Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168492.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_9, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 122000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 44 of 126
Found at i:8785334 original size:3 final size:3
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8785316 ATTTTTAACC
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8785374 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA T
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TTA
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TTTATTATTTATATTAT
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TATTATATTTA
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8787916 CATTTATTTA
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*
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TTTATATTATTTTATTAT
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1 TTTAT
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TTTATTAT
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8788016 ATATTTTATA
* *
8788026 TGTACATATTTTTAACT
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*
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*
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1 T
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TGTATATATTTTTAATT
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8800739 TAAAATAATA
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1 TTTAATAATTTTAACAT
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1 TT
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TTTAATAATTTTAACAT
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*
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* *
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*
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1 AAATTTA
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1 AAATTTA
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1 AAATT
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8814932 AAGAAAGGGC
8814942 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT A
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AAT
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8822469 GTAATAAAAC
* * **
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* * * * *
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* * * **
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** * *
8822674 ACGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAA
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* * * * * * *
8822739 TTAAAAAAAAATATATGTTTCCTGAACATGTTTAAATAGTTATAACTATGTGAAGAATTATCTAT
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325 TTCAAATCATTATGACATTTTGGTTT-ATCATAAAATT
* *
8822840 AATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAAAATTCTAAAAA
1 AATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * ** *
8822905 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGAGA-GTTTAAATTGTTATGATTAT
66 TTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACATGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
8822969 TTGAAA-ACTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTACT
130 CT-AAACACTATATATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTACT
* ** *
8823033 CATAAAATTTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATGTATTAATATTCTAACAATTAATAAGTTA
194 CACAAAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATGTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TA
* * * ** * **
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256 -AAAATTAAAAAA-AAATACATGTT-TCCTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATGTGAAGAAT
** * **
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318 CATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGGTTTATCATAAAATT
* * * *
8823202 -ATTGTCTCTATTTATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATT-TCAAA
1 AATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
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64 AATTAATAAG
8823274 AGATTTAAAA
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TTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAATTATGACTATC
TAAACACTATATATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTACTCA
CAAAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATGTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAT
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TCAAATCATTATGACATTTTGGTTTATCATAAAATT
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* * * **
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1 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
8822532 ATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATC-AAACATGTTCAAAT
66 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
8822596 AATTATGACTATCTAAATCATTATATATTTCAAAACATTATTACCTTTTGTT
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* * ***
8822648 TTGTCATAAAACAATTGGTTCTTTTCACGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTAT
1 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * *
8822711 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTAAAAAA-AAATATATGTT-TCCTG-AACATGTT
64 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTAT-TTAT-C-GAAACAAGTT
* * * * *
8822771 TAAATAGTTATAACTATGTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTT-GT
126 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-TATCATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGGT
* ** *
8822827 TTCATCATAAATTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATT
1 TT-GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * *
8822892 AAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGA-GAGTTTAAA
65 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAACAAGTTCAAA
* * * * *
8822956 TTGTTATGATTATTTGAA-AACTATTTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTT
130 TAGTTATGACTATTTGAATATC-ATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGGT
* * ** *
8823008 TTGTCATAAAACAATTATTTCTACTCATAAAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTATTA
1 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
8823073 ATATTCTAACAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTATC-AAACAAGTTCAAAT
66 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAACAAGTTCAAAT
* * * **
8823137 AGTCATGTCCATTTGAATTATCATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGGT
131 AGTTATGACTATTTGAA-TATCATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGGT
** ** * * * *
8823189 TTGTTGTAAAATTATTGTCTCTATTTATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTT
1 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
8823253 AATATT-TCAAAAATTAATAAG
65 AATATTCT-AAAAATTAATAAG
8823274 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 512, Mismatches: 90, Indels: 48
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 6 0.01
179 22 0.04
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Consensus pattern (181 bp):
TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAACAAGTTCAAAT
AGTTATGACTATTTGAATATCATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGGT
Found at i:8823878 original size:180 final size:180
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Indices: 8823472--8824663 Score: 889
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8823462 TAAAACTATA
* * * * * * ** *
8823472 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTACTTCA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTGCAGTTCA
* * * * * *
8823537 TACATGCTTATTTGAAATAAAATATTACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATACA-TAAGA
66 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTTAATA-AGTAGGA
* ** * * **
8823600 AATTTAAAGTA-AATCTATTTATTC-AA-TAAGTTCAACTAGTAATAACTATTT
129 GATTTAAAAAATAATCTATTTA-TCGAATTAA-TTCAAATAGTTATGGCTATTT
* * * * * * *
8823651 GAATAATGATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTTATCATAAAACAAATGTTGCAGTTCA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTGCAGTTCA
* * * * * *
8823716 TAAAAGCTTATCCGAAA-AAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTGGAGA
66 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAGGAGA
* * * *
8823780 TTTAAAAAATAAGTCAATTTATCAAATTAATTCAAATAATTATGGCCATTT
131 TTTAAAAAATAA-TCTATTTATCGAATTAATTCAAATAGTTATGGCTATTT
* * ** * **
8823831 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT--TTTATC
1 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTGCAGT-TC
* * * *
8823894 ATGCAGGCATATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAACATTT-ATAAGTAGG
65 ATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-ATTTAATAAGTAGG
* * *
8823957 AGATTTCAAAAATGAATCTATTTA-C---TGAA--C---CAGTT-T-G-TATTT
128 AGATTTAAAAAAT-AATCTATTTATCGAATTAATTCAAATAGTTATGGCTATTT
* ** * * * * **
8823999 GAACAACTATCTATTTCAAACCATTATAACCTTTTATTCTAT-TC-TAAAATAATTGTTTTAGTT
1 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAACAAATGTTGCAGTT
* * * * * * * *
8824062 CGTATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAAGATTTCAAAAATTAATAACTAAGA
64 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAGGA
* * * * *
8824127 GATTTAAAAAATAATCTGTTTATCGAAGTAATTCAAATAGTTAAGACTATAT
129 GATTTAAAAAATAATCTATTTATCGAATTAATTCAAATAGTTATGGCTATTT
* * * *
8824179 GAGCAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATCGTTTCAGTTC
1 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-GTTGCAGTTC
* * * * * *
8824243 ATATAAGCTTATTCGAAATATAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAAGTG
65 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAGGAG
* * * * * *
8824308 ATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCGAATTAGTTCAACTACTTAAGGCTATGT
130 ATTTAAAAAAT-AATCTATTTATCGAATTAATTCAAATAGTTATGGCTATTT
* * * * ** **
8824360 CAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAA-AAAT-TGTGTTTGAA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT-TG-CAGTT
* * * * * *
8824423 CATTCAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTTGGA
64 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAGGA
* * ** * * *
8824488 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTT
129 GATTTAAAAAAT-AATCTATTTATCGAATTAATTCAAATAGTTATGGCTATTT
* * * * * *
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* * * * * * *
8834799 TTTTATT-TCGAACAAACTTATATAAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA
64 TTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTCTATGA-AAAACAAAA
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TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATAAATTAGTATTATT
TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTCTATGAAAAACAAAATGTCAAAACGAT
TTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACCATATGAACTGGTTCAG
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8834865 ATTTTTTTCA
* * ** * *
8834875 GTTCATATAAGTTTATTCCAAATTAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TC
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* * * * * * *
8834939 AAGAGATTTTAAAAAA-GAAT-TGGTTTACTGAACAAATTTAAATAATTATGATTTTTTGAACAA
64 AAAAGA-TTTAAAAAATAAATAT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
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* *
8835056 GTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGT
1 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGT
* * *
8835120 AAAAGATTTAAATAATAATTATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAAT
64 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** *
8835183 TATTTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTAT
128 TATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
* * * * * * * *
8835236 GTTCATACAAGGTTATTTGGATTACAATAATATTAA-TTATTAATATTTTGACAATTGATAAGTA
1 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
8835300 AAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTAAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTA
65 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
8835365 ACTATTTCGAATCATTACT-A-TCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACTGTTTCAA
130 TCTATTTCAAATTATTA-TGACT-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-AT
* * * **
8835417 ATTAAATA-AA-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGAAAATTAAGGAGT
1 GTT-CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT
* ** * * * * *
8835479 AAGAGAAATAAAAAATTAATTTGTTTAAC-AAATAAGCTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACAA
64 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACTGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
** * * * * *
8835542 TTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAGTTGGTTCT
127 TTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
* ** * * * *
8835596 GTTCATGCAAGCTTATTTTTAATAAAATAGTA-TAAATTGATTAATATTACAAAAAATAAATAAG
1 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT--TAAAAATTAATAAG
* * * * *
8835660 TAAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAAT
63 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
8835724 TATCCATTTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTT
128 TATCTATTTCAAATTATTATGACT-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
* * * * * *
8835777 GTTCGTAAAAGCTTATTTGGAATAAAAAAAT-CTAATATATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTA
1 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
8835841 AAAGACTTAAAAAATTAAATCTATTTACTGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT
65 AAAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
8835906 ATTTATTTCAAATTGTTATGA-TCTCTTGTTTTCTCAT-AAA-AATTTTTTTT
129 ATCTATTTCAAATTATTATGACT-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
* ** * **
8835956 ATTCATATGAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTT
1 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-T
* * * * ** * * * * * *
8836021 GAAAGATTTAAAAAACAAATCTATCCACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCTATTCGAGCTATT
64 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
8836086 AGCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTAT
129 ATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
* * ** * *
8836138 TTTTATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-
1 GTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT
* * *
8836201 --AA-ATTTAAAAACTAAATCTGTTTA-TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
64 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
8836262 TATCTATCTAAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT
128 TATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
* * * * *
8836314 GTTCATACAAGCTTATTCT-AAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT
1 GTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT
* * * * * **
8836378 AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATCAGAACAATT
64 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
8836443 AGCGATTTCATATCATTCTAACTTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAA
129 ATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-AT
* * * * * *
8836496 CTT-ATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
1 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAA-ATTAATA
8836556 GATTAGTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAA
AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT
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Alignment explanation
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Period size: 361 Copynumber: 4.3 Consensus size: 361
8834987 TGATTTTTTG
* * * * * * * *
8834997 AACAAATATCTATTTGAAATTACTATAATCTTTTGTATTGACATAAAATAATT-TTT-TCTGTTC
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* * *
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* * * *
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* **** * * *
8835185 TTTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAAGGTT
191 TCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
** * * * * * * *
8835250 ATTTGGATTACAATAATATTAATTATTAATATTTTGACAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
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* * * **
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* * * * * **
8835357 AATAATTAACTATTTCGAATCATTACTATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACTGTTTCA-AATT-
1 AACAATTAGCTATTTCAAATCATTA-TATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-ATTGTTC
* * ** *
8835420 A-AATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGAAAATTAAGGAGTAAGA
64 ATAA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * *
8835483 GAAATAAAAAATTAATTTGTTTAAC-AAATAAGCTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACAATTAT
128 GAATTAAAAAATTAATCTGTTTAACGAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
8835546 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAGTTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTA
192 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* * * *
8835611 TTTTTAATAAAATAGTATAAATTGATTAATATTACAAAAAATAAATAAGTAAAAATTTAAAAAAT
257 TTTATAATAAAATAATATAAATT-ATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAT
* * * *
8835676 AAATATATTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTA
320 AAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCA-AGACTATTCA
* * * *
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1 AACAATTAGCTATTTCAAATCATTAT-ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATTGTTCA
* * * * *
8835782 TAAAAGCTTATTTGGAATAAAAAAAT-CTAATATATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGA
65 TAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* * * * * *
8835846 CTTAAAAAATTAAATCTATTT-ACTG-AGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATT
130 ATTAAAAAATT-AATCTGTTTAAC-GAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
*** * * * * * ** *
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193 TATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* * * * *
8835972 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAAGATTTAAAAAAC
258 TTATAATAAAATAATA-TAAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-T-AAAAATTTAAAAAAT
* ** * *
8836037 AAATCTATCCACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCTATTCG
320 AAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGACTATTCA
* * * * *
8836079 AGCTATTAGCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTATT-TTT
1 AACAATTAGCTATTTCAAATCATTAT-ATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATTGTTC
* * *
8836142 ATACAAA-ATTA-TTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---A
64 ATA-AAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *
8836202 A-ATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCG-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
127 AGAATTAAAAAATTAATCTGTTTAACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
8836265 CTATCT-AAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
192 CTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * * * *
8836328 ATTCTA-AGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
256 ATT-TATAATAAAATAAT-ATAAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAA
* * * * *
8836392 ATAAATGTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TCA
318 ATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGACTATTCA
* * * * * * **
8836435 GAACAATTAGCGATTTCATATCATTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-ACTT
1 -AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-ATTGTT
* * * * *
8836499 -ATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTATTTTATTAAT-TTTTAAAATATTAATA
63 CATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA-ATTAATA
8836556 GATTAGTATT
Statistics
Matches: 958, Mismatches: 196, Indels: 93
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Matches are distributed among these distances:
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359 64 0.07
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362 111 0.12
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (361 bp):
AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATTGTTCAT
AAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAA
TTAAAAAATTAATCTGTTTAACGAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
TTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTA
TAATAAAATAATATAAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAT
ATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGACTATTCA
Found at i:8836864 original size:309 final size:314
Alignment explanation
Indices: 8836272--8836864 Score: 682
Period size: 309 Copynumber: 1.9 Consensus size: 314
8836262 TATCTATCTA
* * * * *
8836272 AAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCTAAGT
1 AAATCATTATGACCTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAG-
* *
8836337 AAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
65 AAAATA-T-CTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGC
* * * * *
8836402 TTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATCAGAACAATTAGCGATTTCATATCATTCTAACTT
127 TTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATCAGAACAATTAGCGATTTCAAATCAGTCTAACCT
* * * * * *
8836467 TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAACTTATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTATT
192 TTTGTATAGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
8836532 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTTT
257 ATATTAATATTCAAAAAATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTTT
* *
8836590 AAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTTGATCATCCAAGCTTATTCGAA-
1 AAATCATTATGACC-TTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAG
* *
8836653 AAAATA-CTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT-A-AA-AGATTTAAAAAATAAATATGCTT
65 AAAATATCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTT
* * * ** * * ** *
8836713 ATCGAACCAATTCAAATAGTTAAAATTATTAGAATTATTATCTATTTCAAATTGGTCTGACCTTT
129 ACCGAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATCAGAACAATTAGCGATTTCAAATCAGTCTAACCTTT
* * * * *
8836778 T-TATAGTCATAAAATATTTATTTCATA-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATCCTAATA
194 TGTATAGTCATAAAATAATTATTTCA-ACTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATA
8836841 TATTTAATATTCAAAAAATTAATA
258 TA-TTAATATTCAAAAAATTAATA
8836865 AGCACGAGAT
Statistics
Matches: 230, Mismatches: 41, Indels: 17
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
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AAATCATTATGACCTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAGA
AAATATCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTAC
CGAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATCAGAACAATTAGCGATTTCAAATCAGTCTAACCTTTTG
TATAGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAT
TAATATTCAAAAAATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTTT
Found at i:8837387 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 8836590--8839306 Score: 1747
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8836580 AAACTTGTTT
* * * * *
8836590 AAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTTGATCATCCAAGCTTATTCG---
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAA
* *
8836651 -AAAA-AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATATG
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * ** * * *
8836710 CTTATCGAACCAATTCAAATAGTTAAAATTATTAGAATTATTATCTATTTC
131 TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
*** * * * * * * * ** * * *
8836761 AAATTGGTCTGACCTTTT-TATAGTCATAAAATATTTATTTCATATCATACAAGTTTATTTGGAA
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAA
* * * *
8836825 TAAAATAATCCTAATATATTTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCACGAGATTTAAAAAATAAATC
66 TAAAATAATACTAATTTA-TTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * *
8836889 TATTTACTGAATAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTA-CTTATTTT
129 TATTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTC
* * * * * * * *
8836942 AAATTATTATGATCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGTTTATCCAAA
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCGAA
* * *
8837006 ATAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTCGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAGAAAATAATT
65 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
8837070 ATGTTTTCTAAA-CAAATTCAAATAGTTACGGCTATTTAAATAATTGTATATTTA
128 CTATTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * ** * *
8837124 AAATCGTTAT-AATTTTTTTATTTTGTCATAAAATAATAGTTTCAGT-TCATATAAGCTTATTCA
1 AAATCATTATGAA--CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTCG
* * * * * * *
8837187 AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGATT
63 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
8837252 CTATATACCAAATCAGTTCATATAATTATGACCATTTCAATAATTA-CTATTTC
128 CTATTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * *
8837305 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTTTTATCATACAAGCCTATTCGGAA
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAA
* *
8837370 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTA
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* *
8837435 TTTA-C---T-A---C-ACTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTA-CATATTTC
131 TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTC
** * * * * * * * *
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1 AAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTCGA
* * *
8837537 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAA-AAA-A
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * *** *
8837600 AAGTTTGTCGAAGCAGTTCAAACAGTTAAGAGTGCATGAACAATTATCTATTTC
129 TA-TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * ** ** *
8837654 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTTAAGT-TCATACAAGCTTATTGGAA
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTCGAA
* * * *
8837718 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATAAATAAGTTAATA-ATTTAAAAAGTGAA
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* * * * * * * * *
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1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAA
* * * * *
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66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
8837965 TTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTC
131 TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * ** * * * *
8838016 AAATTGTTATGACCTTTTGTTCTACCATAAAATAATTATATTTGT-TCATACAAGCTTATTTGAA
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTTATCATACAAGCTTATTCGAA
* * ** * * *
8838080 ATAAAATAATACGAATCTAACAATA-TTCAAAAAATTAAT-AGCTAAGATAATT-AAAACTAAAT
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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*
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * *
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64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
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* * * * * * *
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1 AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCGA
** * * * ** * *
8838610 CTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAA-AAATAAAAAAAATAGATA
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * *
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129 TATTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * ** * ** *
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1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTCGAA
* * * * *
8838791 ATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAATAGATTTAGAAAATGAATA
65 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
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129 TATTTACCA-AATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * *
8838908 AAATCACTAT-AA--TTT-TTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATATATGCTTATTTTGA
1 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTA-TTCGA
* * * * * * *
8838968 AAAAAAAAAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAATAAAAAATTTTAAAAATAAA
64 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
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** *
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1 AAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TTATCATACAAGCTTATTCG
* * * ** *
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* * ** * * ** *
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* *
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TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
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8837275 AATTATGACC
* * *
8837285 ATTTCAATAATTACTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTTTTA
1 ATTTCAATAATTACTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCATAAAACAACTGTTTTGTA
* * * *
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* ** * * * *
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*
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127 TAAGAGATTTAAAAAA
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AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTACACTAGTTCCT
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* *
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1 AAA
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AAAATAATATAAAGTTAATAATTTAA
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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** * *
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* * * ** * **
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* * * ** *
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505 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAGAATCTAACAATATTCAAAAAACTAATA
* * * * * * *
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570 AGTAAGTGAATTAAAAACTAATTCTATATACCAAACCAGTTCAAATAATTAAGACCATATCAATA
* * *
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* * *
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700 CCTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAA
* * **
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765 AAATAAATCTATTTACTACACTAGAT-CTATTCGAATAATTACATATTTCAAATCATTATATCCT
** * *
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*
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* * * *
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62 TTATCGAAACAGTTCAAATAGTTAAGAAT-CATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
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* * * * **
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187 TTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAAT-AATCTATTTACTGAATCAGA
* * * * * * * * *
8837798 TAAAATATTTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCAT
250 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCAT
* * *
8837863 ATAGCAAATGTTTTTTATCATTCAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATCTTT
315 A-A-AAAATGTTTTTTATCATT-AAGTTTATTCAAAATAAAATAATATC-AATTTATTAATATTT
* *
8837927 CAAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTAT
376 CAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTATCAGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
8837991 GACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTCTACCATAAAATAATTA-
440 GACTATTTGAATAATTGTATACTTAAAATCGTTATAATCCTTTTATTCTACCATAAAATAA-TAG
* ** * *
8838054 TATT-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACGAATCTAACAATATTCAAAAAATTAA
504 T-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAGAATCTAACAATATTCAAAAAACTAA
* * * * *
8838118 T-AGCTAAGAT-AATT-AAAACTAAATT-TGTTTGCCAAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATAT
568 TAAG-TAAG-TGAATTAAAAACT-AATTCTATATACCAAACCAGTTCAAATAATTAAGACCATAT
* * *
8838179 GAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGATCGTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TTTTTCAATT
630 CAATAATTA-CTATTTCAAAACATTATGAACGTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTTT-AA-T
* * * *
8838242 CATACTAGCTTTATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
692 CATACAAGC-CTATTCGAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAA
* * *
8838306 GAGATTTAAAAAATATATTTCTAACAAGTTCTAGTA-ATTATGAT-TATTCGAATAATTATC-TA
755 GAGATTTAAAAAATA-A-ATCT----A-TT-TACTACACTA-GATCTATTCGAATAATTA-CATA
* * * * ** *
8838368 TTTCATATCATTATGA-CTTTTTGTT-TCGCCACAAACA-AA-TGTTTTTGTTCATGTAAGT-TT
810 TTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCT-ACCACAAA-ATAATTGTTTTAGTTCATACAA-TCTC
8838428 ATTCAAAAT
871 ATTCAAAAT
* * * * **
8838437 AAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGAGATATAAAAAATAAATCTA-TTTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-AAAGTTTA
* * * ** *
8838501 TC-AAACCGTTCAAATAGTTATGATTATC-TG-ACAAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTT
65 TCGAAACAGTTCAAATAGTTAAGA--ATCATGAAC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT
* * * * **
8838563 TTGTTCTATTATAAAACAATTGATTCTATTCATACAAGCTTATTTGGCTTAAAATAATACTAATT
127 TTGTTTTGTCATAAAACAA-TCATT-TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA-TAATT
** * ** * *
8838628 TATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAATAAAAAAAATAGATATGTTTACTGAA-CTAGATC
189 TATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATA-ATCTATTTACTGAATC-AGATC
* * *
8838692 AAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAA
252 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAA
* * *
8838757 AAGAAT-TATTTCAGTTCATATAAATTTATTCAAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCA
317 AA-AATGTTTTTTA--TCAT-TAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * * *
8838821 AAAATTAATAATTAATAGATTTAGAAAATGAATATGTTTA-CAGAACAAGTTTAAATAATTGTAA
378 AAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTATCAGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
8838885 CTATTTGAATAATT
442 CTATTTGAATAATT
8838899 ATCTCTTTGA
Statistics
Matches: 1103, Mismatches: 194, Indels: 121
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (879 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAAAAAGTTTAT
CGAAACAGTTCAAATAGTTAAGAATCATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
TTTGTCATAAAACAATCATTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATAATTTATTAAT
ATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAATCTATTTACTGAATCAGATCAAATAGTTA
TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAAAATGTTT
TTTATCATTAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
AAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTATCAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
GTATACTTAAAATCGTTATAATCCTTTTATTCTACCATAAAATAATAGTTTCAGTTCATACAAGC
TTATTCAAAATAAAATAATAAGAATCTAACAATATTCAAAAAACTAATAAGTAAGTGAATTAAAA
ACTAATTCTATATACCAAACCAGTTCAAATAATTAAGACCATATCAATAATTACTATTTCAAAAC
ATTATGAACGTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTTTAATCATACAAGCCTATTCGAAATAAAA
TAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
TACACTAGATCTATTCGAATAATTACATATTTCAAATCATTATATCCTTTTGTTCTACCACAAAA
TAATTGTTTTAGTTCATACAATCTCATTCAAAAT
Found at i:8838668 original size:711 final size:715
Alignment explanation
Indices: 8837900--8839302 Score: 1522
Period size: 711 Copynumber: 2.0 Consensus size: 715
8837890 TTATTCGAAA
* * ** *
8837900 TAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAAATAAAAAAAATAAATATG
* * * **
8837965 TTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATGAC
66 TTTACT-GAACCAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATATACTTCAAATCATTATGAC
* * * * **
8838029 CTTTTGTTCTACCATAAAATAATTATATT-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-C
130 CTTTTATTCTACCATAAAAGAATTAT-TTCAGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATATC
* * * * *
8838092 GAATCTAACAATA-TTCAAAAAATTAATAGCTAAGATAATTA-AAACTAAATTTGTTTGCCA-AA
194 -AATCTAACAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGAATTAGAAAATAAATATGTTT-ACAGAA
* * *
8838154 CCAGTTCAAAT-ATT-TAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGATCGTTTGTT
256 CAAGTTCAAATAATTGT-A-ACTATATGAATAATTATCTATTTCAAAACACTAT-A--ATTT-TT
*
8838217 TTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACTA-GCTT-TATTTGAAATAAAATAAAAT-GAATTT
315 TTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATA-TATGCTTAT-TTTGAAA-AAAA-AAAATAAAATTT
* * * * *
8838279 ATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAA-AAATATATT-TCTAACAAGTTCT
376 ATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAATAAAAAATTTTAAAATAAATATATTATCAAACAAGTTCA
* * * * *
8838338 AGTAATTATGATTATTCGAATAATTATCTATTTCATATCATTATGACTTTTTGTTTCGCCA-CAA
439 AATAATTATGACTATTCAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGCCATAAA
* ** * *
8838402 ACAAATGTTTTTGTTCATGTAAGTTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAA
504 ACAAATGTTTCTGTTCATACAAGGTTATTC-AAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAA
* * * * *
8838467 AACTAATAAG-AGATA-TAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAAC-CGTTCAAATAGTTATGATTAT
568 AACTAATAAGAAAATATTAAAAAATAAATATATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAT
* * * * * *
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632 -TAAAATAATTAATAATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGATTCTAT
8838592 TCATACAAGCTTATTTGGCT
696 TCATACAAGCTTATTTGGCT
* * * *
8838612 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAA-AAATAAAAAAAATAGATATG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAAATAAAAAAAATAAATATG
* * * *
8838676 TTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
66 TTTACTGAACCAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATATACTTCAAATCATTATGACC
* ** * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * ** * * *
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* * * * * ** * *
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* * *
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* *
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TCAAATAATTGTAACTATATGAATAATTATCTATTTCAAAACACTATAATTTTTTTGTCATAAAA
TAATTTTTTCAATTCATATATGCTTATTTTGAAAAAAAAAAATAAAATTTATTAATATTAAGATA
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AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCGCCATAAAACAAATGTTTCTGTTCA
TACAAGGTTATTCAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGAAAATATT
AAAAAATAAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTAAAATAATTAATAATTTC
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * ** * *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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** * * * * * * *
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** * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * *
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*
8844621 GTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
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* * *
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* * * * * * ** *
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* * *
8844801 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
1 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-
* * * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * *
8844982 ATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGT
1 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-
** * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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65 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * * *
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** ** * * * **
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* ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
8844007 TGTTTAAT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGCTAT-
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** * ** * *
8844070 AAAATTTTGTTTTGTTAT-AAA-TTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAACA
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* ** **
8844133 C-AACGTTATTAATA-TTCAAACAA-T--TAA--AA-A-A--T---AAATCTATTT-ACTG---A
192 CTAA-TTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* * * * * * *
8844180 A-TAAGTTCAAATACTTATAATTATTTGAAGAATTATTTATTTTAAATCGTAATGA-C--TT-TT
255 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
*
8844240 TT-T-ATAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATAAAAGCTTATTC-G
319 TTATCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * * **
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* ** ** * * * * *
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* * *
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* * * * *
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*
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1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
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* * * * * * *
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127 TGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAA
* * * * *
8844831 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTTCCGA
190 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* * * * * * * ** *
8844896 GCAAACTT-AAATAGTTTTAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATT
255 AC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * **
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319 TTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAT
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* ** * * *
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191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA
* * * * *
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256 CT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * ***
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320 TATCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * *** * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAA------TT---AAT--AAGT-AAGAGATT
* * * * * * ** *
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53 TAA-A-AAATA-AAT--TTGT-T-TATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGCTATT--TGA-ACAA
** * ** * *** *** * ** **
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107 TTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTT-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTT-TT-TTATTCATA
** * * ** ** * * * * * * *
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168 TAAGCTTATTCAA-ATAA-AATAATACTAATT--TATTAATATTTCAA-AA--AT-TA-AT-AAG
* * * *** *
8845603 TCATTATGACCTTTTACTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTTATTAAAACTTA-TCCAAAATA
223 T-A--A-GA-----GA--TT-T-AAAAAATAA--ATTT--GTTT-GCCAAAC-TAGTTC-AAAT-
* * * * ** * **** * * **
8845667 AAATAAT-ACTACTT---C-ATTA-ATATTTCAAA-AATTATTAAGCAAGATATTTAAAAACTAA
267 -AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGA-CCTTTTGTTTTATCA-TAA
* * * * * *
8845725 AGCTATT-TTCTAAACTAGTTCA-A-ATAGTTATGACAATTTGAA
328 AACAATTGTT-T---TTA-TTCATACA-AGCT-T----ATTCG-G
** * *
8845767 AATACTACAAGCTTATTTGGATAAAAATATTACTAATTTAATAATTTTCAAAAATTAATAAATAA
1 AATA--A-AA---TA-----AT-ACTA-ATT--T-A-TTAAT-ATTCT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
8845832 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATC-AG-AC-AATGGTTAAGACTATTAGAATAATTA
47 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTA
* ** * * * * * ** *
8845894 TCTATTTCTAATCATTCT-AACCCTTTTATTTAGTCATAAAATAATAGTTTAAGTTCATATAAGC
110 TCTATTTCAAATTGTTATGAA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGC
* * *
8845958 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAGATTAATAAGCAAGAGATTTGAA
173 TTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTT-AA
** **** * * * * * *
8846022 AAAATAAATAAGTTTATTGAACAAGCTCAAATAATTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
235 AAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * ** * * * * **
8846087 ATCATTATGAACTTTTATTTTGCCATAAAACTATTG-TTTTAGTTCATAAAACCTTATCCAA
300 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * *
8846148 AATAAAATAATACCACTTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAG-TTTAAAACATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** * * * ** **
8846208 AATTTA-CGAA-ATTAGTTCAAATAATTATGCCTATTTGAGCAATTATAAATTTCAAATCATTAT
66 TGTTTATCGAACA--AGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * * * *
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128 GAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTAT-TCAAATAAAATAAT
* * * * * * *
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191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA
* * * * * *
8846394 ATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCT
256 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
8846459 GTCATAAAATAATTATTTATATTCATACAAGTTTATTTGG
321 ATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * * *
8846499 AATACAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTCATTACTAAGAGATTTAAAAAATAACTC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * **
8846564 TGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-
66 TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * * * ** ** *
8846628 ACTTTTTATTTTATCATAAAA-TATTTTTTCAACTCATACAAATTTATTTGGAATAAAATAAAAC
130 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAC
* * * * * * ** *
8846692 TAATTTGTTAATAATTCAAAATTTTATAAGTAGGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTATCGAA-
193 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTGCCAAAC
* * * * * * * * *
8846755 TCAATTTAAATAATTTTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATCACTTTTTGTCTT
257 T-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
8846820 GTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTAGA
321 ATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* *
8846860 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * * * *
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65 TTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
** * * * **
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129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATA-TAAGCTTATTCA-AATAAAATAAT
* * ** * * * * **
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191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* ** ** * *
8847116 ACCAGTTCAAATAGTTAAAACTACATGAACAATTATCTATTTCGAATCGTTATGA-CTATTTGGT
255 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTT
* * * * ** * *
8847180 TTGTTATAAAACAAAT-TTTTTGTTTGTAAAAGCTTATTCAG
319 TTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
*
8847221 -ATAAAAATAATA-TAAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
1 AAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
8847283 ATTTGTTTATTGAACTAGTTCATAT-GATTAATACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTGTT
63 ATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTAA-GCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * * * * * * *
8847347 CT-AACCTTTTATTTAGTCATAAAATAGTTATTTCAGTTTATACAAGCTTATTCAGAATAAATTA
126 ATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATA
* * * * * * **
8847411 ATACTAATTTACTAACATTTGAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTATC
189 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTGCC
* * * * **
8847476 AAA-TAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTGT-TAATTTAAAATCACTATGACCTTTT
253 AAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * * *
8847539 GTTTTTTCATAAAAAAATTG-TTTAAGTTAATACAAGTTTATACAG
316 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * *
8847584 AATCAAGTAATATTAATTTATTAATATTTCT-AAAAGTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
** * * * * *
8847648 TTCATTTATCGAATC-AGTT-AAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATGGTTA
64 TTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* *
8847711 TG-AC----T-TTTTG------------TTTTTGATT-ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
127 TGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT
* * * * *
8847757 ACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTGTTTGTCGAA
191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA
** ** ** * * * * *
8847818 CCGGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTATCAACTTCAAATCGTTCTAACC-TTT-TTTT
256 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
8847881 AGTCATAAAATATTTG-TTTCATATCATATAAACTTATTCGA
321 A-TCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * *
8847922 AATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGACATTTGAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * * * **
8847987 CTGTTTACCAAATAAGGTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTAAT-TATTTAAAATCATTAT
65 TTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATTGTTAT
* ** ** * * * *
8848051 G-ACCTTTTG-TTTCACAATAAAACAATTGCTTCAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAA
128 GAACTTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAA
* * * * *
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190 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTGCCA
* * * * * * * *
8848179 AACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTGTATATTT-AAATTGTTTTGACATTTTGTT
254 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
8848243 TTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGCTCATAAAAACTTATTTGA
319 TTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * *
8848285 AATAAAATAATAATAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTCAAAAAATGAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * *
8848350 TGTTTATCGAATC-TGTTCAAATAATTATGGTTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
66 TGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-AGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * *
8848414 AAC-TTTTATTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCA-TCATAAAAGCCTAGTTGAAATAAAATAAT
129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT
* * *
8848477 ACTAATTTATTAATACTTT-AAAAAGTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGA
191 ACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCC-A
* * * * * *
8848540 AA-TAGTTC-CA-A-TT-TGA--A--T----AATTACCTA-TTCAAATTAG-TATAACATTTTGC
254 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * **
8848590 TCTATTATAAAATAATT-ATTTCAGTTCATACACGCTTATTCAA
318 TTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGG
* * *
8848633 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCT-AAAATTAATAACTAAGAGATTAAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** ** **
8848697 TAGTTTATTGAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
65 TTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* ** * * *
8848762 AAC-TTTTGTTTTGTCGTAAAACAATCATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA
* * *
8848826 -TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT--G-G-TTTAAAAAGTAAATTTGTTTACCAAA
192 CT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA
* * * * * *
8848886 -TCATTTTAAATAATTATGA-TCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTT
256 CT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** * ** * * * *
8848949 TGGTCATATAACAAATCCTTTTGATT-ATTCAAGCTTATTTGA
319 TTATCATAAAAC-AATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * *
8848991 AATAAAATAATATTAATTTACTAATCTT-TCAAAAATTAATAAATAAGCA-ATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * ** * * * *
8849054 TTTGTTCATTTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGTAATTGTATACTTCAAATTCTTAT
64 TTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
8849119 -AACCTTTTATTTTATCACAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
128 GAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT
* * * * * **
8849183 ACTAATATAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGA-AATT-AAAAATAAATTTGTTCGCTGAA
191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA
* * * * *
8849246 C-AATTCAAATATTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTT
256 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** ** * * *
8849310 GTCATAAAACAA-AATTTCAATTCATACTAGCTTGTTCGA
321 ATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
*
8849349 AATAAAATCAA-A-TGAATTTATTAATATT-TAAAAA--ATTAA-TAAGAGATTT-AAAAATATA
1 AATAAAAT-AATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-A
* * * * * * * * **
8849407 TTTCTATTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCAT
63 ATT-TGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * ** * * *
8849471 TAT-AGCCTTTTGCTTTGTCATAAAAGCAGATGTTTTGGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAG
125 TATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTTTTTTATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAA
* * * **
8849535 TAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
187 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC
* * * * * * *
8849595 CAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTTAATTTGTTATGACTTTTT
252 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
** * * * * *
8849659 GTCCTATTATAAAACATTTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATT-TG
316 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * *
8849703 AATTAAAATAATATTAATTCATTAATATT-TCAACAATTAATGAA-TAA-AAATTTTAAAAAATA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATA
* * * * * * **
8849765 AATATGTTTATCGACCTAA-ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
62 AATTTGTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
** * * * *
8849829 TAT-AACTTTTTCCTTTGTCATAAAA-GATTTGTTTCAGTTTATATAAG-TTAATTGAAATAAAA
125 TATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTTA-TTCATATAAGCTT-ATTCAAATAAAA
* * * * *
8849891 TAATA-TCAATTTATTTATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-GAATTTGTTTA
187 TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTG
** * * * * * * *
8849954 CTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAAAAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCTTT
251 CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
*
8850019 TGTTTTAAT-ATAAAATAATT-TTTTATATTCATACAAGCTTATTTC-G
315 TGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGG
* * *
8850065 AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAGGTACA-AGATTTAAAAAGTAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * **
8850127 ATATGTTTATCGAATAAGTTAAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTA
63 ATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * ** *
8850192 CG-ACCTTTTGTTTTATAATAAAACAACTATTTCAATTCGA-ATAAGCTTATTTGAAATAAAATA
127 TGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTTATTC-ATATAAGCTTA-TTCAAATAAAATA
* * * * * * **
8850255 ATACTAATATATTAATATTCCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTCTTTATC
189 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCC
* * * * * * *
8850319 GAACAAGCTT-AAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACTTTTT
253 AAACTAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * **
8850382 GTTTTGTCATAAAATAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTG
316 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* *
8850427 AA-AAAATAATA-TAAATTGATTAATATTAC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
*** * * * * *
8850488 TCCATTT-TCTAAACACGTTTAAATAGTTATAACTATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGTT
64 TTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTA-AGCTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * **
8850551 ATGATC-TTTTGTGTTT-TCATAAACCAATTGTTTTTGTTCCTAAAAGCTTATTTGGAATAAAAT
126 ATGAACTTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAAT
* *** * * *
8850614 AATACTAATTTATTAAAACACCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAATAAATATGTTTA
188 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTG
** * * * * * * *
8850679 CTGAGCGAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTT
251 CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * *
8850744 GTCTTATCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGA
316 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTCGG
* * *
8850789 AATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAATAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
8850853 CTATTCA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCTATTCGAACTATTAGCTATTTCAAATTGTTAT
65 TTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * ** *
8850917 G-ACATTTTGTTTTGT-AGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTACAATAAAA-AA
128 GAACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAA
* * ** *
8850979 TAGTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGA
190 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* * * * * * *
8851040 ACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATCATTATGATC-TTTGTTT
255 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
8851104 TGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAACTTATTCGT
320 TATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * * *
8851145 AGT-AAATATTGCTAAATTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** * * ** * *
8851205 TGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTA-GTATTTCAAA-TGTTTTGA
66 TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * ** * * * * *
8851268 CCTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAATTTATACATGCTTTTTTGAAATAAAATAATAC
130 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGC-TTATTCAAATAAAATAATAC
* * * * * * * *
8851333 TATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAGTTTATTTACCGAAC
193 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAC
* * * * * * *
8851397 AAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGTTTTA
257 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA
* * * * **
8851462 TCATAAAACAATTG-TTTTAGTTTATAAAATCTTATCCAA
322 TCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * *
8851501 AATAAAGTAATATTACTTTATTAACATT-TCAAAAATTGAA-AAGTTAGGGATTTAAAAAAATAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT-AATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
* ** * * * ** **
8851564 ATCAT-TTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGGGCAATTATCTATTTCAAATCATT
63 AT-TTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-AGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * ** *
8851628 ATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGATTAAAAT
126 ATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATATAAGCTTA-TTCAAATAAAAT
* * *
8851691 AATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATATATTTGTTT---
188 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCC
* ** * * *
8851752 --A-TCG---AACCAGTTCT---TA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGT
253 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
8851807 TCTATTAGAAAATAATTG-TTTGAGTTCATATAAGCTTATTTGG
318 TTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * *
8851850 AATAAATTAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* ** * ** * * *
8851915 TATTTGCCAAAGTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCT-TTTCCAAATAGTTATG
66 TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATTGTTATG
* * * ** * * *
8851979 -AC----T-TTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGTTGTTTACTGAA--TAAGTTCAAAT-CATTA
129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TT-CATA-T-AAGCTTA-TTCAAATAAAATA
* * * * * ** * * **** * * *
8852035 CGACTATTTAAGTAATTATTTATTTC-AAATTGTTTTGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAA-T
189 --A-TA-CTAATTTATTA-ATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAG-ATT-T-AAAAAATAAATT
* * * * ** * * * ** * *
8852097 TGTTGCTGTTCATACAAGTTTATTTGGATTA-AAATAATATT-AATTTATTA-ATATTTTGATAA
245 TGTT--TG-CCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACT-AT-TTGAA-CAATTATCTA-TTTCA-AA
* ** *** * * * * * * * *
8852159 T--TAAT-AGGTAAAAGATTTA--A-AAAATAAATATGTTTA-CCAAATAAG----TTC--
301 TCGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * ******
8852207 AA-ATAGTCAAGACT-ATTTGAATAAT-TATCTATTACAAATCATTATGACA-TTTTCTTTTGTA
1 AATAAAAT-AATACTAATTT-ATTAATAT-TCTA--A-AAAT--TAAT-A-AGTAAGAGATT-TA
* * * * ** * * * * * *
8852268 ATAAAA-CAATCT-TTCAGTTC-ATATAAGCTT-ATTTGAAGTAAAACAATACT-AATCTATTAA
55 A-AAAATAAATTTGTTTA--TCGA-ACAAG-TTCAAAT--AGTTAAGCTAT-TTGAA-CAATTAT
* * * * ** *** * * * * *
8852328 C-ATTCCAAAAAT-TAATG-A--GTAAGAAAAT-TAAAAAATAAAATCTATTTA-TCGA-ATAAG
111 CTATTTC-AAATTGTTATGAACTTTTTG-TTTTGTCATAAA-ACAATTTTTTTATTC-ATATAAG
** * * ** * * ** *** *
8852385 ----TTCAAATAGTTATGATTATTTGAA-CAATTATCTCTTTCAAAACATT-ATAACCATTTGTT
172 CTTATTCAAATA-AAAT-AATA-CT-AATTTATTA-ATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * **
8852444 TTATCATTAAA-CAATTGGTTTTGTTCTTGCAAGCTTATTTCGAATA-AAAT-A--ATTT-AA-A
231 TTA--A-AAAATAAATTTG-TTTG--C---CAAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * ** ***** * * *
8852502 TTTA-CTAATATTCCAAA-AATTAAGAAGTAAAAATTTA--A-AAAATAAAT-TTATT-TTC-T-
286 ATTATCT-AT-TT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA
* * *
8852558 GAA-CATGTTC--
348 CAAGCTTATTCGG
* * * * * * * * * **** * *
8852568 AA-AGAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATT-TCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 AATAAAATAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTCTAAAAAT-TAATAAGTAAGAG-ATT-TAA
* ** ** * ** *
8852630 TAAACCAA-TTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAA-AAT
56 AAAATAAATTTG-TT-TATCGA-ACAAG----TTC-AAAT-AGTTAA-GCT-A-TT-TGAACAAT
*** ** ** * * * * * *
8852693 TCCAAAAATTAAT-AAGTAAAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAGTGAGTTCAAATAGTTA
108 T--ATCTATT--TCAA--ATTG--TTATGAACT--TTTTG-TT-TT--GTCA--TAAAACAATT-
** * * ** * * *
8852757 TGGCTATTTAAACA-ATTA-TTTATTTCAAATCATTATGAT-CTTTTATTTTGTCATAAAATAAT
156 T---T-TTTATTCATATAAGCTTA-TTCAAAT-AAAATAATAC---TA-ATT-T-AT-TAAT-AT
**** * * ** * ** ***
8852819 TGT-TTCTATTCATAA-AAAGTTTATTCAAAACAAAATAATATTAATTT-ATTAA-TA-TTCTAA
207 T-TCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT--TAA-AAAATAA-ATTTGTTTGCCAAACTAGTTC--A
* * * * *
8852879 AATTTA-TTAGTTGGA-GATTT-AAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTGAAATAGTCTTATC
264 AA--TAGTTA--T-GACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAAT-CGTT---AT-G----A-C
* * * ** **
8852941 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAAATTATTCAA
311 C-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * *
8852992 AATAAAATAATACTAACTTATTAATATT-TAAGAAATTAAT-A--AA-ACATTTAAAAACTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * **
8853052 CTGTTTACCAAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATCTCAAATCATTATG
65 TTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * *
8853117 -A-TCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAATCTTATTCAGAGTAAAATATTA
129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA
* * * ** **
8853180 CTAAACTGA-TCATA-TTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGCGTTTGCTGA
192 CT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* * * * * * * *
8853239 A-TCAGTTCAAATAGTGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTG-T
255 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* *** * * **
8853302 TTAGTCATAAAATAATTGTTGCAATTTATACATGCTTATTCAA
319 TTA-TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* ** * * * *
8853345 AATAAAAT-ATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAGT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
8853409 CTGTTTA-CTGAGCAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTAAAATCATTAT
65 TTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * ** * * *
8853473 G-ACCTTTTGTTTTATCATAAATTAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT
128 GAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT
* * * * * * **
8853537 ATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCAGTTT-CTCAA
191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC-CAA
* ** * * * * * * *
8853601 A-TCAATTGGAATAG---TGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTAATGAGCTCTTGTT
255 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
8853662 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCATATAAGCCTATTTGA
319 TTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* *
8853703 AATAAAATAATATTAATTTATCAATATT-TCAAAAATTAATAAGTCAA-AGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * **
8853766 TATGCTTACCGAACTAGTTTAAATATTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTAT
64 TTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-AGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
8853831 -AACTTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTATTTATCTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGT
128 GAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT
* ** * * * * * *
8853895 ACTAATCTAAAAATATTAT-GAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTATTTGTCGA
191 ACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* * * ** * * * * *
8853959 ACCAATTTAAATAGTTAAAACAATATGGATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTT
255 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
8854024 TGTCATAAAACAAATGTTTTTGTT--TATAAG-TGTGTTCAG
320 TATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCT-TATTCGG
* *
8854063 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAATAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * * *
8854123 CTATTTACCAAACTCGTTC-AATAAGTTATAACTATTTGAATAATTAT-TTTTTCAAATTGTTAT
65 TTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTA-AGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
** * * * * * * ** * * *
8854186 G-ACCATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTAATACAATCTTATTGGTAATATAGTATT
128 GAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATT-CAAATAAAATAAT
* * * * * * **
8854250 GCTAATTTATTAATATTTTC-AAAATTAGTAAGTAACG-GATTTAGAAAATGAATCTGTTAGCTT
191 ACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCA
* * * * * * * * * *
8854313 AACCAATGCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACATTTTATT
254 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** * * * * *
8854378 TCGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATACATGCTTATTCGA
319 TTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
** * * * *
8854420 AATAGCATAATTCTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAACTATAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * ***
8854480 CTATTTATTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTAT-
65 TTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * *
8854544 AACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTCCTATT-ACGACAAGCTTATTTTAATTAAAATAAT
129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT-TTATTCA-TATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT
* * * * * * **
8854608 ACAAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAACTTTGTTT-TTAG
191 ACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCA-
* * * *
8854671 AA-TAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGT
254 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * *
8854735 TTTGTCATAAAATAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTTATT-TG
318 TTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * * *
8854776 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAGGCAAAAGATTTTAAAAATAAG
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
8854840 TATGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTCATAA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA
64 TTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGT--TAAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* ** * * * * *
8854904 TG-ACCTTTTGTTTCATCATAAAATAATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAA
127 TGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTC-AAATAAAATAA
* * * ** *
8854968 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCGA
190 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAA
* * *
8855029 A-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTT
255 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *
8855093 TTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC--
319 TTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGG
* * * * * *
8855134 AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAAAAAGTAAAATATTTAAAAAATAAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
8855198 TCTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTAT
64 TTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * *
8855263 G-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAAT
128 GAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAAT
* * * * * * * **
8855327 ATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAATAAATATGCTT-ATAGA
191 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCA-A
* * * ** * * *
8855391 A-TAAGTTCAAATAGTCATAAC-ATTTGAATAATTATCTATTAGAAATC-TCA-AAACTATTTGA
255 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTG-
* * *
8855452 ATAATTATCTATTTCAAATC-ATT-TTAACCTTTAATTTCATCATAAAACAATTGTATTAATTCA
317 -T-TTTATC-A--T-AAAACAATTGTT----TTT-A--T--TCAT---ACAA--G-CTT-ATTC-
8855515 TATAGG
359 ----GG
* *
8855521 CTTATTAAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAG----ACA
1 --------AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * * * *
8855582 ATATGAATCTGTTTA-CTGAACAAGGTCACATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATGTCAA
57 AAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * *
8855646 ATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCTGAAT
120 ATTGTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTC-AAAT
** *
8855710 AAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCCTAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATTT
183 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTT
** * * * * * * * * *
8855772 GTTTATCGAGCAAGTTCATATCGTTATGACTACTTGAACAACTATTTTATTTCAAATAG---TGA
246 GTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * ** * ** **
8855834 TCTTTTGTTTTGTCAT-AAATAATTAATTCTATTCATACAAATTTATTTAG
310 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * *
8855884 AAT-AAATAATACTACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * *
8855948 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATG-
66 TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * ** ** *
8856012 GCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATAC
130 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAC
* ** * *
8856077 TAATCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTATTG--AA
193 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGT-TTGCCAA
* * * * *
8856136 A-TAGTTCAAAGAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTT
255 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * *
8856199 TGTCATAAACCAATTATTTCTT-TTCATACAAGCTTATTCAG
320 TATCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * * * * *
8856240 ATTAAAATAGTACTAATTTAATAATATTCCAAAGATTAGTAAGAGATTTTTTGCTAAACCAGTTC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA-A--ATTAATA-A------G-T--A--AG---
* ** * * * * * * * *
8856305 AAATAGTTAAAAACGAAATCTCTTTATTGAA-ATAGTTCAAAGAGTCATGACTATTAGAATAATT
48 AGAT--TTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTAAG-CTATTTGAACAATT
* * * * * * *
8856369 ATCTATTTCAAATTGTTTTG-GCATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATCTAAGT
109 ATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATATAAGC
* * *
8856433 TTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAATA
173 TTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * ** * * *
8856494 AAGAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTCAAATAATTATTTATTTCAAGT
237 AATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * *
8856559 TGTTATGACCTTTT-CTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTAATACAATCTTACTCAG
302 CGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGG
* * ** * * *
8856617 AATAAAGTAATGCTAGGTCATTAATATTCTAAAAATTAGTAAGTAATAGATTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA-
** * * * **
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* * * * * * ** * * **
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* * * * ***
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190 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTGCCA
* * * * *** *
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* *
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* * * *
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1 AA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
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* * * *
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* * **** * ** * * **
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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1 AATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * ** * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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190 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCA
* * * * * * *
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254 AACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * *
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* * * * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* *** * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
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* * * * * ***
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* ** * * * * * *
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129 AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTCAAATAAAATAATAC
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193 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACT
* * * * * * * * *
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258 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA
* *
8859101 TCGTAAAAAAATT
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Statistics
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* * * ** * *
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* * *
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* * ** * * * **
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* *** * ** * * * *
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* ** ** *
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* * * *
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* * * * * * * **
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*
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* * * * * * *
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** * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** ** *
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** * * * *** ** *
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** * ** * *** * *
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* * * ***
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* ** * ** ** * *** ** *
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* * * *** * *** **
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** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *** ** *
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* * * * **
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1 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTACCAT
** ** * * * * ** *
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* * * * * * ** ** *
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* * * * **
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1 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTACCAT
*** * ** * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** * * ** **
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* * ** * *** * ** * *
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* * * * * ** **
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** * *** *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * ** **
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* * * * *** * * *
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** * * * ** *
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* * * * * * **
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* *** ** * **** ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* *** * * **** * * * **
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** * * ***
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* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * *
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* * ** * ** *
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* * * * *** *
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* * * *** * * *
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** * * * ** *
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* * * * * *
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** * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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** *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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** ** * ** * * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* ** * **
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* * * * ** * * * ** **
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* * * * * * * **
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*
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* * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
8847387 TACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTACTAACATT-TGAAAAATTAATAAGAAAGAG
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* * * * *
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* * * * * * *
8847514 TAATTTAAAATCACTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAAATTGTTTA-AGTTAA
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* * * * * * * *
8847569 TACAAGTTTATACAGAATCAAGTAATATTAATTTATTAATATTTCT-AAAAGTAATAAGTAAAAG
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* *
8847633 ATTTTAAAAAATAAAT-TCATTTATCGAA-TCAGTT-AAATAATTATGACCATTTAAACAATTAT
65 A-TTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCGAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
** * *
8847695 CTATTTCAAATGGTTATGACTTTTTGTTTT
127 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
8847725 TGATTATACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
8845835 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATCAG-AC-AATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTA
64 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
8845898 TTTCTAATCATTCTAACCCTTTT-ATTTAGTCATAAAATAA-TAGTTT-AAGTTCATATAAGCTT
129 TTTCAAATTATTATAA--CTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTA-TTTCTA-TTCATACAAGTTT
* *
8845960 ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAGATTAATAAGC-AAGAGATTTGAAA
189 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA-ATTAATAA-CTAAGAGATTT-AAA
** * * * * ** * *
8846023 AAATAAATAAGTTTATTGAACAAGCTCAAATAATTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
251 AAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * ***
8846088 TCATTATGAAC-TTTTATTTTGCCATAAAACTATTGTTTT-AGTTCATA-AAACCTTATCCAAAA
316 TCATTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTCAGTTCATACAAA-CTTATTTGAAA
* * ** * ***
8846150 TAAAATAATACCACTTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAG-TTTAAAACATAAATCAA
377 TAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTG
* * * ** *
8846210 TTTA-CGAAATTAGTTCAAATAATTATGCCTATTTGAGCAATTATAAATTTCAAATCATTATTAC
439 TTTATCG-AATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * * ***
8846274 CTTTTGTTTTATGATAGAACAATTG-TTTTCAACA
503 TTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * *
8846308 TACAAGCTTA-TATGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTTTAAGAA-T--T-AGTAAAAG
1 TACAAGCTTATTA-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * *
8846368 ATTT-AAAAAGAAATCTGTTT-GCTAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAATCT
64 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
8846431 ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTATTTATATTCATACAAGTTTATT
128 ATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATT
** * * * *
8846496 TGGAATACAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTCATTACTAAGAGATTTAAAAAATAA
192 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *
8846561 CTCTGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
257 ATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * * *
8846626 TGACTTTTTATTTTATCATAAAATATTTTTTCAACTCATACAAATTTATTTGGAATAAAATAAAA
322 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATA
* * * * *
8846691 CTAATTTGTTAATAATTCAAAATTTTATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCGAAT
387 -TAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT-TGTTTATCGAAT
* * * * ** *
8846756 CAATTTAAATAATTTTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATCACTTTTTGTCTTG
449 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGT-TTG
*
8846821 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCA
513 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * *
8846845 TATAAGTTTGTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGA
1 TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
8846910 TTTAAAAAGTAAATCTGTTTATCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATATGAATAATTATCTTT
65 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * ** * *
8846975 TTCAAATTATTATAACTTTTCATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCA
130 TTCAAATTATTATAACTTTT-GTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCA
* * * * * *
8847040 GAATAAAATAATACTGATTTAATAATATT-TCAAAACA-TAATAACCAAGAAAATTAAAAGATAA
194 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
** ** * * * ** * *
8847103 ATCTAATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTACATGAACAATTATCTATTTCGAATCGTTA
257 ATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * *
8847168 TGACTATTTGGTTTGTTATAAAACAAATTTTTT--GTTTGTA-AAAGCTTA-TTCAGATAAAAAT
322 TGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAA-AAATTTTTTCAGTTCATACAAA-CTTATTTGAAAT-AAAAT
* *
8847229 AATATAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATT
383 AATAT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTATC
* * * * ** * *
8847294 GAA-CTAGTTCATATGATTAAT-ACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTGTTCTAACCTTTT
445 GAATC-AGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTT
* * * * ** *
8847357 ATTTAGTCATAAAATAGTTATTTCAGTTTA
508 GTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * *
8847387 TACAAGCTTATTCAG-AATAAATTAATACTAATTTACTAACATTTGAAAAATTAATAAGAAAGAG
1 TACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * *
8847451 ATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTGT-T
64 A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * * *
8847515 AATTTAAAATCACTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAAATTGTTT-AAGTTAATACAAGTTTA
128 -ATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTA
* * * * * * *
8847579 TACAGAATCAAGTAATATTAATTTATTAATATTTCT-AAAAGTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA
190 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAA
* * * * *
8847643 ATAAAT-TCATTTATCGAA-TCAGTT-AAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
253 ATAAATCT-GTTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * *
8847705 TGGTTATGAC----T-TTTTG-----------TTTTTGA-TT-ATACAAGCTTATTCGAAATAAA
316 TCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAA
* * * *
8847752 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTGTTTG
381 ATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTA
* * * ** ** * * * * *
8847813 TCGAACCGGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTATCAACTTCAAATCGTTCTAACCTTTT
443 TCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA-CTTTT
* * * * *
8847878 T-TTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCA
507 TGTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCA
* * * * * * * * *
8847907 TATAAACTTATTCGAAATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGACA
1 TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * *
8847972 TTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGGTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTAAT-T
65 TTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCT
* * * * ** *
8848036 ATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTCA-CAATAAAACAATTGCTTC-AGTTCATAAAAGTTTA
128 ATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTATC-ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTA
* * *
8848099 TCCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAA
190 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT-AAAA
* * * * ** * *
8848162 AATAAATGTGTTT-TCTAAACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTGTATATTT-AAA
252 AATAAATCTGTTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * *
8848225 TTGTTTTGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATAAAAACTTATTTGAAATAA
316 TCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAA
* * *
8848290 AATAATAATAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTCAAAAAATGAATTTGTTT
380 AATAAT-ATAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTT
* ** * *
8848355 ATCGAATCTGTTCAAATAATTATGGTTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTT
442 ATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTT
* **
8848420 TAT-TTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCATCA
506 T-TGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * *
8848451 TAAAAGCCTAGTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTTAAAAAGTAATAAGTAAGAG
1 TACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
8848515 ATTT-AAAAATAAATCTG-TT-T---ACC-G---AAATAG-T-T-CCAATTTGAATAATTACCTA
64 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
8848567 -TTCAAATTAGTATAACATTTTGCTCTATTATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACACGCTTATT
129 TTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATT
* * *
8848630 CAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCT-AAAATTAATAACTAAGAGATTAAAAAAATA
192 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATA
* * **
8848694 AAT-TAGTTTATTGAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
256 AATCT-GTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* ** *
8848758 TATGAAC-TTTTGTTTTGTCGTAAAACAATCATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
320 TATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAAT
* *
8848822 AATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT--G-G-TTTAAAAAGTAAATTTGTTTACC
383 AATAT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTATC
* * * * * *
8848883 AAATCATTTTAAATAATTATGA-TCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTG
445 GAATCAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTG
* * **
8848947 TTTGGTCATATAACAAATCCTTTTGATT-A
509 TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCA
* * * * * *
8848976 TTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGCA-
1 TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG-AG
* * ** * ** * *
8849040 ATTTAAAAAATAAATTTGTTCATTTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGTAATTGTATA
64 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * *
8849105 CTTCAAATTCTTATAACCTTTTATTTTATCACAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC
129 TTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTC
* * *
8849170 -GAAATAAAATAATACTAATATAATAATATT-TCAAAAATTAATAACTAAGA-AATT-AAAAATA
193 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATA
* ** * * *
8849231 AATTTG-TTCGCTGAAC-AATTCAAATATTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACAT
256 AATCTGTTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* ** * * * * *
8849294 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-AATTTCAATTCATACTAGCTTGTTCGAAATAAAATC
320 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAAT-
* * * * *
8849358 AA-ATGAATTTATTAATATTTAAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAATATATTTCTATTTACC
383 AATAT-AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAATT-TGTTTATC
* * * * * * *
8849419 TAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATAGCCTTTTGC
445 GAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTG-
*
8849484 TTTGTCATAAAAGCAGA-TGTTTTGGTTCA
509 TTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTTTTGTTCA
* * * * * *
8849513 TATAAGTTTGTTCA-AAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAA-T--TAA-TAAGAGA
1 TACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
8849573 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTA
65 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTA
* * * * ** * * * * *
8849637 TTTTAATTTGTTATGACTTTTTGTCCTATTATAAAACATTTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATT-
129 TTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTC
* * * * *
8849701 TGAATTAAAATAATATTAATTCATTAATATT-TCAACAATTAATGAA-TAA-AAATTTTAAAAAA
193 AGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AACTAAGAGA-TTTAAAAAA
* * ** * * *
8849763 TAAATATGTTTATCGACCTAAATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
254 TAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * * * *
8849828 TTATAACTTTTTCCTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCAGTTTATA-TAAGTTAATTGAAATAAAAT
319 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTT-TTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAAT
* * *
8849892 AATATCAATTTATTTATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAGAATTTGTTTA-CT
383 AATAT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTATC-
* * * *
8849956 GAA-CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAAAAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCTTTT
445 GAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTT
* * *
8850020 GTTT-TAATATAAAATAATT-TTTTATATTCA
508 GTTTGT--CATAAAACAATTGTTTT-TGTTCA
* * *
8850050 TACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAGGTACA-
1 TACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTA-AG
* * * ** * * * * *
8850112 AGATTTAAAAAGTAAATATGTTTATCGAATAAGTTAAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAAC
62 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
8850177 TATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAACTATTTCAATTCGA-ATAAGCTTA
127 TATTTCAAATTATTA-TAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTC-ATACAAGTTTA
* * * * *
8850241 TT-TGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAA
190 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-ACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * *
8850304 ATGAATCTCTTTATCGAACAAGCTT-AAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAA
253 ATAAATCTGTTTATCGAACTAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAA
* *
8850368 T-ATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTTT--GTTCATGCAAGCTTATTTTG-AA
316 TCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT--TTTTCAGTTCATACAAACTTA-TTTGAAA
* * ***
8850429 -AAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCCA
377 TAAAATAATAT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTG
* * * * * * **
8850492 TTT-TCTAAACACGTTTAAATAGTTATAACTATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGA
439 TTTATCGAATCA-GTTCAAATAATTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-A
* * *
8850555 TCTTTTGTGTTT-TCATAAACCAATTGTTTTTGTTCC
501 ACTTTT-TGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * *** *
8850591 TAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAACACCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
1 TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
8850656 TTTAAAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAGCGAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATT
65 TTT--AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
8850720 TATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTCTTATCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGTTTAT
127 TATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTAT
* * * *
8850785 TC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAATAAA
191 TCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG-AGATTTAAAAAA
* * * * * * * * *
8850848 TAAATCTATTCA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCTATTCGAACTATTAGCTATTTCAAATT
254 TAAATCTGTTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
8850912 GTTATGACATTTTGTTTTGT-AGTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTT-ACAATA
318 ATTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAA-AATTTTTTC-AGTTCATACAAACTTATTTGA-AATA
*
8850974 AAA-AATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTT
379 AAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTT
* * * * * * * *
8851034 TATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATCATTATGA-TCT
441 TATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTT
* *
8851098 TTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCA
506 TTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * * * *
8851130 TACAAACTTATTCGTAGT-AAATATTGCTAAATTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
1 TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * ** *
8851190 TTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTA-GTAT
65 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
8851254 TTCAAATGT-TT-TGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAATTTATACATGCTTTTT
130 TTCAAAT-TATTAT-AAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-TTTAT
* * * * * * *
8851317 TGA-AATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATA
191 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
8851381 AGTTTATTTACCGAACAAGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
256 AATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * *** *
8851445 TATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-AGTTTATA-AAATCTTATCCAAAATAAAG
320 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT-TTTTCAGTTCATACAAA-CTTATTTGAAATAAAA
* * * * *
8851508 TAATATTACTTTATTAACATTTCAAAAATTGAA-AAGTTAGGGATTTAAAAAAATAAATCAT-TT
382 TAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAT-TTGTT
* * * **
8851571 TATCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGGGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-T
441 TATCGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTT
**
8851635 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCA
505 TTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * *
8851668 TACAAGCCTATTTGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA
1 TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
8851733 TTT-AAAAATATATTTGTTTATCGAACCAGTTC---------T---TA-TTGAACAATTATCTAT
65 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
8851784 TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTAGAAAATAATTGTTT-GAGTTCATATAAGCTTATTT
130 TTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTC
* * * *
8851848 GGAATAAATTAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
193 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * *
8851913 TCTATTTGCCAAAGTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCT-TTTCCAAAT-AGTT
258 TCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCA-TT
8851976 ATGACTTTTTGT
321 ATGACTTTTTGT
8851988 CATAAAATAA
Statistics
Matches: 4521, Mismatches: 871, Indels: 582
0.76 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
518 1 0.00
519 12 0.00
520 244 0.05
521 103 0.02
522 9 0.00
523 1 0.00
524 16 0.00
525 177 0.04
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528 55 0.01
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545 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (536 bp):
TACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
TCAAATTATTATAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGA
ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
GTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
TTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTTTTTCAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATATAAT
TTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTATCGAATCAGTTCA
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AAATTAATAAGAATTTAA
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8851596 GCCATTTGGG
* * * **
8851606 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATAC
1 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCAGAAAACAATTGTTTGACATCATAC
* * * * *
8851671 AAGCCTATTTGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT
66 AAGCCTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT
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** * * **
8851773 CAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTCTATTAGAAAATAATTGTTTGAGTTCATA
1 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTCTATCAGAAAACAATTGTTTGACATCATA
* * * *
8851837 TAAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATT
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130 TAAAAA
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CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCAGAAAACAATTGTTTGACATCATAC
AAGCCTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT
AAAAATATATTTGTTTATCGAACCAGTTCTTATTGAA
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8852000 ATTTCAGTTG
* * ** *
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* * * * *** *
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*** * * * * *
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** * * * * * *
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1 TTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT
* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 TTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC
** * * * * ** *
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65 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAT
* * * *
8852498 TAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAAGAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATTTA
128 T-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAAAGATTT-AAAAATAAATCTA
* * * * **
8852552 TTTTCTGAACATGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACT
1 TTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT
* * *
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* * * * *
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131 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAAAGA-TTTAAAAATAAATCTA
* * * * *
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1 TTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT
* * * *
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66 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATT
* * * **
8852861 AATTTATTAATATT-CTAAAATTTATTAGTTGGAGATTTAAAAATAAATCTA
129 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAATAAATCTA
*
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1 TTTACTGAATAAGTTCAAATAGT
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TTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT
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TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAATAAATCTA
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8853432 AATTATGACT
* * * **
8853442 ATTTGAGCAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAATTAATTG-TTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATAATGACCTCTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
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* *
8853571 AGAGATTTAAAATATAAATCAGTTTCTCAAATCAATTGGAATAGTGGCC
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* * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TAATGACCTCTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* *** *
8853684 ATCATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATCAATATTTCAAAAATTAATAAGTCA
65 ATCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATCAATATTTCAAAAATTAAGAAGTCA
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130 AAGATTTAAAAAATAAAT
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TCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATCAATATTTCAAAAATTAAGAAGTCAA
AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTCTCAAATCAATTGGAATAGTGGCC
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8853767 ATGCTTACCG
* *
8853777 AACTAGTTTAAATATTTAT
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8853796 AACTATTTAAACAATTAT
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8853831 AACT
1 AACT
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Statistics
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AACTATTTAAACAATTAT
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8855522 TTATTAAAAG
* * * * * * *
8855532 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGA--GACAATATGAATCTGT
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* * * * * * *
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* * * * *
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* *
8855709 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCCTAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATTT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * *
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* * * * *
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* **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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126 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAACTTATTCAGAA
* ** * * *
8856066 TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
* * * *
8856131 TTGAAATAGTTCAAAGAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTT
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* * * *
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130 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAACTTATTCAGAA
* * *
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8856289 TTTGCTAAAC
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Consensus pattern (176 bp):
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
TCGAAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTG
TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAACTTATTCAGAA
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Indices: 8852943--8859073 Score: 3917
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8852933 GTCTTATCCA
* * *
8852943 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * ** *
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65 AATTTATTAATATTCCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTA-TTAACA
* * * * ** * *
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127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATTGTTATAACCTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
8853131 ATAAAATAATTATTTCTATTCATACAATCTTA-TTCAGAGTAAAATATTACTAAA-CTGATCATA
192 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATA-TAAATTTAATAATA
* * *
8853194 TTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGC-GTTTGCTGAATC-AGTTCAAATAG
255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAAT-CTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * *
8853253 TGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAT
317 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAT
** * * * *
8853318 TGTTGCAATTTATACATGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTA
382 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTA
* * * * * * * *
8853382 ATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAGTCTGTTTACTGAGCAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
446 ATAAGTAAAAGATTTT-AAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
** * * *
8853447 AGCAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
510 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AAC
* ** * * *
8853477 TTTTGTTTTATCATAAATTAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * *
8853541 CTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCAGTTTCTCAAATCAA
66 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTTAT-TAA-CAA
** * * * * * * *
8853606 -TTGGAATAG---TGGCCATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATAGTAATGAGCTCTTGTTTTGT
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATAACCT-TTGTTTTGT
* * * * * * *
8853666 CATAAAACAATTGTTTTTA-TCATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTT-ATCAATA
191 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAATTTAAT-AATA
* * * * * * *
8853729 TTTCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGTTTAAATATTT
255 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
8853794 ATA-ACTATTTA-AACAATTATATATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTA-TCATAAAAAAA
319 A-AGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAA
* * * * ** * *
8853856 TT-ATTTATCTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATCTAAAAATATT-ATGAAAA
381 TTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA-AAAAA
* * * * ** * * *
8853919 TTAATAATTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATTTATTTGTCGAACCAA-TTTAAATAGTTAAAACAA
443 TTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * *
8853982 TATGGATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
506 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * * * * * *
8854015 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTGTT--TATAAG-TGTGTTCAGAATAAAATAATAT
1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATAC
* * ** *
8854076 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAATAAATAAATCTATTTACCAAACT
64 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAATAAATCTGTTTA-TTAACA
* * * * *
8854137 CGTTC-AATAAGTTATAACTATTTGAATAATTAT-T-TTTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTT
127 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATAACC-TTTGTTTT
* * * * * * * *
8854199 ATCATAAAATAATTGTTTCTATTAATACAATCTTATTGGT-AA-TATAGTATTGCT-AATTTATT
189 GTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT--TCAATTAAAATAAT-ATAAATTTAAT
* ** * ** *
8854261 AATATTTTC-AAAATTAGTAAGTAACGGATTTAGAAAA-TGAATCTG-TTAGCTTAACCAA-TGC
251 AATA--TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAATTAAATCTGTTTA-CCGAA-CAAGTTC
* * * * * * * * *
8854322 AAATAGTCATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACATTTTATTTCGTCACA
311 AAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATA
* ** * *
8854386 AAATAATTGTTTCTA-TTCATACATGCTTATTCGAAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTTC
375 AAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTC
* * * * ** * *
8854450 -AAAAATTAATAAG----ATA-TTTAAAAACTATATCTATTTATTGAATAAGTTTAAATAGTTAT
437 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * **
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501 AACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-C
* * * * ** *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-CTAGTTCA-TAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * *
8854610 AAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAACTTTGTTT-TTAGAA
64 TAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTATT--AA
* * * * * * *
8854673 TAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATTTAT-TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTT
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATAAC-CTTTGTTT
* * * *
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188 TGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAATTTAATAA
* * * * * *
8854801 TATTTCAACAATTAATAGGCAAAAGATTTTAAAAA-TAAGTATGTTTACCGAACAAGTTTAAATA
253 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * *
8854865 GTCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCA-TCATAAAAT
316 GTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTT-AGTCATAAAAT
* * * * * *
8854928 AATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
379 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAA
* * * * *
8854992 ATTAATAAG----AGA-TTTAAAAACTGAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
442 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * *
8855052 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC
506 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * * *
8855085 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAC
1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
8855148 AAATTTATTAATATT-TAGACAACTAAAAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAAT
64 TAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTATT-AAC
* * * * *
8855212 AAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTAT-TTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTT
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATAAC-CTTTGTTTT
* * * * *
8855276 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
189 GTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATATAAATTTAATAA
* * * * ** *
8855340 TATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAA-TAAATATGCTTATAGAATAAGTTCAAATA
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
8855532 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGA----CAATATGAATCTG
410 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATG
* * * * * * * *
8855593 TTTACTGAACAAGGTCACATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATGTCAAATCATTATAACC
475 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-C
* * * * * **
8855658 TTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATA-TA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-
* * * *
8855721 AATTTATTAATATTCC-TAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCA
65 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATCTGTTTAT-TAACA
* * * * * * * *
8855784 AGTTCATATCGTTATGACTACTTGAACAACTATTTTAT-TTCAAATAGTGAT--CTTTTGTTTTG
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATCTT-AAATTGTTATAACCTTTGTTTTG
** ** * * *
8855846 TCAT-AAATAATTAATTCTATTCATACAAATTTATTT-AGAAT-AAATAATACT-ACTTTATTAA
190 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATA-TAAATTTAATAA
** * ** * * *
8855907 TATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
253 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * ** * * *
8855972 TCATGTCTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATGGCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
317 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAT
* ** * * * ***
8856037 TGTTTCT-GTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATT
382 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT
* * ** * * *
8856101 AATAAG----AGA-TTTAAAAACTAAATCTCTTTATTGAA-ATAGTTCAAAGAGTCATGACTATT
445 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * *
8856160 TGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-
508 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * * * * * *
8856190 TCTTTATTTTGTCATAAACCAATTATTTCT-TTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAGTACT
1 T-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * *
8856254 AATTTAATAATATTCCAAAGATTAGTAAGAGATTTTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAAAAC
65 AATTTATTAATATTCCAAA-A--ATTAATA-A------G-TAAA--AG-----AT--TTAAAAA-
* * * * * *
8856319 GAAATCTCTTTATTGAA-ATAGTTCAAAGAGTCATGACTATTAGAATAATTATCTAT-TTCAAAT
109 TAAATCTGTTTATT-AACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAAT
* ** * * * * * *
8856382 TGTTTTGGCATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT-CTAAG-TT-TGTTCAGAAT
171 TGTTATAAC-CTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTAT-TTCA-ATT
* * *
8856444 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAATAAA-GAAATCTG
232 AAAATAATATAAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAATTAAATCTG
* * * * * * * *
8856504 TTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATA-ACAATTCA-AATAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA
295 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATT-AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA
* * * * * * * *
8856567 CCTTTTCTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTA-TTAATACAATCTTACTCAGAATAAAGTAATGC
358 CCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAC
** * * * * * * ** *
8856630 TAGGTCATTAATATTCTAAAAATTAGTAAGTAATAGATTTTAAAAAATAAAT-TATTGGCTTG-A
421 TAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTT-AAAAATAAATATGTTTAC-CGAA
* * ** * *
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484 CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * * * * ** * * *** *
8856748 CTTTATTTGGTCACAAAACAACTATTTCTA-TTTGTACAAGCTGATTTGGAATAAAATAATTCTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *
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66 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAT-AAATCTGTTTATTAA-CAAG
* * **
8856877 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTAAT-TTAACTTACTATAACCTTTTGTTTTGTC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATCTTAAATTGTTATAACC-TTTGTTTTGTC
* *
8856941 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAATTTATTAATATT
192 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAATTTAATAATATT
* * * * * *
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257 CA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAA
* * * *
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* * * * * *****
8857135 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCACATTAAAATAATATTAATTGATTAATATTTTGGCAATTAATA
385 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATA
* *
8857200 AGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TATAACTATTTGAATA
449 AGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATA
* *
8857264 ATTATCTAGTTCAAATCGTTATGAC
514 ATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC
* * * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA-ATACT
* * * * *
8857352 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAATAGATTTAAAATATGAATTTGTTTATCGAACAA
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* *
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128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATAACC--TTTGTTTTG
* * * * *
8857481 TTATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAAGTTTATTTCGAA-TAAAATAATATAAATTTATTAAT
190 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATATAAATTTAATAAT
* * * * *
8857545 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-TAAATATATATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATA
254 ATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAT-TAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATA
* * ** * * * * *
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* * *
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380 ATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAA
* * ** *
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442 ATTAATAAGTAAAAGATTTT-AAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * *
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* *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * **
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66 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTA-TTAACAAG
* * * * * *
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129 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATCTTAAATTGTTAT-AACCTTTGTTTTGTC
* ** * *
8858024 ATAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATGCT-AATTCAATAATAT
192 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAAT-ATAAATTTAATAATAT
* * * * * ** *** *
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256 T-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
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320 AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGT
* *
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* * * * * * *
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449 AGTAAAAGATTT--TAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGA
* * * *
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* * * *
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1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * *
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* * * * * *
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125 CAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATTGTTATAACCTTTGTTTT
* * ** * *
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* * *
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253 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATA
*
8858688 GTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTT-TAACCTTTTGTTTAGTCATACAATA
316 GTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCG-TTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATA
* * *
8858752 ATTGTTTTACTTCATACAATCTTGTTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAT
380 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAT
** * * *
8858817 TAATAAGTATGAGATTTGAAAAAAAAAT-TG-TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
444 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * *
8858880 GAATAATTATCTATTTAAAATCATTATTACC
509 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TAAC
* * * * * *
8858911 ATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAATAAAATAATTCTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * **
8858974 CTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAA-ATCA
66 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTATTAACA--A
* * * *
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128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
8859074 TTCAATTCAT
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ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTATTAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATTGTTATAACCTTTGTTTTGTCATAA
AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAATTTAATAATATTCAAA
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTA
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TCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAA
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ATTTCAAATCGTTATAAC
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Alignment explanation
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8859117 TTTCAACATA
* * *
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* ** *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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*
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* ** * ** * *
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1 CATAAATATTTGAACTGGTTAGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
*
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66 AAATATTAATAAATTAGT
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TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGT
Found at i:8859994 original size:181 final size:180
Alignment explanation
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8859666 AACTGATTCA
* *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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1 ATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTCT-ACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
8860329 ATTTATTTTAAATAAATTATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACT-TATTCG
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** * ** * *
8860383 ATAAGCAGATTTTTTTTTTTTTAAAT-TTCTTGTTTATTAATTTTT-TAATGTT-ATAAATTAGT
1 ATAAATAGA---TTTATTTTTTAAATCTTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
8860445 ATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAATGTTA
62 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * **
8860510 GAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGTCTTAACTATTTAAATTGGCTCA
127 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTG
* * * ** * *
8860565 ATAAAAACATTTATTTTTTAAATCTGT-TACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTACTTTAGCAA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
8860628 TATTTTA-CTCTAAATAAGGTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATGAT
64 TATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * *
8860691 AACAATTTGAGATAGATTATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATATTAG
128 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTG
* * * * *
8860745 -GAAATCATATTTATCTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TAT
1 ATAAAT-AGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTAT
* **** * *
8860807 TATTTT-CTTCGAAATAAGCTTGCGGGAACAT-AACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCA
64 TATTTTATTTCG-AATAAGCTTATATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * *
8860870 TAAT-AGTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAGCATGTTCG
127 TAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTG
* * * * * * * *
8860925 GTAAATAGATTAATTTTTTAATTC-TCTCACTCATTAATTTTAGGAATATGAATAAATTAATATT
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
8860989 ATTTTATTTCAAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAGACAAAATGTCATAA
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* * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * ** ** * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * *
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*
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* * *** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * ** * * **
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* * * * * * * * *
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** * ** * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* *** * *
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* * * * * ** ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * ** *
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* * ** * *
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*
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* * * * * *
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* ** * *
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* * *
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* **
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* * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* ** * * * *
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*
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*
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* * * * *
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8862141 TTGAAATAGATAATTACTT-ATATCG-TCGTAAATATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATT
310 TTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-GATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTA--
* * * * *
8862204 TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCGAAT
371 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAAT
* * * * * * * * * *
8862269 AAGCTTGTATGAACAGACATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATTACGATTTGAAGA-AT
435 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTT-AAAATAT
* *
8862333 ACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTT
499 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTG
* *
8862371 AGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGA-T--T--A--T-T-
1 A-TAAATAGATTTA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGTA
* * *
8862427 TTA--TTC--T--AAATAAGTTTGAATGATAAAAAAACATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTT
62 TTACTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATGAT-AAAAAA-ATTTGTT-TATGACAAAACAAAAGG-T
* * * * * * * * *
8862486 AACAATGATTTGAAATAGATAATCATTGAAATAGCCATAATTATTTGAAATGATTTGGTAAATAG
123 CATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATG-TTTAGTAAACAG
* * * * * *
8862551 ATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATCAATTTTTGGAATACTAATAAATTTATATTATTTTATTT
187 ATTAATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* * * * * * *
8862616 CCAATAAGCTTGTGTGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGCCATAACGGTTTGAA
250 CAAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAA
* * * * ** *
8862681 ATGGGTAATTATTCATATTG-TCTTGACTATTTGAAC-TGCTTCAGCAAACATATTTATTTTTTT
315 ATAGATAATTATTCA-AATGATCATGACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* * * *** *
8862744 AATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
378 AATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
* * * * * * *
8862809 CATGAACTA-AAAAAATTATTTTATAATAAAAC-AAAAGTTTATAATAATTTAAAATAGATAATT
442 TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTAAAATATATAATT
* * * *
8862872 ATTCAAA-A--AAGAACTA---G----T-TCG
505 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTG
* ** * *
8862893 ATAAATAGATTTTTTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAA-TTATA-TA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGTATTA
* * * * ** * *
8862956 GTTTTATTTCG-AATAGGCTTGTATTAT-AAAAAA--TAATTATTG-------AAATGGCCATAA
65 CTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAATTTGTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** * * * * **
8863010 TTATTTG-AAT---TAATTCAGT--AA-A--CATATTTACTTTTTAA--CTCACT-TACTTATTA
128 TAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAATTA-TTTAAAATGTTTAGTAAACAGATTA
* * * * ** * ** * * * * *
8863063 ATTTTTGAAAT-ATTAATAAATT-ATTTTTTCAT-TT--TGAA-TAAGCTTGTATGAATTGAAAT
191 ATTTTTTAAATCTTTACT-TATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT
* * * * ** * * * * **** * * *
8863122 AA-C-TGTTTTAGTAC-AAAATAAAAG-ATCATAATAATTTTAAATAT-ATAA--TTGTTCAAAT
255 AAGCAT-ATAT-GAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGAT-TTGAAAT
* * ** * * ***
8863180 AGTTGTAACTATTTGAAT--TTAT-TC-AAAA----------AAT--A-A-ATTTATTTTTTTAA
317 AG--ATAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTTAA
* * * * **** *
8863227 ATCTATTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTT
379 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGT
** ** * * *
8863292 ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGCCAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTAAATA-AGTAATTGT
443 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATA-TAATTGT
* *
8863356 TCAAATAGTTTTAAAAGGTCATAACTATTTAAACTTGTTCG
507 TC-AA-A----T---A-GTCATAACTATTTGAACATGTT-G
** * * * * * * * *
8863397 ATAAATAGATTT-TTTTTTCAAATCTCATGCCTATGAATTTTCTGAATGTTAATATATTAGGATT
1 ATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTTGTATT
* * *
8863461 A-TTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATATGAAACAAATAT-TTTATG-----AC--TA-GTCA
64 ACTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATGATA--AAA-AAATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * *
8863515 GAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTC-TAACTATTTGAACTGATTCGACAAACACA
125 TAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAATTATTTAAAATGTTTAG-TAAACAGA
* * * * * *
8863579 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTCAT-AATCTTATTAAATTAGTATTATTTT-TAA
188 TTAATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-T
* * * * * * * * * * *
8863642 CCAAATAAGCTTCTACGATCAAAAACAATTGTTATAAGACAAAATAAAA-ATCAT-ACTTATTT-
249 TCAAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAC-GATTTG
* * * * * *
8863704 AAGATTGATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTATTCGAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTT
313 AA-ATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTT
* * * * * * * * *
8863768 TAGATCTCTTATTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAC
376 TAAATCTCTTACTTATTAATTT-T-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGC
* * ** *
8863832 TTGTATGATA-AAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAA
439 TTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAA
* * *
8863896 TTGTTCAAATTA-CCATAATTATTTTAAC-TGGTTCG
503 TTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACAT-GTT-G
* * * * * * *
8863931 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATCAATAAATTAGTATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTTGTATTA
* * * * * *
8863996 -TTTTATTTTG-TATATGCTTGTAT--TAACAAAAGCAATTGTTTAATGACAAAAC-AAATGTCA
65 CTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATGATAA-AAAA--ATTTGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * ** ** * *
8864056 AAACAATTTTAAGTAGATAGTTGTTCAAATAGTAATAACTATATGCATTTGTTCAGTAAATAGA-
125 TAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAT-TTAAAATGTTTAGTAAACAGAT
* * *
8864120 T--TTTTTT--A---TTA---ATT--TTTTT-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCAGA
189 TAATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCA-A
** * *
8864171 ATAAGC---T-TG---TATGA-AA-TG-----T-----AAC--AAT-TCAGAACAATTTGAAATA
253 ATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATA
* * * ** * * *
8864214 GATAACTGTTCTAAT-AGTTTTAACCATTTGAA-TTGATT-AGATAAACAAATTTATTTTTTTAA
318 GATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTG-TTCA-ATAAACATATTTA-TTTTTTAA
* * *
8864276 A--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGT
379 ATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGT
* * * * * **
8864337 ATG---A-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAAT-TGATAATCAT
443 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAT-ATAATTGT
*** * *
8864397 TCATGCAGTCTTAATTATTTGAAC-TAGTTTG
507 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-G-TTG
** * *
8864428 GCAATTAGATTTATTTTTT-AA--TTTT-CTTGGTT-A---TT-AA-A-T--T--A--T-TATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTTAAATATTAATAAATTTGTATTA
* ** * ** * *
8864475 -TTTTATTTC-AAATAAAATAGTATGAATAGAACCAA-TTGTTTAATGATAAAACAAAAGGTTAT
65 CTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
8864537 AACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATGGTTT-GATCAATAGAT
126 AATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAG-TAAACAGAT
* * * * * *
8864601 TTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTTTAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
189 TAATTTTTTAAATCT-TTACTT-ATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
* * * * * * ** *
8864665 GAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTCATGACAAAATTGAAA-GT-ACTAATGATTTGA
251 AAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAATGTCA-TAACGATTTGA
* * * * * * * * * *
8864728 AATAAATAATTGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAAAATTATTTTTTA
314 AATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * *
8864792 AATCTCTTACTTATAAAGTTTTGTAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTTG
378 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
*** * * * * * *
8864857 TATGAGTTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAGATAATTGT
442 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTGT
* * * *
8864922 TCATATAATCTTAATTATTTGAAC-TGATTTG
507 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACATG--TTG
** * * * * * * * *
8864953 GCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTGTATTA
* * * * ** * * * *
8865018 -TTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTACTTTATGACAGAGCAAAAGATTATAA
65 CTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAA-AATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
8865082 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTAG-TTCGAAAAACATATTT
128 TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAG-TAAACAGATTA
** * *
8865146 ATTTTTTAAATC--T-CTTGCTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
191 ATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT
** * * **** * ** * * * ** * **
8865208 AAGTTTTTTTTTGTTGAAAAATAATAATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAATAATTTTATTTC
255 AAG--CATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAAT-
* * * * * * ** * ** * *
8865273 AAAGAAGCTTGTATGCTAAAACACAATTGTTTTATGGCAAAAATAAAGCTAATTACGATTTGAA-
317 AGATAA---T-TAT--T----CA-AA-TG-ATCATGAC-TATTTGAA-CTTGTT-C-A-ATAAAC
* * * * * * * **
8865337 ATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAATGATTTGGTAAACTGATTTATT-TTTTAAA
364 ATA-TTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTA-TT-AAT--TTT-G-AAA-T-A-TTATTAAATT--A
* * ** *
8865401 CCTCTTACTTATTAATTTTTGAGATATTAATGAAGTAGTGTTATTTTATTTTAGATA-AGCTTTT
416 -GTATTA-TT-TTAA---TCCA-A-A-TAA-G--CT--TG------TA---T-GA-ACAG-----
* * * * * * *
8865465 ATTAACTAAAATAATTATTTTATCAGAAAAC-AAAAGTTCGTTACAATTTTAAATAAATAATTGT
451 A--AAC----A--ATTGTTTTATAACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTAAAATATATAATTGT
* * * * *
8865529 TCAAATAATTATAACTATTTTAACTTGTTC
507 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTG
* * * * *
8865559 AGTAAACAGA-TTATTTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAAGTTTTTTAATGTTAATAAATTAGTA
1 A-TAAATAGATTTA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTTGTA
* * * * * *
8865623 TTA-TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTAT-TTTATGA-TAAACAAAAGCTC
62 TTACTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATG-A-TAAAAAAATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** * * * * * * * *
8865685 AAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTAATTGAGCAAACACA
124 ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAGTAAACAGA
* * * * * * * *
8865750 TTTATCTTTTAAA-CTTCTTAATTATTACTTTTTTAAATATTATTAAATTAGTATAATTTT-TAT
188 TTAATTTTTTAAATC-T-TTACTTATTA-ATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-T
* * * * *
8865813 TCAAATAAGCTTATATGATC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAA-TAAA-GATCATAACTATTT
249 TCAAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTT
** * * * * * * * * *
8865875 GAGCTTGATATTTGTTTAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGA-AAACA-ACATTAGTT
312 GAAATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACATA-TTTATTT
* * * * * * * ** *
8865937 TTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGGATAAA
374 TTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAG
* * * * * *
8866002 TTTTTATGAACTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAAGTCA-AATCAATTTGAAATAGT-T
438 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA-CAATTTAAAATA-TAT
* ** * * * *
8866065 AATTATTTGAATATTCATATCTATTTGAACTTATTCG
501 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTT-G
** * * * * *
8866102 ATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCGCTTCCTTATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAG-ATT
1 ATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTTGTATT
* * * * * * ** *
8866166 A-TTTTATTTTG-AATAAGTTTGTATAAATTGAAATAA-TTGCTTTATGATTAAAGAAAAGGTCA
64 ACTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTAT-GA-TAAAAAAATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * * * *
8866228 AAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTATTAGTCTTAACTATTTGAACTGATTAGGCAAACATAT
125 TAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGTTTA-GTAAACAGAT
* * * * *
8866293 TTATTTTTTAAATATCTTA-GTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-
189 TAATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTC
* ** * * * *
8866356 GAATAAGTTTATATGAA-AAGAAATAATT-TTTCTATGACAAAA-TAAA-GATCATAATGATTTG
251 AAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTG
* ** * * * * ** * *
8866417 AGATAGATAACCATTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGGCACAATAAACAAATTTAGTTTTTA
313 AAATAGATAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* * * *** *
8866482 AA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAAG-ATTATTTTAATTTTGAATAA-TT
378 AATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTATTAAAT-TAGTATTATTTTAA-TCCAAATAAGCT
* * ** * ** *
8866541 TGTATGAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATT
440 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATT
* * * *
8866606 ATTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTTG
505 GTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACATG-TTG
* ** * * *
8866639 GTAAAT-GAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTACT
1 ATAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTGTATT
* * * * * **
8866703 ATTTTAATACG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATAACAAAACAAAATATCAT
64 ACTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *** * *
8866766 AACT-ATTTGAACTAAATAATTATCCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTTAATAAACAGAT
126 AA-TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-AAAATGTTTAGTAAACAGAT
* * * **
8866830 TGATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTGTTTTGA
189 TAATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAA
* * * * *
8866895 ATAAGCTTGTATG-ACTAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTC-TAACTATTTGAAAT
253 ATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
8866958 AGATAATTTTTTAAATGGTCATAATTATTT-AATCATGTTCTATAAATAGATTTATTGTCTT-AA
317 AGATAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAA-CTTGTTCAATAAACATATTTATT-TTTTAAA
* * * * *
8867021 T-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGT
380 TCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGT
* * * * * ** * * *
8867084 CTGAATAGAAAGAATTGTCTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTT
443 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTGTT
* *
8867148 CAAATAGTCAT-ACTATTTGAACTTGTTC
508 CAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTG
** * * ** *
8867176 AGTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 A-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTTGTATTA
* * *
8867241 -TTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAA-TTGTTTTAGGACAAAACAAAAGGTTC-T
65 CTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGG-TCAT
* * * *
8867303 AGA-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-TATTCAGTAAACAGA
126 A-ATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGT-TT-AGTAAACAGA
* * * *
8867366 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTCATTTTTAGAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATGT
188 TTAATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTT
* * * * * * * *
8867430 CGAATAAGCTTAAATGAACTAAAATAATT-TTGTTATAACAACACAAAAGGTCATGACGATTTGA
250 CAAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * *
8867494 AATAAATAATTATTCAAAT-AGTCATGACTATTTGAACTTATTCAGTAAACA-ACTTTATTTTTG
314 AATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATA-TTTATTTTTT
* * * ** * * **
8867557 AAATCTTTTACTTATTAAGTGTCTG-AATATTAATAAATTTTTGTAATTTTAATTGAAATAAGCT
377 AAATCTCTTACTTATTAA-T-TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCT
* * * * * * ** * * * **
8867621 TGTGTGAAGAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTTTAGCGATTTGAAATAGGTAATT
440 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATT
* *
8867686 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
505 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATG-TTG
* * * * * * *
8867719 ATAAACAGATTCAGTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGTATTA
* * *
8867784 -TGTT-ATTCTATATAAGCTTGTATGA-ACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
65 CT-TTCATTCGAAATAAGCTTGTATGATA-AAAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * ** ** * * **
8867846 AATGATTTCAAATAGACAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGCACCGATCAGGCCAACAGATT
126 AATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGTTTA-GTAAACAGATT
* * *** * *
8867911 CATTTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA-AAAGTTAAGATTACTTTATTTC
190 -AATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTATTTC
* * * * **
8867975 AAATAA-AATTGTATTAA-TAGAAACAATTGTCTTATGACAAAA-TGAATGGTCATAACGATTTG
251 AAATAAGCA-TATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACGATTTG
* * * * * * * ***
8868037 AAATAAATAATTATTCAAATTATTATAACTAATTAAACTGGTTTGGTAAACA-ATTTATTTTTTA
313 AAATAGATAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* *** * * * * * ** *
8868101 AA-----TGCTTATTAATGTCCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAGAAATTTA
378 AATCTCTTACTTATTAAT-TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
8868161 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAATAT
442 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTGT
* * * * *
8868226 TCATATAGCCTTGACTA-TTGAAC-TGGTTCA
507 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTT-G
* * * * * * * * *
8868256 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATAGTATTAGATTAGTATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTGTATTA
* * * *
8868321 -TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATATAAATAA-TTGTTTTATGACAAAATAAAAGG-CTAT
65 CTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTC-AT
* * * * * * * * *
8868383 AA-AGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATACTTATTTCAATTGGTTCGATAAATAGAT
126 AATA-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGTTTAG-TAAACAGAT
* * * * * **
8868447 TTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTG
189 TAATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCA
* ** * * * *
8868512 AATAGGTTTGTAT-AACGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAATAAT-TCATAATGATTTGAA
252 AATAAGCATATATGAAC-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AATGTCATAACGATTTGAA
* * ** * * * *
8868575 ATAGATAATTGTTCTAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTCGATAAAC-TGATTTATCTTTTA
315 ATAGATAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAT-ATTTATTTTTTA
** * * * * *
8868638 AATCTCCGACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTA--TT--T-----T-A--TT-
378 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
* * * ** * * ** * * *
8868690 T-TG----G-AACAATTATATCT-TGATGAAACACAAGGTCATAATGATTTTAAATAAAAAATTG
442 TATGAACAGAAACAATTGT-TTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTG
* * ****
8868748 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTCAATAAACAG
506 TTCAAATAG---T--C-A--T-AACTAT-TTGAACATGTTG
* * * *
8868788 AT--ATATA-TT-TTTTTT-AAT-TTCTTACTTATTAATTTTATAAATGTTAATAGAA-TAGTTT
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATA-AATTTGTAT
* * * *
8868846 TA-TTTTATTTTG-AATAAGCATGTATGAACTAAAAAAATTAT-TTTATGACTAAACAAAAGGTC
63 TACTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATG-A-TAAAAAAATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** * * ** * * * *
8868908 AGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCTTAGCTATTTGAATTGATTTAGCAAACACA
124 ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATG-TTTAGTAAACAGA
* * * * ** ** * * *
8868973 TTTATTTCTTAAATC--T-CTTATTAACTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTCTA-CTCT
188 TTAATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-
* * * * * *
8869034 AAATAAGCTTGTATGAA-T-AGACAATTGTTTTATGACAAAACAAGA--TCATAATGATTTGAGA
251 AAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAA
* * * ** * ** * *
8869095 TAGCTTATTGTTCAAAT-AGTCAAAACTATTTGAACTAGTTCGGTAACCAGT-TTTAGTTTTTAA
316 TAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACA-TATTTATTTTTTAA
* * * * *** * **
8869158 ATCTCTTA-TTA--ATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTATGAACAATTTTGTA
379 ATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTA
* * ** * * * * *
8869220 TGAATAAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTC
444 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTGTTC
* * * * *
8869285 AAATAGACATGATTATTTGAACTTGTTC
509 AAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTG
* ** * * ** *
8869313 AGTAAAGA-AGTTTATTTTTTAAATCTTCAACTCATCAA-TTTTATAATATTAATAAATTAATAC
1 A-TAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTTGTAT
* * * ** * *
8869376 TA-TTTTATTCTG-AATAAACTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTAAAACAAAACAAAAGATA
63 TACTTTCATTC-GAAATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * ** * *
8869438 ATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCAATAAACAGA
124 ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAGTAAACAGA
* * *
8869503 TTTAA-ATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA--ATTAAATTAGTATTATTTTATTT
188 -TTAATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
** * * * * * *
8869565 TGAATAAG-ATTGTATGAA-TAGAAATAGTTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
250 CAAATAAGCA-TATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTG
* * * *
8869628 AAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGA-AAACA-AATT-TTTT
313 AAATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACT-TGTTCA-ATAAACATATTTATTTT
* * * * * * ** *
8869688 TTAAAT-TTTTACTTGTTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAA
375 TTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTAATCCAAATAAG
* * * * * ** * *** * *
8869751 CTTGCATGAATAGAATCAATTATTTTATAATAAAATGAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAA
438 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAA
* * * * * * *
8869816 TTATTTAGATAGTCATAAGTATTTGAACTTATTCA
503 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTT-G
* * * * * * ** * *
8869851 ATAAGCT-GATTCT-TTGTTTAATTCTCTTACTCATTAATGCTTGGAATACTAATAAATTAGTAT
1 ATAA-ATAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTTAAATATTAATAAATTTGTAT
* * * * * ** * *
8869914 TA-TTTTACTT-TAAATAAGCTTATAGGAACTGAAACGATTAT-TTTATTACAAAAGAAAAGGTC
63 TACTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATG-A-TAAAAAAATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
8869976 ATAATGATTTGAAATAG-------------T--T-ATAATTATTTAAATTGGTTTAATAAATAGA
124 ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAGTAAACAG-
* * * *
8870025 ATT-ATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGCAATATTAATAAATTAGT-TGTATTCTATT
187 ATTAATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATAT-TATTTTATT
* * * * * * * * ** *
8870088 CCAAATAAGCTTGTAT-AAGCTGAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAAGTTG
249 TCAAATAAGCATATATGAA-CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTG
* * * * * * * * *** *
8870152 AAATAAATAATTATTCATAT-AGTCTTAACTGTTTCAACTGGTTCAACAAATGGACTTATTTTTT
313 AAATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTT
* * * * * * * *
8870216 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATTTTACTAAGTTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AGCTT
377 AAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTT
* * * * * * * * **
8870280 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATAATTTGAAATAGATAGCTG
441 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTG
* * * * *
8870345 CTCAAATAGTTATGATTATTTGAA-TTAGTTTG
506 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-G-TTG
* * * * *
8870377 GTAAACAGATTTATTTTTTGAA---TTT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTTGTATTA
* * * * * *
8870438 TTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATGTTGAAAAATAA-TTGTTTTATG--ATAACAAAAGGTAATA
65 CTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATGAT-AAAAA-AATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * * *
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127 ATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATG-TTTAGTAAAC-AGATT
* * * * *
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190 AATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAA
* * * * * * * *
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254 TAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAAT-A
* * * * * * *
8870690 -ATAATTATTTAAAT-AGTCATAACTATTTTAATTTATT-AGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAA
318 GATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTT-AAA
* * * * ** ** * *
8870752 TGTCTTGCTTATTAACCTTTCG-AATGTTAAAAAATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAGCTTAT
380 TCTCTTACTTATTAA--TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGT
** * * * * ** * ** * *
8870816 ATGAATTGAGACAATTATTCTATGATTAAACAAAAGGTTCA-AATGATTTCAAAA-AGATAATTA
443 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTT-AAAATATATAATTG
* *
8870879 TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTCG
506 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTT-G
* * * * *
8870911 ATAAACATATTTATTTTTT-AA--TTCT-CTTATT-ATTTTTGAAATATT-TTAAAATTAGTATT
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAAT-AAATTTGTATT
* * * * * *
8870970 ATTTTTA-TCTG-AATAAGCTTGTATGATCCAAAACAA-TTGTTTTATGAGAAAA-ACAAAGATA
64 ACTTTCATTC-GAAATAAGCTTGTATGAT--AAAAAAATTTG-TTTATGACAAAACA-AAAGGTC
* * * * * * * ** * * * *
8871031 ATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTGGTTAGGAAAATAGT
124 ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGTTTA-GTAAACAGA
* * * * * * *
8871096 TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAATTTTGAA-AGTTAATAAAGTAACATTATTTTATTTT
188 TTAATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
* *** * * * *
8871160 AGATAAATTTTTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-A
251 AAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGA-TTTGA
* * ** * ** * *
8871223 AATAGATAATTGTCCAAAT-AGT-AAAATCTATTTAAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTTTTT
314 AATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGA-CTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTA-TTTTT
* * * * * * **
8871286 TAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTG-AATGTTAATAACTAAGTATTATTTT-TTCTGAATAAGC
376 TAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGC
* * ** * * * * ** * *
8871349 TTG--TGAACTGAAATAATTAATTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATATACAAT
439 TTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAAT
** **
8871412 TGTTTTAATAGTC-TAAACTATTTGAACCGGTATG
504 TGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACATGT-TG
* * * * * ** * * * *
8871446 GTGACA-CG-TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTGGGAATTTTATTAAATTAGCATT
1 AT-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTTGTATT
* * ** * * *
8871509 -TTTTTAACCTAAATAAGATTGTATGA-AAAGAAACAATTGTTTTATG-----ACAAAA--TCAT
64 ACTTTCATTCGAAATAAGCTTGTATGATAAA-AAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * * * *** ** *
8871565 AGCAATGTGAGATAGATAATTACTCAAAAAATTATAACTATTTGAACCGGTGCAGTAAACAAATT
126 AATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-AAAATGTTTAGTAAACAGA-T
* * * * ****
8871630 TAA-TTTTTAAATC-TT--TTATTAA-TTTTCAA-A-TAATAGATCAATAATATTTTATTTTGCG
189 TAATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAA
* * * * * * *
8871688 TAA--ATTTGCATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAGAAGGTCATAATGAATTGAAA
254 TAAGCATAT--ATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAA
* * *** * *
8871750 TAGATAATTTTTCAAATAGA-CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAGCAGATTTATTTTTTAAA
316 TAGATAATTATTCAAAT-GATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * *** *
8871814 TCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAACTTGTA
380 TCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * * *
8871879 TGAATAGAAACAATTATTTTATGACCAAA-AAAAGGATCATAACTATTTCAAATAAACAATTGTT
444 TGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTAAAATATATAATTGTT
* *
8871943 CAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGCTT-
508 CAAATAGTCATAACTATTTGAACATG-TTG
* * * *
8871972 AGTAAACAAATTTATTCTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAT
1 A-TAAATAGATTTATT-TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGTAT
* * * * * * * * **
8872037 T-GTTTTATTTC-AAATATGTTTATATGAATAGAAACAATTGGATTATGACAAAACAAGGGGTCA
63 TACTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
8872100 TAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTCAACATGATCAGAAAATATA
125 TAA-TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-AAAATGTTTAGTAAACAGA
* * * * * *
8872164 TCT-ATTTTTTAAATTTTTGCTTATTCATTTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTGTTTTA-TG
188 T-TAATTTTTTAAATCTTTACTTATT-AATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* * * * * * * *
8872227 CAAAATAACCTTTTATGAAC--AGA-AATTGTTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAATGATTTGA
250 C-AAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
8872289 AATAAATAATTGTTCAAAT-AGTCAT-ACATATTTGCACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTT
314 AATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGAC-TATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTT
* * * * * * * *
8872352 AAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCT
377 AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTT
* ** * * * * ** * * *
8872417 ATATGAATTGATATAGTTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
441 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTG
* * * *
8872482 TTCAAATACTTATAACTATTTGAACTTGTTT
506 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTG
* * * ** **
8872513 AGTAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAATAAATTAATATT
1 A-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTTGTATT
* ** * * * *
8872577 A-TTTTAACCTG-AATACGCTTGTATGAACAAAAATAATTAT-TTTATGATAAAACAAAAAGTCA
64 ACTTTCATTC-GAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * ** * * *
8872639 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACT-TATTCAGTAAATAGA
125 TAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGT-TT-AGTAAACAGA
* * * ** * *
8872703 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTG
188 TTAATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
* * * * * * *
8872768 AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAA
251 AAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * *
8872832 ATA-AGTAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCAGTTTTTAA
315 ATAGA-TAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAA
* * * * * * *
8872896 ATATCATAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-GATGTTATTTTGAT-----TAAGCTTG
379 ATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTATTAAATTAG-TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
* * * * * ** * * *
8872955 --T--AC--AAATAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATTATTGT
442 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTGT
* * * * *
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507 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTG
* * * * * * *
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1 ATA---AATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGT
* * *
8873106 ATTACTTT-ATTTC-AACTAAGATTGTA-GCAATTAAAACAATTAT-TTTATGACAAAACAAATA
61 ATTACTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATG--A-TAAAAAAATT-TGTTTATGACAAAACAAA-A
* * * * * * * * *
8873167 -GTCA-AGACT-ATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTAAACTAGTTTGGTA
120 GGTCATA-A-TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAGTA
* * * *
8873229 AACAAATTTATTTTTTAAATC--T-CTTATTACTTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
182 AACAGATTAATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * * * * * * *
8873291 ATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATT
246 ATTTCAAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATT
* * * * * * * ** *
8873356 TAAAATAGATAATTATTCATAT-AGCCTTAACTATTTAAACTGGTT-AGGCAAACAAATTTATTT
311 TGAAATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACATATTTATTT
* * * *
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374 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTATTA-AATTAGTATTATTTTAATCCAAATAA
* * * * * * * ** * *
8873483 GCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATATATT
437 GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATA
** *
8873548 ATTACTCAAATAGTCATAACTGTTTGAAC-TAGTTCG
502 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTT-G
* * * * *
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1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGTATTA
* * * * * **
8873638 -TTTAATTCCG-AATAGGCTTGTCTAATGAAAAACAA-TTGTTTTATGGCAAAACAAAACTTCAT
65 CTTTCATT-CGAAATAAGCTTGTATGAT-AAAAA-AATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * * *
8873700 AACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTAAACTAATTCAATAAACTA-AT
126 AATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAAT-GTTTAGTAAAC-AGAT
* ** * * * **
8873764 TTATTTTTTAAATCTCCATCTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG
189 TAATTTTTTAAATCTTTA-CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCA
* * * * * * * * *
8873829 GATGAG-ATTCTATAAAATAAAACAATTATTTTATGATAAAA-ACAAAGGTCATAACGATTTTAA
252 AATAAGCA-TATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAATGTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
8873892 ATAAATAATTGTTTAAAT-AGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTCATTTTTTTA
315 ATAGATAATTATTCAAATGA-TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTTA
* ** * * * * * *
8873956 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATCTTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACCTA
378 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
* * * ** * * * * *
8874021 TATGAACTA-ATACAATTCTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTG
442 TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTG
** *
8874085 TTCTTATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGGTTCG
506 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTT-G
* * * * * * * *
8874117 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTA
1 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTTGTATTA
* * ** ** * * * *
8874182 -TTTTATTTTG-AATAAAATTACATGA-ACAGAAATAATTAT-TTTATGACATAATAAAAGATTA
65 CTTTCA-TTCGAAATAAGCTTGTATGATA-A-AAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * ** * * * * * *
8874243 CAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAATAAATAGAT
125 TAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATG-TTTAGTAAACAGAT
* * * *
8874308 T--TGTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAGTAAATTAGA-GTTATTTTATTT
189 TAAT-TTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTT
** * * * *** *
8874370 TGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGA
250 CAAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGA
* * * * * ** *
8874434 AATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC-TGATTTAATAAAC-TGATGGATTTTTG
314 AATAGATAATTATTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAT-ATTTATTTTTT
* * * * * **** *
8874497 AAA-CGTCTAACTTATCAAAATTTTGAAATATTAATAAAGT-GATATTATTTTATTTTGGATAAT
377 AAATC-TCTTACTTAT--TAATTTTGAAATATTATTAAATTAG-TATTATTTTAATCCAAATAAG
* * ** * * ** * **
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438 CTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATA
*
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502 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC--ATGTTG
* * * *
8874659 GTAAACAGATTTATTTTTTTAAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTCTAAATGTTAATAAATTAGTA
1 ATAAATAGATTTA-TTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTTGTA
* * * *
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* * * ** * * * * * **
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122 TCATAATAAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATG-TTTAGTAAAC
* * * * * ** *
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* *** * * * * * *
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249 TC-AAATAAGCATATATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTT
* *
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TTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCAT
ATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
TTCAAATGATCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
TTAATTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA
ATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAACATGTTG
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TTTATTATGAACAAA
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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* * *
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* * * *
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* *
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Matches are distributed among these distances:
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TAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATTA
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8863145 GATCATAATA
* * * * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * *
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* ** * *
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247 TCAAATCTCATACCTATGAATTTTCAAAATATTAATATATTAGGATTATTTTATTTCAAATAAAC
** * *
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* *
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1 ATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTCTAACTATTTGAACTGATTCGACAAACAAATTTATT
* * * * ****
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* * * *
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* * * *
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189 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTGGTTCAATAAATAGATTT-TTTTTTCAAAT
* ** * * *
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* *
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316 ATGATAAAAAACAAATATTTTAT-----AAC---AAGTCAGAATG
* * * * **
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1 ATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTT--C-TAACTATTTGAACTGATTCGACAAACAAATTT
* *
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63 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * * *
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128 TAAGCTTCTATGAACAAAA-CAATTGTTTAATGACAAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTAAGTAGA
* *
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192 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
8864098 ATGCATTTGT
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TGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTGGTTCAATAAATAGATTTTTTTTTCAAATCTCATACC
TATGAATTTTCAAAATATTAATATATTAGGATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGATAAAAA
ACAAATATTTTATAACAAGTCAGAATG
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Alignment explanation
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8864289 TTTCAAAATA
** * * *
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* * * ** ** * * *
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*
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* *
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* * * *
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*
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8864612 ATCTCTTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAATTAGATTTACTTTTTAATTTTCTTGG
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Alignment explanation
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* * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*** * * * *
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** * * * * * *
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64 CAAAAGTACTAATAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTT-G
* *
8864773 TAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAGTTTTGT-AATATTAA
128 TAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTTAAATATTAA
* ****
8864824 TAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGACAAAAC
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* * * *
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* * * * * * *
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127 -GTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAA
* *
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1 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTA-TTTATGACAAAAC
* * * *
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* * *
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (178 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTATGACAAAACA
AAAGTACTAATAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTGTAA
ATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAA
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Alignment explanation
Indices: 8864462--8865266 Score: 849
Period size: 362 Copynumber: 2.2 Consensus size: 358
8864452 TCTTGGTTAT
* * * ** * *
8864462 TAAATTA-TTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTAATGATAAAA
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* * * *
8864526 CAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATGGTTTG
65 CAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCAAAACTATTTAAAATGATTTG
* * * * *
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130 AGCAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATGAATTTTTCAAATATAAATAAATTAGTATTA
*** * *** *
8864656 TTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTCATGACAAAATTGAAAGTACTAAT
195 TTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTCATGACAAAAGCAAAAGTACTAAC
* * * *
8864721 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAAAATTAT
260 AATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAAAATTAT
*
8864786 TTTTTAAATCTCTTACTTATAAAGTT-TTGTAATATTAA
325 TTTTTAAATCTCTTAC---T-AA-TTCTTGAAATATTAA
* * *
8864824 TAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGATAAAAC
* * * ** * * *
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66 AAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCAAAACTATTTAAAATGATTTGA
* * *
8864953 GCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT-ATGAA-TTTTCAGAATATTATTAAATTAGTAT
131 GC-AACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATGAATTTTTCA-AATATAAATAAATTAGTAT
* * * *
8865016 TATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTACTTT-ATGAC-AGAGCAAAAGATTA
193 TATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAATT-CTTTCATGACAAAAGCAAAAG--TA
* * *
8865079 -TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTAG-TTCG-AAA-AAC
255 CTAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAA-
*
8865140 ATATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTAATTCTTGAAATATTAA
319 A-A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAA
* ** * * ** *
8865182 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTTTTTGTTGAAAAATAATAATTTTATGATAAA
1 TAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAGTTG--AAATAATTATTTTATGATAAA
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64 ACAAAAGGTAATAATAATTT
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TTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAA
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Alignment explanation
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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** * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 ATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * * *** * *
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64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTT
* *** *
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129 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAT-TAGTATT
* * * * *
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1 ATTTT-A-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** *
8866586 ATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-TGAA
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACAG-A
* * * *
8866648 TTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTACT
126 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * **
8866703 ATTTTAATACGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATCATAA
1 ATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
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65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACAGATTT
* * *
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129 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
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1 ATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
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65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-TGATTC-AGTAAACAGAT
* * *
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* * * * *
8867062 ATTTTATTCAAAATAAGCTTGTCTGAATAGAAAGAATTGTCTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAA
1 ATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
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65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACAGATTT
* * *
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* * *
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1 ATTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATA
* * * * *
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* * * *
8867368 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTCATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATT
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** * * *
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1 ATTTTAT-TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
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* * * * * ** * *
8867548 TTATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAAGTGTCTGAATATTAATAAATTTTTGTA
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * **
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1 ATTTT-ATTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
8867666 GCGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATT
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* * * * * *
8867730 CAGTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATT
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* * * * *
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* * * * * * * ** *
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* ***
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129 A-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TT-AGTATT
* * ** * * ** *
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1 ATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * **
8868030 CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTA-TTATAACTAATTAAACTGGTTTGGTAAACA-ATTT
65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTT
* * **** *
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129 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * *
8868140 ATTTTATTTCAAAGAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
8868205 CAATTTGAAATAGATAAATATTCATATAGCCTTGACTA-TTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTA
65 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTTA
* * * * *
8868269 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAT-AATAGTATTAGATTAGTATT
130 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
8868320 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGG-CTATA
1 ATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATA
* * * * * * * *
8868384 AAGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCAT-ACTTATTTCAATTGGTTC-GATAAATAGAT
64 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGATTCAG-TAAACAGAT
* * *
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127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * **
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1 ATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCAT
* * * * * * * *
8868564 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTC-GATAAACTGAT
63 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAG-TAAACAGAT
* ** * * * *
8868628 TTATCTTTTAAATCTCCGACTTCTCAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATT
127 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
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1 ATTTTATT
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
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TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:8869413 original size:180 final size:179
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * *
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* **
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131 TATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * ***
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* ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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65 TTCAGTAAACAAGTTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTAT--AATATTAATAAA-TTA
* * * * * *
8869730 -TATTATTTTATTTGAAATAAACTTGCATGAATAGAATCAATTATTTTATAATA
127 GTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
** * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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* ** * *
8870076 T-TGTATTCTATTCCAAATAAGCTTGTAT-AAGCT-GAAATAATTATTTTATGACA
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* * * * * * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
** ** * * * * * *
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*
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* * * * ** * * * *
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** *
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* * *
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127 GTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACA
* * ** * * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-
* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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1 AAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* *
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* *
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126 AGTATTA-TTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAAT--AGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
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1 AAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * *
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** * ** * * *
8871143 TAACATTATTTTATTTTAGATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATA
125 TAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTT
** * * * *
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* * ** *
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125 TAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * ** **
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTG
* * * * ** * *
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* * ** * * *
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* * ** * * * **
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* * * * * * *
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* ** ** * * *
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* * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
** * * *
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* * *
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* * * *
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1 AAACAAAAGG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* *
8871968 GCTT-AGTAAACAAATTTATTCTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGGAATATTAATAAAT
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* * * * * **
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125 TAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
** * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * * * * *
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* *** * * * *
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126 AGTATTATTTTAT-TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTG
* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * *
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66 TCAGTAAACA-AGTTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT-T-TATAATATTAATAAATTAG
** * * * * * *
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128 TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * *
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66 TCAGTAAACAAG-TTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT-T-TATAATATTAATAAATTAG
* * *
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* ** * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
** * * * *
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* * * * *
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128 TATTATTTTATTTGAA-TAAGCTTGTATG-AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * *
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*
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* * * * * *
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** ** * * * * **
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * **
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
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* * * * * *
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* *
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* * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-
* * * ** * * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
** * *
8874656 TTGGTAAAC-AGATTTATTTTTTTAAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTCTAAATGTTAATAAATT
66 TCAGTAAACAAG-TTTA-TTTTTT-AAATCTTC-TACTTATTAATTTTAT-AATATTAATAAATT
* * * * *
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* ** *
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** * * * *
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65 -TTCAGTAAACA-AGTTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAATTA
* ** * * * * *
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127 GTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
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8875014 TT
65 TT
8875016 TGGTAAATAG
Statistics
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Consensus pattern (179 bp):
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TCAGTAAACAAGTTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTATAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
Found at i:8873489 original size:709 final size:703
Alignment explanation
Indices: 8865329--8875015 Score: 4547
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8865319 AGCTAATTAC
* * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
8865585 TTTTGCTTATTAAGTTTT-TTAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT
252 TTTTACTTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATAT
** * * * * * * ** *
8865649 GAATTGAAACAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGCTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCT
316 GAACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCA
* * ** * ** * *
8865713 AATAGTCTTAACTATTTAAACTAATTGAGCAAACACATTTA-TCTTTTAAA-CTTCTTAATTATT
381 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGA-TTAGT-TTTTAAATC-TCTTACTTATT
* * * * * *
8865776 ACTTTTTTAAATATTATTAAATTAGTATAATTTTTATTCAAATAAGCTTATATGATCAGAAACAA
443 AATTTTTGAAATATTAATAAATT-G-AT-ATTATT-TT-GAATAAGCTTGTA--A--A-AAA-AA
* * * ** ** * *
8865841 TTATTTTATGACAAAATAAAGA-TCATAACT-ATTTGAGCTTGATATTTGTTTAAATAGTCATAA
497 TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * *
8865904 CTATTTGAACTGGTT-TAGAAAACAACATT-AGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAA
561 CTATTTGCACT-GTTCAAGTAAACAA-ATTCATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * *
8865967 TATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGGATAA-ATTTTTATGAACTGAAACAATTCTTTTATG
623 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGA-TTATA-GAATTAAAACAATTATTTTATG
8866031 ACAAAACAAAAAGTCA-AAT
685 ACAAAAC-AAAAGTCATAAT
* ** * ** * * * * *
8866050 CAATTTGAAATAGTTAATTATTTGAATA-TTCATATCTATTTGAACTT-ATTCGATAAATAGATT
1 -GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT-ATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACATATT
** * * * ***
8866113 TATTTTTTTAAATCGCTTCCTTATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATT-AGATTATTTTATTTTG
63 TA-TTTTTTAAAT--C-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCA
* ** * * *** * ** ** * * **
8866177 AATAAGTTTGTATAAATTGAAATAATTGCTTTATGATTAAAGAAAAGGTCAAAACAATTTGAAAT
123 AACAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * *
8866242 AGATAATTGTTCTATTAGTCTTAACTATTTGAACTGATTAGGCAAACATATTTATTTTTTAAATA
188 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * *** * * *
8866307 TCTTA-GTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTATAT
252 TTTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATAT
* * * * * * * ****
8866370 GAAAAGAAATAATT-TTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAACCATTC
316 GAACAGAAATAATTATTT-TATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTC
* * * ** *
8866433 AAATAATCATAATTATTTGAACTGGCACAATAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTA
380 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGA-TTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * *
8866494 ATTTTCAAAATATTAATAAATCAAGATTATTTTAATTTTGAATAATTTG-TATGAATAAAAACAA
444 ATTTTTGAAATATTAATAAAT--TGA-TA--TT-ATTTTGAATAA---GCT-TG--TAAAAAAAA
* * * * * * *
8866558 TTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGGAT-ATGA
497 TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAA
* ** ** * *
8866622 CTATTTGAACTTGTT-TGGTAAATGAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTT-AGAA
561 CTATTTGCAC-TGTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCT-CTACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * * * *
8866685 TATTAATAAATTAGTACTATTTTAATACGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATA
623 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGATTATA-GAATTA-AAACAATTATTTTATG
*
8866749 ACAAAACAAAATATCATAACT
685 ACAAAACAAAA-GTCATAA-T
* * * * * * * * * *
8866770 -ATTTGAACTAAATAATTATCCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTTAATAAACAGATTGAT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTAT
** * *** *
8866834 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTGTTTTGAATA
66 TTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACA
* * * ** *
8866898 AGCTTGTATG-ACTAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTC-TAACT-ATTTGAAATAG
127 AACTTATATGAAC-AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAA
* * * * * * * *
8866960 ATAATTTTTTAAATGGTCATAATTATTT-AATCATGTTCTA-TAAATAGATTTATTGTCTT-AAT
190 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-TGGT-TAGTAAACAAATTTATT-TTTTAAAT
*** *
8867022 -TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGT
251 CTTTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTAT
* * * * * * * * * * *
8867084 CTGAATAGAAAGAATTGTCTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTT
314 ATGAACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCT
* * * * *
8867148 CAAATAGTCAT-ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
379 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGA-TTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * *
8867212 AATTGTCG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAA
443 AATTTTTGAAATATTAATAAATT-G-A-TATTAT-TTTG-AATAAGCTTG--T--A-A-AAAAAA
* * * * *
8867276 TTGTTTTAGGACAAAACAAAAGGTTC-TAGA-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATA
497 TTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATA-ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
8867339 ATTATTTGAACTTATTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTCATTTTT-AGA
560 ACTATTTGCAC-TGTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGA-A
* * * * * *
8867402 ATATTAATAAATTAGAATTATTTTATGTCGAATAAGCTTAAATGAACTAAAATAATT-TTGTTAT
622 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGATTATA-GAATTAAAACAATTATT-TTAT
* * * *
8867466 AACAACACAAAAGGTCATGAC
684 GACAAAACAAAA-GTCATAAT
* * * * *
8867487 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTCAGTAAACA-ACTTTA
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATA-TTTA
* * * * ** * * *
8867551 TTTTTGAAATCTTTTACTTATTAAGTGTCT-GAATATTAATAAATTTTTGTAATTTTAATT-GAA
65 TTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCAA
* * * * * ** **
8867614 ATAAGCTTGTGTGAAGAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTTTAGCGATTTGAAAT
124 ACAAACTTATATGAACA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
** * * * * * * *
8867678 AGGTAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATG
188 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATC
*** * * * *
8867743 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA-TTCTATATAAGCTTGTAT
252 TTTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATAT
* * * * * * * *
8867807 GAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGACAATTGTTCA
316 GAACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCA
* * * * *** *
8867872 AACAGTCATAACTATTTGCAC-CGATCAGGCCAACAGATTCATTTTTTTAAATC-CATTACTTAT
381 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACAGATT-A-GTTTTTAAATCTC-TTACTTAT
* ** ** **
8867935 TAATTGTCAAAATATTAA-AAAGTTAAGATTACTTTATTTCAAATAAAATTGTATTAATAGAAAC
442 TAATTTTTGAAATATTAATAAA-TT--GA-TA--TTATTTTGAATAAGCTTG---TAA-A-AAA-
* ** ** * * *
8867999 AATTGTCTTATGACAAAATGAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTA-TTAT
495 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCAT
* ** ** * * * ***
8868063 AACTAATTAAACTGGTT-TGGTAAAC-AATTTATTTTTTAAA----TGCTTATTAATGTCCAAAA
559 AACTATTTGCACT-GTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** * *
8868122 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAA-AGAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATG
623 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAATA-AGA-TTATA-GAATTAAAACAATTATTTTATG
*
8868186 ACAAAACAAAAGGTCATAAC
685 ACAAAACAAAA-GTCATAAT
* * * * * * * * * * *
8868206 AATTTGAAATAGATAAATATTCATATAGCCT-TGACTA-TTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTA
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTA
* * * * * * *
8868269 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATAGTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
65 TTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAAC
* * * * * * * * *
8868334 AAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGG-CTATAAAGATTTGAAATAT
126 AAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAA
* * * * * * *
8868398 ATAATTGTTTAAATAGTCAT-ACTTATTTCAATTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAATTCT
190 ATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * ** * * *
8868462 CTTACTTATTAAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTAT-
253 TTTACTTATT-AATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATG
* * * * * * *
8868525 AACGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAATA-ATTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
317 AAC-AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTT-ATAACGATTTGAAATATATAATTGCT
* * * * * * ** *
8868588 CTAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTCGATAAACTGATTTA-TCTTTTAAATCTCCGACTTC
379 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAGA-TTAGT-TTTTAAATCTCTTACTTA
* * * ** * * *
8868651 TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT--AT----TT-T-GGAACAATTATATCT-
441 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTGATATTATTTTGAATAAGCTTGTAAAAAAAATTGT-TTTA
** * * * * *
8868707 TGATGAAACACAAGGTCATAATGATTTTAAATAAAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
505 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCA
* * * *
8868772 CTTATTCAA-TAAACAGATATAT-ATTTTTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTAT-AAATGTTA
570 C-TGTTCAAGTAAACA-A-AT-TCA-TTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTT-TGAAATATTA
* * * * *
8868834 ATAGAA-TAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCATGTAT-GAACTAAAAAAATTATTTTATGACTA
628 ATA-AATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAG-AT-TATAGAATTAAAACAATTATTTTATGACAA
* *
8868897 AACAAAAGGTCAGAAC
689 AACAAAA-GTCATAAT
* * * * * *
8868913 GATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCT-TAGCTATTTGAA-TTGATTTAGCAAACACATTT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACATATTT
* * * * ** ** * * * * * *
8868976 ATTTCTTAAATCTCTTATTAACTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTCTACTCTAAATAAG
64 ATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAA
* * * * * * ** *
8869041 CTTGTATG-A-ATAGACAATTGTTTTATGACAAAAC--AAGATCATAATGATTTGAGATAGCTTA
129 CTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * ** *
8869102 TTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAGTTCGGTAACCAGTTTTAGTTTTTAAATC---T-C
194 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * ** * *
8869163 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTAT-GAACAATTTTGTATGAATA
258 TTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTATATGAACA
* * * * * * * * *
8869226 AAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAG
321 GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAG
* * * * * * * * * *
8869291 ACATGATTATTTGAACTTGTTCAGTAAAGAAGTTTATTTTTTAAATCT-TCAACTCATCAA-TTT
386 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAA-CAGATTAGTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTT
* * *
8869354 T-ATAATATTAATAAATTAATACTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
449 TGA-AATATTAATAAATT--GA-TA--TTATTTTGAATAAGCTTG--T-AA-A-AAA-AATTGTT
** * *
8869418 TTAAAACAAAAC-AAAAGATAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
502 TTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * ** * * *
8869482 TGAACTCACTCAA-TAAACAGATTTAAATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA--AT
566 TGCACT-GTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC-TCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * **
8869544 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAA-TAGAAATAGTTGGTTTATGACAAAA
629 TAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGATTATA-GAATTA-AAACAATTATTTTATGACAAAA
8869608 CAAAAGGTCATAAT
691 CAAAA-GTCATAAT
* * * *
8869622 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACA-AATT-
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAACATATTTA
* * ** * * ** *
8869684 TTTTTTAAATTTTTACTTGTTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATA
65 TTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACA
** * * * * * ** * *
8869749 AACTTGCATGAATAGAATCAATTATTTTATAATAAAATGAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGAT
127 AACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * * * ** * * ** * * *
8869814 AATTATTTAGATAGTCATAAGTATTTGAACTTATTCAATAAGCTGATTCT-TTGTTTAATTCTCT
192 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTTT
* * ** * *
8869878 TACTCATTAATGCTT-GGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTACTTT-AAATAAGCTTATAGGA
255 TACTTATTAAT-TTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTATATGA
* ** * * * *
8869941 ACTGAAACGATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTATAA-T--T--
318 ACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATA--TATAATTGCTCA
* * *
8870001 -AT--T--TAA--A-TTG-----GTTTAATAAATAGAATTA-TTTTCTAAATCTCTTACTTATAA
381 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAG-ATTAGTTTT-TAAATCTCTTACTTATTA
* * ***
8870052 ATTTTTGCAATATTAATAAATTAGTTGTATTCTATTCCAAATAAGCTTGTATAAGCTGAAATAAT
444 ATTTTTGAAATATTAATAAATT-G--ATA-T-TATTTTGAATAAGCTTGTA-AA----AAA-AAT
* * * * * * * *
8870117 TATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACT
498 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** * *
8870182 GTTT-CAACTGGTTCAA-CAAATGGACTT-ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAA
563 ATTTGC-ACT-GTTCAAGTAAA-CAAATTCATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * * *
8870243 TTTTACTAAGTTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
623 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGATTATA-GAATTA-AAACAATTATTTTATG
* * *
8870306 ATAGAACAAAAAGTTATAAT
685 ACAAAAC-AAAAGTCATAAT
* * ** * * * * *
8870326 AATTTGAAATAGATAGCTGCTCAAATAGTTATGATTATTTGAA-TTAGTTTGGTAAACAGATTTA
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT-GTTTAGTAAACATATTTA
* * * * * ** * *
8870390 TTTTTTGAATTTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAG
65 TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCAAACAAA
* *** * * * * ** * *
8870454 CTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTATG--ATAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAG
129 CTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * * * * * *
8870517 TTGTTTAAATGGCCATAATTATATGAATTGATTCAATAAACTAATTTATTTTTTAAATC---T-C
194 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * *
8870578 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTA
258 TTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC-A
* * * * * ** *
8870642 -AAATAATTTTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATCA-ATAATTATTTAAATA
321 GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAT-ATATAATTGCTCAAATA
* * * * * * * * *
8870705 GTCATAACTATTTTAATTTATT-AGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATGTCTTGCTTATTAACC
385 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACAGA-TTAGTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-T
* * * * *
8870769 TTTCG-AATGTTAAAAAATT-AGTATTATTTTGTTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAGACAATT
446 TTTTGAAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTG-----AATAAGCTTGTA--AA---A-AAAATT
* * ** * * * * *
8870832 ATTCTATGATTAAACAAAAGGTTCA-AATGATTTCAAA-AAGATAATTATTCTAATAGTCTTAAC
499 GTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
8870895 TATTTGAACTAGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTT-AAT-TCT-CTTATT-ATTTTTGAAATAT
562 TATTTGCACT-GTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * * * *
8870955 T-TTAAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTATG-ATCCAAAACAATTGTTTTATGAG
626 TAAT-AAATTAGTATTA-TTTTATTTCAATAAGATTATA-GAAT-TAAAACAATTATTTTATGAC
*
8871018 AAAA-ACAAAGATAATAAT
687 AAAACA-AAAG-TCATAAT
* ** * * * * *
8871036 GATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGC-TGGTTAGGAAA-ATAGTTTT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATA--TTT
* * * * * * ** *
8871099 AGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAATTTTGAAA-GTTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTAGA
64 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
* * * * * *
8871163 TAAATTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATA
125 CAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATA
* * * * ** * *
8871227 GATAATTGTCCAAATAGT-AAAATCTATTTAAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAT
189 AATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC-TGGTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAAT
* * * * * * *
8871291 CTCTTACTCATTAATTTT-TTGAATGTTAATAACTAAGTATTA-TTT-TTTCTGAATAAGC-T-T
251 CTTTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTAT
* * * * * * * * *
8871351 GTGAACTGAAATAATTAATTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATATACAATTGTT
314 ATGAACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCT
** ** ** * * * *
8871416 TTAATAGTC-TAAACTATTTGAACCGGTAT-GGT-GACACGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
379 CAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGT-TCAATAAACA-GATTAGTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
8871478 TTAATTTTGGGAATTTTATTAAATTAGCAT-TTTTTTAACCTAAATAAGATTGTATGAAAAGAAA
441 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-G-ATATTATTT----TGAATAAGCTTG--T--AAA-AAA
* * * ** * * *
8871542 CAATTGTTTTATGACAAAATC--ATAG-C--AATG---TGAGATAGATAATTACTCAAAAAATTA
495 -AATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
8871599 TAACTATTTGAACCGGTGC-AGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCT-T--TTATTAA-TTTTCAA
558 TAACTATTTGCA-CTGTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAA
* * *
8871659 ATAATAGATCAA-TA--A-TATTTTATTTTGC-GTAA-ATT-TGCATGAA-TAGAAACAATTATT
622 ATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTA-TTT-CAATAAGATTAT--A-GAATTA-AAACAATTATT
* *
8871716 TTATGATAAAACAGAAGGTCATAAT
680 TTATGACAAAACA-AAAGTCATAAT
* * * ** * * *
8871741 GAATTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAGCAGATTTAT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTAT
* * *** *
8871806 TTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATA
66 TTTTTAAATCTC-T---TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACA
* * * * *
8871871 AACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACCAAA-AAAAGGATCATAACT-ATTTCAAATAA
127 AACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAA-TGATTTGAAATAA
* * *
8871934 ACAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGCTTAGTAAACAAATTTATTCTTTTAAATCT
190 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGTAAACAAATTTATT-TTTTAAATCT
*** * * *
8871999 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCAAATATGTTTATATGA
253 TTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA
* * *** ** * * * * *
8872064 ATAGAAACAATTGGATTATGACAAAACAAGGGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTTAAA
318 ACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCAAA
* * * * * * * * *
8872129 TAGTCATAACTATTTCAACATGATCAGA-AAATATATCTATTTTTTAAAT-TTTTGCTTATTCAT
383 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACAGAT-TAGTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AA
* * * * * *
8872192 TTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTGTTTTATGCAAAATAACCTTTTATGAACAGAAATTGTT
445 TTTTTGAAATATTAATAAATTGATATT-ATTT-TG---AATAAGCTTGTA--AA-AAAAATTGTT
* *
8872257 TTATGATAAAATAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT-ACATATT
502 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATT
* * * * *
8872321 TGCACTTGTTC-AGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATAGTAA
566 TGCAC-TGTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
** * * * * * *
8872385 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAATTGATATAGTTGTTTTATAACAAAAC
629 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGATTATA-GAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
8872450 AAAAGGTCATAAT
692 AAAA-GTCATAAT
* * *
8872463 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTA-
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTAT
* * ** * * *
8872527 TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ACCTGAAT
66 TTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCC-AAAC
** * * * *
8872591 ACGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA
126 AAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAA
* ** * *
8872656 TAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTT
191 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * *
8872721 TACTTATTAATTGTC-TAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAA
255 TACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA
* * * *
8872785 TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAA
319 CAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATA-TAATTGCTCAAA
* * * * *
8872849 TAATCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCAGTTTTTAAATATCATAGTTATTAATT
383 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATT-AGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
8872914 TTT-AGAATATTAATAAATTGATGTTATTTTGATTAAGCTTGTACAAATAATTATTTTGTGACAA
447 TTTGA-AATATTAATAAATTGATATTATTTTGAATAAGCTTGTAAAAAAAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
8872978 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATTATTGTTAAAATAGTTATAACTATTTGCACTGGTC
511 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTGTTC
** * * * *
8873043 AAGCCAACAAATTCATTTTTCAAATTTGCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGCAT
576 AAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCT-CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* *
8873108 TACTTTATTTCAACTAAGATTGTAGCAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATAGTCA-A
640 TATTTTATTTCAA-TAAGATTATAG-AATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTCATA
8873172 GACT
702 -A-T
* * * * * * *
8873176 -ATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTAAACTAGTTTGGTAAACAAATTTAT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTAT
*
8873240 TTTTTAAATCTCTTATTACTTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACT
66 TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACT
* * * * *
8873305 TATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATT
131 TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* * * * * * * *
8873370 ATTCATATAGCCTTAACTATTTAAACTGGTTAGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
196 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
8873435 ATTAATTTTCATAATATTATTATAA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACATAA
260 ATTAATTTTCATAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAA
* * * * * * *
8873499 ATAATTGTTTTATGATAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATATATTATTACTCAAATAGTCA
324 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAGTCA
* * **
8873564 TAACTGTTTGAACTAGTTCGTTAAACAG---A-----T-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
389 TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* *
8873620 TATTAA-AACTT-AGTATTATTTAATTCCGAATAGGCTTGTCTAATGAAAAACAATTGTTTTATG
454 TATTAATAAATTGA-TATTA-TT--TT--GAATAAGCTTG--T-A--AAAAA-AATTGTTTTATG
* ** ** * * * * **
8873683 GCAAAACAAAACTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTAAACT
507 ACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCACT
* * * * * * *
8873748 AATTCAA-TAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCATCTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGT
572 -GTTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* ** * * * *
8873812 AATATTATTTTATTTTGGATGAGATTCTATA-AAATAAAACAATTATTTTATGATAAAAACAAAG
635 AGTATTATTTTA-TTTCAATAAGA-T-TATAGAATTAAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAA
*
8873876 GTCATAAC
696 GTCATAAT
* * * * *
8873884 GATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTCAT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTA-
* * * * *
8873949 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATCTTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAC
65 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAAC
* * * * ** *
8874014 AAACCTATATGAACTAATACAATTCTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAA
126 AAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAA
* ** * *
8874079 GAATTGTTCTTATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
191 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * ** ** *
8874144 TATTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTACATGAAC
255 TACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
* * * * *
8874209 AGAAATAATTATTTTATGACATAATAAAAGATTACAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATA
320 AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCAAATA
* * *
8874274 GTCATAACTATTTGAA-TTGATTCAATAAATAGATTTGTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT
385 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAGATTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
8874338 TGAAAAATTAGTAAATTAGAGTTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTT
449 TGAAATATTAATAAATT-GA--TA--TTATTTTGAATAAGCTTG--T-A--AAAAA-AATTGTTT
* * *
8874403 TATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTT
503 TATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** ** * * *
8874467 GAACTGATTTAA-TAAACTGATGGATTTTTGAAA-CGTCTAACTTATCAAAATTTTGAAATATTA
567 GCACTG-TTCAAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC-TCT-ACTTAT-TAATTTTTGAAATATTA
* ** ** * * * * * **
8874530 ATAAAGT-GATATTATTTTATTTTGGATAATCTTTTATGCACTAAAACAATTGTTTTATAATTAA
628 ATAAATTAG-TATTATTTTA-TTTCAATAAGATTATA-GAATTAAAACAATTATTTTATGACAAA
*
8874594 ATAAAAGGTCATAAT
690 ACAAAA-GTCATAAT
* ** * * *
8874609 GATTTTAAATAGCTAATTGTTCAAATAGTT-TAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTTAT
1 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTA-
* * * ***
8874673 TTTTTTAAAATTTCTTACTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGA
65 TTTTTT-AAA--TC-T-CTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAA
* * * * * * * *
8874737 ATAAGCATGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATG-TGTTGAAAT
124 ACAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAAT
* ** * * * ** *
8874801 -AGTAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGATTCAACAAACACATTTATTTTTTAAA--
188 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * ** *
8874863 --TT-CTTATTAATTTTTAAAATAGTGATAAATTGGTATTATTTTA-CTCTGAATAATTTTGTAT
252 TTTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATAT
* * * * * * * * * * * *
8874924 GAATAAAAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAAATAGATAATAGTTC
316 GAACAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTT-GAAATATATAATTGCTC
* * * *
8874989 AAATGGACCTGACTATTTGAACTTGTT
380 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
8875016 TGGTAAATAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (703 bp):
GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTAT
TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACT
TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
TTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAAT
AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAATTGATATTATTTTGAATAAGCTTGTAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT
CATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTGTTCAAGTAAACAA
ATTCATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
AATAAGATTATAGAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAAT
Found at i:8874045 original size:182 final size:181
Alignment explanation
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Period size: 182 Copynumber: 7.9 Consensus size: 181
8873584 TTAAACAGAT
* * ** * * *
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* * ** ** * * *
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* ** * **
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* * * * * * * **
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* * * *
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* *
8873903 TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTCATTTTTTTA
130 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTTA
* * ** * *
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1 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA
* * * *
8874021 TATGAACTAATACAATTCTTTTATGAT-GAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTG
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** * ** *
8874085 TTCTTATAGTCT-TAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTA
130 TTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* * ** * * ***
8874137 AATCTTTTATTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTA
1 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA
* * * * * * * * *
8874202 CATGAAC-AGAAATAATTATTTTATGACATAATA-AAAGATTACAACAATTTGAAATATATAATT
66 TATGAACTA-AAACAATTATTTTATGATA-AAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT
* * * * *
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129 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* * * * *
8874317 AATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAGTAAATTAG-AGTTATTTTATTTTGAATAGGCTT
1 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGCCT
* *** * * * * *
8874381 GTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
65 ATATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT
* * * * ** *
8874445 GTTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC-TGATTTAATAAAC-TGATGGATTTTTGA
129 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAT-ATTTATTTTTTA
* * * * * *
8874498 AA-CGTCTAACTTATCAAAATTTTGAAATATTAATAAAGT-GATATTATTTTATTTTGGATAATC
1 AATC-TCTTACTTAT-TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * * * * * * **
8874561 TTTTATGCACTAAAACAATTGTTTTATAATTAAATA-AAAGGTCATAATGATTTTAAATAGCTAA
63 CTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGA-TAAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAA
* *** *
8874625 TTGTTCAAATAGTT-TAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAA
127 TTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTT-A
* * * *
8874681 AATTTCTTACTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAGCAT
1 AATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCT
* * * * * *
8874745 GTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACTAAACA-AAAGGTCAGAATG-TGTTGAAAT-AGTAAT
65 ATATGAACTAAAACAATTATTTTATGA-TAAAAACAAAGGTCATAACGAT-TTGAAATAAATAAT
** * *
8874807 TGTTTTAATAGTCT-TAACTATTTGAA-TTGATTCAACAAACACATTTATTTTTTA
128 TGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * * *** *
8874861 AA----TT-CTTATTAATTTTTAAAATAGTGATAAATTGGTATTATTTTACTCTGAATAATTTTG
1 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA
* * * * * *
8874921 TATGAA-TAAAAAAAATTATTTTACGAT-AAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAAATAGATAAT
66 TATGAACT-AAAACAATTATTTTATGATAAAAAC-AAAGGTCATAACGATTT-GAAATAAATAAT
* * *** *
8874984 AGTTCAAATGGACCTGACTATTTGAACTTGTT
128 TGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTT
8875016 TGGTAAATAG
Statistics
Matches: 978, Mismatches: 217, Indels: 97
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 3 0.00
174 3 0.00
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179 2 0.00
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184 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA
TATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGT
TCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTA
Found at i:8885822 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 8885335--8886476 Score: 779
Period size: 180 Copynumber: 6.4 Consensus size: 179
8885325 AACAATTAAC
* ** *
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* * * * * *
8885399 GTTTTATGATAAAATAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTA
65 ATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
** *
8885464 TTTGAACTTGCTTGGTAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATTAAT
130 TTTGAACTTG-TTCATAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATCAAT
* * *
8885515 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTTTTG-AATAAGCTTGTATAAATAGAAACAAT
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA--TTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAAT
* * * *
8885579 TAGTTTATGACAAAACAAATGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACT
64 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * *
8885644 ATTTGAACGTGTTCATAAAATATATTTATTTTTAAA-ATTTTTACTTATCAA-
129 ATTTGAACTTGTTCAT-AAATAAATTTAATTTTAAATA-ATTTACTTATCAAT
* * *
8885695 TTTTCGTAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGCATGAATAGAATCAAT
1 TTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAAT
* * *
8885759 TATTTTATGACAAAACAAAAGATTATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTCATAAC-
64 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* ** *
8885823 ATTTGAACTTGTT-AT--GTAAA-TGGA---TACAT--TTT--TTA--AAT
129 ATTTGAACTTGTTCATAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATCAAT
* * * ** * ** * * *
8885861 TCTTT----TACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTATATTAACAAAAACAAT
1 T-TTTAGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAAT
* * * * *
8885922 TGTTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATGATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-GC
64 T-ATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * ** *
8885986 TATTTGAACTTGTTCGAT-AATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
128 TATTTGAACTTGTTC-ATAAATAAATTTA-ATTTTAAATAATTTACTTATCAAT
* * * * * * ** * * *
8886039 TGTCAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTAATCCAAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTG
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAATTA
* ** * * **
8886104 TTTTATGACAAAACAAAA-TTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAAAAT
66 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * ** *
8886168 TTAAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
131 TTGAACTTGTTCA-TAAATAAATTTA-ATTTTAAATAATTTACTTATCAAT
* ** **
8886219 TGCCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTA-TTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATAGAAGA-A
1 T--TTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAA-ACA
* ** * * * * * * *
8886279 ATCATTTTACAACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTCAAACAGATAATTATTTAAATAGTCATAG
62 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * * * * * *
8886344 TTATTT-AAATTGGTTCATTAAACAAGTTCATTTTTTAAAT-CTCTTAATTATTAGT
127 CTATTTGAACTT-GTTCA-TAAATAAATTTA-ATTTTAAATAAT-TTACTTATCAAT
* * * * ** *
8886399 TTTTGGAATATTAATAAATCATTTTTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAACT-GAAATAAT
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAA-TAGAAACAAT
* *
8886462 TTTTTTATAACAAAA
64 TATTTTATGACAAAA
8886477 GTCATAATGA
Statistics
Matches: 775, Mismatches: 137, Indels: 99
0.77 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
162 5 0.01
163 38 0.05
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166 3 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAATTA
TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTTGTTCATAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATCAAT
Found at i:8886199 original size:343 final size:342
Alignment explanation
Indices: 8885582--8886217 Score: 841
Period size: 343 Copynumber: 1.9 Consensus size: 342
8885572 AAACAATTAG
* * *
8885582 TTTATGACAAAACAAATGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* **
8885647 TGAACGTGTTCATAAAATATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATCAATTTTCGTAATATTAATA
66 TGAACGTGTTCAT-AAATATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATCAATTGTCAAAATATTAATA
* * * ** * *
8885712 AATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGCATGAATAGAATCAATTATTTTATGACAAAACAA
130 AAATAATATTATTTTAATCCAAATAAGATCGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
*** * * * *
8885777 AAGATTATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTCATAACATTTGAACTTGTTATGTAA
195 AAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAAATTTAAACTTATTATGTAA
**
8885842 ATGGATACATTTTTTAAATTCTTTTACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTAT
260 ACAGATACATTTTTTAAA-TCTTTTACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTAT
8885907 ATTAACAAAAACAATTGTT
324 ATTAACAAAAACAATTGTT
* * * *
8885926 TTTATTACAAAACAAAAGGTCATGATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-GCTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
8885990 TGAACTTGTTCGAT-AATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT
66 TGAACGTGTTC-ATAAATATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATCAATTGTCAAAATATTAAT
* * *
8886054 AAAATAATATTATTTTAATCCAAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-
129 AAAATAATATTATTTTAATCCAAATAAGATCGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* *
8886118 AAA-ATTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAAAATTTAAACTTATTCA-
194 AAAGATT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-AAAATTTAAACTTATT-AT
** *
8886181 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
256 GTAAACAGATACATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAA
8886218 TTGCCTTAAT
Statistics
Matches: 250, Mismatches: 37, Indels: 12
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
341 3 0.01
342 67 0.27
343 125 0.50
344 55 0.22
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (342 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
TGAACGTGTTCATAAATATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATCAATTGTCAAAATATTAATAA
AATAATATTATTTTAATCCAAATAAGATCGCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
AGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAAATTTAAACTTATTATGTAAA
CAGATACATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTATAT
TAACAAAAACAATTGTT
Found at i:8886340 original size:522 final size:523
Alignment explanation
Indices: 8885391--8886342 Score: 1245
Period size: 522 Copynumber: 1.8 Consensus size: 523
8885381 GCTTGAATAG
* *
8885391 AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAAT
* * * *
8885456 CATAACTATTTGAACTTGCTTGGTAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATTAATTTTTAG
66 CATAACTATTTGAACTTGCTTGATAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATTAATTGTCAA
* * ** *** *
8885521 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTTTTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTAGTTTA
131 AATATTAATAAAATAATATTATTTTTAATCCAAATAAGATTGTATAAATAGAAACAATTAGTTTA
** * ** *
8885586 TGACAAAACAAATGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAA
196 TGACAAAACAAAT-ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTAAA
* * * **
8885651 CGTGTTCATAAAATATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATCAATTTTCGTAATATTAATAAATT
260 CGTATTCATAAAACAGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATCAATTGCCGTAATATTAATAAATT
** * ** * **
8885716 TATATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGCATGAATAGAATCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA
325 TATATTATTTTATTCAAAATAAGCTCACATGAATAGAAGAAATCATTTTACAACAAAACAAAAGA
** * * *
8885781 TTATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTCATAACATTTGAACTTGTTATGTAAATGG
390 TTATAATAATTTCAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAACATTTGAACTTGTTATGTAAATGG
8885846 ATACATTTTTTAAATTCTTTTACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTATATTA
455 ATACATTTTTTAAATTCTTTTACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTATATTA
8885911 ACAA
520 ACAA
* * * * * *
8885915 AAACAATTGTTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATGATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * * **
8885980 TCAT-GCTATTTGAACTTG-TTCGAT-AATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGT
65 TCATAACTATTTGAACTTGCTT-GATAAATAAATTTA-ATTTTAAATAATTTACTTATTAATTGT
*
8886042 CAAAATATTAATAAAATAATATTA-TTTTAATCCAAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATT-GT
128 CAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTTAATCCAAATAAGATTGTATAAATAGAAACAATTAG-
*
8886105 TTTATGACAAAACAAA-ATTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAAAATT
192 TTTATGACAAAACAAATA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATT
* * * *
8886169 TAAACTTATTCAGT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCTTAATATTAA
256 TAAACGTATTCA-TAAAACAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATCAATTGCCGTAATATTAA
* *
8886233 TAAATTTATATTA-TTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATAGAAGAAATCATTTTACAACAAAAC
319 TAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTCACATGAATAGAAGAAATCATTTTACAACAAAAC
* *
8886297 AAAAGGTTATAATAATTTCAAACAGATAATTATTTAAATAGTCATA
384 AAAAGATTATAATAATTTCAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATA
8886343 GTTATTTAAA
Statistics
Matches: 362, Mismatches: 59, Indels: 16
0.83 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
521 1 0.00
522 148 0.41
523 95 0.26
524 67 0.19
525 51 0.14
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (523 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAAT
CATAACTATTTGAACTTGCTTGATAAATAAATTTAATTTTAAATAATTTACTTATTAATTGTCAA
AATATTAATAAAATAATATTATTTTTAATCCAAATAAGATTGTATAAATAGAAACAATTAGTTTA
TGACAAAACAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAAAATTTAAAC
GTATTCATAAAACAGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATCAATTGCCGTAATATTAATAAATTT
ATATTATTTTATTCAAAATAAGCTCACATGAATAGAAGAAATCATTTTACAACAAAACAAAAGAT
TATAATAATTTCAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAACATTTGAACTTGTTATGTAAATGGA
TACATTTTTTAAATTCTTTTACTCATTAAATTAGTATTATTTTAGTGCAAACAAGCTTATATTAA
CAA
Found at i:8887127 original size:179 final size:178
Alignment explanation
Indices: 8886511--8887835 Score: 903
Period size: 179 Copynumber: 7.3 Consensus size: 178
8886501 TGACTATTGT
* * * * * * **
8886511 AAACATATTTATTTTTTTAATTTTTTGCTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * ** * * **
8886576 TTAATCCCAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACTATTGTTTTACAACAGAACAAAAAGTCATAACA
66 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * *
8886640 ATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTAAACCGG-TCTG
129 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTC-G
* * ** * * *
8886690 ATAAAAAGATTTATTTTTTAGA--TC-TA-TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAGTATTATTA
1 A-AACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
8886751 ATTTATTTCGAACAAACTTATAT-AGA-TAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACA
64 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATTAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * *
8886814 ATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGGTTAGG
126 ATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-CG
* * *
8886868 TAAGCAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTA
1 -AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTA
* * * * * *
8886932 TTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACG
64 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * *
8886997 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTGCTTCG
129 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCG
* * * * *
8887047 ACAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAGTATTATTATATTAGTATTAT
1 A-AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
8887112 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATGAATAATTGTTTGATGATAGAACAAAAGGTTTATTTT
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TTAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCA----
* * * * * * *
8887177 TTAAATAACTGACTTAAAGTATACATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-GAGTTCGG
124 -T-AATGA-T--TTTAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTG-GTTC-G
* * * * * * *
8887239 TAAATAGATTTAATTTTTTTAATTTCTTACTTTTTAACTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTA
1 -AAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * * * *
8887304 TTTT-GTTCTAAATAAGCTTGTATGATAAGAAAAACAATTGTTATATGACCAAACATAAGGTAAT
64 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG--AATTAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * *
8887368 ATTGATTTCAAATCGATAATTATTAAAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTTGG
125 AATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTG-GTTCG
* *
8887423 TAAAC--ATTATCATTTTTTAAA----TTACTTATTAATTTTTTG-AATATGAATAAATTACTAT
1 -AAACAAATT-T-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * ** **
8887481 TATTTTATTTCGAATCAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC-TGACAAAACATCATA
62 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
8887545 ATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-TAACTATTTAAATTTGTTCGG
126 ATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTC-G
* * * * *
8887598 TAAACAAATTCATTTTTTTAAGCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTAT
1 -AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
8887663 TTTATTT-GGATAAGCTTTTATGAATTAAAACATTTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATA
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * **
8887727 ATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTTACAACTATTTGAAGTTATTCG
129 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCG
* * * * *
8887777 TTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATT
1 --AAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATT
8887836 TGGATATAAT
Statistics
Matches: 900, Mismatches: 192, Indels: 106
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
175 27 0.03
176 39 0.04
177 150 0.17
178 46 0.05
179 202 0.22
180 130 0.14
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182 17 0.02
183 10 0.01
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186 1 0.00
187 4 0.00
188 4 0.00
189 1 0.00
190 5 0.01
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194 4 0.00
195 21 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (178 bp):
AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
TTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCG
Found at i:8888291 original size:182 final size:178
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Indices: 8887868--8891423 Score: 1068
Period size: 181 Copynumber: 19.9 Consensus size: 178
8887858 CAATTTGAAC
* * * * * * *
8887868 TAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTTAAATGATTTGATAAATAAATTTA-TTTTTAAAT
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCTTAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* *** **
8887932 CTCTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTCTGTCTAAGCTTGTAT
64 CTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT
* * * * *
8887996 TAACTAAAACAATTGTTTTATGAC-AAATCAAAAAGTTATAAAGATTTAAAA
129 GAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAAT-AAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* ** * **
8888047 TAGATAATTGTTCAAATAGTAATAATAATTTGTACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTTAAA
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCTTAATAA-TTGAACTAATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAA
** * * *
8888112 TCTCTTGTTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTA
63 TCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTA
* *
8888177 TGAATTGAAACAATTGTTTTATAACTAAATAAAAGGTCAAAATGATTTAAAA
128 TGAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAAAA-GATTTAAAA
* * *
8888229 TAAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACCAATTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
1 T-AGATAATTATTC-AATAGTCTTAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * *
8888294 TCTCTTAATTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTTTA
63 TCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
8888359 TGAA-CAAAAAAATTGCTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGAAA
128 TGAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * * * * ** * *
8888410 TAGATAATCATTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTGATTTAACAATTAAATTAATTTTGT-AAT
1 TAGATAATTATTCA-ATAGTCTTAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * ** *
8888474 TTC-TAGGTTATTAA-GTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGT
64 CTCTTA-ATTATTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * * *
8888537 AT-AAATAGAACCAATTGTTTGATAAAAAATATAAAAGGTTATAACAATTGAAA
127 ATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAA-ATAAAAGGTCAAAAGATTTAAAA
* * * ** * * * *
8888590 TAGATAATTATTCATATA-T-TTAAAAATATTTAAAATGGTTTGATAAGCAGATTTAGTTTTAAA
1 TAGATAATTATTCA-ATAGTCTT---AATAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * * *
8888653 ATCTCTTACA-GATTAA-TTTTCTAAATATTAACAAATTAGTATTCTTTTATT-TCAAACAAACT
62 ATCTCTTA-ATTATTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCT
* * ** ** *
8888715 TCTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAA-GT-AATAACGATTTAAAA
124 TGTATGAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAA-AA-GATTTAAAA
* * * * * * *
8888770 TAGATAATTGTTTAAATAAT-TATAATTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGAA-TTATTTTCTAA
1 TAGATAATT-ATTCAATAGTCT-TAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACA-AATTTATTTTTTAA
* * * * * * ** *
8888833 ATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCT-TCATTCTGTTCCAAACAAGCTTG
62 ATCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG
** * * * * * * *
8888897 TATGAGCTGAAATAATTATTCTATGACAAAACAAAAGGTCACAATA-ATTTGAAA
126 TATGAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AA-AGATTTAAAA
* * * ** * ** ** *** *
8888951 TAAATAATTATTCATATAGACTTAGCTGTTTGAATTGGTTCAATAAATGGATTTATTTTTTTAAT
1 TAGATAATTATTCA-ATAGTCTTA-ATAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * ** *
8889016 CTCTTAGTTATTCA-TTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTATTCCAAATAAGTTTGTA
64 CTCTTAATTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTA
* * * * * * *
8889079 TGAA-TAGAAGCAATTGTTTTATGATAGAA-CAAAGGTTATAACA-ATTTGAAA
128 TGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AA-AGATTTAAAA
* * * ** *
8889130 TAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACTAATTTATTTTTTAAA
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCT-TAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * *
8889194 TCTC----TTATTAATTCTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTA
63 TCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTA
* * * *
8889255 TG--TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-AACAACAATTTGAAA
128 TGAATT--AAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAA-AA-GATTTAAAA
* * * * * * * ** *
8889307 TAGATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACTAATTTATTTTTATAAA
1 TAGATAATT-ATTCAATAGTCTTAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTT-TAAA
* * * * * * * * * *
8889372 TCTATTACTTATTAATTTTTGAAATATTACTAAAGTAGCT-TT-TATGA-ACTAAAACAATTG-T
63 TCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTCT-GAATAA--GCT
* * * * * * *** * ** *
8889433 TTTATG-A-TAAAATAAATG-GTCATAATGATTTTAAATA-G--ATAATTTTTCAAA
124 TGTATGAATTAAAACAATTGTTTTATAA-CAAAATAAA-AGGTCAAAAGATTTAAAA
* ** * * * ** *** *** * *
8889484 TAGTCATAACTATTTGA-A--CTT-AT--TTG--GTAAATAGATTTA-TTTTTTAAAATCT-CAT
1 TAG--ATAATTATTCAATAGTCTTAATAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
8889539 GCTTATTAATT-TT--TTTAAT-G--TA--AATAAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAGTTTG
64 -C-TCTTAATTATTAATTT-TTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG
* * * * ** * * * * *
8889596 TATGAACTAAAACAATTATTATATGATGAAAGAAAATGTCAGAATGATTTGAAC
126 TATGAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * ** * * * *
8889650 T-GATAATTATTCTAACAGT-TTCAACTATTTGAACTGGTTT-AGCAAATACATTTATTTTTTGA
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCTT-AA-TAATTGAACTAATTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * *
8889712 ATGTC----TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATT-TGCATAAGCTTG
62 ATCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTG
* * * * * * ** * *
8889772 TATG-ATTAGAAACAATTATTTTATGAGAAAA-CAAAGATTAGAACCATTTGAGA
126 TATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * * * * ** * * ** * *
8889825 TTGATATTTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAAA
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCTTAA-TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * * * *
8889890 ATCTTGTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTAT
64 CTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT
* * * * *
8889955 GAACTAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AAA
129 GAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGA-TTTAAAA
* * * * * * * * ** * *
8890006 TCGTTAATTGTTTAAATAGTC-AAACCTATTTTAATTTGTTCGATAAACAAACTTACTTTTTTAA
1 TAGATAATT-ATTCAATAGTCTTAA--TAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAA
* ** * * * *
8890070 ATCTCATGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGT
62 ATCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * *
8890135 ATGAACTAAAACAAGTGTTTTATGAA-TAAACAAAAGGTCAAAATAATCTAAAA
127 ATGAATTAAAACAATTGTTTTAT-AACAAAATAAAAGGTCAAAA-GATTTAAAA
* * ** ** *
8890188 TAGATAATTATTTTAATAATCTTAACT-ATTGAAACTGGTTTGGCAAATC-CATTTATTTTTTAA
1 TAGATAATTA-TTCAATAGTCTTAA-TAATTG-AACTAATTTGATAAA-CAAATTTATTTTTTAA
* * ** * * * *
8890251 ATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTGC
62 ATCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * *
8890316 ATGAA-AAGAAACAATTATTTTATGAGAAAAT-AAAGATTATAACA-ATTTGATA
127 ATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AA-AGATTTAAAA
* * * * * ** * *
8890368 TAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-ATTCTGGTAAATGAATTTAGTTTTAAAA
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCTTAA-TAATTGAACTAATT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* ** * * * ** *
8890432 TCTC----TTATTAACTTTGAAAATATT-ATAGATCATTATTATTTTAATT-TGAATAATTTTGC
63 TCTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * **
8890491 ATCAA-CAGAAGCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACA-ATTTGCAA
127 ATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAAT-AAAAGGTCA-AA-AGATTTAAAA
* * * * * * ** * *
8890545 TAGATATTTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAAT
1 TAGATAATTATTC-AATAGTC-TTAATAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * * *
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64 CTCTTAATTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AGCTTGT
* ** * * ** *
8890673 ATGAA-TAGAAGCAATTGTTTTAGGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAA
127 ATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * * ** * * * * *
8890726 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATGATTTGAACTAGCTCGGTAAACAGATTTACTTTTAAAAT
1 TAGATAATTATTC-AATAGTCTTAAT-AATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * ** * * *
8890791 TTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATACGGTTGTA
64 CTCTTAATTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTA
* * * * * ** *
8890855 TGAATAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACTATTT-GAA
128 TGAATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * * * * * * *
8890906 TAGATAATTGTTTAA-AGAATCATAACTATTTGGAC-ATGTTTAGA-AACCAGATTTATTTTTTA
1 TAGATAATTATTCAATAG--TCTTAA-TAATTGAACTA-ATTT-GATAAACAAATTTATTTTTTA
* * *
8890968 AAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TAGAATAAGCT
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* * * * *
8891030 TGTTTGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAA
124 TGTATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * * * * * * * * *
8891086 TAAATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTT-TTTATTAAA
1 TAGATAATTA-TTC-AATAGTC-TTAATAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * **
8891149 TCTC-CAACCTATTAA-TTTTAAGAATATTAATTAATTAGTATTAGTTTATTCAAAATAAGCTTG
63 TCTCTTAA-TTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG
* * * * * *
8891212 T-TTAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAA
126 TATGAATTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCA-AAAGATTTAAAA
* * * * * * * * *
8891266 TAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAAA
1 TAGATAATTA-TTC-AATAGTC-TTAATAATTGAACTAATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * ** * *
8891330 TCTC-CAACCTATTAA-TTTTAAGAATATTAATTGATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTT
63 TCTCTTAA-TTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTT
* *
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8891424 CTTAACTATT
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ATTAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAAAAGATTTAAAA
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8887844 ATCATGATAA
* * ** * * * * *
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* ** ***
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * **
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* * * * ** * * * *
8888215 AAAATGATTTAAAATAAAATAATTATTC-TAATAGTCTTAACCA-A-TTGAACTAATTTGGTAAA
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*
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* * * * * * * * *
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* ** * **
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185 TAAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAATTATTTGAACTG-TTTAACAAACAAATTTAATTT
* * *
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* *
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* * * *
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* * *
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66 TTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTA-TTCA
* *
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* * * * * *
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192 GATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-GTTTAACAAACA-AATTTAATTTTGTAAAT
* * * * * * * *** * ** *
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255 CTC-TAGGTTATTAATGTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATT-TATTTTGAATAAAATAGT
** * * * * *
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* * * * ** * * * * ** **
8888937 ACAATAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGACTT--AGCTGTTTGAATTGGTTCAATAAATG
1 AAAACAA-TTGAAATAGATAATTATTCATAT--ATTTAAAAATATTTAAAATGATTTGATAAACA
* * ** * * * *
8889000 GATTTATTTTTTTAATCTCTTAGTTATTCATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTATTC
63 AATTTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTTTTTATT-
* * * * * * * * * * * * *
8889065 CAAATAAGTTTGTATGAATAGAAGCAATTGTTTTATGATAGAACAAAGGTTATAACAATTTGAAA
125 CAAACAAGCTTCTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTAATAACGATTTAAAA
* * * * *
8889130 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACTAATTT-ATTTTTTAAA
190 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-GTTTAACAAACAAATTTAATTTTGTAAA
* * * * *
8889194 TCTC----TTATTAAT-TCTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGT
254 TCTCTAGGTTATTAATGT-TTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAAATAGT
** * * * * *
8889254 AT-GTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-
318 ATAAAT-AGAAACAATTGTTTGATAAAAAAATAAAAGGTC
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1 AA-AACAA-TTGAAATAGATA
8889313 GTTGTTTAAA
Statistics
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Consensus pattern (356 bp):
AAAACAATTGAAATAGATAATTATTCATATATTTAAAAATATTTAAAATGATTTGATAAACAAAT
TTATTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTATTCAAACA
AGCTTCTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTAATAACGATTTAAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGTTTAACAAACAAATTTAATTTTGTAAATCTCTAG
GTTATTAATGTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAAATAGTATAAATAG
AAACAATTGTTTGATAAAAAAATAAAAGGTC
Found at i:8888891 original size:180 final size:180
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8887907 TTGATAAATA
** *
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1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TCATTTTATT
*** * * * * * * *
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* * * * ** *
8888043 AAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTAATAA-TAATTTGTACTTGTTTGATAAACA
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAACT-ATAACT-ATTTGAACTAGTTCAATAAACT
** * * * *
8888096 AATTTATTTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTAT
1 AATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TCATTTTAT
*** * * *** * * * **
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64 TCCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-AACAACAATTT
* * * * * * * * *** *
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128 GAAAT-AGATAATTGTTCAAATA-ACTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
* * * * *
8888279 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TCATTTTATT
** * * * * * * * * *
8888344 CTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAA-AATTGCTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGA
65 CCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGA
** * * * * * *
8888408 AATAGATAATCATTCATATAGTCT-TAATTATTTGAACT-GATTTAA-CAATT
130 AATAGATAATTGTTCAAATA-ACTATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACT
* * * * * ** * *
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1 -AATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TCATTTTA
*** * * * * * * * * * * * * *
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63 TTCCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTAACAACAATT
* * ** * * * * * ** *
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* * ** *
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1 A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAG--TTCATTTT
* * * * * *
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62 ATTCCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATT
* * * * **
8888765 TAAAATAGATAATTGTTTAAATAATTATAATTATTTGAACTAGTTTGATAAA-T
127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAACTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
* * * * *
8888818 AGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCTTCATTCTGT
1 A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TTCATTTTAT
* * ** * * * * *
8888883 TCCAAACAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTATTCTATGACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTG
64 TCCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTG
* * * * * * *
8888948 AAATAAATAATTATTCATATAGACT-TAGCTGTTTGAATTGGTTCAATAAA-T
129 AAATAGATAATTGTTCAAATA-ACTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
* * * * * * *
8888999 GGATTTATTTTTTTAATCTCTTAGTTATTCA-TTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTA
1 -AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-TCATTTTA
* ** * * * * * * *
8889062 TTCCAAATAAGTTTGTATGAATAGAAGCAATTGTTTTATGATAGAAC-AAAGGTTATAACAATTT
63 TTCCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTT
**
8889126 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAACTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
* * *
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1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TCATTTTATT
*** * ***
8889240 TTGAATAAACTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGA
65 CCAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGA
* * ** * * *
8889305 AATAGATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACT
130 AATAGATAATTGTTCAAATAACTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
* *
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1 AATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
8889406 GTAGCTTTTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTCATTTTATTC
CAAACAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAACTATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACT
Found at i:8889526 original size:161 final size:161
Alignment explanation
Indices: 8889261--8889552 Score: 367
Period size: 161 Copynumber: 1.8 Consensus size: 161
8889251 TGTATGTTGA
* *
8889261 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG
*
8889326 CCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACTAATTTA-TTTTTATAAATCT-ATTACTTATTAATT
66 CCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAACTAATTTATTTTTTA-AAATCTCA-TACTTATTAATT
8889389 TTTGAAATATTACTAAAGTAGCTTTTATGAACT
129 TTTGAAATATTACTAAAGTAGCTTTTATGAACT
* * * * * ** *
8889422 AAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATT-TTTCAAATA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGAAATAGATAATTGTTT-AAATA
* * *** *
8889486 GTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAAATCTCATGCTTATTAATT
65 GCCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTAAAATCTCATACTTATTAATT
8889550 TTT
129 TTT
8889553 TTAATGTAAA
Statistics
Matches: 110, Mismatches: 17, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
160 5 0.05
161 98 0.89
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (161 bp):
AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG
CCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAACTAATTTATTTTTTAAAATCTCATACTTATTAATTTT
TGAAATATTACTAAAGTAGCTTTTATGAACT
Found at i:8890450 original size:538 final size:531
Alignment explanation
Indices: 8889411--8891424 Score: 1690
Period size: 538 Copynumber: 3.7 Consensus size: 531
8889401 CTAAAGTAGC
* * * * *
8889411 TTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAA
1 TTTTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTTAAATAGATAA
* *
8889475 TTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCATG
66 TTTTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCATG
* * * * *
8889540 CTTATTAATTTTTTTAATGTAAATAAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAGTTTGTATGAACTA
129 CTCATTAA-TTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * * * * *
8889605 AAACAATTATTATATG-ATGAAAGAAAATGTCAGAATGATTTGAACT-GATAATTATTCTAACAG
193 AAACAATTGTTTTATGAAT-AAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
* * * *
8889668 T-TTCAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAATACATTTATTTTTTGAATGTCTTA--T-TAATTTTT
257 TCTT-AACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATCCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTT
* * **
8889729 GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTTGCATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTATTTT
321 GGAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTT
* * * * * **
8889794 ATGAGAAAACAAAGATTAGAACCATTTGAGATTGATATTTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAA
385 ATGAGAAAACAAAGATTATAACAATTTGA-ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA
* * * **
8889859 CTGGTTTGAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAAAATCTTGTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAG
449 CT-ATTTG-GAAATAGATTTAG-TTTT-AAAATC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-
*
8889924 TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGT
508 TA-TATTATTTTATTTTGAATAAGT
* * * *
8889949 TTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGACTTTAAATCGTTAA
1 TTTTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTTAAATAGATAA
* * * * * *
8890013 TTGTTTAAATAGTCA-AACCTATTTTAATTTGTTCGATAAACAAACTTACTTTTTTAAATCTCAT
66 TT-TTTAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCAT
*
8890077 GCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
128 GCTCATTAATTTTT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
8890142 AAAACAAGTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAATAATCTAAAATAGATAATTATTTTAATAA
192 AAAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
8890207 TCTTAACTA-TTGAAACTGGTTTGGCAAATCCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTT
257 TCTTAACTATTTG-AACTGGTTTGGCAAATCCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTT
* *
8890271 TGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTGCATGAAAAGAAACAATTATTT
320 TGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTT
*
8890336 TATGAGAAAATAAAGATTATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGA
384 TATGAGAAAACAAAGATTATAACAATTTGA-ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGA
* *
8890401 ACTATTCTGGTAAAT-GAATTTAGTTTTAAAATCT-CTTATTAA-CTTTGAAAATATT-ATAGAT
448 ACTATT-TGG-AAATAG-ATTTAGTTTTAAAATCTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAAT
*
8890462 CATTATTATTTTAATTTGAATAA-T
509 -A-TATTATTTTATTTTGAATAAGT
* * * * * *
8890486 TTTGCATCAAC-AGAAGCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAAC-AATTTGCAATAGA
1 TTT-TATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGAATTT-AAATAGA
* * *
8890549 T-ATTTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
63 TAATTT-TT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * *
8890613 CTAC-CTACTAATTTTTAGAGTATTAATTAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATATA-CTTGTATG
126 ATGCTC-ATTAATTTTTA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTGTATG
* * * * * *
8890676 AA-TAGAAGCAATTGTTTTAGGACA-AAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTATTC
188 AACTA-AAACAATTGTTTTATGA-ATAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * * * * *
8890739 AAATAGTCATAA-TGATTTGAACTAGCTCGGTAAA-CAGATTTACTTTTAAAATTTTTTACTTAT
251 TAATAGTCTTAACT-ATTTGAACTGGTTTGGCAAATC-CATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-
* * * *
8890802 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATACGGTTGTATGAATAA-AAAC
313 TAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAAC
** * * * * * *
8890866 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAATAGATAATTGTTTAAAGAATCATAA
376 AATTATTTTATGAGAAAACAAAGA-TTATAACAATTTGAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAA
* * * * * * *
8890931 CTATTTGGACATGTTTAGAAACCAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
440 CTATTTGAAC-TATTTGGAAA-TAGATTTA-GTTTTAAA-ATCTACTTATTAATTTTTGAAATAT
*
8890996 TAATAAATTTATATTATTTTATTTAGAATAAGCT
501 TAATAAA--TATATTATTTTATTTTGAATAAG-T
* * * *
8891030 TGTT-TGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAAG-ATTTGAAATAAATA
1 TTTTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTT-AAATAGATA
* * * * * * * * * * * *
8891092 ATAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTT-TTTATTAAATCTCCAA
65 AT-TTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CAT
* * * * * *** * *
8891156 CCT-ATTAATTTTAAGAATATTAATTAATTAGTATTAGTTTATTCAAAATAAGCTTGT-TTAAAT
128 GCTCATTAATTTTTA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * *
8891219 AGAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAATGTCATAAA-GATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAA
192 A-AAACAATTGTTTTATGA-ATAAACAAAAGGTCA-AAATAATTTGAAATAGATAATTA-TTCTA
* * * * * ** * * * ** *
8891281 ATGGACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAA-CAAATTTTTTTTTTAAATCTCCAACCTATTAA
253 ATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATC-CATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAA
** * * * * *
8891345 TTTTAAGAATATTAATT-GATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAAC-AT
316 TTTTTGGAATATT-ATTAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAAT
* *
8891408 ATGTTTTATGACAAAAC
379 -TATTTTATGAGAAAAC
8891425 TTAACTATTT
Statistics
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0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
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543 133 0.11
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (531 bp):
TTTTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTTAAATAGATAA
TTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATGCT
CATTAATTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
CAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTT
AACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATCCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGGAAT
ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAGA
AAACAAAGATTATAACAATTTGAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTATTTG
GAAATAGATTTAGTTTTAAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATATATTATTTTAT
TTTGAATAAGT
Found at i:8890612 original size:177 final size:175
Alignment explanation
Indices: 8890290--8890762 Score: 420
Period size: 177 Copynumber: 2.7 Consensus size: 175
8890280 ATTAAATTAG
* * *
8890290 TATTATTTTAATATGAATAAGCTTGCATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAGAAAATAAAGATTA
1 TATTATTTTAATATGAATAAGCTTGCATCAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAGATCA
* *
8890355 TAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTATTCTGGTAAATGAAT
66 TAACAATTTGATATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTATTCTGATAAATGAAT
8890420 TTAGTTTTAAAATCTCTTATTAACTTTGAAAATATTATAGATCAT
131 TTAGTTTTAAAATCTCTTATTAACTTTGAAAATATTATAGATCAT
* ** * * *
8890465 TATTATTTTAATTTGAATAATTTTGCATCAACAGAAGCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGT
1 TATTATTTTAATATGAATAAGCTTGCATCAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAAT--AAAGAT
* * * *
8890530 CATAACAATTTGCA-ATAGATATTTATTCAAATGGA-CATGACTATTTGAACT-TGTTTGATAAA
64 CATAACAATTTG-ATATAGATAATTATTCAAAT-AATCATAACTATTTGAACTAT-TCTGATAAA
* * * * * * * * *
8890592 T-AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTACTAATTTTTAGAGTATTAATTAG-TTAG
126 TGA-ATTTAGTTTTAAAATCT-CT---TATTAACTTTGAAAATATT-A-TAGATCAT
* * * * * * * * *
8890647 TATTATTTTATTTTGAATATA-CTTGTATGAATAGAAGCAATTGTTTTAGGACAAAACAAAAGAT
1 TATTATTTTAATATGAATA-AGCTTGCATCAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-TAAAGAT
** * * *
8890711 CATAATTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTA
64 CATAACAATTTGATATAGATAATTATTCAAATAATCATAACT-ATTTGAACTA
8890763 GCTCGGTAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
TATTATTTTAATATGAATAAGCTTGCATCAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAGATCA
TAACAATTTGATATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTATTCTGATAAATGAAT
TTAGTTTTAAAATCTCTTATTAACTTTGAAAATATTATAGATCAT
Found at i:8890856 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 8889408--8891424 Score: 1451
Period size: 181 Copynumber: 11.2 Consensus size: 181
8889398 TTACTAAAGT
* * * * * ** *
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* *
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* * ** * * * **
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* * * ** * * ** *
8889590 AGTTTGTATGAACTA-AAACAATTATTATATGATGAAAGAAAATG-TCAGAATGATTTGAACT-G
1 AGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
8889652 ATAATTATTCTAACAGT-TTCAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAATACATTTATTTTTTGAA--T
64 ATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* *
8889714 -GT-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTTGC--ATA
128 CCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTT-CAAATA
* * * * * * * *
8889766 AGCTTGTATGATTAGAAACAATTATTTTATGAGAAAAC-AAAGATTAGAACCATTTGAGATTGAT
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * ** * * * ** *
8889830 ATTTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAAAATCTT
66 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCT
** * ***
8889895 GTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATA
131 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * *
8889946 AGTTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AAATCG
1 AGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC-AATTTGAAATAG
* * * * * * * * * *
8890009 TTAATTGTTTAAATAGTCA-AACCTATTTTAATTTGTTCGATAAACAAACTTACTTTTTTAAATC
64 ATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC
* * * * * * **
8890073 TCATGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATA
127 TCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * *
8890128 AGCTTGTATGAACTA-AAACAAGTGTTTTATGA-ATAAACAAAAGGTCAAAATAATCTAAAATAG
1 AGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAG
** * * * * *
8890191 ATAATTATTTTAATAATCTTAACTA-TTGAAACTGGTTTGGCAAATC-CATTTATTTTTTAAATC
64 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTAGTTTGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *
8890254 TCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATA
127 TCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATA
* * * * * * *
8890309 AGCTTGCATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAGAAAA-TAAAGATTATAACAATTTGATATAGAT
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * *
8890373 AATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTA-TTCTGGTAAA-TGAATTTA-GTTTTAAA-AT-
66 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
8890433 CT-CTTATTAA-CTTTGAAAATATT-ATAGATCATTATTATTTTAATTT-GAATA
129 CTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATA
** * * * * * * * *
8890484 ATTTTGCATCAACAGAAGCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACAATTTGCAATAGA
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * * *
8890549 TATTTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCC
65 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCC
* * * * * **
8890614 TACCTACTAATTTTT-AGAGTATTAATTAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATA
130 TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * ** *
8890666 TA-CTTGTATGAATAGAAGCAATTGTTTTAGGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAA
1 -AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * *
8890730 TAATTATTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTAGCTCGGTAAACAGATTTACTTTTAAAATTTT
65 TAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* *
8890794 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
129 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * *
8890847 CGGTTGTATGAATAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACTATTTG-AATAGA
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * *
8890910 TAATTGTTTAAAGAATCATAACTATTTGGAC-ATGTTTAG-AAACCAGATTTATTTTTTAAAT-T
65 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTTGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCT
**
8890972 TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-AGAATA
128 CCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA-AATA
* *
8891026 AGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAA-AGATTTGAAATAA
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACA-ATTTGAAATAG
* * * * * *
8891089 ATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTA-TTTGGTAAACAAATTT-TTTATTAAATC
64 ATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
8891151 TCCAACCTATTAA-TTTTAAGAATATTAATTAATTAGTATTAGTTTA-TTCAAAATA
127 TCCTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATA
* *
8891206 AGCTTGTTTAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAA-AGATTTGAAATAG
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACA-ATTTGAAATAG
* * * * * *
8891269 ATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTA-TTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAAATC
64 ATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * **
8891332 TCCAACCTATTAA-TTTTAAGAATATTAATTGATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
127 TCCTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* *
8891387 AACTTATATGAATAGAAAC-ATATGTTTTATGACAAAAC
1 AGCTTGTATGAATAGAAACAAT-TGTTTTATGACAAAAC
8891425 TTAACTATTT
Statistics
Matches: 1493, Mismatches: 271, Indels: 143
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.00
175 75 0.05
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177 68 0.05
178 14 0.01
179 139 0.09
180 365 0.24
181 457 0.31
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183 5 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGAT
AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCT
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
Found at i:8892150 original size:854 final size:856
Alignment explanation
Indices: 8890569--8892153 Score: 1859
Period size: 854 Copynumber: 1.9 Consensus size: 856
8890559 AATGGACATG
* * * *
8890569 ACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTACTAATTTTTAGAGT
1 ACTATTTGAACTTGTTCGACAAATACATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTACTAATTTTTAGAAT
* *** * *
8890634 ATTAATTAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATATACTTGTATGAATAGAAGCAATTGTTTTAGGAC
66 ATTAATTAATTAGTATTATTTTAACATGAATATACTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTA-GAC
** *
8890699 AAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATGATTTGAACTAG
130 AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAATGATTTGAACTAG
* * ** * *
8890764 CTCGGTAAACAGATTTACTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
195 CTCGGTAAACAAATTTACTTTTAAAA--TTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCACT
* * * *
8890829 ATTATTTTATTTCAAATACGGTTGTATGAATAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
258 ATTATTCTATTTCAAATAAGGTTGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
* * * * * *
8890894 TAACTATTTGAATAGATAATTGTTTAAAGAATCATAACTATTTGGACATGTTTAGAAACCAGATT
323 TAACTATTTGAATAGATAATTATTCAAAGAATCATAACTATTTGAACATATTCAGAAACCAAATT
** * * *
8890959 TATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTAGAA
388 TATTTTTTAAATTCCTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAGTCAGAA
* * *
8891024 TAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAATAA
453 TAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAGGACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAATAA
* * * ***
8891089 ATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTATTAAATCTCC
518 ATAATAGTTCAAATAGACATGAATATTTAAACTTACTCAATAAACAAATTTTTTATTAAATCTCC
* * * *
8891154 AACCTATTAATTTTAAGAATATTAATTAATTAGTATTAGTTTATTCAAAATAAGCTTGTTTAAAT
583 AACCTATTAATTTTAAGAATATGAATAAATTAATATTAGTTTATTCAAAATAAGCTTGTATAAAT
* * * **
8891219 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATG
648 AGAAACAATTGGTTTATCACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAAAA
*
8891284 GACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTT
713 GACATAACTATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTT
8891349 AAGAATATTAATTGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAACATATGTTT
778 AAGAATATTAATTGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAACATATGTTT
8891414 TATGACAAAACTTA
843 TATGACAAAACTTA
* * *
8891428 ACTATTTGAA-TTGGTTCGACAAATACATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGA
1 ACTATTTGAACTT-GTTCGACAAATACATTTATTTTTT-AAATCTCCTACCTACTAATTTTTAGA
8891492 ATATT-ATTAAATTAGTATTATTTTAACATGAATA-AGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTT
64 ATATTAATT-AATTAGTATTATTTTAACATGAATATA-CTTGTATGAAAAGAAACAATTG-TTTT
* * * *
8891555 A-ACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT-ATTTGA
126 AGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAA-TGATTTGA
* * * *
8891617 ACTA-TTCCGGTAAATAAATTTAGTTTTTAAA-TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
190 ACTAGCT-CGGTAAACAAATTTACTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* ** * * *
8891679 CACTATTATTCTATTTTAAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAG
254 CACTATTATTCTATTTCAAATAAGGTTGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAA
* * * *
8891744 GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGA-CATGACTATTTGAACTTATTCATTAA
319 GTCATAACT-ATTTG-AATAGATAATTATTCAAAGA-ATCATAACTATTTGAACATATTCA-GAA
* *
8891807 A-CAAATTTATTTTTT-AATCTCCTACCTT-CTAATTTTT-AGAGTATTAATCAA-TTAGTATTA
380 ACCAAATTTATTTTTTAAAT-TCCTA-CTTACTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTTA-TATTA
** * *
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* * ** * * *
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* *** * * *
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* * * **
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* * *
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* * * *
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*** * * * *** * **
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* *
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*
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* * *
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* *** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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256 AATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
** * * * * *
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* *
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* ** ** * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
8893452 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTCTTTTATGAAAAAACA
252 AATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * *
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* * * * *** ** * * * * *
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* * * *
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* * * **** * *** * *
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* ** * * * * **** **
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* * * * * *
8893812 AATTTTTTACTTATTAATTGTTGATATACTAATAAATTAGTATTAGTTTA-ATCTAAATAAGCTT
226 -------TACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT
* * * * * * *
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** * *
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345 ATTCAAATAGTCA
* * ** * * *
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1 TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGA
* * ** * * * * *
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* *
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* * * * * *
8894142 CTAT-TT-AGGTAAACAGAATTATTTTTCAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATA
192 CT-TGTTCA-ATAAACAGATTTATTTTT-AAAT-TT-TTTACTT-A--TTAATTT-TT--AAAT-
* * * * ** * * * ** * *
8894205 AGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAAAATTTGAAATAG
245 A-TTA--ATAAATT----AATA-TTATTTTATTTC--AA-ATAAGCTTGTATGAA-TAG-AA-AC
* * * * * * * * * ** *
8894270 ATATTATTTTAT-TC---TCAATA-GAC-T--TGTGTGACAA-A-AAAATTGTT-TTAT-GACA
296 A-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * ** * * *
8894322 AAACAAAAGTTGATAATAATTTAA-AATAGATAATTT-TTGTAATGGCCATAATAT-TATTTGAA
1 TAAC--TATTTGA-ACTTGTTCAATAA-ACA-AATTTATT-T--T----TTAA-ATCT-TTT--A
* * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * *** * *
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* * * * *
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** ** * * * * * * *
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* * * *
8894759 GAATGTTAATATATTACG-ATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT-AATATGAAACAAATATT
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* * * * ** * * * **
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* * * * * * *
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* * ** * *
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** * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * *
8895121 AATATTAATAAATTAATATTATTTCAAT-ATGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTG
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATCA-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
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* *** * * *** *
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** * * * *
8895313 ATTAGCATCATTTTA-TTCTGAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
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* * * * * * *
8895376 AATGGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTA
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* * * * * * *
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* *
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CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTTG
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TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
ATATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
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* * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* *
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* ** * * * *
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* *** * *** *
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** * * *
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*
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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** * *** * * * * *** *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * **
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*
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*
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* * * ** * *
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*** *** * * *
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* * *
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* * * * * * * ** *
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* * * *
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*
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*
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* * **
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* *
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** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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380 TACTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * *
8893531 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTTGGTAAACCTATTTATTTT
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*
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Consensus pattern (533 bp):
AATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTATGAACAAAAAACAATTGGTTTATAATAA
AACAAAAAATAATAACAAGTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAATGTGTT
CAAAAAATCAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTTAAATTA
TTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
AATTTCAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTAAACTTATTAAGTAAACAAAATCAT
TTTTCAAATCTTTTACTAATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATA
AGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT
AATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTTATTTAAATCTTTAAC
TTATTACAATATC
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Alignment explanation
Indices: 8893686--8894172 Score: 509
Period size: 178 Copynumber: 2.7 Consensus size: 177
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*
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* ** * * * * * *
8893932 AATAATTGCTAAAATAGTAATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA-TC
65 GATAATTAATCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAAATTC
* * * * *
8893996 TCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTCCCG
130 TCTTATTAATTGTTAAAATACTAATAAATTAGTATTACTTTAATCCCA
* * * * *
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* * * *
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127 T
8894173 ATTAATAAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
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ATAATTAATCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAAATTCT
CTTATTAATTGTTAAAATACTAATAAATTAGTATTACTTTAATCCCA
Found at i:8894126 original size:16 final size:17
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** *
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* ** **
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* ** ***
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* * **
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* * * * * *
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* * *
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* * ***
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* * * *
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189 TTAACC--ATAAGCTTCTATGAACTAAAACAA-G-TT-TTTTATGACAAAACAAAGACCATAACA
* * *
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CTTGCTTAGTGATTTTTTGAATGTTAATATATTACG
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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ATATTTATTATTATTTATCTATTAT
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*
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*
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1 TATTATTATT
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TATTATTATTTATC
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* *
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*
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1 TTTTA-T-TTTTATTTATTTTT
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*
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*
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*
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8901791 AATTGTTTAA
* ***
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*
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1 TATTTT
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* * * * *
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* * *
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*
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* * * *
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* * *
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CCTTTGATTAGAGGAGCTTT
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8913359 TCAAGGAGTA
* *
8913369 ATTTATTTTTTAAAATCGTTGAGCCTTTGATTAGAGGAGCCATTTATTT-TTCCAAAGTTGTTGA
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*
8913433 GCTTCTGATTAGAGGAGC-TTTATTTA-T-TTTTCAAAGTCGTTAAGCCTCTGATTAAAGAAGCC
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*
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* * *
8913560 TGATTAGAGGAGCATTTGTTTATTCATTTTCAAAGTCGTTGAGCCTTTGATTA
65 TGATTAGAGGAGCATTTATTTATT-ATTTTCAAAGTCGTTAAGCCTCTGATTA
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*
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*
8913551 TTGAGCCTCTGATTAGAGGAGCATTTGTTTATTCATT
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8913588 TT
1 TT
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Statistics
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8913360 CAAGGAGTAA
* * **
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* * * *
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* * * **
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* * * *
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*
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*
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* *
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Period size: 49 Copynumber: 2.0 Consensus size: 49
8923747 TTAGCATTTG
* * **
8923757 GTTTAGGGTTTATGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAGGGTTTA
1 GTTTAGGGCTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAAAGTTTA
* *
8923806 GTTTAGGGCTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAGGGTTTAAAGTTTA
1 GTTTAGGGCTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAAAGTTTA
8923855 G
1 G
8923856 ATGGTGGTTT
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 6, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
49 44 1.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.04, G:0.33, T:0.42
Consensus pattern (49 bp):
GTTTAGGGCTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAAAGTTTA
Found at i:8923868 original size:49 final size:49
Alignment explanation
Indices: 8923760--8923887 Score: 141
Period size: 49 Copynumber: 2.6 Consensus size: 49
8923750 GCATTTGGTT
* ** *
8923760 TAGGGTTTATGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAGGGTTTAGTT
1 TAGGGTTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAAAGTTTAGTA
* * *
8923809 TAGGGCTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAGGGTTTAAAGTTTAG-A
1 TAGGGTTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAAAGTTTAGTA
* * *
8923857 TGGTGGTTTAAGGTTTAGTTAAGGGTTTAGG
1 TAG-GGTTTAAGG-TTAGTTTAGGGTCTAGG
8923888 GTTTGAATGG
Statistics
Matches: 66, Mismatches: 11, Indels: 3
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
48 2 0.03
49 49 0.74
50 15 0.23
ACGTcount: A:0.21, C:0.03, G:0.34, T:0.41
Consensus pattern (49 bp):
TAGGGTTTAAGGTTAGTTTAGGGTCTAGGTTAAGCTTTAAAGTTTAGTA
Found at i:8923910 original size:45 final size:45
Alignment explanation
Indices: 8923861--8923957 Score: 115
Period size: 45 Copynumber: 2.2 Consensus size: 45
8923851 TTTAGATGGT
*
8923861 GGTTTAAGGTTTAG-TTAAGGGTTTAGGGTTTGAATGGTGATTTAG
1 GGTTTAAGGTTTAGATTAA-GGTTTAGGGTTAGAATGGTGATTTAG
** * * * *
8923906 GGTTTTGGGTTTGGATTGAGGTTTAGGGTTAGGATGGTGGTTTAG
1 GGTTTAAGGTTTAGATTAAGGTTTAGGGTTAGAATGGTGATTTAG
8923951 GGTTTAA
1 GGTTTAA
8923958 AATTTATGGT
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 9, Indels: 2
0.79 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
45 39 0.93
46 3 0.07
ACGTcount: A:0.19, C:0.00, G:0.39, T:0.42
Consensus pattern (45 bp):
GGTTTAAGGTTTAGATTAAGGTTTAGGGTTAGAATGGTGATTTAG
Done.