Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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* *
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*
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* *
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**
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*
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*
658 TA-TTTAATT-TGTTTT-TGTATATATATTAAATATATATAATTGTA-ATTTAATGGCTTTTTTA
130 TATTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGC-TTTTTA
*
719 TATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTT-ATAAATATGAAG-GATTCATGACATTGA
194 TATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGA
* *
782 ATGGCTGTGAGAATGGTATG-TGTTGTAT-GCATGTATATGATGATGTTGCAAA-TTAAAATGTA
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*
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*
969 ATAAAAAGG-AAAATGGG-ATCGTGA-TAGAGATTTATTCGATGTGTTAAGATCCAGCACAAATT
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1031 A
517 A
* *
1032 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGAATCGTATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGT-C
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
* * *
1096 CTGAAGCTTTCTAGTTGCCATTTTCTA-GTTATTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTA-
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
*
1159 ATTTTAATTCTGTTTTCGTATAT-TATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGC-TTTTAT
131 ATTTTAATTCTGTTTT-GTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTAT
*
1222 ATAAAATGGATCAAAATCGTAAAATAAGAAATATTTTATAAATATG-A-AGATTCATGACATTGA
195 ATAAAATGGATC-AAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGA
* *
1285 ATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATTTATATTATG-TGTTGCAAATTTAAAATGTA
259 ATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTA
* *
1349 TAGAGAACTGTTATTCAAAATAACTAATTTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAA
324 TAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAA
* * *
1414 TCGGTAAAAAGAACCTGTATGAATTTAGCAAATGG--TA-ATAAGAATGG-AAGTTATTATGGTA
389 TGGGT-AAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTA
*
1475 ATAAAAAAGGAAAAAT-GGAA-CGTGATTCGAGATTTATTCGATGG-TGAGATCCAGCACAAATT
453 AT-AAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATT
1537 A
517 A
*
1538 TGGATTCTCGACAACTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
* * * *
1603 CTAAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTAAGTATGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCG-ATTAT
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
* * *
1667 A-TTTAATTCAG-TTTGTCGTATATATATTAAATATA-ATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTAT
131 ATTTTAATTCTGTTTTGT-ATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTAT
*
1729 ATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTTATAAATATGAAGAGATTCATGACAATTGA
195 ATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGAC-ATTGA
*
1794 ATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTTAAATGTA
259 ATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTA
*
1859 TAGAGAATTGTTATT-AAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATATGAAA
324 TAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAA
* *
1923 TCGGT-AAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTTGATTATGGCA
389 TGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAG-TGATTATGGTA
1987 ATAAAAAGGAGAAAATGGGAAT-GTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCAC-AATT
453 ATAAAAAGGA-AAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATT
2050 A
517 A
* *
2051 TGGATTCTCGACAGC-CGAGTGAGCAGAATCGTATCAT-ATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
* *
2114 CTGAAGCTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGAAAGTTC-TATGGAAGTTT-TGCATTTTCGTATTAT
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
* *
2177 ATTTTAATTCTGTTTTCGTATATATATATTAAATATATATGATTGTACATTTAAT-GCTTTTTAT
131 ATTTTAATTCTGTTTT-GTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTAT
* *
2241 A-CAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTTAT-AATATG-AGAGATTCATGACATTGAA
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*
2303 TGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGAATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTAT
260 TGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTAT
*
2368 AGAGAACTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAAT
325 AGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAAT
* * *
2433 CGATAAAAGAACCTGTATGAATTT-ACAAAT-GTTTAGATAAGAATGGAAAGTTATTATGGTAAT
390 GGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAAT
* *
2496 AAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTCGAGATTTATTCGATAGTTGAGATCCAGCACAAATTA
455 AAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
* * * *
2559 TTGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGAGAGAATCGTATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTC
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAG-CAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTC
* *
2624 CCTGAAGCTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTGGTATTA
65 CCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTA
* *
2689 TATTTTAATTCTGTTTTCGTATTATATATATTAAATATATATGATTGTACATTTAAT-GC-TTTT
130 TATTTTAATTCTGTTTT-GTA-TATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTT
* * * *
2752 -TACAAGATGGATCAAATCGTAAAAACAAAAAATATTT-ATAAATA-GAAGAGATTCATGACATT
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*
2814 GAATGGATGTGAGAAT-GTATGTTGTTGGATAGCATGAATATGATGATGTTGCAAATTT-AAATG
257 GAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATG
*
2877 TATAGAGAACTGTTATTCAAAATAACTAATTGTGTGTATACAA-TAAAGAGTTTGAAATGATACG
322 TATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAA-TGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACG
* * *
2941 AAATCGGATAAAAGAGCCTGTATGAATTTAGCAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT--TTATA
386 AAAT-GGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTAT-
* * *
3004 TGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGGAATCGTGATTCGAGATTTATTCGATAGTTGAGATCCAGCAC
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*
3069 AAAATA
512 AAATTA
*
3075 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATTTGTGATGA-TAGTCC
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
*
3139 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGTATTTTCGTATTAT
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
* **
3204 ATTTTTAATTGTGTTTTTGT-TATATATA-TAAATATATATAACAGTAAGATTTAATGGCTTTTT
131 A-TTTTAATTCTG-TTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGT-AGATTTAATGGCTTTTT
* *
3267 ATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTC
193 ATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTG
* *
3332 AATGGCTGTGAGAATGGTATGTTGTTTGG-TAAGC-T-TGTATGATGATGTTGCAAATTTAAAAT
258 AATGGATGTGAGAATGGTATGTTG-TTGGAT-AGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAAT
* * *
3394 GTATAGAG-ATTGTTATTCACAATAACTAA-GTGTGTATAAAATTAAAGAGTTTGATA-GATACG
321 GTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACG
* *
3456 AAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTAATTACGG
386 AAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGG
* *
3521 TTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCTAGCAC-AAT
451 TAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAAT
3585 TA
516 TA
*
3587 TGGATTCTCGAACATCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTC
1 TGGATTCTCG-ACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTC
* * *
3652 CCTGAAACTTTCTTGTTGCCATTTTCTCGATAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTA-TA
65 CCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTA
* *
3716 TATTTTTAATTGTGTTTT-TGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTA
130 TA-TTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTA
* * *
3780 TA-GAAATGGAT-TAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACAGATG
194 TATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACA-TTG
* *
3843 AATAGAATGATGAGAAT-GTATGTTGTTGGATAG-ATGTATATGATGATTTTGCAAATTTAAAAT
258 AAT-GGATG-TGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAAT
* * *
3906 CTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATAAAATTAAAGAGTTTGATTAT-ATAC
321 GTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGA-AATGATAC
* * *
3970 GAAATGGGTAAAAAGAACCTTGTATG-A-TTGACAAATCGTTTAG-TAATAATGGAAAG-GATTA
385 GAAATGGGT-AAAAGAACC-TGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTA
* * ** * * *
4031 T-GTGAT-AAAAGG-AGAATGAAAATC-TGAATTAGA-ATTAATTCGATGGTGGAAATCCAGC-C
448 TGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTG-ATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCAC
4090 ACAATTA
512 A-AATTA
4097 TGGATTCTCGACAGCTCGA-TAGGAGGCAGTATCGGATTCATAA-ATAAGC-ATCTGTGATGATT
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGT--GA-GCAGTATCGGA-TCATAATAT-AGCAATCTGTGATGATT
* * * *
4159 AGT-CCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTAAGTAAGTCCATTTGGGAAGTTTCTTGCATTTTC
61 AGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATAT-GGAAGTTTC-TGCATTTTC
* *
4223 GTATTATATTTTAATTC-GTTTTCTTACATATATATGTTAAATAT-TATAATTGTAGATTTAATG
124 GTATTATATTTTAATTCTGTTTT-GT--ATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATG
*
4286 GCTTTTT-TAT-AAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAAT-CTTGATAAATATGAAGAGATTCAT
186 GCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCAT
*
4348 GACATTTG-ATGG-TGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGC--ATT
251 GACA-TTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATT
*
4409 T-AAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT-ACTAATGTGTGCT-TAAAATTAAAGAGTTTGAAA
315 TAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTG-TATACAATTAAAGAGTTTGAAA
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*
4534 A-T-TGGT--TATAAAGGAAAAAT--GAATCGTGATTAGA-ATTTATTCGATGGTTGAGATCCAG
444 ATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAG
4592 CACAAATTA
509 CACAAATTA
*
4601 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTTC
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*
4666 CTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCT--CTAAGTTCATATAGGAAGTTTCTGCATTTTCGT-TTA
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATAT-GGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTA
* *
4727 TATTTTAATTGTGTTTT-TGT-T-TATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGC-TTTT-T
130 TATTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTAT
*
4787 ATAAAATGGATGAAATCGTAAAATAAG-AATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAA
195 ATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAA
4851 T-GATGTG-GAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTAT
260 TGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTAT
* * * *
4914 AGAGAATTGTTATTC-AAATAACTAATGTGTGTATAAAATTCAAGAGCTTGATATGATACGAAAT
325 AGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAAT
*
4978 GGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTAT
390 GGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAAT
* *
5043 AAAAAGGAGAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAACACAAATTA
455 AAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
*
5106 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCAT-ATATAGCAATCAGTGATGATTAGTCC
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
* *
5170 CTGAAACTTTCTAGTTGCCA--TT-TAAGTAAGTTCATAT-GAAGTTT-TGCATTTTCGTGTTAT
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
* *
5230 A-TTTAATTGTGTTTTATA-ATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
131 ATTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
5293 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
196 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
5358 GGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATA
261 GGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATA
* * * *
5423 GAGAATTTTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATAAAATTCAAGAGTTTGATATGATACGAAATG
326 GAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATG
5488 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTAA-
391 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGG-TAAT
* *
5552 AACAAGGAGAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
455 AAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
5615 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAG-CC
1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
* *
5679 CTGAAACATTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
* * *
5744 ATTTTAATTGTGTTTT-TGTATATGTATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
131 ATTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
5808 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
196 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
5873 GGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATA
261 GGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATA
* *
5938 GAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATAAAATTAAAGAGTTTGATATGATACGAAATG
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*
6003 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATA
391 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATA
* *
6068 AAAAGGAGAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAACACAAATTA
456 AAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
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1 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCC
* * * *
6194 CTGAAACATTCTAGTTGCCAGTTTCTAGGTAAGTTCATATAGATGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
* *
6259 ATTTTAATTGTGTTTTG--TATATGTATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
131 ATTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
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196 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
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* *
6452 GAGAATTGTTATTC--AA-AACTAATGTGTGTATAAAATTAAAGAGTTTGATATGATACGAAATG
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*
6514 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGA--ATGGTTATA
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*
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* *
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* *
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* * * *
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*
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* *
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* *
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131 ATTTTAATTCTGTTTTGTATATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
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196 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
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261 GGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATA
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326 GAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATG
*
7527 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAAT-GTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATA
391 GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATA
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456 AAAAGGA-AAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
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*
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66 CTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCT-AGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTA
*
7778 TATTTTAATTGTGTTTTG--TATATATATTAAATATATAT-ATTGTAGATTTAATGGCTTTTTAT
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*
7840 AT-AAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTT-AT-AATATGAAGAGATTCATGACATTAAA
195 ATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAA
*
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* *
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** * *
8094 AAAAAGGAAAAAATGTTAATCGTGATTCGAGATTTATTCGATAGTTGAGATCCAGCACAAATTA
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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* * *
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* *
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*
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*
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*
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*
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* * * *
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*
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517 A
*
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* * *
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*
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*
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*
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* * * * *
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* *
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* *
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* * * *
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* *
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*
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* * * *
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*
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*
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* *
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* * * * *
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*
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ACCGGGCTAAGTC
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* * * * * *
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** * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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*** *
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* * * *
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* *
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66 GAACGAGTCA-CTAAA
*
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12142 TACGTGATTT
Statistics
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GAACGAGTCACTAAA
Found at i:15231 original size:517 final size:516
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13482 ACATTTCGTA
*
13492 TATATATATTAAATATATATAATTGTAAATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
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*
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*
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* *
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*
13881 GAGCAGTATCGGATCATTATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-
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*
13945 TTTCTATGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTCTG-TTTTG
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* *
14136 TGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTTTTATTTAAAAT
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**
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* *
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* * * *
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* * * * *
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325 CGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGT
14909 GAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAT
390 GAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAT
*
14974 TTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTG
455 TTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTCTGTTTTTG
*
15036 TATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
1 TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
15101 AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGT
66 AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGT
15166 TGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT
131 TGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT
15231 AACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGA
196 AACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGA
* *
15296 ATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATATG-AAGTTATTAT-GTAAT-AAAAGGAAAACGATGGGA
261 ATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAAT-GGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAA--ATGGGA
*
15358 ATCGTGATTCGAGATTTATTCGCAT--TTGA-ATCCAGCAC-AATT-TGGATTCT-GACAGCTCG
323 ATCGTGATTAGAGATTTATTCG-ATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCG
*
15417 -GTGAGGC-GTATCGAGAT-AT-ATATAGCAATCTGTGAT-AGTTAGT-CCTAAAACTTTCTAGT
387 AGTGA-GCAGTATCG-GATCATAATATAGCAATCTGTGATGA-TTAGTCCCTGAAACTTTCTAGT
* * * *
15476 TGCCAGTTACTAAGTATGTTCATATGGAAGTTTTCATGCATTTTCG-ATTATATTTTAAATTCT-
449 TGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAG-TTTC-TGCATTTTCGTATTATATTTT-AATTCTG
*
15539 TTTTCG
511 TTTTTG
15545 TAATATATATTAAATATATATAA-TGTACTATTTTAATGGCTTTTTTATATAAAATGGAGATCGA
1 T-ATATATATTAAATATATATAATTGTAC-A-TTTAATGGC-TTTTTATATAAAAT-G-GATC--
15609 AAATCGTAAAATAAGAAATATGTT-ATAAATATGAAGA-ATTCATTGACATTGAA-GTGATGTGA
58 AAATCGTAAAATAAGAAATAT-TTGATAAATATGAAGAGATTCA-TGACATTGAATG-GATGTGA
15671 GAATGGTATGTTGTT-GATTAGCATGT-TAT-ATGGATGTTGCAAATTT-AAATGT-T-G-GAA-
120 GAATGGTATGTTGTTGGA-TAGCATGTATATGAT-GATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAAT
* *
15728 TGTTATTTAAAATAACTAAT-TGTGTGA-ACAAATTAAAGATTTTGAAATGATACG-AATCGGTA
183 TGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGT-ATAC-AATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTA
* * * * *
15790 AAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATTGTTTACCATAAGAATGGAAAGTGATTATGGCAACACAA
246 AAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTA-GATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAA
* * *
15855 AGGAGAAATGGGAATTGGAGATTAGAGATTTATTCGATGG-T-AGTATCCAGCACAAAAATTAAT
310 AGGAAAAATGGGAA-TCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAG-ATCCAGCAC--AAATT-AT
* *
15918 GGA-TCTCGACAGCTCGAGTGAG-ATTATCGTATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGT-CC
370 GGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCC
* * *
15980 TGAAGCTTTCTTAGTTGCCA-TTTCTATGTAAGTTCATATGGAAGTTT-TACA-TTTCGTA-TAT
435 TGAAACTTTC-TAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTAT
*
16041 ATTTT-ATTCTGTTTTCGTA
499 ATTTTAATTCTGTTTT--TG
* * *
16060 TATATATATTAAATATATATGATTGTACATTTAATGGCTTTTTATACAAGATGGATCAAATCGTA
1 TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
* *
16125 AAATAAGAAATATTTAATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTAAAGAATGGTATG
66 AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGT-GAGAATGGTATG
16190 TT-TTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAGAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATT-AAA
130 TTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA-AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAA
* * *
16253 ATAACTAATTTGTGTAT--ATTTAAAAGAGTTTGAAATGATTCGAAA-CGG-AAAAG-ACCTGTA
194 ATAACTAATGTGTGTATACAATT-AAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTA
* *
16313 TGAATTTAAC-AAT-GTTGGAGATAAGAATGGAACGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGG
258 TGAATTTAACAAATGGTT-TAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGG-AAAAATGG
* *
16376 GAATCGTGATTCGAGATTTATTCGATAGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTC
321 GAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTC
* * *
16441 GAGTGAGCAGAATCGTATCATAATATATGCAATCTGTGATGA-TAGT-CCTGAAGCTTTCTAGTT
386 GAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATA-GCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTT
16504 GCCATTTT-TAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTTCTGCATTTTCGTATATTATATTTTAATTCT
450 GCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAG--T-TTCTGCATTTTCG--TATTATATTTTAATTCT
**
16568 GTTTCGG
510 GTTTTTG
* * *
16575 ATATATATATTAAATATAT-TTATT-TACATTTAATGGCTTTTTATACAAGAT-GATCAAATCGT
1 -TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGT
*
16637 AAAATAAGAAATATTTTAT-AATATGAAGAGA-TCATGACATTGAATGGATGTGAGATAT--TAT
65 AAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGA-ATGGTAT
*
16698 GTTGTTTGGATAGCATGAATATGAT-ATGTTGCAAATTT-AAATGTATAGAG-A-TGTTATATC-
129 GTTG-TTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTAT-TCA
*
16758 AAATAACTAATGTTGTGTATACAATT-AAGAGTTTGAAATGATACGAATATCGATAAAAG---CT
192 AAATAACTAATG-TGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAA-ATCGGTAAAAGAACCT
* *
16819 GTATTGAATTTAGCAAATGGTTTAGATAAGAATGG-AAGTTATTATGGTAAT-AAAAGGAAAAA-
255 GTA-TGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAT
* *
16881 -GGAATCGTGATTCGAGA-TTATTTCGATAGTTGAGATCCAGCACAAATTATGG-TTCTCGAC-G
319 GGGAATCGTGATTAGAGATTTA-TTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAG
*
16942 CCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCAT-ATATAAG-AATCTGTGATGATTAGTCCTTG-AACTTTCT
383 -CTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATAT-AGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCT
* * * *
17004 AGTTGCCAGATTTCCAAGTATGTTCATATGGAAG-TTCTGCATTTTCGTATTTGATATTTTAATT
446 AGTTGCCA-TTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTA-TT-ATATTTTAATT
*
17068 CTGTTTTCG
508 CTGTTTTTG
17077 TATATACATATT-AATAT-TATAATTGTA-ATTTAATGGCTTTTTATAT-AAATGGATCAAATCG
1 TATAT--ATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCG
* *
17138 T-AAATAAGAAATATTTTAAAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTAT
64 TAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTAT
*
17202 GTTGTTTGGATAGCATGAATAATGATGATGTTGCAAATTTAATAAATGTATAGAGAATTGTTA-T
129 GTTG-TTGGATAGCATGTAT-ATGATGATGTTGCAAATTT-A-AAATGTATAGAGAATTGTTATT
* * * *
17266 CACATAAT-ACTAACGTGTGTGTAAAATTAAAGAGTTAGAAATGATACGAAAT-GGTAAAAGTAA
190 CA-A-AATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAG-AA
* * * *
17329 -CTGAACAGGAATTTAAC-AATGGTTTAGATAAGCATAGAAAGT-ATTATCGG-AATATAAAAGG
252 CCTG--TATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTAT-GGTAATA-AAAAGG
17390 AAAAAT-GGAATCGTCGATTAGCAAGATTTATTCGAATGG-T-AGATCCA-C-CAAATTAT-GA-
313 AAAAATGGGAATCGT-GATTAG--AGATTTATTCG-ATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGAT
* * * * * *
17448 T-TCGACAAC-CGA-TGAGTAGTATTGGAT-ATAATATAGC-ATTTGTGATGGTTTAGTCCCGGA
374 TCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGAT-GATTAGTCCCTGA
* * ** *
17508 AAC-TTCTAGTTGCAAATTTTCTAGGTAAGTTC-TATGGAA-TTTCTAC-GGTTCGTTTTATA-T
438 AACTTTCTAGTTGC-CATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATT
* *
17568 TT-ATTAT-TGTTATG
502 TTAATTCTGT-TTTTG
* * * * *
17582 TATATA-ATTAAATATAGTATAATTTTAGATTTATTGGCTTTTTTTAGCACAAATGG-TCAAATC
1 TATATATATTAAATATA-TATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATA-TA-AAATGGATCAAATC
* *
17645 GTGAAATAAGAAATCTTTGATAAGATATGAAGA-ATTCATGGACATT-AA-GGATGT--GAATGG
63 GTAAAATAAGAAATATTTGATAA-ATATGAAGAGATTCAT-GACATTGAATGGATGTGAGAATGG
* * * *
17705 TGAATGTT-TTTG--AGCACGGT-TAAGTTAGATG-TGCAAATTTACAAATGT-TAGGAGAATTG
126 T--ATGTTGTTGGATAGCA-TGTATATGAT-GATGTTGCAAATTTA-AAATGTATA-GAGAATTG
* * * * * *
17764 TTA-TAAAAATAACTAATGTGTGTATATATATTATAGCGAGTTTTAAAATTATATCCGAAATGGG
185 TTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACA-ATTA-A-AGAG-TTTGAAATGATA--CGAAATCGG
* * * * *
17828 TAACAGAAACTGTAAGAATTT-AC-AATGG-TTAGACT---AAT-GAAAGTAATTAT-GTTATAA
244 TAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGA-TAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAA
*
17885 AAAGGGGAAAAT-GGAATCG-GATTAGAGATTT-TATCGATGTGGTT-AGATCCAGCACAAATTA
308 AAA-GGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTAT-TCGA--TGGTTGAGATCCAGCACAAATTA
* *
17946 T-G--TCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGAATCGTATCATAATATAGCAATACT-TAGAAATGATTA
369 TGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT-CTGT-G--ATGATTA
* *
18007 GTCCCTG--GCTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAA-TTTCTTGCATTTTC-A
430 GTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC-TGCATTTTCGT
*
18068 ATTTATATTTTAATTCTGTTTTCAG
494 A-TTATATTTTAATTCTGTTTT-TG
* *
18093 TATATATATATTAA-ATATATAATTGTACATTTAATGG-TTTTTATAACAAAATGGATCAAATCG
1 TATATATAT-TAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTAT-ATAAAATGGATCAAATCG
* * * *
18156 TAAAATAA-AGAATA-CTGATAAATAGGCAGAGATT-ATGA-ATTGAATGGATGT-TGAATGGTA
64 TAAAATAAGA-AATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTA
*
18216 TGTTG-TGGATAGCATGTATATAGATGATGTTGGCAGATTTAAACATGTATAGAGAATTGTTATT
128 TGTTGTTGGATAGCATGTATAT-GATGATGTT-GCAAATTTAAA-ATGTATAGAGAATTGTTATT
* *
18280 C-AAATAACTAATGTGTGTTATA-ATATTAAAGAGTTTGAAACGATACGAAATGGGT-AAAG-AC
190 CAAAATAACTAATGTGTG-TATACA-ATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAAC
18341 CTGTAT-AA-TTAAC-AATGGTTTAGAT-AG-ATGGAAAAGTGATTATGGTAAT--AAAGGAACA
253 CTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGG-AAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAA-A
* *
18399 AATGAAGAATCGTGA-TAGAGATTTATTCAGATGGTTGAGATGCAAGCAC-AATTATGGATTC-C
316 AATG-GGAATCGTGATTAGAGATTTATTC-GATGGTTGAGAT-CCAGCACAAATTATGGATTCTC
* * * * *
18461 GACAGCTTCG-GTGAGTTCAGAAGCGGGATAAAAATATAGCAATTTGTGATGGATTAGTCCCTGA
378 GACAGC-TCGAGTGAG--CAGTATC-GGATCATAATATAGCAATCTGTGAT-GATTAGTCCCTGA
* *
18525 AGC-TTCTAGTTGCAATTTGTCTAGGTCAAGTAGTC-TATTGGAAG-TTCTGCATTTTCGTATTA
438 AACTTTCTAGTTGCCATTT-TCTAGGT-AAGT--TCATA-TGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATT-
*
18587 ATCATTTTAATTGTGTTTTTG
497 AT-ATTTTAATTCTGTTTTTG
* *
18608 TATATATATTGAATATAT-T-ATTGTAGATTTTAATGGCTTTTT-TATACAATCATGGATC-AAT
1 TATATATATTAAATATATATAATTGTACA-TTTAATGGCTTTTTATATA-AA--ATGGATCAAAT
* * * * *
18669 TGTAAAA-GAGAAATACTTGAATAAATAGAGAAGAGATTCATGACA-TGAATGGATGTATAGAAT
62 CGTAAAATAAGAAATATTTG-ATAAATA-TGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGT-GAGAAT
*
18732 GGTATGTTGTT-GATAGCATGTATATGGGATGATGTTG-AAATCTAAAATAGT-TATGAGACATT
124 GGTATGTTGTTGGATAGCATGTATAT--GATGATGTTGCAAATTTAAAAT-GTATA-GAGA-ATT
* * * * * *
18794 GGTTA-TCAAAATCAA-TAATGTGTGTATAAAACTCAAGAGTTTGATATGAAACGAAATGGGTAA
184 -GTTATTCAAAAT-AACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAA
* * *
18857 AAGACCCTGTATGAATTTAACAAAAGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGCATTATGGTTATAAAAA
247 AAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTG-ATTATGGTAATAAAAA
* *
18922 GGAGAAATGCGAATCGTGGGATTAGAGAGGTTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGG
311 GGAAAAATGGGAATCGT--GATTAGAGA--TTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGG
18987 ATTCTCGACAGCTCGATGTGAGCAGTA-CGGATCATAATATAGCAATCTGTGTATGATTAGTCCC
372 ATTCTCGACAGCTCGA-GTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTG-ATGATTAGTCCC
19051 TGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCT-GGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATA
435 TGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATA
19115 TTTTAATTCTGTTTTTG
500 TTTTAATTCTGTTTTTG
19132 TATATATATATAAA-ATATAT-ATTAG-AC-TTTAATGGCTTTTTATATAAAAGATGGATCAAAT
1 TATATATAT-TAAATATATATAATT-GTACATTTAATGGCTTTTTATAT-AAA-ATGGATCAAAT
*
19193 CGTTAAAATAAGAAATA-TT-ATAAATATGAAGAGATTCATGACA-TGAAT-AATGTGAGAATGG
62 CG-TAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGG
19254 TATGTTGTTGGA-AGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTC
126 TATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTC
19318 AAAATAACTAATGTG-GTATACAATTAAAGAGTTTGAAATTGATACGAAAT-GGTAAAAGAACCT
191 AAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAA-TGATACGAAATCGGTAAAAGAACCT
*
19381 GTATGAATTTAAC-AATGGTTTAAGAT-AGAATGG-AAGTGATTATGGTTATAAAAAGG-AAAAT
255 GTATGAATTTAACAAATGGTTT-AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAT
19442 -GGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGA-TCTCGACAGC
319 GGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGC
* *
19505 TCGAGTGAGCAGTATC-GATCATTATATAGCAATCTGTGATGATTAGT-CCTG-AACTTTTTTAG
384 TCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAAC-TTTCTAG
* *
19567 TT-CCAGTTTC--GCGTAAGTTGATATGGAAGTTTCT-CATTTTCGTATTATATTTTAATTGTTC
448 TTGCCATTTTCTAG-GTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTTAA---TTC
*
19628 TGTTTTCG
509 TGTTTTTG
*
19636 TATATATATTAAATATATATAATTGTA-ATTTAATGGCTTTTTATA-CAAATGGATCAAATCGTA
1 TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
* ** * * *
19699 AAATAAGAAATA-TT--TAAACATGAAGAGATTCATGACATTGAATGCTTGGGAGAATCGTAAGT
66 AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGT
*
19761 TGATGGATAGCATGTATATGATGATGTTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAAAATTGTTATTC--
131 TGTTGGATAGCATGTATATGATGATG-TTGCAAATTTAAAATGTATAGAG--AATTGTTATTCAA
* *
19824 AATAACTAAATGTGTGAAATTAC--TTAAAGAGTTTGAAATGATTACGAAATGGGTAAAAAAGAA
193 AATAACT-AATGTGTG-TA-TACAATTAAAGAGTTTGAAATGA-TACGAAATCGGT--AAAAGAA
19887 CCTGTATGAAATTTAACAAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAA-TGAATTATGGTAATAAAAAGGA
252 CCTGTATG-AATTTAAC-AAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTG-ATTATGGTAATAAAAAGG-
*
19951 AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGAGATTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCT
313 AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGA-TTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCT
* *
20016 CGACAGGCTCGAGTTGAGCAAAAG-AGCGGAT-AAAATATAGCAAT-TGTGATGATTCAGTCCCT
377 CGACA-GCTCGAG-TGAGC---AGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATT-AGTCCCT
* * *
20078 CGAAGCTTTCTAGTTGCAATTTCTGTAGG--AGTTCATATGGAAGTTTCTGCAATTTTCGTATTA
436 -GAAACTTTCTAGTTGCCATTT-TCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGC-ATTTTCGTATTA
20141 TATTTTAA-T-TGTTTTTAG
498 TATTTTAATTCTGTTTTT-G
*
20159 T-TATATATATAAATATAATATAA-T-TAGATTT--TGGCTTTTTATATACAAAT-GATCAAATC
1 TATATATAT-TAAATAT-ATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATA-AAATGGATCAAATC
* *
20218 GTAAAATAAGAAA-ATTTGATAAATATGAAGAGATTCATAACATTGGAAT-G-TG-AAGAATGGT
63 GTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATT-GAATGGATGTGAGAATGGT
20279 ATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATG-TGCGAAA-TT-AAAT-TATAGAGAATTGTTATTC
127 ATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGC-AAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTC
*
20340 -AAATAACTAATGTGTGTATA-AATAACTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGAGGTAAAAGAA
191 AAAATAACTAATGTGTGTATACAAT---TAAAGAGTTTGAAATGATACGAAAT-CGGTAAAAGAA
*
20403 CCTGTATGAATTTAA-AAATGG-TTAGATAAGAATGGAAAAT-A-TA-GGTAATAAAAAAGG-AA
252 CCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAAT-AAAAAGGAAA
*
20462 AAT-GGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGA--G-TGAGAATCCAGCACAAA-T-T-GA-ACTCGA
316 AATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAG-ATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGA
* *
20519 CAGCGCTCGAGTGAGCAGTAACGGATCATAATATAGCAAACTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTT
380 CA--GCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTT
20584 TCTA-TTGCCATTTT-TAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTT-ATT
443 TCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTTAATT
*
20646 GCTGTTTTCG
508 -CTGTTTTTG
* * *
20656 TA-ATA-A-TATATAAAT-TAATTGTA-ATTTAATGGCTTTTTATAAAAAATGGATCAAATCGTA
1 TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
* *
20716 AAATAAGAAATACTT-ATAAATATGAAGAGATTCATGACAATGAAT-GATGT-AGAATGGTATGT
66 AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGT
20778 TGTTGGA-AGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATT--AAAT
131 TGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT
*
20840 AACTAATGTGTGTAT-CATATTAAAGAGTTTGAAATGAT-CGAAA-GGGTAAAAGAACCTGTATG
196 AACTAATGTGTGTATACA-ATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATG
*
20902 AATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGGAATAAAAAGGAAAAATGGGAAT
260 AATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAAT
*
20967 CGTGATTAGAGATTTA--CGATGGTTGAGATCCAGCAAAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGT
325 CGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGT
* * * * *
21030 GAGCAG-AGGCGGATCAAAATATAGCAATTTCTGATGATTAGTCCCTGAAGCTTTCTAGTTG-CA
390 GAGCAGTA-TCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA
*
21093 TTTTCTAGGTAAGTTCATATGGTAGTTTCTGCA-TTTCGTTACTTATA-TTTAATT-TGTTTTTG
454 TTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCG-TA-TTATATTTTAATTCTGTTTTTG
* *
21155 TATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATACAAAATGGATCAAATCGTA
1 TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
* * *
21220 AAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTAAATGGATGTAAGAATGGTATGT
66 AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGT
* * *
21285 TTTTGGATAGCACGTATATGACGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT
131 TGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT
* * * * *
21350 AACTAATGTGTGTATA-ATATTAAAGAGTTTAAAATTATACGAAATGGGTAACAGAACCTGTAAG
196 AACTAATGTGTGTATACA-ATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATG
* *
21414 AATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTAATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAAT
260 AATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAAT
21479 CGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGT
325 CGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGT
* * *
21544 GAGCAGAATCGTATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTG--GCTTTCTAGTTGCCAT
390 GAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-
* **
21607 TTTTCATA-G-AAGTTTCATATGGAAG-TTCT-CGAGCTTTCAACATTATATTTTAA-T-TG--T
454 TTTTC-TAGGTAAG-TTCATATGGAAGTTTCTGC-A-TTTTC-GTATTATATTTTAATTCTGTTT
21664 TTG
514 TTG
*
21667 -ATATATATTATAA-ATATAATAATTGTACATTTAA-GTGCTCTTTTATA-CAAATGGATCAAAA
1 TATATATATTA-AATATAT-ATAATTGTACATTTAATG-GCT-TTTTATATAAAATGGATC-AAA
* * * *
21728 TCGTAAAATAAAGAAAATACTTGATAAAAATGCAGAAGA-TCATGACATTGAATGAATGT-AGAA
61 TCGTAAAAT-AAG-AAATATTTGATAAATATGAAG-AGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAA
21791 TGGTTATGTTGGTTTGGATAGCATGTATATTGATGATGTTTGCAAAATTTAAAATGTATAGAGAA
123 TGG-TATGTT-G-TTGGATAGCATGTATA-TGATGATG-TTGC-AAATTTAAAATGTATAGAG-A
* * * * *
21856 ATTATTTATTC-AAATAAACTAATGTGTAGTA-ATAATATAAAAAGTGTGAAACAGATA--AACG
181 ATT-GTTATTCAAAAT-AACTAATGTGT-GTATACAAT-TAAAGAGTTTGAAA-TGATACGAA--
* *
21917 AT-GGGAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAAT-GAAAGTGATTTATAGT
239 ATCGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGA-TTATGGT
* * *
21980 AATAAAAGGGAAAAAATGTGAATCGTGA-TAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAAA
303 AATAAAAAGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAAT
* * * *
22044 TATGGATTCTCGACAGCTCGAGAATGAGCAGAAGCGGAT-ATAAAATTAGCAATTTGTTGATGAT
367 TATGGATTCTCGACAGCTCGAG--TGAGCAGTATCGGATCATAATA-TAGCAATCTG-TGATGAT
22108 TAGTCCCTTG-AACTTTCTAGTTGCCATTTTCT--GT-AGTTCATATGGAAGTTTTCTGCATTTT
428 TAGTCCC-TGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAG-TTTCTGCATTTT
22169 CGTATATATA
491 CGTAT-TATA
22179 CTCTCCAAAA
Statistics
Matches: 7260, Mismatches: 403, Indels: 1009
0.84 0.05 0.12
Matches are distributed among these distances:
491 25 0.00
492 9 0.00
493 30 0.00
494 56 0.01
495 102 0.01
496 60 0.01
497 97 0.01
498 31 0.00
499 110 0.02
500 96 0.01
501 152 0.02
502 193 0.03
503 132 0.02
504 221 0.03
505 205 0.03
506 234 0.03
507 160 0.02
508 334 0.05
509 379 0.05
510 420 0.06
511 396 0.05
512 342 0.05
513 563 0.08
514 531 0.07
515 356 0.05
516 280 0.04
517 430 0.06
518 253 0.03
519 57 0.01
520 119 0.02
521 72 0.01
522 149 0.02
523 187 0.03
524 122 0.02
525 98 0.01
526 57 0.01
527 54 0.01
528 23 0.00
529 46 0.01
530 29 0.00
531 31 0.00
532 14 0.00
533 5 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.09, G:0.19, T:0.35
Consensus pattern (516 bp):
TATATATATTAAATATATATAATTGTACATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA
AAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGT
TGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAT
AACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGA
ATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATC
GTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTG
AGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATT
TTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTCTGTTTTTG
Done.