Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168428.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_641, whole genome shotgun sequence
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842 TGTTTATTCA
* * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * *
1100 TTTGATTGT-C-AAACTAGTACAAACAATTAAAATTATATGAACAATTATCTATTTCAAA----T
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* *** * *
1159 -TG--TTTTTGTTTTGCCATAAAATTTTTTTTTC-ATTTCATACTAGCTTATTTG
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
1338 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTATTCATATAAG-TT-TGTTC
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* * *
1390 AGAATAAAATAATACTAATCTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAA-T--G-GATTTTAAAAATAAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** * *
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** * * * * * ** * ** *
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* ** * * * *
1566 ATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGACAATTGATAAGCAA-A-TTTTAAAAAATAAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
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* * * * *
1693 AACATTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATC-AGCTTATTTG
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* * * *
1745 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
1810 CTATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTATA
66 CTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
** ** * *
1875 ACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTACG
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* * *
1927 -AATAAAATAATAC-AATTTACTAATA--TTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * *
1988 ATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTA
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* *
2053 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCATACAAGCTTA-TTC
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* * * * * * *
2105 ATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** *
2170 TCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTG
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* * *
2234 TGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTG
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* * * * * *
2287 AAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ***
2351 TTGTTTATTGAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTAT
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* * * * *
2415 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAG-TTCTGTTTATGCAAGCTTATTTC
130 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
**
2467 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
2529 ATATGTTTTCTTAACACGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
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* * * * * * *
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* * *
2646 AGAATAAAATAATACTTATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAATA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATA
* ** * * * * * * *
2710 AATCTAGTTACCGAGCGAGTTCAAATGGTTATGACTCTTTGAACGATTATTTATTTTAAA-TGTT
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* **
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* * ** *
2828 AAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAA-TTGGAGATTTAAAAACTAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * *** *
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* * ** *
2957 GA-TATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTA-TTA
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* *
3008 AGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAACTAAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
3069 TCTATTTA-TCAAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCGTTA
65 TCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * *
3133 T-A-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAATCG
129 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * * * * **
3184 AATTAAAATATTACAAAAATCA-TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTGAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
* * * * ** * * * * **
3247 ATGTGTTT-TTTAACCGGTTTAAATCGTTAAGACTATTAGAA-AATTATCCTATTTTCAAATCAT
64 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-CTA-TTTCAAATTGT
* * * * * * * *
3310 TTTGAC-CTTTG-TTAGTC-TTAAA-TATTTTTTC-AGTTCATACATGGTTATATTCG
127 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TT-G
* * * ** * *
3363 AAAT-AAATAATACTAATTT-TAAATTATCATTCAAAATT-ATAACCAAGAAATTT-TAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TAT-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** ** * **
3424 AT-TCGTTACTAAACAAGTT-TGATA-TTATGACTATTTTTGAAC-GTTATCTATTT-ATAAGAA
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* * * ** * * * **
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125 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * * * * *
3540 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTAAAAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAG
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
3721 GAATAAAGTAATATTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** *
3786 TTATTTACTGAACCAG-T----T--TT-T-A-TA--TGAACAATTATTTATTTCCAATCATTATA
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* * * * * * *
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* * ** * * *
3890 GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ** * **
3955 CTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAACAATTAAGACAACATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATT
66 CTATTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATTGTT
* * * * * *
4018 ATGGCTTTTTGTTTGGTAATATAACAATTGCTTT-TGA-TCATTCAAGCCTATTTG
128 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTG
* * *
4072 AAATAAAATAATACTAATTTGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * **
4137 CTGTTTACTAAACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT
66 CTATTTACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * *
4199 -ATCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTGTGTTCATACAAGCTTATTCG
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* * ** * *
4251 AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
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* * * *
4381 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAA-CTTATTTG
131 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTG
* * * *
4434 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAT
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * *
4610 GAATAAAGTAATACTAATATATTAATA-TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * **
4670 CTATTTA-TCAAATGAGTTCAAACAATTATGACTATCTGAGCAGTTATTTATTTCAAATCATTAT
66 CTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
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* * * * *
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* ** * *
4955 ---TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * * *
5017 CTGTTT-GTCGAACAAGTTTGAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTAT
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* * ** *
5081 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG
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* ** * * *
5134 -AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TAAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * * *
5197 TTTATTTACCGAACAAGTCCAAAT-TTTATGACTATTTGAACAATTATTTACTTCAAATTCTTAT
65 TCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
5261 GACTTCTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGGTTA-TTC
130 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* ** * * *
5312 AAATTACAATAATGTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-AAT
1 AAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-
* * * * * **
5376 ATGT-TTT-TTGAACAAGTTCAAATAGTCTA-GACTATTT-AATAATTATCTATTTTAAATCATT
64 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * *
5437 GTGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTG
128 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG
** * * *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
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5556 ATGTTTAC-GAACATGTTCAAATAGTTGTGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATG
66 CTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * *
5620 ACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTG
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* * * *
5672 -AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATACTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
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5734 TATGTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTAT
65 TCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * *
5799 GACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTT-
130 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * ** * *
5850 AGAATAAAACAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAG-TTTAACAAAATAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAA
* * * * * * ***
5914 ATCTGTTTACTAAACGAGTTCAACTATTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTA
64 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * **
5979 TGA-TCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCC
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* * *
6032 AAA-ATAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTATAAGT-TGAAGATTTAAAAACA-A
1 AAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAA-ATA
* * * * * * * **
6094 AATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAATCA
63 AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTG
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6157 TTATGACATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTCTTCATGCAAAG-TTATTCA
126 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTG
* * * *
6213 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TGA-TAAGAGATTTAAAAATTAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * *
6274 TTGTTTATCGAGTCAA-TTCTAATAGTTATGA-TCATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTA
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* * * * * *
6337 T-AATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTTATTCAAGCTTATTCG
129 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * * * * *
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6453 TGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCT
65 TCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * * **
6518 AACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCA
130 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* ** * *
6570 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACTACA-A-ATTTTAAAAATAA
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* * * * * ***
6633 ATCTATTTGCCT-AACAAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATAAAT
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* * * * * *
6697 ATGAC-CTTTCTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCTG
128 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * * * * * **
6750 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAATAATATGT
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* * ** * * * * * *
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** * * *
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* * *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
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66 CTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* ** * * * *
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* **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* ** * **
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * * *
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* **
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* *
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** * * * * *
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* * *
2060 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATT
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* * * * * *
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193 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTC
* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
2612 TAAATCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTCAGAATA
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* * * *
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** * * * * * * * *
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* ** * *
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** * * ** *
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* * ** *
2972 CATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTAAGAATA
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* * * * *
3014 AAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * *
3075 TA-TCAAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCGTTAT-A-AT
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** *
3366 TAAATAATACTAATTTTAAATT-ATCATTCAAAATT-ATAACCAAGAA-ATTT-TAAAATAAATT
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* ** * **
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * *
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64 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * **
3844 TTATTCT-ACTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAA
129 TTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGC-TTATTCAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
3907 TTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AG
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAG
* * * * ** * ** * * *
3971 TTCAAACAATTAAGACAACATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGCTTTTTGTTTGGT
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
4035 AATATAACAATTGCTTTT-GA-TCATTCAAGCCTATTTGAAATA
318 CATAAAACAATT--TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG-AATA
* * * *
4077 AAATAATACTAATTTGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * ** * *
4142 TACTAAACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATCC
64 TACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CC
* * * * *
4203 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTGTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
4268 TCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACTAGT
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* * * * ***
4333 TCAAACATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCACCATGACCTTTTGTTTTGTCAT
256 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
4398 AAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATA
321 AAAACAA--TTTTTTCTATTCATAC-AAGCTTA-TTCGAATA
* *
4439 AAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAT-AATTCTA
1 AAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TG
* * * * * *
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62 TTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * ** *
4561 CTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACT
126 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACT
* * **
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* * * * * * * *
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253 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
4749 TATAAAATAGTTGTTTCCATTCATACAAGCCTATTCAGATTA
318 CATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATA
* ** * ** *
4791 AAATATTACTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAAAAAGTAAAAAATAAATATGTT
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* * * * * * *
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64 TACTAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
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* * * * *
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** * * * * * * *
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** *
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** * * * *
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** * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * ***
6639 TTGCCT-AACAAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATAAATATGACC
63 TT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
6703 -TTTCTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAC
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAATAATACTAA
* * * ** ** * **
6767 TTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAATAATATGTCAATTTA-TCGAATTAG
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * * ** *
6831 TTGAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCATTACAAACTTTTGTTTTG-CT
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-
* *
6895 ATAAAACAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATTCGAAATA
319 ATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG-AATA
* * *
6936 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * *
7001 TACCAAAC-----C----AGTT-T--CTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTT
64 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* ** * * *
7054 TTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
129 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * ** * ** *
7118 TTAATAATATTCCAAAAATTAATCTGTTTGTTGAAGTAG-TTGAAACAGTTAAGA-CTGTATGAC
192 TTATTAATATTTCAAAAATTAA----TAAG-T-AAG-AGATTTAAA-AAATAA-ATCTGT-TTAC
* * * * * * * ** * ** *
7181 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCAGTTC-AT
247 TAA--A-CAAGTTCAAATAGTTATGA--C--T-ATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATCGTT
** * * **** * ** * * * *
7244 ACAAAC--TT-ATTCAAAATAAAATAA--TAAT-AATTTAT-TAA---TATTCCAA-A
301 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATA
* * * * * ** * ** ** * *
7291 AAGTAAAAAGTAAGTGATTTAA-AAGATAAATCTGTTTACCTAATAAG-TTTAAATAAT-TATGG
1 AAAT-AATACTAATTTA-TTAATATTAAAAAT-T-AATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAT--
* ** * * * * * * * * * *
7353 CCATGCCAATAATTAACTATTTCAAATAGTTATTACCT-TTTG----TTTGTC-ATATAACAATT
59 --TTG--TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATC
* * ** * * * *
7412 GTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTAATCT-TTCA-A-AA-ATTA
118 GT-TATG-ACCTT-TTG-TT-TT--GTCATAAAACAAT--T-GTT--TCTATTCATACAAGCTTA
* ** * *** * * *
7472 AT-ATGTAAAAT-AT-TTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAATTCAA-ATAGTTATGA-ATA
171 TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTT--C-AA-AAATT-AATA-AG-TAAGAGAT-
** * ** * * * ** * * * **
7532 TT--TGAA-CAAT-TGTAAACT--TCAAATCCTTATAACCTTTTGTACTGTCATAAAACAATTAT
226 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-A-GTTATG-ACTAT--TTGAACAATTAT
* * * * * * * * * *
7591 TTTTGTTC--AT--ATAAG-CTTATTCG----G-AATAAAATAA----TACTAAT-ATA-ATA--
286 CTAT-TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACA-AGC
* *
7638 ATATTCCAAT-
348 TTATTCGAATA
* * *** * ** ** * **
7648 AATTAACAACTAAAAGAATTAA-A-AAATAAATTTGTCTGTCGAACTAG-TTTAAATATTTAAAA
1 AAATAA-TACT-AATTTATTAATATTAA-AAATTAATAAGT--AA-AAGATTTAAA-AAAT-AAA
** * * * * * ** ** *
7710 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG---TTTTATCATAAAAT-AAG
58 -T-T-TGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATC-T-ATTTCAAA
** * * ** * *
7769 TTTTTTTGAACTTATACTAGCTTATTTGGAATAACATA-AAATG----AATT--TACTAA---TA
116 TCGTTATGACCTT-T--T-G--T-TTTGTCATAA-A-ACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTA
* * *** * ** ** ** ** * **
7824 TTTC-AA-AAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAT--AATTTTGTTTACCTAACCAG-TCCAAA
171 -TTCAAATAAAATAATA-CTAATTTA-TTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAA-GAGATTTAAA
* * * * **
7884 ATAATTATGAT-TATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACTATTTG---TTTTATC
231 A-AA-TA-AATCTGTTT--ACTAA--A-CAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * * * ** * * * ** *
7943 ATAAAAT-AAAT-GTTTTTGTTCATATAAG-TTTGTTCGAAAAAAAGTAATACTAATCTATTAAT
287 -T-ATTTCAAATCG-TTATG-ACCT-TTTGTTTTG-TC--ATAAAA-CAAT-TTTTTCTATTCAT
** **
8005 ATTTCTAATATTAATAAGAGATTTA
342 A---C-AAGCTT-ATTCGA-A--TA
* * * * * * * * *
8030 AAA-AATA--AATCTATT--TATCAAACTAGTTTAA-ATGGT-TATGACTATAAGAGTAAT-TAT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTAAA--A-ATTAATA-AGTAAAAGA-TTTAA-A-AAATAAAT
* * * * * * * *
8087 TTATTT--TAAATC--GTT---ATGACTTTTTG-CTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATA
59 TTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAAT-A-GTTATGAC--TATT-T-GAACAATTATCTAT-TTCAAA
* * * * ** * * *
8144 -C---A--AGC--TTATTTAGAC-TAAAACAATACTCATT-TATTAATATTTCAA-C-AATTAAA
116 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTCTATTCATA---CAAGCTTATT-CA
* *** * * * * * * **
8197 AAGTAAAA-AAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGA-TTATTTA
175 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCA-AAAATTA-AT-AAGTAA-GA-GATTTA-AAA
* * * ***
8259 AAT-AAT-TATTTA-T-------TTCAAATCGTTATGAC-ATTTTG--C-TTTATC-ATAAAAGA
232 AATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCA-A
* * * * ** ** * * * * *
8309 ATTGTTTTGGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAA----TACTAATTTAT-TAA---TAAT
295 ATCGTTAT-G-ACCT-TTTG-TT-TT-GTCATAAAACAATTTTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT
*
8366 CCAA-A
353 CGAATA
* * * * * *
8371 AATTAATAGTAA---A-GAGAT-TTAAAAAATGAATCATTTATTGAACAAG-TTTAAATAATTAT
1 AAATAATACTAATTTATTA-ATATT-AAAAATTAAT-A---AGT-AA-AAGATTTAAA-AAATA-
* * * * * * * *
8430 AA-TTGTTTGAAC-AATTATATATTTGAAATCGCTATAACCT-TTTG-----TT-T-TGTTATAA
56 AATTTGTTT--ACTAA--ACA-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT-TCA
** * * * * **
8485 AAGAGTT-T----TTTT-CTAT-TCAT---ACAA--G-CTC-ATT--T-CAA--ATA-AAATAAT
114 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AAT
* * * * * *
8530 ATAAAT-TTATTAATATTAAT-ATAATT-AATAATTAA-AA-T-----ATTTAAAAAATAAATAT
178 A-AAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * ** * * * *
8585 GTTTACTGAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGTGCAATTAT-TTTTTCAACTTGTAATGAC
241 GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
8649 TTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTA
306 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATA
* * * *
8703 GAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGT
* * ***
8768 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCACAATGACCT
63 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
8832 TTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTATTTAAATTAAAATAATACTAA
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAA
* ** **** * ** *
8896 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAACGGGAATCTATTTACCGAATAAG
191 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
** * * * * * *
8960 TTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTAGACA
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * *
9025 TAAAACAATTGATTCCATTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATA
320 TAAAACAATTTTTTCTATTCATA-CAAGCTTA-TTCGAATA
* * *
9065 AAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTTAAAAATAAATTTGC
1 AAATAATACT-AATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG-
* * * *
9128 TTT-CTGAACACGTTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
62 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * ** *
9192 TTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTTTGTTCATAAAAGCCTAATTGGAATAAAATAATAGTAA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
9257 TTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAGCGAG
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * *
9321 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTATCA
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
9386 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATA
320 TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG-AATA
* *** * *
9426 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * * * * * * * * * *
9491 TACCGAATAAGTTTAAACAATCATGTCCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT
64 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * **
9555 TTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * ** *
9620 TTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATTATTT
192 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTT
* * * * * * ** * ** *
9681 TAATTAGTTATGACTATTTCATCAATTATATATCTCAAATCACTATGATC-TTCATTTTGTCGTA
257 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * *
9745 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAGTA
322 AAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATA
* * *** * ** * *
9783 AAATATTGCTAAACGAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATCAATGTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * *
9848 CATTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCT
64 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * **
9912 TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCCTATTCAAA-ATAAATAATACTCC
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAATA-AAATAATACTAA
* * * * *
9975 TTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAAAAATCTGTTTATTGAACAA
191 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * *
10038 GTTCAGATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATC
254 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
10103 ATAAAACAATTGTTT-TAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATA
319 ATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATA
* * * * ** * ** *
10144 AAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGATTTTAAAAATAAATCAGCT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * ** * *
10209 TATCGAATC-AGTTTAAATAATT-TCG-CCATTTCGAATAATTATCTATTTCAAATATTTATAAT
64 TA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
10271 CTTTTGTTTTGCCATAAAA-AAATGTTT-TCA-TCATATAAGCTTGTTTCGAATAAAATAATACT
126 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACT
* * * * * ** *
10333 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGATATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAACCA
189 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * *
10398 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTT
254 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
10463 ATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
319 ATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATA
* * * ** * *
10504 CAATATTACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * * * ** * * * * * * *
10569 TGTTGAACCAA-TACAAATAGTTAAGGTTGTATGAATATTTATCTATTTCAAACCATTATGACAT
64 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
10633 TTT-TTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAAT
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* ** * ** * *
10697 TTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAGTT
192 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTT
* * * * ** * * *
10758 CAAATAGTTAT-AATAATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGTCAT
257 CAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
10822 AAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTTGAAATA
321 AAAACAATTTTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCG-AATA
* * * * * * *
10861 AAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGT-AACGATTTAAAAAATGAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATAT--TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * * * * * * * * *
10925 GGGCTGACCAA-TACAAATGGTTATAATTGTTTGAACAA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACC
64 -TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACC
** * * ** * * *
10987 TTTTGTTTCATTACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAGCTAACTTAAAATAACATAA-ATCTA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-CTA
* * * * *
11051 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATATGTTTA-TCGATCAA
190 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
* * * *
11115 GTTTAAATAGTTA-CACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTC
254 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
*
11179 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTA
319 ATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAA-TA
* * * * * * * *
11220 AAATAATACAAATGTATTAATATTTGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
* * * * * *
11285 A-TCAAATAAGTTCAAGTAGTTACGACTATTTGAATAATTATTTTTTTCAAATCGTTATGA-CTT
65 ACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * * *
11348 TTGTTTTTTCATAAGATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATT
129 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT
** * * * * * **
11413 TATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
193 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTC
* * * ** * ** *
11478 TAATTGTTATAACTACTTT-AGTATTTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATA
258 AAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
11542 AAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTACT-GAACA
322 AAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATA
** * * * * * * ** * **** * *
11578 AGCTCAA-A-T-AGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAG-TTATGATCTTTTATT
1 AAAT-AATACTAATTTATTAAT-ATT-AAAAATTA-ATAAGT-AAA-AGATT-TAAAAAATAAAT
* * **** * * *
11639 TTG-TCA-TAAAACAATTTTTTCTA-TTCAT-ACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT
59 TTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGAC-----TATT-TG-A-ACAATTAT-CT-ATTT
* * ** * * ** ** *** *
11700 -ATTAAT-ATTCTAGAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAA-AA-TAAATCTATT--TACCAA-AT
112 CA--AATCGTTAT-GACCTT--TTGTTTTGTCA--TAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCT
* ** ** * * * * ** *** *
11758 AAGTTCAAATAGTCATGTTCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTA-TT
169 TA-TTCAAATA-AAATAAT-A-CT-AATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTAAGAGAT
* ** * * ** *
11820 TTATAGTAAAA-CAAT-TGTTT-CTATTC-A-TACAGAATTATTTA-GA--A-TAAAATAA-TAT
226 TTA-A--AAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCA-AA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* *** ** *** * * *** *
11875 -TGA-TTCATTAA--GATTTTGAAAATTAATAAAAGT-ATTAAA-AACTAAATCTATTTAT-CAA
286 CT-ATTTCA--AATCG-TTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAA
* * *
11933 AC-TAGCTCAAAT-
346 GCTTA-TTCGAATA
** * * ** *** *** *
11945 AGTTATTACT-TTTTGAACAATTATATATCTCAAACCGTTATGATCTTTATTTTG-TTATAGAAC
1 AAATAATACTAATTT-----ATTA-ATAT-T-AAA-AATTA--ATAAGTA-AAAGATT-TA-AAA
** * * * * * * * * *** *
12008 AAT-TGTTTTTTTTCATATAAGCTTA-TTCAGATTAAGATAATAAATGTGTTTGCCAA--A-CCA
52 AATAAATTTGTTTAC-TA-AA-C-AAGTTCA-AAT-AG-TTATGACTAT-TTGAACAATTATCTA
* * * * * **
12068 GTTCAAATAGTTAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTC-T-AACCTTTTGTTTAGT
109 TTTCAAATCG-T----TA-T-G-AC-CTT-T-TGTTT----T-G-TCATAAAACAATTG--T--T
* *
12131 CATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AA
153 --T----C-------T-A-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
12195 TTCAAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGCTCAAATAG
202 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
12259 ATATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTTCTTTTGTCATAAAACAA
264 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
12324 TTGTTTC-AGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTA
328 TTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA-TA
* * * * ** *
12356 AAATAAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAAACTAAACCTATA
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGT-
** * * * ** * * * * * *
12421 TT-CCGAACCATTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-
63 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * *
12484 TTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAATAAAAAGAATACTAA
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAA
* * * *
12548 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAATCAA-
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAG
* * * * * * * * * * * *
12612 TTGAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACTTTTTGTTTAGTCG
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * *
12677 TAAAACTGTTCTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTC-AA-A
320 TAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAATA
* * * * * * *
12714 ATA-AACATTAATTTATTAACATTCAAATAATTAATAAGCAAAAGATTTGAACAAATAAACTTGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-AAA-AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGT
* * * * *
12778 TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATT-T-TATTTAAAATTGTTATGAACT
63 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
12841 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAC
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA-
* * * * * * * *
12905 TTTTTTTAATATTACAAAAACTAGTAAGTAAGAAATTTAACAAAATAAATCAGTTTACCAAATC-
190 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACTAAA-CA
* *
12969 AGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAA--A---A--T----T-GTTAAT-A-CTTTTCGTTT
253 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTT-GTTT
* * **
13019 TGTCATAAAACAATTGTTTT-TCA-ACATACAAACTTATTTAAAATA
315 TGTCATAAAACAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTCGAATA
* ** * * ** * *
13064 AAATAATACTAATTGATTAATATT-TCAA-GAATTAGTAATTGATTT-AAAAATAAAATCTATTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTT
** * * * * *
13126 ACCGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT
65 ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * *
13191 TGTTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGT
130 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * * *
13255 AATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-GTCGAACCAGTTC
194 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTC
** * * * * **
13319 AAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAA
258 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
13384 GACAATTATTTC-AGCTCATATAGGTTTACTTGGAATA
323 AACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAATA
* * * * * * * *
13421 CAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTAT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGT
* * * * * * * *
13485 TTACCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATAGTTATTACCT
63 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
13550 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAA
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
13614 TTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAT
191 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
13678 TTCACATAGTTTTGACTATTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * ** * *
13743 ATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCATAATG
319 ATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATA
* * * * * *
13784 AAATAATACTAATTTAATT-ATATTTCAAAACTTAATAACTAATAA-AATTAAAAAATTAATCTA
1 AAATAATACTAATTT-ATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * ** * ** * *
13847 ATTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAATGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACC
62 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* *** * * **** **
13912 TTTTGTTTTATCATAAAACAAAAATTT-TTTTCGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAAA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
13976 TTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACTGAACCAGT
191 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* ** * * *
14040 TC--ATAGGTTAAGACTATTACAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCA
256 TCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
14103 TAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGTTTATTTGGAATA
320 TAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAATA
* * **
14143 AATTAATACTAATTTATTAAAATTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAAACTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * *
14207 CACTGAACAAGTTCAAATAATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTT
64 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * ** *
14272 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATATATGCTTAAACAGAATAAAATAATATTAAT
129 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* * * *
14336 TTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATC-AG-
192 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGT
* * * * * * * * *
14395 TAAAATTAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTT-ATTTGTTA
256 TCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
14459 TAAACCAATTGTTTTTTA-TCAGACAAGCTTATTCGAAATA
320 TAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG-AATA
*
14499 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGACTTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * *
14560 T--T---C--G----AATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACC--
64 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* *
14611 TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTTA
129 TTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAC-TA
* * * * * *
14674 ATATATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAA
190 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
** * * * *
14738 ACTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTTTGACCTTTTGCTTTGT
254 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
14802 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAACTTATACTAAATA
318 CATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATA
* * *
14844 AAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTTTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * *
14905 TACTAAATCAA-TTAAAATAATTTTG-GTCATTTGAACAATTAGCTATTTGAAATCGCTATGACC
64 TACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
14968 TTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-AGTTCTTACTAA-CTTATTTGAAATAAAATAAAAAA
127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTA-TTCAAATAAAAT-AATAC
* * * * * * * * *
15031 AAATTTA-TAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTGATTTTAAAAGTGAATCTGTTTACCGAATC
188 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAAC
* * * * * * *
15095 -AGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG
252 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
15159 TCATAAAACAATTGTTTT-TCA-TAATACAAACCTATTTGGAATA
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* * ** * *
15202 AAGTAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAAGAAATCTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * * *
15267 TAC----CGAA--TC--A-A--T-T-CCTATTTGAATAATTACCTGTTTCAAATTGTCATAATCT
64 TACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * *
15319 TTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACATATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTA
128 TTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * ** **
15382 ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTA
190 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * * * *
15447 GTTCAAAAATTTAAGATTATATGAACAATTATATATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTC
254 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * *
15512 ATAAAACAATCGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATA
319 ATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCG-AATA
* ** * *
15553 AAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * * * * * * *
15618 TACCGAATC-ATTTCAAATAATTAGGGCCATTTCAATAACTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
64 TA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
15682 TTT-CTTGGTCATATAACAAATGTTT
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
15707 TTGATCATTT
Statistics
Matches: 10798, Mismatches: 2653, Indels: 2079
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
317 5 0.00
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Consensus pattern (358 bp):
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AATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATA
Found at i:8332 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 7182--15707 Score: 4580
Period size: 181 Copynumber: 47.3 Consensus size: 180
7172 CTGTATGACC
* * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * ***
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* * * * ** *
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* * * *
7427 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-A---ATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAAATATTTA
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * *
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130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* ** * * * ** * *
7539 AATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTACTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACA
** * * * * * * *
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65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * ** * * ** *
7669 AAAAATAAATTTGTCTGTCGAACTAGTTTAAATATTTAAAACTATATGAAT
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATAC
* * * * *
7968 AAG-TT-TGTTCGAAAAAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCTAATATTAATAAG----AGAT
64 AAGCTTAT-TTAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * ** *
8027 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATGGTTATGACTATAAGAGT
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
8081 AATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGCTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACA
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* * * * * *
8146 AGCTTATTTAGACTAAAACAATACTCATTTATTAATATTTCAACAATTAAAAAGTAAAAAATTTA
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * *
8211 AAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTAAAT
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
8262 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGCTTTATCATAAAAGAATTGTTTTGGTTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACA
** * *
8327 AGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAAT-AGTAAAGAGATTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT
* * ** * * * * * * *
8391 AAAAAATGAATC-ATTTATTGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAAC
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * * *
8442 AATTATATATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAGTTTTTTTCTATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTT-TGTTCATAC
* * *
8507 AAGCTCATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AATATAATTAATAATTAAAAT
64 AAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAG
* * * ***
8568 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGTGC
125 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
8624 AATTAT-TTTTTCAACTTGTAATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * ** *
8688 AGTTTATTCAGATTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT
* ** * *
8753 AAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAAT
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
*** * * * *
8805 AATTATCTA-TTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACA
* * * **
8869 AGTTTATTTA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAA
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**** * ** * *
8932 TAAAACGGGAATCTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAAC
128 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * ***
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATA-C
* * * *
9049 AAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATT
64 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * *
9112 TTAAAAATAAATTTGCTTT-CTGAAC-ACGTTCAAATAGTTACGACTATTTGAAC
128 TAAAAAATAAATCTG-TTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACA
* * * * * *
9230 AGCCTAATTGGAATAAAATAATAGTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * *
9295 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * ***
9411 AGTTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATT
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* * * * * * * *
9474 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAGTTTAAACAATCATGTCCAATT-AAT
128 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
9526 CTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATGC
1 -AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATAC
** * * *
9591 AAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTT
64 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * ** * * * * *
9652 AAAAACTAAATTTGTTTACAAAATTATTTTAATTAGTTATGACTATTT-CAT
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * ** * *
9703 CAATTATATATCTCAAATCACTATGATC-TTCATTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
1 -AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC
* * * *** * * **
9767 AAGCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAACGAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT
64 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * ** * * * * *
9832 AAAAAATCAATGTGTTCATTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
9884 AATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * ** * *
9949 TGCCTATTCAAAAT-AAATAATACTCCTTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAG-TT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATT
* ** * *
10011 TAAAAAAAAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAAT
128 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
10064 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACA
** * * * * * ** *
10129 AGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAGATTTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * *
10194 AAAAATAAATCAGCTTATCGAA-TCAGTTTAAATAATT-TCG-CCATTTCGAAT
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTT-GAAT
** * * * * ** *
10245 AATTATCTATTTCAAATATTTATAATCTTTTGTTTTGCCATAAAA-AAATGTTTTCATCATATAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAA
* * ** *
10309 GCTTGTTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGATATTTAA
66 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * *
10374 AAAAGAAATATGCTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
131 AAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
10424 AATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAATAATTATTTATGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * ** *
10489 AGCTTATTCAGAATACAATATTACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACCAAGAGATTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * *** * * * * ** * *
10553 AAAAAATAAATTTTTTTGTTGAACCAATACAAATAGTTAAGGTTGTATGAAT
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
10605 ATTTATCTATTTCAAACCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACA
* * * * * *
10669 AGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTA
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
** * ** * * *
10730 AAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAAT
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAAT
* * ** * * * * *
10781 AGTTATTTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * *
10845 AGTCTTATTT-GAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGT-AACGAT
65 AG-CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * ** * * * * * * * * *
10907 TTAAAAAATGAATCTATTGGGCTG-ACCAATACAAATGGTTATAATTGTTTGAAC
127 TTAAAAAATAAATCTGTT-TACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * * * **
10961 AA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTCATTACAAAACAATTGTTTCTATTTGTAC
1 AATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC
* * * * *
11024 AAGCTAACTTAAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
64 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
11088 TAAAAACTGAATATGTTTATCGATCAAGTTTAAATAGTTA-CACTATTTGAAC
128 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
11140 AATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * * * * *
11205 AGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATGTATTAATATTT-GACAACTAATTATTAAAAGATTT
65 AGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * *
11268 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAAGTTCAAGTAGTTACGACTATTTGAAT
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
11320 AATTATTTTTTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTTTCATAAGATAATTGTTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACA
* * * ** * *
11384 AGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * *
11449 AAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATTGTTATAACTACTTT-AGT
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAAT
* ** * *** *
11500 ATTTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATCAATTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGTTCATACA
* ** * * * * *
11565 GGCTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACT-GTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTT-AT
65 AGCTTA-TTTAGAA--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT
** *** ** * * * * * * * *
11628 GATCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTCTATTC-ATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA
116 -AAGTAAAAGATT-T-AAAAAATAAATCTGTT-TA-CCGA-ACTAG----TTCA-AAT--AGTTA
*
11691 T-ACTAATTT-ATT
168 TGACT-ATTTGAAT
* * * * ** *** *** ** * * **
11703 AA-TATTCTAGAAATT--AATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA---ATAAGT
1 AATTA-TCT---ATTTCAAATCGTTATGACCTTT---TGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTGT
* * * ****
11762 TCAAATAGTCATG-TTCATTT-GAAT--AATTAT-CT-ATTTCA--AATCATTATGACCTTTTAT
58 TC--ATA--CAAGCTT-ATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAAT-ATT-TCAAAAATTA-
* * ** * * * ** *
11819 TTTATAGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAGAAT-TATTTA--GAA-TAAAAT-AATATTGAT
114 -ATA-AGT--AA-AA--GATT-TA-AAAAATA-AATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAA-ATAG-T
* **
11879 TCATTAAGATTTTGAA-
166 T-ATGACTA-TTTGAAT
** * * * * * * * * * * *
11895 AATTAATAAAAGTATTAAAAAC--TA-AATCTATTTATCAAACTAG-C-TCAAATAGTTATTACT
1 AATT-AT-CTA-T-TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGT----TTTGTCATAAAACAATTGTT--T
* * * ** * * * * * *
11955 TTTTGA-ACAA--TTATATA-TCTCAAACCGTTATGATCTTTATTTTGTTATAGAACAATTGT-T
55 TGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAA--ATAAT-A-C--TA--AT-TTAT-TAA-TATT-TCA
**** ** * * * * *
12015 TTTTTTCATATAAGCTTATTCAGA-TTAAGATAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGT
107 AAAATT-A-ATAAG--TA-AAAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGT
* * *
12079 TA-AACTATTAGAAC
166 TATGACTATTTGAAT
* * * * * *
12093 AATTATCTATTTCAAATCGCTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * *
12158 AGCCTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATAAGTGAGAGATT
65 AGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * *
12221 TAAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGCTCAAATAGATATGACTATTTGAAT
128 T-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
12275 AATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC
* * ** * * *
12340 AAACTTGTCCA-AACTAAAATAAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGATT
64 AAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * ** * *
12404 TAAAAACTAAACCTATATT-CCGAACCATTTCAATTAGTTACAACCATTTGAAC
128 TAAAAAATAAATCTGT-TTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * * *
12457 AAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTGTTTTTGATCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACA
* * * *
12521 AGCTTATTCA-AATAAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
65 AGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * * * * *
12585 AAAAAATAAATGTGTTTGCC-AAATCAATTGAAATGGTTAAGACTATTAGAAT
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * ** * *
12637 AATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACTTTTTGTTTAGTCGTAAAACTGTTCTTTTAGTTCATAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACA
* * * * *
12702 AGCTTATTCAAAAT-AAA-CAT--TAATTTATTAACA-TTCAAATAATTAATAAGCAAAAGATTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * *
12762 GAACAAATAAA-CTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAAC
129 -AAAAAATAAATC-TGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
12815 AATT-T-TATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
** * * * * * *
12878 AGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTACAAAAACTAGTAAGTAAGAA-ATT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATT
* * * *
12942 TAACAAAATAAATCAGTTTACC-AAATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTG---
128 TAA-AAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAT
* *
12993 -A--A-C-A----AAATTGTTAAT-A-CTTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TCAACAT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT--TCAT
* * * * **
13046 ACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAATTGAT
62 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * *
13107 TT-AAAAATAAAATCTATTTACCGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAC
127 TTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
13161 AATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * * ** * * *
13225 AGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTA
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* ** * ** * *
13290 AAAAATAAATCTATTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAAC
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * ** * * * * *
13341 AATTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGACAATTATTTCAGCTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* * * * * * * * * * *
13406 GGTTTACTTGGAATACAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTA
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * * *
13471 AAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAAC
130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
13522 AATTACCTATTTCAAATAGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTG-TTCATACA
* * * *
13587 AGTTTGTTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATT
65 AGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
13650 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTCACATAGTTTTGACTATTTGTAAT
128 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AAT
* * * * * * *
13704 AATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACA
** * * * * * *
13769 ATTTTATTCATAATGAAATAATACTAATTTAATT-ATATTTCAAAACTTAATAACTAATAA-AAT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATT
* ** * * * ** *
13832 TAAAAAATTAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAAT
128 TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *** * *
13885 GATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAAATTTTTTTCGTACAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAA
* ** ** * *
13950 GCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
66 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * **
14014 AAAATATATTTATTTACTGAACCAGTTC--ATAGGTTAAGACTATTACAAT
131 AAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAAT
* *
14063 AATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACA
* * * *
14128 AGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATTT-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTT
65 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT
* * * * * * * *
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* * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACA
* *** * *
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* * * * * * * *
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130 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACT-AGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACA
* * *
14484 AGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGACTT
65 AGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * *
14544 AAAAAATAAATTTGTTT-TCGAA-TAGTT---A-A---A--ACTATTAGAAT
129 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * **
14585 AATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATAC
* * * * *
14647 AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAAT-CTTAATATATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGCAAGAGA
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* * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC-
* ** * * **
15006 AA-CTTATTT-GAAATAAAATAAAAAAAAATTTA-TAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTGAT
64 AAGCTTATTTAG-AATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * **
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* *
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* * * * * * * * * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC
* * * * * *
15355 ATGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATT
64 AAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
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* * * * * *
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* **
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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Statistics
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Consensus pattern (180 bp):
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAA
GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
AAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
Found at i:8650 original size:542 final size:538
Alignment explanation
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7172 CTGTATGACC
** * * * * ** *
7182 AATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTTGGTTCATATA
* ** * * * *
7247 AACTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAAAAAGTAAGTGATTTA
66 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA-TTAATAGTAAGAGATTTA
* * * * * ***** *** *
7312 AAAGATAAATCTGTTTACCTAATAAGTTTAAATAATTATGGCCATGCCAATAATTA-ACTATTTC
130 AAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATA-TATTTC
* * * * *
7376 AAAT-AGTTATTACCTTTTG-TTTGTCATATAACAATTGTATTT-GA-ACATTCAAGCT-TATTC
194 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T-TTTCTATTCATACAAGCTAT-TTC
* * * *
7436 AGAATAAAATAATACT-AATTAATCT--T-TCAA-A-AATTAATATGTAAAATATTTAAAACATA
255 A-AATAAAATAATA-TAAATTTAT-TAATATTAATATAATTAATA-ATAAAA-ATTTAAAAAATA
* * * * * * *** *
7495 AATCTATTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCT
315 AATATGTTTACTGAA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTAT-TTTTTCAAATCGT
* * ** * * * *
7559 TATAACCTTTTGTACTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATA
377 TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * * * **
7624 ATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAACAACTAAAAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTCTGTC
442 ATACTAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC
* * * * ** * *
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507 AAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAAT
* * * *
7720 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTTTTTTTGAACTT-AT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAACAA-TTGTTTTG--GTTCAT
* * * * *
7784 ACT-AGCTTATTTGGAATAACATAA-AATGAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAG
63 A-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA-GTAAGAG
* * * * ** * * *
7847 ATTTAAAAAAT-AATTTTGTTTACCTAACCAGTCCAAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATC
125 ATTTAAAAAATGAA-TCTATTTACCGAACAAGT-TTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATA
* * * * * *
7911 TATTTCAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTATCATAAAATAAATGTTTT-TGTTCATATAAG-TT
188 TATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTCTATTCATACAAGCTA
* * * *
7973 TGTTCGAAA-AAAAGTAATACT-AATCTATTAATATT--TCTAA-TATTAATAAGAGATTTAAAA
251 T-TTC-AAATAAAA-TAATA-TAAATTTATTAATATTAATATAATTAATAATAA-AAATTTAAAA
* * * * * ** * *
8033 AATAAATCTATTTA-TCAAACTAGTTTAAATGGTTATGACTATAAGAGTAATTATTTATTTTAAA
311 AATAAATATGTTTACTGAAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTT-TTTCAAA
* * * * *
8097 TCGTTATGACTTTTTGCTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGACTAA
373 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * * *
8162 AACAATACTCATTTATTAATATTTCAACAATTAAAAAGTAAAA-AATTTAAAAAATAAATATGTT
438 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTT
* * *
8226 TACCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTAAAT
503 TACCAAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAAT
* * * *
8262 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGCTTTATCATAAAAGAATTGTTTTGGTTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTTGGTTCATATA
* * *
8327 AGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAGTAAAGAGATTTA
66 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAGT-AAGAGATTTA
** *
8392 AAAAATGAATC-ATTTATTGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATATATTTGA
130 AAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATATATTTCA
** * * * *
8456 AATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAGTTTTTTTCTATTCATACAAGCTCATTTCAAA
195 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTTTTTCTATTCATACAAGCT-ATTTCAAA
8521 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTAATATAATTAATAATTAAAATATTTAAAAAATAAATATG
258 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTAATATAATTAATAA-TAAAA-ATTTAAAAAATAAATATG
* * * * *
8586 TTTACTGAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGTGCAATTATTTTTTCAACTTGTAATGACTT
321 TTTACTGAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTTTTCAAATCGTTATGACTT
* * * * *
8651 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAGAATAATACTAAT
385 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
*** * * *
8716 TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGT
450 TTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGT
*
8781 TCAAATAGTCATGACTATTTGAAT
515 TCAAATAGTCATGACTATTTAAAT
** * * * *
8805 AATTATCTA-TTCAAATCACAATGACCTTTT-CTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTAT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGC-TTTATCATAAAACAATTGTTTTGGTTCATAT
* * **
8868 AAGTTTATTT-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAA
65 AAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATT
*** * * * * * * * *
8932 TAAAACGGGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAG-CTAAACAATTATTTATT
128 TAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTAT-AATTGTTTGAACAATTATATATT
* * * ** * *
8996 TCAAAACATTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATTGATTCCATTCA-ATCAAGCTTATTTT
192 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATA-CAAGC-TATTTC
* * * *
9060 GAATAAAATAATTTAAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGCAAAAATTTTAAAAATAAA
255 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT--AATATAATTAATAA-TAAAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
9123 TTTGCTTT-CTGAACACGTTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
317 TATG-TTTACTGAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTAT-TTTTTCAAATCGTTA
* * * * * * *
9187 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTTTGTTCATAAAAGCCTAATT-GGAATAAAATAA
379 TGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * *
9251 TAGTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
443 TACTAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA
* * *
9315 AGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
508 AACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAAT
* ** * * * * *
9346 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTT-TGGTTCATAT
* * * **
9410 AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTT
65 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTT
* * * * * *** * *
9475 AAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAACAATCAT-GTCCAATT-AATCTATTATCTATT
129 AAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAAT-TGTTTGAA-CAATTATATATT
* * * * * * **
9538 TCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATGCAAAAT-TATTC
192 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTAT-TTC
* * *
9601 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAA-AA-AGAGATTTAAAAACTAA
255 -AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AATATAATTAATAATAAAAATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * **
9661 ATTTGTTTAC-AAAATTATTTTAATTAGTTATGACTATTTCATCAATTATATATCTCAAATCACT
316 ATATGTTTACTGAAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTAT-TTTTTCAAATCGTT
* ** ** * * * * *
9725 ATGA-TCTTCATTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAGTAAAATAT
378 ATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* *** * ** * ** * * * ***
9789 TGCTAAACGAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAG-ATTTAAAAAATCAATGTGTTCATTG
443 TACTAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA
* * * * *
9853 AACCAATTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAAC
508 AACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTA-AAT
* * * ** *
9884 AATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTGGTTCATAT
* * ** ** * *
9948 ATGCCTATTCAAAAT-AAATAATACTCCTTTATTAACATT-CAGAAAATTAATAAGCAAGA-AGT
65 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAAT-AGTAAGAGA-T
** * ** * * * * * * * *
10010 TTAAAAAAAAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
127 TTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATATATT
* * * * * * * *
10075 TAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGCTCATAAAAGCT-TATCC
192 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTAT-TTC
* * * * * * *
10138 AAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAA-A-AATTGAGAAGTTGAAGATTTTAAAAATA
255 -AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AATATAATTAATAA--TAAAAATTTAAAAAATA
* * * * * ** *
10201 AATCA-GCTTA-TCGAATCAGTTTAAATAATT-TCG-CCATTTCGAATAATTATCTATTTCAAAT
315 AAT-ATGTTTACT-GAA-AAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTT-GAGCAATTAT-TTTTTCAAAT
** * ** * ** * *
10262 ATTTAT-AATCTTTTGTTTTGCCATAAAA-AAATG-TTTTCATCATATAAGCTTGTTTC-GAATA
374 CGTTATGACT-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCAGAATA
* * * *
10323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AGGATATTTAAAAAAGAAATATG
437 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGA-ATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
10386 CTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
501 TTTACCAAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAAT
* * * ** * * * * *
10424 AATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAATAATTATTTAT-GTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTT-TGGTTCATAT
* * * * ** **
10488 AAGCTTA-TTCAGAATACAATATTACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACCAAGAGATT
65 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATT
* * * *** ** * * * * * *
10552 TAAAAAATAAATTTTTTTGTTGAACCAA-TACAAATAGTTA-AGGTTGTATGAATATTTATCTAT
128 TAAAAAATGAATCTATTTACCGAA-CAAGTTTAAATAATTATA-ATTGTTTGAACAATTATATAT
* * * * *
10615 TTCAAACCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TATTCATATAAG-TTTGTT
191 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTCTATTCATACAAGCTAT-TT
* * * **
10677 CAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAAT-A-AGAGATTTAAAAGGTAA
254 C-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA--TTAATATAATTAATAATAAAAATTTAAAAAATAA
* *** * * ** * **
10738 GTCCATTTAC-CAAACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATTAT
316 ATATGTTTACTGAAA--AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAGCAATTATTT-TTTCAAATCGT
* * * * * * *
10801 TAT-AATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATT-TGAAATAAA
377 TATGACT-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCAG-AATAAA
* * * * * * * *
10863 GTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGT-AACG-ATTTAAAAAATGAATCTATT
439 ATAATACTAATTTATTAATATTCC-AACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTT
*** ** * * * * * * * * * *
10925 GGGCTGACCAATACAAATGGTTATAATTGTTTGAAC
503 TACCAAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAAT
* * * * * * **
10961 AA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTCATTACAAAACAATTGTTTCT-ATTTGT
1 AATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGCTTT-ATCATAAAACAATTGTTT-TGGTTCAT
* * * * * *
11022 ACAAGCTAACTTAAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
63 ATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTAAGAGA
* * * * * * * * * *
11086 TTTAAAAACTGAATATGTTTATCGATCAAGTTTAAATAGTTA-CACTATTTGAACAATTATCTAT
126 TTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATATAT
** * *
11150 TTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC
191 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGC-TATTTC
* * * * * *
11215 AATTAAAATAATACAAATGTATTAATATT--TGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAA
255 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAAT-ATAATTAA-TAATAAAA-ATTTAAAAAATAAA
* * * * **
11278 TCTGTTTA-TCAAATAAGTTCAAGTAGTTACGACTATTTGAATAATTATTTTTTTCAAATCGTTA
317 TATGTTTACT-GAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTA-TTTTTTCAAATCGTTA
* * * * *
11342 TGAC-TTTTGTTTTTTCATAAGATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAAT
379 TGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* *** * * *
11406 ATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAG-ATTTTAAATATAAATATGTTTACCGA
444 ACTAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA
* * * * * *
11470 ACAAGTTCTAATTGTTATAACTACTTT-AGT
509 ACTAGTTCAAATAGTCATGACTA-TTTAAAT
* * *
11500 ATTTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTCATTATAAAACAATTGT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTT-ATCATAAAACAATTGT
11552 ATCAATTCAT
Statistics
Matches: 3005, Mismatches: 670, Indels: 312
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
534 3 0.00
535 53 0.02
536 243 0.08
537 242 0.08
538 403 0.13
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545 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (538 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTTGGTTCATATA
AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAA
AAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATATATTTCAA
ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTATTTCAAATAA
AATAATATAAATTTATTAATATTAATATAATTAATAATAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
TGAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTTTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTT
TTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAAT
AGTCATGACTATTTAAAT
Found at i:8849 original size:723 final size:714
Alignment explanation
Indices: 4955--15684 Score: 4032
Period size: 718 Copynumber: 14.9 Consensus size: 714
4945 TAGTTCATAT
* * * *
4955 TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTG
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * ** * * * * * *
5020 TTTGTCGAACAAGTTTGAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAACC
64 TTT-ACTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGACT
* ** * * ** *
5085 TTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAA
127 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
** * * * * **
5150 TTTATTAATA-TAAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACAAG
192 TTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
** * * * * * * *
5214 TCCAAAT-TTTATGACTATTTGAACAATTATTTACTTCAAATTC-TTATGA-CTTCTTGTTTTGT
256 TTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTT-TTCTTTTGT
* * * * **
5276 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGGTTATTCAAATTACAATAATGTTAATTTATTAATAT
319 CATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *** * *
5341 TTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-A-AAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCT
383 TTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATAGT-T
* * * * * * *
5404 A-GACTATTT-AATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTG
447 ATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAATTG
* *
5467 -TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
511 TTTTC-GTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * ** * * * *** *
5531 TGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATATGTTTACGAACATGTTCAAATAGTTGTGACTATCTGAAC
575 T-AGTAAAAGATTTAAAAAAT-AA-ATCTTTTTGAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTGAAC
* * * ** * *
5596 AATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTCTATTCATGCA
637 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAGTTTTTTTTATTCATACA
* *
5661 AGCTTATTTTGAA
702 AGCTCATTTGGAA
* * *
5674 TAAAATAATATAAATTTATTAATACTTGAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATG
1 TAAAATAATAT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * **
5738 TTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTT-AAATCATTATGAC
64 TTTACT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-T-TTTTCAAATTGTTATGAC
* * * * * ** * *
5802 CTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTAGAATAAAACAATACTA
126 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
5867 ATTTATTAAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAG-TTTAACAAAATAAATCTGTTTACTAAACGA
191 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * * * *
5931 GTTCAACTATTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTATTTTGTC
255 GTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTC
* * *
5996 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCCAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATA-
320 ATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATT-CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * * * * * * *
6059 TTCTAAAAATTTATAAGTTGAAGATTTAAAAACA-AAATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGT
383 TTC-AAAAATTAAAAAGTAAAAAATTT-AAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATAGT
* * * * * * * **
6123 CAT--ATCCATTTAAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTTGTAAAACAA
446 TATGAAT--ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAACAA
** * ***
6186 TTGTTTTTC-TTCATGCA-AAG-TTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAA
508 TTG-TTTTCGTTCAT--ATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * * * * * **
6248 ATT--GA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTATCGAGTCAA-TTCT-AATAGTTATGA-TC
570 ATTAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT-T-GA-ACAAGTT-TAAATAATTAAAACT-
* * * * * *
6307 ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTAT
629 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTTT
* * * * *
6370 ATTTATTCAAGCTTATTCGGAG
693 ATTCATACAAGCTCATTTGGAA
* * * * * *
6392 TAAAATATTGCTAATTTGA-TAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT
1 TAAAATAAT-ATAATTT-ATTAATATTC-AAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * * * * * *
6456 GTTTGCCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAAC
63 GTTT-ACTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGAC
* * * * * * *
6521 CTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
126 TTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * *
6585 AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACTACA-A-ATTTTAAAAATAAATCTATTTGCCT-AA
190 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTAAA
* * * * * * * * * * *
6647 CAAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATAAATATGACC-TTTCTTTT
252 CAAGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTT
* ** * * * *
6711 ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAA
317 GTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * ** * * * * *
6775 TATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAATA-ATATGTCAATTTATCGAATTAGTTGAAATA
380 TATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAA-ACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATA
* * *** * * * ** *
6839 ATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCATTACAAACTTTTGTTT-TGCTATAAAACA
444 GTTATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAT-C-ATAAAACA
** * * * * *
6903 ATTGTTTTCCATCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
507 ATTGTTTTCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * ** * *
6968 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTT--ACCA----AACCAGTT---TCTATTTGA
572 TAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTGAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTGA
* ** * * * ** *
7023 ACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTGTTGTAAAATAA--TTGTTTTAGTTCA
635 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTTTA-TTCA
* * * * *
7086 TATAAACTTATTCGAAA
698 TACAAGCTCATTTGGAA
* * ** *
7103 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT--CT----G-TTT----GTTGAAGTA-
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATAT
* * * *
7156 GTTGA--AAC-AGTT---A-AG--ACTG--TA--TGACCAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
63 GTTTACTAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGAC
** * ** * *
7208 CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAAT
126 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
7272 AATTTATTAATATTCCAAAAAGTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAGATAAATCTGTTTACCT-AATA
190 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACA
* * *** * * *
7336 AGTTTAAATAATTATGGCCATGCCAATAATTAACTATTTCAAAT-AGTTATTACCTTTT-GTTTG
254 AGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTCTTTTG
* ** * * *
7399 TCATATAACAATTGTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-A---ATTAATC
318 TCATAAAACAATTGT-TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
7460 TTTCAAAAATTAATATGTAAAATATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTA-ATTCAAATAGT
382 TTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGA-TCAAATAGT
* * ** * * * * *
7524 TATGAATATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTACTGTCATAAAACAATT
446 TATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTATCATAAAACAATT
* * * * *
7589 ATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAA
510 GTTTTCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * * *
7654 CAACTAAAAGAATTAAAAAATAAAT-TTGTCTGTCGAACTAGTTTAAATATTTAAAACTATATGA
575 -TAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-T-T-T-GAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTGA
* * *
7718 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTTTTTTTGAACTT-
635 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTT-TA-TTC
* *
7782 ATACTAGCTTATTTGGAA
697 ATACAAGCTCATTTGGAA
* * * * * *
7800 TAACATAAAATGAATTTACTAATATTTCAAAAATTAAT-ATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTT
1 TAAAATAATAT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAT-TAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * **
7864 GTTTACCTAACCAGTCCAAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
63 GTTTA-CTAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGA
* * * * * * * *
7929 CTATTTGTTTTATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTC-GAAAAAAAGTAATAC
125 CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAA-TAATAC
* *
7993 TAATCTATTAATATTTCT---AA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAA
189 TAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA
* ** * * ** * * * * *
8052 CTAGTTTAAATGGTTATGACTATAAGAGTAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGC-TT
252 CAAGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-CTTT
* * * * * *
8116 TGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGACTAAAACAATACTCATTTATTAA
316 TGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
8181 TATTTCAACAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAA
380 TATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATAG
* * * * * *
8246 TCATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGCTTTATCATAAAAGAAT
445 TTATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAAT
* * *
8311 TGTTTTGGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTA
509 TGTTTTCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * *
8376 ATAGTAAAGAGATTTAAAAAATGAATCATTTATTGAACAAGTTTAAATAATTATAATTGTTTGAA
574 ATAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATC-TTT-TTGAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTGAA
* * ** * * *
8441 CAATTATATATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAGTTTTTTTCTATTCATA
636 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAGTTTTTTT-TATTCATA
**
8506 CAAGCTCATTTCAAA
700 CAAGCTCATTTGGAA
*
8521 TAAAATAATATAAATTTATTAATATT-AATATAATTAATAATTAAAATATTTAAAAAATAAATAT
1 TAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * ** * *
8585 GTTTACTGAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGTGCAATTATTTTTTCAACTTGTAATGACT
63 GTTTACT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTCAAATTGTTATGACT
* * * *
8650 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAGAATAATACTAA
127 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
8715 TTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
192 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
* * * ** *
8780 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAA
256 TTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCA
* * * * *
8844 TAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATAAGTTTATTTAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
321 TAAAACAATTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** *** *
8908 CTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAA--TAAAACGGGAATCTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGT
385 C-AAAAATTAAAAAGTAA-A-AAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACT-AGATCAAATAGT
* ** * *
8970 TATGACTAGCTAAACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATT
446 TATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAACAATT
* * * ** *
9035 GATTCCATTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
510 GTTTTCGTTCATAT-AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * * **
9098 AATAAGCAAAA-ATTTTAAAAATAAATTTGCTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTACGACTATTTG
573 AAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAA--T-CTTTTTGAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTG
** * *
9162 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCA-TTGTTTTTGTTCA
634 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-AAAGTTTTTTTTATTCA
* *
9226 TAAAAGC-CTAATTGGAA
698 TACAAGCTC-ATTTGGAA
* * *
9243 TAAAATAATAGTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * *
9308 TTTA-TCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AA
64 TTTACT-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTT-TTTCAAATTGTTATGAC
*
9371 TCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATAC
126 T-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATAC
* ** ** *
9435 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATA
189 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* * * * * * * *
9500 AGTTTAAACAATCATGTCCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTA
254 AGTTTAAATAATCATGACCATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG
* * * **
9564 TCATAAAATAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
318 TCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * ** * *
9629 TTTCAAAAATTAAAAAG----AGATTTAAAA-ACTAAATTTGTTTACAAAATTATTTTAATTAGT
382 TTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACA-TAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATAGT
* * * * * * * * * *
9689 TATGACTATTTCATCAATTATATATCTCAAATCACTATGATCTTCAT-TTTGTCGTAAAACAATT
446 TATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTATCATAAAACAATT
* * ** * * * *** * **
9753 G-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAACGAATAATATTTTAAAAATTA
510 GTTTTC-GTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
** * * * * * *
9817 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTCATTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAG
574 AT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TT--TTGAA-CAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTG
* * * * *
9881 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA--TTGTTTCAGTTC
634 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTTTA-TTC
* ***
9944 ATACATGC-CTATTCAAAA
697 ATACAAGCTC-ATTTGGAA
** * ** * *
9962 T-AAATAATACTCCTTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAAAAATCT
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAATTAA-AAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * *
10025 GTTTATTGAACAAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAC
63 GTTTACT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGAC
** * * * * * *
10090 CCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGCTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATT
126 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
10154 AGTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGAAGT-TGAAGATTTTAAAAATAAATC-AGCTTATCGAA
190 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTA-CTAA
* * * * *
10216 TC-AGTTTAAATAAT-TTCG-CCATTTCGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATAATCTTTTG
251 ACAAGTTTAAATAATCAT-GACCATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTC
* * ** * * *
10277 TTTTGCCATAAAA-AAATGTTTTCATCATATAAGCTTGTTTC-GAATAAAATAATACTAATTTAT
313 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * * * ** * *
10340 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGATATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAACCAGTTCAAA
377 TAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAA
* * * * * * *
10405 TAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAA
442 TAGTTATGAA-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAA
* * * * * * * **
10469 TAATTATTTAT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATACAATATTACTAATTTAATAATATTATAAA
505 CAATTGTTT-TCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
** * * ** * ***
10533 AATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGTTGAACCAA-TACAAATAGTTAAGGTT
569 AATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAA--TCTTT-TTGAA-CAAGTTTAAATAATTAAAACT
* * * * * * * *
10597 GTATGAATATTTATCTATTTCAAACCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAA-ATGTTTTT
629 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTTT
* * ** ***
10660 ATTCATATAAGTTTGTTCAAAA
693 ATTCATACAAGCTCATTTGGAA
* * ** * ***
10682 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAGGTAAGTCCA
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
10743 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATTATTAT-AA
64 TTTA-CTAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTT-TTTCAAATTGTTATGAC
* * * * * *
10806 TCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATT-TGAAATAAAGTAATG
126 T-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGT-TTATTCAG-AATAAAATAATA
* * * * ** * *
10869 CTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-CGATTTAAAAAATGAATCTATTGGGCTGAC
188 CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTAAA
** ** * * *** * * * * *
10933 CAA-TACAAATGGTTATAATTGTTTGAACAA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTT
252 CAAGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTCTTT
** * * * ** * *
10995 CATTACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAGCTAACTT-AAAATAACATAA-ATCTAATTTATT
316 TGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATT
* * * * * * * * * * *
11058 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-ACTGAATATGTTTATCGATCAAGTTTAAA
378 AATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACA-TAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAA
* * * * ** * * *
11122 TAGTTA-CACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
442 TAGTTATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAC
* * * * **
11186 AATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC--AATTAAAATAATACAAATGTATTAATATT-TGA
506 AATTGTTTTC-GTTCATATAAGCTTA-TTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA
* * * * * * * * **
11247 CAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAGTAGTTACGACT
568 AAATTAA-TAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT-T-GAACAAGTTTAAATAATTAAAACT
* * * * * * *
11312 ATTTGAATAATTATTTTTTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTTTCATAAGATAA-TTGTTTTT
629 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-AAAAGTTTTTTTT
* * ** *
11375 GTTCATACAAGCTTATTCAGAT
693 ATTCATACAAGCTCATTTGGAA
** * * * *
11397 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATG
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * ** * * *
11462 TTTACCGAACAAGTTCTAATTGTTATAACTACTTT-AGTATTTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
64 TTTA-CTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGAC
* * * * * * * * * * **
11526 CTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTA--CTGAACAAGCTCAA-A-T
126 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAAT-AATACT
* * * * * * ** * * ** ** * *
11587 -AGTTATGACTGTT-TGAACAATTATTTATTTCAA-ATAGTT--ATGAT-CTTTTATTTTGTCAT
190 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTA-ATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTT-AC-T
* *** * * *
11646 AAAACAATTTTTTCTATTCAT-ACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAAT-AT
249 -AAACAAGTTTAAATAATCATGACCA---T-TT--GAAT--AATTAT-CT-ATTTCA--AATCAT
* ** *** ** ** *** * * * *
11708 TCTAGAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAA-AATAAATCTATT--TACCAA-ATAAGTTC-AAAT
301 TAT-GACCTT--TTCTTTTGTCA--TAAAACAATTGTTTTGTTCATA-CAAGCTTA-TTCAAAAT
** ** * * * *
11768 AGTCATGTTCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATAGTAAAAC
359 A-AAATAAT-A-CT-AATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTA--A------A----A-AGTAAAA-
* ** * * * *
11832 AATTGTTTCTATTCATACAGAAT-TATTTA--GAA-TAAAAT-AATATTGATTCATTAAGATTTT
404 AA---TTT-AAAACAT--A-AATCTATTTACCGAACT-AGATCAA-ATAG-TT-ATGAATA-TTT
* * ** * * * * *
11892 GAA-AATTA---A--TAAAAGT-ATTAAAAACTAAATCTATTTATCA-AACTAGCTCAAATAGTT
457 AAACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGACCT---TTTGTTTATCATAA--A--AC-AATTGTT
** ** ** *** * * * ***
11949 ATTAC-TTTTTGA-ACAATTATATATCTCAA-ACCGTTATGATCTTTATTT-TGTTATAGAACAA
513 -TT-CGTTCAT-ATA-AGCT-TAT-TCGGAATAAAATAAT-A-C-TAATTTAT-TAATATTCCAA
*** ** * * * * *
12010 TTGTTTTTTTTCATATAAGCTTATTCAGA-TTAAGATAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTCAA
568 ------AAATT-A-AT-AG--TA-AAAGATTTAA-AAAATAAATCTTTTTG---AACAAGTTTAA
* * ** * * *
12074 ATAGTT-AAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAA
617 ATAATTAAAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
12138 CAA--TTATTTCAGTTCATACAAGC-CTATTCGAAA
682 -AAGTTTTTTTTA-TTCATACAAGCTC-ATTTGGAA
* * * *
12171 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAATAAATAT
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATTAAAAGATTT-AAAAAATAAATAT
* * * * * * **
12236 GTTTATCGAACAAGCTCAAATAGATATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
63 GTTTA-CTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGAC
* * * * ** * * *
12301 ATTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTTATAAAAACTTGTCCA-AACTAAAATAAAA
126 -TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAA-TAAAATAATA
* * * * * **
12364 CTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAAACTAAACCTATATT-CCGA
188 CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACTAA
* * * * ** * * * * ** * *
12427 ACCA-TTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTT
251 ACAAGTTT-AAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTT
* * * * * *
12490 TTGTCAAAAAAAAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTC-AAATAAAAAGAATACTAATTTAAT
315 TTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * *
12554 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCC-AAATCA-ATTGAA
378 AATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACT-AGA-TCAA
* * * * * * ** * * * *
12617 ATGGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACTTTTTGTTTAGTCGTAAA
441 ATAGTTATGAATATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAA
** * * * * * * *
12681 ACTGTTCTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC--AA-AATA-AACATTAATTTATTAACATT-CAAA
504 ACAATTGTTTTCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * **
12741 TAATTAATAAGCAAAAGATTTGAACAAATAAA-CTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
569 -AATTAAT-AGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATC-T-TTT--TGAACAAGTTTAAATAATTAAAA
* * ** * * *
12805 TTATTTGAACAATT-T-TATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA--TTGTT
627 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTT
* * * * ****
12866 TCAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAA
691 TTA-TTCATACAAGCTCATTTGGAA
* * * * *
12891 TAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTACAAAAACTAGTAAGTAAGAA-ATTTAACAAAATAAAT
1 TAAAATAATA-TA-ATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATTAA-AAGATTTAA-AAAATAAAT
* * *
12955 CA-GTTTACCAA-ATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAAC----A-------AAATTGTTA
61 -ATGTTTACTAACA--AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTTTTCAAATTGTT-
* * * * ** * *
13006 AT-ACTTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAACTTATTTAAAATAAAATA
121 ATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATA
* * **
13069 ATACTAATTGATTAATATT-TCAAGAA-T--T-AGTAATTGATTT-AAAAATAAAATCTATTTAC
185 ATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTAC
** * * * * ** * *
13128 CGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG
248 TAAACAAGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTC
* * * * *
13193 TTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAA
313 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * * * * ** * *
13257 TAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAACCAGTTCAAA
377 TAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAA
* * * * * * * ** *
13322 TAGTTA-AAACTATATGAACAATTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGA
442 TAGTTATGAA-TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAA
* * * * * * * *
13386 CAATT-ATTTCAGCTCATATAGGTTTACTT-GGAATACAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAA
505 CAATTGTTTTC-GTTCATATAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA
* * * * * ** * * *
13449 AATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATAACT
568 AAATTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT--TGAACAAGTTTAAATAATTAAAACT
* * * *
13514 ATTTAAACAATTACCTATTTCAAAT-AGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT
629 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTT
* * * ** *
13577 GATTCATATAAGTTTGTTTGAAA
692 TATTCATACAAGCTCATTTGGAA
* * * * * *
13600 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * ** *
13665 TTTACCAAACCATTTCACATAGTTTTGACTATTTGTAATAATTATCTATTTT-AAATCATTATAA
64 TTTA-CTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTAT-T-TTTTCAAATTGTTATGA
* * * * * * * *
13729 CCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCATAATGAAATAATACT
125 CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
13794 AATTTAATT-ATATT-TCAAAACTTAATAACTAATAAAATTAAAAAATTAATCTAATTACTGAAC
190 AATTT-ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
* * * ** * * * * * * *
13857 CAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAATGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTA
253 AAGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG
*** * * ***** ** *
13922 TCATAAAACAAAAATTTTTTTCGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAAATTTAATAATAT
318 TCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
13987 TTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACTGAACCAGTTC--ATAGGTT
383 TTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATA-GTT
* * * * * *
14049 AAGACTA-TTACAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
447 ATGAATATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAACAATT
* * * * * * *
14113 GTTTTAGTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATT-TAAAAATTAA
510 GTTTTCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * **
14177 TAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAAACTGTTCACTGAACAAGTTCAAATAATCATTACTATTTGA
575 T-AGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCT-TT--TTGAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTGA
* * * * *
14241 ACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTAA
635 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTTTA-TTCA
* * * ****
14304 TATATGCTTAAACAGAA
698 TACAAGCTCATTTGGAA
* * * *
14321 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA
1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
14382 TTTACTGAATC-AG-TAAAATTAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAA
64 TTTACT-AA-CAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATGA
* * * * * *
14445 CCTTTTATTTGT-T-ATAAACCAATTGTTT-TTTATCAGACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAAT
125 CTTTTTGTTT-TATCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAAT
* * * * * *
14506 ACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTTC-GAA
187 ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA
* * * * *
14566 -TAG-TT-AA-AA-C-T----ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACCTTGT-TTTA
252 CAAGTTTAAATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTT
* * ** * *
14619 GTCATAAAATATTTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTTAATATATTAA
317 GTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAA
* * * * * * * *
14683 CA-TTCGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAA-ATAAATCTGTTTACC-AAATAAACTCAAA
380 TATTTC-AAAAATTAAAAAGTAAAAAATTT-AAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGA-TCAAA
* * * * * *
14745 TAGTTATGACTATTTGAACAATTACTTATTTAAAATCATTTTGACCTTTTGCTTTGTCATAAAAC
442 TAGTTATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAC
* * * * * ** * * *
14810 AATTGTTTTAGTTAATACAAACTTATACTAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAA
506 AATTGTTTTCGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * * * ****
14875 TT-A-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTAAATCAA-TTAAAATAATT-TTGGTCAT
571 TTAATAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTTTT--TGAA-CAAGTTTAAATAATTAAAACT-AT
* * ** * * *
14935 TTGAACAATTAGCTATTTGAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA--TTATTTCAG
631 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTTTTTTTA-
* * *
14998 TTCTTACTAA-CTTATTTGAAA
694 TTCATAC-AAGCTCATTTGGAA
* * * * ** * * * *
15019 TAAAATAAAAAAAAATTTA-TAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTGATTTTAAAAGTGAATCT
1 TAAAAT--AATATAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * * **
15083 GTTTACCGAATC-AGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
63 GTTTA-CTAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATTGTTATG-
* * * *** ** *
15147 AC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TAATACAAACCTATTTGGAATAAAGTAATA
124 ACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATA
* * * * *
15210 CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAAGAAATCTGTTTAC----C
188 CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
* * ** * * * * *
15271 --G----AATCAAT--T--CCTATTTGAATAATTACCTGTTTCAAATTGTCATAATCTTTTGTTC
253 AAGTTTAAAT-AATCATGACC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTT
* * * * * * * * *
15326 T-ACTATAAAATAATTGTTTCAGTTCACATATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATA
316 TGTC-ATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * * * *
15390 ATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAAA
379 ATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAA-ACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAAT
* * * * * * * *
15455 ATTTAAGATTATATGAACAATTATATATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
443 AGTTATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACA
* * * * *
15520 ATCG-TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAA
507 ATTGTTTTC-GTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
** * * *** *
15584 TTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAATC-A-TTTCAAATAATTAGGGCCA
571 TTAAT-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT--TGAA-CAAGTTT-AAATAATTAAAACTA
* * * *
15647 TTTCAATAACTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT
630 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
15685 CTTGGTCATA
Statistics
Matches: 7664, Mismatches: 1767, Indels: 1166
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Consensus pattern (714 bp):
TAAAATAATATAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
TACTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTCAAATTGTTATGACTTTTT
GTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTTAA
ATAATCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAA
CAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
TTAAAAAGTAAAAAATTTAAAACATAAATCTATTTACCGAACTAGATCAAATAGTTATGAATATT
TAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTTCGTTCA
TATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAGTAAAAGAT
TTAAAAAATAAATCTTTTTGAACAAGTTTAAATAATTAAAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAGTTTTTTTTATTCATACAAGCTCATTTGGAA
Found at i:15120 original size:521 final size:516
Alignment explanation
Indices: 14060--15059 Score: 1205
Period size: 521 Copynumber: 1.9 Consensus size: 516
14050 AGACTATTAC
* * *
14060 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT
1 AATAATTATCCATTTCAAATCGTTTTGACCTTGTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT
* * * * * *
14125 ACAAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATT
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** ** *
14190 TAAAAAATAAAACTGTTCACTGAACAAGTTCAAATAATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTT
131 TAAAAAATAAAACTGTTCACCAAACAAACTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * **
14255 AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATATATGCTTAAACAGA
196 AAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAACTTAAACAGA
* *
14320 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
261 ATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
* * * * *
14385 ACTGAATCAGTAAAATTAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTT
326 ACTAAATCAGTAAAATTAATTATGGCCATTTGAACAATTAGCTATTTCAAATCGCTATAACCTTT
* * ** * **
14450 TATTTGTTATAAACCAATTGTTTTTTATCAGACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
391 TATTTGTTATAAAACAATTATTTAGTATCAGACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAAAAAATTTA
* * *
14515 TTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTTCGAATAGTTAAAACTATT
456 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTTCCGAATAGTT---AC---T
14580 AG
515 AG
* * *
14582 AATAATTATCTATTTCAAATCG-TTTGACCTTGT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCA
1 AATAATTATCCATTTCAAATCGTTTTGACCTTGTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCA
* *
14644 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTTAATATATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAGAG
65 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATATATTAAAATT-GAAAAATTAATAAGAAAGAG
* * * * * *
14708 ATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAACTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTT
128 ATTTAAAAAATAAAACTGTTCACCAAACAAACTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATC-T
* * *
14772 ATTTAAAATCATTTTGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAACTTATA
192 ATTTAAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAACTTAAA
14837 CTA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATT
257 C-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * *
14901 TTTTTACTAAATCAATTAAAA-TAATTTTGGTCATTTGAACAATTAGCTATTTGAAATCGCTATG
321 TATTTACTAAATC-AGTAAAATTAATTATGGCCATTTGAACAATTAGCTATTTCAAATCGCTATA
* * ** *
14965 ACCTTTTGTTT-TATCATAAAATAATTATTTCAGT-TCTTACTAA-CTTATTTGAAATAAAATAA
385 ACCTTTTATTTGT-T-ATAAAACAATTATTT-AGTATCAGAC-AAGCTTATTCGAAATAAAAT-A
15027 AAAAAAATTTA-TAATATTCCT-AAAATTAATAAG
445 AAAAAAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAG
15060 TAAGTGATTT
Statistics
Matches: 409, Mismatches: 57, Indels: 24
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
519 2 0.00
520 61 0.15
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522 80 0.20
523 13 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (516 bp):
AATAATTATCCATTTCAAATCGTTTTGACCTTGTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT
ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAAAATTGAAAAATTAATAAGAAAGAGATT
TAAAAAATAAAACTGTTCACCAAACAAACTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
AAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAACTTAAACAGA
ATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
ACTAAATCAGTAAAATTAATTATGGCCATTTGAACAATTAGCTATTTCAAATCGCTATAACCTTT
TATTTGTTATAAAACAATTATTTAGTATCAGACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAAAAAATTTA
TTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTTCCGAATAGTTACTAG
Found at i:15142 original size:358 final size:351
Alignment explanation
Indices: 12083--15639 Score: 2162
Period size: 358 Copynumber: 10.0 Consensus size: 351
12073 AATAGTTAAA
* * * * *
12083 CTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTCTAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTT
* * *
12147 CAGTTCATAC-AAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATA
64 CAGTTCATACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTA-TAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * *
12210 AGTGAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGCTCAAATAGA-TATGACTATTTGA
126 AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAATC-AGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGA
* * * * * * *
12273 ATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTAT
188 ACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAAT
* * * ** * * * *
12338 AAAAACTT-GTCCAAACTAAAATAAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGA
252 ACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--TAAA--ATTAA-TAAGAGA
* * * * * * * * *
12402 TTTAAAAACTAAACCTATATT-CCGAACCATTTCAATTAGTT
311 TTTAAAAAATAAATCTGT-TTACTGAATCAATTAAAATAATT
* * * * * * * * *
12443 ACAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTG
1 ----CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG
** * * *
12507 TTTTTGATCATA-TAAGCTTATTC-AAATAAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
61 TTTCAGTTCATACTAA-CTTATTCGAAAT-AAAATAATATTAATTT-ATAATATTTCAAAAATTA
* * * * * ** * *
12570 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAATCAATTGAAATGGTTAAGACTATTAGA
123 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * ** * * * * ** * *
12635 ATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACTTTTTGTTTAGTCGTAAAACTGTTCTTTTAGTTCATA
188 ACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATA
* ** * * **
12700 AAAGCTTATTCAAAAT-AAA-CAT--TAATTTATTAACATTCAAATAATTAATAAGCAAAAGATT
253 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAG----AGATT
* *
12761 TGAACAAATAAA-CTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAT
313 T-AAAAAATAAATC-TGTTTACTGAATCAA-TT-AAA-A-TAAT--T
* * * *
12806 -TATTTGAACAATT-T-TATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC
* * * * * * * * * *
12868 AGTTTATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTACAAAAACTAGTAA
65 AGTTCATACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTA--ATTTATAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
12932 GTAAGAAATTTAACAAAATAAATCAGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAAC
127 GTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAAC
* * *
12996 AA-AAT-T-GTT---A--A---T-A-CTTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--TCAACAT
190 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TA-AT
* * * * * **
13046 ACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAGAATTAGTAATTGATTT-A
252 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGAGATTTAA
* * * *
13110 AAAATAAAATCTATTTACCGAA-CTAGTTTAAATAATTAT
316 AAAAT-AAATCTGTTTACTGAATC-AATTAAAATAA-T-T
* * * * *
13149 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTT-GCATAAAACAATTATT
1 --CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTT
* * * * * * ** *
13213 TCTGTTCACAC-AAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATA
63 TCAGTTCATACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTAAT-TTATAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * * ** *
13277 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACA
126 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * ** * * * * * * *
13342 ATTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGACAATTATTTCAGCTCATATAG
191 ATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAA
* * * * * * *
13407 GTTTACTTGGAATACAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAA
256 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA---T-TAA-TAAGAGATTTAA
* * ** * * *
13472 AAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTAT
316 AAAATAAATCTGTTTACTGAATCAATTAAAATAA-T-T
* * * * * *
13510 AACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATAGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 --CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTT
* * * * *
13575 T-TGATTCATA-TAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAA
63 TCAG-TTCATACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTA-TAATATTTCA-AAAATTAA
* * * * * * * *
13637 TCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTCACATAGTTTTGACTATTTGTA
124 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG-A
* * * * * * *
13702 ATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCAT
188 ACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTAAT
* ** * * * *
13766 ACTATTTTA-TTCATAATGAAATAATACTAATTTAATT-ATATTTCAAAACTTAATAACTA-ATA
252 ACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTTAAAA-TTAATAA-GAGAT-
* ** * * *
13828 AAATTAAAAAATTAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAATT
312 ---TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAATTAAAATAATT
* ** * * * ***
13871 AAAACTATATGAATGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAAA
1 ----CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG
** * * *** **
13936 TTT-TTTTCGTAC-AAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAAATTTAATAATATTTC-AAAATTAA
61 TTTCAGTTCATACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTT-ATAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * * **
13998 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACTGAACCAGTTC--ATAGGTTAAGACTATTACA
124 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGA
* * * *
14061 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA
188 ACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATA
* * * * *
14126 CAAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT
253 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAAT----AAGAGATTT
* * *
14191 AAAAAATAAAACTGTTCACTGAA-CAAGTTCAAATAATCATT
314 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAA-TT--AA-AATAATT
* * *
14232 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT
* * ** *
14297 CAGTTAATA-TATGCTTAAAC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TA
64 CAGTTCATACTA-ACTTATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * *
14357 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATCAG-TAAAATTAATTATGGCCATTTGAAC
126 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAA-TAATTATGACTATTTGAAC
** * * * * * *
14420 AATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTT-ATTTGTTATAAACCAATTGTTTT--TTATCAGA
190 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTA--ATA
* *
14482 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGACTTAAA
253 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGAGATTTAAA
* * *
14547 AAATAAATTTGTTTTC-GAAT-AGTT--AA-AA--
317 AAATAAATCTGTTTACTGAATCAATTAAAATAATT
* * * *
14575 CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTC
* * *
14638 A-TATCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTTAATATATTAACA-TTCGAAAAATTAATA
65 AGT-TCATACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTA-TAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * * ** *
14700 AGCAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAACTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
126 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* *
14765 ATTA-CTTATTTAAAATCATTTTGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACA
191 ATTATC-TATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACA
* * *
14829 AACTTATACT-AAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAA
255 AGCTTAT-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGAGATTTAAAA
* * *
14893 AATAAATTTTTTTACTAAATCAATTAAAATAATTTT
318 AATAAATCTGTTTACTGAATCAATTAAAATAA--TT
* * * *
14929 GGTCATTTGAACAATTAGCTATTTGAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATT
1 -CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTT
* * * ** * *
14994 TCAGTTCTTACTAACTTATTTGAAATAAAATAAAAAAAAATTTATAATATTCCTAAAATTAATAA
63 TCAGTTCATACTAACTTATTCGAAATAAAAT-AATATTAATTTATAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
15059 GTAAGTGATTTTAAAAGTGAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAA
127 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* * *** *
15124 TTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATAATACAAA
192 TTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAG
* * *
15189 CCTATTTGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAA
257 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAAT--A-A-GAGATTTAAA
* * *
15254 AAAGAAATCTGTTTACCGAATC------AAT--TC
317 AAATAAATCTGTTTACTGAATCAATTAAAATAATT
* * * * * * *
15281 CTATTTGAATAATTACCTGTTTCAAATTGTCATAATCTTTTGTTCTA-CTATAAAATAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT-ATGACCTTTTGTTTTATC-ATAAAATAATTGTTT
* *
15345 CAGTTCACA-TATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
64 CAGTTCATACTA-ACTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTT-ATAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
15409 CTAAGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGT-AGTTCAAA-AATTTAAGATTATATGAA
127 GTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCGAA-TCAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAA
* * * * *
15472 CAATTATATATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTCAGTTCATAT
189 CAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATAC
* *
15537 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTT
254 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAG--A--GATTT
* * * *
15602 AAAAAATGAATCTGTTTACCGAATCATTTCAAATAATT
314 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAATTAAAATAATT
15640 AGGGCCATTT
Statistics
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0.75 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
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CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCA
GTTCATACTAACTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTA
TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
TGTTTACTGAATCAATTAAAATAATT
Found at i:15182 original size:18 final size:19
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
15141 TTATGAACTT
15151 TTGTTTTGTCATAAAACAA
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*
15170 TTGTTTT-TCATAATACAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAA
15188 ACCTATTTGG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.35, C:0.11, G:0.08, T:0.46
Consensus pattern (19 bp):
TTGTTTTGTCATAAAACAA
Found at i:15419 original size:169 final size:171
Alignment explanation
Indices: 15198--15627 Score: 436
Period size: 182 Copynumber: 2.5 Consensus size: 171
15188 ACCTATTTGG
* * *
15198 AATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAAGAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATC
* * * * * ** *
15263 TGTTTACCGAATCAA-TT-CCTATTTGAATAATTACCTGTTTCAAATTGTCATAATCTTTTGTTC
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* * *
15326 TACT-ATAAAATAATTGTTTCAGTTCACATATGCTTATTCGA
130 TACTCATAAAACAATCGTTTCAGTTCACATAAGCTTATTCGA
* * * *
15367 AATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA-AAAGAAAT
* * * ** *
15432 CTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAAAATTTAAGATTATATGAACAATTATATATTTCAAATCATTTTG
65 CTGTTTACCG-A--A--TC---AATTT-A-ACTATATGAACAATTACATATTTCAAATCATCATA
** * *
15497 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA
120 ACCTTTTGTTTACTCATAAAACAATCGTTTCAGTTCACATAAGCTTATTCGA
* * *
15549 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATG-AAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAA-GAAAT
15613 CTGTTTACCGAATCA
65 CTGTTTACCGAATCA
15628 TTTCAAATAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATC
TGTTTACCGAATCAATTTAACTATATGAACAATTACATATTTCAAATCATCATAACCTTTTGTTT
ACTCATAAAACAATCGTTTCAGTTCACATAAGCTTATTCGA
Found at i:18283 original size:180 final size:179
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Period size: 182 Copynumber: 6.1 Consensus size: 179
17819 AAAGCTAACA
* ** *
17829 AAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATGTGTAAAAGATT
1 AAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
17893 TAAAAA-AATATGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCA
65 TAAAAATAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCA
* * * * *
17957 AATTATTGTAACCTTTTATTATGTCATAAAACAATTATTTCTATTCACAC
130 AATTGTTATGACCTTTTATTATGCCATAAAACAATTATTTCAATTCACAC
* * * * *
18007 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTGAAAATTAACAACTAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * *
18071 TTAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTCTTTATTT
64 TTAAAAAT-AATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * * ** *
18136 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGCCGTAGAACAATT-TTT-AAGTTCTTAGT
128 CAAATTGTTATGACCTTTTATTATGCCATAAAACAATTATTTCAA-TTCACA-C
* * *
18188 AA-CTTATTTAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
18251 TAAAAAATAATTTTGTTCACCAAGCTAGTTCAAATAATTATG-TCTATTTGAACAATTATTTATT
65 T-AAAAATAA-TTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAT-TATTTGAACAATTATTTATT
* * * * * * ** * *
18315 TCAAATCGTTATGACATAAAAAAATGTTTTTGTTCATTCATAAAAGAATT-TTT-TTTTCATAT
127 TCAAATTGTTATGACCT-------T-TTATTATGC---CATAAAACAATTATTTCAATTCACAC
* * * * * * * * ** *
18377 AAGTTTGTT-TGAAATAAAACAAGATTAATTTATTAATGTTTTGAAAATTAAAAAGTAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
18441 TAAAAAATAAATCT-ATTACTAAACTAGTTC--A-A-TTA-G-TTATTTGAACAATTATTTATTT
65 T-AAAAAT-AATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTT
* ** * * * * * * * * *
18499 TAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATGCATA-
128 CAAATTGTTATGACCTTTTATTATGCCATAAAACAATTATTTCAATTCACAC
* * * * *
18550 TAGTCTTATTCGGAATAAAATAATGCTAATTT-ATGAATA-TTCGAAAAGTTAATAAGTAACAGA
1 AAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * ** * * * * *
18613 TTTAAAAAACAAATCT-ATTGGCATGACCAGTGCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTA
63 TTT-AAAAA-TAATTTGTTTACCA-AACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTA
* * * * ** * * ** ***
18677 TTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATTGTTTCTGTTTGTAC
125 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTATGCCAT-AAAACAATTATTTCAATTCACAC
* * * * * *
18733 AAGCATATTCAAAATAATATAATTCTAATTTATTATTATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * *
18798 AAAAAATTAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
66 -AAAAA-TAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTC
* * * * * * **
18863 AAATTGCTATCACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCTATTCATGC
129 AAATTGTTATGACC-TTTTATTATGCCATAAAACAA-TTATTTCAATTCACAC
18916 AAGCTTATTTCA-AATAAAATTAATA
1 AAGCTTA-TTCAGAATAAAA-TAATA
18941 AGTAAAATAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
AAAAATAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
ATTGTTATGACCTTTTATTATGCCATAAAACAATTATTTCAATTCACAC
Found at i:18367 original size:23 final size:24
Alignment explanation
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* *
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CATAAAAAAATGTTTTTGTTCATT
Found at i:18368 original size:24 final size:23
Alignment explanation
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18319 ATCGTTATGA
18329 CATAAAAAAATGTTTTTGTTCATT
1 CATAAAAAAATGTTTTT-TTCATT
* *
18353 CATAAAAGAATTTTTTTTTCAT
1 CATAAAAAAATGTTTTTTTCAT
18375 ATAAGTTTGT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 1
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
23 5 0.25
24 15 0.75
ACGTcount: A:0.37, C:0.09, G:0.07, T:0.48
Consensus pattern (23 bp):
CATAAAAAAATGTTTTTTTCATT
Found at i:19059 original size:155 final size:155
Alignment explanation
Indices: 18776--19061 Score: 416
Period size: 155 Copynumber: 1.9 Consensus size: 155
18766 TATTATTTCA
* *
18776 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *
18841 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
66 TATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTATTTTATCATAAAACAATTTTTTT
18906 CTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
131 CTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
* * * *
18931 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAGATAAATCTTTTTACCT-AATAAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
18995 TTATTTCAA-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
65 CTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTATTTTATCATAAAACAATT-TTT
19058 TTCT
129 TTCT
19062 TCACACAAAC
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 13, Indels: 5
0.87 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
153 23 0.20
154 29 0.25
155 62 0.53
156 2 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (155 bp):
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
TATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTATTTTATCATAAAACAATTTTTTT
CTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
Found at i:19208 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 18931--19948 Score: 821
Period size: 181 Copynumber: 5.6 Consensus size: 180
18921 TATTTCAAAT
* * * * * * *
18931 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAGATAAATCTT-TTTACCTAATAAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * *
18995 TTATTTCAA-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT
65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
19059 TCTTCACACAAACTTATTTGGATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTTG
130 TATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTG
** *
19111 CCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * *
19175 TATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTAT-
66 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * *
19239 TAGTTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-
130 TA-TTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG
*** * * * * * *
19290 AAAATCTAACGTGTAAGAGATTTAAGAAAATGAATCTACTTA-CTGAACAAGTTCAATTAGTAAT
1 AAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAATAAATTTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
19354 GATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGT
63 AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * **
19418 TTCTATTCATACAAGCTTATTCCGAATAAAATAAT--TAAATTTGTCAATATTTCA
127 TTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTG
* * * * * * * * *
19472 AAAATTAATAAGTCAAA-A-TAAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACCCATTTAAATAATTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAA-CAAGTT-CA-AA-TA-GTC
* * * *
19535 TATTTATCTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA
61 -A--TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
** * ***
19600 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCA
123 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG
* * * * * * * *
19659 AAAATTAATAAGTTAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAGCAAGTTAAAATAGTTATGA
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTCATAA
* * * * *
19723 TTGTTTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CTCTTTT-TTTTATCATAAAACAATTATTT
65 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
* * *
19786 CTATTCAAACAAGTTTATTCTGAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTTG
129 CTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG
* * * ** * * *
19839 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCACAT
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATA-
* * *
19904 GC-ACTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
64 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT
19949 GTTGTAGAAA
Statistics
Matches: 666, Mismatches: 136, Indels: 71
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
178 18 0.03
179 49 0.07
180 176 0.26
181 196 0.29
182 74 0.11
183 2 0.00
184 2 0.00
185 3 0.00
186 90 0.14
187 32 0.05
188 6 0.01
189 18 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAAC
TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
ATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG
Found at i:20007 original size:146 final size:147
Alignment explanation
Indices: 19837--20124 Score: 436
Period size: 146 Copynumber: 2.0 Consensus size: 147
19827 ATTAATATTT
*
19837 TGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCAC
1 TGCAATTTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCAC
* * * *
19902 ATGCACTTGAA-CATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAGAAAAAG-TAT
65 ATACACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAAGTTAT
19965 TTCTATTCATACATGTTC
130 TTCTATTCATACATGTTC
* * * **
19983 TGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAGCAAGTTGACATAGTCATG
1 TGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCACA
* *
20048 TACACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAAGTTGTT
66 TACACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAAGTTATT
*
20113 TCTGTTCATACA
131 TCTATTCATACA
20125 GAATTATTGA
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 13, Indels: 3
0.89 0.09 0.02
Matches are distributed among these distances:
145 44 0.35
146 69 0.54
147 14 0.11
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.14, T:0.41
Consensus pattern (147 bp):
TGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCACA
TACACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAAGTTATT
TCTATTCATACATGTTC
Done.