Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168480.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_79, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 117042
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Warning! 2000 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:12723 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 12060--13708 Score: 1092
Period size: 179 Copynumber: 9.2 Consensus size: 179
12050 ATTTGCTATT
* * * * * * *
12060 TATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTGAT-AAACAAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTA
1 TATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTA
* * * * * *
12124 TTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTATAAAAT
64 TTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * * * * *
12189 AAATCTGTTTATTG-AGTAAGCTCAAATTA-TTATGACTGTTTGAGCAATT-TT
128 AAATCTGTTTACTGAACCAA-TTTAAA-TAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
12240 TATTTCAAATAGTTAGGATCTTTTTTTTTGGTCATAAAAAAATTGTTTTTATTC-CA-TA-CATT
1 TATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTATTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCACACAAGC-TT
* ** * * *
12302 ATTCAGAATAAAATAATACT-ACTTATTAATATTTTGCAAGTTAATATCGTAGGTTAGAATTT-A
63 ATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTAAG--AG-ATTTAA
* * * ** *
12365 AAAATATATATGTTTA-TCGAA-CAAGTTCAAAATAGTTATGTCAATTTGAACACATTATC
123 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAA-TT-TAAATAGTTATAACTATTTGAACA-ATTATC
* * ** * * ** * * * *
12424 TATTTTACATTATTAATGACCATTTTGTTTTTGTGGTAAAACAATTGTTTCTATTTATAC-AGAA
1 TATTTCAAATCGTT-ATGA--ACTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCACACAAG-C
* * *
12488 TTATTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA
61 TTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * *
12549 CTAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATC
126 ATAAATCTGTTTACTGAACCAATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
12603 TATCTCAAATCGTAATGATCTTTATTTTGTCATACAACAATTGTTTCTTTTCACATAAGCTTATT
1 TATTTCAAATCGTTATGAACTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTATT
* * * * *
12668 CGATTAAAATGATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATCAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 CGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
12733 TATGTTT-GTCGAACGAGTTTAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATC
131 TCTGTTTACT-GAACCAATTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
12782 TATTTC-AATCGTTCT-AACCTTT-TGTTTAGTCATAAAACTATTATTT-TAGTTCATACAAACT
1 TATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTAT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCACACAAGCT
* * ** *
12843 TATTCGGAATAAAATAATACTAATGTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA
62 TATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAA
* * *
12908 AATAAATCTGTTTACTGAA-CAATTTTAATTAGATATGACTATTTGAACAATTATC
125 AATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * ** * *
12963 TATTTAAAATTGTT-TTAACTTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT-A-ATAA-CGTA
1 TATTTCAAATCGTTATGAACTTTAT-T-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTA
* * * * *
13024 TCCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACT
64 TTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** ** * *
13089 AAAGT-TGTTTTCTAAAGTAATTCT-AATAGTTACGACTATTTGGACAAATATC
128 AAA-TCTGTTTACTGAACCAATT-TAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
13141 AATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAG-TTAAT
1 TATTTCAAATCGTTATGAACTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTT-AT
* * *
13205 TC-AGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCAAAATTAAT-A--AATA-ATTTAAAAAAT
65 TCGA-AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
13265 AAATATGTTTGCTGAATCAATTTAAATAGTTA-AGATTATTAGAATAATTATC
128 AAATCTGTTTACTGAACCAATTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
13317 TATTTCAAATCATTTTGACCTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTT-TAGTTTAAACAAGCTTAT
1 TATTTCAAATCGTTATGAACTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCACACAAGCTTAT
* * * *
13380 TCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAA-CTTTCAAAAATTAATAAGGAAGAGATTTAAAAAATA
65 TCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * *
13444 AATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGCTATAACTATTTAAATAATTATC
129 AATCTGTTTACTGAACCAA-TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
13495 TATTTAAAATCGATATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCACAAAAGTTTA
1 TATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCACACAAGCTTA
* * * *
13559 TCCAAAAAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
64 TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
13620 AATCAGTTTACTAAATCAATTTAAATAATTATGGA-TATTTAAATAATTATC
129 AATCTGTTTACTGAACCAATTTAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATC
* *
13671 TATTTC-AAT--TTATTACCTTTCATTTTGTCATAAAACAA
1 TATTTCAAATCGTTATGAACTTT-ATTTTGTCATAAAACAA
13709 CCGTTTTTCA
Statistics
Matches: 1166, Mismatches: 226, Indels: 161
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
172 3 0.00
173 21 0.02
174 13 0.01
175 101 0.09
176 151 0.13
177 41 0.04
178 165 0.14
179 243 0.21
180 164 0.14
181 117 0.10
182 57 0.05
183 8 0.01
184 11 0.01
185 5 0.00
186 22 0.02
187 21 0.02
188 23 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TATTTCAAATCGTTATGAACTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTATT
CGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
TCTGTTTACTGAACCAATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
Found at i:13261 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 13226--13269 Score: 51
Period size: 18 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
13216 TAATACTAAT
*
13226 TTAAT-AATATTTTCAAAA
1 TTAATAAATAATTTCAAAA
13244 TTAATAAATAATTT-AAAA
1 TTAATAAATAATTTCAAAA
13262 --AATAAATA
1 TTAATAAATA
13270 TGTTTGCTGA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 1, Indels: 4
0.83 0.03 0.14
Matches are distributed among these distances:
16 8 0.33
18 9 0.38
19 7 0.29
ACGTcount: A:0.59, C:0.02, G:0.00, T:0.39
Consensus pattern (19 bp):
TTAATAAATAATTTCAAAA
Found at i:13483 original size:354 final size:347
Alignment explanation
Indices: 12360--13678 Score: 1055
Period size: 354 Copynumber: 3.7 Consensus size: 347
12350 GTAGGTTAGA
* * ** *
12360 ATTT-AAAAATATATATGTTTATCGAACAAGTTCAAAATAGTTATGTCAATTTGAACACATTATC
1 ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTCT-GAACAAGTTC-AAATAGTTA-AACTATTTGAACA-ATTATC
* * * * ** * * *
12424 TATTTTACATTATTAATGACCATTTTGTTTTTGTGGTAAAACAATTGTTTCTA-TTTATACAGAA
61 TATTTCAAATCATT-ATGA--A-CTT-TTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGATCATACA-AG
* * * * *
12488 TTATTCAAAT-AAAATAATACAAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTA
119 TTATTCAGATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * *
12552 AATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGT
184 AATATGTTTACTGAATCAATTTAAATAATTATAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
** * * * * * *
12616 AATGATCTTTATTTTGTCATACAACAATTGTTTCT-TTTCACATAAGCTTATTCG-ATTAAAATG
249 TTTGACCTTT-GTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTT-AAATAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * *
12679 ATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATCAATAAGTAAGAG
310 ATACTAATTTATTAAT-TTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG
* * *
12719 ATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAACGAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTCT-GAACAAGTTCAAATAGTTAA-ACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
12784 TTTC-AATCGTTCT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACTATTATTTTAGTTCATACAAACTTATT
63 TTTCAAATCATTATGAA-CTTTT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATAC-AAGTTATT
* * * **
12847 CGGA-ATAAAATAATACTAATGTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAT
124 CAGATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--A-A-ATTT-AAAAAAT
* * * *
12911 AAATCTGTTTACTGAA-CAATTTTAATTAGA-TAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
183 AAATATGTTTACTGAATCAA-TTTAAATA-ATTATAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
12973 TGTTTTAACTTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT-AATAA-CGTATCCGAAATAAAA
246 CGTTTTGAC-CTTTGT-TTGTCATAAAACAATT-TTTTATTTAAATAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * *
13036 TAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTATTAAGCAAGAG
308 TAATACTAATTTATT-A-ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG
* * * * * * * *
13078 ATTTAAAAACTAAAGTTGTTTTCTAAAGTAA-TTCTAATAGTTACGACTATTTGGACAAATATCA
1 ATTTAAAAAATAAA-TTG-TTTCTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAACAATTATCT
* *
13142 ATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATCATACAAGTTAATT
62 ATTTCAAATCATTATGAACTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGATCATACAAGTT-ATT
* *
13206 CAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCAAAATTAATAA-ATAATTTAAAAAATAAATA
124 CAGATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGA-AATTTAAAAAATAAATA
* * * * *
13270 TGTTTGCTGAATCAATTTAAATAGTTA-AGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTG
188 TGTTTACTGAATCAATTTAAATAATTATAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTG
* * *
13334 ACCTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTAGTTTAAACAAGCTTATTCGAAAGAAAATAATACTA
253 ACCTTTGTTT-GTCATAAAACAATTTTTTA-TTTAAATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
*
13399 ATTTATTAACTTTCAAAAATTAATAAGGAAGAG
316 ATTTATTAA-TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG
* * *
13432 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGCTATAACTATTTAAATAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAAT-TGTTT-CTGAACAAGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * *
13497 TTTAAAATCGA-TATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCACAAAAGTTTATC
63 TTTCAAATC-ATTATGAAC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATACAAG-TTATT
* * *
13561 CA-AAAAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCA
124 CAGATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAAT-A
* * *
13625 -GTTTACTAAATCAATTTAAATAATTATGGA-TATTTA-AATAATTATCTATTTCAA
188 TGTTTACTGAATCAATTTAAATAATTATAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAA
13679 TTTATTACCT
Statistics
Matches: 773, Mismatches: 136, Indels: 107
0.76 0.13 0.11
Matches are distributed among these distances:
352 8 0.01
353 35 0.05
354 268 0.35
355 115 0.15
356 5 0.01
357 5 0.01
358 21 0.03
359 176 0.23
360 111 0.14
361 29 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (347 bp):
ATTTAAAAAATAAATTGTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTAAACTATTTGAACAATTATCTATTT
CAAATCATTATGAACTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGTTATTCAGATAA
AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
GAATCAATTTAAATAATTATAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTGT
TTGTCATAAAACAATTTTTTATTTAAATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
TTCAAAAATTAATAAGCAAGAG
Found at i:13961 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 13936--13990 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 2.9 Consensus size: 20
13926 AACCTTTTTG
13936 TTCTGTCATAAAATAATTAT
1 TTCTGTCATAAAATAATTAT
13956 TTCTGTTCATATAAAT--TTAT
1 TTCTG-TCATA-AAATAATTAT
*
13976 TTC-G-AATAAAATAAT
1 TTCTGTCATAAAATAAT
13991 ACTAAATTAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 1, Indels: 10
0.73 0.02 0.24
Matches are distributed among these distances:
16 4 0.13
17 3 0.10
18 1 0.03
19 1 0.03
20 12 0.40
21 5 0.17
22 4 0.13
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.05, T:0.45
Consensus pattern (20 bp):
TTCTGTCATAAAATAATTAT
Found at i:14247 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 13980--14412 Score: 496
Period size: 181 Copynumber: 2.4 Consensus size: 179
13970 ATTTATTTCG
* *
13980 AATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TTAAAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * *
14045 TGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGAC-TATATGAATAATTATCTATTATTTTAAATCATT
64 TATTTATCAAACCACTTCAAATAATT-AGACTTATATGAACAACTA--TA-TATTTTAAATCATT
* * * * * *
14109 ATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCAACCTCATCCAAGTTTATTCAT
125 ATAACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATGTCAA-CTCATACAAGCTTATTCAA
* * *
14165 AATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTTAAAATT-TTA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATGTT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TT
** * * * **
14227 ATTTATGGAACCACTTCAAATAATTATACTTATTTGAACAACTATATATTTTAATTTGTTATAAC
65 ATTTATCAAACCACTTCAAATAATTAGACTTATATGAACAACTATATATTTTAAATCATTATAAC
* * *
14292 CTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATGTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
130 CTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATGTCAACTCATACAAGCTTATTCAA
* *
14342 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGACAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTT-AAAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
14407 TATTTA
64 TATTTA
14413 ACTATTTGTA
Statistics
Matches: 210, Mismatches: 31, Indels: 18
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 42 0.20
178 47 0.22
179 2 0.01
180 8 0.04
181 74 0.35
182 5 0.02
184 7 0.03
185 25 0.12
ACGTcount: A:0.45, C:0.10, G:0.05, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA
TTTATCAAACCACTTCAAATAATTAGACTTATATGAACAACTATATATTTTAAATCATTATAACC
TTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATGTCAACTCATACAAGCTTATTCAA
Found at i:15015 original size:160 final size:160
Alignment explanation
Indices: 14738--15028 Score: 354
Period size: 160 Copynumber: 1.8 Consensus size: 160
14728 AGGTTATAAC
* ** * * *
14738 GATTTGAAATAGATAATTATTCATATATCCTTAACTATTTGAATTAGTTCGACAAAAAAATTTAC
1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATCAATAACTATTTAAACTAGTCCGACAAAAAAATTTAC
* * * * *
14803 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTGATTTTCATAATATTATTAGATAAGTATTATTTTATTCCGAATA
66 TTTTTAAATCTCCTACTTATTGATTTTCATAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTCCAAATA
14868 AGCTTATGTGAACATAAATAATTATTTTAT
131 AGCTTATGTGAACATAAATAATTATTTTAT
* * ** *
14898 GATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGT-AATAACTATTTAAACTAGTCCGATAAGTATATTTA
1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TCAATAACTATTTAAACTAGTCCGACAAAAAAATTTA
* * * *
14962 TTTTTTAATTCTCCTACTTATTAGTTTTTGA-AATATTAATAAATTAA-TATTATTTTATTCCAA
65 CTTTTTAAATCTCCTACTTATT-GATTTTCATAATATTAATAAA-TAAGTATTATTTTATTCCAA
15025 ATAA
128 ATAA
15029 ACTTGTATGA
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 20, Indels: 6
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
160 98 0.91
161 10 0.09
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.08, T:0.45
Consensus pattern (160 bp):
GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATCAATAACTATTTAAACTAGTCCGACAAAAAAATTTAC
TTTTTAAATCTCCTACTTATTGATTTTCATAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTCCAAATA
AGCTTATGTGAACATAAATAATTATTTTAT
Found at i:15974 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 14896--26861 Score: 3991
Period size: 181 Copynumber: 66.2 Consensus size: 180
14886 TAATTATTTT
* * * * * ** * ** *
14896 ATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTAGTCCGATAAGTATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * *
14961 ATTTTTTAATTCTCCTACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * *
15026 TAAACTTGTATGATTAAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAAGTTCATA
130 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATA
** ** * * * * ** * * *
15078 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTTGAATGGCCATAATTATTTAAACTAATTCGATAAACTGATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
** * * * * * ***
15143 ATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * *
15208 TAAG-TTTTATTAAACTA-AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTTATA
130 TAAGCTTGTA-TGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * ** *
15259 ACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
*
15324 ATTTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCTA-AATATTAATAAAATTA-TATTATTTTATTTC
66 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT-TAGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC
* * **** * *
15387 AAATTAGCTTGTATGAACT-GAAAAAAAAAAATTTCTGACAAAACAAAAGGTCAGA
127 AAATAAGCTTGTATGAA-TAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
15442 ATGATTTGAAATAGACAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTAT-AA-TTGGTTTGGCAAGCACAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT-TGAACTT-GTTTGGTAAACAGAT
* * ** *
15505 TTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAAT-A-TTTAGAAT-TTATTAGTTTAGCATTATTTTATTT-AG
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-
* *
15565 AATAAGCTTGCATGAATAGAAACAATTTGTTTTATGACAAAAC--AAGATCATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
15617 CT-ATTTGAGATAGGTAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
** * * * * *
15681 AGCTTTTAAATGTCTTA-TTA--ACTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTACTTGA-TTCTGA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
** ** *
15741 ATAATTTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
15792 ATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAATTTGTTTGGCAAACATATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
**
15856 TATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * **
15921 ATAAACTTGTATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
15973 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCGTTAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * *
16038 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATCATTTCTA-TTCTG
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTTC-A
* * ** * ** *
16102 AATAAGTTTTTATGAGCAAAAACAATTAG-TTTATGATGAAACAAAAGATCAT-
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
**
16154 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAG--AA-A-A--
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATT
* * * *
16212 CA-TTTTT---T-TCTTA-TTA--ATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTA-TTCAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-A
* * * * *
16267 AATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTATTTTGTGGCAAAACAAAAGGTCATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * **
16320 ATGTTTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATGGATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
** * * *
16385 -TTTTTT-GTTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * *
16448 TAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAGTCATA
130 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
16499 ATGATTTGAAATAGATAAATATTTAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTTGGCAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* *
16564 ATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-
66 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTC
* * * * * *
16627 AAATAAACTTGTAT-AAGCAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGCCATA
127 AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * *** * *
16681 ACAAGTTGAAATAAATAATTACACAAATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * * * *
16746 ATTTTTAAAATCTTTTACATTTTTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGAATTATATTATTTGA
66 ATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATT-T-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * ** *
16810 AATAAGATTGTATGAATAGATAA-AATTCTTTTGTGACAAAACACTAGGTTATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
*** * * * * *
16863 GCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTT-TTTCAGTAAACAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAACAGATT
* * * * *
16927 CATCATTTTAAATTTCTTTA-TTATGAAATTTT-GAATTACTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
65 TAT-TTTTTAAATCTC-TTACTTAT-TAATTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * *
16990 TGAATAAGCTTATATGAACT-GAAACATTTCTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA
126 CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * * *
17045 ACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAAAATCATGATTATTTGATCTAGTTTAGTAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * *
17110 ATTTTTTAAAT-T-TTATTTATCAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTCCAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * *
17172 ATAAGCATGTATGAACAGAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAAGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
17224 A-GATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * * * *
17288 A-TTTTTAAATCTTTTA-TTAAT-ATTTGA-AATATTAATAGATTAGTATTATTTTAGTCCGAAC
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
** * * *
17349 AAATTTATATGAACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
131 AAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
17399 ATGATTTGGAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGGATAGGTAAATAGAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * *
17464 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTCATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTCTTTTATTCCAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAA
* * * *
17528 GTAAACTAT-TATGAATTCA-AAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
129 ATAAGCT-TGTATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * ** * *
17582 ACGATTTGAAATCGATAACTGTTCATATAGTCTTAAATATTGGAAC-TGATTCGCCAAATAAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATT
* * * * *
17646 TATTTTTTAATTCTCTTAGCTT-TTAATTTTCATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCG
65 TATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
17710 AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTCTTTTATGACGAAACAAAAGGTTATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * ** ** * * * *
17763 ACAATTTGAAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCATTGCTGTTTGAACTAGTTTGGTAAATATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGA-TT
* * * * * * *
17828 TATTTTTTAAGTCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAA-AAGTATTATTGTATTCCGA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
** * * ** * *
17892 ATAAAATTGAATG-CTCA-AATACAATTGTTACATGATAAAACAAATGGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** ** * *
17944 GTGATTTCAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACT-GTTGAAGCTACTTCAGCAAACAAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTTGGTAAACAGATT
* * *
18008 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTGAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * *
18073 ATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTACGATAGAACAAAAGGTTACA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * ** * *
18125 ACAATCTAAAATAGATAATTGTTTAAATA---AGAAC----TG-A----TTCAGTAAATAGATAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * *
18178 A-TTTTTAAATCTCCTT-CCTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATACTATTTTATTCCAA
66 ATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * **
18241 ATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTTGTA
129 ATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
18293 ATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAG--T--T---C-GATGT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * *
18350 ATTTTTTAAATCTC-TAATATATCAATTTTTGAATTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAG
66 ATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * *
18414 GTAAGCTTTTATAAATTGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
18466 TTTATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* ** * ** **
18531 ATTTTTTAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTCTGAATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
66 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * *
18596 ATAAGCATGCATGAGCTA-AAA-ATACTATTTTATGAC-AAGCGAAAGGTCAAA
129 ATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * * *
18647 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATTTTCTTATCTATTTGAA-TTAGTTTGGTAAACACATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATT
* * * * *
18711 TATTTTTTAAA-----T-CTT-TT-A--TTAGAATATTATTAATTTA-TCAATATTTTACTCCAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAA
* * *
18765 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAA-AAATA--TCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATA
* * * * * ***
18815 ACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAAAAATCATAATTATTTGAA-TTGGTTCAATATAA-AGAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTA-AACAGAT
* * * * **
18878 TTAGTTTTTAAATCTTTTACTAATT--TTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
** * ** *
18940 ATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATAATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * * *
18992 ACAATTTGATATAAATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTT-AAGCTTGTTTGGTGAACAAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTTGGTAAACAGATT
*
19056 TATTTTTTAAAT-T-TTCAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
65 TATTTTTTAAATCTCTT--ACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTT
** * *
19119 TGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
126 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
19174 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCGATAAACAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * * *
19239 AGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAGTTAGTATTATTTCATTTAAAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* *
19304 TAAGCCTT-TATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTCATA
130 TAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * ** * * * *
19355 ACAATTTTAAATAGATAACTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAAATGTTTAGAAAATATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * ** *
19420 A-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTTTTTTATTTTA-TTCGAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * * * * *
19482 ATATGCTTGTATGAATAGAACCAAATGTTTTATAAGAAAACAAAATGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* *
19534 AT-ATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTGGT-AACAAGAT
1 ATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AGAT
* * * *
19597 TTATTTTTTAATTCTCTTTCTAATTAATTTCTAGAAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTT
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TAG--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
19662 CAAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGTTCACA
126 CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * *
19717 ATGATTTGAAATAGATAATAATTCAGATAGCCATAACTATTTGAACATGTTAGGT-AACAAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AGATT
* * * * *
19781 CT-TTTTTTAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCA
65 -TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * *
19845 AATAAGCTTATATGAGCTA-AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACA
128 AATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *** *
19898 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTAGTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * *
19962 ATTTTTTAAATAT-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTAATATT-TTGTTA-ATCG
66 ATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTC-
* * * * *
20024 AAATAAACATGTATG-ATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATA
127 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
*** * * * ** *** *
20077 CCAATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTTATAAAGATTTGATA-TTGTTCAATAAATAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * *
20141 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCTT--AATATTAATAAATTTGTATAATTTTA-TTC
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT---TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
** * * * * * ** * * * ***
20203 AAAATAAGAGATCTTTTACT--TATTAATTGTCTTAAT-ATTAATA-AATTTGT-ATTA
127 -AAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGT-TTTATGA-CAAAACAAAAGGTCA-TA
* * ** * *** * * **** ***
20257 TTTTATTCAAAATAAGCTTGATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATAAC-AAAACAAAAGGTTATA
1 -ATGATTTGAAAT-A----GAT-AATTG--TTCAAAT-A-GTCATAACTATTTGAACTTGTT-T-
* * * * * * * * * *
20321 ACGATTTCAAATAGA-TAATTGTTCAAA-CAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCG--T-TAAACA
53 --G--GT-AAACAGATTTATTTTTTAAATC--TCTTACTTA-TT-AA-TT-TTAGAATATTAATA
* * * *
20381 AATTCA-T-TT-TTTAAATCTCTTAATTATTAA--TTTTCA-GAATATTGATAACTTAATATTAT
107 AATT-AGTATTATTT-TAT-T-TCAA--A-TAAGCTTGT-ATGAATA--GA-AAC---A-ATTGT
**** * * *
20440 TTTAT--TTTGA-ATAAGCTTAT-
157 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
*** ** * * * *
20460 ATGAACCGAAAT-GATTTTTTTATAACAAA-A--CAAAAGGTCA--T-AAC--GATTT-G-AAAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--CAAATAGTCATAA-CT-ATTTGAACTTG-TTTGGTAAAC
* * * * * * * * *** *
20514 AGA-TAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAGAATATTTATGTTTTA-AA
60 AGATTTATTTTTTAAAT-CTC-T---TACTT-AT-TAATT---TTAGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *** ** *
20577 TT-TTTTAGTT--ATTAA--TTGT-TGAAATATTATTA-AATTGGTATTATTTTAATCCAAATAA
115 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATA-GA-AACAATT-GTTTTATGACAAAACAAA-AG
20635 G-C-T-
175 GTCATA
* * * * * * * **
20638 -TG-TATG-AACAGAAACTATTGTTTTATAACA--CAATGAA-AAGTCAT-AAC-AATTT-G-AA
1 ATGATTTGAAATAGATA--ATTG-TTCA-AATAGTC-AT-AACTA-T-TTGAACTTGTTTGGTAA
* * * * ** * * * * * *
20693 ATA-AATAAATGCTCAAATATTCATAACTATATGAACTGGTTTGATAAATATCAATAAATTAGTA
58 ACAGATTTATTTTTTAAAT-CTC-TTACT-TATTAA-T--TTT-A-GAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * * * * * * *
20757 TTATTTTGTTTTAAACAAACTTATATTAACAAAAAAAAATATTGTTTTATTACAAAATAAAAAGT
115 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA-TGA-ATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
*
20822 AATA
177 CATA
* * * * * * * * * *
20826 ATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATACTTATAATTATTTAAACTGGTTTTGTAAATAGAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * *
20891 ATTTTCTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTACTCTATTTCGAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
** * * * *
20952 TAAATTTTTA-CAAGCTA-AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
130 TAAGCTTGTATGAA--TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * ** * * *
21003 ACAATTT-AAGTTAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTT-AAATTGGTTCAGCAAACATAA
1 ATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGAT
* * * * * *
21066 TTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTACTAAAATAGTATTATTTTATTTCG
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
21131 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTATAGAATAAAATGTTATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * *
21184 ACAATATGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAAAGATCT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * ** * * * * ** * * * **
21249 ATTTTTAAAAACAATT-GTT-TT-A--TGACAA-A-CAA-AAGGTAATAATAATTTGAAAT-AAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAA
* * * ** * * * * ** ** ** * *
21305 T-AG-TTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAATTTATTTAGTCAACTGAT--TT
130 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT-TA-TGA-CAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * ** *
21355 AT-TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACT-ATCGAAATAATAATAAAGTAGTATTG-TTTTCTTTT
1 ATGATTTGAAA-----TAG--A-TAATTGTTC-AAATAGTCAT-AACTA-T-TTGAACTT-GTTT
* * **** * ** ** * **** * **
21417 GG-ATA-AGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTTTA
53 GGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTAGAA--T-ATTAAT-AAATTA
* * * * *
21479 -AATTGATAATT-GTTCAAAT-AGTCATAACTCTTTGAACTTATTCGATAAACACATT-TATCTT
112 GTATT-AT-TTTATTTCAAATAAG-C-T---TGTATGAA--TA---G--AAACA-ATTGT-T-TT
* * * **** *
21540 -T-TCGAATCTCTTGCT-ATTA
160 ATGACAAAACAAAAGGTCA-TA
* * * ** *
21559 AT-TTTTGGAAT-GTTAA----T-AAATTAGT-ATTATTTTATTTCGAA-TAAG--TGAGTATAA
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA-TA-ACTATTT-GAACT-TGTTTG-GTA-AA
* *** * * * *** ** * **
21613 AATGAAACAATTATTATAGGAC-TAAATA-AAAAGTTAGAATGATT--TGAAA-TAGATAATTAT
59 CA-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAT-ATTAAT-AAATTAG-T-ATTAT
* * * ** * * * *
21673 TCTAATAATCTT-AACT-A-TTTGAACTGGTTCAGTAAATATATATATTTT-T--TAAATC----
119 T-T--T-AT-TTCAAATAAGCTTGTA-TGAAT-AG-AAACA-AT-TGTTTTATGACAAAACAAAA
**
21728 TCTCACTA
174 GGTCA-TA
* * * * ** * * * *
21736 AT-TTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTGTCCAT-A-TA----AGCTTGTATGATCAAA
1 ATGATTTGAAATA-GA-T-AATT-GT-TCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTTGGT--AA
* * * * * **
21794 AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTA-AACTAGTTCAA
58 ACAGAT--T--T-ATTT----TTTAAATCTCTT-ACTTA-T--TAA-T-TTTAGAA-TA-TT---
* * * * * * * * *
21858 AAAAACAACTTTAGTTTTAAATCTTT-TGTT-TATTAA--TTTTTTAAATATTAATA-AAGTAGT
103 -AATA-AA--TTAGTATT--AT-TTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAA-ACAA-TTGT
* *** **** * *
21918 ATTATTTTATTTTGAATAAGGT-TTT
157 TTTATGACA-AAACAA-AAGGTCATA
** * ** * * * * *
21943 ATGAAATGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTG
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCATAACTA-TTTGAACTTG-T--TTG
* * ** * * * * * * * **
22006 TTCAAATAG-TCAAATCTATTTGAA-CTTGTTTGA-TAAATAAATTTA-TAT-TTTTTAAATCTC
54 GT-AAACAGAT-TTAT-TTTTTAAATC-T-CTT-ACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAA--T-
* * * * ** * * *** * *
22066 TTGCTCATCA-ATT-TTTCAAAT--G-TT-AAT-AA-A-TTACAGTTATTTTATTTTGAATA-AG
110 TAG-T-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAA
***
22121 TTTGT-ATGA
172 AAGGTCAT-A
* ** * *** * * * *
22130 ACTGAAATAATTG--TTTTATAACTAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTA
1 A-TG--AT--TTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTTG-T--TTGGTA
* * * ** ** * * *
22192 TAATAG-TCTTAACTATTTAAACTAATTCTACAAACACATTTATTTTTCA-AAGCTCTTATTAAT
57 -AACAGAT-TT-A-T-TTT---TTAAATCT-CTTACTTA-TTAATTTT-AGAA--TATTAATAA-
* * * * * * * * * * ** *
22255 TTTTGGA--ATATTA-TT-AAATTAGTATTATTTTAATCTGAGTAAGC--TTGTATGAAAAGAAC
108 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAA--T-AG-AAACAATTGT-T-TTATG-AC
**
22314 AATTCTTTTATGACAAAATAAACATCATA
165 AA-------A--AC---A-AAAGGTCATA
* * ** * * *
22343 ACGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTAT-TTTGGTAAATAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATT
* * **
22407 TAGTATTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
** * * * *
22467 ATAATTTTGCATGAATAGAAGCAATTATTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** *
22519 A-CATTTTGAAATAGATAATTATTCATGTAGAT-ATGACTATTTGAACTT-TATTCGGTAAACAG
1 ATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGT-TT-GGTAAACAG
* * *
22581 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
62 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * * * *
22646 TGAATAAACTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATTATA
126 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
22701 CT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTTGATAAATAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * * * * **
22764 TA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-CTTATTTTGA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
22827 ATACA-CTTGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
129 ATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** *
22879 ATTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAAC--GTATTCATAAAACATAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TTGGT-AAACAGA-
* *
22942 TTTATTTTTTAAAAT-T-TTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
63 TTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * * * **
23004 TGAAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAATATCATA
125 TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
23060 ATGATTTGAAATAGA-AATTATTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTGTTTGGTAAATAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * **
23124 ATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * * ** *
23189 TTAGCCTATATGAACTA-ATATATTTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATA
130 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * *** *** *
23240 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATCAAAACTTGTTCAATAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * * *
23305 ATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCATA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * *
23370 TAAGCTTTTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATA
130 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATA
* * * * ** * * *
23421 ACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CACT-ACTATTTGAATTTATTCAGTAATCATAGT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * * ** * *
23484 TATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAA--CT-GAATATTAATAAATTTCTATTATTTTAATTGAAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * *
23546 TAAGGTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATTATA
130 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * *
23597 GCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAATCGTAATTGTTTTAACTTG-TT--CAAACAGATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * ** * *
23659 AGTTTTTAAATCT-TTCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTCCGA
66 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * *
23723 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *** **
23775 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGAT-ATAACTATTTGCA-TCGGTCAAGCCAACAGAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGAT
* * * *
23838 TCATTTTCTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCC
64 TTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
** * * *
23902 AAATAAAATTGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAACAAATGGTCATA
127 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** * ** * * *
23955 ACGATTTAAAATAAATAATTAATCAAATTGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * *
24020 ATATTTTAAAATCTCTTA---A-TAATTTTCAAAATATTAATAAGTTAATATTATTTTATTCCAA
66 AT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * *
24081 ACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGATAAAAC-AAATGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
24132 ACGATTTGAAAATAGGTAATTATTC---TCA--CTTTACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACA-AT
1 ATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGAT
* * * * * * * *
24191 TTTTTTTTTAAATCT-TTAGTTATTTATTTAATAAT-TTATCTAGA-TAGTATTATTTTATTTTG
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTC
* * * * * *
24253 AAATAAG-TTATATGAACT--AAA-TATTGTTATAAT-A-ACAACGAAAGGTTTATA
127 AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGG-TCATA
* * * * * *
24304 ATGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATACGTTATAACTATTTGAACTAGTTCTGCTTAACA-AT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAACAGAT
* ** * * *
24368 TTATTTTTT-AATCTCCTACTCCTTAATCTTTTTGAAATATT-ATAAATTAATATTA-TTCA-TT
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
24429 CGAATAGGCTTATATGAATGAAAAAACAATTGTTTT-TGACAAAATAAAAGTTCATA
126 CAAATAAGCTTGTATGAAT--AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * **
24485 AACAGTTTGAAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGA
1 ATGA-TTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGA
* ** * * * * * * **
24549 TTTATTTTTTCAATCTCCAATTTCTCAATTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG
63 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * *
24614 GATAAGCTTCTATGAATTGACACAAATGTTTTATTATAAAGCAAAAGGTCATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** *
24667 ATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * * *
24732 ATTTTTTAAAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTGAATGTTATTAACA-TAATATTATTTTATTTCGA
66 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * *
24795 ATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGA
129 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * ** *
24847 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCT-ACAAACACATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAACAGATT
* * * * ** ** * *
24911 TACTTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATTTTAGAATATTATTAGTTTACCAATATTTTACTTT-G
65 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCA
* * * *
24975 AATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AATGATCATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
25027 ATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TAATTTAAACTAGTTTGGTTAACAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * * *
25091 TAGTTTTTAAA--TC-T-CTTGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTG
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
** * * * *
25151 AATAATATTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTACGACCAAAC-AAAGTGTCATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATA
* * * * *
25204 ATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGAT-GTGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * ** * ** * *
25268 AATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTTATTATATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTTCGAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * *
25333 TAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATA
130 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
25385 ATGATTTCAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTGTCTT-GTAAACAAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TTGGTAAACAGATT
* * * * *
25449 TATTTTTTAAATATTTTACTTAATAACTTTT-GAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTAT-
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TC
*
25512 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
127 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** ** * *
25566 ACGA-TTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGAAAATAGATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* *
25630 ATTTTTTAAAT-T-TTAACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-CTCG
66 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTT-TAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-
** * * * * * * *
25691 AAATAAGCTTACACGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAAAAAAAGGCCATA
127 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
25745 ATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTC
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * * * * * *
25810 CTTTTTCAATTTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAGTATTATTTTACTTCAAA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
** * * *
25875 TAAGCTCATATGAACTA-AAACAATTATTTTATTAC-AAAGAAAAGGTCATA
130 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
25925 ATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * ** * *
25990 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTA-ATCTGA
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * * * * * * *
26054 ATAAGTTTGAATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
26106 ATAAGTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAA-TGATTTGAACTTATTCGGTAAACATATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * *
26170 TATTTTTTAAATCT-TTGACTAATTAATTATCT-TAATATTAATAACTTTA-TATTATTTTA-TT
65 TATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-T-TAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT
* * ** **
26231 CGAAATAAGCTTGTATTAACT-GAAA-AATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTTA
126 C-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * * * *
26286 AAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATT
1 ATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
* * * * *
26350 TATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTT-GTTCT
65 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
* * * * *
26414 GAATAAGCTTATATGAACTA-TAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAA
127 AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
26468 ATAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTT-AAGC-TGATTTGGTAAACAAAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTG-TTTGGTAAACAGAT
* * * *
26531 TTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TT-ATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCA
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * * * * * *
26592 AATAAGCTTGTACAAACA-AAATAATTATTTTACGAGAAACCAAAAGGTCATA
128 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* ** ** * **
26644 ATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT-ATTAGA-T
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGG-TAAACAGATT
* * ** * * * * *
26707 TA--TTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATCATTAAATTATTATTA-TTTATTTCAA
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
** * * * * * * *
26769 ATAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAATAAAAGGTTATA
129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
26822 ATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATAGTTAAAACTAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
26862 AAATAGATTT
Statistics
Matches: 8826, Mismatches: 2194, Indels: 1532
0.70 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
164 3 0.00
165 42 0.00
166 68 0.01
167 8 0.00
168 175 0.02
169 70 0.01
170 37 0.00
171 35 0.00
172 52 0.01
173 201 0.02
174 163 0.02
175 226 0.03
176 468 0.05
177 540 0.06
178 380 0.04
179 648 0.07
180 1270 0.14
181 2012 0.23
182 1203 0.14
183 492 0.06
184 30 0.00
185 23 0.00
186 40 0.00
187 37 0.00
188 41 0.00
189 51 0.01
190 45 0.01
191 60 0.01
192 43 0.00
193 15 0.00
194 24 0.00
195 20 0.00
196 23 0.00
197 34 0.00
198 28 0.00
199 9 0.00
200 11 0.00
201 11 0.00
202 16 0.00
203 18 0.00
204 26 0.00
205 9 0.00
206 21 0.00
207 20 0.00
208 11 0.00
209 10 0.00
210 32 0.00
211 2 0.00
212 4 0.00
213 4 0.00
214 2 0.00
215 3 0.00
216 2 0.00
217 5 0.00
218 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
Found at i:16228 original size:166 final size:166
Alignment explanation
Indices: 16050--16364 Score: 409
Period size: 166 Copynumber: 1.9 Consensus size: 166
16040 TTTTTAAATC
* * ** * **
16050 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAA-TTAGTATCATTTCTATTCTGAATAAGTTTTTA
1 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-AATCATTT-TATTCAAAATAAGCTTGCA
* ** *
16114 TGAGCAAAAACAATTAGTTTATGATGAAACAAAAGATCAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
64 TGAACAAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTC
16178 AAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAACATT
129 AAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAACATT
* * *
16216 TTTTTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATG
1 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTAAATCATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATG
* * * * * * *
16281 AACAAAACCAATTATTTTGTGGCAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAT
66 AACAAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAA
16346 ATAGTCATAACTATTTGAA
131 ATAGTCATAACTATTTGAA
16365 CTTATTTGGT
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 21, Indels: 4
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
165 46 0.37
166 77 0.61
167 3 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (166 bp):
TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTAAATCATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATG
AACAAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAACATT
Found at i:18442 original size:173 final size:173
Alignment explanation
Indices: 18200--18512 Score: 398
Period size: 173 Copynumber: 1.8 Consensus size: 173
18190 CCTTCCTATT
* * *
18200 AATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATACTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAA
1 AATTTTTGAAATTTTAATAAAGTAATACTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAATGAAAAACAA
* ** * * * * *
18265 TTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTTGTAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGGCCATAAT
66 TTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAAC
18330 TATTTGAACTAGTTCGATGTATTTTTTAAATCTCTAATATATC
131 TATTTGAACTAGTTCGATGTATTTTTTAAATCTCTAATATATC
* * ** *
18373 AATTTTTG-AATTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGGTAAGCTTTTATAAATTG-AAAA
1 AATTTTTGAAATT-TTAATAAAGTAATACTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT-AA-TGAAAAA
* * * *
18436 -AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
63 CAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAT
18500 AACTATTTGAACT
128 AACTATTTGAACT
18513 TGTTTGATAA
Statistics
Matches: 117, Mismatches: 20, Indels: 6
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
172 4 0.03
173 106 0.91
174 5 0.04
175 2 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (173 bp):
AATTTTTGAAATTTTAATAAAGTAATACTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAATGAAAAACAA
TTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAAC
TATTTGAACTAGTTCGATGTATTTTTTAAATCTCTAATATATC
Found at i:20231 original size:62 final size:62
Alignment explanation
Indices: 20151--20272 Score: 226
Period size: 62 Copynumber: 2.0 Consensus size: 62
20141 TATTTTTTAA
20151 ATCTTTTACTTATTAATTGCCTTAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTCAAAATAAGAG
1 ATCTTTTACTTATTAATTGCCTTAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTCAAAATAAGAG
* *
20213 ATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAG
1 ATCTTTTACTTATTAATTGCCTTAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTCAAAATAAG
20273 CTTGATGAAT
Statistics
Matches: 58, Mismatches: 2, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
62 58 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.06, T:0.49
Consensus pattern (62 bp):
ATCTTTTACTTATTAATTGCCTTAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTCAAAATAAGAG
Found at i:20591 original size:425 final size:421
Alignment explanation
Indices: 19814--20635 Score: 897
Period size: 425 Copynumber: 1.9 Consensus size: 421
19804 TAATTTTTGG
* * **
19814 AATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGCTAAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGCAAAAAAAATCATTTTAT
* * * * * * *
19879 TACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTAGTTGAAC
66 AACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAACTAGTTAAAC
* * *
19944 TTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTA
131 TTGTTCAAAAACAAATTCATTTTTTAAATATTCTAATTATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTA
* * *
20009 ATATTTTGTTAATCGAAATAAACATGTATGATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTC
196 ATATTTTGTTAATCGAAATAAACATATATGATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTC
* * * *
20074 ATACCAATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTTATAAAGATTTGATATTGTTCAATAAATAGA
261 ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGATATAGTTCAATAAATAGA
* * *
20139 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCTT-AATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTC
326 TTTATGTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTG--TTAAATATTAATAAATTGGTATAATTTTAATC
20203 AAAATAAGAGATCTTTTACTTATTAATTGTCTT
389 AAAATAAGAGATCTTTTACTTATTAATTGTCTT
* *
20236 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGATGAAT-AG-AAAAAAAATCATT
1 AATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-AT--ATGAGCAAAAAAAATCATT
* * * * * *
20298 TTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTT
62 TTATAACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAACTAGTT
** * * * **
20363 AAACTTGTTCGTTAAACAAATTCATTTTTTAAAT-CTCTTAATTATTAATTTTCAGAATATTGAT
127 AAACTTGTTC-AAAAACAAATTCATTTTTTAAATATTC-TAATTATTAATTGTCAAAATATAAAT
* * * * * ** *
20427 AACTTAATATTATT-TTATTTTG-AATAAGCTTATATGA-ACCGAAATGATTTTTTTATAACAAA
190 AAATTAATATT-TTGTTA-ATCGAAATAAACATATATGATA--GAAACAATTATTTTATAACAAA
* * * * ** *
20489 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTC
251 ACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGATATAGTTC
** * * * *
20554 GGTAAGA-ATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTTATTAATTGTTGAAATATTATTAAATTGGTAT
316 AATAA-ATAGATTTATGTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-AAATATTAATAAATTGGTAT
* *
20618 TATTTTAATCCAAATAAG
379 AATTTTAATCAAAATAAG
20636 CTTGTATGAA
Statistics
Matches: 325, Mismatches: 62, Indels: 23
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
421 3 0.01
422 34 0.10
423 78 0.24
424 67 0.21
425 142 0.44
426 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (421 bp):
AATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGCAAAAAAAATCATTTTAT
AACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAACTAGTTAAAC
TTGTTCAAAAACAAATTCATTTTTTAAATATTCTAATTATTAATTGTCAAAATATAAATAAATTA
ATATTTTGTTAATCGAAATAAACATATATGATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTC
ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGATATAGTTCAATAAATAGA
TTTATGTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTAAATATTAATAAATTGGTATAATTTTAATCAA
AATAAGAGATCTTTTACTTATTAATTGTCTT
Found at i:23081 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 21793--26861 Score: 2999
Period size: 180 Copynumber: 28.3 Consensus size: 176
21783 GTATGATCAA
* * * * * * *
21793 AAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTAAACTAGTTCAA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTC--
* * ** * *
21858 AAAAACA-ACTTTA-GTTTTAAATCTTTTGTTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATT
63 ATAAACAGA-TTTATTTTTTAAA--TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* *
21921 ATTTTATTTTGAATAAGGTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
125 ATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
21974 AAAATGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTT
1 AAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-T-ATT
* * * * * * * * *
22037 GATAAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATCAATTTTTCAAATGTTAATAAATTA-CA
62 CATAAACAGA-TT-TATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * *
22101 GTTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATAACTAAAC
123 -TTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
22157 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTAATTCT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTC-
* * * ** ** *
22221 ACAAACACATTTATTTTTCAAA-GCT-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATT
63 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
22284 TTAATCTGAGTAAGCTTGTATGAAAAG-AACAATTCTTTTATGACAAAAT
128 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
22333 AAACA--TCATAACGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTATTTTG
1 AAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA--TTC
* * * * * *
22396 GTAAATAGATTTAGTATTTAAA-TCT-CTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATT
63 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * *
22458 TTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAGCAATTATTTTTTGACAAAAC
128 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** *
22508 AAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAATTATTCATGTAGAT-ATGACTATTTGAACTTTATT
1 AAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC--TATT
* * * *
22571 CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
62 C-ATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
22636 TATTTTATTTTGAATAAACTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAAC
124 TATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * *
22690 AAAAGATTATACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTTG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAAC-T-ATTC
* ** * *
22753 ATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA
63 ATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* *
22817 -CTTATTTTGAATACA-CTTGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAAC
126 TTTTA-TTTGAATA-AGCTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAAC
* * *
22868 AAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACGTATTCAT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAT
* * **
22933 AAAACATATTTTATTTTTTAAAATTTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTA
65 -AAACAGA-TTTATTTTTT-AAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * *
22997 TTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAAAAC
126 TTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * * * * * **
23049 AAAATATCATAATGATTTGAAATAGA-AATTATTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTGTTTGG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T-ATTCA
* * * * *
23113 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
64 TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * ** *
23178 TTTATTTTGAATTAGCCTATATGAACTA-ATATATTTGTTTTATGATGAAAT
127 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * *** *
23229 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATCAAAACTTGTTCAA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTC-A
* * * * *
23294 TAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
64 TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
23359 TTTAATTCATATAAGCTTTTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAAAC
127 TTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
23409 AAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CACT-ACTATTTGAATTTATTC
1 -AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAA-CTATTC
* * * * * * **
23472 AGTAATCATAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAA---CT-GAATATTAATAAATTTCTATT
63 A-TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
23533 ATTTTAATTGAAATAAGGTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAAC
125 ATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * ** * * * * * * * *
23586 AAAAGATTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAATCGTAATTGTTTTAACTTGTTC--
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAT
* * * *
23649 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTTTCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATG
65 AAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
23714 CTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAAT
128 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * **
23764 AGAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGAT-ATAACTATTTGCA-TCGGTCA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT-ATTCA
* * * * *
23827 -AGCCAACAGATTCATTTTCTAAATCCGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCAT
64 TA---AACAGATTTATTTTTTAAAT--TTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
** ** * * *
23891 TATTTTATTCCAAATAAAATTGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAAC
124 TATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * ** * **
23944 AAATGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTAATCAAATTGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA--TTCA
* * * * * * * *
24009 TAAACAAATTTATATTTTAAAATCT-CTTAATAATTTTCAAAATATTAATAAGTTAATATTATTT
64 TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * * * *
24073 TATTCCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGATAAAAC
129 TATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
24122 -AAATGTCATAACGATTTGAAAATAGGTAATTATTC---TCA--CTTTACTATTTGAACTGGTTT
1 AAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACT--ATT
*** * * * * *
24181 GGCAAACA-ATTTTTTTTTTAAATCTTTAGTTATT--TATTTAATAAT-TTATCTAGA-TAGTAT
62 CATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTACTTATTAATTTTTAA-AATATTA-ATAAATTAGTAT
* * * * *
24241 TATTTTATTTTGAAATAAG-TTATATGAAC-TAAA-TATTGTTATAAT-A-ACAAC
124 TATTTTA-TTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAAC
* * * * * *
24292 GAAAGGTTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATACGTTATAACTATTTGAACTAGTTC
1 AAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTA-TTC
* * * ** * *
24357 TGCTTAACA-ATTTATTTTTT-AATCTCCTACTCCTTAATCTTTTTGAAATATT-ATAAATTAAT
63 --ATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAA--TTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
24419 ATTA-TTCATTCGAATAGGCTTATATGAATGAAAAAACAATTGTTTT-TGACAAAAT
122 ATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAA--CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** * * * * *
24474 AAAAGTTCATAAACAGTTTGAAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTTGAACTGATTC
1 AAAAGGTCATAATGA-TTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTC
** * ** * * *
24539 GATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAATT-TCTCAA-TTTTAAAATATTAATAAAGTAATAT
63 -ATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTACTTAT-T-AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * ** * * * * *
24602 TATTTTATTTTGGATAAGCTTCTATGAATTGACACAAATGTTTTATTATAAAGC
124 TATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
24656 AAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTATTCA-
* * * * * *
24721 TAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTGCTTATTAATTTTT-GAATGTTATTAACA-TAATATTA
64 TAAACAGATTTATTTTTT-AAA-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA-ATTAGTATTA
* * * *
24784 TTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAAC
126 TTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
24836 AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCTA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTC-A
* * * * * * ** ** *
24901 CAAACACATTTACTTTTTTAAATCTATTGCTTACTAA-TTTTAGAATATTATTAGTTTACCAATA
64 TAAACAGATTTA-TTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
24965 TTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
126 TTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
25017 -AATGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TAATTTAAACTAGTTTG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTA--TTC
* * * * * *
25080 GTTAACAGATTTAGTTTTTAAA-TCT-CTTGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
63 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * *
25143 TTATTCTGAATAATATTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTACGACCAAAC
128 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * *
25193 -AAAGTGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGAT-GTGACTATTTGAACTTATT
1 AAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TA-T
** * * ** * **
25255 TGGTAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TTTTATTATATTAATAAATTAGTAT
61 TCATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
25319 TCTTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAC
124 TATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC
* * * * * * *
25374 AAAAGTTTATAATGATTTCAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACT-TGTCTT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TC--
* * * * * * *
25438 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAATAACTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTA
63 ATAAACAGATTTATTTTTT-AA-ATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
*
25503 TTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAAC
126 TTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * *
25555 AAAAGGTCATAACGA-TTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTCA-
* * *
25619 AAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTAACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTA-TATTAT
64 TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * ** * * * * *
25683 TTTACTCGAAATAAGCTTACACGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAAA
127 TTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
25734 AAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TA-TTCA
** * * * *
25799 TAAACAGATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAGTATTAT
64 TAAACAGATTTATTTTTTAA-ATT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** ** * * *
25864 TTTACTTCAAATAAGCTCATATGAACTA-AAACAATTATTTTATTAC-AAAG
127 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * *
25914 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTC-A
* * * **
25979 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTAT
64 TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
26044 TTTAATCTGAATAAGTTTGAATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAAT
127 TTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
26095 AAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAA-TGATTTGAACTTATTCG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TATTC-
* * * *
26159 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATTAATTATCTT--AATATTAATAACTTTA-TA
63 ATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTT-ACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAA-ATTAGTA
* * * * **
26221 TTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAA-AATTGTTTTATGGCAAGTC
123 TTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * ** * * * * *
26275 AAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTG
1 AAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T-ATTC
* * ** *
26339 ATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
63 ATAAACAGATTTA-TTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
26404 AATTTGTTCTGAATAAGCTTATATGAACTA-TAACAATTGTTTTATGACTAAAC
125 ATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
26457 AAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTT-AAGCTGATTTG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-A-TTC
* * * * * * *
26521 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCT-CTTATTTATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATT
63 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
*** ** * * * * *
26584 TTAATCCAAATAAGCTTGTACAAACA-AAATAATTATTTTACGAGAAACC
128 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * ** * *
26633 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T-ATT--
** * ** * * * * *
26698 C-T-ATTAGA-TTA--TTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATCATTAAATTATTATT
62 CATAAACAGATTTATTTTTTAA-ATT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * *
26758 A-TTTATTTCAAATAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAAT
125 ATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC
* * * * *
26811 AAAAGGTTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATAGTTAAAACTAT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
26862 AAATAGATTT
Statistics
Matches: 3826, Mismatches: 823, Indels: 481
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
170 4 0.00
171 22 0.01
172 18 0.00
173 52 0.01
174 106 0.03
175 113 0.03
176 311 0.08
177 371 0.10
178 258 0.07
179 214 0.06
180 947 0.25
181 896 0.23
182 333 0.09
183 179 0.05
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTCATA
AACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
Found at i:23348 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 21793--26861 Score: 3531
Period size: 361 Copynumber: 14.1 Consensus size: 360
21783 GTATGATCAA
* * * * * * *
21793 AAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATA-TTCATAACTATTTAAACTAGTTCA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTT-ATAACTATTTGAACTTGTTC-
*** * ** * *
21857 AAAAAACA-ACTTTAGTTTT-AAATCTTTTGTTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTAT
64 GGTAAACAGA-TTTATTTTTAAAATC-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * *
21920 TATTTTATTTTGAATAAGGTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAT
127 TATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * *
21984 AACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAA
190 AACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGA
* * * * * *
22047 TTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATCAATTTTTCAAATGTTAATAAATTA-CAGTTATTTTAT
253 -TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTAT
* * *
22111 TTTGAATAAGTTTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATAACT-AAAC
315 TTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAAC
* * * **
22157 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCT-TAACTATTTAAACTAATTC
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTC
*** * * * * *
22220 TACAAACACATTTATTTTTCAAAGC--T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTA
64 GGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
22282 TTTTAATCTGAGTAAGCTTGTATGAAAAG-AACAATTCTTTTATGACAAAATAAACA--TCATAA
129 TTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAA
* * * *
22344 CGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTAT-TTTGGTAAATAGATTT
192 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTT
* * *
22408 AGTATTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
256 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
** * * * * *
22468 TAATTTTGCATGAATAGAAGCAATTATTTTTTGACAAAAC
321 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* ** * * *
22508 AAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAATTATTCATGTAGATATGACTATTTGAACTTTATTC
1 AAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TTGTTC
* * * **
22572 GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT
64 GGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
22637 ATTTTATTTTGAATAAACTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATTAT-A
128 ATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
22701 CTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTTGATAAATAGATTT
192 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
* * * * *
22765 A-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-CTTATTTTGAA
256 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
*
22828 TACA-CTTGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAAC
321 TA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGATAAAAC
* * * * * * *
22868 AAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACGTATTC-A
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
* * *
22932 TAAAACATATTTTATTTTTTAAAAT-TTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TAT
66 T-AAACAGA-TTTA-TTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTAT
* * * * **
22995 TATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAATATCATA
127 TATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
23060 ATGATTTGAAATAGA-AATTATTTATATAGCCATAACAATTGGAACTTGTTTGGTAAATAAATTT
191 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
* *
23124 ATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
256 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * * * * * *
23189 TTAGCCTATATGAACTA-ATATATTTGTTTTATGATGAAAT
321 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
** * *** **
23229 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATCAAAACTTGTTCAA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
* * ** *
23294 TAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
66 TAAACAGATTTATTTTTAAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
23359 TTTAATTCATATAAGCTTTTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAAC
130 TTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAAC
* * * * **
23423 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CACT-ACTATTTGAATTTATTCAGTAATCATAG--T
193 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAA--ATAGATT
* * * ** *
23484 TATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAA---CTG-AATATTAATAAATTTCTATTATTTTA-ATTGA
255 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-
* * * * *
23544 AATAAGGTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAAC
319 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * ** * * * ** * * *
23586 AAAAGATTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAATCGTAATTGTTTTAACTTGTTC--
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
*
23649 -AAACAGATTTAGTTTTT-AAATCTTTCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA
66 TAAACAGATTTA-TTTTTAAAATCTTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * *
23712 TGCTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAAC
129 TTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * *** ** * *
23777 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGAT-ATAACTATTTGCA-TCGGTCAAGCCAACAGATTC
193 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTT
* * ***
23840 ATTTTCTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCA
256 ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
** * * *
23903 AATAAAATTGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGA-CAAAC
319 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * * * * * *
23944 AAATGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTAATCAAATTGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
* * ** * *
24009 TAAACAAATTTATATTTTAAAATC--T-CTTAATAATTTTCAAAATATTAATAAGTTAATATTAT
66 TAAACAGATTTAT-TTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * * *
24071 TTTATTCCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGATAAAAC-AAATGTCATAACG
130 TTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * *
24135 ATTTGAAAATAGGTAATTATTC---TCA--CTTTACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACA-ATTTT
194 ATTTG-AAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA
* * * * *
24194 TTTTTTAAATCT-TTAGTTATT--TATTTAATAAT-TTATCTAGA-TAGTATTATTTTATTTTGA
257 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-
* * *
24254 AATAAG-TTATATGAACT--AAA-TATTG--TTATAATAACAAC
319 AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAA-AAC
* * * * * *
24292 GAAAGGTTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATACGTTATAACTATTTGAACTAGTTC
1 AAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-GTTATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * ** *
24357 TGCTTAACA-ATTTATTTTT-TAATCTCCTACTCCTTAATCTTTTTGAAATATT-ATAAATTAAT
64 -GGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCT-TTACTTATTAA--TTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
24419 ATTA-TTCATTCGAATAGGCTTATATGAATGAAAAAACAATTGTTTT-TGACAAAATAAAAGTTC
125 ATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAA--CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
24482 ATAAAC-AGTTTGAAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCACAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAA
188 AT-AACGA-TTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA
* * ** * * * * * *
24545 TTGATTTATTTTTTCAATCTCCAATTTCTCAA-TTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTA
249 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
24609 TTTTGGATAAGCTTCTATGAATTGACACAAATGTTTTATTATAAAGC
314 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * *
24656 AAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
* * * * * *
24721 TAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTGCTTATTAATTTTTG-AATGTTATTAACA-TAATATTA
66 TAAACAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTA
* * * * *
24784 TTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAA
129 TTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * ** * *
24848 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCT-ACAAACACATTT
192 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAATAGATTT
* * * * * ** ** * *
24912 ACTTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTACCAATATTTTACTTTGA
256 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * *
24976 ATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
320 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * * * *
25017 -AATGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TAATTTAAACTAGTTTG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACTTGTTCG
* *
25080 GTTAACAGATTTAGTTTTT-AAATC--T-CTTGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
65 GTAAACAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * *
25141 TTTTATTCTGAATAATATTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTACGACCAAAC-AAAGTGTCATAA
129 TTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAA
* * * * * *
25205 TGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGAT-GTGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATT
192 CGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATT
* * ** * * * *
25268 AATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TTTT-ATTATATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTTCG
255 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * *
25331 AATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAC
319 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAAC
* * * * * * *
25374 AAAAGTTTATAATGATTTCAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTG-TCTT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTC-G
* * * * *
25438 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATAT-TTTACTTAATAACTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATT
65 GTAAACAGATTTA-TTTTTAAA-ATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
*
25502 ATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
128 ATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** ** *
25566 ACGA-TTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAAATTTTTAAACAAGTTAAGAAAATAGATTT
191 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
* * * *
25630 ATTTTTTAAAT-T-TTAACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-CTCG
256 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG
** * * * * *
25691 AAATAAGCTTACACGAACAGAACCAATTGTTTTAAGATAAAAA
319 -AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * * * * * *
25734 AAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
** * * * * * *
25799 TAAACAGATTCCTTTTTCAATTTTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAGTATTAT
66 TAAACAGATTTATTTTTAAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** ** * * * *
25864 TTTACTTCAAATAAGCTCATATGAACTA-AAACAATTATTTTATTAC-AAAGAAAAGGTCATAAT
130 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
25927 GATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTAT
193 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTAT
* * ** ** * *
25992 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGAATA
258 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * *
26057 AGTTTGAATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAAT
323 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * *
26095 AAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAA-TGATTTGAACTTATTCG
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACTTGTTCG
* * * *
26159 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTGACTAATTAATTATCTT--AATATTAATAACTTTA-TA
65 GTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTT-ACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAA-ATTAGTA
* * * * ** **
26221 TTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATTAACTGAAA-AATTGTTTTATGGCAAGTCAAAAGGTTTT
126 TTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * ** * * * *
26285 AAAGCTTCT-AAATAGGCAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGAT
190 AACGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT
* * * * *
26349 TTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTGTTC
254 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *
26413 TGAATAAGCTTATATGAACTA-TAACAATTGTTTTATGACT-AAAC
317 TGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAAC
* * * *
26457 AAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACCATTT-AAGC-TGATT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAA-CTTG-TT
* * * * * *
26519 TGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC--T-CTTATTTATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATT
63 CGGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
*** ** * * * * *
26581 ATTTTAATCCAAATAAGCTTGTACAAACA-AAATAATTATTTTACGAGAAACCAAAAGGTCATAA
128 ATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** * *
26645 TGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT-ATTAGA-TT
192 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGG-TAAATAGATTT
* * ** * ** * * * **
26708 A--TTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATCATTAAATTATTATTA-TTTATTTCAAA
256 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
** * * * * * * *
26770 TAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAAT
321 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAAC
* * * *
26811 AAAAGGTTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATAGTTAAAACTAT
1 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTAT
26862 AAATAGATTT
Statistics
Matches: 3699, Mismatches: 799, Indels: 424
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
346 5 0.00
347 1 0.00
348 15 0.00
349 33 0.01
350 57 0.02
351 142 0.04
352 58 0.02
353 89 0.02
354 239 0.06
355 68 0.02
356 170 0.05
357 319 0.09
358 392 0.11
359 270 0.07
360 596 0.16
361 760 0.21
362 318 0.09
363 90 0.02
364 67 0.02
365 9 0.00
366 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (360 bp):
AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGG
TAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTT
TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
Found at i:27912 original size:354 final size:348
Alignment explanation
Indices: 27020--28105 Score: 814
Period size: 353 Copynumber: 3.1 Consensus size: 348
27010 ATTTTGAACA
* * * *
27020 ATTAATAAATTAGTTTTATTCTATT-TCGAATAAGCTT-ATATAA-GCTGAAATAATTGCTTTAT
1 ATTAATAAATTAG-TTTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGA-ATAATG-AGAAATAATT-TTTTAT
* * * * * *
27082 GAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTACATATAGTCTTAACTGTTTGAAC
61 G-ATAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTTTGAAC
* * * * * *
27147 TAGTTTGAAAAATAGATTT-TTTTCTAAAATCTCTTAGTTGTTAATTTTTAGAATACTACTAAAT
125 TAGTTTGATAAATAGATTTATTTT-TTAAATCTCTTA----TTAATTTTGA-AATATTAATAAAG
* * * * *
27211 TAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCCTGTAGGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAG
184 TAATAATATTTTATTTCGAAAAAGCCTATAGGAATAGAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAG
* * ** * *
27276 GTTATAACAATTTGAAATGATAATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATA
249 GTCATAACAATTTGAAATAATAATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTAATTGGGTAAACA
27341 GATTTACTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAAT
314 GATTTACTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAAT
* * ** * * *
27376 ATTAATAAATTAGTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTGAATGTTGAAAAACAATTTTTTAAGATAA
1 ATTAATAAATTAGTTTATTTTATTCTAAATAAGCTTGAATAATGAGAAATAATTTTTTATGAT-A
* * * * *
27441 AACAAAAGGTAATAACGA-TTCAAATAGGTAGTTGTTCAAAT-GCCCAT-ACTTGTTTGAACTA-
65 AACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAAC-TGTTTGAACTAG
*
27502 TTTCGATAAACT-GATTTATTTTTTAAATCCCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATAA
128 TTT-GATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAAGTAATAA
* * * * * * * *
27566 TATTTT-TTTGGGATAAGCTTATATGAGCTA-AAGTAATTATTTTATAATA-AGCAAAAGGTCAT
190 TATTTTATTTCGAAAAAGCCTATAGGA-ATAGAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTCAT
* * ** * *
27628 AACAATTTGAAATAAATAATTGTTTATA-TAGTCTTAACTGTTTGAACTAATTGGGTAAACATAT
254 AACAATTTGAAAT-AATAATTATTCA-AGTAGTCAAAACTATTTGAACTAATTGGGTAAACAGAT
* *
27692 TTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTATG-AAT
317 TTACTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCT-TGAAAT
* *
27728 ATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-TCTGTATAAAT-AGAAATAATTATTTTATG
1 ATTAATAAATTAGT-TTATTTTATTCTAAATAAGCT-TGAAT-AATGAGAAATAATT-TTTTATG
* * * *
27791 ATAAACAATAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTA
62 ATAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACTA
* * * **
27856 GTTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTACTGAAATATTAATAAATTAGTTT
127 GTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAAGTAATAA
* *** * * * * *
27920 TATTTTATTTCAAATAAAATTGTATATTGAA-A-AAA-AATTATTTTA-AGACAAAATAAAAAG-
190 TATTTTATTTC-GA-AAAAGCCTATA-GGAATAGAAATAATTATTTTATA-ATAGAACAAAAGGT
* * ** * * * * * * * **
27980 CAATAACGATTTGAAATAGGTAGCTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATT
251 C-ATAACAATTTGAAATA-ATAATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTAATTGGGTAAACA
* *
28045 GATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAACTT-TTGAAAT
314 GATTTA-CTTTTAAATCTCTTATTAA-TTCTTGAAAT
*
28081 ATTAATAAAATAGTGTTATTTTATT
1 ATTAATAAATTAGT-TTATTTTATT
28106 TTGGATAAGC
Statistics
Matches: 581, Mismatches: 108, Indels: 85
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
347 24 0.04
348 77 0.13
349 27 0.05
350 7 0.01
351 1 0.00
352 36 0.06
353 135 0.23
354 125 0.22
355 55 0.09
356 76 0.13
357 15 0.03
358 3 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (348 bp):
ATTAATAAATTAGTTTATTTTATTCTAAATAAGCTTGAATAATGAGAAATAATTTTTTATGATAA
ACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACTAGTTT
GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATAATATTTT
ATTTCGAAAAAGCCTATAGGAATAGAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTCATAACAATT
TGAAATAATAATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTAATTGGGTAAACAGATTTACTTTTA
AATCTCTTATTAATTCTTGAAAT
Found at i:28152 original size:177 final size:175
Alignment explanation
Indices: 26928--28149 Score: 858
Period size: 177 Copynumber: 6.9 Consensus size: 175
26918 AGTAATAATG
* * * ** ** *
26928 ATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TCATTTGAACTAGTTCAGTAAATAAAATTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT-ATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTAT
* ** * * *
26992 TTTCTAAATCT-TTACAAAATTTTGAACA-ATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGC
65 TTTTTAAATCTCTTA-TTAATTTTGAA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * **
27055 TTATAT-AAGCTGAAATAATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGTC-ATAACA
128 TTGTATGAA-CTAAAACAATTATTTTATG-AAAAACAAAAGG-CAATAACA
* * * * * * * ** *
27104 ATTTGAAATAAATAATTGTACATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTTGAAAAATAGATTT-TT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTATT
* * * * * *
27168 TTCTAAAATCTCTTAGTTGTTAATTTTTAGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAA
66 TT-TTAAATCTCTTA----TTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * **
27233 AGCCTGTAGGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACA
125 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGGCAATAACA
* * * * *
27285 ATTTGAAAT-GATAATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTTA-
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAT-TTTGGTAAATTGATTTAT
*
27347 CTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGT-TTATTTTATTTTGAATAAGCT
65 TTTTTAAATCTCTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* **** * * *
27411 TGAATGTTGAAAAACAATT-TTTTAAGATAAAACAAAAGGTAATAACG
129 TGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGGCAATAACA
* * * * * * *
27458 A-TTCAAATAGGTAGTTGTTCAAAT-GCCCAT-ACTTGTTTGAACTATTTCGATAAACTGATTTA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CCATAAC-TATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTA
* * * * * *
27520 TTTTTTAAATCCCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATAATATTTT-TTTGGGATAAGC
64 TTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * ** *
27584 TTATATGAGCTAAAGTAATTATTTTAT-AATAAGCAAAAGGTC-ATAACA
128 TTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAA-AAACAAAAGG-CAATAACA
* * * * * * * * *
27632 ATTTGAAATAAATAATTGTTTATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAATTGGGTAAACAT-ATTTA-
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAA-TTGATTTAT
* * *
27695 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-ATGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
65 TTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTGA--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * **
27759 AAG-TCTGTAT-AAATAGAAATAATTATTTTATGATAAACAATAGGTTATAACA
124 AAGCT-TGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGGCAATAACA
* * * * *
27811 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTATT
* * ** **
27876 TTTTAAATCTCTTATTAATTACTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAAATT
66 TTTTAAATCTCTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * *
27941 GTATATTGAA--AAAA-AATTATTTTAAGACAAAATAAAAAGCAATAACG
130 G--TA-TGAACTAAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGGCAATAACA
* ** *
27988 ATTTGAAATAGGTAGCTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTATT
* * * *
28053 TTTTAAATCTTTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTATTTTGGATAAGCTT
66 TTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* **
28118 TTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAA
130 GTATGAACTAAAACAATTATTTTATGA-AAAA
28150 TAANNNNNNN
Statistics
Matches: 825, Mismatches: 166, Indels: 109
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
172 9 0.01
173 61 0.07
174 116 0.14
175 83 0.10
176 124 0.15
177 150 0.18
178 41 0.05
179 102 0.12
180 63 0.08
181 74 0.09
182 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (175 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTATT
TTTTAAATCTCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
TATGAACTAAAACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGGCAATAACA
Found at i:29512 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 29158--30859 Score: 1304
Period size: 181 Copynumber: 9.5 Consensus size: 180
29148 NNNNNTTTTA
* * * * * *
29158 TTCAAATTAGTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAGTCATAC-AGTCTTA-TT
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA-AAATCAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTT
* * * * * *
29221 CAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAATGA-ATTT-CAAAATGA
64 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAA
** * * * * *
29284 AT-T-TGTTAGTTTGCTC-AGTGCAAATATTTATGATTGTTTGAACAATTATCTAT
128 ATCTAT-TTA--TTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTAT
* * * *
29337 TTCAAATCATTATAATCTTTTGTGTTATCACAAATCAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTG
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA-AAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * ** ** *
29402 AAATAACATAATTCTAGCTTATTAATATTCCAAAAATTAGCAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* *
29467 CTATTTGTTGAACAAGTTAAAATAGTTATGACTATTT-ATCAATTATCTAT
130 CTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTAT
** * * * * *
29517 TTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTGCTATTCATACAATCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA-AAATCAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTATTT
* * * * * * *
29581 CAAATAAAATAACACAAATTTATTAATATT-TAAACAATTAAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATA
64 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA-AATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * *
29645 AATCTATTTATCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAT-AATTATTTAT
127 AATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAATTATCTAT
* * * *
29699 TT-AAATCATTACGA-CTTTT-TTTTAT-AAAA--AATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-A
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCAAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
* * ** * *
29757 GATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCCTCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAA
66 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *** * * ** *
29821 TATGTTTACCCAAAAAGTCCAAATAGCCATAACTATTTGAAT-AATTATCTAT
129 TCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAATTATCTAT
** * * * * * *
29873 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTGATTTTAAAAT-AATTGTATC-AGTTCATATAGGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTT--TATCAAAATCAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT
** * * * * *
29936 CAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCTAAAATCAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGA
63 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * *
30001 AT-TAGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTCTTACTATTTGAACAATTATCTAT
128 ATCTA-TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTAT
** * * * * * * * **
30054 TTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATACGGTTATTCC
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA-AAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* *
30119 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAA
65 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
30182 TCTATCTT-CTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATAT
129 TCTAT-TTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTAT
* * *
30234 TTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
1 TTCAAATCA-TTATGATCTTTTGTTTTATCA-AAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* ** *
30298 GAAACAAAATAATACTAATTTATTTGTATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA-AAA
64 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
30361 TCTGTTTATT-AAGCAAACTT-AAATAGTTATGA-TCGTTTGAAT-AATTATTTAT
129 TCTATTTATTGAA-C-AAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG-ATCAATTATCTAT
* * **
30413 TTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCTATTCATACAATTTTATT
1 TTCAAATCA-TTATGATCTTTTGTTTTATC--AAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * **
30476 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTTGGAGATTTAAAAAATAA
63 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * **
30541 ATTTATTTATCAAACATGTTCAAATAGTTATGTCCCTTTGAAT-AATTATCTAT
128 ATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAATTATCTAT
** * **
30594 TTCAAATCATTATGAGATTTT-TTTGTCAT-AAAA-CAATTGTTTCTCTTCATACAAAATTATTT
1 TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTT-T-ATCAAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* ** *
30656 -ATAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAAT---T-AGAGATTTAAAAACTAA
64 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *
30716 ATCTGTTTGTTGAATCAA-TTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTAT
128 ATCTATTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTAT
* ** * * *
30769 CTCAAATTGTTATGATCTTTATGTTGTCAT-AAAAT-AATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGATCTTT-TGTT-TTATCAAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-
* * * *
30832 CG-ATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
63 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
30860 AAAAATAAAT
Statistics
Matches: 1245, Mismatches: 216, Indels: 127
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 68 0.05
175 120 0.10
176 67 0.05
177 9 0.01
178 8 0.01
179 266 0.21
180 336 0.27
181 349 0.28
182 19 0.02
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCAAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
TATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTAT
Found at i:30896 original size:153 final size:153
Alignment explanation
Indices: 30734--31012 Score: 361
Period size: 153 Copynumber: 1.8 Consensus size: 153
30724 GTTGAATCAA
* ** *
30734 TTCAAATAGTTATGACTACTT-GAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTTATG-TT-GT
1 TTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTAGT
* * * * *
30796 CATAAAATAATTGTTTC-TTTTCATATAAGCTTATTCCG-ATTAAGATAATACTAATTTAATAAT
64 CATAAAA-AATTATTTCAATTT-ATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
30859 AAAAAATAAATGTGTTTTGCCGATCTAG
126 AAAAAATAAATGTGTTTTGCCGATCTAG
* *
30887 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* *
30952 TAAAAAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 TAAAAAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
31013 TTCAAAAAAT
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 13, Indels: 10
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
152 5 0.05
153 91 0.84
154 12 0.11
ACGTcount: A:0.38, C:0.11, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (153 bp):
TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCA
TAAAAAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAAAAA
ATAAATGTGTTTTGCCGATCTAG
Found at i:31271 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 30885--37581 Score: 2606
Period size: 181 Copynumber: 37.3 Consensus size: 180
30875 TTGCCGATCT
* * *
30885 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
*
30950 CATAAAAAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 CATAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ***
31014 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATTAATATGTTTATGTAACA
129 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
31066 AGTTTAAATAGATATAACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* ** * * *
31131 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAATTTATCCGA-AATAAAATAATACTACTTCATTAAT
65 CATAAAA-AATTATTTCAATTCA-TACAAGCTTAT-TGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
31194 ATTTC-AAAAATTATTAAGCAAGAGATTT-AAAAACTAAAGCTAT-TTT-CCAAACC
127 A-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAA--TATGTTTACCAAACA
* * * ** ** *
31247 AGTTCAAATAGTTATGATCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGCTATGGTC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * * * *
31311 CATAAAAAAACTATTTC-TTATCATATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACAAATTTAATAATA
65 CAT-AAAAAATTATTTCAAT-TCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
31375 TTTC-AAAAATTAATCAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATC-
128 -TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACA
* * * * * * * * * **
31427 ATTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCCTTTATTTACA
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * *
31492 CATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
65 CATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
31557 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-GAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
129 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * ** ** **
31608 AGCTT-AAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATTATTA-GTTCTAATAATTAT
1 AG-TTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-
* * * ** * * * * **
31671 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAATGTTATAACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAT-ATGTT
63 GTC-A--T-AA-AA-AAT-TATTTC-AATTCATACAAGCTTATTG---AG-AATAAAATAATACT
** * * * * * *
31734 TTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATAA-AAATCTATTAATATTACAAAAATTCATA
116 AAT-TT-AT-TAA---TATTCA-AA-AAATTAATAAGCAA--GA--GAT-TTA-AAAAA---ATA
* * *
31798 AGAGAT-TTTA-AAAATAA
164 A-ATATGTTTACCAAA-CA
* * *
31815 ATCTTTTTATCAAACTAGTTCAGATAGTTATAACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTCAAATCGTT
1 A-----GT-TCAAA-TAGTT---AT-G-----AC-ATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * *
31879 TTGACTTTTTGTTCCACT-ATAAAAAAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATA
48 ATGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAAAATTA-TTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATA
* *** * ** * * *
31943 ATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTAA-AAATTTTAAAACATAAATATGTTTACC
111 ATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACC
*
32007 AAACT
176 AAACA
* * * * * *
32012 AGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * * * *
32076 CATAAGAAAATTATTTTAGTTCATATAAGGTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAAGTTGTTAATA
65 CATAA-AAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATT-GAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * ***
32140 TTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAATAAA-ACTATTTATTGAACA
128 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATA-TGTTTACCAAACA
* * * ** *** * *
32192 AGTTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * * * * *
32257 CATAAAAAGATT-TCATCTATTTATACAAGCCTATTTCA-AATAAAATAATTCAAATTTATTACT
65 CATAAAAA-ATTAT-TTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
32320 A-ACAGATAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTCACCACAA-A
127 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCA-AACA
* * * * * *
32372 AGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC----A---A---CAAATTATTATAACTTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
*** * *
32427 CATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 CATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * * * *
32491 TTTTGACAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAACATAAATATGTTTACCGAACA
128 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
32543 ATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * ** * * * * *
32608 AATAAAAAAATTGTTTCGGTTAACATAAGTTTATTTGA-AGTAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 CAT-AAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * * * * *
32672 TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTGTTTGCTAAACA
128 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * *** * ** *
32725 AGTTCAAAGAGTTATGATTATCAAAACAATTATCTCCTTAAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAG
* * ** * *
32789 TCAGAAAAATATTGGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTAATTA
64 TCATAAAAA-ATT-ATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * **
32851 ATATTC-CAAAGTT-ATAAGCAA-A-ATTT-GAAAAATGAATTTTTTTATTAAACA
125 ATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
32902 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTA-
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAG
* * * *
32966 TCATAAACCAATTATTTCTATTCATGCAAGCTTATTTG-GAA-AAAATAATACTAATTTATTAAA
64 TCATAAA-AAATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
33029 ATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAAT-TTTTTACCAAGCG
127 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * *
33081 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA-
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAG
* * * *
33145 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAG-TATATTTG-GAATAAAATAATATTAATTTATTAA
64 TCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCT-TA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
33208 TATTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTT-AAAGAATAAATTTGTTTGCCGAACA
126 TATTCAAAAAATTAATAAG-CAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
33262 AGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTATCATCTATTTCGAAT-TTTATGACATTTTGTTTTA-
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAG
* * * ** * * ** * * *
33325 ACATAAAATAA-TA--CCAATT-ATTCAAAATAATTG-GTAT-TCATACAAAATTATTTAGAATA
64 TCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATA-ATACTAATTT---AT-
* * * ** * * *
33384 AAATAATACAAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAGGATTT-AAAAAATAAATGTGTTTACT
123 TAAT-ATTCAAA---A--A--A-TT-AATAAGCAA-GA-GATTTAAAAAAATAAATATGTTTACC
* *
33448 GAACT
176 AAACA
* * * ** * *
33453 AGTTCAAATAATTAAGCCTATGAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACCTTTTATTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * * * *
33517 CATAAAATAATTGTTTTAA-T-GTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
65 CATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
33580 T--TAAAATTAATAAGTAAGA-AATTAAAAAAATAAATCTGTTT---AAA-A
129 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * *
33625 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTATTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTT-TGTTTA
* * * ** * * *
33690 TTGT-A-AAAAAATTGTTTCAATACATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TCACTTATTAA
63 --GTCATAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * ** * *
33752 TATTTC-AAATTTTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAAATGAAT-TAGTTTA-TAGAATCA
126 TA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATAT-GTTTACCA-AA-CA
* * * * * * *
33807 A-TTCAAATAATTTTGGCCTTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGA-ATTTTGTTTTA-T
1 AGTTCAAATAGTTATGACATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGT
* * * *
33869 CATAAAATAATTATTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTCG-GTATAAAATAATACTCATTTACTAA
65 CATAAAA-AATTA--TTTCAATTCATACAAGCTTATT-GAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** * ** ** * * **
33931 TATT-TAGAAATTAATAATTAGGAGA-TGCAAAAAATTGATCTGTTTACTAAATT
126 TATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * ** * *
33984 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTATA-
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAG
*** * * * *
34048 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT-AAATAATACTAA-TTA-TAATA
64 TCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
34110 TTCTAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATGTATTTACCAAACC
128 TTCAAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * * *
34161 GGTTCAAATAGTTAAGACTATATCAACAATTCTTTATTTTAAATCATTAGGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
** ** * * *
34226 CATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAGTTTATTTG-GAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
65 CAT-AAA-AAATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*** * * * * *
34289 ATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTAAACC
127 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * *
34342 AGTTGAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTATTTACTTT-AAATCGTGATGA-CTATTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTA
* * * *
34405 GTCATAAAAGAATTGTTTCTATTCATAC-AGTCTTATTCG-GAATAAAGTAATGCTAATTTATTA
63 GTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAG-CTTATT-GAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * ** *
34468 ACATTCTAAAAATTAAAAAGTAATG-GATTT-AAAAAATGAATTTG-TTAGCCTGACG
125 ATATTCAAAAAATTAATAAGCAA-GAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAACA
* * ** *
34523 AGTGCAAATAGTTATGAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATG-AC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTA
* * * * * * *
34588 TTGC--AAAAAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATCT-AAAATAAGATAATTCTAATTTATTAA
63 GT-CATAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTAT-TGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * **
34650 TATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATGAAT-TTTTTACTGAACA
126 TATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
** * * **** * * *
34702 AGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATATCAAGTTGCCATAACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * *
34767 TATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATACAAATTT-TTAATA
65 CATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
34828 TTC-AAAAATTAATGAGTAA-A-AATT-AAAAAA-AAGT-T-TTT---GAACA
128 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * *
34871 CA-TTCAAATAGTT-TGACTATTTGATCAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTA
** * * *
34933 GTCA-AAAACCAATT-TGTTTTATTCATACAAGCCTATTTGA-AATAAAATAATGCTAGTTTATT
63 GTCATAAAA--AATTAT-TTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
34995 AATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAGCA
124 AATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* ** * * * * *
35051 ACTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAG
* * *
35115 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATT--GAATAAAAAAATACTAATTTATTAATA
64 TCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * **
35178 TT-TGAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
128 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
35229 AGTTCAAATACTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGATCTTTT-TTT-GT
1 AGTTCAAATAGTTATG-ACATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * ** * ** *
35292 CATAAAAAATTTGTTTCTATTTGTGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAA-TTATTAATAT
65 CATAAAAAA-TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*** * *
35356 TTTGAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAACTAAATATGTTTACGAAACA
129 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
35403 A-TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTATGA--TATTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTAG
* * * * * * * * *
35465 TCATAAAATAGTTTGTTTC-TTTTATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTAATAAT
64 TCATAAAA-A-ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
35529 ATTCCAAAAATTAAT----AA-AGATTT-AAAAAATAAATGTGTTTGTCGAAACCA
127 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTT-ACCAAA-CA
* * * ** *
35579 A-TTCAAATAGTTAAT-ACTATTAGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTT-TGACCTTTTGTTTCG
1 AGTTCAAATAGTT-ATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * *
35641 TCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAACAAAATAATAGC-AATTTATTAAC
64 TCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAAT
** * * *
35705 ATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TT----AAA-AAA-ATGTTTATCAAA-A
127 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
** * * * * *
35751 AGTTGTAATAGATT-TGACTATTTAAATAATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTAGTTTT
1 AGTTCAAATAG-TTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTA
* * * * * * ** * * * * *
35814 GTAATAAAACATTTGTTTCAGTTCA-AGAAACTTA-TCCGAATCAAATAATTCTACTTCACTAAT
63 GTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*** * * * * *
35877 ATTTTGAAAATTAGTAAGCAAGAGATTT-AAAAACTAAAGTCTTGTTTTTCGC-ACCA
127 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAA-T-ATG-TTTAC-CAAACA
* * *
35933 A-TTCAAATAGTTATGACCTATTTGAACAAATATCAATCTT-AAAT-AGTTATGATCCTTAT-TT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-C-ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCA-TTATGA-CCTTTTGTT
* * * * * * *
35994 T-CTCATAAAACAATTGTTTCTAA-TCACACAAGATT-TTTAG-ATAAAAAGAATATTAATTTAA
61 TAGTCATAAAA-AATTATTTC-AATTCATACAAGCTTATTGAGAAT-AAAATAATACTAATTT-A
* * * * *
36055 ATAATATTC-AAAAATTAATAAG--A-AGATTTAAAAAAAT--AT-TCTTGT--CGAGCC
122 TTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTT-TACCAAACA
* * * * * * *
36106 AGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTGGTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * * *
36170 CAGTATAATAATT-GTTCAGTTATATACAAGCCTAATCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
65 CA-TA-AAAAATTATTTCAATT-CATACAAG-CTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
36233 TATTCAAAAAA-TAATAAGCAAAAGATTT-GAAAATTAAATCTGTTTACTAAACA
126 TATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * *
36286 AGTTTAAATA-TTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAATCATTATGACCTTTTATTTT
1 AGTTCAAATAGTT-ATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTA
* * * * * ** * * *
36350 GTCATAAAACCATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAACA-AATATTTATTAA
63 GTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
* * *
36414 TATTTTC-AAAAGTTAAT----AAGAGATTTAAAAATA-AAATCA-ATTTACCAAA-A
126 TA--TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACA
* * * * ** * * * *
36464 TGATCAAATAATTATGGCCA-TTGAACAGCTACCTATTTCAAATCGTTATTG--CTTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTAT-GACATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTAG
* * * *
36526 TCTTAAAAATAATTTTTTTCAA-T-ATACAA-TTTATTTGA-AATAAAA-AAAACTAA-TTATTA
64 TCAT-AAAA-AA-TTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *** * * *** *
36585 ATTATTTAGTTAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATTCTATTTATTGAACT
125 A-TATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAACA
* ** *
36638 AGTTTAAATAG-TATGACTATTTGAACAATTAT-TATTTCAAATTGTTAT-AGCCTATTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTT-TA
* * *
36700 -TCATAAAATAATTATTTCTATT-ATAC-AGACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAA
63 GTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATACAAG-CTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * **
36762 TATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--TAAAATAAATATGTTTTCCCAATT
126 TATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* ** * * * * **
36815 AGTTCAAACAGTGTAAAACTATATAAAGAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCCTTTTGCTTT
1 AGTTCAAATAGT-TATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTG-TTT
* ** * ** * *
36880 -GTTATAAAATAATTATTTTCAGCTCATATAAGCTTATCCCA-AA-AAAATAAATATTACTTTAT
62 AGTCATAAAA-AATTA-TTTCAATTCATACAAGCTTAT-TGAGAATAAAAT-AATACTAATTTAT
* * *
36942 TAATATTTC-AAAAGTTAATAAG---G-GATTT-AAAAGATAAATCA-GTTTATCCGAAA-T
123 TAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CC-AAACA
* * * * *
36996 AGTTTC-AATAAG-TATGGCCATTTGAACAATTACCTATTTCGAATCATTATTACCTTTTTTTTT
1 AG-TTCAAAT-AGTTAT-GACATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTT
* * *
37059 A-TCTTAAAACAATTTTTTTTTCAA--CATTCAAGCTTATTCGA-AATAAAATAA-ACTAATTTA
62 AGTCATAAAA-AA---TTATTTCAATTCATACAAGCTTATT-GAGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
37119 TTAATATTTC--AAAATT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAGTAAATCTATTTACCAAAACA
122 TTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACA
* * ** *
37174 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA-
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAG
* ** * * * ** * *
37237 TCATGAAATAATTATTTCTGTTCCTACAGGCTTTTTTCGAATAAAATAATACTAATTTGAGTAGT
64 TCAT-AAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAAT
* ** * * ** *
37302 ATTCTAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTTGAAAAATAAATCTATTTTGCAAACT
127 ATTCAAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * ** **
37356 AGTTCAAACAGTTAAGACTATATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * *
37421 CATAAAGCAATTATTTCAGCTT-ATA-AAGCTTATTCGA-AATAGAATAAAACTAATTTTATTAA
65 CATAAA-AAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATT-GAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA
* * * * * * * *
37483 TTGTTC--AAAATT--T-TGTAAGAGATTT-AGAAAAT-AATTTATTTACTGAACCA
126 -TATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAACA
*
37533 A-TTCAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTAT
1 AGTTCAAATAG-TTATGAC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
37582 TACTAATTTA
Statistics
Matches: 4992, Mismatches: 1096, Indels: 861
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.00
168 45 0.01
169 24 0.00
170 102 0.02
171 84 0.02
172 148 0.03
173 173 0.03
174 257 0.05
175 160 0.03
176 345 0.07
177 390 0.08
178 412 0.08
179 330 0.07
180 722 0.14
181 889 0.18
182 408 0.08
183 145 0.03
184 11 0.00
185 3 0.00
186 6 0.00
187 11 0.00
188 14 0.00
189 6 0.00
190 16 0.00
191 94 0.02
192 5 0.00
193 11 0.00
194 11 0.00
195 3 0.00
196 6 0.00
197 13 0.00
198 12 0.00
199 1 0.00
200 4 0.00
201 4 0.00
202 5 0.00
204 5 0.00
206 11 0.00
207 13 0.00
208 7 0.00
211 3 0.00
212 3 0.00
213 11 0.00
214 10 0.00
216 11 0.00
217 9 0.00
218 2 0.00
219 2 0.00
220 1 0.00
222 1 0.00
223 22 0.00
224 6 0.00
225 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
ATAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
AAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
Found at i:31694 original size:16 final size:15
Alignment explanation
Indices: 31621--31694 Score: 55
Period size: 16 Copynumber: 4.7 Consensus size: 15
31611 TTAAATAGTT
*
31621 ATTAT-TATTTGAACA
1 ATTATCTATTT-AATA
*
31636 ATTATCTACTTAA-A
1 ATTATCTATTTAATA
31650 ATTAT-TAGTTCTAATA
1 ATTATCTA-TT-TAATA
31666 ATTATGACTATTTGAATA
1 ATTAT--CTATTT-AATA
31684 ATTATCTATTT
1 ATTATCTATTT
31695 CAAAATGTTA
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 2, Indels: 15
0.74 0.03 0.23
Matches are distributed among these distances:
13 2 0.04
14 7 0.14
15 10 0.20
16 16 0.33
17 1 0.02
18 11 0.22
19 2 0.04
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.05, T:0.49
Consensus pattern (15 bp):
ATTATCTATTTAATA
Found at i:32050 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 32029--32061 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
32019 ATAGTCATGA
32029 CTATTT-AAATAATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
*
32045 CTATTTCAAATTATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
32062 GACTTTTGTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.00, T:0.52
Consensus pattern (17 bp):
CTATTTCAAATAATTAT
Found at i:32211 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 31656--37581 Score: 3556
Period size: 181 Copynumber: 33.3 Consensus size: 181
31646 TAAAATTATT
* * * * * *
31656 AGTTCTAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAATGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
31721 CATAAAA-TATGT-TTTT-GTTCATATAAGTTTGTT-TAGAATAAAATAATAAAAATCTATTAAT
66 CATAAAACAAT-TATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
31782 ATTACAAAAA-T--TCA-TAAGAGATTTTAAAAATAAATCTTTTTA-TCAAACT
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACA
* * * ** * * **
31831 AGTTCAGATAGTTATAACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTG-TTCC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
31894 ACTATAAAA-AAATAGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAGATTAAAATAATACTAATTTATT
65 TC-ATAAAACAATTA-TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * * * * ** *
31956 ATTATTTTGACAATTAATAATTAA-AAATTTTAAAACATAAATATGTTTACCAAACT
126 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * *
32012 AGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
32076 CATAAGAA-AATTATTTTAGTTCATATAAGGTTATTCGAAATAAAATAATAGTAAGTTGTTAATA
66 CATAA-AACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
32140 TTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTATTGAACA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * ** ** *
32192 AGTTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
32257 CATAAAA-AGATT-TCATCTA-TTTATACAAGCCTATTTC-AAATAAAATAATTCAAATTTATTA
66 CATAAAACA-ATTAT--TTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
32318 CTA--ACAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCAC-CACAAA
127 ATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA-ACA
* * * *
32372 AGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC----A---A---CAAATTATTATAACTTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
32427 CATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * *
32491 TTTTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTACCGAACA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * *
32543 ATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * * * * *
32608 AATAAAAAAATTGTTTCGGTTAACATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * * *
32673 TCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTGTTTGCTAAACA
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * *** ** * *
32725 AGTTCAAAGAGTTATGATTATCAAAACAATTATCTCCTTAAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
32790 CAGAAAA-ATATTGGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTAATTA
66 CATAAAACA-ATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * * * *
32851 ATA-TTCCAAAGTT-ATAAGCAA-A-ATTTGAAAAATGAATTTTTTTATTAAACA
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * ** * *
32902 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
32967 CATAAACCAATTATTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTGGAA-AAAATAATACTAATTTATTAA-A
66 CATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
33029 ATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTAC-CAAGCG
130 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CA
* * * * *
33081 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
33146 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAG-TATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
33209 A-TTCTAAAAATTAATAAGTTAA-AGATTTAAAGAATAAATTTGTTTGCCGAACA
129 ATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * * * **
33262 AGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTATCATCTATTTCGAATT-TTATGACATTTTGTTTTAA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
33326 CATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAA
66 CAT---A-AA-A-CAATTA-T-----T--TTAG--TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAA
* * *
33390 TACAAATTTATTACTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGA
114 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA
*
33450 ACT
179 ACA
* * * ** ** * *
33453 AGTTCAAATAATTAAGCCTATGAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACCTTTTATTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
33517 CATAAAATAATTGTTTTA-AT-GTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
66 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
33580 TT--AAAATTAATAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTA---AA-A
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * *
33625 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTATTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTT-GTTTTG
** * * * * * * * * * *
33690 TTGTAAAAAAATTGTTTCAATACATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TCACTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *
33754 TTTCAAATTTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATGAAT-TAGTTTA-TAGAATCA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-GAA-CA
* * * * * * * * *
33807 A-TTCAAATAATTTTGGC-CTTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGA-ATTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * ** * *
33869 CATAAAATAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAATACTCATTTACTAATAT
66 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** ** * **
33934 TT-AGAAATTAATAATTAGGAGATGCAAAAAATTGATCTGTTTACTAAATT
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * * * *
33984 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTATAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
34049 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT-AAATAATACTAA-TTA-TAATA-
66 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** *
34110 TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATGTATTTACCAAACC
131 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * * * * * * *
34161 GGTTCAAATAGTTAAGACTATATCAACAATTCTTTATTTTAAATCATTAGGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * *
34226 CATAAAACAAATGCTTTT-GTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
66 CATAAAAC-AATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * *
34290 TTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACC
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * * ** *
34342 AGTTGAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTATTTACTTT-AAATCGTGATGA-CTATTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTATTATGACCT-TTTGTTTT
* * * * *
34405 GTCATAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTA
64 GTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
34468 ACA-TTCTAAAAATTAAAAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATTTG-TTAGCCTG-ACG
127 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--CTGAACA
* * * * *
34523 AGTGCAAATAGTTATGAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTG
*** * * * * *
34588 TTGCAAAA-AATTGTTTCTA-TTCGTACAAGCTTA-TCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
34650 TA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAAT-TTTTTACTGAACA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * *** * *
34702 AGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATATCAAGTTGCCATAACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
34767 TATAAAACAATT-TTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAAATTT-TTAATA-
66 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
34828 TTCAAAAATTAATGAGTAA-A-AATT-AAAAA-AAA---GTTT-TTGAACA
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* *
34871 CA-TTCAAATAGTT-TGACTATTTGATCAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTATTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
34933 GTCA-AAAACCAATTTGTTTTA-TTCATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTA
64 GTCATAAAA-CAA-TTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
34996 ATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAGCA
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CA
* * * * * * *
35051 ACTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTGTTTATTT-AAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* *
35115 TCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATT-G-AATAAAAAAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
35177 ATTT-GAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * ** *
35229 AGTTCAAATACTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGATC-TTT-TTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * ** *
35292 CATAAAA-AATTTGTTTCTA-TTTGTGCAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAA-TTATTAA
66 CATAAAACAA-TTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * *
35353 TATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTAC-GAAACA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AACA
* * * * * *
35403 A-TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTATGA--TATTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCT-TTTGTTTTG
* * ** * * * * *
35465 TCATAAAATAGTT-TGTTTCTTTTATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTTAATAA
65 TCATAAAACAATTAT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
35528 TATTCCAAAAA-T--TAA-TAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAAACCA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-G-AA-CA
* * * * *
35579 A-TTCAAATAGTTAAT-ACTATTAGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTT-TGACCTTTTGTTTCG
1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
35641 TCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAACAAAATAATAGC-AATTTATTAAC
65 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAAT
* * * *
35705 ATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TT--AAAA-AAA--TGTTTA-TCAAAA
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
** * * * * *
35751 AGTTGTAATAGATT-TGACTATTTAAATAATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTAGTTTT
1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * * * * *
35814 GTAATAAAACATTTGTTTCAGTTCA-AGAAACTTATCCG-AATCAAATAATTCTACTTCACTAAT
64 GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * *
35877 ATTTTGAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGTCTTGTTT-TTCGCACCA
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TC-TGTTTACT-G-AACA
* * *
35933 A-TTCAAATAGTTATGACCTATTTGAACAAATATCAATCTT-AAA-TAGTTATGATCC--TTATT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTA-TTATGA-CCTTTTGTT
* * * * * * * * * * *
35993 TTCTCATAAAACAATTGTTTCTA-ATCACACAAGATTTTTAGATA-AAAAGAATATTAATTTAAA
62 TTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT-AT
* * * *
36056 TAATA-TTCAAAAATTAATAAG--A-AGATTTAAAAAA-ATATTCT-TGT-C-GAGCC
125 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACA
* * * * * * * * *
36106 AGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTGGTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
36170 CAGTATAATAATT-GTTCAGTTATATACAAGCCTAATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
66 CA-TAAAACAATTATTTTAGTT-CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
36234 A-TTCAAAAAATAATAAGCAAAAGATTTGAAAATTAAATCTGTTTACTAAACA
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * *
36286 AGTTTAAATA-TTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAATCATTATGACCTTTTATTTT
1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATTATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
36350 GTCATAAAACCATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAACA-AATATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
* ** *
36414 TATTTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAATCAATTTAC-CAA-A
128 TA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACTGAACA
* * * * ** * ** *
36463 ATGATCAAATAATTATGGCCA-TTGAACAGCTACCTATTTCAAATCGTTATTG--CTTTTATTTT
1 A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA-TGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
36525 GTCTTAAAAATAATTTTTTTCA-AT-ATACAA-TTTATTTGAAATAAAA-AAAACTAA-TTATTA
64 GTCAT-AAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
36585 ATTATTT----AGTTAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATTGAACT
127 A-TATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACTGAACA
* * * * *
36638 AGTTTAAATAG-TATGACTATTTGAACAATTAT-TATTTCAAATTGTTAT-AGCCTATTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * *
36700 TCATAAAATAATTATTTCTA-TT-ATAC-AGACTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAGTA
65 TCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * ** **
36761 ATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAATAAATATGTTTTCCCAATT
127 ATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* ** * * * * * *
36815 AGTTCAAACAGTGTAAAACTATATAAAGAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCCTTTTGCTTT
1 AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
36880 GTTATAAAATAATTATTTTCAGCTCATATAAGCTTATCCCAAA-AAAATAAATATTACTTTATTA
64 GTCATAAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT-AATACTAATTTATTA
* * * *
36944 ATATTTCAAAAGTTAATAAG---G-GATTTAAAAGATAAATCAGTTTATCCGAA-A
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACA
* * * * * * *
36995 TAGTTTC-AATAAG-TATGGCCATTTGAACAATTACCTATTTCGAATCATTATTACCTTTTTTTT
1 -AG-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTT
* * * *
37058 TATCTTAAAACAATT-TTTT-TTTCAACATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-ACTAATTTAT
63 TGTCATAAAACAATTATTTTAGTT---CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * **
37120 TAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAAACA
125 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACA
* * * * * *
37174 AGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
37238 CATGAAATAATTATTTCT-GTTCCTACAGGCTTTTTTCG-AATAAAATAATACTAATTTGAGTAG
66 CATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGC-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAA
* * * *
37301 TA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTGAAAAATAAATCTATTT--TGCAAACT
128 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG--AACA
* * * * * * *
37356 AGTTCAAACAGTTAAGACTATATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
37421 CATAAAGCAATTATTTCAGCTT-ATA-AAGCTTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTTATTAAT
66 CATAAAACAATTATTTTAG-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAAT
* * * *
37484 -TGTTC-AAAATT--T-TGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATTTATTTACTGAACCA
129 AT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CA
* *
37533 A-TTCAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTAT
1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
37582 TACTAATTTA
Statistics
Matches: 4478, Mismatches: 953, Indels: 639
0.74 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
167 5 0.00
168 42 0.01
169 29 0.01
170 104 0.02
171 74 0.02
172 135 0.03
173 234 0.05
174 277 0.06
175 166 0.04
176 336 0.08
177 447 0.10
178 418 0.09
179 349 0.08
180 573 0.13
181 685 0.15
182 321 0.07
183 126 0.03
184 12 0.00
185 5 0.00
186 6 0.00
187 3 0.00
188 1 0.00
191 77 0.02
192 3 0.00
193 4 0.00
194 1 0.00
195 1 0.00
196 40 0.01
197 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
Found at i:33525 original size:191 final size:192
Alignment explanation
Indices: 33163--33527 Score: 416
Period size: 191 Copynumber: 1.9 Consensus size: 192
33153 CAATTGTTTC
* * **
33163 TATTCATAAAAGTATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
1 TATTCATAAAAATATATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-
* * * * * * ** *
33228 TAAAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTATC
65 ---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATCAAGCCTATGAGAACAATC
* * *
33293 ATCTATTTCGAATTTTATGACATTTTGTTTTAACATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTG
127 ATCTATTTCAAATGTTATGACATTTTGATTTAACATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTG
33358 G
192 G
*
33359 TATTCATACAAAAT-TATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTACTATT-TCAAAAATTAATAA
1 TATTCATA-AAAATATATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA
* * * *
33422 G-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAATTAAGCCTATGAGAACAATTAT
64 GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATCAAGCCTATGAGAACAATCAT
* *
33486 CTATTTCAAATCGTT-TGACCTTTT-ATTTAGTCATAAAATAAT
129 CTATTTCAAAT-GTTATGACATTTTGATTTA-ACATAAAATAAT
33528 TGTTTTAATG
Statistics
Matches: 142, Mismatches: 23, Indels: 13
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
190 4 0.03
191 79 0.56
192 2 0.01
195 1 0.01
196 52 0.37
197 4 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (192 bp):
TATTCATAAAAATATATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGA
GATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATCAAGCCTATGAGAACAATCATCT
ATTTCAAATGTTATGACATTTTGATTTAACATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGG
Found at i:35985 original size:531 final size:519
Alignment explanation
Indices: 33359--36799 Score: 1700
Period size: 528 Copynumber: 6.5 Consensus size: 519
33349 AAATAATTGG
** * ** * * * *
33359 TATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT-AAG
1 TATTCATACAAGTTTA-TTAGATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAA
* * * * ** * * *
33423 GATTTAAAAAATAAATGTGTTT-ACTGAACTAGTTCAAATAATTAAGCCTATGAGAACAATTATC
65 GATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTC-GAACCAATTCAAATAGTTAATACTATTAGAACAATTGTT
* * * * * * *
33487 TATTTCAAATCGTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTTA-AT-GTACATGCTTATT
128 TATTTCAAATTGTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * *
33550 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT--AAAATTAATAAGTAAGAAATTAAAAAAATAA
193 CAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAAT-AGTAAGAGATT-TAAAAATAA
* * *
33613 ATCTG-TT-T-AAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTAT
255 A-CTGTTTATCAAAAAGTT-TAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* ** * * * * *
33675 GACCTTTTATTTTTATTGTAAAAAAATTGTTTCAATACATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAA
318 GACC-TTTA-TTTTGTCATAAAACATTTGTTTCAGTTCA-AGAAA-CTTATCC-GAATAAAATAA
* * * * * *
33739 TA-TCACTTATTAATA-TTTCAAATTTTGATA-AGTTAGAGATTTAAAAAATGAAT-TAGTTTAT
378 TACT-AATTACTAATATTTTGAAA-ATT-A-ACA---AGAGATTTAAAAACTAAATAT-GTTTA-
* * * * * * * * *
33800 AGAATCAATTCAAATAATTTTGGC-CTTTGAATAATTATCTATTTTAAATCA-TTATGAATTTTG
434 CGAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAAT-AGTTATG-ATTTTA
* * *
33863 TTTTATCATAAAATAATTATTTTTC
497 TTTTGTCATAAAA-CATT-TGTTTC
** * * * * * * *
33888 -A-TCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAATACTCATTTACTAATATT-TAGAAATTAATAATT
1 TATTCATACAAGTTTATTAGAT-TAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAA--
** ** * * ** *
33950 AGGAGATGCAAAAAATTGATCTGTTT-ACTAAATTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTA-AACA
63 A--AGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTC-GAACCAATTCAAATAGTTAAT-ACTA-TTAGAACA
* * * * * ** *
34012 ATTATATATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTATA-TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAA
122 ATTGTTTATTTCAAATTGTT-TGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACA
* * *
34076 AGTTTATTCAAAATAAATAATACTAA-TTA-TAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
185 AGCTTATTCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TGAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTT-
** * * ** * * * * * * * *
34138 AAAAATAATGTATTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGACTATATCAACAATTCTTTATTTTAA
247 AAAAATAAACTGTTTATCAAA-AAGTT-TAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * ** * * ** **
34203 ATCATTAGGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAGTTTATTTGGAAT
310 ATCATTATGAC-CTTTATTTTGTCATAAAACATTTG-TTTCAGTTCA-AGAAACTTA-TCCGAAT
* * * * *
34267 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
371 AAAATAATACTAA-TTACTAATATTTTGAAAATT---AA-CAAGAGATTTAAAAACTAAATATGT
* * * * * * * * *
34332 TTACTAAACCAGTTGAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTATTTA-CTTTAAATCGTGATGACT
431 TTACGAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC-TTAAATAGTTATGA-T
* * *
34396 ATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC
493 -TTTATTTTGTCATAAAACATTTGTTTC
* * * ** * * * *
34424 TATTCATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAAAAAG
1 TATTCATACAAGT-TTATT-AGATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAA-
* * * * * * * *
34488 TAATGGATTTAAAAAATGAATTTGTTAGCCTG-ACGAGTGCAAATAGTT-ATGAACTGTTTGAAC
63 -AA--GATTTAAAAAAT-AAATTGTTTGTC-GAACCAATTCAAATAGTTAAT--ACTATTAGAAC
* * * * * *
34551 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATTGC--AAAA-AATTGTTTCTA-TTCGT
121 AATTGTTTATTTCAAATTGTT-TGACCTTTTG-TTTAGT-CATAAAATAATTATTTC-AGTTCAT
* * * *
34612 ACAAGCTTA-TCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGA
182 ACAAGCTTATTC-AAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAAT-AGTAAGAGA
* * * * * * * * * *
34675 TTTAAAAAATGAATTTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATA
244 TTT-AAAAATAAACTGTTTA-TCAAAAAGTT-TAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * **** * * * * * * **
34740 TCAAGTTGCCATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTT-TTT-A-TTCATACAAGCTTATTTT
306 TAAAATCATTATGAC-CTTTATTTTGTCATAAAAC-ATTTGTTTCAGTTCA-AGAAACTTA-TCC
* * ** ** ** * *
34802 AAATAAAATAATACAAATTTTTAATA-TTCAAAAATTAATGAGTAAAAATTAAAAA--AAAGT-T
367 GAATAAAATAATACTAATTACTAATATTTTGAAAATTAACAAG--AGATTTAAAAACTAAA-TAT
*
34863 -TTT--G-AACACATTCAAATAGTT-TGACTATTTGATCAATTATCTAT-TTCAAATAGTTATGA
429 GTTTACGAAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATAGTTATGA
34922 CCTTTTATTTTGTCA-AAAACCAATTTGTTT-
492 --TTTTATTTTGTCATAAAA-C-ATTTGTTTC
** * * ** * *
34952 TATTCATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGT
1 TATTCATACAAGTTTATTAG-ATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-T
* * * * *
35017 AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAGCAACTTCAAATAGTT-ATGATTGTTTGAACAA
61 AAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTGTCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAT-ACTATTAGAACAA
* * * * *
35080 TTGTTTATTTAAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAA
123 TTGTTTATTTCAAATTGTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAA
* * * *
35144 GTTTATTGAATAAAAA-AATACTAATTTATTAATATTTG-AAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAA
186 GCTTATTCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATA-GTAAGAGATTT-AA
* * * * * *
35207 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATACTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
249 AAATAAA-CTGTTTA-TCAAAAAGTT-TAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
* * * *** * **
35272 TCGTTATGATCTTT-TTTTGTCATAAAAAATTTGTTTCTA-TTTGTGCAAAATTATTTAGAATAA
311 TCATTATGACCTTTATTTTGTCATAAAACATTTGTTTC-AGTTCAAG-AAACTTA-TCCGAATAA
* *
35335 AATAATACTAATTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACGAA
373 AATAATACTAATTACTAATATTTTGAAAATTAACAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACGAA
* * * * *
35400 ACAATTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTATGATATTTATTTTG
438 ACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATAGTTATGAT-TTTATTTTG
*
35465 TCATAAAATAGTTTGTTTC
502 TCATAAAACA-TTTGTTTC
*
35484 T-TTTATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT-AAA
1 TATTCATACAAGTTTATT-AGATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAA
* *
35547 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAAACCAATTCAAATAGTTAATACTATTAGAGCAATTATT
65 GATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTCG-AACCAATTCAAATAGTTAATACTATTAGAACAATTGTT
*
35612 TATTTCAAATTGTTTGACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT
128 TATTTCAAATTGTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT
*
35677 CAAAACAAAATAATAGC-AATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TT-AAAA-AA
193 CAAAA-AAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAATAA
* * * *
35738 A-TGTTTATCAAAAAGTTGTAATAGATT-TGACTATTTAAATAATTATTTATTTAAAGTCATTAT
255 ACTGTTTATCAAAAAGTT-TAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * *
35801 GACCTTTAGTTTTGTAATAAAACATTTGTTTCAGTTCAAGAAACTTATCCGAATCAAATAATTCT
318 GACCTTTA-TTTTGTCATAAAACATTTGTTTCAGTTCAAGAAACTTATCCGAATAAAATAATACT
* * * * *
35866 ACTTCACTAATATTTTGAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGTCTTGTTTTTCGCAC
382 AATT-ACTAATATTTTGAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAACTAAA-T-ATG-TTTACGAAA
* * * *
35931 CAATTCAAATAGTTATGACCTATTTGAACAAATATCAATCTTAAATAGTTATGATCCTTATTTTC
439 CAATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATAGTTATGAT-TTTATTTTG
*
35996 TCATAAAACAATTGTTTC
502 TCATAAAACATTTGTTTC
* * * *
36014 TAATCACACAAGATTT-TTAGATAAAAAGAATATTAATTTAAATAATATT-CAAAAATTAATAAG
1 TATTCATACAAG-TTTATTAGATTAAAATAATATTAATTT-AATAATATTCCAAAAATTAATAA-
* * * * * * * *
36077 AAGATTTAAAAAA-ATATT-CTTGTCGAGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTGTC
63 AAGATTTAAAAAATAAATTGTTTGTCGAACCAATTCAAATAGTTAATACTATTAGAACAATTGTT
* * * * *
36140 TATTTCAAATCAT-TTTGACC-TTTGGTTAGTCAGTATAATAATT-GTTCAGTTATATACAAGCC
128 TATTTCAAAT--TGTTTGACCTTTTGTTTAGTCA-TAAAATAATTATTTCAGTT-CATACAAGCT
* * * * * *
36202 TAATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATAATAAGCAAAAGATTTGAAAA
189 TATTC-AAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTT-AAAA
*
36266 TTAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTTAA-ATATTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
251 ATAAA-CTGTTTATC-AAA-AAGTTTAATA-ATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAA
* *
36329 ATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACCA-TTGTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAA
310 ATCATTATGACC-TTTATTTTGTCATAAAA-CATTTGTTTCAGTTCA-AGAAA-CTTATCC-GAA
* * * * * * *
36392 TAAAATAACAAATATTTATTAATATTTTCAAAAGTTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAA-ATCAAT
370 TAAAATAA-TACTAATTACTAATATTTTGAAAA-TTAACAAGAGATTTAAAAACTAAATAT--GT
* * * * ** * * *
36455 TTAC-CAA-AATGATCAAATAATTATGGCCA-TTGAACAGCTACCTAT-TTCAAATCGTTATTGC
431 TTACGAAACAAT--TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATAGTTA-TGA
* * *
36516 TTTTATTTTGTCTTAAAAATAATTTTTTTC
492 TTTTATTTTGTCAT-AAAA-CATTTGTTTC
* * * * * * * **
36546 -AAT-ATACAA-TTTATTTGAAATAAAA-AAAACTAA-TTATTAATTATT-TAGTTAATTAATAA
1 TATTCATACAAGTTTATTAG-ATTAAAATAATATTAATTTAATAA-TATTCCA-AAAATTAATAA
* * * * * * * *
36605 GAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATTGAACTAGTTTAAATAG-T-ATGACTATTTGAACAATT
63 AAGATTTAAAAAATAAA-T-TGTTTGTCGAACCAATTCAAATAGTTAAT-ACTATTAGAACAATT
* *
36668 -ATTATTTCAAATTGTTAT-AGCCTATTGTTCTA-TCATAAAATAATTATTTCTA-TT-ATAC-A
125 GTTTATTTCAAATTGTT-TGA-CCTTTTGTT-TAGTCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAA
* * * *
36727 GACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
186 G-CTTATTCA-AAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGA-AAAATTAAT-AGTAAGAGATTT
*
36791 TAAAATAAA
247 AAAAATAAA
36800 TATGTTTTCC
Statistics
Matches: 2291, Mismatches: 440, Indels: 362
0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
522 64 0.03
523 30 0.01
524 29 0.01
525 22 0.01
526 152 0.07
527 240 0.10
528 292 0.13
529 172 0.08
530 160 0.07
531 255 0.11
532 138 0.06
533 57 0.02
534 33 0.01
535 90 0.04
536 150 0.07
537 60 0.03
538 83 0.04
539 101 0.04
540 57 0.02
541 96 0.04
542 10 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (519 bp):
TATTCATACAAGTTTATTAGATTAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAAG
ATTTAAAAAATAAATTGTTTGTCGAACCAATTCAAATAGTTAATACTATTAGAACAATTGTTTAT
TTCAAATTGTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAA
AAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAATAAACTGTT
TATCAAAAAGTTTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTA
TTTTGTCATAAAACATTTGTTTCAGTTCAAGAAACTTATCCGAATAAAATAATACTAATTACTAA
TATTTTGAAAATTAACAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACGAAACAATTCAAATAGTTATG
ACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATAGTTATGATTTTATTTTGTCATAAAACATTTGTTTC
Found at i:39032 original size:176 final size:178
Alignment explanation
Indices: 38717--39059 Score: 401
Period size: 176 Copynumber: 1.9 Consensus size: 178
38707 ACCGAACAAA
* * * *
38717 TTCAAATAGTTATGGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATA
1 TTCAAATAATTATGGACCATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTATA
* * * *
38782 ATAAAACATTTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
66 ATAAAACATTGTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
38847 TTTAAAAATTGA-GAAGTTGGAGATTTAAAAAA-AAATCATCGAATCAG
131 TTTAAAAATTAATG-AGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCATCGAATCAG
* * * ** * *
38894 TTCAAATAATTGTGG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAATTATGGACCATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTATA
* ** * *
38958 ATAAAACAATTGT-TTTC-A-TCATATAAGCCTATTCGGAAATGAAATAATACTAATTTCTTAAT
66 ATAAAAC-ATTGTGTTTCAATTCATAAAAGCCTA-TCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
39020 ATTTTCAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAAT
129 ATTTT-AAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAAT
39060 TTGTAAGCGG
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 23, Indels: 10
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 11 0.08
175 30 0.22
176 75 0.54
177 22 0.16
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (178 bp):
TTCAAATAATTATGGACCATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTATA
ATAAAACATTGTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTTAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCATCGAATCAG
Found at i:40062 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 37584--40444 Score: 1967
Period size: 361 Copynumber: 8.0 Consensus size: 360
37574 ATCATTATTA
* * * *
37584 CTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAA
1 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGA
* * * * * * * * *
37647 ACCATTTTAAATAGTTTTAACTATTTTGAATAATTATTTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATT
64 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** * * * ** ** * *
37712 TTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTGATACTATTTTATTTGAAAT-AAATAATA-TAATTTAATG
128 TTTTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
** * ** * * * ** *
37775 ATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATT--AAAATAATCT-AATAGCC-AACAAGTTCAAATA
193 ATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTA-CCGAACCAGTTCAAATA
* ** ** * * *
37836 GTTAAGACTAAATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGGTTTCTCATAAAATAA
256 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
** * * *
37901 TTA-TTTTGTTTGTACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA
321 TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATT
* * * *
37940 CTAATTTAAT-ATAGTTCAAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTA-CAAG
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACCGA-
* * * * * * *
37998 ACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTATTTATTTGAAATCATTATAAACTTTTGTTT
64 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
38063 TTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAAGAATACTAATTTATTA
129 TT-TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * ** * * * * **
38128 ATA-TGATAAAATTAATGAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATA
193 ATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATA
* * * * * * *
38192 GTCA-CATCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTAT-ACAC-TTTGTTTGGTCGTAAAAC
256 GTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* ** * *
38254 AATTATTTTTATTCATACAATATTATTC-AAATAAAATAATA
319 AATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATT
* * * *
38295 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTGTTAACCAAAC
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAAC
* * * *
38356 TAGTT-AAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTT
66 AAGTTCAAA-TAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * ** *
38418 GTT-ATAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAA
130 -TTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ***
38482 TATTCTAAAATTAATAAGCAATAGATTTAAAAAGTAA-ATGTGTTTGTGAACCAGTTCAAATAGT
194 TATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGT-TTACCGAACCAGTTCAAATAGT
* * * * * *
38546 TAAGAATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT
258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * *
38611 GTTTTAGTTCATA-ATGCTTATTCGAAATAAAATAATAT
323 ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT-T
* * * * *
38649 -TATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCG
1 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATCTTTTTACCG
* * * *
38711 AACAAATTCAAATAGTTATGGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
63 AACAAGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
38776 TTTATAATAAAACATTTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTAT
127 TTTTTCATAAAACA-ATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * * *
38841 TAATATTTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAA-AA-A---TCATCGAATCAGTTCAAAT
191 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAAT
* * * * ** * * *
38901 AATTGTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACA
255 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* ** * * * *
38966 ATT-GTTTTCATCATATAAGCCTATTCGGAAATGAAATAATA
320 ATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGG-AATAAAATAATT
* * * * * *
39007 CTAATTTCTTAATATTTTCAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTAAGCGGA
1 CTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CCGA
* * * *
39071 ACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCCAAATCATTATAACCTTTTCTT
64 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTT
** * * * *
39136 TTGTT-ATGTAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTA-TC-AAAT-AAATAATTACTAATCTAA
128 TT-TTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTAT
* * *
39197 TAATATT-ATTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AATTTGTTTGCC-AACCAGTTCAA
191 TAATATTCA---AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTACCGAACCAGTTCAA
* * * * * * * * * *
39259 ATAGTAAAGGCTGTATGAATAATTATCCATTTCGAATCGTTATGAACCTTTTTGTTTCGT-ATTA
253 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACC-TTTTGTTTTGTCA-TA
* * * * * *
39323 AAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TTGTTTGGAATAAAATAATAT
315 AAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT-T
** * * * *
39369 -TAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAATATTAAATC-TGTTACCAAA
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAATCTTTTTACCGAA
* * * * * * * ** *
39428 CTAGTTTAATTAGTTATAACAATTTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTG--T
65 CAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * ** *
39491 TTTCATAAAACAATTATTTCTATTGATACAA-TTTATT-GGAATAAAATAATGCTAATTTATTAA
129 TTTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** * * *
39554 CATTCTAAAAATTAATAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAATGCAAAT
194 TATTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTAC-CGAACCAGTTCAAAT
* * ** * * ** *
39617 AGTTAT-ATCTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTCTATTTTGTCACCAAAC
255 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * **
39681 AATTGTTTCTCTTCATACAAGCTTATTCGGAATAGCATAATT
319 AATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATT
* *
39723 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAACTAAATCTTTTTATCGAAC
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAAC
* * * * * ** *
39788 AAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTT
66 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTT
* * * * * *
39853 TCATAAAATAATTTTTTCTAATCATACAACCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAAT
131 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** *
39917 ATTCAGATAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAACTATGTTTACCGAATAAATT-AAATAGT
195 ATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT
* * * *
39981 TGTGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
258 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
40046 T-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAATTAAAATAATAT
322 TATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAAT-T
** * * * * * **
40085 -TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAACAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAAC
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAAC
*** * * * ** * **
40149 AAGTTTTGATAGTCATAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTCA
66 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTT
* * * *
40214 TCATAAAACAATTATATC-AGTTCATATAGGCTAATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
131 TCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
40278 ATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATTTACTTACCAAACAAGTTCCAATTG
195 A-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGT--TTACCGAACCAGTTCAAATAG
* * * * * ** * *
40342 TTATGGCTATATAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTCTATCATAAAATAAT
257 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * *
40407 TATTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT
322 TATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAAT
40445 ATAAATTTTT
Statistics
Matches: 1970, Mismatches: 424, Indels: 216
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
350 42 0.02
351 83 0.04
352 79 0.04
353 184 0.09
354 89 0.05
355 161 0.08
356 219 0.11
357 70 0.04
358 184 0.09
359 125 0.06
360 142 0.07
361 334 0.17
362 217 0.11
363 41 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAAC
AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTT
TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATT
TTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATT
Found at i:40183 original size:542 final size:539
Alignment explanation
Indices: 37584--40452 Score: 2109
Period size: 542 Copynumber: 5.3 Consensus size: 539
37574 ATCATTATTA
* *
37584 CTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAA
1 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAA
* * * * * * * * *
37647 ACCATTTTAAATAGTTTTAACTATTTTGAATAATTATTTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATT
63 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTT
* * ** ** * * ** * * *
37712 TTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTGATACTATTTTATTTGAAAT-AAATAATA-TAATTTAATG
127 TTATCATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTA
** * ** * * *
37775 ATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAATAATCTAATA-G---CC-AAC-AAGTTCAAA
192 ATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAA-AAT-AAATATGTTACCAAACTAAGTT-AAA
* ** ** * * *
37834 TAGTTAAGACTAAATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGGTTTCTCATAAAAT
254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * * * * *
37899 AATTATTTTGTTTGTACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT-ATA-GTTCAAA--
319 AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATT
* * ** *
37960 AATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CAAGACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTT
384 AATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGA-ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * * * * * *
38024 GAATAGTTATTTATTTGAAATCATTATAAACTTTTGTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTC
448 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * *
38089 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAAGAATA
512 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATT
* * ** * * *
38117 CTAATTTATTAATA--TGATAAAATTAATGAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAA
1 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAA
* * * * *
38180 TAAGTTCAAATAGTCA-CATCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTAT-ACAC-TTTGTT
64 CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC-CTTTTGTT
** * * ** *
38242 TGGTCGTAAAACAATTATTTT-TATTCATACAATATTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
127 TTATCATAAAACAATT-TTTTCTAATCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATT
* *
38305 AATATTTCAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTAACCAAACT-AGTTAAAT
191 AATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT-ACCAAACTAAGTTAAA-
* * * *
38365 TA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTTATAAAAC
254 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * ** * *
38428 AATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAT
319 AATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAT
* * * * * * *
38493 TAATAAGCAATAGATTTAAAAAGTAAATGTGTTT-GTGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGAATATT
383 TAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATT
* * * * *
38556 AGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTT
447 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTT
*
38620 CATA-ATGCTTATTCGAAATAAAATAATAT
511 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-T
* * * * * *
38649 -TATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAA-AAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCG
1 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAAT-TTTTTACCA
* * * *
38711 AACAAATTCAAATAGTTATGGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
62 AACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * *
38776 TTTATAATAAAACATTTTGTTTC-AATTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATATTACTTT
126 TTTATCATAAAACAATTT-TTTCTAA-TCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATTAATTT
* * * * ** * *
38839 ATTAATATTTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAA-AAATCA---T--CGAA-TCAGTTC
188 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTACCAAACTAAGTT-
* * * * * ** * *
38897 AAATAATTGTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAA
251 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
38962 AACAATTGTTTTCA-TCATATAAGCCTATTCGGAAATGAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTC
316 AACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTC-GAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-
* * ** *
39026 AAAAATTAATGAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATTTG-TAAGCGGAACCAGTTCAAATAGTTAT
378 -AAAATTAATAAGTA-ACAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * ** *
39089 AACTATTTGAACAATTATATATTTCCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTTATGTAACAATTAT
440 AACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
*
39154 TTATGTTCATACAAGCTTA-TC-AAAT-AAATAATT
504 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATT
* * ** * *
39187 ACTAATCTAATAATATTATTGAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTGCC-A
1 -CTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAA
* * * * * * * * * *
39249 ACCAGTTCAAATAGTAAAGGCTGTATGAATAATTATCCATTTCGAATCGTTATGAACCTTTTTGT
63 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACC-TTTTGT
* * * **
39314 TTCGTAT--TAAAACAAATGTTTTTGT--TCATATAAG-TTGTTTGGAATAAAATAATATTAATT
126 TT--TATCATAAAAC-AAT-TTTTTCTAATCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATT
** * *
39374 TATTAATATTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAATATTAAATCTGTTACCAAACT-AGTT
187 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAA-AATAAATATGTTACCAAACTAAG-T
* * * * * ** *
39434 TAATTAGTTATAACAATTTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTG-TTT-TCAT
250 TAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
39497 AAAACAATTATTTCTATTGATACAA-TTTATTGGAA-TAAAATAATGCTAATTTATTAACATTCT
314 AAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T
* * * * ** * *
39560 AAAAATTAATAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTTATA
377 TAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATA
* * * * * **
39624 TCTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTCTATTTTGTCACCAAACAATTGTTT
441 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * **
39689 CTCTTCATACAAGCTTATTCGGAATAGCATAATT
506 CTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATT
* * * *
39723 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAACTAAATCTTTTTATCGAAC
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAAC
* * * * ** *
39788 AAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTT
65 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * **
39853 TCATAAAATAATTTTTTCTAATCATACAACCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA
130 TCATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * *
39918 -TTCAGATAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAACTATGTTTACCGAA-TAAATTAAATAGT
195 TTTCA-AAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATG-TTACCAAACTAAGTTAAATAGT
* * * *
39981 TGTGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
258 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
40046 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAA
322 TTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAA
* * *** * *
40111 TAAGTAACAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTTGATAGTCATAACTATATGAA
386 TAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * ** * * * *
40176 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATAT
451 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC
* * * *
40241 AGGCTAATTCAAAATAAAATAATA
516 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATT
* *
40265 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAAAC
1 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAAC
* * * * * * * * ** *
40330 AAGTTCCAATTGTTATGGCTATATAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTCTA
65 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * ** * *
40395 TCATAAAATAATTATTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTT
130 TCATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTT
40453 TTTATGAATA
Statistics
Matches: 1822, Mismatches: 403, Indels: 213
0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
525 3 0.00
526 3 0.00
527 12 0.01
528 1 0.00
529 24 0.01
530 115 0.06
531 95 0.05
532 108 0.06
533 150 0.08
534 154 0.08
535 104 0.06
536 184 0.10
537 174 0.10
538 80 0.04
539 108 0.06
540 98 0.05
541 103 0.06
542 306 0.17
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (539 bp):
CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTACCAAACA
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
CATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTACCAAACTAAGTTAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
TTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGT
AACAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT
TATTCGAAATAAAATAATT
Found at i:40445 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 37582--40445 Score: 2001
Period size: 181 Copynumber: 16.0 Consensus size: 180
37572 AAATCATTAT
* *
37582 TACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACC
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACC
* * * * * * * * * * *
37645 AAACCATTTTAAATAGTTTTAACTATTTTGAATAATTATTTATTCCAAATCATTATAACCTTTTA
63 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * ** *
37710 TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTGATACTATTTTATTTGAAAT-AAATAA
127 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * ** * ** * * * **
37763 TA-TAATTTAATGATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATT--AAAAT-AATCTAATAGCC-A
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTA-CCGA
* ** ** * *
37823 ACAAGTTCAAATAGTTAAGACTAAATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGGTT
65 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * ** * * *
37888 TCTCATAAAATAATTATTT-TGTTTGTACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA
130 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * *
37938 TACTAATTTAAT-ATAGTTCAAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCGA
* * * * * * * *
37997 GACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTATTTATTTGAAATCATTATAAACTTTTGTT
65 -ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-T
* * * *
38062 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAAGAA
128 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * ** * * * *
38115 TACTAATTTATTAATA--TGATAAAATTAATGAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATCTATTTACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCG
* * * * *
38178 AATAAGTTCAAATAGTCA-CATCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTAT-ACAC-TTTG
64 AACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTG
* * * * * **
38240 TTTGGTCGTAAAACAATTATTTTTATTCATACAATATTATTC-AAATAAAATAA
127 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * *
38293 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTAACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCGA
* * *
38354 ACTAGTT-AAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTT
65 ACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
38416 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATAT
129 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* ** * * * * * * **
38468 TGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGCAATAGATTTAAAAAGTAAATGTGTTT-GTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCGA
* * * * * *
38531 ACCAGTTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTT
65 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * *
38596 AGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-ATGCTTATTCGAAATAAAATAA
130 TGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * *
38646 TATTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAA-AAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTAC
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAAT-TTTTTAC
* * *
38709 CGAACAAATTCAAATAGTTATGGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTT
62 CGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * ** * * *
38774 GTTTTATAATAAAACATTTTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA
126 GTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * ** * *
38830 TATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAA-AAA----TCATCGAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTACCGAA
* * * * ** * *
38890 TC-AGTTCAAATAATTGTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTT
66 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
** * * *
38954 TGTCATAAAACAATTGTTT-TCATCATATAAGCCTATTCGGAAATGAAATAA
130 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAA
* * * * *
39005 TACTAATTTCTTAATATTTTCAAAAATTAATGAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTAAGCG
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTTTTA-CC
* * * * *
39069 GAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCCAAATCATTATAACCTTTTC
63 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTG
* ** * *
39134 TTTTGTTATGTAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTA-TC-AAAT-AAATAA
127 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * ** * *
39185 TTACTAATCTAATAATATTATTGAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTGCC
1 -TACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACC
* * * * * * * * * *
39248 -AACCAGTTCAAATAGTAAAGGCTGTATGAATAATTATCCATTTCGAATCGTTATGAACCTTTTT
63 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACC-TTTT
* * * * * * *
39312 GTTTCGT-ATTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TTGTTTGGAATAAAATAA
126 GTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* ** * * * *
39366 TATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAATATTAAATCTGTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATTTTTTACCGA
* * * * * * * * ** *
39427 ACTAGTTTAATTAGTTATAACAATTTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTG-T
65 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
39491 TT-TCATAAAACAATTATTTCTATTGATACAA-TTTATT-GGAATAAAATAA
129 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * **
39540 TGCTAATTTATTAACA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCT
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTAC-
* * * * * ** *
39603 TGACCAA-TGCAAATAGTTAT-ATCTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTCT
62 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* ** * * **
39666 ATTTTGTCACCAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAGCTTATTCGGAATAGCATAA
126 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * *
39721 TTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAACTAAATCTTTTTATCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCGA
* * * * ** *
39786 ACAAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTT
65 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * ** * *
39851 TTTCATAAAATAATTTTTTCTAATCATACAACCTTATTTC-AATTAAAATAA
130 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAA
* * * * * *
39902 TACAAATTTATTAATA-TTCAGATAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAACTATGTTTACCG
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCG
* * * * * *
39966 AATAAATT-AAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTTGT
64 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGT
* * *
40030 TTTGTCATAAAATAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAA
128 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* ** * * * * **
40082 TATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAACAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCGA
*** * * * * ** *
40147 ACAAGTTTTGATAGTCATAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTT
65 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
** * * * * * * *
40212 CATCATAAAACAATTATATCAGTTCATATAGGCTAATTCAAAATAAAATAA
130 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * *
40263 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTACTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCGA
* * * * * * * ** *
40328 ACAAGTTCCAATTGTTATGGCTATATAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTC
65 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * *
40393 TATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATATAAGCTTATTTC-AAATAAAATAA
130 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAA
40444 TA
1 TA
40446 TAAATTTTTT
Statistics
Matches: 2103, Mismatches: 477, Indels: 206
0.75 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
171 7 0.00
172 2 0.00
173 9 0.00
174 148 0.07
175 242 0.12
176 133 0.06
177 134 0.06
178 224 0.11
179 191 0.09
180 240 0.11
181 553 0.26
182 104 0.05
183 53 0.03
184 59 0.03
185 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTACCGAA
CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
Found at i:40881 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 40445--45020 Score: 1897
Period size: 181 Copynumber: 25.2 Consensus size: 180
40435 ATAAAATAAT
* * * *
40445 ATAAATTT-TTTA-TGAATACGTTCAAATAGTTATGAT-TATCTGAATAATTATCTATTTTAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
**
40507 AATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTCAAAAT-
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCAAAATA
* * * * *
40569 AAGTAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA
128 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * ** * * * *
40622 ATAAATCTATTTA-CGAGCAAGTTCAAATAGTTAT-GCTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATC-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * *
40685 AGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
** * *
40750 ATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAA
130 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* **
40802 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATATCTACATGAATAATTATCTATTTCAAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAAT
* * **
40867 -GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
** *
40931 ATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT---AAGAGATTTAAATA
130 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * *
40979 CTAAATCTATTTACC-AAAATAGTTTAAATAGTTAT-TACTATTTGAATGATTATCTATCTCAAA
1 ATAAATTTGTTTACCGAATA-AGTTCAAATAGTTATAT-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * *
41042 TCGTTATGA--TGTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTA
64 TCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
41105 AAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT---AAGAGCTTTGAAAA
128 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
* *** ** * * *
41155 ATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTA-AGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAA
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATA-TCTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
41218 TCGTTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAACTTATTCAGAATA
64 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATA
** * * * *
41282 AAATAATTGTTATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA
128 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTT-AAAAA
* * * * * *
41337 TATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATA--TATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AA
1 -ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAT--CTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * **
41399 AGTCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCGTAAAAACTTATTTGAAA
63 A-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
41463 GAAAATAATACTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAACAAAAGATTT-AAAA
126 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGAAGAGATTTAAAAA
* * * *** * * * * * *
41518 CTAAAGTCGTTTTTTTGAACT-AGTTTAAATAGTTATGA-ATATTTGAACAAATATCAATCTCAA
1 ATAAATTTG-TTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * ***
41581 ATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATCTTTTTTTA-TCATACAAGCTTA-T-ATGGG
63 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AAA
* * * * * *
41642 CAAAATAATTCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGT--G-AGAGATTTAAGAA
126 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
* * * * ** * *
41694 ATAAATATATTTGCTGGACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
1 ATAAATTTGTTTAC-CGAATAAGTTCAAATAGTTATA-TCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * * * *
41757 TCATTCTAACCTTTTATTTAGTCCTATAATAATTGTTTC-AGTTTATA-AATGCTTATTCGAAAT
64 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTCAAAAT
* * * *
41820 AAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTCGAAAAG
127 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATT-TAAAAA
* * * * *
41876 ATAAATGTG-TTATCGAATAAGTTCAAAGAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCAATTTAAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * *
41939 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAGAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * *
42002 AATAATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
129 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAA
* * ** * ** * * * * * *
42055 ATAAATTAGTTGACTAAATAAGTTCAAATAATTATCGCCATTTAAACAACTATTTATTTCAAATT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *** * *
42120 ATTATTACCTTTT-ATCTATCATAAAACAATTGTTTTTAAAAAAATA-AATCTTTTTACCAAACC
66 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATT--C-AA--
* * * * * * ****
42183 AATTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTC-ATATTGTTATAACATTTTATTCT
124 AA-T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAAAAT-TAATAAGAAGAGATT-T
42246 ATAATAA
176 A-AA-AA
* ** *
42253 A-ACAA-TTGTTT--C---T-A-TTCATACA-AGCTTAT-TCGAAAT-AA-AATAATACTAATTT
1 ATA-AATTTGTTTACCGAATAAGTTCA-A-ATAG-TTATATCTATTTGAATAATTAT-CT-ATTT
* ** ** ** * * ** *
42305 -AGTAAT-ATTATGAAATAACTAAGAAATT-T-AAAAAATAAATATGTTTGCTGAACCAATTCAA
60 CA--AATCGTTATGACCT---TTTG-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTT-CT-ATTC-ATACAA
* * * * * *
42366 -ATAATTAAGACTATATGAACAATTATTTGACTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAA
114 GCTTATTCA-A--A-AT-AA-AA-TA-AT-ACT--AA-T-TTATTAA------TATT-TCA-AAA
* *
42430 A-TAATTATTTTAGCTTGTAGAAATTTATTCGGAATAGA
158 ATTAA-TA----A----GAAGAGATTTA-----AA-A-A
* * ** ** * * * ***
42468 GTAAAACTAATTTA-TTAAT-ATTTCAAAAATTTATAAGAGATTTAGAAAATAATTA--TATTTA
1 AT-AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTT-G--AATAATTATCTATTT-
* * ** * ** * * ** * * * *
42529 TAGAACCAAT-TCAAATAATTATAACTATT-T-A-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACA
60 CA-AATCGTTATGACCT-TTTGT---T-TTGTCATAA-AACAAT-TGTTTCTATTCA-TA-CA-A
** *** * * ** * * *
42590 TTTTATTTGTTAATAAAACAATATTTTTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTC-AAAATAAAATAATA
114 GCTTA-TTCAAAATAAAATAATA----CTAAT-TT-AT-TAA-TAT-TTCAAAAAT-TAATAAGA
** ***
42654 CTA-ATTT-CTTA
168 AGAGATTTAAAAA
* ** * ** * *
42665 AT--ATTTATCAACC----CAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAGCATTTATTTATTTCAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *** *
42723 TGTTATGACTTTTTGTTGTGTTATAAAGCAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * *
42788 ATAATACCAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAC
130 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAA
* * * *
42840 ATAAATATT-CTTATCAAACT-AGATCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
1 ATAAAT-TTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * ** * *
42902 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATCATTT-TGGTTCATATAAGCTTATTCAAAAT
63 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * ** *
42966 AAAATAATATTAAGTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAA
127 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * *
43021 ATAAATTTGTTTAACGAACAAGTTTAAATAATTATGAT-TGTTTGAACAATTATCTATTTGAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * ***
43085 CGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAAT
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
43150 AAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATCAGTAAAAGATCT----A
127 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * * ** * *
43201 ATAAA--TCTAT-CCGAACAAGTTCAAATCTTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *** *
43262 TGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* ** * * * *
43327 A-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAAGTAACAAGTAAAAGATTTAAAAA
130 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * * * * **
43378 ATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATGGTCATAAGTATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAAT
* * * * * * **
43442 CATTGTGACC-TTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTTATATAAGCTTATTTGAAATAAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* *
43505 ATAATACTAGTTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAA
130 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
43557 ATTAATCTATTTACC-AATCATGTTCAAATAGTTATGA-CTATCTGAACAATTATCTATTTCAAA
1 ATAAATTTGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * ***
43620 ACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATA
64 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
*
43684 AAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAA
128 AAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
43737 ATAAATATGTTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * ** *
43801 TGTTATGACCTTTAGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAA
65 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * *
43865 ATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAA
130 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * ** * ** *
43917 ATAAATTTGTTTACTGAGCT-AGTTTGAATAGTTATGA-CCATTCAAATAATTATTTATTTCAAA
1 ATAAATTTGTTTACCGA-ATAAGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * ** *
43980 TCATTTTGATCTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAA
64 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* **
44045 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAA
129 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * *** * * * * * *
44097 ATAAATATGCTTAGTTAACAAGTTCAAATAGTCATGTTTATTTGAATTATTAT-TATTTCAAATT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * ** **
44161 TTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAA
66 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * *
44226 TAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A-A-ATTTAAGAA
131 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * ** * * *
44273 TTAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATACTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATT
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
44338 ATTAT--CATATTTGTTTTGTAATAAAACAAATGCTTCTGTTCATACAAACTTATT-ATGAGTAA
66 GTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AAATAA
* * * * * **
44400 AATATTGCTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAAT---AAGAGCTTCGAAAA
129 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
* * ** * * *
44449 ATAAATGTGTTAATTGAACTAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAA
1 ATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATA-TCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
44512 TCATTCTTACCCTTTGTTTAT-TCATGAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT
64 TCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT
** *
44575 AAAATAATTGTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAATAAA
127 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTT-AA-AAA
* * * * * * *
44632 ATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAAATT-TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTT-AAA
1 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAAT-AGTTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
44694 GTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC-ATTTCATA-AATACTTATTCGAAA
64 -TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTCAAAA
* * *
44757 TAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAACATTCATAAGCAAGAGATTT-AAAA
126 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA
* * * *** ** * *
44812 CTAAAGTTATTTTTTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAATATC-ATTCTCAAA
1 ATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATTATCTATT-TCAAA
* * * **
44875 TCTTTATGA-TTTTTG-TTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATA
64 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-
* * * *
44936 AAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGT--GAA-AGATTTAAAAA
127 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
* * **
44987 ATAAATGTATTTGTCGAACT-AGTTCAAATAGTTA
1 ATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTA
45021 AGACCATTAA
Statistics
Matches: 3347, Mismatches: 774, Indels: 558
0.72 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
172 8 0.00
173 42 0.01
174 47 0.01
175 101 0.03
176 367 0.11
177 345 0.10
178 211 0.06
179 343 0.10
180 553 0.17
181 605 0.18
182 49 0.01
183 275 0.08
184 68 0.02
185 12 0.00
186 6 0.00
187 2 0.00
188 14 0.00
189 9 0.00
190 20 0.01
191 24 0.01
192 22 0.01
194 12 0.00
195 23 0.01
196 31 0.01
197 15 0.00
198 7 0.00
199 1 0.00
200 1 0.00
201 5 0.00
202 4 0.00
203 2 0.00
204 2 0.00
205 4 0.00
206 1 0.00
207 1 0.00
210 3 0.00
211 3 0.00
213 4 0.00
214 6 0.00
215 9 0.00
216 3 0.00
217 6 0.00
218 5 0.00
219 3 0.00
220 9 0.00
221 8 0.00
222 13 0.00
223 7 0.00
224 17 0.01
225 11 0.00
226 4 0.00
227 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAA
Found at i:41483 original size:536 final size:533
Alignment explanation
Indices: 40459--45064 Score: 2266
Period size: 536 Copynumber: 8.4 Consensus size: 533
40449 ATTTTTTATG
* * * * *
40459 AATACGTTCAAATAGTTATGATTATCTGAATAATTATCTATTTTAAATAATTATGACCTTTTGTT
1 AATA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA--TTTTGTT
* * * * * *
40524 TTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTCAAAAT-AAGTAATGCTAGTTTAT
63 TTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAA
* * * * *
40586 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTA-CGAGCAAGTTCAAAT
126 TAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAAT
* * * *
40650 AGTTATG-CT-TGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTA-TCATAA
187 AGTTAAGACTAT-TAT-AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAA
* * * * *
40711 AACAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG
248 AACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTTG
* * * * * * * *
40775 -AAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATA
311 AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGT-ATT
** * *
40838 T--CTACATGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
375 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* *
40900 TTTCTATTCATGCAAAA-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA
439 TTTCTATTCAT-AAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA
40964 TAAGAGATTTAAATACTAAATCTATTTACCAA
503 TAAGAGATTTAAA-ACTAAATCTATTTACCAA
* * ** * ** *
40996 AATAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATGATTATCTATCTCAAATCGTTATGATGTTTATTTT
1 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAT-TTTGTTTT
*
41061 GTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * *
41126 ATTCCAAAAATTAATAAGAGCTTTGAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTAAG
130 ATTCCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTAAG
* *
41191 ACTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTT
194 ACTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * * * *
41256 CAGTTCATACAAACTTATTCAGAATAAAATAATTGTTATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAG
259 CAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAG
41321 CAAGAGATTTAAAAAATATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAAC
324 CAAGAGATTTAAAAAA-ATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTATTTGACTATTTGAAC
*
41385 AATTATCTATTT-AAAGTCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCGTA
388 AATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * ** *
41448 AAAACTTATTTGAAAGAAAATAATACTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAACAAAAGATT
451 AAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT----AAGAGATT
****
41513 TAAAACTAAAGTCGT-TTTTTTGA
512 TAAAACTAAA-TC-TATTTACCAA
* * * * * * *
41536 ACTAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTT
1 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAT-TTTGTTTT
* * * *** *
41601 CTCATAAAACAATCTTTTTTTA-TCATACAAGCTTA-T-ATGGGCAAAATAATTCTAATTTAATA
65 GTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-GATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * ** * * *
41663 ATATTCCAAAAATTAGTGAGAGATTTAAGAAATAAATATATTTGCTGGACCAATTCAAATAGTTA
128 ATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
41728 AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCCTATAATAATTGT
192 AGACTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTAT
* * * **
41793 TTCAGTTTATA-AATGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAA
257 TTCAGTTCATACAA-GCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAA
** * * * * * * *
41856 TAAGCAAGAGATTCGAAAAGATAAATGT-GTTATCGAATAAGTTCAAAGAGT-TATGACTATTTG
320 TAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTATTTGACTATTTG
* * * *
41919 AATAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCA
385 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
* * * * * * * *
41982 TAAAAGCTTATCCAAAAGAAAATAATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAACTAAGAGA
449 TAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAA---ATTAA-TAAGAGA
* * *
42047 TTTAAAAAATAAAT-TAGTTGA-CTA
510 TTT-AAAACTAAATCTA-TTTACCAA
* * * * * * *
42071 AATAAGTTCAAATAATTATCG-CCATTTAAACAACTATTTATTTCAAATTATTATTACCTTTT-A
1 AAT-AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA--TTTTGT
* * * *** * * * *
42134 TCTATCATAAAACAATTGTTTTTAAAAAAATA-AATCTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAT
62 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATT--C--A--GATT-AAA-A-TAAT
* * * * * * * *
42198 AACT-ATTTGAACAAT-TATCTATTTCATATTGTTATAACATTTTATTCTATAATAAAACAAT-T
116 -ACTAATTT-AATAATAT-TCCA----AAAAT-TAATAAGA---GATT-TA-AA-AATA-AATAT
* * ** * * ** **
42260 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAA-TATTATGAAATAAC
166 G-TT-TATTGA-ACTAG----TTC-AAAT-AGTTAAGACT-A-TTA-TAACAATTAT-CTATTTC
* ** ** * * * *
42324 TAAGA-AATTTAAAAAATAAATATGTTT-G-C-TGAACCAATTCAAATAATTAAGACTAT-ATGA
218 -AA-ATCA-TTATGACCT---TTTGTTTAGTCAT-AA--AA--CAATTATTTCAG--T-TCAT--
* * * ** * ** * * * * *
42384 ACAA--TTATT-TGACTCAAATTGTTATGAACTTT-TGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGCT
267 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCT-AA-TTTAT-TAATAT-TTGAAA-AATTA-ATAAGC-
* * * * * * * * * * * ** *
42445 TGTAGAAATTTATTCGGAATAGAGTAAAACTAATTTAT-TAA-TATTTCAAAAATTTATAAGA-G
325 --AAGAGATTTA-----AA-AAAAT-AAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATA-GTATTTGACT
* * * * * * ** * *
42507 ATTTAGAA-AATAATTATATTTATAGAACCAATTCAAAT-A-ATTATAACTATT-T-A-AACAAT
380 ATTT-GAACAATTA-TCTATTT-CA-AATC-GTT---ATGACCTT-T-TGTTTTGTCATAA-AAC
* * * * * ** * * * * ** *
42566 TATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTATTTGTTAATAAAACAATATTTTTTTTTGTTAATATA
434 AAT-TGTTTCTATTCA-TA--AAAACTTATTCG-AAATAAAATAATA--CTAATTTATTAATAT-
* * ** * *
42631 AGTTTGTTCAAAA-TAA-AATA-ATACTAATTTCTTAA--TATTTATCAA
491 --TTTG---AAAATTAATAAGAGAT-TTAA-AACTAAATCTATTTACCAA
*** * * * * *
42676 CCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCATTTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTG
1 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA--TTTTGTTT
* * * ** * *
42741 TGTTATAAAGCAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAA
64 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * ** *
42806 TATTTCAATAATTAATAACTAAAAAATTTAAAACATAAATAT-TCTTATCAAACTAGATCAAATA
129 TATTCCAA-AA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAA-ATAAATATGT-TTATTGAACTAGTTCAAATA
* * * * * *
42870 GTTATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAA
188 GTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
* ** * * * *
42934 ATCATTTTGGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT-TAAGTTATCAATATTTTG-AAA
252 ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATA-TTTGAAAA
** * * * * *
42997 ATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAACGAACAAGTTTAAATA--ATTATGAT
315 ATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTATT-TGAC
* * * * * *
43059 TGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTT
379 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTT
* * * * ** *
43124 TCTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATC
441 TCTATTCATAAAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-A--
* *
43188 AGTAAAAGATCT--AA-TAAATCTA--T-CCGAA
502 A-TAAGAGATTTAAAACTAAATCTATTTACC-AA
* ** * *
43216 CA-AGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTT
1 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA--TTTTGTTT
* * * ** * *
43280 TGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA-AATATTAATTTATTAA
64 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * * * *
43344 TATTTTGACAAGTAA-CAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATG
129 TA--TT-CCAA-AAATTAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATA
* * *
43408 GTCATAAG--TATT-TGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTT-GTAATAAA
188 GT--TAAGACTATTAT-AACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAA
* * * * * * *
43467 ACAATTGTTTCAATTTATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCT-A
249 ACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATT-TGA
* * * * * * * *
43530 AAAATTAATAAGTAAGAGAATT-AAAAAATTAATCTATTTACCAATCATGTTCAAATAGT-TATG
312 AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTATTTG
* * * * *
43593 ACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTT
377 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT
* ** * * * *
43658 T-TGTTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
441 TCTATTCATAAAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT
* * * * * *
43720 AAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA
504 AAG---AGATTT-AAAACTAAATCTATTTAC-CAA
* * * *
43755 CA-CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTAGTTT
1 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA--TTTTGTTT
** * * * *
43819 TGTCATAAGCCAATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * **
43883 AATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAGCTAGTTTGAATAG
129 TATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
43948 TTATGACCATTCA-AATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTAGTTTTGTCATAAAACAA
189 TTAAGACTATT-ATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* ** * * *
44012 TTGTTTCTA-TTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAA
253 TTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATT-TGAAAAA
*** * ** *
44074 TTAATAAGTTGGAGATTT-AAAAAATAAATATGCTTAGT-TAACAAGTTCAAATAGTCATGTT--
316 TTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGT-AT-TTGA
** ** * **
44135 -TATTTGAATTATTAT-TATTTCAAATTTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTC
378 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * **
44198 TATTCATACAAAA-TTATTCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
443 TATTCATA-AAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
* * * *
44262 AAATTTAAGAATTAAATCTGTTTATCGAA
507 AGATTTAA-AACTAAATCTATTTA-CCAA
* * * *
44291 CAA-A-TTCAAATACTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATCATATTTGTTT
1 -AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAT-TTTGTTT
* * * * * * * * *
44354 TGTAATAAAACAAATGCTTCTGTTCATACAAACTTATT-ATGAGTAAAATATTGCTAAATTAATA
64 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-GATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * * * *
44418 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGCTTCGAAAAATAAATGTGTTAATTGAACTAATTCAAATAGTTA
128 ATATTCCAAAAATTAATAAGAGATT-TAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
44483 AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCCTTTGTTTATTCATGAAACAATTAT
192 AGACTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTAT
* ** *
44548 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTGTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATG
257 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATA
* *
44613 AGCAAGAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATA-AATTTGACTATTTGA
322 AGCAAGAGATTTAAA-AAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTATTTGACTATTTGA
* * *
44677 ACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC-ATTTCA
386 ACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
* * * *
44740 TAAATACTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA-TTTCAAACATTCATAAGCAAGAG
449 TAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAA-A-T--TAA-TAAGAG
****
44804 ATTTAAAACTAAAGT-TATTTTTTGA
509 ATTTAAAACTAAA-TCTATTTACCAA
* * *
44829 ACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAATATC-ATTCTCAAATCT-TTATGATTTT-TGT
1 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAAT-TATTATGATTTTGT-T
* * * *
44891 TTCTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAAATAATATTAATTTAA
63 TTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-ATTAAAATAATACTAATTTAA
* * * * *
44954 TAATATTCCAAAAATTAGTGAA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAACTAGTTCAAATAG
126 TAATATTCCAAAAATTAAT-AAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATAG
* * * *
45018 TTAAGACCATTA-AACTAATTATCTATTTCAAACCATTCTAACCTTTT
189 TTAAGACTATTATAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
45065 ATTAATATTT
Statistics
Matches: 3104, Mismatches: 677, Indels: 575
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
529 3 0.00
530 1 0.00
531 2 0.00
532 141 0.05
533 95 0.03
534 134 0.04
535 151 0.05
536 687 0.22
537 105 0.03
538 288 0.09
539 611 0.20
540 188 0.06
541 71 0.02
542 5 0.00
543 2 0.00
544 15 0.00
545 5 0.00
546 17 0.01
547 15 0.00
548 19 0.01
549 6 0.00
550 12 0.00
551 4 0.00
552 22 0.01
553 16 0.01
554 9 0.00
556 3 0.00
557 3 0.00
558 5 0.00
559 5 0.00
560 9 0.00
561 3 0.00
563 2 0.00
564 5 0.00
565 8 0.00
566 9 0.00
567 19 0.01
568 9 0.00
569 15 0.00
570 5 0.00
571 11 0.00
572 8 0.00
573 4 0.00
574 8 0.00
575 10 0.00
576 5 0.00
577 14 0.00
578 9 0.00
579 18 0.01
580 10 0.00
581 6 0.00
582 7 0.00
583 4 0.00
585 4 0.00
586 11 0.00
587 5 0.00
588 5 0.00
589 2 0.00
590 4 0.00
591 3 0.00
592 12 0.00
593 18 0.01
594 24 0.01
595 9 0.00
596 4 0.00
597 6 0.00
598 7 0.00
599 7 0.00
600 12 0.00
601 3 0.00
603 11 0.00
604 67 0.02
605 25 0.01
606 17 0.01
608 3 0.00
609 4 0.00
612 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (533 bp):
AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGATTTTGTTTTG
TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
TTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAC
TATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA
GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGCA
AGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTATTTGACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAAC
TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAACTAA
ATCTATTTACCAA
Found at i:43764 original size:539 final size:536
Alignment explanation
Indices: 42679--53305 Score: 3207
Period size: 540 Copynumber: 19.7 Consensus size: 536
42669 TTATCAACCC
* * *
42679 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCATTTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTGTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTG
* * * * **
42743 TTATAAAGCAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * *
42808 TTTCAATAATTAATAACTAAAAAATTTAAAACATAAATAT-TCTTATCAAACTAGATCAAATAGT
130 TTT-TACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTATCGAACTAGTTCAAATAGT
* * * *
42872 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATC
192 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATT
*** * * * * * * *
42937 ATTTTGGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATCAATATTTTGAAAATTAA
256 ATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * * * * *
43002 TAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAACGAACAAGTTTAAATAATTATGATTGTTTGAA
321 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* ** *
43067 CAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCA
385 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA--A-AATTGTTTCTATTCA
* * *
43132 TACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATCAGTAAAA
447 TACAAACTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAA
* * * *
43195 GATCT---AAT-AA-ATCTATCCGAACA
510 -ATTTAAAAATAAATATTTTTCTGAACA
**
43218 AGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* *
43283 CATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA-AATATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * *
43347 TTTGACAAGTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATGGTCA
131 TTT-ACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * *
43412 TAAGTATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACCTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGT
194 TAACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAT
* * * *
43475 TTCAATTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
258 TTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* * * * *
43540 AGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCAATCATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACA
323 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
43605 ATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGCA
387 ATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-GTTTCTATTCATACA
*
43669 AGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
451 AACTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTT-
43733 AAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
514 AAAAATAAATAT-TTTTCTGAACA
* * * *
43757 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTAGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
** * * *** * * *
43822 CATAAGCCAATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
** * * * * **
43886 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAGCTAGTTTGAATAGTT
131 T-TTACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTT
* * ** * * * * *
43950 ATGACCATTCAAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTG
193 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-GTTTTGTAATAAAACAATTA
* **
44015 TTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAAT
257 TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
** * ** ** * * ** *
44079 AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTAGTTAACAAGTTCAAATAGTCATGTTTATTTGAAT
322 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* ** * * **
44144 TATTAT-TATTTCAAATTTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACA
386 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACA
* *** * *
44208 AAATTATTCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAATTTAA
451 AACTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* *
44270 GAATTAAATCTGTTTATC-GAACA
516 -AAATAAATAT-TTT-TCTGAACA
* * * * * * * *
44293 AATTCAAATACTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATCAT-ATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * * ** * *
44357 AATAAAACAAATGCTTCTGTTCATACAAACTTATTAT-GAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * ** * * * *
44421 -TTT-CAAAAATTAA-TAAGAGCTTCGAAAAATAAATGTGTTAATTGAACTAATTCAAATAGTTA
130 TTTTACAATAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
44483 -AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCCTTTGTTTAT-TCATGAAACAATT
194 TA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTT-TGTAATAAAACAATT
* * * ** *
44546 ATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTGTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAA
256 ATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * *
44611 TGAGCAAGAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAAATT-TGACTATTT
321 TAAGTAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTA-CCAACAAGTTCAAAT-AATTATGACTATTT
*
44675 GAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC-ATTT
382 GAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TT
* * * * *
44738 CATA-AATACTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAACATTCATAAGCA
445 CATACAA-ACTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
44800 AGAGATTTAAAACTAAAGTTATTTTT-TGAACT
507 A-AAATTTAAAAATAAA--TATTTTTCTGAACA
* * *
44832 AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAATA-TCATTCTCAAATCT-TTATGAT-TTTTG-TTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT-TCAAAT-TGTTATGATCTTTTGTTTT
* * * * *
44893 CTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGAATAAAAATAATATTAATTTAATAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * * *
44958 A--TTCCAAAAATTAGTGAAAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAACTAGTTCAAATAGTTA
129 ATTTTACAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * ** *
45021 -AGACCA-TTAAACTAATTATCTATTTCAAACCATTCTAACC-TT-TTAT-TAATATTTAGAA--
194 TA-ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTAATA-AAACAATT
* ** *
45079 AATT-AA-TCAGTA-AGAG---ATTTAAAAAGTAAAATTGTTTACCAAACCCTTTCA--AATAGT
256 ATTTCAATTCA-TACA-AGCTTATTT-AAAA-TAAAA-T-AATA-CTAA---TTT-ATTAATA-T
* ** * * *** * ** * * *
45136 TTTGACTATTTGAATAA-TTATCTATTCCAATTCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAAT
309 TCT-AAAAATT-AATAAGTAAGAGATT-TAA---AAAATAA--ATCTA--TT-T-A-CCAACAA-
* * ** * * * **
45200 TGGTTC---T-ATTCAT-ACTATTAGTCAA-AATAAAATAATACTAAT--TTAATAATATTTTGA
360 --GTTCAAATAATT-ATGACTATT--TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATAACCTTTTG-
*** * ***** * * * **
45257 CACT-TAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCAAATTGCTAAAC-AATTTCAAATAGTAAGAC
418 TTTTGTCAT-A--AA-AAAATT-GTTTCT-ATTC--A-TAC-AAACTTATTTTGAATA--AA-A-
* * * * ** ***** * * *
45320 T-ATATGAA-TGATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
469 TAATATAAATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAAAATT-T-A-AAAATAAAT-AT
* *
45382 TTTTATCATACA
526 TTTTCTGA-ACA
** * * * ** ** *
45394 AGCTTATTCGAAATA-AAAT-A-AAATT--A-ATTTATTAATATTTCAAA-AATTA--ATAAGTA
1 AG----TTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT--TATTTCAAATTGTTATGAT-CTTT
* *** *** * * * * *
45450 AGAGAT-T--TAAAA-AA-TAAATCTGTT--T---A-CTGAATTAG-TTCAAATAATTATGACTA
58 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA-TATTA--A
** ** * ** ***** * * *
45503 TTTGAGCAATTATCAATCCAAATCGTTAAGATCTTTTATTTCGTCATAAAA-CAAT-TGTTTCT-
120 TTT-ATTAA-TAT-TTTAC-AAT-AATAAG-TAAAAGA-TT--T-AAAAAATAAATATGTTTATC
* ** * * * * * *
45565 GATCATAAAGCTT-ATTTAGTTAAAAATA-AT-ACTAATTTAATAATATTTCAAA-AATTAAT-A
175 GAAC-T--AG-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA-TT-AT-CTATTTCAAATCATT-ATGA
** ** ** * * * * * *
45625 AGTAAGAGATT-TAA-AAAATAAATGTGTTTGCCGAA-CCAGTTCAA--ATAGTTAAAACTATTA
232 CCTTTG-TTTTGTAATAAAA-CAAT-TATTT--C-AATTCA-TACAAGCTTATTTAAAA-TA--A
* *** ** * * * * *
45685 GAATAATTA-TATATTT-TAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTTAGAAAATATTTGTTTCATAT
287 -AATAA-TACTA-ATTTATTAAT-ATTCTAA-AAATTAATAAG-T--AAGAGA----TTT-AAAA
** * * * * * * * *
45748 CTTACAATCTTATTCA-AAATAAAATAATCCAAAT--TTATTAAC-ATTTGAAAAATTA-ATA-A
339 AATA-AATC-TATTTACCAA-CAAGT--T-CAAATAATTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * ** * ** * * * *
45807 GGAAA-AGTTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTGATTACTATTTGA-AC
397 TCAAATCG-TT-ATAACCT---TTTG-TT-TTG-TC-A-TAAAAAAATTG-TTTCTA-TTCATAC
* * ** * ** * *
45870 -AA-TTA-TTT-ATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGAA-A-TAAAAAAATTATTTCAGTA
450 AAACTTATTTTGA-ATAAAAT-AATAT-A--AATT-TATT-AATATTTCAAAAATTA-ATAAG--
* * * *
45929 TATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTAATTTCTTAA-T
505 TA-AAAA--TT-T---AAA-AATA-AATA-T-TTTTCTGAACA
* * * * * *
45971 ATTTCAAA-AATTAATAAGCAATAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACAAATTCAAATAG
1 AGTTCAAATAGTT-AT--G-ACTA-TTT----GAA-CAATTA-TTTA-T-------TTCAAATTG
* ** *
46035 TTATGCT-TATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACA
47 TTATGATCT-TTTG---TTTTGTC-A--TAAAA-CAAT-TG---TTTCTG---T-TCAT---ACA
* * * * *
46098 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAAT
93 A--GCTT--ATT--T----G--GATT-AAAAT--AAT-AT--TAATTTATTAATATTT-TACAA-
** * * ** * * * * **
46163 TAATAAGTAAGCGATTTCAAAAGTAAATCGGTTTA-CCAAATCAGTTCAAATAATTGT-GGTCAT
138 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTATAACT-AT
* * * ** * * * * * * **
46226 TTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTTTTTAT
201 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTAATAAAACAATT-ATTTCAAT
* * * * *
46291 T-ATACAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAAT-CTCTCAAAA-T--TAA-TAA
264 TCATAC-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
46350 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAAT-AGT-TGACTATTTGAATAAATGT
328 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** * * * ** *
46413 ATACTTCAAATAGTTATAACCTATTGTTCCGTCATAAAACAATTATTTCTGTTTTTACAAGCTTA
392 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAACTTA
*** * ** * * *
46478 TTCAAAATAAAATAATACT-AATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA
457 TTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAA
* *
46542 TAAAT-TTGTTTGCTAAACC
519 TAAATATT-TTT-CTGAACA
*
46561 AGTTCAAATAG-T-T-AC-----G-AC---TA--TATTTC-AA-----ATCAT-TTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * * * *
46605 CATAAAATAATTTTTTCAATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTCACA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* ** * * * * * * * * * * *
46669 CTAAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTTAAATAATTA
130 TTTTACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
46734 TGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAAT-AGCTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAAATG
194 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTA
*** * ** * * * * * *
46798 TTTTTGTTCGTGTAAGTTTGCTCT-GAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTA
257 TTTCAATTCATACAAGCTT-ATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTA
* * * * * *
46861 ATAAG---G-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGATCAAGTTCAAATCATTATGATTATTTGT
320 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * * * * * *
46922 GCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTTTTTGTTATAAGACAATAGTTTTTGTTCAT
384 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAT
* * * * ** * * * *
46987 ATAAGCTTA-TTCGGATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTAACAATTACTAAATAAAAAC
448 ACAAACTTATTTTGAAT-AAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAA-
* * * * *
47051 TTTAAAAAATAAGTATGCTTACCGAACT
511 TTT-AAAAATAAATAT-TTTTCTGAACA
* * * * * *
47079 AGATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTGTTTCAAATGGTTATGA-CATTTTCTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTT
* * ** * * * *
47142 GTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * * * * * * *
47207 ATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTTGTCGAACAAGTTTAAATAAT
129 ATT-TTACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * **
47272 TTTGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT
192 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATT
* * ** ** *
47337 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-T-TAAGCCAATT
256 ATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA--AAATT
* ** ** *
47400 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAA-TATCAAATCTTTACGACTATTT
319 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAACAAGT-TCAAATAATTATGACTATTT
* * * ** * * * *
47464 GAAAAATTATTTATTTCAAATTGGAATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TCA
382 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCA
*** * * ** *
47528 TACATGTTTATTTCT-ATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAGAA
447 TACAAACTTATTT-TGAATAA-AATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AA
* *
47591 TATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACA
509 AATTT-AAAAATAAATAT-TTTTCTGAACA
* * * * * * ** * * *
47621 AGTTCAACTAGTCATAATTAGTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
47686 AATAAAAAAATTATTT-TAGCTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
** * * * ** * *
47750 TTCCAAAAATTAATGAG-AAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTA-CATAAC-ATGTTCAAAT
130 TT-TTACAA-TAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGT-TTATC-GAACTA-GTTCAAAT
* * * *
47811 AGTTATGACTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAA
189 AGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACA
* * * * * *
47876 ATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAGAAAT
253 ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * * *
47941 TAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-TGTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATT
318 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACC-AACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * * *
48005 TGAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAACATTTGGTTCTATT
381 TGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATT
* * * * *
48069 CATGCAAGCATATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
445 CATACAAACTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * *
48134 ATTTTAAAATAAAGATATTTTCTAAACA
510 ATTTAAAAATAAATAT-TTTTCTGAACA
** * * * * * *
48162 TTTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTA-GATATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
48226 CATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATGAAATAATACTAACTTATTAAAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
48291 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAGCAAGTTCAAATAATTA
131 T-TTACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
48356 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
194 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAT
* * * ** *
48421 TTCTATTGATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
258 TTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* * * * * * * * *
48486 AGTTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGCTT-AAATAGTCATGTCCATTTGAA
323 AG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACAAG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * * ** *
48549 CTATTATCTATATCAATTTGTTATTATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
385 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATAC
* *** *
48614 AAAATTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AAGAATTT
450 AAACTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTT
*
48675 AAAAACTAAATCTTTATAT-TGAACCA
514 AAAAA-TAAATATTT-T-TCTGAA-CA
* * * * * * *
48701 A-TTCAAATAATTATGATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT-ATTT-TTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
48763 CATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAAT-ATTAATTTATTAATA
* ** * * *
48827 --TT-C-----TAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAATTCAAATAGATA-
130 TTTTACAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAT
** * * * * * * * *
48882 AGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGGCCTTT-TGCTTGTCATAAAATAGTATT
195 A-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGT-TTTGTAATAAAACA--ATT
* * * * **
48946 -TTT-AGTTCATGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTC-AGAAAATTA
256 ATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTA
** * * * * * * *
49008 ATAAACAACAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTT
320 ATAAGTAA-GAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* *** * * * * * * * *
49073 GAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCATTTGTTGTATCATAAAATAATTTTTTCAATTTA
382 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCA
* * * * * * *
49138 TA-AAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAATTGATATATTAGA
447 TACAAA-CTTATTTTG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAA
* ** *
49201 GATTT--AAA-AAATA--CATC-GAACT
509 AATTTAAAAATAAATATTTTTCTGAACA
* * * * ** ** *
49223 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTACAAACTTTT-TTTT-T
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * *
49286 CATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAGTATTAATTTATTAAAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * *
49351 TTCAAAAATTAAT-AGGAAGGAGATTTAAAAAAT--ATATCTATT-T---ACT-G----AATCAG
131 TT-TACAA-TAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTATCGAACTAGTTCAAAT-AG
* * ** * * * * ** *
49404 TT-T--CTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCGTAAAATAAT
191 TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAAT
* * ** * **
49466 TGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCCAAAATTA
255 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * ** * * * *
49531 ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGTAGCTT-AAACAGTTAAGACTATATG
320 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAACAAG-TTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * * *
49595 AACAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGGTCA
383 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCA
* * *** * *
49659 TAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT---TA
447 TACAAACTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAA
* *
49720 TTTAAAAAGTGAAT-TTGTTTATCGAATCA
511 TTTAAAAA-TAAATATT-TTTCT-GAA-CA
* * * * *
49749 A-TTCAAATAATTATGA-TCATGTT-ATCAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-AT-TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTT
* ** * ** * * *
49811 GTCATATAACAATTGTATT-TGAGCATTCAATTTTATTTGGAATACAATAATACT-ATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * * * * *
49874 TCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTTAAACAA
128 TATTTT-ACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAG
** * * ** * ** * *
49939 CAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
191 TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAAT
*** ** * * * *
50004 TATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTATGAAAATTA
255 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * * *
50069 A-AGGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCCAATATTTAAGACTATAT
320 ATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * **
50132 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTTTTTTGAATT
382 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-ATTGTTTCTATT
* * * * * *
50197 CATA-ATAACTTACTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATTTTTCAAAAATAAATAAGTAAG
445 CATACA-AACTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-
* * ** * *
50261 AGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-ATCC
508 AAATTT-AAAAATAA--ATATTTTTCTGAACA
* * * * * * ** *
50292 AGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * ** * *** * * *
50357 CATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAATTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA
66 CATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
50421 TTTCA-AATATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTATTTCAAATAGTTTT
130 TTTTACAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAT
* ** * * * * * * *
50484 GACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTT
195 AACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATT
* * ** * * ** *
50548 TCTATTCATACATGCTTATTTGGACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTGATAA
259 TCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * * * * * * * *
50613 GTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAA
324 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* *
50676 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAA-TGTTTC-AGTTCATATA
388 TTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTA-TTCATACA
* *** * * * * *
50739 AGCTTATTCAAAATAATACAATACT-AATTTATTAGTAATTAAAAAATTAATAA-TAAAAAAATT
451 AACTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAAAATT
* * * * *
50802 TAAAAAGATTAATCTGTTTACTAAAAA
513 T-AAAA-ATAAATAT-TTTTCTGAACA
* * * * * * * *
50829 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * *
50894 CACAAAAGAATT-TTATCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAAT-TCAAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAT-TAATTTATTAAT
** * * * * * * * *
50957 ATTAAGACAATTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACCAAACAAGTTCAGATCG
129 ATT-TTACAA-TAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAG
* ** * * ** * * * *
51022 TTATGACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCTTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
191 TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
* * * * * * * *
51087 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCGACAATT
255 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * * *
51151 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTT
319 AATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACC-AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * * * * *
51215 AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCA
382 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCA
* * * * * *
51280 TA-TAAGTTTTATTTAAAGTAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAG
447 TACAAACTTAT-TTTGAA-TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-
** * * ** *
51343 AGAA-CAAAAAAAAGAATCCA-TTTACCAAATA
508 A-AATTTAAAAATA-AAT--ATTTTTCTGAACA
* * * * * *** * *
51374 AGTTCAAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTGTTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
51439 CACAAAATAAGTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAAT
66 CATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATT-AATTTATTAAT
* * * * * *
51502 A-TTT-C-A-AA-AA-T--TA-A--TAAGAAAA-AAACATGTTTTTTGAAC-ACATTTAAATAGT
129 ATTTTACAATAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAATAAATATGTTTATCGAACTA-GTTCAAATAGT
* ** * ** *
51554 TATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTCATCAT-AAACTAAT
192 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTAATAAAAC-AAT
* **** * * * *** * *
51617 TGTTTTTGCTCACAAAAACTTATTCGGAATAGAAATAATACTAAATTATTAAAATTCTAAAAATT
255 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * ** * * *
51682 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
319 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * ** *
51747 AACGATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCAT
383 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAT
** *** * ** *
51811 ACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-GTCTAAAAATTAATAAGTTGGAG
448 ACAAACTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAA
* *
51874 ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACA
510 ATTT-AAAAATAAATAT-TTTTCTGAACA
* * * * * * ** *
51903 AATTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTATG-GCATTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTT
** * ** ** * * * *
51966 GTTGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAAATTATTCAGAATCAAGTAATACTAATTTATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * ** * * * * *
52030 A-TTT-CAAAAATTAA-TAAGACATTTAAAAGCTAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTT
129 ATTTTACAATAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
52092 ATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAAT-AGTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTG
193 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTAATAAAAC-AATTA
* * * * ** *
52156 TTTCTATTCATGCAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAA
257 TTTCAATTCATACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* ** * * * * *
52220 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCAGTT-ATAATAGTTAAGACTATTAGA
321 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACAAGTTCA-AATAATTATGACTATTTGA
* * * * * **** *
52284 ATAATTGTCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCA-AAATTTTTTTTTTC-AGTTCAT
384 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCAT
* * * * *
52347 ACAAGC-TAATTTGAAATAAAATAATATAATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAA
448 ACAAACTTATTTTG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--TAAA
* * * *
52410 ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATA
509 AATTT-AAAAATAAATAT-TTTTCTGAACA
* * * * *
52440 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * **** * *
52505 CATAAAACAATTATTT-TAGTTTAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCT-G-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * *** * * *
52568 ATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATCA-GTTTATCGAATTAGTTCAAATAA
129 ATTT-TACAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAG
** * * * * * *
52632 TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTATTTTGTTATAAAACAA
191 TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-AC-CTTTGTTTTGTAATAAAACAA
* ** *
52697 TTATTTTTC-A-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAA
254 TTA--TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * * * * *
52759 ACTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATTACTAT
316 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACAAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
52824 TTGAATAATTATATA-TT----TC---A-AA------------TCATAAAATAATT-ATT-TGTT
380 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATT
* * ** * * * * * *
52866 CACACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-TATCTACTAATATTAT-GAAAATCAATAACTAA
445 CATACAAACTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA
* *
52929 GAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTGTCGAACTA
508 -AAATTT-AAAAATAAATATT-TTTCT-GAAC-A
* ** * * * * * *
52962 A-TTCAAATAGTTAAGGTTATATGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * * *
53026 CGTAAAACAAATATTTCTGTTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATAACATTTATTTTTTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
53091 TTTGA-AA-ATTAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAATCTATTTACCAAACCAATTCAAGTAGTTAT
131 TTT-ACAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
53151 AACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTT
195 AACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTATT
* * * * * * * *
53216 TCTATTGATA-TAGTCTTATTTAGAATAAAGT-ATGCTAATTTATTGATATTCAAAAAATTAATA
259 TCAATTCATACAAG-CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* *
53279 AATAACG-GATTTAAAAAATGAATCTAT
323 AGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTAT
53306 GGCCTGACCA
Statistics
Matches: 7592, Mismatches: 1836, Indels: 1346
0.70 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
512 4 0.00
513 48 0.01
514 76 0.01
515 185 0.02
516 23 0.00
517 46 0.01
518 99 0.01
519 9 0.00
520 18 0.00
521 263 0.03
522 86 0.01
523 176 0.02
524 23 0.00
525 117 0.02
526 128 0.02
527 185 0.02
528 58 0.01
529 121 0.02
530 91 0.01
531 174 0.02
532 164 0.02
533 102 0.01
534 30 0.00
535 100 0.01
536 605 0.08
537 397 0.05
538 644 0.08
539 521 0.07
540 728 0.10
541 218 0.03
542 548 0.07
543 195 0.03
544 299 0.04
545 278 0.04
546 65 0.01
547 13 0.00
548 7 0.00
549 10 0.00
551 13 0.00
552 14 0.00
553 2 0.00
554 10 0.00
555 8 0.00
556 13 0.00
557 18 0.00
558 17 0.00
559 7 0.00
560 15 0.00
561 13 0.00
562 14 0.00
563 11 0.00
564 15 0.00
565 8 0.00
566 31 0.00
567 20 0.00
568 8 0.00
569 8 0.00
570 7 0.00
571 16 0.00
572 19 0.00
573 34 0.00
574 9 0.00
575 23 0.00
576 16 0.00
577 24 0.00
578 9 0.00
579 7 0.00
580 4 0.00
581 1 0.00
584 1 0.00
585 1 0.00
586 2 0.00
587 5 0.00
588 7 0.00
589 4 0.00
590 11 0.00
591 4 0.00
592 4 0.00
594 7 0.00
595 6 0.00
596 3 0.00
597 5 0.00
598 2 0.00
599 6 0.00
600 13 0.00
601 6 0.00
602 6 0.00
603 7 0.00
604 9 0.00
605 7 0.00
606 2 0.00
607 4 0.00
608 3 0.00
609 15 0.00
610 9 0.00
611 12 0.00
612 8 0.00
613 6 0.00
614 4 0.00
615 1 0.00
617 1 0.00
618 4 0.00
620 1 0.00
622 2 0.00
623 1 0.00
624 1 0.00
626 5 0.00
627 6 0.00
628 13 0.00
629 3 0.00
630 5 0.00
631 15 0.00
632 25 0.00
633 18 0.00
634 11 0.00
635 2 0.00
636 2 0.00
637 8 0.00
638 8 0.00
639 4 0.00
640 8 0.00
642 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (536 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
TTTACAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATA
ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTC
AATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA
TCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAACTT
ATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATA
AATATTTTTCTGAACA
Found at i:43978 original size:360 final size:359
Alignment explanation
Indices: 42679--53305 Score: 4052
Period size: 359 Copynumber: 29.5 Consensus size: 359
42669 TTATCAACCC
* * * * *
42679 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCATTTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTGTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * *
42744 TATAAAGCAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
42809 TTCAATAATTAATAA-CTAAAAAATTTAAAACATAAATAT-TCTTATCAAACTAGATCAAATAGT
131 TCCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
42872 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATC
194 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
* * * * * * *
42937 ATTT-TGGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATCAATATTTTGAAAATTA
259 GTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTA
* * *
43001 ATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAAC-GAACA
321 ATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * * * * * *
43041 AGTTTAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *
43106 CATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAA
66 CATAAAA-CA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
43171 TATT--AAGACAATTAATCAGTAAAAGATCT----AATAAATCTA--T-CCGAACAAGTTCAAAT
128 TATTCCAA-A-AATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAAT
** * ** * * *
43227 CTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
191 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
* * * * * *
43292 ATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAAG
256 ATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAAAAT
*
43356 TAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACA
319 TAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * * * * ** *
43398 AGTTCAAATGGTCATAAGTATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACC-TTT-TTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
43460 TAATAAAACAATTGTTTCAATTTATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
43524 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTA-CCAATCATGTTCAAATAG
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAG
* *
43588 TTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
* *
43653 TGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATT
258 T-GTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATT-TAAAAATT
*
43717 AATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
320 AATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* *
43757 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTAGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * *
43822 CATAAGCCAATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * **
43886 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAGCTAGTTTGAATAGTT
131 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * * *
43950 ATGACCATTCAAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTG
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* * ** *
44015 TTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAAT
260 TTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
** * ** *
44079 AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTAGTTAACA
323 AAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* ** ** * *
44117 AGTTCAAATAGTCATGTTTATTTGAATTATTAT-TATTTCAAATTTTTATGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** ** * * *
44181 CATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
44246 TTCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAGAATTAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATACTTA
131 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
44307 TGGCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTAT--CATATTTGTTTTGTAATAAAACAAA-T
196 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA-AAATT
* * * * * * * *
44369 GCTTCTGTTCATACAAACTTA-TTATGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTTCAAAAATTA
259 GTTTATGTTCATACAAGCTTATTTA-GAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT-AAAAATTA
* ** * *
44433 ATAAG---AGCTTCGAAAAATAAATGTGTTAAT-TGAACTA
321 ATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TTCTGAAC-A
* * ** * * *
44470 A-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACCCTTTGTTTAT-
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT-TG
* * **
44533 TCATGAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTGTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
44597 ATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATA
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAAT-
* **
44662 AATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
191 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * *
44725 AATTGTTTCAT-TTCATA-AATACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAA
255 AATTGTTT-ATGTTCATACAA-GCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT-AA
* * * * *
44787 ACATTCATAAGCAAGAGATTT-AAAACTAAAGTTAT-TTTT-TGAACT
315 AAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAA--TATGTTTTCTGAACA
* * *
44832 AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAATATC-ATTCTCAAATCT-TTATGA-TTTTTG-TTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
44893 CTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAAATAATATTAATTTAATA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
44956 ATATTCCAAAAATTAGT--G--AAAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAACTAGTTCAAATA
127 ATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
45017 GTTAAGACCA-TTAAACTAATTATCTATTTCAAACCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TTAGAAA
192 GTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTT--T-TGTCATAAA
* * * * * * * * ** *
45080 ATTAATCAG-TAAGAGATTTA-AAAAG-TAAAATT-GTTTACCAAACCCTTTCAA-ATAGTTT-T
253 A-AAAT-TGTTTA-TG-TTCATACAAGCT-TATTTAGAATA--AAA-----T-AATATAATTTAT
* * * * * * * * ** ** *
45139 GACTATTTGAATAATT-ATCTATTCCAA-TTCATTATAACCT-TTTAT-TTTGTCATCAAACA
305 TAATATTT-AAAAATTAAT-AAGT-AAAGAT--TTAAAAAATAAATATGTTT-TC-T-GAACA
* *
45198 ATTGGTTC---TA-TTCAT-ACTATTAGTCAA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATAT-TT-T
1 A---GTTCAAATAGTT-ATGACTATT--TGAACAAT----T-AT-CT-ATTTCA-AAT-TGTTAT
****** ** *** * *
45255 GACACTTAATAACCAAGAAAATTAAAA-AA-TAAATCAAATTGC-TA-AA-C-AATTTCA-AATA
51 GAC-CTT--TTGTTTTG-TCA-TAAAACAATTGTTTC-TATT-CATACAAGCTTA-TTCAGAATA
* * * * * * **** * *
45313 GTAAGACT-ATA-TGAA-TGATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
108 --AA-A-TAATACT-AATTTATTA-ATATTCCAAA-AATTAATAAGCAAAAG-ATT-T-AAAAAA
* * * * ** * * ** *
45374 CAATTGTTTTTTATC-ATACAAGCTTATTCGAAATA-AAAT-A-AAATT-AATTTATTA-ATATT
163 TAAAT-CTATTTATCGA-ACAAG----TTC-AAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATT
* * ** ** * *
45433 TCAAA-AATTAATAA--GTAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAATT-AGTTCAA--
220 TCAAATCATT-ATAACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA-AAAT-TGTTTA-TG--TTCA-TACAAGC
* * ** ** ** ** * * * *** *
45490 ATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCAATCCA--AATCGTT-AAGATCT-TTTA-TTTCG--TC
277 TTATTTA-GA--A-TAAAATAA-TAT-AATTTATTAATATTTAAAAAT-TAATAAGTAAAGATTT
* * *
45548 ATAAAA-CAAT-TG-TTTCTGATCATAA
335 AAAAAATAAATATGTTTTCTGA--A-CA
** ** * * * * * ** **
45573 AGCTT-ATTTAGTTAAAAATA-AT--ACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT-TAAT-A-AGTAAG
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AA-TT-AT-CTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTG
** * * * ** * * *
45631 AGATT-T-AAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAA--ATAGTT-AAAACTATTAGAATAA
60 -TTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTT--CTATTCA-TACAAGCTTA-TTCAGAA-TA--A-AATAA
* * *** * * * * ***
45691 TTA-TATATTT-TAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTTAG-AAAATATTTGTTTCATATCTTAC
114 -TACTA-ATTTATTAAT-ATTCCAA-----AAATTAATAAGCAAAAGA----TTT-AAAAAATA-
* ** * * * * * ****
45753 AATCTTATTCAAAATAAAATAA-TCCAAAT--TTATTAAC-ATTTGAAAAATTA-ATAAGGAAAA
165 AATC-TATT---TATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* ** * ** * * *
45813 GT--TTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTGATTACTAT-TTGA-ACAA--
225 -TCATT-ATAACCT---TTTG-TT-TTG-TC-A-TAAAAAAATTG-TT--TATGTTCATACAAGC
** * * * **
45872 TTATTTA-TTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGAA-ATAAAAAAATTATTTCAGTATA-TAA
277 TTATTTAGAATAAAAT-AATAT-A---ATT-TATT-AATATTTAAAAATTA----A-TA-AGT-A
* * ** * *
45934 AAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTAATTTCTTAA-T
328 AAGATT-T--AAAA-AATA-AATA-TGTTTTCTGAACA
* * * * * * *
45971 ATTTCAAA-AATTAATAAGCAATAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACAAATTCAAATAG
1 AGTTCAAATAGTT-AT--G-ACTA-TTT----GAA-CAATTA---T-CT-----ATTTCAAATTG
* ** * * *
46035 TTATG-CTTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
47 TTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-A--TAAAA-CAAT-TG----TTT-CTAT-TCAT-------
* * *
46099 TTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATT
90 --------A--C----AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* ** * * ** * * * * *
46164 AATAAGTAAGCGATTTCAAAAGTAAATCGGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTGTG-GTCATT
141 AATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATT
* * ** * * * * * *
46227 TCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTT-TTTAT
204 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTATGT-T
* * * * * * *
46291 TATACAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTCTCAAAATTAATAAG---AG
268 CATAC-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAG
* * * * *
46353 ATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACC
331 ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * * * * * **
46382 AGTTTAAATAG-T-TGACTATTTGAATAAATGTATACTTCAAATAGTTATAACCTATTGTTCCGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * **
46445 CATAAAACAATTATTTCTGTTTTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
46510 TCCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAGTTCAAATAG-
131 TCCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGT
*
46572 T-T-AC-----G-AC---TA--TATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
194 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
* * * * * * * * *
46617 TTTTCA-ATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTCACACTAAAAAATTA
259 GTTT-ATGTTCATAC-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTAAAAATTA
* * * * * * *
46680 ATATGCAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACT
321 ATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * * * * *
46720 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATAGCTATGACCTTTTGTTCTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * ** * * *
46785 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCGTGTAAGTTTGCTCTGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
46850 TTCAAAAATTAATAAG----GGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGATCAAGTTCAAATCA-TT
131 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTT
* ** * ** * * * * * * *
46910 ATGATTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTTTTTGTTATAAGACAATA
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
* * * * * *
46975 GTTTTTGTTCATATAAGCTTA-TTCGGATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTAACAATTA
259 GTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTA
* * * * * * * *
47039 CTAAATAAAAACTTTAAAAAATAAGTATGCTTACCGAACT
321 ATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * *
47079 AGATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTGTTTCAAATGGTTATGACATTTTCTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
47143 TCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*** ** * * * * * * *
47207 ATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTTGTCGAACAAGTTTAAATAAT
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * **
47272 TTTGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT
194 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
* * * * * *
47337 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TTAAGCCAATTA
259 GTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTAA--AAATTA
* *
47401 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-TGAACA
321 ATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
** * * * ** * *
47441 A-TATCAAATCTTTACGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGAATGACTTTTTGTTTTA
1 AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
47505 TCATAAAATAATTGTTTCTA-TCATACATGTTTATTTC-TATTAACAA-AATATTAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAA
*** * * * * * * * * *
47567 TATTTTGACAATTAATAAGTAGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAACTAG
128 TATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
47632 TCATAATTAGTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTAATAAAAAAAT
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
* * * * *
47697 TATTT-TAGCTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTCCAAAAAT
258 TGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAAT
* * * ** * *
47760 TAATGAGAAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTACAT-AACA
319 TAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGT-TTTC-TGAACA
* ** ** *
47802 TGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
47867 AATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
47930 ATTCTAGAAATTAATGAG-AAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-TGTTACCAAACATGTTCAAATA
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCGAACAAGTTCAAATA
* * * * *
47993 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAACA
192 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
* * * * * * * *
48057 TTTGGTTCTATTCATGCAAGCATATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
256 ATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTT-AAAAAT
* * * * *
48122 TAATAAGTAAAAATTT-TAAAATAAAGATATTTTCTAAACA
319 TAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
** * * * * **
48162 TTTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTA-GATATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
48226 CATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATT-TGAAATGAAATAATACTAACTTATTAAAA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
48290 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAGCAAGTTCAAATAATT
130 TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
48355 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* * * * *
48420 TTTCTATTGATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
260 TTTATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAA
* * * ** **
48484 TAAGTTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCAAACA
322 TAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * * * **
48523 AGCTT-AAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATATCAATTTGTTATTATATTTTGTTTTG
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** *
48587 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
48652 TTTCAAAAATTAAT-A--AAGA-ATTTAAAAACTAAATCT-TTATATTGAACCAA-TTCAAATAA
130 TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TATCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * **
48711 TTATGATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--TATTT-TTTTGTCATAAAGCAA
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAAAAA
* * * * * * *
48773 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGATAAATTAATAATA-TT-----CTA
257 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTAAAAATTA
* * **
48832 AT-A--AAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTA
321 ATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAAC-A
* * ** * * * * *
48869 A-TTCAAATAGATAAGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGGCCTTTTG-CTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * **
48932 CATAAAATAGTAT-TTT-TAGTTCATGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGC
66 CATAAAACAAT-TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
48995 ATT-CAGAAAATTAATAAACAACAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTGAAAT
129 ATTCCA-AAAATTAATAAGCAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
49059 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCATTTGTTGTATCATAAAATA
191 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
* * * * *
49124 ATTTTTTCAAT-TT-ATAAAAGCTTATCT-GAAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAA
256 ATTGTTT--ATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAA
* * * * *
49186 AATTGATATATTAGAGATTTAAAAAAT--ACA-----TC-GAACT
316 AATTAATA-AGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * ** ** *
49223 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTACAAACTTTT-TTTT-T
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * *
49286 CATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAGTATTAATTTATTAAAA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
49350 TTTCAAAAATTAAT-AGGAAGGAGATTTAAAAAATATATCTATTTA-CTG---AA--TC----AG
130 TTCCAAAAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAG
* * * ** * * * * *
49404 TT-T--CTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCGTAAAATAAT
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
* * * * **
49466 TGTTTCA-ATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCCAAAATT
258 TGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAATT
* * * **
49530 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGT
320 AATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * ** * * *
49571 AGCTT-AAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCATTTGTTTTA
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
49635 TCATAAAACAATTGTTTC-AGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * *
49699 ATTCCAAAAATTAATAAG----TTATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAA
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAG
* ** * * *
49759 TTATGA-TCATGTT-ATCAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACA
193 TTATGACT-AT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
** * ** * * *
49822 ATTGTATT-TGAGCATTCAATTTTATTTGGAATACAATAATACT-ATTTATTAATCTTTTAAAAA
256 ATTGT-TTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT-ATTTAAAAA
* * *
49885 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACT
318 TTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * *** ** * *
49928 AGTTTAAACAACAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
49993 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATATAATAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * * * * * * *
50057 TTATGAAAATTAA-AGGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCCAATAT
130 TTCCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * *
50120 TTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAG
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-
* * * * * *
50185 GTT-TTT-TGAATTCATA-ATAACTTACTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATTTTTCAAA
256 ATTGTTTATG--TTCATACA-AGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTT-AAA
* * * * * * *
50247 AATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-ATCC
316 AATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * * * * **
50292 AGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * *
50357 CATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAATTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA
66 CATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
50421 TTTCAAATATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTATTTCAAATAGTT
130 TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
50482 TTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTG
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* * * * * ** *
50546 TTTCTATTCATACATGCTTATTTGGACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTGAT
260 TTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* *
50611 AAGTAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACT
323 AAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * * *
50647 AGATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
50712 CATAAAAGAAATGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAATACAATACTAATTTATTAGTA
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-
* ** * * * * * *
50776 ATT-AAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAAGATTAATCTGTTTA-CTAAAAAAGTTTAAATA
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATA
* * * *** * *
50839 ATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAAGAA
192 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
* * * *
50904 TT-TTATCTATTCATACAATCTTATTTCA-AATAATATAAT-TCAAATTTATTAATA-TTAAGAC
257 TTGTT-TATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATAT--AATTTATTAATATTTAA-A-
* * * * **
50965 AATTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACCAAACA
316 AATTAATAA-GT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * *** * * * * *
51011 AGTTCAGATCGTTATGACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
51076 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * ** * * *
51141 TTCGACAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTC
131 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
51205 ATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTG
195 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* * * *
51270 TTTCA-ATTCATATAAGTTTTATTTA-AAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
260 TTT-ATGTTCATACAAG-CTTATTTAGAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAATT
* ** * *** * ** *
51333 AATGAGTAAGAGA-ACAAAAAAAAGAATCCATTTACCAAATA
320 AATAAGTAA-AGATTTAAAAAATA-AATATGTTTTCTGAACA
* * * * *** *
51374 AGTTCAAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTGTTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
51439 CACAAAATAAGTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAAT
66 CATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * *
51502 ATTTCAAAAATTAATAAG---AA-A---AAAACAT--GT-T-TTT-T-GAACACA-TTTAAATAG
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA-AGTTCAAATAG
* * * ** **
51553 TTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTCATCATAAACTAAT
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
* * * * * ** * *
51617 TGTTTTTGCTCACAAAAACTTATTCGGAATAGAAATAATACTAAATTATTAAAATTCTAAAAATT
258 TGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA-AAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAATT
** * *
51682 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATGAGCG
320 AATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * ** **
51723 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTT-TTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
51787 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAG
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* **** * * ** * *
51852 TCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAATTCAAATAGTCA
131 TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * ** * ** *
51917 T-ATCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTATGGCATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTG
196 TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* ** * * *
51981 TTT-TATTCATACAAAATTATTCAGAATCAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
260 TTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* ** * * ** *
52045 AAG---ACATTTAAAAGCTAAATTTGTTTACCAAACC
323 AAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * *
52079 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATAG-TATGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *
52142 CATAAAACAAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTCTGAATAAAATAATGCTAAACTAATAATA
66 CATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** ** * *
52207 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCAGTT-ATAATAGT
130 TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCA-AATAGT
* * * * * * ****
52271 TAAGACTATTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCA-AAATTTTTT
194 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
* * * *
52335 TTTTCA-GTTCATACAAGCTAATTT-GAAATAAAATAATATAATTTTATTAACATTCAAAAAATT
259 GTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATATAA-TTTATTAATATT-TAAAAATT
* * * *
52398 AATAAGCATGAAA-TTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATA
320 AATAAG--T-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * *
52440 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
52505 CATAAAACAATTATTT-TAGTTTAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * **** * ** *
52568 ATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATC-AGTTTATCGAATTAGTTCAAATAA
129 ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
52632 TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTATTTTGTTATAAAACAA
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
* * ** * * *
52697 TTATTTTTCATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAACT
257 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT-AAAAATT
* * ** * ** *
52762 AATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACT
320 AATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * *
52803 AGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTC--A-----A--A------------T
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
52847 CATAAAATAATT-ATT-TGTTCACACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTTATCTACTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*** * * * * *
52910 TATGAAAATCAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAA-TTCAAATAGT
131 TCCAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGT
* ** * * * * *
52973 TAAGGTTATATGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAA-
194 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT
* * * * * * * * * *
53037 TATTTCTGTTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAATAACATTTATTTTTTAATATTTTGAAAATTA
258 TGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTA
* * * **
53102 ATAAG---AGATTT-AAAAA-AAATCTATTTACCAAACCA
321 ATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-CA
* * * * ** * *
53137 A-TTCAAGTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
53201 CATAAAAAAATTGTTTCTATTGATA-TAGTCTTATTTAGAATAAAGT-ATGCTAATTTATTGATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** ** *
53264 TTCAAAAAATTAATAAATAACGGATTTAAAAAATGAATCTAT
130 TTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
53306 GGCCTGACCA
Statistics
Matches: 7735, Mismatches: 1838, Indels: 1391
0.71 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
333 47 0.01
334 43 0.01
335 34 0.00
336 34 0.00
337 3 0.00
338 35 0.00
339 90 0.01
340 325 0.04
341 5 0.00
342 24 0.00
343 8 0.00
344 72 0.01
345 68 0.01
346 20 0.00
347 12 0.00
348 126 0.02
349 147 0.02
350 188 0.02
351 16 0.00
352 179 0.02
353 103 0.01
354 104 0.01
355 402 0.05
356 516 0.07
357 351 0.05
358 340 0.04
359 711 0.09
360 651 0.08
361 711 0.09
362 646 0.08
363 514 0.07
364 420 0.05
365 97 0.01
366 17 0.00
367 6 0.00
368 11 0.00
369 19 0.00
370 20 0.00
371 4 0.00
372 3 0.00
373 12 0.00
374 20 0.00
375 33 0.00
376 21 0.00
377 22 0.00
378 16 0.00
379 24 0.00
380 19 0.00
381 10 0.00
382 10 0.00
383 22 0.00
384 26 0.00
385 15 0.00
386 16 0.00
387 17 0.00
388 15 0.00
389 9 0.00
390 5 0.00
391 22 0.00
392 7 0.00
393 1 0.00
396 4 0.00
397 8 0.00
398 3 0.00
399 3 0.00
400 4 0.00
401 7 0.00
402 6 0.00
403 1 0.00
405 3 0.00
406 3 0.00
407 2 0.00
408 2 0.00
409 4 0.00
410 10 0.00
411 10 0.00
412 4 0.00
413 4 0.00
414 3 0.00
415 8 0.00
416 4 0.00
417 2 0.00
419 4 0.00
420 3 0.00
421 1 0.00
422 1 0.00
423 1 0.00
424 13 0.00
425 13 0.00
426 6 0.00
427 10 0.00
428 6 0.00
429 10 0.00
430 9 0.00
431 7 0.00
432 10 0.00
433 1 0.00
434 16 0.00
435 13 0.00
436 5 0.00
437 3 0.00
440 6 0.00
441 3 0.00
444 1 0.00
445 11 0.00
446 10 0.00
447 1 0.00
448 2 0.00
449 4 0.00
450 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT
TTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAG
TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
Found at i:45826 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 45062--46574 Score: 972
Period size: 181 Copynumber: 8.4 Consensus size: 179
45052 ATTCTAACCT
* * * * ** ***
45062 TTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAATTGTTTACCAAACCCT
1 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGCAAAAG-TTTAAAAAAT-AAATTGTTTACTGAACAAG
* * * ** * * * *
45126 TTCAAATAGTT-TTGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAATTCATTATAACCTTTTATTTTGTC
63 TTCAAATAGTTAAT-ACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTA
* * * ** *
45190 ATCAAACAATTGGTTC-TATTCATACTA--TTAGTCAAAATAAAATAATACTAA
127 ATAAAAAAATTGTTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * ** *** * * *
45241 TTTAATAATATTTTGACACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCAAATTGCTAAACAATT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AAGTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACAAGT
* * ** * * *
45306 TCAAATAG-TAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
64 TCAAATAGTTAATACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAAT
* ** * * * *
45370 AAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATTAA
129 AAAAAAATTGTTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * **
45421 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAG-TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACAAGT
* * ** * * * * * *
45486 TCAAATAATT-ATGACTATTTGAGCAATTATCA-A-TCCAAATCGTTAAGATCTTTTATTTCGTC
64 TCAAATAGTTAAT-ACTATTTGAACAATTAT-ATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTA
* * **
45548 ATAAAACAATTGTTTC-TGATCAT-AAAGCTTATT-TAGTTAAAAATAATACTAA
127 ATAAAAAAATTGTTTCAT-ATCATAAAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAA
* * * * * *
45600 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAG-TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACAAGT
* * * * * * * * *
45665 TCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATATATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTTAG
64 TCAAATAGTTAATACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAAT
* * * * * * *
45730 AAAATATTTGTTTCATATCTTACAATCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAA
129 AAAAAAATTGTTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
45781 TTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAAAAGTTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTT-AAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACAAGT
* * * * * *
45846 TTAAATAGTGATTACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGAAAT
64 TCAAATAGTTAATACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAAT
* * *
45911 AAAAAAATTATTTCAGTAT-ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTAA
129 AAAAAAATTGTTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
45962 TTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAATAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACAAAT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTT-AAAAAATAAATT-GTTTACTGAACAAGT
* * * *
46027 TCAAATAGTT-ATGCTTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
64 TCAAATAGTTAATAC-TATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAA
*
46091 TAAAACAATTGTTTCA-ATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
128 TAAAAAAATTGTTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * **
46143 TTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGATTTCAAAAGTAAATCGGTTTACCAAATC-AG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAG-TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAA-CAAG
* * ** * * * ** * * * *
46207 TTCAAATAATT-GTGGTCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTTGGTT
63 TTCAAATAGTTAATACT-ATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTA
* * ** * * *
46271 ATATAACAATTGTTTTTTATTATACAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAA
127 ATAAAAAAATTGTTTCATATCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
46325 TTTATTAATCTCTC-AAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACAAGTT
* * * * * * * * * ** *
46386 TAAATAGTT--GACTATTTGAATAAATGTATACTTCAAAT-AGTTATAACCTATTGTTCCGTCAT
65 CAAATAGTTAATACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTAAT
* * * ** *
46448 AAAACAATTATTTC-TGTTTTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
129 AAAAAAATTGTTTCAT-ATCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * * *
46499 TATAAAAATATTCCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAAAG-TTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACAAG
46563 TTCAAATAGTTA
63 TTCAAATAGTTA
46575 CGACTATATT
Statistics
Matches: 1057, Mismatches: 234, Indels: 85
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 35 0.03
175 61 0.06
176 2 0.00
177 33 0.03
178 73 0.07
179 193 0.18
180 163 0.15
181 448 0.42
182 49 0.05
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAATTGTTTACTGAACAAGTTC
AAATAGTTAATACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAA
AAAAATTGTTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
Found at i:46236 original size:362 final size:360
Alignment explanation
Indices: 45062--46570 Score: 1215
Period size: 362 Copynumber: 4.2 Consensus size: 360
45052 ATTCTAACCT
* * * * *
45062 TTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAAT-TGTTTACCAAACCC
1 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACTAAATCA
* * * * * * ** * * * *
45125 TTTCAAATAGTT-TTGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAATTCATTATAACCTTTTATTTTGT
64 GTTCAAATAATTGTGGTCTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTCGT
* * * * ** *
45189 CATCAAACAATTGGTTCTAT-TCATACTA--TTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
129 AATAAAACAATTGTTTCTGTAT-ATAAAAGCTTA-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * ** * ** * ** * *
45251 TTTTGACACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCAAATTGCTAAACAATTTCAAATAG-T
192 TTTCAAAAATTAATAA-GAAG-AGTTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
45315 AAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
255 ATG-CTATTTGAATAATTGTATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
45380 TTT-TTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATTAA
319 TTTCTATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* *
45421 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATCAGT
* * * * * ** * * *
45486 TCAAATAATTAT-GACTATTTGAGCAATTA-TCAATCCAAATCGTTAAGATCTTTTATTTCGTCA
66 TCAAATAATTGTGGTCTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTCGTAA
** ** *
45549 TAAAACAATTGTTTCTG-ATCAT-AAAGCTTATTTAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
131 TAAAACAATTGTTTCTGTAT-ATAAAAGCTTATCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
*
45612 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTA
194 TCAAAAATTAATAAG-AAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTT-
** * * * * * * * * *
45676 AAACTATTAGAATAATTATATATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTTAGAAAATATTTGT
255 ATGCTATTTGAATAATTGTATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
45741 TTC-ATATCTTACAATCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAA
320 TTCTATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
45781 TTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAAAAG-TTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAA-CAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAATC-A
* * * * *
45844 GTTTAAAT-A--GTGATTACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTT
64 GTTCAAATAATTGTG-GT-CTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTC
* * * * * *
45906 GAAATAAAAAAATTATTTCAGTATATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTAATTTCTTAAT
127 GTAATAAAACAATTGTTTCTGTATATAAAAGCTTAT-CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * *
45971 ATTTCAAAAATTAATAAGCAATAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACAAATTCAAATAGT
191 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGTTT-AAAAAATAAATTAGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT
* * * *
46036 TATGCTTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
254 TATGC-TATTTGAATAATTGTATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *
46101 GTTTCAAT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
318 GTTTCTATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
46143 TTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGATTTCAAAAGTAAATCGGTTTACCAAATCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATCAGT
* * * * * * * * *
46208 TCAAATAATTGTGGTC-ATTTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTTGGTTA
66 TCAAATAATTGTGGTCTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTCGTAA
* * * * *
46272 TATAACAATTGTTT-TTTATTATACAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCT
131 TAAAACAATTGTTTCTGTA-TATA-AAAGCTTA-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
46336 CTC-AAAATTAATAAG-AGA-TTTAAAAAATAAATTTA-TTTACCGAACCAGTTTAAATAG-T-T
193 TTCAAAAATTAATAAGAAGAGTTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** *
46395 GACTATTTGAATAAATGTATACTTCAAAT-AGTTATAACCTATTGTTCCGTCATAAAACAATTAT
257 G-CTATTTGAATAATTGTATATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* **
46459 TTCTGT-TTTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
320 TTCTATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * * *
46499 TATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATCAGT
46564 TCAAATA
66 TCAAATA
46571 GTTACGACTA
Statistics
Matches: 919, Mismatches: 194, Indels: 77
0.77 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
355 1 0.00
356 145 0.16
357 4 0.00
358 78 0.08
359 155 0.17
360 158 0.17
361 49 0.05
362 279 0.30
363 45 0.05
364 2 0.00
365 3 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (360 bp):
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATCAGT
TCAAATAATTGTGGTCTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTCGTAA
TAAAACAATTGTTTCTGTATATAAAAGCTTATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
AAAAATTAATAAGAAGAGTTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGCTA
TTTGAATAATTGTATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
ATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
Found at i:47280 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 46594--52847 Score: 4313
Period size: 181 Copynumber: 35.0 Consensus size: 180
46584 TTCAAATCAT
* * * * * *
46594 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATG
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-
* * * * * * * * * * *
46657 AATTTATTCACACTAAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAG
64 AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
* * * * *
46722 TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATAGCTATGACC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * ** * * * *
46774 TTTTGTTCTGTCATAAAACAAA-TGTTTTTGTTCGTGTAAGTTTGCTCTG-AATAAAAGAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACT
* * * *
46837 AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---G-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGATCAA
64 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* ** * * *
46898 GTTCAAATCA-TTATGATTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAT
128 GTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-C
* * * * * * * * * * *
46952 TTTTTTTTTGTTATAAGACAATAGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCG-GATGAAAATAATACCA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTA
* * * * * * * * *
47016 ATTTATTAATATTTTAACAATTACTAAATAA-AAACTTTAAAAAATAAGTATGCTTACCGAACTA
65 ATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * * * *
47080 GATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTGTTTCAAATGGTTATGACA
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * *
47133 TTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
47198 GTTATTAATATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTTGTCGAACAAGT
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGT
* * * * * ** *
47263 TTAAATAATTTTGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACC
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * **
47314 TTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATAAAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTA
* * * *
47378 ATTTATTAATA-TTAAGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAA
65 ATTTATTAATATTTAA--AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
** * * * * ** *
47442 -TATCAAATCTTTACGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGAATGACT
128 GT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * ** * *
47495 TTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TCATACATGTTTATTTCTATTAACAA-AATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA-AATAATACTA
* * * * * *
47558 ATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGT-AGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAA
65 ATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * * * * * * * *
47622 GTTCAACTAGTCATAATTAGTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
47675 TTTTATTTTGTAATAAAAAAATTATTT-TAGCTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * ** *
47739 ATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTA-CATAACA
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTATC-GAACA
* ** * *
47802 TGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* *
47856 TTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * * *
47920 ATTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-TGTTACCAAACAT
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTATCGAACAA
* * *
47984 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACA
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * **
48037 TTTTGTTTTCTCATAAAACATTTGGTTCTATTCATGCAAGCATATTTCG-AATAAAATAATAAAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTA
* * ** * * *
48101 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-TAAAATAAAGATATTT-TCTAAACAT
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAA
* * * * * * **
48163 TTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTA-GATA
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * * *
48215 TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATGAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
48280 CTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAGCAAGT
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGT
* * * *
48345 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATC
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * *
48396 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
48461 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAG
66 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
* * * * * * * * **
48525 CTT-AAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATATCAATTTGTTATTATA
129 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* ** **
48577 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* *
48642 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AAGA-ATTTAAAAACTAAATCT-TTATATTGAACCAA
66 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TATCGAA-CAA
* * * *
48702 -TTCAAATAATTATGATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * * * * *
48752 TATTT-TTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-T
1 T-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACT
* * * * ** *
48815 AA---ATT-A-A--T-AATATT-CTAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA
64 AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-AA
* * ** * * *
48870 -TTCAAATAGATAAGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGGCC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * **
48922 TTTTG-CTTGTCATAAAATAGTAT-TTT-TAGTTCATGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT-TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
** * ** * * * *
48984 AATTTATTAGCATTCAGAAAATTAATAAACAACAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAAC
64 AATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAA-GAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC
* * ***
49049 AAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACC
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * * * * *
49104 ATTTGTTGTATCATAAAATAATTTTTTCAATTTATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTAC
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
49169 TTTATTAATACTTCAAAAATTGATATA-TTAGAGATTTAAAAAAT--A-C-----ATCGAACTAG
66 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
* * * * * ** *
49225 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTACAAAC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
49277 TTTT-TTTT-TCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAGTATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * *
49339 ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAAT-AGGAAGGAGATTTAAAAAATATATCTATTTA-CTG---A
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACA
* * * * * *
49399 A--TC----AGTT-T--CTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
49444 TTTTGTTCTATCGTAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* ** * * **
49509 TTTAATAATATTCCCAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GCTGAAGTAG
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAG
* * * * * *
49573 CTT-AAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATAACC
129 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * **
49625 ATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * *
49689 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----TATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAA
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAA
* * * *
49750 -TTCAAATAATTATGA-TCATGTT-ATCAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACC
128 GTTCAAATAGTTATGACT-AT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * ** * *
49802 TTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTATT-TGA-GCATTCAATTTTATTTGGAATACAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * *
49865 -ATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTA
64 AATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * *** ** * * *
49929 GTTTAAACAACAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTTATAACC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
49982 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
50047 TATAATAATATTATGAAAATTAA-AGGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-A
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAA
* * * * *
50110 GTTCCAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * * * *
50163 TTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTTTTTTGAATTCATA-ATAACTTACTTGGAATAAAATAA-AA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-ATTGTTTCTATTCATACA-AGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
50226 TGAATTTATTAATTTTTCAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTATC
63 T-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC
* * * * * * *
50291 CAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAGTCATTATGACC
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * **
50346 TTTTGTTTTGTCATAAAACAAA-TGCTTT-TGTTCATATAAATTTGTTCAAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
50409 AATCTATTAATATTT-CAAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTAT
64 AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
* * * * *
50471 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACT
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
50522 TTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACATGCTTATTTGGACTAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
** * * *
50587 TTTATTAATATTTTAGCAATTGATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACTAG
66 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAG
* * * * * *
50649 ATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* ** * *
50701 TTTTGTTTTGTCATAAAAGAAA-TGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAATACAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
50764 AATTTATTAGTAATTAAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAGATTAATCTGTTTA-CTAAA
64 AATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTATC-GAA
* * * * * * * *
50827 AAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACC
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
50883 TTTTGTTTTGTCACAAAAGAATT-TTATCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAATTCAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTT-TCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
50947 ATTTATTAATA-TTAAGACAATTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACCAAACA
65 ATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA
* * *** * * * * *
51011 AGTTCAGATCGTTATGACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCT
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
51065 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-AGATTAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTA
* * * * ** * *
51129 ATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATAA
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * * * *
51193 GTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
51246 TTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGTTTTATTT-AAAGTAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGAAA-TAAAATAATACT
* * ** * ** * * *
51310 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA-ACAAAAAAAAGAATCCATTTACCAAATA
64 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATCGAACA
* * * * * *
51374 AGTTCAAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTGTTTTAAAACATTATGACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
51428 TTTTGTTTTGCCACAAAATAAGTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT
* *
51490 AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-A---AAAACAT--GT-T-TTT-T-GAACA
64 -AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA
* * * *
51542 CA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATC-ATATGATC
127 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** ** * ** * * * * *
51595 TTTTGTTTCATCATAAACTAATTGTTTTTGCTCACAAAAACTTATTCGGAATAGAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATA-AAATAATACTA
* * * * * *
51660 AATTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAAT-GAGCGA
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCGAACAA
* * * **
51724 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTATGATA
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * **
51777 TTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* ** * ** *
51841 TTTATTAATAGTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAAT
66 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGT
* * * * * * *
51906 TCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTATGGCA
130 TCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * ** * * *
51957 TTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAAATTA-TTCAGAATCAAGTAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTA
* ** * * * *
52020 ATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAGCTAAATTTGTTTACCAAACCAG
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
* * * * * *
52081 TTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATAG-TATGATC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* *
52132 -TTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATGCT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACT
** * * * ** * *
52195 AAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCA
64 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * * * * *
52260 GTT-ATAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTCTGACC
128 GTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
**** * *
52313 TTTTGTTTTGTCA-AAATTTTTTTTTTC-AGTTCATACAAGCTAATTTGAAATAAAATAATA-TA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
52375 ATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAAT
65 A-TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAAC
* * * *
52439 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAAC
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *** *
52494 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TAGTTTAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * ** * * **
52557 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATCAGTTTATCGAATTA
64 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAA
* * * *
52622 GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACT
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACC
* * * * * * * *
52676 TTTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * ** * * *
52740 ATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAG
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAG
* * * *
52805 TTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
52848 ATAAAATAAT
Statistics
Matches: 4791, Mismatches: 1032, Indels: 500
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
165 1 0.00
166 15 0.00
167 69 0.01
168 138 0.03
169 141 0.03
170 16 0.00
171 77 0.02
172 13 0.00
173 53 0.01
174 19 0.00
175 77 0.02
176 196 0.04
177 309 0.06
178 242 0.05
179 187 0.04
180 656 0.14
181 1569 0.33
182 768 0.16
183 234 0.05
184 11 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
Found at i:48200 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 48167--48203 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.2 Consensus size: 17
48157 AAACATTTTC
48167 AAATAGTTATGACTATTT
1 AAATAGTTAT-ACTATTT
48185 AAATAGTTAT-CTATTT
1 AAATAGTTATACTATTT
48201 AAA
1 AAA
48204 ATTGTTAGAT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.47
18 10 0.53
ACGTcount: A:0.43, C:0.05, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (17 bp):
AAATAGTTATACTATTT
Found at i:48602 original size:721 final size:715
Alignment explanation
Indices: 45062--52847 Score: 5090
Period size: 721 Copynumber: 10.9 Consensus size: 715
45052 ATTCTAACCT
* * * * **
45062 TTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAA-ATTGTTTACCAAACCCT
1 TTTATTAATATTTA-AAAATTAAT-AGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTG-TTACCAAA-CAG
* * * * * *
45126 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAATTCATTATAACCTTTTATTTTGTCA
62 TT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
45191 TCAAACAATTGGTTCTATTCATACTA--TTA-GTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
126 TAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-T
** * * ** * ** * *
45253 TTGACACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCA-AATTGCTAAACAATTTCAAATAG-TA
189 TCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * ** * ** *
45316 AGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
252 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * *
45381 TT-TTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
317 TTCTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* ** * *
45445 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAG
381 AAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
45509 CAATTATC-AATCCAAATCGTTAAGA-TCTTTTATTTCGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCAT
444 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCAT
* ** * *
45571 A-AAGCTTATT-TAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
507 ACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAA
* * * * * ** * * *
45634 TTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATATAT
570 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * * * *
45699 TTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTTAGAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAATCTTATTC
634 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTT
* * *
45763 AAAATAAAATAATCCAAA
698 GAAATAAAATAATACTAA
* * ***
45781 TTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAAA-AG-TTTGAAAAAATAAAT-TTGTTTATTGAACA
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-A-GAAAGAGAATT-AAAAAATAAATCTTG-TTACCAAAC-
* * * * * *
45843 AGTTTAAATAGTGATTACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGA
60 AG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * ** *
45908 AATAAAAAAATTATTTC-AGTAT-ATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAAGAATACTAATTTCTTAA
124 CATAAAACATTTGTTTCTA-T-TCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATAAAAATTTATTAA
* * * * *
45970 TATTTCAAAAATTAATAAGCAATAGTTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTACTAAACAAATTCAAATA
186 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTT-AAAAAATAAATAT-GTTTTCTAAACAAGTTCAAATA
* * * ** *
46034 GTTATG-CTTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
248 GTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACA
** * *
46098 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAAT
312 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * * * *
46163 TAATAAGTAAGCGATTTCAAAAGTAAATCGGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTGTG-GTCAT
377 TAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-AT
* * ** * * * * *
46226 TTCAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTTTTTAT
439 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG-TTTCTAT
* * * * *
46291 T-ATACAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTCTC-AAAATTAATAAG---
503 TCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
46351 AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAGT--TGACTATTTGAATAAATGTA
567 AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * ** * * **
46414 TACTTCAAATAGTTATAACCTATTGTTCCGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTTTTACAAGCTTA
631 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA
**
46478 TTCAAAATAAAATAATACTAA
695 TTTGAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *
46499 TATAAAAATATTCCAAAAATTAATA-ACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTGCTAAACCA
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAGA--AAGAGAATTAAAAAATAAATCTTG-TTACCAAA-CA
46562 GTTCAAATAG-T-T-AC-----G-AC---TA--TATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTC
61 GTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
46606 ATAAAATAATTT-TTTCAATTCACACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTCAC
125 ATAAAA-CATTTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTCGAATAAAATAATAA-AAATTTATTAAT
* * * * * * * * * * * *
46668 ACTAAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAGTTTAAATAAT
187 ATTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAGT
* * * ** * * *
46732 TATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATAGCTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAAAT
250 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * ** * ** ** * *
46797 GTTTTTGTTCGTGTAAGTTTGCTCTGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAA
315 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * **
46862 TAAG---GGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGATCAAGTTCAAATCA-TTATGATTATTTGTG
380 TAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAA
* ** * * * * *
46923 CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTTTTTGTTATAAGACAATAGTTTTTGTTCATA
444 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * * * *
46988 TAAGCTTATTCG-GATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTAACAATTACTAAATAAAAACT
508 CAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAA-T
* * * * * *
47052 TTAAAAAATAAGTATGCTTACCGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTG-ACTAATTATCTGT
571 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTCATGACTATTTGAAC-AATTATCTAT
* * * * * *
47116 TTCAAATGGTTATGACATTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
634 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG
47181 AAATAAAATAATACTAA
699 AAATAAAATAATACTAA
* * * ** *
47198 GTTATTAATATTATGAAAATTAATA-ATTAAGAG-ATTAAAAAAATGAATC-TGTTTGTCGAACA
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAGA--AAGAGAATT-AAAAAATAAATCTTG-TTACCAAAC-
* * * * * *
47260 AGTTTAAATAATTTTGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGT
60 AG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
47325 CATAAAATGATTT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA
124 CATAAAA-CATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA
* * * * *
47389 TT-AAGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-TGAACAA-TATCAAATC
188 TTCAA--AAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGT-TCAAATA
* * * * * ** *
47451 TTTACGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGAATGACT-TTTTGTTTTATCATAAAATA
248 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TATTTTGTTTTATCATAAAACA
* * * * * * ** *
47515 ATTGTTTCT-ATCATACATGTTTATTTC-TATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACA
312 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * *
47577 ATTAATAAGTAGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAACTAGTCATAATTAG
375 ATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
47642 TTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTAATAAAAAAATTATTT-TAGC
439 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * *
47706 TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTCCAAAAATTAATGAG-AAA
503 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * **
47770 GAGAATTAAAAAAGGAATCTTG-TTA-CATAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATTAT
568 -A-ATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCA-AACTA-GTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACAAT
* * * *
47832 TATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATATAAGC
627 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
47897 TTATTTGAAATAAAATAATACTAA
692 TTATTTGAAATAAAATAATACTAA
*
47921 TTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTGTTACCAAACATGT
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAAT-AGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTGTTACCAAACA-GT
* * *
47986 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTCTCA
63 T-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
48050 TAAAACATTTGGTTCTATTCATGCAAGCATATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTT
126 TAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TT
* * * **
48115 CAAAAATTAATAAGTAAAAATTT-TAAAATAAAGATATTTTCTAAACATTTTCAAATAGTTATGA
190 CAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
48179 CTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTA-GATATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTC
255 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* ** * * * *
48243 TGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATGAAATAATACTAACTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGT
320 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
48308 AAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAGCAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
385 -AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
48373 ATTTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATACAAGT
449 ATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *
48437 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAAAAATTTTAAA
513 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAA
* * * * * * *
48502 AATAAATTTGTTCACCAAACAAGCTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATATCAATT
577 AATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * ** * ** **
48567 TGTTATTATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAA
641 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
48631 AATAATACTAA
705 AATAATACTAA
* * ** * *
48642 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT--AAAGA-ATTTAAAAACTAAATCTT-TATATTGAACCAAT
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTGT-TA-CCAAACAGT
* * * * *
48703 TCAAATAATTATGATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA--TATTT-TTTTGTCA
63 T-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
48765 TAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGATAAA-TTAATAATATT
126 TAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT-AAAAATTTATTAATATT
* * * * * *
48829 C------TAAT-A--AAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-TTCAAATAGATAAG
190 CAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATG
** * * *** * * *
48884 AAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGGCCTTTTG-CTTGTCATAAAATAGTATT-T
254 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACA--ATTGT
* * * **
48947 TT-AGTTCATGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTCAGAAAATTAAT
317 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT
** * * *
49010 AAACAACAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGA
381 -AAGTA-AAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** * * * * * * *
49075 ACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCATTTGTTGTATCATAAAATAATTTTTTCAATTTATA
443 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * * * * *
49140 AAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAATTGATATATTAGAGAT
508 CAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAAAAT
* * * * * * *
49204 TTAAAAAATACA------T--CGAACTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATT
571 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * *** * *
49261 TCAAATCATTACAAACTTTT-TTTT-TCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGG
635 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* *
49324 AATAAAATAGTATTAA
700 AATAAAATAATACTAA
* * * *
49340 TTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAGGAAGGAGATTTAAAAAATATATCTAT-TT-----AC---
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATA-GAAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-TGTTACCAAACAGT
* * * * ** * * * * *
49396 TGAATCAGTT-T--CTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCGT
63 TAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * ** *
49458 AAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCC
127 AAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATT-C
* * * * * * ** * *
49523 CAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGTAGCTT-AAACAGTTAAG
191 AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAG-TTCAAATAGTTATG
* * * * *
49587 ACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCA-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
254 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * * *
49651 TCAGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
318 TCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
49716 GT---TATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAATTATGA-TCATGTT-ATC
383 GTAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-AT-TTGAAC
** * * * * * *
49775 AATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTATT-TGA-GCATT
445 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATA
** * * * * * *
49838 CAATTTTATTTGGAATACAATAATACT-ATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
508 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATT
* * * * * * ** *
49902 TAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTTAAACA-ACAATGACTATTTGAACAATTATAAACT
572 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTC-ATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
49966 TCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA
635 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
50031 AATAAAATAATACTAA
700 AATAAAATAATACTAA
* * * * * *
50047 TATAATAATATTATGAAAATTAA-AGGCTAAGAGAATTAAAAAATAAAT-TTATTTACCGAATCA
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATA-G-AAAGAGAATTAAAAAATAAATCTT-GTTACC-AAACA
* * * *
50110 GTTCCAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
61 GTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * *
50175 ATAAAATAAGGTTT-TTTGAATTCATA-ATAACTTACTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
125 ATAAAA-CA--TTTGTTTCTATTCATACA-AGCTTATTTCGAATAAAATAATAA-AAATTTATTA
* * * * * * * * * *
50237 ATTTTTCAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-ATCCAGTTTAAAT
185 A-TATTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAAT
* * * * * ** *
50301 AATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
247 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACA
* * ** * * *
50366 AATGCTTT-TGTTCATATAAATTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAATA
312 ATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
50430 TTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTT
376 TTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
50492 GAGCAATTATTTATTTTAAATC-TTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCA
441 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * * ** *
50556 TACATGCTTATTTGGACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTGATAAGT-AAAAT
506 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAT
* ** * * * * *
50620 TTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATT
571 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * **
50685 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAA-TGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
635 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG
* *
50749 AAATAATACAATACTAA
699 AAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
50766 TTTATTAGTAATTAAAAAATTAATA-ATAAAAAAATTTAAAAAGATTAATC-TGTTTACTAAAAA
1 TTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAGA-AAGAGAA-TTAAAAA-ATAAATCTTG-TTAC-CAAAC
* * * *** *
50829 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT
60 AG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * **
50894 CACAAAAGAATTT-TATCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAATTCAAATTTATTAATA
124 CATAAAA-CATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA
* * * * * * *
50958 TT-AAGACAATTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACCAAACAAGTTCAGATCG
188 TTCAA-A-AATTAATAA-GTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAG
*** * * * *
51022 TTATGACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCT-TTTTGTTTTATCATAAAACAA
249 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GATATTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * * * * * * *
51086 TTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAATT
313 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * ** * * * *
51151 AATAAGTAAAAATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTA
378 AATAAGTAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
51216 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
442 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * *
51281 ATAAGTTTTATT-TAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAG
507 ACAAG-CTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-
* * *** * * *
51345 AA--CAAAAAAAAGAATCCATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATGATTATATGAACAATTAT
568 AATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCAAACT-AGTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
51407 CTGTTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGCCACAAAATAAGTGGTTTT-GTTCATGCAAGCTT
630 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT
*
51471 ATTTTG-AATAAAATAAT-TTAAA
694 A-TTTGAAATAAAATAATACT-AA
* * * * *
51493 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT---AAGA-AA--AAAACAT--GT-TTTTTGA--ACACATTT
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTGTT-ACCAAACAGTT
* * **
51547 AAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTCATCAT-A
64 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * * * * *
51610 AACTAATTGTTTTTGCTCACAAAAACTTA-TTCGGAATAGAAATAATACTAAA-TTATTAAAATT
129 AAC-ATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATA-AAATAATA-AAAATTTATTAATATT
** * * *
51673 CTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATGAGCGAGTTCAAATAGTTAT
190 C-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
51738 GACTATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTT
253 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * *
51802 TCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-GTCTAAAAATTAATA
318 TCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
** * ** * * *
51866 AGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAATTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAAC
382 AG-TAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAC
* * * * *
51930 TATTATCTATTTTAAATCATTATGGCATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACA
445 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * * *
51994 AAATTATTC-AGAATCAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---ACATTTA
510 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
** * * * * *
52055 AAAGCTAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCA
574 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * *
52120 AATAG-TATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTCTG-
638 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TGA
*
52181 AATAAAATAATGCTAA
700 AATAAAATAATACTAA
** * * * * *
52197 ACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-GTGCTTGCCAAACCAG
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAAT-AGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTG-TTACCAAA-CAG
* * * * *
52261 TTATAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCA
62 TTA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
*** * * * * *
52326 -AAATTTTTTTTTTC-AGTTCATACAAGCTAATTT-GAAATAAAATAATATAATTTTATTAACAT
126 TAAAACATTTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATAAAAATTTATTAATAT
* * * * * *
52388 TCAAAAAATTAATAAGCATGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTT
189 TC-AAAAATTAATAAG--TAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
52453 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT-AAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
251 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA-TTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * * *
52517 ATTT-TAGTTTAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATT
315 GTTTCT-G-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * ** * ** ** * * *
52580 GAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATCAGTTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTG
378 AATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
52645 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTTTCA-TC
442 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTC
* * * * * *
52709 ATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAGGAG
505 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA--AA
* ** * * * *
52774 AA-TTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATAT
568 AATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCT
52838 ATTTCAAATC
632 ATTTCAAATC
52848 ATAAAATAAT
Statistics
Matches: 5567, Mismatches: 1165, Indels: 665
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
690 26 0.00
691 9 0.00
692 161 0.03
693 38 0.01
696 159 0.03
697 122 0.02
698 179 0.03
699 152 0.03
700 50 0.01
701 7 0.00
702 24 0.00
703 98 0.02
704 130 0.02
705 111 0.02
706 130 0.02
707 100 0.02
708 173 0.03
709 47 0.01
710 15 0.00
711 185 0.03
712 113 0.02
713 76 0.01
714 12 0.00
715 63 0.01
716 65 0.01
717 196 0.04
718 354 0.06
719 475 0.09
720 393 0.07
721 829 0.15
722 217 0.04
723 438 0.08
724 207 0.04
725 76 0.01
726 16 0.00
727 113 0.02
728 8 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (715 bp):
TTTATTAATATTTAAAAATTAATAGAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTTGTTACCAAACAGTTAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
CATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCAAAAA
TTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGAT
TTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
TCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTT
GTTTACCAAACTAGTTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
Found at i:51081 original size:364 final size:355
Alignment explanation
Indices: 46725--52847 Score: 2322
Period size: 361 Copynumber: 17.1 Consensus size: 355
46715 TAACTAGTTT
* * * * * *
46725 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATAGCTATGACCTTTTGTTCTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * ** ** * * *
46790 AACAAATGTTTTTGTTCGTGTAAGTTTGCTCTGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTCAA
66 AACAAATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-AA
*** * ** ** * *
46855 AAA-T--TAATAAGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGATCAAGTTCAAATCA-TTATGATT
130 AAATTAATAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAAT-AGTTATGACT
* * * * * * * *
46916 ATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTTTTTGTTATAAGACAATAGTTTTT
194 ATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATT-CTATGAC-TTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCT
* * * *** * *
46981 GTTCATATAAGCTTATTCGGATGAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTAA-CAATTACTAAA-
257 ATTCATACAATCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAGCAATTA-AAAAG
* * *
47044 TAAAAACTTTAAAAAATAAGTATG-CTTACCGAACTAGATC
318 T-AAAA-TTTAAAAAATAAATATGTC-TACCAAACAAGATC
* * * * * *
47084 AAATAGTCATGACTATTTGACTAATTATCTGTTTCAAATGGTTATGACATTTTCTTTTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * ** *
47149 AA-AAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT-ATTAT
66 AACAAA-TGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTA-
* * * * * * * * *
47212 GAAAATTAATAATTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGTTT-GTCGAACAAGTTTAAATAATTTTG
129 -AAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAAAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * ** *
47276 ACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTT
191 ACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAT-TCTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT
* * ** *
47341 CTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTAAGCCAATTAATAAG
255 CTATTCATACAATCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAG-CAATTAAAAAG
* * * *** *
47406 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAATATC
318 T-AAA-ATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
** * * * * * ** * *
47446 AAATCTTTACGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGGAATGACTTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * *
47511 AATAATTGTTTC--TATCATACATGTTTATTTC-TATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATTT
66 AACAAATGTTTCAGT-TCATATAAGTTTA-TTCAAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATA-AT
* * * * * ** * * * * * *
47572 TGACAATTAATAAGTAGAATATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAACTAGTCATA
127 TAAAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAGTTATG
* * ** * * * * * *
47637 ATTAGTTGAATAATTATTTATTTCAAA-TCATTGTGACCTTTTATTTTGTAATAAAAAAATTATT
191 ACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * * * *
47701 T-TAGCTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTCCAA-AAATTAAT
254 TCTA-TTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAGCAATTAAA
* * * ** * * *
47764 GAGAAAGAGAATTAAAAAAGGAATCTTGT-TA-CATAACATGTTC
315 AAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAAT-ATGTCTACCA-AACAAGATC
* * * * * *
47807 AAATAGTTATGACTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** *
47872 AA-AAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
66 AACAAA-TGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-TA
* * * * * * *
47936 GAAATTAATGAGAAAGAGAA-TTAAAAAATAAATCT-TGTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG
129 AAAATTAATAATAAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACTAAAAAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * *
47999 ACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAATAT-TATGACATTTTGTTTTCTCATAAAACATTTGGT
191 ACTATTTGAGCAATTATCTA-TTTCAAAT-TCTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * * ** * *
48063 TCTATTCATGCAAGCATATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATA
254 TCTATTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAGCAATTAAAA
* * * * * * ***
48127 AGTAAAAATTT-TAAAATAAAGATATTTTCTAAACATTTTC
316 AGT-AAAATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * * **
48167 AAATAGTTATGACTATTTAAATAGTTATCTATTTAAAATTGTTA-GATATTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * ** * *
48231 ACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATGAAATAATACTAACTTATTAA-AATTCCA
66 AACAAATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT--A
* * * * ** * *
48295 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAGCAAGTTCAAATAATTATGA
129 AAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAAAAGTTTAAATAGTTATGA
* * *
48359 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
192 CTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACT-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * *
48422 TCTATTGATACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AAATTAAT
254 TCTATTCATACAA-TCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAGCAATTAAA
* * * *
48485 AAGTTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGT-TCACCAAACAAGCTT
315 AAG-T-AAAATTTAAAAAATAAATATGTCT-ACCAAACAAGATC
* * * * * * * **
48528 AAATAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATATCAATTTGTTATTATATTTTGTTTTGTCATA
1 AAATAATCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** *
48592 AAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
65 AAACAAATGTTTC-AGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-
* * * ** * *
48656 AAAAA-T--TAATAAAGAATTTAAAAACTAAATCT-TTATATTGAACCAA-TTCAAATAATTATG
128 AAAAATTAATAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACT-AAAAAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * *
48716 ATTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAA-TCGTTATGA-TATTT-TTTTGTCATAAAGCAATTGTT
191 ACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * * * * * *
48778 TTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATATT---CTAA-T-AAA
254 TCTATTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTAAGC-AATTAAAA
* * * *
48837 AG----ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-TTC
316 AGTAAAATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAAC-AAGATC
* ** * * * * *
48873 AAATAGAT-AAGAAAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGGCCTTTTG-CTTGTCATA
1 AAATA-ATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * * **
48936 AAATAGTAT-TTTTAGTTCATGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AGCATTC
65 AAACA-AATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-
* * * *
48999 AGAAAATTAATAAACAACAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTGAAATAGTT
128 A-AAAATTAAT-AATAA-AAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAAAAGTTTAAATAGTT
* * ** ** * * * * *
49063 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCATTTGTTGTATCATAAAATAATTT
188 ATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAT-TCTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG
* * * * * * * *
49128 TTTCAATTTATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAA-AAATTGA
252 TTTCTATTCATACAATCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAGCAATT-A
* * * * * * * *
49192 TATATTAGAGATTT---AAA-AAATA---C-ATCGAACTAGTTC
313 AAAAGTA-AAATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * * ** *
49228 AAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTACAAACTTTT-TTTT-TCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** *** * *
49291 AATAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAGTATTAATTTATTAA-AATTT
66 AACAAATG--TTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAA-TT
** * * * *
49353 CAAAAATTAATAGGAAGGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACT------G----AATCAGTT-T
128 -AAAAATTAATAATAA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAAT-AGTTAT
* ** * * * * * ** *
49407 --CTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATTGT-TGTAACCTTTTGTTCTATCGTAAAATAATTGT
190 GACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTCTATG--ACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
* * * * *
49469 TTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCCAA--AATTAA
253 TTCTATTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT---AAGCAATTAA
* * * * * ** ** * *
49532 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGTAGCTT
314 AAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * * * * * * *
49576 AAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCATTTGTTTTATCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
49641 AACAATTGTTTCAGGTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCCA
66 AACAAATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT--A
* * * * * ** * *
49705 AAAATTAATAAGT----TATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAATTATGA
129 AAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAAAAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * *
49765 -TCATGTT-ATCAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTA
192 CT-AT-TTGAGCAATTATCTATTTCAAATT-CTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT-
* * * * * * *
49828 TT-TGA-GCATTCAATTTTATTTGGAATACAATAATACT-ATTTATTAATCTTTTAA-AAATTAA
253 TTCT-ATTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTAAGCAATTAA
* * * * * * * * *
49889 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTT
314 AAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * ** * * *
49933 AAACAA-CAATGACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
1 AAATAATC-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * * * *
49997 AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAAT-ATTAT
65 AAACAAATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTA-
* * * * ** ** ** * *
50061 GAAAATTAA-AGGCTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAGTTCCAATATTTAA
129 -AAAATTAATA--ATAA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * *
50124 GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTT
190 GACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAA--TT
* ** * ** * * *
50188 TTTTGAATTCATA-ATAACTTACTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATTTTTCAA--AAA
251 GTTTCTATTCATACA-ATCTTA-TTTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-TATT-AAGCAAT
* * * * * * * * *
50249 TAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTATCCAGTTT
311 TAAA-AAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * *
50297 AAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTCCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * **
50362 AACAAATGCTTT-TGTTCATATAAATTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAAT-ATTTC
66 AACAAATG-TTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTAA
* * * * * * ** *
50425 AAA-TATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTA-TTTCAAATAGTTTTGACT
130 AAATTAATAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTT-AAATAGTTATGACT
* * * * *
50488 ATTTGAGCAATTATTTATTTTAAA-TCTTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTA
194 ATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC-TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
50552 TTCATAC-ATGCTTATTTGGACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTGATAAGTA
258 TTCATACAAT-CTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAGCAATTAAAAAGTA
* ** *
50616 AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATC
320 AAATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* *
50652 AAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
50717 AAGAAATGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAATACAATACTAATTTATTAGTAATTAAA
66 AACAAATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-AA
* *
50782 AAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAAGATTAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAATTATGAC
130 AAATTAATAAT-AAAAAATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAGTTATGAC
* * * * * *
50847 TATTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAAGAATT-TTATC
193 TATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATT-CTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT-TC
* * *
50911 TATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAATTCAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAAAATG
256 TATTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAG-CAATTAAAAA-G
* *
50976 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACCAAACAAGTTC
318 T-AAA-ATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* ** * ** * * * * * *
51016 AGATCGTTATGACTATTTGTGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGGCTTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * *
51081 AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCG
66 AACAAATGTTTC-AGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-A
* * * * * * *
51145 ACAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCATGA
129 AAAATTAATAA-TAAAAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAGTTATGA
* ** *
51209 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTT
192 CTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT
* * * * **
51273 CAATTCATATAAGTTTTATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-AAATTAATG
255 CTATTCATACAA-TCTTATTTAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAGCAATTAAAA
** * * *
51337 AGTAAGAGA-ACAAAAAAAAGAATCCAT-T-TACCAAATAAGTTC
316 AGTAA-A-ATTTAAAAAATA-AAT--ATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * * * * * * *
51379 AAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTGTTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGCCACAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * *** * *
51444 AATAAGTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTTC
66 AACAAAT-GTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT-
* * * * *
51507 AAAAA-T--TAATAAGAAA---AAAACAT--GT-T-TTT--TGAACACA-TTTAAATAGTTATGA
128 AAAAATTAATAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAAAAGTTTAAATAGTTATGA
** *
51559 CTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAA-TCATATGA-TCTTTTGTTTCATCAT-AAACTAATTGTT
192 CTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC-TATGACT-TTTTGTTTTGTAATAAAAC-AATTGTT
* ** * * * ** * * * *
51621 TTTGCTCACAAAAACTTATTCGGAATAGAAATAATACTAAATTATTAAAATTCTAA-AAATTAAT
254 TCTATTCATACAATCTTATT-TAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAGCAATTAAA
* *** * * *
51685 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATGAGCGAGTTC
315 AAGT-AAA-ATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * ** * * **
51728 AAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTT-TTTTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
51792 AATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAGTCTA
66 AACAAATGTTTC-AGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-TA
*** * * * * * * *
51856 AAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAA-TTCAAATAGTCAT-A
129 AAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAAAAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * **
51919 TCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAA-TCATTATGGCATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTT
192 -CTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
** * * * * *
51983 T-TATTCATACAAAATTATTCAGAATCAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATA
254 TCTATTCATACAATCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAGCAATTAAAA
* ** * * * * *
52046 AG--ACATTTAAAAGCTAAATTTGTTTACCAAACCAGTTT
316 AGTAAAATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * * * *
52084 AAATAGTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATAG-TATGATC-TTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * ** * ** * *
52147 AACAAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTCTGAATAAAATAATGCTAAACTAATAATATTCT
66 AACAAA-TGTTTC-AGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-T
* * * * * * ** *
52211 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCAG-TTATAATAGTTAAG
128 AAAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTA-AATAGTTATG
* ** * * * * **** *
52275 ACTATTAGAATAATTGTCTATTTCAAA-TCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCA-AAATTTTTTTTT
191 ACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * ** *
52338 TC-AGTTCATACAAGCTAATTTGAAATAAAATAATA-TAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAAT
254 TCTA-TTCATACAATCTTATTT-AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATT-AAGCAATTAAA
* * * ** * *
52401 AAGCATGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTC
315 AAG--T-AAAATTTAAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
* * * * * * * *
52445 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * ** * * * *
52510 AACAATTATTTTAGTTTA-ATAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCA
66 AACAAATGTTTCAGTTCATAT-AAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-A
* * *** * * * * ** * * *
52574 AAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATCAGTTTA-TCGAATTAGTTCAAATAATTATGG
129 AAAATTAATAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAAAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * *
52638 CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAACTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTATT
192 CTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTC--TATG-ACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * * *
52702 TTTCA-TCATACAAGT-TTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-AAACTAA
254 TCT-ATTCATACAA-TCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAGCAATTAA
* * * * *
52764 TAAGTAGGAGAA-TTAAAAAATAAATAT-ACTTACCAAACTAGTTT
314 AAAGTA--A-AATTTAAAAAATAAATATGTC-TACCAAACAAGATC
* * * *
52808 AAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATC
1 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
52848 ATAAAATAAT
Statistics
Matches: 4457, Mismatches: 1005, Indels: 600
0.74 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
338 3 0.00
339 8 0.00
340 97 0.02
341 3 0.00
342 4 0.00
343 13 0.00
344 61 0.01
345 62 0.01
346 22 0.00
347 8 0.00
348 129 0.03
349 140 0.03
350 165 0.04
351 18 0.00
352 75 0.02
353 13 0.00
354 64 0.01
355 237 0.05
356 315 0.07
357 225 0.05
358 165 0.04
359 375 0.08
360 250 0.06
361 591 0.13
362 562 0.13
363 442 0.10
364 392 0.09
365 15 0.00
366 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAAATGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTAAA
AATTAATAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAAAAGTTTAAATAGTTATGACTAT
TTGAGCAATTATCTATTTCAAATTCTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTC
ATACAATCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAGCAATTAAAAAGTAAAATTT
AAAAAATAAATATGTCTACCAAACAAGATC
Found at i:51230 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 51209--51241 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
51199 ATAGTCATGA
51209 CTATTT-AAATAATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
*
51225 CTATTTCAAATCATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
51242 GACTTTTTCT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
CTATTTCAAATAATTAT
Found at i:51951 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 51547--52849 Score: 1084
Period size: 180 Copynumber: 7.2 Consensus size: 180
51537 GAACACATTT
* * **
51547 AAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TATGATCTTTTGTTTCATCAT-A
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * * * * *
51610 AACTAATTGTTTTTGCTCACAAAAACTTATTCGGAATAGAAATAATACTAAATTATTAAAATTCT
66 AAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTTATTAATA-TCT
** ** * *
51675 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATGAGCGAGTTC
128 AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
* *
51728 AAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTT-TTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAA
* * *
51792 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAGTCTAA
66 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCTAA
* * *
51857 AAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAATTC
130 AAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
* * * * ** **
51908 AAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTATGGCATTTTGTTTTGTTGTA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATA
** * * *
51972 AAACAATTGTTT-TATTCATACAAAATTATTCAGAATCAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCA
65 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCT-A
* ** * * * *
52036 AAAATTAAT-A--A-GACATTTAAAAGCTAAATTTGTTTACCAAACCAGTTT
129 AAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
* * * * *
52084 AAATAGTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAAT-AGTATGAT-CTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** *
52147 AACAAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTCTGAATAAAATAATGCTAAACTAATAATATTCTA
66 AAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TCTA
* * * * * *
52212 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCAGTT-
129 AAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
* * * * * **
52263 ATAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCA-A
1 A-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATA
**** * * * *
52327 AATTTTTTTTTTC-AGTTCATACAAGCTAATT-TGAAATAAAATAATA-TAATTTTATTAACATT
65 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA-T
* * * * * * *
52389 CAAAAAATTAATAAGCATGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTC
126 CTAAAAATTAATAAGTAGGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
* ** * *
52445 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT-AAACTTTTGTTTTATCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATA-TTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
52509 AAACAATTATTT-TAGTTTAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
65 AAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCT
* * * * * **
52572 CAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATCA-GTTTATCGAATTAGTTC
128 -AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACAAGTTC
* * * * * *
52626 AAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTTTATTTTGTTAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATA--TTTTGTTTTGTCAT
* * * ** * *
52690 AAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
64 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCT
* * ** * * *
52754 CAAAAACTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAGTTT
128 -AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
* * *
52808 AAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
52850 AAAATAATTA
Statistics
Matches: 895, Mismatches: 192, Indels: 69
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 16 0.02
175 13 0.01
176 105 0.12
177 4 0.00
179 12 0.01
180 282 0.32
181 244 0.27
182 210 0.23
183 8 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCTAAA
AATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
Found at i:52348 original size:356 final size:360
Alignment explanation
Indices: 51644--52846 Score: 890
Period size: 356 Copynumber: 3.3 Consensus size: 360
51634 ACTTATTCGG
* * * * * *
51644 AATAGAAATAATACTAA-ATTATTAAAATTCTAAAAATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAA
1 AATA-AAATAATA-TAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACATGAAA-TTTTAAAAAATAA
* *** * * * * *
51707 ATATGTTTAATGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTA
63 ATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTA
* * * *
51772 TGATATTTTTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAT
127 TGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
** * ** * *
51836 ACTAATTTATTAATAGTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAA
192 ACTAAACTAATAATAGTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTGCCAAA
* * * *
51901 CAAATTCAAATAGTCATATCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTATGGCATTTTGTTTT
257 CAAATTCAAATAGTCATAACCATTAGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT
* *
51966 GTTGTAAAACAATTGTTTTATTCATACAAAATTATTCAG-
322 GTTGCAAAACAATTGTTTTATTCATACAAAATAATT-AGA
* * * * **
52005 AATCAAGTAATACTAA-TTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A-A-GACA-TTTAAAAGCTAAA
1 AATAAAATAATA-TAATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAACATGAAATTTTAAAAAATAAA
* * * * * *
52064 TTTGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTACCTATCTCAAATAGTATG
64 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTATG
* ** *
52129 ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTCTGAATAAAATAATGC
129 ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * *
52194 TAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACC
194 TAAACTAATAATAGTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTGCCAAACA
* * * * * *
52259 AGTT-ATAATAGTTA-AGACTATTAGAA-TAATTGTCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTT
259 AATTCA-AATAGTCATA-ACCATTAGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTT
*** * ** *
52321 TG-T-CAAAATTTTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATTTGA
321 TGTTGCAAAACAATTGTTTT-A-TTCATACAAAATAATTAGA
52361 AATAAAATAATATAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAAATTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATATAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAA-CATGAAATTTTAAAAAATAAAT
** * * * *
52426 CTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATA
65 CTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TATG
* * * * * *
52491 AACTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTATTT-TAGTTTAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAA
129 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* *** * * * * ** * * **
52553 TATTACTTTATTAATA-TTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAATATAAATCA-GTTTATC
191 TACTAAACTAATAATAGTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGCTTGCC
* ** * * * ** * * * * *
52616 GAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTA
254 AAACAAATTCAAATAGTCATAACCATTAGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACATTTTG
** * ** * * *
52681 TTTTGTTATAAAACAATTATTTT-TCATCATACAAGTTTATTTGG
318 TTTTGTTGCAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAAAATAATTAGA
* * * *
52725 AATAAAATAATATTAA-TTTATTAATATTTC-AAAAACTAATAAGTAGGAGAA--TTAAAAAATA
1 AATAAAATAATA-TAATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAA-CATGA-AATTTTAAAAAATA
* ** * * * * *
52786 AATATACTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT
62 AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
52847 CATAAAATAA
Statistics
Matches: 670, Mismatches: 140, Indels: 62
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
354 10 0.01
355 35 0.05
356 241 0.36
357 1 0.00
358 2 0.00
359 2 0.00
360 32 0.05
361 71 0.11
362 114 0.17
363 92 0.14
364 52 0.08
365 18 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
AATAAAATAATATAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAACATGAAATTTTAAAAAATAAATC
TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTATGAT
CTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
AACTAATAATAGTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTGCCAAACAAA
TTCAAATAGTCATAACCATTAGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTG
CAAAACAATTGTTTTATTCATACAAAATAATTAGA
Found at i:52970 original size:158 final size:159
Alignment explanation
Indices: 52688--53005 Score: 365
Period size: 158 Copynumber: 2.0 Consensus size: 159
52678 TTATTTTGTT
* * * *
52688 ATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTATTTTTCATCA-ACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATATTAATCTACTAATATT
* * * * *
52753 TCAAAAACTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTAT
65 TCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAATTCAAATAGTTAA
* *
52818 TACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATC
130 GACTATATGAATAATTATATATTTCAAATC
*
52848 ATAAAATAATTATTTGTTCA-C-ACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTT-ATCTACTAATAT
1 ATAAAACAATTATTT-TTCATCAACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA-TTAATCTACTAATAT
* * * * ** ** *
52910 TATGAAAATC-AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAATTCAAATAGTT
64 T-TCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAATTCAAATAGTT
**
52974 AAGGTTATATGAATAATTATATATTTCAAATC
128 AAGACTATATGAATAATTATATATTTCAAATC
53006 GTTATAACCT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 23, Indels: 8
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
158 105 0.80
159 8 0.06
160 15 0.11
161 4 0.03
ACGTcount: A:0.46, C:0.09, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (159 bp):
ATAAAACAATTATTTTTCATCAACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATATTAATCTACTAATATTT
CAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTAATTCAAATAGTTAAG
ACTATATGAATAATTATATATTTCAAATC
Found at i:53642 original size:177 final size:180
Alignment explanation
Indices: 53327--53998 Score: 656
Period size: 177 Copynumber: 3.7 Consensus size: 180
53317 TACAAATAGT
* * * * * *
53327 TAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTAT
1 TAAATAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTAG-TATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *
53392 TTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGAGAAAAC-AAAAGGTTATAAC
64 TTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAAC
* * * *
53456 AAATTAAAATATATAATTGTTCAAATAGGT-ATAATTATTTGAAGTGGTTCCA
129 AATTTAAAATATATAATTATTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTGGTTCCA
*
53508 TAAATAACATTATTTTTTAAATCTCTTA-TA-AAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATT
1 TAAATAA-ATTATTTTTTAAATCTCTTAGTATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
53570 TTATTATGAATAAACTTGGATGAGTTGAAATAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAAGGTTATAACG
65 TTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAACA
* * *
53634 ATTTAAAATAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGA
130 ATTTAAAAT-AT--ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCCA
* * * * * * *
53688 CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTAT
1 TAAATAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTAG-TATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
53753 TTTATTCCAAATAAATTTATATGAACAGAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAAGGTTGTAAC
64 TTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAAC
* * * **
53818 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACTTATT-CA
129 AATTTAAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCCA
* * *
53869 GTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTC--A-TACT-AATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 -TAAATA-AATTATTTTTTAAATCTCTTAGTA-TAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
53930 TTTTATT-TCAAATAAACTTGTATG-TTCA-AAATTATTGTTTTATGACAAAACGAAAA-G-TAC
63 TTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAAT-AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTTA-
53990 TAACAATTT
125 TAACAATTT
53999 TATTTCAAAT
Statistics
Matches: 403, Mismatches: 71, Indels: 39
0.79 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 10 0.02
177 109 0.27
178 54 0.13
179 6 0.01
180 56 0.14
181 26 0.06
182 54 0.13
183 5 0.01
184 62 0.15
185 20 0.05
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TAAATAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTATAAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAACAA
TTTAAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCCA
Found at i:54003 original size:66 final size:67
Alignment explanation
Indices: 53929--54065 Score: 195
Period size: 67 Copynumber: 2.1 Consensus size: 67
53919 AATTAGTATT
* ** *
53929 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTT-CAAAATTATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTACTAA
1 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAA
53993 CA
66 CA
* * *
53995 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAA
*
54060 CG
66 CA
54062 ATTT
1 ATTT
54066 GAAATAGATA
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 8, Indels: 1
0.87 0.11 0.01
Matches are distributed among these distances:
66 26 0.42
67 36 0.58
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (67 bp):
ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAGTAATAA
CA
Found at i:55562 original size:528 final size:523
Alignment explanation
Indices: 54025--55618 Score: 1561
Period size: 528 Copynumber: 3.0 Consensus size: 523
54015 GTATGTTGAA
* * * * *
54025 AAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATA-T
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAT-AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
54089 CCATAATTATTTAAATTGATTCAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAA
65 -TATAATTATTTGAATTGATTCAGTAAA-TAGATTTAGTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTAAA
*
54153 ATATTAATAAACTAGTATTATTTT-TTTTGGATAAACTTTTGTGAACTA-AAACAATTGTTTTAT
128 ATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTT-G---AA---TTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
54216 GACAAAACAAAAGTTCAT-ATCGATTTTAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATAGCTATTTGAA
185 GACAAAACAAAAGGTCATAAT-AATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
54280 CTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAAA-GTTAATAA
249 CTTGTTCAGTAAACATATATA-TTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAA--TTTGAAAATGTTAATAA
* * *
54344 ATTAGTATTATTTTCTT-TCGAATAAGCTTGTTTGAACTAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAA
310 ATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAATTGTTTTATGACTAAACAAA
* * * * *
54408 AGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAATATTTGAATTGATTCAGCAAA
374 AGGTCAAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAATATTTGACTT-ATTCAGCAAA
* * * * *
54473 CATATTTATTTTTTAAA---TTATTTATTAGTTTTGAAAATATTATTAAATTAGTATTC-TTTTT
437 CATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTA-TCATTTTA
* **
54534 ATCTGAATTAA-CTTGTATGATCAG
501 ATC-GAA-TAAGCTTATATGAAAAG
* ** * * *
54558 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGAGCATAATAATTTGAGATTGATATTTGTCCAAATAGTT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
54623 GTAACTATTGGAATTGCTT-AGAAAATAG-CTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTAA
66 ATAATTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTAA
* * *
54686 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTTGATACGTTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGAC
127 AATATTAATAAACTAGTATTATTTTA-TTTTGA-A--TTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * *
54751 AAGACAAAAAGTTAAAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTAATTAAAATTG
188 AAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * *** *
54816 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATACATTAG
253 TTCAGT-AA-ACATATATATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTGAAAATGTTAATAAATTAG
** * * *
54881 TATTATTTTATTCCAAATAAGTTTGTATGAACTAAAATAATAGTTTTATGACTAAACAAAAGGTT
315 TATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-AATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTC
* * ** * *
54946 AGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTAACAAACATA
379 A-AACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAA-TATTT-GACTTATTCAGCAAACATA
*
55011 TATATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATCATTTTAATCG
441 TTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATCATTTTAATCG
*
55076 AATAAGCTTATGTGAAAAG
505 AATAAGCTTATATGAAAAG
* *
55095 AAACAATTGTTGTATGACAAAATAAAGATCATTACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTT
* *
55160 ATAATTATTTGAACT-AGTTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAAT
66 ATAATTATTTGAATTGA-TTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTAAAAT
* * **
55224 ATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAA-TATGAATAGAAACAATTGTTTTACCACAAAACAA
130 ATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * *
55288 AAGGTCATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATTGACATAACTATTTGAACTTGTTC-GAT
195 AAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-T
* * * * * *
55352 AAACATATATATTTTTAAATCTCCTACGTATTAACTTGCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTT
259 AAACATATATATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTG-AAAATGTTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
55417 TATTCTGAATAAACTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCCTAACTA
323 TATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAA-AATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGT-CAAACTA
* * * * * * * *
55481 TTTGAAATAAAAAATTGCTCAAACAGTCATAATAATTTGAGCTTACTCAGTAAACAGATTTATTT
385 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAAT-ATTTGA-CTTATTCAGCAAACATATTTATTT
* * * * * *
55546 TATAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
448 TTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTATTAAATTAGTATCATTTTA-ATCGAATAA
*
55610 GCTTGTATG
510 GCTTATATG
55619 GACAGTAACA
Statistics
Matches: 864, Mismatches: 160, Indels: 78
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
527 6 0.01
528 190 0.22
529 18 0.02
530 93 0.11
531 13 0.02
532 184 0.21
533 90 0.10
534 78 0.09
535 40 0.05
536 7 0.01
537 86 0.10
538 47 0.05
539 12 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (523 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTT
ATAATTATTTGAATTGATTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTAAAATA
TTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
AGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAA
ACATATATATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTGAAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTAT
TCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAACTATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAATATTTGACTTATTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATC
TTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATCATTTTAATCGAATAAGCTTATATGAA
AAG
Found at i:55672 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 53995--55670 Score: 1300
Period size: 181 Copynumber: 9.4 Consensus size: 180
53985 AGTACTAACA
* * * ** *
53995 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
54059 ACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATA-TCCATAATTATTT-AAATTGATTCAGTAAACTGAT
65 ACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGAT
*
54122 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAACTAGTATT
128 TTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
54172 ATTTT-TTTTGGATAAACTTTTGTGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * *
54235 TCGATTTTAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATAGCTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTT
65 ACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTT
* * *
54300 ATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAAA-GTTAATAAATTAGTATT
130 A-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
54353 ATTTTCTTTCGAATAAGCTTGTTTGAACTA-AAA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCA-A
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
54415 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAA-TATTTGAA-TTGATTCAGCAAACATAT
65 ACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGAT
* * * *
54478 TTATTTTTTAAA----TTATTTATTAGTTTTGAAAATATTATTAAATTAGTATT
128 TTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * *
54528 CTTTT-TATCTGAATTAA-CTTGTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGAG-C
1 ATTTTATTTC-GAA-TAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTC
* * * * ** * * * *
54588 ATAA-TAATTTGAGATTGATATTTGTCCAAATAGTTGTAACTATTGGAA-TTGCTT-AGAAAATA
62 ATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACA
* * * *
54650 G-CTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATT
125 GATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
54706 ATTTTATTTTTG-AT-A-CGT-TATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAGACAAAAAGTTA-A
1 ATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
54766 AATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTAATTAAAATTGTTCAGTAAATAGATT
65 ACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATT
* ** * *
54831 TATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATACATTAGTATT
129 TA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
54885 ATTTTATTCCAAATAAGTTTGTATGAACTA-AAATAATAGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** * ** * *
54949 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTAACAAACATATAT
65 ACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTT
* * *
55014 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATC
130 A-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
55066 ATTTTA-ATCGAATAAGCTTATGTGAAAAGAAACAATTGTTGTATGACAAAA-TAAAGATCATTA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
55129 CGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAC-TAGTTCAGTAAATAGATTT
66 CTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAGTAAACAGATTT
* *
55193 AGTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTTGTATT
130 A-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* **
55241 ATTTTATTTTG---AA-----TATGAATAGAAACAATTGTTTTACCACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
55298 -TAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATTGACATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACATATA
66 CT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAACAGATT
* * * ** *
55361 TATTTTTAAATCTCCTACGTATTAACTTGCAAAATATTAATAAAGTAGTATT
129 TATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
55413 ATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCCTA
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
55477 ACTATTTGAAATAAAAAATTGCTCAAACAGTCATAA-TAATTTGAGCTTACTCAGTAAACAGATT
65 ACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATT
* * *
55541 TATTTTATAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATT
129 TATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
55594 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGGACAGTAACAGTT-TGTTTATCACAAAACAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
55658 ACTATTTGAAATA
65 ACTATTTGAAATA
55671 AATAGCAAAT
Statistics
Matches: 1188, Mismatches: 243, Indels: 132
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
168 35 0.03
169 58 0.05
170 3 0.00
171 2 0.00
172 38 0.03
173 3 0.00
174 19 0.02
175 148 0.12
176 179 0.15
177 27 0.02
178 42 0.04
179 127 0.11
180 156 0.13
181 237 0.20
182 111 0.09
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTA
TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:69741 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 68478--70969 Score: 2132
Period size: 181 Copynumber: 13.9 Consensus size: 181
68468 NNNNNNNNNT
* * * *
68478 ATAAAATAGTATTA--TT-TTT-GAATAAGCTTTTCTGAACTA-AAACAATTGTTTTATGAAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * *
68538 ACAAAAGGTCTTAATAATTTTAAATCGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTGTTC
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* ** * * *
68603 -GATAAACACATTTATCTTTTCCAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTGGAATGTTA
130 AG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * *
68655 ATAAATTAGTATTA-TTTATTCCGAATAAGCGTGTATGAATTGAAAACAATTATTATATGACTAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
68719 ACAAAAGGTTAGAACTATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGAACTGGTT-
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * * * *
68783 TGACAAATACATTTATTTTTTAAATC-CTT-C--ACTAAGTTTTGGAATATTA
130 AG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * ** * **
68832 TTAAATTAGTATTATTTT-TGTCAAATAAGCTTGTATG-ATCAGAAATGATTGCTTTATGAGGAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * * * * *
68895 AC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCCAATAGTCCTAACTATTTAAACTAGTTT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * **
68959 AGAAAACAACTTTA-GTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTT-GAAATATTA
130 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTA
* * * * * * *
69010 ATAAAGTAGTGTTATTTTATTTCTAATAAGTTTTTATGAA-ATGAAACAATTATTTTATAACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
69074 ACAAAAGATCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTCCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACATAT
65 ACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-T-T
* * * * * * * *
69137 -TTGA-TAAATAGATTTATATTTTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTA
126 GTTCAGTAAACA-AATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * *
69193 ATAAATTACTATTATTTTA-TTCTGAATAAGATTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATGACTA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
69256 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAGTAGATAATTATT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGT
64 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * *
69320 TTAGCAAACACATTTATTTTTCAAA--GC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTA
128 TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * *
69370 TTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTATAACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
69435 TAAATA--TGATAACGATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTT-AAGC-TGTT
66 CAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTG-T
* * * *
69496 TCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTA
128 TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * ** * *
69546 ATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
69611 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCA
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
*
69676 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAGAATATTA
131 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * *
69727 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
69791 AC-AAAGGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAATTATTTGAACTTGC
65 ACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * *
69854 TCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGGAATATTA
128 TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * * *
69908 ATAAACTAGTAATA-TTTATTTTGAATATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGATAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * **
69972 CAAAATGTCATAATTATTTGAGATAGATAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* * *
70037 GTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTA
131 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * *
70088 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACT-GATATAATTGTTTTATGACGAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * *
70152 ATAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * * * *
70217 AATAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATGTTA
130 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * *
70269 ATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * **
70334 CAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATATTTATTTAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTTG
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
*** * * * *
70399 GTAAATGTAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAA-TTGTATGAATATTA
131 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTA
* * * *
70450 ATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATT-ATTTATGACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
70513 ACAAAATGTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTC
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * *
70578 -GATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTT-GAAATATTA
130 AG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTA
* ** * * * *
70630 ATAAATTAGAATTATGCTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTCTTGTGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
70695 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGCACTAG-TCA
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-
** * * * * *
70759 AGCCAACAGATTCATTTATTAAATTTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
130 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * * *
70811 ATAAACTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
** * * * * * *
70875 ACAATTGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTACAACTATTTGAACTAGTTT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * *
70940 GGTAAATATATTTATATTTTAAATCTCTTA
130 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
70970 ATGTTAGCCT
Statistics
Matches: 1870, Mismatches: 375, Indels: 136
0.79 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 9 0.00
175 63 0.03
176 159 0.09
177 195 0.10
178 46 0.02
179 46 0.02
180 367 0.20
181 835 0.45
182 23 0.01
183 124 0.07
184 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
Found at i:70013 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 69981--70013 Score: 50
Period size: 16 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
69971 ACAAAATGTC
*
69981 ATAATTATTTGAGATAG
1 ATAATTATTTCAGATAG
69998 ATAATTA-TTCAGATAG
1 ATAATTATTTCAGATAG
70014 TCATAACTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 8 0.53
17 7 0.47
ACGTcount: A:0.42, C:0.03, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (17 bp):
ATAATTATTTCAGATAG
Found at i:70025 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 68493--70969 Score: 2171
Period size: 361 Copynumber: 6.9 Consensus size: 362
68483 ATAGTATTAT
* * * * *
68493 TTTTGAATAAGCTTTTCTGAACTA-AAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCTTAATAATT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * *
68557 TTAAATCGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTG-TTCGATAAACACATTTATCTT
65 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTAT-TT
** * * * **
68621 TTCCAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCCGAATAAG
128 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG
* * * * * * * *
68684 CGTGTATGAATTGAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGG-TTAGAACTATTTGAAATAAAT
193 CTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGATCATAACTATTTGAAATAGAT
* * * * * * * *
68748 AATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATACATTTATTTTTTAAATC-CTT
256 AATTATTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * *
68812 -C--ACTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-
321 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * ** * ** *
68850 TGTCAAATAAGCTTGTATGATCAGAAATGATTGCTTTATGAGGAAAC-AAAGATCATAATGATTT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * * * *
68914 GAGATTGATATTTGTTCCAATAGTCCTAACTATTTAAACTAGTTTAGAAAACAACTTTA-GTTTT
66 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
** * * *
68978 AAATCTCTTGTTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAGTGTTATTTTATTTCT-AATAAGT
131 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGC
* * * *
69041 TTTTATGAA-ATGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAA-TGACTTT-AAATAGAT
194 TTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGATCATAACT-A-TTTGAAATAGAT
* * * * * * *
69103 AATTGTCCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACATATTTGATAAATAGATTTATATTTTTTAAATCT
256 AATTATTCAAAAAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGA-TT-TATTTTTTAAATCT
* * * * *
69167 TTTGCTCATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTACTATTATTTTA
318 CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * **
69212 TTCTGAATAAGATTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * *
69277 GAAGTAGATAATTATT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTAGCAAACACATTTATTTTT
66 GAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTT
* * * * *
69341 CAAA--GC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTC-GAATAAGC
130 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGC
* * * * * * * * *
69401 TTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTATAACAAAATAAA-TATGATAACGATTTTAGATAGATAAT
194 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGATCATAACTATTTGAAATAGATAAT
* * * *
69465 TATTCAAATAA-TAATAACTATTT-AAGC-TGTTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T
259 TATTCAAA-AAGTCATAACTATTTGAA-CTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** *
69524 -CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTA
321 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * * *
69565 TTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * *
69630 GAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT
66 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
* *
69695 AAATCTCTTACATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT
131 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT
* * * *
69760 GCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTG
196 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGATCATAACTATTTGAAATAGATAATTA
* * * * *
69825 TTCAAACAAG-CATAATTATTTGAACTTGCTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACAT
261 TTCAAA-AAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *
69889 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTAATA-TTTA
325 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * *
69926 TTTTGAATATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATTATTT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * *
69991 GAGATAGATAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTT
66 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * *
70056 AAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCC
131 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCT
* * * * * * *
70120 TATATGAACT-GATATAATTGTTTTATGACGAAATAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAAT
195 TGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGATCATAACTATTTGAAATAGATAAT
* * * * * ** * *
70184 TATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTTAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACT
259 TATTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* ** * *
70249 TATTAATTGTCAAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTA
324 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
70288 ATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAAGTCATAACGATTT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * * *** *
70353 GAAATAAATATTTATTTAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTTGGTAAATGTAGTTATTTTTT
66 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * *
70418 AAATCTTTTATTTATTAA-TTGTATGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGC
131 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGC
* * * * * * *
70481 TTGTATGAATAGAAAAAATT-ATTTATGACAAAACAAAATG-TTATAGCAATTTGAAATAGGTAA
194 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGATCATAACTATTTGAAATAGATAA
* *
70544 TTATTCAAATAA-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTA
258 TTATTCAAA-AAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * **
70608 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTA
322 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
*** * * *
70649 TTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTCTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * ** ** * * *
70714 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGCACTAGTCAAGCCAACAGATTCATTTATT
66 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * * *
70779 AAATTTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAAC-
131 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-AAGCT
* * * * *
70843 TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATTGG-TCATAACGATTTGAAATAAATAAT
195 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGGATCATAACTATTTGAAATAGATAAT
** * * * * * * * *
70907 TATTCAAATTGTTACAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATATATTTATATTTTAAATCTCTTA
259 TATTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
70970 ATGTTAGCCT
Statistics
Matches: 1704, Mismatches: 354, Indels: 119
0.78 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
352 4 0.00
353 139 0.08
354 29 0.02
355 90 0.05
356 85 0.05
357 138 0.08
358 72 0.04
359 46 0.03
360 85 0.05
361 603 0.35
362 342 0.20
363 65 0.04
364 6 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (362 bp):
TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT
GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGATCATAACTATTTGAAATAGATAATTA
TTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
Found at i:70206 original size:542 final size:537
Alignment explanation
Indices: 68478--70965 Score: 2352
Period size: 542 Copynumber: 4.6 Consensus size: 537
68468 NNNNNNNNNT
* * * *
68478 ATAAAATAGTATTA--TT-TTT-GAATAAGCTTTTCTGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAA
1 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
68539 CAAAAGGTCTTAATAATTTTAAATCGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTGTTC-
65 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* ** * *
68603 GATAAACACATTTATCTTTTCCAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTGGAATGTTAATAAATTAGTAT
130 G-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTAT
* * * * * *
68667 TA-TTTATTCCGAATAAGCGTGTATGAATTGAAAACAATTATTATATGACT-AAACAAAAGGTTA
193 TATTTTATTCCGAATAAACTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGA-TAAAAC-AAAGGTCA
* * * * * * *
68730 GAACTATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATACAT
255 TAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACACAT
* * * * *
68795 TTATTTTTTAAATCCTTC--ACTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTGTCAAAT
320 TTATTTTTTAAATCTTTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-TCGAAT
* * * ** * *
68858 AAGCTTGTATGATCAGAAATGATTGCTTTATGAGGAAAC-AAA-GATCATAATGATTTGAGATTG
384 AAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGATTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAGATAG
* * * * * * * * * *
68921 ATATTTGTTCCAATAGTCCTAACTATTTAAACTAGTTTAGAAAACAACTTTAG-TTTTAAATCTC
448 ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC
**
68985 TTGTTTATTAATTTTTGAAATATTA
513 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * *
69010 ATAAAGTAGTGTTATTTTATTTCTAATAAGTTTTTATGAAATGAAACAATTATTTTATAACAAAA
1 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AATGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
69075 CAAAAGATCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTCCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACATAT-
65 CAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-T-TG
* * * * * * *
69137 TTGA-TAAATAGATTTATATTTTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTA
126 TTCAGTAAACA-AATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTA
* * *
69201 CTATTATTTTATTCTGAATAAGA-TTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATGACT-AAACAAAA
189 GTATTATTTTATTCCGAATAA-ACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAAC-AAA
* * * * * * *
69263 GGTCATAACAATTTGAAGTAGATAATTATT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTAGCAA
250 GGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAA
* * *
69327 ACACATTTATTTTTCAAAGC--TCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAA
314 ACACATTTATTTTTTAAATCTTTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--
* * * *
69390 TTCGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTATAACAAAATAAATATG--ATAACGATTT
377 TTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGATTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACGATTT
* *
69453 TAGATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTT-AAGC-TGTTTCGGTAAACAAATTTAGTTT
441 GAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA-CTTGTTT-GGTAAACAAATTTAGTTT
**
69516 TTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTA
504 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * ** * *
69546 ATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
1 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
69611 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCA
65 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* *
69676 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
130 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTA
** *
69741 TTTTATTCTAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGATCATAAC
195 TTTTATTCCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGG-TCATAAC
* * * * * * * *
69806 TATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAATTATTTGAACTTGCTCGGTAAACAGATTTA
259 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACACATTTA
* * * *
69870 TTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTAATATTTATTTTGAATA
323 TTTTTTAAATC-TTT-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TTTCGAATA
* * * * **
69935 TGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATTATTTGAGATAGAT
385 AGCTTGTATGAACAGAAATAATTGATTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAGATAGAT
* * * *
70000 AATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
450 AATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTT
* *
70065 ACTCATTAATTTTTGGAATATTA
515 ACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
70088 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTGATATAATTGTTTTATGACGAAA
1 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
70153 TAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTTA
65 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* * * * * * *
70218 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATGTTAATAAATTAATATTA
130 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTA
* * * ** *
70283 TTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAAGTCATAA
195 TTTT-ATTCCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGGTCATAA
* * * * * * *** *
70347 CGATTTGAAATAAATATTTATTTAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTTGGTAAATGTAGTTA
258 CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACACATTTA
* * *
70412 TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTGTAT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAA
323 TTTTTTAAATC-TTT-CTTATTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--TTCG-A
* * * * * *
70475 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATT-ATTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCAATTTGAAATA
382 ATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGATTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAGATA
* * * * *
70539 GGTAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCT
447 GATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCT
*
70604 CTTACTTATAAATTTTTGAAATATTA
512 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * * * *
70630 ATAAATTAGAATTATGCTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTCTTGTGACAAAA
1 ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * * * *
70695 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGCACTAG-TCA
65 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-
** * * * * * * * *
70759 AGCCAACAGATTCATTTATTAAATTTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGCATT
129 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATT
* * * * *
70824 ATTTTATTCCAAATAAAAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATTGGTCATA
194 ATTTTATTCCGAAT-AAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAA-AGGTCATA
* * * * * * *
70888 ACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTACAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATATATTT
257 ACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACACATTT
*
70953 ATATTTTAAATCT
322 ATTTTTTAAATCT
70966 CTTAATGTTA
Statistics
Matches: 1610, Mismatches: 282, Indels: 119
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
532 12 0.01
533 8 0.00
534 154 0.10
535 21 0.01
536 205 0.13
537 74 0.05
538 261 0.16
539 115 0.07
540 13 0.01
541 13 0.01
542 695 0.43
543 39 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (537 bp):
ATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTCCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGTCATAACGA
TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACACATTTATTT
TTTAAATCTTTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTCGAATAAGCTTG
TATGAACAGAAATAATTGATTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAGATAGATAATTAT
TCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAT
TAATTTTTGAAATATTA
Found at i:79240 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 78919--80459 Score: 1391
Period size: 181 Copynumber: 8.6 Consensus size: 180
78909 AAAAGCTAAC
* * * * * * *
78919 ACTTAATAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATGTTATTTTA-TTCGAACAAACTTATATGAACA
1 ACTTATTAATTTT-ATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * *
78983 -AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAATTATTCATACA
65 GAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
79047 GCCTTTACTATTTGAACAGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTGAATCTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * *
79099 AGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA
1 ACTTATTAATTTT-ATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * *
79164 TAAATAAATGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAG
65 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *
79229 TCATAACTATTTGAACTAGTT-TGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
130 TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGC-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * **
79280 ACTCATTAATTTT-TGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAGGCTTATATGATG
1 ACTTATTAATTTTAT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * *
79344 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
64 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *** ** **
79409 GCCACAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCA
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
79461 ACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACT
1 ACTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-
* * * * * *
79526 A-AAACATTTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
64 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
79590 GTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTAAAATTTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
* * * * * * * *
79643 GCTTATTAGTTTTTTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TACGAAC
1 ACTTATTAATTTTAT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAAC
* * * * * * *
79707 TGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATA
64 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
79772 TTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATT
129 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * * *
79824 ACTTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTT-TCTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACA
* * *
79888 GAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAG
65 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
79952 TCATAACAATTTGAACTAGTTTGGTC-AATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTT
130 TCATAACTATTTGAACTGGTTCGG-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** *
80003 A-TTAATT--TTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
1 ACTT-ATTAATTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * ** *
80064 AAAATAATTTTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAATTCAAATGG
65 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * * **
80129 ACGTGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTAATTTCTTAAGTCTCCA
130 TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
80180 ACTCATTAATTTTATTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAG
1 ACTTATTAATTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAG
* * * * * *
80245 AAACAACTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAG
66 AAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *** * * *
80310 TTATAACTATTTAAACTCACTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
130 TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * *
80361 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTACGAATAAGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA
**
80426 GAAACAATTGGTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATA
65 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
80460 TCTGTTCATT
Statistics
Matches: 1090, Mismatches: 245, Indels: 52
0.79 0.18 0.04
Matches are distributed among these distances:
176 59 0.05
177 80 0.07
178 3 0.00
179 84 0.08
180 162 0.15
181 491 0.45
182 209 0.19
183 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
ACTTATTAATTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAG
AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
Found at i:81285 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 80522--110275 Score: 7795
Period size: 181 Copynumber: 163.6 Consensus size: 180
80512 TAGAAACTCA
* * * *
80522 TAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTCA-CGAA-AGCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
80585 ATTACCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
80649 GCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATTTTCCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
** *** ** * **
80702 TAAGAGA-TT-AAAAATAATAAGTGTTTGTTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
80765 TTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTCTT-TTTAGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTTATGCA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * *
80828 AGCTTATTTAAAATATAATAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAAATTAATGAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAG
* * * *
80882 CAAGAGATTTAAAAACATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
80946 ATTTTCTATTT-AAAGACATTACGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAA
64 ATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * *
81009 AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * *
81064 CAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
81129 TATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATCCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
*** * * * ** *
81193 TTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * ** * * *
81243 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCCGTTCAAATAGTTAAGACCATTAGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** *
81308 TATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTATTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
** * * *
81372 CTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAG
* * * * *
81424 CAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * ** *
81489 TTATCTATTTAAAATCGTTATGA-CTTTT-TTTTATAATAAAACAATTGTTT-AAGTTTTTAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * * * * *
81551 GTTTATCCAAAATAACATAATATTAATTTACTAATATTTCAAAAATTGAGAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
** * * * * * *
81604 TTAA-AGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCAATTTAAACA
1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
81667 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTCATT-ATA-
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * *** * *
81730 ATGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * *
81785 TAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
81850 TATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * ** * * **
81915 TTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTATGAAAATTAGTATC
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * *
81966 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
82031 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
82096 TTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* ** * * * *
82145 --AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
82208 TATTTATTGCAAATCATTATGACCATTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTCTATTAATACAATC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* ** * *
82273 TCATTCGGAATAAAATAATGCTAATTAATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * ** * * * * *
82324 TAACAGATTTAAAAAATTAATCTGTTGGCCTAACCAA-TGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
82388 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC--ACAACAATTGTTTCTATTCCTATAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
82451 CTTATTCAGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAA--ATTAA-
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * ** * ***
82499 TAAGAGATTTAAAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
82564 TACCTATTTTAAATTGCTATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * * * *
82629 TTATTTTAATTAAAACAATACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AATTAATAAG
* * * * * * *
82680 TAAAAGATTTAAAAAACAACTCTATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
82745 TATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTCGTTTTGTCAAAAAACAAATT-TTT-T-TTCATAGAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAA
*** * * *
82806 GCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATATT-TCAACAATTAATGAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAATAAG
* * * * * * *
82858 TAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * * *
82923 TATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *
82988 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * **
83039 CAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACC-AAAAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
83103 TTTTTATTTCAAATCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *
83167 TTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-C-TAAAATTAATAAG
* * * * ** * *
83219 TAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** *
83282 TTATCTATTTCAAATAGTTATGAGCTTTTGTTTTGTTATAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** *
83347 CATATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATT-TCAAAATT--TAA-
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * *
83395 TAAGA-TTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAGCATGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAA
* * * * *
83458 CAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAT
62 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** *
83523 AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * *
83578 TAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * **
83642 TATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAATAATTGTTT-TGTTCATGCAAAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * *
83706 TTATTCAGAACAAAATAATAC-AGATCTATTAAAATTTTGAAAA-T--TAA-
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * *
83753 TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAGAA-ATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** * *
83817 TTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAA
65 TTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
*** * * * *
83880 GCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA--ATTAA-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
83929 TAAGAGATTTAAAAAATATATGTATTTA-CGAACCAA-TTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
83992 TTATCTACTTCAAATCGTT-TGGA-CTTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTT-TAATTCATAC
65 TTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * *
84054 AAGCTTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
* * * *
84109 CAAGAGATTTAAAAAA-AAA-CTATTTATCGAACAAGTTCGAATAGATT-TGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAA
* * * *
84171 TTATCTATTT-AAAGTCATCA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAA
65 TTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * * *
84233 AACTTA-TCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTCAAAAATTAAAAAG
128 AGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * ** * ** * * * *
84286 CAAGTTATGACTATTTGAATAAATATCAATCT-TAAATC-ATTAAGATC--TTTGTT-T-TCTCA
1 TAAG--A-G---ATTT-AA-AAA-ATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-A
* ** * ** * *** **** *
84345 --T-AA-AATAAT-TATTTCTTATC-ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATT-TATT
56 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-TT
* * * * ** *
84403 AATATTC-TA-AAACTTAGT-AAGAGACTTAAAA-AA-AATAA---ATGCAT-TTGCTGAACCAG
117 -CTATTCATACAAGCTTATTCAA-A-A--TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CT-AA--AA
84459 TTCAA-ATAG
173 TT-AATA-AG
* * * * * * **
84468 TTAAGA-CTGTT--AGAAT-AAT-T-TTTAATTTCAAATC-ATTTTAACAT--TT-TGTTTAGTC
1 -TAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTT-A--CCGAA-CAAGTTCAA-ATAGTTATGACTA-T-
* * * * * * *** *** *
84523 ATAGAATAATTGTTTCAGTTCAAA-C---A--AGCTTACTTGGAATAAAATAATACTAATT-TAT
57 -TTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTT--TTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-T
* * ** * * *
84581 TAATATT--TAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAA-AATA--AATTTGTT--TA-TCGAAC
116 T-CTATTCATACAAGCTT-AT--TCAA-A-A--T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TA-
**
84638 AAATTTGAATATT
170 AAA-TT-AATAAG
* * * * ** * * * ** ** * * *
84651 TATGATGATTTGAACAAT-TATCAATTTA--AAATC-ATTATGACCTTTTTTTTG-CCA--TAAA
1 TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGT-TCA-AATAGTTATGACTATTTGAA
* * * ** **** *** * * *
84709 CAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATG--C----AAAATAAAATAATACTATTGTATTAATATT
62 CAATT-ATCTATTTCA-AATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TT-CTA-T
* ** * ** *
84768 TCA-A-AAG-TTAAT-AAGAGATTTAAAA-AATA--AATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTAA
121 TCATACAAGCTTATTCAA-A-A--TAAAATAATACTAATTTATT--AAT-ATTCT--AAAATT-A
*
84826 ATAAC
176 ATAAG
*** * * ** * * *
84831 T-ATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTGGTTTTTTCCTAAAACAATTGCTTTTCAATATAG--A
1 TAAGAGATTT-AAA----AAATAAATCT-G--TTTACC--GAACAA--G---TTCAA-ATAGTTA
* * ** * * * ** * * * **** *
84893 AGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGA-ATTAAT-AACAGAT-TTAA
50 TGACTATT--TGA-ACAATTAT-CT-ATTTCA-AATCGTT-ATGACCTT-TTGTTTTG-TCATAA
*** * * * * * **
84955 AA-AA-TAAATCTGTT--TACCAAAC-CAGTTC-AAAT--AGTTATGACT-ATTTGAACAATA-T
106 AACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAATATT
* *
85010 CTATTTCAAATTGTTATAACC
167 CTA----AAA-T-TAATAA-G
*** * * * * ** * * * *
85031 T-TTTG-TTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC-ATATAAGCCTATTCGAATAAAATAAT-AC
1 TAAGAGATT-TA--A-AAAATAAATCTGTTT-ACCGA-ACAAG----TTC-AA-ATAGTTATGAC
** *** ** ** ** *
85092 TAATTT-AGTAA-TATTCTAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTATTTG-C-TAA
54 T-ATTTGAACAATTA-TCT---ATT--T--C-AA-ATCGTTATGACCT-TTTGT-TTTGTCATAA
* *** * ** * *** * ** **
85153 ACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTTTT
106 A--A---C-AATTGTTTCTA-TTCAT--ACAA--GCTTA-TTCAAAATAAAAT-A-ATACTAATT
* * ***
85218 CTCATAAAACAATTGTCT-TCGTTAAT-A-
157 -T-AT-TAA-TA-T-TCTAAAATTAATAAG
** * ** * ** * * *
85245 TAAGTTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAATTTA-TTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGA-
1 TAAG-AGATTT-AAA-AAATA-AAT-CT-GTTTACCGAACAAGTT--CAAA-TAGT---TATGAC
* * * * * * * ** * *
85307 GATTT-AAAAAGTAAATCTATTTACTAAACCATTTTAAATAGTTTTGACTATTTG--A-ATAACT
54 TATTTGAACAA-T-TATCTATTT-C-AAATCGTTAT-GA-CCTTTTG--T-TTTGTCATAAAACA
* * * * * * ** * *
85368 ATCTATTTCTAATCATTATAACTTCTTATTTTGCATCAAA-CAATTGGTCCT-ATTCATACTATT
110 AT-TGTTTCTATTCA-TACAA--GCTTA--TT-CA--AAATAAAATAATACTAATT--TA-T-TA
* *
85431 TTATTC-AAAATAAAATAA-
162 ATATTCTAAAAT-TAATAAG
** * * * * * * ** *
85449 TACTA-ATTTAAGAATATTCTAAAACT-TAATAACCAAAAAAATT-AAA-AAATA-AATCTAATT
1 TAAGAGATTTAA-AA-A--ATAAATCTGT--TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CT-ATT
* ** * * * * **
85509 GTCAAACAAGTTCAAATAGTT-AAGA-C-TATATGAACAATTATCTGTTTCAAAGTGTTATGACC
58 -T-GAACAA-TT-ATCTATTTCAA-ATCGT-TATG-AC-CTT-T-TGTTT-----TGTCATAAAA
** * * * * ** ** * * * * * ** *
85571 CTTTTCTTT-TGTT-GTAAAATAATTATT-TTATTCATACAA-GCTTTTTTTATTAAAATAATGC
108 CAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATAC-TAATTTATT--AAT-ATTC
*
85632 -AAATTTAATAA-
168 TAAAATTAATAAG
* * * * *
85643 TATTTTGAAAATTAATAAATAAGA--TATTTA---AA-AA-TT-AAAT--TT-T---T-TTGTCG
1 TA---AGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-T-G
** ** ** * * * * ** *
85693 AATCAATTGAAATGGTT-AAGATTATTA-GAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAACATTTTG
60 AA-CAATT-ATCTATTTCAA-ATCGTTATG-AC-CTTTTGT-TTTG---TC-ATAAAACA-ATTG
* *
85756 TTT-T-GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTA
114 TTTCTATTCAT---ACAA--G-CTTA-TTC-A-AA----A--T---A-AAA-TAATACTAATTTA
* *
85819 TTAACATTCAAAAATTAATAAG
159 TTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * *
85841 AAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAACGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
85906 ATGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* ** *
85970 GCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTCACTAAAA-TAATAAG
129 GCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TCTAAAATTAATAAG
* * * ** * * * **
86023 TAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTAAAATAATTAT-ACTCGTTTGAATGA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA
* * * * * *
86087 TTATTTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTATCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAA
* *
86152 GCTTATAT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
129 GCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* ** ** *
86205 TAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
86269 TTATTTAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGATTTTTA-TCATAG
65 TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAC
*** * *
86331 AAGCTTATT-TGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
127 AAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * ** * ** * *
86386 TAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTT-TTGAGCTAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
86449 TTAT-TAATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACA
65 TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACA
* * * *
86512 AGATTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
* * * * * *
86566 GAA-ATGATTTGAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACA
1 TAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
86630 ATTATTTATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * *
86694 AGCTTATCCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* * * ** * *
86748 CAAGAG-TTT--CAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * ** *
86810 TGTCTATTT-AAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTATCTGAATCCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
86874 TTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATAAACATTCCAAAAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
86925 CAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAATTAATGTC-ATTTCAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACA
* * * *
86988 ATTATCAATTTCAAATCGTT-TG----TTTG----GTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATATA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * ** * * *
87043 TGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
87097 TAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** * * * * * * * *
87162 TT-GCATACTGAAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAA
65 TTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * ** * *
87226 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAAT
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
87279 TAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
87344 TATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATACTAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * * *
87402 TTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATATG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * *
87453 TAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * * * * * *
87518 TATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTCCATATAAGT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
87583 TTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* ** * * *
87632 T---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAA-TTCAAAAAGTTATGACTAAATATTTCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC----TATTTGA
* * *** * **** * * **
87693 AAAATTAATATAGATTT-AAAAAATAAAT-A--TGTTTGTTAAACCAATTCAAAA-AGTTATGAC
61 ACAATT-ATCT--ATTTCAAATCGT-TATGACCT-TTTGTTTTGTC-A-T-AAAACAATTGTTTC
* ** ** * ** * * *
87753 TATT--TGAGCAA--TTATT-TATTTAAAATTGTTA-TTATTT-TTTCTTTTCTTACAA--AACA
118 TATTCAT-A-CAAGCTTATTCAAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATA
87809 A-
179 AG
*** * * * * * **** * * *
87810 TAATTTATGTTCATAAA-AACT-TATTCAAATTA-AAG-T-AATACTATTTTATTAATATTTTG-
1 TAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAA-A-TA-GTTATGACTA-TTTGA
* *** * * ** * * * * *
87869 ACAATTAAT-AAGTAAAAAAT-TTTA-AAAATAAATATGTTTACTG-AACTAGATCAAATAGTCA
61 ACAATT-ATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCT---TTTGTTT--TGTCA-TAAAAC-AATTGT--
** * * * * * * ** **
87930 TGAT-TATTTGTATAAGTATTTATTTC-AAAT--GATTATGACCT-TTTTTTTTGTCA-TAAAAA
115 T--TCTATTCATACAAG--CTTA-TTCAAAATAAAATAAT-A-CTAATTTATTAAT-ATTCTAAA
* *
87989 ATTATTTTAG
172 ATTA-ATAAG
* * * * * * * *
87999 TTCATATCAGCCTATTCGAAATAAACTAATAATAAGTTATTAATATTCTAA-AAATT--AATAAT
1 -T-A-A-GAG---ATT-TAAA-AAA-T-A-AAT---CTGTT--TA-CCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
88061 TAAGA-GATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACA-AGTTTAAAT-A-ATTATGATTATT-TGA
48 TATGACTATTTGAACAAT-TATCTA-TT-TC-AA-ATCG-TT--ATGACCTTTTG-TT-TTGTCA
** * * * * * ***** * *
88121 -AAAATTATCTATTTCAAATTGC-TATAACCTTTTGTTTTGTTACCAAATGAT-CT-TTTCTATT
103 TAAAACAAT-TGTTTC-TATT-CATACAAGCTTAT-TCAAAATA--AAATAATACTAATT-TATT
88182 CATATAAGCTTACTACAAA-TAA-AA-
161 -A-AT-A--TT-CTA-AAATTAATAAG
* * * * ** * * **
88206 TAATACAATTTATTAATATTAAGA-C-AATTACTAGGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATG--T
1 TAAGA-GATTTA--AAAAATAA-ATCTGTTTAC--CG-AACAAG--TT--CAAATAGTTATGACT
* ** * * * * *
88266 TTTTCGAACACATTCAAATATTTGTCACTAT--TTGAAT-A-ATTATCTATT-TCA-AATCATTA
55 ATTT-GAACA-ATT-ATCTA-TT-TCA-AATCGTT--ATGACCTTTTGTTTTGTCATAA--A--A
* * * * ** * *
88325 CGATTTTTTGTTTTGTCATAAACTAATTTTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCAAAATAA-AATAAT
108 CAATTGTTT-CTAT-TCAT--AC-AA----GCTTATTC---AAA----AT-AAAATAATACTAAT
* * ***
88389 ACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAG
156 --TTA-TTAAT-ATTCT---AAAATTAATAAG
* * * * * * *
88421 TAAAAGATTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTGAAGTAGTTATGACTCTTTGAACA
1 TAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * *
88486 ATTATTTATTTCAAATTTTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCTATTTATGCAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** ** * *
88551 TTTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
88604 TTAGAGGTTTAAAAAATAAATTTATTCACCGAACAAGTTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAGCTA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA
* * * * * *
88668 TTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
*
88733 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAGTTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TTAATAAG
* * *** * * *
88785 T----GATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATA-TTCATGACTACTTCAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA
* * ***
88845 TTATCTATCTCAAATTGTTATGATGATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * *
88910 CTTATTCGAAGTAAAATATTGCCTAAATTAATAATATTATAAAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAG
* * * * * * *
88964 TAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTT-GCGAAGCTAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
89028 ATTATCTATTTCAAAAT-GTTCTAAACATTTGTTTAGTCATAAAATAATAT-TTTC-AGTTCATA
64 ATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTA-TTCATA
** * ** * *
89090 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAGCCAAAAAATTAATAAA
126 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
* * * * **
89146 TAAAAAATTTTTAAAAATAATTCTGTTTACAAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * * * ** * *
89211 TTATATATTT-ATAAGAAG-TACGACCTTTTATTTTATCATAGAATGATTGTTTC-AGTTTATAA
65 TTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * ** *
89273 AAGCTTATGT-GAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAG
127 AAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATT-AATAAG
* * * * * *
89328 ATAA-AGATTTAAAAAATAACT-TAGTTTATCGAATC--GCTTCAAATAATTATGGCCATTTAAA
1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
89389 CAATTATTTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTT-TCA-TCATA
62 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA
* * * * *
89452 CAAGCCTATTCGAAATTAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
126 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * *
89508 TAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTATCG---AA--TC-AAT--TT-T---TATTTAAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
89561 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * * * * *
89625 CTTTTTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAAT
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * ** *** * * * *
89677 TAAGAGATTTAAAAAA-CAATATGTTTGTCGAAGTCGTTCAAATAATTAAGACTATATGAGCAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *** * * * * * *
89741 TATCTATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTTA-TCATTCAAG
66 TATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* *** * * * * *
89805 CCTATTTGGAATAAAATAATACTAATATGTTAATCTTTCAAAAATTAAAAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* *
89857 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATACG-TA--ACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * * * * * * *
89919 TTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAC-ATTATTT-TGTTCATACAAT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
89982 CTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTAATAATATTCTGAAAATTAATAAC
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* ** * * ** *
90034 TAA-AGAAATTAAAAAATAAATTTCT-TTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAAACTATATGAA
1 TAAGAG-ATTTAAAAAATAAA--TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAA
* * * * * * *
90097 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCGTTGGTTTTAG-CATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTT
62 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTC
* *** *
90161 ATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAATT--TAA-
123 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * ** * **
90216 CAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
90281 TATCTATTTCAAATAGTTAT-ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *** * *
90345 TTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * *
90392 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TGAA-ATGAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
90455 ATTATTTATTTCAAATAGTTAT-AACTTGTTGTTTTGTTATAAAACAACTGTTTCTATTCATACA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
*
90519 AGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAATAAG
* * * * ** * * * *
90573 TAA-AAATTTTAAAAATAAGTATGTTTATTGAAATAAATT-AAATAGTAATGACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *** ** * *
90636 TTATTTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAC-AATT--GTTTCTATTCATA
* * * ** ** * **
90701 CTAAG-TTATT-AATATTACAAA-AATCAATAA-GTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTG
126 C-AAGCTTATTCAA-AATA-AAATAAT-ACTAATTTATTA-ATATTCTAAAATTAA----TAAG
* ** * * * *** * **
90760 TTAAGCA-ACTTTAAATAATTATGTCT-ATT-CC-AATAATTTTCTTTTTGAAATTG-CTA--T-
1 -TAAG-AGA-TTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACAA-GTTCAAATAGTTA-TGACTATTTG
* * * * *
90817 AAC-CTTTTGTTTTGTCATAA-C---ATGA--TTTTTTTTTGTTCAT---ACAA--G-TT-TA-T
60 AACAATTATCTATT-TCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * * *
90867 --TGCAA----A-T-AAAATAATAA-AA-ATTTATTAATATAA-A---GATACTTAATATG
122 CATACAAGCTTATTCAAAATAA-AATAATACTAATTTAT-TAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * *
90914 TAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
90978 TATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTATTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
66 TATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
91041 GCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * ** * * * *
91094 AAAAAGATTTAAGTAAA-AAATATGTTTTTCAAACAAGTTCAAATAGTTCTAACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
91158 TTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** * ** *
91222 GCTTATTTGAAATAAAATAATACCAA--T-TCCA-A----AAAA-TAATGAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * *** * * * * *
91265 TAAGAGAATAAAAAAATGAATTTGTTTATTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * **
91330 TATCTATTTCAAAACATTATGACATTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
*
91395 TTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TGAAAAATCAATAAG
131 TTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAG
* **** * *
91446 TAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTTAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
91509 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTATGTTCATAAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
*** * *
91574 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAAATTAATAAG
* * * * *
91628 TAAAAGATTTAAAATATAAATCTAG-TTACC-AAGCGAGTTCAAATAG-T-TGACTATTTAAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * **
91689 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTCTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATATGA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *
91754 GTTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
** * * * * * * * *
91807 TTTGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCATCGAACAAGTTTAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACA-
* * *
91870 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * *
91935 -ATTATTCAAAATAAAATAATAGAAATTTATCAATATTTTGAAAA-T--TAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * ** * *
91984 -AAAAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCCGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
92048 TATCTATCTT-AAAACGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTGTTTATATTCATACAA
66 TATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
*** * * * * * * * *
92111 GCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTATTCTAAAA--ATTAA-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * * *
92160 TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAAT-GATTAAGACTATTAGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACA
* * * * *
92223 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTCAGTTCACAC
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATAC
* * * * * *
92287 ATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAA
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
92341 CAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *** *
92406 TTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-A
65 TTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * * *
92468 ATGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAG
128 A-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * ** *** * * * *
92523 TTAGAGATTTAAAAAA-AAGT-TAGTTTATTGAATTGGTTTAAATAATT-TTAGCCATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACA
* ** * * * * *
92585 ATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * * * * *
92649 AGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAAAAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * *
92702 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC--A-AA---C-CA-A---CT-CCTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
92755 TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTGTAGTTCATATAAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * * * *
92819 CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAC
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
92871 TAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAA-TTTAAACAATTAAGACTATATGAATAG
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
92935 CTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * *
92999 GCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTTTTGAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * ** * * * ***
93052 T----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCAAATTATTTCAAATAATTAT-AGCCATGCCAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * * * * * * ** *
93112 TTATCTATTTCAAATCGATATTACCCTTT-TTTGGTCATATAACAGTTATATT-TGAAAC-TTCA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACA
*** * * * *
93174 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAC
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
93228 TAAGAGATTTAAAAAATATA-CTTATTTACCAAACTA-TCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACCGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * * * *
93291 ATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
93356 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAC
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * ** * * *
93409 TAAGAGAATTT--AAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAA
1 TAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * **
93471 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TATGTTTTTTTAATTCATATT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCT-ATTCATACA
*** * *
93535 AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
93589 TAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTT-AAATAATTATGACTATTTAAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
93653 TATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * *
93718 TTGTTC-GAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTTGAATATTAAT---
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * *
93765 CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
93829 CATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
93894 TTATTTAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAATAAG
* * * * * * * * *
93945 TAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACTAA-ATCAAATAATCATGATTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
94008 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA-AATTG-TTCCAGTTCATATAT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
*** * *
94071 GCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* *** * *
94123 TAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACATA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACA
1 T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
94187 ATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * *
94252 GCTTATTTAAAA-AAAATAATACAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-A-AATTAATAAG
* * * * * **
94304 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
94368 TTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** *
94433 TTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAATAAG
* * * * * * *
94485 TAAAAGTTTTTAAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
1 TAAGAG-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
94550 ATTATCTACTTCAAATCATAATGACCTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATG
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * * * * *
94614 TAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAG
126 CAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * ** * * * *
94670 TAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
94734 TTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGCAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
** * * *
94799 CTTATTCCGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAACTTAGTAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAA-TTAATAAG
* * * * * * *
94851 -AAAAAATTTTAAAAATAAATCTATGTT-CTGAACAAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
94914 TAATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATTT-TGTTCATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAA
** * *
94978 GCTTATT-TGAATAAAATAACACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CTAAAATTAATAAG
* * * ** * * *
95030 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGTGAA-TTCAAATAGTTATTATTATTTAAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * *
95094 TTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** * * *
95159 TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAAT
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
** * * * * ** * * * *
95211 TTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAGCAGTCATGTCCATTTGAACTAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
95276 TATCTATTTGAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA-AATTTGTTT-TATTCATGCAAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAG
* *
95339 ATTATTCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * ** **
95390 --AG-G-TTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
95451 TATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * ** * *
95515 CTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAAT-AAG
* * ** * * *
95567 TAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACTAA-TT-GAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** *
95630 TTATCTAATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACA
65 TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * *
95694 TGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-TTTGTATTAACATTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * *
95747 CAAGAAGTTTTAAAGAAATAAATCTGTTTATCAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 TAAG-AGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
95811 ATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTGTATCATAAAACATTTGTTT-TAATTCATTA-
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA-TAC
* * * * * * *
95874 AAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* ** * *
95929 TTAA-AGATTTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAAGCAA-TTC-AATAATTATTG-GTATTTGAA
1 -TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAA
* * * * * * *
95990 CAATTATTTGTTTCAAAATCTTTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTATCA
62 CAATTATCTATTTC-AAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCA
* * * *
96055 TACAAGCCTATTCTAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
124 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
96113 TAGGGGATTTAAAAAATAAATATGCTCACAGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
96178 TATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * * * * *
96243 TTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAAC
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * *
96294 TAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCTAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * ** *
96358 TTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
96423 TTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAA-T--TAA-
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
96470 TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAATC-A-TTCAAATAGTTATAACAATTTTGAACC
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTG-A--
* * * *
96533 ACAATTATTTATTTTCAAATCGATTATAACCAATTGTGTTTTGGT-ATAAAATAATT-TTTCTAT
61 ACAATTATCTA-TTTCAAATCG-TTATGACC--TTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTA-
* * * * * * * * *
96596 TTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAACTTTGTTTAATATCCTAAAAATTAACAAG
120 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTT-ATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * ** * * * * * *
96660 TAACG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAA-TACAAATAGTTATAACTGTTTAAATA
1 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * **
96723 ATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTGT--TACAAACAATTGTTTTTGTTTGTAC
64 ATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * *
96784 AAGCTAATT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTTATTAATATTCCAAAATTAATAAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAA-TTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * ** *
96838 TAATAGA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCGATTAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *** * * * * *
96902 TATTTATTTTAAATTACTATAACCTTTT-TTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTATTCCTAACAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAAG
* * ** *
96966 CCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACAAAATTAG
130 -CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-A-AA-TTAATAAG
* * * * * *
97020 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * *
97085 TATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTT-TGTTCATAAAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
** * * * * **
97149 TTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
97200 TAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCTAATAGTTATAACTACTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
97265 TATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * *
97329 TTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * ** * *
97380 TAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTATTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * **
97445 TATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *
97509 TTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAATTAATAGG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
97558 TAGGAGACTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAA-AA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA
** ** * * *
97620 TTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTATTTCTGTTCATA-TA
65 -TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * ** * * *
97684 GAATTATTTAGAATAAAATAATACCGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAG
129 G-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * *
97738 --AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTTTTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
97799 TATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCGTTATAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAG
* * * * * * * *
97863 CCTATTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA---AAAAATAAATGAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * * *** * * * *
97911 TTTTTCCAA-ACCAATTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAT
1 ----T--AAGA--GATTTAAA-AAATAAATCTGTT----TACCGAACAAGTTCAAATAG-T-TAT
* * ** * **** ***
97975 -CCTTTTGTTTAGTCAACAAACAATC-ATTTC-AGT--TTAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
51 GAC---TATTT-G--AAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC---CTT-TT-GTTTTGTCAT
* ** ** * *
98034 AATACTAATT-TATTAAAATTCA-A-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAA-AA-A-AAAGTTT
104 AAAAC-AATTGT-TT-CTATTCATACAAGCTT-AT--TCAA-A-A--TAAAATAATACTAA-TTT
* * ** *
98093 ATCAAACAAGCTCAAA-TAGAT-A-
158 AT-TAATATTCTAAAATTA-ATAAG
* ** * * * * * * * ** * * *
98115 T-GGCCATCTCAACAAT-TATCTATTT--C-AA-ATTGTT--ATTCCTTTTTGTTTAGTCATAT-
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAAT-AGTTATG---ACT-ATTTG
* * * * ** ** **** *** *
98171 AAGAATTGT-T-TTT--TATC-ATACAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATCT
60 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTG-TT--TCT
* * * * *
98231 -TTCA-A-AA-ATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAA-AATA--AATCTGTT--TA-CCAAACCAAT
119 ATTCATACAAGCTT-AT---TCAA-A-A--TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA--AAT
98285 TCACAT-AG
174 T-A-ATAAG
* * ** ** *** ** * * * *
98293 TTGAACA-ATTGT-ATACTTCAAAT-TAATTATTTTAA-AAAAT-AAACA-TTTTGCTCTATCAT
1 -T-AAGAGATT-TAAAAAAT-AAATCTGTTTA-CCGAACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTAT-TT
* ** *** * ** * * * *
98352 -AAAAAAAAT-TATTT---AT-GTTTAT-ACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAA
59 GAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTAT
* ** * ** * ** * *
98409 TAATATTCTAA--AAATT-AATAACTAAGAGAT-TTAAAAATTAAATTTGT-TTGCCGAACCAGT
121 TCATA--C-AAGCTTATTCAA-AA-TAA-A-ATAATACTAATT-TATTAATATT--CTAA--A-A
98469 TTAA-ATAG
173 TTAATA-AG
* * * * * * * * * ** * * * **
98477 TTAAGACTATATGAACAAT-TATCTATTT--CAAATC-ATTATGACCT-TTTCT-TCTATCATAA
1 -TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGT-TCAAATAGTTATGACTAT--TTG
* * * ** *** *
98536 AACAA-T-T-T-TTTCAATTC-ATA-GTAGCTTATTCAG-AATAAAAGTAAAATGAATT-TATTA
60 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTT-TT--GTTTTGTCA-TAAAA-CAATTGT-TT-
* * * * * * *
98593 ATATTTCA-A-AA-ATTAAT--AAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT--TA-CCTAACCAA
117 CTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAA-A-A--T-AATACTAATT-TATTAATATTCTAA--AA
*
98650 TTCTAATAAT
173 -T-TAATAAG
* * ** ** * *** ** * *
98660 TATGACTATTTGAACATTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCA-TATAAG
1 TAAGA-GATTT-AA-AAAAT-AAATCT-G--TT-T-ACCGAAC-AA-G-TTCAAAT-AGT-TATG
** * * * * * ** *** ** *** *
98724 TTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATAT-TAAT-ATTACAAAAATTAATAAGAGAT-TTAAAA
52 ACTATTT-G-A-ACAATTAT-CT-AT-T-TCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTG-TCATAAAA
*** * * * * * * ** ** * * *
98786 -AA-TAAATCTTTTTAT-CAAACCTGTTCAATAATTATCT-ATTTTAAATTGTT-ATGACCTTTT
108 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-A--TTCT
**** * *
98846 GTTTTGTCATAAA
169 AAAAT-TAATAAG
* ** * **** * * * * * * * *
98859 CAATTGTTTTAGTTCATAAA--AGCTTATCTAA-AA--TAAAATAAAGTTGTATTAATATTTCAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT--AG-T-TATGACTATTTGAA
* ** * ** ** * * * * * *
98919 -AAGTTA-ATAAGTAAGAGAT--TTAAAAAATAAATTAGTTTACTAAATTAGTTCAAATAATTAT
62 CAA-TTATCTATTTCA-A-ATCGTTATGACCT---TTTGTTT--T--GTCA--TAAAACAATTGT
** * * * * ** * ** ** * ** *
98980 GGCCATTTAAACAA-C-TA-TCTATTTCAAATTGTTGTTATCTT-TTGTTTTCTCATAAAACAAT
115 TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATAT-TC-T--AA-AA-
99041 TGCTTTTCAATATAG
173 -----TT-AATA-AG
** * * * * * * *
99056 -AAGCTTATTCGAAATAAA-ATAATACTAATTTA-CTAA-TATTTC-AATAATTAATAAGA-GAT
1 TAAG-AGATT-TAAA-AAATA-AAT-CT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT-AT--GACTAT
* * * * * * * *** * * ***
99115 TTAAAAAAATAAAATTTGTTTAACAAACTAGTTCA-AATAGTTAGACTATTTG--A-ACAATTCT
57 TT-GAACAAT--TATCTATTT--CAAA-TCGTT-ATGACCTTTTG--T-TTTGTCATAAAACAAT
* * ** * * * ** * ** * *
99176 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTCTGGTTAAATAAGCTTA
112 -TGTTTC-TATTCATACAAGC-TTATTC-AAAATAAAATAA-TA----CTAATTTATTAA---TA
*
99241 TTCGAAATAAAA-TAATACTAA
165 TTC----TAAAATTAATA--AG
* * * *** * *
99262 TTAGTAATATTCTAAAAATTAATAAT-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTAATTTGCTAAAGTAGT
1 TAAG--AGATT-TAAAAAAT-A-AATCT----G-TTT----ACCGAA-CAAGTT-C-AAA-TAGT
* * ** * * *
99326 T-TCAAATAGTTAAACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCGTTTGTTTTGTCA
48 TAT-GACTA-TTTGA--A------CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
99390 TAAAACAATTATTTTTCTTAATATAAG-TTGATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT
103 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
99454 TTAGAAAATTAATTAG
167 CT--AAAATTAATAAG
* * * * * * *
99470 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTT-GCTAAGCCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
99534 TTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTAG-TCCTATTCATACCA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAA
** * * *
99598 TTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-TTAAT-A--AG
* ** ** * * * * *
99654 TAA-A-ATTTAAAAAATAAATATAATTGTCGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACGAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * **
99717 TATCTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAA-
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
** * * * *
99780 CTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
99832 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATC-AGTTCATATGGTTAAGATTATTAGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** ** *
99896 TTATCTATTTGAAATCATTCTGATATTTTGTTGAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
99961 CTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
* * * * * * ** * *
100013 AAATAGATTTAAAGAAATAAATATGCTCACTGAACAAGTTTGAATAGTTATTACTATTTTAACAA
1 TAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *
100078 TTGT-TAATTTAAAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTCATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAA
65 TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * *
100142 GCTTAGGT-GGATTAAAATAATACCAATTTATTAATAATTACTAAAA-TAATAAG
129 GCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-CTAAAATTAATAAG
* * * ** ** * * *
100195 TAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAATAGTTAT-AGCCATTTGAACGA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * * * * *
100259 TTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATATAACAATTG-TTCTTTATCACACAT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAA
* * *
100323 GCTTATTCAAAACAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
100376 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
100441 TAT-TAATCTCAAATCGTTAAGATC-TATGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAA
66 TATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* ** * *
100503 ACTTATTTCATTA-AAAATAATACTAATCTAATAATATT-TCAAAATT--TAA-
129 GCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* ** * * ** * *
100552 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTCGAATAGTTAAAACTA-TAGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
100615 TTATCTAATTT-AAATCATTCTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATATTTTTTTTCATATT-TTAC
65 TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTC-TATTCATAC
* *** *
100677 AAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATT-TAGAAAATT-A-AA-
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAG
** * * * * *
100729 -AAG-G----AAATGATATTAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTA
1 TAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** * * *
100787 TTATTTATTTAAAATCATTATGACCAATTGTTTTGACATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * *
100851 GCTTATCCAAAAT---A-AA-A-TAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* * ** * *
100898 CAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTATAGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * ** *
100960 TGTCTATTTAAAATCATTATGACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTGAATTTATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
101025 TTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAG
131 TTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAATAAG
* * * * * * * * * *
101076 TAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAGCGAATC-AGGTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
101140 TTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTT-T-TACATATATG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
101203 TTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAATTAATAAG
* * ** * * * *
101255 TAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTGGTTTAAAGATTTATAACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
101320 ATTGAAT-T-CTTCAAATCGTTATAACCTTTT-TTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATA
64 ATT--ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
** * ** * *
101382 CAAG-TTCATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAAC
126 CAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * *** * * * * *
101438 TAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTCGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
101503 TATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTTTTTC-ACTTCATACTAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * * *
101560 CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
101612 TAAGAGATTTAAAAAA-AAAT-TATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
101675 TATTTTATTTCAAATTGCTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAG
66 TA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** * * *
101740 TTTGCTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * **
101791 T--G-GATTTTAAAAATAAATCTCTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** ** * * * * ** * **
101853 TATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
101918 TTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * *
101969 TAA-A-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACC-AAGCTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
102030 AGTA-CTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATAT
64 ATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-
** * * *
102093 C-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAT
126 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * ** * * *
102148 TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * ** ** *
102213 TATCTATTTGAAATTGCTACAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * ** *
102278 TTATT-ACGAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTAAGAAAATTAATAGG
131 TTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * ** ** *
102328 TAAAAAATTTTAAAAATAAAAT-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
102392 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTCTATTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAA
* * * * *
102457 GCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATT-TCAACAACTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATTAATAAG
* * ** * * *
102510 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATCGTCT-TAACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
102574 TTATCTATTTCAAATCATTGTGATCTTTTG-TTTGTAATAAAACCAA-TG-TT-TAGTCGTATAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * *
102635 GC-TATTTGAAA-AAAATAATAC--ATTCATGAATATTCT-AAATTAATGAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
102682 TAAGAGAATTAAAAAATTAAT-TCGTTTATCCAAACCATTTCCAATAGTTATGACTATCTAAACC
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-C
* * * * * * *
102746 AATTATCGATTTCAAAAACATTATGACATTTTTGTTTTTGTCATAAAACATTTGGTTCTGTT-AT
63 AATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAC-CTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
** * *
102810 GTAAGCTTATTTC--GATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
125 ACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * ** * * *
102866 TAA-A-ATTT-AAAAATAAATATGTTTTCTTTAACACGTTCAAATAGTTATG-CTATTTAAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
102927 -TATCTATTTCAAAATC-TTATGGACCTTTCAT-TTTTGTGATAAATCCCATTGTTTCTATTTAT
65 TTATCTATTTC-AAATCGTTAT-GACCTTT--TGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * *
102989 AAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTTATGTTATTCAACTTTTCAAAAATTAATTCATA-
125 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATT-AA-TATTCTAAAATTAA-T-A-AG
** * * * ** * * * * *
103050 TAAGCTATTGGGAATAAAGAT-GATACTAATTTA--TTATAA-TCCAAAATAATAATAAAAGA-G
1 TAAGAGATT--TAA-AAA-ATAAAT-CT-GTTTACCGAACAAGTTC-AAATAGT--T--ATGACT
* * * * * *
103110 ATTTAAAAAAATAATC-ATTTTACTAAA-CAAGTTTAAAT-A-ATTATGACTATT-T-A-AACAA
55 ATTT-GAACAATTATCTA-TTT-C-AAATC--G-TT--ATGACCTTTTG--TTTTGTCATAA-AA
* * ** * * * * **** * * **
103168 TTAATATATTTGAAATCCACTATAACCTTTGTTTTGCTATAAAAGAAT-TTTTTTGTATTTCATA
108 -CAAT-TGTTT-CTATTCA-TACAAGC-TT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TA-TT-A-A
* ** * ** *
103232 CAGGCTCATTTTCA-AA-
163 TATTCTAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * * * * *
103248 TAAAACA-AT-ACAAATTTAT-TAATATTA-AG-ACAAGTT-ATA-AG-TA-AAATATTTAAAAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GT-TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** * *
103304 ATAATATGT-TTTCCGAATAAGTTCA--ACTTCATTATGACTATTTTGTGC---AATTATTTATT
64 AT--TATCTATTT-CAAAT-CGTT-ATGAC--C-TT-T---TGTTTTGT-CATAAAACAATTGTT
* ** * * **** ** * * *
103363 TCAAATTTGT-TATGACTT-TT-GTTTTGTAATAAAAC-AATTGT-TT-CTATTCATACAAGTTT
116 TC-TATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTC-TA-AA--AT
* *
103422 TATTCAG
174 TAATAAG
* * * *** * * ** * * * * ** *
103429 ATTAGATAATACTAATTTATTAATAT-TTTGACAATTAATAAG-TAAAAGATTTTAAAAAATAAA
1 -TAAGA-GAT-TTAAAAAATAAATCTGTTT-AC--CGAACAAGTTCAAATA-GTT-ATGACT--A
* *** * * * * * * * * * * *
103492 TATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGA-CTAATTATCTATTTCAGATCACAATGATC-TT
56 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT--TT-TGT-TTT--G-TCATAA--AACAAT
* * * * * * * * ** *
103555 TTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATAAGTTTGTTTAAACTAAAATAATACTAATTTA
112 TGTTTCTATTCATACAA--G-CTTA-TTC--A-AA-----ATAAAATAAT------ACTAATTTA
*
103620 TTAATATTCTAAAAATTAATGAG
159 TTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* ** * * * ** *
103643 TAATAGAAATAAAAAATGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
103708 AATTTATTTCAAAACATTATCACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCTGTTCA-ATCAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAG
*** * *
103772 CTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * *
103824 TAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTA-TGAACACA-TTCAAATAG-T-TGACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
103884 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA-AAAACCCATTGTTTTTATTCATAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
103948 AGCTTAATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * *
104002 TAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
104066 ATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * * *
104131 GTTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAATTTTATAAT
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-TTAATAAG
** * * * * * * * * * *
104184 TTGGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCAAATAAGTTTAAA-CGATCATGTCCAATT-AATCT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAA-CA
* * * * * *
104247 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** *
104312 AATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * ** ** * * * *
104362 -AAGAGGTTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATTATTTCAATTAGTTATGACTATTTGATCAGT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * **
104426 TATCTATCTCAAATCACTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * ** * *
104490 TTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * *** * * *
104541 TAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTGGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
104606 TATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAAG-CATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
*** * *
104669 GCTTATTCAAAAT-AAATAATACCCTTTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
* * * *
104721 CAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
1 TAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
104785 ATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * * * *
104849 AGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* ** * * * *
104903 TTAA-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATC-AGTTAAAATAATT-TCG-CCATTTGAAT
1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAAC
** * * *
104964 AATTATCTATTTCAAATATATTATGATCTTTTATTTTGTCAT-AAACAAATGTTT-TCA-TCATA
63 AATTATCTATTTCAAAT-CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA
** ** * *
105026 CAAGCTTATTTC-GCATAAAATAATACTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAG
126 CAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * *
105082 TAGGAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
105147 TATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * *
105212 CTTATTCAAAATACAATATTACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAAC
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * * *
105264 CAAGAGATTTAAAAACTAAATTTTTTTGCTGAACCAA-TACAAATAGTTAAGGCTATATGAATAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
105328 TTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTT-TCATTCATATAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * * * * *
105392 GTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAA--ATTAA-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
** * ** * * *
105441 TAAGAGATTTAAAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA
* ** * * * *
105505 TTATTTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
105569 TCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-CCTAAAAATTAATAAG
130 -CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
105621 TAACG-GATTTAACAAATGAATCTATTTGACTGACCAA-TACAAATGGTTATAACTGTTTGAACA
1 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * **
105684 A-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTATTAGAAAATAATTGTTTCTATTTGTACA
64 ATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
105747 AGCTGACTT-GAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * ** * * *
105801 TAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTATCGATTAAGTTCGAATAGTTACT-ACTCTTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAA
** * * *
105865 TTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * *
105930 CTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAATTAT
130 CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-A-AATTAATAAG
* * * *
105982 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
106047 TATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTT-TCATAAAATAATTGTTT-TTTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * * *
106110 TTATTCAGATTAAAATAATATTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATGAG
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * * * * * **
106161 TAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATTGTCATAACTACTTT-AGTAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAA
* * * ** * * * *
106225 TTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * ** *
106290 CTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACT-GTTTGAACAATTATT-T--ATTTCAA-ATAG
130 CTTATTCAA-AA--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-ATTAA-TATTCTAAAATT-AATA-AG
* * * * *
106347 TTATGATATTTTATTTTATCATAAA-ACAATTTTTTCTATTC-ATACAAGTTTATTCAGAATAAA
1 -TAAGAGA-TTTA----A--A-AAATA-AATCTGTT-TA-CCGA-ACAAG----TTCA-AAT--A
* * ** * * ** ** ** *
106410 CTAAT-ACTAATTT-ATTAA-TATTCTA---GAAAT--TAAT-A-GGTAGGAGATT-T-AAAAAA
46 GTTATGACT-ATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA
* * * * ** * * *
106463 TAAATTTGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAATAATTATCTATTTC-AAAT
108 -CAA-TTGTTT--C---T--ATTC--ATA--CAAGCTT-A-TTCAA-AATAAAATAATACTAATT
* * ** *
106526 CATT-ATGACCTT-TTATTTTATAGTAAAA
157 TATTAAT-A--TTCTAAAATTA-A-T-AAG
* ** * * * * * ** * * **
106554 CAATTGTTTCTATTCATACAT-AAT-TATTTA--GAATAAAAT-AATATTGATTCATTAAGATTT
1 TAAGAGATT-TA---AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAA-ATAG-TT-ATGACTATTT
* * ** * * * * * * *
106614 TAAAAATTAATAAGAGTATTAAAAAC--TA--A--ATCTG-TTTATCA-AACTAGCTCAAATAGT
59 GAACAATT-AT-CTA-T-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA--A--AC-AATTGT
* * * * *** * * * *
106671 TATGACTTTTTGAT-CAA-TTATATATCTCAAATCGTTATGAT-CTTTATTTTGCTATAGAACAA
115 T-T--C-TATTCATACAAGCT-TAT-TC-AAAAT-AAAATAATAC--TA-ATT--TAT-TAA-TA
* ****
106733 TTATTTTTTTTCATATAAG
165 TT-CTAAAATT-A-ATAAG
** * * ** ** * *
106752 CTTATTCAGA-TTAAGATAATACTAAT-T-TAATA-ATAA-AAAAT-AAATGTGTTTTGCTGAAC
1 --TA-AGAGATTTAA-AAAATA--AATCTGT-TTACCGAACAAGTTCAAAT-AG--TT-ATG-AC
* * * * ** *
106811 TAGTTCAA-ATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTA
54 TATTTGAACA-A-TT--ATCTATT----------------TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
106875 GTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAACCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAA
99 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
106939 AACTCAAAAAATTAATAAG
163 TATTC-TAAAATTAATAAG
* * * * * * *
106958 TGAGAGATTTAAAAAAAGAAATATGTTTATCGAACAAGCTT-AAATAGATATGATTATTTGAATA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
107022 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * * * *
107086 AAACTTGTCCAAACTAAAACAAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAG
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * ** *
107141 TAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATATT-CCGAACCAGTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
107205 ATATCAATCTCAAAT-TTTATGATC-TTTGTTTTTTCA-AAAA-AATTTGTTTATGA-TCATATA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-ATTCATACA
* * *
107265 AGCTTATTC-AAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
107319 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATC-AGTTGAAATGGTTAAGGCTATTAGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
107383 TTATCTATTTCAAGTTGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACTATTGTTT-TAGTTCATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** * * *
107447 GCTTATTCGGAAT-AAA-CAT--TAATTTATTAACATTCAAACAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AATTAATAAG
* * * ** *
107496 CAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * * *
107561 TT-T-TATTTGAAATTATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * *
107623 GCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTTCAAAAATTAGTAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * *
107677 TAAGAAATTTAACAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAA
1 TAAGAGATTTAA-AAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA
* *
107739 C-A--A---A-GT----T-GTTAAT-A-CTTTTCGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTT-T-TTAAC
62 CAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT--C
* * * * * *
107788 ATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATT-T-CAA-GAATTAG
123 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
** * * * * * *
107843 TAATTGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
107908 TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACAAGT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * *
107972 TTATTCAAAAGAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAAC
131 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
** * * * ** *
108023 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCAAACTAGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * ** * * * *
108088 CATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGACAATTATTTC-AGCTCATATAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* ** * * * *
108152 TTTACTT-GGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATT-TCAAAATTTTATAAC
130 CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TTAATAAG
* * * * * * *
108204 TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
108269 TACCTATTTCAAATAGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTATTCACATAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * ** ** *
108333 TTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGAAAAAATTAATCAG
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * *
108385 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGTAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAA
* * * * * * * * *
108450 TTATATATTTTAAATCGTTATAACCTTTCGTTTTATCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTAT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * *
108515 TTTATTCATAATGAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACTTAATAAC
130 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-TTAATAAG
* * * ** * * * * * * *
108567 CAAGAAAATTT-AAAAATTAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGTCTATATGAACGA
1 TAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * *
108631 TTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAATT-TTT-T-TTCATACA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC--AATTGTTTCTATTCATACA
***** * * *
108693 AGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * * * *
108747 TAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACCAAACCAGTTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
108810 TTATCTATTTCAAATCATTTTGA-CTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * * **
108873 GTTTATT-AGGAATACATTAATACTAATTTATTAAAATTGAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
* * * ** * * * *
108925 AAAGATATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAATAATCATTACTATTTGAACAA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
108990 TTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** ** *
109054 GCTTAAAC-GGATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * * * ** * *
109102 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTGAATC-GGTAAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACA
* * * * * * * * *
109165 ATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTCTGTTATAAACCAATTGTTT-TTTATCAAACA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACA
* * *
109229 AGCTTATTCGAAATATAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
* * * * *
109279 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAA-TAGTT---A-A---A--ACTATTAGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
109333 TATCTATTTCAAATCATT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ACATCATACAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * *
109394 GCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAG
** * * * *
109447 CGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * *
109512 TTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACA
65 TTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * *
109575 AGCTTATACGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAAT-A-
128 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * ** * * * * * *
109627 -AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTAAATCAA-TTGAAAAAATTTTGGCCATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
109689 TTATTTATTTGAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCTTACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * *
109753 GCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATAATAATAATTTATAATATTCCTAAAATTAACAAG
129 GCTTA-TT----CAAAATAA-AATAATACTAAT--T--TAT-TAATATT-CTAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * *
109817 TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
109881 TTAACTATTTCAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * *** *
109945 ACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAG
* * *
109998 -AAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-----C--A-A--T-T-CCTATTTGAATAA
1 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
110050 TTA-CTTATTTCAAATCGTCATAATCTTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACAT
65 TTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * * *
110112 ATGCTTATGCGAAATTAAATAATATTAATTTAATAATATATTCAAAAATTAATAAC
127 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-ATTA-ATATTCTAAAATTAATAAG
* * ** * * * * *
110168 TAAGAAATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAACATTTAAGATTATATGAACAA
1 TAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * *
110233 TTATCTATTTTAAATTATTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
110276 TAATAATTTC
Statistics
Matches: 21983, Mismatches: 5452, Indels: 4275
0.69 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
151 8 0.00
152 13 0.00
153 9 0.00
154 11 0.00
155 5 0.00
156 7 0.00
158 9 0.00
159 6 0.00
160 9 0.00
161 3 0.00
162 12 0.00
163 8 0.00
164 57 0.00
165 50 0.00
166 61 0.00
167 20 0.00
168 183 0.01
169 202 0.01
170 60 0.00
171 244 0.01
172 301 0.01
173 139 0.01
174 294 0.01
175 428 0.02
176 1178 0.05
177 1604 0.07
178 1034 0.05
179 1846 0.08
180 3502 0.16
181 4584 0.21
182 2183 0.10
183 828 0.04
184 362 0.02
185 217 0.01
186 138 0.01
187 95 0.00
188 65 0.00
189 71 0.00
190 65 0.00
191 78 0.00
192 147 0.01
193 45 0.00
194 72 0.00
195 72 0.00
196 106 0.00
197 82 0.00
198 124 0.01
199 125 0.01
200 123 0.01
201 109 0.00
202 82 0.00
203 89 0.00
204 87 0.00
205 96 0.00
206 92 0.00
207 49 0.00
208 50 0.00
209 57 0.00
210 37 0.00
211 42 0.00
212 28 0.00
213 29 0.00
214 47 0.00
215 34 0.00
216 29 0.00
217 27 0.00
218 11 0.00
219 17 0.00
220 18 0.00
221 15 0.00
222 12 0.00
223 17 0.00
224 12 0.00
225 2 0.00
226 7 0.00
228 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
Found at i:81711 original size:542 final size:538
Alignment explanation
Indices: 80485--110275 Score: 9071
Period size: 540 Copynumber: 55.3 Consensus size: 538
80475 TTATTTAGAC
* * * * * * * * *
80485 TAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTAGAAACTCATAAG---AGATTTAAAAATTAAATTTGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * *
80547 TCACGAAAGCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATCTCAAATCGTTATGATCT
66 TTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCT
* * **
80612 TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAAT
131 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAAT
* * ** ** **
80676 TTAATAATTTTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-AAAAATAATAAGTGTTTGTTGAATTAGT
195 TTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTGCCGAACCAGT
** * * *
80739 TCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTCTT-TTTAGTCA
258 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTAGTCA
* * * * *
80803 TAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGCTTATTTAAAATATAATAATACTAATTTATTAACATTT
322 TAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT
* *
80868 GAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAACATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATT-
386 -AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTA
* * * *
80932 TGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAGA-CATTACGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTG
448 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
*
80996 TTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAAAA
512 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
81023 TAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
81088 TTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
65 TTTACT-AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * *
81152 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATCCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAA
129 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
** * *
81217 ACTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCCGTT
194 TTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAGTT
* * * * *
81282 CAAATAGTTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTATTTAATCATA
259 CAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATA
* * *
81347 AAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAACATTTAG
324 AAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTA-
* * *
81412 AAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGA
387 AAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
81477 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGA-CTTTT-TTTTATAATAAAACAATTGTTTA
451 CTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
** * *
81540 AGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAA
516 AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
81563 TAACATAATATTAATTTACTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
81628 TTTA-TCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA
65 TTTACT-AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * *
81692 CATTTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTCATT-ATA-ATGCCTATTTGGAATAAAATAATAC
129 C--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * * * ** *
81755 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACT
191 TAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACC
* * * * * *
81820 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGT
255 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGT
* * ** *
81885 CATAAAACAATTA-TTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATA
320 CATAAAACAATTATTTTA-GTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* * * * * * *
81949 TTATGAAAATTAGT-ATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGT
383 TT-TAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
82013 TAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAAT
446 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
** * * * *
82078 GTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAA
511 GTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
82106 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G-AGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * *
82168 TTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTGCAAATCATTATGACCA
66 TTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-
* * * * * * * *
82233 TTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTCTATTAATACAATCTCATTCGGAATAAAATAATGCTAA-
130 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
82297 TTAATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATTAATCTGTTGGCCTAACCAAT
195 TTAA-TAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAGT
* ** * * * *
82362 GCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC--
258 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCAT
* * * * * * * *
82425 ACAACAATTGTTTCTA-TTCCTATAAGCTTATTCAGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTC
323 AAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-
* * * * ** *
82489 TAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACTGAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATG
385 TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *** * * *
82550 ACTATTTGAGTGATTACCTATTTTAAATTGCTATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTTTTT
450 ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* ** *
82615 CTA-TTCATACAAGCTTATTTTAAT
515 C-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
82639 TAAAACAATACAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACAACTCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * *
82703 ATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * *
82767 CTTTTCGTTTTGTCAAAAAACAAATT-TTT-T-TTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-
129 C-TTT-GTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * * * * * * *
82828 TTATTTATTAATATT-TCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGTAC
191 TAATTTAATAATATTCT-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC
* * * *
82892 AAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTC
254 CAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-
* * * * **
82956 A-TCATAAAACAATTATATCT-GTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
317 AGTCATAAAACAATTAT-TTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * **
83019 ATATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACC-AAAAAGTTTGAATA
380 ACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * * *
83083 GTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAATAA
444 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * *
83147 TTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCCAAA
509 TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
83177 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * *
83241 ATTTTCTAAA-CACATTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
64 ATTTACTAAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * ** * * *
83305 GCTTTTGTTTTGTTATAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACT
128 TC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * * *
83370 AGTTTATTAATATT-TCAAAATT--TAA-TAAGA-TTTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAGCA
192 AATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
* * * * *
83429 TGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTT
256 -GTTCAAATAGTTA--A-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
83494 TGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
317 AGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
83558 ATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATA
380 ACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
83622 GTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTTTAATAAAATAA
444 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* *
83687 TTGTTT-TGTTCATGCAAAA--TTATTCAGAA
509 TTGTTTCAGTTCAT--AAAAGCTTATTCAAAA
* * * ** * * *
83716 CAAAATAATAC-AGATCTATTAAAATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTG
1 TAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * *
83777 TTTACAGAAAT-AGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGA
65 TTTAC-TAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGA
* ** * * *
83840 TCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTA
128 TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
* * * * * * *
83905 ATTTAATAATATTCCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATGTATTT-ACGAACCAAT
193 ATTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAGT
* * * *
83966 TCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAATCGTT-TGGA-CTTGTTGTTTAGTT
258 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTT-TTGTTTAGTC
* * *
84029 ATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACATT
321 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
* * * *
84094 CAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AAA-CTATTTATCGAACAAGTTCGAATAGATT-
385 -TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTA
* * * * *
84156 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATCA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
448 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
*
84220 TTCAGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAA
513 TTCAGTTCATAAAAGCTTATTC-AAAA
* * * *
84246 TAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAAAATTAAAAAGCAAGTTATGACTATTTGAATAAAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA---A-G---ATTT-AAAAAAT
* * * * * * * **
84310 --ATCAATCT--TAAATCA-TT-AAGAT-CTT-TG--TTTTCTCATAAAATAAT-TATTTCTTAT
58 AAATCTATTTACTAAATCAGTTCAA-ATAGTTATGACTATT-TGA-ACAATTATCTATTTCAAAT
* ** * * **** * * * **
84364 C-ATACAAGCTTAT-TCAAATAAAAATAATACTAATT-TATTAATATTC-TA-AAACTTAGTAAG
120 CGTTATGATCTT-TGT---TTTGTCATAAAAC-AATTGT-TT-CTATTCATACAAGCTTA-TTTG
* * * * * *
84424 AGACTTAAA-AA-A--AA-TAAATGCAT-TTGCTGAACCAGTTCAA-ATAGTTAAGA-CTGTT--
177 -GAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATT-CT-AA--AATT-AATA-AG-TAAGAGAT-TTAA
* * ** * * * * * * * * * * *
84479 AGAAT-AAT-TTTTAATTTCAAATCATTTTAACATTTTGTTTAGTC-A-TAGAATAATTGTTTCA
232 AAAATAAATCTGTT--TGCCGAACCAGTTCAA-A--TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCT-A
* * * ** ** * * *
84540 GTTCAAA-CAAGCT-T-A-C-TTGGAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAA
291 TTTCAAATC--GTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC--A---ATT-AT-TTT----AGTTCA
** * ** * * * *
84599 TAAGCAAG-AGATTTGAA-AAAATAA-ATTTGTTTATCGAACAAATTTGAATATT--TATG--A-
343 T-A-CAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTAT-TAAC--ATTTAAAAATTAATAAGCAAG
* * * * * * *
84656 TGATTTGAACAAT-TATCAATTT----AA-AA--TC----A-TTATGACCTTTTTTTTGCCATAA
403 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C---TATTTG-AAT-A
** * * ** ** * * **** ** *
84708 ACAAT-TGTTTTAGTTCA-TAAAAGCTTATG---CAAAATAAAATAATACTATT--G-T-AT-TA
462 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCAGTTCATAAA
84763 A---TATTTCAAAA
526 AGCTTA-TTCAAAA
* * * ** * ** *
84774 GT-TAATAAGA--GATTTA--AA-AAAT-AAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAACT
1 -TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA--AATT--AATAAGTAAAG--ATTTAAA-AAAT
* * * * ** * * *
84832 --ATCTATTT-C-AAAT-TGTT--ATTACTTTTGGTTTTTTCCTAAAACAATT-GCT-TTTC-AA
58 AAATCTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATT--T-GAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** * * * *
84887 T--ATA-GA----AGCCTAT-TCA-AAATA-AAATAATACTAATTTA-ATAA---TATTT-CAA-
119 TCGTTATGATCTTTG-TTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAAT
* * * * ** ** ** * * * *
84936 GAATTAATAAC-AGATTTAAAAAATAAATCT--GTTTACCAA--ACCAG-TTCAAATAGT-TATG
181 AAAATAAT-ACTA-ATTT-AATAAT-ATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
* * * * * * ** *
84994 ACTATTTGAACAATATCTATTTCAAATTGTTATA-ACCT-TTTGTTC---TATC-A--T-AAAAC
241 -CTGTTTG-CCGA-A-CCAGTTCAAATAGTTA-AGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
** * * * * ** * ** *
85050 AAT-TG--TTTTTGTTCA-T-AT-AAGC--CTATTCGAATAAAATA-ATA-CTAATTTAGTAATA
300 GTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGT-TCATACA-AGCTTATTT-G-AATA
*** * * * * * * * * * **
85105 TTCTAAAATTAA-TAACTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCTAA-ACTAGTTCAAATAGT
361 AAATAATACTAATTTA-TTA-ACATTTAAAAA-TTAA--TA--AGC-AAGA-GA-TTTAAA-AAA
* * * * * *
85168 TAAGA-CTACATGAAC-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTT---T--TT-TCTCA--
415 TAA-ATCTA-TTTACCGAA-CA---AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCT-ATT
* * ** * *
85222 TAAAA-CAAT-TGTCTTCGTTAATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT-A-TTAAT
472 TAAAATCATTATGAC--C-TT--T-T--G--T-TTTGTCATAAAATAAT--T-GTTTCAGTTCAT
** *
85283 ATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGA
523 A----A-AAGCTTATTC---AA-A-A
* * * * * ** * *
85309 TTTAAAAAGTAA-ATCT-ATTTACTAAACCATTTTAAATAGTT--T---TGACTATTTGAATAAC
1 --T-AAAA-TAATA-CTAATTTA-TTAA-TATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAGATTT-AAAAAA
* * * * * * **
85367 T--ATCTATTT-CT-AATCA-TT-ATA-ACTTCTTA-T-TTTGCATCAA--A-CAATTGGTCCTA
57 TAAATCTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATT--TCAAA
* * * ** * **
85420 T--TCAT-A-CTATT-TTAT-TCA-AAATA-AAATAATACTAATT--T--AAGAATATTCT--AA
119 TCGTTATGATCT-TTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-TGGAA
** * ** * * * **
85471 -AACTTAATAACCAA---AA-AA-ATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAA-ACAAGTTCAAATAGT
180 TAAAATAAT-ACTAATTTAATAATATTCTAAAATTAA--TAA--GT-AAGA-GA-TTTAAA-AAA
* * * * * * * ** * *
85529 TAAGA-CTATATGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATGACCCTTT--TC--TT-T-TGTTGT
236 TAA-ATCTGTTTG-CCGA--ACCAG-TTCAAA-TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATT-T
* * * * * * *
85586 -AAA-----AT-A-ATTAT-TTTATTCATACAAGC--TTTTTTTA-TT-A-A-AA---TA-ATGC
294 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATA-AAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
** * * * * *** *
85632 A-AATTTAATAAT-ATTT-TGAA-AATTAATAAATAAGATATTTAA-A-AATTAAA---T---T-
358 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAA-AAATTA-ATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * * * * *
85684 TTTTTGTCGAATCAA-TTGAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTA
421 TATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATG
* * * * * * *
85748 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA-ACAAGCCTATTTAGAA
485 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
85801 TAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAAATAAATCT
* * * * * *
85865 ATTTAAC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCGTTATA
64 ATTT-ACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * **
85928 ACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATA
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * **
85992 CTAATTTATTAATACTCACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA
190 CTAATTTAATAATA-T-TCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA
** * * * * ** * * * *
86056 TTAGTTAAAATAATT-ATACTCGTTTGAATGATTATTTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTT
253 CCAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * ** *
86120 TGTCATAAAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
317 AGTCATAAAACAATTATTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * ** * **
86185 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAA-TTCAAAT
380 ACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
86249 AGTTATGACTATTTAAACAATTATTTAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTTGTTTTGTCAAAAAA
443 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTAAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * ***
86312 CAATTGATTT--TTATCATAGAAGCTTATT-TGGA
506 TAATTG-TTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
86344 TAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGT
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * ** * * *
86409 GTTT--TTGAGCTAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TAATTTCAAATCGTTTTG
64 ATTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * * *
86471 ACCTTTTGTGTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * * * ** *
86534 CTAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATTTATTTATCA
190 CT-AATTTAATAATATTC-TAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTGCCG
* * * * * * *
86598 AACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTT
251 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * ***
86663 TTGACATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAGCTTATCCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTA
316 TAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * ** * *
86728 ATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--CAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATT
380 A-CATTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * ** * * *
86790 GTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACAA
444 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * * * *
86854 TTATCTGAATCCATACAAGCTTAGTCAAAA
509 TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * * * *
86884 TAAAATAATACTAATTTATAAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGTGATTTAAAAAGTGAATATG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
** * * * *
86949 TTTACCGAATCAGTTCAAATAATTAATGTC-ATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTT-TG--
65 TTTACTAAATCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * * * *
87010 -TTTG----GTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTA
129 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
* * * * **
87069 ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCA
193 ATTTAATAAT-ATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
* * * * * ** * *
87134 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTGAAAATCATTATAACCTTTTGTTCTA-
256 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TAG
* * * * ** *
87197 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATA
319 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* ** * * * * * * *
87262 TTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATT
383 TT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * ** *
87327 AAGACTATATGAACAATTATCTATTT-CAA--A-T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTT
447 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* ** **
87385 TTTCAATTCATACTAGCTTATTCGGAA
512 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
87412 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * **
87476 GTTTGCCTAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGA
64 ATTT-ACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * * * *** *
87540 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACT
128 TC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * * *
87605 AATCTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCA
192 AATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
* * * * * * *** *
87665 ATTCAAAAAGTTATGACTAAATATTTCAAAAATTAATATAGATTT-AAAAAATAAAT-A--TGTT
256 GTTCAAATAGTTAAGAC----TATTTGAACAATT-ATCT--ATTTCAAATCGT-TATGACCT-TT
* ** * ** * * * * ** *
87726 TGTTAAACCAATTCAAAA-AGTTATGACTATTTGA-GCAA--TTATTT-ATTTAAAATTGTTATT
312 TGTTTAGTC-A-T-AAAACAATTAT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-ATAAAA-TAATACT
* * ** * * * * *
87786 ATTTTTTCTTTTC-TTACAAAACAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCAAATTAAAGT-AAT
371 A--ATTTATTAACATT-TAAAA-ATTAA--TAAG--CA-AGAGA--T-TT-AAA--AAA-TAAAT
** * ** * ** * * * *
87849 ACTATTTTA-TTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAAT-TTTAAAAATAAATATGT-TTACT
420 -CTA-TTTACCGAACAAGTT--C-A--AAT-AGTTATGACTATTT--GAATAATTATCTATT--T
* * * * * * * * ** * ** *
87911 GAACTAGATCA-AATAGTCATGATT-ATTTGT-AT-AAGTATTTATTTCAAATGATTATGACCTT
473 -AA--A-ATCATTAT-GACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCA-TAAAAGC--
* ****
87972 TTTTTTTGTCA
529 -TTATTCAAAA
* * *
87983 TAAAA-AAT--TATTTTAGTTCATATCAGCCTATTCGAAATAAACTAATAA-T-AAGTTATTAAT
1 TAAAATAATACTAATTTA-TT-A-AT-A---T-TTC--AA-AAATTAATAAGTAAAGAT-TTAA-
* * * * * * * * * * *
88043 ATTCTAA-AAAT-TAATAATTAAGA-GATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAAT
53 A---AAATAAATCTATTTACTAA-ATCAGTT--CAAAT-AGT-T----AT-G-ACTA-TTTGAAC
* * ** * **** * ** *
88105 AATTATGATTATTTGAAA-AATTATCTAT-TTCAAATTG-C-TATAACCTTTTGTTT-TGTTACC
103 AATTAT--CTATTTCAAATCGTTAT-GATCTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTATT--C
* ** * * ** ** * * ** * *
88165 AAATGATCTTTTCTATTCATATAAGCTTACTACAAATAAAATAATA--C-AATTTATTAAT-ATT
162 ATACAAGCTTAT-T-TGGA-ATAA-AATAATACTAATTTAATAATATTCTAA--AATTAATAAGT
* *** * ***** * * * **
88226 AAGACAATTACTAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCGAACACATTCAAATATTTGT
221 AAGA-GATT--TA---AAAA-A--T---AAATCTGTTTGCCGAAC-CA---GTTCAAATAGTTAA
* * * * ** * *
88291 CACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGATTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTTT
270 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AATTAT
* * *** * *
88355 TTTTGTTCATAAAAGCTTATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAA
334 TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
88420 GTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTGAAGTAGTTATGACTCTTTGAAC
398 GCAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * * * * * **
88485 AATTATTTATTTCAAATTTTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCTA-TTTATGC
461 AATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAA
** ** *
88549 AATTTTATTTGAGA
525 AAGCTTATTCAAAA
* * * *
88563 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAGAGGTTTAAAAAATAAATTTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* ** * * * * *
88628 TTCACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTAT-A
65 TTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * ** ***
88690 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAC
128 TC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * * ****
88755 TAATTTATTAATATT-TCAAAAGTTAATAAGT----GATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAAC
191 TAATTTAATAATATTCT-AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC
* * * * * *** *
88815 CAGTTCAAATA-TTCATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATGATTTGTTTT
254 CAGTTCAAATAGTT-AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTA
* * * * * *
88879 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCCTAAATTAATA
318 GTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAAT-ACTAATTTATTA
* * * * * *
88943 ATATTATAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTT-GCGAAGCTAGTTCAA
380 ACATT-T-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAA
* * * * * * * * *
89007 ATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTCTAAACATTTGTTTAGTCATAAA
441 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* **
89071 ATAATAT-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
505 ATAAT-TGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* ** * * * *
89105 TAAAATAATACTAATTTATTAACA-GCCAAAAAATTAATAAATAAAAAATTTTTAAAAATAATTC
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAAGA-TTTAAAAAATAAATC
* * * **
89169 TGTTTAC-AAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TA
63 TATTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTA
* * * * * ** * * * *
89231 CGACCTTTTATTTTATCATAGAATGATTGTTTC-AGTTTATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAA
125 TGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* ** * * * **
89295 TATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGATTTAAAAAATAACT-TAGTTTAT
188 TACTAATTTAATAATA-TTCTAAAATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGC
* * * * * * * * *
89357 CGAATC-GCTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAAACTTTT
249 CGAACCAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * * * *
89421 ATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCGAAATTAAATAATAGTAATTT
313 GTTTAGTCATAAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTT
* * * *
89484 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTATCG---AA--TC-
376 ATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCA
* * * * * *
89543 AAT--TT-T---TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAA
440 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
89602 ATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTAGAA
505 ATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
89636 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAACAATATGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAA-ATCT
* * * * * * * ***
89701 -TTGT-CGAAGTC-GTTCAAATAATTAAGACTATATGAGCAATTATCTATTTATAAAAAATTATG
64 ATT-TACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATG
** * * * * * *
89763 GCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTTA-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATAC
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* ** * * * * *
89827 TAATATGTTAATCTTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACC
191 TAATTTAATAAT-ATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACC
* ** * * *
89892 AGTTCAAATACG-T-A-ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTA
255 AGTTCAAATA-GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TA
* ** * * * *
89954 -TCATAAAAC-ATTATTTT-GTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTAATAAT
318 GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
* * ** *
90016 ATTCTGAAAATTAATAA-CTAA-AGAAATTAAAAAATAAATTTCT-TTTGTCGAACCAGTTCAAA
382 ATT-TAAAAATTAATAAGC-AAGAG-ATTTAAAAAATAAA--TCTATTTACCGAACAAGTTCAAA
* ** * * * * *
90078 TATTTAAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCGTTGGTTTTAG-CATAAA
442 TAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAA
* * * * ** ***
90142 ATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAA
505 ATAA---TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
90179 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAATTTAACAAG---AGATTTAAAAAATAATTCTA
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * ** *
90240 TTTACTTAACCAGTTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-ATC
65 TTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC
* * * * * * *
90304 TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAA
130 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
* * * * ** **
90369 TCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATGAAATGAG
194 TTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCG-AACCAG
* * * * * * * *
90429 TTGAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATAGTTAT-AACTTGTTGTTTTGTT
257 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTAGTC
* * ** *
90493 ATAAAACAACTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
321 ATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * * * * * ** * * *
90557 TTCAATAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAGTATGTTTATTGAAATAAATT-AAATAGTA
384 TT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTT
* * *
90620 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAACCATTATGACC-----TTTTG---T----T--TTG
447 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
90671 --TCA--T-AT--AAGCTTATTCAAAA
512 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
90691 TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATCAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * ** * * * * * * * *
90756 TTT-GTTAAGCAACTTTAAATAATTATGTCTATTCCAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAAC
65 TTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
** * * * * * * *
90820 CTTTTGTTTTGTCATAACATGATTTTTTTTTGTTCATACAAGTTTA-TTGCAAATAAAATAATAA
129 C-TTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG-GAATAAAATAATAC
* * * * * * * * *
90884 AAATTTATTAATA-T-AAAGATACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA
191 TAATTTAATAATATTCTAA-A-A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA
** * * * * *
90947 TAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTATT
253 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTT-TGTT
* * * ** * *
91009 TTGTCGTAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATT
316 TAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * ** *
91073 AATATTTTGACAATTAATAAGAAAAAGATTTAAGTAAA-AAATATGTTTTTCAAACAAGTTCAAA
379 AACA-TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAA
* * * * * *
91137 TAGTTCTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAC
442 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * **
91202 AATTATTTTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAA
507 AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * * * *
91234 TAAAATAATAC---------CA-ATTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
91289 TTTATTAAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGA-
65 TTTACTAAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * ** **
91352 CATTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-T
129 C-TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * ****
91416 AAATTTATTAATATT-TGAAAAATCAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTTA
192 -AATTTAATAATATTCT--AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTG-TTTGCCGA
* * * * * *
91478 A-CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATT
252 ACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * *
91542 TTGTCATAAACCAATT-GTTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
316 TAGTCATAAAACAATTATTTTA-GTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
91606 AAAATTTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAATATAAATCTAGTTACC-AAGCGAGTTCAA
379 AACATTT--AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAA
* * * * * * *
91670 ATAG-T-TGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTCTCATGAAA
441 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** *
91733 CAATTGTTTCTA-TTCATATGAGTTTATTCAAAA
506 TAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * ** *
91766 TAAAATAATACTAACTTATTAATA-TTCTTAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * *
91830 ATTCA-TCGAA-CAAGTTTAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGATATTATCTATTTCAAATCATTA
64 ATTTACT-AAATC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * ***
91891 TGA-CATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-ATTATTCAAAATAAAATAA
125 TGATC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
** * * * * **
91954 TAGAAATTT-ATCAATATTTTGAAAA-T--TAAG-AAAAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCG
188 TACTAATTTAAT-AATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCG
* * * * *
92014 AACCCGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAAACGTTATGA-CTTTTGT
251 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
92077 TTTGTCATAAAAAAAATTGTTTATA-TTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTA
315 TTAGTCAT-AAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTA
* ** * * * *
92141 ATAGTATTCTAAAAATTAATAA-C---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCA
377 TTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCA
* * * * *
92201 AAT-GATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAA
440 AATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
92265 AATAATTTTTTTCAGTTCACACATGCTTATTCGAAA
504 AATAA-TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * ** * *
92301 TAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAAATCT
* ** * * ***
92365 GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATG
64 ATTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATG
* * ****
92428 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AATGCTTATCCAAAATAAAATAAT
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTTGGAATAAAATAAT
* * * * * * * ***
92491 ATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAA-AAGT-TAGTTTATTGA
189 ACTAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGCCGA
*** * * * * * ** *
92554 ATTGGTTTAAATAATTTTAG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTT
252 ACCAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *** * * * *
92618 TTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATCATAAAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTA
316 TAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
92683 A-TTTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC--A-AA---C-CA-A
380 ACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * * ** *
92739 ---CT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
444 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
*
92800 TTGTTGT-AGTTCATATAAA-CTTATTCAGAA
509 TTGTT-TCAGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
92830 TAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * * * ** * * *
92895 TTTA-TCGAAGCAATTTAAACAATTAAGACTATATGAATAGCTATCTATTTCAAATCATTAAGAC
65 TTTACT-AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* *** *
92959 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAT
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * * * * * **
93023 AATTTATTAATGTTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCAAATTA
192 AATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
* * * *** * * * *
93084 TTTCAAATAATTATAG-CCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGATATTACCCTTT-TTTGGT
256 GTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGT
* * ** * *
93147 CATATAACAGTTATATTT-G-AAACTTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
320 CATAAAACAATTAT-TTTAGTTCA-TACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAA-
* * *
93210 C-TTTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATATA-CTTATTTACCAAACTA-TCTCAAA
381 CATTT-AAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATC-TATTTACCGAACAAGT-TCAAA
* * * ** * * * * * * *
93271 TAGTTATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTTATAAAAC
442 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* ** * *
93336 AATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA
507 AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
93368 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTT--AAAA-AAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AG-ATTTAAAAAATAAATCT
* * ** * * * * * *
93430 GTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * ** *
93495 CTTTTATTTTGTCATAAAA-TATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AA
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * * * * * * *
93558 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAAC
191 T-AATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC
* * * * * * * *
93623 TAGTT-AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTG
254 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * * * * * * *
93687 TCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATA
319 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATT-TATTAACA
* * * * * *
93751 TTTTGAATATTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTT
383 -TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * * * *
93812 AAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTG
447 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
** * * * * *
93877 TTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGAT
512 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
93904 TAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* ** ** * * * * *
93969 TTGCCGAA-CTAAATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-C
66 TTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC
* * * * *
94032 ATTTTATTTTGTCATAAAA-AATTG-TTCCAGTTCATATATGCTTATTGGGAATAAAATAATACT
130 --TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * *** *
94095 AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATTAAAC
192 AATTTAATAAT-ATTCTAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACC
* * * * * * * *
94158 ATATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTG
255 A-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * * * * *
94223 TTATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAAAAAATAATACAAATTTATTAATA-
319 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * * * *
94287 TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-T
384 TTAA-A-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGT
* *** * * * ** * *
94351 TATGACTATATGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
446 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * ** *
94416 GTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGGAT
511 GTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
94444 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGTTTTTAAAAAAATAAATA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAG-ATTT-AAAAAATAAATC
* * * * * * *
94509 TGTTTAC-AGAA-CAAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATCATAAT
63 TATTTACTA-AATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * **
94572 GACCTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATGTAAGTTTGCTT-GAACTAAAAT
126 GA---TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAAT
* * * * * * *
94635 AATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTAC
186 AATACTAATTTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTGC
** ** ** * * * * *
94699 TAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTG
249 CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
94764 TTTTA-TCATAAAATAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTCCGAATAAAATAAT-TTAAATT
314 -TTTAGTCATAAAACAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACT-AATT
* * * * * * * * *
94826 TATTAATATTCCAAAACTTAGTAAG-AAAAAATTTTAAAAATAAATCTATGTT-CTGAACAAATT
375 TATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACCGAACAAGTT
* * * * * *
94889 CAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
438 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
*** * **
94954 AACCCATTGATTT-TGTTCATAAAAGCTTATT-TGAA
503 AAATAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
94989 TAAAATAACACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * * * ** *
95053 ATTTACCGAGTGAATTCAAATAGTTATTATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAAT
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * *
95118 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
* * * * ** * * ** *
95183 ATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAA
193 ATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAG
* ** * * * * * * * * *
95248 TTTAAGCAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTGAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCA
257 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* * ** ** *
95313 TAAAA-AATTTGTTTTA-TTCATGCAAAATTATTCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
322 TAAAACAA-TTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAACATT
* * * * * ** **
95376 TCAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTCAAATAGTTATG
385 TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
95437 ACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
450 ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * *
95501 CTA-TTCATACAAGCCTATTCAAAG
515 C-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * ** * * * *
95525 TAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
95590 GTTTACTAAA-CTAATT-GAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTTCAAATCGTTTTG
64 ATTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATG
* ** * * ***
95653 ACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATA
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * * * ** *
95717 CT-TTTGTATTAACATTCAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAGAAATAAATCTGTTTATCAA
190 CTAATT-TAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTGCCGA
* * * * *
95781 ACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTG
252 ACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-
* * * * *** * *
95845 TA-TCATAAAACATTTGTTTTAATTCATTA-AAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
316 TAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCA-TACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * **
95908 AATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAA-AGATTTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAAGCAA-TTC
379 AACATTT-AAAAATTAATAAG-CAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAA-CAAGTTC
* * * * * * * *
95970 -AATAATTATTG-GTATTTGAACAATTATTTGTTTCAAAATCTTTTATAATCTTTTGTTTTGTCA
439 AAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *** * * *
96033 TAAAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCTAAA
501 TAAAATAATTGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAA
* ** * *
96072 TAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGGGATTTAAAAAATAAATATG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
96137 CTCAC-AGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATATATTTCAAATCATTATAA
65 TTTACTA-AATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * *
96200 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACT
128 TC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
96265 AATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCTAACCA
192 AATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
* * * * * * *
96330 ATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
256 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * * * * * ** * *
96395 TTAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
321 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
* * *
96460 TTAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAATC-A-TTCAAATAGTTAT
385 TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
96519 AACAATTTTGAACCACAATTATTTATTTTCAAATCGATTATAACCAATTGTGTTTTGGT-ATAAA
449 GACTA-TTTG-A--ATAATTATCTA-TTTAAAATC-ATTATGACC--TTTTGTTTT-GTCATAAA
* * ** * *
96583 ATAATT-TTTCTATTTGATACTATCTTATTCGAAA
505 ATAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
96617 TAAAGTAATGCTAACTTTGTTTAATA-TCCTAAAAATTAACAAGTAACGGATTTAAAAAATGAAT
1 TAAAATAATACTAA-TTT-ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * * * *
96681 CTATTGGCCT-GACCAATACAAATAGTTATAACTGTTTAAATAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTA
62 CTATT-TACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTA
* * * * ** * *
96744 TAACCTTT-TGTTTGT--TACAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGC-TAATTGGAATAACATAA
125 TGATCTTTGT-TTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * **
96805 -ATCTAATTTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAATAGA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCG
188 TA-CTAA-TTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCG
*** * * * * *** *
96868 ATTAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTTAAATTACTATAACCTTTT-TT
251 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
96932 TTGTCACAAAATAATTTTTTCTA-TTCCTAACAAGCCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTA
316 TAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCAT-ACAAG-CTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * * *
96996 TTAATATTTAGACAACA-AAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTT
377 TTAACATTTA-A-AA-ATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * **
97060 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAA
439 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** *
97125 AACT-ATTGTTT-TGTTCATAAAAGCTTATTCGGAT
504 AA-TAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * **** * * *
97159 TAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
97224 TTTA-TCGAATAAGTTCTAATAGTTATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGAC
65 TTTACT-AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * * *** *
97287 CTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTA
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
* * * * * * *** *
97352 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTATTGAACAAG
193 ATTTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAG
* * * * * * * *
97417 CTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCA
257 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* ** * * *
97482 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAATTTA-TTCAAAATAAATAATACTAATTTATTAAAATT
322 TAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAATA-AAATAATACTAATTTATTAACATT
* * * * * * * * * *
97544 CT-AAAATTAATAGGTAGGAGACTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCAT
385 -TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** * *
97607 G-TTCATTTGAA-AATTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTA
449 GACT-ATTTGAATAA-TTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * *
97670 TTTCTGTTCATATAGAA--TTATTTAGAA
512 TTTCAGTTCATA-A-AAGCTTATTCAAAA
** * * ** * *
97697 TAAAATAATACCGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAG---AG-TATTAAAAACTAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
97758 TTTA-TCAAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGA
65 TTTACT-AAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * ** * *
97821 TCTTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCGTTATAAGCCTATTCAGATTAAGATAATACT
128 TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * *
97886 AATTTAAT-A-A---TAAAA--AATAA--ATGAG--------------T-T-TTT-CCAAACCAA
192 AATTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAG
* * * * * *
97925 TTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCT-ATCCTTTTGTTTAGTC
257 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTAGTC
* * * ** *
97989 A-ACAAACAATCATTTCAGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
321 ATA-AAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * * *
98053 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAA-AAA---AGTTTATCAAACAAGCTCAAATAGAT
384 T-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * ** * * * *
98114 ATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-TCCTTTTTGTTTAGTCATATAAGAATT
447 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
** * * *
98178 GTTT-TTTATCATACAAGGTTGTTCAAAA
511 GTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
98206 TAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * ***
98271 TTTACCAAACCAATTCACATAG-T-TGAAC-AATTGTATACTTCAAATTAAT-TATTTTAAAAAA
65 TTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTG-A-A---C-AATT-ATCTATTTCAAATCG
* ** * * * * * * * * *
98332 TAAACAT-TTTGCTCTATCATAAAAAAAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
122 TTATGATCTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * * * *
98396 AATAGTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCC
186 AATACTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCC
* * * *
98461 GAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCT
250 GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* ** * *
98526 TCTA-TCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATAGTAGCTTATTCAGAATAAAAGTAA-AATGAATT
315 T-TAGTCATAAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAA-TAATACT-AATT
* * * *
98588 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAA-TT
375 TATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTT
* * *
98652 CTAATAATTATGACTATTTG----A--A-C-A-TT---ATC------ACCTTTGGTTTTGTCATA
438 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * ***
98699 AAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGTTTGGAA
503 AAATAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
98735 TAAAATAATGCTAATATATTAATATTACAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCT-T
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * *
98796 TT--T--ATCA----AACCT-G-T-T--C------AATAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACC
66 TTACTAAATCAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC
* * ** *
98842 TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAA-AGT-
130 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
* * * ** **
98903 -TGTATTAATATT-TCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTAAATT
193 ATTTAATAATATTCT-AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGCCGAACC
* * * * * * * * * * **
98965 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCT
255 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * * *
99030 CATAAAACAATTGCTTTTCA-AT-ATAGAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAAT
320 CATAAAACAATT-ATTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAC
* * * * * *
99093 ATTTCAATAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAAATAAAATTTGTTTAACAAACTAGTTCAAATA
382 ATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * ** * * * *
99154 GTTA-GACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATCATAAAACAA
444 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * *
99217 TTATTTTCTGGTT-A-AATAAGCTTATTCGAAA
509 TT-GTTTC-AGTTCATAA-AAGCTTATTCAAAA
* *
99248 TAAAATAATACTAA-TTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * *
99310 AATTTGCTAAAGT-AGTTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT
64 -ATTTACTAAA-TCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * * *
99373 GACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCTTAATATAAG-TTGATTCGAAATAAAATAAT
126 GATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGGAATAAAATAAT
* * * * * *
99437 ACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTG-CTA
189 ACTAATTTAATAATATTCT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGA
* ** * * * * *
99501 AGCCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTT
252 A-CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * ** * ** * *
99566 TTGTCATCAAATAATTAGTCCTA-TTCATACCATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAAT
316 TAGTCATAAAACAATTA-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * ** * *
99630 AATATTCCAAAACTTAATAA-CCAGTAAAATTTAAAAAATAAATATAATTGTCGAACTAGTTTAA
379 AACATT-TAAAAATTAATAAGCAAG--AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAA
* * ** ** * * **
99694 ATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGTAAA
441 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAA
* * * ** *
99759 ACAATTGTTTTA-TTCATACAA-CTTATTCTGAT
505 ATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
99791 TAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * * * *
99856 TTTACTGAATCAGTTCATATGGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCTGATA
65 TTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT-
* ** * ** *
99921 TTTTGTTGAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAA
129 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * ** * *
99986 TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAGAAATAAATATGCTCACTGAACAAG
194 TTTAATAATATTC-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTGCCGAACCAG
** ** * * * * * *
100051 TTTGAATAGTTATTACTATTTTAACAATTGT-TAATTTAAAATCGTTATAACTTTTTGATTT-CT
257 TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGT
* * * * * * * * * * *
100114 CATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGGTGGATTAAAATAATACCAATTTATTAATAA
320 CATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * ** ** *
100179 TTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATTAGTTAAAATAGT
384 TTA--AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* ** * * * * * *
100242 TAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATATAACAAT
446 TATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
** * * *
100306 TG-TTCTTTATCACACATGCTTATTCAAAA
510 TGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
100335 CAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
100400 TTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGA
65 TTTACT-AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
100463 TCTATGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAACTTATTT-CATTAAAAATAATAC
128 TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATAC
* * * **
100526 TAATCTAATAATATT-TCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTC
191 TAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACC
* * * * * * *
100587 AATTCGAATAGTTAAAACTA-TAGAATAATTATCTAATTT-AAATCATTCTGACC-TTTGTTTAG
255 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * ** *
100649 TCATAAAATATTTTTTTTCA-TATTTTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTA
319 TCATAAAACAATTATTTT-AGT-TCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTA
** * * *
100712 ACATTTAGAAAATT-A-AA--AAG-G----AAATGATATTAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
380 ACATTTA-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * ** *
100767 AGTGATGACTATTTAAACT-ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAATTGTTTTGACATAAAAT
443 AGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* *
100831 AATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA
507 AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
100863 T---A-AA-A-TAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTT--AAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
100919 TTTA-TAGAA-CAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGA
65 TTTACTA-AATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * ** * * **
100982 CCGTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTGAATTTATACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACT
128 TC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * * *
101047 AATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAG-CGAAT
192 AATTTAATAATATTCT-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GCCGAAC
* * * * * * * * *
101110 CAGGTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGG
254 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * * * ** *
101175 TCATATAACAATTGTTTT--TACATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATC
319 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-C
* * ** * *
101238 -TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTGGTTTAAAGA
382 ATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
101302 TTTATAACTATTTGAACAATTGAAT-T-CTTCAAATCGTTATAACCTTTT-TTTCTATCATAAAA
444 GTTATGACTATTTGAATAATT--ATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAA
* * * **
101364 CAATTATTTCTA-TTCATACAAG-TTCATTTGAAA
506 TAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTT-ATTCAAAA
* ** * * *
101397 TAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAAT-T-
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * *
101460 TGTT-CGTCAAA-CTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA----T-T
65 T-TTAC-T-AAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * **
101518 G-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTTTTTC-ACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-A
126 GATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * * * ** *
101580 ATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAA-AAAT-TATTTATCTAA
190 CT-AATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA
* * * * * *
101643 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGCTATGACATTTTGTTT
253 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TT
* * * ** *
101708 TA-TCATAAAACAAATGT-TTTTA-TTCATATAAGTTTGCTCAGAATAAAATAATACTAATCTAT
316 TAGTCATAAAAC-AAT-TATTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTTGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
101770 TAATATTTCAAAAATTAAT-A--ATG-GATTTTAAAAATAAATCTCTTTATCAAACTAGTTTAAA
378 TAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAA
* * * ** ** ** * * * * *
101831 AAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAAC
442 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
** ** * *
101896 AATAATTTCTA-TTCATAAAAAATTATTCAGAT
507 AATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
** * *
101928 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAA-ATTTTAAAAAATAAAT-TG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
101991 TTTAC-CAAGCTAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAGTA-CTTATTTCAAATCGTTATAA
65 TTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGA
* * * * *
102054 CCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATC-AGCTTATTTGAAATAAAATAATA
128 TC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * * * * **
102117 CTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAAC
190 CTAATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC
* * * * * * * * ** * *
102182 AAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTACAACTTTTTGTTTTG
254 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
** ** * * * *
102247 TCACCAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTACGAATAAAATAATA-AAATTTATTAAT
319 TCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
* * * * * * * ** **
102310 ATTAAGAAAATTAATAGGTAAAAAATTTTAAAAATAAAAT-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATCC
382 ATTTA-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * ** * * *
102374 TTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAAT
445 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * *
102439 TGTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAT
510 TG-TTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
102469 TAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
102534 TTTATTGAA-CAAGTTCAAATCGTCT-TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGA
65 TTTACTAAATC-AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * *
102597 TCTTT-TGTTTGTAATAAAACCAA-TG-TT-TAGTCGTATAAGC-TATTT-GAAAAAAATAATAC
128 TCTTTGT-TTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * * * * *
102656 --A-TTCATGAATATTCT-AAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAAT-TCGTTTATCCAAA
191 TAATTTAAT-AATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTT-GCCGAA
* * * * * * * * *
102716 CCATTTCCAATAGTTATGACTATCTAAACCAATTATCGATTTCAAAAACATTATGACATTTTTGT
253 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAC-CTTTTG-
* * * * **
102781 TTTTGTCATAAAACATTTGGTTCT-GTT-ATGTAAGCTTATTTCG-ATAAAATAATA-TAAATTT
314 TTTAGTCATAAAACAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * * ** *
102842 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTT-AAAAATAAATATGTTTTCTTTAACACGTTC
376 ATTAACATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CGAACAAGTTC
* *
102904 AAATAGTTATG-CTATTTAAATAA-TATCTATTTCAAAATC-TTATGGACCTTTCAT-TTTTGTG
439 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAAATCATTAT-GACCTTT--TGTTTTGTC
* * *
102965 AT-AAATCCCATTGTTTCTA-TTTATAAAAGCTTATTCAGAA
500 ATAAAAT--AATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * *
103005 TAAAATAATACTTATGTTATTCAACT-TTTCAAAAATTAATTCA-TATAAGCTATTGGGAATAAA
1 TAAAATAATACTAAT-TTATT-AA-TATTTCAAAAATTAA-TAAGTA-AAG--ATT--TAA-AAA
* * ** * * * * * * *
103068 GAT-GATACTAATTTATTATAATCCA--AAATAATAATAAAAGA-GATTTAAAAAAATAATC-AT
56 -ATAAAT-CT-ATTTACTA-AAT-CAGTTCA-AATAGT-TATGACTATTT-GAACAATTATCTA-
* * * * * ** *
103128 TTTACTAAA-CAAGTTTAAATAAT-TATGACTATT-T-A-AACAATTAATATATTTGAAATCCAC
112 TTT-C-AAATC--G-TT--ATGATCTTTG--TTTTGTCATAA-AA-CAAT-TGTTT-CTATTCA-
* * * ** * ** * * * * *
103188 TATAACCTTTGTTTTGCTATAAAAGAATTTTTTTGTATTTCATACAGGCTCATTTTCAAA-TAAA
163 TACAAGC-TT-ATTTGGAATAAAATAA---TACT-AATTTAATA-A---T-ATTCTAAAATTAAT
* * * * ** * * * ** *
103252 ACAATACA-A-ATTTATTAATATTAAGA-CAAGTTAT-AAGTAA-AATATTTAAA-AAATAATA-
217 A-AGTA-AGAGATTTA--AAAAATAA-ATC-TGTT-TGCCG-AACCA-GTTCAAATAGTTAAGAC
* * * * * * * ** * * **
103310 TGTTTTCCGAATAAGTTCAACTTCATTATGACTAT-TTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTTGTT
273 T-ATTT--GAACAA-TT-ATC-T-ATT-TCA-AATCGTTATG-ACCT-TTTGTTT---A-GTCAT
** ** * * * * * * *
103374 ATGACTTTTGTTTT-GTAATAAAACAATTGTTTCTATT-CATACAAGTTTTATTCAGATTAGATA
323 AAAACAATTATTTTAGT--TCATACAA--GCTTAT-TTGAATA-AA-----A-T-A-A-TA-CTA
* * * * * * * * *
103437 ATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACT
372 A------TTTATTAACA-TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACC
* * * * ** *
103502 AAACAAGTTCAAATAG---T--C-A--TGACTAATTATCTATTTCAGATCACAATGATC-TTT-T
429 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
103557 TTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATAAGTTTGTTTAAAC
494 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* ** *
103602 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAATAGAAATAAAAAATGAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
** * ** * * * * * * *
103666 ATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAATAATTTATTTCAAAACATTATCAC
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * *
103731 CTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCTGTTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TT
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * * * ***
103794 AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTATGAACA
192 -AATTTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-
* * *
103858 CA-TTCAAATAGTT--GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTG
254 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * *
103920 TCA-AAAACCCATTGTTTTTA-TTCATAAAAGCTTAATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
319 TCATAAAA-CAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
103983 AATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CTAAGCGAGTTCAAAT
381 CATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * ** * *
104047 AGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
443 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* **
104112 ATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTTGAAA
508 ATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * ** *
104143 TAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTTTATAATTTGGAGATTTAAAAAATAATTCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-GTAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * * *
104207 GTTTACCAAATAAGTTTAAA-CGATCATGTCCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATG
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * ** ***
104270 A-CATTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATA
127 ATC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * * * ** *
104334 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGGTTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAAT
190 CTAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC
* * * * * * * ** * *
104395 TATTTCAATTAGTTATGACTATTTGATCAGTTATCTATCTCAAATCACTATGATCTTCAT-TTT-
254 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTA
* * * * * ** *
104458 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAA
318 GTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *** *
104522 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTAAACCAGTTCAAATAG
381 CA-TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
104587 TTAAGACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAAG-CATAAAATAA
445 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAATAA
* *
104651 TTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAA
509 TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
*** * *
104681 T-AAATAATACCCTTTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAG-CAAGAAGTTTAAAAAAATAAAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAG-A-TTT-AAAAAATAAAT
* * * * *
104743 TTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTAT
62 CTATTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ****
104807 GACCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT
126 GA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
* * * * * * * ***
104871 ATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGA
189 ACTAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGA
* * * ** * * ** * *
104935 ATCAGTTAAAATAATTTCG-CCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATATATTATGATCTTTTATT
252 ACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CGTTATGACCTTTTGTT
* * * * **
104999 TTGTCAT-AAACAAATGTTTTCA--TCATACAAGCTTATTTCGCATAAAATAATACTAATGCATT
316 TAGTCATAAAACAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * ** *
105061 AATATTTCAAAAAATAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAACTAGTTCAAAT
379 AACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
105126 AGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
443 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAT
* *
105191 AATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
507 AATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * ** * *
105223 TACAATATTACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAACTAAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * * * * * *
105287 TTTTGCTGAACCAATACAAATAGTTAAGGCTATATGAATATTTATCTATTTCAAACCGTTATGAC
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* * * * * * * *
105352 CTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTT-TCATTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATT
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * * ** * ** * *
105416 AATTTATTAATATTTTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAG
192 AATTTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAG
* ** * * * *
105478 TTCAAATAGTTATA-A-TAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGT
257 TTCAAATAGTTA-AGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGT
* * ** * * * *
105541 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAAT
320 CATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAG-CTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
** * * * * * * *
105604 ACCTAAAAATTAATAAGTAACG-GATTTAACAAATGAATCTATTTGACTGACCAA-TACAAATGG
382 ATTTAAAAATTAATAAGCAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
105667 TTATAACTGTTTGAACAA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTATTAGAAAATAA
445 TTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
** * * *
105730 TTGTTTCTA-TTTGTACAAGCTGACTT-GAAA
509 TTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAA
* * *
105760 TAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATAT
1 TAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * ** *
105824 GTTTA-TCGATTAAGTTCGAATAGTTACT-ACTCTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATA
64 ATTTACT-AAATCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * *
105887 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-CAATTAAAATAATA
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATA
* * * * * * **
105951 CAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA
190 CTAATTTAATAATATTCTA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA
** * * * * * * *
106015 TAAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTT-
253 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTA
* * * * * * * * *
106079 TTCATAAAATAATTGTTTT-TTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTAATTAAT
318 GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
* * * * * * * * * * *
106143 ATTTTGACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATTGT
382 A-TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * ** *
106208 CATAACTACTTT-AGTAATTATCTA-TTACAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAA
446 TATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTA-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * * *
106271 TTGTATCAATTCATATAGGCTTACTGAACAA
509 TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAA-AA
* * * * ** ***
106302 GCTCAAATAGTTATGACT-GTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATTTTAT
1 --T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAA-AATTA--ATA-AGTA-AAGAT
* *** * * * * **
106366 CATAAAACAATTTTTTCTATTCATAC-AAGTTTA-TTCAGAATAAACTAAT-ACTAATTT-ATTA
49 -TTAAAA-AA-TAAATCTATT--TACTAA-ATCAGTTCA-AAT--AGTTATGACT-ATTTGAACA
* * ** * ** *
106427 A-TATTCTAGAAATT-AATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCAAATAAATTCAA
104 ATTA-TCT---ATTTCAA-A--T---CG--TT--ATGAT--CTTTGTTTTGTC--ATAAA-AC-A
* * * ** ** * ** *
106489 ATAGTCATGT-TCATTTGAATA-ATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATAGTA
149 ATTGT--T-TCT-A-TT-CATACA--AGCTTATTTGGAAT-AAAAT-A-ATACTAATTTA-A-T-
* * *** * ** * ** *
106551 AAACAATTGTTTCTATTCATACA-TAA-TTATTTAGAATAAAATAATAT-TGATT-CATTAA-GA
200 -AA-TATT-CTAAAATTAATA-AGTAAGAGATTT--AA-AAAATAA-ATCTGTTTGC-CGAACCA
* * * * * ** ** *
106611 TTTTAAAAATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACTAGCTCAAATAGTTATGA
256 GTTCAAATAGT--TAAGACTATT-TGAAC--AA-----TTAT----CTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * *
106676 CTTTTTGATCAATTA-T-ATATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTGCTATAGAA-CAATTATT
307 CCTTTTG-T---TTAGTCATA----AAA-C--AATTAT-TTTA-GTT-C-ATACAAGC--TTATT
*** * * * * * ** *
106738 T---T-TTTTCATA-TAAGCTTATTCAGA-TTAAGATAA-TACTAATTTAATA-A--TAAAAAAT
355 TGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAACATTTAA-A-AATTAATAA-GCAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * ** * * * **
106793 AAATGTGTTTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTG
416 AAATCT-ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCA
** * * * * * * * *
106858 TTATGATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAACCTTATTTAGAA
480 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* ** * * *
106917 TAAAATAATACTAATTTACTAA-AACTCAAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAAGAAATA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * * * *
106981 TGTTTA-TCGAA-CAAGCTT-AAATAGATATGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTA
63 TATTTACT-AAATC-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * *** *
107043 TGACCTTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAACTT-GTCCAAACTAAAAC
125 TGA--TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAAT
* * * * * * * *
107106 AAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATATT-C
186 AATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTGC
* * * * * * *
107170 CGAACCAGTTCAATTAGTTACA-ACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAAT-TTTATGATC-TTT
249 CGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
** * * ** *
107232 GTTTTTTCA-AAAA-AATT-TGTTTATGATCATATAAGCTTATTCAAATAAAAATAATATTAATT
313 GTTTAGTCATAAAACAATTAT-TTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAT-AAAATAATACTAATT
* * * * * * *
107294 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATC-AGTT
375 TATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * ** * * *
107358 GAAATGGTTAAGGCTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATA
438 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* **
107423 AAACT-ATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGAA
503 AAA-TAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
107459 T-AAA-CAT--TAATTTATTAACA-TTCAAACAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAG-TAAAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * * **
107519 TGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATT-T-TATTTGAAATTATTATG
63 TATTTACTAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * ****
107581 AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* ** * * * * *
107645 CTACTTTTTTTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAAATTTAACAAAATAAAT-TAGTTTACCA
190 CTA-ATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCT-GTTTGCCG
* * * *
107709 AATCAGTTCAAATAATTATAG-CCATTTGAAC-A--A---A-GT----T-GTTAAT-A-CTTTTC
251 AACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTT-
* * * * * *
107759 GTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTT--TTAACATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACCAATT
313 GTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTT--CATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATT
* * * ** * * * *
107822 TATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAATTGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCAAACTAGTTT
375 TATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * ** *
107883 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-CATAA
439 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
107947 AACAATTATTTCTGTTCACACAAGTTTATTCAAAA
504 AATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * ** * * *
107982 GAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA
* * ** * * * *
108047 TTT-GTCAAA-CTAGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATCATCTATTTCATATCATTATGA
65 TTTACT-AAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * ** * * * * * * *
108110 CCTTTTATTTTGTTTTAAGACAATTATTTC-AGCTCATATAAGTTTACTTGGAATAAAATAAAAC
128 TC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
** * * * * * *
108174 TAATTTGTTAATATT-TCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAAC
191 TAATTTAATAATATTCT-AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC
* * * * * * *
108238 CAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATAGTTATTACTTTTTGTTTT
254 CAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTA
* * * * * *
108302 GTCATAAAATAAATTTTTTTA-TTCACATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
318 GTCATAAAA-CAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * * *
108366 TATTGAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTCAAATAG
381 CATT-TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
108431 TTTTGACTATTTGTAATAATTATATATTTTAAATCGTTATAACCTTTCGTTTTATCATCAAACAA
445 TTATGACTATTTG-AATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* ** ** *
108496 TTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCATAA
509 TTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * ** * *
108526 TGAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTT-AAAAATTAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTA-AAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * * * *
108590 AATTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGTCTATATGAACGATTATCAATTTCAAATCTTTATGAC
64 ATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
* **
108655 CTTTTGTTTTATCATAAAACAAAATT-TTT-T-TTCATACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAC
129 C-TTTGTTTTGTCATAAAAC--AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * * * * * *
108717 AAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACCAAACC
191 TAATTTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACC
* * *
108782 AGTTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-CTTTTGTTTAG
255 AGTTCAAATA-GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * * * *
108844 TTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATTAGGAATACATTAATACTAATTTATTAAAA
319 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* * * ** * * *
108909 TTGAAAAATTAATAAGAAAGATATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAATAATC
383 TTTAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
108974 ATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
447 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * ** **
109039 TTTCAGTTAATACATGCTTAAAC-GGA
512 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
109065 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * ** * * * * * *
109127 TTACTGAATCGGTAAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACC
66 TTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC
* * * * * * *
109191 TTT-TATTCTGTTATAAACCAATTGTTT-TTTATCAAACAAGCTTATTCGAAATATAATAATACT
130 TTTGT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * *
109254 AATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG-TT---------
192 AATTTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
* * * * * *
109305 -TTCGAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-TGACCTTGT-TTTAGTC
256 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * ** ** * *
109367 ATAAAATATTTGTTTCACATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATATATTAACATT
321 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
* * * * * *
109432 CAAAAAATTAATAAGCGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTA
385 -TAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * *
109497 TGACAATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
448 TGACTATTTGAATAATTATC-TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * *
109561 TTTTAGTTAATACAAGCTTATACGAAA
512 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * *
109588 TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAAT-A--AAAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * * * * * * *
109650 CTACTAAATCAATTGAAAAAATTTTGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATGACCT
66 TTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-
* * *
109715 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAA
130 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAAT--AA-AATAATAC
* * * *
109779 TAATAATAATAATTTATAATATTCCTAAAATTAACAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTT
191 TAAT--T--T-A---ATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** * * * ** * * * * * * *
109844 ATCAAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATTATGAACTTC
247 GCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * *** * *
109909 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
312 TGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTT
* * *
109974 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-----C
376 ATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * * * * *
110033 --A-A--T-T-CCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATCGTCATAATCTTTTGTTCT-ACTAT
439 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-AT
* * * * *
110089 AAAATAATTGTTTCAGTTCACATATGCTTATGCGAAA
502 AAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
110126 TTAAATAATATTAATTTAATAATATATTCAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAATAAATAAATC
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAA-AAATAAATC
* * * * * * * * * * ** * *
110191 TGTTTGCCGAAGT-AGTTCAAACATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTTAAATTATTTTA
63 TATTT-ACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
*
110255 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
127 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAA
110276 TAATAATTTC
Statistics
Matches: 22157, Mismatches: 5090, Indels: 4006
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
484 1 0.00
485 8 0.00
486 10 0.00
487 15 0.00
488 16 0.00
489 14 0.00
490 3 0.00
491 11 0.00
492 4 0.00
493 9 0.00
494 13 0.00
495 22 0.00
496 23 0.00
497 8 0.00
498 42 0.00
499 137 0.01
500 13 0.00
501 24 0.00
502 66 0.00
503 5 0.00
504 32 0.00
505 17 0.00
506 40 0.00
507 32 0.00
508 84 0.00
509 139 0.01
510 60 0.00
511 49 0.00
512 118 0.01
513 85 0.00
514 19 0.00
515 19 0.00
516 119 0.01
517 71 0.00
518 69 0.00
519 72 0.00
520 81 0.00
521 220 0.01
522 326 0.01
523 231 0.01
524 159 0.01
525 140 0.01
526 321 0.01
527 142 0.01
528 369 0.02
529 491 0.02
530 263 0.01
531 710 0.03
532 287 0.01
533 397 0.02
534 698 0.03
535 838 0.04
536 1239 0.06
537 1321 0.06
538 1399 0.06
539 1235 0.06
540 1506 0.07
541 1174 0.05
542 1438 0.06
543 1477 0.07
544 1033 0.05
545 276 0.01
546 619 0.03
547 384 0.02
548 34 0.00
549 63 0.00
550 82 0.00
551 112 0.01
552 21 0.00
553 16 0.00
554 14 0.00
555 15 0.00
556 20 0.00
557 31 0.00
558 19 0.00
559 17 0.00
560 17 0.00
561 34 0.00
562 28 0.00
563 25 0.00
564 24 0.00
565 22 0.00
566 25 0.00
567 29 0.00
568 33 0.00
569 21 0.00
570 12 0.00
571 19 0.00
572 33 0.00
573 17 0.00
574 22 0.00
575 31 0.00
576 37 0.00
577 20 0.00
578 13 0.00
579 21 0.00
580 44 0.00
581 24 0.00
582 29 0.00
583 30 0.00
584 36 0.00
585 15 0.00
586 21 0.00
587 27 0.00
588 27 0.00
589 26 0.00
590 31 0.00
591 15 0.00
592 28 0.00
593 24 0.00
594 49 0.00
595 41 0.00
596 19 0.00
597 45 0.00
598 21 0.00
599 14 0.00
600 11 0.00
601 16 0.00
602 18 0.00
603 16 0.00
604 17 0.00
605 47 0.00
606 15 0.00
607 42 0.00
608 43 0.00
609 17 0.00
610 9 0.00
611 4 0.00
612 16 0.00
613 1 0.00
614 3 0.00
615 15 0.00
616 83 0.00
617 13 0.00
618 19 0.00
619 1 0.00
620 3 0.00
621 2 0.00
622 5 0.00
623 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (538 bp):
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
TTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCT
TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT
TAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCAGTTCA
AATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAA
ACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAA
TTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
TGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTC
ATAAAAGCTTATTCAAAA
Found at i:84402 original size:137 final size:137
Alignment explanation
Indices: 84156--84414 Score: 319
Period size: 137 Copynumber: 1.9 Consensus size: 137
84146 CGAATAGATT
* * * *
84156 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATCAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
1 TGACTATTTGAACAAATATCAATTTAAAGTCATAAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
* *
84221 TCAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTCAAAAATTAAAAAG
66 TCAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAAAAAG
84286 CAAGTTA
131 CAAGTTA
* * * *
84293 TGACTATTTGAATAAATATCAATCTTAAA-TCATTAAGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTA
1 TGACTATTTGAACAAATATCAAT-TTAAAGTCA-TAAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA
* * * * *
84356 TTTC-TTATCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
64 TTTCAGT-TCATAAAAACTTATCTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA
84415 CTTAGTAAGA
Statistics
Matches: 103, Mismatches: 15, Indels: 8
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
136 6 0.06
137 87 0.84
138 10 0.10
ACGTcount: A:0.42, C:0.12, G:0.05, T:0.40
Consensus pattern (137 bp):
TGACTATTTGAACAAATATCAATTTAAAGTCATAAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
TCAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAAAAAG
CAAGTTA
Found at i:84744 original size:491 final size:486
Alignment explanation
Indices: 83797--84778 Score: 1172
Period size: 494 Copynumber: 2.0 Consensus size: 486
83787 TAGTTTAAAT
* * *
83797 AGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATCTTTATTTCATCATAAAACAA
1 AGTTATGACTATGTGAACAAATATCAATCTTAAATCATTAAGATCTTTATTTCATCATAAAACAA
* * * *** *
83862 TTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
66 TTATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
* * * *
83927 AATAAGAGATTTAAAAAATATATGTATTTACGAACCAATTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAA
131 AATAAGAGATTAAAAAAATAAATGCATTTACGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
* * * * *
83992 TTATCTACTTCAAATCGTTTGGACTTGTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAG
196 TTATCTACTTCAAATCATTTGAACTTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCAAACAAG
* *
84057 CTTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAA
261 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAA
* * *
84122 AAAAAACTATTTATCGAACAAGTTCGAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTC
326 AAAAAACTATTTATCGAACAAATTCGAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATC
*
84187 ATCAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAAT
391 ATCAGACCTTTTGTTTTACCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATC----A-AAAAT
84252 AATACTACTTTATTAATTTTCAAAAATTAAAAAGCA
451 AATACTACTTTATTAATTTTCAAAAATTAAAAAGCA
* * * *
84288 AGTTATGACTATTTGAATAAATATCAATCTTAAATCATTAAGATCTTTGTTTTC-TCATAAAATA
1 AGTTATGACTATGTGAACAAATATCAATCTTAAATCATTAAGATCTTT-ATTTCATCATAAAACA
* * *
84352 ATTATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAACT
65 ATTATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAT
* * * *
84417 TAGTAAGAGACTTAAAAAAAATAAATGCATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTGTTAGA
130 TAATAAGAGA-TT-AAAAAAATAAATGCATTTAC-GAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGA
* * * * * * * *
84482 ATAATT-TTTAATTTCAAATCATTTTAACATT-TTGTTTAGTCATAGAATAATTGTTTCAGTTCA
192 ACAATTATCT-ACTTCAAATCATTTGAAC-TTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCA
* * *
84545 AACAAGCTTACTT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAGAG
255 AACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAG
* * * *
84609 ATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTTGAATA-TTTATGA-TGATTTGAACAATTAT
319 ATTT-AAAAAA-AAA-CTATTTATCGAACAAATTCGAATAGATT-TGACT-ATTTGAACAATTAT
* * * *
84672 CAATTTAAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGCCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA
379 CAATTTAAAATCATCA-GACCTTTTGTTTTACCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTA
*
84735 TGCAAAATAAAATAATACTA-TTGTATTAATATTTCAAAAGTTAA
443 T-C---A-AAAATAATACTACTT-TATTAAT-TTTCAAAAATTAA
84779 TAAGAGATTT
Statistics
Matches: 419, Mismatches: 56, Indels: 26
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
491 116 0.28
492 6 0.01
493 18 0.04
494 131 0.31
495 12 0.03
496 58 0.14
497 70 0.17
498 8 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (486 bp):
AGTTATGACTATGTGAACAAATATCAATCTTAAATCATTAAGATCTTTATTTCATCATAAAACAA
TTATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
AATAAGAGATTAAAAAAATAAATGCATTTACGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
TTATCTACTTCAAATCATTTGAACTTGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCAAACAAG
CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAA
AAAAAACTATTTATCGAACAAATTCGAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATC
ATCAGACCTTTTGTTTTACCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCAAAAATAATAC
TACTTTATTAATTTTCAAAAATTAAAAAGCA
Found at i:84748 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 84288--110293 Score: 9061
Period size: 181 Copynumber: 143.4 Consensus size: 181
84278 TTAAAAAGCA
* * * * * * * *
84288 AGTTATGACTATTTGAATAAATATCAATCTT-AAATCATTAAGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* *
84351 AATTATTTCT--TATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTA
65 AATTGTTT-TAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * *** * *
84412 AAACT--T-AGTAAGAGACTTAAAAAAAATAAATGCATTT-GCTGAACCAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGA-TT-TAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * * *
84466 AGTTAAGACTGTTAGAATAATT-TTTAATTTCAAATCATTTTAACATTTTGTTTAGTCATAGAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** *
84530 AATTGTTTCAGTTCAAACAAGCTTACTT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * **
84594 ATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTTGAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
84648 ATTTATGA-TGATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGCCAT-AAAC
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* *
84710 AATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACT-ATTGTATTAATATTTC-AAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAA
*
84773 AGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AA-------AT----CAA-TTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
84810 AATTATGGCCATTTAAATAACTATCTATTTCAAATTGTTATTA-CTTTTGGTTTTTTCCTAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
84874 AATTGCTTTTCA-AT-ATAGAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAG
65 AATTG-TTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * *
84937 AA-T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * *
84987 AGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
85051 ATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * *
85114 TAATAACTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTATTT-GCTAAACTAGTTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* ** * * *
85165 AGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTCTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * ** *
85229 ATTGTCTTCGTTAATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA
* * * * * * * *
85294 TTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTA-CTAAACCATTTTAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
85346 AGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTCTAATCATTAT-AACTTCTTATTTTG-CATCAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAC
** * ** **
85409 AATTGGTCCTA-TTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATA-TTCTAAA
65 AATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* ** * * * * ** * *
85472 ACTTAATAACCAAAAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACAAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * **
85526 AGTTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATGACCCTTTTCTTTTGTTGTAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *** * * * * **
85590 TAATTATTTTA-TTCATACAAGCTT-TTTTTATTAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
85653 ATTAATAAATAAGATATTTAAAAATTAAATTTTTTTGTCGAATCAA-TTGAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
85706 GGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
85771 ATTGTTTTAGTTCA-ACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
85834 TAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAACGAACAAGTTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
85886 AGTTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** *
85951 ATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCACTAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AA
* * * ** *
86014 AA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTAAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** * * * *
86067 AATTAT-ACTCGTTTGAATGATTATTTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** *
86131 AATTGTTTTTTTATCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
65 AATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* ** *
86195 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTATTGAACCAA-TTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * *
86249 AGTTATGACTATTTAAACAATTATTTAATCTCAAGTCGTTAAGA--TATTTGTTTTGTCAAAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA
* *** *
86312 CAATTGATTTT--TATCATAGAAGCTTATT-TGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
64 CAATTG-TTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
86374 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTACAAAATAAATGTGTTT-TTGAGCTAA-TTCAAAT
126 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAC-AAGTTCAAAT
** * * * * * *
86429 AGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TAATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
86493 ATTTGTTTCA-TATCTTACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAA
65 AATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AA
* * *
86555 AAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
86611 AGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGACATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
86676 ATTGTTTTAATTCATAAAAGCTTATCCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
86741 TAATAAGCAAGAG-TTT--CAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAATTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * *
86789 TGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTGATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * * *
86853 ATTATCTGAATCCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATAAACATTCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
86918 TAATAAGCAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATC-AGTTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * *
86969 AATTAATGTC-ATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTT-TG----TTTG----GTCATATAAC
1 AGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * ** * *
87024 AATTGTTTTTGATT-ATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAA
65 AATTGTTTTAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* *
87088 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTTAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * ** * * * *
87142 AGTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTGAAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * ** *
87206 AATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * ** * *
87271 TTAATAATTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
87323 AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAGCA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * *
87381 ATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** * *
87444 ATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACTAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * **
87497 AATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *
87562 AATGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
87627 T-ATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAA-TTCAAAA
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * ** ** *
87673 AGTTATGACTAAATATTTCAAAAATTAATATAGATTT-AAA---AAAT-A-AATATG-TTTGT--
1 AGTTATGAC----TATTTGAACAATT-ATCT--ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ***** * ** ** *
87729 TAAACCAATTCAAAAAGTT-ATGACTATTTGAGCAATTATT-TATTTAAAATTGTTA-TTATTT-
59 TAAAACAATTGTTTTAGTTCAT-AC-A----AGC--TTATTCAAAATAAAA-TAATACTAATTTA
** * * * * * * * * * ****
87790 TTTCT-TTTCTTACAAAA-CAATAATTTA-TG--TT-CATAA-AAACTTATTCAAATTA-AAG-T
115 TTAATATTTC--A-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTT
87846 -AATACT
177 CAA-A-T
* * * * *** * * ** *
87852 ATTTTATTAATATTTTG-ACAATTAAT-AAGTAAAAAAT-TTTA-AAAATAAATATGTTTACTG-
1 A-GTTATGACTA-TTTGAACAATT-ATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCT---TTTGTTT--TGT
* * * * ** * * * *
87912 AACTAGATCAAATAGTCATGATTA-TTTGTATAAGTATTTATTTC-AAAT--GATTATGACCT--
57 CA-TAAAAC-AATTGT--T--TTAGTTCATACAAG--CTTA-TTCAAAATAAAATAAT-A-CTAA
** * * * * * * *
87971 TTT-TTTTTGTCATAAAAAATTATTTTAGTTCATATCAGCCTATTCGAAATAAACTAATAATAAG
111 TTTATTAATAT-TTCAAAAATTA-ATAAG-T-A-A-GAG---ATT-TAAA-AAA-T-A-AAT---
* * *
88035 TTATTAATATTCTAA-AAATT--AAT
159 TTGTT--TA-TCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
88058 AATTAAGA-GATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACA-AGTTTAAAT-A-ATTATGATTATT-
1 AGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTA-TT-TC-AA-ATCG-TT--ATGACCTTTTG-TT-TTG
* ** * * * * * * ***** * *
88118 TGA-AAAATTATCTATTTCAAATTGC-TATAACCTTTTGTTTTGTTACCAAATGAT-CT-TTTCT
56 TCATAAAACAAT-TGTTT-TAGTT-CATACAAGCTTAT-TCAAAATA--AAATAATACTAATT-T
* * * * * * * ***** *
88179 ATTCATATAAGCTTACTACAAA-TAA-AA-TAATACAATTTATTAATATTAAGACAATTACTAGG
114 ATT-A-AT-A--TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTA-AAAAATAAATTTGTTTA-T-CG
*
88241 TAA-AAGATTTAAAAAAT
169 -AACAAG--TT--CAAAT
** * ** * * * * *
88258 AAATATG--TTTTTCGAACACATTCAAATATTTGTCACTAT--TTGAAT-A-ATTATCTATT-TC
1 AGTTATGACTATTT-GAACA-ATT-ATCTA-TT-TCA-AATCGTT--ATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** * **** * *
88316 A-AATCATTACGATTTTTTGTTTTGTCATAAACTAATTTTTTTTGTTCATAAAAGCTTAT-CAAA
58 ATAA--A--ACAATTGTTT-TAGT-TCAT--AC-AA-GCTTATTCAAAATAAAA--TAATAC-TA
** * * * * * ** * ***
88379 ATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAA
110 ATTTATTAATA-T--TTCA--AAAATT--AATAAGTAAGAGA-TTTAA-A----AAATAAATTTG
* ** * * * *
88443 TCTATTTACCGAG--CGAGT
162 TTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** * ** * *
88461 TG-AAGTAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGATCTTTTGTTTTGTTA
1 AGTTA-T-G-ACT-A---TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** ** *
88525 TAAAACAATTATTTCTA-TTTATGCAATTTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
59 TAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
88589 CCAAAAATTAATAAGTTAGAGGTTTAAAAAATAAATTTATTCACCGAACAAGTTCAAAT
123 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
88648 AGTCATG-TTCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * **
88712 AATTATTTCTA-TTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * ** *
88776 GTTAATAAGT----GATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * ***
88825 A-TTCATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATGATTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * *
88889 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCCTAAATTAATAATATTATAAA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATT-TCAA
* * *
88953 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTT-GCGAAGCTAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
89009 AGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTCTAAACATTTGTTTAGTCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * **
89073 AATAT-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-GCCAAAA
65 AAT-TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * * *
89136 AATTAATAAATAAAAAATTTTTAAAAAT-AATTCTGTTTA-CAAAACAAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATT-TGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* ** * * * *
89191 AGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TACGACCTTTTATTTTATCATAGAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
** * * * * * **
89254 TGATTGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATGT-GAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* *
89318 AATTGAA-AAGATAA-AGATTTAAAAAATAACTTAGTTTATCGAATC--GCTTCAAAT
128 AATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAG-TTCAAAT
* * * * * * * * *
89372 AATTATGGCCATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
89437 ATTGTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCGAAATTAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
89500 TTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTATCG---AA--TC-AAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
89546 --TT-T---TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
89605 ATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * ***
89670 TGATAATTAAGAGATTTAAAAAA-CAATATGTTTGTCGAAGTCGTTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *** * * *
89720 AATTAAGACTATATGAGCAATTATCTATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *** * * *
89785 AATT-TTTT-TTATCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATATGTTAATCTTTCAAAA
65 AATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
89848 ATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* ** * * * * *
89901 ACG-TA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAC
1 A-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
89963 -ATTATTTT-GTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTAATAATA-TTCTGAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *
90025 ATTAATAACTAA-AGAAATTAAAAAATAAATTTCTTTTGTCGAACCAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTT-GTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* ** * * * *
90079 ATTTAAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCGTTGGTTTTAG-CATAAAA
1 AGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAA
* * * * * *** *
90143 TAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC
64 CAA--TTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * * *
90207 -AAAATT--TAA-CAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTA-CTTAACCAGTTCAAAT
125 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
** * *
90260 AACTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *** * **
90324 AATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * *
90388 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-GAA-ATGAGTTGAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA--AGTTCAAAT
* * * * *
90436 AGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATAGTTAT-AACTTGTTGTTTTGTTATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
90500 AACTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
90564 ATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAGTATGTTTATTGAAATAAATT-AAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCG-AACAAGTTCAAAT
* * * * * *
90616 AGTAATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATATAAGC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAC
* *** * ** * * * * *
90681 TTATTCAAAATAAAATAATACTAAG-TTATT-AATATTACAAA-AAT-C-AA-TAAGTAAGAGAT
65 -AATT--GTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAA-AATA-AAATAATACTAATTTA-TTA-ATAT
* * ** * * * *
90740 TTAAAAAATAAATCTGTTTGTTAAGCA-ACTTT---AAAT-AATTATGTCTATTCCAATAATTTT
122 TTCAAAAATTAA----TAAG-TAAG-AGA-TTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-TCGAACAA-GTT
***
90800 CTTTT
177 CAAAT
* ** * * * * *
90805 TGAAATTG-CTA--T-AAC-CTTTTGTTTTGTCATAA-C---ATGA--TTTTTTTTTGTTCAT--
1 AGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAA
* * * *
90857 -ACAA--G-TTTA--T--TGCAA----A-T-AAAATAATAA-AA-ATTTATTAATATAA-A----
62 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA-AATAATACTAATTTAT-TAATATTTC
* * * * * * *
90901 GATACTTAATATGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATAAGTTCAAAT
125 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * *
90958 -CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTATTTTGTCGTAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAA
* * * ** *
91020 CAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAC
64 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
91084 AATTAATAAGAAAAAGATTTAAGTAAA-AAATATGTTTTTCAAACAAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
91138 AGTTCTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** * * *
91203 ATTATTTTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATAC---------CA-ATTCCAAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * ** * *
91258 TAATGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATTTGTTTATTAAACATGTTTAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
91309 AGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTCGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** *
91374 ATTGGTTCTA-TTCATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAA
66 ATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* * * ** *
91436 AATCAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTTAACACGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTG-TTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
91490 AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAACCA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *** *
91555 ATTG-TTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAA
66 ATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *
91619 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAATATAAATCTAG-TTA-CCAAGCGAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * *
91672 AG-T-TGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTCTCATGAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * *
91735 ATTGTTTCTA-TTCATATGAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA-TTCTTAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * *
91798 ATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCATCGAACAAGTTTAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
91851 AGTCAT-ATCCATTT-AAGATATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAA
1 AGTTATGA-CTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * **
91914 CAATTGTTTCTA-TTCATACAA-ATTATTCAAAATAAAATAATAGAAATTTATCAATATTTTGAA
64 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * ** *
91977 AA-T--TAAG-AAAAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCCGTTCTAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* *
92027 AGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAAACGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAA
* *** * * * * * * *
92090 AAATTGTTTATA-TTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTA-TTCTAA
64 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
* * ** *
92153 AAA-T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * *
92204 -GATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT
1 AG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
92268 AATTTTTTTCAGTTCACACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAA
65 AATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
** * * *
92332 ATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * *** *
92386 AGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
92450 AATTGTTTCAGTTCATA-AATGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *** *
92514 ATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAA-AAGTTAGTTTATTGAATTGGTTTAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * ** * * *
92566 AATT-TTAGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAAT
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
*** * * * *
92630 AATTGTTTTTCATCATAAAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
92694 TTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C---CAA--AC-CA-
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
92738 A---CT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
92799 ATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
92864 TAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAA-TTTAAAC
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * ** * * *
92915 AATTAAGACTATATGAATAGCTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * **
92980 ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTTTTGAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* ** * * * ** *
93045 TAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCAAATTATTTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * *** * * * * *
93092 AATTAT-AGCCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGATATTACCCTTT-TTTGGTCATATAAC
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * *** * *
93155 AGTTATATTT-G-AAACTTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTTCAAA
65 AATTGT-TTTAGTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
93218 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATACTTATTTACCAAACTA-TCTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGT-TCAAAT
* * ** * * * * *
93272 AGTTATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTTATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
93337 ATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* ** **
93402 TAATAACTAAGAGAATTT--AAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
93451 ATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** *** *
93516 TGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA
66 -ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
93580 ATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTT-AAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
93632 AATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * ** *
93697 AATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTC-GAATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTTGAATA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
93760 TTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
93808 AGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
93873 ATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** *
93938 TAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACTAA-ATCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAC-AAGTTCAAAT
* * * * * * *
93988 AATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA-A
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * *** * *
94052 ATTGTTCCAGTTCATATATGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
** *
94117 TAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACATA-TTTAAAT
131 TAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA-AGTTCAAAT
* * * * * *
94168 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
94233 ATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-AAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-A
* *
94295 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATAAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* ** * * * *
94348 CA-TTATGACTATATGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 -AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * *
94412 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
94476 ATTAATAAGTAAAAGTTTTTAAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAACAAATTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAG-ATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
94531 AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATCATAATGACCTTTTTTCTTTTGTAATAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * * * * * *
94596 CAATTGTTTCAGTTCATGTAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
94660 AATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTA-CTAAAAAAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
94714 AGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * *
94779 ATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTCCGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAA
66 ATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
94842 CTTAGTAAG-AAAAAATTTTAAAAATAAATCTATG-TTCT-GAACAAATTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
94894 AGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * *
94959 ATTGATTTT-GTTCATAAAAGCTTATT-TGAATAAAATAACACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAA
66 ATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAA
* * * **
95021 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGTGAA-TTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGA-ACAAGTTCAAAT
* * * * ** * * *
95074 AGTTATTATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * *
95139 ATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * * * * * **
95203 TTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAGC
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
95255 AGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTGAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA-A
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** *
95319 ATTTGTTTTA-TTCATGCAAAATTATTCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
66 A-TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
95382 TTAATAAG--AG-G-TTTAAAAACTAAATTTGTATA-C-AAAATTAGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA--AGTTCAAAT
* * * *
95430 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * ** * *
95494 ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCCTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
95558 TTAATAAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTAAACTAA-TT-GAAT
130 TTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAAC-AAGTTCAAAT
* * * ** *
95610 AGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
95675 AATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-TTTGTATTAACA-TTCAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAA
* * * *
95738 ATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAGAAATAAATCTGTTTATCAAACAAG-TCAAAT
129 ATTAATAAGTAAG-AGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
95792 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTGTATCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
95857 TTTGTTTTAATTCATTA-AAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * ** *
95921 TTGAGAAGTTAA-AGATTTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAAGCAA-TTC-AAT
130 TTAATAAG-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * *
95973 AATTATTG-GTATTTGAACAATTATTTGTTTCAAAATCTTTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAA
1 AGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
** * * *
96037 ACAATTGTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCTAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAA
63 ACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
96102 AAATTAATAAGTAGGGGATTTAAAAAATAAATATGCTCA-CAGAACTAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * *
96157 AGTTATGACTATTTGAGCAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * * * *
96222 ATT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAA
66 ATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
* * * * *
96285 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCTAACCAA-TTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * *
96338 AGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *
96403 AATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-TAAAA-
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
96466 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAATC-A-TTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * *
96513 AGTTATAACAATTTTGAACCACAATTATTTATTTTCAAATCGATTATAACCAATTGTGTTTTGGT
1 AGTTATGACTA-TTTG-A--ACAATTATCTA-TTTCAAATCG-TTATGACC--TTTTGTTTT-GT
* * * * * * * * *
96578 -ATAAAATAATT-TTTCTATTTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAACTTTGTTTAA
57 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTT-ATTAA
* * * * * *** * *
96641 TA-TCCTAAAAATTAACAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAA-TACAAA
119 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAA
96703 T
181 T
* * * * * *
96704 AGTTATAACTGTTTAAATAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTGT--TACAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAA
* ** * ** * *
96765 CAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTAATT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTTATTAATA-TTCCA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAA-TTTATTAATATTTCAA
* * * **
96827 AAATTAATAAGTAATAGA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCGATTAAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * *** * * *
96881 AGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTTAAATTACTATAACCTTTT-TTTTGTCACAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
96945 ATTTTTTCTA-TTCCTAACAAGCCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AG
66 ATTGTTT-TAGTTCAT-ACAAG-CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-
* * * * * *
97007 ACAACA-AAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAAT
126 A-AA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* ** *
97064 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * * * ****
97129 ATTGTTTT-GTTCATAAAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
97193 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCTAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * *
97244 AGTTATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
97308 ATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
97373 TAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTATTGAACAAGCTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
97424 AGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * *
97489 ATTGTTTCTA-TTCATA-AAATTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * * *
97550 TTAATAGGTAGGAGACTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** **
97601 AGTCATG-TTCATTTGAA-AATTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAA
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * ** * * **
97664 CAATTATTTCT-GTTCATA-TAGAATTATTTAGAATAAAATAATACCGATTCATTAAGATTTTGA
64 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * *
97727 AAATTAATAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
97778 AGTTAAGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *
97842 ATTGTTTCT-TTTCGTTATAAGCCTATTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAA
66 ATTGTTT-TAGTTC-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* *** ** *** * * * *
97902 A-T-A-AA-T--GAGTTTTTCCAAACCAATTCAAATAAT-TAA-AACTATTAGAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCGAACAAGT-TCA-AAT
* * * *** * * ** ** *
97950 AATTAT--CTATTT-CA-AATTGTTCTA--TCCTTTTGTTTAGTCAACAAACAATCATTTCAGTT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCG-TTA-T-GAC---CTTTTGTTT-TG-T
* * * *** * ** * * *
98009 TATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATT-AAAATTCAAAA-AAT--TAA-TAA
57 CATA-AAAC-AATT--GTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAA-T-AAAATAATACTAATTTA
** * * ** ** * * * * *
98068 GCAAGAGATTT-AAAAA--AAAAAGTTTATCA-A-ACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTCAAC
115 -TTA-ATATTTCAAAAATTAATAAG--TAAGAGATTTAA---AAAATAAAT-TTG---T-TTATC
* * *
98128 AATTATCTATTTCAAAT
168 GA--A-CAAGTTCAAAT
* ** * * * * * * * * *** *
98145 TGTTATTCCTTTTTG----TTTAGTC-ATATAAGAATTGTTTTTTATCATACAAG-GTTGTTCA-
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCA-AATCG-TTATGA-CCT-TTTGTTTTG-TCAT
* ** ** * * * * * **
98203 AAATAAAATAATACTAATTGAT-TAATC-T-TTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
60 AAA-ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAATAA-TACTA-ATTT-----AT
* * * * *
98264 AAATCTGTTTACCAAACCAATTCACAT-AGTTGAACA-ATTGTATACTTCAAATTAATTAT-TTT
116 TAA--TATTT--CAAA--AATT-A-ATAAG-T-AAGAGATT-TA-A---AAAATAAATT-TGTTT
* *
98326 A---AA-AA-AT-AAAC
165 ATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * ** *** * **
98337 A-TTTTGCTCTATCAT-AAAAAAAAT-TATTT---AT-GTTTAT-ACAAGCTT-ATTTGAAATAA
1 AGTTATG-ACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * **
98393 AATAATAG---TA-ATC-TA-ATA--ATATTCTAAAA-ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTA
62 AACAATTGTTTTAGTTCATACA-AGCTTATTC-AAAATA-AAATAA-TACTA-ATTT----ATT-
* ** * * * * * * * *
98449 AATTTGTTTGCCGAACCAGTTTAA-ATAGTTAAGACTATATGAACAAT-TATCT-ATT-TCAAAT
117 AA--TATTT--C-AA--AAATTAATA-AG-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-
* * **
98510 C-ATTATGACCT
171 CAAGT-TCAAAT
* * * ** * * * ** ***
98521 -TTTCT-TCTATCATAAAACAA-T-T-T-TTTCAATTC-ATA-GTAGCTTATTCAG-AATAAAAG
1 AGTTATGACTAT--TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTT-TT--GTTTTGTCA-
* * * * * * *
98577 TAAAATGAATT-TATTAATATTTCA-A-AA-ATTAAT--AAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
59 TAAAA-CAATTGT-TT--TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA-A-A--T-AATACTAATT-T
** * * * * ** **
98636 ATT--TACCT-AACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAACATTATCACCTTTGGTTTTGTCAT
114 ATTAATATTTCAA--AAAT-TAATAAGTAAGA-GATTT-AA-AAAAT-AAATTT-G--TT-T-AT
** ** *
98698 AAAACAAATGTTTTTATT
167 CGAAC-AA-G-TTCAAAT
* ** * * * * * ** ** * *
98716 CA-TATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATAT-TAAT-ATTACAAAAATTAATAAGAG
1 -AGT-TATGACTATTT-G-A-ACAATTAT-CT-AT-T-TCAAATCGTTA-TGACCTT--T-TG-T
* * * * * * * * * ** ** * *
98778 ATT-T-AAAAAATAAAT-CTTT--TT-AT-CAAACCTGTTCAATAATTATCT-ATTTTAAATTGT
52 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTAT
***** * ** ** * **** * * *
98835 T-ATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA--AGCTTATCTAA-AA--T
116 TAAT-A--TTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTT
*
98893 AAAAT
177 CAAAT
* * * * ** * ** ** *
98898 AAAGTTGTATTAATATTTCAA-AAGTTA-ATAAGTAAGAGAT--TTAAAAAATAAATTAGTTTAC
1 --AG-T-TATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCA-A-ATCGTTATGACCT---TTTGTTT--
* * * * * *** * * * **** * *
98959 TAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCA-TTTAAACAA-CTATCTATTTCAAATTGTTGTTAT-CTT
54 T--GTCA--TAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGC--T-TA-TTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *** *** ** * * **
99021 TTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAATATAG-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
110 AT-TTAT-TAATATTTCAA---AAATT-AATA-AGTAAG-AGATT--TAA-AAAATAA-ATTTGT
* * *
99085 TTA-CTAA-TATTTC-AAT
163 TTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
99101 AATTAATAAGA-GATTTAAAAAAATAAAATTTGTTTAACAAACTAGTTCA--A---ATAG-TTAG
1 AGTT-AT--GACTATTT-GAACAAT--TATCTATTT--CAAA-TCGTT-ATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * ** * * * ** * *
99159 ACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAAT--TATT
56 TC-A-TAAAACAA-T-TGT-TTT--AGTTCATACAAGC-TTATTC-AAAATAAAATAATACTA-A
* * * * * *
99222 TTCTGGTTAAATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTAGTAATATTCTAAAAATTAATAA
111 TT-T-ATT-AAT-A---T-TTC--AA-AAATTAATA--AGTAAG--AGATT-TAAAAAAT-A-AA
* * * *
99287 TTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTAATTTGCTAAAGT
158 TT---TG-TTT-----ATCGAA-CAAGTT-C-AAA-T
* * ** * * *
99323 AGTT-TCAAATAGTTAAACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCGTTTGTTTTG
1 AGTTAT-GACTA-TTTGA--A------CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * *
99387 TCATAAAACAATTATTTTTCTTAATATAAG-TTGATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
56 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
99451 ATTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTT-GCTAAGCCATTTCAAAT
120 ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
99514 AGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * ** * * * *
99579 ATTAGTCCTA-TTCATACCATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAC
66 ATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * *
99643 TTAATAACCAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATAATTGTCGAACTAGTTTAAAT
130 TTAAT-A--AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * **
99696 AGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGTAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * *
99761 AATTGTTTTA-TTCATACAA-CTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* *
99824 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTGAATC-AGTTCATAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * ** **
99876 GGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCTGATATTTTGTTGAGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
99941 ATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * * * **
100005 TTAATAAGAAATAGATTTAAAGAAATAAATATGCTCA-CTGAACAAGTTTGAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
100058 AGTTATTACTATTTTAACAATTGT-TAATTTAAAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * ** * * * *
100122 ATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGGT-GGATTAAAATAATACCAATTTATTAATAATTACTAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAA
* * ** * ** *
100186 AA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
100239 AGTTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATATAAC
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
100303 AATTGTTCTT--TATCACACATGCTTATTCAAAACAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
65 AATTGTT-TTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* *
100366 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACCAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
100420 AGTTATGACTATTTAAATAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGATC-TATGTTTTATCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** * *
100483 AATTGTTTCT-GATCATAGAAACTTATTTCATTA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTTC-AA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * *
100545 AATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTCGAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGA-ACAAGTTCAAAT
** * * * * * *
100596 AGTTAAAACTA-TAGAATAATTATCTAATTT-AAATCATTCTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * *** *
100658 ATTTTTTTTCA-TATTTTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTT-AG
65 AATTGTTTT-AGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-
** * * *
100720 AAAATT-A-AA--AAG-G----AAATGAT-ATTATTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
126 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * ** * *
100767 AGTGATGACTATTTAAACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAATTGTTTTGACATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
100832 ATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT---A-AA-A-TAATTTCTTAATAATTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * *
100891 TAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTATAGAACAAATTCAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
100939 AATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCGTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
101004 ACTGTTTGAATTTATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
101068 TTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAGCGAATC-AGGTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
101120 AATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
101185 ATTGTTTT--TACATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * *
101248 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTGGTTTAAAG
131 TAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
101301 ATTTATAACTATTTGAACAATTGAAT-T-CTTCAAATCGTTATAACCTTTT-TTTCTATCATAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATT--ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAA
* ** * ** *
101363 ACAATTATTTCTA-TTCATACAAG-TTCATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCA
63 ACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * ** * * *
101426 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTCGTCAAACTAGTACAAAT
126 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * *
101482 AGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
101540 GTT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
101603 ATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAA-AAA-TTATTTATCTAACCAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
101654 AATTATGACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGCTATGACATTTTGTTTTATCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** * *
101719 AAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGCTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAA
65 AATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
101783 ATTAATAA-T--G-GATTTTAAAAATAAATCTCTTTATCAAACTAGTTTAAAA
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
** * * * ** ** * * * *
101832 AGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * ** * * ** *
101897 ATAATTTCTA-TTCATAAAAAATTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
101961 TTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTA-CCAAGCTAGATCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * *
102011 AGTTATGACTATTTGAATAAGTA-CTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * **
102075 AATTATTTTAGTTCATATC-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
102139 ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAAACAAGTTTAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * ** * ** **
102192 AATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTACAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATG
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
102257 ATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-ACGAATAAAATAATA-AAATTTATTAATA-TTAAGAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AA
* * * * * *
102318 AATTAATAGGTAAAAAATTTTAAAAATAAAATTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
** * * * * *
102372 CCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
102437 ATTGTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACA
66 ATTG-TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
102501 ACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
102554 CGTCT-TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGATCTTTTG-TTTGTAATAAAAC
1 AGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-
* * ** * * *
102617 CAA-TG-TTTAG-TCGTATAAGC-TATTTGAAA-AAAATAATAC--ATTCATGAATA-TTC-TAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
102673 ATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTCGTTTATCCAAACCATTTCCAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-CGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
102727 AGTTATGACTATCTAAACCAATTATCGATTTCAAAAACATTATGACATTTTTGTTTTTGTCATAA
1 AGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAC-CTTTTG-TTTTGTCATAA
* * ** * *
102792 AACATTTGGTTCT-GTT-ATGTAAGCTTATTTC--GATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC
62 AACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * *
102852 CAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTT-AAAAATAAATATGTTT-TCTTTAACACGTTCAAAT
124 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC--GAACAAGTTCAAAT
* * *
102908 AGTTATG-CTATTTAAATAA-TATCTATTTCAAAATC-TTATGGACCTTTCAT-TTTTGTGATAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTAT-GACCTTT--TGTTTTGTCATAA
* * * * * *
102969 ATCCCATTGTTTCTA-TTTATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTTATGTTATTCAACT-T
62 A-ACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATT-AA-TAT
** * * *
103032 TTCAAAAATTAATTCATA-TAAGCTATTGGGAATAAAGATGATACTAATTTATTATAATCCAA-A
122 TTCAAAAATTAA-T-A-AGTAAGAGATT-----TAAA-A-AATA--AATTTGTT-T-ATCGAACA
103095 A--T--AAT
173 AGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
103100 AATAAAAGA-GATTTAAAAAAATAATC-ATTTTACTAAA-CAAGTTTAAAT-A-ATTATGACTAT
1 AGT-TATGACTATTT-GAACAATTATCTA-TTT-C-AAATC--G-TT--ATGACCTTTTG--TTT
* * * * * * * * **** *
103160 T-T-A-AACAATTAATATATTTGAAATCCACTATAACCTTTGTTTTGCTATAAAAGAAT--T--T
54 TGTCATAA-AA-CAAT-TGTTT-TAGTTCA-TACAAGC-TT-ATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* *** * ** * * * * **
103218 TT-TT-GTATTTCATACAGGCTCAT-TTTCA-A-A-TAAAACAATACAAATTTATTAATATTAAG
112 TTATTAATATTTCA-A-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AA-ATAAATTTGTT--TATCGA-
*
103277 ACAAGTT-ATA-
170 ACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
103287 AG-TA-AAATATTTAAAAAATAATATGT-TTTCCGAATAAGTTCA--ACTTCATTATGACTATTT
1 AGTTATGACTATTTGAACAAT--TATCTATTT-CAAAT-CGTT-ATGAC--C-TT-T---TGTTT
* *** * ** ** ** * **
103347 TGTGCAATTATTTATTTCAAATTT-GTT-ATGACTTTTG-TT-TT-GTAATAAAACAAT--TGTT
54 TGT-C-ATAAAACAATT--GTTTTAGTTCAT-AC--AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** ** * *
103405 TCTATTCATACAAGTTTTATTCAGATTAGATAA-TACTA-ATTT-ATTAAT-ATTTTGACAATTA
112 T-TATT-A-A-TA-TTTCA--AAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG----TTT
* *
103466 ATAAGTAA-AAGATTTTAAA-
165 AT-CG-AACAAG--TTCAAAT
* * * * * * * * * *
103485 A--AATAAATATGTT-TACTAA--A-CAAGTTCAAATAGTCATGA-CTAATTATCTATT-TCAGA
1 AGTTATGACTAT-TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT--TT-TGTTTTGTC--A
* ** * * * * * * * ** *
103542 TCACAATGATCTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATAAGTTTGTTTAAACTAAAA
59 T-AAAACAAT-TGTTTTAGT--TCATACAA--G-CTTA-TTC--A-AA-----ATAAAATAAT--
* * ** * * *
103607 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAATAGAAATAAAAAATGAATCTATTTA
106 ----ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
* *
103671 CCGAATAAGTTCAAAT
166 TCGAACAAGTTCAAAT
** * * * * * * *
103687 AGTTATGACTAGCTAAACAATAATTTATTTCAAAACATTATCACCTTTTGTTTTGACATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *** * *
103752 ATTGATTCT-GTTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAA
66 ATTG-TTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* *
103814 AATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTAT-GAACACA-TTCAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTATCGAACA-AGTTCAAAT
* *
103867 AG-T-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA-AAAACC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-C
* * * * * *
103929 CATTGTTTTTA-TTCATAAAAGCTTAATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAA
65 AATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
103993 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTT-TTTA-CTAAGCGAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * *
104047 AGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** *
104112 ATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * ** * * * *
104175 TTTTATAATTTGGAGATTTAAAAAAT-AATTCTGTTTACCAAATAAGTTTAAA-
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
104227 CGATCATGTCCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCGTAAAA
1 AG-TTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* **
104291 CAATTGTTTTTA-TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
64 CAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * *
104355 AATT-A-AA--AAGAGGTTTAAAAACTAAATTTGTTTA-C-AAAATTATTTCAATT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA--AGTTCAAAT
* * * ** * **
104405 AGTTATGACTATTTGATCAGTTATCTATCTCAAATCACTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * ** * *
104469 ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * ** *
104533 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTAAACCAGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
104585 AGTTAAGACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAAG-CATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAAC
* * *** *
104649 AATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAAT-AAATAATACCCTTTTATTAACA-TTCAGAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAA
*
104712 ATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * *
104766 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
104831 ATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * *
104896 TGAGAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATC-AGTTAAAAT
131 TAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * ** * *
104947 AATT-TCG-CCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATATATTATGATCTTTTATTTTGTCAT-AAA
1 AGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** **
105009 CAAATGTTTTCA--TCATACAAGCTTATTTC-GCATAAAATAATACTAATGCATTAATATTTCAA
64 CAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * *
105071 AAAATAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAACTAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * *
105126 AGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
105191 AATT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATACAATATTACTAATTTAATAATATTAT-AAA
65 AATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA
** * *
105254 AATTAATAACCAAGAGATTTAAAAACTAAATTT-TTT-TGCTGAACCAA-TACAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-C-GAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * *
105308 AGTTAAGGCTATATGAATATTTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
105373 AATGTTTTCA-TTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA
66 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * *** * * *
105437 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** * * *
105485 AGTTAT-AATAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * **
105549 AATTGTTTCTA-TTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATACCT-AAA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
105611 AATTAATAAGTAACG-GATTTAACAAATGAATCTATTTGA-CTGACCAA-TACAAAT
128 AATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
105665 GGTTATAACTGTTTGAACAA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTATTAGAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * *
105728 AATTGTTTCTA-TTTGTACAAGCTGACTT-GAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAA
* * ** *
105790 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTATCGATTAAGTTCGAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** * *
105845 AGTTACT-ACTCTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
1 AGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
105909 AATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A
* * * * * * * *
105971 CAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAGT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
106026 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTT-TCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * ** *
106090 ATTGTTTT-TTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTAATTAATATTTTGACAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
106154 TAATGAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * ** * * * **
106205 TGTCATAACTACTTT-AGTAATTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAAC
1 AGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
106269 AATTGTATCAATTCATATAGGCTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACT-GTTTGAACAATTA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAA-AA--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA
* * * **** * *
106333 TTTATTTCAAATAGTT-ATGA-TATTTTATTTTATCATAAAA-CAATTTTTTCTATTC-ATACAA
118 -ATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGA-TTTA--A-AAAATAAATTTGTT-TA-TCGA-ACAA
106394 GTTTATTCAGAAT
174 G----TTCA-AAT
* * ** * * ** **
106407 AAACTAAT-ACTAATTT-ATTAA-TATTCTAGAAATT-AATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
1 --AGTTATGACT-ATTTGAACAATTA-TCT---ATTTCAA-A--T---CG--TTATGACCT---T
** * * ** ** ** * ** *
106468 TTG-TTTACCAAATAAATTCAAATAGTCAT-GTTCATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCATT
48 TTGTTTTGTC--ATAAA-AC-AATTGTTTTAGTTCA-TACAA-GCTTATTCAAAAT-AAA--ATA
* * * **
106530 ATGACCT--TTTATT-TTATAGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-TAA-TTATTTAGAATAA
104 AT-A-CTAATTTATTAATAT-TTCAAA-AA-----T-TA---ATA-AGTAAGAGATTTA-AA-AA
* * * * *
106590 A-ATAATATTGATTCAT-TAA-GATTTTAAA-
153 ATA-AAT-TTG-TTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** ** * *
106618 AATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACTAGCTCAAATAGTTATGACTTTTTG
1 AGTT-AT--GACTATT-TGAAC--AA-----TTAT----CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * *** * * * ** * * * * * *
106683 ATCAATTAT-ATATCTCAAATCGTTAT-GATC-T-TTA--TT-TTGCTATAGAACAATTAT-TTT
51 -T--TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-CAAAATAA-AATAATACTA
* * * * *
106740 TTTTCATATAAGCT-TATTCAGATTAAGA-TAAT-ACTAATTTA-ATAATAAAAAATAAATGTGT
110 ATTT-AT-TAA--TAT-TTCA-A--AA-ATTAATAAGTAA--GAGAT-TTAAAAAATAAATTTGT
*
106801 TT-TGCTGAACTAGTTCAAAT
163 TTAT-C-GAACAAGTTCAAAT
** * * ** *
106821 AGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTAGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * **
106886 ATTATTTTAGTTCATACAACCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAA-AACTCAAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * *
106950 TTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAAGAAATATGTTTATCGAACAAGCTT-AAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAG-TTCAAAT
* * * * * *
107003 AGATATGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
107068 AATTGTTTTAGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTAAAACAAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * ** * * * *
107133 TTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATATT-CCGAACCAGTTCAATT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-TTATCGAACAAGTTCAAAT
** * * * * * * *
107185 AGTTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAAT-TTTATGATC-TTTGTTTTTTCA-AAAA-A
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
107246 ATT-TGTTTATGATCATATAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAA
66 ATTGT-TTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* ** * *
107309 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATC-AGTTGAAAT
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
107363 GGTTAAGGCTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * *
107428 ATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGAAT-AAA-CAT--TAATTTATTAACA-TTCAAACAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AA
* * *
107488 TTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * ** * *
107541 AGTTATGATTATTTGAACAATT-T-TATTTGAAATTATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
107604 ATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTTCAAAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
107669 TTAGTAAGTAAGAAATTTAACAAAATAAATTAGTTTACCAAATC-AGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * *
107722 AATTAT-AGCCATTTGAAC-A--A---A-GT----T-GTTAAT-A-CTTTTCGTTTTGTCTTAAA
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAA
* * *
107772 ACAATTGTTTT--TTAACATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCA
63 ACAATTGTTTTAGTT--CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* ** * * * * * * *
107835 AGAA-T--T-AGTAATTGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAAT
126 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * *
107887 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-CATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * **
107951 ATTATTTCT-GTTCACACAAGTTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAA
66 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * *
108015 TTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCAAACTAGTTCAAAC
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
** * * * * * ** *
108067 AGTTAAAACTATATGAACAATCATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * ** * * *
108132 ATTATTTCAGCTCATATAAGTTTACTT-GGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
108196 TTTATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
108248 AATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATAGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-C
* * * * * ** **
108313 AATTTTTTTA-TTCACATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGAAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * *
108377 TTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTCAAAT
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
108429 AGTTTTGACTATTTGTAATAATTATATATTTTAAATCGTTATAACCTTTCGTTTTATCATCAAAC
1 AGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * * * *
108494 AATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCATAATGAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAA
65 AATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * * ** *
108558 CTTAATAACCAAGAAAATTT-AAAAATTAATCTAATTA-CTGAACCAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
108611 AATTAAGTCTATATGAACGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-
***** * *
108676 AAATT-TTTT--TTCATACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAA
65 -AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
108738 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACCAAACCAGTTC--AT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
108789 AGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-CTTTTGTTTAGTTATAAAAC
1 A-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
108853 AATTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATT-AGGAATACATTAATACTAATTTATTAA-AATTGAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
108916 ATTAATAAGAAAGATATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
108970 AATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** ** * *
109035 ATTGTTTCAGTTAATACATGCTTAAAC-GGATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAA-
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * **
109098 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTA-CTGAATC-GGTAAAAAT
131 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
109146 AATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTCTGTTATAAACC
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
109210 AATTGTTTT-TTATCAAACAAGCTTATTCGAAATATAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
65 AATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* *
109274 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAA-TAGTT---A-
129 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * *
109317 A---A--ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAAC
* * ** * * *
109374 ATTTGTTTCACATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATATATTAACA-TTCAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * * * *
109438 ATTAATAAGCGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAAT
129 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * *
109492 AGTTATGACAATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
109556 AATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
109621 TTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTCTA-CTAAATCAA-TTGAAAA
130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * *
109669 AATTTTGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
109734 ATTGTTTCAGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATAATAATAATTTATAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TT----CAAAATAA-AATAATACTAAT--T--TAT-TAAT
* * * * * * * *
109799 ATTCCTAAAATTAACAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATC-AGTTCAAAT
120 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
109861 AATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
*** * * ***
109926 ATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
*
109991 TAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-----C--A-
131 TAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
110034 A--T-T-CCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATCGTCATAATCTTTTGTTCT-ACTATAAAA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAA
* * * * * * * * * *
110093 TAATTGTTTCAGTTCACATATGCTTATGCGAAATTAAATAATATTAATTTAATAATATATTCAAA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAA
* * * ** ** *
110158 AATTAATAACTAAGAAATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAAC
128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * * * ** * * *
110213 ATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTTAAATTATTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** *
110278 ATAATTTCAGTTCATA
66 ATTGTTTTAGTTCATA
110294 GGAGGATCAA
Statistics
Matches: 19381, Mismatches: 4680, Indels: 3529
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
151 2 0.00
152 8 0.00
153 9 0.00
154 11 0.00
155 14 0.00
156 11 0.00
158 9 0.00
159 6 0.00
160 6 0.00
161 6 0.00
162 48 0.00
163 23 0.00
164 131 0.01
165 60 0.00
166 61 0.00
167 17 0.00
168 189 0.01
169 217 0.01
170 74 0.00
171 243 0.01
172 313 0.02
173 141 0.01
174 302 0.02
175 289 0.01
176 995 0.05
177 1407 0.07
178 875 0.05
179 1374 0.07
180 3176 0.16
181 3996 0.21
182 2012 0.10
183 796 0.04
184 356 0.02
185 214 0.01
186 111 0.01
187 82 0.00
188 97 0.01
189 40 0.00
190 81 0.00
191 59 0.00
192 159 0.01
193 58 0.00
194 62 0.00
195 66 0.00
196 70 0.00
197 65 0.00
198 55 0.00
199 72 0.00
200 69 0.00
201 74 0.00
202 64 0.00
203 83 0.00
204 62 0.00
205 72 0.00
206 72 0.00
207 54 0.00
208 45 0.00
209 24 0.00
210 29 0.00
211 31 0.00
212 27 0.00
213 13 0.00
214 1 0.00
215 10 0.00
216 28 0.00
217 15 0.00
218 16 0.00
219 32 0.00
220 20 0.00
221 19 0.00
222 11 0.00
223 9 0.00
224 7 0.00
225 3 0.00
226 13 0.00
227 3 0.00
228 7 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
Found at i:87697 original size:71 final size:71
Alignment explanation
Indices: 87613--87754 Score: 259
Period size: 71 Copynumber: 2.0 Consensus size: 71
87603 CTAATCTATT
87613 AATATTTCAAAAATT-ATAATAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAATTCAAAAAGTT
1 AATATTTCAAAAATTAAT-ATAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAATTCAAAAAGTT
87677 ATGACTA
65 ATGACTA
*
87684 AATATTTCAAAAATTAATATAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTTAAACCAATTCAAAAAGTTA
1 AATATTTCAAAAATTAATATAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAATTCAAAAAGTTA
87749 TGACTA
66 TGACTA
87755 TTTGAGCAAT
Statistics
Matches: 69, Mismatches: 1, Indels: 2
0.96 0.01 0.03
Matches are distributed among these distances:
71 67 0.97
72 2 0.03
ACGTcount: A:0.51, C:0.08, G:0.07, T:0.35
Consensus pattern (71 bp):
AATATTTCAAAAATTAATATAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAATTCAAAAAGTTA
TGACTA
Found at i:89069 original size:184 final size:181
Alignment explanation
Indices: 87737--97897 Score: 3972
Period size: 180 Copynumber: 56.7 Consensus size: 181
87727 GTTAAACCAA
* * * * *** * * *
87737 TTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTT-AAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTCTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-TGTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
87801 ACAAAACAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTC-AAATTAAAGTAATACTATTTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * * *
87865 TTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CTAG
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * * * * *
87918 ATCAAATAGTCATGATTATTTGTATAAGTATTTATTTC-AAATGATTATGACCTTTTTTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATG-TTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * *
87982 ATAAAA-AATTATTT-TAGTTCATATC-AGCCTATTCGAAATAAACTAATAATAAGTTATTAATA
65 ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
88044 TTCT-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAA-CAAG
128 TT-TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * * *
88098 TTTAAATAATTATGATTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
** ** * *
88163 CCAAATGATCT-TTTCTATTCATATAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-
66 TAAAACAAT-TATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
88224 TTAAGACAATTACTAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCGAA-CACA-
129 TTAA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTCCGAAGCA-AG
* * * * * ** ***
88278 TTCAAATATTTGTCACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTACGATTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * *
88342 AT-AAACTAATTTTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
65 ATAAAAC-AATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
88405 TCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCG-AGCGAG
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * * * *
88460 TTGAAGTAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGATCTTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * ** * * *
88525 TAAAACAATTATTTCTATTTATGCAATTTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
88590 CAAAAATTAATAAGTTAGAGGTTTAAAAAATAAATTTATTCACCGAA-CAAG
131 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TCCGAAGCAAG
* * * *
88641 TTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAGCTATTATCTATTTC-AAATGGTTAT-AACATTTTGTTTTG
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACA-TTTGTTTTG
* ** *
88703 TCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
63 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *** * *
88768 TTTCAAAAGTTAATAAGT----GATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACCAG
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
* * * * * **
88818 TTCAAATA-TTCATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATGATTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * *
88882 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCCTAAATTAATAATAT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATAT
* * * *
88947 TATAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGCGAAGCTAG
129 T-TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
* * * * * *
89002 TTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAATGTTCTAAACATTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * *
89067 TAAAATAA-TATTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAG
66 TAAAACAATTATTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * * * *
89130 CCAAAAAATTAATAAATAAAAAATTTTTAAAAATAATTCTGTTTACAAAACAAG
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
* * ** * * * *
89184 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TACGACCTTTTATTTTAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-ATGTTATAAACATTTGTTTTGT
* ** * * * * **
89247 CATAGAATGATTGTTTC-AGTTTATAAAAGCTTATGT-GAAATAAAATAATATTGCTTTATTAAT
64 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
89310 ATTTCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGATTTAAAAAATAACT-TAGTTTATCGAATC--G
127 ATTTAAAAAATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * *
89364 CTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATTTATTTC-AAATCGTTATAAACTTTTATTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * * * *
89428 CTTAAAACAATTGTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCGAAATTAAATAATAGTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
89491 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTT----ATCGAA-
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGC-AAG
* * * * * *
89541 -TC-AAT--TT-T---TATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * ** *
89597 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTT-TTTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * *
89660 TTCCAAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAACAATATGT-TTGT-CGAAGTC--G
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTATT-TCCGAAG-CAAG
* * * * * ** *** * *
89713 TTCAAATAATTAAGACTATATGAGCAATTATCTATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
89778 ATATAACAATTTTTTTTA-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATATGTTAATCTT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
89842 TCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CCAG
130 TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* ** * * * * * *
89894 TTCAAATACG-TA--ACTATTTGAACAATTGTAAACTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTAT
1 TTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * * * * *
89955 CATAAAAC-ATTATTT-TGTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATCTAATAATAT
64 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
90018 TCT-GAAAATTAATAACTAA-AGAAATTAAAAAATAAATTTCT-TTTGTCGAA-CCAG
129 T-TAAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAA--TCTATTT-CCGAAGCAAG
* ** * * * * * *
90072 TTCAAATATTTAAAAACTATATGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCGTTGGTTTTAG
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTT-G
* * * * * * * *
90136 -CATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATT
63 TCATAAAACAA-TTATTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * ** *
90199 AATATTT-CAAAATT--TAA-CAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTAA-CCAG
124 AATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
** * *
90253 TTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATAGTTAT-ATCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
90316 ATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** ** ***
90381 TTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATGAAATGAG
130 TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
* * * *
90429 TTGAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC-AAATAGTTAT-AACTTGTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACAT-TTGTTTTGT
* * *
90492 TATAAAACAACTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * ** ** *
90556 TTTCAATAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAGTATGTTTATTGAAATAAA
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * *** * * *
90610 TT-AAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * ** ** * * *
90674 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAG-TTATT--AATATTACAAA-AAT-C-AA-TAAG
66 TA-AAAC-AATT--ATTTCTATTCATAC-AAGCTTATTCGAA-A-TA-AAATAATACTAATTTA-
* * * ** * **
90732 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTTAAGCA-ACTTTAAATAATTATGTCTA-TTCC-AA-
122 TTA-ATATTTAAAAAATTAA----TAAG-TAAG-AGA-TTTAAA-AAATAAATCTATTTCCGAAG
* *
90793 TAATT
178 CAA-G
* * * * * **** * * *
90798 TTC---T--TTTTGA--AATTG--CTATAACCT-TTT-GTTTTGTCATAACATGATTTTTTTTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAA-A-CA-TTTGTTTTG
* ** * * * * ** ** * **
90852 TTCATACAA-GTTTATTGC-A--AATA-AA--ATAATAAAAATTTATTAATA-TAAAGATACTTA
63 -TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTA-TTA
* * * * *** * * ** *
90909 ATATGTAAAACATTTAAAAAATAA-ATTTG-TTTACTGAATAAGTTCAAATCTTATG-A-CTA-
125 ATATTTAAAA-AATTAATAAGTAAGA---GATTTAAAAAATAA-ATC-TAT-TTCCGAAGCAAG
** * * * * * *** *
90968 TTTGAATAATTAT--TTATTTCAA-ATTCTTAT-GACTTTCTATTTTGTCGTA-AAACAATTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA--ATTATCTA-TTTC-AAAATGT--TATAAACATTTGTT
* * * *** ** *
91028 TCTGTTCATACAAGC--TTA-TTCAAAT--TACAATAATATT---AATTTATTAATA-T--TTTG
60 T-TG-TCATA-AAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT-
** * * * ***** * *
91082 ACAATTAATA-AGAAAAAGATT--TAAGTAAAAAATAT-GTTTTTCAAA-CAAGTT-C-AA--AT
121 ---ATTAATATTTAAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTCCGAAGCA-
91138 AG
180 AG
* * * * * * * * *
91140 TTCTAACTA-TT-TGAATAATT-ATC---TA--T-TTT--AAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 TTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * * * *
91194 AATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATAC--------CAAT-
64 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * * *** * *
91249 TCCAAAAAA-TAATGAGTAAGAGAATAAAAAAATGAATTTGTTTATTAAACATG
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
* * * * ** *
91302 TTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTAT-GACATTTCGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTT-GTTTTGTC
* ** **
91366 ATAAAATAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *** *
91429 TTTGAAAAATCAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTTAA-CACG
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AA-ATCTATTTCCGAAGCAAG
* * * * * *
91483 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GACTTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAAC-ATTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
91547 ATAAACCAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
91612 TCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAATATAAATCTAGTTACC-AAGCGAG
130 T-AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTCCGAAGCAAG
* * * * * * *
91665 TTCAAATAG-T-TGACTATTTAAATAATTATTTATTTC-AAATCGTTATGATCTTTTGTTTTCTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * ** * * *
91727 ATGAAACAATTGTTTCTATTCATATGAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** *
91792 CT-TAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTCATCGAA-CAAG
130 -TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTC--CGAAGCAAG
* * * * * *
91844 TTTAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGATATTATCTATTTC-AAATCATTAT-GACATTTTGTTTT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACA-TTTGTTTT
* * * * ** *
91905 GTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-ATTATTCAAAATAAAATAATAGAAATTTATCAAT
62 GTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * **
91969 ATTTTGAAAA-T--TAAG-AAAAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAA-CCCG
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * *
92020 TTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAAACGTTAT-GACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * * * *
92083 ATAAAAAAAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTAT
65 AT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
92148 TCT-AAAAA-T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-
129 T-TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * *
92197 TTCAAAT-GATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * * * * *
92260 CATAAAATAATT-TTTTTCAGTTCACACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAC
64 CATAAAACAATTATTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * * *
92324 A-TTCAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAG
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* ** ** * * * *
92379 TTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * *
92443 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AATGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** ***
92506 TTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAA-AAGT-TAGTTTATTGAA-TTGG
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * *
92559 TTTAAATAATT-TTAGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * *
92623 ATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATAAAAGCCTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-
65 ATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
92685 TTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC--A--AA-
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * *
92735 --C-CA-A---CT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
92792 TAAAATAATT-GTTGTAGTTCATATAAACTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTAATAATAT
66 TAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
92855 TCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAA-
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * ** * * *
92908 TTTAAACAATTAAGACTATATGAATAGCTATCTATTTC-AAATCATTA-AGACCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATA-AACATTTGTTTTGT
* * * * *
92971 CATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATG
64 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *** *
93035 TTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATTTACC-AAATTAT
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * *** * * * * *
93085 TTCAAATAATTAT-AGCCATGCCAACAATTATCTATTTC-AAATCGATATTACCCTTT-TTTGGT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * ** * * * *
93147 CATATAACAGTTATATT-TGAAAC-TTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
64 CATAAAACAATTAT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
93210 CTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATA-CTTATTTACC-AAACTA-
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TATTT-CCGAAGCAAG
* * ** * * * * *
93264 TCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTC-AAATCCTTATAACCTTTTGTATTGT
1 T-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * * *
93328 TATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
64 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * **
93393 TCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTT--AAAA-AAATTTGTTTGCCGAA-TTAG
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * *
93444 TTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
93509 TAAAA-TATGTTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATA
66 TAAAACAAT-TATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * *
93572 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAA-CTAG
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * *
93626 TT-AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTC-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
93689 ATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCG-AATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATAT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATAT
** * * * * *
93752 TTTGAATATTAAT---CAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAG
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * *
93801 TTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTTATTTC-AAATCGTTAT-GACTTTTTGTTTTAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAAC-ATTTGTTTTGT
* * * * * * * *
93864 TATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATT-TAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
93928 TTTCAACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAA-CTAA-
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGC-AAG
* * * * * * * *
93981 ATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTC-AAATCGTTAT-GACATTTTATTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACA-TTTGTTTTGT
* * * * * *
94044 CATAAAA-AATT-GTTCCAGTTCATATATGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * *** *
94107 ATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACATA-
128 TTTAAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCA-AG
* * * * * * *
94161 TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-GAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * *
94225 ATAAAAGAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TAAAAAAAATAATACAAATTTATTAATA-T
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
94288 TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAG
130 TAA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* ** * ** * *
94341 TTCAAATCA-TTATGACTATATGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTAT-GACTTTTTGTTTTGT
1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAAC-ATTTGTTTTGT
* * * *
94404 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
64 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
94469 TTCAACAATTAATAAGTAAAAGTTTTTAAAAAAATAAATATGTTTACAGAA-CAAA
129 TTAAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTT-AAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * * *
94524 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTACTTC-AAATCATAATGACCTTTTTTCTTTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAAC--ATTTGTTTTG
* * ** * * * *
94588 TAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATGTAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAA
63 TCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * * * **
94651 TATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAAAAAG
126 TATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTCCGAAGCAAG
* * * ** * * *
94707 TTCAAATAGTTTTGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTAT-GACTTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAAC-ATTTGTTTTGTC
* ** * *
94771 ATAAAATAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTCCG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATA
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
** * * * * * * *
94834 TTCCAAAACTTAGTAAG-AAAAAATTTTAAAAATAAATCTATGTTCTGAA-CAAA
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTCCGAAGCAAG
* * * *
94887 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAATCTATTTC-AAATCGTTAT-GACTTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAAC-ATTTGTTTTGT
* * * * * *
94950 CATAAACCCATTGATTT-TGTTCATAAAAGCTTATTTG-AATAAAATAACACTAATTTATTAA-A
64 CATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *
95012 CTTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCG-AGTGAA-
128 -TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAG-CAAG
* * * * * * * *
95067 TTCAAATAGTTATTATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * * *
95132 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTT
66 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** * *
95197 TAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAA
131 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* ** * * * * * * *
95248 TTTAAGCAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTT-GAAATCGTTAT-GACATTTTATTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACA-TTTGTTTTGT
* * **
95311 CATAAAA-AATT-TGTTTTATTCATGCAAAATTATTC-AAAGTAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 CATAAAACAATTAT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * ***
95373 ATTT-CAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAG
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
* * ** *
95423 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTC-AAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * ** *
95486 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCCTATTC-AAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATAT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
95550 TTTAAAAATTAATAAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACTAA-
129 TTAAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGC-AAG
* * * * * * * **
95604 TT-GAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTTC-AAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGT
* * * * * *
95667 CATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-TTTGTATTAAC
64 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAAT
* * * * * *
95730 A-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAGAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAG
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAA-AAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * *
95786 -TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATTGTTATAACCTTTTGTTGTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-TGTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * *
95849 ATAAAACATTTGTTT-TAATTCATTA-AAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTATTTCT-ATTCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * **
95912 TTTCAAAAATTGAGAAGTTAA-AGATTTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAAGCAA-
128 TTTAAAAAATTAATAAG-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTA-TTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * *
95967 TTC-AATAATTATTG-GTATTTGAACAATTATTTGTTTCAAAATCTTTTATAATCTTTTGTTTTG
1 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA--TGTTATAAACATTTGTTTTG
* * * * * *
96030 TCATAAAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCTAAATAAAATAATGCTAATTTATTAAT
63 TCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
96095 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGGGGATTTAAAAAATAAA--TATGCTCACAGAA-CTAG
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTC-C-GAAGCAAG
* * * * *
96150 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATATATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * *
96214 ATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATA-T
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
96278 TATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCTAACCAA-
130 TA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * *** * * * *
96331 TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * ** * * * * *
96396 TAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
96461 -TAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAATC-A-
131 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * *
96506 TTCAAATAGTTATAACAATTTTGAACCACAATTATTTATTTTC-AAATCGATTATAACCAATTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTA-TTTG-A--ACAATTATCTA-TTTCAAAAT-G-TTATAAAC-ATT-T
* * * * * *
96570 GTTTTGGT-ATAAAATAATT-TTTCTATTTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAACT
57 GTTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-T
* * * * * *
96633 TTGTTTAATATCCT-AAAAATTAACAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTG-ACC
119 TT-ATTAATAT-TTAAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TCC-GAAGC
96695 AA-
179 AAG
* * * * * * * * *
96697 TACAAATAGTTATAACTGTTTAAATAATTATCTGTTTCAAAGTGTTATAACCTTTTG-TTTGT--
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
96759 TACAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTAATT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTTATTAATA
66 TA-AAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-CTAA-TTTATTAATA
** * * * * **
96822 -TTCCAAAATTAATAAGTAATAGA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCG-ATTAAG
128 TTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * ** * *
96874 TTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTTAAATTACTAT-AACCTTTTTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * * * *
96938 CAAAATAATTTTTTCTATTCCTAACAAGCCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATA
66 TAAAACAATTATTTCTATTCAT-ACAAG-CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * **
97002 TTTAGACAACAA--AATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAG
128 TTTA-A-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * ***
97057 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC-AAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
97121 ATAAAACTATTGTTT-TGTTCATAAAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
**** * * * * * *
97185 TTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAAG
130 TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * *
97237 TTCTAATAGTTATAACTACTTGAATAATTATCTATTTC-AAATGTTATGACCTTTTGTTTCGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
97301 TAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * **
97366 CAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTATTGAA-CAAG
131 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * *
97417 CTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTC-AAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* ** * *
97481 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAATTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAAAATT
65 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
97544 CT--AAAATTAATAGGTAGGAGACTT-AAAAATAAATATGTTTACC-AAATAAA
130 -TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * *
97594 TTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAA-AATTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGT
** * * * * ** * *
97657 TGTAAAACAATTATTTCTGTTCATA-TAGAATTATT-TAGAATAAAATAATACCGATTCATTAAG
64 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * *
97720 ATTTTGAAAATTAATAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATC-AAACTAG
127 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-CCGAAGCAAG
* * * * * * * * *
97771 TTCAAATAGTTAAGACTTTTTGAATAATTATATATCTC-AAATCATTATGATC-TTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAAACATTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
97834 ATAGAACAATTGTTTCTTTTCGTTATAAGCCTATTC-AGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
65 ATAAAACAATTATTTCTATTC-ATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
97898 AAAAATAAAT
Statistics
Matches: 7687, Mismatches: 1729, Indels: 1132
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
156 1 0.00
157 1 0.00
158 18 0.00
159 6 0.00
160 4 0.00
161 13 0.00
162 17 0.00
163 8 0.00
164 8 0.00
165 3 0.00
166 1 0.00
167 16 0.00
168 158 0.02
169 117 0.02
170 16 0.00
171 60 0.01
172 24 0.00
173 28 0.00
174 40 0.01
175 174 0.02
176 454 0.06
177 698 0.09
178 214 0.03
179 520 0.07
180 1825 0.24
181 1670 0.22
182 678 0.09
183 419 0.05
184 245 0.03
185 115 0.01
186 47 0.01
187 17 0.00
188 7 0.00
189 4 0.00
190 37 0.00
191 24 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATAAACATTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTCCGAAGCAAG
Found at i:89683 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 89382--89688 Score: 413
Period size: 169 Copynumber: 1.8 Consensus size: 168
89372 AATTATGGCC
* * *
89382 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTCA
1 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTATTCTGTCTTAAAACAATTGTTTTCA
* * * * *
89447 TCATACAAGCCTATTCGAAATTAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
66 TCATACAAGCCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG
89512 AGATTTAATAAATAAATCTATTTATCGAATCAATTTTT
131 AGATTTAATAAATAAATCTATTTATCGAATCAATTTTT
* * *
89550 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGT-TATAAAATAATTGTTTT-
1 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTATTCTGTCT-TAAAACAATTGTTTTC
* * * * *
89613 AGTTCATATAAGCTTTTTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAAT
65 A--TCATACAAGC-CTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
89677 TAAGAGATTTAA
127 TAAGAGATTTAA
89689 AAAACAATAT
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 16, Indels: 7
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
167 2 0.02
168 55 0.46
169 58 0.49
170 4 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.06, T:0.43
Consensus pattern (168 bp):
ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTATTCTGTCTTAAAACAATTGTTTTCA
TCATACAAGCCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG
AGATTTAATAAATAAATCTATTTATCGAATCAATTTTT
Found at i:93647 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 93621--93675 Score: 60
Period size: 18 Copynumber: 3.1 Consensus size: 18
93611 TATTTACCTA
*
93621 ACTAGTTAAATAATTATG
1 ACTATTTAAATAATTATG
*
93639 ACTATTTAAACAATTAT-
1 ACTATTTAAATAATTATG
*
93656 A-TATTTCAAATCATTATG
1 ACTATTT-AAATAATTATG
93674 AC
1 AC
93676 CTTTTATTTT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 4, Indels: 5
0.77 0.10 0.13
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.17
17 9 0.30
18 16 0.53
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.05, T:0.40
Consensus pattern (18 bp):
ACTATTTAAATAATTATG
Found at i:97390 original size:360 final size:360
Alignment explanation
Indices: 90663--110275 Score: 5903
Period size: 360 Copynumber: 54.0 Consensus size: 360
90653 TTATGACCTT
* * * * *
90663 TTGTTTTG-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATCA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *** * * * * * **
90727 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTTAAGCAACTTTAAATAATTATGTCTATTCC
66 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *** * ** * * * *
90791 AATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAACATGATTTTTTTTTGTTCA
130 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTTTCTATTCA
* ** *
90856 TACAAGTTTATT-GCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--T-AAAGATACTTAATATGTAA
194 TACAAGCTTATTCG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAATAAGTAA
* * * * * *
90917 AACATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAATAATTA
255 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
90980 TTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTATTTTGTCGTAAAACAA
318 TCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** *
91023 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * * * *
91087 TAATAAGAAAAAGA-TTTAAGTAAA-AAATATGTTTTTCAAACAAGTTCAAATAGTTCTAACTAT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAA--AAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
91150 TTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTT-TAGT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * *
91214 TCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATAC---------CA-ATTCCAAAAAATAATGAGTAAG
191 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * * * *
91269 AGAATAAAAAAATGAATTTGTTTATTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATC
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
91334 TATTTCAAAACATTATGACATTTCGTTTTGTCATAAAATAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** *
91375 TTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAA
1 TT-GTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
* * **** * *
91438 TCAATAAGT-AAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTTTAACACGTTCAAATAGTTATGACTA
63 TTAATAAGTAAAAGATTTT-AAAAATAAATCTG-TTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * * * *
91501 TTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTATGT
126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * *
91566 TCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAAATTAATAAGTAA
191 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * ** * * *
91631 AAGATTTAAAATATAAATCTAG-TTACCAAGCGAGTTCAAATAG-T-TGACTATTTAAATAATTA
255 GAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCAA-ATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
91693 TTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTCTCATGAAACAA
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * *
91736 TTGTTTCTATTCATATGAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA-TTCTTAAAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
*** * * * * * * * * *
91800 TAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCATCGAACAAGTTTAAATAGTCAT-ATCCATT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATT
* * *
91864 T-AAGATATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATT
128 TGAACA-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * ** * ** *
91928 CATACAA-ATTATTCAAAATAAAATAATAGAAATTTATCAATATTTTGAAAA-T--TAAG-AAAA
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * **** * *
91988 GATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCCGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCT
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
92053 ATCTT-AAAACGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAA
321 AT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAA
* * * * * * *
92093 TTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGCAG--TAAATTATTGCTAAATTAATAGTA-TTCTAAAA
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TT-CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * *
92155 A-T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAAT-GATTAAGACT
62 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAG-TTATGACT
* * * *
92214 ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTC
125 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * * * **
92278 AGTTCACACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAAC
189 A-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
92342 AACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAT
253 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *** *
92407 TATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
316 TATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
92452 TTGTTTCAGTTCATA-AATGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAA-GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** ** * * * *
92516 TGATAAGTTAGAGA-TTTAAAAA-AAAGT-TAGTTTATTGAATTGGTTTAAATAATT-TTAGCCA
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAA-TCT-GTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTA
** ** * * * *
92577 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA
126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A
* * * *
92642 -TCATAAAAGCCTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAAAAAGTA
190 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
92704 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-CA-AA--C-CA-A---CT-CCTATTTGAACAATTAT
254 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
92758 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
319 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
92800 TTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
1 TTGTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * * * *
92865 AACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTATCGAAGCAA-TTTAAACAATTAAGACTATAT
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * *
92929 GAATAGCTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTC
129 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * * **
92993 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTTTTGAAAATTAATAAGT----G
193 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * ***
93054 ATTTAAAAAGTAAACCTATTTACCAAATTATTTCAAATAATTAT-AGCCATGCCAACAATTATCT
258 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
93118 ATTTCAAATCGATATTACCCTTT-TTTGGTCATATAACAG
321 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * ** * *
93157 TTATATTTG-AAACTTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTACTTTATTAATCTTTCAAAAAT
1 TTGT-TTTGTTCA-TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
93221 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATA-CTTATTTACCAAACT-A-TCTCAAATAGTTATAACTA
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATC-TGTTTACCGAA-TAAGT-TCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * * * * * *
93283 TTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTTATAAAACAATTATTTTTGT
126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * *
93348 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG
191 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* ** * * * * *
93413 AGAATTT--AAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTAT
256 AG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
93475 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATATG
319 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-A
* * ** ** *
93518 TTTTTTTAATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT
** * * * * * *
93582 TAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACT-AGTT-AAATAATTATGACTATT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
93645 TAAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTC
128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * * ** * *
93710 ATATAAGTTTGTTCG-AATAAAGTAATAC-AATTCTATTAATATTTTGAATATTAAT---CAA-A
193 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
93769 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAGCAATCATTT
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
93834 ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAA
321 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
93874 TTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATT
1 TTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * *
93939 AATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACTAA-ATCAAATAATCATGATTATTT
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
94002 GAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA-AATTG-TTCCAGTTC
129 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * * * * *
94065 ATATATGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGA
193 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGA
* * * * *
94129 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACATATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
94194 ATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAA
321 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
94234 TTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTA-AAAAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA
1 -TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AA
* * *
94296 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTAT
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTAT
* ** * * ** *
94360 ATGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * *
94425 CATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAA
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
94490 GTTTTTAAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAACAAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA
257 G-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCA-AA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * *
94554 TCTACTTCAAATCATAATGACCTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAA
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * *
94599 TTGTTTCAGTTCATGTAAG-TT-TGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAA
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTC-AGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * ** * *
94662 TTAATGAGTAAAAGA-ATTAAAAAAAGAATCTATTTACTAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTAT
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATA-AATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
94726 CTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGGTTCTATT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * *
94791 CATGCAAGCTTATTCCG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAACTTAGTAAG-AA
192 CATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
94853 AAAATTTTAAAAATAAATCTATGTTCTGAACA-AATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATAA
255 GAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTATCAA-ATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
94917 TCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCA
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
94960 TTGATTTTGTTCATAAAAGCTTATT-TGAATAAAATAACACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAT
1 TTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAAT
* * * * * *
95023 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGTGAA-TTCAAATAGTTATTATTATT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
95087 TAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTC
128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * * * **
95152 ATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAATTTGGAG
193 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * ** * * * *
95217 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAGCAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTA
258 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * *
95282 TTTGAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA-AA
322 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * **
95320 TTTGTTTTATTCATGCAAAATTATTCA-AAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAT
1 -TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** *
95383 TAATAAG----AG-GTTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *
95443 TGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * ** * *
95507 ATACAAGCCTATTC-AAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAGTAAG
193 ATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAG
* * * * *
95571 AGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTAAACTAATT-GAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** *
95634 CTAATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAATCATAAAATAA
319 CT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
95677 TTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-TTTGTATTAACA-TTCAAAAAT
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
95740 TAATAAGCAAGAAG-TTTTAAAGAAATAAATCTGTTTATCAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTA
64 TAATAAGTAA-AAGATTTT-AA-AAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * *
95803 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTGTATCATAAAACATTTGTTT-TAA
126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A
* * * * * * *
95867 TTCATTA-AAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTT
190 TTCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T
* * ** * *
95931 AA-AGATTTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAAGCAATTC-AATAATTATTG-GTATTTGAACAA
253 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAATAATTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAA
* * * * *
95993 TTATTTGTTTCAAAATCTTTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
315 TTATCTATTTC-AAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
96041 TTGTTTTTTTATCATACAAGCCTATTCTA-AATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAAAA
1 TTG-TTTTGT-TCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
*** * * * * *
96105 TTAATAAGTAGGGGATTTAAAAAATAAATATGCTCACAGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
96169 TTGAGCAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * *
96234 CATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAG
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** * * * *
96298 AGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCTAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATC
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
96363 TATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
96404 ATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-TAAAATT
1 TTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
96468 AATAAG----AGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAATCA-TTCAAATAGTTATAACAATTT
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT
* * * *
96527 TGAACCACAATTATTTATTTTCAAATCGATTATAACCAATTGTGTTTTGGT-ATAAAATAATT-T
128 TG-A--ACAATTATCTA-TTTCAAATC-ATTATGACC--TTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGT
* * * * * * *
96590 TTCTATTTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAACTTTGTTTAATA-TCCTAAAAATT
185 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TTT-ATTAATATTTC-AAAAATT
* * * *** * ** * * *
96654 AACAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAATACAAATAGTTATAACTGTTT
246 AATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
96718 AAATAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTGT--TACAAACAA
309 GAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAA
** * * * *
96768 TTGTTTTTGTTTGTACAAGCTAATT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTTATTAATA-TTCCAAAA
1 TTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-CTAA-TTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
96830 TTAATAAGTAATAGA--TTAAAAACTAAATCTGTTTATCGATTAAGTTCAAATAGTTATGACTCT
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
96893 TTGAACAATTATTTATTTTAAATTACTATAACCTTTT-TTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTATT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * *
96957 CCTAACAAGCCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACA-AAATTA
192 CAT-ACAAG-CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A-AA-ATTAATAA
* * *
97019 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
251 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** *
97084 TTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTA
315 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * ****
97130 TTGTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * *
97195 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCTAATAGTTATAACTACTTGA
66 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
97260 ATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATA
131 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * * *
97324 TAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATT
196 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** * * * *
97389 TAAAATATGAATCTATTTATTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTT
261 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
97454 CAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAA
325 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * *
97490 TTGTTTCTATTCATA-AAATTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAATT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * * * * * *
97552 AATAGGTAGGAGA-CTTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCATG-TTCATTT
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTT
* ** * *
97615 GAA-AATTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTATTTCTGTTC
129 GAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * ** * * **
97679 ATA-TAGAATTATT-TAGAATAAAATAATACCGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAG--AG
193 ATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
97740 -TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTTTTTGAATAATTATA
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
97803 TATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
97843 TTGTTTCTTTTCGTTATAAGCCTATTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAAAT
1 TTGTTT-TGTTC-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * * * * *** * *
97904 AAATGAGTTTTTCCAAACCAATTCAAATAATTAAAACT-ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATT
64 TAATAAG----T--AAAAGATTTTAAA-AA-TAAATCTGTTTA-CCGAA-TA---AGTTCAAATA
* * ** * ** *
97968 GTTCTAT-CCTTTTGTTTAGTCAACAAACAATC-ATTTC-AGT--TTAT-A-C--AAGCTTAT-T
116 G-T-TATGAC---TATTT-G--AAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGT
* ** * * * ***
98023 CA-AAATA-AAATAATACTAATTTATTA-AA----ATTC-AAA-AAATTAATAAGC-AAGAGATT
171 CATAAA-ACAATTGTTTCT-ATTCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-A-CTAATTTA-T
** * * * * *** ** * *
98078 TAA-A--AAAAAAAGTTTATCAA--ACA-AG-CTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCT
230 TAATATTTCAAAAA-TTAAT-AAGTA-AGAGATTTAAA-AAATAAATCTGT-TTATCAA--A--T
* * ** * * * * * * * * ***
98136 ATTTCAAATTGTTATTCCTTTTTG----TTTAGTC-ATATAAGAATTGTTTTTTATCATACAAG-
286 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCA-AATCG-TTATGA-CCT-TTTGT
* *
98195 GTTGTTCA-AAATAAAA
346 TTTG-TCATAAA-ACAA
** * ** * * * ** * *
98211 TAATACTAATTGAT-TAATC-T-TTCA-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TTGT-TTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAA--AATAA-TACTA-ATTT-----ATTAA--TA
* * * * *
98271 TTTACCAAACCAATTCACAT-AGTTGAACAATTGTATACTTCAAATTAATTAT-TTTA---AA-A
54 TTT--CAAA--AATT-A-ATAAG-T-AA-AA--G-AT-TTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATA
* * * * * * ** ** *** *
98330 A-AT-AAACA-TTTTGCTCTATCAT-AAAAAAAAT-TATTT---ATGTTTAT-ACAAGCTT-ATT
106 AGTTCAAATAGTTATG-ACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTT
** * * * * * ** * * * **
98385 TGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAAT--AACTAAGAGAT-TTAAAAAT
168 TGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATA--C--AAGCTTATTCGAAATAA-A-ATAATACTAAT
* * ** * * * * * *
98447 TAAATT--TGTTTGCCGAACCAGTTTAA-ATAGTTAAGACTATATGAACAAT-TATCT-ATT-TC
226 T-TATTAATATTT--C-AA--AAATTAATA-AG-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * ** ** * * *
98506 AAATCATT---ATGACCTTTTCTTCTATCATAAAACAA-T-T-T-TTTCAATTC-ATA-GTAGC-
282 AAATAATTCAAAT-A-GTTAT-GACTAT--TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCT
* ** * *
98561 -TTATTCAG-AATAAAAGTAAA
341 TTTGTTTTGTCATAAAA--CAA
* * * * ** * * *
98581 ATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT-ATTTACCTA
1 TTG-TTTTGTTCATA---C-AAGCTT-AT---TCAGA-A--T--AAAATAATACTAATTTA-TTA
* * * * * * * * *
98645 ACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAACATTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTT
51 A-TATTTC-AAAAATTA--A-TA--AGTA-A--A--A------GATTT-T-A-AAAATAAATCTG
* * **
98710 TTTATTC-ATATAAGTT----T-GTT-TGGAATAAAAT-AATGCTAATATAT-TAATATTACAAA
95 TTTA-CCGA-ATAAGTTCAAATAGTTAT-GACT-ATTTGAA--C-AAT-TATCT-AT-TT-CAAA
* ** ** * * * * * * ** *
98766 -AATTA--A---TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTTTTTA-TCAAACCTGTTCAATAATTATC
149 TCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG--C--TTA-T-TC
* ** * ** ** * * ** * * *
98822 TATTTTAAATTGTTA-TGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTT
207 GA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TC--AAA-AATT-AATAAG----TAAGAGATT
** ** * * ** * *
98884 ATCTAAAATAAAATAAAGTTGTAT-TAATATTTCAAA-AGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
261 -TAAAAAAT-AAAT-CTGTT-TATCAAATAATTCAAATAGTT-AT--G--A-CTATTTGAACAAT
* * * * ** *
98947 AAAT-TAGTTTACTAAATTAGTTCAAAT-A-ATTATGGCCATT-T-A-AACAACTA
316 -TATCTA-TTT-C-AAA-TCGTT---ATGACCTT-TTG-TTTTGTCATAA-AACAA
* ** ** ** * *
98997 TCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTG-TT-TTC-TCATAAAACAATTGCT--TTTCAATATAGA
1 T-T-GTT----TTGTTCATA-C--AAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTT--AT-TA-A
* * * * * * ***
99057 -AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAATAATTAATAAGAGATTTA---
52 TA---T-TTC---A-AAAAT--TAATAA-GTA-AAAGATTTTAA-AAATAA-ATCTG-TTTACCG
** * * ** * * * *
99118 AA-AAAATAAAATTTGTTTAACAAACTAGTTCAA-ATAGTTAGACTATTTGAACAATTC-TCTAT
102 AATAAGTTCAAA-TAG-TT-A-TGACTATTTGAACA-A-TTA-TCTATTT---CAAATCAT-TA-
* ** * ** ** * * * * *
99180 TTCAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTCTGGTT-AAATAAGCTTATTC
155 -TGACCTT-TTGT----TTTGTCATAAAACA-----ATT-GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC
* *
99244 GAAATAAAATAATACTAA-TTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
207 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
99307 AT-TAATTT-GCTAAAGTAGTTTCAAATAGTTA-AACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTG
271 ATCT-GTTTATC-AAA-TA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
*
99369 TTATGACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAA
332 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
99398 TTATTTTTCTTAATATAAG-TTGATTC-GAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAA
1 TT-GTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAA
* * * * ** * *
99461 ATTAATTAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATCTGTTT-GCTAAGCCATTTCAAATAGTTTTGACT
62 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
99524 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTAG-TCCT
125 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCT
* ** ** * * *
99588 ATTCATACCATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCA
189 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A
* ** * * * * * * *
99653 GTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATAATTGTCGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACGA
251 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * **
99716 TTATCTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTTGTAAAACAA
315 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
99763 TTGTTTTATTCATACAA-CTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * * * * *
99827 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATCAGTTCATATGGTTAAGATTATTAGA
66 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** ** *
99892 ATAATTATCTATTTGAAATCATTCTGATATTTTGTTGAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
131 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * *
99957 CAAGCTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAATAGA
196 CAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * ** * * *
100020 TTTAAAGAAATAAATATGCTCACTGAACA-AGTTTGAATAGTTATTACTATTTTAACAATTGT-T
259 TTTAAA-AAATAAATCTGTTTA-TCAA-ATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
100083 AATTTAAAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTCATAAAACAT
321 -ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * * * * * *
100124 TTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGGT-GGATTAAAATAATACCAATTTATTAATAATTACTAAAA
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAA
* * * ** * * *
100188 -TAATAAGTAAGAA-ACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAATAGTTAT-AGCCA
63 TTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTA
* * * * * *
100250 TTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATATAACAATTG-TTCTTT
126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
100314 ATCACACATGCTTATTCAAAACAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
191 -TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * *
100379 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT
255 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * *
100444 -TAATCTCAAATCGTTAAGATC-TATGTTTTATCATAAAACAA
319 CT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * *
100485 TTGTTTCTGATCATAGAAACTTATTTCATTA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTTC-AAAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * **
100548 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTCGAATAGTTAAAACTA-T
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
100608 AGAATAATTATCTAATTT-AAATCATTCTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATATTTTTTTTCATA
128 TGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTC-TA
* * * * *
100671 TT-TTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTT-AGAAAATT-A-AA--
190 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
** * * * * * *
100729 AAG-G----AAATGATATTAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTAT
253 AAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * *
100788 TATTTATTTAAAATCATTATGACCAATTGTTTTGACATAAAATAA
316 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
100833 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TC----CAAAATAA-AATAATTTCTTAATAATTCAAAAATT
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * ** * * *
100892 AATAAG--CAAGAGTTT-AAAATAAATTTGTTTATAGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTG
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * ** *
100954 AACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTGAATTTAT
130 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * *
101019 ACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAGTGA
195 ACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * ** * * * *
101083 TTTAAAAAGTGAATTTGTTTAGCGAATCAGGTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTAT
259 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
101148 TTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAA
323 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
101186 TTGTTTT-TACATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * * *
101250 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTATTTACCGAACT-GGTTTAAAGATTTATAACTATT
66 ATAAGTAAAAGATTT--TAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
101314 TGAACAATTGAAT-T-CTTCAAATCGTTATAACCTTTT-TTTCTATCATAAAACAATTATTTCTA
128 TGAACAATT--ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * ** * *
101376 TTCATACAAG-TTCATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTA
190 TTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * *
101440 AGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTCGTCAAACTAGTACAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTA
254 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* *
101505 TCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAG
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
101541 TT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAAAAA
1 TTGTTTT--GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * ** *
101604 TTAATATGTAAGAGA-TTTAAAAAAAAAT-TATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATT
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* *** * * * *
101667 TGAACAATTATTTTATTTCAAATTGCTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTATT
128 TGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * ** *
101732 CATATAAGTTTGCTC-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--G
192 CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * ** *
101793 -GATTTTAAAAATAAATCTCTTTATCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATT
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** ** * * * *
101857 TATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * ** * ** *
101898 TAATTTCTATTCATAAAAAATTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
*
101963 AATAAGT-AAA-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACC-AAGCT-AGATCAAATAGTTATGACTAT
65 AATAAGTAAAAGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAA--TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
102023 TTGAATAAGTA-CTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTT-TAG
127 TTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-
* * ** *
102086 TTCATATC-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTA
190 TTCATA-CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
102150 AGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
254 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** * ** **
102214 ATCTATTTGAAATTGCTACAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGA
317 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
102258 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT-ACGAATAAAATAATA-AAATTTATTAATA-TTAAGAAAA
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA
* * ** * ** *
102320 TTAATAGGTAAAAAATTTTAAAAATAAAAT-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAA
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * *
102384 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTCTAT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTAT
* * * * *
102449 TCATACAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAACTAATAAGTAA
191 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * * *
102513 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATCGTCT-TAACTATTTGAATAATTA
255 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
102577 TCTATTTCAAATCATTGTGATCTTTTG-TTTGTAATAAAACCAA
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAA
* * * * * * * *
102620 -TGTTTAG-TCGTATAAGC-TATT-TGAAAAAAATAATAC--ATTCATGAATA-TTC-TAAATTA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * ** * * *
102677 ATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAAT-TCGTTTATCCAAACCATTTCCAATAGTTATGACTATCT
66 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTA-CCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
102741 AAACCAATTATCGATTTCAAAAACATTATGACATTTTTGTTTTTGTCATAAAACATTTGGTTCTG
129 GAA-CAATTATCTATTTC-AAATCATTATGAC-CTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** *
102806 TT-ATGTAAGCTTATTTCG--ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
190 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
102867 AA-A-ATTT-AAAAATAAATATGTTT-TCTTTAACACGTTCAAATAGTTATG-CTATTTAAATAA
253 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC--AAATA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * *
102927 -TATCTATTTCAAAATC-TTATGGACCTTTCAT-TTTTGTGATAAATCCCA
315 TTATCTATTTC-AAATCGTTAT-GACCTTT--TGTTTTGTCATAAA-ACAA
* * * *
102975 TTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTTATGTTATTCAACT-TTTCAAAA
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT-TTATT-AA-TATTTCAAAA
* * ** * * * ** * *
103039 ATTAATTCA-TATAAGCTATTGGGAATAAAGATGATACTAATTTA--TTATAA-TCCAAAATAAT
62 ATTAA-TAAGTAAAAG--ATT-TTAA-AAATA-AAT-CT-GTTTACCGAATAAGTTC-AAATAGT
* * * * * * * *
103100 AATAAAAGA-GATTTAAAAAAATAATC-ATTTTACTAAA-CAAGTTTAAAT-A-ATTATGACTAT
118 --T--ATGACTATTT-GAACAATTATCTA-TTT-C-AAATC-A--TT--ATGACCTTTTG--TTT
* * ** * * * * * ** * * **
103160 T-T-A-AACAATTAATATATTTGAAATCCACTATAACCTTTGTTTTGCTATAAAAGAAT-TTTTT
168 TGTCATAA-AA-CAAT-TGTTT-CTATTCA-TACAAGC-TT-ATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * *
103221 TGTATTTCATACAGGCTCATTTTCAAATAA--AACAA-TACA-A-ATTTATTAATATTAAGA-CA
226 T-TA--T--TA-A---T-A-TTTCAAA-AATTAATAAGTA-AGAGATTTA--AAAAATAA-ATC-
* * * * * * * *
103280 AGTTATAAGTAAAATATTTAAAAAATA-ATATG--T-TTTCCGAATAAGTTCAACTTCATTATGA
274 TGTT-T-A-TCAAATAATT--CAAATAGTTATGACTATTT--GAACAA-TT-ATC-T-ATT-TCA
* * * ** * * ** ** **
103341 CTAT-TTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTTGTTATGACTT
327 -AATCGTTATG-ACCT-TTTGTTT----TGTCATAAAACAA
* * * ** ** * * * * *
103381 TTGTTTTG-TAATA-AAAC-AATT--GTTTCTATTCATAC-AAGTTTTATTCAGA-TT-AGATAA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA--TTTATTAATATTTCA-AAAA
* * * * *** ***
103438 -TACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACT
63 TTAATAA-GTA-AAAGATTTT-A-AA--AATAA--ATCTG--TTTACCGAAT--A-A-G-TT-C-
* * * * ** *
103502 AAACAAGTTCA--AATAGTCATG-ACTAATTATCTATTTCAGATCACAATGATC-TTT-TTTTGT
111 AAA-TAGTT-ATGACTA-T-TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
103562 AATAAAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTGTT-TAAACTAAAATAATACTAATTTATTAAT
171 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * * *
103625 A-TTCTAAAAATTAATGAGTAATAGAAATAAAAAATGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAG
234 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAG
** * * * * * * *
103689 TTATGACTAGCTAAACAATAATTTATTTCAAAACATTATCACCTTTTGTTTTGACATAAAACAA
297 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * *
103753 TTGATTCTGTTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAA
1 TTG-TTTTGTTCATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
103816 TTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATTTGTTTTA-TGAACACA-TTCAAATAG-T-TGACTA
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTG-TTTACCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * *
103876 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA-AAAACCCATTGTTTTTA
126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTA
* * * *
103940 TTCATAAAAGCTTAATCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA
190 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * *
104005 AAGATTTTAAAAAATAAATCTTTTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATT
255 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AA-ATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
104069 ATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
317 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
104113 TTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * *** * * * * * * * * *
104176 TTTATAATTTGGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCAAATAAGTTTAAA-CGATCATGTCCAA
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTAT
* * * * * * *
104240 TT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTAT
127 TTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** *
104304 TCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAG
191 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
104365 AGGTTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAAATTATTTCAATTAGTTATGACTATTTGATCAGTTAT
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * **
104429 CTATCTCAAATCACTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAA
319 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** * *
104470 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *** ** * *
104535 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTGG
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
104600 AACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAAG-CATAAAATAATTGTTTC-AGTTC
130 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * *** * *
104663 ATACATGCTTATTCAAAAT-AAATAATACCCTTTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGA
193 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA
* * * *
104726 -AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
257 GA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-TCAA-ATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
104789 TCTATTTAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACAA
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
104832 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATT
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * ** * * * *
104897 GAGAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAGTTAAAATAATT-TCG-CCATTT
65 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTT
* * * * *
104960 GAATAATTATCTATTTCAAATATATTATGATCTTTTATTTTGTCAT-AAACAAATGTTT-TCA-T
129 GAACAATTATCTATTTCAAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATT
* ** * *
105022 CATACAAGCTTATTTCG-CATAAAATAATACTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAGG
192 CATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
105086 AGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATA
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* *
105151 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
105193 TTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATACAATATTACTAATTTAATAATATTAT-AAAAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAAT
** * * * * * * * * *
105257 TAATAACCAAGAGA-TTTAAAAACTAAATTTTTTTGCTGAACCAA-TACAAATAGTTAAGGCTAT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
105320 ATGAATATTTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTT-TCAT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* * * * *
105384 TCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAG
191 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
** * ** * * * *
105445 AGATTTAAAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAACAATTAT
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTAT
* ** * * *
105509 TTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAA
319 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * **
105551 TTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATACCT-AAAAAT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
** * * * ** * * * *
105614 TAATAAGTAACGGA-TTTAACAAATGAATCTATTTGACTGACCAA-TACAAATGGTTATAACTGT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAA-AAATAAATCTGTTT-ACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
105677 TTGAACAA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTATTAGAAAATAATTGTTTCTAT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * *
105740 TTGTACAAGCTGACTT-GAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
191 TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
105803 AGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTATCGATTAAGTTCGAATAGTTACT-ACTCTTTGAATAATT
254 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATT
** * *
105867 ATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
317 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
105911 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAA
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA
* * * * * *
105974 CTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAGTAGTTATGACTATT
63 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
106039 TGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTT-TCATAAAATAATTGTTT-TTTTC
128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * ** * * *
106102 ATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATGAGTAAAA
193 ATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * * * **
106166 GATTTTAAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATTGTCATAACTACTTT-AGTAATTATC
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATC
* * * **
106230 TATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
*** * * ** * * * *
106271 TTGTATCAATTCATATAGGCTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACT-GTTTGAACAATTATT
1 TTGT-TTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAA--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-A
* * **** * * * * *
106335 TATTTCAAATAGTT-ATGA-TATTTTATTTTATCATAAA-ACAAT-T-TTT-TCTATTCA-TACA
52 TATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTTA--A-AAATA-AATCTGTTTACCGAATAAGTTCA
* * ** * * ** * * **
106393 AGT--TTAT-TC-AGAATAAACTAA-TA-CTAATTT-ATTAAT-ATTCTAGAAATTAATAGGTAG
112 AATAGTTATGACTA-TTTGAAC-AATTATCT-ATTTCA--AATCATTAT-GACCTT--TTGTTTT
** ** * * * * ** ** *
106450 GAGATTTAAAA-AATAAATTTGT-TT-A-CCAA-ATAAATTC-AAATAGTCATGTTCATTTGAA-
169 GTCA--TAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCGAAATA-AAATAAT-A-CT-AAT
* * * ** *** * *
106508 TAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTA-TTTTATAGTAAAA-CAAT-TGTTTCTATTC
226 TTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTAAGAGATTTA-A--AAAATAAATCTG-TT-TA-TC
** * * * * ** * **
106569 ATACATAATT-ATTTAG-AATAAAATAATATTGATTC-ATTA-AGATTTTAAA-AATTA--A---
282 A-A-ATAATTCAAATAGTTAT-GACT-AT-TTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
** * *
106624 TAAGAGTAT-T-A-AAAACTAAA
341 TTTG-TTTTGTCATAAAAC--AA
* * * * * * * **
106644 TCTG-TTT-ATCAAACTAGC----TCA-AAT--AGTTATGACT-TTTTGATCAATTATATATCTC
1 T-TGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAA-TAT-T-TCAA
* * *** ** * * **
106699 AAATCGTTATGA-TCTTTATTTTGCTATAGAACAAT-TAT-TTTTTTTC-ATATAAGCTTATTCA
60 AAAT--TAATAAGT-AAAAGATT--T-TA-AA-AATAAATCTGTTTACCGA-ATAAG----TTCA
* * * ** ** ** * *
106760 GATTAAGATAAT-ACTAATTT-AATAA-TA-AAAAAT-AAATGTGTTTTGCTGAACTAGTTCAAA
112 -AAT-AG-TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA--T-CATT-ATGACCT--TT----
**** * * * ** * ** * * ** *
106820 TAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTAGTCATAAAAC
163 T-GTTTTGTC-A-TAAAAC-A--AT-TGTTTC-TATTCATA-CA-AGCTT-ATTCGAAATAAAAT
* * * * * * * *** * *
106885 AATTATTTTAGTTCATACAACCTTATTTAGAATAAAATAAT-ACTAATTTA-CTAAAACTCAAAA
217 AA-TA--CTAATTTAT-TAA---TATTT-CAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA---AATA
** * * * * * * * ** * * * * * *
106948 AAT-TAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAAGAAAT-A-TGTTT-ATCGA--A-CAAGCTT-AAATAG
270 AATCTGTTTA-TCAAATAATT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCG
* * * * **
107005 ATATGA-TTATTTGAATAATTATCTATTTAA-AA
332 TTATGACCT-TTTG--T-TTTGTC-ATAAAACAA
** * * * **** * * ** ** * * *
107037 TCATTATG-ACCT-TTTTCTTTTGTCATAA-AACAATTGTTTTAGTTTATAAAAACTTGTCCAAA
1 TTGTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATA-TT-T-CAAA
* * * * * ** **
107099 CTAA-AACAAAACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACC
61 --AATTA-ATAAGTA----A--AAGATTTTAAAAA-TA--AA-T--CTG-TTT----ACCGAA--
* * * ** * * * * *
107163 TATA-TTCCGAACCAGTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAAT-TTTATG
104 TA-AGTT-C-AA--A--T-AGTTA-TGACTA-TTTG--AACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * *
107226 ATC-TTTGTTTTTTCA-AAAA-AATTTGTTTATGA-TCATATAAGCTTATTC-AAATAAAAATAA
157 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAA
* * * **
107286 TATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAA
219 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
* * * * * * * * * * *
107351 ATCAGTTGAAATGGTTAAGGCTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTGACTTTTTGTTT
284 AT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* *
107416 AGTCATAAAACTA
348 TGTCATAAAACAA
* * * *
107429 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGAAT-AAA-CAT--TAATTTATTAACA-TTCAAACAAT
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AAT
* * * ** * *
107489 TAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATT
64 TAATAAGTAAAAGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
107554 TGAACAATT-T-TATTTGAAATTATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC-AGTT
128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * * * *
107616 CATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAG
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * *
107681 AAATTTAACAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAAC-A--
256 AGATTTAA-AAAATAAATCT-GTTTATCAAAT-AATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATT
* *
107741 A---A-GT----T-GTTAAT-A-CTTTTCGTTTTGTCTTAAAACAA
317 ATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
107776 TTGTTTT-TTAACATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAGAA-
1 TTGTTTTGTT--CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
** * * * *
107839 T--T-AGTAATTGA-TTTAAAAATTAAATCTATTTACCAAACT-AGTTTAAATAATTATGACTAT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * * *
107899 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * ** * *
107963 CACACAAGTTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGA
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * ** * *
108028 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCAAACTAGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATCATCT
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * ** *
108093 ATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGACAA
321 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * * *
108133 TTATTTCAGCTCATATAAGTTTACTT-GGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATT
1 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * ** * *
108197 TTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
108262 AAACAATTACCTATTTCAAAT-AGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTATT
129 GAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATT
* * * * * ** *
108325 CACATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGAAAAAATTAATCAGTAAGA
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
108390 GATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGTAATAATTATA
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATC
* * * * *
108455 TATTTTAAATCGTTATAACCTTTCGTTTTATCATCAAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * * * *
108496 TTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCATAATGAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACTT
1 TT-GTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
** * * ** * ** * * * *
108561 AATAACCAAGAA-AATTTAAAAATTAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGTCTATAT
65 AATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
108625 GAACGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAATT-TTT-T-TT
129 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC--AATTGTTTCTATT
* *** * *
108687 CATACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * *
108752 GATTTAAAAAATATATTTATTTACCAAACCAGTTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
257 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-TAATTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *
108815 TATTTCAAATCATTTTGA-CTTTTGTTTAGTTATAAAACAA
320 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
108855 TTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATT-AGGAATACATTAATACTAATTTATTAA-AATTGAAAAAT
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * * *
108918 TAATAAG-AAAGATATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAATAATCATTACTAT
64 TAATAAGTAAA-AGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
*
108982 TTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT
127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * ** * * *
109046 TAATACATGCTTAAACG-GATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAG
191 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * ** ** * *
109106 AGATTTAAAAAATAAATTTCTTTA-CTGAATCGGTAAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTA
256 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAAT-AATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
109169 TCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTCTGTTATAAACCAA
318 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
109212 TTGTTTTTTATCAAACAAGCTTATTC-GAAATATAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
1 TTGTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
109276 TAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAAT-AGTT---A-A---A--ACTATTA
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
109326 GAATAATTATCTATTTCAAATCATT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ACAT
129 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * * **
109387 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATATATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCGAG
192 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * *
109451 AGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTA-
256 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* *
109515 CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
319 C-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
109558 TTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATAC-GAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAA-
1 TTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * * * * *
109621 T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTAAATCAA-TTGAAAAAATTTTGGCCATT
64 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** *
109682 TGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTT
128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * * *
109746 CTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATAATAATAATTTATAATATTCCTAAAATT
192 CATACAAGCTTATTCGAAAT--AA-AATAATACTAAT--T--T-A--T-TAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * *
109811 AACAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTC
246 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
109876 AACAATTAACTATTTCAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACAA
310 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * **
109927 TTGTTTT-TCATCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
1 TTGTTTTGT--TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
109991 TAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCG---AA---C-CA-A--T-T-CCTATT
64 TAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
110043 TGAATAATTA-CTTATTTCAAATCGTCATAATCTTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTC-AG
128 TGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-
* * * * * * * *
110105 TTCACATATGCTTATGCGAAATTAAATAATATTAATTTAATAATATATTCAAAAATTAATAACTA
190 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTA
* ** * * * * * * *
110170 AGAAATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAACATTTAAGATTATATGAACAATT
254 AGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTATC-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * *
110235 ATCTATTTTAAATTATTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
317 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
110276 TAATAATTTC
Statistics
Matches: 14294, Mismatches: 3552, Indels: 2822
0.69 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
339 7 0.00
340 33 0.00
341 30 0.00
342 46 0.00
343 54 0.00
344 76 0.01
345 80 0.01
346 260 0.02
347 158 0.01
348 187 0.01
349 127 0.01
350 90 0.01
351 108 0.01
352 319 0.02
353 312 0.02
354 268 0.02
355 357 0.02
356 765 0.05
357 1220 0.09
358 478 0.03
359 768 0.05
360 1540 0.11
361 1421 0.10
362 1481 0.10
363 1055 0.07
364 339 0.02
365 291 0.02
366 347 0.02
367 97 0.01
368 66 0.00
369 156 0.01
370 76 0.01
371 55 0.00
372 58 0.00
373 102 0.01
374 64 0.00
375 40 0.00
376 39 0.00
377 40 0.00
378 52 0.00
379 55 0.00
380 33 0.00
381 37 0.00
382 40 0.00
383 26 0.00
384 22 0.00
385 27 0.00
386 33 0.00
387 20 0.00
388 13 0.00
389 37 0.00
390 37 0.00
391 42 0.00
392 54 0.00
393 45 0.00
394 33 0.00
395 60 0.00
396 39 0.00
397 41 0.00
398 27 0.00
399 45 0.00
400 47 0.00
401 23 0.00
402 39 0.00
403 29 0.00
404 19 0.00
405 30 0.00
406 26 0.00
407 30 0.00
408 21 0.00
409 13 0.00
410 18 0.00
411 11 0.00
412 21 0.00
413 17 0.00
414 5 0.00
415 10 0.00
416 11 0.00
417 11 0.00
418 14 0.00
419 13 0.00
420 9 0.00
421 23 0.00
422 8 0.00
423 4 0.00
424 2 0.00
426 3 0.00
427 4 0.00
428 4 0.00
429 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
TTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
Found at i:98970 original size:158 final size:155
Alignment explanation
Indices: 98493--98979 Score: 413
Period size: 158 Copynumber: 3.0 Consensus size: 155
98483 CTATATGAAC
* * * *
98493 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATAG
1 AATTATCTATTTCAAAT--TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--ATTCATAA
*
98557 TAGCTTATTCAGAATAAAAGTAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
62 AAGCTTATT-AGAATAAAA-T-AAA-G-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
98622 TAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAATTCTAAT
121 TAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACTAGTTCAAAT
* * * * *
98657 AATTATGACTATTTGAACA-TTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATAT
1 AATTAT--CTATTTCAA-ATTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTCATAA
* * * * * * *
98721 AAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATATTAATATTACAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTA
62 AAGCTT-ATTAGAATAAAATAAAG---ATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
*
98783 AAAAATAAATCTTTTTA-TCAAACCT-GTTC-AAT
123 AAAAATAAATCTATTTACT-AAA-CTAGTTCAAAT
*
98815 AATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
1 AATTATCTATTTCAAA-T-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATAAA
*
98879 AGCTTATCTAAAATAAAATAAAG-TTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAA
63 AGCTTAT-TAGAATAAAATAAAGATT-TATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAA
*
98943 AAATAAAT-TAGTTTACTAAATTAGTTCAAAT
125 AAATAAATCTA-TTTACTAAACTAGTTCAAAT
98974 AATTAT
1 AATTAT
98980 GGCCATTTAA
Statistics
Matches: 263, Mismatches: 35, Indels: 55
0.75 0.10 0.16
Matches are distributed among these distances:
153 1 0.00
154 15 0.06
155 1 0.00
156 14 0.05
157 38 0.14
158 61 0.23
159 41 0.16
160 5 0.02
161 1 0.00
162 6 0.02
163 15 0.06
164 50 0.19
165 2 0.01
166 12 0.05
167 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (155 bp):
AATTATCTATTTCAAATTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATAAAAGC
TTATTAGAATAAAATAAAGATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
ATCTATTTACTAAACTAGTTCAAAT
Found at i:102221 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 102189--102224 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
102179 AACAAGTTTA
102189 AATAATTATGACTATTTG
1 AATAATTAT-ACTATTTG
102207 AATAATTAT-CTATTTG
1 AATAATTATACTATTTG
102223 AA
1 AA
102225 ATTGCTACAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.50
18 9 0.50
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.08, T:0.44
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:104787 original size:719 final size:712
Alignment explanation
Indices: 103352--106285 Score: 1993
Period size: 719 Copynumber: 4.1 Consensus size: 712
103342 TATTTTGTGC
* * * *
103352 AATTATTTATTTCAAATTTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
1 AATTATTTATTTCAAA-TTGTTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAA
* * * * ** * * * *
103416 AAGTTTTATTC-AGATTAGATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATT
65 AAG-TTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGA-T
* * * *
103480 TTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-A-GT--C-A-TGACTAATTATCTATTT
128 TTAAAAAATAAATCA-GTTTACCAAATAAGTTAAAATAATGTCCCAATTGAATAATTATCTATTT
* * * * ** *
103538 CAGATCACA--ATGATCTTTT-TTTGTA--ATAAAACAATTGTTTT-AGTTCTTATAAGTTTGTT
192 CAAAT-ACATTATGATCTTTTATTT-TATCAT-AAACAAATGTTTTCA--TCATACAAAATTATT
** * * ** **
103597 T-AAACTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAATAGAAATAAAAAAT
252 TCAAA-TAAAATAATACTAATGCATTAATATTTC-AAAAAATAATAAG-AGGAGATTTAAAAAA-
* ** ** * * * * *
103660 GAATCTAT--TTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAATAATTTATTTCAAAA
313 GAA-ATATGCTTACAAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAAT
* * ** * * **
103722 CATTATCAC-CTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCTGTTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATA
376 CACTATAACTC-TTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-CAAGCTTATTCAGAATA
* ** * *
103785 AAATAATT-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGT
439 AAAT-ATTCTAAA-TTAATAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
103848 TTTATGAACACATTCAAATAGTT--GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
502 TTT-TGAAC-CATTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * *
103911 TTTATTTTGTCA-AAAACCCATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTAATCGAAATAAAATAATACTAA
564 TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
*
103975 TTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAAATAAATCTTTTTACTAAGCGA
628 TTTATTAAAATT-CAAAAATTAATAAG-AAGAAG--TTTAAAAAATAAAT-TTTTTACTAA-CAA
*
104039 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
687 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* *
104065 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAA
1 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
** * * * * **
104130 AGTTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTTTATAATTTGGAGATTT
66 AGTTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTGAGAAGTTAAAGATTT
* * * *
104194 AAAAAATAATTCTGTTTACCAAATAAGTTTAAACGATCATGT-CCAATT-AATCTATTATCTATT
130 AAAAAATAAATCAGTTTACCAAATAAG-TTAAA--ATAATGTCCCAATTGAAT-AATTATCTATT
* * * * *
104257 TCAAAT-CGTTATGA-CATTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTA-TT
191 TCAAATACATTATGATC-TTTTATTTTATCAT-AAACAAATGTTTTCA-TCATACAAAATTATTT
** * * **
104319 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AA-A-GAGGTTTAAAAACTAAA
253 C-AAATAAAATAATACTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAGAGGAGATTTAAAAAAGAAA
* * * * * * * *
104381 TTTGTTTACAAAATTATTTCAATTAGTTATGACTATTTGATCAGTTATCTATCTCAAATCACTAT
317 TATGCTTACAAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCACTAT
* * *
104446 GA-TCTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTG
382 AACTCTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATATT-
* * * * *
104510 CTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTAAAC
446 CTAAATTAATAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-TTGAAC
* *
104575 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAA
510 CA-TTCAAATAGTTAAGACTATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-T
* * * * ***
104640 G-CATAAAATAATTG-TTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAAT-AAATAATACCCTTTTATTAA
572 GTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
*
104702 CATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
636 AATTCA-AAAATTAATAAG-AAGAAGTTT-AAAAAATAAATTT-TTTACT-AACAAGTTCAAATA
104767 GTTATGACTATTTGAAT
696 GTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
104784 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAA
1 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAA
* * *
104848 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATAT-TAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGATT
65 AAGTTTATTCAAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGATT
*** * * *
104912 TAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAGTTAAAATAATTTCGCCATTTGAATAATTATCTATTTC
129 TAAAAAATAAATCAGTTTACCAAATAAGTTAAAATAATGTC-CCAATTGAATAATTATCTATTTC
* * ** **
104977 AAATATATTATGATCTTTTATTTTGTCATAAACAAATGTTTTCATCATACAAGCTTATTTCGCAT
193 AAATACATTATGATCTTTTATTTTATCATAAACAAATGTTTTCATCATACAAAATTATTTCAAAT
105042 AAAATAATACTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAGAAATATGC
258 AAAATAATACTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAG-AGGAGATTTAAAAAAGAAATATGC
** * *
105107 TTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCT
322 TTACAAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCACTATAA-CT
* ** * * * *
105172 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATACAATATTACTAA
386 CTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATATT-CTAA
* ** *
105237 TTTAATAATATTATAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAACTAAATTT-TTTTGCTGAACCAA
450 ATTAATAATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTT--TGAACC-A
* * * * * * *
105301 TACAAATAGTTAAGGCTATATGAATATTTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCG
512 TTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
105366 TAAAACAAATGTTTTCATTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
576 TAAAACAATTGTTTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATT
* ** * ** * *
105431 TAAAAATTAATAAG-AG-A-TTTAAAAGGTAAGTCCATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-A
640 CAAAAATTAATAAGAAGAAGTTTAAAAAATAAAT-TTTTTA-CTAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* *
105492 ATAATTTGAAC
703 CT-ATTTGAAT
* * *
105503 AATTATTTATTTCAAATTATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGAT-AC
1 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
* * * ** * * *
105567 AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATACCT-AAAAATTAATAAG-TAACGGATT
66 AGT-TTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAA-AGATT
* * * * * **** *
105630 TAACAAATGAATCTATTTGACTGACCAATACAAATGGTTATAACTGT-----TTGAACAA-TATC
129 TAAAAAATAAATC-AGTT---T-ACCAA-ATAAGTTAAAATAA-TGTCCCAATTGAATAATTATC
* * * * * * * ** **
105689 TATTTTAAAGT--GTTATAACCTTTTGTTTTATTAGAAA-ATAAT-TGTTTCTATTTGTACAAGC
187 TATTTCAAA-TACATTATGATCTTTTATTTTATCATAAACA-AATGT-TTTC-A-TCATACAAAA
* * * * ** * *
105750 TGACTTGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
247 TTATTTCAAATAAAATAATA-CTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAG-AGGAGATTTAAA
** * * * * * * * *
105814 AACTAAATATGTTTATC--GATTAAGTTCGAATAGTTACT-ACTCTTTGAATAATTATCTATTTC
310 AAAGAAATATGCTTA-CAAAACT-AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATATATCTC
** * * *
105876 AAATCACTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-
372 AAATCACTATAACTC-TTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAG
* * * * * * * *
105939 ATTAAAATAATAC-AAATTTATTAATATT-TAGACAACTAATTATTAAAAGATTTAAAAAATAAA
435 AATAAAAT-ATTCTAAA-TTAATAATATTATA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * *
106002 TCTGTTTATCGAATAAGTTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTAT
497 TTTGTTT-TTGAACCA-TTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * *
106067 GACTTTTTCTTTT-TCATAAAATAATTGTTTT-TTTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAAT
559 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT
* * * ** * * * * * *
106129 ATTAATTAATTAATATTTTGACAATTAATGAGTAA-AAGATTTTAAATATAAATATGTTTACCGA
623 ACTAATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAG-AAGAAG-TTTAAAAAATAAAT-TTTTTA-CTA
* * * * *
106193 ACAAGTTCTAATTGTCATAACTACTTT-AGT
683 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAAT
* * ** * * ** * *
106223 AATTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATA
1 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
106286 TAGGCTTACT
Statistics
Matches: 1775, Mismatches: 338, Indels: 208
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
712 41 0.02
713 93 0.05
715 3 0.00
716 65 0.04
717 171 0.10
718 331 0.19
719 488 0.27
720 197 0.11
721 86 0.05
722 63 0.04
723 190 0.11
724 42 0.02
725 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (712 bp):
AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
AGTTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAAAGATTTA
AAAAATAAATCAGTTTACCAAATAAGTTAAAATAATGTCCCAATTGAATAATTATCTATTTCAAA
TACATTATGATCTTTTATTTTATCATAAACAAATGTTTTCATCATACAAAATTATTTCAAATAAA
ATAATACTAATGCATTAATATTTCAAAAAATAATAAGAGGAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTAC
AAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCACTATAACTCTTCA
TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATATTCTAAATTAAT
AATATTATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTGAACCATTCAAATAG
TTAAGACTATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
GTTTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAATTAAT
AAGAAGAAGTTTAAAAAATAAATTTTTTACTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
Found at i:106475 original size:286 final size:284
Alignment explanation
Indices: 106020--106571 Score: 688
Period size: 286 Copynumber: 1.9 Consensus size: 284
106010 TCGAATAAGT
* * *
106020 TCAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTTTCATA
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATTTTTCATA
* * * *
106085 AAATAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTAATTAATATTTTGA
66 AAACAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTAGA
* * * * * *
106150 CAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAATATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATTGTCATAACT
131 CAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCAT--CT
* *
106215 AC-TTT-AGTAATTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTCATCA-TAAAACAATTGTAT
194 ACATTTGAATAATTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTATTTCAT-AGTAAAACAATTGTAT
106277 CAATTCATATAGGCTTACTGAACAAGC
258 CAATTCATATAGGCTTACTGAACAAGC
*
106304 TCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-TATTTTATTTTATC
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACT-TTTTATTTT-TC
* * *
106367 ATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAACTAATACTAATTTATTAATAT
63 ATAAAACAATTGTTTT-T-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTAATTAATAT
** * *
106431 TCTAGA-AATTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAATTCAAATAGT
126 T-TAGACAATTAATGA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAATAGT
* * * * *
106494 CATGTTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATAGTAAAACAATT
189 CATCTACATTTGAATAATTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTATTTCATAGTAAAACAATT
* *
106559 GTTTCTATTCATA
254 GTATCAATTCATA
106572 CATAATTATT
Statistics
Matches: 228, Mismatches: 30, Indels: 18
0.83 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
283 2 0.01
284 58 0.25
285 18 0.08
286 147 0.64
287 3 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.11, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (284 bp):
TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATTTTTCATA
AAACAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTAGA
CAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATCTAC
ATTTGAATAATTATCTATTACAAATCATTATGACCATTTATTTCATAGTAAAACAATTGTATCAA
TTCATATAGGCTTACTGAACAAGC
Found at i:109022 original size:359 final size:357
Alignment explanation
Indices: 107753--110293 Score: 1700
Period size: 359 Copynumber: 7.1 Consensus size: 357
107743 GTTGTTAATA
* * *
107753 CTTTTCGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTT--TTAACATACAAACTTATTTA-AAATAAAATAAT
1 CTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTT--CATACAAGCTTA-TTAGGAATAAAATAAT
* * * ** *
107815 ACCAATTTATTAATATTTCAAGAATTAGT-A-ATTG-ATTTAAAAATTAAATCTATTTACCAAAC
62 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-
* * ** *
107877 TAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG
126 TAGTTCAAATAA-TATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
107942 -CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACAAGTTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATGTAATAATA
190 TCATAAAACAA-AATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
** * * ** * *
108006 TTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCAAACTAGTTCAAACAGTT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC-AATAGTT
* * * *
108071 AAAACTATATGAACAATCATCTATTTCATATCATTATGAC
318 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* ** * * * * * * *
108111 CTTTTATTTTGTTTTAAGACAATTATTTCAGCTCATATAAGTTTACTT-GGAATAAAATAAAACT
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTAGGAATAAAATAATACT
* * * ** * *
108175 AATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TA
* * * * *
108240 GTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAAT-AGTTATTACTTTTTGTTTTGT
128 GTTCAAATAA-TATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
108304 CATAAAATAAATTTTTTTATTCACATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
191 CATAAAACAAA-ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
** * * * *
108369 TGAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTCAAATAGTTT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC-AATAGTTA
* * * * * *
108434 TGACTATTTGTAATAATTATATATTTTAAATCGTTATAAC
319 AGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * ** * *
108474 CTTTCGTTTTATCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCA-TAATGAAATAATAC
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AGGAATAAAATAATAC
* * * * * * * * *
108537 TAATTTAATAATATTTTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTT-AAAAATTAATCTAATTACTGAAC
64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAA-AGAATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAA
* * * * * *
108601 CAGTTCAAATAAT-TAAGTCTATATGAACGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTT
126 TAGTTCAAATAATATTA--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *** *
108665 ATCATAAAACAAAATTTTTTTTCATACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAATAATA
189 GTCATAAAACAAAATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * *
108730 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTACCAAACCAGTTC-ATAGGTT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATA-GTT
* *
108794 AAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-
318 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
108833 CTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATTAGGAATACATTAATACTA
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTA
* * ***
108898 ATTTATTAA-AATTGAAAAATTAATAAGAAAGATATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAA
66 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGA-A-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-A
*
108962 GTTCAAATAATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
128 GTTCAAATAAT-ATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * *
109027 ATAAAAC--AATTGTTTCAGTTAATACATGCTTAAACG-GATAAAATAATATTAATTTATTAATA
192 ATAAAACAAAATT-TTT--GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * ** * * ** *
109089 TTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTGAATCGGTAAAAATAATT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGT-TCAATAGTT
* * *
109150 ATAG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAC
318 A-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * * *
109190 CTTTTATTCTGTTATAAACCAATTGTTTT-TTATCAAACAAGCTTATTCGAAATATAATAATACT
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACT
* * * *
109254 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG-ATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCGAATAG-
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAGT
* *
109314 T----TAA-A--ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-TGACC--TTGTTTTAGTCAT
130 TCAAATAATATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCAT
* * ** * * * * *
109369 -AAA-ATATTTGTTTCACATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATATATTAACA-T
194 AAAACAAAATT-TTT--GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
** ** *
109431 TCAAAAAATTAATAAGCGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAGTT
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC-AATAGTT
* * *
109496 ATGACAATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGAC
318 AAGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGAC
* *
109536 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTA-TACGAAATAAAATAATACT
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTA-GGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
109600 AATCTATTAATATTTCTAAAATTAAT-A-AAAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTAAATCAA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AG
* * * * * * * ** *
109662 TTGAAAAAATTTTGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCA
129 TTCAAATAATATT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
109727 TAAAAC--AATTGTTTCAGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATAATAATA
193 TAAAACAAAATT-TTT--GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT--T--TAAT-
* * * * * * *
109790 ATTTATAATATTCCTAAAATTAACAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATCAGT
250 A---AT-AT-TT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGT
* ** * * * * *
109855 TCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATTATGAA
309 TC-AATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* *** * * *
109905 CTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTA
* *
109970 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT------TA--
66 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAGT
* ** * * * * * * * *
110026 TCGAACCA-ATTCCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATCGTCATAATCTTTTGTTCT-AC-T
130 TCAAATAATATTACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
110087 ATAAA-ATAATTGTTTCAGTTCACATATGCTTATGCGAAATTAAATAATATTAATTTAATAATAT
194 A-AAACAAAATT-TTT--GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * ** * *
110151 ATTCAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAACATT
255 -TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC-AATAGT
* * * * * *
110216 TAAGATTATATGAACAATTATCTATTTTAAATTATTTTAAC
317 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* ** *
110257 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAATTTCAGTTCATA
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA
110294 GGAGGATCAA
Statistics
Matches: 1719, Mismatches: 370, Indels: 194
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
339 10 0.01
340 29 0.02
341 30 0.02
342 30 0.02
344 4 0.00
345 12 0.01
346 157 0.09
347 4 0.00
348 1 0.00
349 1 0.00
350 1 0.00
351 24 0.01
352 92 0.05
353 22 0.01
354 1 0.00
355 32 0.02
356 43 0.03
357 163 0.09
358 55 0.03
359 208 0.12
360 52 0.03
361 173 0.10
362 206 0.12
363 166 0.10
364 12 0.01
365 3 0.00
366 1 0.00
367 1 0.00
368 1 0.00
369 141 0.08
370 23 0.01
371 4 0.00
372 1 0.00
373 16 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAGTT
CAAATAATATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAAAATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA
AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATAGTTAAGACTAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
Found at i:109776 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 109763--109791 Score: 51
Period size: 3 Copynumber: 10.0 Consensus size: 3
109753 GCTTATTTGA
109763 AAT AA- AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
109792 TTATAATATT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 2
0.93 0.00 0.07
Matches are distributed among these distances:
2 2 0.08
3 23 0.92
ACGTcount: A:0.69, C:0.00, G:0.00, T:0.31
Consensus pattern (3 bp):
AAT
Found at i:109831 original size:192 final size:188
Alignment explanation
Indices: 109586--109971 Score: 438
Period size: 192 Copynumber: 2.0 Consensus size: 188
109576 GCTTATACGA
* * * *
109586 AATAA-AATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AATAATAATAATAATAATCTATTAATATTCCTAAAATTAACAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * ** * ** *
109650 CTA-CTAAATCAATTGAAAAAATTTTGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATGACC
66 CTATC-AAATCAATTCAAAAAATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATAATGAAC
* * * *
109714 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
130 TTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA--TCATACAAACCTATTTGAAATAAAATAAT
* * *
109774 AATAATAATAATAATAATTTA-TAATATTCCTAAAATTAACAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
1 AATAATAATAATAATAATCTATTAATATTCCTAAAATTAACAA--AA--GATTTAAAAAATAAAT
* * * *
109838 CTGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATTATG
62 CTGTCTATCAAATCAATTCAAAAAATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATAATG
*
109903 AACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAAT
127 AACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATCATACAAACCTATTTGAAATAAAATAAT
*
109966 ACTAAT
1 AATAAT
109972 TTATTAATAT
Statistics
Matches: 164, Mismatches: 26, Indels: 12
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
188 24 0.15
189 13 0.08
190 2 0.01
192 119 0.73
193 1 0.01
194 5 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (188 bp):
AATAATAATAATAATAATCTATTAATATTCCTAAAATTAACAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT
CTATCAAATCAATTCAAAAAATTCTGGCCATTTCAACAATTAACTATTTCAAATCATAATGAACT
TCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATCATACAAACCTATTTGAAATAAAATAAT
Found at i:110148 original size:369 final size:362
Alignment explanation
Indices: 109452--110149 Score: 788
Period size: 369 Copynumber: 1.9 Consensus size: 362
109442 ATAAGCGAGA
* *
109452 GATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTACT
1 GATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAATTATGACAATTTCAACAATTACT
* * ** * *
109517 TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAT
66 TATTTAAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACATAATACAAACCTAT
* *
109582 ACGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATT
131 ACGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * *
109647 TGTCTACTAAATCAATTGAAAAAATTTTGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTAATGA
196 TGTCTA-T-AATC-A--GAAAAAA-TTT-GCCATTTGAACAATTACTTATTTCAAATCGTAATAA
** **
109712 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAAT
254 CCTTTTGTTTACTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC-TACAAGCTTATGCGAAATAAAATAATAAT
109777 AATAATAATAATAATTTATAATATTCCTAAAATTAACAAGTAAGT
318 AATAATAATAATAATTTATAATATTCCTAAAATTAACAAGTAAGT
* * * * * * * *
109822 GATTT-AAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTAAC
1 GATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAATTATGACAATTTCAACAATT-AC
* * *
109886 -TATTTCAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTA
65 TTATTTAAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACATAATACAAACCTA
** * *
109950 TTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGGAGATTTAAAAAAT
130 TACGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-AA--AGATTTAAAAAAT
** * * *
110015 AAATCTGT-T-T-ATC-GAACCAA-TT-CCTATTTGAATAATTACTTATTTCAAATCGTCATAAT
191 AAATCTGTCTATAATCAGAAAAAATTTGCC-ATTTGAACAATTACTTATTTCAAATCGTAATAAC
* * *
110074 CTTTTGTTCTACT-ATAAAATAATTGTTTCAGTTC-ACATATGCTTATGCGAAATTAAATAATAT
255 CTTTTGTT-TACTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCTACA-A-GCTTATGCGAAATAAAATAATAA
*
110137 TAAT-TTAATAATA
317 TAATAATAATAATA
110150 TATTCAAAAA
Statistics
Matches: 277, Mismatches: 42, Indels: 28
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
359 3 0.01
360 11 0.04
361 78 0.28
362 4 0.01
364 5 0.02
368 3 0.01
369 141 0.51
370 9 0.03
371 2 0.01
372 1 0.00
373 20 0.07
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (362 bp):
GATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAATTATGACAATTTCAACAATTACT
TATTTAAAATCATTATGAACTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACATAATACAAACCTAT
ACGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATC
TGTCTATAATCAGAAAAAATTTGCCATTTGAACAATTACTTATTTCAAATCGTAATAACCTTTTG
TTTACTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCTACAAGCTTATGCGAAATAAAATAATAATAATAATAA
TAATAATTTATAATATTCCTAAAATTAACAAGTAAGT
Done.