Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 244914714
ACGTcount: A:0.31, C:0.18, G:0.18, T:0.31
Warning! 4503000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 466 of 770
Found at i:143757264 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 143757240--143757283 Score: 54
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
143757230 GAATCTTTAG
*
143757240 TATTTATTGTATCATTT-TATT
1 TATTTAAT-TATCATTTCTATT
*
143757261 TATTTAATTATCCTTTCTATT
1 TATTTAATTATCATTTCTATT
143757282 TA
1 TA
143757284 ATTAGGTCGT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
20 7 0.35
21 13 0.65
ACGTcount: A:0.25, C:0.09, G:0.02, T:0.64
Consensus pattern (21 bp):
TATTTAATTATCATTTCTATT
Found at i:143759541 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 143759514--143759557 Score: 88
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
143759504 CTCTCGATTT
143759514 TTTTATTGCTCCTTTTCAATCA
1 TTTTATTGCTCCTTTTCAATCA
143759536 TTTTATTGCTCCTTTTCAATCA
1 TTTTATTGCTCCTTTTCAATCA
143759558 AAAGAGATAA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 22 1.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.23, G:0.05, T:0.55
Consensus pattern (22 bp):
TTTTATTGCTCCTTTTCAATCA
Found at i:143763712 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 143763676--143763737 Score: 115
Period size: 32 Copynumber: 1.9 Consensus size: 32
143763666 AGCTTTTGGT
143763676 TTTTTCATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATGGA
1 TTTTTCATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATGGA
*
143763708 TTTTTCGTGTTGTCAAAGAGTTGAACAATG
1 TTTTTCATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATG
143763738 AAAATAGATG
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
32 29 1.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.10, G:0.23, T:0.39
Consensus pattern (32 bp):
TTTTTCATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATGGA
Found at i:143776336 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 143776275--143776372 Score: 108
Period size: 28 Copynumber: 3.5 Consensus size: 28
143776265 TCACAAATTG
** * *
143776275 GCACTAAGTGTGCGGGTTCAAATTATACA
1 GCACTAAGTGTGCAAGTTC-GATTATATA
*
143776304 GCACTAAGTGTGCAAGTTTGATTATATA
1 GCACTAAGTGTGCAAGTTCGATTATATA
* *
143776332 GCACTAAGTGTGCGAGTTCGACTAT-TAA
1 GCACTAAGTGTGCAAGTTCGATTATAT-A
143776360 GCACTAAGTGTGC
1 GCACTAAGTGTGC
143776373 GGGCTTATTG
Statistics
Matches: 60, Mismatches: 8, Indels: 3
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 1 0.02
28 43 0.72
29 16 0.27
ACGTcount: A:0.30, C:0.16, G:0.24, T:0.30
Consensus pattern (28 bp):
GCACTAAGTGTGCAAGTTCGATTATATA
Found at i:143779443 original size:48 final size:47
Alignment explanation
Indices: 143779322--143779533 Score: 241
Period size: 46 Copynumber: 4.5 Consensus size: 47
143779312 TATGTGTGAT
* * * *
143779322 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCAC-A-TTATGAGAGAC
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCTCGAGATAT-AAAGCC
143779368 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCTCGAGATATACAAGCC
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCTCGAGATATA-AAGCC
* * * * * * *
143779416 AGTTTAAGACATGTTTGGGACATGCATCGGCATTGAGACA-AGAGCT
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCTCGAGATATAAAGCC
* * *
143779462 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCAGCCTCGACATATACAAGCT
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCTCGAGATATA-AAGCC
*
143779510 AGTGTAAGACCTGTCTGGGACATG
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATG
143779534 GCGTCAGCTT
Statistics
Matches: 141, Mismatches: 20, Indels: 8
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
46 69 0.49
47 4 0.03
48 68 0.48
ACGTcount: A:0.30, C:0.20, G:0.27, T:0.23
Consensus pattern (47 bp):
AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCTCGAGATATAAAGCC
Found at i:143779471 original size:94 final size:92
Alignment explanation
Indices: 143779322--143779533 Score: 293
Period size: 94 Copynumber: 2.3 Consensus size: 92
143779312 TATGTGTGAT
*
143779322 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCACATTATGAGAGACAGTGTAAGACATGTCTGGG
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGG-C-CATTATGAAAGACAGTGTAAGACATGTCTGGG
* *
143779387 ACATGCATCGGCCTCGAGATATACAAGCC
64 ACATGCATCAGCCTCGACATATACAAGCC
* *
143779416 AGTTTAAGACATGTTTGGGACATGCATCGG-CATTGA-GACAAGAGCTAGTGTAAGACATGTCTG
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCATT-ATGA-AAGA-C-AGTGTAAGACATGTCTG
*
143779479 GGACATGCATCAGCCTCGACATATACAAGCT
62 GGACATGCATCAGCCTCGACATATACAAGCC
*
143779510 AGTGTAAGACCTGTCTGGGACATG
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATG
143779534 GCGTCAGCTT
Statistics
Matches: 105, Mismatches: 9, Indels: 8
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
91 6 0.06
92 4 0.04
93 1 0.01
94 94 0.90
ACGTcount: A:0.30, C:0.20, G:0.27, T:0.23
Consensus pattern (92 bp):
AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGGCCATTATGAAAGACAGTGTAAGACATGTCTGGGAC
ATGCATCAGCCTCGACATATACAAGCC
Found at i:143781503 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 143781478--143781510 Score: 57
Period size: 17 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
143781468 AAAAAGAGTA
*
143781478 AGAGGGAAAAGAAAAAG
1 AGAGCGAAAAGAAAAAG
143781495 AGAGCGAAAAGAAAAA
1 AGAGCGAAAAGAAAAA
143781511 TTAAAAGAAC
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 15 1.00
ACGTcount: A:0.67, C:0.03, G:0.30, T:0.00
Consensus pattern (17 bp):
AGAGCGAAAAGAAAAAG
Found at i:143785716 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 143785691--143785734 Score: 79
Period size: 20 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20
143785681 ACATACAGGA
143785691 GTGTCCCTAAGCACACGAGC
1 GTGTCCCTAAGCACACGAGC
*
143785711 GTGTCCCTAAGCACACGGGC
1 GTGTCCCTAAGCACACGAGC
143785731 GTGT
1 GTGT
143785735 GCTTTGCCTC
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 23 1.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.30, T:0.18
Consensus pattern (20 bp):
GTGTCCCTAAGCACACGAGC
Found at i:143789890 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 143789865--143789910 Score: 92
Period size: 22 Copynumber: 2.1 Consensus size: 22
143789855 TTTTAATTTA
143789865 TGTAGCCTATTTTATTATGGTT
1 TGTAGCCTATTTTATTATGGTT
143789887 TGTAGCCTATTTTATTATGGTT
1 TGTAGCCTATTTTATTATGGTT
143789909 TG
1 TG
143789911 AACTATACAA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 24 1.00
ACGTcount: A:0.17, C:0.09, G:0.20, T:0.54
Consensus pattern (22 bp):
TGTAGCCTATTTTATTATGGTT
Found at i:143794141 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143793975--143794159 Score: 182
Period size: 40 Copynumber: 4.6 Consensus size: 40
143793965 TTCGAATGAT
* * *
143793975 ATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGC-TTTGTGCTAAGTGACTAA
1 ATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTCGTGC-GAGTTACTAA
* *
143794015 ATCCGGACTAAGAT-CC-AACGGCATACGTGCGAGTTACTAA
1 ATCCGGGCTAAG-TCCCGAA-GGCATTCGTGCGAGTTACTAA
* * * *
143794055 ATCCGGACTAAGAT-CCGAAGGCTTTCGAGCGAGCTACTAA
1 ATCCGGGCTAAG-TCCCGAAGGCATTCGTGCGAGTTACTAA
* *
143794095 ATCCGGGTTAAGTCCCGAAGGCATTCGTGCGAGTTACTGTA
1 ATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTCGTGCGAGTTACT-AA
*
143794136 A-CCGGGCTATGTCCCGAAGGCATT
1 ATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATT
143794160 TGAATGTGTA
Statistics
Matches: 122, Mismatches: 17, Indels: 12
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
39 3 0.02
40 109 0.89
41 10 0.08
ACGTcount: A:0.26, C:0.24, G:0.26, T:0.23
Consensus pattern (40 bp):
ATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTCGTGCGAGTTACTAA
Found at i:143796394 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 143796376--143796406 Score: 62
Period size: 15 Copynumber: 2.1 Consensus size: 15
143796366 TTAACCAATC
143796376 GCTAACTAACTAATT
1 GCTAACTAACTAATT
143796391 GCTAACTAACTAATT
1 GCTAACTAACTAATT
143796406 G
1 G
143796407 TTCTTCAGCA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 16 1.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.19, G:0.10, T:0.32
Consensus pattern (15 bp):
GCTAACTAACTAATT
Found at i:143798380 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 143798350--143798394 Score: 72
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
143798340 GAGAATCCAA
143798350 ATGCTAAAAGTCAAACGTCAT
1 ATGCTAAAAGTCAAACGTCAT
* *
143798371 ATGCTGAAAGTCAAATGTCAT
1 ATGCTAAAAGTCAAACGTCAT
143798392 ATG
1 ATG
143798395 GTTTGTGGCT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 22 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.16, G:0.18, T:0.27
Consensus pattern (21 bp):
ATGCTAAAAGTCAAACGTCAT
Found at i:143801777 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 143801731--143801780 Score: 64
Period size: 22 Copynumber: 2.3 Consensus size: 22
143801721 GCGCCGATCC
* * * *
143801731 TATAAGTTTTTGAAACTCTGTT
1 TATAATTTTTTGAAAATATGAT
143801753 TATAATTTTTTGAAAATATGAT
1 TATAATTTTTTGAAAATATGAT
143801775 TATAAT
1 TATAAT
143801781 ATACTGAGAC
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 4, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 24 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.04, G:0.10, T:0.50
Consensus pattern (22 bp):
TATAATTTTTTGAAAATATGAT
Found at i:143807423 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 143807369--143807521 Score: 243
Period size: 39 Copynumber: 3.9 Consensus size: 39
143807359 GAATGTTCGA
*
143807369 GTGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAATT
1 GTGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTT
*
143807408 GTGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGCT
1 GTGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTT
* *
143807447 ATGATATCTGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTT
1 GTGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTT
* *
143807486 GTGATATCCGGGTTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCG
1 GTGATATCCGGGCTAAG-CCCGAAGGCAATTGTGCG
143807522 GGTTACCATA
Statistics
Matches: 104, Mismatches: 9, Indels: 1
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
39 87 0.84
40 17 0.16
ACGTcount: A:0.24, C:0.20, G:0.32, T:0.24
Consensus pattern (39 bp):
GTGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTT
Found at i:143807537 original size:40 final size:39
Alignment explanation
Indices: 143807370--143807551 Score: 238
Period size: 39 Copynumber: 4.6 Consensus size: 39
143807360 AATGTTCGAG
* *
143807370 TGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAATTG
1 TGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTTA
*
143807409 TGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGCTA
1 TGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTTA
* *
143807448 TGATATCTGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTTG
1 TGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTTA
* * *
143807487 TGATATCCGGGTTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGGGTTA
1 TGATATCCGGGCTAAG-CCCGAAGGCAATTGTGCGAGTTA
** * *
143807527 CCATAACCGGGCTATGTCCCGAAGG
1 TGATATCCGGGCTAAG-CCCGAAGG
143807552 TGTTTTGAAC
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 16, Indels: 1
0.88 0.11 0.01
Matches are distributed among these distances:
39 86 0.68
40 40 0.32
ACGTcount: A:0.24, C:0.21, G:0.31, T:0.24
Consensus pattern (39 bp):
TGATATCCGGGCTAAGCCCGAAGGCAATTGTGCGAGTTA
Found at i:143815951 original size:27 final size:28
Alignment explanation
Indices: 143815921--143815990 Score: 106
Period size: 27 Copynumber: 2.5 Consensus size: 28
143815911 ATAATAAGTC
*
143815921 CGCACACTTAGTGCTATATAATC-AGCT
1 CGCACACTTAGTGCTATATAATCAAACT
* *
143815948 CGCACACATAGTGCTATATAATCAAATT
1 CGCACACTTAGTGCTATATAATCAAACT
143815976 CGCACACTTAGTGCT
1 CGCACACTTAGTGCT
143815991 GTACAAATTT
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 4, Indels: 1
0.88 0.09 0.02
Matches are distributed among these distances:
27 22 0.58
28 16 0.42
ACGTcount: A:0.31, C:0.26, G:0.14, T:0.29
Consensus pattern (28 bp):
CGCACACTTAGTGCTATATAATCAAACT
Found at i:143826860 original size:143 final size:141
Alignment explanation
Indices: 143826651--143826946 Score: 556
Period size: 143 Copynumber: 2.1 Consensus size: 141
143826641 GTGAGTTAAA
*
143826651 ATTCGGCCATGCATGTTGTTTTCCTTGGTGAGTGTTTTGATGTTGTTGTGATGAAAGCATGGAGA
1 ATTCGGCCATGCATGTTGTCTTCCTTGGTGAGTGTTTTGATGTTGTTGTGATGAAAGCATGGAGA
143826716 TGAGTGAGTTCGAATGTTTAACAAAAAGGAAATTTTGTGCCATTGAGTTCTTGTTGTTATGTGTG
66 TGAGTGAGTTCGAATGTTTAACAAAAAGGAAATTTTGTGCCATTGAGTTCTTGTTGTTA--TGTG
143826781 TGTGTGCATGAGT
129 TGTGTGCATGAGT
*
143826794 ATTCGGCCATGCATGTTGTCTTCTTTGGTGAGTGTTTTGATGTTGTTGTGATGAAAGCATGGAGA
1 ATTCGGCCATGCATGTTGTCTTCCTTGGTGAGTGTTTTGATGTTGTTGTGATGAAAGCATGGAGA
143826859 TGAGTGAGTTCGAATGTTTAACAAAAAGGAAATTTTGTGCCATTGAGTTCTTGTTGTTATGTGTG
66 TGAGTGAGTTCGAATGTTTAACAAAAAGGAAATTTTGTGCCATTGAGTTCTTGTTGTTATGTGTG
143826924 TGTGCATGAGT
131 TGTGCATGAGT
143826935 ATTCGGCCATGC
1 ATTCGGCCATGC
143826947 TATAGAATTT
Statistics
Matches: 151, Mismatches: 2, Indels: 2
0.97 0.01 0.01
Matches are distributed among these distances:
141 29 0.19
143 122 0.81
ACGTcount: A:0.22, C:0.10, G:0.29, T:0.39
Consensus pattern (141 bp):
ATTCGGCCATGCATGTTGTCTTCCTTGGTGAGTGTTTTGATGTTGTTGTGATGAAAGCATGGAGA
TGAGTGAGTTCGAATGTTTAACAAAAAGGAAATTTTGTGCCATTGAGTTCTTGTTGTTATGTGTG
TGTGCATGAGT
Found at i:143827623 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 143827590--143827721 Score: 165
Period size: 29 Copynumber: 4.6 Consensus size: 29
143827580 GTGACGAGAT
*
143827590 TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAATATA
1 TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAAAATA
*
143827619 TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAATATA
1 TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAAAATA
* *
143827648 AGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAAAATA
1 TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAAAATA
* * **
143827677 TGACACTATGTGTGCAAGCTGGAAAAATA
1 TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAAAATA
* **
143827706 CGGCACTGGGTGTGCG
1 TGGCACTAAGTGTGCG
143827722 AGCTCGGAGG
Statistics
Matches: 91, Mismatches: 12, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 91 1.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.15, G:0.31, T:0.24
Consensus pattern (29 bp):
TGGCACTAAGTGTGCGTGCTGGAAAAATA
Found at i:143829299 original size:45 final size:45
Alignment explanation
Indices: 143829212--143829325 Score: 137
Period size: 45 Copynumber: 2.6 Consensus size: 45
143829202 CCAGTATTTC
*
143829212 GCCTGTTAGGCTCG-AGGCCCG-ATATCAGTTCACCGGCATTATA
1 GCCTGCTAGGCTCGAAGGCCCGAATATCAGTTCACCGGCATTATA
143829255 GCCTGCTAGGCTCGAAGGCCCGAATAGT-A-TCTCACCGGCATTATA
1 GCCTGCTAGGCTCGAAGGCCCGAATA-TCAGT-TCACCGGCATTATA
** * *
143829300 GTTTGCTAAGCTCAAAGGCCCGAATA
1 GCCTGCTAGGCTCGAAGGCCCGAATA
143829326 ATCAAGTCAA
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 5, Indels: 6
0.85 0.07 0.08
Matches are distributed among these distances:
43 13 0.21
44 8 0.13
45 40 0.65
46 1 0.02
ACGTcount: A:0.25, C:0.27, G:0.25, T:0.24
Consensus pattern (45 bp):
GCCTGCTAGGCTCGAAGGCCCGAATATCAGTTCACCGGCATTATA
Found at i:143829772 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 143829642--143829851 Score: 237
Period size: 43 Copynumber: 4.9 Consensus size: 43
143829632 ACATATCATT
* * * *
143829642 TCACCGGCATTACGCCTGCAAGGCACGAAGGCTCGAATACACA
1 TCACCGGCAATAAGCCTGCTAGGCACGAAGGCCCGAATACACA
* * ** *
143829685 TCACCGACACA-AAGCCTACTAGG-AAAAAGGCCTGAATACACA
1 TCACCGGCA-ATAAGCCTGCTAGGCACGAAGGCCCGAATACACA
* *
143829727 TCACTGGCAAGAAGCCTGCTAGGCAC-AGAGGCCCGAATACACA
1 TCACCGGCAATAAGCCTGCTAGGCACGA-AGGCCCGAATACACA
* * * *
143829770 TCACCGGTACTAAGCCTGCTAGGCATGAAGACCCGAATACACA
1 TCACCGGCAATAAGCCTGCTAGGCACGAAGGCCCGAATACACA
*
143829813 TCACCGGCACTAAGCCTGCTAGGCACGAAGGCCCGAATA
1 TCACCGGCAATAAGCCTGCTAGGCACGAAGGCCCGAATA
143829852 TAATACCAGC
Statistics
Matches: 139, Mismatches: 23, Indels: 10
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
41 1 0.01
42 34 0.24
43 103 0.74
44 1 0.01
ACGTcount: A:0.33, C:0.31, G:0.22, T:0.13
Consensus pattern (43 bp):
TCACCGGCAATAAGCCTGCTAGGCACGAAGGCCCGAATACACA
Found at i:143832526 original size:15 final size:14
Alignment explanation
Indices: 143832490--143832551 Score: 61
Period size: 15 Copynumber: 4.2 Consensus size: 14
143832480 GATATAGATA
* *
143832490 ATAAGAAAACCAGG
1 ATAAGAAATCCAAG
*
143832504 ATTAAGAAGTCCAAG
1 A-TAAGAAATCCAAG
*
143832519 ATAGAGAAATCCGAG
1 ATA-AGAAATCCAAG
143832534 ATAAGGAAATCCAAG
1 ATAA-GAAATCCAAG
143832549 ATA
1 ATA
143832552 CAGTATCATA
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 6, Indels: 5
0.78 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
14 4 0.10
15 35 0.90
ACGTcount: A:0.52, C:0.13, G:0.21, T:0.15
Consensus pattern (14 bp):
ATAAGAAATCCAAG
Found at i:143834299 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 143834244--143834374 Score: 171
Period size: 30 Copynumber: 4.5 Consensus size: 30
143834234 ATAGTGAATC
*
143834244 CGCACACTTAGTGCTATAT-ATTTTCAGCT
1 CGCACACTTAGTGCTATATAATTTTCAACT
*
143834273 CGCACACTTAGTGCTATATAATTTTCAGCT
1 CGCACACTTAGTGCTATATAATTTTCAACT
143834303 CGCACACTTAGTGCTATATAA---TCAAACT
1 CGCACACTTAGTGCTATATAATTTTC-AACT
* * * *
143834331 CGCACACTTAGTGCTGTACAATTTTAAACC
1 CGCACACTTAGTGCTATATAATTTTCAACT
143834361 CGCACACTTAGTGC
1 CGCACACTTAGTGC
143834375 CAATCTTGTC
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 5, Indels: 9
0.87 0.05 0.08
Matches are distributed among these distances:
27 2 0.02
28 22 0.24
29 19 0.21
30 48 0.52
31 1 0.01
ACGTcount: A:0.28, C:0.26, G:0.14, T:0.32
Consensus pattern (30 bp):
CGCACACTTAGTGCTATATAATTTTCAACT
Found at i:143834354 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 143834243--143834374 Score: 176
Period size: 58 Copynumber: 2.3 Consensus size: 58
143834233 TATAGTGAAT
* * * * *
143834243 CCGCACACTTAGTGCTATATATTTTCAGCTCGCACACTTAGTGCTATATAATTTTCAGC
1 CCGCACACTTAGTGCTATATA-TATCAACTCGCACACTTAGTGCTATACAATTTTAAAC
* *
143834302 TCGCACACTTAGTGCTATATA-ATCAAACTCGCACACTTAGTGCTGTACAATTTTAAAC
1 CCGCACACTTAGTGCTATATATATC-AACTCGCACACTTAGTGCTATACAATTTTAAAC
143834360 CCGCACACTTAGTGC
1 CCGCACACTTAGTGC
143834375 CAATCTTGTC
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 8, Indels: 3
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
57 2 0.03
58 42 0.66
59 20 0.31
ACGTcount: A:0.28, C:0.27, G:0.14, T:0.32
Consensus pattern (58 bp):
CCGCACACTTAGTGCTATATATATCAACTCGCACACTTAGTGCTATACAATTTTAAAC
Found at i:143838942 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 143838923--143838954 Score: 55
Period size: 16 Copynumber: 2.0 Consensus size: 16
143838913 AATTGTTTTA
143838923 TTACAAAATTTCACTT
1 TTACAAAATTTCACTT
*
143838939 TTACATAATTTCACTT
1 TTACAAAATTTCACTT
143838955 ACTCCATTCT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
16 15 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.19, G:0.00, T:0.47
Consensus pattern (16 bp):
TTACAAAATTTCACTT
Found at i:143839308 original size:50 final size:50
Alignment explanation
Indices: 143839246--143839478 Score: 288
Period size: 50 Copynumber: 4.6 Consensus size: 50
143839236 CGGGTACGTA
*
143839246 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACATGTGACCTATCAATCTGGTACACG
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGACCTATCAATCTGGTACACG
* * * * * *
143839296 TAGTAGCTTGCACTTAGTACTACACACATGACTTAACCATCTGATACACG
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGACCTATCAATCTGGTACACG
* * ** * * * *
143839346 TAGTAGCCTGTACTTAGTACTACACACATGATCGAAGTTAA-CGGGTACGCA
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGA-CCTA-TCAATCTGGTACACG
* *
143839397 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACATGCGACCTATCAATCTGGTACACG
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGACCTATCAATCTGGTACACG
143839447 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGAC
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGAC
143839479 TCACAATGGA
Statistics
Matches: 150, Mismatches: 30, Indels: 6
0.81 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
49 3 0.02
50 111 0.74
51 35 0.23
52 1 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.26, G:0.18, T:0.27
Consensus pattern (50 bp):
TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACGTGACCTATCAATCTGGTACACG
Found at i:143839393 original size:101 final size:101
Alignment explanation
Indices: 143839246--143839473 Score: 280
Period size: 101 Copynumber: 2.3 Consensus size: 101
143839236 CGGGTACGTA
** ** * * * *
143839246 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACATGTGA-CCTA-TCAATCTGGTACACGTAGTAGCTTGCAC
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACATGATCGAAGTTAA-CGGGTACACATAGTAGCCTGCAC
* * *
143839309 TTAGTACTACACACATGACTTAACCATCTGATACACG
65 TTAGTACTACACACACGACCTAACAATCTGATACACG
* *
143839346 TAGTAGCCTGTACTTAGTACTACACACATGATCGAAGTTAACGGGTACGCATAGTAGCCTGCACT
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACATGATCGAAGTTAACGGGTACACATAGTAGCCTGCACT
** * *
143839411 TAGTACTACACATGCGACCTATCAATCTGGTACACG
66 TAGTACTACACACACGACCTAACAATCTGATACACG
143839447 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACAC
1 TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACAC
143839474 GTGACTCACA
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 18, Indels: 3
0.84 0.14 0.02
Matches are distributed among these distances:
100 28 0.26
101 77 0.71
102 3 0.03
ACGTcount: A:0.30, C:0.26, G:0.18, T:0.27
Consensus pattern (101 bp):
TAGTAGCCTGCACTTAGTACTACACACATGATCGAAGTTAACGGGTACACATAGTAGCCTGCACT
TAGTACTACACACACGACCTAACAATCTGATACACG
Found at i:143839856 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 143839826--143839872 Score: 60
Period size: 19 Copynumber: 2.4 Consensus size: 20
143839816 GAGAACGTGT
143839826 TATATCATCAAAATAATCACA
1 TATAT-ATCAAAATAATCACA
* *
143839847 TA-ATATCAAATTATTCACA
1 TATATATCAAAATAATCACA
143839866 TATATAT
1 TATATAT
143839873 ACTTACAACT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 3
0.82 0.07 0.11
Matches are distributed among these distances:
19 15 0.65
20 6 0.26
21 2 0.09
ACGTcount: A:0.49, C:0.15, G:0.00, T:0.36
Consensus pattern (20 bp):
TATATATCAAAATAATCACA
Found at i:143844522 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 143844497--143844570 Score: 60
Period size: 22 Copynumber: 3.2 Consensus size: 22
143844487 TGATAAGGCC
143844497 GAATGGCCAATGTGACGAATGT
1 GAATGGCCAATGTGACGAATGT
** * * *
143844519 GAATGTGTATATATGTGA-TAAGGCC
1 GAATG-G-CCA-ATGTGACGAATG-T
143844544 GAATGGCCAATGTGACGAATGT
1 GAATGGCCAATGTGACGAATGT
143844566 GAATG
1 GAATG
143844571 TGTATATATG
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 10, Indels: 10
0.65 0.18 0.18
Matches are distributed among these distances:
22 16 0.43
23 5 0.14
24 5 0.14
25 11 0.30
ACGTcount: A:0.32, C:0.11, G:0.31, T:0.26
Consensus pattern (22 bp):
GAATGGCCAATGTGACGAATGT
Found at i:143844666 original size:45 final size:47
Alignment explanation
Indices: 143844435--143844725 Score: 509
Period size: 47 Copynumber: 6.3 Consensus size: 47
143844425 ATAAGATGTG
143844435 TATATGTGATAAGGCCGAATGG-CAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
*
143844481 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGACGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
*
143844528 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGACGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
143844575 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
143844622 TATATGTGATAAGGCC-AATGGCCAATGTGATGAATGTG-ATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
* *
143844667 TATATGTGATAAGGCC-AATGGCCAATGTGATGGATGTGAAAGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
*
143844713 TAAATGTGATAAG
1 TATATGTGATAAG
143844726 TCCCGAAGGG
Statistics
Matches: 238, Mismatches: 5, Indels: 4
0.96 0.02 0.02
Matches are distributed among these distances:
45 44 0.18
46 62 0.26
47 132 0.55
ACGTcount: A:0.33, C:0.09, G:0.30, T:0.29
Consensus pattern (47 bp):
TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
Found at i:143847211 original size:38 final size:38
Alignment explanation
Indices: 143847147--143847221 Score: 107
Period size: 38 Copynumber: 2.0 Consensus size: 38
143847137 AATCCGAGTT
*
143847147 TAAAGACCCGCTGACTATATGAAGAGATTATGTCCGGG
1 TAAAGACCCGATGACTATATGAAGAGATTATGTCCGGG
* *
143847185 TAAAGACCCGATGGCTATGT-ACAGAGATTATGTCCGG
1 TAAAGACCCGATGACTATATGA-AGAGATTATGTCCGG
143847222 ATTAAAATTC
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 3, Indels: 2
0.87 0.08 0.05
Matches are distributed among these distances:
37 1 0.03
38 32 0.97
ACGTcount: A:0.31, C:0.19, G:0.27, T:0.24
Consensus pattern (38 bp):
TAAAGACCCGATGACTATATGAAGAGATTATGTCCGGG
Found at i:143847336 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143847275--143847619 Score: 500
Period size: 40 Copynumber: 8.7 Consensus size: 40
143847265 AGGTCTCGAC
* *
143847275 GATG-ATCCGGGTTAAGTCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
143847314 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
* ** *
143847354 GATGTATCCGGGCTATGTTCTGAAGAGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
143847394 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
* *
143847434 GATGTATCCGGGCTAAG--CTGAAGGGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
**
143847472 GATGTATCCGGGCTAAG-TTCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
* *
143847511 GATATATCCGGGCTAAGCCCCGAAGGGCATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
** *
143847551 GATGTATCCGGGCTAAGTTCCGAAGAGTATTCGTGCTAGT
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
* * *
143847591 GATATATCCGTGCTAAACCCCGAAGAGCA
1 GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCA
143847620 ATCATGCTGG
Statistics
Matches: 273, Mismatches: 30, Indels: 5
0.89 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
38 36 0.13
39 38 0.14
40 199 0.73
ACGTcount: A:0.23, C:0.21, G:0.30, T:0.26
Consensus pattern (40 bp):
GATGTATCCGGGCTAAGCCCCGAAGAGCATTCGTGCTAGT
Found at i:143847836 original size:25 final size:25
Alignment explanation
Indices: 143847795--143847846 Score: 70
Period size: 25 Copynumber: 2.1 Consensus size: 25
143847785 TGTGTAATAA
143847795 TGAATGAATAAGAGCACTATGTGTG
1 TGAATGAATAAGAGCACTATGTGTG
* *
143847820 TGAATG-ATTAGAGGCACTGTGTGTG
1 TGAATGAATAAGA-GCACTATGTGTG
143847845 TG
1 TG
143847847 CGAATTCCTT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 2
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
24 5 0.21
25 19 0.79
ACGTcount: A:0.29, C:0.08, G:0.33, T:0.31
Consensus pattern (25 bp):
TGAATGAATAAGAGCACTATGTGTG
Found at i:143850187 original size:47 final size:47
Alignment explanation
Indices: 143850131--143850421 Score: 491
Period size: 47 Copynumber: 6.3 Consensus size: 47
143850121 ATAAGATGTG
* *
143850131 TATATGTGATAAGGCCTAATGGACAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
*
143850178 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGACGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
*
143850225 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGACGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
143850272 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
143850319 TATATGTGATAAGGCC-AATGGCCAATGTGATG-ATGTG-ATGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
* *
143850363 TATATGTGATAAGGCC-AATGGCCAATGTGATGGATGTGAAAGTGTA
1 TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
*
143850409 TAAATGTGATAAG
1 TATATGTGATAAG
143850422 TCCCGAAGGG
Statistics
Matches: 236, Mismatches: 6, Indels: 5
0.96 0.02 0.02
Matches are distributed among these distances:
44 39 0.17
45 10 0.04
46 34 0.14
47 153 0.65
ACGTcount: A:0.33, C:0.09, G:0.29, T:0.30
Consensus pattern (47 bp):
TATATGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAATGTGTA
Found at i:143850346 original size:37 final size:38
Alignment explanation
Indices: 143850305--143850392 Score: 115
Period size: 44 Copynumber: 2.2 Consensus size: 38
143850295 CAATGTGATG
143850305 AATGTGA-ATGTGTATATATGTGATAAGGCCAATGGCC
1 AATGTGAGATGTGTATATATGTGATAAGGCCAATGGCC
143850342 AATGTGATGATGTGATGTGTATATATGTGATAAGGCCAATGGCC
1 AA--TG-TGA---GATGTGTATATATGTGATAAGGCCAATGGCC
143850386 AATGTGA
1 AATGTGA
143850393 TGGATGTGAA
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 0, Indels: 10
0.81 0.00 0.19
Matches are distributed among these distances:
37 2 0.05
39 2 0.05
40 3 0.07
41 3 0.07
42 2 0.05
44 32 0.73
ACGTcount: A:0.32, C:0.09, G:0.28, T:0.31
Consensus pattern (38 bp):
AATGTGAGATGTGTATATATGTGATAAGGCCAATGGCC
Found at i:143856908 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 143856874--143856931 Score: 80
Period size: 30 Copynumber: 1.9 Consensus size: 30
143856864 CCGAACCTAG
143856874 GGGCAAAAGTGTAAATATGCAAAAGTTTAA
1 GGGCAAAAGTGTAAATATGCAAAAGTTTAA
* * * *
143856904 GGGCAAAATTGTAATTTTGCCAAAGTTT
1 GGGCAAAAGTGTAAATATGCAAAAGTTT
143856932 GAGTTAAGGG
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 4, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
30 24 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.22, T:0.29
Consensus pattern (30 bp):
GGGCAAAAGTGTAAATATGCAAAAGTTTAA
Found at i:143857299 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 143857260--143857302 Score: 52
Period size: 19 Copynumber: 2.3 Consensus size: 18
143857250 CTTTATTATG
*
143857260 TTTTTGTATTTTAGCATA
1 TTTTTGTATTGTAGCATA
143857278 TTTTATGTATTGTAGC-TGA
1 TTTT-TGTATTGTAGCAT-A
143857297 TTTTTG
1 TTTTTG
143857303 AATCATAATT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 4
0.81 0.04 0.15
Matches are distributed among these distances:
18 7 0.32
19 15 0.68
ACGTcount: A:0.19, C:0.05, G:0.16, T:0.60
Consensus pattern (18 bp):
TTTTTGTATTGTAGCATA
Found at i:143861251 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 143861191--143861251 Score: 104
Period size: 20 Copynumber: 3.0 Consensus size: 20
143861181 ATAAATGTGG
*
143861191 TATGTATGAGATGCACATGA
1 TATGTATGATATGCACATGA
*
143861211 CATGTATGATATGCACATGA
1 TATGTATGATATGCACATGA
143861231 TATGTATGATATGCACATGA
1 TATGTATGATATGCACATGA
143861251 T
1 T
143861252 GTAATCATAA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 3, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 38 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.11, G:0.21, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
TATGTATGATATGCACATGA
Found at i:143861328 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 143861301--143861443 Score: 209
Period size: 24 Copynumber: 6.0 Consensus size: 24
143861291 GAGGAAGTGA
143861301 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
143861325 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
143861349 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTAT-
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
*
143861372 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATT
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
* * *
143861396 GAAAGGGCTTTTGCCCCAGTTATT
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
*
143861420 AAAAGAGGC-TAGGCCTCCAGTTAT
1 AAAAG-GGCTTATGCC-CCAGTTAT
143861444 ATGATAAAGC
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 5, Indels: 5
0.92 0.04 0.04
Matches are distributed among these distances:
23 23 0.21
24 77 0.69
25 11 0.10
ACGTcount: A:0.29, C:0.22, G:0.22, T:0.27
Consensus pattern (24 bp):
AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
Found at i:143861394 original size:47 final size:47
Alignment explanation
Indices: 143861301--143861443 Score: 207
Period size: 47 Copynumber: 3.0 Consensus size: 47
143861291 GAGGAAGTGA
143861301 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTAT-AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
*
143861349 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATT
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
* * *
143861396 GAAAGGGCTTTTGCCCCAGTTATTAAAAGAGGC-TAGGCCTCCAGTTAT
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTA-TAAAAG-GGCTTATGCC-CCAGTTAT
143861444 ATGATAAAGC
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 4, Indels: 5
0.91 0.04 0.05
Matches are distributed among these distances:
47 43 0.49
48 34 0.39
49 11 0.12
ACGTcount: A:0.29, C:0.22, G:0.22, T:0.27
Consensus pattern (47 bp):
AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATC
Found at i:143861417 original size:71 final size:72
Alignment explanation
Indices: 143861301--143861444 Score: 220
Period size: 71 Copynumber: 2.0 Consensus size: 72
143861291 GAGGAAGTGA
*
143861301 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAG-GGCTTATGCC-
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGAGGC-TAGGCCT
143861364 CCAGTTAT
65 CCAGTTAT
** * *
143861372 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATTGAAAGGGCTTTTGCCCCAGTTATTAAAAGAGGCTAGGCCTC
1 AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGAGGCTAGGCCTC
143861437 CAGTTAT
66 CAGTTAT
143861444 A
1 A
143861445 TGATAAAGCA
Statistics
Matches: 66, Mismatches: 5, Indels: 3
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
71 54 0.82
72 12 0.18
ACGTcount: A:0.29, C:0.22, G:0.22, T:0.26
Consensus pattern (72 bp):
AAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGGGCTTATGCCCCAGTTATCAAAAGAGGCTAGGCCTC
CAGTTAT
Found at i:143861672 original size:31 final size:31
Alignment explanation
Indices: 143861634--143861697 Score: 101
Period size: 31 Copynumber: 2.1 Consensus size: 31
143861624 CCGTTACAGT
143861634 AAAGGCTTCGGCCCAGTAATATGAAATATGA
1 AAAGGCTTCGGCCCAGTAATATGAAATATGA
** *
143861665 AAAGGCTTCGGCCCAGTGTTATGGAATATGA
1 AAAGGCTTCGGCCCAGTAATATGAAATATGA
143861696 AA
1 AA
143861698 CATGAAAAGG
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 3, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
31 30 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.25, T:0.23
Consensus pattern (31 bp):
AAAGGCTTCGGCCCAGTAATATGAAATATGA
Found at i:143866290 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 143866258--143866330 Score: 101
Period size: 29 Copynumber: 2.5 Consensus size: 29
143866248 CTTCGAGCTC
*
143866258 GCACACCCAGTGCCGTATATTTCCAGCAT
1 GCACACCCAGTGCCATATATTTCCAGCAT
**
143866287 GCACACTTAGTGCCATATATTTCCAGCAT
1 GCACACCCAGTGCCATATATTTCCAGCAT
**
143866316 GCACACTTAGTGCCA
1 GCACACCCAGTGCCA
143866331 ATCTCGTCAC
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 3, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 41 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.32, G:0.16, T:0.26
Consensus pattern (29 bp):
GCACACCCAGTGCCATATATTTCCAGCAT
Found at i:143874254 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 143874222--143874294 Score: 101
Period size: 29 Copynumber: 2.5 Consensus size: 29
143874212 CTTCGAGCTC
*
143874222 GCACACCCAGTGCCGTATATTTCCAGCAT
1 GCACACCCAGTGCCATATATTTCCAGCAT
**
143874251 GCACACTTAGTGCCATATATTTCCAGCAT
1 GCACACCCAGTGCCATATATTTCCAGCAT
**
143874280 GCACACTTAGTGCCA
1 GCACACCCAGTGCCA
143874295 ATCTCGTCAC
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 3, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 41 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.32, G:0.16, T:0.26
Consensus pattern (29 bp):
GCACACCCAGTGCCATATATTTCCAGCAT
Found at i:143879583 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 143879550--143879680 Score: 122
Period size: 29 Copynumber: 4.5 Consensus size: 29
143879540 GTGACGAGAT
143879550 TGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAATATA
1 TGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAATATA
143879579 TGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAATATA
1 TGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAATATA
* ** * ***
143879608 CGGCACTGGGTGTGCGA-GCTCGAAGGGTA
1 TGGCACTAAGTGTGC-ATGCTGGAAATATA
* ** * *
143879637 TGGCACTATGTGTGCGGGCT-TAAATCACA
1 TGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAAT-ATA
143879666 TGGCACTAAGTGTGC
1 TGGCACTAAGTGTGC
143879681 GAAATCGAGT
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 17, Indels: 6
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
28 2 0.02
29 79 0.96
30 1 0.01
ACGTcount: A:0.25, C:0.18, G:0.32, T:0.25
Consensus pattern (29 bp):
TGGCACTAAGTGTGCATGCTGGAAATATA
Found at i:143886488 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 143886463--143886500 Score: 58
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
143886453 GTTTATTCGC
*
143886463 GATTTTCAATATTTTGTAAA
1 GATTTTCAAAATTTTGTAAA
*
143886483 GATTTTTAAAATTTTGTA
1 GATTTTCAAAATTTTGTA
143886501 TTTGGATGTG
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 16 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.03, G:0.11, T:0.53
Consensus pattern (20 bp):
GATTTTCAAAATTTTGTAAA
Found at i:143888160 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 143888128--143888196 Score: 122
Period size: 28 Copynumber: 2.5 Consensus size: 28
143888118 GCGTAGATCA
143888128 CGAAATTACCCCTAAAGAGCAAAATTAC
1 CGAAATTACCCCTAAAGAGCAAAATTAC
143888156 CGAAATTACCCCTAAAGAGCAAAATTAC
1 CGAAATTACCCCTAAAGAGCAAAATTAC
*
143888184 CGATA-TACCCCTA
1 CGAAATTACCCCTA
143888197 GGGTTTTAAA
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 1, Indels: 1
0.95 0.02 0.02
Matches are distributed among these distances:
27 8 0.20
28 32 0.80
ACGTcount: A:0.43, C:0.28, G:0.10, T:0.19
Consensus pattern (28 bp):
CGAAATTACCCCTAAAGAGCAAAATTAC
Found at i:143889641 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 143889570--143889647 Score: 66
Period size: 26 Copynumber: 2.9 Consensus size: 26
143889560 TAAAACTGAT
* * * *
143889570 AAAATTACTGAAATACCTTTATAGGTGG
1 AAAATTACTGATATACC-CT-TAGGAGC
* *
143889598 AAAATTTACAGATTTACCCTTAGGAGC
1 AAAA-TTACTGATATACCCTTAGGAGC
*
143889625 AAAATTACTGATATACCCCTAGG
1 AAAATTACTGATATACCCTTAGG
143889648 GTTAAGGTTG
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 9, Indels: 4
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
26 16 0.40
27 9 0.22
28 5 0.12
29 10 0.25
ACGTcount: A:0.38, C:0.17, G:0.15, T:0.29
Consensus pattern (26 bp):
AAAATTACTGATATACCCTTAGGAGC
Found at i:143890909 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 143890877--143890909 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
143890867 CATCAATAAG
143890877 GGTTTTCGATGAAAACAT
1 GGTTTTCGA-GAAAACAT
143890895 GGTTTTCGA-AAAACA
1 GGTTTTCGAGAAAACA
143890910 CTTCAATGTG
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.21, T:0.30
Consensus pattern (17 bp):
GGTTTTCGAGAAAACAT
Found at i:143891689 original size:51 final size:51
Alignment explanation
Indices: 143891613--143891710 Score: 187
Period size: 51 Copynumber: 1.9 Consensus size: 51
143891603 CACCTATTGC
*
143891613 TTAGTCCTTAATGTTTTACAATGTTTTCCAGTTAGCAGAATTTCCTTACAT
1 TTAGTCCTTAATGTTTTACAATGTTTTCCAATTAGCAGAATTTCCTTACAT
143891664 TTAGTCCTTAATGTTTTACAATGTTTTCCAATTAGCAGAATTTCCTT
1 TTAGTCCTTAATGTTTTACAATGTTTTCCAATTAGCAGAATTTCCTT
143891711 GCATCATTAC
Statistics
Matches: 46, Mismatches: 1, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
51 46 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.17, G:0.11, T:0.46
Consensus pattern (51 bp):
TTAGTCCTTAATGTTTTACAATGTTTTCCAATTAGCAGAATTTCCTTACAT
Found at i:143892003 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 143891993--143892019 Score: 54
Period size: 5 Copynumber: 5.4 Consensus size: 5
143891983 GTCTGATGTA
143891993 TTATT TTATT TTATT TTATT TTATT TT
1 TTATT TTATT TTATT TTATT TTATT TT
143892020 TTAGTACCTT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 22 1.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.00, G:0.00, T:0.81
Consensus pattern (5 bp):
TTATT
Found at i:143893316 original size:23 final size:21
Alignment explanation
Indices: 143893274--143893316 Score: 50
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
143893264 ATCGAGAACT
* *
143893274 TTAGAAATTTTTTTACAACAC
1 TTAGAAATTTTTCTAAAACAC
143893295 TTAGAAAATTTTTGCTAAAACA
1 TTAG-AAATTTTT-CTAAAACA
143893317 GTGGTAACAC
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 2
0.82 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
21 4 0.22
22 8 0.44
23 6 0.33
ACGTcount: A:0.42, C:0.12, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (21 bp):
TTAGAAATTTTTCTAAAACAC
Found at i:143893362 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 143893319--143893362 Score: 54
Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 18
143893309 CTAAAACAGT
143893319 GGTA-ACACACCCGTGTG
1 GGTAGACACACCCGTGTG
*
143893336 GCTTGAGACACACCCGTGTG
1 G-GT-AGACACACCCGTGTG
143893356 GGTAGAC
1 GGTAGAC
143893363 CGTGTGGTCA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 5
0.76 0.07 0.17
Matches are distributed among these distances:
17 1 0.05
18 5 0.23
19 2 0.09
20 14 0.64
ACGTcount: A:0.23, C:0.27, G:0.32, T:0.18
Consensus pattern (18 bp):
GGTAGACACACCCGTGTG
Found at i:143895227 original size:42 final size:42
Alignment explanation
Indices: 143895064--143895227 Score: 159
Period size: 42 Copynumber: 3.9 Consensus size: 42
143895054 TACTGTACCA
* ** *
143895064 ATGCCATGTCCCAGATATGGTCTTACATATAATCTCGTATCG
1 ATGCCATATCCCAGATATGGTCTTACACGTAATCTCATATCG
* * * * * *
143895106 ATGCCAGTAGCCCAGCTATAGCCTTACCCGAAATCTCATATCG
1 ATGCCA-TATCCCAGATATGGTCTTACACGTAATCTCATATCG
* * * * *
143895149 ATGTCATATCCAAGATATGGTCTTATACG-AAGTCTCACATTG
1 ATGCCATATCCCAGATATGGTCTTACACGTAA-TCTCATATCG
*
143895191 ATGCCATATCCCAGATATGGTCTTACATGTAATCTCA
1 ATGCCATATCCCAGATATGGTCTTACACGTAATCTCA
143895228 GTAACCCTAA
Statistics
Matches: 95, Mismatches: 24, Indels: 6
0.76 0.19 0.05
Matches are distributed among these distances:
41 2 0.02
42 60 0.63
43 33 0.35
ACGTcount: A:0.29, C:0.25, G:0.16, T:0.30
Consensus pattern (42 bp):
ATGCCATATCCCAGATATGGTCTTACACGTAATCTCATATCG
Found at i:143898320 original size:93 final size:93
Alignment explanation
Indices: 143898208--143898378 Score: 315
Period size: 93 Copynumber: 1.8 Consensus size: 93
143898198 GCCCATAAGT
* *
143898208 GAACTCGGACTCAACTCAACGAGCTCGGGCGTTCGCATCCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAA
1 GAACTCGGACTCAACTCAACGAGCTCGGACGCTCGCATCCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAA
143898273 CGAGTTCGGATGCCTAGTTACATCTCAC
66 CGAGTTCGGATGCCTAGTTACATCTCAC
*
143898301 GAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACGCTCGCATCCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAA
1 GAACTCGGACTCAACTCAACGAGCTCGGACGCTCGCATCCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAA
143898366 CGAGTTCGGATGC
66 CGAGTTCGGATGC
143898379 TCAACCATCC
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 3, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
93 75 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.30, G:0.22, T:0.20
Consensus pattern (93 bp):
GAACTCGGACTCAACTCAACGAGCTCGGACGCTCGCATCCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAA
CGAGTTCGGATGCCTAGTTACATCTCAC
Found at i:143898394 original size:46 final size:46
Alignment explanation
Indices: 143898200--143898380 Score: 233
Period size: 46 Copynumber: 3.9 Consensus size: 46
143898190 TGTAACCCGC
* * *
143898200 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGCTCGGGCGTTCGCAT
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACGCTCGCAT
* *
143898246 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGATGCCTAGTTACAT
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACG-CTCG---CAT
* *
143898296 -C-TCA-CGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACGCTCGCAT
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACGCTCGCAT
*
143898339 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGATGCTC
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACGCTC
143898381 AACCATCCTA
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 12, Indels: 14
0.82 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
43 3 0.03
44 1 0.01
45 2 0.02
46 72 0.62
47 32 0.28
48 2 0.02
49 1 0.01
50 3 0.03
ACGTcount: A:0.28, C:0.30, G:0.22, T:0.21
Consensus pattern (46 bp):
CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACGCTCGCAT
Found at i:143901797 original size:46 final size:45
Alignment explanation
Indices: 143901708--143901815 Score: 130
Period size: 46 Copynumber: 2.4 Consensus size: 45
143901698 TATGTGTGCT
* * *
143901708 AGTGTAAGACATGTCTGGTACATGCATCAGCCACATTATGAGAGCC
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCAG-CACATTACGAGAGAC
*
143901754 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATC-G-ACATTGAAACGAGAGAT
1 AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCAGCACATT---ACGAGAGAC
143901800 AGTGTAAGACATGTCT
1 AGTGTAAGACATGTCT
143901816 AGGAGCATCA
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 4, Indels: 6
0.85 0.06 0.09
Matches are distributed among these distances:
43 5 0.09
45 1 0.02
46 49 0.89
ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.26, T:0.24
Consensus pattern (45 bp):
AGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCAGCACATTACGAGAGAC
Found at i:143901998 original size:48 final size:49
Alignment explanation
Indices: 143901886--143902009 Score: 144
Period size: 48 Copynumber: 2.6 Consensus size: 49
143901876 CTTGTTGTGT
* * * *
143901886 GTCAGTTTAAGACCTGTCTGGGACATGGCATCAACACTGATAGATGAGA
1 GTCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGACATCAACACTAATAGATGAAA
* * *
143901935 GCCAGTGTAAGACCTGTCTGGG-CATGACATCAGC-CTCAATATATGAAA
1 GTCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGACATCAACACT-AATAGATGAAA
* *
143901983 GTCAGTGTAATACCTGTCTAGGACATG
1 GTCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATG
143902010 GTATCGAGAC
Statistics
Matches: 63, Mismatches: 10, Indels: 4
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
47 2 0.03
48 37 0.59
49 24 0.38
ACGTcount: A:0.30, C:0.20, G:0.25, T:0.25
Consensus pattern (49 bp):
GTCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGACATCAACACTAATAGATGAAA
Found at i:143902005 original size:141 final size:135
Alignment explanation
Indices: 143901753--143902010 Score: 311
Period size: 141 Copynumber: 1.9 Consensus size: 135
143901743 TTATGAGAGC
* * *
143901753 CAGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCGACATTGAAACGAGAGATAGTGTAAGACATGTCTAG
1 CAGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCAACACTGAAACGAGAGACAGTGTAAGACATGTCTAG
* *
143901818 GAGCATCAGCCTCGAGATATGCAAGCTAGTATAAGACCTGTATAGGACATGGCGTCAGCTTGTTG
66 GAGCATCAGCCTCAAGATATGAAAGCTAGTATAAGACCTGTATAGGACATGGCGTCAGCTTGTTG
143901883 TGTGT
131 TGTGT
* * * * *
143901888 CAGTTTAAGACCTGTCTGGGACATGGCATCAACACTGATAGATGAGAGCCAGTGTAAGACCTGTC
1 CAGTGTAAGACATGTCTGGGACAT-GCATCAACACTGA-A-ACGAGAGACAGTGTAAGACATGTC
* * * * *
143901953 TGGGCATGACATCAGCCTCAATATATGAAAG-TCAGTGTAATACCTGTCTAGGACATGG
63 TAGG-A-G-CATCAGCCTCAAGATATGAAAGCT-AGTATAAGACCTGTATAGGACATGG
143902011 TATCGAGACC
Statistics
Matches: 101, Mismatches: 15, Indels: 8
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
135 22 0.22
136 11 0.11
137 1 0.01
138 23 0.23
139 1 0.01
140 2 0.02
141 41 0.41
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.27, T:0.25
Consensus pattern (135 bp):
CAGTGTAAGACATGTCTGGGACATGCATCAACACTGAAACGAGAGACAGTGTAAGACATGTCTAG
GAGCATCAGCCTCAAGATATGAAAGCTAGTATAAGACCTGTATAGGACATGGCGTCAGCTTGTTG
TGTGT
Found at i:143903426 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143903381--143903547 Score: 185
Period size: 40 Copynumber: 4.2 Consensus size: 40
143903371 CGGAATATAA
143903381 CCGGATATAATCACGT-GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
1 CCGGATATAATCAC-TAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
* * * * *
143903421 CCGGATAGAATAACTCGCACGAATGCCTTCGGGCCTTAGC
1 CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
* * *
143903461 CCGGATATAACCACTAGCACAATTGCCTTCGGGTCTTAAC
1 CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
** * * * *
143903501 CCGGATATAATTTCCAGCATAATTGTCTTCGGG-CTTAGC
1 CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
143903540 CCGGATAT
1 CCGGATAT
143903548 CATTCAATTT
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 19, Indels: 3
0.83 0.15 0.02
Matches are distributed among these distances:
39 14 0.13
40 93 0.87
ACGTcount: A:0.25, C:0.28, G:0.22, T:0.26
Consensus pattern (40 bp):
CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
Found at i:143903531 original size:80 final size:79
Alignment explanation
Indices: 143903381--143903547 Score: 205
Period size: 80 Copynumber: 2.1 Consensus size: 79
143903371 CGGAATATAA
* *
143903381 CCGGATATAATCACGTGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGCCCGGATAGAATAACTCGCACGAATG
1 CCGGATATAACCACGTGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAGAATAACTCGCACGAATG
143903446 CCTTCGGGCCTTAGC
66 CCTTCGGG-CTTAGC
* * ** *
143903461 CCGGATATAACCAC-TAGCACAATTGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATATAATTTC-CAGCA-TAA
1 CCGGATATAACCACGT-GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAGAATAACTC-GCACGAA
*
143903523 TTGTCTTCGGGCTTAGC
64 -TGCCTTCGGGCTTAGC
143903540 CCGGATAT
1 CCGGATAT
143903548 CATTCAATTT
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 8, Indels: 7
0.84 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
79 18 0.24
80 58 0.76
ACGTcount: A:0.25, C:0.28, G:0.22, T:0.26
Consensus pattern (79 bp):
CCGGATATAACCACGTGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAGAATAACTCGCACGAATG
CCTTCGGGCTTAGC
Found at i:143904395 original size:17 final size:19
Alignment explanation
Indices: 143904372--143904417 Score: 53
Period size: 17 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
143904362 AAGAAGCATG
143904372 AATCATGCTCAAGAATG-C
1 AATCATGCTCAAGAATGAC
*
143904390 -ATCATGGC-CAAGTATGAC
1 AATCAT-GCTCAAGAATGAC
143904408 AATCATGCTC
1 AATCATGCTC
143904418 CTTTTCAACT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 1, Indels: 7
0.74 0.03 0.23
Matches are distributed among these distances:
17 12 0.52
18 5 0.22
19 6 0.26
ACGTcount: A:0.35, C:0.24, G:0.17, T:0.24
Consensus pattern (19 bp):
AATCATGCTCAAGAATGAC
Found at i:143911420 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143911375--143911541 Score: 185
Period size: 40 Copynumber: 4.2 Consensus size: 40
143911365 CGGAATATAA
143911375 CCGGATATAATCACGT-GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
1 CCGGATATAATCAC-TAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
* * * * *
143911415 CCGGATAGAATAACTCGCACGAATGCCTTCGGGCCTTAGC
1 CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
* * *
143911455 CCGGATATAACCACTAGCACAATTGCCTTCGGGTCTTAAC
1 CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
** * * * *
143911495 CCGGATATAATTTCCAGCATAATTGTCTTCGGG-CTTAGC
1 CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
143911534 CCGGATAT
1 CCGGATAT
143911542 CATTCAATTT
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 19, Indels: 3
0.83 0.15 0.02
Matches are distributed among these distances:
39 14 0.13
40 93 0.87
ACGTcount: A:0.25, C:0.28, G:0.22, T:0.26
Consensus pattern (40 bp):
CCGGATATAATCACTAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
Found at i:143911525 original size:80 final size:79
Alignment explanation
Indices: 143911375--143911541 Score: 205
Period size: 80 Copynumber: 2.1 Consensus size: 79
143911365 CGGAATATAA
* *
143911375 CCGGATATAATCACGTGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGCCCGGATAGAATAACTCGCACGAATG
1 CCGGATATAACCACGTGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAGAATAACTCGCACGAATG
143911440 CCTTCGGGCCTTAGC
66 CCTTCGGG-CTTAGC
* * ** *
143911455 CCGGATATAACCAC-TAGCACAATTGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATATAATTTC-CAGCA-TAA
1 CCGGATATAACCACGT-GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAGAATAACTC-GCACGAA
*
143911517 TTGTCTTCGGGCTTAGC
64 -TGCCTTCGGGCTTAGC
143911534 CCGGATAT
1 CCGGATAT
143911542 CATTCAATTT
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 8, Indels: 7
0.84 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
79 18 0.24
80 58 0.76
ACGTcount: A:0.25, C:0.28, G:0.22, T:0.26
Consensus pattern (79 bp):
CCGGATATAACCACGTGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAGAATAACTCGCACGAATG
CCTTCGGGCTTAGC
Found at i:143912389 original size:17 final size:19
Alignment explanation
Indices: 143912366--143912411 Score: 53
Period size: 17 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
143912356 AAGAAGCATG
143912366 AATCATGCTCAAGAATG-C
1 AATCATGCTCAAGAATGAC
*
143912384 -ATCATGGC-CAAGTATGAC
1 AATCAT-GCTCAAGAATGAC
143912402 AATCATGCTC
1 AATCATGCTC
143912412 CTTTTCAACT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 1, Indels: 7
0.74 0.03 0.23
Matches are distributed among these distances:
17 12 0.52
18 5 0.22
19 6 0.26
ACGTcount: A:0.35, C:0.24, G:0.17, T:0.24
Consensus pattern (19 bp):
AATCATGCTCAAGAATGAC
Found at i:143913320 original size:49 final size:47
Alignment explanation
Indices: 143913223--143913354 Score: 149
Period size: 49 Copynumber: 2.7 Consensus size: 47
143913213 CACACGATAG
*
143913223 ATGAGAGCCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGGCATCAGCCTCGATAT
1 ATGAAAGCCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGGCATCAGCCTCG--AT
* * * *
143913272 ATGAAAGTCAGTGTAAGACCTGTCTAGGACATGGCATC-GACTTTGAT
1 ATGAAAGCCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGGCATCAG-CCTCGAT
** *
143913319 ATGCTAGCCAGTGTAAGACCATGTATGGGACATGGC
1 ATGAAAGCCAGTGTAAGACC-TGTCTGGGACATGGC
143913355 GTCGGCATCT
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 10, Indels: 5
0.83 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
47 19 0.27
48 14 0.20
49 38 0.54
ACGTcount: A:0.28, C:0.20, G:0.28, T:0.24
Consensus pattern (47 bp):
ATGAAAGCCAGTGTAAGACCTGTCTGGGACATGGCATCAGCCTCGAT
Found at i:143920040 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143919913--143920042 Score: 165
Period size: 40 Copynumber: 3.2 Consensus size: 40
143919903 ATGCTGGAAA
* *
143919913 TTATATCCGGGTTAAGACCCGAAGGCAATT-GTGCTAGTGG
1 TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGC-ATTCGTGCGAGTGG
* * **
143919953 CTACATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTCA
1 TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTGG
*
143919993 TTCTATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGC-ACGTGG
1 TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGA-GTGG
143920033 TTATATCCGG
1 TTATATCCGG
143920043 TTGTATTCCG
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 12, Indels: 4
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
39 4 0.05
40 72 0.95
ACGTcount: A:0.23, C:0.25, G:0.28, T:0.24
Consensus pattern (40 bp):
TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTGG
Found at i:143928105 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143927978--143928107 Score: 165
Period size: 40 Copynumber: 3.2 Consensus size: 40
143927968 ATGCTGGAAA
* *
143927978 TTATATCCGGGTTAAGACCCGAAGGCAATT-GTGCTAGTGG
1 TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGC-ATTCGTGCGAGTGG
* * **
143928018 CTACATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTCA
1 TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTGG
*
143928058 TTCTATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGC-ACGTGG
1 TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGA-GTGG
143928098 TTATATCCGG
1 TTATATCCGG
143928108 TTGTATTCCG
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 12, Indels: 4
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
39 4 0.05
40 72 0.95
ACGTcount: A:0.23, C:0.25, G:0.28, T:0.24
Consensus pattern (40 bp):
TTATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTGG
Found at i:143937488 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 143937442--143937480 Score: 60
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
143937432 AAATTTGTTA
*
143937442 AAGGTGGTTTCAGTTTTGG
1 AAGGTGGTTTCAATTTTGG
143937461 AAGGGTGGTTTCAATTTTGG
1 AA-GGTGGTTTCAATTTTGG
143937481 GCAGGTGGGT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
19 2 0.11
20 16 0.89
ACGTcount: A:0.18, C:0.05, G:0.36, T:0.41
Consensus pattern (19 bp):
AAGGTGGTTTCAATTTTGG
Found at i:143947829 original size:46 final size:46
Alignment explanation
Indices: 143947754--143947882 Score: 177
Period size: 46 Copynumber: 2.8 Consensus size: 46
143947744 TGTAACCCGC
* * * * * *
143947754 CCATAAGCGAACTTGGACTCAACTCAACGAGCTCGGGCGTTCGTAT
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACATTCGCAT
* *
143947800 CCATGAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACATTTGCAT
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACATTCGCAT
*
143947846 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTTAACGAGTTCGGA
1 CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGA
143947883 TGCTCAACCA
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 10, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
46 73 1.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.26, G:0.22, T:0.22
Consensus pattern (46 bp):
CCATAAGTGAACTCGGACTCAACTCAACGAGTTCGGACATTCGCAT
Found at i:143953566 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 143953545--143953575 Score: 55
Period size: 12 Copynumber: 2.7 Consensus size: 12
143953535 TTCAAAAAAT
143953545 AAAT-AAAACAA
1 AAATAAAAACAA
143953556 AAATAAAAACAA
1 AAATAAAAACAA
143953568 AAATAAAA
1 AAATAAAA
143953576 TAAATAAAAT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 1
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
11 4 0.21
12 15 0.79
ACGTcount: A:0.84, C:0.06, G:0.00, T:0.10
Consensus pattern (12 bp):
AAATAAAAACAA
Found at i:143955135 original size:9 final size:9
Alignment explanation
Indices: 143955121--143955151 Score: 55
Period size: 9 Copynumber: 3.6 Consensus size: 9
143955111 TAAAAAATAA
143955121 GAAATAAAT
1 GAAATAAAT
143955130 GAAATAAAT
1 GAAATAAAT
143955139 -AAATAAAT
1 GAAATAAAT
143955147 GAAAT
1 GAAAT
143955152 TGAAATAACA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 0, Indels: 2
0.91 0.00 0.09
Matches are distributed among these distances:
8 8 0.38
9 13 0.62
ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.10, T:0.23
Consensus pattern (9 bp):
GAAATAAAT
Found at i:143955144 original size:17 final size:19
Alignment explanation
Indices: 143955122--143955165 Score: 65
Period size: 17 Copynumber: 2.4 Consensus size: 19
143955112 AAAAAATAAG
143955122 AAATAAATGAAA-T-AAAT
1 AAATAAATGAAATTGAAAT
143955139 AAATAAATGAAATTGAAAT
1 AAATAAATGAAATTGAAAT
143955158 AACATAAA
1 AA-ATAAA
143955166 AGTGGGGGTA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 3
0.89 0.00 0.11
Matches are distributed among these distances:
17 12 0.50
18 1 0.04
19 6 0.25
20 5 0.21
ACGTcount: A:0.68, C:0.02, G:0.07, T:0.23
Consensus pattern (19 bp):
AAATAAATGAAATTGAAAT
Found at i:143958219 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 143958212--143958248 Score: 74
Period size: 2 Copynumber: 18.5 Consensus size: 2
143958202 TCATGACATG
143958212 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA T
1 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA T
143958249 GACTAGTCTC
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 35 1.00
ACGTcount: A:0.49, C:0.00, G:0.00, T:0.51
Consensus pattern (2 bp):
TA
Found at i:143962866 original size:49 final size:49
Alignment explanation
Indices: 143962755--143962849 Score: 181
Period size: 49 Copynumber: 1.9 Consensus size: 49
143962745 CTTAATCCGT
*
143962755 AGAAATCCCTGATTTATGTTAATATCTCTCTCGAGACTAAAAATAACTG
1 AGAAATCCCTGATTTATGTTAATATCTCTCTCGAGACTAAAAACAACTG
143962804 AGAAATCCCTGATTTATGTTAATATCTCTCTCGAGACTAAAAACAA
1 AGAAATCCCTGATTTATGTTAATATCTCTCTCGAGACTAAAAACAA
143962850 TTGACTCTAG
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 1, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
49 45 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.19, G:0.12, T:0.32
Consensus pattern (49 bp):
AGAAATCCCTGATTTATGTTAATATCTCTCTCGAGACTAAAAACAACTG
Found at i:143964934 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 143964909--143964981 Score: 69
Period size: 20 Copynumber: 3.4 Consensus size: 20
143964899 ATAATTGAGA
143964909 TAGTTTAAGGTATTTGTAAG
1 TAGTTTAAGGTATTTGTAAG
143964929 TAGTTTAAATGGTTGATAATTG--AG
1 TAGTTT-AA-GG-T-AT--TTGTAAG
143964953 ATAGTTTAAGGTATTTGTAAG
1 -TAGTTTAAGGTATTTGTAAG
143964974 TAGTTTAA
1 TAGTTTAA
143964982 ATGAATGAAC
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 0, Indels: 18
0.71 0.00 0.29
Matches are distributed among these distances:
19 3 0.07
20 14 0.32
21 6 0.14
22 3 0.07
23 3 0.07
24 6 0.14
25 6 0.14
26 3 0.07
ACGTcount: A:0.33, C:0.00, G:0.23, T:0.44
Consensus pattern (20 bp):
TAGTTTAAGGTATTTGTAAG
Found at i:143964954 original size:45 final size:45
Alignment explanation
Indices: 143964890--143964984 Score: 190
Period size: 45 Copynumber: 2.1 Consensus size: 45
143964880 AATAATTTAC
143964890 AAATGGTTGATAATTGAGATAGTTTAAGGTATTTGTAAGTAGTTT
1 AAATGGTTGATAATTGAGATAGTTTAAGGTATTTGTAAGTAGTTT
143964935 AAATGGTTGATAATTGAGATAGTTTAAGGTATTTGTAAGTAGTTT
1 AAATGGTTGATAATTGAGATAGTTTAAGGTATTTGTAAGTAGTTT
143964980 AAATG
1 AAATG
143964985 AATGAACAAT
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
45 50 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.00, G:0.24, T:0.41
Consensus pattern (45 bp):
AAATGGTTGATAATTGAGATAGTTTAAGGTATTTGTAAGTAGTTT
Found at i:143966243 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 143966189--143966318 Score: 181
Period size: 39 Copynumber: 3.3 Consensus size: 39
143966179 TAATGGAGAA
*
143966189 TTATATCCGAGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCTGGTG
1 TTATATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCTGGTG
* *
143966228 TTATATCCGGGCTAAGTCCCAAAGGCATTCGTGCTGGTG
1 TTATATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCTGGTG
* * * *
143966267 TTATATCTGGGCTAAAGTCCCGTAGGC-TTTGTGTTGGTA
1 TTATATCCGGGCT-AAGTCCCGAAGGCATTTGTGCTGGTG
143966306 TTATATCCGGGCT
1 TTATATCCGGGCT
143966319 TAAAGTCCTG
Statistics
Matches: 80, Mismatches: 10, Indels: 2
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
39 69 0.86
40 11 0.14
ACGTcount: A:0.19, C:0.20, G:0.28, T:0.33
Consensus pattern (39 bp):
TTATATCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCTGGTG
Found at i:143966336 original size:40 final size:39
Alignment explanation
Indices: 143966188--143966344 Score: 156
Period size: 39 Copynumber: 4.0 Consensus size: 39
143966178 ATAATGGAGA
* * *
143966188 ATTATATCCGAGCT-AAGTCCCGAAGGCATTTGTGCTGGT
1 ATTATATCCGGGCTAAAGTCCCGTAGGC-TTTGTGGTGGT
* ** * *
143966227 GTTATATCCGGGCT-AAGTCCCAAAGGCATTCGTGCTGGT
1 ATTATATCCGGGCTAAAGTCCCGTAGGC-TTTGTGGTGGT
* * *
143966266 GTTATATCTGGGCTAAAGTCCCGTAGGCTTTGTGTTGGT
1 ATTATATCCGGGCTAAAGTCCCGTAGGCTTTGTGGTGGT
* *
143966305 ATTATATCCGGGCTTAAAGTCCTGTATGCTTTGTGGTGGT
1 ATTATATCCGGGC-TAAAGTCCCGTAGGCTTTGTGGTGGT
143966345 GATTGGATTT
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 14, Indels: 3
0.86 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
39 68 0.67
40 34 0.33
ACGTcount: A:0.19, C:0.18, G:0.28, T:0.34
Consensus pattern (39 bp):
ATTATATCCGGGCTAAAGTCCCGTAGGCTTTGTGGTGGT
Found at i:143973506 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143973447--143973588 Score: 124
Period size: 40 Copynumber: 3.5 Consensus size: 40
143973437 AAATTGAATG
* * *
143973447 ATATCCGGGCTAAGCCCCGAAGACAATTATGCTGGAAATT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGACAATTATGCTAGAAACT
* * * ***
143973487 ATATCCGGGTTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTAGTGGCT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGACAATTATGCTAGAAACT
* * * ** *
143973527 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGC-ATTCGTGCGAGTTATT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGACAATT-ATGCTAGAAACT
*
143973567 CTATCCGGGCTAAGACCCGAAG
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAG
143973589 GCATTTGTGC
Statistics
Matches: 86, Mismatches: 15, Indels: 2
0.83 0.15 0.02
Matches are distributed among these distances:
39 3 0.03
40 83 0.97
ACGTcount: A:0.27, C:0.23, G:0.27, T:0.23
Consensus pattern (40 bp):
ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGACAATTATGCTAGAAACT
Found at i:143973589 original size:40 final size:39
Alignment explanation
Indices: 143973486--143973614 Score: 152
Period size: 40 Copynumber: 3.2 Consensus size: 39
143973476 TGCTGGAAAT
* * *
143973486 TATATCCGGGTTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTAGTGGC
1 TATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGC-ATTGTGCGAGTGAC
* *
143973526 TATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTCGTGCGAGTTAT
1 TATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATT-GTGCGAGTGAC
* *
143973566 TCTATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGC-ACGTGAT
1 TATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCA-TTGTGCGA-GTGAC
143973606 TATATCCGG
1 TATATCCGG
143973615 TTATATTCCG
Statistics
Matches: 78, Mismatches: 8, Indels: 6
0.85 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
39 4 0.05
40 72 0.92
41 2 0.03
ACGTcount: A:0.24, C:0.22, G:0.28, T:0.26
Consensus pattern (39 bp):
TATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTGTGCGAGTGAC
Found at i:143981486 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143981420--143981586 Score: 169
Period size: 40 Copynumber: 4.2 Consensus size: 40
143981410 AAATTGAATG
* * *
143981420 ATATCCGGGCTAAG-CCCGAAGACAATTATGCTGGAAATT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTGGTAATT
* * ***
143981459 ATATCCGGGTTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTAGTGGCT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTGGTAATT
*
143981499 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGC-ATTCGTGC-GAGTTATT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCAATT-GTGCTG-GTAATT
* * ** *
143981539 CTATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCACGTGATT
1 ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTGGTAATT
143981579 ATATCCGG
1 ATATCCGG
143981587 TTATATTCCG
Statistics
Matches: 105, Mismatches: 18, Indels: 9
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
39 16 0.15
40 87 0.83
41 2 0.02
ACGTcount: A:0.26, C:0.22, G:0.27, T:0.25
Consensus pattern (40 bp):
ATATCCGGGCTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTGGTAATT
Found at i:143990555 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 143990405--143990572 Score: 151
Period size: 40 Copynumber: 4.2 Consensus size: 40
143990395 CGGAATACAA
* * *
143990405 CCGGATATAACCA-CATGCACGAATGCCCTCGGGTCTTAGC
1 CCGGATATAATCACCA-GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
* ** *
143990445 CCGGATAGAA-CGACTTGCACGAATGCCTTCGGGTCTTAGC
1 CCGGATATAATC-ACCAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
* * * * *
143990485 CCGGATGTAGTCACTAGCACAATTGCCTTCGGGTCTTAAC
1 CCGGATATAATCACCAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
** * * *
143990525 CCGGATATAATTTCCAGCATAAATGTCTTCGGGACTTAGC
1 CCGGATATAATCACCAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
143990565 CCGGATAT
1 CCGGATAT
143990573 CATTCAATTG
Statistics
Matches: 104, Mismatches: 21, Indels: 6
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
39 1 0.01
40 102 0.98
41 1 0.01
ACGTcount: A:0.24, C:0.27, G:0.23, T:0.25
Consensus pattern (40 bp):
CCGGATATAATCACCAGCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGC
Found at i:143992330 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 143992273--143992381 Score: 125
Period size: 27 Copynumber: 4.0 Consensus size: 27
143992263 TAGGGATGTC
* * *
143992273 ACAGATAA-TGTGACAGAGTCACCAGAT
1 ACAGATAATTGTGGCAGAGCCACCAG-G
*
143992300 ACAGATAATCGTGGCAGAGCCACCAGG
1 ACAGATAATTGTGGCAGAGCCACCAGG
143992327 ACAGA-AATATGTGGCAGAGCCACCA-G
1 ACAGATAAT-TGTGGCAGAGCCACCAGG
*
143992353 ATCAGATAATTGTGGCATAGCCACCAGG
1 A-CAGATAATTGTGGCAGAGCCACCAGG
143992381 A
1 A
143992382 TGCTTCCTCC
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 6, Indels: 9
0.83 0.07 0.10
Matches are distributed among these distances:
26 5 0.07
27 47 0.66
28 19 0.27
ACGTcount: A:0.37, C:0.22, G:0.26, T:0.16
Consensus pattern (27 bp):
ACAGATAATTGTGGCAGAGCCACCAGG
Found at i:143998518 original size:11 final size:10
Alignment explanation
Indices: 143998498--143998532 Score: 52
Period size: 10 Copynumber: 3.4 Consensus size: 10
143998488 AGTACAGACA
143998498 AATAATTCAG
1 AATAATTCAG
143998508 AATATATTCAG
1 AATA-ATTCAG
*
143998519 AAAAATTCAG
1 AATAATTCAG
143998529 AATA
1 AATA
143998533 CTTACAGGCT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
10 13 0.59
11 9 0.41
ACGTcount: A:0.54, C:0.09, G:0.09, T:0.29
Consensus pattern (10 bp):
AATAATTCAG
Found at i:143999652 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 143999590--143999701 Score: 129
Period size: 27 Copynumber: 4.1 Consensus size: 27
143999580 AGCATGGCTG
* *
143999590 CCAGAACAGATAA-TGTGACAGAGTCA
1 CCAGAACAGATAATTGTGGCAGAGCCA
* *
143999616 CCAAATACAGATAATTGTGGCAAAGCCA
1 CCAGA-ACAGATAATTGTGGCAGAGCCA
*
143999644 CCAGAACAGA-AATATGTGGCAGATCCA
1 CCAGAACAGATAAT-TGTGGCAGAGCCA
* *
143999671 CCAGATCAGATAATTGTGGCATAGCCA
1 CCAGAACAGATAATTGTGGCAGAGCCA
143999698 CCAG
1 CCAG
143999702 GACGCTTCCT
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 10, Indels: 7
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
26 7 0.10
27 48 0.67
28 17 0.24
ACGTcount: A:0.39, C:0.22, G:0.21, T:0.17
Consensus pattern (27 bp):
CCAGAACAGATAATTGTGGCAGAGCCA
Found at i:143999681 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 143999590--143999701 Score: 156
Period size: 54 Copynumber: 2.1 Consensus size: 54
143999580 AGCATGGCTG
*
143999590 CCAGAACAGATAATGTGACAGAGTCACCAAATACAGATAATTGTGGCAAAGCCA
1 CCAGAACAGAAAATGTGACAGAGTCACCAAATACAGATAATTGTGGCAAAGCCA
* * *
143999644 CCAGAACAGAAATATGTGGCAGA-TCCACCAGAT-CAGATAATTGTGGCATAGCCA
1 CCAGAACAGAAA-ATGTGACAGAGT-CACCAAATACAGATAATTGTGGCAAAGCCA
143999698 CCAG
1 CCAG
143999702 GACGCTTCCT
Statistics
Matches: 52, Mismatches: 4, Indels: 4
0.87 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
54 36 0.69
55 16 0.31
ACGTcount: A:0.39, C:0.22, G:0.21, T:0.17
Consensus pattern (54 bp):
CCAGAACAGAAAATGTGACAGAGTCACCAAATACAGATAATTGTGGCAAAGCCA
Found at i:144003393 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 144003363--144003406 Score: 79
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
144003353 TGTCACCCAT
144003363 TGAATATATTTGAAATATCGA
1 TGAATATATTTGAAATATCGA
*
144003384 TGAATTTATTTGAAATATCGA
1 TGAATATATTTGAAATATCGA
144003405 TG
1 TG
144003407 GATACACAAA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 22 1.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.05, G:0.16, T:0.41
Consensus pattern (21 bp):
TGAATATATTTGAAATATCGA
Found at i:144005404 original size:119 final size:119
Alignment explanation
Indices: 144005192--144005543 Score: 524
Period size: 119 Copynumber: 3.0 Consensus size: 119
144005182 ATATTTTCAT
* * *
144005192 ATGAATATTTTCATTATCATATGATGTCATGGGTCTCTGCCACATGGTCTTACACATATCTGCAT
1 ATGAATATTTTCATTGTCATATGATGCCATGGGTCTCTACCACATGGTCTTACACATATCTGCAT
* * *
144005257 GTCGTGATCTGCCAATCCAGTTAACAATGTACCTACCTTATCGGAGGCAACACC
66 GTCGTGATCTGCCAATCCAGTTAGCAATGTACCTACCCTACCGGAGGCAACACC
* * **
144005311 ATGAATATTTTCATTGTCATATGATGCCACGGGTCTCTACCACGTGGTCTTACACATATCAACAT
1 ATGAATATTTTCATTGTCATATGATGCCATGGGTCTCTACCACATGGTCTTACACATATCTGCAT
* * *
144005376 GTCGTGATCTGTCAGTCCAGTTAGCAATGTACCTACCCTACCGAAGGCAACACC
66 GTCGTGATCTGCCAATCCAGTTAGCAATGTACCTACCCTACCGGAGGCAACACC
* * *
144005430 ATGAATATTTTCATTGTCATATGATGCCATGGATCGCTACCACATGGTCTTACACATATTTGCAT
1 ATGAATATTTTCATTGTCATATGATGCCATGGGTCTCTACCACATGGTCTTACACATATCTGCAT
* * * *
144005495 GTGGTGATCTACCAATCCAGCTAGCAATGTACCTGCCCTACCGGAGGCA
66 GTCGTGATCTGCCAATCCAGTTAGCAATGTACCTACCCTACCGGAGGCA
144005544 TCACAAATGG
Statistics
Matches: 206, Mismatches: 27, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
119 206 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.25, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (119 bp):
ATGAATATTTTCATTGTCATATGATGCCATGGGTCTCTACCACATGGTCTTACACATATCTGCAT
GTCGTGATCTGCCAATCCAGTTAGCAATGTACCTACCCTACCGGAGGCAACACC
Found at i:144006907 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 144006859--144006906 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.6 Consensus size: 19
144006849 TTATTTATTT
** *
144006859 AATTAATTTTAATCAATTA
1 AATTAATTTTTCTCAAGTA
144006878 AATTAATTTTTCTCAAGTA
1 AATTAATTTTTCTCAAGTA
144006897 AATT-ATTTTT
1 AATTAATTTTT
144006907 TGAACCCAAT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 3, Indels: 1
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
18 6 0.23
19 20 0.77
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.02, T:0.52
Consensus pattern (19 bp):
AATTAATTTTTCTCAAGTA
Found at i:144008926 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 144008883--144008926 Score: 52
Period size: 19 Copynumber: 2.3 Consensus size: 19
144008873 ATCACAATCT
*
144008883 TTTATGATATTTAAAATAA
1 TTTATAATATTTAAAATAA
* * *
144008902 TATATAATATTTAAATTTA
1 TTTATAATATTTAAAATAA
144008921 TTTATA
1 TTTATA
144008927 TATGAAAAAT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 5, Indels: 0
0.80 0.20 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 20 1.00
ACGTcount: A:0.45, C:0.00, G:0.02, T:0.52
Consensus pattern (19 bp):
TTTATAATATTTAAAATAA
Found at i:144013542 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 144013521--144013551 Score: 53
Period size: 16 Copynumber: 1.9 Consensus size: 16
144013511 TATTTATTAA
144013521 ATTTTATAATTTATTT
1 ATTTTATAATTTATTT
*
144013537 ATTTTATATTTTATT
1 ATTTTATAATTTATT
144013552 GAAACACCCC
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 1, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
16 14 1.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.00, G:0.00, T:0.71
Consensus pattern (16 bp):
ATTTTATAATTTATTT
Found at i:144016912 original size:21 final size:19
Alignment explanation
Indices: 144016888--144016928 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
144016878 AATTGACAAG
144016888 AAATTTATTTTAACTATAATT
1 AAATTT-TTTTAACTA-AATT
*
144016909 AAATTTTTTTAGCTAAATT
1 AAATTTTTTTAACTAAATT
144016928 A
1 A
144016929 GAAGTTTAAT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
19 5 0.26
20 8 0.42
21 6 0.32
ACGTcount: A:0.41, C:0.05, G:0.02, T:0.51
Consensus pattern (19 bp):
AAATTTTTTTAACTAAATT
Found at i:144017046 original size:29 final size:32
Alignment explanation
Indices: 144016990--144017066 Score: 79
Period size: 29 Copynumber: 2.5 Consensus size: 32
144016980 ACTGCAATCA
* * *
144016990 TGGTTACTCAATTATTAGTAAATTTTACACTT
1 TGGTCACTCAATTATTAGTAAATGTTACAATT
144017022 TGGTCACTCAATTA-T-G-AAATGTTACAATT
1 TGGTCACTCAATTATTAGTAAATGTTACAATT
* * *
144017051 TGATCATTCAACTATT
1 TGGTCACTCAATTATT
144017067 TAAAATTGAC
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 6, Indels: 4
0.79 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
29 22 0.58
30 2 0.05
31 1 0.03
32 13 0.34
ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (32 bp):
TGGTCACTCAATTATTAGTAAATGTTACAATT
Found at i:144017567 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 144017560--144017605 Score: 51
Period size: 2 Copynumber: 24.0 Consensus size: 2
144017550 AAAAATTTTA
* * *
144017560 AT AT AT AT AT AT CT CT A- AT AG A- AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
144017600 AT AT AT
1 AT AT AT
144017606 CTAATAGAAC
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 3, Indels: 4
0.85 0.07 0.09
Matches are distributed among these distances:
1 2 0.05
2 37 0.95
ACGTcount: A:0.48, C:0.04, G:0.02, T:0.46
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:144017809 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 144017780--144017833 Score: 56
Period size: 20 Copynumber: 2.7 Consensus size: 20
144017770 AAAATATTTT
* *
144017780 TATATTTATATTTTGATATA
1 TATATATATATTTTCATATA
* *
144017800 TATATATATATATTCCTATA
1 TATATATATATTTTCATATA
144017820 -ATTATATATATTTT
1 TA-TATATATATTTT
144017834 TTGGTGAAAG
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 5, Indels: 2
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
19 1 0.04
20 27 0.96
ACGTcount: A:0.37, C:0.04, G:0.02, T:0.57
Consensus pattern (20 bp):
TATATATATATTTTCATATA
Found at i:144019117 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 144019080--144019118 Score: 60
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
144019070 TACATGCCCT
**
144019080 TGTTTGTACTTCGGTACCCC
1 TGTTTGTACTTCAATACCCC
144019100 TGTTTGTACTTCAATACCC
1 TGTTTGTACTTCAATACCC
144019119 TTGATTGCAC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 17 1.00
ACGTcount: A:0.15, C:0.28, G:0.15, T:0.41
Consensus pattern (20 bp):
TGTTTGTACTTCAATACCCC
Found at i:144027238 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 144027202--144027332 Score: 171
Period size: 30 Copynumber: 4.5 Consensus size: 30
144027192 GACAAGATTG
* * * * *
144027202 GCACTAAGTGTGCGGGTTTAAAATTGTACA
1 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATATA
*
144027232 GCACTAAGTGTGCGAGTTTG---ATTATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAG-CTGAAAATTATATA
144027260 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATATA
144027290 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAA-TATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATATA
144027319 GCACTAAGTGTGCG
1 GCACTAAGTGTGCG
144027333 GATTCACTAT
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 5, Indels: 9
0.87 0.05 0.08
Matches are distributed among these distances:
27 2 0.02
28 22 0.24
29 20 0.22
30 46 0.50
31 2 0.02
ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.26, T:0.28
Consensus pattern (30 bp):
GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATATA
Found at i:144027293 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 144027202--144027332 Score: 174
Period size: 58 Copynumber: 2.2 Consensus size: 58
144027192 GACAAGATTG
* * * * * *
144027202 GCACTAAGTGTGCGGGTTTAAAATTGTACAGCACTAAGTGTGCGAGTTTG-ATTATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATACAGCACTAAGTGTGCGAG-CTGAAATATATA
*
144027260 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATATAGCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATACAGCACTAAGTGTGCGAGCTG-AAATATATA
144027319 GCACTAAGTGTGCG
1 GCACTAAGTGTGCG
144027333 GATTCACTAT
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 7, Indels: 3
0.86 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
57 2 0.03
58 41 0.64
59 21 0.33
ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.26, T:0.28
Consensus pattern (58 bp):
GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAATTATACAGCACTAAGTGTGCGAGCTGAAATATATA
Found at i:144035177 original size:29 final size:30
Alignment explanation
Indices: 144035135--144035261 Score: 142
Period size: 28 Copynumber: 4.5 Consensus size: 30
144035125 GACAAGATTG
* *
144035135 GCACTAAGTGTGCG-GTTTAAAATTGTACA
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTTAAAATTATATA
*
144035164 GCACTAAGTGTGCGAGTTT--GATTATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTTAAAATTATATA
* *
144035192 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAA-TATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTTAAAATTATATA
* *
144035221 GCACTAAGTGT-CGAGCTGAAAA-TATAT-
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTTAAAATTATATA
144035248 GCACTAAGTGTGCG
1 GCACTAAGTGTGCG
144035262 GATTCACTAT
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 6, Indels: 9
0.85 0.06 0.09
Matches are distributed among these distances:
27 11 0.12
28 41 0.47
29 31 0.35
30 5 0.06
ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.25, T:0.28
Consensus pattern (30 bp):
GCACTAAGTGTGCGAGTTTAAAATTATATA
Found at i:144035224 original size:57 final size:56
Alignment explanation
Indices: 144035135--144035262 Score: 152
Period size: 57 Copynumber: 2.3 Consensus size: 56
144035125 GACAAGATTG
* * * * **
144035135 GCACTAAGTGTGCGGTTTAAAATTGTACAGCACTAAGTGTGCGAGTTTGATTATATA-
1 GCACTAAGTGTGCGGCTGAAAATTATACAGCACTAAGTGT-CGAG-CTGAAAATATAT
*
144035192 GCACTAAGTGTGCGAGCTGAAAA-TATATAGCACTAAGTGTCGAGCTGAAAATATAT
1 GCACTAAGTGTGCG-GCTGAAAATTATACAGCACTAAGTGTCGAGCTGAAAATATAT
144035248 GCACTAAGTGTGCGG
1 GCACTAAGTGTGCGG
144035263 ATTCACTATA
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 7, Indels: 6
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
55 9 0.15
56 18 0.29
57 29 0.47
58 6 0.10
ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.26, T:0.28
Consensus pattern (56 bp):
GCACTAAGTGTGCGGCTGAAAATTATACAGCACTAAGTGTCGAGCTGAAAATATAT
Found at i:144056851 original size:46 final size:45
Alignment explanation
Indices: 144056798--144056973 Score: 185
Period size: 46 Copynumber: 3.8 Consensus size: 45
144056788 TATTTGGGCA
144056798 TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAATG
1 TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAA-G
* *** * *
144056844 TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCAAGTTCGAGAGATGTAACTAG-GCA-
1 TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTC-ACTTATG-GA-T-GCGAAG
* *
144056891 TCCGAGCTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAAACG
1 TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAA-G
* * *
144056937 CCCGAGCTCATTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGG
1 TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGG
144056974 GCGGGTTACA
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 16, Indels: 14
0.78 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
43 1 0.01
44 2 0.02
45 1 0.01
46 67 0.63
47 31 0.29
48 1 0.01
49 3 0.03
50 1 0.01
ACGTcount: A:0.23, C:0.21, G:0.28, T:0.28
Consensus pattern (45 bp):
TCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAAG
Found at i:144056951 original size:93 final size:93
Alignment explanation
Indices: 144056794--144056965 Score: 281
Period size: 93 Copynumber: 1.8 Consensus size: 93
144056784 AGGATATTTG
* * * *
144056794 GGCATCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAATGTCCGAACTCGTTGAG
1 GGCATCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAAACGCCCGAACTCATTGAG
144056859 TTGAGTCCAAGTTCGAGAGATGTAACTA
66 TTGAGTCCAAGTTCGAGAGATGTAACTA
* *
144056887 GGCATCCGAGCTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAAACGCCCGAGCTCATTGAG
1 GGCATCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAAACGCCCGAACTCATTGAG
*
144056952 TTGAGTCCGAGTTC
66 TTGAGTCCAAGTTC
144056966 ACTTATGGGC
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 7, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
93 72 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.22, G:0.28, T:0.27
Consensus pattern (93 bp):
GGCATCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAAACGCCCGAACTCATTGAG
TTGAGTCCAAGTTCGAGAGATGTAACTA
Found at i:144059949 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 144059913--144059992 Score: 74
Period size: 15 Copynumber: 5.4 Consensus size: 15
144059903 ATATCTTGGG
*
144059913 TTTCTTTATCCTGGA
1 TTTCTTTATTCTGGA
**
144059928 TCACTTTATTCTGGA
1 TTTCTTTATTCTGGA
*
144059943 TTTCTTTATTCTGGG
1 TTTCTTTATTCTGGA
*
144059958 TTTCTCTA-TCTTGGA
1 TTTCTTTATTC-TGGA
* *
144059973 TTTGTTTATTC-GGT
1 TTTCTTTATTCTGGA
144059987 TTTCTT
1 TTTCTT
144059993 GTTATCTTTG
Statistics
Matches: 51, Mismatches: 12, Indels: 5
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
14 9 0.18
15 40 0.78
16 2 0.04
ACGTcount: A:0.11, C:0.16, G:0.15, T:0.57
Consensus pattern (15 bp):
TTTCTTTATTCTGGA
Found at i:144059973 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 144059904--144059991 Score: 81
Period size: 30 Copynumber: 3.0 Consensus size: 30
144059894 CATAGTATCA
* * ** *
144059904 TATCTTGGGTTTCTTTATCCTGGATCACTT
1 TATCTTGGATTTCTTTATTCTGGATTTCTC
*
144059934 TAT-TCTGGATTTCTTTATTCTGGGTTTCTC
1 TATCT-TGGATTTCTTTATTCTGGATTTCTC
* *
144059964 TATCTTGGATTTGTTTATTC-GGTTTTCT
1 TATCTTGGATTTCTTTATTCTGGATTTCT
144059992 TGTTATCTTT
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 8, Indels: 5
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
29 8 0.17
30 39 0.81
31 1 0.02
ACGTcount: A:0.11, C:0.16, G:0.17, T:0.56
Consensus pattern (30 bp):
TATCTTGGATTTCTTTATTCTGGATTTCTC
Found at i:144062501 original size:45 final size:45
Alignment explanation
Indices: 144062344--144062517 Score: 206
Period size: 45 Copynumber: 3.8 Consensus size: 45
144062334 ATTTGGGCAT
* *
144062344 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAATGT
1 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGC-AACGC
*** * * * *
144062390 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCGAGAGATGTA-ACTAGGC
1 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTC-ACTTATGGATGCAACGC
*
144062435 ATCCGAGCTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAACGC
1 --CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAACGC
*
144062482 CCGAGCTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGG
1 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGG
144062518 GCGGGTTACA
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 16, Indels: 9
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
45 38 0.35
46 34 0.31
47 36 0.33
ACGTcount: A:0.21, C:0.21, G:0.29, T:0.28
Consensus pattern (45 bp):
CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCAACGC
Found at i:144064766 original size:42 final size:42
Alignment explanation
Indices: 144064627--144064944 Score: 177
Period size: 43 Copynumber: 7.5 Consensus size: 42
144064617 TTTTCTTTAG
* * * *
144064627 CCCGCACATCTGAGGCACCAGGGTGCCCCTGCTGCTCGAGGCA
1 CCCGCACATC-CAAGCACCAGGGTGCCACTGCTGCTCGAGGCT
* * * * *
144064670 CCCGTACATCCAACGTC-CTAGGTTACCGAC-GGTG-TCAGAGGCT
1 CCCGCACATCCAA-G-CACCAGGGTGCC-ACTGCTGCTC-GAGGCT
** * *
144064713 CTAGCACATCCAAGCACCAGGGTGCCCCTGCTGCTCGAGGCA
1 CCCGCACATCCAAGCACCAGGGTGCCACTGCTGCTCGAGGCT
* * * *
144064755 CTCGCATATCCAA-CATCCTAGGTTGCCGA-TGGTG-TCAGAGGCT
1 CCCGCACATCCAAGCA-CC-AGGGTGCC-ACTGCTGCTC-GAGGCT
* * *
144064798 CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGATGCTCGAGGCT
1 CCCGCACATCCAAGCACCAGGGTGCCACTGCTGCTCGAGGCT
* * * *
144064840 CCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCTAATGGTGC-CTGAGGCT
1 CCCGCACATCCAA-GCACCAGGGTGCCACTGCTGCTC-GAGGCT
** * * * *
144064883 CCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTG-TCCGAAGCT
1 CCCGCAC-ATCCAAGCACC-AGGGTGCCACTGCTGCT-CGAGGCT
144064926 CCCGCACATCCAAGCACCA
1 CCCGCACATCCAAGCACCA
144064945 AGGTACCGAT
Statistics
Matches: 215, Mismatches: 39, Indels: 43
0.72 0.13 0.14
Matches are distributed among these distances:
41 5 0.02
42 69 0.32
43 135 0.63
44 6 0.03
ACGTcount: A:0.22, C:0.35, G:0.26, T:0.17
Consensus pattern (42 bp):
CCCGCACATCCAAGCACCAGGGTGCCACTGCTGCTCGAGGCT
Found at i:144064810 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 144064771--144089415 Score: 25358
Period size: 43 Copynumber: 575.5 Consensus size: 43
144064761 TATCCAACAT
* * **
144064771 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144064814 CCAAGG-TGCCAATGATGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-G
* ** *
144064857 CCAAGG-TGCTAATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
144064899 CCTAGGTTGCCAATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144064942 CCAAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144064983 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*** **
144065026 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144065069 CCAAGG-TACCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144065111 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144065152 CCTAGGTTACCGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144065195 CCTAGGTTG-CGATGGTGTCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144065237 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGCCCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144065280 CCTA-GATGTCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144065322 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGCGGCTCCCGCACGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144065365 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144065408 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * * * * *
144065451 CCTAGACTGCCGATGGTGCTCGAGGCTTCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144065494 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144065537 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144065580 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144065622 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * *
144065665 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144065708 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144065751 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144065794 CCAAGGTTGCCAATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144065837 CCTA-GATGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144065879 CCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144065922 CCTAGGTTGCCGATGGCGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144065965 CCTAGGTTGCCGATAGTGCTCGAGCCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144066008 CCTAGATTGCAGATGGTGCCTGGGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144066051 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144066094 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066137 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144066179 CCTAGGTCACCGATGGTGCCCGAGGCTCCAG-AGTGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGG
** * * *
144066222 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144066265 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144066308 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144066351 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144066393 CTTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTACTGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144066435 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * * *
144066478 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCTGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066521 CCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
144066564 CCTAGGTTTCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * ** * *
144066607 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTGGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066648 TCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
144066691 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144066734 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTCCCGAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066776 CCTAGGTT-CCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * *
144066817 CCTAGGTTGGCGATGGTGATCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144066860 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGA-CAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066902 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066945 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144066987 CCTAGGTTGCCTATGGTG-CCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144067029 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144067072 CCTAGGTTGCCGATGGTACCTGAGCCTCCCGCAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144067115 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144067158 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144067200 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* * *
144067254 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * *
144067297 CCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGTGCGACTAGGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144067340 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144067383 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTTTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144067425 TGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
144067468 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144067510 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
**
144067554 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * * * **
144067596 CCTAGGTTGTCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
** *
144067639 CGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144067680 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144067723 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144067765 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * ** *
144067808 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144067851 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144067894 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144067937 CCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144067980 CCTA-GATGTCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068022 CCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068065 CCTAGGTTGCCGATGGCGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144068108 CCTAGGTTGCCGATAGTGCTCGAGCCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144068151 CCTAGATTGCAGATGGTGCCTGGGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068194 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144068237 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068280 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144068322 CCTAGGTCACCGATGGTGCCCGAGGCTCCAG-AGTGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGG
** * ** *
144068365 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACGTGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144068408 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144068451 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144068494 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144068536 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTACTGGACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144068579 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * * *
144068622 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCTGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068665 CCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144068708 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * ** * *
144068751 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTGGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068792 TCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
144068835 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144068878 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTCCCGAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144068920 CCTAGGTT-CCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * *
144068961 CCTAGGTTGGCGATGGTGATCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144069004 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144069047 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144069090 CCTAGG-TGCCGATTGTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144069132 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144069174 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144069217 CCTAGGTTGCCGATGGTACCTGAGCCTCCCGCA-GCACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACG-ACCAAGGG
* * * * *
144069260 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144069303 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144069346 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* * *
144069400 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * *
144069443 CCTAGGTTATCC-ATGGTG-CCGAAGCTCTCGTGCGACTAGGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144069485 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144069528 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144069571 TGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
144069614 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144069656 TCCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
**
144069699 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGATACT-CCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * * **
144069741 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
** *
144069784 CGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144069826 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144069869 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144069911 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * ** * *
144069954 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144069997 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGA-CAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144070039 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144070082 CCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144070125 CCTA-GATGCCTATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144070167 CCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144070210 CCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144070253 CCTAGGTT-ACGATAGTGCCTGAGGCT-CCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144070294 CCTAGATTGCAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144070337 CCTAGCTTGGCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144070380 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * *
144070423 CCTAGGTTTGTCGAT-GTTACCGA-GCTCTCGCACGACCAATGG
1 CCTAGG-TTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144070465 CCTAGGTCACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG-AGTGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGG
** **
144070508 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGTGCGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144070550 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCTGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** * *
144070593 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144070636 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144070678 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTACGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144070721 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * * *
144070764 TCTAGGTTGCCAAATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144070808 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACAACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
144070850 CCTAGGTTG-CGATGGTGTCCGAAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144070892 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTTCCGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144070933 TCTAGTTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
144070976 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144071019 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCAAGGCTCCCGAACGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144071060 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144071101 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144071144 CCTAGGTTGCCGACGGTG-CC--GGCTCCTGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144071184 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGC-CCCTCAAGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144071226 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CC-CGCACGACCAAGGG
* * *
144071270 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144071313 CCTAGGTTGCCGATGTGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATG-GTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144071357 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGA-CCT-CCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144071398 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144071441 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144071484 CCTAGGTTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGG-TTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144071528 CCTAGGTTGTCGAT-GTGGTACCGAAGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-G-CCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144071572 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCT-CC-CACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144071612 CCTAGGTTGCCGAT-GTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144071654 CCTAGGTTCCCGATGGCGCCCGAGGCTCCCG--CGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144071695 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144071738 CCTAGGTTGTCGATGGTACCCGAAGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144071781 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144071824 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * * *
144071867 CCGAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAA--G
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
144071908 CACGAAGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144071951 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144071994 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144072036 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * ** *
144072079 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144072122 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144072165 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144072208 CCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144072251 CCTA-GATGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144072293 CCTAGGTTGCCTATAGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144072336 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** *
144072379 CCTAGGTTACCGATAGTGCCTGAGGCTCAAGCATGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144072421 CCTAGATTGCAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144072464 CCTAGCTTGCCGATAGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144072507 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144072550 CCTAGGTTGTCGAT-GTTACCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144072592 CCTAGGTCGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG-AGTGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGG
** **
144072635 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTGCGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144072678 CCCAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** * *
144072721 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144072764 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCT-CCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144072805 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144072848 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * * * *
144072891 TCTAGGTAGCCAATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144072934 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
144072977 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144073020 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144073061 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
144073104 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144073147 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCAAGGCTCCCGAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144073189 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144073230 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144073273 CCTAGGTTGCCGACGGTG-CCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144073315 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144073358 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCT-CCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144073399 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144073442 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144073485 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144073528 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144073571 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144073614 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144073657 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAAGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144073699 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144073742 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144073785 CCTAGGTTCCCGATGGCGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144073828 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144073871 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144073914 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144073956 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144073999 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144074042 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144074084 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAAGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144074126 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144074169 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144074212 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * **
144074255 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCAAAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144074298 CCTAGGTTGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC-AGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGG-T----T--G---CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144074350 CCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGA-CTAGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144074392 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144074435 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144074478 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144074520 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144074563 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144074606 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
144074649 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * *
144074692 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144074735 CCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144074778 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144074821 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144074862 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * **
144074905 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCTAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * **
144074948 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTACCAAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144074990 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144075031 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144075074 CCTAGGTTGCCGACGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144075117 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144075160 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144075202 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144075245 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144075288 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144075331 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCGGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144075374 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144075417 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144075460 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAAGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144075502 CCTAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144075545 CCTAGGTTGCCTATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144075588 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGA-CTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * **
144075630 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCAAAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * * *
144075673 CCTAGGTTGGGCCTA-GGTTACCGATGG-TGCCCAGGCTC--CCACATGA
1 CCTAGGTT--GCCGATGGTGCCCGA-GGCT-CCC--GCACGACCA-AGGG
* * * * * ** * * * *
144075719 CCAAGG--GCCCGAAGCT-CTCG-CGC-GAC-TAGGGCCTAGGTTG
1 CCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG--G
* * * * * * * * * *
144075759 CCGATGATGCCCGAAGCT-CCCGCA--CTACC-AAGGGCCTAGGTTG
1 CCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCG-AGGCTCCCGCACGACCAAGG--G
* * ** * * * *
144075802 CCGATGG-TGTCCGA-GGCT-CCCTTA--CGACC-AAGGGCCTAGGTTG
1 CCTA-GGTTG-CCGATGG-TGCCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGG--G
* * * * * * *
144075845 CCGATGG-TGCCCGA-GGCT-CCCGCACG-ACCAG--GGGCCTAGGTTG
1 CCTA-GGTTG-CCGATGG-TGCCCG-AGGCTCCCGCACGACCAAGG--G
* * *
144075888 CCGATGG-TGCCCGA-GGCT-CCC--GC-------ACGACCAGGGG
1 CCTA-GGTTG-CCGATGG-TGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144075922 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144075965 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
144076008 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * *
144076051 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144076094 CCGAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144076137 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144076180 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144076221 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * **
144076264 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCTAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * **
144076307 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTACCAAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144076349 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144076390 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144076432 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144076475 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144076518 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144076560 CCTAGCTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144076603 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144076646 CCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGCAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144076689 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTA-GAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACG-ACCAAGGG
* *
144076732 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144076775 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144076818 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCAAGACTCTCGCACGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144076860 CCTAGGTTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144076903 CCTAGGTTGCCGATTGTGGCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144076946 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144076989 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCAAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* *
144077043 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144077086 CCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGACTAGGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144077129 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAACCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** **
144077172 CCTAGGTTGCCGATGGTTTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144077215 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144077258 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144077301 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144077344 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144077387 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
144077429 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144077471 CCTAGGTTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * *
144077513 ACCTAGGCTACCGATGGAGCCAGAGGCTTCTGCGCGACTAGGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144077557 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144077600 -CTCAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTAAGACCAAGGG
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144077643 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144077685 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** ** *
144077728 TGTAGGTTGCAAATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
144077771 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144077813 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
* **
144077857 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * *
144077900 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAA--G
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
144077941 CATGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCT--AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144077985 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** *
144078028 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACAAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144078070 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * ** *
144078113 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144078156 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A-----A----GGG
* * * *
144078209 CCTCGGTTGCCGATGGCGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144078252 CCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCACGA-CTAGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144078294 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144078337 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
144078380 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144078422 CCTAGGTTGCCGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGG
1 CCTAGGTT----GCC------G---ATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144078478 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144078521 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144078564 CCTAGGTTGTCGAT-GTTACCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144078606 CCTAGGTCGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG-AGTGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGG
** **
144078649 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTGCGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144078692 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** *
144078735 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144078778 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTATGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144078820 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTACGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144078863 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * * *
144078906 TCTAGGTTACCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144078949 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
144078992 CGTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144079035 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGATCTCGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144079076 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
144079119 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144079162 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCAAGGCTCCCGAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144079204 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144079245 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144079288 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144079331 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144079374 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144079416 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144079459 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144079502 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144079545 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144079588 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144079631 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144079674 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144079716 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144079759 CCTAGGTTGCCTATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144079802 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** ** *
144079845 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAACTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* *
144079899 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144079942 CCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGA-CTAGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144079984 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144080027 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144080070 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
144080113 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144080155 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144080198 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
144080241 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144080283 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
**
144080327 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * * *
144080370 CCGAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAA--G
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * *
144080411 CACGAAGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144080455 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144080498 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144080540 CCTAGGTTACCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * *
144080583 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGC-GGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144080625 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
144080668 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144080711 CCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144080754 CCTA-GATGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144080796 CCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144080839 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * *
144080882 CCTAGGTTACCGATAGTGCCTGAGGCTCAAGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144080925 CCTAGATTGCAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144080968 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144081011 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144081054 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144081096 CCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144081139 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144081182 CC-AAGATGTCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144081223 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGGCCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * **
144081266 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCTAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144081309 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTCCCGAACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144081351 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144081392 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144081435 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144081478 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144081521 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCTCGCACGATCAAGGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144081563 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144081606 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144081648 CCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGCAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144081691 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCTAGG-TCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144081733 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** *
144081776 CCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGTTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** *
144081819 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCAAGACTCTTGCACGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144081861 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144081904 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144081947 CCTAGGTTACCGATGGCGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144081990 CCTAGGTTGCCAATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* *
144082044 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144082087 CCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGACTAGGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144082130 CCTAGGTTGCCGATAATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144082172 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144082215 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144082257 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144082300 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAATCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144082343 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
144082385 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144082427 CCTAGGTTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
144082469 ACCTAGGCTACCGATGGAGCCCGAGGCTTCTGCGCGACCAGGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144082513 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144082556 -CTCAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTAAGACCAAGGG
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144082599 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCTCACGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** * *
144082640 TCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGGCCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144082683 TGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
144082726 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144082768 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
* **
144082812 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** **
144082855 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTGCGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144082898 CCTAGGTTG-CGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144082940 CCTAGATTGCCGATGGTGCCCGA-GCTCCCTTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144082982 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144083024 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTACGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144083067 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * *
144083110 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083153 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
144083196 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144083239 CCAAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGATCTCGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083280 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** **
144083323 CCTAGATTGTCGATGGTGTCCAAGGCTCTCAAAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * * *
144083366 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCAAGGCT-CCGAACGAACAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083407 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144083448 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAATGCTCCCGCACAACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144083491 CCTAGCTTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083534 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083577 CCTAGG-CGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGATCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083619 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144083662 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144083705 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCTGTAGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144083748 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144083791 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144083834 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144083877 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACGGAGGCTCTCGCACGACTAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144083919 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144083962 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144084005 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144084048 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* * *
144084102 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144084145 CCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGA-CTAGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144084187 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144084230 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144084273 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144084316 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144084359 CCTAGGTTGTCGATGGTGGCCGAGGAT-CCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144084401 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
144084444 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * *
144084487 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCT-CCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144084529 CCGAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144084572 CCTAGGTTGCCGATGGT-CTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGC-CCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * *
144084615 CC-AAGATACCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144084656 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * **
144084699 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCTAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144084742 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTCCCGAACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144084784 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144084825 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144084868 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144084911 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144084954 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144084996 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144085039 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144085082 CCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGCAGGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144085124 TCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144085168 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144085211 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** *
144085254 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCAAGACTCTTGCACGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144085296 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144085339 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144085382 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144085425 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* *
144085479 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144085521 CCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGACTAGGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144085564 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCTGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144085607 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144085650 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144085693 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144085736 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144085778 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAATCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144085821 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
144085863 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144085905 CCTAGGTTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
144085947 ACCTAGGCTACCGATGGAGCCCGAGGCTTCTGCGCGACCAGGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144085991 CCTAGGTTACCGATGATTCCCGAAGCTCCCGTACGACTAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144086034 -CTCAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTAAGACCAAGGG
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144086077 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144086119 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144086162 TGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
*
144086205 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144086247 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
* **
144086291 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * * **
144086334 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
** *
144086377 CGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** *
144086419 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGTCTCCTTCACGACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144086462 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144086504 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * ** *
144086546 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCTGCGGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144086589 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA-GCTCCTGCATGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144086631 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144086673 CCTAGG-TGCCGAT-GTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144086714 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144086757 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144086800 CCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGCAGGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144086842 TCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144086886 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144086928 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** *
144086971 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCAAGACTCTTGCACGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144087013 CCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144087056 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144087099 CCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144087141 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-A------A----GGG
* *
144087195 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144087238 CCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGACTAGGGG
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144087281 CCTAGGTCGCCGATGATGCCCGAAGCTCCTGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144087324 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144087367 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144087410 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144087453 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144087496 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAATCGAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144087539 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
144087581 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144087623 CCTAGGTTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
144087665 ACCTAGGCTACCGATGGAGCCCGAGGCTTCTGCGCGACCAGGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144087709 CCTAGGTTACCGATGATTCCCGTA-GCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG-AGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144087752 -CTCAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTAAGACCAAGGG
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144087795 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGA--CTCCCTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144087835 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * *
144087877 TGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
*
144087920 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGC-CGACC-AGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144087961 CCTAGGTTACCGATGGT--CCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
* **
144088002 CCTAGGTTACCGATGGTG-CCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * * **
144088044 CCTAGGTTGCCGATGGT-ATCGA-TCTCTCGCA-GATCGAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
** *
144088085 CGAAGG-TGCCGATGGTG-CCGAGGCT-CCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144088125 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
144088167 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACC--GGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144088207 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * ** *
144088250 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCTGCGGGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144088293 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGACCAAGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** * * *
144088336 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGA-GCTCCTGCTCGACAAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144088378 -CTAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCGAGGG
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144088421 CCT-GGATGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAATAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AA-GGG
* * * * *
144088465 CCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGA-GCGCCCGCACTACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144088507 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** *
144088550 CCTAGGTTACCGATAGTGCTTGA---TCCCGCATGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144088589 CCTAGATTGCAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144088632 CCTAGCTTGTCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
144088675 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
144088718 CCTAGGTTGTCGAT-GTTACCGAGGCT-CTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
144088759 CCTAGGTCGCTGATGGTGCCCGAGGCT-CCG-AGTGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGG
** **
144088801 CCTAGGTTATCGATGG-GCCCGAGGCTCCCGTGCGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144088843 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCACTACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** *
144088885 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144088928 CCTAAG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144088970 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTATGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144089013 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTAG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * *
144089056 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
144089099 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
144089142 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
144089185 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGTACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
144089226 TCTAAGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * **
144089269 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCAAGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
144089311 CCAAGG-TG-CAATGATGGCCAAGGCTCCCGAATGACCAAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AAGGG
* * *
144089353 TCCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
144089395 CCTAGGTTGACGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
144089416 CAAGGGCCTA
Statistics
Matches: 20291, Mismatches: 3737, Indels: 1148
0.81 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
33 7 0.00
34 10 0.00
36 6 0.00
38 2 0.00
39 58 0.00
40 204 0.01
41 776 0.04
42 5145 0.25
43 13322 0.66
44 292 0.01
45 46 0.00
46 12 0.00
47 11 0.00
48 1 0.00
50 3 0.00
51 1 0.00
52 28 0.00
53 65 0.00
54 266 0.01
55 25 0.00
56 11 0.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.33, T:0.18
Consensus pattern (43 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
Found at i:144064872 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 144064627--144065441 Score: 346
Period size: 85 Copynumber: 9.6 Consensus size: 85
144064617 TTTTCTTTAG
* * * ** * * * * *
144064627 CCCGCACATCTGAGGCACCAGGGTGCCCCTGCTGCTCGAGGCACCCGTACATCCAA-CGTCCTAG
1 CCCGCACATC-CAAGCACCAAGGTGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC-ACCAAG
* *
144064691 GTTACCGACGGTGTCAGAGGCT
64 GTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
** * ** * * * * *
144064713 CTAGCACATCCAAGCACCAGGGTGCCCCTGCTGCTCGAGGCACTCGCATATCCAA-CATCCTAGG
1 CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCA-CCAAGG
144064777 TTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
65 TTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
*
144064798 CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGATGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGG
1 CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGG
** * *
144064863 -TGCTAATGGTGCCTGAGGCT
65 TTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
** * *
144064883 CCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTG-TCCGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACCAA
1 CCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAA
* * * *
144064946 GG-TACCGATGGTGCCCGAGGTT
63 GGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
* ** * * * * ** *
144064968 CTCGCACGAT-CAAG-GTCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTA
1 CCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAA
*
144065030 GGTTGCCGATGGTGTTAGAGGCT
63 GGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
* * * * ** *
144065053 CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGGC-CAAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAG
1 CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAG
*
144065116 G-TGCCGATGGT-TCCGAGGCT
64 GTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
* ** * * * * * * ** *
144065136 CTCGCACGA-CCAAGTGCCTAGGTTACCGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTA
1 CCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAA
*
144065199 GGTTG-CGATGGTGTCCGAGGCT
63 GGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
* ** * * * * ** *
144065221 CCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCTCA-AGCCCAAGGGCCT
1 CCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCA
* * * *
144065283 A-GATGTCGATGGTGGCCGAGGCT
62 AGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
* * * * * * * ** *
144065306 CCCGCACGA-CCAAAG-GCCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGCGGCTCCCGCACGA-CTAGGGGCCT
1 CCCGCAC-ATCC-AAGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCA
* *
144065368 AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCT
62 AGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCT
* ** * * *
144065392 CCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC
1 CCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC
144065442 GACCAGGGGC
Statistics
Matches: 613, Mismatches: 87, Indels: 58
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
83 26 0.04
84 98 0.16
85 372 0.61
86 114 0.19
87 3 0.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.33, G:0.30, T:0.17
Consensus pattern (85 bp):
CCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT
TGCCGATGGTGTCAGAGGCT
Found at i:144064881 original size:128 final size:127
Alignment explanation
Indices: 144064771--144088563 Score: 6115
Period size: 128 Copynumber: 185.1 Consensus size: 127
144064761 TATCCAACAT
* *
144064771 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGATGCTCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * *
144064836 GGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCTAATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGAT-CAAGG--CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144064899 CCTAGGTTGCCAATGGTGTCCGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * *
144064964 GGTTCTCGCACGATCAAGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144065026 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGGCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * *
144065091 GGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
66 GGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * ** * * *
144065152 CCTAGGTTACCGATGGTGCTCA-AGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144065215 GAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGCCCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * *
144065280 CCTA-GATGTCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAAG-GCCTAGGTTGCCTATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * *
144065342 CGCGGCTCCCGCACGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144065406 GG
126 GG
* * * ** * * * * * *
144065408 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGACTGCCGATGGTGCTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144065472 GAGGCTTCCGTAC-AACTAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144065536 G
127 G
* ** * * ** * * *
144065537 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CCAATG-GCCTAGGTTGTCGATGGT-AC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * * *
144065599 CGAGGCTCTTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144065664 G
127 G
** * * * * * ** * * * *
144065665 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * **
144065729 CAAGCTCCCGCACGACCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTC-CTGCACGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144065793 G
127 G
* * * * * ** * * * * * *
144065794 CCAAGGTTGCCAATGGTGTCCGAGGCTCCCTCA-AGACCAAGGGCCTAGATGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144065858 AGGCTCCCGCACGACCAAAGGCCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
144065922 CCTAGGTTGCCGATGGCGCCCA-AGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGAT-AGTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGA-TGC
* * * * * * * * * * * * *
144065984 TCGAGCCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGATTG-CAGATGGTGCCTGGGGCTCCCGTACAACTAG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCA-ATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAA
144066048 GGG
125 GGG
* * * * ** ** * * * * *
144066051 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCTTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * *
144066115 GAGGCTCCTTCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
** * * * * ** * * * *
144066179 CCTAGGTCACCGATGGTGCCCGAGGCTCCAG-A-GTGACCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * *
144066242 CGAGGCTCCCACGCGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144066307 G
127 G
* * ** ** * * *
144066308 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCAAT-AGTGGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTACCAATGA-TGCCC
* * ** * *
144066371 TAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTACT-GCACGACC-AGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCT-CTCGCACGACCAAGG
144066434 G
127 G
* * * *** * * * * *
144066435 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGTGGTCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-CACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * *
144066498 TGAGGCTCCTGCACGACCAGGGGCCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144066563 G
127 G
* * * * * *
144066564 CCTAGGTTTCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* ** * * * * * * *
144066629 GGTTCTGGTACGATCAAGGTCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * *
144066691 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCA-AGGCTCTCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGATGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGT-CAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144066755 AGGCTCCCGAACGACCAAGGGCCTAGGTT-CCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
65 AGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * *
144066817 CCTAGGTTGGCGATGGTGATCA-AGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * *
144066880 CGAGGCTCCTGCATGA-CAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144066944 G
127 G
* * * ** * * * *
144066945 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCCCGCACGAT-CAAGGGCCTAGGTTGCCTATGGTG-CC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144067007 GAGGCTCCCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
** * * * * ** * * * * *
144067072 CCTAGGTTGCCGATGGTACCTGAGCCTCCCGCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144067136 GAGGCTCCCGTAC-AACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGTTCCCGCACGACCTAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144067199 G
127 G
** * * * * *
144067200 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGGGCCTAGGTTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA--G-C-A-------CCAAGG-TAC
* * * * * * * *
144067264 CGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGCCCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCG
53 CAATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTT-GCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCG
** * *
144067328 TGCGACTAGGGG
116 CACGACCAAGGG
* * * * ** * * * *
144067340 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * *** ** * *
144067403 GAGGCTTTCGCACGACCAGGGGTGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG-G
144067467 G
127 G
* * * ** * * *
144067468 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGTCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * ** *
144067532 GAGGCTCCCGCACGACCAGGAGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * * * *
144067596 CCTAGGTTGTCGATGGTATCCGATGCTCTCGCAGATCGAAGCACGAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * * * *
144067661 GGCTCCCGTACGACCAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTC-CTTCACGACCAATGG
66 GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGGG
* * * ** ** * * *
144067723 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * ** * * ** *
144067786 GAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* ** * ** * * * * **
144067851 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGA-CCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGTTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144067915 GAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144067980 CCTA-GATGTCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAAG-GCCTAGGTTGCCTAT-AGTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGCACCAAGG-TACCAATGA-TGC
* * * * * * * *
144068041 CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGCGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144068106 GG
126 GG
* * * ** * * ** *
144068108 CCTAGGTTGCCGATAGTGCTC-GAGCCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGATTGCAGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTACCA-ATGATGCC
* * * * * * * * * * *
144068171 TGGGGCTCCCGTAC-AACTAGGGGCCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144068235 GG
126 GG
* ** ** * ** * * *
144068237 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * ** * *
144068300 GAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTCACCGATGGTGCCCGAGGCTC-CAG-AGTGACCAAG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCA-CGACCAAG
144068363 GG
126 GG
** * * * * ** * * * *
144068365 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCT-CC-CACGTGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * **
144068428 CGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144068493 G
127 G
* * * ** ** * ** * *
144068494 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144068557 GAGGCTACTGGACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG-G
144068621 G
127 G
* * * * ** * * * *
144068622 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCTGCACGA-CCAGGGGCCGAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144068686 GAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144068750 A
127 G
* * * * ** * ** * * *
144068751 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTGGTACGAT-CAAG-GTCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144068813 GAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144068877 A
127 G
* * * * * * ** * * * * *
144068878 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTCCCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTCCGATGGT-TCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * ** * * *
144068940 AGGCTCTCGCACGACCAAGTGCCTAGGTTGGCGATGGTGATCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * *
144069004 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * * *
144069068 GAGGCTCCCTCAAGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATTGTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * *
144069132 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CC-AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144069195 GAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCTGAGCCTCCCGCA-GCACCAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACG-ACCAAGG
144069259 G
127 G
* * * * * * ** * * * *
144069260 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACAACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * *
144069325 AGGTTCCCGCACGACCTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTC-CGGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACC-A---
144069389 CCTAGGTTGGG
124 ---A----GGG
* * * *
144069400 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CC-CACATGACCAAGGC-CCTAGGTTATCC-ATGGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT--CCAA-GCACCAAGG-TA-CCAATGATG
* * ** * * * * * * *
144069461 -CCGAAGCTCTCGTGCGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCA
61 CCCGAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCA
144069524 AGGG
124 AGGG
* * ** * ***** * ** *
144069528 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGA-CCAGGGGTGTAGGTTGCGGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * *
144069592 GAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144069655 G
127 G
* * * * * * *
144069656 TCCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGG-TACCAATGATGC
** * * * ** * *
144069718 CCGATACT-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAA
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAA
**
144069781 GCA
125 GGG
** * * * ** * * * * *
144069784 CGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * *
144069847 GAGGCTCCTTCACGACCAATGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * *
144069911 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTATCTATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * * *
144069975 GAGGCTCCCGCGGGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGA-CAAGT
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144070038 G
127 G
* ** * * * *
144070039 CCTAGGTTGCCGATGGTGTTC-GAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCAAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * *
144070102 CGAGGCTCCCTCAAGACCAAGGGCCTA-GATGCCTATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144070166 G
127 G
* * * * * ** * * *
144070167 CCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGAT-AGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGA-TGCC
* * * * * * * * *
144070230 CGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTT-ACGATAGTGCCTGAGGCTC-CGCATGACCAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144070293 G
127 G
* * * * * * * * * ** * * ** * *
144070294 CCTAGATTGCAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCA-CTAGGGGCCTAGCTTGGCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144070358 GAAGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTC-CTTCACGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144070422 G
127 G
* * * * * * *
144070423 CCTAGGTTTGTCGAT-GT-TACCGA-GCTCTCGCACGA-CCAATG-GCCTAGGTCACCGATGGTG
1 CCTAGG-TTGCCGATGGTGT-CAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGGT-ACCAATGATG
* * * ** * **
144070483 CCCGAGGCTCCCG-AGTGACCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTC-CGTGCGACCA
61 CCCGAGGCTCCCGCA-CGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCA
144070546 AGGG
124 AGGG
* * * * ** * * * * * *
144070550 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCTGAAGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
** * * * * * * * *
144070614 GAGGCTCCCTTACAACCATGGGCCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * ** * * * * *
144070678 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTACGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144070742 GAGGCTCCCGCACGACCAGTGGTCTAGGTTGCCAAATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCC-AATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144070807 G
127 G
* * * * * ** * * *
144070808 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCA-AGGCTCCCGTACAACCAAG-GCCTAGGTTGCGATGGTGTCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * * *
144070871 AAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGG-TTTCCGTACGATCAA-G
65 AGGCTCCCGCACGAT-CAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCT-CGCACGACCAAGG
144070932 G
127 G
* * * * * * ** * * * * * *
144070933 TCTAGTTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACA-AGACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144070997 AAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGATGGCCAAGGCTCCCGAACGACCAA-G
64 GAGGCTCCCGCACGAT-CAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144071059 G
127 G
* * ** * * * *
144071060 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGTGCCTAGGTTGA-CGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-ACCAATGATGCC
* * * * * * *
144071121 CAAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGACGGTG-CC--GGCTC-CTGCATGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAG
144071182 GG
126 GG
* * * ** * * * * *
144071184 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGC-CCCTCAAGAT-CAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGC-ACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * *
144071247 AGGCTCCCGCGCACGATCAAGGGCCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGG
65 AGGCT-CC-CGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144071312 G
127 G
* * ** * * * *
144071313 CCTAGGTTGCCGATGTGTGCCCA-AGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 CCTAGGTTGCCGATG-GTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGC
* * * * * * * * * * * *
144071376 CTGA-CCT-CCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144071439 GG
126 GG
* * * * ** * * * * *
144071441 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGA-CCTAGGGCCTAGGTTTGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG--TACCAATGATGCC
** * * * * * * * *
144071505 CGAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGAT-GTGGTACCGAAGCTCTCGCACGACTAA
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGT-G-CCCGAGGCTCTCGCACGACCAA
*
144071569 GGA
125 GGG
* * * ** * * *
144071572 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCT-CC-CACGA-CC-AGGGCCTAGGTTGCCGATG-TGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144071632 GAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTCCCGATGGCGCCCGAGGCTC-C-CGCGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* ** * ** * ** * * *
144071695 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTACCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * *
144071760 AAGCTCTCGCACGA-CTAAGGACCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** ** * * * * **
144071824 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGATACTCCCGCACGA-CCAAGGGCCGAGGTTGCCGATGGTATCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144071888 GATGCTCTCGCA-GATCGAA-GCACGAA-GTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGC-C-AAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144071949 GG
126 GG
* ** * * ** * * *
144071951 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CCAATG-GCCTAGGTTGTCGATGGT-AC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * * *
144072013 CGAGGCTCTTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144072078 G
127 G
** * * * ** * ** * * * *
144072079 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGC-ACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * **
144072143 CAAGCTCCCGCACGACCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTC-CTGCACGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144072207 G
127 G
* * * * ** * * * * * *
144072208 CCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCA-AGACCAAGGGCCTAGATGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * * * *
144072272 AGGCTCCCGCACGACCAAAGGCCTAGGTTGCCTATAGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * *
144072336 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGAT-AGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGA-TGCC
* ** * * * * * * * * * * *
144072399 TGAGGCTCAAGCATGACCAGGGCCTAGATTG-CAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCACTAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCA-ATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144072463 G
127 G
* * * * * * ** * * * * *
144072464 CCTAGCTTGCCGATAGTGCCCGAAGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * **
144072528 GAGGCTCCTTCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGAT-GTTACCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * *
144072592 CCTAGGTCGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG-A-GTGACCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * * *
144072655 CGAGGCTCCCGTGCGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACTACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144072720 G
127 G
* * ** * * ** * * * *
144072721 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCATGGGCCTAGGTGCCAAT-AGTGGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGA-TGCCCG
* * * * * * * *
144072785 AGGCT-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGC-CGTACAACTAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCT-CTCGCACGACCAAGGG
*** * * *
144072848 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACGA-CC-AGTGGTCTAGGTAGCCAATGGTGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-CACCAAGGTA-CCAATGATGC
* * * * * * * *
144072910 CTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144072975 GG
126 GG
* * * * * *
144072977 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCTGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * * * * *
144073042 GGTTCTCGTACGATCAAGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAAGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144073104 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCA-AGGCTCTCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGATGGCCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGT-CAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144073168 AGGCTCCCGAACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
65 AGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * * *
144073230 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCA-AGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGACGGTG-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * * *
144073292 CGAGGCTCCTGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGATCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144073357 G
127 G
* * ** * * * *
144073358 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCT-CCGCACGAT-CAAGGGCCTAGGTTGCCTATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144073420 GAGGCTCCCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * ** * * * *
144073485 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144073549 GAGGCTCCCGTAC-AACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144073613 G
127 G
* ** * ** * ** * * *
144073614 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * *
144073678 AAGCTCTCGCACGA-CTAAGGACCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * **
144073742 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTCCCGATGGCGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144073806 GAGGCTCCCGCGCGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTC-CTTCACAACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144073870 G
127 G
** * ** * * * *
144073871 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCA-AGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * * * * * *
144073934 TGAGCCTCCCGTAGGACCAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * *
144073999 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGA-CCTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-TC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * * * * *
144074062 GAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAAGCTCTCGCACGACTAAGGA
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
144074126 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATTG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACC-AATGATGCC
* * * * * * * * *
144074189 CGAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144074254 G
127 G
* * * * * * * *
144074255 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCAAAACCAAGGGCCTAGGTTGGCCTAGGTTACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAA--G-C-A------CCAAGG-TACCA
* * * * * * * * *
144074320 ATGGTGCCC-AGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCG
55 ATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTT-GCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCA
*
144074383 CGA-CTAGGG
118 CGACCAAGGG
* * * * ** * * * * *
144074392 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * *
144074456 GAGGCTCCCTTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * * *
144074520 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144074584 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * *** * * * * *
144074649 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGTGGTCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-CACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * *
144074712 TGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144074777 G
127 G
* * * * * *
144074778 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGATGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * * *
144074843 GGTTCTCGCACGATCAAGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * *
144074905 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCA-AGGCTCTCGCACATCTAAGCACCAAGGTGCCAATGATGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGT-CAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* ** * * * * *
144074969 AGGCTACCAAACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
65 AGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * * *
144075031 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCA-AGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGACGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * * *
144075094 CGAGGCTCCTGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGATCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144075159 G
127 G
* * ** * * * *
144075160 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGAT-CAAGGGCCTAGGTTGCCTATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144075223 GAGGCTCCCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * ** * * * * *
144075288 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144075352 GAGGCTCCCGTAC-AACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144075416 G
127 G
* ** * ** * ** * * *
144075417 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * ** * *
144075481 AAGCTCTCGCACGA-CTAAGGACCTAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * ** * * * *
144075545 CCTAGGTTGCCTATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * ** * **
144075609 GAGGCTCCCGCGCGA-CTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTC-CGGCAAAACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144075672 G
127 G
* * * * *
144075673 CCTAGGTTGGGCCTA-GGT-TACCGATGG-TGCCCAG-GC-TCC---CA-C-ATG-ACCAA-G-G
1 CCTAGGTT--GCCGATGGTGT-CAGA-GGCT-CCC-GCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGAT
* * * * * * * * * *
144075725 GCCCGAAGCTCTCGCGCGA-CTAGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACTACCA
60 GCCCGAGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCA
144075789 AGGG
124 AGGG
* ** ** * * * *
144075793 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144075857 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * *
144075922 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144075986 GAGGCTCCCGTACAACCGAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGTG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG-G
144076050 G
127 G
* * * ** * * ** *
144076051 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCGAGGTTGCTGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144076115 GAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144076179 A
127 G
* * * * * * ** * * * *
144076180 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGAT-CAAG-GTCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144076242 GAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCTAAGC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144076306 A
127 G
* * * * * * ** ** * * * * *
144076307 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTACCAAACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-TCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * * * *
144076369 AGGCTCTCGCACGACCAAGTGCCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * * *
144076432 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGA-CCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * * *
144076496 GAGGCTCCCTCAAGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCCCGCACGATCAAGGC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * ** * * * *
144076560 CCTAGCTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * * *
144076624 GAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGCAGGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * ** * * * *
144076689 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTAGAACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * * *
144076754 AGGTTCCCGCACGACCTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTC-CTTCACAACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGGG
* ** * * * * * * *
144076818 CCTAGGTTGTCGATGGTACCA-AGACTCTCGCACGA-CCAAGGACCTAGGTTTCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144076881 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATTGTGGCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * * *
144076946 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144077010 AAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCAC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCC-A----------AGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGC
*
144077075 ATGACCAAGGG
117 ACGACCAAGGG
* * * * * * * * ** * * *
144077086 CCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCC
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * ** * **
144077149 CGAACCTCCCGCACTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTTTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144077214 G
127 G
* * * ** * * * *
144077215 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144077279 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * *
144077344 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * *
144077409 -GGCTCCCACAC-ATCCAAGTACCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGAT-CAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
144077471 CCTAGGTTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGCTACCGATGGA-GCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAAT-GATGCC
* * * * * * * * * *
144077534 AGAGGCTTCTGCGCGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144077598 GG
126 GG
* ** * ** * * * * *
144077600 -CTCAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTA-AGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGGCC
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144077663 GAGGCTCCCTCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
** ** * * * * * * *
144077728 TGTAGGTTGCAAATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA--CAAG-AGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA--CCAAGG-TACCAATGATGC
* * * * * *
144077790 CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGTCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144077854 GAG
126 G-G
* * * ** ** * * * * **
144077857 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGATACTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144077921 GATGCTCTCGCA-GATCGAA-GCATGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGC--CAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144077983 GG
126 GG
* ** * * ** * * *
144077985 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CCAATG-GCCTAGGTTGTCGATGGT-AC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * *
144078047 CGAGGCTCTTGCACGA-CAAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATC-AA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144078111 GG
126 GG
** * * * ** * ** * * * * **
144078113 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGC-ACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144078177 GAAGCTCCGGCACGACCAAGGCCTAGGTTGGGCCTCGGTTGCCGATGGCGCCCGAGGCTCCCACA
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGGCC-A----------AGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCA
*
144078242 TGACCAAGGG
118 CGACCAAGGG
* * * * * * * ** * * *
144078252 CCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCACGA--CTAGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCC
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * **
144078314 CGAAGCTCCCGCACTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144078379 G
127 G
* * * * *
144078380 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGCCTAGGTTGCCGGCCTAGGTTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCA------A----G-C-ACCAAGG-TA
* * * * * * *
144078444 CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCC
52 CCAATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC
*
144078508 GCACGACCAGGGG
115 GCACGACCAAGGG
* ** * * ** * **
144078521 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CCAATG-GCCTAGGTTGTCGATG-TTAC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * *
144078583 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTCGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG-AGTGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCA-CGACCAAG
144078647 GG
126 GG
** * * ** ** * * * *
144078649 CCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTGCGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * ** *
144078713 GAAGCTCCCGCACTACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * ** * ** * *
144078778 CCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTATGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144078841 GAGGCTGCCGTACGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGT
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG-
144078904 GG
126 GG
* * * * ** * * * *
144078906 TCTAGGTTACCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * ** * * *
144078970 GAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCGTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAAGCTC-CTGCAC-ATCCAAG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGA-CCAAG
**
144079033 CA
126 GG
* * * * * * ** * * * *
144079035 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGATCTCGTACGAT-CAAG-GTCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144079097 GAGGCTCCCACAAGACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCCAAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGC
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144079161 A
127 G
* * * * * ** * * * * *
144079162 CCAAGG-TGCCAATGATGGCCA-AGGCTCCCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-TCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144079223 GAGGCTCTCGCACGACCAAGTGCCTAGGTTGACGATGGTGCTCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * *
144079288 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144079352 GAGGCTCCCTCAAGACCAAGGTCCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGATCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * *
144079416 CCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * * * *
144079480 AAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGTAGGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * ** * * * *
144079545 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * * *
144079610 AGGTTCCCGCACGACCTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTC-CTTCACAACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGGG
* * * * * * * * * *
144079674 CCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGA-CTAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144079737 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCTATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * **
144079802 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCA-AGGCTCCCGCGCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * *
144079865 CGAAACTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCA
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCC-A----------AGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCG
*
144079930 CATGACCAAGGG
116 CACGACCAAGGG
* * * * * * * * ** * * *
144079942 CCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGA--CTAGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCC
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * ** *
144080004 CGAAGCTCCCGCACTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAATG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144080069 G
127 G
* * * ** * * * *
144080070 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144080134 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * *
144080198 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144080263 AGGCTCCCGCACGACCAGGGTCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGAG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG-G
* * ** ** * * * * **
144080327 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGATACTCCCGCACGA-CCAAGGGCCGAGGTTGCCGATGGTATCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * *
144080391 GATGCTCTCGCA-GATCGAA-GCACGAA-GTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGC-C-AAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144080453 GG
126 GG
* ** * * ** * * *
144080455 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGA-CCAATG-GCCTAGGTTGTCGATGGT-AC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * *
144080517 CGAGGCTCTTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144080582 G
127 G
** * * * ** * ** * * * * *
144080583 CCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * **
144080647 AAGCTCCCGCACGACCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAGGCTC-CTGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * * *
144080711 CCAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCA-AGACCAAGGGCCTAGATGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144080775 AGGCTCCCGCACGACCAAAGGCCTAGGTTGCCTATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
** * * ** * *
144080839 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGAT-AGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGA-TGCC
* ** * * * * * * * * * * *
144080902 TGAGGCTCAAGCATGACCAGGGGCCTAGATTG-CAGATGGTGCCCGGGGCTCACGTACCACTAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCA-ATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144080966 GG
126 GG
* * * * * ** * * * * *
144080968 CCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * *
144081032 GAGGCTCCTTCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * * *
144081096 CCGAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * *
144081161 AAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAA-GATGTCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
65 AGGCTCCCGCACGAT-CAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * * *
144081223 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-AGGCCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144081287 AAGGCTCTCGCAC-ATCTAAGCACCAAGG-TGCCAATGATGGCCGAGGCTCCCGAACGACCAAAG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144081350 G
127 G
* * ** * * * *
144081351 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGTGCCTAGGTTGA-CGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-ACCAATGATGCC
* * * * * * *
144081412 CAAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGCTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTC-CTGCATGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAG
*
144081476 GA
126 GG
* * * ** * * * * *
144081478 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCA-AGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * * *
144081542 TGGCTCTCGCACGATCAAGGCCCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * *
144081606 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * * * * *
144081669 GAGCCTCCCGCAGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCTAGG-TCCCGTACAACTAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * ** * * *
144081733 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCTAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* ** * * * * * * * * * *
144081797 GAGGTTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCAAGACTCTTGCACGACCAAGGA
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
144081861 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATTG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACC-AATGATGCC
* * * * * * * * * *
144081924 CGAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGCGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144081989 G
127 G
* ** * * * * *
144081990 CCTAGGTTGCCAATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGGGCCTAGGTTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA--G-C-A-------CCAAGG-TAC
* * * * * * * *
144082054 CGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCG
53 CAATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTT-GCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCG
* * *
144082118 CGCGACTAGGGG
116 CACGACCAAGGG
** * * * * * * * * *
144082130 CCTAGGTTGCCGATAATGCCCGAAGCTCCCGCAC-TACCAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144082193 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * *
144082257 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144082321 GAGGCTCCCGTACAATCGAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACAC-ATCCAAGT
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144082384 A
127 G
* * * * * ** * ** *
144082385 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCAATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144082448 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGACCTAGGCTACCGATGGAGCCCGAGGCT-TCTGCGCGACCAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144082512 G
127 G
* * * * ** * * * *
144082513 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTC-AGGTTGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCAC-CAAGG-TACCAATGATGCC
** * * * * * * *
144082576 CGAGGCTCCCTTAAGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCTCACGACCAA-G
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144082639 G
127 G
* * * * ** ** * ***** * ** *
144082640 TCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGGCCAGGGGTGTAGGTTGCGGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * *
144082705 AGGCTCCCGTACGA-CAAGAGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
65 AGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
144082768 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGAGCCTAGGTTACCGATGGTGC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGG-TACCAATGATGC
** * * ** * * **
144082831 CCGATACTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTGCGACCAAG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144082896 GG
126 GG
* * * ** * * * * *
144082898 CCTAGGTTG-CGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGATTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
** * * * * * * *
144082961 GA-GCTCCCTTACAACCAAGGGCCTAGG-TGCCAATAGTGGCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * ** * * * * *
144083024 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTGCCGTACGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144083088 GAGGCTCCCGCACGACCAGTGGTCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * * *
144083153 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* * * * * * * *
144083218 AAGCTCCTGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGATCTCGTACGATCAA-GG
65 AGGCTCCCGCACGAT-CAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * ** * * *
144083280 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACA-AGACCAAGGGCCTAGATTGTCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAG-GTACCAATGATGCCC
* * ** * * * * * *
144083344 AAGGCTCTCAAAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGATGGCCAAGGCTC-CGAACGAACAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGAT-CAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144083406 G
127 G
* * ** * * * *
144083407 CCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGTGCCTAGGTTGA-CGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-ACCAATGATGCC
* * * * * * * * * *
144083468 CAATGCTCCCGCACAACCAGGGGCCTAGCTTGCCGATGGAGCCCGAGGCTC-CTGCATGACCAAG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAG
144083532 GG
126 GG
* * * ** * ** * * *
144083534 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCA-AGACCAAGGGCCTAGGCGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * *
144083598 AGGCTCCCGCACGATCAAGGGCCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAGGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * *
144083662 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCA-AGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * * * * * * *
144083725 TGAGCCTCCTGTAGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144083790 G
127 G
* * * * ** * * * * *
144083791 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGA-CCTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * * * * *
144083855 GAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACGGAGGCTCTCGCACGACTAAGGA
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
144083919 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATTG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACC-AATGATGCC
* * * * * * * * *
144083982 CGAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144084047 G
127 G
* * * * * *
144084048 CCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGGGCCTAGGTTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA--G-C-A-------CCAAGG-TAC
* * * * * * * * * *
144084112 CGATGGTGCCCAAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCG
53 CAATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTT-GCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCG
* *
144084176 CGCGA-CTAGGG
116 CACGACCAAGGG
* * * * ** * * * * *
144084187 CCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * * *
144084251 GAGGCTCCCTTACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * ** * * *
144084316 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144084380 GAGGAT-CCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCGAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * *** * * * *
144084444 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGTGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-CACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * *
144084507 TGAGGCT-CCGCACGACCAGGGGCCGAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144084571 G
127 G
* * * * * *
144084572 CCTAGGTTGCCGATGGTCTCCGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGATACCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * * *
144084637 GGTTCTCGCACGATCAAGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
144084699 CCTAGATTGCCGATGGTGTCCA-AGGCTCTCGCACATCTAAGTACCAAGGTGCCAATGATGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGT-CAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144084763 AGGCTCCCGAACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGTG
65 AGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * *
144084825 CCTAGGTTGACGATGGTGCTCA-AGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * * *
144084888 CGAGGCTCCTGCATGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144084953 G
127 G
* * * * * * *
144084954 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGTGGCTCCCGCACGAT-CAAGGC-CCTAGGTTGCCTATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * * * *
144085016 CGAGGCTCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144085081 G
127 G
* * * * * * ** * * * *
144085082 CCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGCCTCCCGCAGGA-CCAGGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * *
144085146 GAGGCTCCCGTAC-AACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144085210 G
127 G
* ** * ** * ** * * * *
144085211 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCCG
* ** * * * * *
144085275 AGACTCTTGCACGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * *
144085339 CCTAGGTTGCCGATTGTGCCCGAGGCTCTCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * *
144085403 GAGGCTCCCGCGCGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTC-CGGCACGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144085467 G
127 G
* * ** *
144085468 CCTAGGTTGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAGGCT-CC-CACATGACCAAGGGCCTAGGTTAT
1 CCTAGGTT--GCC---GATG--G-T-GT-CAGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGCACCAAGG-TA-
* * * * * * * * *
144085531 CC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCGCGCGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGATGCCCGAAGCTC-C
52 CCAATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC
*
144085593 TGCACTACCAAGGG
115 -GCACGACCAAGGG
* ** ** * * * *
144085607 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * *
144085671 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * *
144085736 CCTAGGTTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144085799 GAGGCTCCCGTACAATCGAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACAC-ATCCAAGT
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG
*
144085862 A
127 G
* * * * * ** * ** *
144085863 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCAATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144085926 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGACCTAGGCTACCGATGGAGCCCGAGGCT-TCTGCGCGACCAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144085990 G
127 G
* * * * * * ** * * * *
144085991 CCTAGGTTACCGATGAT-TCCCGAAGCTCCCGTACGA-CTAAGGGCTC-AGGTTGCCGATGGTGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGT-CAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCAC-CAAGG-TACCAATGATGC
** * * * * * * *
144086053 CCGAGGCTCCCTTAAGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCTCACGACCAAG
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG
144086117 GG
126 GG
* * * ** * ***** * ** *
144086119 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGA-CCAGGGGTGTAGGTTGCGGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * *
144086183 GAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACC-AGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-A-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144086246 G
127 G
* * * * * * *
144086247 TCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGAGCCTAGGTTACCGATGGTGC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGG-TACCAATGATGC
** * * * ** * *
144086310 CCGATACTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCCGATGCTCTCGCA-GATCGAA
62 CCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAA
**
144086374 GCA
125 GGG
** * * * ** * * * * *
144086377 CGAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* ** * * * * * *
144086440 GAGTCTCCTTCACGACCAATGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * * *
144086504 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG--CATGACAAGGGCCTAGGTTATCTATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* ** * * * * *
144086567 GAGGCTCCTGCGGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA-GCTC-CTGCATGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
*
144086630 A
127 G
* * * ** * * * *
144086631 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCA-AGACC-AGGGCCTAGGTGCCGATG-TGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCG
* * * * * *
144086693 TGGCTCCCGCACGATCAAGGACCTAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * *
144086757 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * * * *
144086821 GAGCCTCCCGCAGGACCAGGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAACTAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGG-CCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * * * *
144086886 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGA-CCTAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * * * * * * *
144086949 GAGGCTCCTTCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-ACCAAGACTCTTGCACGACCAAGGA
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
144087013 CCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATTG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACC-AATGATGCC
* * * * * * * * *
144087076 CGAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCGCGACCAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144087140 G
127 G
** * * * * *
144087141 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGGGCCTAGGTTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA--G-C-A-------CCAAGG-TAC
* * * * * * * *
144087205 CGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTTATCC-ATGGTGCCCGAAGCTCTCG
53 CAATGATGCCCGAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTT-GCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCG
* * *
144087269 CGCGACTAGGGG
116 CACGACCAAGGG
* * * * * * ** * * * * *
144087281 CCTAGGTCGCCGATGATGCCCGAAGCTCCTGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * * * *
144087345 GAGGCTCCCTTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * * *
144087410 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144087474 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACAATCGAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * *
144087539 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCG-GGCTCCCACACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGCCTGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * *
144087603 GGCTCTCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
66 GGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * * ** * * *
144087665 ACCTAGGCTACCGATGGAGCCCGAGGCTTCTGCGCGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGATTCC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCC
* * * * * ** *
144087729 CGTA-GCTCCCGTACGACCAAGGGCTC-AGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTAAGACCAA
63 CG-AGGCTCCCGCACGATCAA-GGC-CAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAA
144087792 GGG
125 GGG
* * * ** * ** * *
144087795 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGA--CTCCCTCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
** * * *** ** * *
144087856 GAGGCTTTCGCACGACCAGGGTGTAGGTTGCGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG-GG
* * ** * * *
144087920 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGC-CGA-CC-AGGTCCTAGGTTACCGATG--GTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * ** *
144087980 GAGGCTCCCGCACGACCAGGAGCCTAGGTTACCGATGGTG-CCGATACTCCCGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAAG-GCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * *
144088044 CCTAGGTTGCCGATGGTATC-GA-TCTCTCGCAGATCGAAGCACGAAGGTGCCGATGGTG-CCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
* * * * * * *
144088106 GGCT-CCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTC-CTTCACGA-CAATGG
66 GGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGGG
* ** ** ** * * *
144088167 CCTAGGTTGTCGAT-G-GT-ACCGGCTCTTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * ** * ** *
144088228 GAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTATCTATGGTGCCCGAGGCTC-CTGCGGGACCAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGATCAA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGG
144088292 G
127 G
* ** * ** * * * * **
144088293 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCCAAGCTCCCGCACGA-CCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGTTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGATGCCC
* * * * * * * * *
144088357 GA-GCTCCTGCTCGA-CAAAGGGCTAAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCAAGACCGAGG
64 GAGGCTCCCGCACGATC-AA-GGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
144088420 G
127 G
* * * ** * * *
144088421 CCT-GGATGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAATAGGCCTAGGTTGCCTAT-AGTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA--CCAAGG-TACCAATGA-TG
* * * * * * * *
144088483 CCCGA-GCGCCCGCACTACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAA
61 CCCGAGGCTCCCGCACGATCA-AGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAA
144088547 GGG
125 GGG
*
144088550 CCTAGGTTACCGAT
1 CCTAGGTTGCCGAT
144088564 AGTGCTTGAT
Statistics
Matches: 19472, Mismatches: 3275, Indels: 1834
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
118 10 0.00
119 10 0.00
120 68 0.00
121 3 0.00
122 27 0.00
123 115 0.01
124 129 0.01
125 329 0.02
126 1161 0.06
127 3506 0.18
128 6977 0.36
129 5642 0.29
130 202 0.01
131 75 0.00
132 19 0.00
134 5 0.00
135 3 0.00
136 2 0.00
137 44 0.00
138 106 0.01
139 414 0.02
140 502 0.03
141 123 0.01
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.33, T:0.18
Consensus pattern (127 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGTCAGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGATGCCCGA
GGCTCCCGCACGATCAAGGCCAAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
Found at i:144067276 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 144067197--144067304 Score: 162
Period size: 54 Copynumber: 2.0 Consensus size: 54
144067187 GCACGACCTA
** *
144067197 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT
* * *
144067251 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGCCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT
144067305 ATCCATGGTG
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 6, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
54 48 1.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.34, T:0.18
Consensus pattern (54 bp):
GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT
Found at i:144067341 original size:97 final size:95
Alignment explanation
Indices: 144067155--144067348 Score: 248
Period size: 97 Copynumber: 2.0 Consensus size: 95
144067145 GTACAACTAG
* * * *
144067155 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAGGTTCCCGCACGACCTAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAGGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTTGCCGATGGTACC
144067220 CGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
66 CGAAGCTCCGG-ACGACCAAGGGCCTAGGTT
* * *
144067251 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGCCCTAGGTTATCC-ATGGTG
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT-GCCGATGGTA
* *
144067315 CCCGAAGCTCTCGTG-CGACTAGGGGCCTAGGTT
64 CCCGAAGCTC-CG-GACGACCAAGGGCCTAGGTT
144067348 G
1 G
144067349 CCGATGATGC
Statistics
Matches: 85, Mismatches: 9, Indels: 7
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
96 21 0.25
97 59 0.69
98 4 0.05
99 1 0.01
ACGTcount: A:0.16, C:0.30, G:0.35, T:0.19
Consensus pattern (95 bp):
GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAGGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTTGCCGATGGTACC
CGAAGCTCCGGACGACCAAGGGCCTAGGTT
Found at i:144069422 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 144069343--144069450 Score: 162
Period size: 54 Copynumber: 2.0 Consensus size: 54
144069333 GCACGACCTA
** *
144069343 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT
* * *
144069397 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGCCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT
144069451 ATCCATGGTG
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 6, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
54 48 1.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.34, T:0.18
Consensus pattern (54 bp):
GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGCCCTAGGTT
Found at i:144077071 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 144076986--144077093 Score: 162
Period size: 54 Copynumber: 2.0 Consensus size: 54
144076976 GCGCGACCAG
**
144076986 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCAAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCAAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
* * * *
144077040 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCAAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
144077094 ATCCATGGTG
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 6, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
54 48 1.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.30, G:0.34, T:0.18
Consensus pattern (54 bp):
GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCAAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
Found at i:144078237 original size:53 final size:54
Alignment explanation
Indices: 144078153--144078259 Score: 135
Period size: 53 Copynumber: 2.0 Consensus size: 54
144078143 GCGGGACCAG
* * **
144078153 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTCCGGCACGACCAA-GGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGCACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
* * * *
144078206 GGGCCTCGGTTGCCGATGGCGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGCACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
144078260 ATCCACGGTG
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 8, Indels: 1
0.83 0.15 0.02
Matches are distributed among these distances:
53 35 0.78
54 10 0.22
ACGTcount: A:0.17, C:0.31, G:0.35, T:0.18
Consensus pattern (54 bp):
GGGCCTAGGTTGCCGATGGCACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
Found at i:144078275 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 144078125--144078302 Score: 225
Period size: 96 Copynumber: 1.9 Consensus size: 96
144078115 TAGGTTATCT
* * * * * *
144078125 ATGGTGCCCGAGGCTCCCGCGGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAGCTC-CGGCA
1 ATGGCGCCCGAGGCTCCCACAGGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGACGGTACCCGAAGCTCTC-GCA
144078189 CGACCAAGGCCTAGGTTGGGCCTCGGTTGCCG
65 CGACCAAGGCCTAGGTTGGGCCTCGGTTGCCG
* * *
144078221 ATGGCGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTTATCC-ACGGTGCCCGAAGCTCTCGCA
1 ATGGCGCCCGAGGCTCCCACAGGACCAAGGGCCTAGGTT-GCCGACGGTACCCGAAGCTCTCGCA
* *
144078285 CGACTAGGGCCTAGGTTG
65 CGACCAAGGCCTAGGTTG
144078303 CCGATGATGC
Statistics
Matches: 69, Mismatches: 11, Indels: 4
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
96 66 0.96
97 3 0.04
ACGTcount: A:0.17, C:0.32, G:0.34, T:0.17
Consensus pattern (96 bp):
ATGGCGCCCGAGGCTCCCACAGGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGACGGTACCCGAAGCTCTCGCAC
GACCAAGGCCTAGGTTGGGCCTCGGTTGCCG
Found at i:144078438 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 144078420--144078446 Score: 54
Period size: 13 Copynumber: 2.1 Consensus size: 13
144078410 GCACGACCAG
144078420 GGCCTAGGTTGCC
1 GGCCTAGGTTGCC
144078433 GGCCTAGGTTGCC
1 GGCCTAGGTTGCC
144078446 G
1 G
144078447 ATGGTGCCCG
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 14 1.00
ACGTcount: A:0.07, C:0.30, G:0.41, T:0.22
Consensus pattern (13 bp):
GGCCTAGGTTGCC
Found at i:144078462 original size:55 final size:56
Alignment explanation
Indices: 144078378--144078489 Score: 208
Period size: 55 Copynumber: 2.0 Consensus size: 56
144078368 TACGACCAAG
144078378 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-GGGCCTAGGTTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCC
*
144078433 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGGCCTAGGTTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCC
144078489 G
1 G
144078490 ATGGTGGCCG
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 1, Indels: 1
0.96 0.02 0.02
Matches are distributed among these distances:
55 40 0.73
56 15 0.27
ACGTcount: A:0.12, C:0.33, G:0.38, T:0.17
Consensus pattern (56 bp):
GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCC
Found at i:144079937 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 144079842--144079949 Score: 153
Period size: 54 Copynumber: 2.0 Consensus size: 54
144079832 GCGCGACCAG
* **
144079842 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTATCCGAAACTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAACTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
* ** *
144079896 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAACTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
144079950 ATCCACGGTG
Statistics
Matches: 47, Mismatches: 7, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
54 47 1.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.29, G:0.34, T:0.19
Consensus pattern (54 bp):
GGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAAACTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
Found at i:144079965 original size:97 final size:96
Alignment explanation
Indices: 144079799--144079992 Score: 230
Period size: 97 Copynumber: 2.0 Consensus size: 96
144079789 GCATGACCAA
* * * * *
144079799 GGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCGCGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTAT
1 GGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGACGGTAC
144079864 CCGAAACTC-CGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
66 CCGAAACTCTC-GCACGA-CAAGGGCCTAGGTT
* * * * *
144079896 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTTATCC-ACGGTG
1 GGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT-GCCGACGGTA
* * *
144079960 CCCGAAGCTCTCGCGCGACTAGGGCCTAGGTT
65 CCCGAAACTCTCGCACGACAAGGGCCTAGGTT
144079992 G
1 G
144079993 CCGATGATGC
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 13, Indels: 5
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
96 14 0.17
97 65 0.79
98 3 0.04
ACGTcount: A:0.17, C:0.31, G:0.34, T:0.18
Consensus pattern (96 bp):
GGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGACGGTAC
CCGAAACTCTCGCACGACAAGGGCCTAGGTT
Found at i:144082072 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 144081987--144082094 Score: 162
Period size: 54 Copynumber: 2.0 Consensus size: 54
144081977 GCGCGACCAG
**
144081987 GGGCCTAGGTTGCCAATGGTACCCGAAGCTCCGGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCAATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
* * * *
144082041 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATGACCAAGGGCCTAGGTT
1 GGGCCTAGGTTGCCAATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
144082095 ATCCATGGTG
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 6, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
54 48 1.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.30, G:0.34, T:0.18
Consensus pattern (54 bp):
GGGCCTAGGTTGCCAATGGTACCCGAAGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTT
Done.