Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 106989029
ACGTcount: A:0.31, C:0.17, G:0.17, T:0.31
Warning! 3754247 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 155 of 322
Found at i:50900511 original size:29 final size:28
Alignment explanation
Indices: 50900478--50900555 Score: 70
Period size: 29 Copynumber: 2.8 Consensus size: 28
50900468 GCTGCAAACT
* *
50900478 AAGACACAATTAAAAATTATG-ACATGAC
1 AAGACACAATTAAAAACTATGTA-ATAAC
**
50900506 AAAGACGTAA-TAAAAACTATGTAATAAC
1 -AAGACACAATTAAAAACTATGTAATAAC
*
50900534 AAGACACAATTTAAAAGCTATG
1 AAGACACAA-TTAAAAACTATG
50900556 GAATTAATTA
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 7, Indels: 6
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
27 7 0.18
28 14 0.36
29 18 0.46
ACGTcount: A:0.54, C:0.13, G:0.12, T:0.22
Consensus pattern (28 bp):
AAGACACAATTAAAAACTATGTAATAAC
Found at i:50901921 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 50901880--50901921 Score: 59
Period size: 16 Copynumber: 2.5 Consensus size: 17
50901870 ATAAAGAAAT
* *
50901880 TATTCAAGTTTTCGATA
1 TATTCAAGTTTGCAATA
50901897 TA-TCAAGTTTGCAATA
1 TATTCAAGTTTGCAATA
50901913 TATTCAAGT
1 TATTCAAGT
50901922 AAAGAATAGA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
16 14 0.64
17 8 0.36
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.12, T:0.43
Consensus pattern (17 bp):
TATTCAAGTTTGCAATA
Found at i:50909182 original size:15 final size:16
Alignment explanation
Indices: 50909162--50909196 Score: 54
Period size: 15 Copynumber: 2.2 Consensus size: 16
50909152 AGGAAGAAAA
50909162 AGAAGAAAA-AAATGG
1 AGAAGAAAATAAATGG
*
50909177 AGAAGAAAATAAATTG
1 AGAAGAAAATAAATGG
50909193 AGAA
1 AGAA
50909197 AATAAGTGTG
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
15 9 0.50
16 9 0.50
ACGTcount: A:0.66, C:0.00, G:0.23, T:0.11
Consensus pattern (16 bp):
AGAAGAAAATAAATGG
Found at i:50910272 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 50910246--50910293 Score: 96
Period size: 23 Copynumber: 2.1 Consensus size: 23
50910236 ACATATGAGC
50910246 AAGAAAATTCATTGAATAGAATT
1 AAGAAAATTCATTGAATAGAATT
50910269 AAGAAAATTCATTGAATAGAATT
1 AAGAAAATTCATTGAATAGAATT
50910292 AA
1 AA
50910294 ACAATGTCTT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 25 1.00
ACGTcount: A:0.54, C:0.04, G:0.12, T:0.29
Consensus pattern (23 bp):
AAGAAAATTCATTGAATAGAATT
Found at i:50910673 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 50910633--50910686 Score: 99
Period size: 28 Copynumber: 1.9 Consensus size: 28
50910623 AATCTTTCCT
50910633 ATATGTCATCAAGTATAAGAAAGGTACC
1 ATATGTCATCAAGTATAAGAAAGGTACC
*
50910661 ATATGTTATCAAGTATAAGAAAGGTA
1 ATATGTCATCAAGTATAAGAAAGGTA
50910687 AAGAAAATAT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
28 25 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.19, T:0.28
Consensus pattern (28 bp):
ATATGTCATCAAGTATAAGAAAGGTACC
Found at i:50914544 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 50914522--50914566 Score: 54
Period size: 13 Copynumber: 3.4 Consensus size: 13
50914512 ATCCCACCCC
50914522 AAATACAGATACA
1 AAATACAGATACA
*
50914535 AAATATAGATACA
1 AAATACAGATACA
* *
50914548 ATATACAAATACA
1 AAATACAGATACA
50914561 GAAATA
1 -AAATA
50914567 ATAGATTTAA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 5, Indels: 1
0.81 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
13 22 0.85
14 4 0.15
ACGTcount: A:0.62, C:0.11, G:0.07, T:0.20
Consensus pattern (13 bp):
AAATACAGATACA
Found at i:50914773 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 50914750--50914783 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
50914740 CATGTGGCTT
50914750 GCTCGTATGGGCCCACAA
1 GCTCGTAT-GGCCCACAA
*
50914768 GCTCGTGTGGCCCACA
1 GCTCGTATGGCCCACA
50914784 TGTCCAACTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 8 0.53
18 7 0.47
ACGTcount: A:0.18, C:0.35, G:0.29, T:0.18
Consensus pattern (17 bp):
GCTCGTATGGCCCACAA
Found at i:50918910 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 50918875--50918913 Score: 55
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
50918865 TTTGTCTTGG
50918875 TTTTCTTGTAATGCAACCT
1 TTTTCTTGTAATGCAACCT
50918894 TTTTCTT-TAAGTG-AACCT
1 TTTTCTTGTAA-TGCAACCT
50918912 TT
1 TT
50918914 GGAACACCCC
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 3
0.86 0.00 0.14
Matches are distributed among these distances:
18 10 0.53
19 9 0.47
ACGTcount: A:0.21, C:0.18, G:0.10, T:0.51
Consensus pattern (19 bp):
TTTTCTTGTAATGCAACCT
Found at i:50921679 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 50921649--50921826 Score: 205
Period size: 27 Copynumber: 6.6 Consensus size: 27
50921639 ATATTGAGTC
* * * *
50921649 CGCACACTCAGTGCTATATAATCAACT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
* *
50921676 CGCACACTTAGTGCTACGTAATCAAAT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
50921703 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAACT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAA-T
** * *
50921731 CGCACACTTAGTGCCGCATGGTCAATT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
* **
50921758 CGCACACTTAGTGC-ATCATATTCATTT
1 CGCACACTTAGTGCTA-CATAGTCAAAT
*
50921785 CGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAAT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
50921812 CGCACACTTAGTGCT
1 CGCACACTTAGTGCT
50921827 GTACAATTTA
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 18, Indels: 6
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 106 0.82
28 24 0.18
ACGTcount: A:0.30, C:0.28, G:0.15, T:0.27
Consensus pattern (27 bp):
CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
Found at i:50921788 original size:82 final size:81
Alignment explanation
Indices: 50921670--50921825 Score: 233
Period size: 82 Copynumber: 1.9 Consensus size: 81
50921660 TGCTATATAA
* *
50921670 TCAACTCGCACACTTAGTGCTACGTAATCAAATCGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAACTCGCA
1 TCAACTCGCACACTTAGTGCTACATAATCAAATCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAA-TCGCA
50921735 CACTTAGTGCCGCATGG
65 CACTTAGTGCCGCATGG
* * **
50921752 TCAATTCGCACACTTAGTGC-ATCATATTCATTTCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAATCGCA
1 TCAACTCGCACACTTAGTGCTA-CATAATCAAATCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAATCGCA
50921816 CACTTAGTGC
65 CACTTAGTGC
50921826 TGTACAATTT
Statistics
Matches: 67, Mismatches: 6, Indels: 3
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
81 16 0.24
82 51 0.76
ACGTcount: A:0.29, C:0.28, G:0.15, T:0.27
Consensus pattern (81 bp):
TCAACTCGCACACTTAGTGCTACATAATCAAATCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAATCGCAC
ACTTAGTGCCGCATGG
Found at i:50929869 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 50929839--50930016 Score: 205
Period size: 27 Copynumber: 6.6 Consensus size: 27
50929829 ATATTGAGTC
* * * *
50929839 CGCACACTCAGTGCTATATAATCAACT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
* *
50929866 CGCACACTTAGTGCTACGTAATCAAAT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
50929893 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAACT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAA-T
** * *
50929921 CGCACACTTAGTGCCGCATGGTCAATT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
* **
50929948 CGCACACTTAGTGC-ATCATATTCATTT
1 CGCACACTTAGTGCTA-CATAGTCAAAT
*
50929975 CGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAAT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
50930002 CGCACACTTAGTGCT
1 CGCACACTTAGTGCT
50930017 GTACAATTTA
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 18, Indels: 6
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 106 0.82
28 24 0.18
ACGTcount: A:0.30, C:0.28, G:0.15, T:0.27
Consensus pattern (27 bp):
CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAAT
Found at i:50929978 original size:82 final size:81
Alignment explanation
Indices: 50929860--50930015 Score: 233
Period size: 82 Copynumber: 1.9 Consensus size: 81
50929850 TGCTATATAA
* *
50929860 TCAACTCGCACACTTAGTGCTACGTAATCAAATCGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAACTCGCA
1 TCAACTCGCACACTTAGTGCTACATAATCAAATCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAA-TCGCA
50929925 CACTTAGTGCCGCATGG
65 CACTTAGTGCCGCATGG
* * **
50929942 TCAATTCGCACACTTAGTGC-ATCATATTCATTTCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAATCGCA
1 TCAACTCGCACACTTAGTGCTA-CATAATCAAATCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAATCGCA
50930006 CACTTAGTGC
65 CACTTAGTGC
50930016 TGTACAATTT
Statistics
Matches: 67, Mismatches: 6, Indels: 3
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
81 16 0.24
82 51 0.76
ACGTcount: A:0.29, C:0.28, G:0.15, T:0.27
Consensus pattern (81 bp):
TCAACTCGCACACTTAGTGCTACATAATCAAATCGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAATCGCAC
ACTTAGTGCCGCATGG
Found at i:50934291 original size:27 final size:26
Alignment explanation
Indices: 50934240--50934292 Score: 61
Period size: 26 Copynumber: 2.0 Consensus size: 26
50934230 CCTACAAGAA
*
50934240 GGACAAACAAACACAAGTAGCAAAAC
1 GGACAAACAAACACAAGAAGCAAAAC
* *
50934266 GGACCAACAACACACAAAGAAGAAAAA
1 GGACAAACAA-ACAC-AAGAAGCAAAA
50934293 AAAGAAAAGA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 3, Indels: 2
0.81 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
26 9 0.41
27 4 0.18
28 9 0.41
ACGTcount: A:0.60, C:0.23, G:0.15, T:0.02
Consensus pattern (26 bp):
GGACAAACAAACACAAGAAGCAAAAC
Found at i:50947675 original size:175 final size:177
Alignment explanation
Indices: 50947337--50948032 Score: 668
Period size: 175 Copynumber: 4.0 Consensus size: 177
50947327 CCCTCTATCA
** **
50947337 TTGCCTCCCTCGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTCCATC-GACAG
1 TTGCCTCCCTCGGTTACAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGAATCAGACAG
* * * * * * * ** *
50947401 CGAAGTAGATCAAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTCGATGGCAGTGGAGTAGGTTGAAGATAGCAG
66 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTAGGTTGCAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAG
*** * * * * *
50947466 ATCTTGCC-TCCCAAAGCAG-TAGTGGAGTAGATCGAATATACCAGCC
131 ATCTTGCCTTCCTGTA-CTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * *
50947512 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGTGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGGATC-G-TAG
1 TTGCCTCCCTCGGTTACAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGAATCAGACAG
* * *
50947575 TGGAGCAGATCGAAGATACCAGCTTTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAG
66 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTAGGTTGCAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAG
* * *
50947640 ATATTGCCTTCCTGTACTGACAGTGAAGCAGATCGAAGACACTAGCC
131 ATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * * *
50947687 TTGCCTCCCTCGATTACAGCGGAGCAGGTTGAATATA--ATGAATCTTGCCTCCCT-AAGCAG-T
1 TTGCCTCCCTCGGTTACAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCA-G-ATCTTGCCTTCCTGAATCAGAC
* * * * * * *
50947748 AGTGGAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGTCTCCCTCGGTTGTAGTGAAGTAGACTGAAGATAGC
64 AGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTAGGTTGCAGTGGAGCAGACTGAAGATAAC
*
50947813 AGATCTTGCATT-C----CTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
129 AGATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * *
50947857 TTGCCTCCCTGGGTTACAGTGGAGTAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTA-CTGACAA
1 TTGCCTCCCTCGGTTACAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGAATCAGACAG
* * * * ** *
50947921 TGAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTTCCTCCCTAGGTTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAAC-G
66 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTAGGTTGCAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAG
* * ** * *
50947985 AATCTTGCCTTCTTGTACTAATGGCGAAGCAGATCAAAGATACCAGCC
131 -ATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
50948033 CTATCTCTCT
Statistics
Matches: 428, Mismatches: 78, Indels: 29
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
170 76 0.18
171 61 0.14
172 1 0.00
173 1 0.00
174 67 0.16
175 196 0.46
176 26 0.06
ACGTcount: A:0.26, C:0.24, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (177 bp):
TTGCCTCCCTCGGTTACAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGAATCAGACAG
TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTAGGTTGCAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAG
ATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
Found at i:50947809 original size:262 final size:257
Alignment explanation
Indices: 50947337--50947994 Score: 879
Period size: 262 Copynumber: 2.5 Consensus size: 257
50947327 CCCTCTATCA
* **
50947337 TTGCCTCCCTCGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTCCA-TCGACAG
1 TTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTACT-GACAG
* * * * * * * * *
50947401 CGAAGTAGATCAAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTCGATGGCAGTGGAGTAGGTTGAAGAT-AGCA
65 TGAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTGCCTCCCTCGATTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAAG-A
* *
50947465 GATCTTGCCTCCCAAAGCAGTAGTGGAGTAGATCGAATATACCAGCCTTGCCTCCCTCGGTTGCA
129 -ATCTTGCCTCCCAAAGCAGTAGTGGAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTCGGTTGCA
** ** * *
50947530 GTGGTGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGGATCGTAGTGGAGCAGATCGAAGATACC
193 GTGAAGCAGACTGAAGATAGCAGATCTTGCATTCCT-GA-C--AGTGAAGCAGATCGAAGATACC
*
50947595 AGCT
254 AGCC
** * *
50947599 TTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAGATATTGCCTTCCTGTACTGACAGT
1 TTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGT
*
50947664 GAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTGCCTCCCTCGATTACAGCGGAGCAGGTTGAATATAATGAA
66 GAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTGCCTCCCTCGATTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAA-GAA
* * *
50947729 TCTTGCCTCCCTAAGCAGTAGTGGAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGTCTCCCTCGGTTGTAGT
130 TCTTGCCTCCCAAAGCAGTAGTGGAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTCGGTTGCAGT
*
50947794 GAAGTAGACTGAAGATAGCAGATCTTGCATTCCTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
195 GAAGCAGACTGAAGATAGCAGATCTTGCATTCCTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* ** * *
50947857 TTGCCTCCCTGGGTTACAGTGGAGTAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTACTGACAAT
1 TTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGT
* * *
50947922 GAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTTCCTCCCTAGGTTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAACGAA
66 GAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTGCCTCCCTCGATTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAA-GAA
50947987 TCTTGCCT
130 TCTTGCCT
50947995 TCTTGTACTA
Statistics
Matches: 349, Mismatches: 44, Indels: 10
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
258 148 0.42
260 1 0.00
261 2 0.01
262 194 0.56
263 3 0.01
264 1 0.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.24, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (257 bp):
TTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTACTGACAGT
GAAGCAGATCGAAGACACTAGCCTTGCCTCCCTCGATTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAAGAAT
CTTGCCTCCCAAAGCAGTAGTGGAGCAGATCGAAGATACCAGCCTTGCCTCCCTCGGTTGCAGTG
AAGCAGACTGAAGATAGCAGATCTTGCATTCCTGACAGTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
Found at i:50948014 original size:88 final size:87
Alignment explanation
Indices: 50947337--50948032 Score: 594
Period size: 87 Copynumber: 8.0 Consensus size: 87
50947327 CCCTCTATCA
* * ** *
50947337 TTGCCTCCCTCGGTTGTAGTGGAGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTCCATCGACA-G
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTA-CTA-ATG
* * *
50947401 CGAAGTAGATCAAAGATACCAGCC
64 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * *** *
50947425 TTGCCTCCCTCGATGGCAGTGGAGTAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCC-TCCCAAAGC-AGTAG
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTA-CTAAT-G
* * *
50947488 TGGAGTAGATCGAATATACCAGCC
64 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * *
50947512 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGTGCAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGGATCGT-A-G
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTA-C-TAATG
* *
50947575 TGGAGCAGATCGAAGATACCAGCT
64 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * ** *
50947599 TTGCCTCCCTAGGTTGTAGTGGAGCAGACTGAAGATAACAGATATTGCCTTCCTGTACTGACA-G
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTACT-A-ATG
* *
50947663 TGAAGCAGATCGAAGACACTAGCC
64 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * * * * *
50947687 TTGCCTCCCTCGATTACAGCGGAGCAGGTTGAATATAA-TGAATCTTGCCTCCCT-AAGC-AGTA
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAG-ATCTTGCCTTCCTGTA-CTAAT-
*
50947749 GTGGAGCAGATCGAAGATACCAGCC
63 GTGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * ** * *
50947774 TTGTCTCCCTCGGTTGTAGTGAAGTAGACTGAAGATAGCAGATCTTGCATTCCTG-AC--A-GTG
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTACTAATGTG
50947835 AAGCAGATCGAAGATACCAGCC
66 AAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * *
50947857 TTGCCTCCCTGGGTTACAGTGGAGTAGGTTGAAGATAGCAGATCTTGCCTTCCTGTACTGACA-A
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTACT-A-ATG
* *
50947921 TGAAGCAGATCGAAGACACTAGCC
64 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
* * * * *
50947945 TTTCCTCCCTAGGTTGCAGCGGAGCAGGTTGAATATAAC-GAATCTTGCCTTCTTGTACTAATGG
1 TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAG-ATCTTGCCTTCCTGTACTAAT-G
* *
50948009 CGAAGCAGATCAAAGATACCAGCC
64 TGAAGCAGATCGAAGATACCAGCC
50948033 CTATCTCTCT
Statistics
Matches: 493, Mismatches: 93, Indels: 44
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
83 71 0.14
84 2 0.00
85 1 0.00
86 5 0.01
87 207 0.42
88 207 0.42
ACGTcount: A:0.26, C:0.24, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (87 bp):
TTGCCTCCCTCGGTTGCAGTGGAGCAGGTTGAAGATAACAGATCTTGCCTTCCTGTACTAATGTG
AAGCAGATCGAAGATACCAGCC
Found at i:50948089 original size:44 final size:44
Alignment explanation
Indices: 50948032--50948217 Score: 248
Period size: 44 Copynumber: 4.2 Consensus size: 44
50948022 AGATACCAGC
* **
50948032 CCTATCTCTCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTGTAAGT
1 CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTACAAGT
* * *
50948076 CATATCTCCCTGACCAGCAGTAGAATAGGTCGAAGATTACAAGT
1 CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTACAAGT
* * **
50948120 CCTACCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGGAGATTGTAAG-
1 CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTACAAGT
* *
50948163 CCTTATCTCCCTGACCAGTAGTGGAATAGGTTGAAGATTACAAGT
1 CC-TATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTACAAGT
50948208 CCTATCTCCC
1 CCTATCTCCC
50948218 CGACGTTGCA
Statistics
Matches: 121, Mismatches: 19, Indels: 4
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
43 2 0.02
44 117 0.97
45 2 0.02
ACGTcount: A:0.28, C:0.23, G:0.24, T:0.25
Consensus pattern (44 bp):
CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTACAAGT
Found at i:50948190 original size:88 final size:88
Alignment explanation
Indices: 50948032--50948217 Score: 300
Period size: 88 Copynumber: 2.1 Consensus size: 88
50948022 AGATACCAGC
* *
50948032 CCTATCTCTCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTGTAAGTCATATCTCCCTGACCAGCAGT
1 CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTGTAAGCCATATCTCCCTGACCAGCAGT
50948097 AGAATAGGTCGAAGATTACAAGT
66 AGAATAGGTCGAAGATTACAAGT
* * * *
50948120 CCTACCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGGAGATTGTAAGCCTTATCTCCCTGACCAGTAGT
1 CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTGTAAGCCATATCTCCCTGACCAGCAGT
* *
50948185 GGAATAGGTTGAAGATTACAAGT
66 AGAATAGGTCGAAGATTACAAGT
50948208 CCTATCTCCC
1 CCTATCTCCC
50948218 CGACGTTGCA
Statistics
Matches: 89, Mismatches: 9, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
88 89 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.23, G:0.24, T:0.25
Consensus pattern (88 bp):
CCTATCTCCCTGACCAGCAGTGGAATAGGTGGAAGATTGTAAGCCATATCTCCCTGACCAGCAGT
AGAATAGGTCGAAGATTACAAGT
Found at i:50948728 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 50948687--50948728 Score: 52
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
50948677 AACAGCACAC
*
50948687 AAAGAAGTAAAAAAAACTAGA
1 AAAGAAGTAAAAAAAACGAGA
50948708 AAAGAAG-AAAACAAAA-GAGA
1 AAAGAAGTAAAA-AAAACGAGA
50948728 A
1 A
50948729 TAACAGATTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 3
0.83 0.04 0.13
Matches are distributed among these distances:
20 8 0.42
21 11 0.58
ACGTcount: A:0.74, C:0.05, G:0.17, T:0.05
Consensus pattern (21 bp):
AAAGAAGTAAAAAAAACGAGA
Found at i:50951891 original size:47 final size:47
Alignment explanation
Indices: 50951828--50970675 Score: 37624
Period size: 47 Copynumber: 401.0 Consensus size: 47
50951818 ATGATAGTAT
50951828 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50951875 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50951922 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50951969 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952016 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952063 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952110 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952157 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952204 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952251 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952298 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952345 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952392 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952439 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952486 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952533 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952580 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952627 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952674 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952721 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952768 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952815 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952862 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952909 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50952956 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953003 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953050 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953097 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953144 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953191 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953238 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953285 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953332 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953379 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953426 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953473 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953520 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953567 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953614 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953661 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953708 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953755 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953802 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953849 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953896 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953943 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50953990 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954037 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954084 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954131 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954178 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954225 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954272 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954319 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954366 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954413 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954460 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954507 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954554 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954601 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954648 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954695 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954742 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954789 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954836 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954883 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954930 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50954977 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955024 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955071 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955118 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955165 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955212 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955259 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955306 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955353 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955400 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955447 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955494 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955541 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955588 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955635 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955682 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955729 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955776 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955823 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955870 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955917 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50955964 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956011 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956058 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956105 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956152 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956199 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956246 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956293 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956340 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956387 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956434 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956481 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956528 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956575 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956622 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956669 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956716 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956763 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956810 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956857 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956904 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956951 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50956998 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957045 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957092 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957139 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957186 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957233 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957280 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957327 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957374 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957421 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957468 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957515 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957562 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957609 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957656 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957703 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957750 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957797 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957844 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957891 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957938 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50957985 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958032 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958079 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958126 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958173 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958220 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958267 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958314 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958361 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958408 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958455 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958502 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958549 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958596 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958643 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958690 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958737 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958784 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958831 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958878 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958925 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50958972 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959019 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959066 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959113 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959160 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959207 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959254 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959301 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959348 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959395 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959442 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959489 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959536 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959583 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959630 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959677 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959724 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959771 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959818 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959865 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959912 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50959959 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960006 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960053 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960100 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960147 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960194 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960241 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960288 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960335 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960382 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960429 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960476 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960523 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960570 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960617 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960664 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960711 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960758 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960805 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960852 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960899 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960946 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50960993 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961040 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961087 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961134 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961181 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961228 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961275 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961322 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961369 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961416 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961463 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961510 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961557 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961604 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961651 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961698 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961745 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961792 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961839 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961886 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961933 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50961980 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962027 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962074 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962121 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962168 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962215 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962262 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962309 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962356 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962403 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962450 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962497 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962544 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962591 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962638 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962685 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962732 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962779 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962826 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962873 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962920 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50962967 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963014 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963061 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963108 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963155 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963202 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963249 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963296 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963343 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963390 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963437 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963484 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963531 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963578 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963625 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963672 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963719 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963766 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963813 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963860 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963907 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50963954 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964001 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964048 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964095 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964142 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964189 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964236 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964283 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964330 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964377 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964424 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964471 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964518 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964565 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964612 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964659 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964706 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964753 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964800 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964847 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964894 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964941 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50964988 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965035 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965082 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965129 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965176 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965223 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965270 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965317 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965364 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965411 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965458 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965505 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965552 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965599 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965646 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965693 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965740 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965787 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965834 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965881 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965928 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50965975 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966022 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966069 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966116 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966163 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966210 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966257 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966304 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966351 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966398 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966445 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966492 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966539 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966586 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966633 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966680 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966727 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966774 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966821 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966868 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966915 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50966962 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967009 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967056 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967103 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967150 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967197 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967244 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967291 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967338 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967385 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967432 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967479 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967526 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967573 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967620 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967667 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967714 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967761 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967808 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967855 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967902 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967949 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50967996 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968043 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968090 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968137 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968184 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968231 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968278 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968325 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968372 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968419 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968466 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968513 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968560 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968607 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968654 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968701 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968748 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968795 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968842 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968889 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968936 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50968983 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969030 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969077 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969124 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969171 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969218 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969265 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969312 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969359 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969406 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969453 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969500 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969547 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969594 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969641 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969688 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969735 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969782 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969829 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969876 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969923 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50969970 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970017 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970064 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970111 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970158 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970205 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970252 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970299 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970346 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970393 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970440 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970487 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970534 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
* *
50970581 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGACAG
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
* * * * * *
50970628 GGCCGAGTGGCCAACGTGATGGATGTGAAAGTGTATAAATGTGATAA
1 GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
50970675 G
1 G
50970676 TCCCGAAGGG
Statistics
Matches: 18791, Mismatches: 10, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
47 18791 1.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.09, G:0.30, T:0.30
Consensus pattern (47 bp):
GGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAA
Found at i:50970850 original size:37 final size:37
Alignment explanation
Indices: 50970794--50970872 Score: 122
Period size: 37 Copynumber: 2.1 Consensus size: 37
50970784 CCGAGCTCTA
* * *
50970794 AAGACCCGATGACTACGTGTGGGGATTTTGTCCGGGT
1 AAGACCCGATAACTACGTGTGGAGATTATGTCCGGGT
*
50970831 AAGACCCGATAACTTCGTGTGGAGATTATGTCCGGGT
1 AAGACCCGATAACTACGTGTGGAGATTATGTCCGGGT
50970868 AAGAC
1 AAGAC
50970873 TTCGTAATAA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 4, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
37 38 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.19, G:0.32, T:0.25
Consensus pattern (37 bp):
AAGACCCGATAACTACGTGTGGAGATTATGTCCGGGT
Found at i:50972660 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 50972637--50972670 Score: 50
Period size: 13 Copynumber: 2.5 Consensus size: 13
50972627 ATTAGTTTAA
50972637 TATTAATTTGTTAT
1 TATT-ATTTGTTAT
50972651 TATTATTTGTTAT
1 TATTATTTGTTAT
*
50972664 TTTTATT
1 TATTATT
50972671 GACATTATTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
13 15 0.79
14 4 0.21
ACGTcount: A:0.24, C:0.00, G:0.06, T:0.71
Consensus pattern (13 bp):
TATTATTTGTTAT
Found at i:50978594 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 50978549--50978740 Score: 235
Period size: 40 Copynumber: 4.8 Consensus size: 40
50978539 ATAACCACAA
* * *
50978549 GCACAATTGCCTTCGGGTCTTAACCCGGGTATAGCAACTC
1 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATATATCAACTC
*
50978589 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGCCCGGATATATCAACTC
1 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATATATCAACTC
* * *
50978629 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAGCCCGGATAAAATC-ACTA
1 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGAT-ATATCAACTC
* * *
50978669 GCATAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAAAATC-ACTA
1 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGAT-ATATCAACTC
* * *
50978709 GCATAAATGCCTTCGGGACTTAGCCCGGATAT
1 GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATAT
50978741 CATTCAAATG
Statistics
Matches: 140, Mismatches: 11, Indels: 3
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
39 1 0.01
40 135 0.96
41 4 0.03
ACGTcount: A:0.27, C:0.28, G:0.21, T:0.24
Consensus pattern (40 bp):
GCACAAATGCCTTCGGGTCTTAACCCGGATATATCAACTC
Found at i:50986873 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 50986757--50986919 Score: 213
Period size: 39 Copynumber: 4.1 Consensus size: 39
50986747 GCTCCTCGTT
* *
50986757 CAAATGCCTTCGGGACATAGCCC-GATTATAGTAAT-TTGCA
1 CAAATGCCTTC-GGACTTAGCCCGGATT-TAGT-ATCTCGCA
*
50986797 CAAATGCCTTCGGAACTTAACCCGGATTTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGG-ACTTAGCCCGGATTTAGTATCTCGCA
* *
50986837 CAAATGCCTTCGGCCTTAGCTCGGATTTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGACTTAGCCCGGATTTAGTATCTCGCA
* *
50986876 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGACTTAGCCCGGATTTAGTATCTCGCA
50986915 CAAAT
1 CAAAT
50986920 ATTCGACCAC
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 9, Indels: 7
0.87 0.07 0.06
Matches are distributed among these distances:
39 68 0.61
40 39 0.35
41 4 0.04
ACGTcount: A:0.26, C:0.26, G:0.20, T:0.28
Consensus pattern (39 bp):
CAAATGCCTTCGGACTTAGCCCGGATTTAGTATCTCGCA
Found at i:50990931 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 50990895--50990936 Score: 50
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 20
50990885 ACAAACTCAC
* *
50990895 AAATAAAAAGCAGAATT-AT
1 AAATAAAAACCAAAATTGAT
50990914 AAATAAAAACCATAAATTGAT
1 AAATAAAAACCA-AAATTGAT
50990935 AA
1 AA
50990937 GTTTAAACAA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
19 11 0.58
20 4 0.21
21 4 0.21
ACGTcount: A:0.64, C:0.07, G:0.07, T:0.21
Consensus pattern (20 bp):
AAATAAAAACCAAAATTGAT
Found at i:50991402 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 50991384--50991434 Score: 57
Period size: 13 Copynumber: 3.8 Consensus size: 13
50991374 ATCCCACCCC
50991384 AAATACAGATACA
1 AAATACAGATACA
*
50991397 AAATACATATACA
1 AAATACAGATACA
* *
50991410 ATATACAAATACA
1 AAATACAGATACA
50991423 GAAATAACAGAT
1 -AAAT-ACAGAT
50991435 TTACATACTT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 5, Indels: 2
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
13 23 0.74
14 3 0.10
15 5 0.16
ACGTcount: A:0.61, C:0.14, G:0.06, T:0.20
Consensus pattern (13 bp):
AAATACAGATACA
Found at i:50996433 original size:12 final size:11
Alignment explanation
Indices: 50996414--50996438 Score: 50
Period size: 11 Copynumber: 2.3 Consensus size: 11
50996404 GAGTAAGTTT
50996414 GTAAAAAAATA
1 GTAAAAAAATA
50996425 GTAAAAAAATA
1 GTAAAAAAATA
50996436 GTA
1 GTA
50996439 TTTGTTTTTA
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
11 14 1.00
ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.12, T:0.20
Consensus pattern (11 bp):
GTAAAAAAATA
Found at i:51003272 original size:38 final size:38
Alignment explanation
Indices: 51003221--51003297 Score: 145
Period size: 38 Copynumber: 2.0 Consensus size: 38
51003211 AAAGAATAAG
51003221 TTAGAAACATGAACCGCATCGTCATTTTTTGTGCAGGC
1 TTAGAAACATGAACCGCATCGTCATTTTTTGTGCAGGC
*
51003259 TTAGAAACATGAACCGCATCGTTATTTTTTGTGCAGGC
1 TTAGAAACATGAACCGCATCGTCATTTTTTGTGCAGGC
51003297 T
1 T
51003298 ATGAAATGCG
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
38 38 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.19, G:0.21, T:0.34
Consensus pattern (38 bp):
TTAGAAACATGAACCGCATCGTCATTTTTTGTGCAGGC
Found at i:51004847 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51004803--51004849 Score: 60
Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 20
51004793 AGCTCGTTTC
51004803 CAGCTCACTTGAGCTCAAGT
1 CAGCTCACTTGAGCTCAAGT
* *
51004823 AAGCTCA-TTCGAGCTCAATT
1 CAGCTCACTT-GAGCTCAAGT
51004843 CAGCTCA
1 CAGCTCA
51004850 ATTTTAACCC
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 2
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
19 2 0.09
20 21 0.91
ACGTcount: A:0.28, C:0.30, G:0.17, T:0.26
Consensus pattern (20 bp):
CAGCTCACTTGAGCTCAAGT
Found at i:51006386 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 51006371--51006436 Score: 51
Period size: 12 Copynumber: 5.1 Consensus size: 12
51006361 AAAAAATTCG
51006371 AAAAAAAAAAGA
1 AAAAAAAAAAGA
**
51006383 AAAAGAAATGAGCA
1 AAAA-AAAAAAG-A
*
51006397 AAAAAAAGAAACA
1 AAAAAAA-AAAGA
51006410 AAAGTAAAAAAAGA
1 AAA--AAAAAAAGA
*
51006424 AGAAAAAAAAGA
1 AAAAAAAAAAGA
51006436 A
1 A
51006437 GTGAAAAGTC
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 7, Indels: 10
0.71 0.12 0.17
Matches are distributed among these distances:
12 14 0.33
13 12 0.29
14 12 0.29
15 4 0.10
ACGTcount: A:0.80, C:0.03, G:0.14, T:0.03
Consensus pattern (12 bp):
AAAAAAAAAAGA
Found at i:51006436 original size:9 final size:10
Alignment explanation
Indices: 51006372--51006433 Score: 54
Period size: 11 Copynumber: 5.8 Consensus size: 10
51006362 AAAAATTCGA
51006372 AAAAAAAAAG
1 AAAAAAAAAG
51006382 AAAAAGAAATGAG
1 AAAAA-AAA--AG
*
51006395 CAAAAAAAAG
1 AAAAAAAAAG
*
51006405 -AAACAAAAG
1 AAAAAAAAAG
51006414 TAAAAAAAGAAG
1 -AAAAAAA-AAG
51006426 AAAAAAAA
1 AAAAAAAA
51006434 GAAGTGAAAA
Statistics
Matches: 43, Mismatches: 3, Indels: 12
0.74 0.05 0.21
Matches are distributed among these distances:
9 8 0.19
10 8 0.19
11 15 0.35
12 6 0.14
13 6 0.14
ACGTcount: A:0.81, C:0.03, G:0.13, T:0.03
Consensus pattern (10 bp):
AAAAAAAAAG
Found at i:51007505 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 51007480--51007526 Score: 60
Period size: 15 Copynumber: 3.1 Consensus size: 15
51007470 AGAAAAGAAT
51007480 AAAGAAAATGAAAATG
1 AAAG-AAATGAAAATG
*
51007496 AAAGAAATGAAAAAG
1 AAAGAAATGAAAATG
51007511 AAA-AATATGAAAATG
1 AAAGAA-ATGAAAATG
51007526 A
1 A
51007527 GATTTCAAAA
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 2, Indels: 3
0.85 0.06 0.09
Matches are distributed among these distances:
14 2 0.07
15 22 0.79
16 4 0.14
ACGTcount: A:0.70, C:0.00, G:0.17, T:0.13
Consensus pattern (15 bp):
AAAGAAATGAAAATG
Found at i:51007573 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 51007556--51007631 Score: 50
Period size: 12 Copynumber: 6.3 Consensus size: 12
51007546 AGTGAAAAGC
51007556 AAAAAGAGATTG
1 AAAAAGAGATTG
*
51007568 AAAAAGAAATTG
1 AAAAAGAGATTG
*
51007580 --AAAGAGA-AG
1 AAAAAGAGATTG
*
51007589 AAAAAGAAAGAGTGG
1 AAAAAG--AGA-TTG
*
51007604 AAAAAGAAATTG
1 AAAAAGAGATTG
* *
51007616 AAAGAGAGCTTG
1 AAAAAGAGATTG
51007628 AAAA
1 AAAA
51007632 GAAATCGAGT
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 10, Indels: 12
0.69 0.14 0.17
Matches are distributed among these distances:
9 1 0.02
10 6 0.12
11 4 0.08
12 25 0.52
13 5 0.10
15 7 0.15
ACGTcount: A:0.62, C:0.01, G:0.25, T:0.12
Consensus pattern (12 bp):
AAAAAGAGATTG
Found at i:51007597 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 51007579--51007612 Score: 50
Period size: 15 Copynumber: 2.3 Consensus size: 15
51007569 AAAAGAAATT
51007579 GAAAGAGAAGAAAAA
1 GAAAGAGAAGAAAAA
**
51007594 GAAAGAGTGGAAAAA
1 GAAAGAGAAGAAAAA
51007609 GAAA
1 GAAA
51007613 TTGAAAGAGA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 17 1.00
ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.29, T:0.03
Consensus pattern (15 bp):
GAAAGAGAAGAAAAA
Found at i:51011877 original size:15 final size:14
Alignment explanation
Indices: 51011841--51011895 Score: 65
Period size: 15 Copynumber: 3.8 Consensus size: 14
51011831 TCTATTGAGC
51011841 GAGAAAAAGAAAAA
1 GAGAAAAAGAAAAA
*
51011855 GAGAAAAACAAAAA
1 GAGAAAAAGAAAAA
*
51011869 GAGTGAAAAGAAAAA
1 GAG-AAAAAGAAAAA
*
51011884 GAAAGAAAAGAA
1 GAGA-AAAAGAA
51011896 TGATGAGAGT
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 5, Indels: 3
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
14 16 0.47
15 18 0.53
ACGTcount: A:0.75, C:0.02, G:0.22, T:0.02
Consensus pattern (14 bp):
GAGAAAAAGAAAAA
Found at i:51020438 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 51020419--51020445 Score: 54
Period size: 14 Copynumber: 1.9 Consensus size: 14
51020409 TACATTGGAC
51020419 AGATTCATGCATGT
1 AGATTCATGCATGT
51020433 AGATTCATGCATG
1 AGATTCATGCATG
51020446 GGAGATGCAT
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 13 1.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.15, G:0.22, T:0.33
Consensus pattern (14 bp):
AGATTCATGCATGT
Found at i:51021531 original size:21 final size:23
Alignment explanation
Indices: 51021486--51021532 Score: 62
Period size: 23 Copynumber: 2.1 Consensus size: 23
51021476 TCACCTGCAA
* *
51021486 TAAACACATTAAAATGAGTTTAT
1 TAAACACATTAAAATCAGCTTAT
51021509 TAAACACATTAAAA-CA-CTTAT
1 TAAACACATTAAAATCAGCTTAT
51021530 TAA
1 TAA
51021533 TCATAACACA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
21 7 0.32
22 1 0.05
23 14 0.64
ACGTcount: A:0.51, C:0.13, G:0.04, T:0.32
Consensus pattern (23 bp):
TAAACACATTAAAATCAGCTTAT
Found at i:51028307 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 51028272--51028310 Score: 62
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
51028262 CAGCTCGTTG
51028272 AGCTCAATTCAGCTCATTTCC
1 AGCTCAATTCAGCTCATTTCC
*
51028293 AGCTC-ATTGAGCTCATTT
1 AGCTCAATTCAGCTCATTT
51028311 GCTTGTTTGA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
20 12 0.71
21 5 0.29
ACGTcount: A:0.23, C:0.28, G:0.13, T:0.36
Consensus pattern (21 bp):
AGCTCAATTCAGCTCATTTCC
Found at i:51028718 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 51028700--51028725 Score: 52
Period size: 13 Copynumber: 2.0 Consensus size: 13
51028690 TGTGTCCTAA
51028700 TATGAATTAAATT
1 TATGAATTAAATT
51028713 TATGAATTAAATT
1 TATGAATTAAATT
51028726 GCTTTCAGGT
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 13 1.00
ACGTcount: A:0.46, C:0.00, G:0.08, T:0.46
Consensus pattern (13 bp):
TATGAATTAAATT
Found at i:51032515 original size:49 final size:49
Alignment explanation
Indices: 51032445--51032891 Score: 721
Period size: 49 Copynumber: 9.3 Consensus size: 49
51032435 GTGAACATGC
*
51032445 ATATATGAGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
51032494 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTG--T
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
*
51032541 ATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
*
51032590 ATATATGTGATAGGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
*
51032639 ATATATGTGATAGGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTG--T
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
*
51032686 ATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
*
51032735 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCAATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
51032784 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTG--T
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
* * * * * * *
51032831 ATATATGTGACAGGGCCGAGTGGCCAACGTGATGGATGTGAAAGTGTAT
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
51032880 A-A-ATGTGATAAG
1 ATATATGTGATAAG
51032892 TCCCGAAGGG
Statistics
Matches: 374, Mismatches: 18, Indels: 14
0.92 0.04 0.03
Matches are distributed among these distances:
47 139 0.37
48 1 0.00
49 234 0.63
ACGTcount: A:0.33, C:0.09, G:0.29, T:0.29
Consensus pattern (49 bp):
ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTAT
Found at i:51032525 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 51032424--51032891 Score: 721
Period size: 96 Copynumber: 4.9 Consensus size: 96
51032414 TTAGGATTCT
* * *
51032424 ATGTGATGGATGTGAACA-TGCATATATGAGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAA
1 ATGTGATGAATGTGAA-AGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAA
51032488 GTGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
65 GTGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
*
51032520 ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATGAATGTGAAAG
1 ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAG
*
51032585 TGTATATATATGTGATAGGGCCTAATGGCCG
66 TGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
*
51032616 ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAGGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAA
1 ATGTGATGAATGTGAAAGTG--TATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAA
*
51032681 AGTG--TATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCG
64 AGTGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
*
51032712 ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCAATGTGATGAATGTGAA
1 ATGTGATGAATGTGAAAGTG--TATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAA
51032777 AGTGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
64 AGTGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
* * * * * * *
51032810 ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGACAGGGCCGAGTGGCCAACGTGATGGATGTGAAAG
1 ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAG
51032875 TGTATA-A-ATGTGATAAG
66 TGTATATATATGTGATAAG
51032892 TCCCGAAGGG
Statistics
Matches: 349, Mismatches: 18, Indels: 12
0.92 0.05 0.03
Matches are distributed among these distances:
94 10 0.03
95 2 0.01
96 246 0.70
98 91 0.26
ACGTcount: A:0.33, C:0.09, G:0.29, T:0.29
Consensus pattern (96 bp):
ATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAG
TGTATATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCG
Found at i:51032609 original size:145 final size:145
Alignment explanation
Indices: 51032445--51032891 Score: 772
Period size: 145 Copynumber: 3.1 Consensus size: 145
51032435 GTGAACATGC
*
51032445 ATATATGAGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGC
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGC
51032510 CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATG
66 CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATG
51032575 AATGTGAAAGTGTAT
131 AATGTGAAAGTGTAT
* *
51032590 ATATATGTGATAGGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAGGGC
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGC
51032655 CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATG
66 CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATG
51032720 AATGTGAAAGTGTAT
131 AATGTGAAAGTGTAT
*
51032735 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCAATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGC
1 ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGC
* * * * * * *
51032800 CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGACAGGGCCGAGTGGCCAACGTGATG
66 CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATG
*
51032865 GATGTGAAAGTGTAT
131 AATGTGAAAGTGTAT
51032880 A-A-ATGTGATAAG
1 ATATATGTGATAAG
51032892 TCCCGAAGGG
Statistics
Matches: 288, Mismatches: 14, Indels: 2
0.95 0.05 0.01
Matches are distributed among these distances:
143 10 0.03
144 1 0.00
145 277 0.96
ACGTcount: A:0.33, C:0.09, G:0.29, T:0.29
Consensus pattern (145 bp):
ATATATGTGATAAGGCCTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATATGTGATAAGGC
CTAATGGCCGATGTGATGAATGTGAAAGTGTATATATGTGATAAGGCCTAATAGCCGATGTGATG
AATGTGAAAGTGTAT
Found at i:51044014 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 51044006--51044048 Score: 86
Period size: 3 Copynumber: 14.3 Consensus size: 3
51043996 ATAAAACGCA
51044006 TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT T
1 TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT T
51044049 GTGTTTTAAT
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 40 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.00, G:0.00, T:0.67
Consensus pattern (3 bp):
TAT
Found at i:51045474 original size:50 final size:50
Alignment explanation
Indices: 51045362--51045560 Score: 227
Period size: 50 Copynumber: 3.9 Consensus size: 50
51045352 CATTTGGGTA
* *
51045362 GAGAGATCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCATCATTGAGATTAT
1 GAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCACCA---AG---AT
*
51045418 GAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCGTTGGCACCAAGAT
1 GAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCACCAAGAT
** * * *
51045468 GAGAGGTCCCCCGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATGGGCACCGATAT
1 GAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCACCAAGAT
** * * *
51045518 GAGAACTCCCATGTAAGACCATATCTGGGATATGGTATTGGCA
1 GAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCA
51045561 GTACAAGAAA
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 17, Indels: 6
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
50 81 0.64
53 2 0.02
56 43 0.34
ACGTcount: A:0.27, C:0.21, G:0.29, T:0.23
Consensus pattern (50 bp):
GAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCACCAAGAT
Found at i:51045559 original size:100 final size:103
Alignment explanation
Indices: 51045374--51045560 Score: 254
Period size: 100 Copynumber: 1.8 Consensus size: 103
51045364 GAGATCCCAT
* **
51045374 GTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATTGGCATCATTGAGATTATGAGAGGTCCCATGTAAGACCA
1 GTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATGGGCATC--T-AGATTATGAGAACTCCCATGTAAGACCA
* *
51045439 TGTCTGGGACATGGCGTTGGCACCAAGATGAGAGGTCCCCC
63 TATCTGGGACATGGCATTGGCACCAAGATGAGAGGTCCCCC
*
51045480 GTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATGGGCA-C-CGA-TATGAGAACTCCCATGTAAGACCATAT
1 GTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATGGGCATCTAGATTATGAGAACTCCCATGTAAGACCATAT
* *
51045542 CTGGGATATGGTATTGGCA
66 CTGGGACATGGCATTGGCA
51045561 GTACAAGAAA
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 8, Indels: 6
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
100 40 0.55
101 2 0.03
105 1 0.01
106 30 0.41
ACGTcount: A:0.27, C:0.21, G:0.29, T:0.23
Consensus pattern (103 bp):
GTAAGACCATGTCTGGGACATGGCATGGGCATCTAGATTATGAGAACTCCCATGTAAGACCATAT
CTGGGACATGGCATTGGCACCAAGATGAGAGGTCCCCC
Found at i:51049523 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 51049398--51049777 Score: 518
Period size: 39 Copynumber: 9.6 Consensus size: 39
51049388 GCTCCTCGTT
* * *
51049398 CAAATGCCTTCGGGACATAGCCCGG-TTATAGTAAT-TCACA
1 CAAATGCCTTCGGG-CTTAGCCCGGAAT-TAGT-ATCTCGCA
* * * *
51049438 CAAATGCCTTCGGGACTTAACCCGGATTTAGTAACTCGGA
1 CAAATGCCTTCGGG-CTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
*
51049478 CCAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
* *
51049517 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCAGAATTTGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
51049556 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
51049595 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
51049634 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
51049673 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
1 CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
* * * *
51049712 CAAATGCCTTCGGATCTTAGTCCGG-ATATGGTCA-CTTAGCA
1 CAAATGCCTTCGG-GCTTAGCCCGGAAT-TAGT-ATC-TCGCA
51049753 CAAA-GCCTTCGGGACTTAGCCCGGA
1 CAAATGCCTTCGGG-CTTAGCCCGGA
51049778 CATCATTCAA
Statistics
Matches: 311, Mismatches: 21, Indels: 15
0.90 0.06 0.04
Matches are distributed among these distances:
39 227 0.73
40 73 0.23
41 11 0.04
ACGTcount: A:0.24, C:0.28, G:0.23, T:0.26
Consensus pattern (39 bp):
CAAATGCCTTCGGGCTTAGCCCGGAATTAGTATCTCGCA
Found at i:51064734 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 51064701--51064760 Score: 111
Period size: 23 Copynumber: 2.6 Consensus size: 23
51064691 CCTTCATCTG
51064701 TCCCTTTGTTAAACAACCAATTAA
1 TCCC-TTGTTAAACAACCAATTAA
51064725 TCCCTTGTTAAACAACCAATTAA
1 TCCCTTGTTAAACAACCAATTAA
51064748 TCCCTTGTTAAAC
1 TCCCTTGTTAAAC
51064761 CAATCTTTGT
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 0, Indels: 1
0.97 0.00 0.03
Matches are distributed among these distances:
23 32 0.89
24 4 0.11
ACGTcount: A:0.35, C:0.27, G:0.05, T:0.33
Consensus pattern (23 bp):
TCCCTTGTTAAACAACCAATTAA
Found at i:51066400 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 51066375--51066432 Score: 55
Period size: 10 Copynumber: 5.8 Consensus size: 10
51066365 GCCATCCTTG
*
51066375 CAAGCTCGAT
1 CAAGCTCAAT
*
51066385 CCAGCTCAAT
1 CAAGCTCAAT
51066395 CAAGCTCAAT
1 CAAGCTCAAT
**
51066405 TTAGCTCAATT
1 CAAGCTCAA-T
*
51066416 CTAGCTCAAT
1 CAAGCTCAAT
51066426 -AAGCTCA
1 CAAGCTCA
51066433 TTCCTAGCTC
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 7, Indels: 3
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
9 6 0.15
10 25 0.62
11 9 0.22
ACGTcount: A:0.33, C:0.29, G:0.12, T:0.26
Consensus pattern (10 bp):
CAAGCTCAAT
Found at i:51066430 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 51066387--51066443 Score: 66
Period size: 20 Copynumber: 2.8 Consensus size: 21
51066377 AGCTCGATCC
* *
51066387 AGCTCAA-TCAAGCTCAATTT
1 AGCTCAATTCTAGCTCAATTA
51066407 AGCTCAATTCTAGCTCAA-TA
1 AGCTCAATTCTAGCTCAATTA
51066427 AGCTC-ATTCCTAGCTCA
1 AGCTCAATT-CTAGCTCA
51066444 CAAGCTCCAT
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 2, Indels: 4
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
19 3 0.09
20 21 0.64
21 9 0.27
ACGTcount: A:0.32, C:0.28, G:0.11, T:0.30
Consensus pattern (21 bp):
AGCTCAATTCTAGCTCAATTA
Found at i:51066448 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51066407--51066460 Score: 58
Period size: 19 Copynumber: 2.8 Consensus size: 20
51066397 AGCTCAATTT
*
51066407 AGCTCAATTCTAGCTCAATA
1 AGCTCAATTCTAGCTCAACA
51066427 AGCTC-ATTCCTAGCTC-ACA
1 AGCTCAATT-CTAGCTCAACA
* *
51066446 AGCTCCATTTTAGCT
1 AGCTCAATTCTAGCT
51066461 TACTTTAGTT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 2, Indels: 5
0.81 0.05 0.14
Matches are distributed among these distances:
19 15 0.50
20 15 0.50
ACGTcount: A:0.28, C:0.30, G:0.11, T:0.31
Consensus pattern (20 bp):
AGCTCAATTCTAGCTCAACA
Found at i:51066454 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51066407--51066460 Score: 58
Period size: 20 Copynumber: 2.8 Consensus size: 20
51066397 AGCTCAATTT
* *
51066407 AGCTCAATTCTAGCTCAATA
1 AGCTCCATTCTAGCTCAACA
51066427 AGCT-CATTCCTAGCTC-ACA
1 AGCTCCATT-CTAGCTCAACA
*
51066446 AGCTCCATTTTAGCT
1 AGCTCCATTCTAGCT
51066461 TACTTTAGTT
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 3, Indels: 5
0.78 0.08 0.14
Matches are distributed among these distances:
19 14 0.48
20 15 0.52
ACGTcount: A:0.28, C:0.30, G:0.11, T:0.31
Consensus pattern (20 bp):
AGCTCCATTCTAGCTCAACA
Found at i:51069803 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 51069759--51069878 Score: 208
Period size: 38 Copynumber: 3.1 Consensus size: 39
51069749 TTTAAGTATA
* *
51069759 TAATTATGTCTTAGTTTGAAAATCATTAATATATGTCTT
1 TAATTATGTCTTAGTTTGAACATCATTAATATGTGTCTT
51069798 TAATTATGTCTTAGTTTGAACATCATTAATATGTGTC-T
1 TAATTATGTCTTAGTTTGAACATCATTAATATGTGTCTT
51069836 TAATTATGTCTTAGTTTGAACATCATTAATATGTGT-TT
1 TAATTATGTCTTAGTTTGAACATCATTAATATGTGTCTT
51069874 TAATT
1 TAATT
51069879 GTGTGTCTTA
Statistics
Matches: 78, Mismatches: 2, Indels: 3
0.94 0.02 0.04
Matches are distributed among these distances:
38 43 0.55
39 35 0.45
ACGTcount: A:0.31, C:0.08, G:0.12, T:0.49
Consensus pattern (39 bp):
TAATTATGTCTTAGTTTGAACATCATTAATATGTGTCTT
Found at i:51070949 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51070921--51070978 Score: 75
Period size: 20 Copynumber: 3.0 Consensus size: 20
51070911 TTCCATGTGG
51070921 TTCAGCTCATTCGAGCTCAA
1 TTCAGCTCATTCGAGCTCAA
**
51070941 GTT-AGCTCACACGAGCTCAA
1 -TTCAGCTCATTCGAGCTCAA
51070961 TTCAGCTCATT-GAGCTCA
1 TTCAGCTCATTCGAGCTCA
51070979 TTATTAGCTC
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 4, Indels: 4
0.80 0.10 0.10
Matches are distributed among these distances:
19 9 0.28
20 21 0.66
21 2 0.06
ACGTcount: A:0.26, C:0.29, G:0.17, T:0.28
Consensus pattern (20 bp):
TTCAGCTCATTCGAGCTCAA
Found at i:51072424 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51072396--51072440 Score: 63
Period size: 20 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20
51072386 TAATGTGTCT
51072396 TGTCCTAACCGAATTAATTG
1 TGTCCTAACCGAATTAATTG
* **
51072416 TGTCTTAACTTAATTAATTG
1 TGTCCTAACCGAATTAATTG
51072436 TGTCC
1 TGTCC
51072441 AGTTTTAATT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 4, Indels: 0
0.84 0.16 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 21 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.18, G:0.13, T:0.42
Consensus pattern (20 bp):
TGTCCTAACCGAATTAATTG
Found at i:51073348 original size:23 final size:24
Alignment explanation
Indices: 51073310--51073354 Score: 65
Period size: 23 Copynumber: 1.9 Consensus size: 24
51073300 ACCTATACCG
* *
51073310 TTTCGTACCTATACCAA-ACCACA
1 TTTCGTACCAAAACCAATACCACA
51073333 TTTCGTACCAAAACCAATACCA
1 TTTCGTACCAAAACCAATACCA
51073355 TTCCCTAACT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 1
0.86 0.09 0.05
Matches are distributed among these distances:
23 15 0.79
24 4 0.21
ACGTcount: A:0.38, C:0.33, G:0.04, T:0.24
Consensus pattern (24 bp):
TTTCGTACCAAAACCAATACCACA
Found at i:51073601 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 51073579--51073616 Score: 60
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
51073569 ATAAAAAAAT
51073579 AAAAAAAATT-CGAAATTA
1 AAAAAAAATTACGAAATTA
*
51073597 AAAAAATATTACGAAATTA
1 AAAAAAAATTACGAAATTA
51073616 A
1 A
51073617 TTAGAAAAAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 9 0.50
19 9 0.50
ACGTcount: A:0.66, C:0.05, G:0.05, T:0.24
Consensus pattern (19 bp):
AAAAAAAATTACGAAATTA
Found at i:51075785 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 51075768--51075794 Score: 54
Period size: 12 Copynumber: 2.2 Consensus size: 12
51075758 ATTCCGAAGT
51075768 ATATATATATAC
1 ATATATATATAC
51075780 ATATATATATAC
1 ATATATATATAC
51075792 ATA
1 ATA
51075795 AGTATGCCAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
12 15 1.00
ACGTcount: A:0.52, C:0.07, G:0.00, T:0.41
Consensus pattern (12 bp):
ATATATATATAC
Found at i:51076307 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 51076276--51076453 Score: 205
Period size: 27 Copynumber: 6.6 Consensus size: 27
51076266 TAAATTGTAC
51076276 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
* ** *
51076303 TGCACTAAGTGTGCGAAATGAATATG-
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
* * *
51076329 ATGCACTAAGTGTGCGAATTGACCATGC
1 A-GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
*
51076357 GGCACTAAGTGTGCGAGTTTGACTATGT
1 AGCACTAAGTGTGCGA-TTTGACTATGT
* *
51076385 AGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACGT
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
* * *
51076412 AGCACTAAGTGTGCGAGTTGATTATAT
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
*
51076439 AGCACTGAGTGTGCG
1 AGCACTAAGTGTGCG
51076454 GACTCAATAT
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 19, Indels: 6
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 106 0.82
28 23 0.18
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.28, T:0.30
Consensus pattern (27 bp):
AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
Found at i:51076390 original size:82 final size:81
Alignment explanation
Indices: 51076277--51076432 Score: 233
Period size: 82 Copynumber: 1.9 Consensus size: 81
51076267 AAATTGTACA
* *
51076277 GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTTGCACTAAGTGTGCGAAATGAATATG-ATGCACTAAGTG
1 GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTA-GCACTAAGTG
51076341 TGCGAATTGACCATGCG
65 TGCGAATTGACCATGCG
** *
51076358 GCACTAAGTGTGCGAGTTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACGTAGCACTAAGTG
1 GCACTAAGTGTGCGA-TTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTAGCACTAAGTG
*
51076423 TGCGAGTTGA
65 TGCGAATTGA
51076433 TTATATAGCA
Statistics
Matches: 67, Mismatches: 6, Indels: 3
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
81 15 0.22
82 51 0.76
83 1 0.01
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.28, T:0.29
Consensus pattern (81 bp):
GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTAGCACTAAGTGT
GCGAATTGACCATGCG
Found at i:51076444 original size:82 final size:81
Alignment explanation
Indices: 51076273--51076453 Score: 229
Period size: 82 Copynumber: 2.2 Consensus size: 81
51076263 GATTAAATTG
* *
51076273 TACAGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTTGCACTAAGTGTGCGAAATGAATATGATGCACTAA
1 TACAGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGATGCACTAA
51076338 GTGTGCGAATTGACCA
66 GTGTGCGAATTGACCA
* * ** *
51076354 TGCGGCACTAAGTGTGCGAGTTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACG-TAGCACT
1 TACAGCACTAAGTGTGCGA-TTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGAT-GCACT
* **
51076418 AAGTGTGCGAGTTGATTA
64 AAGTGTGCGAATTGACCA
* *
51076436 TATAGCACTGAGTGTGCG
1 TACAGCACTAAGTGTGCG
51076454 GACTCAATAT
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 14, Indels: 3
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
81 18 0.21
82 66 0.79
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.28, T:0.30
Consensus pattern (81 bp):
TACAGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGATGCACTAA
GTGTGCGAATTGACCA
Found at i:51093750 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 51093705--51093767 Score: 81
Period size: 21 Copynumber: 3.0 Consensus size: 21
51093695 TTTGAACCAT
* *
51093705 TACCAATTCGTACCAAATACCA
1 TACCATTTCGTACC-AATTCCA
51093727 TACCATTTCGTACCAATTCCA
1 TACCATTTCGTACCAATTCCA
* *
51093748 TACTATTTCGAACCAATTCC
1 TACCATTTCGTACCAATTCC
51093768 CAAATACCAA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 4, Indels: 1
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
21 24 0.65
22 13 0.35
ACGTcount: A:0.33, C:0.32, G:0.05, T:0.30
Consensus pattern (21 bp):
TACCATTTCGTACCAATTCCA
Found at i:51101613 original size:51 final size:51
Alignment explanation
Indices: 51101537--51101675 Score: 165
Period size: 51 Copynumber: 2.7 Consensus size: 51
51101527 GATGAACACG
* * * *
51101537 TGTGTAGTACTTTGTGATGGCTACTATATGTATCGATAAA-TAATGGTCACA
1 TGTGTAGTACTATGTGAAGGCTACTATGTGTATCGAAAAACT-ATGGTCACA
* * * *
51101588 TGTGTAGTACTAAGTGAAGGCTACTATGTGTA-CTAAAAAGCTTTGGTCACG
1 TGTGTAGTACTATGTGAAGGCTACTATGTGTATCGAAAAA-CTATGGTCACA
*
51101639 TGTGTAGTACTATGTGAAGGCTACTACGTGTATCGAA
1 TGTGTAGTACTATGTGAAGGCTACTATGTGTATCGAA
51101676 TGATAATAAT
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 11, Indels: 5
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
50 5 0.07
51 65 0.88
52 4 0.05
ACGTcount: A:0.29, C:0.13, G:0.24, T:0.34
Consensus pattern (51 bp):
TGTGTAGTACTATGTGAAGGCTACTATGTGTATCGAAAAACTATGGTCACA
Found at i:51118518 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 51118463--51118635 Score: 194
Period size: 32 Copynumber: 5.5 Consensus size: 32
51118453 GAATGGCTAC
* *
51118463 AAGCCATAAGT-ACAGTAATATGATTGGCACA
1 AAGCCATCAGTAACAGTAATATGATCGGCACA
** *
51118494 AAGCCATCAGTAGTAGTGATATGATCGGCACA
1 AAGCCATCAGTAACAGTAATATGATCGGCACA
* *
51118526 CAA-CCATCAGTAACGGTAATATGATCAGCACA
1 -AAGCCATCAGTAACAGTAATATGATCGGCACA
**
51118558 AAGCCATCAGTAATTGTAATATGATCGAGTCAC-
1 AAGCCATCAGTAACAGTAATATGATCG-G-CACA
*
51118591 -AGCCATCAGTAACAGTAATAT-ATCGACACA
1 AAGCCATCAGTAACAGTAATATGATCGGCACA
51118621 AAGCCATCAGTAACA
1 AAGCCATCAGTAACA
51118636 TTGCAACAAA
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 16, Indels: 14
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
29 3 0.03
31 30 0.25
32 80 0.67
33 3 0.03
34 3 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.21, G:0.18, T:0.21
Consensus pattern (32 bp):
AAGCCATCAGTAACAGTAATATGATCGGCACA
Found at i:51118923 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 51118893--51119089 Score: 159
Period size: 27 Copynumber: 7.7 Consensus size: 27
51118883 ATTTGGCCTT
*
51118893 AAGGGTATTACGGTTATTTTACCCTAC
1 AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
*
51118920 AAGGGCATTACGGTCATTTTACCCTAC
1 AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
* **
51118947 AGGGGTATTACAATCATTTTA-CCTAC
1 AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
51118973 -AGGAGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
1 AAGG-GTATTACGGTCATTTTACCCTAC
* * * *
51119000 -A--G-----CGGTAATTTTAACTTAT
1 AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
*
51119019 AAGGGTATTACGATCATTTTACCC--C
1 AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
* * *
51119044 AGGGGTATTACAGTCATTTTTCCCTAC
1 AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
*
51119071 -AGAGGTATTACGGTAATTT
1 AAG-GGTATTACGGTCATTT
51119090 AACAACCTTT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 25, Indels: 26
0.72 0.14 0.14
Matches are distributed among these distances:
19 13 0.10
20 1 0.01
22 1 0.01
24 1 0.01
25 22 0.17
26 21 0.16
27 73 0.55
ACGTcount: A:0.27, C:0.19, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (27 bp):
AAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTAC
Found at i:51118989 original size:53 final size:52
Alignment explanation
Indices: 51118908--51119089 Score: 175
Period size: 53 Copynumber: 3.6 Consensus size: 52
51118898 TATTACGGTT
*
51118908 ATTTTACCCTACAAGGGCATTACGGTCATTTTACCCTACAGGGGTATTACAATC
1 ATTTTA-CCTAC-AGGGTATTACGGTCATTTTACCCTACAGGGGTATTACAATC
* **
51118962 ATTTTACCTACAGGAGTATTACGGTCATTTTACCCTACAGCGGTAATTTTAA-C
1 ATTTTACCTACAGG-GTATTACGGTCATTTTACCCTACAGGGGT-ATTACAATC
* *
51119015 ---TTA--TA-AGGGTATTACGATCATTTTACCC--CAGGGGTATTACAGTC
1 ATTTTACCTACAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTACAGGGGTATTACAATC
* *
51119059 ATTTTTCCCTACAGAGGTATTACGGTAATTT
1 A-TTTTACCTACAG-GGTATTACGGTCATTT
51119090 AACAACCTTT
Statistics
Matches: 105, Mismatches: 12, Indels: 24
0.74 0.09 0.17
Matches are distributed among these distances:
43 4 0.04
44 7 0.07
46 19 0.18
47 3 0.03
48 4 0.04
50 5 0.05
51 2 0.02
52 17 0.16
53 33 0.31
54 11 0.10
ACGTcount: A:0.27, C:0.20, G:0.17, T:0.35
Consensus pattern (52 bp):
ATTTTACCTACAGGGTATTACGGTCATTTTACCCTACAGGGGTATTACAATC
Found at i:51119051 original size:25 final size:27
Alignment explanation
Indices: 51119021--51119082 Score: 76
Period size: 25 Copynumber: 2.4 Consensus size: 27
51119011 TAACTTATAA
51119021 GGGTATTACGA-TCATTTTACCC-CAG
1 GGGTATTACGAGTCATTTTACCCACAG
*
51119046 GGGTATTAC-AGTCATTTTTCCCTACAG
1 GGGTATTACGAGTCATTTTACCC-ACAG
*
51119073 AGGTATTACG
1 GGGTATTACG
51119083 GTAATTTAAC
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 2, Indels: 5
0.82 0.05 0.13
Matches are distributed among these distances:
24 1 0.03
25 19 0.61
27 11 0.35
ACGTcount: A:0.24, C:0.21, G:0.21, T:0.34
Consensus pattern (27 bp):
GGGTATTACGAGTCATTTTACCCACAG
Found at i:51120953 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 51120938--51121006 Score: 52
Period size: 10 Copynumber: 6.9 Consensus size: 10
51120928 ACGAGCTCAA
51120938 TGAGCTGAAT
1 TGAGCTGAAT
51120948 TGAGCTCGAA-
1 TGAGCT-GAAT
* *
51120958 TGAGATGACT
1 TGAGCTGAAT
*
51120968 TGAGCTCAAAT
1 TGAGCT-GAAT
*
51120979 T-AGCTGACT
1 TGAGCTGAAT
* *
51120988 TGAGCTCAAG
1 TGAGCTGAAT
51120998 TGAGCTGAA
1 TGAGCTGAA
51121007 CCACATGAAA
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 11, Indels: 8
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
9 5 0.11
10 33 0.75
11 6 0.14
ACGTcount: A:0.30, C:0.16, G:0.28, T:0.26
Consensus pattern (10 bp):
TGAGCTGAAT
Found at i:51120959 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 51120930--51121006 Score: 91
Period size: 20 Copynumber: 3.9 Consensus size: 19
51120920 AGCTAATAAC
51120930 GAGCTCAATGAGCTGAATT
1 GAGCTCAATGAGCTGAATT
* *
51120949 GAGCTCGAATGAGATGACTT
1 GAGCTC-AATGAGCTGAATT
* *
51120969 GAGCTCAAATTAGCTGACTT
1 GAGCTC-AATGAGCTGAATT
51120989 GAGCTCAAGTGAGCTGAA
1 GAGCTCAA-TGAGCTGAA
51121007 CCACATGAAA
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 7, Indels: 3
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
19 8 0.16
20 41 0.84
ACGTcount: A:0.31, C:0.17, G:0.27, T:0.25
Consensus pattern (19 bp):
GAGCTCAATGAGCTGAATT
Found at i:51122799 original size:15 final size:16
Alignment explanation
Indices: 51122776--51122805 Score: 53
Period size: 15 Copynumber: 1.9 Consensus size: 16
51122766 TTTCTCACAC
51122776 TCATCTTCTTTTTCTT
1 TCATCTTCTTTTTCTT
51122792 TCAT-TTCTTTTTCT
1 TCATCTTCTTTTTCT
51122806 AACTCGTTTT
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 1
0.93 0.00 0.07
Matches are distributed among these distances:
15 10 0.71
16 4 0.29
ACGTcount: A:0.07, C:0.23, G:0.00, T:0.70
Consensus pattern (16 bp):
TCATCTTCTTTTTCTT
Found at i:51122912 original size:45 final size:45
Alignment explanation
Indices: 51122827--51122935 Score: 114
Period size: 45 Copynumber: 2.4 Consensus size: 45
51122817 TCTTCTTTCT
** * *
51122827 TCAATTTC-TTTTTCTATTTTCTCTTTTTCACATCCTTTTTCAATC
1 TCAATTTCTTTTTTCT-TTTTCTCACTCTCACATCCATTTTCAATC
* *
51122872 TCAATTTCTTTTTTCTTTTTCTCACTCTCAC-TCTCATTTTCATTT
1 TCAATTTCTTTTTTCTTTTTCTCACTCTCACATC-CATTTTCAATC
*
51122917 TCAATTTCTTGTTCTCTTT
1 TCAATTTCTT-TTTTCTTT
51122936 CATTTTCATT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 7, Indels: 5
0.82 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
44 2 0.04
45 38 0.70
46 14 0.26
ACGTcount: A:0.14, C:0.25, G:0.01, T:0.61
Consensus pattern (45 bp):
TCAATTTCTTTTTTCTTTTTCTCACTCTCACATCCATTTTCAATC
Found at i:51122914 original size:6 final size:6
Alignment explanation
Indices: 51122905--51122973 Score: 61
Period size: 6 Copynumber: 11.5 Consensus size: 6
51122895 ACTCTCACTC
*
51122905 TCATTT TCATTT TCAATT TC-TTGT TC-TCTT TCATTT TCATTT TCATTT
1 TCATTT TCATTT TCATTT TCATT-T TCAT-TT TCATTT TCATTT TCATTT
* ** *
51122953 TCTTTT TGTTTT TCTTTT TCA
1 TCATTT TCATTT TCATTT TCA
51122974 CATGCAGTTT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 6, Indels: 6
0.82 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
5 1 0.02
6 51 0.94
7 2 0.04
ACGTcount: A:0.12, C:0.17, G:0.03, T:0.68
Consensus pattern (6 bp):
TCATTT
Found at i:51122955 original size:24 final size:25
Alignment explanation
Indices: 51122909--51122973 Score: 71
Period size: 24 Copynumber: 2.7 Consensus size: 25
51122899 TCACTCTCAT
*
51122909 TTTCATTTTCAATTTC-TTGTTCTC
1 TTTCATTTTCATTTTCATTGTTCTC
*
51122933 TTTCATTTTCATTTTCATT-TTCTT
1 TTTCATTTTCATTTTCATTGTTCTC
** *
51122957 TTTGTTTTTCTTTTTCA
1 TTTCATTTTCATTTTCA
51122974 CATGCAGTTT
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 5, Indels: 2
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
24 33 0.94
25 2 0.06
ACGTcount: A:0.11, C:0.17, G:0.03, T:0.69
Consensus pattern (25 bp):
TTTCATTTTCATTTTCATTGTTCTC
Found at i:51125455 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 51125426--51125482 Score: 78
Period size: 20 Copynumber: 2.9 Consensus size: 19
51125416 AGCTAATAAC
51125426 GAGCTCAATGAGCTGAATT
1 GAGCTCAATGAGCTGAATT
*
51125445 GAGCTCGAATGAGCTGACTT
1 GAGCTC-AATGAGCTGAATT
*
51125465 GAGCTCAAGTGAGTTGAA
1 GAGCTCAA-TGAGCTGAA
51125483 CCACATGAAA
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 3, Indels: 3
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
19 8 0.24
20 25 0.76
ACGTcount: A:0.30, C:0.16, G:0.30, T:0.25
Consensus pattern (19 bp):
GAGCTCAATGAGCTGAATT
Found at i:51131074 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 51131049--51131097 Score: 73
Period size: 20 Copynumber: 2.6 Consensus size: 19
51131039 TCACTCTCAA
51131049 TCTCTTTTTCTCTTTTTCAT
1 TCTCTTTTTCT-TTTTTCAT
*
51131069 TCTCTTTTTCTTTTTTGAT
1 TCTCTTTTTCTTTTTTCAT
51131088 T-TCTTTTTCT
1 TCTCTTTTTCT
51131098 GTCTTCCTTT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 1, Indels: 2
0.90 0.03 0.06
Matches are distributed among these distances:
18 9 0.32
19 8 0.29
20 11 0.39
ACGTcount: A:0.04, C:0.20, G:0.02, T:0.73
Consensus pattern (19 bp):
TCTCTTTTTCTTTTTTCAT
Found at i:51131080 original size:26 final size:24
Alignment explanation
Indices: 51131007--51131084 Score: 68
Period size: 26 Copynumber: 3.1 Consensus size: 24
51130997 CTTCCTGCAA
* *
51131007 TTTCTTTTTCAATTCTCTTGT-TTG
1 TTTCTTTTTC-ATTCTCTTCTCTTT
* *
51131031 TTTCTTTTTCACTCTCAATCTCTTT
1 TTTCTTTTTCATTCTC-TTCTCTTT
*
51131056 TTCTCTTTTTCATTCTCTTTTTCTTT
1 TT-TCTTTTTCATTCTC-TTCTCTTT
51131082 TTT
1 TTT
51131085 GATTTCTTTT
Statistics
Matches: 43, Mismatches: 8, Indels: 5
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
23 5 0.12
24 12 0.28
25 5 0.12
26 21 0.49
ACGTcount: A:0.08, C:0.22, G:0.03, T:0.68
Consensus pattern (24 bp):
TTTCTTTTTCATTCTCTTCTCTTT
Found at i:51131082 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 51131049--51131097 Score: 55
Period size: 19 Copynumber: 2.6 Consensus size: 18
51131039 TCACTCTCAA
51131049 TCTCTTTTTCTCTTTTTCAT
1 TCTC-TTTT-TCTTTTTCAT
*
51131069 TCTCTTTTTCTTTTTTGAT
1 TCTCTTTTTC-TTTTTCAT
51131088 T-TCTTTTTCT
1 TCTCTTTTTCT
51131098 GTCTTCCTTT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 5
0.82 0.03 0.15
Matches are distributed among these distances:
17 1 0.04
18 10 0.37
19 12 0.44
20 4 0.15
ACGTcount: A:0.04, C:0.20, G:0.02, T:0.73
Consensus pattern (18 bp):
TCTCTTTTTCTTTTTCAT
Found at i:51133023 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 51132992--51133169 Score: 205
Period size: 27 Copynumber: 6.6 Consensus size: 27
51132982 TAAATTGTAC
51132992 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
* ** *
51133019 TGCACTAAGTGTGCGAAATGAATATG-
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
* * *
51133045 ATGCACTAAGTGTGCGAATTGACCATGC
1 A-GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
*
51133073 GGCACTAAGTGTGCGAGTTTGACTATGT
1 AGCACTAAGTGTGCGA-TTTGACTATGT
* *
51133101 AGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACGT
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
* * *
51133128 AGCACTAAGTGTGCGAGTTGATTATAT
1 AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
*
51133155 AGCACTGAGTGTGCG
1 AGCACTAAGTGTGCG
51133170 GACTCAATAT
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 19, Indels: 6
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 106 0.82
28 23 0.18
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.28, T:0.30
Consensus pattern (27 bp):
AGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGT
Found at i:51133106 original size:82 final size:81
Alignment explanation
Indices: 51132993--51133148 Score: 233
Period size: 82 Copynumber: 1.9 Consensus size: 81
51132983 AAATTGTACA
* *
51132993 GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTTGCACTAAGTGTGCGAAATGAATATG-ATGCACTAAGTG
1 GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTA-GCACTAAGTG
51133057 TGCGAATTGACCATGCG
65 TGCGAATTGACCATGCG
** *
51133074 GCACTAAGTGTGCGAGTTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACGTAGCACTAAGTG
1 GCACTAAGTGTGCGA-TTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTAGCACTAAGTG
*
51133139 TGCGAGTTGA
65 TGCGAATTGA
51133149 TTATATAGCA
Statistics
Matches: 67, Mismatches: 6, Indels: 3
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
81 15 0.22
82 51 0.76
83 1 0.01
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.28, T:0.29
Consensus pattern (81 bp):
GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTAGCACTAAGTGT
GCGAATTGACCATGCG
Found at i:51133160 original size:82 final size:81
Alignment explanation
Indices: 51132989--51133169 Score: 229
Period size: 82 Copynumber: 2.2 Consensus size: 81
51132979 GATTAAATTG
* *
51132989 TACAGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTTGCACTAAGTGTGCGAAATGAATATGATGCACTAA
1 TACAGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGATGCACTAA
51133054 GTGTGCGAATTGACCA
66 GTGTGCGAATTGACCA
* * ** *
51133070 TGCGGCACTAAGTGTGCGAGTTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACG-TAGCACT
1 TACAGCACTAAGTGTGCGA-TTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGAT-GCACT
* **
51133134 AAGTGTGCGAGTTGATTA
64 AAGTGTGCGAATTGACCA
* *
51133152 TATAGCACTGAGTGTGCG
1 TACAGCACTAAGTGTGCG
51133170 GACTCAATAT
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 14, Indels: 3
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
81 18 0.21
82 66 0.79
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.28, T:0.30
Consensus pattern (81 bp):
TACAGCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGATGCACTAA
GTGTGCGAATTGACCA
Found at i:51137714 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 51137685--51137722 Score: 51
Period size: 15 Copynumber: 2.6 Consensus size: 15
51137675 GTTATTTTAC
*
51137685 TTAATTTCA-TTAGT
1 TTAATTTAACTTAGT
*
51137699 TTTATTTAACTTAGT
1 TTAATTTAACTTAGT
51137714 TTAATTTAA
1 TTAATTTAA
51137723 TTTCTACAAG
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 3, Indels: 1
0.83 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
14 7 0.35
15 13 0.65
ACGTcount: A:0.32, C:0.05, G:0.05, T:0.58
Consensus pattern (15 bp):
TTAATTTAACTTAGT
Found at i:51141596 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 51141581--51141618 Score: 51
Period size: 10 Copynumber: 3.8 Consensus size: 10
51141571 TTGGGTTAAG
51141581 ATTGAGCTGA
1 ATTGAGCTGA
51141591 ATTGAGCTCGA
1 ATTGAGCT-GA
51141602 A-TGAGCTGA
1 ATTGAGCTGA
*
51141611 CTTGAGCT
1 ATTGAGCT
51141619 CAAGTGAGTT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 4
0.83 0.03 0.13
Matches are distributed among these distances:
9 2 0.08
10 20 0.80
11 3 0.12
ACGTcount: A:0.26, C:0.16, G:0.29, T:0.29
Consensus pattern (10 bp):
ATTGAGCTGA
Found at i:51150903 original size:52 final size:50
Alignment explanation
Indices: 51150788--51150906 Score: 143
Period size: 50 Copynumber: 2.3 Consensus size: 50
51150778 TAATAAAGTT
51150788 ATGCATTATGTAACTTC-CATGCTAGTTAAGTATGCATCATAAATAATGAC
1 ATGCATTATGTAAC-TCACATGCTAGTTAAGTATGCATCATAAATAATGAC
* * *
51150838 ATGCATTATGTAACTCACATGTTAGTTTAAGTCTGCATCATTAAATTAA-GTC
1 ATGCATTATGTAACTCACATGCTAG-TTAAGTATGCATCA-TAAA-TAATGAC
* *
51150890 TTGCATTAAGTAACTCA
1 ATGCATTATGTAACTCA
51150907 TTTGTCATTT
Statistics
Matches: 60, Mismatches: 5, Indels: 6
0.85 0.07 0.08
Matches are distributed among these distances:
49 2 0.03
50 21 0.35
51 13 0.22
52 21 0.35
53 3 0.05
ACGTcount: A:0.34, C:0.16, G:0.13, T:0.36
Consensus pattern (50 bp):
ATGCATTATGTAACTCACATGCTAGTTAAGTATGCATCATAAATAATGAC
Found at i:51152237 original size:86 final size:86
Alignment explanation
Indices: 51152092--51152264 Score: 310
Period size: 86 Copynumber: 2.0 Consensus size: 86
51152082 CTATTCAATT
*
51152092 TGGGTTTCTTGATCTGACAAGTTTAGTTCTCTGTTTTCTGTTTTCATTGCAGCCAATTTGTTTAT
1 TGGGTTTCTTGATCTGACAAGTTTAGTTCTCTATTTTCTGTTTTCATTGCAGCCAATTTGTTTAT
51152157 AGATCTCGTAGGACTTTCCCG
66 AGATCTCGTAGGACTTTCCCG
* *
51152178 TGGGTTTCTTGATCTGACAAGTTTAGTTCTCTATTTTCTGTTTTCGTTGCAGGCAATTTGTTTAT
1 TGGGTTTCTTGATCTGACAAGTTTAGTTCTCTATTTTCTGTTTTCATTGCAGCCAATTTGTTTAT
*
51152243 AGATCTTGTAGGACTTTCCCG
66 AGATCTCGTAGGACTTTCCCG
51152264 T
1 T
51152265 TACTTGATGA
Statistics
Matches: 83, Mismatches: 4, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
86 83 1.00
ACGTcount: A:0.16, C:0.17, G:0.20, T:0.46
Consensus pattern (86 bp):
TGGGTTTCTTGATCTGACAAGTTTAGTTCTCTATTTTCTGTTTTCATTGCAGCCAATTTGTTTAT
AGATCTCGTAGGACTTTCCCG
Found at i:51157594 original size:30 final size:27
Alignment explanation
Indices: 51157559--51157624 Score: 80
Period size: 29 Copynumber: 2.4 Consensus size: 27
51157549 GCTGCACCAT
51157559 GACAAATTAAAATGTAGCTGACAAATTAAA
1 GACAAATTAAAATGTAGCTGA-AAA--AAA
* *
51157589 TACAAATT-AATTGTAGCTGAAAAAAA
1 GACAAATTAAAATGTAGCTGAAAAAAA
51157615 GACAAATTAA
1 GACAAATTAA
51157625 TTTCATGTCT
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 3, Indels: 5
0.80 0.08 0.12
Matches are distributed among these distances:
26 10 0.31
27 1 0.03
28 3 0.09
29 11 0.34
30 7 0.22
ACGTcount: A:0.55, C:0.09, G:0.12, T:0.24
Consensus pattern (27 bp):
GACAAATTAAAATGTAGCTGAAAAAAA
Found at i:51157624 original size:26 final size:28
Alignment explanation
Indices: 51157559--51157626 Score: 86
Period size: 26 Copynumber: 2.4 Consensus size: 28
51157549 GCTGCACCAT
*
51157559 GACAAATTAAAATGTAGCTGACAAATTAAA
1 GACAAATT-AATTGTAGCTGACAAA-TAAA
*
51157589 TACAAATTAATTGTAGCTGA-AAA-AAA
1 GACAAATTAATTGTAGCTGACAAATAAA
51157615 GACAAATTAATT
1 GACAAATTAATT
51157627 TCATGTCTTA
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 3, Indels: 4
0.83 0.07 0.10
Matches are distributed among these distances:
26 14 0.40
28 3 0.09
29 11 0.31
30 7 0.20
ACGTcount: A:0.53, C:0.09, G:0.12, T:0.26
Consensus pattern (28 bp):
GACAAATTAATTGTAGCTGACAAATAAA
Found at i:51164494 original size:416 final size:416
Alignment explanation
Indices: 51163723--51164556 Score: 1668
Period size: 416 Copynumber: 2.0 Consensus size: 416
51163713 ACTGAACAAA
51163723 GCCACTAAAAAAGACCACTACCCCCTCCCATTCATGGATCAAATGTTAGAAAGGTTAGCTGGTCG
1 GCCACTAAAAAAGACCACTACCCCCTCCCATTCATGGATCAAATGTTAGAAAGGTTAGCTGGTCG
51163788 CTCACATTTTTGTTTTTTGGATGGCTATTCAGGTTACCTAGAGGTACCCATCGCACCTGAGGATC
66 CTCACATTTTTGTTTTTTGGATGGCTATTCAGGTTACCTAGAGGTACCCATCGCACCTGAGGATC
51163853 AAGAGAAGACCACTTTCACTTGCCCATTTGGAACTTATGCCTTCAAGAGAATGCCCTTCAGATTG
131 AAGAGAAGACCACTTTCACTTGCCCATTTGGAACTTATGCCTTCAAGAGAATGCCCTTCAGATTG
51163918 TGCAATGCACCATCCACGTTCCAACGAGGTATAACGAGTATTTTTTCAGATTTTATTTCACATTT
196 TGCAATGCACCATCCACGTTCCAACGAGGTATAACGAGTATTTTTTCAGATTTTATTTCACATTT
51163983 AATGGAAGTGTTTATGGATGACTTTACTGTTTATGGTGATTCATTTGATCAGTGTTTGCATAATC
261 AATGGAAGTGTTTATGGATGACTTTACTGTTTATGGTGATTCATTTGATCAGTGTTTGCATAATC
51164048 TTGTGTTAGTTCTTAGGCGTTGCATTGAGACTAATCTGATTTTGAATTTTGAGAAATGTCATCTC
326 TTGTGTTAGTTCTTAGGCGTTGCATTGAGACTAATCTGATTTTGAATTTTGAGAAATGTCATCTC
51164113 ATGGTTGAAAAGGGTGTAGTATCGGG
391 ATGGTTGAAAAGGGTGTAGTATCGGG
51164139 GCCACTAAAAAAGACCACTACCCCCTCCCATTCATGGATCAAATGTTAGAAAGGTTAGCTGGTCG
1 GCCACTAAAAAAGACCACTACCCCCTCCCATTCATGGATCAAATGTTAGAAAGGTTAGCTGGTCG
51164204 CTCACATTTTTGTTTTTTGGATGGCTATTCAGGTTACCTAGAGGTACCCATCGCACCTGAGGATC
66 CTCACATTTTTGTTTTTTGGATGGCTATTCAGGTTACCTAGAGGTACCCATCGCACCTGAGGATC
51164269 AAGAGAAGACCACTTTCACTTGCCCATTTGGAACTTATGCCTTCAAGAGAATGCCCTTCAGATTG
131 AAGAGAAGACCACTTTCACTTGCCCATTTGGAACTTATGCCTTCAAGAGAATGCCCTTCAGATTG
51164334 TGCAATGCACCATCCACGTTCCAACGAGGTATAACGAGTATTTTTTCAGATTTTATTTCACATTT
196 TGCAATGCACCATCCACGTTCCAACGAGGTATAACGAGTATTTTTTCAGATTTTATTTCACATTT
51164399 AATGGAAGTGTTTATGGATGACTTTACTGTTTATGGTGATTCATTTGATCAGTGTTTGCATAATC
261 AATGGAAGTGTTTATGGATGACTTTACTGTTTATGGTGATTCATTTGATCAGTGTTTGCATAATC
51164464 TTGTGTTAGTTCTTAGGCGTTGCATTGAGACTAATCTGATTTTGAATTTTGAGAAATGTCATCTC
326 TTGTGTTAGTTCTTAGGCGTTGCATTGAGACTAATCTGATTTTGAATTTTGAGAAATGTCATCTC
51164529 ATGGTTGAAAAGGGTGTAGTATCGGG
391 ATGGTTGAAAAGGGTGTAGTATCGGG
51164555 GC
1 GC
51164557 ATGTCGTCTT
Statistics
Matches: 418, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
416 418 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.19, G:0.21, T:0.34
Consensus pattern (416 bp):
GCCACTAAAAAAGACCACTACCCCCTCCCATTCATGGATCAAATGTTAGAAAGGTTAGCTGGTCG
CTCACATTTTTGTTTTTTGGATGGCTATTCAGGTTACCTAGAGGTACCCATCGCACCTGAGGATC
AAGAGAAGACCACTTTCACTTGCCCATTTGGAACTTATGCCTTCAAGAGAATGCCCTTCAGATTG
TGCAATGCACCATCCACGTTCCAACGAGGTATAACGAGTATTTTTTCAGATTTTATTTCACATTT
AATGGAAGTGTTTATGGATGACTTTACTGTTTATGGTGATTCATTTGATCAGTGTTTGCATAATC
TTGTGTTAGTTCTTAGGCGTTGCATTGAGACTAATCTGATTTTGAATTTTGAGAAATGTCATCTC
ATGGTTGAAAAGGGTGTAGTATCGGG
Found at i:51173028 original size:14 final size:13
Alignment explanation
Indices: 51172992--51173030 Score: 51
Period size: 13 Copynumber: 2.9 Consensus size: 13
51172982 TAAAAAAATC
* *
51172992 TTTTCTATATTTG
1 TTTTCTTTAATTG
51173005 TTTTCTTTAATTG
1 TTTTCTTTAATTG
51173018 TTTTACTTTAATT
1 TTTT-CTTTAATT
51173031 CCATTTTATT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 1
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
13 15 0.65
14 8 0.35
ACGTcount: A:0.18, C:0.08, G:0.05, T:0.69
Consensus pattern (13 bp):
TTTTCTTTAATTG
Found at i:51175067 original size:26 final size:28
Alignment explanation
Indices: 51175024--51175080 Score: 82
Period size: 27 Copynumber: 2.1 Consensus size: 28
51175014 AAATCCCTAA
51175024 TTTTCTATTTAAAATCTAA-TTGTTTTC
1 TTTTCTATTTAAAATCTAATTTGTTTTC
* *
51175051 TTTT-TATTTGAATTCTAATTTGTTTTC
1 TTTTCTATTTAAAATCTAATTTGTTTTC
51175078 TTT
1 TTT
51175081 CGTAATTGAC
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 2
0.87 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
26 12 0.44
27 15 0.56
ACGTcount: A:0.21, C:0.09, G:0.05, T:0.65
Consensus pattern (28 bp):
TTTTCTATTTAAAATCTAATTTGTTTTC
Found at i:51180640 original size:12 final size:13
Alignment explanation
Indices: 51180605--51180637 Score: 66
Period size: 13 Copynumber: 2.5 Consensus size: 13
51180595 AAAGGAGTTC
51180605 AAAAAAAATTGAA
1 AAAAAAAATTGAA
51180618 AAAAAAAATTGAA
1 AAAAAAAATTGAA
51180631 AAAAAAA
1 AAAAAAA
51180638 TTGCATACGG
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 20 1.00
ACGTcount: A:0.82, C:0.00, G:0.06, T:0.12
Consensus pattern (13 bp):
AAAAAAAATTGAA
Found at i:51186213 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 51186168--51186230 Score: 81
Period size: 21 Copynumber: 3.0 Consensus size: 21
51186158 TTTGAACCAT
* *
51186168 TACCAATTCGTACCAAATACCA
1 TACCATTTCGTACC-AATTCCA
51186190 TACCATTTCGTACCAATTCCA
1 TACCATTTCGTACCAATTCCA
* *
51186211 TACTATTTCGAACCAATTCC
1 TACCATTTCGTACCAATTCC
51186231 CAAATACCAA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 4, Indels: 1
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
21 24 0.65
22 13 0.35
ACGTcount: A:0.33, C:0.32, G:0.05, T:0.30
Consensus pattern (21 bp):
TACCATTTCGTACCAATTCCA
Found at i:51186618 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 51186602--51186627 Score: 52
Period size: 11 Copynumber: 2.4 Consensus size: 11
51186592 GCTTAATTTC
51186602 ATCTGTTTTTA
1 ATCTGTTTTTA
51186613 ATCTGTTTTTA
1 ATCTGTTTTTA
51186624 ATCT
1 ATCT
51186628 TGGTGCTTAA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
11 15 1.00
ACGTcount: A:0.19, C:0.12, G:0.08, T:0.62
Consensus pattern (11 bp):
ATCTGTTTTTA
Found at i:51188095 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51188070--51188108 Score: 60
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
51188060 TACTTTCTTT
51188070 TTTACTTACACTCTTACTTG
1 TTTACTTACACTCTTACTTG
**
51188090 TTTACTTACTTTCTTACTT
1 TTTACTTACACTCTTACTT
51188109 AAAGAATTCA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 17 1.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.23, G:0.03, T:0.56
Consensus pattern (20 bp):
TTTACTTACACTCTTACTTG
Found at i:51213036 original size:33 final size:35
Alignment explanation
Indices: 51212999--51213070 Score: 105
Period size: 33 Copynumber: 2.1 Consensus size: 35
51212989 GAGTTAGTTT
*
51212999 ATTAAATTT-AGTTCAGCTCAAATAAGTGTTAG-A
1 ATTAAATTTCAATTCAGCTCAAATAAGTGTTAGTA
*
51213032 ATT-AATTTCAATTCAGCTTAAATAAGTGTTAGTA
1 ATTAAATTTCAATTCAGCTCAAATAAGTGTTAGTA
51213066 ATTAA
1 ATTAA
51213071 TTTGTTTAAA
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 2, Indels: 4
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
32 5 0.15
33 24 0.71
34 4 0.12
35 1 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (35 bp):
ATTAAATTTCAATTCAGCTCAAATAAGTGTTAGTA
Found at i:51214266 original size:139 final size:139
Alignment explanation
Indices: 51214085--51214363 Score: 558
Period size: 139 Copynumber: 2.0 Consensus size: 139
51214075 TTCCTAATAG
51214085 GGTTAGGAAAATAGTTAGGAGGCTTATATTAAGGCTTGGCCGGCCACCCTTATGAATTACATTGA
1 GGTTAGGAAAATAGTTAGGAGGCTTATATTAAGGCTTGGCCGGCCACCCTTATGAATTACATTGA
51214150 TTATACATTAAAGTCAAATTTCTTTTTGAGTGAAAATTCTCTTTGAGTTTCTCCAAGAATTTTCT
66 TTATACATTAAAGTCAAATTTCTTTTTGAGTGAAAATTCTCTTTGAGTTTCTCCAAGAATTTTCT
51214215 CTTGAGTTT
131 CTTGAGTTT
51214224 GGTTAGGAAAATAGTTAGGAGGCTTATATTAAGGCTTGGCCGGCCACCCTTATGAATTACATTGA
1 GGTTAGGAAAATAGTTAGGAGGCTTATATTAAGGCTTGGCCGGCCACCCTTATGAATTACATTGA
51214289 TTATACATTAAAGTCAAATTTCTTTTTGAGTGAAAATTCTCTTTGAGTTTCTCCAAGAATTTTCT
66 TTATACATTAAAGTCAAATTTCTTTTTGAGTGAAAATTCTCTTTGAGTTTCTCCAAGAATTTTCT
51214354 CTTGAGTTT
131 CTTGAGTTT
51214363 G
1 G
51214364 CTTTAGAAGT
Statistics
Matches: 140, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
139 140 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.14, G:0.19, T:0.39
Consensus pattern (139 bp):
GGTTAGGAAAATAGTTAGGAGGCTTATATTAAGGCTTGGCCGGCCACCCTTATGAATTACATTGA
TTATACATTAAAGTCAAATTTCTTTTTGAGTGAAAATTCTCTTTGAGTTTCTCCAAGAATTTTCT
CTTGAGTTT
Found at i:51221289 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51221266--51221305 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20
51221256 TTTATTATTA
*
51221266 TTATTATTA-TTTCATTTGTT
1 TTATT-TTACTTTCAATTGTT
51221286 TTATTTTACTTTCAATTGTT
1 TTATTTTACTTTCAATTGTT
51221306 AACTAAACTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
19 3 0.17
20 15 0.83
ACGTcount: A:0.20, C:0.07, G:0.05, T:0.68
Consensus pattern (20 bp):
TTATTTTACTTTCAATTGTT
Found at i:51221505 original size:26 final size:27
Alignment explanation
Indices: 51221445--51221505 Score: 65
Period size: 26 Copynumber: 2.3 Consensus size: 27
51221435 TTTCAAAAAA
* *
51221445 TTTATATTATTATTATTATTATTTTGT
1 TTTATTTTAATATTATTATTATTTTGT
*
51221472 TTTA-TTTAATATTTTTATT-TTCTT-T
1 TTTATTTTAATATTATTATTATT-TTGT
51221497 TTTATTTTA
1 TTTATTTTA
51221506 CAATTAGCTT
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 3, Indels: 5
0.78 0.08 0.14
Matches are distributed among these distances:
25 7 0.24
26 18 0.62
27 4 0.14
ACGTcount: A:0.23, C:0.02, G:0.02, T:0.74
Consensus pattern (27 bp):
TTTATTTTAATATTATTATTATTTTGT
Found at i:51223299 original size:66 final size:67
Alignment explanation
Indices: 51223218--51223351 Score: 191
Period size: 66 Copynumber: 2.0 Consensus size: 67
51223208 AGTCCTTTTC
*
51223218 AGAGAGCACACTCTCGCAAACC-CTATTTCTTACAGCAGAATTAGCAGTCC-AGCTAAATCCCCT
1 AGAGAGCACACTCTCGCAAACCTC-ATTTCTTACAGCAGAATTAGCAGTCCAAGCTAAATCCCAT
51223281 GTA
65 GTA
* * * **
51223284 AGAGAGCACACTCTCGCGAACCTCATTTCTTACAGCGGGATTATTAGTCCAAGCTAAATCCCATG
1 AGAGAGCACACTCTCGCAAACCTCATTTCTTACAGCAGAATTAGCAGTCCAAGCTAAATCCCATG
51223349 TA
66 TA
51223351 A
1 A
51223352 TGACAAATAC
Statistics
Matches: 60, Mismatches: 6, Indels: 3
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
66 43 0.72
67 17 0.28
ACGTcount: A:0.31, C:0.28, G:0.16, T:0.24
Consensus pattern (67 bp):
AGAGAGCACACTCTCGCAAACCTCATTTCTTACAGCAGAATTAGCAGTCCAAGCTAAATCCCATG
TA
Found at i:51223529 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 51223420--51223563 Score: 171
Period size: 58 Copynumber: 2.5 Consensus size: 58
51223410 CATTTACTTT
* * * * * * * * *
51223420 GGATTACCCGTCCGGGATAAATCCATTTCGCACATATTTTTTGGGAGGGCTTATATTA
1 GGATCACCCGTCCGGGCTAGATCCTTTTCACACATATTCTTTAGGAAGGCTTATATCA
*
51223478 GGATCACCCATCCGGGCTAGATCCTTTTCACACATATTCTTTAGGAAGGCTTATATCA
1 GGATCACCCGTCCGGGCTAGATCCTTTTCACACATATTCTTTAGGAAGGCTTATATCA
* * *
51223536 GGATCACTCGTTCGAGCTAGATCCTTTT
1 GGATCACCCGTCCGGGCTAGATCCTTTT
51223564 TACTGTCAAA
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 14, Indels: 0
0.84 0.16 0.00
Matches are distributed among these distances:
58 72 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.23, G:0.20, T:0.33
Consensus pattern (58 bp):
GGATCACCCGTCCGGGCTAGATCCTTTTCACACATATTCTTTAGGAAGGCTTATATCA
Found at i:51233447 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 51233404--51233472 Score: 138
Period size: 34 Copynumber: 2.0 Consensus size: 34
51233394 CAAGTTTTAG
51233404 ATTTAATTTGTGGATGAAAGGTGAGAACAAGAGA
1 ATTTAATTTGTGGATGAAAGGTGAGAACAAGAGA
51233438 ATTTAATTTGTGGATGAAAGGTGAGAACAAGAGA
1 ATTTAATTTGTGGATGAAAGGTGAGAACAAGAGA
51233472 A
1 A
51233473 ATTAGTGAGT
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
34 35 1.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.03, G:0.29, T:0.26
Consensus pattern (34 bp):
ATTTAATTTGTGGATGAAAGGTGAGAACAAGAGA
Found at i:51237542 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 51237471--51237553 Score: 98
Period size: 39 Copynumber: 2.1 Consensus size: 39
51237461 AAATATAACC
* * *
51237471 AAAAATAAATAAAATTTAAAAATACTTAAATCA-ATAATT
1 AAAAATAAAAAAAATTGAAAAATACATAAATCACA-AATT
*
51237510 AAAAATAAAAAAAATTGATAAAATTCAT-AATCACAAATT
1 AAAAATAAAAAAAATTGA-AAAATACATAAATCACAAATT
51237549 AAAAA
1 AAAAA
51237554 AAACTAAAAT
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 4, Indels: 4
0.83 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
39 30 0.79
40 8 0.21
ACGTcount: A:0.66, C:0.06, G:0.01, T:0.27
Consensus pattern (39 bp):
AAAAATAAAAAAAATTGAAAAATACATAAATCACAAATT
Found at i:51252992 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 51252964--51253014 Score: 59
Period size: 24 Copynumber: 2.1 Consensus size: 24
51252954 TGAAATAGTA
51252964 AAAGAAATACATAAT-AAATAACAT
1 AAAGAAATACAT-ATGAAATAACAT
* **
51252988 AAAGATATATGTATGAAATAACAT
1 AAAGAAATACATATGAAATAACAT
51253012 AAA
1 AAA
51253015 AATATATGAA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 2
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
23 2 0.09
24 21 0.91
ACGTcount: A:0.63, C:0.06, G:0.08, T:0.24
Consensus pattern (24 bp):
AAAGAAATACATATGAAATAACAT
Found at i:51254362 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 51254337--51254375 Score: 60
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
51254327 AGGGTTTCTT
**
51254337 GGTTTTTTTTTGGGGGGTTA
1 GGTTTTTTTGGGGGGGGTTA
51254357 GGTTTTTTTGGGGGGGGTT
1 GGTTTTTTTGGGGGGGGTT
51254376 TAATGGGCTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 17 1.00
ACGTcount: A:0.03, C:0.00, G:0.46, T:0.51
Consensus pattern (20 bp):
GGTTTTTTTGGGGGGGGTTA
Found at i:51254985 original size:16 final size:18
Alignment explanation
Indices: 51254951--51254988 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.2 Consensus size: 18
51254941 ATCCTTATTT
*
51254951 AAATAAAATATAATGGTA
1 AAATAAAATATAATAGTA
51254969 AAATAAAATA-AA-AGTA
1 AAATAAAATATAATAGTA
51254985 AAAT
1 AAAT
51254989 CCATATAGAA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
16 7 0.37
17 2 0.11
18 10 0.53
ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.08, T:0.24
Consensus pattern (18 bp):
AAATAAAATATAATAGTA
Found at i:51257918 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 51257882--51258002 Score: 197
Period size: 30 Copynumber: 4.0 Consensus size: 30
51257872 TAAATCTTAG
*
51257882 CCTTTTCCACCACCAATTCCACTAGCCACA
1 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA
* *
51257912 CCTTTTCCACCACCAAATCCATTAGCCACT
1 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA
* *
51257942 CCTTTTCCACTACCAACTCCACTAGCCACA
1 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA
51257972 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA
1 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA
51258002 C
1 C
51258003 TTGCTCCATT
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 9, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
30 82 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.46, G:0.03, T:0.23
Consensus pattern (30 bp):
CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA
Found at i:51258021 original size:60 final size:60
Alignment explanation
Indices: 51257887--51258046 Score: 207
Period size: 60 Copynumber: 2.7 Consensus size: 60
51257877 CTTAGCCTTT
* * * * *
51257887 TCCACCACCAATTCCACTAGCCACACCTTTTCCACCACCAAATCCATTAGCCACTCCTTT
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACTACTTC
51257947 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCAC-ACTTGC
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACTACTT-C
* * * *
51258007 TCCATTACCTACTCCACTAACCACA-CTTGCTCCACCACCA
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACCTT-TTCCACCACCA
51258047 CTTGTACCTA
Statistics
Matches: 89, Mismatches: 9, Indels: 4
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
59 6 0.07
60 83 0.93
ACGTcount: A:0.28, C:0.46, G:0.04, T:0.23
Consensus pattern (60 bp):
TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACTACTTC
Found at i:51258023 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 51257887--51258046 Score: 137
Period size: 30 Copynumber: 5.3 Consensus size: 30
51257877 CTTAGCCTTT
* * *
51257887 TCCACCACCAATTCCACTAGCCACACCTT-T
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACA-CTTGC
* * * * *
51257917 TCCACCACCAAATCCATTAGCCACTCCTT-T
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCAC-ACTTGC
*
51257947 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACCTT-T
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACA-CTTGC
* *
51257977 TCCACCACCAAATCCACTAGCCACACTTGC
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACTTGC
* * *
51258007 TCCATTACCTACTCCACTAACCACACTTGC
1 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACTTGC
*
51258037 TCCACCACCA
1 TCCACTACCA
51258047 CTTGTACCTA
Statistics
Matches: 109, Mismatches: 18, Indels: 6
0.82 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
29 3 0.03
30 106 0.97
ACGTcount: A:0.28, C:0.46, G:0.04, T:0.23
Consensus pattern (30 bp):
TCCACTACCAACTCCACTAGCCACACTTGC
Found at i:51258041 original size:90 final size:90
Alignment explanation
Indices: 51257882--51258046 Score: 199
Period size: 90 Copynumber: 1.8 Consensus size: 90
51257872 TAAATCTTAG
* * * * * *
51257882 CCTTTTCCACCACCAATTCCACTAGCCACACCTTTTCCACCACCAAATCCATTAGCCACTCCTTT
1 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACACCTTCTCCACCACCAAATCCACTAACCACTACTTC
*
51257947 TCCACTACCAACTCCACTAGCCACA
66 TCCACCACCAACTCCACTAGCCACA
** * *
51257972 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACA-CTTGCTCCATTACCTACTCCACTAACCAC-ACTT
1 CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACACCTT-CTCCACCACCAAATCCACTAACCACTACTT
51258035 GCTCCACCACCA
65 -CTCCACCACCA
51258047 CTTGTACCTA
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 11, Indels: 4
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
89 6 0.10
90 56 0.90
ACGTcount: A:0.27, C:0.46, G:0.04, T:0.24
Consensus pattern (90 bp):
CCTTTTCCACCACCAAATCCACTAGCCACACCTTCTCCACCACCAAATCCACTAACCACTACTTC
TCCACCACCAACTCCACTAGCCACA
Found at i:51267629 original size:17 final size:16
Alignment explanation
Indices: 51267605--51267642 Score: 58
Period size: 17 Copynumber: 2.3 Consensus size: 16
51267595 AAGGCATCTT
*
51267605 AAAAAAAAGAGAAAAG
1 AAAAAAAAGAAAAAAG
51267621 AAAAGAAAAGAAAAAAG
1 AAAA-AAAAGAAAAAAG
51267638 AAAAA
1 AAAAA
51267643 GAGAGAGGGA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 2
0.87 0.04 0.09
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.25
17 15 0.75
ACGTcount: A:0.84, C:0.00, G:0.16, T:0.00
Consensus pattern (16 bp):
AAAAAAAAGAAAAAAG
Found at i:51268649 original size:91 final size:91
Alignment explanation
Indices: 51268516--51268762 Score: 453
Period size: 91 Copynumber: 2.7 Consensus size: 91
51268506 TGTCTTTCAA
51268516 AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGGGCCTCAGGTCACACGCTGAGGTATTTTCAAT
1 AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGGGCCTCAGGTCACACGCTGAGGTATTTTCAAT
51268581 TTCCGTTTTTTCAATTTATGCTTTTC
66 TTCCGTTTTTTCAATTTATGCTTTTC
51268607 AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGGGCCTCAGGTCACACGCTGAGGTATTTTCAAT
1 AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGGGCCTCAGGTCACACGCTGAGGTATTTTCAAT
51268672 TTCCGTTTTTTCAATTTATGCTTTTC
66 TTCCGTTTTTTCAATTTATGCTTTTC
* * *
51268698 AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCATCAGG--ACACGCTGAGGTAATTTCAAT
1 AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGGGCCTCAGGTCACACGCTGAGGTATTTTCAAT
51268761 TT
66 TT
51268763 ATGCCTTTCA
Statistics
Matches: 153, Mismatches: 3, Indels: 2
0.97 0.02 0.01
Matches are distributed among these distances:
89 22 0.14
91 131 0.86
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.21, T:0.34
Consensus pattern (91 bp):
AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGGGCCTCAGGTCACACGCTGAGGTATTTTCAAT
TTCCGTTTTTTCAATTTATGCTTTTC
Found at i:51268835 original size:73 final size:74
Alignment explanation
Indices: 51268678--51268835 Score: 210
Period size: 73 Copynumber: 2.1 Consensus size: 74
51268668 CAATTTCCGT
* * *
51268678 TTTTTCAATTTATGCTTTTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCATCAGGACA
1 TTTTT-AATTTATGCCTTTCAAAAAATCAACTCATATTGCAAGAGGTGAGCTGAGCATCAGGACA
* *
51268743 CGCTGAGGTA
65 CGCCGAAGTA
* * * * *
51268753 ATTTCAATTTATGCCTTTC-AAAAATCAACTCATATTGCAAGAGGTGAGCTGAGCCTCGGGGCAC
1 TTTTTAATTTATGCCTTTCAAAAAATCAACTCATATTGCAAGAGGTGAGCTGAGCATCAGGACAC
51268817 GCCGAAGTA
66 GCCGAAGTA
51268826 TTTTTAATTT
1 TTTTTAATTT
51268836 CTATTTTTCA
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 12, Indels: 2
0.84 0.14 0.02
Matches are distributed among these distances:
73 55 0.77
74 13 0.18
75 3 0.04
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.20, T:0.32
Consensus pattern (74 bp):
TTTTTAATTTATGCCTTTCAAAAAATCAACTCATATTGCAAGAGGTGAGCTGAGCATCAGGACAC
GCCGAAGTA
Found at i:51268848 original size:14 final size:13
Alignment explanation
Indices: 51268824--51268870 Score: 58
Period size: 13 Copynumber: 3.5 Consensus size: 13
51268814 CACGCCGAAG
51268824 TATTTTTAATTTC
1 TATTTTTAATTTC
51268837 TATTTTTCAATTTC
1 TATTTTT-AATTTC
**
51268851 TGCTTTTAATTTC
1 TATTTTTAATTTC
*
51268864 TGTTTTT
1 TATTTTT
51268871 CAAAAATCAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 3, Indels: 2
0.86 0.09 0.06
Matches are distributed among these distances:
13 19 0.63
14 11 0.37
ACGTcount: A:0.17, C:0.11, G:0.04, T:0.68
Consensus pattern (13 bp):
TATTTTTAATTTC
Found at i:51269005 original size:99 final size:99
Alignment explanation
Indices: 51268774--51269240 Score: 740
Period size: 99 Copynumber: 4.7 Consensus size: 99
51268764 TGCCTTTCAA
* * ** * * * * *
51268774 AAATCAACTCATATTGCAAGAGGTGAGCTGAGCCTCGGGGCACGCCGAAGTATTTTTAATTTCTA
1 AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTCTG
* ** * *
51268839 TTTTTCAATTTCTG-CTTTTAATTTCTGTTTTTC
66 TTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
51268872 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTC
1 --AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTC
51268937 TGTTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
64 TGTTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
51268973 AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTCTG
1 AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTCTG
51269038 TTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
66 TTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
51269072 AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTCTG
1 AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTCTG
51269137 TTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
66 TTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
* * *
51269171 AAATCAACTCATATTGCGAGAGATGAGTTGAGCCTC-AGGACACGCTGAGGTATTTTCAATTTTT
1 AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGG-CATGCTGAGGTATTTTCAATTTCT
51269235 GTTTTT
65 GTTTTT
51269241 TTAATTTATG
Statistics
Matches: 348, Mismatches: 17, Indels: 5
0.94 0.05 0.01
Matches are distributed among these distances:
98 3 0.01
99 261 0.75
100 69 0.20
101 15 0.04
ACGTcount: A:0.25, C:0.18, G:0.18, T:0.39
Consensus pattern (99 bp):
AAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGGCATGCTGAGGTATTTTCAATTTCTG
TTTTTCAATTTTTGCCTTACAAATTCTGCTTTTC
Found at i:51269359 original size:71 final size:71
Alignment explanation
Indices: 51269238--51269512 Score: 308
Period size: 71 Copynumber: 3.7 Consensus size: 71
51269228 AATTTTTGTT
* * * *
51269238 TTTTTAATTTATG-TTTCAAAAAAATTAACTCATATTGCGAGAAGTGAGTTGAGCCTCAAGACGC
1 TTTTCAATTTTTGTTTTC-AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGACGC
51269302 TGAGGTA
65 TGAGGTA
* *
51269309 ATTTCAATTTTTGTTTGTC-AAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCATGACAC
1 TTTTCAATTTTTGTTT-TCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCA--AGAC
51269373 GCTG-GGATA
63 GCTGAGG-TA
**
51269382 TTTTCAAATTCTATT-TTTATCAAAAAAAT-AACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCGGG
1 TTTTC-AATT-T-TTGTTT-TC-AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAG
51269445 ACATGCTGAGGTA
61 AC--GCTGAGGTA
*
51269458 TTTTCAATTTCTGCTTTTCAAAAGAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAG
1 TTTTCAATTTTTG-TTTTCAAAA-AATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAG
51269513 TCTCGGGCCA
Statistics
Matches: 175, Mismatches: 12, Indels: 30
0.81 0.06 0.14
Matches are distributed among these distances:
71 47 0.27
72 4 0.02
73 20 0.11
74 12 0.07
75 40 0.23
76 44 0.25
77 8 0.05
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.21, T:0.34
Consensus pattern (71 bp):
TTTTCAATTTTTGTTTTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGACGCT
GAGGTA
Found at i:51269519 original size:75 final size:74
Alignment explanation
Indices: 51269253--51269512 Score: 325
Period size: 76 Copynumber: 3.5 Consensus size: 74
51269243 AATTTATGTT
* * * *
51269253 TCAAAAAAATTAACTCATATTGCGAGAAGTGAGTTGAGCCTCAAGAC-GCTGAGGTAATTTCAAT
1 TCAAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAGGACAGCTGAGGTATTTTCAAT
* *
51269317 TTTTGTTTG
66 TTCTGTTTA
*
51269326 TC--AAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCATGACACGCTG-GGATATTTTCA
1 TCAAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAGGACA-GCTGAGG-TATTTTC-
* *
51269388 AATTCTATTTTTA
63 AATT-TCTGTTTA
*
51269401 TCAAAAAAAT-AACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCGGGACATGCTGAGGTATTTTCAA
1 TCAAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAGGACA-GCTGAGGTATTTTCAA
51269465 TTTCTGCTTT-
65 TTTCTG-TTTA
*
51269475 TCAAAAGAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAG
1 TCAAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAG
51269513 TCTCGGGCCA
Statistics
Matches: 164, Mismatches: 13, Indels: 18
0.84 0.07 0.09
Matches are distributed among these distances:
71 40 0.24
72 2 0.01
73 12 0.07
74 15 0.09
75 41 0.25
76 46 0.28
77 8 0.05
ACGTcount: A:0.32, C:0.15, G:0.22, T:0.32
Consensus pattern (74 bp):
TCAAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAGGACAGCTGAGGTATTTTCAAT
TTCTGTTTA
Found at i:51269765 original size:71 final size:71
Alignment explanation
Indices: 51269665--51269802 Score: 231
Period size: 71 Copynumber: 1.9 Consensus size: 71
51269655 CTGTTTTAAT
* *
51269665 TCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAACCTCAAGTCACATTGAGGTATTTTCAAT
1 TCAAAAAATCAACTCATATTGCGAAAGGTGAGTTGAACCTCAAGACACATTGAGGTATTTTCAAT
51269730 TTATCA
66 TTATCA
* * *
51269736 TCAAAAAATCAACTCATATTGTGAAAGGTGAGTTGAGCCTCAAGACCCATTGAGGTATTTTCAAT
1 TCAAAAAATCAACTCATATTGCGAAAGGTGAGTTGAACCTCAAGACACATTGAGGTATTTTCAAT
51269801 TT
66 TT
51269803 CTGCTCAATT
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 5, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
71 62 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.17, G:0.17, T:0.31
Consensus pattern (71 bp):
TCAAAAAATCAACTCATATTGCGAAAGGTGAGTTGAACCTCAAGACACATTGAGGTATTTTCAAT
TTATCA
Found at i:51269903 original size:155 final size:156
Alignment explanation
Indices: 51269574--51269928 Score: 409
Period size: 155 Copynumber: 2.3 Consensus size: 156
51269564 AATTTATGTG
* * * * *
51269574 TTTCAAAAAAATCAGCTCATATTGCGAGAGGTGGGTTGAACCTCAAGACACTGAGGTGTTTTCCA
1 TTTC-AAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGACACTGAGGTATTTTCAA
** *
51269639 TTTCTATTTTCAATTTCTGTTTTAATTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAACC
65 TTTC-ATGCTCAATTTATGTTTT-ATTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAACC
51269704 TCAAGTCACATTGAGGTATTTTCAATTTAT
128 TCAAGTCACA-TGAGGTATTTTCAATTTAT
** * * *
51269734 CATCAAAAAATCAACTCATATTGTGAAAGGTGAGTTGAGCCTCAAGACCCATTGAGGTATTTTCA
1 TTTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGA--CACTGAGGTATTTTCA
* *
51269799 ATTTC-TGCTCAATTTATG-TTT-TTC-AAAAATCAACTCATATTGTGAGAGGTGAGTTGAGCCT
64 ATTTCATGCTCAATTTATGTTTTATTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAACCT
* *
51269860 CACA-T-GC-TGAGGTGTTTTCAATTTCTATT
129 CA-AGTCACATGAGGTATTTTCAA-TT-TA-T
*
51269889 TTTCAAAAAATCAACTCCTATTGCGAGAGGTGAGTTGAGC
1 TTTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGC
51269929 ATTGGCTTAC
Statistics
Matches: 167, Mismatches: 22, Indels: 17
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
152 13 0.08
153 2 0.01
154 3 0.02
155 74 0.44
156 4 0.02
158 3 0.02
159 48 0.29
160 2 0.01
161 18 0.11
ACGTcount: A:0.30, C:0.17, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (156 bp):
TTTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCAAGACACTGAGGTATTTTCAAT
TTCATGCTCAATTTATGTTTTATTCAAAAAATCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAACCTCA
AGTCACATGAGGTATTTTCAATTTAT
Found at i:51269984 original size:69 final size:68
Alignment explanation
Indices: 51269899--51270039 Score: 192
Period size: 69 Copynumber: 2.1 Consensus size: 68
51269889 TTTCAAAAAA
* * * * * *
51269899 TCAACTCCTATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCATTGGCTTACACGCTGAGGTATTTTTCAATTTCTG
1 TCAACTCATATTGCGAGAGGTAAGTTGAGCATCGGCTCACACGCTGAGGT-GTTTTCAACTTCTG
51269964 TTTG
65 TTTG
* *
51269968 TCAACTCATATTGCGAGAGGTAAGTTGAGCCTCGGGTCACACGCTGAGGTGTTTTCAACTTCTGT
1 TCAACTCATATTGCGAGAGGTAAGTTGAGCATCGGCTCACACGCTGAGGTGTTTTCAACTTCTGT
*
51270033 TTT
66 TTG
51270036 TCAA
1 TCAA
51270040 AAAAATCAAC
Statistics
Matches: 63, Mismatches: 9, Indels: 1
0.86 0.12 0.01
Matches are distributed among these distances:
68 19 0.30
69 44 0.70
ACGTcount: A:0.21, C:0.19, G:0.24, T:0.35
Consensus pattern (68 bp):
TCAACTCATATTGCGAGAGGTAAGTTGAGCATCGGCTCACACGCTGAGGTGTTTTCAACTTCTGT
TTG
Found at i:51270147 original size:74 final size:76
Alignment explanation
Indices: 51269968--51270176 Score: 264
Period size: 74 Copynumber: 2.8 Consensus size: 76
51269958 TTTCTGTTTG
* *
51269968 TCAACTCATATTGCGAGAGGTAAGTTGAGCCTCGGGTCACACGCTGAGGT-GTTTTCAACTTCTG
1 TCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCGGG--ACACGCTGAGGTAGTTTTCAATTTCTG
**
51270032 TTTTTCAAAAAAA
64 TTCATCAAAAAAA
* * ** *
51270045 TCAACTCATGTTGCGAGAGGTGAATTGAGCCTTAGGACACGTTGAGGTAGTTTT-AATTTCTGTT
1 TCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCGGGACACGCTGAGGTAGTTTTCAATTTCTGTT
51270109 CATC-AAAAAA
66 CATCAAAAAAA
** *
51270119 TCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCACGCTGAGGTA-TTTTCAATT
1 TCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCGGGACACGCTGAGGTAGTTTTCAATT
51270177 AATGTTTTTT
Statistics
Matches: 113, Mismatches: 17, Indels: 7
0.82 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
73 4 0.04
74 51 0.45
75 22 0.19
76 5 0.04
77 31 0.27
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.23, T:0.31
Consensus pattern (76 bp):
TCAACTCATATTGCGAGAGGTGAGTTGAGCCTCGGGACACGCTGAGGTAGTTTTCAATTTCTGTT
CATCAAAAAAA
Found at i:51270324 original size:87 final size:87
Alignment explanation
Indices: 51270114--51270411 Score: 243
Period size: 88 Copynumber: 3.4 Consensus size: 87
51270104 CTGTTCATCA
* *
51270114 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCACGCTGAGGTATTTTCAATTAA
1 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCACACCGAGGTATTTTCAA-TAA
* * *
51270179 TGTTTTTTCAATTTATGCTTTTC
65 TCTCTTTACAATTTATGCTTTTC
* * *
51270202 AAGAATCAACTCATATTACGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGTCACATACCGAGGTATTTTCAA-A
1 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCAC--ACCGAGGTATTTTCAATA
51270266 ATCTGCTTTACAAATTT-TG-TTTT-
64 ATCT-CTTTAC-AATTTATGCTTTTC
* * * * * * * * *
51270289 AAAAATCAACTCATATTGGGATAAGTAAGTTGAGCCTTGGCGCACGTGCTGAGCTATTTTCAAT-
1 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCAC--ACCGAGGTATTTTCAATA
* * **
51270353 TTCTGTTTTTAATGTT-TAG-TTTT-
64 ATCTCTTTACAAT-TTAT-GCTTTTC
* *
51270376 AAAGAGTCAATTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGC
1 AAA-AATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGC
51270412 TCAGGATCAC
Statistics
Matches: 171, Mismatches: 31, Indels: 16
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
85 3 0.02
86 6 0.04
87 61 0.36
88 76 0.44
89 6 0.04
90 19 0.11
ACGTcount: A:0.30, C:0.15, G:0.19, T:0.35
Consensus pattern (87 bp):
AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCACACCGAGGTATTTTCAATAAT
CTCTTTACAATTTATGCTTTTC
Found at i:51270405 original size:175 final size:175
Alignment explanation
Indices: 51270114--51270429 Score: 417
Period size: 175 Copynumber: 1.8 Consensus size: 175
51270104 CTGTTCATCA
* * *
51270114 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCCTCGGGGCACGCTGAGGTATTTTCAATTAA
1 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATAAGTTGAGCCTCGGCGCACGCTGAGCTATTTTCAATTAA
* *
51270179 TGTTTTTTCAATTTATGCTTTTCAAGAATCAACTCATATTACGAGAAATGAGTTGAGCCTC-GGG
66 TGTTTTTTCAATTTATGCTTTTAAAGAATCAACTCATATTACGAGAAATGAGTTGAG-CTCAGGA
51270243 TCACATACCGAGGTATTTTCAAAATCTGCTTTACAAATTTTGTTTT
130 TCACATACCGAGGTATTTTCAAAATCTGCTTTACAAATTTTGTTTT
* * * *
51270289 AAAAATCAACTCATATTGGGATAAGTAAGTTGAGCCTTGGCGCACGTGCTGAGCTATTTTCAATT
1 AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATAAGTTGAGCCTCGGCGCAC--GCTGAGCTATTTTCAATT
** * * *
51270354 TCTG-TTTTT-AATGTT-TAG-TTTTAAAGAGTCAATTCATATTGCGAGAAATGAGTTGAGCTCA
64 AATGTTTTTTCAAT-TTAT-GCTTTTAAAGAATCAACTCATATTACGAGAAATGAGTTGAGCTCA
*
51270415 GGATCACATGCCGAG
127 GGATCACATACCGAG
51270430 TAAAGAATCA
Statistics
Matches: 121, Mismatches: 15, Indels: 10
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.02
175 91 0.75
176 8 0.07
177 19 0.16
ACGTcount: A:0.30, C:0.16, G:0.20, T:0.34
Consensus pattern (175 bp):
AAAAATCAACTCATATTGCGAGAAATAAGTTGAGCCTCGGCGCACGCTGAGCTATTTTCAATTAA
TGTTTTTTCAATTTATGCTTTTAAAGAATCAACTCATATTACGAGAAATGAGTTGAGCTCAGGAT
CACATACCGAGGTATTTTCAAAATCTGCTTTACAAATTTTGTTTT
Done.