Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  96304692

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  112  of  313  ( 37448 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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2
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14
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.0
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0
0
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2.0
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10
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19
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2.0
59
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17
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1.97
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207
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159
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186
32
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1.96
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1.9
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3
186
32
17
21
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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4.2
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27
23
23
2.00
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24
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22
10
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1.82
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2.0
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1.91
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5
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17
14
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13
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19
1.81
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1.33
36682195--36682266
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56
2
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1.33
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2
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29
1.25
36682172--36682364
25
7.8
25
68
15
55
58
3
6
31
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36682358--36682578
25
8.5
25
75
12
137
60
1
6
31
1.32
36682172--36682573
50
7.8
51
71
14
227
58
2
6
31
1.37
36682358--36682573
77
2.7
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193
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1
6
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9
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79
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366
35
18
17
28
1.94
36707112--36707280
91
1.9
91
86
2
241
31
20
21
26
1.98
36707213--36707637
68
5.9
70
80
11
276
30
19
17
32
1.95
36707207--36707643
72
6.1
70
80
10
368
31
19
17
31
1.95
36707257--36707643
140
2.7
140
81
8
435
31
18
16
33
1.93
36719421--36719470
15
3.4
15
86
2
66
20
4
16
60
1.52
36719718--36719785
30
2.3
29
79
2
82
39
2
23
33
1.70
36724918--36724943
11
2.4
11
100
0
52
46
26
7
19
1.77
36725631--36725697
29
2.3
30
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5
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40
8
10
40
1.71
36727294--36727339
21
2.2
21
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58
32
10
10
45
1.74
36727442--36727501
20
2.8
20
82
9
66
66
3
3
26
1.23
36732016--36732224
102
2.0
103
84
5
269
38
12
17
32
1.87
36734847--36734891
10
4.3
11
78
18
51
28
2
0
68
1.01
36738864--36738908
19
2.4
19
88
7
65
26
17
6
48
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36740421--36740446
12
2.2
12
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0
52
38
7
15
38
1.76
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44
8.0
44
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3
271
34
17
18
29
1.94
36746632--36746938
132
2.3
133
88
0
436
35
17
18
28
1.94
36746985--36747050
33
2.0
33
100
0
132
30
9
27
33
1.88
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13
2.0
13
100
0
52
7
46
15
30
1.74
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4
9.0
4
100
0
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0
25
1.50
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15
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0
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11
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1.65
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2.0
30
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0
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2.0
21
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0
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1.93
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45
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0
0
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10
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62
0
6
31
1.20
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14
1.9
14
100
0
54
22
7
11
59
1.56
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13
2.3
13
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0
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0
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20
0.92
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3.5
16
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50
1
5
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1.36
36767915--36767975
16
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16
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47
3
13
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19
3.0
18
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15
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47
3
11
37
1.58
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18
4.3
18
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0
102
39
8
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38
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36769345--36769507
40
4.1
40
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0
173
30
13
19
36
1.90
36769515--36769714
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2.6
79
86
4
255
31
17
20
31
1.95
36778238--36778738
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10.3
49
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29
28
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1.87
36784565--36784613
21
2.3
21
89
0
71
30
20
2
46
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36785623--36785664
13
3.1
13
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12
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78
2
0
19
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25
1.9
24
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12
60
63
0
6
29
1.19
36785943--36786038
48
2.0
48
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0
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20
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2.2
17
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0
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21
18
21
1.94
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22
1.9
22
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5
57
53
2
21
21
1.57
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0
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0
0
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8
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0
0
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17
2.2
16
90
5
54
30
25
8
36
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313