Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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*
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* *
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* *
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*
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1 -CATAAGGGAAAA-ACAGTCATTTTA-CC
* *
5057 CATAAGGGCAAAATAGTCA-TTTACC
1 CATAAGGGAAAAACAGTCATTTTACC
* *
5082 CATAAGGGAAAAATAATCATTTTACC
1 CATAAGGGAAAAACAGTCATTTTACC
*
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1 CATAAGGGAAAAACAGTCATTTTAC-C
* *
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CATAAGGGAAAAACAGTCATTTTACC
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4967 ACATACATCA
* * *
4977 CATAAGGGTAAAACAGTCATCTTA-CCATAAAAGGGCAAAACAGTAATTTTACCT
1 CATAAGGGTAAAACAATCATTTTACCCAT--AAGGGCAAAACAGTCATTTTA-CT
* * *
5031 CACAA-GG-AAAACACAGTC-TTTTAGCCCATAAGGGCAAAATAGTCA-TTTACC
1 CATAAGGGTAAAACA-A-TCATTTTA-CCCATAAGGGCAAAACAGTCATTTTACT
* * *
5082 CATAAGGGAAAAATAATCATTTTACCCATAAGGGAAAAACAGTCATTTTACGT
1 CATAAGGGTAAAACAATCATTTTACCCATAAGGGCAAAACAGTCATTTTAC-T
5135 CATAAGGGTAAAACAATCATTTTA
1 CATAAGGGTAAAACAATCATTTTA
5159 TTAATTTGGG
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CATAAGGGTAAAACAATCATTTTACCCATAAGGGCAAAACAGTCATTTTACT
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6547 TTGAGCATCC
*
6557 GAACTCGTTGAGTTGAATCCGAGTTCACTTATGGATGCGAATGTCT
1 GAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATG-GAATGTCT
* * * * * *
6603 GAACTCGTTGAGTTGAGTCTGAGTTC-GTGA--AATGTAACTAGGCATCC
1 GAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGGAA-T--G--TCT
* *
6650 GAACTCGTTGAGTTGAGTTCGAGTTCACTTATGGATGTGAACG-CT
1 GAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATG-GAATGTCT
*
6695 CGAGCTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTA
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6727 GGGGCGGGTT
Statistics
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GAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGGAATGTCT
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6541 GGATGGTTGA
*
6551 GCATCCGAACTCGTTGAGTTGAATCCGAGTTCACTTATGGATGCGAATGTCTGAACTCGTTGAGT
1 GCATCCGAACTCGTTGAGTTGAATCCGAGTTCACTTATGGATGCGAACGTCTGAACTCGTTGAGT
*
6616 TGAGTCTGAGTTCGTGAAATGTAACTAG
66 TGAGTCCGAGTTCGTGAAATGTAACTAG
* * * *
6644 GCATCCGAACTCGTTGAGTTGAGTTCGAGTTCACTTATGGATGTGAACG-CTCGAGCTCGTTGAG
1 GCATCCGAACTCGTTGAGTTGAATCCGAGTTCACTTATGGATGCGAACGTCT-GAACTCGTTGAG
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6722 ACTTAGGGGC
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14114 GGTTGAGCAT
*
14124 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAATG-
1 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAACGC
* * * * *
14169 TCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTC-GTGA--AATG-TAACTAGGC
1 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAAC---GC
14214 ATCCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAACGC
1 --CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTATGGATGCGAACGC
*
14262 CCGAGCTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTA
1 CCGAACTCGTTGAGTTGAGTCCGAGTTCACTTA
14295 GGGGCGGGTT
Statistics
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17213 GAAGTACTGT
* *
17223 AATACCCCTGTAAGGTAGAATTACCGAAATACTCC-TATAGGATAGAATTACCGA
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* * * *
17277 AATACCTTTGTAAGGTAGAAATATCGAAATACCCTTGTAGGGTAGAATTACCGA
1 AATACCCTTGTAAGGTAGAAATACCGAAATACCCTTATAGGATAGAATTACCGA
* ** *
17331 GATACCCTTGTGGGGTAAAAATACC
1 AATACCCTTGTAAGGTAGAAATACC
17356 ATTTTTCCCC
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17213 GAAGTACTGT
* *
17223 AATACCCCTGTAAGGTAGAATTACCGA
1 AATACCCTTGTAGGGTAGAATTACCGA
* *
17250 AATACTCC-TATAGGATAGAATTACCGA
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* * * *
17277 AATACCTTTGTAAGGTAGAAATATCGA
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17304 AATACCCTTGTAGGGTAGAATTACCGA
1 AATACCCTTGTAGGGTAGAATTACCGA
* *
17331 GATACCCTTGTGGGGTA
1 AATACCCTTGTAGGGTA
17348 AAAATACCAT
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23064 TATTTGATTC
**
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*
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* * *
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* *
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* *
23334 ATAACAAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
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* *
23371 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCAAGGCTCAATCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
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66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
*
23499 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GG-GAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGACCTACTGGGAAGTCCTC
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*
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131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
* *
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**
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* *
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* *
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*
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131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
*
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*
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1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
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* *
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* * *
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* *
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* *
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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* * * **
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* *** * * * *** ** *** ** * ** ***
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* * *** * * ** * *
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* * * * * * ** * * * * *
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292 -CG-AA
* ** * * * * * *** *
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** *** ** * * * * * *** *
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** ** * *** * * * *** * *** ** **
54767 GTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA--AT-TTTTTTCTATTTTTTTTA-TATCTC
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* * * ** * ** * * ** * * * ** * *
54824 AT-CGTATAACTAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTT
171 ATGGGT-GACCT-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCACCCCTC-CAATTTTATAT-CTC--A-TT
*** * *** * * * ** * * ** ** * * *
54885 AAATTCAAATTCGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAG
227 AAATT-TTTTTCTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-AC-TAAT-TAGTTA-TTTACGGAAT
* *
54947 AATTGACGGGTGCGATCA
284 AAATCAC---T-CGA--A
* * ** * *** * * * * *
54965 TACCAG-CACTAATGCACCGGA-TCCCA-TCAGAACTCCGCA-G-TTAAGCGTGCT-TGGGCG-A
1 -A-C-GTTA-T-TTG-GTCGTATTTAAATTCA-AA-TTCG-AGGCTCAAGCGCGATCAGGG-GTA
** * * * *** * * * **
55023 G--AGTA-GT-ACTAGGATG-G---G---TGACCTCCTGGGA--AGT-CC-TC-GTGTTGCACC-
56 GCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGA-CGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAATGCACCG
** * *** * * * *** * *** ** ** * * **
55071 CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA--AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCAT-CGTTATA
119 GATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACC
** * ** * * ** * * * ** * * ***
55128 TAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATT
181 T-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCACCCCTC-CAATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTT
* *** * * * ** * * ** ** * * * * *
55190 CGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGT
237 CTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-AC-TAAT-TAGTTA-TTTACGGAATAAATCAC---T
55252 GCGATCA
292 -CGA--A
* * ** * *** * * * * *
55259 TACCAG-CACTAATGCACCGGA-TCCCA-TCAGAACTCCGCA-G-TTAAGCGTGCT-TGGGCG-A
1 -A-C-GTTA-T-TTG-GTCGTATTTAAATTCA-AA-TTCG-AGGCTCAAGCGCGATCAGGG-GTA
** * * * *** * * * **
55317 G--AGTA-GT-ACTAGGATG-G---G---TGACCTCCTGGGA--AGT-CC-TC-GTGTTGCACC-
56 GCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGA-CGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAATGCACCG
** * *** * * * *** * *** ** ** * * * *
55365 CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA--AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAAC
119 GATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACC
** * ** * * ** * * * ** * * ***
55423 TAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATT
181 T-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCACCCCTC-CAATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTT
* *** * * * ** * * ** ** * * * * *
55485 CGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGT
237 CTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-AC-TAAT-TAGTTA-TTTACGGAATAAATCAC---T
55547 GCGATCA
292 -CGA--A
* * ** * *** * * * * *
55554 TACCAG-CACTAATGCACCGGA-TCCCA-TCAGAACTCCGCA-G-TTAAGCGTGCT-TGGGCG-A
1 -A-C-GTTA-T-TTG-GTCGTATTTAAATTCA-AA-TTCG-AGGCTCAAGCGCGATCAGGG-GTA
** * * * *** * * **
55612 G--AGTA-GT-ACTAGGATG-G---G---TGACCTCCTG-GA--AGT-CC-TC-GTGTTGCACC-
56 GCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGA-CGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAATGCACCG
** * *** * * ** *** * *** ** ** * * * *
55659 CTTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA--ATTTTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAAC
119 GATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACC
** * ** * * ** * * * ** * * ***
55718 TAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATT
181 T-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCACCCCTC-CAATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTT
* *** * * * ** * * ** ** * * * * *
55780 CGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGT
237 CTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-AC-TAAT-TAGTTA-TTTACGGAATAAATCAC---T
55842 GCGATCA
292 -CGA--A
* * ** * *** * * * * *
55849 TACCAG-CACTAATGCACCGGA-TCCCA-TCAGAACTCCGCA-G-TTAAGCGTGCT-TGGGCG-A
1 -A-C-GTTA-T-TTG-GTCGTATTTAAATTCA-AA-TTCG-AGGCTCAAGCGCGATCAGGG-GTA
** * ** * ** *** * * * * ****
55907 G--AGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGC-ACCCTTCCAATTTTAT
56 GCCTTTA-TA-TA-AATAGAATG--C-GC-AAGAA-TTGACG-GGTGCGATCATACCAGCACTA-
* **** **** **** ***** * * * ** * * *
55968 ATCTCATTAAATTTTTTTTCTA-T-TTTTTTTATATCTCATCGCAT-AACTA-ATTAGTTATTTA
111 AT-GCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTA-A--GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAG-TA-CTA
* ** * * ** * ** *** * ** *
56029 CGGA---AT-AAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTA-AATTCAAATTCGAGGCTCAAGC
169 -GGATGGGTGACCTC-CTGGGAA-G-T-CCTCGT-GT-TGCACCCCTCCAATTTTA---T--ATC
* * ** **** * *** * * * * * *** ** *
56089 GCGATCAGGGGTAGCCTT-TATATAAATAGAATGCGCA-AGAATTGAC-GGGT-GCGATCATACC
222 TC-ATTA--AATTTTTTTCTATTTTTTTA-TAT-CTCATCG-TTTAACTAATTAGTTAT-TTA-C
* * *
56150 AGCACT-AATGCAC-CGGA
279 -GGAATAAAT-CACTCGAA
* ** ** * * * * * ***** * * * **
56167 TC-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT
1 ACGTTATTTG--GT-CGTATTTAA--ATTCAAATTCGAG-G--CT-C-A--A-GCGCGA--TCAG
* * ** * ** ** **** *
56231 GGGAAGTCCTCGTGT-TGCACCCTCCAATTTTATAT-CTCATTA-AATTTTTTTC-TATTTTTTT
51 GGGTAG-CCT--T-TAT--A---T--AAATAGA-ATGCGCA--AGAA---TTGACGGGTGCGATC
* * * ** * *
56292 ATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAAT-AAATC---ACT-CGAAACGTTATTTGG
99 ATA-C-CA--G---CACTAA-T-G-CA---CCGG-ATCCCATCAGAACTCCG-CA-GTTA---AG
** *** * * * ** ***
56352 TCGTATTTAAATTC-AAATTCGAGGCT-CAAGCGCGATCAGGG-GTAGCCTTTATATAAATAGAA
145 -CGTGCTT--GGGCGAGAGT--A-G-TACTA--G-GAT--GGGTG-A-CC-TCCT-GGGA-AG--
** ** *** * * * * * * **** * **** * * *
56414 TGCGCAAGAATTG-ACGGGTGCGA--TCATACCAGCACT-AA--TGCACCGGATCCCATCAGAAC
191 T-C-CTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATC-TCATTAAATTTTTTTC-TATTTTTTTATATC
** ** * ** ** * * * *** *
56473 TCCGCAG-TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTA-GTACTAGGATGGGT-GACCT
252 TCATC-GTTTAA-C-TAATT-AGTTA-TTTACGGAATA-AATCACTCGA--A
* ** ** ** * * *** * ** ** ******* ****** *** *
56522 CCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTATTTTTTT
1 AC-GTTATTTGGTCGTATT-TAAATTCAAATTCGA-GGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTA
* * * ** * * * ** * * *
56587 TATATCTCATCGTTTAT-CTAATTAGTTATTTACGGAAT-AAATCACT-CGA-AACGTTATTTG-
63 TATA---AATAG--AATGCGCA--AG-AATTGACGG-GTGCGATCA-TACCAGCAC--TA-ATGC
** * *** * * * * * ** * *
56647 GTCGTATTTAAATTCA-AA-TTCG-AGGCTCAAGCGCGATCAGGG-GTAGCCTTTATATAAATAG
115 ACCGGA-TCCCA-TCAGAACTCCGCA-G-TTAAGCGTGCT-TGGGCG-AG--AGTA-GT-ACTAG
* *** * * * ** ** * ***
56708 AATGCGCAAGAATTGA-CGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACT
170 GATG-G---G---TGACCTCCTGGGA--AGT-CC-TC-GTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T
* * * *** * *** ** ** * * * * ** * ** *
56770 CCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCT-CCTGGGAAGTCCT-
221 -CTCA-TTAA--AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTA-T-TTA
* ** * * *
56831 CGTG-TTGCACCCCTC-CA
278 CG-GAATAAATCACTCGAA
** * * *** * *** * * * * *
56848 ATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTTCTATTTTTTTTATATCTC-ATC---GTTA-ACTAA
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGA---GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCT--
* * * ** * * *
56903 TTAGTTATTTACGGAATA-AATCACTCGAA-ACGTT-ATTTGGT-CGTAT-TTA-AATTCA--AA
60 TTA--TA--TA---AATAGAAT-GCGC-AAGA-ATTGA-CGGGTGCG-ATCATACCA-GCACTAA
* * *** * ** *** ** *
56960 TTCGA--GGCTCAAGCGCGATCAGGGGT-AGCCTTTATATAAATAGAATGCGC-A-AG-A--A-T
112 TGC-ACCGGATC---C-C-ATCAGAACTCCGCAGTTA-A-GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAGTACT
* * * * *** * ** ** * *** *
57016 -TGACGGGTG-CGATCAT-ACCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTA
168 AGGATGGGTGAC-CTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTA
* * *** * *** ** ** * * * * ** * ** * * **
57074 AGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCT-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGC
228 A--AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAA
* * *
57134 ACCCCTC-CA
286 ATCACTCGAA
** * * *** * *** * * * ** *
57143 ATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTTCTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-ACTAAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCT--T
* * * ** * * *
57199 TAGTTATTTACGGAATA-AATCACTCGAA-ACGTT-ATTTGGT-CGTAT-TTA-AATTCA--AAT
61 TA--TA--TA---AATAGAAT-GCGC-AAGA-ATTGA-CGGGTGCG-ATCATACCA-GCACTAAT
* * *** * ** *** ** *
57256 TCGA--GGCTCAAGCGCGATCAGGGGT-AGCCTTTATATAAATAGAATGCGC-A-AG-A--A-T-
113 GC-ACCGGATC---C-C-ATCAGAACTCCGCAGTTA-A-GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
* * * * *** * ** ** * *** *
57311 TGACGGGTG-CGATCAT-ACCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAA
169 GGATGGGTGAC-CTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA
* * *** * *** ** ** * * * * ** * ** * * **
57370 GCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCT-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCA
229 --AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAA
* *
57430 -CCCTC-CA
287 TCACTCGAA
** * * **** * *** * * * ** *
57437 ATTTTATAT-CTC--A-TTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-ACTAAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCT--T
* * * ** * * *
57494 TAGTTATTTACGGAATA-AATCACTCGAA-ACGTT-ATTTGGT-CGTAT-TTA-AATTCA--AAT
61 TA--TA--TA---AATAGAAT-GCGC-AAGA-ATTGA-CGGGTGCG-ATCATACCA-GCACTAAT
* * *** * ** *** ** *
57551 TCGA--GGCTCAAGCGCGATCAGGGGT-AGCCTTTATATAAATAGAATGCGC-A-AG-A--A-T-
113 GC-ACCGGATC---C-C-ATCAGAACTCCGCAGTTA-A-GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
* * * * *** * ** ** * *** *
57606 TGACGGGTG-CGATCAT-ACCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAA
169 GGATGGGTGAC-CTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA
* * *** * *** ** ** * * * * ** * ** * * **
57665 GCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCT-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCA
229 --AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAA
* * *
57725 CCCCTC-CA
287 TCACTCGAA
** * * **** * *** * * * ** *
57733 ATTTTATAT-CTC--A-TTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-ACTAAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCT--T
* * * ** * * *
57790 TAGTTATTTACGGAATA-AATCACTCGAA-ACGTT-ATTTGGT-CGTAT-TTA-AATTCA--AAT
61 TA--TA--TA---AATAGAAT-GCGC-AAGA-ATTGA-CGGGTGCG-ATCATACCA-GCACTAAT
* * *** * ** *** ** *
57847 TCGA--GGCTCAAGCGCGATCAGGGGT-AGCCTTTATATAAATAGAATGCGC-A-AG-A--A-T-
113 GC-ACCGGATC---C-C-ATCAGAACTCCGCAGTTA-A-GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
* * * * *** * ** ** * *** *
57902 TGACGGGTG-CGATCAT-ACCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAA
169 GGATGGGTGAC-CTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA
* * *** * *** ** ** * * * * ** * ** * * **
57961 GCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCT-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCA
229 --AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAA
* * *
58021 CCCCTC-CA
287 TCACTCGAA
** * * *** * *** * * * ** *
58029 ATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTTCTATTTTTTTATATCTC-ATC--GTTTA-ACTAAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCT--T
* * * ** * * *
58085 TAGTTATTTACGGAATA-AATCACTCGAA-ACGTT-ATTTGGT-CGTAT-TTA-AATTCA--AAT
61 TA--TA--TA---AATAGAAT-GCGC-AAGA-ATTGA-CGGGTGCG-ATCATACCA-GCACTAAT
* * *** * ** *** ** *
58142 TCGA--GGCTCAAGCGCGATCAGGGGT-AGCCTTTATATAAATAGAATGCGC-A-AG-A--A-T-
113 GC-ACCGGATC---C-C-ATCAGAACTCCGCAGTTA-A-GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
* * * * *** * ** ** * *** *
58197 TGACGGGTG-CGATCAT-ACCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAA
169 GGATGGGTGAC-CTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA
* * *** * *** ** ** * * * * ** * ** * * **
58256 GCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCT-CCTGGGAAGTCCT-CGTG-TTGCA
229 --AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTA-T-TTACG-GAATAAA
* * *
58316 CCCCTC-CA
287 TCACTCGAA
** * * *** * *** * * * * *
58324 ATTTTATAT-CTC--A-TTAAATT-TTTTTCTATTTTTTTATATCTC-ATC---GTTA-ACTAAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGA--GGCTCA-AGCGCGATCAGGGGTAGCCT--T
* * * ** * * *
58379 TAGTTATTTACGGAATA-AATCACTCGAA-ACGTT-ATTTGGT-CGTAT-TTA-AATTCA--AAT
61 TA--TA--TA---AATAGAAT-GCGC-AAGA-ATTGA-CGGGTGCG-ATCATACCA-GCACTAAT
* * *** * ** *** ** *
58436 TCGA--GGCTCAAGCGCGATCAGGGGT-AGCCTTTATATAAATAGAATGCGC-A-AG-A--A-T-
113 GC-ACCGGATC---C-C-ATCAGAACTCCGCAGTTA-A-GCGT-GCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
* * * * *** * ** ** * *** *
58491 TGACGGGTG-CGATCAT-ACCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAA
169 GGATGGGTGAC-CTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CCTCCAATTTTATA-T-CTCA-TTAA
* * *** * *** ** ** * * * * ** * *
58550 GCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA--GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCC
229 --AT-TTTTTTCTATTTTTTTA-TATCTCATCGTTTAACTAAT---TAGT--T-AT-TT--A--C
** **
58613 TCCAATTTTAT-ATCTCATGAA
279 -GGAA-TAAATCA-CTC--GAA
* ** * * * * ** * *
58634 A--TT-TTT-TTC-TATTT-TTTTTATATCTC-A-TCGTTAA-C-TAATTA--GTTA---TTTAC
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAAT-TCGAGGC-TCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTA-
* * * * * * ** *** * * * *
58684 GGAATAAAT-CACT-CGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAG-GCTCAAGCGCG
63 --TATAAATAGAATGCGCAA-G--AATT-GACG-GGTGCGA-TC--ATACCAGCACT-AA-TGC-
* * * * * * * ** * ** *
58746 ATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAA-TGCGCAAGAATTGACGGGTGC--GATC-ATACCAGC
115 A-C--CGG-ATCC----CAT---CAGAACTCCGC-AG--TT-AAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGT
* * ** * * * *** * * * ***
58807 ACTA--ATGCACCG-GATCC-CATCAGAACTCCGCAGT-TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTA-
165 ACTAGGATG---GGTGA-CCTCCTGGGAAGTCCTC-GTGT-TGCACCCCT--CCAATTTTA-TAT
** *** ** * ** *** * *
58866 CT-A--GGATGGGTGAC-CTCCTGGGA-AGTC-C-TCGTGTTGCACCCCTCCAATT--TTATAT-
221 CTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATA-TCTCATCGT-TT--A--ACT--AATTAGTTATTTA
** * *** * *
58921 CTCATTAAATTTTTTTCTATT
278 CGGAATAAA--TCACTCGA-A
*** ** * * * ** **
58942 TTTTTATATCTCATCGTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATC-A--CTCGAAACGTTATTT
1 ACGTTAT-T-TGGTCG-T-A-T--TTA---AATT-C---A-AATTCGAGGCTC-AAGCGCGATCA
* * * * * * * * * *
59004 GGTCGTA---TTTAAATTCAAATTCG-AGGCTCAAGCGCGA-TCAGGGGTAGCCTTTATATAAAT
50 GG-GGTAGCCTTTATA-T-AAA-TAGAATGCGCAA--G-AATTGACGGGT-G-C----GAT-CAT
** ** * * * * * * * *
59064 AGAATGCGCAAGAATTG-A-CGGGTGCGATCA-TAC-CAGCA-CTAATGCACCGGATCCCATCAG
101 ACCA---GCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAA-G---C-G-T-GC-T-TG
** ** * * ** ** * * * * *
59124 AACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTA-CTAGGATGGG-TGACCTCCTG-GGAAGT
153 GGC-GAG-AG-T-A--GTACTAGGATG-G-GT-G-ACCT--CCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA--
* ** *** *
59186 CCTCGTGTTGCACCCTACCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATC
204 CC-C---CT-C-CAAT-TTTATAT-----CTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATC
59251 G-TTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
257 GTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
59289 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
59354 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
59419 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
59484 GTGTTGCA-CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTTATATCTCATCGTT
196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTA-TTTTTTTATATCTCATCGTT
59548 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
260 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
59584 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
59649 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
59714 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
59779 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTTATATCTCATCGT
196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTA-TTTTTTTATATCTCATCGT
59844 TTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
259 TTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
59881 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
59946 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
60011 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
60076 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCT-TTTTTTTATATCTCATCG-T
196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTT
60139 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
260 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
60175 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
60240 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
60305 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
60370 GTGTTGCA-CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTT
196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTT
60434 AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
261 AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
60469 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
60534 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
60599 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
60664 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCG-T
196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTT
60728 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
260 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
60764 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
60829 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
60894 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
60959 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCG-TT
196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTT
61023 AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
261 AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
61058 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
61123 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
61188 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
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196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTT
61317 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
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61353 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
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66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
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131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
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196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTA-TTTTTTTATATCTCATCGTT
61613 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
260 TAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
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1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
61714 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
66 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
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131 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
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196 GTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTT
61909 AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
261 AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
61944 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
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*
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*
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* * *
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*
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*
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*
97651 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGTTCAAGCGCG
1 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCG
Statistics
Matches: 72518, Mismatches: 1019, Indels: 1579
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Consensus pattern (295 bp):
ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
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AACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
Found at i:54648 original size:228 final size:231
Alignment explanation
Indices: 54221--54682 Score: 851
Period size: 228 Copynumber: 2.0 Consensus size: 231
54211 CTAGGATGGG
54221 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTA
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCG-GTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTA
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130 TGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAAAA
* *
54416 TGCGCAAGAATTAGTGGGTGCGATGATACCAGCACTAA
195 TGCGCAAGAATTA-CGGGTGCGATCATACCAGCACTAA
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*
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*
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*
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*
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**
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*
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326 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
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390 GTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCA
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131 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
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325 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
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455 AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCA
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520 GCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAG
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585 GATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTT
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780 AGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTC
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845 CGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
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1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
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131 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
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326 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
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390 GTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCA
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585 GATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTT
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325 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATT
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584 GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTT
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844 CCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
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326 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAG
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391 TTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAA
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521 CACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG
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260 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCAC
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521 CACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG
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91474 ATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
716 ATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
91539 GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
781 GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
91604 GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
846 GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
91644 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTA
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTA
91709 TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTT
65 TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTT
91774 GGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAAT
130 GGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAAT
91839 GCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAG
195 GCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAG
91904 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCAC
260 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCAC
91969 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
325 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
92034 GTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCA
390 GTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCA
92099 AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCA
455 AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCA
92164 GCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAG
520 GCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAG
92229 GATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTT
585 GATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTT
92294 TTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGT
650 TTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGT
92359 TATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAAT
715 TATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAAT
92424 AGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTC
780 AGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTC
92489 CGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
845 CGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
92530 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTA
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTA
92595 TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTT
65 TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTT
92660 GGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAAT
130 GGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAAT
92725 GCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAG
195 GCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAG
92790 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-
260 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCAC
92854 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATT
325 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATT
92919 AGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTC
389 AGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTC
92984 AAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACC
454 AAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACC
93049 AGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
519 AGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
93114 GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCTACCAATTTTATATCTCATTAAATTT
584 GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCT-CCAATTTTATATCTCATTAAATTT
93178 TTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAAC
648 TTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAAC
93243 GTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAA
713 GTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAA
93308 ATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC
778 ATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC
93373 TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
843 TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
93416 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
93481 TTTTTTATATCTCATCG-TTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
66 TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
93545 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
131 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
93610 CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
196 CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
93675 TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
261 TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
93740 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAG
326 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAG
93805 TTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAA
391 TTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAA
93870 GCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAG
456 GCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAG
93935 CACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG
521 CACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG
94000 ATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTT
586 ATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTT
94065 TCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTT
651 TCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTT
94130 ATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
716 ATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
94195 GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
781 GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
94260 GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
846 GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
94300 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTA
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTA
*
94365 TTTTTTTTATATCTCATCGTATAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATT
65 -TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATT
94430 TGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAA
129 TGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAA
94495 TGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA
194 TGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA
94560 GTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA
259 GTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA
94625 CCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAA
324 CCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTA-TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAA
94690 TTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGC
387 TTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGC
94755 TCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATA
452 TCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATA
94820 CCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTAC
517 CCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTAC
94885 TAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATT
582 TAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-T
94950 TTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
646 TTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAA
*
95015 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAATCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
711 ACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATAT
95080 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
776 AAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA
95145 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
841 ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
95190 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
95255 TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
66 TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
95320 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATC--GGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
131 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
95383 CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
196 CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
95448 TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
261 TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
95513 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
326 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTA
95578 GTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCA
390 GTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCA
*
95643 AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAA-CA---A---GTGCGATCATACCA
455 AGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCA
*
95701 GCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAG
520 GCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAG
95766 GATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTT
585 GATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTT
95831 TTTCTA-TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACG
649 TTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACG
95895 TTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAA
714 TTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAA
95960 TAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACT
779 TAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACT
96025 CCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
844 CCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
* *
96067 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCTTCCAATTTTATATCTCATTAATTTTTTTTCTAT
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
96132 TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
66 TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
96197 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATC-GGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
131 GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
96261 CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
196 CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
96326 TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
261 TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
96391 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCG-TTAACTAATTAG
326 CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAG
96455 TTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAA
391 TTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAA
*
96520 GCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAC
456 GCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAG
* * *
96585 CACTAATGCACCAGATCCCATTAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA-AAGTACTAGG
521 CACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG
*
96649 ATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTTATTAAATTTTTT
586 ATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTT
96714 TCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTT
651 TCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTT
* *
96779 A--------TATTTAAATTTAAATTCGAGGCTCAAGCGAGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
716 ATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
96836 GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
781 GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
96901 GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
846 GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
96941 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTTCTA
1 TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAA-TTTTTTTCTA
97006 -TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTT
65 TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTT
97070 GGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAAT
130 GGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAAT
97135 GCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAG
195 GCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAG
97200 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCAC
260 TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCAC
97265 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATT
325 CCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTA-TTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATT
97330 AGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTC
389 AGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTC
*
97395 AAGCGCGATCA-GGGTAGACTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACC
454 AAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACC
97459 AGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
519 AGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTA
97524 GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTT
584 GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTT
97589 TTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACG
649 TTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACG
*
97654 TTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGTTCAAGCGCG
714 TTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCG
Statistics
Matches: 42232, Mismatches: 41, Indels: 172
0.99 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
874 314 0.01
875 200 0.00
876 240 0.01
877 649 0.02
878 328 0.01
880 1 0.00
881 33 0.00
882 720 0.02
883 1502 0.04
884 2291 0.05
885 12977 0.31
886 15496 0.37
887 6484 0.15
888 408 0.01
889 295 0.01
890 294 0.01
ACGTcount: A:0.27, C:0.20, G:0.20, T:0.32
Consensus pattern (885 bp):
TGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTAT
TTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTG
GTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATG
CGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGT
TAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC
CCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTTTCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAG
TTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTTATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAA
GCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATAGAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAG
CACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG
ATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCCAATTTTATATCTCATTAAATTTTTT
TCTATTTTTTTATATCTCATCGTTTAACTAATTAGTTATTTACGGAATAAATCACTCGAAACGTT
ATTTGGTCGTATTTAAATTCAAATTCGAGGCTCAAGCGCGATCAGGGGTAGCCTTTATATAAATA
GAATGCGCAAGAATTGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCC
GCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGG
Done.