Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Scaffold2070
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 22030
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Found at i:588 original size:109 final size:105
Alignment explanation
Indices: 393--592 Score: 303
Period size: 109 Copynumber: 1.9 Consensus size: 105
383 TTGTGCAGGT
393 ACAAATCCTTGTTTGGAATTATTGCTTTCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCA
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTATTGCTTTCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCA
* *
458 CTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CCAACTATTTCTAGA-GCTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
499 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCAT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAA-TTATTGCTTT-CC-TTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCAT
* *
564 TCACCAACTGTTT-TAGAATCTTTTTACCT
63 TCACCAACTATTTCTAG-AGCTTTTTACCT
593 ATATTAATAA
Statistics
Matches: 85, Mismatches: 5, Indels: 6
0.89 0.05 0.06
Matches are distributed among these distances:
106 18 0.21
107 9 0.11
108 14 0.16
109 44 0.52
ACGTcount: A:0.22, C:0.18, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (105 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTATTGCTTTCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCA
CCAACTATTTCTAGAGCTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:1938 original size:107 final size:107
Alignment explanation
Indices: 1742--1941 Score: 339
Period size: 107 Copynumber: 1.9 Consensus size: 107
1732 TTGTGCAGGT
1742 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
1807 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
1849 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
1914 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTACCT
1942 ATATCATAAG
Statistics
Matches: 87, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
106 1 0.01
107 86 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.45
Consensus pattern (107 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:2648 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 2451--2652 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
2441 TTGTGCAGGT
2451 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
2516 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
2559 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
2624 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
2653 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:3370 original size:107 final size:107
Alignment explanation
Indices: 3160--3372 Score: 322
Period size: 107 Copynumber: 2.0 Consensus size: 107
3150 TTGTGCAGGT
3160 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTC
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTC
* * * * *
3225 ACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 ACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
*
3267 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGG-TTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
3332 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGC
65 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCTATATCAATAAGGC
3373 TTGCTAAGAT
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 8, Indels: 4
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
107 48 0.50
108 48 0.50
ACGTcount: A:0.23, C:0.18, G:0.14, T:0.44
Consensus pattern (107 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTC
ACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
Found at i:4068 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 3871--4072 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
3861 TTGTGCAGGT
3871 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
3936 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
3979 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
4044 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
4073 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:4281 original size:712 final size:712
Alignment explanation
Indices: 1079--19785 Score: 36705
Period size: 712 Copynumber: 26.3 Consensus size: 712
1069 TGGAATTTAC
*
1079 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTC---AGGTTTTTTACCTCTTTCAATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1141 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
1206 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATTAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATA-TAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
1271 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
1336 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
1401 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
1466 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
1531 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
1596 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
1661 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
1726 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
1789 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGG-TTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1853 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
*
1918 AACTGTTTTTAGAATC-TTTTACCTATATCATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
1982 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
2047 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
2112 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAAT-CTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
2176 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
2241 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
2306 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
2371 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
2436 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
2498 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
2563 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
2628 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
2693 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
2758 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
2823 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAAT-CTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
2887 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
2952 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
3017 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATC--TAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
3080 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
3145 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGG-TTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
3206 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
3271 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
3336 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
3401 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
3466 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
3531 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
3596 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
3661 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
3726 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
3791 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
3856 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
3918 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
3983 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
4048 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
4113 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
4178 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
4243 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
4308 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
4373 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
4438 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
4503 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
4568 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
4630 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
4695 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
4760 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
4825 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
4890 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
4955 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
5020 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
5085 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
5150 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATC--TAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
5213 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
5278 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
5340 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
5405 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
5470 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
5535 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
5600 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
5665 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
5730 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
5795 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
5860 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATC--TAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
5923 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
5988 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
6050 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
6115 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
6180 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
6245 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
6310 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
6375 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
6440 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
6505 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
6570 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
6635 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
6700 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
6762 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTA-AGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
6826 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
6891 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
6956 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
7021 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
7086 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
7151 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
7216 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
7281 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
7346 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
7411 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
7473 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
7538 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
7603 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATTAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATA-TAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
7668 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
7733 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
7798 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
7863 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
7928 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
7993 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
8058 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
8123 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
8186 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
8251 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
8316 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
8381 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
8446 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
8511 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
8576 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
8641 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
8706 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
8771 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
8836 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
8898 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
8963 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
9028 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATTAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATA-TAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
9093 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
9158 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
9223 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
9288 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
9353 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
9418 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTAT-AAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
9482 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
9547 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
9610 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
9675 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
9740 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
9805 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
9870 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
9935 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAAT-CTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
9999 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
10064 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
10129 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
10194 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
10259 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
10321 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
10386 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
10451 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
10516 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
10581 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
10646 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
10711 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
10776 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
10841 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
10906 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
10971 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
11033 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGG-TTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
11097 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
11162 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
11227 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
11292 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
11357 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
11422 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
11487 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
11552 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
11617 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
11682 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
11744 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
11809 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
11874 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
11939 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
12004 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
12069 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
12134 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
12199 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
12264 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
12329 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
12394 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
12456 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTA-AGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
12520 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
12585 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTT-CTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
12649 AGTA-ATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
12713 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
12778 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAAT-CTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
12842 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
12907 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
12972 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
13037 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
13102 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
13164 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTA-AGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
13228 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
13293 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATTAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATA-TAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
13358 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
13423 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
13488 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
13553 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
13618 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
13683 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
13748 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
13813 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
13876 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGG---TTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
13938 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
14003 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTT-CTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
14067 AGTA-ATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
14131 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
*
14196 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATACTATAAAAGCAATAGGTATAGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
14261 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
*
14326 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATACATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
14391 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
14456 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
14521 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
14583 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
14648 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
14713 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
14778 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
196 AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
14843 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
261 AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
14908 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTA-AGA
326 AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
14972 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
391 TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
15037 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
456 TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
15102 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
521 ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
15167 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
586 TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
15232 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
651 GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
15294 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
*
15359 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTACTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
* *
15424 AACTGTTTTTAGAATATTTTTACCTATATCAATAAGGCTTTCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
15489 TAGTA-ATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
15553 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
*
15618 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCTTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
15683 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
*
15748 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATACATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
*
15813 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTAGAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
*
15878 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCAGTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
15943 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
16006 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTA-AGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
16070 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
16135 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATTAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATA-TAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
16200 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
16265 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
16330 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
16395 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
16460 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
16525 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
16590 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
16655 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
16718 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGG---TTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
16780 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
16845 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATCAATAAGGCTT-CTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
16909 TAGTA-ATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
16973 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
*
17038 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCTTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
17103 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
17168 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
17233 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
17298 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
17363 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
17426 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGG---TTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
*
17488 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTACTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
*
17553 AACTGTTTTTAGAATATTTTTACCTATATCAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
17618 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
17683 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
*
17748 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCTTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
17813 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
17878 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
*
17943 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTAGAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
*
18008 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCAGTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
18073 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
*
18136 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAAAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
*
18201 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCGTTTGTTGGG-TTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
*
18265 AACTG-TTTTAGAATCTTTTTACCTATATTAATAAGGCTTGCTAATATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATA-TAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
18329 TAGTACATAAAAGTACAT-ATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
18393 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
18458 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
18523 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
*
18588 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAATAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
*
18653 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTAGAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
18718 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
18783 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGG-TTTTTT
18847 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
18912 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
* *
18977 AACTGTTTTTAG-ATATTTTTACCTATATCCATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
19041 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATT
19106 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
260 TAAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAG
19171 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
325 AAAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAG
*
19236 ATGGTAATAAAACCATAATTTCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
390 ATGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGA
*
19301 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGTATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
455 TTTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTT
19366 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
520 TATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTT
19431 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
585 ATATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAA
*
19496 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTATTTGGAA-TTA-TGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
650 TGGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
*
19557 TGTAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
1 TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
*
19622 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTTCCTTTGTT-GGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
66 ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
*
19686 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATCAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGCAATAATTTAT
131 AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTAT
*
19751 TAGTACATAAAAGCACATAATTTATTCTTTTAATG
195 TAGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATG
19786 GTGTAAAAGT
Statistics
Matches: 17902, Mismatches: 50, Indels: 90
0.99 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
707 547 0.03
708 1578 0.09
709 1007 0.06
710 3627 0.20
711 4058 0.23
712 5418 0.30
713 1667 0.09
ACGTcount: A:0.37, C:0.12, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (712 bp):
TATAAACAGTAGTCCATTCACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCCACAA
ATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCACC
AACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATATAATAAGGCTTGCTAAGATAATCAGAAATAATTTATT
AGTACATAAAAGTACATAATTTATTCTTTTAATGTAATACATATATTGAAATTACATTTCAATTT
AAAGAATATAAAAATATTCTTTACATGCTTTATTAGATACTGGAGCTACAATTAGTAGTTGCAGA
AAGAATGCCATTCCTGTAGAAAAATGAGAAATTATTAAAAATCCTATAAAAGCAATAGGTATAGA
TGGTAATAAAACCATAATTCCATATAAAGATAAAAATATTTCAATCTACATAAATAATGTAAGAT
TTGTAATTCTTAAAATTTTATATTTTCCTGAAATGCATGGAGATATATTATTAGGAAACAATTTT
ATATGTCAATATTTACCATTTTCTATTAATAAAAAGTCAATTAGTTTATCTATAAAAAATTCTTA
TATAGAAATACCATTAGTTAATAATAATAAATTTGTGTGTAATAAAACTTTTACGCCATTAAAAT
GGTACTTGTGCAGGTACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTT
Found at i:4780 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 4583--4784 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
4573 TTGTGCAGGT
4583 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
4648 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
4691 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
4756 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
4785 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:5490 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 5293--5494 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
5283 TTGTGCAGGT
5293 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
5358 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
5401 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
5466 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
5495 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:6200 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 6003--6204 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
5993 TTGTGCAGGT
6003 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
6068 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
6111 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
6176 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
6205 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:6925 original size:107 final size:107
Alignment explanation
Indices: 6715--6927 Score: 322
Period size: 107 Copynumber: 2.0 Consensus size: 107
6705 TTGTGCAGGT
6715 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* * * * *
6780 CACTAACTATTTCTAAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAAGATTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
*
6822 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
6887 CACCAACTGTTT-TTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGC
66 CACCAACTATTTCTAAG-AT-TTTTTACCTATATCAATAAGGC
6928 TTGCTAAGAT
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 8, Indels: 4
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
106 3 0.03
107 82 0.85
108 11 0.11
ACGTcount: A:0.23, C:0.18, G:0.14, T:0.45
Consensus pattern (107 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAAGATTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
Found at i:7623 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 7426--7627 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
7416 TTGTGCAGGT
7426 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
7491 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
7534 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
7599 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
7628 ATATTAATAA
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:8336 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 8139--8340 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
8129 TTGTGCAGGT
8139 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
8204 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
8247 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
8312 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
8341 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:9048 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 8851--9052 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
8841 TTGTGCAGGT
8851 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
8916 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
8959 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
9024 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
9053 ATATTAATAA
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:9760 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 9563--9764 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
9553 TTGTGCAGGT
9563 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
9628 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
9671 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
9736 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
9765 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:10471 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 10274--10475 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
10264 TTGTGCAGGT
10274 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
10339 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
10382 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
10447 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
10476 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:11196 original size:107 final size:107
Alignment explanation
Indices: 10986--11198 Score: 329
Period size: 107 Copynumber: 2.0 Consensus size: 107
10976 TTGTGCAGGT
10986 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* * * * *
11051 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGCTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
*
11093 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* * *
11158 CACCAACTGTTTTTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGC
66 CACCAACTATTTCTAG-AGCTTTTTACCTATATCAATAAGGC
11199 TTGCTAAGAT
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 9, Indels: 2
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 84 0.88
108 12 0.12
ACGTcount: A:0.23, C:0.18, G:0.14, T:0.44
Consensus pattern (107 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGCTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
Found at i:11894 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 11697--11898 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
11687 TTGTGCAGGT
11697 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
11762 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
11805 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
11870 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
11899 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:12619 original size:107 final size:107
Alignment explanation
Indices: 12409--12621 Score: 322
Period size: 107 Copynumber: 2.0 Consensus size: 107
12399 TTGTGCAGGT
12409 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* * * * *
12474 CACTAACTATTTCTAAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAAGATTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
*
12516 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
12581 CACCAACTGTTT-TTAGAATCTTTTTACCTATAT-AATAAGGC
66 CACCAACTATTTCTAAG-AT-TTTTTACCTATATCAATAAGGC
12622 TTCTAAGATA
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 8, Indels: 4
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
106 3 0.03
107 82 0.85
108 11 0.11
ACGTcount: A:0.23, C:0.18, G:0.14, T:0.45
Consensus pattern (107 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAAGATTTTTTACCTATATCAATAAGGCC
Found at i:14733 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 14536--14737 Score: 343
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
14526 TTGTGCAGGT
14536 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
14601 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
14644 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
14709 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
14738 ATATAATAAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 87 0.99
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:15444 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 15247--15448 Score: 334
Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
15237 TTGTGCAGGT
*
15247 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTACTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
15312 CACTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
*
15355 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTACTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTACTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
15420 CACCAACTGTTTTTAGA-ATATTTTTACCT
66 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
15449 ATATCAATAA
Statistics
Matches: 87, Mismatches: 6, Indels: 2
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
107 1 0.01
108 86 0.99
ACGTcount: A:0.23, C:0.18, G:0.13, T:0.46
Consensus pattern (108 bp):
ACAAATCCTTGTTTGGAATTTATTACTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
CACCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Found at i:19706 original size:107 final size:106
Alignment explanation
Indices: 19512--19710 Score: 285
Period size: 107 Copynumber: 1.9 Consensus size: 106
19502 TTGTGCAGGT
*
19512 ACAAATCCTTATTTGGAATTATGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTGTAAACAGTAGTCCATTCA
1 ACAAATCCTTATTTGGAATTATGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCA
* *
19577 CTAACTATTTCTAGAGGTTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
66 CCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
* * *
19618 ACAAATCCTTGTTTGGAATTTGTTGCTTTTCCTTTGTT-GGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
1 ACAAATCCTTATTTGGAA-TT-ATGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATT
* *
19682 CACCAACTGTTTTTAGA-ATCTTTTTACCT
64 CACCAACTATTTCTAGAGAT-TTTTTACCT
19711 ATATCAATAA
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 8, Indels: 5
0.86 0.08 0.05
Matches are distributed among these distances:
106 18 0.22
107 50 0.61
108 14 0.17
ACGTcount: A:0.22, C:0.19, G:0.14, T:0.46
Consensus pattern (106 bp):
ACAAATCCTTATTTGGAATTATGCTTTCCCTTTGTTGGGTTTTTTTATAAACAGTAGTCCATTCA
CCAACTATTTCTAGAGATTTTTTACCTCTTTCCATAAGGCC
Done.