Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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* * *
1 ACGAATATCATGAATACTAATACCCAAT-CTTTTAGGCGGACACAAATTCTTTCCAC-GGAATAT
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** *
64 --CCC-A-ATTACCCTCTTTCCTTTCCAGGACCACC-AA-T-TGC-TATC-TT-AT-AGAGCTCC
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* * * * *
118 TCGATCACAAT-CTAATTGTCCAA-CTACATGTAAATCACAAAATTTT-CAAAGTATGTAGTGTT
127 TCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGT-AATCGC-AAATTTTCCAAAGTATGTTGTG-T
* * *
180 TTGTAACGCCTTAAAAATTAGGTCTACTAGTTTTGGAGTGAGGTTTATC-GGTAT-CGGGTGAAT
189 TTGTAACGCC-CAAAAAATAGGTCTACTAGTTTT-GAGT-AAGTTTATCGGGT-TCCGGGTGAA-
* * * * **
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249 AG-TAGGAGTTAATCGGGTTTACT--A-GTTAAT-TTAAAAAAAAAT-TAG-TTAGC--TTAATT
* * *
306 TCA-TTACAATCGGTTAAAT--TATTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAGAAATCATTTTATTG
305 TCAGTTAAAAACGG-TAAATAATATTCC-GAAAAT-AAAATA-TTTTAGAG-AATCAATTTA-TG
* * * *
368 GTATTTAAAATTTTTTTGGTTAAGAATAAGTATTTCATT-GAAAA-T--T-AAATGGGGTTCATT
364 GT-TTT-AAATATTTTTGGTT-A-AATAA-TATTTTATTGGAAAATTAATAAAAT-GGGTTTAAT
*
428 TGGAGAGAAGTATACAATATTAACTAAATATGTATATAAT-A-TT-C--AAAATTAAAAA-ATTT
423 T-GAGAGAAGT-TACAATATTAACTAAATAGGTATA-AATGATTTCCGGAAAA-TAAAAATATTT
*
487 GGTAGAAAAATATC
484 -TTAGAAAAATATC
*
501 ACGAATAGCATG-ATACTAATACCCCATCCTTTTTAGG-TGACA-AATTCTTCCACGGGAGTATC
1 ACGAATATCATGAATACT-ATACCCCATCC-TTTTAGGCTGACACAATTCTTCCACGGGAGTATC
* * *
563 GCCCAAT-TTTTCCTC-TTCCTTTCTAGACCACCAAATTCTACCTTATC-TTGATAGAAGCT-CT
64 GCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCT-GCTTATCTTTGATAAAAGCTCCT
* * *
624 CGA-CAC-ATCCTAAT-GTCCAACCTACTTTTAATCAACCAAATTTTCC-AAGTATGTT-TG-TT
128 CGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATC--GCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTGTTT
*** * * * *
683 GTAACGCTTTAAAAATAGGTCTACTAGTTTGGGGAGTAAGTTTTTCGTGTTCCGGGTGAATGCTA
191 GTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTT--TGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAG-TA
* * ** *
748 GGAGTTAAT-GAGTTTACTACCATTTCTTT-AAAAAAAATTACTATAGCTTAATTTCA-TTAGCA
253 GGAGTTAATCGGGTTTACTA--GTTAATTTAAAAAAAAATTAGT-TAGCTTAATTTCAGTTA--A
* * * * *
810 AATCGGTGAATAATATTTCGGAAAATAAAAATTTTTTAGAGAATCAATTTTATGGTTATAACATA
313 AAACGGTAAATAATA-TTCCGAAAAT-AAAATATTTTAGAGAATCAA-TTTATGGTTTTAA-ATA
* * *
875 -TTTTGGTTAAATAAGT-TTTCATTTGAAAA-TAATTAAAATGGGGTTTCATTGAGAGAAGTTAC
374 TTTTTGGTTAAATAA-TATTTTATTGGAAAATTAA-TAAAAT-GGGTTTAATTGAGAGAAGTTAC
* * * *
937 AATATGAACT-AAGAGGTATATAATTA-TT-C-G-AAAT-TAAAT-TTTTTAG-AAAATATC
436 AATATTAACTAAATAGGTATA-AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAATATC
* * *
991 ACGAATATCATG-ATACTAAACCCCCATCCATGTTAGGTTTGACACAAATTCTTTCCAC-GGAGT
1 ACGAATATCATGAATACTATA-CCCCATCC-TTTTAGG-CTGACAC-AATTC-TTCCACGGGAGT
1054 ATCG-CC-A-ATTTTCCTCTTTTCC-TTCCTAGACCACCAAA-TCTGCTTA-C-TTGATAGAAAG
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* ** * * *
1112 CTCCTCCGATCACAATCCGAATTCTCCAA-CTACTTGTAA-CACAAAGTTTTCCAAAGTATGTAG
123 CTCCT-CGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAA-TTTTCCAAAGTATGTTG
* * ** * *
1175 TG-CTGTAACGCCTTAAAAAATAGGTCTAC-AGTTTTGAGTAAGTTTAT-TTG-T-CGAGTG-AT
186 TGTTTGTAACGCC-CAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAA
* ** * ** * * *
1234 GCTA-GAGTTAATAGGG-TTACTACCTATTTCTTTAAAAAAATTACTTAGCTTAATTTCATTTCA
250 G-TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATT-TAAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCAGTTAA
* * *
1297 AATCGGTGAATAATATTCCGGAAAATAAAAAATTTTTTAGAGAGAATCCAATTTATGGTATTT-A
313 AAACGGTAAATAATATTCC-GAAAAT--AAAATATTTT--AGAGAAT-CAATTTATGGT-TTTAA
* * * *
1361 ATATTTTTTGGTTAAATAAGTATTTTCATTGGAAAAATAAATTAAAATGGGGTTTCATTAAAAGA
371 ATA-TTTTTGGTTAAATAA-TATTTT-ATTGG-AAAATTAA-TAAAAT-GGGTTTAATTGAGAGA
* * * *
1426 AGTATACCATACTGAACTAAA-AGGTGGATATAAT-ATTTCCCGAAATTAAAAATATTTTTAGAA
430 AGT-TACAATA-TTAACTAAATAGGT--ATA-AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAG-A
1489 AAAATATC
489 AAAATATC
* ** * *
1497 GA-GCATATCATGAATACTAATACCCCATCCTTGGAGGTTGACACAAATTCTTCCACGGGAGTTT
1 -ACGAATATCATGAATACT-ATACCCCATCCTTTTAGGCTGACAC-AATTCTTCCACGGGAGTAT
* * * *
1561 CGCCCAAATATTTTCCTCCTTCCTTTCATAGACCACCAAATTGCTACTTAGTCTTTGATAGAAGC
63 CGCCC-AATATTTTCCTCTTTCCTTTC-CAGACCACCAAATT-CTGCTTA-TCTTTGATAAAAGC
* * *
1626 TCCTCGATCAC-ATCCT-ATTGTCCAA-CTACTTGTAATCACAAA-TTTCCAAAGAGTTATGTTA
124 TCCTCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCC-AA-AG-TATGTT-
*** *
1687 GTGTTTGTAACG--CTTTAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTT-TCGATGTTCCGGGTG-A
185 GTGTTTGTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCG-GGTTCCGGGTGAA
* * *** ** *
1748 TGTAGGAGTTAATCGAGTTTACTA-CCCATTCTTTAAAAAAATTACATTTAGCGTTAATTTCA-T
249 AGTAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATT-TAAAAAAAAATT--AGTTAGC-TTAATTTCAGT
* * * * *
1811 TTACAACGGTGAAT-ATATTTCGCG-AAATAAAAATATTTTCTAGAGAAAACATGTTTATGGTTT
310 TAAAAACGGTAAATAATA-TTC-CGAAAAT-AAAATA-TTT-TAGAG-AATCA-ATTTATGGTTT
* ** * * *
1874 TAAACTAGTTTT-GTTAAAATAAGTATTCAATTTTGAAAATAAATTAAAATTGGGGTTTCATTGA
368 TAAA-TATTTTTGGTT-AAATAA-TATTTTA-TTGGAAAATTAA-TAAAA-T-GGGTTTAATTGA
* * * * * *
1938 GCAGAAGTTACAATATGACCTAAAGA-GTATATAATTA-TT-C-GAAATTAAAAAT-TTTGTAGA
426 G-AGAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTATA-AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGA
*
1998 AACATATC
489 AAAATATC
*
2006 ACGCAAT-TCATGAAATACTAATACCCCCATCCTTTTAGGTTGACCACAATTCTTCCAACGGGAG
1 ACG-AATATCATG-AATACT-ATA-CCCCATCCTTTTAGGCTGA-CACAATTCTTCC-ACGGGAG
* * * *
2070 --TCGCCC-ATA-TTTCCT-TTTCC-TTCTAGATCA-CAAATTCTGC-TATCTTTGAT-AGAGTT
60 TATCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTTTGATAAAAGCT
** * * *
2126 CCCATCGATCACAATCCTAATTCTC-AA-CTACTTGTAAGGCACAAATTTTTCCAAAGTA-G-TA
125 -CC-TCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAA-TCGCAAA-TTTTCCAAAGTATGTTG
* ** * *
2187 TGCTTGTAACG-CTTAAAAATAGTGTCTTACTAGTTTTTGAGTAAAGATTTATCGTGTTCCGAGT
186 TGTTTGTAACGCCCAAAAAATAG-GTC-TACTAG-TTTTGAGT-AAG-TTTATCGGGTTCCGGGT
* * *** * * *
2251 CG-ATGCAGGAGTTAAAT-GGGTTTTACTACCCATTTCTTAAAAAAAATTACTTAGCTTAATTTC
246 -GAAAGTAGGAGTT-AATCGGG-TTTACTAGTTAATT-TAAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTC
* *
2314 A-TTGACAAATC-GTGAATAATATTCCGGAAAATGAGAAAATATGTATTAGAGAAATC-ATTTAT
307 AGTT-A-AAAACGGTAAATAATATTCC-GAAAAT---AAAATAT-T-TTAGAG-AATCAATTTAT
* * * * * *
2376 -GTTTTAAATATTTTGGGTTAAAATAAGTATTTCATTATGAAAATAAATTAAAA-AGGTTTCATT
363 GGTTTTAAATATTTTTGGTT-AAATAA-TATTTTATT-GGAAAATTAA-TAAAATGGGTTTAATT
* * * *
2439 AAAAGAAGTTACAATA-TAAC-AAAAAGGCCTATATAAT-ATTT-CGG-AAATTAAAATATTTTT
424 GAGAGAAGTTACAATATTAACTAAATAGG--TATA-AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTT
*
2499 -TAAAAA-ATC
486 AGAAAAATATC
* *
2508 ACGAATATCTATGAACTACTAGAACCCCATCCTTTTAGGGTGACACAAATTCTTCCAC-GG-GTA
1 ACGAATATC-ATGAA-TACTA-TACCCCATCCTTTTAGGCTGACAC-AATTCTTCCACGGGAGTA
* *
2571 CCGCCCAATATTTTCCTCTTTTCC-TTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATC-TT-A-AGAAGCCT
62 TCGCCCAATATTTTCCTC-TTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTTTGATAAAAG-CT
* * * * * *
2632 CCTCGATCACAATTTCTAATTTGTCCAACCTACTTG-AATCGGAAAATTTTGTCAAGGTATGTTG
125 CCTCGATCACAA-TCCTAA-TGGTCAAACCTACTTGTAATC-GCAAATTTT-CCAAAGTATGTTG
* * *
2696 TGTTTTGT-ACGCCCTTAAAAATAGATCTCACTAG-TTTGAGTAA--TTATCGAGTTCCGGGTGA
186 TG-TTTGTAACGCCC-AAAAAATAGGTCT-ACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGA
* * * * * * *
2757 AAGCTAGGAGTTTATCAGTTTTACTAGTCACTTTCATTGAAAAAAAATT-GTTATCTTAACTTCC
248 AAG-TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATTT-A---AAAAAAAATTAGTTAGCTTAA-TTTC
* *
2821 ATTTAAAAATCGGTAAATTAATATT-CGAAAAAATAAAAATATTTTTAGA-AATCAGTTTTATGG
307 AGTTAAAAA-CGGTAAA-TAATATTCCG--AAAAT-AAAATA-TTTTAGAGAATCA-ATTTATGG
* * *
2884 TTTTAAATACTTTTTGGTT-AATAAATATTTTATTGAAAAATAAATATAAAATGGAGGTTTCATT
365 TTTTAAATA-TTTTTGGTTAAAT-AATATTTTATTGGAAAAT-TA-ATAAAAT-G-GGTTTAATT
* ** *
2948 GAGAG-AGGTAGTATA-TAACTAAATAGGTATATAACT-A-TTCCGG-AAATAAAAGATATCTTA
424 GAGAGAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTATA-AA-TGATTTCCGGAAAATAAAA-ATAT-TTT
3008 TAG-AAAATATC
485 TAGAAAAATATC
* *
3019 ACAAATATCATGAATACTAATACCCCCATCCTTTTAGGCTTGACACAAATCTTCCACGGGAGTAT
1 ACGAATATCATGAATACT-ATA-CCCCATCCTTTTAGGC-TGACACAATTCTTCCACGGGAGTAT
* * ** *
3084 CGCCCAAATATTTTCCACTTT-CTTTCCAAACCACC-AATTCTGCTTATTACTTAAATAGAAGCT
63 CGCCC-AATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTA-T-CTTTGATAAAAGCT
** * *
3147 CCTCGATCACAA-CCTAATTGACCAAACCTTACTTGTAATCGACAATTTTATTC-AAGTATGTTG
125 CCTCGATCACAATCCTAA-TGGTCAAACC-TACTTGTAATCG-CAAATTT-TCCAAAGTATGTTG
*
3210 -GTTCTTGT-ACGCCCTATAAAATAGGTGCTACTAGTTTTGAGTAATGTTTATCGGGTTCCTGGG
186 TG-T-TTGTAACGCCC-AAAAAATAGGT-CTACTAGTTTTGAGTAA-GTTTATCGGGTTCC-GGG
* * *
3273 TGAAAGCTAGGAGTT-ATCGGGTGTAC-AG-TAATTAACAAAAAAAATT--TTAACTTAATTTCA
245 TGAAAG-TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATTTA-AAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCA
* ** * *
3333 TTTAAAGTCGGTAAGT-ATATTCCAAAAATAAAAATATTTTTA-AGAAATCAATTTTATGGTTTT
308 GTTAAAAACGGTAAATAATATTCCGAAAAT-AAAATA-TTTTAGAG-AATCAA-TTTATGGTTTT
* **
3396 CAATATTTTTTTGGCTTAAAATAA-ATTTTATT-GAAAAAAAATTAAAATGGCGTTTAA-TGAGA
369 -AA-ATATTTTTGG-TT-AAATAATATTTTATTGGAAAATTAA-TAAAATGG-GTTTAATTGAGA
* *
3458 GAAGTTTAACAATCATTAACTAGAATTAGGTATATAAT-A-TTCTGGAAAAATAAACACTATCTT
428 GAAG-TT-ACAAT-ATTAACTA-AA-TAGGTATA-AATGATTTCCGG-AAAATAAA-AATAT-TT
*
3521 ATAGAAATAATATC
484 TTAGAAA-AATATC
* *
3535 ACG-ATATCATGAATACTAATTACCCCATCCTTTTA-GCTGACACAAAACTCTTCCGA-AGGAGT
1 ACGAATATCATGAATACT-A-TACCCCATCCTTTTAGGCTGACAC--AATTCTTCC-ACGGGAG-
* * * *
3597 TATCGCCAAATATTTTCCTCCTTTCCTTTCTAGACCACCAAATTCTGCTTATCCATT-ATAGAAG
60 TATCGCCCAATATTTTCCT-CTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTAT-CTTTGATAAAAG
* * *
3661 ATCCTCGATCACAATTCTAAAT-GTCCAAACCCTACTTGTACTCGC-AATTTT-CAAAG-ATGTT
123 CTCCTCGATCACAATCCT-AATGGT-CAAA-CCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGTT
* * * *
3722 GTGTTTGTAACGCCCTAAAAATTGGTCTAC-AG-TTTGAGTAAATTTATCGGTTTCCGGGTGAAA
185 GTGTTTGTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAA
* * * * *
3785 GCTAGGAGTTAATCGGGTGACCTACTCCTGTCT-CTTTAAAAAAAATTTAGGTAGCTT-A--TCA
250 G-TAGGAGTTAATCGGGT---TTACT--AGT-TAATTTAAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCA
* * *
3846 TTTAAAAATCCGGCAGGTAAACACTATTCCG-AAATAACATATTATTTTTTAGAGAAATGCAAAT
308 GTTAAAAA-----C-GGTAAATAATATTCCGAAAATAA-A-A-TA--TTTTAGAG-AAT-C-AA-
* * * * *
3910 TTTATTGTTTTAAAATATTTTTTGTTGAAAATAAATATTTTAGT-GAAAATAAATATAAA-AGGT
358 TTTATGGTTTT-AAATATTTTTGGTT--AAAT-AATATTTTATTGGAAAATTAATA-AAATGGGT
* * *
3973 TTCATGTGAGGGAGAAGTTACAATATTAAC--AATACGTATTATAAT-A-TTCCAGAAAATAAAA
418 TTAAT-TGA--GAGAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTA-TA-AATGATTTCCGGAAAATAAAA
*
4034 ATATTTATAGAAAAATATC
478 ATATTTTTAGAAAAATATC
4053 ACG-ATATCATGCAA-ACTAATA-CCCATCCTTTTA-GCT-ACACAAATTTCTTCCACGGTGAGT
1 ACGAATATCATG-AATACT-ATACCCCATCCTTTTAGGCTGACAC-AA-TTCTTCCACGG-GAGT
* * *
4113 ATCG-CCAAT-CTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACAAAATTCTTGCTTATCTTTGATAGAAG--
61 ATCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTC-TGCTTATCTTTGATAAAAGCT
* * * *
4174 CCTCGATCACAATCCTAATTGTTCCAA-CTACATGTAATGCGC-AATTTTTC-AAGTATGTTGTG
125 CCTCGATCACAATCCTAA-TGGTCAAACCTACTTGTAAT-CGCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTG
* *
4236 TTTGTAACGCCC-TAAAATAGGATCTACTAGTTTGGAGTAAGTTAATATCGGGTGTCC-GGTGAA
188 TTTGTAACGCCCAAAAAATAGG-TCTACTAGTTTTGAGTAAGTT--TATCGGGT-TCCGGGTGAA
* * *
4299 AGGCTAGGAGTTAAT-GCGG--T-CCAGTT-ATTT-AAAAAAAATTATGTTAACTTTAATTTCAT
249 A-G-TAGGAGTTAATCG-GGTTTACTAGTTAATTTAAAAAAAAATTA-GTTAGC-TTAATTTCAG
* * * *
4358 TTAAAAGTCTGGTAAGTAAGTATTCAGAAAATAAAAATATTTTTTAGAGAATCAATTTTTATGGG
309 TTAAAA-AC-GGTAAATAA-TATTCCGAAAAT-AAAATA--TTTTAGAGAATCAA--TTTATGGT
* * *
4423 TTTCAAT-TTTTTGGTTAATATTAATATTTTATT-GAAAATAAATTAAATGGGTTTAATT-AGAG
366 TTTAAATATTTTTGGTTAA-A-TAATATTTTATTGGAAAATTAATAAAATGGGTTTAATTGAGAG
* * * *
4485 AAGTT-CAATATT-AC-AAATATGTATATAAT-A-TTCTGGAAAATAAAAA-A-TCTTAGAATAA
429 AAGTTACAATATTAACTAAATAGGTATA-AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAA
4543 TATC
493 TATC
*
4547 ACGAATAT-ATGAATTACTAATACCCCCATCCTTTTA-GCTGACACAAACTCTT-CAC-GGAGTA
1 ACGAATATCATGAA-TACT-ATA-CCCCATCCTTTTAGGCTGACAC-AATTCTTCCACGGGAGTA
** * * * * * *
4608 T-GCAAAAAATTTTCC-CCTTCCTTTCTAGACCACGCAAATT-TGATTATC-AT-AT-AAAGATC
62 TCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCAC-CAAATTCTGCTTATCTTTGATAAAAGCTC
*
4667 CTCGATCACAATTCTAAGTTGGTCCAAACCTACTTTGTAATACGCAAATTTTCCAAAGTATG-TG
126 CTCGATCACAATCCTAA--TGGT-CAAACCTAC-TTGTAAT-CGCAAATTTTCCAAAGTATGTTG
* * * ***
4731 TGCTTGTAACGCCCTAAAAATA-GTCTACTAGCTTTTTGAGT-AG-TTATCGAGTTTCATAGTGA
186 TGTTTGTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAG--TTTTGAGTAAGTTTATCG-GGTTCCGGGTGA
* * * * * ** * *
4793 AAGCTTA-GAGTTTATCGGGCTTACCAGTCATTTCCTGGTTAAAAAAA-TCGTTATCTT-A-TTC
248 AAG--TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATT--T--AAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTC
* *
4854 ATTTAAAATA-GGT-AATAATATTCC-AAAA-AAAAT-TTTTAGAGAAATCATTTTATGG-TTT-
307 AGTTAAAA-ACGGTAAATAATATTCCGAAAATAAAATATTTTAGAG-AATCAATTTATGGTTTTA
* * * *
4912 AATATTTTTTGGTTAAAATAAATATTTT-CT-GATAATAAATTAAAAT-GG-TTCA-TGAGAGGA
370 AATA-TTTTTGGTT-AAAT-AATATTTTATTGGAAAATTAA-TAAAATGGGTTTAATTGAGA-GA
*
4972 AGTTAC-ATATTAAACATAAATAGGTAT--ATGATATTTC--AAAATAAAAATATTTTTAGAAAA
430 AGTTACAATATT-AAC-TAAATAGGTATAAATGAT-TTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAA
5032 ATATC
492 ATATC
* * *
5037 AGCGAAATACCATGGAATACTAATCCCCCAT-CTTTTAGGCTGACAAAAATTCTTCCACGGGAGT
1 A-CG-AATATCAT-GAATACT-ATACCCCATCCTTTTAGGCTGAC-ACAATTCTTCCACGGGAGT
*
5101 ATCGCCCAATATTTT-CTTTCTTCC-TTCCAGACCACC-AATTCTGCTTATCTTTGATAACAAGC
61 ATCGCCCAATATTTTCCTCT-TTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTTTGATAA-AAGC
* * * * *
5163 T-CTCGATCACAATCCTAATTGTCCAACCTACTTATTAAT--CAAAGTTTCCAAAGTATGTTGTC
124 TCCTCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTT-GTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTG
* * * *
5225 TTTGT-ACGCGCTTAAAAAATAGGTCAACTAGTTGTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGAGTGAAAG
188 TTTGTAACGC-C-CAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAG
** *
5289 CTAGGAGTTAATCCAGTTTACTAG-TAATTT-AAAAAAAA-TAG-TAGCTTAAATTTCATTTAAA
251 -TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATTTAAAAAAAAATTAGTTAGCTT-AATTTCAGTTAAA
* * **
5350 AACTGGTAGATTATAATCTGGGAAAATAAAAATATTTTAGAGAATCAGAATTCTTATGGTCTTTA
314 AAC-GGTAAATAAT-AT-TCCGAAAAT-AAAATATTTTAGAGAATC--AA-T-TTATGGT-TTTA
* * * * *
5415 AATTTTTTTTTTGTTAAAAAATATTTTATTGAAAAATAAATTTAAAATGGG-TTAATTGAGAGAA
370 AA--TATTTTTGGTTAAATAATATTTTATTGGAAAATTAA--TAAAATGGGTTTAATTGAGAGAA
** * * * *
5479 --TACAATATTAACTAAA-A-ACATATATCATATT-CGGAAAATAAAAATATTTATATAAAAATA
431 GTTACAATATTAACTAAATAGGTATAAATGAT-TTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAATA
5539 TC
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*
5541 -CGAATATCATGAATACTAATGACCCCCCAT-CTTTTAGGCTAACACAATTCTTCCCCACGGGCA
1 ACGAATATCATGAATACT-AT-A--CCCCATCCTTTTAGGCTGACACAATTCTT--CCACGGG-A
*
5604 GTAATCGCCCAATATTTTCCTCTGT-CTTTCCAGACCA-CAAATTTCTTGCTTATCTCTTGATAA
59 GT-ATCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAA-TTC-TGCTTATCT-TTGATAA
* * * * * * *
5667 CAGCT-C-AGGTCAGCGAGTCCAAATTGCCAAACCTACTTGTAATCGCAAA-TTTCCAAAGTATG
120 AAGCTCCTCGATCA-C-AATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATG
* * *
5729 TATGTGTTTGTAACG-CCAAAAAGTAGGCGTCTACTAGTTTTTCAGTACAAACTTTTATCGGGTT
183 T-TGTGTTTGTAACGCCCAAAAAATA-G-GTCTACTAG-TTTTGAGT---AA-GTTTATCGGGTT
* * **
5793 CCTGAGTGAAAGCTAGGAGTTAATCGGG-TTACTACTCT--TTCT-TTAAAAAA--A-TTAGC-T
240 CC-GGGTGAAAG-TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGT-TAATT-TAAAAAAAAATTAGTTAGCTT
* *
5850 AA-TTCATTTAAAAAAC-GTAAATAAATATGTCAGAAAATAAAAATATTCTTAGAGAAATCAATT
301 AATTTCAGTT-AAAAACGGTAAAT-AATAT-TCCGAAAAT-AAAATATT-TTAGAG-AATCAATT
* * * * **
5913 TATGGTTTTAAATATTTTTTGGTTAAGATAA-A-TAT-TTGTG-AAATAAATTAAATGGGGTTCC
360 TATGGTTTTAAATA-TTTTTGGTTAA-ATAATATTTTATTG-GAAAATTAATAAAATGGGTTTAA
* * *
5974 TTGAGAGAAGTTACGAATATTAACAAAATAAGTACTATTAAT-AATTCCGGAAAATAAAAATATT
422 TTGAGAGAAGTTAC-AATATTAACTAAATAGGTA-TA--AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATT
* *
6038 TATAG-AATATATC
483 TTTAGAAAAATATC
*
6051 ACGAATATCATGTAATGACTATTACCCCCATCCTGTTTA-GCTGGACACAAATTTCTTCCACGAG
1 ACGAATATCATG-AAT-ACTA-TA-CCCCATCCT-TTTAGGCT-GACAC-AA-TTCTTCCACGGG
* * *
6115 AGTAT-G-CCAATATTTTTCTCTTTCCTTT-CAGACCACC-AA-TCTTG-GTACTCTTT-ATAGA
58 AGTATCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTC-TGCTTA-TCTTTGATAAA
*
6173 AGCT-CTCGATCACAAT-CTAATTGTTCCAAACCTACTTGTAATCGCAAA-TTTCC-AAGTATGT
121 AGCTCCTCGATCACAATCCTAA-TGGT-CAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGT
** **
6234 TGTG-TTGTAACGCCC-CTAAATAGGTCTAC-AG-TTTGAGTAA--TTATCGGGTTATGGGTG-A
184 TGTGTTTGTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAA
* *** * * *
6292 GGCTTCAGGAGTTAATC-GGTTTACTACACATTTCTTAACAAAAATTAGTTAGCTTAA-TTCAGT
249 AG--T-AGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATT-TAAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCAGT
* * *
6355 TTAAACCGG--AAT-ATAATTCCGGAAATAAAAATATTTTTAGAGAAATCAATATTATGGTTTCT
310 TAAAAACGGTAAATAAT-ATTCCGAAAAT-AAAATA-TTTTAGAG-AATCAAT-TTATGGTTT-T
* *
6417 AAAT-TTTTTGGTAAAATAAATATTTTATT-GAAAAATAAGCTTAAAAATCGGGTTTAATT--GA
369 AAATATTTTTGGTTAAAT-AATATTTTATTGGAAAATTAA---T-AAAAT-GGGTTTAATTGAGA
*
6478 GAA-TTACAATATTAAC-AAATAGGTATATAAT-A-TT-CGGAAAACT-AAAAGATTTTTAG-AA
428 GAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTATA-AATGATTTCCGGAAAA-TAAAAATATTTTTAGAAA
6536 AATATC
491 AATATC
6542 AC-AATGATCATGAATACAAGATAATACCCCAATCC-TTTAGGCTGACAC-A-------A----A
1 ACGAAT-ATCATGAATAC----T-ATACCCC-ATCCTTTTAGGCTGACACAATTCTTCCACGGGA
* *
6593 -T-TC-TCC---A---TCCTCTTTCCTGTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTGTGATAAAAA
59 GTATCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCT-TTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTTTGAT-AAAA
* **
6649 GCTCCTTGATC-CAATTATAAT-GTCCAAACC-ACTTGTAATCGCAAA-TTTCCAAAGT-TGTTG
122 GCTCCTCGATCACAATCCTAATGGT-CAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGTTG
* * *
6709 TGTTTTGTAAACGCCC-TAAAATA-GTCTACCTGAG-TTTGAGTAA-TTTAACGGGTTTCGGGTT
186 TG-TTTGT-AACGCCCAAAAAATAGGTCTA-CT-AGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGG-T
* *
6770 GAAAGTTA-GA-TTAATC-GGTTTACTA-CTCATTTATTTAAAAAAAATTAGTTAGCTT-ATTTC
246 GAAAG-TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTAATTTA---AAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTC
* * *
6830 ATTTAAAACACGGTAAATAATATTCC-AAAATATAAAAATTTTAGAGAAATCAATTTTGTGGTTT
307 AGTTAAAA-ACGGTAAATAATATTCCGAAAATA-AAATATTTTAGAG-AATCAA-TTTATGGTTT
* * * * *
6894 TAAATA-TTTTGGTTTAAAATAAATATTTTAGTGAAAAATAAATTAAAATAGGTTTCATTGAGAG
368 TAAATATTTTTGG-TT-AAAT-AATATTTTATTGGAAAATTAA-TAAAATGGGTTTAATTGAGAG
* *** * *
6958 AAGTTACAATTATTAACTAAATCACGTATATAAT-A-TTCAAAAAAAT-AAAATATTTATAG-TA
429 AAGTTACAA-TATTAACTAAAT-AGGTATA-AATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAA
7019 AA-ATC
491 AATATC
*
7024 -CGGAATATC-TGAATTACTAACACCCCCA-CC-TTTAGGCTGACAC-ATTCTT-CACGGGAGTA
1 AC-GAATATCATGAA-TACT-ATA-CCCCATCCTTTTAGGCTGACACAATTCTTCCACGGGAGTA
* * * * * * *
7083 TCGCTCAATATTTTCCTCTTTCC-TTCCA-AACAGC-ATTTAT-CCTATCTTATGATAGGAA-CT
62 TCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTT-TGATA-AAAGCT
* * * *
7143 CCTCG-TCACAATCCAAATTGTCAAACCTACATGTAA-CGCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTGGT
125 CCTCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTGTT
*
7206 TG-AACGCCCTAAAAATAGGTCGT--TAGTTTTGAGTAAAGTTGTGATCGGGTT-CGGGTGAAAG
190 TGTAACGCCCAAAAAATAGGTC-TACTAGTTTTGAGT-AAGTT-T-ATCGGGTTCCGGGTGAAAG
* * ** ** *
7267 CTAGCAATT-ATCGGCG-TTACTAGTCATTGTCTTTCAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCATTT
251 -TAGGAGTTAATCGG-GTTTACTAGT--TAAT-TTAAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCAGTT
* * * *
7330 AAGAATCGGTAAATTAATTATCTCGGAAGATACAAATATTTTTAGTAGAAATCAAATTTA--ATT
311 AA-AAACGGTAAA-TAA-TAT-TCCGAAAATA-AAATA-TTTTAG-AG-AATC-AATTTATGGTT
* * *
7393 TT-AATATTTTTTGGTTAAATAACGTATTTTTATTGAAAAATAAATTAAAATGGGTTTCATTGAG
367 TTAAATA-TTTTTGGTTAAATAA--TA-TTTTATTGGAAAATTAA-TAAAATGGGTTTAATTGAG
* *
7457 AG-AGTTACCAAT-TTAACTAAAATAGGTAT--AT-ATATCCCGAAAAT-AAAA-ATTTTTAGAA
427 AGAAGTTA-CAATATTAACT-AAATAGGTATAAATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAA
* *
7515 AAGATTTTTTT
490 AA-A---TATC
***** * ** *** ** * ****** ** *** * *
7526 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACGAATATCTGAATTACTAATAACCCCA
1 ACGAATATCATGAATACTATACCCCATCCTTTTAGGC-TG-ACA-C--AATT-CT--T----CCA
** *
7591 GTCCTTTTAGGTTGACACAAGTCTTCCACGGAGTATGCCAATATTT-CTC-TTCCTTTCCCAGAC
54 ---C-----GG--G--AGTA-TC-GCC-C--A--AT----AT-TTTCCTCTTTCCTTT-CCAGAC
* * * * * *
7654 CACCAAATTCTG-TGTTTCTTTTA-ATAAAGCTCC-CG-TCACAATCGT-AT-TTCCAACCTACG
94 CACCAAATTCTGCT-TATCTTTGATA-AAAGCTCCTCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACT
* *
7713 TGTAATCG-AAAATTTCCAAAG-ATGTTG-GTTTGT-ACGCCCCTAAAAATAGGTCTA-TAG-TT
157 TGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTGTTTGTAACG-CCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTT
* * * * * * *
7772 TGAGTAAG-TTATCGAGTTCCGGGTG-AAGCTAATGAGTCT-ATCAGCTTAACATGTCATTTTCA
221 TGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAG-T-AGGAGT-TAATCGGGTTTAC---T-A-GTTAA
** * * * * * *
7834 TTTTTAAAAAAATTCGTTCATCTTAATTTCA-TTTAAATCGGTAATTAATATGCCGAAAAATAAA
278 TTTAAAAAAAAATTAGTT-AGCTTAATTTCAGTTAAAAACGGTAAATAATATTCCG-AAAATAAA
* * *
7898 A-GTTTT----AAT--ATTTTTGG---T-AA-A------GTT--A-AATA-TTTATT-GAAAATA
341 ATATTTTAGAGAATCAATTTATGGTTTTAAATATTTTTGGTTAAATAATATTTTATTGGAAAATT
* *
7940 AATTTTAAATCGGGCGTTTCATGTGAGAGAAGTTACAATATTTAACT-AATAGGTATAAATGATT
406 AA--TAAAAT--GG-GTTTAAT-TGAGAGAAGTTACAATA-TTAACTAAATAGGTATAAATGATT
**
8004 TCCGG-AAATAAATCTATTTTTAGAAAAATATC
464 TCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAATATC
* *
8036 -CGAATATTCAATGAATTACTATA-CCCATCCTTTTAGGCTAACACAA-TCCT-C-CGGGAGTGA
1 ACGAATA-TC-ATGAA-TACTATACCCCATCCTTTTAGGCTGACACAATTCTTCCACGGGAGT-A
* *
8096 TCGCCCAATATTTTCCTTTTTCCTTTCCAGACCACCAAATT-TGCTTTATCTTTG-TAGAAGCTC
62 TCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGC-TTATCTTTGATAAAAGCTC
* *
8159 CTCGATCACAATCCTAATTGTCCAAACCCACTTGTAATCGCATAATTTTCCAAAGTATGTTGTGT
126 CTCGATCACAATCCTAATGGT-CAAACCTACTTGTAATCGCA-AATTTTCCAAAGTATGTTGTGT
* *
8224 TTGT-ACGCCCTAAAAATAAGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCC-GGTGAAAGCT-
189 TTGTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAG-TA
*
8286 -GAGTTAATCGGG-TTACTAGCTT-ATTT--AAAAAAATTAGTTTAGCTTAATATTCATTTAAAA
253 GGAGTTAATCGGGTTTACTAG-TTAATTTAAAAAAAAATTAG-TTAGCTTAAT-TTCAGTTAAAA
* * *
8346 GTCGGTAAATAATATTCCAGAAAAGACAAATTTTTTTAGAGAAAT-AAGTTTTATATGG-TTTAA
315 -ACGGTAAATAATATTCC-GAAAATA-AAA-TATTTTAGAG-AATCAA---TT-TATGGTTTTAA
*
8409 ATA-TTTTGGTTTAAAATAAATATTTCT-TTGGAAAAATAAATTAAAAATGGGTTTACATTGAGA
371 ATATTTTTGG-TT-AAAT-AATATTT-TATTGG-AAAATTAA-T-AAAATGGGTTTA-ATTGAGA
* * * **
8472 TGAAGTTACAATATTAACTGAA-A-G---ACATAATTTCCATAAAATAAAAAATATTTTTTAGAA
428 -GAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTATAAATGATTTCCGGAAAAT-AAAAATA-TTTTTAGAA
*
8532 ACATATC
490 AAATATC
* * * * *
8539 -CGAAATATCAT-AATACTATACCCGCATCCTTTTAGGCGGACTCATTTCTTCCAC-AGAGGATC
1 ACG-AATATCATGAATACTATACCC-CATCCTTTTAGGCTGACACAATTCTTCCACGGGAGTATC
* *
8601 GCCCCAATA-TTTCCTCTTTCCTTTCCAAAACCACCAATATATCTGCTTATCTTTTAATAAAA-C
64 G-CCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCC-AGACCACCAA-AT-TCTGCTTATC-TTTGATAAAAGC
* * * * *
8664 TACGCAGCATCACAACTCCCTGAATGG-CCAACCTACATGTAAT-GTAAATTTATCCAAA-TATG
124 TCCTC-G-ATCACAA-T-CCT-AATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTT-TCCAAAGTATG
* ** *
8726 TTGTGTTTGTAATGCTTTAAAAAATAGGTCT-CTAGTTTTGAGTAAGGTTATTC-GGTTCCGAGG
183 TTGTGTTTGTAACGC-CCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTA-TCGGGTTCCG-GG
* * * * *
8789 -G-AAGCTGGGAGTTAATCGGGTTTACTACTCATTTCTTGGAAAAAAAATTAGTT-GCTTAATTT
245 TGAAAG-TAGGAGTTAATCGGGTTTACTAGTTA-AT-TT-AAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTT
* *
8851 CAGTTAAAAATC-GTAAAATAACTATTCCGAAAAAAAAATATTTTAGAGAATCATTTTATGGTTT
306 CAGTTAAAAA-CGGT-AAATAA-TATTCCGAAAATAAAATATTTTAGAGAATCAATTTATGGTTT
* * **
8915 TAAATA-TTTTGGTAAAAAAATATTTTATTCAAAAATT--TAAAATGGGGTTTAATTGAGAGAAG
368 TAAATATTTTTGGTTAAATAATATTTTATTGGAAAATTAATAAAAT-GGGTTTAATTGAGAGAAG
* *
8977 TTAC-ATATTAAACTAAATATGTAT--ATGACTATCCGGAAAATAAAAATATTTTTAAGAAAAAA
432 TTACAATATT-AACTAAATAGGTATAAATGA-TTTCCGGAAAATAAAAATATTTTT-AG-AAAAA
*
9039 AATAC
493 TAT-C
*
9044 ACGAAT-T-ATGAATACTAATA-CCCATCCTTTTATGCTGACACAAATTCTTCCACGGGAG-ATC
1 ACGAATATCATGAATACT-ATACCCCATCCTTTTAGGCTGACAC-AATTCTTCCACGGGAGTATC
* *
9105 GCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTTCCAGACCACCCAAA-TCTGTTTATCTTTG-TGAAAGCTCC
64 GCCCAATATTTTCCTCTTTCC-TTTCCAGACCA-CCAAATTCTGCTTATCTTTGATAAAAGCTCC
* * *
9168 TCGATTACAATCCT-ATTGTGCCAACCTACTTGTAATCGCAAA--TT-CAAAGTAATGTTGTGTT
127 TCGATCACAATCCTAATGGT-CAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGT-ATGTTGTGTT
* * *
9229 TGTAACGCCCTAAAAATAGGTCTACTAGTGTTGAGTAAGGTTATCGGGTTCCGGGTGAAAGTAGG
190 TGTAACGCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAGTAGG
* *
9294 AGATAATCGGGTCTTACTAGTTAATTTAAAAAAATAATATAGTTAGCTTTAATTTCAGTT-AAAG
255 AGTTAATCGGGT-TTACTAGTTAATTTAAAAAAA-AAT-TAGTTAGC-TTAATTTCAGTTAAAAA
*
9358 CGGTTAAATAATATTCCAGAAAATAAAATATGTTAGAG-ATCAATTTATGGTTTTAAATATTTTT
316 CGG-TAAATAATATTCC-GAAAATAAAATATTTTAGAGAATCAATTTATGGTTTTAAATA-TTTT
9422 TGGTTAAATAATATTTTA-T-GAAAATTAAATAAAATTGGGGTTTAATTGAGAGAAGTTACAATA
378 TGGTTAAATAATATTTTATTGGAAAATT-AATAAAA-T-GGGTTTAATTGAGAGAAGTTACAATA
* * * *
9485 TTAACT-AATAGGTATAAATTATTTCCAGAATATAAAAATATTTATAGAAAAATATC
440 TTAACTAAATAGGTATAAATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAATATC
* *
9541 ACGAATATCATG-ATACTAATACCCCATCCTATTTAGGTTTGACAGAATTC-TCCACAGGGAGTA
1 ACGAATATCATGAATACT-ATACCCCATCCT-TTTAGG-CTGACACAATTCTTCCAC-GGGAGTA
*
9604 TCGCCCAATAGTTTCCTCTTTCCTTTCCAGA-CACCAAATTCTGCTT-TC-TTGATAAAAG-TCT
62 TCGCCCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTTTGATAAAAGCTC-
* * * *
9665 CTCGATCACAAT-CTAATGGTCAAACCTACATGTAATCGTAAATTTTGCAAAGGTATTGTTATGT
126 CTCGATCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAA-GTA-TGTTGTGT
* * * * *
9729 TTGTAATGCTCGAAAAAATAGTTCTACTTAG-TTTGAGTAAGTTTAT-GGGTTCC-GCT--CA-T
189 TTGTAACGC-CCAAAAAATAGGTCTAC-TAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAGT
* * ** *
9788 CGG-GTTTA-C-----TACTCA-TTTCTATTAAAAAAACAATTCGTTAG--TAATTTTCA-TGTA
252 AGGAGTTAATCGGGTTTACT-AGTTAAT-TTAAAAAAA-AATTAGTTAGCTTAA-TTTCAGT-TA
* *
9842 AAAA-TGTAAATAATATTCCGAAAAATAAAAATATTTCTAGAGAATCAATTTATTAG-TTTAAAT
312 AAAACGGTAAATAATATTCCG-AAAAT-AAAATATTT-TAGAGAATCAATTTA-TGGTTTTAAAT
*
9905 ATTTTTGGTTAAAATAATATTTTATT-CAAAATT--TAAAATGGG--TAATTGAGCAGAAGTTAC
373 ATTTTTGGTT-AAATAATATTTTATTGGAAAATTAATAAAATGGGTTTAATTGAG-AGAAGTTAC
* *
9965 AATATTAACTAAATAGGTATAAA--A-TTCCCGAAAATAAAAA-A-TTTTAGAAAAGTAATC
436 AATATTAACTAAATAGGTATAAATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAAT-ATC
10022 ACGAATTATCATGAATTACTATACCCCCATCCTTTTAGG-T-ACACAAATTTCTTCCACGGGAGT
1 ACGAA-TATCATGAA-TACTATA-CCCCATCCTTTTAGGCTGACAC-AA-TTCTTCCACGGGAGT
* *
10085 ATCGCCTAATATTTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACC-AATTCTGCTTATCTCTTGATAGAAGC
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*
10149 TCCTCCGATCACCAATCCTAATTGATCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTTCCAAAGTTATGT
124 TCCT-CGATCA-CAATCCTAA-TGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAA-TTTTCCAAAG-TATGT
* * * *
10214 TGTGTTTTGTAACGCCCTAAAAAATAGGTATACTAGGTTATTGAGTAAATTTATCGGTTTCTGGG
184 TGTG-TTTGTAACGCCC-AAAAAATAGGTCTACTA-GTT-TTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGG
* * * **
10279 TGAGAAGTA-GAGTTAATCAGGTTTACTACATTTATTTCTTTAAAAAAATTAAG-TAGCTTAATT
245 TGA-AAGTAGGAGTTAATCGGGTTTACT--AGTTAATT-TAAAAAAAAATT-AGTTAGCTTAATT
*
10342 TCATTTAAAAACGGTAAATAACTATTCCGGAAAATAAAATAGTATTTAGAGAAAATCAATATGTA
305 TCAGTTAAAAACGGTAAATAA-TATTCC-GAAAATAAAATA-T-TTTAGAG--AATCAAT-T-TA
* * * *
10407 TGGTTTTAAATATTTTTTGTTTTAACTAAAATTTTTATTGGCAAAAATAACTTAAAATGGGTATT
362 TGGTTTTAAATA-TTTTTG-GTTAAATAATA-TTTTATTGG-AAAATTAA--TAAAATGGGT-TT
* * * *
10472 -ATGAGAGAGAAGTT-CAATATT-ACT-AA-ACGTATATAAT-A-ATCCGGAAAAAGAAAAAATA
420 AAT-TGAGAGAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTATA-AATGATTTCCGG-AAAA-TAAAAATA
10530 TTTTTAGAAAAAATATC
481 TTTTTAG-AAAAATATC
10547 ACGAATATCATGAGAATACTAAATACCCCAATCCTTTTAGGCTGACACAA
1 ACGAATATCAT--GAATACT--ATACCCC-ATCCTTTTAGGCTGACACAA
10597 ATCTCCATCC
Statistics
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Consensus pattern (496 bp):
ACGAATATCATGAATACTATACCCCATCCTTTTAGGCTGACACAATTCTTCCACGGGAGTATCGC
CCAATATTTTCCTCTTTCCTTTCCAGACCACCAAATTCTGCTTATCTTTGATAAAAGCTCCTCGA
TCACAATCCTAATGGTCAAACCTACTTGTAATCGCAAATTTTCCAAAGTATGTTGTGTTTGTAAC
GCCCAAAAAATAGGTCTACTAGTTTTGAGTAAGTTTATCGGGTTCCGGGTGAAAGTAGGAGTTAA
TCGGGTTTACTAGTTAATTTAAAAAAAAATTAGTTAGCTTAATTTCAGTTAAAAACGGTAAATAA
TATTCCGAAAATAAAATATTTTAGAGAATCAATTTATGGTTTTAAATATTTTTGGTTAAATAATA
TTTTATTGGAAAATTAATAAAATGGGTTTAATTGAGAGAAGTTACAATATTAACTAAATAGGTAT
AAATGATTTCCGGAAAATAAAAATATTTTTAGAAAAATATC
Found at i:12114 original size:25 final size:24
Alignment explanation
Indices: 12084--12174 Score: 128
Period size: 25 Copynumber: 3.6 Consensus size: 24
12074 GATATGGGTA
*
12084 GTAAATGTTCCTGATAATGGGTTAG
1 GTAAATGTTCATGATAAT-GGTTAG
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*
12160 GTAAATGTCCATGAT
1 GTAAATGTTCATGAT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.31, C:0.07, G:0.24, T:0.38
Consensus pattern (24 bp):
GTAAATGTTCATGATAATGGTTAG
Found at i:12130 original size:27 final size:25
Alignment explanation
Indices: 12071--12167 Score: 121
Period size: 25 Copynumber: 3.9 Consensus size: 25
12061 TATGGTACAA
*
12071 ATTGAT-ATGGGTA-GTAAATGTTC
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*
12094 -CTGATAATGGGTTAGGTAAATGTTTC
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12120 ATTGATAATGGTTATGGTAAATGTTC
1 ATTGATAATGGTTA-GGTAAATGTTC
12146 A-TGATAATGGTTAGGTAAATGT
1 ATTGATAATGGTTAGGTAAATGT
12168 CCATGATGGG
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 3, Indels: 11
0.82 0.04 0.14
Matches are distributed among these distances:
22 4 0.06
23 2 0.03
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*
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*
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* * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* *
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*
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* * *
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*
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*
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* *
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*
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*
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* *
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*
18782 TTTAATTTA-TTTT-AAAAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
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* *
18845 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCC-GAATATTATTTA-CGTTTTTAAATG-AATTAAGATAACTA
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* *
18968 ACTCAAAACTAGTTGACCTATTTTTAGGGCGTTAC-AA-GCAACATACTTTGGAAAATTTGCGAT
326 ACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGAT
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391 TACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTTG
*
19096 GTGGTCTGGAAAGG-AAGAAGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
456 GTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
19147 TGTGTCAGCCTAAAAGGAT-GGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
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*
19275 TTCAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
*
19340 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACTA
196 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACAA
* * *
19405 -TTTTTTTAAAGAAT-AGTA-AAAACCCGATTAACTCCTAG-TTTCACCCGTAACCCGATAAACT
261 TTTTTTTTAAA-AATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
*
19466 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTCGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
19531 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
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19596 GGTGGTCTGGAAAGGAAAGA-GAAAATATTGGGCGATACTCCCGT-GAAGAATT
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*
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* *
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*
19967 GATAAACTTACTCAAAACTAGTAGACCTA-TTTTAGGGCGTTAC-AA-GC-ACATACTTTGGAAA
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20028 ATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGA-GAGCTTCTATCAAAGATAAG
382 ATTTGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAG
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
* *
20215 TTTTATTTTCTGGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATTAAACCCCA
66 TTTTATTTTC-CGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCA
*
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130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
* *
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*
20407 A-TTTTTTT--AAAT--CTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGTTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
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* *
20467 TACTCAAAACTAGTAGACCTA-TTTT-GGGCGTTAC-AAGACAACATACTTTGGAAAATTT-TGA
325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
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390 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
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131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
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261 TTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACTT
20966 ACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGAT
326 ACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGAT
* *
21031 TACAAGTGGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATGAAAGATAAGCAGAATTTG
391 TACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTTG
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456 GTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
21147 TGTGTCAGCCTAAAAGGAT-GGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
21211 TTTTATTTTCCGGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCT---TAAAACCCCA
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*
21273 TTTTAATTTATTTTACAA-AAAATATTTA-TTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
* *
21336 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTTCGGAATATTATTTACCGATTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
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* * *
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259 -AATTTTTTT-TAA--AAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGAT
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320 AAACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAA-CACAACATACTTTGGAAAAT
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*
21588 GAATTTGGTGGTCTGGAAAGGAAAGA-GAAAATATTGGGTGATACTCCCGTGGAAGAATT
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21647 TGTGTCAGCCTAAAAGGAT-GGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
21711 TTTTATTTTCTGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCT-AATGAAACCCCAT
66 TTTTATTTTCCGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCAT
*
21775 TTCAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
* *
21840 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCATTTTTAAATGAAATTAAGCTAACTA
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*
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261 TTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACTT
* * *
21965 ACTCAAAACTAGTTGACCTATTTTTAGGGCGTTAC-AAGACAACATACTTTGGAAAATTTGTGAT
326 ACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGAT
*
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*
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*
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*
22276 CATTTTAATTTATTTTACAA-AAAAT-TTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTG
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* *
22339 CTTTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTA-CGATTTTTAAATGAAATTAAGATA
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** * * *
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*
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22658 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
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*
22723 TTTTATTTTCTGGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCA
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*
22788 TTTCAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
*
22853 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCC-GAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACT
195 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACA
* * *
22917 ATTTTTTTT--AAATCACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGTTTTCACCCGTAACCCGATAAACT
260 ATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
* * *
22980 TACTCAAAACTAGTTGACCTATTTTTCGGGCGTTACAAAGAC-A-ATACTTTGGAAAATTTGCGA
325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
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*
23107 GGTGGTCTGGAAAGG-AAGAAGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAAGAATT
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*
23161 TGTGTCAGCCTAAAAGGAT-GGGGTATTAGTATTCATGGTATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
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*
23225 TTTTATTTTCCGAA-ATTATATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTTAATGAAACCCC
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* * *
23289 ATTTTAATTTATTTTACAAGAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGC
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*
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194 TTTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAA
** * * * *
23418 CGAATTTTTTAAAAGGAAATGACTGGTAAGCCCGATAAACTCCTAGCATTCACCCGGAACCCGAT
258 C-AATTTTTTTTAA--AAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGAT
*
23483 AAACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAGCACAACATACTTTGGAAAATT
320 AAACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATT
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450 AATTTGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
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* *
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*
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* *
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* *
23926 ATTTTTTTT--AAATTACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAG-TTTCACCCGTAACCCGATAAACT
260 ATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
* *
23988 TACTCAAAACTAGTTGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAAGACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
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390 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
* *
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455 GGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAG-AAT
*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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* *
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* *
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196 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC-
* *
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*
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321 AACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTT
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*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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66 TTTTATTTTC-CGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCA
*
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* * *
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259 AATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAAC
* * *
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* * *
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454 TGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAA-T
* *
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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* * *
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* *
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* * * *
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
* *
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*
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*
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* *
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260 ATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
* *
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325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
*
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390 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
*
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455 GGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAA-T
*
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* * *
26306 TTTAATTTATTTTACAAGAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGCTT
131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
* *
26371 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTACCGATTTTTAAATGAAATTAAGATAACG
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* * * *
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*
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*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAA-AAATA
* *
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*
26812 ATTTCAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGA
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*
26877 TTTCTCTAAAAATA-TTTT-TTTTCCAGAATATTATTTATCAGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAA
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* * * *
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* * * *
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*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
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196 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC-
* * *
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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391 TACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTTG
*
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456 GTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
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*
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* *
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*
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*
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321 AACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTT
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*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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66 TTTTATTTTCCGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCAT
* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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* * * *
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*
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*
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*
31257 TTTTATTTTCCGGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTTAATGAAACCCCA
66 TTTTATTTTCC-GAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCA
31322 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
31387 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCC-GAATATTATTTA-CGATTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
195 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
31450 TAA-TTTTTTT-AAAATGACT-GTAAACCCGATTAACTCCTAG-TTTCACCCGGAACCCGATAAA
259 -AATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAA
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66 TTTTATTTTCCGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCAT
* *
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131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
*
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196 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATC-GTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACA
*
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260 ATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
* * *
32011 TACTCAAAACTAGTTGACCTA-TTTTCGGGCGTTAC-AAGACAACATACTTTGGAAAATTT--GA
325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
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390 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
32136 GGTGGTCTGGAAAGG-AAGAAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAATT
455 GGTGGTCTGGAAAGGAAAG-AGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAA-T
*
32190 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGGTATTCGTGATATTTTTCTAAAAATA-
1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
32254 TTTTATTTTCCGAAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTTAATGAAA-CCCA
66 TTTTATTTTCCG-AATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCA
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130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
*
32380 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTACCGATTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
195 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
* *
32445 GATTTTTTTAAAAGGAAATGACT-GTAAACCCGATTAACTCCTAG--TTCACCCGGAACCCGATA
259 AATTTTTTT-TAA--AAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATA
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321 AACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTT
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451 ATTTGGTGGTCTGGAAAGG-AAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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*
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130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
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*
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* *
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389 ATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATT
*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
**
33257 TTTTATTTT-CGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCTTAT
66 TTTTATTTTCCGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCAT
* * *
33321 TTTAATTTATTTTACAAGAAAATATTTATTTTAACC-AAAAATATTTAAAACCATAAAATTGCTT
131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
* *
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196 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC-
* * * * *
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259 AATTTTTTTTAAAAATG-ACT---A-GTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGA
*
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319 TAAACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAAT
*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
* *
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*
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195 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACA
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* * *
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390 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
*
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455 GGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAG-AAT
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
* *
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130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
*
34391 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCC-GAATATTATTTATCATTTTTAAATGAAATTAAGCTAACT
195 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC-
34455 AATTTTTTTT--AAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAG-TTTCACCCGGAACCCGATAAAC
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*
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324 TTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCG
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389 ATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATT
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454 TGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAA-T
*
34696 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGGTATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
34761 TTTTATTTTCCGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATTAAACCCCA-
66 TTTTATTTTCCGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCCAT
*
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131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGA--
*
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* * *
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* * *
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*
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* *
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452 TTTGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAA-T
*
35200 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGGTATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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* * *
35330 TTTTAATTTATTTTACAAGAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGCT
130 TTTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGAT
*
35395 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTA-CGATTTTTAAATGAAATTAAGATAAC
195 TTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCG-TTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
* *
35459 GAATTTTTTTAAAAGGAAATGACT-GTAAGCCCGA-TAA-TCCTAGCTTTCACCCGGAA-CCGAT
259 -AATTTTTTT-TAA--AAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGAT
*
35520 -AACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAGCACAACATACTTTGGAAAATT
320 AAACTTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATT
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385 TGCGATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAG
*
35649 AATTTGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGAAAGAAT
450 AATTTGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
* *
35771 TTTTATTTTCTGGAAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATTAAACCCC
66 TTTTATTTTC-CG-AATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTCAATGAAACCCC
*
35836 ATTTCAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGA
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* *
35901 TTTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCAGAATATTATTTATCATTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
194 TTTCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAAC
* * *
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259 AATTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATTAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAAC
* *
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324 TTACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCG
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389 ATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATT
* *
36153 TGGTGGTCTGGAAAGGATAGAAG-AAATATTGGGCGATACTCCCGT-GAAGAATT
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*
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
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* *
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131 TTTAATTTATTTTTCAATAAAATATTTATTTTAACCAAAAAATATTTAAAACCATAAAATTGATT
*
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*
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389 ATTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATT
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454 TGGTGGTCTGGAAAGGAAAGAGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
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1 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
*
36772 TTTTATTTT-CGAATATTATATACCTATTTAGTTAATATTGTAACTTCTCTTAATGAAACCCCAT
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* *
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196 TCTCTAAAAATATTTTTATTTTCCGGAATATTATTTATCGTTTTTAAATGAAATTAAGCTAACAA
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261 TTTTTTTTAAAAATGACTAGTAAACCCGATT-AACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATAAACT
*
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325 TACTCAAAACTAGTAGACCTATTTTTAGGGCGTTACAAACACAACATACTTTGGAAAATTTGCGA
*
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390 TTACAAGTAGGTTTGGACAATTAGGATTGTGATCGAGGAGCTTCTATCAAAGATAAGCAGAATTT
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455 GGTGGTCTGGAAAGGAAAG-AGGAAAATATTGGGCGATACTCCCGTGGAAGAAT
37206 TGTGTCAGCCTAAAAGGATGGGGGTATTAGTATTCATGATATTCGTGATATTTTTCTAAAAATAT
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*
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* *
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*
37459 ATTTTTTTTAAAAGGAAATGACTAGTAAGCCCGA-TAACTCCTAGCTTTCACCCGGAACCCGATA
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*
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*
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*
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* * *
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* *
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*
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*
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