Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Scaffold1774
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 29927
ACGTcount: A:0.31, C:0.13, G:0.22, T:0.34
Found at i:51 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 1--87 Score: 106
Period size: 24 Copynumber: 3.7 Consensus size: 24
* *
1 TTAAACACTTCAATTT-GCAACAT
1 TTAAACACTTCAATTTATCAGCAT
* *
24 TTAAGCACATCAATTTA-CAGCCAT
1 TTAAACACTTCAATTTATCAG-CAT
48 TTAAACACTTCAATTTATCAGCAT
1 TTAAACACTTCAATTTATCAGCAT
*
72 TCAAACACTTCAATTT
1 TTAAACACTTCAATTT
88 GCACACTTTA
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 6, Indels: 5
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
23 16 0.29
24 36 0.65
25 3 0.05
ACGTcount: A:0.38, C:0.23, G:0.05, T:0.34
Consensus pattern (24 bp):
TTAAACACTTCAATTTATCAGCAT
Found at i:147 original size:22 final size:21
Alignment explanation
Indices: 76--149 Score: 73
Period size: 22 Copynumber: 3.5 Consensus size: 21
66 CAGCATTCAA
76 ACACTTCAATTTGCA-CACTTT
1 ACAC-TCAATTTGCAGCACTTT
*
97 ACACTC-ATTTACAGCAC-TT
1 ACACTCAATTTGCAGCACTTT
116 AGCACTTCAATTTGCAGCACTTT
1 A-CAC-TCAATTTGCAGCACTTT
*
139 ACTTCTCAATT
1 AC-ACTCAATT
150 AACAACATTT
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 3, Indels: 11
0.76 0.05 0.19
Matches are distributed among these distances:
19 9 0.20
20 8 0.18
21 6 0.14
22 17 0.39
23 4 0.09
ACGTcount: A:0.28, C:0.28, G:0.07, T:0.36
Consensus pattern (21 bp):
ACACTCAATTTGCAGCACTTT
Found at i:264 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 212--723 Score: 261
Period size: 23 Copynumber: 22.7 Consensus size: 23
202 TTTTCAGTCC
* *
212 TAAACACTTCAA-TTGCAACATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
*
234 TAAGCACTTCAATTTACAGCATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
*
257 TAAACACTTCAATTTGCAGCATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
*
280 CAAAACACTTCAATTTGA-AGCACTT
1 -TAAACACTTCAATTT-ACAGCA-TT
305 T-AACACTTC-A-TTACAGCATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
* *
325 TAAGCACTTCAATTTGCAGCATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
* * *
348 T--ACATCTGCAATTAACAACATT
1 TAAACA-CTTCAATTTACAGCATT
* *
370 TATACACCTT--ATATACAGCA--
1 TAAACA-CTTCAATTTACAGCATT
* * **
390 TAAACA-TCTCAATGTCCAGCAAC
1 TAAACACT-TCAATTTACAGCATT
* * *
413 TAAACACTTCAATTTGCAGTACT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
* *
436 TAAACACTTCAATTTGCAACATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
*
459 TAAGCACTTCAATTTACAGCATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
* *
482 TAAACACTTCAGTTGT-TAGC-TT
1 TAAACACTTCAATT-TACAGCATT
* * *
504 CAAACCAACTTCAAGTTGCAGACACTT
1 TAAA-C-ACTTCAATTTACAG-CA-TT
*
531 T-AACACTTAAATTTACAGACATT
1 TAAACACTTCAATTTACAG-CATT
* *
554 TAAGCACTTCAATTTGCAGCACTT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCA-TT
* * *
578 TTAACA-TCTCAATTAACAACATT
1 TAAACACT-TCAATTTACAGCATT
* *
601 TATACACCTCAATTTA-A-CGA--
1 TAAACACTTCAATTTACAGC-ATT
* * *
621 TAAACA-TCTCAAATGATCCAGCA-A
1 TAAACACT-TC-AAT-TTACAGCATT
* * *
645 TAGACAC-TCAATTTTCAG-A-C
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
* *
665 TAAA-ACTTCAATTTGCAACATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
*
687 TAAGCACTTCAATTTA-AGCATT
1 TAAACACTTCAATTTACAGCATT
*
709 TTAACACTTC-ATTTA
1 TAAACACTTCAATTTA
724 AACTTGTTAA
Statistics
Matches: 376, Mismatches: 74, Indels: 81
0.71 0.14 0.15
Matches are distributed among these distances:
18 1 0.00
19 3 0.01
20 29 0.08
21 37 0.10
22 61 0.16
23 153 0.41
24 84 0.22
25 4 0.01
26 2 0.01
27 2 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.23, G:0.07, T:0.32
Consensus pattern (23 bp):
TAAACACTTCAATTTACAGCATT
Found at i:733 original size:21 final size:23
Alignment explanation
Indices: 669--734 Score: 68
Period size: 23 Copynumber: 3.0 Consensus size: 23
659 TCAGACTAAA
*
669 ACTTCAATTTGCAACA-TTTAAGC
1 ACTTCAATTT-AAACATTTTAAGC
*
692 ACTTCAATTTAAGCATTTTAA-C
1 ACTTCAATTTAAACATTTTAAGC
714 ACTTC-ATTTAAAC-TTGTTAAG
1 ACTTCAATTTAAACATT-TTAAG
735 TACTGCAAAA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 3, Indels: 7
0.79 0.06 0.15
Matches are distributed among these distances:
20 2 0.05
21 11 0.30
22 9 0.24
23 15 0.41
ACGTcount: A:0.35, C:0.18, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (23 bp):
ACTTCAATTTAAACATTTTAAGC
Found at i:836 original size:23 final size:22
Alignment explanation
Indices: 787--1209 Score: 284
Period size: 23 Copynumber: 18.5 Consensus size: 22
777 TTATCGCTGT
* * **
787 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
810 AATTGACA-TGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGA-AGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
833 AATTGAAGTGCTAAATGCTGTTA
1 AATTGAAGTGTTAAATGCTG-CA
*
856 AATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
879 AATTGAAGTCCTTGAATGCTGTA
1 AATTGAAGT-GTTAAATGCTGCA
*
902 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
925 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
948 AATTGAAGTGTTTAAGTAG-TGAA
1 AATTGAAGTG-TTAAAT-GCTGCA
* ** *
971 AATTGATGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
994 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
1016 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
* *
1039 AATTG-AGATGTAAAAGTTCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
1062 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
1085 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
*
1108 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
1131 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
1154 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCT
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
1177 AATTGAAGTGTTTAA-GACTG-A
1 AATTGAAGTGTTAAATG-CTGCA
*
1198 AATTGTAGTGTT
1 AATTGAAGTGTT
1210 TAGTTGCTGG
Statistics
Matches: 322, Mismatches: 57, Indels: 44
0.76 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
21 12 0.04
22 40 0.12
23 251 0.78
24 19 0.06
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.37
Consensus pattern (22 bp):
AATTGAAGTGTTAAATGCTGCA
Found at i:873 original size:46 final size:46
Alignment explanation
Indices: 787--2090 Score: 674
Period size: 46 Copynumber: 28.8 Consensus size: 46
777 TTATCGCTGT
* * * * *
787 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGACA-TGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTTAAGTGCTGCA
833 AATTGAAGTG-CTAAATGCTGTTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTG-TAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * *
879 AATTGAAGT-CCTTGAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * *
925 AATTGAAGTG-CTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTAG-TGAA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGT-GCTGCA
* * ** * * * *
971 AATTGATGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-T
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTTAAGT-GCTGCA
* * * * ** *
1016 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTTCTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTTAAGTGCTGCA
*
1062 AATTGAAGTG-CTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * * *
1108 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* *
1154 AATTGAAGTG-CTTAAATGTTGCT-AATTGAAGTGTTTAAG-ACTG-A
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTG-TAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * ** * * *
1198 AATTGTAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTTTA-T-C-GC-
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTTAAGTGCTGCA
* * * **
1239 --------TGTATAAATGTTGTTAATTGAGA-TGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * * *
1277 AATTGAAGTGCCTAAGTGCTATAAATTGAAGTGTTAAAGTGTTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * * *
1323 AATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * *
1369 AATTGATGTG-CTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* ** * * * * * *
1415 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGGA-TGTTTTTA-TCACTG-T
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTTAAGT-GCTGCA
* * * * *
1460 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAAATTG-AGATG-TAAAGTGCTACA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTG-TAAATTGAAG-TGTTTAAGTGCTGCA
*
1506 AATTGAAGTG-CTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * * * * *
1552 AATTGAAATGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTATTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * * *
1598 AATTGAAGTG-CTTAAATGTTGGAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * *** * * * *
1644 AATTAAAGTGTTTTGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-T
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTTAAGT-GCTGCA
* * * * * *
1689 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATAG-AGATGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTTAAGTGCTGCA
* *
1735 AATTGAAG-CTCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * * * *
1781 AATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAGGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* *** * *
1827 AATTGATGTG-CTTAAACATTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTGTC-TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * ** * * * * *
1873 AATTTAAGTGTTTAGTTGCTGGACATT-TAGATGCTTT-A-TCACTG-T
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TG-TTTAAGT-GCTGCA
* * * * ** **
1918 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTTTA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTTAAGTGCTGCA
* *
1964 AATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCC
1 AATTGAAGTGTCTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTTT-AAGTGCTGCA
* * * * *
2010 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAATGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
* * * *
2056 AATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTT
1 AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTT
2091 GGTGCAAGAA
Statistics
Matches: 951, Mismatches: 234, Indels: 146
0.71 0.18 0.11
Matches are distributed among these distances:
33 10 0.01
34 6 0.01
35 1 0.00
36 2 0.00
37 2 0.00
41 1 0.00
42 3 0.00
43 8 0.01
44 18 0.02
45 148 0.16
46 725 0.76
47 27 0.03
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.23, T:0.37
Consensus pattern (46 bp):
AATTGAAGTGTCTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTGCTGCA
Found at i:1293 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 1267--2090 Score: 414
Period size: 23 Copynumber: 36.0 Consensus size: 23
1257 TGAGATGTAA
**
1267 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGCCT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
** *
1290 AAGTGCTATAAATTGAAGTGTTA
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
*
1313 AAGTGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
**
1336 GAA-TGCTATAAATTGAAGTGTTT
1 -AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * * *
1359 AAATGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* *
1382 AAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
*
1405 AAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * *
1428 -AGTTGCTGGACATTGGA-TGTTTT
1 AAG-TGCTGCAAATTGAAGTG-TTT
* * * * *
1451 TA-TCACTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAGT-GCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * * *
1473 AAATGTTGTTAAATTG-AGATG-TA
1 AAGTGCTG-CAAATTGAAG-TGTTT
* *
1496 AAGTGCTACAAATTGAAGTGCTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * *
1519 AAATGCTGTAAATTGAAGTGTTA
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
*
1542 AAGTGCTGCAAATTGAAATGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
*
1565 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTATTT
1 -AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * *
1588 AAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * *
1611 AAATGTTGGAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * * *
1634 AACTACTGTAAATTAAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * *
1657 -TGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT
1 AAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTTT
* * * *
1680 TA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAGT-GCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * ** * *
1702 AAATGTTGTTAATAG-AGATGTTA
1 AAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTTT
*
1725 AAGTGCTGCAAATTGAAGCT-CTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTTT
* * *
1748 AAATGCTGTAAATTGAAGTGTTA
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1771 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
** *
1794 GAA-TGCTATAAATTGAGGTGTTT
1 -AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * * *
1817 AAATGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
****
1840 AAACATTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* *
1863 AAGTACTGCAAATTTAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * *
1886 -AGTTGCTGGACATT-TAGATGCTTT
1 AAG-TGCTGCAAATTGAAG-TG-TTT
* * * *
1910 -A-TCACTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAGT-GCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * ** **
1931 AAATGTTGTTAATTG-AGATGTAA
1 AAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTTT
** *
1954 AAGTGCTTTAAATTGAAGTGTTA
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1977 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
*
2000 GAA-TGCTGCCAATTGAAGTGTTT
1 -AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * * *
2023 AAATGCTGTAAATTGAAATGCTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* *
2046 AAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
* * * *
2069 AACTACTGTAAATTAAAGTGTT
1 AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
2091 GGTGCAAGAA
Statistics
Matches: 612, Mismatches: 150, Indels: 78
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
21 2 0.00
22 61 0.10
23 524 0.86
24 25 0.04
ACGTcount: A:0.33, C:0.08, G:0.23, T:0.37
Consensus pattern (23 bp):
AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
Found at i:1566 original size:229 final size:228
Alignment explanation
Indices: 1239--2070 Score: 1240
Period size: 229 Copynumber: 3.6 Consensus size: 228
1229 GTTTTATCGC
* * *
1239 TGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCCTAAGTGCTATAAATT
1 TGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATT
*
1304 GAAGTGTTAAAGTGTTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
66 GAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
* *
1369 AATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGC
131 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTAAAGTGTTTAGTTGC
1434 TGGACATTGGATGTTTTTATCACTGTAATTGAGG
196 TGGACATTGGATG-TTTTATCACTGTAATTGAGG
*
1468 TGTATAAATGTTGTTAAATTGAGATGT-AAAGTGCTACAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAAT
1 TGTATAAATGTTGTT-AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAAT
* ** *
1532 TGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAATGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTATTTAAATGCTGT
65 TGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGT
* * * *
1597 AAATTGAAGTGCTTAAATGTTGGAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTTTTGTTG
130 AAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTAAAGTGTTTAGTTG
*
1662 CTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATTGAGG
195 CTGGACATTG-GATGTTTTATCACTGTAATTGAGG
* *
1697 TGTATAAATGTTGTTAATAGAGATGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGCT-CTTAAATGCTGTAAAT
1 TGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCTTAAATGCTGTAAAT
*
1761 TGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAGGTGTTTAAATGCTGT
65 TGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGT
* ** *
1826 AAATTGATGTGCTTAAACATTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTTAAGTGTTTAGTTG
130 AAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTAAAGTGTTTAGTTG
* *
1891 CTGGACATTTAGATGCTTTATCACTGTAATTGAGG
195 CTGGACA-TTGGATGTTTTATCACTGTAATTGAGG
** *
1926 TGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTTTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAAT
1 TGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAAT
* * * * * * *
1990 TGAAGTGTTTGAA-TGCTGCCAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAATGCTTAAATGTTG
65 TGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTG
* *
2054 CAAATTGAAGTGTTTAA
129 TAAATTGAAGTGCTTAA
2071 CTACTGTAAA
Statistics
Matches: 545, Mismatches: 50, Indels: 16
0.89 0.08 0.03
Matches are distributed among these distances:
228 16 0.03
229 507 0.93
230 22 0.04
ACGTcount: A:0.33, C:0.07, G:0.23, T:0.37
Consensus pattern (228 bp):
TGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATT
GAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTAAAGTGTTTAGTTGC
TGGACATTGGATGTTTTATCACTGTAATTGAGG
Found at i:7098 original size:23 final size:22
Alignment explanation
Indices: 7063--7106 Score: 52
Period size: 23 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
7053 CATCATAAAG
* *
7063 TGTTTTGTTGCTGGACATTGAGA
1 TGTTTTATCGCTGGA-ATTGAGA
*
7086 TGTTTTATCGCTGTAATTGAG
1 TGTTTTATCGCTGGAATTGAG
7107 GTGTATAAAT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 1
0.82 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
22 6 0.33
23 12 0.67
ACGTcount: A:0.18, C:0.09, G:0.27, T:0.45
Consensus pattern (22 bp):
TGTTTTATCGCTGGAATTGAGA
Found at i:7149 original size:23 final size:22
Alignment explanation
Indices: 7100--10231 Score: 1881
Period size: 23 Copynumber: 137.5 Consensus size: 22
7090 TTATCGCTGT
* * **
7100 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
7123 AATTG-AGATGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
* *
7146 AATTGAAGCTCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAG-TGTTAAATGCTGCA
7169 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
*
7192 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
**
7215 AATTGAAGTGTTTAAATGCTATA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
7238 AATTGAAGTACATAAATGTTGCA
1 AATTGAAGT-GTTAAATGCTGCA
* * *
7261 AATTGAAGTGTTTAAGGACTGAA
1 AATTGAAGTGTTAAATG-CTGCA
* ** *
7284 AATTGTAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * ** *
7307 CA-TGGAGATGTTTTATCGCTGTA
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
7330 AA-TGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
7352 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
7375 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
7398 AATTGAAGTGTTAAAGTGTTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* **
7421 AATTGAAGTGTTTGAATGCTATA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
7444 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
7467 AATTGATGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
7490 CATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
7513 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
7536 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
** * **
7558 AATTGGGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
7581 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
7604 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
7627 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
7650 AATTGAAGTGTTTGAATGCTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
7673 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
7696 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
7719 AATTGAAGTGTTTAAGGACTGAA
1 AATTGAAGTGTTAAATG-CTGCA
** *
7742 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * ** *
7765 CA-TGGAGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
7787 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
7810 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
7833 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
7856 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* **
7879 AATTGAAGTGTTTGAATGCTATA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
7902 AATTGAAGTGTTTAAATGCTG-T
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
7924 AATTGATGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
7947 AATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
7970 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * * *
7993 CATTG-AGATGTTTTATTGCTG-T
1 AATTGAAG-TG-TTAAATGCTGCA
* * **
8015 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
8038 AATTG-AGATGTAAAATGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAATGCTGCA
* * *
8060 AATTGAAGTTCTTAACTGCTGTA
1 AATTGAAG-TGTTAAATGCTGCA
*
8083 AATTTAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
8106 AATTGAAGTGTTTGAATGCTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
8129 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
8152 AATTGATGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
8175 AATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
8198 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
8221 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
8243 AATTGAGGTGTTAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGTTAAATGCTGCA
* *
8265 AGTTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
8288 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
8311 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
8334 AATTGAAGTGTTTGAATGCTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
8357 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
8380 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
8403 AATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
8426 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
8449 CA-TG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
8470 AATTGAGGTG-TATAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGTTA-AATGCTGCA
*
8492 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
8515 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
8538 AATTGAAGTGTTAAAGTG-TGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
*
8560 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
8583 AATTAAAGTGTTTAAATGTTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
8606 AATTGTAGTGCTTAAAGGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
8629 AATTGAAGTGTTTAAGTACTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
8652 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
8675 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
8697 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
8720 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
8743 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
8766 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
*
8789 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
8812 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
8835 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
8858 AATTGAAGTGTTTAAGTACTG-A
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
8880 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
8903 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
8925 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
8948 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
8971 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
8994 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
9017 AATTGAAGTGTTTGAATGCTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9040 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9063 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
9086 AATTGAAGTGTTTAACTACTG-A
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
9108 AATTAAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * ** *
9131 CA-TGGAGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
9153 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
9176 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
9199 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
9222 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
*
9245 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9268 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9291 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
9314 AATTGAAGTGTTTAAGTACTG-A
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
9336 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
9359 CA-TG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
9380 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
9403 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
9426 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9449 AATTGAAGT-TTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAATGCTGCA
*
9470 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9493 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
9516 AATTGAAGTGTTTAACTACTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** * *
9539 AATTAAAGTGTTTAGTTGTTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
9562 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
9584 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
9607 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
* *
9630 AATTGAAATGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
9653 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
9676 AATTGAAGTGTTTGAATGCTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9699 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9722 AATTG-AGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* * *
9744 AATTGAAGTGTTTAAGTACTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
9767 AATTGAAGTGTCTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
* ** *
9790 CATTG-AGATGTTTTAT-CTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAATGCTGCA
* * **
9810 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
9833 AATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
9855 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
9878 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
* *
9901 AATTGAAGTGTTTGAATGCTACA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
9924 AACTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
9947 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
9970 AATTGAAGTGTTTAAGTACTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
** *
9993 AATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* ** *
10016 CATTG-AGATGTTTTATCGCTG-T
1 AATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCA
* * **
10038 AATTGAGGTGTATAAATGTTGTT
1 AATTGAAGTGT-TAAATGCTGCA
*
10061 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCA
1 AATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCA
*
10084 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
10107 AATTGAAGTGTTAAAGTGCT-CA
1 AATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCA
*
10129 AATTGAAGTGTTTGAATGCTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
10152 AATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
*
10175 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCA
1 AATTGAAGTG-TTAAATGCTGCA
* *
10198 AATTGAAGTGTTTAA-GACTGAA
1 AATTGAAGTGTTAAATG-CTGCA
10220 AATTGAAGTGTT
1 AATTGAAGTGTT
10232 TAGTTGCTGG
Statistics
Matches: 2449, Mismatches: 499, Indels: 323
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
20 7 0.00
21 53 0.02
22 488 0.20
23 1774 0.72
24 127 0.05
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.36
Consensus pattern (22 bp):
AATTGAAGTGTTAAATGCTGCA
Found at i:7162 original size:46 final size:46
Alignment explanation
Indices: 7112--24700 Score: 7691
Period size: 46 Copynumber: 384.5 Consensus size: 46
7102 TTGAGGTGTA
*
7112 TAAATGTTGTTAATTG-AGATGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGCT-CT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* *
7158 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * ** * *
7204 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTATAAATTGAAGTACA
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
7250 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAG-GACTGAAAATTGTAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG-CTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * * ** * *
7296 TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTA-TCGCTGTAAA-TGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
7340 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
7387 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
7433 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
7479 TAAATGTTGCACATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * **
7525 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGGGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
7569 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
7616 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** *
7662 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
7708 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAG-GACTGAAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG-CTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * * ** * *
7754 TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
7798 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
7845 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
7891 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTG-TAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
7936 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * * *
7982 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATTGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
8026 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTTCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
8072 TAACTGCTGTAAATTTAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** * *
8118 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
8164 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
8210 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
8254 TAAATGTTGTTAGTTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8300 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** *
8346 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
8392 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
8438 TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG--
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8480 TATAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 TA-AATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8527 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG-TGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * * *
8572 TGAATGCTGCAAATTAAAGTGTTTAAA-TGTTGTAAATTGTAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
8618 TAAAGGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
8664 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8708 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8755 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
8801 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
8847 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
8892 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8936 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
8983 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** *
9029 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
9075 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTG-AAATTAAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * * ** * *
9120 TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
9164 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
9211 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
9257 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
9303 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
9348 TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
9391 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
9438 TAAATGCTGTAAATTGAAGT-TTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
9482 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * * *
9528 TAACTACTGTAAATTAAAGTGTT-TAGTTGTTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
9573 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * * *
9618 AAAAGTGCTGCAAATTGAAATGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
9664 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTACAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
9711 TAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** ** * *
9756 TAAGTACTACAAATTGAAGTGTCT--AGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
9801 TTTAT-CTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG--
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
9843 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
9889 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTACAAACTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
9936 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
9982 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
10027 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
10072 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
10118 TAAA-G-TGCTCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTG-T-AAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
10164 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
10209 TTAA-GACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCTGT
1 TAAATG-TTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGA-A-G-----T-GC--T
* *
10264 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
10311 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
10357 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
10403 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * * *
10449 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCACTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
10493 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
*
10540 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
10585 TAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTACAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * **
10631 TAAATGCT-TAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTATT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** ** * *
10676 TAAGTACTACAAATTGAAGTGTCT--AGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * * **
10721 TTTATCGCTAT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
10766 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
10812 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
10857 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
10903 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
10948 TTTATCGCTAT-AATT-AAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAA-GTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
10993 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
11039 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
11086 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
11132 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCTGT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGA-A-G-----T-GC--T
* *
11186 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
11233 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
11279 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
11325 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
11371 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
11415 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
11462 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
11508 TGAATG--CTAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
11551 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
11597 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-T-CTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
11639 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
11686 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** * *
11732 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
11778 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
11824 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
11868 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
11913 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGT-GTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
11960 TAAATGCTATAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
12005 TTAA-GACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATG-TTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
12050 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
12095 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
12141 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTTCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
12188 TAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
12234 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * ***
12279 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TG-TTTTAATTG-AGATG--
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
12322 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
12368 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
12413 TAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** ** * * * *
12458 TAAGTACTGCGAATTGAAGTGTT-TAGTTGTTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * ** *
12503 TTTATCGCTT-T-AATTGAGGTGTTTAAA-TGTTGTTAGTTG-AGATG-T
1 TAAAT-G-TTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
12548 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
12595 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * * *
12641 TAAGTATCGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
12686 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
12731 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
12777 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
12824 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * * * * *
12869 TTAAGGACTGAAAATTGTAGTGTT-TAGTTGCTGGACATGGAGATGTTTTATCGCTGT
1 TAAATG-TTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGA-A-G-----T-GC--T
* *
12926 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
12973 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
13019 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
13065 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAAATGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
13111 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
13155 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
13202 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
13248 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
13294 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
13340 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
*
13384 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
13430 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
13476 TGAATG--CTAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
13519 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * * *
13565 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCACTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
13609 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
13655 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
13702 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
13748 TAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
13793 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-T-TTGTTAATTG-AGATG--
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
13836 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
13882 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
13929 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
13974 TTAA-GACT-AAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TG-AGATG-T
1 TAAATG-TTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
14017 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
14062 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** * *
14108 TAAA-GTTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTATAAATTGAGGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
14153 TAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
14199 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
14244 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
14289 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
14335 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
14382 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
14427 TTAA-GACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TG-AGATG-T
1 TAAATG-TTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
14471 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
14516 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
14562 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
14609 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
14655 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
14699 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
14744 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
14790 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTACAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
14837 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
14883 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
14927 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
14972 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
15018 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
15065 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * * *
15111 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGGAGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
15156 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
15201 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
15247 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
15294 TAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
15340 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
15385 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
15430 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
15476 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTTGAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGT-GTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
15523 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
15569 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
15614 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
15659 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
15705 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
15752 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
15798 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCTGT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGA-A-G-----T-GC--T
* *
15853 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
15900 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
15946 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
15992 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
16038 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
16082 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
16129 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
16175 TGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
16221 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
16267 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
16311 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
16358 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** * *
16404 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
16450 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
16496 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
*
16540 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-T
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
16585 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT-AA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
16630 TAAATGCTATAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
16676 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTGGAGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
16721 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
16766 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
16812 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
16857 TAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
16903 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * ***
16948 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTTTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * * *
16993 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGT-TCTTAACTGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
17039 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTACAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
17086 TAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
17132 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
17177 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
17222 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
17269 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
17315 TAAGTATTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
17360 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG--
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
17404 TAAAAGTTCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAATG-T-TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
17451 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
17498 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
17543 TTAA-GTACTAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGA-A-G-----T-GCT
* *
17595 GT-AATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
17641 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
17687 TGAATG--CTAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
17730 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
17776 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
17820 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
17867 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
17913 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
17959 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
18004 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
*
18048 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
18094 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
18140 TGAATG--CTAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
18184 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
18230 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
18274 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCT--AAATTGAAGTG-T
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
18318 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
18365 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
18411 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
18455 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
18500 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
18546 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
18593 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
18638 TTAA-GTACTAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
18681 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
18726 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
18772 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
18817 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * * * *
18863 TAGTTGCTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATT-TAGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
18908 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
18953 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
18999 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
19046 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * * *
19092 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGGAGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
19137 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
19182 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
19228 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
19275 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
19321 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
19365 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
19410 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
19456 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTACAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
19503 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
19549 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
19593 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
19638 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
19684 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
19731 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
19777 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
19820 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
19865 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
19911 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
19958 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
20004 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
20049 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
20094 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
20140 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
20187 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
20233 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
20277 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
20322 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
20368 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
20413 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
20459 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
20504 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * * * *
20549 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAATTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
20596 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
20642 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
20687 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
20731 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
20778 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
20824 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
20870 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
20915 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
20959 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
21006 TAAATGCTGTAAATTTAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** ** *
21052 TGAATGCTACAACCTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
21098 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
21143 CTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-T-C-GTTATAATTGAGGTG-T
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTG-CA-AATTGAAGTGCT
* *
21188 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
21235 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTTCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
21281 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
21327 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * * *
21373 TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTTTA-TCGCTGTAAATGTTGTTAATTGAGAT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAA--TTG--AA--GTGCT
* * *
21424 GTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 -T-AAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * ** *
21472 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTATAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
21519 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTTCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
21565 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
21609 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
21654 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
21700 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
21747 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * *
21793 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
21837 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
21882 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
21928 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT-AAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
21974 TAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
22019 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
22064 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG--
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
22108 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
22154 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
22199 TAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
22245 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
22290 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG--
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
22334 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
22381 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
22427 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACATTG-AGATG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGCT
** * * * **
22472 TTTATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 TAAAT-GTTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * * *
22517 AAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-T
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
22563 TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAA-TGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
22610 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** * * * *
22656 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT-TAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCTGT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAG-TGCTGCAAATTGA-A-G-----T-GC--T
* *
22711 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
22758 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
22804 TGAATG--CTAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
22848 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACT-AAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
22893 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
22937 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
22984 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
23030 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
23076 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAA-TACTGTAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
23121 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
23165 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
23212 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
23258 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
23304 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
23350 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
23394 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
23441 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTACAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * * *
23487 TGAATGCTGCAAATTAAAGTGTTTAAA-TGTTGTAAATTGTAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * *
23533 TAAAGGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
23579 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
23623 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
23670 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * ** *
23716 TGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
23762 TAAATGTT-TCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTG--
1 TAAATGTTGT-AAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * ** *
23806 TATA-GTTGCAGGACA-TGGAGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTG-AGTTG-T
1 TAAATGTTGTA--A-ATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAG-TGCT
* * *
23852 ATAATTGTTGTTAATTG-AGCTGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
23899 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
23945 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
23991 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * * ** * *
24037 TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
24081 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
24128 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * *
24174 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTAAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
24220 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
24266 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
24310 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
24357 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
24403 TGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * * * * *
24449 TAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
** * * * ** * *
24495 TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTG-T
1 TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGCT
* *
24539 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
1 -TAAATGTTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * * *
24586 TAAATGCTGTAAATTGAATTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* * *
24632 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
* ** *
24678 TAACTACTGTAAATTAAAGTGTT
1 TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTT
24701 TAGTTGTTGG
Statistics
Matches: 13931, Mismatches: 2647, Indels: 1931
0.75 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
42 12 0.00
43 170 0.01
44 989 0.07
45 3420 0.25
46 8501 0.61
47 575 0.04
48 12 0.00
49 14 0.00
50 6 0.00
51 8 0.00
52 11 0.00
53 27 0.00
54 14 0.00
55 34 0.00
56 90 0.01
57 42 0.00
58 6 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.37
Consensus pattern (46 bp):
TAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
Found at i:7212 original size:69 final size:68
Alignment explanation
Indices: 7095--24926 Score: 10428
Period size: 69 Copynumber: 259.9 Consensus size: 68
7085 ATGTTTTATC
* * **
7095 GCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGCT-
1 GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAG-TG
*
7156 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
7163 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
7228 AAAT
65 AAAT
* ** * * * * *
7232 GCTATAAATTGAAGTACATAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT-AAGGACTGAAAATTGTAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGT-GTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG-CTGCAAATTGAAGTGGT
**
7296 TAGTT
64 TAAAT
* * * ** * * * * **
7301 GCTGGACA-TGGAGATGTTTTATCGCTGTAAA-TGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
7362 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * * *
7369 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
7433 TGAAT
64 TAAAT
* * * * * * *
7438 GCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCACATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
7503 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * **
7507 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGGGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
7568 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
7575 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
7638 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * * *
7644 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
7709 AAAT
65 AAAT
* * * * * ** * * *
7713 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGGACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATG-CTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
7776 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
7781 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
7843 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* ** *
7850 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
7915 AAAT
65 AAAT
* * * * *
7919 GCTGT-AATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
7983 AGTT
65 AAAT
* * * * * * * * **
7987 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATTGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
8048 TAAAAT
63 TTAAAT
* * * * * *
8054 GCTGCAAATTGAAGTTCTTAACTGCTGTAAATTTAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
8118 TGAAT
64 TAAAT
** * * * * *
8123 GCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
8188 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
8192 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
8253 TTAAAT
63 TTAAAT
* * * * * *
8259 GTTGTTAGTTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
8322 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * * *
8328 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
8393 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
8397 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
8459 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
8464 CGCTGT-AATTGAGGTG-TATAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGTTA-AATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
8525 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * *
8532 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG-TGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTAAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
8596 AAAT
65 AAAT
* * * * * * * *
8600 GTTGTAAATTGTAGTGCTTAAAGGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
8665 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
8669 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
8730 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
8737 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
8801 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
8806 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
8871 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
8875 ACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
8935 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
8942 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
9005 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * * *
9011 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
9076 AAAT
65 AAAT
* * * * * ** * * *
9080 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTG-AAATTAAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
9142 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
9147 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
9209 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
9216 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
9281 AAAT
65 AAAT
* * * *
9285 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
9349 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
9353 GCTGGACA-TG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
9413 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * * *
9420 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAA--GTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
9483 AAAT
65 AAAT
* * * * * *
9487 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
9552 AGTT
65 AAAT
* * * ** * * * * **
9556 GTTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
9617 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * * *
9624 GCTGCAAATTGAAATGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
9688 TGAAT
64 TAAAT
** * * * *
9693 GCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
9757 AAGT
65 AAAT
* ** ** * * * * *
9761 ACTACAAATTGAAGTGTCTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TAT-CTG-TAATTGAGGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
9821 ATAAAT
64 -TAAAT
* * * *
9827 GTTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
9889 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * * * *
9895 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAACTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
9960 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
9964 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
10027 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
10032 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
10094 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
10101 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCT-CAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
10165 AAAT
65 AAAT
* * *
10169 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT-AA-GACTGAAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG-CTGCAAATTGAAGTGGT
**
10232 TAGTT
64 TAAAT
* * ** * * *
10237 GCTGGACA-TG-AGATGTTTTATCGCTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTG--CAAA--TTG--AA--GTG-T-TTAAA-TGCTGCAA
*
10300 ATTGAAGTGCTTAAAT
53 ATTGAAGTGGTTAAAT
* ** *
10316 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
10381 AAAT
65 AAAT
* * * * * *
10385 GCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
10450 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * * **
10454 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCACTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
10515 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* *
10522 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
10585 TAAGT
64 TAAAT
* * * * * *
10590 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCT-TAAATTGATGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
10654 AAAT
65 AAAT
* * * * * * * ** * *
10658 GTTGCAAATTGAAGTATTTAAGTACTACAAATTGAAGTGTCTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGT-GTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
10721 TTTAT
64 TAAAT
* * * ** *
10726 CGCTAT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
10788 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
10795 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
10858 AAAT
65 AAAT
* * * *
10862 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
10927 AGTT
65 AAAT
* * ** * * **
10931 GCTGGACATTG-AGATGTTTTAT-C-GCTATAATT-AAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAATGCTGC-A-AATTGAA-GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-T
*
10991 -GTAAAAGT
61 GGTTAAA-T
* * *
10999 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
11063 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
11068 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
11133 AAGT
65 AAAT
* ** * * * *
11137 ACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTT-TATCGCTGTATAAATGTTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTG--CAAA--TTG--
*
11198 AATTGAGATGTAAAAGT
57 AAGTG-G-T-T-AAA-T
* * *
11215 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
11279 TGAAT
64 TAAAT
* * * * * *
11284 GCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
11349 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
11353 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
11414 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
11421 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
11484 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
11490 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
11552 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
11556 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
11619 TTTAT
64 TAAAT
* * ** * *
11624 -CTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
1 GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGG
11685 TTAAAT
63 TTAAAT
* * *
11691 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
11756 AAAT
65 AAAT
* * * * *
11760 GCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
11825 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
11829 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
11890 -TAAAGT
63 TTAAA-T
* * * *
11896 GTTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
11961 AAAT
65 AAAT
* * * *
11965 GCTATAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT-AA-GACTGAAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG-CTGCAAATTGAAGTGGT
**
12028 TAGTT
64 TAAAT
* * ** * * * * **
12033 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
12094 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
12101 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
12165 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
12170 GCT-TCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGT-AAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
12234 TAAGT
64 TAAAT
* * ** * * * * *
12239 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
12300 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * *
12307 G-TTTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
12368 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
12374 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
12436 AAAT
65 AAAT
* * * * * ** * * *
12440 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCGAATTGAAGTGTTTAGTTGTTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
12503 TTTAT
64 TAAAT
* * * ** *
12508 CGCT-TTAATTGAGGTGTTTAAATGTTGTTAGTTG-AGATG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGT-
1 -GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
12569 GTTAAAGT
62 GTTAAA-T
* * * * *
12577 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
12642 AAGTAT
65 AA--AT
* ** * * * * *
12648 -C-GCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
12707 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
12714 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
12777 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
12783 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
12848 AAAT
65 AAAT
* * * * * * ** * * *
12852 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGGACTGAAAATTGTAGTGTTTAGTTGCTGGACATGGAGATGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATG-CTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGA-A-G---
12917 TATCGCTGTATAAAT
60 --T-G--GT-TAAAT
* * * * *
12932 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
12995 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * ** * *
13001 GTTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
13066 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
13070 GTTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAAATGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
13133 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
13138 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
13200 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
13207 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
13272 AAAT
65 AAAT
* * * * *
13276 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
13341 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
13345 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
13406 -TAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
13412 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
13476 TGAAT
64 TAAAT
* * * *
13481 GC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
13543 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * * *
13547 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCACTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
13608 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
13615 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGG
*
13678 TTGAAT
63 TTAAAT
* * * * *
13684 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
13749 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
13753 ACTGTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
13814 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * *
13821 -TTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
13882 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
13888 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
13953 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
13957 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAA-GACT-AAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATG-CTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
14017 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
14022 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
14084 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * ** * *
14091 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-GTTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAGGTGTTTA
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTTA
14155 AAT
66 AAT
* * * * *
14158 GCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
14223 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
14227 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
14288 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
14295 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
14359 TGAAT
64 TAAAT
* * * *
14364 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGT-GTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
14428 TAA-
65 AAAT
* ** * * * * *
14431 GACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-
1 G-CTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTG
14491 GTATAAAT
62 GT-TAAAT
* * * * *
14499 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
14562 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
14568 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
14633 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
14637 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
14699 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
14704 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
14766 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * *
14773 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
14838 AAAT
65 AAAT
* * * * *
14842 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
14907 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
14911 GCTGGACA-TG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
14971 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
14978 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
15042 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
15047 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
15112 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * * *
15116 ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
15177 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
15184 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
15247 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * * *
15253 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
15318 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
15322 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
15385 TTTAT
64 TAAAT
* * **
15390 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
15452 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * * *
15459 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTTGAATGCTGTAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
15524 AAAT
65 AAAT
* * * *
15528 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
15593 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
15597 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
15658 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
15665 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
15729 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
15734 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
15799 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * *
15803 ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTT-TATCGCTGTATAAATGTTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTG--CAAA--TTG--
*
15865 AATTGAGATGTAAAAGT
57 AAGTG-G-T-T-AAA-T
* * *
15882 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
15946 TGAAT
64 TAAAT
* * * * * *
15951 GCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
16016 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
16020 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
16081 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
16088 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
16151 TAAAGT
64 TAAA-T
* * ** * * *
16157 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
16222 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
16226 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
16289 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
16294 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
16356 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * *
16363 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
16428 AAAT
65 AAAT
* * * * *
16432 GCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
16497 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
16501 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
16562 -TAAAGT
63 TTAAA-T
* *
16568 GCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT-AATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
16631 AAAT
65 AAAT
* * * * *
16635 GCTATAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
16699 AGTT
65 AAAT
* * * ** * * * * **
16703 GCTGGACATTGGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
16765 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
16772 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
16836 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
16841 GC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
16904 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
16908 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
16969 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
16976 GTTTTTAATTG-AGATGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGT-TCTTAACTGCTGTAAATTGAAGT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGT-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGG
17038 TTAAAGT
63 TTAAA-T
* * * * * *
17045 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
17110 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
17114 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
17177 TTTAT
64 TAAAT
* * **
17182 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGT-
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
17243 GTTAAAGT
62 GTTAAA-T
* * * * *
17251 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
17316 AAGT
65 AAAT
** * ** * * * * *
17320 ATTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
17381 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * * *
17388 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTTCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
17451 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
17457 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
17522 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
17526 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAA-G-TACTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGC-AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
17586 TTTAT
64 TAAAT
* * * *
17591 CGCTGTAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATT
1 -GCTGTAA-ATTG---A---AG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATT
17656 GAAGT-GTTAAAGT
56 GAAGTGGTTAAA-T
* * * *
17669 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
17731 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
17735 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
17798 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
17803 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
17865 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
17872 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
17937 AAAT
65 AAAT
* * * *
17941 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
18005 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
18009 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
18070 -TAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
18076 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
18140 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
18145 GC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
18208 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
18212 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
18273 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * *
18280 GTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAG-TGCTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAATGCTGC-AAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGG
*
18341 TTGAAT
63 TTAAAT
* * * * *
18347 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
18412 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
18416 ACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
18476 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
18483 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
18546 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
18552 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
18617 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
18621 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAA-G-TACTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGC-AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
18681 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
18686 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
18748 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
18755 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
18818 AAAT
65 AAAT
* ** *
18822 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
18887 AGTT
65 AAAT
* * * ** * * * * **
18891 GCTGGACATT-TAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
18952 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
18959 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
19023 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
19028 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
19093 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * * *
19097 ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
19158 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
19165 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
19228 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
19234 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
19299 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
19303 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
19365 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
19370 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
19432 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * *
19439 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
19504 AAAT
65 AAAT
* * * *
19508 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
19572 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
19576 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
19637 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
19644 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
19708 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
19713 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
19778 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
19782 ACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
19841 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
19848 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
19911 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
19917 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
19982 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
19986 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
20049 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
20054 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
20116 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
20123 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
20188 AAAT
65 AAAT
* * * *
20192 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
20256 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
20260 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
20321 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
20328 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
20392 TGAAT
64 TAAAT
* * * *
20397 GC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
20460 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
20464 ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
20525 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * * * *
20532 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAATTGTT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
20596 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
20601 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
20666 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
20670 ACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
20730 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
20737 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
20800 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
20806 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
20871 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
20875 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
20937 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
20942 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
21004 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * * ** *
21011 GCTGTAAATTTAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAACCTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
21076 AAAT
65 AAAT
* * *
21080 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGT-GTC
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT-
**
21144 TAGTT
64 TAAAT
* * ** * * * * **
21149 GCTGGACATTG-AGATGTTTTAT-C-GTTATAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAATGCTG-CA-AATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TG
*
21209 GTAAAAGT
62 GTTAAA-T
* * * *
21217 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTTCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
21281 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
21286 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
21351 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * *
21355 ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTT-TATCGCTGTAAATGTTGTTAA
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAA--TTG--AA
*
21417 TTGAGATGTAAAAGT
59 GTG-G-T-T-AAA-T
* * *
21432 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
21496 TGAAT
64 TAAAT
* * * * * *
21501 GCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTTCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
21566 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
21570 ACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
21630 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
21637 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
21700 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
21706 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
21771 AAAT
65 AAAT
* * * * ** * *
21775 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
21837 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
21842 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
21904 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * *
21911 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT-AAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
21975 AAAT
65 AAAT
* * * *
21979 GCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
22043 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
22047 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
22108 -TAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
22114 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
22178 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
22183 GC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
22246 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
22250 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
22311 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * *
22318 GTTGTTAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGG
22380 TTAAAT
63 TTAAAT
* * * *
22386 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
22451 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
22455 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
22516 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
22523 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
22587 TGAAT
64 TAAAT
* * * * *
22592 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
22657 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * *
22661 ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTT-TATCGCTGTATAAATGTTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTG--CAAA--TTG--
*
22723 AATTGAGATGTAAAAGT
57 AAGTG-G-T-T-AAA-T
* * *
22740 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
22804 TGAAT
64 TAAAT
* * * *
22809 GC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
22872 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
22876 ACT-AAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
22936 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
22943 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
23006 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
23012 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
23077 AAAT
65 AAAT
* * * * * ** * *
23081 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAATACTGTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGTT
**
23144 TTAT
65 AAAT
* * ** *
23148 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
23210 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* *
23217 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
23282 AAAT
65 AAAT
* * * * *
23286 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
23351 AGTT
65 AAAT
* * ** * * * * **
23355 GCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
23416 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * * *
23423 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTACAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
23487 TGAAT
64 TAAAT
* * * * * * * * *
23492 GCTGCAAATTAAAGTGTTTAAATGTTGTAAATTGTAGTGCTTAAAGGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
23557 AAGT
65 AAAT
* ** * * * * *
23561 ACTGTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
23622 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
23629 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
23692 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * * *
23698 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
23763 AAAT
65 AAAT
* * * * * * ** * * * *
23767 G-TTTCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTATAGTTGCAGGACA-TGGAGAT-G
1 GCTGT-AAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
**
23829 TTTTAT
63 TTAAAT
* * ** *
23835 CGCTGT-AATTG-AGTTGTATAATTGTTGTTAATTG-AGCTG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGT
1 -GCTGTAAATTGAAG-TGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGT
*
23896 GCTTAAAT
61 GGTTAAAT
* *
23904 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
23969 AAAT
65 AAAT
* * * * *
23973 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
**
24038 AGTT
65 AAAT
* * * ** * * * * **
24042 GCTGGACA-TGGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGAT-G
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGG
*
24103 TAAAAGT
63 TTAAA-T
* * *
24110 GCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGGT
*
24174 TGAAT
64 TAAAT
* * * * * *
24179 GCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTAAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
*
24244 AAGT
65 AAAT
* * ** * * * * *
24248 ACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGT-G
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGG
24309 TATAAAT
63 T-TAAAT
* * * * *
24316 GTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-GT
1 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGT
24379 TAAAGT
64 TAAA-T
* * * *
24385 GCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
24450 AAAT
65 AAAT
* * * * * * ** * *
24454 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
24517 TTTAT
64 TAAAT
* * ** *
24522 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
24584 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * * *
24591 GCTGTAAATTGAATTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
24656 AAAT
65 AAAT
* * * * * * ** * * *
24660 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGTTTAGTTGTTGGACATTG-AGAT-GT
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGGT
**
24723 TTTAT
64 TAAAT
* ** ** * * *
24728 CGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATTTTGTTAATT-CAGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAATG
1 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG
*
24790 CTTAAAT
62 GTTAAAT
* * * *
24797 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGAATTGTTT
1 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTT
24862 AAAT
65 AAAT
* * * * * *
24866 GCT-TAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTATTTAAGTACTACAAATTGAAGTG
1 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG
24927 TCTAGTTGCT
Statistics
Matches: 13772, Mismatches: 2925, Indels: 2134
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
64 2 0.00
65 75 0.01
66 406 0.03
67 1756 0.13
68 3927 0.29
69 6535 0.47
70 655 0.05
71 15 0.00
72 17 0.00
73 10 0.00
74 32 0.00
75 4 0.00
76 47 0.00
77 48 0.00
78 38 0.00
79 108 0.01
80 84 0.01
81 13 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.37
Consensus pattern (68 bp):
GCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGGTTA
AAT
Found at i:10302 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 10288--11153 Score: 558
Period size: 23 Copynumber: 38.0 Consensus size: 23
10278 TTGAGATGTA
10288 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10312 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
10334 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* **
10358 GAA-TGCTATAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
10381 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10404 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
10426 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
10449 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * * *
10472 TTA-TCACTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
10495 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
10517 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10541 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
10563 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
10586 -AAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
10609 GAA-TGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
10632 AAA-TGCT-TAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
10654 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTATT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
10676 TAAGTACTACAAATTGAAGTGTCT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT-T
* *
10700 --AGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** *
10722 TTA-T-C-GCTATAATTGAGGTGTAT
1 AAAGTGCTGC-A-AATTGAAGTGT-T
* ** *
10745 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
10767 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10791 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
10813 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10837 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10858 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
10881 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
10903 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
10926 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
**
10949 TTA-T-C-GCTATAATT-AAGGTGTAT
1 AAAGTGCTGC-A-AATTGAA-GTGT-T
* ** *
10972 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
10994 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11018 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
11040 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11064 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11087 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11110 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
11132 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
11154 TAGTTGCTGG
Statistics
Matches: 680, Mismatches: 105, Indels: 116
0.75 0.12 0.13
Matches are distributed among these distances:
20 2 0.00
21 24 0.04
22 138 0.20
23 473 0.70
24 41 0.06
25 2 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.07, G:0.23, T:0.36
Consensus pattern (23 bp):
AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
Found at i:11224 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 11210--12892 Score: 987
Period size: 23 Copynumber: 74.0 Consensus size: 23
11200 TTGAGATGTA
11210 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11234 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
11256 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* **
11280 GAA-TGCTATAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
11303 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11326 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
11348 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
11371 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
11394 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
11417 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
11439 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11463 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
11485 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11509 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11530 AAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11552 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
11574 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
11597 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
11620 TTA-T-CTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
11641 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
11663 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11687 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
11709 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
11733 GAA-TGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
11756 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11779 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
11801 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
11824 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
11847 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
11870 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
*
11891 AAAGTGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
*
11914 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGT-GTT
11938 AAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
**
11961 AAA-TGCTATAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
11984 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
12006 TAAG-ACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
12028 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
12051 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
12074 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
12096 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12120 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
12142 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
12166 GAA-TGCTTCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
12189 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12212 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
12234 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
12257 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
12280 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
***
12303 AAA-TG-TTTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
12323 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12347 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
12369 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12393 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12414 AAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12436 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
12458 TAAGTACTGCGAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
12481 -TAGTTGTTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** ** *
12504 TTA-TCGCT-TTAATTGAGGTGTTT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTG-TT
* ** *
12527 AAA-TGTTGTTAGTTG-AGATGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
12549 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
12572 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12596 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12619 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
12641 TAAGT-ATCGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCT-GCAAATTGAAGTGTT
* * *
12664 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
12687 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
12710 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
12732 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12756 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
12778 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12802 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12825 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12848 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
12870 TAAG-GACTGAAAATTGTAGTGTT
1 AAAGTG-CTGCAAATTGAAGTGTT
12893 TAGTTGCTGG
Statistics
Matches: 1340, Mismatches: 208, Indels: 223
0.76 0.12 0.13
Matches are distributed among these distances:
20 11 0.01
21 57 0.04
22 259 0.19
23 931 0.69
24 82 0.06
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.37
Consensus pattern (23 bp):
AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
Found at i:12964 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 12950--24927 Score: 3892
Period size: 23 Copynumber: 524.0 Consensus size: 23
12940 TTGAGATGTA
12950 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
12974 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
*
12996 AAAGTGTTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* **
13020 GAA-TGCTATAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13043 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
13066 AAA-TGTTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13088 TAAGTACTGCAAAATGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13111 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
13134 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
13157 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
13179 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13203 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
13225 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13249 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13272 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13295 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13317 TAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13340 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
13363 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
13386 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
13407 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13431 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
13453 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13477 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13498 AAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13520 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
13542 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13565 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * * *
13588 TTA-TCACTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
13611 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
*
13633 AAAGTGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
13656 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13680 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13703 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13726 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13748 TAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13771 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
13794 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
13817 AAA-T-TTGTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
13837 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13861 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
13883 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13907 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13930 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
13953 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13975 TAAG-ACT-AAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
13996 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
14018 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
14041 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
14063 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14087 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
14109 AAAGT--TGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* ** *
14131 GAA-TGCTATAAATTGAGGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
14154 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14177 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
14199 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
14222 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
14245 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
14268 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
14290 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14314 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
14336 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14360 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14383 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14406 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
14428 TAAG-ACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
14450 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
14472 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
14495 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
14517 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14541 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
14563 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14587 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14610 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14633 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
14655 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
14677 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
14700 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
14723 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
14745 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14769 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
14791 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
14815 GAA-TGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14838 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14861 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
14883 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
14906 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
14928 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
14951 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
14973 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
14997 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
15019 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15043 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15066 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15089 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
15111 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
15134 -TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
15157 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
15180 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
15202 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15226 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
15248 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15272 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
15295 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15318 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
15340 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
15363 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
15386 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
15409 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
15431 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15455 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
*
15477 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGT-GTT
* *
15501 GAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15524 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15547 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
15569 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
15592 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
15615 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
15638 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
15660 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15684 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
15706 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15730 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15753 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
15776 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
15798 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
15821 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * * *
15843 TTA-TCGCTGTATAAATG--TTGTT
1 AAAGT-GCTGCA-AATTGAAGTGTT
* * * * *
15865 AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AA-AGTGCTG-CAAA-T--TG-AAGTGTT
* * *
15892 GAAGTGCT-TAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * *
15915 GAAGTG-T-TAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA-T--TG-AAGTGTT
* * **
15938 GAAGTGTTTG--AA-TGCTATA-AATT
1 AAAGTG-CTGCAAATTG--A-AGTGTT
* ** *
15961 GAAGTG-TTTAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * * *
15984 GATGTGCT-TAAATGTTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA--TTG-AAGTGTT
* ** * *
16007 GAAGTG-TTTAAGTACTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAA--ATTG-AAGTGTT
* ** * ** **
16030 GAAGTG-T-TTAGTTGCTG-GAC
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
** * * *** * ** *
16050 ATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
1 AAAGTGCTG-CAAATTGAAGT-GTT
* * ** *
16075 GAGGTG-TATAAA-TG--TTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
16094 AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AA-AGTGCTG-CAAA-T--TG-AAGTGTT
* * *
16121 GAAGTGCT-TAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * *
16144 GAAGTG-T-TAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA-T--TG-AAGTGTT
* * **
16167 GAAGTGTTTG--AA-TGCTATA-AATT
1 AAAGTG-CTGCAAATTG--A-AGTGTT
* ** *
16190 GAAGTG-TTTAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * * *
16213 GATGTGCT-TAAATGTTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA--TTG-AAGTGTT
* ** * *
16236 GAAGTG-TTTAAGTACTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAA--ATTG-AAGTGTT
* ** * ** **
16259 GAAGTG-T-TTAGTTGCTG-GAC
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
** * * *** * ** *
16279 ATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
1 AAAGTGCTG-CAAATTGAAGT-GTT
* * ** *
16304 GAGGTG-TATAAA-TG--TTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
16323 AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AA-AGTGCTG-CAAA-T--TG-AAGTGTT
* * *
16350 GAAGTGCT-TAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * *
16373 GAAGTG-T-TAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA-T--TG-AAGTGTT
* * **
16396 GAAGTGTTTG--AA-TGCTACA-AATT
1 AAAGTG-CTGCAAATTG--A-AGTGTT
* ** *
16419 GAAGTG-TTTAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * * *
16442 GATGTGCT-TAAATGTTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA--TTG-AAGTGTT
* ** * *
16465 GAAGTG-TTTAAGTACTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAA--ATTG-AAGTGTT
* ** * ** **
16488 GAAGTG-T-TTAGTTGCTG-GAC
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
** * * *** * ** *
16508 ATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
1 AAAGTGCTG-CAAATTGAAGT-GTT
* * ** *
16533 GAGGTG-TATAAATGTTGTTAATTGAGATGT
1 AAAGTGCTGCAAA--TTG--AA--GTG-T-T
16563 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
16586 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
16609 -AA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
**
16631 AAA-TGCTATAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
16654 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
16676 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
16698 -TAGTTGCTGGACATTGGAGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
16722 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
16745 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
16767 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
16791 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
16813 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
16837 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
16858 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
16881 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
16903 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
16926 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
16949 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ***
16972 AAA-TGTTTTTAATTG-AGATGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
16994 AAAGTGCTGCAAATTGAAGT-TCT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT-T
* * *
17017 TAACTGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
17040 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
17064 GAA-TGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
17087 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17110 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
17132 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
17155 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
17178 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
17201 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
17223 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
17246 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17270 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17293 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* **
17315 TAAGTATTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
17338 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
17361 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
17384 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
*
17406 AAAGTTCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17430 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
17452 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17476 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17499 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17522 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
17544 TAAGTACT--AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
17565 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
17587 TTA-TCGCTG-TAA-TG--TTGTT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
17606 AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AA-AGTGCTG-CAAA-T--TG-AAGTGTT
* * *
17633 GAAGTGCT-TAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * * *
17656 GAAGTG-T-TAAAGTGCTGCAAAT-TG
1 AAAGTGCTGCAAA-T--TG-AAGTGTT
* *
17680 AAGTGTTTGAATGCTAAATTGAAGTGTTT
1 AA-AG--TG-CTGC-AAATTGAAGTG-TT
*
17709 AAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17731 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
17753 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
17776 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
17799 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
17822 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
17844 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17868 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
17890 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17914 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17937 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
17960 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
17982 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
18004 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
18027 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
18050 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
18071 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18095 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
18117 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18141 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
18162 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18185 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
18207 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
18230 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
18253 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
18276 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
18298 AAAGTGCT--AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
18319 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18343 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18366 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18389 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
18411 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
18433 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
18456 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
18479 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
18501 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18525 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
18547 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18571 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18594 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18617 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
18639 TAAGTACT--AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
18660 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
18682 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
18705 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
18727 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18751 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
18773 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18797 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18818 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18841 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
*
18863 -TAGTTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
18886 -TAGTTGCTGGACATT-TAGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
18909 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
18932 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
18954 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
18978 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
19000 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19024 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19047 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19070 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
19092 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
19115 -TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
19138 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
19161 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
19183 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19207 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
19229 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19253 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19276 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19299 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
19321 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
19343 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
19366 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
19389 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
19411 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19435 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
19457 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
19481 GAA-TGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19504 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19527 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
19549 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
19571 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
19594 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
19617 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
19639 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19663 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
19685 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19709 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19732 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19755 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
19777 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
19799 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
19821 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
19844 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
19866 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19890 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
19912 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19936 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19959 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
19982 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
20004 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
20027 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
20050 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
20073 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
20095 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20119 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
20141 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20165 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20188 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20211 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
20233 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
20255 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
20278 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
20301 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
20323 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20347 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
20369 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20393 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20414 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20437 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
20459 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
20482 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
20505 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
20528 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
20550 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
20574 AAA-TGCTGTAAATTGAATTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20597 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20620 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20643 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
20665 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
20687 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
20710 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
20733 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
20755 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20779 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
20801 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20825 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20848 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
20871 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
20893 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
20915 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
20938 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
20961 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
20983 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
21007 AAA-TGCTGTAAATTTAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
21029 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* * **
21053 GAA-TGCTACAACCTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21076 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21099 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
21121 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTCT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT-T
* *
21145 --AGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
21167 TTA-T-C-GTTATAATTGAGGTGTAT
1 AAAGTGCTG-CA-AATTGAAGTGT-T
* ** *
21190 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
21212 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21236 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
*
21258 AAAGTGCTTCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21282 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21305 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21328 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
21350 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
21373 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
21395 TTA-TCGCTGTAAA-TG--TTGTT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
21415 AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AA-AGTGCTG-CAAA-T--TG-AAGTGTT
* * *
21442 GAAGTGCT-TAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * *
21465 GAAGTG-T-TAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA-T--TG-AAGTGTT
* * **
21488 GAAGTGTTTG--AA-TGCTATA-AATT
1 AAAGTG-CTGCAAATTG--A-AGTGTT
* ** *
21511 GAAGTG-TTTAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * * *
21534 GAAGTGCT-TAAATGTTTCAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAA---TTGAAGTGTT
* ** * *
21557 GAAGTG-TTTAAGTACTGAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAA--ATTGAAGTGTT
* ** ** *
21579 GAAGTG-TTTAGTTGCTGGACA-T-TG
1 AAAGTGCTGCAAAT--T-GA-AGTGTT
* ** * *
21603 AGATGTTTTATCGCTGTAATTGAGGTGTAT
1 A-AAG--TGCT-GC--AAATTGAAGTGT-T
* ** *
21633 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
21655 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21679 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
21701 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21725 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21748 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21771 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
21793 TAAGTACTG-AAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
21815 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
21838 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
21861 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
21883 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21907 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
21929 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
21953 GAA-TGCT-AAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21975 AAA-TGCTGTAAATTG-AGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
21997 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
22019 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22042 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
22065 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
22088 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
22109 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22133 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
22155 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22179 GAA-TGCT--AAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
22200 AAA-TGCTGTAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22223 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
22245 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22268 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
22291 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* **
22314 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
22335 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
22358 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22382 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22405 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
22427 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22450 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
22473 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
22496 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
22518 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22542 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
22564 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22588 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22611 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22634 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22656 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22679 -TAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * * *
22701 TTA-TCGCTGTATAAATG--TTGTT
1 AAAGT-GCTGCA-AATTGAAGTGTT
* * * * *
22723 AATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA--ATT
1 AA-AGTGCTG-CAAA-T--TG-AAGTGTT
* * *
22750 GAAGTGCT-TAAATGCTGTAA--ATT
1 AAAGTGCTGCAAAT--TG-AAGTGTT
* * * *
22773 GAAGTG-T-TAAAGTGCTGCAAAT-TG
1 AAAGTGCTGCAAA-T--TG-AAGTGTT
* *
22797 AAGTGTTTGAATGCTAAATTGAAGTGTTT
1 AA-AG--TG-CTGC-AAATTGAAGTG-TT
*
22826 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22849 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22871 TAAGTACT-AAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
22893 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
22916 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
22939 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
22961 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
22985 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
23007 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23031 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23054 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23077 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
23099 TAA-TACTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
23121 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
23144 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
23167 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
23189 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23213 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
23235 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23259 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23282 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23305 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
23327 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
23350 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
23373 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
23396 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
23418 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23442 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
*
23464 AAAGTGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
23488 GAA-TGCTGCAAATTAAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* * *
23511 AAA-TGTTGTAAATTGTAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23534 AAAG-GTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
23556 TAAGTACTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
23579 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
23602 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
23625 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
23647 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23671 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
23693 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
23717 GAA-TGCTACAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23740 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
23763 AAA-TGTTTCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
23785 TAACTACTGTAAATTAAAGTG-T
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
23807 ATAGTTGCAGGACA-TGGAGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** *
23831 TTA-TCGCTG-TAATTG-AGT-TGT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* * ** *
23852 ATAATTGTTGTTAATTG-AGCTGTA
1 A-AAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
23876 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23900 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
23922 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23946 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23969 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
23992 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
24014 TAAGTACTGAAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
24037 -TAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
24060 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
24083 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
24105 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24129 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
24151 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24175 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
24198 AAA-TGCTGTAAATTAAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24221 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* *
24243 TAAGTACTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
24266 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
24289 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
24312 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
24334 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24358 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
24380 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24404 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24427 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24450 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
24472 TAACTACTGTAAATTAAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
24495 -TAGTTGCTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
24518 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
* ** *
24541 AAA-TGTTGTTAATTG-AGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
24563 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
24587 AAA-TGCTGTAAATTGAATTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24610 GAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24633 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24656 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * * *
24678 TAACTACTGTAAATTAAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * * *
24701 -TAGTTGTTGGACATTG-AGATGTT
1 AAAG-TGCTGCAAATTGAAG-TGTT
** * *
24724 TTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTAT
1 AAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT-T
** ** * *
24747 AAA-TTTTGTTAATT-CAGATGTA
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGTT
*
24769 AAAGTGCTGCAAATTGAAATGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
*
24793 AAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
24815 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* * *
24839 GAA-TGCTACAAATTGAATTGTTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
24862 AAA-TGCT-TAAATTGATGTGCTT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTG-TT
* *
24884 AAA-TGTTGCAAATTGAAGTATT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
* * *
24906 TAAGTACTACAAATTGAAGTGT
1 AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
24928 CTAGTTGCTG
Statistics
Matches: 9444, Mismatches: 1601, Indels: 1819
0.73 0.12 0.14
Matches are distributed among these distances:
19 10 0.00
20 45 0.00
21 315 0.03
22 1746 0.18
23 6600 0.70
24 571 0.06
25 42 0.00
26 41 0.00
27 31 0.00
28 8 0.00
29 16 0.00
30 8 0.00
31 11 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.37
Consensus pattern (23 bp):
AAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTT
Found at i:23509 original size:229 final size:223
Alignment explanation
Indices: 7133--24927 Score: 8154
Period size: 229 Copynumber: 78.0 Consensus size: 223
7123 AATTGAGATG
*
7133 TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGCT-CTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTG
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTG
* * ** * * *
7197 AAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTATAAATTGAA-GTACATAAATGTTGCA
63 AAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATGT---TTAATGCTG-T
* * * * ** * * * **
7261 AATTGAAGTGTTT-AAGGACTGAAAATTGTAG-TGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTAT
123 AATTGAGGTGTTTAAATG-CTGTAAATTG-AGATG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT
* * **
7323 CGCTGTAAA-TGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
184 -GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* * *
7362 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGTTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* ** * * * *
7427 AGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-ATGTGCTTAAATGTTGCAC
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATGT--TT-AATGCTGTA-
* * * * * ** * * **
7491 ATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCG
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-G
** * **
7554 CTGT-AATTGGGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
185 CTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
7591 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
7656 AGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * ** * * * **
7721 TTGAAGTGTTT-AAGGACTGAAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTATCG
125 TTGAGGTGTTTAAATG-CTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-G
* * **
7783 CTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
185 CTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
7820 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* ** * * * *
7885 AGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTG-TAATTG-ATGTGCTTAAATGTTGCAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATGT--TT-AATGCTG-TA
* * * * * ** * * * *
7948 ATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATTG
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TG-TTAAATG
* * **
8011 CTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
185 CTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* * *
8048 TAAAATGCTGCAAATTGAAGT-TCTTAACTGCTGTAAATTTAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGT-TTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * *
8112 AGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-ATGTGCTTAAATGTTGCAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATGT--TT-AATGCTG-TA
* * * * * ** * * **
8176 ATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCG
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-G
* * ** *
8239 CTGT-AATTGAGGTGTTAAA-TGTTGTTAGTTG-AGATG-
185 CTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
8275 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
8340 AGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * * ** * * **
8405 TTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
8467 TGT-AATTGAGGTG-TATAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGTTA-AAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
8502 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG-TGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * * * * * *
8566 AGTGTTTGAATGCTGCAAATTAAAGTGTTTAAATGTTGTAAATTGTAGTGCTTAAAGGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTG-AATG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * ** * * **
8631 TTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
8694 TGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
8730 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * *
8795 AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * ** * * **
8860 TTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
8922 TGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
8958 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
9023 AGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * * ** * * * **
9088 TTGAAGTGTTTAACTACTG-AAATT-AAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
9150 TGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
9186 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * *
9251 AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * ** * * **
9316 TTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
9377 TGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* * *
9413 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGT-TTGAATGCTGCAAATTGAA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * *
9477 GTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAAT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGT-AAT
* * ** * * * *** * * *
9542 TAAAGTGTTTAGTTGTTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
126 TGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * * *
9606 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAATGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * *
9641 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * **
9705 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTACAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCT-GTAA
* * ** * * *** * * *
9769 TTGAAGTGTCTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTAT-CTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* *
9832 TAATTG-AGATG-TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * *
9866 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAACTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
9930 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * *
9995 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
10059 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
10095 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCT-CAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * *
10158 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAA-GACTGAAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAATG-CTG-TAA
* ** * * *** * * *
10222 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTAT-C-GC----T---GT-ATAAATGTTGTT
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAATGCTGTA
* *
10276 AATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
190 AATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * **
10310 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
10374 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * * *
10439 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCACTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
10503 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
10539 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAGTGCTGCAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * *
10603 GTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATGCT-TAAATTG-ATGTGCTTAAATGTTGCAAA
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATGT--TT-AATGCTG-TAA
* * * * ** * ** * * **
10666 TTGAAGTATTTAAGTACTACAAATTGA-AGTGTCTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TGT-AAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * * **
10729 TAT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
10765 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * *
10830 AGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * * ** * * **
10893 TTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
10956 TAT-AATT-AAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAA-GTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
10992 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * *
11057 AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * ** * *
11122 TTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATGAGATGTTTTATCGCTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCT-G-CA--A-A---TTGA-AG-TG
* * * *
11185 TATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
178 T-TAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * **
11232 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTATAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
11296 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * *
11361 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
11425 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
11461 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
11523 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * *
11587 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTAT-CTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * *
11650 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * *
11685 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
11749 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * *
11814 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* *
11878 TTAATTG-AGATG-TAAAGTGTTGCAAATTGAAGTG-
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * **
11912 TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTATAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
11977 AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAG-ACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-A
* * * * ** *
12041 TTGAGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGC
125 TTGAGGTGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAGATGTA-AAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAA-TGC
* *
12103 TGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* *
12140 TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT-TCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGT-AAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTG
* * * * * *
12204 ATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGAC
63 AAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-
* * * ***
12269 ATTGAGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATG-TTTTAATTG-AGATG-TAAAGTG
124 ATTGAGGTGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAGATGTA-AAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAA-TG
* *
12329 CTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* *
12367 TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC--TAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * * *
12429 AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCGAATTGAAGTGTTTAGTTGTTGGACA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-A
* * * * * * ** *
12494 TTGAGATGTTT-TATCGCT-TTAATTGAGGTGTTTAAATGTTGTTAGTTG-AGATGTTAAAGTGC
125 TTGAGGTGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAGATG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAA-TGC
*
12556 TGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
186 TGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * *
12594 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTAT-C-GCAAATTG
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAA--ATGCTGCAAATTG
** * * * * * *
12657 AAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
63 AAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TG-TTTAGT-GCTGCAAATTGA-ATGT-TTAATGCTG-
* * * * *
12719 TAATTGAGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAG
122 TAATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAA-
* *
12782 TGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGT
183 TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * * * * *
12823 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGGACTGAAAATTGTA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAATG-CTGCAAATTGAA
** * * * * *
12888 GTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTA-TCGCTG--TA-TAAATG--T--TG-T-TAATT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TG-TTTAGT-GCTGCAAATTGAATGTTTAATGCTGTAATT
* * * * * *
12942 GAGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGTTG
127 GAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTG
* * **
13005 CAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTATAAATTGAAGTGT
188 TAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * * *
13041 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGTAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAAATGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
** * * * * * *
13106 GTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTA
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TG-TTTAGT-GCTGCAAATTGA-ATGT-TTAATGCTG-TA
* * * * *
13168 ATTGAGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAA-TG
* *
13231 CTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * * * *
13270 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
** * * * * * *
13335 GTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTA
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TG-TTTAGT-GCTGCAAATTGA-ATGT-TTAATGCTG-TA
* * * *
13397 ATTGAGATG--TAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAA-TG
* *
13459 CTGCAAATTGAAGTGTTTGAA-TGCT--AAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * * *
13496 TTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
** * * * * * * *
13560 GTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCACTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTA
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TG-TTTAGT-GCTGCAAATTGA-ATGT-TTAATGCTG-TA
* * * *
13622 ATTGAGATG-TAAAAGTGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* * *
13685 CTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * ** * *
13724 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** * *
13788 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAAT-TTGTTAATTGAGATG-TAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
13849 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * *
13913 TGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * *
13951 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT-AA-GACT-AAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG-CTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * * ** ** *
14011 AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCA
64 AG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-T
* * * * *
14074 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAA-GTTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
123 AATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * * * *
14137 TATAAATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * *
14175 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** ** *
14239 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
14302 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * *
14366 TGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * *
14404 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTT-AA-GACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG-CTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * * ** ** *
14465 AGATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCA
64 AG-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-T
* * * *
14528 AATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATG
123 AATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* * *
14592 CTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * ** * *
14631 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** ** *
14694 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
14757 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
** * *
14821 TACAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * *
14859 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** ** *
14922 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
14985 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * *
15049 TGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * * *
15087 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** ** *
15151 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
15214 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * * *
15278 TGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGATGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * *
15316 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** * *
15380 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTTAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * * *
15443 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTCTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGT-GTTAAATGC
* *
15507 TGTAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * *
15545 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** ** *
15609 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
15672 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * *
15736 TGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * **
15774 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATGAGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCT-G-CA--A-A
* * * * ** ** *
15839 TGTTTTATCGCTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAA
60 ---TTGA-AG-TGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTA
* * ** **
15903 ATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGT
116 ATGCTGT-AATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGT
* *
15966 GTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
177 G-TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * * ** *
16014 TTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
16077 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * ** **
16141 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* *
16204 CTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * * ** *
16243 TTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
16306 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * ** *
16370 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* *
16433 CTGTAAATTGATGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * * ** *
16472 TTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** * *
16535 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* * * ** *
16599 TTGAAGTG-TT-AATGCTGCAAATTGA-AGTGTTTAAATGCTATAAATTGAAGTGCTTAAATGTT
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGCT
* * *
16661 GCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGT
187 GTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
** * * * * * * **
16697 TTAGTTGCTGGACATTGGAGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTG
* * * * *
16760 -AGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGC
63 AAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-
* * * * * *
16823 AAATTGAAGTGTTTGAATGC--TAAATTGA-AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAAT
122 TAATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAAT
* * * *
16885 GTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGT
184 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
** * * * * * ***
16925 TTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTTTTAATTG
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTG
* * *
16987 -AGATG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGT-TCTTAACTGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTG
63 AAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGT-TT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG
* * * ** * * *
17049 CAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGA-AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAA
122 -TAATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAA
* * * *
17113 TGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGT
183 TGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
** * * * * * **
17154 TTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTG
*
17216 -AGATG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGT
63 AAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTT-TAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTT-AATGCTGT
* * * * * * ** **
17279 AAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGA-AGTGTTTAAGTATTGCAAATTGAAGTGTTTAGTT
123 -AATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAAT
* * ** * *
17343 GCTGGACATTG-AGATGTTTTA-TCGCTG-TAATTGAGGTGT
184 GCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * * * *
17382 ATAAATGTTGTTAATTG-AGATG-TAAAAGTTCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTG
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTG
*
17445 AAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTA
63 AAGTGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTT-AATGCTGT-
* * * * ** * **
17509 AATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGA-AGTGTTTAA-G-TACTAAATTGAAGTGTTTAGTTG
123 AATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TGTAAAATGCTGC-AAATTGAAGTG-TTAAATG
* * ** * * *
17571 CTGGACA-TG-AGATGTTTTA-TCGCTGTAATGTTGTTAATTGAGAT
185 CTGTAAATTGAAG-TGTTAAAGT-GCTGCAA-ATTG--AA--GTG-T
* *
17615 GTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTG
1 -TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTG
* * * * * * *
17680 AAGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGTGCTTAAATGTTGCAAA
63 AAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * * ** * * **
17743 TTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
17806 TGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* *
17842 TAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * * *
17907 AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTG-TAA
* * * * ** * * **
17972 TTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGC
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-GC
* * **
18034 TGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
186 TGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
*
18070 -TAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGCAAATTGA
* * * * *
18134 AGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-ATGTGCTTAAATGTTGCAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAATGT--TT-AATGCTG-TA
* * * * * ** * * **
18196 ATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGA-AGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCG
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAAT-G
* * **
18259 CTGT-AATTGAGGTGTATAAA-TGTTGTTAATTG-AGATG-
185 CTGTAAATTGAAGTGT-TAAAGTGCTGCAAATTGAAG-TGT
* * *
18296 -TAAAAG-TGCTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTG
1 TTAAATGCTGC-AAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTG
* * * * * *
18358 AAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAA
63 AAGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGTAA
* ** * * *** * * *
18423 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
18487 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
18523 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
18587 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACT-AAAT
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGTAAT
* ** * * *** * * *
18651 TGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
126 TGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * *
18714 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
18749 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
18811 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTG-TAA
* ** * * * *** * * *
18876 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTTAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
18940 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
18976 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
19040 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * * *** * * *
19105 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATGGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
19169 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
19205 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
19269 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAT
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGTAAT
* ** * * *** * * *
19334 TGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
126 TGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * *
19398 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * *
19433 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
19497 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAT
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGTAAT
* ** * * *** * * *
19562 TGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
126 TGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * *
19626 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
19661 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
19725 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAT
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGTAAT
* ** * * *** * * *
19790 TGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
126 TGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * *
19853 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
19888 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
19952 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * *
20017 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
20081 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
20117 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
20181 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAT
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTGTAAT
* ** * * *** * * *
20246 TGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGT
126 TGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGT
* * *
20310 TAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
189 AAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
20345 TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCT--AAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
20407 AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-TAA
* ** * * *** * * *
20472 TTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TAAATGCTG
* * *
20536 TTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGC
188 TAAATTGAAG-TGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * *
20572 TTAAATGCTGTAAATTGAATTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * *
20637 GTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACAT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-AT
* * * * ** *
20701 TGAGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCT
126 TGAGGTGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAGATGTA-AAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAA-TGCT
* *
20763 GCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-
187 GTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
20799 TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * *
20864 AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-A
* * * * ** *
20928 TTGAGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGC
125 TTGAGGTGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAGATGTA-AAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAA-TGC
* * *
20990 TGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTTAAGTG-
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* ** ** *
21027 TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAACCTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
21092 AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTCTAGTTGCTGGACA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-A
* * * * ** *
21157 TTGAGATGTTT-TAT-C-GTTATAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTG
125 TTGAGGTGTTTAAATGCTG-TA-AATTGAGATGTA-AAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTAAA-TG
* *
21218 CTGCAAATTGAAGTGCTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTG-
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * *
21256 TTAAAGTGCTTCAAATTGAAGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGA
1 TTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGA
* * * * * *
21321 AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTT-AGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTA-ATGCTGTA-A
* * *
21386 -TGAGATGTTTTATCGCTGTAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCT
125 TTGAG--G-----T-G-TTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG-T
21450 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
179 TAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* ** * *
21495 TTGAATGCTATAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTTCAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * *
21560 GTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAG-TGCTGCAAATTGA-ATGTTTAAT-GCTGTAATT
* * *
21624 GAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
127 GAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGTA
21689 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
190 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* *
21723 TTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * *
21788 GTGTTTAAGTACTG-AAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAG-TGCTGCAAATTGA-ATGTTTAAT-GCTGTAATT
* * *
21852 GAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
127 GAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGTA
21917 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
190 AATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
21951 TTGAATGCT-AAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTG-AGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * *
22014 GTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAG-TGCTGCAAATTGA-ATGTTTAAT-GCTGTAATT
* * * *
22079 GAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
127 GAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGTAA
22144 ATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
191 ATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * *
22177 TTGAATGCT--AAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGATGTGCTTAAATGTTGCAAATTGAA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * *
22240 GTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTGAGATGTTTTATCGCTGTAATT
65 GTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAG-TGCTGCAAATTGA-ATGTTTAAT-GCTGTAATT
* * * * *
22305 GAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAA
127 GAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAA-TGCTGTAA
* *
22370 ATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
191 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * *
22403 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-A
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCTGCAAATTGAA
* * * * * * ** ** *
22467 GATGTTT-TATCGCTG-TAATTGAGGTGTATAAATGTTGTTAATTGAGATGTAAAAGTGCTGCAA
65 G-TGTTTAAAT-GCTGCAAATTGAAGTGT-TTAGTGCTGCAAATTGA-ATGTTTAA-TGCTG-TA
* * * *
22530 ATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAAATTGA-AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGTTTGAATGC
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * *
22594 TGCAAATTGAAGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAAGTGC
186 TGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * **
22632 TTAAATGTTGCAAATTGAAGTGTTTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATGAGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAATGCT-G-CA--A-A
* * * * ** ** *
22697 TGTTTTATCGCTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAA
60 ---TTGA-AG-TGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTA
* * **
22761 ATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCT--AAATTGAAGT
116 ATGCTGT-AATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGT
*
22822 GTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
177 G-TTAAATGCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * ** * * ** *
22870 TTAAGTACT-AAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
22932 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * **
22996 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
*
23059 CTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * * ** *
23098 TT-AATACTGTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
23160 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * **
23224 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
*
23287 CTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * ** * * ** *
23326 TTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
23389 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* ** ** *
23453 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTACAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTGCAAATTAAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* * *
23516 TTGTAAATTGTAGTGCTTAAAG-GTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * ** * * ** *
23555 TTAAGTACTGTAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
23618 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * ** *
23682 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTACAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* *
23745 CTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTTCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * * ** * * * * ** *
23784 TTAACTACTGTAAATTAAAGTGTATAGTTGCAGGACA-TGGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTG-
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
23846 AGTTGTATAATTGTTGTTAATTG-AGCTGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTA
64 AG-TGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-
* * **
23910 AATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAAT
123 AATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAAT
*
23973 GCTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
184 GCTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * ** * * * ** *
24013 TTAAGTACTGAAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACA-TGGAGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
24076 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * **
24140 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
* *
24203 CTGTAAATTAAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * ** * * ** *
24242 TTAAGTACTGCAAATTGAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
24305 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
* * **
24369 ATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGA-AGTGTTTGAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATG
124 ATTGAGGTGTTTAAA-TGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATG
*
24432 CTGTAAATTGAAGTGCTTAAA-TGTTGCAAATTGAAGTGT
185 CTGTAAATTGAAGTG-TTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
* * * * ** * * ** *
24471 TTAACTACTGTAAATTAAAGTGTTTAGTTGCTGGACATTG-AGATGTTTTATCGCTG-TAATTGA
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAG-TGTTAAAT-GCTGCAAATTGA
* * * ** ** *
24534 GGTGTATAAATGTTGTTAATTG-AGATGTAAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGCTTAAATGCTGTAA
64 AGTGTTTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGT-TTAGTGCTGCAAATTGAA-TG-TTTAATGCTGT-A
** * * * * *
24598 ATTGAATTGTTTGAATGCTGCAAATTGA-AGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGCTTAAATGT
124 ATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAATGC
* * * * * *
24662 TGCAAATTGAAGTGTTTAACTACTGTAAATTAAAGTGT
186 TGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
** * * * * * ** **
24700 TTAGTTGTTGGACATTG-AGATGTTT-TATCGCTGT-AATTGAGGTGTATAAATTTTGTTAATT-
1 TTAAATGCTGCAAATTGAAG-TGTTTAAAT-GCTGTAAATTGAAGTGT-TAAATGCTGCAAATTG
* * * * * * *
24761 CAGATG-TAAAAGTGCTGCAAATTGAAATGCTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGC
63 AAG-TGTTTAAA-TGCTGCAAATTGAAGTG-TTTAGTGCTGCAAATTGAA-TGTTTAA-TGCTG-
* * * ** * * *
24825 AAATTGAAGTGTTTGAATGCTACAAATTGA-ATTGTTTAAATGCT-TAAATTGATGTGCTTAAAT
122 TAATTGAGGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAGA-TG-TAAAATGCTGCAAATTGAAGTG-TTAAAT
* * * * * *
24888 GTTGCAAATTGAAGTATTTAAGTACTACAAATTGAAGTGT
184 GCTGTAAATTGAAGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
24928 CTAGTTGCTG
Statistics
Matches: 16292, Mismatches: 849, Indels: 851
0.91 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
215 77 0.00
216 83 0.01
217 32 0.00
218 201 0.01
219 6 0.00
220 5 0.00
221 5 0.00
222 1 0.00
223 4 0.00
224 410 0.03
225 609 0.04
226 1625 0.10
227 2493 0.15
228 4266 0.26
229 5511 0.34
230 49 0.00
231 12 0.00
232 41 0.00
233 43 0.00
234 34 0.00
235 55 0.00
236 23 0.00
237 81 0.00
238 197 0.01
239 180 0.01
240 240 0.01
241 9 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.24, T:0.37
Consensus pattern (223 bp):
TTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAAATGCTGTAAATTGAAGTGTTAAATGCTGCAAATTGAAG
TGTTTAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTTAGTGCTGCAAATTGAATGTTTAATGCTGTAATTGAGG
TGTTTAAATGCTGTAAATTGAGATGTAAAATGCTGCAAATTGAAGTGTTAAATGCTGTAAATTGA
AGTGTTAAAGTGCTGCAAATTGAAGTGT
Done.