Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  303  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102588230--102588436
42
5.0
42
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2
229
35
27
17
19
1.94
102599465--102599947
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3.7
130
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18
19
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1.94
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0
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0
0
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2.0
21
95
4
75
58
2
4
34
1.32
102605104--102605150
21
2.2
21
88
7
69
55
2
4
38
1.31
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2.2
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100
0
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63
0
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3.3
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3
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38
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12
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0
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2
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2.0
19
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5
58
83
0
10
5
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5.7
205
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21
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261
2.0
260
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1
763
32
17
22
27
1.96
102614979--102615021
19
2.4
18
88
7
61
37
13
11
37
1.82
102614987--102615112
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10
13
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102614995--102615112
17
6.6
17
82
7
128
38
11
12
37
1.79
102615012--102615112
35
2.8
35
93
3
166
38
10
12
37
1.79
102615067--102615148
18
4.1
20
75
10
62
35
6
15
42
1.72
102616159--102616249
19
4.7
19
72
16
62
38
4
2
54
1.32
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18
2.2
18
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4
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76
5
5
12
1.11
102618896--102618929
10
3.6
9
85
14
50
73
2
2
20
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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10
3
41
1.57
102619502--102619951
145
3.0
142
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13
446
43
11
4
41
1.59
102622596--102622781
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2.5
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99
0
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40
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6
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1.80
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2.1
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50
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102631942--102631979
16
2.4
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90
0
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26
23
15
1.95
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1.9
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0
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33
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20
20
1.97
102631902--102632021
57
2.1
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18
19
1.94
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2.7
44
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0
202
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26
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1.92
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2.7
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29
3.0
29
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26
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30
1.92
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1.9
18
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13
13
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2.3
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0
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2
2
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1.20
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1.9
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28
0
3
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2.1
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20
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55
3
4
36
1.38
102701064--102701126
30
2.1
30
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5
101
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4
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1.53
102711050--102711142
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8.2
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19
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5
6
27
60
1.44
102711048--102711136
22
4.0
22
83
11
110
4
6
29
59
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102711023--102711102
10
7.3
10
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2
7
32
57
1.40
102711022--102711136
44
2.6
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78
10
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4
6
30
59
1.41
102711489--102711536
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2.0
25
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8
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58
4
0
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1.18
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2.0
24
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31
2
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0
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2
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2.0
80
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0
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2.3
22
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40
2
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2.2
55
90
1
188
63
4
3
29
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102777117--102777149
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1.9
17
88
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50
18
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66
1.36
102790666--102790708
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19
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28
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22
28
1.99
102808742--102808850
37
2.9
37
94
0
182
26
32
19
22
1.97
102808997--102809438
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49
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3
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32
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5
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1.78
102808997--102809453
100
4.6
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4
661
32
25
5
36
1.78
102823237--102823340
52
2.0
51
98
1
199
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198
20
22
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19
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102838648--102838806
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20
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2
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171
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7
100
0
50
16
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0
32
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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28
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1.95
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100
0
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26
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102932497--102932716
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2.3
92
80
9
223
28
16
27
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
20
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4.2
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2.0
51
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1.84
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0
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2.9
228
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58
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0
200
30
21
24
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345