Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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9524 GCTACTCGTT
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11290 ATATTAAGTC
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11290 ATATTAAGTC
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11355 CGCACACTTAGTGCTGTACAATTTAAACC
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1 CGCACACTTAGTGC
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19137 ATATTAAGTC
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20669 GGCTGTCACA
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*
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* * ** *
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196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
* * *
20939 TTCGATAACTCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCCAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
* * *
21004 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACAAAATCGAGAACATATGAAATCTTAAGGAAAAAGT
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* * *
21069 TAGAAAAAATGCAGACTACAAGGGTCACAGTTTCTAACTTTATACGTGGTCACTCTATGAGCACA
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*
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456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
* *
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*
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*
21326 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTACAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
21584 ATTCGATAACTCATAGCATAA-TCAATGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCCAG
260 ATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAG
* * * *
21648 GCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACAAAATCGAGAACAAATGAAATCTTAAGGAAAAAG
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*
21713 TTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACAGTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCAC
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* *
21778 ATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGTTTGAGGTTGTGGAACTATGGAGTTTACCATTAAA
455 ATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAA
* *
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* *
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*
21971 AGAACCTCCTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
* *
22036 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTATATCCATGCTAAGT
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* * * *
22101 TTAGTTTGAGAATCTACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAATCGTATTT
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* * *
22166 GTCACTCAAATAGGGTTGCACAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACT
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* * *
22231 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGCAACACGTGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTAAAGG
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*
22490 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACAAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
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* * * *
22555 GGTCTAGGTTCGTTCTGCGTACTTTGCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
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* * *
22682 AAAGCTATCACACTATCTGCAGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGATTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
* * * * *
22747 TTAGTTTGAGAATCAACTAAATTGTAGCTCTAATATCC-CTAAATGTAACACCCCTAACCGTATT
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* * * *
22811 CGTCACTAAAATACGGTTACATAGCATT-CTGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAAC
195 CGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAAC
* * *
22875 ATTCGATAACTCATAGCATAA-TCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCCAG
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* * * * *
22939 GCCTTAAAAATTTTTAAAAATGATCCCGGACAAAATCAAGAACATATGAAATCTTAAGGAAAAAG
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* *
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455 ATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAA
* * * *
23120 TGTGCATCGTACACGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTATTG
520 TGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTA
*
23185 CGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTTTCTACCTCATT
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* * * * * *
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* *
23378 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTAATACCACTAAACGTAACACTCCTAACCGTATTC
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* *
23443 ATCACTCAAATAGGGTTACACAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
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*
23508 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCACATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
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* *
23573 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCAGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAGAGT
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*
23638 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTAACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
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*
23703 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGA-GTTGTGGAAATGTGGAGTTTACCATTAAAT
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23767 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
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* * * * *
23832 GGTCTAGGTTCATTCTGTGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAGAACTTTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
*
23894 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCC
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
*
23959 AAAGCTATCACACTATCTCTGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
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* *
24089 GTCACTCAAATAGGGTTAC-GAGCATTACCTTAAAATCGTAACATAAAAAAATCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
* *
24153 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCACATTATCCCTTAATCGAACCCTCAAGG
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* *
24218 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCAGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAGAGT
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*
24283 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTAACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
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*
24348 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGGAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
*
24413 GCGCATCGTACATGTCATACATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
* * * * * *
24478 AGTCTAGGTTCATTCTGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAGAACTTTCGACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
* *
24540 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCCTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGAAAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
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* *
24670 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTACTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAATCGTATTC
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* * * *
24735 GTCTCTCAAATAGGGTTACAGAGCAGTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAAATCATTACCAAACA
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* * * *
24800 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTAAAACACATGCACATTATCCCTTAATCGAACCATCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
* * *
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* *
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** *
24992 ---C--AC-TG---C----T--T-A-C---TTGAGCCT-T-G----GTGGAGTTTACCATTAATT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
* *
25031 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAAAAAATTAGGTGCTACTTCTTTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
* * *
25096 GGTCCAGGTTCATTCTGCGTACTTTCCTCGTTAGAAGGTGGAATAAAACTTTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
* *
25158 AGAACCTACTTTATTAGATCCCGACAAAATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
* *
25223 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTAATGTATTTCTAGATTCTATCCATGCTAAGT
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* * * * * *
25288 TTAGTTTGAGAATCAACTAAATTGTAGCTCTAATATCACTAAATGTAACACCCCTAACCGTATTC
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* * *
25353 GTCACTAAAATACGGTTACATAGCATT-CCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
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* *
25417 TTTGATAACTCATAGCATAA-TCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
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* * * *
25481 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACAAAATCAAGAACATATGAAATCTTAAGGAAAAAGT
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25546 TACAAAAAATG--CAC-AC-----T---AC---CTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
25597 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
25662 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
25727 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
25789 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
*
25854 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
*
25919 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACTCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
*
25984 GTCACTCAAATAGGGTTACACAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
26049 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
26114 CCTTAAAAAA-TTTAAAAATGATCCC--ACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGG--AAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
26174 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
26239 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
* *
26304 GCGCATCGTACACGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTGC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
26369 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACT-TCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
*
26430 AGAACCTAC-TGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTACATAAGAACATTTCAAA-ATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
26493 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
* * *
26558 TTAGTTTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTAATACCACTAAACGTAACACTCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
*
26623 GTCACTCAAATAGGGTTACACAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
26688 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
*
26753 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCAGACTAAATCGAGAACATATGAAA-CTTGAGG-AAAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
*
26816 TAGAAAAAATGCACACTACAATGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
*
26881 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGGAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
** *
26946 GCGCATCGTACATGTCATATATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTAATTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
* * *
27011 GGTCTAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAGAACTTTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
* *
27073 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCCTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGAAAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
27138 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
27203 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGT-A-ACCCCTAA-C-TATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
* *
27264 GT--CTCAAATAGGGTTACAGAGTATTACCGTAAAATCGTAACAT-AAAAATTTATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
*
27326 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTAAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
* * *
27391 CCTTAAAAAAATTTAAAAATGATCCCAGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAGAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
27456 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
27521 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
* *
27586 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTATTGC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
27651 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
27713 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAA-ATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
*
27777 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
27842 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA--ACTAAACGTAACA-CCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
27904 GTCACT-AAATA-GGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
27967 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
28032 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
* *
28097 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTTTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGAACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
* * *
28162 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCATACTAAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
28227 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
* *
28292 GGTCCAGGTTCATTCCGCATACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTTTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
* * *
28354 AGAACCTACTTAATTAGATCCTGGCAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
* *
28419 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTTGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
*
28484 GTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
*
28549 GTCACTCAAATTGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
*
28614 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGGGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
* ** *
28679 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATTCCGGACTAAATCGCCAACATATGAAACCTTGAGGAAGAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
* *
28744 TAGAAAAAATGCTCACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCAGTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
*
28809 TTGCTTTCTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
* * * *
28874 GCGTATCGTACACGTCATGCATCATACGAA-AAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTATTGC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
*
28938 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGT-GAGTGGAATAAAACTCTCTACCTAATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAG-GTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
*
29000 AGAACCTACTTGATTAGAT-CCGACGACATCTCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAA-ATAAT
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACA--TCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAAT
*
29063 CAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAA
64 CAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAA
*
29128 GTTTAGTCTAAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTAT
129 GTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTAT
*
29193 TCGTCACTAAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAA
194 TCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAA
*
29258 CATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGGCCTCAA
259 CATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAA
29323 GGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAA-CTTGAGGAAAAA
324 GGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAA
* *
29387 GTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTTTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGAA
389 GTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCA
* * * *
29452 CATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCATACTGAGGTTGTGGAACTATGGAGTTTAACATTAA
454 CATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAA
* *
29517 ATGCGCACCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTAAC-CTAGATTCT
519 ATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACT-TCTCTAGATTCT
* *
29581 TACGGTCCAGGTTCATT-CGCATACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTTTCTACCTCATT
583 TACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
* *
29645 AGAACCTACTTAATTAGATCCCGGCAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
* *
29710 AAAGCTATCACACTATCTCCGGGTT-GTTAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAG
66 AAAGCTATCACACTATCTCC-GGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAG
29774 TTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATT
130 TTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATT
* *
29839 CGTCACTAAAATAGGGTTACAGAGCATTACTGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAAC
195 CGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAAC
* *
29904 ATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTAAAACACATGTATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAG
260 ATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAG
* * * * *
29969 GCCTT-AAAAATTTTAAAAATTATCCCGGACTAAATCGCGAACATATGAAATCTTAAGGAAGAAG
325 GCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAG
30033 TTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCAC
390 TTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCAC
* * * *
30098 ATTGCTTACTTGAACTTTGATGGTGAGGAGATTGAGGTTGTTGAACAGTGGAGTTTACCATTAAA
455 ATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAA
* *
30163 TTCGCATCGTACATGTCATACATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTA
520 TGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTA
30228 CGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
585 CGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
30291 AGAACCTACTTGATTAGATCCCCGACACACTTTTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAAT
1 AGAACCTACTTGATTAGAT-CCCG--ACA--------A-C---AT-----C-TTT------T-A-
*
30356 CAAAAGCTATCACACTAAGAACATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCTGGTTAGT
37 C-----CTAT---A-TAAGAACATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGT
*
30421 CAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTG
93 CAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTG
* *
30486 CTCTGATACCACTAAACATAACACCCCTAACCGTATTCGTCACTAAAATAGGGTTACAGAGCATT
158 CTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATT
30551 ACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTG
223 ACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTG
*
30616 AAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGA-CCCA
288 AAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCG
30680 GACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCA
353 GACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCA
30745 CACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGC
418 CACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGC
30810 AGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATAC
483 AGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATAC
30875 GAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCC
548 GAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCC
*
30940 TCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTTTCTACCTCATT
613 TCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
30975 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
31040 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
31105 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
31170 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
31235 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
31300 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
31365 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
31430 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
31495 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
31560 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTC-ACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
31621 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
31686 AAAGCTATCACACTA--TCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
31749 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
31814 GTCA--CAAATA-GGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
31876 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
31941 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
32006 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
32071 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
32136 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
*
32201 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAAT-AAACTTTCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
32262 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
*
32327 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
32392 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTG-TGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
32456 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
196 GTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACA
32521 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
261 TTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGG
32586 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
326 CCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGT
32651 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTAT--G---A
391 TAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACA
32711 --G----C----A-CTTGAT--T-A-C---TTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
456 TTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACTGTGGAGTTTACCATTAAAT
32758 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
32823 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACT-TCTACCTCATT
586 GGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAAAACTCTCTACCTCATT
32884 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
1 AGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAACATTTCAAAGATAATCA
32949 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
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*
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*
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521 GCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGCTACTTCTCTAGATTCTTAC
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*
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66 AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
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131 TTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTC
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.34, C:0.21, G:0.15, T:0.30
Consensus pattern (647 bp):
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AAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGT
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Found at i:28186 original size:641 final size:646
Alignment explanation
Indices: 25012--37125 Score: 21066
Period size: 641 Copynumber: 19.0 Consensus size: 646
25002 TTGAGCCTTG
* *
25012 GTGGAGTTTACCATTAATTGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAAAAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
* * *
25077 TACTTCTTTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCTGCGTACTTTCCTCGTTAGAAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
* * *
25142 AACTTTCTACCTCATTAGAACCTACTTTATTAGATCCCGACAAAATCTTTTACCTATATAAGAAC
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* * *
25207 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTAATGTATTTCTAGAT
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
* * * * *
25272 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTTTGAGAATCAACTAAATTGTAGCTCTAATATCACTAAATGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
* * *
25337 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTAAAATACGGTTACATAGCATT-CCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
* *
25401 AATTCATTTCCAAACATTTGATAACTCATAGCATAA-TCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
* *
25465 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACAAAATCAAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
* * *
25530 ATCTTAAGGAAAAAGTTACAAAAAATG--CAC-AC-----T---AC---CTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
25581 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
25643 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
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66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
25773 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
25838 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
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261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
* *
25968 ACTCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACACAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
26033 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
26098 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAA-TTTAAAAATGATCCC--ACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
26160 ACCTTGAGG--AAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
26223 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
*
26285 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACACGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
*
26350 TACTTCTCTAGATTCTTGCGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
*
26415 AACT-TCTACCTCATTAGAACCTAC-TGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTACATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
*
26478 ATTTCAAA-ATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
* *
26542 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTTTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTAATACCACTAAACGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
* *
26607 ACTCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACACAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
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390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
*
26737 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCAGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
*
26802 A-CTTGAGG-AAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAATGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
*
26865 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGGAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
**
26927 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATATATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
* * *
26992 TAATTCTCTAGATTCTTACGGTCTAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAG
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
* *
27057 AACTTTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCCTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
* *
27122 ATTTCAAAGAAAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
27187 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGT-A-
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
*
27250 ACCCCTAA-C-TATTCGT--CTCAAATAGGGTTACAGAGTATTACCGTAAAATCGTAACAT-AAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
* *
27310 AATTTATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTAAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
* *
27375 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAAATTTAAAAATGATCCCAGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
*
27440 ACCTTGAGGAAAGAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
27505 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
27567 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
* *
27632 TACTTCTCTAGATTATTGCGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
27697 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAA-ATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
27761 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
27826 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-ACTAAACGTAACA
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACACTAAACGTAACA
27890 -CCCTAACCGTATTCGTCACT-AAATA-GGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAA
326 CCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAA
27952 ATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTA
391 ATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTA
28017 ATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAA
456 ATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAA
*
28082 CCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTTTAACTTTATACATGGT
521 CCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGT
* * * *
28147 CACTCTATGAGAACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCATACTAAGGTTGTGGAACT
586 CACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
28208 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
*
28273 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCATACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
* * * *
28338 AACTTTCTACCTCATTAGAACCTACTTAATTAGATCCTGGCAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
*
28403 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTTGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
*
28468 TCTATCCATGCTAAGTGTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
*
28533 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATTGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
28598 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
* * **
28663 AATCGGGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATTCCGGACTAAATCGCCAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
* *
28728 ACCTTGAGGAAGAAGTTAGAAAAAATGCTCACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
* *
28793 TCAGTCTATGAGCACATTGCTTTCTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
* *
28855 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGTATCGTACACGTCATGCATCATACGAA-AAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
* *
28919 TACTTCTCTAGATTATTGCGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGT-GAGTGGAATA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAG-GTGGAATA
* *
28983 AAACTCTCTACCTAATTAGAACCTACTTGATTAGAT-CCGACGACATCTCTTTTACCTATATAAG
130 AAACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACA--TCTTTTACCTATATAAG
29047 AACATTTCAAA-ATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTA
193 AACATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTA
*
29111 GACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTAAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGT
258 GACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGT
*
29176 AACACCCCTAACCGTATTCGTCACTAAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATA
322 AACACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATA
29241 AAAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCC
387 AAAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCC
*
29306 CTTAATCGAGGCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATAT
452 CTTAATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATAT
*
29371 GAAA-CTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTTTAACTTTATACA
517 GAAACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACA
* * *
29435 TGGTCACTCTATGAGAACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCATACTGAGGTTGTGGAACT
582 TGGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
* * *
29500 ATGGAGTTTAACATTAAATGCGCACCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
* *
29565 TACTAAC-CTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATT-CGCATACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATA
66 TACT-TCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATA
* * *
29628 AAACTTTCTACCTCATTAGAACCTACTTAATTAGATCCCGGCAACATCTTTTACCTATATAAGAA
130 AAACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAA
*
29693 CATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGGTT-GTTAAGTGTCATATATTTCTAG
195 CATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCC-GGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAG
29757 ACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTA
259 ACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTA
* *
29822 ACACCCCTAACCGTATTCGTCACTAAAATAGGGTTACAGAGCATTACTGTAAAATCGTAACATAA
323 ACACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAA
* *
29887 AAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTAAAACACATGTATATTATCCC
388 AAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCC
* *
29952 TTAATCGAGCCCTCAAGGCCTT-AAAAATTTTAAAAATTATCCCGGACTAAATCGCGAACATATG
453 TTAATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATG
* * *
30016 AAATCTTAAGGAAGAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACAT
518 AAACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACAT
* * * *
30081 GGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACTTTGATGGTGAGGAGATTGAGGTTGTTGAACA
583 GGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
* *
30145 GTGGAGTTTACCATTAAATTCGCATCGTACATGTCATACATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
30210 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
30275 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCCGACACACTTTTTTTACCTATATAAGA
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGAT-CCCG--ACA--------A-C---AT----
30340 ACATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTAAGAACATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCAC
177 -C-TTT------T-A-C-----CTAT---A-TAAGAACATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCAC
*
30405 ACTATCTCTGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGA
223 ACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGACTCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGA
* *
30470 ATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACATAACACCCCTAACCGTATTCGTCACTAAAAT
288 ATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAACACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAAT
30535 AGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATC
352 AGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAAAATTCATTTCCAAACATTAGATAAATC
30600 ATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAAT
417 ATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTTAATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAAT
*
30665 TTTAAAAATGA-CCCAGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATG
482 TTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAAACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATG
30729 CACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTG
547 CACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGGTCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTG
30794 AACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
612 AACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
30829 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
30894 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
*
30959 AACTTTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
*
31024 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
31089 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
31154 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
31219 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
31284 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
31349 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
31414 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
31476 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
31541 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
31606 AACTCTC-ACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
*
31670 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTA--TCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
31733 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
31798 ACCCCTAACCGTATTCGTCA--CAAATA-GGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
31860 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
31925 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
31990 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
32055 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
32117 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
32182 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAAT-A
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
*
32246 AACTTTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
32311 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
32376 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTG-TGCTCTGATACCACTAAACGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
32440 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
32505 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
32570 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
32635 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
32700 TCACTCTAT--G---A--G----C----A-CTTGAT--T-A-C---TTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
32739 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
32804 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
32869 AACT-TCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
*
32933 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATGTATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
*
32998 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTG-TGCTCTGATACCACTAAATGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
33062 ACCCCTAACCGTATTCGTCACT-AAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
33126 AATTCATTTCCAAACA-T---TAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
33187 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
33252 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATG-------C-A----CACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
33305 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
33367 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
33432 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
33497 AA--CTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACA-----TACCTA-ATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
33554 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
33619 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTC-GAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATACCACTAAACGTAAC
261 TCTATCCATGCTAAGTTTAGTCTGAGAATCGACTAAATTGTTGCTCTGATA-CACTAAACGTAAC
33683 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATA-GGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
325 ACCCCTAACCGTATTCGTCACTCAAATAGGGTTACAGAGCATTACCGTAAAATCGTAACATAAAA
33747 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
390 AATTCATTTCCAAACATTAGATAAATCATAGCATAATTCATTGAAACACATGCATATTATCCCTT
33812 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
455 AATCGAGCCCTCAAGGCCTTAAAAAATTTTAAAAATGATCCCGGACTAAATCGAGAACATATGAA
33877 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
520 ACCTTGAGGAAAAAGTTAGAAAAAATGCACACTACAAGGGTCACACTTTCTAACTTTATACATGG
33942 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
585 TCACTCTATGAGCACATTGCTTACTTGAACCTTGATGGTGAGCAGATTGAGGTTGTGGAACT
34004 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
1 GTGGAGTTTACCATTAAATGCGCATCGTACATGTCATGCATCATACGAAGAAATAAATTAGGTGC
34069 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
66 TACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATAA
34134 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTA-ATAAGAAC
131 AACTCTCTACCTCATTAGAACCTACTTGATTAGATCCCGACAACATCTTTTACCTATATAAGAAC
34198 ATTTCAAA-ATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
196 ATTTCAAAGATAATCAAAAGCTATCACACTATCTCCGGTTAGTCAAGTGTCATATATTTCTAGAC
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* *
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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65 CTACTTCTCTAGATTCTTACGGTCCAGGTTCATTCCGCGTACTTTCCTCGTTAGTAGGTGGAATA
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*
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*
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*
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**
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1 TA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (36 bp):
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Done.