Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168492.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_9, whole genome shotgun sequence
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Warning! 122000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 45 of 126
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* * * *
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8926169 GCTAAGAAAT
* * *
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TTTAAAAATCTTAATTTGAGAAAGGCTCCTATAAACAAAGGTAGAGAACTTTAAAAATCTCAATT
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*
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* * * * * *****
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** * **** ** * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * ** * *
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* *** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * ** ***
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* *
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Statistics
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*
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* ***
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*
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* * * * * *
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** *
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* ** * * ** *
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* * * * * * * *
8936660 ATAGATATTTGCT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAAATGGTTTGACAAACACA-
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* *
8936712 -T-TTTTTTAAA--TC-T--TTATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTATTCTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TG
** *** * ** * *
8936770 AATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGCAACAAAATAAAATATCATAATGATTTAAAAT
64 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * *
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* **
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--T
* * * *
8936951 -AATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAG-CATAATGATTTAAA
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* * * * *
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127 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGATAAACAGAT
* * * *
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TG
* * * * **
8937132 AATATGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAT
64 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
8937197 AGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA--AGTGTTCAAGAAATAGAT
129 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TT-GATAAACAGAT
* * * *
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTAT-TTTATT-
** ** * * * ** * * * * * *
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* * * * *
8937374 ATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAAT
127 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAGAT
* *** * *
8937427 TCATATTTTTGGTTCTCTTACTCATTAATTTTTAGTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
1 TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-
* * * * * * * * * *
8937492 AAATAAGCTTATATTAATTGAAACAATTATTTTATTATAAAATAGAAGGTCACAACGATTTGAAA
63 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
8937557 TGGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAA-A-AT
128 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGAT
* * * * * * * *
8937607 ATATATTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAAT-TTACTTTAATCTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTG
* * *
8937671 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTT
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8937731 TGTTTGCTTA
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AAATAGCATAATTATTC
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* * * *
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* * ** * *
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* *
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* * * * * *
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* *
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* ** * *
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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128 TATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AA
* ****
8938281 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATTGGAATGA-TCTTTGTTTTG
1 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTTTTG
* * * * ** * * * ** *
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8938410 ATTCTAAAAATTAATAA
129 ATTCTAAAAATTAATAA
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CAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGT
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TCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
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* *
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*
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*
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* *
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* *
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131 ACTAAT
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1 AA
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TAATTGTTTCAATTCATACAAACTGATTTAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAA
ACTAAT
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8938415 AAAAATTAAT
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * *
8938732 AAAAATTAATAAGGAAAGAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTTA
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* * *
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* * * *
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* *
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*** * * * *
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* * * **
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAA-CTTTTGTTCTATCATAA
** * * * * *
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* * ** * * * * * **
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128 AAAATTAAGAAGGAAAGA-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAATAAGTTCA
* * * * * * * *
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1 AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAAC-TTTTGTTCTATCATA
* * * * *
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* * * * * ** * *
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127 AAAAATTAAGAAGGAAAGAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCA
* * * * * * ** * * * *
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1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCATAAA
* * * * *** * ** *
8939559 ATAATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAA
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** * * * * *** * ** *
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130 AATTAAGAAGGAAAGAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCA
* * * * * * * *
8939675 AATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTCTTGTTTTGA-CACAC
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTCT-ATCATAA
* * ** * *** * *
8939739 AATAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTTGGAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCA
65 AACAATT-ATTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTA
* * * * *
8939803 AAAATTAATAA--ATAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTA
128 AAAATTAAGAAGGA-AAGA-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCA
* * * * * * * *
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1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAA-CTTTTGTTCTATCATAA
* * * ** *
8939920 AACAATTTTTTCCATTAATACAAG-TGTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTC
65 AACAATTATTT-CATTCATACAAGCT-TA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
* * ** *
8939982 AAATAATTAATAAGTAAA-AGGTTTAAAAAATAAATC---TTACCAAATAAGTTCA
127 AAA-AATTAAGAAGGAAAGAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCA
* * * ** * *
8940034 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAAC-TTTTGTTCTATCATAA
* ** * *** * * *
8940098 AACAATTTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAC
65 AACAATTATTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAA
* * ** * * * * *
8940163 AGTTAATAACTAAA-AGA-TTTCAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCA
130 AATTAAGAAGGAAAGA-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCA
* * * * * * * *
8940214 AATAGTCAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGT-CACATTTTATT-TCATCATA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAAC-TTTTGTTCT-ATCATA
* * * * * * **
8940277 AAAC-ATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCA
64 AAACAATTATTTC-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTA
* * * *
8940341 AAAATTAATG-AGTAAGAGAA--TTAAAAAATGAATCTATTT-GCTAAACAAGTTCA
128 AAAATTAA-GAAGGAA-AGAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAATAAGTTCA
* * * * * *
8940394 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCCTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
1 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTCTATCATAAA
* * ** * * * * *
8940459 ATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT--GAATAAATTAACATAAATTTATTAATATTTCAAA
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* *
8940522 AATTAATAAGCAAA-AA-TTTAAAAAATAAAT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * *
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* * * * * * * *** *
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127 TTCA--AAAATTAATAAGTAAAAGGT-TTAAAAAATGAA--TCTTT-GCCAAACAAGTTCAAATA
* * * * * * *
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* * * * * **
8939390 ATGTTTTTATTTATATAAG-TT-TGCT-AA-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T
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* * * *
8939450 --TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTGCCCAACA
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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128 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGG-TTTAAAAAATGAATCT-TT-GCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
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189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* *
8939747 TTTTTGTTCGTACAAGCTTATTTGGAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * *
8939811 TAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACA
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* * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTGT
* * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * * **
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTG
* * * * *
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* * ** *
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126 ATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
8940400 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCCTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
188 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *
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253 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * ** **
8940529 AAGC-AAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAGT
318 AA-CTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
8940565 A-TTCAAATAGTTATGACCTTTTTG---TTTTGTC-A--T-AAA-C----CAA-TTGTT-TTTAT
1 AGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTT-TTGTTT-T
* * * * *
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63 GTCATA-AAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTATTTCAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * **** * * *
8940660 GCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAGCAAGTTCAATTACTTA
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
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* * * ** ** *
8940788 TTTCTGTTCATACAAGTTTCTTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAAT
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* ** * * *
8940852 AAGTAGGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACA
318 AACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * ** * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTGT
* * * *** * * * * * * *
8940955 TACAAAATAATTGTTTTTGTTTATGCAAAATTATTT-AGGATTAAATAATATTGATCTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATAC-AAGTTATTTCA--ATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * *
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127 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAA-TGA-ATC--TTTGCCAAACA-AGTTCAAATA
* * * *
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186 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
8941140 ATTGTTTCTT-TTCATAAAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA
250 ATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * *
8941203 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACC
312 ATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTG
* * * * * **
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64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * ** * * *
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126 A-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GAA-TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
8941440 TATGAATATTTGAACAAATATCAATCTT-AAATCATTATG--ATCTTTCTTTTCTCATAAAACAA
188 TATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
8941502 TTGTTTCTGATCATCCAAGCTTATTTGGATAAAAATAATACTAATGTAATAATATTTCAAAAA-T
251 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * *
8941566 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACT
315 AATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTG
* * * * * *
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64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * **** * *
8941731 TT------TT--T---T--TA--TTT-CAAATTG--T-TATGACC--TTGTGTTCAAACAGTTAA
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCTTTG-CCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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319 ACTAAAAGATTTA-AAAACTAAATATGTTTAC-CAAACA
* * * ** * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTGT
* *** * * * * *
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* * * * * * * * * *
8942071 TTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTACTTGCCAAACCATTTCAAATAATTT
128 TCA-AAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCT--TTGCCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
8942136 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAACTTG
190 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTG
* * ** * * * ** *
8942201 -TTCTGTTCATACTATTTTATTCGAAATTAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTCGTAACTTAA
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * ** *
8942264 TAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGCCAAACCA
317 TAACTAA-AAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAA-CA
* * * * * * * * * * *
8942304 A-TTCAAATAGTTAAAACCATATGAACAACTATCTATTTGAAATCATTATGACCTATTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTGT
* ** *** * * *
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65 CATAAAACAATTGTTTCAAT-TAATACAAG-TTATT-TCAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** * ** *
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127 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
8942496 AAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTT-TGGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
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*** * * * *
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253 GTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * *
8942624 ATAA-GAAAGAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACTAAACA
316 ATAACTAAA-AGATTTAA-AAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * **
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA-ACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTG
* * * * * ** * **
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* * ** * * *
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127 TTCAA-AAATT-AATAAGTAA-AAGGTTTAAAAAATGAATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * ** * * * * *
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189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * **
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253 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * *
8942968 AAGTAATAGATTTAAAAAATATATATGTTTACCAAACC
318 AACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * *
8943006 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAATAATTATCAATCTCAAATTG-T-TAAGATCTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CT-TTTGTTTT
* * * * * *
8943068 GTCATAAAACAATTGTTTCTAA-TCATAGAAGCTTATTTGATTAAAAATAGTACTAATTTAATAA
63 GTCATAAAACAATTGTTTC-AATTAATACAAG-TTATTTCAAT-AAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * ** * *
8943132 TTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGGTGAACCAA-TTGAAATA
125 -TATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTT-GCCAAACAAGTTCAAATA
** * * * * * * * * *
8943196 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAT
186 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
8943261 TTGTTTCAT-ATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTAACA-TTCAAAAAA
251 TTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* ***
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313 TTAATAA-CTAAAAGATTT-AAAAACTAAA--TATGTTTACCAAACA
* * * ** * * *
8943368 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTAAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGA
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTG-
* * * * ** *
8943432 T-ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAGAAT-AAATAATACTAATTTCTTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTAT-TTCAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
8943495 TTTCAAAGATTAATAAGCAAGA-GTTTAAAACAATAAATTCCTTTACCAAACAAATTCAAATAGT
127 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAA-AATGAA-T-CTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
8943559 TATGACTATTTTG---AA--A---A--T----T-GTTATGACATTTTGTTTTGTC-TCAAAACAA
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* ** ** ** *
8943608 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACAAATTTTTTAATATTTCAAAAATT
251 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * * * * **
8943673 AATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGCTTACCAAATT
315 AATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* ** * * * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTT-GTAACTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
8943779 AATATAACAATTGTTTTTAATT-GTACAAGTTCATTTGGAATAATGTGATACTAATTTATTAATC
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* * * * **** * *
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126 ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * ** *
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189 A-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * * *
8943972 ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATATAATAATA-TTCTAAAAATTA
253 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * * *
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316 ATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * *
8944076 AGTTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC------ATTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
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65 CATAAAACAAT-TGTTTCAATTAATAC-AAGTTATTTCA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
8944188 ---AGAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATT
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA-TC--TTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
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* * * * * *
8944314 TTTTTGTTCATATAAGTTTTTTTTCAA-ATAAATAGATACTAATCTATTAATATTTC-AAAATTA
254 TTTTTGTTCATACAAG-CTTATTTGAATA-AAATA-ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * * *
8944377 AT-A-T--GAGATTTAAAAGTTAAATCTGTTTATCAAACC
316 ATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* ** * * * *
8944413 AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAGA-AATTATTTATTTCAAA-CTGTTATGACTTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA-ACTATTATCTATTTCAAATC-GTTGTAAC-TTTTGTTTT
* * * *
8944476 GTTATAAAACAATAGTTTATAATT-ATACAAGTT-TATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTA
63 GTCATAAAACAATTGTTT-CAATTAATACAAGTTAT-TTC--AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * * *
8944539 AAATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAAGTTT-AAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGATCAAAT
124 ATA-TTCAAAAATTAATAAGT-AAAAGGTTTAAAAAATGAATCT--TTGCCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * * *
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* * * * ** *
8944667 ATTATTTCAATTATT-ATA-AA-ATTATTCGAAATAAAATAATATTAGGTTATTAATATTCCAAA
250 ATTGTTT---TTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
8944729 AATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAACA
311 AATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA-ACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTG
** * *** * *
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* * * ** **
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126 ATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATG-A-ATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
8944966 TTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGCTATG--ATTTT-TTTTGTCATAAAATAAT
187 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
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252 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * *
8945092 AATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA
315 AATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * *
8945132 AGTTCAAAGAGTCATGA-TATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTGTGAC----CTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTGT
* * ** * * * *
8945191 AATAAAA-AATTACTTT-TGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATT-GTTTCAATTAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * *
8945254 TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAAA-ATA-TTTAAATAG
127 TT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCC-AAACA-AGTTCAAATAG
* * * * * *
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187 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
*** * * * *
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251 TT-GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ****
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315 AATAACTAAAAGA-TTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTT-GTAACTTTTGTTTTG
* *** * * * *
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64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * * *
8945613 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCGAGTTCAATTAGTT
127 TT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
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189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** *** *
8945742 GTTTCTATTCATACAATTTTATACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTA
253 GTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* *** * * * * *
8945806 ATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA
316 ATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
** * ** * * *
8945846 AGTTCTGATAGTCATGTCTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
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* * ** * * * * *
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* * * * ** *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTG
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* * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * * *
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* ** *
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* * * * ** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTAT-TTCAAATCGTTGTAACT-TTTGTTTTG
* * * ** * ** *
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64 TCATAAAACAATT-GTTTCAATTAATACAAG-TTATTTCAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
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126 A-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCT-TT-GCCAAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * * * * *
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188 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * *
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** ** ** * *
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316 ATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * ** *
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1 AGTTCA-AATAGTTAT-AACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTT
* ** *
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* * * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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255 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * *
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319 ACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * *
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* ** * * * *
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63 GTCATAAAACAATT-GTTTCAATTAATACAAGTTAT-TTC--AATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** ** * * * *
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* ** * * * * *
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183 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * **
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* * * *
8947554 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGA-TAAATTTGGTTACCAAATC-
312 ATTAATAACTAAAAGATTTAAAA-ACTAAATATGTTTACCAAA-CA
* * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATT-TGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTT
* * * * * *
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62 TGTCATAAAACAATTGTTTC-AATT-AATACAA-GTTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * * * * *
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122 TAAT-A-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-G-TTTAAAAAATGAA-TCTTTGCCAAACAAGTTCA
* * * * * * * * * * * *
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182 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA
* ** * * * * * * *
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* * * *
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310 AAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACC-AAACA
* * ** * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTGT
* * * *
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* * * * * * *
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125 TA-TTCAAAAATTAAT-AAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGC-CAAACAAGTTCAAAT
* * ** * *
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185 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * ** *
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248 CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-ATAAAA-TAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
* ** * * *
8948268 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTGCCAAACC
311 AATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATT-TGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTT
* * * * * * * * *
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63 GTCATAAAACAATTGTTTCA-AT-TAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * * *
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124 ATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAG-GTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
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* * *** *
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* * * * * *
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313 TTAATAACTAAAAGATTTAAAAACT-AAATATGTTTACCAAACA
* * * * * ** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
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65 C-ATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTAT-TTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * **** * * * *
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126 ATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * *
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187 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATA-AAACA
* * * * * * *
8948920 ATTG-TTTTGATCGTACAAGTTTATTCAGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCCAAAA-
250 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * **
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314 TAATAACTAAAAGATTTA-AAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * *
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66 ATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTAT-TTC-A-ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * * *
8949144 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTT
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAAC-AAGTTCAAATAGTT
* * * * *
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*** ** * * *
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252 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-AAA-T
** * * * * * * * *
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314 TAATAACTAAAAGATTT-AAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * *
8949370 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTG-TTT-
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTG
** * * * * *
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* * * * * * * * *
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126 -ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
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188 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *** * * * *
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* * * * *
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* * *
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1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
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* * * * **
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126 A-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGG-TTTAAAAAATGAATCTTTG----CCAAACAAGTTCAAAT
* * *
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185 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** *
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250 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
** * * * *
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314 TAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
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1 AGT-TCAAATAGTTATAACTATTTGAA-CTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTT
* * * * * * * *
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63 GTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATAC-AAGTTATTTCA-A-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ** * * * ****
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* * * * * * * *
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175 A--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTT
* * * * * * * * * * *
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** * ** *
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* * * * * * * *
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1 AG-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTT
* * * * * *
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63 GTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * * * *
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* * * * * * * * **
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** *
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* * * * * *
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314 TAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * ***
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* * * * * *
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* * * * * * *
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125 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
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187 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* *** * * * * **
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* * * * * * * * *
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316 ATAACTAA-AAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTC-AAATCGTTGT-AACTTTTGTTTT
** * *
8951217 GTCATAAAACAATTGGTTT-TTTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTA
63 GTCATAAAACAATT-GTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC-AATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * *
8951280 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAGAATAGATATGTTTTCTAAATACA-TTCAAAT
124 ATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAACA-AGTTCAAAT
* * ** * * * *
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185 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-C---ATTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * ** * *
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246 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * ** * *
8951473 AAATTATTAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAGCG
310 AAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* ** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTA-TTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTT-GTTTT
* * ** * *
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63 GTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAA-GTTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *** * * * * *
8951648 ATTTTAAAATTTCATAAGTTGGAGATTTAAAATATAT-ATTTATTTACCAAACAAGTTCCAATAG
126 A-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAA-A-ATGA-ATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * ** * *
8951712 TCATGTCCATTTGAACTATCATCTATTTCAAATCATTATGATGTTTTGTTTTGTTATAAAATAAT
187 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** * ** *
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252 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * ** * * *** *
8951839 TAA-TAAGAGATTTGAAATGTAAATCTATTTATTGAACT
317 TAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
8951877 AGTTTAAATCGTTATGA-TCTTTG---TTTTGTC-A-TT-AAA-C-----AA-TTATT-TTAT-T
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTT-TTGTTTTGT
* * * * * * * *
8951926 --T-AGACAA--GGTT-ATTTAGAGTA-AA-ATA-TT-ACTAAATTAATAAT-ATTCTA--AAAA
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTA-A-TACAAGTTATTTCAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA
* * ** * * *
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* ** * * * * * *
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186 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATT-TTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
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* * * *
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* * * * **
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAAT-CGTTGTAA-CTTTTGTTTT
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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184 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
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* *** * * *
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313 T-TAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
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* * * * * * **
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** *
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** * * ** * *
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253 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
** * * * *
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317 TAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAA-CA
* * * ** * * * * * * **
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1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTT-GTAACTTTTGTTTTG
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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124 AT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTT-AAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAAT
* ** * * *
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185 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * * * * *
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250 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
8953226 TAATAACTAAGAGAATTAAAGAA-AAAAT-TGTTTGCCAAACT
314 TAATAACTAAAAGATTTAAA-AACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * * *
8953267 AGTTCAAATATTTAAAACAATATGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
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65 CATAAAACA---ATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * *
8953395 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TTTGTTTATCTAACTAGTTCAAG
124 ATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCTTTG----CCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *
8953458 TAATTGTGACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
184 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * ** * * * *
8953523 AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAGTACTAATCTATTAATATTTCAAAAA
249 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * ** *
8953588 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTATAAAACT
313 TTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
8953627 AGTTCAAATAGTTATGAA-TATTT-AAGCAATTATTTATTTAAAATCATTATGACTTTT-TTTTA
1 AGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAA-CTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTG
* * * * *
8953689 TTATAAAACAATAGTTT-ATGTTCATACATGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTCA-ATTAATACAAG-TTATTTC-AA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * * * *
8953752 TATTTCGATAATTAATAACTAAAA-CTTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA-TATCAAATA
125 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAACAAGT-TCAAATA
* * * * * * * * *
8953815 ATCATGACTACTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAGAA
186 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * ** * * * *
8953880 TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATAATCCAAAAATT
251 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * ***
8953945 AATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACA
315 AATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * * *
8953986 AATTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTGT
* * ** * * *
8954051 CATAAAAGAATTTTTTTTATTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * **** * * * *
8954115 TAAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACAAATTTAAAAAATT
128 TCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
8954180 ATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTC
189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** *
8954245 TTTTTATTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA--TAAAGATAATTA
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTA
* * * * *
8954308 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATA
316 ATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * ** * * * * * * * **
8954348 AGCTCAAATCGTTATGTCAATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGATTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
8954413 CATAAAACAATTATTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATAAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTCAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-
** * * * * ** * *
8954478 TTTGAAAACTAATAAGTAAAA-GTTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCA
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
8954542 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTT-TTGTTGTAATAAAACACTTG
190 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTG
*** * * * *
8954606 TTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* ** * * * **
8954671 GAGC-AAGGGAATTAAAAA--AGGATATGTTTACCGAATT
318 -AACTAAAAGATTTAAAAACTA-AATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
8954708 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTGTCTTT-T
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGT-TTTGT
* * ** * * * *
8954772 CATAAAACAATTGGTCCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAACATAAT-TTAAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * ** *
8954836 TTTCAAAAATTAATAAATAAAA-TTTTAAAAAAATAAATATATTTTCTGAACACGTTC-AATAGT
127 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTT-AAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
8954899 TATGACTAGTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAAT
188 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT
* * * * * * * *
8954963 TGTTTCTATTCATAAAAGCTTTTTTGAAATAAAACAATAGTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTA
252 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
8955028 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA
316 ATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * ** * *
8955068 AGTTTAAATAGTCAT-GTTCATTTGAACTATTATTTATTTCAAATTGTAATG-ATA-TTTTGTTT
1 AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGT--TGTA-ACTTTTGTTT
* * * * * *
8955130 TGTCATAAAAAAAATTGTTTCTATTTATGCAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATCTATT
62 TGTCAT-AAAACAATTGTTTCAATTAATAC-AAGTTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * * *
8955194 AATATTTTGATAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATGAAATCTATTTACTGAAA-TAGTTCAA
123 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATG-AATC--TTTGC-CAAACAAGTTCAA
* * * *
8955253 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCTTTATG--ATCTTT-ATTTGTCAAAAA
183 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
8955315 ATAATTTTTTTTGTTTTCATACAAGCTTATTCAT-ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCC
247 ACAATTGTTTTTG--TTCATACAAGCTTATT--TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC
** * * * * * * *
8955379 AAAAATTGGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACC
308 AAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
8955427 AGTTCAAATTGTTA-AGACTACTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTTTAACCTTATGTTTAG
1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTG
* * * * * * *
8955491 TCGTAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCGTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * * *
8955555 ATTCAAAATATTAATGCGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTGAAATAG
126 ATTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAG-GTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * * **
8955620 ATT-TGACTATTTGCATAATTATATGTTT-ATAGTCATTATGACCTTTTGTTTTATCTTAAGTCA
187 -TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
8955683 ATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCTGAAATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAAT
250 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * *
8955748 TAATAAGC-AAGAGATTTAAAAACTAAAGTTATTTTTTA--AATC-
314 TAATAA-CTAAAAGATTTAAAAACTAAA--TA-TGTTTACCAAACA
* * ** * * * * * * * **
8955790 ACTTCAAATAGGTATGGCTATTTGAACAAATAGT-AATCTCAAATCCTTATGA-TCTTTGTTTCC
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTA-TCTATTTCAAATCGTTGTAACT-TTTGTTTTG
* * *
8955853 TCATAAAACAATTATTT--TTTATCATATC-AGTTTATTT-AGATAAAAATAATACTAATTTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTA--ATA-CAAG-TTATTTCA-AT-AAAATAATACTAATTTATT
* * * * **
8955914 AATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCGGTTCAAAT
123 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
8955975 AGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATA
185 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *** * * * *
8956040 ATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAA
250 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
** * * ***
8956104 TTAATAAGC-ATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACA
313 TTAATAA-CTAAAAGATTT-AAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
** * * * * * * * *
8956148 AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
8956213 CATAAAACAAATGTTTTAGTTTATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
8956277 TTTCAAAGATTAATAAGCAAGAGATATAAAAAAATAAATCAATTTACCAAATC-AGTTCAAATAA
127 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGT-TTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * **
8956341 TCATGA-TCATTTAAATAACTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATGA
187 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
*** * * * *
8956404 TTGTTTTTCAACATACAAGGTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTC------
251 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT--GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
8956462 -AAGAA--AAAAG----GAAATCT--GTTTG-TT--GAACCA
314 TAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * * * *
8956492 A-TTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATC
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
8956556 ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATAATAATTTAGTAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
8956620 TCTAAAAATTAATAACT--ATGGATTAAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAGTTCAAACAGTT
128 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGG-TTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
8956683 AAGATTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * *
8956748 TTTTAGCTT-GTACAAGTTTATTCAT-AATAGAAA-AAAATTAAATTATTAATATTTCAAAAATT
254 TTTTTG-TTCATACAAGCTTATT--TGAATA-AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * *
8956810 TATAAATAAAATATTTAGAAAA-TAATTCTATTTACGAAACT
315 AATAACTAAAAGATTTA-AAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
8956851 AGTTCAAATAATTATAATTATTTGCACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTGT
*** * ** *
8956916 CATAAAACAATTGTTTTTCTTAATATAAGTTGGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * ** * * * *
8956981 TTGAAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAGGTAAATATGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTT
127 TTCAAAAATTAAT-AAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCT--TTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * ** * * * *
8957045 TTGACTATTTGAATAATTACCTA-TTCAAATTATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTG
189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ** * ** * ** *
8957109 GTTCTATTTATACTATTTTATTCGAAATAAAATAATACAAATTTAATAATATTTTGAAACTTAAT
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* ** * * * *
8957174 AACCAGGAAA-A-TTAAAAAAAAAAAATCTACTTGCTAAACCA
318 AACTA--AAAGATTTAAAAACTAAATATGT--TTACCAAA-CA
* * * * * * *
8957215 A-TTCAAATAGTTA-AGACTATAT-AAATGATTATCTATTTTAAATTGTTATGATCTTTTCTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTT
* * ** ** *
8957277 GTCACAAAAC-ATTATTT-TGTTTGTACAACCTTA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTTCA-TA
63 GTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAA-GTTATTTCA-A-TAAAATAATACTAATTT-ATTA
* * * * ** * * * * * *
8957338 ATATTTCAAAAACTAAAAAGCAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC-ATTTCAAAT
124 ATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGC-CAAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * * *
8957402 GGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAACCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATA
185 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
*** * * *
8957467 ATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA----AAT----TAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATT
250 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
** * * * ** * * * *
8957524 AAT-AGGAAAGAGACTGAAAAAATAAAGCTATTTATCGAATA
315 AATAACTAAA-AGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * **
8957565 AGTTCAAATAGTTATTATTTTTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTAATTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTGT
* * ** * *
8957630 TATAAAATAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTA-GACAAAATAAAATAACATTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * **
8957694 TTTTC-TAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-AGTAAAAATA
127 --TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAA-CAAGTTCAAATA
* * * * * *
8957756 ATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTCTATTTTGTCATAAAACAA
186 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
8957821 TTATTTTT-TATCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAGTTGATTAATATTTCAAAAAT
251 TTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
8957885 TAATAAGTTACAA-ACTTAAACAA-TAAATCTATTTATCGAACCA
314 TAATAA-CTAAAAGATTTAAA-AACTAAATATGTTTA-CCAAACA
* * ** * * **
8957928 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTT-AAATCATTAAAATCTTTT-TTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTAT-TTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTTG
* * * *** *
8957990 TCATAAAACAATTATTTCTAA-TCATAGAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTC-AATTAATACAAG-TTATTTCAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
8958054 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGT
126 ATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
** * * * * * *
8958119 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCA-GACTTTTTGTTTAGTCATAAAATATT
188 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** * * * **
8958183 TGTTTAAT-ATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CCAAATTATGAACATTTGGAAAATT
252 TGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
8958246 AATAAGC-AAAACATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAACGAACA
315 AATAA-CTAAAAGATTT-AAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
8958288 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATGTAAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGA
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTGT
* * * * * *
8958353 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTATTTTCTTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *** * *
8958417 TTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAGTT
127 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA--TCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
8958482 ATGACTATTTGCACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
189 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
*** * * *
8958547 TTCCAGTTCATGCAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
254 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* ** * * * * * *
8958611 TAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTGCTAAATC-
317 TAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAA-CA
* ** * * * * * *
8958650 AGTTCAAATAATTAT-GGTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGG
1 AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTTG
* * * *
8958714 TCATATAACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCTTATTTGGAAGAAAATAATACTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTA--ATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * ** * **
8958777 TCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCTGTTCAAATAG
125 T-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAATAG
* * ** * * * * *
8958842 TTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTT-AAATTATTATAACCTTTTGTTATGTCTTAAAATAA
187 TTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * *
8958906 TTATTTCTATTCATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAAT
251 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * * *
8958970 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAATCA
314 TAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACC-AAACA
* * * * * *
8959013 A-TTCAAATTGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTAATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTCTT
1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACTATTATCT-ATTTCAAATCGTTGT-AACTTTTGTTTT
* * * * * *
8959075 ATCATAAAACAATT-TTCTTAATTCATACTAGCTTA-TTCGGAATAAAATAA-AATGAA-TTAGT
63 GTCATAAAACAATTGTT-TCAATTAATACAAG-TTATTTC--AATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * * * *
8959136 AATATTTCAAAAATTAATATGTAAGA-GATTAAAAAA--AATTCTATTTACCTAACTAGTTTAAA
123 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAA-TC--TTTGCCAAACAAGTTCAAA
* * * * * *
8959198 TAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT----TCG--A--CCTTTTTTTTTTGTCATAAAAT
184 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * * **
8959255 AAATGTTTTTCTCCATAGAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAAAATTTTGAAAA
249 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * ** *
8959320 -T--TAA-TAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACC
313 TTAATAACTAAAAGA-TTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * * *
8959360 AGTTCAAATAATTATGAA-TATAT-AAGCGATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTCTTTGTTCT
1 AGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAA-CTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACT-TTTGTTTT
* * * * * *
8959423 CTTATAAAATAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAA
63 GTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTTCA-A-TAAAATAATACTAATTTATTAA
** * ** * * * * *
8959487 TATTTTGATAATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAA-ATCAAATA
125 TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-GA-ATCTTTGCCAAAC-AAGTTCAAATA
* * * * * * *
8959551 GTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
186 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* *** ** * ** **
8959615 TTATTTCAATTCATGTAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACTTAATACTATGTTATTGGTATTAT
251 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATA--T--TA--AT-TTATTAATATT-T
* * * * * *
8959680 -GAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTATTTACCAAACA
307 CAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * ** ** * *
8959728 AGTTTAAATAATTATGACTATTT-AAATAATTAT-TGATTTGGAATCACTATAACCTTTTGGTTT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCT-ATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTT
** * * *** * *
8959791 GTCATAAGATGATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTA
63 GTCATAA-AACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTA-TTTCAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* **
8959855 ATATT-AAGACAATTAATAAGT-AAAGGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAA
124 ATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGG-TTTAAAAAATGAATC--TTTGCCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *
8959918 TCGTTATAATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTC-TTATGGCTTTTTTGTTTTATCATAAA
184 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCGTTATGAC-ATTTTGTTTTGTCATAAA
* * ** * * * *
8959982 ACAATTGTTTTTATCCATATGAGCTTATTCAGATTAACATAATATTAATTTATTAATATTTCAAC
247 ACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
* ** ***
8960047 AATTAATAAGTAAAAGATTT-TTAA--AAA-ATGTTTATTGAACA
311 AATTAATAACTAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
8960088 AATTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAAC-TTTTGTTTTG
* * ** *
8960152 TAATAAAACAATTGTTTCAATTCATGTAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTA
64 TCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG-TTATTT-CAATAAAATAATACTAATTTATTA--A
* ** * * **
8960217 TTATTCCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAACTAAAAAAATAAATCTGTTTAG-TGAACAAGTTCAA
125 -TATT-CAAAAATTAATA-AGTAAAAG-GTTTAAAAAATGAATC--TTT-GCCAAACAAGTTCAA
* * * * * * * *
8960280 ATAGTTATAACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTTATGACCTTTTGTTTTCTTATAAA
183 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
8960345 ACAATTGGTTTTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAGATTTATTAATGTTCCAA
247 ACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATTA-ATTTATTAATATTTCAA
** * * * **** *
8960409 AAATTAAT-ACGTAAAA-ATTTAAAAAAGAAGTTTATTTTTTGAACC
310 AAATTAATAAC-TAAAAGATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
* * * ** *
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1 AGTTC-AAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTGTAA-CTTTTGTTTT
*
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63 GTCATAAAACAATTGTT
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Consensus pattern (355 bp):
AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTGTAACTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTATTTCAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA
AAAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
TCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAA
GATTTAAAAACTAAATATGTTTACCAAACA
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * *
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** * * * *
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130 TTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTG
* * * * * *
8939552 TCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** * *
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* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
8939799 TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACA
131 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTT
* * * *
8939913 GTCATAAAACAATT-TTTTCCATTAATACAAG-TGTATTT-CAATTAAAATAATACAAATTTATT
64 GTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCT-TATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
8939975 AATA-TTCAAATAATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-AA-AT-CTTACCAAATA
126 AATATTTCAAA-AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * *
8940028 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
* * * *
8940093 CATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
8940157 TTCAACAGTTAATAACTAAAAGATTTCAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
131 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* ** * * * **
8940208 AGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGTCACATTTTATTTCAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
* ** * * *** *
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66 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
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131 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * *
8940388 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCCTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
* * * *
8940453 CATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TT-GAATAAATTAACA-TAAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
*
8940515 TTTCAAAAATTAATAAGC-AA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT
130 TTTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
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Statistics
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Consensus pattern (181 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
Found at i:8940800 original size:180 final size:181
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 6.5 Consensus size: 181
8940556 TTTCTGAGTA
* ** * * *
8940566 TTCAAATAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTC
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* ** *
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* *** * * * * *
8940696 TTTGTTTATTGAGCAAGTTCAATTACTTATGACTATTT-AACAAATATTTAT
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* * * * * *
8940747 TTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAACTGTTTCTGTTCATACAAGTTTCTTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
8940812 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATGAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
8940876 TTGTTTACCAAACAAGTTGAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCAAT
131 CTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * ** *
8940927 TTCAAATCGTTATGACCTTCTATTTTGTTACAAAATAATTGTTTTTGTTTATGCAAAATTATT-T
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * ** * *
8940991 AGGATTAAATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--A-A-A-CTAAAAAACTAG
66 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAA
* * *
8941051 ATCTGTTTACTAAA-ACAGTTCCAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT
129 ATCTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
8941104 CTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATAAAAGCTTATT-T
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCG
* *
8941167 AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
66 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
8941231 ATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAATTAAGACAATTAGAACAATTATCTAT
129 ATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
8941284 TTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATAGAAGATTATTC
1 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC
* ** * *
8941348 AAAATAAAATAATACTTCTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * *
8941413 ACTATTTTTCAAACCAGTTTAAGTAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAAT
130 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
8941465 CTT-AAATCA-TTATGATC-TTTCTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATCCAAGCTTATT
1 -TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT
* * * *
8941527 TG-GATAAAAATAATACTAATGTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
64 CGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
8941587 AATGTGCTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACCATTAGAATAATTAACTAT
128 AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * ** *
8941641 TTCAAATTGTTTTGA-C-TTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCG
* * *
8941704 GAATAAAATAATACTACTTTATTAACATTT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
8941734 TTTTATTTCA
Statistics
Matches: 778, Mismatches: 188, Indels: 48
0.77 0.19 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 65 0.08
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AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
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* * * ** * *
8941776 ACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTATT
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* * *
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65 TTGTTAATATAGCTTT-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAG
* * *
8942087 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTACTTGCCAAACCATTTCAAATAATTTTA
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* * *
8942138 ACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAACTTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATAAAACAA-TTGTT
* * * ** *
8942203 CTGTTCATACTA--TTTTATTCGAAATTAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTCGTAACTTAAT
65 TTGTTAATA-TAGCTTTT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTT-AAAAATTAAT
** * * * *
8942265 AACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAA
125 AAGTAAG-AGATTTAAAAATAAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAATTATA
* * * * * * * * *
8942319 ACCATATGAACAACTATCTATTTGAAATCATTATGACCTATTCTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
*** * * *
8942384 TGTCCGGTCA-AGCTTATTATG-ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA
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* ** ** * ** * **
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127 GTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAATTATA
* * * ** * * *
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1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * ** * * * *
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* * * * * *
8942626 AAGAAAGAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATT
125 AAGTAAGAGATTT-A-AAAATAAATCTAATTGCCAAACCAA-TTCAAATAATTATA
* * * * ** * * * *
8942681 ACCAATTGAGA-AATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTAATTTGTCATTAAATAATTGTT
1 ACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
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TGTTAATATAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAA
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* *
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* ** * * * *
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** * *
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* * * * * ** * *
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* * *
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66 TAAAACAATTGTTTCAATCCATACAAGCTTAATTAGAATAAAATAATAATAATTTAATAACATTC
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TTCAAATAGTTAAAACCATTAGAACAACTATCTATTTGAAATCATTTGGACATATTCTTTAGTCA
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AAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAACAAAATAAATTTCTTTATCGAATTAG
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * ** *
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* * * * * * *
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*
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* * * ** *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * ** *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* *
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** * *
8943620 ATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACAAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAAT
126 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* * * * * * ** ** * * * * *
8943676 AATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGCTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAAC
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * * * * **
8943741 AATTATCTAATTCAAATTGTTATTATCTATTATTTGGTAATATAACAATTGTTT-TTAATTGTAC
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCATAC
* * ** * *
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130 AAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAAT
* * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAA
* * * * * ** * * *
8943921 TAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTAGTATCATAAAACAATTATTTC-TGTTCATA
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCATA
* * * *
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129 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT
* * * * * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
8944103 AATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTATCGTAAAATAGTAT-TTTCACT-TTATA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCA-TATCATA
* * * * *
8944159 CTAA-CTTTTTC-AGA-ACAA-AATA--AA---A-TGA-A---AGAAATTAAT
129 C-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAAT
* * * * *
8944198 ATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** * * * * * *
8944262 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTCTGTTTTGTAATAAAATAAATGTTT-TTGTTCATA
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCATA
* * * *
8944326 TAAGTTTTTTTTC-AAAT-AAATAGATACTAATCTATTAATATTTC-AAAATTAAT
129 CAAG--CTTATTCGAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
** * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-
* * * * *
8944439 A-AATTATTTATTTCAAA-CTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTT-ATAATTA
64 ATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCA
* * * * *
8944501 TACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAACAATTAAT
127 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * * * *
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1 AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * *
8944620 TAAATGTCTATTTTAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTTCAATTATTAT
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-A-TATCAT
* * **
8944684 A-AA-ATTATTCGAAATAAAATAATATTAGGTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
128 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT
* * * * *
8944736 AATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-TCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTT-AG
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-
* * * * * ** ** *
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64 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCAT
*
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128 ACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAA-A-AATTAAT
* * * * ** * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
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66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCATAC
* * * * *
8945043 AAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTACAAA-TAAT
130 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-AAAAATTAAT
* * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * ** *
8945158 AATTATCTATTTCAAATCATTGTGACC-----TTTTGTAATAAAA-AATTACTTTTGT-TCATAT
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* *
8945216 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
130 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT
* * * * * * *
8945268 GAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAA-AATATTTAAATAGTAAT-ACTATTTGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
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* * *
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* * * ** ** *
8945447 AAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATTTTCAAATAGTTATTACTATTTGAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
8945511 AATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTT-TTGTTCATAA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-ATCATAC
* * *
8945575 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAAT
130 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT
* * * * *
8945627 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCGAGTTCAATTAGTTATGACTATTTGAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * *
8945692 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATAC
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** * *
8945756 AATTTTATACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
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** * ** * *
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* * * * *
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* ** * * **
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* * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * * * *
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* * * * *
8946110 ACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAC-CATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT
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* * * * * *
8946163 AAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTA--AGTATTAGAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
8946226 AATTATATATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGT-TCATAC
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* * *
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* * ** * *
8946342 GAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCCAAAAAGTTCAAA-AGGATT-TGACTTTTTG
1 AAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA-G-TTATGACTATTTG
* * * * * *
8946405 AACAATCATTCTAACTATTTAAAGTCGTTATGAGCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAG
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* * * * *
8946470 T-TTATAAAATCTT-TTCTGAAATAAAATACTACTACTTT-TTAATATTTCAAAAATTAAT
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* * * * * * * * *
8946528 AAGCAAAAAATTTAAAAACTAAATATGTTT-TTCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * * * * * *
8946592 CAAATATGAATCTT-AAATCATTATGA--TATTTGTTTTCTCATAAAATAATTCCTTTC-GACCA
65 TAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCATATCA
* * * *
8946653 TCCAAGCTTATTTG-GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
127 TACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* ** * * * * *
8946708 -AG---GAGATTTAAAAAATAAATATGTTGGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGATT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
8946769 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTT-TTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGT-TCATA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TATCATA
* * *
8946832 CAAACTTATTCTAAATAAAA-AATATTAATTTATTAA
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8946868 CATTTATTTA
Statistics
Matches: 3082, Mismatches: 608, Indels: 425
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Matches are distributed among these distances:
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** * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * **
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* * * * * * * ** * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * ** * *
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* * *
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* * * **
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* ** * * * *
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* ** * ** * *
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** * ** * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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** * * * * * * * *
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* * ** ** *
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* * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * **
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*
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * **
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* * * * * *
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* * **
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ATA
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** ** * *
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** * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * ***
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* * * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
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**
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *** * * * * *
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* * * ** * * ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *** * *
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** ** * * * * *
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*
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* * ** * *
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* ** * * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* ** **
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** ** * *** * * * * * *
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* * * * ** * * **
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** * * * * ** * ** *
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195 TTTCAAAAATTAATAAG
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Statistics
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TTTTCATACAAACTTATTTAAATAAAATAATA
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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** * * * * **
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* * * * *
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* *** * * * * * * * * * *
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* * * ** * ** * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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315 CAA-ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * ** * ** * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * * * *
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* * ***
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* * * * * *
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* ** * * * ** ** * * * *
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1 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
* * * ***
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** * *
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* * * * * * * ** *
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192 -AAAAATGAATCTGTTTACCAAGCAAGT-TCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTAACTATTT
* ** * * * * * * * * * *
8950108 CAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTCTATTTATACAAACTTATT-TAG
255 CAAAATACTATAACCTTTTGTTTTATCAT-AAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTCCA-
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317 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-A-----A-
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** * * *** *
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* * * * *
8950529 AGCTTATTTAAAATAAAATAATA-TAAGTTATTAATATTTCAAAAATTTATAATTAAAAGAATTA
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* * * * * *
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* * **
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*
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* *
8951320 ATGTTT-TCTAAATACATTCAAATA-GTTATGACAATTTAAAGGATTA-TCTATTTCAAATCATT
381 ATGTTTATC-AAATAAATTCAAATATGTTATGACAATTTAAAGAATTATTC-ATTTCAAATCATT
* *
8951382 ATGACCTTTTTTTTTTTTTGCCATAAATCAATTGCTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAA
444 ACGA-C---TTTTTGTTTTGCCATAAA--AATT--TT-TATTCATACAAA-CTTATTCAAAATAA
* * *
8951446 AATATTATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTATTA
499 AATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAAATAATA
* * ** * * * * *
8951482 AGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAGCGAGTTTAAATAGTTATGGCTATTTGAATA
1 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
* * * * *
8951547 TTTATTTATTTCAAATCATTATAATCTTTTATTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATTTA
66 ATTATCTATTTC-AATCATTATAA-CTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATA
**
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128 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
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ATTATCTATTTCAATCATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGC
TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAA
ATGAATCTGTTTACCAAGCAAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTAACTATTTCAAAAT
ACTATAACCTTTTGTTTTATCATAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATA
ATATAAATTTATTAATATTAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCA
AATAAATTCAAATATGTTATGACAATTTAAAGAATTATTCATTTCAAATCATTACGACTTTTTGT
TTTGCCATAAAAATTTTTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAAT
TTCAAAAAATAATA
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8952465 CATGCATGCC
* *
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* * *
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* * * *
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**
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* * * * *
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*** * *
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* * * * * * *
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66 AATCTATTTACCAAACCAATTCACATAA------CTATATGAACAATTATCTACTTT-AAATCGT
* * * *** *
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* ** * * * *
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1 TATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TT-ATAA-TAAGTGATTT-AAAA
* * * * * * * * ** *
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* * * * * ** * **
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* * * * * * *
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1 TATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAATT-ATAA-TAAGTGATTTAAA-A
* * * * * * *
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62 AATAAATCTATTTACCAAACCAATTC--ACA--T--AACTATATGAACAATTATCTACTTTAAAT
* * * * * * * *
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* * * *
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62 AATAA
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AATCTATTTACCAAACCAATTCACATAACTATATGAACAATTATCTACTTTAAATCGTTATGAAC
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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124 TATATTTACTGAAC-AGTTCAA-TAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** ***
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* * * * * *
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63 AGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTC-CAAAAATTAATAA-ATA-AAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
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* ** * * * * ** * *
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* * * * * * ** *
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* * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATAT
** * * * **
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* * * * * **
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* * * * * * * * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAATTTAAAAAATAAATATAT
** * * * * * * * *
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* ** * * * * **
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCTATTCATAT-AAGCTTA-TTT
* * * * * * *
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* * ** * ** *
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** * * * * * * ** *
8953127 AAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAATTTATTTGAAA
1 AAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG
* * * * * *
8953192 TAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAGAAA-AAAT-T
65 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAA-AAATAAATAT
* * ** * ** * *
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127 ATTTACTGAAC-AGTTC-AATAGTTATGACTAT-TGAACAATTATCTATTTC
** * * * ** *
8953307 AAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAGGTATTG-TTGAATTCATACT-AGCTTTTTT
1 AAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACA---ATTGTTTCTATTCATA-TAAGCTTATTT
* * * ** *
8953370 GGAA-TTAAATAAAATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
61 -GAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
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123 ATATATTTA-CTGAAC-AGTTCAA-TAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * ** *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG
* * * * * * * * *
8953555 TAAAGTAGTACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-GAGATTTAAAAAATAATTTTATT
65 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAATTTAAAAAATAAATATATT
* * * * *
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130 TACT-GAAC-AGTTC-AATAGTTATGACTATTGAA-CAATTATCTATTTC
* * * * * * * * ** *
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1 AAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAGT
* * * * * * *
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66 AAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAA-TTTAAAAAATAAATATATT
* * * * *
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130 TACTGAAC-AGT-TC-AATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTC
* * **
8953845 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAAA
1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
8953974 GTTTATTGAACAAATTTAAATAATTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTG
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* * * * * ** *
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1 AAATCA-TTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAA
* ** * * *
8954090 ATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-AAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAAT
64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAAT-AAA-ATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
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* * * * * ** *
8954207 AAAT-AGGTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTCTTTTTATTCATCCAAGCTTATTTCAA
1 AAATCA-TTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAA
* ** * *
8954271 ATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-AAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAAT-AAA-ATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
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* ** ** * * *
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1 AAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG
* *** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *** **
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65 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A--AATAAAATTTAAAAAATAAATAT
* * * *
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* * * * **
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1 AAATCATTATGACCTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTT-GAA
* *
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64 GTAAAATAATATT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAA-TTT-AAAAAATAAATA
* *
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* *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAA-ATTTAAAAAATAAATAT
* * * * *
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** * ** * * ** ** *
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* * *** * * * *
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* *
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127 ATTTACTG-AACAGTTC-AATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * *
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1 AAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGA-
* * * ** * *
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63 AGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATA
* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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125 ATATTTACTGAA-CAGTTC-AATAGTTATGACT-A-TTGAACAATTATCTATTTC
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* * * * * * * * *
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** * * * * *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATATAAGCTTATT--T
* * * * *
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* * * * * * **
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1 AAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTT-ATTTGAA
* ** * **
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATAT
** * ** * * * *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-TAAGCTTATTTGAA
* ** * *** * * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA--A-TAAAATT-TAAAAAATAAAT
* * * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG
* * * * * **
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* * * * * *
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127 ATTTACT-GAA-CAGTTC-AATAGTTATGA-CTATTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * ****
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* * * * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAAT-A-AAATTTAAAAAATAAATA
* ** ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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** * * * * *
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1 AAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG-
* * * * *
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* * * ** *
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1 AAATCATT-ATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATATAAGCTTATTT-G
** * * * ***
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* * * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * * * * * *
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65 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATATA
* * * * *
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* * * *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-T-ATTCATA-TAAGCTTATT-T
* * * * ** *
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* * * *
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1 AAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTT-GAAG
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* * * * * * *
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1 AAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGA-A
* * *** * * *
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64 GTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAAA-TTTAAAAAATAAATAT
* ** ** * * * *
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1 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG
** *** * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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1 AAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAG
* * * *
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65 TAAAATAATATTAATTTATTA--A-TATTCCAAAAATTAATA-AAT-A-A-AATTTAAAAAATAA
* * * * *
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* * ** * * *
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63 AGTAAAATAATATTA-ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAAATTTAAAAAATAAATA
** * * * *
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* * * * *
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8960542 AAAAAACTTA
Statistics
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AAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAAATTTAAAAAATAAATATATTT
ACTGAACAGTTCAATAGTTATGACTATTGAACAATTATCTATTTC
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Indices: 8951882--8960533 Score: 4423
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* * *
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* ** * * * * * **
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* * * *
8952484 AAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAACATCT-ATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATCT
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* * * * * *
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125 ATTTACTGAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAC
* * * * * ** ** **
8952601 CTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTTGTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
190 CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
* * *
8952666 TTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGTA-
253 TTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAC
* ** * * *
8952729 ATTCAAGCAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTACTTT-AAATCGTTATGAGCTTTTGTTTTGT
314 GTTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * *
8952793 CATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACAAG-TTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATA
377 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTT-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA
* * * * * * * *
8952857 TTTC-AAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCAAATCAA-TTTAAATAAT
441 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAAT
* * * * *
8952917 TGTG-GCCATATCAATAATTATCTATTTC
505 TATGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
* ** * * * * * *
8952945 AAATCATTATTACCTTTTGTTTCATCATATAAGAATTGCATTTGA-ACATTCAAGCTTAGTCAGA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGA
* * * * * *
8953009 ATAAAATAATACTAATCTATTAATCTTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATTAATT
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA---ATTAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * ** *
8953074 TGTTTAC-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAAT-TGTTAT
124 TATTTACTGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCT-TTAT
* * * ** * *
8953137 AACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAATTTATTTGAAATAAAATAACA
187 GAC-CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA
* * * * *
8953202 CTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAGAAA-AAAT-TGTTTGCCAAA
249 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCAAA
* * * * ** *
8953265 CTA-GTTCAAATATTTAAAACAATATGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTT
311 C-ACGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * *
8953329 TATCATAAAATAGGTATTG-TTGAATTCATACTAGCTTTTTTGGAATTAAATAA-AATGAATTTA
374 TGTCATAAAACA---ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACT-AATTTA
* ** * * * *
8953392 TTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATCTAACTAGTTCAA
435 TTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAA
* * * * *
8953457 GTAATTGTG-ACTATTTGAATAATTATATATTTT
500 ATAATTATGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * ** * * *
8953490 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAA
* * * * * *
8953555 TAAAGTAGTACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTA
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * *
8953620 -TAAAACTAGTTCAAATAGTTATGAATATTT-AAGCAATTATTTATTTAAAATCATTATGACTTT
130 CTGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTT
* * ** * *
8953683 TTTTTATTATAAAACAATAGTTTATGTTCATACATGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTA
193 TTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * *
8953748 TTAATATTTCGATAATTAATAACTAAAACTTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACTA--TATCA
257 ATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-ACGT-TCA
* * * * * *
8953811 AATAATCATGACTACTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAA
319 AATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * ** *
8953876 AGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATAA-TCCAA
383 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCCAA
* * * * * **
8953940 AAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACAAATTTAAATAATTATAAT-
447 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTATGTTC
* * *
8954004 TGTTTGAACAATTATCTATTTG
512 TATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * *
8954026 AAAT-AGGTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTTTATTCATCCAAGCTTATTTCA-
1 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTATTCATGCAAGCTTA-TTCAG
* * *
8954089 AATAAAATAATACAAATTTATTAATA--TAAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAA
63 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * ***
8954152 TCTGTTTATTGAACA-AATTTAAAAAATTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTA
122 TCTATTTACTGAA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTA
* * * * *
8954216 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTCTTTTTATTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT
186 TGACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT
* * * * *
8954281 ACAAATTTATTAATA--TAAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA
248 ACTAATTTAATAATATTTCAA-A-AATTAATAAAT-AAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * * * * * * * * ** **
8954344 AATAAGCTCAAATCGTTATGTCAATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGATTTTTTGTT
309 AACACGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
8954409 TTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATATAAG-TTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTA-
373 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTT-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
*** * * *
8954471 TAAATATTTTGAAAACTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTTA
436 TAAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTTA
* * ** *
8954534 AATAGTCAT-AACTATTTGAATAATTATCTATTTT
499 AATAATTATGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * ** *
8954568 AAATCATTATGACCTTTT-TTGTTGTAATAAAACACTTGTTTCAATTCATATAAGCTTATT-TGA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTATTCAGA
* ** * * ** *
8954631 AGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGCAAGGGAATTAAAAAA-GGATA
64 A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
8954695 TGTTTACCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGA
124 TATTTACTGAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGA
** ** * * * *
8954760 CCTTTGTCTTT-TCATAAAACAATTGGTCCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAACATAAT-TT
189 CCTTT-T-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT
* * * * **
8954823 AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAATTTTAAAAAAATAAATATATTTTCTGAACA
251 -AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* *
8954888 CGTTC-AATAGTTATGACTAGTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
313 CGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
8954952 CAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTTTTTGAAATAAAACAATAGTAATTTATTAAA
377 CATAAAAC-AATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * * *
8955015 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGT
440 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
* *
8955080 CATGTTC-ATTTGAACT-ATTATTTATTTC
505 TATGTTCTATTTGAA-TAATTATCTATTTC
** * ** * * **
8955108 AAATTGTAATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTGTTTCTATTTATGCAAAATTATTCAGA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTATTCAGA
* * *
8955173 ATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAATAAGAGATTT-AAAAATGAAATCTATT
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATT
* *
8955237 TACTGAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCTTTATGATCTT
128 TACTGAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTT
* * * *
8955302 TATTTGTCAAAAAATAATTTTTTTTGTTTTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATACTAATT
193 TTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT
* ** * * * *
8955367 TAATAATATTCCAAAAATTGGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAAC-CAGTT
255 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAC-GTT
* * * * * * * *
8955431 CAAATTGTTAAGACTACTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTTTAACCTTATGTTTAGTCGTA
317 CAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
8955496 AAACAATTATTTTAGTTCATACAAGC-GTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-C
381 AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTTTTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCC
** * * * *
8955559 AAAATATTAATGCGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTGAAATAGATT-
445 AAAA-ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATA-ATTA
* * * *
8955623 TG-ACTATTTGCATAATTATATGTTT-
507 TGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * ** ** * *
8955648 ATAGTCATTATGACCTTTTGTTTTATCTTAAGTCAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTA-TCTGA
1 A-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATGCAAGCTTATTCAG-
* * * * *
8955712 AATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGT
63 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAA-T
* * * * * * * * *
8955777 -TATTT-TTTAAATCACTTCAAATAGGTATGGCTATTTGAACAAATAGT-AATCTCAAATCCTTA
123 CTATTTACTGAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCTTTA
* ** * * * *
8955839 TGATCTTTGTTTCCTCATAAAACAATTATTTTTT-ATCATATC-AGTTTATTTAGATAAAAATAA
186 TGACCTTT-TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAT-AAAATAA
* * * * *
8955902 TACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-AA-GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAAC
247 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * *
8955965 -CGGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTA
312 AC-GTTCAAATAGTTAAGACTATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
8956029 GTCATATAATAATTATTTCAATTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGAC
375 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * * * * *
8956094 ATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAG
440 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAA
* * * *
8956159 TTATG-GCTATTTCAACAATTATCTATTTA
504 TTATGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * ** * *
8956188 AAATCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATGCAAGCTTATTCAGAA
* * * * *
8956253 TAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAGATTAATAAGCAAGAGATATAAAAAAATAAATCA
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGAT-TTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * *
8956318 ATTTAC-CAAATCAGTTCAAATAATCATGA-TCATTTAAATAACTATCTATTTTAAATCATTATT
125 ATTTACTGAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATG
** * *** * *
8956381 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATGATTGTTTTTCAACATACAAGGTTTTTCAAAATAAAATAATAC
188 ACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAC
* * * ** * * *
8956445 TAATTTATTACTATTTC-AAGA--AA-AAAGGAAATCT-----GT---T-TGTTGAACC--A-A-
250 TAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCAAACAC
* * * * * ** * * *
8956493 -TTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTATC
314 GTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
8956556 ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAATAATTTAGTAATATT
378 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
* * * * * * * * * *
8956621 CTAAAAATTAATAACTATG-GATTAAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTAGTTCAAACAGTTAA
443 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTAT
* * *
8956685 GAT-TATATGAATAATTATTTATTTC
508 GTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * * *
8956710 AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTT-GTACAAGTTTATTCATA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA--TTCATGCAAGCTTATTCAGA
* * * * * * * *
8956774 ATAGAAA-AAAATTAAATTATTAATATTTCAAAAATTTATAAATAAAATATTTAGAAAATAATTC
64 ATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA--T-T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
8956838 TATTTAC-GAAACTAGTTCAAATAATTATAATTATTTGCACAATTATCTATTTCAAATCATTATT
124 TATTTACTGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATG
* * * * * *
8956902 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTTAATATAAG-TTGGTTCAAAATAAAATAATA
188 AC-CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTC-AAATAAAATAATA
* * * * ** * * *
8956966 TTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAGGTAAATATGCTTGCCAAAC
249 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* ** * * * * *
8957031 -CATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTACCTA-TTCAAATTATTATAACCTTTTATTTT
312 AC-GTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
8957094 GTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTTATACTA--TTTTATTCGAAATAAAATAATACAAATTTAAT
375 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTTT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATT
* *** * ** * * * * * ** * * *
8957156 AATATTTTGAAACTTAATAACCAGGAAAATTAAAAAAAAAAAATCTACTT-GCTAAACCAA-TTC
437 AAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTT
* * * * * * *
8957219 AAATAGTTAAG-ACTATATAAATGATTATCTATTTT
498 AAATAATTATGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * * ** * * *
8957254 AAATTGTTATGATCTTTTCTTTTGTCACAAAAC-ATTATTTTGTTTGTACAACCTTATTCAGATT
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAAT
* * * * *
8957318 AAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTCAAAAACTAAAAAGCAAGATATTTAAAAAATAAATTTG
66 AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * * * * *
8957382 TTTACTG-AATCATTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAACCGTTCTAAC
126 TTTACTGAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAC
* * ***
8957446 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGC---TT-AAAT----TAATACTAA
190 CTTTT-TTT-GTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * * * * *
8957503 TTTATTAACATTCCAAAAATTAATAGGAA-AGAGACTGAAAAAATAAAGCTATTTATCGAATAAG
253 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATA--AATA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACACG
** * * * * * * ** *
8957567 TTCAAATAGTTATTATTTTTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTAATTTGTTA
315 TTCAAATAGTTAAGA-CTATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ***** * * *
8957632 TAAAATAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGACAAAATAAAATAACATTAATTTATTAATATTT
379 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATT
* * * * * **
8957697 TC-TAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-AGTAAAAATAATTA
443 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAATTA
*
8957760 TG-GCTATTTGAATAATTATCTATTTC
507 TGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * **
8957786 AAATCATTATGACATTCTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTATCATATAAGCTTATTC-GAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TCATGCAAGCTTATTCAG-A
* * * * * *
8957850 ATAAAATAATACTAGTTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTACAAACTTAAACAATAAATCT
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * **
8957915 ATTTA-TCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCAATCTT-AAATCATTAAA
125 ATTTACT-GAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCTTTATG
* * * ** * ****
8957978 ATCTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATAGAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACT
188 A-CCTTTTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACT
* * * *
8958043 AATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACT
251 AATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAATAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-
* * * * *
8958107 A-GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCA-GACTTTTTGTTTA
312 ACGTTCAAATAGTTAAGACTATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
8958170 GTCATAAAATATTTGTTT-AATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CCAAATTATGAA
375 GTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *** * * * * * *
8958233 CATTTGGAAAATTAATAAGCAAAACATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAACGAACAAGTTCAAATA
439 AATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATA
* * * * * * *
8958298 GTTATG-ACTATATGAACAATTATTTATGTA
503 ATTATGTTCTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * ** * *
8958328 AAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATGCAAGCTTATTCAGAA
* * * * *
8958393 TAAAATAATACTATTTTCTTAATATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTTAAAAAATAAATTTG
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA--TTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
8958458 TTTA-TAAAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGCACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGAC
126 TTTACT-GAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAC
* *** * *
8958522 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCCAGTTCATGCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTA
190 C-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * *
8958587 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTGCTAAATCA-
252 ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAA--AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAC
* * * * * *
8958651 GTTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGT
314 GTTCAAATAGTTAAGACT-A-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * **
8958715 CATATAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTTGGAAGAAAATAATACTAATTTATTAATC
377 CATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA
** * * ** * *
8958779 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCTGTTCAAATAGTT
441 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATT
* * * *
8958844 ATG-ACTATTTGAACAATTGTATACTTT-
506 ATGTTCTATTTGAATAATTATCTA-TTTC
* * * * * * * *
8958871 AAATTATTATAACCTTTTGTTATGTCTTAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATAC-GAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTATTCAG-A
* * * *
8958935 ATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
8959000 GTTTGCCG-AATCAATTCAAATTGTTAAGACTATATGAACAATTATCTAATTT-AAATCGTTATG
125 ATTTACTGAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCTTTATG
* * ** * * *
8959063 ACCTTTTGTCTTATCATAAAACAATTTTCTTAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AA
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* ** * * *
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** * ** * *
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1 TAAGCCCAGATTAGCTAGCACA
* *
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1 TAAGCCCAGATTAGCTAGCACA
* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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TAAGCCCAGATTAGCTGGCACATAAGCCCAGTTTAGCTAGCACA
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* * * * *
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64 TAG
* * **
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66 G
* * * * *
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66 G
* * * * *
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G
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*
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* * * *
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*
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AATG
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* *
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* *
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* ** * * *
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* * *
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*
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* * *
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* *
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* * *
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* * *
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* * **
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* *
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TGATGAAAATTTTAAGCCCTATTTATCTAGACTA
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* * * * * * *
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*
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* ** * * * *
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*
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* * * * * * * * * *
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*
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*
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* * *
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**
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CTA
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8970422 TATCTAGTCT
* * * * * *
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* *
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63 ACCC
* * **
8970500 ATGATGAAAATTTTAAGCCTAGTTTACCTGGCATTTGATGAAAATTTAAGCCCAATTTATATGAC
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65 CC
* * **
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C
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*
8971060 ATTTGCATTTGCATC
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1 ATTTGCATTTACATC
8971090 A
1 A
8971091 CAAAAAAAGG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
15 15 1.00
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8971028 AAGACATTCA
* * * *
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*
8971080 CATTTACATCACAAAAAAAGGACATTTGCATTTGCATCACTTG
1 TATTTACATCA-AAAAAAA-GACATTTGCATTTGCATCACTTG
* * * *
8971123 AATCTGCATCATAAGAAAAAGACATTTCCATTTGCATCACTTATTG
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* *
8971169 TA-TTACAT---GAAAAAGACATTTGCATTTGCATTA-TTCG
1 TATTTACATCAAAAAAAAGACATTTGCATTTGCATCACTT-G
*
8971206 TATCTGTATCAT-AAAAAAAAGAACATTTGCATTTGCATCGCTTG
1 TAT-T-TA-CATCAAAAAAAAG-ACATTTGCATTTGCATCACTTG
* **
8971250 TATCTGTATCAAGAAAAAAGACATTTGCATTTGCATCA
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8971288 TGAAAAAGAT
Statistics
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0.75 0.11 0.14
Matches are distributed among these distances:
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37 3 0.02
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41 5 0.03
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8971050 AAAAAAAAAT
* *
8971060 ATTTGCATTTGCATCATTTGCAT-T-TA-CATCACAAAAAAAGGACATTTGCATTTGCATCACTT
1 ATTTGCATTTGCATCATTCGCATCTGTATCAT-A-AAAAAAAGAACATTTGCATTTGCATCACTT
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* * * *
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1 ATTTGCATTTGCATCATTCGCATCTGTATCATAAAAAAAAGAACATTTGCATTTGCATCACTTGA
* *
8971251 ATCTGTATCAAGAAAAAAGACATTTGCATTTGCATCA
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8971288 TGAAAAAGAT
Statistics
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8971040 TTTACAACAT
* * * * * **
8971050 AAAAAAA-AATATTTGCATTTGCATCATTTGCATTTACATCACA-AAAAAAGGACATTTGCATTT
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64 GCATCACTTGAATCTGCATCATA
* *
8971136 AGAAAAAG-ACATTTCCATTTGCATCAC-T-TAT-TGTATTACATG-AAAAAGACATTTGCATTT
1 AAAAAAAGAACATTTCCATTTGCATCACTTGTATCTGTA-T-CAAGAAAAAAGACATTTGCATTT
* * *
8971196 GCATTA-TTCGTATCTGTATCATA
64 GCATCACTT-GAATCTGCATCATA
* *
8971219 AAAAAAAGAACATTTGCATTTGCATCGCTTGTATCTGTATCAAGAAAAAAGACATTTGCATTTGC
1 AAAAAAAGAACATTTCCATTTGCATCACTTGTATCTGTATCAAGAAAAAAGACATTTGCATTTGC
8971284 ATCA
66 ATCA
8971288 TGAAAAAGAT
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 16, Indels: 20
0.78 0.10 0.12
Matches are distributed among these distances:
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ATCACTTGAATCTGCATCATA
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8971936 AAAACATTTA
* *
8971946 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTTTGATTAGAGGAGCATTCAAATATTTTAAGATTTGTAAGACC
1 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACC
8972011 TTTAGGCATAATCTCTAAGACCTTCGAACAAAATTTTT
66 TTTAGGCATAATCTCTAAGACCTTCGAA-AAAATTTTT
* ** * * * *
8972049 AAAATTTTTAAAGTTTCAAGGTTTTTAATT-GAATGAGCATTCAAAGATTTGAAGATTTGTAAGA
1 -AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAG-AGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGA
* * *
8972113 CCTTTGGGCATAATCTCTAAGACCTTCGAGTTAAACTTTTT
64 CCTTTAGGCATAATCTCTAAGACCTTCGA--AAAAATTTTT
* ** * * *
8972154 AAATTTTTAAATTTTCATGGATTCTGATTGGAAGAGCATTCAAAGGTTTTAAGATTTGTAAGACC
1 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACC
** * * ***
8972219 TCCAAGCATAATCTCTAAGACTTTCG-GGTAA-----
66 TTTAGGCATAATCTCTAAGACCTTCGAAAAAATTTTT
* * *
8972250 AACTTTTTAAATTTTCATGGCCTCTAATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACC
1 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACC
* * * *
8972315 TTTGGGCATAATCTCTAAGACCACTAGCAAAACA-TTTT
66 TTTAGGCATAATCTCTAAGACC-TTCG-AAAAAATTTTT
*
8972353 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGTATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGA-C
1 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACC
* *
8972417 -TTATGAGCATAATCTCTAAGACCTTTAGGAAAAACTTTTT
66 TTTA-G-GCATAATCTCTAAGACC-TT-CGAAAAAATTTTT
* ** * *
8972457 AAATTTTTAAAATTTCATAACCTCTGATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGAAC
1 AAATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACC
* *
8972522 TAT-GCGCATAATTTCTAAGACCTT
66 TTTAG-GCATAATCTCTAAGACCTT
8972546 TGAGCATAAT
Statistics
Matches: 416, Mismatches: 63, Indels: 35
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
96 75 0.18
97 2 0.00
99 1 0.00
101 3 0.01
102 2 0.00
103 84 0.20
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106 1 0.00
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Consensus pattern (102 bp):
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TTTAGGCATAATCTCTAAGACCTTCGAAAAAATTTTT
Found at i:8972324 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 8972157--8972542 Score: 364
Period size: 96 Copynumber: 3.9 Consensus size: 96
8972147 ACTTTTTAAA
** * * * **
8972157 TTTTTAAATTTTCATGGATTCTGATTGGAAGAGCATTCAAAGGTTTTAAGATTTGTAAGACCTCC
1 TTTTTAAATTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACCTTT
* * *
8972222 AAGCATAATCTCTAAGACTTTCGGGTAAAAC
66 GAGCATAATCTCTAAGACTTTCAGGAAAAAC
*
8972253 TTTTTAAATTTTCATGGCCTCTAATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACCTTT
1 TTTTTAAATTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACCTTT
* ** * *
8972318 GGGCATAATCTCTAAGAC-CACTAGCAAAACATTTTAAA
66 GAGCATAATCTCTAAGACTTTC-AG--GAA-A----AAC
* *
8972356 TTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGTATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGA-CTTA
1 TTTTTAAATTTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTAAGACCTT-
8972420 TGAGCATAATCTCTAAGACCTTT-AGGAAAAAC
65 TGAGCATAATCTCTAAGA-CTTTCAGGAAAAAC
** *
8972452 TTTTTAAATTTTTAAAATTTCATAACCTCTGATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTA
1 TTTTTAAA----T----TTTCATGGCCTCTGATTAGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTGTA
* * * *
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* * *
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* ***
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* * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* *
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* *
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** * *
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* * *
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* * * *
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* *
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** * ** *** *
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* *
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** * *
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* *
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*
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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* * *
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* * * * * * **
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* * * * * ** * *
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*
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* * * * *
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* * * * * *
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*
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* **
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* * *
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*
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*
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1 CATT
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*
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* *
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* *
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*
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*
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* * *
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* *
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*
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**
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*
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TACCATGCATTCATATTTTGTCATTCATGTCCAACCA
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* *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * *
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*
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Done.