Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167904.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_17, whole genome shotgun sequence
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* * * * ** * *
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* * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* ** * *
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504 TT-TAAAAAATA-AATATGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTAAATAATTATT
* * * * * *** *
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* * * * ** *
9636204 -TAG-AATAAAAT--TA-ATTTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGTGATTTAGAAAATA
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* * * *
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258 TTTATATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTT-AT--TATATT-AAAATTAAT
** * * * ** * * * *
9636603 AACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCT-AAACCAATTCAAATAG-TAAGCCTATATGAA
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* ** * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * * ** * *
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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** **
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* * * * *
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1 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAAT-TATCT-A-T-TTCAA
* * * * *** * * * ***
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61 A-TCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGAAAT
* * ** * *
9635733 AAAATAATAGTATTTTCCTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAACTAAAATTAT
125 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAA-TAT
* * * * *
9635794 -TTTCTGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCA-TTATGA
188 GTTTATGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * ** *
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251 CCTTTTGTTTTGTCATAAACA-AA-TGTTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * ** *
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314 TAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CA
* * * * * * *
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378 TCTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCAT-TATGATCTTTTGTTTTA
** * * * *
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442 -TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAGTTTATTAA
* * **
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* ** * *
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1 A-AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATC
* * * * * *
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64 ATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * * * * *
9636209 TAAAATTAATTTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGTGATTTAGAAAATAATTTTATTTA
129 TAATACTAA-TTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
** * * * *
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193 -TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTT-
* * * * ** * *
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255 TTGTTTTGTCATAAACA-AATGTTT-TTATTCATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
9636399 TTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCAAACCAT-T
318 TTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CATCT
* * * * ** ** * * * *
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381 TCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCAT
* * * ** ** * * * * *
9636528 CAAATAATTGGTTT-TGTTCATATTATTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
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** * ** *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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65 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACACAAGCTTATT-TGAAATAAAA
* *** * *
9636749 TAATATTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
129 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-
* * * * * * * *
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193 TGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT
* * *
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257 GTTTTGTCAT-AAACAAATGTTTTTA-TTCATGCAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * ** *
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319 TATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT---AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAT
* * * * * * * * * * * * * *
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379 CTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * * * * * * * * *
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444 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATAT
** *
9637134 TTCCTTAAA-TAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAGT
508 TT-CAAAAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * ** *
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1 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * **
9637230 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGTGATCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT
65 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* ** * * *
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130 AATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-T
* * * * * * * ** *
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194 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGT
* ** ** *
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259 TTTGTCATAAACA-AATGT-TTTTAT-TCATGCAAGCTTATTCAAAATAAA-ATAATACTAATTT
* * * * * *** *
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320 ATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CATCTTC
* * * * * * *
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383 AAATAGTTATGAA-TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA-TCAT
* * * *** *
9637612 AAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATCCAAATTTATTAATA-T
446 AAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATATTAGTTTATTAATATT
* *
9637674 TCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAAT
509 TC-AAAAATTAATAAGTAGAAGA-TTTAAAAAAT
* * * * *
9637708 ---T-TATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCAT
1 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
** * * * * * *** *
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66 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * ** * ** * * *
9637834 ATAATATTTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAAAAAGAG-TTTAAAAAAATAATTTTTTTTTAC
131 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA-ATATGTTTA-
** * * * ** *
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*
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257 GTTTTGT
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ATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATGA
ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTT
TGTCATAAACAAATGTTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACATCTTCAAATAGTT
ATGAATATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
AAGTAGAAGATTTAAAAAAT
Found at i:9634786 original size:17 final size:18
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* *
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TCAAATAGTTATAGTATT
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * ** ** * * * *
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** * ***
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* *** * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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194 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATCAATTCAAATAGTTAAGA
* * ** * * *
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*
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* * * * ** ***
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* * * * * * ** *
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62 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAATTTTTGTTTTGT
* ** * * * * * * *
9637069 CATAAAATAATTATTTCAATTAACACAAGTTTAGAT-GGAATAAAATAATATTAATTTACTAATA
127 CATAAAACAATTATTT-TGTTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATA
** * * * * * *
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190 TTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATCAATTCAAATAGT
* * * * *
9637196 TATAGCCAT-TT-GAACGATTATCTCTTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
254 TA-AG-AATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA
* *
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** * * * ** * *
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1 TTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAA-AAATTTAATTACCAAACAAGT
* * * * * *
9637368 TCAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCAATCTC-AATCGTTA-AAATCTTTGTTTTGTCAT
65 TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAATTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
9637431 AAAATAATTATTTTTTATCATAAAAGCTTATTCAG-TTAAATATAATAGTAATTTAATAATATTC
130 AAAACAATTATTTTGT-TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAA-ATAATATTAATTTAATAATATTT
* * * *** *
9637495 CAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTTAAAAGATAAATGTGTTTGTTGAACCAATTCAAATAGTTAA-
193 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATCAATTCAAATAGTTAAG
* * * *
9637559 AACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTTACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTT
258 AA-TATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTT
** * * * *
9637624 TCATATCTTACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATCCAAA
322 TTGT-TCATACAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * *
9637663 TTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAA-AAGATT-TTAAAAAATTTATTTACCAAATAAGTT
1 TTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAAAAATTTAATTACCAAACAAGTT
* * * *
9637726 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGAAA-TTTTGTTTTGACAT
66 CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AAATTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * **
9637790 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATATAATAATAATATTTTCTTAATATTTC
130 AAAACAATTATTTT-GTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTC
** * * * * * *
9637855 AAAAATTAATAAAAAAGAG-TTTAAAAAAATAATTTTTTTTTACCAAATAAATTCAAATAGTTAT
194 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA-ATATGTTTACCGAATCAATTCAAATAGTTAA
* * * ** *
9637919 GACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCATTAAGACCTTTT
257 GAATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
9637962 ATTTTGTTAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (360 bp):
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CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAATTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTATTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAA
AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATCAATTCAAATAGTTAAGAAT
ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTGT
TCATACAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
Found at i:9637293 original size:180 final size:181
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Period size: 179 Copynumber: 9.7 Consensus size: 181
9636209 TAAAATTAAT
* ** * * * * *
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* * * *
9636283 TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA--TTATT-TTTGGTC
66 TTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTC
* * * * * ** *
9636345 ATAAAACAATTTTTCTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAA
130 ATAAAATAATTGTT-TTGATCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
9636398 TTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCAAACCAT
1 TTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG
* * * ** ** * *
9636462 TTCAAATAGTT-TTGATTATTTGAATAATTATCTATTTTGAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTC
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* * ** ** ***
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* * * *
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* *
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**** * * *
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*
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* * *
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** * ** * * * *
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* * * * * *
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA---TTGTTT-CATT
* * *
9651220 CATACCAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAA
62 CATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
9651279 GAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCC-TACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
9651343 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTTTTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TATTCATATAAGT
190 CTATTTCAAATCGTTATAACC--TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTCTATTCATACAAGC
** ** * * *
9651407 TTGCTCAAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGTGATTTAAAAA
252 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAA
* *
9651469 ATAAATCTATTTA-TCAAACTAGTTC-AATAGTTATGACTATTTG
316 ATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
** * * ** * * *
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCATTC-AT
* * * *
9651575 ATGCAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG---G-C
65 A--CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
**** * * *
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128 ATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
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192 ATTTCAAATCGTTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * * * *
9651765 TCAAAATAAAATCATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACT-A-ATATTTAAAAAATG
256 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
* ** * * * * *
9651828 ATTCCGTTT-GTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG
319 AATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * ** * * *
9651869 AATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAATAATTATTTCAGCTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTCA-TTCA
** * * * * * *
9651933 TGTAAGCCTA-TTCAAAAAAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAG
64 TACAAGCTTATTTGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * **** * * *
9651997 ATTTAGAAAATAATTCT-TTTTTTTAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATATA
128 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
9652061 -TTCAAATCATTATTA-CTTTT-TTGTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TGTTAATATAAGTTTGT
193 TTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * * * *
9652122 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTAGATAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGCA
256 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAA--A
* * * * *
9652187 -AAATCTATTTACCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTG
317 TAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * * * * * *
9652229 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTTATTTTGTAATCAAATAATTGGTTAT-GTTA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTT-TCATTC
* ** * * * ** * ** *
9652293 ATACTATTTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAA
63 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * ** *
9652358 AATTAAAAAATAAATCCAATTGCCTAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATGTA
128 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * ** ** * * *
9652423 TTTCAAATCATTATGACATTTTCCTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTGT-TT-GTATAAGCTTATT
193 TTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * *
9652486 TGGATTAAAATAATACTAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAATAA
257 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * ** * *
9652550 ATTTCTTTACTGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTA-TTA
320 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * *
9652589 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTG-TTGAGTAATAAAATAATTGTTTCAATTC
1 -AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTC-ATTC
* ** *
9652653 ATACAAGCTTATTT-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTGGAAAATTAATAAGAAAGA
63 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* *** * * * * * *
9652717 GATTTAAAAATTAAATCTATTTGTTGAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTTAACAACTGTCT
127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
9652782 ATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTAATATAAGCTTA-G
192 ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* **
9652846 AGTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
257 TG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
* * ** * * *
9652911 AACCTATTTACCAAATTAGTTAAAATAATTATGACCATTTA
319 AATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * * *
9652952 AATCATTATCTTTTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTACCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCATT--CA
* * * *
9653016 TATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAAA
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * ** * *
9653081 TTTAAACAATAAATCTATTTATCAAACTGGTTTGAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCAAT
129 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * ** * *
9653146 CTCAAATCGTTAAAACC-TTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTCTAAACATAAAAGCTTA-TTC
194 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
** * *
9653209 AGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAAT--A
259 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * ** *
9653272 TGTGTTT-GTCAAACCAGTTCAAATAGGTAAAACTATTAAA
321 TCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TA
* * * * * *
9653312 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAT-TCA
* * * * * *
9653376 TACAAGCTTATTTG-GATAAAATAATCCAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAG
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * *
9653439 ATTTGAAAAATAAATCTGCTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATTT
128 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
9653502 ATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCAT-CAAAGCTTA
192 ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTA
* * * * *
9653565 -ATCAAATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAA
255 TTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAA
* * * * * *
9653628 ATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAGATAGTTATGGCTATTTA
316 ATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * ** * *
9653672 AACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCA-TTCAT
* *
9653737 AAAAGC-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGTGA
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * ** * * * * * * *
9653800 TCTAAAAAGTAAATCTATTTATAGAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTAT
129 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
9653865 TTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTA-TT
194 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * * *
9653928 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTTAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
258 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* *
9653992 A---A--T-C---AC----T----TAGTTATAACTATTTT
320 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * ** * * * **
9654015 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTATTGTCATAAGACAATTGTTTTTGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCATTCAT
* * * * *
9654080 -CCAGTCTTACTCGAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTAT-GAAAATTAATAAGTAATG-
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* * ** * * * * * * *
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127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CGAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * *
9654206 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTT
190 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTT
** * * *
9654270 ATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
254 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
9654335 GAATCTATTTTCTGAACAAGTTCGAATATTTATGACTATTTG
318 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * * * *
9654377 AACAATTATCTATTTCAAA-GAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-ATTCA
* * * * *
9654441 TACAATCTTATTTCAAATAAAATTATACAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAGTAAAAG
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * *
9654505 CTTTAAAACATAAATCTGTTTACC-AAATAAGTTCAAACAATTGTGACTATTTGAACAATTATTT
128 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
9654569 ATTTCAAATTG-T-TGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAA-TTGTT-TACTTCATACAAGCTTAT
192 ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
* * * * ** * * *
9654630 TTGGATTAAAATAATATTAATTTAAT-AT-TTTGACAATTAATAACTAAAAGATTT-TAAAATAA
256 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
9654692 ATATGTTTACCAAACAAGTTCATATAGTCATAACTATTTG
320 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * *
9654732 AATAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAACAACTGTATT-AGTTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TTCA-TTCA
* * * * * *
9654796 TATAGGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATCAATCAGTAAGAGA
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
9654860 TTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTGTCTAT
129 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
9654925 TTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATT
194 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
9654965 GTTATTCATC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (359 bp):
AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCATTCATA
CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA
ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
Found at i:9654048 original size:163 final size:169
Alignment explanation
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9653837 AATTATGGCC
* *
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1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-GTCATA-AACAATTGTTTTTG
*
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*
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127 AGAGATTTAAAAAATGAATCTAGCTTGAGATATAGTAA-TGATT
* *
9654012 -TTT-AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTATTGTCATAAGACAATTGTTTTTG
1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTGTCATAA-ACAATTGTTTTTG
* * * * *
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*
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* * * *
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1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCA-TAAACAATTGTTTTTG
* * * *
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** * * * *
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129 AGATTTAAAAAATGAATCTA-GCT-TG----AGAT---ATAGTAATGATT
* ** * * *
9654372 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCT
1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCAT-AAACAATTGTTTT-T
* * * * * *
9654436 ATTCATACAATCTTATTTCA-AATAAAATTATACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAATAAGT
63 GTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTAAA-AATTAATAAGT
* * * * * * * *
9654500 AAAAGCTTTAAAACATAAATCT-G-TTTACCAAATAAGTTCAAACAATTGTGACT
126 AAGAGATTTAAAAAATGAATCTAGCTTGA-GATAT-AG-T-----AA---TGATT
* * * * * **
9654553 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTG-T-TGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTTAC
1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTG
** * * * * * * *
9654615 TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTAAT-A-TTTTGACAATTAATAACTAAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *** * * *
9654678 AGATTTTAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACAAGTTCATATAGTCATAACT
129 AGA-TTT-AAA-AAATGA-ATCTAGC--TTGAG---ATATAGTAATGATT
* * ** * * * *
9654727 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAACAACTGTATTAG
1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTG
* * * * * * *
9654792 TTCATATAGGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATCAATCAGTA
64 TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTTAAAAATTAATAAGTA
** * *
9654855 AGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATT
127 AGAGATTTAAAAAATGAATCTAGCT--TG----AG---ATATAGTAATGATT
* * * * *
9654907 ATTTGAACAATTGTCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTT
1 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTC-ATAAACAATTGTT
9654968 ATTCATCATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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172 2 0.00
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ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (169 bp):
ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAACAATTGTTTTTGTT
CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
ATTTAAAAAATGAATCTAGCTTGAGATATAGTAATGATT
Found at i:9654979 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 9653999--9654977 Score: 889
Period size: 180 Copynumber: 5.5 Consensus size: 178
9653989 ATAAATCACT
* * * * *
9653999 TAGTTATAACTATTTTAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTATTGTCATAAGAC
1 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * * * *
9654064 AATTGTTTTTGTTCATCCAGTCTTACTCGAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTATGAAAA
66 AATTG-TTTTCATCATACAGT-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* ** * *
9654129 TTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAGTGAATCTATTGGCTTGAGCAA-TGCAAA
128 TTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAC-TGAACAAGTTCAAA
* * * * * *
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1 TAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * ** * * * *
9654245 TAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATTTTCAAAAA
65 CAATTG-TTTTCATCATAC-AGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* *
9654310 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTTCTGAACAAGTTCGAA
128 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAA
* ** * * *
9654361 TATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
1 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
9654426 AATT-TTTTCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATTATACAAATTTATTAATATTCAAACA
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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** ** * ** *
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* ***
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* *
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* *
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** * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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** *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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**
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TTTAAATTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
Found at i:9666097 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 9666068--9666106 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
9666058 AACTAAATAA
9666068 GTTTCTATGATCAGAAACAATT
1 GTTTCTATGA-CA-AAACAATT
9666090 GTTT-TATGACAAAACAA
1 GTTTCTATGACAAAACAA
9666107 GCATCTTAAC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 3
0.85 0.00 0.15
Matches are distributed among these distances:
19 6 0.35
20 2 0.12
21 5 0.29
22 4 0.24
ACGTcount: A:0.41, C:0.13, G:0.13, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
GTTTCTATGACAAAACAATT
Found at i:9666915 original size:181 final size:180
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Indices: 9665740--9667428 Score: 1298
Period size: 181 Copynumber: 9.3 Consensus size: 180
9665730 AGTAATATCT
* * * * * * * *
9665740 AAACAAAA-GTTATAATGATTTAAAATAAATATTTGTTTAAATTGTCATAACTATTTGAACAT-G
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGG
** * ** ** *
9665803 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAGGTTAATAAATTTG
65 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG
* * * * * * * * * * *
9665868 GATTATTTTTTTTTTAATAATCTAGTAAGATATGAAACAAATATTTTATGACT
129 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
9665921 AAACAAAATGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAAATAGT
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGT
* * * * *
9665986 TCA-TCAAACACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTTAAAATATTATTAAGTTCA-
66 TCAGT-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AG
* * *
9666048 TATTATTTT-TAACTAAATAAGTTTCTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACA
129 TATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAAT-A-AAACAATTGTTTTATGACA
* * ** * * * * *
9666101 AAAC--AAGCATCTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
1 AAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGG
* * * *
9666164 TTCAGTAAACA-ATTTTATGTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT-AGATATTAAATAAATTA
65 TTCAGTAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATT-AATAAATTA
* * * * *
9666227 GTATTATTTCATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTTTTTTATGACA
128 GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACA
** * * * * * *
9666281 AAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGA
1 AAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGG
* * *
9666345 TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTACTTATT-A-TTTTAGGAAATATTAATAAA
65 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--TACTTATTAATTTTTA--AAATATTAATAAA
* * ** * * * *
9666408 TTACTATTATTTT-TTCCATCTAAGCTTCTATTAACTAAAAAAATTGTTTTATGATA
125 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * ** *
9666464 AATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGAAGTT-A
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGG
* * * * *
9666528 TTC-GATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATATTTCAAATGTTAATAAATTA
65 TTCAG-TAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA
* * * * *
9666592 ATATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACT
128 GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * ***
9666646 AAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTAAA
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGG
* ** * * * * *
9666711 TTCGGTAAGCAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTATTAAATTAGT
65 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* ** *
9666776 ATTATTTTAATAAAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTACGACA
130 ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACA
** * *
9666827 AATGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGT
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGT
* * * * * ** * * * *
9666892 TAAGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTACTAAATTAATA
66 TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * *
9666957 TTATTTTATTCCAAATAAGATGGTATGAATAAAATCAATTGTTTGATGACA
131 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAA-CAATTGTTTTATGACA
* * * * * ** *
9667008 TAATAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATT-G
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT-GAATTGG
** * *
9667072 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGT
65 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
9667136 ATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATTAACAAAAATAATTATTTTATGACA
130 ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
9667188 AAACAAAAAGTAATAATGATTAGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT-TATAATTACTTGAACTGG
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAATTGG
** * * * *
9667252 TTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGT
65 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * ** *
9667317 -TTAATTGTATTCTGAATACA-CTTGTATTAGCCAAAATAATTGTTTTATGACA
130 ATT-ATTTTATTCTAAATA-AGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACA
** * * * * *
9667369 AAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAAATAATTGTTCATAGAGTCTTAACAATTTGAA
1 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA
9667429 CAAAAGGTCA
Statistics
Matches: 1196, Mismatches: 267, Indels: 90
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 5 0.00
179 62 0.05
180 360 0.30
181 399 0.33
182 210 0.18
183 120 0.10
184 34 0.03
185 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGT
TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACA
Found at i:9667360 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 9665743--9667408 Score: 1141
Period size: 361 Copynumber: 4.6 Consensus size: 361
9665733 AATATCTAAA
* * * * * * * *
9665743 CAAAA-GTTATAATGATTTAAAATAAATATTTGTTTAAATTGTCATAACTATTTGAACAT-GTTT
1 CAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TGGTTA
* ** ** ***
9665806 GGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAGGTTAATAAATTTGGAT
65 GGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATAT
* * * * * * * * * * * *
9665871 TATTTTTTTTTTAATAATCTAGTAAGA-TATGAAACAAATATTTTATGAC-TAAACAAAATGTTA
129 TAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGACTA--AAATAATTGTTTTATGACAT-AACAAAAGGTCA
* * * * * *** * * * * *
9665934 GAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAAAT-AGTTC-ATCAAACAC
191 CAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTAAAATAAATTCGGT-AAACAA
* ** * * * *
9665997 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTTAAAATATTATTAAGTTCA-TATTATTTTTAA
255 ATTTATTTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTA-TTTTAT
* * * * * *
9666060 CT-AAATAAGTTTCTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-
318 TTAAAATAAGCTTATATTAACA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAT
* * ** ** * * * *
9666103 -ACAAGCATCTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC
1 CAAAAG-GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTT-
* * * * *
9666167 A-GTAAACA-ATTTTATGTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT-AGATATTAAATAAATTAGT
64 AGGTAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATT-AATAAATTAAT
* * * * * *
9666229 ATT-ATTTCATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAATA-GT
127 ATTAATTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGACT-AAAATAATTGTTTTATGACATAACAAA-AGGT
* * * * * * * * ** * ** *
9666292 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-TAATTGATTCAGTAAACA
189 CACAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTAAAATAAATTCGGTAAACA
* * * * *
9666356 AATTTATTTTTTAAATTTCTTAGT-ACTTATTATTTTAGGAAATATTAATAAATTACTATTATTT
254 AATTTATTTTTAAAATCTCTTACTGA-TTA--ATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** ** * *
9666420 T-TTCCATCTAAGCTTCTATTAACTAAAAAAATTGTTTTATGATAAAT
315 TATTTAAAATAAGCTTATATTAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAT
* * * * * * ** *
9666467 CAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGAAGTTATTCG
1 CAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTAG
* * * * * *
9666532 ATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATATTTCAAATGTTAATAAATTAATATT
66 GTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
* * * *
9666597 AATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGAC-TAAACAAAAGGTCATA
130 AATTTATTCTAAATAAGCTTGTATG-ACTAAAATAATTGTTTTATGACAT-AACAAAAGGTCACA
* * * ** * * *
9666661 ACGATTTCAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTAAATTCGGTAAGCAAATT
193 ACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTAAAATAAATTCGGTAAACAAATT
* * * * *
9666726 TATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAAAA
258 TATTTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAA
* * * * *
9666791 ATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTACGACAAAT
323 ATAAGCTTATATTAACAAAAAAATTGTTTTATGACAAAT
* * * * *
9666830 GAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGTCT-TAACTATTTGAATTGGTTA
1 CAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTGGTTA
* * * * * ** * * *
9666894 AGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTACTAAATTAATATT
65 GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * *
9666959 ATTTTATTCCAAATAAGATGGTATGAATAAAATCAATTGTTTGATGACATAATAAAAGGTCACAA
130 AATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGACTAAAAT-AATTGTTTTATGACATAACAAAAGGTCACAA
* * * ** * * *
9667024 TGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAAT-TGTTTGGTAAATAGATTT
194 CGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTAAAATAAATTCGGTAAACAAATTT
* * **
9667088 ATTTTT-TAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
259 ATTTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAAA
* * *
9667152 TAAACTTATATTAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAA
324 TAAGCTTATATTAACAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAT
* * * * * *
9667191 CAAAAAGTAATAATGATTAGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAATTACTTGAACTGGTTTG
1 CAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTAG
* * * * *
9667256 GTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGT-TTA
66 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTA
* * * * *
9667320 ATTGTATTCTGAATACA-CTTGTATTAGCCAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
131 ATT-TATTCTAAATA-AGCTTGTATGA-CTAAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAGGTCACA
* * * *
9667384 ACAAATTGAAATAAATAATTGTTCA
193 ACGATTTAAAATAAATAATTATTCA
9667409 TAGAGTCTTA
Statistics
Matches: 1020, Mismatches: 244, Indels: 83
0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
359 12 0.01
360 190 0.19
361 279 0.27
362 123 0.12
363 154 0.15
364 96 0.09
365 118 0.12
366 47 0.05
367 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (361 bp):
CAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTAG
GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTA
ATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGACTAAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAGGTCACAACG
ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTAAAATAAATTCGGTAAACAAATTTAT
TTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAAATA
AGCTTATATTAACAAAAAAATTGTTTTATGACAAAT
Found at i:9667379 original size:542 final size:539
Alignment explanation
Indices: 9665998--9667428 Score: 1389
Period size: 542 Copynumber: 2.6 Consensus size: 539
9665988 ATCAAACACA
** * * * * *
9665998 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTTAAAATATTATTAAGTTCATATT-ATTT-TTAAC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATATTTCAAATATTAATAAATTAATATTAATTTATT--C
** * * * * ** ** * ** *
9666061 TAAATAAGTTTCTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAGCA-TCTTAACAATTTGAG
64 TAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTACAA
* * * * *
9666125 ATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAATTTTATGTTTTAAA
129 ATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAA-ATTAT-TTTTAAA
* * *
9666190 TCTGTTACTTATTAA-TTTTTAGATATTAAATAAATTAGTATTATTTCATTTTGAATAAGCTTGT
192 TCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATT-AATAAATTAGTATTATTT-ATTATGAATAAGCTTGT
* *
9666254 ATGATTAAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
255 ATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
9666318 TCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTACT
318 TCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGATTAAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTACT
* * ** * * *
9666383 TATTATTTTAGGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTTTCCATCTAAGCTTCTATTAACTAAAA
383 TA-TATTTCA-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTTCCAAATAAGATGCTATGAACTAAAA
* * * * * * * *
9666448 AAATTGTTTTATGATAAATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTGAT
446 AAATTGTTTGATGACAAATCAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTCAA
* *
9666513 AACTATTTGAAGTTATTCGATAAATAGAT
511 AACTATTTAAAATTATTCGATAAATAGAT
* * * *
9666542 TTATTTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATATTTCAAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCT
1 TTATTTTTT-AAATCTCTTACTGATTAATATTTCAAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCT
* * ** * * * *
9666607 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAA
65 AAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTACAAA
* * * *
9666672 TAAATAATTGTTCT-AATAGTCT-TAACCATTTGAACTAAATTCGGTAAGCAAATTTATTTTTAA
130 TAGATAATTGTT-TAAATAGT-TATAACTATTTGAACT-AGTTCGGTAAACAAA-TTATTTTT-A
* * * * **
9666735 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAAAAATAAGCTTG
190 AATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTATGAATAAGCTTG
* * ** ** *
9666800 TATGAATAAAACAATTGTTTTACGACAAATGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTT
254 TATGAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * * *
9666865 CATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTAAGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTA-T
319 CATATAGTCTTAACTATTTGAATTGATTAAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAG-TACT
* *
9666929 TA-AGTTTCA-AAATATTACTAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGATGGTATGAA-TAAAA
383 TATA-TTTCAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-TTCCAAATAAGATGCTATGAACTAAAA
* * *
9666991 TCAATTGTTTGATGACATAAT-AAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
446 -AAATTGTTTGATGACA-AATCAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTC
* * *
9667055 AAAACTATTTAAAATTGTTTGGTAAATAGAT
509 AAAACTATTTAAAATTATTCGATAAATAGAT
* * * * * *
9667086 TTATTTTTT-AATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATATTTCAAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTA
* * * *
9667150 AATAAACTTATATTAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTAGAAAT
66 AATAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTACAAAT
* * * * *
9667215 AGATAATTGTTTAAATAGTTATAATTACTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAATC
131 AGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACA-AATTATTTT-TAAATC
* *
9667280 TCTTACTTATAAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGT-TTAATTGTATTCTGAATACA-CTTGTA
194 TCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATT-ATT-TATTATGAATA-AGCTTGTA
* ** * * *
9667343 TTAGCCAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAAATAATTGTTC
256 TGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* *
9667408 ATAGAGTCTTAACAATTTGAA
320 ATATAGTCTTAACTATTTGAA
9667429 CAAAAGGTCA
Statistics
Matches: 721, Mismatches: 141, Indels: 52
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
540 4 0.01
541 71 0.10
542 198 0.27
543 29 0.04
544 108 0.15
545 85 0.12
546 147 0.20
547 67 0.09
548 12 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (539 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATATTTCAAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTA
AATAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTACAAAT
AGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTATTTTTAAATCTC
TTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTATTATGAATAAGCTTGTATGAAA
AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG
TCTTAACTATTTGAATTGATTAAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTACTTATATTTC
AGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTTCCAAATAAGATGCTATGAACTAAAAAAATTGTTTG
ATGACAAATCAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAA
AATTATTCGATAAATAGAT
Found at i:9668153 original size:881 final size:878
Alignment explanation
Indices: 9666576--9668170 Score: 1956
Period size: 881 Copynumber: 1.8 Consensus size: 878
9666566 TTAATATTTC
* * *
9666576 AAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTA
1 AAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAACTATTATA
* * * *
9666641 TGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAA
66 TGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTAAAATAAAGAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAA
* *
9666706 CTAAATTCGGTAAGCAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTATTAAA
131 CTAAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTAAAA-CTCTTA-TTATTAATTTTTGAAACATTATTAAA
*
9666771 TTAGTATTATTTTAATAAAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTACGACAAATGAAAAG
194 TTAATATTATTTTAATAAAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTACGACAAATGAAAAG
* ** * * * * *
9666836 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTAAGCAATT
259 ATCATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTGGTGAA-CAAAT
* * * * * *
9666901 AGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTACTAAATTAATATTATTTTAT
323 AGATTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT
* * **
9666966 TCCAAATAAGATGGTATGAATAAAATCAATTGTTTGATGACATAATAAAAGGTCACAATGATTTA
388 TCCAAATAAGATGGTATGAATAAAATCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTCACAACAATTTA
* *
9667031 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTA
453 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAA
* * * *
9667096 ATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTAT
518 ATCTCTTACTCATTAAATTTTTAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAACTTAT
* * *
9667161 ATTAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTAGAAATAGATAATTGTT
583 ATAAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAAGAATGATTAGAAATAGATAATTATT
* * * * *
9667226 TAAATAGTTATAATTACTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATA
648 TAAATAGTTATAACTACTTGAACTGATTTAGCAAATACAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATA
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778 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAAATAATTGTTCATAGAGTCTTAAC
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843 AATTTGAACAAAAGGTCATTGCAATTTGAAATAAAT
* * * * *
9667457 AAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAGCTATTATA
1 AAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAACTATTATA
* * * * *
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** * * * * *
9667587 CT-GGTTCTGCAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTT-TTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATT
131 CTAAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTAAAACTCTTATTATTAATTTTTGAAACATTATTAAATT
* *** * * * *
9667649 AATATTATTTTTATCCGAATAAGCTTAG-ATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAGAAA-GCAAAG
196 AATATTATTTTAATAAAAATAAGCTT-GTATGAATA-AAACAATTGTTTTACGACAAATGAAAAG
* * * * *
9667712 ATCATAACAATTTGAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGAATTGGCTCGAA-AAA
259 ATCATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTGG-T-GAACAAA
* * * *
9667776 TAGTTTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA
322 TAGATTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTA
* * ** * * *
9667841 TTTCGAATAA-ATCTTTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAC
387 TTCCAAATAAGAT-GGTATGAA-TAAAATCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTCACAACAA-
* * * * *
9667904 TTTAAATAGTTAGAATAATTATTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACTTTTTTGGTAAACATA-TT
449 TTTAAA-A--TAG-ATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATTGTTTGGTAAACAGATTT
* * * *
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510 ATTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTTAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAGAA
* * ** * * * * *
9668032 TAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTGTTTTTATGACTAAACAAAATGTTAGAATGCCTT-GAAAT
574 TAAACTTATATAAACAAAAATAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAAGTAAGAATG-ATTAGAAAT
* * * * *
9668096 AGATAATTATTCT-AATAGTCT-TAACTATTTGAATTGATTTAGCGAATACATTTATTTTTTAAA
637 AGATAATTATT-TAAATAGT-TATAACTACTTGAACTGATTTAGCAAATACAATTATTTTCTAAA
* *
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700 TCTCTTACTTAT
9668171 TTTTTGGGAA
Statistics
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AAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAACTATTATA
TGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTAAAATAAAGAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAA
CTAAATTCGGCAAACAAATTTATTTTTAAAACTCTTATTATTAATTTTTGAAACATTATTAAATT
AATATTATTTTAATAAAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTACGACAAATGAAAAGAT
CATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTGGTGAACAAATAGA
TTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTCC
AAATAAGATGGTATGAATAAAATCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTCACAACAATTTAAAA
TAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATC
TCTTACTCATTAAATTTTTAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAACTTATATA
AACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAAGAATGATTAGAAATAGATAATTATTTAA
ATAGTTATAACTACTTGAACTGATTTAGCAAATACAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAAT
TTTTTAAATATTAATAAATTAGTTTAATTGTATTCTGAATACACTTGTATTAGCCAAAATAATTG
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAAATAATTGTTCATAGAGTCTTAACAAT
TTGAACAAAAGGTCATTGCAATTTGAAATAAAT
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9668169 ATTTTTTGGG
* * * * * * * * * *
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* * * *
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*
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128 CTGTTT-AAAAAAC-AATTT-ATTCTTTAAATATCTTACTATAATTTTTCAA
* * * **
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1 AATATTAATAAATCAATAATATTTTATTTCGT--ATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * *
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*** *
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126 AAC-TGTTTAAAAAACAATTTATTCTTTAAATATCTTA-CTA-TAATTTTTCAA
* * * *
9668534 AATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGTATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATCAATAATATTTTATTTCGTATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTAC
* *
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* ** * * **
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* * * ** ** * * *
9668714 AATATAAATAAA-CTAGTATTATTTTATTTCAAATATGGC-TGAATAAACAGAAACAATTGGTTT
1 AATATTAATAAATC-AATAATATTTTATTTCGTATA-AACTTGCATGAATAGAAACAATT-GTTT
** * *
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63 -TACGAC-AAACAAAAAATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
9668833 TGTCATAACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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183 1 0.00
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Consensus pattern (176 bp):
AATATTAATAAATCAATAATATTTTATTTCGTATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTAC
GACAAACAAAAAATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATACTATTTAAACTG
TTTAAAAAACAATTTATTCTTTAAATATCTTACTATAATTTTTCAA
Found at i:9668658 original size:180 final size:180
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 7.7 Consensus size: 180
9667447 TGAAATAAAT
* * * * ** * *
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* * * * * * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * *
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129 AACTTGTTTGGTAAACA-A--TTT-ATTTTTAAATATCTTATC-TACTAATTTTTCA
* *
9667814 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATCTT-TATGAACT-GAAACAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTT
* * * *
9667877 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGTTAGAATAATTATTCAAATAGTCA-AATC
64 TATGACAAAACAAAAGATCATAACTA-TTTGAA-A--TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-C
* * * *
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123 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAT-TTATTTTTAAATATCTTAT-CT-ACT-AATTTTTCA
** * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG-TT
* * * ** * * *
9668061 TTATGACTAAACAAAATG-TTAGAA-TGCCTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTAT
63 TTATGACAAAACAAAA-GATCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * **
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126 TTGAACTTG-TTT-G-GTAA-ACAATTTATTTTTAAATATCTTATCTAC-TAATTTTTCA
* * * * * *
9668178 GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGAATG-ATAAAAAAAATTGTTCT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * * *
9668241 ATGACAAAA-TAAAGATCATAAC-ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTAA
65 ATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
*** *
9668304 AC-TGTTTCAAAAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTA--T--TAA-TTTTCA
130 ACTTGTTT-GGTAAAC-AATTT-ATTTTTAAATATCTTATCTACTAATTTTTCA
* * * * * ** *
9668352 AAATATTGATAGATCAATATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
9668416 ACGACAAAACAAAAAATCGTAA-TGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTA
65 ATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
*
9668480 AACTTGTTTGGTAAACAATTTGTTCTTTAAATATCTTATCTACTAATTTTTCA
129 AACTTGTTTGGTAAACAATTTATT-TTTAAATATCTTATCTACTAATTTTTCA
* * *
9668533 AAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGTATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
*
9668598 TGAC-AAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
66 TGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** ** * * *
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131 CTTGTTTGGTAAACA-ATTTATTTTT-AAATATCTTATC-TACTAATTTTTCA
* * * * * * * * *
9668713 GAATATAAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATGGC-TGAATAAACAGAAACAATTGGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * *
9668777 GTAACAAAACAAAATG-TCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
65 ATGACAAAACAAAA-GATCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
9668833 TGTCATAACT
Statistics
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0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
172 2 0.00
173 1 0.00
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188 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
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CTTGTTTGGTAAACAATTTATTTTTAAATATCTTATCTACTAATTTTTCA
Found at i:9668849 original size:42 final size:42
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1 ATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
*
9668874 ATGTCATAACTATTTGAATTAGATAATTATTCAAATAGTCAT
1 ATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
9668916 A
1 A
9668917 ACAATTTGAA
Statistics
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ATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
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9669043 TAACAAAACA
* * * * * *
9669053 AAAT-GTCATAACGATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTCATTTTTTAAATCTCTTA-TTCATT
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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** ** * * *
9669476 ATTGTCTG-AATATTAATAAATTTTTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATTAAAAAAA
64 ATTGTC-GAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATGAAAACAA
* * * * * *
9669540 TTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAGCGATTTGATATAGGTCATTGTTC
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* * **
9669592 AAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGATAAACAGATTCAGCTTTTAAATC---T-CTTATTA
1 AAATAGTCAT-ACTATTTGAACTTATTTG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * ** *
9669653 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTCCTAGTAAGCTTGTATGAACAAAAATAA
64 ATTGTCGAAATATTAATAAATTA-ATATTAT-TTAATCCAAATAAGCTTATATGAATGAAAACAA
* * *
9669717 TTATTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTC
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* * * ** ** * * ** **
9669769 AAACAGTCATAACTATTTGCA-TTGGTCAGGCCAACCGATTCATTTTTTAAATCCGTTACACATT
1 AAATAGTCAT-ACTATTTGAACTT-AT-TTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
** * ** * *
9669833 AATT-TTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGAC-TATATCAAT-AGTAA
63 AATTGTCGA-AATATTAATAAATTAATATTA-TTTAATCCAAATAAG-CTTATATGAATGA-AAA
** * * *
9669895 CAATCGTTTTATGACAAAGCAAATGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC
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* * * * *
9669950 AAAT--T-GT--TA--T-AAC-TA-AT-TAAACATATTTATTTTTCAAATC---T-CTTATTGAT
1 AAATAGTCATACTATTTGAACTTATTTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * ** * * ** * *
9670000 TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATTCTTAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTG
66 TGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTAA-TCCAAATAAGCTTATATGAATGAAAACAATTA
* * * * * *
9670065 GTTTACGATAAGACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTC
130 TTTTATGA-CA-A-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * ** * * *
9670114 ATAGAGTCATAACTATTT-AAATTGGATCGGTAAATAGATTTAGTTTTT-AA--TTAT-CTTATT
1 AAATAGTCAT-ACTATTTGAACTT--ATTTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * ** * ** ** *
9670174 AATTTTTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTATATGAA-CACAAACA
63 AATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATGA-AAACA
** * *
9670237 ATTATTTTACAACAAAACAAAATGTC--AATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTC
126 ATTATTTTATGAC--AA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTC
* *
9670288 AAATGGACATAACTATTTGAACTT
1 AAATAGTCAT-ACTATTTGAACTT
9670312 GTTCAATAAA
Statistics
Matches: 834, Mismatches: 186, Indels: 123
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
163 5 0.01
164 83 0.10
165 8 0.01
166 2 0.00
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AAATAGTCATACTATTTGAACTTATTTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
TGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATGAAAACAATTAT
TTTATGACAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
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* * *
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* * **
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* * * * * * * *
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** * *
9669348 ATGAATGAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-A-AA-GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATT
252 ATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATT
*
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317 CAAACAGTCATAATGATTAGAACTTATTTGGTAACCAGAGTT
* ** * *
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1 ATTTTTTAAACCTCTTA-TTCATTAATT-TCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCAATTCA
* * * * ** *
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* * *
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* ** ** * *
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* * * *
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* * * ** *
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* ** * * *
9669809 CATTTTTTAAATCC-GTTACACATTAATTT-TTAGAATATTAATAAATTAATATTATTT-TATTC
1 -ATTTTTTAAA-CCTCTTATTCATTAATTTCTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTCAATTC
* * * * * ** * * *
9669871 TGAATAAGACTATATCAA-TAGTAACAATCGTTTTATGACAAAGCAAATGGTTATAACGATTTGA
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* * * * * *
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Statistics
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ATAATGATTAGAACTTATTTGGTAACCAGAGTT
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** * *
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* ** *
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* * * ** *
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* * *
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* * * *
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* ** ** *
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* * * * *
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251 TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-A-AA-GTCATAACGATTTAAAATAAATAATT
* * *
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*
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* * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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191 ATCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAA-CCCTAATAAGCTTATA
* ** * * * *
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255 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAA-A-AAAAG-TCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTC
* * * **
9670114 ATAGAGTCATAACT-ATTTA-AA-TTGGATC-GGTAAATAG
317 AAACAGTCATAA-TGA-TTAGAACTT--ATCAGGCAACCAG
* * * **
9670151 ATTTAGTTTTT-AA---TTATCTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCT
1 ATTCATTTTTTAAATCCTTA-CTCATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-T
** * ** * *
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* * ** * * * * *
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* * * * ** * *
9670328 A-C-T-C--ATTAATT-TTATAATATTAATAAATTAATATT-TTTTTATTCTAAATAAACTTGTA
191 ATCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCT-AATAAGCTTATA
* * * * * * * ** *
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255 TGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAAG-TCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTC
* * * ** * *** **
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317 AAACAG-TCATAATGATTAGAA-CTTATCAGGCAACCAG
** ** * * * * * *
9670481 ATT--TTTGGAATAAATAAATTAGT-ATT-A-TTTT--AT-TT--TGAA-TAAGATTGTTTGAAT
1 ATTCATTT--TTTAAAT-CCTTACTCATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * * **
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63 TGAAATAA--GCTATATGAATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTTGA
* * * * * * * * * * * *
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126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCA-CTTTTAA
* * * * * * * ***** **
9670644 ATTTTTACTTTTTAATT-TCTAGAATACTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGC
190 AATCTTACTTATTAATTGTC-AAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCTAATAAGCTTAT
* * * * * * * * * *
9670708 ATTATCAGAACCAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTT
254 ATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAA-GTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATT
* * * ** * * ** *
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316 CAAACAGTCATAATGATTAGA-ACTTATCAG-GCAACCAG
* * * *** *
9670809 ATTCTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTTATTCTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTT
1 ATTCATTTTTTAAATC-CTTACTCATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TT
* * * * * * *
9670874 T-AAACAAGCTTATATGAACTGAAACGATTGTTTTATTACAAAAGAAAAGG---T--C-A--T--
63 TGAAATAAGC-TATATGAA-TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTTGA
* * * ** * *
9670928 AAT-GAT--TTG---AAATAGTTATAATTATTTGAA-GTAGTTCGGTAAATAGAATT-ATTTTCT
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTA-TTTAGTAAACAG-ATTCACTTT-T
* * * ** * * ** *
9670985 AAATTTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTA-TTCT-TTCCTAAATAAAC
188 AAA-ATCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTT-TAACCCT-AATAAGC
* * ** * *
9671048 TTGTATGAGCCGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAAATAAT
250 TTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAAG-TCATAACGATTTAAAATAAATAAT
* * * * * * ** * *
9671113 TGTTCATATAG-GATTAACT-ATTTG-AGTTAGTTTGACAAACAG
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* * * * * * ** *
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1 ATTCATTTTTTAAATC-CTTACTCATTAATTTT-TGAAT-ATTAATAAATTAATATTATTTTATT
** * * * * * * * * **
9671219 CCAAATAAAGTTGTATTAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTAAAATAATTTGA
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* * * * * * * *
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126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCACTTTTAAA
* ** * ** * *** * *
9671349 ATC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAAAAAATTAGGATTA-TTTTATTTTGAATAAACTTGTA
191 ATCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCT-AATAAGCTTATA
* * * * * * ** * *
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255 TG--AACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-A-AA-GTCATAACGATTTAAAATAAATAATTAT
* * * * * * * ***
9671475 TGAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTA-GCAAATTG
315 TCAAACAGTCATAATGATTAGAACTTA-TCAGGCAACCAG
* * * * * * *
9671514 ATTTATTTTATAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTTTTATTTTATTT
1 ATTCATTTTTTAAAT-CCTTACTCATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TT
* * * * * * * ** *
9671579 TG-GATAAACTTTTATGAACTAAAATAATTATTGTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTA
63 TGAAATAAGC-TATATGAA-TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTTGA
* * * * ** * *
9671643 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAATTGATTTATTTTTTCT
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCA--CTTT-T
** * * * *** * * ** *
9671708 AATCTCTTGCTTACTAATTTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTT
188 AAAATCTTACTTATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCTAATAAGCTT
* *** * * * * * * *
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252 ATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC--AA-AAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTA
* * * * * *
9671838 TTCTAATAGT-ATTACCT-ATTTGAACTGGT-TC-TGCGAA-CAT
314 TTCAAACAGTCA-TA-ATGATTAGAACT--TATCAGGC-AACCAG
* * * * **
9671878 ATTTATTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTGTTGAAATATTATTAAATTACCATTATTTTTATTT
1 ATTCATTTTTTAAATCCTTACTCATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATTT
* * * * * *
9671940 G-AATAAGCT-TGTTGATAAAAAACAATTGA-TTTATGAGAAAACAAA-GATCATAACAATTTGA
64 GAAATAAGCTAT-ATGA-ATAAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTTGA
* ** * * * * ** * ** * *
9672001 GATTTATAGTTGTTCAAATAGTAATAATTATTTGAACTGGTTTTG-AAAGCATCTTTAGTTTTTT
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAA-CAGATTCA--CTTTT
** * * * * * *** * *
9672065 AATCTCTTACTTCTTAAGTT-TTAAAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTTATTTTGGATAAGTT
188 AAAATCTTACTTATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCT-AATAAGCT
* **** * * * **** **
9672128 TTTATGATTTGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGACCCGAAATTGATCAAT
251 TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAA--GTCATAACGATTTAAAATAAAT-AAT
* * * * * * * * *
9672193 TATTCAAATAGT-AAAATTTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACAT
312 TATTCAAACAGTCATAA-TGATTAGAACTT-ATCAGGCAACCAG
* * * * *
9672235 CTTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTCA-TTTTTTAAATC-CTTACTCATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-T
* * * * * * *
9672300 TTG-AATAAGCT-TGAATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTGAGAATGATTT
62 TTGAAATAAGCTAT--ATGAA-TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTT
* * * * * * * *
9672363 GAAATAGATAATTGTTCTAATAATCT-TAACTATTTGAAC-TAGTTTGGCAAA-TGCATTTATTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTAAACTTA-TTTAGTAAACAG-ATTCA-CT
* * * * * *
9672425 TTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTC-AAATATTAGTAAATTAGA-ATTATTTTAATCCGAATA
185 TTTAAA-ATCTTACTTATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTA-ATATTAGTTTAACCCTAATA
* * * * *
9672488 AGCTTATATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATTATAACAATTTGAAATAGAT
247 AGCTTATATGAACAA-AAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAG-TCATAACGATTTAAAATAAAT
* * * ** *
9672552 AATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTA-AACTATTTC-GAAAAACAG
309 AATTATTCAAACAGTCATAA-TGA-TTAGAACT-TATCAGGCAACCAG
* ** * ** * * * *
9672597 ATTTAGATTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATCAT
1 ATTCATTTTTTAAATCCTTACTCATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TT
* * * * * * ** *
9672659 G-AATAA-TTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTAGGATAAAACTAAA-GGGCATAATGATTTG
64 GAAATAAGCTAT--ATGAATA-AAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAATGGTTATAACGATTTG
* * * ** * * * *
9672721 AAATAAACAATTGTTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA-TTTCTT
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCACTTT-TA
* * * * * * * *** *
9672785 AAATCTTCTACCTATTACTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAACT
189 AAATC-T-TACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCT-AATAAGCT
* * * * *
9672849 TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTAAAGTAAATAATT
251 TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAAG-TCATAACGATTTAAAATAAATAATT
* * ** **
9672914 ATTCAAACAGTAATAACT-ATCTA-AACTTA-CTTGATAAATAG
313 ATTCAAACAGTCATAA-TGAT-TAGAACTTATC-AGGCAACCAG
* * ** * *
9672955 ATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT
1 ATTCATTTTTTAAA-TCCTTACTCATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* * * * * * *
9673020 -AGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAAAGGTCATAATGATTT
64 GA-AATAAGC-TATATGAATA-AAACAATTATTTTATGAC-AAA-ACAAATGGTTATAACGATTT
* * * * *
9673084 CAAATACG-TAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTC-TTTTT
124 GAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCACTTTT
* * * * * * ***
9673147 AAATCTCTTACTCATTAAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTAAATAAGC
188 AAA-ATCTTACTTATT-AATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTAACCCT-AATAAGC
* ** * * * * *
9673210 CTATATGAACTGATATAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTC-TAACGATTTGAAATAGATAAT
250 TTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAA-GTCATAACGATTTAAAATAAATAAT
* * * * * * ** * *
9673274 TATTTAAATAGTTATGACT-ATTTGAACTTGTTCA-TTAAACAT
312 TATTCAAACAGTCAT-AATGATTAGAACTT-ATCAGGCAACCAG
* * * * * ** *
9673316 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAACTATTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTATC
1 ATTCATTTTTTAAATC-CTTACTCATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATT
* * ** * *
9673381 CG-AATAAGCTTGTATGAGCA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTT-
63 TGAAATAAGC-TATATGA--ATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTTG
* * * * * * * * *
9673443 AAGATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
125 AA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCACTTTTA
** * * * ** * *
9673508 AAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCATAATAAACT
189 AAATC--TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTA-ACCCTAATAAGCT
* * *** ** * * *
9673573 TGTATAAATTGAAACTTTTATTTTATAACAAAACATAAGATCATAACGATTTGAAATGAATAATT
251 TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-A-AAG-TCATAACGATTTAAAATAAATAATT
* * * * *
9673638 ATTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAAT-A---AA-TAG
313 ATTCAAACAGTCATAATGATTAGAACTT-ATCAGGCAACCAG
* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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** * * *** * * ** ** * *
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* * * * * *
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*
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* ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * ** ** * *
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * ** * * * *
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*
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * **
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* * *
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* * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
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* * *
9673768 T-GTTTATGA-AAAA-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTT
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* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * ** * *
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* *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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*** * ** * * *
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* *** * *
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* * * * *
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* *
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* * * * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * *
9671108 ATAATTGTTCATATAG-GATTAACTATTTG-AGTTAGTTT-GACAAACAGATTTATTTTTAAATC
129 ATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTT-GTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTAAATC
* * * * ** * *
9671170 GCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATGTTTACTAAATTGGTATTATTTTAATCCAAATAAAG-TTGT
191 TCTTACTTATTAACTTTT-AGAAT-ATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAAT-AAGCTTGT
* * * * * * * * *
9671233 ATTAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTT
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* * * * *
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318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTACTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATT
* * * * *
9671359 AATTCTTGAAATATTAAAAAATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGTTGAA-A-AAA
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* * * * * * * * * *
9671422 CAAATGTTTTATGA-TAAAACACAAGGTAATAACGATTTGAAATAGCTAGTTGTTGAAATAGCCA
443 CAATTGTTTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG-TAATTGTTCAAATAGTCA
* * * *
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* * * * *
9671519 TTTTATAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTTTTATTTTATTTTGGAT
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* * * * * ** *
9671584 AAACTTTTATGAACTAAAATAATTATTGTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGA
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* ** *
9671649 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAATTGATTTATTTTTTCTAATCTC
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* * * * *
9671714 TTGCTTACTAATTTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA
193 TTACTTATTAA-CTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA
*** * * * * * ** * * *
9671779 ATTGAAACAATTATTATATAACTAAACAAAAAATCAAAACAATTTTAAATAGATAATTATTCTAA
257 ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * *
9671844 TAGT-ATTACCTATTTGAACTGGTTCTGCGA-ACAT--ATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTA
322 TAGTCA-TAACTATTTGAACT--TACT-TGATAAATAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTA
* * ** *
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* * * * * * * *
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** * * **
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* * * *
9672058 GTTTTTTAATCTCTTACTTCTTAAGTTTTA-AAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGGA
1 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* ** * * *** *
9672122 TAAGTTTTTATGATTTGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGACCCGAAATTG
64 TAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * **
9672187 ATCAATTATTCAAATAGT-AAAATTTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATCTTTATTTTTTTAAAT
129 AT-AATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA--TTTTTAAAT
* * * * * * ** *
9672251 CTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGAAT
190 CTCTTACTTATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTAT
*** * * * * * *
9672316 GAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTGAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCT
255 GAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * ** **
9672381 AATAATCTTAACTATTTGAAC-TAGTTTGGCAAATGCATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTA
320 AATAGTCATAACTATTTGAACTTA-CTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTA
* * * * ** * *
9672445 ATTTTTCAAATATTAGTAAATTAGAATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAAT
383 ATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * *
9672510 TGTTTTATGAC--AAAATAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
447 TGTTTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG-TAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* ** *
9672573 TATTTAAAC-TATTTCGAAAAACAGATTTA
511 TATTTGAACTTATTT-GGTAAATAGA-TTA
* * * **
9672602 GATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCA-AAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATCATGAA
1 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * * *
9672662 TAA--TTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTAGGATAAAACTAAAGGGCATAATGATTTGAAAT
64 TAAGCTTTT--ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *
9672725 AAACAATTGTTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTCTTAAATC
127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTT-TTAAATC
* * ** *
9672790 T-TCTACCTATT-ACTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTA
191 TCT-TACTTATTAAC-TTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTA
* * * *
9672853 TGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTT-AAAGTAAATAATTAT
254 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAA-TAGATAATTGT
* * * * * *
9672916 TCAAACAGTAATAACTATCTAAACTTACTTGATAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTAT
317 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTACTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTAT
9672981 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
381 TAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * *
9673045 AATTGTTTTATAACAAAATAAAAAAGGTCATAATGATTTCAAATACGTAATTGTTCAAATAGTTA
444 AATTGTTTTATAACAAAA-AAAAAAGATCATAACGATTTGAAATA-GTAATTGTTCAAATAGTCA
* *
9673110 TAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTC
507 TAATTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTA
* *
9673142 TTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * *
9673206 AAGCCTATATGAACTGATATAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTC-TAACGATTTGAAATAGA
65 AAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
9673270 TAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCATTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTT
130 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCT
* * *
9673335 TACTTATTAACTATTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-TATCCGAATAAGCTTGTATGAG
194 TACTTATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TCCGAATAAGCTTGTATGAA
* *
9673399 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTT-AAGATAAATAATTGTTTAA
258 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAA
* * *
9673462 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
321 ATAGTCATAACTATTTGAACTTACTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAT
* * * * * * **
9673527 TGTCTGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCATAATAAACTTGTATAAATTGAAACTTTT
385 T-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * * * * *
9673592 ATTTTATAAC-AAAACATAAGATCATAACGATTTGAAATGAATAATTATTTAAATAGTCATAATT
448 GTTTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAAT-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAATT
*
9673656 ATTTGAACTTA----ATAAATAGATTTA
512 ATTTGAACTTATTTGGTAAATAGA-TTA
* * * * *
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1 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
*
9673745 AAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTG-TTTATGA-AAAA-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
65 AAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
9673806 ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAATTTTT
129 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCT
* * * * *
9673871 TTCTTATTAA-TCTTTGGAATATTAGTAAAGTT-ATATTATTTTATTCGGAATATGCTTGTATGA
194 TACTTATTAACT-TTTAGAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA
* * * *
9673934 ACAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAA
257 ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * *
9673999 TAGTCATAACTATTT---CTT--TTCA-AAAT--CTCTTA----CT-CA--TTTA---A-T--TT
322 TAGTCATAACTATTTGAACTTACTTGATAAATAAAT-TTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATT
* * * * * * * *
9674043 TTAGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTT-CAACAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTT
386 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* ** * * * * * * * * *
9674107 TTATGA-TGAAATAAAAGGTCATAA-TATTTGAAGTAGATAATTATTCAAACAATTATTATTATT
451 TTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG-TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
** * * *
9674170 TGAACTTGCTAGGTAAACATATTTA
515 TGAACTTATTTGGTAAATAGA-TTA
* * * * *
9674195 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATT-GAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTAATCTGAAT
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * *
9674259 AAGCTTGTATGAA--GAAAATAATTGTTTTATGACAAAGCAAGAA-GTCATAATGATTTGAAATA
65 AAGCTTTTATGAACTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *
9674321 AATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACCTATTTGGTAAACAGATTT
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT
9674373 GAAATAAGCT
Statistics
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AGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTA
CTTATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACAA
AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTACTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATA
ACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
TATTTGGTAAATAGATTA
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9673676 TTTATTTTTT
* * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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*
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325 ATTTCTTTTCA
*
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* * *
9674084 CTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAATAAAA-GGTCATAAT-ATTTGAAGTAGATAA
64 CTATATGAATAGAAACAATTG-TTTATGA--AAA-AAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * * *
9674147 TTATTCAAACAATTATTATTATTTGAACTTGCT-AGGTAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTAC
125 TTATTCAAACAATCATAACTATTTGAACGTGCTCA-GAAAACAGATTTATTTTTAAATCTTTTAC
* * *
9674211 TTATTAAT-TATTGAAATATTAATAAA-TTAATATTTTTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAGA
189 TTATTAATCT-TTGAAATATTAATAAAGTT-ATATTATTTTAATCGGAATAAGCTTGTATGAACA
* *
9674274 AAA-TAATTGTTTTATGACAAAGCAAGAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
252 AAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAGAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
*
9674338 TTATAACTATTT
317 TCATAACTATTT
9674350 GAACCTATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (335 bp):
AAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCCT
ATATGAATAGAAACAATTGTTTATGAAAAAAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
AAACAATCATAACTATTTGAACGTGCTCAGAAAACAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
TCTTTGAAATATTAATAAAGTTATATTATTTTAATCGGAATAAGCTTGTATGAACAAAAGCAATT
GTTTTATGACAAAACAAGAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
TTTCTTTTCA
Found at i:9675227 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 9674369--9680540 Score: 3752
Period size: 181 Copynumber: 34.3 Consensus size: 181
9674359 TGGTAAACAG
* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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129 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * *
9674549 ATTCCAAATAAGTTTTTATGAACAG-AAACAATTGTTTTGTGA-TAAACAAAGGGCCATAATGAT
1 ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * **
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65 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTA--AACAAATTTATT
* * *
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128 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* ** * * * * * ** *
9674729 ATTCCAAATAAG-ACTAT--ATAAGCATAGACAATTATTTTATAATAAAACCATTGGTCATAATG
1 ATTTCAAATAAGTTGTATGAAT-AG-A-AAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * ** * * *
9674791 ATTTAAAATAAATAAATGTTCAAATGGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGACAAATAGATTTACT
63 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATT
* * *
9674856 TTTTAAATCTCTTACTTAATAA-TTTTCAAATTATTAATAAATTAATATTATTTT
128 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * *
9674910 A-TTCTAAACAAACTTATATG-ATCA-AAAACATTTGTTTTATGATAAATAAAAAAAAAGGTAAT
1 ATTTC-AAA-TAAGTTGTATGAAT-AGAAAAAAATTG-TTT-T-AT-AACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * **
9674972 AACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCTTAATTATTTGAACTAT-TTTGGCAAATTGAA
59 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAA-CAAA
* *
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122 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTT
* * * * * * *
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1 ATTTCAAATAAGTT-GTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * *
9675159 TTGAAAGAGATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGTAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTT
65 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTT
* * ** * * *
9675224 TTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATACTATTAGATTAGTATTATTTT
130 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * * * * *
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1 ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * ** *
9675340 TTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAA-TAATTTGAACTGGTTCAATAAATAGAA-TTATT
65 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-AATTTATT
* * * *
9675403 TTTTAAATCTATTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTACTTT
128 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * *
9675457 ATTAC-GATAAACTTGGATGAGT-TAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAATGAT
1 ATTTCAAAT-AAGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * ** ** * ***
9675520 TTGAAATAGGTAACTCTTCATATAGTCTTAATTAGTTGAACTACTTCAATGAATGGATTTATTTT
65 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTT
* * * * *
9675585 TTAAATCTTTTAGC-TATGAA-TTTTCATAATATTATTAATTTTAGTATTATTTT
130 TTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTT
* * * * * * * *
9675638 ATTTCGAATAAACTTATATGAATAG-AAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAAGGTTATAACAA
1 ATTTCAAAT-AAGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAAGGTCATAACGA
* *
9675702 TTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATT
64 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTATT
* ** ** ** * **
9675766 TTTTGAATCTCATATTAATTCTTGAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAA-AAGGTACTAACAAT
128 TTTTAAATCTC---TT-A--CTT--ATTAA---TTTT-TGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTAT
9675829 TTT
179 TTT
* * * * ** * *
9675832 ATTTCAAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTCTTCTATGACAAAATGAAAGGTAATAACAA
1 ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAA-AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* ** * * *
9675895 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ACGATATTTATTTGAAC-TGATTTGGCAAACTAATTTAT
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* ** *
9675958 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT
127 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*** * * * * * * * * *
9676013 ATTTTGGATAAACTTTTATGGACA-AAAATAACTGTTTTATCACAAAACAAAAGTTCATAACAAT
1 ATTTCAAAT-AAGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* ** * *
9676077 TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAATTTTATTTT
65 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTT
* * *
9676142 TTCAATTCTCTTACTTATTAATTTTTTGGAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTT
130 TT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * *
9676195 CTTTCAAATAAGCTTGTATGACT-G-AAACAATTATTTTATAACTAAAA-AAAA-GTTAGAATGA
1 ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAAC-AAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * *** * *
9676256 TTTGAAATAGACAATTATTCTAATAGCCTTAACTATTTGAACAAATTCGATAAACATA-TT-TTT
64 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTT
** ** *
9676319 TAAAAAAATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
129 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * * *
9676370 -TATCCAAATCAGCTTGTATGATTAG-AAACAATTATTTTTTGATAAAGC-AAAGATCATAACAA
1 AT-TTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * * * ** *
9676432 TTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGCTCAGAAAATAGCTTTAGTT
64 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTT
* * * * * **
9676497 TTTAAATCTCTTGCCTAATAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATCGTTTT
129 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * *
9676550 ATGTT-GGATAAGTTTTTATGAACT-G-AAATAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCAAAATG
1 AT-TTCAAATAAG-TTGTATGAA-TAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * ** * * *
9676611 ATTTTAAATGGATAATTGTCCAAATAGTCATATCTAATCAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATT
63 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATT
* * * *
9676676 TCTTAAATGTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
128 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * *
9676730 A-TTCTGAATAAGTTTGTATGAATTG-AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTGAAAACAA
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * * * *
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1 ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* *
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* * * * * * * **
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1 ATTTCAAAT-AAGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * ** * *
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*
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* * * * * * * * **
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1 ATTTCAAAT-AAGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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1 ATTTC-AAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * *
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* **
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** * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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1 ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTAT-AACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 ATTTC-AAATAA-GTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA
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1 ATTTCAAATAAGTT-GTATGAA-TAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA
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* *
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1 ATTTCAAAT-AAGTTGT-ATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAG-GTCATAACG
* * * ** ** * * *
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* * *
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128 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * *
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1 ATTTC-AAATA-AGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * *
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* *
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128 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * ** * * *
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1 A-T-TTC-AAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * ** * * *
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** * *
9680256 ATATTTTTAGTTCTCTTA-TTCATTAATTTTT-AGTATATTAATAAATTAATATTATTTT
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* * * * *
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1 ATTTCAAATAAGTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
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* * ** *
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* * * * * * *
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1 -ATTTCAAATAAG-TTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAAC
9680541 AATTCTGTTT
Statistics
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TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTT
TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
Found at i:9676845 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 9674369--9680539 Score: 3984
Period size: 361 Copynumber: 17.2 Consensus size: 360
9674359 TGGTAAACAG
* * * * * * ***
9674369 ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTATAGCAATT
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* *** * * * ** *
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128 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC
* * * * * ** *
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* *
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320 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * **
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1 ATT-TAAATAAG-CTTGTATGAA-CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * * * * * *
9674792 TTTAAAATAAATAAATGTTCAAATGGTTATAACTAATTGAACTGGTT-TGACAAATAGATTTACT
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* * * * * *
9674856 TTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTCAAATTATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAA
126 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
* * * * * * * * *
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191 GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG----ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * ** * * * *
9674986 GATAGTTGTTCAAATAGTCTTAATTATTTGAACTATTTTGGCAAATTGAATAATTTTTTAAATCT
252 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
*
9675051 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT--TATTTTATTT
317 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTT
* *** * ** * * * *
9675094 ATTTCAAATAAG-TTAGTAAGAGTTGAAAAAAATTGTTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACGA
1 ATTT-AAATAAGCTT-GTATGAACAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * * * * * ** * * *
9675158 TTTGAAAGAGATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGTAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATTT
63 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-AGATTTAGTT
* * * * * * *
9675223 TTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATACTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
127 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG
* * * * * * ** *
9675288 CTTGTAAGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAA
192 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * *
9675353 TTGTTCAAATAGTTATAA-TAATTTGAACTGGTTCA-ATAAATAGAATTATTTTTTAAATCTATT
257 TTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTCAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * *
9675416 ACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTACTTT
320 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * ** * * * *
9675457 A-TTACGATAAACTTGGATGAGTTA-AAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAATGAT
1 ATTTA-AATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
** * * * * * * ** * ** *
9675520 TTGAAATAGGTAACTCTTCATATAGTCTTAATTAGTTGAACTACTTCAATGAATGGATTTATTTT
64 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT-AAAAGATTTAGTTT
* * * *
9675585 TTAAATCTTTTAGC-TATGAATTTTCATAATATTATTAATTTTAGTATTATTTTATT-TCGAATA
128 TTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCT-GAATA
* * * * * *
9675648 AACTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGA
190 AGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * ** * * * *
9675713 TAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTGAATCTC
254 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
** ** ** * **
9675777 ATATTAATTCTTGAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAA-AAGGTACTAACAATTTT
318 ---TT-A--CTT--ATTAA---TTTT-TGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTT
*** * * * ** * **
9675832 ATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTCTTCTATGACAAAATGAAAGGTAATAACAATT
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* * * ** ** * *
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65 TGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAA--AGATTTAGT
* * * * *
9675959 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAA
126 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
* * * * * * * * *
9676024 ACTTTTATGGACAAAAATAACTGTTTTATCACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATA
191 GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
** * ** * * *
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256 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAGA-TTTATTTTTT-AAATCTCT
* *
9676153 TACTTATTAATTTTTTGGAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTT
319 TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * *
9676195 CTTTCAAATAAGCTTGTATG-ACTGAAACAATTATTTTATAACTAAAA-AAAA-GTTAGAATGAT
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** * * * * * * *
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** * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* **
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** * *
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* * *
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* * * * *
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*
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*
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * *
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* *
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* **
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* * *
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* * * **** * * * *
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* * * * * ** * **
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*
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* *
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* * *
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* * * *
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1 AA
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ATTAAT
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* ** **
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* * * * * ** * * *
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** * *
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* ** * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * ***
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* *
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1 AATAGTTA-AGACT-ATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** * * *
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* * * * ** ** ** *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * *
9695010 AATAGTTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTGCTCTAATCTTTTGTTTTGTCATAA
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*
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** *
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* * *
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* *
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* * * * *
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** * *
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568 ATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTGGAATAA
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1 AATAATT-AT--G--A-CTATTTAAACAATTACA--T-ATT-TC--A-AA--TT-ACTA--TAAT
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* *
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635 TAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT---AAACT-AATCTATTT
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA-
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126 AAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAA-TTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAG
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189 ACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATT-TTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** ** * * * *
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376 TTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAAAG
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** * * * * * * * * * *
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503 AAAAATGAATCTGTTAACTGATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * *
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568 ATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-GGAAT
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* * * * *
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312 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAA
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376 TTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAAAG
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441 CTTATTCAAAATAA-AATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAG-ATTTA
* * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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630 TAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAACTAAT--CT
** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * ** **
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * ** * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * ** * * *
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309 T--AATAAGA-GAT-TTAAA-AAATAA-A-T---ATA-TT--T-ACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * *
9700526 A-AATATAATTGCCAAACCATTTCAAATAGTT-AAGACT-ATAAGAACAATTGTCTATTTTAAAT
360 ATAAT-TATTTG---AA-CAATT-ATATATTTCAA-ATTGTTATG-AC-CTT-T-TGTTTT--GT
** ** * * * *** *
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* * * * * * *
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457 TAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGA-TTTAAAAATGAATCTG-TTAA
** ** * ** * * * *
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* * * * * **
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** ** * * * * *
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9700908 CA
707 CA
* * * * * * * ** * * * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATT-ACATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
* ** * * * * * * * *
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64 AATAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TT-AT
* * * ** * * * * * *
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126 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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314 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATTA
* ** * * * * * * * *
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379 T-ATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATAT-TCATAAAAGC
* * * * *
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442 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAA
* * ** ** * * * *
9701416 AAGAAATTTGTT-TGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
507 ATG-AATCTGTTAACT-G-ATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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689 CTATTTATCAAACAAGTTCA
* * * ** * * * * * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * **
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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** ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** ** * * * *
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375 ATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAATAATTGTTTATATTCATAAA
* * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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566 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTGGAA
* * * * ** * *
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630 TAAAATAATTCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-AATCT
* * * * *
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691 ATTTATCAAACAAGTTCA
* * * * * * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTACTATAATCTTTGTTTTGTC-ATAAA
* ** * * * * * *
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65 A-TAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTAT-
*** * * * * * * * *
9702470 AAAATTTAATATGAAAGAAATTTATAAAAT-AATTATGTTCATCTAGCCAGTTCAAATAATTATA
126 AAAA-TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA-A
* * * * * * ** * * *
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188 GACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
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251 TTTGTTCATACAAGTTTTTTCGAAAT--AAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * **
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313 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATT
* ** * * * * * * * ** *
9702726 ATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTATTCTATTATAAAACAATAGTTTCTATTTGTACAAGCT
378 ATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAAAGCT
* * * * ** * * *
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443 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGA-TTT-AAA
* * * * *
9702855 AAT-AAGTATGTTTATAGAACTAGATCAAATAGTCATAACGATTTGAAAATTGTCATTATTATTT
506 AATGAA-TCTG--T-T--AACT-GAT----TAGT--T--C-------AAATAGTTATGACTATTT
* ** * * *
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* ** ** * * *
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612 CATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
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676 GATTT--AAACT-AATCTATTTATC-AAACAAGTTCA
* * * * * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
* * * * ** * * *
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64 AATAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTATA
* * ** * * ** *
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127 -A-AATTAATAAC-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAA
* * * * * * * **
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188 GACTA-TTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
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250 TTTTGTTCATACAAG-TTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AA-AAATTAA
* * * * * * * * *
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312 TAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAA-
* * * ** * * *
9703463 TAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTTAAAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA
373 CAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATA-TTCATA
* * ** *
9703527 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATGAA-TAAGAGAA
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* * * * ** ** * * *
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500 TTTAAAAATGAATCTGTTAACTGATTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
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564 TCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-G
* * *
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627 GAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAACTA-AT
* * * * *
9703782 ATATGTTTTCTTAATATGTTCA
689 CTAT-TTATC-AAACAAGTTCA
* * * * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTATAATC-TTT-GTTTTGTCATA
* * * * * *
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* * * * * * * *
9703930 TCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACGAGTTTAAATAGTTA
123 T-ATAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA
* * * * * * *
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187 AGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTG
* * *
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249 TTTTTGTTCATACAAGTTTT-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAA
* * * * ** *
9704122 TAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-TCAAACAAGTTAAAATAGTCA-CGTCCATTTGA
312 TAA----GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAAT-TATTTGA
* * * * * * * *
9704185 ACTATCATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTG-CTGTAAAACT-ATTGTTTCTATACG
372 ACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAA-TAATTGTTTATATTC-
* ** * * * * *
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434 ATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TT-AATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA
**** * * * * * * * * * * **
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* * * **** * * ** *
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* * * * *** * *
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*
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* * * * *
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1 AATAATTATGA-CTATTTAAACAATTACATATTTCA-AATTACTATAATCTTTGTTTTG-TCATA
* ** * ** * * * *
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* ** * ** * *
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* * * *** * * * * *
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189 ACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
** * * * **
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253 TGTTCATACAAGTT-TTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAA-T--TAA-
* * * * * * * ****
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312 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACA
* * ** * * * *
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375 ATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTAT-ATTCATAA
* * * * * *
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438 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAC-AGATT
* * *
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502 T-AAAAATGAATCTGTTAACTGATTAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
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565 CAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-GG
* * * * * * *
9705088 AATAAAATAATACTAATTTAATAATA-CTCTAAAAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAGTAAAT
628 AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-AAT
* * ** *
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689 CTATTTATC-AAACAAGTTCA
** * * * * * * * * * *
9705171 AATCAATTAAAACTATATGAACAATTACCTATCTCAAA-CAGTTATGACTTTTTATTTTTTTCAT
1 AAT-AATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTA-CTAT-AATCTTT-GTTTTGTCAT
* * * * * *
9705235 AAAACAATTATTTCA-GTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACAAAT-TATTAATATT-
62 AAAATAATT-TTTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTA
* * * *** ** * * * * *
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125 T--AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAA
* * * * * * *
9705358 G-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTGTTTGTCATATAACAATTATT
188 GACT-A-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
9705422 TTT-ATCATACAAGTTTATTT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATA
251 TTTGTTCATACAAGTTT-TTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATT-A-A
* * * * * * *
9705485 GGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATATGA-TTACTGAACCAA-TTTAAATAATTAAAACTATTTGAA
312 --TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAA
* * * ** * *
9705548 TAATTGTATACTTCAAATCATTAT-AGCC----------T--T--AATTATT-TTTGT-TT-ATA
373 CAATTATATATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATA
* ** * * ** ** *
9705595 CAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATATTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACCAAAAGAT
437 AAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGAT
* * ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * ** * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * * * * * * *
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* * *
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383 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTAT-A-TTCATAAAAGCTTA
* * * * *
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* * ** * * * * * * *
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* * ** * * *
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571 ATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAA
* * * * *
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635 TAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAACTA-ATCTATT
*
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** * * ** ** * * *
9706569 AATCTTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAAAAA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTACTAT-AATCTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
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65 ATAATT-TTTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-A
* * * * * * *
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127 -AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *
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190 CTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * *
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253 TGTTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTT-AAAAATT-A--A-
* * * * * * * * * *** *
9706889 TAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTGCTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCAAAATAAT
312 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAAT
* *** * * * * * **
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377 TATATATTTCA-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAAAG
*** * ** *
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441 CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGA-TTT-A
* ** ** * * *
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504 AAAATGA-ATCTGTTAACTGATTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
9707145 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAAA
567 AATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTGGAATA
* * * * * * * *
9707210 AAATAATAT-TAATTTATGAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
632 AAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-AATCTAT
* * *
9707274 TTA-CTGAGCAAGTTTA
693 TTATC-AAACAAGTTCA
* * * ** * * *
9707290 AATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * ** ** *
9707355 ACAATTGTTTCTATTCGTTCAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTTTAATATTTTAAA
65 ATAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-AA
* * * * * * * *
9707419 AATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAATCGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATGTCC
128 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACT
* * * * * * *
9707483 ATTTGAACGATCATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTA
192 A-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* ** * * * ** * *
9707548 TTGATACAAAATTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGA
255 TTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGAGA
* *** * ** * ***
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319 TTTAAAAA-ATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATTAT-AT
*** * * * ** * *
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382 ATTTCAAATTGTTATGAC-CTTT---T--G-TT-TTGTCA-TAAAATAATTGTTTATATTCATAA
* * * ** * **
9707732 TA--TT-TTACAAATTAAGTAAGAGAT-TTAAAATATAAATGTATTTGCTGAACCAATTCAA-AT
438 AAGCTTATT-CAAAATAA--AATA-ATATTAATTTATTAA--TA-TT--T-AAAAAATT-AATA-
* * * * * *
9707792 AGTTA-AGACTATT-AGAAT-AA----TT-A-T--TTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTTG---
491 AGTAACAGA-T-TTAAAAATGAATCTGTTAACTGATTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAC
* * * * ** * * *
9707843 -TTTAGT-TA--TAAAATAATTTTTTTAGTTTATACGTACTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAA
553 AATTA-TCTATTTCAAATCA-TTATGAACTTT-T--GT--TT-TGTC---ATAAAACAAT--T-G
* ** * * * * *** *
9707903 TTTAGCAACATTCA-A-AAAATTAAT-AAACAAGA-AATT-TAAAAAAATAAATCTATTTACCGA
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* * * * * * * *
9707963 ACAAGTTCAA-ATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTA--AAATAAATATGA
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** * * * * * * * *****
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1 AATAATTATGACTATTTA--A-ACAATTACATAT-TTCAAATTAC-TATAATCTTTGTTTTGTCA
* * * *
9708072 TAAAATAATGACTTTATTAATATTTCA-AAAATTG-TTAAGTTAGAAATTTAAAA-AATAAGTCA
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* * ** * ** * * * * * *
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111 ATCTAAT--AA-TA-TTATAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC
* * ** * ** * **
9708190 CATTATGAAATTTCA-TTTTGTC-ATAAAACAATTGT-T-TTT---ATC---ATG-CATGCCTTT
172 CAAT-TCAAA--T-AGTTAAGACTATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTTT
** * * ** * * * * **
9708244 TTGGAATAAGATAATATG--AAT-TT-AT-TAA--TATTTC---A-AACAT-TTA-TAA-GCA--
232 TTGTCATAAAACAAT-TGTTTTTGTTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATT
* * *** * ** ** * ** * *
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* * ** ** ** * * * ** *
9708356 ATCGTTATAACCT-TTTGTTCTGTTATA-AAAT--AATTGTTTTAGTTCGTATAAGCTTAT-TCA
354 ATAGTTATAA-TTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTAT-G-ACCT-TTTG-TTTTGTC-
** * * * * * * ***
9708416 AAATAAAATAATACTAGTTTAATAATATTTTGAAA-TTTAAT--AACTAAGA-GAT-TTAAAAAA
413 --ATAAAATAAT--T-GTTT-AT-AT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* *** * * * * * * *
9708476 TAAATATATTTGCCAAAGTAGTTCA--AACAG--TTAAAACT--ATATG--AACAATTATCTACT
470 T-TA-ATATTTAAAAAATTA-ATAAGTAACAGATTTAAAAATGAATCTGTTAAC--TGAT-TAGT
* ** * ** *
9708533 TCAAATCA-TTATGACTTTTTG---TTTTGTCATATAACAATCATTACAGTTCATACAAGCTTAT
529 TCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAA--A-T-CA-TT-AT-GAA-CTT-T
**** *** * * *
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583 T-GTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-TT-CTA-TTCATACAAGCTT-AT---T--G-GA-AT-AAA
* ** * ** * * *
9708655 AGTGAATT-T-GTTTACCAAATTAGTTT-AAATAATT-AT-GGCCAG-G--TTAATAATTATCCA
634 A-T-AATTCTAATTTA-TTAA-TA-TTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA-ACTAATCTA
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692 TTTATCAAA-CAAGTTCA
* * * * ** **
9708724 ATTACATTTTG-TTTTGTCATAAAACAATT--AT-TTT--TGTT-C--TAA-C-AAGTTTAT-TC
1 AATA-ATTATGACTAT-T--T-AAACAATTACATATTTCAAATTACTATAATCTTTGTTT-TGTC
*** * * * * * * *
9708777 AAATAAAATAA-CACTAAT-CT-A-ATAA---TATTCCAA-AAATTAATAGCTAA--G-A-GA-A
60 --ATAAAATAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATA-CTAATCTAATAATA
* * *
9708829 -T-T--AA--AA-AA-T-A-A-A-TT------T--GTTTG-TT---GAACCAATTCAAATA-TTT
122 TTATAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA
* * * * * * *
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187 AG-ACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACA-ATT
* * * * *
9708934 -TTGTTGGATTCATACTAGTTTCTTT-AAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT
248 GTT-TTTG-TTCATACAAGTTT-TTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAA-
* * * ** * * *
9708997 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAATGAGTTCAAATAATTATGACTATTT
308 T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTT
* * ** * * * *
9709062 GAATAATTATATATTTTAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGCCATAAAATAAATGTTTTTATTCA
370 GAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCA
* * ** * * * * *
9709127 TATAAGTTTGCTCGAAAA-AAAGTAATACTAATCTATTAATATTT-CAAAATTAAT-AG---GAG
435 TAAAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAG
* * * * ** * * * *
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499 ATT-TAAAAATGAATCTGTTAACTGATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
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563 TTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT
* * * * * * * * * *
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* * * * *
9709379 TATGTTTATCTAACTAGATCAA
688 TCTATTTATCAAACAAGTTC-A
* * * *** *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
9709465 AAGAATTTTTCAAT-TT-A-CCTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATAA
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* * * * * * * *
9709527 AAAATTAATAA-TAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAATTTAAATAATTATGA
126 AAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * *
9709591 CTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGTCAT--AA-ATTTTTTTT
190 CTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* *
9709653 CTGTTCAT-CTAAGCTTACTTT-G-AATAAAATAAT-TCAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTA
253 -TGTTCATAC-AAG-TT-TTTTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTAA-A-AATTA
*** * * ** *
9709713 ATAAGTAAAAGATTCGGAAAATAAATATGTTTA-CAAATAAGTTCAAATCA-TTATGTTTATTGG
311 ATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATAATTATTTG
* * * * * * * *
9709776 AGCAATTATTTATTTCAACTTGTTAAGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
371 AACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCAT
* * ** * * ** * * *
9709841 ACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGACAATTAATAGGTAAAAGAT
436 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGA-
* * * ** *
9709906 TTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
500 TTTAAAAATGAATCTGTTAACT-G-ATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
9709970 TTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTGATGCACGCTTATTT
563 TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT
** * * * *
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626 GGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-A
* * ** *
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687 ATCTATTTATCAAACAAGTTCA
* * * * * * * *
9710119 AATAGTTATAACTATTTGAA-AATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTCATAA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
** * * * * * * * * * *
9710182 ACCAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAAAA
64 AATAATTTTTTATGTTCATACAAGC-TTATTCAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ATA
* * * * * * *
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127 AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAC
* * * * * * *
9710311 TATTTGCATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTATC
191 TA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * *
9710375 TATTCATACAA-TTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAAT-A-
253 TGTTCATACAAGTTTT-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * * * * ** **
9710437 AG-TTTGAGAATTACAAAATAAAT-CTAAACAAATTCAAATGGTCAT-GTCCATTCAAACTCTTA
316 AGATTTAAAAAATA-AATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAAT-TATTTGAACAATTA
* * * * ** * * *
9710499 TCTATTTTAAATCGTAATGACAGTTGGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATGCAAAA--
379 TATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCAT--AAAAGC
*** * ****
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442 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAA
* * * * * * *
9710623 ATGAAATCTATTTACTAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAAT
507 ATG-AATCTGTTAACT-GATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
9710688 CCTTATGATC-TTT-ATTTGTCAAAAAAAAAAAT-TAT-T-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAA
570 CATTATGAACTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTGGAATAA
* * * * * * * *
9710748 AATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGGGATTTAAAAAATAAATGTGTTT
633 AATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-AATCTATTT
** * *
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* ** * * * * * *
9710827 AATAGTTAAAACTA-TTAAAGCAATTATAAATTTCAAATCA-TTTAAACCTTTTGTTTAGTCATA
1 AATAATTATGACTATTTAAA-CAATTACATATTTCAAATTACTAT-AATC-TTTGTTTTGTCATA
* * * * *
9710890 AAACAATTATTTTA-GTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA
63 AAATAATT-TTTTATGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-A
* * *
9710954 -AAATATTAATGACCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTGAAATAGATT
125 TAAA-ATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAG-TT
* * * * *
9711017 -TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCGTTATTACCTTTCATTTTGTCATAAATCAATT
186 AAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACATTT-TTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
9711080 GTTTTAGTTCATAAAAACTTATTT-GAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAATAA-TA
248 GTTTTTGTTCAT-ACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTA
* * * * * * * *
9711143 AGCAAGAGATTTAAAAACTAAA-ATTATTTTCTAAACCACTTCAAATATTTATGACTT-TTTGAA
311 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-AATTATTTGAA
* * * * * *
9711206 CAGA-TATCA-ATCTCAAATCGTTATGATC-TTTG-TTGGCTCATAAAATAATTATTT-TTTATC
373 CA-ATTAT-ATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTATAT-TC
* * * * *
9711266 ATACAAGCTTATTC-AGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG----A
434 ATAAAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACA
* * *** ** * * * *
9711326 GATTTGAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTGTCT
498 GATTT-AAAAATGAATCTGTTAACTG-ATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * * *
9711391 ATTTCAAATCGTTTTGATCCTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATT
561 ATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-T
* * * * * *
9711456 TGGAATAAAATAATACTAATTTACTAA-AATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAATAT
625 TGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAA-CT
* * *
9711520 AAATATGTTTACCAAACAAGTTCA
686 -AATCTATTTATCAAACAAGTTCA
* * * * * * ** * **
9711544 AATAGTTATGGCTATTTCAACAATTATC-TATTTAAAATCATTACGACCATTTAATTTGTCATAA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
* * * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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*
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191 TA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
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* * * * * *
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** * * * * ** * * * * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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502 T-AAAAATGAATCTGTTAACTG-ATTAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * **
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * * *** * * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATT-ACATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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126 -AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* ** ** * * *
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190 CTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * *
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* ** * * * * * *
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438 AAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGATT
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502 TA-AAAATGAATCTGTTAACT-GATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * * * *
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565 CAAATCATTAT-GAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-G
** * ** * * * * * *
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627 GAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT---AAACT-AA
* *
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688 TCTATTTATCAAACAAGTTCA
* * * * ** * * ** * *
9713700 AATAGTTATGAATATTTGAACAACTATTTATGTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGACATAAA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * *
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* * ** * *
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126 AAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACCAATTCAAATAGTTAAG
* * * * * * * *
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189 ACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * * * *
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* * * * * * * * * ** **** * *
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* * * * * *
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375 ATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTAT-ATTCATAA
* * * * * * *
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438 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGATTT
* * * ** * * * ***
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* * * * * * *
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566 AAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TGGA
* * * * * *
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629 ATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-AATC
* **
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690 TATTTATCAAAC-AAGTTCA
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9714422 AATAGTTAAGACTATATGAACAATTATC-TAATTT-AAATTGTTATGACCTTTTGTCTGGTCATA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CAT-ATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
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63 AAATAATTTT-TTATGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTA
* * * * * * *
9714547 TCAAAAATTAATAAATAAGATA-TT-AAAAA-AAA-TTATTTACCTAAGCAATTCAAATAATTAT
125 T--AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAA
* * * * * *
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188 GACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAA-CAATTGT
* * * * * * *
9714672 TTTTGTTCATAGAAGTTTGTTCAAAATGAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAATAATTAATA
250 TTTTGTTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATA
* * * *
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314 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-AATTATTTGAA-CAA
* * * * * ** * * *
9714799 TTATTTATTTCAAATTGTTATG--CTATTTGTTCTCTTATAAAATAGTAATTTCTATTCATACAG
376 TTATATATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAAA
* * * * ** * * * *
9714862 GCTTATTCAGATTAAAATAATAATAATTTTTTAATATTTTGACAATGAATAAGTAAGAAATTTTA
440 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAACAGA-TTTA
* * * * * * * * *
9714927 AAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
504 AAAATGAATCTGTTAACTG-ATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
9714992 ATCATTATGACCTATTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC-AGGTCATATAAGGTTATTTGAAAT
568 ATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTGGAAT
* * * * *
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631 AAAATAATTCTAAT-TTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAACT-AATCT
** *
9715119 ATTTATGGAACAAGTTTA
691 ATTTATCAAACAAGTTCA
* * * * * * * *
9715137 AATAATTATGACCATTTGAACAATTATC-GATTTGAAATCACTATAACCTTTTGGTTTATCATAA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTATAATC-TTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
9715201 AATGATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTA-A
64 AAT-AATTTTTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATA
* * * * * * *** *
9715265 GACAATTAATATGCAAAAAAATTT-TAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAATTTCAAATAGTTAT
127 -A-AATTAATA-ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAA
* * ** * * * *
9715328 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACAATATAACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGGT
188 GACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * ** *
9715393 TTTGTTCATGCCAACTTATTTC-AAATAAAATAAAATAAATCTATTAATGCTCCAAAAATTAAGA
251 TTTGTTCAT-ACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATA
* * *** * * * * *
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314 AG---AGATTTAAAAAATAAA--TATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAC
* * * * ** * * *
9715520 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGCTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTAAAAAA
374 AATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAA
* * * * ***
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* * * * ** * * *
9715648 TAAAAATAAATTTGTTTACCGAGCGAGTCCAGATAGTTATGACTATTT-AATCAATTATTTATTT
502 TAAAAATGAATCTGTTAACTGA-TTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTT
* * * * * * **
9715712 CAATTCATTATGAACCTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTCTCTATTCATAAAAGTTTATTCAAA
565 CAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-GGA
* * *
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* *
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689 CTATTTATCAAACAAGTTCA
* * * * ** * ** *
9715860 AATAGTTATGTCCACTTAAATTATTGTC-TATTTCAAATTGTTATGACAT-TTGGTTTTGTCATA
1 AATAATTATGACTATTTAAACAATT-ACATATTTCAAATTACTAT-A-ATCTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * ** * * *
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63 AAATAATTTTTTATGTTCATACA-AGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT
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9715986 CAAAA--ATTAA-TAAGAGGTTTAAAAACTAAATCTCTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTACGA
126 -AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *
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190 CTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * * ** * * *
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253 TGTTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-
* * * *
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316 -A-GATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ATTATTTGAACAATT
* * * * * ** * ** * * *
9716231 ATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAGCTGCTTCA-GCTCTTACATGC
378 ATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTATATTCATAAAAGC
* * * * * *
9716295 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTCAAA
442 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAA
* * * *
9716360 AA--AA-CT-TT-ACTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCCATTTA
506 AATGAATCTGTTAACTGATT-----AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * **
9716420 AAAT-AGCTATG-ACCTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAA
566 AAATCA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-GG
* * **
9716482 AATAAAATAATAT-TACTTTATTAATATTAT-AAAAATTGATAAGTTGGAGATTTAAAACATAAA
628 AATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAC-T-AA
* * *
9716545 TCAATTTACTGAATC-AGTTCA
688 TCTATTTA-TCAAACAAGTTCA
* * * **
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTA-CATATTTCAAATTACTA-TAATC-TTTGTTTTGTCATA
** * * * *
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63 AAATAATT-TTTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT
* * * * * * * * *
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126 --AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAG
* * * * * * * * *
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189 ACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
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252 TTGTTCATACAAGTTTTTTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAA-T--TAA
* * * * ** *
9716885 CTAAGATATTTAAAAAATAAA-ATTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGCTA-AGGCTATATGAAC
312 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ATTATTTGAAC
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9716948 AATTCTTTA-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAACAATT-TTT-TCAGTTCTTA
374 AATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAT-A-TTCATA
** * *
9717010 CTAAA--TTATTTGAAAT-AAA-AA-A--AATTTATTAATATTT-CAAAATTCAATCAGT-ACGA
437 --AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATT-AATAAGTAAC-A
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9717066 CATTTAAAAAAT-AATTATGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATC
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* * * * * * *
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560 TATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * ** * *
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* *
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685 T-AATCTATTTATCAAA-CAAGTTCA
* * * * * *** * *
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1 AATAATTATGACTATTTAAACAATTACAT-ATTTCAAATTACTAT-A-ATCTTTGTTTTGTCATA
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63 AAATAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-
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254 GTTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATATTAAT-TTATTAATATT-TAAAAA-T--TAA-T
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313 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATT
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9717666 ATGGATTTGGAATCGCTATAACCTTTTGGTTTGTCAAAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAGCT
378 ATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAAAAGCT
* *
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*
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* * * * * * * ** *
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* * * * *
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* * *
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*** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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*
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* * **
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* ** * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * * * * **
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* ** * * * *
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** * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * * * *** *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
9697444 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATATTTTTGT-
314 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TA
* * * * * * *
9697489 TCATATAAGTTTTTTTGAAATAAAAAAATACTAATCTATTAATATTTC-AACACTAAT-A-T--G
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
9697549 AGATTTAAAAATTATATTTGTTTATCAAACCCA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGTACAATTAT
66 AGATTTAAAAAATAAATATG-TTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTAT
* * * * *
9697613 TTATTTCAAA-CTATTATGAC-TTTTATTTCTGTTACAAAACAATAG-TT-TAAGTTCATACAAG
128 CTATTTCAAATC-ATTA--ACATTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTAA--TCATACAAG
* ** * * * * * *
9697674 CTTATTTAGATTAAAATAATACTAATGTATTAAAATTTCAACAATTAATAAGTCAAAAAATTTTA
187 CTTATTTGGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAA
* * * * * ** *
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251 AAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCA
* * *
9697803 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTAA
315 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT---TTTA
* ** * * * * * *
9697850 T-ATA-AAAC-TATTCAAAATAAAATAATACAAAGTTATTAATATTCCAAAAGTTAA-AATTAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * *
9697911 AGATTTAAAAAATGAATCTAT-TTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
66 AGATTTAAAAAAT-AA-ATATGTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTAT
* * * ** * ** *
9697975 CTATTTGAAATTACTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTTTGTTCATACAACCTT
128 CTATTTCAAATCA-T-TAA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTT
* * * * * **
9698039 ATTT-CAAATAAAATAATATTAATATATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAATAAAAGATTTTTA
190 ATTTGGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * ** * * *
9698101 AAA-AAATATGTTTATTGAACAAATTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAA
252 AAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * *
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317 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA
* * * *
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1 -TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * *
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* ** * * * * * * **
9698334 TATCTATTTTAAAAAATTGTGACCTTTTGTTTTATAAT-AAACAATTGTTTCCATTCATATTAGC
125 TATCTATTTCAAATCA-T-TAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGC
* * * * * *
9698398 TTATTT-AAAAAATAATAATACTAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAA
188 TTATTTGGAAAAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * ** * *
9698462 AAATGAATCTATTTACT-AAAGATGTTCAAATAG-TATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
252 AAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * *
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316 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTTA
* * * *
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** *
9698631 A-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTATTTTAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
64 AGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATT
* * * *
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* * * * *
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188 TTATTTGGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * *
9698816 AAATAAATCTATTTACT-AAGCGAGTTCAATTAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
252 AAATAAATCTGTTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* *
9698880 ATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
316 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA
** * * * *
9698922 TTCATACAATTTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTCTTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTT
1 -TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * *
9698986 GGAGATTTAAAATATAAATCTAT-TTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTA
64 AGAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT-AACAA
* * * * ** * * **
9699048 TTATCTATTTCAAATCATTAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAGTTACTGTTAATGCAAAAT
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** ** * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * *
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318 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTTTA
* * *
9699278 TCATACAAGCTTA-TT-AAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATGAGTA
1 TCATACAAGCTTATTTGAA-A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * *
9699341 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTT-TGCTGAACTGGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT
64 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTAT-C-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TAACAATT
* * * * * * *
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126 ATCTATTTCAAATCA-T-TAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-ATCATACAAGC
* * * * * * * *
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188 TTATTTGGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* ** ** * * * * *
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252 AAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAA-TA--A-T-TATCTAT
* * * *
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311 TTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TTTA
* * * * * *
9699646 TCATAAAATCTTATCTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAG
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
9699711 AGATTTAAAAACTAAA-ACTGTTTTCCAAACCAA-TTCACATAGTTATGACTATTTGAACAAATA
66 AGATTTAAAAAATAAATA-TGTTAT-CAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTA
* ** * * ** * *
9699774 T-TAATCTCAAATCATTATGATTTTCATTTTCTCATAAAACAATTCCTTCTGATCATCCAAGCTT
127 TCT-ATTTCAAATCATTAACATTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCTT
* * * *
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190 ATTTGGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
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255 TAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * **
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* *
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CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA
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* * * * * * * *
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* * * ** ** * *
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*
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* * * * * *
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* * * * *
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** ** * * * **
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* * * * * * * * * * *
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1 TTACCAAACCATTTCAAATAGTTAAGACTATAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAAACT
* * * * * * * * *
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* * ** *** ** * * * * * **
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* ** * ** * * * * *
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* * ** *** ** *
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* * ** ** ** **
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* * * * * * ** * * * *
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* * * **** *
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* * ** * * *
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* * * * * ** * * * *
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1 TTACCAAACCATTTCAAATAGTTAAGACTATAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAAACT
* * * * * * *
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* * * * * **
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** * * * * * *
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1 TTACCAAACCA-TTTCAAATAGTTAAGACTATAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAAAC
* * * * * ** * * * ** *
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* * * * * * **
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* * * ** * * * *
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* * * * ***
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* ** *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (181 bp):
TTACCAAACCATTTCAAATAGTTAAGACTATAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAAACT
TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTGTTCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAAT
TAATAATATTCCAAAAATTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAGTAAATATAA
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Period size: 897 Copynumber: 4.5 Consensus size: 892
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* * * * * *
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* * *
9700238 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTA--AGATAAGTTTA-CTCAAAATAAAATAACATTA
127 TT-TTTTGTCATAAAATAATT-TTTTT-TTATCATACAAGTTTATC-CAAAATAAAATAATATTA
* * * * * * * * *
9700300 ATTTAGTAATATTTAGAAAATTAATTAGCAAGAGAGTTAAAAAGTAAATCTAATTATCAAACTAT
188 ATTTATTAATACTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG
* * * * * *
9700365 TTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATACTTATCTATTTCAAAACATTTAA-ACTTTTATTTTGTCA
252 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTAAGAC-TTTATTTTATCA
* * * * * * * * *
9700429 TTAAACAATTCGTTTTGTTCATTCTATTTTATTTGGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTC
315 TAAAACAATT-ATTTTTTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTA
* * * * ** *
9700494 CAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAGTAAATATAATTGCCAAACCA-TTTCAAATAGTTA
379 CAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAAG-AAATTTGTTTGCCGAACCAGTTT-AAATAGTTA
* * * * *
9700558 AGACTATAAGAACAATTGTCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTCGTAAAACAATTAT
438 AGACTATAAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGTAGTAAAACAATTAT
** * ** * * * *
9700623 TTTGTTCTTACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA
503 TTCATTCTCACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTAATAACATTCTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
9700688 GTAAGATATTTTAAAAAAAATTGTTTACCAAACCAGTTCAAATGGTTAAAACTATTATAACAAAT
568 GCAAAAGATTTAAAAAAAAATTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTAAAACTATTATAACAAAT
* * * * * * *
9700753 ATCTATTTGAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTCCATTTCATACAAGCT
633 ATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATTATTCCAGTTCATAAAAGCT
** * * **
9700818 TATTTAGAATAAATTAATAATAATTTATTAGCATTTGGAAAATTAATAAGAAACAGATTTAAAAA
698 TATCCAGAATAAAATAATAATAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGAAACAGATTTAAAAA
* * * * *
9700883 ATTAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATTACCATTCAAACATTTGTCTATTTAAAAG
763 AATAAATCTGTTTACGAAATAAGTTCAAATAGTTATGACCATTCAAACAATTGTCTATTGAAAAG
* * *
9700948 CATTATAACCTTTTGATTTATCATAAAACAATTGCTTAAGTTAAAACAAGCTT-AGATC-GAATA
828 CATTATAACCTTTTGATTTACCACAAAACAATTGCTTAAGTTAAAACAAG-TTCA-ATCAAAATA
9701011 AA
891 AA
* *
9701013 ATAATACTAATTTATTAATATTTCTTAAAA-TAATAAGTAAAAAATTTTTAAAA-TAAATATGCT
1 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAA-TTTAAAAAGTAAATATGCT
* * * * * *
9701076 TGCCAAATCAATTAAAATAATTATAGCCATTTGAACGATTATTTATTTCAAATCATTCTAACTTT
64 TACCAAATCAATTAAAATAATTATAGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTT
*
9701141 TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTTTATCATACAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTA
129 TTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTTTATCATACAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* * * * *
9701206 TTAATACTTCAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTCAAA
193 TTAATACTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAA
* * *
9701271 TTGTTATGACTCTTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTAAGATCTTTATTTTATCATAAAACA
258 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAAGA-CTTTATTTTATCATAAAACA
* * * * * *
9701336 ATTATTTTTTATCATAGAAGCTTA-TT-CATTAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
322 ATTATTTTTT-TCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAAT
* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * **
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* * * ** * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* *
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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** *
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* * ** * * * ** *
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* * * * * * ** * *
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* * * * *
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* ** **
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250 CAAATAGT--T-A--A---G---A----C--TATTA---GAA-CAATTATCTATTGAAAATCATT
* * * * * * * *
9702944 ATAATCTTTTGTTT-GTCATAAAATAATTATTTCA-ATTCATATAAAATTATTCAAAATAAA
294 ATAACCTTTTTTTTAGCCACAAAACAATTGTTTCATA-TCATA-CAAGTTATTCAAAATAAA
* * * * *
9703004 ATAATACTAAGTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** * * * * * * * *
9703068 ACTGAACAAGTTTAAATAATTGTGACTATTTCAATAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTT
65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTT
** * * * ** *
9703133 TGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTTATACATTCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATT
129 TG-TTTGTCATAAAACAATTTTTT-TAATCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATT
* * * *
9703197 TATTAATA-TT-AAGATAATTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAATAAG
190 TATTAATATTTCAA-A-AATT-A-A--TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAAA
* ** ** * * * * * ** * * *
9703259 TTTAAATCTTTATCACTATTTGAGCAATTTTTTACTT-TAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGT
248 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTTT-TTTAGC
* * ** * ** *
9703322 TATAAAACAATTAATTC-TATTTATACAAGCTTATTTGAATTAAA
311 CACAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * *
9703366 ATAACATTAATTTATTAATATT-TCAACAAA-TAATAAGAAAAAGT--TTT-AAAAATAAATATG
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AAATTAAT-A-AATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * *
9703426 TTTTCTAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTT-AAGTAATTATCTATTTTAAATCATTGTGA-
62 TTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTAAAATCATTAT-AT
* * * * * *
9703489 CCTTTTGTTTTGTTAAAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
124 CCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT
* * * * * * *
9703554 AATTTATTAATATTTTC-AAAATTAATGAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGA
186 AATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAAT--A-AA-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACA
** * * * **
9703618 TGTTCAAATAGTTATGACAATCTA-AACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATAATATTTTGTTTT
246 AATTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTT
* * * *
9703681 -GTCATAAAACAATTGGTTC-TATTCATACAAGCTTATT-ATGAATAAA
308 AGCCACAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCA-AAATAAA
* * * *
9703727 ATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA--AATTTTAAAATATAAATATGT
1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGA-TTTAAAAAATAAATCTGT
* ** * * * * *
9703788 TTTCTTAATATGTTCAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATCA
63 TTACCAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCC
* * * * *
9703853 TTTCAT-TTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTCGTAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
126 TTT--TGTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
9703917 ATTCATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACGAG
187 ATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAA
* * * * ** * * * * *
9703982 TTTAAATAGTTATGACTATTTA-AAAAATTATTTATTTCAAATCGTGATGATCTTTTGTTTTA-T
248 TTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGC
* * * * **
9704045 TATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAATTTTATTTGAAATAAA
311 CACAAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAA-GTTATTCAAAATAAA
* * ** * * *
9704089 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * * * * ** *
9704153 TCAAACAAGTTAAAATAGTCACGTCCATTTGAACTATCATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTT
66 CCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTTT
* * * * *
9704217 TATTT-TGCTGTAAAACTATTGTTTCT-ATACGA-ACAAA-ATTATTC------AA-AATA--AA
129 TGTTTGT-C-ATAAAACAATT-TTTTTAAT-C-ATA-AAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * *
9704269 ---A-TAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCAAACCAGTTTAA
188 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAA
* * ** * ** * *** *
9704330 ATTA-TTATGA-TATTTG---TTTTGTC-A-T-AAAA-CAATTAT-TTCTATTCATACAAGCTTA
253 A-TAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATC-ATTATAACCT-TT-TTTTTAGC-CA
* * * * * * *
9704385 TTCAAAGTA-AAATATTGC-TA-AATTGATAA--TATGCTAAAAGT-TA
313 --CAAA--ACAATTGTTTCATATCA-T-ACAAGTTATTC-AAAA-TAAA
** ** * * **** * * * * *
9704428 ATAAGTAAGAGATTTA--AA-A-AATAAATATGT-TTGCCGAA-TCAATTCAAATAGTAAAGACT
1 ATAA-TACTA-ATTTATTAATATTCTAAAAAT-TAATAAATAAGT-GATTTAAAAAATAAA-TCT
* * * * * * * *
9704487 GTTAGAACAATTACTATTTCAAATCA-TTATTACCT-TTTGTTTAGTCACAAAATAACTTTTTTA
61 GTT-TACCAA--AC-AGTTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTG---A---AC-AATTATCTATTTAA
** * * * * ** * **
9704550 GTTCA-TACATGC--TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT-AT--T--AA-C--ATTCAAA-A
113 AATCATTATATCCTTTTGTTTGTCATAAAACAAT--TTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCAAATA
* ** * * *
9704603 AATTAATAC--A--TAAGAA-ATTT-AAAAA--AATAAATCCGCTTACAAAATAAGTTAAAATAG
176 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAA--AGATT-TAAAA-AAG----AA-A-
* * * ** * * * * * * * *
9704660 TTATGATTATTTGAA-TAATT-ATCTATTTAA-AATAAATATAAC-CTTTTTTATT-ATAA--A-
231 TT-TGTTTA-TCGAACAAATTCAAATAGTTAAGACT-ATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCAT
* ** ** * * * * * * * * ***
9704717 -ATAA--TTGTTTCAATTCA-TAAA-AGTTAATTTGAAATAAAATAA--TATT-ACTTTAACA
293 TATAACCTTTTTTTTAGCCACAAAACAATT-GTTTCATATCATACAAGTTATTCAAAATAA-A
* * ** * * * * * *
9704772 ATATTTC-AA-AAATTGATAAGT-TAGAGATT--TAAA-AA---A---------TAAGTCAGTTT
1 ATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * * * **
9704819 ATCTAATCAGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTACAAACTTT
65 A-CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTT
* * ** *
9704884 TGTTTTGTCATAAAAAAAATTGTTTTTCATCATACTAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATT
129 TG-TTTGTCAT-AAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT
* *
9704949 TATTAATATTTCAAAAATTAATATGTACGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-G---AAA--C
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATA---A-AAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTC
* * ** *
9705008 ---TAGTT---CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTT--------
251 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCCACAA
* * *
9705059 ----ATTATTTCAGT-TCATATAAGCTTATTCAGAATAAA
316 AACAATTGTTTCA-TATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * ** * *
9705094 ATAATACTAATTTAATAATACTCTAAAAATTAA-AAACTAAAAGATTTAAAAAGTAAATCTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAA-TAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * ** * * ** * * * *
9705158 GCTGAAGTAGTT-TAATCAATTAAAACTATATGAACAATTACCTATCTCAAA-CAGTTATGA-CT
65 AC-CAAACAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTAT-ATC-
* * * * * * * * *
9705220 TTTTATTTTTTTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATAC-A
125 CTTT-TGTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTA
* * * *** *
9705284 AATTATTAATATTTCAAAAATTAATACATA-ATTT-AAAAAGTGAATCCATTTA-CTGAATC-AG
187 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AAAGATTTAAAAAAG-AAATTTGTTTATC-GAA-CAAA
* * * * ** ** * * * *
9705345 TTTAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTGTTT-GTC
248 TTCAAATAGTTAAGACT-ATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCC
* * * * ***
9705408 ATATAACAATTATTT-TTATCATACAAGTTTATTTGGAATAAA
312 ACAAAACAATTGTTTCATATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* ** * * * *
9705450 ATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAGGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATATGATT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * ** * * * * * *
9705514 ACTGAACCAATTTAAATAATTAAAACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCATTATAGCC--T
65 AC-CAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTT
** * * * * *
9705577 T-AAT-T-AT-------TTTTGTT--T-ATACAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATATTAATATA
129 TGTTTGTCATAAAACAATTTTTTTAATCATAAAAGCTTA-TTCAAAT-AAAATAATACTAATTTA
* * * * *
9705629 ATAATATTCCAAAAATTAATAACCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCGGAACTAATTTC
192 TTAATATTTCAAAAATTAAT----AAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAAC-AAATTC
* ** * *
9705693 -AATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTATCCATTTCAAATCA-T-T----TTTGTTTT-GCCATA
251 AAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCCACA
* *
9705749 AAATAATT-TTTCA-ATTCATACTAGTTTATTCAAAATAAA
315 AAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * ** *
9705788 ATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCCAAAATTAATATGTAAGTGATTTAAAAAAT-AATTTGTT
1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * *
9705850 TACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CAT
64 TACC-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCT
* *** * * ** *
9705914 TTTGTTTTGTCATAAAACGAATGTTTTTGGCCATATAAGCTTGTT-TGAT-AAAT-ATACTAATC
127 TTTG-TTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * * ** * *
9705976 TATTAACATTTTAAAACTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTAAACCATTTCAAAT
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAAAT
* * * * * * ** ** * * **
9706041 ACTTATGACTTTTTA-AGCAATTATTTCTTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTCA-TTACAAAA
255 AGTTAAGAC-TATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTT-TTTAGCCACAAAA
* * ** *
9706103 CAATAGTTTC-TATTTATACAAGCTTATTTGAATTAAA
318 CAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* ** * * * *
9706140 ATAATACTAGTTTATTAATATT-T--TGA-TAATTAATAACT-A---AACAAATAAATATGTTTA
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
** * * * * * * ** * *
9706197 CTGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATTGTTGTGA-CTTTT
66 CCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTTT
* * * *
9706261 TGTTTTGTCATAAAGA-AATTTTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGT
129 TG-TTTGTCATAAA-ACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * * *
9706325 TATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAAAGAATTAAAAAATG-AATCTATTCACCAAATAAGTT
190 TATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAA-GAAATTTGTTTATCGAACAAATT
* * * * * * * * *
9706389 TAAATAATTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTGAAATTGA-TATAAAC-GTTTTTT-GTCA
250 CAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCCA
* ** * * *
9706450 TAAAATTATTTTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA
313 CAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* *** *
9706492 ATAATA-TAAATTTATTAATA-T-TAAGATAATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAGATCTG
1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAAT-AAGTGATTTAAAAAATAAATCTG
* * ** * * * **
9706553 TTTATCGAATCAGTT-AAATCTTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-C
62 TTTA-CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATC
* * * ** * * *
9706616 TTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTACTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATATTA
125 CTTTTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * * *
9706681 ATTTATTAATATTGTGATAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAACCAA
187 ATTTATTAATATT-TCA-AAA-ATTAA-TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAA-CAA
* * * * * ** *
9706745 GTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT-GT
247 ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGC
* * * *
9706809 AATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATATAAGCTTATTCGAAATAAA
311 CACAAAACAATTGTTTCA-TATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
9706853 ATCATTCTAATTTATTAA-ATT-TCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * *** * * *
9706916 GCTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCAAAATAATTATCTATTTCAGAA-CACTATGA-CCT
65 ACCAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCATTAT-ATCCT
* * * ** ** **
9706979 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGATTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAA
127 TTTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AA
* * * * * **
9707043 TTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAGATATGTTT-TCTGAACACG
188 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AAAGA-TTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAAA
* * * * * ** * *
9707106 TTTAAATAGTTATGCCTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTC
248 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCC
* * * * **
9707170 ATAAATCAATTGTTTC-TGTTCATAAAAGCTTATTTGAAA-AAA
312 ACAAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * ** ** *
9707212 ATAATATTAATTTATGAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
** * * * * *
9707277 CTGAGCAAGTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAT-CTTT
66 CCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTTT
* * * ** **
9707341 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTTCAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
129 TG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
9707406 -TTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAATCGTTTACCAAACAAGTTCA
191 ATTAATATTTCAAAAATTAATAA---A-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCA
* * * * * * * ** * * ** * **
9707470 AATAGTCATGTCCATTTGAACGATCATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTT-GTCGTAA
252 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCACAA
* * *
9707534 AATAATTGTTTC-TATTGATACAAAATTATTCAAAATAAA
316 AACAATTGTTTCATA-TCATAC-AAGTTATTCAAAATAAA
* * * * * *
9707573 GTAATGCTAATTTTTTAATATT-TCAAAATT--T-AATAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTT
** * ** *** *
9707633 ATTGAACCAGTTCAAATTTTTATGA-TATTT---TTTTTATC-A--TAAAA-CA--AT-T-GTTT
65 A-CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTT
* * * * *
9707686 CTATTTAG--AT-AAGC--TTATTCTAA--GTAAAA---TATTGCCAAAT----T-A-A-TAA--
129 -TGTTT-GTCATAAAACAATTTTTTTAATCATAAAAGCTTATT--CAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * *
9707732 TA----T-TTT-ACAAATTAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATGTATTT-GCTGAACCAATTCAA
190 TATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAAATTCAA
* * ** ** * * ** *
9707790 ATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTTGTTTAGTTATAAA
253 ATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTT-TTTAGCCACAAA
* * * * * *
9707855 ATAATTTTTTTAGT-TTATACGTACTTATTCAAAATAAA
317 ACAATTGTTTCA-TATCATAC-AAGTTATTCAAAATAAA
** * * * ** *
9707893 ATAATACTAATTTAGCAACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT
* * * * *
9707958 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGA-CCTT
65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCC-T
* * * * * * *
9708022 TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTCTAGTTCATACAAGCTTATCCAAAATAAAATAATGAC---
127 TTTG-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT-ACTAA
* * * ** ** *
9708084 TTTATTAATATTTCAAAAATTGTTAAGTTAGAA-ATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAAGTAG
188 TTTATTAATATTTCAAAAA---TTAA--TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAA
* * ** * * * ** * * *
9708148 TTTAAATAATTGTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-ATTTCATTTT-GT
248 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTAT-AACCTTT-TTTTTAGC
* * * * *** *
9708211 CATAAAACAATTGTTT-TTATCATGCATGCCTT-TTTGGAATAAG
311 CACAAAACAATTGTTTCATATCATACAAG--TTATTCAAAATAAA
* * ** *
9708254 ATAATA-TGAATTTATTAATATT-TCAAACATTTATAAGCAAGTGATTTAAAAAATAAATCTATT
1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * *
9708317 TACCAAAC----C----AG-T-T-CCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTT
64 TACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTT
* * * * * * *
9708371 TGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCGTATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTT
129 TGTT-TGTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * ** * ** *
9708436 AATAATATTTTGAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTGCCAAAGTAGTTCA
191 ATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCA
* * * * * * *
9708501 AACAGTTAAAACTA-TATGAACAATTATCTACTT-CAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCAT
252 AATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTTT-TTTAGCCAC
* ** *
9708563 ATAACAATCATTACAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
314 AAAACAATTGTTTCA-TATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * *
9708604 ATAAAACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * * * * *
9708668 ACCAAATTAGTTTAAATAATTATGGCCAGGTT-AATAATTATCCATTTCAAATCGTTAT-TACAT
65 ACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAT-CCT
** * *
9708731 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTC-TAACAAGTTTATTCAAATAAAATAACACTAAT
127 TTTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAA-AAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *
9708795 CTAATAATATTCCAAAAATTAATAGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAATT
189 TTATTAATATTTCAAAAATTAATA---AA-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATT
* * ** ** *
9708860 CAAATA-TTTAGAACTA-TATGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTTT-GTC
250 CAAATAGTTAAG-ACTATTA-GAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCC
* * * ** * * *
9708922 ATAAAATAGGTTTTGTTGGAT-TCATACTAGTTTCTTTAAAATAAA
312 ACAAAACA---ATTGTTTCATATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * *
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1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
** * * * *
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64 TACC-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCT
* * * * * * * **
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127 TTTG-TTTGTCATAAAA-CAATTTTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAA-TAATACTAA
* ** * * * * * *
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188 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAA
* * * ** ** * ** *
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253 ATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTT-TTTAGCCACAA
* * * *
9709283 AACAATAGTTTC-TATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAA
316 AACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
9709322 AGAATACTAATTTATTAATATT-TCGACATTTAATAAGTAAAAT-ATTTTAAAAATAAATATGTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAAT-AAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * *
9709385 TATCTAACTAGATCAAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAT-C
64 TACCAAAC-AGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCC
* * * * *
9709449 TTTTATTTTGTCATAAAAGAA-TTTTTCAAT-TTACCTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
126 TTTT-GTTTGTCATAAAACAATTTTTTTAATCATA--AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * * * * *
9709512 ATTTATTAATA-ATAAAAAATTAATAATAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAA
187 ATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAA-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAA
* * * * * * *
9709575 ATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAAT-AGGTATAACCTTTTGTTTT-G
247 ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCA-TTATAACCTTTT-TTTTAG
* * ** * * **
9709638 TCA-TAAA-TTTTTTTTC-TGTTCAT-CTAAGCTTACTT-TGAATAAA
310 CCACAAAACAATTGTTTCAT-ATCATAC-AAG-TTA-TTCAAAATAAA
* * * ** *** *
9709681 ATAATTCAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTCGGAAAATAAATATGTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* ** * * * * * ** * *
9709744 TA-CAAATAAGTTCAAATCA-TTATGTTTATTGGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTA-AGACT
64 TACCAAA-CAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA-TCC
* * * * * * *
9709806 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAA
126 TTTTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* ** * * * * *
9709871 TTTATAAATATTTTGACAATTAATAGGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT
188 TTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAAT
* * * *
9709936 TCAAATAGTTATGACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTA-T
249 TCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGC
* ** * * *
9709998 CATAAAACAATTGGTTTTGT-TGATGCACGCTTATTTC-AAATAAA
311 CACAAAACAATT-GTTTCATATCATACAAG-TTA-TTCAAAATAAA
* * * ** * * * *
9710042 ATAAT-TTAAATTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAATATATTTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
*** * *
9710106 TTGAACATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTT
66 CCAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCC-TT
* * * * * *
9710169 TTTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTT
128 TTGTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGC-TTATTCAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * *
9710234 ATTAAAATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAGTAAATTTGTTTA-CTAAGCAAGTT
191 ATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAAG-AAATTTGTTTATCGAA-CAAATT
* * * * * * ** ** * * * *
9710297 TAAATAGTTATGACTATTTGCATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTCTTTT-GTCAT
250 CAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCAC
* * *
9710361 AAAATAATTGTATC-TATTCATACAATTTTATTCAAAATAAA
314 AAAACAATTGTTTCATA-TCATACAA-GTTATTCAAAATAAA
* * * ** * * * *
9710402 ATAATATTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGAATTACAAAATAAATC---TAA
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * ** ** * * * ** *
9710464 AC-AA-A-TTCAAATGGTCATGTCCATTCAAACTCTTATCTATTTTAAATCGTAATGA-CAGTTG
66 CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTTTT
* * * ** *
9710525 GTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAAAATAATACCGATC
130 G-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCAT--AAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
**** * * * * * *
9710588 TATTAATATTTTGCCAATTAATAAGAGATTTAAAAATGAAATCTATTTA-CTAA-AATAGTTTAA
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAA-A-TTCAA
* * * * * * * *
9710651 ATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATCT-CAAATCCTTATGATC-TTTATTT-GTCAAAA
253 ATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTAT-TGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAG-C-CAC
* * *** *
9710712 AAAAAAATT-ATT--T-TCATACAAGCTTATTTGGATTAAA
314 AAAACAATTGTTTCATATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * * *
9710749 ATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGGGATTTAAAAAATAAATGTGTTTG
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* ** * ** * *
9710814 CCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTA-TTAAAGCAATTATAAATTTCAAATCATT-TAAACCTT
66 CC-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTT
* * * *
9710877 TTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
128 TTGTTT-GTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT
* * * * *
9710942 TATTAACA-TTCAAAATATTAATGACCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
190 TATTAATATTTCAAAA-ATTAAT-A--AA-AGATTT-AAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAAT
* * * * * * * * *
9711006 TGAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCGTTATTACCTTTCATTTT-GTC
249 TCAAATAG-TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTT-TTTTTAGCC
* * * * * **
9711069 ATAAATCAATTGTTTTAGT-TCATAAAAACTTATTTGAAATAAA
312 ACAAAACAATTGTTTCA-TATCAT-ACAAGTTATTCAAAATAAA
* * ** * * *
9711112 ATAATACTATTTTATTAATATT-T--CAA-TAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAAT-TATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT
* * * * * * * * *
9711172 TCTAAACCACTTCAAATATTTATGACTTTTTGAACAGA-TATCAATCTCAAATCGTTATGAT-C-
65 ACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCT
* * * * *
9711234 TTTGTTGGCTCATAAAATAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATACTAAT
127 TTTGTTTG-TCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAAT
* * * * * * * * * *
9711299 TTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTGAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAA
189 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAAA
* * ** * * * * * * *
9711364 TAGTTAAGACTATTAGAATAATTGTCTATTTCAAATCGTTTTGATCC-TTTGTTTAGTCATATAA
254 TAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTAT-AACCTTTTTTTTAGCCACAAAA
* * ***
9711428 TAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
318 CAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * ** * * *
9711465 ATAATACTAATTTACTAAAATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAATATAAATATGTTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTT
* * *
9711530 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATCATTACGA-CCAT
65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA-TATCC-T
** ** * * * **
9711594 TTAATTTGTCATAAAACAATTGCTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTGCTT
127 TTTGTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
** * * * * *
9711659 TATTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCAAATC-AGTT
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AAG--ATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAA-CAAATT
* * * * * * ** * *
9711723 CAAATAATCATGGCCATTTA-AACAACTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTT-GTCA
250 CAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCA
* * * *
9711786 TAAAACAATTGTTTTTCA-A-CATAGAAGCTTTTTAAAAATAAA
313 CAAAACAATTG--TTTCATATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * *
9711828 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAAGAAATATGTTTG
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-
*** * * * ** *
9711889 TTGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTT
65 ACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTTT
* ** * *
9711953 GTTT-TGCTATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCATAATAAAATAATAATAATTT
130 GTTTGT-C-ATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * ** * *
9712017 AGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCGAACTAGTTC
191 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAA--A--AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTC
* * ** * * * *
9712081 AAATAGTTAAGACTA-TATGAATAATTATTTATTTCAAATTACTATAACCTTTTGTTTT-GTCAT
251 AAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCAC
* * * ** * *
9712144 AAAACAAATATTTTAGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAGA
314 AAAACAATTGTTTCATATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * * * * *
9712185 ATAAAATTAATTTATTAACATT-TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** * * * * * * * ** *
9712249 ATTAAACTAATTCACATAATTATAACTATTTGCACAACTATCTATTTCAAATTGTTAT-TACTTT
65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAT-CCTT
** * * * *
9712313 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATT
128 TTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
* ** ** * * *
9712378 TATTAATATTT-AAAAATTAATTAGTAAGAGATTT-AAAAAGTAAATCTACTTGCCAAACCATTT
190 TATTAATATTTCAAAAATTAA-TA--AA-AGATTTAAAAAAG-AAATTTGTTTATCGAACAAATT
* ** * * ** *
9712441 TAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTT-GTCAT
250 CAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCA-
** * * *
9712505 C-AAACAATTCATTC-TAT-TTACATTATTTTCTTCAAAATAAA
313 CAAAACAATTGTTTCATATCATACA--A-GTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * * *
9712546 ATAATGCAAATTTAATAATACTCTGAAACTTAAT-AATCAG-GAAAATTTTTAAAAATCTAAT-T
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTG---A-TTTAAAAAAT-AAATCT
* * * * * ** * * *
9712608 G-TTA--AACCAATTCAAATAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTGTTTTAAGTCATTATGA-C
61 GTTTACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATC
* * * * * ** ** *
9712669 CTTATCTTGTGTCACAAAACAACTGTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAA
125 CTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAA
* * * *
9712734 TTCA-TAATATTTCAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTGAATC--
188 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAA-CAA
* * * * * * * * *
9712795 ATTACAAACAATTAAGACTATTAGAATAATTATATATTTAAAATCATTTTGACC--TTGTTTAGT
247 ATT-CAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGC
* *
9712858 CATAAAACAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
311 CACAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * ** *
9712902 TTAATACTAATTTATTAACATT-TCAAAAATTAATAAGA-AAAAGAGTT-AAAAATAAATCTGTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-ATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * *
9712964 TACAAAACAAGCTCAACTAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTT
64 TACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTT
* * * * * * * * *
9713029 TTGATTTGTCATGAAATAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGAAATAAAATAATACTAATA
128 TTG-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTAA-TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATT
** * * *
9713094 TATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATC-AGTT
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AAG--ATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAA-CAAATT
* * * * * * ** ** * * ** *
9713158 AAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTT-TTCAT
250 CAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCAC
* * * **
9713222 AAAACAATTATTT-TTGATCATATAAGCTTATTTGAAATAAA
314 AAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * *** * *
9713263 ATAATACTAATTGATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAATAATAAATCTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * * * *
9713327 ACCGAATCAATTCTAATAGTTATAACTATTTGAACAGTTATCAATCTCAATTCATTAAAAAT-C-
65 ACC-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT--ATATCCT
* * * * ** *
9713390 TTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTATTT-CTCATAAAAGCTCATTCAGTTGAAAATAATACTATTT
127 TTTG-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATT
* * * * * *
9713453 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAGAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAATT
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AAG--ATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAAATT
* * * * * ** ** * * *
9713517 TAAATAGTTAAAACTATCAGAATAATTATGTATTTCAAATTGTT-TAGACCTTTTGTTTAGTCAT
250 CAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATA-ACCTTTTTTTTAGCCAC
* * * * * * *
9713581 AAAATATTTCTTTAATGTCTTACAAGCTTATTCAGAATAAA
314 AAAACAATTGTTTCATATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
** * ** * ** ***
9713622 ATAACCCAAATTTATGGACATT-TGAAAAATTAATAAGCAAAACATTTGAAAAAATAAATCTGTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTT-AAAAAATAAATCTGTT
* * * * * ** *
9713686 TA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAACTATTTATGTAAAATTGTTATAACCTT
64 TACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTT
* * * * *
9713750 TTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATT
128 TTG-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTAA-TCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
* * * *
9713815 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAAAAATTTGCTTATTGAAAAAATTCA
190 TATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AAGA-TTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCA
* * * * * * * * * *
9713880 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTATTTT-GTCATAA
252 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACC-TTTTTTTTAGCCACAA
* * *
9713944 AACAGTTATTTCAGT-TTATACAAGCTTATTCAAAATAAA
316 AACAATTGTTTCA-TATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
9713983 GTAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTG
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * ** * * * * * **
9714048 CTGAATCAATTTAAAGAAATATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATCA-CCTTT
66 C-CAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTTT
* * * *
9714112 TGTTTGTTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAGAGTAAAATAATACTAATTT
129 TGTTTG-TCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
9714177 GTTAA-CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACCAGTTC
191 ATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAAATTC
* * * * * * * * * *
9714240 AAATAGTTATGACTATTTGAATAGTTA--TATCCGTCAAATCGTTATAACC-TCTTGTTATGTCA
251 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT-TG-AAAATCATTATAACCTTTTTTTTA-GCCA
* * * * *
9714302 TAAAACAATTATTT-TTGTTCATACAAGCTTATAT-GAAATAAA
313 CAAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAAG-TTAT-TCAAAATAAA
* * * * * * *
9714344 ATAATATTAATCTAATAATATTAC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
**** * * * **
9714408 GTTGAACTAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTAATTT-AAATTGTTATGA-CCT
65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTAAAATCATTAT-ATCCT
* * * ** * *
9714471 TTTGTCTGGTCATAAAACAATTTTCTCAATTCATACTAGCTTATTCGAAATAAAAGAA-AATGAA
127 TTTGT-TTGTCATAAAACAATTTTTTTAA-TCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AA
* * *
9714535 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGATATT-AAAAA-AAA-TTATTTACCTAAGC-AAT
188 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-AAGAT-TTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAA-CAAAT
* * * * * * ** * *
9714596 TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCCA-TGTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTC
249 TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTG-AAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCC
* * * * * * *
9714659 ATAAAATTAA-TGTTT-TTGTTCATAGAAGTTTGTTCAAAATGAA
312 ACAAAA-CAATTGTTTCAT-ATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * *
9714702 ATAATACTAATCTATTAATATT-T--TAA-TAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * *
9714763 TCAAACCAATTCAAATAATTATGAATATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAAT--TGT-TATGCTA
66 CCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTAAAATCAT-TATATCCT-
* * * * * * * * * * *
9714824 TTTGTTCTCTTATAAAATAGTAATTTCTATTCATACAGGCTTATTCAGATTAAAATAATAATAAT
127 TTTGTT-TGTCATAAAACAAT-TTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* ** * * * * * *
9714889 TTTTTAATATTTTGACAATGAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACTAGA
189 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AAG--ATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAAC-AAA
* * * * * * * * *
9714953 -TCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTATTGTTTT-GTC
248 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCT-TTTTTTTAGCC
* * * ** * **
9715016 ATAAAAAAATTATTTCAGGTCATATAAGGTTATTTGAAATAAA
312 ACAAAACAATTGTTTCATATCATACAA-GTTATTCAAAATAAA
* * * * * *
9715059 ATAATACT-ATGTTATTAATATTCTGAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT
1 ATAATACTAAT-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
*** * * * * * * *
9715123 ATGGAACAAGTTTAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCGATTTGAAATCACTATAACCTTT
65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTT
* * * ** * * *
9715188 TGGTTTATCATAAAATGATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACAAATT
129 T-GTTTGTCATAAAA-CA-ATTTTTTTAATCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
9715253 TATTAATA-TT-AAGACAATTAATATGCAAAAAAATTT-TAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAT
190 TATTAATATTTCAA-A-AATT-A-AT---AAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAA
* * * * * * * *
9715315 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAA-CAATATAACCTTTTGTTTCGTC
248 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCC
* ** * *
9715379 ATAAAACAATTGGTTTTGT-TCATGCCAACTTATTTC-AAATAAA
312 ACAAAACAATT-GTTTCATATCAT-ACAAGTTA-TTCAAAATAAA
* * ** * * * ** *
9715422 ATAA-AATAAATCTATTAATGCTCCAAAAATTAAGAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTT
1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATC--TGT
*** * * * * * *
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* * * * * * *
9715548 TTTGCTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTAAAAAAACCTTATTTATAATAAAATAATACTAAT
127 TTTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
9715613 TTATTAATA-TGCCAAAATTAATAAGTATAAGACTTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAGCGAGT
189 TTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-AAGA-TTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAAT
* * * * * ** * * *
9715676 CCAGATAGTTATGACTATTTA-ATCAATTATTTATTTCAATTCATTATGAACCTTTGTTTT-GTC
249 TCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTAT-AACCTTTTTTTTAGCC
* * * *
9715739 ATAAAACAACTGTCTC-TATTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAA
312 ACAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * *
9715782 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAA--GATTTAAAAAATTAATCTATT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-AT-AAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * ** * * ** *
9715845 TACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGTCCACTTAAATTATTGTCTATTTCAAATTGTTATGA-CAT
64 TACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCT
* ** * **
9715909 TTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCCTATTCATACACAA--TTATTTTGAATAAAATAATACTA
127 TTTG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATA-A-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTA
* * * ** * * *
9715972 ATTTATTATTATTTCAAAAATTAATAAGAGGTTTAAAAACTAAATCTCTTTA-CTGAACCAATTC
187 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATC-GAACAAATTC
* * * * * * * *
9716036 AAATAGTTACGACTATTTGAACAATTATCTATCT-CAAATCGTTATGATCTTTGTTTT-GTCC-T
251 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT-TGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAG-CCAC
* * ** *
9716098 AAAACATTTATTTC-TATTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAA
314 AAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * ** * * * ** *
9716139 AGATTGGTAAATTAATAATATTCTAAACATTAATAAGCAAG-GATCTAAAAAATAAA--TG--T-
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * *
9716198 CC--A-A-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTG
66 CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTTTG
* ** ** * * * * *
9716259 TTTAGTCATAAAATAGCTGCTTCAGCTCTTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
131 TTT-GTCATAAAACAATTTTTTTA-ATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** * *
9716324 TAACA-TTCAAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTCAAAAA-AACTTTACTTATTGAACAAGTTCAA
193 TAATATTTC--AAAAATTAATAA--AAG-ATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAA
** * * * * * * * *
9716387 ATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCCATTTAAAAT-AGCTATGACCTTTATTTTA-TCATAAA
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*
9716450 ACAATTGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAA
317 ACAATTGTTTCA-TATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * ** * * **
9716488 ATAATATTACTTTATTAATATTATAAAAATTGATAAGTTGGAGATTTAAAACATAAATCAATTTA
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * ** *
9716553 CTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-TAACTTT
66 C-CAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAT-CCTTT
* * * * *
9716617 TGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCATCAT-CAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTT
129 TG-TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT
* * * *
9716681 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AATTT
191 ATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-A--AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAA-CAAATTC
* * * * * ** ** * ** *
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251 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTAGCCACA
* * *
9716809 AAACAATTATTTC-TATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAA
315 AAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * *
9716849 ATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAT-ATTTAAAAAATAAAAT-TATT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAG-TGATTTAAAAAAT-AAATCTGTT
* * * * * * * *
9716912 TGCCAAACCAGTTCAAATAGCTAAGGCTATATGAACAATTCTTTA-TTCAAATCATTATGA-CCT
64 TACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCT
* * * * * *
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* * * * *
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187 ATTTATTAATATTTCAAAAATT-AAT-A--A-AAGATTTAAAAAAGAAATT-TGTTTATCGAACA
* * * * **
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246 AATTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTT-TTTTA
* * * * * * * *
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309 GCCACAAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * *
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1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-ATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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127 TTTGTT-TGTCATAAAACAAT-TTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* * * * *
9717394 TTATTAATATTTTGATAATTAA-TAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTATCAAACTAAA
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* * * * ** * * *
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248 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCT-TTTTTTTAGCC
* * * * *
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312 ACAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAA-GTTATTCAAAATAAA
* ** ** * *
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1 ATAATACTAAT-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** * * * ** ** ** *
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* ** * * *
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129 T-GTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTA-ATT
* * * * * * *
9717756 TATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAAATCTATTTACCAAACAAGT
190 TATTAATATTTCAA-A-AA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAAT
** * * * * * * *
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249 TCAAAT-AGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCC
* * * * *
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312 ACAAAACAATTGTTTCATAT-CATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * ** * *
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1 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * ** * * * *
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65 ACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-ATCCTT
* * * * * ** *
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128 TTG-TTTGTCATAAAACAATTTTTTTAA-TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
9718114 TATTAATATTTCAAAAATTAAAGAGTAAGAGAATTAAAAATAAATAAATCTGTTTATTGAACAAG
190 TATTAATATTTCAAAAATT--A-A-TAAAAG-ATT-TAAA-AAAGAAATTTGTTTATCGAACAAA
* * * *
9718179 TTCAAATAG-TAATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTATTGTTTT-
248 TTCAAATAGTTAA-GACTATTAGAACAATTATCTA-TTGAAAATCATTATAACCTT-TT-TTTTA
** * ** * * * *
9718240 GTTATAAAACAGCTGGTTC-TGTTTATGCAAGCTTATTTC-AAATAAA
309 GCCACAAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAAG-TTA-TTCAAAATAAA
* * ** *
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1 ATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGA-TTTAAAAAATAAATCTGTT
**** * * * *
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* * ** * * *
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126 TTT-TGTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAATCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* * * * * * ** *
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188 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-A-AGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATT
* * ** * * * *
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250 CAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTA-TCTATTGAAAATCATTAT-AACCTTTTTTTTAGCC
* * * * *
9718601 ATAAAATAATTGTTT-ATATTTATACAAGTTTATTCGAAACAAA
312 ACAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* *
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1 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
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ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATATCCTTTTG
TTTGTCATAAAACAATTTTTTTAATCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
TATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAGAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTAA
GACTATTAGAACAATTATCTATTGAAAATCATTATAACCTTTTTTTTAGCCACAAAACAATTGTT
TCATATCATACAAGTTATTCAAAATAAA
Found at i:9704171 original size:542 final size:540
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* * * * * *
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** * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** ** * **
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*
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* * ** * * * *
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323 ATAAATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATCACTATTTGAACAATTATCTACTTTAAATC
* * * ** * * *
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388 ATTATAACATTTCATTTTGTCATAAAACAATTAATTCTATTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAA
* * * * * * *
9703367 TAACATTAATTTATTAATATTTCAACAAATAATAAGAAAAAGTTTTAAAAATAAATATGTTTTCT
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** * * * *
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** *
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* * * * * *
9703583 TAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGATGTTCAAATAGTTATGACAATCTAAACAAT
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* *
9703648 TATCTATTTCAAAACATTATAATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGC
192 TATCTATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGC
*
9703713 TTATTAT-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAA-TTTTA
257 TTATT-TCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * *
9703774 AAATATAAATATGTTTTCTTAATATGTTCAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTA-TTTC
319 AAAAATAAATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATCACTATTTGAACAATTATCTACTTT-
* ** *
9703838 AAATCATTATAATCATTTCATTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTCGTAAAAGCTTATTTAGA
383 AAATCATTATAA-CATTTCATTTTGTCATAAAACAATTAATTCTATTCATAAAAGCTTATTT-GA
* *
9703903 A-TAAAATAATACTAATTCATTAAAATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
446 ATTAAAATAACACTAATTCATTAAAATTTCAACAAA-TAATAAGAAAAAG-TTTAAAAAATAAAT
* * * *
9703966 CTATTTACCGAACGAGTTTAAATAGTTATGAC
509 ATATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGAC
* * *
9703998 TATTTAAAAAATTATTTATTTCAAATCGTGATGATCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCT
1 TATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTGATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCT
* ** **
9704063 GTTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTT
66 GTTCATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-TT
* * *
9704128 GGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTTCAAACAAGTTAAAATAGT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAACAAGTTAAAATAGT
9704172 CACGTCCATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (540 bp):
TATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTGATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCT
GTTCATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAATTA
GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAACAAGTTAAAATAGTTATGACAATCTAAACAATTATC
TATTTCAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
TTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
AATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATCACTATTTGAACAATTATCTACTTTAAATCATT
ATAACATTTCATTTTGTCATAAAACAATTAATTCTATTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAA
CACTAATTCATTAAAATTTCAACAAATAATAAGAAAAAGTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAA
CAAGTTTAAATAGTCATGAC
Found at i:9705730 original size:165 final size:163
Alignment explanation
Indices: 9705415--9705734 Score: 370
Period size: 165 Copynumber: 2.0 Consensus size: 163
9705405 GTCATATAAC
* * * * * *
9705415 AATTATTTTTATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAAT
1 AATTATTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAAAT
*** * * * *
9705480 TAATAGGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATATGATTACTGAACCAATTTAAATAATTAAAACTATTT
66 TAATAACCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGATTACGGAACCAATTTAAATAATTAAAACTATAT
* * *
9705545 GAATAATTGTATACTTCAAATCATTATAGCCTT
131 GAACAATTATACACTTCAAATCATTATAGCCTT
* * *
9705578 AATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATATTAATATAATAATATTCCAAAA
1 AATTATTTTT-ATCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAA
* * * * * * *
9705643 ATTAATAACCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCGGAACTAATTTCAATAGTTAAGACTAT
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* *
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TAATAACCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGATTACGGAACCAATTTAAATAATTAAAACTATAT
GAACAATTATACACTTCAAATCATTATAGCCTT
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* * * * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATT--AAAA
** * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* *** * * * * * *
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* * *
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* ** * * * * *
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1 -AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATT-A-ATATTAAAA
* * * * * * ** *
9705992 CTTAATAAG-----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTAAACCA-TTTCAAATACTTATGACT
62 ATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAGATATGTTTATCGAA-CAGTTT-AAATAGTTATGACT
* * * * ** * *
9706051 -TTTTAAGCAATTATTTCTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCAT-T-ACAAAAC
124 ATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTT-TTGTCATAAAAC
* * * * * * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA--TTAAAAA
* * * * * *
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63 TTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAGATATGTTTATC-GAAC-AGTTTAAATAGTTATGACTAT
* ** *
9706225 TTGAATAAATATCTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCATAAAGA-
126 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA-AC
* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT--AAAAA
* * * * * * * * *
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63 TTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAGATATGT-TT-ATCGAA-CAGTTTAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
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* * ** *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTAA-A-A
* **
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62 ATTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAGATATGTTTATCGAA-CAGTTTAAATAGTTATGACTAT
* ** *
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* * *
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1 AATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-T-T-AAA
* * * * *
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* * *
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* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT-AATATAATTTATTAATA-TT-AAAAA
* * * * * * * *
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63 TTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAG-ATATGTTTATC-GAACA-GTTTAAATAGTTATGACTA
*** * * *
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* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATT-AAAAA
* *
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63 TTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAGATATGTTTATC-GAACA-GTTTAAATAGTTATGACTA
* * *
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* * * *
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1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT--AAAAA
* * * * *
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63 TTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAGATATGTTTATC-GAAC-AGTTTAAATAGTTATGACTA
* *
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125 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** *
9707357 AATTGTTTCTATTCGTTCAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTTAAAAA
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA--TTAAAAA
* * * * * * * * * *
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63 TTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAGATAT-GTTTATCGAAC-AGTTTAAATAGTTATGACTA
** * * * *
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125 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** * * * * *
9707537 AATTGTTTCTATTGATACAAAATTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATTTCAAAAT
1 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATA-TT-AAAAA
9707602 TTAATAAG
63 TTAATAAG
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAGATATGTTTATCGAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA
TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
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Alignment explanation
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* * * *
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* * * **
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131 TTATTGAACCAG
** * * ** *
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1 TTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTGAGACAAAATTATTCA
* * * * *
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** *
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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142 62 0.50
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TTATTGAACCAG
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* *
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66 AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * **** * * *
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129 G-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG-A
* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTATT-
** * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TATT
* * * ** * *
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* * *
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128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTT
* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTC-AAATAGTTATGA
* * * * *
9709412 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTATTTTGTCATAAAAGAATT-TTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* * *
9709476 AATT--TACCTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-ATAAAAAATTAATAA
66 AGTTCATA-C-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
9709538 -TAAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAATTTAAATAATTATGA
129 GT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * ** *
9709591 CTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-TTTTTTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* ** * *
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* *** * * *
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127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACT-AGTTCAAAT-AGTTATGA
* * * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* ** * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTT
* * * * * *
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65 CAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * **** *
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128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGA
* * *
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* * ** * **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
** * *
9710375 TA-TTCATACAATTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAA
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** * * * * * *
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* ** ** * * ** * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* ** ** * ****
9710549 TA-TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCGATCTATTAATATTTTGCCAA-T--TAA-
66 -AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
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130 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC--ATAAAACAATTATT
*** * * * *
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* * * * * * **
9710785 GTAAGGGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAA
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * *
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1 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * *
9710901 TTAGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAATATTAATG
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** * * * *
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128 AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGA
* ** * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * * ** *
9711084 TAGTTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTC---AA-TAATAAG
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* * * * * *
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** * * *
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* * * **** * *
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127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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131 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
** * * * * * * *
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131 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
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131 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTATTT
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9714136 TTGATCATATAAGCTTATTCAGAGTAAAATAATACTAATTTGTTAA-CTTTCAAAAATTAATAAG
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130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *** * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
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* **** * *
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130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
9714433 CTATATGAACAATTATCTAATTT-AAATTGTTATGACCTTTTGTCTGGTCATAAAACAATT-TTC
1 CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-
* * * * *
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* * * * *
9714735 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGA
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * * *
9714787 ATATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATG--CTATTTGTTCTCTTATAAAATAGTAATT
1 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
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9714849 TCTA-TTCATACAGGCTTATTCAGATTAAAATAATAATAATTTTTTAATATTTTGACAATGAATA
64 TC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * ** * *
9714913 AGTAAGAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGA
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
9714967 TTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTATTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
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9715032 AGGTCATATAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATA-TTCTGAAAATTGATAA
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9715095 TTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATGGAACAAGTTTAAATAATTATGA
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTT
** * *
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9715275 ATGCAAAAAAATTT-TAAAATAAATCTGTTTATTGAACAATTTCAAATAGTTATGA
127 AAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * *
9715330 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACAATATAACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTT
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9715395 -TGTTCATGCCAA-CTTATTTC-AAATAAAATAA-AATAAATCTATTAATGCTCCAAAAATTAAG
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9715456 AAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGGAA-TCGTTCAAATAATTATGA
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
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9715638 TATA-AGACTTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAGCGAGTCCAGATAGTTATGA
130 TA-AGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
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1 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* *
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* * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* *** *
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
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9716112 TA-TTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAAGATTGGTAAATTAATAATA-TTCTAAACATTAATAA
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * ** **
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * *
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
9716397 CTATTTGAACAATTATCCATTTAAAATAGCTATGACC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * *
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66 AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG
** * * ** * *
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130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* *
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* * * * * *
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
9716757 CTATTTGAATAAGTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTATTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * *
9716822 TA-TTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA
66 -AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
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9716885 CTAAGATATTTAAAAAATAAAAT-TATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGCTAAGG
129 GTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
9717113 CTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT
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9717291 ATATTTCAGCAATTAT-TAATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTATGTTATAAAAGAA-TAGTT
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9717354 TCCA-TTCATATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATA
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* * * * * *
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9717536 AATTCATATAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAA
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129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** **
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* * *** * *
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* * * ** **
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* * * * *
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* * ****
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* * * * *
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* * * * * * * *
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66 AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * ** * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * ** * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * ** **
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* **** * * * ** *
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* * * * * * *
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* * *** * *
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* * * * * * *
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* * *
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* ** * *
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* * * * **
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * *
9712624 TAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTGTTTTAAGTCATTATGACC
315 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
9712670 TTATCTTGTGTCACAAAACAACTGTTTTGT-TT-GTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTA
* * * * *
9712733 ATTCA-TAATATTTCAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATC-A
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAA
* * * * * * * *
9712796 TTACAAACAATTAAGACTATTAGAATAATTATATATTTAAAATCATTTTGACC--TTGTTTAGTC
128 TT-CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
9712859 ATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATT
192 ATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
9712924 TCAAAAATTAATAAGAAAAAGAGTT-AAAAATAAATCTGTTTACAAAACAAGCTCAACTAGTTAT
257 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
9712988 TATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACC
322 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * ** * * *
9713027 TTTTGATTTGTCATGAAATAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *
9713092 TATATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAATCAG
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAA
* * * * * * * *
9713156 TTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTTTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * ** *
9713221 TAAAACAATTATTTTTGATCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTT
193 TAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * * *
9713286 CAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAATAATAAATCTATTTACCGAATCAATTCTAATAGTTATA
258 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * **
9713351 ACTATTTGAACAGTTATCAATCTCAATTCATTA-AAAA
323 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * **
9713388 TCTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TATTT-CTCATAAAAGCTCATTCAGTTGAAAATAATACTA
1 T-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTA
* * * * * *
9713450 TTTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAGAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAA
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAA
* ** ** * ** *
9713515 TTTAAATAGTTAAAACTATCAGAATAATTATGTATTTCAAATTGTT-TAGACCTTTTGTTTAGTC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * ** * ** *
9713579 ATAAAATATTTCTTT-AATGTCTTACAAGCTTATTCAGAATAAAATAACCCAAATTTATGGACAT
192 ATAAAACAATTATTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
9713643 TTGAAAAATTAATAAGCAAAACATTTGAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTT
256 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
9713707 ATGAATATTTGAACAACTATTTATGTAAAATTGTTATAACC
320 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* ** * * *
9713748 TTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* * * * **
9713813 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAAAATTTGCTTATTGAAAAAAT
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAAT
* * * * ** *
9713877 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTATTTTGTCAT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
9713942 AAAACAGTTATTTCAGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAGTAATTCTAATTTATTAATATTCC
194 AAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * ** * * * * ** *
9714007 AAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTGCTGAATCAATTTAAAGAAATATGG
259 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
9714072 CCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATCACC
324 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * *
9714109 TTTTG-TTTGTTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAGAGTAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT
* *
9714172 AATTTGTTAA-CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCA
63 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCA
* * * *** * * * *
9714236 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAGTTATATCCGTCAAATCGTTATAACCTCTTGTTATGTC
127 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * *
9714301 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAATAATATTAATCTAATAATAT
192 ATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * **** * *
9714365 TACAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTTGAACTAATTCAAATAGTTA
256 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA
* * *
9714430 AGACTATATGAACAATTATCTAATTT-AAATTGTTATGACC
321 TGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * * *
9714470 TTTTGTCTGGTCATAAAACAATT-TTCTCAATTCATACTAGCTTATTCGAAATAAAAGAA-AATG
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-
* * * *
9714533 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGATA-TT-AAAAA-AAA-TTATTTACCT-AAGC
63 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACC
* * * **
9714593 AATTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCCATGTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
126 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
9714658 CATAAAATTAATGT-TTT-TGTTCATAGAAGTTTGTTCAAAATGAAATAATACTAATCTATTAAT
191 CATAAAA-CAAT-TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
9714721 ATTTTAATAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAATTCAAATAAT
254 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGT
* * *
9714782 TATGAATATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATG--C
319 TATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * ** * * * *
9714822 TATTTGTTCTCTTATAAAATAGTAATTTCTATTCATACAGGCTTATTCAGATTAAAATAATAATA
1 T-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTA
* ** * * * * * *
9714887 ATTTTTTAATATTTTGACAATGAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAG
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCA-
* * * *
9714952 A-TCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTATTGTTTTGTC
127 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **
9715016 ATAAAAAAATTATTTCAGGTCATATAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATA-
192 ATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATAT
* * * * * * *** * * *
9715079 TTCTGAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATGGAACAAGTTTAAATAATT
256 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT
* * * ** *
9715144 ATGACCATTTGAACAATTATCGATTTGAAATCACTATAACC
320 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * *
9715185 TTTTGGTTTATCATAAAATGATTTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
9715250 ATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATATGCAAAAAAATTT-TAAAATAAATCTGTTTATTGAA-
64 ATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATA-G-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC
* * * *
9715311 CAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACAATATAACCTTTTGTTTC
125 CAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
9715376 GTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCCAA-CTTATTTC-AAATAAAATAA-AATAAATCTAT
189 GTCATAAAACAATT-ATTTCAGTTCAT-ACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
** * * * **** *
9715437 TAATGCTCCAAAAATTAAGAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTAT-TTTTTGGAATC-GTTCA
250 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACCAAACCAGTTCA
* *
9715499 AATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
313 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * * *
9715547 ATTTGCTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTAAAAAAACCTTATTTATAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAA
* * * * *
9715612 TTTATTAATA-TGCCAAAATTAATAAGTATA-AGACTTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAGCGA
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTA-AGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCA
* * * * *
9715674 GTCCAGATAGTTATGACTATTT-AATCAATTATTTATTTCAATTCATTATGAACC-TTTGTTTTG
127 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTG
* * * * *
9715737 TCATAAAACAACTGTCTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
190 TCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
9715801 A-TTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATA
254 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATA
* * * * ** * * *
9715864 GTTATGTCCACTTAAATTATTGTCTATTTCAAATTGTTATGACA
317 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* ** * **
9715908 TTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCCTATTCATACACA-ATTATTTTGAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA-AGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTA
* * * * *
9715972 ATTTATTATTATTTCAAAAATT-A-A-TAAGAGGTTTAAAAACTAAATCTCTTTACTGAACCAAT
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAAT
* * * * * *
9716034 TCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * ** * *
9716098 AAAACATTTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAAGATTGGTAAATTAATAATA-TT
194 AAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
9716161 CTAAACATTAATAAGCAAG-GATCTAAAAAATAAA--TG--T-CC--A--A-TTCAAATAGTTAA
258 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * *
9716215 GACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACC
322 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * * * * *
9716254 TTTTGTTTAGTCATAAAATAGCTG-CTTCAGCTCTTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * * ** *
9716318 ATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTCAAAAA-AACTTTACTTATTGAA-C
64 ATTTATTAATATTTC--AAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACC
* * * * * *
9716379 AAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCCATTTAAAAT-AGCTATGACC-TTTATTTT
126 AA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
9716442 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
189 GTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * *** ** * *
9716507 ATTAT-AAAAATTGATAAGTTGGAGATTTAAAACATAAATCAATTTACTGAATCAGTTCAAATAA
254 ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAG
* * * * *
9716571 TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTAAC
318 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * *
9716614 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCA-TCAT-CAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * * * *
9716677 GTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATCA
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCA
* * * ** * * *
9716741 ATTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAGTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGTT
127 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
9716806 ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-
192 ATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
9716869 TTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAAATTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGCT
256 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
9716934 AAGGCTATATGAACAATTCTTTA-TTCAAATCATTATGACC
320 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
9716974 TTTTGTTTTATCGTAAAACAATT-TTTTCAGTTCTTACTAA-ATTATTTGAAAT-AAA-AA-A--
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATAC-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT
* * *
9717032 AATTTATTAATATTTC-AAAATTCAATCAGTACGACATTTAAAAAAT-AATTATGTTTACCGAAC
63 AATTTATTAATATTTCAAAAATT-AAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAAC
* * * * *
9717095 CAATTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG
125 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * * *
9717160 TCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA
190 TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *
9717225 TTTTGAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAATTCAAATAGT
255 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGT
* * * *
9717286 TATGAATATTTCAGCAATTAT-TAATTTCAAATCGTTATGACA
319 TATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * ** * * *
9717328 TTTTGTTATGTTATAAAAGAATAGTTTCCATTCATATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAA
** * * * * * *
9717393 TTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTA-TCAAACTAA
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAA
* * * *
9717456 ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTATTGTTTTATCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
9717521 TAAAAAAATTATTTTAATTCATATAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATA-T
193 TAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT
* * ** * ** * * *
9717584 TCTAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAGCATAAATTTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTA
257 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA
* ** ** * *
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321 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** *
9717689 TTTTGGTTTGTCAAAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAG
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTA-
* * * * * *
9717753 ATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAACATAAATCTATTTAC-CAAAC
64 ATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACC
* * * *
9717815 AAGTTCAAATCA-TTGTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTC-TCAT-AACTTTT-TTT
126 AA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
9717876 TGTCATAAAACAATTATTTCTA-TCCATACGAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATCTATTA
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* * * * *
9717940 ATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAT--ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
252 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATA
* * ** * * * *
9718003 GTCATAACTATTTGAATGATTATCTACTTCAAATCATTGTGACA
317 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * ** *
9718047 TTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTGATGTAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
* * * *
9718112 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAAGAGTAAGAGAATTAAAAATAAATAAATCTGTTTATTGAA-C
65 TTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAGTAAGAG-ATT-TAAA-AAATAAATTTGTTTACTGAACC
* **
9718176 AAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTATTGTTT
126 AA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTT-TTGTTT
* ** ** * * *
9718239 TGTTATAAAACAGCTGGTTCTGTTTATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATT
188 TGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * * * ****
9718302 AATGTTCCAAAAATTAATAAATAA-AAATTTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAA-CATGTTCAA
251 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCA-GTTCAA
* *
9718365 ATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGACC
314 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * * * *
9718412 ATTTCTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTGTTCAAAAAACCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * ** *
9718477 TTTATTAGTA-TTCCAAAATTAATA-AACATAAATTT-TAAAATAAATTTATTTA-TCG-AGTAG
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAA
* * * * *
9718537 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTAGT-TATTTTAAATCGTTATGATCC-TTTGTTTTGT
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
9718600 CATAAAATAATTGTTT-ATATTTATACAAGTTTATTCGAAACAAAATAATACCAATTTATTAATA
191 CATAAAACAATTATTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*
9718664 TTTTAAAAATTAAT
255 TTTCAAAAATTAAT
9718678 CTATTTACCA
Statistics
Matches: 8311, Mismatches: 1925, Indels: 845
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
345 6 0.00
346 93 0.01
347 124 0.01
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365 115 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
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TTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAATTC
AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
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9708969 AAAATGAATT
* *
9708979 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAATGAGTTC
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* * * * * *
9709044 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGCCATAA
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* * * *
9709109 AATAAATGTTTTTATTCATATAAGTTT-GCTCGAAAAAAAGTAATACTAATC
130 AACAAATGTTTCTATTCATACAAGTTTAGCTAGAAAAAAAG-AATACTAATC
* *
9709160 TATTAATATTTC-AAAA-T-T-AATAGGAGATTCAAAAAATAATT-TTTTTA-CAAACT-AGTTC
1 TATTAATATTTCAAAAATTATAAATAAGAGATTCAAAAAATAATTCTATTTACCAAA-TGAGTTC
* * * * **
9709218 AAATAGTTATGAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTACGACTTTTTATTTTGTTATAA
65 AAATAATTATGAATATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTACGACCTCTTATTTTGCCATAA
** ** *
9709283 AAC-AATAGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAAGAATACTAATT
130 AACAAAT-GTTTCTATTCATACAAGTTTAGCTAGAAAAAAAGAATACTAATC
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1 TATTAATATTTC
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TATTAATATTTCAAAAATTATAAATAAGAGATTCAAAAAATAATTCTATTTACCAAATGAGTTCA
AATAATTATGAATATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTACGACCTCTTATTTTGCCATAAA
ACAAATGTTTCTATTCATACAAGTTTAGCTAGAAAAAAAGAATACTAATC
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*
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TTATTCAAAATAAAATAATAATAAT
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*
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* * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * ***
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* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATA-TTATGACTTTTGTTTTGTAA
** * *
9716446 TAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
65 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATAT
* *** * * * * *
9716509 TAT-AAAAATTGATAAGTTGGAG-ATT-TAAAACATAAATCAATTTACTGAATC-AG
128 T-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTA-TGACTTTTGTTTTGTAA
* * * * *
9716627 TAAAATAATTATTTTTCA-TCAT-CAAGCCTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AGTTTATTAATA
65 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
* ** * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGA-CTTTTGTTTTGTAA
* ** * *
9716807 TAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATGTAATAATA-
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
* * * * * * *
9716869 TTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATA-AAAT-TATTTGCCAAACCAG
128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGTA
* * * * * *
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64 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATGC-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA
* * * * * * *
9717044 TTTC-AAAATTCAATCAGT--ACGACATT-TAAAAAATAATTATGTTTACCGAACCAA-
127 TTTCAAAAATT-AATAAGTAAAAGA-ATTAAAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAG
* * * * * * *
9717098 TTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-TAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGTA
* * * ** *
9717162 ATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAATAATACT-AAGTTATTAAT
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTAT-TTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
** * * * * *
9717224 ATTTTGAAAATTAATAAG----A-TATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAA-
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAG
* * * * *
9717276 TTCAAATAGTTATGAATATTTCAGCAATTAT-TAATTTC-AAATCGTTATGACATTTTGTTATGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAAT-ATTATGAC-TTTTGTTTTGT
* * * * ** *
9717339 TATAAAAGAATAGTTTCCATTCATATAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACT-AATTTATTAAT
63 AATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
** * * * * *
9717402 ATTTTGATAATTAATAAGTAAAA-AATT--TAAAAATAAATATGTTTATCAAACTAA-
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC-AAG
* * * * * *
9717456 ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTATTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGTA
* * ** *
9717520 ATAAAAAAATTATTT-TAATTCATATAAGGTTA-TTCAAAATAAAATAATACT--ATGTTATTAA
64 ATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAAT-TTATTAA
* * * ** * **
9717581 TA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGA-AATT-TAAAGCATAAATTTATTTACTGAACAAG
125 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * * ** ** ** * *
9717637 TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATGGATTT-GGAATCGCTATAACCTTTTGGTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGT-
** * *
9717701 AA-AAAATGATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAGATTTATTAATA-
63 AATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATAT
* *
9717764 TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAG-ATT-TAAAACATAAATCTATTTACCAAACAAG
128 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
9717818 TTCAAATCA-TTGTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTCTCATAACTTTT-TTTTGTCA
1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACTTTTGTTTTGTAA
* * * * * * *
9717881 TAAAACAATTATTTCTATCCATACGAGCTTA-TTCATATTAAAATAATATTAATCTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATT
* ** * *
9717945 TCAACAATTAATAAGTAAAAG-ATT-TTAAAAAT--ATATGTTTACCAAACAAG
129 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * ** * *
9717995 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGATTATCTACTTC-AAATCATTGTGACATTTTGTTTTGTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGAC-TTTTGTTTTGTA
* * * * *
9718059 ATAAAATAATTGTTTCAATTGATGTAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
* * ***
9718123 TTCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAATAAATAAATCTGTTTATTGAACAAG
128 TTCAAAAATTAATA-AGTAAAAGAATTAAAAA-AAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * *
9718179 TTCAAATAGTAATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAAATATTATGACTTATTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACTT-TTGTTTTGTAA
** * * * * *
9718244 TAAAACAGCTGGTTCTGTTTATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATGTTC
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
* ** **** *
9718309 CAAAAATTAATAAAT-AAA-AATTTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACATG
130 CAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * * * * *
9718360 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTAAGACCATTTCTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGTA
* * * *** * * *
9718424 ATAAACCAATTATTTCTGTTCAAAAAACCTTA-TTCGAAATAAAATAATGCT-AATTTATTAGTA
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATA
* * ** * * * **
9718487 -TTCCAAAATTAATAA--ACATA-AATT--TTAAAATAAATTTATTTATC-GAGTAG
127 TTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * * * *
9718537 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTAGT-TATTT-TAAATCGTTATGATCCTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGT
* * * * * * * **
9718600 CATAAAATAATTGTTTATATTTATACAAGTTTA-TTCGAAACAAAATAATACCAATTTATTAATA
63 AATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA
*
9718664 TTTTAAAAATTAAT
127 TTTCAAAAATTAAT
9718678 CTATTTACCA
Statistics
Matches: 1820, Mismatches: 363, Indels: 228
0.75 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 6 0.00
174 12 0.01
175 52 0.03
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182 40 0.02
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AAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTC
AAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
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9718897 TTAATAAATT
** * ** * * * * * *
9718907 TTATTTTATTTGGAATAAGCTTCTATGACCAAAAATAATTCTATCATGACAAAATAAAAAGTCTT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGTCAT
* * * * *
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* * * * *
9719036 TCA-CTTTTAGAATCTCTTA-TTCAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATG
129 TTATTTTTTA-AATCT-TTACTT-ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
** * * * * *
9719088 TTATTTTATTTCAAATAAGCTAATATAAACT-AATACAATTGCTTTT-TGACGAAACAAAAGGCC
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAA-GTC
* * * * * * * * *
9719151 ATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATA
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* * *** *
9719216 ATTA-TTTTTAACATCTTTACTTATAAATTGTCAAAATATTAA-AAATTTAATA
128 TTTATTTTTTAA-ATCTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAA-TTAGTA
* * ** *
9719268 TTATTTTAATTCAAATAAGCTTGCATGACCAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAGAAAGTCAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGTCAT
* * * * * * * *
9719333 -TCCATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAACTTATTCGACAAACAGATT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATT
*
9719397 TATTTTTTAAATCTTATACTTATTAATTATTTGAATATTAATAAATTTGTA
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* * * * *
9719448 TTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTCTTTTACGACAAAACAAAAAGT-T
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTCA
* * * * * *
9719511 TAGCGGTTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGTTTGATAAACA-AC
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* * * ** * *
9719575 TTCAATTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAGAA
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* ** * * * * * * *
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1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTCAT
* * * * * ** ***
9719692 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCA-TTGGTCAGGCCAACAGAT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGATAAACAGAT
* * *
9719756 TTATTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTG
129 TTATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * * *
9719808 TTACTTTATTTCAAATAAAC-TATATCAATAGAGACAATTATTTTATGATAAAA-AAATGGTCAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTCAT
* * * * * * * *
9719871 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAGTTGTTATAAATAATTGAACTAGTTTGGTGAAA-AGAT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGAT-AAACAGAT
* ** *
9719935 TTATTTTTTAAGTC--T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATA
129 TTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * * * * *
9719983 TTATTTTATTCCCAACAA-TTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCCAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTCAT
* * * * * ** *
9720047 AACGATTTGAAATTA-ATAATTATTCATATA-ACCTTACTATTT-AAATTGATTTGGCAAACAAA
65 AACGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAGA
* * * *
9720109 TTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTCAT-AATATTATTAGATTAGTA
128 TTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
9720162 TTATTTTATTTTC-AATAAACTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTTA
1 TTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCA
* * * * * * *
9720226 TAACTGGTTTGAAATATATAGTTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCTGGTTCTG-TAAACAG
64 TAAC-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGATAAACAG
* *
9720290 ATTTATTTCTTAAATCTTCTA-TTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATA
127 ATTTATTTTTTAAATCTT-TACTT-ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * *
9720344 TTATTTTA-TTCTGAATAAG-TTATATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGTTC
1 TTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TC
* ** * * * **
9720406 TTAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAATT
63 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACA
* ** * * *
9720469 GATTTATTTTTTAAATATCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGCT-GTA
126 GATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTA
** * * * * * * * *
9720524 TTATTTGGTTTTAGATATGCTTTTATGAATAGAAGCAATTGTTTTATTG-TAAAACAAAAGGTCA
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAA-GTCA
* * * * * * * * * *
9720588 TAACG-CTT----TAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTTATTCGGTAAATAAAT
64 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGAT
* * * *
9720648 TTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAGTAAAATAGTA
129 TTATTTTTT-AAA-TCTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTA
* * ** * * * *
9720701 TTATTTTATCTTGAAA-AAGCATGTATGAATTGAAACAATCATGTTATGACTAAATAAAAGGTCA
1 TTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCA
* * * * * * * **
9720765 GAATGATTTTAAAAAGAT-ATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTTTGGCAAACA
64 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-G--TTTGATAAACA
* * * * **
9720828 TATATATTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGTA
126 GATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
9720878 ATATTTTACTCCAAAGAAGCTTGTACGAATAGAAACAATTATTTTA--ACAAAAC-AAAGATCAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT
* * * *
9720940 AACGA-TTAAAGATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTCTGATAAACAGAT
65 AACGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGAT
* *
9721004 TTAGGTTTTT-AATC--T-CTTATT-A-TTTTGAAGTATTAATAAATTAGTG
129 TTA-TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTA
* ** * * * *
9721050 TTATTTTA-TTCTGAATAATTTTTTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAAAAAATGTCA
1 TTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCA
* * * * * * * * *
9721114 TAATGATTTCAAATGGATAATAATTCAAATGGACATATAACTTTTTAAACTTGTTT-AGTAAATA
64 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC--ATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACA
* * ** * *
9721178 GA-TTAGTTTCTTAAGTCTACAACTCATTAATTTTAT-AATAATAATAAATTAGTA
126 GATTTA-TTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTA
** * * * * *
9721232 TTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGATTAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT
* * * * * * * *
9721297 AACGATTT-AAACTA-AGTAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGGACTCGCTTGGTCAACAAA
65 AACGATTTGAAA-TAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGA
* * *
9721360 TTTATTTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTA
128 TTTA--TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
** * * * * * *
9721414 TTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAATA-AAAGGTCAC
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAA-ACAAAAGTCAT
* * * * * *
9721478 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACGTGTTAAGA-AAACATAT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGATAAACAGAT
* * * *
9721542 TTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATGCA-TA
129 TTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAAT-TAGTA
* * * * * *
9721593 TTATTTTA--T----T---CTTGCATAAACAGAACCAATTATTTTATGACAAAACAGAATGTCAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGTCAT
* * *
9721649 AA-TATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGAAT-GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAG-
65 AACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGA
* * *
9721711 TTTCTTTTTTTAATTCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTTAA-AAATTAGTA
128 TTT-ATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AATA-TTAATAAATTAGTA
* * * * * *
9721765 TTATTTTACTTCAAAT-AGACTTATATGAA-ATGAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTT
1 TTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTC
** * * ** *
9721828 ATAATAACTTT-AAATAGATAATTATCCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAT
63 ATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAG
* *** * **
9721892 ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAACAAATTAAAA
127 ATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTA
* * * *
9721945 TTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAGCAAAAAGTCAT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTCAT
* * * * * * * * ** *
9722010 AACAAGTTGAAATAAATAATTGTTTAGATAGTTATAACGATTTGAACTTGTTTGGGAAATAGATT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATT
*
9722075 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-ACTATTAATAAATTTA-TA
130 TATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAA-TTAGTA
* * * * * * *
9722126 TTATTTTA-TTCAAAATAGGCTTGTTTGAATAGAAAA-AATCATTTTATGATAAAATGAAAGGTT
1 TTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGTC
* * * * * * * *
9722189 ATAGCAATTTCAAATAAATAATTATTCAAATAG-CTATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAATAG
63 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAG
* * * *
9722253 -TTTCATTTTTTTAATCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAATA
127 ATTT-ATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
9722307 TTATTTTATTTCAAACAAGTTTATATGAACAAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTCTT
1 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTCAT
9722372 AACGATTTGA
65 AACGATTTGA
9722382 TCTAGTTCGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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183 31 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATA
ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTT
ATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTA
Found at i:9719585 original size:360 final size:354
Alignment explanation
Indices: 9718920--9722381 Score: 1370
Period size: 361 Copynumber: 9.7 Consensus size: 354
9718910 TTTTATTTGG
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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65 A-AATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAA-TT-ATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTA-A
* * * * **
9719047 ATCTCTTA-TTCAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATGTTATTTTATTTCAAATAAGCTAA
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* * * * * ** * * * *
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187 TATGAA-TAGAAAAAATT-ATTTTATGAC-AAAAAAAAGG-TTTAACGGTTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
9719174 ATTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACTTA-TTTGGT-AAACATAATT--ATTTTTAACATCTTTA
248 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAAC-TAGTTTGATGAAA-A-GATTCAATTTTTAA-ATCTTTA
* *
9719235 CTTATAAATTGTCAAAATATTAA-AAATTTAATATTATTTTAATTCA
309 CTTATTAATTTTCAAAATATTAACAAA-TTAATATTATTTTAATTCA
* * * * *
9719281 AATAAGCTTGCATGACCAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAGAAAGTCAT-TCCATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGTCATATCGATTTGAAAT
*
9719345 AAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATC
65 AAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAA-TTATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * *
9719410 TTATACTTATTAATTATTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATG
129 TT-TACTTATTAATT-TTT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATG
* * * * *
9719475 AATAGAAAAAATTCTTTTACGACAAAACAAAAAGTTTAGCGGTTTGAAATAGGTAATTGTTCAAA
191 AATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTTTAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * *
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255 TAGTTATAACAATTTGAACTAGTTTGATGAAA-AGA-TTCAATTTTTAAATCT-TTACTTATTAA
* * **
9719603 TTTTCAAAATATTAACAAATTAGA-ATTATGTTATTTTG
317 TTTTCAAAATATTAACAAATTA-ATATTATTTTAATTCA
* * * * * *
9719641 AATAAGCTTGTACGAAGAGAAACAATTGTTTTGTGGC-AAACAAATGGTCATAAT-GATTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCAT-ATCGATTTGAAA
* * * * * ** *
9719704 TAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCATTGGTCAGGCCAACAGATTTATTTTTTAAAT
64 TAAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAATTATTC-GGCAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * *
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128 -CTTTACTTATTAA-TTTTT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT
* * * * * * ** *
9719833 CAATAGAGACAATTATTTTATGATAAAAAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
190 GAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAAAAAGGT-TTAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * *
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254 ATAGTTATAACA-ATTTGAACTAGTTTGATGAAAAGATTCAATTTTTAAATCTTTACTTATTAAT
* *
9719959 TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCC
318 TTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATT-CA
* * * * * * *
9719996 AACAA-TTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCCATAACGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATATCGATTTGAAAT
* * * * * * *
9720060 TAATAATTATTCATATAA-CCTTACTATTTAAATTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATA
65 AAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAATT-ATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * *
9720124 TCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAACTTGTAT
129 T-TTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAACTTGTAT
* * * * *
9720188 GAACATAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACTGGTTTGAAATATATAGTTGTTC
190 GAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTT-TAAC-GGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
9720253 AAATAGTTATAACTATTTGAGCTGGTTCTG-T-AAACAGATT-TATTTCTTAAATCTTCTA-TTC
252 AAATAGTTATAACAATTTGAACTAGTT-TGATGAAA-AGATTCAATTT-TTAAATCTT-TACTT-
** * *
9720314 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCTG
312 ATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTC-A
* ** * * * *
9720357 AATAAG-TTATATGATGAAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGTTCTTAAT-AATTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT-ATCGATTTGAAA
* * * * * * * * ** **
9720420 TAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAAT
64 TAAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAA-TTATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * ** * * ** *
9720485 ATCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGCT-GTATTATTTGGTTTTAGATATGCTTTTA
128 CT-TTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTA
** * * * *
9720549 TGAATAGAAGCAATTGTTTTATTGTA-AAACAAAAGGTCATAAC-GCTT----TAGATAATTGTT
189 TGAATAGAAAAAATTATTTTA-TG-ACAAAAAAAAGGT-TTAACGGTTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * * * * *
9720608 TAAATAGTCATAACTATTTAAATTTA-TTCGGT-AAATAAATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTT
251 CAAATAGTTATAACAATTTGAA-CTAGTTTGATGAAA-AGATTCAATTTTT-AAA-TCTTTACTT
*** * ** * * * *
9720671 ATTAATTTTTTGAATGTTAGTAAAATAGTATTATTTTATCTTGA
312 ATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTA-ATTCA
* *** ** * * * * *
9720715 AA-AAGCATGTATGAATTGAAACAATCATGTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAAT-GATTTTAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCA-TATCGATTTGAAA
* * * * * * *
9720778 -AAGAT-ATTGTTCTAATAGTC-TTAACTATTTGAATTGGTTTTTGGCAAACATATATATTTTTT
64 TAA-ATAATTATTCAAATAATCATT-ACTATTTGAA-T--TATTCGGCAAACAGATTTATTTTTT
* * ** * * * * *
9720840 AAATC--T-CTTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGTAATATTTTACTCCAAAGAAGCTTGT
124 AAATCTTTACTTATTAATTTT-TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGT
* * * * * * * *
9720902 ACGAATAGAAACAATTATTTTA--ACAAAACAAAGATCATAAC-GATTAAAGATAGATAATTATT
188 ATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAAAAAGGT-TTAACGGTTTGAA-ATAGATAATTGTT
* * * * * *
9720964 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTCTGAT-AAACAGATTTAGGTTTTT-AATC--T-CTTAT
251 CAAATAGTTATAACAATTTGAACTAGTTTGATGAAA-AGATTCA-ATTTTTAAATCTTTACTTAT
* * * * * *
9721024 T-ATTTT-GAAGTATTAATAAATTAGTGTTATTTT-ATTCTG
314 TAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTC-A
** * * * * *
9721063 AATAATTTTTTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAAAAAATGTCATAAT-GATTTCAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT-ATCGATTTGAAA
** * * * * * ** * * *
9721127 TGGATAATAATTCAAATGGACAT-ATAACTTTTTAAACTTGTTTAGTAAATAGA-TTAGTTTCTT
64 TAAATAATTATTCAAAT--A-ATCATTACTATTTGAA-TTATTCGGCAAACAGATTTA-TTTTTT
* ** * * **
9721190 AAGTCTACAACTCATTAATTTTATAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTG
124 AAATCT-TTACTTATTAATTTT-TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTG
* * * * *
9721255 TATGAATAGAAACAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGATTATAACGATTT-AAACTA-AGTAATT
187 TATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTT-TAACGGTTTGAAA-TAGA-TAATT
* * * * * * * * * * * * * *
9721318 ATTCAAACAATCATAACTATTTGGACTCGCTTGGTCAACAA-ATTTATTTTTTTTAATTTTTTAC
248 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACTAGTTTGATGAA-AAGATTCA--ATTTTTAAATCTTTAC
** * * * * **
9721382 TTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
310 TTATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTCA
* * * * * *
9721427 AATAAGTTTGTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAAATA-AAAGGTCACAACAATTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTTATGACAAA-ACAAAAGTCATATCGATTTGAAA
* * * ** * * ** * * *
9721490 TAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACGTGTTAAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT
64 TAAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAA-TTATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * *
9721555 TTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATGCA-TATTATTTTA--T----T---CTTGCAT
128 CTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT
* * ** * * * *** *
9721610 AAACAGAACCAATTATTTTATGACAAAACAGAATGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTGTTTA
190 GAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGT-TTAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * ** * *
9721675 GAAT-GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGAT-AAACAGTTTCTTTTTTTAATTCTCTTACTGATT
253 -AATAGTTATAACAATTTGAACTAGTTTGATGAAA-AGATTCAATTTTTAAATCT-TTACTTATT
** * *
9721738 AATTTTTGAAATATTTAA-AAATTAGTATTATTTTACTTCA
315 AATTTTCAAAATA-TTAACAAATTAATATTATTTTAATTCA
* * * * * * *
9721778 AAT-AGACTTATATGAA-ATGAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAAGGTTATAAT-AACTTT-
1 AATAAG-CTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT-ATCGA-TTTG
* * * * * * * *
9721839 AAATAGATAATTATCCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAACATATTTATTTTTTA
61 AAATAAATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAA-TTATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTA
* ** * ** * * *
9721904 AATTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAACAAATTAAAATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGT
125 AATCTTTACTTATTAATT-T-TTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGT
* * * *
9721969 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAGCAAAAA-GTCATAACAAG-TTGAAATAAATAATTG
188 ATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAA--AAAAAGGT-TTAAC-GGTTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
9722032 TTTAGATAGTTATAACGATTTGAACTTGTTTG-GGAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
249 TTCAAATAGTTATAACAATTTGAACTAGTTTGATGAAA-AGATTCAATTTTTAAATC-TTTACTT
* ** * * *
9722096 ATTAATTGTCTTACTATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTCAA
312 ATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTC-A
* * * ** * * * * * * *
9722139 AATAGGCTTGTTTGAATAGAAAA-AATCATTTTATGATAAAATGAAAGGTTATAGCAATTTCAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTCATATCGATTTGAAA
* * * * * ** * *
9722203 TAAATAATTATTCAAAT-AGCTATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAATAG-TTTCATTTTTTTA
64 TAAATAATTATTCAAATAATC-ATTACTATTTGAA-TTATTCGGCAAACAGATTT-ATTTTTTAA
* * * * ** *
9722266 ATCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTCAAACAAGTTTAT
126 ATC-TTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGT
* * * *
9722331 ATGAACA-AAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTCTTAACGATTTGA
188 ATGAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGT-TTAACGGTTTGA
9722382 TCTAGTTCGA
Statistics
Matches: 2376, Mismatches: 549, Indels: 351
0.73 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
347 2 0.00
348 2 0.00
349 69 0.03
350 49 0.02
351 99 0.04
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354 208 0.09
355 118 0.05
356 112 0.05
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364 62 0.03
365 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (354 bp):
AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATATCGATTTGAAATA
AATAATTATTCAAATAATCATTACTATTTGAATTATTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT
TACTTATTAATTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAG
AAAAAATTATTTTATGACAAAAAAAAGGTTTAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
TAACAATTTGAACTAGTTTGATGAAAAGATTCAATTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTCAAAA
TATTAACAAATTAATATTATTTTAATTCA
Found at i:9721103 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 9721063--9721104 Score: 59
Period size: 20 Copynumber: 2.1 Consensus size: 20
9721053 TTTTATTCTG
*
9721063 AATAATTTTTTATGAATAAA
1 AATAATTTTTTATGAACAAA
9721083 AATAATTGTTTTATG-ACAAA
1 AATAATT-TTTTATGAACAAA
9721103 AA
1 AA
9721105 AAAATGTCAT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 2
0.87 0.04 0.09
Matches are distributed among these distances:
20 13 0.65
21 7 0.35
ACGTcount: A:0.50, C:0.02, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (20 bp):
AATAATTTTTTATGAACAAA
Found at i:9721771 original size:172 final size:172
Alignment explanation
Indices: 9721354--9722317 Score: 495
Period size: 181 Copynumber: 5.4 Consensus size: 172
9721344 TCGCTTGGTC
*
9721354 AACAAATTTATTTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATT
1 AACATATTTA-TTTTTTTAA-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATT
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* * * ** **
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* * * * * *
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1 -ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAA-TTTA
* * * * ***
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Statistics
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* * * * *
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* * *
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** * * * *
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*
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* * * *
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*** * *
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323 TAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * *
9726446 A-TTG---TTGA-AA----TC-ACTA-TGAT---TATTTGACA-TGATTTGGTAAATAGATTCAC
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTGGTTTGGTAAACAAATTTAT
* ** * **
9726496 ATTTTAAA----TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * * **
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130 AGCTTGTAT-GAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* ** * * * * * ** * *
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194 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
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* ** * * * *
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* ** * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAA-ATTTAT
* * *
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65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * *
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130 AGCTTGTATGAATAG-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
** * * * * * * * *
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194 TAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC
* * * * * * *
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256 TCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * *
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320 AATTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-C
* * * * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATT
* * * * *
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66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * ** *
9727266 ACTT-TTTGAACTA-AAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATA-AG
131 GCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-
* * * *
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194 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCT
* * * * *
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257 CTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * * * * *
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320 A-ATTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-C
* * ** ** * * ** **
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATT
* * * ** **
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* * * * * ** * *
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130 AGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * ** * * * *
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194 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * *
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259 TACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-
** *
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* * * * * *
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1 -ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTT-TGGTAAACAAATTT
* * * *
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* * *
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128 TAAGCTT-GTA-T-G-AATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * ** * *
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* * * * * * *
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** * * *
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316 TATGAA-TTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * ** * * *
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1 -ATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * ** *
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* ** * * * * *
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** * * * * * * ** * * *
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** *** * * ** *
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* * * * * * * *
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323 TAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-C
* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATT
* * ** *
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* * * * * * * **
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129 AAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * *
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* * * * * *
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258 TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
* * * *
9728896 CTGAAATAATTGTCTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAAC
322 TTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
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1 -ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACAAA-TTT
* * * * ***
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* *
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* ** * *
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Statistics
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AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** ** *
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* * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* ***
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* * * * * * *
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** * * *
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* * * *
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* * * * * ** * * * *
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192 GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACCATTTCAA-GTGTCAAGAAAA
* * * *
9725081 CATATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAA-TTGTT-GAAAAATTAATAAATTAATATTATTT
256 CAGATTTATTTTTAAAAT-TT-T--TTATTAACTT-TTAG-AATACTAATAAATTAATATTATTT
* ** * * * * * * ***
9725144 TAATCCGAATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGG
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* * *
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1 CAAAACAAAAGA-TCATAATGA-TTGAAAATAAATAAGTGTTCAAATAATCATAAC
9725241 GATATCAACT
Statistics
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TTATTTTTAAAATTTTTTATTAACTTTTAGAATACTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATA
AGCTTGCATGAATAGAAGCAATTATTTTACAA
Found at i:9729336 original size:67 final size:67
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* *
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9729293 AT
66 AT
* * * *
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9729359 TGATTTGAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTATTTCAAATAAGCTTGTACGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGATAATAAC
AT
Found at i:9729701 original size:182 final size:176
Alignment explanation
Indices: 9729361--9730301 Score: 635
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9729351 GGTAATAATG
* * * * * ***
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* *
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* ** * *
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* * **
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* * * *
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* **
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* * * * ** * * * *
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* *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * *
9729963 GTTTTT-AGATCTCTTCCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTGTTATTTTATTTC-AG
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* * * *
9730026 ATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATTGTCACAACA
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* * * * * * * *
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** * * * * *
9730145 TTTTCTAAA--TCTCTTATTAATTTTTCTAATGTTAATAAATTAATA-TA-TTTATTCCAAATAA
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* * * * *
9730206 GCTAGTATGAACTAAAATAATTATTCTATGACTAAACAAAAGGTT-AGAACA
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* * *
9730257 ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTG
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTG
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Statistics
Matches: 600, Mismatches: 124, Indels: 79
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.00
176 93 0.16
177 110 0.18
178 45 0.08
179 6 0.01
180 68 0.11
181 124 0.21
182 137 0.23
183 15 0.03
ACGTcount: A:0.38, C:0.10, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGTTTGATAAACAAATTTATTT
TTTCAAATCTCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGT
TTGTATGAACCAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAGTTCAGAACA
Found at i:9729850 original size:606 final size:603
Alignment explanation
Indices: 9728740--9729885 Score: 1378
Period size: 606 Copynumber: 1.9 Consensus size: 603
9728730 GTTTTATCAC
** * *
9728740 AAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATACTTATTTGAACTAG
1 AAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTAGTTGAACTAG
* * *
9728805 TTCGGTAAATAGAATTATTTTGTAAATCTCTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAATTTTA
66 TTCAGTAAATAGAATTATTTTGTAAATCTCTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTA
* *
9728870 TTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTGTCTTATGACAAAACAAAGGTCATAACA
131 TTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTCTTATGACAAAACAAAGGTCATAACA
* * * * * * *
9728935 ATTTGAAATAGATAATTGTGCATATAGTCTTAATTGTTTGAACTTGTCTGGCAAACAAATTTTAT
196 ATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAATCATAATTATTTAAACTCGTCTGACAAACAAATTTTAT
* *
9729000 TTTTTAAATCTCTCAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
261 TTTTTAAATCTCTCAGTTATGAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATA
* *
9729065 AACTTGTATGAATAGAAATAAATATTTAATGATAGAACAGAAGGTTATGATAATTTGAAATAGAT
326 AACTTGTATGAACAGAAACAAATATTTAATGATAGAACAGAAGGTTATGATAATTTGAAATAGAT
* * *
9729130 AATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
391 AATTATTCAAACAGTCATAACCATTTGAACTAGTTCGACAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTT
* * *
9729195 ACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAGGTTGAAAAA
456 ACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAGGATCAAAAA
9729260 CAA-TTGTTTTATGACAAAATGAAAGATAATAACATTTTTATTTCAAATGAGCTTGTACGTTGAA
521 CAATTTGTTTTATGACAAAATGAAAGATAATAACATTTTTATTTCAAATGAGCTTGTACGTTGAA
9729324 AAACAATTGTTTTGTGAG
586 AAACAATTGTTTTGTGAG
* * ** *
9729342 AAAACGAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTAGTTGAACT-G
1 AAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTAGTTGAACTAG
* * * * * *
9729406 TTCAGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGT
66 TTCAGTAAATAGAATTATTTTGTAAATCTCTTA--TA--AAATTTTGAAATATTAACAAAGTAAT
* * * * * * * *
9729471 ATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTCTGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAATGA-AAAGTTC
127 ATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTCTTATGACAAA--ACAAAGGTC
* * * * **
9729535 ATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTCGTTTGATAAACGGA
190 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAATCATAATTATTTAAACTCGTCTGACAAACAAA
* * * * *
9729600 -TTTATTTTTTCAAATCTCT-AGCTTATTAGTTTTTTGAATGTTAATAAACTAGTATTATTTTCT
255 TTTTATTTTTT-AAATCTCTCAG-TTATGAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTAT
* * ** * * * *
9729663 TTCGAATAAGTTTGTATGAACCA-AGACAATTATTTTATGACTA-AACTA-AAGGTTA-GAATGA
318 TCCAAATAAACTTGTATGAA-CAGAAACAAATATTTAATGA-TAGAAC-AGAAGGTTATG-ATAA
* * * * * *
9729724 TTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTTACCATTTGAACT-GATTTGACAAACACATTTAAT
379 TTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACCATTTGAACTAG-TTCGACAAACAAATTTAAT
* * * * * *
9729788 TTTTCAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAGTTAGTATTATTTT-TATCCGAATAAGCT
443 TTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAGCT
* * *
9729852 TGTATGATCAGAAACAATTTTTTTTATGACAAAA
507 TGTAGGATCAAAAACAATTTGTTTTATGACAAAA
9729886 CAAGGATCAA
Statistics
Matches: 450, Mismatches: 79, Indels: 25
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
601 30 0.07
602 54 0.12
603 2 0.00
605 81 0.18
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607 20 0.04
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.12, T:0.41
Consensus pattern (603 bp):
AAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTAGTTGAACTAG
TTCAGTAAATAGAATTATTTTGTAAATCTCTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTA
TTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTCTTATGACAAAACAAAGGTCATAACA
ATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAATCATAATTATTTAAACTCGTCTGACAAACAAATTTTAT
TTTTTAAATCTCTCAGTTATGAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATA
AACTTGTATGAACAGAAACAAATATTTAATGATAGAACAGAAGGTTATGATAATTTGAAATAGAT
AATTATTCAAACAGTCATAACCATTTGAACTAGTTCGACAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTT
ACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAGGATCAAAAA
CAATTTGTTTTATGACAAAATGAAAGATAATAACATTTTTATTTCAAATGAGCTTGTACGTTGAA
AAACAATTGTTTTGTGAG
Found at i:9731480 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 9730543--9731984 Score: 928
Period size: 181 Copynumber: 8.0 Consensus size: 179
9730533 ATTCTATATG
* ** * * * *
9730543 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAGTAGATAGCTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAATTGTT
* * * * * * *
9730608 CAGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTGT-AAATATTAATGAATTAATA
65 TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAATA
* * * *
9730672 TTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAGACAATTGTTTTATGACAA
129 TTATTTT-ATCTAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * ** * * * * *
9730724 AACAAAAACTCATGACAATTTAAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTT
** * * * ** * **
9730789 CGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAACAAATTTGTAT
65 TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATA-
* * * * * * * *
9730854 TTTTTTTATTTGAAATAAGCTTCTATGAATAGAATA-AATTATTTTATGCCAA
129 TTATTTTATCT-AAATAAACTTATATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAA
** * * * *
9730906 AACAAAGGGTTATAGTGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTT
* * * * * *
9730971 TAGTGAATAGATTCATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTCTAGAATATTAATAAATTAGA-A
65 TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATA
* * * * ** * * * * *
9731031 TTATGTTATTTCAAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATTTTGTGATAA
129 TTATTTTATCT-AAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
** * * * * * *
9731083 AACAAATTGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTT-ACACTGGT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTGTT
** * * *
9731147 TAGGCCAATAAATTCT-TTTTTTAAATC-CTTTACTTTTTAATTTTTTAAAATATTAACAAATTA
65 TA-GTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTA
** * *
9731210 GCATTACATTGT-TCTAAATAAGAC-TGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
126 ATATT--ATTTTATCTAAATAA-ACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
9731265 AACAAATAGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAATTGGTT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTT
* * * *
9731330 TAGTAAATAGATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATAT
65 TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATAT
* * * * *
9731395 TATTTTATCTCGAACAAACTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTATGATAA
130 TATTTTATCT-AAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * *
9731446 AACAAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAGATAATTGGTCAAATAGTCATAATTATTTCAACTGGT
1 AACAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGT
* * * * *
9731510 TTAGCAAACAAAATTATTTATTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAT
64 TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAAT
* * * * * * * *
9731574 TTTATTTTATTTTAAAT-AAGTTAGTAAGAACTGAAAA-AATTATTTTACGATAA
128 ATTATTTTA-TCTAAATAAACTTA-TATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAA
* ** * * * * * * *
9731627 AACAAAATGTCATAACAATTTAAAATAAAGAACTGTTCATATAGCCTTAACTATTT-ATATTGGT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATT-GT
* * ** * * * * * * *
9731691 TTAGCAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTATTGGTTAGTAATTTTCATAACATTATTACATTACTA
64 TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATA
* * * * * *
9731755 TTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAG
129 TTATTTTA-TCTAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
9731807 AACAAAAGGT--T-AT-A--AGAAATTGA-AA---TACAAATAGGCATAACTATTTGATTTGGTT
1 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTT
* * * ** * *
9731862 CAATAAACAGATTTATTTTTTAAATAACCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAT
65 TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATAT
** * **
9731927 TATTTTAT-TACGAATAGGC-TAGTAGGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAA
130 TATTTTATCTA--AATAAACTTA-TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
9731978 AACAAAA
1 AACAAAA
9731985 GTTCAAATAA
Statistics
Matches: 992, Mismatches: 225, Indels: 98
0.75 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 37 0.04
171 78 0.08
173 2 0.00
174 5 0.01
176 9 0.01
177 107 0.11
178 29 0.03
179 8 0.01
180 104 0.10
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183 11 0.01
184 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTT
AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
ATTTTATCTAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
Found at i:9732406 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 9731995--9735811 Score: 2485
Period size: 181 Copynumber: 21.3 Consensus size: 180
9731985 GTTCAAATAA
* * * * * * * *
9731995 TTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATCAGTTTAAATAATTATGACCATTTCAACACTTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * ** * * *
9732060 TCAAATAGTTATTACATTTTGTTTGGTCACATAAA-AA-TGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTA
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATA-AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
**
9732123 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATCCTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
9732171 TT-AAAAATAAATTTGCTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTA-TATAT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTATTT
* ** * * * *
9732234 CAAATCGTTATAACTTTTTGTCCTATCATAAAAAAATTATTTTTGTTCTTACAAGCCTATTTGAA
66 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * *
9732299 ATAAAATAATACTAATATAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGAT
131 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
** * * * **
9732349 TTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGAATATACGAACAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * ** * *
9732414 TCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTAG
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTG
* *
9732478 GAATAAAATAA-AATGAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-
129 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *
9732528 TTCAAAAAT-AATTTGCTTACCTAACCAGATCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTACTATTT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTATTT
* ** * * * * *
9732592 CAAATCATTGCGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAAAAT-TTTTTGTTTATATAA-CTT-TGCTT
66 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT--TT
* *
9732654 GGAATAAAATAATACT-ATTGTACTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-
128 GAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * ** * ** *
9732702 TTAAAAAAAAAACTATGTTTATCAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAGTAATTCTTTAT
1 TTAAAAAATAAA-TTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATTAT
* * * * * * * *
9732767 TTCAACCAAATCGTTATAACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGTTTCTATTCATATAAG-TCT
64 TT----CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-T
* * * ** * * * *
9732831 A-TTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTTGACAATTAATAAATAAAACAT
124 ATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
9732888 TTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGATTATTT-AAGTAATTATCTAT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTAT-TAT
* * ** * ** *** * *
9732952 TTCAAATCATTTTGACTTTTCCTTTTATAATAAAGTAATTGTTCCAGTTCATATAAACTTATTTG
64 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
** * * * *
9733017 ATGTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAA
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * ** * *
9733069 TTAAAAGA-GAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATCTAAACAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * * * * *
9733132 TCAAAAC-ATATTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTATTTG
65 TCAAATCGTTA-TGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
9733196 GAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGGTAAAAGAT
129 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *** * *
9733248 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGATTGAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TTATT
* * * * * * **
9733313 TCAAATCATTATTACGTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCT-
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TG
9733377 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
** * * * *
9733425 TTAAAATCTAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAATAATTATCTATC
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAT-
* * * * *
9733490 TT-AAATCATTATGA-TCTGTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTC
64 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
* ** ** * * *
9733552 AAAGTAAAATATTGTTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAACAAGTAAGAGAT
129 AAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * *
9733604 TTAAAAAGTAAATGTATTTGCCAAACCAATTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAGTTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * ** * * *
9733669 TCAAATTGTTCTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCAAACATGCTTATCTG
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
* * *
9733733 AAATAAAATAATACT-ATTCTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAAATT
129 AAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * ** * * *
9733786 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGCCAAGTCTATTTGAATAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * * * * ***
9733851 TAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAAAAAAACAATTGTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGCA
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
9733916 AAATAAAATGATATTACTTTATTAATATTTC-AAAATT--TGAG-AAGAGAT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* *** * * * *
9733964 TTAAAAAATAAATTAGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * * *
9734029 TCAAATCGTTATGAATTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTG-T-AGTATAAGCCTACTT
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCA-TACAAGCTTATTT
* * * *
9734092 GGAATAAAATAATACTAATTT-TTAGTATTTCAAAAATTAATGAGTAAAAGAT
128 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
9734144 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * * * *
9734209 TCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTA--ATAAAATAATTATTTATGTTAATACAAGCTTATTT-A
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * * *
9734271 GAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAGTAACTTAGAGAT
130 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
9734323 TTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * * ** * * **
9734388 TTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTTATTTAAGTTTGTTCA
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
* * **
9734452 AAATAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
*** * * * * *
9734500 TTAAAAAATAAATCCCTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TTATT
* ** ** * * * * * **
9734565 TCAAATCATTATTCCCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATAC-AGCCTTATTCA
65 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTTG
* * *
9734629 AAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGAT
129 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *** * ** * * *
9734681 TTAAAAAATGAATCTG-TTAGCCTGGCTAGGGCAAATAATTAT-AATAATTTGAATAATTATCTA
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTAT-TA
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ***** *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * ** * *
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* * * * * * ** *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * **** ** * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATT
* * * * * * * * **
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * ** * * *
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* * * *
9732651 CTTGGAATAAAATAATACTATTGTACTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTAAAAAAAAA
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*
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ATACTAATATAATAATATTTCAAAAATTATAACTAAGAGATTAAAAAAAAAACTATGTTTATCAA
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* * ** * * * * *
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* **** * * * * * * *
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* * * ** ** * *
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* * ** ***
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* * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * * * * **
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** * *
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1 TAAAATAATACTAATT-T-TTAGTATTTC-AAAAATTAA-GAGTAAA-AGA-TTTAAAAAATAAA
*** * * * ** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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185 ATACTAATCTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATCT-G-TTAGC
** *** * * * * *
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* * * ** **
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*
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1 TAAAATAATACTAATTTTTAGTATTTCAAAAATTAA-GAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCAT
* * * * ** **
9734161 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGCTATAACTT
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* * *
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130 TTTGTTTTAATAAAATAATTATTTATATTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCT
* * * * * * **
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195 AATAATATTATAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATCTGTTAGCCAAATCAGGGCA
* * * **
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260 AATAATTAA-GATATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA
9734421 ACAAATTTTTTTGTTTATTTAAGTTTGTTCAAAA
324 ACAAATTTTTTTGTTTATTTAAGTTTGTTCAAAA
* ** * *
9734455 TAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTTGAAAATT-A-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCCCT
1 TAAAATAATACTAATTT-TTAGTATTTCAAAAATTAAGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCAT
* * * * **
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65 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTAAACAATTATATATTTCAAATCACTATAACCA
* * * * * *
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130 TTTG-TTT-TAATAAAATAATTATTTATATTAATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ***
9734646 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTAGCC-TGGCTAG
192 TCTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATCTGTTAGCCAAATC-AG
* * *
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256 GGCAAATAATTA-AGAT-ATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTC
* * ** ** * * * *
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319 ATAAAACAAATT-TTTTTGTTTATTTAAGTTTGTTCAAAA
* * * * * * ** * * * **
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1 TAAAATAATACTAATTT-TTAGTATTTCAAAAATTAA-GAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCA
* * ***** * * * * * * ** *
9734878 TTCATCGTTTAAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTA-CACC
64 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTAAACAATTATATATTTCAAATCACTATAACC
* * * * * * *
9734942 TTTTTGTTTTACCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTGC-AATTAAAATAAAACA
129 -ATTTGTTTTA--ATAAAATAATTATTTATATTAATACAAGCTTATT-CAAAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
9735006 AAT-TTATCGATATTCA-AACAATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAAATAAATCTGTTTA-TCTA
190 AATCTAAT-AATATT-ATAAAAATTAATAACTAACAGAT-TTAAAAAATAAATCTG-TTAGCCAA
* ** * * * ** * * *
9735068 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTACGACTTTTTGTTC
251 ATCAGGGCAAATAATTAAGA-TATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTT
* * * * * ** * * ** *
9735133 TATCATAAAATAATTATTTTTTATTCATACAAATTTATTCGGAT
315 TGTCATAAAACAAAT-TTTTTTGTTTATTTAAGTTTGTTCAAAA
* ** ** * * * **
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1 TAAAATAATACTAATTT-TTAGTATTTCAAAAATT-AAGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCA
* * * * ** * * * ***
9735242 TTTACCAAACAAGTACAAGTAGTCATAATTATTTGAATAATTATCTAGTTT-AAATTGTTATAA-
64 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTAAACAATTATATA-TTTCAAATCACTATAAC
* ** * * ** *
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* * * * * * * * * * * *
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**** * * * * * *** *
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251 ATC-AGGGCAAATAATTAAGA-TATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTT
* * * ** ** * *
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* * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * ** * *
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** * *
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* ** ** * *
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** * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* *** * * ** ** ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * **
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* * *
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* ** * *
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*
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*** * * *
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* *** * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* **
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* * * * ** * * * *
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* * * *** ** * ** * * * *
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* * *
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** * ** * ** ** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * * * *** * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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AA
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*
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AAAT
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Done.