Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  234  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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77620917--77621028
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92
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26
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2.2
93
91
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6
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1
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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4
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2.7
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8
58
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8
10
18
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.53
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3.1
74
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297
32
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18
27
1.96
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14
2.3
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100
0
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25
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102
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5
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14
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2.2
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12
15
1.30
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78
3.7
79
89
4
439
32
21
17
28
1.96
77693911--77693980
28
2.5
28
90
4
106
32
27
12
27
1.93
77698872--77698913
22
1.9
22
85
0
57
54
4
16
23
1.61
77702883--77702926
20
2.1
21
87
4
63
50
6
9
34
1.61
77702904--77702965
26
2.4
26
75
2
72
51
6
9
32
1.60
77703053--77703611
24
23.8
23
64
21
105
54
5
4
34
1.45
77702859--77703343
23
21.4
22
65
23
90
54
5
5
34
1.48
77703406--77703534
47
2.7
47
83
11
149
58
2
3
34
1.29
77703408--77703548
22
6.2
23
69
21
84
60
2
3
34
1.26
77703512--77703548
16
2.2
18
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9
60
70
0
0
29
0.88
77703533--77703594
26
2.3
27
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33
1.36
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14
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15
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10
0
27
1.28
77703705--77703737
3
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3
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0
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1.10
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29
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29
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15
19
1.84
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7
4.6
7
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3
57
30
0
69
0
0.88
77704148--77704182
14
2.4
15
90
9
63
31
0
68
0
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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5
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0
15
0
84
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20
1.9
20
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0
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18
5
28
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1.70
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22
2.0
22
100
0
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0
18
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1.50
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25
2.0
25
100
0
102
19
3
15
60
1.50
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19
2.1
19
100
0
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15
25
30
1.96
77711521--77711570
2
25.0
2
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0
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2
0
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1.12
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16
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1.97
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2.0
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32
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3.1
51
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1
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32
1.85
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2.4
43
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0
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22
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1.93
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2.6
29
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1.96
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26
23
2.00
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2.1
51
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0
196
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25
2.1
25
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0
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19
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1.9
13
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0
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0
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2.0
46
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0
157
26
27
17
29
1.97
77776145--77776326
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3.1
59
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0
231
50
8
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1.57
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33
5.6
32
73
6
140
29
25
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77779223--77779452
101
2.3
101
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0
379
29
25
15
30
1.96
77781236--77781307
30
2.4
31
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85
65
1
2
30
1.15
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17
3.7
17
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9
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1.70
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17
2.9
17
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0
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1.67
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2.0
23
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0
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0
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0
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15.4
5
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15
70
78
0
3
17
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344