Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168438.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_650, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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5678 AGGTTGTATT
5688 TTCAATTCAAGAATAGTGGATTG
1 TTCAATTCAAGAATAGTGGATTG
5711 TTCAATTCAAGAATAGTGGATT
1 TTCAATTCAAGAATAGTGGATT
5733 AAAGCCTTGG
Statistics
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1.00 0.00 0.00
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TTCAATTCAAGAATAGTGGATTG
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Indices: 6022--7562 Score: 1248
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6012 AAAAGCTAAC
* ** * * * * * *
6022 ACTTAATAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATGTTATTTTA-TTCTGAACAAACTTATATGAAC
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* * * * *
6086 A-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATAC
65 AGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
6149 AGCCTTTACTATTTGAAC-AGGTTTGGC-AAACAAATTTA-TTTTTAGAATCTCTT
129 AGTCATAACTATTTGAACTA-GTTT-GCTAAACAGATTTATTTTTTA-AATCTCTT
* * * * *
6202 AGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * *
6266 ATAAATAAATGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATA
65 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
6331 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
130 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
6383 ACTCATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAGGCTTATATG-ATG
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-
* * * *
6447 AAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAGTTCATAA-CATTTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
65 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * ** **
6511 GGCCACAATTATTTGAACT-GATT-CAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCA
129 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGC--TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
6564 ACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * *
6629 A-AAACATTTGTTTTATTATAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
6693 GTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTAAAATTTCTT
130 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
* * * * * * *
6746 GCTTATTAGTTTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TACGAA
1 ACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAA
* * * * * * * **
6809 CT-GAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTGAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAA
64 -TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * ** * * *
6873 TATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAAC-AAACACATTTACTTTTTAAATCTATT
128 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * *
6927 ACTTATTAATTTTAG-AATATTATTATTTTAGCAATATTTT-TCTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * * *
6990 AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTTTTCAAATA
65 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
7054 ATCATACCAATTTGAATTAGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAA--TCTT
130 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* **
7104 --TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * ** *
7167 AAAATAATTTTTTTACGATAAAACAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAATAATTCAAATGG
66 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * **
7232 AT-GTGACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTAATTTCTTAAGTCTCCA
131 -TCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
7283 ACTCATTAA-TTTT-ATTATATTAATAAATTGGTATTGTTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * *
7346 AGAAACAACTATTTTATGACAAAAATAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
65 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
7411 AGTTATAACTATTTAAACTCA-CTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
129 AGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
7464 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTGTTATTTTATTACGAATAAGCTTGTACGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
*
7529 GAAACAATTGGTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATA
66 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
7563 TCTGTTCATT
Statistics
Matches: 1074, Mismatches: 247, Indels: 80
0.77 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 12 0.01
176 58 0.05
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178 1 0.00
179 75 0.07
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183 8 0.01
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Consensus pattern (181 bp):
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTAGTTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
Found at i:6951 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 6929--6964 Score: 56
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6919 AATCTATTAC
6929 TTATTAATTTTAG-AATA
1 TTATT-ATTTTAGCAATA
6946 TTATTATTTTAGCAATA
1 TTATTATTTTAGCAATA
6963 TT
1 TT
6965 TTTCTTCGAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 7 0.39
17 11 0.61
ACGTcount: A:0.36, C:0.03, G:0.06, T:0.56
Consensus pattern (17 bp):
TTATTATTTTAGCAATA
Found at i:8132 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 7625--11404 Score: 2834
Period size: 181 Copynumber: 21.0 Consensus size: 180
7615 TAGAAACTCA
* * * * * *
7625 TAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTCAC--AA-AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * **
7687 TACCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC
* *
7751 TTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAAT-TTTCCAAAAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAAATTAAT-AG
* * * ** * **
7802 TAAGAGATTAAAAATAATAAGTGT-TTGT--TGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACA
1 TAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTATT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
7864 ATTATCTATTTCAAATCATTCT-AACCTTCTT-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATGC
64 ATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAC
* * * *
7927 AAGCTTATTTAAAATATAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AG
* *
7982 CAAGAGATTTAAAAACATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
8046 ATTTTCTCTTT-AAAGACATTACGAACTTTTGTTTTGTTAAAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAA
64 ATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* * *
8110 AACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AG
* * * * * * *
8164 CAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
8228 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAGAACAATTGTTTCCA-TCCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CAGTTCATACAA
*** * * * ** * *
8291 GCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AG
* * * * * ** * * * *
8343 TAAGAGATTAAAAAAATAAATGTTTTTGCCGAACCCGTCCAAATAGTTAAGACCATTAGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * * * ** * *
8408 TATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTATTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC
** * * * *
8473 TTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAACATTT-AGAAAACTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AG
* * ** *
8524 CAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * ** *
8589 TTATCTATTTAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTAAGTTTTTAAAAG
65 TTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG
* * * *
8654 TTTATCCAAAATAACATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGA-AG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-ATAG
* * * * * *
8706 TTAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TCAA-ATCAGTTCAAATAATTATGACAATTTAAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
8769 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTTATTCTGCCATAAAACAATTGTTTTTCA-TT-ATA-
64 ATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATAC
* * * *
8831 AAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCATATTAATATTTCAAAAATTAAT
127 AAGCTTA-TT----CAAAATAA-AATAA--TACT-A-A-TT--TATTAATATTTCAAAAATTAAT
8896 GAG
179 -AG
* * * * *
8899 TAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACTAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACTA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
8963 TTATATATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACA
65 TTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACA
** * ** * * *
9026 AGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTAT-GAAAATTAGTATC
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA-G
* * * * * * * * *
9080 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** ** *
9145 TATCTATTTCAAATCATTATG-ACATTTTGCTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAG
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG
* * * *
9209 TTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-G
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAG
* * * * * *
9259 --AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAGT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
9322 TATTTATTGCAAATCATTATGACCATTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTAATACAAT
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAG
* * * * *
9386 CTCATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AG
* * * ** * * * * *
9438 TAACAGATTTAAAAAATTAATCTGTTGGCCTG-ACCAGTGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
9502 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC--ACAACAATTGTTTCTA-TTCCTATAA
65 TTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAA
** * *
9564 GCTTATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATT-A-A-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAG
* * * * * * * ***
9613 TAAGAGATTTAAAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAGTCCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *** * * * *
9678 TACCTATTTTAAATTGCTAT-AACCTTTGGTTTTGCCATAAAATAATTTTTTTCTA-TTCATACA
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTC-AGTTCATACA
** * * * *
9741 AGCTTATTTTAATTAAAACAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AG
* * * * * *
9795 TAAAAGATTTAAAAAACAACTCTATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** *
9860 TATTTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTCGTTTTGTCA-AAAACAAATTTTTTTTGTTCATAGAA
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAA
*** * * *
9923 GCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AG
* * * * * * * * *
9975 TAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * * *
10040 TATCTATTTCAAATCGTTATG-ACATTTTGTTTCATCATAAAAACAATTATATCTGTTAATATAG
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA
* * *
10104 GCTTATTCAAAATAAAAAAAATACTAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAG
129 GCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AG
* * * ** *
10158 CAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTTCTGAA-AAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
10222 TTTTTATTTCAAATCATTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-ATGTTCATATAA
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAA
* *
10285 GCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAACATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAAT-AG
* * *
10339 TAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTA-TGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** *
10401 ATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACA
64 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* ** *
10465 AGCATATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A-
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAG
* * * *
10515 T-A-AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAA
* * * *
10578 CAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TCCAT
62 CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCAT
* * **
10641 ATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGG
125 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA-G
* * * ** * * * * *
10698 TAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTACTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * **
10762 TATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAA
66 TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC
* * * * * **
10827 TTATTCAGAACAAAATAATACTGATCTATTAAAATTTTGAAAATT-A-A-
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAG
* * * * * *
10874 CAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAGAA-ATAGTTTAAATAGTTATGACTATATT-AACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACA
* * * ** ** *
10937 ATTGTCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATA
64 ATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
** * * *
11000 AGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-A-A-
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAG
* * * * *
11050 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGC-ATTTACCGAAC-CGATTCAAATAGCTAGGACTATTAGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTACTGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * * *
11113 ATTATCTACTTCAAATCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTTAATTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA
* * * * * *
11178 GCCTATTTAGAATGAAATAATACTAATTTAATAACA-TTCAAAAAATTAATGAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AG
* *
11231 CAAGAGATTTAAAAAA-AAATCTATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACA
* * *
11293 ATTATCTATTT-AAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAA
64 ATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* *
11356 AACTTA-TCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAAAATTAA
128 AGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
11405 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 2848, Mismatches: 615, Indels: 279
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 87 0.03
176 173 0.06
177 273 0.10
178 81 0.03
179 370 0.13
180 516 0.18
181 658 0.23
182 425 0.15
183 89 0.03
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185 14 0.00
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193 116 0.04
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ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC
TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAG
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* *
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66 CTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
** * *
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131 TTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
** *** ** **
7816 TAATAAGTGTTTGTTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATC
194 TAA-ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *
7881 ATTCTAACCTTCTT-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGCTTATTTAAAATATA
258 GTTATGACCTT-TTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAA
*
7945 ATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAACATAAATCTATTT
321 ATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTT
* * * * *
8010 ACTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAATTTTCTCTTTAAAGA-CATTACGAACT
384 ACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA-ATCATTATGACCT
* * * * *
8073 TTTGTTTTGTTAAAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACT
447 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
*
8138 TTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
512 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * *
8165 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-CAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *
8230 ATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAGAACAATTGTTTCCATCCATACAAGCT
64 ATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * ** *
8294 TATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAA
129 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * *
8359 TAAATGTTTTTGCCGAACCCGTCCAAATAGTTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTG
194 TAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * *
8424 TTCTGACCTTTTATTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAAT
259 TTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAAT
* * *
8489 AATACTATTTTATTAACATTTAGAAAACTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTAC
323 AATACTAATTTATTAACATTTA-AAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * *
8554 CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGATCTTTTG
386 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
* * * ** * * * *
8619 TTTTATAATAAAACAATTGTTTAAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACATAATATTAATTTAT
451 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
8684 TAATATTTCAAAAATTGAGAAGT
516 TAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * * * *
8707 TAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGACAATTTAAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-CAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
8772 ATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTTATTCTGCCATAAAACAATTGTTTTTCATT-ATA-AAGC
64 ATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGC
* *
8835 CTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCATATTAATATTTCAAAAATTAATGAGT
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTC-TA--AA-A-TT----AA-T-A--AGT
* * * * * *
8900 AGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACTATT
179 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* * * *
8965 ATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTA-TTTATGTTCATACAAGC
244 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTA-GTTCATACAAGC
* * ** * * * *
9029 TTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTATGAAAATTAGT-ATCTAAGAGATTTAAA
308 TTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAA
* * * * * * * *
9093 AAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA
370 AAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAA
* * ** ** * * *
9158 TCATTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAA
435 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAA
* *
9223 AATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G-
500 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * * * *
9259 -AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAGTT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTAC-AAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
9323 ATTTAT-TGCAAATCATTATGACCATTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTCTATTAATACAATC
64 ATCTATCT-CAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* ** * * *
9387 TCATTCAGAATAAAGTAATGCTAA-TTAATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAA
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAA-TAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* ** * ** * *
9451 AAATTAATCTGTTGGCCTG-ACCAGTGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAA
191 AAATAAATCTGTTTACC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * *
9515 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC--ACAACAATTGTTTCTA-TTCCTATAAGCTTATTCGGAAT
255 ATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAT
* * * * * * *
9577 AACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACTGAATTTGT
318 AAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
** * * * * * * *** *
9638 TTATTGAATAAGTCCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTTAAATTGCTATAACCT
382 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
* * * * * ** * * *
9703 TTGGTTTTGCCATAAAATAATTTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTAATTAAAACAATACAA
447 TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *
9767 ATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGT
510 ATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGC
* * * * *
9796 AAAAGATTTAAAAAAC-AACTCTATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTT-AAAAACTAAATCTATTTAC-AAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
9860 TATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTCGTTTTGTCA-AAAACAAATTTTTTTTGTTCATAGAA
63 TATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * *
9923 GCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATT-TCAACAATTAATGAGTAAAAAATTTT
126 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * *
9986 AAAAATAAATATGTTTACTGTACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTC
189 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
10050 AAATCGTTATGACATTTTGTTTCA-TCATAAAAACAATTATATCT-GTTAATATAGGCTTATTCA
253 AAATCGTTATGACCTTTTGTTT-AGTCAT-AAAACAATTAT-TTTAGTTCATACAAGCTTATT-T
* * * * * * *
10113 AAATAAAAAAAATACTAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATGAA
314 GAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
10178 TCTATTTTCTGAA-AAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTTTATTTCAAATCATTAT
377 TCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * *
10242 GACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-ATGTTCATATAAGCTTATTCCAAATAAAATAAT
442 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* *
10306 A-TAAATTTATTAATATTCCAAAACATTAATAAGT
506 ACT-AATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGC
* * * *
10340 AA-AAATTTTAAAAA-TAAATCTATTTTATGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAA
1 AAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTA-TTTA-CAA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * ** *
10402 TTATCTATTTCAAATAGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACAAG
62 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * *
10467 CATATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-T-A-AGATTTAAA
127 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA
* * * * * *
10526 AAAATAAATCTGTTTACTGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAACAATTATTTATTT
190 AAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA--A-GACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
10591 CAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TCCATATAAGTTTATTTGA
252 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTG-
* * * * *
10655 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATC
315 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * *
10719 TACTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGA
379 TATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGA
* * * * *
10784 CCTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAA--TTATTCAGAACAAAATAATA
444 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT--AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * **
10847 CTGATCTATTAAAATTTTGAAAA-T--TAA-C
507 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * *
10875 AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAGAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATATT-AACAAT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTAC--AAATAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAAT
* * * * ** * *
10939 TGTCTATCTTAAATCATTATGATC-TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGC
63 TATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
11003 TTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAA
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * *
11065 ATAAATGC-ATTTACCGAACC-GATTCAAATAGCTAGGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAA
193 ATAAAT-CTGTTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
11128 TCGTTTTGACCTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCCTATTTAGAATGA
256 TCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAA
* * *
11193 AATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AAATCTATTT
320 AATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * *
11257 ATCGAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTA-GACCTT
384 ACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT
* * *
11320 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAATAAAATAATACTACT
448 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAAT
*
11384 TTATTAAT-TTTCAAAAATTAAAAAGC
512 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
** * *
11410 AAGTTATGACTATT-TGAA-TAAA--TA--T-C-AAT-CTT-AAATCA-TTATGA-TCTTTG---
1 AAG--A-GA-T-TTAAAAACTAAATCTATTTACAAATAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAAC
* *** ** * ** * *
11460 --TTTTCTCATAAAATAATTATTTTTGATCATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATACTAATT-
60 AATTATCT-ATCTCA-AA-TCGTTATGATCAT--TTG-TT-TT--G-T---CATAAAAC-AATTG
* * ** * * * * * * *
11522 TATTAGTATTC-TA-AAACTTAGTAAGAGACTTAAAAAAATA--AATGT-GT-TTGTT-GAACCA
111 T-TT-CTATTCATACAAGCTTA-TTTG-GA-ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAA--A
* * * * * * * * *
11580 GTTCGAAT-AGTTAAGA-CTATT--AGAAT-AAT-T-TTTAATTTCAAATCATTTTAACATTTTG
169 ATT--AATAAG-TAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTT-A--CCGAACCAGTTCAA-A--TAG
* * * * ** * ** * ** ** *
11638 TTTAGTC-A--T--ACAATAAT-TGTTTCAGTTC-ATACAAGCTTACTTGAAATA-AAATAATAC
224 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT--TTG-TTTAGTCATAAAAC
* * * ** * **
11695 TAATT-TATTAACATTCAAAAAATTAAAAAGCAAGAGATTTGAA-AAAATAA-ATTTGTTTATTA
286 -AATTAT-TTTA-GTTC-----A-T-ACAAGC---TTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * * *
11757 A-A---CAAATTTGAAT-AGTTATGATGATTTGAACAAT-TATCAATTT----AA-AA--TCATT
338 ACATTTAAAAATT-AATAAG-CAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCA-A
* * * ** * * ** ** * **** ***
11809 ATGACTTTTTG--T-TTTGCCATAAACAAT-TGTTTTAGTTCA-TAAAAGCTTATTCAAAATAAA
399 AT-A-GTTATGACTATTTG-AAT-AATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT-TT-GTTTTGTC
* * * * * *
11869 ATAATACTATTGTATT-AATAT-TTCAAAAG-TTAAT-AAGACATTTAAA-AA-A-TAA---A-T
458 ATAAAACAATTGT-TTCAGT-TCAT-AAAAGCTTATTCAA-A-A-TAAAATAATACTAATTTATT
*
11923 CA-A-TTCAAATAATT-AT--G-
517 AATATTTCAAA-AATTAATAAGC
** * * * * ** * *
11940 --GCCATTTAAACAACT--ATCTATTT-CAAATTGTT--ATTACTTTTGGTTTTCTCCTAAAACA
1 AAGAGATTTAAA-AACTAAATCTATTTACAAATAGTTCAAATAGTTATGACTAT-T--T-GAACA
* * * * * * ** * *
11998 ATT-GCT-TTTC-AAT--ATA-GA--A---GCCTAT-TCA-AAATA-AAATAATACTAATTTA-A
61 ATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTG-TTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT-ATTCATA
* * * * * * ** ** **
12048 TAA---TATTT-CAA-GAATTAATAAC-AGATTTAAAAAATAAATCT--GTTTACCAA--ACCAG
123 CAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-ACTA-ATTT-AATAAT-ATTCTAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * * **
12103 -TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATATCTATTTCAAATTGTTATA-ACCT-TTTGTTC--
184 ATTTAAAAAATAAAT--CTGTTT-ACCGA-A-CCAGTTCAAATAGTTA-AGA-CTATTTGAACAA
* * * * **
12162 -TATC-A--T-AAAAC---A--A--TTTT-TTTTGTTCATATAAGC-A-TA--TTCG-AAATA-A
242 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG-TCATA-AAACAATTATTTTAGTTCATACA
* * * * * * *
12208 AG--TA-AT-ACT--AAT-TTAGTAATATT-CTAAAAATT---AA-TAACTAAG---GA-ATTTA
305 AGCTTATTTGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAACATTTAAAAATTAA-TAAGCAAGAGATTTA
* * * ** * *
12257 AAAAATAAATCTATTT-CCTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG-ACAATTATTTAATTT
368 AAAAATAAATCTATTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTT
* ** * * * *
12320 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTTCA-TTAATATAAGTTTATTCAA
431 AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAA
* * *
12384 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGT
495 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGC
* * * * * *
12429 AAGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACTAAACCACTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTAC-AAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * * * **
12493 ATCTATTTCTAATCATT-TTAACTTCTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTGTTCATACTATT
64 ATCTATCTCAAATCGTTATGATCAT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * * ** * *
12557 TTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAAACGTAATAACCAAGAAAATTAAAA
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
** ** * * *
12622 AATAAATCTAATTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAAG
192 AATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-
* * * * * * * *
12687 T-GTT-TGACCTTTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAACCTTTTTTTTATT
256 TCGTTATGACC--TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGC-TTATTTGAAT
* * * * * ** * * *
12749 AAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAAT-AATTTTT
318 AAAATAATACTAATTTATTAACA-TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
** * * * * * * * * * *
12813 TTGTC-AATCAA-TTGAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACA
382 TTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
* * * * *
12876 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-ACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAA
446 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* *
12940 TTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAGA
511 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * * *
12967 AAGAGGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTAACGAACA-AGGTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTT-AAAAACTAAATCTATTT-AC-AA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * ** * *
13031 ATGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTCATTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAA
62 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** * * *
13095 GCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAAAAATTTA
126 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
** * ** ** *
13159 AAAAATAAATCTGTTTACCGAATTAGTT-AAATAATTATAG-CCGTTTGAATGATTATCTATTTT
189 AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
13222 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATATGAA
253 AAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG-A
* * **
13286 ATAAAATAATACTAATTTATT-ACAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAA
316 ATAAAATAATACTAATTTATTAAC-ATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * * *
13350 TGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTAT-TAATCTCAAGTCGTTAAG
379 TATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTAAAATCATTATG
* * * ****
13414 A--TATTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGATTT--TTATCATAGAAGCTTATT-TGGTTAAAAATA
443 ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAAT-AAAATA
** * *
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* * * * *
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* * * ** ** *
13573 GACTATATGAACAATTATCTAT-TCCAAAT-GTTATGACCTTTTCATTTGTTGTAGAACAATTGT
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* * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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302 ACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
* * * * ** * * * *
13890 TTAAAAATAAATCTGTCTATCGAAACAAGTTTGAATAGTTATTACTATTTTAACAATTAT-TAAT
366 TAAAAAATAAATCTATTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
** ** * * * * * * * * *
13954 TAAAATTGTTAAAACTTTTTGATTTCTCATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-G
430 TAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTCA
* * * *
14018 GATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACAAAAA-TAATAAGT
494 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGC
* * * * * * * * *
14063 AAGAAACTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACGA
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTA-TTTA--CAAATAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * * * *
14126 TTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCACACAA
62 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
14189 GCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
126 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
14254 AAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATGTAAATAATTAT-TAATCTCA
190 AAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCA
* * * * * * * *
14318 AATCGTTAAGATCTATAT-TTTA-TCATACAACAATTGTTTCT-GATCATAGAAACTTATTTTG-
254 AATCGTTATGACCT-TTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTTGA
* * * * * * *
14379 TTAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA-AAATG
316 AT-AAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * ** * * * * *
14442 TGTTTGTCGAGTCAA-TTCGAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATAATTCTA
379 TATTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATG
* ** * ** *
14506 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-ATATTTGTTTCA-TATTTTACAA-CTTTATTCGGAGTAAAATA
443 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-A-TTGTTTCAGT-TCATAAAAGC-TTATTCAAAATAAAATA
* * *
14568 AT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAAAAGG
504 ATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGC
* * * * * * * *
14603 AA-ATGATATGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTA
1 AAGA-GAT-TTAAAAACTAAATCTATTTA-CAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *
14667 TTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-GAGTTCATAAAA
62 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
**** ** * *
14731 GCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAGTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--
126 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
14793 AAAATAAATTTGTTTAACGAA-CATATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAA
190 AAAATAAATCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * **
14857 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TGTTTGAATTTATACAAGCTTAGTTAAAAT
254 AATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAT
* * * * * * * * *
14921 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATCAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGT
318 AAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * * *
14986 TTACCGAATCAGGTT-AAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACC
382 TTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
* * * * * * * * *
15050 TTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTA-ATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTA
446 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *
15114 ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
510 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * *
15143 AAGAGATTTTTAAAAA-TAAATCTATTTACCGAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGA--TTTAAAAACTAAATCTATTTA-C-AAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
15207 TTGTATA-CTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA
62 TTATCTATC-TCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
15271 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-A
126 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* ** * * * *
15335 AAAATGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCA
190 AAAAT-AAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
15400 AA---TTAT----TTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAA
254 AATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-TGAA
* * * *
15457 TAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAATC
317 TAAAATAATACT-AATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * * * * *
15521 TATTTATCTG-ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTACTATG
379 TATTTA-CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATG
* * * * * * *
15585 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATA
443 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
*
15649 CTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--
507 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * **
15678 ATG-GATTTGAAAAA-TAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAAT
1 AAGAGATTT-AAAAACTAAATCTATTTA-CAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * ** ** * * * * * ** * **
15741 TATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAATAATAATTTCTATTCATAAAAAT
63 TATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
*** * * * * * * *
15806 TTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAAGTAATAAG-AA-AAATTTTTAA
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA
* * * * * * * * * *
15869 AAATAAAT-TGTTAATCAAACTAGATCAAATAATTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAA
191 AAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * *
15933 TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATCAA-CTTATTTGAAATA
256 TCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTTG-AATA
* * * ** * *
15997 AAATAATACTAAGTTATTAATAATTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTTAAAAATGAATCTATT
319 AAATAATACTAATTTATTAA-CATTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * *** * *
16062 TACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACTTT
383 TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT
* ** ** * * *
16127 TTATTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-ACGAATAAAATAATAC-AA
448 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAA
* *
16189 TTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGT
511 TTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGC
* * * * * * ** *
16217 AAAAGATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTGCTAAACAAATTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAACT-AAATCTATTTAC-AAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** * *
16281 TATTTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCTATTCATACAA
63 TATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
16345 GCTTA-TT-GATATTAAAATAATATTAATTTATAAAATATT-TCAACAACTAATAAGTAAAAGAT
126 GCTTATTTGGA-A-TAAAATAATACTAATTTA-ATAATATTCT-AA-AATTAATAAGTAAGAGAT
** * * * *
16407 TTAAAAAATAAATAC-GTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAGTTATCTA
186 TTAAAAAATAAAT-CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT-TAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * *
16470 TTTCAAATCATTGTGACATTTTATTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTT
249 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * * ** *
16535 GAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAATTAA
314 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
16599 TTTGTTTATCAAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CATT
377 TCTATTTACCGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAATCATT
* * * * **
16662 ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTTATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATA
440 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATA
* *
16726 ATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
504 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * *
16761 AA-A-ATTTTAAAATA-TAAATATGTTTTCTTAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 AAGAGA-TTTAAAA-ACTAAATCTATTTAC--AA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
16822 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTCATTTTGTGATAAATCAATTGTTTCTATTTATAAA
61 ATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * * * * * *
16886 AGCTTATTCAGAATAAAATAACACTTATTTATTAA-ACTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTT
125 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA--TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** * *
16950 AAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTCTGACTCTTTGAACAATTATTTATTT
188 -AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * ** *
17015 CAAAT-GTTATGATCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAATTTTATTCG
252 CAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTG
* * **
17078 AAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAA-TTAGAGATTTAAAAAATAAA
315 -AATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAAT-AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * * * *
17142 TCTATGCACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
377 TCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCA-TTA
** * * * *
17206 TGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTA-TTTATACAAA-ATTATT-AAGAATAAAAT
441 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATTCAA-AATAAAAT
* *
17268 AGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G-
503 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * *
17301 -AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTCAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-CAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *
17364 ATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATATAAGCT
64 ATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * *
17428 TA-TTCGAATTAAAATATTACAAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT-----ATTTAAAA
129 TATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * *** * * * *
17487 AACAAATGTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTA-CTAATTTCAAA
192 AATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAA
* * * * * *
17551 TCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCTTAAAATAATT-TTTTCAGTTCATACATGGTTATTTGAAATA
256 TCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTG-AATA
* * * * *
17615 AAATAATACTAATTTATTATCATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGT
319 AAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAT
** * * * * * *
17680 TTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGCTATTTATAAGA-AAGTATAAC
382 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTA-AA-ATCATTATGAC
* * * * *
17744 TTTTTGTTTTATCAATAAAACGATTGTTTCAATTCATAAAAG-TATATCCAAAATAAAAATATAT
445 CTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCT-TATTCAAAAT-AAAATA-AT
* * * *
17808 ATTACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAAAAGTT
506 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-C
* * * * ** * * * *
17841 AA-AGATTTAAAAGC-AAGTCAATTAATTGAATCACTTTCAAATAATTATTG-CCATTTAAACAA
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-CAAAT-A-GTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
17903 TTATCTATTTAAAATTGTTA-CA-AATTTTGTTTTGGTCATTAAAATAAATTGTTT-TTTCATCA
62 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATCA-TTTGTTTT-GTCA-TAAAA-CAATTGTTTCTAT--TCA
* * * * * * * *
17965 TACAAGCCTAATT-CAGATAAAGTAAGTATTAATTTTATTGATATTCCAAAAATTAAAATAAGTA
121 TACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAA-TACTAA-TTTAATAATATT-CTAAAATT--AATAAGTA
* * * ** *
18029 AGAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTACTAAACTAGTT----T--TT-A-A-TA--TGAACAATTA
180 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * * *
18083 TCTATTTCCAATC-ATATAACATTTTATTTA-TTATAAAATAATTGTTTCAGTTCCATATAAGCT
245 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTT-CATACAAGCT
* * * ** * * *
18146 TTTTTGGAATAAAAGTAATACTAATTTAATAATATTCCAAAATTGATAA-CTAAAAGATGT-AAA
309 TATTT-GAATAAAA-TAATACTAATTTATTAACATTTAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
18209 AATAAATCTA-TTGCCAAAGC-AGTTCAAACAATTA-GACTATATGAACAATTATCTGTTTATCA
371 AATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTA--A
* * ** * * * ** * ** * *
18271 AA-AATTATG-GCTTTATGTTTCATCGGTATAACAGTTGTTTTTGATCATTCAAGCCTATTTAAA
433 AATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAA
* *
18334 ATAAAATAATACTAATTTGTTAATCTTTC-AAAATTAATAAG-
496 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * * *
18375 TAGAGATTTAAAAAAATAAATTCT-GTTACTAAACTAATTCCAAATA--TATAACTATTCTG-AC
1 AAGAGATTT-AAAAACTAAA-TCTATTTAC-AAA-TAGTT-CAAATAGTTATGACTATT-TGAAC
* * * * * * * * * *
18436 AATTGT-AAACTTCAAATCATTAT-ATCCTTT-TCTTCTATCA-CAAACAATTATTTTTTGTTCA
60 AATTATCTATC-TCAAATCGTTATGATCATTTGT-TT-TGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCA
* *** ** * * *
18497 TTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCGAATAATATTCCAAAATTAATAACTAAGAGAA
121 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * *
18562 TTAAAAAA-AAATTTGTTTGGTCGAACCAGTTCAACCTA-TTAAGACTATATGAACAATTATCTA
186 TTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCGAACCAGTTCAA-ATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
18625 -TTCAAATCATCATGA-C-TTTGTTT-GTCATAAAATAATGTTTTTTTCAATTCACACTAA-CTT
249 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA--TTATTTT-AGTTCATAC-AAGCTT
* *
18685 ATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAA
310 ATTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA
* * * * * ** **
18744 ATAATTTTATTTACCTAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACGATTATCTATTCCAAAT
372 ATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAAT
* * * ** * * ***
18808 -GTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAAATGTTTTTGTT--TAATTAAGTTTGTTTGGAAT
436 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATAA--AAGCTTATTCAAAAT
* *
18870 AAAGTAATACTAATATATTAATA-TTCAAAAATTAAT----
498 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * *
18906 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAGTT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-CAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
18971 ATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCCATTCATACAAGC
64 ATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *** * * * * **
19035 CTATCCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCTCACCAATTAATAAGT-AGAAAAAGTAA
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-A-AAATTAATAAGTAAG-AGATTTAA
* ** * * * * * *
19098 AAAATAAATATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAA
190 AAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
19163 ATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCGAAAT
255 ATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG-AAT
* * * ** * * *
19226 AAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTGT
318 AAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
*** ** * * * * * *** *
19291 TTGTTGAACAAGTTTGAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAACCT
382 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
** * * *** *
19356 TTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAA
447 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
**
19420 TTTATTAATA-TAAAGAAAATTAATTAA--
511 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAA-TAAGC
* * * * * *
19447 AAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACA-AGTTCAAAT-TTTATGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-C-AA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
19510 TATTTA-CTTCAAATTC-TTATGA-CTTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTTATTC--A-
63 TATCTATC-TCAAA-TCGTTATGATCAT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATAC
* * * *
19569 AA--TTA-----CAT--AAT--T--TAATTTATTAAT-TT-TGACAATTAATAAGTAAAAGATTT
124 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *** *** *
19619 AAGAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAGTTCAAATAGTCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTT-
188 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
19682 TAATCATTGTGACC-TTTGTTTTGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA
253 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG-AA
* * * * * * * *
19745 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATATG
317 TAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
** * * * *
19810 TTTATTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGAC
381 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAATCATTATGAC
* * * ** ***
19874 ATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-T
445 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* *
19937 AAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGT
509 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * * * *
19968 AA-AAATTTTAAAAA-TAAATATGTTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTAC-AAATA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
20031 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAAC
63 TATCTATCTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * *
20096 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAAC
128 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-
** * * * * * *
20161 AAAATAAATCTGTTTACTAAACGAGTTCAACTATTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAA
190 AAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * ** *
20226 ATCACTATGA--TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCCAAAA
255 ATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAT
* * ** * *
20288 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTATAAG-TTGAAGATTTAAAAAATAAATTTG
318 AAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
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* * * ** *
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444 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* ** *
20477 CCAATTTATTAATATTTTGAAAATTGAT----
507 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
* * ** * *
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**
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AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
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*
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** *
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11401 TTAAAAAGCA
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* * *
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*
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* *
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* * * * * ** * * * *
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* ** *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* ** * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * ** * ** **
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** * * ** * * *
12601 TAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACCAGTTCAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
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* * *** * * * * **
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* * * * * * * *
12780 ATTAATAAATAAGATATTTAAAAAAT-AATTTTTTTGTCAATCAA-TTGAAAT
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* * * * * * * *
12831 GGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
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* * *** *
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* * * * * * * ** *
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1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** *
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66 ATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CAAAA
* * *** **
13140 A-TAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATTAGTT-AAAT
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* ** ** * * *
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*
13255 AATTGTTTT-TGATCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTACA-ATTTCAA
65 AATTGTTTTAT--TCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATA-TTCAA
* ** * *
13317 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAGTTCAAAT
125 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
13372 AGTTATGACTATTCGAACAATTAT-TAATCTCAAGTCGTTAAGA-TATTTGTTTTGTCAAAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* **** **
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* * * * * *
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126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-T----TAA-AC-A-AG-----TT--C
13563 AAAT
176 AAAT
* * * * * ** ** *
13567 AGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAAT-GTTATGACCTTTTCATTTGTTGTAGAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * * *
13631 ATTGTTTTATTCATGCAAGCTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTC-AAAATT
66 ATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATT
* * *
13695 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TATTACTGAATC-AGTTTAAAT
130 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTA-TTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
13744 GGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTTTGATATTTTTGTTTAGTCATAAAAC
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* * * * *
13809 AATTGTTTCCATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA
65 AATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAT
* * * * * **
13874 TAATAAGAAATAGATTTTAAAAATAAATCTGTCTATCGAAACAAGTTTGAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TAAACAAGTTCAAAT
* * * * ** ** * *
13926 AGTTATTACTATTTTAACAATTAT-TAATTAAAATTGTTAAAACTTTTTGATTTCTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * ** *
13990 TTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACAAAA
66 ATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CAAAA
* * * * ** *
14054 A-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAAT
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* * * *
14106 AATTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * *
14170 AATT-TTTTTTATCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA
65 AATTGTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * *
14234 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
14286 AGTTATGACTATGTAAATAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGA-TCTATATTTTATCATACAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * **** * *
14349 AATTGTTTCTGA-TCATAGAAACTTATT-TTGTTAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAA
65 AATTGTTT-T-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * ** *
14412 ATTTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA-AAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTCGAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TAAACAAGTTCAAAT
** * * * * * * * *
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66 -A-TTGTTT--TATTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC-A
* * * ** *
14590 AAAATTAAAAAGGAA-ATGATATGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAAT
124 AAAATTAATAAGTAAGA-GAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * *** *
14647 AGTGATGACTATTTAAACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACA
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* * * *
14712 ATTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAGTTCAAAAAT
66 ATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * ***
14777 TAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTAACGAACATA-TTCAAAT
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* * * *
14825 AATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
14890 A-TGTTTGAATTTATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAA
66 ATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * * ** * *
14953 TCAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATCAGGTT-AAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
15005 AATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
15070 ATTGTTTTTAATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAAT
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* * *** ** *
15135 TAATAAGTAAGAGATTTTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACTGGTTTAAAT
129 TAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
15187 AGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACA
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* ** * **
15252 ATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAAT
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* * * * * *
15317 TAATAACTAAGAGATTT-AAAAATGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAAAT
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* * *
15368 AGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-T-A-TTTTTATTTTGTCATAAAACA
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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** * * ** ** * * * * * *
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** * ** * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * **
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* * * * * * *
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* * *** * * ** **
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* *
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* * ** *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *** *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *** **
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* * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATC-TCAAATCATTATGACC-TTTGTT-TAGTCAT
* * ** *
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** * * * * **
15311 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTAC
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* * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTT-TGTTTAGTCATAA
* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCATAA
* * * * * * * *
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65 AACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATT-ATATTCT-
* * * * * *
15667 AAAAATTAATAATGGATTTGAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTT
127 AAAAATTAATAA-AGATTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * ** ** ** * *
15716 AAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTA-TTACA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CCTTTGTT-TAGTCATA
* * * ** * *
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* * * * * * * * *
15844 GACAAGTAA-TAAGAAAAATTTTTAAAAATAAAT-TGTTAATCAAACTAGATC
127 -A-AA--AATTAATAAAGA-TTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * * * *
15895 AAATAATTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCATAA
* * *
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* * ** * * *
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126 T-AAAA--ATTAA-TAA-AGATTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * *** * * * * **
16076 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACTTTTTATTTTGTCACCA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTAGTCATAA
** *
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* ** * *
16202 AGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTGCTAAACAAATTC
128 A-A-AATT-A-A--T-AAAGATTTAAAAAA-CAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
** * * * * * * *
16256 AAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTAGTCATAA
* * * *
16321 AACAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT-GATATTAAAATAATATTAATTTATAAAATATT-
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* * * *
16384 TCAACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAC-GTTTATTGAACAAGTTC
126 T-AA-AA--ATTAA-T-AAAGATTTAAAAAACAAAT-CTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * * *
16439 AAATAGTCT-TGACTATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTGTGACATTTTATTTTGTAATA
1 AAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTAGTCATA
* * * * *
16503 AAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCT
64 AAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT-TATATTCT
** ** * *
16567 -AAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAC-A-TTT
127 AAAAATT-A--A-TAA-AGATTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * * *
16617 CCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTATTTTGTCAT
1 --AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCAT
** * * **
16682 AAAACAATTGGTTCTGTTTATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
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* * * * * * *
16745 CCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAATATAAATATGTTT-TCTTAACACA-TTC
125 CTAAAAATTAAT-A--AAGA-TTTAAAAAACAAATCTGTTTAT-TAAACA-AGTTT
* * * * * *
16799 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTGTGATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTT-GTTTAGTCATAA
* * * * * * *
16864 ATCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTC-AGAATAAAATAACACTTATTTATTAAACTT-TC
65 AACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTATA-TTCT-
* * *** * * *
16927 AAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTC
127 AAAAA-T--T-AAT-AAAGATTT-AAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * * * *
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* * ** *
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* * ** ** *
17110 AAAATTAATGAATTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATGCACCAAACAAGTTC
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* * * * * * ** * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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130 AATTAATAAAG-ATTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * *
17513 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTA-CTAATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCTTA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATCTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCATA
* * * * * *
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* * *
17641 AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTT
127 AAAAATTAAT-A--AAG--A-TTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * ** * * *
17695 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGCTAT-TTATAAGAAAGTATAACTTTTTGTTTTA-TCA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCA-AA-TCATTATGAC-CTTTG-TTTAGTC-
* * * * * * * *
17758 ATAAAACGATTGTTTCAATTCATAAAAG-TATATCCAAAATAAAAATATATATTACTTTATTAAT
61 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCT-TATTCGAAAT-AAAATA-ATACTAATTTATT-AT
* * * ** * * *
17822 ATT-TCAAAAATAAAAAGTTAAAGATTT-AAAAGCAAGTCAATTAATTGAATC-ACTTT
122 ATTCT-AAAAAT--TAA--TAAAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTATT-AAACAAGTTT
* * * * * * ** ** ** *
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1 -AAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTG-TTTAGTCA-
* * * * * * *
17942 TAAAATAAATTGTTT-TTTCATCATACAAGCCTAATTC-AGATAAAGTAAGTATTAATTTTATTG
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* * * * * * *
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* * * * * * *
18066 ---T--TTA--A-TA--TGAACAATTATCTATTTCCAATCA-TATAACATTTTATTTA-TTATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTAGTCATAA
* * * * * * *
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* * * * * *** *
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* * * * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC--TATCTCAAATCATTATGACCTT-TGTTT-AGTC-
* * * * * * * ** *
18296 GTATAACAGTTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTGTTA-ATC
61 ATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTATAT-
* * * * *
18359 TTTCAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAAATAAATTCTG-TTACTAAACTAA-TTCC
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* * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATT-TGAATAATTATCTATC-TCAAATCATTATGA-CC-TTTGTT-TAGTC
* * * * * ** *
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61 ATAAAACAATTA-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTATAT
* * * * * ** * *
18539 TCCAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAA-AAATTTGTTTGGTCGAACCAGTTC
124 TCTAAAA--ATTAA-TAA-AGATTTAAAAAACAAATCTGTTT-ATTAAACAAGTTT
* * * * *
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1 AA-ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTGTTTAGTCATAA
* * * * * * *
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* * * * * *
18718 T-TCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAATTTTATTTACCTAACCAA-TTT
124 TCT-AAAAATTAATAA-AGATTTAAAAAACAAATCTGTTTA-TTAAACAAGTTT
* ** *
18769 AAATAATTATGACTATTTGAACGATTATCTAT-TCCAAAT-GTTATGACCTTTTGTCTT-GTCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCT-CAAATCATTATGACC-TTTGT-TTAGTCAT
* * * * * * * * * *
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* * * ** *
18894 TC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTC
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** * * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTAGTCATAA
* * * * * * *
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** ** * * * * * *
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* * *
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* *
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** * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCATAA
** * * * **
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* * * *** *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
19602 TAATAAGT-A-AAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAAC-AGTTC
126 TAAAAATTAATAAAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
** ** * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTAGTCATAA
* ** * *
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* * * * * *
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* * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCATAA
* * * * * * *
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* * * *
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127 AAAAA-T--TAA-T-AAAGATTTAA-AAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * * * *
20189 AACTATTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT-TCCAAATCACTATGA-TTTTATTTTGTCATAA
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* * * * *
20252 AACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
65 AACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATATTCTAA
* * * * ** *
20317 AAATTTATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTC
129 AAA--T-TAA--TAAAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTATTAAACAAGTTT
* * * * * * * **
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1 AAATAGTTATGA-CTATTTGA-ATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTT-TGTTTAGTCAT
* ** * * *
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* * * * * *
20495 GAAAATTGATAAGAGATTT-AAAAACTAAATTTGTTTATCAAGCCAGTTCT
127 AAAAATTAATAA-AGATTTAAAAAAC-AAATCTGTTTATTAAACAAGTT-T
* * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTG-AATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA
20591 TATAACATAT
Statistics
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11908 ATTTAAAAAA
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* * * * * *
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** * * *
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* * * * *
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* * ** **
12275 TAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATG-ACAATTATTTAATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * *
12339 GTTTTCTCATAAAACAATTGTCTTC-ATTAATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
12403 ATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACTAAACCACTTC
129 ATTAATATTCTA-AAAATT-A--A-TAAG-TATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTC
* * * * * * * *
12467 AAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCTAATCATT-TTAACTTCTTATTTTGTCATC
188 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATA
* ** * * * ** * **
12531 AAACAATTGGTCCTGTTCATACTATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTA
252 AAATAATTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-A
** ** * **
12596 AAACGTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C
315 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT-TTGTT-TAC
* * * * * *
12638 -AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTT-TGACCTTTT
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGACC--TT
* * * * * *** * * *
12700 TTCTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAACCTTTTTTTTATTAAAATAATGCAAATT
63 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * *
12764 TAATAATATTTTGAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAAT-AAT-T-TTT-TTGTCAATCAA-
128 TATTAATATTCT--AAA--AATTAATAAG-TATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTG--AA-CAAG
* * * * * * * * *
12824 TTGAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACATTTTGTTTTGTCA
185 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
12889 TAAAACAATTGTTTCAGTTCA-ACAAGCCTATTT-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATT
250 TAAAATAATTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** *
12952 CAAAAATTAATAAGAAAGAGGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTAAC
313 CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATTTGTTT-AC
* * * * * * * * * *
12997 -GAACAAGGTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTC
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
13061 ATTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTT
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* ** ** **
13124 ATTAATACTTACTAAAATAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATTAGTT-A
129 ATTAATA-TT-CTAAAA-ATTAA-T-AAGTATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCA
* ** ** * *
13188 AATAATTAT-AGCCGTTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAA
189 AATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
13252 AACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTACA-ATTTC
253 AATAA-T-TTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATA-TTC
** *
13315 AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTAT
314 AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * * *
13357 TGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATTAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTT
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCT-TTT
* * * * **
13420 GTTTTGTCAAAAAACAATTGATTTTTA-TCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAAAATAATACTAATT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATT
** * * * *
13483 TAAGAATATT-TCAAAGATTAATAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTTACTGAGCTAATT
128 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-T-TG--AA--
* * * * *
13547 CAATAGTTAAATTAAAAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAAT-GTTATGACC
181 C-A-AG-----TT--CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
** ** * * * * *
13611 TTTTCATTTGTTGTAGAACAATTGTTTT-ATTCATGCAAGCTTATTCTG-ATTAAAATAATGCTA
237 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTA
* * *
13674 ATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-ATTAC
300 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * * * * * **
13729 TGAATC-AGTTTAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTTTGATATTTT
1 T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CCTTT
* * * *
13793 TGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATT
64 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATT
* * * * *
13857 TATTAACATTC-AAAAAATAATAAGAAATAGATTTTAAAAATAAATCTGTCTATCGAAACAAGTT
128 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAG---T--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTG-AACAAGTT
** * * * * ** ** * * *
13921 TGAATAGTTATTACTATTTTAACAATTAT-TAATTAAAATTGTTAAAACTTTTTGATTTCTCATA
187 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * *
13985 AAA-CATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTA
252 AAATAATTT-TTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-
* ** *
14049 CAAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTAT
313 CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* ** * * * * * * *
14091 TGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTT
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * *
14155 GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTA
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** *
14219 TTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAA
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAA
* * * * * * * * * * *
14284 ATAGTTATGACTATGTAAATAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGATC-TATATTTTATCATACA
190 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * ** * *
14347 ACAATTGTTTC-TGATCATAGAAACTTATTTTGTTA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTTCA
254 ATAATTTTTTCAT--TCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCA
* * * *
14410 AAATTTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA-AAATGTGTTTGTC
315 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTT-AC
* ** * ** * * * * * * *
14450 GAGTCAA-TTCGAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATAATTCTAACCTTTTG
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * *
14514 TTTAGTCATAAAA-ATATTTGTTTCATATT-TTACAA-CTTTATTCGGAGTAAAATAAT-CTAAA
66 TTTTGTCATAAAACA-A-TTGTTTC-TATTCATATAAGC-TTATTCGAAATAAAATAATACT-AA
* * * * *** *
14575 TTTATTAACATTCAAAAAATTAAAAAGGAAATGATATGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAA
126 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-G---T-AT-TTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAG
* * * * * ** *
14640 TTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACA
185 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *** *
14705 TAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAGTT
250 TAAAATAATTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* *
14770 CAAAAATTAATAAGCAAG-AGTTT--AAAATAAATTTGTTTAAC
313 CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTT-AC
* * * * *
14811 -GAACATA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTT
1 TAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
** * * *
14874 GTTTTGTCATAAAACAA-TGTTTGAATTTATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * ** *
14937 ATTAATATT-TCAATAATCAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATCAGGTT
129 ATTAATATTCT-AA-AA--ATTAA-TAAGT-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTT
* * * * * * * *
15001 -AAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACCTTTTATTTGGTCATA
187 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * ** * *
15065 TAACAATTGTTTTTAATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCA
252 AAATAATT-TTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCA
* * * *
15130 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTTAAAAATAAATCTATTTAC
315 AAAATTAATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
** ** * * * * * *
15172 CGAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCTTTTG
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * * *
15237 TTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * ** * *
15302 AAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATGAAATTTGTTTGTCAAACTAGTACAA
131 TAATATTCTAAAAA-T--TAA-TAAG-TATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAA
* * *
15366 ATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--ATTAT----TTTTATTTTGTCATAAAA
190 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
15424 CAATTTTTTCACTTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAA
255 TAATTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAA
* * * * *
15487 AAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAATCTATTTATC
316 AAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-C
* * * * *
15529 T-GACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTACTATGACCTTTTG
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
15593 TTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTT-TAGAATAAAATAATACTAATCTA
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * ** * * *
15657 TTAATATT-TCAAAAATTAATAATGGATTTGAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAAA
130 TTAATATTCT-AAAAATTAATAA-GTATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATA
** * * ** ** ** * * * *
15721 GTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAATAA
193 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
** * ** * * ** * *
15786 TAATTTCTATTCATAAAAATTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAAG
258 TTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* *
15850 TAATAAG-AA-AAATTTTTAAAAATAAA-TTG-TTAA
320 TAATAAGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * *
15883 TCAAACTAGATCAAATAATTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT
1 T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * *
15948 GTTTTGTTATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATCAA-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGT
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAT-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
16011 TATTAATAATT-TGAAAATTAATAATTAAGAGATTTTAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTT
128 TATTAAT-ATTCT-AAAA--ATTAA-TAAG-TATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTT
* * * *** * * * **
16075 TAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACTTTTTATTTTGTCACC
187 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* *
16140 AAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTACG-AATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT-A
252 AAATAATTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA
* * *
16202 AGACAATTAATAGGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAATTGTTTGC
315 A-A-AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* ** * * *
16245 TAAACAAATTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTG
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * *
16310 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT-GATATTAAAATAATATTAATTT
66 TTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * *
16374 ATAAAATATT-TCAACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAC-GTTTATTGAACAAGT
129 AT-TAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-----ATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTATTGAACAAGT
* * * * * *
16437 TCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTGTGACATTTTATTTTGTAA
186 TCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
16501 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTC
250 TAAAATAATTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * *
16566 TAAAATTAATGAGTAAGAGAA-ATAAAAAATTAATTTGTTTA-
314 AAAAATTAATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * *
16607 TCAAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTT
1 T-AAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * *
16671 TATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTTATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAAT
64 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AAT
* * * *
16734 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAATATAAATATGTTT-TCTTAACACA-T
127 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT---A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAACA-AGT
* ** *
16797 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTGTGAT
186 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
16862 -AAATCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAACACTTATTTATTAA-ACT
251 AAAAT-AATTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA--
* * *
16924 TTCAAAAATTAATAAATAA-AAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAC
311 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAC
** * * * * * *
16970 CGAGCGAGTTCAAATAGTTCTGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTATGATCTTTTT
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTT
** *
17034 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAATTTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTA
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** ***
17099 TTAATATTCTAAAAATTAATGAATTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATGCACCAAACAAGTTCAA
130 TTAATATTCTAAAAATTAAT--A--AG-TATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAA
* * * *** ** *
17164 ATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAA
190 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * ** * * *
17228 ACAATTATTTCTATTTATACAAAATTA-TTAAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAA
254 ATAATTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAA
* * * *
17292 AAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-
316 AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * *
17327 TCAAACCAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTT
1 T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * *
17390 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAATTAAAATATTACAAAATTA
65 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
17455 ATAATATTCTAAAAATTAATAAGTATTTAAAAAACAAATGTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAGT
130 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
17520 TAAGACTATTAGAATAATTA-CTAATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCTTAAAATAAT
195 TATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* *
17584 TTTTTCAGTTCATACATGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCATTCAAAAAATT
259 TTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC-AAAAATT
*
17648 AATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
321 AATAAGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* ** ** * * *
17684 TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGCTATTT-ATAAGAAAGTATAACTTTT
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA-AA-TCATTATGACCTTT
* * * * * * *
17748 TGTTTTATCAATAAAACGATTGTTTCAATTCATAAAAG-TATATCCAAAATAAAAATATATATTA
64 TGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCT-TATTCGAAAT-AAAATA-ATACTA
* * ** * ** *
17812 CTTTATTAATATT-TCAAAAA-TAAAAAGTTAAAGATTT-AAAAGCAAGTCAATTAATTGAATCA
125 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-T----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CA
** * * * * ** * **
17874 CTTTCAAATAATTATTG-CCATTTAAACAATTATCTATTTAAAATTGTTA-CAAATTTTGTTTTG
183 AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-
* * * * * *
17937 GTCATTAAAATAAATTGTTTTTTCA-TCATACAAGCCTAATTCAGATAAAGTAAGTATTAATTTT
246 GTCA-TAAAAT-AA---TTTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TACTAA-TTT
* * * *
18001 ATTGATATTCCAAAAATTAAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTTTTTAC
304 ATTAATATT-CAAAAATT--AATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * *
18056 TAAACTAGTT----T--TTA--A-TA--TGAACAATTATCTATTTCCAATCA-TATAACATTTTA
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * *
18109 TTTAT-T-ATAAAATAATTGTTTC-AGTTCCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAAGTAATACTAAT
66 TTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT-CATATAAGCTTATTCGAAATAAAA-TAATACTAAT
* * * * * ****
18171 TTAATAATATTCCAAAATTGATAACTAAAAG-ATGT-AAAAATAAATCT-ATTGCCAAAGC-AGT
127 TTATTAATATTCTAAAAAT--TAA-T--AAGTATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGT
* * * * * * **
18232 TCAAACAATTA-GACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATG-GCTTTATGTTTCAT
186 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGT
* * * * * * * * *
18294 CGGTATAACAGTTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTGTTAAT
248 C-ATAAAATA-AT-TTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
18358 CTTTC-AAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAAATAAATTCTG-TTAC
310 -ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATT-TGTTTAC
* * ** *
18404 TAAACTAA-TTCCAAATA--TATAACTATTCTG-ACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATCCT
1 TAAAC-AAGTT-CAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CCT
* * * * * * * *
18464 TTTCTTCTATCA-CAAACAATTATTTTTTGTTCAT-TCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
62 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAT-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
** * * * * * * * * *
18527 ATCGAATAATATTCCAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAA-AAATTTGTTTGGTCGAACCAG
125 ATTTATTAATATTCTAAAA--ATTAA-TAAG-TATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATTGAACAAG
* * * *
18591 TTCAACCTA-TTAAGACTATATGAACAATTATCTA-TTCAAATCATCATGA-C-TTTG-TTTGTC
185 TTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
18651 ATAAAATAATGTTTTTTTCAATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
249 ATAAAATAA---TTTTTTC-ATTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* *
18714 ATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTT-AAAAATAATTTTATTTACC
308 ATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C
* * * * * * *
18759 TAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACGATTATCTATTCCAAAT-GTTATGACCTTTTG
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * * * * * * *
18822 TCTTGTCATAAAACAAAATGTTTTTGTTTA-ATTAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATAT
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* * ** **
18886 ATTAATATTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTCAAATA
129 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * *
18950 GTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAG
193 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * ** * **
19015 TTGTTTCCATTCATACAAGCCTA-TCCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATCTCACCAAT
258 TT-TTTTCATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCAAAAAT
** *
19079 TAATAAGT-AGAAAAAGTAAAAAATAAATATGTTTAC
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* * * *
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* * *
19180 TTTTATCATAAAA-AATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTA
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* * * **
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* * * * *** *
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* * **
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** * *
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1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGACCTT-T
* ** * *
19537 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTTATTC--A-AA--TTA--C-ATAATTTAAT-TTATTAAT
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* * * * * *
19593 TT-TGACA-A-T-TAATAAGTAA-AAG-ATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAAC-AGTTCAAA
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** * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
19815 TGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTG
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* * ** *
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* * * *
19943 ATTAATATT-TGAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACACGTTC
129 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAACAAGTTC
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** * * * *
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253 AATAATTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-C
* *
20135 AAAAATTAGTAAGTAA-AAGATTTAACAAAATAAATCTGTTTAC
314 AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAA-AAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * *
20178 TAAACGAGTTCAACTATTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGA--TTTTA
1 TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * *
20241 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCCAAAAAAAATAATACTAATTTAT
66 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ***
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131 TAATATTCTAAAAATTAATAAG-T----ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAA
* * * * * * * **
20371 TAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATC-TTATGACATTATATTTTGTTGTAAAA
191 TAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** ** * **
20434 CAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAA
255 TAATTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* *
20499 ATTGATAAG--AG--ATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-
318 ATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * *
20532 TCAAGCCAGTTCTAATAG-TATGATTATTTGAAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGA
1 T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA
20591 TATAACATAT
Statistics
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Consensus pattern (355 bp):
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TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
TAATATTCTAAAAATTAATAAGTATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
TTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAA
GTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
Found at i:18918 original size:175 final size:178
Alignment explanation
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18676 CACTAACTTA
* *
18686 TTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAATT
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* * *
18750 TTATTTACCTAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAAC-GATTATCTATTCCAAAT-GTTAT
66 CTATTTACCAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAG-TTATCTATTCCAAATCGTTAT
18813 GACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAAATGTTTTTGTTTAATTAAGTTTG
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* *
18862 TTTGGAATAAAGTAATACT-AATATATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
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* ** * * * * *
18925 TCTATTTATCAAATGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATCGTTAT
65 TCTATTTACCAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTCCAAATCGTTAT
* * *
18990 GACTTTTTGTTTTGTTATAAAA
130 GACCTTTTGTCTTGTCATAAAA
19012 TAGTTGTTTC
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 18, Indels: 7
0.84 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 22 0.17
176 79 0.62
177 27 0.21
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTTGGAATAAAATAAAATGAATATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTACCAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTCCAAATCGTTATG
ACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAAATGTTTTTGTTTAATTAAGTTTG
Done.