Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15014211--15014249
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0
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0
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15045456--15045498
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26
20
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1.99
15056697--15056875
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2.9
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0
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26
20
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1.99
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2.5
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190
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105
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78
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2.3
57
82
6
149
10
7
8
73
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.9
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16
27
29
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3
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3
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1.18
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57
0
0
42
0.98
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124
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0
0
39
0.97
15077132--15077200
27
2.6
27
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4
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73
5
7
13
1.22
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2.9
20
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1
33
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82
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1.13
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0
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12
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2
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2.1
20
82
8
50
35
0
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1.53
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2.2
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0
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4
74
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61
64
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3
1.31
15107979--15108073
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1.9
50
95
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2.0
35
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0
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32
12
26
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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68
1.00
15125222--15125280
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2.0
28
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73
28
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19
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0
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0
0
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58
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29
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1.89
15151500--15151645
27
5.4
27
89
0
211
29
25
6
38
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15151500--15151670
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0
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28
24
8
38
1.84
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2.1
81
88
0
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28
24
8
38
1.85
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27
5.6
27
87
2
214
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21
8
29
1.83
15151702--15151965
27
9.7
27
81
5
189
39
19
9
31
1.84
15151702--15151878
81
2.2
81
83
6
216
41
20
8
29
1.82
15151722--15151965
110
2.2
109
81
4
269
38
18
9
32
1.84
15151996--15152072
27
2.9
28
81
11
90
33
18
23
24
1.96
15152869--15152938
25
2.8
24
91
4
104
24
27
24
24
2.00
15152868--15152951
25
3.4
24
83
8
98
27
23
23
25
2.00
15153086--15153177
42
2.2
42
98
0
175
31
15
20
32
1.94
15153201--15153284
31
2.7
31
85
1
107
28
16
26
28
1.97
15156028--15156137
51
2.2
50
83
9
134
38
4
30
26
1.76
15158863--15158926
29
2.1
32
82
8
80
35
1
9
53
1.43
15162442--15162499
25
2.2
25
84
9
71
53
1
1
43
1.21
15163552--15163576
6
4.2
6
100
0
50
32
0
32
36
1.58
15163774--15163833
31
2.0
30
83
9
77
33
15
3
48
1.61
15165100--15165159
28
2.1
30
87
6
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26
3
11
58
1.49
15177739--15177772
16
2.1
16
88
0
50
88
0
11
0
0.52
15177734--15177774
13
3.2
13
83
13
50
82
2
14
0
0.76
15182593--15182624
16
2.0
16
100
0
64
43
0
37
18
1.51
15182744--15182802
28
2.1
28
100
0
118
30
13
20
35
1.91
15193962--15193999
17
2.3
17
86
4
51
63
5
23
7
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15206844--15206869
13
2.0
13
100
0
52
23
0
0
76
0.78
15208095--15208126
8
4.0
8
91
0
55
50
21
25
3
1.64
15208712--15208755
20
2.2
20
88
4
63
29
15
27
27
1.96
15208759--15208877
60
2.0
59
85
9
161
27
21
25
26
1.99
15211262--15211308
23
2.0
23
95
0
85
27
8
19
44
1.79
15218660--15218715
20
2.7
21
88
5
87
60
0
3
35
1.14
15219298--15219342
2
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2
100
0
90
51
0
0
48
1.00
15219827--15219905
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2.1
38
100
0
158
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15
10
29
1.78
15221193--15221254
24
2.6
24
78
12
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51
1
3
43
1.27
15221274--15221316
22
2.0
22
81
9
52
39
11
0
48
1.40
15224255--15224298
19
2.3
19
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4
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50
6
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38
1.50
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3.6
37
80
12
157
32
23
12
31
1.91
15233280--15233312
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
15235409--15235492
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2.0
42
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0
150
21
5
15
57
1.60
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2
18.0
2
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50
0
0
50
1.00
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40
2.0
40
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5
113
37
32
14
16
1.89
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21
1.9
21
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0
53
37
0
17
45
1.49
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25
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25
72
12
170
17
26
21
34
1.95
15247472--15247675
48
4.2
47
76
11
162
17
26
22
33
1.96
15256379--15256407
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3.6
8
100
0
58
37
0
0
62
0.96
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5
100
0
92
41
0
0
58
0.98
15257750--15257806
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15258204--15258286
21
4.0
21
90
0
121
14
24
27
33
1.94
15258178--15258286
42
2.5
42
83
2
128
15
22
25
36
1.93
15269924--15269966
19
2.1
21
83
8
54
62
0
6
30
1.21
15270156--15270188
7
4.7
7
100
0
66
87
0
0
12
0.53
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51
2.2
51
85
0
152
25
20
12
41
1.88
15281947--15281981
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
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13
100
0
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4
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1
100
0
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0
0
0
0.00
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133
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9
20
35
1.85
15301793--15301853
25
2.5
23
80
12
68
14
29
22
32
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378