Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Gbar_A09
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Warning! 1491452 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 250 of 250
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TTTTTTATTTTTAAAATA
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* ** * *
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TTTTTATTTTTGAAAATAA
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*
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66 ATATATTTAGCCCACAATGCAGGAGAAAGGTAAGCATGAACACAACCGAGAAAAGTGCTGTACCA
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131 GCATTCCTATATAATGAGCTTAAAGCCCTCTCTTATAACAAATGGAACTTAATCGAAATCAAATG
*
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*
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1 ATATA
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*
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*
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* * *
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*
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*
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1 GGTTTAG
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1 GGTTTAG
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1 GGTTTAG
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1 GGTTTAG
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1 GGTTTAG
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*
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1 GGTTTAG
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1 GGTTT-AG
77927506 GGTTTA
1 GGTTTA
77927512 AACACA
Statistics
Matches: 2903, Mismatches: 94, Indels: 582
0.81 0.03 0.16
Matches are distributed among these distances:
4 7 0.00
5 71 0.02
6 460 0.16
7 1525 0.53
8 590 0.20
9 168 0.06
10 63 0.02
11 16 0.01
12 3 0.00
ACGTcount: A:0.15, C:0.01, G:0.42, T:0.43
Consensus pattern (7 bp):
GGTTTAG
Done.