Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Chr08 129432109
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 129432109
ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.18, T:0.32
Warning! 350 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 56 of 425
Found at i:15256647 original size:38 final size:38
Alignment explanation
Indices: 15256490--15256679 Score: 229
Period size: 38 Copynumber: 4.9 Consensus size: 38
15256480 ATTTGATGTG
* *
15256490 TATCCGGGCTTAAAGACCCGCAGGCTATA-TGCTGGAATTA
1 TATCCGGG-TTAAA-TCCCGCAGGCT-TAGTGCTGGTATTA
* * *
15256530 TATTCGGGTTAAATCCCGCAGGCTTCGTGCTGGTAATA
1 TATCCGGGTTAAATCCCGCAGGCTTAGTGCTGGTATTA
* *
15256568 TATCTGGGTTAAATCCCGCAGGCTTCGTGCTGGTATTA
1 TATCCGGGTTAAATCCCGCAGGCTTAGTGCTGGTATTA
15256606 TATCCGGGTTAAATCCCGCAGGCTTAGTGCTGGTATTA
1 TATCCGGGTTAAATCCCGCAGGCTTAGTGCTGGTATTA
* * * *
15256644 TATCCGAGCTTAAAGTCCCACAGGTTTTGTGCTGGT
1 TATCCG-GGTTAAA-TCCCGCAGGCTTAGTGCTGGT
15256680 GACTGGATTC
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 14, Indels: 6
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
37 1 0.01
38 96 0.72
39 11 0.08
40 25 0.19
ACGTcount: A:0.22, C:0.22, G:0.26, T:0.31
Consensus pattern (38 bp):
TATCCGGGTTAAATCCCGCAGGCTTAGTGCTGGTATTA
Found at i:15261283 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 15261250--15261421 Score: 77
Period size: 24 Copynumber: 7.1 Consensus size: 23
15261240 TATCTGGGCT
15261250 ATAAT-AGGAAGCTCATAAGAGCC
1 ATAATCAGGAAGCTCA-AAGAGCC
**
15261273 ATAATCAGGAAGCTCATGTGAGCC
1 ATAATCAGGAAGCTCA-AAGAGCC
* *
15261297 AATAA-CGGGTAGCTCCGAAAG-GCC
1 -ATAATCAGGAAGCT-C-AAAGAGCC
* *
15261321 ATTAA-C-GGAAGCTCCAGATAGCC
1 A-TAATCAGGAAGCT-CAAAGAGCC
* * *
15261344 ATATATCGGGAAGTTCAAGCGAGCC
1 ATA-ATCAGGAAGCTCAA-AGAGCC
*
15261369 AT-ATCAGGAAGCTCATAAAGAGTCT
1 ATAATCAGGAAGCTC--AAAGAG-CC
*
15261394 TTAATCAGGAAGCTCAAGAAGAGCC
1 ATAATCAGGAAGCTC-A-AAGAGCC
15261419 ATA
1 ATA
15261422 TAATGGGACG
Statistics
Matches: 113, Mismatches: 21, Indels: 28
0.70 0.13 0.17
Matches are distributed among these distances:
22 4 0.04
23 29 0.26
24 36 0.32
25 26 0.23
26 18 0.16
ACGTcount: A:0.37, C:0.20, G:0.24, T:0.19
Consensus pattern (23 bp):
ATAATCAGGAAGCTCAAAGAGCC
Found at i:15268415 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 15268393--15268453 Score: 54
Period size: 11 Copynumber: 5.7 Consensus size: 11
15268383 TGATATACAA
15268393 GATATG-ACAT
1 GATATGCACAT
15268403 GATATGCACAT
1 GATATGCACAT
**
15268414 GATATG-TTAT
1 GATATGCACAT
*
15268424 GAGATGCACAT
1 GATATGCACAT
* *
15268435 GATATACTCAT
1 GATATGCACAT
*
15268446 TATATGCA
1 GATATGCA
15268454 TGGGTTGGGT
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 11, Indels: 3
0.73 0.21 0.06
Matches are distributed among these distances:
10 13 0.34
11 25 0.66
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.18, T:0.33
Consensus pattern (11 bp):
GATATGCACAT
Found at i:15268419 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 15268393--15268439 Score: 67
Period size: 21 Copynumber: 2.2 Consensus size: 21
15268383 TGATATACAA
*
15268393 GATATGACATGATATGCACAT
1 GATATGACATGAGATGCACAT
**
15268414 GATATGTTATGAGATGCACAT
1 GATATGACATGAGATGCACAT
15268435 GATAT
1 GATAT
15268440 ACTCATTATA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 23 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.11, G:0.21, T:0.32
Consensus pattern (21 bp):
GATATGACATGAGATGCACAT
Found at i:15270746 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 15270712--15270779 Score: 82
Period size: 29 Copynumber: 2.3 Consensus size: 29
15270702 GTGGTTGTTT
* *
15270712 TATGTTATATATGAGCCCTTGTGGCGGAA
1 TATGTTATATATCAGCCCTTGTGGCAGAA
* * *
15270741 TATGTTATATGTCAGCCTTTGTGGTAGAA
1 TATGTTATATATCAGCCCTTGTGGCAGAA
*
15270770 TAGGTTATAT
1 TATGTTATAT
15270780 GTAGAAGCCT
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 6, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 33 1.00
ACGTcount: A:0.25, C:0.10, G:0.25, T:0.40
Consensus pattern (29 bp):
TATGTTATATATCAGCCCTTGTGGCAGAA
Found at i:15270780 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 15270715--15270795 Score: 81
Period size: 29 Copynumber: 2.7 Consensus size: 29
15270705 GTTGTTTTAT
* * * * *
15270715 GTTATATATGAGCCCTTGTGGCGGAATAT
1 GTTATATGTAAGCCTTTGTGGCAGAATAG
* *
15270744 GTTATATGTCAGCCTTTGTGGTAGAATAG
1 GTTATATGTAAGCCTTTGTGGCAGAATAG
15270773 GTTATATGTAGAAGCCTTTGTGG
1 GTTATATGT--AAGCCTTTGTGG
15270796 ATGTTCTCTG
Statistics
Matches: 43, Mismatches: 7, Indels: 2
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
29 32 0.74
31 11 0.26
ACGTcount: A:0.23, C:0.11, G:0.28, T:0.37
Consensus pattern (29 bp):
GTTATATGTAAGCCTTTGTGGCAGAATAG
Found at i:15270888 original size:55 final size:55
Alignment explanation
Indices: 15270814--15270937 Score: 160
Period size: 55 Copynumber: 2.3 Consensus size: 55
15270804 TGTTATATGG
* * *
15270814 AGCCTTAGTGGTCGACTCTATGAATGCGCTTTCGTGGCAAAATATGTTAAGTGAA
1 AGCCTTTGTGGTTGACTCTATGAATGCACTTTCGTGGCAAAATATGTTAAGTGAA
* * ** * *
15270869 AGCTTTTGTGGTTGACTCTATGAATGCACTTTTGTGGTGAAATATGTTAAGTTAG
1 AGCCTTTGTGGTTGACTCTATGAATGCACTTTCGTGGCAAAATATGTTAAGTGAA
15270924 AGCCTTTGT-GTTGA
1 AGCCTTTGTGGTTGA
15270938 TTCTGTTAAA
Statistics
Matches: 59, Mismatches: 10, Indels: 1
0.84 0.14 0.01
Matches are distributed among these distances:
54 5 0.08
55 54 0.92
ACGTcount: A:0.24, C:0.13, G:0.26, T:0.37
Consensus pattern (55 bp):
AGCCTTTGTGGTTGACTCTATGAATGCACTTTCGTGGCAAAATATGTTAAGTGAA
Found at i:15275917 original size:83 final size:82
Alignment explanation
Indices: 15275774--15275926 Score: 279
Period size: 83 Copynumber: 1.9 Consensus size: 82
15275764 ATACTTTGGA
*
15275774 AAATCTGCGATTACAAGTAGGTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAA
1 AAATCTGCGATTACAAGTAGGTTGGACAATTAGAATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAA
15275839 GCAGACCGCGTTGAGTC
66 GCAGACCGCGTTGAGTC
*
15275856 AAATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGAATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATA
1 AAATCTGCGATTACAAGTAGG-TTGGACAATTAGAATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATA
15275921 AGCAGA
65 AGCAGA
15275927 ATTTGGTGGT
Statistics
Matches: 68, Mismatches: 2, Indels: 1
0.96 0.03 0.01
Matches are distributed among these distances:
82 20 0.29
83 48 0.71
ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (82 bp):
AAATCTGCGATTACAAGTAGGTTGGACAATTAGAATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAA
GCAGACCGCGTTGAGTC
Found at i:15276286 original size:133 final size:133
Alignment explanation
Indices: 15276048--15276353 Score: 542
Period size: 133 Copynumber: 2.3 Consensus size: 133
15276038 ATATATTTCT
*
15276048 AAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTACCTATTGAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATT
1 AAAAATATTTTTA-TTTCCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATT
15276113 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
65 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
15276178 CTCA
130 CTCA
15276182 AAAAATATTTTTATTTCCCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAA-TTCTCTCCATT
1 AAAAATATTTTTATTT-CCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATT
*
15276246 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
65 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
15276311 CTCA
130 CTCA
* *
15276315 AAAAATATTTTTATTTTCGGAAATATTATTTACCGATTT
1 AAAAATATTTTTATTTCCGG-AATATTATTTACCTATTT
15276354 TTAAATGAAA
Statistics
Matches: 166, Mismatches: 4, Indels: 5
0.95 0.02 0.03
Matches are distributed among these distances:
132 3 0.02
133 115 0.69
134 48 0.29
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.05, T:0.44
Consensus pattern (133 bp):
AAAAATATTTTTATTTCCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATTT
TAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTTC
TCA
Found at i:15280457 original size:83 final size:83
Alignment explanation
Indices: 15280318--15280471 Score: 299
Period size: 83 Copynumber: 1.9 Consensus size: 83
15280308 ATACTTTGGA
15280318 AAATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGAAGCTTCTATCAAAGATA
1 AAATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGAAGCTTCTATCAAAGATA
15280383 AGCAGACCATGTTGAGTC
66 AGCAGACCATGTTGAGTC
*
15280401 AAATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATA
1 AAATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGAAGCTTCTATCAAAGATA
15280466 AGCAGA
66 AGCAGA
15280472 ATTTGGTAGT
Statistics
Matches: 70, Mismatches: 1, Indels: 0
0.99 0.01 0.00
Matches are distributed among these distances:
83 70 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.25, T:0.29
Consensus pattern (83 bp):
AAATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGAAGCTTCTATCAAAGATA
AGCAGACCATGTTGAGTC
Found at i:15280831 original size:133 final size:133
Alignment explanation
Indices: 15280593--15280898 Score: 533
Period size: 133 Copynumber: 2.3 Consensus size: 133
15280583 ATATATTTCT
*
15280593 AAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATAATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATT
1 AAAAATATTTTTA-TTTCCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATT
15280658 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
65 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
15280723 CTCA
130 CTCA
15280727 AAAAATATTTTTATTTCCCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAA-TTCTCTCCATT
1 AAAAATATTTTTATTT-CCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATT
*
15280791 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
65 TTAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTT
15280856 CTCA
130 CTCA
** *
15280860 AAAAATATTTTTATTTTTGGAAATATTATTTACCGATTT
1 AAAAATATTTTTATTTCCGG-AATATTATTTACCTATTT
15280899 TTAAATGAAA
Statistics
Matches: 165, Mismatches: 5, Indels: 5
0.94 0.03 0.03
Matches are distributed among these distances:
132 2 0.01
133 115 0.70
134 48 0.29
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.04, T:0.44
Consensus pattern (133 bp):
AAAAATATTTTTATTTCCGGAATATTATTTACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCCATTT
TAAATTATTTTTCAATAAAATATTTACTCTAAACAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATTTC
TCA
Found at i:15285284 original size:58 final size:59
Alignment explanation
Indices: 15285216--15285336 Score: 190
Period size: 58 Copynumber: 2.1 Consensus size: 59
15285206 GTGAGGGACA
* * *
15285216 GGGACGATTCATTCATTGTTGGGTACCGGACATGCAACGGTATCCGAATCCTACC-TTT
1 GGGACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGATATCCGAATCCTACCTTTT
* *
15285274 GGGACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGTAACGATATCCGAATTCTACCTTTT
1 GGGACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGATATCCGAATCCTACCTTTT
15285333 GGGA
1 GGGA
15285337 TTGGGGAGGG
Statistics
Matches: 57, Mismatches: 5, Indels: 1
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
58 50 0.88
59 7 0.12
ACGTcount: A:0.25, C:0.21, G:0.23, T:0.31
Consensus pattern (59 bp):
GGGACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGATATCCGAATCCTACCTTTT
Found at i:15285412 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 15285371--15285424 Score: 63
Period size: 24 Copynumber: 2.2 Consensus size: 24
15285361 TTTGTATATC
* * *
15285371 CCGGGATGGCTTGCCGGATCATCG
1 CCGGGATGGATCGCCGGATCACCG
* *
15285395 CCGGGATGGATCGTCGGATCACCT
1 CCGGGATGGATCGCCGGATCACCG
15285419 CCGGGA
1 CCGGGA
15285425 ACCTAACCGA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 5, Indels: 0
0.83 0.17 0.00
Matches are distributed among these distances:
24 25 1.00
ACGTcount: A:0.15, C:0.30, G:0.37, T:0.19
Consensus pattern (24 bp):
CCGGGATGGATCGCCGGATCACCG
Found at i:15285979 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 15285971--15286026 Score: 94
Period size: 5 Copynumber: 11.2 Consensus size: 5
15285961 TACAAGAAGT
* *
15285971 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATAGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ACGGC
1 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC
15286021 ATGGC A
1 ATGGC A
15286027 CGGTACGGTA
Statistics
Matches: 47, Mismatches: 4, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 47 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.21, G:0.38, T:0.18
Consensus pattern (5 bp):
ATGGC
Found at i:15286034 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15285973--15286034 Score: 61
Period size: 15 Copynumber: 4.1 Consensus size: 15
15285963 CAAGAAGTAT
* *
15285973 GGCATGGCATGGCAT
1 GGCATGGCACGGCAC
* * *
15285988 GGCATAGCATGGCAT
1 GGCATGGCACGGCAC
*
15286003 GGCATGGCATGGCAC
1 GGCATGGCACGGCAC
*
15286018 GGCATGGCACGGTAC
1 GGCATGGCACGGCAC
15286033 GG
1 GG
15286035 TAGAAAATTG
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 5, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 42 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.23, G:0.40, T:0.16
Consensus pattern (15 bp):
GGCATGGCACGGCAC
Found at i:15293389 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15293298--15294103 Score: 899
Period size: 42 Copynumber: 19.1 Consensus size: 43
15293288 CCAAGGTGCT
* *
15293298 GATGGTGGCTGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGTTGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
*
15293340 GAT-GTGCCCGAGGCTGCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* *
15293381 GATGGTGCCTGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* * * * *
15293424 AATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
*
15293466 GATGGTGCCCGTA-GCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACC
1 GATGGTGCCCG-AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* *
15293509 GATGGTGTCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* *
15293551 AATGGTGACCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTG-C
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* * **
15293593 GATGATACTTGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGTTGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* *
15293635 GATGGTG-CCGAGGCTCCTGTACGACCAA-GGCCTAGGTTGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* * * * *
15293676 GATGGTGCCCAAGGCTCCCGCAC-ATTCAAGCAG-CAAGG-TCCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-GGCCTAGGTTGCC
* *
15293718 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCAAGG-TGTC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* *
15293760 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCAAGG-TACC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* *
15293802 GATGGTGCTCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
*
15293844 GATGGT-ACCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
* * *
15293886 GATGGT-ACCGAGGCTCTCGCATGACC-AGAGGCCTAGGTTGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCC
* *
15293928 GATGGTGCCCGAGGCTCCCACACGACC-AGGAGCCTAGGTTGCT
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-GCCTAGGTTGCC
* *
15293971 GATGGTGACCGAGGCTCCTGCA-GATCCAA--GCACTAAGG-TGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGC-CT-AGGTTGCC
*
15294013 GATGGTGCCGGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGG-CTAGG-TGCC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCC
* ** * * * * *
15294055 AATGGTGCTTGAGGCTCTCCGCACGATCGACGTCCTAGGTTGCT
1 GATGGTGCCCGAGGCTC-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
15294099 GATGG
1 GATGG
15294104 CGTCTAAGGC
Statistics
Matches: 657, Mismatches: 77, Indels: 58
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
41 109 0.17
42 384 0.58
43 153 0.23
44 10 0.02
45 1 0.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.33, T:0.16
Consensus pattern (43 bp):
GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC
Found at i:15294114 original size:128 final size:125
Alignment explanation
Indices: 15293291--15294144 Score: 563
Period size: 128 Copynumber: 6.8 Consensus size: 125
15293281 CCAAGCACCA
* * * * *
15293291 AGGTGCTGATGGTGGCT-GAGGCTCCCGCACGACCAGGGCCTAGGTTGCCGATGTGCCCGAGGCT
1 AGGTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCACGACC-GAGCCTAGGTTGCTGATGGGTCCGAGGCT
*
15293355 GCC-GCACGA-CCAAGGGC-CT-AGGTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCGCACGACCAAG-GGCC
64 -CCTGCACGATCCAA--GCACTAAGGTGCCGATGGTGCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGAGGCC
15293415 T
125 T
* * * * * * *
15293416 AGGTTGCCAATGGTAC-CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGTA-
1 AGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC--GAGCCTAGGTTGCTGATGG-GTCCG-AG
* * *
15293479 GCTCCCGCACGA-CCAAGGGC-CT-AGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCACGACCAAG-G
61 GCTCCTGCACGATCCAA--GCACTAAGG-TGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAG
15293540 GCCT
122 GCCT
* * * *
15293544 AGGTGCCAATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-GAT-GATACTTGAG
1 AGGTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACGACC--GAGCCTAGGTTGCTGATGGGT-C-CGAG
* * * *
15293606 GCTCCCGCACGA-CCAGGGC-CT-AGGTTGCCGATGGTGCCGAGGCTCCTGTACGACC-A-AGGC
61 GCTCCTGCACGATCCA-AGCACTAAGG-TGCCGATGGTGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGGC
15293666 CT
124 CT
* * * * * * * *
15293668 AGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCAC-ATTCAAGCAGCAAGG-TCCCGATGGTGCCCGAG
1 AGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGA-CCGAGC--CTAGGTTGCTGATGG-GTCCGAG
* ** * *
15293731 GCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCAAGGTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCC
61 GCTCCTGCACGATCCAAGCACTAAGGTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGGCC
*
15293794 A
125 T
* * * *
15293795 AGGTACCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGAT-GGTACCGAGGC
1 AGGTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC--GAGCCTAGGTTGCTGATGGGT-CCGAGGC
* * * *
15293858 TCCCGCACGA-CCAAGGGC-CT-AGGTTGCCGATGGTACCGAGGCTCTCGCATGACC-AGAGGCC
63 TCCTGCACGATCCAA--GCACTAAGG-TGCCGATGGTGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGGCC
15293919 T
125 T
* * *
15293920 AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACACGACCAGGAGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGG
1 AGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACC--GAGCCTAGGTTGCTGATGG-GTCCGAGG
15293985 CTCCTGCA-GATCCAAGCACTAAGGTGCCGATGGTGCCGGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGG-CT
62 CTCCTGCACGATCCAAGCACTAAGGTGCCGATGGTGCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGAGGCCT
* * * **
15294048 AGGTGCCAATGGTGCTTGAGGCTCTCCGCACGATCGACGTCCTAGGTTGCTGATGGCGTCTAAGG
1 AGGTGCCGATGGTGCTCGAGGCTC-CCGCACGACCGA-G-CCTAGGTTGCTGATGG-GTCCGAGG
*
15294113 CT-CTAGCACG-TCCAAGCAGC-AATGTGCCGATG
62 CTCCT-GCACGATCCAAGCA-CTAAGGTGCCGATG
15294145 CTCCCACATC
Statistics
Matches: 601, Mismatches: 78, Indels: 97
0.77 0.10 0.12
Matches are distributed among these distances:
123 2 0.00
124 17 0.03
125 145 0.24
126 154 0.26
127 109 0.18
128 164 0.27
129 10 0.02
ACGTcount: A:0.19, C:0.31, G:0.33, T:0.17
Consensus pattern (125 bp):
AGGTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCGAGCCTAGGTTGCTGATGGGTCCGAGGCTCC
TGCACGATCCAAGCACTAAGGTGCCGATGGTGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGGCCT
Found at i:15304929 original size:85 final size:83
Alignment explanation
Indices: 15304804--15306121 Score: 384
Period size: 85 Copynumber: 15.5 Consensus size: 83
15304794 ACCCCTGCTA
* * * * * * * *
15304804 CTCGAGGCACCCGCGCATCCAACGTCCTAGGTTGCTGATGGTGTCTAAGGCTCCCGCACATCCAA
1 CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GGCCCAAGTTGCCGATGGTGCCGAA-GCTCCCGCACATCCAA
* * *
15304869 GCACCAAGGTACCAATGCTG
64 GCACCAAGGTGCCGATGGTG
* *
15304889 CTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCA
1 CTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGC-CCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCAC-ATCCA
** *
15304953 AGGTCCTAGGTTGCCGATGGTG
63 AGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * ** * *
15304975 -TCCGAGGCTCCCGCACATCTAA-GCACCAAGGTGCAAATGGTGCCCGAAGTTCTCGCACGAT-C
1 CT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGC-CCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCAC-ATCC
* *
15305037 AAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * *
15305059 CCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCACATCCA
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGCCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCACATCCA
15305123 AGCACCAAGGTGCCGATGGTGG
63 AGCACCAAGGTGCCGATGGT-G
** * * * * * * *
15305145 C-CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGTCTAGGTGCTGATGGTCCCGAGGCTCTCGCATGA-CCAA
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCCCAAGTTGCCGATGGTGCCGAAGCTCCCGCA-CATCCAA
** * *
15305207 GGGCCTAGGTTACCGATGGTG
64 GCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * * * ** *
15305228 CTCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCAATGGTGCCCCAGTCTCCCGCATGA-CC
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGGCCCAAGTTGCCGATGGTGCCGAAG-CTCCCGCA-CATCC
* * **
15305291 AAG-GCCTAGGTTTTCGATGGTG
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * * * * *
15305313 CCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAAGG-CCTAGGTGCCGATGATGCCCAAGGCTCTCGCATGA-CC
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGCCCAAGTTGCCGATGGTGCCGAA-GCTCCCGCA-CATCC
* * * *
15305375 AAGGACCTAGGTTGCCGATAGTA
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * * * **
15305398 CCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAAGCTCCTACACGA-CC
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGGCCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCAC-ATCC
** * *
15305461 AAGGGCCTAGGATGCCAATGGTG
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* ** * * * *
15305484 CCCGAGGCTCCTACACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCA
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCAC-ATCCA
** * * *
15305547 AGGGCCTAGGTTACCGATGGTA
63 AGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
** * * * * * * * *
15305569 C-CGAGGCTCTTGCACGA-CCAGGGGTCTAGGTTACCGATAGTGCCCGAGGCTCCCTCACGA-CC
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGGCCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCAC-ATCC
*** * *
15305631 AAGGGGCTAGGTTGCTGATGGTG
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * * * *
15305654 -TCCGAGGCTCCCTCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCTGCACGA-CC
1 CT-CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCCCAAGTTGCCGATGGT-GCCGAAGCTCCCGCAC-ATCC
** * *
15305716 AAGGGCCTAGGTTACCGATGGTG
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * * * * * **
15305739 CCCGTGGCTCCCGCACGA-CCAGGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGCCCA
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGG-CCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCACATCCA
** *
15305803 AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
63 AGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * *
15305825 CCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAACGG-CCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CC
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGCCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCAC-ATCC
** *
15305887 AAGGGCCAAGGTGCTGATGGTG
62 AAGCACCAAGGTGCCGATGGTG
* * * * * * *
15305909 CCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-ACTAAGGCTCTCGCACGA-CC
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGCCCAAGTTGCCGATGGTGCCGAA-GCTCCCGCAC-ATCC
* ** *
15305971 AGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
62 AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
* * * * * * * *
15305994 CCCGAAGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCA
1 CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGGCCCAAGTTGCCGATGGTG-CCGAAGCTCCCGCACATCCA
** **
15306058 AGCACCAAGGTGTTGACAGTG
63 AGCACCAAGGTGCCGATGGTG
** * *
15306079 C-CGGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGGCTAGGTGCCGATGGTGC
1 CTC-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCCCAAGTTGCCGATGGTGC
15306122 TTGAGGCTCC
Statistics
Matches: 981, Mismatches: 209, Indels: 88
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
83 27 0.03
84 194 0.20
85 536 0.55
86 216 0.22
87 8 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.33, G:0.32, T:0.16
Consensus pattern (83 bp):
CTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCCCAAGTTGCCGATGGTGCCGAAGCTCCCGCACATCCAAGC
ACCAAGGTGCCGATGGTG
Found at i:15305166 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15304829--15306161 Score: 1407
Period size: 43 Copynumber: 31.4 Consensus size: 43
15304819 CATCCAACGT
* * ** **
15304829 CCTAGGTTGCTGATGGTGTCTAAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
15304872 CCAAGG-TACCAATGCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
15304913 CACCAAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGT
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15304957 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCTAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* ** * * * *
15305000 CCAAGG-TGCAAATGGTGCCCGAAGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
15305041 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
15305084 CCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
15305127 CCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15305169 TCTAGG-TGCTGATGGT-CCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15305210 CCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15305253 CCTAGGTTACCAATGGTGCCCCAGTCTCCCGCATGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
15305295 CCTAGGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15305338 CCTAGG-TGCCGATGATGCCCAAGGCTCTCGCATGACCAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15305380 CCTAGGTTGCCGATAGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15305423 CCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAAGCTCCTACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15305466 CCTAGGATGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCTACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
15305509 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** *
15305551 CCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15305593 TCTAGGTTACCGATAGTGCCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15305636 GCTAGGTTGCTGATGGTGTCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15305679 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15305721 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGTGGCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15305763 TCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGCCCAAGGG
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15305807 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAACGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15305850 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15305892 CCAAGG-TGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** * *
15305934 CCTAGGTTACCGATGGT-ACTAAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15305976 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
15306019 CCTAGGTTACTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* ** ** *
15306062 CCAAGG-TGTTGACAGTGCCGGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * * * *
15306104 GCTAGG-TGCCGATGGTGCTTGAGGCTCCCACACGACCGACGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15306146 CCTAGGTTGCTGATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGG
15306162 CGTCCAAGGT
Statistics
Matches: 1075, Mismatches: 191, Indels: 48
0.82 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
41 33 0.03
42 494 0.46
43 541 0.50
44 7 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (43 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
Found at i:15305481 original size:213 final size:213
Alignment explanation
Indices: 15304851--15306140 Score: 1360
Period size: 213 Copynumber: 6.1 Consensus size: 213
15304841 ATGGTGTCTA
** * * * *
15304851 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGG
1 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG
* * * * *
15304913 CACCAAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
64 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
* ** * * * * *
15304978 GAGGCTCCCGCAC-ATCTAAGCACCAAGG-TGCAAATGGTGCCCGAAG-TTCTCGCACGATCAA-
128 GAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCT-GCACGACCAAG
15305039 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
191 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCG
** * * *
15305063 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-G
* * * *
15305127 CCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGTCTAGG-TGCTGATGGT-CCCG
64 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
* * * * * * *
15305189 AGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGC
129 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGC
* * *
15305254 CTAGGTTACCAATGGTGCCCC
194 CTAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * **
15305275 AGTCTCCCGCATGACCAA-GGCCTAGGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAGGC
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AAGGC
* * * * * * *
15305339 CTAGG-TGCCGATGATGCCCAAGGCTCTCGCATGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATAGTACCCGA
65 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
* * *
15305403 GGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAAGCTCCTACACGACCAAGGGCC
130 GGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCC
*
15305468 TAGGATGCCAATGGTGCCCG
195 TAGG-TGCCGATGGTGCCCG
** *
15305488 AGGCTCCTACACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGC
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGC
* * ** * * * *
15305552 CTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAGGGGTCTAGGTTACCGATAGTGCCCGA
65 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
* * * *
15305616 GGCTCCCTCACGACCAAGGGGCTAGGTTGCTGATGGTGTCCGAGGCTCCCT-CACGACCAAGGGC
130 GGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCT-CCTGCACGACCAAGGGC
*
15305680 CTAGGTGCCGATGGTGGCCG
194 CTAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * *
15305700 AGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGTGGCTCCCGCACGACCAGGGTC
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-C
* *
15305765 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGCCCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
65 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
* * * * *
15305830 GGCTCCCGCACGACCAACGGCCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCC
130 GGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCC
* *
15305894 AAGGTGCTGATGGTGCCCG
195 TAGGTGCCGATGGTGCCCG
* ** * *
15305913 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-ACTAAGGCTCTCGCACGACCAGGGGC
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGC
* * * * *
15305977 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGACCGA
65 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
** * ** ** * * *
15306042 GGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGTTGACAGTGCCGGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGG
130 GGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGC
**
15306105 CTAGGTGCCGATGGTGCTTG
194 CTAGGTGCCGATGGTGCCCG
*
15306125 AGGCTCCCACACGACC
1 AGGCTCCCGCACGACC
15306141 GACGTCCTAG
Statistics
Matches: 914, Mismatches: 143, Indels: 42
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
210 22 0.02
211 107 0.12
212 314 0.34
213 390 0.43
214 81 0.09
ACGTcount: A:0.20, C:0.33, G:0.32, T:0.16
Consensus pattern (213 bp):
AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGCC
TAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAG
GCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCT
AGGTGCCGATGGTGCCCG
Found at i:15306152 original size:170 final size:168
Alignment explanation
Indices: 15304921--15306161 Score: 1359
Period size: 170 Copynumber: 7.3 Consensus size: 168
15304911 GGCACCAAGA
* *
15304921 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
* ** * ** * * * *
15304986 CGCAC-ATCTAAGCACCAAGGTGCAAATGGTGCCCGAAGTTCTCGCACGATCAA-GGCCTAGGTT
66 CGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
15305049 GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGT
130 --CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGT
* * * ** * *
15305091 TGTCGATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTC
* * * *
15305154 CCGCACGACCAAGGGTCTAGGTGCTGATGGT-CCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTT
65 CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT
*
15305218 ACCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGT
130 --CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-GGGCCTAGGT
* * * * * **
15305260 TACCAATGGTGCCCCAGTCTCCCGCATGACCAA-GGCCTAGGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
* * * * * *
15305324 CGCACGACCAAAGGCCTAGGTGCCGATGATGCCCAAGGCTCTCGCATGACCAAGGACCTAGGTTG
66 CGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-
* *
15305389 CCGATAGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGT
130 -CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-GGGCCTAGGT
* * ** * *
15305430 TGCAGATGGTGCCCGAAGCTCCTACACGACCAAGGGCCTAGGATGCCAATGGTGCCCGAGGCTCC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
**
15305495 TACACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
66 CGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-
* ** *
15305560 CCGATGGT-ACCGAGGCTCTTGCACGACCAGGGGTCTAGGT
130 -CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-GGGCCTAGGT
* * * * * *
15305600 TACCGATAGTGCCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGGGCTAGGTTGCTGATGGTGTCCGAGGCTCC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
* * *
15305665 CTCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
66 CGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-
*
15305730 CCGATGGTGCCCGTGGCTCCCGCACGACCAGGGTCCTAGGT
130 -CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGG-CCTAGGT
* *
15305771 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGCCCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
* * * * *
15305836 CGCACGACCAACGGCCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCAAGGTGC
66 CGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTC
15305901 TGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGT
131 -GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGT
* * ** * * *
15305941 TACCGATGGT-ACTAAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCC
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
* * * * ** *
15306005 CGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT
66 CGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGT
* ** * *
15306069 GTTGACAGTGCCGGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGGCTAGG-
129 -TCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGT
** * * * * *
15306110 TGCCGATGGTGCTTGAGGCTCCCACACGACCGACGTCCTAGGTTGCTGATGG
1 TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
15306162 CGTCCAAGGT
Statistics
Matches: 912, Mismatches: 143, Indels: 32
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
168 24 0.03
169 233 0.26
170 425 0.47
171 230 0.25
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (168 bp):
TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC
CGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTC
GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGCCTAGGT
Found at i:15306393 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 15306361--15306436 Score: 82
Period size: 24 Copynumber: 3.2 Consensus size: 24
15306351 TCAATATTCT
*
15306361 GGGATGGCTCACCAGAGCACCGTC
1 GGGATGGCTCGCCAGAGCACCGTC
* *
15306385 GGGATGGCTCGCC-GAAACACCATC
1 GGGATGGCTCGCCAG-AGCACCGTC
* * *
15306409 GGAATGGATCGCCAGAGCACCGTT
1 GGGATGGCTCGCCAGAGCACCGTC
15306433 GGGA
1 GGGA
15306437 ACCTAATCGG
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 9, Indels: 4
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
23 1 0.02
24 39 0.95
25 1 0.02
ACGTcount: A:0.24, C:0.29, G:0.34, T:0.13
Consensus pattern (24 bp):
GGGATGGCTCGCCAGAGCACCGTC
Found at i:15306950 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 15306841--15306953 Score: 156
Period size: 58 Copynumber: 1.9 Consensus size: 58
15306831 AGGGACAGGG
* * *
15306841 ACGATTCATTCATTGTTGGGTACCGGACATGCAACGATATTCGAATCCTACCTTTGGT
1 ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGATATTCAAATCCTACCTTTGGT
* * *
15306899 ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGTAACGGTA-TCTAAATTCTACCTTT
1 ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGATATTC-AAATCCTACCTTT
15306954 TGGGATTGGA
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 6, Indels: 2
0.86 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
57 2 0.04
58 46 0.96
ACGTcount: A:0.27, C:0.21, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (58 bp):
ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGATATTCAAATCCTACCTTTGGT
Found at i:15307630 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 15307620--15307665 Score: 74
Period size: 5 Copynumber: 9.2 Consensus size: 5
15307610 TACAAGAAGT
* *
15307620 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ACGGC ATGGC ACGGC ATGGC A
1 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC A
15307666 CGGTACAGCA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 4, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 37 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.24, G:0.39, T:0.15
Consensus pattern (5 bp):
ATGGC
Found at i:15308806 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 15308780--15308822 Score: 86
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
15308770 TAGAGTCAAG
15308780 CTCAACAGGGTCTTCTTTCCC
1 CTCAACAGGGTCTTCTTTCCC
15308801 CTCAACAGGGTCTTCTTTCCC
1 CTCAACAGGGTCTTCTTTCCC
15308822 C
1 C
15308823 GCTGATTCTG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 22 1.00
ACGTcount: A:0.14, C:0.40, G:0.14, T:0.33
Consensus pattern (21 bp):
CTCAACAGGGTCTTCTTTCCC
Found at i:15314754 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15314707--15315784 Score: 620
Period size: 43 Copynumber: 25.3 Consensus size: 43
15314697 CCCTGCTGCT
* * *
15314707 CGAGGCACCCACACATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * *
15314750 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGG-TACCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-TCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
15314793 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* ** *
15314836 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * *
15314877 CTGAGGTTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGTC
1 C-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
** * ** * * *
15314921 TAAGGCTCCCGCACATCCATGCACCAATG-TGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * *
15314963 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * * * *
15315004 CGATGCTCTCGCATGA-CCAAGGGCCTTGGTTGTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * *
15315047 CGAGGCTCCCGCACGA-CTAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * *
15315090 CTAGGCTACCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
** * *
15315132 TCGAGGCTCCCATACGA-CCAGAGG-CCTAGGTTGCCGACGGTGCC
1 -CGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * *
15315176 CCAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
*
15315218 TCGAGGCT-CCGCACGA-CCAAAGG-CCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 -CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * *
15315260 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * *
15315302 TCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGGCCTAAGTTACAGATGGT-TCC
1 -CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGT-C
* * * * *
15315345 CGAAGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * *
15315388 CGAGGGTCCAGCACGA-CCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * *
15315430 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCTGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * ** * * *
15315473 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCGTAAATTACCGACGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* ** * *
15315516 CGAGGCACCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * *
15315558 CGAGGCTCCCGCAC-TACCAAGGGT-CAAGG-TGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAA-GGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * * *
15315600 CGAGTCTCCTGCACGA-ACAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * * * * *
15315643 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGACCTATGTCGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * *
15315685 CTGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 C-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
* * *
15315729 CGAGGCTCCCGCACATTCAA-GTACCAAGG-TGCCAATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGT-CCTAGGTTGCCGATGGTGTC
15315770 CGAAGGCTCCCGCAC
1 CG-AGGCTCCCGCAC
15315785 GACCAAAGGG
Statistics
Matches: 838, Mismatches: 152, Indels: 91
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
41 54 0.06
42 284 0.34
43 487 0.58
44 13 0.02
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.17
Consensus pattern (43 bp):
CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
Found at i:15314994 original size:127 final size:127
Alignment explanation
Indices: 15314730--15315830 Score: 952
Period size: 127 Copynumber: 8.6 Consensus size: 127
15314720 CATCCAACGT
* * * * * *
15314730 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TACCAATGGTGCC
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15314793 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-TCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA
63 CGAGGCTCCCGCACGACC-AGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACGA-CCAA
**
15314856 GCA
125 GGG
* * * * * * **
15314859 CCAAGGTGCCGATGGTGCCTGAGGTTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGTCTAA
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
* * * * *
15314924 GGCTCCCGCAC-ATCCATGCACCAATG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGA-CCAGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTC-CGCACGACCAAGGG
* * * *
15314986 CCTAGGTGCCGATGGT-CCCGATGCTCTCGCATGACCAAGGGCCTTGGTTGTCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
* * * *
15315050 GGCTCCCGCACGACTAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCTAGGCTACCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACGACCAAGGG
* * ** *
15315113 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCATACGACC-AGAGGCCTAGGTTGCCGACGGTGCCC
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
* * * * *
15315177 CAGGCTCCCGCACGACCAAGG-GCCTAGGTTTCCGATGGTGCTCGAGGCTCCGCACGACCAAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGACC-AGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15315241 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTACTCGA
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
* * *
15315306 GGCTCCCGCACGACCAGG-GCCTAA-GTTACAGATGGTTCCCGAAGCTCCTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAGGCGCC-AAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCC-GCACGACCAAGGG
* *
15315368 CCTAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGGTC-CAGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
* * * * * *
15315431 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCTGATAGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACGACCAAGGG
* ** * * * * ** *
15315496 CGTAAATTACCGACGGTGCCCGAGGCACCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
1 CCT-AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
* * * * * *
15315559 GAGGCTCCCGCACTACCAAGG-GTCAAGG-TGCTGATGGTGCCCGAGTCTCCTGCACGAACAAGG
64 GAGGCTCCCGCACGACC-AGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCC-GCACGACCAAGG
15315622 G
127 G
* * * * * *
15315623 CCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCTCGCATGACC-AGGGACCTATGTCGCCGATGGTGCCT
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
* * *
15315687 GAGGCTCCCGCACGACCAAGG-GCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATTCAAG
64 GAGGCTCCCGCACGACC-AGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACGA-CCAAG
**
15315750 TA
126 GG
* * * * * *
15315752 CCAAGGTGCCAATGGTG-CCGAAGGCTCCCGCACGACCAAAGGG-CTAGG-TGTCGATGATGCCT
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCG-AGGCTCTCGCACGACC-AAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
*
15315814 GAGGCTCCCGTACGACC
64 GAGGCTCCCGCACGACC
15315831 GACATCCTAG
Statistics
Matches: 796, Mismatches: 140, Indels: 74
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
126 86 0.11
127 293 0.37
128 292 0.37
129 116 0.15
130 9 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (127 bp):
CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGA
GGCTCCCGCACGACCAGGCGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCGCACGACCAAGGG
Found at i:15315139 original size:170 final size:168
Alignment explanation
Indices: 15314730--15315830 Score: 1033
Period size: 170 Copynumber: 6.5 Consensus size: 168
15314720 CATCCAACGT
* * * *
15314730 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TACCAATGGTGCC
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-ACCTAGGTTGCCGATGGTG-C
* * *
15314793 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG
62 CGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
** * * * * *
15314857 CACCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGTTCTCGCACGACCAGGGG
124 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * *
15314901 CCTAGGTTGCAGATGGTGTCTAAGGCTCCCGCAC-ATCCATGCACCAATG-TGCCGATGGTGGCC
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGT-GCC
* * * *
15314964 GAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-CCCGATGCTCTCGCATGACCAAGGGC
63 GAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGC
* * * *
15315028 CTTGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGG
127 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15315070 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCTAGGCTACCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCTCG
1 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGC-CG
** * *
15315135 AGGCTCCCATACGACCAGAGGCCTAGGTTGCCGACGGTGCCCCAGGCTCCCGCACGACCAAGGGC
64 AGGCTCCCGCACGACCAG-GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGC
* * *
15315200 CTAGGTTTCCGATGGTGCTCGAGGCT-CCGCACGACCAAAGG
127 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15315241 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTACTCGA
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGC-CGA
* * * * * *
15315306 GGCTCCCGCACGACCAGGGCCTAAGTTACAGATGGTTCCCGAAGCTCCTGCACGACCAAGGGCCT
65 GGCTCCCGCACGACCAGGGCCT-AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * *
15315371 AGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGGTCCAGCACGACCAAGGG
129 AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15315411 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCTGATAGTGCCCGA
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGA
* * ** * * * **
15315476 GGCTCCCGTACGACCAAGGGCGTAAATTACCGACGGTGCCCGAGGCACCCGCAC-ATCCAAGCAC
65 GGCTCCCGCACGACC-AGGGCCT-AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGC
* *
15315540 CAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACTACCAAGGG
127 CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
15315581 TCAAGGTGCTGATGGTGCCCGAGTCTCCTGCACGAACAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGA
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGA
* * * *
15315646 GGCTCTCGCATGACCAGGGACCTATGTCGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCC
65 GGCTCCCGCACGACCAGGG-CCTAGGT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCC
* * * **
15315711 TAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATTCAAGTA
128 TAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
15315752 CCAAGGTGCCAATGGTG-CCGAAGGCTCCCGCACGACCAAAGG-GCTAGG-TGTCGATGATGCCT
1 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCG-AGGCTCCCGCACGACC-AAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC-
*
15315814 GAGGCTCCCGTACGACC
63 GAGGCTCCCGCACGACC
15315831 GACATCCTAG
Statistics
Matches: 770, Mismatches: 138, Indels: 45
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
168 20 0.03
169 147 0.19
170 387 0.50
171 168 0.22
172 48 0.06
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (168 bp):
CCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAG
GCTCCCGCACGACCAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAG
GTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
Found at i:15315851 original size:213 final size:212
Alignment explanation
Indices: 15314741--15315830 Score: 991
Period size: 213 Copynumber: 5.1 Consensus size: 212
15314731 CTAGGTTGCC
* * * * *
15314741 GATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGGTACCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGC
* * * ** * *
15314805 ACGACCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGC
64 ACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTAC
* * * * * **
15314868 CGATGGTG-CCTGAGGTTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTG-CAGATGGTGTCTAAGGCTCCC
128 CGATGGTGACC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCAAGG-TGCCA-ATGGTG-CCGAGGCTCCC
* ** * * *
15314931 GCAC-ATCCATGCACCAATGTG-CC
189 GCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGTCT
* * * * *
15314954 GATGGTGGCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-CCCGATGCTCTCGCAT
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC
* * * *
15315018 GACCAAGGGCCTTGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGGCCTAGGTTACCGA
66 GACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGA
* * * * * * **
15315083 TGGTGCCCTAGGCTACCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCATACG
131 TGGTGACCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCAAGG-TGCCAATGGTGC-CGAGGCTCCCGCACG
*
15315148 ACC-AGAGGCCTAGGT-TGCC
194 ACCAAG-GGCCTAGGTGT-CT
* * * *
15315167 GACGGTGCCCCAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGCTCGAGGCTC-CGCA
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCA
* * * * *
15315231 CGACCAAAGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGACCTAGGTTGCCG
65 CGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCG
* ** * * *
15315295 ATGGT-ACTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAA-GTTACAGATGGTTCCCGAAGCTCCTGC
130 ATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACC-AAGGTGCCA-ATGG-TGCCGAGGCTCCCGC
15315357 ACGACCAAGGGCCTAGGT-TGCT
191 ACGACCAAGGGCCTAGGTGT-CT
* * * *
15315379 GATGGTGCCCGAGGGTCCAGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC
* * * * * **
15315444 GACCAGGGGCCTAGGTTGCTGATAGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCGTAAATTACCGA
66 GACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGA
* * * * * *
15315509 CGGTGCCCGAGGCACCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACT
131 TGGTGACCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGACCAAGGTGCCAATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACG
* *
15315573 ACCAAGGGTCAAGGTG-CT
194 ACCAAGGGCCTAGGTGTCT
* * * *
15315591 GATGGTGCCCGAGTCTCCTGCACGAACAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCTCGCA
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCA
* * * *
15315656 TGACC-AGGGACCTATGTCGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACC
65 CGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACC
* *
15315720 GATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATTCAAGTACCAAGGTGCCAATGGTGCCGAAGGCTCCCGCA
129 GATGGTGACCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGACCAAGGTGCCAATGGTGCCG-AGGCTCCCGCA
15315784 CGACCAAAGGG-CTAGGTGTC-
192 CGACC-AAGGGCCTAGGTGTCT
* * *
15315804 GATGATGCCTGAGGCTCCCGTACGACC
1 GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACC
15315831 GACATCCTAG
Statistics
Matches: 718, Mismatches: 129, Indels: 60
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
211 82 0.11
212 207 0.29
213 380 0.53
214 41 0.06
215 8 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (212 bp):
GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC
GACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGA
TGGTGACCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCAAGGTGCCAATGGTGCCGAGGCTCCCGCACGAC
CAAGGGCCTAGGTGTCT
Found at i:15316573 original size:58 final size:59
Alignment explanation
Indices: 15316504--15316625 Score: 138
Period size: 58 Copynumber: 2.1 Consensus size: 59
15316494 GGGAGGGACA
* * * * * *
15316504 GGGACGATTCATTCATTGTTCGGTACCGGACATGCAACGGTATTCAAATCCTACC-TTT
1 GGGATGATTCATTCATTATGCGGTACCGAACATGCAACGATATCCAAATCCTACCTTTT
* * * * *
15316562 GGGATGATTCATTTATTATGGGGTACCGAACATGTAACGATATCCGAATTCTACCTTTT
1 GGGATGATTCATTCATTATGCGGTACCGAACATGCAACGATATCCAAATCCTACCTTTT
15316621 GGGAT
1 GGGAT
15316626 TAGGGAGGGA
Statistics
Matches: 52, Mismatches: 11, Indels: 1
0.81 0.17 0.02
Matches are distributed among these distances:
58 44 0.85
59 8 0.15
ACGTcount: A:0.25, C:0.20, G:0.22, T:0.33
Consensus pattern (59 bp):
GGGATGATTCATTCATTATGCGGTACCGAACATGCAACGATATCCAAATCCTACCTTTT
Found at i:15317299 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 15317284--15317319 Score: 54
Period size: 10 Copynumber: 3.6 Consensus size: 10
15317274 TACAAGAAGT
*
15317284 ATGGCATGGC
1 ATGGCACGGC
15317294 ATGGCACGGC
1 ATGGCACGGC
15317304 ATGGCACGGC
1 ATGGCACGGC
*
15317314 ACGGCA
1 ATGGCA
15317320 GAAAATGAAC
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
10 24 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.28, G:0.39, T:0.11
Consensus pattern (10 bp):
ATGGCACGGC
Found at i:15317306 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15317286--15317319 Score: 59
Period size: 15 Copynumber: 2.3 Consensus size: 15
15317276 CAAGAAGTAT
*
15317286 GGCATGGCATGGCAC
1 GGCATGGCACGGCAC
15317301 GGCATGGCACGGCAC
1 GGCATGGCACGGCAC
15317316 GGCA
1 GGCA
15317320 GAAAATGAAC
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 18 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.29, G:0.41, T:0.09
Consensus pattern (15 bp):
GGCATGGCACGGCAC
Found at i:15319042 original size:43 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15319004--15319202 Score: 184
Period size: 42 Copynumber: 4.7 Consensus size: 42
15318994 TTGCCGACTT
*
15319004 TGCCTGAGGCTCCCGCACAACCAAAGGCCTAGGTTGCCGATGG
1 TGCC-GAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
* ** * * ** * *
15319047 TACCGAGGCTATCACACGATTAGGGGCCTAGGTTGCCAATGG
1 TGCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
*
15319089 TGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
1 TGCC-GAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
* ** * *
15319132 TGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGG
1 TG-CCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
* **
15319174 TGCCGGAGGCTCCCGGATGACCAAGGGCC
1 TGCC-GAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCC
15319203 GACACTTCTG
Statistics
Matches: 123, Mismatches: 30, Indels: 7
0.77 0.19 0.04
Matches are distributed among these distances:
41 2 0.02
42 60 0.49
43 59 0.48
44 2 0.02
ACGTcount: A:0.22, C:0.32, G:0.32, T:0.15
Consensus pattern (42 bp):
TGCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG
Found at i:15319075 original size:42 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15319009--15319142 Score: 142
Period size: 43 Copynumber: 3.1 Consensus size: 42
15318999 GACTTTGCCT
* * * *
15319009 GAGGCTCCCGCACAACCAAAGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
1 GAGGCTACCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
* ** * * *
15319051 GAGGCTATCACACGATTAGGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 GAGGCTACCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
* *
15319093 AGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGACC
1 -GAGGCTACCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACC
15319137 GAGGCT
1 GAGGCT
15319143 CCCGCACATC
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 18, Indels: 3
0.77 0.19 0.03
Matches are distributed among these distances:
42 32 0.44
43 38 0.53
44 2 0.03
ACGTcount: A:0.22, C:0.29, G:0.33, T:0.16
Consensus pattern (42 bp):
GAGGCTACCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
Found at i:15319169 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15319004--15319202 Score: 240
Period size: 85 Copynumber: 2.3 Consensus size: 85
15318994 TTGCCGACTT
* * * * *
15319004 TGCCTGAGGCTCCCGCACAACCAAAGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCGAGGCTATCACACGATTA
1 TGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCGAGGCTACCACACGATCA
* ** *
15319069 GGGGCCTAGGTTGCCAATGG
66 AGCACCAAGGTTGCCAATGG
* *
15319089 TGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATC
1 TGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTACCACACGAT-
15319153 CAAGCACCAAGG-TGCCAATGG
64 CAAGCACCAAGGTTGCCAATGG
* * *
15319174 TGCCGGAGGCTCCCGGATGACCAAGGGCC
1 TGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCC
15319203 GACACTTCTG
Statistics
Matches: 98, Mismatches: 14, Indels: 4
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
85 78 0.80
86 20 0.20
ACGTcount: A:0.22, C:0.32, G:0.32, T:0.15
Consensus pattern (85 bp):
TGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCGAGGCTACCACACGATCA
AGCACCAAGGTTGCCAATGG
Found at i:15319198 original size:42 final size:41
Alignment explanation
Indices: 15319076--15319198 Score: 131
Period size: 43 Copynumber: 2.9 Consensus size: 41
15319066 TTAGGGGCCT
** *
15319076 AGGTTGCCAATGGTGCCAGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCT
1 AGGTTGCCAATGGTGCC-GAGGCTCCCGCA-GACCAAGCACCA
* *
15319119 AGGTTGCCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCA
1 AGGTTGCCAATGGTG-CCGAGGCTCCCGCAGA-CCAAGCACCA
*
15319162 AGG-TGCCAATGGTGCCGGAGGCTCCCGGATGACCAAG
1 AGGTTGCCAATGGTGCC-GAGGCTCCCGCA-GACCAAG
15319199 GGCCGACACT
Statistics
Matches: 68, Mismatches: 8, Indels: 9
0.80 0.09 0.11
Matches are distributed among these distances:
41 2 0.03
42 27 0.40
43 37 0.54
44 2 0.03
ACGTcount: A:0.22, C:0.32, G:0.33, T:0.14
Consensus pattern (41 bp):
AGGTTGCCAATGGTGCCGAGGCTCCCGCAGACCAAGCACCA
Found at i:15319523 original size:58 final size:59
Alignment explanation
Indices: 15319432--15319552 Score: 172
Period size: 58 Copynumber: 2.1 Consensus size: 59
15319422 GAGAGGGACA
* * *
15319432 GGGACGATTCATTCATTGTTGGGTACCGGACATGCAACGGTATCCGAATCCTACC-TTT
1 GGGACGATTCATTCATTATTGGGAACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTTT
** * *
15319490 GGGACGATTCATTCATTATTGGGAATTGAACATGTAACGGTATCCGAATTCTACCTTTT
1 GGGACGATTCATTCATTATTGGGAACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTTT
15319549 GGGA
1 GGGA
15319553 TTGGGGAGGG
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 7, Indels: 1
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
58 48 0.87
59 7 0.13
ACGTcount: A:0.25, C:0.20, G:0.24, T:0.31
Consensus pattern (59 bp):
GGGACGATTCATTCATTATTGGGAACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTTT
Found at i:15327291 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15327244--15328327 Score: 995
Period size: 43 Copynumber: 25.5 Consensus size: 43
15327234 CCCCGCTGCT
* * * * *
15327244 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCAATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15327287 CGAGGCTCCAGCAC-ATCCAA--GCACTAAGG-TGCCAATGCTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGC-CT-AGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15327329 CGAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15327372 CAAGGCTCTCGCACGACCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*** * * *
15327415 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAATCACCAAGG-TGCCGACGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15327457 CGAGGTTCTCGCACAATCAA-GGCCTAGGTTGCCAATAGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15327499 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGACGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15327541 CGAGGCTCCAGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-CCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15327583 CGAGGCTCTCGCACCACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * **
15327626 CGAGGCTCCCACACGACCAGGGGCCGAGGTTGCTAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15327669 CGAAGCTTTCGCACGACCAATGGCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15327711 CAAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15327754 CGAAGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** * *
15327797 CGAGGCTCCCTTACAACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* **
15327839 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGACTAGGTTATCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15327882 CGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGAAGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15327925 CGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATAGTACC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15327968 CAAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15328010 CAAGGCTCCTACACGACCAAAGGCCTA-GCTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15328052 CGAGGGTCTCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGTCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15328094 AGAGGCTCTTGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15328137 CGAGGCTCCCTCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * **
15328180 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-CACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15328222 GGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGGCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15328264 TGAGGCTCTCGCACGACCGACGTCCTAGGTTGCCGATGGCGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15328307 CAAGGCTCCAGCACGTCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15328328 CAGTAATGTG
Statistics
Matches: 840, Mismatches: 178, Indels: 46
0.79 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
41 7 0.01
42 394 0.47
43 436 0.52
44 2 0.00
45 1 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.16
Consensus pattern (43 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
Found at i:15327392 original size:85 final size:83
Alignment explanation
Indices: 15327238--15328327 Score: 575
Period size: 85 Copynumber: 12.8 Consensus size: 83
15327228 GGGTACCCCC
* * * * *
15327238 GCTGCTCGAGGCACCCGCACATCCAACGTCCTAGGTTGCCAATGGTGTCCGAGGCTCCAGCAC-A
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC-GCACGA
15327302 TCCAA-GCACTAAGG-TGCCAAT
64 -CCAAGGC-CT-AGGTTGCCAAT
* * *
15327323 GCTGCTCGAGGCTCTCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCTCGCACGA
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTC-CGCACGA
*
15327388 CCAAGGTCCTAGGTTGCCGAT
64 CCAAGG-CCTAGGTTGCCAAT
* ** * * * * *
15327409 GGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCAATCACCAAGGTGCCGACGGTGCTCGAGGTTCTCGCACAA
1 GCTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTC-CGCACGA
*
15327473 TCAAGGCCTAGGTTGCCAAT
64 CCAAGGCCTAGGTTGCCAAT
* *
15327493 AG-TG-TCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGACGATGGTGCCCGAGGCTCCAGCAC
1 -GCTGCT-CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC-GCAC
*
15327555 GACCAAGGGCCTAGGTT-CCGAT
62 GACCAA-GGCCTAGGTTGCCAAT
* * * * *
15327577 GGTGCCCGAGGCTCTCGCACCA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACACG
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACG
* * *
15327641 ACCAGGGGCCGAGGTTGCTAAT
63 ACCA-AGGCCTAGGTTGCCAAT
* * * ** * *
15327663 GGTGCCCGAAGCTTTCGCACGA-CCAATGG-CCTAGGTTGCCGATGGT-ACCAAGGCTCTCGCAC
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTC-CGCAC
* *
15327725 GACCAGGGGCCTAGGTTGCCGAT
62 GACCA-AGGCCTAGGTTGCCAAT
* * * * * *
15327748 GGTGCCCGAAGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCC-CTTAC
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCGC--AC
* *
15327811 AACCAAGGGCCTAGG-TGCCGAT
62 GACCAA-GGCCTAGGTTGCCAAT
* **
15327833 GGTGGC-CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGA-CTAGGTTATCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA
1 GCT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCA
* *
15327895 CGACCAGGGGCCTAGGTTACCGAA-
61 CGACCA-AGGCCTAGGTTGCC-AAT
* * * * * * *
15327919 GGTGCTCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAAGTTGCCGATAGTACCCAAGGCTCCCGCAC-
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACG
* * * *
15327982 ATCCAAGCACCAAGG-TACCGAT
63 A-CCAAG-GCCTAGGTTGCCAAT
* * * ** * *
15328004 GGTGCCCAAGGCTCCTACACGA-CCAAAGG-CCTAGCTGCCGATGGTGCCCGAGGGTCTCGCACG
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTC-CGCACG
* *
15328067 ACCAAGAGCCTAGGTTGTCGAT
63 ACCAAG-GCCTAGGTTGCCAAT
* * * ** * * * *
15328089 GGTAC-AGAGGCTCTTGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCTCACG
1 GCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACG
*
15328152 ACCAAGGGCCTAGGTTGCCGAT
63 ACCAA-GGCCTAGGTTGCCAAT
* * * ** * *
15328174 GGTGACT-GAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAAGGCACCGATGGTGCCGGAGGCTCCCGCAAGA
1 GCTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCACGA
* *
15328238 CCAAGGGGCTAGG-TGCCGAT
64 CCAA-GGCCTAGGTTGCCAAT
* * * * * * * *
15328258 GGTGC-CTGAGGCTCTCGCACGA-CCGACGTCCTAGGTTGCCGATGGCGTCCAAGGCTCCAGCAC
1 GCTGCTC-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCC-GCAC
*
15328321 GTCCAAG
62 GACCAAG
15328328 CAGTAATGTG
Statistics
Matches: 822, Mismatches: 128, Indels: 111
0.77 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
83 7 0.01
84 188 0.23
85 426 0.52
86 194 0.24
87 7 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.16
Consensus pattern (83 bp):
GCTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCGCACGACC
AAGGCCTAGGTTGCCAAT
Found at i:15327444 original size:128 final size:126
Alignment explanation
Indices: 15327244--15328320 Score: 963
Period size: 128 Copynumber: 8.5 Consensus size: 126
15327234 CCCCGCTGCT
* * * * *
15327244 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCAATGGTGTCCGAGGCTCCAGCACATCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * *
15327308 CACTAAGGTGCCAATGCTGCTCGAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGC
64 GACCAAGGTGCCGATGGTGC-CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15327371 C
126 C
* * * **
15327372 CAAGGCTCTCGCACGACCAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAATC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAGG
* * * * * * *
15327437 ACCAAGGTGCCGACGGTGCTCGAGGTTCTCGCACAATCAA-GGCCTAGGTTGCCAATAGTGTC
65 ACCAAGGTGCCGATGGTGC-CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15327499 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGACGATGGTGCCCGAGGCTCCAGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAGG
* * * *
15327563 GCCTAGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACCACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
65 ACCAAGGTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * ** * * **
15327626 CGAGGCTCCCACACGACCAGGGGCCGAGGTTGCTAATGGTGCCCGAAGCTTTCGCACGACCAATG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAA-G
* * * *
15327691 G-CCTAGGTTGCCGATGGTACCAAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
64 GACCAAGG-TGCCGATGGTGCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * **
15327754 CGAAGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACAACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAGG
* * * * **
15327819 GCCTAGGTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGACTAGGTTATCGATGGTGCC
65 ACCAAGGTGCCGATGGT-GCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15327882 CGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGAAGGTG-CTCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC-CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * ** * *
15327946 GGCCTAAGTTGCCGATAGTACCCAAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCGATGGTGC
64 GACC-AAGGTGCCGATGGT-GCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15328009 C
126 C
* ** * * * * *
15328010 CAAGGCTCCTACACGACCAAAGGCCTA-GCTGCCGATGGTGCCCGAGGGTCTCGCACGACCAA-G
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAGG
* * * * * * *
15328073 AGCCTAGGTTGTCGATGGTACAGAGGCTCTTGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
65 A-CCAAGG-TGCCGATGGTGCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15328137 CGAGGCTCCCTCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGACTGAGGCTCCCGCACATCCAAGT
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAGG
** * * *
15328202 ACCAAGGCACCGATGGTGCCGGAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGGCTAGG-TGCCGATGGTGCC
65 ACCAAGGTGCCGATGGTGCC-GAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * * *
15328264 TGAGGCTCTCGCACGACCGACGTCCTAGGTTGCCGATGGCGTCCAAGGCTCCAGCAC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC
15328321 GTCCAAGCAG
Statistics
Matches: 778, Mismatches: 148, Indels: 47
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
126 87 0.11
127 238 0.31
128 405 0.52
129 48 0.06
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.16
Consensus pattern (126 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACACCAAGGA
CCAAGGTGCCGATGGTGCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
Found at i:15333883 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 15333857--15333899 Score: 77
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
15333847 GCTGCTACCC
15333857 GCTACCAGGCGACATTCATGT
1 GCTACCAGGCGACATTCATGT
*
15333878 GCTACCAGGTGACATTCATGT
1 GCTACCAGGCGACATTCATGT
15333899 G
1 G
15333900 TTTGAAATAG
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 21 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.26, G:0.26, T:0.26
Consensus pattern (21 bp):
GCTACCAGGCGACATTCATGT
Found at i:15334227 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 15334162--15334271 Score: 177
Period size: 58 Copynumber: 1.9 Consensus size: 58
15334152 GACAGGGACG
15334162 ATTCATTCACTATTGGGTACC-AGACATGGAACGGTATCCGAATCCTACCTTTCAGACA
1 ATTCATTCACTATTGGGTACCGA-ACATGGAACGGTATCCGAATCCTACCTTTCAGACA
* * *
15334220 ATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGTAACGGTATCCGAATGCTACCTTT
1 ATTCATTCACTATTGGGTACCGAACATGGAACGGTATCCGAATCCTACCTTT
15334272 TGGGATTGGG
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 3, Indels: 2
0.91 0.06 0.04
Matches are distributed among these distances:
58 47 0.98
59 1 0.02
ACGTcount: A:0.28, C:0.24, G:0.17, T:0.31
Consensus pattern (58 bp):
ATTCATTCACTATTGGGTACCGAACATGGAACGGTATCCGAATCCTACCTTTCAGACA
Found at i:15334952 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 15334936--15334969 Score: 50
Period size: 5 Copynumber: 6.8 Consensus size: 5
15334926 TATAAGAAGT
* *
15334936 ATGGC ATTGC ATGGC ATGGC ATGGC ACGGC ATGG
1 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGG
15334970 TACGGCACGG
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 4, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 25 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.21, G:0.38, T:0.21
Consensus pattern (5 bp):
ATGGC
Found at i:15334956 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15334936--15334981 Score: 56
Period size: 15 Copynumber: 3.1 Consensus size: 15
15334926 TATAAGAAGT
* *
15334936 ATGGCATTGCATGGC
1 ATGGCATGGCACGGC
15334951 ATGGCATGGCACGGC
1 ATGGCATGGCACGGC
* *
15334966 ATGGTACGGCACGGC
1 ATGGCATGGCACGGC
15334981 A
1 A
15334982 GAAAATTGAA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 4, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 27 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.24, G:0.37, T:0.17
Consensus pattern (15 bp):
ATGGCATGGCACGGC
Found at i:15335111 original size:44 final size:44
Alignment explanation
Indices: 15335048--15335134 Score: 174
Period size: 44 Copynumber: 2.0 Consensus size: 44
15335038 ATGGCCTCCG
15335048 TTGTGCCATGTTTCGCGAGGGGGCGGCACGGCCAAGTGTTTAAT
1 TTGTGCCATGTTTCGCGAGGGGGCGGCACGGCCAAGTGTTTAAT
15335092 TTGTGCCATGTTTCGCGAGGGGGCGGCACGGCCAAGTGTTTAA
1 TTGTGCCATGTTTCGCGAGGGGGCGGCACGGCCAAGTGTTTAA
15335135 CTAACTCCTT
Statistics
Matches: 43, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
44 43 1.00
ACGTcount: A:0.16, C:0.21, G:0.37, T:0.26
Consensus pattern (44 bp):
TTGTGCCATGTTTCGCGAGGGGGCGGCACGGCCAAGTGTTTAAT
Found at i:15345318 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15345139--15346675 Score: 1517
Period size: 85 Copynumber: 18.1 Consensus size: 85
15345129 CCCTACTGCT
* * * *
15345139 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGTAC-ATCCAA
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAA
** * * * *
15345202 GCACCAAGG-TGCCAATGCTGCT
63 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15345224 CGAGGCTCCCGCAC-ATCTAAGGCACCAGG-TGCCGATAGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACTAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGC-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
* *
15345287 GTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
64 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15345309 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-TGTCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
* * *
15345371 GGCCTAAGTTACCAATGGTGCC
64 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15345393 CGAGGCTCCCGCAGGACCAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCACACGACCAAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15345458 CCTAGGTTGCCGATGGTGTC
66 CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15345478 CGAGGCTCCCGGAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
*
15345541 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGCC
64 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * * * * *
15345563 CAAGGCTCTTGCATGACCAGGGGCCAAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGGACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15345628 GCCTAGGTTGCCGATAGTGTC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15345649 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
*
15345712 GG-CTAAGG-TACCGATGGTGCC
64 GGCCT-AGGTTGCCGATGGTGCC
*
15345733 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGTCACGACC-AG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCG-CACGACCAAG
15345796 AGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
64 -GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15345819 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGACTCCCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15345884 GCCAAGG-TACCGATGGTGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * ** * *
15345904 CAAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT--ACAAGGCTTTCACACGACCAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15345967 GCCTAGGTTGTCGCTGGTGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * ** * *
15345988 CGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTTGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCTACATGACTAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15346053 GCCTAGGTTGCTGATGGTGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15346074 CGAGGCTCCAGCACGACTAAGGGCCTAGGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCAC-ATCTAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
** * *
15346138 CACC-AAGATGCCGATGGTGCC
64 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15346159 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCAAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15346223 GCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15346244 CGAGGCTCTCGCACGACCAGTGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGCCAAAGCTCCCGTACGACCAAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15346309 GCCTAGG-TGCCGATAGTGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15346329 CGAGGCACCTGCACGACAAAGGGCCTAGG-TGCCAATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15346393 GCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15346413 CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGCTGGTACCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15346478 GCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * ** * *
15346499 TGAGGCTCTCTAACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACGAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15346563 GCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15346584 CGAGGCTCCCGTATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTG-CCGAGGCTCCCGTACGACCTAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15346648 GCCTAGGTTGCTGATGATGCC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15346669 CGAGGCT
1 CGAGGCT
15346676 TCTGCACATC
Statistics
Matches: 1207, Mismatches: 205, Indels: 80
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
83 27 0.02
84 270 0.22
85 594 0.49
86 311 0.26
87 5 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.16
Consensus pattern (85 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
Found at i:15345918 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15345139--15346675 Score: 1613
Period size: 43 Copynumber: 36.2 Consensus size: 43
15345129 CCCTACTGCT
* * * *
15345139 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * * *
15345182 CGAGGCTCCCGTAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGCTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15345224 CGAGGCTCCCGCAC-ATCTAA-GGCACCAGG-TGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGC-CTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15345266 CAAGGCTCCCGTACGACTAAGGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15345309 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-TGTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15345351 CGAGGTTCTCGCACGATCAA-GGCCTAAGTTACCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15345393 CGAGGCTCCCGCAGGACC-AGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15345435 CGAGGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15345478 CGAGGCTCCCGGAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15345520 CGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * * *
15345563 CAAGGCTCTTGCATGACCAGGGGCCAAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15345606 CGAGGCTTCCGGACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** *
15345649 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15345691 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CTAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCT-AGGTTGCCGATGGTGCC
*
15345733 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15345776 CGAGGCT-CCGTCACGACC-AGAGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCG-CACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15345819 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15345862 CGAGACTCCCGCACGACCAAGGGCCAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15345904 CAAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT--A
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * * *
15345945 CAAGGCTTTCACACGACCAGGGGCCTAGGTTGTCGCTGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15345988 CGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTTGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15346031 CAAGGCTCCTACATGACTAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15346074 CGAGGCTCCAGCACGACTAAGGGCCTAGGATGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * ** * *
15346117 CGAGGCTCCTGCAC-ATCTAAGCACC-AAGATGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15346159 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15346201 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15346244 CGAGGCTCTCGCACGACC-AGTGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15346287 CAAAGCTCCCGTACGACCAAAGGCCTAGG-TGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15346329 CGAGGCACCTGCACGACAAAGGGCCTAGG-TGCCAATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15346371 CGAGGCTCCCGCACGACCAAAGGCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15346413 CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGCTGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15346456 CGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * ** *
15346499 TGAGGCTCTCTAACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15346541 CGAGGCTCCCGCACGACGAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15346584 CGAGGCTCCCGTATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15346626 CGAGGCTCCCGTACGACCTAGGGCCTAGGTTGCTGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15346669 CGAGGCT
1 CGAGGCT
15346676 TCTGCACATC
Statistics
Matches: 1242, Mismatches: 218, Indels: 68
0.81 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
41 42 0.03
42 545 0.44
43 649 0.52
44 6 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.16
Consensus pattern (43 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
Found at i:15346754 original size:42 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15346695--15347027 Score: 382
Period size: 42 Copynumber: 7.9 Consensus size: 42
15346685 CCAAGCACCA
* * * *
15346695 AGGCTCCCACACGACCAAGTGCCAAGGTGCCGATGGAGCCCG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
15346737 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
* *
15346779 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGCGATGGT-ACCG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15346821 AGGCTCTCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15346864 ATGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGACCG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* *** *
15346907 AGGCTCCTGCAC-ATCCAAGCATCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
* *
15346949 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGGCTAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15346991 AGGCTCCTGCACGACCGACGTCCTAGGTTGCCGATGG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGG
15347028 CGTCCAAGGC
Statistics
Matches: 248, Mismatches: 38, Indels: 9
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
42 171 0.69
43 77 0.31
ACGTcount: A:0.19, C:0.33, G:0.33, T:0.15
Consensus pattern (42 bp):
AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
Found at i:15346849 original size:193 final size:194
Alignment explanation
Indices: 15346511--15346864 Score: 523
Period size: 193 Copynumber: 1.8 Consensus size: 194
15346501 AGGCTCTCTA
* * * *
15346511 ACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACGAAGGGCCTAGGTTGCCA
1 ACGACCAAGGGCCAAGGTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCA
* * * * * *
15346576 ATGGTGCCCGAGGCTCCCGTATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGCCGAGGCTCCCGTACG
66 ATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTACCGAGGCTCCCGCACA
* *
15346641 ACCTAGGGCCTAGGTTGCTGATGATGCCCGAGGCTTCTGCACATCCAAGCACCAAGGCTCCCAC
131 ACCTAGGGCCTAGGTTACCGATGATGCCCGAGGCTTCTGCACATCCAAGCACCAAGGCTCCCAC
* *
15346705 ACGACCAAGTGCCAAGGTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCG
1 ACGACCAAGGGCCAAGGTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCA
* * *
15346769 ATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGCGATGGTACCGAGGCTCTCGCACA
66 ATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTACCGAGGCTCCCGCACA
*
15346834 ACC-AGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGA
131 ACCTA-GGGCCTAGGTTACCGATGATGCCCGA
15346865 TGCTCCCGTA
Statistics
Matches: 141, Mismatches: 18, Indels: 3
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
192 1 0.01
193 86 0.61
194 54 0.38
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.33, T:0.15
Consensus pattern (194 bp):
ACGACCAAGGGCCAAGGTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCA
ATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTACCGAGGCTCCCGCACA
ACCTAGGGCCTAGGTTACCGATGATGCCCGAGGCTTCTGCACATCCAAGCACCAAGGCTCCCAC
Found at i:15346910 original size:236 final size:237
Alignment explanation
Indices: 15346460--15346933 Score: 673
Period size: 236 Copynumber: 2.0 Consensus size: 237
15346450 GGTACCCGAA
* * * * * * *
15346460 GCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCTCTAACGACCAAGGGCCT
1 GCTCCCACACGACCAAGGGCCAAGGTTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGAACGACCAAGGGCCT
* * *
15346525 AGGTGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACGAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGC
66 AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGACCGAGGC
* ** * *
15346590 TCCCGTATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGCCGAGGCTCCCGTACGACCTAGGGCCTAGG
131 TCCCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTACCGATAGTGCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG
* * * *
15346655 TTGCTGATGATGCCCGAGGCTTCTGCACATCCAAGCACCAAG
196 TTACCGATGATGACCGAGGCTCCTGCACATCCAAGCACCAAG
* *
15346697 GCTCCCACACGACCAAGTGCCAAGG-TGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCT
1 GCTCCCACACGACCAAGGGCCAAGGTTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGAACGACCAAGGGCCT
* *
15346761 AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGCGATGGT-ACCGAGGC
66 AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGACCGAGGC
* * *
15346825 TCTCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGATGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAG
131 TCCCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTACCGATAGTG-CCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAG
* *
15346890 GTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCTGCACATCCAAGCATCAAG
195 GTTACCGATGATGACCGAGGCTCCTGCACATCCAAGCACCAAG
15346933 G
1 G
15346934 TGCCGATGGT
Statistics
Matches: 208, Mismatches: 28, Indels: 3
0.87 0.12 0.01
Matches are distributed among these distances:
235 36 0.17
236 150 0.72
237 22 0.11
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.16
Consensus pattern (237 bp):
GCTCCCACACGACCAAGGGCCAAGGTTGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGAACGACCAAGGGCCT
AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGACCGAGGC
TCCCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTACCGATAGTGCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG
TTACCGATGATGACCGAGGCTCCTGCACATCCAAGCACCAAG
Found at i:15347046 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15346695--15347027 Score: 376
Period size: 85 Copynumber: 3.9 Consensus size: 85
15346685 CCAAGCACCA
* * * * *
15346695 AGGCTCCCACACGACCAAGTGCCAAGG-TGCCGATGGAGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCTGCACGACCAAGCGG
15346758 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
65 CCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15346779 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGGCGATGGTACCGAGGCT-CTCGCACAACC-AGGGG
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAGGCTCCT-GCACGACCAAGCGG
*
15346842 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCG
65 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15346864 ATGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGC-
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGCG
** *
15346927 ATCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
64 GCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * *
15346949 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGGCTAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCTGCACGACCGA-CGT
1 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC-GAGGCTCCTGCACGACCAAGCGG
15347012 CCTAGGTTGCCGATGG
65 CCTAGG-TGCCGATGG
15347028 CGTCCAAGGC
Statistics
Matches: 210, Mismatches: 27, Indels: 23
0.81 0.10 0.09
Matches are distributed among these distances:
83 6 0.03
84 77 0.37
85 105 0.50
86 18 0.09
87 4 0.02
ACGTcount: A:0.19, C:0.33, G:0.33, T:0.15
Consensus pattern (85 bp):
AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGCGGC
CTAGGTGCCGATGGTGCCCG
Found at i:15347774 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 15347709--15347821 Score: 163
Period size: 58 Copynumber: 1.9 Consensus size: 58
15347699 AGGGACATGG
* * *
15347709 ACGATTCATTCATTGTTGGGTACCGGACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTTGGA
1 ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACAGTATCCGAATCCTACCTTTGGA
* * * *
15347767 ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGTAACAGTGTCTGAATTCTACCTTT
1 ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACAGTATCCGAATCCTACCTTT
15347822 TGGGATTGGG
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 7, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
58 48 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.22, G:0.19, T:0.33
Consensus pattern (58 bp):
ACGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACAGTATCCGAATCCTACCTTTGGA
Found at i:15348494 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 15348486--15348521 Score: 54
Period size: 5 Copynumber: 7.2 Consensus size: 5
15348476 TACAAGAAGT
* *
15348486 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ACGGC ACGGC A
1 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC A
15348522 AAAAATTGAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 30 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.25, G:0.39, T:0.14
Consensus pattern (5 bp):
ATGGC
Found at i:15353753 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15353657--15358356 Score: 3439
Period size: 85 Copynumber: 55.7 Consensus size: 85
15353647 CATCCAAAGT
* * **
15353657 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGCTGCTTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
15353721 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCA
65 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-A
* * * * ** ** * **
15353743 CCAAGG-TGCCGATGTTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAAGGTCTTAGGTTCCCGATGGTGTTCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
*
15353807 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
65 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* * * * * * *
15353828 CCAAGG-TACCAATGCTG-CTCAAGGCTCCCGCAC-ATCTAAGGCACCAAGGTGCCGATGTTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTC-CGAGGCTCCCGCACGA-CCAA-GCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15353890 CTAGGCTCCCGCACGACCAAGGT
63 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * *
15353913 CCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCAGATAGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * *
15353977 AGGTTCTCGCACGATCAAGG-
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * ** *
15353997 CCTAGGTTACTGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* *
15354062 AGGCTCCCTCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * *
15354083 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCATGGTGCCGATGGTG-GCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
*
15354146 AGGCTTCCGCACGACCAA-GA
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** * * *
15354166 GCCTAGG-TGCCGATGGTCT-CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACGGATGGTGCCC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* *
15354229 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * ** **
15354251 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCTCGTACGACC-AGGGCCTCGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* *
15354315 AGGCTCTCGCAC-ATCCTA-G-
65 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* ** * *
15354334 CTCAAGG-TGCCGATGGTG-CCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGTTGGTGCCC
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCC
* *
15354397 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* **
15354419 CCTAGGTTGCCGATGGTGT-CGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA-CAAGGTGCCGATGGTGGTCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
*
15354481 AGGCTCCCGCATGACCAATGG-
65 AGGCTCCCGCACGACCAA-GGA
* ** *
15354502 CCTAGG-TGCCGAT-G-GTCCTGAGGCTCTCGCACGACCAAG-GGCATAGGTTGTCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCA-AGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15354563 CAAGGCTCCCGTACGACCATGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* ** ** *
15354586 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15354650 AGACTCCCACAC-ATCCAAGCA
65 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* * ** * *
15354671 CC-AAGATGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGGTGGTG-CCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
** *
15354733 GGCTCTTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* ** * ** * *
15354753 CCTAAGTTTTCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15354817 AAGCTCCCGTACGACGAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** ** **
15354838 CCTAGGTTGCCTATGGTG-CCGAGCCTCCCGCACGACC-AGGGCTTAGGTGTAGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15354901 GGCTCCTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * * * *
15354921 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGAGCCTAGGTTACCCAGGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCA-CCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* * * *
15354984 GAAGCTCCCGCACAACAAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
** * * * *
15355006 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAG-GCCTAGGTGCCGATGGTGGCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
*
15355070 GGCTCCCGCATGACCAAAGG-
66 GGCTCCCGCACGACC-AAGGA
* * * * **
15355090 CCTAGGTTACCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGTACGACCAAG-GGCATAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCA-AGG-TGCCGATGGTGCCC
* * * *
15355153 AAGGCTCCCGTACGA-CATGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
** * * ***
15355174 CCTACATTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCATGACCAAGGGTCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15355238 GGCTCCTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * *** * * **
15355258 CCTAGGTTGCTGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGTCTAGGTTGCTGATGGTGCCTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
*
15355322 AGGCTCCCGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * *
15355343 CCTAGGTTGCCAATGGTGACCTAGGCTCCCACAC-ATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * *
15355407 AGGTTCTCGCACGATCAAGG-
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * ** * *
15355427 CCTAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15355491 AAGCTCTCGTACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * *
15355512 CCTCGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC-ATCCGAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
*
15355576 AGGCTCCCGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** * *
15355597 CCTAGG-TGCCGTTGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTC-CGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* *
15355660 GAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
64 GAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* * * ** *
15355682 CCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT--CCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15355744 GGCTCTCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * * ** *
15355764 CATAGGTTGTCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCATGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15355829 AGACTCCCACAC-ATCCAAGCA
65 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* * * ** * *
15355850 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGGTGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
** *
15355914 GGCTCTTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* ** * * ** * *
15355934 CCTAAGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15355999 AAGCTCCCGTACGACGAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * ** **
15356020 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAAG-GCTTAGGTGTAGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15356084 -GCTCCTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * * * *
15356103 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGAGCCTAGGTTACCCAGGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCA-CCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* * * *
15356166 GAAGCTCCCGCACAACAAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* ** ** **
15356188 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGCCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTGTAGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15356253 GGCTCCTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * * * *
15356273 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGAAGCCTAGGTTACCCAGGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCA-CCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* * * *
15356336 GAAGCTCCCGCACAACAAAGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
** * * * *
15356358 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAG-GCCTAGGTGCCGATGGTGGCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15356422 GGCTCCCGCATGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * **
15356442 CCTAGGTTACCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGTACGACCAAG-GGCATAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCA-AGG-TGCCGATGGTGCCC
* * * *
15356505 AAGGCTCCCGTACGACCATGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * ***
15356527 CCTACGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGTCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
*
15356592 GGCTCCCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * *** * **
15356612 CCTAGGTTGCCGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCCTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
*
15356676 AGGCT-CCGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * *
15356696 CCTAGGTTGCCAATGGTGACCTAGGCTCCCACAC-ATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * *
15356760 AGGTTCTCGCACGATCAAGG-
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * ** *
15356780 CCTAGGTTGCTGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15356845 AGGCTCTCACACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** *
15356866 CTTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAA-CGACCTCGGTGCCGATGGT-TCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGC-ACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* *
15356929 AGGCTCTCGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** * ** * *
15356950 CCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACGATAGTG-CCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* * *
15357013 GACTCTCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * *
15357033 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-TATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* *
15357097 AGGCTCCAGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** * *
15357118 CCTAGG-TGCCGATGGTG-CCTGAGGCTCTCGCAAGACCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* *
15357181 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
64 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * *
15357203 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* * * *
15357267 AGGCTCCCTCATGACCTAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * ** ** *
15357288 CCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCATACGACCAAGGGCCTAGGATGCCGATGGTG-CCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15357350 AGGCTCCCGTACGACCATGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * ** * * *
15357371 CCTAGGTTACCGATGGTG-CCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* *
15357435 GAGACTCCCGCAC-ATCCAAGTA
64 GAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* * * * * * *
15357457 CCAATG-TGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CAAGGACCTAGGTGCCGGTGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15357520 GGCTCTCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * *
15357540 CCTAGGTTTCTGATGGTG-CCTGAGGCTCCCGCACGACCAGAGC-CCTAGGTTGCCGATAGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACGACCA-AGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15357603 CGAAGCTCTCGTACGACCAAGGG
63 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * ** * *
15357626 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAA-GTGTCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCAC-CAAGGTGCCGATGGTGCCCG
* *
15357690 AGGCTCCTGCACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * * * ** * * *
15357711 CCTAGGTTGCCAATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCCATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15357775 AAGCTCCCGCACAACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
** * * * *
15357796 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAAG-GCCTAGGTGCCGATGGTGGCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15357860 GGCTCCCGCATGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * ** * *
15357880 CCTAGGTTACCGATGATG-CCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGGGCCTAGGTTGCCCATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15357943 ATGCT-CCGCA-GATCTAAGCA
65 AGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* * * * * **
15357963 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGGCCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* *
15358027 GGCTCCCGCACGACTAAGGG
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* ** * * *
15358047 CCTAGG-TGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGT-ACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCG
* * *
15358109 AGGCTCTCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACGACCAAGGA
* * * ** * * * *
15358130 CCTAGGTTGCCGGTGGTG-CCTGAAGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATAGTGACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCC
* *
15358194 GAGGCTCCCACAC-ATCCAAGCA
64 GAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGA
* *** * **
15358216 CCAAGG-TGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGGCTAGGTGCCGATGGTGCCTTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
* * * *
15358280 GGCTCTCGCACGACCGACGT
66 GGCTCCCGCACGACCAAGGA
* ** * * * *
15358300 CCTAGGTTGCCGATGGCGT-CGAAGGCTCTAGCACGTCCAAACAGCAATGTGCCGATG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCG-AGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATG
15358357 CTTCCGCACC
Statistics
Matches: 3778, Mismatches: 685, Indels: 303
0.79 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
80 2 0.00
81 4 0.00
82 132 0.03
83 682 0.18
84 992 0.26
85 1404 0.37
86 541 0.14
87 21 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (85 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGA
GGCTCCCGCACGACCAAGGA
Found at i:15353826 original size:128 final size:127
Alignment explanation
Indices: 15353657--15358290 Score: 2729
Period size: 127 Copynumber: 36.6 Consensus size: 127
15353647 CATCCAAAGT
* * *
15353657 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCAATGCTGCTTGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * * *
15353722 GGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGTTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAAGGT
66 GGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * **
15353785 CTTAGGTTCCCGATGGTGTTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCAATGCTGCTCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * * * *
15353850 GGCTCCCGCACATCTAAGGCACCAAGGTGCCGATGTTGCCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGT
66 GGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15353913 CCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCAGATAGTGCCTGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * * * * *
15353978 GGTTCTCGCACGAT-CAAGG-CCTAGGTTACTGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAGGGG
66 GGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15354040 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCTCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-TC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCT-
* * * *
15354103 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACC-ATGGTGCCGATGGTG-GCGAGGCTTCCGCACGACCAAGA
63 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15354166 G
127 G
* * ** * * * **
15354167 CCTAGG-TGCCGATGGT-CTCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACGGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * *
15354229 GAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCTCGTACGACC-AGG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15354292 G
127 G
* * * * *
15354293 CCTCGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACATCCTAGC-TCAAGGTGCCGATGGTGCCTGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * *
15354357 GGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGTTGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
66 GGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15354419 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCGAGGCTCCTGCACATCCAAGCA-CAAGGTGCCGATGGTGGTCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * *
15354482 GGCTCCCGCATGA-CCAATGG-CCTAGGTGCCGATGGT-CCTGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCA-CATCCAA-GGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * **
15354543 CATAGGTTGTCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGA-CCATGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
** * * *
15354607 GAGGCTTTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGACTCCCACAC-ATCCAAG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
**
15354669 CA
126 GG
* * ** * * *
15354671 CC-AAGATGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGGTGGTGC-CG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
** * * ** *
15354732 AGGCTCTTGCACGA-CCAAGGGCCTAAGTTTTCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
15354795 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGA-CGAAGGGCCTAGGTTGCCTATGGTGC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * ** *
15354858 GAGCCTCCCGCACGA-CC-AGGGCTTAGGTGTAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * *
15354921 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGA-CC-AGGAGCCTAGGTTACCCAGGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGG-TGCCGATGGTGCT
* * * * * * **
15354983 CGAAGCTCCCGCACAACAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAA-G
63 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15355047 G
127 G
* * * * * * *
15355048 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGCATGA-CCAAAG-GCCTAGGTTACCGATGGT-CC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CATCC-AAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCT
* * * * * * * *
15355109 CGAGGCTCTCGTACGA-CCAAGGGCATAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGA-CATG
63 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15355172 GG
126 GG
** * *** **
15355174 CCTACATTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCATGA-CCAAGGGTCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * * * *
15355237 AGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCTGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** ** * * *
15355300 TCTAGGTTGCTGATGGTGCCTAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTG-CT
* * * * * * *
15355364 T-AGGCTCCCACACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGCCTGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
63 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * *
15355427 CCTAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * * * * *
15355490 AAAGCTCTCGTACGA-CCAAGGGCCTCGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC-ATCCGAG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
**
15355553 CA
126 GG
* * ** * * *
15355555 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGTTGGTGCTCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * *
15355618 AGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGC
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG
*
15355681 A
127 G
* * * ** * *
15355682 CCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-C-CG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * * * *
15355743 AGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCATAGGTTGTCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCATGGG
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
15355807 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGACTCCCACACATCCAAGCACCAAGATGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * **
15355872 GGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGGTGGTGCCCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
66 GGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * ** * * **
15355934 CCTAAGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * *
15355998 GAAGCTCCCGTACGA-CGAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAA-G
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15356061 G
127 G
* ** * ** * * * *
15356062 CTTAGG-TGTAGATGGTGCCCGA-GCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTAC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * * * *
15356123 GAGGCTCTCGCACGA-CC-AGGAGCCTAGGTTACCCAGGGTGCCCGAAGCTCCCGCACAACAAAG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15356186 GG
126 GG
* * ** ** ** **
15356188 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGCCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGTAGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * * *
15356252 AGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGAA
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-G
15356314 G
127 G
* * * * * * ** * *
15356315 CCTAGGTTACCCAGGGTGCCCGAAGCTCCCGCACAACAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-TCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCT-T
** * * *
15356379 GAGGCTCCTTCACGA-CCAAGG-CCTAGGTGCCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** *
15356442 CCTAGGTTACCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGTACGA-CCAAG-GGCATAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCA-AGG-TGCCGATGGTGCT
** * * * * *
15356504 CAAGGCTCCCGTACGA-CCATGGGCCTACGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAG
63 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15356568 GG
126 GG
* * ** * * * *
15356570 TCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTAC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * ** **
15356632 GAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGCCTAAGGCT-CCGCACGACCAAGG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15356695 G
127 G
* * * * * *
15356696 CCTAGGTTGCCAATGGTGACCTAGGCTCCCACACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGCCTGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
* * * * *
15356761 GGTTCTCGCACGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCTGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
66 GGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** **
15356823 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCACACGA-CCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTG-TC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCT-
* * * *
15356886 TGAGGCTCCCGCACGA-CCAACGACCTCGGTGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGG
63 TGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15356949 G
127 G
* * ** * ** * **
15356950 CCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACGATAGTGC-CA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * *
15357012 AGACTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-TATCCAAGC
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG
*
15357075 A
127 G
* * * ** * *
15357076 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCAGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * *
15357139 AGGCTCTCGCA-AGACCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 AGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15357203 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGGC-CG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGT-GCTTG
* * * * * **
15357267 AGGCTCCCTCATGA-CCTAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCATACGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
15357329 CCTAGGATGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGTACGA-CCATGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * * *
15357392 GAGGCTCTCACACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGACTCCCGCAC-ATCCAAG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
**
15357455 TA
126 GG
* * * * * * **
15357457 CCAATG-TGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA--CAAGGACCTAGGTGCCGGTGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * * * *
15357519 AGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACC-AGAG
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-G
*
15357582 C
127 G
* * * * ** * * **
15357583 CCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAAGCTCTCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * * *
15357647 GAGCCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAAGTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * **
15357711 CCTAGGTTGCCAATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCCATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * **
15357774 GAAGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAA-GG
64 GAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * *
15357838 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGATGC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * *
15357900 GAGGCTCCCGTACGA--CAAGGGCCTAGGTTGCCCATGGTGCCCGATGCT-CCGCA-GATCTAAG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
**
15357961 CA
126 GG
* * * * ** **
15357963 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGA-CCAAGGGCCAAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTG
* * *
15358026 AGGCTCCCGCACGA-CTAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
65 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
15358088 CCTAGGTTGCCGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGGTGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCTT
* * * * * * *
15358151 GAAGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATAGTGACCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAG
64 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
**
15358214 CA
126 GG
* * *** *
15358216 CCAAGG-TGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGGCTAGGTGCCGATGGTGCCTT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTG-CTT
*
15358279 -AGGCTCTCGCAC
64 GAGGCTCCCGCAC
15358291 GACCGACGTC
Statistics
Matches: 3717, Mismatches: 640, Indels: 299
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
123 2 0.00
124 143 0.04
125 562 0.15
126 885 0.24
127 1179 0.32
128 856 0.23
129 89 0.02
130 1 0.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (127 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCTTGA
GGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
Found at i:15354032 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15353657--15358315 Score: 4688
Period size: 42 Copynumber: 110.4 Consensus size: 43
15353647 CATCCAAAGT
* **
15353657 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * ** *
15353700 CCAAGG-TGCCAATGCTGCTTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-G
* * * *
15353743 CCAAGG-TGCCGATGTTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * ** **
15353785 CTTAGGTTCCCGATGGTGTTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * * * *
15353828 CCAAGG-TACCAATGCTGCTCAAGGCTCCCGCAC-ATCTAAGGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-G
* * * *
15353871 CCAAGG-TGCCGATGTTGCCCTAGGCTCCCGCACGACCAAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15353913 CCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * * * *
15353956 CCAAGG-TGCAGATAGTGCCTGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15353997 CCTAGGTTACTGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15354040 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCTCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15354083 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * *
15354126 CC-ATGG-TGCCGATGGTG-GCGAGGCTTCCGCACGACCAAGAG
1 CCTA-GGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15354167 CCTAGG-TGCCGATGGT-CTCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15354208 CCTAGGTTACGGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15354251 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCTCGTACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15354293 CCTCGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC-ATCCTA--G
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
15354334 CTCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15354377 CCTAGG-TGCCGTTGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15354419 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAA--G
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* ** * *
15354459 CACAAGG-TGCCGATGGTGGTCGAGGCTCCCGCATGACCAATGG
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15354502 CCTAGG-TGCCGATGGT-CCTGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15354543 CATAGGTTGTCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
**
15354586 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15354629 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGACTCCCACAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
15354671 CC-AAGATGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15354712 CCTAGG-TGCCGGTGGTG-CCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15354753 CCTAAGTTTTCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15354795 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACGAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15354838 CCTAGGTTGCCTATGGTG-CCGAGCCTCCCGCACGACC-AGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15354879 CTTAGG-TGTAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15354921 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGAG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
* * * * * *
15354963 CCTAGGTTACCCAGGGTGCCCGAAGCTCCCGCACAACAAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15355006 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15355048 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGCATGACCAAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15355090 CCTAGGTTACCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15355132 CATAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGA-CATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
** *
15355174 CCTACATTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15355216 TCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15355258 CCTAGGTTGCTGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15355300 TCTAGGTTGCTGATGGTGCCTAAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
15355343 CCTAGGTTGCCAATGGTGACCTAGGCTCCCACAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
15355386 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15355427 CCTAGGTTGCTGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15355470 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CCAAAGCTCTCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
15355512 CCTCGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCAC-ATCCGAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
15355555 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15355597 CCTAGG-TGCCGTTGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15355639 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * *
15355682 CCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15355724 CCTAGG-TGCCGATGGT--CCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15355764 CATAGGTTGTCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15355807 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGACTCCCACAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
15355850 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15355892 CCTAGG-TGCCGGTGGTGCCCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15355934 CCTAAGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15355977 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACGAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15356020 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15356062 CTTAGG-TGTAGATGGTGCCCGA-GCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15356103 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGAG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-G
* * * * * *
15356145 CCTAGGTTACCCAGGGTGCCCGAAGCTCCCGCACAACAAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15356188 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGCCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15356231 CTTAGG-TGTAGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15356273 CCTAGGTTGCCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGAAG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * * * *
15356315 CCTAGGTTACCCAGGGTGCCCGAAGCTCCCGCACAACAAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15356358 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15356400 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15356442 CCTAGGTTACCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15356484 CATAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15356527 CCTACGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15356570 TCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15356612 CCTAGGTTGCCGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15356654 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCTAAGGCT-CCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
15356696 CCTAGGTTGCCAATGGTGACCTAGGCTCCCACAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
15356739 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGTTCTCGCACGATCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15356780 CCTAGGTTGCTGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15356823 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15356866 CTTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACGACCAACGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15356909 CCTCGG-TGCCGATGGT-TCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15356950 CCTAGGTTACCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15356992 CCTAGGTT-ACGATAGTG-CCAAGACTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15357033 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-TATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * *
15357076 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCAGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15357118 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCTCGCAAGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15357160 CCTAGGTTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * **
15357203 TCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * * *
15357246 CCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCTCATGACCTAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15357288 CCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCATACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15357329 CCTAGGATGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGTACGACCATGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15357371 CCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGGCTCTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
15357414 CCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGACTCCCGCAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
15357457 CCAATG-TGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CAAGGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15357498 CCTAGG-TGCCGGTGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15357540 CCTAGGTTTCTGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACC-AGAGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GG
* * * *
15357583 CCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAAGCTCTCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15357626 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15357669 CTTAAG-TGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15357711 CCTAGGTTGCCAATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15357753 CCTAGGTTACCCATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* **
15357796 CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTTCACGACCAA-GG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15357838 CCTAGG-TGCCGATGGTGGCCAAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * *
15357880 CCTAGGTTACCGATGATG-CCGAGGCTCCCGTACGA-CAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * **
15357921 CCTAGGTTGCCCATGGTGCCCGATGCT-CCGCA-GATCTAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* * * *
15357963 CC-AAGATGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* *
15358005 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
*
15358047 CCTAGG-TGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15358088 CCTAGGTTGCCGATAGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15358130 CCTAGGTTGCCGGTGGTGCCTGAAGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* * * * **
15358173 CCTAGGTTACCGATAGTGACCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGG
* *
15358216 CCAAGG-TGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
* ** * * * *
15358258 GCTAGG-TGCCGATGGTGCCTTAGGCTCTCGCACGACCGACGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
15358300 CCTAGGTTGCCGATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGG
15358316 CGTCGAAGGC
Statistics
Matches: 3785, Mismatches: 709, Indels: 244
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
40 64 0.02
41 592 0.16
42 1661 0.44
43 1456 0.38
44 12 0.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (43 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
Found at i:15364429 original size:58 final size:59
Alignment explanation
Indices: 15364361--15364482 Score: 192
Period size: 58 Copynumber: 2.1 Consensus size: 59
15364351 GGAAGGGACA
* *
15364361 GGGATGATTCATTCATTGTTGGGTACCGGACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTT-T
1 GGGATGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTAT
* * *
15364419 GGGATGATTCATTCATTATTGGGTATCGAACATGTAACGGTATCCGAATTCTACCTTAT
1 GGGATGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTAT
15364478 GGGAT
1 GGGAT
15364483 TGGGGAAGGA
Statistics
Matches: 58, Mismatches: 5, Indels: 1
0.91 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
58 52 0.90
59 6 0.10
ACGTcount: A:0.25, C:0.19, G:0.24, T:0.33
Consensus pattern (59 bp):
GGGATGATTCATTCATTATTGGGTACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCTTAT
Found at i:15371701 original size:43 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15371653--15394581 Score: 12038
Period size: 43 Copynumber: 544.4 Consensus size: 42
15371643 CCCTGCTGCT
* * * * *
15371653 CGAGGCACCTGCACATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15371696 CGAGGCTCCCGTACATCAAAGCA-CTAAGGTGCCAATGCTGCA
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* *
15371738 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCGAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15371781 CGAGGCTCCCGCACCA-CCAAGTG-CCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15371824 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAAGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ***
15371867 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15371910 CGAGGCTCCCGTACATACAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * ** * *
15371945 CAAGGTTCTCAAACGAT-CAAGG-CCTAGGTTGTCGATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15371987 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15372030 CGAGGCTCCCACACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGATGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15372072 CGAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGGTGCTGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15372113 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15372154 TGAGGGTTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15372196 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTACCGAT-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15372238 CGAGCCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15372281 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAAGTGCCGATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGT-GCC
* *** *
15372323 CGACGCTCCCGCACGA-CCAAGGGTGTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15372364 CGAGGCTCTCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15372407 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15372449 TGAGGCTCCCGCAC-TACCAAGGGTCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15372491 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15372534 CAAGGCTCCCGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15372577 CGAGGCTCCTGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15372620 TGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15372663 CGAGGCTCCCACACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15372698 CGAGGTTCTTGTATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGG-GACT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTG-CC
* *
15372740 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15372783 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGAAGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15372826 CGAGGCTCCCGCACATCAAACCACCAAGGTCCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15372868 CAAGGCTCACGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15372909 CGAGGGTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15372952 CTAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15372994 CAGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGGC
1 C-GAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15373038 CGAGGCTCCCGCACAT-CAGAGCACCAAAGTGCCGATGGTGCA
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA-AGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15373080 AGAGGCTCCTGCACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15373123 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15373166 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGCCCTAGGTACCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGT-GCCGATGGTGCC
* * * *
15373209 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15373252 TGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15373295 CGAGGCTCCCGTACGA-CC-AGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * ** *
15373336 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCATAGGTTGCCAATTTTG-T
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * *
15373378 CGAGGCTCTTGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15373421 CGAGGCTCCTGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15373464 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15373507 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAAGTTGTCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15373550 CGAGGCTCCCGCACATCCCAGCACCAAGGT---G-T-G-GCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15373586 C-AGGTTCTTGCACGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCC-AGTGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGA-TGGTGCC
* * * *
15373627 CGAGGCTCCCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15373670 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15373713 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCAGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15373755 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGGTAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15373796 CGAGGGTCTCGCACGAT-CAAGGGA-CTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15373839 CGAGGCTCCCGCACAACCGAGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15373882 TGAGGCTCCCGCACAT-CAGAGCACGAAAGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA-AGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15373924 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * **
15373967 CGAGGC-ACC-CACAT-GATGAGCGACCTAGGTTGCCGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA--AG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15374010 CGAAGC-CCCGCACGA-CCAATGCCCTAGGTTGTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15374052 CGAGGCTCTCGCACATCCAAGTACCAACGTGCCGAAGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15374094 CGAGGCACCCGCACGA-CCAAAGG-CCTAGGTGCCGATTGT-CT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15374135 CGAGGCTCTCGAACGA-CCGAAGG-CCTTGGTAGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGGT-GCCGATGGTGCC
* * * * *
15374178 CGAGGCTACCGTACGA-CC-AGCGGCCTAGGTTACCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15374221 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * * *
15374265 CGAAGCTCTCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15374307 CGAGACTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15374349 CGAGGCTTTCG-A-ATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15374392 CAAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15374435 CGAAGCTCCCGCACGGCCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15374478 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15374520 TGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15374563 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAACGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15374605 CGAGGCTCTAGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15374648 TGAGGCTCTCGTACAACAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15374691 CGAGGCTTCCGCACATCCAAGTAACAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * * *
15374733 CGAGGCTCCCATACGA-CTAGGGGCCTAGGTGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15374774 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGTTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAG-GTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15374817 CGAGGCTCCCGTAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15374860 CGAGGCTCCCTCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * *
15374904 CTAGGCTCCCGTACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15374946 CGAGGCTCCC-CTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGC-AC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15374987 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15375030 CAAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15375073 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15375116 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15375158 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTACTGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15375200 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15375243 CGAGCCTTCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15375286 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15375329 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15375372 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15375414 TGAGGCT-CCGCAC-TACCAAGGGTCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15375455 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15375498 CAAGGCTCCCGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15375541 CGAGGCTCCTGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15375584 TGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGG-GCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15375625 CGAGGCTCCCACACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15375660 CGAGGTTCTTGTATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGG-GACT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTG-CC
* *
15375702 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15375745 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGAAGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15375788 CGAGGCTCCCGCACATCAAACCACCAAGGTCCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15375830 CAAGGCTCACGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATAGT--C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15375870 CGAGGGTCTTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTC-CCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15375914 CTAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15375956 CAGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGGC
1 C-GAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15376000 CGAGGCTCCCGCACAT-CAGAGCACCAAAGTGCCGATGGTGCA
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA-AGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15376042 AGAGGCTCCTGCACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGATG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15376084 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15376127 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGCCCTAGGTACCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGT-GCCGATGGTGCC
* * * *
15376170 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15376213 TGAGGCTCCCGCACGA--CAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15376255 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * ** *
15376297 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCATAGGTTGCCAATTTTG-T
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * *
15376339 CGAGGCTCTTGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15376382 CGAGGCTCCTGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15376425 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15376468 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAAGTTGTCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15376511 CGAGGCTCCCGCACATCCCAGCACCAAGGT---G-T-G-GCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15376547 C-AGGTTCTTGCACGAT-CAAGG-CCTAGTTGCC-AGTGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGA-TGGTGCC
* * * *
15376587 CGAGGCTCCCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15376630 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15376673 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCAGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15376715 CGAGGCTCCCGCACGA--CAA-GAGCCTAGGTGCCGGTAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15376755 CGAGGGTCTCGCACGA-CCAAGGGA-CTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15376798 CGAGGCTCCCGCACAACCGAGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15376841 TGAGGCTCCCGCACAT-CAGAGCACGAAAGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA-AGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15376883 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * **
15376926 CGAGGC-ACC-CACAT-GATGAGCGACCTAGGTTGCCGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA--AG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15376969 CGAAGC-CCCGCACGA-CCAATGCCCTAGGTTGTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15377011 CGAGGCTCTCGCACATCCAAGTACCAACGTGCCGAAGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15377053 CGAGGCACCCGCACGA-CCAAAGG-CCTAGGTGCCGATTGT-CT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15377094 CGAGGCTCTCGAACGA-CCGAAGG-CCTTGGTAGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGGT-GCCGATGGTGCC
* * * * *
15377137 CGAGGCTACCGTACGA-CC-AGCGGCCTAGGTTACCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15377180 CGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * *
15377223 CGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15377265 CGAGACTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15377307 CGAGGCTTTCG-A-ATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15377350 CAAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * *
15377393 CGAAGCT-CCGCACGGCCAAGG-CCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15377434 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15377476 TGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15377519 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAACGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15377561 CGAGGCTCTAGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15377604 TGAGGCTCTCGTACAACAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15377647 CGAGGCTTCCGCACATCCAAGTAACAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15377689 CGAGGCTCCCGTACGA-CTAGGGGCCTAGGTGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15377730 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGTTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAG-GTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15377773 CGAGGCTCCCGTAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15377816 CGAGGCTCCCTCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * *
15377860 CTAGGCTCCCGTACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15377902 CGAGGCTCCC-CTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGC-AC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15377944 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15377987 CAAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15378029 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15378072 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15378114 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTACTGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15378156 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15378199 CGAGCCTTCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTG-A
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15378241 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15378284 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * *
15378327 TGAGGCTTTCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15378361 CGAGGTTCTTGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15378402 CGAGGCT-CCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15378444 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAATGG-CCTAAGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15378487 CGAGGCTCCCGCAC-TCTAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15378528 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15378571 CAAGGCTCTCGCACGA-CCATAGG-CCTAGGTTGCAGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15378614 CGAGGCTCCCG-A-ATGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15378657 CGAGGCTCCTGTACATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15378699 CAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGCTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * **
15378741 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15378784 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGCCCTAGGTTAACGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15378827 AGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15378870 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGTTTGTCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAG-GTG-CCGATGGTGCC
* * * *
15378914 CGAGGCTCCCACACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15378956 CGAGGCTCCCGCA-AGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15378998 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGACGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15379041 CGAGGCGCACGCTCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
15379084 CGAGGCTCCCGCACGA--CAAGG-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15379124 CGAGGCTCTCGCACGA--CAAGGGGGCTAGGTTGCCGATGGT--A
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15379165 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15379208 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGCG-CC-A--AG-C--T-GTTCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-GACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15379243 C--GGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCAATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGT-GCC
* * * * * **
15379283 CGAGGCTCCCTCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * ** *
15379326 CGAGTCTCTCG-ACGA-CCAATGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * ** *
15379368 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCATCAAGGTACAAATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15379410 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15379451 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15379494 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATAGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15379537 CGAGGTTCCAGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * * *
15379580 CGAGGCTCTTGCAGATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15379622 CAAGGCTCCCGCACGGCCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15379664 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGTCC-AGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15379706 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGCC-GATGGTGCC
* * *
15379749 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15379792 CAAGGCTCCCGCATGA-CCAAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCC-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15379835 CGAGGCTCCCGCACAT-CAAGGACCTAGGTTACCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15379877 CGAGGCTCCCGCTCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15379920 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15379963 CGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGGTGTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15380005 CAATGCTCCCCCACGA-CCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15380047 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * **
15380090 CAAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-T-GCCGATGGTGCC
* * *
15380133 CGAAGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15380176 TGAGGCTTCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15380219 TGAGGC-CCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** ** * *
15380261 CGAGGCTCCCGCACATTTAATTACCAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15380303 CGAAGCTCCCGCA-AGACCAA-GAGCCTAGGTGCC-AGTGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGA-CCTAGGTGCCGA-TGGTGCC
*
15380344 CGAGGCTCTCG-A-ATGACCAAGTG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15380387 TGAGGCTCCCGTACGA-CAAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15380429 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15380471 CGAAGCTCTCGCACGA-CC-AGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15380513 CGAGGCTCTCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15380556 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15380599 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGG-CCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *** * * *
15380641 TGAGGCTTTGGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15380676 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTACCGAT-GTACC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15380717 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15380760 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAA-TAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15380803 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15380845 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGAAAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * **
15380886 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGATACCGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15380929 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGCCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15380972 AGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15381015 CGAGGCTCTCGCACGA-CC-AGGGCCTATGTTGTCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTG-CCGATGGTGCC
* * *
15381058 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15381100 CGACGCTCCCGCA-AGAACAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15381142 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15381185 CGAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCA
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15381228 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15381271 CGAGTCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCTATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** *
15381313 CGAGGCTCCCGCACGA--CAAGGGGCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15381354 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGC-CGATGGTGCC
* * * * * *
15381397 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAAGTTACCGATAGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* *
15381440 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15381483 CGAGGTTCCTGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTTCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** *
15381526 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGCCCCAAGGT---G-T--T-CC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15381561 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCTGATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGT-GCC
* * *
15381603 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15381645 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCTGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCC-GATGGTGCC
* * * *
15381688 CGAGGCTCCTGCACAACCAAGGACCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15381731 CGAGGCTCCTGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15381774 CGAGGC-CCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * *
15381816 TGAGGCTTTCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15381851 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTACT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15381893 CGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15381935 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAA-TAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15381978 CGTGGCTCCCGTACATCCAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15382020 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGAAAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15382061 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15382104 CAAGGCTCCC-CCCGA-CCAAGG-CCTAGGTTGCAGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15382145 CGAGGCTCCCG-A-ATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15382188 CGAGGCTCCTGCACATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15382230 CAAGGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * **
15382271 CGAGGCTCCCG--CAT-GACAGGGCCTTGGTTGCTGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA-AGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15382312 CGAAGCTCCTGTACGA-CCAAGGCCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15382355 AGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * ** *
15382398 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGTCAAATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TG-CCGATGGTGCC
* * * *
15382442 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGGCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * * *
15382484 ATAGGCTCCCGCA-AGACCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15382526 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * * *
15382569 CGAGGAACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15382612 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCAATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15382655 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15382697 C--GGCTCCTGCACGA--CAAGGGGGCTACGTTGCCGAT-GT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTA-GGTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15382736 CGAGGCTCTCGTATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCTCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGC-CGATGGTGCC
* ** *
15382779 CGAGGCT-CCGCACAACCAACGG-CCTAGGTTACGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAA-GGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15382820 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15382863 CGAGGTTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** ** *
15382906 TAAGGCTCCCGCACATCCAAGCCCCAAGGT---G-T--T--C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15382940 CGAGG-TCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTGCCGATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGT-GCC
* * * * * * **
15382980 CGAGGCTCTCTCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * ** *
15383023 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAACGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15383066 CGCGGCTCCCGCACATCCAAGCAACAAGGTACCAATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15383108 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15383149 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTACATTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15383192 CGAGTCT-CCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGCTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15383234 CGAGGCT-CC-CACATCACTAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATC-C-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15383277 CGAGGCTCCTGCAGATCCGAGAACCAAGGTGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15383319 TAAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTTACCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15383362 CGAGGCTCCCGCTCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15383405 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15383448 CGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15383490 CAATGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15383532 CGAGGCTCTCGCTCGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * **
15383575 CAAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-T-GCCGATGGTGCC
* * *
15383618 CGAAGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15383661 TGAGGCTTCCGCACGA-CCAGGGACCTAAGTTGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15383703 TGAGACCCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** ** * *
15383746 CGAGGCTCCCGCACATTTAATTACCGAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15383788 CGAAGCTCCCGCA-AGACCAA-GAGCCTAGGTGCC-AGTGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGA-CCTAGGTGCCGA-TGGTGCC
*
15383829 CGAGGCTCTCG-A-ATGACCAAGTG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15383872 TGAGGCTCCCGTACGA-CAAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15383914 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15383956 CGAGGCTCTCGCACGA-CC-AGG-CCTAGGTTCCCGATGATACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15383997 CGAGGCTCTCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15384040 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15384083 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *** * * *
15384126 TGAGGCTTTGGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15384161 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTACCGATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15384203 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15384246 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAA-TAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15384289 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15384331 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGAAAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * * * **
15384372 CGAGGCTCTAGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTG-CGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15384414 CGAAGCT-CCGCACGA-CCAAGGCCCTAAGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15384456 AGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * **
15384499 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTATGTTGTCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTG-CCGATGGTGCC
* * * * *
15384543 CGAGGCTCACGCACATCCAAGCACCAAGGTGCTGATAGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15384584 CGACGCTCCCGCA-AGAACAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15384626 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15384669 CGAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCA
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15384712 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15384755 CGAGTCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCTATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** *
15384797 CGAGGCTCCCGCACGA--CAAGGGGGCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15384839 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGC-CGATGGTGCC
* * * * * *
15384882 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAAGTTACCGATAGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* *
15384925 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15384968 CGAGGTTCCTGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTTCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** *
15385011 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGCCCCAAGGT---G-T--T-CC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15385046 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCTGATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGT-GCC
* * *
15385088 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15385130 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15385173 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15385216 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15385259 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** * *
15385302 TGAGGCTTTCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15385337 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTACT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15385379 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATTCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15385422 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAA-TAGCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15385465 CGAGGCTCCCGTACATCCAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15385507 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGAAAGT--C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15385547 CGAGGCTCTCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * ** *
15385590 CAAGGCTCCCGCCCGA-CCAAGGCCCTAGGTTGCAAATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15385633 CGAGGCTCCCG-A-ATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15385676 CGAGGCTCCTGCACATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15385718 CAAGGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * **
15385760 CGAGGCTCCCGCATGA-CC-AGGGCCTTGGTTGCCGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15385802 CGAAGCTCCTGTACGA-CCAAGGCCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15385845 AGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * **
15385888 TGAGGCTCCCGCATGA-CC-AGGGCCTACGTTGTCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTA-GGTG-CCGATGGTGCC
* * * *
15385931 CGAGGCTCCCGCACATCCATGCACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * * *
15385973 ATAGGCTCCCGCA-AGACCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15386015 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * * * *
15386058 CGAGGAACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15386101 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCAATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15386144 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15386186 CGAGGCTCCTGCACGA--CAAGGGGCTACGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15386227 CGAGGCTCTCGTATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCTCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGC-CGATGGTGCC
* * *
15386270 CGAGGCTCCCGCACAACCAACGG-CCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15386313 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15386356 CGAGGTTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** ** *
15386399 TAAGGCTCCCGCACATCCAAGCCCCAAGGT---G-T--T-CC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15386434 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGT-GCC
* * * * * * **
15386476 CGAGGCTCTCTCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * ** **
15386519 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAACGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15386562 CGCGGCTCCCGCACATCCAAGCAACAAGGTACCAATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15386604 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * **
15386645 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTACATTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15386688 CGAGTCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGCTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15386731 CGAGGCT-CC-CACATCACTAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATC-C-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15386774 CGAGGCTCCTGCAGATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15386816 TAAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTTACCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15386859 CGAGGCTCCCGCTCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15386902 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCT-AGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15386945 CGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15386987 CAATGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15387029 CGAGGCTCTCGCTCGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15387072 CAAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCAGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15387115 TGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15387158 CGAGGCTCCTGCACATTCTAGAACCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15387200 CAAGGCTCTCGCACGA-CCTAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15387242 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * **
15387285 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTAGCC-ATGGCGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-T-GCCGATGGTGCC
* * *
15387328 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTTGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15387371 TGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15387414 TGAGG--CCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15387455 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15387497 CGAAGCTCCCGCA-AGACCAA-GAGCCTAGGTGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15387538 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15387581 CGAGGCTCTCGTACGA-CAAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15387624 CGAGGCTCCCGCACATCGATGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15387667 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15387710 TGAGGCTCCCGCACATCCGAGCCCCAAGGT----A---TGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15387745 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTAG-C
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGT-GCC
* * * * * **
15387787 CGAGGCTCCCTCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15387830 CGAGTCTCCCGCACGA-CCAATG-CGCTAGGTTGCGGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGAC-CTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15387873 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCATCAAGGTACCAATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15387915 CGAGGCTCCCGCA-AGACCAA-GAGCCTAGGTGCCGATAGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15387956 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15387999 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15388042 CGAGGCTCCTGCACATCCGAGGACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15388084 CAAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15388126 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * * *
15388168 CGAGGCTATCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTCCTGATGGTGCG
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGGTGCC-GATGGTGCC
* * * * * *
15388211 CGAGGCTCCTGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGAGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15388254 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15388297 CGAGGCTCCAGCACATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15388339 CAAGGCT-CCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15388381 CAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15388423 CGAGGCTCTCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * **
15388466 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATAGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15388509 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15388552 TGAGGCTTCCC-AACGA-CCAGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGC-TCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15388595 TGAGGCCCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* ** *
15388638 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACAAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15388680 CGAAGCTCCTGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15388721 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAAGG-CCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15388764 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * **
15388807 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAATATG-CGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15388847 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15388889 CAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15388931 CGAGGATCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15388974 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15389017 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15389060 CGAGGCTCACGCA-TTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15389103 CGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGATGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15389145 CAATGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15389187 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15389230 CGAGGCTCCCGCA-AGACCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGG-T-GCCGATGGTGCC
* * *
15389273 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15389316 TGAGGCTTCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15389359 TGAGG-TCCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCT-CCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * *
15389402 CGAGGCTATCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15389437 CGAGGTTCTCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15389480 CGAGGCTTCCGTACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15389523 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15389565 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15389607 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTTCA
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15389650 CGAGGCTCCCGCAGAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15389693 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGACACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-GACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15389736 CGAGGCTCCAGCACGA-CCAAGGGCCT-GGTGCCGATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15389777 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15389819 CGAAGCTCTCTCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCACGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGC-CGATGGTGCC
** * * * *
15389862 CGACACTCCCACACAACCAAGTG-CCTAGGTTGTCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15389905 CGAGGCTCCCCCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** * *
15389948 CGAGGCTCCCGCACGA-CAAAGCCCCTAGGTTGCCTATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15389991 CGAAGCTCCCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * ** *
15390026 CGAGGTTCTCGCGCGAT-CAAGG-CCTAGGTTACCGATGGCACA
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *** *
15390068 CGAGGGTCCCGCACGA-CC-AGGGCCTAGATTAATGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAG-GTGCCGATGGTGCC
* * * **
15390110 CTAGACTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTTTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15390153 CGAGGCTCCCCCACAACCAAAGG-CCTAGGATGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCC-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15390196 CGAGGCTCCCGCACACCCAAGTAACAAGGTGCCGAT-GTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15390237 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCAAGGTGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15390278 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15390321 CGATGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15390364 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCGATATGCCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15390406 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15390448 CAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15390490 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15390533 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15390576 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGT-CACAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGC-C-GATGGTGCC
* * * *
15390619 CGAGGCTCACGCA-TTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15390662 CGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGATGCCGATGGTGCG
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15390704 CAATGCTCCCGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15390746 CGAGACTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCTATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * **
15390789 CGAGGCTCCCGCA-AGACCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGGACCTAGG-T-GCCGATGGTGCC
* * *
15390832 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15390875 TGAGGCTTCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCG
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * *
15390918 TAAGGCCCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * * *
15390961 CGAGGCTATCGCACATCTAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15390996 CGAGGTTCTCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15391039 CGAGGCTCCCGTACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15391082 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15391124 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15391166 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTTCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15391209 CGAGGCTCCCGCAGAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15391252 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGACACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-GACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15391295 CGAGGCTCCAGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15391337 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15391379 CGAAGCTCTCTCAC-TACCAGGGGCCTAGGTTCACGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGGTGC-CGATGGTGCC
** * * * * *
15391422 CGACACTCCCACACAACCAAGTACCTAGGTTGTCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15391465 CGACGCTCCC-CACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15391507 CGAGGCTCCCGCACGA-CAAAGCCCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15391550 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * ** *
15391585 CGAGGTTCTCGCGCGAT-CAAGG-CCTAGGTTACCGATGGCACA
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15391627 CGAGGGTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15391670 CTAGACTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15391713 CGAGGCTCCCGCACAACCAAGG-CCTAGGATGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15391755 CGAGGCTCCCGCACA-CTCAAGTAACAAGGTGCCGAT-GTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATC-CAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15391796 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15391839 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * *
15391883 CGAGCCT-CCGCACATCCAAGTACCAAGGTACCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15391924 CGAGCCTCCCGCCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCG-CAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15391967 CGAGGCTCTCG-ATCGA-CCAAGGGCCTAGGTCACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-C-ATCCAAGGACCTAGGT-GCCGATGGTGCC
* * * * * *
15392010 CGAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATCGTACC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15392053 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15392096 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15392137 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * * * *
15392179 CGAGGCACTCGTACGA-CTAGGGGCCCAGGTTCCCGATGATGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * ** **
15392222 CGAGGCTCCCGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCTAATGGTTAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15392265 CGAGGCTCCCGTACAGCCAAGGCACCAAGGTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15392308 CGAGGCTCCCGCACGA-CTAAGGGCCTCGGTTGCTGATGGTTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGG-TGCC
* * * *
15392352 TGAGGCTCTCGCACATCCAAGCACC-A--AG--G-T-GTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15392387 CGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG-CCTAGGTTGCCG-TGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15392428 CGAGG--CCCGTACGA-CC-AGGGCCTAGGTTACTGAT-GTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** *
15392467 CGAGGCTCCTGCAC-TACCAGGGGTCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * *
15392511 CGAGCCTCCCGCACATCTAAGAACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15392553 CGAGGCACCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTTCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15392595 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGTTACCGATGGTGCA
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15392637 AGAGGCACACGCACGA-CTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15392680 C-AAGCTCCCGTACGA-CCAAGG-CCTAGGTTGCCAATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15392721 CGAGGCTCACGTACATCCAAGTACCAATGTGCCAATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15392763 CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15392805 CAAGGCT-CCGCACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15392846 CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15392889 CGAGGCTCCC-CACAACCAAGGTCCTAGGTTTCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15392931 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15392974 CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGG-CCTAGGTTTCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15393016 CGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15393058 CAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15393099 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * ** **
15393142 TGAGGCTCCCGCATA-AC-TGGAGCCTAGGTTAACGATGGTGTT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGA-CCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15393184 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15393227 TGAGGCTTCCGTACGA-CCATGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15393270 TGAGGCCCCCGCACGA-CCAAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15393313 CGAGGCTCCTGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
*
15393355 CGAAGCTCCCGCACGA-CCAA-GAGCCTAGGTGCCGAT-GT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGA-CCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15393395 CGAGGCTCTCGGACAAT-AAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15393438 CGAGGCTTCCGCACATCCAAGTATCAAGGTGCCGATAGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15393480 CGAGGCTCCCACACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
** * * * * * *
15393522 CGAATCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTTCC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15393565 CGAGGCTCCAGCAGAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15393608 CGAGGCTCCCGCCCATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* ** *
15393650 CGAGGCT-CCGCATGA-CCAAGCCCCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCA-CATCCAAG-GACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15393693 TGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGTCCCGA-GGTTCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTG--CCGATGGTGCC
* * ** *
15393736 CG-GG----CG---AT-CAAGG-CCTAGTTACCGATGGCACA
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15393768 CGAGGGTCCCGCACGA-CC-AGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15393810 CTA-G-ACCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15393851 TGAGGCTCCCGCACAACCAAAGG-CCTAGGATGCTGATGGTG-T
1 CGAGGCTCCCGCACATCC-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15393893 CGAGGCTCCCGCACAT-CACAGTAACAAGGTGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCA-AGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15393935 CGAGGCT-CCGTACGA-CC-AGGGCCTAGGTGCCGATCGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15393974 CGAGGCTCTCG-A-ATGACTAAGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15394016 CGAGGCTCCCGTACGA-CC-AGGGCCTAGATTACTGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAG-GTGCCGATGGTGCC
* ** *
15394058 CGAGGCTCCTGCAC-TACC-AGGGTCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGGACCTAGG-TGCC-GATGGTGCC
* * * * *
15394101 CGAGCCTCCCGCACATCTAAGAACCAAGGTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
** * *
15394143 CGAGGAC-CTTGCA-AGACCAAGGGCCTACGGTGCCGATGGTG-C
1 CGAGG-CTCCCGCACA-TCCAAGGACCTA-GGTGCCGATGGTGCC
* * * *
15394185 CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * * *
15394228 CGAGGCACACACACGA-CTAGGGGCCTAGTTGTCGATGGTG-C
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15394269 CGAAGCT-CCGCACGA-CCAAAGG-CCTAGGATACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
*
15394311 CGAGGCT-CCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15394352 CGAGG-TCTCGCACGA-CTAAGGGA-TTAGGTTACCAATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15394393 CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGATGCT
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15394436 CGAGGC-CCCGCACAAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTG-A
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * *
15394478 CGAGGCTCCCGAAAAGCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * *
15394521 CGAGGCTCCCGCACGA-CTAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* *
15394564 TGAGGCTCTCGCACATCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCC
15394582 NGCATGAAAT
Statistics
Matches: 18080, Mismatches: 3657, Indels: 2298
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
31 4 0.00
32 14 0.00
33 32 0.00
34 77 0.00
35 321 0.02
36 62 0.00
37 19 0.00
38 26 0.00
39 80 0.00
40 281 0.02
41 1647 0.09
42 5989 0.33
43 8995 0.50
44 504 0.03
45 25 0.00
46 4 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (42 bp):
CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
Found at i:15372091 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15371965--15394577 Score: 18466
Period size: 85 Copynumber: 268.4 Consensus size: 85
15371955 AAACGATCAA
* *
15371965 GGCCTAGGTTGTCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15372030 CGAGGCTCCCACACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * * *
15372051 TACCAAGG-TGCCGATGATGGCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGG-TGCTGATAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15372113 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15372134 GGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCTGAGGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15372196 CGAGGCTCCCGCACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15372216 GGACCTAGGTTACCGAT-GTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 GG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15372280 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * ** *
15372302 CACCAAAG-TGCCGATGGTAG-CCGACGCTCCCGCACGACCAAGGGTGTAGG-TGCCGATAGT-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15372363 CCGAGGCTCTCGTACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
*
15372385 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15372449 TGAGGCTCCCGCACTACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15372470 GGTCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTCCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15372533 CCAAGGCTCCCGCACAACTAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15372555 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15372618 CCTGAGGCTCCCGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** *
15372641 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* ** * * *
15372697 CCGAGGTTCTTGTATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* *
15372718 GGCCTAGGTTGCCGATGG-GACTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15372782 CCGAGGCTCCCGCATGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *** * * *
15372804 GGCCTAGGTTGTCGAAGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCAAACCACCAAGG-TCCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15372867 CCAAGGCTCACGTACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15372889 GGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCCGAGGGTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15372952 CTAGGCTCCCGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15372973 GGCCTAGGTTGCAGATAGT-CCCAGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15373037 CCGAGGCTCCCGCACATCAGAG
65 CCGAGGCTCCCGCACACCA-AG
** * * ** * * * *
15373059 CACCAAAG-TGCCGATGGTGCAAGAGGCTCCTGCACGACAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGATGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15373123 CGAGGCTCCCGCATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * * ** *
15373144 GGCCTAGGTTGCCGATAGTGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGCCCTAGGTACCCAATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15373209 CGAGGCTCCCGTACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15373230 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15373295 CGAGGCTCCCGTACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * ** *
15373315 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCATAGGTTGCCAATTTTG-T
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** *
15373378 CGAGGCTCTTGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15373399 GGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15373464 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * * *
15373485 GCACCAAGG-TGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAAGTTGTCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15373549 CCGAGGCTCCCGCACATCCCAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** * *
15373571 CACCAAGG-T---G-T-G-GCCC-AGGTTCTTGCACGATCAA-GGCCTAGGTTGCC-AGTGGTAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGA-TGGTGC
*
15373626 CCGAGGCTCCCGCACAACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15373648 GGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15373713 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * *
15373734 CACCAAGG-TGCAGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGGTAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15373796 CGAGGGTCTCGCACGATCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * *
15373817 GGACTAGGTTTCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCGAGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15373882 TGAGGCTCCCGCACATC-AG
66 CGAGGCTCCCGCACACCAAG
* * * *
15373901 AGCACGAAAG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
1 GGC-C-TAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
* **
15373965 CCCGAGGC-ACC-CACATGATGAG
64 CCCGAGGCTCCCGCACACCA--AG
* ** * * * *
15373987 CGACCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAAGC-CCCGCACGACCAATGCCCTAGGTTGTCGATGGTGC
1 -GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15374051 CCGAGGCTCTCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * * * *
15374073 TACCAACG-TGCCGAAGGTGGCCGAGGCACCCGCACGACCAAAGGCCTAGG-TGCCGATTGT-CT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15374135 CGAGGCTCTCGAACGACCGAA-
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACC-AAG
* * * * *
15374156 GGCCTTGGTAGCCGATGGTGCCCGAGGCTACCGTACGACC-AGCGGCCTAGGTTACCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15374220 TCGAGGCTCCCGCACGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * ** * * *
15374242 GGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCGAAGCTCTCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCGATAGTG
1 GGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15374305 CCCGAGACTCCCGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * *
15374328 GGCTTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGAATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15374392 CAAGGCACACGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15374413 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGGCCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15374478 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15374499 GGCCTAGG-TGCAGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15374563 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** *
15374584 TACCAACG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTAGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15374648 TGAGGCTCTCGTACAACAAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *** * *
15374669 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTTCCGCAC-ATCCAAGTAACAAGG-TGCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
** * *
15374732 CCGAGGCTCCCATACGACTAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15374754 GGCCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGTTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15374817 CGAGGCTCCCGTAGGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * * * *
15374838 GGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCCCTCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGC
* *
15374903 CCTAGGCTCCCGTACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * *
15374925 CACCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCC-CTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTG-
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGC-ACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15374986 CCGAGGCTCTCGAACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15375008 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCAAGGCACACGCACGACCAGGGGCCTAGGGTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15375073 CGAAGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15375094 GGCCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCAGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15375158 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * * * *
15375179 GGATTAGGTTACTGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15375243 CGAGCCTTCCGCACAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15375264 GGCCTAGGTTACTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
15375327 CCCGAGGCTCCCGCACAACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
*
15375350 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15375414 TGAGGCT-CCGCACTACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15375434 GGTCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTCCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15375497 CCAAGGCTCCCGCACAACTAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15375519 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15375582 CCTGAGGCTCCCGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** *
15375605 GGCCTAGG--GCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* ** * * *
15375659 CCGAGGTTCTTGTATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* *
15375680 GGCCTAGGTTGCCGATGG-GACTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15375744 CCGAGGCTCCCGCATGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *** * * *
15375766 GGCCTAGGTTGTCGAAGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCAAACCACCAAGG-TCCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15375829 CCAAGGCTCACGTACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15375851 GGCCTAGG-TGCCGATAGT--CCGAGGGTCTTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTC-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15375913 CCTAGGCTCCCGCACGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15375935 GGCCTAGGTTGCAGATAGT-CCCAGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15375999 CCGAGGCTCCCGCACATCAGAG
65 CCGAGGCTCCCGCACACCA-AG
** * * ** * * * *
15376021 CACCAAAG-TGCCGATGGTGCAAGAGGCTCCTGCACGACAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGATG-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15376084 CGAGGCTCCCGCATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * * ** *
15376105 GGCCTAGGTTGCCGATAGTGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGCCCTAGGTACCCAATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15376170 CGAGGCTCCCGTACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15376191 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGA-CAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15376255 CGAGGCTCCCGTACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * ** *
15376276 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCATAGGTTGCCAATTTTG-T
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** *
15376339 CGAGGCTCTTGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15376360 GGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15376425 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * * *
15376446 GCACCAAGG-TGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAAGTTGTCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15376510 CCGAGGCTCCCGCACATCCCAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** * *
15376532 CACCAAGG-T---G-T-G-GCCC-AGGTTCTTGCACGATCAA-GGCCTA-GTTGCC-AGTGGTAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGA-TGGTGC
*
15376586 CCGAGGCTCCCGCACAACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15376608 GGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15376673 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * *
15376694 CACCAAGG-TGCAGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CAAGAGCCTAGG-TGCCGGTAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15376755 CGAGGGTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * *
15376776 GGACTAGGTTTCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCGAGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15376841 TGAGGCTCCCGCACATC-AG
66 CGAGGCTCCCGCACACCAAG
* * * *
15376860 AGCACGAAAG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
1 GGC-C-TAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
* **
15376924 CCCGAGGC-ACC-CACATGATGAG
64 CCCGAGGCTCCCGCACACCA--AG
* ** * * * *
15376946 CGACCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAAGC-CCCGCACGACCAATGCCCTAGGTTGTCGATGGTGC
1 -GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15377010 CCGAGGCTCTCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * * * *
15377032 TACCAACG-TGCCGAAGGTGGCCGAGGCACCCGCACGACCAAAGGCCTAGG-TGCCGATTGT-CT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15377094 CGAGGCTCTCGAACGACCGAA-
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACC-AAG
* * * * *
15377115 GGCCTTGGTAGCCGATGGTGCCCGAGGCTACCGTACGACC-AGCGGCCTAGGTTACCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15377179 TCGAGGCTCCCGCACGACC-AG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** * * *
15377200 GGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCGATAGTG
1 GGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15377263 CCCGAGACTCCCGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * *
15377286 GGCTTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCGAATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15377350 CAAGGCACACGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15377371 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCT-CCGCACGGCCAA-GGCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15377434 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15377455 GGCCTAGG-TGCAGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15377519 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** *
15377540 TACCAACG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTAGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15377604 TGAGGCTCTCGTACAACAAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *** * *
15377625 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTTCCGCAC-ATCCAAGTAACAAGG-TGCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15377688 CCGAGGCTCCCGTACGACTAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15377710 GGCCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGTTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15377773 CGAGGCTCCCGTAGGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * * * *
15377794 GGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCCCTCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGC
* *
15377859 CCTAGGCTCCCGTACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * *
15377881 CACCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCC-CTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGC-ACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15377943 CCGAGGCTCTCGAACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15377965 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCAAGGCACACGCACGACCAGGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15378029 CGAAGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15378050 GGCCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCAGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15378114 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * * * *
15378135 GGATTAGGTTACTGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15378199 CGAGCCTTCCGCACAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15378220 GGCCTAGGTTACTGATGGTG-ACGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
15378282 CCCGAGGCTCCCGCACAACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** ** *
15378305 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTTTCGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTG-
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* ** * *
15378360 CCGAGGTTCTTGCATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * *
15378381 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCT-CCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15378444 CGAGTCTCCCGCACGACCAAT
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * ** * * * *
15378465 GGCCTAAGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-TCTAAGCACCAAAG-TACCGATGGTGGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15378528 CGAGGCTCCTGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15378549 GGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCCAAGGCTCTCGCACGACCATA-GGCCTAGGTTGCAGATGGTGT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15378613 CCGAGGCTCCCGAATGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * ** *
15378635 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGTAC-ATCCGAGAACCAAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15378698 CCAAGGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * **
15378720 GGCCTA-GCTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGTT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15378784 CGAAGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * * * * *
15378805 GCCCTAGGTTAACGATGGTGCCAGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15378870 CGAGGCTCCCGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * ** * *
15378891 GGCCTAGTTTGTCAAATGGTGCCCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATAGTG
1 GGCCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15378954 CCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGC-ACACCAAG
* * *
15378977 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGACGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15379041 CGAGGCGCACGCTCGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
*
15379062 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGA-CAA-GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15379124 CGAGGCTCTCGCACGA-CAAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAA-G
* * * * * *
15379145 GGGCTAGGTTGCCGATGGT--ACGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15379208 TGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * * * *
15379229 CGCC-A---AG-C--T-GTTCCC--GGTTCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTGCCAATGGTAG-
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-GC
* * *
15379282 CCGAGGCTCCCTCAGGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * * * * ** *
15379304 GGCCTAGGTTGCCAATAATGCCCGAGTCTCTCG-ACGACCAATGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15379368 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
*** * * ** * * * *
15379389 CATCAAGG-TACAAATGGTGGCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15379451 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15379472 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATAGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15379537 CGAGGTTCCAGCATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * ** *
15379558 GGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCTTGCA-GATCCGAGAACCAAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15379621 CCAAGGCTCCCGCACGGCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
*
15379643 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGTCC-AGGTTGCCGATGGT-A
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15379705 CCGAGGCTCTCGCATGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* *
15379727 GGCCTAGGTT-CCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15379791 CCAAGGCTCCCGCATGACCAAA
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * *
15379813 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCAAGGACCTAGGTTACCGATAGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15379877 CGAGGCTCCCGCTCGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15379898 GGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15379963 CGAGGCTCCTGCACATTCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15379984 AACCTAGG-TGTCGATGGTGCCCAATGCTCCCCCACGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15380047 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15380068 GGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-GCCGATGGTGC
* * *
15380132 TCGAAGCTCTCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15380154 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTTCCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15380218 CTGAGGC-CCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** *** * *
15380239 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATTTAATTACCAAGG-TGCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15380302 CCGAAGCTCCCGCAAGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGC-ACACCAAG
* * * * *
15380324 AGCCTAGG-TGCC-AGTGGT-CCCGAGGCTCTCGAATGACCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGA-TGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15380386 CTGAGGCTCCCGTACGACAAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * *
15380408 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGATTAGGTTACCGATGGT-AC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15380471 CGAAGCTCTCGCACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15380491 GGCCTAGGTTCCCGATGATGCCCGAGGCTCTCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15380556 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * *
15380577 GCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAA-GGCCTAGGTTACCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* ***
15380640 CTGAGGCTTTGGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * * * *
15380662 CACC-A---AG--G-T-GTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTACCGAT-GTACC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15380717 CGAGGCTCCCGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * ** *
15380738 GGCCTAGGTTGCCAATGATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAATAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15380803 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * **
15380824 CACCAAAG-TACCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGG-TGCCGAAAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15380886 CGAGGCTCTCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * ** * * *
15380907 GGCCTAGGATACCGATGGTGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGCCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15380972 AGAGGCTCCCGTACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * **
15380993 GGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCTCGCACGACC-AGGGCCTATGTTGTCAAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTG-CCGATGGTGC
15381057 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15381079 CACCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGACGCTCCCGCAAGAACAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15381142 CGAGGCTCTCGAACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15381163 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCACACGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15381228 CGAAGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15381249 GGCCTAGGTTACTGATGGTGTCCGAGTCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGG-TGCCTATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15381313 CGAGGCTCCCGCACGA-CAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15381333 GGGCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTT-CTCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-CGATGGTGC
15381396 CCGAGGCTCCCGCACAACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * *
15381418 GGCCTAAGTTACCGATAGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-GGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
* *
15381481 CCCGAGGTTCCTGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * ** *
15381504 GGCTTAGGTTTCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCCCCAAGG-T---G-T--T-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * *
15381560 CCGAGGTTCTCGCATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * ** *
15381581 GGCCTAGGTTGCTGATGGTAG-CCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGATTAGGTTGCCGATGGT-A
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15381644 CCGAGGCTCTCGCACGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15381666 GGCCTAGGTT-CCTGATGATGCCCGAGGCTCCTGCACAACCAAGGACCTAGGTTGCTGATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15381730 CCGAGGCTCCTGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * *
15381752 GCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-CCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* **
15381815 CTGAGGCTTTCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * * *
15381837 CACC-A---AG--G-T-GTGCCCGAGGTTCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTACT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15381893 CGAGGCTCCCGCACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * ** *
15381913 GGCCTAGGTTGCCAATGATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAATAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15381978 CGTGGCTCCCGTACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * **
15381999 CACCAAAG-TACCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGG-TGCCGAAAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15382061 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15382082 GGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCCAAGGCTCCC-CCCGACCAA-GGCCTAGGTTGCAGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15382145 CGAGGCTCCCGAATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * ** *
15382166 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCAC-ATCCGAGAACCAAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15382229 CCAAGGCTCCCGCACTACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * **
15382251 GGCCTAGG-TGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCATGA-C-AGGGCCTTGGTTGCTGATGGTGTT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15382312 CGAAGCTCCTGTACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * * *
15382333 GCCCTAGGTTACCGATGGTGCCAGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15382398 CGAGGCTCCCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
** * ** * * *
15382419 GGCCTAGGTTGTCAAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGGCGATAGTG
1 GGCCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
** *
15382482 CCATAGGCTCCCGCAAGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGC-ACACCAAG
* * *
15382505 GGCCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** * *
15382569 CGAGGAACACGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15382590 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCAATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15382655 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15382676 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCC--GGCTCCTGCACGA-CAAGGGGGCTACGTTGCCGAT-GT-A
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * *
15382735 CCGAGGCTCTCGTATGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *
15382757 GGCCTAGGTT-CTCGATAGTGCCCGAGGCT-CCGCACAACCAACGGCCTAGGTT-ACGATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGC-CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15382819 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * * *
15382841 GCACCAAGG-GGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
**
15382905 CTAAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * *
15382927 CCCCAAGG-T---G-T--T--CCGAGG-TCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGT-GCCGATGGTAG-
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-GC
* * * *
15382979 CCGAGGCTCTCTCAGGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * * * ** *
15383001 GGCCTAGGTTGCCAATAATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAACGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15383066 CGCGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
*** * * * * * *
15383087 CAACAAGG-TACCAATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15383149 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * *
15383170 GGCCTACATTGCCGATGGTGCCCGAGTCT-CCGCATGACCAGGGGCCTAGGCTGCAGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15383234 CGAGGCTCCCACATCACTAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * ** * *
15383255 GGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCTGCA-GATCCGAGAACCAAGG-TGCTGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
**
15383318 CTAAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * *
15383340 GACCTAGGTTACCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCTCGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15383405 CGAGGCTCCCGCATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * **
15383426 GGCCTAAGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCAC-ATTCGAGAACCTAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15383489 CCAATGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15383511 GGCCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCTCGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15383575 CAAGGCTCCCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
** * *
15383596 GGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTTCGAAGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15383660 CTGAGGCTTCCGCACGACC-AG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15383681 GGACCTAAGTTGCCGATGGTG-CTGAGACCCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 GG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
** *
15383745 CCGAGGCTCCCGCACATTTAAT
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15383767 TACCGAGG-TGCCGATGGTGGCCGAAGCTCCCGCAAGACCAAGAGCCTAGG-TGCC-AGTGGT-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGA-TGGTGC
* * *
15383828 CCGAGGCTCTCGAATGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *
15383850 TGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACGACAAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15383914 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * * *
15383935 GGATTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACC-A-GGCCTAGGTTCCCGATGATACC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15383997 CGAGGCTCTCGCACAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15384018 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15384081 CCCGAGGCTCCTGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *** ** *
15384104 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTTTGGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * * *
15384160 TCGAGGTTCTCGCATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *
15384181 GGCCTAGGTTACCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15384246 CGAGTCTCCCGCACGACCAAT
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** * * * *
15384267 AGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAAG-TACCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15384330 CCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** ** * * **
15384352 GGCTTAGG-TGCCGAAAGT-CCCGAGGCTCTAGCATGACCAGGGGCCTAGGTTG-CGATGGTGTT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15384414 CGAAGCT-CCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * * * *
15384434 GCCCTAAGTTACCGATGGTGCCAGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15384499 CGAGGCTCTCGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * ** * * *
15384520 GGCCTATGTTGTCAAATGGTGCCCGAGGCTCACGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCTGATAGTG
1 GGCCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
* * *
15384583 -CCGACGCTCCCGCAAGAACAAG
64 CCCGAGGCTCCCGC-ACACCAAG
* *
15384605 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15384669 CGAGGCACACGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15384690 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCACGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15384755 CGAGTCTCCCGCATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * *
15384776 GGCCTAGG-TGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CAAGGGGGCTAGGTTGCCGATGGT-A
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15384838 CCGAGGCTCTCGCACGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15384860 GGCCTAGGTT-CTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAAGTTACCGATAGTGA
1 GGCCTAGGTTGC-CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15384924 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * * * *
15384946 GCACCAAGG-GGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCTGCACGACCAAGGGCTTAGGTTTCCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15385010 CTGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * *
15385032 CCCCAAGG-T---G-T--T-CCCGAGGTTCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTGCTGATGGTAG-
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-GC
*
15385087 CCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * *
15385109 GGATTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15385173 CGAGGCTCCCGCACAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15385194 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
15385257 CCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** ** *
15385280 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTTTCGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * *
15385336 CCGAGGTTCTCGCATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * * *
15385357 GGCCTAGGTTGCCGATGGTACTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATTCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15385422 CGAGTCTCCCGCACGACCAAT
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * ** * * * *
15385443 AGCCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGTAC-ATCCAAGCACCAAAG-TACCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15385506 CCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * *
15385528 GGCTTAGG-TGCCGAAAGT--CCGAGGCTCTCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15385590 CAAGGCTCCCGCCCGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * * *
15385611 GCCCTAGGTTGCAAATGGTGTCCGAGGCTCCCGAATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15385676 CGAGGCTCCTGCACATCCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * *
15385697 AACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACTACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15385760 CGAGGCTCCCGCATGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * * * * *
15385780 GGCCTTGGTTGCCGATGGTGTTCGAAGCTCCTGTACGACCAAGGCCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15385845 AGAGGCTCCCGTACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** * * **
15385866 GGCCTAGGTTACTGATGGTGCTTGAGGCTCCCGCATGACC-AGGGCCTACGTTGTCAAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTG-CCGATGGTGC
*
15385930 CCGAGGCTCCCGCACATCCATG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** * *
15385952 CACCAAGG-TGCCGATAGTGCCATAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15386015 CGAGGCTCTCGAACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * *
15386036 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGAACACGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15386101 CGAAGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15386122 GGCCTAGGTTACCAATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15386186 CGAGGCTCCTGCACGA-CAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * * *
15386206 GGGCTACGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGTATGACCAGGGGCCTAGGTT-CTCGATAGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-CGATGGTGC
*
15386269 CCGAGGCTCCCGCACAACCAAC
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15386291 GGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-GGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
* *
15386354 CCCGAGGTTCCTGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** ** *
15386377 GGCCTAGGTTTCCGATGGTGTCTAAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCCCCAAGG-T---G-T--T-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * *
15386433 CCGAGGTTCTCGCATGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * * **
15386454 GGCCTAGGTTGCCGATGGTAG-CCGAGGCTCTCTCAGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15386518 CCGAGTCTCCCGCACGACCAAC
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** ** * *** * * * *
15386540 GCCCTAGGTTGTGGATGGTGTTCGCGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCAACAAGG-TACCAATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15386603 CCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * **
15386625 AGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTACATTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15386688 CGAGTCTCCCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *
15386709 GGCCTAGGCTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCACATC-ACTAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15386773 CCGAGGCTCCTGCAGATCCGAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * ** * * *
15386795 AACCAAGG-TGCCGATGGTGCCTAAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGACCTAGGTTACCGATAGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15386858 CCGAGGCTCCCGCTCGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15386880 GGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15386945 CGAGGCTCCTGCACATTCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * *
15386966 AACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAATGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15387029 CGAGGCTCTCGCTCGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15387050 GGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTTCAGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15387115 TGAGGCTCCCGCATGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * **
15387136 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCAC-ATTCTAGAACCTAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15387199 CCAAGGCTCTCGCACGACCTAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15387221 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15387285 CGAGGCTCCCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * *
15387306 GGCCTAGGTTAGCC-ATGGCGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTTGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15387370 CTGAGGCTTCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15387392 GACCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGG--CCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15387455 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15387476 TACCAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAAGCTCCCGCAAGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATGGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15387538 CGAGGCTCTCGAACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15387559 GGCCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAGGCTCTCGTACGACAAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15387624 CGAGGCTCCCGCACATCGATG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * *
15387645 GCACCAAGG-GGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15387709 CTGAGGCTCCCGCACATCCGAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15387731 CCCCAAGG-T----A---TGCCCGAGGTTCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTAG-
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-GC
* * *
15387786 CCGAGGCTCCCTCAGGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* ** * * * *
15387808 GGCCTAGGTTGCCAATAATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAA-TGCGCTAGGTTGCGGATGGTGT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGC-CTAGGTTGCCGATGGTGC
15387872 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
*** * * * * * * *
15387894 CATCAAGG-TACCAATGGTGGCCGAGGCTCCCGCAAGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATAGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15387956 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15387977 GGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15388042 CGAGGCTCCTGCACATCCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * *
15388063 GACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15388126 CGAAGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** *
15388147 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTATCGCATGACCAAGGGCCTAGGTT-CCTGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGC
* *
15388210 GCGAGGCTCCTGCACAACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15388232 GGCCTAGGTTGCAGATGGAGGCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15388297 CGAGGCTCCAGCACATCCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * *
15388318 AACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCT-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15388381 CAAGGCTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15388402 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15388466 CGAGGCTCCCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * ** * *
15388487 GGCCTAGGTTACCGATAGTGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15388552 TGAGGCTTCCC-AACGACC-AG
66 CGAGGC-TCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15388572 GGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCCCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 GG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15388637 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** ** * * * *
15388659 TACAAAGG-TGCCGATGGTGGCCGAAGCTCCTGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATGGT-CC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15388721 CGAGGCTCTCGAACGACCAAA
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15388742 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15388807 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * *
15388828 TACC-A-ATATG-CGATGGTG-CCGAGGCTCCTGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGT-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15388888 CCAAGGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15388910 GGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGATCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15388974 CGAGGCTCCCGCACAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *
15388995 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15389060 CGAGGCTCACGCATTACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * ** *
15389081 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTGCAC-ATTCGAGAACCTA-GATGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15389144 CCAATGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15389166 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15389230 CGAGGCTCCCGCAAGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGC-ACACCAAG
** * *
15389251 GGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGC
1 GGCCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15389315 CTGAGGCTTCCGCACGACC-AG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
*
15389336 GGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGG-TCCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
1 GG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
* **
15389400 TCCGAGGCTATCGCACATCCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15389423 CACC-A---AG--G-T-GTGCTCGAGGTTCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15389480 CGAGGCTTCCGTACGACAAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * *
15389501 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-TGCCGATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15389564 CCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * *
15389586 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTTCA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15389650 CGAGGCTCCCGCAGAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * ** *
15389671 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGACACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15389734 CCCGAGGCTCCAGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15389757 GGCCT-GG-TGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15389819 CGAAGCTCTCTCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * *
15389840 GGCCTAGGTT-CACGATGGTGCCCGACACTCCCACACAACCAAGTGCCTAGGTTGTCGATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGC-CGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15389904 CCGAGGCTCCCCCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * ** * *
15389926 GCACCAAGG-TGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACAAAGCCCCTAGGTTGCCTATGGTGT
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15389990 CCGAAGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * * * ** *
15390012 CACC-A---AG--G-T-GTGCCCGAGGTTCTCGCGCGATCAA-GGCCTAGGTTACCGATGGCACA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15390068 CGAGGGTCCCGCACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* *** * * * **
15390088 GGCCTAGATTAATGATGATGCCCTAGACTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTTTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15390153 CGAGGCTCCCCCACAACCAAA
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *** * *
15390174 GGCCTAGGATGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCCAAGTAACAAGG-TGCCGAT-GTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15390236 CCGAGGCTCCCGTACGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15390258 GGCCAAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15390321 CGATGCTCCCGTACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** ** *
15390342 GGCCTAGGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACC--GATATGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGT-TGCCGATGGTG
* *
15390404 ACCGAGGCTCCTGCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15390427 GGCCTAGG-TGCTGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTG-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15390490 CGAGGCTCTCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* *
15390511 GGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15390576 CGAGGCTCCCGTACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * ** *
15390597 GGCCTAGGTCACAGATGGTGCCCGAGGCTCACGCATTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15390662 CGAGGCTCCTGCACATTCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15390683 AACCTA-GATGCCGATGGTGCGCAATGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15390746 CGAGACTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15390767 GGCCCAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAAGACCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-GCCGATGGTGC
* *
15390831 TCGAAGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15390853 GGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCTGAGGCTTCCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGC
*** *
15390917 GTAAGGCCCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * ** *
15390939 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTATCGCAC-ATCTAAGCACC-A---AG--G-T-GTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * *
15390995 TCGAGGTTCTCGCATGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * *
15391017 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15391082 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15391103 TACCAAGG-TGCCGATGGTGACCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15391166 CGAGGCTCTCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * *
15391187 GGCCTAGGTTTCCGATGGTTCCCGAGGCTCCCGCA-GAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACG-ACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15391251 CCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * *
15391273 ACACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCAGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTAC
1 -GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
15391336 CCGAGGCTCCCGCACAACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * *
15391358 GGCCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAAGCTCTCTCACTACCAGGGGCCTAGGTT-CACGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-CGATGGTGC
** *
15391421 CCGACACTCCCACACAACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * *
15391443 TACCTAGGTTGTCGATGGTGACCGACGCTCCC-CAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
* *
15391505 TCCGAGGCTCCCGCACGACAAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * ** *
15391528 CCCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * * *
15391584 CCGAGGTTCTCGCGCGATCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * * *
15391605 GGCCTAGGTTACCGATGGCACACGAGGGTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15391670 CTAGACTCCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15391691 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACAACCAA-GGCCTAGGATGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15391755 CGAGGCTCCCGCACACTCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACAC-CAAG
*** * * * * * * *
15391776 TAACAAGG-TGCCGAT-GTGGCCGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15391839 CGAGGCTCCCGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** * * *
15391860 GGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCGAGCCT-CCGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-TACCGATAGTG
1 GGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15391922 CCCGAGCCTCCCGCCACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCG-CAC-ACCAAG
* * **
15391946 GGCCTAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGCTCTCG-ATCGACCAAGGGCCTAGGTCACCGATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-CGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* * *
15392009 CCGAGGCACACGCACGACCAGG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * ** *
15392031 GGCCTAGGTTGCCGATCGTACCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15392096 CGAGG-TTCCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** *
15392116 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGATTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15392179 CGAGGCACTCGTACGACTAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * ** **
15392200 GGCCCAGGTTCCCGATGATGCCCGAGGCTCCCGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCTAATGGTTAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15392265 CGAGGCTCCCGTACAGCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * *
15392286 GCACCAAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAAGGGCCTCGGTTGCTGATGGTTG
1 G-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGG-TG
* * *
15392350 TCTGAGGCTCTCGCACATCCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15392373 CACC-A---AG--G-T-GTGCCCGAGGTTCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTGCCG-TGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15392428 CGAGG--CCCGTACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * * *
15392446 GGCCTAGGTTACTGAT-GTGCTCGAGGCTCCTGCACTACCAGGGGTCTAGGTTGCCAAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGC
* *
15392510 CCGAGCCTCCCGCACATCTAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * * * *
15392532 AACCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGCACCCGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTTCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15392595 CGAGGCTCTCGAACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* ** * * * *
15392616 GGCCTA-GTTACCGATGGTGCAAGAGGCACACGCACGACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15392680 C-AAGCTCCCGTACGACCAA-
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * ** * * * *
15392699 GGCCTAGGTTGCCAATGGTGCTCGAGGCTCACGTAC-ATCCAAGTACCAATG-TGCCAATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15392762 CCGAGGCTCCTGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15392784 GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCT-CCGCACGACAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGT-AC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15392846 CGAGGCTCTCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * *
15392867 GGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCC-CACAACCAAGGTCCTAGGTTTCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15392931 CGAGGCTCTCGCACGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15392952 GGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAA-GGCCTAGGTTTCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15393016 CGAGGCTCCTGCACATTCGAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** *
15393037 AACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGACCAA-GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15393099 CGAGGCTCTCGCACGACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * ** *
15393120 GGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCA-TAAC-TGGAGCCTAGGTTAACGATGGTGT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15393183 TCGAAGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15393205 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTTCCGTACGACCATGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15393270 TGAGGCCCCCGCACGACCAAA
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * ** * *
15393291 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-TGCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15393354 CCGAAGCTCCCGCACGACCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * ** *
15393376 AGCCTAGG-TGCCGAT-GT-CCCGAGGCTCTCGGACAATAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15393438 CGAGGCTTCCGCACATCCAAG
66 CGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
*** * * * * *
15393459 TATCAAGG-TGCCGATAGTGACCGAGGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-AC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** * * *
15393522 CGAATCTCTCGCATGACCAGG
66 CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * *
15393543 GGCCTAGGTTCCCGATGGTTCCCGAGGCTCCAGCA-GAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGA
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACG-ACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15393607 CCGAGGCTCCCGCCCATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** *
15393629 CACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCT-CCGCATGACCAAGCCCCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15393692 CTGAGGCTCCCGCACATCCAA-
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * ** * * **
15393713 -G-C-A-----CC-AAGGTGTCCCGAGGTTCTCGGGCGATCAA-GGCCTA-GTTACCGATGGCAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
* *
15393767 ACGAGGGTCCCGCACGACC-AG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * *
15393788 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCTA-G-ACCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15393851 TGAGGCTCCCGCACAACCAAA
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *** * *
15393872 GGCCTAGGATGCTGATGGTG-TCGAGGCTCCCGCAC-ATCACAGTAACAAGG-TGCCGATGGTGG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
*
15393934 CCGAGGCT-CCGTACGACC-AG
65 CCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * *
15393954 GGCCTAGG-TGCCGATCGT-CCCGAGGCTCTCGAATGACTAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15394016 CGAGGCTCCCGTACGACC-AG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * * *
15394036 GGCCTAGATTACTGATGGTGCTCGAGGCTCCTGCACTACC-AGGGTCTAGGTTGCCAAATGGTGC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGC
* *
15394100 CCGAGCCTCCCGCACATCTAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
** * * ** *
15394122 AACCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGAC-CTTGCAAGACCAAGGGCCTACGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG-CTCCCGCACGACCAAGGGCCTA-GGTTGCCGATGGTG
* *
15394184 -CCGAGGCTCTCGAACGACCAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * *
15394206 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCACACACACGACTAGGGGCCTA-GTTGTCGATGGTG-C
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15394269 CGAAGCT-CCGCACGACCAAA
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15394289 GGCCTAGGATACCGATGGTGTCCGAGGCT-CCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15394352 CGAGG-TCTCGCACGACTAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
** * * * * * * * *
15394372 GGATTAGGTTACCAATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGATGCT
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
15394436 CGAGGC-CCCGCACAAACCAAG
66 CGAGGCTCCCGCAC--ACCAAG
* * ** * *
15394457 GGCCTAGGTTGCTGATGGTG-ACGAGGCTCCCG-AAAAGCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTG
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTG
*
15394519 CCCGAGGCTCCCGCACGACTAAG
64 CCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * *
15394542 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCTCGCAC
1 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC
15394578 ATCCNGCATG
Statistics
Matches: 17973, Mismatches: 3670, Indels: 1767
0.77 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
73 4 0.00
74 47 0.00
75 91 0.01
76 144 0.01
77 509 0.03
78 370 0.02
79 51 0.00
80 39 0.00
81 128 0.01
82 357 0.02
83 1369 0.08
84 3533 0.20
85 5900 0.33
86 5077 0.28
87 350 0.02
88 4 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (85 bp):
GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
CGAGGCTCCCGCACACCAAG
Found at i:15379375 original size:160 final size:158
Alignment explanation
Indices: 15379100--15379389 Score: 370
Period size: 160 Copynumber: 1.8 Consensus size: 158
15379090 TCCCGCACGA
* * * * *
15379100 CAAGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACAAGGGGGCTAGGTTGCCGATGGTA
1 CAAGGCCTAGGTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACAAGGGGCCTAGGTTGCCAATGGCA
* * *
15379165 CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCACATCCAAGC
66 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGCCCTAGGTTTCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC
15379230 GCCAAGCTGTTCCCGGTTCTCGCATGAT
131 GCCAAGCTGTTCCCGGTTCTCGCATGAT
* * *
15379258 CAAGGCCTAGGTTGCCAATGGTAG-CCGAGGCTCCCTCAGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAA
1 CAAGGCCTAGG-TGCCAATGGT-GCCCGAGGCTCCCGCACGACAAGGGGCCTAGGTTGCCAAT--
* * * * *
15379322 TGCCCGAGTCTCTCG-ACGACCAATGCCCTAGGTTGT-GGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATC
62 GGCACGAGGCTCTCGCACGACCAAGGCCCTAGGTT-TCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATC
15379385 CAAGC
126 CAAGC
15379390 ATCAAGGTAC
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 16, Indels: 8
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
158 11 0.10
159 41 0.37
160 47 0.42
161 12 0.11
ACGTcount: A:0.19, C:0.31, G:0.31, T:0.19
Consensus pattern (158 bp):
CAAGGCCTAGGTGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACAAGGGGCCTAGGTTGCCAATGGCA
CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGCCCTAGGTTTCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC
GCCAAGCTGTTCCCGGTTCTCGCATGAT
Found at i:15384288 original size:163 final size:163
Alignment explanation
Indices: 15384018--15385491 Score: 432
Period size: 163 Copynumber: 8.8 Consensus size: 163
15384008 CACAACCAAG
* * * *
15384018 GGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCC
1 GGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGATGCC
* * * ***
15384083 CGAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTTTGGCACATCCAAGC
66 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC
15384148 ACCAAGGTGTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA
131 ACCAAGGTGTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA
** *
15384181 GGCCTAGGTTACCGATGGT-ACCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGGGCCTAGGTTGCCAATGAT
1 GGCCTAGGTTACCGATGGTGA-CCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCAATGAT
* *
15384243 GCCCGAGTCTCCCGCACGACCAATAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCA
63 GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCA
* * * *
15384308 AGCACCAAAGTACCGATGGTGGC-CGAGGCTCCCGCACGACCAA
128 AGCACC-AAG----G-T-GT-GCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA
* * ** * ** * ** * * *
15384351 GGGCTTAGG-TGCCGAAAGT-CCCGAGGCTCTAGCATGA-CC-AGGGGCCTAGGTTG-CGATGGT
1 -GGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGCACCAAGG-TGCCAATGAT
** * * * *
15384411 GTTCGAAGCT-CCGCACGACCAAG-GCCCTAAGTTACCGATGGTG-CCAGAGGCTCCCGTACGA-
63 GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAG-CCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCAC-AT
* ** * * * * *
15384472 CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCTCGCACGACCAGG
125 CCAAGCACC-A----A--GGT-GTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCA-A
* * ** * * **
15384520 GGCCTATGTTGTCAAATGGTGCCCGAGGCTCACGCACATCCAA-GCACCAAGGTGCTGAT-AGTG
1 GGCCTAGGTT-ACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGA-TG
* * * * * * *
15384583 -CCGACGCTCCCGCAAGAACAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGAACGA-CCA
64 CCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCA
** * * ** * * * *
15384645 AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCACACGCACGACCAGG
128 AGCACC-A---AG--G-T-GTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCA-A
* * * * * ** *
15384690 GGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CACGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTACTGATGGT
1 GGCCTAGGTTACCGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCAATGAT
* * * * * *
15384752 GTCCGAGTCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGG-TGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA--C
63 GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCC
*** * * * * * *
15384814 AAGGGGGCTAGGTTGCCGATGGTACCGAGGCTCTCGCACGACCAGG
127 AA-GCACCAAGG-T---G-TGCT--CGAGGTTCTCGCATGATCA-A
* * * * * *
15384860 GGCCTAGGTT-CTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGC-CTAAGTTACCGAT-AGT
1 GGCCTAGGTTAC-CGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GGCACCAAGGTGCCAATGA-T
* * * * * *
15384922 GACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG-GCACCAAGG-GGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCTGCACGA
63 GCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGAG--CCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-A
** ** * * * *
15384984 -CCAAGGGCTTAGGT-TTC-CGATGGTGTCT-G-AGGCTC-C
124 TCCAAGCACCAAGGTGTGCTCGA-GGT-TCTCGCATGATCAA
* * * * * * * * * * **
15385020 CGCACATCCAAG--CCCCAAGGTGTTCCCGAGGTTCTCGCATGAT-CAAGG--CCTAGGTTGCTG
1 GGC-C-T--AGGTTACCGATGGTG--ACCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGGCACCAAGG-TGCCA
* * * ** * *
15385080 ATGGTAG-CCGAGGCTCCCGTACGACCAAGGGATTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCA
58 ATGAT-GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCA
* ** * * * * ** *
15385143 CGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAA
122 C-ATCCAAGCACC-AAG-----G-TG-TGCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA
* * * *
15385193 GGGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGC
1 -GGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGATGC
* * **
15385258 CCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTTTCGCACATCCAAG
65 CCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAG
*
15385323 CACCAAGGTGTGCCCGAGGTTCTCGCATGATCAA
130 CACCAAGGTGTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA
* ** *
15385357 GGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACTCGAGGCTCCCGCACGA-CC-AGGGGCCTAGGTTGCCAATGAT
1 GGCCTAGGTTACCGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCAATGAT
* * * * *
15385419 TCCCGAGTCTCCCGCACGACCAATAGCCTAGGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGTACATCCA
63 GCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCA
15385484 AGCACCAA
128 AGCACCAA
15385492 AGTACCGATG
Statistics
Matches: 1011, Mismatches: 200, Indels: 200
0.72 0.14 0.14
Matches are distributed among these distances:
160 2 0.00
161 1 0.00
162 59 0.06
163 252 0.25
164 48 0.05
165 6 0.01
166 4 0.00
167 52 0.05
168 45 0.04
169 68 0.07
170 221 0.22
171 208 0.21
172 41 0.04
173 2 0.00
174 2 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.31, G:0.31, T:0.18
Consensus pattern (163 bp):
GGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGATGCC
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC
ACCAAGGTGTGCTCGAGGTTCTCGCATGATCAA
Found at i:15389549 original size:121 final size:123
Alignment explanation
Indices: 15371676--15393808 Score: 4178
Period size: 128 Copynumber: 175.2 Consensus size: 123
15371666 CATCCAACGT
* * * * *
15371676 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGTACATCAAAGCACTAAGGTGCCAATGCTGCATG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * * *
15371740 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCGAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACCACCAAGT
61 AGG-TTCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15371803 G
123 G
* * * *
15371804 CCTAGGTTACCGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAAGTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACC-AAG-GTCGATGCT--AC
* *** * * * *
15371868 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATTCGAGGCTCCCGTAC-ATACAAGC
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15371932 A
123 G
* * * * ** * * *
15371933 CCAAGGTGTGCCCAAGGTTCTC-A----AACG---AT-CAAGGC-CTAGGTTGTCGATGGTACCC
1 CCTAGGT-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAG--GTCGATGCTA--C
* * * *
15371988 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGT
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15372052 A
123 G
* * * * ** * *
15372053 CCAAGG-TGCCGATGATGGC-CGAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGGTGCTGATAG-TCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT-C-GAT-GCT-ACG
* * * *
15372115 AGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCTGAGGGTTCCGCACGACCAAGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15372177 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTACCGATG-TGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * *
15372239 GAGCCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGC
60 GAG-GTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15372303 A
123 G
* * * ***** *
15372304 CCAAAG-TGCCGATGGTAGC-CGACGCTCCCGCACGA-CCAAGGGTGTAGGTGCCGATAG-TCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT-AC
* * * *
15372365 GAGGCTCTCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
*** * *
15372430 CCTAGG-TGCCGATGGTGC-CTGAGGCTCCCGCAC-TACCAAGGGTCTAGGTTACCGATGGTACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA-C
* * * * * *
15372492 GAGGCTCTCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACAACTAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15372556 G
123 G
* * * *
15372557 CCTAGGTTGCTGATGGTGAC-CGAGGCTCCTGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGT--CGATGCT-AC-
* * * * *
15372621 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGC
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15372685 A
123 G
* * * * *
15372686 CCAAGGTGTGCCCGA-GGTTCTTGTA---T---G---AT-CAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGGAC
1 CCTAGGT-TG-CCGATGGTGCTCG-AGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT--G-C
* * * *
15372739 T-CGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAA
57 TACGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAA
15372803 GGG
121 GGG
* * * * * * *
15372806 CCTAGGTTGTCGAAGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCAAACCACCAAGGTCCCGATGGTGGCCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * *
15372870 AGGCTCACGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCCGAGG-GTCTCGCACGACCAAGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * *
15372932 CCTAGGTTTCTGATGGTGCCCTAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATAG-TCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GAT-GCT-AC
* * * * * *
15372995 AGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCAC-ATCAGAG
60 -GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCA-AG
**
15373059 CA
122 GG
* * ** * * ** * * *
15373061 CCAAAG-TGCCGATGGTGCAAGAGGCTCCTGCACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGATGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT--AC
* * * ** * * *
15373124 GAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGC
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
** * * * * ** * * *
15373189 CCTAGGTACCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-
* * * *
15373253 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACC-AGGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * ** *
15373317 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAG-GGCATAGGTTGCCAATTTTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCA-AGG-T--CGATGCT-AC
* * * * * *
15373379 GAGGCTCTTGCACGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCACAACTAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAAGG
15373443 G
123 G
* * *
15373444 CCTAGGTTGCCGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCAATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGT--CGATGCT--AC
* * * * * * * *
15373508 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAAGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCCAGC
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15373572 A
123 G
* * * ** * * * *
15373573 CCAAGG-T---G-T-G-GC-CCAGGTTCTTGCACGAT-CAAG-GCCTAGGTTGCCAGTGGTACCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-CGA-TGCTA--C
* * * * *
15373628 GAGGCTCCCGCACAACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* *
15373693 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCAGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT-C-GATGCT--ACG
* * * * * *
15373757 AGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGGTAGT-CCCGAGG-GTCTCGCACGATCAAGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * * *** * * *
15373819 ACTAGGTTTCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCGAGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGGCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-G
* * * * *
15373884 AGGCTCCCGCAC-ATC-AGAGCACGAAAG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCACGACCAAG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGC-C-TAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAAG
15373945 GG
122 GG
* * * * *
15373947 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC-ACC-CACAT-GATGAGCGACCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCA--AGC-ACCAAGG-T--CGAT-G-CT
* * ** * * *
15374009 TCGAAGCCCCGCACGACCAATGCCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGC-TCTCGCAC-ATCCAA
58 ACGAGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGA-CCAA
**
15374072 GTA
121 GGG
* * * * * *
15374075 CCAACG-TGCCGAAGGTGGC-CGAGGCACCCGCACGA-CCAAAG-GCCTAGGTGCCGATTGTCT-
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCC-AAGCACCAAGGT--CGA-TG-CTA
* * * * * *
15374135 CGAGGCTCTCGAACGACCGAA-GGCCTTGGTAGCCGATGGTGCCCGAGGCTACCGTACGACC-AG
59 CGAGGTTC-CGCACGACC-AAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15374198 CGG
122 -GG
* * ** * * * *
15374201 CCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--C-GATGCT--A
* * ** * * * * *
15374265 CGAAGCTCTCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TACCGATAGTGCCCGAGACTCCCGCACGACCAAG
59 CGAGGTTC-CGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15374328 GG
122 GG
* * ** ** * * *
15374330 CTTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTTTCG-A-ATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--A
* ** * * * * *
15374392 CAAGGCACACGCACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGGCCAAGG
59 CGAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15374457 G
123 G
* ** * * *
15374458 CCTAGGTTACCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCAGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT-C-GATGCT-AC-
* * * * *
15374521 GAGGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGT
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15374585 A
123 G
* * * ** ** * * *
15374586 CCAACG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTAGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-
* * * * * *
15374649 GAGGCTCTCGTACAACAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTTCCGCAC-ATCCAAGT
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15374713 A
123 G
* * ** * * ** * * *
15374714 ACAAGG-TGCCGATGGTGGC-CGAGGCTCCCATACGA-CTAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT-ACG
* * * * * * * *
15374776 AGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGTTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTAGGACCAGGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * * *
15374840 CCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCCCTCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--C-GATGCT--A
* * * ** * * *
15374904 CTAGGCTCCCGTAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGC-TCCCCTACGACCAA
59 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGC-ACGACCAA
15374966 GGG
121 GGG
* * ** * * *
15374969 CCTAGG-TGCCGATGGTGC-CGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* ** * * * *
15375031 AAGGCACACGCACGACCAGGGGCCTAGGGTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* ** * * *
15375096 CCTAGGTTACCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCAGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT-C-GATGCT--AC
* ** * * * *
15375159 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGATTAGGTTACTGATGGT-ACCGAGGC-TCTCGCACGACCAGGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15375222 G
123 G
* * * * * * ** * *
15375223 CCTAGGTTCCCGATGATGCCCGAGCCTTCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT-A-CG
* * * * *
15375288 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGG
61 AGG-TTCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15375351 G
123 G
* * ** * * *
15375352 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT-AC-G
* * * * *
15375416 AGGCTCCGCACTACCAAGGGTCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGC-TCTCGCACGACC-AGGG
61 AGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * *
15375477 ACCTAGGTTCCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGACC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT-A-C
* * * * *
15375542 GAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAG
60 GAGGTTCC-GCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15375605 GG
122 GG
* *
15375607 CCTAGG--GCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCACACATCCAAGCACCAAGGT-G-TGC-CCGAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGATGCTACGAGGT
* * * * * * *
15375666 TCTTGTATGATCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGG-GACTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
65 TC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * *
15375725 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGTCGAAGGTG-TC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACC-AAG--GTCG-A--TGCTA
* * *** * * * * *
15375788 CGAGGCTCCCGCAC-ATCAAACCACCAAGG-TCCCGATGGTGGCCAAGGC-TCACGTACGACCAA
59 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAA
15375850 GGG
121 GGG
* * * ** * * *
15375853 CCTAGG-TGCCGATAGT-C-CGAGGGTCTTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTC-CCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG--TC-GATGCT--A
* * * * * * *
15375914 CTAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATAGT-CCCAGAGGCTCCCGCACAACCAAG
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC-GAGGCTTCCGCACGACCAAG
15375978 GG
122 GG
* * * *
15375980 CCTAGGTTGTCGATGGTGGC-CGAGGCTCCCGCACAT-CAGAGCACCAAAGTGCCGATGGTGCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCACATCCA-AGCACC-AAG-GTCGATGCT--AC
* * * * * *
15376043 GAGGCTCCTGCACGACAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGATG-CCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGG
60 GAGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
15376107 CCTAGGTTGCCGATAGTGTTCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGC-CCTAGGTACCCAATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGGT---CGATGCT--A
* * * * * *
15376170 CGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGA-CAAGG
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15376234 G
123 G
* * * * ** * * *
15376235 CTTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * ** * * *
15376299 AGGCTCCCGTACGACCAAGGGCATAGGTTGCCAATTTTG-TCGAGGC-TCTTGCACGACCAGGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * *
15376362 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-A-CG
* * * * *
15376427 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
61 AGG-TTCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15376490 G
123 G
* * * * *
15376491 CTTAAGTTGTCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCCAGCACCAAGGT-G-TGGC--CCAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGAT-GCTACGAGG
* * * * * *
15376551 TTCTTGCACGATCAA-GGCCTA-GTTGCC-AGTGGTACCCGAGGCTCCCGCACAACCAGGGG
64 TTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGA-TGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * * *
15376610 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
* ** * * * * *
15376674 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCAGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGA-CAAGA
60 GAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15376736 G
123 G
* * * * * * * * *
15376737 CCTAGG-TGCCGGTAGT-CCCGAGGGTCTCGCACGA-CCAAGGGA-CTAGGTTTCTGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG--TC-GATGCT--A
* * * * * * * * *
15376798 CGAGGCTCCCGCACAACCGAGGGTCTAGGTTGCCGATGGTGGCTGAGGCTCCCGCAC-ATC-AGA
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15376861 G
123 G
* * * * ** * *
15376862 CACGAAAG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 C-C-TAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--
* ** ** * ** * *
15376925 CCGAGGCACC-CACATGA-TGAGCGACCTAGGTTGCCGATGGTGTTCGAAGC-CCCGCACGACCA
58 ACGAGGTTCCGCAC--GACCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCA
* *
15376987 ATGC
120 AGGG
* * * * * * * *
15376991 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACATCCAAGTACCAACGTGCCGAAGGTGGCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAA-G-GTCGATGCT--ACGA
** * * * *
15377056 GGCACCCGCACGACCAAAGGCCTAGG-TGCCGATTGT-CTCGAGGC-TCTCGAACGACCGAA-GG
62 GG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACC-AAGGG
* * * * * * *
15377117 CCTTGGTAGCCGATGGTGCCCGAGGCTACCGTACGA-CC-AGCGGCCTAGGTTACCGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGC-ACCAAGG-T--CGA---TGCT
* * * *
15377180 -CGAGGCTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCA
58 ACGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCA
**
15377242 AGCA
120 AGGG
* * * * * ** ** * *
15377246 CCAAGG-TACCGATAGTGCCCGAGACTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * * * *
15377309 AGGCTTTCGAATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGGCCAAGGC-ACACGCACGACCAGGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * ** * * * *
15377373 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAAGCT-CCGCACGGCCAAG-GCCTAGGTTACCGATGGTGTCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTACG
* * * * *
15377436 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCAGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACGACCAAGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
15377499 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAACGTGCCGATGGTGCCCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAA-G-GTCGATGCT--ACGA
* * * * * * *
15377564 GGCTCTAGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCTGAGGC-TCTCGTACAACAAAGGG
62 GGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * *
15377627 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTTCCGCACATCCAAGTAACAAGGTGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * *
15377691 AGGCTCCCGTACGACTAGGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGC-TCTCGAACGACCAAGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * * ** *
15377753 CCTAGTTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT-
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T-C-GA---TGCTA
* * * * * * * *
15377816 CGAGGCTCCCTCATGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCTAGGCTCCCGTAC-ATCCAA
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAA
**
15377880 GCA
121 GGG
* * * ** * * *
15377883 CCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCC-CTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGC-AC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--AC
* * * * * *
15377945 GAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCAAGGC-ACACGCACGACCAGGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15378009 G
123 G
* * ** * * *
15378010 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
* * *
15378073 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
** * * * * * ** * * *
15378137 ATTAGGTTACTGATGGTAC-CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * * *
15378200 GAGCCTTCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTG-ACGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGG
60 GAG-GTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15378263 CA
123 -G
* * * ** * * *
15378265 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-G
* ** * * * *
15378329 AGGCTTTCGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTG-CCGAGG-TTCTTGCATGATCAA-G
61 AGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15378382 G
123 G
* * ** * *
15378383 CCTAGGTTGCCGATGGTAC-CGAGGCT-CCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--C---GATGCTA
* * * * * * *
15378444 CGA-GTCTCCCGCACGACCAATGGCCTAAGTTACCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-TCTAAG
59 CGAGGT-T-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
**
15378507 CA
122 GG
* * * * ** * * * *
15378509 CCAAAG-TACCGATGGTGGC-CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--A
* * * * * * * *
15378571 CAAGGCTCTCGCACGACCATA-GGCCTAGGTTGCAGATGGTGTCCGAGGCTCCCGAATGACCAGG
59 CGAGGTTC-CGCACGACCA-AGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15378635 GG
122 GG
* * * * * * * * *
15378637 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGTACATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACGA
* * * * *
15378702 GGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTA-GCTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
62 GG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
15378764 CCTAAGTTGCCGATGGTGTTCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGC-CCTAGGTTAACGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T--CGATGCT-AC
* * * * * * * *
15378827 AGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGG
60 -GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15378892 G
123 G
* ** * * *
15378893 CCTAGTTTGTCAAATGGTGCCCGAGGCTCCCACACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATAG-TGCCC
1 CCTAGGTTG-CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT--AC
* * *
15378957 GAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCTCGAACGACCAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15379020 G
123 G
* * * * * * ** * * *
15379021 CCTAGGTTGCCGACGGTGCCCGAGGCGCACGCTCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
*
15379085 GAGGCTCCCGCACGA-CAA-GGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCTCGCACGA-CAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAA-G
15379145 GG
122 GG
* * * * ** * * *
15379147 GCTAGGTTGCCGATGGT--ACGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG--T-CGATGCT-AC-
* * * * * *
15379209 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCGCC-A---AG-C--T-GTTCCC--GG-TTCTCGCATGATCAA-
60 GAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15379261 GG
122 GG
* * * * ** * *
15379263 CCTAGGTTGCCAATGGTAGC-CGAGGCTCCCTCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGC-
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--C---GATGCT
* * * ** * *
15379325 CCGA-GTCTCTCG-ACGACCAATGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCA
58 ACGAGGT-TC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCA
**
15379387 AGCA
120 AGGG
* * * ** * * *
15379391 TCAAGG-TACAAATGGTGGC-CGAGGCTCTCGCACGA-CCAAG-AGCCTAGGTGCCGATAG-TCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGGT--CGAT-GCT-A
* * * *
15379451 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGG
59 CGAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15379516 G
123 G
* * * * * ** * * * *
15379517 CCTAGGTTGCAGATAGTGCTCGAGGTTCCAGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * ** * * * *
15379581 GAGGCTCTTGCA-GATCCGAGAACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGGCCAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15379644 G
123 G
* ** *
15379645 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGTCC-AGGTTGCCGATGGTACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T--CGATGCTA-C
* * * * *
15379707 GAGGCTCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTT-CCTGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15379771 G
123 G
* * * * * * * *
15379772 CCTAGGTTGCAGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCATGA-CCAAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCC-AAGCACCAAGG-T--CGATGCT--A
* * * * * * * *
15379835 CGAGGCTCCCGCAC-ATCAAGGACCTAGGTTACCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCTCGACCAGGG
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15379899 G
123 G
* * * ** * * *
15379900 CCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACC-AAG--GTCGATGCT--AC
* * * ** * * * * *
15379964 GAGGCTCCTGCAC-ATTCGAGAACCTAGG-TGTCGATGGTGCCCAATGCTCCCCCACGACCAAGG
60 GAGGTTCC-GCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15380027 G
123 G
* * * ** * * *
15380028 CCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * ** *
15380091 AAGGCTCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTAG-CGATGGTGTTCGAAGC-TCTCGCACGACCAAG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15380154 GG
122 GG
* * * * * *
15380156 CCTAGGTTGCCGATGGTGC-CTGAGGCTTCCGCACGA-CCAGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC
** * * ** **
15380219 TGAGGCCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATTTAATT
60 -GAGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15380283 A
123 G
* * * * * * *
15380284 CCAAGG-TGCCGATGGTGGC-CGAAGCTCCCGCA-AGACCAAG-AGCCTAGGTGCCAGTGGTCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCA-CCAAGGT-CGA-TGCT-AC
* * * * * * * *
15380345 GAGGCTCTCGAATGACCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGTACGACAAAGGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* ** *
15380410 CCTAGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTACCGATGGTACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T--CGATGCTA-C
* * * * *
15380472 GAAGCTCTCGCACGACC-AGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCCCGAGGC-TCTCGCACAACCAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15380535 G
123 G
* * *
15380536 CCTAGGTTGCTGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGT--CGATGCT--AC
* * * * ** *
15380600 GAGGCTCCTGCACGACCAA-GGCCTAGGTTACCGATGGTGTCTGAGGCTTTGGCAC-ATCCAAGC
60 GAGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15380663 A
123 G
* * * * * *
15380664 CC-A---AG--G-T-GTGCTCGAGGTTCTCGCATGAT-CAAG-GCCTAGGTTACCGATG-TACCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA--C
* * * * * * **
15380718 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAATAG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * *
15380783 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * ** * *
15380847 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGG-TGCCGAAAGT-CCCGAGGC-TCTCGCATGACCAGGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * * *
15380909 CCTAGGATACCGATGGTGTTCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGC-CCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T--CGATGCT-AC
* * * * * *
15380972 AGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGC-TCTCGCACGACC-AG
60 -GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15381035 GG
122 GG
* ** * *
15381037 CCTATGTTGTCAAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGCCGATAG-TGCCC
1 CCTAGGTTG-CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT--AC
* * * * *
15381101 GACGCTCCCGCAAGAACAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCTCGAACGACCAAGG
60 GA-GGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15381164 G
123 G
* * * * ** * *
15381165 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCAC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * * * * *
15381229 GAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGTCCGAGTCTCCCGCATGACCAAGGG
60 G-AGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * *** * *
15381294 CCTAGG-TGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA--CAAGGGGCTAGGTTGCCGATGGTACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA-CG
* * * *
15381356 AGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTT-CTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-CGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * *
15381420 CCTAAGTTACCGATAGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAA--GGTCGATGCT--AC
* * * * * *
15381484 GAGGTTCCTGCACGACCAAGGGCTTAGGTTTCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGC
60 GAGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15381548 C
123 G
* * * * * * * *
15381549 CCAAGG-T---G-T--T-CCCGAGGTTCTCGCATGAT-CAAG-GCCTAGGTTGCTGATGGTAGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCTA--C
* * ** * *
15381604 GAGGCTCCCGTACGACCAAGGGATTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGC-TCTCGCACGACCAGGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15381667 G
123 G
* * * * * * *
15381668 CCTAGGTT-CCTGATGATGCCCGAGGCTCCTGCACAACCAAGGACCTAGGTTGCTGATGGTGACC
1 CCTAGGTTGCC-GATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT-A-C
* * * *
15381732 GAGGCTCCTGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-CCCGCACGACCAAG
60 GAGGTTCC-GCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15381794 GG
122 GG
** *
15381796 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCTGAGGCTTTCGCACATCCAAGCACCAAGGT-G-TGC-CCGAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGATGCTACGAGGT
* * * * *
15381857 TCTCGCATGATCAA-GGCCTAGGTTGCCGATGGTACTCGAGGCTCCCGCACGACC-AGGG
65 TC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
15381915 CCTAGGTTGCCAATGATGCCCGAGTCTCCCGCACGA-CCAA-TAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGG-T--CGAT-G-CTA
* * * ** * * * * *
15381978 CGTGGCTCCCGTAC-ATCCAAGCACCAAAG-TACCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
59 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15382041 GG
122 GG
* ** * * ** * * * *
15382043 CTTAGG-TGCCGAAAGT-CCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * * * * * *
15382105 AAGGCTCCCCCCGACCAA-GGCCTAGGTTGCAGATGGTGTCCGAGGCTCCCGAATGACCAAGGG
60 GAGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
15382168 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACATCCGAGAACCAAGGTGCCGATGGTGCCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACGA
* * * *
15382233 GGCTCCCGCACTACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTG-CCGAGGCTCCCGCATGA-C-AGGG
62 GG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * * * * * *
15382292 CCTTGGTTGCTGATGGTGTTCGAAGCTCCTGTACGA-CCAAGGC-CCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T--CGATGCT-AC
* * * * * * * * *
15382355 AGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCATGACCAGGG
60 -GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15382420 G
123 G
** *
15382421 CCTAGGTTGTCAAATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTGGCGATAG-TGCCA
1 CCTAGGTTG-CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT-AC-
* * * * *
15382485 TAGGCTCCCGCAAGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGC-TCTCGAACGACCAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15382548 G
123 G
* ** * * ** * * *
15382549 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGAACACGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * * *
15382613 GAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCAATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
60 G-AGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * * *
15382678 CCTAGG-TGCCGATGGTGC-C-CGGCTCCTGCACGA--CAAGGGGGCTACGTTGCCGATG-TACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA--GCACCAAG--GTCGATGCTA-C
* * * * * * *
15382737 GAGGCTCTCGTATGACCAGGGGCCTAGGTT-CTCGATAGTGCCCGAGGC-TCCGCACAACCAACG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-CGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15382800 G
123 G
* * * *
15382801 CCTAGGTT-ACGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAA--GGTCGATGCT--AC
* * ** * *
15382864 GAGGTTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTCTAAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGC
60 GAGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15382928 C
123 G
* * * * * *
15382929 CCAAGG-T---G-T--T-C-CGAGG-TCTCGCATGAT-CAAG-GCCTAGGTGCCGATGGTAGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCTA--CG
* * * * * ** * * * *
15382982 AGGCTCTCTCAGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAACGC
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
** * * * * *
15383046 CCTAGGTTGTGGATGGTG-TCCGCGGCTCCCGCACATCCAAGCAACAAGGTACCAATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * *
15383110 AGGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCCGAGGC-TCTCGCACGACCAAGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
** * * * * ** * * *
15383172 CCTACATTGCCGATGGTGCCCGAGTCT-CCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGCTGCAGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT--AC
* * *
15383235 GAGGCTCC-CAC-ATCACTAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCA-GATCCG
60 GAGGTTCCGCACGA-C-C-AAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGA-CCA
**
15383296 AGAA
120 AGGG
* * * * * *
15383300 CCAAGG-TGCTGATGGTGC-CTAAGGCTCCCGCACATCCAAGGACCTAGGTTACCGATAG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-GCT--A
* * * * * *
15383362 CGAGGCTCCCGCTCGACCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGG
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15383427 G
123 G
* * * * * * * * * *
15383428 CCTAAGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGGTGCCGATGGTGCCCAA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACGA
* * * *
15383493 TGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGC-TCTCGCTCGACCAAGGG
62 -GGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * *
15383555 CCCAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTAGCGATGGTGTTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
* * *
15383619 GAAGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTTCCGCACGACC-AGGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
15383683 ACCTAAGTTGCCGATGGTGCT-GAGACCCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTA
* ** *** * * * * *
15383746 CGAGGCTCCCGCAC-ATTTAATTACCGAGG-TGCCGATGGTGGCCGAAGCTCCCGCAAGACCAAG
59 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
*
15383809 AG
122 GG
* * ** * * *
15383811 CCTAGG-TGCC-AGTGGT-CCCGAGGCTCTCG-A-ATGACCAAGTGCCTAGGTTGCCGATGGTGC
1 CCTAGGTTGCCGA-TGGTGCTCGAGGCTCCCGCACAT--CCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-A
* * * * *
15383871 CTGAGGCTCCCGTACGACAAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
59 C-GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15383935 GG
122 GG
** * * * * * *
15383937 ATTAGGTTACCGATGGTAC-CGAGGCTCTCGCACGA-CC-AG-GCCTAGGTTCCCGATGATACCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA--C
* * * * *
15383998 GAGGCTCTCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15384062 CA
123 -G
* * * ** * * *
15384064 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-
** ** * * * *
15384127 GAGGCTTTGGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGCTCGAGG-TTCTCGCATGATCAA-
60 GAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15384181 GG
122 GG
* * * * ** * *
15384183 CCTAGGTTACCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATGC-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--C---GATGCTA
** * *
15384246 CGA-GTCTCCCGCACGACCAATAGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA
59 CGAGGT-T-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAA
**
15384309 GCA
121 GGG
* * * ** ** * *
15384312 CCAAAG-TACCGATGGTGGC-CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTGCCGAAAG-TCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CG-ATGCT-AC
* * * * ** * *
15384373 GAGGCTCTAGCATGACCAGGGGCCTAGGTTG-CGATGGTGTTCGAAGC-TCCGCACGACCAAGGC
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** *
15384436 CCTAAGTTACCGATGGTGC-CAGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GA---TGCT
* * * **
15384499 -CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTATGTTGTCAAATGGTGCCCGAGGC-TCACGCAC-ATCC
58 ACGAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGA-CC
**
15384561 AAGCA
119 AAGGG
* * * * ** ** * * *
15384566 CCAAGG-TGCTGATAGTGC-CGACGCTCCCGCA-AGAACAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * *
15384628 AGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC-ACACGCACGACCAGGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * ** * * *
15384692 CCTAGGTTGCCGATGGTGCACGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACTGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GAT-G-CTAC
* * *
15384756 GA-GTCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGG-TGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CAAGG
60 GAGGT-T-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAA-G
15384818 GG
122 GG
* * * * ** * * *
15384820 GCTAGGTTGCCGATGGTAC-CGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTCTCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG---TCGATGCT--AC
* * * * * * *
15384883 GAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAAGTTACCGATAGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15384947 CA
123 -G
* * * * * ** ** * *
15384949 CCAAGG-GGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCTGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTTCCGATGGTGTCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG--T-CGATGCT-AC-
* ** * * *
15385012 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCCCCAAGG-T---G-T--T-CCCGAGG-TTCTCGCATGATCAA-
60 GAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15385066 GG
122 GG
* * * ** *
15385068 CCTAGGTTGCTGATGGTAGC-CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGA-TTAGGTTGCCGATGGTAC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T--CGATGCTA-
* * * * * *
15385130 CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGATGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGG
59 CGAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15385195 G
123 G
* * *
15385196 CCTAGGTTGCTGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGT--CGATGCT--AC
* * * * *
15385260 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTTTCGCAC-ATCCAAGC
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15385324 A
123 G
* * * * * * * *
15385325 CC-A---AG--G-T-GTGCCCGAGGTTCTCGCATGAT-CAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTACTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA--C
* * * * * * * **
15385380 GAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATGATTCCCGAGTCTCCCGCACGACCAATAG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15385445 CCTAGGTTACCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGTACATCCAAGCACCAAAGTACCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * ** *
15385509 AGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGG-TGCCGAAAGT--CCGAGGC-TCTCGTACGACCAAGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
15385570 CCTAGGTTGCCAATGGTGCCCAAGGCTCCCGCCCGA-CCAAGGC-CCTAGGTTGCAAATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GCACCAAGG-T-C-GAT-G-CTA
* * * * *
15385633 CGAGGCTCCCGAATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCAC-ATCCGA
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGA-CCAA
**
15385696 GAA
121 GGG
* * * ** * * *
15385699 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCAC-TACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACAT-CCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * ** * * *
15385762 AGGCTCCCGCATGACC-AGGGCCTTGGTTGCCGATGGTGTTCGAAGC-TCCTGTACGACCAAGGC
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
15385825 CCTAGGTTACCGATGGTGC-CAGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCTAC-
* * * ** * *
15385888 TGAGGCTCCCGCATGACC-AGGGCCTACGTTGTCAAATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAT
60 -GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTG-CCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAA
**
15385951 GCA
121 GGG
* * * * ** * * *
15385954 CCAAGG-TGCCGATAGTGC-CATAGGCTCCCGCA-AGACCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--AC
* * ** *
15386016 GAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG-AACACGCACGACCAGGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15386080 G
123 G
* * * * ** * * * *
15386081 CCTAGGTTACTGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTACCAATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
*
15386145 GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCACGA-CAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAAGG
15386207 G
123 G
* * * * * * * ** * *
15386208 GCTACGTTGCCGATGGTAC-CGAGGCTCTCGTATGA-CCAGGGGCCTAGGTTCTCGATAG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG---TCGAT-GCT--A
* * * * * *
15386270 CGAGGCTCCCGCACAACCAACGGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAG
*
15386334 GCA
122 G-G
* * * * * ** * * *
15386337 CCAAGG-GGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTTCCGATGGTGTCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG--T-CGATGCT-AC-
* * ** * * *
15386400 AAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCCCCAAGG-T---G-T--T-CCCGAGG-TTCTCGCATGATCAA-
60 GAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15386454 GG
122 GG
* * * * ** * *
15386456 CCTAGGTTGCCGATGGTAGC-CGAGGCTCTCTCAGGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGC-
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--C---GATGCT
* * * ** ** * *
15386518 CCGA-GTCTCCCGCACGACCAACGCCCTAGGTTGTGGATGGTGTTCGCGGCTCCCGCAC-ATCCA
58 ACGAGGT-T-CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCA
**
15386581 AGCA
120 AGGG
* * * * * *
15386585 ACAAGG-TACCAATGGTGGC-CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-AGCCTAGGTGCCGATAG-TCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCAAGGT--CGAT-GCT-A
* ** * * * *
15386645 CGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTACATTGCCGATGGTGCCCGAGTCTCCCGCATGACCAGGG
59 CGAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15386710 G
123 G
* * * ** * * * *
15386711 CCTAGGCTGCAGATGGTGCCCGAGGCT-CC-CACATCACTAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATC-C-AAGCACCAAGG-T--CGATGCT--A
* * ** * ** *
15386774 CGAGGCTCCTGCA-GATCCGAGAACCAAGG-TGCCGATGGTGCCTAAGGCTCCCGCAC-ATCCAA
59 CGAGGTTCC-GCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAA
*
15386836 GGA
121 GGG
* * * * * ** * * *
15386839 CCTAGGTTACCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCTCGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT--AC
* * * * *
15386903 GAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCAC-ATTCGAG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGA-CCAAG
**
15386966 AA
122 GG
* * * ** * * *
15386968 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAATGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTACCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * * *
15387031 AGGCTCTCGCTCGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
15387095 CCTAGGTTTCAGATGGTGCTTGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * ** * *
15387159 GAGGCTCCTGCAC-ATTCTAGAACCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGC-TCTCGCACGACCTAG
60 GAGGTTCC-GCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15387221 GG
122 GG
* * ** * * *
15387223 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * ** * *
15387286 GAGGCTCCCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTAGCC-ATGGCGTTCGAAGCTCCCGCACGACCAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTT-GCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15387350 G
123 G
* * * * * *
15387351 CCTTGGTTGCCGATGGTGC-CTGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC
* * * * *
15387414 TGAGG-CCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGT
60 -GAGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15387477 A
123 G
* * * * * *
15387478 CCAAGG-TGCCGATGGTGGC-CGAAGCTCCCGCA-AGACCAAG-AGCCTAGGTGCCGATGGTCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCA-CCAAGGT--CGATGCT-AC
* * * * *
15387539 GAGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAGGC-TCTCGTACGACAAAGG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15387603 G
123 G
* * * * * *
15387604 CCTAGGTTACCGATGGTGAC-CGAGGCTCCCGCACATCGATGGCACCAAGGGGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCA-AGCACCAA--GGTCGATGCT--AC
* * * * * *
15387668 GAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCGAGC
60 GAGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15387732 C
123 G
* * * * * * * *
15387733 CCAAGG-T----A---TGCCCGAGGTTCTCGCATGAT-CAAG-GCCTAGGTTGCCGATGGTAGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA--C
* * * * * ** * * *
15387788 GAGGCTCCCTCAGGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAATAATGCCCGAGTCTCCCGCACGACCAA-TG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * *
15387852 CGCTAGGTTGCGGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCATCAAGGTACCAATGGTGGCC
1 C-CTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--AC
* * * *
15387916 GAGGCTCCCGCAAGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATAGT-CCCGAGGC-TCTCGCACGACCAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15387978 G
123 G
* * * ** * * *
15387979 CCTAGGTTGCAGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * * * * *
15388043 GAGGCTCCTGCAC-ATCCGAGGACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGTACGACCAAGG
60 GAGGTTCC-GCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15388106 G
123 G
* * ** * *
15388107 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA-CG
* * *
15388170 AGGCTAT-CGCATGACCAAGGGCCTAGGTT-CCTGATGGTGCGCGAGGC-TCCTGCACAACCAAG
61 AGG-T-TCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAAG
15388232 GG
122 GG
* * * ** * * *
15388234 CCTAGGTTGCAGATGGAGGC-CGAGGCTCCCGCATGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGG-TGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--A
* * ** * *
15388297 CGAGGCTCCAGCAC-ATCCGAGAACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGC-TCCGCACGACCAAG
59 CGAGGTTCC-GCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15388359 GG
122 GG
* * * ** * * *
15388361 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * *
15388425 AGGCTCTCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAGGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** ** * *
15388489 CCTAGGTTACCGATAGTGTTCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-
* **
15388553 GAGGCTTCC-CAACGACC-AGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCCCCCGCACGACCAAG
60 GAGG-TTCCGC-ACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15388616 GG
122 GG
* * * *
15388618 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACAAAGGTGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * *
15388682 AAGCTCCTGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGC-TCTCGAACGACCAAAGG
61 AGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * ** * * *
15388744 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* ** *
15388808 GAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACC-A-ATATG-CGATGGTG-CCGAGGC-TCCTGCACGACCAA
60 GAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGT-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAA
*
15388867 GAG
121 GGG
* * ** * * *
15388870 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-ACG
* * * * * *
15388933 AGGATCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * * *
15388997 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT--AC
* ** * * *
15389061 GAGGCTCACGCATTACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGC-TCCTGCAC-ATTCGAG
60 GAGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGA-CCAAG
**
15389124 AA
122 GG
* * * * ** * * *
15389126 CCTA-GATGCCGATGGTGCCCAATGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * * *
15389189 AGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAAGACCAGGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * * * *
15389253 CCTAGGTTAG-CGATGGTGTTCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCC
1 CCTAGGTT-GCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC
* *
15389316 TGAGGCTTCCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGG-TCCCCGCACGACCAA
60 -GAGG-TTCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCT-TCCGCACGACCAA
15389379 GGG
121 GGG
**
15389382 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTATCGCACATCCAAGCACCAAGGT-G-TGCT-CGAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGATGCTACGAGGT
* * *
15389443 TCTCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGTACGACAAAGGG
65 TC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* *
15389503 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGACCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT-A-CGA
* * * *
15389568 GGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAGGC-TCTCGCATGACCAGGGG
62 GG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * *
15389630 CCTAGGTTTCCGATGGTTCACGAGGCTCCCGCAGAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT-A-CG
* ** *
15389695 AGGCTCCCGCAC-ATCCAAGACACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCAGCACGACCAAG
61 AGG-TTCCGCACGA-CCAAG-GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAAG
15389757 GG
122 GG
* * * ** * *
15389759 CCT-GG-TGCCGATGGTACCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTACCGA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCTA-CGA
* * * * ** * * * *
15389822 AGCTCTCTCACGACCAGGGGCCTAGGTT-CACGATGGTGCCCGACACTCCCACACAACCAAGTG
62 GGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGC-CGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15389885 CCTAGGTTGTCGATGGTGAC-CGAGGCTCCCCCACATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGT--CGAT-G-CTAC
* * ** * * * * *
15389949 GAGGCTCCCGCACGACAAAGCCCCTAGGTTGCCTATGGTGTCCGAAGCTCCCGCAC-ATCCAAGC
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15390013 A
123 G
* * * * * *
15390014 CCAAGGTGTGCCCGA-GGT--T-----CTCGCGC-GAT-CAAG-GCCTAGGTTACCGATGGCACA
1 CCTAGGT-TG-CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-GC-TA
* * *** * * * *
15390068 CGAGGGTCCCGCACGACC-AGGGCCTAGATTAATGATGATGCCCTAGACTCCCGCACGACCAAGG
59 CGA-GGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
15390132 G
123 G
* * * * * * *
15390133 CCTAGGTTGCCGATGGT-TTCCGAGGCTCCCCCACAACCAAAG-GCCTAGGATGCCGATGGTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCC-AAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTA
* *** * * * * *
15390196 CGAGGCTCCCGCAC-ACCCAAGTAACAAGG-TGCCGAT-GTGGCCGAGGCTCCCGTACGACCAGG
59 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15390258 GG
122 GG
* * * * ** * * *
15390260 CCAAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGAACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * ** * *
15390322 GATGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTTTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGT
60 GA-GGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15390386 A
123 G
* * ** * * *
15390387 CC--GATATGCCGATGGTGAC-CGAGGCTCCTGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCTGATGGTGCC
1 CCTAGGT-TGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT-C-GATGCT--A
* * * * *
15390448 CAAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCTTAGGTTGCCGATGGTG-CCGAGGC-TCTCGCATGACCAGG
59 CGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAG
15390511 GG
122 GG
* * * ** * * *
15390513 CCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--ACG
* * * ** * **
15390578 AGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTCACAGATGGTGCCCGAGGC-TCACGCATTACCAAGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * * * *
15390642 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCTGCACATTCGAGAACCTAGATGCCGATGGTGCGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACC-A-AGGTCGATGCTACG--
* * * *
15390706 ATGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGAC-TCTCGCACGACCAAGGG
61 A-GGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * ** * * *
15390769 CCCAGGTTGCCTATGGTGCCCGAGGCTCCCGCA-AGACCAGGGGCCTAGGTTAGCGATGGTGTTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACA-TCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
* * * *
15390833 GAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCAATGGTGCCTGAGGCTTCCGCACGACC-AGGG
60 G-AGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * ** * *
15390897 ACCTAGGTTGCCGATGGTGCGT-AAGGCCCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGT
1 -CCTAGGTTGCCGATGGTGC-TCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CT
* * ** * * *
15390960 CCGAGGCTAT-CGCAC-ATCTAAGCACC-A---AG--G-T-GTGCTCGAGG-TTCTCGCATGACC
58 ACGAGG-T-TCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACC
15391014 AAGGG
119 AAGGG
* * * ** *
15391019 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCT-
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGA---TGCTA
* ** * * * *
15391082 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGTACCAAGG-TGCCGATGGTGACCGAGGCTCCCGTACGACCAAG
59 CGAGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG
15391145 GG
122 GG
* * * * * ** * * *
15391147 CCTAGGTTACCGATGGTAC-CGAGGCTCTCGCATGA-CCAGGGGCCTAGGTTTCCGATGGTTCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCA-CATCCAAGCACCAAGG--T-CGAT-GCT-AC
* * * *
15391210 GAGGCTCCCGCA-GAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG
60 GAGG-TTCCGCACG-ACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAG
**
15391273 ACA
122 -GG
* * * ** * *
15391276 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCAGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTACCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCTA--CG
* * * * * * * *
15391339 AGGCTCCCGCACAACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAAGC-TCTCTCACTACCAGGGG
61 AGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* ** * * * * *
15391402 CCTAGGTT-CACGATGGTGCCCGACACTCCCACACAACCAAGTACCTAGGTTGTCGATGGTGACC
1 CCTAGGTTGC-CGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACC-AAG--GTCGATGCT-A-C
* * * * * * * * *
15391466 GACGCTCCCCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACAAAGC
60 GAGGTTCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG
*
15391529 C
123 G
*
15391530 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT-G-TGC-CCGAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGATGCTACGAGGT
* * * ** * * * *
15391591 TCTCGCGCGATCAA-GGCCTAGGTTACCGATGGCACACGAGGGTCCCGCACGACCAGGGG
65 TC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
15391650 CCTAGGTTACCGATGGTGCCCTAGACTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGAT-G-CTAC
* * * * * *
15391714 GAGGCTCCCGCACAACCAA-GGCCTAGGATGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACTCAAGT
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGAC-CAAGG
*
15391777 A
123 G
* * * * ** *
15391778 ACAAGG-TGCCGAT-GTGGC-CGAGGCTCCCGTACGA-CCAGGGGCCTAGGTTACTGATGGTGCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGT-GCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GA---TGCT
* * * *
15391839 -CGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCGA-GCCTCCGCAC-ATCCA
58 ACGAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCA
**
15391901 AGTA
120 AGGG
* * * * * ** * *
15391905 CCAAGG-TACCGATAGTGCCCGAGCCTCCCGCCACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATAG-TGCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCG-CAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT--A
* ** * *
15391967 CGAGGCTCTCG-ATCGACCAAGGGCCTAGGTCACCGATGGTGCCCGAGGC-ACACGCACGACCAG
59 CGAGGTTC-CGCA-CGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAA
15392030 GGG
121 GGG
* * * * ** * * *
15392033 CCTAGGTTGCCGATCGTACCCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTATCGATGGTGTCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG---TCGAT-G-CTAC
*
15392097 GAGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCTCGAGGC-TCTCGCACGACCAAGGG
60 GAGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
** * * * * * * ** * * *
15392160 ATTAGGTTGCCGATGGTAC-CGAGGCACTCGTACGA-CTAGGGGCCCAGGTTCCCGATGATGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT--AC
* * * ** ** * *
15392223 GAGGCTCCCGCACAACTAAGGGCCTAGGTTGCTAATGGTTACCGAGGCTCCCGTAC-AGCCAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAGG
*
15392287 CA
123 -G
* * * * ** ** * *
15392289 CCAAGG-TACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CTAAGGGCCTCGGTTGCTGATGGTTGTC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GAT-GCT-AC
* ** * * *
15392352 TGAGGCTCTCGCAC-ATCCAAGCACC-A---AG--G-T-GTGCCCGAGG-TTCTCGCATGATCAA
60 -GAGGTTC-CGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAA
15392407 -GG
121 GGG
* * ** *
15392409 CCTAGGTTGCCG-TGGTGCCCGAGG--CCCGTACGA-CC-AGGGCCTAGGTTACTGATGTGCT-C
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GA--TGCTAC
* * * * * * * *
15392468 GAGGCTCCTGCACTACCAGGGGTCTAGGTTGCCAAATGGTGCCCGAGCCTCCCGCAC-ATCTAAG
60 GAGGTTCC-GCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCC-GATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGA-CCAAG
**
15392532 AA
122 GG
* * * * * ** * * *
15392534 CCAAGG-TGCCGATAGTGCCCGAGGCACCCGTACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTTCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT-ACG
* * * ** * * *
15392597 AGGCTCTCGAACGACCAAGGGCCTA-GTTACCGATGGTGCAAGAGGC-ACACGCACGACTAGGGG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * * * * *
15392660 CCTAGGTTGCCGATGGTGC-CCAAGCTCCCGTACGA-CCAAG-GCCTAGGTTGCCAATGGTGCT-
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--C---GATGCTA
* * ** * * * *
15392721 CGAGGCTCACGTAC-ATCCAAGTACCAATG-TGCCAATGGTGACCGAGGC-TCCTGCACGACCAA
59 CGAGGTTC-CGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGACCAA
15392783 GGG
121 GGG
* * * ** * *
15392786 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCT-CCGCACGA-CAAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCTA-CG
* * * * * * *
15392848 AGGCTCTCGCATGACCAGGGGCCTAGGTTCCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCCCACAACCAAGGT
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * * ** * * *
15392911 CCTAGGTTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCAGATGGTGCCC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT--AC
* * * * *
15392975 GAGGCTCCCGCATGACCAA-GGCCTAGGTTTCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCTGCAC-ATTCGAG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCC-GCACGA-CCAAG
**
15393037 AA
122 GG
* * * * * *
15393039 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-GCCTAGGTGCCGATGGTGCCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * * * *
15393101 AGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCCAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCA-TAAC-TGGAG
61 AGGTTC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGG-G
** * * ** * * *
15393164 CCTAGGTTAACGATGGTGTTCGAAGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-T--CGATGCT-AC-
* * * ** ** *
15393228 GAGGCTTCCGTACGACCATGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCTTGAGGCCCCCGCACGACCAAAGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
* * * *
15393293 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTCCTGCACATCCAAGTACCAAGGTGCCGATGGTGGCCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGATGCT--ACG
* * * * * **
15393357 AAGCTCCCGCACGACCAAGAGCCTAGG-TGCCGAT-GT-CCCGAGGC-TCTCGGACAATAAAGGG
61 -AGGTTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGGG
* * *
15393418 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCCGAGGCTTCCGCACATCCAAGTATCAAGGTGCCGATAG-TGACC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT--CGAT-GCT-A-C
* * * ** * *
15393481 GAGGCTCCCACACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGT-ACCGAATC-TCTCGCATGACCAGGG
60 GAGG-TTCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTC-CGCACGACCAAGG
15393544 G
123 G
* * * * * * ** * *
15393545 CCTAGGTTCCCGATGGTTCCCGAGGCTCCAGCAGAACCAAGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGACCG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-T-C-GATGCT-A-CG
* * ** * * *
15393610 AGGCTCCCGC-CCATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGC-TCCGCATGACCAAGCC
61 AGG-TTCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAG-G
*
15393672 C
123 G
*
15393673 CCTAGGTTGCCGATGGTG-TCTGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGT-G-T-C-CCGAGGT
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGATGCTACGAGGT
** * * ** * * *
15393733 TCTCGGGCGATCAA-GGCCTA-GTTACCGATGGCACACGAGGGTCCCGCACGACC-AGGG
65 TC-CGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
*
15393790 CCTAGGTTACCGATGGTGC
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGC
15393809 CCTAGACCCG
Statistics
Matches: 17214, Mismatches: 3284, Indels: 3024
0.73 0.14 0.13
Matches are distributed among these distances:
114 1 0.00
115 19 0.00
116 23 0.00
117 169 0.01
118 176 0.01
119 377 0.02
120 762 0.04
121 362 0.02
122 63 0.00
123 91 0.01
124 319 0.02
125 875 0.05
126 2485 0.14
127 4015 0.23
128 4668 0.27
129 2518 0.15
130 264 0.02
131 26 0.00
132 1 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.32, T:0.17
Consensus pattern (123 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTCGATGCTACGAGGTT
CCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTTCCGCACGACCAAGGG
Found at i:15404506 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15404452--15405002 Score: 326
Period size: 43 Copynumber: 13.0 Consensus size: 43
15404442 CCTTGCTGCT
* * *
15404452 CGAGGCACCCGCACATCCAA-CGTCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGC-ACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * * * *
15404495 CAAGCCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATGCTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* *
15404537 CGAGGCTCCCACACATCCAAGGCACCAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
** * * *
15404580 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGTTCCTAAGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * *
15404623 CGAGGCTCCCGCATATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * *
15404665 CGAGGTTCTCGTACGAT-CAAG-GCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * * ** *
15404707 CAAGGCTCCCACACGA-ACAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * *
15404750 CGAGGCTCCCGCAC-TACCAATG-GCCTAGATTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAA-GCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * ** * * *
15404793 CGAGGCTCCCGCACATCTAACCACGAAGG-TGCTGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* ** * **
15404835 TGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * * **
15404878 TGATGCTCCCGCAGATCGAAGCACGAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* *** * *
15404920 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGGCTAGG-TGCTGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * *
15404962 CGACGCTCCCGCACGAT-CGA-CATCCTAGGTTTCCGATGGTG
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA-CCTAGGTTACCGATGGTG
15405003 TATAAGGCTC
Statistics
Matches: 391, Mismatches: 96, Indels: 42
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
41 5 0.01
42 175 0.45
43 207 0.53
44 4 0.01
ACGTcount: A:0.21, C:0.33, G:0.29, T:0.18
Consensus pattern (43 bp):
CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCTAGGTTACCGATGGTGCC
Found at i:15404571 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15404445--15404665 Score: 234
Period size: 85 Copynumber: 2.6 Consensus size: 85
15404435 AGGGTGCCCT
* * * *
15404445 TGCTGCTCGAGGCACCCGCACATCCAA-CGTCCTAGGTTACCGATGGTGTCCAAGCCTCCCGCAC
1 TGCTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC-ACCAAGG-TACCGATGGTGCCCAAGCCTCCCGCAC
15404509 -ATCCAAGCACC-AAGGTACCAA
64 GA-CCAAGCACCTAAGGTACCAA
* * *
15404530 TGCTGCTCGAGGCTCCCACACATCCAAGGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACG
1 TGCTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGTACCGATGGTGCCCAAGCCTCCCGCACG
** * * *
15404595 ACCAAGTTCCTAAGTTGCCGA
65 ACCAAGCACCTAAGGTACCAA
* * *
15404616 TGGTG-TCCGAGGCTCCCGCATATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCC
1 TGCTGCT-CGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGCCC
15404666 GAGGTTCTCG
Statistics
Matches: 115, Mismatches: 16, Indels: 10
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
85 79 0.69
86 35 0.30
87 1 0.01
ACGTcount: A:0.22, C:0.36, G:0.25, T:0.17
Consensus pattern (85 bp):
TGCTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCAAGCCTCCCGCACGA
CCAAGCACCTAAGGTACCAA
Found at i:15404980 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15404537--15404981 Score: 434
Period size: 85 Copynumber: 5.2 Consensus size: 85
15404527 CAATGCTGCT
* * *
15404537 CGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGATCGAA-GCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
** *
15404601 TTCCTAAGTTGCCGATGGTGTC
65 GGCCT-AGGTGCCGATGGTGTC
* * * * * *
15404623 CGAGGCTCCCGCA-TATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGTACGATCAA-G
1 CGAGGCTCCCGCACGATCGAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15404686 GCCTAGGTTACCGATGGTGCC
66 GCCTAGG-TGCCGATGGTGTC
* * * * ** * * *
15404707 CAAGGCTCCCACACGAAC-AGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACTACCAAT
1 CGAGGCTCCCGCACGATCGAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
*
15404771 GGCCTAGATTGCCGATGGTGTC
65 GGCCTAG-GTGCCGATGGTGTC
* * * * * *
15404793 CGAGGCTCCCGCAC-ATCTAACCACGAAGGTGCTGATGGTGGCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGATCGAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15404857 GCCTAGGTTGCCGATGGTATC
66 GCCTAGG-TGCCGATGGTGTC
* * * * *
15404878 TGATGCTCCCGCA-GATCGAAGCACGAAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGATCGAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* * *
15404942 GGCTAGGTGCTGATGGTGCC
66 GCCTAGGTGCCGATGGTGTC
*
15404962 CGACGCTCCCGCACGATCGA
1 CGAGGCTCCCGCACGATCGA
15404982 CATCCTAGGT
Statistics
Matches: 291, Mismatches: 58, Indels: 21
0.79 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
83 2 0.01
84 53 0.18
85 183 0.63
86 53 0.18
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.30, T:0.17
Consensus pattern (85 bp):
CGAGGCTCCCGCACGATCGAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
GCCTAGGTGCCGATGGTGTC
Found at i:15412254 original size:43 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15412200--15412723 Score: 307
Period size: 43 Copynumber: 12.3 Consensus size: 42
15412190 CCTTGCTGCT
* * *
15412200 CGAGGCACCCGCACATCCAACGTCCTAGGTTACCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAA-GACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * * ** *
15412243 CAAGCCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGG-TACCAATACTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-ACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* *
15412285 CGAGGCTCCCACACATCCAAGGCACCAAGG-TACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAA-G-ACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * *
15412328 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGTCCTAAGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * *
15412371 TGAGGCTCCCGCATATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-ACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * *
15412413 CGAGGTTCTCGTACGAT-CAAGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * * * *
15412455 CAAGGCTCCCACACGA-ACAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCA-AGACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * *
15412498 CGAGGCTCCCGCAC-TACCAATGGCCTAGATTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACAT-CCAA-GACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * * *
15412541 CGAGGCTCCCGCACATCCAACCACCAAGG-TGCTGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAA-GACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * **
15412583 TGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTATC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* * * ** *
15412626 CGATGCTCCCGCAGATCGAAGCACGAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACATCCAAG-ACCTAGGTTACCGATGGTGCC
* ** *
15412668 CGAGGCTCCCGTACGA-CCAAGGGGCTAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAA-GACCTAGGTTACCGATGGTGCC
*
15412710 CGACGCTCCCGCAC
1 CGAGGCTCCCGCAC
15412724 GATCGACATC
Statistics
Matches: 377, Mismatches: 84, Indels: 41
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
41 5 0.01
42 170 0.45
43 200 0.53
44 2 0.01
ACGTcount: A:0.21, C:0.34, G:0.29, T:0.16
Consensus pattern (42 bp):
CGAGGCTCCCGCACATCCAAGACCTAGGTTACCGATGGTGCC
Found at i:15412319 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15412195--15412413 Score: 221
Period size: 85 Copynumber: 2.6 Consensus size: 85
15412185 GGTGCCCTTG
* * * *
15412195 CTGCTCGAGGCACCCGCACATCCAA-CGTCCTAGGTTACCGATGGTGTCCAAGCCTCCCGCAC-A
1 CTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC-ACCAAGG-TACCGATGGTGCCCAAGCCTCCCGCACGA
15412258 TCCAAGCACC-AAGGTACCAATA
64 -CCAAGCACCTAAGGTACCAATA
* * *
15412280 CTGCTCGAGGCTCCCACACATCCAAGGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGAC
1 CTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAA-GCACCAAGGTACCGATGGTGCCCAAGCCTCCCGCACGAC
** * * * *
15412345 CAAGGTCCTAAGTTGCCGATG
65 CAAGCACCTAAGGTACCAATA
* * *
15412366 GTG-TCTGAGGCTCCCGCATATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCC
1 CTGCTC-GAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGCCC
15412414 GAGGTTCTCG
Statistics
Matches: 112, Mismatches: 17, Indels: 10
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
85 78 0.70
86 33 0.29
87 1 0.01
ACGTcount: A:0.23, C:0.36, G:0.25, T:0.16
Consensus pattern (85 bp):
CTGCTCGAGGCTCCCGCACATCCAAGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCAAGCCTCCCGCACGACC
AAGCACCTAAGGTACCAATA
Found at i:15412729 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15412285--15412727 Score: 484
Period size: 85 Copynumber: 5.2 Consensus size: 85
15412275 CAATACTGCT
* *
15412285 CGAGGCTCCCACAC-ATCCAAGGCACCAAGGTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGATCCAA-GCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
* *
15412349 GTCCTAAGTTGCCGATGGTGTC
65 GGCCT-AGGTGCCGATGGTGTC
* * * * * *
15412371 TGAGGCTCCCGCA-TATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGTACGATCAA-G
1 CGAGGCTCCCGCACGATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15412434 GCCTAGGTTACCGATGGTGCC
66 GCCTAGG-TGCCGATGGTGTC
* * * * ** * * *
15412455 CAAGGCTCCCACACGA-ACAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACTACCAAT
1 CGAGGCTCCCGCACGATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
*
15412519 GGCCTAGATTGCCGATGGTGTC
65 GGCCTAG-GTGCCGATGGTGTC
* * * *
15412541 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAACCACCAAGGTGCTGATGGTGGCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15412605 GCCTAGGTTGCCGATGGTATC
66 GCCTAGG-TGCCGATGGTGTC
* * * *
15412626 CGATGCTCCCGCA-GATCGAAGCACGAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15412690 GGCTAGGTGCCGATGGTGCC
66 GCCTAGGTGCCGATGGTGTC
*
15412710 CGACGCTCCCGCACGATC
1 CGAGGCTCCCGCACGATC
15412728 GACATCCTAG
Statistics
Matches: 292, Mismatches: 55, Indels: 21
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
83 2 0.01
84 56 0.19
85 180 0.62
86 54 0.18
ACGTcount: A:0.20, C:0.33, G:0.30, T:0.16
Consensus pattern (85 bp):
CGAGGCTCCCGCACGATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
GCCTAGGTGCCGATGGTGTC
Found at i:15420166 original size:128 final size:127
Alignment explanation
Indices: 15419974--15421482 Score: 1288
Period size: 128 Copynumber: 11.8 Consensus size: 127
15419964 CCTTGCTGCT
* * * *
15419974 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGCCTCCCGCACATCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * * *
15420038 CACCAAGG-TGCCAATGCTGCTCGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGGTGCCGATGGTGC
64 CGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-ACCTAGGTGCCGATGGTGC
15420101 C
127 C
* *
15420102 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGTCCTAAGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACATCCAAGC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACA-CCAAGC
* * * * * * *
15420167 ACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAAGG-CCTAGGTTACCGATGGTGCT
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15420229 CAAAGCTCCCACACGAACAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACTACCAATG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAA-G
* * * * ** * * *
15420294 -GCCTAGATTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGGAC-ATCAACCACCAAGATGCCGATGGTGGC
64 CGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* *
15420356 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGTCTAGG-TGCCGAT-G-GTCCTGAGGCTCTCGCACGACCAAT
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCAC-ACCAA-
** * *
15420418 G-GCCTAGGTTGTAGATGGTGCCCGAGGCACCCGCACGACCAGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGC
63 GCGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGC
15420482 C
127 C
*
15420483 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTG-CCAGAGGCTCCCGCACATCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCACA-CCAAG
* * * * *
15420547 CACCAAGG-TGCTGATGGCGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGA-CTATGTGCCGATGGTGCC
64 CGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * * * * * * *
15420610 AGAGGCTCTCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGTTGGTGCCCGAGGCTCCCACACGACTAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAGC
* * * * *
15420675 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * *
15420739 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCGCAGGACCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC-CGAGGCTCCCGCA-CACCAAG
* * * * ** * *
15420803 GGCCTAGGTTTCCGATAGT-ACCGAGGCTTTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
64 CGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420867 CGAGGCTCCCACACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGTCCGAAGCTCCCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAGC
* * ** * * *
15420932 GCCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGGGCTTAGGTGCCGATGGTGGC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420995 TGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTG-CTCGAGGCTCCCACACGACCAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTC-CGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * * * **
15421059 GGCCTAGGTTGTCGATGGT-CCCGAGGCTCCCGTATGACCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGCACC
64 CGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * ** * * ** * *
15421123 CGAAGCTCCCGCAC-ATTCAAGCACCAAGG-TACTAATAGTG-CCGGAGGCTCTCGCACGACCAA
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCC-GAGGCTCCCGCAC-ACCAA
* * * * * * *
15421185 GAGCCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCACACAACCAAGGGCCTAGGTGTCGATGGTGCC
63 GCGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15421249 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAGC
* * * * *
15421313 GCCTAGGTTGCCGATAGTGCCCGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGAC
65 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGG-TGCCGATGGTGCC
* * * ** * * *
15421377 CGAGCCTCTCGCA-TATCCAAGTACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCGA-
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCAC-ACCAAG
* * * * * *
15421439 CGTCCTAGGTTACCGATGGCGTCCAAGGCTCCAGCACGTCCAAG
64 CG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15421483 CAGCAATGTG
Statistics
Matches: 1129, Mismatches: 213, Indels: 78
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
124 3 0.00
125 48 0.04
126 85 0.08
127 358 0.32
128 499 0.44
129 135 0.12
130 1 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.17
Consensus pattern (127 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACACCAAGCG
CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGACCTAGGTGCCGATGGTGCC
Found at i:15420222 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15419974--15421482 Score: 1459
Period size: 43 Copynumber: 35.5 Consensus size: 43
15419964 CCTTGCTGCT
* * * *
15419974 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * * *
15420017 CGAGCCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCAATGCTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15420059 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15420102 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGTCCTAAGTTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** *
15420145 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420187 CGAGGTTCTCGCACGATCAA-GGCCTAGGTTACCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420229 CAAAGCTCCCACACGAACAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420272 CGAGGCTCCCGTACTACCAATGGCCTAGATTGCCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *** * * *
15420315 CGAGGCTCCCGGAC-ATCAACCACC-AAGATGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15420356 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGTCTAGG-TGCCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * **
15420397 TGAGGCTCTCGCACGACCAATGGCCTAGGTTGTAGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15420440 CGAGGCACCCGCACGACC-AGGGACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG-CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
*
15420483 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* ** * * *
15420526 AGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCTGATGGCGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15420568 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGACTATG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420610 AGAGGCTCTCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGTTGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15420653 CGAGGCTCCCACACGACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15420696 CGAAGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15420739 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15420782 CGAGGCTCCCGCAGGACCAAGGGCCTAGGTTTCCGATAGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** *
15420824 CGAGGCTTTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15420867 CGAGGCTCCCACACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15420910 CGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** * *
15420953 CGAGGCTCCCTTACGACCAAGGGCTTAGG-TGCCGATGGTGGC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15420995 TGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCT
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15421038 CGAGGCTCCCACACGACCAGGGGCCTAGGTTGTCGATGGT-CC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * **
15421080 CGAGGCTCCCGTATGACCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGCACC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * ** * * ** *
15421123 CGAAGCTCCCGCAC-ATTCAAGCACCAAGG-TACTAATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15421165 GGAGGCTCTCGCACGACCAAGAGCCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15421207 CAAGGCTCCCACACAACCAAGGGCCTAGG-TGTCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15421249 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-AC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15421291 CGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATAGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15421334 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGAC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * ** *
15421377 CGAGCCTCTCGCA-TATCCAAGTACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15421419 CGAGGCTCCCGCACGACCGACGTCCTAGGTTACCGATGGCGTC
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *
15421462 CAAGGCTCCAGCACGTCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15421483 CAGCAATGTG
Statistics
Matches: 1191, Mismatches: 249, Indels: 52
0.80 0.17 0.03
Matches are distributed among these distances:
41 57 0.05
42 454 0.38
43 675 0.57
44 5 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.17
Consensus pattern (43 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
Found at i:15420654 original size:85 final size:86
Alignment explanation
Indices: 15419974--15421482 Score: 1459
Period size: 85 Copynumber: 17.7 Consensus size: 86
15419964 CCTTGCTGCT
* * * * *
15419974 CGAGGCACCCGCAC-ATCCAACGTCCTAGGTTGCCGATGGTGTCCGAGCCTCCCGCAC-ATCCAA
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAA
** * * * *
15420037 GCACCAAGG-TGCCAATGCTGCT
64 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15420059 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGG-GCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA
* * *
15420122 GGTCCTAAGTTGCCGATGGTGTC
64 GGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** * * * *
15420145 CGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCTCGCACGATCAA-
1 CGAGGCTCCCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
* *
15420207 GGCCTAGGTTACCGATGGTGCT
65 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * * *
15420229 CAAAGCTCCCACACGAACAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGTACTACCAATG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15420294 GCCTAGATTGCCGATGGTGTC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * *** * * *
15420315 CGAGGCTCCCGGAC-ATCAACCACC-AAGATGCCGATGGTGGCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15420378 GTCTAGG-TGCCGATGGT-CC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * ** *
15420397 TGAGGCTCTCGCACGACCAATGGCCTAGGTTGTAGATGGTGCCCGAGGCACCCGCACGACC-AGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
15420461 GACCTAGGTTGCCGATGGTGCC
66 G-CCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* *
15420483 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCAGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
** * * *
15420547 CACCAAGG-TGCTGATGGCGCC
65 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420568 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGACTATG-TGCCGATGGTGCCAGAGGCTCTCGTACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15420632 GCCTAGGTTACCGTTGGTGCC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * *
15420653 CGAGGCTCCCACACGACTAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15420718 GCCTAGGTTGTCGATGGTGTC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15420739 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCAGGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* * *
15420804 GCCTAGGTTTCCGATAGT-AC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
** * * *
15420824 CGAGGCTTTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGCCCGAGGCTCCCACACGACCAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15420889 GCCTAGGTTGCCGATAGTGTC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * **
15420910 CGAAGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCTTACGACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* *
15420975 GCTTAGG-TGCCGATGGTGGC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15420995 TGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAAGTTGCCGATGGTGCTCGAGGCTCCCACACGACCAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15421060 GCCTAGGTTGTCGATGGT-CC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * ** * *
15421080 CGAGGCTCCCGTATGACCAAGGGCCTAGGTTTCTGATGGCACCCGAAGCTCCCGCAC-ATTCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
** * * ** *
15421144 CACCAAGG-TACTAATAGTGCC
65 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * *
15421165 GGAGGCTCTCGCACGACCAAGAGCCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCCACACAACCAAGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15421229 GCCTAGG-TGTCGATGGTGCC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * *
15421249 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGT-ACCGAGGCTCTCGCACGACCAGGG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
*
15421313 GCCTAGGTTGCCGATAGTGCC
66 GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * *
15421334 CGAGGCTCCCGCATGACCAAGGGCCTAGGTTACCGATGGTGACCGAGCCTCTCGCA-TATCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG
** *
15421398 TACCAAGG-TGCCGATGGTGCC
65 GGCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
* * * * * * * * *
15421419 CGAGGCTCCCGCACGACCGACGTCCTAGGTTACCGATGGCGTCCAAGGCTCCAGCACGTCCAAG
1 CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAG
15421483 CAGCAATGTG
Statistics
Matches: 1167, Mismatches: 231, Indels: 52
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
82 12 0.01
83 20 0.02
84 236 0.20
85 560 0.48
86 337 0.29
87 2 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.32, G:0.31, T:0.17
Consensus pattern (86 bp):
CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
GCCTAGGTTGCCGATGGTGCC
Found at i:15425247 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 15425239--15425269 Score: 62
Period size: 5 Copynumber: 6.2 Consensus size: 5
15425229 TACAAGAAGT
15425239 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC A
1 ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC ATGGC A
15425270 CAGCACGGCA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 26 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.19, G:0.39, T:0.19
Consensus pattern (5 bp):
ATGGC
Found at i:15429431 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 15429254--15429447 Score: 255
Period size: 96 Copynumber: 2.0 Consensus size: 96
15429244 TCGCTTCTTT
* *
15429254 TTGCTCCTCTTAGCCCTCTTGGTTTCGGCTTTACCCTTGCTCGAACCAAGCTTCTTGGGCTCCTT
1 TTGCTCCTCTTAGCCCTCTTGGCTTCGGCTTTACCCTTGCTCGAACCAAGCTTCTTGGGCTCCGT
* * * *
15429319 GTCTGCTCCATCATTCCCTTCGATGATAGAC
66 ATCTGCTCCATCATTCCCATCGATAACAGAC
* * * *
15429350 TTGCTCCTTTTTGCCCTCTTGGCTTCGGCTTTTCCCTTGCTCGAACCCAGCTTCTTGGGCTCCGT
1 TTGCTCCTCTTAGCCCTCTTGGCTTCGGCTTTACCCTTGCTCGAACCAAGCTTCTTGGGCTCCGT
** *
15429415 ATCTAG-TTGATTATTCCCATCGATAACAGAC
66 ATCT-GCTCCATCATTCCCATCGATAACAGAC
15429446 TT
1 TT
15429448 CCTCAGACAC
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 13, Indels: 2
0.85 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
96 83 0.99
97 1 0.01
ACGTcount: A:0.13, C:0.32, G:0.18, T:0.38
Consensus pattern (96 bp):
TTGCTCCTCTTAGCCCTCTTGGCTTCGGCTTTACCCTTGCTCGAACCAAGCTTCTTGGGCTCCGT
ATCTGCTCCATCATTCCCATCGATAACAGAC
Found at i:15432056 original size:132 final size:132
Alignment explanation
Indices: 15431820--15432389 Score: 929
Period size: 132 Copynumber: 4.4 Consensus size: 132
15431810 GTCGGTCCAC
* *
15431820 GCCAAGATTTGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAAGGAAACGA-ATCTAAAATTTCAA
1 GCCAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
15431884 CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
66 CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
15431949 AA
131 AA
*
15431951 GCCAAGATTCATCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
1 GCCAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
* *
15432016 CCTACTCCACTACAACTTTATGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
66 CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
15432081 AA
131 AA
* * *
15432083 GTCAAGATTCGTCGTCTTCGATCTGTTCCACTGCAACTTCAGGGAAAC-AGGATCTAAAATTTCA
1 GCCAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGA-GATCTAAAATTTCA
*
15432147 ACCTACT---C--CAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAA
65 ACCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAG
15432207 GAA
130 GAA
* * *
15432210 GCCAAGATTCGTCGTTTTTTATCTACTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
1 GCCAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
* *
15432275 CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGA
66 CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
15432340 AA
131 AA
* * *
15432342 GTCAAGATTCGTTGTCTTTGATTTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAAC
1 GCCAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAAC
15432390 AGGATCTGTG
Statistics
Matches: 404, Mismatches: 27, Indels: 15
0.91 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
127 115 0.28
128 1 0.00
129 1 0.00
130 1 0.00
131 48 0.12
132 238 0.59
ACGTcount: A:0.29, C:0.24, G:0.17, T:0.29
Consensus pattern (132 bp):
GCCAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
AA
Found at i:15432285 original size:259 final size:261
Alignment explanation
Indices: 15431822--15432396 Score: 976
Period size: 259 Copynumber: 2.2 Consensus size: 261
15431812 CGGTCCACGC
* * *
15431822 CAAGATTTGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAAGGAAAC-GAATCTAAAATTTCAACC
1 CAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACAGGATCTAAAATTTCAACC
*
15431886 TACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGGAA
66 TACT-C-C-ACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAAGAA
*
15431951 GCCAAGATTCATCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
128 GCCAAGATTCATCGTCTTTGATCTACTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAA
* *
15432016 CCTACTCCACTACAACTTTATGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGG
193 CCTACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGA
15432081 AAGT
258 AAGT
* *
15432085 CAAGATTCGTCGTCTTCGATCTGTTCCACTGCAACTTCAGGGAAACAGGATCTAAAATTTCAACC
1 CAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACAGGATCTAAAATTTCAACC
15432150 TACT-C-CAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAAGAAGCC
66 TACTCCACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAAGAAGCC
* * *
15432213 AAGATTCGTCGTTTTTTATCTACTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAACCT
131 AAGATTCATCGTCTTTGATCTACTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAACCT
15432278 ACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGAAAG
196 ACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGAAAG
15432343 T
261 T
* *
15432344 CAAGATTCGTTGTCTTTGATTTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACAGGATCT
1 CAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACAGGATCT
15432397 GTGGGATTCG
Statistics
Matches: 295, Mismatches: 16, Indels: 6
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
259 231 0.78
261 1 0.00
263 42 0.14
264 21 0.07
ACGTcount: A:0.30, C:0.24, G:0.17, T:0.30
Consensus pattern (261 bp):
CAAGATTCGTCGTCTTTGATCTGCTCCACTGCAACTTCAGGGAAACAGGATCTAAAATTTCAACC
TACTCCACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAATGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAAGAAGCC
AAGATTCATCGTCTTTGATCTACTCCACTGCAACTTCAGGGAAACGAGATCTAAAATTTCAACCT
ACTCCACTACAACTTTAGGGAGCTAGGTTAGTGACTTAAATCTGCTTCACTGCAACTTCAGAAAG
T
Found at i:15445183 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 15445114--15445214 Score: 114
Period size: 28 Copynumber: 3.5 Consensus size: 28
15445104 GACAAGATTG
* * * *
15445114 GCACTAAGTGTGCGGGTTTAAAATTGTACA
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTT--GATTATATA
15445144 GCACTAAGTGTGCGAGTTTGATTATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTTGATTATATA
*
15445172 GCACTAAGTGTGCGAG-CTGAATGTATATA
1 GCACTAAGTGTGCGAGTTTG-AT-TATATA
15445201 GCACTAAGTGTGCG
1 GCACTAAGTGTGCG
15445215 GATTCACTAT
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 5, Indels: 5
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
27 2 0.03
28 24 0.38
29 20 0.31
30 18 0.28
ACGTcount: A:0.29, C:0.14, G:0.28, T:0.30
Consensus pattern (28 bp):
GCACTAAGTGTGCGAGTTTGATTATATA
Found at i:15445208 original size:29 final size:28
Alignment explanation
Indices: 15445143--15445214 Score: 110
Period size: 29 Copynumber: 2.5 Consensus size: 28
15445133 AAAATTGTAC
*
15445143 AGCACTAAGTGTGCGAGTTTGATTATAT
1 AGCACTAAGTGTGCGAGTCTGATTATAT
15445171 AGCACTAAGTGTGCGAG-CTGAATGTATAT
1 AGCACTAAGTGTGCGAGTCTG-AT-TATAT
15445200 AGCACTAAGTGTGCG
1 AGCACTAAGTGTGCG
15445215 GATTCACTAT
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 1, Indels: 3
0.91 0.02 0.07
Matches are distributed among these distances:
27 2 0.05
28 19 0.46
29 20 0.49
ACGTcount: A:0.29, C:0.14, G:0.28, T:0.29
Consensus pattern (28 bp):
AGCACTAAGTGTGCGAGTCTGATTATAT
Found at i:15450854 original size:42 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15450629--15452132 Score: 1283
Period size: 43 Copynumber: 35.4 Consensus size: 42
15450619 CATTCAACGT
* * * *
15450629 CCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGTAC-ATCCAAGTA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-G
* * * * * **
15450672 CCAAGG-TGCCAATGCTGCTCGAGGCTCCTGCAC-ATCCGAGACA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CC-A-AGG
* * *
15450715 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * * * *
15450757 CCTACGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCACA-TATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-G
* * * *
15450800 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGTACGATCAAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
* * *
15450841 CCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGGCTCTCGCACGACCAGAGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * * *
15450884 CCTAAGGTT-TCGATCGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCT-AGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * * *
15450927 CCTAGGTTGCTGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-G
* * * **
15450970 CCAAGG-TGTCGATGGT-CTCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * * * *
15451011 CCTAGGCTACCGAAGGTGCCTGAAGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
** *
15451054 CCTAGGTTGCCGATGGTGTGCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
*
15451097 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * *
15451140 CCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * * *
15451183 CCTAGG-TGTCAATGGTGCCCGAGGCTCTCACATGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * *
15451225 CCTAGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGTACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* *
15451268 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACTAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
** ** * *
15451311 CCTAGGTTGCTAATGGTGTTCGAGGCTCCCTCACGACTAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
** *
15451354 CCTA-GTTATCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * *
15451396 CCTAGG-TGCTGATGGTGGCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
*
15451438 CCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * *
15451479 CCTAGGTTACAGATGGTGCCCGAGGATCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * * *
15451522 CCTAGGTTGTCGATAGTGCCCGAGGCTCCCTCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-G
*
15451565 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
*
15451607 CCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * * * *
15451649 CCTAAGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCACACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * * ** *
15451691 CCTAGTTTGTCGATGGTG-CCGAGGTTTTCACACGACCAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * * *
15451733 CCTAGGTTACCGATGTTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * *
15451776 CCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGATCTCGCACGACCAACGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * *
15451819 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGGGGCTTCCGCAC-ATCCAAGCA
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAAG-G
* * * * * *
15451862 CCAAGG-TGCCGATGGTGCCAGACGCTCCCACATGAACAAGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* *
15451904 GCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAA-GG
* * *
15451946 CCTTGGTTGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * * *
15451988 TCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTACCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* *
15452031 CGTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
* * * *
15452074 CCTAGGCTGTCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGG
1 CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCA-AGG
15452117 CCTAGGTTGCCGATGG
1 CCTAGGTTGCCGATGG
15452133 CGCTAAGGCT
Statistics
Matches: 1195, Mismatches: 221, Indels: 90
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
41 53 0.04
42 474 0.40
43 661 0.55
44 7 0.01
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.33, T:0.18
Consensus pattern (42 bp):
CCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGG
Found at i:15450913 original size:127 final size:128
Alignment explanation
Indices: 15450723--15452132 Score: 1299
Period size: 127 Copynumber: 11.1 Consensus size: 128
15450713 CACCAAGGTG
* * * * * * *
15450723 CCGATGGTGCCCAAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTACGTTGCCGATGGTGTCTGAGGCTCCCA
1 CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCA
* ** * * *
15450788 CA-TATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGTACGATCAA-GGCCTAGGTTA
66 CACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* * *
15450850 CCGATGGTGCTCGAGGCTCTCGCACGACC-AGAGGCCTAAGGTT-TCGATCGTGCCCGAGCCTCC
1 CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAG-GGCCT-AGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCC
* * * * * * ** *
15450913 CGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGTCTGAGGCTCCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGGT
64 CACACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGA-CCAAGGGCCTAGGT
15450977 GT-
127 -TA
** * ** * * * *
15450979 -CGATGGT-CTCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGGCCTAGGCTACCGAAGGTGCCTGAAGCTCCCG
1 CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCA
* ** * * *
15451042 CACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGTGCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTG
66 CACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
*
15451106 CCGATGGTGC-CTGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAAGCTCCC
1 CCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
** * * * * *
15451170 GTACGACCAAGGGCCTAGGTGTCAATGGTGCCCGAGGCTCTCACATGACCAAGGGCCTAGGTTG
65 ACACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* * * *
15451234 TCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
1 CCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
* * * ** ** * * *
15451298 GCACGACTAGGGGCCTAGGTTGCTAATGGTGTTCGAGGCTCCCTCACGACTAAGGGCCTA-GTTA
65 ACACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* *
15451362 TCGATGGTG-TCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TG-CTGATGGTGGCCGAGGCTCC
1 CCGATGGTGCT-CGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTC-GATGGTGCCCGAGGCTCC
** *
15451424 CGTACAACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
64 CACACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* * * * * *
15451488 CAGATGGTGCCCGAGGATCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGTCGATAGTGCCCGAGGCTCCCT
1 CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCA
** * * *
15451553 CAC-ATCCAAGCACCAAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TG
66 CACGA-CCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* * * * *
15451615 CCGATGGTGCCCGAGGTTCCCGCACGACCAAGGGCCTAAGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCA
1 CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCA
* * * * * *
15451679 CACGACCAGGGGCCTAGTTTGTCGATGGTG-CCGAGGTTTTCACACGACCAAGGGCCTAGGTTA
66 CACGACCAAGGGCCTAG-GTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* * * * * *
15451742 CCGATGTTGC-CTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGGATCTC
1 CCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
* * * ** *
15451806 GCACGACCAACGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGGGGCT-TCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-
65 ACACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCT-CGCACGA-CCAAGGGCCTAGGT
*
15451868 TG
127 TA
* * * * * *
15451870 CCGATGGTGC-CAGACGCTCCCACATGAACAAGGGGCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
1 CCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
* * * * * * *
15451933 GCACAACCAATGGCCTTGGTTGCCGATGGT-CCCGAGGCTCTCGCACGACCAGGGGTCTAGGTTG
65 ACACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
* * * *
15451997 CCGATGGTGC-CTGAGGCTACCGCACGACCAGGGGCGTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
1 CCGATGGTGCTC-GAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCC
* * * * * * *
15452061 GCACGACCAGGGGCCTAGGCTGTCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTG
65 ACACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
15452126 CCGATGG
1 CCGATGG
15452133 CGCTAAGGCT
Statistics
Matches: 1067, Mismatches: 178, Indels: 74
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
125 24 0.02
126 124 0.12
127 412 0.39
128 346 0.32
129 160 0.15
130 1 0.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.33, T:0.18
Consensus pattern (128 bp):
CCGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTGTCGATGGTGCCCGAGGCTCCCA
CACGACCAAGGGCCTAGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGCACGACCAAGGGCCTAGGTTA
Found at i:15450942 original size:86 final size:85
Alignment explanation
Indices: 15450718--15452132 Score: 1408
Period size: 85 Copynumber: 16.6 Consensus size: 85
15450708 CGAGACACCA
* * * * * * *
15450718 AGGTGCCGATGGTGCCCAAGGCTCCTGCACGACCAAGGGCCTACGTTGCCGATGGTGTCTGAGGC
1 AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC
* * ** *
15450783 TCCCACA-TATCCAAGCACCA
66 TCCCGCACGA-CCAAGGGCCT
* * * * * * *
15450803 AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCTCGTACGATCA-AGGCCTAGGTTACCGATGGTGCTCGAGGC
1 AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC
*
15450867 TCTCGCACGACC-AGAGGCCT
66 TCCCGCACGACCAAG-GGCCT
* * * * * *
15450887 AAGGTTTCGATCGTGCCCGAGCCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCTGATGGTGTCTGAGG
1 -AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
** *
15450952 CTCCCGCAC-ATCCAAGCACCA
65 CTCCCGCACGA-CCAAGGGCCT
* ** * * * * * *
15450973 AGGTGT-CGATGGT-CTCGAGGCTCTTGCACGACCAAGGGCCTAGGCTACCGAAGGTGCCTGAAG
1 AGGT-TCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
*
15451036 CTCCCGCACGACCAGGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
** *
15451057 AGGTTGCCGATGGTGTGCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCTGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
15451122 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * * * * *
15451143 AGGTTGTCGATGGTGCCCGAAGCTCCCGTACGACCAAGGGCCTAGG-TGTCAATGGTGCCCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
* * *
15451207 CTCTCACATGACCAAGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * *
15451228 AGGTTGTCGATGGTGTCCGAGGCTCCCGTACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
* *
15451293 CTCCCGCACGACTAGGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
** ** * * * ** *
15451314 AGGTTGCTAATGGTGTTCGAGGCTCCCTCACGACTAAGGGCCTA-GTTATCGATGGTGTCCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
15451378 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * * * * *
15451399 AGGTGCTGATGGTGGCCGAGGCTCCCGTACAACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGT-CCCGAGGC
1 AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC
*
15451462 TCTCGCACGACCAAGGGCCT
66 TCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * * *
15451482 AGGTTACAGATGGTGCCCGAGGATCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGTCGATAGTGCCCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
* ** *
15451547 CTCCCTCAC-ATCCAAGCACCA
65 CTCCCGCACGA-CCAAGGGCCT
* * *
15451568 AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAAGGGCCTAGG-TGCCGATGGTGCCCGAGGT
1 AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC
15451632 TCCCGCACGACCAAGGGCCT
66 TCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * * * * * *
15451652 AAGTTGTCGATGGT-ACCGAGGCTCTCACACGACCAGGGGCCTAGTTTGTCGATGGTG-CCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
* ** *
15451715 TTTTCACACGACCAAGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * *
15451736 AGGTTACCGATGTTGCCTGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTACCCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
* * *
15451801 ATCTCGCACGACCAACGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * * ** * * *
15451822 AGGTTGCCGATGGTGCCCGGGGCTTCCGCAC-ATCCAAGCACCAAGG-TGCCGATGGTGCCAGAC
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGA-CCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAG
* * * *
15451885 GCTCCCACATGAACAAGGGGCT
64 GCTCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * ** *
15451907 AGGTGCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACAACCAATGGCCTTGGTTGCCGATGGT-CCCGAGGC
1 AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC
* * *
15451971 TCTCGCACGACCAGGGGTCT
66 TCCCGCACGACCAAGGGCCT
* * *
15451991 AGGTTGCCGATGGTGCCTGAGGCTACCGCACGACCAGGGGCGTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
1 AGGTT-CCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGG
*
15452056 CTCCCGCACGACCAGGGGCCT
65 CTCCCGCACGACCAAGGGCCT
*
15452077 AGGCTGT-CGATGGTGCTCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGG
1 AGG-T-TCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGG
15452133 CGCTAAGGCT
Statistics
Matches: 1093, Mismatches: 208, Indels: 57
0.80 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
83 33 0.03
84 311 0.28
85 384 0.35
86 361 0.33
87 3 0.00
88 1 0.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.31, G:0.33, T:0.18
Consensus pattern (85 bp):
AGGTTCCGATGGTGCCCGAGGCTCCCGCACGACCAGGGGCCTAGGTTGCCGATGGTGCCCGAGGC
TCCCGCACGACCAAGGGCCT
Found at i:15452366 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15452253--15452436 Score: 191
Period size: 43 Copynumber: 4.3 Consensus size: 43
15452243 GTGGTGTCTG
* *
15452253 AGGCTCCCGCACATCCGAGGCACCAAGCTGCCGATAG-TG-TCA
1 AGGCTCTCGCACATCCGAGGCACCAAGTTGCCGAT-GCTGCTCA
*
15452295 GAGGCTCTCGCACATCTGAGGCACCAAGTTGCCGATGCTGCTCA
1 -AGGCTCTCGCACATCCGAGGCACCAAGTTGCCGATGCTGCTCA
* * *
15452339 AGGCTCTCGCACATCCGAGGTACCAAGTTACC-AGTGCTGCTCG
1 AGGCTCTCGCACATCCGAGGCACCAAGTTGCCGA-TGCTGCTCA
* * *
15452382 AGGCT-TCCGCACATCTCTCA--CACCAAGGTGCCGATGCTGCTCG
1 AGGCTCT-CGCACATC-C-GAGGCACCAAGTTGCCGATGCTGCTCA
15452425 AGGCTCTCGCAC
1 AGGCTCTCGCAC
15452437 CACCGACATC
Statistics
Matches: 122, Mismatches: 11, Indels: 16
0.82 0.07 0.11
Matches are distributed among these distances:
42 3 0.02
43 112 0.92
44 6 0.05
45 1 0.01
ACGTcount: A:0.21, C:0.35, G:0.26, T:0.19
Consensus pattern (43 bp):
AGGCTCTCGCACATCCGAGGCACCAAGTTGCCGATGCTGCTCA
Found at i:15453222 original size:58 final size:59
Alignment explanation
Indices: 15453125--15453246 Score: 165
Period size: 58 Copynumber: 2.1 Consensus size: 59
15453115 GGGAGGGACA
* ** *
15453125 GGGACGATTAATTCATTGTTGGGTACCGGACATGCAACGGTATCCGAATCCTA-CATTT
1 GGGATGATTAATTCATTACTGGGTACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCATTT
* * * *
15453183 GGGATGATTCATTCATTACTGGGTACCGAACATGTAACGGTATCCGAATTCTACCTTTT
1 GGGATGATTAATTCATTACTGGGTACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCATTT
15453242 GGGAT
1 GGGAT
15453247 TAGGGAGAGA
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 8, Indels: 1
0.86 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
58 46 0.84
59 9 0.16
ACGTcount: A:0.25, C:0.20, G:0.24, T:0.31
Consensus pattern (59 bp):
GGGATGATTAATTCATTACTGGGTACCGAACATGCAACGGTATCCGAATCCTACCATTT
Found at i:15457468 original size:182 final size:182
Alignment explanation
Indices: 15457157--15457485 Score: 561
Period size: 182 Copynumber: 1.8 Consensus size: 182
15457147 GAAGCTGAAT
* * * * *
15457157 GAAGTATGGCATAGCATGGCATGGTACGGCACGGCAGAAAATTGAACAAGTGCCCGGACCGCCAA
1 GAAGTATGGCATAGCATGGCACGGAACGGCACAGCAAAAAATTGAACAAGTGCCCAGACCGCCAA
* *
15457222 CAGTTGGGAGCTCGCACCCGCACCACCACAGCCCCCGTTGTGCCATGTTTCCTGAGGAGGCGGCA
66 CAGTTGGGAGCTCGCACCCGCACCACCACAGCCCCCGTTGTGACATGTTTCCCGAGGAGGCGGCA
15457287 CGGCCAAGTGTTTAACTTAGAAATTTTTTCTGTTGGCCCGAAACAAATACAA
131 CGGCCAAGTGTTTAACTTAGAAATTTTTTCTGTTGGCCCGAAACAAATACAA
*
15457339 GAAGTATGGCATGGCATGGCACGGAACGGCACAGCAAAAAATTGAACAAGTGCCCAGACCGCCAA
1 GAAGTATGGCATAGCATGGCACGGAACGGCACAGCAAAAAATTGAACAAGTGCCCAGACCGCCAA
*
15457404 CAGTTGGGAGCTCGCACCCGCACCACCAC-GACCCCCGTTGTGACATGTTTCCCGAGGGGGCGGC
66 CAGTTGGGAGCTCGCACCCGCACCACCACAG-CCCCCGTTGTGACATGTTTCCCGAGGAGGCGGC
15457468 ACGGCCAAGTGTTTAACT
130 ACGGCCAAGTGTTTAACT
15457486 AACTCTTTAC
Statistics
Matches: 137, Mismatches: 9, Indels: 2
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
181 1 0.01
182 136 0.99
ACGTcount: A:0.27, C:0.28, G:0.27, T:0.18
Consensus pattern (182 bp):
GAAGTATGGCATAGCATGGCACGGAACGGCACAGCAAAAAATTGAACAAGTGCCCAGACCGCCAA
CAGTTGGGAGCTCGCACCCGCACCACCACAGCCCCCGTTGTGACATGTTTCCCGAGGAGGCGGCA
CGGCCAAGTGTTTAACTTAGAAATTTTTTCTGTTGGCCCGAAACAAATACAA
Found at i:15460176 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 15460137--15460204 Score: 100
Period size: 35 Copynumber: 1.9 Consensus size: 35
15460127 CTCCGGAGCT
*
15460137 TGGCAAATATGGAAAGTAATCTTCAAAGATATGCG
1 TGGCAAATATGGAAAGGAATCTTCAAAGATATGCG
* * *
15460172 TGGCAAATATGGAAGGGGATCTTCAAATATATG
1 TGGCAAATATGGAAAGGAATCTTCAAAGATATG
15460205 TGATCCTAGA
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 4, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
35 29 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.10, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (35 bp):
TGGCAAATATGGAAAGGAATCTTCAAAGATATGCG
Found at i:15465522 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 15465504--15465532 Score: 58
Period size: 13 Copynumber: 2.2 Consensus size: 13
15465494 GGTTGTTTAT
15465504 TAAACTAATTAAC
1 TAAACTAATTAAC
15465517 TAAACTAATTAAC
1 TAAACTAATTAAC
15465530 TAA
1 TAA
15465533 TTAAACTAAA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 16 1.00
ACGTcount: A:0.55, C:0.14, G:0.00, T:0.31
Consensus pattern (13 bp):
TAAACTAATTAAC
Found at i:15473884 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 15473866--15473893 Score: 56
Period size: 13 Copynumber: 2.2 Consensus size: 13
15473856 GGTTGTTTAT
15473866 TAAACTAATTAAC
1 TAAACTAATTAAC
15473879 TAAACTAATTAAC
1 TAAACTAATTAAC
15473892 TA
1 TA
15473894 GTTAAACTAA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 15 1.00
ACGTcount: A:0.54, C:0.14, G:0.00, T:0.32
Consensus pattern (13 bp):
TAAACTAATTAAC
Found at i:15474938 original size:21 final size:22
Alignment explanation
Indices: 15474905--15474948 Score: 54
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
15474895 ATCTTCTTGA
* *
15474905 TTTGGTCCATTTTGTC-CCTTT
1 TTTGCTCCATTTTGGCTCCTTT
*
15474926 TTTGCTCCTTTTTGGCTCCTTT
1 TTTGCTCCATTTTGGCTCCTTT
15474948 T
1 T
15474949 GACTCTTGGT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 3, Indels: 1
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
21 13 0.68
22 6 0.32
ACGTcount: A:0.02, C:0.25, G:0.14, T:0.59
Consensus pattern (22 bp):
TTTGCTCCATTTTGGCTCCTTT
Found at i:15475432 original size:43 final size:42
Alignment explanation
Indices: 15475307--15475464 Score: 158
Period size: 43 Copynumber: 3.7 Consensus size: 42
15475297 GATTGCTGAG
* * *
15475307 ATGTGATTACATGTAA-AGCCATGTCTGGGACAATGGCATTGT
1 ATGTGATTACGTGTAAGA-CCATGTCTGGGACATTGGCATCGT
* *
15475349 ATTGTGATTACGTGTAAGA-CATGTCTAGGACATTGACATCGTT
1 A-TGTGATTACGTGTAAGACCATGTCTGGGACATTGGCATCG-T
* * *
15475392 ATATGATTTCGTGTAAGACCATGTTTGGGACATTGGCATCGAT
1 ATGTGATTACGTGTAAGACCATGTCTGGGACATTGGCATCG-T
* ** *
15475435 ATGTGATAACACGTAAGACCATATCTGGGA
1 ATGTGATTACGTGTAAGACCATGTCTGGGA
15475465 TATGGAATTG
Statistics
Matches: 94, Mismatches: 18, Indels: 7
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
42 34 0.36
43 59 0.63
44 1 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.15, G:0.25, T:0.32
Consensus pattern (42 bp):
ATGTGATTACGTGTAAGACCATGTCTGGGACATTGGCATCGT
Found at i:15479939 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 15479920--15479951 Score: 64
Period size: 14 Copynumber: 2.3 Consensus size: 14
15479910 CATCCATGCC
15479920 AAACTATCAAATGT
1 AAACTATCAAATGT
15479934 AAACTATCAAATGT
1 AAACTATCAAATGT
15479948 AAAC
1 AAAC
15479952 ATACTTCATT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 18 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.16, G:0.06, T:0.25
Consensus pattern (14 bp):
AAACTATCAAATGT
Found at i:15483448 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 15483364--15483548 Score: 227
Period size: 40 Copynumber: 4.7 Consensus size: 40
15483354 TCGAATGATG
* *
15483364 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGC-TTTGTGCTAAGTGACT-AT
1 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGC-GAGTTACTAAT
*
15483403 ATCCGGACTAAGAT-CCGAAGGCATTTGTGCGAGTTACTAAT
1 -TCCGGGCTAAG-TCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTTACTAAT
* *
15483444 TCCGGGCTAAG-CCCGAAGGCATTGGTGCGAGTTACTAAA
1 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTTACTAAT
*
15483483 TCCGGGTTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTTACT-AT
1 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTTACTAAT
* *
15483522 AACCGGGCTATGTCCCGAAGGCATTTG
1 -TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTG
15483549 AACGAGTAGC
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 12, Indels: 12
0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
39 36 0.28
40 81 0.64
41 10 0.08
ACGTcount: A:0.24, C:0.22, G:0.28, T:0.26
Consensus pattern (40 bp):
TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTTACTAAT
Found at i:15483500 original size:79 final size:81
Alignment explanation
Indices: 15483364--15483546 Score: 241
Period size: 79 Copynumber: 2.3 Consensus size: 81
15483354 TCGAATGATG
* *
15483364 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGC-TTTGTGCTAAGTGACTATATCCGGACTAAGATCCGAAGGCATT
1 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTGGTGCTAAGTGACTAAATCCGGACTAAGATCCGAAGGCATT
15483428 TGTGCGAGTTACTA-A
66 TGTGCGAGTTACTATA
* * **
15483443 TTCCGGGCTAAG-CCCGAAGGCATTGGTGC-GAGTTACTAAATCCGGGTTAAG-TCCCGAAGGCA
1 -TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTGGTGCTAAGTGACTAAATCCGGACTAAGAT-CCGAAGGCA
15483505 TTTGTGCGAGTTACTATA
64 TTTGTGCGAGTTACTATA
* *
15483523 ACCGGGCTATGTCCCGAAGGCATT
1 TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATT
15483547 TGAACGAGTA
Statistics
Matches: 91, Mismatches: 8, Indels: 8
0.85 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
78 1 0.01
79 60 0.66
80 30 0.33
ACGTcount: A:0.24, C:0.22, G:0.28, T:0.26
Consensus pattern (81 bp):
TCCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTGGTGCTAAGTGACTAAATCCGGACTAAGATCCGAAGGCATT
TGTGCGAGTTACTATA
Found at i:15483570 original size:79 final size:78
Alignment explanation
Indices: 15483365--15483581 Score: 237
Period size: 79 Copynumber: 2.7 Consensus size: 78
15483355 CGAATGATGT
* *
15483365 CCGGGCTAAGTCCCGAAGGC-TTTGTGCTAAGT-GACTATATCCGGACTAAGATCCGAAGGCATT
1 CCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGC-GAGTAG-CTATATCCGG-TTAAG-TCCGAAGGCATT
*
15483428 TGTGCGAGTTACTAATT
62 TGTGCGAGTTACTAATA
* *
15483445 CCGGGCTAAG-CCCGAAGGCATTGGTGCGAGTTA-CTAAATCCGGGTTAAGTCCCGAAGGCATTT
1 CCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAG-TAGCTATATCC-GGTTAAGT-CCGAAGGCATTT
15483508 GTGCGAGTTACT-ATAA
63 GTGCGAGTTACTAAT-A
* ** *
15483524 CCGGGCTATGTCCCGAAGGCATTTGAACGAGTAGCTATATCCGGTTAAATTCCGAAGG
1 CCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTAGCTATATCCGGTT-AAGTCCGAAGG
15483582 TACGTGATTC
Statistics
Matches: 117, Mismatches: 11, Indels: 19
0.80 0.07 0.13
Matches are distributed among these distances:
78 3 0.03
79 68 0.58
80 46 0.39
ACGTcount: A:0.25, C:0.22, G:0.28, T:0.25
Consensus pattern (78 bp):
CCGGGCTAAGTCCCGAAGGCATTTGTGCGAGTAGCTATATCCGGTTAAGTCCGAAGGCATTTGTG
CGAGTTACTAATA
Found at i:15497592 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15497567--15497602 Score: 54
Period size: 15 Copynumber: 2.3 Consensus size: 15
15497557 TTTAAAAAGG
15497567 AAAACAAATGAATCTT
1 AAAA-AAATGAATCTT
*
15497583 AAAAAAATGAGTCTT
1 AAAAAAATGAATCTT
15497598 AAAAA
1 AAAAA
15497603 CTTAATGAAA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
15 15 0.79
16 4 0.21
ACGTcount: A:0.61, C:0.08, G:0.08, T:0.22
Consensus pattern (15 bp):
AAAAAAATGAATCTT
Found at i:15499046 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15499000--15499046 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
15498990 ATATATAACC
*
15499000 TATAA-AAATAATAAATAA
1 TATAATAAAAAATAAATAA
15499018 TATAGAATAAAAAATAAA-AA
1 TAT--AATAAAAAATAAATAA
15499038 TATAATAAA
1 TATAATAAA
15499047 TGTTATAAAA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 6
0.78 0.03 0.19
Matches are distributed among these distances:
18 9 0.36
20 7 0.28
21 9 0.36
ACGTcount: A:0.72, C:0.00, G:0.02, T:0.26
Consensus pattern (19 bp):
TATAATAAAAAATAAATAA
Found at i:15499306 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 15499285--15499360 Score: 57
Period size: 16 Copynumber: 4.2 Consensus size: 17
15499275 AAATAATTTT
15499285 ATAATATATAATATAAAA
1 ATAATATAT-ATATAAAA
* *
15499303 ATAAGGTATAAAAATAAAACA
1 ATAA--TATATATAT-AAA-A
*
15499324 ATTAACA-ATATATAAAA
1 A-TAATATATATATAAAA
15499341 AT-ATATATATATAAAA
1 ATAATATATATATAAAA
15499357 ATAA
1 ATAA
15499361 AAATAAACAT
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 6, Indels: 15
0.68 0.09 0.23
Matches are distributed among these distances:
15 2 0.04
16 13 0.29
17 3 0.07
18 7 0.16
19 7 0.16
20 8 0.18
21 2 0.04
22 3 0.07
ACGTcount: A:0.66, C:0.03, G:0.03, T:0.29
Consensus pattern (17 bp):
ATAATATATATATAAAA
Found at i:15501522 original size:204 final size:205
Alignment explanation
Indices: 15500999--15501499 Score: 783
Period size: 205 Copynumber: 2.4 Consensus size: 205
15500989 ATCTTCGATC
* * *
15500999 TGTTCTCCGCCAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCAACGTAAACACATGAAAGC
1 TGTTCTCTGACAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCAACGTAAACACGTGAAAGC
* * * * * * * *
15501064 TAAATCAGCTGTGTCTTTGATTTGCTCCTTGTAAGCACAAGGATGCTAAATCGTGTTGGATCTGC
66 CAAATCAGCTATGTCTTCGATTTGCTCCTTGTAAGCACAAGGATGCCAAACCATCTTGGATCTAC
*
15501129 TTCAGTATAACCATCTGAAAGTGAGATCTGCTATGTATCTACTCCCCATTGAAGTGGAGATGCCA
131 TTCAGTATAAACATCTGAAAGTGAGATCTGCTATGTATCTACTCCCCATTGAAGTGGAGATGCCA
15501194 GACTTTGATT
196 GACTTTGATT
* * * *
15501204 TGCTCTCTGACAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCGACGTAAGCATGTGAAAGC
1 TGTTCTCTGACAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCAACGTAAACACGTGAAAGC
*
15501269 CAAATCAGTTATGTCTTCGATTTGCTCCTTGTAAGCACAAGGATGCCAAACCATCTTGGATCTAC
66 CAAATCAGCTATGTCTTCGATTTGCTCCTTGTAAGCACAAGGATGCCAAACCATCTTGGATCTAC
* *
15501334 TTCAGTATAAACATCTG-AAGTTTG-GATCTGCTATGTGTCTTC-CCCCATTGAAGTGGAGATGC
131 TTCAGTATAAACATCTGAAAG--TGAGATCTGCTATGTATCTACTCCCCATTGAAGTGGAGATGC
15501396 CAGACTTTGATT
194 CAGACTTTGATT
15501408 TGTTCTCTGACAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCAACGTAAACACGTGAAAGC
1 TGTTCTCTGACAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCAACGTAAACACGTGAAAGC
*
15501473 CAAATCAGCTATGTCTTCGATCTGCTC
66 CAAATCAGCTATGTCTTCGATTTGCTC
15501500 TCCACTAATA
Statistics
Matches: 269, Mismatches: 25, Indels: 5
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
204 121 0.45
205 146 0.54
206 2 0.01
ACGTcount: A:0.28, C:0.22, G:0.19, T:0.31
Consensus pattern (205 bp):
TGTTCTCTGACAATACAGAGATGCCAAATCATCTTAGATTTGCTTCAACGTAAACACGTGAAAGC
CAAATCAGCTATGTCTTCGATTTGCTCCTTGTAAGCACAAGGATGCCAAACCATCTTGGATCTAC
TTCAGTATAAACATCTGAAAGTGAGATCTGCTATGTATCTACTCCCCATTGAAGTGGAGATGCCA
GACTTTGATT
Found at i:15501537 original size:44 final size:44
Alignment explanation
Indices: 15501471--15501578 Score: 155
Period size: 44 Copynumber: 2.4 Consensus size: 44
15501461 ACACGTGAAA
*
15501471 GCCAAATCAGCTATGTCTTCGATCTGCTCTC-CACTAATACAGAGAT
1 GCCAAATCTGCTA--TCTTCGATCTGCTCTCTCAC-AATACAGAGAT
* *
15501517 GCCAAATCTGGTATCTTCGATCTGCTCTCTGACAATACAGAGAT
1 GCCAAATCTGCTATCTTCGATCTGCTCTCTCACAATACAGAGAT
15501561 GCCAAATCTGCTATCTTC
1 GCCAAATCTGCTATCTTC
15501579 AACTTGTTCC
Statistics
Matches: 57, Mismatches: 4, Indels: 4
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
44 44 0.77
45 2 0.04
46 11 0.19
ACGTcount: A:0.27, C:0.28, G:0.16, T:0.30
Consensus pattern (44 bp):
GCCAAATCTGCTATCTTCGATCTGCTCTCTCACAATACAGAGAT
Found at i:15501688 original size:44 final size:44
Alignment explanation
Indices: 15501522--15501825 Score: 185
Period size: 44 Copynumber: 6.9 Consensus size: 44
15501512 GAGATGCCAA
* * * * * * * *
15501522 ATCTGGTATCTTCGATCTGCTCTCTGA-CAATACAGAGATGCCAA
1 ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCT-ATAAACACAGGGATGTCAG
* * *
15501566 ATCTGCTATCTTC-AACTTGTTCCCTATAAACACAGGGACG-C-C
1 ATCTGCTATCTTCGATC-TGTTCCCTATAAACACAGGGATGTCAG
** * * * *
15501608 ATGCTGAAATCCTCGATCTGCTTCGCTGTAAGCACA-GGAGTGTCAG
1 AT-CTGCTATCTTCGATCTG-TTCCCTATAAACACAGGGA-TGTCAG
* * *
15501654 ATCTGTTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGCCAA
1 ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGTCAG
* *
15501698 ATCTGCTATCTTC-AACTTGTTCCCTATAAACACAGGGATG-C-C
1 ATCTGCTATCTTCGATC-TGTTCCCTATAAACACAGGGATGTCAG
*** * * * *
15501740 ATGCTAAAATCCTT-GATCTGCTTCACTGTAAGCACAGGAATGTCAG
1 AT-CTGCTAT-CTTCGATCTG-TTCCCTATAAACACAGGGATGTCAG
* *
15501786 ATCTGCTATTTTCGATCTGTTCCTTATAAACACAGGGATG
1 ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATG
15501826 CCAAATCTTG
Statistics
Matches: 196, Mismatches: 47, Indels: 34
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
42 4 0.02
43 26 0.13
44 133 0.68
45 29 0.15
46 4 0.02
ACGTcount: A:0.27, C:0.25, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (44 bp):
ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGTCAG
Found at i:15501759 original size:132 final size:132
Alignment explanation
Indices: 15501522--15501833 Score: 482
Period size: 132 Copynumber: 2.4 Consensus size: 132
15501512 GAGATGCCAA
* * * * * *
15501522 ATCTGGTATCTTCGATCTGCTCTCTGA-CAATACAGAGATGCCAAATCTGCTATCTTCAACTTGT
1 ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCT-ATAAACACAGGGATGCCAAATCTGCTATCTTCAACTTGT
* * *
15501586 TCCCTATAAACACAGGGACGCCATGCTGAAATCCTCGATCTGCTTCGCTGTAAGCACAGGAGTGT
65 TCCCTATAAACACAGGGACGCCATGCTAAAATCCTCGATCTGCTTCACTGTAAGCACAGGAATGT
15501651 CAG
130 CAG
*
15501654 ATCTGTTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGCCAAATCTGCTATCTTCAACTTGTT
1 ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGCCAAATCTGCTATCTTCAACTTGTT
* *
15501719 CCCTATAAACACAGGGATGCCATGCTAAAATCCTTGATCTGCTTCACTGTAAGCACAGGAATGTC
66 CCCTATAAACACAGGGACGCCATGCTAAAATCCTCGATCTGCTTCACTGTAAGCACAGGAATGTC
15501784 AG
131 AG
* *
15501786 ATCTGCTATTTTCGATCTGTTCCTTATAAACACAGGGATGCCAAATCT
1 ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGCCAAATCT
15501834 TGTTTCTTTG
Statistics
Matches: 165, Mismatches: 14, Indels: 2
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
131 1 0.01
132 164 0.99
ACGTcount: A:0.27, C:0.25, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (132 bp):
ATCTGCTATCTTCGATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGCCAAATCTGCTATCTTCAACTTGTT
CCCTATAAACACAGGGACGCCATGCTAAAATCCTCGATCTGCTTCACTGTAAGCACAGGAATGTC
AG
Found at i:15501776 original size:88 final size:87
Alignment explanation
Indices: 15501667--15501828 Score: 218
Period size: 88 Copynumber: 1.9 Consensus size: 87
15501657 TGTTATCTTC
* *
15501667 GATCTGTTCCCTATAAACACAGGGATGCCAAATCTGCTATCTTCAA-CTTGTTCCCTATAAACAC
1 GATCTGTTCACTATAAACACAGGAATGCCAAATCTGCTATCTTCAATC-TGTTCCCTATAAACAC
15501731 AGGGATGCCATGCTAAAATCCTT
65 AGGGATGCCATGCTAAAATCCTT
* * * * * * *
15501754 GATCTGCTTCACTGTAAGCACAGGAATGTCAGATCTGCTATTTTCGATCTGTTCCTTATAAACAC
1 GATCTG-TTCACTATAAACACAGGAATGCCAAATCTGCTATCTTCAATCTGTTCCCTATAAACAC
15501819 AGGGATGCCA
65 AGGGATGCCA
15501829 AATCTTGTTT
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 9, Indels: 3
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
87 6 0.09
88 57 0.89
89 1 0.02
ACGTcount: A:0.28, C:0.25, G:0.17, T:0.30
Consensus pattern (87 bp):
GATCTGTTCACTATAAACACAGGAATGCCAAATCTGCTATCTTCAATCTGTTCCCTATAAACACA
GGGATGCCATGCTAAAATCCTT
Found at i:15509956 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 15509933--15509962 Score: 51
Period size: 14 Copynumber: 2.1 Consensus size: 14
15509923 ATTCTGGTTC
15509933 AACTTCATTTAGAA
1 AACTTCATTTAGAA
*
15509947 AACTTTATTTAGAA
1 AACTTCATTTAGAA
15509961 AA
1 AA
15509963 AGAATATCTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 15 1.00
ACGTcount: A:0.47, C:0.10, G:0.07, T:0.37
Consensus pattern (14 bp):
AACTTCATTTAGAA
Found at i:15513344 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 15513277--15513377 Score: 103
Period size: 28 Copynumber: 3.5 Consensus size: 28
15513267 ATAGTGAATC
* * * *
15513277 CGCACACTTAGTGCTATATATTTCCAGCT
1 CGCACACTTAGTGCTATACA-ATCAAACT
*
15513306 CGCACACTTAGTGCTATAGAATCAAACT
1 CGCACACTTAGTGCTATACAATCAAACT
* * *
15513334 CGCACACTTAGTGCTGTACAATTTTAAACC
1 CGCACACTTAGTGCTATACAA--TCAAACT
15513364 CGCACACTTAGTGC
1 CGCACACTTAGTGC
15513378 CAATCTTGTC
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 8, Indels: 3
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
28 24 0.39
29 19 0.31
30 19 0.31
ACGTcount: A:0.29, C:0.28, G:0.15, T:0.29
Consensus pattern (28 bp):
CGCACACTTAGTGCTATACAATCAAACT
Found at i:15517153 original size:17 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15517039--15517156 Score: 61
Period size: 19 Copynumber: 6.2 Consensus size: 19
15517029 ACAAATTTTA
*
15517039 AAATTATAAATAATATAAT
1 AAATAATAAATAATATAAT
* *
15517058 GAATAATATAA-ACGTA-AAT
1 AAATAATA-AATA-ATATAAT
*
15517077 AATATAATAGATAATAT-AT
1 AA-ATAATAAATAATATAAT
* * *
15517096 -GAT-ATATATAACCTATAAA
1 AAATAATAAATAA--TATAAT
15517115 AAATAATAAATAATATAGAAT
1 AAATAATAAATAATAT--AAT
15517136 AAA-AATAAA-AATATAAT
1 AAATAATAAATAATATAAT
15517153 AAAT
1 AAAT
15517157 GTTATAAAAT
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 12, Indels: 27
0.65 0.11 0.24
Matches are distributed among these distances:
16 7 0.09
17 8 0.11
18 3 0.04
19 25 0.34
20 19 0.26
21 12 0.16
ACGTcount: A:0.63, C:0.03, G:0.04, T:0.31
Consensus pattern (19 bp):
AAATAATAAATAATATAAT
Found at i:15517380 original size:25 final size:26
Alignment explanation
Indices: 15517352--15517414 Score: 71
Period size: 25 Copynumber: 2.5 Consensus size: 26
15517342 AAAATAAAAC
15517352 ATAATAAAAATAA-TATA-AATACTAT
1 ATAATAAAAATAATTATATAATA-TAT
*
15517377 ATAAT-AAAATAATTTTATAATATAT
1 ATAATAAAAATAATTATATAATATAT
15517402 A-ATATAAAAATAA
1 ATA-ATAAAAATAA
15517415 GGTATAAAAA
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 1, Indels: 7
0.80 0.02 0.17
Matches are distributed among these distances:
24 8 0.24
25 14 0.42
26 11 0.33
ACGTcount: A:0.63, C:0.02, G:0.00, T:0.35
Consensus pattern (26 bp):
ATAATAAAAATAATTATATAATATAT
Found at i:15518446 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 15518428--15518454 Score: 54
Period size: 13 Copynumber: 2.1 Consensus size: 13
15518418 ATGATTCGAA
15518428 GCCTGGAATCACG
1 GCCTGGAATCACG
15518441 GCCTGGAATCACG
1 GCCTGGAATCACG
15518454 G
1 G
15518455 TGTTGATGGC
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 14 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.30, G:0.33, T:0.15
Consensus pattern (13 bp):
GCCTGGAATCACG
Found at i:15521730 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 15521665--15521764 Score: 173
Period size: 43 Copynumber: 2.3 Consensus size: 43
15521655 TATTTAAAAA
15521665 AAACGCCGCTAAAGGTCATGACCTTTAGCGGCGCATCTCCAAC
1 AAACGCCGCTAAAGGTCATGACCTTTAGCGGCGCATCTCCAAC
* * *
15521708 AAACGCCGCTAAAGGTCTTGACCTTTAGCGGCGCTTCTCCCAC
1 AAACGCCGCTAAAGGTCATGACCTTTAGCGGCGCATCTCCAAC
15521751 AAACGCCGCTAAAG
1 AAACGCCGCTAAAG
15521765 ATAATGAAAT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 3, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
43 54 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.33, G:0.21, T:0.19
Consensus pattern (43 bp):
AAACGCCGCTAAAGGTCATGACCTTTAGCGGCGCATCTCCAAC
Found at i:15521817 original size:28 final size:27
Alignment explanation
Indices: 15521780--15521833 Score: 72
Period size: 28 Copynumber: 2.0 Consensus size: 27
15521770 GAAATTTTAA
*
15521780 AAAAAAATAAAATATTATAAAAATCATG
1 AAAAAAATAAAAAATT-TAAAAATCATG
* *
15521808 AAAAATATAAAAAATTTAAAATTCAT
1 AAAAAAATAAAAAATTTAAAAATCAT
15521834 TATCAAAATA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 1
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 9 0.39
28 14 0.61
ACGTcount: A:0.67, C:0.04, G:0.02, T:0.28
Consensus pattern (27 bp):
AAAAAAATAAAAAATTTAAAAATCATG
Found at i:15525417 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 15525399--15525427 Score: 58
Period size: 13 Copynumber: 2.2 Consensus size: 13
15525389 TGTTACATCA
15525399 AGTATATTAATTC
1 AGTATATTAATTC
15525412 AGTATATTAATTC
1 AGTATATTAATTC
15525425 AGT
1 AGT
15525428 TGTGAAATTA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 16 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.10, T:0.45
Consensus pattern (13 bp):
AGTATATTAATTC
Found at i:15525575 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 15525547--15525595 Score: 89
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
15525537 CCAAAATAAC
15525547 AATTAATTTTTATATAAACTTTTA
1 AATTAATTTTTATATAAACTTTTA
*
15525571 AATTAATTTTTGTATAAACTTTTA
1 AATTAATTTTTATATAAACTTTTA
15525595 A
1 A
15525596 TAAATATATG
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
24 24 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.04, G:0.02, T:0.53
Consensus pattern (24 bp):
AATTAATTTTTATATAAACTTTTA
Found at i:15526238 original size:29 final size:30
Alignment explanation
Indices: 15526188--15526252 Score: 105
Period size: 29 Copynumber: 2.2 Consensus size: 30
15526178 TTAGTGGCGT
*
15526188 TTTACCAAAAGCGCCGCGAATGCTCTGGTC
1 TTTAGCAAAAGCGCCGCGAATGCTCTGGTC
*
15526218 TTTAGCAAAA-CGCCGCTAATGCTCTGGTC
1 TTTAGCAAAAGCGCCGCGAATGCTCTGGTC
15526247 TTTAGC
1 TTTAGC
15526253 GGCGTTTTGC
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 2, Indels: 1
0.92 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
29 24 0.73
30 9 0.27
ACGTcount: A:0.23, C:0.28, G:0.22, T:0.28
Consensus pattern (30 bp):
TTTAGCAAAAGCGCCGCGAATGCTCTGGTC
Found at i:15526373 original size:81 final size:81
Alignment explanation
Indices: 15526218--15526413 Score: 209
Period size: 81 Copynumber: 2.4 Consensus size: 81
15526208 TGCTCTGGTC
* * * * * *
15526218 TTTAGC-AAAACGCCGCTAATGCTCTGGTCTTTAGCGGCGTTTTGCCAAAAGCGCCGCTAATGGT
1 TTTAGCAAAAACACCGCTAATGCTCT-GTTTTTAGCGGCGTTTTACAAAAAACGCCGCTAATGCT
*
15526282 CTGGTCTTTAGCGGCGT
65 CTAGTCTTTAGCGGCGT
* * *
15526299 TTT-GCCAAAAGCACCGCTAATGCTCTGTTTTTAGCGGCGTTTTAACAAAAAACGTCGCTATTGC
1 TTTAG-CAAAAACACCGCTAATGCTCTGTTTTTAGCGGCGTTTT-ACAAAAAACGCCGCTAATGC
* *
15526363 TC-AGTTTTTAGCGGTGT
64 TCTAGTCTTTAGCGGCGT
* *
15526380 TTTAGCAAAAACGCCGCTATTGCTCTGTGTTTTA
1 TTTAGCAAAAACACCGCTAATGCTCTGT-TTTTA
15526414 CAATTTTTGC
Statistics
Matches: 95, Mismatches: 15, Indels: 9
0.80 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
80 1 0.01
81 55 0.58
82 39 0.41
ACGTcount: A:0.21, C:0.22, G:0.23, T:0.33
Consensus pattern (81 bp):
TTTAGCAAAAACACCGCTAATGCTCTGTTTTTAGCGGCGTTTTACAAAAAACGCCGCTAATGCTC
TAGTCTTTAGCGGCGT
Found at i:15526413 original size:41 final size:41
Alignment explanation
Indices: 15526218--15526413 Score: 208
Period size: 41 Copynumber: 4.8 Consensus size: 41
15526208 TGCTCTGGTC
15526218 TTTAGC-AAAACGCCGCTAATGCTCTG-GTCTTTAGCGGCGT
1 TTTAGCAAAAACGCCGCTAATGCTCTGTGT-TTTAGCGGCGT
* *
15526258 TTT-GCCAAAAGCGCCGCTAATGGTCTG-GTCTTTAGCGGCGT
1 TTTAG-CAAAAACGCCGCTAATGCTCTGTGT-TTTAGCGGCGT
* *
15526299 TTT-GCCAAAAGCACCGCTAATGCTCTGT-TTTTAGCGGCGT
1 TTTAG-CAAAAACGCCGCTAATGCTCTGTGTTTTAGCGGCGT
* * * * *
15526339 TTTAACAAAAAACGTCGCTATTGCTCAGT-TTTTAGCGGTGT
1 TTTAGC-AAAAACGCCGCTAATGCTCTGTGTTTTAGCGGCGT
*
15526380 TTTAGCAAAAACGCCGCTATTGCTCTGTGTTTTA
1 TTTAGCAAAAACGCCGCTAATGCTCTGTGTTTTA
15526414 CAATTTTTGC
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 14, Indels: 11
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
39 1 0.01
40 39 0.29
41 96 0.71
ACGTcount: A:0.21, C:0.22, G:0.23, T:0.33
Consensus pattern (41 bp):
TTTAGCAAAAACGCCGCTAATGCTCTGTGTTTTAGCGGCGT
Found at i:15534967 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 15534942--15534991 Score: 66
Period size: 21 Copynumber: 2.4 Consensus size: 21
15534932 CAAAATATTG
*
15534942 TAATA-ATTAATAAGTATGGGA
1 TAATATATTAACAAG-ATGGGA
*
15534963 TAATATATTAACAAGATGGTA
1 TAATATATTAACAAGATGGGA
15534984 TAATATAT
1 TAATATAT
15534992 ATTATGGAGG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 2
0.87 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
21 18 0.69
22 8 0.31
ACGTcount: A:0.48, C:0.02, G:0.14, T:0.36
Consensus pattern (21 bp):
TAATATATTAACAAGATGGGA
Found at i:15535609 original size:22 final size:21
Alignment explanation
Indices: 15535584--15535632 Score: 62
Period size: 21 Copynumber: 2.3 Consensus size: 21
15535574 TTATGTGTAG
* *
15535584 ATTATTTTTAAATTTTATTTTA
1 ATTATTTGTAAA-TTTATTTAA
*
15535606 ATTATATGTAAATTTATTTAA
1 ATTATTTGTAAATTTATTTAA
15535627 ATTATT
1 ATTATT
15535633 CTAATTTAGG
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 4, Indels: 1
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
21 13 0.57
22 10 0.43
ACGTcount: A:0.37, C:0.00, G:0.02, T:0.61
Consensus pattern (21 bp):
ATTATTTGTAAATTTATTTAA
Found at i:15544552 original size:64 final size:65
Alignment explanation
Indices: 15544354--15544639 Score: 269
Period size: 64 Copynumber: 4.4 Consensus size: 65
15544344 CATAATTTTG
* * * ** *
15544354 GCTCTCTTGTAC-ACATGATGAACACTTAGTACCACCCATGTGACCTAGCCACT-T-TATCTCGT
1 GCTCTCTTGT-CTACATGGTGTACACATAGTACCACCCATGCAACCTAGCTACTATATATCTCGT
15544416 A
65 A
* * * * * * *
15544417 GCTCTCTTGTTTACATGGTGTCCTTCACCTGGAACCACACATGCAACCTAGCTAC-ATTTATCTC
1 GCTCTCTTGTCTACATGGTG---TACACATAGTACCACCCATGCAACCTAGCTACTATATATCTC
*
15544481 ATA
63 GTA
* *
15544484 GCTCTCTTGTCTACATGGTGTACACATAGTATCACCCATGCAACCTAGCTA-TATATATCCCGTA
1 GCTCTCTTGTCTACATGGTGTACACATAGTACCACCCATGCAACCTAGCTACTATATATCTCGTA
* * * *
15544548 GCTCTCTTGTCTACATGGTGTACACATAGTATCACCTATGCGACCTAGCTACCTCATAATGTCTC
1 GCTCTCTTGTCTACATGGTGTACACATAGTACCACCCATGCAACCTAGCTA-CT-AT-ATATCTC
15544613 GTA
63 GTA
*
15544616 GCTCTCTTGTAC-ACATGGTATACA
1 GCTCTCTTGT-CTACATGGTGTACA
15544640 TCCCGTATTA
Statistics
Matches: 184, Mismatches: 27, Indels: 19
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
63 17 0.09
64 83 0.45
66 25 0.14
67 29 0.16
68 29 0.16
69 1 0.01
ACGTcount: A:0.25, C:0.29, G:0.15, T:0.32
Consensus pattern (65 bp):
GCTCTCTTGTCTACATGGTGTACACATAGTACCACCCATGCAACCTAGCTACTATATATCTCGTA
Found at i:15552307 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 15552301--15552329 Score: 58
Period size: 3 Copynumber: 9.7 Consensus size: 3
15552291 CACCACCTCC
15552301 TCT TCT TCT TCT TCT TCT TCT TCT TCT TC
1 TCT TCT TCT TCT TCT TCT TCT TCT TCT TC
15552330 AGTTTACTTG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 26 1.00
ACGTcount: A:0.00, C:0.34, G:0.00, T:0.66
Consensus pattern (3 bp):
TCT
Found at i:15555175 original size:123 final size:123
Alignment explanation
Indices: 15554956--15555294 Score: 588
Period size: 123 Copynumber: 2.8 Consensus size: 123
15554946 GAATTATGTG
15554956 AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGACATATGTGTGTATGAGTATTTGAATGGTACCCGG
1 AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGACATATGTGTGTATGAGTATTTGAATGGTACCCGG
*
15555021 GCTAAGTCCCGAAGGCAATTATGCTAGTGATATGTTTGTGTTTGAGCCTTAGTAACGA
66 GCTAAGTCCCGAAGGCAATTATGCTAGTGATATGTTTGTGTTCGAGCCTTAGTAACGA
15555079 AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGACATATGTGTGTATGAGTATTTGAATGGTACCCGG
1 AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGACATATGTGTGTATGAGTATTTGAATGGTACCCGG
*
15555144 GCTAAGTCCTGAAGGCAATTATGCTAGTGATATGTTTGTGTTCGAGCCTTAGTAACGA
66 GCTAAGTCCCGAAGGCAATTATGCTAGTGATATGTTTGTGTTCGAGCCTTAGTAACGA
** * * * *
15555202 AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGATTTATGTGTGCATGAGCAATTGAATGATACCCGG
1 AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGACATATGTGTGTATGAGTATTTGAATGGTACCCGG
* *
15555267 GCTAAGTCCCGAAGACATTTATGCTAGT
66 GCTAAGTCCCGAAGGCAATTATGCTAGT
15555295 AATTATATCC
Statistics
Matches: 205, Mismatches: 11, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
123 205 1.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.25, T:0.34
Consensus pattern (123 bp):
AAATGAAATATGGATGTGTAATGATTATTGACATATGTGTGTATGAGTATTTGAATGGTACCCGG
GCTAAGTCCCGAAGGCAATTATGCTAGTGATATGTTTGTGTTCGAGCCTTAGTAACGA
Found at i:15555318 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 15555263--15555490 Score: 287
Period size: 40 Copynumber: 5.7 Consensus size: 40
15555253 TGAATGATAC
* * * * **
15555263 CCGGGCTAAGTCCCGAAGACATTTATGCTAGTAATTATAT
1 CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
* * * * *
15555303 CCGGGTTAAGACCCGAAGGCAATTGTGCTA-CTGACTATAT
1 CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTG-TTATAT
*
15555343 CCGGGCTAATACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
1 CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
*
15555383 CCGGGCTAATACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
1 CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
* *
15555423 CCGGGCTAATACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTCGTTATAT
1 CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
* *
15555463 CCGGGCTAAGACCCGAGGGCATTCGTGC
1 CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGC
15555491 GTGTGGTTAT
Statistics
Matches: 167, Mismatches: 19, Indels: 4
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
40 165 0.99
41 2 0.01
ACGTcount: A:0.25, C:0.22, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (40 bp):
CCGGGCTAAGACCCGAAGGCATTTGTGCAAGTTGTTATAT
Found at i:15558020 original size:14 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15558001--15558030 Score: 53
Period size: 14 Copynumber: 2.1 Consensus size: 15
15557991 ATATTTGACT
15558001 TGTTCTTAATT-TTG
1 TGTTCTTAATTCTTG
15558015 TGTTCTTAATTCTTG
1 TGTTCTTAATTCTTG
15558030 T
1 T
15558031 TTTAATATTC
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 1
0.94 0.00 0.06
Matches are distributed among these distances:
14 11 0.73
15 4 0.27
ACGTcount: A:0.13, C:0.10, G:0.13, T:0.63
Consensus pattern (15 bp):
TGTTCTTAATTCTTG
Found at i:15569158 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 15569132--15569171 Score: 71
Period size: 21 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
15569122 AATAGATAGT
*
15569132 GAAACAATCGATTGAAAAGGG
1 GAAACAATCAATTGAAAAGGG
15569153 GAAACAATCAATTGAAAAG
1 GAAACAATCAATTGAAAAG
15569172 AGGAGAGATA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 18 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.10, G:0.23, T:0.15
Consensus pattern (21 bp):
GAAACAATCAATTGAAAAGGG
Done.