Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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* * * * *
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* * *
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* * *
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*
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* *
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*
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1001 AT-
514 ATA
*
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*
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* *
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* *
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* *
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* *
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1506 ATA
514 ATA
* *
1509 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATTGGTAAAAGAACTTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
*
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* * * *
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*
1768 TATGGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATACTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATA
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*
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455 GATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
*
2023 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGG-AAAA-AACCTGTTTGAATTTAACAAATGGTTT
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* *
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*
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*
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* ** *
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1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
* *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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*
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* *
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*
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1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
* *
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*
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* * * * *
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* * *
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260 TATGGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTG-TTTTTGTATATATATTAAATATAT
* * *
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*
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*
3505 TCATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
454 TGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
* *
3568 AAATTAAATAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAACGGTTT
1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
*
3633 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCCTGATTAGAGATTTAT
66 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTAT
* *
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* * *
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*
3828 ATGGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATACTTTAATTGTGTTTTTTTGTATATATATTAAATATAT
261 ATGGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTG--TTTTTGTATATATATTAAATATAT
*
3893 A-AA-TGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACCTGAT
324 ATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGAT
* *
3956 AAATATGAAGCGATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATATATA
389 AAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATA
* *
4021 TGATGATGCTT-CAAATTTAAAATGTATATAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATA
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*
4084 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACTTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
*
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* * * * *
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* *
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* *
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455 GATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
*
4601 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATAGTTT
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* * * *
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* * * *
4731 TCGATGGTTGAGATCCAACACAAATGATGGATTCCCGACAGCTCGAGTGACCAGTATCGGATCAT
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*
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*
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** * *
4908 AA---T-G-CCT--T---TTTTT-TAT-AAATGGATCAAATCATAAAATAAGAAATACGTGATAA
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*
4961 ATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATATCATGTATATG
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* *
5026 ATGATGTTGCAAATTTAAAATGGATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATA
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*
5087 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAACGGTTT
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*
5152 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCCTGATTAGAGATTTAT
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* *
5217 TCGATGGTTGAGATCTAGCACAAATTATGGATTTTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCAT
131 TCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCAT
* * *
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196 TATATAGCAATCGGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTAGGTAAGTTCAT
* * * *
5347 ATGGAAGTTAGTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATGTATATGAAATATATAT
261 ATGGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATAT
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326 AATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAA
* *
5477 ATATGAAGCGATTCATGACATTGAACT-GATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTTTAT
391 ATATGAAGAGATTCATGACATTGAA-TGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATAT
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455 GATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
* *
5603 CAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
* *
5668 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATCAAAAGGAAAAATTGGGAATCGTGATTAGAGATTTA
66 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAA-TGGGAATCGTGATTAGAGATTTA
* * *
5733 TTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGATAGCTCGAGTGACCAGTATCAGATCA
130 TTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCA
* *
5798 TTATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACATTCTAGTTGCCAGTTTCTAGGTAAGTTCA
195 TTATATAGCAATCGGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTAGGTAAGTTCA
*
5863 TATGGAAGTTTACTACATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATAT
260 TATGGAAG-TTACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATAT
* * *
5928 GTAATTGTTGATTTAATAGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGAT
324 ATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGAT
* *
5993 AAATATGAAGCGATTCATGACATTGAACT-GATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTTT
389 AAATATGAAGAGATTCATGACATTGAA-TGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTAT
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* * * * *
6121 CAATTAAAGTGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCAGTATGAATTTAACAAACGGTTT
1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
* * *
6186 AGATAAGAATGGAAAGTGATTACGGTAATAAAAAGGAAAAATTGGGAATCGTGATTAAAGATTTA
66 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAA-TGGGAATCGTGATTAGAGATTTA
*
6251 TTCGATGGTTGAGATCCAGTACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCA
130 TTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCA
**
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*
6380 ATATAGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATAT
259 ATATGGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATAT
* *
6445 ATAATTTTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATGAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGAT
324 ATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGAT
* *
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*
6574 ATGATGATGCTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
453 ATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA
* * *
6638 CAATTAAAGTGTTTGAAATGATACGAAATTGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
1 AAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTT
* * *
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* *
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* * *
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** * *
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*
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* * *
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* *
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* *
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* *
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* * *
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* * **
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*
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* * *
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* * *
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*
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* *
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* *
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* *
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* * * *
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*
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*
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* *
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* *
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