Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168406.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_621, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 21409
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Found at i:310 original size:176 final size:174
Alignment explanation
Indices: 73--2036 Score: 900
Period size: 176 Copynumber: 11.0 Consensus size: 174
63 TAAGTTTTTT
* * * * * * *
73 TGAACTGAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAATGACTTTAAATAGATAATTGTTT
1 TGAAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-CAATTTAAATAAATAATTGTTT
* *
138 AAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTGA-TAAACA-TT-TTTTTT-AATCTCTTACTCATTA
65 AAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-TGTTTCACTAAACATTTATTTTTTAAATCTCTT--T-ATTA
* * *
198 ATTTTTCAAATGTTAATAAATT-GCTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTGTA
125 ATTTTTCAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTCTGAATAA-CTTGTA
* * * * * * *
249 TGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC
1 TGAAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTG-TT
* * * *
314 T-AATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCT-TTTATTAAT
64 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTC-ACTAA-ACATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAAT
** * * *
377 TTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAACTTGTA
127 TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAACTTGTA
* * * * * ** *
425 TAAAAAGAAACAAACTATTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAATTATTTGAGATAAATAATTGTT
1 TGAAATGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTT
* *
489 TAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTTC-CATAAACATATTTAGTTTTTAAATCTC-TTATTAA
64 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCAC-TAAAC--ATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAA
* * * *
552 -TTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCA
126 TTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA-CTTGTA
* * * *
602 -CAAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGATCATAACGATTTAAATAGATAATTGTTC
1 TGAAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAATAAATAATTGTTT
* * * * *
665 AAATGGACATAACTATTTGAACT-TTTCAGTAAAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAAT
65 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCACTAAACATTTATTTTTTAAATCT-CT--TTATTAAT
* **
729 TTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCCAATAAACTTGTA
127 TTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AACTTGTA
* * *
778 TG-AATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTT
1 TGAAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC-AATTTAAATAAATAATTGTT
* * *
842 CAAACA-TCATAACTATTTGAA--GTTGCTCGCTAAACAAATTTATTTTTTTAAAATCT-TTTAG
64 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTT--TCACTAAAC--ATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTTA-
** * * *
903 CTTATCAATTTTTGGGAATATTAATAAACTAAGTATTATTTTATT-TCAATAGGCTTGTA
122 --T-T-AATTTTT-CAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATA-ACTTGTA
* * * * *
962 TGAAGCA-GAAACAAGTTG-TTTCTGACAAAA-TAAAGGTCATATAACTATTTGAAATAGATAAT
1 TGAA--ATGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC--ATAACAATTT-AAATAAATAAT
* ** * * * *
1024 TGATCCAATAGTCATAACTAATTTGAA-TGTGTTCA-AAAAC-TTT-TTTTTTTAATTTTTACTT
60 TGTTTAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGT-TTCACTAAACATTTATTTTTTAAATCTCT--TT
* * *
1085 ATTAATTTTTGGAAATATTAAAAAATTTGTATTAATTTTATT-TAAGAATAAGCTTGTA
121 ATTAATTTTT-CAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTCT--GAATAA-CTTGTA
* * * *
1143 TGATAA--AAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTTATAAGCAATTTGATATAAGATAATT
1 TGA-AATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA-CAATTT-AAATAA-ATAATT
* * * * * * * *
1205 GTTCAGACAATCATAACTATTTGAAACTTGTTAGT-AATAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTG
61 GTTTAAATAGTCATAACTATTTG-AAC-TGTT--TCACTAA-ACATTTATTTTTTAAATCTC-T-
** * * * * *
1269 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATT-TTAGATAGCATGTA
119 -TTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAACTTGTA
*** * * * * *
1326 TG-AATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTT
1 TGAAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTT
* * * * * ** * *
1390 CAGCGACAGTCATAATTATTTGCACT-CATCAGGCTTAACAAATTCATTTTTTAAATCCATTACT
64 TA--AATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCA--C-TAA-ACATTTATTTTTTAAAT-C--T-CT
* * * *
1454 TT-TTAATTTTT-AGAATGTTAATGAAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TGTA
119 TTATTAATTTTTCA-AATATTAAT--AAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-A-ACTTGTA
* * * *
1512 TG-AATAGAAACAATTTTTTTTATGAC-AAACAAATAG-TCATCATAATTTAAAGTAAATAATGG
1 TGAAAT-GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAACAATTTAAA-TAAATAATTG
* * * * * * *
1574 TTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTATTT-AGTAAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTC
62 TTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCACT-AAAC--ATTTATTTTTTAAATCTCTT--TA
* ** *
1638 TTAA--TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATA
122 TTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AACTTGTA
* ** * * * * * **
1691 TGCAACAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAATAATTTGAAGTTTATAATTGT
1 TGAAATGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTGT
* * ** * * *
1756 TCAAAATGGTC-TTGCTGTTTAAAACTAG-TTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTC-TT
63 T-TAAATAGTCATAACTATTT-GAACT-GTTTC-ACT-AA-ACATTTA-TTTTTTAAATCTCTTT
* * * *
1817 ATTAATTTTT-AAAGATTAATAAA-TAGTAATTATTGTATTCTGAATAAATTGAA
121 ATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCTGAATAACTTGTA
* * * *
1870 TGCTCAAAT---ACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG
1 TG---AAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTG
* * * * * * * *
1932 -ATAACAT-GATCATAATTATTTGAATTAATTTGA-TAAACAGATTCA-CTTTTAAAT-AC-TTA
62 TTTAA-ATAG-TCATAACTATTTGAACT-GTTTCACTAAAC--ATTTATTTTTTAAATCTCTTTA
** *
1991 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
122 TTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
2037 TTTGAACTTA
Statistics
Matches: 1392, Mismatches: 254, Indels: 286
0.72 0.13 0.15
Matches are distributed among these distances:
172 16 0.01
173 14 0.01
174 47 0.03
175 63 0.05
176 286 0.21
177 142 0.10
178 65 0.05
179 116 0.08
180 87 0.06
181 71 0.05
182 64 0.05
183 97 0.07
184 105 0.08
185 67 0.05
186 103 0.07
187 37 0.03
188 9 0.01
189 2 0.00
190 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (174 bp):
TGAAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAATAAATAATTGTTTA
AATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCACTAAACATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTT
CAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAACTTGTA
Found at i:1126 original size:364 final size:359
Alignment explanation
Indices: 607--1387 Score: 799
Period size: 364 Copynumber: 2.2 Consensus size: 359
597 TTGCACAAAT
* * ** * *
607 AGAAACAATTGTTTT-ATGA-AAAACAAAAGATCATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAAT
1 AGAAACAATTGTTTTGA--ACAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGATCCAAT
* * * ** *
669 GGACATAACT-ATTTGAACT-T-TTCAGTAAAGA-TTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATT
64 AGTCATAACTAATTTGAA-TGTGTTCA--AAA-ACTTT-TTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATT
* * ** * *
730 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTA-TTCCCAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTG
123 TTTAGAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTAACAATAAACTTGTATG-ATAAAAAAAATTG
* * *
794 TTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAA-CTATTTTAAATAA-ACAATTGTTCAAAC-ATCATAAC
187 TTTTATAACAAAACAAAAAG-TCATAAGCAATTTGAAATAAGACAATTGTTCAAACAATCATAAC
* * * *
855 TATTTG-AAGTTGCTCGCT-A-AACAAATTTATTTTTTTAAAATCTTTTAGCTTATCAATTTTTG
251 TATTTGAAACTTGCTAG-TAATAACAAATTCA-TTTTTT-AAATCTCTT-GCTTATCAATTTTT-
* * *
917 GGAATATTAATAAACTAAGTATTATTTTATTTCA-ATAGGCTTGTATGAAGC
311 GGAATATTAATAAA-TAAGAATTATCTTATTTCAGATA-GCATGTATGAA-C
*
968 AGAAACAAGTTGTTTCTG-ACAAAATAAA-GGTCAT-ATAACTATTTGAAATAGATAATTGATCC
1 AGAAACAA-TTGTTT-TGAACAAAACAAATGGTCATAAT-A--ATTTGAAATAGATAATTGATCC
1030 AATAGTCATAACTAATTTGAATGTGTTCAAAAACTTTTTTTTTTAATTTTTACTTATTAATTTTT
61 AATAGTCATAACTAATTTGAATGTGTTCAAAAACTTTTTTTTTTAATTTTTACTTATTAATTTTT
* * * *
1095 GGAAATATTAAAAAATTTGTATTAATTTTATTTAAGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAATTGTT
126 AG-AATATTAAAAAATTAGTATT-ATTTTATTTAACAATAAACTTGTATGATAAAAAAAATTGTT
* * * *
1160 TTATAACAAAACAAAAAGTTATAAGCAATTTGATATAAGATAATTGTTCAGACAATCATAACTAT
189 TTATAACAAAACAAAAAGTCATAAGCAATTTGAAATAAGACAATTGTTCAAACAATCATAACTAT
* * *
1225 TTGAAACTTGTTAGTAATAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATT
254 TTGAAACTTGCTAGTAATAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTGCTTATCAATTTTTGGAATATT
* * *
1290 AATAAATTAGAATTATCTTATTTTAGATAGCATGTATGAAT
319 AATAAATAAGAATTATCTTATTTCAGATAGCATGTATGAAC
*
1331 AGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG
1 AGAAACAATTGTTTTG-AACAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTG
1388 TTCAGCGACA
Statistics
Matches: 349, Mismatches: 44, Indels: 53
0.78 0.10 0.12
Matches are distributed among these distances:
360 1 0.00
361 16 0.05
362 53 0.15
363 49 0.14
364 99 0.28
365 57 0.16
366 29 0.08
367 22 0.06
368 14 0.04
369 9 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
AGAAACAATTGTTTTGAACAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGATCCAATAG
TCATAACTAATTTGAATGTGTTCAAAAACTTTTTTTTTTAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAAT
ATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTAACAATAAACTTGTATGATAAAAAAAATTGTTTTATAAC
AAAACAAAAAGTCATAAGCAATTTGAAATAAGACAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAAAC
TTGCTAGTAATAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTGCTTATCAATTTTTGGAATATTAATAAAT
AAGAATTATCTTATTTCAGATAGCATGTATGAAC
Found at i:1559 original size:186 final size:183
Alignment explanation
Indices: 1242--1577 Score: 425
Period size: 186 Copynumber: 1.8 Consensus size: 183
1232 TTGTTAGTAA
* * *
1242 TAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATC
1 TAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATC
*
1307 TTATTTTAGATAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAATAAT
66 TTATTTTAGATAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAGTCATAATAAT
* *
1372 TTGAAA-TAGATAATTGTTCAGCGACAGTCATAATTATTTGCACTCATCAGGCT
131 TT-AAAGTAAATAATGGTTCAGCGACAGTCATAATTATTTGCACTCATCAGGCT
* * *
1425 TAACAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTTTTAATTTTTAGAATGTTAATGAAAATTAGCATT
1 TAACAAATTCATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT--AAATTAGAATT
**
1489 A-CTTTATTTT-GAATAAG-ACTGTATGAATAGAAACAATT-TTTT-TTATGACAAACAAATAGT
63 ATC-TTATTTTAG-AT-AGCA-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAAT-A-AAACAAATAGT
*
1549 CATCATAATTTAAAGTAAATAATGGTTCA
122 CATAATAATTTAAAGTAAATAATGGTTCA
1578 AATAGTTATA
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 12, Indels: 17
0.82 0.08 0.11
Matches are distributed among these distances:
182 1 0.01
183 44 0.34
184 4 0.03
185 29 0.22
186 53 0.40
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (183 bp):
TAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATC
TTATTTTAGATAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAGTCATAATAAT
TTAAAGTAAATAATGGTTCAGCGACAGTCATAATTATTTGCACTCATCAGGCT
Found at i:1615 original size:183 final size:181
Alignment explanation
Indices: 461--1675 Score: 532
Period size: 184 Copynumber: 6.7 Consensus size: 181
451 AAAATAAAGA
* * * * * * *
461 TCATAATTATTTGAGATAAATAATTGTTTA-AATAATCATAACTATTTGAACTGTTTCCA-T-AA
1 TCATAATAATTTGAAATAAATAATGGTTCACAACAGTCATAACTATTTGAACTATTT--AGTAAA
* * * * * * * *
523 ACATATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTT
64 ACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATCTT
* * *** * ** ***
584 ATTCTAAATAATTTTGCACAAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAA-AG
129 ATTTTAGAT-AGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAG
** * * ** *
636 ATCATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCA-AATGGACATAACTATTTGAACT-TTTCAGT--A
1 -TCATAATAATTTGAAATAAATAATGGTTCACAACAGTCATAACTATTTGAACTATTT-AGTAAA
* * * * * * *
696 A-AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTT
64 ACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATCTT
** * * * *** *
760 ATTCCCA-ATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AG
129 ATT-TTAGAT-AGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAG
* * * * * *
813 ATCATAACT-ATTTTAAATAAACAATTGTTCA-AACA-TCATAACTATTTGAAGT-TGCTCGCT-
1 -TCATAA-TAATTTGAAATAAATAATGGTTCACAACAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTAG-TA
* * * * * *
873 AAACAAATTTATTTTTTTAAAATCTTTTAGCTTATCAATTTTTGGGAATATTAATAAACTAAGTA
62 AAACAAATTCA-TTTTTT-AAATCTCTTA-CTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAA-TTAGAA
* * * * * * *
938 TTATTTTATTTCA-ATAGGCTTGTATGAAGCAGAAACAAGTTGTTTCTG--ACAAAATAAA-GG
122 TTATCTTATTTTAGATA-GCATGTATGAA-TAGAAACAA-TTGTTT-TGCAATAAAACAAATAG
* * * * * * *
998 TCAT-ATAACTATTTGAAATAGATAATTGATC-CAATAGTCATAACTAATTTGAA-TGTGT--TC
1 TCATAAT-A--ATTTGAAATAAATAATGGTTCACAACAGTCATAACT-ATTTGAACTATTTAGTA
* * * * * * * *
1058 AAA-AACTT-TTTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAAATATTAAAAAATTTGTATTAA
62 AAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGAATT-A
* * * * * ** * *
1120 TTTTATTTAAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAG
125 TCTTATTTTAG-AT-AGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAG
* * * * * *
1178 TTATAAGCAATTTGATATAAGATAATTGTTCA-GACAATCATAACTATTTGAAACT-TGTTAGTA
1 TCATAA-TAATTTGAAATAA-ATAATGGTTCACAACAGTCATAACTATTTG-AACTAT-TTAGTA
* * *
1241 ATAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTAT
62 A-AACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTAT
*
1306 CTTATTTTAGATAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGG
126 CTTATTTTAGATAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAG
* * * * * *
1362 TCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAGCGACAGTCATAATTATTTGCACTCA-TCAGGCT-
1 TCATAATAATTTGAAATAAATAATGGTTCA-CAACAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTA-G-TA
* * * *
1425 TAACAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTTTTAATTTTTAGAATGTTAATGAAAATTAGCATT
62 AAACAAATTCATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT--AAATTAGAATT
**
1489 A-CTTTATTTT-GAATAAG-ACTGTATGAATAGAAACAATT-TTTT-TTATGACAAACAAATAG
124 ATC-TTATTTTAG-AT-AGCA-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAAT-A-AAACAAATAG
* * * *
1548 TCATCATAATTT-AAAGTAAATAATGGTTCA-AATAGTTATAACTAATTGAACTATTTAGTAAAA
1 TCATAATAATTTGAAA-TAAATAATGGTTCACAACAGTCATAACTATTTGAACTATTTAGTAAAA
* * * * * *
1611 CAAATTTATTTTTAAAATCTCTTAC-TCTTAA-TTTCAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTT
65 CAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGA-ATTATCTT
1673 ATT
129 ATT
1676 CCAAATAAAC
Statistics
Matches: 833, Mismatches: 132, Indels: 145
0.75 0.12 0.13
Matches are distributed among these distances:
172 14 0.02
173 4 0.00
174 6 0.01
175 34 0.04
176 77 0.09
177 41 0.05
178 33 0.04
179 79 0.09
180 38 0.05
181 36 0.04
182 34 0.04
183 107 0.13
184 111 0.13
185 78 0.09
186 104 0.12
187 29 0.03
188 8 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TCATAATAATTTGAAATAAATAATGGTTCACAACAGTCATAACTATTTGAACTATTTAGTAAAAC
AAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTAT
TTTAGATAGCATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATAG
Found at i:3261 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 2054--14223 Score: 6054
Period size: 181 Copynumber: 67.3 Consensus size: 179
2044 TTATTTGGCA
* * * *
2054 AACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGA-AATATTAATAAATTAATATTATT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
2118 TTA-ATCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGCCATAACA
65 TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * *** *
2182 AGTTGACATAAATAATTACACAAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTAGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * *** * *
2235 AGACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACATTTTTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGAATTAT
1 A-ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
2300 ATTATTTGAAATAAGATTGTATGAATAGATAA-AATTCTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGC
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
2364 AATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATTTTTCAGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACTGTTCGGT
* * * * * *
2417 AAACAGATTCATCTTTTTAAATTTTTTTA-TTATTAATTTTTGA-ATTACTAATAAATTAGTATT
1 -AACAAATTTAT-TTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * ** * *
2480 GTTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACATTTCTTTTATG-----AC---AGGTCATAA
62 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * *
2537 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAATCATGATTATTTGATCTAGTTCAGT
127 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * *
2591 AA-ACATATTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATCAATTGCTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AACAAAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* *
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1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * ** * * * **
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64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * *
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129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * * *
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1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTTGAGAATATTAATAAATT-AGTATT
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* *
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* ** ** * * *
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129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * * * * *
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1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * ** * * *
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64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * *
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129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAG-TCATAACTATTTGAACTG-TTCGGT
* * *
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** * * ** * * * **
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* * * * * **
3612 ATTTCAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTT-AACCTACTTCAGCA
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-GTTC-GGT
* * * *
3665 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGTATTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * *** * * * * * * *
3730 TATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTCACGATAGAACAAAAGGTTACAACAAT
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * *
3795 TTAAAATAGATAATTATTTAAATAG---GAAC----TG-A---TTCAGT
131 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGGT
* * * * *
3833 AA-ATAGATATATTTTTTAAATCTCTTTCCTATTAATTTTTGA-AATTTTAATAAATTAATATTA
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** ** * * * *
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63 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * *
3960 TTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGAT
127 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * ** ** **
4014 AAACAAATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTATTAATTTTCTGAATGCTAATAAATTAGTATTAT
1 -AACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * * *
4079 TTTATTTTGAATAAGCATGCATGAACTGAAAA-TACTATTTTATGAC-AAGCAAAAGGTCAAAAC
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * ** * * * * *
4142 GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATTTTCTTATCTATTTGAATTAGTTTGGCA
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGG-T
* * * *
4196 AACACATTTATTTTTTAAA-----T-CTT-TT-A--TT-AGAATATTATTAATTTA-TCAATATT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATT
** * * **
4249 TTGCTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAATT
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACA
* * * * * **
4311 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAAAAATCATAATTATTTGAATTGGTTCAAT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
*
4363 ATA-AAGATTTAGTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
1 A-ACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
** ** * * * * ** *
4422 TTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAATATAATAAC
63 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
4487 ATTTTGATATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTT-AAGCTTGTTTGGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-TGTTCGGT
* *
4540 GAACAAATTTATTTTTTAAAT-T-TTCAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT--ACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
4603 TTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
63 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * **
4668 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAAT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * *
4721 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-GAATTTTAATAAGTTAGTATTAT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
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64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * **
4850 ATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAAATGTTTAG-
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTGTTCGGT
* * **
4901 AAAATATATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTTTTATTA
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
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* * * *
5027 TATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTGGT
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* * * *
5081 AACAAGATTTA-TTTTTAATTCTCTTTCTCATTCATTTCT-AGAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * **
5144 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATG
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
** * *
5209 ATTTGAAATAGATAATAATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTAGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * * *
5261 AACAAGATTTCTTTTTTAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTG-GAATATTAAAAAATTAGTATTAT
1 AACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * **
5325 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATG
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * ***
5390 ATTTGGAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACTTGTTCAAAA
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTC-GGT
* * * * * *
5443 AACATATTTATTTTTTAAATAT-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATT-TT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
5506 GTTA-ATCGAAATAAACATGTATG-ACAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATACC
65 -TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * ** **
5569 AGTTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCTTAAAGATTTGAACATGTTCAGAA
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTC-GGT
* * * * **
5623 AACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTCTATTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * ***
5687 TA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAAATCATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAGTG
66 TATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * **
5749 ATTTTAAACAGATAATT-ATCAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTCGACA
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCG-GT
* * * * * * *
5802 AACAAATTCATTTTTTTAATCTCTTAATTTTTAATTTTCATAATATTAATAACTTAGTATTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * *** * * * * *
5867 TA-TTCAAATAGGCTTTTATGAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACCAT
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * **
5931 TTGAAATAGATAATTAG-TCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCTAT
131 TTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * *
5981 AACCATATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTGTTGA-AATATTAATAAATTGGTATTAT
1 AA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
6045 TTTCA-TCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAACTATTGTCTTATAACAAAAAAAAAGGTCATAAC
64 TTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* ** *
6109 AATTTGAAATAAATAATTGCACAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTTGGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TGTTCGGT
* * *** *
6162 AAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * ** * *
6227 TTA-TTCGAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAG
65 TTATTTC-AAATAAGCTTGTATG-A-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
6291 CAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTC-TT
127 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTCGGT
* * **
6345 AA-ATAGATTCATTTTTTAAATC-CATAAACAGATTTAATTCTT-A-AATTTCTTATTAATTTTT
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTC-T-TACTTA-TTAATT-TTGAGAA-----TATTAA----T
* * * * ** ** ** * ** * *
6406 GAAATATCAATAAACTAATATTATTTTATTTTGAATAATT-T-TGTATGAATAGAAATAG--TCA
51 -AAAT-T-AGT--A-TTATTTTATTTCA-AAT-AA-GCTTGTATG-AACAAAAACAATTGTTTTA
*** ** * * *** * *
6467 TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-AGATTTGAAATGGATAATAACTCAAAT-GACATGACTA
106 TGACAAAACAA-----AAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
6530 TTTTAACTTGTTCAGT
165 TTTGAAC-TGTTCGGT
* **
6546 AAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * **
6610 TTATTTTAAATAA--ATGTATGAATAGAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACTAAAGATCA-AATG
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * ** * * *
6671 ATTTGAAATAAAATAATTATTTGAATGGT-ATAACTATTCGAACTCGTT-AGT
129 ATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * *
6722 AAAAAATTGTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AAT-TTAATAAATTTGTATTAT
1 AACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** ** *
6785 TTTA-TTCTGAATAAGCTTTTATGAA-TGAAAC-ATTGGCTTATGACAAAACTAAAGGTCATAAC
64 TTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
**
6847 AATTTGAAAT-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACCTATTTGAACTGTTCAAGAA
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGTTC--GGT
* * * *
6901 AACATATTTA-TTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTAT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTGAGAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * * *
6963 TTTATTCCAAAATAAGCCTGCATGAACATAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
64 TTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
** *
7028 GTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGATT-GGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTCGGT
* * * *
7081 AA-ATAGA-TTAATTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * **
7143 TTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCACAATG
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * *
7208 ATTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATACTCATGACCATTTGAACTTGTTCGAT
129 ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * * * *
7260 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGT-AGAAATATTAATAAATTAAT-TTTT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
7323 TTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACA
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* ** *
7388 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGGTCGGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTC-GGT
* * * * * *** * *
7441 ---AGATTTA----TTAGATTTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTCTTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * ** * * *
7499 TA-TTAATAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAAT
66 TATTTCA-AATAAGCTTGTATG-A-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
7563 GATTTCAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * * * *
7616 AAACAAATTCATTTTTTGAATCTCTTAATTATTAATTTTTG-GAATATTGATAACTTAATATTAT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * ** ** * *
7680 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACCGAAATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
7745 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * * * * *
7797 AAAAATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTTATTAATTGTTGA-AATATTAATAAATTGGTATTAT
1 AACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
7861 TTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC--AAACCATTATTTTATAACACAACAAAAAGCCATAACA
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
7924 ATTTGAAATAAATAAATGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT---T
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * ** ** * * * **
7973 GATAAA--TA-TTAATAAAT-TAGTA-TTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAAAAA
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTTG---AGA---ATATT-A-ATAAATTA
* * * * * * * *
8033 ATATTGTTTTATTACAAAATAAAAAGTAATAATGATTTGAA-ATAGATAATTG-TTTA--A-ATA
57 GTATTATTTTATTTC-AAAT---AAG--CT--TG-TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-A
*** * * * * * *
8093 GTTATAA--TTATTTGAACTGATTCTGTAAATAGAATTATT-TTCTAAAT-CTCTTATAA-AATT
112 AACAAAAGGTCA--T-AAC-AATT-TG-AAATAG-ATAATTGTTC-AAATAGTC--ATAACTA-T
* * **
8153 TTGAAATATT-AAT
166 TTGAACTGTTCGGT
* * * * * * * **
8166 AA-ATTATTTCACTATATTCCAAATAAATTTCTATAAGCTAAAATAATTATTTTATGACAAAACA
1 AACA-AATTT-A-T-T-TT----TTAAATCTCT-T-A-CT-TATTAA-T-TTTGA-GA-ATATTA
* * ** * * * * * ** *
8230 A-AAGGTCA-TAACAATTTGAGTT-AAATAA--TTGT-T-CATATAGTCTTAATTGTTTGAATTG
49 ATAA-ATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC--AATTGTTT-TA-T-
* * * ** * * ** * *
8288 GTTCAGCAAACATATTTA-TTTTTAA-ATTTCTTAGTTA-TTAATT-TTCATAATATTACTAAAT
107 G-ACA--AAACA-A--AAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGT-C---A-
* *
8349 TAGTATTATTT-TA-T-TTC-G-
159 TA--ACTATTTGAACTGTTCGGT
* * **** * * * * *
8367 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA-TTATAGAATAAAATGTT-ATAATAAT-ATGA
1 AACAA-ATT-TAT---TTTTTA-AA-TCTCTTACTTAT----T--AATTTTGAGAATATTAAT-A
* * * * ***
8429 AA-TAG-ATAATTGTTCAAATAGTT-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAA-AAAGATTTATT-T
52 AATTAGTATTATT-TT---AT--TTCA-AA-TA----AGCTTGTAT-G-AACAAA-AACAATTGT
* * * * * *
8489 TTTAAAAACAATGGTTTTATGATAGACAAAAGG-CAATAATAATTTGAAATAAATAGTTGTTTAA
102 TTT-------AT-G----A-CA-AAACAAAAGGTC-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * **
8553 ATGGCCATAATTATTTGAACTTATTTAGT
152 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
** * * * * * *
8582 CAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTTTCAAAATAATAATAAAGTAGTATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* *** * * **
8647 TTCTTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* * * * *
8711 TTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTATTCGAT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* ** * * *
8762 AAACACATTTATCTTTTCGAATCTCTTGCTTATTAATTTTTG-GAATGTTAATAAACTAGTATTA
1 -AACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** * * * * * * * * *
8826 TTTTATTCCAAATAAGCGTGTATAAACTGAAACAATTATTATAGGACTAAATAAAAGTTTAGAAT
63 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *
8891 GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * * *
8944 AA-ATATATTTATTTTTAAAATCTCTCAC-TAAT-A-TTTG-GAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
9004 TTT-GTCCATATAAGTTTGTATGATCAAAAA-AGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAAT
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * ***
9066 GATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACTAGTTCAAAAA
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTC--GGT
* * * ** * *
9121 AACAACTTTA-GTTTTAAATCTTTTGTTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAAGTAGTATTATT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
9184 TTATTTCGAATAAGTTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACG
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-
* * * * *
9248 ACTTT-AATTAGATAGTTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGAT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * * * **
9300 AAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATTACAATT
1 -AACAAA-TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * *
9364 ATTTTA-TTCTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCATA
62 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ***
9428 ACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACA
126 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTC-GGT
* * * * *
9484 AACACATTTATTTTTCAAAGCTCTTAC-TA--ATTTTTG-GAATATTATTAAATTAGTATTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* *
9545 TAATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAACA--TCATAAC
66 T-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAAC
* * ** * * *
9606 GATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTATTTCGGTAAAT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGG----T
* * *
9663 AGATTTAGTAAACGGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
1 --A---A--CAA---ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATT
** ** * * * *
9724 AGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG
56 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAG
*** * * * * *
9789 GTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGAT-ATGACTATTTGAACTTATTTGGT
120 GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * *
9850 AA-ACAATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
9913 TTAGTTT-GAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACT
65 TTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
9977 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTCGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * *
10029 AA-ATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-GAATATTAATAAACTAGCATTA
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * *
10091 -CTTATTTTGAATACA-CTTGTATGAATATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
63 TTTTATTTCAAATA-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * **
10154 TTATTTAAAATAGATAATTATTTAGATAATCATAACTATTTGAA-TGTATTCAGAA
127 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG--TTC-GGT
*
10209 AACATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTG-GAATATTAATAAATTTA-TATTA
1 AACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * * * * * ** *
10270 TTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAATATCATAAT
63 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * *
10335 GATTTGAAATAGAAAATTATTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTGTTTGGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * *
10388 AAATAAATTTATCTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * ** * * ** *
10452 TTATTTCGAATTAGCCTATATGAACTGATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAACAA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* * * * * **
10517 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTA-TCGAAACTTTTCAAT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTGTTCGGT
* * * * * * *
10567 AAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * **
10632 TTAATTCGAATAAGCTTGTA-GAAC-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAATG
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACA
* * * *
10694 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTCGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCGGT
* * * * * *** *
10746 AAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTGTATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * *
10811 TTAATTGAAATAAGGTTGTATCAATAGAAAA-AATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGCA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * **
10875 ATTTGACATAGGTAATTGTTCAAGTAATCGTAATTATTTGAACTTGTTCAAT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * *
10927 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGAATTAT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * *
10991 GCTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAAC
64 TTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * **
11055 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGAT-ATAACTATTTGCATTGGTCAAGCC
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGTTC--GGT
* * * *
11109 AACAGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * ** * * * *
11173 TTATTCCAAATAAAATTGTATCAATAGCAATAATTGCTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* * ** * * * *
11238 TTTAAAATAAATAATTACTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGGT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* * * * *
11289 AAACAGATTTATATTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
11350 TTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAATGA-AAAACAAAAGGTCATAACA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * * *
11414 ATTCGAAATAGATAATTATTCATACAGCCTTTACTATTTGAACTGGTTTGGCA
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGG-T
* * * * * *
11467 AACAAATTTCTTTTTTAAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTAATTA
1 AACAAATTTATTTTTT--AAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGT-ATTA
** * * * * * *
11532 TTTTATTTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTATAA
63 TTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
11597 CGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGCT
127 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* *
11651 AA-AGAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * ** * *
11714 TTCATTCCGAATAGGCTTATATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACA
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * *
11779 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTTGAACTGATTC-G-
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGGT
* * ** * * * * * *
11829 -ATAAATTGATTTTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTAT
1 AACAAATT--TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * *** * * * **
11893 TTTATTT-GGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAAATGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATG
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
11957 ATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGATTCGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTG-TTCGGT
* * * * * * *
12010 AAACATATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTT-TGAATGTTAATAAAATAATATTAT
1 -AACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
12074 TTTACTTCGAATAAGCATT-TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTCAGAAT
64 TTTATTTCAAATAAGC-TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * ***
12138 GATTTGAAATAGATAGTTGTTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACA
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTC-GGT
* * * * * ** ** *
12192 AACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTATTAATTTT-AGAATATTATTAGTTTAACAATATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * ***
12256 TACTTCGAATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAATGGT
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * *
12320 TTGAGATAAATAATTGTTCACATAGTCATAA-TAATTTGAATTAGTTTGGTT
131 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT-GTTCGG-T
* *
12371 AACAGATTTAGTTTTTT-AATCTCTTA-TTA--ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * ** * *
12431 TTA-TTCTGAATAATATTGTATGAATAAAAACAATTTTTTTACAACCAAAC-AAAGTGTCATAAT
65 TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAAC
* * * * * * * *
12494 GATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGAT-GTGATTATTTGAACTTATTCAGT
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * ** * ** *
12547 AAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTT-ATTATATTAATAAAATAGTATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * **
12611 TTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATG
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * **
12676 ATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTCATCTGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTC-GGT
* * * * *
12728 AAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATT-A-----A-AATGTTAATAAATTAATATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
12786 TTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAAGGTCCTAAC
65 TTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAAC
* * * * * * **
12850 AATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAG-
128 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * *
12902 AAAATAGATTTATTTTTTTAAT-T-TTAACTTATTAATTTCT-AAAATATTAAAAAATTTA-TAT
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTT-TGAGAATATTAATAAA-TTAGTAT
* ** * * * * * * *
12963 TGTTTT-TGTTCGAAATAAGCTTACATGAATAGAACCAATTGTTTTAAGA-TAAACGAAAGGCCA
61 TATTTTAT-TTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
*** * * * * * *
13026 TAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGAT
124 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
** * * * * * * *
13083 AAACAAATTCCTTTTTCAAATTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * * * * **
13148 TTACTTCAAATAAGGTCATATGAACTAAAATAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* * *
13213 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGAT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * * * **
13264 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * *
13329 TTA-ATCTAAATAAGTTTGAATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAAGTCATAATA
65 TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * *
13393 AGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTTATTCGGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * * * ***
13445 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTA-TATTAT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * ** **
13509 TTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATTAACTAAAA-AATTGTTTTGTGGCAAGTCAAAAGGTTTTAA-
64 TTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* ** * * * *
13571 AGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGAT
128 A-ATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGT
* * ** *
13625 AA-ATAGATTTATTTTTTTGAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA
1 AACA-A-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * **** * *
13689 ATTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGAATTGTAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAA
63 TTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
13753 CAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAGCTGATTTGGT
127 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGGT
* * *
13807 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TTATTTTTGA-ACTATTATTAAATTAGTATTATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * * * * * **
13868 TTAATTCGAATAAGCTTGTACAAAC-AAAATAATTATTTTACGAGAAACCAAAACGTCATAATGA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* ** ** * *
13932 TTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGG-T
** * * * ** * * * *
13984 ATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * * * * ** *
14049 TATTTCAAATAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGAC
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * *
14114 TTGGAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAAACTATTTAAAATGGTTTGGT
131 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGT
* *
14164 AA-ATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTA
1 AACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-GAGAATATTAATAAATTAGTA
14224 ATAATGATTT
Statistics
Matches: 9240, Mismatches: 2115, Indels: 1268
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 3 0.00
168 65 0.01
169 166 0.02
170 84 0.01
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172 22 0.00
173 55 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGGT
Found at i:3730 original size:720 final size:714
Alignment explanation
Indices: 2053--21237 Score: 5102
Period size: 720 Copynumber: 26.7 Consensus size: 714
2043 CTTATTTGGC
* * * *
2053 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACATATTTA-TTTTTAAA----TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * ** * **
2118 TTA-ATCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGCCATAACA
61 TTATTTC-GAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATG
* * * *** * * * * * *
2182 AGTTGACATAAATAATTACACAAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTT-AGGTAGACAAATTTA
124 ATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCA-GCAAACAGATTTA
* * * * * **
2246 TTTTTTAAATCTTTTACATTTTTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGAATTATATTATTTGA
187 TTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * * * * * * *
2309 AATAAGATT-GTATG-AAT-AGATAAAATTCTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCA
249 AATAAGCTTATTATGAAATCA-A-AAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * ** * ** * * *
2371 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATTTTTCAGTAAACAGATTCATCTTTTTA
312 AATAGATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGT-AACAAATTTAT-TTTTT-
* * * * * *
2436 AATTTTTTTAT--TATTAATTTTTGAATTACTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGCT
374 AATTCTCTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
** * * * * *
2499 TATATGAACTGAAACATTTCTTTTATG-----AC---AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
438 TATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATT
* * * * * * * * *
2556 ATTCAAAAAATCATGATTATTTGATCTAGTTC-AGTAAACATA-TTATTTTTT-AA-ATTTTACT
503 GTTCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACT
* ** * * * * **
2617 TATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTCCAAATAGGCA-TGTATGAAT-AG
567 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATA-AAATTGTATG-ATCA-
* * * * * * * * *
2680 AAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAAGTCATAA-GATTTAAAATAAATAATTGCTCAAGTAGT
628 AAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
2744 CAAAACTATTTGAAAT-AGTTCAA
692 CATAATTATTTGAAATGA-TTCGA
* * * * *
2767 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATATTTGAAATATTAATAGATTAGTATTA-TTT
1 -AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * ** * * * *
2830 ATTTTGAACAAATTTATATGAACAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACT
63 ATTTCGAATAAGCTTCTATGAACAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATT
* * * * * *
2895 TGGAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTGGAT-AGGTAAATAGAATTATTTT
127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCA-GCAAACAGATTTATTTT
* * * *
2959 TTAAATCTCTTACTTATTTATTTTTGAAAAATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAGTAAG
191 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAG
*
3023 -TTATTATGAAATCAAAAACCTTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTGAAATAGAT
255 CTTATTATGAAATCAAAAA-CTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * *
3087 AATTGTTCATACAATCTTAAATATTGGAACTGATTCGGTAATAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA
319 AATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA
* * * * *
3152 GCCT-TTAATTTTCATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
384 TCCTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACA
* * * **
3216 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTATAATTGTTCAAATA
448 AAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * * * **
3281 GTCATTGCTGTTTAAACTAGTTCGATAAATAGATTTCTTTTTTAAATATCCTACTTATTAATTTT
512 GTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTT
* * * *
3346 TAAAAGATTAATAAA-TAGTATTATTGTATTCCGAATAAAATTGAATGCTCAAATACAATTGTTA
577 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATT-CGAATAAAATTGTATGATCAAA-ACAATTATT-
*
3410 TATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGAT-AACAT-GATCATAATTATT
639 TATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAG-TCATAATTATT
*
3473 TGAATTGATTCGA
702 TGAAATGATTCGA
* * *
3486 TAAACAAATTCACTTTTTAAATAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 -AAACATATTTA-TTTTTAAATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * *
3551 TTTTGAATAAGCTTCTATGACCTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTT
64 TTTCGAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTT
* * * * * * **
3616 CAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTAACCTACTTCAGCAAACAGATTTATTTTTT
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTT
* * * *
3681 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
193 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * * * * * * * * *
3746 A-TATGAATTGAAACAA-TTATTTCACGATAGAACAAAAGGTTACAACAATTTAAAATAGAT-A-
258 ATTATGAAATCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * *
3807 A-TT---AT--T--TAA--ATAGGAACTGATTCAGTAA-ATAGATATATTTTTTAAATCTCTT-T
322 AGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACA-A-ATTTATTTTTTAATTCTCTTAT
* * * * * **
3860 CCTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATAAATTG
385 CCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-CA
* * * * * * * *
3925 AAAAT-TTTGTTTTATGATACAACAAATGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
448 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * **
3989 TCATAACTATTTCAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA-ATTTGTTGTTTATTAATTT
513 TCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATA-TT-TTACTTATTAATTT
* ** * * * * * * *
4053 TCT-GAATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCA-TGCATGAACTGAAAA-TACT
576 T-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAA-AATTGTATG-A-TCAAAACAATT
* * * ** *
4115 ATTTTATGAC-AAGCAAAAGGTCAA-AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATTTTC-TTATC
636 A-TTTATGACAAAACAAAAGGT-AATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-
* * * *
4177 TATTTGAATTAGTTTGGC
698 TATTTGAAAT-GATTCGA
* * * * * *
4195 AAACACATTTATTTTTTAAA-T-CTT-TT-A---TTAGAATATTATTAATTTA-TCAATATTTTG
1 AAACATATTTA-TTTTTAAATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTA
* * * * * * *
4252 CTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAA-AAAT-ATCATAATTATTT
64 TTTCGAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTT
* * * * * ** *
4315 GAGATAGATAATTGTTCAAAAAATCATAATTATTTGAATTGGTTCAATATAA-AGATTTAGTTTT
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCA-AACAGATTTATTTTT
***
4379 TAAA--TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA--T
192 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCT
* * * ** * *
4438 TTTGTATG-AAT-AGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAATATAATAAC-ATTTTGATATAGA
257 TAT-TATGAAATCA-AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGA
* * * *
4500 TAATAGTTCAAATGGA-CATGACTATT-TAAGCTTG-TTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATT
318 TAATAGTTCAAAT-AATCATAACTATTGGAA-C-TGATTCGGT-AACAAATTTATTTTTT-AATT
* * * * * * *
4562 -T-TCAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTA
378 CTCTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATA
* * * * *
4625 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC
442 TGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * *
4690 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
507 AAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTA
** * * * * ** * *
4755 ATTTTTGGAATTTTAATAAGTTAGTATTATT-TCATTTCAAAGAAGCTTTTATGAACAGAAACAA
572 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGT-A-TTCGAATAAAATTGTATGATCA-AAACAA
* * * * * * *
4819 TTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAC
634 TT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* *
4884 TATTTGAAAATGTTTAGA
698 TATTTG-AAATGATTCGA
* * **
4902 AAATATATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTTATTATTTT
1 AAACATATTTATTTTTAAA---TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * *
4967 A-TTCGAAATATGCTTGC-ATGAATAGAACCAAATGTTTTATGAGAAAACAAAAT-GTCATAAT-
63 ATTTCG-AATAAGCTT-CTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATG
* * * * **
5028 ATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTT-TGGTAACAAGATTT
124 A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-TGGTTCAGCAAAC-AGATTT
* * * * * *
5091 A-TTTTTAATTCTCTTTCTCATTCATTTCT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
186 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * *
5154 ATAAGCTTA-TATGAACT-AAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAA
250 ATAAGCTTATTATGAAATCAAAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
5217 TAGATAATAATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATG-TTAGGTAACAAGATTTCTTTTTTAAT
314 TAGATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGGTAACAA-ATTTATTTTTTAAT
* *
5281 TCTCTT-T-CTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
377 TCTCTTATCCT-ATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * * * * * * *
5344 TATGAGCTAAAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGGAATAGATAATTAT
440 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * * * *
5409 TCAAATAATTATGACTAG-TTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTA
505 TCAAATAGTCATTACT-GTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTA
* * * *
5473 TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATT-TTGTTAATCGAAATAAACA-TGTATGA-CAGAA
569 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTG-TATTCG-AATAAA-ATTGTATGATCA-AA
* * * * * * * *
5535 ACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATACCAGTTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCT
630 ACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
**
5600 TAAAGATTTGAACATG-TTCAGA
694 TAATTATTTGAA-ATGATTC-GA
* **
5622 AAACATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTCTATTATTT
1 AAACATATTTATTTTT-AAA---TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * ** * * *
5687 TA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAAATCATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAGTGA
62 TATTTC-GAATAAGCTTCTATGAACAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGA
* * * * * * *
5750 TTTTAAACAGATAATT-ATCAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTC-GACAAACAAATTCAT
125 TTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAG-CAAACAGATTTAT
* * * * *
5813 TTTTTTAATCTCTTAATTTTTAA-TTTTCATAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATT-CAAAT
188 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
* * * * * * *
5876 AGGCTT-TTATGAATTGAAATAA-TTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACCATTTGAAATA
252 AAGCTTATTATGAAATCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * ** *
5939 GATAATTAG-TCAAATAGTCATGACTATTTGATCT-AGTTCTATAACCATATTTATTTTTTAAAT
316 GATAA-TAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGA-TTCGGTAA-CAAATTTATTTTTT-AAT
* * *
6002 T-TCTTA-CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTCA-TCCAAATAAGCTTA
377 TCTCTTATCCTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTA
* * * *
6064 TATGAACAAAAACT-ATTGTCTTATAACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
440 TATGAACAAAAA-TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
** * * *
6128 CACAAATAGTCA-TAATGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTT
504 TTCAAATAGTCATTACTG-TTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTT
* * * ** *
6192 ATTAATTTTCT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGTTTGTATGAATAGAA
568 ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTCG-AATAAAATTGTATG-AT--CA
* * * * *
6256 AAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
628 AAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
6321 CATAATTATTTAAACTTGTTTCTTAAATAGATTC-A
692 CATAATTA--T----TTG------AAAT-GATTCGA
* * * * *
6356 TTTTTTAAATCCATAAACAGATTTAATTCTTAAATTTCTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAAC
1 ------AAA--CAT------ATTT-ATTTTTAAATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT
* * ** * * * * **
6421 TAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATAGTCATTTTATGACAAAACAAAAT
51 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAT
* * *** * * * * * * *
6486 -GTCATAAAGATTTGAAATGGATAATAACTCAAAT-GACATGACTATTTTAACTTGTTCAGTAAG
114 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAA
* ** *
6549 CATATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
179 CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * * *
6613 TTTTAAATAA----ATGTATG-AAT-AGAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACTAAAGATCA-AAT
244 TTCCAAATAAGCTTAT-TATGAAATCA-AAAAC--TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* ** ** * * *
6670 GATTTGAAATAAAATAATTA-TTTGAATGGT-ATAACTATTCGAACTCG-TT-AGTAAAAAATTG
305 GATTTGAAAT-AGATAA-TAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACT-GATTCGGTAACAAATT-
* * * *
6731 TATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTTGAAAT-TTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCT
366 TATTTTTTAATTCTCTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
* * ** * ** * *
6793 GAATAAGCTTTTATGAA-TGAAA-CATTGGCTTATGACAAAACTAAAGGTCATAACAATTTGAAA
429 AAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAA
* * * *
6856 T-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACCTATTTGAAC-TGTTCAAGA-AAACATATTTA-TTTTTA
494 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATTA-CTGTTTGAACTTGTTC--GATAAACAAATTTATTTTTTA
* * * *
6917 AAT-TTTTGCTTATTAAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCAA-AATAAG
556 AATATTTTACTTATT-AATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTGTATTCGAATAA-AA-
* * * * * * ***
6979 CCTGCATGAACATAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAA
617 -TTGTATGATCA-AAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * *
7044 TTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGATTGGT
679 TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-ATGATTCGA
* * * * * **
7081 AAATAGATTAATTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AAACATATTTATTTTTAA----ATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * *
7145 TATTTCAAATAAGCTTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCACAATGAT
62 TATTTCGAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGAT
* * * ** * * * *
7210 TTGAAATA-ATTAATTATTCAAATACTCATGACCATTTGAACTTGTTC-GATAAACATATTTATT
126 TTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAG-CAAACAGATTTATT
* * * * * * *
7273 TTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGTAGAAATATTAATAAATTAAT-TTTTTTTAATCCAAATAA
189 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * * * * *
7337 GCTT-GTATG-AA-CAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAA
254 GCTTATTATGAAATCA-AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * ** * * *
7399 ATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTG-GTCGGGT---AGATTTA----TTAGATT-
317 ATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTC-GGTAACAAATTTATTTTTTA-ATTC
* * * * * * *
7455 TTTTA-CTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGTCTTATTTTA-TTAATAATAAGCTTGT
379 TCTTATCCTATTAATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTAT
* * ** * * * *
7517 ATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTCAAATAAATAATTG
441 ATG-A-ACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * * * * * *
7582 TTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAATTCATTTTTTGAATCTCTTAATTA
504 TTCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTA
** * * * * * ** * * *
7647 TTAATTTTTGGAATATTGATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACCGAAAT
569 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAAAATTGTATG-ATC-AAAA
* * * * * * *
7712 GATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
631 CAATTATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* **
7777 ACTATTTGATCT-AGTTCGGTA
696 ATTATTTGAAATGA-TTC-G-A
* * * *
7798 AAA-ATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTATT
1 AAACATATTTAT-TTTTAAA----TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * ** * **
7862 TTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAACCATTATTTTATAACACAACAAAAAGCCATAACAAT
61 TTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGAT
* * * * * * * *
7926 TTGAAATAAATAAATGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TG-ATA-A-A--TA-TTA
126 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTT
* ** * * ** * *
7984 ATAAAT-TAGTA-TTATT-TTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAAAAAATATTGTTTTATT
191 TTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTG----AA---ATATT-A-ATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * ** * *
8046 ACAAAATAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTT-T-A-AATAGTTATAA--TTAT
246 -CCAAAT---AAGCTTATTATGAAATCAAA-A-ACTTATT-TTATGACAA-A-ACAAAAGGTCA-
* * * * * *
8104 TTGAACTGATTCTGTAAATAGA-ATTATTTTCTAAAT-CTCTTATAA-AATTTTGAAAT-A-T--
301 -T-AAC-GATT-TG-AAATAGATAATA-GTTC-AAATAATC--ATAACTA-TTGGAACTGATTCG
* * * * * * * *
8162 -TAATAAA-TTA---TTTCA--CT-ATATTCCAAATAAATTT---CTA-TAAGCTAAAATA--AT
356 GTAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA-TCCTATTAATTTTGAAATATTAA--TAAATTAGTAT
** * * ** * * * ** * ** *
8213 TATTTTATGAC-AA-AA-C--AAAAGGTC-ATAACAA---TTTGA-G-TTAAATAATTGTTCAT-
418 TATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * *** * * * *
8266 ATAGTCTT-AATTGTTTGAATTGGTTCAGCAA-ACAT-ATTTA-T-TTTTAA-AT-TTC--T-TA
483 ATAAT-TTGAAATAAAT-AATT-GTTCA--AATA-GTCA-TTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAA
*** * * ** ** * * * *
8321 GTTA-TTAATTTTCATAATA--TTAC-TA--AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT-TGTA
541 CAAATTTATTTTTTA-AATATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA-AT-AAATTAG-TAT-TA
* * * * ** * * * *
8379 -TG-AATAGAA-ACAATTGT-T--T---TATTA-----TA-GA-ATAA-A--ATGTTATAATAAT
601 TTGTATTCGAATAAAATTGTATGATCAAAACAATTATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAAT
* * * * * *
8425 ATGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTA
666 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAAT-GATTCG-A
* * ***** *
8476 AAA-AGATTTATTTTTTAAAAACAATGGT-TTTATGATAGACAAAAGGCAATAATAATTTGAAAT
1 AAACATATTTA-TTTTT----A-AAT--TACTTAT--TA-ATTTTTGG-AATATTAA--T-AAAT
* * * ** * * * *
8539 AAATAGTT-GTTTAAATGGCCATAA--TTATTTGAACTTATTTAGTCAACTGATTTATT-TTTTA
51 TAGTA-TTATTTTATTTCG-AATAAGCTTCTATGAAC--A---A---AAC--A---ATTGTTTT-
** * ** * * * * * * ** * *
8600 AATCTCTTAGTTATTAACT-TTCAAAATAATAAT-AAAGTAGTATTATT-TTC-TTTTG-GATAA
100 -ATGAC--A--AAACAAATGGTCATAATGAT-TTGAAA-TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * ** ** *
8660 GCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTATGACAAAACA-A--AAGGTCATAATGAT-T-TTAAATT
157 ----TTAT----TTAAAC--TGGTTCA-G-C-AAACAGATTTATTTTTTAA--ATCTCTT-ACTT
* * * * * * * ** ** * * * *
8720 GA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTATTCGATAAACACATTTATCTT-TT-CG-
206 -ATTAATTTTTGAAATATTAATAA--ATTAGTA-TTATTTTAT-TCCA-AATAAGCTTATTATGA
***** * * * *** **
8781 AATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGA-ATGTTAATAAACTA-GT-ATTATTTTATTCCAAATAAGC
265 AATCAAAAACTTA-T--TTTAT-GACA---AAACAAA--AGGTCA-TA-ACGATTTGAAAT-A--
* * ** * * * * * *
8843 GTGTATAA-ACTGAAACAATTATTATAGGACTAAATAAAAGTTTAGAA-TGATT-TGAAATAGA-
316 --G-ATAATAGT-T--CAA--A-TA-ATCA-TAACT---A--TTGGAACTGATTCGGTAACAAAT
* * ** * * *
8904 TAATTATTCTAATAGTCTTA-ACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATATATTTATTTTTAAAATCTC
365 TTATT-TTTTAATTCTCTTATCCTA-TT-AA-T--TT---TGAA-ATA-TTA---AT-AAA--T-
* * * * * * * * *
8968 TCACTAATATTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTG-TC-CATATAA--GTTTGTATGATC
412 T-AGTATTATTT----TATT-TCAAATAAG-CTTA-TATGAACAAAAATAATTGTTT-TATGA-C
* * * * * **** * * * *
9029 AAAA-AAGATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATA
467 AAAACAA-A-AG-GTCATAATAATTTGAA-AT-A-AAT-AATT--G-TTCA-AATAG-TC----A
* * * * * * * **
9093 TTCATAACTATTTGAACTAGTTCAAAAAAACAACTTTA-GTTTTAAATCTTTTGTTTATTAATTT
516 -T--T-ACTGTTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTT
* * * ** * * *
9157 TTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAAAT-GAAACAATTGT
576 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAAAATTGTATG--ATCAAAACAATT-A
* * * * *
9221 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AATTAGATAGTTGTTCAAATAGTCA-AATCTA
637 TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TA
* *
9284 TTTGAACTTG-TTTGA
700 TTTGAA-ATGATTCGA
* * ** * **
9299 TAAATAAATTTATATTTTTTAAATCT-CTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACAAT
1 -AAACATA-TT-TA-TTTTTAAAT-TAC-T--T-ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
9363 TATTTTA-TTCTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCAT
57 TATTTTATTTC-GAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCAT
* * * * *
9427 AACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACAT
120 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGAT
* * * * *
9491 TTATTTTTCAAAGCTCTTAC----TAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-T
184 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCC
* * ** * *
9551 GAATAAGCTT-GTATGAAAAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAATAAACA--TCATAACGATTTG
248 AAATAAGCTTATTATGAAATCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTG
* * * **
9612 AGATAGATAATCA-TTCAAATAGTAATAACTATTTAAACT-ATTTCGGTAA-ATAGATTTAGTAA
311 AAATAGATAAT-AGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGA-TTCGGTAACA-A-ATTTA-T--
** * *
9674 ACGGATTT-ATT-TTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
369 ---TTTTTAATTCTCTT--ATC-C-TATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** ** ** * * * * **
9737 TTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGTTTT
426 TTCAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATAATTT
* * * * * * * *
9802 GAAATAGATAATTATTCATATAGAT-ATGACTATTTGAACTTATTTGGTAAAC-AATTTA-TTTT
490 GAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTT
* ** * * * * *
9864 TAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTTGAATAAACT
554 TAAATATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAAAAT
* * * * * * *
9929 TGCATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAAT
618 TGTATG-ATCA-AAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * *
9993 TGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTG-CTCGGT
680 TGTTCAAA-TAGTCATAATTATTTGAA-ATGATTC-GA
* * * * *
10029 AAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-CT
1 AAACATATTTATTTTTAAA----TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * *
10093 TATTTTGAATACA-CTTGTATGAATATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTA
62 TATTTCGAATA-AGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGA
* * * * * * * * * *
10157 TTTAAAATAGATAATTATTTAGATAATCATAACTATTTGAA-TGTATTCAGAAAACATATTTATT
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTG-GTTCAGCAAACAGATTTATT
* **
10221 TTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAAT
189 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAAT
* * * ** *
10283 AAGCTTA-TATG-AA-CAGAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAAT
252 AAGCTTATTATGAAATCA-AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * ** * * * * *
10345 AGAAAATTA-TTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTG-TTTGGTAAATAAATTTATCTTTTAAA
315 AGATAA-TAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGGT-AACAAATTTATTTTTTAAT
* * *
10408 TCTCTTA--CTCATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATTAGCCTAT
377 TCTCTTATCCT-ATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT
** * ** * * * *
10471 ATGAACTGATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
441 ATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTT
* * * * * * * * *
10536 CAAATAGTTATGACT-ATCGAAACTT-TTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTAT
506 CAAATAGTCATTACTGTTTG-AACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAT
* * * * ** *
10599 TAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA-GAACAAAA-AA
570 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGT-ATTCGAATAAAATTGTATGATCAAAACAA
* * ** * *
10662 TTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAA
634 TTA-TTTATGACAAAAC-AAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * *
10727 CTATTTGAATTTATTCGGT
697 TTATTTGAAATGATTC-GA
* * *
10746 AAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTATCTT--AATATTAATAAATTTGTATTA
1 AAACATATTTA-TTTTTAAA----TTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * * * *
10809 TTTTAATT-GAAATAAGGTTGTATCAATAGAAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAG
59 TTTTATTTCG-AATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
** * * * * * * * **
10873 CAATTTGACATAGGTAATTGTTCAAGTAATCGTAATTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA
122 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTA
* * * ** ***
10938 GTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTATGAAT
187 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
* * * * * *
11003 AAGCTT-GTATG-AAT-AGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTGAAAT
252 AAGCTTATTATGAAATCA-AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * ** * * *
11065 AGATAATTGTTCAAACAGAT-ATAACTATTTGCATTG-GTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAA
315 AGATAATAGTTCAAATA-ATCATAACTATTGGAACTGATTC--GGTAACAAATTTATTTTTTAAT
* * * * ** *
11128 TC-CGTTA-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAATTG
377 TCTC-TTATCCTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * ** * * ** * **
11191 TATCAATAGCAATAATTGCTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTAC
440 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * ** * * * * * * *
11256 TCAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATATTTT-AA-A-TCT-CTTAA
505 TCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAT
* * * * * *
11317 TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAA-ACAAACTTATATGAACAAAAAC
570 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTCGAATA-AAA-TTGTATGATC-AAAAC
* * * * * * * * *
11381 ATTTGTTTTAATGA-AAAACAAAAGGTCATAACAATTCGAAATAGATAATTATTCATACAGCCTT
632 AATT-ATTT-ATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
11445 TACTATTTGAACTGGTTTGGC
695 AATTATTTGAAAT-GATTCGA
* * * *** * *
11466 AAACAAATTTCTTTTTTAAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTAATT
1 AAACATATTT-ATTTTT--AAA----TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * * * * * *
11531 ATTTTATTTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTATA
58 ATTTTA-TTTCGAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATA
* * * * * * *
11596 ACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTC-GCTAA-AGAATT
121 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAG-ATT
* * * *
11659 TATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCCGA
185 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * *
11724 ATAGGCTTA-TATG--ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGAA
250 ATAAGCTTATTATGAAATCAAAAAC--TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* *** * * * * *
11786 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTTGAACTGATTC-G--ATAAATTGATTTTTTTTAA
313 ATAGATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACAAATT--TATTTTTTAA
* * * * * * * * * ** *
11848 ATCTC-CAACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-GGATAAGCTTT
376 TTCTCTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
*** * * * * * * **
11911 TATGAATTGAAACAAATGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGT
440 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * * *
11976 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA-ATTTCTTGCT
505 TCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATA-TT-TTACT
* * * * * * *
12040 TATTAATTTTT-GAATGTTAATAAAATAATATTATTTTACTTCGAATAAGCATT-TATGAACTAA
567 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAA-AATTGTATGATC-AA
* * * ** * * *
12103 AACAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCTAATATTC
629 AACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
12168 TTAACTATTTGAACTGGTTCAA
693 ATAATTATTTGAAATGATTCGA
* * * ** ** *
12190 CAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTATTAA-TTTTAGAATATTATTAGTTTAACAATAT
1 -AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TA---CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
12254 TTTACTTCGAATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA-GATCATAATG
60 TTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATG
* * * * * * * * ** **
12318 GTTTGAGATAAATAATTGTTCACATAGTCATAATAATTTGAATTAGTTTGGTTAACAGATTTAGT
124 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTA-T
**
12383 TTTTT-AA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
188 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
** * * ** * *
12443 ATATT-GTATG-AAT-AAAAACAATTTTTTTACAACCAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTGAAAT
253 AGCTTATTATGAAATCAAAAAC--TTATTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
12504 AGATAATAGTTCAAATGGAT-GTGATTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTAATTTTTTAAGT
315 AGATAATAGTTCAAAT-AATCATAACTATTGGAACTGATTCGGT-AACAAATTTATTTTTTAATT
* * * * ** * *
12568 CTC-CA-ACTCATTAATTTT-ATTATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGT
378 CTCTTATCCT-ATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT
* * * * * * * *
12630 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGT
441 ATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * ** *
12695 TCAAATAGTTATAACTATTTAAAC-TCATCTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAA-ATTTT--TTA
505 TCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTA
* * * * **
12755 CTT-A---TTAAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA
569 -TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATT-CGAATAAAATTGTATG-ATCA-AA
* * ** * *
12815 ACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAAGGTCCTAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
630 ACAATT-ATTTATGACAAAAC-AAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** *
12880 ATAAATT-TTT-AAACAAGTTAAGA
693 AT-AATTATTTGAAATGA-TT-CGA
* * * * ** * *
12903 AAATAGATTTATTTTTTTAATTTTAACTTATTAATTTCTAAAATATTAAAAAATTTA-TATTGTT
1 AAACATATTTA--TTTTTAA-ATT-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
* * * * *
12967 TT-TGTTCGAAATAAGCTTAC-ATGAATAGAACCAATTGTTTTAAGA-TAAACGAAA-GGCCATA
61 TTAT-TTCG-AATAAGCTT-CTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATA
* * * * * * ** * * *
13028 ATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGATAAACAAATT
121 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAG-CAAACAGATT
** * * * * * *
13092 CCTTTTTCAAATTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTACTT-CA
185 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCA
* * * * * * *
13156 AATAAGGTCA-TATGAACT-AAAATAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAA
249 AATAAGCTTATTATGAAATCAAAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * *
13219 ATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTA
313 ATAGATAA-TAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGGT-AACAAATTTATTTTTTA
* * * ** ** * *
13282 AATCTTTTA-CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTA-ATCTAAATAAGTT
375 ATTCTCTTATCCTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCT
* * * * * * *
13345 TGA-ATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAAT
438 T-ATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT
* * * * * *
13409 TGCTCAAATAGTCATAAC-GATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
502 TGTTCAAATAGTCATTACTG-TTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTAC
* * ** * *
13473 TAATTAATTATCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAAC
566 TTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTGTATTCG-AATAAAATTGTATGATC
* * * ** ** * **
13535 TAAAA-AATTGTTTTGTGGCAAGTCAAAAGGTTTTAA-AGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAA
627 -AAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACA-ATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * *
13597 TTGTAATAACTATTTGAACTTG-TTTGA
688 TAGTCATAATTATTTGAA-ATGATTCGA
* * * * * *
13624 TAAATAGATTTATTTTTTTGAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA
1 -AAACATATTTA--TTTTT-AA---ATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *** * * *
13689 ATTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGAATTGTAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAA
59 TTTTATTTC-GAATAAGCTTCTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
** * * * ** * * * ** * *
13753 CAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAGCTGATTTGGTAAACAAATTTA
122 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTA
* * *
13818 TTTTTTAAATCTCTTA--T-TT-ATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-CGAA
187 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAA
* * * * * * * *
13878 TAAGCTT-GTA-CAAA-CAAAATAATTATTTTACGAGAAACCAAAACGTCATAATGATTTGAAAT
251 TAAGCTTATTATGAAATCAAAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* ** * * * * ** *
13940 AAATAATCA-TTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTG-TTTGGCTATTAGATTTATTTTTTAAT
315 AGATAAT-AGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGG-TAACAAATTTATTTTTTAAT
* * ** * **
14003 TTTCTTGGT--TATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-AATA
377 TCTCTT-ATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * ** * * * * * * * *
14065 GTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGACTTGGAATAGATAATTA
440 -TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
* ** * * * * * * * * * * *
14130 TTCAAATAGTTAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTG
504 TTCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTT-
* * * *
14194 ATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTAATAATG-ATT----TGAAATTGATAATTGTTCAA
568 ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTCGAATAAAATTG-T-A-TGATCAA
* * ** * ** * ** *
14253 ATAGTCATAATCATTTGAACTGGTTCAATAA-ATAAAATTATTTTCTAAATCT--CTTACA-AAT
629 A-A--C--AATTATTT--A-T-G-ACAA-AACA-AAAGGTAATAAC--AATTTGAAATAGATAAT
** * * * * *
14314 T-TTTGAATAATTAATAAATTAGTTT-TATTCTATTTCGA
680 TGTTCAAAT-AGTCAT-AATTA-TTTGAAAT-GA-TTCGA
* ** * * * ** * * *
14352 ATAAGC-T-TGTATGAGCTGAAA-TA---ATTACTTTAT-GACA-A--AGCAAA--AG-GTCATA
1 A-AA-CATATTTAT--TTTTAAATTACTTATTAATTTTTGGA-ATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * ** * * *
14404 ACATTTTGAAATAA-ATAAT-TGTACATATAGTCTTAATTGTTTGAACTATTTAGATAACTATTT
61 TTATTTCG-AATAAGCTTCTATGAACA-A-A-AC--AATTGTTT----TA--T-GACAA--A---
* * * * * * * * ** * * **
14467 ACAAAAGTTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAGCTATTTGAGCTTATTC
108 ACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTC
* * * * * ** *
14532 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTAAGTAATATTAATAAATTAGTATT
173 AGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * *
14597 ATTTTATTTCAAATAAGCTTAGT-TG-AATTGAAACCATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCAT
238 ATTTTATTCCAAATAAGCTTATTATGAAATCAAAAAC-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** * *
14660 AATGATTTGAAATAGTTAATTA-TTCAAATAATCATGATTATTTCAATTTG-TTCGGTAAACATA
302 AACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAA-CTGATTCGGT-AACAAA
* * * ** * *
14723 TTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTGTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATC
364 TTTATTTTTTAATTCTCTTATCCTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
14786 CAAATAACCTTGTATAAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGA
428 CAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATAATTTGA
* * * * *
14850 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAA
492 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * * **
14914 ATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTGATAATTTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTT
557 ATATTTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTCG-AATAAAATT
* * * * * * * * *
14977 GTATGAATAGAAAAAAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAAATAATT
619 GTATG-AT-CAAAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATT
* *
15042 GTTCAAATAGTCATAATCATTT-AAAGTTATTCGA
681 GTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAA-TGATTCGA
* * * * * *
15076 TAAATAGATTT-TTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTGGTGTTAT
1 -AAACATATTTATTTTT-AAA----TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
15140 TTTATTTCGAGTAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACG
60 TTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATG
* * * * * * * * *
15205 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCAT-GTCCATTTGATCTAGTTCGATC-AACATATTTA
124 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TATTTAAACTGGTTC-AGCAAACAGATTTA
* * * * ***
15268 TTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAA
187 TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
** * * * ** *
15332 TAAGC--ATGTATG-AA-CAGAAACAAATGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAA
251 TAAGCTTAT-TATGAAATCA-AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * *
15393 ATAAATAAT-TTGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAA-ATAGATTTATTTTTTA
313 ATAGATAATAGT-TCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACA-A-ATTTATTTTTTA
* * * * * *
15456 AATCTCTTAT--TA--ATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTACTTTATTATGAACA-AA-CT
375 ATTCTCTTATCCTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCT
* * * * * * *
15515 TATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAAAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATT
438 TATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATT
* * * * ** *
15580 GTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGCAAACAGAAATATT-TTTTTTAAATATCTT
503 GTTCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTT-GTTCGATAAAC--AAAT-TTATTTTTTAAATATTTT
** * * * * * ** * *
15643 ACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATCA-TTTTATTTTATTTCAAATCAGCTAGTATGAATT
564 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAAAATTGTATG-ATC
* * * * * * *
15707 GAAA-ATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACATTTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG
627 AAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
15771 TCTTAAATATTTG--ATGGTTTGTC
691 TCATAATTATTTGAAATGATTCG-A
* * * * * * * *
15794 AAACAAATTTATTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAGTATATTTGTATTATTG
1 AAACATATTTATTTTTAA----ATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * * * *
15859 TATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGGAATAATTATTTTGTGGCAAAACAAAAGGTTATAACGAT
62 TATTTCGAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGAT
* * * * * * *
15924 TTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTT-TG-ATGAACAGATTTATA
126 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCA--AACAGATTTATT
* * * **
15987 TTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTATATTCTGAATAA
189 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * * * * * * *
16052 CCTTGA--ATG--ATCAAAAACACTTGTTATATGACCAAACAAATGGTAATAATGGTTTGAAATA
254 GCTT-ATTATGAAATC-AAAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
*** * * * * **
16113 GATAA-ATGTTGC-AATGGCCATAATTATTTGAAATGATTCAGTAA-ATAGATTCCTTTTTTAA-
316 GATAATA-GTT-CAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACA-A-ATTTATTTTTTAAT
* * * * * *
16174 -ATC--AT--TGATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTTGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
377 TCTCTTATCCT-ATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * * * ** * *
16234 TATGAACTAAAACAATTGTTGTATGACAAAACAAAA-TTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
440 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
** * * * ** * *** *
16298 TCGTATTGTC-TTAACTATTTAAACTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTA
505 TCAAATAGTCATT-ACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTA
* * * * * ** * * *
16362 TTAATTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTGTGAACTAAAAT
569 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAAAATTGTATGATC-AAAAC
* * * ** * * *
16427 AATTATTTA-GA-ATAGAATAAAACGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA---AG
632 AATTATTTATGACA-A-AACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
**
16487 AATTGCTT----TGA-T---
695 AATTATTTGAAATGATTCGA
* * * * * *
16499 AAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATCTTTGAAATCTTAATAAATTAGTATTAGT
1 AAACATATTTA-TTTTT-AA-A--TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
16564 TTATTCCAAACAGGCTTGTATGATGA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAATG
61 TTATTTCGAATAAGCTTCTATGA--ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATG
* * * * * ** * * *
16627 ATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTTGGTAAACAGATTCACT
124 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTATT
* *
16692 TTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAA
189 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * * * ** * * *
16753 GCTT-TAATGAATTGAAACAA-TT-TTTTAATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATAT
254 GCTTATTATGAAATCAAA-AACTTATTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * ** * * ** * *
16815 ACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTATTCAGAAAACACATTTATTTTTTTAAATCT
317 ATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTC-GGTAACAAATTTA-TTTTTTAATTCT
* * * * ** * *
16880 CTT-GCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTGGTATTATTTTACTTT-GGATAACCTTTTAT
380 CTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTATAT
** ** * * * *
16943 GAACTGAAGCAATTGCTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTTAAAT-ATTAATCT-TTC
443 GAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT-TGTTC
* ** * * * * * * *
17005 AAATAGTCATAACTACTTGAGCTTATT-TAGTAAAAAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTAT
507 AAATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTT-AAATATTTTACTTAT
* * * * * * *
17069 TAATTTTTCAAATGTTAATATATTAGGATTATTTTGTTCTAAATAATAAGCTTGTATGAT-ATGA
570 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTC-GAATAA-AA--TTGTATGATCA--A
* * * * * * * ** *
17133 AACAAATATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTATAGTT
629 AACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
17197 TTAACTATTTGAACTGGTTTGA
693 ATAATTATTTGAAATGATTCGA
* *
17219 CAAACACATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 -AAACATATTTA-TTTTT-AA---ATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
17284 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAATGGTTATAG
60 TTTATTTCGAATAAGCTTCTATG---AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
** * * ** * *
17349 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTT-AACTAATTC-GATAAACAAATTT
122 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAG-CAAACAGATTT
* ***
17412 ATTTTTTAAATCTCTTAC---TT-A---TT--AATA--AAT---TT-GTATTATTTTATTTCGTG
186 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
* * * * * * * * * *
17462 TAAACTT-GTATTAACTGAAACAA-TTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTTAAAT
251 TAAGCTTATTATGAAATCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * ** *
17525 AGACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTTTTCGGTAA-ATAGATTTATTTTCTTAAA
315 AGATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACA-A-ATTTATTTT-TTAAT
* * * * * *
17589 TCTCTT-TCTTCTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCGAGTAAGC---
377 TCTCTTATCCTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * * * * *
17649 T-TG-----AAACAAGTGCTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTG
440 TATGAACAAAAATAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * * * * * *
17708 TTCTAATAAT-ATTAATCATATAAACTGGTTCGATAAAC-AA--T-TTTTTT-GATCTCTTATTT
504 TTCAAATAGTCATTACT-GTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTT
* * * * ** * * *
17767 ATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACGAACAAAAA
568 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGT-ATTCGAATAAAATTGTATGATCAAAAC
* * * * ** * *
17831 AATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTGATAACTATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTA
632 AATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
17896 ACTATTTGAACTCATTC-A
696 ATTATTTGAAATGATTCGA
* * * * * *** *
17914 ACAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTA
1 A-AA-CATATTTAT-TTTTAAATTAC----TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** ** * * * ** *
17979 TTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAAT
59 TTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAT
* * * *
18044 GATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCA-AA--A--T----T--TT---C-TACTGA-TTA-
123 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTAT
* * * * *
18092 --ATTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAC
188 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
* * ** * * *
18154 AAACTTA-TATG-AA-CAAAAACAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAAT
252 AAGCTTATTATGAAATCAAAAAC--TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * ** * *
18216 AAATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTTAACT-ATTCGGTAA-ATAGTATTATTTTTTAAAT
315 AGATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACA-AAT-TTATTTTTTAATT
* * * * * *
18279 CTCTTA-CTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGT
378 CTCTTATCCTAT-TAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTAT
** * ** * * *
18342 AT-AAGCTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAACAATTAT
441 ATGAA-CAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATT-G
* * * ** * ** * * *
18406 TTTATATAGTC-TTAATTGTTTGAA-TTGGTTTAACAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
504 TTCAAATAGTCATT-ACTGTTTGAACTT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACT
* * * * * * *
18469 TATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAA
567 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTC-GAATAAAATTGTATGATC-AAA
* * * * * * *
18534 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTCAAATAG---
630 ACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
18596 --------T----T-A-T---
694 TAATTATTTGAAATGATTCGA
* * * *
18600 -AAC-TATTTATTTTTAGATCT-CTTAGTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 AAACATATTTATTTTTAAAT-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * **
18662 TTCAAATAAGCTTGTATGTTGA-AAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTT
65 TTCGAATAAGCTTCTATG--AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTT
** * * * * **
18726 -ATAATTTATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAACTA-ATTTATTTT
128 GA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAAC-AGATTTATTTT
* * * ****
18789 TTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGC
191 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
* * * * ** * *
18854 TT-TTATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAGTAGATA
256 TTATTATGAAATCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
18917 ATTGTTCAAATGATAATAACTATTTGAGCTTG-TTTGGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCT
320 ATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGGT-AACAAATTTATTTTTT-AATTCTCT
* * * *
18981 T-GCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAAGCTTGTAT
382 TATCCTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAAT-AAGCTTATAT
* *** * * * * * * * * * *
19043 AAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT
443 GAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCA
* * ** * * * *
19108 AATAGT-TTTAATCACTTGAA-ATGATTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATT
508 AATAGTCATTACT-GTTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATT
* * * * ** * * *
19171 AATTTTTCAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGATAAGAAATAG
571 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGT-ATTCGAATAAAATTGTATGATCA-AAACA-
* * * * * * * * *
19236 TTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GATCATA
633 -ATTATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATA
* * * * *
19299 ACTATTTGAACTGGTTTGG
696 ATTATTTGAAATGATTCGA
* * ** * * *
19318 AAA-ATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAATATTAATGAAGTAATATTA
1 AAACATA--TTTA-TTTTTAAA----TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * *
19382 TTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
59 TTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAT
* * * * * * * * *
19447 GATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATGGTTAT-ATCTATTTGAACTTGTT-AGGTAAACATATTA
123 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TATTTAAACTGGTTCA-GCAAACAGATTT
* * ** **
19510 ATTTTTTTAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
186 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * * *
19575 ATAAGCTT-GTATGAACTGAGATAA-TTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
250 ATAAGCTTATTATGAAATCA-AAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
19638 TAGATAATTA-TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGA-TCAGTAA-AACA--TA---TTT-A
314 TAGATAA-TAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAACT-GATTCGGTAACAA-ATTTATTTTTTAA
* *
19694 -----TT-T--T-TT-A---T----TA-T--TAAATTAGTATTA-CTTA-ATCAGAATAAGCTTA
376 TTCTCTTATCCTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTA
* * * * * *
19737 TATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTG
440 TATGAACAA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * *
19800 TTC-AGTAGTCATAACTATTTGAA-TTGATT-TAGTAAACAAATTTAGTTTTT-AA-A-TCT-CT
504 TTCAAATAGTCATTACTGTTTGAACTTG-TTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACT
* * * * ** **
19858 AATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAAGAGAA
567 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTATTC-GAATAAAATTGTATGATCA-AA
* * * ** * ** *
19923 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACA
630 ACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
19988 TAACTATTTGAACTTGTTTTGG
694 TAATTATTTGAA-ATGATTCGA
* * * * *
20010 TAATAGATTTATTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AAACATATTTATTTTTAAAT-T---ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * * * *
20075 TATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAT-ATCATAACT-
62 TATTTCGAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAA-TG
* * * * * ** * * **
20138 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAGTTTGCTCAATAAACAGATTTATT
124 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTATT
* * * * * *
20203 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAA
189 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * * ** * *
20268 ACTT-GTATG-AA-CAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAA
254 GCTTATTATGAAATCA-AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * ** * *
20330 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATT-T
317 ATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGGTAACAAATTTATTTTTT-AATTCT
* ** * * *
20394 C-TA-CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAACCGTGTAT
380 CTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATAT
* * * *
20455 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
443 GAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCA
* * ** * * * * * * *
20520 AATAATAAGAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACTAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA
508 AATAGTCATTACTGTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAA
* * *** * * * **
20585 -TTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTGATGCAAT
573 TTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCGAATAAAATTGTATGATC-AAAACAAT
* * * * * ***
20649 TATTT-TAAAATCAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGC
635 TATTTATGACA--AAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* * ** * *
20713 TATTTGGACTTTTTAGGT
698 TATTTGAAATGATT-CGA
** *
20731 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGAGGAAATATTAATAAATTAATATTAT
1 AAACATATTTATTTTT-AAA----TTACTTATTAATTTTTGG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * *
20795 TTTA-ATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-TTTTAT---AAAA-AAA--GTCATAAT
60 TTTATTTC-GAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAT
* * * * ** * *
20852 GATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTC-GATAAATAGATTTA
123 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAG-CAAACAGATTTA
* * * * ** * **
20916 TTTTTTAAATCTTTGTATTTTTTTAATTGTTT-AAATATTAACAAATTTCTGTTATTTTATTAGA
187 TTTTTTAAATCTCT-TA-CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * ** *
20980 AATAAGCTT-GTATGAATAGC-AAAA-TTGTTTTATGAC-AAAC-AAAGGTTTTAGCGATTTGAA
249 AATAAGCTTATTATGAA-ATCAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * **
21040 ATAGATAATTGAT-AAATAGTCATAACTATTTTAACTTG-TTC---AACAAATAGATTCA-TTTT
313 ATAGATAATAGTTCAAATAATCATAACTATTGGAAC-TGATTCGGTAACAAAT---TT-ATTTTT
* * * ** *
21099 TAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTTA-TTCAAAATAA
373 TAATTCTCTTATCCTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTC-AAATAA
* * ** * * * * * * * *
21162 ACTTGTATGAGTAGAAATAATTGATTTGTGATAAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGAT
435 GCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAAT
*
21227 AATTATTCAAA
499 AATTGTTCAAA
21238 CAATCATAAA
Statistics
Matches: 13938, Mismatches: 3205, Indels: 2653
0.70 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
676 14 0.00
677 100 0.01
678 65 0.00
679 10 0.00
680 10 0.00
681 11 0.00
682 13 0.00
683 7 0.00
684 12 0.00
685 4 0.00
686 12 0.00
687 19 0.00
688 22 0.00
689 181 0.01
690 180 0.01
691 196 0.01
692 22 0.00
693 16 0.00
694 66 0.00
695 141 0.01
696 272 0.02
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698 216 0.02
699 198 0.01
700 42 0.00
701 181 0.01
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703 38 0.00
704 79 0.01
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712 305 0.02
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716 667 0.05
717 903 0.06
718 535 0.04
719 962 0.07
720 1076 0.08
721 938 0.07
722 483 0.03
723 359 0.03
724 338 0.02
725 268 0.02
726 244 0.02
727 191 0.01
728 175 0.01
729 196 0.01
730 22 0.00
731 101 0.01
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768 6 0.00
769 6 0.00
770 3 0.00
771 6 0.00
772 2 0.00
773 7 0.00
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778 6 0.00
779 4 0.00
780 10 0.00
781 4 0.00
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792 3 0.00
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800 3 0.00
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810 1 0.00
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814 2 0.00
815 1 0.00
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819 9 0.00
820 2 0.00
821 9 0.00
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824 9 0.00
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826 6 0.00
827 8 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (714 bp):
AAACATATTTATTTTTAAATTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TCGAATAAGCTTCTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAA
TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATT
ATGAAATCAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTT
CAAATAATCATAACTATTGGAACTGATTCGGTAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTATCCTATT
AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATTACT
GTTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
AATAAATTAGTATTATTGTATTCGAATAAAATTGTATGATCAAAACAATTATTTATGACAAAACA
AAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAATGATTCGA
Found at i:3973 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 3658--3988 Score: 385
Period size: 169 Copynumber: 2.0 Consensus size: 169
3648 TTTAACCTAC
* ** * * *
3658 TTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGT
1 TTCAGCAAACAGATATATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAAT
* * *
3723 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTCACGATAGAACAAAAGGTTA
66 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATAAATTGAAACAATTATTTCACGATACAACAAAAGGTCA
*
3788 CAACAATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGGAACTGA
131 CAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGGAACTGA
* * * * *
3827 TTCAGTAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTTCCTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAAT
1 TTCAGCAAACAGATATATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAAT
* * * * * * * *
3892 ATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATAAATTGAAA-ATTTTGTTTTATGATACAACAAATGGTC
66 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATAAATTGAAACA-ATTATTTCACGATACAACAAAAGGTC
* *** * *
3956 ATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
130 ACAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG
3989 TCATAACTAT
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0.81 0.18 0.01
Matches are distributed among these distances:
168 1 0.01
169 131 0.99
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (169 bp):
TTCAGCAAACAGATATATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAAT
ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATAAATTGAAACAATTATTTCACGATACAACAAAAGGTCA
CAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGGAACTGA
Found at i:6739 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 6393--7968 Score: 1138
Period size: 179 Copynumber: 8.8 Consensus size: 177
6383 TCTTAAATTT
* * * * *** *
6393 CTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAACTAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAG
1 CTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTTGTATGAATAG
* * ** * * * ** * * *
6458 AAATAGTCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAATGGATAATAACTCAAAT-GA
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * ***
6522 CATGACTATTTTAACTTGTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCAA
129 CATAACTATTTGAAC-TGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
** *
6573 CTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAA-ATGTATGAATAGAA
1 CTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAACTTGTATGAATAG-A
* ** *
6637 AACAATTGTTTTATGA-AAAACTAAAGATCA-AATGATTTGAAATAAAATAATTATTTGAATGGT
65 AACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AAATAATTATTCAAATAGT
*
6700 -ATAACTATTCGAACTCGTTAGTAAA-AAATTGTATTTTTTAAATCTTTTA
129 CATAACTATTTGAACT-GTTAGTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTTTTA
* * ** *
6749 CTTATTAATTTTTGAA-ATTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAAT-G
1 CTTATTAATTTTAGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTTGTATGAATAG
** ** * *
6812 AAAC-ATTGGCTTATGACAAAACTAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-GATAATTGTTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * *
6875 CATAACCTATTTGAACTGTTCAAGAAAACATATTTA-TTTTTAAAT-TTTTG
129 CATAA-CTATTTGAACTGTT--AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* *
6925 CTTATTAAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCAAAATAAGCCTGCATGAA
1 CTTATT-AA-TTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCC-AAATAA-CTTGTATGAA
* * * * * * * *
6989 CATAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGAT
61 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * * * * *
7054 AGTCATAACTATTTGAACATGATTGGTAAATAGA-TTAATTTTTAATTCTCTTA
126 AGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * *
7107 CTCATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACT-G
1 CTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTTGTATGAA-TAG
* * * * *
7171 AAACAATTGTTTTATTATAAAA-TAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAATTAATTATTCAAATAC
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACT-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
* * * *
7235 TCATGACCATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
128 TCATAACTATTTGAAC-TGTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * *
7287 CTTATTACTTGTAGAAATATTAATAAATTAAT-TTTTTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAG
1 CTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTTGTATGAATAG
* * * ** *
7351 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
** * *** ** * * *
7416 CATAAAGATTTGAAC--TTGGT---CGGGTAGATTTATTAGATTTTTTA
129 CATAACTATTTGAACTGTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * *
7460 CTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGTCTTATTTTATT-AATAATAAGCTTGTATGAAT
1 CTTATTAATT-T-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-AATAA-CTTGTATGAAT
* ** * * * * *
7523 AGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAA
62 AG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * * * * * *
7588 CAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAATTCATTTTTTGAATCTCTTA
125 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * *** * **
7643 ATTATTAATTTTTGGAATATTGATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACCG
1 CTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTTGTATGAATAG
** * * * *
7708 AAATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
7773 CATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAA-AATATTTATGTTTTAAATTTTTTA
129 CATAACTATTTGAACT-GTT-AGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * *
7824 GTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATG-A-A
1 CTTATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTTGTATGAATA
* * * * * * * * ** * **
7886 CAAACCATTATTTTATAACACAACAAAAAGCCATAACAATTTGAAATAAATAAATGCTCAAATAG
63 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
7951 TCATAACTATTTGAACTG
128 TCATAACTATTTGAACTG
7969 GTTTGATAAA
Statistics
Matches: 1112, Mismatches: 228, Indels: 114
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 41 0.04
174 26 0.02
175 29 0.03
176 179 0.16
177 82 0.07
178 61 0.05
179 212 0.19
180 173 0.16
181 210 0.19
182 34 0.03
183 63 0.06
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
CTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAACTTGTATGAATAGAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTGTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
Found at i:7737 original size:537 final size:527
Alignment explanation
Indices: 2063--7967 Score: 2614
Period size: 540 Copynumber: 11.0 Consensus size: 527
2053 AAACATATTT
** * * *
2063 ATTT-TTTAAATCTTTTACTTATT-AATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTA
1 ATTTATTTAAAT-TTTTACTTATTAAATT-TTTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA
* * ** * * * ** * *
2126 AATAAACTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGCCATAACAAGTTGACA
64 AATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA
* *** * * *
2190 TAAATAATTACACAAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTAGGTAGACAAATTTATTTTTTAA
129 TAGATAATTGTTC-AAA-AGTCATAACT-ATTTAAACTTGTT-CGTAAACAAA-TTATTTTTT-A
* * * * * * * *
2254 ATCTTTTACATTTTTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGAATTATATTATTTGAAATAAGATT
188 ATCTCTTA-ATTATTAATT-T-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT
* * * * * * *
2318 GTATGAATAGATAA-AATTCTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATA-GCAATTTCAAATAGATAAT
250 ATATGAACAGA-AACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAAATG--ATTTGAAATA-ATAAT
* * * * * ** * * *
2381 TGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATTTTTCAGTAAACAGATTCATCTTTTTAAATTTTTTTA
310 TATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTC-GTAAA-ATATTTAT-TTTTTAAA-TCTTTTA
* * * * * * * *
2446 -TTATTAATTTTTGAATTACTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTG
371 CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-G
* * ** * * * *
2510 AAACATTTCTTTTATG-----AC---AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAAT
435 AAACA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
2567 CATGATTATTTGATCTAGTTCAGTAAACAT
499 CATAACTATTTGAACTTGGTCAG-AAACAG
* * * * *
2597 ATTATTTTTTAAA-TTTTACTTA-TCAATTGCTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAGTC
1 A-T-TTATTTAAATTTTTACTTATTAAATT-TTTAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC
* * * * * * * * *
2659 CAAATAGGCATGTATGAATAG-AAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAAGTCATAA-GATTTAA
62 AAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGA
* * * * * * * *
2722 AATAAATAATTGCTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAAA-TAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTA
127 AATAGATAATTGTTCAA-AAGTCATAACTATTT-AAACTTGTTC-GTAAACA-AATTATTTTTT-
* * * * * **
2786 AATCTCTT-ATTAAT-ATTTGA-AATATTAATAGATTAGTATTA-TTTATTTTGAACAAATTTAT
187 AATCTCTTAATTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTAT
* * * *
2847 ATGAACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTGGAATAGATAATTGT
252 ATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATA-ATAATTAT
* * * * * ** * * *
2911 TCAAATAATCATAATTATTTAAACTGGATAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
313 TCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAG-TTCGTAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * * * * *
2976 TTATTTTTGAAAAATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAGTAAG-TTATTATGAAATCAAA
376 TAATTGTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTT-GTATG-AA-C-GA
* * ** * * * * * *
3039 AACCTTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATACAATCT
436 AACATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
3104 TAAATATTGGAAC-TGATTCGGTAATAA
501 TAACTATTTGAACTTG-GTCAGAAACAG
* * * * *
3131 ATTTATTTTTTAATTCTCTTAGCCT-TT-AATTTTCATAATATTATTATA-TTAGTATTATTTTA
1 ATTTA--TTTAAATT-T-TTA-CTTATTAAATTTTTA-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
* * ** * * **
3193 TTTC-AAATAAGCTTGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAACAA
59 -TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAAC-AAAATGTCATAATGA
* ** ** * * * * *
3256 TTTGAAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCATTGCTGTTTAAACTAGTTCGATAAATAGATTTCTTT
122 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-AGTCATAACTATTTAAACTTGTTCG-TAAACA-AATTATTT
* * * * * * *** *
3321 TTTAAATATCCTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAA-TAGTATTATTGTATTCCGAATAAA
184 TTT-AATCTCTTAATTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAG
* ** * * **
3385 ATTGA-ATGCTCA-AATACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGAT
247 CTT-ATATGAACAGAA-ACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATA-AT
* * * * * *
3448 AATTGA-T-AACAT-GATCATAATTATTTGAA-TTGATTCGATAAACAAATTCACTTTTTAAA--
307 AATT-ATTCAA-ATAG-TCATGACTATTTGAACTAG-TTCG-TAAA-ATATTTATTTTTTAAATC
* * * * *** *
3507 --TAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATG
366 TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * ** * * *
3570 ACCTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAT
431 AAC-GAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
* * ***
3635 ATAGTCTTAACTGTTT-AACCTACTTCAGCAAACAG
494 ATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGGTCAG-AAACAG
* * ** *
3670 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATT-AATTTTGGGAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTAT
1 ATTTA---TTTAAAT-TTTTACTTATTAAATTTT-TAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAT
* * * * * * * * * * * * **
3733 TCCAAATAAGCTTATATGAATTG-AAACAATTATTTCACGATAGAACAAAAGGTTACAACAATTT
60 TCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTT
* * ** * *
3797 AAAATAGATAATTATT------T-A-AA-TA--GGAAC-TGATTCAGTAAATAGATATATTTTTT
125 GAAATAGATAATTGTTCAAAAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTC-GTAAACAAAT-TATTTTTT
*** * * * * *
3850 AAATCTCTTTCCTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTT
187 -AATCTCTTAATTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT
* * ** * * * * * *
3915 TTATAAATTGAAA-ATTTTGTTTTATGATACAACAAATGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATT
250 ATATGAACAGAAACA-ATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATA-ATAATT
* * * * * * **
3979 GTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTGTTGT
311 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTCG-TAAA-ATATTTATTTTTT-AAATCTT-TTAC
* ** * *** * *
4043 TTATTAATTTTCTG-AATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGCATGAACTG
372 TTATTAATTGT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-G
* * * * * * * **
4107 AAA-ATACTATTTTATGAC-AAGCAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATTT
435 AAACAT--TGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * ** *
4170 TCTTATCTATTTGAA-TTAGTTTGGCAAACAC
498 TCATAACTATTTGAACTT-GGTCAG-AAACAG
** * * ** *
4201 ATTTATTT---TTTAAATCTT-TT--A---TTAGAATATT-ATTAATTTATCAATATTTTGCTCC
1 ATTTATTTAAATTTTTA-CTTATTAAATTTTTA-AATATTAATAAATTTAT-ATTATTTTATTCA
* * *** * * *
4256 AAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGCTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAATTATTTGAG
63 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
4318 ATAGATAATTGTTCAAAAAATCATAATTATTTGAA-TTGGTTCAATATAA-AGATTTAGTTTTTA
128 ATAGATAATTGTTC-AAAAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTC-GTA-AACA-AATTATTTTTTA
* * * ** *
4381 A-ATCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGT
188 ATCTCTTAATTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTAT
* * * ** ** *
4443 ATGAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAATAT-AATAACATTTTGATATAGATAA-TAG
252 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAA-ATGA-TTTGAAATA-ATAATTA-
* * * * *
4506 TTCAAATGGACATGACTATTT-AAGCTTGTTTGGTGAACAA-ATTTATTTTTTAAAT-TTTCAAC
312 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-CTAG-TTCGT-AA-AATATTTATTTTTTAAATCTTT-TAC
* * * * * * *
4568 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGA
372 TTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-CGA
**
4633 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
436 AAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * *
4698 ATAACTATTTGAACTTGCTCAATAAACAA
500 ATAACTATTTGAACTTGGTC-AGAAACAG
* * * *
4727 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTGGAATTTTAAT-AAGTTAGTATTATTTCAT
1 ATTTA---TTTAAAT-TTTTACTTATTAAATTTTT-AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-
* * * * *** **
4790 TTC-AAAGAAGCTTTTATGAACAG-AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATT
59 TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATT
* * * * * * * *
4853 TTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAA-ATGTTTAGAAAATATATTTATTTT
124 TGAAATAGATAATTGTTCAAA-AGTCATAACTATTT-AAACTTG-TTCGTAAACA-AATTATTTT
* * * * ** ** *
4917 TAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTTATTATTTTATTCGAAATATGCT
185 TTAATCTCTTAATTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCT
** * * * * *
4981 TGCATGAATAGAACCAAATGTTTTATGAGAAAACAAAATGTCATAAT-ATTTTAAAATAGATAAT
249 TATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGA-TTTGAAATA-ATAAT
* * * * *
5045 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-ATGTTTGGTAACAAGATTTA-TTTTTAATTCTCTTT-
310 TATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTA-G-TTCGTAA-AATATTTATTTTTTAAATCT-TTTA
* * * * *
5107 CTCATTCATT-TCT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
371 CTTATTAATTGT-TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * ** * ** *
5170 TAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAGATA
434 -GAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * *
5235 GTCATAACTATTTGAACAT-GTTAGGTAACAAG
497 GTCATAACTATTTGAACTTGGTCA-GAAAC-AG
* * * * * *
5267 ATTTCTTTTTTAATTCTCTTTCTCATT-AATTTTTGGAATATTAA-AAAATTAGTATTATTTTAT
1 A-TT-TATTTAAATT-T-TTACTTATTAAATTTTT-AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-
* * * ** * * *
5330 TTC-AAATAAGCTTATATGAGCT--AAAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGAT
59 TTCAAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGAT
* * * * * * * ** *
5392 TTGGAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTT
123 TTGAAATAGATAATTGTTCAAA-AGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-GTAAACA-AATTATTTT
* * * * * * **
5457 TTAAATAT-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATT-TTGTTAATCGAAATAA
185 TT-AATCTCT-TAATTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTTAAATAA
* * * * * * **
5520 ACATGTATG-ACAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATACCAGTTTGAAATAAATA
246 GCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAAATGA-TTTGAAAT-AATA
* * * ** * *
5584 ATTTTTCAAATAGTCTTAAAGATTTGAAC-ATGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTT
308 ATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTA-GTTC-GTAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTTTT
* ** * *
5647 ACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTTCTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAC
370 ACTTATTAATTGTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC
* ** * * *** * * * *
5711 AAAACAAATCATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAGTGATTTTAAACAGATAATT-ATCAAAAT
434 GAAAC--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAAT
* * * * * *
5774 AGTCAAAATTATTTAAACTTGTTCGACAAACAA
496 AGTCATAACTATTTGAACTTGGTC-AGAAACAG
* * * * * * *
5807 ATTCATTTTTTTAATCTCTTAATT-TTTAATTTTCATAATATTAAT-AACTTAGTATTATTTTAT
1 A-T--TTATTTAAAT-TTTTACTTATTAAATTTTTA-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAT
* * * * ** * **
5870 TC-AAATAGGCTTTTATGAATTG-AAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACCATTT
60 TCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTT
* * * * *
5933 GAAATAGATAATTAG-TCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTC-TATAACCATATTTATTTT
125 GAAATAGATAATT-GTTCAAA-AGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGTA-AA-CA-AATTATTTT
* * * **
5996 TTAAATTTCTTACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTCA-TCCAAATAA
185 TT-AATCTCTTAATTATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTAAATAA
* * * * * **
6059 GCTTATATGAACAAAAACTATTGTCTTATAACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATA
246 GCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAAT-AATA
*** * * * * *
6124 ATTGCACAAATAGTCAT-AATGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTT
308 ATTATTCAAATAGTCATGACT-ATTTGAACTAG-TTCGTAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTTTT
** * * * *
6188 ACTTATTAATT-TTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGTTTGTATGAAT
370 ACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-
* * ** * * * * *
6252 AGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAA
433 CG---AAACATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
* * * ** *
6317 TAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTCTTAAATAG
495 TAGTCATAACTATTTGAACTTG-GTCAGAAACAG
* *
6351 ATTCATTTTTTAAATCCATAAACAGATTTAATTCTTAAATTTCTTATTAATTTTTGAAATATCAA
1 A-T--TTATTTAAAT---T-------TTT-A--CTT--A----TTA--AATTTTT-AAATATTAA
* * *** ** * *
6416 TAAACTAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAG-AAATAGTCATTTTATGACAAAA
41 TAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAA
* * *** * * * *
6480 CAAAATGTCATAAAGATTTGAAATGGATAATAACTCAAATGACATGACTATTTTAACTTGTTCAG
106 CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-G
* * *
6545 TAAGCATATTTATTTTTTAAATCTC-CAACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
170 TAAACA-AATTATTTTTT-AATCTCTTAA-TTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
6609 TTTATTTTAAATAA--ATGTATGAATAGAAAACAATTGTTTTATGAAAAACTAAAGATCAAATGA
232 TTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACAG-AAACAATTGTTTTATGAAAAACAAAAGGTCAAATGA
** * * * * * *
6672 TTTGAAATAAAATAATTATTTGAATGGT-ATAACTATTCGAACTCGTTAGTAAAAAATTGTATTT
296 TTTGAAAT--AATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTCGTAAAATATT-TATTT
* * * **
6736 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT-TTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTGAATAAG
358 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAG
* * ** * * *
6800 CTTTTATGAATGAAACATTGGCTTATGACAAAACTAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-GATAATT
423 CTTGTATGAACGAAACATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATT
* *
6864 GTTCAAATAGTCATAACCTATTTGAAC-TGTTCAAGAAAACAT
488 GTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGGTC-AG-AAACAG
*
6906 ATTTATTTTTAAATTTTTGCTTATTAAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCC
1 ATTTA--TTTAAATTTTTACTTATTAAATTTTTA-AATATTAATAAATTTATATTATTTTATT-C
* * * * ** ** * *
6971 AAAATAAGCCTGCATGAACA-TAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGA
62 AAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
7035 AATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGATTGGTAAATAGATTAATTTTTAAT
127 AATAGATAATTGTTCA-AAAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCGTAAACAAATTATTTTTTAA-
* * * *
7100 TCTCTTACTCATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATAT
189 TCTCTTAATTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATAT
* * * *
7165 AAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAATTAATTATTCA
254 GAACAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAA-TAATTATTCA
* * * *
7230 AATACTCATGACCATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAC
316 AATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTCG-TAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * *
7295 TTGTAGAAATATTAATAAATTAAT-TTTTTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATT
379 TTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-GAAA-CATT
**
7359 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGA
442 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
***
7424 TTTGAACTTGGTC-G-GGTAG
507 TTTGAACTTGGTCAGAAACAG
* * *
7443 ATTTA-TTAGATTTTTTACTTATT-AATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTCTTATTTTATT-A
1 ATTTATTTA-AATTTTTACTTATTAAATT-T-TTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCA
* *
7504 ATAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTC
63 A-AATAAGCTTGTATGAATAG-AAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTG
* *
7569 AAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAATTCATTTTTTG
126 AAATAGATAATTGTTCAAA-AGTCATAACTATTTAAACTTGTTCG-TAAACAAATT-ATTTTTT-
* * * * *
7634 AATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTGATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
187 AATCTCTTAATTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTA
* ** * *
7699 TATGAACCGAAATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
251 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATA-ATAATTAT
* * * *
7764 TCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAAAATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTTAT
313 TCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTC-GT-AAAATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
*
7829 TAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAACCA
376 TAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACGAAA-CA
* * * * * *
7893 TTATTTTATAACACAACAAAA-AGCCATAACAATTTGAAATAAATAAATGCTCAAATAGTCATAA
440 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
7957 CTATTTGAACT
504 CTATTTGAACT
7968 GGTTTGATAA
Statistics
Matches: 4241, Mismatches: 834, Indels: 590
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
518 25 0.01
519 6 0.00
520 49 0.01
523 1 0.00
524 7 0.00
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530 25 0.01
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546 1 0.00
551 1 0.00
552 2 0.00
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566 72 0.02
567 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (527 bp):
ATTTATTTAAATTTTTACTTATTAAATTTTTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAA
TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
GATAATTGTTCAAAAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGTAAACAAATTATTTTTTAATCTCTTA
ATTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACAGA
AACAATTGTTTTATGAAAAACAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAATAATTATTCAAATAGTCATG
ACTATTTGAACTAGTTCGTAAAATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATAT
TAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACGAAACATTGTTTTATGACAAAA
CAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGGTCA
GAAACAG
Found at i:9235 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 8494--18607 Score: 5926
Period size: 181 Copynumber: 56.4 Consensus size: 180
8484 TATTTTTTAA
* * * * * * * *
8494 AAACAATGGTTTTATGA-TAGACAAAAGG-CAATAATAATTTGAAATAAATAGTTGTTTAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
8557 CCATAATTATTTGAACTTA-TTTAGTCAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTTT
65 TCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * * * * * * *
8621 CAAAATAATAATAAAGTAGTATTATTTTCTTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* *
8674 AAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** *
8738 CATAACTCTTTGAACTTA-TTCGATAAACACATTTATCTTTTCGAATCTCTTGCTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAACA-ATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
8802 TGGAATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCGTGTAT-AAACTG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAA-TG
* * * * * * * * * *
8855 AAACAATTATTATAGGACTAAATAAAAGTTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
8920 CTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATATATTTATTTTTAAAATCTC-T-C--ACTAATATTTG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
8981 GAATATTATTAAATTAGTATTA-TTT-TGTCCATATAAGTTTGTATGATCAA--
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGA--AATG
* * * * * *
9031 AAA-AGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAT
1 AAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * **
9094 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAAAAAAACAACTTTA-GTTTTAAATCTTTTGTTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTC-AATAAACAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
9158 TTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAAATG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * *
9211 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AATTAGATAGTTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * *
9275 TCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATT
65 TCATAA-CTATTTGAACTAGTTCAATAAA-CAA-TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * ** * *
9339 TTTCAAATGTTAATAAATTACAATTATTTTA-TTCTGAATAAGTTTGTATGAACTG
126 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * *
9394 AAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAG
* * * * * *
9458 TCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTCAAAGCTCTTAC----TAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
9519 GGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAG
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * **
9571 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAACA--TCATAACGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
9634 TAATAACTATTTAAACTATTTCGGTAAATAGATTTAGTAAACGGATTTATTTTTTAAA--TC-T-
65 ---T--C-A--T-AACTATTT--G-AACTAG-TTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * ** *
9695 CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATG-AATA
116 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAT-
9759 G
180 G
* * * *
9760 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *** * *
9825 AT-ATGACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACAATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTT
65 -TCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * *
9887 CAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTT-GAATAAACTTGCATG-AATAG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * *
9940 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TA
* * ** * *
10004 G-CATAACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
64 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
10067 TGGAATATTAATAAACTAGCATTA-CTTATTTTGAATACA-CTTGTATGAATAT-
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATGAA-ATG
* * * * * * *
10119 AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTTAGATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
*
10184 CATAACTATTTGAATGTA-TTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTT
66 CATAACTATTTGAA-CTAGTTCA-ATAAACA-ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT
* *
10245 TTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTATATGAACA-G
127 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * * ** * * * * *
10299 AAATAATTATTTTATAATAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAGAAAATTATTTATATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *** * * *
10364 CATAACAATTGGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATCTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAA-CAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
10428 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATTAGCCTATATGAACTG
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * ** * ** *
10479 ATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
10544 TATGACTA-TCGAAACT-TTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTC
66 CATAACTATTTG-AACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
10607 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA-GAACA--
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * *
10657 AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
10721 TCACAACTATTTGAATTTA-TTCGGTAAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTAT
65 TCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * * *
10785 CTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGGTTGTAT-CAATAG
127 -TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * *** * * * *
10838 AAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGACATAGGTAATTGTTCAAGTAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
10903 CGTAATTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* **
10968 AAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTAT-GAATAAGCTTGTATG-AATAG
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * *
11019 AAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
* * * ** *
11084 T-ATAACTATTTGCA-TTGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAA-TAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTT
* * * ** *
11146 TT-AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAATTGTAT-CAATAG
127 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * * * * ** *
11200 CAATAATTGCTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAATTGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *** * **
11265 TATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATATTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTCA
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
11326 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACA-A
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* ** * * * *
11377 AAACATTTGTTTTAATGA-AAAACAAAAGGTCATAACAATTCGAAATAGATAATTATTCATACAG
1 AAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * **** * *
11441 CCTTTACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAAATTTCTTTTTTAAAAATCTCTTAGTTATTAA-TT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTT--AAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
11505 TTCATAATATTATTAGATTAGTAATTATTTTATTTTGGAATAAGCTTGTATGAACAT-
127 TTGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * * * * *
11562 AAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * * *
11627 TATAACTATTTGAACTAGTTCGCTAAAGAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGA
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * *
11692 AATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCCGAATAGGCTTATATG--ATG
131 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * ** *
11740 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** ** * *
11805 GCCACAATTATTTGAACT-GATTCGATAAATTGA-TT-TTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTT
64 GTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAA-CAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
11867 TTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-GGATAAGCTTTTATGAATTG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * *
11920 AAACAAATGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * *
11985 CATAACTATTTGAATTTGATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACA-ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
12050 TG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTACTTCGAATAAGCATT-TATGAACTA
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAAATG
* * * * * *
12102 AAACAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCTAATATT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
12167 CTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTATTAATTTTAG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* ** ** * * *
12232 -AATATTATTAGTTTAACAATATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATG-GATAG
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * * *
12282 AAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAATGGTTTGAGATAAATAATTGTTCACATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* *** *
12346 CATAA-TAATTTGAATTAGTTTGGTTAACAGATTTAGTTTTTT-AA--TC-T-CTTATTAATTTT
66 CATAACT-ATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** *
12405 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAATATTGTATG-AATAA
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* ** * * *
12458 AAACAATTTTTTTACAACCAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * ** *
12522 AT-GTGATTATTTGAACTTA-TTCAGTAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TT
65 -TCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
12584 TT-ATTATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATG-AATAG
127 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * *
12638 AAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
12703 TTATAACTATTTAAACTCA--TCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATT-A---
65 TCATAACTATTTGAACT-AGTTC-AATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* *
12762 ---AAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATG-AATAG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * ** * *
12813 AAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAAGGTCCTAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
12878 TCATAAATTTTTAAACAAGTT-AAGAAAATAGATTTATTTTTTTAAT-T-TTAACTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAA-TAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTT
* * * * **
12940 CTAAAATATTAAAAAATTTA-TATTGTTTT-TGTTCGAAATAAGCTTACATG-AATAG
127 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAT-TTCG-AATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * * * * * *
12995 AACCAATTGTTTTAAGA-TAAACGAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** ** * * *
13059 CATAACTATTTGAACTTA-TTTGATAAACAAATTCCTTTTTCAAATTTCTTACTCATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * ** * *
13123 AAAATATTAATAAATCAATATTATTTTACTTCAAATAAGGTCATATGAACTA
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * *
13175 AAATAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * **
13240 CATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCA
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * * * *
13305 AAATATTAATAAATTAAAATTATTTTA-ATCTAAATAAGTTTGAATGAACA-G
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * * * * * *
13356 AAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * *
13421 CATAACGATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTATC
66 CATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-
* *
13485 TT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATTAACT-
127 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAAATG
* * * ** ** * * ** *
13536 AAAAAATTGTTTTGTGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
13600 TAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTGAATCTCTTTCTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * *
13665 TTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGAATTG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * ** * *
13718 TAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ***
13783 CTTAACCATTTGAGCT-GATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TT-ATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * **
13843 GAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA-CAAACA
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * * * * ** **
13894 AAATAATTATTTTACGAGAAACCAAAACGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * ** *
13959 CTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCTAT-TA-GATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT
66 CATAACTATTTGAACTAG-TT--CAATAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * ** * *
14022 CAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATCAACA-G
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * * * * *
14075 AACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGACTTGGAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *** * *
14140 TAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTC
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-
* * * *
14204 T-AAATATTAATAAATTAGTAATA-ATGATTT-G-A-AA--TTG-AT-AATTG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
** * * * **** ** *
14248 -TTCAAATAG--TCATAATCATTTGAACTGGTTCAATAA--A--T--AA-A-ATTATT-TTCTAA
1 AAAC-AATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGG-TC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AA
* * * * * * * * *
14301 AT-CTCTTACAAATTTTTGAA-TAATT-AATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTA
61 ATAGTC--ATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAA-CA-ATTTATT-T-TTT---A-AATC-TCT-
* * ** * * ** ** *
14363 TGAGCTGAAATAATTACTTTATGACAA-AGCAA-AAGGTCA-TAACATTTTGAAAT-AAATAA--
114 T-A-CT----T-ATTAATTTTTGA-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGC
* *
14422 TTGTA-CATAT-
169 TTGTATGAAATG
** * * * *
14432 AGTCTTAATTGTTTGAACTATTTAGATAACTATTTACAAAAGTTCATAATGTTTTAAAATAGATA
1 AAAC--AATTGTTT----TA--T-GACAA--A---ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * ** *
14497 ACTATTTAGATAGTCATAGCTATTTGAGCTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTT
52 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * * *
14561 ACTCATTAATTTAAGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAGT-TGAAT
115 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAAA
14625 TG
179 TG
* * * * *
14627 AAACCATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * ** * * **
14692 CATGATTATTTCAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCA
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
14757 AAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATCCAAATAACCTTGTATAAACAT-
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
** *
14807 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
14871 TCATAAC-ATTTGAACTTGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTC
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-
* * *
14935 TT--AATATTGATAATTTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATG-AATAG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * * ** * *
14987 AAAAAAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
15052 TCATAA-TCATTTAAAGTTA-TTCGATAAATAGATTT-TTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTT
65 TCATAACT-ATTTGAA-CTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * **
15114 TTGGAATATTAATAAACTGGTGTTATTTTATTTCGAGTAAACTTATATGAACCG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * * * *
15168 AAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * * * * *
15233 CATGTCCATTTGATCTAGTTCGATCAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTT
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
15297 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCATGTATGAACA-G
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * ** * * *
15349 AAACAAATGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAG
* ** *
15413 TCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * *
15474 GAAATATTAGTAGATTAGTATTACTTTATTAT-GAACAAACTTATATGAACA-A
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * *
15526 AAACATTTGTTTTATGAAAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
15591 CATAATTATTTGAATTGGTTAGGCAA-ACAGA-AATATT-TTTTTTAAATATCTTACTTATTAAT
66 CATAACTATTTGAACTAGTT---CAATA-A-ACAAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * *
15653 TTTTGCAATATTAATAAATCA-TTTTATTTTATTTCAAATCAGCTAGTATGAATTG
125 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * *
15708 AAA-ATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * *
15771 TCTTAAATATTTG-A-TGGTT-TGTCAAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAAT-AAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
15832 T-AGAATATTAGTATATTTGTATTATTGTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-G
128 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * * * * * * * *
15885 GAATAATTATTTTGTGGCAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * * *
15950 CATAATTATTTGAACTAGTTTGATGAACAGATTTATATTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
16015 AAAGATTAATAAATTAGTATTATTATA-TTCTGAATAACCTTGAATGATCAA--
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA--AATG
* * * * * * * *
16066 AAACACTTGTTATATGACCAAACAAATGGTAATAATGGTTTGAAATAGATAAATGTTGC-AATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAG
* * * * * **
16130 CCATAATTATTTGAAAT-GATTCAGTAAATAGATTCCTTTTTTAAA--TC--A-TTGATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTT
* * * * * * *
16189 TTGGAATGTTAATAAATTTGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * ** *
16243 AAACAATTGTTGTATGACAAAACAAAA-TTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCGTATTGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
16307 CTTAACTATTTAAACTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAA-TTTTC
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
16371 ATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTGTGAACTA
130 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * * * *
16423 AAATAATT-ATTTA-GA-ATAGAATAAAACGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACA-A-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
16485 ---A-GA--A-TTG--CT--TT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATCTT
64 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
16538 TGAAATCTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTCCAAACAGGCTTGTATG--ATG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * *
16589 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATA
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *** * *
16653 GCCATAATTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTT
64 GTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
16713 TTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-TAATGAATTG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT-ATGAAATG
* ** * * *
16767 AAACAATT-TTTTAATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
16831 TCATAACTATTTAAATTTA-TTCAGA-AAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT
65 TCATAACTATTTGAA-CTAGTTCA-ATAAACA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
16894 TTTGAAATATTAAAAAATTGGTATTATTTTACTTT-GGATAACCTTTTATGAACTG
126 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * *
16949 AAGCAATTGCTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTTAAATA-TTAATCT-TTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAG
* * * * * *
17011 TCATAACTACTTGAGCTTA-TTTAGTAAAAAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAAT-AAACAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * ** *
17075 TTCAAATGTTAATATATTAGGATTATTTTGTTCTAAATAATAAGCTTGTATGATATG
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-T--CGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * * * * ** * * **
17132 AAACAAATATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * ** * * *
17196 TTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACACATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* **
17261 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAA
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--AAATG
* * * *** * *
17314 AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAATGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
17379 CATAATTATTT-AACTAATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC---TT-A---TT-
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * * *
17435 -AATA--AAT---TT-GTATTATTTTATTTCGTGTAAACTTGTATTAACTG
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* *** * *
17479 AAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** ** * * *
17544 TATAACTATTTGAACTTTTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA-ATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
* * *
17609 TG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCGAGTAAGC-----T----TG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATG
* * * ** * *
17652 AAACAAGTGCTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAA
1 AAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
17717 T-ATTAA-TCATATAAACTGGTTCGATAAACAA--T-TTTTTT-GATCTCTTATTTATTAA-TTT
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* * * *
17775 TGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACGAACA--
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * ** *
17827 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTGATAACT-ATTTGAAATAGATAATCATTCATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * * ** *
17891 TCTTAACTATTTGAACTCA-TTCAACAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT
65 TCATAACTATTTGAACT-AGTTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * * ** *
17955 CAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATG-AATAG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAT-G
* * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** *
18073 CA-AA--A--T----T--TTC--T--AC---TGATTAATTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TG
* * * *
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130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-ATG
** * * * * *
18170 AAACAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * * *
18235 TATAATTATTTTAACTA-TTCGGTAAATAGTATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTG
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
18299 AAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTAT-AAGCTG
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * ** * * * * *
18350 AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAACAATTATTTTATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
18415 TCTTAATTGTTTGAATTGGTTTAACAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
18480 -AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAACA-A
129 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-ATG
* * * * ** * *
18532 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
*
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CATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
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12582 TTTTATTATA
* * * *
12592 TTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA
1 TTAATAAAATAATATTATTTTATTATGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATAACA
* * ** * * * *
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* * *
12722 TCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAAAATG
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* * *
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* * *
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66 AAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTA
* * **
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TTAATAAAATAATATTATTTTATTATGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATAACA
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TCTAGAAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTAACTTATTAAAATG
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3822 ACTGATTCAG
* * * * * *
3832 TAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTTCCTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTAT
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * ** *
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* * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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** ** * * *
4247 TTTTGCTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAA
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* * * * * * ** *
4309 TTATTTGAGATAGATAATTGTTCAAAAAATCATAATTATTTGAA-TTGGTTCAATATAA-AGATT
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* *
4372 TAGTTTTTAAATCT-TT--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
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** * * ** * * *
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* * * * * *
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* * *
4539 TGAACAAATTTATTTTTTAAAT-T-TTCAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT--ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* *
4602 ATTTTATT-TCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
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* ** ** *
4666 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAATAAACAAATTT
128 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
* * * * * *
4731 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAGTTAGTATTATTTCATTTCAAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAA
* * * * *
4796 GAAGCTTTTATGAAC-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACA-ATTTTAAAT
254 TAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAAT
* * ** *
4859 AAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAAATGTTTAGA
317 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
* * * **
4902 -AAATATATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
4964 TTTATTC-GAAATATGCTTGCATGAATAGAACCAAATGTTTTATGAGAAAACAAAATGTCATAAT
66 TTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * *
5028 -ATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTGGT-AACAAGATTT
130 GA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAAC-ATATTT
* * * * * *
5091 A-TTTTTAATTCTCTTTCTCATTCATTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTT-T-TAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAA
* * * *
5155 TAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAG
254 TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAG
** * * * *
5220 ATAATAATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTAGG
319 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * ** *
5260 TAACA-AGATTTCTTTTTTAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAATTAGTATTA
1 TAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
5324 TTTTATT-TCAAATAAGCTTATATGAGCTA-AAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACA
65 TTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * ***
5387 ATGATTTGGAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTT
128 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
* * ** *
5452 ATTTTTTAAATAT-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATT-TTGTTAATCGA
193 ATTTTTTAAATCTCT-TACTAATTAATT-T-TTAATATTAATAAATTA-TATTATT-TTATTCG-
* * * * * *
5515 AATAAACATGTATG-AC-AGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATACCAG-TTTGAA
252 AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-AAGATTTGAA
* * * ** *
5577 ATAAATAATTTTTCAAATAGTCTTAAAGATTTGAACATGTTCAGA
315 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GA
* * * * * **
5622 -AAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTCTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * ** * *
5685 TTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAAATCATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAGT
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * ** * *
5748 GATTTTAAACAGATAATT-ATCAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTCGACAAACAAATTCA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA
* * ** * *
5812 TTTTTTTAATCTCTTAATTTTTAATTTTCATAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTCAAATA
194 TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT--TAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCGAATA
* * * * * * * * **
5877 GGCTTTTATGAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACCATTTGAAATAGAT
256 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGAT
* * * *
5942 AATTAG-TCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCTA
321 AATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
** * * * * *
5980 TAACCATATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * * *
6045 TTTCA-TCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAACTATTGTCTTATAACAAAAAAAAAGGTCATAAC
66 TTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * ** * * *
6109 AATTTGAAATAAATAATTGCACAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA
* * * *
6173 TTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAAT
194 TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAA-TTT-TTAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCG-AAT
* * ** * * *
6238 AAGTTTGTATGAA-TAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCA-ATTTCAAA
255 AAGCTTGTATGAACT---AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-AAGATTTGAAA
* * *
6301 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTC-T
316 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
* *
6344 TAAATAGATTCATTTTTTAAATCCATAAACAGATTTAATTCTTAAATTTCTTATTAATTTTTGAA
1 TAAATAGATTTATTTTTT-AA---AT---C---------TCTT--A---CTTATTAATTTTTAAA
* * * * ** * * **
6409 ATATCAATAAACTAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATAGTCATTTTATG
45 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * *** * * *
6474 ACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAATGGATAATAACTCAAAT-GACATGACTATTTTAACT
110 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * ** * *
6538 TGTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAG
175 TATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT-TAATATTAATAAATTA-
** * * *
6603 TATTATTTTATTTTAAATAA--ATGTATGAA-TAGAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACTAAAGA
238 TATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * ** * * * *
6664 TCA-AATGATTTGAAATAAAATAATTATTTGAATGGT-ATAACTATTCGAACTCGTTAG-
300 TCATAAAGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * *
6721 TAAA-AAATTGTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT-TTAATAAATTTGTATTA
1 TAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * *
6784 TTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAAT-GAAAC-ATTGGCTTATGACAAAACTAAAGGTCATAAC
65 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * *
6847 AATTTGAAAT-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACCTATTTGAAC-TGTTCAAGAAAACATATTT
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTATTC-GGTAAACATATTT
* * * *
6910 A-TTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCCAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATT-AATTTTT--AATATTAATAAA-TTATATTATTTTATT-C-G
* * * * *
6973 AATAAGCCTGCATGAAC-ATAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAA
252 AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAA
* * *
7037 TAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGATT-GG
316 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
* * *
7080 TAAATAGA-TTAATTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
7143 TTTATT-TCAAATAAGCTTATATAAACT-GAAACAATTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCACAA
66 TTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
7206 TGATTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATACTCATGACCATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTT
129 TGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
* * * ** * * *
7270 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGTAGAAATATTAATAAATTA-ATTTTTTTTAATCCAAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATT-T-TTAATATTAATAAATTATA-TTATTTT-ATTCGAA
* *
7334 TAAGCTTGTATGAAC-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACA-ATTTGAAAT
254 TAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAAT
* ** *
7397 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGGTCG-
317 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
** * * * * *
7438 --GGTAGATTTA----TTAGATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTCTT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * *
7495 ATTTTATTAAT-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTTA
64 ATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAATAG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * *
7559 TAATGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAAT
126 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATAT
* * * * * * *
7624 TCATTTTTTGAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTGATAACTTAATATTATTTTATTTTG
191 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-ATATTATTTTA-TTCG
* ** ** * *
7689 AATAAGCTTATATGAACCGAAATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
252 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAAT
* * * * *
7754 AGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGG
317 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * * * * *
7796 TAAAAATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * * * * **
7861 TTTAATCCAAATAAGCTTGTATG-A-ACAAACCATTATTTTATAACACAACAAAAAGCCATAACA
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* * * ** * * *
7924 ATTTGAAATAAATAAATGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATATTAATAAA
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* * * * ** *
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* * * * * * * ** * ** ** *
8046 ACAAAATAAAAAGTAATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTTAAAT-AGTTATA-ATTATTTGA
250 -C-GAAT---AAG--CT--TG-TATGAACTAAAACAATTGTTT-TATGA-CAAAACAAAAGGTCA
** * * * * * *
8108 -ACTGATTCTGTAAATAGAATTATT-TTCTAAAT-CTCTTATAA-AATTTTGAA-ATATT-AA
303 TAAAGATT-TG-AAATAG-ATAATTGTTC-AAATAGTC--ATAACTA-TTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
8165 TAAAT-TATTTCACTATATTCCAAATAAATTTCTATAAGCTAAAATAATTATTTTATGACAA-AA
1 TAAATAGATTT-A-T-T-TT----TTAAATCTCT-T-A-CT-TATTAA-T-TTTTA--A-AATAT
* * * ** * * * * **** *
8228 CAA-AAGGTCA-TAACAATTTGAGT-TAAATAA--TTGT-TCATATAGTCTTAATTGTTTGAATT
49 TAATAA-ATTAGT-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTT-TA-T
**** * * * * *
8287 GGTTCAGC-AAA---CATATTTATTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATT-TTCATAATA-TTACTA
109 GACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAA-----TAG--A-TAATTGTTCA-AATAGTCA-T-
* ** * * * * * * **** * * *
8346 AATTAGTATT-ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTATAGAATA
162 AACTA-T-TTGAACTTA-TTCG-GTAAACATAT-TTATTTTTTA-AA-TCTCTTA--CT--AAT-
* * * * * * ** *
8410 AAATGTTATAATAAT-ATGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGG
215 TAAT-TTTTAATATTAAT-AAAT-TAT-ATTATT---TTA-TTCGAA-TA----AGCT----T-G
* * * * *
8474 TAAAAAGATTTATTTTTTAAAAACAATGGTTTTATGA-TAGACAAAAGG-CAATAATA-ATTTGA
262 T---ATGA---A----CT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAA-AGATTTGA
* * * * * * * *
8536 AATAAATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAACTTATT-TA
314 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
8580 GTCAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTTTCAAAATAATAATAAAGTAGTATT
1 -T-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
8644 ATTTTCTTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
8707 ATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTATTCGATAAACACATTT
128 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
** * * * * *
8772 ATCTTTTCGAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAA
193 AT-TTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT-CGA
* * * * * * * * * * * *
8837 ATAAGCGTGTATAAACTGAAACAATTATTATAGGACTAAATAAAAGTTTAGAATGATTTGAAATA
253 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATA
* * * *
8902 GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTC-A
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * ** *
8942 GTAAATATATTTATTTTTAAAATCTC-T-C--ACTAATATTTGGAATATTATTAAATTAGTATTA
1 -TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
9003 TTTT-GTC-CATATAAGTTTGTATG-ATCA-AAAAAGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCAT
65 TTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ***
9063 AATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAAAAAAACA-A
127 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTC-GGTAAACATA
* * ** * *
9126 CTTTA-GTTTTAAATCTTTTGTTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
190 -TTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAA-TTTTT-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TT
* * * * * *
9190 CGAATAAGTTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-A
250 CGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGA-TTTGA
* * *
9254 ATTAGATAGTTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGA
314 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * **
9299 TAAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACAATT
1 TAAATAGA-TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
9364 ATTTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** *** *
9428 ACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACATT
128 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATT
* * ** * *
9492 TATTTTTCAAAGCTCTTACTAATT--TTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAAT
192 TATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATTA-TATTATTTT-ATTCGAAT
* * * *
9555 AAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAACA--TCATAACGATTTGAGATA
255 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAAAGATTTGAAATA
** * *
9617 GATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTAT-TTCGGTAAA
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTC-G---A
*
9662 TAGATTTAGTAAACGGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAT
1 TA-A---A-T--A--GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* ** * *
9723 TAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAA
57 TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAA
* * * * *
9788 GGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGAT-ATGACTATTTGAACTTATTTGGTAA
121 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAA
* *
9852 ACA-ATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCT-ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
185 ACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTAATTAATTTT--TAATATTAATAAATTA-TATTATTT
* * * * * **
9914 TAGTTTGAATAAACTTGCATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACTA
246 TA-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGA
* * * *
9978 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTCGG
309 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* ** * *
10028 TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * *
10091 CTTATTTTGAATACA-CTTGTATGAATATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
66 TTTATTCTGAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *
10155 TATTTAAAATAGATAATTATTTAGATAATCATAACTATTTGAA-TGTATTCAGAAAACATATTTA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTCGGTAAACATATTTA
* *
10219 TTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAA
194 TTTTTT-AAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCG-AA
* * * * * ** *
10282 TAAGCTTATATGAAC-AGAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATA
254 TAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
10346 GAAAATTATTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTGTTTGG
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * *
10387 TAAATAAATTTATCTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * ** *
10451 TTTATT-TCGAATTAGCCTATATGAACT-GATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAA
66 TTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * **
10514 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTA-TCGAAACTT-TTCAATAAACATATTT
129 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTTATTCGGTAAACATATTT
* * * **
10577 ATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATT-T-TTAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-ATTCGAA
* * *
10642 TAAGCTTGTA-GAAC-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
254 TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAAAGATTTGAAATA
* * * * *
10704 AATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTCGG
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
10745 TAAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTATCTT--AATATTAATAAATTTGTATT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
10808 ATTTTAAT-TGAAATAAGGTTGTATCAATAGAAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATA
64 ATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
*** * * * * * * * ** *
10872 GCAATTTGACATAGGTAATTGTTCAAGTAATCGTAATTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTT
128 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
* * * * ** *
10937 AGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTATGAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT-CGAA
* * * *
11002 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTGAAATA
254 TAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATA
* * * *
11066 GATAATTGTTCAAACAGAT-ATAACTATTTGCA-TTGGTCAA
318 GATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
** * * * *
11106 GCCAACAGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATT
1 -TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
** ** * * * * *
11170 ATTTTATTCCAAATAAAATTGTATCAATAGCAATAATTGCTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
64 ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** * * * * *
11235 CGATTTAAAATAAATAATTACTCAAATTGTTATAACTAATTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGATTT
129 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATATTT
* * *** * *
11299 ATATTTTAAATCTCTTAATAATT--TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATT-CGAATA
* * * * *
11362 AACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAATGA-AAAACAAAAGGTCATAACA-ATTCGAAATAG
256 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
11425 ATAATTATTCATACAGCCTTTACTATTTGAACTGGTTTGG
319 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * * * * *
11465 CAAACAAATTTCTTTTTTAAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTAAT
1 TAAATAGATTTATTTTTT--AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT-AT
* * * * * * * *
11530 TATTTTATTTTGGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTAT
63 TATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
11595 AACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TAGTTCGCTAAAGA-AT
127 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATAT
* * *
11658 TTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCCG
191 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT-CG
* * *** * *
11723 AATAGGCTTATATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACA-ATTTGAAA
252 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAA
* * * *
11787 TAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTTGAAC-TGATTCGA
316 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
* ** * * * *
11830 TAAATTGA-TT-TTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
11893 TTTATT-TGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAAATGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATG
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * *
11957 ATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGATTCGGTAAACATATTTAT
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATATTTAT
* * * * *
12022 TTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTACTTCGAATA
195 TTTTT-AAATCTCTTACTAATTAATTTTT-AATATTAAT-AAATTATATTATTTTA-TTCGAATA
* * * *
12087 AGCATT-TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGA
256 AGC-TTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGA
* * * * * *
12151 TAGTTGTTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAA
320 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * * * * ** ** *
12190 CAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTATTAA-TTTTAGAATATTATTAGTTTAACAATAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
12254 TTTACTTC-GAATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAAT
66 TTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * *
12317 GGTTTGAGATAAATAATTGTTCACATAGTCATAA-TAATTTGAA-TTAGTTTGGTTAACAGATTT
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATATTT
* **
12380 AGTTTTTT-AATCTCTTATTAATT--TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
193 A-TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTC-GAAT
** * ** * *
12442 AATATTGTATGAA-TAAAAACAATTTTTTTACAACCAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTGAAATA
255 AAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAAAGATTTGAAATA
* * * * * *
12505 GATAATAGTTCAAATGGAT-GTGATTATTTGAACTTATTC-A
318 GATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * ** * ** *
12545 GTAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TTTTATTATATTAATAAAATAGTATTA
1 -TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
12609 TTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAA
65 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
12674 TGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTCA-TCTGGTAAACAAATTT
129 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC-GGTAAACATATTT
* * * * * *
12738 ATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-----AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATT-CGAATA
* * *
12798 AGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAAGGTCCTAACA-ATTTGAAATA
256 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATA
* * * * * ** *
12861 AATAATTATTCAAATAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGA
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-CGA
* * *
12903 -AAATAGATTTATTTTTTTAAT-T-TTAACTTATTAATTTCTAAAATATTAAAAAATTTA-TATT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * ** * * * * *
12964 GTTTTTGTTC-GAAATAAGCTTACATGAATAGAACCAATTGTTTTAAGA-TAAACGAAAGGCCAT
64 -ATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
13027 AATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATT
127 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATT
** * * * * *
13092 CCTTTTTCAAATTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTACTTCAA
192 TATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAAT-TATATTATTTTA-TTCGA
* ** * * * * *
13157 ATAAGGTCATATGAACTAAAATAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
253 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATA
* *
13222 GATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGA
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * **
13263 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * *
13328 TTTAATCTAAATAAGTTTGAATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAAGTCATAATA
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * *
13393 AGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATT
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATT
*
13458 TTTTAAATCTTTTACTAATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAA
196 TTTTAAATCTCTTACTAATTAATT-T-TTAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCG-AATAA
* * * ** ** * **
13523 GCTTGTATTAACTAAAA-AATTGTTTTGTGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGGC
257 GCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATT-TGAAATAGAT
* * *
13586 AATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGA
321 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * ** *
13624 TAAATAGATTTATTTTTTTGAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
13689 ATTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATTGTAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAAC
65 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * * *
13754 AATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAGCTGATTTGGTAAACAAATTTAT
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTAT
*
13819 TTTTTAAATCTCTTA-T--TT-ATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATA
195 TTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT-AA-TATTAATAAATTA-TATTATTTT-ATTCGAATA
** * * * * * * * *
13880 AGCTTGTACAAAC-AAAATAATTATTTTACGAGAAACCAAAACGTCATAATGATTTGAAATAAAT
256 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGAT
** ** * * *
13944 AATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGC
321 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
* * * ** * * *
13983 T-ATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * * * *
14047 TTTATT-TCAAATAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAAT
66 TTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * ** * * * *
14111 GACTTGGAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTAC
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTAT
* * *
14176 TTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATGATTTGAAATT-
195 TTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT-T-AATATTAATAAATTA-T-AT--T-ATTT--TATTC
* * ** * ** * * * **
14240 G-ATAA--TTGT-TCAAATAGTCATAATCATTTGAACTGGTTCAATAAATAAAATTATTTTC-TA
251 GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT-TA-T-G-AC-A-AAA-CAAA--A-GGTCATA
** * * ** ** *
14300 AATCTCTTACAAATTTTTGAATAATTAAT-AAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTAT
305 AAGAT-TT-GAAA---TAG-ATAATTGTTCAAA-TAGTCATA-ACTATTT-G---AA-CTTGT-T
14364 -GA
356 CGA
** * *** * * * *
14366 GCTGAAATA-A-TTACTTTATGACAAAGC-AAAAGGTCA-TAACATTTTGAAATA--AAT-AATT
1 --T-AAATAGATTTA-TTT-T-TTAAATCTCTTA-CTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATT
* * * * ** * **
14424 -GTA-CA-TATAGTCT---TAA--TTGT-T---T-G-AACTA-T-TTAGATAACTATTTACAAAA
58 AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-A-AAACAAAA
* * * * * * * * *
14473 GTTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAGCTATTTGAGCTTATTCGGTAAA
121 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAA
* * * *
14538 CAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTAAGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
186 CATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTT--TTAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA
* * * * * *
14603 TTTCAAATAAGCTTAGT-TGAATTGAAACCATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATT
248 -TTCGAATAAGCTT-GTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATT
* * * * * * * *
14667 TGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGATTATTTCAATTTGTTCGG
311 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * *
14715 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * *
14779 TTTAATCCAAATAACCTTGTATAAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAAC
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAAT
* * * * * * *
14843 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTTGATAAAGAGATTTAT
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTAT
* * * * *
14907 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTGATAATTTTGTATTATTTTATTCGAAATA
195 TTTTTAAATCTCTTACTAATTAATT-T-TTAATATTAATAA-ATTATATTATTTTATTCG-AATA
* * * * * ** * *
14972 AGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAA
256 AGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAG
* * *
15036 ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TCATTTAAAGTTATTCGA
319 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGA
* * ** * * *
15076 TAAATAGATTT-TTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTGGTGTTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * * *
15140 TTTATT-TCGAGTAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAAC
66 TTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * ** * * * *
15204 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGTCCATTTGATC-TAGTTCGATCAACATATTTA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATATTTA
* * *
15268 TTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-GA
194 TTTTTT-AAATCTCTTACTAATTAATT-TT-TAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-AT-TCGA
* * * * ** * *
15331 ATAAGCATGTATGAAC-AGAAACAAATGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAAAT
253 ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAAT
* * *
15395 AAATAATT-TGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGA
317 AGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * *
15437 TAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTAC
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * *
15498 TTTATTATGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAAAAAACAAAATGTTATAATG
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * *
15563 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGCAAACAGAAATAT
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAAC--ATAT-T
* * * * *
15627 T-TTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATCATTTTATTTTATTTCAAA
192 TATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTATATTATTTTA-TTCGAA
* * * * * * *
15691 TCAGCTAGTATGAATTGAAA-ATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACA-TTTTGAAATA
254 TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATA
* * * * *
15754 GATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTG-A-TGGTTTG-
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * * * *
15792 TCAAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAGTATATTTGTATTA
1 T-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * * * * *
15856 TTGTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGGAATAATTATTTTGTGGCAAAACAAAAGGTTATAAC
65 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *
15921 GATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTTTGATGAACAGATTTA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATATTTA
* * * * *
15985 TATTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTATATTCTGAAT
194 TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTC-GAAT
* * * * * * * * * * *
16050 AACCTTGAATGATCAAAAACACTTGTTATATGACCAAACAAATGGTAATAATGGTTTGAAATAGA
255 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGA
* * * * *
16115 TAAATGTTGC-AATGGCCATAATTATTTGAA-ATGATTC-A
320 TAATTGTT-CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
** ** * * *
16153 GTAAATAGATTCCTTTTTTAAA--TC--A-TTGATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTTGAATT
1 -TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * *
16213 ATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTGTATGACAAAACAAAA-TTCAT
64 ATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * ** * * * ** *
16275 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCGTATTGTCTTAACTATTTAAAC-TACTTCGACAAACAAAT
127 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATAT
* * * * *
16339 TTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCA
191 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT--TAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCG
* * * * * * *
16404 AATAAGCTTGTGTGAACTAAAATAATT-ATTTA-GA-ATAGAATAAAACGTTATAATGATTTGAA
252 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACA-A-AACAAAAGGTCATAAAGATTTGAA
* * *
16466 ATAGGTAATTATTCAAATA---A-GA--A-TTG--C-T-TT-GA
315 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
16498 TAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATCTTTGAAATCTTAATAAATTAGTATTAG
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * *
16563 TTTATTCCAAACAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAAT
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * *
16626 GATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAGATTCA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATATTTA
* * * ** *
16690 CTTTTTAAATCACTTATTAATT--TTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAA
194 TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAATAA
* * * ** * * *
16753 GCTT-TAATGAATTGAAACAATT-TTTTAATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATATA
257 GCTTGT-ATGAACTAAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGA
* * * *
16816 CAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTATTCAGA
320 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GA
* * * * * *
16856 -AAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTGGTATTA
1 TAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
16920 TTTTACTT-TGGATAACCTTTTATGAACT-GAAGCAATTGCTTTATGACAAAACAAAA-GTCATA
65 TTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** * *
16982 ATGATTTTAAATA-TTAATCT-TTCAAATAGTCATAACTACTTGAGCTTATTTAGTAAAAAAATT
128 ATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATT
* * * * * *
17045 TATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATATATTAGGATTATTTTGTTCTA
192 TATTTTTT-AAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTC--
* * * * * * * *
17110 AATAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACA-ATTT
251 --GAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTT
* * ** ** * *
17172 AAAATAGATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGA
312 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
17219 CAAACACATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
17284 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAATGGTTATAG
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATG--AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * *
17349 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTT-AACTAATTCGATAAACAAATTTA
129 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA
* ** *
17413 TTTTTTAAATCTCTTAC---TT-A---TTAATA--AAT---TTGTATTATTTTATTTCGTGTAAA
194 TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATTATATTATTTTA-TTCGAATAAG
* * * * * *
17466 CTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAGCA-ATTTTAAATAGACA
258 CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-AAGATTTGAAATAGATA
* * *
17530 ATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTTTTCGG
322 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * ** *
17567 TAAATAGATTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAATAGATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
17632 ATTTATT-TCGAGTAAGC-----T---T-GAAACAAGTGCTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAA
65 TTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * ** *
17687 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAAT-ATTAA-TCATATAAACTGGTTCGATAAACA-A-
128 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACT-ATTTGAACTTATTCGGTAAACATAT
* * * * * *
17748 -T-TTTTTT-GATCTCTTATTTATTAATTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCGA
191 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT-TAATATTAATAAA-TTATATTATTTT-ATTCGA
* * * * **
17810 ATAAGCTTGTACGAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTGATAACTATTTGAAATA
253 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATA
** * * ** *
17874 GATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTCATTCAA
318 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * ** * * *
17915 CAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** ** * * * * *
17980 TTTATTCCAAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATG
66 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* *
18045 ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTC---A--A----AA-TT-TTC--T--AC-TGA-TTA-
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAT-ATTTAT
* * *
18092 --ATTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACA
195 TTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTT-T-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAATA
* * * ** * * * * *
18155 AACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAAT
256 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGAT
* * * * *
18220 AATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTTAAC-TATTCGG
321 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * *
18257 TAAATAG-TATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTA
1 TAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * **
18321 TTTTATTCTAAATAAACTTGTAT-AAGCT-GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATA
65 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA--TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * **** **
18384 ATGATTTGAAATAAACAATTATTTTATATAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGGTTTAACAAACGGAT
128 ATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATAT
* * * * *
18448 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTA
191 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTC-G
* * * * * *
18513 AATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATAACA-ATTTGAAA
252 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAA
* * *
18577 TACATAGTTGTTCAAATAGTTATAACTATTT--A--T-TT---
316 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * ** *
18612 T---TAGATCT-CTTAGT-AAT-TC-T--TGA--AA----T---A--TTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
18657 TTTATT-TCAAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAA
66 TTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** ** * * * * **
18720 CAATTT-ATAATTTATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAAC-TAATT
129 TGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAT-ATT
* * * * * *
18783 TATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTGG
192 TATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGA
* * * * *
18848 ATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATA-ATTTTAAGT
253 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAAT
* * * *
18912 AGATAATTGTTCAAAT-GATAATAACTATTTGAGCTTGTTTGG
317 AGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * ** *
18954 TAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
19019 TTTTATTCTAAATAAAGCTTGTATAAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTTAGAA
65 TTTTATTCTGAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** * * * * ** *
19084 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAA-TCACTTGAAATGATTTGACAAACACATTT
129 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
* * * * *
19148 ATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTCAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGAA
193 ATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT--AATATTAATAAATTA-TATTATTTT-ATTCGAA
* * * ** *
19213 TAAGCTTATATG-A-TAAGAA-ATAGTTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGAG
254 TAAGCTTGTATGAACTAA-AACA-A--TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAA
* * * *
19274 ATTGATATTTGTTCAAAT-GATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGA
315 ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA
* * * * * * * *
19319 -AAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAATATTAATGAAGTAATATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** *
19383 TTTATT-TCGGATAAATTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
66 TTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
19446 CGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATGGTTATATCTATTTGAACTTGTTAGGTAAACATATTAA
129 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA
* * * **
19511 TTTTTTTAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAA
194 -TTTTTTAAATCTCTTACTAATTAA--TTTTTAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAA
* * * * *
19576 TAAGCTTGTATGAACTGAGATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
254 TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAG
* * *
19641 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA
319 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
19672 TTAGATCAGT
Statistics
Matches: 11904, Mismatches: 2688, Indels: 1771
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
333 2 0.00
334 160 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATT
TTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTAATATTAATAAATTATATTATTTTATTCGAATAAGCTT
GTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTG
TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
Found at i:15632 original size:541 final size:536
Alignment explanation
Indices: 2061--21253 Score: 8966
Period size: 539 Copynumber: 35.6 Consensus size: 536
2051 GCAAACATAT
* * * * *
2061 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
* * * * * * *
2125 AAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGCCATAACAAGTTGAC
65 AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* ** * * * * *
2189 ATAAATAATTACACAAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTAGGTAGACAAATTTATTTTTTA
129 ATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * * * *
2253 AATCTTTTACATTTTTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGAATTATATT-ATTTGAAATAAGA
192 AATCTCTTAC-TTATTAATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGC
* * * * * * * * * *
2316 TTGTATGAATAGATAA-AATTCTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAA
253 TTGTATGAACAGA-AACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
2380 TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATTTTTCAGTAAACAGATTCATCTTTTTAAATTTTTTT
317 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGA-TAAACAGATTTAT-TTTTTAAA----TCT
* * * * * *
2445 A-TTATTAATTTTTGAATTACTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACT
376 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACA
* * * * * * * *
2509 GAAACATTTCTTTTATG-----AC--AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAAAT
440 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
2567 CATGATTATTTGATCT-AGTTCA-GTAAACA-TA
505 CATAATTATTTGAACTGA-TT-AGGTAAATAGAA
* ** * *
2598 TTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * *
2661 AATAGGCATGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAAGTCATAA-GATTTAAAA
66 AATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* ** * * * * * *
2724 TAAATAATTGCTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAAATAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAT
130 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * ** *
2789 CTCTTA-TTAAT-A-TTTGAAATATTAATAGATTAGTATTA-TTTATTTTGAACAAATTTATATG
195 CTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
2850 AACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTGGAATAGATAATTGTTCA
260 AACAGAAA-CAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * * *
2914 AATAATCATAATTATTTAAACTGGATAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTTA
324 AATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAA
* * ** * *
2979 TTTTTGAAAAATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAGT-AAGTTATTATGAAATCAAAAAC
385 TTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTGAA-TAAACTT-GTATG-AA-CAAAAAC
* * * * * * *
3042 -CTTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATACAATCTTA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
3106 AATATTGGAACTGATTCGGT-AATA-AA
509 ATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * * *
3132 TTTATTTTTTAATTCTCTTAGCCT-TTAA-TTTTCATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATT
1 -TTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * *
3195 TCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAACAATTTG
63 TCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTG
* ** * ** * * * * *
3260 AAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCATTGCTGTTTAAACTAGTTCGATAAATAGATTTCTTTTTTA
127 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * * ** **
3325 AATATCCTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAA-TAGTATTATTGTATTCCGAATAAAATTG
192 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTG
* ** * * * * * *
3389 AATGCTCA-AATACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG
256 TATGAACAGAA-ACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-
* * * * * * *
3453 A-T-AACAT-GATCATAATTATTTGAATTGATTCGATAAACAAATTCACTTTTTAAAT-AACTTA
319 ATTCAA-ATAG-TCATAACTATTTGAACTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTA
* * * * **
3514 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGACCTGAAAC
381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * * * * *
3579 AATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
3644 ACTGTTT-AACCT-ACTTCA-GCAAACAGAT
509 ATTATTTGAA-CTGA-TT-AGGTAAATAGAA
* * * * *
3672 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * * * * *
3737 AATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTCACGATAGAACAAAAGGTTACAACAATTTAAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * *
3802 AGATAATTATTTAAATAG---GAACTGA-TT---C-AG-T--A-AATAGATA--TATTTTTTAAA
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTCGATAA-ACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
3853 TCTCTTTCCTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCAGATAAGCTTTT
194 TCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGT
* ** * * * ** *** * *
3917 ATAAATTGAAA-ATTTTGTTTTATGATACAACAAATGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGT
257 ATGAACAGAAACA-ATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * **
3981 TCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTA
321 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AAA--T-CTACTTA
** * * * *
4046 TTAATTTTCTG-AATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGCATGAACTGAAA
381 TTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAAC-AAAA
* * * * * * **
4110 A-TACTATTTTATGAC-AAGCAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATTTTC-
443 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
4172 TTATCTATTTGAA-TTAGTTTGGCAAACACAT
507 TAAT-TATTTGAACTGA-TTAGGTAAATAGAA
* * * ** *
4203 TTATTTTTTAAA--TCTT--TTATT-A-----G-AATATTATTAATTTA-TCAATATTTTGCTCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTC
** * ** *
4256 AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAATTATTTGAG
65 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * * *
4318 ATAGATAATTGTTCAAAAAATCATAATTATTTGAATTGGTTCAATATAA-AGATTTAGTTTTTAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATA-AACATATTTATTTTTTAA
* * * **
4382 A--TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGT
193 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT
* * * * * *
4443 ATGAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAATA-TAATAAC-ATTTTGATATAGATAA-TA
257 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAA-AGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * *
4505 GTTCAAATGGACATGACTATTT-AAGCTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATTTTCAACT
320 -TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA---TCTACT
* * *
4569 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAA
379 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAAAA
* *
4634 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
443 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
4699 TAACTATTTGAACTTGCTCA-ATAAACA-AA
507 TAATTATTTGAAC-TGATTAGGTAAATAGAA
* * * * *
4728 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAGTTAGTATTATTTCATTTC
1 -TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * *
4793 AAAGAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTTAAA
65 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
4858 TAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-AATGTTTAGA-AAATATATTTA-TTTTTAA
130 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-G-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAA
* ** * * * *
4920 AT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTTATTATTTTATTCGAAATATGCTTGC
193 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT
* * * * * * * * *
4984 ATGAATAGAACCAAATGTTTTATGAGAAAACAAAATGTCATAA-TATTTTAAAATAGATAATTGT
257 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTAT
* *
5048 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTGGT-AACAAGATTTA-TTTTTAATTCT-CTT-TCT
321 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTACTTAT-T
* * * * * *
5109 CATTCATTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAA
383 AATT--TTT-GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAAAA
* * * ** *
5174 ACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAGATAGTCA
443 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* *
5239 TAACTATTTGAACATG-TTAGGTAACA-AGAT
507 TAATTATTTGAAC-TGATTAGGTAA-ATAGAA
* * * * * *
5269 TTCTTTTTTAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * *
5334 AATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGGAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * *
5399 AGATAATTATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAATA
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATC
** * * * *
5464 T-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATT-TTGTTAATCGAAATAAACATGTA
196 TCT-TACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTAATCTAAATAAGCTTGTA
* * * * *
5527 TG-ACAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCAT-ACCAGTTTGAAATAAATAATTTTT
258 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATT
* ** * * * *
5590 CAAATAGTCTTAAAGATTTGAACATGTTCAGA-AAACATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATT
322 CAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TCTACTTATT
** ** *
5654 AATTTTT-AGAATATTAATAAATTTCTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACA
383 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC-
** * ** * * * *
5717 AATCATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAGTGATTTTAAACAGATAATT-ATCAAAATAGTCAA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCAT
* * ** *
5780 AATTATTTAAACTTG-TTCGACAAACA-AA
508 AATTATTTGAAC-TGATTAGGTAAATAGAA
* * * * *
5808 TTCATTTTTTTAATCTCTTAATTTTTAA-TTTTCATAATATTAATAACTTAGTATTATTTTA-TT
1 TT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
5871 CAAATAGGCTTTTATGAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACCATTTGAA
64 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * *
5936 ATAGATAATTAGTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCTATAACCATATTTATTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * *
6001 TTTCTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTCATCCAAATAAGCTTATA
194 TCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTA
* * * * * * ***
6066 TGAACAAAAACTATTGTCTTATAACAAAA-AAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCA
258 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* * *
6130 CAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAT
322 CAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AA-A-TCTACTTAT
* * * ** *
6194 TAATTTTCT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAA
382 TAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAACTTGTATG-A-ACAAAA
* ** * * * *
6258 AAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
443 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ***
6323 TAATTATTTAAACTTG-TTTCTTAAATAG-A
507 TAATTATTTGAAC-TGATTAGGTAAATAGAA
*
6352 TTCATTTTTTAAATCCATAAACAGATTTAATTCTTAAATTTCTTATTAATTTTTGAAATATCAAT
1 TT-ATTTTTT-AA---AT---C---------TCTT--A---CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * ** ** * * **
6417 AAACTAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAGAAATAGTCATTTTATGACAAAAC
44 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * *
6481 AAAATGTCATAAAGATTTGAAATGGATAATAACTCAAAT-GACATGACTATTTTAACTTGTTC-A
108 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGA
* **
6544 GTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTA
173 -TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
6608 TTTTATTTTAAATAA--ATGTATGAATAGAAAACAATTGTTTTATGA-AAAAC-TAAAGATCA-A
236 TTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAG-TCATA
* * ** * * * *
6668 ATGATTTGAAATAAAATAATTATTTGAATGGT-ATAACTATTCGAACTCGTTAG-TAAA-AAATT
299 ACGATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATT
*
6730 GTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT-TTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTG
362 -TATTTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TG
* * ** ** * *
6794 AATAAGCTTTTATGAA-TGAAAC-ATTGGCTTATGACAAAACTAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
422 AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
6857 -GATAATTGTTCAAATAGTCATAACCTATTTGAACTG-TTCAAGAAAACATAT
486 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TTATTTGAACTGATT-AGGTAAATAGAA
* *
6908 TTA-TTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAAATTTTT-AGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
6969 CCAAAATAAGCCTGCATGAACAT-AACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTT
63 TC-AAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * *
7033 GAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC-ATGATT-GGTAAATAGA-TTAATTT
126 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-G-TTCGATAAACATATTTATTTT
* * * *
7095 TTAATTCTCTTACTCATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGC
189 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGC
* * * * * * * *
7159 TTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCACAATGATTTGAAATA-ATTAA
253 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAA
* * * * *
7223 TTATTCAAATACTCATGACCATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
317 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TAC
* * * * * *** * *
7288 TTATTACTTGTAGAAATATTAATAAATTAAT-TTTTTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
378 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAAA
* * *
7352 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
442 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** ***
7417 ATAAAGATTTGAAC---TT-GGTCGGGTAG--
506 ATAATTATTTGAACTGATTAGGT-AAATAGAA
* * * * * *
7443 --ATTTATTAGATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTCTTATTTTA-TT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * *
7503 AATAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATT
64 CA-AATAAGCTTGTATGAACT-G--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * * * * *
7567 TCAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAATTCATTTTT
125 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTT
* * * * * * * * *
7632 TGAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTGATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCT
190 TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCT
* * ** * * * *
7697 TATATGAACCGAAATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
254 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
7762 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAAAATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTT
319 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA---TCTACTT
* * *** *
7827 ATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC--AAA
380 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAA
* * * * * * * * *
7890 CCATTATTTTATAACACAACAAAAAGCCATAACAATTTGAAATAAATAAATGCTCAAATAGTCAT
444 CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
7955 AACTATTTGAACTGGTTTGATAAATATTAA
508 AATTATTTGAACTGATTAGGTAAATA-GAA
* * ** * *** * ** * *
7985 TAAATTAGTATTAT-T-TTA-TT-TTGAACAAACTT---ATATTAACAAAAAAAAATATTGTTTT
1 TTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATT--A-ATTTTTGAAATATT-A-ATAAATTAGTATTATTTT
* ** ** * ** ** * *
8043 ATTACAAAATAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-T-A-AATAGTTATAA--TT
60 ATTTC-AAAT---AAGCTTGT-ATGAACTGAAACA-ATTGTT-TTATGACAA-A-ACAAAAGGTC
* * * *
8102 ATTTGAACTGATTCTGTAAATAGAATTATT-TTCTAAAT-CTCTTATAA-AATTTTGAAATA-TT
116 A--T-AAC-GATT-TG-AAATAG-ATAATTATTC-AAATAGTC--ATAACTA-TTTGAACTAGTT
* * * * *
8163 -AATAAA-TTATTTCACTATATTCCAAATAAATTTCTATAAGCTAAAATAATTATTTTATGACAA
170 CGATAAACATATTT-A-T-T-TT----TTAAATCTCT-T-A-CT----T-ATTAATTT-TGA-AA
** * * ** * * * * **** *
8226 -AACAA-AAGGTCA-TAACAATTTGAGT-TAAATAA--TTGT-TCATATAGTCTTAATTGTTTGA
217 TATTAATAA-ATTAGT-ATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTA
* **** * *** * *** * **
8284 -ATTGGTTCAGCAAA--CATATTTATTTTTAAATTTCTTAGTTATT--AATTTTCATAA-TA-TT
279 TAATAAAACA-AAAAGTCATAACGA-TTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * *
8342 --AC----T-A-AATTAG-TATTATTTTATT---TCGA---A-TAAGCTTGTATG-AATA-GAA-
341 GAACTGTTTGATAAACAGAT-TTATTTT-TTAAATCTACTTATTAA--TT-TTTGAAATATTAAT
* * * * * * * * *
8388 ACAATT-GT-TT-TATTA-TAGAATAAA-ATGTTAT-AATAATATGA-AATAG-ATAATTGTTCA
401 A-AATTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTTG-TATGAACAA-A-AACAATTGTTTTA-TG-ACA
* * * * * * * * * **
8445 AATAGTTATAACT-ATTTGAACTAGTTTGGTAAAAAGATTTATTTTTTAAA-A-ACAATGGTT-T
460 AA-A--CAAAAGTCA--T-AACGA-TTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTC-ATAATTAT
*** ** *
8506 TATGATAGACAAAAGGCAATAATAATTTGAAA
514 T-TGA-ACTGATTAGG---T-A-AA-TAG-AA
* * * **
8538 TAAATAGTTGTTTAAATGGC-CATAATTATTTGAACTTATTTAGTCAACTGATTTATTTTTTAAA
1 T---TA-TTTTTTAAAT--CTCTTACTTA-TT-AA-TT-TTT-G--AA---A--TA-TTAATAAA
** * * * * * ** * * *
8602 TCTCTTAGTTA-TTAACTTTCAAAATAA---T-AATAAAGTAGTATTATTTTCTTTTGGATAAGC
47 T-TAGTA-TTATTTTA-TTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACA-ATTGTTTT--ATGA-C
* ** * * * * * *
8662 TTTTATGAACTAAAA---CA-ATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT--TG
103 ----A-AAAC-AAAAGGTCATAACGATT-TGA-AATAGATAA--T--TA-----TTCAAATAGTC
* * * * *
8721 ATAA-T-TGTTCAAATAG-TC-AT-AAC-TCTTTGAACTTATTCGATAAA-CACATTTATCTT-T
151 ATAACTAT-TTGAACTAGTTCGATAAACATATTT--A-TT-TT--TTAAATCTC--TTA-CTTAT
* * *
8778 TCGAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
206 T--AAT-T-TTG---A--AA----T---A--TTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGC
* * * * * * * * * * *
8843 GTGTATAAACTGAAACAATTATTATAGGACT-AAA-TAAAAGTTTAGAATGATTTGAAATAGATA
253 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA-TAATAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
8906 ATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATATATTTATTTTTAAAATCT-CTC
316 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTT
* * * * * ** ** *
8970 ACTAATATTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-GTCCATATAAGTTTGTATGATCAAAAA
380 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGA-ATAAACTTGTATGAACAAAAA
* * * * * *
9034 -AGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATATTCA
444 CA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * *
9097 TAACTATTTGAACT-AGTTCA--AAAAAACAA
507 TAATTATTTGAACTGA-TT-AGGTAAATAGAA
* * ** * *
9126 CTT-TAGTTTTAAATCTTTTGTTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
1 -TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
9190 CGAATAAGTTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-A
64 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGA
* * * * * * *
9254 ATTAGATAGTTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATATTTTT
128 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTCGATAAACATA-TT-TATTTTT
* * * * ** * * *
9318 TAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACAATTATTTTATTCTGAATAAGTT
190 TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCT
* * *
9383 TGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATAACT-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
254 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAA-TAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * ** * * * *
9447 TGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTCAAAGCT-CTTA
318 TATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTA
* * * *
9510 CTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAA
381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAA-AAA
* * ** *
9574 CAATTGTTTTATGACAAAATAAACA-TCATAACGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGTAAT
444 CAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *
9638 AACTATTTAAACT-ATTTCGGTAAATAGATTTAGTAAACGGA
508 AATTATTTGAACTGA-TTAGGT--A-A-A--TAG---A---A
** *
9679 TTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
1 -TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* ** * * * *
9740 GAATAATTTTGCATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGTTTTGA
65 AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *
9804 AATAGATAATTATTCATATAGAT-ATGACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACA-ATTTA-TTTTT
128 AATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACATATTTATTTTTT
* * * * * * *
9865 AAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTTGAATAAACTT
191 AAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTT
* * * * *
9930 GCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATT
255 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
9994 GTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACT
319 ATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACT
* * * * * * *
10057 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-CTTATTTTGAATACACTTGTATGAATATAA
379 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAACAAAA
* ** * * * * *
10121 ACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTTAGATAATCA
443 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
10186 TAACTATTTGAA-TGTATTCA-GAAAACATAT
507 TAATTATTTGAACTG-ATT-AGGTAAATAGAA
*
10216 TTATTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT
1 TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * ** *
10278 GAAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAATATCATAATGATTTGAA
64 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * * * * * *
10343 ATAGAAAATTATTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATCTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
10408 TCTCTTACTCATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATTAGCCTATA
194 TCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
10472 TGAACTGATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
258 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * *
10537 AAATAGTTATGACTA-TCGAAACT-TTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATT
323 AAATAGTCATAACTATTTG-AACTGTTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTATT
* ** * * *
10600 AATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA-GAAC-AAAA-AA
383 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAA
* * * *
10662 TTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAA
447 TTGTTTTATGACAAAAC--AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * *
10727 CTATTTGAATTTATTCGGTAAACATAG
510 TTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * *
10754 TTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTATCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * *
10817 GAAATAAGGTTGTATCAA-TAGAAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGA
64 CAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * * * * *
10881 CATAGGTAATTGTTCAAGTAATCGTAATTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTTAA
128 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAA
* * ** * * *
10946 ATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTATGAATAAGCTTGT
193 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT
* * * * * * * *
11011 ATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
257 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * ** ** *
11076 CAAACAGAT-ATAACTATTTGCATTGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAATCCGTTACTTAT
322 CAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-C--TACTTAT
* ** * * * ** *
11140 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAATTGTATCAATAGCAAT
382 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * * ** * *
11204 AATTGCTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAATTGTTATA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
11269 ACTAATTGAACT-AGTTTGGTAAACAGAT
509 ATTATTTGAACTGA-TTAGGTAAATAGAA
* ** * *
11297 TTATATTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * ** * * *
11358 AACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAATGA-AAAACAAAAGGTCATAACAATTCGAAA
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * ** * *
11422 TAGATAATTATTCATACAGCCTTTACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAAATTTCTTTTTTAAAA
130 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTT--AA
* * * * * * *
11487 ATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTAATTATTTTATTTTGGAATAAGCTT
193 ATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTAATCT-AAATAAGCTT
* * * * * * * * *
11552 GTATGAACATAAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTG
255 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * *
11617 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGCTAAAGA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCA
320 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--T-CTACTTA
* * ** * **
11681 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCCGAATAGGCTTATATGATGAAAAAC
381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * * *
11746 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
11811 ATTATTTGAACTGATTCGATAAATTG-A
509 ATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
** * * * * * *
11838 TT-TTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-G
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * *
11901 GATAAGCTTTTATGAATTGAAACAAATGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
11966 TGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAA
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACATATTTATTTTTT-AAA
* * * * * * *
12031 TTTCTTGCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTACT-TCGAATAAGCATT-
194 TCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGC-TTG
* * ** * * * * *
12093 TATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAGTTG
256 TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * ** * * *
12157 TTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTA
320 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTA---CTTA
* * ** ** * * * * * *
12222 TTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAACAATATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGGATAGAAAC
381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * * * *
12286 AATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAATGGTTTGAGATAAATAATTGTTCACATAGTCATA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
12350 ATAATTTGAA-TTAGTTTGGTTAACAGAT
509 ATTATTTGAACTGA-TTAGGTAAATAGAA
12378 TTAGTTTTTT-AA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTC
1 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* ** * * ** * *
12437 TGAATAATATTGTATGAA-TAAAAACAATTTTTTTACAACCAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTG
65 -AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTG
* * * * * *
12500 AAATAGATAA-TAGTTCAAATGGAT-GTGATTATTTGAACTTA-TTC-AGTAAACAGATTAATTT
127 AAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGA-TAAACATATTTATTT
* ** * * * * * * *
12561 TTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTT-ATTATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAA
188 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAG
* * * * *
12625 CTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA-AAAAC-AAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAA
252 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT-A-ATAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
12688 TAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTCATCTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAAT-T--
314 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTAC
* * * * * * * *
12750 TT-TTACTTATTAAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATAGA
378 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAA
* * * * * *
12814 AACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAAGGTCCTAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
442 AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
12879 CATAAATT-TTTAAAC-AAGTTAAGAAAATAGAT
505 CAT-AATTATTTGAACTGA-TTAGGTAAATAGAA
* * * * *
12911 TTATTTTTTTAAT-T-TTAACTTATTAATTTCTAAAATATTAAAAAATTTA-TATTGTTTT-TGT
1 TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAT-T
** * * * * * * *
12972 TCGAAATAAGCTTACATGAA-TAGAACCAATTGTTTTAAGA-TAAACGAAAGGCCATAATGTTTT
63 TC-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * **
13035 GAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGATAAACAAATTCCTTTTT
126 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACATATTTATTTTT
* * * * * * * *
13099 CAAATTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTACT-TCAAATAAGG
190 TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGC
** * * * * * * *
13163 TCATATGAACTA-AAATAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
253 TTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * *
13227 TTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
317 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TAC
* ** ** * * ** * *
13292 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTAAATAAGTTTGAATGAACAGA
378 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAAA
* * * ** * * *
13357 AACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTC
442 AACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * * * *
13422 ATAACGATTTGAACTTATTCGGTAAACATAT
506 ATAATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* *
13453 TTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTATCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-T
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * ** ** * *
13514 TCGAAATAAGCTTGTATTAACT-AAAAAATTGTTTTGTGGCAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT
63 TC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-T
** * * * * * * *
13578 -AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTT
126 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTA-TTTTT
* * * * * *
13642 TGAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGC
190 TAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGC
* ** * * * * *
13706 TTATATGAATTGTAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAA
253 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT-AATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * *
13770 TTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAGCTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTA
317 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTA
* * * * * ** *
13834 TTTATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACAAAC-AAAAT
381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * * * * ** ** *
13898 AATTATTTTACGAGAAACCAAAACGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * *
13963 ACTATTTGAACTTG-TTTGGCT-ATTAGAT
509 ATTATTTGAAC-TGATTAGG-TAAATAGAA
* * ** * ** *
13991 TTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * * * * * * * * * *
14056 AATAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGACTTGGAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
14121 AGATAATTATTCAAATAGTTAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATC
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * *
14186 TCTTA-TTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATGATTTGAAAT-T-GATAA--T
196 TCTTACTT-ATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGT-AT--T-ATTT-TAATCTAAATAAGCT
* * * * * ** **
14246 TGT-TCAAATAGTCATAATCATTTGAACTGGTT-CAATAAATA-AAATTATTTTC-TAAATCTCT
254 TGTAT-GAACAG--A-AA-CAATTG---T-TTTATAATAAA-ACAAA--A-AGTCAT-AA-CGAT
** * * ** * *
14307 TACAAATTTTTGAATAATTAAT-AAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTATGAGCTGA
304 TTGAAA---TAG-ATAATTATTCAAA-TAGTCATA-ACTATTT-G---AA-C-TGTTTGA--T-A
* ** * * * * * *
14371 AATA-A-TTACTTTATGACAAAGCAAAAGGTCA-TAACATTTTGAAATA--AAT-AATT-GTA-C
354 AACAGATTTA-TTT-T-TTAAATC--TA-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * ** * **
14428 A-TATAGTCT---T-AA-TTGTTTG------AACTA-T-TTAGATAACTATTTACAAAAGTTCAT
412 ATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-A-AAACAAAAG-TCAT
* * * * * * * ** * * * *
14479 AATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAGCTATTTGAGCTTATTCGGTAAACA-AA
473 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * ** *
14542 TTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTAAGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
1 -TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * *
14607 AAATAAGCTTAGT-TGAATTGAAACCATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
65 AAATAAGCTT-GTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * *
14671 ATAGTTAATTATTCAAATAATCATGATTATTTCAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
* ** * *
14736 TCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATCCAAATAACCTTGTA
194 TCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
14800 TAAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
258 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
*
14865 AAATAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
323 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTATTA
* * * * * * *
14929 ATTGTCTT--AATATTGATAATTTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAA
384 ATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAACTTGTATGAACA-AAAAC
* * * * * *
14992 AATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
15057 ATCATTTAAAGTTATTCGATAAATAG-A
509 ATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * * *
15084 TT-TTTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTGGTGTTATTTTATTTC
1 TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * * *
15148 GAGTAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGAAA
65 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* ** * * *
15213 TAGATAATTATTCAAATAATCATGTCCATTTGATCTAGTTCGATCAACATATTTATTTTTTAAAA
130 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTT-AAA
* * * * *
15278 T-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCATGTA
194 TCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTA
* ** *
15342 TGAACAGAAACAAATGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT-TGT
258 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT-T
*
15406 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAAT
322 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAAT
* * * * * *
15470 TTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTACTTTATTATGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTG
386 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTG
* * *
15535 TTTTATGAAAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
450 TTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
* * * *
15600 TTGAATTGGTTAGGCAAACAGAAA
514 TTGAACTGATTAGGTAAATAG-AA
* * * * *
15624 TATTTTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATCA-TTTTATTTTATTTC
1 T-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * *
15688 AAATCAGCTAGTATGAATTGAAA-ATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAA
65 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAA
* * * * * * *
15751 ATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTG-A-TGGTTTG-TCAAACAAATTTA-TTTTTAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGAT-AAACATATTTATTTTTTAA
* * * * * * * * *
15812 TTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAGTATATTTGTATTATTGTATTCCAAATAAGCTTGT
193 ATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT
* * * * *** * * * * * *
15877 ATGAACAGGAATAATTATTTTGTGGCAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTGTT
257 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* * *
15942 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGATGAACAGATTTATATTTTAAATCACTTACTTATT
322 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT--C-TACTTATT
* * * * * *
16007 AATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTATATTCTGAATAACCTTGAATGATCAAAAACAC
383 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAA
* * * * * * * * *
16072 TTGTTATATGACCAAACAAATGGTAATAATGGTTTGAAATAGATAAATGTTGC-AATGGCCATAA
447 TTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTCATAA
*
16136 TTATTTGAAATGATTCA-GTAAATAG-A
510 TTATTTGAACTGATT-AGGTAAATAGAA
* * * * *
16162 TTCCTTTTTTAAA--TC--A-TTGATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTTGAATTATTTTATTT
1 TT-ATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
16222 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTGTATGACAAAACAAAA-TTCATAACGATTTGAA
64 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
** * * * * * *
16286 ATAGATAATTATTCGTATTGTCTTAACTATTTAAACTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * *
16351 TCCCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGT
194 TCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGT
* * * * * * * * * *
16415 GTGAACTA-AAATAATT-ATTTAGAATAGAATAAAACGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTAT
257 ATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * *
16478 TCAAATA---A-GA--A-TTG--C--TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATT
321 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AA-A-TCTACTTATT
* * * ** * **
16532 AATCTTTGAAATCTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTCCAA-ACAGGCTTGTATGATGAAAAACA
383 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA-A-ACTTGTATGAACAAAAACA
* * * *
16596 ATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAA
446 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * *
16660 TTATTTGAATTGATTTGGTAAACAG-A
510 TTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* *
16686 TTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTC
1 TT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * ** * *
16747 AAATAAGCTT-TAATGAATTGAAACAATT-TTTTAATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTTA
65 AAATAAGCTTGT-ATGAACTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
16810 AATATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTA-TTCAGA-AAACACATTTATTTTTT
128 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTC-GATAAACATATTTA-TTTTT
* * * * * ** *
16873 TAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTGGTATTATTTTACTTTGGATAACCT
190 TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCT
* * * * * * * * *
16938 TTTATGAACTGAAGCAATTGCTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTTAAATA-TTAATC
254 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-
* * * * * *
17001 T-TTCAAATAGTCATAACTACTTGAGCT-TATTTAGTAAAAAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTG
318 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAA--TC-TA
* * * * * *
17064 CTTATTAATTTTTCAAATGTTAATATATTAGGATTATTTTGTTCTAAATAATAAGCTTGTATGAT
377 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAT-A-AA-CTTGTATGA-
** * * * * * * * * * **
17129 A-TGAAACAAATATTTTATGACTAAAA-ATAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTA
437 ACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
** * * * ** * * *
17192 TAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACACAT
501 TAGTCATAATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * **
17228 TTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
*** * * * * *
17293 AATAAGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAATGGTTATAGCAATTTGAA
66 AATAAGCTTGTATG--AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
17358 ATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTT-AACTAATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA
* * ** *
17422 TCTCTTACTTATTAA---T-AAAT-TT-GT--ATTA-TTTTA-TTTCGTGT--A-AA-CTTGTAT
194 TCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * *
17473 TAACTGAAACAATTGTTTTATGAA-AAAACAAAAGGTCATAGCAATTTTAAATAGACAATTGTTC
259 GAACAGAAACAATTGTTTTAT-AATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * *
17537 AAATAGTTATAACTATTTGAACTTTTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTCTT
323 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTT-GATAAACAGATTTATTTT-TTAAA--TC-TACTTATT
* * * *
17602 AATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCGAGTAAGC---T-TG-----AAACA
383 AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAAAAACA
* * * * *
17657 AGTGCTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAAT-ATT
446 ATTG-TTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-T
* * * * * * *
17721 AATCATATAAACTGGTTCGAT-AA-ACAA
508 AATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * * * *
17748 -T-TTTTTT-GATCTCTTATTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
17809 AATAAGCTTGTACGAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTGATAACTATTTGAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * ** * * *
17873 AGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTCA-TTCAACAATTAGATTTATCTTTTAATT
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT
* ** ** * * * ** *
17937 TTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTAT
195 CTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
18002 GAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
259 GAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * ** * ** * * *
18067 TATAGTCA-AA--ATTT--TCT-ACTGAT---TA-A-TTA-AATCT--CT-TACTGATTAATTTT
324 AATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTT
* *
18117 CT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTT
389 -TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTT
** * * * *
18181 TTACAATAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTT
452 TTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
* * *
18246 TAACT-ATTCGGTAAATAGTA
516 GAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * *
18266 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
* * * ** *
18330 AAATAAACTTGTAT-AAGCTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAA
65 AAATAAGCTTGTATGAA-CTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * * * ** * **
18394 ATAAACAATTATTTTATATAGTCTTAATTGTTTGAATTGGTTTAACAAACGGATTTATTTTTTAA
129 ATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAA
* * * * * *
18459 ATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGT
193 ATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT
* * * * * * * * * *
18524 ATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGATTATAACAATTTGAAATACATAGTTGT
257 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* *
18588 TCAAATAG---T---TA--T-AAC-------T------ATTTA-TTTTTAGATCT-CTTAGTAAT
321 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAAT
* * * *** *
18629 TCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAATAATTG
386 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTG
* * * ** * *
18694 TTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-ATAATTTATAATTGTTCAAATGGCCATAATTA
450 TTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA
* *
18758 TTTGAACTGATTCA-ATAAACTA-AT
513 TTTGAACTGATT-AGGTAAA-TAGAA
* * * **
18782 TTATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * ** * *
18847 GATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAGT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
18912 AGATAATTGTTCAAAT-GATAATAACTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTCAAA
131 AGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTT-AAA
* * *
18976 TCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAGCTTG
194 TCTCTTACTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAAT-AAGCTTG
* ** * * * * * * *
19040 TATAAATTGAAACAATTATTTTATGACT-AAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTA
256 TATGAACAGAAACAATTGTTTTAT-AATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* ** * * * * *
19104 TTCTAATAGTTTTAA-TCACTTGAAATGATTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATATTTTACTT
320 TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AA-A-TCTACTT
* * ** * * *
19168 ATTAATTTTTCAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGATA-AGAA
380 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGA-ACAAAA
* * * * * * *
19232 ATAGTTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GAT
443 ACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-T
* * * * **
19295 CATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAGCT
505 CATAATTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * * * * * *
19327 TTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAATATTAATGAAGTAATATTATTTTATTTCG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* ** * * *
19392 GATAAATTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
19457 AGATAATTGTTTAAATGGTTATATCTATTTGAACTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAAC
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTA-TTTTTTAAAT
* ** * *
19522 CTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTAT
195 CTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * *
19587 GAACTGAGATAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
259 GAACAGAAACAATTGTTTTAT-AATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * *
19651 TAATAGTCTTAACTATTTGAA---TTAGAT---CAG---TA------AAA-C-A--TATTTATTT
323 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTT
* * * ** * *
19697 TT----TATTATTAAATTAGTATTACTTAATCAGAATAAGCTTATATGAA-AAGAAACAATTGTT
388 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTTGTATGAACAA-AAACAATTGTT
* * * * *
19757 TTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTC-AGTAGTCATAACTATTT
452 TTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
* *
19820 GAATTGATTTA-GTAAACA-AA
516 GAACTGA-TTAGGTAAATAGAA
* * *
19840 TTTAGTTTTTAAATCTC-TA---ATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTC
1 -TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
** ** * *
19900 TAAATAATTTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAA
65 -AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
** * * * * * *
19965 ATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACTTGTTTTGGT-AATAGATTTA-TTTTTAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAA
** * * * **
20028 ATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAAATTG
193 ATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTG
* * * * * *
20092 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATA-TCATAACTATTTGAAATAAATAATTA
256 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* ** * **
20156 TTCAAATGGTCATAACTATTTGAGTTTGCTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
320 TTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTA
* * * *
20221 TTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAACTTGTATGAACAGAAAC
381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * *
20286 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * *
20351 ACTATTTGAACGTGTTTA-GAAAATAGAT
509 ATTATTTGAAC-TGATTAGGTAAATAGAA
* *
20379 TTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC
* * * ** *
20441 GAATAACCGTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAAGAATTTGAA
65 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAA
* * * * * * *
20505 ATAGATAATTGTTCAAATAATAAGAACTATTTAAACTTGTTCGATAAAC-TAATTCATTTTTTAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAT-ATTTATTTTTTAA
* * * * * *
20569 ATCTCTTACTCATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCCTA
193 ATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTG
* ** * * * * *
20633 TATGAACTGATGCAATTATTTTAAAATCAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
256 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* ** * * * * *
20698 TCAAATAGTTATGGCTATTTGGACTTTTTAGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTAT
321 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTAT
** * * * * *
20763 T-ATTTGAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAT
382 TAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAAC
* * * *
20827 AATT-TTTTAT----AAA-AAAAGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
445 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * *
20886 CTATTTAAACTTATTCGATAAATAGAT
510 TTATTTGAACTGATTAGGTAAATAGAA
* * * * ** *
20913 TTATTTTTTAAATCTTTGTATTTTTTTAATTGTTT-AAATATTAACAAATTTCTGTTATTTTATT
1 TTATTTTTTAAATCTCT-TA-CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * ** *
20977 AGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGCAA-AATTGTTTTATGAC-AAAC-AAAGGTTTTAGCGATTTG
63 TCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * *
21038 AAATAGATAATTGA-T-AAATAGTCATAACTATTTTAACTTGTTCAACAAATAGATTCA-TTTTT
127 AAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTT
* ** * * * *
21100 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTTATTCAAAATAAACT
191 AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTAATCTAAATAAGCT
** * * * * * *
21165 TGTATGAGTAGAAATAATTGATTTGTGAT-AAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAA
254 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACA-AAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * *
21229 TTATTCAAACAATCATAAATATTTG
317 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
21254 CACAGGGCAA
Statistics
Matches: 14371, Mismatches: 3182, Indels: 2208
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
507 8 0.00
508 126 0.01
509 44 0.00
510 126 0.01
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519 13 0.00
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607 7 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (536 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGA
ACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
TAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTG
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
GATTAGGTAAATAGAA
Found at i:17538 original size:165 final size:168
Alignment explanation
Indices: 17264--17604 Score: 429
Period size: 165 Copynumber: 2.0 Consensus size: 168
17254 ATTTTTGAAA
* *
17264 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT-ATAAAAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
17329 AACAAAACAAATGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTT-AAC
65 AACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC
17393 TAATTCGATAAACAAATTTATTTT-TTAAATCTCTTACT
130 TAATTCGATAAACAAATTTATTTTCTTAAATCTCTTACT
* ** ***
17431 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCGTGTAAACTTGTAT-TAACTGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATATAAAAAAAACAATTGTTTTAT-
* **
17495 AA-AAAACAAAAGGTCATAGCAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
65 AACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC
** * * * *
17559 TTTTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCTCTTTCT
130 TAATTCGATAAACAAATTTATTTTCTTAAATCTCTTACT
*
17598 TCTTAAT
1 TATTAAT
17605 TTTTTGAATG
Statistics
Matches: 148, Mismatches: 23, Indels: 6
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
165 68 0.46
166 24 0.16
167 56 0.38
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (168 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATATAAAAAAAACAATTGTTTTATA
ACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT
AATTCGATAAACAAATTTATTTTCTTAAATCTCTTACT
Found at i:17787 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 17765--17806 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.5 Consensus size: 17
17755 GATCTCTTAT
17765 TTATTAATTTTGAAATA
1 TTATTAATTTTGAAATA
* * *
17782 TTATTAAATTTGTATTA
1 TTATTAATTTTGAAATA
17799 TT-TTAATT
1 TTATTAATT
17807 CGAATAAGCT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 4, Indels: 1
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.24
17 16 0.76
ACGTcount: A:0.36, C:0.00, G:0.05, T:0.60
Consensus pattern (17 bp):
TTATTAATTTTGAAATA
Found at i:18575 original size:182 final size:178
Alignment explanation
Indices: 18093--18601 Score: 521
Period size: 182 Copynumber: 2.8 Consensus size: 178
18083 TACTGATTAA
* * * *
18093 TTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAACAA
1 TTAAATCTCTTACTTATAAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAA
* * ** * * *
18156 ACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAATA
64 ACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATA-TAATAACGATTTGAAATAAACA
* * *
18221 ATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTTAACTATTCGGTAAATAGTATTATTTT
128 ATTGTTCAAATAGTTATAATTAGTTTAAC-ATTCGGTAAAAAGGATTATTTT
* * *
18273 TTAAATCTCTTACTTATAAAATTTT-GAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCTAAATAAA
1 TTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAA
** * * *
18337 CTTGTAT-AAGCTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAACA
65 CTTGTATGAA-CAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATATAATAACGATTTGAAATAAACA
* * * *
18401 ATTATTTTATATAGTCT-TAATT-GTTTGA-ATT-GGTTTAACAAACGGATTTATTTT
128 ATT-GTTCAAATAGT-TATAATTAGTTTAACATTCGG--TAA-AAA-GGA-TTATTTT
* * *
18455 TTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
1 TTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
* * * * *
18520 TTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATAACAATTTGAAATACATAGT
66 TTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAT-ATAATAACGATTTGAAATAAACAAT
18585 TGTTCAAATAGTTATAA
130 TGTTCAAATAGTTATAA
18602 CTATTTATTT
Statistics
Matches: 269, Mismatches: 44, Indels: 31
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
177 2 0.01
178 3 0.01
179 6 0.02
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181 35 0.13
182 114 0.42
183 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
TTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATATAATAACGATTTGAAATAAACAATT
GTTCAAATAGTTATAATTAGTTTAACATTCGGTAAAAAGGATTATTTT
Found at i:18760 original size:153 final size:153
Alignment explanation
Indices: 18482--18760 Score: 382
Period size: 153 Copynumber: 1.8 Consensus size: 153
18472 GAATTTTTAG
*
18482 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT
* * * **
18547 GACAAAACAAATGATTATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTCAAATAGTTATAACTATTTATTT
66 GACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTATTT
18612 TTAGATCTCTTAGTAATTCTTGA
131 TTAGATCTCTTAGTAATTCTTGA
* ***
18635 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTA
* * ** * *
18699 TGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-ATAATTTATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT
65 TGACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGA-AATACATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTT
18761 GAACTGATTC
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 16, Indels: 4
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
152 2 0.02
153 106 0.98
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (153 bp):
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTATTT
TTAGATCTCTTAGTAATTCTTGA
Found at i:19700 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 18620--19700 Score: 958
Period size: 181 Copynumber: 5.9 Consensus size: 179
18610 TTTTAGATCT
* * * *
18620 CTTAGTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG--TTG
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * **
18683 AAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-ATAATTTATAATTGTTCAAAT
66 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
18747 GGCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAAC-TAATTTATTTTTTAAACCTCTTA
128 -GTCATAACTATTTGAATTGATT-AGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCTTG
* * * *** *
18801 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* ** * *
18866 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAGTAGATAATTGTTCAAATGAT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG-T
* * * *
18931 AATAACTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTG
130 CATAACTATTTGA-ATTGATTAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTG
* * * *
18983 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAAGCTTGTATAAAT
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAAT-AAGCTTGTATGAAC
* * * * * * * *
19047 TGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
64 TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-
** * * * * * * * *
19112 GTTTTAA-TCACTTGAAATGATTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATATTTTA
128 GTCATAACT-ATTTGAATTGATTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTG
* * * * * * *
19165 CTTATTAATTTTTCAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGATA-A
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACT
* * * * * * * *
19229 GAAATAGTTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATG
65 GAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * * *
19293 ATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAA-ATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTG
129 -TCATAACTATTTGAATTGATTAGTAAACATA--TTTATTTTTTAAATCTCTTG
* * * * ** ** * *
19346 CTTAATAATTTTTTAAATATTAATGAAGTAATATTATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTA
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* *
19411 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATGGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GT
* * * *
19476 TATATCTATTTGAACTTG-TTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAACCTCTTG
130 CATAACTATTTGAA-TTGATTA-GTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTG
* *
19528 CTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * *
19593 AGATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GT
* *
19658 CTTAACTATTTGAATTAGATCAGTAAAACATATTTATTTTTTA
130 CATAACTATTTGAATT-GATTAGT-AAACATATTTATTTTTTA
19701 TTATTAAATT
Statistics
Matches: 717, Mismatches: 154, Indels: 57
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 2 0.00
180 22 0.03
181 312 0.44
182 272 0.38
183 108 0.15
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.10, T:0.44
Consensus pattern (179 bp):
CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGTC
ATAACTATTTGAATTGATTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTG
Found at i:19700 original size:545 final size:545
Alignment explanation
Indices: 18620--19700 Score: 1424
Period size: 545 Copynumber: 2.0 Consensus size: 545
18610 TTTTAGATCT
* * * * *
18620 CTTAGTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAA
1 CTTAGTAATTCTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGATGAA
* * * *
18685 AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTTATAATTTATAATTGTTCAAATGGC
66 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACAATTTATAATTGATAATTGTTCAAATGAC
* * *
18750 CATAATTATTTGAACTGATTCAATAAACTAATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTG
131 CATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACTAATTTAGTTTTTAAACCTCTTACTTAATAATTTTTG
* * *
18815 AAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTA
196 AAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTCGGATAAACTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * *
18880 TGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAGTAGATAATTGTTCAAATGATAATAACTATTTGAG
261 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGATAATAACTATTTGAA
* * * *
18945 CTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA
326 CTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTCAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
* *
19010 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAGCTTGTATAAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAA
391 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAA
* * **
19075 AGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAATCACTTGAAATGATTTGACAA
456 AGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATCACTTGAAATGATCAGACAA
19140 ACACATTTATTTTTTAAATATTTTA
521 ACACATTTATTTTTTAAATATTTTA
* * * *
19165 CTTATTAATTTTTCAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAT-AA
1 CTTAGTAATTCTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGATGAA
* * * * * * *
19229 GAAATAGTTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAGCGATTTGA-GATTGATATTTGTTCAAAT
66 -AAATA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACAATTT-ATAATTGATAATTGTTCAAAT
* * ** * * *
19292 GATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGA-AAA-TAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAAT
128 GACCATAACTATTTGAACT-GATTCAATAAACTA-ATTTAGTTTTTAAACCTCTTACTTAATAAT
* * *
19355 TTTTTAAATATTAATGAAGTA-ATATTATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTAAAACAATT
191 TTTTGAAATATTAATAAAGTAGA-ATTATTTTATTTCGGATAAACTTTTATGAACTAAAACAATT
* * * * *
19419 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATGGTTATATCTA
255 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGATAATAACTA
* *
19484 TTTGAACTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATATT
320 TTTGAACTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTCAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATT
* * * * *
19549 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT-AAGCTTGTATGAACTGAGATAATTGTTTTATGACTA
385 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACTA
* * *
19613 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-CTATTTGAATTAGA
450 AACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATC-ACTTGAAAT-GA
*
19677 TCAGTA-AAACATATTTATTTTTTA
513 TCAG-ACAAACACATTTATTTTTTA
19701 TTATTAAATT
Statistics
Matches: 461, Mismatches: 66, Indels: 18
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
543 1 0.00
544 89 0.19
545 350 0.76
546 21 0.05
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.10, T:0.44
Consensus pattern (545 bp):
CTTAGTAATTCTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGATGAA
AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACAATTTATAATTGATAATTGTTCAAATGAC
CATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACTAATTTAGTTTTTAAACCTCTTACTTAATAATTTTTG
AAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTCGGATAAACTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGATAATAACTATTTGAA
CTTGTTAGGTAAACATATTAATTTTTTCAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAA
AGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATCACTTGAAATGATCAGACAA
ACACATTTATTTTTTAAATATTTTA
Found at i:19849 original size:151 final size:153
Alignment explanation
Indices: 19574--19850 Score: 384
Period size: 152 Copynumber: 1.8 Consensus size: 153
19564 TTTTATTTTA
* ** * * *
19574 AATAAGCTTGTATGAACTGAGATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAAT
* *
19639 AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGATCAGTAAAACATATTTATTTTTTATTA
66 AGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAATTAGATCAGTAAAACAAATTTATTTTTTATTA
19704 TTAAATTAGTATTACTTAATCAG
131 TTAAATTAGTATTACTTAATCAG
*
19727 AATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAAGATCATAATGATTTGAGA
1 AATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACTAAACA-AAAGATCATAATGATTTGAAA
* * * *
19790 TAGATAATTGTTC-AGTAGTCATAACTATTTGAATT-GATTTAGT-AAACAAATTTAGTTTTTA
65 TAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAATTAGA-TCAGTAAAACAAATTTATTTTTTA
19851 AATCTCTAAT
Statistics
Matches: 109, Mismatches: 13, Indels: 7
0.84 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
150 18 0.17
151 25 0.23
152 34 0.31
153 32 0.29
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (153 bp):
AATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAAT
AGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAATTAGATCAGTAAAACAAATTTATTTTTTATTA
TTAAATTAGTATTACTTAATCAG
Found at i:20071 original size:180 final size:182
Alignment explanation
Indices: 19699--21378 Score: 1434
Period size: 181 Copynumber: 9.4 Consensus size: 182
19689 ATTTATTTTT
* * * * * *
19699 TATTATTAAATTAGTATTA-CTTA-ATCAGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
19762 ACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTC-AGTAGTCATAACTATTTGAA-T
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
19824 TGATTTAG-TAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC-TA---ATTAATTTTTAAAA
130 TG-TTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** *
19873 CATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* ** *
19937 ACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** *
20002 TGTTTTGGT-AATAGATTTA-TTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAA
130 TGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
20053 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * **
20118 CAAAACAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAGTT
66 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
20182 TGCTCA-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
130 TGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * *
20234 TACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * *
20299 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACG
66 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
*
20363 TGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTT-GAA
130 TGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * * *
20413 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAACCGTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
20477 ACAAAACAAAAGGTCA-AAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATAAGAACTATTTAAAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
20541 TTG-TTCGATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTAGGAA
129 TTGTTTAGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-GAA
* * * * * ** * **
20594 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTGATGCAATTATTTTAAAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
** * ** *
20659 TC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACT
66 -CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
20723 T-TTTAGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-A-TTTGAGGAAA
130 TGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-G-AA
* * * * *
20775 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-TTTTAT-
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
20837 ---AAA-AAAA-GTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
20897 T-ATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTGTATTTTTTTAATTGTTTA-AA
130 TGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TA-CTTATTAATT-TTTAGAA
* ** * ** * * *
20951 TATTAACAAATTTCTGTTATTTTATTAGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAA-AATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
** ** *
21015 C-AAAC-AAAGGTTTTAGCGATTTGAAATAGATAATTGA-T-AAATAGTCATAACTATTTTAACT
66 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
21076 TGTTCA-ACAAATAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA
130 TGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * ** * * *
21127 TATTAATAAGCTAGAATTATGTTTA-TTCAAAATAAACTTGTATGAGTAGAAATAATTGATTTGT
1 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * *
21191 GATAAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAAATATTTGCA
64 GACAAA-ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** *** * * * * * *
21256 CAGGGCAAGCTACCA-A-ATTCATTTTTGAAAT-TCATTAGTTATTAACTTTTAAGAA
128 CTTGTTTAGATA-AATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTAGAA
* ** *
21311 TATTAATAAATTAGCATTA-TTTATTTTGAATAAGAC-TGTAT--ATAG-AACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
*
21371 ATAAAACA
65 ACAAAACA
21379 CAATGGTCGT
Statistics
Matches: 1237, Mismatches: 209, Indels: 116
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 88 0.07
175 55 0.04
176 122 0.10
177 56 0.05
178 37 0.03
179 198 0.16
180 212 0.17
181 377 0.30
182 44 0.04
183 24 0.02
184 24 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (182 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
GTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
Found at i:20603 original size:360 final size:358
Alignment explanation
Indices: 19727--21252 Score: 1403
Period size: 360 Copynumber: 4.3 Consensus size: 358
19717 ACTTAATCAG
* * * * *
19727 AATAAGCTTATATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGAT
1 AATAAACTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAAAGATTTGAAAT
* * * * * * *
19791 AGATAATTGTTC-AGTAGTCATAACTATTTGAA-TTGATT-TAGTAAAC-AAATTTAGTTTTTAA
65 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCGA-TAAACTAGATTTATTTTTTAA
* * * **
19852 ATCTC-TA---ATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGT
128 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGT
* *
19913 ATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTAT
192 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTAT
** * * ** * * *
19977 TCAAAGGGACATAACTATTTGAACTTGTTTTGGTAATAGATTTATTTTTAAATCTCCAACCTATT
255 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAATCTTCTACTTATT
20042 AATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA
320 AATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-A
* * * * * **
20082 AATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAAT
1 AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGATCATAAAGATTTGAAAT
* * ** * *
20147 AAATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAGTTTGCTCAATAAAC-AGATTTATTTTTTAAAT
65 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACTAGATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
20211 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAACTTGTAT
130 CTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTAT
* * *
20276 GAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCA
194 GAACAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
*
20341 AATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAA
258 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTCTACTTATTAA
*
20405 TTTTT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGG
322 TTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT-A
* * *
20442 AATAACCGTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAAGAATTTGAAA
1 AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGATCATAAAG-ATTTGAAA
* * * * * *
20506 TAGATAATTGTTCAAATAATAAGAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACTA-ATTCATTTTTTAAA
64 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACTAGATTTATTTTTTAAA
* * *
20570 TCTCTTACTCATTAA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTAT
129 TCTCTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGT
* ** * ** *
20634 ATGAACTGATGCAATTATTTTAAAATCAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
192 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATT
* ** * * * * *
20699 CAAATAGTTATGGCTATTTGGACTT-TTTAGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTAT
256 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-GAAAATAGATTTATTTTT-AAATCTTCTACTTAT
* * *
20763 T-A-TTTGAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTA
319 TAATTTTTA-G-AATATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTTA
* * * *
20804 AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-TTTTAT----AAAAAAAG-TCATAATGATTTAAAATA
1 AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAAAGATTTGAAATA
*
20863 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATC
66 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACTAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * ** * *
20927 TTTGTATTTTTTTAATTGTTTA-AATATTAACAAATTTCTGTTATTTTATTAGAAATAAGCTTGT
131 TCT-TA-CTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCG-AATAAGCTTGT
* * ** * *
20991 ATGAATAGCAA-AATTGTTTTATGACAAAC-AAAGGTTTTAGCGATTTGAAATAGATAATTGA-T
192 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATT-ATT
* * *
21053 -AAATAGTCATAACTATTTTAACTTGTTCA-ACAAATAGATTCATTTTTAAATC-TCTTACTTAT
256 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTAAATCTTC-TACTTAT
* ** * *
21115 TAATTTTTGGAATATTAAT-AAGCTAGAATTATGTTTATTCAA
319 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTAT-TTTATT-TA
** * * * * * * *
21157 AATAAACTTGTATGAGTAGAAATAATTGATTTGTGATAAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAA
1 AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-A-AAAAGATCATAAAGATTTGAAA
* * * *
21222 TAGATAATTATTCAAACAATCATAAATATTT
64 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
21253 GCACAGGGCA
Statistics
Matches: 958, Mismatches: 164, Indels: 92
0.79 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
351 4 0.00
352 29 0.03
353 61 0.06
354 39 0.04
355 108 0.11
356 52 0.05
357 85 0.09
358 9 0.01
359 23 0.02
360 270 0.28
361 214 0.22
362 61 0.06
363 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAAAGATTTGAAATA
AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACTAGATTTATTTTTTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGA
ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT
TAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTA
Done.