Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167911.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_176, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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410 TCTTTGAGCT
* ** * * * *
420 AACAATAATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGATTT-TGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCA
* * * * *
484 TAAAAGCTTATTTGGAATAAAA-AATACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATTAATAAGTAAAA
64 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT--TAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * *
547 GATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTA
126 GATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* *
601 AACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * **
666 ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTCTTAAAAATTAATAATTTGGAGAT
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *
731 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATA-AATTTAAACA-TTCATGTCCATTTG
129 TTAAAAAATAAATTTATTTA-CCAA-ACAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTG
* * * * * *
782 AACTATTATCTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* ** *
847 GCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
908 TTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
129 TTAAAAAATAAATTTATTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** *
959 AACAATTATCTATCTCAAATTATTAGGATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * ** *
1024 CAAGCTTATTC-AAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
66 CAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
1088 TAAAAAATCAATGTGTTTACTGAACCAATTGAAATAGTTAAGACTA-TTG
130 TAAAAAATAAATTTATTTAC-CAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * ** *
1137 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
* * * * * * *
1201 TACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-CTTGTAATAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-
64 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *
1264 AGTTTAAAGAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
127 A-TTTAAA-AAATAAATTTATTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
1319 AACAATTATCTTATTTAAAATTGTTATAACCTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTT-TAATTCA
1 AACAATTATC-TATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA
* * * * * * *
1383 TAAAAGCCTA-TCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTAA-AG
64 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG-TAAGAG
* ** * * *
1446 ATTTTAAAAAAATAAA-TCAGTTTATTGAAGCAGTTCAAATAATTATTG-CCATTTG
127 A-TTT-AAAAAATAAATTTA-TTTA-CCAAACAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTG
* * *
1501 AACAATTATCTATTTCAAATCT-TTATGATCTTTTGTTTTGTCCATAAAACAATTGTTTTTTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAAT-TATTAT-AACTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTAT-T
* * * *
1565 CATACAAACCTATTCG-AATAAAATAATTGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGG
62 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG
** * *
1629 AGATTTAAAAAATAAATATGCTTCACAAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTG
125 AGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
1684 AACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * * *
1749 ACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATATAATAATATTATGAAAATTAATAA-CAAGAGAT
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
1813 TTAAAAAAATAAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTCA-GGCTATATG
129 TT-AAAAAATAAATTTATTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTG
* ** * * * * **
1865 AATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACAAATGTTTTTGCTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * * *
1930 ATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAAA-T--TAA-TAAGATA
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
1991 TTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTG
128 TTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
2043 AATAATTATTTATTTCAAATCATTATAACTGTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTGAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * * * * *
2108 ACTATCTTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAACAAGTAATG-GA
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAA-GAGA
* * ** * * * * * *
2172 TTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAATACAAATAGTTATAACTGTTTG
128 TTTAAAAAATAAATTTATTTACC-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
2224 AACAATTATTTATAACTGTTTGAACAATTATCTGTTTCAAAGTGTTATAACCTTTTGTTTGTTAC
1 AAC-A--A-TTAT--CTATTT-CA-AATTA--T-TAT--AA--CTT-T-----TGT-TTTGTCAT
* * * * * * *
2289 AAAACAATTGTTTTTGTTCGTATAAGCTGACTT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATT
44 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
2352 CCAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAAA-GTGTTTATCGATTA-AGTTCAAATAGTT
107 -TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTATTTA-CCA-AACAGTTCAAATAGTT
* *
2415 ATGATTCTTTG
168 ATGACTATTTG
* * * * * * *
2426 AACAATTATTTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTTTTTCTTTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * *
2491 GCAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT
65 ACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
2534 CGACAACTAA
Statistics
Matches: 1518, Mismatches: 313, Indels: 205
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 9 0.01
176 68 0.04
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178 153 0.10
179 114 0.08
180 74 0.05
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187 5 0.00
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189 6 0.00
191 3 0.00
192 2 0.00
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199 1 0.00
201 4 0.00
202 99 0.07
203 5 0.00
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AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
AAAAAATAAATTTATTTACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
Found at i:2236 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 2211--2254 Score: 88
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
2201 ATACAAATAG
2211 TTATAACTGTTTGAACAATTAT
1 TTATAACTGTTTGAACAATTAT
2233 TTATAACTGTTTGAACAATTAT
1 TTATAACTGTTTGAACAATTAT
2255 CTGTTTCAAA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 22 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.09, G:0.09, T:0.45
Consensus pattern (22 bp):
TTATAACTGTTTGAACAATTAT
Found at i:2624 original size:143 final size:138
Alignment explanation
Indices: 2413--2696 Score: 320
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2403 GTTCAAATAG
* * *
2413 TTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCACTATAA-CTTTTGTTTTATCACAAAAT-A-
* * * *
2478 TTTTTCTTTTCATGCAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCGACAACT
63 TTTTT-TGTTCATACAAGCCTA-TTCGAATTAAAATAATACAAATTTATTAAAATTTCGACAACT
2542 AATTAGTAAAAGAT
126 AA-TAGTAAAAGAT
* * * *
2556 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCATTATGA-TTTTTTTTTATCATAAAACTAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TCACTATAACTTTTGTTTTATCACAAAA-TAT
* * ** * * *
2620 TTTTTGTTCATACAAGCCTATTCGGATTAAACTAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAAT
64 TTTTTGTTCATACAAGCCTATTCGAATTAAAATAATACAAATTTATTAAAATTTCGACAACTAAT
2685 AGTAAAAGAT
129 AGTAAAAGAT
2695 TT
1 TT
2697 TAAAATATAA
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 18, Indels: 10
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
139 16 0.13
140 45 0.38
141 5 0.04
142 16 0.13
143 31 0.26
144 7 0.06
ACGTcount: A:0.37, C:0.11, G:0.07, T:0.45
Consensus pattern (138 bp):
TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCACTATAACTTTTGTTTTATCACAAAATATTT
TTTGTTCATACAAGCCTATTCGAATTAAAATAATACAAATTTATTAAAATTTCGACAACTAATAG
TAAAAGAT
Found at i:4332 original size:157 final size:157
Alignment explanation
Indices: 4096--4388 Score: 351
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4086 CTATTTGAAC
*
4096 ATTATCAATTTGAAATCATTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAA
1 ATTATCAATTTGAAATCATTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATAAAA
* * * ** * *
4161 GTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATATTAATATTACAAAA-ATTAA-TAAGAGATTTAAAA
66 GCTTATCTAAAATAAAATAAAG-T--TATATTAATATTACAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAA
4224 AATAAATCTTTTTATCAAACCTATTCAACA
128 AATAAATCTTTTTATCAAACCTATTCAACA
* * ** * * *
4254 ATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG-TTTTAGTTCATAAA
1 ATTATCAATTTGAAATCATTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATAAA
* *
4317 AGCTTATCTAAAATAAAATAAAGTTGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
65 AGCTTATCTAAAATAAAATAAAGTTATATTAATATTACAAAA--TAATAAGTAAGAGATTTAAAA
4382 AATAAAT
128 AATAAAT
4389 AAGTTTACTG
Statistics
Matches: 113, Mismatches: 17, Indels: 10
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
154 16 0.14
156 6 0.05
157 36 0.32
158 55 0.49
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (157 bp):
ATTATCAATTTGAAATCATTATCACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATAAAA
GCTTATCTAAAATAAAATAAAGTTATATTAATATTACAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
AAATCTTTTTATCAAACCTATTCAACA
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Alignment explanation
Indices: 4250--10836 Score: 4588
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4240 AAACCTATTC
* * * *
4250 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
4314 AAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAA-AGT--TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * * *
4375 TTTAAAAAATAAATAAGTTTACTGAATCAATTTCAAATAATTATGGCCATTTA
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
4428 AACAACTATCTATTTCAAATTGTT-TGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAA-
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG--ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAAT
* * * * ** *
4491 T-ATAGAAGCTTATTCGAAATGAAATCATACTAATTTGGCTAATATTTCAAGAATTAAT-A--AA
62 TCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * ** *
4552 GA-ATTTAAAAAAATAAAATCTATTTATCCAAACCAGTTCAAATAGTTTATGAACTAATTTG
126 GAGATTT-AAAAAAT-AAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAG-TTATG-ACT-ATTTG
* * * * * **
4613 AACCAATTCTCTATTTCAAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACACATTGTTTATCTG
1 AA-CAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTG-TT-TCAA
* * *
4678 TTTATATAAGCCCTTATT-TGAAATAAAATAA-ACATAATTTAGTT-ATA-TTAAAAAATTAATA
61 TTCATACAAG--CTTATTCT-AAATAAAATAATAC-TAATTTA-TTAATATTTCAAAAATTAATA
* *** * * *
4739 ACTTAAGAAGATTTAAAAAAATAAATCCAATTTGCTTGAACTAGTTTCAAATAGTGTAAGACTAT
121 A-GTAAG-AGATTT-AAAAAATAAAT-TTGTTTAC-TGAACAAG-TTCAAATAGT-TATGACTAT
*
4804 AATGG
179 --TTG
* * * * ***
4809 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTTATGACCTTTTG-TTTGTTGA-AAAACAATTGGCTTTTTGT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-G-TTTCAAT
* * * * * * *
4872 TGAATAATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAAT-AGT
62 T-CAT-ACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
* * * * *
4936 AAGAGA-TTAAAAAGTAAATCTGTTTAGCT-AACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTG
124 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
4993 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTTGTTTTTGTCATCAAACAATTTGGTCCTATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTG-TTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAATT
* ** * * * **
5058 CATACTATTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAG
63 CATACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * ** * * * *
5122 AAAATTAAAAAAATAAATATAATTA-TCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTGTATG
127 -AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * *
5178 AATGATTACCTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-TATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* * *
5242 TACAAGCTTATTCTAATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 TACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
5307 TTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGATTATTAG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
5359 AACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
5424 ACAAGCTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAATAG
66 ACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
5487 ATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCGAATAGTTATTACTATTTT
129 ATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
5541 AACAATTGT-TAATTTAAAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTCATAAAACATTTGTTTCAATTAA
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* ** * * *
5605 TACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTT-ACTAAA-TAATAAGTAAGA
65 TACAAGCTTA-TTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * ** * * * *
5667 AACTT-AAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTTAAAATAATTATAGCCCATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAG-TTCAAATAGTTAT-GACTATTTG
** * * ** *
5722 AATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCAC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* *
5786 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT--AAAATTAATAAGTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
5849 TTAAAAAAT-AATATGTTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
131 TTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
5899 AACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGATC-TATGTTTTATTCAATAAAACAATTGTTTCTGA-
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTC-ATAAAACAATTGTTTC-AAT
* * * * * *
5961 TCATAGAAACTTATTTCGT-TA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAATTTAATAAGTA
62 TCATACAAGCTTA-TTC-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
6024 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAGTCAA-TTCGAATAGTTA-AAATATTAG
125 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
6080 AATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATT-T
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCA
* * * * *
6144 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAAAAGGAA-A
65 TACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
** * *
6206 TGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTA
128 -GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * ** * * * *
6262 AACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * * * *
6327 AAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-T
66 ACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
6391 TT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTG
131 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
6440 AACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * *
6505 ACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAGTGA
66 ACAAGCTTA-TTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * ** * * * *
6569 TTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTC
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
6621 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTAA-TC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTC
* * * * * *
6685 ATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
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* * * ** *
6750 ATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
129 ATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
6804 AACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* ** * *
6869 ACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * ** * *
6933 TTTAAAAAAGAAATTTGATTGT-C-AAACTAGTACAAACAGTTAAAATTATATG
130 TTTAAAAAATAAATTTG-TT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
6985 AACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCATTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
** * * * *
7043 ACTGGCTTATT-TGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATGTAAGAG
66 ACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
7106 ATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCT-AACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * **
7159 AACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
7224 ATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--G-GA
66 ACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
7284 TTTTAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * ** ** * * * * ** *
7336 AGTAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* ** * ** * *
7401 AAAAATTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-A-A
66 ACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * *
7463 TTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTG
130 -TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * *
7515 AATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* ** *
7580 ATC-AGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAG
66 A-CAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
7643 ATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * ** ** * *
7696 AATAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * *
7761 ACAAGCTTATTAC-GAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAA
66 ACAAGCTTATT-CTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGA
* ** *
7822 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTG
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
7876 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * * * *
7941 ACAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAACTAATAAGTAAAAGA
66 ACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* *
8005 TTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTG
* * * * * *
8057 AATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTGAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * * *
8122 ATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATA-TTCTAAAATTAATGAGTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
8185 ATTAAAAAATTAATTTGTTTA-TCGAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTA
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** *
8237 AACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * *
8302 GCAAGCTTATTTCGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-
66 ACAAGCTTA-TTCTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
8363 ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTTAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
129 A-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
8417 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTATGATAAATCAATTATTTCTATTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
8482 A-ACAGCTTATTC-AGAATAAAATAATGCTTATTTATTAA-ATTTGCAAAAATTAATAAATAAAA
66 ACA-AGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** *
8544 GATTTAAAAAATAAATGTGTTT-CCCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTG
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
8598 AACAATTATTTATTTCAAAT-GTTATGATCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* ** * * * * **
8662 TATAATTTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTTGGAG
65 TACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
** * * * *
8726 ATTTAAAAAATAAATCTATGCAT-C-AAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTG
129 ATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*** * * ** * * *
8779 AGTTATTATCAATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTT-ATATTTA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCA
** * * *
8843 TACAAAATTATT-AAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAG
65 TACAAGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
8903 ATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTC
129 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
8956 AATAATTATCTATCTCAAATCGTTATTATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * * * *
9020 ACAAGCTTATTCGAATTAAAATATTA-TGAAATTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * * *
9083 TTTAAAAAAT-AATGTGTTTGTTGAACAGGTTTAAATAGTTAAGACTATTAG
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* * * * ** * * * *
9134 AATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTTTACTCTTAAAATAATTTTTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* ** * * *
9199 ACATGGATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCA-TTCAAAAAATTAATAA-CAAGAA
66 ACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
9261 ATTTTAAAAAGTAAATTTGTTTAATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
129 A-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
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1 AACAATTATCTATTT-CAA-ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * ** * * * * *
9378 ATAAAAGCATACCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAAAAAGTTAA-A
64 ATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGA
* ** * * * *
9442 GATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATTGAATC--GCTTCAAATAATTATTG-CCATTTA
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAG-TTCAAATAGTTA-TGACTATTTG
** * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTG--TTTCAATT
* ** * * *
9558 CATACAAGCCTATTCGGAATAAAGTAATATTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
63 CATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
9623 GATTT-AAAAATAAATTTATTTATTGAAC-----C-AAT--TT-T---TATATG
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * * *
9664 AACAATTATTTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * * * * *
9729 ATAAGCTT-TTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * ** * * * ***
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* * *** * * * **
9845 AACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TC
1 AACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTC
* * * *
9909 ATTCAAGCCTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
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* * *
9973 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * ** * * * ***
10025 AACAATTATAAACTTCAAATCATTAAAACAATTATTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-----CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAA
* * * * * *
10090 TTCATACAAGCTTATTCAAAACAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
61 TTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
10155 AAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAA-TTCAAACATTTAAGACTATATG
126 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
10211 AATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAATTC
* *
10276 ATACTAA-CTTATT-TGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAA
64 ATAC-AAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
10334 GAGATTT-AAAAAT-AATTCTATTTACCT-AAGC-AGTTTAAATAATTATGACTATTTG
126 GAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * ***
10389 AATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * * * * *
10454 ACAAGTTTGTT-TGGAATAAAGTAATAGTAATATATTAATA-TTCAAAAA-T--TAA-TAACAGA
66 ACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
10513 TTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-ATGAGTTCAAATAGTTATGACT-TTATG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TG
* * * * * * *
10565 ACTATTTGAGTAGTTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTT
1 A--A---CA--A-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * **
10630 CCGTTCATACAAGCCTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAA
58 CAATTCATACAAGCTTATTCTAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** * * * * *
10694 GTAAAAAAAGTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTG
122 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
10754 AATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* *
10818 ATAAGCTTATTCGAAATAA
66 ACAAGCTTATTCTAAATAA
10837 TAATTAAGAG
Statistics
Matches: 5082, Mismatches: 1027, Indels: 598
0.76 0.15 0.09
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166 4 0.00
167 2 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
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ACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
Found at i:6020 original size:541 final size:539
Alignment explanation
Indices: 4250--30788 Score: 7809
Period size: 542 Copynumber: 48.8 Consensus size: 539
4240 AAACCTATTC
* * *
4250 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATCA
* * * * * *
4313 TAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAA-AGT--TGTATTAATATTTC-AAAAGTTAATAAGTAAGAG
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
** * * * * * * *
4374 ATTTAAAAAATAAATAAGTTTACTGAATCAATTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCT
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
4439 ATTTCAAATTGTT-TGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAA-T-ATAGAAGCT
192 ATTTAAAATCGTTATG--ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATACAAGCT
* * ** * *
4501 TATTC-GAAATGAAATCATACTAATTTGGCTAATATTTCAAGAATTAAT-A--AAGAATTTAAAA
253 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTACAA-AATTAATAAGTAAAAATTT-AAA
* * *
4562 AAATAAAATCTA-TTTATCCAAACCAG-TTCAAATAGTTTATGAACTAATTTGAACCAATTCTCT
314 AAAT-AAATC-AGTTTAT-CAAACTAGTTTCAAATAG-TTATG-ACT-ATTTGAA-TAATTATCT
* * * * * * * *
4625 ATTTCAAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACACATTGTTTATCTGTTTATATAAGCC
372 ATTTC-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTG-TT-TCTATTCATACAAG--
* * ** *
4690 CTTATTTGAAATAAAATAA-ACATAATTTAGTT-ATATTAAAAAATTAATAACTTAAGAAGATTT
431 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TTAATTTA-TTAATATTTCAAAATTAATAA-GTAAG-AGATTT
** * * * *
4753 AAAAAAATAAATCCAAT-TTGCTTGAACTAGTTTCAAATAGTGTAAGACTATAATGG
492 -AAAAAAT-AAT---ATGTTTATCGAACAAG-TTCAAATAGT-TATGACTAT--TTG
* * * * * *
4809 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTTATGACCTTTTG-TTTGTTGA-AAAACAATTGGCTTTTTGT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-G-TTTCTGA
* * * * * * * *
4872 TGAATAATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAAT-AGT
62 T-CAT-ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
4936 AAGAGA-TTAAAAAGTAAATCTGTTTAGCTAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATT
123 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
5000 ATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTTGTTTTTGTCATCAAACAATTTGGTCCTATTCATACTA
188 ATCTATTTAAAATCGTTATGAC-CTTTTG-TTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATACAA
** * * * ** *
5065 TTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAA
250 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAA-TTAATAA-GTA-AAAATTTA
* * * * * *
5130 AAAAATAAAT-A-TAATTATCGAACTAG-TTCAAATAGTTAAGACTGTATGAATGATTACCTATT
312 AAAAATAAATCAGT--TTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * *
5192 CCAAATCGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCT
375 TCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG
* ** *
5256 AATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
439 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * * *
5321 TTATTTA-CTGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGATTATTAG
502 ATGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
5359 AACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * * * * *
5423 TACAAGCTTA-TTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAATAG
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
5487 ATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCGAATAGTTATTACTATTTTAACAATTGT-T
128 ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
5551 AATTTAAAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTCATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAG
192 -ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-
* * * * *
5616 AT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAA-TAATAAGTAAGAAACTT-AAAAAT
255 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT
** * * * * * * *
5678 AAATCAGTTTATTGAATTAGTTTAAAATAATTATAGCCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATT
318 AAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* *
5743 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCACACAAGCTTATTCGAAATAAAA
382 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
5807 TAATATTAATTTATTAATATTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTATCG
447 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTATCG
* *
5871 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
512 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
5899 AACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGATC-TATGTTTTATTCAATAAAACAATTGTTTCTGAT
1 AACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTC-ATAAAACAATTGTTTCTGAT
* * ** *
5962 CATAGAAACTTATTTCGTTA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTTC-AAAATTTAATAAGTAA
63 CATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAAT-TAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * * * *
6025 GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTCGAATAGTTA-AAATATTAGAATAATTA
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * *
6088 TCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATT-TTACAAGTT
189 TCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCT
* * * * *
6152 TATTC-GAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAAAAGGAAATGATTTGAA
253 TATTCAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-ACAAAATTAATAAGTAAA-AATTT-AA
** * * * * * *
6215 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG-TTCAAATAGTGATGACTATTTAAACT-ATTATTTATTTA
313 AAAATAAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTC
* *** * * * * *
6278 AAATCATTATGACCAGTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAA
377 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA
* * * * * *
6342 ATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAATA-AATTTG
441 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATG
* * *
6405 TTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTG
505 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
6440 AACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGAATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG-A-TC
* * * * *
6503 ATACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AATAATTAATAAGTAAGT
64 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
6567 GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATC
127 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * * * *
6631 TATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTAA-TCATATATGTTT
191 TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATACAAGCTT
* * * * *
6695 ATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
254 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAA
* * * * * * *
6760 ATAAATCTA-TTTACCGAACTGGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAA
316 ATAAATC-AGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
6823 TCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
380 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* * ** * * * * *
6888 AATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGATT
445 AATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAATATGTTT
* * * * * ** * *
6953 GTCAAACTAGTACAAACAGTTAAAATTATATG
508 ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
6985 AACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCAT-TTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TGATCA
** * * * * *
7042 TACTGGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACATTTC-AAAAATTAATATGTAAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
7105 GATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATT
127 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * ** * * *
7169 TATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGT
191 TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT
* * ** *
7234 TCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--GGATTTTAAAAATAA
256 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
** * * * * *
7296 ATTTGTTTATCAAACTAGTTT-AAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTAAAATTGTT
320 ATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
** * * * * * ** * ** *
7360 ACAATTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTATTC-AGATTAAAATA
385 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * * *
7424 ATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAA-ATTGTTTACC
449 ATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAATA-TGTTTATC
* * *
7486 AAACTAGATCAAATAGTTATGACTATTTG
511 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
7515 AATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTT-TAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATCA
* *** *
7579 TATC-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAG
65 TA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
7643 ATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * ** ** * *
7708 TTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT-
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
*
7772 ACGAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTA-AGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATA
258 A-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATA
** * ** * * * *
7835 AATTTGTTTA-CTAAACAAG-TTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTG
319 AATCAGTTTATC-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
*
7898 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-ATATTAAAA
383 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAA
* * *
7962 TAATATTAATTTATAAATATTTCAACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT
447 TAATATTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTAT
*
8027 TGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTG
510 CGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTG
* * * * * * *
8057 AATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTGAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * *
8122 ATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTC-TAAAATTAATGAGTAAGAGAA
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTAAT-AATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
8186 TTAAAAAATTAATTTGTTTATCGAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTAT
130 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * *
8250 TTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTTATGCAAGCTTATTT
194 TT-AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TT
* * *
8314 C-GAAAAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAA
257 CAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
* *
8377 AT-ATGTTT-TCTTAAC-ACGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
320 ATCA-GTTTATC-AAACTA-GTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *
8438 ATTATGACCTTTCGTTTTATGATAAATCAATTATTTCTATTTATA-ACAGCTTATTC-AGAATAA
382 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGCTTATTCGA-AATAA
* * *
8501 AATAATGCTT-ATTTATTAA-ATTTGCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAA-ATGTG
445 AATAAT-ATTAATTTATTAATATTT-C-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGT-
* *
8563 TT-TCCCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTG
506 TTAT-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* *
8598 AACAATTATTTATTTCAAAT-GTTATGATCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* ** * * * * **
8661 ATATAATTTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTAATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTTGGAG
64 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTAA-TAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * * * * *** *
8726 ATTTAAAAAATAAATCTATGCATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCAA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * ** * * * **
8791 TTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTT-ATATTTATACAAAATTATT
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
8855 AAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAAT--G-AGAGATTTAAAAACTAA
257 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTACAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
* * *
8916 ATCTA-TTTATCAAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCGT
320 ATC-AGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * *
8979 TATTA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATA
384 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * * *
9043 TTATGAAATTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATGTGTTTGTTGA
449 ATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTATCGA
* * * *
9107 ACAGGTTTAAATAGTTAAGACTATTAG
513 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * ** * * * * *
9134 AATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTCGTTTACTCTTAAAATAATTTTTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* ** * * * * *
9199 ACATGGATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTATCATTCAAAAAATTAATAA-CAAGAAAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTAATAAT-ATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-
* * *** * *
9263 TTTAAAAAGTAAATTTGTTTAATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-
* * * * * * *
9328 TTGTAAGAA--G-TATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACGATTGCTTCAATTCATAAAAGCATA-
193 TT-TAA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT
* * * * * * *
9389 CCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAAAAAGTTAAAGATTTAAAAAAT
256 TCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAAT
* ** * * * * * * *
9454 AAGTCAGTTTATTGAA-TCGCTTCAAATAATTATTG-CCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATT
318 AAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
9517 ATTATGAACTTTTT-TTTGGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGGAATAA
382 GTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* * * *
9580 AGTAATATTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTATTT
445 AATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTT
* *
9644 ATTGAAC-----C-AAT--TT-T---TATATG
508 ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * * * *
9664 AACAATTATTTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * * *
9729 ATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * *** *
9794 GTAAAAAACAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAACAATTCA-AACTATACAAACAATTATCTG
130 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTA
*** * * * ** * *
9857 TTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTAT
193 TTTA-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTAT
* * * * *
9921 T-TGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
256 TCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT
* * * * ** *
9985 AAATCTGTTTA-CTAAACTA-ATTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATC
318 AAATCAGTTTATC-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* ** * * * * *
10046 ATTAAAACAATTATTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
382 GTTATGAC-----TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA
* * * * * * * * *
10111 CAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATTTG
442 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATG
** * * * *
10176 TTTGCCGAACCAA-TTCAAACATTTAAGACTATATG
505 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
10211 AATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTCAATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-GA-T
* * *
10275 CATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TA
63 CATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTA
* * * * * **
10333 AGAGATTT-AAAAATAATTCTATTTACCTAAGC-AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATGATT
124 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *** *
10396 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTT
188 ATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT
* ** * * * * *
10461 TGTTTGGAATAAAGTAATAGTAATATATTAATATT-CAAAAATTAAT-A--ACAGATTTAAAAAA
253 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA
*
10522 TAAATCTA-TTTATCAAA-TGAG-TTCAAATAGTTATGACT-TTATGACTATTTGAGTAGTTATT
317 TAAATC-AGTTTATCAAACT-AGTTTCAAATAGTTATGACTATT-TGA--A--T-A--A-TTATC
* * * * ** *
10583 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCCGTTCATACAAGCCTAT
371 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * **
10648 TC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAAAAAGTAAAAAAT
436 TCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * *
10712 AAATATGTTTA-CTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTG
499 -AATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
10754 AATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * * ** **
10818 ATAAGCTTATTCGAAAT--AATAAT--TAA--GA-GAT-TT-AAAAAATGAATCTGT--TTG-TT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * ** * * * * * *
10871 GAACAAGTTTGAA--TAATTA-TG-ACTATTTCAACA-A-TTAT--CTTTTTGAAATTGCTATAA
131 TAA-AA-AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTG-AA---CAATTA
* **** * * * * * * *
10928 TCTTTTGTTTTGTCATAAAATGA--TTTT-TTCTAT-TCATACAAGCTTATT-TTGAATAAAATA
189 TCTATT-TAAAATCGT--TATGACCTTTTGTT-T-TGTCATA-AAAC-AATTGTT---TCAATTC
** *
10988 ATACAAATTTATT-A-ATATAAAGA-AA-A-TGAA-TTAGTAA-A--AC---A-T--T---TAAA
244 ATACAAGCTTATTCAGA-ATAAA-ATAATACT-AATTTATTAATATTACAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *
11035 AA--T--A-AAT---T-TGTTTACCGAAACAAG-TTCAAAT-TTTATGACTATTTGAACAATTAT
306 AATTTAAAAAATAAATCAGTTTATC-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * *
11089 TTACTTT-AAATTC-TTATGACTTCTTGTTTTGTCATAGAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGGT
370 CTA-TTTCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * * * *
11152 TATTC-AAATTACAATAATGTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGA
433 TATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * *
11216 AATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGCCTA-GACTATTTG
496 AAT-AATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTG
* * * * * * * *
11261 AATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTT-TAATAAAACAATTGATTCAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * *
11325 ATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAA
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
11390 TTAAAAAATGAATATGTTTACTGAATATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATT
130 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * **
11455 TCAAAAT-ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTT
195 T-AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
** *
11519 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAAT-
259 GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTACAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATC
* * *
11582 ATGTTT-TCTAAAC-ACG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATT
323 A-GTTTATC-AAACTA-GTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
** * * * * *
11644 ATGACCATTTCTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATT-TAGAATAAAATA
385 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * * * * *
11708 ACACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTGTTTA-C
449 ATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAAT-AATATGTTTATC
* * *
11772 TAAACGAGTTCAAATATTTATGACTATTTG
511 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * *
11802 AACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * ** * * * *
11866 TATAAGTTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAATTTATAAGT-TGAA
65 TACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTAAT-AATATTCAAAAAATTAATAAGTAAG-A
* * * * * * *
11930 GATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCTATTATC
127 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATC
* * * * * ** * * **
11994 TATTTCAAATAGTTATGACATTATATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAAATTAT
191 TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT
* * ** * * *
12059 TCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAG---AGATTTAAAAACTAA
256 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
** * * * * * * * *
12121 ATTTGTTTATCGAGCCA-ATTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTT
320 ATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* ** * * * *
12185 AT-AATCATTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATGCAAGCTTATTC-AGAGTAAAATA
385 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* ** * * * **
12248 TTGCTAATTTGA-TAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCC
449 ATATTAATTT-ATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTATC
* * * * *
12312 AAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAG
511 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
12341 AATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATAT-TTT-TAATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTGA-TC
* * ** * * *
12404 ATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACTACA-
64 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAAT-AAGTA-AG
* * * * * * *
12468 A-ATTTTAAAAAATAAGTCTATTTGCC-TACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTCGAACAATTAC
126 AGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
*** * * *
12531 CTATTTAAAATAAATATGACCTTTTCTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA
190 CTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA
* * * * * * * * *
12596 -TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAATAG
255 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAA
** * * * * * * * * *
12660 TATGTCAATTTATCGAA-TTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAATTC
317 TAAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* ** * * * *
12724 ATTACAAAC-TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAA
382 GTTA-TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* * *
12787 AATAATATTAATTTATTAATATGTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
445 AATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTT
* * *
12852 A-C-TA-AA---C---CAG-T-T-CCTATTTG
508 ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
12872 AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATCA
* * ** * * * *
12936 TATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAAA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * ** * * * * *
13001 TTTAAAAAATTAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTGAAATAGTTAAGACTGTATGACCAATTATCTAT
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
13066 TTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAACTTATTCA
194 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * * **
13131 AAATAAAATAATAATAATTTATTTATATTCCGAAAAGTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAAT
259 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *** * * *
13196 CAGTTTACCTAA-TAAGTTT-AGATAATTATTG-CCATGCCAACAATTAACTATTTCAAATAGTT
322 CAGTTTATCAAACT-AGTTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * *
13258 ATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTATTC-AGAATAAAA
385 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAA
* * * * * * *
13320 TAATACT-A---ATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTTTTTAT
447 TAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTAT
*
13381 CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
510 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * * * * * *
13411 AACAATTGTAAACTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * * *
13476 ATAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAAAGA
66 ACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAAT-TAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * ** * *
13540 ATTAAAAAATAAATTTATCTATCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAGTTATCTAT
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * ***
13605 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATA-AGTTTTTTTGAATTTATTTTAGCTTATT
194 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACA-ATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT
** * * * * * *
13669 TGGAATAACATAA-AATGAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTT-AAAAATA
257 CAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATA
* ** * * * * *
13732 ATTTTGTTTACCTAACCT-G-TCCAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
319 AATCAGTTTATC-AAACTAGTTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *** * * * * * *
13795 ATTATGACTGTTTGTTTTATCATAAAATAAACATTTTTGTTCATATAAGTTTGTT--AAAAAAAA
382 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * * * * *
13858 GTAATACTAATCTATTAATATTTC-TAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
447 -TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTAT
* * * *
13920 CAAACGAGTTTAAATAGTTATGACTATATG
510 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
13950 AGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTTATAAAACAATTTTTTATGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * *
14014 ACAAGCTTATTT-AGACTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTC-AACAATTAATAAGTAA-AA
66 ACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * * *
14076 ATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTAAATAATTATTT
128 A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* ** * * *
14141 ATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
192 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT
** * * *
14206 GGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATG
257 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAATA
* * * * *
14270 AATCA-TTTA-CTGAA-TAAGTTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAATC
319 AATCAGTTTATC-AAACT-AGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
14331 GCTAT-AATCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTCATTTC-AAATA
382 GTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATA
** * * *
14394 AAATAATACAAATTTATTACTA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
444 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGT
* *
14458 TTACCGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTG
506 TTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTG
** * * * *
14492 TGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * * * ** *** * * *
14556 TACAAGTTTA-TTCAGATTAGAATAATACTAATTTTTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAT
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *** * *
14620 ATTTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT
128 A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *** * * * * * * * *
14685 ATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTTAGTTCGTATAAGTTTGTT
192 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT
* * *
14749 TA-AACTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATGAGTAAGAGAA-ATAAAAAA
257 CAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC--AAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAA
* * ** * * * *
14811 TGAATCTA-TTTA-CTGAA-TAAG-TTCAAATAGTTATGACTAGCTAAACAAATATTTATTTCAA
317 TAAATC-AGTTTATC-AAACT-AGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * * *
14872 AACATTATGACCTTTTGCTTTGACATAAAACAATTGATTCTATTCA-ATCAAGCTTATTTTG-AA
379 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTA-TTCGAAA
* * * *
14935 TAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTT
442 TAAAATAATATT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATAT
* * * * *
14998 GTTTTTTGAACACGTTTAAATAGCTATGACTATTTG
504 GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * *
15034 AACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTTTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCA
* * * * * ** *
15099 TAAAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTGAAAATTAAT-AGTTATGAC
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAG-TAAGA-
* * * * * * * * * * *
15163 TATTTAGATAAT-TATTTATTT--C-AA-ATTGTT-ATAAT-CTTTTG--T-TTTGTCATAAAAC
127 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCA-AATAGTTATGACTATTTG--A-ACAAT
* * ** * * ** * ** * ** * *
15218 AAT-TGTTT-CTAT--TCATCA-AGTTT-ATTTGAAATAAAATAA-T-ACT-AATTTAT-TAA--
187 TATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
* * * * * ** * *
15271 -TATTC----TAAAA-ATTAATAATTT-TGAGATTTTAAAAACAATTCTGTTTATTAAATAAGTT
252 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATT-ACAA-AA-T-TAATAAGTAAA-AA-TT
* * * * *** ** *
15329 T---AAAT-AATCA--TT-TCCAATTAG--TC---TA-TTATCTA-TTTCAA-ATCGTTAT-GA-
310 TAAAAAATAAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * **
15377 -T---AT--TT-T-A---TTT-TATCG---TAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAAATTATTC
374 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTC
* * * *
15427 AAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAA
438 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * * *
15488 TTTGTTTA-C-AAAATTATTTCAATTAGTTATGACTATTTG
501 TATGTTTATCGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * ** * *
15527 ATCAATTATCTATCTCAAATCACTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAATAATTGTTCCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * * * * **
15590 TACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * *
15654 ATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
15719 TTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACATGCTTATTC
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
* ** * * * *
15784 AAAAT-AAATAATACTCTTTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAAAAATAA
258 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAA
* * * * * * *
15848 ATCTGTTTA-CTGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCAT
320 ATCAGTTTATC-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
** * * * *
15911 TATGACCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT
384 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * *
15975 ACTATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGA-AATTGA-AGATTTAAAAAATAA-ATCAGTTT
448 AATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT-A-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATAT--GTTT
* * * *
16037 ATCGAATC-AGTTTAAATAATT-TCACCATTTG
508 ATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * **
16068 AATAATTATCTATTTCAAATATTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TCCTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * *
16132 ACAAGCTTGTTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGGAG
66 ACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
16195 ATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGAAC-CGATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATAT
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
16259 ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT--ATGCTCATACAAGCTTA
192 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT--TCATACAAGCTTA
** * * * * ** *
16322 TTTGGAATACAATATTACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAAT
255 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTA-CAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT
* * * * * * *
16387 AAAT---TTTTTGCTAAACCAG-TACAAATAGTTAAGGCTATATGAATATTTATCTATTTCAAA-
318 AAATCAGTTTAT-C-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
16447 CTATTATGACCTTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TCGTTCATATAAGTTTGTTCGGAAT
381 C-GTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAAT
* * ***
16510 AAAA-AAGTATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAGTCCA
443 AAAATAA-TATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TATG
* * * *
16570 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTG
505 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* * ** ** *
16605 AACAATTATTTATTTTAAATTATTAT-AATTATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * ** * *
16668 ATAC-AGTCTTATTTGAAATAAAAGCAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAC
64 ATACAAG-CTTATTTGAAATAAAA-TAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAA-
* * * * * * * * * *
16732 G-GATTTAAAAAATGAATCTATTGGACTGACCAA-TACAAATGGTTATAAATGTTTGAACAA-TA
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * ** *
16794 TCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAACT
189 TCTA-TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT
* * * * *
16858 GACTTGA-AATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAGATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
253 TA-TTCAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTACAAA-ATTAATAAGTAA-AAATTTAAA
* * * * * * *
16921 AACTGAATCTGTTTATCGATCAAG-TTCAAATAGTTACT-ACTCTTTGAATAATTATCTATTTCA
314 AAATAAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
16984 AATCGCTATAACCTTGTGTTTTGTCAAAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAT
378 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAA
** * * * *
17048 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
442 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATAT
* *
17112 GTTTATCAAATAAGTTCAAGA-AGTTATGACTATTTG
504 GTTTATCGAACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
17148 AACAATTATTTTTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * *** * * * *
17213 ACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAATAAAATA
66 ACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * **
17277 TTTTAAATATAAA-CATGTTTACCGAACAAGTTCTAACT-GTCATAACTACTTT-AGTAATTATC
129 TTTAAAAAATAAATC-TGTTTACCGAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATC
* ** * ** * * *
17339 TATTTCAAATTATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTAC
191 TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-
** * * * ** *
17404 TGAATAAGCTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTT-ATGATCTTT
255 TTCAGAA--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-ATTAA-TA-TTA---CAAA-A-TTAAT-A-AGTA
* ** * *** * * * *
17467 TATTTTGTCATAAAAT-AATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAT-ACTAAT
304 AAAATT-T-AAAAAATAAATCAGTT-TA-TCAAACTAG--T-TTCA-AAT--AGTTATGACT-AT
* * * * * * *** * * *
17530 TT-ATTAA-TATTCTAGAAATT--AATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATA
358 TTGAATAATTA-TCT---ATTTCAAATCGTTATGA-CTTT------TTGTTTTG-TCATAAAACA
* * * * * * * * *
17591 A--G-TTCAAAT-AGT-TATG-TTCATTTG-AAT-AATTATCTATTTCAGATCGTTATGACCT-T
411 ATTGTTTCTATTCA-TACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATA-ATA-TT-A-AT--TTATTA-ATAT
* * * * **** * * * * * **
17647 TT---ATTTTAT-AGTAAAACAATTGTTTCTATTCATATAGAATTATTTAGAATAAAAT-AATAT
467 TTCAAAATTAATAAGTAAGA-GATT-TAAAAAATAATAT-G--TT-TATCGAACAAGTTCAA-AT
* * **
17707 TGATTCATTAAGATTTTG
525 AG-TT-ATGACTA-TTTG
* * * * ** * **
17725 AA-AATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAGCTCAAATAGTTATGACTTT
1 AACAATT-AT----CTATT----TC-AAATC--GTTATGACCTT---T----T-GTTTTG--TCA
** * * * ** * ** * * ** ** **
17789 TTGAACAATTATATATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTTATAGAACAATTGTTTTTTTTC
44 TAAAACAATTGT-T-TCT--GATC-ATACAAGC-TTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTAAT-
* *** * * * **
17854 CATA-T-AAGCTTATTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATAAAAAATAAATATGTTTTGCG
101 AATATTCAA-AAAATT-A-A-TAAG-TAAGA--GA--T--T--TAAAAAATAAATCTGTTTACCG
* ** * * *
17917 AAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT-TCGACCTTTTG
153 -AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAT-GACCTTTTG
* * **
17981 TTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
216 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
18046 TAAAATTCAAAAAATTAATAAGTGAGAGATTT-AAAAATATAT-ATGTTTATCGAACAAG-CTCA
281 TAATATT-ACAAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCAAACTAGTTTCA
* * * * *
18108 AATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAGCTTTTTCTTTTGTCATAA
343 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * **
18173 AACAATTGTTTC-AGTTTATAAAAACTT-GTCCAAACTAAAATAA-AACAATGTTATTAATATTT
407 AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAAT-TTATTAATATTT
* * * * * * *** *
18235 CAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATATTTCTTTTG-TCATAAAAC-AATTG
469 C-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA--TAT-GTT-TATCGAACA-AGTTCAAATAG
* *
18298 TT-TCAGT-TTAT-
527 TTATGACTATT-TG
* * * ** * *** * * ** **
18309 AAAAACTTGTCCAAACTAAAATAAAACTATG---TTATTAATATT-TCA-AAAATTATTAAGTAA
1 AACAA-TTAT-CTATTTCAAAT--CGTTATGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAACAATT--GTTT
** * * * * ** * * * * *
18369 GAGATTTAAAAACTAAACCTATATTTCAAACCAATTCAAT--TAGTTTACTAACCATTTGAACAA
58 CTGA--T-CATAC--AAGCT-TATTTGAAATAAAAT-AATACTA-ATTAATAA-TA-TTCAA-AA
* * * * *
18432 ATATCAATCTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTGGTCAAAAAA-AAAT-TGTTTCTAATC-ATAT
112 A-ATTAA--T--AA--G-TAAGA-----G-ATT--T-AAAAAATAAATCTG-TT-T-ACCGA-AC
* * * ** * ** **
18494 AAGCTTATTCAAATAAAATAAT-ACTATTT-AATAATT-T-T-TCAAAAAT--TAAT-A-AGTAA
156 AAG----TTCAAAT--AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTT
*** * * * * * *
18550 GAAATGT-AAAAAATAAATGTGTTTGCCAAATCAGTTGA-AATGGTTAAGACTATTAGAAT-AAT
215 GTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTT--CAATTCA--T-ACAA-GCTT---A-T-TCAGAATAAAA
* * * * ** *
18612 TATCTATTTCAAGTTGTTTTAAGTTTTTGTTTAGTCGTAAAACTATTGTTTTAGTTCATAAAAGC
267 TA-ATA-CT-AA-TT-TATTAA-----T-ATTA--C---AAA--ATT-AATAAG-T-A-AAAA--
**** * * * * * **
18677 TTATTGGGAATAAACATTAATTTAT-TAAC-A--TTCAAACAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAA
308 TT-TAAAAAAT-AA-ATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTT-AT--G---ACTATTTG-AA
* * * * * * * *
18738 AAATAAATTTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAAT-A-GTTATGATTAT-T--T-GAACAATT-TTAT
363 TAAT-TATCTATTT-C-AAATC--GTT---ATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTT-T
* ** * * ** * * * * *
18795 TTAAAATTGTTATGAA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTTA-TAACAGCTTATC
418 CT---ATTCATA-CAAGC--TTATTCGA-AATAAAATAA-T-ATT-AATTTATTAATA--TT-T-
* * * * ** ** *
18858 CAAAATAAAATAA-TACTACTTTTTTTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAG-AAATTTAACAAA
469 CAAAAT-TAATAAGTA--A--------GAGATTT-AAAAA--A-TAA-TATGTTTATCGAACAAG
* ** * **
18921 AT-AAATTAGTTTACCAAATCAGTTCA
518 TTCAAA-TAG-TTA-TGACT-A-TTTG
* * * * *
18947 AATAATTATAGCCATTTGAACAAAATTGTTAAT-A-CTTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTT
1 AACAATTAT--CTATTT---C-AAATCGTT-ATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
19010 TTCAACATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAGAA-T--T-A
58 CTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAA
** * ** * * * *
19070 GTAATTGATTTAAAAATTAAATCTACTTACTGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAA
121 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * ** *
19135 TTATCTATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACAAG
186 TTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* * * * ** * * *
19199 TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAA
251 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAA
* * * ** * * *
19264 AAATAAATCTGTTTGTCAAACTAG-TTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATCATCTATTTCAA
314 AAATAAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * ** * * * * * *
19328 AT-GATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAAGACAATTATTTC-AGCTCATATAAGTTTACTT-GGA
379 ATCG-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAA
* * * * * *
19390 ATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
441 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TAT
* * * * * * *
19455 ATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTA
504 GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
19491 AACAATTACCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * * * * * * *
19555 TATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * * * * * *
19620 TTTAAAAAGCAAATATGTTTACCAAACCATTTAAAATAGTTTTGACTACTTGTAATAATTATCTA
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTA
* * * * * * * **
19685 TTTTAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTC
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
* * * ** * ** *
19750 ATAATGAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGGAAA-TTAAAAAATTA
258 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTAA--AAATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
19814 ATCTA-ATTA-CTGAACCAG-TTCAAATAATTAAGACTA-TTGAATGATTATCAATTTCAAATCT
320 ATC-AGTTTATC-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * *** * * ***
19875 TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAAAATTT-T-TTCGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAA
383 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
** * * * *
19938 TAATACAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATATATCTATTTAC
447 TAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-ATATGTTTAT
* * *
20002 CGAACTAGTTC--ATAGGTTAAGACTATTAG
510 CGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTG
* * *
20031 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATCA
* * * * * * * * *
20095 TACTAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATT-TAAAAATTAA-ATAGAAAGAA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATA-AGTAAGAG
* * * * * *
20158 ATTTTAAAAATAAAT-TGATTTACTGAATAAGTTCAAATAATCATTACTATTTGAACAATTATCT
128 ATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
20222 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACATGCTTAAA
192 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTT-AT
* * * *
20287 T-GGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAT
256 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATA-
* * ** * ** * * * * * *
20348 ATTTA-TTTATTGAATTAG-TAAAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCAT
319 AATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * ** * * *
20411 TCTAACCTTTTATTTTGTTGTAAACCAATTGTTT-TTTGTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
384 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * *
20475 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA-ATGTGTT-T--
448 AATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGT-TTATCG
* ** *
20533 ------TT-GAATAGTTAAAACTATTAG
512 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
20554 AATAATTATCAATTTCAAATCGTT-TTACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTC-TGATC
* * * * *
20615 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAG
64 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
20680 ATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTCAAATAAGCT-AATATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-C
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CGAACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
20743 TTATTTAAAATCATTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTA
191 -TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA
* * * * *
20808 TACAGAGTAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAAT-A--AAAGATTTAAAAAATA
255 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATA
** * * * * *
20870 AATTTGTTTA-CTAAA-TCAG-TTAAAATAATTTTG-GTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
319 AATCAGTTTATC-AAACT-AGTTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * *
20931 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCTTACAAGCCTATTTGAAATAA
381 CGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* * *
20995 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTATAATAATCCTAAAATTAA-TAAGTGATTTAAA
445 AATAAT-AT--TAAT--T--TATTAAT-ATTT-CAA-AAT--T--AA-TAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * * * *
21059 AAGTGAATCTGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAATTCTGGCCATTTC
495 AAAT-AATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
21105 AATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * *
21170 ACAAACCTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGGAG
66 ACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
21233 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC-----C--A-A--T-T-CCTATTTGAATAATTACCTA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * * * * *
21286 TTTCAAATCGTCATAATCTTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTTAGTTCACATATGCTTATT
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
21350 C-GAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAAT
257 CAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAA-AAAT
* ** * * * * * * * * *
21414 AAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTT-AAACATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA
318 AAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * *
21478 TTTTGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAA
383 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
** * *
21542 TAATACAAATTTATTAATATTT---AA--AA-AA-T----G-----------AATCTGTTTACCG
447 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGTTTATCG
* * * * * *
21585 AATC-ATTTCAAATAATTAGGGCCATTTC
512 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
21613 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTTATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * *
21678 TCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTC-AAAAATTAATATGTAAAAGA
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
21742 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATAT
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * ** * * *
21807 TTCAAATTATTATAACCTTTTGTTATGTTATAAAACAATTATTTCTGTTAACACAAGTTTATTCA
194 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
* ** * * ** * *
21872 AAATAAAATAATACTAATGCAATGATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
259 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT
** ** * * ** * * * * *
21937 TTGTTTGCCAAACCAG-TTCAAATAGTTAAGGTTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTAT
322 CAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * *
22001 GACATTTTGTTTTGCCTTAGAACAATT-TTT-TAGTTCTTAGTAA-CTTATTC-ATAATAAAATA
387 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * * * *
22062 AAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAATAATTTTGTTT-GCC
449 ATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TATGTTTATCG
* * *
22126 AAGCTAGTTCAAATAATTATGTCTATTTG
512 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * **
22155 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-------------CATAAAACAAATGTTTTTTTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * * * * *** *
22207 ATAAGTTTGTTTGAAATAAAACAAGATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAAAGTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * * * *
22272 TTAAAAAATAAATCT-ATTACTAAACCAGTTCAATTAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATT
130 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
22336 TCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATGCATA-TAGTCTTATTC-
195 TAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG-CTTATTCA
* * * * *
22399 GAAATAAAATAATGCTAATTTATGAATATT-CTAAAAGTTAATAAATAACGAATTTAAAAAACAA
259 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAA-TTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAA
*** ** * * * * * *
22463 ATCTA-TTGGCCTGACTAG-TGCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGT
320 ATC-AGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * * ** * *
22526 TATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCATATTCGAAATAATAT
384 TATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * *
22591 AAT-TCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTAC
448 AATAT-TAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAATATGTTTAT
*
22655 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
510 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
22685 AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCT-ATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTGA-TC
* * *
22749 ATGCAAGC----TT---AT----T--T-C--A--AATAAAATT--AAAAAGTAA-AA-T-----A
64 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
22787 TTTAAAAAATAAATCTTTTTACCTAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATTTAT
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *** * * **
22852 TTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCTTCACACAAACTTATTTG
194 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
22917 GATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTTGC-CAATTAATAAGTAAAATATTT-TAAAATAA
259 GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA--TTACAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAA
** * * * * *
22979 ATTTGTTTATCGAACAAG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
320 ATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
** * * * * * *
23043 ATGACCTTTTT-TTTCATTATAAAACAATTGTATC-AGTTTATATAGGCTTATTCTAAATAAAAT
385 ATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * * **
23106 AATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATT--TAA-CAAGTGATTTAAGAAAATGAATCTACTTA-
448 AATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAAT-AATATGTTTAT
*
23166 CTGAACAAGTTCAATTAGTTATGACTATTTG
510 C-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
23197 AACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTGT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * *
23261 TACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAAT--TAAATTTATCCATATTC-CAAAATTAATAAGTCAA-
65 TACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTAAT-AATATTCAAAAAATTAATAAGT-AAG
* * ** *
23321 A-A-TAAAAAAATAAATCTATTT-TTGAACACA-TTCAAATAATTATGACTATTTATCTATTTGA
126 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATG-------A-CTATTTGA
* * * *
23382 ACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATA
182 ACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
* * * *
23447 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTATATATT
247 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAG-TAAAAATT
* * * * * * *
23512 TAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CTGAGCAAG-TTAAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTT
310 TAAAAAATAAATCA-GTTTATC-AAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * * *
23574 TTTCAAATAGTTATG-CTCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATATTCAAACAAGTTTATT
373 TTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
23638 CTG-AATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTTGC-AATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAA
437 C-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAA
* * * *
23701 TAAATTTTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCACATG-C-ACTTG
498 T-AATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGT--TATGACTATTTG
* ** * *
23744 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAGAAA-AAGTATTTCT-ATGC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTGAT-C
* * * * ** ** * * ** *
23807 ATAC-A---TA-TT---CTACAAT-TTAATAGGTAGGAGGT-TT-AAAAAATAAATCTGTTTACC
64 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTAATA-ATATTCAAAAAATTAATAAG--TA-A
* * ** ** ** * * * * * * *
23861 GAGCAAGTTGACATCATCATGTCCACTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCT-TTTG
125 GAG--A-TTTAAAAAAT-AAAT-CTGTTTACCGA--A-CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTG
* ** ** * ** ** * *
23925 -----TTTTCTCA--TAAAAAAG-T-TG---TTTCTG-TTCAT-ATAGAATTATTGAAAATAAAA
181 AACAATTATCT-ATTTAAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAAT
* * *** * * * * **
23976 TAATACTAA-TTTATT---AATATTTTGA-A--AATTTATAAGAGATTTA-AAAACTAAATTTGT
242 TCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATA-TTACAAAA-TTAATAAGT
** * * ** *** * **
24033 --TTATCTAACCAGTTCAAAT-AG-TTAT--GGTTA-TTTGAACA-A-TTAT--CTATCTCAAAT
303 AAAAATTTAA-AAAAT-AAATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAA-ATAGTTATGACTAT-TTGAAT
* ** ** * * * ** * * *** **
24087 TATTATGAACTTT-ATTTTGTCATAGAACAATTGTTT-TTTTTTTTTTAGACAAGCATTTAGGAT
364 AATTATCTA-TTTCAAATCGTTAT-G-AC--TT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTAT
* * * * * * * * * * * * *
24150 TAAAATAATACTGATT--TAATAATATTCCAAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
422 TCATACAA-GCTTATTCGAAATAA-AAT---AATATTAATTTA-TTA-ATATTT-CAAAATTAAT
* * ** * * * * * * * *
24212 ACATTTGCTGAACTA-ATTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAAT-TATCTATTTCAAATCGTTT
479 A-A---G-T-AA-GAGATTTAAA-AAATA--A-TA-T-G-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
*
24275 TGAACTTTTGTTTAG
530 TG-AC---TATTT-G
* ** ** * ** * * ** * *
24290 TCATAAAACAAT-TATTTCAGTTC-ATAT-A-AGTTT-ATTCGGAATAAAACAATACTAATTTAT
1 --A-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--T-GTTT-C
* ** * * * * * * * * ** * * *
24350 TAACTTTTGAAAAG-TTAGTAGCCAAGAAATTTTAA-A-AAATAAATCTGTTTATTGAATAAGTT
59 TGA-TCAT-ACAAGCTTATTTG-AAATAAA--ATAATACTAATTAA--T-AATATTCAAAAAATT
* * * * * * *
24412 CAA-ACAGATAAGACTATTTAAACAAT-TATCTATTTA---AA-ATTGTT-AAA-ACCTTTTG--
116 -AATA-AG-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATA-GTTATGAC
* * * * * * ** * ** * *** *** * *
24467 TTTTATAATAAAATAAT-TGTTTCAGTTC-ATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATACTATT-T
175 TATT-TGA-ACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTT--TTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** ** * * **
24529 TATTAATATTTTA-AA-CAAATATCA-ATCTTAAATCATTATGA-TAATTGT-TTTGTCA-TA-A
236 T-TCAAT-TCATACAAGCTTAT-TCAGA--ATAAA--ATAAT-ACTAATT-TATTAAT-ATTACA
** * * *
24587 AGTAATTGTTTCTAATCATA-TAAGCTGATTCGGATAAAAAT-AATACTAATTTAAC-AA-TA-T
291 A--AA-----T-TAAT-A-AGTAA--AAATT--TA-AAAAATAAAT-C-AGTTTATCAAACTAGT
* * * * * * * * * *
24647 TTCAAA-AATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAATTAGTT-TGAATAGT
339 TTCAAATAGTT-AT--G---ACTATTTGAATAAT-TATCTATTT-C--AAATCGTTATGACT--T
** * * * ** * * ** * * * **
24710 TAAGGCTAT-T-AGAATAATTATCTATTTCAACTTGTTATAACCTGTTATTTAGTTATAAAAT--
392 T-TTGTTTTGTCATAA-AACAAT-TGTTTCTA-TTCATACAAGC--TTA-TTCGAAATAAAATAA
* * ** ** * ** * * **
24771 TATT-GTTTCAGTTCATA---CAAGCTT-ATTTGGAAGA-AAATAATACTAATTTATTAACTTT-
450 TATTAATTT-A-TTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-A--AA-ATAATATGTTTA
* * * * *
24829 T-GAA-AAATTCATA-AG-CAAGA-AATTTG
509 TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
24855 AAAAAATAAATCCGTTTGCCGAACAGGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATC-
1 -AACAAT-TAT-C---T-------A-TTTCAAATCGTTATGACCT-TTTG-----TT-T-TGTCA
* * * * * * * * *
24918 TCAAATCTTTATGATCTTTATTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCAT-AT-TT
44 T-AAAAC---A--AT-TGT-TTCTGATCAT---ACAA--GCTT-ATTTGAAATAA-AATAATACT
* ** * * * * *
24980 GGATTAAAATAATATT-AATTTAA-TAAT-ATTCCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAT
94 -AATT--AATAATATTCAA-AAAATTAATAAGT--AAGAGATTTAA-AA--AATAAATCT-G--T
* * * * * ** * * *
25040 TAAATATGTTTGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAGGATTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
147 T---TA------CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCG
* * ** ** * * * *
25105 TTTTGATCTTTCATTTAATCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAA
203 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA
* * *
25169 TAATACTAACTTATTAACT-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTA-TT
267 TAATACTAATTTATTAA-TATT-ACAAAATTAATAAGTAA-AAA-TTTAAAAAATAAATC-AGTT
** * ** * * * *
25232 TATTGAACAAG-TTCAAATAAATATAACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCGCTATGACTT
327 TATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTT
* * * * * *
25296 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTTATCCGAAATAAAATAATAGTAC
392 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAA
* * * * *
25360 TTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTAT-TTT-TTGAACCA
456 TTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA--TATGTTTATCGAACAA
*
25423 GTTCAAATAGTTATGACTATTTA
517 GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
25446 AATAAATGTCAATCTCACAT-GATTATGA---TCT-TTTTGTCAT--AA-TATTG--T-T--TCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCA
* * * * **
25498 TACAAGCTGATTCG-GATAAAAATAATACTAATTTAATATTAGTT-TGAAAATTAATAAGTAAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAA-TTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * *
25561 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTAACACTATTAGAATAATTATC
127 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
25625 TATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCAAAAAATAATTGTTTCAATTCAAACAAGCTTAT
191 TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
25690 T-TGAAAAAGAATAATACTAATTTATTAACTTTTGA-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTGGAAAA
256 TCAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAA-TATT-ACAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAA
* ** * * * *
25753 ATCAATCTA-TTTATTGAA-TAGGTTGAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAA
316 ATAAATC-AGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * ** *
25816 TCATTATGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAATTTA-TCCAGAA
380 TCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AA
* * * * * *
25878 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAGATCAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAAATAG
442 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATAT-G
* *
25943 TTTATCGAATC-ACTTCAAATAATTAT-ACTATTTG
505 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
25977 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* ** * ** * ** *
26042 ACAAGCTTATTTTAAATAAAATTGTTATTTCCTT-TTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTTGAAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAA-TAATA-CTAATTAATAATAT-TCA-AA-A-AA-----TT-AAT
* ** * ** * *
26106 ATA-CAAGCTTATTTTATATAAAAT-AATACTAATTTA-TTAA-TATTTCAAGAATTAG-TATGA
119 A-AGTAAG-AGA-TTTA-A-AAAATAAAT-CT-GTTTACCGAACAAGTTC-A-AA-TAGTTATGA
* ** * * * * * * * *
26166 -GATTCAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAATTTAAAT-A-ATTATGACTATTTG--A-ACAA
174 CTATTTGAACAAT-TATCTATTTA--AAATC--GTT--ATGACCTTTTG--T-TTTGTCATAAAA
** ** * * * ** * * **
26225 TTATCCT-TTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAA
229 CAAT--TGTTTC-AATTCATACAAGC--TTATTC-AGAATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAA
* * *
26289 GT-TTATTCAAAATAAAGTAATACAAAATTAAAAATATTCTAAAAATCAAAACTAAGAGATTTAA
284 -TATTA--CAAAAT----TAAT----AAGTAAAAAT-TT-AAAAAAT--AAA-T--CAG-TTT--
** * * ** ** * *
26353 AAAATAAATCAATTTGCCGAACCAGTTAAAACAATTAAAACT-ATATGAAGAATTATCTATTTTA
328 ATCA-AACT-AGTTT--C-AAATAGTTATGACTATT-----TGA-AT----AATTATCTATTTCA
* * * * * * * * *
26417 AATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAGA-AATTATTTC-AGCTCATCCAAGTTTATTTGTA
378 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA
* * * * * * * *
26480 ATAAAATAAAACTAATTTTTTAATATTTCAAAATTTTACAAGTTAGAGATTTAAAAAAAAAT-TA
441 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATG
* * * *
26544 TTTA-CTGAACCATTTCAAATAATTATAACTATTTG
505 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * **
26579 AACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTTTTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * *
26644 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAAGATT-ATGACAATTAATAACTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TAATAATATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * * * * *
26708 TTTAAAAAAT-ATTTTTTTTGCCAAACCACTTCAAATAGTTAAGGA-TGTATGAACAATTACCTA
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTA
** ** * ** * * * **
26771 TTGCAAATTATTATGGCCTTTTAG-TTTGTTGTAAAACAATT-TTTCAGTGCTTACTAA-CCAAT
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC-AAGCTTA-
* * * * * * * **
26833 TTC-GAATAAAACAAAACAAACTTACTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGGTTTAAAAAAT
255 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT
* * * * * * *
26897 -AATTATGTTTGTCGAACCAG-TTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
318 AAATCA-GTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * ** * * * * *
26960 ATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTGATATGAGTTTGTTTGGAATCAAA
382 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* *
27025 TAATATT-ATTTA-TAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT
447 TAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTAT
* * * *
27084 CAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTG
510 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
27114 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * * * ***
27179 A-AAGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAA-AGG
66 ACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGA-G
** ** * ** * * * *
27242 ATTTAGGAAATGTATTTGTTGGCCTAACCAA-TGCAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCT
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * ** *
27306 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATCGTTTCTGTTCGTACAAGCTTATT
192 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT
* * * * ** * *
27371 TAGAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAACGAGTAACAGATTTAAAAAATGA
257 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAA
* * * *
27436 ATCTA-TTTATCGAA-TAAG-TTCAAATAGTTATAAATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
320 ATC-AGTTTATCAAACT-AGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * *
27498 TTATGACCTTTTTATGTTGTTATAAAACAATTGTTCCTATTCATACAAGCTTATTATG-AATAAA
383 TTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAA
* * * * * * * * * *
27562 ATAATATAAACTGACTAATAATCCAACAATTAATAAGCAA-AAATTTAAAAAATAA-ATCTATTT
446 ATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATATGT-TTA
* * *
27625 TCTGAACACGTTCAAATAGTTCTAACTA-TTG
509 TC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
27656 AACAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACCTTTTAG-TTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCA
* * * * * * * *
27720 TAAAAGCTTA-CTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAG
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *** * * * *
27784 ATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTGAGTGAGTCCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * ** *
27849 TTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTC
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
* ** *
27914 -GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAA--AATTAGTTGGAAGTTTAAAAAATAAA
258 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * **
27975 TCTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAATCATGTCCATTTGAACT-ATTA-CGAATTTTAAATTAT
321 TCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATC-TATTTCAAATCGT
* * ** *
28037 TATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATT-TAGAATAAAAT
384 TATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAAT
** * * * *
28101 AATACCAATTTATTAATATTTCAAAA-T--TAA-T-A-AG-CTTAAAAACTAAATTTGTTTACTG
448 AATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTA-TC
* * ** *
28159 GATC-GGTTCAAATAGTTACAATTATTTG
511 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
28187 AACAATTATCTATCTCAAATTGGTATGAGC-TTTGTTTTATCATGAAACAATTGTTTCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * * * * * *
28250 TACAAACTTATTTGGAGT-AAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
28314 TTT-AAAAATAAATGTGTTTGA-TGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTA
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * * * *
28377 TTTCAAATTGTTCTGACTTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTATTTTAGTTCATACATGCTTAGTT
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TT
* * * * * * *
28442 GA-AATAAAATAATACTATTTTATTAACATCCAAAAAATTAATAAGCAAGGAATTTAAAAAA-AA
257 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TACAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAA
* ** * * * *
28505 ATCTG-TTGCCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTT
320 ATCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * * * * *
28568 ATGGCCTTTTG-CTTATCATAAAACAATT-ATTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATTAAATA
385 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * **
28630 ATAATACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAA-ATTAGTTTAT
449 ATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAATA-T-GTTTAT
* * * *
28694 CAAATCAA-CTCAAATAGTTATGGCTGTTTG
510 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
28724 AACAATTATCTAATTCAAATCATTATGAACTTTTTTTTTGTCATCAAACAATTGTTTTTCATCAA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCAT
* * * *
28789 ACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGGAGA
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT-AATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
28853 --T------T--ATCTATTTACTGAACCAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATAT
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
28908 TTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTGACATTCATACTAGCTTATTC
194 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTC
* * * *
28972 AGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTACAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
258 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAA
** * ** * * **
29037 TTTGTTTGTTGAACCAG-TTCAAATAGTTAAGGGTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
321 TCAGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * * * *
29101 TGACCTTTT-TTTTGTCGTAAAATAAATGCTTT-TGTTTATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAT
386 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * *
29164 TTTTAATTTATTAATATTTTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTAA
450 TATTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTATC-GA
* * * *
29225 ACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTG
513 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *** ** * *
29252 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATAATTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTCT-ATTGA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * ** * *
29316 AACAATCTTATTTGAAATAAAGCAA-AGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACG-
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAA-GA
* ** * * * * *
29379 GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TACAAATTGTTATGACTGTTTGAA-ACATTAT
127 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTAT
* * ** * * ** *
29442 TTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTTTTGTATAC--GCTT
190 CTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT-CATACAAGCTT
* * * * ** *
29505 ATTCGGAATAACATAACT-CTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAATAAGTGAGTTAAAAA
254 ATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATT-ACAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAA
* * ** * * **
29569 TTGAATTTGTTTATCGAACAAGTTGT--AATAGTTATGACTATTTGAATAATTCCCTATTTCAAA
316 ATAAATCAGTTTATCAAACTAGTT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * ** * * * *
29632 TCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATTAAATTATTTTTTCTATTCATACAAGCCTATTCCAATTAA
380 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
** * * * * *
29697 AATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGATGACTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
445 AATAATATTAATTTATTAATATTTCA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTT
* * *
29761 AATCGAATAAGTTCAAATAGCTATGACTATTTG
507 TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
29794 AACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTA
1 AACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCA
* * * *** * * *
29858 TACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAAAAG
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * ** * * * *
29922 ATTTTAAAAATAAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGGCATAACTATTTGAATAATTGTCCA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * ** * * * *
29987 TTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTC
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
* * * * *
30052 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATGAT
258 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTA-CAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
30117 TCTA-TTTTTCGATCAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
321 TC-AGTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * *
30180 ATGACTTTTTGTTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAGTCTAAATAAAATA
385 ATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * *
30245 ATATAAATTTATTAATA-TTCTAGAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTT
449 ATATTAATTTATTAATATTTC-A-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTATC
30308 GAACACA-TTCAAATAGTTATGA-TAATTTG
511 GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* * **
30337 AATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAATCCAATTGTTTCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCA
* * * *
30401 TACAAGCGTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-CAAAATTAAATAAGTAAAAG
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTCAAAAAATT-AATAAGTAAGAG
* * * * * * *
30465 ATTT-AAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTTAAATAGTTATCACTGTTTGAACAATTATTTA
128 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
30529 TTTAAAATAGTTATTATCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTC
193 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
* ** * * * *
30594 AGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAACTAAA
258 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAA
** * * * * * * *
30659 T-ATGTTTGCCAAACAAG-TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTAGTTCAAATCATT
321 TCA-GTTTATCAAACTAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * ** * * * * ** *
30722 ATTACCTCCTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATGCAAAATTATT-TAGAATAAAATA
385 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
30786 ATA
449 ATA
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Statistics
Matches: 19418, Mismatches: 4701, Indels: 3740
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
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* * * ***
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * **
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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** * ** *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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*** * * * * * * ** *
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1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
12740 TTGTTATAAAACAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT
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* * * *
12804 AATATGTC-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTA
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* * ** * *
12856 AAC-----C----AG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTT
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* * * * *
12909 TTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT
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* * * * * *
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** * * * * * ** *
13025 AAGTAGTTGAAATAGTTAAGACTGTATGACCAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* *
13090 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATT
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* ** * * ** *
13154 TATATTCCGAAAAGTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTACC-T
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* * * * * *** * *
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* * * *
13269 TTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA-TT
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* * * * * * *
13331 AAT-CT-TTC-AAAAATTAATATGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCG-
125 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * ** * * * *
13383 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTA
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
13448 TTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * *
13513 ATATTCCAATAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATTTATCTATCG-
129 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAATAAATATGTTTACCGA
* * ** * *
13564 AACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *** ** * *
13629 TTGTCATAAATA-AGTT-TTTTTGAATTTATTTTAGCTTATTTGGAATAACATAA-AATGAATTT
65 TTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * *
13691 ACTAATATT-TCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAATAATTTTGTTTACC-T
125 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCGA
** * *
13745 AACCTGTCCAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTGTTTG
1 AACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCT-TTTG
* * *** * * * * * * *
13809 TTTTATCATAAAATAAACATTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AAAAAAAAGTAATACTAATCTAT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAA-TAATACTAATTTAT
* * *
13873 TAATATTTCT-AATATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-A
127 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * * *
13922 AACGAGTTTAAATAGTTATGACTATATGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTATT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
13986 TTGTTATAAAACAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGACTAAAACAATACTAATTTATTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
14051 ATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAATATATTTACC-A
129 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * * * * *
14102 AACTAGATCAAATAATCATGATTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
** * * **
14167 TCATCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATT
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
14231 AATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCA--TTTACTG-
128 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAATAAAT-ATGTTTACCGA
* * * * ** * *
14282 AATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAATCGCTATAATCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
14347 TTGTTATAAAAGAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATT
65 TTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
*
14412 ACTA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-
128 AATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* ** * ** *
14464 AATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT
1 AACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
14528 TTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAGAATAATACTAATTTTTT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * **
14593 AATATTTTGACAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-TTA
128 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * ** *
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1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
14711 TTGTAAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCGTATAAGTTTGTTTAAACTAAAATAATACTAATTTATT
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * *
14774 AATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAATGAATCTATTTACTG-
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* ** * * * * *
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1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** *
14891 TTGACATAAAACAATTGATTCTATTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTAT
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * ***
14954 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATTTGTTTTTTG-
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* * * *
15006 AACACGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTTGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACC-TTTTGT
* * * * * **
15071 TTTGTCATAAACCCATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * **
15136 AAAATTCTGAAAATTAAT-AGT-TATGACTATT-TAGATAATTAT-TTATTTC-A
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** * * * * * * * * **
15186 AA-TTGTT-ATAAT-CTTTTG--T-TTTG-TC-ATAAAACAATTGT--TTCTATTCATCA-AGTT
1 AACAAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATT-TAAATC-ATT-ATGACCTTT
* ** * * * * **
15240 T-ATTTGAAATAAAATAA----TACTAATTTAT-TAA---TATTCTAAA-AATTAATAATTTTGA
61 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAA--AATAATACT-A
** * **** * * * * ***** * * **
15295 GATTTTAAAAACAATTCTGTTTATTAAATAAGTTTAAATAATCATTTCCAATTA-GTCTA--TT
121 -A-TTTATTAA-TATTCTAAAAATT-AATAAG-TAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * * * * *
15356 ATCTATTTCAAATCGTTATGA-TATTT----TATT-T-TATCGTAAAACAAT-TG----TTT-TT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * ** * * * * ** *
15408 AT-TCATGCAAA-AATT-ATTC-A-AAATA-AA-ATAATACTAAT-TTATCAATA-T--TTCA--
65 TTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAAT-AATACTAATTTATT
* ** * * *
15460 AAAATTAAAAAGAGATTTAAAAACTAAATTTG-TTTACAAAAT---TA--TTT-----
128 AATATTCTAAA-A-A-TTAATAAGTAAA--AGATTTA-AAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * **
15507 --CAA--T----TAGTTATGACTATTTGATCAATTATCTATCTCAAATCACTATGATC-TTCATT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * ** *
15563 TTGTCATAAAATAATTGTTCCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * **
15628 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTG-
129 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * *
15679 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * **
15744 TAGTCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACATGCTTATTCAAA-ATAAATAATACTCTTTTATT
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAATA-AAATAATACTAATTTATT
* * * *
15807 AACATT-TAGAAAATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTG-
128 AATATTCTA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTT--AAAAATAAATATGTTTACCGA
* *
15860 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCCTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
15925 TTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATACTATTAGTTTATT
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * ** *
15989 AATATT-TCAAAAATTGAGAAATTGAAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGA
128 AATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAT-ATGTTTACCGA
* * * * * * *
16042 ATC-AGTTTAAATAATT-TCACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGATCTTTTGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCA-TTATGACCTTTTGT
* ** * *
16104 TTTGTCATAAAACAAATGTTT-TCCTCATACAAGCTTGTTTCGAATAAAATAATACTAATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * *
16168 AATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCGA
128 AATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * * *
16221 ACCGA-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** ** * * *
16285 TTGTCATAAAACAATTATTTATGCTCATACAAGCTTATTTGGAATACAATATTACTAATTTAATA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * ** *
16350 ATATTATAAAAATTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TTTTGCTA
129 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * * * * * *
16400 AACCAGTACAAATAGTTAAGGCTATATGAATATTTATCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTTTTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATC-ATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
16464 TTTGTCATAAAACAAATGTTT-TCGTTCATATAAGTTTGTTCGGAATAAAA-AAGTATTAATTTA
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA-TACTAATTTA
* * * ***
16527 TTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAGTCCATTTACC-A
126 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTACCGA
* * * * **
16577 AACCAGTTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTATTAT-AATTATTTG
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTA-TTTAAATCATTATGACCT-TTTG
* * * *
16640 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTTGAAATAAAAGCAATGCTAATTT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTA-TTCAAATAAAA-TAATACTAATTT
* * ** * * * * *
16704 GTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATCTATTGGACTG-
125 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTT-TACCGA
* * * * * * * *
16760 ACCAA-TACAAATGGTTATAAATGTTTGAACAA-TATCTATTTTAAAGT-GTTATAACCTTTTGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTAAA-TCATTATGACCTTTTGT
* * * ** * * * *
16822 TTTATTACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAACTGACTTGAAATAACATAA-ATCTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-CTAATTTAT
* * * * *
16886 TAATATT-TCAAAGATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCG-
127 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTACCGA
* * * ** * *
16939 ATCAAGTTCAAATAGTTACT-ACTCTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTGTGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
17003 TTTGTCAAAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
17068 AATATT-TAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-A
128 AATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * ** *
17120 AATAAGTTCAAGA-AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT
1 AACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
17184 TTTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
17249 AATATTTTGACAATTAATAAATAAAATATTTTAAATATAAACATGTTTACCG-
128 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCGA
* * * ** * *
17301 AACAAGTTCTAACT-GTCATAACTACTTT-AGTAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTG
1 AACAAGTTC-AAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTG
** * *
17364 TTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATA
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
17395 TAGGCTTACT
Statistics
Matches: 4923, Mismatches: 1080, Indels: 678
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
143 8 0.00
144 5 0.00
147 1 0.00
148 3 0.00
149 3 0.00
150 10 0.00
151 2 0.00
154 4 0.00
155 12 0.00
156 13 0.00
157 9 0.00
158 6 0.00
159 3 0.00
160 2 0.00
161 4 0.00
162 5 0.00
163 19 0.00
164 24 0.00
165 20 0.00
166 6 0.00
167 16 0.00
168 19 0.00
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170 9 0.00
171 22 0.00
172 21 0.00
173 7 0.00
174 15 0.00
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176 175 0.04
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184 1 0.00
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Consensus pattern (179 bp):
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAATCATTATGACCTTTTGTTT
TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
ATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCGA
Found at i:12713 original size:719 final size:711
Alignment explanation
Indices: 4891--14788 Score: 2710
Period size: 721 Copynumber: 13.8 Consensus size: 711
4881 AGTTTGTTCG
* * * * * *
4891 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTA-ATAGTAAGAGA-TTAAAAAGTAAA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCA-AAAATTATA-AATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
4954 TCTGTTTAGCTAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
64 TTTGTTTA-CGAA--A---C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTAT
* * ** * * ** *
5019 AACTTTTTTGTTTTTGTCATCAAACAATTTGGTCCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATA
121 AA---TTTTG-TTTTGTCATAAAATAA-TT-GTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATA
** * ** * ** **
5084 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATATAATTATC
180 AT-CTAATTT-ATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC
* * ** * * *
5149 GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT-GTATGAATGATTACCTATTCCAAATCGTTATGACCTTTTT
242 AAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTT
* * * * * * *
5213 CTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCTAATTAAAATAATGCTAATTTA
305 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
5277 ATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTATTTACTGAATC-AGTT
370 TTAA-AATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACT-AA-CAAGTT
* * * * * ** *** * * * *
5339 CAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAATCTTTTGTT-TAGTCAT
432 CAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTACCTATTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTA-TCAT
* * * * *
5403 AAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTC
496 AAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTC
* * ** ** * * * * *
5467 AAAAAATTAATAAG-AAATAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCGAATAGTTA
561 TAAAAATTGATAAGTTGA-AGATTT-AAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCA
* * * * * * * * * *
5531 TTA-CTATTTTA-ACAATTGT-TAATTTAAAATCGTTA-TAACTT-TTTGATTTCTCATAAAACA
624 -TAGCCATTTGAGA-TATTATCT-ATTTCAAATCATTACAAACTTATAT--TTTGTTATAAAACA
* * * * * *
5591 TTTG-TTTCAATTAATAC-AAGCTTAGAT-G
684 ATTGTTTTCCA-TCATACAAAAC-TA-TTCA
* * * * * * * *
5619 GATTAAAATAATACTAATTTATTAATACT-T-ACTAAATAATAAGTAAGAAACTT-AAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATA-TGTCA-AAAATTATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * * **
5681 TCAGTTTATTGAATTAGTTTAAAATAATTATAGCCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTT
64 TTTGTTTA-CG-A--A----ACAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTT
* * **
5746 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATCACACAAGCTTATTC-GAAATAAAATA
119 AT-A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAT-TCATGCAAGCTTATTCAG-AATAAAATA
* * ** *
5809 ATATTAATTTATTAATA-TTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTATCG
180 AT-CTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCA
* * * * * *
5871 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGATCTATGT
243 AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCT-T-T
* * * ***
5934 T-TTAT-TCAATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAACTTATTTCGTTA-AAAATAATACTAA
304 TATTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAACTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * * * *
5995 TCTAATAATATTTC-AAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCA
366 TTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTT-ACTA-ACA
* * * * * * ** * * * *
6058 A-TTCGAATAGTTA-AAATATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTT-TAG
428 AGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTACCTATTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTA-
* * * * * * *
6120 TCATAAAATATTTGTTTCATATT-TTACAAGTTTATT-CGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTA
492 TCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACT-AATTTATGA
* * * * *** *
6182 ACATTCAAAAAATTAAAAAG--GAAATGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAA
555 ATATTCTAAAAATTGATAAGTTG-AA-GATTT-AAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAA
* * * * * * ** * * * **
6245 ATAGTGAT-GACTATTT-AAACTATTATTTATTTAAAATCATTATGACCAGT-TGTTTTGACATA
617 ATAATCATAG-CCATTTGAGA-TATTATCTATTTCAAATCATTACAAAC-TTATATTTTGTTATA
* *** * *
6307 AAACATTTGTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATCCA
679 AAACAATTGTTTTCCATCATACAAAAC-TATTCA
* * **
6340 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAAT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAAT-ATGTCAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
6401 TTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTAT
64 TTTGTTTA-CG---AAA--C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTAT
* * * * *
6466 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAAT
121 -A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT
* * ** * * * *
6530 ACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAA
182 -CTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAA
* * * * * ** *
6595 TCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTT
245 -CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTT
* * * *** *
6659 GGTCATATAACAATTGTTTTTTAA-TCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATT
309 TGTCATAAAACAATTG--TTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * * ** *
6723 AATCTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTGGTTTAA
372 AA-AATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTTCAA
* *** *** * *
6787 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTC-AAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAA
435 ATAGTTATGACTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCATAAA
* * * ** * ** *
6851 ACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAA
499 ACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAA
* * * * ** ** * * * * * * *
6915 AAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAAGAAATTTGATT-GTCAAACTAGTACAAACAGTTAAAA
564 AAATTGATAAGTTGA-AGATTTAAAAAATAAA-TCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAG
** * * ** * * *
6978 TTATATGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTT------TT-TGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTT
627 CCATTTGAGA-TATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTT
*** **
7034 T-CATTTCATAC-TGGCTTATTTG
691 TCCA--TCATACAAAAC-TATTCA
* * ** * * **
7056 GAATAAAATAAAATAAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
7120 TCTATTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTAT
65 T-TGTTTA-C-GA--AA--C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTAT
* * * ** * *
7185 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATA
121 -A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-
* * * * * **
7250 CTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--G-GATTTTAAAAATAAATTTGTTTATCAAAC
182 CTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAAC
* * * * ** * * ** ** ** * * *
7311 TAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTA
246 TAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTG
* * ** * * * *
7376 TTACAAAACAATAATTTCT-ATTCATAAAAATTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT
311 TCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
*** * * * * * *
7440 ATTTTGACAATTAATAAGC-AAAA-TTTTAA-AAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGATCAAATA
375 ATTCAAAAAATTAATAA-CTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTTCAAATA
* * * ** *** * * * * * *
7501 GTTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTC-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAA
438 GTTATGACTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCATAAAACA
* * * ** ** * * * *
7565 ATTATTTTAGTTCATATCAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAA
502 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAA
* * * * * ** * * *
7629 TTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTAT-GACTA
567 TTGATAAGTTGA-AGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAG-CCA
* *** * * * * ** **
7692 TTTGA-ATAATTATCTATTTGAAATTGCTA-TAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATT-TTTTC
630 TTTGAGAT-ATTATCTATTTCAAATCATTACAAAC-TTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTC
* *
7754 TATTCATAC-AAGCTTATT-A
693 CA-TCATACAAAAC-TATTCA
* ** *
7773 CGAATAAAATAATA-CAATTTATTAATAT-T-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATA
1 -AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAA-A-AATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATA
* * * *
7835 AATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
62 AATTTGTTTACGAAACAA--T---A--GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTT
* * * * *
7900 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAA
119 AT-A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * ****
7965 TATTAATTTATAAATATTTCAACAACTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTG
181 T-CTAATTTAT-AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCA
* * * * * *
8029 AACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGT
243 AACTAGTTCAAATAGT-TAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTAT
* * * * * * ** * *
8093 TTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTGATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATG
307 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * * * *
8158 AATATTC-TAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAA-AAAATTAATTTGTTTATCGAAC-ATTTCCAA
372 AAAATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTT-CAA
* * * * * * *
8220 ATAGTTATGACTA-TCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
435 ATAGTTATGACTATTC-GAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCATAA
* ** * ** * * * *
8283 AACAATTGGTTCTGTTTATGCAAGCTTATTTCGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCC
498 AACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACT-AATTTATGAATATTCT
* * * ** ** * * * *
8346 AAAAATTAATAAG-T-AAAATTTTAAAAAATAAAT-ATGTTTTCTTAACACGTTTAAATAGTTAT
562 AAAAATTGATAAGTTGAAGA-TTTAAAAAATAAATCA-ATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCAT
* * ** * * * * *
8408 -GACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TCGTTTTATGATAAATCAATT
625 AG-CCATTTGAGA-TATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTAT-ATTTTGTTATAAAACAATT
* * * * *
8470 -ATTTCTATTTATA-ACAGCTTATTCA
687 GTTTTCCA-TCATACAAAAC-TATTCA
* * ** * *
8495 GAATAAAATAATGCTTATTTATTAA-ATTTGCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGT-CAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
8559 TGTGTTTCCCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATGTTATG
64 TTTGTTT---ACG-AA--AC-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGTTAT-
* * ** ** *
8624 ATCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAATTTTATTC-GAAAGAAAATAAT
121 A--ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT
* * * ** * * *
8688 ACTAATTAATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTTGGAGATTTAAAAAAT-AA-ATCTATGCATCA
182 -CTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGC--CA
* * * * * * *** * ** *
8751 AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGTTATTATCAATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGT
243 AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTAT
* * * *
8815 TTTGTCGTAAAACAATT-ATTTATATTTATACAAAA-TTATT-AAGAATAAAATAGTACTAATTT
307 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-ATTCATA-AAAACTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * *
8877 ATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TGAGAGATTTAA-AAACTAAATCTATTTATCAAACCAGTTC
369 ATTAAAATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTTC
* * *** * * *
8937 AAATAGTTATGACTATTTC-AATAATTATCTATCTC-AAATCGTTATTATCTTTGT-TT-TGTCA
433 AAATAGTTATGACTA-TTCGAACAATTACCTAT-TCAAAATAAATATGACCTTT-TATTCTATCA
* * * * * *
8998 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CGAATTAAAATATTA-TGAAATTAAT-AATA
495 TAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACT--AATTTATGAATA
* * *** ***** * * *
9060 TTCT-AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATGTGTTTGTTGAACAGGTTTAAATAGT
558 TTCTAAAAATTGATAAGTTGA-AGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAAT
* * * *** * * ** *
9122 TA-AGACTATTAGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT-TCGTTTACTCT-TAAAAT
622 CATAG-CCATTTGAGAT-ATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTAT-ATTTTGT-TATAAAAC
** *
9183 AATT-TTTT-CAGTTCATACATGGA-TATTCG
683 AATTGTTTTCCA--TCATACA-AAACTATTCA
* * * *
9212 AAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCAT-TCAAAAAATTA-ATAACAAGAAATTTTAAAAAGTA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAAT-ATGTC-AAAAATTATA-AATAAGAGA-TTTAAAAAATA
** * * *
9274 AATTTGTTTAATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTGTAAGAAG-
62 AATTTGTTTACGAAAC-------AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAA-ATGT
* * ** ** ** * * *
9338 TATAACCTTTTGTTTTATCACAAAACGATTGCTTCAATTCATAAAAGCATA-CCCGAAATAAAAT
118 TATAA--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTATTCATGCAAGCTTATTCAG-AATAAAAT
* * * * * * *
9402 AATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAAAAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCA-GTTTA
179 AAT-CTAATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAGAAATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTG
*** * * * * * *
9465 TTGAA-TCGCTTCAAATAATTATTG-CCATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACT
240 CCAAACTAG-TTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * ** * *
9527 TTT-TTTTGGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGGAATAAAGTAATATTA
302 TTTATTTT-GTCATAAAACAATTG-TTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
9590 ATTTATTGATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A-AAAATAAATTTATTTATTGAAC-
365 ATTTATT-AAAATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACT-AACA
* ** * * * *
9651 ----C-AAT--TT-TTA-TA-T-GAACAATTATTTATTTC-CAATCATTATAACCTTTTATTCTA
428 AGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTA
* * * * ****
9704 TTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTT-TTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAAT-AA
492 TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTT-ATGAA
* * * * * * ** *
9767 TATTCCAAAAATTGATAA-CTAAGAGATGTAAAAAACAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAAC
556 TATTCTAAAAATTGATAAGTTGA-AGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAA-CAAGTTCAAAT
* * ** * * * * ** **** * * * * *
9830 AATTCA-AACTA-TACAAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATA
619 AA-TCATAGCCATTTGAGA-TATTATCTATTT-CAAATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAA
** * ** **
9893 ACAATTGTTTTTGATCATTCAAGCCTATTTG
681 ACAATTGTTTTCCATCATACAAAACTATTCA
* * * * *
9924 AAATAAAATAATACTAATTTGTTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * *
9989 CTGTTTACTAAACTAATTCAAATATATAACTATTTGAACAATTATAAACTTCAAATCATTAAAAC
65 TTGTTTACGAAAC-AA-T--AGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTT-----
* * * * * * * *
10054 AATTATTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAACAAAATAA
119 -A-TAATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* ** * * * *
10119 TACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA-AAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCG
181 T-CTAAT-TTATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCA
* * * * * * *
10183 AACCAATTCAAACATTTAAGACTA-TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGT
243 AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTAT
* * ** *** *
10247 TTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAACTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTT
307 TTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT-AATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTT
* * *
10311 ATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-A-AAAATAATTCTATTTACCTAAGC-AGT
369 ATTAA-AATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-CTAA-CAAGT
* * * ** * * * * *
10368 TTAAATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTT-GTCTTGTC
431 TCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTC-TATC
* *** * * * *** * * * *
10431 ATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTGTT-TGGAATAAAGTAATAGTAATATATTAATAT
494 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATAT
* * * * * **
10495 TC-AAAAATTAATAA----CAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTCAAATAGTTA
559 TCTAAAAATTGATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATA---A
* * * ** ** * *
10555 TGACTTTATGACTATTTGAG-TAGTTATTTATTTCAAATTGTTA-TGACTTTTTGTTTTGTTATA
621 T--C-ATA-G-CCATTTGAGATA-TTATCTATTTCAAATCATTACAAAC-TTATATTTTGTTATA
* * * **
10618 AAATAGTTG-TTTCCGTTCATACAAGCCTATTCA
679 AAACAATTGTTTTCC-ATCATACAAAACTATTCA
* * * ** * * * **
10651 AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAAAAAGTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
10716 ATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
65 TTGTTTAC--GA--A-A-C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTAT-
* *
10781 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-----TTATT--T-C-AG----TTC---AT---ATAAGC--
121 A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTA
** * * * * *** *
10824 -----T--TA--TTCGAAA-TAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAACAAGT
185 ATTTATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGT
** * * ** * * *** * * *
10879 TTGAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAATCTTTTGTTTTGTCAT
250 TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT
** * * * *** * * *
10944 AAAATGATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TA
315 AAAACAATTGTTTT-AATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTC
* * * * * * * *
11007 AAGAAAATGAATTAGTAAAACATTT-A-AAAATAAATTTGTTTACCGAAACAAGTTCAAAT-TTT
379 AA-AAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-C-TAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * *** * * * *
11069 ATGACTATTTGAACAATTATTTACTT-TAAATTCTTATGA-CTTCTTGTTTTGTCATAGAACAAT
441 ATGACTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTT-TTATTCTATCATAAAACAAT
*** * * * * ** * * * *
11132 TGTTTTTGTTCATACAAGGTTATT-CAAATTACAATAATGTTAATTTATTAATATTTTGACAATT
504 TGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAATT
* ** * * ***** * * *
11196 AATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAAT-ATGTTTTTTGAACAAGTTCAAAT-AGCCTAGACTATT
569 GATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAG-CCATT
* *** * * * * *
11259 TGA-ATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTT-TAATAAAACAATTG-ATT-CAG
632 TGAGAT-ATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCA-
* * **
11320 TTCATA-TAAGCTTATTTG
695 -TCATACAAAAC-TATTCA
* * * * *
11338 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGT-CAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
11402 TATGTTTACTGAATATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTAT
64 TTTGTTTAC-GAA-A----C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATGTTAT
* * ** *
11467 GACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA
121 -A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATC
* * * *
11532 TAAATTTATTAATA-TTTGAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAAC
183 T-AATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAAC
* * * * *
11595 -ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCATTTCTTTT
246 TA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTT
* * * *
11659 GTCATAAACCAATTGTTTCT-ATTCATAAAAACTTATTTAGAATAAAATAACACTAATTTATTAA
310 GTCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
11723 AATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTGTTTACTAAACGAGTTCAAATA
374 AATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACT-AACAAGTTCAAATA
* * ** * * * * *
11788 TTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTATTCTGTCATAAAACAA
438 GTTATGACTATTCGAACAATTACCTATTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAA
* * *
11853 TTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAAT
503 TTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAAT
* *** * *
11918 TTATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGTCATATCCATTT
568 TGATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAGCCATTT
* ** * *
11983 GAGCTATTATCTATTTCAAAT-AGTTA-TGACATTATATTTTGTTGTAAAACAATTG-TTTCTAT
633 GAGATATTATCTATTTCAAATCA-TTACAAAC-TTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCA-
* *
12045 TTATACAAAATTATTCA
695 TCATACAAAACTATTCA
* ** * *
12062 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAA-T-T-GATAAGAGATTTAAAAACTAAATT
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAAAAATTATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* *
12124 TGTTTATCGAGCCAATTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAA
66 TGTTTA-CGA---AA--C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATAA
* * *
12189 TCATTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATGCAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTA
123 T-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTA
* * *
12254 ATTTGATAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAG
185 ATTT-ATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAG
* * * * *
12319 TTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCA
249 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
* * ** *
12384 TAAAATAATAT-TTTTAATTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
314 TAAAACAAT-TGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
* * *
12448 CAAAAAATTAATAAACTACAAA-TTTTAA-AAAATAAGTCTATTTGCCT-ACAAGTTCAAATAGT
378 CAAAAAATTAAT-AACTA-AAAGATTTAACAAAATAAATCTATTT-ACTAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
12510 TATGGCTATTCGAACAATTACCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTCTTTTATCATAAAACAATT
440 TATGACTATTCGAACAATTACCTATTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAATT
** * * *
12575 GTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATT
505 GTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCT-AAAAATT
* * ** * * * *** ** *
12638 GATAAGTT-AGAGATTTAAATAGTATGTCAATTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTT
569 GATAAGTTGA-AGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAGCCATTT
* * *
12702 GA-ATAATTATCTATTTCAATTCATTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCATC
633 GAGAT-ATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCATC
**
12766 ATACAAGCCTATTCA
697 ATACAAAACTATTCA
**
12781 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATGTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
12846 TTGTTTACTAAAC--CAG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTT
65 TTGTTTACGAAACAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGTTATAA--TTTT
* ** * *
12906 GTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
127 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAATTT-
** * * * * * *
12971 ATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAAATTTAAAAAATTAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTGAA
189 ATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAA
* * **
13036 ATAGTTAAGACT-GTATGACCAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAA
254 ATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAA
* * * * * * **
13100 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTTATATTCCGAA
318 ACAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAA
* * * ** * * * *
13165 AAGTAAAAAGTAAGTGATTTAA-AAAATAAATC-AGTTTACCTAATAAGTTTAGATAATTATTG-
383 AATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTA-TTTA-CTAACAAGTTCAAATAGTTA-TGA
* * * * ** * * * *
13227 CCATGCCAACAATTAACTATTTC-AAATAGTTATTACCTTTTGTT-TGGTCATATAACAATTGTA
445 CTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCT-ATCATAAAACAATTG--
* ** * * * *
13290 TTTGAA--CATTCAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATACTAATTAAT--CT-TTC-AAAAATTAA
506 TTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAATTGA
* ** * ** * * * * * * *
13348 TATGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGA
571 TAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAG-CCATTTGA
* * ** * * * * * * * * * * ***
13412 -ACAATTGTAAACTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCAT
635 GA-TATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCATCAT
* *
13476 A-TAAGCTTATTCA
699 ACAAAAC-TATTCA
* * * * * * * *
13489 GAATAAAATAATACTAATATAATAATAT-TCCAATAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGT-CAAAAATT-ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * *
13553 TTTATCTATCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTAT
64 TTTGTTTA-CGAA--A---C-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTAT
* * * *** ** *
13618 GACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATAAGTTTTTTTGAATTTATTTTAGCTTATTTGGAATAACATAA
121 -A-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTT--ATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
** * * * * * *
13682 AATGAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTT-AAAAATAATTTTGTTTACCTA
181 TCT-AATTTA-TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC-A
* * * * * *
13746 ACCT-GTCCAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTGTTTG
243 AACTAGTTC-AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTA
* * *** ** * ** * *
13809 TTTTATCATAAAATAAACATTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AAAA-AAAAGTAATACTAATCTA
306 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAA-TAATACTAATTTA
* * * * * * *
13872 TTAATATTTC---TAA-TATTAA-TAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTATTTACCAAACGAGTTT
370 TTAA-AATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTTC
* ** * * * * *
13931 AAATAGTTATGACTATAT-GAGCAATTATTTATTTC-AAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTTAT
433 AAATAGTTATGACTAT-TCGAACAATTACCTA-TTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCAT
* * * * * * * *
13993 AAAACAATT-TTTTATGTTCATACAAGCTTATT-TAGACTAAAACAATACTAATTTATTAATATT
496 AAAACAATTGTTTCA-ATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATT
* * * * * * *
14056 -TCAACAATTAATAAG-TAAAAATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTACCAAACTAGATCAAATAAT
560 CT-AAAAATTGATAAGTTGAAGA-TTTAAAAAATAAATCA-ATTCACCAAACAAGTTCAAATAAT
** * * * ** * * * ** * *
14118 CAT-GATTATTT-AAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAAGAA
622 CATAG-CCATTTGAGAT-ATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAAACAA
* * **
14181 TTG-TTT-CAGTTCATA-TAAGCTTATTGG
685 TTGTTTTCCA--TCATACAAAAC-TATTCA
* * * *
14208 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-CCAAAAATTA-ATAATAAAGAGATTTAAAAAATGA
1 AAATAAAATAATACCAATTTATTAAT-ATGTCAAAAATTATA-AAT-AAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * *
14271 A-TCATTTACTGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAATCGCTA
63 ATTTGTTTAC-G-A-AA----CAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTA
* * * * *
14335 TAATCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTCATTTCA-AATAAAATA
120 TAA--TTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTT-TATTCATGCAAGCTTA-TTCAGAATAAAATA
* * *
14399 ATACAAATTTAT--TACTATTAAGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
180 AT-CTAATTTATAATA-TTTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTG
* * * ** * ** *
14461 CCGAA-TAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTT
240 CCAAACT-AGTTCAAAT-AGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * ** * * *
14524 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGATTAGAATAATACTAAT
303 TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *** * * * * * *
14588 TTTTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAATATTTTAA-AAAATAAATATGTTTATTAAACAAG
367 TTATTAAAATTCAAAAAATTAATAACTAAAAGA-TTTAACAAAATAAATCTATTTACT-AACAAG
* * * * * * * *
14652 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCACA-ATGACCTTTTCTTTTGT
430 TTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTACCTA-TTCAAAAT-AAATATGACCTTTTATTCTAT
* * * * * * * * * *
14715 AAT-AAACAATTGTTTTAGTTCGTATAAGTTTGTT-TAAACTAAAATAATACTAATTTATTAATA
493 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATA
14778 TTCTAAAAATT
558 TTCTAAAAATT
14789 AATGAGTAAG
Statistics
Matches: 7147, Mismatches: 1498, Indels: 1054
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
684 2 0.00
685 1 0.00
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730 5 0.00
731 1 0.00
732 3 0.00
733 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (711 bp):
AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATGTCAAAAATTATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATT
TGTTTACGAAACAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGTTATAATTTTGTTT
TGTCATAAAATAATTGTTTTATTCATGCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAATTTATAATAT
TTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTA
AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
TTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATA
ACTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACA
ATTACCTATTCAAAATAAATATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA
GCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTCTAAAAATTGATAAGTTGAAGATTTA
AAAAATAAATCAATTCACCAAACAAGTTCAAATAATCATAGCCATTTGAGATATTATCTATTTCA
AATCATTACAAACTTATATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCCATCATACAAAACTATTCA
Found at i:15285 original size:133 final size:135
Alignment explanation
Indices: 15016--15287 Score: 352
Period size: 133 Copynumber: 2.0 Consensus size: 135
15006 AACACGTTTA
*
15016 AATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAA
1 AATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
15081 ACCCATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTGA
66 AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAA
15146 AAATT
131 AAATT
* * * *** *
15151 AATAGTTATGACTATTT-AGATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATC-TTTTGTTTTGTCATA
1 AATAGCTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
15214 AAACAATTGTTTCTATTCAT-CAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
65 AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTA
15278 AAAATT
130 AAAATT
15284 AATA
1 AATA
15288 ATTTTGAGAT
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 18, Indels: 4
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
133 48 0.41
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ACGTcount: A:0.38, C:0.10, G:0.08, T:0.44
Consensus pattern (135 bp):
AATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAA
AAATT
Found at i:17664 original size:286 final size:286
Alignment explanation
Indices: 17120--17683 Score: 667
Period size: 286 Copynumber: 2.0 Consensus size: 286
17110 TTGTTTATCA
* * * *
17120 AATAAGTTCAAGAAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTT
1 AATAAGCTCAAGAAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTATT
* * * * *
17185 TTTTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTA
66 TTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
17250 ATATTTTGACAATTAATAAATAAAATATTTTAAATATAAACATGTTTACCGAACAAGTTCTAACT
131 ATATTTAGACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTACCAAACAAGTTCTAAAT
* * *
17315 GTCATAACTACTTTAGTAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTGTTTCATCATAAAACAA
196 GTCATAACTACTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTCATCATAAAACAA
17380 TTGTATCAATTCATATAGGCTTACTG
261 TTGTATCAATTCATATAGGCTTACTG
*
17406 AATAAGCTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TCTTTTA
1 AATAAGCTCAAGA-AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTA
*
17469 TTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
64 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
** ** ** * *
17533 TTAATATTCTAGA-AATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTC-
128 TTAATATT-TAGACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTACCAAACAAGTTCT
** * * * * *
17596 AAATAGT--TATGTTCATTTGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTATGACCTTTTATTTTAT-AG
192 AAAT-GTCATAACTAC-TTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTCATCA-
* *
17658 TAAAACAATTGTTTCTATTCATATAG
253 TAAAACAATTGTATCAATTCATATAG
17684 AATTATTTAG
Statistics
Matches: 233, Mismatches: 37, Indels: 16
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
284 4 0.02
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ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (286 bp):
AATAAGCTCAAGAAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTATT
TTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTTAGACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTACCAAACAAGTTCTAAAT
GTCATAACTACTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTCATCATAAAACAA
TTGTATCAATTCATATAGGCTTACTG
Found at i:17732 original size:181 final size:176
Alignment explanation
Indices: 17406--17888 Score: 503
Period size: 181 Copynumber: 2.7 Consensus size: 176
17396 AGGCTTACTG
* * *
17406 AATAAGCTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTAT
1 AATAAGCTCAAATAGTTATGTTC-ATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGATCTTTTAT
* * * * *
17470 TTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT
65 TTTAT-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATT
* * *
17535 AATATTCTAGAAATTAATAGGTAGGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCA
129 AAGATTCTAGAAATTAATA---A-GAGTA-TTAAAAAATAAATCTATTTATCA
* * * *
17587 AATAAGTTCAAATAGTTATGTTCATTTGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTATGACCTTTTATT
1 AATAAGCTCAAATAGTTATGTTCATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATT
* * * *
17652 TTATAGTAAAACAATTGTTTCTATTCATA-TAGAATTATTTAGAATAAAATAATATTGATTCATT
66 TTATA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-ATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATT
* *
17716 AAGATT-TTGAAAATTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATCTATTTATCA
129 AAGATTCTAG-AAATTAATAAGAGTATTAAAAAATAAATCTATTTATCA
* * *
17764 AATTAGCTCAAATAGTTATGACTT--TTTGAACAATTATATATCTCAAATCGTTATGATC-TTTA
1 AATAAGCTCAAATAGTTATG--TTCATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGATCTTTTA
* * * * * * * *
17826 TTTTGTTATAGAACAATTGTTTTTTTTCCATATAAGCTTATTCAGATTAAGATAATACTAATT
64 TTTT-ATATAAAACAATTGTTTCTATT-CATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
17889 TAATAATAAA
Statistics
Matches: 254, Mismatches: 38, Indels: 24
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 24 0.09
177 97 0.38
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179 2 0.01
180 5 0.02
181 121 0.48
182 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (176 bp):
AATAAGCTCAAATAGTTATGTTCATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATT
TTATATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAA
GATTCTAGAAATTAATAAGAGTATTAAAAAATAAATCTATTTATCA
Found at i:18305 original size:117 final size:117
Alignment explanation
Indices: 18158--18395 Score: 467
Period size: 117 Copynumber: 2.0 Consensus size: 117
18148 TTATGAGCTT
18158 TTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTAAAATAAAACAATG
1 TTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTAAAATAAAACAATG
18223 TTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATA
66 TTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATA
*
18275 TTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTAAAATAAAACTATG
1 TTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTAAAATAAAACAATG
18340 TTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATA
66 TTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATA
18392 TTTC
1 TTTC
18396 AAACCAATTC
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 1, Indels: 0
0.99 0.01 0.00
Matches are distributed among these distances:
117 120 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.07, T:0.38
Consensus pattern (117 bp):
TTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAACTTGTCCAAACTAAAATAAAACAATG
TTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTATA
Found at i:18967 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 18279--21570 Score: 1921
Period size: 181 Copynumber: 18.4 Consensus size: 182
18269 CCTATATTTC
* * * * * *
18279 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAACTT-GTCCAAACTAAAATAAAACT-ATGTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAACAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAAT-TT
* * * * * *
18342 ATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAACCTA-TATT-TCAAACCAATT
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGT-TTACCAAATCAGTT
* * * * * * * * *
18405 CAATTAGTTTACTAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTG
128 CAAATA-ATTA-TAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * *
18461 TTTTGGTCAAAAAAAAATTGTTTCTA-ATCATATA-AGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-ATT
1 TTTT-GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-ACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
18522 TAATAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATGTAAAAAATAAATGT-GTTTGCCAAATCAGTT
63 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTT
* ** * * * * * *
18586 GAAATGGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTT-TTAAGTTTTTG
128 CAAATAATTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTG
* * * * * * * *
18641 TTTAGTCGTAAAACTATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTGGGAAT-AAA-CAT--TAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
18702 TAACA-TTCAAACAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAAT-TTGTTTACTAAA-CAAGTT
66 TAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATC-AGTT
* * * *
18764 CAAATAGTTAT-GATTATTTGAACAATT-T-TATTTAAAATTGTTATGAACTTTTG
128 CAAATAATTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * * * *
18817 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAACAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTA
* *
18882 TTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAAATTTAACAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATCAGTTC
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTTC
* *
18946 AAATAATTATAGCCATTTGAACAA--A---A--T----T-GTTA--ATACTTTTCA
129 AAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTT-G
* * * **
18988 TTTTGTCATAAAACAATTATTT---TTCAACATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC-ATA-AC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* ** * * **
19050 TATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAATTGATTTAAAAATTAAATCTA-CTTACTGAA-CTAGT
63 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATC-AGT
* *
19109 TTAAATAATTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AAGCTTTTG
127 TCAAATAATTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTG
* * * * * *
19165 TTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCA-CACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* ** * * **
19228 ATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGTCAAA-CTAGTTC
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATC-AGTTC
* * * * * * * *
19291 AAACAGTTAAAACTATATGAACAATCATCTATTTCAAAT-GATTATGACCTTTTA
129 AAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGAACTTTTG
** * * * * * *
19345 TTTTGTTTTAAGACAATTATTTCAGCTCATATA-AGTTTACTT-GGAATAAAATAAAACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-ACAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
19408 GTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCAAACCAGTTC
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTTC
* * * *
19472 AAATAATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCGTTAT-TACATTTTG
129 AAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTG
* * * * *
19526 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATA-AGTTTGTTTGAAATAAAATAATACCAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATA-ACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * *
19589 ATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGCAAATAT-GTTTACCAAACCATTT
64 ATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTT
* * * * * * *
19652 AAAATAGTT-TTGACTACTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCGTTAT-AACCTTTTA
128 CAAATAATTATAG-CTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTG
* * ** *
19708 TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCAT-ACTATTTTATTC-ATAATGAAATAATACTAATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAC-AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATT
* ** * ** * * * ** *
19770 TAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAG-GAAATTAAAAAATTAATCTA-ATTACTGAACCAGT
63 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGT
** * * *
19833 TCAAATAATTA-AGACTA-TTGAATGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTG
127 TCAAATAATTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* *** * * * *** *
19888 TTTTATCATAAAACAAAAAATTT--TTTCGT-ACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTT
1 TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATAAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
19950 AATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATATATCTA-TTTACCGAA-CTAGTT
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATC-AGTT
* * * *
20012 C--ATAGGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTG
128 CAAATA-ATTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * * * *
20066 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT-ACTAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * ** *
20130 TTAAAATTT-AAAAATTAA-ATAGAAAGAAATTTTAAAAATAAAT-T-GATTTACTGAATAAGTT
65 TTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTTACCAAATCAGTT
* * *
20191 CAAATAATCATTA-CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG
128 CAAATAATTA-TAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * * *
20246 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAAT-ACATGCTTAAAT-GGAATAAAATAATATTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAACA-GCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * *** * **
20309 ATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATTTA-TTTATTGAATTAGTAA
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTTC
* * * * * *
20369 AAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCT-AACCTTTTA
129 AAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTG
** * **
20423 TTTTGTTGTAAACCAATTGTTT-TTTGTCA-AACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATAAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * ***
20486 ATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTT-TTGAAT-AG-T-
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTTC
* * * * *
20542 ---TAA--A-A-CTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCGTT-T-TAC-CTTG
129 AAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * *
20586 TTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCAT-ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCCTAATA
1 TTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATAAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
20649 TATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATCT-GTTTACTCAAATAAG
63 TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTAC-CAAATCAG
* * * * * *
20712 CT-AATATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTGG
126 TTCAA-ATAATTATAG-CTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * * *
20769 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAAT-ACAAGCTTATAC-AGAGTAAAATAATACTAATCT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAC-AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * *
20832 ATTAATATTTCTAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACTAAATCAGTTA
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTTC
* * *
20892 AAATAATT-TTGGTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
129 AAATAATTATAGCT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * * *
20946 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTC-TTACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATAATAATAAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAC-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT--T
* * *
21010 AATAATAATAATAATTT-ATAATAATCCTAAAATTAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCT-GTT
63 --T-AT--TAAT-ATTTCA-AA-AAT--T--AA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTT
* * * * * * *
21072 TACCGAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTT
115 TACCAAATCAGTTCAAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTT
21137 TTG
180 TTG
* * *
21140 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT---TTCATCATACAAACCTATT-TAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT-A-AC-AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAAT
* *
21201 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTA-C---T--G-
62 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGT
** * * * *
21258 --AACCAA-T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGTCAT-AATCTTTTG
127 TCAAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTG
* * * * * * *
21309 TTCT-ACTATAAAATAATTGTTTTAGTTCACATA-TGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTT
1 TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-ACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * *
21372 AATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAATAAATCT-GTTTGCCGAAGT-AGT
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTAGTTTACC-AAATCAGT
* * * * * * * *
21435 TTAAACATTTA-AGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG
127 TCAAATAATTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * *
21491 TTTTCTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATA-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-ACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
*
21555 TTAATATTTAAAAAAT
65 TTAATATTTCAAAAAT
21571 GAATCTGTTT
Statistics
Matches: 2455, Mismatches: 453, Indels: 404
0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
163 8 0.00
164 62 0.03
165 42 0.02
166 38 0.02
167 5 0.00
168 30 0.01
169 112 0.05
170 46 0.02
171 55 0.02
172 11 0.00
175 4 0.00
176 139 0.06
177 317 0.13
178 178 0.07
179 183 0.07
180 274 0.11
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182 329 0.13
183 43 0.02
184 8 0.00
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186 9 0.00
187 5 0.00
188 1 0.00
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190 3 0.00
191 4 0.00
192 3 0.00
193 3 0.00
194 119 0.05
195 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (182 bp):
TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAACAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAA
ATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
Found at i:19872 original size:362 final size:355
Alignment explanation
Indices: 19036--21570 Score: 1585
Period size: 363 Copynumber: 7.1 Consensus size: 355
19026 ATTTAAAATA
* * * ** * *
19036 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAA-TTG--ATTTAAAAATTAAATCTACTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACAAGAAATTAAAAAATT-AATCTATTT
* * * * * *
19098 ACTGAACTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAGCTTT
65 ACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * ** * *
19163 TGTTTTG-CATAAAACAATTATTTCTGTTCACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGT
130 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTT
* * * **
19227 AATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCAAACTAGTTCA
194 AATAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTT-A
* * * **
19292 AACAGTTAAAACTATATGAACAATCATCTATTTCAAAT-GATTATGACCTTTTATTTTGTTTTAA
258 AATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAA
* * *
19356 GACAATTATT-TCAGCTCATA-TAAGTTTACTTGGAAT
321 AACAATTGTTCT-AGTTCATACT-AGTTTA-TTGGAAT
* * * * * *
19392 AAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAA-TAATTCTA
1 -AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAC-AAGA-AATTAAAAAATTAA-TCTA
** * * *
19456 TTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATTAC
62 TTTACTGAACCAGTTCAAATAATTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
19520 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACCA
126 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTT-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAA
* * ** * * *
19585 ATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGCAAATATGTTTACCAAACCAT
190 ATTTAATAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAG
** * * *
19650 TTAAAATAGTTTTGACTACTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTC
255 TT-AAATAGTTAAGACTA-TTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTC
* * **
19715 ATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTCATAAT
317 ATAAAACAATT-GTTCTAGTTCATACTAGTTTATT-GGAAT
* * * *
19755 GAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGGAAATTAAAAAATTAATCTAA
1 -AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-CAA-GAAATTAAAAAATTAATCTAT
** * *
19820 TTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTA-TTGAATGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCT
63 TTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* ** * * * ***
19884 TTTGTTTTATCATAAAACAAAAAATTTTTTCGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATT
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAATT
* * *
19949 TAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATATATCTATTTACCGAACTAGTT
193 TAATAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTT
* * * *
20012 -CATAGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATA
257 AAATA-GTTAAGACTATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
*
20076 AAACAATTGTTTTAGTTCATACTAGTTTATTTGGAAT
320 AAACAATTGTTCTAGTTCATACTAGTTTA-TTGGAAT
* * *
20113 AAATTAATACTAATTTATTAA-AATTTAAAAATTAAATAGA-AAGAAATTTTAAAAATAAAT-TG
1 AAA-TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATA-ACAAGAAA-TTAAAAAATTAATCT-
** * ** *
20175 ATTTACTGAATAAGTTCAAATAATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAC
61 ATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * ** * **
20240 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACATGCTTAAATGGAATAAAATAATATTA
126 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAA
* ** * * * *** *
20305 ATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTATTGAATTAG
190 ATTTAATAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAG
* * * * * * * * * **
20366 TAAAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTTTGTTG
255 T-TAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
* ** * * * *
20431 TAAACCAATTGTT-TTTTGTCAAACAAGCTTATTCGAAAT
318 TAAAACAATTGTTCTAGT-TCATACTAGTTTATT-GGAAT
* * * * *
20470 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-GAG-ATTTAAAAAATAAATGTGTTT
1 -AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACAAGAAATTAAAAAATTAATCTATTT
* * * * * *
20533 -TTGAA-TAG-T----T-A--AA-ACTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCGTT-TTACC--T
65 ACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * * * * * * *
20584 TGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCCTAATA
130 TGTTTT-GTCATAAAACAATTATTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAATT
* * * * * * *
20649 TATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTCAAA-TAAGC
193 TAATAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACT-AGT
* * * **
20713 TAATATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTGGTTTTGTCA
256 TAA-ATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
* * * * ** *
20777 TAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATACAGAGT
318 TAAAACAATTGTTCTAGTTCATACTAGTTTAT-TGGAAT
* * * * *
20816 AAAATAATACTAATCTATTAATATTTCT-AAAATTAATAA-AAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTT
1 -AAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAACAAGAAATTAAAAAATTAATCTATT
* * * ** *
20878 TACTAAATCAGTTAAAATAATTTTG-GTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
64 TACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * ** * ** *
20942 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCTTACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATAATAAT
128 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAAT-A-CA-
* * * *
21007 AATAATAATAATAATAATTTATAATAATCCTAAAATTAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGT
189 AAT--T--TAATAAT-ATTTAGAA-AAT--T--AA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * ** * * * * * *
21071 TTACCGAA-TCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAAC
243 TTACCAAACT-AGTT-AAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * *** * *** *
21135 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTAGAAT
305 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTCTAGTTCATACTAGTTTA-TTGGAAT
* * * * * * *
21187 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 -AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-CAAGA-AATTAAAAAATTAATCTAT
* * * * * *
21252 TTACTGAA-C----C----AATT---CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGTCATAATCT
63 TTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * * * * * **
21305 TTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTTAGTTCACATATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAA
128 TTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTATTTT-TTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAA
* * * *
21369 TTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTA
191 TTTAATAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCAAACTA
* * * * * * *
21433 GTTTAAACATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTCTC
254 G-TTAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTC
* *
21498 ATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAAT
317 ATAAAACAATTGTTCT-AGTTCATACT-AGTTTA-TTGGAAT
* *
21538 AAAATAATACAAATTTATTAATATTTAAAAAAT
1 -AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
21571 GAATCTGTTT
Statistics
Matches: 1733, Mismatches: 342, Indels: 212
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
340 7 0.00
341 56 0.03
342 5 0.00
343 28 0.02
344 4 0.00
345 26 0.02
346 137 0.08
347 7 0.00
348 2 0.00
349 4 0.00
350 16 0.01
351 125 0.07
352 6 0.00
353 5 0.00
354 19 0.01
355 13 0.01
356 52 0.03
357 203 0.12
358 163 0.09
359 100 0.06
360 37 0.02
361 123 0.07
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363 207 0.12
364 12 0.01
365 1 0.00
366 9 0.01
367 6 0.00
368 3 0.00
370 1 0.00
371 120 0.07
372 29 0.02
373 5 0.00
374 1 0.00
375 26 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (355 bp):
AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACAAGAAATTAAAAAATTAATCTATTTA
CTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
GTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTAA
TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTAAAT
AGTTAAGACTATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA
TTGTTCTAGTTCATACTAGTTTATTGGAAT
Found at i:20443 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 18988--22742 Score: 1676
Period size: 181 Copynumber: 21.1 Consensus size: 176
18978 ATACTTTTCA
* * * * **
18988 TTTTGTCATAAAACAATTATTTT--TCAACATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TA-ATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTT
* * ** * * * * *
19051 ATTAATATTTCAAGAATTAGTAATTGATTTAAAAATTAAATCTACTTACTGAACTAGTTTAAATA
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAAAATA
* * *
19116 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTG
128 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * ** *
19165 TTTTG-CATAAAACAATTATTTCT-GTTCACACAAG-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * *
19227 AATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTCAAACTAGTTC
64 ATTAATA-TTTCAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAATTAG-TA
* * ** * * *
19291 AAACAGTTAAAACTATATGAACAATCATCTATTTCAAAT-GATTATGACCTTTTA
123 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTG
** * * * * * * * * * *
19345 TTTTGTTTTAAGACAATTATTTCAGCTCATATAAGTTTACTTGGAATAAAATAAAACTAATTTGT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** ** *
19410 TAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCAAACCAGTTCAA
66 TAATATTTCAAAA--AT-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTACTGAATTAG-TAAA
* * * * *
19474 ATAATTATAACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTG
125 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * ** * *
19526 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACCAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTA
** * * ** ** *
19590 TTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGCAAATATGTTTACCAAACCATTTAA
65 TTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTA-GTAA
* * * * * * *
19654 AATAGTTTTGACTACTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTA
124 AATAATTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * ** *
19708 TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTA-TTTTATTCATAATGAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * * * ** *
19771 AATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGGAAATTAAAAAATTAATCTAATTACTGAACCAGTTCA
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAA--GA-G-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAA
* ** * *
19836 AATAATTAAGACTA-TTGAATGATTATCAATTTCAAATCTTTATGACCTTTTG
124 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* *** ** * ** *
19888 TTTTATCATAAAACAAAAAATTTT--TTCGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTA
1 TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * **
19951 ATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAATATATCTATTTACCGAACTAGT-TCAT
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTAAAAT
* * * *
20015 AGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTG
127 A-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
20066 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACTAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
20131 TAAAATTT-AAAAATTAAATAGAAAGAAATTTTAAAAATAAATTGATTTACTGAATAAGTTCAAA
66 TAATATTTCAAAAATT-AAT---AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAAAA
* * *
20195 TAATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG
126 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * *
20246 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACATGCTTAAATGGAATAAAATAATATTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
20311 TAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATTTATTTATTGAATTAGTAAAAATAAT
66 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGT-AAAATAAT
* * * * * * *
20376 TATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTA
130 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
** * * * *
20423 TTTTGTTGTAAACCAATTGTTTTTTGTCAA-ACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTT
* * * *
20486 ATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TTGAA-TAGT----TAA
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTAAAATAA
* * * *
20545 --A--ACTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCGTT-TTACC--TTG
129 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * *
20586 TTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATCCTAATA
1 TTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
20649 TATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTCAAATAAGC
63 TATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAATTAG-
* * * * *
20713 TAATATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTGG
121 TAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
** * *
20769 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTT-ATACAGAGTAAAATAATACTAATCTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAAT-TGGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
20833 TTAATATTTCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATCAGTTAAAATAA
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAAAATAA
* *
20898 TTTTG-GTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
129 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * ** * * * *
20946 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCTTACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAAT--AA-AATAATACTAAT-
* * * * * * *
21011 ATAATAATAATAATTTATAATAATCCTAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACC
62 -T--T-AT--TAA--TAT--T--T-CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT
* * * * * * * * *
21076 GAATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
114 GAATTAG-TAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
*** * * * * *
21140 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* **
21205 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-----T-G--AACC
66 TAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTAAAAT
* * * * * *
21262 AA-T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGTCATAATCTTTTG
127 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * * * *
21309 TTCT-ACTATAAAATAATTGTTTTAGTTCACATATGCTT-ATTCGAAATAAAATAATATTAATTT
1 TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
21372 AATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTGCCGAAGTAGTTT
64 ATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAA-AAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TA
* * * * * * *
21437 AAACATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG
123 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * *
21491 TTTTCTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *** * * *
21556 TAATATTT--AAAA--AAT--GA-A--T-----CT--GTTTACCGAAT-CATT--TCAAATAATT
66 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTAAAATAATT
* * * * * *
21602 AGGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTG
131 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * *
21648 TTTGGTCATATAACAAATGTTTT--TTATCATTCAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTA--ATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATT
* * * ** ** * *
21710 TACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTC
63 TATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTA-GTA
* * ** *
21775 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTG
123 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * ** **
21829 TTATGTTATAAAACAATTATTTCT-GTTAACACAAG-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGC
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * ** ** *
21892 AATGATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTCA
64 ATTAATA-TTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAA
* * ** * * * * *
21957 AATAGTTAAGGTTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTG
124 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * ** * ** *
22010 TTTTGCCTTAGAACAATT-TTTTAGTTCTTAGTAA-CTT-ATTCATAATAAAATAA-AATAAATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATA-CAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACT-AATT
* * * * * *
22071 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAATAATTTTGTTTGC-CAAGCTAGTT
63 TATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-TTAG-T
* * * *
22135 CAAATAATTATGTCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACATAAAACAAATGTTT-
122 AAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC------C---T-TTTG
* ** * ** * * *
22199 TTTT-TCATATAA-GTTTGTTTGAAATAAAACAAGATTAATT----T--ATTAATA-T--TTTGA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTT-A
* * * ** * *
22253 --AA-A-TT--AAAA--AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTACTAAACCAGTTCAATTAA
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAAAATAA
* * * * *
22309 TTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTG
129 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* ** * * *
22357 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TGCATA-TAGTCTT-ATTCGAAATAAAATAATGCTAATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAG-CTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATT
* * * * * ** *
22419 TATGAATA-TTCTAAAAGTTAATAAATAACGAATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCTG-ACTAGT
63 TATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AA-GA-G-ATTTAAAAAATAAATTTATT-TACTGAATTAGT
* * * * * *
22482 GCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTG
122 -AAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * ** * * * *
22538 TTTTATCACAAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCAT-ATTCGAAATAATATAATTCTAATTT
1 TTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTT
* * * ** ** *
22602 ATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
64 ATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAG-TAA
* * * * *
22667 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTT
124 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
*
22720 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
22743 CTATTCATGC
Statistics
Matches: 2763, Mismatches: 593, Indels: 440
0.73 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
155 2 0.00
156 2 0.00
157 103 0.04
158 4 0.00
159 16 0.01
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161 4 0.00
162 2 0.00
163 14 0.01
164 58 0.02
165 5 0.00
166 30 0.01
167 55 0.02
168 52 0.02
169 109 0.04
170 25 0.01
171 7 0.00
172 11 0.00
173 1 0.00
174 8 0.00
175 13 0.00
176 66 0.02
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178 126 0.05
179 139 0.05
180 418 0.15
181 532 0.19
182 437 0.16
183 26 0.01
184 8 0.00
185 7 0.00
186 3 0.00
187 8 0.00
188 13 0.00
189 12 0.00
190 3 0.00
191 12 0.00
192 2 0.00
193 1 0.00
194 126 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTAAAATAATT
ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
Found at i:21003 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 20990--21034 Score: 65
Period size: 3 Copynumber: 15.0 Consensus size: 3
20980 GCCTATTTGA
*
20990 AAT AA- AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AATT TAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AA-T AAT AAT AAT
21035 CCTAAAATTA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 2, Indels: 4
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
2 2 0.05
3 34 0.89
4 2 0.05
ACGTcount: A:0.64, C:0.00, G:0.00, T:0.36
Consensus pattern (3 bp):
AAT
Found at i:21181 original size:194 final size:194
Alignment explanation
Indices: 20818--21200 Score: 511
Period size: 194 Copynumber: 2.0 Consensus size: 194
20808 TACAGAGTAA
* * * * *
20818 AATAATACTAATCTATTAATATTTCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTA
1 AATAATAATAATCTATTAATAATCCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * *
20883 AATCAGTTAAAATAATTTTGGTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
66 AATCAGTTAAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTT
* * *
20948 TTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCTTACAAGCCTATTT-GAAATAAAATAATAATAATAATAA
131 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TCATACAAACCTATTTAG-AATAAAATAATAATAATAATAA
21012 T
194 T
* ** * * *
21013 AATAATAATAATTTA-TAATAATCCTAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCG
1 AATAATAATAATCTATTAATAATCCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * *
21077 AATCAGTTCAAATAATTCTGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTT
66 AATCAGTTAAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTT
*
21142 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAACCTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
131 TTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTCATACAAACCTATTTAGAATAAAATAATAATAAT
21201 TTATTAATAT
Statistics
Matches: 163, Mismatches: 22, Indels: 7
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
194 144 0.88
195 14 0.09
196 5 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (194 bp):
AATAATAATAATCTATTAATAATCCTAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
AATCAGTTAAAATAATTCTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTCATACAAACCTATTTAGAATAAAATAATAATAATAATAAT
Found at i:21309 original size:169 final size:170
Alignment explanation
Indices: 21100--21423 Score: 404
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 170
21090 AATTCTGGCC
** * ** *
21100 ATTTCAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTCAATAATTACCTATTTCAAATCGTCATGAACTTTTGTTCTACT-ATAAAACAATTGTTTTA
* * *
21164 CATCATACAAACCTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
65 CATCACACAAACCTA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACT
* *
21228 AGGAGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTACTGAACCAATTCCT
129 AAGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCCT
* *
21269 ATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGTCAT-AATCTTTTGTTCTACTATAAAATAATTGTTTTA
1 ATTTCAATAATTACCTATTTCAAATCGTCATGAA-CTTTTGTTCTACTATAAAACAATTGTTTTA
** * ** * * *
21333 GTTCACATATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTA
65 CATCACACAAACCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTA
21398 AGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTT
130 AGAGATTTAAATAAATAAATCTGTTT
21424 GCCGAAGTAG
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 21, Indels: 7
0.82 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
168 5 0.04
169 110 0.85
170 15 0.12
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (170 bp):
ATTTCAATAATTACCTATTTCAAATCGTCATGAACTTTTGTTCTACTATAAAACAATTGTTTTAC
ATCACACAAACCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAA
GAGATTTAAATAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCCT
Found at i:22507 original size:528 final size:531
Alignment explanation
Indices: 21654--22704 Score: 1214
Period size: 528 Copynumber: 2.0 Consensus size: 531
21644 TTTGTTTGGT
* * *
21654 CATATAACAAATGTTTTTTATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATAT
1 CATAAAACAAATGTTTTTTATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAACAAGACTAATTTACTAATAT
* * * *
21719 TTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTA
66 TTCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTA
* * * *
21784 TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTATGTTATAAAACAATTAT
131 TAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTATGTCATAAAACAATTAT
* *
21849 TTCTGTTAACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGCAATGATATTTTGAAAATTAATA
196 TTCTGATAACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGCAATGATATTCTGAAAATTAATA
* * * * * * *
21914 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGTTATATGAACA
261 AATAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTTAAGATTATATGAACA
* * * * *
21979 ATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTT-GC-CTTAGAACAATT-TTTTAGTTCT-TA
326 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTAGCAC-AAAAACAATTGTTTTAGTT-TGTA
* *
22040 GTAA-CTTATTC-ATAATAAAATAAAAT-AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
389 -CAAGCATATTCGA-AATAAAAT-AAATCAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * *
22102 ATCTAAAAAA-TAATTTTGTTTGCCAAGCTAGTTCAAATAATTATGTCTATTTGAACAATTATTT
451 ATCTAAAAAATTAA-TCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
22166 ATTTCAAATCATTATGA
515 ATTTCAAATCATTATGA
* * * * * *
22183 CATAAAACAAATGTTTTTTTTCATAT-AAGTTTGTTTGAAATAAAACAAGATTAATTTATTAATA
1 CATAAAACAAATGTTTTTTATCAT-TCAAGCTTATTCGAAATAAAACAAGACTAATTTACTAATA
** * * *
22247 TTTTGAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTACTAAACCAGTTCAATTAATT
65 TTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * *
22311 ATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
130 ATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTATGTCATAAAACAATTA
* * * * **
22376 TTTCT-AT-GCATATAGTCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAAT-TTATGAATATTCT-AAAAGT
195 TTTCTGATAACACA-AGT-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATGCAATG-ATATTCTGAAAA-T
** * * * * *
22437 TAATAAATAACGA-ATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCTGACTAGTGCATATAGTTATGATTGTT
256 TAATAAATAA-GAGATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTTAAGATTATA
* * * * *
22501 TGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAATAATTGTTTTTGTT
320 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTAGCACAAAAACAATTGTTTTAGTT
* * * *
22566 TGTACAAGCATATTCGAAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA
385 TGTACAAGCATATTCGAAATAAAATAAATCAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* *
22631 GATTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
450 GATCTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
22696 ATTTCAAAT
515 ATTTCAAAT
22705 TGCTATCACC
Statistics
Matches: 433, Mismatches: 75, Indels: 27
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
526 3 0.01
527 11 0.03
528 192 0.44
529 105 0.24
530 118 0.27
531 4 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (531 bp):
CATAAAACAAATGTTTTTTATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAACAAGACTAATTTACTAATAT
TTCAAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTA
TAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTATGTCATAAAACAATTAT
TTCTGATAACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGCAATGATATTCTGAAAATTAATA
AATAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTTAAGATTATATGAACA
ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTAGCACAAAAACAATTGTTTTAGTTTGTACA
AGCATATTCGAAATAAAATAAATCAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTA
AAAAATTAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
AATCATTATGA
Found at i:22601 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 22234--22746 Score: 523
Period size: 182 Copynumber: 2.8 Consensus size: 181
22224 AAAACAAGAT
* * * * *
22234 TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-AAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-ACTAAAC
1 TAATTTATGAATATTCTAAAAATTAATAAA-TAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGACCAAAC
* * * * * * * * *
22297 CAGTTCAATTAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTG
65 AAGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
22362 TCATAAAATAATTGTTTCTATGCATATAGTCTTATTCGAAATAAAATAATGC
130 TCAAAAAATAATTGTTTCTATGCACATAGTCATATTCGAAATAAAATAATGC
* * **
22414 TAATTTATGAATATTCTAAAAGTTAATAAATAACGA-ATTTAAAAAACAAATCTATTGGCCTGAC
1 TAATTTATGAATATTCTAAAAATTAATAAATAA-GAGATTTAAAAAACAAATCTATTGACCAAAC
* * * * * *
22478 TAGTGCATATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA
65 AAGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
22543 TCACAAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACA-AG-CATATTCGAAATAATATAATTC
130 TCA-AAAAATAATTG--TTTCTATGCACATAGTCATATTCGAAATAAAATAATGC
* * * ** *
22596 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACA
1 TAATTTATGAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGACCAAACA
* * * * *
22661 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTTTTTGT
66 AGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
22726 CATAAAACAATTTTTTTCTAT
131 CAAAAAATAA-TTGTTTCTAT
22747 TCATGCAAGC
Statistics
Matches: 268, Mismatches: 57, Indels: 16
0.79 0.17 0.05
Matches are distributed among these distances:
180 49 0.18
181 70 0.26
182 139 0.52
183 2 0.01
184 8 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TAATTTATGAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGACCAAACA
AGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
CAAAAAATAATTGTTTCTATGCACATAGTCATATTCGAAATAAAATAATGC
Found at i:22790 original size:154 final size:155
Alignment explanation
Indices: 22614--22899 Score: 441
Period size: 154 Copynumber: 1.9 Consensus size: 155
22604 TAATATTTTA
* * *
22614 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *
22679 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTT-TTTTGTCATAAAACAATT-TTTT
66 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATCA-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT
22742 TCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
130 TCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
* * * *
22768 AAAATTAAAAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCTAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
22833 TATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
66 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
22898 CT
131 CT
22900 TCACACAAAC
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 12, Indels: 3
0.89 0.09 0.02
Matches are distributed among these distances:
153 6 0.05
154 105 0.89
155 7 0.06
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (155 bp):
AAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
CTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
Found at i:23488 original size:362 final size:356
Alignment explanation
Indices: 22786--23782 Score: 966
Period size: 358 Copynumber: 2.8 Consensus size: 356
22776 AAAGTAAAAT
* ** *
22786 ATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCT-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATTT
1 ATTTAAAAAATAAATATACTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATTT
* * * * * *
22850 ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCTTCACACAAACTTATT
65 ATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCAAACAAGCTTATT
* * * * **
22915 TGGATTAAAATAATATGAATTTATTAATATTTTGCCAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAATAAA
129 TCGAATAAAATAATATAAATTTATCAATA-TTTGCCAATTAATAAGTAAAATA-TAAAAAATAAA
* * * * *
22980 TTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
192 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT
* * * * *
23045 GACCTTTTTTTTCATTATAAAACAATTGTATCAGTTTATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATA
257 GACCTTTTTTTTCATCATAAAACAATTGTATCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* *
23110 CTAATTTATTAATATTCTAAAATTTAACAAG-T-G
322 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTTAG
* * * * *
23143 ATTTAAGAAAATGAATCTACTTACTGAACAAGTTCAATTAGTTATGACTATTTGAACAATTATAT
1 ATTTAA-AAAATAAATATACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATTT
* * * * *
23208 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTGTATTCATACAAGCTTATT
65 ATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCAAACAAGCTTATT
*
23273 TCGAATAAAATAAT-TAAATTTATCCATA-TT-CCAAAATTAATAAGTCAAAATA-AAAAAATAA
129 TCGAATAAAATAATATAAATTTATCAATATTTGCC--AATTAATAAGT-AAAATATAAAAAATAA
* * *
23334 ATCTATTT-TTGAACACA-TTCAAATAATTATGACTATTTATCTATTTGAACAATTATCTATTTC
191 ATCTATTTATCGAACA-AGTTC--A-AA-TA-GAC-A--TAACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * *
23397 AAATAGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
247 AAATAGTTATGACCTTTT-TTTTCATCATAAAACAATTGTATC-AGTTCATACAAGCTTATTCAA
* *
23460 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTATAT
310 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAG-T-TAG
** * * * * *
23509 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAGCAAGTTAAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTT
1 ATTTAAAAAATAAATATACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATTTA
* *
23574 TTTCAAATAGTTATG-CTCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATATTCAAACAAGTTTA-T
66 TTTCAAATA-TTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCAAACAAGCTTATT
* * * * *
23637 TCTGAATAAAATTATACT-AATTTATTAATATTTTG-CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAA
129 TC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATCAATA-TTTGCCAA-TTAATAAGTA--AAATAT-AAAAA
* * * * *
23700 ATAAATTTTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCACAT-GC-ACTTGAACAATTATCTATTTCAAA
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*
23763 TTGTTATGACCTTTTGTTTT
250 TAGTTATGACCTTTT-TTTT
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TTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTTAG
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22776 AAAGTAAAAT
* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * *
23091 TATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAATTTAACAAGT---G
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* * * *
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* * * *
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** **
23272 T-TCGAATAAAATAAT--TAAATTTATCCATATTCCA-AAATTAATAAGTCA-A-
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* * * *
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* * *
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** ** * * *
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* * * * * * * *
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1 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * *
23574 TTTCAAATAGTTATG-CTCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATATTCAAACAAGTTTATT
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* * * *
23638 CTGAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTTGCAATTTAATAGGTAGGAG
130 CTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTACAAATTAATAAGTA-GAG
* * * *
23690 ATTTAAAAAAATAAATTTTTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTCACATG-C-ACTTGAACAATTA
1 ATTT-AAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGT--TATGACTATTTGAACAATTA
*
23752 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
62 TCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT
23783 GTTGTAGAAA
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TTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTC
TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTACAAATTAATAAGTAGAG
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Alignment explanation
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Period size: 146 Copynumber: 1.9 Consensus size: 147
23662 TAATATTTTG
* * *
23672 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCACAT
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* * **
23737 GCACTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAGAAAAAGTATTTC
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131 TATGCATACATATTCTA
* * * * **
23819 CAATTTAATAGGTAGGAGGTTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTGACATCA-TCATG
1 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTCACA
*
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23942 TGTTTCTGTT
Statistics
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CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCACAT
CCACTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAGAAAAAGTATTTC
TATGCATACATATTCTA
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Alignment explanation
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25768 GAATAGGTTG
*
25778 AAATAGTTATGACTATTT-
1 AAATAATTATGACTATTTA
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*
25813 AAATCATTATGA
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25825 ACTTTTGTTT
Statistics
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AAATAATTATGACTATTTA
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25946 ATCGAATCAC
25956 TTCAAATAATTATACTAT
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*
25974 TT-GAATAATTAT-CTAT
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*
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26003 TACCTTTCGT
Statistics
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26064 TG
65 TG
* * * * * *
26066 TTATTTCCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTTGAATATACAAGCTTATTTTATATAAAAT
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Statistics
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TTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAACATACAAGCTTATTTTAAATAAAATT
G
Found at i:26634 original size:179 final size:180
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26062 ATTGTTATTT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * ** * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACC
* * * * *
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* * ***
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* * * * * * * * * * **
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* * * * * ** *
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** * * ** * *
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1 CCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAC-AAGCTTATTT-GAATAAAATAATA
* * * * * **
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* * * * *
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126 ACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * ** * ** * * *
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1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT
* ** * * *
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* * *
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* * * * * *
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** ** ** * * **
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* * * * * *
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* ** * * * *
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* ** * * **
27388 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAACGAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAATA
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*
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* * *
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1 CCTTTTGT-T-TTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAAT
* * * * * * * * *
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* *
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* * ** * ** *
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* * * * ***
27748 TAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTGAGTG
64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACC
* * * * * *
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* * * *
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1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATAC
* ** * *
27929 TAATTTATTAATA-TTC-AAAA--AATTAGTTGGA-AGTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
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* * * ** * * * * **
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* * * **
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* * * * * * *
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64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACC
* * * * * *
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* * * * * * * *
28215 GC-TTTGTTTTATCATGAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAACTTATTTGGAGT-AAATATTGC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATAC
** * * *
28277 TAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGA-TGAA
64 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTGAA
* * * * * *
28339 CTAGTTTAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGA
127 CCAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * *
28393 CTTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTATTTTAGTTCATACATGCTTAGTTGAAATAAAATAATACT
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACT
* * * * * * **
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* * * * *
28519 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGG
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* * * *** * *
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1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATACT
* * * ** *
28635 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TCAAA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTA-TTTACT-GAA
* ** ** * * *
28698 TCAACTCAAATAGTTATGGCTGTTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATGA
127 CCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
28752 ACTTTTTTTTTGTCATCAAACAATTGTTTTTCA--TCAAACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATA
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA
* *
28815 CTAATTCATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA--T------T--ATCTATTTACTGAAC
63 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * * *
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* * * * *
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1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-TCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATAC
* * * * * * **
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** *
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* * ** * * * * * * * **
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1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATAC
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*** ** * * * * * **
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1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATA-
* * **
29343 CTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG
63 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-TG
* * * * * * ** *
29406 -ACCAATACAAATTGTTATGACTGTTTGAA-ACATTATTTATTTCAAATTATTATAA
125 AACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * ** * * *
29461 CCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTTTTGTATAC--GCTTATTCGGAATAACATAACT-
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTT-CATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAA-TA
** * * * * * * *
29523 CTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAATAAGTGAGTTAAAAATTGAATTTGTTTA-TCGAA
63 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA
* ** * * ** * *
29587 CAAGTTGTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTCCCTATTTCAAATCGCTATAA
127 CCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* ** * * **
29641 CCTTTTGTTTTGTCATTAAATTATTTTTTCTA-TTCATACAAGCCTATTCCAATTAAAATAATAC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATAC
* ** * * * * *
29705 AAATTTATTAATA-TTCAGATGACTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTAATCGAA
64 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA
** * * *
29768 TAAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA
127 CCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGA
* * ** * * *
29822 CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATT
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACT
** * * * * * * * **
29887 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCAAATA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACC
** * * * * *
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** * * * * **
30003 CCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
30068 AATTTATTAATATTAT-GAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATGATTCTATTT-TTCGATC
65 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* * *
30131 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
128 CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * *
30184 CTTTTTGTTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTAGTCTAAATAAAATAATA
1 CCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATA
* * **
30248 -TAAATTTATTAATA-TTCTAGAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGA
63 CT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
* * *
30310 ACACA-TTCAAATAGTTATGA-TAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
126 AC-CAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
** * *
30365 CCTTTTGTTTTGTCATAATCCAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCGTATTTGAAATAAAATAATAC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATAC
* * *
30429 TAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACTGAGC
64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * * * * * * *
30492 AAGTTTAAATAGTTATCACTGTTTGAACAATTATTTATTTAAAATAGTTATTA
128 CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * *
30545 TCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATAC
* ** * * * * * * ** *
30609 TAATTTATAAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTGCCAAACA
64 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACC
* ** * * * * *
30674 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTAGTTCAAATCATTATTA
129 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
** * * * **
30726 CCTCCTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATAC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATAC
* * *
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64 TAATTTATTAATATTT
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ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAG
TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
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28695 AAATCAACTC
** * * *
28705 AAATAGTTATGGCTGTTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATGAACTTTTTTTTTGTCATCA
1 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATAATTCAAATCATTATGAACTTTTTTTTTGTCATAA
* ** ** * *
28770 AACAATTGTTTTTCATCAAACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAAT-TCATTAATATTTCA
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* *
28834 AAAATTAATAAGTAGGAGATTATCTATTTACTGAACCAGTTT
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*
28876 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTTTGTCATA
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* * * *
28940 AAATAATT-ATTGACATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTAC
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AACAATTGATTGACATCAAACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTACAA
AAATTAATAACTAAGAGATTATCTATTTACTGAACCAGTTT
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* * *
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TTCAAATAGTTATGATAAT
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26062 ATTGTTATTT
* * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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128 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-CTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * **
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* * * *** * * * * * *
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* * * * * *
26388 TAAAACTATATGAAGAATTATCTATTTTAAATTGTTATTA
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* * * * * *
26428 CCTTTTGTTTTGTCATAAAGA-AATTATTTC-AGCTCATCCAAGTTTATTTGTAATAAAATAAAA
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
26619 TCATAAAATAATTATTTTTTTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATCTAATAAG
192 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
26683 ATTATGACAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-ATTTTTTTTGCCAAACCACTTCAAATAGT
256 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
26747 TA-AGGA-TGTATGAACAATTACCTATTGCAAATTA-TTATGG
321 TATA--ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGA
** * * ** *
26787 CCTTTTAG-TTTGTTGTAAAACAATT-TTTC-AGTGCTTACTAA-CCAATTTCG-AATAAAACAA
1 CCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTT-GAAATAAAATAA
* * * * * * * * **
26847 AACAAACTTACTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGGTTTAAAAAAT-AAT-TATGTTTGTC
62 TACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACT-
* * * *
26910 GAACCAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGT
124 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGT
* * ** * * ** * *
26975 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTGATATGAGTTTGTTTGGAATCAAATAATA-TTATTTA-T
188 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
27038 AATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAATT
253 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
*
27099 AGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGA
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* * * * * *
27142 CCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATAC
** * ** ** * * **
27206 TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAGGAAATGTATTTGTTGGCCT-AAC
65 TAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTGAA-
* * *
27270 CAA-TGCAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
127 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
27334 GTCACAAAACAATCGTTTCTGTTCGTACAAGCTTATTTAGAATAATATAATTCTAATTTATTAAT
191 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** ** * * * * * * *
27399 ATTCCAAAAATTAACGAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGT
256 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* *
27464 TATAAATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
321 TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* *
27504 CCTTTT-TATGTTGTTATAAAACAATTGTTCCTATTCATACAAGCTTATTATG-AATAAAATAAT
1 CCTTTTGT-T-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAAT
* * * * * *
27567 A-TAAACTGACTAATAATCCAACAATTAATAAGCAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGA
63 ACT-AATTTATTAATATTCCAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
* * * * *
27630 ACACGTTCAAATAGTTCTAACTA-TTGAACAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACCTTTTAG-T
126 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTT-GTT
* * * *
27693 TTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTACTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTA
189 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * * * * ** *** *
27758 AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTGAGTGAGTCCAAATA
254 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* * * * *
27823 GTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
319 GTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
27865 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* ** * *
27930 AATTTATTAATATT-CAAAA--AATTAGTTGGAAG-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAA
66 AATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAA
* * * * * * * *
27991 GTTCAAATAATCATGTCCATTTGAACTATTA-CGAATTTTAAATTATTATGACATTTTGTTTTGT
130 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * *
28055 CGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTAATA-
193 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * *
28119 TTTCAAAA-T--TAA-T-A-AG-CTTAAAAACTAAATTTGTTTACTGGATC-GGTTCAAATAGTT
258 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
28176 ACAATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGGTATGA
322 ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
28215 GC-TTTGTTTTATCATGAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTGGAGT-AAATATTGCT
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
** * * * * * *
28278 AAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGA-TGAACT
66 AATTTATTAATATTC-CAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTGAACA
* * * * * * * *
28341 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACTTTTTGTTTAGT
129 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
28406 TATAAAATAATTATTTTAGTTCATACATGCTTAGTTGA-AATAAAATAATACTATTTTATTAACA
193 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * * *
28470 TCCAAAAAATTAATAAGCAAG-GAATTTAAAAAA-AAATCTG-TTGCCAAACAAGTTCAAATAGT
257 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
28532 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGG
321 TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * *** * *
28572 CCTTTTG-CTTATCATAAAACAATT-ATTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATTAAATAATAA
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * *** *
28634 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TCAA
65 TAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTA-TTTACT-GA
* * * * * *
28697 ATCAA-CTCAAATAGTTATGGCTGTTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATGAACTTTTTTT
126 A-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT
* ** * * ** *
28761 TTGTCATCAAACAATTGTTTTTCATCAAACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTCATTA
189 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * ** * *
28826 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA--T------T--ATCTATTTACTGAACCAGTTTAAATA
254 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* *
28881 GTTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATAA
319 GTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * * * *
28923 CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTGAC-ATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATA
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA
* * * * * * * **
28986 CTAATGTAATAATATTACAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAAC
64 CTAATTTATTAATATT-CCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * ** * *
29051 CAGTTCAAATAGTTAAGGGTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTG
128 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * **
29115 TCGTAAAATAAATGCTTTTGTTTATATAAGTTTGTTC-GAAATAAAATATTTTTAATTTATTAAT
192 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
29179 ATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAATTAGT
256 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
29240 TATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
321 TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
*** ** * * * * **
29280 TAATTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTCTATTGAAACAATCTTATTTGAAATAAAGCAA-AGC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-C
* ** * * ** *
29344 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACC
65 TAATTTATTAATATTC-CAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-TGAAC
* * * * *
29409 AA-TACAAATTGTTATGACTGTTTGAA-ACATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTT
128 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
29472 GTCACAAAACAATTGTTTCTT-TTGTATAC--GCTTATTCGGAATAACATAACT-CTAATTTATT
191 GTCATAAAACAATTGTTT-TTGTT-CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATT
** * * * * * * * **
29533 AATATTAAAAAAATTAATAAATAAGTGAGTTAAAAATTGAATTTGTTTATCGAACAAGTTGTAAT
253 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * ** * * *
29598 AGTTATGACTATTTGAATAATTCCCTATTTCAAATCGCTATAA
318 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* ** * * ** * *
29641 CCTTTTGTTTTGTCATTAAATTATTTTTTCTATTCATACAAGCCTATTCCAATTAAAATAATACA
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
29706 AATTTATTAATATT-CAGATGACTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTAATCGAAT
66 AATTTATTAATATTCCA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* * * *
29769 AAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTATGACTTTTTGTTTTG
128 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
29834 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
192 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * **
29899 TTTTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGGC
257 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
29964 ATAACTATTTGAATAATTGTCCATTTCAAATCA-TTGTGA
322 ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
** * * * **
30003 CCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
** * * * * *
30067 TAATTTATTAATATTATGAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATGATTCTATTT-TTCGATC
65 TAATTTATTAATATT-CCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* *
30131 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTT
128 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTG-TTTT
* * * * * *
30196 ATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAGTCTA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTA
191 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * ****
30259 ATATTCTAGAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACACA-TTCAAAT
254 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA-AGTTCAAAT
* *
30322 AGTTATGA-TAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
318 AGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
** *
30365 CCTTTTGTTTTGTCATAATCCAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTTGAAATAAAATAATACT
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
*
30430 AATTTATTAATATTCCAAAATTAAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACTGAGCAA
66 AATTTATTAATATTCCAAAATT-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAA
* * * * * * * *
30494 GTTTAAATAGTTATCACTGTTTGAACAATTATTTATTTAAAATAGTTATTATCTTTTGTTTTGTT
130 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
30559 ATAAAAAAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATT
194 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
30624 TTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTCAT
259 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
** * * * *
30689 GTCCATTTGAAAAATTATCTAGTTCAAATCA-TTATTA
324 AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
** * * * * **
30726 CCTCCTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATGCAAAATTATTT-AGAATAAAATAATAC
1 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATAC
* *
30790 CAATCTATTAA
65 TAATTTATTAA
30801 GATTTTGAAG
Statistics
Matches: 3442, Mismatches: 764, Indels: 329
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
347 6 0.00
348 22 0.01
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364 6 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAG
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
Found at i:31776 original size:180 final size:175
Alignment explanation
Indices: 31397--32251 Score: 681
Period size: 180 Copynumber: 4.8 Consensus size: 175
31387 TATAATGATT
* * * * * * *
31397 TTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAACTAATTGTTTTTATTCATAAAAG
1 TTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTG-TTTGTCATAAAAT-ATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * *
31462 CTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAA
64 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTT-AAAAATTAATAAG--GAAAATTTAAA
* * *
31527 AAATAAATCTATTTGCCT-AGAAAGTTAAAATAGTTATGACTATTTAAACAA
126 AAATAAATCTATTT-ACTGA-AAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *
31578 TTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTCTTGTTTGTCATAAAGCATA-TGTTTCTATTCATACAAG
1 TTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTGTCATAAA--ATATTGTTTCTATTCATACAAG
* *
31642 TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAAATTTAAT
64 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATT-TAAAAATTAATAAG--GAAAATTTAAA
* * * *
31707 AAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAATCATGACCATTTGAACTA
126 AAATAAATCTATTTACTGAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * **
31758 TTATCTATTTCCAATCGTTATGA-CATTTTG--T-T--TACAA-ATTGTTTTTATTCATACAAAA
1 TTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTTGTTTGTCATAAAATATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * *
31816 TTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTC-ATATTTCAAAACTTAATAA-G-AGATTTAAAA
65 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA-TCAATATTT-AAAAATTAATAAGGAAAATTTAAAA
* ** * *
31877 ACTAAATCTGCTTATTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AAAAA
127 AATAAATCTATTTACTGAA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
31926 TTATTTATCTT-AAATCATTATGAT-TTTTGTATTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAA
1 TTATCTAT-TTCAAATCGTTATGATCTTTTGT-TTGTCAT-AAAATATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * **
31989 GCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAAATAAT-AATATTTTAAAAATTAATAACCAAGAGATTTA
63 GCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATCAATA-TTTAAAAATTAATAAGGAA-A-ATTTA
* * * * *
32053 AAAAATAAATATGTTT-GTCGAAACAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAA
124 AAAAATAAATCTATTTACT-GAAA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
32106 TTATCTAGTTCAAATCGTTATGAGCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATATATA
1 TTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTT-GTCATAAAAT-ATTGTTTCTATTCATACA-A
* * * * *
32171 -CTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAA
63 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATT-TAAAAATTAATAAG-GA-AAATTTAA
32235 AAAA-AATCATCTATTTA
125 AAAATAA--ATCTATTTA
32252 TCGAACATTG
Statistics
Matches: 538, Mismatches: 91, Indels: 88
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
167 5 0.01
168 20 0.04
169 43 0.08
170 4 0.01
171 1 0.00
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180 180 0.33
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182 10 0.02
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
TTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTGTCATAAAATATTGTTTCTATTCATACAAGCT
TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTTAAAAATTAATAAGGAAAATTTAAAAAATA
AATCTATTTACTGAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
Found at i:32102 original size:348 final size:348
Alignment explanation
Indices: 31441--32139 Score: 801
Period size: 348 Copynumber: 2.0 Consensus size: 348
31431 ATCATAAACT
* *
31441 AATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAA
1 AATTGTTTTTATTCATAAAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAA
* * *
31506 TTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCTAGAAAGTTAAAATAGTTATGACTATT
66 TTAATAAG---AAAATTTAAAAAATAAATCTACTT-CATAGAAAATTAAAATAGTTATGACTATT
* **
31571 TAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTCTTGTTTGTCATAAAGCATATGTTTCTATTCA
127 TAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTCTTGTTTGTCATAAAAAATATGTTTCTATTCA
* * * **
31636 TACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAAA
192 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAATAATCAATATTCTAAAAATTAATAAG-CCAAAA
* * * * *
31701 TTTAATAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAATCATGACCATTTGAACTATTATCTAT
256 TTTAAAAAATAAATATATTTACTGAATAAGTTCAAATAATCAAGACCATTTGAACAATTATCTAG
*
31766 TTCCAATCGTTATGA-CATTTTGTTTACA
321 TTCAAATCGTTATGAGC-TTTTGTTTACA
* *
31794 AATTGTTTTTATTCATACAAA-ATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTCATATTTCAAAA
1 AATTGTTTTTATTCATA-AAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAA
* * * * * *
31858 CTTAATAAG-AGATTTAAAAACTAAATCTGCTT-ATTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTT
65 ATTAATAAGAAAATTTAAAAAATAAATCTACTTCATAGAA--AATTAAAATAGTTATGACTATTT
*
31921 AAA-AATTATTTATCTT-AAATCATTATGAT-TTTTGTATTGTCATAAAAAA-ATTGTTTCTATT
128 AAACAATTATTTAT-TTCAAATCATTATGATCTCTTGT-TTGTCATAAAAAATA-TGTTTCTATT
* * * * * *
31982 TATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAAATAAT-AATATTTTAAAAATTAATAA-CCAA
190 CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AAATAATCAATATTCTAAAAATTAATAAGCCAA
* * * * * *
32045 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GTCGAA-ACAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
254 -A-ATTTAAAAAATAAATATATTTACT-GAATA-AGTTCAAATAATCAAGACCATTTGAACAATT
32108 ATCTAGTTCAAATCGTTATGAGCTTTTGTTTA
315 ATCTAGTTCAAATCGTTATGAGCTTTTGTTTA
32140 GTCATAAAAT
Statistics
Matches: 294, Mismatches: 40, Indels: 29
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
346 2 0.01
347 13 0.04
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349 51 0.17
353 64 0.22
354 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (348 bp):
AATTGTTTTTATTCATAAAAGATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAA
TTAATAAGAAAATTTAAAAAATAAATCTACTTCATAGAAAATTAAAATAGTTATGACTATTTAAA
CAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTCTTGTTTGTCATAAAAAATATGTTTCTATTCATACA
AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAATAATCAATATTCTAAAAATTAATAAGCCAAAATTTAA
AAAATAAATATATTTACTGAATAAGTTCAAATAATCAAGACCATTTGAACAATTATCTAGTTCAA
ATCGTTATGAGCTTTTGTTTACA
Found at i:34869 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 34314--35076 Score: 615
Period size: 182 Copynumber: 4.2 Consensus size: 178
34304 ATGGCTATGC
* * * * *
34314 GAACAATTCTCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTAATTC
1 GAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GTTC
* * ** *
34379 ATATAAGTTTG-TTTATAATAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAG--AG
65 ATATAA-CTTGATTT-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * *
34440 A-TTTTAAAAAATAAATC-TATATAAAACT-AGTTCAATTAGTTATAACAATTT
126 AGATTTAAAAAATAAATCTTTTATCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * ** * *
34491 GAACAATTATTTATTTCAAA-CTGTTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAA-AATTTCTGTTG
1 GAACAATTATATATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * *
34554 ATATAATCCT-ATTTGGAATAAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAT
65 ATATAA-CTTGATTT-GAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* ** * ** * * *
34618 AGATTTAAAAAATGAAT-TTATTGGCATGACCAGTACAAATAGTTATAATTGTTT
126 AGATTTAAAAAATAAATCTT-TTATCA-AATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* *
34672 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTGTTCA
1 GAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * **
34737 TACAA-TTGATTATGAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
66 TATAACTTGATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* *
34801 TTTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
129 TTTAAAAAATAAATCT-TTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * * * * *
34852 AAACAGTTACT-TATTTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTATTATAAAA-TATTTTTTTTGTAT
1 GAACAATTA-TATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG--T
* * * * *
34915 TCATAAAACCTTG-TTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGACAACTAATAAGTAA
63 TCATATAA-CTTGATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAA
* * * * *
34979 -ATGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTT
125 GA-GATTTAAAAAATAAATCT-TTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
*
35034 GAACAATTATATAATTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCA
1 GAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
35077 AACAGTCATA
Statistics
Matches: 467, Mismatches: 91, Indels: 52
0.77 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 21 0.04
176 31 0.07
177 47 0.10
178 2 0.00
179 23 0.05
180 109 0.23
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182 120 0.26
183 3 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
GAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
TATAACTTGATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAAATAAATCTTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
Found at i:34915 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 34883--34922 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
34873 CACTATAACC
34883 TTTTATTTTATT-ATAAAATA
1 TTTTATTTTATTCATAAAATA
*
34903 TTTTTTTTGTATTCATAAAA
1 TTTTATTT-TATTCATAAAA
34923 CCTTGTTTCA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 2
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
20 7 0.41
21 4 0.24
22 6 0.35
ACGTcount: A:0.35, C:0.03, G:0.03, T:0.60
Consensus pattern (21 bp):
TTTTATTTTATTCATAAAATA
Found at i:35333 original size:179 final size:177
Alignment explanation
Indices: 35106--35872 Score: 612
Period size: 179 Copynumber: 4.3 Consensus size: 177
35096 GCTTCTCGAT
* * *
35106 AAATAAATTTATTTTTTAAAACATTTATTTATTAATTTTT-AGAATATTAGTAAATTAGTATTAT
1 AAATAGATTTATTTTTT--AA-ATTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* *
35170 TTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGCT
62 TTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-CT
* *
35235 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTA-AAGTATTTGAATGTGT-TCTGA
126 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGTGTAT-GGA
*
35286 AAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTAGTAATTTTTGAAATATTAATAAAATTA-TATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAA-TT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATT
* * * * * * *
35350 TTA-TTCGAAATAAGCTTGA-ATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAACGTCATAAT
63 TTATTTC-AAATAAG-TTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATACT
* * * *
35413 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAATTTGTATGGT
126 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGTGTATGGA
* * * *
35466 AAATAGATTCATTTTTTAAA-TTACTCATTAATTTTGGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * *
35530 TTTTAAATAAGTTTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
66 TTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-ACTATTT
* * * * * * *
35595 GAAATAAATAATTACTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACT-TATTTGGT
130 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TGTGTATGGA
** * * * * * *
35643 AAGCACATTTA--TTTAAAATTTTTTTCTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAA---TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * *
35706 TTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTATATGAAAAAACTAAAA-GTAATAAC
63 TT-ATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCAT-AC
* * * * * * * ** *
35769 GATTTAAAATAAATAATTGTTAAAATAATCATAAC-ATTT-AAACT-TATTCGA
125 TATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGTGTA-TGGA
* *
35820 TAAACAGATCTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTT-AAATATTAATA
1 -AAATAGATTTATTTTTTAAA---TTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATA
35873 GGCTCGAGCA
Statistics
Matches: 474, Mismatches: 87, Indels: 52
0.77 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.01
176 10 0.02
177 127 0.27
178 25 0.05
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180 99 0.21
181 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
AAATAGATTTATTTTTTAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
TTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATACTATTTG
AAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGTGTATGGA
Found at i:35569 original size:177 final size:179
Alignment explanation
Indices: 35136--35632 Score: 605
Period size: 177 Copynumber: 2.8 Consensus size: 179
35126 ACATTTATTT
* *
35136 ATTAATTTTTAGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
* * *
35201 CAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGCT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTA
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTA
* * * *
35265 -AAGTATTTGAATGTGTTCTGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTT
130 TAACTATTTGAATGTGTTCGGAAAATAGATTCATTTTTTAAA-TTCTACTC
* * * * *
35315 AGTAATTTTTGAAATATTAATAAAATTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGA-ATGAACAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAG-TTTATATGAATAG
* * * * *
35377 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAACGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATTAGT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
35442 TATAACTATTTGAATTTGTAT-GGTAAATAGATTCATTTTTTAAA-T-TACTC
128 TATAACTATTTGAATGTGT-TCGGAAAATAGATTCATTTTTTAAATTCTACTC
* * * *
35492 ATTAATTTTGGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTATATGAATTGATA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
* * * * *
35557 CAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTTGT
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
*
35622 GACTATTTGAA
131 AACTATTTGAA
35633 CTTATTTGGT
Statistics
Matches: 268, Mismatches: 41, Indels: 20
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
176 9 0.03
177 111 0.41
178 7 0.03
179 97 0.36
180 43 0.16
181 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.06, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
AACTATTTGAATGTGTTCGGAAAATAGATTCATTTTTTAAATTCTACTC
Found at i:35789 original size:356 final size:355
Alignment explanation
Indices: 35136--35789 Score: 863
Period size: 356 Copynumber: 1.8 Consensus size: 355
35126 ACATTTATTT
* *
35136 ATTAATTTTTAGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
* * * *
35201 CAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGCTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAA
66 CAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTTAA
* * * * * * *
35266 AGTATTTGAATGTGTTCTGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTAGTAATTTTTGAAATA
131 ACTATTTGAATGTATTCTGAAAACACATTTA-TTTTAAAATTTCTACTTAGTAATTGTCGAAATA
* *
35331 TTAATAAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTTTATGATA
195 TTAATAAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTATATGAAA
* * * *
35396 AAACAAAACGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAATTTGT
260 AAACAAAACGTAATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAATTTGT
35461 ATGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTACTC
325 ATGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTACTC
* * * *
35492 ATTAATTTTGGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTATATGAATTGATA
1 ATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
* * * *
35557 CAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTTGT
66 CAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTT-A
* * * * * *
35622 GACTATTTGAACT-TATT-TGGTAAGCACATTTA-TTTAAAATTTTTTTCTTATTAATTGTCGAA
130 AACTATTTGAA-TGTATTCT-GAAAACACATTTATTTTAAAA-TTTCTACTTAGTAATTGTCGAA
* *
35684 ATATTAAT-AAATTAATATTATTTTAATAT-G-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTAT
192 ATATTAATAAAATT-ATATTATTTT-AT-TCGAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTAT
35746 ATGAAAAAACTAAAA-GTAATAACGATTTAAAATAAATAATTGTT
254 ATGAAAAAAC-AAAACGTAATAACGATTTAAAATAAATAATTGTT
35790 AAAATAATCA
Statistics
Matches: 255, Mismatches: 35, Indels: 16
0.83 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
355 11 0.04
356 214 0.84
357 28 0.11
358 2 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
ATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA
CAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTTAA
ACTATTTGAATGTATTCTGAAAACACATTTATTTTAAAATTTCTACTTAGTAATTGTCGAAATAT
TAATAAAATTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTATATGAAAA
AACAAAACGTAATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAATTTGTA
TGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTACTC
Found at i:37178 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 37148--37213 Score: 64
Period size: 28 Copynumber: 2.4 Consensus size: 27
37138 TACACCTAAA
*
37148 AAGGCCCATTGAGTGT-GAGAAGAGGGT
1 AAGGCCCATTG-GTGTAGAAAAGAGGGT
37175 AAGGACCCCA-TGGTGTAGAAAAGAGGGT
1 AAGG--CCCATTGGTGTAGAAAAGAGGGT
*
37203 AATGGCACATT
1 AA-GGCCCATT
37214 AGGCATAGAG
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 2, Indels: 9
0.74 0.05 0.21
Matches are distributed among these distances:
27 11 0.34
28 15 0.47
29 6 0.19
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.35, T:0.18
Consensus pattern (27 bp):
AAGGCCCATTGGTGTAGAAAAGAGGGT
Found at i:39169 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 39135--39195 Score: 113
Period size: 30 Copynumber: 2.0 Consensus size: 30
39125 TGCCAATCCT
*
39135 GATCGAGGTATGTGCCTACACCAAGGGCCA
1 GATCGAGGTATGTACCTACACCAAGGGCCA
39165 GATCGAGGTATGTACCTACACCAAGGGCCA
1 GATCGAGGTATGTACCTACACCAAGGGCCA
39195 G
1 G
39196 CATGTGTCAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
30 30 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.26, G:0.30, T:0.16
Consensus pattern (30 bp):
GATCGAGGTATGTACCTACACCAAGGGCCA
Found at i:43518 original size:9 final size:9
Alignment explanation
Indices: 43504--43533 Score: 51
Period size: 9 Copynumber: 3.2 Consensus size: 9
43494 GATATTTTAT
43504 TAATTAAAA
1 TAATTAAAA
43513 TAATTAAAA
1 TAATTAAAA
43522 TATATTAAAA
1 TA-ATTAAAA
43532 TA
1 TA
43534 TAAAAGATCA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 1
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
9 11 0.55
10 9 0.45
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Consensus pattern (9 bp):
TAATTAAAA
Found at i:43530 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 43506--43535 Score: 53
Period size: 10 Copynumber: 3.1 Consensus size: 10
43496 TATTTTATTA
43506 ATTAAAATA-
1 ATTAAAATAT
43515 ATTAAAATAT
1 ATTAAAATAT
43525 ATTAAAATAT
1 ATTAAAATAT
43535 A
1 A
43536 AAAGATCAAT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 1
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
9 9 0.45
10 11 0.55
ACGTcount: A:0.63, C:0.00, G:0.00, T:0.37
Consensus pattern (10 bp):
ATTAAAATAT
Done.