Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168481.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_8, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 67000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 75 of 127
Found at i:14409800 original size:51 final size:50
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Indices: 14409731--14410063 Score: 343
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14409721 CTCCTTTAAT
* * * *
14409731 CAAAGGCATTGAAGCTTTAAAAGTTCTTGTTTGAAAATGGCTTCCCCAAAA
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* * * * *
14409782 TAAAGGCTTTGACACTTTAAAAAAACTTGCTTGAAAATGGCTCCCCCTAAA
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* * * * *
14409833 CAAAGGCTTTGACACTTTAAAAAACTTGCTTGAAAATAGC-TCCAACTAAA
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* * ** *
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* *
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* *
14409983 CAGAGGCTTTAAAACTTTAAAAATCTTGTTTGAAAATGGCTTCCCCTAAA
1 CAAAGGCTTTGAAACTTTAAAAATCTTGTTTGAAAATGGCTTCCCCTAAA
* *
14410033 -TAAGGACTTTGAAACTTTAAAATTCTTGTTT
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CAAAGGCTTTGAAACTTTAAAAATCTTGTTTGAAAATGGCTTCCCCTAAA
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14410060 GTTTTTATTT
14410070 TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC T
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14410099 TTTATTTATT
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TC
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14421534 GCTGATGTTG
*
14421544 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA CTA TTA TTA
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14421574 GAAAGAATTA
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TTA
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14423452 TTAGAAATTT
14423462 TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA
1 TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA
14423510 TCA TCA TCA TCA TCA TCA
1 TCA TCA TCA TCA TCA TCA
14423528 CCATTATTAT
Statistics
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1.00 0.00 0.00
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Consensus pattern (3 bp):
TCA
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14424340 CGTAGGAGGA
* * * * * * *
14424350 AAAAGGGAAGTACTTTGTATACCTGGCAATTTATAAAGAAACAGTAAGCTCGCGAAGACATTTTG
1 AAAAGGGACGTAATTTGTGTACATGGCAGTTTATAAA-AAACAGTAAGCTTGCGAAGACACTTTG
* * * *
14424415 TCTAGAAAATTCC-CTCCA-ACATGAAACAAAGCTACAATCTTGAAGCCCAATGGACAGCCAAAA
65 TCTAGAAAATTCCAAT--AGACATGGAACAAAGCTGCAATCTTGAAGCCCTATGGACAGCCAAAA
* * * * *
14424478 GAAAAGCATAACCAAGACAAACCTCTAGACTCCAAAACCTTTATTTCCCTCTGTTTATTGGAAGT
128 GAAAAGCATAACCGAGACAACCCCCTAGACTTCAAAACCTTCATTTCCCTCTGTTTATTGGAAGT
* * * *
14424543 TTCTAGATGCTAAAAAAAAAAGCTTCCACCCTTTAGACGAACCATATCAGCGAAGATGAAAACAC
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256 AAAAAATTTTAGCAAAACTGGG
* * * ** *
14424629 AAGAGGGACGTAATCTATGCGCATGGCAGTTTAAAAAAAACAGTAAGCTTGCGAAGACACTTTGT
1 AAAAGGGACGTAATTTGTGTACATGGCAGTTTATAAAAAACAGTAAGCTTGCGAAGACACTTTGT
* *
14424694 CTAGAAAATACCAATAGACATGGAACGAAGCTGCAATCTTGAAGCCCTATGGACAGCCAAAAGAA
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131 AAGCATAACCGAGACAACCCCCTAGACTTCAAAACCTTCATTTCCCTCTGTTTATTGGAAGTTCC
* * *
14424824 TAGATGCTAAAAAAAAGCTTCCAACTTTTAGTCGAAACCATATCAGCAAAGATGAAAACATAAAA
196 TAGATGCTAAAAAAAAGCTTCCACCTTTTAGAC-AAACCATATCAGCAAAGATGAAAACACAAAA
14424889 AATTTTAGCAAAACTGGG
260 AATTTTAGCAAAACTGGG
* * * *
14424907 AAGAGGAACGTAATTTGTGTGCATGGCAGTTCATAAAAAACAGTAAGCTTGCGAAGACACTTTGT
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* *
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*
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131 AAGCATAACCGAGACAACCCCCTAGACTTCAAAACCTTCATTTCCCTCTGTTTATTGGAAGTTCC
* *
14425102 TAGATGCTAAAAAAAAGTTTCCACCTTTTAGACAAAACCATATCCGCAAAGATGAAAACACAAAA
196 TAGATGCTAAAAAAAAGCTTCCACCTTTTAGAC-AAACCATATCAGCAAAGATGAAAACACAAAA
*
14425167 AAATTTAGCAAAACTGGG
260 AATTTTAGCAAAACTGGG
*
14425185 AAAAGGGACGTAATTTGTGTACATGGTAGTTTATAAAAAA
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14425225 GGTACAAAGT
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ATTTTAGCAAAACTGGG
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14425782 GATTTTAAAG
* * * ** *
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*
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64 AAGGTAAATTATAAAAATACCCTTATAAGGGTATTTTGGTAATTTCACATTTCTCAGGGTACATC
* *
14425922 TATGATTTCAAATA
129 TATAATTTAAAATA
* * * * * * *
14425936 CACCAAAGATCATGAAATATTATGAACTTAAGATCTG-AAATATTTCACAAAAACCTGAGCTTGA
1 CACCAAAAATCATGAAATATTATAAAATTAAGATCTGAAAAT-TTTCATAAAAA-TTGAAC-T-C
* * **
14426000 AAAAGATAAATTATGAAAATACCCTTAT-AGGCGTATTTTGGTAATTTCACACTTT-TTGGGGTA
62 AAAAGGTAAATTATAAAAATACCCTTATAAGG-GTATTTTGGTAATTTCACA-TTTCTCAGGGTA
* * *
14426063 -TTGTGATAATTTAAAATG
125 CATCT-ATAATTTAAAATA
** * * *
14426081 CATTAAAAATCATGAAATGTTATAAAATTGAGATCTGAAAATTTTCATGAAAATTTGAACTCAAG
1 CACCAAAAATCATGAAATATTATAAAATTAAGATCTGAAAATTTTCAT-AAAAATTGAACTCAA-
* * *
14426146 AAGGCTGAATTATAAAAATACCC-TATAATGGGCATTTTAGTAATTT
64 AAGG-TAAATTATAAAAATACCCTTATAA-GGGTATTTTGGTAATTT
14426192 TGTACTTCTC
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GGTAAATTATAAAAATACCCTTATAAGGGTATTTTGGTAATTTCACATTTCTCAGGGTACATCTA
TAATTTAAAATA
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1 ATTTGAAGATAGTCTTTCC
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1 ATTTGAAGAT
14428508 TTATCATAAT
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*
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14428558 CACTTTTTGT
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* * *
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*
14430037 CTTTC
1 TTTTC
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14431038 GTGCCATCCC
* * * * *
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1 AAATAAACAAATAAATTAGTACACATGAAAAATCATAAGTTACA
* *
14431091 AAATAAACAAATAAATTAGTACACTTAAAAAATCATAAGTTACA
1 AAATAAACAAATAAATTAGTACACATGAAAAATCATAAGTTACA
** *
14431135 AAATAAACAAATATGTTAGTGCACATGAAAAATCATAA
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AAATAAACAAATAAATTAGTACACATGAAAAATCATAAGTTACA
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*
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*
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1 CAAAGAATAAAT
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*
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*
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1 AAATTAATAATCATGCAAAAAT
14431906 AAATTAATAATCATGCAAAAAT
1 AAATTAATAATCATGCAAAAAT
14431928 A
1 A
14431929 TAAAAAAATA
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*
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*
14431932 AAAAAT-AAGTAATAAATCATGCAAATATATA
1 AAAAATAAAGTAATAAATCATGCAAAAATATA
14431963 TTCATGCAAA
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1 ATTATTTTAATTTAATTAA
14437731 AT
1 AT
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1 CTTGAAGCTTCT
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1 CTTGA
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1 ATAAACCAATAAA
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Indices: 14454324--14454370 Score: 58
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*
14454324 ATAAACCAATAAAAATAAACCA
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* * *
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1 ATA
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*
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** ** ** *
14457798 CAATTAAGGCGTTTGACT-ACACAAACCCCTTAATTGATCCAACT-TAAA-TTATAAATTG-GAT
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* * * *
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* * ** ** *
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* * * *
14457977 CAATTAAGGCATTTGTGTAGCCAAACT-CCTTAATTGATCTTA-TATAATTTTAAAAAGAGAT
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* * **
14458038 CAATTAA-------G-GT----AAATGCTTTAATTGGTCCAATGTATAAATTTTATATAA-ATTG
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60 GAT
* * * * * * *
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55 AAAGAGAT
* * * *
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60 -GAT
* * * *
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** *** * * * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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** * * *
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* * *
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** *** * *
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63 G
* * * *
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14460059 ACCATAGCAA
*
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AT
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* * * *
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* * *
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* * **
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* * *
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* * * * * * *
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* *
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* ** **
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* ** * ** *
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* * * * * * *** * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * **
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** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * ***
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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* ** * *
14464804 AGCTTGTGTGAAAAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAA-TCATAACGA
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* * * * **
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** * * *
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TTAAATCTTTTCTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCGAATAAGCTTG
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14462247 ATAAATTTAT
*
14462257 TTTTTGAATCTTTTATTAA
1 TTTTTGAATCTATTATTAA
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1 TTTTTGAATCTATTATTAA
14462294 ATTAGTATTA
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TTTTTGAATCTATTATTAA
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14462508 ATAAAATGTT
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1 ATAATGATTTGAAATAG
*
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1 ATAATGATTTGAAATAG
14462551 TCAAAACTAT
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ATAATGATTTGAAATAG
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* * * * * *
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* * *** * * * *
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** *
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* * * *
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* * * * *
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129 ATAGATTTATCGTTTAAATTTCTT
14462602 ACCAATTAAT
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TTAGTATTATTTTAATCCAAACAAAATAGTATGAACAAAACAATTGTTTGATGACAAAACAAAAG
GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTCGGATAAT
AGATTTATCGTTTAAATTTCTTGG
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14462439 ATTTTCTTGG
** * ** * * * * *
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* * ** * * * * *
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** * ** *
14462578 ATAGATTTATCGTTTAAATTTCTTACCAATTAATTTTCTAAATATTAATAAA
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* * * * * *
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* ** * *
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* * *
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130 AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * * *
14462811 TAAGTTTTATTCTATTCTGAATAAGCTTGTAT-AAGCTAAAATAATTATTTTTTGATAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * ** * * **
14462875 AGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAA-CTGTTTGAACTAGTTTGACA
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTA
* * * *
14462939 AATAGATTT-TTTTTT-AATTTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAA
130 AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAA
* * * * * * * * *
14462990 TTATTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAGGAACATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
14463055 GGTTATAACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CAATAA-CTATTTGAATTGGCTCGATA
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTA
* * * *
14463118 AATAGATATACTTTTTAAA-C-C-T-CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAG
130 AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAA
** * *** * *
14463167 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGTTGAAAAACAATTATTTTAAGACAAAGA-AAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAA
** * * * *
14463231 AAATAATAACGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAAT-TATTTGAACT-GTTTCGGT
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTT-GGT
14463294 AAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAA
129 AAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA
* * * * ** * * *
14463348 GTAGTATTATTTTTTTTTGGATAGGCTTGTATGAGTAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * *
14463413 GGTCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCATATATTCTTAAT-TGTTTTAACTAGTTTGGCAA
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTAA
** * *
14463476 ACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATT-ATCAAA
131 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAAT-AAA
* * * * * * * *
14463528 TTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCCTATATGAACAGAAATAATTGTTTTATCATAGAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
14463593 GGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAA-CTATTTGAACTGGTTCGGTAT
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTAA
*
14463657 ATAGATTTA-CTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAA
131 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAA
* * * *** * * *
14463704 TTAATATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACTATTGTTTTAAT-ATAAAATAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAA
** *** * * * * * * * *
14463768 AAATAATATGGATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCATAGT-TATTTGAACTGTTTTTGAA
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTA
14463832 AACT-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAA
130 AA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAAT-AAA
* * * * *
14463886 GTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * *
14463951 GGTGATAACAATTTTAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTGTTCGGTAA
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTAA
* * * * * *
14464015 ACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTAATTAATTTTTTAAATGTTAATAAA
131 ATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * *
14464068 TTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGGATAAACTAAAACAATTATTATATGACTAAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * ** * * *
14464133 AGTAAGAACGATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTTTTAA-CTATTTGAATTTG-TTCG-AC
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTA-
* * * * *
14464195 AA-ACA-TAATTTTTTAAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGGAATATTATTAAA
130 AATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * * *
14464243 TTAATATTATTTT-TATCTAAAAAAGCTTGTATGATCAAAAATAATTTTTTTATGAGAAAAC-AT
1 TTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * * * * * * **
14464306 AGGTAGGAACTATTTAGGACT-GATATTTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTG-ATTGGTTCGAA
65 AGGTAATAACAATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGT
* * * *
14464368 AAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAA
129 AAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA
* ** * * * * *
14464422 GTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTAAAACAAGTGTTTTATGACAAAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * ** *
14464487 GGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCA-AATTTGTTTGAACTTATTCT-AT
66 GGTAATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTT-TGGT
* * * * * *
14464549 AAAT--ATATATTTTTT-AATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAAGAAA
129 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * *
14464600 TTATTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGAATGAACTAAAATAATTATTTTATGACTAAGCAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * ** * * * *
14464665 GATCAGAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAGTTAGTCTTAA-CTATTTGAATTGGTTTAGCAA
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTAA
** * * * * *
14464729 GCACATTTGTTTTCTAAATCTCTTA-TATATTAATTTTTAGAATATTATTAAA
131 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTGA-AATATTAATAAA
* * * * *
14464781 TTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTGTGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * **
14464845 A-ATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAA-CTATTT-AAATTGTTTCCAT
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTT-GGT
* * * * * *
14464907 AAACAAATTTA-GTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGA
129 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAA
* * ** * * * *
14464957 TCAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
*
14465022 GGTCATAA
66 GGTAATAA
14465030 TGATTTATTT
Statistics
Matches: 1882, Mismatches: 443, Indels: 154
0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
173 4 0.00
174 43 0.02
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180 366 0.19
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
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GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCTATTTGAACTGGTTTGGTAA
ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAA
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Period size: 361 Copynumber: 19.4 Consensus size: 358
14462439 ATTTTCTTGG
* ** * * ** * *
14462449 TTAGTATTATTTTATTTCAAACAAAATAGTATGAACATAACCAATTGTTTGATGACAAA-ATAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AAA
* * ** * * * * *
14462513 ATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTT-GATA
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTCGGTA
* ** * ** * *
14462577 AATAGATTTATCGTTTAAATTTCTTACCAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTTTTTATT
129 AACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAG-TATTATT
* * * * * * * * * * *
14462642 TTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAAGTAATAATGA
191 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * *
14462707 TTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAA-TCATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGA-ATTAT
256 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACT-ATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATA-TAT
* * *
14462770 TTTTTAAATCTCATACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAA
318 TTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * * *
14462811 TAAGTTTTATTCTA-TTCTGAATAAGCTTGTAT-AAGCTAAAATAATTATTTTTTGATAAA-ACA
1 TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-A
* * * ** * *
14462873 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAACTGTTTGAACTAGTTT-GA
63 AAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTCGG
* * * * * * *
14462937 CAAATAGATTT-TTTTTT-AATTTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTATTATTAT
127 TAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * *
14463000 TTTATTCTGAATAAGCTTGTAGGAACATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACA
190 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACG
* * *
14463065 ACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAATTGGCTCGATAAATAGATATACT
255 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGC-ATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATATATT
* *
14463130 TTTTAAAC-C-T-CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAG
319 TTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* *** * *
14463167 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGTTGAAAAACAATTATTTTAAGACAAAGAAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGAAAAA
** * * * * *
14463232 AATAATAACGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGTAAA
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCGGTAAA
* *
14463297 CTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTT
131 C-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * *
14463362 TTTTGGATAGGCTTGTATGAGTAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
194 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * * * * * ** ** *
14463427 -AAATAAATAATTGTTCATATATTCTTAATTGTTTTAACTAGTTTGGCAAACGGATTTATTTTTT
259 GAAATAGATAATTGTTCAAATA-GCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATATATTTTTT
*
14463491 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATT-ATCAAA
323 AAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAA
* * * * * *
14463528 TTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCCTATATGAACAGAAATAATTGTTTTAT--CATAGAACA
1 TTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAG-A-A
* * * * *
14463590 AAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAACTATTTGAACTGGTTCGGT
63 AAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCGGT
* * * *
14463655 ATATAGATTTA-CTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
128 AAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * ** * **
14463715 TTGTTTCGAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACTATTGTTTTAAT-ATAAAATAAAAAATAATATG
191 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTT-ATGATAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** * * * *
14463778 GATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCATAGTTATTTGAACTGTTTTTGA-AAACT-GATTT
254 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAATTG-GTTCGATAAA-TAGATAT
* *
14463841 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAA
316 ATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAA
* *** * * * **
14463886 GTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAA-ACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AAA
* * * *
14463950 AGGTGATAACAATTTTAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT-TGTTCGGTA
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTCGGTA
* * * *
14464014 AACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTAATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATT
129 AAC-AATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
14464079 TTATTTTGACTAAGCTTGGATAAACTA-AAACAATTATTATATGACTAAATA-AAAA-GTAAGAA
191 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAA-ACAAAAGGTCATAA
* * * ** * * *
14464141 CGATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTTGTTCGA-CAA-ACATA-A
253 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATATA
* ** *
14464203 TTTTTTAAAATC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAA
317 TTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * * * *
14464243 TTAATATTATTTT-TATCTAAAAAAGCTTGTATGATCAAAAATAATTTTTTTATGAGAAA-ACAT
1 TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGAAAA
** * * * * * * **
14464306 AGGTAGGAACTATTTAGGACT-GATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ATTGGTTCGAAA
65 AGGTAATAACAATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCGGTA
* * * *
14464369 AACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTT
129 AACAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * *
14464434 TATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTA-AAACAAGTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGA
192 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * *
14464498 CTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCA-AATTTGTTTGAACTT-ATTCTATAAAT--ATATA
256 -TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAA-CTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATATA
* * * * * *
14464558 TTTTTTAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAAGAAA
317 TTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * *
14464600 TTATTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGAATGAACTAAAATAATTATTTTATGACTAAGCAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGAAAAA
* * * * * * ** * * * *
14464665 GATCAGAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAGTTAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTT-AGCAA
66 GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTCGGTAA
* * * * * *
14464729 GCACATTTGTTTTCTAAATCTCTTA-TATATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAATATTATTT
130 ACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * *
14464793 TAATCTGAATAAGCTTGTGTGAAAAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-ATCATAACGAT
192 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * * *
14464857 TTGAGATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAATTGTTTCCATAAACAAATTTA-GTT
257 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATATATTTT
* * *
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321 TTAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * ** ** * * * * * *
14464957 TCAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AAA
* * * ** *** * * * *
14465021 AGGTCATAATGATTTATTTTTGAAAGATTTAAAACTT-AAATTTATTTGTCA-AACCAGTTCAAT
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** * ** * * * ** * *
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* ** * * * * * *
14465146 -CAATTCTTAATTA-GTTA-TTTCAA-AA-ATTAGTA--AATAG-----ATT-TTTTTTAAAAAA
176 TAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAA
*** * * * * * * *
14465198 ATCTCTTATTAATTTTTGAATAAGCTTG-TATGATAAAAAACAATTGTT-ATATGACCA-AACAA
239 A---C--A--AA-AGGT-CATAA-C--GATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAAT-AGCATAAC--
* ** * * * * * * * *
14465260 AAGGTAACAATGATTTG--AAATAGATA-A-TTATTAAAATGGTGATAATTATTTGCACTGATTC
288 TATTTGA-ATTGGTTCGATAAATAGATATATTTTTTAAACT-CT--TACTTA-TT--A---ATT-
** * *
14465321 AGTAAACAAATTCACTTTTGAAA
342 TTTAAA-ATATT-A---AT-AAA
* * * * *** *** *
14465344 TCACTTATTAATTTTTGAAATATT--AATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTAT
1 TTA-GTATT-A-TTTT---AT-TTCAAATAAGCTT-GTATGA-ACAAAAAT-AATTA-TTT-TAT
** * * * ** * * *
14465406 GA-ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAT-AAA-AGGTCATAA-TGATTTTAAATAG--ACAAT
54 GACAAAGAAA-AA--G-GTAATAACAATTTGAAATA-G--ATAATTG--TTCAAATAGTCATAAC
* ** * * *
14465465 TA-TTGAAATAGTCGTAACTATGTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAGCTCTTGC
110 TATTTGAACT-GT--T---TCGGT-AA------------AC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * *
14465529 TTATTAATTTTTAATATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT--
155 TTATTAATTTTGAA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * *
14465592 AAACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCATGATGGTTTTAAATAAATAATTATTCAAATAG
218 AAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
14465656 TCTTAACTATTTGAATTTGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTCATATCTTTTGCTTATTAATTTT
282 -CATAACTATTTGAATTGGTTCGA-TAAATAGATATATTTTTTA-AACTCTTACTTATTAATTTT
* *
14465720 TCAAATGTTAATAAA
344 TAAAATATTAATAAA
* * * * * * *
14465735 TTTGGATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTAAGATA-TAAAATAAATATTTTATGACCAAACAA
1 TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAATAATTATTTTATGA-CAAAGAA
** * * ** * ** *
14465798 AATA--TCAA-AATGATCTGAAATAGATAATTATTGTAATGGTTTTAATTATTTGAACTAGTTTC
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* * * * * * *
14465860 -ATAAGGAC-ATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATGTTATTAAATTAGTTT
125 GGTAA--ACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
** * * * * * * * *
14465923 TATTTT-TAACTAAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAACTGCTTTATGACAAAAC-AAAGATCTT
187 TATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
14465986 AATGATTTGAGATTA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAAT
251 AACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGAT
*
14466050 TTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTTTAAAATATTAA-AACA
314 ATA-TTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA-A
* * * *
14466096 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT-AATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAA-ACAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AA
* * * ** * * * * * *
14466159 AAGATCATAACAATTTCAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCGGTA
64 AAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCGGTA
* * * * *
14466224 AATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTATTTATTAATTTTAAAAATATGAATAAATTAGTATTATTT
129 AACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** ** * * *
14466288 TATTCTGTCTAAGCTTGTACCAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGA
192 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * * * *
14466352 -TTGTAAATAGATAATAGTTTAACTAGTAATAACTATTTAAACTT-GTTTGATAAACAAATTTAT
256 TTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATATA-
** ** *
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317 TTTTTTAAA-CTC--TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* ** ** * * * *
14466460 TTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACTAAA-CAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC-AAAGAAAA
* * * * * * * * **
14466524 AGGTTAGAATGAA-TTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCAATA
65 AGGTAATAA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCGGTA
* * *
14466588 AACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATATTAAATTAGTATTATTT
129 AAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* *** * * * *
14466653 TAATCCAAATAAGCTTGTACGAACA-AAACAATTGTTTTA-GAGCT-AAATAAAAGGTCATAACA
192 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA--TAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * *
14466715 ATTTGAAATAGATAATCGTTCATATATTC-TTACTATTTGAATAGGTTCGATAATTAGATTTATT
255 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATATATT
** * * * *
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319 TTTTAA-ACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * ** * ** * *
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1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AAA
* * ** * * * * * *
14466883 ATGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATACTCAAAATTATTTGAAATAGTTT-GGTA
65 AGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTCGGTA
* * * * * *
14466947 AGCAAATTTACTTTTTCAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAATATTATTT
129 AAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * * * *
14467012 TCTTTCGAACAAACTTCTATTAACA-AATACAATTGTTTTATGACAAAACATATA-GTAATAATG
192 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAA-ACAATTGTTTTATGATAAAACA-AAAGGTCATAACG
* * *
14467075 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTTATAATTATTTAAATTGGTTC-AGTAAATAGA-ATT
255 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--CATAACTATTTGAATTGGTTCGA-TAAATAGATA-T
* * * * *
14467137 ATTTTCTACATCTCTGACTTATAAATTTTTGAAATATTAA-AAA
316 ATTTTTTA-AACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * ** * ** * * *
14467180 TTAGTTTTATTATATTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAA
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* * * * * * * *
14467245 GGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTAAATTGGTTT-AGTAA
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* * * * * * *
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129 AACAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * ** * * * *
14467373 TATTCTAAATAATCTAGTATGAGCATAAACAA-TGTTTTATGATAAAAC-AAAGTGTTATAGCAA
192 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG-GTCATAACGA
* * * * * *
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256 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAAT-AGATATATT
* *
14467500 TTGTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
319 TTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
** ** * *
14467537 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-ATTGAAAAACAATTATTTTATGATAAA-ACAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AA
* ** * * *
14467600 GAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTT-GGT
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* * * * * *
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* * * * *
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190 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * *
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* * * *
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** * *** * * *
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1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC-AAAGAAAA
* * *** * * * * * * **
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* * * *
14468028 ACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTAC-TA--ATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT
130 ACA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
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* * * * * * *
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* * * *
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* *** * * *** * * *
14468258 ATAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAA-ACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AAA
* * * *
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* *
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187 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG----A---T-AA-AA-C
* * * * * * * * * *
14468511 AAAAAGTTAGAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-TATTTAAAATGGTTC-A
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* * * * * ** * *
14468574 GCAAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTGAA
305 -TAAATAGATATATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * *
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1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAATAATTATTTTATGACAAAGAAAA
* * ** * * * * **
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* * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * ** *
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257 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATATATTT
* **
14468950 TTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAA
320 TTT-AAACTCTTACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * * **
14468991 ATAATATTATTTTATTTCGAATACGCTTGTATGAACATAAACAATTGGTTTATGACAAA-ATAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAGA-AAA
* * * *
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* * * *
14469119 AACAGATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGCAATATTAATAAATTTA-TATTATT
129 AACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
*** * * * * * *
14469182 TTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGTTAAAACAAATGGTCATAATGA
191 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * *
14469247 TTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTCCGATAAACAAAT-TCAT
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* * * * *
14469310 ATTTTAAATATATTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
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** ** * * * * *
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* ** * ** * *
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129 AACA-ATTTATTTT
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Statistics
Matches: 5079, Mismatches: 1226, Indels: 757
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Consensus pattern (358 bp):
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GGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCGGTAAA
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AATAGATAATTGTTCAAATAGCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATATATTTTTTAAA
CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
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Alignment explanation
Indices: 14462510--14469493 Score: 3097
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14462500 ATGACAAAAT
* ** * * *
14462510 AAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAA-AACTATTTGAAATGGTTTG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * * *
14462574 ATAAATAGATTTA-TCGTTTAAATTTCTTACCAATTAATT-TTCTAAATATTAATAAATTAGTTT
65 ATAAATAGATATACT-TTTTAAATCTCTT----ATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATTA-ATA
** * * * * * *
14462637 TTATTTTATTTTGAACAAACTTATAT-TAACAAAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAAGTAA
123 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGT-TCAAAAACAATTTTTTAA-GACAAAACAAAAAATAA
* * * ** * *
14462701 TAATGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATCATTTGAACTGGTTT-GGTAAA-TAG
186 TAACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GTTTCGGAAAACTA-
* * * * *
14462764 AATTATTTTTTAAATCTCATACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAA-TAAGTTTTATTCTATT
249 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTTATT
* * * * *
14462827 CTGAATAAGCTTGTAT-AAGCTAAAATAATTATTTTTTGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
313 TTGAATAAGCTTGTATGAA-CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-
* * * *
14462891 AAATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAACTGTTTGAACTAGTTTGACAAATAGATTT-TTTTTT-
376 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTA
* * * *
14462954 AATTTCTTAG-TTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTCTGAATAAGCTT
441 AATCTCTT-GCTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
*
14463018 GTAGGAAC-ATAAATAATTATTTTATAATAGAAC
504 GTATGAACTA-AAATAATTATTTTATAATAGAAC
* * *
14463051 AAAAGGTTATAACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAATTGGCTCGA
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCAATAACTATTTGAATTGGTTCGA
* * * *
14463116 TAAATAGATATACTTTTTAAACCTCTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTA
66 TAAATAGATATACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* *
14463181 TTTCAAATAAGCTTCTATGTTGAAAAACAATTATTTTAAGACAAAGA-AAAAAATAATAACGATT
131 TTTCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATT-TTTTAAGACAAA-ACAAAAAATAATAACGATT
* *
14463245 TGAAATAGATAGTTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGTAAACTAATTTATTTTT
194 TGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGAAAACTAATTTATTTTT
* * *
14463310 TAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTTTTTTGGATAGGCT
259 TAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * *
14463375 TGTATG-AGTAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAATAAATAATT
324 TGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAATAAATAATT
* * * * *
14463439 GTTCATATATTCTTAATTGTTTTAACTAGTTTGGCAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-T
388 GTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCT
* * *
14463503 TATTAATTTTTAAAATATT-ATCAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCCTATATGAAC-AG
452 TATTAATTTTT-AAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-
* *
14463566 AAATAATTGTTTTATCATAGAAC
514 AAATAATTATTTTATAATAGAAC
* * * * * *
14463589 AAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAACTATTTGAACTGGTTCGG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCAATAACTATTTGAATTGGTTCGA
* * *
14463654 TATATAGATTTAC-TTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTG
66 TAAATAGATATACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * * * **
14463718 TTTCGAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACTATTGTTTTAATATAAAATAAAAAATAATATGGATTT
131 TTTCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATT-TTTTAAGACAAAACAAAAAATAATAACGATTT
* * * ** *
14463783 GAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCATAGTTATTTGAACTGTTTTTGAAAACTGATTTATTTTTT
195 GAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGAAAACTAATTTATTTTTT
*
14463848 AAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCT
260 AAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAAT-AAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * *
14463913 TTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTGATAACAATTTTAAAGAGATAATT
324 TGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTAAATAAATAATT
* * * * ** *
14463978 GTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCT
388 GTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCT
* * * * *
14464043 AATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGGATAAACTAAA
452 TATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAA
* * * *
14464108 ACAATTATTATATGACTA-AAT
516 ATAATTATTTTAT-AATAGAAC
* * * * * * *** *
14464129 AAAAAGTAAGAACGATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTTGTTCGA
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCAATAACTATTTGAATTGGTTCGA
* * * * * *
14464194 -CAA-ACATA-ATTTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT
66 TAAATAGATATACTTTTT-AAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * * * * * ** ** *
14464256 -TATCTAAAAAAGCTTGTATGATCAAAAATAATTTTTTTATGAGAAAAC-ATAGGTAGGAACTAT
130 ATTTC-AAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAA-TTTTTTAAGACAAAACAAAAAATAATAACGAT
* * * * * * * * *
14464319 TTAGGACT-GATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ATTGGTTCGAAAAAC-AACTTTAGT
193 TT-GAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGAAAACTAA-TTTATT
* * * **
14464381 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
256 TTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * * *
14464446 GTTTTTATGAACTAAAACAAGTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGACTTTAAATAGATA
321 GCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTAAATAAATA
* * * * *
14464511 ATTGTTTAAATAGTC-AAATTTGTTTGAACTTA-TTCT-A-TAA-ATATATATTTTTT-AATCTC
385 ATTGTTCAAATAGTCTTAA-TTGTTTGAAC-TAGTT-TGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
14464570 TTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAAGAAATTATTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGAATGAA
447 TTGCTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* *
14464635 CTAAAATAATTATTTTATGACTA-AGC
511 CTAAAATAATTATTTTAT-AATAGAAC
* * * * * * * ** * *
14464661 AAAAGATCAGAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAGTTAGTC-TTAACTATTTGAATTGGTT-T
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTGAATTGGTTCG
* ** * ** * *
14464724 AGCAAGCACAT-TTGTTTTCTAAATCTCTTATATATTAATT-TTTAGAATATTATTAAATTAATA
65 A-TAAATAGATATACTTTT-TAAATCTC---T-TATTAATTCTTGA-AATATTAATAAATTAATA
* * * ** * * *
14464787 TTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTGTG-AAAAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAAATC
123 TTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGTTCAA-AAACAATT-TTTTAAGACAAAACAAAAAATA
* * * * * * * * * *
14464849 ATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAATTGTTTC-CATAAACAA
185 ATAACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGA-AAACTA
* * * * *
14464913 ATTTA-GTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAGA-TCAATATTATTTTAT
249 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTT-GAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTTAT
** * * **
14464972 TTTGAATAATTTTGCAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TT
312 TTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * *** * * * * * *
14465035 ---T--AT--TT-TTGAAAGA-T-TTAA-AACTTAAATTTA-TTTGTCAAACCAG-TTCAATTGT
376 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAA-CTAGTTTGACAAA-CAGATTTATTTTT
* * * * *
14465087 TAAGA-CTATATGAATAATT-ATCTATT-AAT-TTCAA-AACTTAGTAATTGATTTGAAGTAAAC
439 TAA-ATCTCT-TG-CTTATTAAT-TTTTAAATATT-AATAAATTAGT-ATT-ATTT----T----
* * * ** * * * *
14465147 AATTCTT-AATTAGTTATTTCAAAAATTAGTAAATAGATT-TTTTTTAAAAAAATCTC
489 -ATT-TTGAATAAGCT-TGT-ATGAACTA--AAATA-ATTATTTTATAATAGAA---C
*** * * * * * * * ** **
14465203 TTATTAATTTTTGAATAAGC-TTGTATGATAAAAAACAATTGTT-ATATGACCAA-ACAAAAGGT
1 --A--AAAGGTT--ATAA-CAAT-T-TGA-AATAGATAATTATTCAAAT-AGCAATA-ACTATTT
* * * * * ** * * * * *
14465265 AACAATGATTTG--AAATAGATA-A-TTATTAAAAT-GGTGA-TAATTATTTGCACTGATTCAGT
54 GA-ATTGGTTCGATAAATAGATATACTT-TTTAAATCTCTTATTAATT-CTTGAAAT-ATT-AAT
* ** * ** * * *
14465324 AAA-CAA-ATTCACTTTTGAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATT-AATAAATTAGTATTATTT
114 AAATTAATATT-A-TTTT-ATTTCA---AATAA-GCTTG-TATGTTCAA-AAA-CA--ATT-TTT
* ** ** * * * *
14465386 TATTTTGA-ATAAGTTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGA
166 TA---AGACA-AA----ACAAAAAAT--AATAA-CG-ATT-TG---AAAT---A-G--AT-A-G-
* * * * * *
14465450 TT-TT-AAATAGACAATTATTGAAATAGTCGTAACTATGTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTAT
206 TTGTTCAAATAG-CCATAATT---AT--TTG-AAC--TGT---TTCG----GAAAACTAATTTAT
* * * * * *
14465513 TTTTTTAAGCTCTTGCTTATTAA-TTTTTAATATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGAT
255 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAA-ATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * ****
14465577 AAGCTTTTATGAACT-AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATGATGGTTTTAAATAAA
319 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AACAATTTAAATAAA
* * * * * * * * * *
14465641 TAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTTGTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTCATATCTT
383 TAATTGTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTTGA-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
14465705 TTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGAT
447 TTGCTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-
* **
14465770 A-TAAAATAAATATTTTATGACCA-AAC
510 ACTAAAATAATTATTTTAT-AATAGAAC
** * * ** * ** * *** * * *
14465796 AAAATATCAAAATGATCTGAAATAGATAATTATTGTAATGGTTTTAATTATTTGAACTAGTTTC-
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCAATAACTATTTGAA-TTGGTTCG
** * * * * * * * *
14465860 ATAAGGACATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAGAATGTTATTAAATTAGTTTT
65 ATAAATAGATATACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTCTTGA-AATATTAATAAATTAATATT
** * * ** * * **
14465924 ATTTT-TAACTAAATAAGCTTCTATGATT-AGAAACAACTGCTTTATGACAAAAC-AAAGATCTT
125 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG-TTCAAAAACAA-TTTTTTAAGACAAAACAAAAAATAAT
* * * * * * * * *
14465986 AATGATTTGAGATTA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAAT
187 AACGATTTGA-AATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGAAAACTAAT
* * *
14466050 TTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTTTAAAATATTAA-AACATTAGTATTATTTTATTT
251 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAA-AGTAGTATTATTTTATTT
* * * *
14466113 CGAATAAACTTGTAT-AA-TAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTC
314 TGAATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-
* ** * * * * * * * ** *
14466176 AAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAA-TTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTT
376 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTAG-TTTGACAAACAGATTTATTTTTT
* ** * * * **
14466240 AAAT-TTTTATTTATTAATTTTAAAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGTCTAAGCTT
440 AAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
** * * * *
14466304 GTACCAACTAAAACAATTGTTTTATGACA-AATC
504 GTATGAACTAAAATAATTATTTTATAATAGAA-C
* * * * *
14466337 AAAAGGTTATAACGA-TTGTAAATAGATAA-TAGTTTAACTAGTAATAACTATTTAAACTT-GTT
1 AAAAGGTTATAACAATTTG-AAATAGATAATTA-TTCAAATAGCAATAACTATTTGAA-TTGGTT
* * * * * * *
14466399 TGATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTTTTGTTATTAATTTTTCG-AATGTTAATAAATTA
63 CGATAAATAGATATA-CTTTTTAAATCTC------TTATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATTA
* * ** ** ** * **
14466463 GTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATA-ACTAAACAAAAGG
120 ATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATT-TTTTA-AGACAAAACAAAAAA
* * * * * * * * * ** * *
14466527 TTAGAATGAATTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTC-AATAAAC
183 TAATAACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTTCGGA-AAAC
* * * * * * *
14466591 AAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATATTAAATTAGTATTATTTTAA
247 TAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAT
*** * * *
14466656 TCCAAATAAGCTTGTACGAAC-AAAACAATTGTTTTA-GAGCTAAATAAAAGGTCATAACAATTT
312 TTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * * * * **
14466719 GAAATAGATAATCGTTCATATATTCTT-ACTATTTGAA-TAGGTTCGATAATTAGATTTATTTTT
376 -AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTA-GTTTGACAAACAGATTTATTTTT
* * * * * * **
14466782 TAATTTTCTTG-TTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAAAT
439 TAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * * *
14466846 AGTATGAAC-AAAACCAATTGTTTGATGACAAAAC
503 TGTATGAACTAAAA-TAATTATTTTATAATAGAAC
* ** * * * * * *
14466880 AAAATGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATACTCAA-AATTATTTGAAATAGTTTG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-GCAATAACTATTTGAATTGGTTCG
* ** * * * *
14466944 GTAAGCAAATTTACTTTTTCAATCTCTTACTGATTAATT-TTCTAAATATTAATAAATTAATATT
65 ATAAATAGATATACTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * * * * * *
14467008 ATTTTCTTTCGAACAAACTTCTAT-TAACAAATACAATTGTTTTATGACAAAACATATAGTAATA
125 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGT-TCAAAAACAATT-TTTTAAGACAAAACAAAAAATAATA
* * ** * * * * * *
14467072 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTTATAATTATTTAAATTGGTTCAGTAAA-TAGAA
188 ACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAG-CCATAATTATTTGAACTGTTTCGGAAAACTA-AT
* * * * * * * *
14467135 TTATTTTCTACATCTCTGACTTATAAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTATATTTTG
251 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG
* * * * *
14467199 AATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
316 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-AAAT
* * * * * * *
14467264 AAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTAAATTGGTTTAGTA-AAA-AAAATTATTTTTTAAA
380 AAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTT-G-ACAAACAGATTTATTTTTT-AA
* * * * * * *
14467327 AT-TTTTAG-TTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAATCTAG
442 ATCTCTT-GCTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * *
14467390 TATGAGC-ATAAACAA-TGTTTTATGATAAAAC
505 TATGAACTA-AAATAATTATTTTATAATAGAAC
* * * * *
14467421 -AAAGTGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTC
1 AAAAG-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTGAATTGGTTC
* * * * *
14467484 AAT-AATCAAATTTA-TTTTGTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
64 GATAAAT-AGATATACTTTT-TAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
** * * * * * ** *
14467547 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATATTGAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAGAGGTAATAATG
127 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATT-TTTTAAGACAAAACAAAAAATAATAACG
* * * * *
14467612 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTT-GGTAAATTGATTTTA
191 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTG-TTTCGGAAAACT-AATTTA
* * * *
14467676 TTTTTCAAATCTTTTACTTATTAACTTTTGAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTA-TTTGGAT
254 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * *
14467740 AAGATTTTATGAATTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGA
319 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTAAATAAA
* * * * ** *
14467805 TAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACA-ATTTTTTTTTTCAAATCT
383 TAATTGTTCAAATAGTCT-TAATTGTTTGAACTAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCT
* * *
14467868 CATGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGA
446 CTTGCTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
14467933 AGTGAAACAATTATTGTATGACTA-AAC
510 ACTAAAATAATTATTTTAT-AATAGAAC
* * *** * * * * * *
14467960 AAAAGGTCAGAGTGATTTGAAATAGATAATTCTTCTAATAGTC-TTAACTATTTAAACTGGTACG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * * * * * *
14468024 ACAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTT
65 ATAAATAGATATA-CTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTT
* * * ** * * * * *
14468089 T-TATCCAAA-AAGCTTATTTAATCAAAAACAATTGTTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATG
129 TAT-TTCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAA-T-TTTTTAAGACAAAACAAAAAATAATAACG
* * * * *
14468151 ATTTGAGATTA-ATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GAAAAAC-AACTT
191 ATTTGA-AATAGAT-AGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GTTTCGGAAAACTAA-TT
* * * * * * *
14468213 TAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTTTGG
252 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * * *
14468278 ATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAGCTTTAAATA
317 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTAAATA
* * * ** * **
14468343 GATAATTATTCAAATAGTC-AAATCAATTT-AAGCTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA
381 AATAATTGTTCAAATAGTCTTAAT-TGTTTGAA-CTAGTTTGACAAACAGATTTA-TTTTTTAAA
* * * *
14468406 TCTCTTACTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA
443 TCTCTTGCTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA
* * * *
14468471 TGAACTGAAACAATTGTTTTATGATTTATTTTGAATAAGC
507 TGAACTAAAATAATTATTTTAT-A---A---T--AGAA-C
* * ** * * * * *
14468511 AAAAAGTTAGAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TTAA-TATTTAAAATGGTTC-
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTGAATTGGTTCG
* * * * * * * * * *
14468573 AGCAAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATT
65 A-TAAATAGATATACTTTTTAAATCTCTTA--T--TAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATT
* * ** * * * *
14468638 ATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATG-AAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATA
125 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTCAA-AAACAATT-TTTTAAGACAAAACAAAAAATAATA
* * * * * * * *
14468701 ATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACT-TGTTC--AATAAATAGA
188 ACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGT-TTCGGAA-AACTA-A
* * * * *
14468763 TTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTC
250 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGA-AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
* * * ** * *
14468827 TGAATAAACTTATATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATATCGTAACTATTTGA
314 TGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-A
* * * * * * * ** * *
14468890 AATAAATAATTGTTGAAACAGTCATAA-CGATATAAACTTA-CTTGGTAAATAGATATATTTTTT
377 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTG-TTTGAAC-TAGTTTGACAAACAGATTTATTTTTT
* * * * * * * *
14468953 AAAACTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCGAATACGCT
440 AAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* ** * * * *
14469018 TGTATGAAC-ATAAACAATTGGTTTATGACAAAAT
503 TGTATGAACTA-AAATAATTATTTTATAATAGAAC
* * * * * *
14469052 AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACATGTTTA
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTGAA-TTGGTTC
* * * * * * *
14469116 GA-AAACAGATTTA-TATTTTAAATTTTTACTTACTAATTTTTGCAATATTAATAAATTTATATT
64 GATAAATAGATATACT-TTTTAAA--TCT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATT
** * * ** *** *
14469179 ATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGTTAAAACAAATGGTCATA
125 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATT-TTTTAAGACAAAACAAAAAATAATA
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * **
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*
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* * * ** * * **
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* * * * *
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** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * ***
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * ** *
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** * * * *
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* * * *
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1 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* *** ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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*** * ** *
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* * ** * *
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* * * *
14469314 TAAATATATTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
129 TTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * *
14469366 TTTTGAATAAGCTTACATGAACTAATATAATTGTTTTATGA-AGAAACAAAAAGTTATAATGATT
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* * * * *
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1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
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* * * *
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* * * * * ** * *
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1 TGAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
** * ** * * ** * *
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* * * *
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130 ATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TC
* * * * * * *
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* * * * *
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*
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* * * **
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1 T-GAATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * * * *
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* * *
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** ** * * *
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1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-A
* * * * *
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65 AATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAAATTTA-TTTTTT
** * * * *
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* * * * * *
14466477 TGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAATGAATTGAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * *
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* * *
14466606 AT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATATTAAATTAGTATTATTTTAATC
130 ATCTT-TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * **
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1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
** * * * * * ** *
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65 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-ATAAACAAATTTATTTTTTA
** * * *
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** * * * * *
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1 T-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * ** * * *
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* * * *
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129 AATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * *
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1 T-GAATAAGCTTGTATGAACTAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTT
* * * * * *
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63 GAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTCA-TAAACA-AATTTATTT
* * * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * * *
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66 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTCA-TAAACAAATTTATTTTTT-
* * *
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128 AAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * ***
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* * * * *
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*
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* * * * *
14467554 TGAATAAGCTTGTAT--ATTGAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAGAGGTAATAATGATTTG
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* * * * ** ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGA
* ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * ** ** * * *
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* * * *
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129 AATCTTTTACTTATTAA-TTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * *
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* * * * *
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* *
14469134 TAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGCAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC
127 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC
** * ** *
14469188 AAAATAAGCTTGTATGAAC-ATAAACAATTATTTTATGTTAAAACAAATGGTCATAATGATTTGA
1 TGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * *
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* * * *
14469316 AATATATTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
129 AATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * *
14469369 TGAATAAGCTTACATGAACTAATATAATTGTTTTATGA-AGAAACAAAAAGTTATAATGATTTGA
1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
** * *** * **
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14469498 ATCTTTTA
130 ATCTTTTA
14469506 ATGGTTTGAA
Statistics
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Consensus pattern (180 bp):
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TCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
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Alignment explanation
Indices: 14465214--14469505 Score: 3292
Period size: 361 Copynumber: 11.9 Consensus size: 358
14465204 TATTAATTTT
** * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
14465533 TAATTTTTAATATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTT
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* * * * * *
14465572 TGGATAAGCTTTTATGAACTAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATGATGGTTTTAAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * * **
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* * * ** * *
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* * * *
14465897 TTTTTAGAATGTTATTAAATTAGTTTTATTTT-TAAC
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* * * * * * *
14465933 TAAATAAGCTTCTATGATTA-GAAACAACTGCTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAATGATTTGA
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* * * * ** *
14465996 GATTA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTT
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* * * * *
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* * ** *
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191 TGTATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * * * * *
14466187 CATTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTATT
254 TATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTGTTTC-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* *
14466251 TATTAATTTTAAAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTATTC
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** ** * * *
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1 TGAATAAGCTTGTATGAACT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-A
* * * ** * *
14466357 AATAGATAATAGTTTAACTAGTAATAACTATTTAAACTTGTTT-GATAAACAAATTTATTTTTTT
64 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTA-TTTTTC
* *
14466421 AAATCTCTTTTTG-TTATTAATTTTTCG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAA
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* * * * * *
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* * *
14466549 ATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTT
252 ATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTGTTTC-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TT
* * *
14466613 ACTTATTAATTTTTGAAATAATATTAAATTAGTATTATTTTAATC
315 ACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * * **
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* * * * * * ** * *
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65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTCAA
* * * * * ** *
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129 ATCTT-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * *
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193 TATGAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
* ** * * ** * * * * *
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257 TCAAATAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTTCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* *
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321 TAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
14467016 TCGAACAAACTTCTATTAACAAATACAATTGTTTTATGACAAAACATATA-GTAATAATGATTTG
1 T-GAATAAGCTTGTATGAACTAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTG
* * * * *
14467080 AAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTTATAATTATTT-AAATTGGTTCAGTAAATAGAA-TTA-TTT
63 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAACA-AATTTATTTT
* * * * *
14467141 TCTACATC-TCTGACTTATAAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTATATTTTGAATAA
125 TC-AAATCTTTTG-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * * ** *
14467204 GCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATA
188 GCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
14467269 ATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTAAATTGGTTT-AGTAAAAAAAATTATTTTTTAAAAT-TTT
252 ATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTTCA-TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTT
* * *
14467332 TAGTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAATATTATTTTATTC
314 TACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * ***
14467378 TAAATAATCTAGTATGAGCATAAACAA-TGTTTTATGATAAAAC-AAAGTGTTATAGCAATTTGA
1 TGAATAAGCTTGTATGAAC-TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGA
* * * * * *
14467441 AATAGATAATTGTTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAATCAAATTTATTTTGT-A
64 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTT-TCA
14467505 AATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
128 AATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * *
14467566 TAT-ATTGAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAGAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTG
193 TATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * ** ** * *
14467630 TTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAATTGATTTTATTTTTCAAATCTTTTACTT
256 TTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTG-TTTCATAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
14467695 ATTAACTTTTGAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-
319 ATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * *
14467735 TGGATAAGATTTTATGAATTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAACT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * *
14467800 ATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAATTTTTTTTTTCAA
65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTCAA
** * * *
14467864 ATCTCATGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGATTGT
129 ATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT
* * * * * * *
14467929 ATGAAGTGAAACAATTATTGTATGACTAAACAAAAGGTCAGAGTGATTTGAAATAGATAATTCTT
194 ATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * *
14467994 CTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTACGACAAACACATTTATTTTTTTAAATC---T-CTTAC
258 CAAATAGTCTTAACTATTTGAACTGTTTC-ATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * *
14468055 TAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATC
321 TAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TC
* * * * * * *
14468094 -CAAAAAGCTTAT-TTAATCAAAAACAATTGTTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTG
1 TGAATAAGCTTGTATGAA-C-TAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * *
14468156 AGATTA-ATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GAAAAACAACTTTAGTTT
63 A-AATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTA-TTT
* * * * *
14468219 TT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTTTGGATAAG
124 TTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
* * * * * *
14468283 TTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAGCTTT-AAATAGATA
189 CTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATA
* * ** * *
14468347 ATTATTCAAATAGTC-AAATCAATTT-AAGCTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTC
252 ATTATTCAAATAGTCTTAA-CTATTTGAA-C-TGTTTCATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTT
* * * *
14468410 TTACTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
313 TTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * *
14468457 TGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATTTATTTTGAATAAGCAAAAAGTTAGA
1 TGAATAAGCTTGTATGAACT-AAACAATTGTTTTATG----A----CAA-AA-CAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
14468522 ATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-TATTTAAAATGGTTCAGCAAACACATGT
55 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTT
* * * * * * * * ***
14468586 ATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTAATCCAAA
120 ATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * *
14468651 TAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAG
185 TAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * *
14468715 ATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACT-TGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
249 ATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTGT-TTC-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
14468779 CTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTC
312 TTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** *
14468827 TGAATAAACTTATATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATATCGTAACT-ATTTG
1 TGAATAAGCTTGTATGAACT--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTG
* * * * * * * ** * * * * *
14468889 AAATAAATAATTGTTGAAACAGTCATAACGATATAAACTTACTTGGTAAATAGATATATTTTTTA
63 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTCA
* * * * * * *
14468954 AAACTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCGAATACGCTT
128 AATCTTTTGCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * *
14469019 GTATGAACATAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATT
192 GTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
14469083 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTT-AGAAAACAGATTTATATTTTAAAT-TTTTACT
255 ATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTTCA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* *
14469146 TACTAATTTTTGCAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC
318 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC
** * ** *
14469188 AAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGTTAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAAC-TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * ** *
14469253 ATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TCCGATAAACAAATTCATATTTT-A
65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTAT-TTTTCA
* * * * *
14469316 AATATATTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
128 AATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * *
14469381 CATGAACTAATATAATTGTTTTATGA-AGAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTA
193 TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* *** * **
14469445 TTCAAATAGT-TGTGACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACATATTTATTTTGAAAATCTTTTA
256 TTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAAC-TGTTTCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
14469506 ATGGTTTGAA
Statistics
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355 1 0.00
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Consensus pattern (358 bp):
TGAATAAGCTTGTATGAACTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTCAAAT
CTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
GAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
ATAGTCTTAACTATTTGAACTGTTTCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
Found at i:14469532 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 14469511--14469569 Score: 66
Period size: 16 Copynumber: 3.6 Consensus size: 16
14469501 TTTTAATGGT
14469511 TTGAAATAGATAATTA
1 TTGAAATAGATAATTA
*
14469527 TTGAAATAG-TAATAAGA
1 TTGAAATAGATAAT--TA
14469544 TTTGAAATAGATAATTA
1 -TTGAAATAGATAATTA
*
14469561 TTCAAATAG
1 TTGAAATAG
14469570 TTATGACTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.49, C:0.02, G:0.14, T:0.36
Consensus pattern (16 bp):
TTGAAATAGATAATTA
Found at i:14469802 original size:297 final size:296
Alignment explanation
Indices: 14469240--14469791 Score: 655
Period size: 297 Copynumber: 1.9 Consensus size: 296
14469230 ACAAATGGTC
* * * *
14469240 ATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTCCGATAAACAAA
1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTCAGACAAACAAA
* ** * * *
14469305 TTCATATTTTAAATATATTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
66 TT-ATATTTTAAATATATTACTCATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCT
* * * * *
14469370 GAATAAGCTTACATGAACTAATATAATTGTTTTATGAAGAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAA
130 AAATAAGCTTACATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAGAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAA
* ** * * * * *
14469435 TAGATAATTATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACATATTTATTTTGAAAAT
195 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTTATTTTG-AAAT
14469500 CTTTTAATGGTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGTA
259 CTTTTAATGGTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGTA
* * * *
14469538 ATAA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAG-CAAACAT
1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TCAGACAAACAA
* * * * *
14469601 ATT-TATTTTGAAAATCTTTTACTTATCAATTGCTGAAATATTAATAACTTAATGTTATTTTAAT
65 ATTATATTTT--AAATATATTACTCATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
** * *
14469665 CTAAATAAGCTTGTATGTA-TAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAAGTCATAGCGATTT
128 CTAAATAAGCTTACATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGA-AGAAACAAAAAGTCATAACGATTT
* *
14469728 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTAATTTT
191 GAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTT-ATTTT
14469792 TGTATCTTTT
Statistics
Matches: 210, Mismatches: 38, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
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296 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (296 bp):
ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTCAGACAAACAAA
TTATATTTTAAATATATTACTCATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTA
AATAAGCTTACATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAGAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAAT
AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTTATTTTGAAATCT
TTTAATGGTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGTA
Found at i:14469972 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 14469542--14470124 Score: 591
Period size: 181 Copynumber: 3.2 Consensus size: 177
14469532 ATAGTAATAA
* * * *
14469542 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAACATATTTA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTTGTTCAG-AAACAAATTAA
* * * *
14469606 -TTTTGAAAATCTTTTACTTATCAATTG-CTGAAATATTAATAACTTAATGTTATTTTAATCTAA
64 TTTTTG--AATCTTTTACTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTTATATTATTTTAAT-TAA
* * * *
14469669 ATAAGCTTGTATGTATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGC
125 ATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGC
* * * *
14469723 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTAA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTC-AGAAACAAA-TTAA
* * *
14469788 TTTTTGTATCTTTTACTTGTTAGTTGTCTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTAAAATA
64 TTTTTGAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATT-AAATA
* *
14469853 AGCTTGTATGAATAGAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGC
128 AGCTTGTATGAATAGAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGC
* * * *
14469903 GATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCTTTACTATTTAAACTTGTTCAAGAAACAGATTCAA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTC-AGAAACAAATT-AA
* * * * * * * * * *
14469968 TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTTGAATATTATTAAA-TTAGAATTATGTTATTCTGAAT
64 TTTTTGAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAAT-TAAAT
* * * * * * * **
14470032 CATCTCGTAAGAAAAGAAAAAGTTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTAATAAT
127 AAGCTTGTATGAATAGAAAAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGC
14470084 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTG
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTG
14470125 TACTAGTCAG
Statistics
Matches: 335, Mismatches: 56, Indels: 22
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
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TTTGAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTAAATAAGC
TTGTATGAATAGAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGC
Found at i:14471209 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 14470512--14471333 Score: 581
Period size: 181 Copynumber: 4.6 Consensus size: 182
14470502 AATAATTCAT
* * * * *
14470512 GGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTA-CAAAAAGAAACAATTGA-T
1 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATT-ATT
* * * * ** * * * *
14470575 TTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGGTAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
64 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACAATAT
* * * * *
14470639 GAAC-TATTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC--A---TATTAATTTTCA
129 GAACTTA-CTCGATAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCTATTAATTTT-A
* * * * * * ** * * * *
14470689 -AAATATTCATAGATCAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTT
1 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTT
* * * * * ** ** * * *
14470753 ATGAGAAAACAAAAAGCCATAATAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATGGAT-ATGGCTATTTA
66 ATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAG-TCATAACAATATG
* ** * * * *
14470817 AACTT-GTTTAGTAAACATATTC-TTTTTTAAATGTCCTAC-CTATTAATTTTCA
130 AACTTACTCGA-TAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCTATTAATTTT-A
* * * * * * *
14470869 -AAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTT
1 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTT
* * * * ** *
14470933 ATGACAAAACAGAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAGTAGTTATAACAATATG
66 ATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACAATATG
* * * * * *
14470997 AACTTGCTCGCTAATCATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTCACT-TATTAATTTTA
130 AACTTACTCGATAAACAGATTCATATTTT-AAATCTCTT-ACTCTATTAATTTTA
* ***
14471049 GGAATATTAATAACTTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTT
1 GGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTT
* * *
14471113 TATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAACAGTCATAACCATATG
65 TATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACAATATG
* * * *
14471178 ATCTTATTTGATAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCT-TTAATTTTT
130 AACTTACTCGATAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCTATTAATTTTA
* * ** * *
14471230 GGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTACATGAACTAATACAATTATTTT
1 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTT
* *
14471295 ATGATGAAGCAAAAGG-CATAATGATTTGAAATAGATAAT
66 ATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
14471334 CATTCAAATA
Statistics
Matches: 510, Mismatches: 111, Indels: 45
0.77 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
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177 53 0.10
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180 156 0.31
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (182 bp):
GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTT
ATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACAATATGA
ACTTACTCGATAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCTATTAATTTTA
Found at i:14471752 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 14471357--14474825 Score: 994
Period size: 181 Copynumber: 19.2 Consensus size: 180
14471347 TTGAGATTGC
* * * * * * *
14471357 AAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTATTTGAACTTATTCT-AT-AA-ACA--TAATTATT
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGATAAATACATTTATTTTTT
* * ** * *
14471417 -AATATTTTATTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTT
65 AAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTT
* * *
14471481 GTATGAACAAAAATAATTGTTTTATAAGAAAATAAAAAGTTATAACGATTTG
130 GTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * *
14471533 AAATAAATAGTTGTTCAGATAGTCATTACTACTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
* *
14471598 AATCTTTTACTTTTTAGTTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* * * * *
14471663 TATGAAAAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCAATTTG
131 TATGAAAA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
** ** * * * * * * *
14471714 TTATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
* * * * *
14471779 AATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAAA-AAGCC
66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-ATTGAAATAAGCT
* * ** *
14471842 TGTATGAACTAATATAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTATAACGATTTG
129 TGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * * * * *
14471895 -AATAAATAACTATTCAAATAGTTATGA-TCATTTAAACTTGTTTGGTAAACT-TATTTATTTTT
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTATTTGATAAA-TACATTTATTTTT
* * ** * *
14471957 AAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCT
64 TAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCT
* * * * *
14472022 TGTACGGACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTG
129 TGTA-TGAAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * *
14472075 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATATGATAAACAAACTTATTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
* * * * *
14472140 AGTCTTTTACTGATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTCAATTGAAATAAGCTTA
66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* ** * * *
14472205 TATGATTAGAAAATTTTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTG
131 TATGA--AAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
** * * * * * * * * *
14472257 AAATAGGTAATTGTTTAAATGGTCATAGCTATTTAAACTTACTCGATAAATAGATATAGTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
* * * *
14472322 AATC---T-CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGAATTATGTTATTCTG-AATAAGC
66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAAT-TGAAATAAGC
* * * * * * *
14472380 GTATACGAATAGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTG
128 TTGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * ** * ** * *
14472434 AAATAAATAATTATTC-AA-A--C--AATTATGTT-CA-TTGGTTAAGCCAATAGATTCATTTTT
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTTATTTGA-TAAATACATTTATTTTT
* * * * * *
14472491 TAAAT-TCATTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAA-TTAGCATTACTTTATTTCAAATAA
64 TAAATCT-TTTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATTGAAATAA
* * * * ** ** **** * * * * *
14472553 GATTGTATTAATAGAAACAATT-AATTCCGA-ATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGTT
126 GCTTGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACA-AA-ACAAAAAG-TTA-TAACGATT-TG
** * * * * ** * * *
14472612 TTATGACA-AA-----CAAATGGTCATACCGATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATA-GTTATAA
1 AAAT-AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG---AACTTATTTGAT-AAATACATT-T-A
* * * ** ** *** * ** * * *
14472670 CTTATTGAA-CTAGT--TTGGTAAACATATTTAT-TTATTAACTCTCT-TATTAATTT--TTGAA
59 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAAT-T-TATATTATTTTAATTGAA
* * * * ** *
14472728 AT-A--TT-AAT-AAATTAATATTATT-TTATTTTGA-ACAAACTTATATAAA-CAAAAAC-ATT
122 ATAAGCTTGTATGAAA--AAAATAATTGTT-TTATGACA-AAAC--A-A-AAAGTTATAACGATT
14472784 TG
179 TG
*** * ** * * * ** *
14472786 TTTTACAACAA---AACAAA-AGATCTTAA-TGATTTGAAATAGATAATT-ATCCATATCGTTTT
1 AAATA-AATAATTGTTCAAATAG-TCATAACT-ATTTGAACT---TATTTGATAAATA-C-ATTT
* * ** * * * * * *
14472845 AACTATTTAAAT-TGGTTCGGTAAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTCATA
58 -ATTTTTTAAATCT--TT---T--ACTTATTAATTGTCTGAA--TATTA---A-TAAATTT-ATA
* * * * * * *
14472909 ATATTTTTAGATCAGTACTATTTTATTTTGAATAATCTTCTCTGAAGATAAATAATTATTTTATG
108 TTATTT---------TA--A-TTGA-----AATAAGCTTGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATG
* * *
14472974 ATAAAACAGAAGGTTATAACGATTTG
155 ACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * ** * ** *
14473000 AAATATATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
** * *
14473065 AATCTTCGACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGC
66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATT-GAAATAAGC
* * *
14473127 TTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTG
128 TTGTATGA-AAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT-ATAACGATTTG
* * ** * * * ** *
14473181 AAACAGATAATCATTCTAATAGCCAT---TGTTTGAACTTATTCAATAAACT-GATTTATTTTTT
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAA-TACATTTATTTTTT
*** * * * * * * * * * *
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* ** * * * * * * *
14473306 TCTATGAACTGAAACAATTGTTTTATCATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTT
129 TGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * * * ***
14473359 AAATAGATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGGCTTATTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTT-
* * * * * * *
14473424 AAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAACAAA-ATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
65 AAATCTT-TTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATTGAAATAAGC
* * * * * * * * *
14473487 ATGTAT-AAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTC
128 TTGTATGAAA--AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * * * *
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1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGATAAATACATTTATTTTTT
* * * * * * * *
14473604 AAATCTCTTA-TTA--AATT-T-T-AAAATATGAT-CATTTAGCAATATTTTACTCTG-AATAAA
65 AAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATAT-TAATAAATTTA-TATTATTTTAAT-TGAAATAAG
* *** * * * * *
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127 CTTGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * * * * *
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1 AA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGATAAATACATTTATTTTT
* * * * * * *
14473778 TAAA---TGT-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATT-TTTTTATTCTAAATAAT
64 TAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATT-GAAATAAG
* * * * * * * * *
14473837 TTTATATGAATAAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAATGTCATAATGATTTG
127 CTTGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * * * *
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1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA-TAAATACATTTATTTTTT
* * * * *
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* * * *
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* * ** **
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1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAAT-ACATTTATTTTTT
* * * * * * *
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* * * * * *
14474186 CTTTTAT-AAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
127 CTTGTATGAAA-A-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * ** * * * *
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1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTTGATAAATACATTTATTTTTT
* * * * *
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65 AAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCT
* * ** * * * * *
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129 TGTATGAA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TTATAACGA-TTTG
* * ** * * * * *
14474420 AAAGAGATAATCATTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTT-TTTTTTT
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
* * * ** * * * *
14474484 AATTTTCTTACTCATTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTGGTATTGTTTTACTTCAAATATGCT
66 AATCTT-TTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCT
* ** * * * * * * * *
14474548 TATATGAGTTAAAACAATTATTTTATTACAAAATAAAAGGTCATAATGAGTTG
129 TGTATGA-AAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* * * * * * * *
14474601 TAATATATAATTTTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTTATAAACATATTTATTTTTTA
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTTA
* ** * * *
14474666 AATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCG-AATAAACTT
66 AATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAAT-TGAAATAAGCTT
* * * * * * *
14474730 GTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAATAAAAAGTCAAAACAATTTG
130 GTATGAAA-A-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
* *
14474782 AAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAA-TAATTTGAACTTATTT
1 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTATTT
14474826 AGTAAACAAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
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AATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
TATGAAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
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14471347 TTGAGATTGC
* * * * *
14471357 AAATAGATAATTATTCAAATAATTATGACTATTTGAACTTATTCTATAAAC-A-TAATTATTAAT
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAATTAATTTTTAA-
* * * * * *
14471420 AT-TTTATTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTA
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* ** *
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130 TGAACAAAAATAATTGTTTTATAAGAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAACTATTC
* * * * *
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* ** * * *
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* * *
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** * * *
14471714 TTATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTA
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* * *
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64 AATCT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-ATTCAAATAAGCCT
* * * *
14471843 GTATGAACTAATATAATTGTTTTATGATG-AAACAAAAGGTTATAACGATTTG-AATAAATAACT
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* * * * * *
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*
14471969 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTACGGACAA-
254 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTA-GGAAAAG
* * **
14472033 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTG
318 AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG
* * * *
14472075 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATAT-GATAAACAAACTTATTTTTT
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTAT-TCGATAAAC-AA-TTAATTTTT
* * * * *
14472139 AAGTCTTTTACTGATTAATTGTTT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTCAATTGAAATAAGCT
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* ** ** * * * * * ** *
14472203 TATATGATTAGAAAATTTTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGGTAAT
126 TGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTATAAGAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAAC
* * * * * * * *
14472268 TGTTTAAATGGTCAT-AGCTATTTAAACTTACTCGATAAATAGATATAGTTTTT-AAATC---T-
190 TATTCAAATAGTCATGA-CTACTTAAACTTATTTGATAAATACATTTA-TTTTTAAAATCTTTTA
* ** * * * * * *
14472327 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTT-ATTCTGAATAAGCGTATACGAAT
253 CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTAGGAAA
* * * * * **
14472390 AGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTG
316 AGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG
* *
14472434 AAATAAATAATTATTCAAA
1 AAATAGATAATTGTTCAAA
14472453 CAATTATGTT
Statistics
Matches: 606, Mismatches: 106, Indels: 52
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Matches are distributed among these distances:
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364 6 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAATTAATTTTTAAA
TCTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTCAAATAAGCCTGTAT
GAACAAAAATAATTGTTTTATAAGAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAACTATTCA
AATAGTCATGACTACTTAAACTTATTTGATAAATACATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA
TTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTAGGAAAAGAAAAAATT
ATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG
Found at i:14473327 original size:925 final size:927
Alignment explanation
Indices: 14471653--14473370 Score: 1913
Period size: 925 Copynumber: 1.9 Consensus size: 927
14471643 TTTTAATTGA
* * * ** *
14471653 AATAAGCTTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCAATTTGTTAT
1 AATAAGATTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATACCAATTTGAAAA
** *
14471718 AGGTAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATC
66 AAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATC
** * *
14471783 TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAAAAAGCCTGTATG
131 TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAAAAAGCCTATATA
* * * ** ** * *
14471848 AACTAATATAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAATAAATAACTATTCAAA
196 AACAAAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGATTATAACGATTTGAATAAATAACTATCCAAA
* * ** * *
14471913 TAGTTATGATCATTTAAACTTGTTTGGTAAACTTATTTATTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATT
261 TAGTTATAATCATTTAAACTTGTTCGGTAAACGAATTTATTTTTAAAATCTTTAGCTCATTAATT
* * * *
14471978 GTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTACGGACAAAAACAATTGT
326 GTCAAAATATTAATAAATCAATACTATTTTAATTCAAATAAGCTTCTACGGACAAAAACAATTAT
* *
14472043 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
391 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATT
* * * **
14472108 TGAATTTATATGATAAACAAACTTATTTTTTAAGTCTTTTACTGATTAATTGTTTGAATATTAAT
456 TGAACTGATATGATAAACAAACTTATTTTTTAAATCTTCGACTGATTAATTGTTTGAATATTAAT
* ***
14472173 AAATTTATATTATTTCAATTGAAATAAGCTTATATGATTAGAAAATTTTTATTTTATGACAAAAC
521 AAATTTATATTATTTCAATTGAAATAAGCTTATATGATGAGAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * ** * * *
14472238 AAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAATGGTCATAGCTATTTAAACTTACTCGA
586 AAAAGGTTATAACGATTTGAAACAGATAATCATTTAAATAGCCATA--TATTTAAACTTACTCAA
* *
14472303 TAAATAGATATAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA
649 TAAATAGATATAGTTTTTAAATCTCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATGTTA
* * * * * **
14472368 TTCTGAATAAGCGTATACGAATAGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTTATAATGATTT
714 TTCTGAATAAGCGTATACGAATAGAAACAATTGTTTTATCACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
14472433 GAAATAAATAATTATTCAAACAATTATGTTCATTGGTTAAGCCAATAGATTCATTTTTTAAATTC
779 GAAATAAATAATTATTCAAACAATTATGTTCATTGGTTAAGCCAATAGATTCATTTTTTAAATTC
14472498 ATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATTA
844 ATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATTA
14472563 ATAGAAACAATTAATTCCG
909 ATAGAAACAATTAATTCCG
* * * *
14472582 AATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAC-AAATGGTCATACCGATTTGAAA
1 AATAAGATTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATACCAATTTGAAA
* * * *
14472645 AAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATTGAACTAGTTTGGTAAACATATTTA-TTTATT-A
65 AAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT-TTGAACTAGTTCGATAAACAGATTCAGTTT-TTAA
*
14472707 A-CTC-T-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAA-CTT
128 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAA-AAAGCCT
* * * *
14472767 ATATAAACAAAAACATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGATCT-TAATGATTTGAAATAGATAATT
191 ATATAAACAAAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGAT-TATAACGATTTG-AATAAATAACT
* * * *
14472831 ATCCATATCGTTTTAA-CTATTTAAA-TTGGTTCGGTAAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
254 ATCCAAATAGTTATAATC-ATTTAAACTT-GTTCGGTAAACGAATTTATTTTTAAAATCT-TTAG
* * ** * * * ** * *
14472894 -TCATTAATTTTCATAATATTTTTAGATCAGTACTATTTTATTTTGAATAATCTTCT-CTGA-AG
316 CTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATCAATACTATTTTAATTCAAATAAGCTTCTACGGACA-
* * * * * *
14472956 ATAAATAATTATTTTATGATAAAACAGAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
380 A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
14473021 ATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTTCGACTTATTAATT-T
444 ATCATAACTATTTGAACTGATATGATAAACAAACTTATTTTTTAAATCTTCGACTGATTAATTGT
* * *
14473085 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGATGA-AAAACAATT
509 TTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTCAATT-GAAATAAGCTTATATGATGAGAAAACAATT
* * *
14473147 GTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAACAGATAATCATTCT-AATAGCCAT-TG
571 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAACAGATAATCATT-TAAATAGCCATATA
* * * * * *
14473209 TTTGAACTTATTCAATAAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTTAAATATT
634 TTTAAACTTACTCAATAAA-TAGATATAGTTTTTAAATCT----CTTATCAATTTTTGAAATATT
* * * * * * * *
14473273 AATACAGTA-ATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTCTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATCATA
694 AATAAAGTAGA-ATTATGTTATTCTGAATAAGCGTATACGAA-TAGAAACAATTGTTTTATCACA
* *
14473336 AAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATT
757 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
14473371 GTTTAAATAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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929 33 0.05
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (927 bp):
AATAAGATTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATACCAATTTGAAAA
AAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAAAAAGCCTATATA
AACAAAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGATTATAACGATTTGAATAAATAACTATCCAAA
TAGTTATAATCATTTAAACTTGTTCGGTAAACGAATTTATTTTTAAAATCTTTAGCTCATTAATT
GTCAAAATATTAATAAATCAATACTATTTTAATTCAAATAAGCTTCTACGGACAAAAACAATTAT
TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATT
TGAACTGATATGATAAACAAACTTATTTTTTAAATCTTCGACTGATTAATTGTTTGAATATTAAT
AAATTTATATTATTTCAATTGAAATAAGCTTATATGATGAGAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
AAAAGGTTATAACGATTTGAAACAGATAATCATTTAAATAGCCATATATTTAAACTTACTCAATA
AATAGATATAGTTTTTAAATCTCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATGTTATT
CTGAATAAGCGTATACGAATAGAAACAATTGTTTTATCACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
AATAAATAATTATTCAAACAATTATGTTCATTGGTTAAGCCAATAGATTCATTTTTTAAATTCAT
TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATTAAT
AGAAACAATTAATTCCG
Found at i:14474592 original size:360 final size:357
Alignment explanation
Indices: 14472593--14474834 Score: 1460
Period size: 360 Copynumber: 6.3 Consensus size: 357
14472583 ATAAGATTGT
* * * * ** * * **
14472593 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAATGGTCATACCGATTTGAAAAAAATAATTGTT
1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGATCATAATGATTT-AAATAGATAATCATT
* * * * * *
14472657 CAAATAGTTATAACT-TATTGAAC-TAGTTTGGTAAACATATTTATTTATTAA--CTC-T-CTTA
65 CAAATAATCATAACTAT-TTGAACTTA-TTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAATTTTCTTACTTA
* * ** * * * **
14472716 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATAAACAAAAAC
128 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAATTAAAAC
* * ** * * * * * ** *
14472781 ATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGATCTTAATGATTTGAAATAGATAATTATCCATATCGTTTTA
192 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
* * ** * * * *
14472846 ACTATTT-AAATTGGTTCGGTAAAC-GAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-GTCATTAATTTTCAT
257 ACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTC-TAAATTTTTAA
* * * * * *
14472908 AATATTTTTAGATCAGTACTATTTTATTTTGAATAATCTT-C
319 AATA-TTATA-ATTA-AATTATTTTACTTTGAATAAACTTGC
* * * * * * * * * * * **
14472949 TCTGAAGATAAATAATTATTTTATGATAAAACAGAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGT
1 -ATGAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGATCATAATGATTT-AAATAGATAATCAT
** * * * * *
14473014 TCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTTC-GACTTA
64 TCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTT-TTTTTTTAATTTTCTTACTTA
* * * *
14473078 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATGAAAAA
128 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAAT-TAAAA
* * * * * *
14473142 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAACAGATAATCATTCTAATAGCCAT
191 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * ** * *
14473207 ---TGTTTGAACTTATTCAATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTTAAA
256 GACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTTTTAAAA
* * * *
14473269 TATTAATACAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-C
321 TATT-ATA-ATTAA-ATTATTTTACTTTGAATAAACTTGC
* ** *
14473308 TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATC-ATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATT
1 -ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTA-CGATAAAACAAAAGATCATAATGA-TTTAAATAGATAATC
* * * ** * * *
14473371 GTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGGCTTATTTTTTAAAATTTCTTACT
62 ATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACA-AATTTTTTTTTTAATTTTCTTACT
* * * * * * * *
14473436 TATTAATTTTTTGAATGTTAACAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATAAATTGAA
126 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAATTAAA
* * * ** * * *
14473501 ACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTCAAATAGATAACTATTC-AATAGTCT
190 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* ** * *
14473565 TCACTATTTGAAC-TAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TAAA-TTTTAA
255 TGACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTTTTAA
* * * **
14473625 AATATGATCATTTAGCAA-TATTTTACTCTGAATAAACTTTT
319 AATATTAT-AATTA--AATTATTTTACTTTGAATAAACTTGC
* * * * *
14473666 ATGAATGGGAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAATGATTTAAGATATATAATTATT
1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGATCATAATGATTTAA-ATAGATAATCATT
* * * * ** * *
14473730 CAAATAGTCATAATTATTTAAAC-TAGTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAA--AT-GT-CTTAT
65 CAAATAATCATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAATTTTCTTACTTAT
** * ** *
14473790 TAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCTAAATAATTTTATATGAATAAAAACA
129 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAATTAAAACA
* * * * *
14473855 ATTATTTTACGAGAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATG
193 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATG
* * * * * * * *
14473919 ACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAAT
257 ACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTTTTAAAAT
* * *
14473984 A-T-TAA-TAAATTA--GTA-TTTAAAATAAACTTGT
322 ATTATAATTAAATTATTTTACTTT-GAATAAACTTGC
* * *
14474015 ATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAA-C-TT
1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGATCATAATGATTT-AAATAGATAATCATT
* * ** *** ** * * *
14474078 --AA-AGTCATAACTATTTAAACTTGCTCAATAAATGAATTTATTTTTTAAGTCTT-TTGCTTAT
65 CAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAA-TTTTCTTACTTAT
* * * * *
14474139 TAATTTTTGGAATTTTCATAAATTAGTATTATTTCATTCTAAATAAGCTTTTAT-AAATAGAAAC
129 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAATTA-AAAC
** * * *
14474203 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTCATA
192 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
* * * * * **
14474268 ACTATTTGAA-TGTGTTCAAAAAACAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTCTGAA-TTTTGGAA
257 ACTATTTGAACT-TATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTTTTAAAA
*
14474330 TATTAGTAAATTTAAATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGC
321 TATTA-T-AA-TTAAATTATTTTACTTTG-AATAAACTTGC
* * * *
14474370 ATGAAT-GAAACCAATCGTTTTACGATAAAACAAATGATTATAAT-ATTTTGAAAGAGATAATCA
1 ATGAATAGAAA-CAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGATCATAATGA-TTT-AAATAGATAATCA
* * *
14474433 TTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTTTTTTTTAATTTTCTTACTCA
63 TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAATTTTCTTACTTA
* * * *
14474498 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTGTTTTACTTCAAATATGCTTATATGAGTTAAAAC
128 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAATTAAAAC
* * * * * *
14474563 AATTATTTTATTACAAAATAAAAGGTCATAATGAGTTGTAATATATAATTTTTCAAATAGTCATG
192 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
* ** * * * * * * *
14474628 ACTATTTGAACTTGTTTTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAAT
257 ACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTTTTAAAAT
* ** *
14474693 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGT
322 ATT-AT-AATTAA-ATTATTTTACTTTGAATAAACTTGC
* * ** * * * ** * *
14474732 ATAAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAATAAAA-AGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTAT
1 ATGAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGA-TCATAATGATTT-AAATAGATAATCAT
* * *
14474796 TTAAATAGTCATAA-TAATTTGAACTTATTTAGTAAACAA
64 TCAAATAATCATAACT-ATTTGAACTTATTTGGTAAACAA
14474835 CTAAAATAAT
Statistics
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0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
ATGAATAGAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAATAGATAATCATTC
AAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAATTTTCTTACTTATTA
ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTATATGAATTAAAACAATT
ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTA
TTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTTTTAAAATATTA
TAATTAAATTATTTTACTTTGAATAAACTTGC
Found at i:14475136 original size:167 final size:165
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14474910 AACTGTTTAG
* * * *
14474920 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTAGAATATTATTAAAGCAATATTAT
1 ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAAGCAATATTAT
* * *
14474985 TTTATTTCAAATAAG-CT-TAT-ATGAACTGAAAGAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTT-AT
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14475046 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGGAACTGGTTCA
125 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGGAACTGGTTCA
* * ** *
14475087 ATAAATAAATTTATTTTTTGAA-CTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAAGCAATATTA
* * *
14475151 TTTTATCCTAATAGCCTCGTATGATGAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAATA
65 TTTTATCCAAATAGCCTC-TATGATGAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAACA
14475216 ATTTGAAATAGATAATT
129 ATTTGAAATAGATAATT
14475233 ACTCAAATGG
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 15, Indels: 13
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
165 5 0.04
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169 5 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (165 bp):
ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAAGCAATATTAT
TTTATCCAAATAGCCTCTATGATGAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAACAAT
TTGAAATAGATAATTGTTCAATAGGAACTGGTTCA
Found at i:14475971 original size:535 final size:535
Alignment explanation
Indices: 14474864--14478477 Score: 2480
Period size: 542 Copynumber: 6.8 Consensus size: 535
14474854 ACCAAAGGTC
* * * * * * * *
14474864 ATAACGATTTGAAAAAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAC-TGTTTAGATAAATAG
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ACATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAG
* * * * ** *
14474928 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTAG-AATATTATTAAAGCAATATTATTTTATTT
64 A-TTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * **
14474992 CAAATAAGCTTATATGAACTGAAAGAATTATTTTATAACAGAAC-AAAAGGTTATAACAATTTGA
128 CAAATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * *
14475056 AATAGATAATTG------T--TC--AA-TA--GGAACTGGTTCAATAAATAAATTTATTTTTTGA
193 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAA
** * *
14475108 A-CTCCTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCCT-AAT-AGCCTC
258 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAAT-AATTA-TAATATTTTATCCTGAATAAGCCTT
** * **
14475169 GTATGATGAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAA-AGTTCATAATAATTTGAAATAGATAATT
321 GTATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGAG-TCATAACGATTTGAAATAG-TAATT
* * * * ** *
14475233 ACTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC-TGATTCAATAAAC-TGATTTATTTTTTTGAATCCCTAA
384 ATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAT-ATTTA--TTTTTAAAT--CT-A
* * * * * * * ** * * *
14475296 ATTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTACTTTATTTTGGATAAGATTTTATGAACTG
442 CTTATTAATTTTT-TAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAG
* * *
14475361 AAATAATTGTTTTATGATAACACAAAATGTT
505 AAACAAATGTTTTATGATAAAACAAAATGTT
* *
14475392 ATAACGATTCT-AAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAG
1 ATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAA-CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAG
* * *
14475456 ACTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAGTATTATTTCAT
64 A-TTATTTTTT-AAATTTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * *
14475520 TTAAAATAAACTTGTATAAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAA-GTCAAAATGATTT
126 TTCAAATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAAGGTCATAATGATTT
* ** * * **
14475584 GAAATA-CTAATTGTTTTAATAATCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACT-TTTATTTTT
191 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-TATTTATTTTT
* * * * *
14475647 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATGTTATTAATT-TCCAATATTTTAGCCTAAATAAG-
255 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAATTAT--AATATTTTATCCTGAATAAGC
* * * * *
14475709 TTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAGA-TCATAACGATTTTAAATAGTAAT
318 CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGAGTCATAACGATTTGAAATAGTAAT
* **
14475773 TATTTGAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACATATTTAGTTTTTAAATCT-CCAA
383 TATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTACTTA
** * *
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446 TTAATTTTTT-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAC
*
14475900 AAATGTTTTACGATAAAACAAAATGTT
509 AAATGTTTTATGATAAAACAAAATGTT
* * * * * * * *
14475927 ATAACGATTTGAAATAGCTAATGGTTCAGATAGACTTGACTATTTGAATTTGTCTAGTGAACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGA
* *
14475992 TATATATTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
65 T-TAT-TTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
14476056 TCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGGCAAGAC-AAAAGATCATAATGATTT-
127 TCAAATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * *
14476119 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTCGCTC-AGTAAACATATTTATTTTTT
192 AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACATATTTA-TTTTT
* * * *
14476183 TAAATCATTTACTTATTAATTTTTA-AAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAG-
255 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAAT-AATT-ATAATATTTTATCCTGAATAAGC
* * * * * *
14476246 CTTTTATGAACAAAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAATGA-TCATAATGATTTGAAATTGATA
318 CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA-GAGTCATAACGATTTGAAATAG-TA
* * * * *
14476310 ATTGTTTAAATAGTTATAACTCTTTGAACATGTTCTGA-AAACATATTTATTTTTAAAATTTTTA
381 ATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGATAAACATATTTATTTTT-AAA--TCTA
* *
14476374 CTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGCATGAACA-
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* * * *
14476438 AAACCATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTC
505 AAACAAATGTTTTATGATAAAACAAAATGTT
* * * * *
14476469 ATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTGAGCTTG-TTCGATAAACAG
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* *
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* ** * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * *
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** * * * *
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** * * * **
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * ** *
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* ** * * * * *
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* *
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* * *
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**
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* * * * *
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* *
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*
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* *
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* *
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*
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* * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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1 AATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* ** * * * * * *** * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * *
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*** ** * * *
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* * ** * * * * *
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14486953 CAA
177 CAA
* * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * **
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* *
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* * * * *
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* ** ** * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * **
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* * * * * *
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* ** * * * * **
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* * * * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * ** * **
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* * * ** *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * *
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65 TTAT
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* * * *
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* * * *
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* * * ***
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* * *
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* * **
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* ** * *
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* **
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* * *
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Consensus pattern (415 bp):
TTTTGTTTTATCACAAAACAATTGCTTCTATTCATACAAGCTAATTCAAAATAAAATAAATCAAA
TATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAATAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGT
ACAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGCCATACCCTTTTTATTTTGCCAT
AAAATAAAATTTTTTATTCATACAAGCGTATTTCAAACAAAATAATACAAATTTATTAATATTTA
GAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
TGTTTATACAAAAATCATTATGACC
Found at i:14487720 original size:181 final size:179
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 7.6 Consensus size: 179
14487324 TTGTTTTATT
* * * * *
14487334 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTAATT-TTGAATAAAATAA-AATAAATATATTAGTA
1 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * *
14487397 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAGTAAATCTATTTTCTAAACACATTTAAATAATT
64 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC-CATTCAAATAGTT
* * * *
14487461 -TGACTATTTGGATAATTATCTATTTCAAATAGTTATTACCTTTTATTTTGTC
128 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-TTTTTATTTTGTC
* * * *
14487513 ATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCGTATTCATAACAAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*
14487578 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAGGTAAGCA-T-AAATAGTT
66 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA---AACCATTCAAATAGTT
* * * * *
14487641 ATGATTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTC
128 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAT-TTTTATTTTGTC
** * * *
14487694 ATAAAACAATCATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * *
14487759 TTAAAAATTAATAGGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGTCAT
66 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC-CATTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
14487823 GTCCATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTATTTTATC
130 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-TTTTTATTTTGTC
* * * * * * * * * * *
14487874 ATTAAACAATTATTTCTTTTCATAAAAACTGATTTAGAATTAAAATAATAGTGATTTATTAATTT
1 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA-TA
** * * * *
14487939 TTTTGAAAA-T--T-AGTGAGAGATTT-AAAAAT-AATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTT
64 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-TTCAAATAGTT
* *
14487998 ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATTTTTATTTTGTC
128 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATTTTTATTTTGTC
* * * * *
14488050 ATAGAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGCTTATTCCA-ATTAAAATAAAACTAATTTAATAATAT
1 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CATAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * **
14488113 TCCAAAAATTAATCCA-TAAGAA-ATTCAAAACATAAATATGTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGT
65 TTCAAAAATTAAT-AAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-TTCAAATAGT
* * * * *
14488176 TAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGACTTTTTGTTTAGTC
127 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-TTTTTATTTTGTC
* * * *
14488230 ATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAACTTATTCGA-AATAAAAT-A-A-TAATTTATTAACA-
1 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-ATAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * *
14488290 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGAT
65 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-TTCAAATAGTT
* * *
14488355 ATGAATATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTAGTT-TGACCTTTTGTTTTGTC
128 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGA-TTTTTATTTTGTC
* * * * * * *
14488407 ATAAAACAATTGTTT-AAGTTCAAAAAAACTTA-TCTTAAATAAAATAATACTACTTTATTAACA
1 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAT-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
14488470 TTTCAAAAATTATTAA-TCTAAAGATTTAAAAACTAAAGCTGCTTT-CCAAATCAATTCAAATAG
64 TTTCAAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAA-CCATTCAAATAG
* * * * * * * ** **
14488533 TTACGATTGTTTGAATAAATATCAATCTCAAATCTTTATGATCCTTATTTTGTC
126 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATTTTTATTTTGTC
** * *
14488587 ATAAAA-AATTTGTTTCTAAGCACACAAGCTTATTCGGAT-A-AAAATAATACTAATTTAATAAT
1 ATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC--ATAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*
14488649 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAAAT
63 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
14488688 GTGTTTGCTG
Statistics
Matches: 942, Mismatches: 181, Indels: 103
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 7 0.01
174 19 0.02
175 16 0.02
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177 121 0.13
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182 11 0.01
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTCAAATAGTTATG
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATTTTTATTTTGTC
Found at i:14488633 original size:357 final size:359
Alignment explanation
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Period size: 357 Copynumber: 2.2 Consensus size: 359
14487944 AAAATTAGTG
* * *
14487954 AGAGATTTAAAAAT-AATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 AGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTAT
* * ** * * *
14488018 CTATCTCAAATTGTTATGATTTTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATT
66 CTATCTCAAATTGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCAAAAAAACTTATT
* * * *
14488083 CCAATTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATCCATAAGAAATTCAAAACATAA
131 CCAAATAAAATAAAACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATCCATAAGAAATTAAAAACATAA
* * * * * *
14488148 ATATGTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTT
196 AGATGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAATATCAATCTCAAATCATTT
* * * *
14488213 TGACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAACTTATTCGAAATAAAAT-A-
261 TGACCTTATGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATGCACACAAACTTATTCGAAATAAAATAAT
*
14488276 A-TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCA
326 ACTAATTTAATAACATTTC-AAAAATTAATAAGCA
*
14488309 AGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGATATGAATATTTGAACAATTA
1 AGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTA
* *
14488374 TCTAT-TTAAATTAGTT-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCAAAAAAACT
65 TCTATCTCAAATT-GTTATGA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCAAAAAAACT
* * * * * *
14488437 TA-TCTTAAATAAAATAATACTACTTTATTAACATTTCAAAAATTATTAATCTA-AAG-ATTTAA
127 TATTC-CAAATAAAATAAAACTAATTTAATAACA-TTCAAAAA--ATTAATCCATAAGAAATTAA
* * * * * * *
14488499 AAAC-TAAAGCTGCTTT-CCAAATCAATTCAAATAGTTACGATTGTTTGAATAAATATCAATCTC
188 AAACATAAAGATG-TTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAATATCAATCTC
* *
14488562 AAATC-TTTATGATCCTTAT-TTT-GTCATAAAA-AATTTGTTTCTAA-GCACACAAGCTTATTC
252 AAATCATTT-TGA-CCTTATGTTTAGTCATAAAACAA-TTATTTC-AATGCACACAAACTTATTC
* * *
14488622 G-GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
313 GAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCA
* * * * * *
14488669 A-ATGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAATTAA-TTCAAATAGTTA-AAACTATTAGAATAA
1 AGA-GATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAA-TATTTGAACAA
14488731 TTATCTAT
62 TTATCTAT
14488739 GTTAGCACAA
Statistics
Matches: 354, Mismatches: 54, Indels: 39
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
355 8 0.02
356 19 0.05
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358 89 0.25
359 26 0.07
360 82 0.23
361 13 0.04
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (359 bp):
AGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTAT
CTATCTCAAATTGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCAAAAAAACTTATT
CCAAATAAAATAAAACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATCCATAAGAAATTAAAAACATAA
AGATGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAATATCAATCTCAAATCATTT
TGACCTTATGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATGCACACAAACTTATTCGAAATAAAATAAT
ACTAATTTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCA
Found at i:14490705 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 14490371--14490709 Score: 393
Period size: 181 Copynumber: 1.9 Consensus size: 182
14490361 AAACTTATTC
**
14490371 AAAGTAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATAAGATTTGAAAAAATAA
1 AAAGTAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAACCAATAAGCATAAGATTTGAAAAAATAA
* * *
14490436 ATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATACTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTACAATCATTT
66 ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTACAATCATTT
*
14490501 TGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACATCTCT
131 TGAACTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACATCTCT
* * *** *
14490553 AAAGTAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTGAAAACCAATAAGTA-AGAGATTT-AAAAAATA
1 AAAGTAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAACCAATAAGCATA-AGATTTGAAAAAATA
* * * * * * *
14490616 AATC-AGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGGCCT-TTTGTATAAATATCTATTT-CAAATT
65 AATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATACTTAT-GACTATTTGAACAAATATCTATTTAC-AATC
* * *
14490678 GTTATTGCA-TTTTGATTTGTTATAAAACAATT
127 ATT-TTGAACTTTTGATTTGTCATAAAACAATT
14490710 ATTTTTCAAC
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 22, Indels: 11
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
180 2 0.02
181 77 0.59
182 51 0.39
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (182 bp):
AAAGTAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAACCAATAAGCATAAGATTTGAAAAAATAA
ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTACAATCATTT
TGAACTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACATCTCT
Found at i:14491118 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 14490740--14491555 Score: 698
Period size: 177 Copynumber: 4.6 Consensus size: 179
14490730 ATTTGAAATA
* * * * *** ** *
14490740 AAATCGTTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAACTTATTTGAAA
1 AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGGTTATTTGGAA
* ** * *
14490805 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGGA-T-T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * *
14490867 TTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTTTTTATTTC
131 TTCTC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTC
* ** * *
14490917 AAATTGTTATAATTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGGTTATTTGGAA
1 AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGGTTATTTGGAA
* * *
14490982 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAAATTCATGACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCA
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATT-ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * *
14491047 TTTGCTCAAGC-AGTTCAAACAGTTAGGACTATATGAACAATTATCTATTTC
130 TTT-CTCAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTC
* * *
14491098 AAATTGTTATGACCTTTTG--TTGTCAT--AA-AATTATTTCAT-CTCATACAAGTTTA-TTGGA
1 AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGGTTATTTGG-
* * * * * *
14491156 AATCAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGA-ATTTAAAAACTAATTC
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAAATTATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
14491220 TATTTACTGAACTAATT-AAATAATTATAACTATTTGAATAATTTTCTATTTC
128 TATTT-CTCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTC
* * * * *
14491272 AAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAA-GTTTTTTTGAA
1 AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGGTTATTTGGAA
* * * * *
14491335 AAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTTAGAGATTTAAAAAGTAAATCTA
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATT-ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
14491400 TTTAC-CAAATCATTTTAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTATCTCTTTC
130 TTT-CTCAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTC
** * * * ** * * * ** *
14491450 AAATCATTATAACGC-TTCGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTGTTTGGA
1 AAATTGTTATTAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGGTTATTTGGA
* * *
14491514 ATTAAATAACACTAATTTATTAATA-TTATAAAATTAATGAGT
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATT-ATGAGT
14491556 TGGAGATATT
Statistics
Matches: 517, Mismatches: 98, Indels: 46
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 46 0.09
175 29 0.06
176 67 0.13
177 130 0.25
178 93 0.18
179 42 0.08
180 30 0.06
181 77 0.15
182 3 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGGTTATTTGGAA
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
TTCTCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTC
Found at i:14492256 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 14491886--14494523 Score: 2158
Period size: 181 Copynumber: 14.6 Consensus size: 180
14491876 TTGTTCTGAC
* * * * * **
14491886 CTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTT-TAGTTAATACATGCTTATTTTGAAATAAAATAATAC
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
14491950 TAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGGAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTT-TTTACCGAA
64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAGAGA-TTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAA
* * * * * * * * *
14492014 TAAATTCAAATAGTTCTGACTATTTGAACAGTTATTTATTTAAAACCATTGTGAC
126 TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
* * * * *
14492069 CTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATT
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * *** *
14492133 ATTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGCAGATTCAAAAAATAAATCAATTTATCAAATCA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCA
* * * *
14492198 GTTCAAATAATTATG-GTCATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCATTATGAA
129 GTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
* * * * *
14492250 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACT
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * *
14492314 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACTAAA-CT
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-
* * * *** *
14492378 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTATATTTCAAATTGGTCT-AA
128 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
* * **
14492430 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTGTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
1 -CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
14492495 AATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGATATTTCAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAC
65 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT
* * * * * *
14492559 CAATTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACA
127 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-A
* * * * * * * * * * *
14492614 C-TTCGTTTTGTCGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTGTTTTAGAATAAAATAATATT
1 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACT
**
14492678 AATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT---GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CTA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-A
* * * * * * *
14492739 GTTCAATTAGTTATAACAATTCGACCAATTATTTATTTTC-AATCGTTAT-AA
129 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGAA
* * * * * * * * *
14492790 CCATTTATTTTATCATAAAAGAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTTAGAATAAAGTAATGC
1 -CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATAC
** * * * ** * *
14492854 TAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATTATTTTGTTGGCCTATTC
64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC
* * * **
14492919 AGTGCAAATAGTTATGAC-ATTTTAAACAATTATCTATTTCACATTGTTAT-AA
128 AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
* * * * * *
14492971 CTTTTTCTTTTGTC-TCAAAATAATTGTTTCTATTCGTACAAACTTATTCAAAATAACATAATTC
1 C-TTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * ***
14493035 TAATTTGTTATTA-TTCTAAAAATTCATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAAT
64 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT
* * * * * ***
14493099 GAGTTCGAATAGTTATGAATATTTGAACAATTACCTATTTTAAATTGCTAT-AA
127 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
* * * * *
14493152 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAAT-TTTCTATTCATACAAGCCTATTTC-AATTAAAATGATA
1 -CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA
* * * * * * * *
14493215 CAAATTTATTAACA-TTCAGACAATTAGTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAACTTTGTTTACCAAA
63 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA
* * * * * * *
14493279 TAAGTTCAAATAGTTTTAACTATTTGAAAAATTATTTATTTTAAATCATTATG-T
126 TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
* * * ** * *
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*
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* *** **** ** * * *
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* * * * * ** *
14496578 AATAATATT-TCAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAGTAGTTC
250 ATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTT
* * * * * ** *
14496642 AAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTC
314 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
14496686 TAACTTTTTGTTTAGT--TAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAATTAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * ** * **
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65 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTA
* * * ** * * ** * *
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125 AA-TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTT
* * ** ** *
14496878 TTGTCATAAAGCAATTATTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATGCAATAAAATAACACTAATTTATT
189 TTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
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253 AATATTAT-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTTA
* * * ** * **
14497004 AATAATTATGGCCATTTGAATGATTATTTATTTCAAATTGTTA
315 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
14497047 TGACCTTTTGTTTTGCCATAAAA-AAATGCTTTTTAATT-ACACAAGCTTATTC-GAAATAACAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAAT
* *
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63 AATATTAATTTAT-TAATA-TT-TTAAA--AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTT
* ** * * * * * * * *
14497171 AATGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATC-AATCTCGAGTTGTTA-AGATCG
121 ACT-AAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATA-A-CC
* * * ***
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182 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAA-ATAATACT
** * * * ** * *
14497295 AATTTAATT-ATATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATTAATATATTTGTCGAACC
245 AATTT-ATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* ** ** ** * * *
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309 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** * * * *
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1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCAT-ACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * ** * * * *
14497466 AT-TCAAATTTTTTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAATTTTGAAAAAAGAAACA-GTTTATCG
64 ATAT-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTA-CT
* * * ** * *
14497529 AACA-AGTT--AATAGTTATGACTATTT-AACTATTATTTATTTAAAATCATTATAACATTTTGT
124 AA-ATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGT
* ** * **
14497590 TTT-TCAT--AACAATATGATTCCGGTTCATAAAAGGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT
188 TTTGTCATAAAACAAT-T-ATTTCTATTCATACAA-GCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
14497652 CTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAATAAATTGGTTTATCAAACCAA-
250 ATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAG
* * ** * ** *
14497714 TTCAACTAGTTACAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTCA
311 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
14497761 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-ATATTGTTTC-AGTTCATGCAAGCTTTTTCAAAATAAAATA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * ** *
14497824 ATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTACTTA-TCGAAT
64 ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAAT
* * ** * * * *** * * *
14497888 CAATTCAAATAATTAT-GGTCATTTTAAGAATTATCTCTTCGAAATTGTTATTACCTTTTGTTTG
128 -AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
* * * * * *
14497952 GTCATATAACAGTTGTTT-TAGTTCATACAAACTTATTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAA
191 GTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * **
14498016 CATTCA-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTGACAACATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCGAA
255 TATT-ATAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAA
* *
14498079 TAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTA-TGCAAAATCATTA
317 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTA
* ** * * * * * *
14498120 TGACATTTT-TTCTACCACAAAATAATT-TTT-TAGCTT-ATAAAAGCTTATCCACAATGAAATA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * *
14498181 ATAATACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTCAGAGATTTAAAAAATAAATGA-GTTTACT
64 ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACT
* * ** * * ** * * *
14498245 AAATCAACTT-AAATAATTATGGCCATTTCAACAGCTATCTATTTCCAATTGTTATTACCTTTTG
124 AAAT--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTG
* * * * * * *
14498309 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCCTATTCAAAATTAAATAATACTAATTTG
187 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * ** *
14498373 CTAATATT-TCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAAACAAATCTATTTGGCTGAACCAGTT
251 TTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAACAAGTT
* * **
14498433 TGAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTTA
313 T-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * * **
14498478 TAACCTTTTGTTCTACCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* ** * * *
14498543 ACTAATTTAGAAATATTTTGAAAATTAATAAGATATTT-AAAAATAAATCCAT-TTGT-CGAACA
66 ATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT--ATGTT-TACTAA-A
** * * * * *
14498605 -AGTTCAAGCAGTTA-AGACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
127 TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
* * ** * *
14498668 GTCATAAAATAATTATTTC-AGCTT-ATAGAAGCTTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTA
191 GTCATAAAACAATTATTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
14498731 ATATCTAAAAAAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAACTCTATTTATCAAACCAA-TTT
254 ATAT-T---ATAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTT
* * * * *
14498794 AAATAATTATAACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCGTTA
314 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * * *
14498838 TTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * * *
14498902 TACTAATTTATTAATA-TTTACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTA
65 TATTAATTTATTAATATTTTA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA
* * * ** *
14498966 AACCATTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATAATTATAACCTTTTA
125 AA-TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTTTG
* ** * ** ** * *
14499029 TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAA
187 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * ** * * *
14499094 TAATATT-TCCAAACTTAATAACCAGGAAA-A-TTAAAAAATAAATCTAATCACCAAACTAGTTC
252 TAATATTAT-AAAAATTAATAAGTA--AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTT
* * * *
14499156 AGATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAATCATTA
314 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * * *
14499200 TGACCTTTTCTTTTGTCATCAAAA-TATTGTAT-TGTTCAAAGAAGCTTATACTGATTAAAATAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * *
14499263 TATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGA
65 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTA
* * * * ** ** * * * *
14499328 AGTAATTCAACTGGTTA-AGACTATTAAAACAATTATCTATTTGAAATCATTTTGACTTTTTGTT
125 AATAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTT
* * * *
14499392 TAGTC--AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATT
189 TTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
14499454 AAGATTCA-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACAAGTTCA
253 AATATT-ATAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTA
* * * * *
14499517 AATAGTTTTTACTATTTGAATAATTGTCTATTTGAAATCATTA
315 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * *
14499560 TAACCTTTTGATTTGTTATAAAGCAATTATTTC-AGTTAATACAAGCTTA--GATGCAATAAAAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-G-AATAAAAT
* * * *
14499622 -ATCACTAATTTATTAATATTTTGTAAAATAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-
63 AAT-ATTAATTTATTAATA-TTT-TAAAA-ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * * * ** * ** *
14499685 TGGAATCAGTTAAAATAATTACAGCCATTTGAATTATTATTTA-TTTCAAATTATTATGACCTTT
123 T-AAAT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTT
* ** * * ** *
14499749 TGTTTTGTCATAAAAAAATGCTTTTTAAT--TACGTAAGCTTATTCGAAATAACATAATACTAAT
185 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAC--AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAAT
* * *** *
14499812 TTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAATGAACCAGT
248 TTATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
* * * * * **
14499876 TCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTCAAATTGTTA
312 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * **
14499922 AGATC-TTTAT-TTTT-TCATAAAACAGTTGTTTCT-TATCATAGAAGCTTATT-TGGCTAAACA
1 TGA-CATTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAA-A
* * ** *
14499982 TAAAATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTAAA
62 TAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAA
* * * * *
14500047 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAT-AATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTT
127 -TAGTTCAAATAGTTATAACTATT-TGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTTTGTT
** * * * * ** * * *
14500110 GAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCAAATTTTTT
189 TTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *** * * **
14500174 AACATTCA-AAAAATTAATAAG-CAAA-TTTTGAAAAAGAAA-CAATTTATCGAACAAGTGCAAA
253 AATATT-ATAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAA
* * *
14500235 TAGTTATGACTATTT-AACTATTATTTATTTAAAATCATTA
317 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * *
14500275 TGACCTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAAAAAATA
1 TGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * *
14500339 ATACTAA-TTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT-AAAAATAAATAAATTGGTTTA
64 ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAAT--A-T-GTTTA
* * * * ** * *
14500402 CCAAATAAATTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT
122 CTAAAT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTT
* *** * *
14500467 GTTTTGTCATAAAAAAATTGCGT-TAGTTCATGCAAGCTTTTTTAAAATAAAATAATACTAATTT
186 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
14500531 CTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAATAAATTGGTTTACCGAACAAAT
250 ATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
** ** * * **
14500594 TCGAATAGTTACAACTATTTGAACAATCGTCTCT-TTTAAAATTGTTA
312 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT--TATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
14500641 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCA-AGCAAGCTTTTTCAAAATAAAATA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * * *
14500704 ATATTAATTTCTTAATATTCTAAAAATTGAA-AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTAT-TTTTC-GA
64 ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAGAGATTTAAAAAAT-AA-ATATGTTTACTAA
* * ** * * * ** * * *
14500766 ATCAATTCAAATAATTAT-GGTCATTTCAAGAATTATCTCTTTGAAATTGTTGTTACCTTTTGTT
126 AT-AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
14500830 TGGTCATATAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAGAATATAATAATACTAATTTCTTA
189 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
14500895 ACT-TTCA-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTGACAAAATAAATTTCTTTTATCGAACAAGTTC
254 A-TATT-ATAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATTT-GTTTACCAAACAAGTTT
*
14500957 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
314 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * *
14501001 TGACA-TTT-TTTTGTCATGAAATAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * * *
14501063 TAATACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAACAAATCA-GTTTACTG
65 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTA
* ** * * *
14501127 AATCAGCTT-AAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGT
125 AAT-AG-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT----TCA--A-T--C----G-
* * * *
14501191 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAA
174 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAA
** *
14501254 ATAATACTAATTTGCTAATATT-TCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT
237 ATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
* * * * * **
14501314 ACTAAACCAGTTGAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTTA
301 ACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * * * * **
14501370 TAACCTTTTGTTCTACCACAAAACGATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* ** * * *
14501435 ACTAATTTAGAAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCAAT-TTGT-CG
66 ATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAAT--ATGTT-TACT
** ** * * * * * * *
14501498 AACA-AGTTCAAGCAGTTA-AGACTACATAAACACTTATTTATTTTAAATTGTTATGACCCTTTG
124 AA-ATAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTG
* * * * *
14501561 TTTTGTAATAAAATAATTATTTC-AGCTT-ATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAACTAATTT
187 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * ** *
14501624 ATTAATATCTTAAAAAAAATTTCTAAGTAAGAGATTTATAAAAT-AATTCTATTTATTAAACCAG
250 ATTAATA--TT-ATAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAG
* * * *
14501688 TTTAAATAATTATAACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
311 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * * * *
14501735 TTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * * * * *
14501800 AATAATTTATTAATA-TTTACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTATTAA
66 ATTAATTTATTAATATTTTA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAA
* * * * ** *
14501864 ACCATTTCGAATAGTT-TAGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATAATTATAACCTTTTAT
126 A-TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTTTGT
* ** * ** * * *
14501927 TTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT
188 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * ** * * ** ** * * *
14501992 AATATTTTCAAACTTAATAACCAATAA-AATTAAAAAATAAATCTAATCGCCAAACTAGTTCAGA
253 AATATTATAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAA
* * * *
14502056 TAGTTAAGACTATATGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTA
317 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * *
14502097 TGACCTTTTCTTTTGTCAT-CAA-AA-TATTTCATTGTTCATAGAAGCTTATTCTA-ATTAAAAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC--TATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAAT
* ** * * *
14502158 AATACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
63 AATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
* * * * * ** * * *
14502223 AAAGCAATTCAAATGGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTGTTTGAAATCGTTCTGACTTTTTG
124 AAA-TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTG
* * * * *
14502287 -TTTATC-CAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTA
187 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * *
14502349 TTAAGATTCA-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACAAGTT
251 TTAATATT-ATAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * * *
14502412 CAAATAGTTTTTACTATTTGAATAATTGTCTATTTGAAATCGTTA
313 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * * *
14502457 TAACCTTTTGATTTGTCATAAAGTAATTATTTC-AGTTAATACAAGCTTA--GATGCAATAAAAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-G-AATAAAAT
* * * * * *
14502519 AACACTAATTTATTAATATTTTGTAAAATAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTA-T
63 AATATTAATTTATTAATA-TTT-TAAAA-ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
* * * *** * * * * * *
14502583 GGAATCAGTTAAAATAATTACGGCCATTTG-ACTGATTATTTA-TTTCAAATTGTTATGACATTT
124 -AAAT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-AATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTT
* *** * * ** *
14502646 TGTTTTGTCATAAAAAAAGGCTTTTTAAT--TACATAGCTTATTCGAAATAACATAATACTAATT
185 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACA-AGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATT
* * *** *
14502709 TATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAATGAACCAGTT
249 TATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * **
14502773 CAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTCAAATTGTTA
313 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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252 TAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTTA
* * * * *
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315 AATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAA---TCATTA
* * *
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* * * * *
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312 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
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* * * * * * * * *
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64 ATATTAATTTATTAATAT-TT-TAAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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187 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
14504522 TAATATT-TACCAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACTAAACAA-TTTC
252 TAATATTATA-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTT-
* *
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314 AAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * ** **
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* * ** * * * * ** ** *
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* * * * *
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124 AAA-TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTTT
* * * * * * * *
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186 GTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
14504880 TAATAATATT-TGAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAGC-AGT
249 TATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGT
* * * * * * *
14504943 TCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTT
312 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
14504989 TGACTTTTTGTTTAGTC--AAAACAATTATTTC-AGTTCAGACAAGCTTATT-----T---A-GA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * *
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65 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTAAA-T
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193 CATAAAACAA-TTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** *
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256 ATTAT-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTTAAAT
* * * * ** * * **
14505281 AATTACGGCCATTTGAATGATTATTTGTTTCAAATTGTTA
318 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** *
14505321 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGCTTTCTAATT-ACGCAAGCTTATTC-GAAATAACAT
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAAT
* * *
14505383 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTAA
63 AATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTAC
*** * * * * * * * *
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123 T-AAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATA-ACCTTT
* * * * * *** *
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185 -TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAA-ATAATACTAA
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247 TTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
** ** ** * * *
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312 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** * * * *
14505679 TGACCTTTTGTTGAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTCGGAATAAAATAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
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14505743 T-TCAAATTTTTTAACA-TTCAAAAACTTAATAAGCAAAATTTTGAAAAAATAAATA-GTTTA-T
65 TAT-TAATTTATTAATATTTTAAAAA-TTAATAAG--AGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACT
* * * * ** * *
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124 -AAA-TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTG
* * * **
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187 TTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
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250 ATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTT
* * * * * * * ** *
14505990 CAAATAATTATG-GTCATTTCAAGAATTATCTTTTTGAAATTGTCA
313 TAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * **
14506035 TTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTATTTC-AGTTCATAAAAACTTATTCAGAATGGAATAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * ** * * *
14506099 TACTAATTTATCAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTGACAAAATAAATTTGTTTATCG
65 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTA-CT
* * *** * * *
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124 AA-ATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGT
* * * * * ** * * * *
14506226 TCTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAATAATACTTTAT
188 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** * *
14506290 TAATATT-TGAAAAGTTAATAGGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTAAATC-AGCTTA
252 TAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTTA
* * * * * * *
14506353 AATAATTAT-AGTCATTTCAACAACTATCTATTTAAAATTGTTATTTCCTTT
315 AATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTT-CAA-----A--TCATTA
* * * * *
14506404 TGTTTATTACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAA
1 TG---A-CA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* ** * * *
14506468 AATAATACTAATTTGCTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA
60 AATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA
* * * * * * * **
14506533 AACCAGTTGAAATA-ATATGAGTATTTAAATAATTATCTA-TTTCAATTTATTATAACCTTTTGT
125 AA-TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAA-TCGTTATAACCTTTTGT
* ** * * * ** **
14506596 TCTACCACAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGA
188 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *** *** ** * *
14506660 AATATTCTGAAAATTAATAAGTAAGTTATTTAAAAAATAAATCAATTTGTCGAACAAGTTCAAGA
253 AATATTATAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAA-A
* ** * * *
14506725 -AGTTAAGACTATAAGAACAATTATTTATTTTAAATTATTA
317 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* *
14506765 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTC-AGCTT-ATACAAGCTTATTC-GAAATAGAAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTCAG-AATA-AAA
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14506827 -AA-AGCTAATTTATTAATATCTTAAAAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATT
62 TAATA-TTAATTTATTAATAT-TT--TAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* ** * * * * * ** * * *
14506890 TATCGAACCAGTTTAAACAATTAGAACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTATTACTTT
120 TA-CTAAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTT
* * * * * * * * *
14506955 TTGTTTCGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATT
184 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * ** * * *
14507020 TATTAATATT-TACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTGAAAGTTAAATCTGTTTA-CTAACCA-TT
249 TATTAATATTATA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
* * *
14507082 TCAAATAGTT-TAGACTATTTGAATAATGATCTATTTCAAATAATTA
313 T-AAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * **
14507128 TAAGC-TTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTC-GAAATAAAATA
1 TGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATA
** * * * * * * * *
14507191 ATGCTAATTTAATAATATTTCCAAACTTAA-TAACTAAGAAAATTAAAAAACAAATCTAATTTTC
64 ATATTAATTTATTAATATTT-TAAA---AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTAC
* * * ** *
14507255 -AAACTAGTTCAGATAGTTA-AGACTATATGAACGATTATCTA-TTTCAAATTTTTATGACCTTT
123 TAAA-TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATAACCTTT
* * * * * * * *
14507317 TCTTTTGTCATCAAAA-TATTGTAT-TGTTCATATAAGCTTATTCT-GATTAAAATAATACTAAT
185 TGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
14507379 TTAATAATATT-TCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAGC-AG
248 TTATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAG
* * * * * * ** *
14507442 TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTGAAATTGTTC
311 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
14507489 TGACTTTTTGTTTGGTC--AAAACAATTATTTC-AGTTCAGACAAGCTTATTTAGAATAAATTAA
1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * *** * *
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* * * * * ** * *
14507616 AACAAGTTCAAATAGTTTTTACTATTTGAATAATTGTCTATTTGAAATCGTTATAACATTTTGAT
125 AA-TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTT
* * * ** ** *
14507681 TTGTCATAAAGCAATTATTTCAATTAATACAAGCTTAGATGCAATTAAATAATACTAATTTATTA
189 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
14507746 ATATTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAA-ATTTAAAACATAAATTTGTTTATCGAATCAA-TTAAA
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* ** * **
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* * * ** * ** *
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1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATA
* * * *
14507913 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAAT-TAGTTTACTGAAT
64 ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACTAAAT
* * * * * * *
14507976 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATC-AATCTCAAATTGTTA-AGATCTTTAT-TT
128 -AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTC-AATCGTTATA-ACCTTT-TGTT
* * * * *** *
14508038 TT-TCATAAAATAATTGTTTCT-TATCGTAGAAGCTTATTT-TGTTAAACATAATACTAATTTAA
189 TTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAA-ATAATACTAATTTAT
* * * *
14508100 TAATATT-TCAAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAATAAATATGTTT-CCTAAACCAGTTCA
252 TAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTTA
** ** ** * * *
14508159 AATAGTTAAAACTATTACATTAATTATCTATTTTAGATCATTC
315 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** * * *
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1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATA
* * ** *
14508265 AT-TCAAATTTTTTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAATTTTGAAAAAATAAATA-GTTTA-T
64 ATAT-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACT
* * * ** * ** * *
14508327 CAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AAGTATTATTTATTTAAAATCATTATAACCTTTTA
124 -AAA-TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTG
* * * **
14508391 TTTTGACATAAAACAATTGA-TTC-AGTTGATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT
187 TTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
14508454 CTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTGGCTTATCGAACAA-AT
250 ATTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
* * *
14508516 TCAA-A--TA-G-----TT--AC-A--A-CTATTTAAAATTATTA
313 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
14508546 TGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTC-AGTTCATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
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14508610 TATTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATATATTTACTGAATCA
65 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAAT-A
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14508675 ATTCAAATAATTATGGGC-ATTTCAAGAATTATCTCTTTGAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGT
129 GTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
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14508739 CATATAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGTTTATTCT-TAATGAAATAATACTAATTTATTATT
193 CATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** * *
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256 ATTAT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * *
14508866 TTATAACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTA
320 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * *
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1 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * * ** * *
14508969 ACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTAT-TTTTCGA
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** * *
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*
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*
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* * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * ** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * ** * ** *
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* * *
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*
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * *
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173 CTATTTC
* * * * ** * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * *
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** * * * ** * * * ** *
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* * *
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* * * * * **
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *** ** *
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*
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* * * * *
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** * * *
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* * * * * * * ** **
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* * * *
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* * *
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* * ** * * ***
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* *
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* * * * * *
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* * * * ** **
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* * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* ** * * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
14503885 AAATTGTTATTACCTTTCG--TT-T-AT--TAC-CTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTG-TT-T
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTTGTTCAT---ACAA--GCTTAT
* * ** * * * * *
14503940 TTCAACATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTGCTAATATTTCAAAAATTAATAA
60 TTGAA-ATA-AA----A-T-AATACTAATTTATTAAT-ATTT-C-AA-AATT----AATAAGTAA
* * * * * *
14504004 GAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTGAAATAGTAT-GACTATTTGAATAATTAT
109 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTAT
14504068 CTATTTC
173 CTATTTC
* * * * ** * * *
14504075 AATTTGTTATAACCTTTTGTTCTACCACAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
** * *
14504139 TAAAATAATACTAATTTAGAAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAAT-TC
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-
* * ** * * * *
14504203 ATTT-GTCAAACAAGTTCAAGCAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTT
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* * * *** *
14504255 AAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTT-ATACAAGCTTATTCGAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * * * *
14504319 ATAGAATAAAACTAATTTATTAATATCTTAAAAAAATTTATAAGTAAGAAATTTAGAAAATAATT
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TT--CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
14504384 CTATTTATTAAACCAGTTTAAATAATTATAG-CTATTTTAACAATTATCTATTTA
127 CTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
14504503 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTACCAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCT
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
14504567 GTTTACTAAACAATTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
129 ATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * ** * * ** ** *
14504619 AAATAATTATAAGCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATATTATTTTATTCGAAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * ** * *
14504684 TAAAATAATTCTAATTTAATAATACTTCCAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* ** ** * * * *
14504749 ATCGCCAAACTAGTTCAGATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTC
130 TTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
14504800 AAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCAT-CAA-AA-TATTGTATTGTTCACAGAAGCTTATTCT-
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-T-TTGTTCATACAAGCTTATT-TG
* * * *
14504861 AATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTGAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
63 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
14504926 TTGTTTA-TCGAAGCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTG
127 CTATTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ** *
14504980 AAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTC--AAAACAATTATTTCAGTTCAGACAAGCTTATTT-AGA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-A
* ** * * *** * *
14505042 ATAAATTAATAAGAA---A--GAGATTTCAAAA--AATAA--ATTTGTTTGCTAAACAAGTTCAA
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATT--TAAA-AA-AT-AA
** ** * *
14505098 A--TAGTTT--T-AGTA-TTTGAATA-ATT-GTCTATTTG---AA--A------T-
125 ATCTA-TTTACTGAACAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * ** ** * ** *
14505134 ---T-GTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAGGCAATTTATTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGCA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * * *
14505195 ATAAAATAACACTAGTTTATTAATATTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAATTT
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** * *
14505259 TTTTTA-TGAAATCAGTTAAAATA-ATTACGGCCATTTGAATGATTATTTGTTTC
128 TATTTACTG-AA-CAGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ** ** ** *
14505312 AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGCTTTCTAATT-ACGCAAGCTTATTCGAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGAA
*
14505376 ATAACATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * *
14505440 AGTTTAATGAACCCGTTTAAATAG-TTATGACTATTTAAAAAATTATCAATATC
129 A-TTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
14505493 AAATTGTTA--ACATCTTTATTTTTTCATAAAACAGTCATTTTTTTATCATAGAAGCTTATTTG-
1 AAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGA
** * * * *
14505555 GTTAAACATAATAATAATTTAATAATA-TTCCAAA--AATCAA-TAAGATATTTAAAAAATAAAT
64 AATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * ** ** *
14505616 ATGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATTACATTAATTATCTATTTT
127 CTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * ** * * *
14505670 AAATCGTTCTGACCTTTTGTTGAGTCATAAAA-TATT-TGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCGG
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
14505733 AATAAAATAATTCAAATTTTTTAACA-TTCAAAAACTTAATAAGCAA-A-ATTTTGAAAAAATAA
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA-TTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAA
* * * *
14505795 A--TAGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTT-AACTATTATTTATTTA
125 ATCTA-TTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ** * ***
14505849 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACATTTGA-TTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* *
14505913 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCT
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * * *
14505974 ATTTACCGAATCAATCCAAATAATTATGGTC-ATTTCAAGAATTATCTTTTTG
129 ATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** * * *
14506026 AAATTGTCATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTA-TTCAGA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-A
** * * * *
14506090 ATGGAATAATACTAATTTATCAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTGACAAAATAAAT
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * *
14506154 TTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTC
127 CTATTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * **
14506207 AAAATCATTATGA-CATTT-TTCTATCATAAAATAATTATTTTAGTTTATAAAAGCTTA-TCCAC
1 -AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-
* * * * * *
14506269 AATGAAATAATAATACTTTATTAATATTTGAAAAGTTAATAGGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
14506334 -AGTTTACTAAATCAGCTT-AAATAATTATAGTC-ATTTCAACAACTATCTATTTA
128 TA-TTTACTGAA-CAG-TTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * ** *
14506387 AAATTGTTATTTCCTTTTG--TT-T-AT--TAC--TTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTT
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTTGTTCAT-ACA-AGCT-TATTT
* * ** * * * * *
14506443 CAACATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTGCTAATATTTCAAAAATTAATAAGA
62 GAA-ATA-AA----A-T-AATACTAATTTATTAAT-ATTT-C-AA-AATT----AATAAGTAAGA
* * * * * * * * *
14506507 AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTGAAATAATAT-GAGTATTTAAATAATTATCT
111 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCT
14506571 ATTTC
175 ATTTC
* ** * * ** * * *
14506576 AATTTATTATAACCTTTTGTTCTACCACAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
** * ** *
14506640 TAAAATAATACTAATTTAGAAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAGTTATTTAAAAAATAAATCAA
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * ** * *
14506705 TTT-GTCGAACAAGTTCAAGA-AGTTAAGACTATAAGAACAATTATTTATTTT
130 TTTACT-GAAC-AGTTCAA-ATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * ** *
14506756 AAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGCTT-ATACAAGCTTATTCGAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG-TTCATACAAGCTTATTTGAA
* *
14506820 ATAGAAA-AA-AGCTAATTTATTAATATCTTAAAAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAGAAAATA
65 ATA-AAATAATA-CTAATTTATTAATAT-TT---CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
14506882 ATTCTATTTA-TCGAACCAGTTTAAACA-ATTAGAACTATTTTAACAATTATCTATTTA
124 AATCTATTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTTAG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
14506939 AAATCATTATTACTTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * ** *
14507004 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTGAAAGTTAAATCTG
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * *
14507069 TTTACT-AACCATTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAATAATGATCTATTTC
130 TTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * ** * * * ** *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
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66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-
* * * * * *
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** * * *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-T-TTGTTCATACAAGCTTATT-TG
* * *
14507362 -ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-A
* * * *
14507542 ATAAATTAATACTAATTTATTAAGA-TGCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * ** * * *
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127 CTATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *** * ** *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
14507725 TTAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAAATTTAAAACATAAATTT
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* * * * * **
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* * * * * ** *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGA
* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 AAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTGTTCATACAAGCTTA-TTTG
* * * *
14508079 --TTAAACATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTTAAAAATAAAT
63 AAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ** ** *
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127 CTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ** * ** * *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
14508256 AGTAAAATAATTCAAATTTTTTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTGAAAAAATAA
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAA
* * ** * *
14508318 A--TAGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAG-TTATGACTATTT-AAGTATTATTTATTTA
125 ATCTA-TTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * ** * * ***
14508372 AAATCATTATAACCTTTTATTTTGACATAAAACAATTGA-TTCAGTTGATAAAAGCTTATCCAAA
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* *
14508436 ATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAAT-
65 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
** * *
14508499 TGGCTTA-TCGAACAAATTCAAATAG-TTACAACTATTT--A-AA--AT-TA-TT-
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* * ** * **
14508545 --AT-G----G-CCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATGCAAGCTTATTCAAAA
1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
14508602 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATATA
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * *
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130 TTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGT-TCATACAAGCTTATT-TGA
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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* * * *
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** * *
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1 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TGTTCATAC-AAGCTTATTTGA
* * *
14509131 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
64 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
14509311 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT-TAAA--AATTAGTAAGACATTTAAAAAATAAATAT
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * *
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* *
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Statistics
Matches: 11289, Mismatches: 2603, Indels: 1710
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Consensus pattern (179 bp):
AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
TTACTGAACAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
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14494521 AATCATTTTG
* * * * *
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* * * * * * *
14494596 TAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
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* ** *
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129 AAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTG-TT
* * * * * * *
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191 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *** * * *
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* * * * ** *
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* ** * * *
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1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAAT
* * * * *
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* ** * * **
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* * * *
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191 T-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCA-A-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
14495143 TAACA-TTCAAAAAATTAATACGAAAGAGATTTGACAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTC-
253 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCA
* * * ** *
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** * * * * * *
14495249 ATATTTT-TTCTA-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAATA
1 ACCTTTTGTT-TAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * ** *
14495312 ATACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTGAAT
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* * * * * ** * * *
14495377 C-AGCTT-AAATAATTATGGCCATTTCAACAACAATCTATATCAAATTGTTATTACCTTTTTTTT
128 CAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTT
* * *** **
14495440 TGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--ACATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTGCT
191 TGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATT
*
14495503 AATAATTT-AAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACTAGTTGAA
254 AAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACTAGTTCAA
* * * *
14495562 ATAG-TATGACTACTTAAATAATTATCTATTTCAATTTGTTATA
317 ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
** * *
14495605 ACCTTTTGTTCTACCATAAAACAATTGCTTTTCA--ACATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTT-TAGTATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* ** * * *
14495668 ACTAATTT-TCTAATAATTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAACATATTTGCTGA
63 ACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAA
* * * * * *
14495728 ACCAGATGAAAAAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTTATATAACCTTTTGT
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-T-TATGACCTTTTGT
** ** ** * * **
14495792 TCTACCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACATCCTTATTTGGAATAAAAGAATACTAATTTAGA
190 T-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *** * * * **
14495857 AATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATCCATTTGTCGAACAAGTTTATG
254 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAA
* * * *
14495921 CAGTTAAGACTATAT-AA-ACATATATTTATTTCAAATTATTATA
318 TAGTTAAGACTATTTGAATA-AT-TATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * *
14495964 ACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTATTTCAGCTT-ATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAAA
1 ACCTTTTG-TTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * *
14496027 ACTAATTTATTAATATCTTAAAAAAATGT-ATAAGTAAAAGATTTCAAAAAT-AATTATATTTA-
63 ACTAATTTATTAATAT-TT-CAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTAC
* * * * * * * ** * * *
14496089 TCAAACCAGTTTAAATAATTATAACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATCATTACTTTTT
124 T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
* * ** * * * * *
14496154 GTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTAATATAAG-TTTTTTGAAATAAAGTAATACTAATTTA
188 G-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
14496218 TTAATATTT-ACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTA-CTAAATCATTTC
252 TTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AGTTC
* **
14496281 AAATAGTTTAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATA
315 AAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
** * * * * ** *
14496327 ACCTTTCATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * ** * * * ** ** *
14496391 CTAACTTAATAATATTTCCAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATCGCCAAAC
64 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC
* * * * * *
14496456 TAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTCTTTGG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT-G
* * * * * *
14496521 TCAT-CAA-AATT-TTGCAATGTTCATAGAATCTTATTCTG-ATTAAAATAATACTAATTTAATA
193 TCATAAAACAATTGTTTC-A-GTTCATACAAGCTTATT-TGCAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
14496582 ATATTTCAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAGTAGTTCAAATG
255 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATA
* * *
14496647 GTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTCTA
320 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * *
14496688 ACTTTTTGTTTAGT-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAATTAATACT
1 ACCTTTTGTTTAGTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * **
14496752 AATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTCGCTAAAC
66 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC
* * ** * * * * *
14496816 AAGTTCAAATAGTTTTTACTATTCAAATAATTTTCTATTTGAAATCGTTATAATCTTTTGATTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTG
* * * ** *
14496881 TCATAAAGCAATTATTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGCAATAAAATAACACTAATTTATTAATA
193 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *
14496946 TTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TCAGTTAAAATAA
258 -TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AGTTCAAATAG
* * * * * *
14497009 TTATGGCCATTTGAATGATTATTTATTTCAAATTGTTATG
321 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * * * *
14497049 ACCTTTTGTTTTGCCATAAAA-AAATGCTTTTTAATT-ACACAAGCTTATTCGAAATAACATAAA
1 ACCTTTTGTTTAG-TATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
** * * *
14497112 ACTAATTT-TCTAATATTTCTTAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAATGA
63 ACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAA
* * * * * * * * *
14497176 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTCGAGTTGTTAAGATCGTTATT-T
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTT-TTGT
* * **
14497240 TT-TCATAAAACAATTGTTTC-TTATCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAACATAATACTAATTTAA
190 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGCAATAAA-ATAATACTAATTT-A
* * * * * *
14497302 TT-ATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATATATTTGTCGAACCAGTTCAA
252 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAA
* ** * * *** * *
14497362 ATAGTTAAAACTATTACATTAATTATCTATTTCAGATCACTCTG
317 ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * **
14497406 ACCTTTTGTTGAGTCATAAAATATTTTTTTCA-TATC-TGACAAGCTTATTCGGAAT-AAATAAT
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * * **
14497468 TCAAATTTTTTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAA-A-TTTTGAAAAAAGAAA-CAGTTTA-TC
63 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACT-
* * * ** * *
14497528 GAACAAGTT--AATAGTTATGACTATTT-AACT-ATTATTTATTTAAAATCATTATAACATTTTG
125 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * ****
14497589 TTTTTCAT--AACAATATGATTCCGGTTCATAAAAGGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT
189 TTTGTCATAAAACAAT-TG-TTTCAGTTCATACAA-GCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
14497652 CTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAATAAATTGGTTTATCAAACCAATT
251 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTT
* * * * *
14497716 CAACTAGTTACA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTCATG
314 CAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* *
14497763 ACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA-ATATTGTTTCAGTTCATGCAAGCTTTTTCAAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTG-TTTAGT-ATAAAACA-ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * ** *
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63 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTA
* * * * * * *
14497886 ATCAA-TTCAAATAATTATG-GTCATTTTAAGAATTATCT-CTTCGAAATTGTTATTACCTTTTG
126 AACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * *** *
14497948 TTTGGTCATATAACAGTTGTTTTAGTTCATACAAACTTATTCAAAATAGAATAATACTAATTTAT
189 TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
14498013 TAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTGACAACATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCG
253 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCA
** * * ** *
14498077 AATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTA-TGCAAAATCATTATG
316 AATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATTGTTATA
* ** * * * * * * *
14498122 ACATTTT-TTCTACCACAAAATAATT-TTTTAGCTT-ATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAATA
1 ACCTTTTGTT-TAGTATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * **
14498184 ATACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTCAGAGATTTAAAAAATAAATGAGTTTACTAAAT
64 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-
* * * * * * ** * *
14498249 CAACTT-AAATAATTATGGCCATTTCAACAGCTATCTATTTCCAATTGTTATTACCTTTTGTTTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTT
* * *** * **
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* * * ** * *
14498376 ATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAAACAAATCTATTTGGCTGAACCAGTTTGAA
255 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACTAG-TTCAA
* *
14498437 ATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTTATA
317 ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
** ** ***
14498480 ACCTTTTGTTCTACCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTT-TAGTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
** ** * *** * *
14498545 TAATTTAGAAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGATATTT-AAAAATAAATCCATTT-GTCGAAC
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** * * * * *
14498604 AAGTTCAAGCAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTG
* * * * * * *
14498669 TCATAAAATAATTATTTCAGCTT-ATAGAAGCTTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT
193 TCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * * *
14498733 ATCTAAAAAAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAACTCTATTTATCAAACCAATTTAAA
257 AT-T---TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAA
* * * * * *
14498797 TAATTATA-ACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATT
318 TAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * ** * * * * **
14498840 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
14498905 TAATTTATTAATATTT-ACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAAC
65 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC
* * ** * *
14498969 CATTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTTTATTTT
129 AAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTT
* * * ** * * * *
14499033 GTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAA
192 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** * * * * ** * * * *
14499097 TATTTCCAAACTTAATAACCAGGAAAATTAAAAAATAAATCTAATCACCAAACTAGTTCAGATAG
256 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAG
* ** ** *
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321 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * ** *
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* * * *
14499264 ATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA
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127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
*
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* * * * *
14499455 AGA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACAAGTTCAA
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317 ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * *
14499562 ACCTTTTGATTT-GTTATAAAGCAATTATTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGC--AATAAAAT-A
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** *
14499623 TCACTAATTTATTAATATTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-T
62 T-ACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT
* * * * * * * *
14499686 GGAATC-AGTTAAAATAATTA-CAGCCATTTGAATTATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTT
125 --AAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
* * * * *
14499749 TGTTTTGTCATAAAA-AAATGCTTT---TTAATTACGTAAGCTTATTCGAAATAACATAATACTA
187 TG-TTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCA-TAC--AAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTA
* *
14499810 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAAT-GAACCA
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* * * * *
14499874 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTCAAATTGTTA-A
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* * * * * ****
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1 -ACCTTT-TGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-ATA
* * * * * *
14499984 AAATTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTA
61 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTA
* ** * *
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126 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
14500109 TGAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCAAATTTTT
190 T-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *** * *
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1 ACC-TTTTGTTTAG-TATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
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254 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAA
* * * *
14500598 ATAGTTACA-ACTATTTGAACAATCGTCTCT-TTTAAAATTGTTATG
317 ATAGTTA-AGACTATTTGAATAAT--TATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * *
14500643 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCA-AGCAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * *
14500707 TTAATTTCTTAATA-TTCTAAAAATTGAA-AAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTAT-TTTTCG
64 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACT
* * * * * * * * *
14500765 AATCAA-TTCAAATAATTATG-GTCATTTCAAGAATTATCTCTTTGAAATTGTTGTTACCTTTTG
125 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
14500828 TTTGGTCATATAACAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAG-AATATAATAATACTAATTTC
189 TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGCAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
14500892 TTAA-CTTTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTGACAAAATAAATTTCTTTTATCGAACAAGTT
252 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTT-GTTTATCGAACTAGTT
* * * ** *
14500956 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG
314 CAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * * * * *
14501003 ACATTTT-TTT-GTCATGAAATAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAATAA
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * ** *
14501066 TACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAACAAATCAGTTTACTGAATC
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAAC
* * * * *
14501131 -AGCTT-AAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTA
129 AAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-----A--A--A----TTG-TTA
* * ***
14501194 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
179 TGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATA
** *
14501257 ATACTAATTTGCTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CT
241 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-
* * * * *
14501317 AAACCAGTTGAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTTATA
305 GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
** * * ** ***
14501372 ACCTTTTGTTCTACCACAAAACGATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTT-TAGTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
** * * *** * *
14501437 TAATTTAGAAATA-TTCTGAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCAATTT-GTCGAA
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAA
** * ** * * * * * *
14501500 CAAGTTCAAGCAGTTAAGACTACATAAACACTTATTTATTTTAAATTGTTATGACCCTTTGTTTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTT
* * * * * *
14501565 GTAATAAAATAATTATTTCAGCTT-ATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAA
192 GTCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * ** * *
14501629 TATCTTAAAAAAAATTTCTAAGTAAGAGATTTATAAAAT-AATTCTATTTATTAAACCAGTTTAA
256 TAT-TT--CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCGAACTAGTTCAA
* * * * ** *
14501693 ATAATTATA-ACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTATT
317 ATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * ** * * * * * *
14501737 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATAA
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * *
14501802 TAATTTATTAATATTT-ACCAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTATTAAAC
65 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC
* * * ** * *
14501866 CATTTCGAATAGTT-TAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTTTATTTT
129 AAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTT
* * * ** * *
14501930 GTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATA
192 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TGCAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * * * * ** *** * *
14501993 ATATTTTC-AAACTTAATAACCAATAAAATTAAAAAATAAATCTAATCGCCAAACTAGTTCAGAT
255 ATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAAT
* * * *
14502057 AGTTAAGACTATATGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
319 AGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * *
14502099 ACCTTTTCTTTTGTCAT-CAA-AA-TATTTCATTGTTCATAGAAGCTTATTCTAATTAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCA--GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
** * *
14502161 ACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA
63 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
* * * * * * * * *
14502226 GCAA-TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTGTTTGAAATCGTTCTGACTTTTTGTTT
128 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * *
14502290 ATC-CAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAATTAATACTAATTTATTAA
192 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
14502353 GA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACAAGTTCAAA
256 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACTAGTTCAAA
*** * * *
14502416 TAGTTTTTACTATTTGAATAATTGTCTATTTGAAATCGTTATA
318 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
** * * *
14502459 ACCTTTTGATTT-GTCATAAAGTAATTATTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGC--AATAAAATAA
1 ACCTTTTG-TTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTT--ATTCAAAATAAAATAA
* ** * *
14502521 CACTAATTTATTAATATTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTA-TG
62 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-
* * * * * * * * * *
14502584 GAATC-AGTTAAAATAATTACGGCCATTTGACTGATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTG
125 -AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
** * * * *
14502648 TTTTGTCATAAAA-AAAGGCTTT---TTAATTACATAGCTTATTCGAAATAACATAATACTAATT
189 -TTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCA-TACA-AGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATT
* *
14502709 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAAT-GAACCAGTT
250 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATCGAACTAGTT
* * * * *
14502773 CAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTCAAATTGTTA-A
314 CAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* *** * * * ****
14502819 CATCTTTAT-TTTTCCATAAAACAGTTGTTTC-TTATCATAGAAGCTTATT-TGGTTAAACATAA
1 -ACCTTT-TGTTTAGTATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-ATAA
* * * * **
14502881 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTAAAAAAATAAATATGTTTGCCGA
62 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAA
* * ** ** * ** *
14502942 ACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATTACATTAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTG
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT-
* * * * * * *
14503007 AGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT-TTAAATTTTT
191 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATT-TGCAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * ** *
14503069 TAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTGAAAAAATAAA-CAGTTTATCGAACAAGTTC
253 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTC
* * ** *
14503130 AAATAGTTATA-ACTATTT-AACT-ATTATTTATTTAAAATCATTATG
315 AAATAGTTA-AGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * *
14503175 ACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTAG-TATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
14503240 TAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAATAAATTGGTTTACTGAA
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
* * ** * * *
14503304 CAAATTCAAATAATTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTT
* * *** *
14503369 ATCATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATGA-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
192 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT-ACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
14503433 TA-TTCTAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCGAA-TCAATTCAAAT
256 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AGTTCAAAT
* * * * * * * *
14503492 AATTATG-GTCATTTCAAGAATTATCTTTTTGAAATTGTTATT
319 AGTTAAGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * *
14503534 ACCTTTTGTTTGGTCGTATAACAATTGTTTCAGTTCTTACAAACTTATTCAAAATAGAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
14503599 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAAAAGAAAGAGATTTGACAAAATAAATTTGTTTA-TCGA
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACT-AA
* * ** **
14503662 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGATATTTT-TTC
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT-
* * * * *** * * *
14503726 TGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAATAATACTTTATTAA
191 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
14503791 TATTTCAAAAGTTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-CTAAATCCGCTT-AAAT
256 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AG-TTCAAAT
* * * * * *
14503854 AATTATGGCCATTTCG-ACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTCGTTTA
319 AGTTAAGACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATTG---TTA---------TA
* *
14503908 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
1 --ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
** *
14503971 ATACTAATTTGCTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTG
61 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTA
* * * *
14504032 AACTAGTTGAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAATTTGTTATAACCTTTTGTT
126 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
** * * * **
14504096 CTACCACAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGAA
191 -TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * ** * * * **
14504160 ATA-TTCTGAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATTCATTTGTCAAACAAGTTCAAGC
255 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAAT
* * * * * *
14504224 AGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTAATG
319 AGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * *
14504266 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTT-ATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAAAA
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * *
14504330 CTAATTTATTAATATCTTAAAAAAATTTATAAGTAAGAAATTTAGAAAAT-AATTCTATTTATTA
64 CTAATTTATTAATAT-TT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTA
* * * * * * ** * *
14504394 AACCAGTTTAAATAATTAT-AGCTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTATTACTTTTTGT
126 AACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* ** * * * * *
14504458 TTCGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
190 TT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
14504523 AATATTT-ACCAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTA-CTAAACAATTTCA
254 AATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACTAGTTCA
* **
14504585 AATAGTTTAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATA
316 AATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * ** ** * *
14504630 AGCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATATTATTTTATTCGAAATAAAATAATT
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * ** * * * ** ** *
14504694 CTAATTTAATAATACTTCCAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATCGCCAAAC
64 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC
* * * * ** * * *
14504759 TAGTTCAGATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTG
* * * *
14504824 TCATCAAAA-TATTGTATT--GTTCACAGAAGCTTA-TT-CTAATTAAAATAATACTAATTTAAT
193 TCAT-AAAACAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTTGC-AA-TAAAATAATACTAATTTATT
* *
14504884 AATATTTGAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAGC-AGTTCAAA
254 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CTAGTTCAAA
* * * * * * *
14504948 TGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTTTG
318 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * *
14504991 ACTTTTTGTTTAGT-CAAAACAATTATTTCAGTTCAGACAAGCTTATT-----T---A-GA-A-T
1 ACCTTTTGTTTAGTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * ** *
14505044 AA---ATTAATA----AGAAA-GAGAT---T-TCA-A---AA--AATAAATTTGTTTGCTAAACA
66 AATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACA
* * * * *
14505091 AGTTCAAATAGTT-TTAGTATTTGAATAATTGTCTATTTGAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGT
130 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTGT
** * * ** * *
14505155 CATAAGGCAATTTATTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGCAATAAAATAACACTAGTTTATTAATA
194 CATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * *
14505220 TTTTGTAAAA-TAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAATTTTTTTTAT-GAAATCAGTTAAAATAA
258 -TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AGTTCAAATAG
* * * * * *
14505283 TTACGGCCATTTGAATGATTATTTGTTTCAAATTGTTATA
321 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * ** * *
14505323 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGCTTTCTAATT-ACGCAAGCTTATTCGAAATAACATAAT
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTG-TTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * *
14505386 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAATGAA
63 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
** * * * * * ** *
14505451 CCCGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATATCAAATTGTTAACATCTTTAT-TTT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT-TGTTT
* * * * ** * *
14505515 TTCATAAAACAGTCATTTTTTTA--TCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAACATAATAATAATTTAA
192 GTCATAAAACA---ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAA-ATAATACTAATTTAT
* * * * ** * *
14505577 TAATATTCCAAAAA-T--CAA-TAAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTTAAA
253 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAA
* ** * * * * *
14505638 TAGTTAAAACTATTACATTAATTATCTATTTTAAATCGTTCTG
318 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * ** *
14505681 ACCTTTTGTTGAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATT
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * *
14505745 CAAATTTTTTAACA-TTCAAAAACTTAATAAGCAA-A-ATTTTGAAAAAATAAA-TAGTTTA-TC
64 CTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACT-
* * **
14505805 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACT-ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
125 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * ****
14505868 TTTTGACATAAAACATTTGATTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
189 -TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
14505933 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCGAA-TCAATCCAA
253 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AGTTCAA
* * * * * * * * *
14505993 ATAATTATG-GTCATTTCAAGAATTATCTTTTTGAAATTGTCATT
317 ATAGTTAAGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * **
14506037 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATGGAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
14506102 TAATTTATCAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTGACAAAATAAATTTGTTTA-TCGA
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACT-AA
** * *
14506165 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAAATCATTATGACATTTT-TC
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *** * * *
14506228 TATCATAAAATAATTATTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCACAATGAAATAATAATACTTTATTAA
191 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ** * *
14506293 TATTTGAAAAGTTAATAGGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-CTAAATCAGCTT-AAAT
256 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACT-AG-TTCAAAT
* * * * * * *
14506356 AATTATAGTC-ATTTCAACAACTATCTATTTAAAATTGTTATT
319 AGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * *
14506398 TCCTTTTGTTTATTACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA--ACATACAAGCTTATTC
1 ACCTTTTG--T-TTA----------GT-ATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
**
14506461 AAAATAAAATAATACTAATTTGCTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAA
50 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
14506522 TCTGTTTACTAAACCAGTTGAAATA-ATATGAGTATTTAAATAATTATCTATTTCAATTTATTAT
115 TTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* ** * * *
14506586 AACCTTTTGTTCTACCACAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
180 GACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATA
** * ** *** *
14506650 CTAATTTAGAAATA-TTCTGAAAATTAATAAGTAAGTTATTTAAAAAATAAATCAATTTGTCGAA
244 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA
* ** * * * * *
14506714 CAAGTTCAAGA-AGTTAAGACTATAAGAACAATTATTTATTTTAAATTATTATG
308 CTAGTTCAA-ATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * *
14506767 ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGCTT-ATACAAGCTTATTCGAAATAGAAA-AA-
1 ACCTTTTGTTTAGT-ATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAATAAT
* * *
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* * * * * * * * ** * *
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* ** * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * **
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* * * * * * ** * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *** * * * *
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* * * *
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*
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** * * *
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** *
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* * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTT-CTGAACCAG-TTCAAATAGTTATGAC
* * * *
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* * * * **
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178 AA
* * * *
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1 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTT-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * ** * *
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* * * ** *
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** * * * * *
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** * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGT-TTC
** * * * * * *
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* * ** *
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* * ** * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * * *
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1 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTCT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * **
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* * * * * * * *
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** * * * *
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** *
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*
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* * **
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* * * *
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* * * * *
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** * * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* ** * * *
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* ** *
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** * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* *
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** * * *
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* * *
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*
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* *
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* *
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* **
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* ** * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * ** * * *
14510596 GAAACAATTATTTTATGACAACAAACAAGGTAATAACAATTTTAAATAGGTAATTGTTCAAATAG
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* * *
14510661 TCGTAATTATTTGAATTTGTTCAGTAAATA-A-ATTTTTTTAA-CTCTT
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
14510951 TA-TGAAACAAATAGTTTATGATAAA-ATGAAAGGTCAGAATGATTGGAAATAGATAATTATTCT
63 -ACTGAAACAATTATTTTATGA-AAACA--AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
** * * ** * * *
14511014 AATAGTTTTAACTATTTTAACTGGTTTGGCAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTT
124 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGA--TATTTTTTTAATCTCTT
* ** *
14511070 ACTTATTGATTTTTTG-AATATT-ATAAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGA
1 ACTTATT-AATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * *
14511132 TCAT-AAACATTTGTTTTATGACAAA-ACAAAGATCTTCATGATTTGAGATTGATAATTATTCAA
63 AC-TGAAACAATTATTTTATGA-AAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* *
14511195 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
125 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGA--TATTTTTTT-AATCTCTT
* * *
14511251 ACTTATTAATGTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--AA
*** * * * *
14511316 AAAAAACAATTATTTTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAAT-GCATAATCATTCAAAT-
64 CTGAAACAATTATTTTATGAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATA
* * * ** * * * *
14511379 GGCTATAATTATTTTAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTT
128 GTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAATAGA--TATTTTTTTAATCTCTT
* ** * * * * * *
14511432 AATTATTAATTTAGGAAACATTAATAAATTAGTGTTATTTTA-TTCCATCTAAACTTGTATTAAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAAC
* *
14511496 TGAATCAATTGTTTTATGA
65 TGAAACAATTATTTTATGA
14511515 CTTTAGAAAT
Statistics
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ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
GAAACAATTATTTTATGAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATATTTTTTTAATCTCTT
Found at i:14510985 original size:182 final size:180
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 5.2 Consensus size: 180
14510521 AAATAGATTA
* * *
14510531 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATAAAT-
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-AGATA
* * ** * * *
14510595 TGAAACAATTATTTTATGACAACAAACAAGGTAATAACAATTTTAAATAGGTAATTGTTCAAATA
65 TGAAACAATTAGTTTATGACAA-AAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *
14510660 GTCGTAATTATTTGAATTTG-TTCAGTAAATA-A---ATTTTTTT-AA-CTCTT
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
14510707 TCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTGTCATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGA-AC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATA-
* * * * *
14510771 TGAAACAATTATTTTATGTCAGAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATA
65 TGAAACAATTAGTTTATGACA-AA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* *
14510836 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTT
128 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
* * * *
14510889 GCTTATTAATTTTTTG-GATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTAAGA
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAAGA
* * * * *
14510951 TATGAAACAAATAGTTTATGATAAAATGAAAGGTCAGAATGATTGGAAATAGATAATTATTCTAA
63 TATGAAACAATTAGTTTATGACAAAA--AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
** * * ** *
14511016 TAGTTTTAACTATTTTAACTGGTTTGGCAAATATATTTA-TTTTTTAAATCTCTT
126 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
* ** * *
14511070 ACTTATTGATTTTTTG-AATATT-ATAAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGA
1 ACTTATT-AATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAAGA
* * * * * *
14511132 TCAT-AAAC-ATTTGTTTTATGACAAAACAAAGATCTTCATGATTTGAGATTGATAATTATTCAA
63 T-ATGAAACAATTAG-TTTATGACAAAA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* **
14511195 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
125 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
* * * *
14511251 ACTTATTAATGTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGAT--
** * ** * *
14511316 AAAAAACAATTATTTTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAAT-GCATAATCATTCAAAT-
64 ATGAAACAATTAGTTTATGACAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
14511379 GGCTATAATTATTTTAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATTTCTT
128 GTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
* ** * *
14511432 AATTATTAATTTAGGAAACATTAATAAATTAGTGTTATTTTATT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
14511476 CCATCTAAAC
Statistics
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175 1 0.00
176 129 0.21
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ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGATAT
GAAACAATTAGTTTATGACAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
Found at i:14511510 original size:362 final size:360
Alignment explanation
Indices: 14510531--14519100 Score: 2290
Period size: 362 Copynumber: 23.6 Consensus size: 360
14510521 AAATAGATTA
*
14510531 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTAT-A-AA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA
* * ** * * *
14510594 TTGAAACAATTATTTTATGACAACAAACAAGGTAATAACAATTTTAAATAGGTAATTGTTCAAAT
65 ATGAAACAATTATTTTATGACAAC-TA-AAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * ** *
14510659 AGTCGTAATTATTTGAATTTGTTCAGTAAATAAA--T-TTTTTT-AA-CTCTTTCTTATTAATTT
128 AGT-ATAATTATTTTAA-CTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
14510719 TTGAAATATTAAGAAATTAGTGTCATTTTATTTCGA-ATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTAT
191 TTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTA-TTCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATTGT
* * * * *
14510783 TTTATGTCAGAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
255 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* ** *
14510848 TGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTT
320 TGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * *
14510889 GCTTATTAATTTTTTG-GATGTTAATAAATTTAGATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTAAGAT
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAT
* * * * * * * *
14510952 --ATGAAACAAATAGTTTATGATAAAATGAAAGGTCAGAATGATTGGAAATAGATAATTATTCTA
63 AAATGAAACAATTATTTTATGA-CAACT-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * *
14511015 ATAGTTTTAACTATTTTAACTGGTTTGGCAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTGAT
126 ATAG-TATAATTATTTTAACT-GTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AA
* ** *
14511080 TTTTTG-AATATT-ATAAAATTAGTATTATTTT-TAAC-TGAATAAGCTTCTATGATCAT-AAAC
188 TTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTGTTATTTTATTCCAT--ATAAGCTTCTATGAAC-TGAAAC
* * * * **
14511140 ATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTCATGATTTGAGATTGATAATTATTCAAATAGTCATA
249 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
*
14511204 ACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
314 ACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * *
14511251 ACTTATTAATGTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA
** * *
14511316 AAAAAACAATTATTTTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAAT-GCATAATCATTCAAATG
65 ATGAAACAATTATTTTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATA
* * * *
14511380 GCTATAATTATTTTAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAATTATTAATTTA
129 G-TATAATTATTTTAACTG-TTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
14511445 GGAAACATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCATCTAAACTTGTATTAACTGAATCAATTGTTT
192 TGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATTGTTT
* ** * * *
14511510 TATGACTTTAGAAATATTAACAAAGTAGT-ATTAATTTTG-TTTGGAAA-AGCT-TTTA-TGAAC
257 TATGAC-----AAA-A--CA-AAAG-A-TCA-TAA---TGATTT-GAAATAAATAATTATTCAAA
** * * * * *** * * * * *** * *
14511570 TA-AAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAA-AAAGTCATAATGATTCTAAAAATATAATTGTT
306 TAGTCATAACTATTTGA--ACTAGTTCAATAAA-T-AGATTTATTTTTTCAA-AT--CTCTT
** * * * *
14511629 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATT-TATT-TTTTCAAATCTCTTGCTT
1 -ACTTA-T--TAA-TTTTTGAAATA--T---T-AATAAATTAGATTATTTT---A--T-TT-C-G
* * * * * * ** *** *
14511692 ATTAA-CTT-TTTGAGTGTTAAT-AAATTAGTAATTTT-T-A-TTCTAAA--TAAGCTTG-TAT-
47 AATAAGCTTGTATGA---TAAATGAAA-CAATTATTTTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTG
* * * * * ** ** * * * *
14511747 AAACTGAAACAATTATT-ATATGACTAAAAAGATGTCAAAATGATTT-G-AATTAGA-TAATTAT
108 AAA-T-AGATAATTATTCAAAT-AGTATAATTAT-TTTAACTG-TTTGGTAAATAAATTTATT-T
* * ** *
14511808 TTTAATAGTC-CTAAC-TATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTATATTTTAAATCTTTTATTA
167 TTTAA-A-TCTCTTACTTA-TT-AATT--TTT-G--AA-ATA-TTA-A---TAAAT-TAGTGTT-
* * * * * * * *
14511871 ATTTTTGAGATAT-TATTAAATTAGCATTATTTTTATCT-AAATAA--GCTTGTATGATCAAAA-
215 A-TTTT---AT-TCCA-T--ATAAGC-TT-CTATGAACTGAAACAATTG-TTTTATGA-CAAAAC
** * * ** * * * * ** ** * *
14511931 ATAATTAT-TTTATGATAAAAGAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATTTTTTTCAAATAGTCAT
268 A-AAAGATCATAATGAT--TTGAAATA-AATAATTA-TTCA-A---ATAGTCAT-AACTA-T-TT
* * * * * *
14511995 -AACTA-TTTAAGTTGGTTCAGAAAACAACTT-TAGTTTTTAAATCTCTT
321 GAACTAGTTCAA------T-A-AATA-GATTTAT-TTTTTCAAATCTCTT
* * * * *
14512042 GCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-ATATAAGTTTTTATG--A
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGATA
* *** * * * * *
14512104 ATTGAATTTATTGTTTTATGGCAAAATAGAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTCA
64 AATGAAACAATTATTTTATGAC-AACT--AAAGGTAATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCA
* * *** * * * *
14512168 AATAATCA-AATCCATTTTAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTTTAAATCTTTTACTCAT
125 AATAGT-ATAAT-TATTTTAAC-TGTTTGGTAAATAAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * *
14512232 TAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGTTTGTGTGAACTGAAAT
185 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAAC
* * * * * ** * * *
14512296 AATTATTTTATGACTAAAGAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCTAATAG-CTT
249 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTA-TTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
14512359 AACTATTTAAACTGGTTCGACAAACACATTTATTTCTT-AAATCTCTT
313 AACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * **
14512406 ACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGAATTATTTTAATTT-GAATAAACTCATAT-A-A
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGATA
* * * * * ** * *
14512468 AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAAT
64 AATGAAACAATTATTTTATGAC-AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * *
14512533 AATCATAACTATTTGAACTATTTTAGTAAACAAATATAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTT
128 AGT-ATAATTATTTTAACT-GTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * * ** * ** *
14512594 TAAAAATATTAAGAGATCAATATTATTTT-TTAAAAATAATTTTGC-ATGAACGGAAACAATTGT
191 TTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCATATAAGCTT-CTATGAACTGAAACAATTGT
* * * * * * * *
14512657 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATGATTATA
255 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
** ** * * * *
14512722 TGAACTTTTTTGATAAACAAATTTATTTTTT-GAATCTCCT
320 TGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * * *
14512762 ACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTACTATT-TTTTATTCCAAATAAACTTGTATAAT-
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-GATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA
* * * ** * *
14512824 AA--AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACT-ATTT-AAATAAATAATTATTCAA
64 AATGAAACAATTATTTTATG--ACAACTAAAGGTAATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * *** * *
14512885 ACAGTCCTAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
126 ATAGT-ATAATTATTTTAAC-TGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
** * *
14512950 TTTTGAAATATTAATAAATTTA-TGTTATTTTATTTGGA-ATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAA
189 TTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTGTTATTTTA-TTCCATATAAGCTTCTATGAACT-GAAACAA
* ** * *
14513012 TTGTTTTATGACAAAACTAAATCTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAAAAC
251 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* ** *
14513077 TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTT-AAATCTCTT
316 TATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * * * *
14513121 TCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC--CTAT-AGAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA
* * * * * ** *
14513183 CTGATACAATTGCTTAATGATGA-AACAAAAGGTCCTAATGACTTGAAATAGATAATTATTCAAA
65 ATGAAACAATT-ATT--TTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * ** * * * ** *
14513247 TAGTTATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAACATATATATTTTAAAAATCTTTTACTTATTAATT
127 TAG-TATAATTATTTTAA-CTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* ** * * * * * **
14513312 GTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGA-ATAAGCTTGTTTGAACAAAAACAATTG
190 TTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTT-ATTCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATTG
* * * *
14513376 TTTTATGACAAAAAAAAAG-TCA-ACT-ATTTGAAATAAATATTTATTCAAATAGTCGTAACTAT
254 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * *** * * *
14513438 TTAAATTTA-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATATTTT
319 TTGAA-CTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * *
14513479 ACTTATTAACTATTTG-AATATTAATAAATTTGTTTTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGA-
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAT
* * * ** * * * *
14513541 ATA-GAAAAAATTATTCTACAACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATA-AGTAATTGTTCA
63 AAATGAAACAATTATTTTATGAC--AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCA
* * * * * * * *
14513604 AATAGTCATAATTATTTGAATTTGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATATCTTACTTCTTAA
125 AATAGT-ATAATTATTTTAA-CTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * *
14513669 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAA
188 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCC-ATATAAGCTTCTATGAACT-GAAACAA
* * * * * *** * * * * *
14513732 TTATTTTCTAACAAAACAAAGGGTCATAGCAATTTGAAAGAGATAATTGTTTAAACAGTCATAAC
251 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * * ** **
14513797 AATTTGCATTGGTT-AGGTCAACGGATCCATTTTTT-AAAT-TCGTT
316 TATTTGAACTAGTTCA-ATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTC-TT
* * **
14513841 ACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATGAGCATTACTTTA-TTCGAAATAAGAGTGTAT--T
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAT
* * * * * *
14513902 -AGTAGAAACAATTATTTTATAACAAAAC-AAATAGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC
63 AAAT-GAAACAATTATTTTATGAC--AACTAAA-GGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * *
14513965 AAATGGTTATAACTAATTAAACTGGTTTGTTATATAGATTTA-TTTTTAAA--T-TT-CTTATTA
124 AAATAG-TATAATTATTTTAACT-GTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* ** * * * * * ** *
14514025 ATTCTAAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT--ATGAACAAACTTATATGAACAAAAATA
187 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCAT--ATAAGCTTCTATGAACTGAAACA
* * * * * *
14514088 TTTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAG-CATTA
250 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-TA
* * * * ** *
14514152 ACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-ATGTCTCTA
314 ACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * *
14514198 AGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTATATTAGTATTATTTTA-TTCCATATAAGCTTGTATGA-
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAT
* * * * * * ** * *
14514260 ACAT-AAATAATTGTTTTTTTGAGAAAACAAAAGGTTAA-AAAAATTTGAAATATATAATTGTTC
63 AAATGAAACAATT-ATTTTAT--GACAACTAAAGG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * * *
14514323 AAACAATCATAACTATTTCAACAAGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT-TCCACTCATT
124 AAATAGT-ATAATTATTTTAAC-TGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATT
** * * * ***
14514386 AATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGAATTATTTTATTTCGA-ATAGGCTTATATGATAAAAAAAC
186 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTA-TTCCATATAAGCTTCTATGA-ACTGAAAC
* * * * * *
14514449 AATTGTTTTATGACAAAA-AAAATGTTCATAAGGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCAT
249 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** * **
14514513 AATTATTTAAACTAATTTGATAAACTA-ATTTA-TTTTTGAAATCTCCA
313 AACTATTTGAACTAGTTCAATAAA-TAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * *
14514560 ACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATG--A
1 ACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA
* * * * * * *
14514622 ACTGAAACAATTATTTTATTATAAAAC-AAATGCTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAA
64 AATGAAACAATTATTTTA-T-GACAACTAAA-GGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * * * *
14514686 ATAGTCTTAAGTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTC-TAGTTTATTA
126 ATAGT-ATAATTATTTTAA-CTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-CTTATTA
* * ** * * *
14514750 ATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCATGTATGAACTGAAACA
187 A-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTGTTATTTTATTCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAACA
* * * * * * *
14514813 ATTATTTTATGACTAAACAAAAGGA-CAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTA
250 ATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** ** * *
14514877 ACTATTTAAAATTTTTTGATAAACAAATTT-TTTTTAT-AAATCTCTT
314 ACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTT-TCAAATCTCTT
* * ** * * *
14514923 ACTTATTAATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTA-CTCTAAATAAGCTTGTATGA-A
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGATA
* * * * * *
14514985 TA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGTTCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTCAAA
64 AATGAAACAATTATTTTATGAC--AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * * *
14515048 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTCTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAATAGATTTAGT-TTTTAAA
127 TAGT-ATAATTATTTTAACT-GTTTGGTAAATAAATTTA-TTTTT--TA-A---A-TCTCTT--A
* *** * * *
14515112 TCTCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAACATTATTTTATTCTGA-ATAA-TTTGGTATG
180 ---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTC-CATATAAGCTT-CTATG
* * ** * *
14515175 AA-TAAAAACAATTATTTTACCACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTG
240 AACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTC
* * * ** * * *
14515238 AAATAGTTATAATTATTTGAACTCGCTT-GGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTT
303 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * *
14515295 AGTTATTAA-TTTCGAAATATTTAA-AAATTTATATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATGA-
1 ACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAAA-TTAGATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAT
* * * * * *
14515356 ATAA--AACCAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTA
63 A-AATGAAACAATTATTTTATGAC--AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
** * * * * * *
14515418 GTTAGTTGTAACTA-ATT-GC-GTTTGCTCGAAAAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCA
125 AATAG-TATAATTATTTTAACTGTTTG---G--TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
14515480 TTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATAT-CAAACAAGTTTATATGAATTGAAA
184 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTAT-TCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAA
* * * * * * *
14515544 CAACTGTTTTATTACAAAAGAAAATTG-TTAGAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTC
248 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAA--GATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
14515608 ATGACTATTTGATA-TTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTT-AAGTCTTTT
311 ATAACTATTTGA-ACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* ** * * * * *
14515656 ACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGA-AC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-
* * ** ** ** * * **
14515720 AA--AAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAAATCCTAACAAGTTGAAATAAATAACTGCTT-AA
64 AATGAAACAATTATTTTATGAC-AACT-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAA-TTATTCAA
** * * * * * **
14515782 ATAGTCATAACGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTCGT
126 ATAGT-ATAATTATTTTAAC-TGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * *
14515847 TGTCTT--AATATTAATAAA-TATGTATTATTTTATTCAAAATAAACTTGTATGAACAGAAAAAA
189 T-T-TTGAAATATTAATAAATTA-GTGTTATTTTATTCCATATAAGCTTCTATGAACTG-AAACA
* ** * * * * * * *
14515909 AATCATTTATGACAAAACAAAA-AGTTAT-TTCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAC
250 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAAT-GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * ** *
14515972 ATTTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
313 AACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * * ** *
14516019 AATTATTAATTTTTGGAATGTTAGTAACTTAGTATTATTTTATTTTAAATAA-ATT-TAT-ATGA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAT-A
* * * * * * * ** *
14516081 ATTGAAATAATTTTTTTATGATAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
64 AATGAAACAATTATTTTATG--ACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* ** * *** * * * * *
14516146 TAGTCA-AGACTATTCGATCTAGTTCAATAAAGATAA-TGATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA
127 TAGT-ATA-ATTATTTTAACT-GTTTGGTAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
**** * * * * *
14516209 TTGCCAAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTAATCC-TAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACTA
188 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCAT-ATAAGCTTCTATGAACT-GAAACAA
* * * * * * *
14516272 TTGTTTTATAATAGAACAAAA-AGTTATAACGATTTGAAATAAATACTTCCTT-AAATAGTCATA
251 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAGTCATA
* *
14516335 ACTATTTGAACTGGATT-ATTAAATAGATTTATTTTTT-AAA--TC-T
314 ACTATTTGAACTAG-TTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * * * *
14516378 -CTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGATAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA
** * * * ** *
14516442 A--AAACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
65 ATGAAACAATTATTTTATGAC--AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * ** *
14516505 AATCTTAATTATTTAAACAAATTAGGTAAACCT-AA-TTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAAT
128 AGT-ATAATTATTTTAAC-TGTTTGGTAAA--TAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * ** * * *
14516564 TTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTAGTTTATTCC-TAATAAGCTAGTACGAATTGAAA-AAA
189 TTTTGAAATATTAATAAATT-AGTGTTATTTTATTCCAT-ATAAGCTTCTATGAACTGAAACAAT
* * * ** * * * * *
14516626 TGTTTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATACAGTCTTAAC
252 TG-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAC
** * * *
14516691 TATTTGAACTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTT-TAATCTCTT
316 TATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* ** **
14516735 A-TGT-TTAATTTTTGAAATATTATTGGATTAGTATTATTTTGCTTCGAATAAGCTTGTATGA-A
1 ACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA
* * * * * * * *
14516797 CAA--AAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAAAGTTATAAAGATTT-AAAGTATG-CAATTGTTC
64 -AATGAAACAATTATTTTATGACA-ACT-AAAGGTAATAATGATTTGAAA-TA-GATAATTATTC
* * * ** *
14516858 AAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGCTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTA
124 AAATAGT-ATAATTATTTTAACT-GTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
14516919 AATTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATG-A-TAAATAACA
187 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCATATAAGCTTCTATGAACT-GA-AACA
** * * * * * * * * * *
14516981 ATTGTTAGATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAG
250 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * * * *
14517046 TTAATTGAAC-CGATTCAGTAAACAGATTCACTTTTT-AAATCACTT
315 CTATTTGAACTAG-TTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * *
14517091 ACTTATTACTTTTTTGAACTATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATG--A
1 ACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA
* * * * * * ** * *
14517154 ACTAAAACAA--A---CATAATAA--AAA-GTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
64 AATGAAACAATTATTTTATGACAACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
14517211 GTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTT
129 GT-ATAATTATTTTAAC-TGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
14517276 CTCAAATGTTAATAAATTTG-GATTATTTTATT--ATGAATAAGCTTGTA--AATATGAAACAGA
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* * * * * * * **
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* ** *
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316 TATTTGAACTAG-TTCAATAAATAG-ATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * * * *
14517441 -CTTATTAATTTTTAAAATATTATTGAATTAGTATTATTTT-TAATCAAATATGCTTCTATGATC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAT-
* ** * ** ** * *
14517504 AAA-G--ACAATTATTTTATAACAAAAAAAAAAAGGTCATAACAATTCAAAATAGATAATCATTT
63 AAATGAAACAATTATTTTATGAC----AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * * *
14517566 AAATGGCCATAATTATTTTAATTGAGTCGATAAACAGATTTATTTTCTAAA--T-TT-CTTATTA
124 AAATAG-TATAATTATTTTAACTG-TTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** ** * * *
14517627 ATTTAGGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCATCA-AAGCTTATATTAACTGAAATAA
187 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCCAT-ATAAGCTTCTATGAACTGAAACAA
** * * * * * * * * * *
14517691 TTGTTTTATGACAAATTAAAAG-CCTACAACGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAATAATAA
251 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
** * * * * *
14517755 CTATTTCCACT-TTTCAGTAAACA-ACTTTATTTTTTTTTAAATCACTT
315 CTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGA-TTTA--TTTTTTCAAATCTCTT
* ** * * *
14517802 CCTTATTAATTTTCCAAATGTTAATAAATTAGAATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATG--A
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGATA
** * * * * * **
14517864 GCTGAAACAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCAA-AATGATTTGAAATAAATAATTTTTGTA
64 AATGAAACAATTATTTTATGAC--AACTAAAGGT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* ** * * ** *
14517928 ATAGTCTTAACCATTTGAATTGATTCAGTAAATAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATT-AT
126 ATAGT-ATAATTATTTTAACTG-TTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * *
14517992 TTTCGAAGTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGA-ATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATT
189 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCC-ATATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATT
* * * * * * ** * * *
14518055 ATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATTATCGTTCATATAGTCTTAATTA
253 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * *
14518120 TTTGAATTGGTTCAGTAATTAAATTTATTTTTT-AATTTTCTT
318 TTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * ** *
14518162 GA-TTATTAAGTTTT-AGAATATTATTAAATTGGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAGTATGA-
1 -ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAT
* * * * * * * *
14518224 ACAT-AACCATTTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAA
63 AAATGAAACAATTATTTTATGAC-AACT-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * ** *
14518288 ATAGTCAAAACTACTTGAAATGGATTT-GTAAGCAAATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTA
126 ATAGT-ATAATTATTTTAACT-G-TTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTA
* * * * * * * **
14518351 A-TTTTGTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAATTTCGA-ACAAACTTATATTAACAAAAACA
187 ATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTA-TTCCATATAAGCTTCTATGAACTGAAACA
* * * * * * * *
14518414 ATTGTTTTTTGATAAAA-AAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAA
250 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* *** * *
14518478 TTATTTGAACTAGTTTTGTAAATAGAATTATTTTCT-AAATCTCTT
315 CTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
14518523 A--TA--AATTTTTGAAATATTAATAAATTA-ATTTTATTTTATTTCGAATGAA-CTTGTATG--
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGA--TTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAT
** * * * * * ** * *
14518580 AGCTAAAATAATT-TGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAAATAATTTTTCA
63 AAATGAAACAATTAT-TTTATGAC--AACTAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * ** ** * *
14518644 TATAGTCTTAACTATTTGT-ATTGGTTTGACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCCTAATTATTA
125 AATAGT-ATAATTATTT-TAACT-GTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * ** *
14518708 ATTTTT-AGAATTTTACTTAATTAGTATTATTTTATTACGA-AAAAACTTCTATGAACAAAAATA
187 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATT-CCATATAAGCTTCTATGAACTGAAACA
* * * * ** **
14518771 ATTGTTTTAAGATAAAATAAAA-ATTTATAACAATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATA
250 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ***
14518835 ACCATTTGAATTGGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTT-AAA--TCTT
314 ACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
* * * * * * * * *
14518879 --TTATAAATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTATATGTTGA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA
* * * * * * * * *
14518942 A--ACACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAACAACGATTTGAAATAAATAGTTGTTCAAAT
65 ATGAAACAATTATTTTATGAC-AACT-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * ** *
14519005 GGCTATAATTACTTAAATTGATTCAGTAAACT-AATTT-TTTTTTAAATTTCTTA-TTATTAATT
128 AG-TATAATTATTTTAACTG-TTTGGTAAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T
* * * * *
14519067 TTTTTAAGTATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATT
189 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATT
14519101 TTTGATAAGC
Statistics
Matches: 6194, Mismatches: 1476, Indels: 1085
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
347 2 0.00
348 104 0.02
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350 2 0.00
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392 17 0.00
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Consensus pattern (360 bp):
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ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
AGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTT
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* * * * * *
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* * * * *
14511583 TTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTCT-AAAAATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
64 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
14511647 TGAACTAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAACTTTTT
128 TGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTT
* * * * * *
14511703 G-AGTGTTAATAAATTAGTAAT-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTAT
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* * * * * * * ** *
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66 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
14511830 A-TTGGTTTGGTAAACACATTTATATTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTT
131 ACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * ** * *
14511877 GAGATATTATTAAATTAGCATTATTTT-TATCTAAATAAGCTTGTATGATCAAAAATAATTATTT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
14511941 TATGATAAAA-GAAAGATCATAATGATTTGAGATTGAT-TTTTTTCAAATAGTCATAACTATTT-
65 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
14512003 AAGTTGGTTCAGA-AAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
130 AACTT-GTTC-GATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * ***
14512056 TAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TCATATAAGTTTTTATGAATTGAATTTATTGTTT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * *
14512120 TATGGCAAAATAGAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCCAT
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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128 TGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * ** * *
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* * * * * **
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* * * * ** * * *
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64 TTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * *
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* * * * * * * ** * *
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* * *
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* * * ** * *
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130 AACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * ***
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* * * * *
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* * * * * * * *
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66 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * * *
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181 T
* ** * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * ** ** *
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*** * * * * *
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* * * * * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * * * ** *
14515553 TATTACAAAAGAAAATTGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATGACTATTT
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* * * * *
14515618 GATA-TTGTTC-AGTAAACATATTTA-TTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTATC
129 GA-ACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * ** * **
14515670 AAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
14515735 ATGACAAAATGAAAA-ATCCTAACAAGTTGAAATAAATAACTGCTT-AAATAGTCATAACGATTT
66 ATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * **
14515798 GAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTCGTTGTCTT
129 GAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TT
* * * * * **
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1 GAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTG-AAACAATTGTT
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* * *
14515980 AAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTT
129 GAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * ** * * * *
14516033 GGAATGTTAGTAACTTAGTATTATTTTATTTTAAATAAATTTATATGAATTGAAATAATTTTTTT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
14516098 ATGATAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATTCG
66 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTG
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14516162 ATCTAGTTCAATAAAGATAATGATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGCC
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* * * *
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* * * * * * * *
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64 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATT
* *
14516341 TGAACTGGATT--ATTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT
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14516391 AAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGATA-AAAAACTTTTGTTT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTT
* * * * *
14516455 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCTTAATTATTTA
65 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
*** * * ** *
14516520 AACAAATTAGGTAAACCTAATTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTT
130 AACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
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* * * * *
14516875 TAAACTGGCTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAAATTTT
128 TGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GA-AACAATTGTT
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14516987 AGATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAGTTAATT
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* * * * *
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* * * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * * *
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65 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
14517225 AACTTGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTCT
130 AACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT
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* *
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* * * ** ** * * * *
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64 TTATGAC--AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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127 TTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
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** * * *
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* * * * *
14517816 CAAATGTTAATAAATTAGAATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAGCTGAAACAATTGTTTT
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14517881 ATAACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTTTTGTAATAGTCTTAACCATTTGA
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131 ACTTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
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** * * * *
14518125 A-TTGGTTC-AGTAATTAAATTTATTTTTTAATTTTCTTGA-TTATTAAGTTTT
131 ACTT-GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTT
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63 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
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* * * * **
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1 G-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGT
* * * * * * *
14518419 TTTTTGATAAAA-AAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAATTATT
63 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * ** *
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* * * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * **
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** * * *
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** * * * **
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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*
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * *
14513651 AAATATCTTACTTCTTAATTTTT
517 AAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
* * ** * * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTT
* * * *** * * * *
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* * * ** **
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* * * ** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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** ***
14514184 TTTTTATGTCTCTAAGTTATTAA-TTTT
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* * * ** * *
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* * * * ** * * *
14514274 TTTTTTGAGAAAACAAAAGGTTAAAAAAATTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATCATAACTAT
62 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* *** ** * * *
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* * * * * *
14514401 AA-AAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAGGCTTATATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGACAA
190 AATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* ** * * * * **
14514465 AAAAAATGTTCATAAGGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAACTAATT
253 AAAAAAAG-TCA-AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTT
* * * *** *
14514530 TGATAAACTA-ATTTATTTTTGAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAAT
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* * * * * * * *
14514593 ATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATTATAAAACAAATGCTC
379 ATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATC
* * * * * *
14514657 ATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAAGTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATA
442 ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAA
* *
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* * * * *
14514757 G-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTATTT
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* * * * *
14514820 TATGACTAAACAAAAGGACAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTA
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* * * * *
14514885 AAATTTTTTGA-TAAACAAATTT-TTTTTATAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTATT
129 GAATTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
** * * * *
14514947 AGTTTAGCAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC
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* * * *
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* * *
14515075 TCAATAGATTTAGTTTTTAATAGATTTAGT-TTTTAAATCTCTTATTAATTTTTTAAATATTAAT
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* * **
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* * * *
14515203 AAAATG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATAGTTATAATTATTTGAACTCGCTT-
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** *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * *
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*** * * * * * **
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* * ** * * * * *
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* * * * * * **** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * ** **
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**** * *
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* * * * * ** *
14516707 GCAAACAAATTTATTTTTTTAATCTCTTA-TGT-TTAATTTTTGAAATATTATTGGATTAGTATT
318 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * *
14516770 ATTTTGCTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAATA-AAAAG-TTAT
382 ATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACA-AA-ACAAAAGATCAT
* *** * * * * * *
14516833 AAAGATTT-AAAGTATGCAATTGTTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGCTCAGTAAACAAAT
444 AATGATTTGAAA-TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAAT
*
14516897 TTATTTTTTAAA--TC-TT-TTATTAAATTTT
508 TTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
* ** * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-GA-AACAATTGTT
** * * * * * * ** *
14516987 AGATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAGTTAATT
64 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * *
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129 GAATTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAA
* *
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192 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA-AA
* * * * *
14517170 TAAAAAGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTG
254 AAAAAAGTCA-AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCG
* * * * * * * ***
14517235 GTAAAAAAAATTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTCTCAAATGTTAATAAATTTGGATT
318 GTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * *
14517300 ATTTTATTATGAATAAGCTTGTA--AATATGAAACAGA-TATTTTATGACTATACAAAAGGTCAT
382 ATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAATA-AAAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* * * * ** ** * **
14517362 AACGATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAAC-TGATTTAGCAAACGCAT
444 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAAT
14517426 TTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTT
508 TTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
* * * * ** * * * * *
14517454 AAAATATTATTGAATTAGTATTATTTT-TAATCAAATATGCTTCTATGATC-AAAGACAATTATT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTATATGAACTGAA-ACAATTGTT
* * ** ** ** * * * *
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64 TTATGAC--AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
14517582 TTTAA-TTGAGTC-GATAAACAGATTTATTTTCTAAA--T-TT-CTTATTAA--TTTAGGAAATA
127 TTGAATTTG-TTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-G-AATA
* * * * *
14517639 TTAATAAATTAGCATTATTTTATTC-CATCAAAGCTTATATTAACT-GAAATAATTGTTTTATGA
188 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAT--AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * * * * * * * **
14517702 CAAATTAAAAGCCTACAACGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAATAATAACTATTTCCACTT
250 CAAAAAAAAAGTC-A-AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT
* ** * ** *
14517767 -TTCAGTAAACA-ACTTTATTTTTTTTTAAATCACTTCCTTATTAATTTTCCAAATGTTAATAAA
313 GTTCGGTAAACAGA-TTTA---TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * *
14517830 TTAGA-ATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAGCT-GAAACAATTGTTTTATAACTAAACAA
374 TTA-ATATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGA-ATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * ** * * *
14517893 AAGGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTTTTGTAATAGTCTTAACCATTTGAA-TTGATTCAGT
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* * * *
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500 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
* * * ** * * *
14517996 GAAGTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTT
1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
14518060 ATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATTATCGTTCATATAGTCTTAATTATTTGA
66 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * * *
14518125 ATTGGTTCAGTAATTAAATTTATTTTTTAATTTTCTTGA-TTATTAAGTTTTAGAATATTATTAA
131 ATTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * ** * * * * * *
14518189 ATTGGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAGTATGAACATAACCATTTGTTTGATGACAAAATAAA
195 ATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAA
* * * * * * *
14518254 AGGTTATAA-TGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAGTCAAAACTACTTGAAA-TGGATT-TG
258 AAGTCA-AACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTTAAACTTG-TTCGG
* * * * *
14518316 TAAGCAAATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAA-TTTTGTAAATATTAATAAATTAGTATT
319 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * * * * *
14518379 ATTTAATTTCGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTTTGATAAAA-AAAAGGTAATAA
382 ATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * * * ** *
14518443 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAATTATTTGAACTAGTTTTGTAAATAGAA-TT
446 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-AATTT
* *
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510 ATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
* * * * * * *
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* ** * * * *
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64 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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191 ATAAATTAGTATTATTTTATT-C-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
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254 A-AAAAAGTCA-AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTT
* * * * * * * *
14518851 TGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA--TA--AATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGAT
316 CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAT
* * * * * * * *
14518912 TATTTTGTTTCGAATAAGCTTATATG-TTGAAACACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-AGTAA
381 TATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCA
* * * * * * * * *
14518975 CAACGATTTGAAATAAATAGTTGTTCAAAT-GGCTATAATTACTT-AAATTGATTCAGTAAACTA
443 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAA
* *
14519038 ATTT-TTTTTTAAATTTC-TTATTATTAATTTTTT
506 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAA-TTTTT
* * * *
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1 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTTGAATAAGCTTATATGAACT
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TTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAG
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ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
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TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
CTCTTTCTTATTAATTTTT
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14515067 TAGTCTGGTC
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1 AATAGATTTAGTTTTT
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1 AATAGATTTAGTTTTT
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1 AA
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Statistics
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AATAGATTTAGTTTTT
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* * * ** *
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* *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * * *
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* *
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** ** *
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* * * * *
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* **
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* * ** * *
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* * * *
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317 TAATTAGTATTATTTTATTACGAAAAAACTACTATGAACAAAAACAATTGTTTGAAGACAAAATA
* * * * *
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382 AAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACCACTTGAAATGGTTTGCT
* * * **
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* * **
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512 TTCGAACAAACTTATATGTACAA
* * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGGTAA-AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
14519005 GGCTATAATT
Statistics
Matches: 492, Mismatches: 88, Indels: 38
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (534 bp):
AAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAGGTAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCT
TAACCATTTGAATAGATTCAGTAAATAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTATAATTTTCGAAAT
ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATAACA
AAACAAAAGGTCATAAAAATTTAAAATAAATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGT
TCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAATTATTAAGTTTTAGAATATTACTTAATTAGTA
TTATTTTATTACGAAAAAACTACTATGAACAAAAACAATTGTTTGAAGACAAAATAAAAAGTTAT
AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACCACTTGAAATGGTTTGCTAAACAAATT
TACTTTTTAAATCTTTTATAAATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGATTATTTAATTTCGAACAA
ACTTATATGTACAA
Found at i:14518986 original size:358 final size:356
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Indices: 14518323--14518993 Score: 805
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14518313 TTGTAAGCAA
* *
14518323 ATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTGTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAATTT
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* * ** * **
14518388 CGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTTTGATAAAAAAAAGGTAATAATGATTTGAAA
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* * ** *
14518453 TAGATAATTGTTCAAATAATTATAATTATTTGAACTAGTTTTGTAAATAGAATTATTTTCTAAAT
131 TAGATAATTATTCAAATAATCATAACCATTTGAACTAGGTTTGTAAATAGAATTATTTTCTAAAT
* * * * ** *
14518518 CTCTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTTTATTTCGAATGAACTTGTATGAGC
196 CTCTTATAAATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGATTATTTTATTTCGAATGAACTTATATGAGC
* * * *
14518583 TAAAATAATTTGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAAATAATTTTTCATATA
261 -AAAACAATTTGTTTATAACAAAACAAAAAGTAACAAAAATTTGAAATAAATAATTTTTCATATA
14518648 GTCTTAACTATTTGTATTGGTTTGACAAATGG
325 GTCTTAACTATTTGTATTGGTTTGACAAATGG
* * * * *
14518680 ATTTATTTTTTAAATCTCCTAATT-ATTAATTTT-TAGAATTTTACTTAATTAGTATTATTTTAT
1 ATTTACTTTTTAAATCT-CTAATTGATTAATTTTGTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTAAT
* * * *
14518743 TACGAAAAAACTTCTATGAACAAAAATAATTGTTTTAAGATAAAATAAAAATTTATAACAATTTG
64 TACGAAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAAGATAAAA-AAAAAGTAATAACAATTTG
* * * * *
14518808 AAATGGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAA-TTGGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTT
128 AAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACCATTTGAACTAGGTTTG-TAAATAGAATTATTTTCT
* *
14518872 AAATCTTTTATAAATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGATTATTTTGTTTCGAAT-AAGCTTATA
192 AAATCTCTTATAAATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGATTATTTTATTTCGAATGAA-CTTATA
* * * **
14518936 TGTTG-AAACACAA-TTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAACAACGATTTGAAATAAATA
256 TG-AGCAAA-ACAATTTG-TTTATAACAAAACAAAAAGTAACAAAAATTTGAAATAAATA
14518994 GTTGTTCAAA
Statistics
Matches: 260, Mismatches: 46, Indels: 15
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Matches are distributed among these distances:
356 2 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (356 bp):
ATTTACTTTTTAAATCTCTAATTGATTAATTTTGTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAATTA
CGAAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAAGATAAAAAAAAAGTAATAACAATTTGAAA
TAGATAATTATTCAAATAATCATAACCATTTGAACTAGGTTTGTAAATAGAATTATTTTCTAAAT
CTCTTATAAATTCTTGAAATATCAACAAATCAAGATTATTTTATTTCGAATGAACTTATATGAGC
AAAACAATTTGTTTATAACAAAACAAAAAGTAACAAAAATTTGAAATAAATAATTTTTCATATAG
TCTTAACTATTTGTATTGGTTTGACAAATGG
Found at i:14520526 original size:179 final size:178
Alignment explanation
Indices: 14519122--14523036 Score: 2313
Period size: 181 Copynumber: 22.0 Consensus size: 178
14519112 TTATGAACTA
* * * **
14519122 AATTGTTCAAATAGTAATAACT-TTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTAATTTTTCAAATCTCA
1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-CGATTT-ATTTTT-AAATCTTT
* * * ** * * *
14519186 TGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAGTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATATGCTTGCATAAA
63 TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
14519250 C-TGAAACAATTATTATATGACTAAATC-AAAGGCCAGAATGATTTGAAATCGAT
126 CAT-AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * ** * * * *
14519303 AATTATTCTAATAATTGTAATTATTTGAACTGGTTC-GCAAACACATTTATTTTTTAAATC---T
1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-GATTTA-TTTTTAAATCTTTT
* * *
14519364 -CATATTAATTTTTGAAATATTATTCAATTAGTATTATTTTTATTTGAATAAGCTTGTATGATA-
64 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTGAATAAGCTTGTATGA-AC
* * * * * * *
14519427 AAAAATAATTGTTTTATAAGAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAGATTGAT
127 ATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * ** * * *
14519478 ATTTGTTCAAATATTCATAACTATTTAAACTGGTTCGAAAAACAACTTTAGTTTTTAAATATCTT
1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACGA-TTTA-TTTTTAAATCTTTT
* * * * * * *
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**
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * *
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** * * * ** *
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* *
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* * * * * *
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1 AATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACGA--TTTATTTTTAAATCTT-
* * * * * *
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* * *
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* * *
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1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACGATTTATTTTT-AAATCTTTTA
* * * *
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* *
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* * ** *
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* * * * **
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* * *
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* * ** *
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* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * ** * ***
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *** *
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* ** * * * * *
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1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-GATTTA-TTTTTAAATCTTTT
** * * *
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* * **
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* * * * ** * **
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* * * * * * **
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* * *
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* * * * * *
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* * ** *
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** * * * *
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** * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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* * ** * * ** *
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* * * * * **
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* * ** * * *
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* * * * * *
14522635 AAAAATAATTGTTTTAAGAC--AA-AATA--TCATAATGGTTTGAAATAGAC
127 ATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
** * * * * * * ***
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1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-GATTTATT-TTTAAATCTTTT
* ** *
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* * ** * *
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127 ATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * *
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* * * * * *
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*
14522991 ACA-AAAGCAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
125 ACATAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
14523037 GAACGTGTCA
Statistics
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* * * * *
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* * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * *
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** * * * ** * * *
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315 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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*
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* * ** *
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* * * *
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*
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*
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*** * **
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * * *
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** *
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* * * * * * * ** ***
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* * * *
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* *
14521031 ATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACTAAAAG-TCATAATGATTTGAAATA-ATTAATTGTTCA
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* * * *
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* * * * *
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* * * *** *
14521222 AATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGT
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* * * * *
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* * * * *
14521391 TCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
126 --AAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * ** * * *
14521456 TAATCATAACTGTTTGCAC-TGCATTGGTAAGGTCAACAGATACATTTTCTAAATCTATTGCTTA
188 TAGTCATAACTATTTGAACTTG--TT--T--GGT-AATAGATTTATTTT-TAAATTTTTTACTTA
* * * * ** *
14521520 TTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTACTTAATTCTAAAT-AGAAATGTATGAACAGAAA
245 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAG-CTTGTATGAACATAAA
* *
14521583 CAATTG-TTTA-G-C-AAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGAT
308 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
14521626 AATTATTCATATAG-CTTTAACTATTTGAATTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
1 AATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTT-TA-GAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * *
14521690 TAGTTATTAATTTTTATAATATT-ATTAGATTAGTATTATTTTGTTCCGAATAAGCTT-AT-ATA
63 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAG-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGATGA-A
* * * * *
14521752 ACATAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAG------------G---T---T-ATAGCTCAAAT
126 A-A-GAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
14521798 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTAAATTAAAA
189 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAA-TAGATTTA-TTTTTAAAT-T--T-TTTACTT---A
* * * * ** *
14521863 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTTCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAAC
245 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAAC
* *
14521928 AATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGAT
309 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * **
14521974 AATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAATTGATTCGATA-AACTGATTTATTTTTTAAATCTTT
1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT---TAGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * * *
14522038 AACTTATCAATTTTTAAAA-ATCAATAAAG-TAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA
63 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAGTTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC-TTGATGAA
* * * * * * * *
14522101 CTATAATAATTGTTTT-CGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
126 -AAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * *
14522165 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTAGCTTTTTAAATTTTTTGCTTATTAATT
189 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT-AATAGATTTA--TTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-T
* * * * * *
14522230 TTTTG-AATGTTAA-AGAAATGGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATGTACGAAC-TGAAATAA-
250 TTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAAT
* * * * *
14522291 --TTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGAT
312 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
14522332 AATTATTCTAATAAGT-TTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCT
1 AATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TA-GAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * *
14522396 TACTTATTAATTTTTAAAATATTACT-AGTTTAGCAATATTTTACTCCGAATAAGTTTGTATGAA
63 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAG-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG-ATGAA
* * * * * * * *
14522460 CAAAAACAATTATTTTATTATAAAACAAAA-ATCAAAACAATTTGAGATAGATAA-TGTTCATAT
126 -AAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
14522523 AGTCATAACTATTTAAACTGGCTCGATAAATAAATTTAATTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTT
189 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT-AATAGATTT-ATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTT
* * ** * * * * *
14522584 TTGAAATATTAA-AAAATATTATTATTTTA-TTGTAATTAATTTTGTGTGGATAAAAATAATTGT
252 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AA-TAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGT
* * * *
14522647 TTTAAGAC--AA-AATA--TCATAATGGTTTGAAATAGAC
315 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
** * * * * * * * ***
14522682 AACAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTGATTGTTTAAATCTCCA
1 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAG--AACAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * ** *
14522747 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAATA
64 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG-ATGAAAA
* * * * *
14522812 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGACATAAATAATTGTTTAAATAG
128 G-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
14522877 TCATAACTATTTGAACTTGCTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAATATTTTACTCATTAATTTT
191 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGG-TAATAGATTTA-TTTTT-AAATTTTTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
14522942 TAAAATTTTAATAAATTA-TCATTATTTTATTCCGAATAAACTTTTATGAACA-AAAGCAATTGG
253 TGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACATAAA-CAATTGT
14523005 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
315 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
14523037 GAACGTGTCA
Statistics
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Consensus pattern (354 bp):
AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGATGAAAAGAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTTGTTTGGTAATAGATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
TAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAA
ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
Found at i:14522438 original size:178 final size:179
Alignment explanation
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Period size: 179 Copynumber: 3.8 Consensus size: 179
14521932 GTTTTATGGC
* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
14522068 AATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTATAATAATTGTTTTCGAT
127 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATGTACGAACTATAATAATTGTTATCAAT
* * *
14522121 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT-TAA-ATAGTCATAACTATTTGAACT
1 AAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA-AGTCATAACTATTTGAACT
* * * * ** * *
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65 GGTTCGA-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAA-TCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATAG-AA
*
14522248 TGGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATGTACGAACTGA-AATAATT-TTAT-AACT
126 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATGTACGAACT-ATAATAATTGTTATCAA-T
* *
14522301 -AAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAAGT-TTAACTATTTGAACTG
1 AAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAAGTCATAACTATTTGAACTG
* * **
14522364 GTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTACTAGTTTAG
66 GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTA-TAGAATAG
* * * * ** * * * * * *
14522429 CAATATTTTACTCCGAATAAGTTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAT-TAT
129 TATTATTTTATTTCGAATAAGCATGTACGAACTATAATAA-T-TGTTATCAAT
* * * * * * *
14522481 AAAACAAAA-ATCAAAACAATTTGAGATAGATAA-TGTTC--ATATAGTCATAACTATTTAAACT
1 AAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA-AGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * *
14522542 GGCTCGATAAATAAATTTAATTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATATT
65 GGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATAGAATAGT
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130 ATTATTTTATT
14522615 GTAATTAATT
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Consensus pattern (179 bp):
AAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAAGTCATAACTATTTGAACTG
GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATAGAATAGTA
TTATTTTATTTCGAATAAGCATGTACGAACTATAATAATTGTTATCAAT
Found at i:14523690 original size:58 final size:57
Alignment explanation
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Period size: 58 Copynumber: 11.7 Consensus size: 57
14523510 TCTTGTGTAG
** * *
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* *
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* *
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1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTGAAA-TTTGATTTTCAA
* *
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* * *
14523763 GGAAAATTGATACTTTCAAGTTTTCCCCAAAAATATTTTTTTAAAAATTTTGATTTTCAA
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* *
14523823 GGAAAATTGATACTTTCATCTTTTCCTCAAAAATATTTTTGGAAACTTTGATTTTCAA
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTGAAA-TTTGATTTTCAA
* *
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1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAA--TATTTTTTGAAATTTGATTTTCAA
* * *
14523939 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAA
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAA----TATTTTTTGAAATTTGATTTTCAA
*
14524000 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCC-CAAAAATATTTTTTGGAACTTTGATTTTCGAGGAAAA
1 GGAAAATTGATACTTTCAAC-TTTTCCTCAAAAATATTTTTT-GAAATTTGATTTTC--------
14524064 TTGATA
56 ---A-A
* * *
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1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAA--TATTTTTTGAAATTTGATTTTCAA
*
14524128 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCC-CAAAAATAATTTTTGAAACTTTGATTTTCAA
1 GGAAAATTGATACTTTCAAC-TTTTCCTCAAAAATATTTTTTGAAA-TTTGATTTTCAA
* *
14524186 GGGAAATTGATACTTTCAACTTTTCCCCAAAAATATTTTTT
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTT
14524227 TTATATTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (57 bp):
GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTGAAATTTGATTTTCAA
Found at i:14523852 original size:177 final size:175
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Indices: 14523520--14524225 Score: 943
Period size: 177 Copynumber: 3.9 Consensus size: 175
14523510 TCTTGTGTAG
** **
14523520 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATTGATTTTTTTTTAATTTTATTTTTTAAGGAA
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAA--CCTTTTTTTGAAATTTTA-TTTTTAAGGAA
* *
14523585 AATTAATACTTTCAACTTTTCCCCAAAAAAATATTTTTTTTTTGGAAATTGTGATTTTCAAGGAA
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*
14523650 ATTTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTGGAAACTTTGATTTTCAA
122 AATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTGGAAACTTTGATTTTCAA
* *
14523704 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAACTTTTTTTTGAAATTTTACTTTTAAGGAAAA
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTC-AAAAACCTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAAGGAAAA
* *
14523769 TTGATACTTTCAAGTTTTCCCCAAAAATATTTTTTTAAAAATTTTGATTTTCAAGGAAAATTGAT
65 TTGATACTTTCAACTTTTCCCCAAAAATATTTTTTT-GAAATTTTGATTTTCAAGGAAAATTGAT
*
14523834 ACTTTCATCTTTTCCTCAAAAATATTTTTGGAAACTTTGATTTTCAA
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14523881 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAAGGAAAAT
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAAGGAAAAT
* * *
14523946 TGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTTTTGAAATTTT-ATTTTTAAGGAAAATTGA
66 TGATACTTTCAACTTTTCCCCAAAAA---TATTTTTTTGAAATTTTGATTTTCAAGGAAAATTGA
14524010 TACTTTCAACTTTTTCC-CAAAAATATTTTTTGG-AACTTTGATTTTCGAGGAAAATTGATA
128 TACTTTCAAC-TTTTCCTCAAAAATA-TTTTTGGAAACTTTGATTTTC-----------A-A
*
14524070 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTAAAATTTTATTTTTAAGGAAAAT
1 GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAAGGAAAAT
* * * *
14524135 TGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATA-ATTTTTGAAACTTTGATTTTCAAGGGAAATTGATAC
66 TGATACTTTCAACTTTTCCCCAAAAATATTTTTTTGAAATTTTGATTTTCAAGGAAAATTGATAC
*
14524199 TTTCAACTTTTCCCCAAAAATATTTTT
131 TTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTT
14524226 TTTATATTTA
Statistics
Matches: 474, Mismatches: 28, Indels: 39
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (175 bp):
GGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAAGGAAAAT
TGATACTTTCAACTTTTCCCCAAAAATATTTTTTTGAAATTTTGATTTTCAAGGAAAATTGATAC
TTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTGGAAACTTTGATTTTCAA
Found at i:14524074 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 14524057--14524081 Score: 50
Period size: 12 Copynumber: 2.1 Consensus size: 12
14524047 TTGATTTTCG
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1 AGGAAAATTGAT
14524069 AGGAAAATTGAT
1 AGGAAAATTGAT
14524081 A
1 A
14524082 CTTTCAACTT
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
12 13 1.00
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Consensus pattern (12 bp):
AGGAAAATTGAT
Found at i:14524124 original size:70 final size:70
Alignment explanation
Indices: 14523999--14524197 Score: 199
Period size: 70 Copynumber: 3.0 Consensus size: 70
14523989 TTTATTTTTA
* * * *
14523999 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATATTTTTTGGAACTTTGATTTTCGAGGAAAA
1 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAACATTTTTTGAAAATTTGATTTTCAAGGAAAA
14524064 TTGAT
66 TTGAT
* * *
14524069 AGGAAAATTGATACTTTCAAC-TTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTAAAATTTTA-TTT--------
1 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCC-CAAAAACATTTTTTGAAAATTTGATTTTCAAGGAAA
14524124 -TT-A-
65 ATTGAT
* * * *
14524127 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATAATTTTTGAAACTTTGATTTTCAAGGGAAA
1 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAACATTTTTTGAAAATTTGATTTTCAAGGAAAA
14524192 TTGAT
66 TTGAT
14524197 A
1 A
14524198 CTTTCAACTT
Statistics
Matches: 103, Mismatches: 12, Indels: 28
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (70 bp):
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TTGAT
Found at i:14524169 original size:128 final size:129
Alignment explanation
Indices: 14523938--14524197 Score: 450
Period size: 128 Copynumber: 2.0 Consensus size: 129
14523928 TTTATTTTTA
*
14523938 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTTTTGAAATTTTATTTTTAAGGA
1 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACC--TTTTTTTTAAAATTTTATTTTTAAGGA
* * *
14524003 AAATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATATTTTTTGGAACTTTGATTTTCGAGGAAAATTGA
64 AAATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATAATTTTTGAAACTTTGATTTTCAAGGAAAATTGA
14524068 T
129 T
14524069 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACC-TTTTTTTAAAATTTTATTTTTAAGGAAA
1 AGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAACCTTTTTTTTAAAATTTTATTTTTAAGGAAA
*
14524133 ATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATAATTTTTGAAACTTTGATTTTCAAGGGAAATTGAT
66 ATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATAATTTTTGAAACTTTGATTTTCAAGGAAAATTGAT
14524197 A
1 A
14524198 CTTTCAACTT
Statistics
Matches: 124, Mismatches: 5, Indels: 3
0.94 0.04 0.02
Matches are distributed among these distances:
128 88 0.71
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Consensus pattern (129 bp):
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ATTGATACTTTCAACTTTTTCCCAAAAATAATTTTTGAAACTTTGATTTTCAAGGAAAATTGAT
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*
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66 C
**
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C
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*
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* *
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*
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1 TTTTTCATTTTTT
14527044 TAAGCATAGT
Statistics
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* *
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* * *
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*
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1 GGAAAATTGATACTTTCAATTTTTCCCCAAAAATATTTTTGGAAACTTTGATTTTCAAGGAAAAT
*
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** * * *
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* * **
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* * **
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Statistics
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* *
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*
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* * * *
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*
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* * * *
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*
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* * **
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* *
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14536000 TCATTTTTAT
Statistics
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*
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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** * * *
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* * *
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* *
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* *
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14535999 TTCATTTTTA
Statistics
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* *
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* *
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14536102 GGTAAAAAGA
Statistics
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AAAAT
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* * *
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* *
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* * *
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*
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*
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* * *
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* * *
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* *
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*
14536961 CAGATAAATAAAAAAAATAA
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* * *
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14537005 TCAGATAAATAAAAAAATTAA
1 -CAGATAAATAAAAAAATTAA
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1 CAGATAA
14537055 TTACATAAAT
Statistics
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*
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14537192 ATAAAAT-AAT-AAAAATA-AAAATAAAA
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*
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1 AAT
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Matches: 35, Mismatches: 1, Indels: 7
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14537341 CTACAGAACG
* * * * * * * *
14537351 GATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAATT
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* * * * * *
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* * * * * * *
14537478 GAACAGAACCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAGTAATTTCAAATA
127 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * *
14537531 GATAATTGTTCAAACAAACATAATTATTTAAACCT-GTTCAGTAAATATATTCATTTTTTAAATC
1 GATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAAT-
* * *
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* * * **
14537659 AATTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
128 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
14537711 GATAATTATTTAAATAGTCAT-ATTATTTGATCTAATT-TGTTAAACATATTTATTTTTAAAATT
1 GATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTAGTTCAG-TAAATATATTTATTTTTTAAATC
* * *
14537774 TTTGACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTAATTT-GAATAAACTTGTAT
65 TTT-ACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT
* * *
14537838 GAATAGAAACAATTGTTTTATAATAGAACTAAAA-GTTATAATGATTTGAAATA
127 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * ** ** *
14537891 AAAAATTGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTAGTT-TGATAAATAGGTTTCCTTTCTAAATC
1 GATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTAGTTCAG-TAAATATATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
14537955 --T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAACTTAG-ATG
65 TTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATG
* * *
14538016 AATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA-TTGAAATA
128 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * *
14538067 GATAATTGCTC-AA-AATCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATATAATTATTTTTTAAATC
1 GATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTAGTTCA-GTAAATATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
14538129 TTTTACTCATTAATTTTTAAAAAATTAATAAATTTA-TTTTATTTTACTCCAAATAAGCTAGTAT
65 -TTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT
** * * * * *
14538193 GAATTCAAA-AACTTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATA
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* * * * * ** ** * * *
14538246 AATAATTGTTTATATAATCTTAAATATTTGAACCGGTTCAACAAATAAATTTATTTGTTAATTCT
1 GATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCT
* * *
14538311 CTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTGTATGA
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* * * * * * * * *
14538376 ACAAAAATAATTATTTTATGA-TAGACTAAAGGGTTATAATGATTTGAAGTT
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* * * * ** * *
14538427 TACAATAGTTCAAATAGTCATAGCTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATC-
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* * *
14538491 TTACTTATTAAATTTTGAA-AGCTTAATAAATTGGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGAATG-
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* ** * * ** * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * * ** **
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* * ** * *
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* ** * * ** *
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* * * * ** * * * *
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1 GATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCT
* * *
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TTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
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1 ATTTGA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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**
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* * * *
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Statistics
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Consensus pattern (174 bp):
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AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTGAAATAAAAAATTGCTCAAAATCAT
AACTATTTGAATTAGTTTGATAAATAGGTTTCCTTTCTAAATCT
Done.