Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168473.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_72, whole genome shotgun sequence
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*
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ATATTTATATTATA
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* *
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1 T
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TAAACAAATAATTATAAATTAAA
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1402 CTTAAATAAC
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*
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AATATTAATTATATATA
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1419 ATTATTATAA
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1 ATATTATTTATATATAAAATAATT
*
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1 ATATTATT-T-ATATA-T-AAAATAATT
***
1481 A-ATTAAAAATATATAAAATAA--
1 ATATTATTTATATATAAAATAATT
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ATATTATTTATATATAAAATAATT
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1409 AACAATATAA
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*
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1471 GATAATAATT
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ATTATTATAAAATATTAT
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*
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*
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1 TTATATAAT
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TTATATAATTA
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2348 TAATCAATTT
* *
2358 ATATAATTATTATATATTTATTA
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* *
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ATATTATTATTATATATTTATAA
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2451 ATATAAATTT
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*
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*
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1 -TAATTATAT
2512 TATACTTATT
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TAATTATATAATAA
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2424 ACTTAAAGTT
* *
2434 ATAATTAT--TAAACTATTATATAAATT
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*
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*
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2512 TATACTTATT
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ATAATTATAATAAATTATTATATAATA
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*
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3170 TATTTTAATA
* *
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1 TAATGTATTATAATATATTAT
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1 TAA
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3206 TATAATATAT
* * *
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*
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* **
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1 T
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*
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*
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1 A
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* *
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*
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* *
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*
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1 TATA
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*
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1 AATTATTA
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* *
7792 AATTAATATTAATATAATTATTATA
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7817 AATTATTA
1 AATTATTA
7825 ACAAATTGTA
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* *
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1 ATTATTA
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7741 ATTATTATGT
* *
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* *
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* * *
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65 A
* *
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* * *
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* *
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* * *
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*
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* * *
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* * *
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* *
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*
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * * **
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* * * ** * * *
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* * ** ***
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
* * *
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261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAAC
* * *
44657 ATGATAACTTCCATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAAGATTTTGGAGC
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* *** * * *
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391 TTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAAT
*
44787 TGTGATATAAAAACCATTTGCATG
456 TGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * ** *
44811 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTCCTTTAGATGCATTTTTAAGAGTATTCATGAACATTCCAGCG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * *
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66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * *
44941 TAACTATGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCATAGCTCAATGTTTTTTAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * * *
45006 TTAAGTTTTGATTTGCAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGGTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTT
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTG-TTTT
* *
45071 AGCAAGTTTTTAAATGAAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAATACAGAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * * *
45136 CATGATAACTTGCATTAGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAATGATTTTAGAG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* * * * *
45201 CTTAAAATATCATAATTTCGTTT-TAGAATAATTATGGGTAGAAAAACCATCTGCATAATTTCAA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCT-GAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAA
*** *
45265 ATTGTGATA-AAAAAAAATTTGCACG
454 ATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* *
45290 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTAATGAATGCTCCAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * *
45355 AATTTGTGGGATGTTGTTGATATTTGGATGACATTTGTGAAATTGTTATT-GCGCTTCATGCGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* *
45419 TAACTGTGTGTTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACACAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * **
45484 TTATGTTTTGCTTTAAAAGCCATTTTTGCTGGAGTTGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
** * *
45549 GCAAGTTTTTAAATAAAAATTAATATCTTGAATCCAATGTTTCAAACTTGCTCAAACACAGAAAC
261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAAC
**
45614 ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTTTAGC
326 ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGC
* * * ** * *
45679 TTAAAA-ATTTAGAATTTTGTTTTTGAACAATTATGGGCATAAAACCCATCTGCACAATTTCAAA
391 TTAAAATA-TCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAA
* * *
45743 TTGTGATATTAAAACTGTTGGCATG
455 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * *
45768 ATTTTAATTTTTTTTTACTCTTTTCCTATAGATGCATTTTTAGGAAGATTCATGAACGCTCCAGG
1 ATTTTAA-TTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* * *
45833 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTATGAAATCGTTGTTGGTGCTTGATGCGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
* * * *
45898 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCAAAAACTTAGGGCTCAATGTTTTTTAAGCC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * ** * * *
45963 TTTATGTTTTGATTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAATGGAGTTTTGAAAGTATGAAATACTATTTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* * * * * *
46028 AACAAGTTTTTAAATGGAAAGGAATATCTTGAATCAAATGTTTTAAATTTGCTCAAATACAGTAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * *
46093 CATTATAACTTGAATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* * * * *
46158 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTATGAACCATTAT-GTGCATAAAAACCAAT-TGCTCAATTTCA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGT-TACAAAAACC-ATCTGCACAATTTCA
* * * *
46221 AATTCTGATATAAAAATCGTTTCCACG
453 AATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * * *
46248 ATTTTTAATTTTTCTGACTCTTTTGCTTTATATGCATTTTAAGG-GGATTCATTAATGCTCTCA-
1 A-TTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTC-CAG
** * * ** * ** *
46311 GGAATTTGCAGGATGCTGTTGATATTTGTAAAGTTGTTTGTGAAATCGTTATTGGCACACGATGT
64 GGAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTG-GATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGC
* * * *
46376 GATTAATTGTGTGCTAACTTGCTTTTATATATTATGCACAAACTCTA-AGCTCAACGTTTTTTTA
128 GATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTC-AGAGCTCAATG-TTTTTGA
* * * * *
46440 AGTCTTTTTGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTG
191 AGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTG
* * * * * *
46505 TTTTGGCAAGTATTTAAGTGGCAATGAATATCTTGAATCCGATGTTTTAAACTTGCTCAAACAAA
256 TTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACA
* *
46570 AAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGT-TTAAGTATGAGTTATGAAGGATTTT
321 GAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT
* * *
46634 TGAGCTGAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAAGTT
386 GGAGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTT
46699 CAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
451 CAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * * * *
46728 ATTTGAATTTTTTTTACTCATTTTCTGTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCGTGAATGCTCCGGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* **
46793 AATTGGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATATGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * * * * * *
46858 TAATTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAATCTGATAGCTCAATGCTGTTGAAACCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * *
46923 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGGTTTGAAAGCAAGAAATATTATTTT-
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
* * * *
46987 GACAAGTATTTAAATGGAAATGAATATCTTAAATCCAATATTTTAAACTTGCTCAAACATAGAAA
261 G-CAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * * * * *
47052 CATTAT-TCTTGCGTTGGTTTTAAATTTTCATAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTAGAG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* * * ** * *
47116 ATTAAAATATCAGAATTTCGTTTTTGAACAATTACGGGCATAAAAACCATTTGCACAATTTCAAA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAA
* * *
47181 TTATCATATAAAAACCGTTTGCACG
455 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* *
47206 -TTTTAGA-TTTTCTTACTCATTTGCTTTATATGCATTTTTAGTAGGATTCATGAACGCTCCAGG
1 ATTTTA-ATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* * *
47269 GAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGTCGCTTGACGCGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
*
47334 TTAACTATGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * *
47399 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGCCAAGCTTTCAAATTATGAAATATTGTTTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* *
47464 ATCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATG--------TTGCTCAAATACAGAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * *
47521 CATGATAACTTGCACTGGTTTTAAATTTTCACAGTGTTAAGTGTAAGTTATGAAGGATTTTAGG-
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GGA
* * * *
47585 GTTTAAAATATTAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGTTTACAAAAACCATCTGCACAATTTGAA
389 GCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAA
*
47650 ATTGTGATATAAAAACCATTTGCATG
454 ATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * * * *
47676 ATTTTAATTTTTCTTACTGATTTGCTTTACAT-CATTTTTAGCAGGATACATTAACACTCTAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * *
47740 AATTTGTGGGATGCTGTCGATATTTGGATGTCATTTGTAAAATCATTATTGGTGCTTGATGCGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * *
47805 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATTTTATGCACAAACTC--AGCTAAATGTTTTGGAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * *
47868 TTACGTTTTGCTTTGAAAGCTATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATAAAATATTGTTTTA
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
* * * *
47933 GCAAGTTTTTAAATGGAAATAAATATCTTGAATCCGATGTTTTAAACTTGCTCAAACAAAAAAAA
261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAAC-ACAGAAA
* * * * *
47998 TATGATAACTTGCAATGGTTTTAAGTTTTCACAATATTAAGTATGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* * *
48063 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACTATTTGCACAAGTTCAAA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAA
48128 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
455 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * * ***
48153 ATTTT-TTTTTTTTTACTCGTTTCCTGTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTTTGGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * *
48217 AATTCGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCTTTATTGGCGCTTGATGTGAC
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * * *
48282 TAATTGTGTACTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTGAGAGCTCAATGTTTTTGAAACCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * *
48347 TTATGTTTTGTTTTGAAA-CCATTACTGCCT-GAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTGTTTT
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTG-CTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* * *
48410 GGCAAGTATTTGAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATG-TTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * *
48474 CATTAT-TCTTGCATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* * ** * **
48538 ATTAAAATATCAGAATTTCGCTTT-TGAACAATTACGGGCATAAAAACCATCCACACAATTTCAA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCG-TTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAA
* * *
48602 ATTATGATATAAAAACTGTTTGCACG
454 ATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * * *
48628 ATTTTAGA-TTTTCATAATCATTTGCTCTATATGCATTTTTAGTAGGATTCATGAATGCTCCAGG
1 ATTTTA-ATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* * * * * * * *
48692 CAATTTATGGGACGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTTTGAAATCATTATTGTCACTTGATGCGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
* * *
48757 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTTAGACCTAAATGTTTTTGAAGCC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* ** * * * *
48822 TTTATGTTTTGCTTGGAAAGCTGTTTCTGCTGGAGCCGAGCTTTCAAATTATGAAATATTGTTTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* *
48887 AGCAAGGTTTTAAAATGGAAATGAATATCTTG-ATCCAATGTTTTAAACTTGGTCAAACACAGAA
260 AGCAA-GTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAA
* * * * *
48951 ACATGATAACTTACACTGGTTTTAAGTTTTCACAATTTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTAGA
324 ACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
* * * * *
49016 GGTTAAAATATCAGAATTTCGTTCCTAAACAATTATGTTTACAAAAACCATCTGCAC--TATCAA
389 GCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAA
* * *
49079 ATTTTGATATAAAAACCATTTGCACG
454 ATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * *
49105 ATTTTCATTTTTCTTACTGATTTGCTTTAGATGCATTTTTA-GAGGGATTCATGAACGCTCAATG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGA-GGATTCATGAACGCTCCAGG
* * *
49169 GAATTTGTGGGATGCTGTCGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCATTATTGGTGCTTGATAG-G
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGAT-GCG
* ** *
49233 ATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACCCAGAGCAAAATGTTTTTAAAGC
129 ATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGC
* * * *
49298 TTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCCAGCTTTCAAATTATGAAATATTGTTT
194 CTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTT
* * *
49363 TGGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTAGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAATACAGAA
259 TAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAG-A
* * * *
49428 AACATTATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTAAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTTAG
323 AACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGG
* * **
49493 AGCTTAAAATATCATAATTTCGTTTCTGAACAATTATGTTTAC-AAAACGCATCTATACAATTTC
388 AGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAAC-CATCTGCACAATTTC
*
49557 AAATTGTGATATAAAAACCATTTGCATG
452 AAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * *
49585 ATTTCAATTTTTCTTATTGATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGGGGATTCATGAACGCTCTAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * * * * *
49650 AATTTGTTGGATGCTGTTGATATTTGGCTGTCATTTGTAAAATGGTTATTGGTGCTTAATGCAAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * * *
49715 TAGC--TGTG------TGTTTTTATATTTTATGCACAAAATC--AGCTAAATGTTTTTGAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * * * *
49770 TTACGTTTTTGCTTTGAAAGCTATTTTTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAATATAAAATATTGTTTT
196 TTATG-TTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* ** * ** * *
49835 AGCAAGTTTTCAAATTAAAATAAATATCTTGAATCTGATGTTTTAAACTTGCTCAAACAAAAAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * * * *
49900 AATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAATGTTAAGGGCGAGTTATGAATGATTTTGGAG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* * * *
49965 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTAAACAATTATGGTTGCAAAAACCATATGCACAAGTTCAAA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAA
50030 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
455 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * *
50055 ATTTTAATTTTTTTTTTACTCATTTCCTGTAGATGC-TTTTTAGGAGGATTCATTAACGCTCCAA
1 ATTTTAA--TTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAG
* *
50119 GGAATTGGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGTG
64 GGAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCG
* * * * *
50184 ATTAACTGTATGCTAATTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTGAGTGCTCAATGTTTTTGAAAC
129 ATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGC
* * * * * * * *
50249 CTTTATCTTTTGCTTTGAAAGACACTTCTGCCGGAGTAAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTATTT
194 CTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTT
* * * *
50314 TGGCAAGTATTTCAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAA
259 TAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAA
* * * * * *
50379 ACATTAT-TCTTGCGTTGGTTTTAATTTTTGACAGCGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
324 ACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
* * * * ** * ** * *
50443 GATTAAATTATCAGAATTTCGTTTTTGAACAATTACGGGCATAAAAATTATCCGCATAATTTCAA
389 GCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAA
* *
50508 ATTATGATATAAAAACTGTTTGCATG
454 ATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * *
50534 ATTTTAGA-TTTTCTTACTCATTTGCTTTATATGCATTTTTAGTAGGATTCATGAACGCTCTAGG
1 ATTTTA-ATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* ** * * * *
50598 GAATTAGTGGGATGCCATTGATATTTGGATGTCATTTTTGAAATCGTTAATGTCGCTTGATGTGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
* *
50663 -T---TGTGTGCTAACTTATTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTAAATGTTTTTGAAGCC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * * *
50724 TTTATGTTTTTCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGCCAAGCTTTCAAATTATGAAATATTGTTTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* *
50789 AGCAAGTTTTGAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGGTCAAACACAGAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* *
50854 CATGATAACTTGCACTCGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTAT----GA------AG
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAG
* *
50909 ------------G-ATTTCGTTTCTGAACAATTATGTTTACAAAAACCAACTGCACAATTTCAAA
390 CTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAA
* * * *
50961 TTCTGATATAAAAATCATTTGCACG
455 TTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * * *
50986 ATTTTAATTTTTCTTATTGATTTGCATTAGATG-ATTTTTAGGGGGATTCATGAATGCTCTAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* *
51050 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTAAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * * * * * *
51115 TAACTGTGTGCTAAGTTGTTTTTATATTTTTTGCACAAACTCAGTG--AAATATTTTTGACGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* *** * * * *
51178 TTACGTTTTGCTTTGAAAGCTGGTTCTGCTGGAGTCGAGCTTGGAAAGCATAAAATATTGTTTTA
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
* * * *
51243 GCAAGTTTTTAAATGGAAATAAATATCTTGAATCCGATGTTTTAAACTTGGTCAAACA-AAAAAC
261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAAC
* * ** * *
51307 ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGCTAATTACGAGTTATGAAGTATTTTGAAGC
326 ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGC
* *
51372 TTAAAATATGAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAAGTTCAAAT
391 TTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAAT
* * *
51437 TGTGATATAAAGATCGTTTACATG
456 TGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * ** * * *
51461 ATTTTAATTTTTTTTTGCTCATTT-CTTGTAGAAACATTTTTAAGAGGATTCACGAAAGCTCC-G
1 ATTTTAA-TTTTTCTTACTCATTTGCTT-TAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAG
* *
51524 GGAA-TTGATGGGATGCTGTTGACATTTGGATGTCATTTGTGAAATCATTATTGGCGCTTGATGT
64 GGAATTTG-TGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATG-
* * *
51588 C-ATTAACTGTGTACTTACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTAAGAGCTCAATGTTTTTGAA
127 CGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAA
* ** * * *
51652 ACCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCCAGAGGCAATG-TTTGAAAGTAAGATATATTG
192 GCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAA-GCTTTGAAAGTATGAAATATTG
* * *
51716 TTTTGGCAAGTATTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAAATTGCTCAAACAC-
256 TTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACA
* * * * * *
51780 -AAATATTAT-TCTTGCGTTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTATGAGTTATGAAGGATTTT
321 GAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT
* * * * * * *
51843 GGTGATAAAAGAAATCAAAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCCGCACAAGT
386 GGAGCTTAAA-ATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATT
*
51908 TCAAATTGTGATATAAAGACCGTTTGCATG
450 TCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * *
51938 ATTTTAATTTTTTTTACTCATTTCCTGTAGATGCACTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCGGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * * * * *
52003 AAATCGTGGGATGCTGTTGACATTTGGATGTCATTTTTAAAATCGTTATTGGCGGTTGATGCCAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* *
52068 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTGAGAGCTCAATGTTTTTGAAACCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * * *
52133 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTACTGGAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTGTCTTG
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
*
52198 GCAAGTATTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACA-AAAC
261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA-
* * *
52262 CATTAT-TCTTG-AGTTGGTTTT-AGTCTTTTTACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTG
325 CATGATAACTTGCA-TTGGTTTTAAG--TTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTG
** * * * * * *
52324 GATATTTAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAATAATTACAGG-CATAAAAATCATCTGCACAATTT
387 GAGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTA-TGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTT
52388 CAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
451 CAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * *
52417 ATTTTAGA-TTTTCTTACTCATTTGCTTTATATGCATTTTTAGTATGATTCATGAACGCTCCACG
1 ATTTTA-ATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
** * * ** * * *
52481 GAATTTGTGGGATGCCATTGATATTTGGATGTCATTTTTAAAATTTTTTTTGTCGTTTGATGCGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
** * **
52546 TTAACTGTGTTTTAACTTGTTTTTATATATTATGCATAAACTCAGAGCAAAATGTTTTTGAAGCC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * * * *
52611 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGACTCGAGCTTTCAAATTATGAAATATTGTTTC
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* *
52676 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATATCTTGAATCTAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATG-A-ATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGA
* * ** *
52741 AACATGATAACTTGCACTCGTTTTAAGTTTTCAGGGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTAG
323 AACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGG
* * *
52806 AGCTTAAAACATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGTTTACAAAAACCAACTGCACAATTTCA
388 AGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCA
* *
52871 AATTGTGATATAAAAACCATTTGCACG
453 AATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * *
52898 ATTTTAA-TTTTCTTACTGATTTGCTTTAGATGCATTTTTATGG-GGATTCATGAATGCTCAAGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTA-GGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* ** * *
52961 GAATTTATTCGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTAAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
* * * * *
53026 TTAACTATGTGCTAAGTTGTTTTTATATTTTATGCCCAAAC-C-CAGCT-AAGTGTTTTTGAAGC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAA-TGTTTTTGAAGC
* * * *
53088 CTTTACGTTTTGCTTTGAAAGCTATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATAAAATATTGTTT
194 CTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTT
* * ** * * *
53153 TAGCAAGTTTTTAAATGGAAATAAATATCTTGACTCCGTTGTTTTAAACTCGCTCAAAAAAAAAA
259 TAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTC---AAACACA
* * * **
53218 AAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAATGTTAGGTACGAGTTATGAAGGATTTT
321 GAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT
* * *
53283 GGAGCTTAAAATATCAGAATTTCATTTTTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAAGTT
386 GGAGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTT
53348 CAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
451 CAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * *
53377 ATTTTAATTTGTT-TTACTCATTTCCTGTAAATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCGGG
1 ATTTTAATTT-TTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* * ** * *
53441 GAATTGGTGGAATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTACGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCCA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
* * * * *
53506 TTAACTGCGTGATAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTGAGAGCTCAATGTTTTTTAAACC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * * * * * * *
53571 TTCATGTTTTGCATTGAAAGCCATTTCAGCCGGAGTTAAGGTTTTGAAAGTAAGAAATATTATTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAA-GCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTT
* * * * *
53636 TGGCAAGTATTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATACAATGTTTTAAGCTTGCTCAAACACAAAA
259 TAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAA
* * ** * *
53701 ACATTAT-TCTTGTGTTGGTTTTAA-TTTT-TCAGTGTTAACTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
324 ACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
* * * * * * *
53763 GTTTAAAATATCAGAATTTCGTTTTTGAACAATTACCGG-CATAAAAACCATCCGAACAATTTCA
389 GCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTA-TGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCA
** * **
53827 AATTAAGATATAAAAACTGTTTGCACC
453 AATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * *
53854 ATTTTAGA-TTTTCTTAATCATTTGCTTTATATGCATTTTTAGTAGGATTCATGAATGCTCCATG
1 ATTTTA-ATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* * * *
53918 GAATTTGTAGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTTTGAAATCATTATTGTCGCTTGATGCGA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
*
53983 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTAAATGTTTTTGAAGCC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * * * *
54048 TTTATGTTTTGCTTTGAATGCCATTTCTGCTGGAG-CTGAGCTTTTAAATTATAAAATATTGTTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTC-AAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTT
*
54112 TAGCAAGGTTTTAAATGGAAATGAATATCTTG-ATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAA
259 TAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAA
* * *
54176 ACATGATAACTTGCACTGGTTTTAACTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTCGA
324 ACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
* *
54241 GTTTAAAATATCAGAA-TTCGGTTTCTGAACAATTATGTTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCA
389 GCTTAAAATATCAGAATTTC-GTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCA
* * * *
54305 AAATGTGATATAAAAGCCATTTGCACG
453 AATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * *
54332 ATTTTAATTTTTCTTACTGATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGG-GGATTCATGAACTCTCAAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * * * *
54396 AATTTGTGGGATGCTATCGATATTTGGATCTCATTTGTCAAATCGTTATTGGTGCTTGAAGCGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
*
54461 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTC--AGCTAAATGTTTTTGAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
** * * * * * *
54524 TTACATTTTGCTTTGAAAGCTATTTCTACTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATAAAATAATATTTTA
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
* * * * *
54589 GCAAGTTTTTAAATGGAAATAAATATCTTAAATCCGATGTTTTAAACTTGCTCAAACAAAAAAAA
261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAAC-ACAGAAA
* *
54654 AATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTACT-AGTTATGAAGGATTTTGGA
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGT-GTGAGTTATGAAGGATTTTGGA
* * * * ** *
54718 GCTTAAAATATCAAAATATCATTTCTAAACAATTACAGTTACAAAAACCATTTGCAC-ATGTTCA
389 GCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAAT-TTCA
* *
54782 AATTGTGATATAAAAACCATTTGCACG
453 AATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * *
54809 CATGATTTAATATTT-TTACTCATTT-CTTGTAGATGCATTTTTAGGAGGATTGATGAACGCTTC
1 -AT--TTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTT-TAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCC
* * *
54872 -GAGGAATTGGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATTGTTATTGGCGATTGAT
62 AG-GGAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGAT
* *
54936 GCCATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCATAAACT--GAGCTCAATGTTTTTGA
126 GCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGA
* * * * * *
54999 AACCTTTATGTTTTGCTTTGCAAGCCATTTCTGCCGTAGTCAAAG-TGTGAAAGTAAGAAATATT
191 AGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTC-AAGCTTTGAAAGTATGAAATATT
* * ** * *
55063 GTTTTGGCTAGCATTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATGCATTGTTTTAAACTTGCTCAAACAC
255 GTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACAC
* * * * **
55128 AGAAACATTAT-TCTTGCATTGGTTTTAATTTTTCATAGTGTTAAGTGTGACCTATGAAGGATTT
320 AGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTT
* * * * * * * * * *
55192 TGGAGATTAAAATATTAGAATTTCGCTTCTAAACAATTACCGG-CATAAAAACCATCCGAACAAG
385 TGGAGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTA-TGGTTACAAAAACCATCTGCACAAT
* *
55256 TTCAAATTATGATATAAAAACCGTTTGCAAG
449 TTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * *
55287 ATTTTAAATTTTCTTACTCATTTGCTTTATATGCATTTTTAGTAGGATTCATGAATGCTCCAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * * * * *
55352 AATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTTGAAGTTATTTTTTAAATCGTTATTGTCGCTTGATGCGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
* * * *
55417 TAACTGTGTGCTAACTTATTTTTATATATTATGCAGAAACTCAGAGCTAAACGTTTTTGAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* * * *
55482 TT-TGTTTTGCTTTGAAAGCCGTTTCTGCTGGAGCCAAGC-TTGCAAATTATGAAACATTGTTTT
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTG-AAAGTATGAAATATTGTTTT
*
55545 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACATAGAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAA
* * *
55610 CATGATAACTTGCACTGATTTTAAGTTTTCGCAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTAGG-
325 CATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GGA
* *
55674 GCTTAAAATATCAGATATTT-GTTTCTGAACAATTATGTTTAC-AAAACCATATGCACAATTTCA
389 GCTTAAAATATCAGA-ATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCA
* * *
55737 AATTTTGATATAAAAACCATTTGCACG
453 AATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * *
55764 ATTTTAATTTTTCTTAATGATTTGCTTTAAATGCATTTTTAGGGGGATTCATGAACGCTCCAGGG
1 ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
* * * * *
55829 AATTTGTGGGATGTTGTCGATATTTGAATGTCATTTGTAAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGAT
66 AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
** * * * * *
55894 TAACTGTGCACTAACTTATTTTTATATTTTATGCACAAAC-C-CAGCTAAATGTTTATGAAGCCT
131 TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
* ** * * *
55957 TTACGTTTTGCTTTGAAAGGTATTTCTGCTGGAATCGAGCTTTGAAAGTATAAAATATTGTTTTA
196 TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
* ** * * *
56022 GCAAGTTTTTAAATGGAAA-AAATATCTTGAATCTGATGTTTTAAACTTGCTCAAACAAAAAAAT
261 GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAAC
* *
56086 ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTATGAGTTATGAAGAATTTTGGAGC
326 ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGC
* * * *
56151 TTAAAATATCAGAATTTTGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAAACATCTGCATAAGTTCAAAT
391 TTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAAT
56216 TGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
456 TGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
* * * * *
56240 ATTTTAATGTTTT-TT-CTCATTTCCTGTAGATGTATTTTTAGGAGGATTCATGAATGCTCCGGG
1 ATTTTAAT-TTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGG
* * * * *
56303 GGATTGGTGGGATACTGTTGATA--T---TGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGGTTGATGCAA
65 GAATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGA
* * *
56363 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATAATATGCACAAACTGAGAGCTCAATGTTTTTGAAACC
130 TTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC
* * * *
56428 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCCGGAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTTTTTT
195 TTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTT
* * * *
56493 GGCAAGTATTTAAATGGAAATGAATATCTTCAAT-CAATTGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAA
260 AGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA-TGTTTTAAACTTGCTCAAACAC-AGA
* * ** * * * *
56557 AACATGGTAACTTGCACTGGTTTTAAGTTTTCGTAATGTTCATTGTGAGTTATGAAGGATTTTAG
323 AACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGG
* * * * *
56622 AGCTTAAAATATCAGAATTTCATTTCTGAATAATTATGTTTACAAAAAACCCTTTGCACAATTTC
388 AGCTTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTAC-AAAAACCATCTGCACAATTTC
*
56687 AAATTGTGATATAAAAACCATTTGCATG
452 AAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
56715 ATTTTAATTTTTCT
1 ATTTTAATTTTTCT
56729 GATGGAGTCA
Statistics
Matches: 10644, Mismatches: 1550, Indels: 408
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
451 84 0.01
452 137 0.01
453 124 0.01
455 37 0.00
456 1 0.00
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465 2 0.00
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483 72 0.01
ACGTcount: A:0.31, C:0.12, G:0.18, T:0.39
Consensus pattern (479 bp):
ATTTTAATTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG
AATTTGTGGGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGCGAT
TAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCT
TTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCAAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTA
GCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAAC
ATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGC
TTAAAATATCAGAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAAT
TGTGATATAAAAACCGTTTGCATG
Found at i:56959 original size:240 final size:244
Alignment explanation
Indices: 56529--56966 Score: 559
Period size: 241 Copynumber: 1.8 Consensus size: 244
56519 TCTTCAATCA
**
56529 ATTGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAAACATGGTAACTTGCACTGGTTTTAAGTTTTCGTAAT
1 ATTGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAAACAT-GTAACTTGCACTGGTTTTAAGTTTTCACAAT
* * * * * *
56594 GTTCATTGTGAGTTATGAAGGATTTTAGAGCTTAAAATATCAGAATTTCATTTCTGAATAATTAT
65 GTTAAGTGTAAGTTATGAAGGATTTTAGAGATTAAAATATCAGAATTTCATTCCTGAACAATTAT
** * *** *
56659 GTTTACAAAAAACCCTTTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCATTTGCATGATTTTA-AT
130 GTCGACAAAAAACCATACACACAATTTCAAATTATGATATAAAAACCATTTGCATGATTTTAGAT
56723 TTTTCTGATGGAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTATTTTGGCAAGT
195 TTTTCTGATGGAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTATTTTGGCAAGT
* * ** *
56773 ATTGTTTTAAACTTGCTCAAACAC-AGAAACAT-TATTCTTTG-GTTGGTTTTAA-TTTTCACAG
1 ATTGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAAACATGTA-AC-TTGCACTGGTTTTAAGTTTTCACAA
* *
56834 TGTTAAGTGTAAGTTATTAAGGATTTTAGAGATTAAAATATCAGAATTTCGTTCCTGAACAA-T-
64 TGTTAAGTGTAAGTTATGAAGGATTTTAGAGATTAAAATATCAGAATTTCATTCCTGAACAATTA
* *
56897 TG-CGAGCATAAAAACCATACACGCAATTTCAAATTATGATATAAAAACCATTTGCGTGATTTTA
129 TGTCGA-CA-AAAAACCATACACACAATTTCAAATTATGATATAAAAACCATTTGCATGATTTTA
56961 GATTTT
192 GATTTT
56967 CTTACTCATT
Statistics
Matches: 165, Mismatches: 24, Indels: 13
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
238 1 0.01
239 4 0.02
240 49 0.30
241 67 0.41
242 10 0.06
243 10 0.06
244 24 0.15
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (244 bp):
ATTGTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAAACATGTAACTTGCACTGGTTTTAAGTTTTCACAATG
TTAAGTGTAAGTTATGAAGGATTTTAGAGATTAAAATATCAGAATTTCATTCCTGAACAATTATG
TCGACAAAAAACCATACACACAATTTCAAATTATGATATAAAAACCATTTGCATGATTTTAGATT
TTTCTGATGGAGTCAAGGTTTGAAAGTAAGAAATATTATTTTGGCAAGT
Found at i:58238 original size:479 final size:480
Alignment explanation
Indices: 56775--61599 Score: 5953
Period size: 478 Copynumber: 10.1 Consensus size: 480
56765 TGGCAAGTAT
* * *
56775 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATTAT-TCTTTG-GTTGGTTTTAA-TTTTCACAGTGT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAAC-TTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGT
* * * * * **
56837 TAAGTGTAAGTTATTAAGGATTTTAGAGATTAAAATATCAGAA-TTTCGTTCCTGAACAATTGCG
65 TAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATG
* * * * * * *
56901 AG-CATAAAAACCATAC-ACGCAATTTCAAATTATGATATAAAAACCATTTGCGTGATTTTAGA-
130 -GTTACAAAAACCAT-CTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTA-AT
* * *
56963 TTTTCTTACTCATTTCCTTTATATGCATTTTTAGTAGGATTCATG-ACGCTCCAGGGAATTTGTG
192 TTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTG
* ** * * *
57027 GGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTCCGAAATTGTTATT-GTCGCTTAATTCGATTAACTGT
257 GGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGT-GCTTGATGCGATTAACTGT
* *
57091 TTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTAAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTT
321 GTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTT
* * * *
57156 TTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGCCAAGCTTTCAAATTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTT
386 TTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTT
*
57221 TTTAAATGGAAATAAATATCTTGAATTCC-A
451 TTTAAATGGAAATGAATATCTTGAA-TCCAA
* * ** *
57251 TGTTTTAAACTTGCTCAAACAGAGAAACATGATAACTTGCACTGGTTTTAAGTTTTCGTAATGTT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
* * * * * *
57316 CATTGTGAGTTATGAAGGATTTTAGAGCTTAAAATATCAGAA-TTTCATTTCTGAATAATTATGT
66 AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
* * *
57380 TTACAAAAAACCCTTTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCATTTGCATGATTTTAATTTT
131 TTAC-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTT
* * *
57445 TCTTACTGATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGGGGATTCATGAATGCTCCAGGGAATTTGTGGGA
195 TCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGA
* * * * * * * *
57510 CGCTGTCGATATTTGGATGTAATTTGTAAAATTGTTATTGGTTCTGGATGCTATTAACTGTGTGC
260 TGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGC
* * * * * * *
57575 TAACTTGTTTTTATATTTTTTGCAGAAAC-C-TAGCTAAATATTTTTGAAGCCCTTATGTTTTGC
325 TAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGC
* * *
57638 TTTGAAAGCTATTTTTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATAAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTA
390 TTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTA
* *
57703 AATGGAAATAAATATCTTGAATCCGA
455 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* * *
57729 T-TTGTTAAACTTGGTCAAACTA-AAAAACATGATAGCTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTG
1 TGTT-TTAAACTTGCTCAAAC-ACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTG
** * * *
57792 TTAAGTAAGAGTTATGAAGGATTTTGGAGGTTAAAATGTCA-AATTTTCGTTTCTTAACAATTAT
64 TTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTAT
* * * *
57856 GGTTACAAAAACCATCTGCATAAATTCAAATTGTTATAAAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTC
129 GGTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATT-
* * * * * * *
57921 TTT-TTACTCATTTCCTGTAGATACATTTTTAGGAGGATTCATGAATGCT-CTGGGAAATTAGTA
193 TTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGG-AATTTGTG
* * * *
57984 GGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAGATCATTATT-GTCGCTTGATGTGATTAATTGT
257 GGATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGT-GCTTGATGCGATTAACTGT
* * * * * **
58048 TTACTAACTTGTTTTTATATGTTATGCACAAACTCAGAGCTAAATGCTTTTGAAGGATTTATGTT
321 GTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTT
* * * *
58113 TTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGATTTAAAATTATGAAATATTGTTTTGGCAAGTT
386 TTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTT
* *
58178 TTAAAATGGAAATGCATATCTTGAATCCAA
451 TTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* * *
58208 TGTTTCAAGCTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCACTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
* *
58273 AAGTGTGAGTTATGATGGATTTTGGAGCTTAAAATATCA-AATTTTCGTTTTTGAACAATTATGG
66 AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
** ** * * *
58337 GCATGAAAACCATCCT-CACAATTTCAAATTGTAATATAAAAACTGTTTGCACGATTTTAATTTT
131 TTACAAAAACCAT-CTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTT
* * * *
58401 TCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGTAAGATTC-TCGAACGCTTCAGGGAATTTATGGG
195 TCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCAT-GAACGCTCCAGGGAATTTGTGGG
* * * *
58465 ATGGTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAACCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTATGAG
259 ATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTG
* * * * *
58530 CTAACTT-ATTTTATATTTTATACACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTT-AAG-------GCTTTG
324 CTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTG
* * *
58586 CTTTGAAAGCCATTTATGCTGGAGTCGAGCTTTGGAAGTATAAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTT
389 CTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTT
*
58651 AAATGG-AATGAATATCATGAATCCAA
454 AAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
** * * *
58677 TGTTTTAAACTTAATCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATCGGTTTTAAGTTTTCATAGTGTG
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
* *
58742 AAGTATGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTGAAATATCAGAATTTT-GTTTCTGAACAATTATGG
66 AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
** * * * *
58806 GCATAAAATCCATATGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCCTTTGCACT-ATTTTAATTTT
131 TTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCA-TGATTTTAATTTT
**
58870 TCTTACTCATTTGCTTTAGATAAATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTG-GTGG
195 TCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTG-GG
* * * * *
58934 ATGCTGCTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATTGTTATT-G-GCAATCATGCGATTAATTGTGT
259 ATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGC-TTGATGCGATTAACTGTGT
* *
58997 CCTAACTTGTTTTTAT-TAATTATGCACAAACTC--AGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTTATGTT
323 GCTAACTTGTTTTTATAT-ATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCC-TTTATGTT
* * * *
59059 TTGCTTTGGAAGCCATTTTTGCTGGAGTTGAGCTTTGAAAGTAAGAAATATTGTTTTAGCAAGTT
386 TTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTT
* * *
59124 TTTAAATTGAAATTAATATCTTGCATCCAA
451 TTTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* * * * *
59154 CGTTTTAAACCTGCTCAAACACAGAAACATGATAATTTGCATTGGTTTTACGTTTTCACAATGTT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
* * **
59219 AAGTGTTAGTAATGATTGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTT-GTTTCTGAACAATTATGG
66 AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
* * *
59283 TTACAAAAACCGTTTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTACATGATTTTAATTTTT
131 TTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTTT
* * * * * *
59348 TTTACTTATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGAAGGATTCGTGAACACTCAAGGGAATTTGTGGGAT
196 CTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGAT
* ** * * * * ** *
59413 GCCGTTGATATTTTTATATCATTTTTGAAATCATTATTAGCACTTGATGCGATTAACTGTGTACT
261 GCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGCT
* *
59478 AACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCGGAGCTCAATGTTTTTGAAGTCTTTATGTTTTGCT
326 AACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCT
* * * * * **
59543 TTGAAAGCCATTTTTGCTAGAGTCAAGCTTTGGAAGTATAAAATATAATTTTAGCAAGTTTTTAA
391 TTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAA
*
59608 ATGGAAATGATTATCTTGAATCCAA
456 ATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* * * *
59633 CGTTTTTAAACATGCTCAAACACAAAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTAT
1 TG-TTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGT
* * *
59698 TAA--GTGAGTTGTGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAA-TTTCATTTCTGAAGAATTATG
65 TAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATG
* * * * *
59760 GTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTTTCATATAAAAACCATTTGCACGATTTTAAATTT
130 GTTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTT
* *
59825 TCTTAGTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGGTCCAGGGAATTTGTGGGA
195 TCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGA
* * * * *
59890 TGTTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTCATGCAATTAACAGTGTGC
260 TGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGC
*
59955 TAACTTGTTTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAACGTTTTTGAAGCC-TTATGTTTT
325 TAACTTG--TTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTT
* * * **
60019 TCTTTGAAAGCCATTT-TCGCTAGATTCGAGCTTTGAAAGTATGATGTATTGTTTTAGCAAGTTT
388 GCTTTGAAAGCCATTTCT-GCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTT
*
60083 TTAAATGGAAATTAATATCTTGAATCCAA
452 TTAAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* * * * *
60112 TGTTTCAAACTTGCTTAAACACAGAAACACGATAACTTGCATTGATTTTAAGTTTTCACAGTATT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
* * **
60177 AAGTGTGGGTTATGAAGGATTTTAGAGCTTAAAATATCAGAA-TTTCGTTTAAGAACAATTATGG
66 AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
*
60241 TTACAAAAACCATCTGCACAACTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTTT
131 TTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTTT
* * * * * *
60306 CTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTTGTAGGTTTCAAGAATGCTCCAGGGAATTTTTGGGAT
196 CTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGAT
* ** *
60371 GCTGTTGACATTTGGATGTCATTTGTGAAATAATTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGGT
261 GCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGCT
* * *
60436 AACTT-ATTTTATATTTTATGCACAAACTGAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCT
326 AACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCT
* * * *
60500 TTGAAAGCTATTTCTACTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATAAAATATTGTTTTGGCAAGTTTTTAA
391 TTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAA
*
60565 ATGGAAATGAATATCTTGAATCTAA
456 ATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* * * *
60590 TTTTTTAAACTTGCTGAAACACAGAAACATTATAACTTGCATTGGTTTTAGGTTTTCACAGTGTT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
* * * * *
60655 AAGTATGACTTATGAAGGATGTTGGAGCTTCAAATATCAAAATTTT-GTTTCTGAACAATTATGG
66 AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
* * *
60719 TTACAAAAACCATTTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCACGGTTTTAATTTTT
131 TTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTTT
* * * * **
60784 TTTACTCATTTCCTGTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTGCAGAAAATTTGTGGGAT
196 CTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGAT
* ** * * * *
60849 GCTGTTGATGTTACGATGGCATTTGTGAATTCAG-TATTGGTGCTTGATGCAAATAACTGTGTGC
261 GCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATC-GTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGC
* * * *
60913 TAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAATTCATAGCTCAATGTTTTTGAAGCTTTTATGTTTTGT
325 TAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGC
** * * * * *
60978 TTTGAAAGCTGTTTCTACTGAAGTCGAGCTTTGAAAGTTTGAAATATTGATTTAGCAAATTTTTA
390 TTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTA
*
61043 AATGGAAATGAATATCTTGAATCTAA
455 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
** * ** * * * * *
61069 TGTTTTAATTTTGCTTAAACATGGAAACATGATAACTTGTATTAGTTTTAATTTTTCACTGTATT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
** *
61134 AAGTGTGAGTTAT-AATGGATTTTGGAGCTTAAAATATCA-AAACTTCGCTTCTGAACAATTATG
66 AAGTGTGAGTTATGAA-GGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATG
** * * * **
61197 GGCATAAAAACCATCCT-CACAATTTCAAATTGTGATATAGAAACAGTTTGCACAATTTTAATTT
130 GTTACAAAAACCAT-CTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTT
** * * * * *
61261 TTCGCACTCATTTGCTTTAGATGTATTTTTAGGAGGATTCATGAACGTTCTAGGGAATTTATGTG
194 TTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGG
** * * * * *
61326 ATGCTGTTGAT-TTT-TTTGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTCATGTGATTAAATGGGTG
259 ATGCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTG
*
61389 CTAACTTGTTTTTATATATTATACACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTG
324 CTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTG
* * * * * * * * * *
61454 CTTTGGAAGCCGTTTCTGCTGAACTTGAGCGTTGAAAGTTTGAAATATTGATTTAGGAAATTTTT
389 CTTTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTT
* *
61519 AAATGGAAATGAAAATCTTGATTCCAA
454 AAATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
* *
61546 TGTTTTAAGCTTGCTTAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTT
1 TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTT
61600 AGAGCTCAAT
Statistics
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TGTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTTTTCACAGTGTT
AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAGAATTTTCGTTTCTGAACAATTATGG
TTACAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAATTTTT
CTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGAT
GCTGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCTTGATGCGATTAACTGTGTGCT
AACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCT
TTGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTGAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAA
ATGGAAATGAATATCTTGAATCCAA
Found at i:61634 original size:179 final size:179
Alignment explanation
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61411 ACACAAACTC
* * * *
61421 AGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGGAAGCCGTTTCTGCTGAACTTGAGCGT
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* * * * *
61486 TGAAAGTTTGAAATATTGATTTAGGAAATTTTTAAATGGAAATGAAAATCTTGATTCCAATGTTT
66 TCAAAGTTTGAAATATTGATTTAGCAAATTTTTAAATGGAAAGGAAAATCTTCAATCCAATGTTT
* * * *
61551 TAAGCTTGCTTAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTGGTTTTAAGTT
131 AAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGAATTGGTTTTAAGTT
* * * *
61600 AGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTTTACTGGAGTCGAGCTT
1 AGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTACTGAACTCGAGCGT
* * * * *
61665 TCAAAGTTTGAAATGTTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAAGGAATATCTTCAATCCTATGTTT
66 TCAAAGTTTGAAATATTGATTTAGCAAATTTTTAAATGGAAAGGAAAATCTTCAATCCAATGTTT
*
61730 AAAACTTGCTCAAACATAGAAACATGATAACTTGAATTGGTTTTAA
131 AAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGAATTGGTTTTAA
61776 TTTTTCACAG
Statistics
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AGAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTACTGAACTCGAGCGT
TCAAAGTTTGAAATATTGATTTAGCAAATTTTTAAATGGAAAGGAAAATCTTCAATCCAATGTTT
AAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGAATTGGTTTTAAGTT
Found at i:63436 original size:211 final size:211
Alignment explanation
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63062 ATTTTTCACA
* *
63072 GTGTTAAGTAAGAGTATTGAAGGACTTTAGAGCTTAAAATATTAGAATTTCATTTCTGAACAATT
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* * *
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* *
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** * *
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* * **
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* *
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*
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GTGTTAAGTAAGAGTATTGAAGGACTTTAGAGCTCAAAATATCAGAATTTCATTTCTGAACAATT
ATGGGCAGAAAAACCATCTGCAAAATTTCAAATTCTAAGATAAAAGCCATTTTGCACAATCTTAA
TTTTTACTTATCATTTCCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCATGAGCTCTCCAGAGAATTTGT
GGGATGCTGTTAATAT
Found at i:66422 original size:478 final size:477
Alignment explanation
Indices: 64981--75851 Score: 7076
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64971 CTTCAAAAGT
** * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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192 ATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAAT
* ** * * *
65238 ACTCCAGGGAATTTGTGGGATAACGTTGACATTTGGATGTCATTTCTGAAATCATTATTGGCGCT
257 GCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCT
* * * * * *
65303 TGATGCGATTAACAGTGTGCTAACTTGTTTTTATATACTATGCGCAAACTTAGAGCTTAATGTTT
322 TGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTT
*
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387 TTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAAT
65433 ATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
451 ATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
** * * * * ** * *
65460 ATGTGTATCATAAATCAAATG-TTTTAAATTTGCAAAAACATAGAAACATGATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * * *
65524 TTTTTATTTTTCACAATGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAACATCAAAATTT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAATTT
* * * * * *
65589 TGTTTTTGAACAACTATGGGCATACAAACCAT-TCGTACAATTTGAACTTGTGATATAAAAACCA
130 TGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCT-GCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCA
* * *
65653 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGGATTTTTTGGAGGATTCATGAATG
193 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATG
* ** ** * **
65718 CTCCAGGGAATTTTTTTGATGCCGTTGATATTTGGATGTTGTTTGTAAAATCGTTATTGTTGCTT
258 CTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTT
*
65783 GATG-G-------G-AT--TAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTT
323 GATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATG-TTT
* *
65837 TTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTGCTAGAGTCGGGCTTTAAAAGTATGAAAT
387 TTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAAT
* * *
65902 ATTATTATAGCAAATTTTTAAATGGAA
451 ATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * *
65929 ATAAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACCTGCTCAGACACAGAAACATGATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
** * * *
65994 TTTTAATTTTTTGCAGTGTTAATTATGAGTTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAATATCAGAATTTC
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAATATCAGAATTTT
* * * *
66059 CTTTCTGAGCAATTATGGGCAAAGAAACTATCTCCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCATT
131 GTTTCTGAACAATTATGGGCAAA-AAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCATT
** * * * *
66124 TATAGGATTTTAATGTTTCTTA-TCGTTTGCTTTAAACGCATTTGTGGGAGGATTTGTGAATGCT
195 TGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATGCT
* * * * ** *
66188 CC-GATGAATTTGTGGGATGCCATTAATATTTGGATGTCGTTTGTGAAATTTTTATTGGTGCTTG
260 CCAG-GGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTG
* * * *
66252 ATGCGATTAATTGTGTGATAACTTGTTTTTATATATAATGCACAAACTCAGAGCTCAATGTTTTT
324 ATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTT
* * * * * * *
66317 TAAGCCTTTACGTTTTGGTTTGAAAACAATTTATGCTGCAGTTGTGCTTTAAAAGTATGAAATAA
389 TAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTG-AGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATAT
66382 TGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
453 TGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * ** *
66407 ATGACTATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGGTCAAATGCAGAAACATTATAACTTGCATTAG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * * * * * *
66472 TTTTAACTTTTCACACTGTTAAG-GCTAAGTTACGAAGGATGTTGGAGCTTAAAATATCATAATA
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTG-TGAGTTATGAAGGAT-TTTGAGCTTAAAATATCAGAATT
* * * *
66536 TTGTTTCTGAACTATTATGGCCATAAAAACCATCTGCACAATTTGAAATTGTGATATAAAAACCG
129 TTGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCA
* * *
66601 TTTGTAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAAAAGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATG
193 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATG
* * * *
66666 CTCCAAGGAATTTGTGTGATGCCATTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCATTATTGGCGCTT
258 CTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTT
* * *
66731 GATGCGATTAACTGTGTGCTAAATT-CTTTTA-ATA-TAT--A-ATACTCAAAGCTCAATGTTTT
323 GATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTT
* * ** *
66790 TTAAGCCTTTATGTTTTGGTTTGAAAACAATTTCTATTTGAGTCGTGCTTTAAAAGTATGAAATA
388 TTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCT-GCTGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATA
*
66855 TTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGCAA
452 TTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* *
66881 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTCTTAAACTT-CATCAAACACAGAAACATTATAACTTGCATTA
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGC-TCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTA
* * * *** *
66945 GTCTTAATTTTTCAAACTGTTAAGCCCGAGTTATGAAGGATGTTGGAGC-TAAAATATCAGAATT
65 GTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGAT-TTTGAGCTTAAAATATCAGAATT
* * ** * * *
67009 TCGTTTCTGAACTATTACATCTG-TAAAAACCATCCGCACAATTTGAAATTGTGATATAAAAACC
129 TTGTTTCTGAACAATT--ATGGGCAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACC
*
67073 ATTTGCAGGATTTTATTGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAAT
192 ATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAAT
* * * * **
67138 GCTCTAGGGAATTTGT-GGAGGCCGTTGATATTTGGATGTCGTTTGTGAAATTGTTATTCACGCT
257 GCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCT
* * * * * *
67202 TGATGTGATTAACTGTGTGCTAAATTCTTTTTTATATCTTATGCACAAACTCAAAACACAATGTT
322 TGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTT-GTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTT
* * * * * * *
67267 TTTGAAGCTTTTATGCTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTAGAGTTGGGCTTCAAAAGTACGAAA
386 TTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAA
* * *
67332 -ATTTTTTTGGCAAGTTTTTGAATGGAA
450 TATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * * * *
67359 ATGAGTATCTTGAATTCAATATTTTTAAACCTGCTCAAACACAGAAATATGATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * *
67424 TTTTAATTTTT-GCAGTGTTAACTGTGCA-TTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAATATCAAAATTT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTG-AGTTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAATATCAGAATTT
* * * ** *
67487 TCTTTCTGAACAATTATGGGCTTAAAAACCATCTGCACAATTTCAAAATGTGATGCAAAAACCGT
130 TGTTTCTGAACAATTATGGGC-AAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCAT
* * * * **
67552 TTGTAGGATTTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGTATTCATGAACAC
194 TTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATGC
* ** * * * * ** *
67617 TCCAGGTAATTTGTGTAATGCCGTTTATATTTGGAT-TCATTCGTGAGACCAATATTGGTGCTTG
259 TCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTG
* * * * *
67681 ATGCGATTTATTGTGTGCTAACTTCTTTTTTATGTATAATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTT
324 ATGCGATTAACTGTGTGCTAACTT-GTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTT
* * * * * *
67746 TGAAGCATTTGTGCTTTGCTTTGAAAACCATTTCTACTGGAGTTGAGCTTTAAAAGTATGAAATA
388 TTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATA
*
67811 TCGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
452 TTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * * *
67837 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTGAAACATAGAAACAAGATAACTTGCTTTTG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * *
67902 TTTTAATTTTTTTTCACAGTGTTAAATGCGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCATAA
66 TTTTAA---TTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAA
** * * * * * * * * *
67967 ---AATATC---AGAATTTTGGGTATAAAAACCATATGCACGATTTAAAATTTTTATATAAAAAC
127 TTTTGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAAC
* * * * **
68026 CACTTGCAAGATTTTAAAGTTTCTTACACGTTTGCTTTAGATGCATTTTTTTGAGG-TGTCGTGA
191 CATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGAT-TCGTGA
* * * * * * *
68090 ATGCTCCAGGGAATTTGTGAGATGCCATTGATTTTTGGGTGTAATTTGTGAAATTGTTATTGCCG
255 ATGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCG
* * * * * *
68155 CTTAATGCGATTAGCTGGGTGCTAACTTGTTTTTTTCTATATTATGCACAAACTCAGAGCTCATT
320 CTTGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTG--TTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAAT
* * * * *
68220 GTTTTTTAATCTTTTATGTTTTTCTTTGAGAACCATTTCTGCTGGAGTGGAGCTTTAAAAGTATG
383 GTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATG
68285 AAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
447 AAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * *
68316 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGGTAAAACACACAAACATGATAACTTGCATTAG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * ** * * **
68381 TTTTAATTTCTCACGGTGTTAAAGTCCGAGTTATGAAGGATTTGGAGCTTAAAAAATTGGAATTT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTT-AAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAATATCAGAATTT
* * * * *
68446 CGTTTCTGAACAATTATGGGCATAGAAACCATTTGCCCAATTTCAAATTGTGATATAAAAAGCAT
130 TGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCAT
* * * *
68511 TTGCATGATTTTAATGTTTCTTACTCATTTTCTTTAGATGCATTTTTGTGAGGATTCGT-AATGC
194 TTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATGC
* * * * **
68575 TCCATGGAATTGGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCGTTTG-CACAATCGTTATTGGCAATT
259 TCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGA-AATCGTTATTGGCGCTT
* * * * *
68639 GATGCGATT-A------G----CTTGTTTTTATATCTTACGTAC-AACGTCAGACCTCAATGTTT
323 GATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAAC-TCAAAGCTCAATGTTT
* *
68692 TTTCAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTACTAGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAAT
387 TTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAAT
* *
68757 ATTGTTTTAACATGTTTTTAAATGGAA
451 ATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * *
68784 ACGAATATCTATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTCCTTAAACACAGAAACATGATAACATGCA
1 ATG-A-A--TATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCA
* * * * * *
68849 ATAGTTTTAATTTTTTAC-CTATTAAGTGTGAGTTATGAAGG-TTTTTAGCACTTAAAATATTTA
62 TTAGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGAG--CTTAAAATA-TCA
* * * ** * *
68912 -AATTTTGTTTATAAACAACTATATGCATACAAACCATCTGCA-AATTTTCAAATTGAGATATAA
124 GAATTTTGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAA-TTTCAAATTGTGATATAA
* * * * * * * * *
68975 AAATCGTTTCCAGGATTTTAATGTTTCTTACTTGTTTGCTTTAG-GGAATTTGTGGAATGCCATT
187 AAACCATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGA-G-GATT
* * * * * * * * * *
69039 -GAT-ATTTGGATATCATTTGTGAAATCATTCTTGG-CG-C-TTG--ATGT-GAT-TAACTATGT
250 CG-TGA-AT-GCT-CCA---G-GGAAT--TTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCA-TTTGT
* * **** * ** ****
69095 GCTAACTTGTT-TT-TATATGTAATGC-ACAAACTCAAAGCTCAA--TGTTTTTGA-AGCCT-TT
304 G--AAATCGTTATTGGCGCT-TGATGCGATTAACTGTGTGCT-AACTTGTTTTT-ATA---TATT
***** * * * ** ** **
69153 ATG-TTTTGCTTTGAAAAC-C-A---TTTCT--G-CTGGA-GTTGAGCTTT-AAAAGTATGAAAT
361 ATGCACAAAC--TCAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCAT----T
* ** * * * ** * * ** * *
69207 AT-TGTTTTGGCAAGTTTTTCAA-T-GGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTAAACATGCTC
420 -TCTGCTGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAAT--AT-TGTTTTA-GCAA-GTTTTTAA-ATG---
*
69269 AAA
475 GAA
* * * * * * * ** * * * *
69272 CACAGAA-A-CATGATAACTTGCATTGGTTTT-AA-TTGTTC--ATAGTGTTAA-GTG-TGAGTT
1 -A-TGAATATCTTG--AA--TCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAG-AAACATGATAACTT
* * *** * *** * * * * ** * * *
69329 --ATGAAGATTTTGGAACTTAAAATA-TCAAAATTTTG-TTTCTGAACAATTGTG-G--GAAAAC
59 GCAT-TAG-TTTT--AATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAAT
* ** * ** ** ** ** * * ** *
69387 A-AACCA-TCTG-CACAATTTA-AATT-TGTGATATAAAAACTGTTTGTAGGATTT-TAA-TGT-
120 ATCAGAATTTTGTTTC--TGAACAATTATG-GGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTG
*** * * ** * ** * *
69444 -T-T-CTTACTCATTTGCTTTAGACCCATTTTTACCTGGAT-TT-GT-GAATGCTCTAGA-GAAT
181 ATATAAAAAC-CATTTGC---AG---GA-TTTTA-ATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCAT
* * ** ** * * * *
69502 TTTTGGGATG--CCGTTGATATTAT-TTGTGAAATTGTTATTGGCACTTGATG-CGATTAACTGT
237 TTTTGGGAGGATTCG-TGA-ATGCTCCAG-GGAA-T-TT-GTGG-----GATGCCG-TTGA-TAT
* * * * * * * * * * * *** * *
69563 GTGCGAAAT-TC-TTTTTTATAT-ATTA-TGCACAAACTTAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTC
289 TTG-G--ATGTCATTTGTGAAATCGTTATTG-GC--GCTTGATGC-GATTAACTGTG-TG-C-T-
* ** * * * ** ** * *
69624 ACCCTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCAGGAGTTGATAA-CTTGCATTGGTTTTCATTTTCATAG
343 A-AC-TTG-TTTTTATA-TA-TTATGCACAAACTCA-AAGC-T-CAAT-G--TT--TTTT-A-AG
* * * * *
69688 --TGTTAAG-TGTGAGTTATGAAGA--A-TT-T--T--G--GAGC-TTAAAA-TATCAGAAT-TT
393 CCT-TTATGTTTTG-CTT-TGAAAACCATTTCTGCTGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGA-AATATT
** **
69737 CGTTTCTA--AA-TAATT--ATGGGC
454 -GTTT-TAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * * * * * * **
69758 ATAAAAACCATCTGCA--CAA---TTTTAAA-TTG-TGATATA-A-AAAC-CG-T---TTGCAGG
1 ATGAATATC-T-TGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATT
* * * * **
69809 A-TTTTAATTTTTCTCACCCATTTTCTTTAGATG-CA-TT-TTTAGGAGTTTTCGTGACTGCTTT
64 AGTTTTAA-TTTT-TCA--CA--GTGTTAAG-TGTGAGTTATGAAGGA--TTT--TGA--GC-TT
* * ** * * * * *****
69870 AGGGAATTTGTTGGATGCCGTTGCTATT-TGGATGTC-ATT-TGTG-AAATCGTTAT-TGGCAC-
115 A--AAATAT-CAGAAT---TTTG-T-TTCT-GA--ACAATTATGGGCAAAAAACCATCT-GCACA
* * * *** ** * * ** ** ***
69929 -TTGATGC-GATTAGCTG-TGTGCAAATTTATTTTTA-TATATT-ATG-CGCAAACTC-AAAGC-
168 ATT--T-CAAATT-G-TGATAT-AAAAACCATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCT
* * ** ** ** *** ** * **
69986 TCA-ATG--TTTTT-GAAGCCTTTATGTTTTG-TTTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTGGAGCTT
227 TTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTG-AATGCTCCAG-GGA--ATTTGTG--GGA-TGCCG-TT
*** * ** *** * **** *** * * *
70046 --TAAAAGCATGAAATATTGTTTTAGCAAGTT-TT-TAAATTGAAATGAATATCT-TGAAT-CGA
284 GATATTTGGATGTCAT-TTGTGAAATC--GTTATTGGCGCTTGATGCGATTAACTGTG--TGCTA
* * * * * * **
70105 A--TGTTTTTAAACT-TGGTCAAATACAGAAACATGATAA-CTGGCATTG-GTTTTAA-TTTTTC
344 ACTTGTTTTTATA-TAT--T---ATGCACAAAC-TCA-AAGCT--CAATGTTTTTTAAGCCTTT-
** ** * * *
70164 ACAATGTTAAGTGTGAGTT-ATAAAGGA-TT-T--TG-G-C-A-C-TTAAAA-AATCAAATTTTC
398 ---ATGTT---T-TGCTTTGA-AAACCATTTCTGCTGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATT-
* * * **** *
70218 GTTTTTGAACAACTATGGGCAT-AAA
454 G-TTTT-AGCAAGTTTTTAAATGGAA
** * * * **** * ** *** *
70243 ATCCATCTGC-AGAATTTCAAATTGTGACAAAAAAACCGTTTC-CAGGATTTTA-ATGTTTC-TT
1 ATGAATAT-CTTGAA--TCCAA-TGT---TTTTAAA-C-TTGCTCA--A--ACACA-GAAACATG
* * * * * * * ** * *
70304 ACTCATTTGCTTTAGATTT-ATTTTTAAGAG-GATTCA-TGACCACTCA--AAGGAATTTGTTGG
52 A-TAACTTGCATTAGTTTTAATTTTTCACAGTG-TTAAGTG-TGAGTTATGAAGG-A-TT-TT-G
* *** * ** * * * **** * * *
70364 ATGCCATT--GATATTTTAATGTCATTTGTGAA-ATTGTTATTGGCACTTGCTACGAT-T-AACT
110 A-G-C-TTAAAATATCAGAATTTTGTTTCTGAACA--ATTATGGGCA--AAAAACCATCTGCACA
* * * * ** * ** * ** * *
70424 GTGTGCTAACTTGCTTTTATATACTATGCACAAACT-CA-AAGCTTAATGTTTTTTAAGC-CTTT
168 AT-TTC-AAATTG---TGATATA--A-AAACCATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTT-A-CTCGTT
** * * ** * *** * ***
70486 ATG-TTT---TGC---TTTGAAAGCCATT--T--CTGCTGGAGTGGAGTTTAAAAGTATGAAATA
223 -TGCTTTAGATGCATTTTTGGGAG-GATTCGTGAATGCTCCAG-GGAATTT-GTGGGATG--CCG
* * * * *
70540 TTG-T-TTTAGCAAGTC-TTTAAATGGAAAT-G-AATAT----CTTGA----ATCCAA-TGT-T-
282 TTGATATTT-GGATGTCATTT--GT-GAAATCGTTAT-TGGCGCTTGATGCGAT-TAACTGTGTG
* * * * *
70589 TTTACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTCTAATCCTTTATGTTTCG
341 CTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTG
* *
70654 CTTTGAAAACCATTTATGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTTTGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTT
406 CTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTT
70719 AAATGGAA
470 AAATGGAA
* * * * *
70727 ATGAATATCTCGAATCCAATGTTTTTAAACTTGGTCAAAAACATAAACATGATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * * * * *
70792 TTTTAATTTTTGACAGT-TCTAAGTGTTAGTTACGAAAGATTTTAGAGCGTAAAATATCAAAATT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGT-TAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAATT
* * * *
70856 TTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTACACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCA
129 TTGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCA
* * * * * *
70921 TTTGTATGA-TTTAATGTTTCTTTCTCGTTTGCTTTAGATGGATTTTTAGGAGGATTCGTGAACG
193 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATG
* ** ** * * *
70985 CT-CAGGGAATTTGAGGTTTAACATTGATA-TTGGATATCATTTGGGAAATCGTTATTGGCGCTT
258 CTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTT
* * * * *
71048 GACGCGATTATCTCTGTGCTAACTTGTTTTTGTATATTATGCACAAACTGAAAGCTCAATGTTTT
323 GATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTT
* * *
71113 TTAAGCTTTTATGTTTTGCTTTGAAAACTATTTCTGCTAGAGTGGAGCTTTAAAAGTATGAAATA
388 TTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATA
*
71178 TTGTTTTAGCAAGTTTTAAAATGGAA
452 TTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * ** *
71204 ATGAATATTTTGAATCCAATGTTTTTAAATTTGCTCAAACACAGAAATAACATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * *
71269 TTTTAGTTTTTCACAATGTTAAGTGTGAGTTACT-AAGGATTTTGAAGCTTAAAATATCAAAATT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTA-TGAAGGATTTTG-AGCTTAAAATATCAGAATT
* * * * * *
71333 TCGTTTCTAAACAACTACGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCG
129 TTGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCA
* * * *
71398 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTACATGCATTTTTAGGAGGATTCATGAACG
193 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATG
*
71463 CTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCATTATTGGCGCTT
258 CTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTT
* * *
71528 GATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTCTTTTATATAGATTATGCACAAACTCAAAACTCAATGTTT
323 GATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTT-TATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTT
* * * * *
71593 TTGT-AGCCTTTATGCTTTGCTTTGAAAGCCATTTCTACTGGAGTTGAGCTTTAAAAGTATAAAA
387 TT-TAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAA
*
71657 TATTGTTTTCA-CAAGTTTTAAAATGGAA
450 TATTGTTTT-AGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * * *
71685 ATGAATATCTTGAATCCAATG-TTTTAAACTCGCTCGAACACAGAAACATGACAACTTTCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * *
71749 TTTTAGA-TTTT--CAGTGTTAAGTGTGAGTTATTAACGATTTTGGAGCTTTAAATATCA-AATT
66 TTTTA-ATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAATT
* * * * * *
71810 TTCTTTTCTGAAAAATTATGGGCATAAAACCATCTGCACAGTTTCAAATTGTGATATAAAAATCG
129 TT-GTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCA
* * * ** * *
71875 TTTGCAAGATTTTAATGTTTCGTACTCATTTGCTGCAGATGCATTTTTAGGAGTATTC-T---T-
193 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATG
* * *
71935 -T--AGAGAATTTGTGGGATGTCGTTGATATTTGGATGTCATTTG-GTAAATTGTTATTGGCGCT
258 CTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTG-AAATCGTTATTGGCGCT
*
71996 TGATGCGATTAACTATGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTT
322 TGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTT
* * *
72061 TTGAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTACTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATTAAAT
387 TTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAAT
*
72126 ATTATTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
451 ATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * *
72153 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACATAGAAATATGATAAGTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* *
72218 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGACGCTTAATATATCATAATTT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGA-GCTTAAAATATCAGAATTT
* ** * * * *
72283 TGTTTCTGAACAACTATGGGCAAAAAAAAATCAGCATAATTTCAAAATGTGATATAAAAACCGTT
130 TGTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCATT
* * * * *
72348 TGAAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTACATGCAATTTTAGGAGGATTCGTGAACGCT
195 TGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATGCT
*
72413 CCAGGGAATTTGTGGAATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGA
260 CCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGA
* ** * * *
72478 TGCAATTAGTTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCATAGTTCAATGTTTTTG
325 TGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTT
* * *
72543 AAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTACTGAAGTTGAACTTTAAAAGTATGAAATATT
390 AAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTG-AGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATT
*
72608 GTTTTAGCAAGTTTTTAAATGCAA
454 GTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
*
72632 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGAATTAG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * * *
72697 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTAGGAGCTTAAAATATCAAAAATT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTT-TGAGCTTAAAATATCAGAATTT
* * * * * * * * *
72762 CGTTTGC-AAAGAACTATGAGCATAAAAACCGTCTGCATAATTTCAAAATGTGATATAAAAACTA
130 TGTTT-CTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCA
* * *
72826 TTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTACATG-ATTTTTTAGGAGGATTCGTGAAT
193 TTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCA-TTTTTGGGAGGATTCGTGAAT
* * * ** * * * * * *
72890 GCTTCAGGGAATTTTTGGGATGCCATCAATTTTTGGAGGTAATTTGTGAAATTGTTATTTGCACT
257 GCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCT
*
72955 TGATGTGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATAGATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGT
322 TGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATAT--ATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGT
* * * *
73020 TTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTTTGCTGAAGTCAAGCTTTAAAAGTTTGAA
385 TTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTG-AGTCGAGCTTTAAAAGTATGAA
*
73085 ATATTGTTTTAGCAAGTTTTAAAATGGAA
449 ATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * *
73114 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTAG-TTAAACACAGAAACAAGATAACTTGCATTG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTT-GCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTA
* * * *
73178 GTTTAAATTTTTTACAGTGTTAAATGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATTA-AATT
65 GTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAATT
* * * *
73242 TTCGTTTTTGAACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTTTCATATAAAAACT
129 TT-GTTTCTGAACAATTATGGGC-AAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACC
* ** * * * * *
73307 GTTTATAAGATTTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGTTTTGTGAAT
192 ATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAAT
** * *
73372 GCTTTAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGCTATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGCT
257 GCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCT
** * * *
73437 TGATGCGATTAGTTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATAAATTATGTACAAACTCAAAGCTCCACGT
322 TGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATAT--ATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGT
* * *
73502 TTTTTAAGCCATTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTATGCTGGAGTCAAGCTTTAAAAGTATGAA
385 TTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAA
** *
73567 ATATTCCTTTAGAAAGTTTTTAAATGGAA
449 ATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * *
73596 AAGAATATCTTGAATCCAATG-TTTTAAACTCGCTTAAATACA-ATAACATGATAACTTGCATT-
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGA-AACATGATAACTTGCATTA
* *
73658 GATTTTAATTTTTCACAGCGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCCTAAAATATCA-AAT
65 G-TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAAT
* * * * * *
73722 TTTCGTTTTTGAACTATTATGGGCTAAATACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATGAAAAGC
128 TTT-GTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACC
* * * * *
73787 GTTTGTAGGATTTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCGTGAAC
192 ATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAAT
* * * * *
73852 GCTCCAGGGAATTTGTTGGATGTCATTGATATTTGAATGTCATTTTGTGAAATTGTTATTGGCGC
257 GCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCA-TTTGTGAAATCGTTATTGGCGC
* * * *
73917 TTGATGCGATTAACTATGCGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAATCTTAACT-T
321 TTGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAA-TGT
** * * *
73981 TTTTTAAGCCTTTATGTTTTAATTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCAAGTTTTAAAAGTACGAA
385 TTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAA
*
74046 ATATTGTTTTTGCAAGTTTTT-AATGGAA
449 ATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * * * *
74074 ATTAATATCTTGAATCAAATGTTTTTAAACTAGCTCAAACACAAAAATATGATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * *
74139 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTTAGTTATGACA-GATTTTGGAGCTTAAAAAAAAATCAAA
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGA-AGGATTTT-GAGCTT---AAAATATCAGA
*
74203 ATTTCGTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAA
126 ATTTTGTTTCTGAACAATTATGGGC-AAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAA
* ** * * * * * *
74268 CCGTTTATAGGGTTTTAATATTTCTTATTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCATAA
190 CCATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGA
* * * * * * *
74333 ACGCTCCAGGGAATTTGTTGGATGTCATTGATATTTGAATGTTATTTTGTGAAATCATTATTGGC
255 ATGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCA-TTTGTGAAATCGTTATTGGC
* * * *
74398 GCTTGATGCGATTAACTATGCGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAATCTCAATT
319 GCTTGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATG
** * * *
74463 TTTTTTAAGCCTTTATGTTTTAATTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCAAGTTTTAAAAGTACGA
384 TTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGA
*
74528 AATATTGTTTTTGCAAGTTTTT-AATGGAA
448 AATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * *
74557 ATTAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTAGCTCAAACACAGAAATATGATAACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * * *
74622 TTTTAATTTTT-ACCGTGTTAAATGTTAGTTATGAAGGATTTGGGAGCTTAAAAAAAATATC-GA
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTT-TGAGCTT----AAAATATCAG-
* *
74685 AATTTCGTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTTAAATTGTGATATAAAA
125 AATTTTGTTTCTGAACAATTATGGGC-AAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAA
* ** * * *
74750 ACCGTTTATAAGG-TTTTAATGTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGTTTCG
189 ACCATTT-GCAGGATTTTAATG-TTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCG
** * *
74814 TGAATGCTTAAAGGAATTTGTGGGATGCCGTT-ACTATTTGGATGTCATTTGTGAAATTGTTATT
252 TGAATGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGA-TATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATT
* * * * * *
74878 GGCGCTAGATGGGATTAGCTATGTACTAACTT-TTGTTTATATATTATGCACAAACTAAAAGCTC
316 GGCGCTTGATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTT-TTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTC
* * ** *
74942 AATGTTTTTGAATCCTTTATGTTTCACTTTGAAAACCATTTCTGCTAAAGTCGAGCTTTAAAAGT
380 AATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGT
75007 ATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
444 ATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
* * * * * *
75041 ATGAAAATCTTGAATCAAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAACAAGATTACTTGCATTGG
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
* * * * * * *
75106 TTTTAATTTTTGACAGTTTTAAGTGTAAGTTACGAAAGATTTTGGAGCTTAAGATATCAAAATTT
66 TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAATTT
** * * * * * * * ** *
75171 TGTTTCCAAACAACTATGAGTATCAAAACCGTATGCATAATTTTTAATTGTGATATAAAAACCGT
130 TGTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCAT
* * * * * * *
75236 TTACAAGATTTTAATGTTTCTTACTTGTTTCCTTTAGATGCATTTTTAGAAGGATTCGTGAACGC
194 TTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATGC
* ** * * * * *
75301 TCCAAGGAATTTGTGAAATACTGTTGATATTTGGATATCATTTGAGAAATCGTTATTGACGCTTG
259 TCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTG
* * * * *
75366 ATGTGATTATCTATGTGCTAACTTGTTTTTAAATATTATGCACAAACTAAAAGCTCAATGTTTTT
324 ATGCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTT
** *
75431 TAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTAAAGCTTTAAAAGTATTAAATAT
389 TAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCT-GAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATAT
*
75496 TGTTTTAGCAAGTTTTTAAATTGAAA
453 TGTTTTAGCAAGTTTTTAAA-TGGAA
* * * * * *
75522 ATGAATATCATGAATCTAGT-TTTTTAAACTTACTCAAACAC-GAAAACAAGATAACTCGCATT-
1 ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAG-AAACATGATAACTTGCATTA
* * ** ** *
75584 GTTTTTAATTTTTCACAATGTTAAATGTGAGTTACAAAAAATTTTAGAACTTAAAATATCA-AAT
65 G-TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GAGCTTAAAATATCAGAAT
* * * * ** *
75648 TTTCATTTCTAAACAACTATAGGCATAAAAACCATCCACACAATTTCTAATTGTG--ATAAAAAC
128 TTT-GTTTCTGAACAATTATGGGCA-AAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAAC
* * * ** * ** *
75711 CGTTTGCAAGATTTTAAAGTTTCTTACTAATTTGCTTTAAATGCATTTTTAAGAAGATT-GTGAA
191 CATTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAA
* * ** * * *
75775 TGCTCCAAGAAATTTGTAAGATGCTGTTAATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGTGC
256 TGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGC
75840 TTGATGCGATTA
321 TTGATGCGATTA
75852 TCTATGTTAC
Statistics
Matches: 8286, Mismatches: 1559, Indels: 1096
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Matches are distributed among these distances:
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509 8 0.00
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512 3 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.13, G:0.17, T:0.39
Consensus pattern (477 bp):
ATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGCATTAG
TTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGAGCTTAAAATATCAGAATTTT
GTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAACCATTT
GCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTGGGAGGATTCGTGAATGCTC
CAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGGCGCTTGAT
GCGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTTA
AGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGT
TTTAGCAAGTTTTTAAATGGAA
Found at i:70751 original size:161 final size:160
Alignment explanation
Indices: 70432--70753 Score: 527
Period size: 160 Copynumber: 2.0 Consensus size: 160
70422 CTGTGTGCTA
* * *
70432 ACTTGCTTTTATATACTATGCACAAACTCAAAGCTTAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTT
1 ACTTGCTTTTATATACTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTCTAAGCCTTTATGTTTCGCTT
* * *
70497 TGAAAGCCATTTCTGCTGGAGTGGAGTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTCTTTAAAT
66 TGAAAACCATTTATGCTGGAGTCGAGTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTCTTTAAAT
*
70562 GGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTT
131 GGAAATGAATATCTCGAATCCAATGTTTTT
* * *
70592 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTCTAATCCTTTATGTTTCGCTT
1 ACTTGCTTTTATATACTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTCTAAGCCTTTATGTTTCGCTT
* *
70657 TGAAAACCATTTATGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTTTGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAA
66 TGAAAACCATTTATGCTGGAGTCGAG-TTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTCTTTAAA
70722 TGGAAATGAATATCTCGAATCCAATGTTTTT
130 TGGAAATGAATATCTCGAATCCAATGTTTTT
70753 A
1 A
70754 AACTTGGTCA
Statistics
Matches: 149, Mismatches: 12, Indels: 1
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
160 82 0.55
161 67 0.45
ACGTcount: A:0.30, C:0.13, G:0.15, T:0.41
Consensus pattern (160 bp):
ACTTGCTTTTATATACTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTCTAAGCCTTTATGTTTCGCTT
TGAAAACCATTTATGCTGGAGTCGAGTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTCTTTAAAT
GGAAATGAATATCTCGAATCCAATGTTTTT
Found at i:75406 original size:480 final size:480
Alignment explanation
Indices: 70592--75858 Score: 6632
Period size: 480 Copynumber: 11.0 Consensus size: 480
70582 CAATGTTTTT
* *
70592 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTCT-AATCCTTTATGTTTCGCT
1 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTT-TGAAGCCTTTATGTTTTGCT
* *
70656 TTGAAAACCATTTATGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTTTGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAA
65 TTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAA
* * * *
70721 ATGGAAATGAATATCTCGAATCCAATGTTTTTAAACTTGGTCAAAAACATAAACATGATAACTTG
130 ATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTG
* * * * * *
70786 CATTGGTTTTAATTTTTGACAGT-TCTAAGTGTTAGTTACGAAAGATTTTAGAGCGTAAAATATC
195 CATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGT-TAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATC
* *
70850 AAAATTTTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTACACAATTTCTAATTGTGATATAA
259 AAAATTTTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAA
* * * * *
70915 AAACCATTTGTATGA-TTTAATGTTTCTTTCTCGTTTGCTTTAGATGGATTTTTAGGAGGATTCG
324 AAACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCG
* ** ** * * *
70979 TGAACGCT-CAGGGAATTTGAGGTTTAACATTGATA-TTGGATATCATTTGGGAAATCGTTATTG
389 TGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTG
* * *
71042 GCGCTTGACGCGATTATCTCTGTGCTA
454 GCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
* * * *
71069 ACTTGTTTTTGTATATTATGCACAAACTGAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCTTTTATGTTTTGCTT
1 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTT
* * * *
71134 TGAAAACTATTTCTGCTAGAGTGGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTAAAA
66 TGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAA
* * * **
71199 TGGAAATGAATATTTTGAATCCAATGTTTTTAAATTTGCTCAAACACAGAAATAACATAACTTGC
131 TGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGC
* * *
71264 ATTGGTTTTAGTTTTTCACAATGTTAAGTGTGAGTTACT-AAGGATTTTGAAGCTTAAAATATCA
196 ATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTA-TGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCA
* * *
71328 AAATTTCGTTTCTAAACAACTACGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCTAATTGTGATATAAA
260 AAATTTTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAA
* * *
71393 AACCGTTTGCAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTACATGCATTTTTAGGAGGATTCAT
325 AACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCGT
*
71458 GAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCATTATTGG
390 GAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTGG
*
71523 CGCTTGATGCGATTAACTGTGTGCTA
455 CGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
* * * * *
71549 ACTTCTTTTATATAGATTATGCACAAACTCAAAACTCAATGTTTTTGTAGCCTTTATGCTTTGCT
1 ACTTGTTTT-TATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCT
* * * * *
71614 TTGAAAGCCATTTCTACTGGAGTTGAGCTTTAAAAGTATAAAATATTGTTTTCA-CAAGTTTTAA
65 TTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTT-AGCAAGTTTTTA
* * *
71678 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATG-TTTTAAACTCGCTCGAACACAGAAACATGACAACTT
129 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTT
* * * *
71742 TCATTGGTTTTAGA-TTTT--CAGTGTTAAGTGTGAGTTATTAACGATTTTGGAGCTTTAAATAT
194 GCATTGGTTTTA-ATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATAT
* * *
71804 C-AAATTTTCTTTTCTGAAA-AATTATGGGCAT-AAAACCATCTGCACAGTTTCAAATTGTGATA
258 CAAAATTTT-GTTTCT-AAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATA
* * * ** *
71866 TAAAAATCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCGTACTCATTTGCTGCAGATGCATTTTTAGGAGTAT
321 TAAAAACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGAT
* * * *
71931 TC-T------T-TAGAGAATTTGTGGGATGTCGTTGATATTTGGATGTCATTTG-GTAAATTGTT
386 TCGTGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTG-AAATCGTT
71987 ATTGGCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
450 ATTGGCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
72018 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTT
1 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTT
* * *
72083 TGAAAACCATTTCTACTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATTAAATATTATTTTAGCAAGTTTTTAAA
66 TGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAA
* * *
72148 TGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACATAGAAATATGATAAGTTGC
131 TGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGC
*
72213 ATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTT-GACGCTTAATATATCA
196 ATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGA-GCTTAAAATATCA
* * ** * * *
72277 TAATTTTGTTTCTGAACAACTATGGGCA-AAAAAAAATCAGCATAATTTCAAAATGTGATATAAA
260 AAATTTTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAA
* *
72341 AACCGTTTG-AAGGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTACATGCAATTTTAGGAGGATTCG
325 AACCGTTTGCAA-GATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATTCG
*
72405 TGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGAATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTG
389 TGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTG
* ** *
72470 GCGCTTGATGCAATTAGTTGTGTGCTA
454 GCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
* *
72497 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCATAGTTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTT
1 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTT
* * * *
72562 TGAAAACCATTTCTACTGAAGTTGAACTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAA
66 TGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAA
* *
72627 TGCAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGA
131 TGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGC
* * *
72692 ATTAGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTAGGAGCTTAAAATATCAA
196 ATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATATCAA
* * * * * * *
72757 AAATTCGTTTGC-AAAGAACTATGAGCATAAAAACCGTCTGCATAATTTCAAAATGTGATATAAA
261 AATTTTGTTT-CTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAA
** *
72821 AACTATTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTACATG-ATTTTTTAGGAGGATTCG
325 AACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCA-TTTTTAGGAGGATTCG
* * * * ** * * * * *
72885 TGAATGCTTCAGGGAATTTTTGGGATGCCATCAATTTTTGGAGGTAATTTGTGAAATTGTTATTT
389 TGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTATTG
* * *
72950 GCACTTGATGTGATTAACTGTGTGCTA
454 GCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
72977 ACTTGTTTTTATATAGATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGC
1 ACTTGTTTTTATAT--ATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGC
* * * * *
73042 TTTGAAAACCATTTTTGCTGAAGTCAAGCTTTAAAAGTTTGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTAA
64 TTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTA
* *
73107 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTAG-TTAAACACAGAAACAAGATAACT
129 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTT-GCTCAAACACAGAAACATGATAACT
* * *
73171 TGCATTGGTTTAAATTTTTTACAGTGTTAAATGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATAT
193 TGCATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATAT
* * * * * * *
73236 -TAAATTTTCGTTTTTGAACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTTTCATAT
258 CAAAATTTT-GTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATAT
* ** * *
73300 AAAAACTGTTTATAAGATTTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGTTT
322 AAAAACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATT
* * ** *
73365 TGTGAATGCTTTAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGCTATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTAT
387 CGTGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCATTTGTGAAATCGTTAT
* ** *
73430 TGGTGCTTGATGCGATTAGTTGTGTGCTA
452 TGGCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
* * * * *
73459 ACTTGTTTTTATATAAATTATGTACAAACTCAAAGCTCCACGTTTTTTAAGCCATTATGTTTTGC
1 ACTTGTTTTTATAT--ATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGC
* * ** *
73524 TTTGAAAACCATTTATGCTGGAGTCAAGCTTTAAAAGTATGAAATATTCCTTTAGAAAGTTTTTA
64 TTTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTA
* * * *
73589 AATGGAAAAGAATATCTTGAATCCAATG-TTTTAAACTCGCTTAAATACA-ATAACATGATAACT
129 AATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGA-AACATGATAACT
* * *
73652 TGCATTGATTTTAATTTTTCACAGCGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCCTAAAATAT
193 TGCATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTTAAAATAT
* * * * *
73717 C-AAATTTTCGTTTTTGAACTATTATGGGC-TAAATACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATAT
258 CAAAATTTT-GTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATAT
* * * * *
73780 GAAAAGCGTTTGTAGGATTTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATT
322 AAAAACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGATT
* * * * *
73845 CGTGAACGCTCCAGGGAATTTGTTGGATGTCATTGATATTTGAATGTCATTTTGTGAAATTGTTA
387 CGTGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCA-TTTGTGAAATCGTTA
*
73910 TTGGCGCTTGATGCGATTAACTATGCGCTA
451 TTGGCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
* * * **
73940 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAATCTTAACT-TTTTTTAAGCCTTTATGTTTTAAT
1 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAA-TGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCT
* * * *
74004 TTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCAAGTTTTAAAAGTACGAAATATTGTTTTTGCAAGTTTTT-A
65 TTGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAA
* * * * *
74068 ATGGAAATTAATATCTTGAATCAAATGTTTTTAAACTAGCTCAAACACAAAAATATGATAACTTG
130 ATGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTG
* *
74133 CATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTTAGTTATGACA-GATTTTGGAGCTTAAAAAAAA
195 CATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGA-AGGATTTTGGAGCTT---AAAAT
* * * *
74197 ATCAAAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATA
256 ATCAAAATTTTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATA
** * * * *
74262 TAAAAACCGTTTATAGGGTTTTAATATTTCTTATTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGAT
321 TAAAAACCGTTTGCAAGATTTTAATGTTTCTTACTCGTTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGAT
* * * * * * * *
74327 TCATAAACGCTCCAGGGAATTTGTTGGATGTCATTGATATTTGAATGTTATTTTGTGAAATCATT
386 TCGTGAACGCTCCAGGGAATTTGTGGGATGCCGTTGATATTTGGATGTCA-TTTGTGAAATCGTT
*
74392 ATTGGCGCTTGATGCGATTAACTATGCGCTA
450 ATTGGCGCTTGATGCGATTAACTATGTGCTA
* * * **
74423 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAATCTCAATTTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTAATT
1 ACTTGTTTTTATATATTATGCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTGAAGCCTTTATGTTTTGCTT
* * * *
74488 TGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCAAGTTTTAAAAGTACGAAATATTGTTTTTGCAAGTTTTT-AA
66 TGAAAACCATTTCTGCTGGAGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAA
* * *
74552 TGGAAATTAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTAGCTCAAACACAGAAATATGATAACTTGC
131 TGGAAATGAATATCTTGAATCCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAGAAACATGATAACTTGC
* * * *
74617 ATTGGTTTTAATTTTT-ACCGTGTTAAATGTTAGTTATGAAGGATTTGGGAGCTTAAAAAAAATA
196 ATTGGTTTTAATTTTTCACAGTGTTAAGTGTGAGTTATGAAGGATTTTGGAGCTT----AAAATA
* * * * * *
74681 TCGAAATTTCGTTTCTGAACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTTAAATTGTGATAT
257 TCAAAATTTTGTTTCTAAACAACTATGGGCATAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATAT
** * * *
74746 AAAAACCGTTTATAAGGTTTTAATGTTTTCTTACTCATTTGCTTTAGATGCATTTTTAGGAGGTT
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* ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * *
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* ** * * * * *
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* *
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* * *
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** *
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* * * * * * *
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* * * ** ** * *
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* * ** *
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* ** * * *
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* * * ** * *
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* *
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TAATATAATTCAATATATAATTAAAAT
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*
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*
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TAAACTATTAATAAT
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*
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TATTTAAATATTTATAGT
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TAATTAAAATA
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*
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TAATATGTTAATAATA
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101033 AAAATTATTT
*
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*
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*
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TTATTATTAATTTAATAAAATTTA
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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TTAATAATATTA
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102725 TTTGGAGGTA
* * * * *
102735 ATTTGTGAAATTGTTATTTGCGCTTGATGTGATTAACTGTGTGCTAACTTGTTTTTATATATTAT
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* * * *
102800 GCACAAACTCAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTTTGTTGA
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* * *
102865 AGTCAAGCTTTAAAAGTTTGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTAAAATGAAAATGAATATCTTGAA
131 AGTCAAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAA
* * * *
102930 TCCAATGTTTTTAAACTTAG-TTAAACACAGAAATAAGATAACTTGCATTGGTTTTAATTTTTCA
196 TACAATGTTTTTAAACTT-GCTCAAACACAAAAACAAGATAACTTGCATTGGTTTTAATTTTTCA
* * * ** *
102994 CAGTGTTAAGTGTTAGTTATGAATGATTTTGGCGCTTAAAAAAAATATCAAAATTTCGTTTCTGA
260 CAGTGTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTTGAAGCTT----AAAATATCAAAATTTCGTTTCTAA
* * * * ** *
103059 ACAATTATGGGCAAAAAAACCATCTGCACAATTTCAAATTGTGATATAAAAATCGTTTATAGGGT
321 ACAACTAT-GGC-ATAAAACCATCTGCACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCAGGAT
* * * ** *
103124 TTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTATATGCATTTTTAGG-AGGTTTCGCGAATGCTTTAGGAA
384 TTTAATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAAATGCATTTTTAGGAAGATTT-GTGAATGCTCCAAGAA
* * * * *
103188 ATTTGTGAGATGCCGTTGCTATTTGGATGTC
448 ATTTGTGAAATACTGTTGATATTTGGATATC
* * * * * * *
103219 ATTTGTGAAATTGTTATTGGCACTAGATGGGATTAGCTATGTGCTAACTTTTTTTTATATATTAT
1 ATTTGAGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGTGATTATCTATGTGCTAACTTGTTTTTATATATTAT
* * * * * *
103284 GCACAAACTAAAAGGTCAATGTTTTTGAATCCTTTATGTTTCGCTTTGAAAACCATTTCTACTAG
66 GCACAAACTAAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGG
* * *
103349 AGTCGAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTGAATGGAAATGAAAATCTTGAA
131 AGTCAAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAA
* * *
103414 TAAAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAACAAGATTACTTGCATTGGTTTTAATTTTTGAC
196 TACAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAACAAGATAACTTGCATTGGTTTTAATTTTTCAC
* * * * *
103479 AGTTTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTTGAAGCTTAAGATATCAAAATTTTGTTTCCAAACAAG
261 AGTGTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTTGAAGCTTAAAATATCAAAATTTCGTTTCTAAACAAC
* * *
103544 TATGAGCATCAAAATCGTCTGCACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCATGATTTTAA
326 TATG-GCAT-AAAACCATCTGCACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCAGGATTTTAA
* ** * * *
103609 TGTTTATTACTTGTTTACTTTAGATGCA-TTTTAGGAAGATTTGTGAACGCTCCAA-AGAATTTG
389 TGTTTCTTACTCATTTGCTTTAAATGCATTTTTAGGAAGATTTGTGAATGCTCCAAGA-AATTTG
*
103672 TGAAACACTGTTGATATTTGGATATC
453 TGAAATACTGTTGATATTTGGATATC
* * *
103698 ATTTGAGAAATCGTTATTGACGCTTGATGTGATTATCTATGTGCTAACTTGTTTTTAAAAATTAT
1 ATTTGAGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGTGATTATCTATGTGCTAACTTGTTTTTATATATTAT
* *
103763 GCACAAACTTAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCTTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGG
66 GCACAAACTAAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGG
* * * *
103828 AGTAAAGCTTTAAAAGTATTAAATACTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATTGAAATGAATATCTTGAA
131 AGTCAAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAA
* * *
103893 TTCAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACGAAAACAAAATAACTTGCATT-GTTCTTAATTTTTCA
196 TACAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAACAAGATAACTTGCATTGGTT-TTAATTTTTCA
* * *
103957 CAGTGTTAAATGTGAGTTACAAAGAATTTTGAAGCTTAAAATATCAAAATTTCGTTTCTAAACAA
260 CAGTGTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTTGAAGCTTAAAATATCAAAATTTCGTTTCTAAACAA
104022 CTATTGGCATAAAACCCAT-TCGCACAATTTCTAATTGTG--ATAAAAACCGTTTGCAGGATTTT
325 CTA-TGGCATAAAA-CCATCT-GCACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCAGGATTTT
* *
104084 AAAGTTTCTTACTCATTTGCTTTAAATGCATTTTTAGAAAGATTTGTGAATGCTCCAAGAAATTT
387 AATGTTTCTTACTCATTTGCTTTAAATGCATTTTTAGGAAGATTTGTGAATGCTCCAAGAAATTT
* *
104149 GT-AAGATACTATTGATATTTAGATATC
452 GTGAA-ATACTGTTGATATTTGGATATC
* **
104176 ATTTGTA-AAATCATTATTGGCGCTTGATACGATTATCT
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104214 GTATGTGACT
Statistics
Matches: 858, Mismatches: 124, Indels: 32
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
477 48 0.06
478 92 0.11
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483 1 0.00
484 258 0.30
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.16, T:0.40
Consensus pattern (478 bp):
ATTTGAGAAATCGTTATTGGCGCTTGATGTGATTATCTATGTGCTAACTTGTTTTTATATATTAT
GCACAAACTAAAAGCTCAATGTTTTTTAAGCCTTTATGTTTTGCTTTGAAAACCATTTCTGCTGG
AGTCAAGCTTTAAAAGTATGAAATATTGTTTTAGCAAGTTTTTAAATGGAAATGAATATCTTGAA
TACAATGTTTTTAAACTTGCTCAAACACAAAAACAAGATAACTTGCATTGGTTTTAATTTTTCAC
AGTGTTAAGTGTGAGTTACGAAGGATTTTGAAGCTTAAAATATCAAAATTTCGTTTCTAAACAAC
TATGGCATAAAACCATCTGCACAATTTCTAATTGTGATATAAAAACCGTTTGCAGGATTTTAATG
TTTCTTACTCATTTGCTTTAAATGCATTTTTAGGAAGATTTGTGAATGCTCCAAGAAATTTGTGA
AATACTGTTGATATTTGGATATC
Done.