTATATAAACTAAAA
703 GTTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTAGTTTATTTCAAACAAACTTATATAAACAAAAA
* **** *
17070365 CAATTGTTTTTTTTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGTCA
768 CAATTGTTCTCACAACAAAACAAAATCTCACAA-GATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGTCA
* * * * * * *
17070430 TGACTATTTGAACTTGTTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTGTTCG
832 TAACTATTTGAACTGGTTACAAAAACAGAATTATATTTTAAATCTCTTACTTTTGTTCG
17070489 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATAAATAGAAACAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATAAATAGAAACAATTATTTTA
*
17070554 TGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTCAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAGTCACCAAGATTTGA
66 TGACAAAACAAAAAGTCAT----ATTCAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAGTCAACAAGATTTGA
* * * *
17070619 ACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATTTTAATAAA
127 ACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAATATTAATAAA
* * **
17070684 TTA-TATTATTTTA-TTCAAACTAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAA
190 TTAGTATTATTTTATTTCAAA-TAAACTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * *
17070747 AGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAA
254 AGGTTATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAA
* * * * * * * *
17070812 ACATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTGATTTTTAGAATATTAACAATTTAGTACTATTTT
319 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* ** * * *
17070877 ATTTCAAATAA-CTTTATATGAATTGAAATAATT-ATTTTATGACAAAA-TAAAAGGCCATAATG
384 ATTCCAAATAAGCTTT-TATGAATAAAAACAATTGA-TTTACGA-AAAACAAAAAGGCCATAATG
* ** * *
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446 ATTTGAAA-TAGAAATAGTTAAAT-ACTCATAAGTATTTAACGTGTTCAGAAAACATATTTATTT
* *
17070995 TTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTTAAAATA-TAGATAAATTAGTATTATTTTAAT-ATGAATA
509 TTT-AAATTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTA-ATAAATTAATATTATTTTAATCA-AAATA
* * * * *
17071058 AGCTTG-TATGAATAGAATCTATTATTTTATAATAGAACAAAAA-GTCATAACAATTTAAAATAA
571 AGATTGCT-TGAATAGAACCAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAA
* ** * * * * * *
17071121 ATAATTTCTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCTAGT-TT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATC
635 ACAATTAATCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-A-TCTTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATC
** * *
17071184 TCTTA-TTAATTTTTGAAATATTAAT-AGATTAGTATTTTTTTTATTTCCAACAAACTTATATGA
698 TCTTAGTTAATTTTTGAAATATTAATCA-ATTAGTA-TTAGTTTATTTCAAACAAACTTATATAA
*
17071247 ACAAAAAC-ATT-TATCTCACAACAAAACAAAAGATCCTCAC-A-ATTTAAAATATATAATTATT
761 ACAAAAACAATTGT-TCTCACAACAAAAC-AAA-AT-CTCACAAGATTTAAAATAGATAATTATT
* ***
17071308 TAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGAATTATATTTTAAATCTCTTACATATT
822 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTACAAAAACAGAATTATATTTTAAATCTCTTAC-T-TT
*
17071373 AAAT-TTTG
885 ---TGTTCG
* * * *** * * * * *
17071381 AAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTTGAGTAAGCTTATATGAATTGAAA-ATTTCGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATAAATAGAAACAATT-ATTTT
* * * * * * *
17071445 ATGGCAAAACAAAAA-TGAT-TT-AAAAT-AGATAATTGTTCATATAGTTTTAAC-TG-TTTGAA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATATTCAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAG--TCAACAAGATTTGAA
* * ** * *
17071504 CTAGTTCGGCAAATAAATTTA-TTTTTATAT-TTCTTTGTTATTAATTTTTGGAATATTATTATA
128 CTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAA
* * * * * * *
17071567 TTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTTTGACAGAATAAAA
190 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * ** * *
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* * * * *
17071697 TGGATTTATTCTGTAAATCTCTTACTTATTAATCTTT-GAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTT
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* * *
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Statistics
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TTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
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TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
ATAAGCTTTTATGAATAAAAACAATTGATTTACGAAAAACAAAAAGGCCATAATGATTTGAAATA
GAAATAGTTAAATACTCATAAGTATTTAACGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTA
CTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCAAAATAAGATTGCTTGAATAG
AACCAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAACAATTAATCAAATAG
TCATAACTATTTAAACATCTTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTAATTTTTGAA
ATATTAATCAATTAGTATTAGTTTATTTCAAACAAACTTATATAAACAAAAACAATTGTTCTCAC
AACAAAACAAAATCTCACAAGATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT
GGTTACAAAAACAGAATTATATTTTAAATCTCTTACTTTTGTTCG
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17072735 TGCTAAAGAG
* * * *
17072745 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATT-ACTTTAAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
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* * * * *
17072809 C-CATCTAAGCTTGTTTTAACTTA-AACAATTGTTTTATAAC-AAATCAAAAGGTTATAATGATT
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* * *
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127 TTAAATAGACAATTGTT-ATAATAGTAATAACCACTTGAATC-AATTCGGTAAACAA
* * * *
17072926 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATACTAATAAATTATTATTAATTTATT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATT
* * *
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* ** *
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Statistics
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ATAGACAATTGTTATAATAGTAATAACCACTTGAATCAATTCGGTAAACAA
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * * *
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* ** * * * * * *
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122 TGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * * * * * * *
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * ** * *
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* ** *
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129 GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * * *
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * *
17074607 AAATAAAA-ATCATAA-CATTTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAT
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** * * * ***
17074670 TTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATA
130 TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * ** * * * **
17074718 TTAATAGATTAGTATTATTTTAATTTGAATAATTTTGCATGAACTA-TAACAATTATTTTATGTT
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC
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65 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT
17074826 GAACATGACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (181 bp):
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AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
TCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
Found at i:17074873 original size:144 final size:144
Alignment explanation
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* * ** * *
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** * * * *
17074765 AACAATTATTTTATGTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGAAC
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* * *
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*
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17074970 AGTCATAATT
Statistics
Matches: 106, Mismatches: 16, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (144 bp):
ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTACATGAATAGAAA
CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAACAAATAATAGTTCAAATGAACAT
GACTGCTCTAACTC
Found at i:17075051 original size:181 final size:181
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Indices: 17074846--17082577 Score: 4117
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17074836 GCTCTAACTC
* **
17074846 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTATATGAATAGAAA
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* * * * *
17074911 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAACAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
17074976 AATTATTTGAACTTGCTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
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* * **
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* * * *
17075091 AAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
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* * * *
17075156 TAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTT
130 TAACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * **
17075207 ATTAAATTTTGGAATATTAATAAGTTTA-TATCATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAA
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
17075334 ATTACTATTTGAACATCTTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAATTCTCTTACTC
129 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* *
17075387 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-AGGAA
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* * *
17075451 AAAATTGTTTTATTG-CAAAATAAAATGTTGC--AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
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* * * * * * *
17075513 TCATGACTATTTAAAATTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTGCTT
127 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTT
* * * * * * *
17075569 ATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATCAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
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* * * *
17075633 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
** * * *
17075697 ATAAAGATTTGAACTTGTTCAGTGAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
129 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * *
17075750 ATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTTTTTTTATTTGAAATAAGGTTGTATGAACA
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* ** * * * * *** * * *
17075812 -AAAAAATCATTTGATGCCAAAACAAAACATTATAGCAATTTCAAATGGATAATTGTTC-AATAG
62 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * *
17075875 TTATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTT
127 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * ** * *
17075930 ATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTATATTAATTGAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * ** ** *
17075995 TAATTTTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATGTTTAGTCAAATAGTCA
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
17076059 TGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTT
130 TAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
** * * * * * * * * *
17076111 ATTAATTGCTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAACATAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * * * *
17076176 CTATTGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTCATAA-CAGTTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTC
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * *
17076239 ATAACTATTTGAACTGGTTT-GATAAATAGATTTGA-TTTTTAAA---TTT-CAT
129 ATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * * *
17076288 ATTAA-TTTTGAAATATTAATAGATTAGTATT-TTTTATTTAAAAAAAACTTATATGAACAAAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * * * *
17076351 CATTTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTACAAATAGTCA
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* * * * *
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* * * *
17076529 AA-ATATTCTTTTTTATGATAAAAC---A-A--A-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATA
64 AACA-A-T-TGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* ** * *
17076586 GTCTTAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
126 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * * *
17076642 ATTAATTTTTAGAATATTATTATATTAGTATTGTTTTATTTCGAATGAGCTTGTATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * * * * * * * * *
17076707 TAATTGTTTTATGACATAAGAAAAGGTTAT-ATCGATTCGAAGTATACAATTGTTC--A-A---A
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * *
17076879 AAACAATTGTTATATTACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTTAAATAGGA-AATTATTGAAAT-G
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATA-GATAATTATTCAAATAG
* * ** * * * ** *
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127 TC-ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * ** * * *
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* * * * * ** * * *
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64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* ** * * * *
17077126 ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAAAAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTT
129 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTT
* * ** * *
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** * * * *
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64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
17077489 TTAACTATTTCAA-TTGGTTT-G-ACAAGCACATCTATTTTTTAAATCTTTCACTT
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* * * ** * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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130 TAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * *
17077722 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCGAATAAGCATGTAT-AATAAAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAT-AGAA
* * * * * * *
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65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * ** * *
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130 TAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTT
* * * * *
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1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-ATATGAATAGA
* * * * *
17077965 ACCAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTAATCAGATAG
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* * * * * *
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* * * * *
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1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAGAA
* * * * * *
17078148 ACAATTGTTTTTTTTACAAAACAAAATG-TCACAATGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGT
65 ACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
17078212 CATGACTATTTGAACTTGTTTCGAAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTAC-T
128 CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
** *** * * * *
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* ** ** * * *
17078326 -AATTATTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTCAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAGTC
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* * * *
17078389 ACCAA-AATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
129 A-TAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
17078442 ATTAATTGTCTT--AATTTTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCAAAATTAAAGCTTGTATAAAT
1 ATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAA-T-AAGCTTATATGAA-
** * * * * * *
17078503 TAGCGCAAA-AA-TCATTTATGA-AAAACAAAACGGTTTATAGTGATTTTCAAATAGATAACTGT
60 TA--G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA--GATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTAT
* * * * * * * *
17078565 TGAAATAATCAT-ATTATTTAAACTT-TGTT-GAAAACATATTCATTTTTTTTTTAAATCTCTTG
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178 ACTT
* * ** * * *
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* * * ** * *
17078691 AATAATTTATTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAATGATTTGAATTCAATAG-TAAGACTATTTG
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** ** ** * * * *
17078755 ATTTAGTTGTAAACATATTT--A-TT-TTT--TAAA-ATTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATA
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* *
17078813 GATAA
179 -CT-T
* * * * ** * * * *
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1 ATTA--ATT-TTTGGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATA
** * * *** * * * * * * * *
17078875 G-AACAAAAAG--TCATAACAATTTAAAATA-AATAAT-TTCTCAAATAGTTATAACTATTTGAG
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* * * * *
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* * * * * *
17078982 -TT-A------GAATATTATTATATTAGTATTGTTTTATTTCGAATGAGCTTGTATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * * * * * * * * *
17079039 TAATTGTTTTATGACATAAGAAAAGGTTAT-ATCGATTCGAAGTATACAATTGTTC--A-A---A
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* * * *
17079097 TAACTATTTAAACTGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
130 TAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* ** * * * * * *
17079149 ATTAATATTT-GCCTAATTAATAAATTAGTATCACTTTATTCCAAATGAA-CTTGTA-CAATAAA
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* * * * * * * * *
17079211 AAACGATTGTTATATTACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTTAAATAGATAATTATTGAAAT-GG
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* ** * * * ** *
17079275 CTATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCACTTAATT
128 C-ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * ** * * *
17079330 ATTTATTTTT-GAAGTATTAAAAAATTTGTATTATTTTATTTTGAAGAAGCTTGTACGAACTA-A
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* * * * * ** * * *
17079393 AATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTTCAATAAACAATTGTTCAAATAGTC
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* ** * * * *
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129 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTT
* * ** * *
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** * * * *
17079573 AACAATTGTTTTATCTCAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
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* * * *
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* * * * ** *
17079693 ATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTTGGT-TTAATTTATTCCAAATAAGCTTGCAAG-ATATGA
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
17079873 ATTAATTTTTGAAAAATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAACAAGCTTTTATGATTAGAA
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* * * ** * * * *
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65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* ** ** * * *
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* * * *
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* * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * ** * * *
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* * * *
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* * * * ** * * *
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*** * * * * **
17081547 ATTTTTGTTTTATGGCAAAAC---A-A--A-AATGATTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTTT
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * * * ** *
17081964 AATAATTATTTAAACTAATTTGGTGAATAGATTCATTTTTTAAATCGCTTAATT
129 -ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* ** * *
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* * * *
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* * *
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* *** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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129 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTTTTACTT
** * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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127 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
** *
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Statistics
Matches: 5857, Mismatches: 1286, Indels: 823
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
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* * *
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* * *
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** * * * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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* * * ** ** *
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* * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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253 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
*
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* * * * * * *
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380 AAT-TTAGTATTAG-TTTATTTCAAATAAGCTTATATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * * *
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442 CAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTATGACTATTTGAACTT-GTTT
* * *** *
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569 ATTTTA-ACCAAAT-AAGCTTGTATGATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATA
** * * * * *
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* *
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* * * ** *
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* * * * * *
17077126 ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAAAAAATTTATTTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTAG
129 ATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTT-G
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** * * *
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** * * * *
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* * * * * * * * *
17077380 ATAAATTTGGT-TTAATTTATTCCAAATAAGCTTGCA-AGATATGAAACAAATATTTTATGACTA
378 AT-AATTTAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTT--ATATAAATAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
17077443 AACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATATATAATTATTTTAATAGTTTTAACTATTTCAA-TTGGT
440 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG-TATGACTATTTGAACTT-GT
** * * * *
17077507 TTGACAAGCACATCTATTTTTTAAATCTTTCACTTATTAATTTTTGAAAAATTATTAAATTAGTA
503 TTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTT-ACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
17077572 TTATTTTTAACCGAACAAGCTTTTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAGATCTTA
567 TTA-TTTTAACCAAATAAGCTTGTATGATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCATA
* * * * * * *
17077637 ACAATTTGAGATTGATAATTATTTAAATAATCATAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAATATATAT
631 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTT
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696 ATTTTTTAAATCTATTACTT
* *
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1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAATAAAAAA
* * ** * *
17077786 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATCATTCAAATGGCCAT
66 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *
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* * **
17077916 TATTAATATATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGATTGCT-TGAATAGAACCAATTGTTTTATG
193 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTG-TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATG
* * * * *
17077980 ACAAAATAAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTAATCAGATAGTCATAAGTATTTAAAC
257 ACAAAA-CAAAAGGTTATAATA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * *
17078045 ATTTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTATGTGTTAATTTTTGAAATATTAATCAA-T
320 ATTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATGTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATT
* *
17078109 TAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTGTTTTTTTTACAAAACAAAA
384 TAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAA-TAAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
17078174 TGTCACAATGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTCGAAAA
447 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA
** * *
17078239 CATATTTA-TTTTTAAATC-TT--TTACTT--TTGCTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
511 CATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTA-TTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * *
17078298 AATCCAAATAAGCTTATAT-AAATAGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAT
574 AA-CCAAATAAGCTTGTATGATA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TCATAACAAT
** * * * * * * * *
17078361 TCAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAGTCACCAA-AATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATT
636 TTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATT
*
17078425 TTTTAAATCTTTTACTT
699 TTTTAAATCTATTACTT
*
17078442 ATTAATTGTCTT--AATTTTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCAAAATTAAAGCTTGTATAAAT
1 ATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAA-T-AAGCTTGTAT-AA-
** ** * * * * *
17078503 TAGCGCAAA-AA-TCATTTATGA-AAAACAAAACGGTTTATAGTGATTTTCAAATAGATAACTGT
59 TA--AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GG-TCATAATGA-TTTAAAATAAATAATTGT
* * * * ** * * *
17078565 TGAAATAATCAT-ATTATTTAAACTTTGTT-GAAAACATATTCATTTTTTTTTTAAATCTCTTGA
119 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC--TGTTCGGTAA-ATA--GATTTATTTTTTAAAT-T-TTTA
* ** * * * ** *
17078628 -TTATTGATTTTTAGAGATATTAACCAGTTAGTACTA-TTTATT-TCAAATACTA-TAT-TGAAT
177 CTTATTAATTTTT-GA-ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGATTGTATGAAT
* * * * **
17078688 TGAAATAATTTATTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAATGA-TT----T-G---A--ATTC-AAT
239 AGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * *
17078741 AGT-A-AGACTATTT---GATTTAGT-TGTAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACT-TATT
302 AGTCATA-ACTATTTAAACATTT--TCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-TGTATT
* * * * * * * *
17078798 AATTGTTAAAATA-TAGATAAATTAGTATTA-TTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAATC
362 AATTTTTGAAATATTA-ATAATTTAGTATTAGTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATAAATA-AAAC
* * * * * * ** * * *
17078860 TATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATT-TCTCAAATAGTTAT
424 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT-TTAAATAG-TAT
* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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** * * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* ** * * * * * *
17079341 AAGTATTAAAAAATTTGTATTATTTTATTTTGAAGAAGCTTGTACGAACTA-AAATAATTGTTTT
191 AA-TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTT
* ** * * * *
17079405 GTGACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTTCAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
254 ATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * * *
17079470 A-TTTGTTCGGTAAAAAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCT-TATTAATTTTT-AGAATATTAA
318 ACATT-TTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT-ATGTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * ** * * * **
17079531 GAAATTAGTATTA-TTTA-TTCTGGATAAACTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATCTCAAAA
379 TAATTTAGTATTAGTTTATTTC-AAATAAGCTTATAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
17079594 CAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATTT-AAGTT-TATT
442 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTTGT-TT
** * * ** *
17079657 CAATAAATAGATTTATTTTTTTCAAATCTTTTGA-TTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTTG
505 -GGTAAACATATTTA-TTTTTT-AAATC-TTT-ACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAA-TTA
* * * * * * * * *
17079720 GT-TTAATTTATTCCAAATAAGCTTGCAAGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT
564 GTATTATTTTA-ACCAAATAAGCTTGTATGATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AT
* ** * ** ** * * ** ** *
17079784 CAGAATGATTTGAAATATATAATTATTTTAATAGTTTTAACTATTTCAATTAGTTTGACAAGCAC
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*
17079849 ATCTATTTTTTAAATCT-TTCACTT
692 ATTTATTTTTTAAATCTATT-ACTT
* * ** * * * * * *
17079873 ATTAATTTTTGAAAAATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAACAAGCTTTTATGATTAGAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAATAAAAA
* * * * * ** * * ** * * *
17079937 ACAATTATTTTATGACAAAAC-GAAGATCTTAACAATTTGAGATTGATAATTATTTAAATAATCA
65 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
17080001 TAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACATATATA-TTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTGAA
130 TAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG-A
* * *
17080065 ATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATT-TCGAATAAGCA-TGTAT-AATAAAAAATAATTGTTTT
192 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAG-ATTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTT
* * * * * * * *
17080126 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTA
254 ATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * * *
17080191 AC-TGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTGAATTTCTTACT-TATTAATTTTT-AGAATATTAAT
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* * * * * *
17080253 -ATATTAATATTATTTTA-TTCAAAATAAGATTGCT-TGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAA
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* * * * * * * * *
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441 A-CAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTTGT
** * * * * * *
17080379 TCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTA-TGTGTTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGT
503 TTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACT-TATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGT
* ** * * * * *
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* * * * * * *
17080595 -TT--TGTTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATAA-ATAGAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAATA-AAAA
* * * ** * *
17080656 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTCAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAGTC
65 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAAT-AAATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
17080721 ACCAA-AATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT
129 A-TAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-T
* * * * **
17080785 T-AATTTTAATAAATT-ATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATCATTTT
189 TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * *
17080848 ATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAA
254 ATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * *
17080913 AC-TTGTTC-GAAAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTAAT-TATTGATTTTT-AGAATATTAA
318 ACATT-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATGTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * * * * * * *
17080974 CAAGTTAGTACTATTTTATTTCAAATAA-CTTTATATGAATTGAAATAATTATTTTATGACAAAA
379 TAATTTAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGC-TTATAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * ** * *
17081038 TAAAAGGCCATAATGA-TT----T-G--AA--ATTCGAATAGTAATGACTATTT-TATTTAGTTT
442 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTT-GTTT
* * *
17081092 GGTAAACATATTTATTTTTAAAAATTTTTACTTATTAATTGTT--AAAATATAGATAAATTAGTA
505 GGTAAACATATTTATTTTT-TAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAAAAT-TA-ATAAATTAGTA
* * * * * * *
17081155 TTATTTTAA-TATGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAATCTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTC
567 TTATTTTAACCA--AATAAGCTTGTATGATA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TC
* * * * * *
17081218 ATAACAATTTAAAATAAATAATT-TCTCAAATAGTTATAAATATTTGAGCTAGTTTGATAAATAG
628 ATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAG
17081282 ATTTATTTTTTAAATC---T-CTT
692 ATTTATTTTTTAAATCTATTACTT
* * * * * * *
17081302 ATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACAAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AATAAAA
* * * ** * * * ** * *
17081367 ACAT--TTATCTCACAACAAAACAAAAGATCGTCACAATTTAAAATATATAATT-TTTAAATAGT
64 A-ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
17081429 CATAATTATTTGAACTGTTTAGGTAAACAGAATTATATTTTAAATCTCTTACATT-TTAAATTTT
128 CATAACTATTTGAACTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTAC-TTATTAATTTTT
* * * * * * * * * ***
17081493 GAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTCTTTTGAGTAAGGTTATATGAATTGAAATTTTTGTTTT
190 G-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * * ** *
17081558 ATGGCAAAACAAAA----AT--GATTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAA
254 ATGACAAAACAAAAGGTTATAATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * * * * * *
17081617 C-TAGTTCGGCAAATAAATTTA-TTTTTATATCTCTTTAT-TATTAATTTTTGGAATATT-ATTA
319 CAT-TTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTATGTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * * *
17081678 TATTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAA
382 T-TTAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * **
17081743 AAGGTTATAATGATTTGAAGTAAACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAATTTGGTA
445 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTA
*** * * *
17081808 AATGGATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATCTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTT
509 AACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * *
17081873 TATTCCAAATAAACTTGTACGATCAA-AAACAATT-TTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACG
573 TA-ACCAAATAAGCTTGTATGAT-AAGAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAA-ATCATAACA
* * * * * * * * *
17081936 ATTTGAAATATATAATTGTTGAAAT-GGCAATAATTATTTAAACTAATTTGGTGAATAGATTCAT
634 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTAT
** *
17082000 TTTTTAAATCGCTTAATT
698 TTTTTAAATCTATTACTT
** *
17082018 ATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACT--A
1 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AA-TAAA
* * * ** *
17082080 AAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTCATAACAATTT----T---CAA----T-AAATAGT
63 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
17082133 CATAACTATTTGAATTTGTTTGATAAA-A-AATTATTTTTTTAAACTATTACTTATTAATTTTTG
128 CATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * * * * *
17082196 AATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGTACTA-AAACAATTATTTT
191 AA-TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATG-AATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * * * * *
17082260 ATGTCAACACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTCA
254 ATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* ** * ** *
17082325 A-TTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTGTTCAAATCT-TT-TGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAA
318 ACATT-TTCAGTAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTCTTATG--TATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * * * * *
17082387 TAAATTT-GGACTATTTTA-TTCTGAATAAGC--ATGTAAGATATGAAATAAATATTTTATGACT
379 T-AATTTAGTATTAGTTTATTTC-AAATAAGCTTATATAA-ATA--AAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
17082448 AAACAAAAGG-C-TAGGATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATTGTTTTAACTATTTAAAC-
439 AAACAAAAGGTCATA--ATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAAATAG-TATGACTATTTGAACT
* ** * * * *
17082509 TGGTT-AAAAAAAAATTT-CTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTT-AAAATATTATTAAATTA
500 TGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAATTA
* * *
17082568 GTATTATTTTTAACCGAATAAGCTTCTATGATCAA-AAATAA----TTT-T------------A-
564 GTATTA-TTTTAACCAAATAAGCTTGTATGAT-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAT
* * * * * * * * * * *
17082614 -AT---GATTTGAGATTGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAT
627 CATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAG
* * *
17082675 ATTTATTTTTTAAATATCTTATTT
692 ATTTATTTTTTAAATCTATTACTT
* * * * * * * * *
17082699 ACTAATTTTTGAAGTATTAATAGATTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAACTTATCTTAA-CAAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT-ATAATAAAAA
* * * * * * * *
17082763 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTTA
65 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * ** * * * * *
17082828 TAATTATTTCAAAAAT-TATCTATTTCAAATTAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATT
130 TAACTATTT--GAACTGT-TC--GGT-AAA-TAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
** * * * *
17082892 TAAGAAATATTAATAAA-T--TA--GTTTTATCCT--AT----TT-CA--AATACG-----CTTG
187 TTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAATA-GAAAAAATTG
* * * * * * * * * *
17082938 TTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTGAAACAAATAATTGTTTAGATAGTCTTAACTATT
250 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* ** *** *
17083003 T---CA-----A-TAAA-AG-TTCA-----T-AA-CAATT-TG-A--AATAAAT-AAATGTTAAT
315 TAAACATTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATGTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * ** * * * * * * *
17083045 AAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGACTAAACA
380 AATTTAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTTATAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * **
17083110 AAAAGACAAAATGATTTGAAATAGATCATTA-TTATAATAGTCTTAACTATTT-AAATTAGTTCA
444 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTA-AATAGT-ATGACTATTTGAACTT-GTTTG
* * * * * *
17083173 GCAAACACATTTATTTTTTAAATC--T-CCTATGAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
506 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTA-
* * * * * * * **
17083235 TTTTATCCGAATAAGCTTGGATGATCAA-AAATAATTATTTTATGAGAAAACAAAGATCATAATG
570 TTTTAACCAAATAAGCTTGTATGAT-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCATAACA
* * * * * * ** * *
17083299 ATTT-AAGATTGATATTTGTTCAAATAGT-ATAGCTATTTGAATTGGTTCAGAAAACA-ATTTTA
634 ATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGA-TTTA
* * *
17083361 GTTTTTAAATCTTTTGCTT
697 TTTTTTAAATCTATTACTT
* * * * * ****
17083380 AATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTA-TATTTTATTTCATATAAGTTTTTATAAGCTGAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAATAAAAAA
* * * * * ** ** * *
17083444 CAATTATTTTATAATAAAACAAAAGCTGGTAACAACTTTAAATAGTTAGAATGATTGTTCAAAAA
66 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTAAA-A--TA-AATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * *
17083509 GTTA-AATCTTTTTTAACTTTTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATT
126 GTCATAA-CTATTTGAAC-TGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-T
* * ** * * * * *
17083573 TTTTGAATGTTTATAAATTGGTATCATTTT-TTCTAAATAAGCTTATATGAACTA-AAATAACTG
186 TTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAA-TAGAAAAAATTG
* * * * **
17083636 TTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATAATTTAAAATAGATAATTGTTTTAATAGT-ATTAACTA
250 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTA
* * * ** * * *
17083700 CTTGAAC-TAGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAAGTTTTGGAATAT
313 TTTAAACAT-TTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TGTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * * *
17083763 TATTAAATTAGTATTA-TTGTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAA-ATGAACAATTATTTTATGAC
376 TAATAATTTAGTATTAGTT-TATTTCAAATAAGCTTATAT-AAATA-AAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
17083826 AAAATAAAA-ATCATAA-CATTTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TT
438 AAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTT
* * * * * * *
17083888 ATTTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAGATTA
501 -GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAATTA
*** ** * ** * ** *
17083949 GTATTATTTTAATTTGAATAATTTTGCATGA-ACTATAACAATTATTTTATGTTAAAACAAAAGG
564 GTATTATTTTAA-CCAAATAAGCTTGTATGATAAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-A
** * * * * *
17084013 TCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTGTTTGAACT-TTTTGGTAAAT
626 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAAT
* * * *
17084076 AAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTC
690 AGATTTATTTTTTAAATCTATTACTT
** * *
17084102 ATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTATATGAAT-AGA
1 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AATAAAA
* * * *
17084165 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAACAAATAATTG------T--TC
64 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
17084222 --AAC------AA--------TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGA
129 ATAACTATTTGAACTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT-GA
* * * ** * * *
17084271 ATTTTAATAAATTAGTATTATTTTACTCTGGATAAGCTTATATGAATA-AAAAAATTGGTTTATG
192 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATG
* * *
17084335 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACG
257 ACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACA
* * * * * * *
17084400 TGTTCAGAAAATATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACT-TATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTT
321 TTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TGTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-TT
* * * ** * * * *
17084463 TA-TATCATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTCTTATGACAAAACAAAAT
384 TAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * ** * * * *
17084527 GTCAT-ATGGTTTTGAAATAGATAATTGTTCCAATAGTATTACTATTTGAACATCTTTGGTAAGC
448 GTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC
* * * * * * *
17084591 AGATTCA--TTTT-AATTTTCTACTCA-TAATTTTT-AGATATTAATAAATTAGTTTTATTTTAT
512 ATATTTATTTTTTAAATCTT-TACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTA-
** * * * *** **
17084651 TTCAAATAAGCTTATATGA-AAGGAAACAATTGTTTTATTG-CAAAATAAAAGGTTGCAATGATT
575 ACCAAATAAGCTTGTATGATAA-GAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAA-ATCATAACAATT
* * * * *
17084714 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTTA-TTTAGTAAACATATTTATTTT
637 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAATAGATTTATTTT
* *
17084778 TTAAAATATTTTACTT
701 TT-AAATCTATTACTT
* ** * * * * *
17084794 GTT-ATTTGTAAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTAATTCAAATCAGCTTGTATGAAT-AGA
1 ATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AATAAAA
* * *
17084857 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
64 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
** * * * * * *
17084922 ATAAAGATTTGAACTTGGTT-AGTGAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCT
129 ATAACTATTTGAAC-T-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT--TT
* * * **
17084986 T-AATATTAATAAATTAATATTTTTTTATT-TGAAATAAGGTTGTATGAACA-AAAAAATCATTT
189 TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGATTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * * * * * *
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253 TATGACAAAACAAAAGGTTATA--ATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
17085111 AAAC-TTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTA-GTTATTAATTTTTGGAATATTAA
316 AAACATT-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATG-TATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * ** * * * *
17085174 TAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTATATTAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAC
379 TAATTTAGTATTAGTTTATTTCAAATAAGCTTATA-TAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * * * *
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443 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGG
* * * ** ** *
17085304 TAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGCTGAAATTTTAATAAATTAATATTAT
507 TAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTTTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * *
17085369 TTTAATCCAAATATGCTTGTATGACCATAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACA
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* * * * * * *
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*
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699 TTTTAAATCTATTACTT
* * * * * *
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1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AATAAAAA
* * * *
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* * *
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129 ATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG-
* * * * * * *
17085702 AATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTCCAAATAA-ATTAGTATAAATTGAAAATATTATTTTA
191 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGATT-GTATGAATAGAAAAAATTGTTTTA
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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382 T-TTAGTATTAG-TTTATTTCAAATAAGCTTATATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * * * *
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444 AAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTATGACTATTTGAACTTGTTTGGT
* *** *
17086009 AAACATATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATATTTGCCTAATTAATAAATTAGTATCACT
508 AAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTA-T
* * * * * * * * *
17086073 TTATTA-CAAATGAA-CTTGTACGATAAAAAACAATTGTTATATTACCAAACAAAAGGTAATAAT
571 TT-TAACCAAAT-AAGCTTGTATGATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAAC
* * * * * *
17086136 GATTTTAAATAGATAATTATTGAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAATAGATTTA
633 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTA
* *
17086200 CTTTTTAAATC-ACTTAATT
697 TTTTTTAAATCTA-TTACTT
* * * ** * *
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* * * ** *
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Statistics
Matches: 8322, Mismatches: 1809, Indels: 1302
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AGTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
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TTGTATGATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCATAACAATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTATTACTT
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* * * * *
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* * * ** * * * ** **
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*
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*
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* *
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* *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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**** * *
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* * *
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* * * * * *
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* **
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* * ** * * * * **
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
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* * * *
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* * ** * * *
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAG-AACAATTGTTTTATGACA
* * * *
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65 AAACAAAAGATCATAA-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAATTAG
** ** * ** * *
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128 TTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGGAATA
* * * * *
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* * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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126 AGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT-T-GGAATA
* * * * *
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAG-AACAATTGTTTTATGACA
* * * **
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * *
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** * *
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* * ** * * ** * *
17085170 TTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTATATTAATTGAAATAATTTTTTTATGACA
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * *
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* * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAG-AACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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GGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGGAATA
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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1 TAAACAGATTTATTT-TTAAAT-TTTTACTTATTAATT--TTTAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
17085123 TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTAT
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* ** * * * * * **
17085188 TTTATTTCGAATAATTTTATATTAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
63 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-ATG
* * * *
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* * * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTT-AAA-TTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * ** * * * **
17085369 TTTAATCCAAATATGCTTGTATGACCATAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACA
63 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATATGA
* ** *
17085434 GTTTGAAATAAATAATTACTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-G
128 -TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG
* * * *
17085484 ATAAATAGATTTAATTTTTAAA--TTT-CATATTAATTTTGAAATATTAATAGATTAGTATT-TT
1 -TAAACAGATTT-ATTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
17085545 TTATTTAAAAAAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
64 TTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-ATGA
* *
17085610 TTTGAAATAAATAATTGTACAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTAGG
128 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTA-G
* * *
17085660 TAAATAGAATTT-TTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTA
1 TAAACAG-ATTTATTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * * * *
17085723 TTTTATTCCAAATAA-ATTAGTATAAATTGAAA-ATATTATTTTATGATAAAAC--AAA---A-A
62 TTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * *
17085780 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTCAG
125 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG
* * * * * *
17085833 CAAACAGATTTATTTTGTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTATTATATTAGTATTGT
1 TAAACAGATTTATTTT-TAAATTT-TTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
17085898 TTTATTTCGAATGAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACATAAGAAAAGGTTATATCG
63 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAT-G
* * * * *
17085963 ATTCGAAGTATACAATTGTTC--A-A---ATAACTATTTAAACTGGTTTAG
127 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG
* * * * *** * *
17086008 TAAACATATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATATTTGCCTAATTAATAAATTAGTATCACT
1 TAAACAGATTTATTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * *
17086073 TTATTACAAATGAA-CTTGTACG-ATAAAAAACAATTGTTATATTACCAAACAAAAGGTAATAAT
64 TTATTTCAAAT-AAGCTTATATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-AT
* * * * * * *
17086136 GATTTTAAATAGATAATTATTGAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTTGG
126 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTTTAG
* ** * * * *
17086188 TAAATAGATTTACTTTTTAAATCACTTAATTATTTATTTTTGAAGTATTAAAAAAATT-GTATTA
1 TAAACAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT-AAATATT-AATAAATTAGTATTA
** * * * * * * *
17086252 TTTTATTTTGAAGAAGCTTGTACGAACTA-AAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAA
62 TTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-A
* ** * *
17086316 TAATTTTCAATAAACAATTGTTCAAATA
125 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
17086344 TGAAACAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
172 4 0.00
173 62 0.04
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176 75 0.05
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183 3 0.00
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Consensus pattern (176 bp):
TAAACAGATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
ATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATATGATTT
GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAG
Found at i:17084871 original size:692 final size:692
Alignment explanation
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17083524 ACTTTTTTAG
* * *
17083534 TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTTATAAATTGGTATCA
1 TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATGTTTATAAATTAGTATCA
* * * * *
17083599 TTTTTTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAATAACTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATA
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* **
17083664 ATTTAAAATAGATAATTGTTTTAATAGTATTAACTACTTGAACTAGTTCAACAAACACATTTATT
131 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTATTAACTACTTGAACTAGTTCAACAAACACATTTATT
* * *
17083729 TTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTGTAATTCGAATAA
196 TTTAAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATCATTGTAATTCGAATAA
* * * *
17083794 GCTTGTATGAAAATGAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAATCATAACATTTTGAGATAAATAA
261 GCTTGCATGAAAATGAACAATTATCTTATGACAAAACAAAAATCATAACATTTTGAAATAAATAA
* * * * *
17083859 TTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTATTTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTAT
326 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATCATTTTGGAAAACAGATTCAG-TTTTAAATCTCTCAT
* * ** * *
17083924 TAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTAATTTGAATAATTTTGCATGAACTATAACA
390 TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTACATGAACGATAACA
* * *
17083989 ATTATTTTATGTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGA
455 ATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATGA
* * * * * * *
17084054 CTGTTTGAACTTTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTCATTAATTTTTAGAATAT
520 CTATTTAAACTTTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTAACTCATTAATTTTAAAAATAT
* * *
17084119 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAA
585 TAATAAATCAATATTATTTTAATTCAAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAA
*
17084184 AACAAAA-GATCATAATGATTTAAAACAAATAATTGTTCAACAA
650 AACAAAATG-TCATAATAATTTAAAACAAATAATTGTTCAACAA
* * *
17084227 TAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT-TTTAATAAATTAGTATT
1 TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATGTTT-ATAAATTAGTATC
** * *
17084290 ATTTTACTCTGGATAAGCTTATATGAA-TAAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
65 ATTTT-CTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAAAAACTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAA
* * * * *
17084354 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACGT-GTTCAGA-AAATATAT
129 TAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGT-ATTAACTACTTGAAC-TAGTTCA-ACAAACACAT
* * * * *
17084416 TTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTTA-TATCATT-TTATTT
191 TTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAA-ATTAGTATCATTGTAATTC
* * * ***
17084478 GAAATAAGCTTGCATGAATA-GAACCAATTGTCTTATGACAAAACAAAATGTCATATGGTTTTGA
255 G-AATAAGCTTGCATGAAAATGAA-CAATTATCTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACATTTTGA
* * * * *
17084542 AATAGATAATTGTTCCAATAGT-ATTACTATTTGAA-CATCTTTGGTAAGCAGATTCA-TTTTAA
317 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATCAT-TTTGGAAAACAGATTCAGTTTTAA
* * * * *
17084604 TTTTCTACTCA-TAATTTT-TAGATATTAATAAATTAGTTTTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTAT
381 --ATCT-CTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-AAATAAGCTTAC
* * * **
17084666 ATGAAAGGA-AACAATTGTTTTAT-TGCAAAATAAAAGGTTGCAATGATTTGAAATAGATAATTA
442 ATG-AACGATAACAATTATTTTATGT-CAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAA-TA
* * * *
17084729 -TTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACT
504 GTTCAAATAGACATGACTATTTAAACTT-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATATCTAACT
** * ** *
17084793 TGTT-ATTTGTAAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTAATTCAAATCAGCTTGTATGAATAGA
567 CATTAATTT-TAAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTAATTCAAATAAAATTATATGAATAGA
* *
17084857 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTGTTCAA
631 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATAATTTAAAACAAATAATTGTTCAA
17084916 ATAGTCATAA
Statistics
Matches: 575, Mismatches: 93, Indels: 43
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Matches are distributed among these distances:
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690 109 0.19
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693 34 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (692 bp):
TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATGTTTATAAATTAGTATCA
TTTTCTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAAAAACTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATA
ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTATTAACTACTTGAACTAGTTCAACAAACACATTTATT
TTTAAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATCATTGTAATTCGAATAA
GCTTGCATGAAAATGAACAATTATCTTATGACAAAACAAAAATCATAACATTTTGAAATAAATAA
TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATCATTTTGGAAAACAGATTCAGTTTTAAATCTCTCATT
AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTACATGAACGATAACAA
TTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATGAC
TATTTAAACTTTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTAACTCATTAATTTTAAAAATATT
AATAAATCAATATTATTTTAATTCAAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAA
ACAAAATGTCATAATAATTTAAAACAAATAATTGTTCAACAA
Found at i:17087108 original size:181 final size:179
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Period size: 180 Copynumber: 15.3 Consensus size: 179
17086404 TAATAGTCTT
* * * *
17086414 AACAATTATTTTTTGATAAAACAAAATGTCATATTTATATT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGT
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* * * * * * ** *
17086478 CATAATTATTTGAAATTGTTT-GACAAATAAAATTATTTTTTAAAATTTATTTTTTTTTAATTTT
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATTT-TTACTTATTAA-TTT
* *** *
17086542 TTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTA-A
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* * * * * *
17086596 AACAATTATTTTATGACT-AAACGAAAGGTCAGAGCA-ATTAGAAGTAGATAATTGTTCTAATAG
1 AACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATA--ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * * *
17086659 TTTTAACTATTTGAAC-TATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT
63 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
17086723 AAAATATTAATAATTTAGTATTATTCTAGTT-TGAAT-AGACTTGTATGAATAAA
127 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAG-CTTGTATGAACAGA
* * * **
17086776 AACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGGTCATAATGGTTTGAAATAAAAAATCATTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* *** * * * *
17086840 ATAACTATCTGAACTCACTTGGTAAATAGATATATTTTTTAAATTGTTTATTTATTAATTTTTGA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATT-TTTACTTATTAATTTTTGA
* *
17086905 AATTTTAATAAATTA-TAATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTTATGAACAGA
129 AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCCAAATAAGC-TTGTATGAACAGA
* * *
17086957 AACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGGC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
17087022 ATAACTAATTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTTAATTTTTACTTATTGATTTTTGGA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAA
* * *
17087087 ATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATT-CAAAGTAAACTTGCATGAACAG-
130 ATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAA-TAAGCTTGTATGAACAGA
* * **
17087136 AACTAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTATTCAGGTAGT
1 AAC-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ***
17087201 CATAACTATTTGAACTTATTTACTAAATAG-TTT-TTTTTT-AATTCTCTTACTCGCTAATTTTT
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTT
* * *
17087263 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTT-CAAATAAGATTATATGAACTA-A
127 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGA
* * * *
17087316 AACAATTGTTTTAATTATAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGT
1 AACAATTGTTTT-ATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
17087381 CATGACTATTTGAACTTG-TTAGTAAACATATATATATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTG
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
17087445 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTGTATGAATAGA
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * *
17087497 AACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAAGTCATCACA-ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAG
1 AACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCAT-A-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *
17087560 TCATAA-TGATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTCCTTATTAATTA
63 TCATAACT-ATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-TTTTACTTATTAATT-
* * * * * * * *
17087624 TCT---ATACTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATGAGTTTTTATGAATAGA
124 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * * * * * * * *
17087677 AA-ATATTATTTTACGAGAAAATAAAAAGGTTATAGCA-ATTTCAAATAAATAATTATTTAAATA
1 AACA-ATTGTTTTATGATAAAA-CAAAAGGTCATA--ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
17087740 ATCACAATTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTT
62 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTTACTTATTAATTT
* * *
17087804 TT-AAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGTTTATATGAACTA-A
125 TTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGA
* * * *
17087859 AACAATT-TTTTATGA-AAAA-AAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * * **
17087921 ATGATTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTAAAATTTTCTACTTATTAATTGTCAA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTT-TACTTATTAATTTTTGA
* * *
17087986 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA-TCCAAATAAGCTTGTGTAAACAAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
** * * * * *
17088037 AACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
17088102 ATAACTATTTGAACTAGATT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTGA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * ** *** * * * *
17088163 AATATTAATAGATTAGTTTTACCTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * * * * *
17088214 AACATTTGATTTAT-AGCAAAACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATAGT
1 AACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
17088278 CATAATTATTTGAACTAG-TTAGGTAAACAAAATTATTCTTTAAA-TCTTATTTATTAATTTTTG
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTG
* * *
17088341 AAATATTAATAAATT-TTTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCA-A
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA--CAGA
* * * ** * * *
17088393 AAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATAATGATTAGAAATAAATAATTGTTCATATAGT
1 AACAA-TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
17088458 CTTAAATATTTGAA-TTGGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTT-AATTCTCTTAGTTATTAATTTC
64 CATAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTT
* * * * * * * *
17088521 TGAAATATTATTAGATTAGTATTACTTT-CTCTAAATAAG-TGTATATGAAAAAA
126 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCT-TGTATGAACAGA
* * * * ** * * *
17088574 AATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTCCAAATAGCC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
17088639 ATAACTATTT-AAATTAGTTTAATAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTAG
65 ATAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
17088703 AAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGAATGTTAA-A-A
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG--AACAGA
* * * * * * * *
17088755 AATAATTATTATATGATGAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAA-TGTTGACAA-GGC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGT
* * ** * * *
17088818 CATGATTATTT-AACTTGATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTT-CTT-TTCAATTT
64 CATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT--TTTTACTTATT-AATTT
* * * * **
17088880 TTGAAATATTTATAAATTAGTATTTTTTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTGA
125 TTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * * * *
17088936 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCATATGGTC
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
17089001 TTAACTGTTTGAAC-TGCTTCGACAAATAGAATTA-TTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTT-
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
* * * * **
17089063 AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGA
128 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * * * *
17089116 AATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
1 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
17089175 TAAGAATTGG
Statistics
Matches: 2065, Mismatches: 405, Indels: 220
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 7 0.00
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Consensus pattern (179 bp):
AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
Found at i:17087379 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 17087347--17087379 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
17087337 AGAAAAGGTC
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*
17087364 ATAATTATTT-AAATAG
1 ATAATGATTTGAAATAG
17087380 TCATGACTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
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Consensus pattern (17 bp):
ATAATGATTTGAAATAG
Found at i:17089085 original size:361 final size:346
Alignment explanation
Indices: 17088674--17089474 Score: 846
Period size: 349 Copynumber: 2.3 Consensus size: 346
17088664 ACGGATTTAT
* *
17088674 TTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
1 TTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* **
17088739 AGCTTGA-ATGTTAA-AAAATAATTATTATATGATGAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAG
66 AGCTT-ATATG--AATAAAATAATTATTATATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAG
*
17088802 ATAA-TGTTGACAAGGCCATGATTATTTAACTT-GATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCA
128 ATAATTGTT--C-A----AT-A--A--GAA-TTGGA-TCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCA
* * *
17088865 CTT-TCTT-TTCAATTTTTGAAATATTTATAAATTAGTATTTTTTTTATTTCAAATAAACTTGTA
179 CTTAT-TTATT-AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAACTTGTA
*
17088928 TGAATTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTT
241 TG-A-TGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAATTGTT
17088992 CATATGGTCTTAACTGTTTGAACTGCTTCGACAAATAGAATTA
304 CATATGGTCTTAACTGTTTGAACTGCTTCGACAAATAGAATTA
* * *
17089035 TTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTAG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TTTTTAAATATCTTACTTATTAA-TTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * *
17089099 AAGCTTATATGAATTGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
65 AAGCTTATATGAA-TAAAATAATTATTATATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGA
* * *
17089164 TAATTGTTCAATAAGAATTGGATCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTT
129 TAATTGTTCAATAAGAATTGGATCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTTATTAATTT
* **
17089229 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTT
194 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGATG-AAAACAATTGTT
* * * * * * *
17089294 TTATGACAAGACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATACATAATTGCTT-AAATGGCCATAATTATT
258 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAATTG-TTCATATGGTCTTAACTGTT
* * * * * * *
17089358 TAAATTGATTCAATAAATTGATTTA
322 TGAACTGCTTCGACAAATAGAATTA
* * * * * * * * * *
17089383 TTTTTTAAATTTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTCTTTTGGAT
1 -TTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * *
17089448 AACCTTTTATGAATTGAAATAATTATT
65 AAGCTTATATGAA-TAAAATAATTATT
17089475 TTCTGATAAA
Statistics
Matches: 378, Mismatches: 49, Indels: 38
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
346 2 0.01
347 1 0.00
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352 1 0.00
354 1 0.00
355 2 0.01
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360 2 0.01
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362 10 0.03
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (346 bp):
TTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTAGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
AGCTTATATGAATAAAATAATTATTATATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATA
ATTGTTCAATAAGAATTGGATCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTTATTAATTTTT
AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGATGAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAATTGTTCATATGGTCTTAACTGTTTGAA
CTGCTTCGACAAATAGAATTA
Found at i:17089325 original size:168 final size:168
Alignment explanation
Indices: 17089035--17089337 Score: 450
Period size: 168 Copynumber: 1.8 Consensus size: 168
17089025 AATAGAATTA
* *
17089035 TTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
1 TTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * *
17089100 AGCTTATATGAATTGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
66 AGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATACAT
17089165 AATTGTTCAATAAGAATTGGATCGGTAAACAGATTTAT
131 AATTGTTCAATAAGAATTGGATCGGTAAACAGATTTAT
* *
17089203 TTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
1 TTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * *
17089268 GGCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAGACAAAA-GTTCATAACGATTTGAAATA
66 AGCTTATATGAATTG--AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATA
17089330 CATAATTG
128 CATAATTG
17089338 CTTAAATGGC
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 12, Indels: 6
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
166 2 0.02
167 4 0.03
168 114 0.95
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (168 bp):
TTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
AGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATACAT
AATTGTTCAATAAGAATTGGATCGGTAAACAGATTTAT
Found at i:17089792 original size:178 final size:174
Alignment explanation
Indices: 17089568--17090226 Score: 585
Period size: 178 Copynumber: 3.7 Consensus size: 174
17089558 CAATAGGACT
* * * * * * *
17089568 AAACAGAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAATTATTTGAACTGGC
1 AAACA-AAGATCATAACGATTT-AAATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT
* * *
17089633 TCAGTAAAAACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGGA
63 TCAGTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-GA
*
17089698 ATATTTTACTCTGAATATGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACA
127 ATATTTTA-T-TGAATAT-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* *
17089748 AAACAAAGTTCATAACGATTTAAGATAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTC
1 AAACAAAGATCATAACGATTTAA-ATAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC
* * * *
17089813 AATAAATAGATTTAGTTTATAAA--TC-TA-TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATT--AAT
65 AGTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGAAT
* * *
17089871 ATTATT-TTGAATAATTTTGTAAGAATAGAAATAATTGTTTTATGACA
129 ATT-TTATTGAAT-ATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
17089918 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATGA-TAATTT-ACACTT
1 AAAC-AAAGATCATAACGATTT-AAATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGA-ACTG
** * *
17089981 GTTCAGTAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG
61 GTTCAGTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG
* *
17090046 TATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAAC-ATTGTTTTATGACA
126 -AATATTTTA--TTGAAT-ATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * **
17090098 AAA-AAAAATCATAACTG-TTTAAAATAAATGATTATTCAAATAGTCATAACTATCTGAACTCAT
1 AAACAAAGATCATAAC-GATTT-AAAT-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT
** * * *
17090161 TTGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT-TGAAATAAATTAG
63 TCAGTAAA-AAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATAT-TAATAAATTAG
17090224 AAT
126 AAT
17090227 TTTATTCTGA
Statistics
Matches: 391, Mismatches: 61, Indels: 57
0.77 0.12 0.11
Matches are distributed among these distances:
169 14 0.04
170 25 0.06
171 26 0.07
172 50 0.13
173 1 0.00
174 26 0.07
175 4 0.01
176 28 0.07
177 3 0.01
178 146 0.37
179 24 0.06
180 22 0.06
181 22 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (174 bp):
AAACAAAGATCATAACGATTTAAATAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA
GTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATAT
TTTATTGAATATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
Found at i:17090620 original size:613 final size:603
Alignment explanation
Indices: 17089644--17090819 Score: 1430
Period size: 613 Copynumber: 1.9 Consensus size: 603
17089634 CAGTAAAAAC
* * * * * * *
17089644 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGGAATATTTTACTC
1 ATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAACATTAATAAATTAGAAATATTTTAATC
* * * *
17089709 TGAATATGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGTTCATAACGATTTAAGAT
66 TGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAGTTCATAACAATTTAAGAT
** *
17089774 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCAATAAATAGATTTAGTTTATAAATCT
131 AATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTGAATTGGTTCAATAAACAGATTTAGTTTATAAATCT
**
17089839 ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGAATAATTTTGTAAGAATAGAAATA
196 ATTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAATAGAAATA
** * *
17089904 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATGA
260 ATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATAA
* * * * *
17089969 TAATTTACACTTGTTCAGTAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTAAAATA
325 TAATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCATAATTATTAAATTTTAAAATA
*
17090034 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAAACTT-GTATGAA-TAGAAA-CATTGTTTTATG
390 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAACTTAG-ATGAACT-GAAATAATT-TTTTATG
* *
17090095 ACAAAA-AAAA-ATCATAACTG-TTTAAAATAAATGATTATTCAAATAGTCATAACTATCTGAAC
451 ACAAAATAAAAGATAATAA-TGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATCTGAAC
* * *
17090157 TCATTTGGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTGAAATAAAT
515 TCATTAGGTAAACCAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGGAATTGAAATAAAT
17090221 TAGAATTTTATTCTGAATAAAATAT
579 TAGAATTTTATTCTGAATAAAATAT
*
17090246 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGA-AACATTAATAAATTA-AAATTATTTTAA
1 ATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAGAACATTAATAAATTAGAAA-TATTTTAA
* *
17090309 TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAATAAATAG-TCATAACAATTT
64 TCTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGAAAAAA-AAA-AGTTCATAACAATTT
* *
17090373 GAA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTT
126 -AAGAT-AATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTGAA-TTGGTTCAATAAACAGATTTAGTTT
* * **
17090436 TTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTG-ATATTACTAAATTTGTATTATTTTAATCGAAATAAG
188 ATAAATC---TA-TTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAATATTA-TTT--T-G-AATAAG
* * * *
17090500 CTTGTATGAATAGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAGGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAA
242 CTTGTAAGAATAGAAATAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAA
* * * * * *
17090564 TTGTTTAAAT-GATCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTA
307 TAGCTCAAATAGA-CATAATAATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCATA
* * *
17090628 ATTATTAAATTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTAGATGAACTG
371 ATTATTAAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAACTTAGATGAACTG
* * * * * *
17090693 AAATAATTTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTT
436 AAATAATTTTTTATGACAAAATAAAAGATAATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * **
17090758 ATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACCAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTT
501 ATAACTATCTGAACTCATTAGGTAAACCAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTT
17090820 CAAAATATTA
Statistics
Matches: 483, Mismatches: 63, Indels: 43
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
601 2 0.00
602 67 0.14
603 24 0.05
604 15 0.03
605 59 0.12
606 2 0.00
608 2 0.00
609 26 0.05
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613 164 0.34
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615 77 0.16
616 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (603 bp):
ATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAACATTAATAAATTAGAAATATTTTAATC
TGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAGTTCATAACAATTTAAGAT
AATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTGAATTGGTTCAATAAACAGATTTAGTTTATAAATCT
ATTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAATAGAAATAA
TCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATAAT
AATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCATAATTATTAAATTTTAAAATAT
TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAACTTAGATGAACTGAAATAATTTTTTATGACAAA
ATAAAAGATAATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATCTGAACTCATTA
GGTAAACCAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGGAATTGAAATAAATTAGAATT
TTATTCTGAATAAAATAT
Found at i:17090664 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 17090246--17091656 Score: 1019
Period size: 180 Copynumber: 7.8 Consensus size: 181
17090236 AATAAAATAT
* * * **
17090246 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-AATTGTTGAAACATTAATAAATTAAAATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* * * * * *
17090310 TTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAATAAATAGTCATAACAATTTG
64 TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTG
* **
17090374 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
* * * * *
17090427 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTG--ATATTACTAAATTTGTATTATTTTAA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAAT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** ** * ** *
17090490 TCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAGGGTTATAGCAATTTC
64 TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTG
* * *
17090554 AAATAGATAATTGTTTAAAT-GATCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
* * *
17090607 ATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAAATTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * *
17090672 CTAATAAGCTTAG-ATGAACT-GAAATAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTG
66 GAAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTG
* * *
17090734 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACCA-
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-GTAAA-CAG
* * *
17090787 AATTATTTTTTAAATCTCTTACATATT-AATTTTCAAAATATTAATAAATTCA-T-TTCATTTT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTT-GAAATATTAATAAATT-AGTATT-ATTTTA
** * * * * * * * *
17090848 TTTTTATTAAGCTAGTGTGAATTGAAAAAATTGTTTTATG---AAA-AAACA--AA-AATGACTT
63 TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTT
* * * * * * * ** * *
17090906 GGAATAGATAATTGTTCATATAATCTTAAAATATTTAAACTGGTTTGGCAAACAA
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
* * ** * *
17090961 ATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
17091026 -AGAATAAGCTTATATG-ATCAAAAATAATTGTTTTATGATATAACAAAAAGTTATAATAATTTG
66 GA-AATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTG
* ** * * * *
17091089 AAGTTTACAAATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCGGTAAACAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAG
** *
17091142 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGGTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * * *
17091206 CATTATAAACTTGTATG-ATAAAAAACAATTGTTATATAACTAAACAAAAAGTAATAGTGA-TTA
66 GA-AATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTG
* * * *
17091269 AAATAGATAATTGTTAAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTC-GATAAATAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAG
* * *
17091322 ATTTACTTTTTAAATCACTTACTTACTTATTAATTTTCAACATATTAATAAATTAGTATTATTTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTA--AATTTTGAA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * **
17091387 ATTTTG-AATAAGCTTGTATAAACT-GAAACAATTATTTTGTGATAAAA-AAAAGGTCATAACGA
62 A-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAA
* * * ** * * * *
17091449 TTTTAAACAGACAATTGTTCAAATAGTTGTAACTATTTGAATTTGTTCAGTGAACAA
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
* * * * *
17091506 ATTTATTTCATTT-AA-CTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGAAATTTGTATT-TATTTA
1 ATTTATTT--TTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTA
* * * * * * * *
17091568 TTT-AGGACAAGCTTCTATGAACTA-AAACAATTGCTTTATGTCAAAAC-AAAAGATCATAATGA
63 TTTGA-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TAATAATAA
* *
17091630 TTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
17091657 TATTACTATT
Statistics
Matches: 977, Mismatches: 195, Indels: 116
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 31 0.03
174 65 0.07
175 34 0.03
176 3 0.00
177 3 0.00
178 7 0.01
179 44 0.05
180 386 0.40
181 238 0.24
182 26 0.03
183 24 0.02
184 104 0.11
185 6 0.01
186 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATAATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
Found at i:17091386 original size:184 final size:181
Alignment explanation
Indices: 17090955--17091389 Score: 446
Period size: 181 Copynumber: 2.4 Consensus size: 181
17090945 CTGGTTTGGC
* * * * * ** *
17090955 AAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
17091020 TTATTTAGAATAAGCTTATATGATCAAAAATAATTGTTTTATGATATAACAAAAAGTTATAATAA
66 TTATTCAGAATAAACTTATATGATAAAAAACAATTGTTATATAATATAACAAAAAGTAATAATAA
* * ** * * * *
17091085 TTTGAAGTTTACAAATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGGT
131 TTTAAAATAGACAAATGTTAAAATAGCCATAACTATTTGAATGAGTTCGAT
* * * *
17091136 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGGTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * *
17091201 TTATTCATTATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATATAACTA-AACAAAAAGTAATAGTG
66 TTATTCAGAATAAACTTATATGATAAAAAACAATTGTTATATAA-TATAACAAAAAGTAATAATA
* * * *
17091265 A-TTAAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCATAATTATTTGAACTGA-TTCGAT
130 ATTTAAAATAGACAAATGTTAAAATAGCCATAACTATTTGAA-TGAGTTCGAT
*
17091316 AAATAGATTTACTTTTTAAATCACTTACTTACTTATTA-ATTTTCAACATATTAATAAATTAGTA
1 AAACAGATTTACTTTTTAAAT--C-T-CTTACTTATTAGATTTTCAA-ATATTAATAAATTAGTA
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TTATTCAGAATAAACTTATATGATAAAAAACAATTGTTATATAATATAACAAAAAGTAATAATAA
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17091727 TAATAAAATTCTAAGATATGAAACAAATAATTTATGACTAAACAAAATATCAGAATGATTGGAAC
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
17092083 GTAAGCTTGTATGATAAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAACGATCATAATGATTTGAAATA
66 ATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * *
17092148 GATCATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAATAGATT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAAATT
* * ** * * ** *
17092199 TATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTATTCCAT
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * ** * * * * * *
17092264 TTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTATGATAAATCAACAGGTTATAATAATTTTAAATA
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* * *** **
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** * * * * * ** *
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* * ** * ** * * * **
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
** * * * *** * * *
17092805 ATAAAATAGTATGAACATAACCAATTGTTCGGTGACAAAATAAATGGTTATAACGATTTGAAATA
66 ATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
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* * *
17092921 TACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCA
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* * * * * * *
17092984 AAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAAAGATTT-AGA
64 AAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGA-A
* * * * * * * *
17093048 ATAGACAACTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAATAAAAT
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* * **
17093102 TATTTTTTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
*** * * * * *
17093163 ATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTATTTTATGATAAAGCAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATA
66 ATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* ** * * * * **
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* * * * **
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* * * * * **
17093341 AATAAGCTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA-TAAACGAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *
17093405 AGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAAATT
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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66 ATAAGCTTGTATG--AAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** *
17093582 AG---A-TGTTCAAAT-GGCCTAATTATTTGAGTTGATTCAGTAAACAAATT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAAATT
* * ** * *
17093629 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATCAACTTTTGAAATATTAATAAAGGAGTATT-TTTTTTTTTGG
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-A
* * * * * *
17093693 AA-AAGCTTTTATGAACTAAAACAATAGTTTTATGATAAAA-AAAGGTCATAACGATTTTTAAA-
65 AATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT
* **
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128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTTAGTAAACAAATT
* ** * * *
17093807 TATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* ** * * * * *
17093872 AATAAGCTTATATGACCTAAAACAATTATTATATGACTAAACTAAATGTCAAAATGATTTG-AAT
65 AATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
17093936 AGATAATTATTCTACTAGTCTTAATTATTTGAACTG-GTTCGACAAATACATT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAG-TAAACAAATT
* * * **
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTT
* * * *
17094047 AAATAAGCTAGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTCATAT
64 AAATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
17094112 TGATATTTATTCAAATAGTCATAACTA-TTGAATTGGTTT-GAAAACAACTT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAAATT
* * * * * * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * *
17094227 ATAAGTTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAAT
66 ATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT
* * * *
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* *
17094343 TATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTT
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* * * * * ** * *
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* * * * ** * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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*
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* *
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* * * * * * * *
17092099 AAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAACGATCATAATGATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATG
64 TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* ** *** * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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** ** * * ** * * *
17092656 ACAACAAAAGACAAA-GTCA-AAGTGATTTGAAATAGATAATCATTCATATAG-CTTAGCTATTT
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* * * * * *
17092718 GAACTAGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
317 GAACTGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAA--ATC-T
* * ** * * * * ** *
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1 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * *** * * * ** * *
17092821 ATAACCAATTGTTCGGTGACAAAATAAATGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
65 A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
17092886 GT-TAAAACTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATT
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* * * * * * *
17092949 TTTAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGT
190 TTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTT-TTTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGT
* * * * * * *
17093014 TTTATGACAAAACAAAAAGTAATAA-AGATTT-AGAATAGACAACTGTTCAAATAGTTATAATTA
253 TTTATGA-TAAAC-AAAGGTCATAATA-ATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
** *
17093077 TTTGAACTAATTTGGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCT
314 TTTGAACTGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
17093116 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTATGAGCTG
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* * * * **
17093181 AAATAATTATTTTATGATAAAGCAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCTTATAGT
66 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
17093245 CTTAACTGTTTGAACTAGTTTGGCAAATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTT
131 CTTAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAAT-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTG
* * * * *
17093310 AGAATATTACTAAATTATTATT-TTTTTTCCAAATAAGCTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTA
193 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA
* * *
17093374 TGATAAACGAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAC
257 TGATAAAC-AAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
*
17093439 TGGTTTGGTAAATAAATTTAATTTTTAAATCT
321 TGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * *
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1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-
* * * *
17093534 AAAAAAATTTTTTTTATGACCAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAG---A-TGTTCAAAT-
65 AAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * *
17093594 GGCCTAATTATTTGAGTTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATCAACTTT
129 GTCTTAACTATTTGAACTG-TTCGGTAAA-TAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
** * *** * *
17093659 TGAAATATTAATAAAGGAGTATTTTTTTTTTTGGAA-AAGCTTTTATGAACT-AAAACAATAGTT
191 TGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTTTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTT
* * * * *
17093722 TTATGATAAAAAAAGGTCATAACGATTTTTAAA-ATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
254 TTATGATAAACAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
17093786 AACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCTT
318 AACTGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAA--TC-T
** * * ** * *
17093825 GCTTATTAATTTTTTTAATGTTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGACCT
1 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * * *
17093890 AAAACAATTATTATATGACTAAACTAAATGTCAAAATGATTTG-AATAGATAATTATTCTACTAG
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* ** * *
17093954 TCTTAATTATTTGAACTGGTTCGACAAATACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAAGTTTA
130 TCTTAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTG
* *
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193 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-TCCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
17094079 TATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTCATATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTA-TTGA
255 TATGA-TAAACAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
17094143 ATTGGTTT-GAAAACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTT
319 ACTGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAA--TC-T
* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
17094308 TTC-AAATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTT
129 GTCTTAA-CTATTTGAAC-TGTTCGGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
17094372 ATTCTGAATA
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CTTAACTATTTGAACTGTTCGGTAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTTTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAT
AAACAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
TGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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** * *
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* * ** *
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*
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* * * * * * *
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* * *
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* **
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* * * *
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* * *
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* * ** *
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*
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* * *
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17094856 CTACCTATTA
Statistics
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AAACAATTTGAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAAATAGTTCCACAAACACATT
TATTTTTTAAATCTCTTATTAATTATAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATACAAATAAACT
AGCATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTCAGATAGATAATTA
TTCAAATAGTCATAACTATTAAATTGGTTTGAAAACAAATTTAGTTTTTAAACTCTTGCTTATTA
ATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTCATTTCAGATAAGTTTTCATGAACTAAAACAAT
TGTTTTACGACAAAACAAAAGCACATAATGACTTTAAATAGATAATTACTCAAATATTAAATCTA
TATGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTC
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* * * * *
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** * * * * *
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66 AAAACAATTTGAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAAATAGTTCCACAAACACAT
* * *
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* * * *
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* * *
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** * *
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322 TATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTCATTTCAGATAAGTTTTCATGAACTAAA
* * ** *
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* **
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451 AATCTATATGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTACC
* * * * * *
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* * * *
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* **
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129 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATTATAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATACAAATA
* * * *
17094554 AACTTGCATGA-AAAGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAGAT
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* * *
17094618 AATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAATT-GTTTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA-TC-T
257 AATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTAAATTGGTTT--GAAAACAAATTTAGTTTTTAAACTCTT
* * ** *
17094680 -CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATT-TTTTTTTTGA-ATAA-TTTTGCATGAA-
319 GCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTCATTTCAGATAAGTTTT-CATGAAC
*
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383 TA-AAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGCACATAATGACTTT-AAATAGATAATTACTCAAA
* * *
17094804 TGGA-TATGAT-TATATGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
446 T--ATTA-AATCTATATGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTACC
17094861 TATTAATTT
1 TATTAATTT
17094870 TTAGAATATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
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TATTAATTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAAGTC
AAAACAATTTGAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAAATAGTTCCACAAACACAT
TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTATAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATACAAATAAAC
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AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTCATTTCAGATAAGTTTTCATGAACTAAAACAA
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ATATGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTACC
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* * * * *
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* * ** * * * * * * * **** *
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* **
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* * * * * *
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1 ATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCA
* * * *
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* ** * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* *
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** * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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*
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 ATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTC
* * * * * * * * *
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64 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGA
* * *
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* * * * *
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1 ATTATTTTATTCTGAATAAACTTGT-ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCA
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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1 ATTATTTTATTCTG-AATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTC-
* ** * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * * * * **
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* * * ** *
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* * *
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128 ATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTATT
* ** * * *
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* * * * * * *
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64 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAACAG
* *
17096277 ATTTATTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAAT
128 ATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTATT
* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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Statistics
Matches: 1710, Mismatches: 353, Indels: 184
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (178 bp):
ATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCAT
AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATT
TATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTATT
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Alignment explanation
Indices: 17094561--17096701 Score: 1804
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17094561 ATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-TAAA-GATCATAA-TGATTTGAGATAGATAATTG
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* *
17094623 TTCAAATAGTCATAA-TTATTTAAATTGTTTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTA
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*
17094814 TATATGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTT-AGAATA
256 TATATGAACTTGTTTA-TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTA-CTATTAATTTTTGA-AATA
* * * *
17094878 TTAATAAATTATTATTATCATATTCTGAATAAACATGTATGAATAGAAACAACTGTTTTATAACA
318 TTAATAAATTATTATTATCTTATTTTGAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACA
* * *
17094943 AAACAAAAGATCATAACTATTTGAAAGAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACTTGT
383 AAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTTGT
* ** *
17095008 TCGGTAAACGGATTTATTTTTCAAGTCTTTTACTTATTAACTTTTGGAATATTAATAAACTT-GT
446 TAGGTAAACATATTTATTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAA-TTAGT
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507 ATTATTTTATTTCAAATA-AGTTT-T
* * * * * *
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1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTAAAATAAATAATTGTT
** * * *
17095162 CAAATAGTCATAA-TAATTTGAACA-TGTTCAAAAAAGAGATTTATTTTTTAAATTATTACTTAT
66 CAAATAGTCATAACTAATTT-AA-ATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-T-CT-CTTAT
* *
17095225 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTGGAATAAGCTTGAATGAATAGAAACA
126 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTGGAATAAGCTTGAATGAATAGAAACA
** * * * * *
17095290 ATTGTTTTGTAACGAAAGAAAATGCCATAACGGTTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAA
191 ATTGTTTTACAACAAAACAAAA-GCCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * *
17095355 CTATCTGAACTTGTTTGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAATTTTGAAATA
255 CTATATGAACTTGTTT-ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTAC-TATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
17095420 TTAATAAATTAGTT-TTATTTTATTTTGAATAAACCTATATGAACT-TATACAATTGCTTGATGA
318 TTAATAAATTA-TTATTATCTTATTTTGAATAAACATATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAA
* * * * * *
17095483 CAAAACAAAAGGTCATAAGGATTTGAAATAGATAATTATTCAATTAGTTATGACTATATAAACTT
381 CAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT-TTAACTT
* * *
17095548 GTTTGGTAAACATATTTATTTTTAGAATCTTTTACTTATTAAGTGTTGAATTATTAATAAATTAA
444 GTTAGGTAAACATATTTATTTTTA-AATCTTTTACTTATTAA-TTTTGAA-TATTAATAAATTAG
* * *
17095613 TATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTTC
506 TATTATTTTATTTC-AAATAAG-TTTT
* *
17095639 ATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA-GAAA-AAAAT-T-ATAACTATTTAAAATAAATAATTGTT
1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTAAAATAAATAATTGTT
* * * * * * *
17095700 CAAATAGTAACAACT-ATTTAAACTTATTCAGTAAACAAATATACTTTTTAAGTTTTTTACTTAT
66 CAAATAGTCATAACTAATTTAAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA---ATCT-CTTAT
* * * * * *
17095764 TAATTGATT-GAATATTAATAAATTTATTTTATTTTAATTGAAATAAGCCT-ATATGAATAGAAA
126 TAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTGGAATAAGCTTGA-ATGAATAGAAA
* * * * * *
17095827 AAATTATTTTACAACAAAACAAAAGGCTACAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCAT
189 CAATTGTTTTACAACAAAACAAAA-GCCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
17095892 AACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGAGTCAGTTTTTAAATAT-CT--TATTAATTTTTGAAAT
253 AACTATATGAACTTGTT-TATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTACTATTAATTTTTGAAAT
* ** * * * * * *
17095954 ACTAATAAATTAGAATTATGTTATTTTGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATTATTTTCTAAC
317 ATTAATAAATTATTATTATCTTATTTTGAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAAC
** * * *
17096019 AAAACCGAGGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTT-ACATTG
382 AAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAC-TT-
** * ** *
17096083 GTTAGGCCAACATATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAG
444 GTTAGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT--GAATATTAATAAATTAG
* * * *
17096148 TATTACTTTATTCCAAATAAGACTAT
506 TATTATTTTATTTCAAATAAG-TTTT
* * *
17096174 ATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGT
1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACTATTTAAAATAAATAATTGT
* * * * *
17096238 TCAAATTGTTATAACTAA-TTAAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA
65 TCAAATAGTCATAACTAATTTAAATT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA
* * * * *
17096302 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCT-GAACAAACTT-ATACGAA-AAAAACCA
129 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT-TGGAATAAGCTTGA-ATGAATAGAAACAA
* * * * * *
17096364 TT-TTTT-CGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTAAAATAGATAATTATT-AATATAGCCTTAA
192 TTGTTTTACAACAAAACAAAA-GCCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCATAA
* * * * * * * *
17096426 CTATTTGAACTAGTTTGGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTCT-TAA
255 CTATATGAACTTGTTT--ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTAC-TATTAATTTT-TGAAA
* * * * * * * * * * * *
17096489 TACTACTAGATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTATATGAACATAAATAATTGTTTTATGA
316 TATTAATAAATTATTATTATCTTATTTTGAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAA
* * * * * * *
17096554 CAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTG
381 CAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTT
* * * * *
17096619 GTTTGGTAGACAATATTGT-TTTTTAAAT-TTCCTACTCATTACTTTTTGAAATATTAA-AAATT
444 GTTAGGTAAAC-ATATT-TATTTTTAAATCTT-TTACTTATTA-ATTTTG-AATATTAATAAATT
17096681 AGTATTATTTTATTTCAAATA
504 AGTATTATTTTATTTCAAATA
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Statistics
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TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTGGAATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTGT
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GAACTTGTTTATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTACTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
TTATTATTATCTTATTTTGAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
GGTCATAATATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAACTTGTTAGGTAAACA
TATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
AATAAGTTTT
Found at i:17096049 original size:358 final size:356
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* * ** * * * *
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* * *
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* * * *
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*** ** * ** **
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* * * * *
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* * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * ** *
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* * * ** *
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320 AA-TA-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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126 ACAAATT-ATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTA-TTTTATTT
* * * * * * **
17095440 TATTTTG-AATAAACCTATATGAACT-TATACAATTGCTTGATGACAAAACAAAAGGTCATAAGG
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* * * * * * * * *
17095503 ATTTGAAATAGATAATTATTCAATTAGTTATGACTATATAAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-T
250 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATT
* * * *
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315 TTTTA-AA---TATACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
* * *
17095613 TATTATTTTAATCTGAATAAGCTT-TCATGAATAAAAACAATTGTTTTAT--GAGAA-AAAA-AT
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* * * * *
17095673 TATAACT-ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTAACAACTATTTAAACTTATTCAGTAAACA
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* * *
17095737 AATATACTTTTTAAGTTTTTTACTTATTAATTGATT-GAATATTAATAAATTTATTTTATTTTAA
129 AAT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT--TTAGAATATTAATAAA-TTATTTTATTTTAA
* * ** *
17095801 TTGAAATAAGCCTATATGAATAGAAAAAATTATTTTACAACAAAACAAAAGG-CTACAACAATTT
190 TTGAAATAAGCCTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACAATTT
* * * * * * *
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254 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTT
*
17095930 AAATAT-CTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTAGA
319 AAATATACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-A
* * * * * * ** * *
17095968 -ATTATGTTATTTTGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAACCGAGGGTC
1 TATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATC
* * **
17096032 ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTACA-TTGGTT-AGGCCAACA
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* ** * * *
17096095 TATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTACTTT-AT
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* * * * *
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191 T-GAAATAAGCCTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * *
17096224 AAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATT-AAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTT
255 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAATAGATTTATTTTTT
* *
17096288 AAATCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAA
319 AAATATACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
* * * * * ** *
17096325 TATTATTTTAATCTGAACAAACTTATACGAA-AAAAACCATT-TTTT-CGACAAAACAAAAGGTC
1 TATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATC
* * * * * * * * * ** *
17096387 ATAACGAATTAAAATAGATAATTATT-AATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGAAAACAA
66 ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAA
* * ** * * * * *
17096451 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTCTTAATACTACTAGATTAGTATTATTTTATTT
130 A-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTA-TTTTATTTTA-AT
* * * * * * * *
17096516 TG-ATTAAGCTTATATGAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGA
191 TGAAATAAGCCTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * * * *
17096580 AATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTGGTTTGGTAGACA-ATATTGTTTTTTA
256 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGAT-TTATTTTTTA
* * * *
17096644 AATTTCCTACTCATTACTTTTTGAAATATTAA-AAATTAG
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1 TATTATTTTA
17096693 TTTCAAATAG
Statistics
Matches: 1436, Mismatches: 288, Indels: 155
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (356 bp):
TATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATC
ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAA
TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTATTTTATTTTAATTGAAA
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ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATA
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
Found at i:17096682 original size:716 final size:705
Alignment explanation
Indices: 17094592--17103574 Score: 2167
Period size: 726 Copynumber: 12.3 Consensus size: 705
17094582 ATGATAAAAT
* * * * *
17094592 AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAATTGTTTCA-G
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* * *
17094656 TAAACAAATTTAGTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATT-TT
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* * * * ** *
17094717 TTTTTTGAAT-AATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGCACATAATGA
128 TATTTTGAATAAACTAT--ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * *
17094781 TTTGAAATAGATAATTGCTCAAATGGATATGATTATATGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTT
191 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTTATGACTA-ATTAAATTGTTTAGTAAATAGATTTATTT
* * * ** *
17094846 TTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATTATTATCATATTCTGAATAAA
255 TTTAAA--T-CTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAA
* * * * *
17094911 CATGTATGAATAGAAACAACTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAAGAAATAA
317 C-TTTATGAATAAAAACAA-T-TTTT-TGACAAAACAAAAG-TCATAACTATTTAAAATAAATAA
* * ** *
17094976 TTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACTTGTTCGGTAAACGGATTTATTTTTCAAGTCTTTTAC
377 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTAC
* ** * *
17095041 TTATTAACTTTTGGAATATTAATAAACTT-GTATTATTTTATTTCAAATACA-TTTGTATGAATA
442 TTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTATATGAATA
* * * * * ** * *
17095104 GGAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTCTTTTAATTAGATAATTGTTCAAATAG
505 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
17095169 TCATAATAATTTGAACATGTTCAAAAAAGAGATTTATTTTTTAAATTAT-TACTTATTAATTTTT
570 TCATAACAATTTGAAC-TGTTTAAAAAA-ATA-TTGTTTTTTAAATT-TCTAC-TATTAATTTTT
* * * *
17095233 GAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTACTTGGAATAAGCTTGA-ATGAATAGAAACAATTGTT
630 GAAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-ATACGAATAGAAACAATTATT
* * *
17095296 TTGTAACGAAAGA
693 TTCTAACAAAACA
* * * * * * *
17095309 AAATGCCATAACGGTTTGAAATATAA-AATTATTCAAATAGTCATAACTATCTGAACTT-GTTTG
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTAA-TTGGTTAG
* * * * * *
17095372 ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTA
63 GTAAACAAATTCATTTTTTAAATC-CTTACTT-ATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
17095437 TTTTATTTTGAATAAACCTATATGAACT-TATACAATTGCTTGATGACAAAACAAAAGGTCATAA
126 -TTTATTTTGAATAAA-CTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
17095501 GGATTTGAAATAGATAATTATTC-AATTAGTTATGACT-ATATAAACTTGTTTGGTAAACATATT
188 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATT-GTTATGACTAAT-TAAA-TTGTTTAGTAAATAGATT
* * * *
17095564 TA-TTTTTAGAATCTTTTACTTATTAAGTGTTGAATTATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTG
250 TATTTTTTA-AATC---TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTG
* * *
17095628 AATAAGCTTTCATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA-GAAA-AAAA-TTATAACTATTTAAAATA
311 AATAAACTTT-ATGAATAAAAACAA-T-TTTT-TGACAAAACAAAAGTCATAACTATTTAAAATA
* * * * * * * *
17095690 AATAATTGTTCAAATAGTAACAACTATTTAAACTTA-TTCAGTAAACAAATATACTTTTTAAGTT
372 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTC
* * * * *
17095754 TTTTACTTATTAATTGATTGAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTA-ATTGAAATAAGCCTATA
436 TTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATA
* ** * * * * *
17095817 TGAATAGAAAAAATTATTTTACAACAAAACAAAAGGCTACAACAATTTGAAATAGGTAATTATTC
499 TGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** *
17095882 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAATAAATAGAGTCAGTTTTTAAATATCT--TATTAA
564 AAATAGTCATAACAATTTGAACTGT-TTAAAAAAATATTGT---TTTTTAAATTTCTACTATTAA
* * *
17095944 TTTTTGAAATACTAATAAATTAGAATTATGTTATTTTGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATT
625 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATT
*
17096009 ATTTTCTAACAAAACC
690 ATTTTCTAACAAAACA
* * * *
17096025 GAGGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTACATTGGTTAGGC
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA-ATTGGTTAGGT
* *
17096090 CAACATATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTACT
65 AAACAAATTCATTTTTTAAATCC-TTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTA-T
*** * *
17096155 TTATTCCAAATAAGACTATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGA
127 TTATTTTGAATAA-ACTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* *
17096220 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTAAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTT
191 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTTATGACTAATTAAATT-GTTTAGTAAATAGATTTATTT
*
17096285 TTTAAATCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAACAAACTT
255 TTTAAATCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTT
* * * * *
17096349 ATACGAA-AAAAACCATTTTTTCGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTAAAATAGATAATTATT
320 -TATGAATAAAAACAATTTTTT-GACAAAACAAAA-GTCATAACTATTTAAAATAAATAATTATT
* * * * * *
17096413 -AATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
382 CAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTAT
* * * * * * * * *
17096477 TAGTTTTCTTAATACTACTAGA-TTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTATATGAACATAAAT
446 TAATTTT-TGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAAA
* *
17096541 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATA
510 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
17096606 ACCATTTGAACTGGTTTGGTAGACAATATTGTTTTTTAAATTTCCTACTCATTACTTTTTGAAAT
575 ACAATTTGAACT-GTTT--AAAAAAATATTGTTTTTTAAATTT-CTACT-ATTAATTTTTGAAAT
* * * * *
17096671 ATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTATACG-AT-GAACAACAATAAATTTCCT
635 ATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAATAG-A-AACAAT-TATTTTCT
** **
17096733 -ACTCATTA
697 AACAAAACA
**** * ** * * * * * ***
17096741 ATTTTTGA-AAT-ATTAAAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAGGCTTATACGATGAACAAAAA
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAA-A-TA-ATT-GTTCAAATAGTCATA-AC--T--A-TTTAA
* ** * * *** * * **
17096804 TTGTTTTATGACAAAAAAAAAATTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAAT
55 TTG-GTTA-G---GTAAACAAATTCAT--T--TTTTAAATCCTTACTTATT--AATTTTCA-AA-
* * * * *
17096869 TATTTGAACT-GATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAACTTTTGATATA
107 TA-TT-AA-TAAATTAG-T--ATT-ATTTA--TTTTGAA--T--AA--ACT--A--TATGA-ATA
* ****** * ** * * ** * * *
17096933 TTAATA-AAGTT-TTATTACTGTATTTTGGATAA-GTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATT
152 -GAA-ACAA-TTGTT-TTA-TG-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG--A-AATAG-ATAATT
* * ** * *
17096995 ATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATGTTCAAATAGTCTTGACTA
207 GT---TCAAATTGT--T-ATGA--CT-AAT-TA-AATTGTTT--A-G-T-AAATA-----G---A
* * * *** *** *
17097060 TTTAAATTTGTTCAGTAA-ATAGATTTCTTTTTAATTTCTT-GCTTATTAATTTTTTGAATGTTA
248 TTT--ATTT-TTTA--AATCT--A---CTTATTAATTT-TTAAAATATTAATAAATT-AATATT-
** * * * * * *
17097123 ATAGAATAGTATTTTTTGTATTTCAAACAAGCATGTATGAACT-GAACCAATTAATTTATGACTA
300 AT----T--T-TAATCTG-A----ATA-AA-C-TTTATGAA-TAAAAACAATT--TTT-TGACAA
* * * * * * * * * * * *
17097187 AACAAAAGGACAGAA-TGATTTGAAATATATAATTATTCGAATAATCTTGATTATTTAAATTGGT
346 AACAAAA-GTCATAACT-ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
** * * * * * * ** *
17097251 TTAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATT-ATTAGTTTAGCA
409 TCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAACTTAGTA
* * * *** * * * * * *
17097315 ATATTTGACTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACCAAACAAAGA-TCAT
474 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTAT
** * * * *
17097379 AATGATTCATG--ATAGATAACTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAATTGGTCTAGTAAAAAAA
539 AACAATT--TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAACT-GT-T--TAAAAAAA
* **
17097442 T-TTAG-TTTTTAAATCTT-T--TATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTT
598 TATT-GTTTTTTAAAT-TTCTACTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTT
* ** * * * * * *
17097502 TGAATAATTTTGTA-TAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
661 CGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAACA
* ** * * * *** *
17097546 AAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTTTTTAACTCACTCGGTA
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAATTGGTTAGGTA
* ** *
17097611 AATAAA-TC---TTTT--A--CTTA-TTAATT--TTTGGAAA-ATAAATAAATTTA-TATTATTT
66 AACAAATTCATTTTTTAAATCCTTACTT-ATTAATTTTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTT
* * * * *
17097663 -TATTTGAAATAAGCT-TGCATGAATTGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATG
129 AT-TTTG-AATAAACTAT--ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * * * * *
17097726 TTTTGAAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGA-TT-TT
190 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTTATGACTAATT-AAATTGTTTAGTAAATAGATTTATT
** * * * *
17097789 TTAAAATTATCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATATC-AAATA
254 TTTTAA--ATC-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTGAATA
* * * * * *
17097853 AGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTT-ACTACAAAAAAAAGGTCA-AAATAATTTGAAATAG
315 AACTT-TATGAA-TAAAAACAATT-TTTTGAC-A-AAACAAAA-GTCATAACT-ATTTAAAATAA
* * * * ** * *
17097915 ATAATTACTT-AAATAGCCATGATTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCT
373 ATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCT
*** * * *** * *
17097979 TTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATG
437 TTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG
* * * * * * * *
17098043 AACA-AAAACTATTGTTTTATAACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGGTAA
501 AATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
17098107 AATAGTCATAACTATTAGAACTTATTTGATAAATAGAT-TTATTTTTTAAA--TC-ACTTATTAA
565 AATAGTCATAACAATTTGAAC-TGTTT-A-AAA-AAATATTGTTTTTTAAATTTCTAC-TATTAA
* * * * * * * * *
17098168 TTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACA-AAAGCATT
625 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAATAGAAA-CAAT
* * *
17098232 TGTTTTATGACAAAACA
689 TATTTTCTAACAAAACA
* * * *
17098249 AAAGGTCATAATGATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGT
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AATTGGTTAGGT
* * *
17098314 AAACAGAATT-ATTTTTTAAAT--TT-CTTACTAATTTTTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTAT
65 AAACA-AATTCATTTTTTAAATCCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATT-AGTATTAT
* * * * * *
17098374 ATTATTCCT-AATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAGTAAAAAAAGTCATA
127 -TTATT-TTGAATAAACTA-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA--ACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * ** * *
17098438 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTCAACAAAAAAATT
187 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGT-TATGACTAATT-AAATTGTTTAGTAAATAGATT
* * * * * *
17098502 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTCTAAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCT-
250 TATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTG
* * * * * * *
17098566 AATAAGA-TTGTATGAACAAAAATAATTTTTTTTATGATATAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
311 AATAA-ACTT-TATGAATAAAAACAA---TTTTT-TGACAAAACAAAA-GTCATAACTATTTAAA
* * * * ** ** * *
17098630 GTATACAATTATTCAAATAGTCATACCTATTCAAACTAGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTAAA
369 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAG
* * **
17098695 TATCTTT-CTTATTAA-TTTTGAAAAATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
434 TCT-TTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
* * * * *
17098757 TATGATTA-AAAATAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG
497 TATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* * ** ** * ***
17098821 TTAAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGCTAAACATATTCACATTTTAAATCATT-TACTA
561 TTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTG-TTT-AAAAAAATATT-GTTTTTTAAAT--TTCTACT-
* * * *
17098885 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AA
620 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAA-TAGAA
* * ** * *
17098949 ATAATTGTTTGATGATAAAACA
684 ACAATTATTTTCTAACAAAACA
* ** * * * * * *
17098971 AAAGGTCAAAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATAGTCATGACTATTTGAATTTGTTTA-G
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-TTGGTTAGG
* * * * *
17099035 TAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTA
64 TAAACAAATTCA-TTTTTTAAATC-CTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
17099099 TTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAA
126 -TTTATTTTGAATAAAC-TATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * *
17099163 TGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCT---TAACT--ATTG----GTAAACAGATTTAT
188 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTTATGACTAATTAAATTGTTTAGTAAATAGATTTAT
* * ** * *** * *
17099218 ATTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTTTGAAT
253 -TTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAT
* * * *
17099283 AAGCTTGTAAGAGATGAAACAA-ATATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAATA
314 AAACTT-TATGA-AT-AAA-AACA-ATTTTTTGACAAAAC-AAAAGTCATAACT-ATTTAAAATA
* * * * * * * * * *
17099346 AAAAATT-TTCTAATAGT-TTAATTGTTAGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCT
372 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCT
* * * * ** * * *
17099409 CTTATTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAA-TTAGTATTGTTTTA-ACTAAATATGCTTCTATG
437 TTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG
* * * * * * * * **
17099472 ATTAGAGACAATTATTTTATGATAAAA-ATAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAATCATTC
501 AATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * * * * * * *
17099536 AAATGGTCATAATTATTTTAACTAAGTCAGTAAACAGAT-TTATTTTTTAAATTTTTTACTCAAT
564 AAATAGTCATAACAATTTGAACT--GT--TTAAAAAAATATTGTTTTTTAAA-TTTCTACT-ATT
** * * ** * * *
17099600 AATTTAGGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTCTAAACTTGTATC-AGCTA-AAAC
623 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATA-CGA-ATAGAAAC
* * *****
17099663 AATTGTTTTAAGTCTTTTACTTGTTA
686 AATT-ATTT---TC--TAACAAAACA
* ** * ** ** * * * *
17099689 ATTATCTTATTTTGAATTATGCTATTTTGAATAAGCTTGTACGAATAG--A-AAC-AATT-ATT-
1 A-AAGGTCATAATG-ATT-TG--A-AATAAATAA--TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAATTG
* *** * * *** * **
17099748 TTCTAACAAAACCAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT-
58 GT-TAGGTAAA-CAAA-TTCAT--T--TTTTAAATCCTTACTTATT--AATTTTCA-AA-TATTA
* * * * ** * * * * * ** * **
17099812 CTCATTGGTCAGGCCAACAGATTCAATTTTTAAATACATTCTTTATTAATTTTCATAA-TATTAA
112 ATAAAT--T-A-G--TA-TTATT-TA-TTTTGAATA-A-ACTATATGAA--TAGA-AACAATTGT
** * ** *** * * *
17099876 TAAATTAGCATTACTTTA-TTCCGAATAAGACTGTATTAATAGAAACA-A-AAGTTTTATGACAA
163 TTTATGA-CAAAACAAAAGGT-C--AT-A-AC-G-ATT--T-GAAATAGATAA-TTGT-T-----
* * * * *
17099938 AACAAATTGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTA-ATTGAATTGGT
210 --CAAATTGT--T-ATGA-CT--AAT-TA-AATTGTT----TAG-TA-AA-TAGATT-TATT--T
* * * * *
17100002 TTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTTT
255 TT--T--A-A-ATCTACTTATT-AAT-T--T-TTAAA-------ATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * *
17100067 TTTAATTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
302 TTTAATCTGAATAAACTT-TATGAATAAAAACA-ATTTTT-TGACAAAACAAAA-GTCATAACTA
* * * * * * * * *
17100132 ATTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAAATTTATTT
363 TTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTT
* * * * * * * *
17100197 TTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTCTTAATATTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
428 TTTAAGTCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * ** * *
17100261 GCTTGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAACATAT
492 GCTTATATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * *
17100325 AATTGTTGAAATAGTCATAGCTATTTGAACTGGTTTGGTAGACAGTTTTATTTTTTAAATTTCCT
556 AATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAACT-GTTT--AAAAAAATATTGTTTTTTAAATTT-CT
* * * * *
17100390 ATTCATTAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATG-AT-
617 ACT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAATA
* * * *
17100452 GAACAACAATTGTTTTATGACCAAACA
681 G-A-AACAATTATTTTCTAACAAAACA
** * * * * * * *
17100479 AAAATTCATAATAATTTGAAATAGAA-AATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTCGA
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AATTGGTTAGG
*** * * * *
17100543 TATATTGAATT-ATTTTTTAAATTTCC-AACTT-TTCAACTTTTCAACTTTTGATATATAAAGTA
64 TA-AACAAATTCATTTTTTAAA--TCCTTACTTATT-AA-TTTTCAA-ATAT--TA-ATAAATTA
* * * * ***
17100605 ATATTATTT-TGTTTCGGATAAGTA-TTTATGAACT-GAAACAACTGTTTTATTTTAAAACAAAA
120 GTATTATTTAT-TTT-GAATAA--ACTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * *
17100667 GGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAA-TGTTCAAATAGTCTTGACTATTTAAATT-T
180 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTG-T----TA----TGACTAATTAAATTGT
* * * ** * *
17100730 GTTCGATAAATAGA-TT-TTTTTTAATTTCCTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAG
236 -TTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAA-AT-CTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA-AATTAA
* * * * *
17100792 TATTATTTT-ATTTCAAATAAGCATGTATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGG
296 TATTATTTTAATCT-GAATAAAC-TTTATGAA-TAAAAACAA-T-TTTT-TGACAAAACAAAA-G
* * * * * * * * * *
17100855 TTAGAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTACTTTGGCAAAC
354 TCATAACT-ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAAC
* * * * * * ** * * *
17100919 ACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTAGAATATT-ATTAGTTTAGCAATATTTTAC
418 AAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTAT
*** * * * *
17100983 TCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACAATTTG
483 TTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTG
* * * * **
17101047 AGATAGATAATTGCTC-AATAGTCATAACTATTTGAACAGGTCCAATAAATAGAT-TTAG-TTTT
548 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAAC-TGTTTAA-AAA-A-ATATT-GTTTTT
* * * * * * **
17101109 TACATCTCT--TATTAACTTTTGAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTT
608 TAAATTTCTACTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTC-GAATAAGCTT
* ** * * * *
17101171 GTATAAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
672 ATACGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAACA
* ** * ** *** * *
17101205 AGATATCATAACGATTCAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-TTTGAACTCACTCA-A
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-TTGGTTAGG
* * * * * *
17101268 TAAATATATTTATTTTTTTAAA-CCTTTTACTTATTACTTTTTGAAA-AATAATAAATTTA-TAT
64 TAAACAAATTCA-TTTTTTAAATCC--TTACTTATTA-ATTTTCAAATATTAATAAA-TTAGTAT
*** * * * * * * *
17101330 TATTTTATTCAAAATTAGCT-TGCATGAACT-GAACCAAGTATTATATGACAAAACAAAAGGTCT
124 TA-TTTATTTTGAATAAACTAT--ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * ** * * * * *
17101393 TTATGTTTTGAAATAGATAACTATTTAGATAGTCACAACGATTTGAA---CTTA-TTAATAGATT
185 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTTATGACTAATTAAATTGTTTAGTAAATAGATT
* * * *
17101454 CT-TTTTTTAATTCTTTTACTGATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-A-CAT
250 -TATTTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC-T
* ** * * * *
17101516 GAA-ATAA---GATGAATTGAAACAATTGTTTTACTACAAAAGAAAAGGTCAGAA-TAATTTGAA
310 GAATA-AACTTTATGAATAAAAACAATT-TTTT--GACAAAACAAAA-GTCATAACT-ATTTAAA
* * * * * *
17101576 ATAGATAATTACTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAA
369 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAG
* *** * * * * * * *
17101640 TCATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA-TAAATATTATTTTAATCTAAATATGCTTGT
434 TCTTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAT
* * * ** * * * * **
17101704 ATGAACA-AAAACTATTGCTTTAAAACAAAACAAGAAGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTAC
498 ATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
17101768 TCAAATAGTCATAACTATTAT-AACTTGTTTGATAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTCT--TAT
562 TCAAATAGTCATAACAATT-TGAAC-TGTTT-A-AAA-AAATATTGTTTTTTAAATTTCTACTAT
* * * * * * * * *
17101829 TAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACCTATATGAATAAAAACA
622 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAATAGAAACA
* * * *
17101894 TTTGTTTTATGACAAAACA
687 ATTATTTTCTAACAAAACA
* * ** * *
17101913 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGTTATTTGAGTTGGTTAAGT
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AATTGGTTAGGT
* * * *
17101978 AAACAAAATT-ATTTTTTAAAT-C-T-CATATTAATTTTTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTGT
65 AAAC-AAATTCATTTTTTAAATCCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATT-AGTATTAT
* * * * *
17102038 GTTATTCCT-AATAAACTAGTATGAATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
127 -TTATT-TTGAATAAACTA-TATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * * *
17102102 TAATTTGAAATAGATAGTTGTTCATATATAGTCTCA--ACTATTTGAACTGGTTT-GACAAACAA
188 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-A-ATTGT-T-ATGACTAATT-AAATTGTTTAG-TAAATAG
* * * * * * *
17102164 ATTTTTTTTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTAT
247 A-TTTATTTTTT-AAA--TC-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAA
* * * * * * *
17102229 TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATA-ATATTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTT
307 TCTGAATAAACTT-TATGAATA-AAA-ACA-ATTTTT-TGACAAAACAAAA-GTCATAACTATTT
* * * * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * * ** **
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* * * * * * *
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* * * * *
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683 AACAATTATTTTCTAACAAAACA
* ** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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126 -TTTATTTTGAATAAAC-TATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** * * * * * **
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** * * * *
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253 TTTTT-AAATC--TA-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAT
* * * * *
17102960 AAACTTGTAAGATATGAAACAA-ATATTTTATGACTAAACCAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATA
314 AAACTT-TATGA-AT-AAA-AACA-ATTTTTTGAC-AAAACAAAAGTCATAACT-ATTTAAAATA
* * ** * * *
17103023 AAAAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAACACATTTATTTTTTATA-TC
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* * * ** * *
17103087 TCTTACTTATTAATTTTTATAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTT-TAACTAAATAAGCTTCTA
436 TTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAACTTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTATA
* * * * * * * **
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499 TGAATAGAAAAAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * ** * * * * * * * *
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563 CAAATAGTCATAACAATTTGAACT--GT--TTAAAAAAATATTGTTTTTTAAA-TTTCTAC-TAT
** * * * * * **** *
17103279 TAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAACTTGTATTTGTTGAAAC
622 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTATACGAATAGAAAC
* * * *
17103343 AATTGTTTTATGACAAATCA
686 AATTATTTTCTAACAAAACA
* * * * * * *
17103363 AAAGGTTATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAAT-ATTAACTATTTGAACTT-ATTTG
1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTT-AA-TTGGTTAG
* * * * ** * *
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* * * ** * *
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125 -ATTTATTTTGAA-TAAAC-TATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* *
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AATAGATAATTGTTCAAATTGTTATGACTAATTAAATTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
TCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTTATGAA
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TGTTTAAAAAAATATTGTTTTTTAAATTTCTACTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAAT
TATTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAACA
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* *
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*
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66 ATACGATGAACAA
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ATACGATGAACAACAA
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* *
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** ** * *
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* * * * *
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*
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* * * **
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * **
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* * ** * * * * ** *
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* * *
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* ** * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * ** * ** * * *
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* * * * *
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126 --A--TC-T--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG
* * *** * * * * * *
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1 AAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAA
* * * * * * ** * * * *
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* * *
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124 TTATC--T-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG
* * * * * * *
17098746 AAATAAGCTTATATG-ATTAAAAATAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAA
1 AAATAAGCTTGTATGAATT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAA
* * * * * * * ** * *
17098810 ATAGATAATTGTTAAAATAGCCATAATTATTTGAACTGA-TTTGCTAAACATAT-TCACATT-TT
65 ATAGATAACTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTCACTCAG-TAAATAGATAT--C-TTATT
17098872 AAATCATTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
126 --ATC--TT--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTG
* * * * * * * *
17098928 -AATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTGATGATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTTAAA
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* * * * ** * *** * * * * *
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* *
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127 -T-CT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTG
* * * * * * *
17099109 -GATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAA
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* * * ** * ** * * ** ** * *
17099173 TAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTGGTAAACAGATTTA-TATTTTCAAATCTT-TT-GC
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* * *
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* * * * *
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17099343 ATA
65 ATA
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Statistics
Matches: 1459, Mismatches: 289, Indels: 194
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (173 bp):
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TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG
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* * *
17097613 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAA-ATAAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAG
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** * * * * **
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* * * * * * * *
17097741 CTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAATAGA--T-TTTTT
129 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATT-TGCTAAACAAATTTATTTTT
* * * *
17097791 AAAATTATCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATATCAAATAAGC
1 TAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * *
17097856 TTATATGAACTGAAACAATTGTTTTACT-ACAAAA-AAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAA
65 TTATATGAAATAAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAA
* * * * *** *
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* * ** * *
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* * ** * *
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* *
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* **
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* * *
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131 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGATTT-GCTAAACAAATTTA-TTTTT
* * ***
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1 TAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * *
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* *
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1 TAAATCATTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * * * * *
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65 TTATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
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130 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTT-GCTAAACAAATTTATTTTT
* * * ** *
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* * * * * * ** *
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64 CTTATATGAAATA-AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGAT
** * * * * ** *
17099528 AATCATTCAAATGGTCATAATTATTTTAACTAAGTCAG-TAAACAGATTTATTTTT
127 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTTGCTAAACAAATTTATTTTT
** * * ** * *** *
17099583 TAAATTTTTTACTCAATAATTTAGGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTCTAAACT
1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * ** * * *** ** * ** * * *
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66 TATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC---AAAAGGTCATAATAATTTGAAATA-GA
* * * * * * * * *** ****
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126 TAATTGTTCAAAT-AGTCAT-AACTATTTG-AAC--TGATTTGCTAAACAAATTTATTTTT
* * ** * * * * * * * * * * ** *
17099767 CATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTCTCATTGGTCA-GGCCAA-
1 TA-AATCATTT-ACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT--TTATTTCAAAT
* * *** * * *** * * *
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61 AAGCTT-ATATGAAATAAA-ACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCA-TAAT-AATTTGAA
* * * * * * * * * * * *
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121 ATAGATAATTGTT-CAAAT-AGTCAT-AACTATTTG-AAC---TG-ATT-TG-CTAAACAAATT-
*
17099947 TCATAACGATTT
175 T-AT----TTTT
* ** * * * *** * *
17099959 GAAAT-AAATAATTGTTCAAATTGTTAT-AACTAATTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTT
1 TAAATCATTTACTTATT--AATT-TT-TGAAAT-ATT-AA-TAAATTAGT--AT-TATTT-TATT
* ** * * *
17100022 TTAAAT-CTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTAATTTGA-ACAAACTT
55 TCAAATAAGCTTA-T-A----T-GAA-A-T-A-AAA--CA-ATTGTTTT-A--TGACA-AAAC--
* * ** * *** * ** * * * *
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100 AAAAGGTCATAATA-ATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACT-G--
* * *
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159 -ATT-TGC-TA-A-AC--AA--ATTT--A-T--TTT-T
* * * * * ***
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1 TAAAT-CATTTACTTATT-AAT-T-TTTG-AAAT-A-----TT-A-A-TA--A-ATTAGTATTAT
* * * * *
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49 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * * **
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113 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATTTAT
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178 TTTT
** *
17100380 TAAAT--TTCCTA-TTCATTAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAG
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* **
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63 GCTTATATGAAAT-AA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGA
* * * * * * * ***
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126 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTA-AACAAATTTATTTTT
* * * *
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* * * ** * **
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121 ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTA-T-TTGA--A-CT-GATTTGCTAAACAAATTTA-T
17100746 TTTT
178 TTTT
* * *
17100750 TTAAT--TTCCTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAAATA
1 TAAATCATT--TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * * * *
17100811 AGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGAT
62 AGCTTATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGAT
* * * * *
17100876 AATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTACTTTGGC-AAACACATTTATTTTT
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* * * ** * * * *
17100931 TAAATC-TCTTACTAATTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGC
1 TAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * *
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65 TTATATGAA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAA
* * * **** * * *
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* * * **
17101109 T--A-CATCT-CTTATTAACTTTTGAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATT
1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGC
* * ** ** ** *
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65 TTATATGAAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAA
* * *** * *
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129 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATTTA-TTTTT
* * * * *
17101286 TAAACCTTTTACTTATTACTTTTTGAAA-AATAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATTAG
1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAG
** * * * * * * * * **
17101348 CTTGCATGAACTGAACCAAGTATTATATGACAAAACAAAAGGTCTTTATGTTTTGAAATAGATAA
64 CTTATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * * *
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129 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATT-TATTTTT
* * * ** *
17101461 TAATTCTTTTACTGATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATGAAATAAG-
1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * *
17101524 ----ATGAATTGAAACAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATAA
65 TTATATGAAATAAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAA
** * * * * *
17101584 TTACTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTA-TTTT
129 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATTTATTTTT
* ** * * * *
17101636 TAAATCATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTA-ATCTAAATATGC
1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGC
* * * ** * * *
17101700 TTGTATGAACA-AAAACTATTGCTTTAAAACAAAACAAGAA-GTCATAACAATTTGAAATAAAAA
65 TTATATGAA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA
** * * *
17101763 ATTACTCAAATAGTCATAACTATTAT-AACTTG-TTTGATAAATAGATTTATTTTT
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* * * * *
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1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* *
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66 TATATGAAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAAT
* ** ** * * *
17101942 TATTCAAATAGTCATAGTTATTTGAGTTGGTTAAG-TAAACAAAATTATTTTT
130 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATT-TGCTAAACAAATTTATTTTT
* * * * * * * * *
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1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * *
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65 TTA-TATGAAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA
* * *
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128 ATTGTTCA-A-ATAGTCAT-AACTATTTGAACTGATTTG-CTAAACAAA-TTTATTTTT
* * * **
17102175 TAAAATC-TCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
1 T-AAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
* * * * * * * * * * *
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* ** * * *
17102302 AATTGTTCAAATAGTTATAACTATTCAAACTGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTT
127 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATTTATTTTT
*
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
17102483 ATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAA-TAGATTAGCTAAATAGATTCACTTTT
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* * *
17102537 TAAATCACTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCT
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* * * * * * * * * * *
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66 TATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATT
* * *
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* * ***
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65 TTATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAAT
** * * * * *
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * **
17103081 TATATC-TCTTACTTATTAATTTTT-ATAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTAAATAA
1 TAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAA
* * * * * *
17103143 GCTTCTAT-TATTGGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
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** * * * * * * * *
17103207 TAATCATTCAAATGGTTATAATTATTTTAAATGAGTCGGTAAACAAATTTATTTTT
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* ** * ** * ** *
17103263 AAAATTTTTTACTTAATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAACT
1 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* **** * * * ** * * *
17103328 TGTATTTGTTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAAACAATT
66 TATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
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* * * * *
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1 T-AAATCAT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATA
* * ** * * * *
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62 AGCTTATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGAT
* * * * * * * *
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127 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATTTATTTTT
* * * *
17103621 TAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATTTGAATTCAAATAAGC
1 TAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * *
17103685 TTGTATG-AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAAATTGATTA
65 TTATATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTG-AAATAGATAA
* * * * * * *
17103749 TAGTTCATATAGTCTTAACTACTTGAATTGGTTCAGC--AACTAAATTTATTTTT
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** ** * * * * *
17103802 T-AATTTTCTTGGTTATTAA-TTTTGGAATATTATTAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAAA
1 TAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAG
* ** * * * * * * * *
17103865 ATGGTAT-AAACAAAATCAATTGTTTGATGATAAAATAAAAGGTTATAACATTTTGAAATAGTTA
64 CTTATATGAAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA
* * * * * * * * *
17103929 ATTATTCAAATAGACAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGATTT-TCATTT
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* *
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64 CTTATATGAA-ATAAAACAATTGTTTTATGA
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Statistics
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GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGCTAAACAAATTTATTTTT
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* * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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*
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*
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17099367 TTGTTAGAAC
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TTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAGATAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAT
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* *
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** * * *** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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253 AATAATATATTTTA-TGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTA-TTCAAATA
* * * * * *
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316 GTCATAG-CTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TA
* ** * * * *
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* * * * * * * * *
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66 TTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * *
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* * ** * * * **
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* * * ** * * * **
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259 ATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAGC
*
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324 TATTTGAATTGGTTTA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATA
* * * * * *
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1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CTAAATAAGCTTGTATG
* * * ** *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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256 AATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * * * * *
17098654 ACCTATTCAAACTAGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTAAATA
321 AGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATA
* * *
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1 --TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTAT
* * * *
17098760 G-ATT-AAAAATAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
63 GAATTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * ** *
17098823 -AAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GATTTG-CTAAACATATTCACATTTTAAATCAT-TTACT
127 CATAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGAC-AAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTAGT
* ** *
17098884 AATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-A
189 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGA
* * * * * *
17098948 AATAAT-TGTTTGATGATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATAGT
253 AATAATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGT
*
17099012 CAT-GACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTA
318 CATAG-CTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA-TA
* * * ** *
17099060 TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * ** * *
17099125 CT-AAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCA-A
66 TTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATA
* * *
17099188 ATAGTCTTAACTA-TTG-----G--T---AAACAGATTTATATTTTCAAATCT-TTTGCTTATTA
131 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTAG-TTATTA
* * * ** * * *
17099241 ATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAGAT-GAAACA
194 A-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAATA
* * ** * * * *
17099304 A-ATATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAAAATT-TTCTAATAGT-TTA
257 ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATA
** * * * * * * * *
17099366 ATTGTTAGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
322 GCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TA
* * * * * *
17099410 TTATTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTA-ACTAAATATGCTTCTATG-
1 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * **
17099472 ATT-AGAGACAATTATTTTATGATAAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAATCATTC
65 ATTGA-AAAAAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * * * * *
17099536 A-AATGGTCATAATTATTTTAACTAAGTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTCAA
128 ATAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
** * *** * * *
17099599 TAATTTAGGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTCTAAACTTGTATCAGCTA-AAAC
192 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAAT
* * * *** ** * * * * * * *
17099663 AAT-TGTTTTAAGTCTTTTAC--TTGTTAATTATCTTATTTTGAATTATG-CTATT-TT-GAATA
256 AATATATTTTATG-ATAAAACAAAAGGTCA-TAAC--AATTTGAAATA-GACAATTATTCAAAT-
* * *
17099722 AG-C-TTG-TA--CGAA------TAG-AAAC-AA-TTATTTTCTAACA-A
315 AGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATA
* ** * * * * *
17099757 -AACCAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCTCATTGGT
1 TTA-CTTA--T--TAAT-TTTTGAAATA-TTAA-TA---AATTAGT-AT---TATT-TTATT-CT
* * ** * * * * * * *** * *
17099821 CAGGCCAA-CAGATTCAAT--TTTTAAATACATT-CTTTATTA-ATTTTCATAA--T-ATTAATA
49 -A----AATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGGTCA-TAA-C
* * * * * ** * * * * * *
17099878 AATTAGCATTA-CT--TTATTCCGAATAAGAC-TGTATTAATAGAAACAAAAGTTTTATGACAAA
106 AATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT-AGTCAT-AACTATTTG-AAC--TAG--TT-TGAC-AA
* * * * ** * *
17099939 ACAAATTGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTA-TAACTAATTGAATTGGTT
162 ACAGATT-T-AT-----TTT---TTAAAT--CTCTT---A--GTTATTAA-TTTTTGAAAT--AT
* * ** * * * ** * *
17100003 TAGTAAA-TAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTT
207 TAATAAATTAGTA-TTA--TTTT--ATTTCAAATAAACTTGTATGA-A-T-AGAAA-TAATA-TA
* * ** * * *** *
17100066 TTTTAATTTGA-ACAAACTTATATGAACAAAAACATTTTTTTAT-GACAA--A-ACAAA-AGGTC
262 TTTT-A--TGATA-AAAC--AAAAGGTC-ATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA-GTC
* * ** * * * **
17100125 ATAACAAATTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAAA
319 ATAGC-TATTTGAATTGGT--TTAGT-A-A-A--C--AA--ATTT--A-T--TTT-TTAAAT--A
* * * ***
17100190 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTCTTAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATT-T
1 -TTACTTATT-AAT-T-TTTG-AAAT-AT-----T-A-A-TA--A-ATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * **
17100254 CGAATAAGCTTGTATGAA--CAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTG
49 -AAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * ** * *
17100317 AAACATATAATTGTTGA-AATAGTCATAGCTATTTGAACTGGTTTGGTAGACAGTTTTATTTTTT
112 AAATAGATAATTGTTCATAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTT
* * ** **
17100381 AAATTTCCTA-TTCATTAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCT
177 AAATCTCTTAGTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACT
* * * ** ** * *
17100444 TATATG-AT-GAACAACAAT-TGTTTTATGACCAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAGAAA
241 TGTATGAATAG-A-AATAATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACA
* * * ** * * ***
17100506 ATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAATT-GATTCGATATATTGAA-TTATTTTTTAAAT-
304 ATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAG-TA-AACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * * * * * **
17100565 TTCCAACTT-TTCAACTTTTCAACTTTTGATATATAAAGTAATATTATTTTGTT-TCGGATAAG-
1 TT---ACTTATT-AATTTTTGAA-ATAT--TA-ATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGC
* * * * * *** ** *
17100627 TATTTATGAACTG-AAACAACTGTTTTATTTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATA
57 T-TGTATGAATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
17100691 ATTGTTCAAATGTTCAAATAGTCTTGACTATTTAAATTTGTTCGATAAATAGA-TT-TTTTTT-A
121 ATTGTTC--A---T--AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * *
17100753 ATTTCCT-GCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCA
179 ATCTCTTAG-TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACT
* * * ** *
17100815 TGTATGAACTA-AAACAAT-TATTTTATGACT-AAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATA
241 TGTATGAA-TAGAAATAATATATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACA
* * * ** * * * *
17100877 ATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTACTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
304 ATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TA
* * * ** * * * * *
17100939 TTACTAATTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
** * * * * *
17101003 CAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGCTC--A
66 TTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATA
*** * * * *
17101064 ATAGTCATAACTATTTGAAC-AGGTCCAATAAATAGATTTAGTTTTTACATCTC----TTATTAA
131 ATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA
* * ** * * *
17101124 CTTTTGAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATAAATAAAAACAAT
195 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAATAGAAATAAT
* * * ** * ** * * * *
17101188 -TGTTTTATGACAAAACAAGATATCATAACGATTCAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
259 ATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAGC
* *** * * * * *
17101252 T-TTTGAACTCACTCAATAAATATATTTATTTTTTTAAACCTT
324 TATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA--TA
* * * * *
17101294 TTACTTATTACTTTTTGAAA-AATAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATTAGCTTGCATGA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA
* ** * * * * *** * *
17101357 ACTG-AACCAAGTATTATATGACAAAACAAAAGGTCTTTATGTTTTGAAATAGATAACTATT--T
65 ATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * * *
17101419 AGATAGTCACAACGATTTGAACT--TATT----AATAGATTCT-TTTTTTAATTCTTTTACTGAT
130 A-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TTGACAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
** * * *
17101477 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATGAAAT-AA---G-ATGAATTGAAAC
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* * * * * * *
17101536 AAT-TGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCA
256 AATATATTTTA-TGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCA
* ** *
17101599 T-GACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCA
320 TAG-CTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-A
* ** * * * *
17101643 TTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTAATCTAAATATGCTTGTATGA
1 -TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA
* * ** ** * * **
17101708 A--CAAAAACTATTGCTTTAAAACAAAACAAGAA-GTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTACTC
65 ATTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
17101770 A-AATAGTCATAACTATTAT-AACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTAT
128 ATAATAGTCATAACTATT-TGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
* * * * *
17101829 TAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACCTATATGAATA-AAA-A
192 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATA
* * * ** *
17101892 CATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
257 -ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
17101957 AGTTATTTGAGTTGGTTAAGTAAACAAAATTATTTTTTAAAT-
321 AGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * * * * * * *
17101999 CT-CATATTAATTTTTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTGTGTTATTCCT-AATAAACTAGTATG
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CTAAATAAGCTTGTATG
* * *
17102061 AATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAGTTGTTCA
64 AATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
17102126 TATATAGTC-TCAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTTTTTTTTTAAAATCTCTTAGTT
129 TA-ATAGTCAT-AACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGA-TTTATTTTTT-AAATCTCTTAGTT
* * ** * *
17102190 ATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
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* * * * * * *
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* ** * * *
17102319 TAACTATTCAAACTGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATATA
320 TAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AA-ATA
* *
17102365 TTACTTATTAATTTTAGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTGT-AA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
17102428 TT-AAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGA-
66 TTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * * * * *
17102491 AATAGCCATAATTATTTGAA-TAGATT-AGCTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATA
130 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-C-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATT
*
17102554 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-AAAGCTTGTATGAATTGAAATA
193 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA-CTTGTATGAATAGAAATA
* * * * *
17102618 AT-TATTTTATGATAAAATAAAAGGTCAAAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATAGTCAT-
257 ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATA
*
17102681 GACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTA
322 G-CTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA-TA
* * * ** * *
17102726 TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTACGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
17102791 TTG-AAACAATTATTTTGTGCCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTC-TC
66 TTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATA
* * * ** *
17102854 ATAGTCATTACTATTTAAACTTGTTTGGTAAGCAGATTTATTTTTTCAAATCT-TTAGCTTATTA
131 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG-TTATTA
* * *
17102918 ATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTAAG-ATATGAAA
194 A-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAATA-GAAA
* * * * * * *
17102979 CAA-ATATTTTATGACT-AAACCAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATAGTT
255 TAATATATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTC
* * * ** * * * *
17103042 TTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAACACATTTATTTTTTATATCTC
319 ATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTA-A-ATA
* * *
17103089 TTACTTATTAATTTTT-ATAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTAAATAAGCTTCTAT-
1 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATG
* * * **
17103151 TATTGGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTC
64 AATTGAAAAAAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * ** * * * * * *
17103216 A-AATGGTTATAATTATTTTAAATGAG-TCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTAA
128 ATAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
** * ** *** * *
17103279 TAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAACTTGTATTTGTTGAAACA
192 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATA
* * * * * * * * *
17103344 AT-TGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAAT-ATT
257 ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCA-T
* * * * * *
17103407 AACTATTTGAACTT-ATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTC
321 AGCTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAA--TA
* * * * *
17103453 TTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAGTAGTATTAATTTATTCTAAGTAAGCTTGTATGA
1 TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * ** * *
17103517 ACT-AAAACAATTACTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTTTTC-T
65 ATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * ** *
17103580 AATAGTCTTAACCATTTGAACTAATTCGATAAACA-A---A-AATTTAAATCTCTTACTTATTAA
130 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA
* * * * * * *
17103640 TTTTTGAAATATTATTAAATTACTATTATTTGAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAAT-
195 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATA
* * * ** * ** * * *
17103703 TGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAAATTGATTA-TAGTTCATATAGTCTTAA
260 TATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAATAGACAATTA-TTCAAATAGTCATAG
* * * * *
17103767 CTACTTGAATTGGTTCAG-CAACTAAATTTATTTTTTAATTTTC
323 CTATTTGAATTGGTTTAGTAAAC-AAATTTATTTTTTAA--ATA
** * * * * ** *
17103810 TTGGTTATTAA-TTTTGGAATATTATTAAAGTAATATTATTTTATT-TCAAATAAAAATGGTAT-
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAAT-AAGCTTGTATG
** * * * * * * * * *
17103872 AA-ACAAAATCAATTGTTTGATGATAAAATAAAAGGTTATAACATTTTGAAATAGTTAATTATTC
64 AATTGAAAA-AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
17103936 A-AATAGACAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGATTT-TCATTTTAAATCTCTTACTAAT
128 ATAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTAGTTAT
* * * * * *
17103999 TAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTCTTTCAAACAAACTTATATTAACA-AACA
192 TAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAA-A
* * * * * * *** *
17104062 CAAT-TGTTTTATGAT-AAACTTATA-TTAACAAAAACAA-TTGTTTTAAGACAA--AAT--AA-
255 TAATATATTTTATGATAAAAC-AAAAGGT--C-ATAACAATTTGAAAT-AGACAATTATTCAAAT
* * ** * *
17104118 A---A-AG-TA-AT-AA-TGATTT-G-----AAATTTAAATGTTCAA-A
315 AGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * *
17104152 -TAGTTA-TAATTATTTGAACTAGTTGAATAAA-TAGAATTATTTTCTAAATGTCTTACTTATAA
1 TTACTTATTAATT-TTTGAAATA-TT-AATAAATTAGTATTA-TTT-T--AT-TC-TA--AATAA
* * * * * *** *** *
17104214 ACTT-TTTGAAATAT-TAATAAATTAGTTTTAT-TCTATTCCAATTAA-G-C-T-TGTATGTGCT
55 GCTTGTATG-AAT-TGAAAAAAATTA-TTTTATGAC-AAAACAA--AAGGTCATAACAATTTG--
* * ** * * *
17104272 AAATA-ATTATT-TT-ATAACA-AAATAA-AAGGTTAT-AAC-AATTTGA-AATA-A-A--TAAT
112 AAATAGATAATTGTTCATAATAGTCATAACTA--TT-TGAACTAGTTTGACAA-ACAGATTTATT
* * * * * * * * *
17104325 TGTT-CA--T-ATAG-TCTTAACTGTTTGAAATGGTTCCACAAA-TAG-ATTTATTGTTTAAATA
173 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATT-AATAAATTAGTA-TTA-T-TTT--ATT
* * ** *** * * * * * **
17104383 TCTTAGT-TGCTGATTGT-TAGAATTTTAACAATAT-TTTTAAGACAAAACAAAATGTAATAATG
230 TC-AAATAAAC---TTGTAT-GAATAGAAATAATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * ** * * * * *
17104445 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGAA-TTAT
290 ATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACA-AATTTAT
*
17104509 TTTCTAAAT-
354 TTTTTAAATA
* * * * * * * * *
17104518 CTA-TTATAAACTTTTGAAATATTATTAAATTAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTATGAG
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
17104582 CT-AAAATAATTATTTTAT-AGCAAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAT
66 TTGAAAAAAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * * * * *
17104645 -ATAGTCTTAACTGTTTGAAAT-GGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTG
130 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTA
* * * * ** * *
17104708 ATTTTT-AGAATTTTACTAAATTAGTTTTATTTTATTAT-GAATAGGCTTGTATGAAAAGAAACA
194 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATA
* * * * * * * * *
17104771 AT-TGTTTTATAATAGAAGAAAA-ATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATA
257 ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATA
** * * *
17104834 ATTATTTGAAATGG-TTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAAT-
322 GCTATTTGAATTGGTTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * * * *
17104875 CT-CTTATTAATTCTTGAAATGTTAGTAAATTA-TGATTATTTTATT-TCGAATAAGTTTGTATG
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATG
* * *
17104937 --TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT-ACTAACAATTTGAAATAGATAGTTGTT
64 AATTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * *** ** * * *** *
17104999 CA-AATGGCTTTTATAA-TAAAAGAA--AAATT-A-TAACA-ATTTGAAATAGATAAATATTCAA
127 CATAATAG---TCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTT--ATTTTTTAAAT-CTC--
* * * * * * * *
17105057 ATAGTTA-TAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAA-CAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATT
184 TTAGTTATTAATT-TTTGAAAT-ATTA-ATAAATTAGTA-TTA--TTTT--ATTTC-AAATAA-A
* * * * * * * * *
17105119 CTTGAAATATTAAT--AAATTATGATTATTTTAT-TTCAAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAAT
239 CTTG---TATGAATAGAAATAAT-A-TATTTTATGATAAAACAA------AAGGT-CATAACAA-
* * * * * * ** * * *
17105181 TGTTTAATGACAAAACAAAATGTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGCCATAATT
291 ---TT--TGA-AATAGACAAT-TA-T-TCAAATAGTCATAGCTA--T-TTGAATTGG---T--TT
* * *
17105246 ATTTAAATGGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAA-A
339 A-GT-AA---A--C---AAATT--TAT-TTTTTAAATA
* * * * *** *
17105283 TCTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTGGTTAAGCTTTTA
1 ----TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTA
* * * * ** * * *
17105348 TGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTATATAGATAATTATT
62 TGAATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * *
17105412 CA-AATAGCCATAACTATATGAACT-TTTTCAATAAACAAAATTTATTTTTTCAAAACTCAT-GC
127 CATAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GACAAAC-AGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG-
* * *
17105474 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACT
188 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAA-T
* * * * * * *
17105537 -GAAACAAT-TATTATAAGACT-AAACAAAAGGTTAGAA-AGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
250 AGAAATAATATATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGACAATTATTCAA
** * * * * ** **
17105598 ATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCAACAAACGCATTTATTTTTTAAAT-
313 ATAGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * * * * *
17105648 CT-CTAATTAATTTTTGGAATATTAGTAATTTAGTATTTTTTTATTC-AAATAGGCTTGTATG-A
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * * ** * * *
17105710 -TCAGACATAGTTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCA-
66 TTGA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * * *
17105772 AATATTCATAACTATTTGAACTAG-TTAAAAAATAGCTGTAGTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTA
130 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTA
* ** ** * * *
17105835 ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATCTT-GGATAAGTTTTTACGAACTAG-AACA
194 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAATA
* * * * * * *
17105898 AT-TCTTTTCTAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTGTTC-AATAGTCAA
257 ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCAT
** * * *
17105960 ATTTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTT
321 AGCTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA--TA
* * * * * *
17106006 TTGCTCATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTTAATAAGCCTGTACGA
1 TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * *
17106070 AATG-AAATAATTATTTTATAACTAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATT--T
65 ATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * ** * * * *
17106132 AATAGCCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGTAAACACACTTATTATTTTAAATCTCTTACTTACTA
130 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATT-TTTTAAATCTCTTAGTTATTA
* * ** * * * * * *
17106197 ATTTTTGGAATTTTCTTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAAT
194 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAAT
* * * * * * * * * * * *
17106262 -TGTTTTTTGAGAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATAAATAATTGTTTAAAT-GTCATAAC
259 ATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAGC
* *** ** *
17106324 GATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTTTTGAACTCACTCAGTAAATATA
324 TATTTG-AATTGGT--TTAG-T--AA-A--CA-AA--TTT--A-T---T-TTTTAA-ATA
* *
17106383 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAAA-ATTAATAAATTTA-TATTACTTTATT
1 -TTA---CTT--A-----------TTAATTTTT-GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
** ** * * * ***
17106446 -TGAAATAAGCTTGCT-TGAA-CCAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTTATGTTT
47 CT-AAATAAGCTTG-TATGAATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
* * ** *
17106508 TGAAATAGATAACTATT--TAGATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTT-AGTAAACAGATTCT-T
110 TGAAATAGATAATTGTTCATA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-CAAACAGATT-TAT
* * * * **
17106569 TTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTACATCAAATA
172 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * * *
17106634 AGCTTATATGAACT-GAAATAAT-TGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATA
237 AACTTGTATGAA-TAGAAATAATATATTTTA-TGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * *
17106696 GATAATTACTCTAATAGTCAT-GACTATTTGAAGTT-GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
300 GACAATTATTCAAATAGTCATAG-CTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
17106759 CA
363 -A
* * ** * * * * *
17106761 TTTACTTATTAGTTATCAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGA
1 -TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA
* * ** * * **
17106826 A--CAAAAACTATTATTTTAAAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCCCA
65 ATTGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * *
17106889 -AATAGTCATAACTATTAGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTA
129 TAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTA
* * * * * *
17106949 ATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTCATTTAAAACAAACTTATATGAATA-AAA-ACA
194 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATA-A
* * * * * ** * * * * *
17107012 TTTTTTTTATTACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTTATAA
258 TATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAG
* *
17107077 TTATTTGAATTGG-TTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAAT-
323 CTATTTGAATTGGTTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * * * * * *
17107117 CT-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTGTGTTATTCCT-AATAAACTAGTATG
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CTAAATAAGCTTGTATG
* * * *
17107179 AATTG-AAAAAATTGTTTTATGGCAAAATAAAAGGTCAT-ACTGATTTGAAATAGATAATTGTTC
64 AATTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
17107242 AT-ATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTCTTTTTTTAAACCTCTTAGTTAT
128 ATAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
* * * ** * * *
17107306 TAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTGTGAACAGAAATA
192 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATA
* * * * * * * *
17107371 AT-TTTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAATCATA
257 ATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** * * * * *
17107435 ACTACTCAAAATGGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTTAATATC
322 GCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAA-ATA
* * * *
17107479 TTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-AA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * *
17107543 TTAAAAAAAATTATTATATGACCAAAA-AAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGA-
66 TTGAAAAAAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* * * * * ** *
17107606 AATA-ACTATAATTATTTGAACT-GATTCACTAAACAGATTCACGTTTTAAATCAT-TTACTTAT
130 AATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGAC-AAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTAGTTAT
* * *
17107668 TAATTTTTGAAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAT
192 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAAT
* * * * * *
17107732 AAT-TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAAATCTT-AAATAAACTATTGTTCCAATAGTCA
256 AATATATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAAT-TTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCA
* *
17107795 TAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTA
320 TAGCTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA-TA
* * * * * ** * *
17107841 TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTACTATAATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
* ** * * * * ** * * **
17107906 CTG-AAGCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGATGATAATGATTTTAAATAAATAATTACTCA-A
66 TTGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATA
* * * * * *
17107969 ATAGTCATAACTATTTAAAATTA-TTCGGA-AAATAGATTTACTTTTTCAAATCT-TTTGCTTAT
131 ATAGTCATAACTATTT-GAACTAGTT-TGACAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAG-TTAT
* * * * ** * *
17108031 TAATTTTTTG-AATGTTAATGAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAA
192 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATA-GAAA
* * * * ** * ** *
17108094 CAA-ATATTTT-TGACT-AAACAAAATGTTAGAATGATTAGAAATAGGTAATTATTCTAATAGTT
255 TAATATATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAG-T
** * **
17108156 C-TAATTATTTGAACTGGTTTA--ACAACGCATTTATTTTTTAAATA
318 CATAGCTATTTGAATTGGTTTAGTA-AACAAATTTATTTTTTAAATA
* * * * * *
17108200 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATGTTACTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTTTAT
1 --TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * ** *
17108264 G-A-TCAAGAACAGTTGTTTTATAACAAAAC-AAA-TTCTTAATGATTTGAAATTGATAATTGTT
63 GAATTGAA-AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * * *
17108325 TA-AATGGTCATAACTATTT-AATCTGGTTCGATAAACATATTTATTTCTTAAATATCTTACTTA
127 CATAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
* ** * * ** * *
17108388 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTATATGACGAAAAAC
191 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAT
* * * * * * * * * *
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** * *** *
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* * * ** * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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** * * ** *** * *
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* * * * * ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** *
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* * ** * * *
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* *
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** * ** * * ** * **
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* ** * * **
17103678 AATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAAA
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAA
* * * * * * ** *
17103742 TTGATTATAGTTCATATAGTCTTAACTACTTGAA-TTGGTTCAG-CAACTAAATTTATTTTTTAA
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAC-AAATTTATTTTTTAA
* * ** * * * *
17103805 TTTTCTTGGTTATTAA-TTTTGGAATATTATTAAAGTAATATTATTTTATT-TCA
128 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
* * *** * * * * * *
17103858 AATAAAAATGGTAT-AAACAAAATCAATTGTTTGATGATAAAATAAAAGGTTATAACATTTTGAA
1 AAT-AAACTTGTATGAATTGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * * * *
17103922 ATAGTTAATTATTCAAATAGACAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGATTT-TCATTTTAA
64 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT-TTTTTAA
* * *
17103986 ATCTCTTACTAATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTCTT-TCA
128 ATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
* * * ** * * * * * *
17104040 AACAAACTTATATTAA-CAAACACAATTGTTTTATGA-TAAACTTATA-TTAACAAAAACAA-TT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAA-ACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGT--C-ATAACAATTT
*** * ** * * * * * * *
17104101 GTTTTAAGACAA--AAT-AAAAAGTAATAA-TGATTTGAAATT-TAAATGTTCAAA-TAGTTATA
61 GAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGT--TTGGT-AAACAAATT-T-
* * * * * * * *
17104160 ATTATTTGAA-CTAGTTGAATAAATAGAATTATTTTCTAAATGTCTTACTTATAAACTT--T-TT
119 ATTTTTTAAATCT-CTT-ACT-TAT-TAA-T-TTTT-GAAA--TATTA---ATAAA-TTAGTATT
** *
17104221 GA-AATATTAATA
171 -ATTTTATT-CTA
* * * ** * ** * ** * *
17104233 AAT-TAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTATGTGCTAAATAATTATTTTATAACAAAATAA
1 AATAAACTTGTA-TGAATT-GAAACAA---T-TAT-T--T---T-ATGA--CAAAAC------AA
* * * * * * * ****
17104297 AAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAATGGTTCCACA
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* * * * * ** * *
17104362 AATAGATTTATTGTTTAAATATCTTAGTTGCTGATTGTT-AGAAT-TT--TAACA--A-TATT-T
110 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAA-ATTAGTATTAT
* ** *
17104419 TTAAGACAA
173 TTTATTCTA
* * * * * * * * * **
17104428 AACAAAATGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTTATAATTATTTG
1 AATAAACT-T-GT-ATGAATTGAAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * *** * * * *
17104485 AACTAGTTCAATAAAT-AGAATTATTTTC-TAAATCTATTATAAAC-T-TTT-G-AAATATTATT
62 AAATAGAT-AATTGTTCA-AA-TA--GTCAT-AA-CTATT-TGAACTTGTTTGGTAAACA-AATT
* * * ** ** * * *
17104544 AAATTAGTTTT-ATTCTATT-CCAATTAA-GCTTG---TATGAGCTAAAATA--ATTATTTTATA
118 -TATT--TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTAT-
* *
17104601 GCAA
178 TCTA
** * * * * * * * * * **
17104605 AATAAA-AGGTCATAACAATTTAAAATAAATA-ATTAT-TC---A-TATA-GTCTTAACTGTTTG
1 AATAAACTTGT-AT--GAA-TTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * * * * * * * *** **
17104662 AAATGGTTCA--G-T-AAATAG--ATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTGATTTTTAGAATTT
62 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTT---ATTT
* * * * ** *
17104721 TACTAAAT-TAGTT--TTATT--TTATTATG-AATAGGCTTGTATGAAA--AGAAACAATTGT-T
123 T-TTAAATCT-CTTACTTATTAATT-TT-TGAAATA---TT-AAT-AAATTAG-TATTATTTTAT
17104777 T-TA
178 TCTA
** *** * * **
17104780 TAATAGAA---G-AAAAATT-ATAACAATT-TGAAATAGATAAATATTCAAATA-GTTATAATTA
1 -AATA-AACTTGTATGAATTGA-AACAATTATTTTAT-GACAAA-A--CAAA-AGGTCATAACAA
* * ** *** * * * * * ** * **
17104838 TTTGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAAT-GTTAGTA
58 TTTGAAATAGATAATTGTTCA-A-ATA-GTCAT-AA-CTATT-TGAA--CTTG-TTTGGTAAACA
* * * * * * *
17104902 AATTATGATTATTTT--A--T-TT-C-GAATAA-GTTTG-TATGTTGAAAAACAATT-GTTTTAT
114 AATT-T-ATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT--AATA-AATTAGTATTAT
*** ** *
17104957 GACAAAACAAA
173 -TTTATTC-TA
* ** ** * * * * *
17104968 AAGTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTG-TTCAAATGGCTTTTATAATAAAAGAAAA-ATTATA
1 AA-TA--AAC---TTG-TAT-GA-A-TTGAAAC-AAT-TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
17105031 ACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAGATTT
54 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTT
*
17105096 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTA-TGATTATTTTATT-TCA
119 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCT-A
** * * *
17105155 AATAAGTTTGTATG--TTGAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAATGT-ACTAACAATTTGA
1 AATAAACTTGTATGAATTG--AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTTGA
* * * * * * * *** ***
17105217 AATAGATAGTTATTCAAATGGCCATAATTATTT-AAATGGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTA
63 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * *
17105281 AATCTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTG
127 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
** * * * * * * ** * *
17105336 GTTAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTATAT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * **
17105401 AGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATATGAACTT-TTTCAATAAACAAAATTTATTTTTTCAA
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAAC-AAATTTATTTTTT-AA
* * * * *
17105465 AACTCATGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
128 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * *
17105519 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATAAGACTAAACAAAAGGTTAGAA-AGATTTGAAA
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAA
* * * * * **** **
17105583 TAGATAATTATTCTAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCAACAAACGCATTTATTTTTTAAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * *
17105648 CTC-TA---ATTAATTTTTGGAATATTAGTAATTTAGTATTTTTTTATTC-A
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
** * * * * * ** *
17105695 AATAGGCTTGTATG-A-TCAGACATAGTTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAG
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACA-A-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * *** * ** * *
17105757 ATTGATATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACTAG-TTAAAAAATAGCTGTAGTTTTTAAA
64 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * *
17105821 TCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA-TCTTG
129 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-TA
* ** * * * * * *
17105874 GATAAGTTTTTACGAACT-AGAACAATTCTTTTCTAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-AA
1 AATAAACTTGTATGAATTGA-AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAA
* *
17105937 ATAGATAATTGTTC-AATAGTCA-AATTTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTA
64 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTA
* * * * *
17106000 AATCTTTTGCTCATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTT
127 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * * * *
17106055 AATAAGCCTGTACGAAATGAAATAATTATTTTATAACTAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAAT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * * *
17106120 AGATAATTATT-TAATAGCCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGTAAACACACTTATTATTTTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATT-TTTTAAAT
* * * ** * *
17106184 CTCTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTCTTAAATTAGTATTATTTTAATCCA
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * ** * * * * * * *
17106236 AATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTTTGAGAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGAT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * ** * * * * *
17106300 AAATAATTGTTTAAAT-GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTTTT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT---TGTTTGGT-AAACAAAT--TTATTTTT
* * * * * * * * * * * *** *
17106363 GAACTCACTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTT--TTACTTATTAATT-TTTAGAAAATT
125 TAAAT--CTC--TTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTT-TATTCTA
* * * * * ** * * * *
17106424 AATAAATTTATATTACTTTATTTGAAATAAGCT-TGCT-TGAACCAAACCAATTGTTTTATGACA
1 AATAAACTTGTATGA----A-TTGAAACAA-TTATTTTATG-A-CAAAACAA------AAGGTCA
* * * * * * *
17106487 AAACAAAAGGTCTTTATGTTTTGAA-ATAGATAACTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTC
52 TAAC--AA-----TT-TG----AAATA--GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * *
17106551 TTTAGTAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAC
103 TTTGGTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
*
17106615 TATTATTTTACATC-A
167 TATTATTTTA-TTCTA
* * * * * * * *
17106630 AATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAGAATAATTTGAAA
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
** * * * *
17106694 TAGATAATTACTCTAATAGTCATGACTATTTGAAGTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * ** * * * *
17106759 CAT-TTACTTATTAGTTATCAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTAATCCA
130 C-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
** *** * ** *
17106811 AATATGCTTGTATGAACAAAAACTATTATTTTAAAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* ** * * * *
17106876 AAATAATTGCCCAAATAGTCATAACTATTAGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * *
17106939 TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTCATT-TAA
131 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
* * ** * * * * **
17106988 AACAAACTTATATGAATAAAAACATTTTTTTTATTACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * *
17107053 AGATAATTGTTCAAATATTTATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAA-
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
17107116 -TC-T-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTGTGTTATTCCT-
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CTA
* * * * * *
17107165 AATAAACTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAATAAAAGGTCAT-ACTGATTTGAAA
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAA
* * * * *
17107229 TAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTCTTTTTTTAAA
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAA
* * * * * * *
17107294 CCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTAGTATTTTATTTTG
129 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * ** * * * * * *
17107347 AATAAGCTTGTGTGAACAGAAATAATTTTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAGT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * ** * * *** * * *
17107412 ATACAATTATTCAAATAATCATAACTACTCAAAATGGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTTAATA
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * *
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* * * * *
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1 AATAAACTTGTATGAATT-GAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * *** * * **
17107591 ATAGATAATTGTTGAAATA-ACTATAATTATTTGAAC-TGATTCACTAAACAGATTCACGTTTTA
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* ** * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * ** * * * * * **
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* * * *
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* * **** * * * *
17108430 AATAAAATTATATGACGAAAAACAATTGTTTTATCACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGAAAT
1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
** * * * * * *
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** * * * * * * * *
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1 AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * ** *
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* * ** *
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* * * *
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* * * * * ** * * *
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** * ** * * * ** ** * ***
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* ** ** ** *
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* * * * * * * * **
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** * * * * * * *
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* *
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** * *
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Statistics
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AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
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17104084 TATTAACAAA
* *
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*
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*
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130 ATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTATGAGCTAAATAATTATTTTATAA
* * *
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*
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* *
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*
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128 AAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTATGAGCT-AAATAATTATTTTA
*
17104599 TAGCAAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAA
192 TAACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAA
* * * * *
17104664 ATGGTT-CAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTGATTTTTAGAATTTT
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1 A
17104723 CTAAATTAGT
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AACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATATAAATGTTCAAATAGTTAT
AATTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGAATTATTTTCTAAAGTCTTACTTATAAACTTTTTGAAA
TATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTATGAGCTAAATAATTATTTTATAAC
AAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAATGG
TTCCACAAATAGATTTATTGTTTAAATATCTTAGTTACTGATTGTTAGAATTTT
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17104414 TATTTTTAAG
* ** * * * *
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* * * * * * * *
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64 TGGTTCAGTAAACAGATTTATTTCT-TAAATCTCTTATTAA-TTCTTGAAATGTTACTAAATTAT
* * * ** * *
17104550 GTTTTATTCTA-TTCCAATTAAGCTTGTATG-AGCTAAAATAATTATTTTATA
127 G-ATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGTA-AAAAAACAATTGTTTTATA
* * * * * * * *
17104601 GCAAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAAT
1 ACAAAACAAAAAGT-ATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAAT
* * * * *
17104666 GGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTGATT-TTTAGAATTTTACTAAATT
65 GGTTCAGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTA-TTA---ATTCTTGA-AATGTTACTAAATT
* *
17104730 A-GTTTTATTTTATTAT-GAATAGGCTTGTATG-AAAAGAAACAATTGTTTTATA
125 ATG-ATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGTAAAA-AAACAATTGTTTTATA
* * * * *
17104782 ATAGAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGT-TATAATTATTTGAAAT
1 ACAAAACAAAAAGTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAAAT
*
17104846 GGTT-AGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATGTTAGTAAATTATGA
65 GGTTCA-GTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATGTTACTAAATTATGA
* ** *
17104910 TTATTTTATTTCGAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATG
129 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAAAAAAACAATTGTTTTATA
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1 ACAAAACAAAAAGTA-TAACAATTTGAAATAGATA
17104993 GTTGTTCAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACAAAACAAAAAGTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATG
GTTCAGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATGTTACTAAATTATGATT
ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTAAAAAAACAATTGTTTTATA
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17104941 AAAACAATTG
* ** *
17104951 TTTTATGACAAAACAAAAAGTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGC
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* * *
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17105059 AGTTATAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTATAACAAAACAAAAAGTACTAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATGGC
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17104765 GAAACAATTG
*
17104775 TTTTATAATAGAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATT
1 TTTTATAATAAAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATT
* *
17104840 TGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATGTTAGTAAAT
66 TGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAT
* *
17104905 TATGATTATTTTATTTCGAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
131 TATGATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAA
*
17104970 GTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGC
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17105007 TTTTATAATAAAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATT
1 TTTTATAATAAAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATT
*
17105072 TGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAT
66 TGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAT
*
17105137 TATGATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAT
131 TATGATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAA
17105202 GTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGC
196 GTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGC
17105239 CATAATTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (232 bp):
TTTTATAATAAAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATT
TGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAT
TATGATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAA
GTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGC
Found at i:17105405 original size:413 final size:410
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17104606 ATAAAAGGTC
* * * *
17104616 ATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAATGGTTCAGTAAATAGA
1 ATAACAATTTAAAATAAATAAATATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAGA
* * * * *
17104681 TTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTGATTTTTAGAATTTTACTAAATTAGTTTTATTTTATTAT
66 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA-T-ATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT
* * * *
17104746 GAATAGGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATAATAGAAGAAAAATTATAACAATTTGAAAT
129 AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTAATAACAGAAGAAAAATTATAACAATTTGAAAT
** *
17104811 AGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAGATTTATTTCTTAAATC
194 AGATAAATATTCAAATAGCCATAATTATTTGAAATGGTTAGATAAACAGATTTATTTCTTAAATC
* * * ***
17104876 TCTTATTAATTCTTGAAATGTTAGTAAATTATGATTATTTTATTTCGAATAAGTTTGTATGTTGA
259 TCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAGTATGATTATTTTATTTCGAATAAGTTTGTATGAACA
* *
17104941 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTACTAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGG
324 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTACTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGG
17105006 CTTTTATAATAAAAGAAAAATT
389 CTTTTATAATAAAAGAAAAATT
* * *
17105028 ATAACAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGT-TATAATTATTTGAAATGGTT-AGGTAAACA
1 ATAACAATTTAAAATAAATAAATATTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAAATGGTTCA-GTAAACA
17105091 GATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA-ATTCTTGA-AATATTAATAAATTA-TGATTATTTTATT
64 GATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATATT-TTGAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATT
* ** *
17105152 -TCAAATAAGTTTGTATGTTGAA-AAACAATTGTTTAATGACA-AA-ACAAAATGTACTAACAAT
127 AT-AAATAAGCTTGTATG-AAAAGAAACAATTGTTTAATAACAGAAGA-AAAAT-TA-TAACAAT
** * **
17105213 TTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGCCATAATTATTT-AAATGGATTCA-ATAAATTGATTTATT
187 TTGAAATAGATAAATATTCAAATAGCCATAATTATTTGAAATGG-TT-AGATAAACAGATTTATT
* * * * * **
17105276 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTGGTTAA
250 TCTTAAATC---T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAGTATGATTATTTTATTTCGAATAA
* * * ** * *
17105341 GCTTT-TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGT-CATAATGATTTTATATAGA
311 G-TTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAC-TAACAATTTGAAATAGA
17105404 TAATTATTCAAAT
374 TAATTATTCAAAT
17105417 AGCCATAACT
Statistics
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0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
406 1 0.00
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410 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.06, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (410 bp):
ATAACAATTTAAAATAAATAAATATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAGA
TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATAA
ATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTAATAACAGAAGAAAAATTATAACAATTTGAAATAG
ATAAATATTCAAATAGCCATAATTATTTGAAATGGTTAGATAAACAGATTTATTTCTTAAATCTC
TTATTAATTCTTGAAATATTAATAAAGTATGATTATTTTATTTCGAATAAGTTTGTATGAACAAA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTACTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCT
TTTATAATAAAAGAAAAATT
Found at i:17105943 original size:538 final size:538
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Indices: 17105094--17106331 Score: 1354
Period size: 536 Copynumber: 2.3 Consensus size: 538
17105084 GTAAACAGAT
* * * * *
17105094 TTATT-TTTTAAATCTCTTAT--TAATTCTTGAAATATTAATAAATTA-TGATTATTTTATTTCA
1 TTATTATTTTAAATCTCTTATACTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGT-ATTATTTTAATCCA
* *** * * * * *
17105155 AATAAGTTTGTATGTTGAA-AAACAATTGTTTAATGACAAAACAAA-ATGTACTAACAATTTGAA
65 AATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGAT-CA-TAACGATTTGAG
* * * * ** * * * * * * *
17105218 ATAGATAGTTATTCAAATGGCCATAATTATTT-AAATGGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAA
127 ATAAATAATTGTTCAAAT-GTCATAACGATTTGAACTAG-TT-AAAAAATAGCTGTAGTTTTTAA
* * * * *
17105282 ATCTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTGGTTAAGCTTTT
189 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGCTTTT
* * * * ** * *
17105347 ATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTATATAGATAATTATT
254 ACGAACTAAAACAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATTATT
17105412 CAAATAGCCATAA-CTATATGAACTT-TTTCAATAAACAAAATTTATTTTTTCAAAACTCATGCT
319 C-AATAGCCA-AATCTATATGAACTTGTTT-AATAAAC-AAATTTATTTTTTCAAAACTCATGCT
* * * *
17105475 TATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAA
380 CATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCCTGTACGAAATGAA
* * *
17105540 ACAATTATTATA-AGACTAAACAAAAGGTTAGAA-AGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
445 ACAATTATTATATA-ACTAAACAAAAGATCAGAACA-ATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGC
* * *
17105603 CATAATTATTTAAACTAGTTCAACAAACGCAT
507 CATAACTATTTAAACTAGTTCAACAAACACAC
* * * *
17105635 TTATT-TTTTAAATCTC-TA-ATTAATTTTTGGAATATTAGTAATTTAGTATT-TTTTTATTCAA
1 TTATTATTTTAAATCTCTTATACTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCCAA
* * ** * * * * **
17105696 ATAGGCTTGTATGATCAGACATAGTTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATTG
66 ATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATAA
* * *
17105761 ATATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACTAGTTAAAAAATAGCTGTAGTTTTTAAATCTCT
131 ATAATTGTTCAAAT-GTCATAACGATTTGAACTAGTTAAAAAATAGCTGTAGTTTTTAAATCTCT
* *
17105826 TGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGTTTTTACGAAC
195 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGCTTTTACGAAC
* * *
17105891 TAGAACAATTCTTTTCTAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATTGTTCAATAG
260 TAAAACAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATTATTCAATAG
* * * ** * * * **
17105956 TCAAATTTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTT
325 CCAAATCTATATGAACTTGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTCAAAACTCATGCTCATTAATTTT
* * *
17106021 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTTAATAAGCCTGTACGAAATGAAATAATTATTT
390 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCCTGTACGAAATGAAACAATTATTA
*
17106086 TATAACTAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAATAGCCTTAACTATTTAA
455 TATAACTAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAATAGCCATAACTATTTAA
* ***
17106151 ACTGGTTCGGTAAACACAC
520 ACTAGTTCAACAAACACAC
* **
17106170 TTATTATTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTCTTAAATTAGTATTATTTTAATCC
1 TTATTATTTTAAATCTCTTA--TACTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCC
* *
17106235 AAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTTTGAGAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGAT
64 AAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGAT
*
17106300 AAATAATTGTTTAAATGTCATAACGATTTGAA
129 AAATAATTGTTCAAATGTCATAACGATTTGAA
17106332 ATAAATAATT
Statistics
Matches: 577, Mismatches: 104, Indels: 33
0.81 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
535 35 0.06
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541 116 0.20
542 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (538 bp):
TTATTATTTTAAATCTCTTATACTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCCAA
ATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATAA
ATAATTGTTCAAATGTCATAACGATTTGAACTAGTTAAAAAATAGCTGTAGTTTTTAAATCTCTT
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGCTTTTACGAACT
AAAACAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATTATTCAATAGC
CAAATCTATATGAACTTGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTCAAAACTCATGCTCATTAATTTTT
TGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCCTGTACGAAATGAAACAATTATTAT
ATAACTAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAATAGCCATAACTATTTAAA
CTAGTTCAACAAACACAC
Found at i:17106326 original size:34 final size:35
Alignment explanation
Indices: 17106283--17106358 Score: 127
Period size: 34 Copynumber: 2.2 Consensus size: 35
17106273 AAAATAAAGA
* *
17106283 TCATAACGATTTGAGATAAATAATTGTTTAAAT-G
1 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
17106317 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
17106352 TCATAAC
1 TCATAAC
17106359 TTTTGAACTC
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 2, Indels: 1
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
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TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
Found at i:17108324 original size:721 final size:719
Alignment explanation
Indices: 17106316--17108978 Score: 1641
Period size: 721 Copynumber: 3.7 Consensus size: 719
17106306 TTGTTTAAAT
** ** * * * * * *
17106316 GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-TTTGAACTCA-CTCAGTAAA
1 GTCATAAAAATTTGAAATAAATAATCATCCAAATAGGCATAACTATTTGAATTGATTTGA-TAAA
* * * * * *
17106379 TATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-GAAA-ATTAATAAATTTATATTACTT
65 CA-ATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAA--TTTAGGAAATATTAAGAAATTAATATAATTT
* * * * ** *
17106442 TATT-TGAAATAAGCTTGCT-TGAAC-CAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTTA-
127 TATTCTG-GATAAGCTTG-TATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATGATAAC
** * * * * * * * * * ** *
17106503 TGTTTTGAAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTTAGTAAACAGAT-T-
189 AATTTT-AAATAAATAATTACTCAAATAGTAATAACTATTTAAAATTATTCGGAAAACAGATCTA
* * * * * ** * *
17106566 CTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTACATC-
253 C-TTTTTCAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGGATTAATTTA-TTCT
* * * * * * * * * * * * *
17106629 AAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAGAATAATTTGAA
315 GAATAAGCTTGTAAGAATTGAAACAAATATTTTA-TAACTAAACAAAAGGTTAAAATGATCTGAA
* * * * * * *
17106693 ATAGATAATTACTCTAATAG-TCATGACTATTTGAAGTTG-TTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
379 ATAGATAAATATTCTAATAGTTC-TAACCATTTGAA-CTGATTT-GAAAACAAATTTA-TTTTTA
* * * * * * *
17106756 AATCAT-TTACTTATTAGTTATCAAAATATTAATAAA-TAAATATTATTTTAATCCAAATATGCT
440 AAT-ATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAGA-ATTATTTTAATCCAAAAAAGCT
* * * * * * * ** *
17106819 TGTATGAACAAAAACTA-TTATTTTAAAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAAT
503 TTTATGATCAAGAAC-AGTTGTTTTATAACAAAAC--AAATTCTTAATGATTTGAAATAGATAAT
*** * * * * * * *
17106883 TGCCCAAATAGTCATAACTA-TTAGAACTTG-TTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAA-ATC-T-
565 TGTTGAAATACTCATAACTATTTA-ATC-TGATTCGATAAACAGATTCAGTTCTTAAATATCTTA
* * * * ** * * **
17106942 CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTCATTTAAAACAAACTTATATGAATAA
628 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATTATATG-ACGA
* * * *
17107007 AAACATTTTTTTTATTACAAAACAAAAT
692 AAACAATTGTTTTATCACAAAACAAAAG
** * ** * *** * * * *
17107035 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTTATAATTATTTGAATTGGTTAGGTAAAC
1 GTCATAAAAATTTGAAATAAATAATCATCCAAATAGGCATAACTATTTGAATTGATTTGATAAAC
* *** * * * * ** *
17107100 AAAATTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAGATTCATTTTGTGTTAT
66 -AATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAATATAATTTTAT
* * * * * * * * *
17107161 TCCT-AATAAACTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAATAAAAGGTCAT-ACTGATT
130 T-CTGGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATGATAAC-AATT
* * ** * ** * * ** * * *
17107224 TGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT-TGATAAACAAAT-TTCTTT
193 TTAAATAAATAATTACTCAAATAGTAATAACTATTTAAAATTATTCGGA-AAACAGATCTAC-TT
* * ** * * * * * * *
17107287 TTTTAAACCTCTTAGTTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAGATTAGTAGTATTTTATTTTGAATA
256 TTTCAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAATA
** ** * * * * * * * * * * *
17107351 AGCTTGTGTGAACAGAAATAATTTTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAGTATAC
320 AGCTTGTAAGAATTGAAACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAAAATGATCTGAAATAGAT
* * * * * ** * * ** * *
17107416 AATTATTCAAATA-ATCATAACTACTCAAAATGGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTTAATATCT
385 AAATATTCTAATAGTTC-TAACCATTTGAACTGATTTGA-AAACAAATTTA-TTTTTAAATATCT
* * * * *** * * *
17107480 TACTTATTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAT
447 TACTTATTAATTTTT-AAAATATTACTAAATTAGAATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTTTATGAT
* * * * * * * * * ** **
17107544 TAAAAAAAATTATTATATGACCAAAAAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT
511 CAAGAACAGTTGTTTTAT-AACAAAACAAA-TTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT
*
17107609 AACT-ATAATTATTTGAA-CTGATTC-ACTAAACAGATTCACGTT-TTAAATCAT-TTACTTATT
574 -ACTCATAACTATTT-AATCTGATTCGA-TAAACAGATTCA-GTTCTTAAAT-ATCTTACTTATT
* * ** * *
17107669 AATTTTTGAAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG-AAATA
634 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATTATATG-AC-GAAAACA
* *
17107733 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
697 ATTGTTTTATCACAAAACAAAAG
* ** *
17107756 GTCATAAAAATCTT-AAATAAACTATTGTTCC-AATAGTCATAACTATTTGAATTTG-TTT-AGT
1 GTCATAAAAAT-TTGAAATAAA-TAATCATCCAAATAGGCATAACTATTTGAA-TTGATTTGA-T
* ** *
17107817 AAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTACTATAAT
62 AAAC-AATTTA-TTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAATATAAT
* * * * * **
17107881 TTTATTTTGGATATGCTTTTATGAACTGAAGCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGATGATAATG
125 TTTATTCTGGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATGATAACA
* * *
17107946 ATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTAAAATTATTCGGAAAATAGATTTACT
190 ATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTAATAACTATTTAAAATTATTCGGAAAACAGATCTACT
* * * *
17108011 TTTTCAAATCT-TTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATGAATTTGGATTATTTTATTTTGAAT
255 TTTTCAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAAT
* * *
17108075 AAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTT-TGACTAAACAAAATGTTAGAATGAT-TAGAAATA
319 AAGCTTGTAAGAAT-TGAAACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAAAATGATCT-GAAATA
* * ** * **
17108137 GGTAATTATTCTAATAGTTCTAATTATTTGAACTGGTTT-AACAACGCATTTATTTTTTAAATAT
382 GATAAATATTCTAATAGTTCTAACCATTTGAACTGATTTGAA-AACAAATTTA-TTTTTAAATAT
* * *
17108201 CTTACTTATTAATTTTTAAAATGTTACTAAATTAGTATTATTTTTAA-CCAAATAAGCTTTTATG
445 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAGAATTA-TTTTAATCCAAAAAAGCTTTTATG
* *
17108265 ATCAAGAACAGTTGTTTTATAACAAAACAAATTCTTAATGATTTGAAATTGATAATTGTTTAAAT
509 ATCAAGAACAGTTGTTTTATAACAAAACAAATTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT
** * * * *
17108330 GGTCATAACTATTTAATCTGGTTCGATAAACATATTTATTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTT
574 ACTCATAACTATTTAATCTGATTCGATAAACAGATTCAGTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTT
*
17108395 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTATATGACGAAAAACAATTGTT
639 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATTATATGACG-AAAACAATTGTT
*
17108460 TTATCACAAAATAAAAG
703 TTATCACAAAACAAAAG
* * * * * *
17108477 TTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATCCAAATGGGCATAATTATTTTAATTGATTTGATAAAC
1 GTCATAAAAATTTGAAATAAATAATCATCCAAATAGGCATAACTATTTGAATTGATTTGATAAAC
* * * *
17108542 AATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAATATAATTTTATT
** * * * *
17108607 CTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGGCAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTA
131 CTGGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATGATAACAATTTTA
* ** * * * * * * * * *
17108672 AATAAATAGTTGTTTAAGTAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATCTAGTTTTTTA
196 AATAAATAATTACTCAAATAGTAATAACTATTTAAAATTATTCGGAAAACAGATCTACTTTTTCA
* *
17108737 TATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTG
261 AATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAATAAGCTTG
* ** * * * *
17108802 TACGAATTGAAACAGTTGTTTTATAACTAAGCACAAGGTTAAAATGATCTGAAATAGATAAATGT
326 TAAGAATTGAAACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAAAATGATCTGAAATAGATAAATAT
* * *
17108867 TCTAATAGTTTTAACCATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATT
391 TCTAATAGTTCTAACCATTTGAACTGATTT-GAAAACAAATTTATTTTTAAATATCTTACTTATT
* *
17108932 AATTTTTGAAATATTATTAAATTAGAATTATTTTAATCCAAAAAAGC
455 AATTTTTAAAATATTACTAAATTAGAATTATTTTAATCCAAAAAAGC
17108979 ATGTAAGAAT
Statistics
Matches: 1538, Mismatches: 330, Indels: 150
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
714 3 0.00
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Consensus pattern (719 bp):
GTCATAAAAATTTGAAATAAATAATCATCCAAATAGGCATAACTATTTGAATTGATTTGATAAAC
AATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAATATAATTTTATT
CTGGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATGATAACAATTTTA
AATAAATAATTACTCAAATAGTAATAACTATTTAAAATTATTCGGAAAACAGATCTACTTTTTCA
AATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAATAAGCTTG
TAAGAATTGAAACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAAAATGATCTGAAATAGATAAATAT
TCTAATAGTTCTAACCATTTGAACTGATTTGAAAACAAATTTATTTTTAAATATCTTACTTATTA
ATTTTTAAAATATTACTAAATTAGAATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTTTATGATCAAGAACAGT
TGTTTTATAACAAAACAAATTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATACTCATAACTAT
TTAATCTGATTCGATAAACAGATTCAGTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATTATATGACGAAAACAATTGTTTTATCACAAAACA
AAAG
Found at i:17108369 original size:179 final size:181
Alignment explanation
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Period size: 179 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
17108174 TTAACAACGC
* *
17108184 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATGTTACTAAATTAGTATTATTTTTA-A
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATA
** * * * * * **
17108248 CCAAATAAGCTTTTATGATC-AAGAACAGTTGTTTTATAACAAAA-CAAA-TTCTTAATGATTTG
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* ** ** * *
17108310 AAATTGATAATTGTTTAAATGGTCATAACTA-TTTAATCTGGTTCGATAAACA
130 AAATAGATAATCATCCAAATGGGCATAACTATTTTAAT-TGATTCGATAAACA
*
17108362 TATTTATTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAT
1 -ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
**** *
17108426 TTTGAATAAAATTATATGACGAAAAACAATTGTTTTATCACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTG
65 ACCAAATAAAATTATATGACGAAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTG
* *
17108491 AAATAGATAATCATCCAAATGGGCATAATTATTTTAATTGATTTGATAAACA
130 AAATAGATAATCATCCAAATGGGCATAACTATTTTAATTGATTCGATAAACA
* *** *
17108543 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
17108604 ATTCTGTCTA
Statistics
Matches: 203, Mismatches: 32, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
178 6 0.03
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182 6 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.07, T:0.45
Consensus pattern (181 bp):
ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATA
CCAAATAAAATTATATGACGAAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGA
AATAGATAATCATCCAAATGGGCATAACTATTTTAATTGATTCGATAAACA
Found at i:17109940 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 17109462--17111314 Score: 1422
Period size: 181 Copynumber: 10.3 Consensus size: 181
17109452 TTTTGTTTTG
* * * * * * * *
17109462 TCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTTATAAAAAACTTATTTCAATTCATATAAGATTATTT-A
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
17109526 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
66 ATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * *
17109591 CTATTTACTGATCAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAAGTATCTATG
130 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * * * * * * *
17109643 TGAAATCACTATAACCTTTTCCTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTT
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* *
17109708 AA-ATAAAATAATACAAATTTATTCATA--TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
65 AATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * *
17109770 AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATTGTTATGACTATTAGAACAATTATTTATT
127 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * *
17109825 TCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGCTTCTATTTGTACAAGTTTATTCGA
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
17109890 ATAAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
66 ATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
17109955 TGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATTTATT
131 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
17110006 GCAAATCATTGTGACCATTTATTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAACCTAATTTG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG
* ** * * *
17110070 AA-ATAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAATATTAA-AGAGTAAAAGAATTAAAAAAATGA
65 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTAAAAG-ATTTAAAAAATAA
** * *
17110133 ATCTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATGTT
128 ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
17110187 TCAAAACATTGTAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TGTTCTATTCATGCAAGCTTATTGT
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATT-T
** * * *
17110251 GAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAA-TTTTAGAAAATAA
64 GAATAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* * *
17110313 AGT-TATTTTCTAAACATA-TTCACATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
128 A-TCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
17110367 TGAAATCATTATGATCATTTGTTTTAT--TAAAATCTAATTGTTTCTGTTCA-AGCAAGCTTATT
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA--AAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATT
** *
17110429 TGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAA-T--T-A--AAAAGATTTAAAGAATA
63 TGAATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
17110486 AATTTGTTTACCAAGCAAGTTCAAATTGTTATGACTATTT-ATATAATTATTTATT
127 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATT
* ** * **
17110541 TCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTCCTATTCATACAAATTTATTTGG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-G
* * ** *
17110606 AAT-AAAATAATACTAAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAAT
65 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * **
17110670 CTATTTACCGATCAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAATTATTATCTATT
130 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * * **
17110722 TCAAATCGTTATGATGTTTCGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAAATTATTTAG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-G
* * * *
17110787 AAT-AAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG----AGAATTAAAAACTAAAT
65 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* *
17110847 C-ACTTTACCAAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC
130 CTA-TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
17110899 TGAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCCTAAATAATTTG-TTCTATTCATACAAGCTTATTTGG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
* * * ** * * *
17110962 ATTAAAATATTGCTTAA-ACAATAATATTCTAAAAATTAATAAG----A-ATTTAAAAAATAATT
66 ATAAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * * *
17111021 GTGTTTGTCAATCCAGTTTAAAAAGTTAAGACTACTGGAACAATTATCTATT
130 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
17111073 TCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATATATGCTTATTCG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG
** * * *
17111136 AA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAGGAAA-TTTTAAAACATA
65 AATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA--AAAGATTTAAAAAATA
* * * * *
17111199 AATTTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATT
127 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * * *
17111254 TAAAATCATTATAACCTTTCATTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTAT
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
17111315 CCAAAATAAA
Statistics
Matches: 1331, Mismatches: 281, Indels: 119
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 9 0.01
174 197 0.15
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176 27 0.02
177 66 0.05
178 10 0.01
179 12 0.01
180 158 0.12
181 520 0.39
182 218 0.16
183 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
ATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
Found at i:17110709 original size:535 final size:524
Alignment explanation
Indices: 17109462--17111314 Score: 1653
Period size: 535 Copynumber: 3.5 Consensus size: 524
17109452 TTTTGTTTTG
* * * * *
17109462 TCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTTATAAAAAACTTATTTC-AATTCATATAAGA-TTATTT
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTAGTTCATATAA-ACTTATTT
* * *
17109525 AAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATGA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATGA
* * * * * * * * * *
17109589 ATCTATTTACTGATCAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAAGTATCTATGTGAAATCACTA
129 ATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * * * * * *
17109654 TAACCTTTTCCTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTAAATAAAATAA
194 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTGTTCTATTCATGCAAGCTTA-TTTGAATAAAATAA
* *
17109719 TACAAATTTATTCATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTA
257 TATAAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGT-AAA-ATTT-AAAAATAAAT-TATTTACTA
* * * * * *
17109783 AACAAGTTCAAATTGTTATGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTT
316 AACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGA-TCTTTGTT
* * ** * * *
17109848 TTGTCATAAAAAAATTGCTTCTATTTGTACAAGTTTATTCGAATAAAAATAATATTAATTTATTA
379 TTGTC-TAAAATAATTGTTTCTA-TTCAACAAGCTTATTTGAAT-AAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
17109913 ATATTTTGACAATTTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATA
441 ATA--TT-CCAA--AATTA--AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AACAAGTTCAAATA
* *
17109978 GTCATAACTATTTGAATAATTATTTATT
498 GTTATGACTATTT-AATAATTATTTATT
* * * * * * * * *
17110006 GCAAATCATTGTGACCATTTATTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAACCTAATTTG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTAGTTCATATAAACTTATTTG
* * * *
17110070 AAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAATATTAA-AGAGTAAAAGAATTAAAAAAATGA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-AGTTAAAG-ATTTAAAAAATGA
** * * * * *
17110133 ATCTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATGTTTCAAAACATTG
129 ATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
*
17110198 TAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTGTTCTATTCATGCAAGCTTATTGTGAATAAAATAAT
194 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTGTTCTATTCATGCAAGCTTATT-TGAATAAAATAAT
* *
17110263 ATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAATTTTAGAAAATAAAGTTATTTTCTAAAC
258 ATAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTA-AAAATAAA-TTATTTACTAAAC
* *
17110328 ATATTCACATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGATCATTTGTTTTA
319 A-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGATC-TTTGTTTTG
*
17110393 T-TAAAATCTAATTGTTTCTGTTCAAGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
382 TCTAAAA--TAATTGTTTCTATTCAA-CAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
17110457 ATTCCAAAATTAAAAAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAGCAAGTTCAAATTGTTATGACT
443 ATTCCAAAATTAAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
17110522 ATTTATATAATTATTTATT
507 ATTTA-ATAATTATTTATT
* ** * * * *
17110541 TCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTCCTA-TTCATACAAATTTATTTG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTAGTTCATATAAACTTATTTG
* * * *
17110605 GAATAAAATAATACTAAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATGAAT
* * * ** * *
17110670 CTATTTACCGATCAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCGTTATG
131 CTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
** * * ** **
17110735 ATGTTTCGTTTTGTCACAAAACAA-TTGTTTCTATTCATAAAAAATTATTTAGAATAAAATAATA
196 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTG-TTCTATTCATGCAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA
* * * *
17110799 CT-AATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG-AGAA-TTAAAAACTAAATCACTTTACCAAACC
259 -TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAA-TAAATTA-TTTACTAAA-C
* * * *
17110861 AATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTGAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTC
319 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGATCTTTGTTTTGT-
* * * ** *
17110926 CT-AAATAATT-TGTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATATTGCTTAA-ACAATAATA
383 CTAAAATAATTGT-TTCTATTCA-ACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATA
* * ** * * * *
17110988 TTCTAAAAATTAATAAGAATTTAAAAAAT-AATTGTGTTTGTCAATCCAGTTTAAAAAGTTAAGA
444 TTC-CAAAATTAAAAAG-ATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
** * *
17111052 CTACTGGAACAATTATCTATT
505 CTA-TTTAATAATTATTTATT
* * * ** *
17111073 TCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATATATGCTTATTCG
1 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTAGTTCATATAAACTTATTTG
* * * *
17111136 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-CAGGAA-ATTTTAAAACATA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTA--AAGA-TTTAAAAAATG
* * * * * *
17111199 AATTTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATCATT
128 AATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
** * * * **
17111264 ATAACCTTTCATTTTATCATAAAATAA-TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAT
193 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTGTTCTA-TTCATGCAAGCTTAT
17111315 CCAAAATAAA
Statistics
Matches: 1071, Mismatches: 195, Indels: 98
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
529 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (524 bp):
TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTAGTTCATATAAACTTATTTG
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATGAAT
CTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTGAATAAAATAATATA
AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAATAAATTATTTACTAAACAATTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCTAAAATA
ATTGTTTCTATTCAACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAA
AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAATAATTATT
TATT
Found at i:17111436 original size:132 final size:132
Alignment explanation
Indices: 17111205--17111462 Score: 315
Period size: 132 Copynumber: 2.0 Consensus size: 132
17111195 CATAAATTTG
* **
17111205 TTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATCATTATAACC
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATCATTATAACC
* * * *
17111270 TTTCATTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAAATC
66 TTTCATTTTAGCATAAAACAATTGTTTTACTTCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATAAATC
17111335 AT
131 AT
* * *
17111337 TTTATCGAATCAA-TTCAAATAACTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
1 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATCATTAT-AA
** * ** * *
17111401 -CTTTTGTTTT-GCAATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACTAGCCTATTCGAAATAAAATAATA
64 CCTTTCATTTTAGC-ATAAAACAATTGTTTTACTTCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATA
17111463 CTAATTTATT
Statistics
Matches: 106, Mismatches: 17, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
131 1 0.01
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Consensus pattern (132 bp):
TTTATCGAACAAGTTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATCATTATAACC
TTTCATTTTAGCATAAAACAATTGTTTTACTTCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATAAATC
AT
Found at i:17111631 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 17111337--17111723 Score: 453
Period size: 181 Copynumber: 2.1 Consensus size: 181
17111327 AATAAATCAT
* * * ** * * *
17111337 TTTATCGAATCAATTCAAATAACTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC
1 TTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAAC
* * * *
17111402 TTTTGTTTTGCAATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACTAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAA
66 TTTTGTTTTGCAATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
17111467 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATTTA
131 TGTAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAG-AGATTTAAAAAATAAACTTA
* *
17111518 TTTATCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATATATTTCAATTTC-TTAT-AA
1 TTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATATATTTCAA-ATCATTATGAA
* ** *
17111581 CCTTTTGTTCTAT-C-ATAAAACCATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATG
65 -CTTTTGTT-T-TGCAATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATA
*
17111644 CTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACTTG
127 CTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACTTA
* *
17111699 TTTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTA
1 TTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTA
17111724 ATGCTAGCTA
Statistics
Matches: 174, Mismatches: 26, Indels: 12
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
180 2 0.01
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183 1 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAAC
TTTTGTTTTGCAATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAA
TGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACTTA
Found at i:17111637 original size:313 final size:313
Alignment explanation
Indices: 17111058--17111642 Score: 797
Period size: 313 Copynumber: 1.9 Consensus size: 313
17111048 AAGACTACTG
* * * *
17111058 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTAGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCAT
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTAGTCATAAAACAATTATTTTACTTCAT
*
17111123 ATATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAGGAAAT
66 ATATGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAGGAAAT
* * * * *
17111188 TTTAAAACATAAATTTGTTTATCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGAT
131 TTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATAGAT
* * *
17111253 TTAAAATCATTATAACCTTTCATTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCA
196 TTAAAATCATTATAACCTTTCATTCTATCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCA
17111318 AAATAAAATAATAAATCATTTTATCGAATCAATTCAAATAACTATGGCTATTT
261 AAATAAAATAATAAATCATTTTATCGAATCAATTCAAATAACTATGGCTATTT
* * *
17111371 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTT-TTGCAATAAAACAATTGTTTTTCTTC
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTAGT-C-ATAAAACAATTATTTTACTTC
*
17111435 ATACTA-GCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-G
64 ATA-TATGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAGG
* *
17111497 AAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTA
127 AA-ATTTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTA
* ** ** * * *
17111561 TATATTTCAATTTC-TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACCATTATTTCTA-TTCATACAAGT
191 TAGATTT-AAAATCATTATAACCTTTCATTCTATCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATAAAAGC
* *
17111624 TTATTCGAAATAAAATAAT
254 TTATCCAAAATAAAATAAT
17111643 GCTAATGTAA
Statistics
Matches: 236, Mismatches: 29, Indels: 14
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Matches are distributed among these distances:
312 1 0.00
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315 5 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (313 bp):
GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTAGTCATAAAACAATTATTTTACTTCAT
ATATGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAGGAAAT
TTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATAGAT
TTAAAATCATTATAACCTTTCATTCTATCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCA
AAATAAAATAATAAATCATTTTATCGAATCAATTCAAATAACTATGGCTATTT
Found at i:17112497 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 17112031--17112997 Score: 945
Period size: 181 Copynumber: 5.4 Consensus size: 179
17112021 ATATTTTGGC
* * * * * * * * *
17112031 AATTAGTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATATTTACCCAACTAGATCAACTAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * *
17112096 TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATTAAAGAATTGTTTC-AG
65 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-
* **
17112160 TTCATATATG-TTCA-TTGAAATAAAATAT-ACCAATTTATTAATATTCTAAA
129 TTCATATAAGCTT-ATTTGAAATAAAATATAATAAATTTATTAATATTC-AAA
* * * * * * *
17112210 AATTAATAATTAAGATATTTAAAAAAT-GATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTATGACAA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
17112274 TTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA
65 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
17112339 TTCATACAAGCCTATTTTAAATAAAATATAATAAATTTATTAAAATTAAAA
129 TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATATAATAAATTTATTAATATTCAAA
* *
17112390 TAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATCA-TTATGAC
1 -AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGAC
* * *** * *
17112454 TATTTGAATAATTATTTATTTCAAA-CTATTATGACTTTTTGTTTAACCATAAAATAATTCTTTC
63 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
17112518 TATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATA-ATATTAATTTATTAATGTTTCAAC
127 TATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATATA-ATAAATTTATTAAT-ATTCAAA
* * * * *
17112572 AATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAGTTCAAATACTCATAACT
1 AATTAATAAGTAAAA-A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** ** * *
17112637 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGTTATGACCTTTTGTTTCAT-ATAAAACAATTGTATCAA
64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
*
17112701 TTCATATAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
129 TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAT-ATAATAAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *
17112752 AATTATTGAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
17112817 TTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGT
65 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
**
17112882 TCATATAAGCTTATTCCAAATAAAATA-ATATAAATTTATTAATATTCCAAA
130 TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATATA-ATAAATTTATTAATATT-CAAA
** * * * *
17112933 AATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAATAAATTTGTTTTTTG-ACACGTTCAAATAGTTATGAC-AT
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
17112996 TT
66 TT
17112998 TGTTTTGTAA
Statistics
Matches: 648, Mismatches: 115, Indels: 51
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 61 0.09
179 154 0.24
180 108 0.17
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183 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
CATATAAGCTTATTTGAAATAAAATATAATAAATTTATTAATATTCAAA
Found at i:17112799 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 17112001--17115960 Score: 1145
Period size: 363 Copynumber: 10.8 Consensus size: 362
17111991 AATTCGGATC
**** * * *
17112001 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGGCAATTAGTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * *
17112066 TTACCCAACTAGATCAACTAGTTATGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
65 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACAT
* * * * **
17112131 TTTGTTTTGTCATTAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATATG-TTCA-TTGAAATAAAAT-ATACCA
130 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATATAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATATAA
* * * *
17112192 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-T-TAAGATATTTAAAAAAT-GATTTGTTTATCGAACA
193 ATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAA
* * * * **
17112254 AGTTTAAATAATTATGACAATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTTGTTTTG
256 AGTTCAAATAATCATAACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTTGTTTCA
* * * * *
17112319 TCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCCTATTTTAAAT
321 TCATAAAACAATTGTATCAATTCATACAAGCCTATTTGAAAT
* * *
17112361 AAAAT-ATAATAAATTTATTAA-AATTAAAATAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCT
* **
17112424 GTTTATTGAACAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAA-CTATTATG
63 ATTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC-ATTATG
* *** * * * * *
17112487 ACTTTTTGTTTAACCATAAAATAATTCTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAT
126 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAT
* * *
17112552 TAATTTATTAATGTTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAA
191 AAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAA
* * * *** *
17112617 AAGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGTTATGACC-TTTTGTTTC
255 AAGTTCAAATAATCATAACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTTGTTTC
* *
17112681 AT-ATAAAACAATTGTATCAATTCATATAAG-TTATTTGAAAT
320 ATCATAAAACAATTGTATCAATTCATACAAGCCTATTTGAAAT
* * * *
17112722 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATTGAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTAT
* *
17112787 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TTCTATTTCAAATCGTTATGACA
65 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT-TATTTCAAATCATTATGACA
* * **
17112851 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCCAAATAAAATAATATAAA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATAAA
* * * * * *
17112916 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTT-TAAAATAAATTTGTTTTTTG-ACACG
194 TTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAAAAG
* * * * * ** ** * * **
17112978 TTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAACCAATTA-ATAAGT-AAAGGATTTAAAAAAT
258 TTCAAATAATCATAACA-----ATTTG-----AA-CAATTATCTATTTCAAATCA-CTATAACCT
* * * * * * * * **
17113041 AAATTTGTTT-ATC--GAATCATTTCATATC-ATTAAGACTATTAGGACAACTATCT-ATTT
311 --TTTTGTTTCATCATAAAACAATT-GTATCAATTCATAC-A--A-G-C--CTATTTGAAAT
* * * * * * ** *
17113098 CAAATCATTCTGACCTTGTGTT--TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACAAGCCTATTTG
1 AAAATAATACT-A-ATT-TATTAATA-T-TTAAAA-AATT-AATAAG--TA-A-AA----ATTT-
* * * ** * * ** * *
17113161 GAATAAATTAATACCAATTTA-TTAAC-A-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAAT
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* * *
17113223 AAATTTATTTACCCAACAAGTTCAGATAGTTATTAC-TATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATC-
105 -TATTTATTT---C-A-AA--TC----A-TTATGACAT-TTTG--T-TTTGTC-A--TAAAA-CA
* * * * * * * *
17113286 GTTATGACCTTTTATTTTGC-TATAAAGTAATTGTTAATGCAAGCTTATATGGAATA-AAATAAT
149 ATTAT----TTCTA--TT-CATAT-AAG--CTTATT--TG-AA-ATAAAAT--AATATAAAT-TT
* * ** * * *
17113349 ACTAATTTATTAATATTTCTAA-AATTGATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCTA
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* * ** * * * * * *
17113412 AATCAA-TTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCCTTTT-
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** * ** * * ** *
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* * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTA-AAAATTT-AAAAAATAAATCTA
* ** * * ** ** * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * ** * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * **
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* * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * ** * ** *
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* * ** * * * *
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** * * * ** * * *
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* ** * * * * * * * *
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* ** * *
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* * * *
17114777 CT-AA--T-TTAA---T--AATATT--TAATTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAA
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* * ** * * ***
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254 A-AAGTTCAAATAATCATAACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTTGTT
* * * * ** **
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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Statistics
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*
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* * * * * *
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* * * ** * **
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* * * * * **
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* * * * ** *
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** * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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129 GTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAA-TAAGTTCAAATAGTT-ATGAC
* * * * * **
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* * * * **
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* * * * * * * * ** * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * **
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64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * * *
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129 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA
* * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* *
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* * ** * *
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* * * *
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*
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* *
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* *
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Statistics
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * * * *
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130 TCTATTTACCTAACAAGTTCAAATAGTTATGAT-TATTTGAACAATTATCTAT
* * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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127 AAAT
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Statistics
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * ** *
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* *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* *** * * * * ** *
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129 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* *
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* * * * *
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* * * * * *
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126 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** * *
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1 GCAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTATTTACC-AAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * * *
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* ** * * * * * ** * *
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* * * * ** * *
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1 GC-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * ** * * ** *
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* * * *
17120501 CTAA-CTTATTTAGAATAAAATAAAACAAATTTATTAA-ATTTCAAAAATTAATACA
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* * * * ** ** * * *
17120556 -TAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGCTTGT-TGAACCAA-TTCAAATAATTATGA-TATATGAAC
1 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* ** * * * ** * *
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64 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGCTTCATACA
* * ** * *
17120682 AGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--
129 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
** * * * *
17120733 --AAGAGATTTTTAAAA-AAATTTGTTTACCAAATTAGTTCAATTAGTTATAGA-TATTTGAACA
1 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACA
* * * * *
17120794 ATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTT-TTTTGTCATAAAACATTTATTTCT-ATTCATAC-
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TGCTTCATACA
* * * * *
17120856 GGTTTTACTCAAAATAAAATAAT-GTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
129 AG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * ** ** * * * * * *
17120909 GTAATG-GAGTTAGAAAATGTATCTATTGGCCTGACT-AGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAAT
1 GCAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
17120972 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-ATTCGTA
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* ** * ** *
17121036 CAAGCTTATTCAGAATAGCATAATTCTAATTTATTGGTATTCCAAAAATTAATAA
127 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
17121091 GTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCGAACAAGTTC-AATAGTTAT-ACTATTTGAACAA
1 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * *
17121154 TTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
17121202 TTTCTATTTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (181 bp):
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TTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGCTTCATACAAG
CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
Found at i:17120354 original size:535 final size:538
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* *
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* * * * * *
17119414 TAAAATAATTGTTTCGCTTCATACAAGCTTATTCTAAAAAAGTTAATACTAATTTATTAACTTTT
66 TAAAATAATTGTTTCGATTCACACAAGCTTATTCTAAAAAAG-CAATACTAATTAATAAAATTTT
* *
17119479 AAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGGTAAATCTATTTACCGAATAAGTTCACATAGTTAT
130 AAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA-GTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
17119544 AACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
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** * * * * **
17119609 TTGGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
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* **
17119674 GTAAGAGATTTAAAAACTAAATCAAATTTCAAAATCAATTTAAATAATTATGGCTATTTGAACAA
324 GTAAGAGATTTAAAAACTAAATCAAATTTCAAAATCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
17119739 TTATCTATTTCAAATCATTTTTACCTTTCGTTTTGTCATAAAGCAAATATTTTTCAACATATAAG
389 TTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTCGTTCTATCATAAAACAAATATTTCTCAACATAGAAG
17119804 CTTATTCAAAATAAAATAACACTGATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTATGAGATTCAAAAAAT
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* * *
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* * * * *
17119953 ATAAAATAATT-TTTCTATTCACATAAGTTTATT-TGGAATAA-CAATACTAAATTAATAAAATT
65 ATAAAATAATTGTTTCGATTCACACAAGCTTATTCT-AAAAAAGCAATACT-AATTAATAAAATT
* * *
17120015 TT-GAAAATTCATAA-CTAAGAGATTTAAAAA-TAAAT-TCATTTGCCAAACT-AGTTCAAATAG
128 TTAAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAGTAAATCT-ATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAG
* * * * *
17120075 TTA-AGACTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAACAT
190 TTATA-ACTATATGAAAAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCAGAAAACAA
** ** * *
17120139 TTATTTCAGCTCATCCAAGTTTATTCGAAATAAAACAAAACTA-ATTATTAATATTTCAAAAATT
254 TTATTTCAGCTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAACAAAACTATATTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * ** * * *
17120203 TATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATTC-TATTT-ACCGACCTAGTTCAAATAATTATAATTAT
319 AATAAGTAAGAGATTT-AAAAACTAAATCAAATTTCA-AAATC-AATTCAAATAATTATAACTAT
* * * *
17120266 TTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCT-AT
381 TTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTCGTTCTATCATAAAACAAATATTTCTCA-
* * **
17120330 TCATAGAAGGTTATTCGGAATAAAATA
445 ACATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATA
17120357 GTGCTAATCT
Statistics
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TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCA
TAAAATAATTGTTTCGATTCACACAAGCTTATTCTAAAAAAGCAATACTAATTAATAAAATTTTA
AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAA
CTATATGAAAAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCAGAAAACAATTATTTC
AGCTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAACAAAACTATATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
AAGAGATTTAAAAACTAAATCAAATTTCAAAATCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATT
ATATATTTCAAATCATTATAACCTTTCGTTCTATCATAAAACAAATATTTCTCAACATAGAAGCT
TATTCAAAATAAAATAACACTGATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTATGAGATTCAAAAAATAA
TTTTTTTTACCAAACCAA
Found at i:17121101 original size:701 final size:700
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17119794 AACATATAAG
* ** *
17119804 CTTATTCAAAATAAAATAACACTGATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTATGAGATTCAAAAAAT
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** * * * * ***
17119869 AATTTTTTTTACCAAACCAATTCATATAGTTAGGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGT
66 AATTTTGCTTACCAAACCAATTCAAATAATTAGGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCAC
* *
17119934 TATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTTTTCTATTCACATAAGTTTATTTGGAATAACAATA
131 TATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTTTTCTATTCACATAAGTTTATTTGAAATAACAATA
* * *
17119999 CTAAATTAATAAAATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATTCATTTGCCAAACT
196 ATAAATTAATAAAATTTTGAAAAAT-ATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATTCATTTACCAAACT
* * *
17120064 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
260 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGT
* * *
17120129 CAGAAAACATTTATTTCAGCTCATCCAAGTTTATTCGAAATAAAACAAAACTAATTATTAATATT
325 CAGAAAACATTTATTTCAGCTCATACAAGTTTACTCAAAATAAAACAAAACTAATTATTAATATT
* * * *
17120194 TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATTCTATTTACCGACCTAGTTCAAATAATTA
390 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATTAATTCTATTGACCGACCTAGTGCAAATAATTA
* * * * *
17120259 TAATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTAT
455 TAACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCGTTATAACCTTTTATTCTATCACAAAACAATTAT
* * * * *** * *
17120324 TTCTATTCATAGAAGGTTATTCGGAATAAAATAGTGCTAATCTAATAAGATTTTGACAATTAATT
520 TTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATCTAATAAGATTCCAAAAATTAATA
*
17120389 ACTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCACACCACTTCAAATAGTTAAGGCAACTTCAAA
585 ACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCACACCACTTCAAATAGTTAAGGCAACTTCAAA
17120454 TCATTATAACCTTTTTATTTTGTTGTAAGACAAAATTTCAACTCTTACTAA
650 TCATTATAACCTTTTTATTTTGTTGTAAGACAAAATTTCAACTCTTACTAA
* * *
17120505 CTTATTTAGAATAAAATAAAACAAATTTATTAA-ATTTCAAAAATTAATACATAAGAGATTTAAA
1 CTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT--AT--GAGATTCAAA
**** * *
17120569 AAATAATTTTGCTTGTTGAACCAATTCAAATAATTATGA-TATATGAACAATTATTTATTTCAAA
62 AAATAATTTTGCTTACCAAACCAATTCAAATAATTAGGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA
* * *
17120633 TCACTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TATTCACATAAGTTTGTTTGAAATA
127 TCACTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-AAAT-TTTTCTATTCACATAAGTTTATTTGAAATA
* * * **
17120697 A-AATAATATTAATTTATTAATATTTT-AAAAAT-TAA-TAAGAGATTTTTAAAA-AAATTTGTT
190 ACAATAATA--AA-TTAATAAAATTTTGAAAAATATAACTAAGAGA-TTTAAAAATAAATTCATT
* * * * *
17120757 TACCAAATTAGTTCAATTAGTTATAGA-TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCA
251 TACCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCA
* * * * **
17120821 TTT-TTTTGTCATAAAACATTTATTTCTA-TTCATAC-GGTTTTACTCAAAATAAAA-TAATGTA
315 TTTGTTTTGTCAGAAAACATTTATTTC-AGCTCATACAAG-TTTACTCAAAATAAAACAAAACTA
* * *
17120882 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAATG-GAGTTAGAAAATGT-A-TCTATTGGCCTGA-
378 A-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGAGTTAAAAAAT-TAATTCTATTGACC-GAC
* * * * * * *
17120943 CTAGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTTATTT
439 CTAGTGCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCGTTATAACC-TTTTATTC
* * * ** * * **
17121008 TGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTCAGAATAGCATAATTCTAAT-TTATTG
503 TATCACAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATCTAATAA
*
17121072 GTATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
568 G-ATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA
17121108 TGAATCTGTT
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (700 bp):
CTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGAGATTCAAAAAAT
AATTTTGCTTACCAAACCAATTCAAATAATTAGGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCAC
TATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTTTTCTATTCACATAAGTTTATTTGAAATAACAATA
ATAAATTAATAAAATTTTGAAAAATATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATTCATTTACCAAACTA
GTTCAAATAGTTAAGACTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTC
AGAAAACATTTATTTCAGCTCATACAAGTTTACTCAAAATAAAACAAAACTAATTATTAATATTT
CAAAAATTAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATTAATTCTATTGACCGACCTAGTGCAAATAATTAT
AACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCGTTATAACCTTTTATTCTATCACAAAACAATTATT
TCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATCTAATAAGATTCCAAAAATTAATAA
CTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCACACCACTTCAAATAGTTAAGGCAACTTCAAAT
CATTATAACCTTTTTATTTTGTTGTAAGACAAAATTTCAACTCTTACTAA
Found at i:17121564 original size:179 final size:176
Alignment explanation
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Period size: 179 Copynumber: 2.1 Consensus size: 176
17121223 TTCAAATCTA
*
17121233 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAGAATTATATATTTCAAATTATTATGACT
1 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAGAATTATATATTTCAAATTATTATGACT
* * ** * * ** * * *
17121298 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATTCAAGCTTATTCGGACTAAAATAATATAAT
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* *** *
17121363 TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATG
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* * *
17121412 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA-GAAC
1 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAGAATTATATATTTCAAATTATTATG-AC
* * * * *
17121476 -CTTTCTTTCATTATAAGACAATTGTATAAGTTTATAT-AGGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
65 TCTTTCTTTCATCATAAAACAATTGTATAAGTTCAT-TCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-T
* * * * *
17121539 ACCTTATTAACATTCCAAAAATTAATATGTGATTTAAAAAATGAATCTG
128 AACTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGTAATTTAAAAAATAAATATG
17121588 TTTACCAAA
1 TTTACCAAA
17121597 CAATTATCTA
Statistics
Matches: 152, Mismatches: 30, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.41
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TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAGAATTATATATTTCAAATTATTATGACT
CTTTCTTTCATCATAAAACAATTGTATAAGTTCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATAAC
TTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGTAATTTAAAAAATAAATATG
Found at i:17122147 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 17121595--17125402 Score: 2612
Period size: 181 Copynumber: 21.3 Consensus size: 179
17121585 CTGTTTACCA
*
17121595 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * *
17121659 TACAAGCTTATTCCT-A-ATAAAAAAATA-TAAATTTACTAATATT-TCAAAAATTAATAAG-CA
65 TACAAGCTTATT--TGAGATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
17121719 AAGATTTGAAAAATAAATCTTTTTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGTCTATTTG
126 AAG-TTTAAAAAATAAA--TTGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
17121776 AACAATTATATATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAACCAATTGTTTCTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * **
17121841 AAAAGCTTA-TTCAGAATATAATAATACT-A---ATT--TA---TAAAAATTTCTAAGTAAAATG
66 ACAAGCTTATTTGAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-G
* * *
17121896 CTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACGAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTA
129 TTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
17121948 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
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* * **
17122013 ACAAGTTTATTTGAGATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGTT
66 ACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGTT
* * *
17122078 TAAAAAATAAAGTTGTTTACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTG
131 TAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
17122128 AACTATTAT-TCATTTCAAATTGTTATGTCATTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
** * *
17122192 TACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATTAG--AGA
65 TACAAGCTTATTTGAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * *
17122253 -TTTAAAAACTAAATTTATTTA-TAGGACCAGCTT-AAATAGTTATGACTATTTA
128 GTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTA-AACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
17122305 AACAATTATCTATCTCAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * ** * * * *
17122369 ACAAAG-TTATTTG-GAGT-AAATATTGCTAAACTAATAAAATTCTAAAAATTAAGAAG--AGA-
66 AC-AAGCTTATTTGAGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG
* * * * * *
17122428 TTTAAAAAACAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTAG
129 TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * *
17122480 AACAATTATCTATTTCGAATCATTCTGACCTTTT-TTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * * ** * *
17122543 ATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTTTTTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAGA
64 ATACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-A
* * * *
17122608 ATTTAATAAAATAAATATGTTTACAAAACAAGTTTAAATATTTATGACTATTTG
128 GTTTAA-AAAATAAAT-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
17122662 AATAATTATCTATTTAAAATTATTAT-AGCTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * *** * * * * * * * * * ***
17122725 ATAAAAGTTTATCCAAAATTACAGAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGAACTTGGA
64 ATACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAA
* * * *
17122789 GATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCAAATC-AGTTCAAATTGTTAAGGCTATTTG
128 G-TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
17122843 AACAATTATCTATTTCAAATCT-TTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TC
1 AACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTC
* * * **
17122905 ATACAAGCCTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAATAGGA
64 ATACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * *
17122968 GATT-----AT---CTGTTAACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTA
128 GTTTAAAAAATAAATTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * *
17123012 AACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * * * * *
17123077 ATAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATATAAT-ATATTATAAAAATGAATAACTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTTGAG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-
* * * *
17123140 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTGTTTG
129 TTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
17123192 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * ** * ** * *
17123257 ATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATTTTAA-TTATTAATA-TCTTGAAAATTAATAAG--AGA-T
66 ACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAAATTAATAAGTAAAAGT
* * * * *
17123317 TTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAACTAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTG
130 TTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
17123368 AACAATTATTTAATTCAAATCGTTATGA-CTATTTGTTTTGTCGA-AAAACAATTATTTTTATTG
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTATC-ATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * ** *
17123431 ATACAATCTTATTCG-GAATAAAGGAA-ACCTAATTGATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAC
64 ATACAAGCTTATTTGAG-ATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-
* ** * * * *
17123494 GAA-TTTGAAAAATAAATCTGTTGGGCTTATC-AGTGCAAATAGTTATGACTGTTTG
126 -AAGTTTAAAAAATAAAT-TGTT-TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * *
17123549 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATCCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
** * * * * *
17123614 ACAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-T
* * * * * *
17123679 TTAAGAATTGAATCTGTTTA-TCGAATAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTG
130 TTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * * * ** *
17123730 AATGATTACCTATTTCAAATCGCTAT-ATCCTTTGGTTTTGTCACAAAATTATTTTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * *
17123794 TACAAGTTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTC-AAACAATTAATACGTAAAA
65 TACAAGCTTATTTGAGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAAA
* * * *
17123857 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAATTAGTTATGATTATTTG
128 G-TTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
17123911 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* ** *
17123976 ACAAGCTTATTTG-GATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-T-T-----TCGACAAGTAAAATG
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* * ** *
17124033 TTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGGCATAACTATTTG
129 TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
17124085 AATAATTATCTATTTCAAATTATTATGGCCTTTTGTTTCATCATAAAATAATTG-TACTAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
* * ** * * * * *
17124149 TATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA
65 TACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-
* * * * * * * *
17124214 TTTAAAAAATGAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAGTAGTTATAACAATTTG
129 TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
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*
17124331 TACAAACTTATTATGA-ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAA
65 TACAAGCTTATT-TGAGATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * *
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* ** * * * ** * *
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* ** * * *
17124512 ACAAGCGTATTAAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAAT
66 ACAAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAAAGT
* * * * * *
17124577 TTTAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAGCAAGTTCAAATAATTATAACTGTTTG
130 TTAAAAAATAAA-TTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
17124628 AATAATTATTTATTTCAAATAGTTATTATC-TTT-CTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCAT
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* * *
17124691 ATAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AG-ACAGGA
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** ** * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * **
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** * * * * *
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* * * **
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* ** * *
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* * * * * ** ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * * **
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* *
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*** * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * *
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** * * ** * * *
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* ** *
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* * * **
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* * * * *
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* * * ** * *
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*
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* * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * ** **
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* * *** **
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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*
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** * *** * * * ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * * **
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385 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTTAATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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*
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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195 TCAAATAGTTATAATCTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTATTTAGA
* * *
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** * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* ** * * ***
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* * * * *
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TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
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TAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATGAATCTATTTATCGAAACAGTTCAAATAGTT
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AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCGAATAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG
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**
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AAAT
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* *
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AATAAATAATAAAATA
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*
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* **
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* *
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* * * * *
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*
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* * *
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** *
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*
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*** *
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GTTTGCAAGAATTTAAG
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** * **
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* **
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1 AA
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* *
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* *
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* *
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** * * *
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1 AAAA
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*
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * **
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* *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAG-TTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* * * * * *
17135280 AATAATA-AATGCTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-
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* * * * * ** * * * **
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** *
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* * * * *
17134368 TCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAACATTAATAAGCAAG
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* * * * * * * *
17134433 AGATTT-AAAAACTAAAGCTGTTT-TCTAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATA
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* * * * * **
17134496 TCAATCTT-AAATCATTATTA-TCTTTAT-TTTCTTATAAAACAATTGTTTCTAA
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* * * *
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* ** * * * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
17134789 AAAGTTTAAAAAAATAAACCTATTTATCT-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
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* *
17134853 ATCTATTTAAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-
125 ATCTATTTCAAATCATTATAG-CCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTT--TC
* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* *
17135148 GATTTAAAAAAATAAATTTATTTATTGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGTAC-A-TATC
65 GATTTAAAAAAATAAA-TTATTTATTGAA-TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAACTATC
** *
17135211 TATTTCAAATTGTTATAGCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGC
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* * * * * * * *
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*
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174 1 0.00
175 42 0.07
176 135 0.21
177 98 0.15
178 20 0.03
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181 7 0.01
182 132 0.21
183 11 0.02
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (176 bp):
TCATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAG
ATTTAAAAAAATAAATTATTTATTGAATAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAACTATCTAT
TTCAAATCATTATAGCCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTTTC
Found at i:17135707 original size:178 final size:181
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Indices: 17135506--17135830 Score: 439
Period size: 178 Copynumber: 1.8 Consensus size: 181
17135496 AAACCTTTTT
*
17135506 ATAAATAAATTTATTTTTTAAATC-TTCAACCTATTAATTTCTAG-AATATCAATAGATTAGTAT
1 ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTCAA-CTATTAATTT-TAGAAATATCAATAAATTAGTAT
* * *
17135569 TATTTTATTTTGAATAAACTTATATTAATAGAAACAATT-TTTCTATG-CAAAATAAAA-GATCA
64 TATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGGTT-TATGACAAAACAAAATG-TCA
17135631 TAACTATTTGAAT-AAATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTGCTCA
127 TAACTATTTGAATAAAATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTGCTCA
* * * * * *
17135685 ATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTC
1 ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTCAACTATTAATTTTAGAAATATCAATAAATTAGTATTA
** * *
17135749 TTTTATTTTGAATATGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAAC
66 TTTTATTTTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAC
17135814 TATTTGAATAAAATAAT
131 TATTTGAATAAAATAAT
17135831 ATTAATTTAT
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 14, Indels: 11
0.83 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 2 0.02
178 74 0.59
179 42 0.33
180 8 0.06
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTCAACTATTAATTTTAGAAATATCAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAC
TATTTGAATAAAATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTGCTCA
Found at i:17136122 original size:182 final size:176
Alignment explanation
Indices: 17135901--17136357 Score: 443
Period size: 182 Copynumber: 2.6 Consensus size: 176
17135891 ACAAAATTAT
* * * *
17135901 TTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCT-TAATAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAA
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAA-GT-TATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAA
* *
17135965 CTATTTGAATTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAA-TTTTCATACT
64 CTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-ACTTA----TTAATTTTTCA-ACT
* * *
17136029 ATTATTAGACTAGTATTA-TTTTATTCCAAAATA-AGCTGGTATGA-GCATAAATAA
123 ATTAATAAACTAGTATTATTTTTATTCC-AAATAGA-CTGGTATGATG-AAAAATAA
* *
17136083 TTGTTTTATGACAAAACAAGATGTTATAACAATTTGAAAT-GTATAATTGTTCAAATAGCCATAA
1 TTGTTTTATGACAAAACAA-AAGTTATAACAATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATAGCCATAA
* * * * * * *
17136147 CTTTTTGAACTAGTTTGGTAAACAAA--TA-ATCTT--ATACTTATTAATTTTTGAATTATTAAT
64 CTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATACTTATTAATTTTTCAACTATTAAT
* * * *
17136207 AAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAGACTTGTATGATGAAAAATAA
129 AAACTAGTATTATTTTTATTCCAAATAGACTGGTATGATGAAAAATAA
* * *
17136255 TTGTTTTATGACAAAA-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGGCCATAAT
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAAC
* * * *
17136319 TATTTGAATTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAAT
65 TATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
17136358 GGCCAACTTC
Statistics
Matches: 225, Mismatches: 36, Indels: 34
0.76 0.12 0.12
Matches are distributed among these distances:
170 4 0.02
171 54 0.24
172 57 0.25
173 17 0.08
174 3 0.01
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177 2 0.01
179 3 0.01
180 2 0.01
181 2 0.01
182 74 0.33
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACT
ATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATACTTATTAATTTTTCAACTATTAATAA
ACTAGTATTATTTTTATTCCAAATAGACTGGTATGATGAAAAATAA
Found at i:17136781 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 17136494--17136969 Score: 422
Period size: 176 Copynumber: 2.7 Consensus size: 177
17136484 AAGCATATAT
* * * * * *
17136494 GAACCGAAATAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCT
1 GAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * * *
17136559 AATAGTCTTAACCATTTGAATTGGTTCGATAGACACATTTAGTTTTTACAGCTCTTTCTTGTT-A
66 AATAGTCACAACCATTTAAATTGGTTCGATAAACAAATTTAGTTTTTA-A-ATC--TCTT-TTCA
* * * **
17136623 ATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTGTATC
126 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTGTA-C
* * * *
17136676 -AACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATTATACCGATTTGAAATTGATAATTGTTCA
1 GAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
17136739 AATAGTCACAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTTTCAATTTT
66 AATAGTCACAACCATTTAAATTGGTTCGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTTTCAATTTT
* * * * *
17136804 CAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTAC
131 CAAAATATTAATAAATTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTGTAC
* * * * * * * * *
17136851 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATG-TCATAACAATTTAAAATCGATAATAGTTT
1 GAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * ** * *
17136915 AAATGGACATGACAATTGGAATTTGTTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
65 AAATAGTCACAACCATTTAAATTGGTTCGA-TAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC
17136970 CAACTTATTA
Statistics
Matches: 239, Mismatches: 50, Indels: 15
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.01
176 71 0.30
177 68 0.28
178 3 0.01
179 1 0.00
180 69 0.29
181 24 0.10
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (177 bp):
GAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
AATAGTCACAACCATTTAAATTGGTTCGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTTTCAATTTT
CAAAATATTAATAAATTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTGTAC
Found at i:17137059 original size:609 final size:604
Alignment explanation
Indices: 17135914--17137078 Score: 1293
Period size: 609 Copynumber: 1.9 Consensus size: 604
17135904 TTTTACGACA
* * *
17135914 AAACAAAAGGTCTTAATAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGT
1 AAACAAAAGGTCTGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACCATTTGAATTGGT
* * * * * * * * *
17135979 TTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTCATACTATTATTAGACTAGTA
66 TCGACAAACAAATTTAGTTTTTAAAGCTCTTACTTGTTAATTTTCAGAATATTATTAGACTAGCA
* * * * * * *
17136044 TTATTTTATTCCAAAATAAGCTGGTATGAGCATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAGATGTTA
131 ATATTTTACTCCAAAATAAGCTGGTATCAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAGA-GTTA
* * *
17136109 TAACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAAATAGCCATAACTTTTTGAACTAGTTTGGTAAACAAAT
195 TAACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAAATAGCCACAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAAAT
* ** * *
17136174 AATCTTATACTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAGACTT
260 AATCTTAAACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAGACTT
* * *
17136239 GTATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
325 GTACGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGTTCATAACAATTTAAAATAGATAATTAT
* ** * * * *
17136304 TTAAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATGGCCAACTTCT
390 TTAAATGGACATAACAATTGGAATTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCGCCAACTTAT
* * * * * *
17136369 CAATTTTTGAAATATTAATAAGGTAATATTTTTTAATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTGAAACA
455 CAATTTTTGAAATAATAATAAAGTAATATTTTTTAATTTCGAATAAACTTGTATAAACTGAAACA
* * **
17136434 ATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTATTTTATTTGGAATAAGCATATATGAACC
520 ATTATTCTACGATAAAACAAAAAATCATAATGATTTATTTTATTTGGAATAAGCATATATGAACC
17136499 GAAATAATTATTTTATAACT
585 GAAATAATTATTTTATAACT
* *
17136519 AAACAAAAGGT-TAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-TAATAGTCTTAACCATTTGAATTG
1 AAACAAAAGGTCT-GAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAT-ATAGCCTTAACCATTTGAATTG
* * * * * * **
17136582 GTTCGATAGACACATTTAGTTTTTACAGCTCTTTCTTGTTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAG
64 GTTCGACAAACAAATTTAGTTTTTAAAGCTCTTACTTGTTAATTTTCAGAATATTATTAGACTAG
* *
17136647 CAATATTTTACTCC-AAATAAGTTTGTATCAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AGAT
129 CAATATTTTACTCCAAAATAAGCTGGTATCAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAGAG-T
* * * * *
17136710 TATACCGATTTGAAAT-TGATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAACA
193 TATAACAATTTGAAATGT-ATAATTGTTCAAATAGCCACAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACA
* * *
17136774 AATTTAGTTTTTAAATCTCTTTTCAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTA-TTCT
257 AA--TA-ATCTTAAA-CT-TATT-AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTC-
* *
17136837 AAATA-ATTTTGTACGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-TGTCATAACAATTTA
315 AAATAGA-CTTGTACG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGT-TCATAACAATTTA
* *
17136899 AAATCGATAA-TAGTTTAAATGGACATGACAATTGGAATTTG-TTC-AGTAAACAAATTTATTTT
376 AAATAGATAATTA-TTTAAATGGACATAACAATTGGAA-TTGATTCGA-TAAACAAATTTATTTT
* * * * * *
17136961 TTAAATCTCCAACTTATTAGTTTTT-AGAATAATAATAAATTTATGTTATTTT-ATTTCGAATAA
438 TTAAATCGCCAACTTATCAATTTTTGA-AATAATAATAAAGTAATATT-TTTTAATTTCGAATAA
* *
17137024 ACTTGTA-AGAA-TAGAAACAATTGTTCTACGATAAAACAAAAAATTATAATGATTT
501 ACTTGTATA-AACT-GAAACAATTATTCTACGATAAAACAAAAAATCATAATGATTT
17137079 GAAATAAATA
Statistics
Matches: 459, Mismatches: 79, Indels: 40
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
602 2 0.00
603 58 0.13
604 40 0.09
605 116 0.25
606 5 0.01
607 6 0.01
608 47 0.10
609 178 0.39
610 7 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (604 bp):
AAACAAAAGGTCTGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACCATTTGAATTGGT
TCGACAAACAAATTTAGTTTTTAAAGCTCTTACTTGTTAATTTTCAGAATATTATTAGACTAGCA
ATATTTTACTCCAAAATAAGCTGGTATCAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAGAGTTAT
AACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAAATAGCCACAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAAATA
ATCTTAAACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAGACTTG
TACGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGTTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATT
TAAATGGACATAACAATTGGAATTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCGCCAACTTATC
AATTTTTGAAATAATAATAAAGTAATATTTTTTAATTTCGAATAAACTTGTATAAACTGAAACAA
TTATTCTACGATAAAACAAAAAATCATAATGATTTATTTTATTTGGAATAAGCATATATGAACCG
AAATAATTATTTTATAACT
Found at i:17137226 original size:182 final size:177
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Indices: 17136468--17137556 Score: 656
Period size: 181 Copynumber: 6.0 Consensus size: 177
17136458 TCATAATGAT
* * * * * * * * * * *
17136468 TTATTTTATTTGGAATAAGCATATATGAACCGAAATAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAG
1 TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* * * * * * * *
17136533 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCTTAACCATTTGAATTGGTTCGATAGACACAT
66 AACGATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTGAATTCGTTAG-TAAACAAAT
* * * * * * *
17136597 TTAGTTTTTACAGCTCTTTCTTGTTAATTTTTAGAATATT-ATTAGTTTAGCA
129 TTATTTTTTA-A-ATCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTA-TA
* * ** * * * *
17136649 ATATTTTACTCCAAATAAGTTTGTATCAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATTAT
1 TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* ** * * * * *
17136713 ACCGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAACAAATT
66 AACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCG-TTAGTAAACAAATT
* *
17136778 TAGTTTTTAAATC-T-CTT-TTCAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTAGTA
130 TATTTTTTAAATCTTACTTATT-AATTTT-TAAATATTAATAAATTTA-TA
** * * *
17136825 TTATTTTATTCT-AAATAATTTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATG-TC
1 TTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATC
* * ** * * * * * * *
17136888 ATAACAATTTAAAATCGATAATAGTTTAAATGGACATGACAATTGGAATTTGTTCAGTAAACAAA
64 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCGTT-AGTAAACAAA
* * * *
17136953 TTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAGTTTTTAGAATAATAATAAATTTATG
128 TTTATTTTTTAAATCT--TACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTATA
* * * * * * * *
17137006 TTATTTTATTTCG-AATAAACTTGTAAGAATAGAAACAATTGTTCTACGATAAAACAAAAAATTA
1 TTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * *
17137070 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATTCGCTTAGTAAACCAAT
65 TAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCG-TTAGTAAACAAAT
*
17137135 TTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTATA
129 TTA-TTTTTTAAATC--TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTATA
* * *
17137188 TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCAT
1 TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* * * * * * * * * * *
17137253 AATGATTTTAAATAAATAATTATTCAATTAGTGATTACTTTTTGAACTT-ATTCGATAAACAGAT
66 AACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTCGTTAG-TAAACAAAT
* * * * * * *
17137317 TCATTTCTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAGTTAATG
129 TTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTTATA
* * * *** * * * *
17137369 TTGTTTTATTTCAAAAAAGCCCATATGAACTGATACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCAT
1 TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
** * * * ** * ** * * *
17137434 AATAATTTGGAATAGATAATTATCCAAATAGTTATTGCTATTTAAACTT--ATACGATAAACATA
66 AACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTCGTTA-G-TAAACAAA
* * ** *
17137497 TTTATTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATA
128 TTTATTTTTTAAATC--TTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTTATA
*
17137550 ATATTTT
1 TTATTTT
17137557 CAAAATATTA
Statistics
Matches: 720, Mismatches: 154, Indels: 68
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.00
176 67 0.09
177 70 0.10
178 3 0.00
179 3 0.00
180 68 0.09
181 352 0.49
182 149 0.21
183 5 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
AACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCGTTAGTAAACAAATTT
ATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTTATA
Found at i:17137560 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 17137528--17137584 Score: 105
Period size: 28 Copynumber: 2.0 Consensus size: 28
17137518 TTATTAATTG
17137528 TCAAAATATTAATAAATTAATAATATTT
1 TCAAAATATTAATAAATTAATAATATTT
*
17137556 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTT
1 TCAAAATATTAATAAATTAATAATATTT
17137584 T
1 T
17137585 ATTCTGAACA
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
28 28 1.00
ACGTcount: A:0.51, C:0.04, G:0.00, T:0.46
Consensus pattern (28 bp):
TCAAAATATTAATAAATTAATAATATTT
Found at i:17137902 original size:182 final size:178
Alignment explanation
Indices: 17137559--17138056 Score: 455
Period size: 182 Copynumber: 2.8 Consensus size: 178
17137549 AATATTTTCA
* * * *
17137559 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATAAGAACAAAAAAAATTGTTTTA
* * * **
17137624 TGACAAAACAAATGTGATAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAATCATAGTTATTTGAAC
66 TGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAAAAGA-AATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAC
* **
17137689 TAGTTTGGCAAATGGAATTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT
130 TAGTTTGACAAATCAAATTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
17137738 GAAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTCTGAA-TAAGTTACTAAGAACAAAAAAAATTGTTT
1 -AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTA-TAAGAACAAAAAAAATTGTTT
** * *
17137802 TATGACAAAACAAAAAGGTCATAACGATTTGAATTAAAG-AATTGTTCATCT-AGCTTTAACTAT
64 TATGACAAAAC--AAAGGTCATAACGATTTGAA--AAAGAAATTGTTCAAATAATC-ATAACTAT
* *
17137865 TTGAACTAGTTTGACAAA-CAAATGTATTTTTTAAATTTTTTAGTTATTAATTTTT
124 TTGAACTAGTTTGACAAATCAAAT-TATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * * * * * *
17137920 AGAATATTATTACATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAATAATTCTTTT
1 A-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATAAGAACAAAAAAAATTGTTTT
* * * * * * * * * * * *
17137985 CTAACATAACGAAGGTTAGAACAATATGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAA
65 ATGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAAAAGA-AATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA
*
17138050 CTGGTTT
129 CTAGTTT
17138057 AATAAACAGA
Statistics
Matches: 253, Mismatches: 53, Indels: 24
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 2 0.01
179 5 0.02
180 102 0.40
181 7 0.03
182 129 0.51
183 4 0.02
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATAAGAACAAAAAAAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAAAAGAAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT
AGTTTGACAAATCAAATTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT
Found at i:17139526 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 17138654--17140136 Score: 1264
Period size: 180 Copynumber: 8.2 Consensus size: 179
17138644 GAATAGAAAT
* * * * * *
17138654 AATTGTTTAACGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCCAATGGACAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCAT
* * ** * *** *
17138718 GACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTAGAA
64 AACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAA
** * * * *
17138783 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGCAAGAA-TAGAAGC
128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
* * * * * *
17138835 AGTTGTTTTATGACCAAACAAAA-GATTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAA-TATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * **** * * * *
17138899 AACTATTTGAAC-AGCTCAGTGGGTAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTTAAG
64 AACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAA
*
17138963 TATCAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAC
128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
* * * *
17139015 AATTGGTTTATGATAAAAC-AAATAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATATTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
17139079 AATTATTTGAA-TGTGTTTAAAAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAA
64 AACTATTTGAACT-TGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAA
* * * * *
17139143 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAGGCTTGCACGAGC-AAAACC
128 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-C
* *
17139195 AATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATA-TTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCAT
* * * * * **
17139259 AACTATTTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGA
64 AACTA-TTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAATT-TTTTACTTATTAATTTTTAAA
* * *
17139324 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAACTGAAAC
127 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
* * * * * * * * *
17139377 AATTGTTTTGTTATAGAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGGTAATTATGCAAACAGTCATG
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * * *
17139442 ACAATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTACTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAAT
65 ACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * *
17139507 ATTAATAAAATAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAT
129 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
* *
17139558 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA--ATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * **
17139622 AACGATTTGAATTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--A
64 AACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TTAAA
* *
17139685 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAGA
127 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-C
** * * * * * *
17139738 AATCATTTTATGACAAAAC-AAATGGTTATAGCTATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATAATCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATA-ATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * *
17139802 AATTATTTAAACTTATTCAATAAACAGATTTA-TTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAAT
64 AACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * ** ** * *
17139866 ACTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACTGAAAT
129 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
* * * * *
17139917 AATT-TTTTATGATAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGAGAATTTTTCAAATAGTCATG
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
17139980 ACTATTTGATCTAGTTTTATAAACATATTTGTTTTTTAAATTTTTTTACTTATTAATTGTTCAAC
65 ACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTT-ATTTTTAAA-TTTTTTACTTATTAATTTTTAAAA
* *
17140045 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAA-TAGAAAC
128 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
* * * *
17140097 TATTGTTTTATAACATAACAAAAAGTCATAACTATTTGAA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TATTTGAA
17140137 CTGGTTTGAT
Statistics
Matches: 1043, Mismatches: 214, Indels: 89
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 55 0.05
178 14 0.01
179 93 0.09
180 450 0.43
181 289 0.28
182 135 0.13
183 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
Found at i:17139690 original size:543 final size:535
Alignment explanation
Indices: 17138668--17140136 Score: 1642
Period size: 543 Copynumber: 2.7 Consensus size: 535
17138658 GTTTAACGAT
* * * * * *
17138668 AAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCCAATGGACATGACTATTTGAACTTA
1 AAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTT
* **
17138733 TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
65 TTAG-TAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
17138798 ATTATTTTATTTTGAATAAACTTGCAAGAA-TAGAAGCAGTTGTTTTATGACCAAACAAAAGATT
128 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGA-TAAACAAAAG-TC
** * * * * **** *
17138862 ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-AGCTCAGTGGGTAGA
190 ATAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATA
* * * * *
17138926 TTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTTAAGTATCAATAAATTAGTATTATTTT-ATTC
255 TTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTGTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * * ** *
17138990 TAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAATAGTCATAATGATTTAAA
319 -GAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAA
* **
17139055 ATAGATAATTATTCAAATATTCATAATTATTTGAATGTGTTTAAAAAACAAATTTATTTTTAAAA
383 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACGATTTGAATGTGTTTAAAAAACAAATTTATTTTTAAAA
* *
17139120 TTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAGGCTTGCAC
448 TTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCAC
* * ** *
17139185 GAGCAAAACCAATTGTTTTATGGC
512 GAACAAAACAAATCATTTTATGAC
17139209 AAAACAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTGAACTT
1 AAAACAAAAGGTCATAATA-TTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTT
* * *
17139274 GTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
64 -TTTAGTAAACAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG
** * * * *
17139339 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAACTGAAACAATTGTTTTGTTATAGAACAAAATGTC
127 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATA-AACAAAA-GTC
* ** * * * * *
17139404 ACAATGATTTGAAATAGGTAATTATGCAAACAGTCATGACAATTTGAACTTGTTTGGTAAACATA
190 ATAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATA
* * *
17139469 TTTACTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTAATTC
255 TTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
*
17139534 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCAATTTGAAA
319 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA
* * *** *
17139599 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGAATTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATT
384 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACGATTTGAATGTGTTTAAAAAACAAATTTATTTTTAAAAT
* * *
17139664 TTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTAT
449 TTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCAC
* *
17139728 GAATAAAAGAAATCATTTTATGAC
512 GAACAAAACAAATCATTTTATGAC
* * * * * * * * *
17139752 AAAACAAATGGTTATAGCTATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTA
1 AAAACAAAAGGTCATA-ATATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-
* * * * * * *
17139817 TTCAATAAACAGATT-TATTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTAATAACTTAGTA
64 TTTAGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA
*
17139881 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACTGAAATAATT-TTTTATGATAAAACAAAAGTCATA
129 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAT-AAACAAAAGTCATA
* *
17139945 ACAATTTGAAATAGAG-AATTTTTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTTA-TAAACATAT
193 ACAATTTGAAATAG-GTAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAG-TTTAGTAAACATAT
* * *
17140008 TTGTTTTTTAAATTTTTTTACTTATTAATTGTTCAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT
256 TTATTTTTTAAA-TTTTTTACTTATTAATTG-TCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * *
17140073 GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACT-ATTGTTTTATAACATAACAAAAAGTCATAACTATTTGAA
319 GAATAAGCTTGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAA
17140137 CTGGTTTGAT
Statistics
Matches: 776, Mismatches: 133, Indels: 40
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
538 63 0.08
539 115 0.15
540 85 0.11
541 51 0.07
542 168 0.22
543 285 0.37
544 7 0.01
545 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (535 bp):
AAAACAAAAGGTCATAATATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTT
TAGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAACAAAAGTCATAACA
ATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATT
TTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAG
CTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
TTATTCAAATAGTCATAACGATTTGAATGTGTTTAAAAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTACT
TATTAATTTTTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCACGAACAAAAC
AAATCATTTTATGAC
Found at i:17140340 original size:323 final size:321
Alignment explanation
Indices: 17139863--17140449 Score: 689
Period size: 323 Copynumber: 1.8 Consensus size: 321
17139853 TAATTTTTAG
* * * * * *
17139863 AATACTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTACATGAACTGAAATAATTTTTTATG
1 AATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTAACATGAACTAAAATAATTTTTTATA
* * * *
17139928 ATAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGAGAATTTTTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTA
66 ACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGATCTA
** * * * * * *
17139993 GTTTTATAAACATATTTGTTTTTTAAATTTTTTTACTTATTAATTGTTCAACTATTAATAAATT-
131 GTTAGATAAACAAAATTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTGTTCAAATATTAATAAATTC
* * * ** *
17140057 AGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAATAG-AAACTATTGTTTTATAACATAACAAAA
195 A-TATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTAGTATAAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
17140120 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAGATTTATTTTTTAAATATCTTATTTTTTTTGA
258 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAGATTTATTTTTTAAATATCTTATTTTTTTTGA
* * * * *
17140184 AATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGTACAAACTAATATGAAC-AAAATCATTTGTCTTA
1 AATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTAACATGAACTAAAATAATTT-T-TTA
* * * *
17140248 TAACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA
64 TAACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG-A
* * * * * *
17140313 T-TAGTTAGGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTCATAAA
127 TCTAGTTAGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTTCAAATATTAATAAA
* * *
17140377 TTCATTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
192 TTCATATTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATAAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAA
*
17140442 AGGTCATA
257 AAGTCATA
17140450 GTGATTTGAA
Statistics
Matches: 216, Mismatches: 43, Indels: 12
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
320 8 0.04
321 45 0.21
322 67 0.31
323 94 0.44
324 2 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (321 bp):
AATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTAACATGAACTAAAATAATTTTTTATA
ACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGATCTA
GTTAGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTTCAAATATTAATAAATTCA
TATTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATAAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGT
CATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAGATTTATTTTTTAAATATCTTATTTTTTTTGA
Found at i:17140466 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 17140240--17143279 Score: 1955
Period size: 181 Copynumber: 16.9 Consensus size: 181
17140230 ACAAAATCAT
* * * * *
17140240 TTGTCTTATAACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAT
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
17140305 TATTTGAATTAGTTAGGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTGAAATAT
66 TATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * *
17140370 TCATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAAA
131 TAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AATTGAAAAAAA
** * * *
17140422 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
17140487 TATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAGTAT
66 TATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * *
17140552 TATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGAATGAACAT-AAATAATTA
131 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AA-TTGAAA-AA-AA
* * * * * * * *
17140606 TT-TTTT-TGATAAAATAAAAATGTTATTTTTTAAATAATTGATTTGAAGTATACAATTGTTCAA
1 TTGTTTTATGACAAAA-CAAAA-G-------GT-CATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * ** * * * *
17140669 ATAGTTATAACTATTTCAACGGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAAT
55 ATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* *
17140734 TTTTG-AATGATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAA-T-AAAATACAA
120 TTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAATTGAAAA-A-AA
* * * * * * * * * * *
17140796 TTGTTATATGACCAAACAGAAGGTAATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTGAGATGGCCATAAT
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * * * * *
17140861 TATTTGAATTGATTCGGTAAACAAAATCACTTTTTAAATCACTTCCTTATTAATATTTGGAATAT
66 TATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
** * * * *
17140926 TAATAAATTAACATTATTTTATTTTGAAGAAGCTTGTATGAACTG-AAACAA
131 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AATTGAAAAAAA
* * * * * *
17140977 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTATTAAAATAGTCGTAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * *
17141042 TATTTGAATTTGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTT-AA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATAT
66 TATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * *
17141105 TAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-AAAACAA
131 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AATTGAAAAAAA
* * * * *
17141156 TTGTTTTATGCCTAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
** * *
17141221 TATTTGAACTT-GTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATACT-TTGCTTATTAATTTTTTG-A
66 TATTTGAA-TTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAAT-CTCTTACTTATTAA-TTTTTGAA
* * * * * *
17141283 ATATTATTAAATTTGGATTCTTTTA-TTCTAAATAAGCTTCTA-AGATATG-AAAAAA
127 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATA-AT-TGAAAAAAA
* * * * * * * * * * **
17141338 -TATTTTATGACAAAACAAAAGATGAGAATGATCTGAAATAGATAATTATTCTAGTGGTTTTAAC
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * ** *
17141402 TATTGGAATTGGTTTC-GCAAGCACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATA
66 TATTTGAATTGG-TTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* ** * * ** * *
17141462 TTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAGTTTCTAGGA-TCAGAAACAA
130 TTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATAATTGA-AAAAAA
* * * * * *
17141514 CTGTCTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAACAATTTGAGATTA-ATAATTGTTCAAATA-TCATAA
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * *
17141576 TTATTTGAACT-G--CGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATGTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATA
65 CTATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * *
17141638 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-TAAAAAATAA
130 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAATTGAAAAA-AA
* * *
17141690 TTGTTGTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCAG-TCAAATAGCCATAA
1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAA
* * * * ** * * * *
17141754 TTATTTTAAATGATTTTGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTCAGAATGTATTCA
65 CTATTTGAATTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT---AAT-TTTTGA
* ** * *** * *
17141819 TATCAATTTTTAAATTAGTATTATTTTATTCCGTCGAAGCTTGTATTAACT-AAAACAA
126 AAT--ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-TAATTGAAAAAAA
* * * * **
17141877 TTGTTTTATGACAAATCAAAAAGTTATAACAAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGGAATAA
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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64 T-GAATAAGCTTTTATGATAGAAACA-A-TTGTTTTATGATAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTT
** * * * * * * * **
17147380 GTAGTAGATAATCGTTCAAA-CGATCATAATTATTTTAATTGATTCAATAAATAGA
125 AAAATAAATAATTGTTTAAATAG-TCATAACTATTTGAATTG-TTTGATAAATAGA
* ** * ** *** * *
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** *** * * * * * *
17147499 TGTCTAAGCACATATTA-ACTGAAACAATTATTTTATGACAAAAATAAAAGTT-ATAACGATTTT
64 TGAATAAGCTTTTATGATA--GAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGTTCATAATGATTTA
* * * * * * ** * *
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* ** * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * * * *
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* * * ** * ** *
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AATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTGATAAATAGA
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* * *
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* ** * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * * *
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** * *
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* * * * *
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*
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* * * *
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TAATTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGAAATAAGCTTATATGAATA
GAAATATTTTTTTATAAAAAACAAAAGGTCAAAACAATT
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* * * * * * * * ** *
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* *
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* *** * * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * ** * * *
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* *** * * *
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** * * * * * * * * * ** *
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* ** * * *
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* *** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *** * ** * * * * **
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* ** * * * * *
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* * * * * * * ** *
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** * * * * * **
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*** * * * * *
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* ** * * * * * * * * *
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1 TTCAAAAAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAAT-AGTCT-CTT
** * * * *
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*** * * * * * *
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* * * * * * *** * *
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** * * ** *
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* *** * * * * *
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* * * ** * * * * * * ** * *
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*** * * * * * *
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** * *
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* * ** * * *
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* * *
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*** ** * * *
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* * * *
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** ** *
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* * * * * * * **
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130 CAAGA---ATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * *** * * * ** *
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1 TTCAAAAAG-TCATAACTATTTAAACTAG-TTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAA-TAGTCTCT
** *** * * ** *** *
17147457 TACCAATTTAGGAAATATTAATAAATT-AGCATTA-TTTTATTCTGTCTAAGCACATATTA-ACT
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** * * * * *
17147519 GAAACAATTATTTTATGACAAAA-ATAAAAGTTATAACGATTTTAAACAGATAATTG
126 GAAACAAGAATTTTATGACAAAACA-AAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * *
17147575 TTCAAATAA-TAATAACTATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTCTTTCT
1 TTCAAA-AAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATAGTC--TCT
* * *
17147638 TATTAAATTTT-AAAATATTATTAAATT-AGTACTA-TTTTAATCTGAATAAGCTTATATGA
63 TATT-AATTTTCAAAATATTAATAAATTAAGTATTATTTTTAATC-GAATAAGCTTGTATGA
17147697 ACAAAATAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
TTCAAAAAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATAGTCTCTTAT
TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAAGTATTATTTTTAATCGAATAAGCTTGTATGATATGAAAC
AAGAATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
Found at i:17148092 original size:16 final size:17
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1 AAATAG-TATAATTATT
17148104 TGAAATGATT
Statistics
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Found at i:17148451 original size:18 final size:16
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*
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1 ATAACTATTTAAATAG
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1 --ATAACTATTTAAA
17148456 CTGGTTTAGT
Statistics
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Indices: 17148283--17151134 Score: 1988
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17148273 AACTAATTCA
* * *
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* * * *
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** * * * *
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* * *
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** ** * * * *
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** * * * *
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* * *
17148705 TTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAT
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* * * *
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* * * * * *
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1 ATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * ** * * * * *
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* * **
17149185 A-AAACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGCAGTATTA
1 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
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* *
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* * ***
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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** * * * * *
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* * *
17149675 ATGATTTGAAATAAATAATTAGTGAAATAG-C----C-------A----T-G
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* * * * * ** * *
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* *** * **
17149773 TATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAATA-GTCA
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** * * * **
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* ** * * ** * *
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*** * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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1 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATT
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* * * * * **
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * *
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1 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
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66 TTTTATT--TTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * *
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* * * ** * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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** * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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** ** * * * * * *
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** * * ** ****
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* * ** * ** *
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** * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * * **
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* * * * *
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* * * * ** * * * *
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** *** * ** * * * * *
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*
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* * ** * * *
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* * *
17148316 TTAATTTTTTGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAA
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*
17148380 CAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCA
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* * * * * * * *
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** *
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* * * *
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* *
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** * *
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* *
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* ** * * ** * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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191 TAACTATTCAAACTAGTT-GAGCAAACACATGT-ATTTTTTAAATCTC-T---TATT-AATTCTT
* * * * * ** * **
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249 GAAATAATAATAAATTAGTATTA-TTTATTTCAAATAAGC-TATATGTAA-AAAAACAATTGCTT
* * * * ** * ** *
17150179 TATGAC-AAACAAAAGGTCAA-AACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTAATT
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* * * * * * * * *
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* * * ** ** * * * *
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* *
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* * * * ** * * * * *
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* * * * * * * ** * ** *
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* * * * ** * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * *
17150655 ATATATTAGTATTATTT-TATTCATTATAAACTTGTATG-ATCAAAAACAATTG-TTATATGACC
258 ATAAATTAGTATTATTTAT-TTCA-AATAAGC-TATATGTA-AAAAAACAATTGCTT-TATGACA
* * *** * ** * ** ** * * * *
17150717 AAACAAAAGGTAATAGTGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGTATTGAT
318 AAAAAAAAGATAATAACAATTTGAAATAGATAGCTATACAAATAACCATAAGTATTGGAACTGAT
* * * * * * * * * **
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* * * * * * * *
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** * **
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* * * * * * *
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* ** ** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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*
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TTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAATAGTCATAACT
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AATTAGTATTATTTATTTCAAATAAGCTATATGTAAAAAAACAATTGCTTTATGACAAAAAAAAA
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TTTAAATAGCATAATTA
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* *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * * *
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* * *** * * *
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** * ** * *
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* * * * * **
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* * * * ** ** *
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* ** * * * * * * * *
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1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** ** **
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* * * * * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
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* ** *
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* * *** * ** *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
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* * ** * *
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130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT-AA
* * ** * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
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* ** * * *
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** ** * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ** *
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* * ** * *
17153305 -AATGTTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGA-ACTA
131 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA--A
* * * * * * * * *
17153355 ATACAATTATTATATGACTAAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * * *
17153420 C-TAACTTTTTGAACTGGTTGGGCAAACACATTTA-TTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTT-
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* ***
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* * * *
17153531 AAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTCAAATTGAT-ATCTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
17153594 TGATAACTA-TTGAACTGGTT-TGGAAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
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* ** * * * * *
17153656 TCAAATATTGGTAAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGA-AGTA
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* * * *
17153709 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACAACTTT-AAATATATAATCT-TTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATA
* * * * * *
17153772 TTCA-AATCTATTTAAACTTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAA-
64 GTCATAA-CTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTT-AATCTCTTACTTATTAAT
* * * *
17153834 --TT----T-TT--TGAA--AGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTGTGA-ACTA
126 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA--A
* * * * * * * * * * * * *
17153879 AAATAATTGTCTTGTAACTAAAGAGAATGTTAGAACGATTTGAAATAGATAGTTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * ** ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * ** ** * * * *
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* * *
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* ** * *
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* * * ** * * *
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* ** * * *
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* *
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* * * * * * * * *
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* ** * ** *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
17155240 GTTTG-AATATTAATAAATTTGT-TTAATTTTA-ATTGAAATAATCTTGTATGAATAGA
127 -TTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATG-ATA-A
* * * * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
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66 CATAACTATTTGAA-TTGATTC-AGTAAATAGATT-TATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * **
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128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAA
* * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
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66 CATAACTATTTGA-ATTGATTCAGTA--AATAGATTTATTTTTTTA-ATCTC-TTACTTATTAAT
* * * * *
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126 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTAT-GATAA
* * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
17155716 TATAACTAGTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAAC-CTT--TTATTAATTTTTA
66 CATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
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* ** * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * * *
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66 C-ATAACTATTTGAATTGATTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTT
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* * * * *
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1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * * * * * * *
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65 TCATAACTATTTGAATTGATTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *** * * *
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129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT-AA
* * * * * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * *
17156253 CAT-A--A-TTAAACTGATTCAATAAACTA-ATTTA-TTTTTTAATCTCCAACTTCTCAACTTTT
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* * * * * * **
17156312 GAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTG
130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAA
* * ** *
17156364 AAACAATTGTTTTATTA-TAAA-AAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-GT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
* * * *
17156426 TCAAATAGTCTTGACCATTTGAATTTG-TTCAGTAAACA-A-TT-TTTTTTTAATTTCTTGCTTA
65 TC--ATA------ACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTA
* * * * * * **
17156487 TTAATTTTTTG-AATGTTAATAGA-TAGTGTTACTTTATTTCGAATAAGCATGTATGAATTG
121 TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAA
* * * * * *
17156547 AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
17156612 CTTAACTATTTGAACTGGTT-TGACAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTA
66 CATAACTATTTGAATTGATTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* ** * * * *** * *
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130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-A
* * * *
17156726 GAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAATA
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
17156789 GTTATAACTATTTGAACTG-GTCTAGT-AATA-ATTTA-GTTTTTAA-ATCTT--TTATTAATTT
64 GTCATAACTATTTGAATTGATTC-AGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTT
** * *
17156847 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TTTTGAATAATTTTGCATAAATAA
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GATAA
* * * * * *
17156899 AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
17156963 TATAACTATTTAAATTCACTCAGTAAATAGATTTATATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTT-
*** *
17157028 GAAA-ATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGA-ACA
130 GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-A
* * * * * * *
17157078 AAACCAATTGTTTTCTGACAAAAAAAAAGGTCATTATGTTTTGAGACAAAGCAAAAGGTCATTGT
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-A-ATAG----A--TAATTGT
* * * *
17157143 TTAAATAGTAATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGATTCT-TTTTTTTAATTCTCTTACA
57 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAGATT-TATTTTTTTAA-TCTCTTACT
* * ** ** * **
17157206 CATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGAATTG
119 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAA
* * ** * *
17157269 AAACAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGAAAATTACTT-AAATA
1 AAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATA
* * * * * * *
17157332 GCCA-AGACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
64 GTCATA-ACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATT
* ** * * * ** * *
17157395 GTCAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATATGCTTGTATGAACAA
127 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAA
* * * * * * *
17157450 AAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
17157515 TATAACTATTAGAACTTGATTGA-TAAATAGATTTA-TTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * ** *
17157575 AAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATAAAAACAA
130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGATAA
* * * * *
17157627 AAACATTTGTTTTATGACAAAACATAGGGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * ** * * * ** *
17157692 CATAATTATATGAACTGGTT-AGGTAAACAGAACTACTTTTTAAATCTCGTAAACAAAACT-ATT
66 CATAACTATTTGAATTGATTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTC-T-TAC-TTATTAATT
* * * * * *
17157755 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAGATTCATTTT-ATATTA--TTCCGAA
127 TTTGAAA-----TA-TTAATAA---ATT-AGTATT-AT---TTTATTTTGA-ATAAGCTT--G--
* * *
17157817 TAAGCTAG
173 TATGATAA
* ** ** ** * * ** *** *
17157825 TATGAATTGAAATTTT-TGTTTTATGACAAAA---CAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAA
1 AAACAATTG---TTTTATG--ACAAAACAAAAGGTCATAACG--AT-TTGAAAT-AGATA----A
* * * * * * * * * * * **
17157886 TTGTTCATATAATCTTAATTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGG
53 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTAC
* * * * * * * *
17157951 TTATTAATTTTTTAAAAATTATTAGATTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAG
118 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GATAA
* * * * * * * * * * *
17158015 AAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAA-GAATTTGAAGTATACAGTTGTTTAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * *
17158079 TCATAATTATTCAAATTGGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAA-AT-AT-CTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* *
17158140 GAAAAATTAATAAATT-GATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAA
130 GAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT-AA
* * * * * * *
17158192 AAACAATTGTTATAT-AGCCAAACAAAAGATAATAACGGTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
17158256 CCATAATTATTTGAACT-AATC-GCTAAACAGATTCA-CTTTTTAA-ATC--ACTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAATTGATTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * ** * *
17158315 TGAAATTTTAATAAATTACTATTTTTTTATTTCAAATAAACTTGTATGA-ACTG
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA--A
* * * * * * * * *
17158368 AAATAATTTTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
17158433 CATAACTATTTCAATTTG-TTCTA-TAAA-A-AATT-TGTTTTTAAACTATTGCTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGAA-TTGATTC-AGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * *
17158493 CAAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAGCT-A
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA--TAA
* * * * *
17158546 AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * ** * * *
17158611 CATAATTATTTAAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTCAAATTTTTTGCTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
* * * * *
17158675 TG-AATGTTAA-AAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGATATA
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-A
* * * * * * * * *
17158726 AAACAAATATTTTATGACTACACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAAAATTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * ** * * * * **
17158791 TTTAACTATTTGAATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA
66 CATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
17158856 AAATATTATTAAATTAGTATTGTTTT-TAATCGAATAAGCTTCTATGATTAGA
131 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGA-TA-A
* **
17158908 AAA-AATTGTTTTAT-----------A-G------CGATTTGAAATATATAATCATTCAAATGA-
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AG
* * * * * * ** * * * *
17158953 TCATAATTATTTTAACTGAGTT-GGTAAACAAATTTA-TTTTAAAATTTTTTACTTAATAATTTA
65 TCATAACTATTTGAATTGA-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * * * * *
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129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTA-T-GATAA
* * * * *
17159069 AAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
17159134 -ATTAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTT
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* * * * * *
17159196 TTG-AATGTTAGT-AATTAGCATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ACTA
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* * * * * *
17159248 AAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ** * *
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* * * ** *
17159376 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTGAATTCAAATAAGCTTGTACGA-ACA
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* ** * ** *
17159428 AAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAACATCATAACGATTTGAAAT-GATTATCATTCATATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ** * * ** *
17159492 CTTAACTATTCGAACTGGTTC-GCGATTAGATTT-TTTTTATT--T-TTTTGGTTATTAAGTTTT
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* * ** ** * *
17159552 -AGAATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTTCAAATAAAATAGTAT-AAACA
130 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-A
* ** * * * * * *
17159603 AAATCAATTGTTTGACAATAAAATAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATA
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
17159969 TATTCTATTCCAA--TTAAGCT-TGTCTGAGC
159 T-TT-GAAT--AAGCTT--G-TATG-AT-A-A
* ** * * * * * * *
17159998 TAA-AATAATTGTT-TTATAACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTATA
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* * * ** * * **
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
17160246 TATAATTATTTGAAAT-AGTT-AGGTAAACAGATTTATTTGTTAAATCTCTTAC----TAATTCT
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* * *
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* * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
17160535 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTTATATAGATAATTGTTTAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
17160600 CATAACTATTTGAACTT-TTTCATTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTT
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***
17160664 TTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT-A-AA
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* * * * * * * * *
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1 ---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
17160958 CATAACTATTTGAACT-AGTT-TGAAAAGCAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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**
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Statistics
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0.72 0.17 0.11
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** * **
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* *** * ** *
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* * * *
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* *** * *
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* * **
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* * * * **
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** * *
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** * * *
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* * *
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* * * * * *
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252 TTCTTGAAAT-ATAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATT
* * *
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* * *
17153403 ATAATTATTCTAATAGTCTAACTTTTTGAACTGGTTGGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC-
1 ATAATTATTCAAATAGCCTAACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCT
* * ** *
17153467 T---TATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATG-A
66 TACCTATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * ** * ** *
17153527 TAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTCAAATTGATATCTGTTCAAA
130 T-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAAAGATAACTGTTCAAA
* * * * * * *
17153591 TAGTGATAACTA-TTGAACTGGTTTG-GAAACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT
194 TAGTCATAACTATTTGAATTAGTCTGATAAACAAATTTAATTTTTAAA---C--GCTTATTAATT
* * * * * ** ** * ** * *
17153654 TTTCAAATATTGGTAAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAAGTAAAATAATTGT
254 CTTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATTAT
* * ** * * *
17153719 TTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACAACTTT-AAATAT
318 TATAAGACAAAACAAAAAGTAAGAACAA-TTTGAAATAG
** * * * * * *
17153757 ATAATCT-TTCAAATATTCAAATCTATTTAAACTTGTTTA-GTAAACAGATTTATTTTTTTAAAT
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* * * *
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* * * * * * * * * * ** * ** *
17153871 GTGAACTA-AAATAATTGTCTTGTAACTAAAGAGAATGTTAGAACGATTTGAAATAGATAGTTAT
125 ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAAAGATAACTGT
* * * * * ** * * * *
17153935 TCTAATAGTCTTAATTATTTGAACTAGTTTG-GCAACATA-TTATTTTTTAAA-TC-TATTACTT
189 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTCTGATAAACAAATTTAATTTTTAAACGCTTATTAATT
* * * * * * * * *
17153996 ATT--AATATTATTAAATTAGTATTATTGTAATAT-GAATAAACTTGTATGAA-AAGAAACAATT
254 CTTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATT-TTATTTCAAATAAGCATATATGAACAA-AAACAATT
* * * * * * * * ** *
17154057 GTTTTATGATAAAATAAAGA-TCATAATGATTTGAGATAG
316 ATTATAAGACAAAACAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
* * * * * * * *
17154096 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC
1 ATAATTATTCAAATAG-CCTAACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * ** * * ** ** ** *
17154161 -T---TGTTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAGCACTATTTT-TTTTGAATAATTTTACATGGA
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* * * * * * * * *
17154221 CAAAAACTATTGTTTTACAA-TAAA-AAAATGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA
130 TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAAAAGATAACTGTTCAAA
* * * * * * * * *
17154283 TGGACATGATTATATGAACTT-GT-TCGATGAATAAATTTATTTTTTAAACTCTTACCTATTAA-
194 TAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTCT-GATAAACAAATTTAATTTTTAAACGC-T---TATTAAT
* * * * * * * * * * * *
17154345 T-TTCACACTATTAATAAATTAGTATTATCTTATTCCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATT
253 TCTTGA-AATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATT
* * * * * * ** *
17154409 ATTTTATGACAAAAGAAAAAATCATAACTTTTTGAAATAA
316 ATTATAAGACAAAACAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
* * * * * * **
17154449 ATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGCTT-GGTAAACTGATTTATTTTTTAAA--T
1 ATAATTATTCAAA-TAGCCTAACTTTTTGAAC-TGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCT
* * ** *
17154511 C-T---TATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGA
64 CTTACCTATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * ** * *
17154572 ATAGAAACAATTGCTTTATGACGAAACGAAAGGTCATAACT-CTTTTAATTAGATAATTGTTTAA
129 ATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAAAAGATAACTGTTCAA
* * * * **
17154636 ATAGTCATAACTATTTGAA-CATGT-TCA-AAAAAGAGATTTATTTTTTAAATTATTACTTATTA
193 ATAGTCATAACTATTTGAATTA-GTCTGATAAACA-A-ATTTAATTTTT-AA--A-CGCTTATTA
* * ** * * * *
17154698 ATT-TTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCGTTTATGAACAGAAATAA
251 ATTCTTGAAATA-TAGTAAA-TTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAA
* * ** * * * *
17154761 TTATTTTATA-ACAAAACAAAATGCCATAGCGATTTGAAATAT
314 TTATTATA-AGACAAAACAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
* * * * ** * * * * * *
17154803 AAAATTATTCAAATAGTCATAACTATCTGAACTTATTTGGTAAATAGATTCATTTTTAAAATCTC
1 ATAATTATTCAAATAG-CCTAACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * ** ** * *
17154868 TTA-CTCATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGA
65 TTACCT-ATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * ** * * * *
17154932 ACT-GATACAATTGCTTTATGATGAAACAAAATGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTATTCA
129 A-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATA-ATTTGAAAAAGATAACTGTTCA
* * * *
17154995 AATAGTTATAACTATTTGAACTT-GT-TTAGTAAACATATTT-ATTTTTAGAATCTTTTACTTAT
192 AATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTCTGA-TAAACAAATTTAATTTTTA-AA-C----GCTTAT
* ** * * * * * * *
17155057 TAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAATTAAGCTTGTATGAATAAAAAC
249 TAATTCTTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTC-AAATAAGCATATATGAACAAAAAC
* * * * *
17155121 AATTATTTTATGAC--AA-AAAAA-T-TGCAACAATTTAAAATAA
312 AATTATTATAAGACAAAACAAAAAGTAAG-AACAATTTGAAATAG
* * * * * ** * * *
17155161 ATAATTATTCAAATGGTCATTACTATTTAAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-T
1 ATAATTATTCAAATAG-CCTAACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTT-AAATCT
* ** * * *** * * *
17155225 GTTTATATATTAATTGTT-TGAATATTAATAAATTTGT-TTAATTTTAATTGAAATAATCTTGTA
64 -CTTACCTATTAATT-TTGAGAATATTACTAAAGGAGTATT-ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA
* * * * *** * * *
17155288 TGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAGACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGGTAACTATTC
126 TGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAAAGATAACTGTTC
* * * ** **
17155353 AAATAGTCATAACTATCTGAACTT-GTTCT-ATAAATAGATTCGATTTTTAAATATCTTTATTAA
191 AAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAG-TCTGATAAACAAATTTAATTTTTAAA-CGC-TTATTAA
* ** * * * * * * *
17155416 TTTTTGAAATACTAAG-AAATTAGAATCATGTTA-TTCTGAATAAGCTTGTA-CAATAAAAACAA
252 TTCTTGAAATA-T-AGTAAATTACTATTATTTTATTTC-AAATAAGCATATATGAACAAAAACAA
* * * * * * *
17155478 TTATTTTCTA-ACAAAACCAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
314 TTATTAT-AAGACAAAACAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
* * * * * * ** * * * * * * * *
17155520 ATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTT-ACATTAATCAGACCAATAGATTCATTATTTAGATC-
1 ATAATTATTCAAA-TAGCCTAACTTTTTGA-ACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCT
* * * * ** * * * *
17155583 CATTACTTATTAATTTTTATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTA-TTCTGAATAAGAC-TATA
64 C-TTACCTATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTATTTC-AAATAAG-CTTGTA
* * * * ** * * *
17155646 TCAATAAAAACAATTGTTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATAACGATTT-AAAATAAATAATTATT
126 TGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAA-AGATAACTGTT
* * * * * * * *
17155708 CAAATTGTTATAACTAGTTGAATTGGT-TTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAC-CTTTTATTAA
190 CAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTCTGA-TAAACAAATTTAATTTTTAAACGC--TTATTAA
* * * * * ** * * * * *
17155771 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTCTTTTATTTTGAACAAACTTATATGAATACAAAC-ATT
252 TTCTTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATT
* * * * * ** *
17155835 TTTTTACA-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAG
316 ATTATA-AGACAAAACAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
* * * * * *
17155875 ATAATTATTCATATAGCTTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTATTCAAATAGC-CTAACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
* ** * *** * ** **
17155940 ATAGTTAGTAATTTTCCTAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
65 TTACCTATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * ** * * * *
17156005 CATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATACATAATTGTTTAAAT
130 TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAAAGATAACTGTTCAAAT
* ** * * * * ** *
17156070 AGTTATAACTAAATGAACTGGTTTGATAAATAGTTTTATTTTTTAAATTTC-CTACTCATTAATT
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* * * ** * * * * ** * *
17156134 TTTGAAAAATTA-AAAATTGGTATTATTTTATTCCAAAGAGGCTTATATGATGAACAACAATTGT
254 CTTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATTAT
* * * * **
17156198 TTTATA-ACAAAA-TAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAG
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* * * * * * **
17156236 ATAATTGTTTAACTGGCCATAA----TTAAACTGATTCA-ATAAACTA-ATTTATTTTTT-AATC
1 ATAATTATTCAAATAGCC-TAACTTTTTGAACTGGTT-AGGCAAAC-ACATTTATTTTTTAAATC
** * * * * * * * *** * *
17156294 TCCAACTTCTCAACTTTTGA-AATTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTAT
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* * * * *
17156358 GAATTGAAACAATTGTTTTATTA-TAAA-AAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCA
127 GAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAAAGATAA-----C-
* * * * * * *
17156421 AATGTTCAAATAGTCTTGACCATTTGAATTTGT-TCAGTAAAC-AATTT-TTTTTTAATTTCTTG
186 --TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTCTGA-TAAACAAATTTAATTTTTAA--AC--G
* * * * * * * * * **
17156483 CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGA-TAGTGTTACTTTATTTCGAATAAGCATGTATGAATT
244 CTTATTAA-TTCTTGAAAT-ATAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACA
* * * * **
17156546 GAAACAATTATTTTATGACTAAAC-AAAAGATCAA-AATGATTTGAAATAG
307 AAAACAATTATTATAAGACAAAACAAAAAG-T-AAGAACAATTTGAAATAG
* * * * * * *
17156595 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATACATTTATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTATTCAAATAG-CCTAACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
** * **** * * * * * *
17156660 TTAGTTATTAATTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAACTTGTACGAA
65 TTACCTATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * * *
17156724 CAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAA
130 TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAA-AAAGATAACTGTTCAAA
* * * * * ** *
17156787 TAGTTATAACTATTTGAACTGGTCT-AGT-AA-TAATTTAGTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTT
194 TAGTCATAACTATTTGAATTAGTCTGA-TAAACAAATTTAATTTTTAAA-CGCTTATTAATTCTT
* * * *** ** * * *
17156849 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTT-GAATAATTTTGCATAAATAAAAA-AATTATTTT
257 GAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATTATTAT
* * ** *
17156911 ATGACAAAACAAAATGTCAA-AATGATTTGAAATAA
321 AAGACAAAACAAAAAGT-AAGAACAATTTGAAATAG
* * ** * * * ** * * * * *
17156946 ATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATTCACTCA-GTAAATAGATTTATATTTTAAATCT
1 ATAATTATTCAAATAG-CCTAACTTTTTGAACT-GGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCT
* * * * ** *
17157010 TTTACTTATTAATTTTTG-GAAAATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCA
64 CTTACCTATTAA-TTTTGAGAATATTACTAAA-GGAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTA
* * * * * ** *
17157072 TGAACA-AAACCAATTGTTTTCTGACAAAAAAAAAGGTCATTATGTTTTGAGACAAAGCAAAAGG
126 TGAATAGAAA-CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGA-A-AAAG-ATAA--
* * * * * ** * *
17157136 TCATTGTTTAAATAGTAATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAACAGATTCTTTTTTTTAATTCT
185 -C--TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTCTGATAAACAAATT-TAATTTTTAA-ACG
* * * * ** *
17157200 CTTACACATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGA
244 CTT----ATTAATTCTTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGA
*** * * ** * * *
17157265 ATTGAAACAATTGTTTTACTACAAAAGAAAAGGTCAA-AATAATTTGAAATAG
304 ACAAAAACAATTATTATAAGACAAAACAAAAAGT-AAGAACAATTTGAAATAG
* * * ** * * * *
17157317 AAAATTACTT-AAATAGCCAAGACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATAGTTATTTTTTAAATCT
1 ATAATTA-TTCAAATAGCCTA-ACTTTTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * ** * * * * *
17157381 TTTACTTATTAATTGTCAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATATGCTTGTATGA
64 CTTACCTATTAATTTTGAGAATATTACTAAAGGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * *
17157446 ACAAAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA-ATAATTGCTCAA
129 ATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAA-AAGATAACTGTTCAA
* * * * * * *
17157510 ATAGTTATAACTATTAGAACTT-GAT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTT
193 ATAGTCATAACTATTTGAA-TTAG-TCTGATAAACAAATTTAATTTTTAAA-CGCTTATTAATTC
* * * * * * * * ** * *
17157573 TTAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATAAAAACAAAAACATTTGTT
255 TTGAAATA-TAGTAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACAAAAACAATTATT
* * * ** * * ** *
17157638 TTATGACAAAACATAGGGTCATAATGACTTGAAATAG
319 ATAAGACAAAACAAAAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
* * * * * ** *
17157675 ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TTATATGAACTGGTTAGGTAAACAGAACTACTTTTTAAATCT
1 ATAATTATTCAAATAG-CCTAACTT-TTTGAACTGGTTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCT
17157739 C
64 C
17157740 GTAAACAAAA
Statistics
Matches: 3872, Mismatches: 915, Indels: 531
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
334 4 0.00
335 1 0.00
336 2 0.00
337 1 0.00
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* * * * * * *
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* * *
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** * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** *
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* * * * * * * ** ** * * *
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* * * * * *
17154225 AACTATTG-TTT-T-ACAATAAAAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGA
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* * * * * * *
17154287 CATGATTATATGAACTTGTTCGATGAA-TAAATTTATTTTTTAAACTCTTAC
130 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA---TT-C
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17154402 AACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAAATCATAACTTTTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATC
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*
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* * *
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* **** **
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* * *
17154692 TTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCGTT-TATGAACA
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* * * * * * * * * *
17154754 GAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAATGCCATAGCGATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAG
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* * * *
17154819 TCATAACTATCTGAACTTATTTGGTAAA-TAGATTCATTTTTAAAATCTC
129 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * *
17154868 TTACTCATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAA
1 -T--T-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
* * ** * ** *
17154933 CT-GATACAATTGCTTTATGATGAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
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* *
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126 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-TGATTTATTTTTTA-AA----TT-C
* * * * * * *
17155053 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAATTAAGCTTGTATGAATAA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGAATAG
* ** * * * * *
17155117 AAACAATTATTTTATGACAAAA-AAATTG-C--AACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATGGT
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* * * * ** *
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* * *
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* * * * * * * * * *
17155292 TAGAAAAAATTATTTTATAACAAGACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGGTAACTATTCAAAT
62 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * *
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* * * * * *
17155408 TTTATTAATTTTT-GAAATACTAAGAAATTAGAATCATGTTA-TTCTGAATAAGCTTGTA-CAAT
1 -TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * *
17155470 AAAAACAATTATTTTCTAACAAAACCAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACA
63 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** ** * *
17155535 ATCATAACTATTT--ACATTAATCAG-ACCAA-TAGATTCATTATTTAGATCCATTAC
128 GTCATAACTATTTGAAC-TTGTTTGGTA--AACT-GATTTATTTTTTA-A---ATT-C
* * * * *
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* * * * * * *
17155652 AAAACAATTGTTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATTG
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
17155715 TTATAACTAGTTGAA-TTGGTTTAGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAACCTT-
129 TCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA--TTC
* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * ** **
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* *** * *
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62 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** * * *
17156070 AGTTATAACTAAATGAACTGGTTTGATAAA-TAGTTTTATTTTTTAAATTTCC
127 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA-TT-C
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * * * * *
17156660 TTAGTTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAACTTGTACGAAC
1 TTA-TTA--ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * *
17156725 AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAA
63 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
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126 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
** * *
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* * * * * *
17156898 AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCA-AAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAG
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** ** *
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129 TCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * *
17157015 TTATTAATTTTTGGAAAATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAACA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * *
17157078 -AAACCAATTGTTTTCTGACAAAAAAAAAGGTCATTA-TGTTTTGAGACAAAGCAAAAGGTCATT
64 GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGA-A-ATAG----A--TAATT
* * * ** * * *
17157141 GTTTAAATAGTAATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTCTTTTTTTTAATTCTC
119 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATT-TATTTTTTAAAT-TC
* ** * *
17157201 TTACACATTAGTTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGA
1 TT----ATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
17157265 ATTGAAACAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCA-AAATAATTTGAAATAGAAAATTACTT-
61 ATAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATT-GTTC
* * * *
17157327 AAATAGCCA-AGACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAT-AGTTATTTTTTAAATCTTTTAC
123 AAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-TGATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * * * * * * *
17157386 TTATTAATTGTCAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATATGCTTGTATGAACAAA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * * * *
17157451 AACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTT
66 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * *
17157516 ATAACTATTAGAACTTGATTGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTC
131 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * * ** * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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130 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * ** ** * ** * *
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1 TTATTAATTTTTAGAA-TA-TTAATAAAT-TAGTA-TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
** * ** ** * * * * *** *
17157792 TAGATTC-ATTTTATATTATTCCGAATAAGCTAGTATG-AATTGAAATTTTTGTTTTATGACAA-
62 TAGAAACAATTGT-T-TTATGAC-AA-AA-C-AAAAGGTCA-T-AACTATTTGAAATA-GATAAT
** * * * * * * *
17157854 --AACAAA-AGGTCATAACGT-TTTAAAATAGATAATTGTTCATA-TAATCTTAATTATTTGAAC
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*
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** * ** ** * *** * * * *
17157920 GGCA-AACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTT-TTT--AA-AA-ATTAT-TAGA
1 -TTATTA-ATTTTTAGAATATT-AATAAATTAG-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GA
* **** * * ** ***
17157977 TTAG-TGTTATT-TTATT-TCGA-ATAAGCTTGTATAAATAGAAATAA-T-TTTTTTAT-GAT-A
61 ATAGAAACAATTGTT-TTAT-GACA-AAAC----A-AAA-GGTCATAACTATTTGAAATAGATAA
** * ** * * * * * *
17158034 --GAACAAA-AGGTTATAAGAATTTGAAGTATACAG-TTGTTTAAA-TGGTCATAATTATTCAAA
117 TTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACT-T---GTTTG-GTAAACTGAT--TTATTTTTTAAA
*
17158094 TTGG
174 TT-C
* * * ** ** * *
17158098 TTCAGTAA---ATAGATTTATTTTTTAAATATCTTATTAATTTTTGAAAAATT--AATAA-ATTG
1 TT-ATTAATTTTTAGA-ATA-TTAATAAAT-TAGTATT-A-TTTT----ATTTCGAATAAGCTTG
* * ** ** * * * * * * ***
17158157 ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAA-AACAATTGTTATATAGCCAAACAAAAGA
56 -TATGAATAGA-AAC-AAT-TG-TTTTATGACAAAACAA-AA-GGTCATA-A--C---TATTTGA
* * * * ** * * *
17158221 TAATAACGGTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TAATCGCTAAACA
108 -AAT-A------G------ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT
* * *
17158285 GATTCACTTTTTAAATCAC
159 GATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * *
17158304 TTATTAATTTTT-GAAATTTTAATAAATTACTATTTTTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACT-
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * * * * *
17158367 GAAATAATTTTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAA-TGATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATA
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * *
17158431 GTCATAACTATTTCAATTTGTTCT-ATAAA-AAATTTGTTTTTAAACTATTGC
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAACTGATTTATTTTTTAA--ATT-C
* * * * * * *
17158482 TTATTAATTTTCAAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAGCTA-
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAG
* * * * *
17158546 AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** *
17158611 CATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTCAAATTTTTTGC
130 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * *
17158663 TTATTAATTTTTTGAATGTTAA-AAATTTGGATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTAAGATATA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA-ATA
* * * * * * * *
17158726 -AAACAAATATTTTATGACTACACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGAAAATTATTCTAATA
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * **
17158789 GTTTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
128 GTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * * * *
17158843 TTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTGTTTT-TAATCGAATAAGCTTCTATGATTAG
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * **
17158907 AAAAAATTGTTTTAT-----------A-G------CGATTTGAAATATATAATCATTCAAATGA-
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AG
* * * ** * *
17158953 TCATAATTATTTTAAC-TGAGTTGGTAAACAAATTTA-TTTTAAAATTTT
129 TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAA-TTC
* * * * * *
17159001 TTACTTAATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAACTTGAATTA
1 TTA-TTAAT-TTTTA-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
17159065 GCT-GAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAA
61 -ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* *
17159129 ATAAT-ATTAACTATTTGAACTTGTTTGATAAA-TAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTC
125 ATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA-----TTC
* * * * * *
17159185 TTATTAATTTTTTGAATGTTAGT-AATTAGCATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * *
17159248 -AAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATA
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
17159311 GTCTTAACCATTTGAAC-TGATTCGATAAAC-GAATTTATTTTTAAAATCTC
128 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACTG-ATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * * *
17159361 TAACTT-ATTAATTTATGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTGAATTCAAATAAGCTTGTACGA
1 TTA-TTAATT--TTTA-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA
* * ** * * ** *
17159425 ACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAACATCATAACGATTTGAAAT-GATTATCATTCATA
61 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * ** ** **
17159488 TAGTCTTAACTATTCGAACTGGTTCGCGATTAGATTTTTTTTATTTTTT---TGG
126 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG-G--TA-AACTGATTTATTTTTTAAATTC
* * * * ** * * *
17159540 TTATTAAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTTCAAATAAAATAGTATAAACA-A
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA
* ** * * * * *
17159604 AATCAATTGTTTGACAATAAAATAAAAGGTTATAA-TGTTTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATA
66 AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* * * * * ** * *
17159667 GTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAAATTTACTTTTTAAAACTC
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTA-TTTTTTAAATTC
* * * * * *
17159717 GTACTAGTTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTGGTGTTATTTTATTTTGAACATA-CTTATATT
1 -T--TA-TTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATG
* * * * * * * * *** *
17159780 AACAAAAATAATTGTTTTATGAC-AAACTTATA-TTAACAAAAACCATTGTTTTATGGCA-AA--
60 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGT--C-ATAACTATT-TGAAATAG-ATAATT
* * * * * * *
17159840 -AT-AAAAAGTAATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-T-AGTTATAATTTTTTGAA--
119 GTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG-T--TTGGT-AAACTGA-TT-T-ATTTTTTAAATT
17159898 C
176 C
*** ** * *
17159899 -TAGTTCAATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATT--AATAA
1 TTA-TT-AATTTTTAGAA-TA-TTAATAAA----TTA-GTAT-TA-TTTT---AT-TTCGAATAA
* * * * ** ** * * * ** * * * **
17159961 -ATTAGTCTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTCTGAGCTAAAATAATTGTTTTATAACAAAAT-A
51 GCTT-GTATGAATAGA-AACAATT--G-TTTTATGA-C-AAAACAAAAG-GTCATAACTATTTGA
* * ** * * ** * * * * * * *
17160024 AA-AGGTCA-T-AACAATTTGAAATAAATAATTG--TTTATATAGTCTTAACT-ATTTGAACTGG
108 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TTG-GTAAACTGATTT--A-T--
** **
17160083 TTTGGCAAATAG
166 TTT-TTAAATTC
* * * * * ** ** * * * * * * *
17160095 AT-TTATTTTTTA-AATCTCTTGGTTATTAATTTTTAGAATTTTA-CT-AAATTAGTATTCTTTT
1 TTATTAATTTTTAGAA--T-AT--TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATG
* * * ** * * * *
17160156 ATTATG-AATAA--GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAATA
60 AATA-GAAACAATTG-TTTTATG-AC-AAAACAAAAG----GTCATA-ACT---A--TT-TGA-A
* * * * * * * * * *
17160218 ATTTGAAATAGATAATTATTAAAATGGTTATAATTATTTGAAATAGTTAGGTAAACAGATTTATT
109 A--T---AGA--TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATT
*
17160283 TGTTAAATCTC
167 TTTTAAAT-TC
* * * * * *
17160294 TTACTAATTCTT-GAAATGTTAATAAAGTA-TAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-TTG
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-
* * * * *
17160356 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAAT-
63 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *** *
17160420 GACCATAATTATTT-AAATAGATTCAATAAATTGATTTTATTTTTTAAATCTTTTAC
128 G-TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACTGA-TTTATTTTTTAAA----TT-C
* * *
17160476 TTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAAGTAGTA-T-TTTT-TTT-G-TTAAGCTTTTATGAACTA
1 TTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * *
17160535 -AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAA-TGATTTTATATAGATAATTGTTTAAATA
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** *
17160598 GTCATAACTATTTGAACTT-TTTCATTAAA-TAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGC
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAACT-GATTTATTTTTT-AAA--T--T-C
* * * *
17160653 TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACT-G
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * * * *
17160717 AAACCATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* **** **
17160781 TCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
129 TCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
** * * * * *
17160830 TCGTTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTTATTT-GAATAGGCTTGTATGATTA-
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * * *
17160893 AACACAATTGTTTTATGAGAAAA-AAAAGATTATAACGATTTGAGATTGATATTTGTTGAAATAT
65 AA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
17160957 TCATAACTATTTGAACTAGTTT-GAAAAGCAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGC
129 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-CTGATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * * * *
17161010 TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAGAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATAAACT-
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * *
17161073 GAAACAATTGTTTTCTAACAAAACAAAA-GTCATAA-TGACTTT-AAATAGATAGTT-TTC-AAT
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
*
17161133 AGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTTAAA-TC
127 AGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTA-TTTTTTAAATTC
** * ** * * * * *
17161183 TT-TTGCTTATT--AAT-TTTTTGAA-T-GCTA--A--TAAATTAGTATAAGCTTGTATGAA-AT
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-
* * * * *
17161237 GAAA-TATTG-TTTATGACTAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAG
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * **
17161299 TCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAGACACATTTATTTTTTAAATCTC
129 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
* * ** * * *
17161348 TTACTTACTAATTTTTGGAATTTTCTTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA
1 TTA--T--TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
17161413 AAGAAACAATTATTTTATGACAATA-AAAA--TCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTCAAAT
62 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
17161475 AGTAATAACTATTTGAA-TTGTTTCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC
127 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * * * * ** ** *
17161526 TTATTAATTTTTAAAATATTTTGGATAATTTTGCATGAATAGA-AAC-AATTAG-TT-TATGACA
1 TTATTAATTTTTAGAATA--TT-AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--A
* * * * * ** * * *
17161587 AAACAAAAGGCCATAATGATTTGAACTAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTT-AAACT--
61 ATA-GAAA---CA-ATTG-TTT-TA-T-GACAA---AACAAAAGGTCATAACTATTTGAAA-TAG
* * * * * * * ** *
17161649 -TATTTAG-T-AAATAG--ATTTATTTTTTAAATCTCCTATCTATTAAA-T--TTTAGAATATTA
113 ATAATT-GTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAA-CT--TGTTTGGTAAACTGATTT---AT-TTT
* *
17161706 ATAAATTA
169 TTAAATTC
* * * * * * ** * * *
17161714 GTATTATTTATTCTAAATAAACTTATGTGAACATAAACAATTGTTTTATGAT-GAAATAAAAGAT
1 TTATTAATT-TT-TAGA-ATA-TTA-AT-AA-AT-TAGTATTATTTTAT-TTCG-AAT--AAGCT
** * * ** * *
17161778 CATAATTATATA-AAATAAATAATTGT-T--C-AAAC---A-GTCATAACTATTTGAACATA-CT
54 TGT-ATGA-ATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA-ATAGAT
* * * * * * * * * * *
17161833 --TT-AT-AAACAAT--TTA-TTTTTTAA-TT-TTT--T-TACTTATTAATTTTTGAAA-TA
115 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAATTC
* * * * * * ** ** * * *
17161882 TTAATAA--ATTAGTATAATT--TTATTTCA--AATATGCTGGTACGAACAGAAACAATTGGT-T
1 TTATTAATTTTTAGAAT-ATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCG-A-ATAAGC--TT-GTAT
* ** * * **** * * * * *
17161940 -AATGACAAAGCAAAAG-GTCATGA-ATATTTGAAA--TAAATAATTA-TTCAAATCATCATAAC
59 GAAT-AGAAA-CAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGT-CATAACTATTTGAAAT-A-GATAAT
* ** * * * * * ** *
17161999 TATTTGAATGTGTTCAAAAAACAAATT-AA-TT-TTT-G-AAA-T-TTTTGCTTATT-AATT-
118 TGTTCAAAT-AG-TC--ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAATTC
* * * ** * * * *
17162053 TT-TGAAATATT--AATA--AATTTA-TATTA-T-TT-TA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAACAT
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAG
* *
17162108 AAACAATTATTTTATGGCAAAACAAATA-GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
17162171 GTCATAATTATTTCAACTTATTCGATAAAATAGA-TCATATTTTAAATCTCC
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAAT-T-C
* * * * * * * *
17162222 TACTCAATAATTTTT-GAAATATTAATTAATTACTATTATTTTATTTCAAAGAAGCCTATAAGAA
1 T--T-ATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
17162286 TTGATACAATTATTTTATGACAAAACAACAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
62 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * ** *
17162350 TAGTTATGACTATTTGAACTT-TTTCCATAAACAT-ATTTATTTTTAAAATCTTTTAC
126 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAAC-TGATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * ** *** * *
17162406 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAACCCGAATAAGCTTGTATAAATAAA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * *
17162471 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATC
66 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
17162536 ATAACTATTTGAACTTATTTAGTAGAC--ATATTCTTTTTTAAATCTTTTAC
131 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGAT-TTATTTTTTAAA----TT-C
* * * *
17162586 TTATTAATTATCT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
1 TTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-A-T-TTC-GA-A-T-A-AGC--TT
* * * * *
17162650 CGAATAAGCTTGTATGATAAAAAACAGTTGTTTTATAATAAAACAAATGGTCATAA-TGATTTGA
55 -G--T-A---TG-A--AT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGA
** * * * * * ** *
17162714 AATAGATAATTGTTTGAATGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTCGGTAAACAAATATATTTTTTA
108 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACTGATTTATTTTTTA
17162778 AATCTC
172 AAT-TC
* * *
17162784 TTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTATATTTC-ATATAAGCTTGTATT
1 TTA-TTA--ATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATG
*** * * * *
17162847 AACTA-AAAC-A-------A--A-AGGTCATAA---C--AA-T-TTT-AAATATACAATTTTTCA
60 AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
17162892 AGTAGTAC-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATTAATTTATTTTTTAAATCTC
124 AATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * * * *
17162946 TTTTTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTGA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * *
17163010 AACAATTGTCTTATGACTAAAA-AAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAGTAGT
66 AACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * * *
17163074 TTTAACCATATGAA-TTCGTTTAGTAAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
130 CATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * *
17163126 TTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAACA-
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *** *
17163189 AAA-AATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATTGATAACCATTCATATAG
65 AAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
17163253 T-ATTGACTATTTGAACTGGTCTAGG--AATTAGATTTATTTTTTTAATTTTC
129 TCA-TAACTATTTGAACTTGT-TTGGTAAACT-GATTTA-TTTTTTAA-ATTC
* * * * * ** *
17163303 TTGGTTATTAA-GTTTCGAAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTA-TTCTAAATAAAATAGTATG
1 ----TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
17163366 ACTAGAACCAATTGTTTGATGACAAAA-AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
60 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* ** ** *
17163430 ATAGTCAAAACTATTTGAAAATGTTTGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATCTC
125 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * *
17163483 TTACTAATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AACCAAACCTATATG
1 -T--T-ATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATG
* * * * * *
17163546 AACAAAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAAC-AATTGAAATAGATAATTGTTCAA
60 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * **
17163610 ATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTTGGTAAA-TAGAATT-TTTTAAAAATCTCTTCC
125 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA----TT-C
* * * * * * * **
17163666 TTATAAAATTTT-GAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTTTTTCCAAATAAACTTGTGCGAACT
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-CGAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * * *
17163730 -GAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGTTAATTGTTTACATA
63 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
17163794 GTCTTAACTGTTTGAACTAG-TTCG-CAAGTAGATTTAATTTTTAAATCTC
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAAT-TC
* * * * * ** *
17163843 TTAGTTAGAATTTTTAGAATATTATTAAACTAGTAATATTTTATTCCAAATAAATTTGTATGAAC
1 TTA-TT--AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * ** * * ** *
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** * * *
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* * ** *
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1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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** * * ** * ** * *
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* * * * *
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* * * ** * ** * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * *** **
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** * * * ** *
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* ** * * ** *
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** * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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** *
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* ** * **
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* * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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** * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * *** *
17158455 ATAAA-AAATTT-GTTTTTAAACTATTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAAGAAATTAGTATTAT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
17158518 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAGCTAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACA
66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAACG
* * * * *
17158583 ATTTTAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTG
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * *
17158633 GTAAACAAATTTATTTTTCAAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAA-AAATTTGGATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
17158697 TTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTAAGATATAAAACAAATATTTTATGACTACACAAAAGGTTATAA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * ** * *
17158761 TGATTTGAAATAGAAAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAA-TTGGTTTG
128 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GTTCG
* * * *** * *
17158813 GCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTG
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
17158878 TTTT-TAATCGAATAAGCTTCTATGATTAGAAAAAATTGTTTTA--T---------A-G------
65 TTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAA
* ** * *
17158924 CGATTTGAAATATATAATCATTCAAATGA-TCATAATTATTTTAACTGAGTT-G
128 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAATTATTTGAACT-TGTTCG
* * * * * **
17158976 GTAAACAAATTTA-TTTTAAAATTTTTTACTTAATAA-TTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * *
17159039 ATTTTA-TTCCATCTAAACTTGAATTAGCTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATA
64 ATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATA
* * * * *
17159103 ACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAAT-ATTAACTATTTGAACTTGTTTG
127 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAATTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * * *
17159156 ATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAGT-AATTAGCATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** * *
17159219 ATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * **
17159283 TGATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAC-TGATTCG
128 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCG
* * * ** * *
17159335 ATAAACGAATTTATTTTTAAAATCTCTAACTTATTAA-TTTATGAAATATTATTAAATTAGTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * ** *
17159399 ATTTGAATTCAAATAAGCTTGTACGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAACATCATAAC
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAAC
* ** * * * * *
17159464 GATTTGAAAT-GATTATCATTCATATAGTCTTAACTATTCGAACTGGTTCG
129 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
** * *** * * * * *
17159514 CG--ATTAGA-TT-TTTTTTATTTTTTTGGTTATTAAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTA
1 -GTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * * * * ** *
17159575 CTTTATTTCAAATAAAATAGTATAAACAAAATCAATTGTTTGACAAT-AAAATAAAAGGTTATAA
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAA-CAATTGTTTTA-TGTCAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * * * * *
17159639 TGTTTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTG
128 CGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * * * * *
17159691 ATAAGCAAATTTACTTTTTAAAACTCGTAC-TAGTTAATTTTCTAAATATTAATAAATTGGTGTT
1 GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAACTCTTGCTTA-TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
17159755 ATTTTATTTTGAACATA-CTTATATTAACAAAAATAATTGTTTTATGAC-AAACTTATATTAA--
64 ATTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAAC--A-A--AAGG
** * * *** * * * * * * * *
17159816 CAAAAACCATTGTTTTATGGCA-AA---AT-AAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTG
122 TTATAACGATT-TGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-T--TCG
* * * * * * * * *
17159874 TTCAAA-TAGTTATAATTTTTTGAACTAGTT-CAATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACT
1 GT-AAACAAATT-T-ATTTTTTAAACT-CTTGC--T-TAT-TAA-T-TTTT-TGAA--TATTA--
* * * * ** *
17159937 TATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTCTTATTCTATTCCAA--TTAAGCT-TGTCTGAGCT
51 -ATAAA---TT--AGTATT-AT---TT--T-AT-TTCGAAT--AAGCTT--G-TATGAAT-A--A
** * * * * * * * * *
17159999 AA-AATAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTATATA
94 AACAATTGTT-TTATGTCA--AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
17160063 GTCTTAACTATTTGAACTGGTTTG
156 GTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * * * *
17160087 GCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTAGAATTTTACTAAATTAGTATTC
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
17160152 TTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAT-AGAATAAAAGGTTATA
65 TTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGTTATA
** * * * * * * *
17160215 ATAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATGGTTATAATTATTTGAAATAGTTAG
127 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * *
17160268 GTAAACAGATTTATTTGTTAAA-TC-T-CTTACTAA-TTCTTGAAATGTTAATAAAGTA-TAATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * * *
17160328 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATAATA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATA
* * * * *
17160392 ACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAAT-GACCATAATTATTT-AAATAGATTCA
127 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATTATTTGAACTTG-TTCG
* ** * * * * *
17160445 ATAAATTGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTA-T
1 GTAAA-CAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
17160509 -TTTT-TTT-G-TTAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * * * *
17160570 TGATTTTATATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTCA
128 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* * *
17160622 TTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTT-AAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * * *
17160687 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACTGAAACCATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * * *
17160752 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCA
128 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GTTCG
** * ** * * *
17160804 ACAAACACATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTCGTTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTAT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA-
* * ** *
17160866 TTTTATTT-GAATAGGCTTGTATGATTAAACACAATTGTTTTATGAGAAAA-AAAAGATTATAAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAA-ACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAAC
* * * * * * * *
17160929 GATTTGAGATTGATATTTGTTGAAATATTCATAACTATTTGAACTAGTT-T
129 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* ** * * *
17160979 GAAAAGCAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAGAGTAGTAT
1 GTAAA-CAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * ** *
17161043 TATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATAAACTGAAACAATTGTTTTCTAACAAAACAAAA-GTCATA
63 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATA
* *
17161107 ATGACTTT-AAATAGATAGTT-TTC-AATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCG
127 ACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTGTTCG
* * * **
17161158 GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGCTAATAAATTAG----
1 GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *****
17161219 --------T---ATAAGCTTGTATGAAATGAAA-TATTG-TTTATGACTAAACAAAAGATCAAAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AATAAAACAATTGTTTTATGTC-AAA-ACAA-AAGGTTA
* * * * * * *
17161271 CAA-T--TTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTG
125 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * * * **
17161322 GCAGACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTCTTAAATTAGTATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
17161387 TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGACAATA-AAAA--TCATAAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAAC
* * * * *
17161449 GATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAA-TTGTTTCA
129 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCG
* *
17161500 GTAAACAGATTTAGTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTT
17161538 AAAATATTTT
Statistics
Matches: 2696, Mismatches: 690, Indels: 469
0.70 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
161 6 0.00
162 72 0.03
163 103 0.04
164 55 0.02
165 5 0.00
166 3 0.00
167 1 0.00
169 1 0.00
170 1 0.00
173 1 0.00
174 16 0.01
175 67 0.02
176 281 0.10
177 459 0.17
178 245 0.09
179 234 0.09
180 406 0.15
181 397 0.15
182 132 0.05
183 24 0.01
184 25 0.01
185 10 0.00
186 1 0.00
187 6 0.00
188 5 0.00
189 2 0.00
190 3 0.00
191 6 0.00
193 4 0.00
194 1 0.00
195 5 0.00
196 5 0.00
197 2 0.00
199 2 0.00
200 4 0.00
201 3 0.00
202 2 0.00
203 4 0.00
205 4 0.00
206 4 0.00
207 2 0.00
208 3 0.00
209 7 0.00
210 2 0.00
211 17 0.01
212 17 0.01
213 18 0.01
214 1 0.00
215 2 0.00
216 20 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (179 bp):
GTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAACGA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG
Done.