Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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1188 TGTATATAAA
** * *
1198 AGGGGTTGCTGTGTGCTGATTCCCCGATTTATGGGTGGTGCTATGTGCGTGATCCACCATATCTT
1 AGGGGTTGCTAAGTGCTGATTCCCCGATTCATGGGTGGTGCTAAGTGCGTGATCCACCATATCTT
1263 TGAAATGTGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCCG
66 TGAAATGTGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATT-CCCCG
* *
1302 AGGGGTTGCTAAGTGCTGATTCCCCGGTTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGAT-ATCCACCATATCT
1 AGGGGTTGCTAAGTGCTGATTCCCCGATTCATGGGTGGTGCTAAGTGCG-TGATCCACCATATCT
1366 TTGAAATGTGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCG
65 TTGAAATGTGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCG
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1 AGGGGTTGCTAAGTGC
1421 GATATCCATT
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TGAAATGTGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCG
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1330 TCATTGGTGG
* *
1340 TGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTGAAATGTGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATT-CCCC
1 TGCTAAGTGCGATATCCACCATATATTTGAAATGTAAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCC
1404 GAGGGGT
66 GAGGGGT
***
1411 TGCTAAGTGCGATATCCATTGTATATTTGAAATG-AAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCC
1 TGCTAAGTGCGATATCCACCATATATTTGAAATGTAAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCC
1475 GAGGGGT
66 GAGGGGT
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1 TGCTAAGTG
1491 ATGATTCCCC
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70 24 0.32
71 50 0.68
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TGCTAAGTGCGATATCCACCATATATTTGAAATGTAAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCC
GAGGGGT
Found at i:8790 original size:25 final size:26
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8734 GAAATGTGAA
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1 AGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCG
8770 AGGGGTTGCTA-GTGCTGATTCCCCG
1 AGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCG
8795 A
1 A
8796 TTCATTGGTG
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25 15 0.58
26 11 0.42
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AGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCG
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8659 GTATATAAAA
** * * *
8669 GGGTTGCTGTGTGCTGATTCCCCGATTTATGGGTGGTGCTATGTGCG-TGATCCACCATACTCTT
1 GGGTTGCTAAGTGCTGATT-CCCGATTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGAT-ATCCACCATA-TCTT
8733 TGAAATGTGAAA-GGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
63 TGAAA--TGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
8772 GGGTTGCT-AGTGCTGATTCCCCGATTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTG
1 GGGTTGCTAAGTGCTGATT-CCCGATTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTG
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65 AAATGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
8872 GGGTTGCTAAGTGCTGATTCCCGATTTCATTGGT-GT-CT-AGTGCGATATCCACCATAT-TTTG
1 GGGTTGCTAAGTGCTGATTCCCGA-TTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTG
*
8933 AAAAGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
65 AAATGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
*
8969 GGGTTGCTAAGTGCTGATT-CCGGTTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTGA
1 GGGTTGCTAAGTGCTGATTCCCGATTCATTGGTGGTGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTGA
9033 AATGTGAAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
66 AA--TG-AAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
*
9071 GGGTTTCTAAGTGC
1 GGGTTGCTAAGTGC
9085 GATATCCATG
Statistics
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AATGAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAG
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8659 GTATATAAAA
**
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*
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*
8872 GGGTTGCTAAGTGCTGATT-CCCGATTTCATTGGT-GT-CTA-GTGCGAT-ATCCACCATA-T-T
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*
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64 TTGAAAGAGAAA-GGGGTTGCTATGTGCTGATTCCCCGAGGGGTTGCT-AGTGCTGATTCCCGAT
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*
9071 GGGTTTCTAAGTGC
1 GGGTTGCTAAGTGC
9085 GATATCCATG
Statistics
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200 15 0.08
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TGGTGGTGCTAAGTGCGATATCCACCATATCTTTGAAAGTGAAAAGGGGGTTGCTATGTGCTGAT
TCCCCGAG
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*
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65 GAGGGGT
* **
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66 AGGGGT
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1 TGCTAAGTG
9152 ATGATCCCCG
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9103 AAATGAAAAG
* *
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1 G
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Done.