Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Scaffold3696
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 19157
ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.21, T:0.32
Found at i:406 original size:44 final size:43
Alignment explanation
Indices: 280--406 Score: 97
Period size: 44 Copynumber: 3.0 Consensus size: 43
270 GAGCATGGTG
280 GGCAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGT
1 GGCAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGT
** * * * * *
323 AGTGCATTATG-TAAGGATTAATAA-A----ATAAAGA-GCATGGGT
1 -G-GCAAGATGTTATGG-CTAAAAACATGTCATAAACATG-TTGGGT
363 GGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGT
1 GG-CAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGT
407 AGTGCATTAT
Statistics
Matches: 58, Mismatches: 14, Indels: 22
0.62 0.15 0.23
Matches are distributed among these distances:
38 1 0.02
39 12 0.21
40 16 0.28
44 17 0.29
45 12 0.21
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.25, T:0.28
Consensus pattern (43 bp):
GGCAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGT
Found at i:417 original size:84 final size:83
Alignment explanation
Indices: 270--443 Score: 298
Period size: 84 Copynumber: 2.1 Consensus size: 83
260 GGCCGGCCAT
*
270 GAGCAT-GGTGGGCAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGTAGTGCATTATG
1 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGTAGTGCATTATG
334 TAAGGATTAATAAA-ATAAA
66 TAAGG-TTAATAAATA-AAA
353 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGTAGTGCATTATG
1 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGTAGTGCATTATG
418 TAAGGTTAATAAATAAAA
66 TAAGGTTAATAAATAAAA
*
436 GGGCATGG
1 GAGCATGG
444 ACAATTAAAT
Statistics
Matches: 87, Mismatches: 2, Indels: 4
0.94 0.02 0.04
Matches are distributed among these distances:
83 24 0.28
84 63 0.72
ACGTcount: A:0.37, C:0.09, G:0.27, T:0.27
Consensus pattern (83 bp):
GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGTAGTGCATTATG
TAAGGTTAATAAATAAAA
Found at i:2804 original size:47 final size:47
Alignment explanation
Indices: 2608--2891 Score: 387
Period size: 46 Copynumber: 6.0 Consensus size: 47
2598 GGATTTTATT
*
2608 TGATGGATGTGAAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
1 TGATGAATGTG-AACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
*** *
2656 TGATGAATGTGAACCTATATATATATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
1 TGATGAATGTGAA-C---ATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
2707 TGATGAA--TGAACATGCGTATGTGTGATAA-GCCGAATGGCCAATG
1 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
*
2751 TGATGAATGTGAACCTGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
1 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
2798 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGG-CGAATGGCCAATG
1 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
** * * *
2844 TGATGAATGTGAACATGAATATATGTTGGTAAGGCCGAATGGCTAATG
1 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTG-TGATAAGGCCGAATGGCCAATG
2892 CGAAACGTGT
Statistics
Matches: 211, Mismatches: 16, Indels: 18
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
44 22 0.10
45 13 0.06
46 56 0.27
47 56 0.27
48 24 0.11
49 4 0.02
51 36 0.17
ACGTcount: A:0.31, C:0.12, G:0.30, T:0.26
Consensus pattern (47 bp):
TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
Found at i:2839 original size:93 final size:93
Alignment explanation
Indices: 2608--2891 Score: 401
Period size: 93 Copynumber: 3.0 Consensus size: 93
2598 GGATTTTATT
*
2608 TGATGGATGTGAAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCTA
1 TGATGAATGTG-AACATGCGTATGTGTGATAAGG-CGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACC--
* *
2673 TATATATATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
62 T-GA-ATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
* **
2707 TGATGAA--TGAACATGCGTATGTGTGATAAGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCTGCG
1 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCTGAA
2770 TATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
66 TATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
*
2798 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACATGAA
1 TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCTGAA
* * *
2863 TATATGTTGGTAAGGCCGAATGGCTAATG
66 TATGTG-TGATAAGGCCGAATGGCCAATG
2892 CGAAACGTGT
Statistics
Matches: 169, Mismatches: 13, Indels: 11
0.88 0.07 0.06
Matches are distributed among these distances:
91 34 0.20
93 58 0.34
94 20 0.12
95 28 0.17
96 21 0.12
97 2 0.01
99 6 0.04
ACGTcount: A:0.31, C:0.12, G:0.30, T:0.26
Consensus pattern (93 bp):
TGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCTGAA
TATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
Found at i:2954 original size:46 final size:47
Alignment explanation
Indices: 2864--2955 Score: 114
Period size: 46 Copynumber: 2.0 Consensus size: 47
2854 GAACATGAAT
* * * *
2864 ATATGTTGGTAAGGCCGAATGGCTAATGCGAAACGTGTATGAGATGG
1 ATATGTTGGTAAAGCCAAATGGCTAATGCGAAACATGTACGAGATGG
* * *
2911 ATATG-TGGTAAAGCCAAATGGCTAATGTGAGATATGTACGAGATG
1 ATATGTTGGTAAAGCCAAATGGCTAATGCGAAACATGTACGAGATG
2956 TGTATATATA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 7, Indels: 1
0.83 0.15 0.02
Matches are distributed among these distances:
46 33 0.87
47 5 0.13
ACGTcount: A:0.33, C:0.10, G:0.32, T:0.26
Consensus pattern (47 bp):
ATATGTTGGTAAAGCCAAATGGCTAATGCGAAACATGTACGAGATGG
Found at i:3189 original size:36 final size:36
Alignment explanation
Indices: 3099--3207 Score: 157
Period size: 38 Copynumber: 3.0 Consensus size: 36
3089 GGAAATATAT
3099 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAAGATTATG
1 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGG-AGATT-TG
3137 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTG
1 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTG
* * *
3173 TCCCGGGTAAGA-CCGATAACTTCATGTGGAGATTT
1 T-CCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTT
3208 CGTCTGAGCT
Statistics
Matches: 67, Mismatches: 3, Indels: 4
0.91 0.04 0.05
Matches are distributed among these distances:
36 23 0.34
37 15 0.22
38 29 0.43
ACGTcount: A:0.25, C:0.19, G:0.30, T:0.26
Consensus pattern (36 bp):
TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTG
Found at i:4841 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 4451--4828 Score: 668
Period size: 40 Copynumber: 9.5 Consensus size: 40
4441 GAGAATTGAG
* *
4451 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCTCGAAGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
*
4491 AGTGATGTATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
4531 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
4571 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
4611 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
4651 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
4691 AGTGATATATCCGGGCTAAGT-CCGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
*
4730 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCTGAGGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
* * *
4770 AGTGATGTATCCGGGCTAAGTTCCGAAGAGCATTCGTGCT
1 AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
* *
4810 AGTGATATATTCGTGCTAA
1 AGTGATATATCCGGGCTAA
4829 ACCCCGAAGA
Statistics
Matches: 325, Mismatches: 12, Indels: 2
0.96 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
39 39 0.12
40 286 0.88
ACGTcount: A:0.23, C:0.21, G:0.30, T:0.26
Consensus pattern (40 bp):
AGTGATATATCCGGGCTAAGTCCCGAGGAGCATTCGTGCT
Found at i:6755 original size:85 final size:85
Alignment explanation
Indices: 6612--6790 Score: 349
Period size: 85 Copynumber: 2.1 Consensus size: 85
6602 GGCCGGCCAT
6612 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGGTAGTGCATTAT
1 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGGTAGTGCATTAT
6677 GTAAGGATTAATAAAATAAA
66 GTAAGGATTAATAAAATAAA
6697 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGGTAGTGCATTAT
1 GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGGTAGTGCATTAT
6762 GTAAGGATTAATAAAATAAA
66 GTAAGGATTAATAAAATAAA
*
6782 GGGCATGGG
1 GAGCATGGG
6791 CAATAAAATA
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 1, Indels: 0
0.99 0.01 0.00
Matches are distributed among these distances:
85 93 1.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.08, G:0.28, T:0.26
Consensus pattern (85 bp):
GAGCATGGGTGGACAAGATGTTATGGCTAAAAACATGTCATAAACATGTTGGGGTAGTGCATTAT
GTAAGGATTAATAAAATAAA
Found at i:9022 original size:47 final size:47
Alignment explanation
Indices: 8971--9312 Score: 414
Period size: 47 Copynumber: 7.1 Consensus size: 47
8961 TTAGGATTTT
* *
8971 ATGTGATGGATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
**
9018 ATGTGATGAATGTGAACCCGTATATATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
1 ATGTGATGAATGTGAA--C--ATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
* * *
9069 ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGTCCGAATGGTCA
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
** *
9116 ATGTGATGAATGTGAACCTGTATATATATATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCA
1 ATGTGATGAATGTGAA-C-----ATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
* * *
9169 ATGTGATGAATGTGAACATTCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGACCA
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
* * *
9216 ATGTGATGAATGTGAACATGCATATATGAGATAAGGCCGAATGACCA
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
* * * *
9263 ATGTGATGAATGTGAACATGAATATATGTGGTAAGGCCGAATGGCTA
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
9310 ATG
1 ATG
9313 CGAAACGTGT
Statistics
Matches: 256, Mismatches: 29, Indels: 20
0.84 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
47 169 0.66
48 1 0.00
49 2 0.01
51 43 0.17
52 1 0.00
53 40 0.16
ACGTcount: A:0.32, C:0.12, G:0.29, T:0.27
Consensus pattern (47 bp):
ATGTGATGAATGTGAACATGCATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
Found at i:9201 original size:100 final size:97
Alignment explanation
Indices: 8971--9312 Score: 485
Period size: 100 Copynumber: 3.5 Consensus size: 97
8961 TTAGGATTTT
*
8971 ATGTGATGGATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACC
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAA-C
9036 CG-TATATATATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCA
65 CGATATATATATG-GTGATAAGGCCGAATGGCCA
* *
9069 ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGTCCGAATGGTCAATGTGATGAATGTGAACC
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACC
9134 TGTATATATATATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCA
66 -G-ATATATATATG-GTGATAAGGCCGAATGGCCA
* *
9169 ATGTGATGAATGTGAACATTCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGACCAATGTGATGAATGTGAA-C
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACC
** * *
9233 -ATGCATATAT-GAGATAAGGCCGAATGACCA
66 GATATATATATGGTGATAAGGCCGAATGGCCA
** * * *
9263 ATGTGATGAATGTGAACATGAATATATGTGGTAAGGCCGAATGGCTAATG
1 ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATG
9313 CGAAACGTGT
Statistics
Matches: 222, Mismatches: 19, Indels: 10
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
94 61 0.27
96 8 0.04
97 2 0.01
98 61 0.27
99 1 0.00
100 89 0.40
ACGTcount: A:0.32, C:0.12, G:0.29, T:0.27
Consensus pattern (97 bp):
ATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACC
GATATATATATGGTGATAAGGCCGAATGGCCA
Found at i:9221 original size:147 final size:149
Alignment explanation
Indices: 8993--9289 Score: 447
Period size: 147 Copynumber: 2.0 Consensus size: 149
8983 TGAACATGCG
*
8993 TATGTGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCCGTATATATATGTGTGATAAGG
1 TATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAA-CCG-ATATATATGTGTGATAAGG
* * * * * **
9058 CCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACATGCGTATGTGTGATAAGTCCGAATGGTCAATGTGAT
64 CCGAATGACCAATGTGATGAATGTGAACATGCATATATGAGATAAGGCCGAATGACCAATGTGAT
* *
9123 GAATGTGAACCTGTATATATA
129 GAATGTGAACATGAATATATA
*
9144 TATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAA-C-AT-TCGTATGTGTGATAAGGC
1 TATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCGATAT-ATATGTGTGATAAGGC
9206 CGAATGACCAATGTGATGAATGTGAACATGCATATATGAGATAAGGCCGAATGACCAATGTGATG
65 CGAATGACCAATGTGATGAATGTGAACATGCATATATGAGATAAGGCCGAATGACCAATGTGATG
9271 AATGTGAACATGAATATAT
130 AATGTGAACATGAATATAT
9290 GTGGTAAGGC
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 11, Indels: 6
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
146 1 0.01
147 92 0.69
149 1 0.01
151 40 0.30
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.27, T:0.28
Consensus pattern (149 bp):
TATGCGTGATAAGGCCGAATGGCCAATGTGATGAATGTGAACCGATATATATGTGTGATAAGGCC
GAATGACCAATGTGATGAATGTGAACATGCATATATGAGATAAGGCCGAATGACCAATGTGATGA
ATGTGAACATGAATATATA
Found at i:9632 original size:37 final size:37
Alignment explanation
Indices: 9524--9632 Score: 173
Period size: 37 Copynumber: 2.9 Consensus size: 37
9514 GGAAATATAT
*
9524 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTATG
1 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTTG
9561 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTTG
1 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTTG
* * * *
9598 TCCGGGTAAGACTCGATAACTTCATGTGGAGATTT
1 TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTT
9633 CGTCTGAGCT
Statistics
Matches: 67, Mismatches: 5, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
37 67 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.18, G:0.30, T:0.28
Consensus pattern (37 bp):
TCCGGGTAAGACCCGATGACTACGTGTGGAGATTTTG
Found at i:10823 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 10807--10839 Score: 50
Period size: 13 Copynumber: 2.6 Consensus size: 13
10797 TATAATTAAA
*
10807 TTAGTTAATTAGT
1 TTAGATAATTAGT
10820 TTAGATAATTAGT
1 TTAGATAATTAGT
10833 TTA-ATAA
1 TTAGATAA
10840 ACAAATCCTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
12 4 0.21
13 15 0.79
ACGTcount: A:0.39, C:0.00, G:0.12, T:0.48
Consensus pattern (13 bp):
TTAGATAATTAGT
Found at i:16239 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 16212--16296 Score: 79
Period size: 24 Copynumber: 3.5 Consensus size: 24
16202 TATTCTTATT
16212 TTTATTTTATTTTATTTTATTTTA
1 TTTATTTTATTTTATTTTATTTTA
*
16236 TTTA-TTTATTTTTATTTT-TCTT-
1 TTTATTTTA-TTTTATTTTATTTTA
* *
16258 TTGATTTTTATTTTCATTTCAATTTTA
1 TTTA-TTTTATTTT-ATTT-TATTTTA
16285 -TTATTTTATTTT
1 TTTATTTTATTTT
16297 GAAAGACATA
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 5, Indels: 13
0.73 0.07 0.19
Matches are distributed among these distances:
22 3 0.06
23 11 0.22
24 21 0.43
25 9 0.18
26 5 0.10
ACGTcount: A:0.19, C:0.04, G:0.01, T:0.76
Consensus pattern (24 bp):
TTTATTTTATTTTATTTTATTTTA
Found at i:16241 original size:4 final size:5
Alignment explanation
Indices: 16199--16296 Score: 78
Period size: 5 Copynumber: 18.8 Consensus size: 5
16189 TCCTCCTATT
16199 TTTTA TTCTTA TTTTTA TTTTA TTTTA TTTTA TTTTA -TTTA -TTTA TTTTTA
1 TTTTA TT-TTA -TTTTA TTTTA TTTTA TTTTA TTTTA TTTTA TTTTA -TTTTA
* *
16250 TTTTTC TTTTGA TTTTTA TTTTCA TTTCAA TTTTA --TTA TTTTA TTTT
1 -TTTTA TTTT-A -TTTTA TTTT-A TTT-TA TTTTA TTTTA TTTTA TTTT
16297 GAAAGACATA
Statistics
Matches: 79, Mismatches: 4, Indels: 20
0.77 0.04 0.19
Matches are distributed among these distances:
3 3 0.04
4 8 0.10
5 38 0.48
6 24 0.30
7 6 0.08
ACGTcount: A:0.18, C:0.04, G:0.01, T:0.77
Consensus pattern (5 bp):
TTTTA
Found at i:16266 original size:7 final size:6
Alignment explanation
Indices: 16198--16276 Score: 76
Period size: 6 Copynumber: 13.5 Consensus size: 6
16188 ATCCTCCTAT
*
16198 TTTTTA TTCTTA TTTTTA -TTTTA -TTTTA -TTTTA -TTTTA TTTATTTA
1 TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA -TT-TTTA
* * *
16244 TTTTTA TTTTTC TTTTGA TTTTTA TTTTCA TTT
1 TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTTTTA TTT
16277 CAATTTTATT
Statistics
Matches: 63, Mismatches: 7, Indels: 6
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
5 20 0.32
6 36 0.57
7 3 0.05
8 4 0.06
ACGTcount: A:0.16, C:0.04, G:0.01, T:0.78
Consensus pattern (6 bp):
TTTTTA
Done.