Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  6  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1996540--1996602
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0
1
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2005535--2005628
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2.1
46
93
2
163
22
15
9
52
1.72
2011313--2011354
6
7.2
6
91
2
59
33
45
16
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2011632--2011670
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2018186--2018231
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0
0
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0
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29
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1
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23
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1
1
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2028025--2028114
35
2.6
32
75
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1
0
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21
3.1
21
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0
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0
0
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19
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42
7
0
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95
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89
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10
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40
2.0
40
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0
144
29
17
11
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2074528--2074594
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2.2
31
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0
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1
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1.38
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18
2.1
17
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5
63
80
0
5
13
0.88
2076210--2076245
17
2.1
18
89
5
56
80
0
5
13
0.88
2076629--2076690
29
2.2
27
80
11
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4
3
29
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2090152--2090193
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2.2
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14
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21
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2.0
21
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52
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0
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17
11
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6.8
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17
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1
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100
0
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0
0
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0.91
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3.0
17
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10
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1
1
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2.1
35
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0
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21
3.3
23
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11
82
15
24
26
34
1.94
2118324--2118384
21
2.8
21
90
5
86
13
24
27
34
1.93
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50
4.8
50
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275
20
28
24
26
1.99
2122472--2122721
100
2.4
104
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348
20
28
24
26
1.99
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13
2.5
13
94
0
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56
12
0
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1.37
2123059--2123116
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1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2125343--2125427
29
3.0
29
91
1
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28
3
17
1.62
2128323--2128363
19
2.2
19
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12
59
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0
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1.53
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0
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50
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9
1.64
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18
2.1
18
95
0
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26
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10
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1.53
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2.0
41
90
0
128
40
13
18
28
1.88
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13
2.4
14
85
10
50
33
3
6
57
1.38
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3.0
24
68
24
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55
5
0
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28
1.87
2162330--2162410
9
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0
54
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15
15
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1.90
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2.7
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16
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50
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21
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50
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5
2
35
1.37
2187138--2187217
28
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2
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0
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1.17
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0
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0
0
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36
0
3
60
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2206578--2206665
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14.5
4
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11
62
21
3
1
72
1.09
2248106--2248187
29
3.0
28
87
5
114
19
3
30
46
1.67
2248133--2248224
23
3.9
22
69
22
62
16
4
33
45
1.67
2248106--2248187
28
3.0
27
87
8
112
19
3
30
46
1.67
2249409--2249473
27
2.3
27
81
7
67
38
35
6
20
1.77
2250528--2250558
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
2250638--2250668
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
2258850--2258878
8
3.6
8
100
0
58
37
0
0
62
0.96
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45
3.3
45
90
0
228
18
19
20
40
1.91
2260611--2260643
6
5.7
6
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7
59
15
15
18
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1.77
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18
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18
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34
10
16
38
1.83
2260818--2261009
54
3.6
52
77
7
188
34
10
16
38
1.83
2260805--2261009
72
2.9
69
79
10
191
35
10
15
38
1.82
2263561--2263716
53
3.0
53
87
4
210
26
16
27
29
1.97
2277079--2277136
29
2.0
29
82
0
71
53
5
5
36
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2285062--2285452
132
3.0
131
82
5
499
29
17
17
36
1.92
2285055--2285438
124
3.0
124
82
6
484
29
16
16
36
1.92
2288782--2288946
78
2.1
78
88
0
240
38
12
10
38
1.77
2290403--2290444
13
2.9
14
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13
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52
2
0
45
1.13
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104
2.0
104
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0
304
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35
1.83
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21
2.0
21
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0
0
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1.00
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2.0
24
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8
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32
4
4
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1.37
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16
2.1
16
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0
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0
0
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4
1
48
1.29
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1.9
41
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7
106
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1
0
46
1.08
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47
5.2
47
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33
4
18
43
1.71
2320507--2320751
95
2.6
94
94
1
436
33
4
18
43
1.71
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20
2.0
20
100
0
80
40
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15
30
1.87
2359620--2359650
11
2.8
11
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0
53
29
3
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19
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2.5
36
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0
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1.95
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18
5.2
18
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0
141
31
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1.95
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11
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11
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0
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29
3
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19
1.64
2364632--2364923
146
2.0
146
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0
575
36
22
13
27
1.91
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13
2.4
13
100
0
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0
0
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22
2.4
22
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0
86
51
1
1
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1.23
2382415--2382465
25
2.0
26
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3
77
58
1
3
35
1.28
2382497--2382530
15
2.2
16
89
5
52
47
0
5
47
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2386032--2386058
13
2.1
13
100
0
54
37
7
14
40
1.74
2389955--2389983
15
1.9
15
100
0
58
44
6
0
48
1.29
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33
2.8
35
72
20
89
50
1
3
45
1.24
2393401--2393481
33
2.7
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78
50
1
1
46
1.17
2393929--2393980
26
2.2
22
80
16
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55
3
5
34
1.42
2410557--2410797
126
1.9
126
92
0
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18
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0
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1.50
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37
2.0
37
100
0
150
16
0
54
29
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356