Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: D04
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Warning! 1600000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 62 of 185
Found at i:17932422 original size:27 final size:27
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Indices: 17932392--17932569 Score: 178
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17932382 ATATTGAGTC
* *
17932392 CGCACACTCAGTGCTATATAATCAACT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAATCAACT
* *
17932419 CGCACACTTAGTGCTACGTAATCAAAT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAATCAACT
*
17932446 CGCACACTTAGTGCTACATAGTCAAACT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAATC-AACT
** ** *
17932474 CGCACACTTAGTGCCGCATGGTCAATT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAATCAACT
* **
17932501 CGCACACTTAGTGC-ATCATATTCATTT
1 CGCACACTTAGTGCTA-CATAATCAACT
* * * *
17932528 TGCACACTTAGTGCAACATAGTCAAAT
1 CGCACACTTAGTGCTACATAATCAACT
17932555 CGCACACTTAGTGCT
1 CGCACACTTAGTGCT
17932570 GTACAATTTT
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Consensus pattern (27 bp):
CGCACACTTAGTGCTACATAATCAACT
Found at i:17952254 original size:29 final size:28
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Indices: 17952218--17952294 Score: 102
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17952208 TCATGAGATT
17952218 GGCACTAAGTGTGCGGGTTTAAATTGTACA
1 GGCACTAAGTGTGCGGGTTTAAA--GTACA
* *
17952248 -GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTACA
1 GGCACTAAGTGTGCGGGTTTAAAGTACA
17952275 TGGCACTAAGTGTGCGGGTT
1 -GGCACTAAGTGTGCGGGTT
17952295 GATTATTAAG
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 4, Indels: 5
0.82 0.08 0.10
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27 5 0.12
29 36 0.88
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Consensus pattern (28 bp):
GGCACTAAGTGTGCGGGTTTAAAGTACA
Found at i:17952515 original size:173 final size:173
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Indices: 17952248--17952746 Score: 948
Period size: 173 Copynumber: 2.9 Consensus size: 173
17952238 AAATTGTACA
*
17952248 GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTACATGGCACTAAGTGTGCG-GGTTGATTATTAAGCACTATG
1 GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTGCATGGCACTAAGTGTGCGCGGTTGATTATTAAGCACTATG
*
17952312 TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATTAAGGGTGCGAC-TTACCGAGTCGA
66 TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATGAAGGGTGCGACTTTACCGAGTC-A
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130 TTTTGGACAGCGGAAAAGGTAAGTGTGCGAACTTGAAATGCATG
17952420 GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTGCATGGCACTAAGTGTGCGCGGTTGATTATTAAGCACTATG
1 GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTGCATGGCACTAAGTGTGCGCGGTTGATTATTAAGCACTATG
17952485 TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATGAAGGGTGCGACTTTACCGAGTCAT
66 TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATGAAGGGTGCGACTTTACCGAGTCAT
17952550 TTTGGACAGCGGAAAAGGTAAGTGTGCGAACTTGAAATGCATG
131 TTTGGACAGCGGAAAAGGTAAGTGTGCGAACTTGAAATGCATG
17952593 GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTGCATGGCACTAAGTGTGCGCGGTTGATTATTAAGCACTATG
1 GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTGCATGGCACTAAGTGTGCGCGGTTGATTATTAAGCACTATG
17952658 TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATGAAGGGTGCGACTTTACCGAGTCAA
66 TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATGAAGGGTGCGACTTTACCGAGTC-A
17952723 TTTTGGACAGCGGAAAAGGTAAGT
130 TTTTGGACAGCGGAAAAGGTAAGT
17952747 ACCTTGAGTT
Statistics
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0.98 0.01 0.01
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ACGTcount: A:0.30, C:0.14, G:0.25, T:0.31
Consensus pattern (173 bp):
GCACTAAGTGTGTGAGTTTAAAGTGCATGGCACTAAGTGTGCGCGGTTGATTATTAAGCACTATG
TGTGCGAACCCAATATATATTTTCTATAAATTATTTACATGAAGGGTGCGACTTTACCGAGTCAT
TTTGGACAGCGGAAAAGGTAAGTGTGCGAACTTGAAATGCATG
Found at i:17956975 original size:14 final size:14
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Indices: 17956958--17956988 Score: 62
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17956948 TTAGATTTTA
17956958 TTTTTTTCTAGAAT
1 TTTTTTTCTAGAAT
17956972 TTTTTTTCTAGAAT
1 TTTTTTTCTAGAAT
17956986 TTT
1 TTT
17956989 CTATTTGTTT
Statistics
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1.00 0.00 0.00
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14 17 1.00
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Consensus pattern (14 bp):
TTTTTTTCTAGAAT
Found at i:17958053 original size:6 final size:6
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17958032 CACTGATATT
*
17958042 CCCTTC CCCTTC CTCTTC CCCTTC CCCTTC CCCT
1 CCCTTC CCCTTC CCCTTC CCCTTC CCCTTC CCCT
17958076 ATCCTTGACA
Statistics
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0.93 0.07 0.00
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6 26 1.00
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CCCTTC
Found at i:17958061 original size:12 final size:12
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17958030 GACACTGATA
17958040 TTCC-CTTCCCC
1 TTCCTCTTCCCC
17958051 TTCCTCTTCCCC
1 TTCCTCTTCCCC
*
17958063 TTCCCCTTCCCC
1 TTCCTCTTCCCC
17958075 TATCCT
1 T-TCCT
17958081 TGACACCTGA
Statistics
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11 4 0.15
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13 3 0.12
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TTCCTCTTCCCC
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17960592 TTGCAATGCT
17960602 TTTATATTTTAATAATTGAGTATTA
1 TTTATATTTTAAT-ATTGAGTATTA
17960627 -TTATATATTTAAT-TTGA-T-TTA
1 TTTATAT-TTTAATATTGAGTATTA
17960648 TTTAT
1 TTTAT
17960653 TTATAAATAA
Statistics
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0.77 0.00 0.23
Matches are distributed among these distances:
21 3 0.12
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TTTATATTTTAATATTGAGTATTA
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17960798 CAAACACCAG
*
17960808 AAAATATTTTCCAACAAATCATTTTACAGAAAAGT
1 AAAACATTTTCCAACAAATCATTTTACAGAAAAGT
* *
17960843 AAAACATTTTCC-AGAAATCATTTTACGGAAAA
1 AAAACATTTTCCAACAAATCATTTTACAGAAAA
17960875 CATTTTACTG
Statistics
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34 18 0.62
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AAAACATTTTCCAACAAATCATTTTACAGAAAAGT
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17960833 ACAGAAAAGT
*
17960843 AAAACATTTTCCAG
1 AAAACATTTTACAG
* *
17960857 AAATCATTTTACGG
1 AAAACATTTTACAG
17960871 AAAACATTTTAC
1 AAAACATTTTAC
17960883 TGGCAATCAA
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AAAACATTTTACAG
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17971055 TCGAGCACTG
*
17971065 TGCCTAGCAGGCTTTA
1 TGCCTAGCAGGCTTCA
*
17971081 TGCCTAGTAGGCTTCA
1 TGCCTAGCAGGCTTCA
17971097 TGCC
1 TGCC
17971101 GGTGTACCAT
Statistics
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0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
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TGCCTAGCAGGCTTCA
Found at i:17971189 original size:41 final size:41
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Indices: 17971072--17971189 Score: 146
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17971062 CTGTGCCTAG
* *
17971072 CAGGCTTTATGCCTAGTAGGCTTCATGCCGGTGTACCATAT
1 CAGGCTTTATGCCTAGAAGGCTTCATGCCGGTGTATCATAT
* * *
17971113 CAGGCTTTATGCCTAGCAGGCTTCGTGTCGGTGTATCATAT
1 CAGGCTTTATGCCTAGAAGGCTTCATGCCGGTGTATCATAT
* * * * *
17971154 CTGGCTTTGTGCCTAGAAGGTTTTATACCGGTGTAT
1 CAGGCTTTATGCCTAGAAGGCTTCATGCCGGTGTAT
17971190 TTTAATAAGC
Statistics
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0.84 0.16 0.00
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41 65 1.00
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CAGGCTTTATGCCTAGAAGGCTTCATGCCGGTGTATCATAT
Found at i:17974668 original size:16 final size:16
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Indices: 17974647--17974718 Score: 126
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17974637 AAATCTCTGA
17974647 CAAGCTTCCAATCGAT
1 CAAGCTTCCAATCGAT
17974663 CAAGCTTCCAATCGAT
1 CAAGCTTCCAATCGAT
*
17974679 CAAGCTTTCAATCGAT
1 CAAGCTTCCAATCGAT
*
17974695 CAAGCTTCCAATCAAT
1 CAAGCTTCCAATCGAT
17974711 CAAGCTTC
1 CAAGCTTC
17974719 TTATAATCTA
Statistics
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16 53 1.00
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Consensus pattern (16 bp):
CAAGCTTCCAATCGAT
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17978015 ATAAGTATTG
*
17978025 TAGTATTATATATTATTATTTTAGTAAATTCATATAAAAATATTTAATATTAAGAATTTTATTAA
1 TAGTATTATATATTATGATTTTAGTAAATTCA-ATAAAAATATTTAATATTAAGAATTTTATTAA
*
17978090 ATTATGTATTTTTATTAAATTATATTTAATAATAATTATGTTAAAATTATATTTTA
65 ATTATATATTTTTATTAAATTATATTTAATAATAATTATGTTAAAATTATATTTTA
* *
17978146 TAGTATTATATATTATGATTTTAGTAAATTC-AT-AGAATATTTAATATTAATAATTTTATTAAA
1 TAGTATTATATATTATGATTTTAGTAAATTCAATAAAAATATTTAATATTAAGAATTTTATTAAA
17978209 TTATATATTTTTATTAAATTATATTTAATAATAATTATGTTAAAAT
66 TTATATATTTTTATTAAATTATATTTAATAATAATTATGTTAAAAT
17978255 ATGATTAAAT
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Matches: 105, Mismatches: 4, Indels: 3
0.94 0.04 0.03
Matches are distributed among these distances:
118 73 0.70
119 2 0.02
121 30 0.29
ACGTcount: A:0.43, C:0.01, G:0.04, T:0.52
Consensus pattern (120 bp):
TAGTATTATATATTATGATTTTAGTAAATTCAATAAAAATATTTAATATTAAGAATTTTATTAAA
TTATATATTTTTATTAAATTATATTTAATAATAATTATGTTAAAATTATATTTTA
Found at i:17978220 original size:18 final size:18
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Indices: 17978186--17978232 Score: 69
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17978176 CATAGAATAT
17978186 TTAATATTA-ATAATTTTA
1 TTAA-ATTATATAATTTTA
*
17978204 TTAAATTATATATTTTTA
1 TTAAATTATATAATTTTA
17978222 TTAAATTATAT
1 TTAAATTATAT
17978233 TTAATAATAA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 2
0.90 0.03 0.07
Matches are distributed among these distances:
17 4 0.15
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Consensus pattern (18 bp):
TTAAATTATATAATTTTA
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Indices: 17978183--17978299 Score: 101
Period size: 41 Copynumber: 2.7 Consensus size: 40
17978173 ATTCATAGAA
* *
17978183 TATTTAATATTAATAATTTTATT-AAATTATATATTTTTAT
1 TATTT-ATATTAATAATATTATTAAAATTATAAATTTTTAT
*
17978223 TAAATTATATTTAATAATAATTATGTTAAAATATGATTAAATTATTTAT
1 T-ATTTATA-TTAATAAT-ATTA--TTAAAAT-T-A-TAAATT-TTTAT
*
17978272 TATTTATATTAATAATCTTATTAAAATT
1 TATTTATATTAATAATATTATTAAAATT
17978300 TAATAACAAT
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 5, Indels: 17
0.74 0.06 0.20
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.44, C:0.01, G:0.02, T:0.54
Consensus pattern (40 bp):
TATTTATATTAATAATATTATTAAAATTATAAATTTTTAT
Found at i:17980549 original size:5 final size:5
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Indices: 17980539--17980582 Score: 61
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17980529 TTGGAAAAAT
*
17980539 AATAA AATAAA AATGA AATAA TAATAA AATAA AATAA AATAA AA
1 AATAA AAT-AA AATAA AATAA -AATAA AATAA AATAA AATAA AA
17980583 GCATAAAAGG
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 2, Indels: 4
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
5 25 0.71
6 10 0.29
ACGTcount: A:0.77, C:0.00, G:0.02, T:0.20
Consensus pattern (5 bp):
AATAA
Found at i:17980559 original size:11 final size:11
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Indices: 17980539--17980582 Score: 63
Period size: 11 Copynumber: 4.1 Consensus size: 11
17980529 TTGGAAAAAT
17980539 AATAAAATAAA
1 AATAAAATAAA
* *
17980550 AATGAAATAAT
1 AATAAAATAAA
17980561 AATAAAAT-AA
1 AATAAAATAAA
17980571 AATAAAATAAA
1 AATAAAATAAA
17980582 A
1 A
17980583 GCATAAAAGG
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 4, Indels: 2
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
10 9 0.32
11 19 0.68
ACGTcount: A:0.77, C:0.00, G:0.02, T:0.20
Consensus pattern (11 bp):
AATAAAATAAA
Found at i:17980564 original size:22 final size:21
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Indices: 17980532--17980580 Score: 73
Period size: 21 Copynumber: 2.3 Consensus size: 21
17980522 GTAGGTCTTG
17980532 GAAA-AATAATAAAATAAAAAT
1 GAAATAATAATAAAAT-AAAAT
17980553 GAAATAATAATAAAATAAAAT
1 GAAATAATAATAAAATAAAAT
*
17980574 AAAATAA
1 GAAATAA
17980581 AAGCATAAAA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 2
0.90 0.03 0.07
Matches are distributed among these distances:
21 15 0.58
22 11 0.42
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Consensus pattern (21 bp):
GAAATAATAATAAAATAAAAT
Found at i:17980920 original size:11 final size:11
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Indices: 17980904--17980934 Score: 53
Period size: 11 Copynumber: 2.8 Consensus size: 11
17980894 TCCTCTCTCA
17980904 AATTTCCTTTC
1 AATTTCCTTTC
*
17980915 AATTTCCTCTC
1 AATTTCCTTTC
17980926 AATTTCCTT
1 AATTTCCTT
17980935 CCAAATTTCT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
11 18 1.00
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AATTTCCTTTC
Found at i:17980932 original size:22 final size:22
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Indices: 17980897--17980949 Score: 72
Period size: 22 Copynumber: 2.4 Consensus size: 22
17980887 AAACTAATCC
*
17980897 TCTCTCAAATTTCCTTTC-AATT
1 TCTCTC-AATTTCCTTCCAAATT
17980919 TCCTCTCAATTTCCTTCCAAATT
1 T-CTCTCAATTTCCTTCCAAATT
17980942 TCTCTCAA
1 TCTCTCAA
17980950 ATCCATATTT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 1, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
22 18 0.64
23 10 0.36
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TCTCTCAATTTCCTTCCAAATT
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Indices: 17981007--17981049 Score: 54
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17980997 TTAACTCCCT
*
17981007 TTTTTTAAATAA
1 TTTTTTAAAAAA
17981019 --TTTTAAAAAA
1 TTTTTTAAAAAA
*
17981029 TTTTTTAAAAAT
1 TTTTTTAAAAAA
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1 TTTTTTAAA
17981050 TCGTAAAAAT
Statistics
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TTTTTTAAAAAA
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*
17981019 -TTTTAAAAAA
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17981040 TTTTTT
1 TTTTTT
17981046 TAAATCGTAA
Statistics
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TTTTTTAAAAA
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* *
17982781 TCCTAGCCCTAATGTGTA
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*
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1 TCCTAACCCTAATATGTA
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1 TCCT
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TCCTAACCCTAATATGTA
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17983230 TTTAAATAAA
* ***
17983240 TTGATATTATTTTATGTAATAAAATA-AAATTTTTTTGAGTTATT
1 TTGATATTATTTGATGTAATAAAATAGAAAAAATTTTGAGTTATT
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1 TTGATATTATTTGATGTAATAAAATAGAAAAAATTTTGAGTTATT
*
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1 TTGATATTATTTGATGTAATAA
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TTGATATTATTTGATGTAATAAAATAGAAAAAATTTTGAGTTATT
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*
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*
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1 GAGCATTAGCGGCATTTTT
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GAGCATTAGCGGCATTTTT
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* * ** *
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*
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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TTTAGCGGCGTTTTTAAAAAGCGCCGCTAATGCTCGGGT
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17986025 CTTTCGGGGC
* * ** * *
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*
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* * * * * *
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65 CCGCTAATGCTCGG-GT
* * * * * *
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1 TTTAGCGGCGTTTTTAAAAAAG-CGCCGCTAATGCTCGGGGTTTTAGCGGCGT-TTTTTAAAAGC
* * *
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17986309 AAACATTTTA
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TTTAGCGGCGTTTTTAAAAAAGCGCCGCTAATGCTCGGGGTTTTAGCGGCGTTTTTTAAAAGCGC
CGCTAATGCTCGGGT
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* * *
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*
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1 G
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GGTTAAGAGTTAAGGATTTAAGGGTTAGA
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*
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*
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GGTTTAAGGGTTGAGAGTTAA
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17990486 TAGTTCGCTG
*
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* *
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1 TAATGGAATAGAGG
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*
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*
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1 ATAAAAATATATAATTTA
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1 ATAAAAATATATAATTTA
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ATAAAAATATATAATTTA
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Period size: 56 Copynumber: 3.3 Consensus size: 54
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*
17990756 TATATAATTTAATAAAAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATATTAAATATTCT
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* * * * *
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1 TATAT-AATTTAATAAAAAT-ATATAAT-T--TA--ATAAAAT-T--CTTAATATAATTATTCT
*
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*
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TATATAATTTAATAAAAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATATAATTATTCT
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17990839 TAATACTATA
17990849 AAATATAATTTAAAATAATTATTATT
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*
17990875 AAATATAATTTAATAATAATATATAATT
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* * *
17990903 TAATAAAATTCTTAATATAATTATT
1 AAATATAA-T-TTAAAATAATTATT
17990928 CTTATATGAA
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AAATATAATTTAAAATAATTATTATT
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Indices: 17990757--17990961 Score: 150
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17990747 TAATCAAAAT
* * * *
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* * ** * * *
17990818 ATTTACTAAAATCATAAAATATAATACT-ATAAAAT-ATAAT-TTAAAATAATTATTAT-TAA
1 ATATAATTTAATAATAATATATAAT-TTAATAAAATCATAATATT-AAAT-ATTATTATATAA
* * * *
17990877 ATATAATTTAATAATAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATA-TAATTATTCTTATATGA
1 ATATAATTTAATAATAATATATAATTTAATAAAA-TCATAATATTAAATATTATTATATAA
* * ** *
17990937 ATTTACTAAAATCATAATATATAAT
1 ATATAATTTAATAATAATATATAAT
17990962 ACTATAAAAA
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ATATAATTTAATAATAATATATAATTTAATAAAATCATAATATTAAATATTATTATATAA
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Indices: 17990757--17990975 Score: 395
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17990747 TAATCAAAAT
17990757 ATATAATTTAATAAAAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATATTAAATATTCTTATATGAATTT
1 ATATAATTTAATAAAAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATATTAAATATTCTTATATGAATTT
17990822 ACTAAAATCATAAAATATAATACTATAAAATATAATTTAAAATAATTATTATTAA
66 ACTAAAATCATAAAATATAATACTATAAAA-ATAATTTAAAATAATTATTATTAA
* *
17990877 ATATAATTTAATAATAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATA-TAATTATTCTTATATGAATTT
1 ATATAATTTAATAAAAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATATTAAATATTCTTATATGAATTT
*
17990941 ACTAAAATCATAATATATAATACTATAAAAATAAT
66 ACTAAAATCATAAAATATAATACTATAAAAATAAT
17990976 ATATAATCTA
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ATATAATTTAATAAAAATATATAATTTAATAAAATTCTTAATATTAAATATTCTTATATGAATTT
ACTAAAATCATAAAATATAATACTATAAAAATAATTTAAAATAATTATTATTAA
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Indices: 17992365--17992470 Score: 146
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17992355 GAAAAAAAAC
* *
17992365 AAATTAAAATTAAGTTTAATATATCATTAATCAAAATGTGAACACTTTATA
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* *
17992416 AAATTAAAATTAAG-TTCA-ATATCATGAATCAAAA-GCTCAATACTTTATA
1 AAATTAAAATTAAGTTTAATATATCATGAATCAAAATG-TCAACACTTTATA
17992465 AAATTA
1 AAATTA
17992471 TAACACATGA
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 4, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:17996133 original size:20 final size:20
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Indices: 17996108--17996151 Score: 88
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17996098 CATAGAACAC
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1 AAAAGAAGGGCCAAGTAGAA
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1 AAAA
17996152 ACTATCCATA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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AAAAGAAGGGCCAAGTAGAA
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Indices: 17996226--17996255 Score: 51
Period size: 12 Copynumber: 2.5 Consensus size: 12
17996216 GTGATAAAGG
*
17996226 AAACGCTATATT
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17996238 AAACTCTATATT
1 AAACTCTATATT
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1 AAACTC
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Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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Indices: 17998058--17998227 Score: 288
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17998048 TTTGTAGTGG
17998058 CGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCTAAAGGTCATGGTCTTTAGCGGCGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCT
1 CGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCTAAAGGTCATGGTCTTTAGCGGCGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCT
**
17998123 AAAGGTCATGGTCTTTAGCGA
66 AAAGGTCATAATCTTTAGCGA
* *
17998144 CGTTTGTGGTAGAAGCGCCG-TTAAGGTCATGGTCTTTAGCGGTGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCT
1 CGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCTAAAGGTCATGGTCTTTAGCGGCGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCT
*
17998208 AAATGTCATAATCTTTAGCG
66 AAAGGTCATAATCTTTAGCG
17998228 GCATTTTTTC
Statistics
Matches: 79, Mismatches: 5, Indels: 1
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
85 59 0.75
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CGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCTAAAGGTCATGGTCTTTAGCGGCGTTTGTGGTAGAAGCGCCGCT
AAAGGTCATAATCTTTAGCGA
Found at i:17998183 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 17997995--17998229 Score: 289
Period size: 43 Copynumber: 5.5 Consensus size: 43
17997985 AATATTTTTT
* * * * * *
17997995 TAAAAGTCAT-GTTTTTAGCCGCGTTTGT-GAAAAAGCACCGC
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* * * *
17998036 TAAAAGTCAT-TTTTTGTAGTGGCGTTTGTGGTAGAAGCGCCGC
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*
17998122 TAAAGGTCATGGTCTTTAGCGACGTTTGTGGTAGAAGCGCCG-
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* *
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* **
17998207 TAAATGTCATAATCTTTAGCGGC
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17998230 ATTTTTTCAA
Statistics
Matches: 171, Mismatches: 19, Indels: 6
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Consensus pattern (43 bp):
TAAAGGTCATGGTCTTTAGCGGCGTTTGTGGTAGAAGCGCCGC
Found at i:18000997 original size:870 final size:856
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17999251 TTAAGGCCGG
* *
17999261 TTTAGATTCC-CTTGGTTTTCTGAAAATGTAGATGAT--ATTCATTGTATGTATATACATTCTAG
1 TTTAGA-TCCTCTTGGTTTTCT-AAAATGTAGATGATGGATTCAATATATGTATATACATTCTAG
* * * *
17999323 ATAAGCTTGGGGCAACACAGAAGAAACAAAAGGCTTTCAGGCTTGCTAAGTTAATATCAAAGTCA
64 ATAAGCTTGGGACAACACAGAGGAAATAAAAGGCTTTCAGGCTTGCTAAGTTAATAGCAAAGTCA
* * * *
17999388 TTACTAACCTCTTAATGTACTTAGTCAATTTATTTGAGCACATACCCTTCAAGGGTATTGCTCAC
129 TTACTAACCTCTTAAGGTACCTAGTCAATTGATTTGAGCACACACCCTTCAAGGGTATTGCTCAC
* * *
17999453 TAAGTCAAAAGAAGAGTCGCTTTTAGCCTCTTAAGGCACTTAGCAACTTATTTAAAGCAAACACC
194 TAAGTCAAAAGAAGAGACGCTTCTAACCTCTTAAGGCACTTAGCAACTTATTTAAAGCAAACACC
*
17999518 CCTTGCAAATATCCTCACTAAGTCAATAGCAAAAATAAGGCTAACCTCTGAAGGCATTTAGCCAA
259 CCTTGCAAATATCCTCACTAAGTCAATAGCAAAAATAAGGCTAACCTCTGAAGGCACTTAGCCAA
* *
17999583 ATTTACAAGTTATAAAACAGACACCCATCATAGATAATGCTTACTAAGTTAATAATAGAAACCAT
324 ATTTACAAGTTATAAAACAAACACCCATCACAGATAATGCTTACTAAGTTAATAATAGAAACCAT
* *
17999648 TTCTAGCCTATTAAAGAATGTGCATAGTTTTTTTTTTTTTTATAAAAAGACCTAACATACAACAC
389 TTCTAGCCTATTAAAGAATGTGCATA-----TATCTTTTTTATAAAAAGACCTAACATACAACAC
* * **
17999713 TAAGGCTTCGCCTCTACTTTTATCTCAGATAAGGCCACGTTATAAACTATTCCTCAACTGAGAGC
449 AAAGGCTTCGCCCCTACTTTTATCTCAGATAAAACCACGTTATAAACTATTCCTCAACTGAGAGC
* *
17999778 AATTATTATGCATATACAAATATTATCTAAACTCATCAAAGGCCTACCTATTTCATCCCCACGCT
514 AATTATTATGCATATACAAATATTATCCAAACTCATCAAAGGCCTACCTATTACATCCCCACGCT
*
17999843 ATTAGGCTATTATTACAAAGGGCCTACACAAGAGGGCAAATCACCTATTTTATTTTCTAAAAGGA
579 ATTAGGCTATTATTACAAACGGCCTACACAAGAGGGCAAATCACCTATTTTATTTTCTAAAAGGA
* * *
17999908 GGGGCTTGAGACAGAAAGGGGAGATTATTCATTTTAAAAAGATCCACTTCCATGGTCACTACGCA
644 GGGGCTTGAGACAGAAAAGAGAGATTATTCA-TTTAAAAAGACCCACTTCCATGGTCACTACGCA
* *
17999973 CTTTCCGCATTGAACTAAATAGGGTGAATCACCTTAAATTCCAAACTCTAAATCTTAAATCATCA
708 CTTTCCGCATTGAACTAAATAGGGTGAAGCACATTAAATTCCAAACTCTAAATCTTAAATCATCA
* * * *
18000038 ACGGTCATTTTGTACTTTAACACATCCACATTATAGATATGTCATACTCTAATATGGATTACAAA
773 ACGATCACTTTGTACATTAACACATCCACATTATAAATATGTCATACTCTAATATGGATTACAAA
* **
18000103 ATGATTTAATTAAATTTGA
838 ATGAATTAATTAAATGCGA
*
18000122 TTTAGATCCTCTTGGTTTTCTAAAATTGTAGATGATGGAATTCAATATATGTATATACGTTCTAG
1 TTTAGATCCTCTTGGTTTTCTAAAA-TGTAGATGATGG-ATTCAATATATGTATATACATTCTAG
* * * **
18000187 TTAAGCTTGGGACAACACAGAGGAAATAAAAGGCTTTCAGGCTTTCTAAGTTAATAGCATAGTTG
64 ATAAGCTTGGGACAACACAGAGGAAATAAAAGGCTTTCAGGCTTGCTAAGTTAATAGCAAAGTCA
* * * * * * *
18000252 TTGCTAGCCTCTTTAAGGTACCTGGTCAATTGATTTGAGCACACACCTTTTAATGGTATTGCTTA
129 TTACTAACCTC-TTAAGGTACCTAGTCAATTGATTTGAGCACACACCCTTCAAGGGTATTGCTCA
18000317 CTAAGTCAATAA-AAGA-ACAGCTTCTAACCTCTTAAGGCACTTAGCAACTTATTTAAAGCAAAC
193 CTAAGTCAA-AAGAAGAGAC-GCTTCTAACCTCTTAAGGCACTTAGCAACTTATTTAAAGCAAAC
* * ** * * ** * *
18000380 ACCTCTTGCAAATATGCTTGCTAAGTCAATAGTAGAAATACTGTTAACCTCTTAAGGCACTTAGC
256 ACCCCTTGCAAATATCCTCACTAAGTCAATAGCAAAAATAAGGCTAACCTCTGAAGGCACTTAGC
* * *
18000445 CAAAATTTACAAGTTATAAAACAAACACCCCTCACAGATAATGCTTACTAAGTTAATAGTATAAA
321 C-AAATTTACAAGTTATAAAACAAACACCCATCACAGATAATGCTTACTAAGTTAATAATAGAAA
* * * * * *
18000510 CCATTTCTAGCCTCTTAAGGAATGTGCATA-ATCTTTTTTATAAAAAGGCTTAGCGTACAACACA
385 CCATTTCTAGCCTATTAAAGAATGTGCATATATCTTTTTTATAAAAAGACCTAACATACAACACA
* * * * * *
18000574 AAGGTTTCTCCCCTACTTTTATCTCGGATAAAACCACTTTATAACCTATATTCCTCAAGTGAGAG
450 AAGGCTTCGCCCCTACTTTTATCTCAGATAAAACCACGTTATAAAC--TATTCCTCAACTGAGAG
* * ** * *
18000639 CAATTGTTATGCATATACAAATATTA-CCAAATCTCATTAGGGGGTCTACCTATTACATCCCCAT
513 CAATTATTATGCATATACAAATATTATCCAAA-CTCATCA-AAGGCCTACCTATTACATCCCCAC
* * * *
18000703 GCTATTAGGCTATTATTACAAACGGCCTACATAAGAGGGCAAATCTCCTCCTCTTTTTTTTTTTT
576 GCTATTAGGCTATTATTACAAACGGCCTACACAAGAGGGCAAA--T-C-AC-C---TATTTTATT
* * * *
18000768 TTCTAAAAGGAGGGGCTTGAGATATAAAAGAGAGTTTTTTGC-TTTAAAAAGACCCACTTCCATG
633 TTCTAAAAGGAGGGGCTTGAGACAGAAAAGAGAGATTATT-CATTTAAAAAGACCCACTTCCATG
* * * * *
18000832 GTCA-TCACGCACTTTTCGCCTT-ATACTAAATGGGGTGAAGCATATTAAA-TCTTAAACTCTAA
697 GTCACT-ACGCACTTTCCGCATTGA-ACTAAATAGGGTGAAGCACATTAAATTC-CAAACTCTAA
** *
18000894 AT-TCTAAATCATCAATTATCACTTTGTACATTAACACATCCACATTATAAATATGTCATAGTCT
759 ATCT-TAAATCATCAACGATCACTTTGTACATTAACACATCCACATTATAAATATGTCATACTCT
18000958 AATA-GGAATTACAAAAT-AATTAAGTTAAA-GCGAA
823 AATATGG-ATTACAAAATGAATTAA-TTAAATGCG-A
* * * * * *
18000992 TTTAGATTCTTTTGGTTTTCTGAAACTGTAGATGATGGCATTCAGTACATGTGTATAGCATTCTA
1 TTTAGATCCTCTTGGTTTTCT-AAAATGTAGATGATGG-ATTCAATATATGTATATA-CATTCTA
* *
18001057 GCTAAGCTTGGGACAAAACAG-GAGAAATAAAAG
63 GATAAGCTTGGGACAACACAGAG-GAAATAAAAG
18001090 AAAGAAAATG
Statistics
Matches: 829, Mismatches: 107, Indels: 54
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.35, C:0.19, G:0.14, T:0.32
Consensus pattern (856 bp):
TTTAGATCCTCTTGGTTTTCTAAAATGTAGATGATGGATTCAATATATGTATATACATTCTAGAT
AAGCTTGGGACAACACAGAGGAAATAAAAGGCTTTCAGGCTTGCTAAGTTAATAGCAAAGTCATT
ACTAACCTCTTAAGGTACCTAGTCAATTGATTTGAGCACACACCCTTCAAGGGTATTGCTCACTA
AGTCAAAAGAAGAGACGCTTCTAACCTCTTAAGGCACTTAGCAACTTATTTAAAGCAAACACCCC
TTGCAAATATCCTCACTAAGTCAATAGCAAAAATAAGGCTAACCTCTGAAGGCACTTAGCCAAAT
TTACAAGTTATAAAACAAACACCCATCACAGATAATGCTTACTAAGTTAATAATAGAAACCATTT
CTAGCCTATTAAAGAATGTGCATATATCTTTTTTATAAAAAGACCTAACATACAACACAAAGGCT
TCGCCCCTACTTTTATCTCAGATAAAACCACGTTATAAACTATTCCTCAACTGAGAGCAATTATT
ATGCATATACAAATATTATCCAAACTCATCAAAGGCCTACCTATTACATCCCCACGCTATTAGGC
TATTATTACAAACGGCCTACACAAGAGGGCAAATCACCTATTTTATTTTCTAAAAGGAGGGGCTT
GAGACAGAAAAGAGAGATTATTCATTTAAAAAGACCCACTTCCATGGTCACTACGCACTTTCCGC
ATTGAACTAAATAGGGTGAAGCACATTAAATTCCAAACTCTAAATCTTAAATCATCAACGATCAC
TTTGTACATTAACACATCCACATTATAAATATGTCATACTCTAATATGGATTACAAAATGAATTA
ATTAAATGCGA
Found at i:18002985 original size:310 final size:313
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* *
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* * * * *
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18002656 TAAAAACACACTAAATTAATACATTTCAAACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATT
130 TAAAAACACACTAAATTAATACATTTCAAACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATT
*
18002721 AGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTAATAAAATTCGGG-AAAAAATACGAACAAAGGGCCGAA
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*
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260 ATAAGGGTTATTTTTGAAATTTATTTAAAAAACACACTAAATGAATACATTTCA
* *
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1 AACATAATGTACTAAAATAATTTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
18002902 ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACGAACAAATGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTT
66 ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACGAACAAATGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTT
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131 AAAAACACACTAAATTAATACATTTCAAACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTA
18003032 GAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTAATAAAATTCGGGAAAAAAATACAAACAAAGGGCCGAAA
196 GAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTAATAAAATTCGGGAAAAAAATACAAACAAAGGGCCGAAA
*
18003097 TAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTTAAAAAACACACTAAATGAGTACATTTCA
261 TAAGGGTT-ATTTTTGAAATTTATTTAAAAAACACACTAAATGAATACATTTCA
* *
18003151 AACATAATGTACTAAAACAATATAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
1 AACATAATGTACTAAAATAATTTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
* *
18003216 ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACAAACAAATGACCGAAATAAGGGTT
66 ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACGAACAAATGGCCGAAATAAGGGTT
18003263 TTTTACTAAA
Statistics
Matches: 401, Mismatches: 18, Indels: 8
0.94 0.04 0.02
Matches are distributed among these distances:
308 18 0.04
309 51 0.13
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ACGTcount: A:0.52, C:0.08, G:0.11, T:0.30
Consensus pattern (313 bp):
AACATAATGTACTAAAATAATTTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACGAACAAATGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTT
AAAAACACACTAAATTAATACATTTCAAACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTA
GAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTAATAAAATTCGGGAAAAAAATACAAACAAAGGGCCGAAA
TAAGGGTTATTTTTGAAATTTATTTAAAAAACACACTAAATGAATACATTTCA
Found at i:18003013 original size:157 final size:157
Alignment explanation
Indices: 18002529--18003262 Score: 1223
Period size: 157 Copynumber: 4.7 Consensus size: 157
18002519 AAAGTTGTCG
* *
18002529 AACATAATATACTGAAATAAT-TAAAATAATAAAA-TACGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGT
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* * * *
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65 AATAAAATTCGGGAAAAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTT
18002657 -AAAAACACACTAAATTAATACATTTCA
130 AAAAAACACACTAAATTAATACATTTCA
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1 AACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
18002749 ATAAAATTCGGG-AAAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTT--TTTTT-AAATTTATTTA
66 ATAAAATTCGGGAAAAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTTA
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* * *
18002837 AACATAATGTACTAAAATAATTTAAAATAATAAAATTATAAAGTAATATATTTTTATTGAAAGTA
1 AACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
*
18002902 ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACGAACAAATGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTT
66 ATAAAATTCGGGAA-AAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTT
18002967 -AAAAACACACTAAATTAATACATTTCA
130 AAAAAACACACTAAATTAATACATTTCA
18002994 AACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
1 AACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
*
18003059 ATAAAATTCGGGAAAAAAATACAAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTTA
66 ATAAAATTCGGGAAAAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTTA
* *
18003124 AAAAACACACTAAATGAGTACATTTCA
131 AAAAACACACTAAATTAATACATTTCA
* *
18003151 AACATAATGTACTAAAACAATATAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
1 AACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
* * *
18003216 ATAAAATTCGGGAAGAAAAATACAAACAAATGACCGAAATAAGGGTT
66 ATAAAATTCGGGAA-AAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTT
18003263 TTTTACTAAA
Statistics
Matches: 548, Mismatches: 21, Indels: 17
0.94 0.04 0.03
Matches are distributed among these distances:
152 10 0.02
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154 1 0.00
155 81 0.15
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AACATAATGTACTAAAATAATGTAAAATAATAAAATTAGAAAATAATATATTTTTATTGAAAGTA
ATAAAATTCGGGAAAAAAATACGAACAAAGGGCCGAAATAAGGGTTAATTTTTGAAATTTATTTA
AAAAACACACTAAATTAATACATTTCA
Found at i:18008886 original size:3 final size:3
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18008870 CCGGCACCAC
* *
18008880 CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTC CTT CTC CTT C
1 CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT CTT C
18008920 AGTTGGGTTG
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 4, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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CTT
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*
18025449 TTAAGTTTTTATAATTTTTAA-AAATT-AAA
1 TTAAATTTTTATAATTTTTAAGAAATTAAAA
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1 TTAAATTTTTATAATTTTTAAGAAATTAAAA
18025508 TATAAATTTATTATATATTTT
1 T-TAAATTT-TTATA-ATTTT
18025529 ATAGATTATA
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 1, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
28 6 0.14
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*
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1 TTTTATATAATTTTTTTAT
18034918 ATAATATTTA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
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**
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1 ATTTTTTTATGATAATATTTA
18034928 GAATTATTTA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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** * *
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*
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1 CGCCGCTATAGATCATGACTTTTAGCGGCGC
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Statistics
Matches: 65, Mismatches: 8, Indels: 1
0.88 0.11 0.01
Matches are distributed among these distances:
42 13 0.20
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Indices: 18035126--18035306 Score: 206
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* *
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18035190 TAGCGACGC-TTTTTCTACAAA
66 TAGCGACGCTTTTTTCTACAAA
* * ** * * * *
18035211 CGCCGCTATAGATCATTACTTTTAGCGGCGC-ATCTCACACAAATGTTGCTATTGTTTGTTGACT
1 CGCCGCTATAGAT-ATGACTTTTAGCGGCGCTATCTC-CACAAACGCCGCTATAGATCGTCGACT
* * *
18035275 TTTAGTGGCGCTTTTTTCTATAAA
64 TTTAGCGACGCTTTTTTCTACAAA
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1 CGCCGCTA
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Statistics
Matches: 79, Mismatches: 13, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
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CGCCGCTATAGATATGACTTTTAGCGGCGCTATCTCCACAAACGCCGCTATAGATCGTCGACTTT
TAGCGACGCTTTTTTCTACAAA
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*
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*
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Statistics
Matches: 29, Mismatches: 2, Indels: 0
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* *
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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* *
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* * *
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*
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* *
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*
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*
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TAAATTTACCCATCCA
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* * ** *
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** * *
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*
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18047455 TTATTACGAA
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* * * *
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* * * * **
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* *
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**
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* *
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* *
18047888 CTTATCGC--ACATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGC
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*
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CTTATCACATATATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGC
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18047688 CCCTTCGGGA
** * * * * ** * *
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*
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*
18047792 CTTATCACGCATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCACATATATATAC
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*
18047857 ACTTTCACATTCATCACATCGGCTATTAGGC
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*
18047888 CTTATCGCACATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCACATATATATAC
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*
18047984 CTTATCACATATATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCC
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TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAGGCCTTATCACATATATACACTTTCACATTCATC
ACATCGGCCTAAT
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18047891 ATCGCACATA
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1 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCAC--ATATATACACTTTCACATTCA
*
18047966 TCACATCGGCCATTAGGCCTTA-TCACATATATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCCTAAT
64 TCACATCGGCCATTAGGCCCTATTCAC--ATATATACACTTTCACATTCATCACATCGGCCTAAT
*
18048030 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAGGCCTTATCACATATATACACTTTCACATTCATC
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TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCACATATATACACTTTCACATTCATC
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18047999 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCTAAT
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18048020 TCGGCCTAAT
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1 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAGGCCTTATCACATATA
*
18048077 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAGGCCCTATTCACATATA
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*
18048125 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCACATATA
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1 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAGGCCTTATCACA
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Indices: 18048030--18048214 Score: 343
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18048020 TCGGCCTAAT
*
18048030 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAGGCCTTATCACATATATACACTTTCACATTCATC
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18048095 ACATCGGCCATTAGGCCCTATTCACATATA
66 ACATCGGCCATTAGGCCCTA-TCACATATA
18048125 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCACATATATACACTTTCACATTCATC
1 TACACTTTCACATTCATCACATCGGCCATTAAGCCTTATCACATATATACACTTTCACATTCATC
*
18048190 ACATCGGCCATTAGGCCTTATCACA
66 ACATCGGCCATTAGGCCCTATCACA
18048215 ATTTAGAATT
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1 TTTACTTACTTGCTTACTT
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** * * * * *
18053764 ATGGTCTTAC-ACGGGAGTTCTCATATCGGTGCCCATGCCATGTCCTAGGC
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*
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* * * *
18053864 ATGGTCTTACGTGGGACCTCTCATAACCTCAATAATGCCAATGCCATGTCCCAGAC
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1 ATGGTCTTAC
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* * * *
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*
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* *
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* *
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* *
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* *
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* * * *
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* ** *
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* *
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*
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*
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* *
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* *
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*
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*
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*
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**
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* * *
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* * *
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* *
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* * *
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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* *
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*
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* *
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*
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*
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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*
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*
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* *
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*
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*
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* * *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* * *
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*
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*
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*
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* * *
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*
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* * * *
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* * * * * * *
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** ** * * **
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* ** * *
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* * * * * * ** ** * * *
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* * * * * * *
18074868 GA-TCATAATATAGC-AATCTGT--ATGATTAGTCCCTGAA-AC
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* ** ** ***** * ** * ** * * *
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1 TTT-GAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAA-TTTAAC-AAATGGTTTAG-ATAAG
* ** * * * * * ** ** * *
18074964 ATTTTAATTGTG-TTTTTG-TATATATATTAAATATAT-ATAATTGTAGATTTA-ATGGCTTTTT
62 AATGGAA-AGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAA-A-ATGGGAATCGT-GA-TTAGA--G--ATTT
*** * * * * * * * * * **
18075025 ATAAAAATGGATCAAAT-C-GTA-AAA-TAAGAAATACTTGATAAAT--A-TGAAG-AG-ATTCA
118 AT-TCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATG-GATTCTCGACAGCTCGAGTG-AGCAGTA-TC-
* * * * * *
18075081 TGA-CATTGAATGGATGTAG-AAT-GGT-ATG-TT-GT---TGGATAGCATGTATATGATG--AT
178 GGATCA-T-AAT--A--TAGCAATCAGTGATGATTAGTCCCT-GA-AAC-TTTCTA-GTTGCCAT
* ** * * * * **
18075135 GTTGCAAATTTAAAATGT-ATAGAGAATTGTTA-TTCAAAATAACTAAT-GTGTGTATAAATTAA
233 -TT-C-TAGGT-AAGT-TCATATAGAA--GTTACTGC---AT---T-TTCGTGT-TATATTTTAA
* * * ** * * * * **** ** *
18075197 -AGAG--TTTG-AAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTAGAT
283 TTGTGTTTTTGTATAT-ATATTAAAT--AT-ATATAA-TTGTA-G-ATTTAATGGCTTTTTATAT
* * * * * ** * *
18075258 AAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAA-AGGAAA-A-ATG-GGAATCGTGATTAGAGATTTATT
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** ** **** * ** * * *
18075319 CGATGGTTGAGATCCA-GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCA-GTATCGGATCA
395 -GA-CATTGA-ATGGATG-TGGGA--ATGG--TAT-G-TTGTTGGA-T-AGCATGTAT---ATGA
* * * ** * * ** *
18075382 TTATATAGC-AATCTGTGATGAT-TAGTCCCTGA-AACTT-TCTAGTTGC--CATTTCT-AGGTA
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* * *** *
18075440 AGTTCATATGGAAGTTTCTGCAT
498 -GTGCATA---AAATTAAAG-AG
* *** * * ** * **
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1 TTT-G-A-AATGATACGAAATG-G-----GTA-A-A-A-GAACCTGTATGAATT-TA-A-CAAAT
* * * * * ** *
18075526 GGCTTTTTATATAA-AATGG--A-TCA-AATCG-TA-AAATAA-GAAATACTTGATAAAT-ATGA
50 GG---TTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAA-AAGGAAA-A-ATG-GGAATCGTGA
* ** ** ** * * * *
18075582 --AGAGATTCA-T-GA-CATTGA-ATGGATG-TGAGA--ATGGTAGTTGTTGGATAGCAT-GTAT
108 TTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA-GCACAAATTATGG-A-TT-CTCGACAGC-TCG-A-
* ** * * * * * * * ***
18075637 ATGATG-ATGT-TGCAAATTTAAAATGTATAGAGAAT-TGTTATTCAAATAACTAATGTGTGTAT
166 GTGA-GCA-GTAT-CGGA-TCATAA--TATAG-CAATCAGTGA-T--GAT---TAGTCCCTG-A-
* *** * * ** * * * * * * * *
18075699 AAATTAAAGAGTTTG-AAATGATACG-AA-ATGATAAAAGAACTGT-CTGAATTTAACAATGTTT
216 AACTT-TCTAG-TTGCCATTTCTAGGTAAGTTCAT-ATAGAAGT-TACTGCATTT-TC-GTG-TT
* *** * * * * * ** **
18075760 AGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAA-A-ATGGGAA-TGT-GA-TT-A-GAG
274 ATATTTTAAT----TGTG-TTTTTGT-ATATATATTAAATATAT-ATAATTGTAGATTTAATG-G
* ** *** * * * * * * **
18075818 ATTTTTCGAT-GGTTGAGATC-CA--GCAAAATTATG--ATTCTCGACAGCTCGAGTG-AGCAGT
331 CTTTTTATATAAAATG-GATCAAATCGTAAAA-TAAGAAATACTTGATAAAT--A-TGAAG-AG-
* * * * *** ** * * **
18075876 ATCGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTC-TGGTA
389 AT---TCATGACATTG-AA--TG-GATG--TGGGAATGGTA-TGT-T-GTTG-GATAGCAT-GT-
* * *** *** * ** * *
18075940 AGTTCAT-ATGGAAGTTTCTGC-ATTTTCGTAT-TATATTTTAATTGTGTTTTGTATATATATTA
439 A--T-ATGAT-G-A-TGT-TGCAAATTTAAAATGTATA-GAGAATTGT-TATTCAAAATA-ACT-
* * *
18076002 AATATAT--ATAATTTAGATTTAATG-G
493 AATGTGTGCATAA---A-A-TTAAAGAG
* * * * * * * *
18076027 CTTTTTATATAAAATGGAT-C-AAAT-CGTAAAATAAGAAATACT-TGATAAATATGA-AGA-GA
1 -----T-T-TGAAAT-GATACGAAATGGGT--AA-AAG-AA-CCTGT-ATGAATTTAACAAATGG
* * * * ** ***** ** *
18076086 TTCATGACATTGAATGG-ATGTGAGAATGG-TATGTTGTTGGATAGCAT-GTATAT-GATGATGT
52 TTTA-GATA-AGAATGGAAAGTGATTATGGTTAT-AAAAAGGA-AAAATGGGA-ATCG-TGAT-T
* * * ** * * * * **
18076147 TGCAAATTTAAAAT-GTATAGAGAATTGTTATTCA--AAAAACTAATGTG-TGTAT--ACAATTA
110 AG-AGATTT--ATTCG-AT-G-G--TTGAGATCCAGCACAAA-TTATG-GAT-TCTCGACAGCT-
* ** * * * ** * * * * *
18076206 AAGAGTTTGAAATGATACGAAATTGGTAA-A-AG-AACCTGT-ATGA--A-T--TTAAAAATGGT
163 -CGAGTGAGCAGT-AT-CG-GA-TCATAATATAGCAATCAGTGATGATTAGTCCCTGAAACT--T
* * **** * * * * ** * * *
18076262 T-TAGATAAG-AATGGAAAGTGATTATGGTAATA-AAAAGGAAAAATGGGA--AT-GTGATTAGA
221 TCTAG-T-TGCCATTTCTAG-G--TAAGTTCATATAGAA-G-TTACT-GCATTTTCGTG-TT--A
* * * ** ** * * * * *
18076321 GATTTT--TCGATGGTTGAG-ATCCAGCA-CAAATTATGATTCTCGACAGCTCGAGTAAGCA-GT
275 TATTTTAATTG-TGTTTTTGTATATA-TATTAAA-TAT-A-TAT--A-A--T--TGT-AG-ATTT
* * ** * * * * * * * * * * * *
18076381 -ATCGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTCGG
326 AATGGCTTTTTATATA--AA-ATG-GATCA--AAT-CGT-AAA----ATA--AG-AAATACTTGA
* * * * * * *** * * * *
18076445 TAAGTTCATATGGA-AGTTTC-TG-CTTTTCGTAT-TATATTTTAATCG--TGTTTTTGTATA-T
376 TAA----ATATGAAGAGATTCATGAC-ATT-GAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGC
* * * * ** * * * * * *
18076503 ATATTAAATAT-AT-ATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAA
435 AT-GT--ATATGATGAT-GTTGCAAATTTAA----AATGTATAGAGAATTG-T-TATTC--AAAA
** * *
18076566 TAAGAAATACT-TG-AT-AAATATGAAGAG
488 TAACTAAT-GTGTGCATAAAAT-TAAAGAG
* * * * * *** *
18076593 ATT--CATGACATTG-AATGGATGTGAGAA--TGGTATG-TTGTTGGATAGCATGTATATGATGA
1 TTTGAAATGATA-CGAAATGGGTAAAAGAACCT-GTATGAAT-TT--A-A-CA---A-ATG--G-
* * * * * * * * * **
18076652 TGTTGCAAATTTAA-AATGTATAGAGA--ATTGTTATTCAAAA-TAACTAATGTGTGTAT--AAA
52 T-TT--AGA--TAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTA-TAAAAAGGAA-AAATG-G-GAATCGTGA
* ** * * * * *
18076711 TTAAAGAGTTTGATATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTATGAATTTAACA-AATGG-TT-TAG
108 TT--AGAGATT--TAT--T-CG--AT-GGT-TGAGATCC-A-GCA--CAA-ATTATGGATTCTCG
* * * ** * ** * * * *
18076773 ATAACAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAATCTGATTCGAGATTTATTC
157 ACAGC--TCG--AGTGAGCA--GT-AT----CGG--ATCAT---AATAT-A-GC-A-A-TCAGT-
* ** ** * * ** * * *
18076838 GATGGTTGAGATCCAACACAAA-TTATGGATTCTCGACAGCTCGA-GTGAG--CAGTATCGGATC
200 GATGATT-AG-TCC--CTGAAACTT-TCTAGT-T-GCCATTTCTAGGTAAGTTCA-TAT-AGA--
* * ** ** * ** * * * * *
18076899 A-TTATATAGCAATCTGT-GATGATTAGTCCCTGAAACTT-TCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAG
254 AGTTA-CT-GC-AT-TTTCG-TG-TTA-T-ATTTTAA-TTGTGTTTTTG-TA-TATATA-TTAAA
* * * * * * * ** *
18076961 T-TCATATGGAAGTTTCTACATTT--TCG-TATTATATTTTAATTGTG-T--TTTTGTATATATA
307 TAT-ATAT--AA--TTGTAGATTTAATGGCT-TTTTATATAAAATG-GATCAAATCGTA-A-A-A
* * * * * * * ** * * * **
18077019 TTAA-ATATATAATTG-TATAT-TTAATG-GCTT-TTTATATAAAATGGATCAAATCGTAA-AAT
362 -TAAGA-A-ATACTTGATAAATATGAA-GAGATTCATGACATTGAATGGAT---GTGGGAATGGT
* * * * * * * *
18077078 AAGAAATATTTGATA--A---ATATGAAGA-GATT-CATGACA-TT-GAATGGATGTGAGAATGG
420 ATG--TTGTTGGATAGCATGTATATGATGATG-TTGCA--A-ATTTAAAATGTAT-AGAGAA---
* * * *
18077134 TATGTTGTTGGATAGCATGTATA-TGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTG
475 T-TGTTATT-CA-A--A-ATA-ACTAATG-TG-TGC--A--TAAAAT-TA-A-AG-A--G
* * * *** * * *
18077193 TTATTCACAAT-A-AC-TAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGG----
1 -T-TTGA-AATGATACGAAATG-G-GTA-A-AA-GAACCTGTATGAATTTA-AC-AAATGGTTTA
* ** * ** * * ***
18077251 GAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAA
56 GATAAGAA--TG---GAAAGTGA-TTATGG-TT--ATAA-AAAGGAAA---A--ATGGGAATCGT
* ** * * ** * ** ** *
18077316 AAGGAAAAATAGGAATCG-TGGTTAGAGATTTA-TTC-GATGGT-TGAGA-TC-CAGCACAAATT
106 GATTAGAGAT-TTATTCGATGGTT-GAGATCCAGCACAAAT--TATG-GATTCTC-G-AC-----
* *
18077375 ATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGATGATTAGTC
159 A--G---CTCG--AG-T-GA--GC--AGTATCGGATCATAATATAGCAATCAGTGATGATTAGTC
* * * * *
18077440 CCTG-AACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTACATTTTCATATTA
211 CCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTA
18077504 TATTTTAATTGTG-TTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
275 TATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATA
*
18077568 CAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
340 TAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAAT
* *
18077633 GGATGTGAGAATGGTAAGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAA-TTAAAATGTATA
405 GGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATA
* *
18077697 GA-AATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATAGAATTAAAGA-
470 GAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
* * *
18077741 TTTGAAATGATACGAAAT-GATAAAAGAACCTGTCTGAATTTAACAAATGGTTTACATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* *
18077805 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAT-GGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATTGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
18077869 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATC-GATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * * *
18077933 CTGTTATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
*
18077998 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
18078063 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
*
18078128 TTCAT-ACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* * *
18078192 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAGAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
* *
18078253 TTTGAAATGATACGAAATCGGAAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* *
18078318 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATGGTGATTAGAGATTT-TTCGATGGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
*
18078382 GATCCAGCA-AAATTAT-GATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGAATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * *
18078445 CTGTGATGATTAGT-CCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTTGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
* *
18078509 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTTTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
18078574 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
*
18078639 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
*
18078704 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTAT-AAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
* *
18078764 TTTGATATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAGGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
*
18078829 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
*
18078894 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGCATCATAATATAGCAA
130 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAA
* * * *
18078959 TCTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTCTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTT
195 TCAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATT-TCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTA
*
18079024 CTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGAT
259 CTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGAT
* *
18079089 TTAATGGCTTTTTATATGAAATGGATCAAATCGTGAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAG
324 TTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAG
* * * *
18079153 ATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGCATGTTGTTGGATAGTATGTTTATGATGATGTTGC
389 ATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGC
* * * *
18079218 AAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCACAATAACTATTGTGTGTATACAATTAAAGAG
454 AAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18079280 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAAT-
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
*
18079344 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
*
18079409 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGAAAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAA
130 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAA
*
18079474 T-ATGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTT
195 TCA-GTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTT
* * * * * * * *
18079538 TCTACATTTTCATATTATATTTAAATTGTGTTTTTGTATATATAGTAAATATATATAAATGAAGA
258 ACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGA
** ** * * **
18079603 TTTAACAAATGG-TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTAAGAATTTAACAAATGGT
323 TTT----AATGGCTTT-TTAT-ATA--AAAT-GG-ATCA-AATC-GTAA-AA--TAAGAAAT-AC
** ** * ** * *
18079667 TTAGATAAGA-ATGGAA-AGTAATT-ATGGTTATAAAAAGGACAAATGGGAATCGTGAATAG-AG
372 TT-GATAA-ATAT-GAAGAG--ATTCAT-GACATTGAATGG--ATGTGGGAAT-G-GTAT-GTTG
* * ** * * *
18079728 ATT-TAT-TCGATGTTGATATCCAGCACAAAT-TATG--GATTCTCGACA-GCTCGAGTGAGCAG
426 -TTGGATAGC-ATG-T-ATAT---G-A-TGATGT-TGCAAATT-T-AAAATG-T--A-T-AG-AG
* * * * * * * * * *
18079787 TATCG-GA-TCATAATATAGC-AATCTGT-TATGATTAGTCCCTGAA-AC
473 AATTGTTATTCA-AA-ATAACTAATGTGTGCAT-A-AAAT---TAAAGAG
* ** ** ***** * ** * ** * *
18079832 TTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGT--AAG-TTC-ATATGGAAGTTT--CTGCAT--TTTCGTATTA
1 TTT-GAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTAT-GAA-TTTAAC-AAATGGTTTAG-ATAA
* * ** * * * * * ** ** * * *
18079889 TATTTTAATTGTG-TTTTTG-TATATATATTAAATATAT-ATAATTGTAGATTTAAGGGCTTTTT
61 GAATGGAA-AGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAA-A-ATGGGAATCGT-GA-TT-AGAG--ATTT
* * * * * * * * * * * **
18079951 ATACAAAATGGATCAAAT-C-GTA-AAA-TAAGAAATACTTGATAAAT---GTGAAG-AG-ATTC
118 ATTC--GATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATG-GATTCTCGACAGCTCGAGTG-AGCAGTA-TC
* * * * * * * * * *
18080007 ATGA-CATTGAATGGAT-GTACGAATGGAATGTTG-TTGGATAGCATGTATA-TGAT-GATGTTG
178 -GGATCA-T-AAT--ATAG--C-AAT-CAGTGATGATTAG-T-CCCTG-AAACT-TTCTA-GTTG
* * * * * * *
18080067 CAAATT-TA---AAATGT-ATAGAGAATTGTTA-TTCAAAATAACTAAT-GTGTGTATAATATTA
229 CCATTTCTAGGTAAGT-TCATATAGAA--GTTACTGC---AT---T-TTCGTGT-TAT-ATTTTA
* * * ** * * * * **** ** *
18080125 A-AGAG--TTTG-AAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTAGA
282 ATTGTGTTTTTGTATAT-ATATTAAAT--AT-ATATAA-TTGTA-G-ATTTAATGGCTTTTTATA
* * * * * ** * *
18080186 TAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATTAAA-AGGAAA-A-ATG-GGAATCGTGATTAGAGATTTA
340 TAA-AATGG--A-TCA-AATCG-TA--AAATAAGAAATACTTGATAAAT-ATGA--AGAGATTCA
** ** **** * *
18080247 TTCGATGGTTGAGATCCA-GCACAAAT--TATGCATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCA-GTATCGG
394 -T-GA-CATTGA-ATGGATGTGGGAATGGTATG---T-T-----GTTGGA-T-AGCATGTAT---
* * * * ** * * **
18080308 ATCATTATATAGC-AATCTGTGATGAT-TAGTCCCAGA-AACTT-TCTAGTTGC-CAGTTTCT-A
441 ATGATGATGTTGCAAAT-T-T-AAAATGTA-T---AGAGAA-TTGT-TA-TT-CAAAATAACTAA
* * * ** *
18080367 GGTAAGTTCATATGGAAGTT-TTGCAT
495 TGT--GTGCATA---AAATTAAAG-AG
* *** * ** ** * **
18080393 TTTCGTATTAT-ATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTATATATAT-AATTGTAGATTTAATG
1 TTT-G-A-AATGATACGAAATG-G-----GTA-A-A-AGAACCTGTATGAATT-TA-A-CAAATG
* * * * * * *
18080456 GCTTTTTATATAA-AATGG--A-TCA-AATCG-TA-AAATAA-GAAATACTTGGTAAAT-ATGA-
51 G---TTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAA-AAGGAAA-A-ATGG-GAATCGTGAT
** * * * *
18080511 -AGAGATTCATGACATT-GAATGGATGTGAGA---ATG-GTAAGTTGTTGGATAGCAT-GTATAT
109 TAGAGATT--T---ATTCG-ATGG-T-TGAGATCCA-GCACAAATT-ATGGAT-TC-TCG-ACA-
* * * * *** * * * * * * * ***
18080569 GAT-GA-TGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAGTAACTAATGT-GTGTAT-
160 GCTCGAGTG-AGC-AGTATCGGAT-CATA-A-TATAG-CAATC--AGTGA-TGAT-TAGTCCCTG
* *** * * * * * * * * * *
18080630 AAAATTAAAGAGTTTG-AAATTATACG-AA-ATGATAAAAGAACTGT-CTGAATTTAACAGATGG
215 AAACTT-TCTAG-TTGCCATTTCTAGGTAAGTTCAT-ATAGAAGT-TACTGCATTT-TC-G-T-G
* *** * * * * * * *
18080691 TTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGT-TATA-A--AAAGGAGAAATGGGAATCGT-GA-TT-
272 -TTATATTTTAAT----TGTG-TTTTTGTATATATATTAAA-TATATAT---AATTGTAGATTTA
* * * * * * * * * * * * **
18080749 A-GAG--ATTGAT-T--GATGGTTGAGATCGAGCACAAATGATG-GATTCTCGACAGCTCGAGTG
327 ATG-GCTTTTTATATAAAATGGATCAAATC--GTA-AAAT-AAGAAATACTTGATAAAT--A-TG
* * * * * * * *
18080807 AGGAGTATCGGATCATTATATAGCAATCGGTGATGATTAGTCCCCGAAACT-TTCTAGTTTCCAT
384 AAGAG-AT----TCATGACATTG-AAT--G-GATG--T-G-----GGAA-TGGTAT-G-TT--GT
*** * * * * * ** ** * * * * **
18080871 TTTCTCAGTAAGTTCATCTGGAAGTTACTGCATTTTCGTATTATATTTTAATCGTGTTTTTGTAT
427 TGGAT-AGCATG-T-ATAT-GATGATGTTGCAAATT--TA--A-AATGT-ATAGAG-AATTGT-T
* * * *
18080936 ATAT-ATTAAATATATATAAT-TGTAG-ATTTAATACTT-TATA-
480 AT-TCA--AAATA-A-CTAATGTGT-GCA--TAA-AATTAAAGAG
* * ** * **** ** ** * * * *
18080976 TATAAAATGGAT-C-AAAT-CATAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAACGATTCATGACAT
1 TTTGAAAT-GATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTA--TGA-ATTTAACAAATGGTTTA-GATA-
* * *** ***** ** *** * *
18081038 TGAACT-G-ATGTGGGAATGG-TATGTTTTGGATAGCATGTTTAT-GATGATGTTGCAAATTTAA
60 AGAA-TGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGA-AAAATGGGAATCG-TGAT-TAG-AGATTT--
* ** * * * ** * ** *
18081099 AAT-GTATAGAGAATTGTTATTCA-CA-ATAACTAATGTG-TGTAT--ACAATTAAAGAGTTTGA
118 ATTCG-AT-G-G--TTGAGATCCAGCACA-AA-TTATG-GAT-TCTCGACAGCT--CGAGTGAGC
* * ** * * ** *
18081158 AATGATGCGAAATGGGTAA-A-AG-AACCTGT-ATGAATT--TAAC--AAA-TGGTT-TAGGTAA
172 AGT-AT-CG-GAT-CATAATATAGCAATCAGTGATG-ATTAGTCCCTGAAACT--TTCTA-GT-T
* **** * * **** ** * ** * * *
18081213 G-AATGGAAAGTGATTATGTAACACCCCGAACCCGAGACCGACACTGGAGTCG-GACATGAGATG
228 GCCATTTCTAG-G--TAAGT-TCATATAGAA---GTTACTG-CA-T--TTTCGTG---TTATATT
***** * * * * * **** * * * * **
18081276 TTAA--CAAACTTTG-AAAAATTTTTCCAGACACTGCCCAGTCTG-AG-TACTAGTCGCTTCAAA
279 TTAATTGTGTTTTTGTATATA-TATT--AAATA-TATATAAT-TGTAGAT-TTAATGGCTT--TT
* *** * * ** *** * * *
18081336 AATCATATCTTGAGTTTCACAACTCG-AAAATCAG---TTTTGTGATTTTTCCCTGAAACTAGAC
336 TAT-ATAAAATG-G-ATCA-AA-TCGTAAAATAAGAAATACT-TGATAAAT--ATG-AA-GAGAT
* * *** * ** * * *
18081397 TCATGTCCCCACCTATGTATTTTTTTCTAGAAT--T-T-TTGGTCAGGCCAATTAGGAAAT-TTT
391 TCATG-----ACAT-TGAATGGATGT-GGGAATGGTATGTT-GT-TGG---A-TA-G-CATGTAT
* * * ** * * ** * * * ** * * *
18081457 ATTAGTCAAAGTCT-CCCATGTT-ACAGGGGTCGACTACACTGACCTT-TTC-CCATTACGACT-
441 ATGA-T-GATGT-TGCAAAT-TTAAAATGTATAGA-GA-ATTG---TTATTCAAAATAACTAATG
*** *
18081517 TG-G-ATATCTCTCTGCACAGAG
497 TGTGCATA-AAAT-T--AAAGAG
* * * ** ** * * * * **
18081538 CTTCAATACTGATGCCG-TTTGTTTCTATGGAAACTAGACTCAGAGAGGAATCCATACATATATG
1 TTTGAA-A-TGAT-ACGAAATG--GGTA---AAA-GA-AC-CTG-TATGAATTTA-ACA-A-ATG
* * * * * * * ** *
18081602 GTAT-GACTCCTAATTATCTCTGGTAAATTTA-TAGTGAATTTCTAAATTCGG-AACA-GGGAAT
51 GTTTAGA----TAA-GA---ATGG-AAAGTGATTA-TG--GTTATAAA-AAGGAAAAATGGGAAT
** * * * ** ** * * * *** * *
18081663 CCAGA--A-A-CTGTTCTGGCCCT-GTT-CCA-CAAGAACCTGAA-TATCTCTTACT-GTACTGT
103 CGTGATTAGAGAT-TTAT-TCGATGGTTGAGATCCAGCA-C-AAATTATGGATT-CTCG-ACAGC
* ** * * * * ** ***
18081719 TC-ATATGA-TTGTTTC-GTTACTTTCATAT-G-AA--AGT-A-GATTCAG--CAAGGTTCGATT
162 TCGA-GTGAGCAGTATCGGAT-C-ATAATATAGCAATCAGTGATGATT-AGTCCCTGAAAC--TT
* * * * ** * * **
18081773 ACATAATT--TATTCACTATTTAA-TTCCACTCCTACGAA-TT-CTTGTGATTTT--T-CCA-AT
221 TC-TAGTTGCCATT-TCTAGGTAAGTT-CA-T-ATA-GAAGTTAC-TG-CATTTTCGTGTTATAT
*** * * * ** * * * * ** * **
18081829 CCACACCACTGCTGCTGTTAGCCTCTGTTTTCAAA-GTA-A-ACCT-TACCTATTT--TCGGGGT
278 -TTTA--ATTG-TG-TTTTTGTATATATATT-AAATATATATAATTGTA--GATTTAAT-GGCTT
* ** * ** *** * * * * * * **
18081888 TTCATGGACCAACTAGGGCCTTGTCAT-ACATATGCCCACATA--TGAT-CATACT-TAGCCATT
334 TTTAT--ATAAAAT-GGATCAAATCGTAAAATAAG---AAATACTTGATAAATA-TGAAGAGATT
* * * ** *** *** ** * * **
18081948 CCAATGGC--TG-AT-CATTTGCTCAACACT-T-CCATTCCA-A-CTATAGT-TA-CATCATGAA
392 -C-ATGACATTGAATGGATGTG-GGAATGGTATGTTGTTGGATAGC-AT-GTATATGATGATGTT
* * * * * * * * * * * **
18082003 AC-CATCTATACAT-TCATAAACACGAATGGTCTAATGC--CAT-ACTCCACT-TCTACA-AGCC
452 GCAAATTTA-AAATGT-AT--AGA-GAATTGT-T-ATTCAAAATAACT--AATGTGTGCATA-AA
***
18082061 ATTTTCGCATG
507 ATTAAAG-A-G
** * * * *** * ** *
18082072 GCTGTACACTTATAC--ATTTCAT-AAAGTA-CTCG-A-GAA-ACAAC-AATGG-GTAGTCCTAT
1 TTTG-A-AATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCT-GTATGAATTTAACAAATGGTTTAG----AT
** * * ** * * *** * *
18082128 ACATGCCATATCAAAATTCAACCAAAATAG-TACCCAAAAGAGCCTTTGATAGTGTGGGCGA-CT
59 A-A-G--A-ATGGAAAGT----GATTATGGTTA--TAAAA-AG-----GA-AAAATGGG-AATCG
** * * * * * ** **
18082191 TCGACTTCA-AGATCCCGAGTCCGATAGCTGGAGAACCA--A-AAATCTAT-AAAACAGAGGAGC
105 T-GA-TT-AGAGAT--TTA-TTCGAT-GGTTGAGATCCAGCACAAAT-TATGGATTC--TCGA-C
* * * * ** * * * *
18082251 AGTGTAACGAGTAAGCAATTTATGCTTAGTAAGTTTTGAGC-A--AG-GA--ATTCCAG--CAT-
159 AG-CT--CGAGTGAGCAGTATCGGATCA-TAA--TAT-AGCAATCAGTGATGATT--AGTCCCTG
**** *** * * * *
18082307 AAACAAAGAATA-ACACACATTTAGCTAAACGGAATATTTCATAATACGCAATTTACCG-ATATC
215 AAAC--TTTCTAGTTGC-CATTT--CT--A-GGTA-AGTTCAT-ATA-G-AAGTTACTGCAT-T-
** * * ** ****** * * * * * * **
18082370 AAACTTGCTTCACAACATTAACAACCCTTATGTACATACA--CAATAGACTA-ACTTAGCCGAAG
266 -TTCGTG-TT-A-TATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATA-TATAATT-GTAG-A-
***** * ** * * * * * ** ** *** * *
18082432 GCCGGTAGCTCGTT-TATCAACT-GAGCGAA-CAT-TTATTTGTAAGGGCTCGATTAAAT-TCAA
323 TTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAG-AAATACTTGA-TAAATATGAA
* * * * * ** * * * * *
18082492 CACATACGTAACATATCCCCAT--AT-TGGG-AT-GT-T-TT-TCGAGTATTCGC-TGGAATTTT
386 GAGATTCATGACAT-T--GAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTG-G-A-TAGCAT-GTATATG
* * * * * * ** * * * **
18082548 ACAGCAAGCT-C-ATTCATTACCAAATCACGTACCTTCG-GGA-T-TTAACCGGATATAGCTCCT
444 A-TG-ATGTTGCAAAT--TTA--AAAT---GTA---TAGAGAATTGTTATTC-AAAATAACTAAT
**
18082608 CGT-T-CA-AATGCCTTCGGGACATAGCCCAG
496 -GTGTGCATAA--AATT----A-A-AG---AG
* * * * * * * * * ** * **
18082637 TTT-TAGTAACTCAC-ACAATGCCTTCGG-GACATAACCCGGATTTAATAACTCGCACGAATGCC
1 TTTGAAATGA-T-ACGA-AATG-----GGTAAAAGAACCTGTA-TGAAT---T-TAACAAATGGT
* * * * * * *** * * *** * *
18082699 TTCG---GGACT-TAACCCG-GATT-TAG-TAT--CTCGCACAAA-GGCCTTCGGGGCTTA-ACC
53 TTAGATAAGAATGGAA--AGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATC-GTGATTAGA--
* * ** ** * *
18082753 CGGAATTTGTATCTCGCACAAATGCCTTCG-GATCTTAGTC-CGGATATATTCACTTAGCAC-AA
113 --G-A-TT-TAT-TCG-----ATG-GTT-GAGATC-CAG-CACAAAT-TATGGA-TT--CTCGAC
* * * * * ** * * * *
18082815 AGCCTTCGGGACTTAGCCCGGA-CAGCATTCAATTAATCAT-GCACATC--T-AACAATAATTCA
159 AG-C-TC--GAGTGAG-CAGTATC-GGA-TC-A-TAAT-ATAGCA-ATCAGTGATGATTAGTCCC
** * * * ** * * * * * * *
18082875 TGGCACATTCATA-TT-TCATTTTCATTTGCG-AAACTCAAACACAAG--GC-ACA-TATCGTCC
213 TGAAACTTTC-TAGTTGCCA-TTTC--TAG-GTAAGTTCATATAGAAGTTACTGCATTTTCGT-G
** * ** * * * * * * * *
18082933 TTGCA----CATTCG-GCTCAATAGCCACACATA-GAGCATGATTTAATCACATCGTA-ATTTAA
272 TTATATTTTAATT-GTG-T-TTTTG-TATATATATTA-AAT-ATAT-AT-A-ATTGTAGATTTAA
* * * * * ** **** * * * * ** *
18082991 --GCTCTCTTA-CT-CAA-GAACTTACCTCGGGTGTTGT-CGAACGATTC-CGCTAGCTATTCAA
328 TGGCT-TTTTATATAAAATGGA-TCAAATC--GTAAAATAAGAA--ATACTTGATAAATA-TGAA
* ** * ** * * * ******** * * * * **
18083049 CCACTTTTTCCTTCCCTT-TATCGGATTTATTTCCCCTTTGCTCTTGAGCTTAATTAAACAAATA
386 -GA--GATTCATGACATTGAAT-GGATGTGGGAATGGTATGTTGTTG-G----A-T-AGCATGTA
* * ** * * * * ** * * * *
18083113 AAT--TGAT-TT-CATCATTTAGGCAT-CAAAAAG-A-TG-AACACAAGGCACTTAGCCCATATT
440 TATGATGATGTTGCA-AATTTA-AAATGTATAGAGAATTGTTATTCAA---A-ATA-ACTA-ATG
* * *
18083170 TATACATTAGACATT-AA-AG
497 TGTGCA-TA-AAATTAAAGAG
* * * ** * * * * *
18083189 TCTCATACATGCA-A-AAATCATGCATCAACACAA-C---AT--A-TTAGCTAAT--TTCT--TT
1 TTTGA-A-ATG-ATACGAA--ATGGGT-AAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTT-TAGAT
***** * * ***** **** *** * * * * * **
18083241 CCCCTTGGCCGAA-T-ATGCAT-GTCTATTTTTGGGGTCGATTTCAA-CACTTAATACACACATA
59 AAGAATGG--AAAGTGAT-TATGGT-TATAAAAAGGAAAAATGGGAATC-GTGATTAGAGATTTA
* * * ** ** * *** ** *
18083302 TACACACTAGTAAAGCATCCTCCCCCTTTTCATCAATT-T--A-A-CAC-A-T--GCA-T-T--G
119 TTC-GA-TGGTTGAG-ATCCAGCACAAATT-ATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGG
* * * * * * * * * * *
18083354 CTCATTAACAT-GCAA--AGTTA-CATTCGGCCTTAGCACAC-ATCTTGCTAGCCGA-TTCT---
180 ATCA-TAATATAGCAATCAGTGATGATTAGTCCCT-G-AAACTTTCTAG-TTGCC-ATTTCTAGG
* * * ** * * * * * *** * *** **
18083410 T--CTCCATTTAGCAA-CCAATGCACATAT-GTGCTCACA-CAAAAATGCTAAAAAGGAGGTTCA
240 TAAGTTCATATAG-AAGTTACTGCA-TTTTCGTG-TTATATTTTAATTG-T------GTTTTTGT
* * ** * * * ** * **
18083470 AGA-ATCATCAAGCCATCATCA-CA-TGCATCA-TTAACAAGCTTCATATTTTGCATGCAATGGC
295 ATATAT-ATTAA-ATAT-AT-ATAATTGTA-GATTTAA-TGGCTT--T-TTAT--ATAAAATGG-
* * ** * * * ** **** * **
18083531 ATTAGCACAA-CCTCCACCTAGGCCGAAT-CTTAACTCATCCTCATG-CCTCATCACCACAACAT
348 A-T--CA-AATCGT-AAAATAAG--AAATACTTGA-T-A-AAT-ATGAAGAGAT--TCATGACAT
** *** ***** *** * * * ** *
18083593 CAAACACCAACCAAGAAT-G-ATGCATCCATGG-T--CAAGTGCCA-ATTCCATCACATAGCAAG
400 TGAA-TGGATGTGGGAATGGTATG--TTGTTGGATAGC-A-TG-TATA-T-GATGATGTTGCAA-
* ** * * * ** *** **
18083652 ATTTAGACCATGGGCTAGGTAGAACTCAAGCTA-ACAACTAA-AAC--ATGCATGCATCTCATGG
456 ATTTA-A-AAT-GTATA-G-AGAA-T--TGTTATTCAA--AATAACTAATGTGTGCATAAAATTA
*
18083713 AACA-
511 AAGAG
* * * * ** * * * * * *** * *** ** ***
18083717 TCATCAAA-CATACCTTAGCCTAGCTACATG--CATGGCCGAATCTCTTCACCTTTCTTCTTCTT
1 T-TTGAAATGATA-C-GA-AATGGGTAAAAGAACCTGTATGAA--T-TTAACAAATGGT-TTAGA
***** * * * ** ** * * *
18083779 TCCTCCT-TAAAAT--TTTTGG--CCAAGGATGAACCAAA--GG-AT-GCGA--A-A-ATTTTTT
58 TAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAA--AAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATT
* * ** *** * * * ** * ** * *
18083831 C-TTTGTT--TTTCTTTC-TAATTTA-GGCTAAAT-GA-AGGT-GA--GAAAAGGAT--GAACA-
121 CGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGAT-TCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCAT
* ** ** ** ** ** *** ** *
18083883 AAGATCTTCTCCTCTCTTTTCTTTAGCTCACGGCAATGGGGGGGAAAAGAATC-AACTACACACT
185 AATAT-AGC-AATCAGTGATGATTAG-TC-C--C--T------G-AAACTTTCTAGTTGC-CA-T
* *** ** **** * ** * * * *
18083947 TTTTTTTTTTGTATTCATCATACTCCTT--TTCATTATTTAAT-TTCATGCCTATT-ATTTTATT
233 TTCTAGGTAAG--TTCAT-ATAGAAGTTACTGCA-T-TTTCGTGTT-AT--ATTTTAATTGTGTT
*** ** ** * * * ** * * *** **
18084008 TTT-TCCACCCATGATGCACCA-ACAAAACATGTCTA-TGACATGTCTTGGCCATCA-AACTTGG
290 TTTGT--ATATAT-ATTAAATATATATAA-TTGTAGATTTA-ATGGCTT-TTTAT-ATAAAATGG
* * *** * **** * * ** *
18084069 -TCTACCATGCTTGTCAT-GGCCGGCCAC-T-ACT-AGTAGGGGGGGAATT--TGACA-TGCAAG
348 ATC-A-AAT-CGTAAAATAAG--AAATACTTGA-TAAATATGAAGAG-ATTCATGACATTG-AA-
*** * ** * * ** * * * * * ** ** *
18084126 TCCCCCCTTTGTCCACAT-GCA-CTAATAGG-T--CCT-CACA-CATTGACCTACCACATTTTAG
404 T---GGATGTG-GGA-ATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGA-TGATGTTGCA-AATTTA-
* * * * * * ** * * ** *
18084184 AATTTTCTCACATAAGTCCTATTGAGTAAAT-TC-ACATGAAAT-CA-ACCAAATT-GA-AG
461 AAATGTAT-AGAGAATTGTTATTCA--AAATAACTA-ATG-TGTGCATA--AAATTAAAGAG
* ** * * * * * * *
18084240 CTTGAAATTTTCAC-ACAT---T--CATAA--T-TA-CATATTCTAGAC-AATAAGTATCACATT
1 TTTGAAATGAT-ACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGA-ATT-TA-ACAAAT-GGT-TTAGA-T
**** * * ** ** ** * ** * * **
18084294 CAA-ACAT-TTCGGTGACT-CGGTT-T--AGCGGTTCCGAAA--CCACTTCCCGACTAG-GGTCA
59 -AAGA-ATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGG---AAAAATGGGA-ATCGTGATTAGAGATTT
* * * ** ** * * * *
18084350 ACTTTG--GGCTGTCACAACTCTCCCCCACTTAAGGAATT-TTCATCCCCGAAAATCTTACCG-G
118 A-TTCGATGG-T-TGA-GA---TCCAGCAC---A--AATTATGGATTCTCG-ACAGC-T--CGAG
* ** * * * ** ** * * * * * **
18084411 TAAATAGGTTTGGGTATCGTTCTTTCATCGAGCTCTCGGT-CTCCCAAGTAGCTTCCTCGATCCC
167 TGAGCA-GTATCGG-ATC-AT-AAT-AT--AGCAATCAGTGAT---GATTAG-TCCCT-GA-AAC
** * * * ** * * * * * **
18084475 GTGTT-TGAGCCATAACACCTTTACTAGCGGAACTCTTTTGTTTCGCAA-CTCCTTCACTTCACG
219 -T-TTCT-AG---TTGC-CATTT-CTAG-GTAA---GTTCATATAG-AAGTTACTGCA-TTTTCG
* * * **** * * * ** * ** ** * *
18084538 AGCTAGGATACGCATCG-GTTCTTCT-TCATAGCTCATGTCGACT-TGAATT-TCA-ACCTCTGA
270 TGTTA-TATTTTAATTGTGTTTTTGTAT-ATATATTAAATATA-TAT-AATTGT-AGA--TTTAA
** *** * *** *
18084598 TGGGCTAATTATATGCGATGGATCAGATCGATAGCGTCGAAG-AAT-C--G--AAACATGAA-AG
328 T-GGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCG-TAAAAT--AAGAAATACTTGATAAATATGAAGAG
* * * * * ** * ** * *
18084656 ACGTCATGAATCTTTTCAA--GCTCCGGGGGCAAAAT-CAATCTATACGCAACCGGACCAAC-TC
389 A-TTCATG-A-C-ATTGAATGGAT--GTGGG---AATGGTATGT-T--G---TTGGA-TAGCAT-
** * ***** * * ** **
18084717 GT-TCGGA-GAT-TTCGTACGGCCCAATGAATCT-T-GGGCTCAACTTGCCCTTACGGCCGAACC
437 GTATATGATGATGTT-GCA-AATTTAA--AATGTATAGAG---AA-TTG---TTA--TTC-AAAA
* * * * * * *
18084777 TGAGTATCAT-TTTCCAAGGTGAAACCTTAAGGAACAC
488 TAACTA--ATGTGTGC-A--T-AAA-ATT-A--AAGAG
** ** ** *** * * * * *
18084814 TTTGTCTCCCACCTGATACTCGATGTCTTTTCGTTTCA-AATCTGCGTACGACTTCTGACGATCC
1 TTTG------AAATGATA--CGA----AATGGGTAAAAGAACCT--GTATGAATT-TAAC-A--A
* * * * *** * * ** *****
18084878 GTGGCTACCTTCAGACTTTCACGGAT-TACCTTTACTT-TCTGTTCAGCATCTTTAATCAAAT--
48 ATGG-T---TT-AGA---T-AAGAATGGAAAGTGA-TTAT-GGTT-ATAAAAAGGAA--AAATGG
* ** ** * * * * * *
18084939 CAACTCCGAAAATTTTA-CTTTCA-CCGA-GCTCG-G-TCCA--A-AACA--ATGG-TGT-ACGG
99 GAA-T-CG-TGATTAGAGATTT-ATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAA-ATTATGGAT-TCTCGA
** * ** * ** * * *
18084992 CATTTACGACCGT-A-CA--A-AGCCTCGTAAGGT-GCCATC-TTAAT-ACTT-GAT---TGAAA
158 CAGCT-CGA--GTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCAGTGATGA-TTAG-TCCCTG-AA
* * * * * ** * * ****
18085045 ACTATTGTTGTAAGCGAATTCAATCAAAGGTAAATACCGTTCCCAT-GAA-CTACTGAACTCGAG
217 ACT-TTCTAGT-TGC-CATT---TC-TAGGT--A-A--GTTCATATAGAAGTTACTGCA-TTTTC
** * * * ** * ** * * * **** * *
18085108 GATGCAACATCTCAA-CAT-ATCCT-CA-AGTAT-CTGAAT-TATCCGCTCG--GATTGACCATC
269 G-TGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATA-TATATTAAATATATATAATTGTAGATTTA--AT-
***** * * * * *** ***
18085165 GG-TTTGGGGGTGAAAA--G--C-AGT-GCTAAAAT--G-CA-GCTTGGTACCCA-G-AGCTTCT
329 GGCTTTTTATAT-AAAATGGATCAAATCG-TAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAG-AGAT
** * * * * * * *
18085217 TGCAATTTC-TTCCAAAATCG-TGAGGTGAATCTCGG-ATCTCTATCCGACACGATAGAAACAGG
391 T-C-ATGACATT---GAATGGATGTGG-GAA--T-GGTATGT-TGT-TG----GATAG---CATG
** * * * * * * * * *
18085279 TACCCCGTG-TAAT-CT-CACAATTTGATAAACGTACA-ATTCAGCTAGTTTATCCAATGAAAAA
438 TA---TATGATGATGTTGCA-AATTT-A-AAATGTATAGA--GA-ATTG-TTATTCAA--AATAA
* * * * * ** *
18085340 TCCGT-ACGTACGGGGATGAAATGAGCCGAC
491 --C-TAATGT--GTGCATAAAATTA-AAGAG
* * * * * **** ** * * * * * **
18085370 TTAGTCAGTCTATCAACAACAACCCAT-ATCGCATCCT-TCTTACTTGCTGAC-AA-GG-GCAG-
1 TTTG-AAAT-GAT--ACGA-AATGGGTAAAAG-AACCTGTATGAATT--TAACAAATGGTTTAGA
** * *** * * * * *** ***** * * * ** * *
18085429 TCCGGACACAAAGTCCATTGTGACTCGAT-CCCATTTCCACTCGGGTATCATGATCGGCTGGAGT
58 TAAGAATGGAAAGT-GATTATG-GT-TATAAAAAGGAAAAAT-GGGAATCGTGATTAG--AGATT
* * * * * * * * ** *
18085493 AATCCTGAAGGCACTTGATGTTCC-GCTTTC-ACTTGTTGACATAT-TAAACATCTCGAAACAAA
117 TATTC-GATGG---TTGA-GATCCAGC--ACAAATT-ATG-GAT-TCTCGACAGCTCG------A
** ** ** ** * * * * ** * *
18085555 GTTGGAG-ATGTCCCGTTTCATACCAT-GCCACCAAAATTGACGTTTCAAATCGTTGTACATTTT
166 G-T-GAGCA-GTATCGGATCATAATATAG-CA--ATCAGTGATGATT--AGTCCCTG-AAACTTT
* ** * * *** * *
18085618 CGTA-CT-CC----CCGGGTGAA-TTGACAT-TCG--GCTACAATG-GGCTTCGT-TCAGAATCA
222 C-TAGTTGCCATTTCTAGGT-AAGTT--CATATAGAAGTTAC--TGCATTTTCGTGTTA-TAT--
** * * * * * * * ** * * * **** **
18085671 TCGAAATGAG-TTCTG-A-AT-TCCTTGGAACACACAAACGATT-TCTGAACCTCAAACAATCAT
278 TTTAATTGTGTTTTTGTATATAT-ATT--AA-ATATATATAATTGT-AG-A-TTTAATGGCTTTT
* ** * * * * *** * * ***** * *
18085731 CATCATCAATTTGAAACTCCGATTCCT-CGTTCAGAAAACACTTAGCCCGTTTTGCAACCA-ATT
336 TAT-AT-AAAATG-GA-T-CAAATCGTAAAATAAG-AAATACTT-GATAAATATG-AA-GAGATT
* * * * * * * * * *
18085794 CAT--CATCGACT--TTCTGAG-CT--TCACGAAT-TTGG-T-G-A-GTCA-ATAATGGT-TTAG
392 CATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGT-ATG-TTGTTGGATAGCATGT-ATATGATGATGTT-G
* * * ** * * * * * ***
18085845 C---TTTTAATTCAGCTACTA-ACACATTGTCTGGT-AGAACAGACAAATGCACGTTCAT-CGCT
453 CAAATTTAAAAT--G-TA-TAGAGA-ATTGT-TATTCAAAATA-ACTAATG--TGTGCATAAAAT
18085904 CGTAAAGCA-
509 --TAAAG-AG
* ** ** * ** ** ***
18085913 ---AACAATGACTTCCAGCTTAA-GGCGT--CCGCAACCACGT-TAGCCTTTCCCGGGTGG--TA
1 TTTGA-AATGA--T--A-CGAAATGG-GTAAAAG-AACC-TGTAT-GAATTTAACAAATGGTTTA
* * * * *** ** ** *
18085969 -AT--CAAT-GACAAGCTCG-TAAT-CTT-TCAACAA--CTCAA-GCCAA-CGTCTTTGTCGCAG
56 GATAAGAATGGA-AAG-T-GATTATGGTTAT-AAAAAGGAAAAATGGGAATCGT-GAT-TAG-AG
* * * * * * **
18086023 ATTCAAGTC--TCGTTGAG-T-CATCA-AATATT-TGAGACTTTTGTGATCCGAAAATAC-A-TG
114 ATT-TATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAA-ATTATG-GA-TTCT-CGA--C--AGCT-CGAGTG
* * ** * * * *** * * * ** ** * *
18086080 -GCACTTCTCACCAAACAGATAATGTCGCCATATTTTTAAAGCA-AACACGATGGCAGCTAGTTC
169 AGCA-GTAT--CGGATC--ATAATATAG-CA-ATCAGTGATG-ATTAGTCCCT-GAAACT--TTC
* * *** * * * * * ** * * * ****
18086143 GAGAT--CATGGGTCGGATAA-TTCCTCTCG-TGTGGCTTCAATTGTCTCGACG-CATAGGCCAC
223 TAGTTGCCATTTCTAGG-TAAGTTCATATAGAAGTTACTGC-ATT-T-TCG-TGTTATATTTTA-
* ** * * ** ** *** ** * *
18086203 GACTCGACCTTCTTGCATCA-ATACGCAACCCA-ACCCAA--GTAG---GGAT-GC--GTCACTA
282 -A-TTG-TGTTTTTGTAT-ATATA-TTAA-ATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTA-TA
* * ** * * * *
18086258 T-AAAT-GA-CAAACTCTTTACCT--G--ATTCGGGTTGCACCAAA-ATTG--GAGCTTCA-GTC
340 TAAAATGGATCAAA-TCGTAAAATAAGAAATAC---TTG-A-TAAATA-TGAAGAGATTCATGAC
* * ** * ** * * * * * * ** *
18086312 A---AATGAGTTTTCAG-TTGGTCGAAACTT-TT--CTAACATTTCTCCGTCCACTCGAACTTAA
398 ATTGAATG-GATGTGGGAATGGT---ATGTTGTTGGATAGCATGTAT--AT-GA-T-GATGTT-G
** * * ** * * * *
18086370 CATCCTTTTGAAGTAGCTTCGTCATTG-GTGTGGCTATCATCGAGAAACCTTTCACAAAT-TGT-
453 CA--AATTT-AA--A--AT-GT-ATAGAGAATTGTTAT--TC-A-AAA----TAACTAATGTGTG
*****
18086432 CGATAATAACCGGCGAG
501 C-ATAA-AATTAAAGAG
**** * * * * ** * *** * * * * *
18086449 CCCCAAAAAGCTCCGAACTTCAGTAATA-TTTCTCGGA-G-GTTTCCAGTCAAGTATGG-CTAAA
1 -TTTGAAATGATACGAA-ATGGGTAAAAGAACCT-GTATGAATTT--A-ACAA--ATGGTTTAGA
** * * * * * ** * * * **
18086510 TTTTG-TTCGGGTCAACTCGAATACCCGACGCGGATACCACATGACCCAAGAA-GCTAACCTC-T
58 -TAAGAAT--GG-AAAGT-GATTA--TG--G-TTATA-AAAAGGA---AA-AATGGGAA--TCGT
* * ** * * * *
18086572 -CTTAACCAGAACTCACACTTACTGAACTTAGCATATAACTGCTTATCCCGCA-AAATT-TGCA-
106 GATT-A-GAG-A-T-TTA-TT-C-G-A--T-G-GT-TGA--G---ATCCAGCACAAATTATGGAT
* * * * * * *
18086633 --GC-ACTAGCCTCAGATGCTCAGCATGT-TCGGTCTCATCTCTTGAATAGACCAA-AATGTCAT
152 TCTCGAC-AG-CTC-GA-G-TGAGCA-GTATCGG----A--TCAT-AATATAGCAATCA-GTGAT
* * * * ** * ** * ** * ** * ** *
18086693 CAAT-GAACACAACTACGAACCGATCCAAATACGGTCTGAAGATCCGATTCATCAAATCCATAA-
203 GATTAG-TC-C--CT--GAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTAGGTAAG-TTCAT---AT--AGAAG
* ** * ** * *** * * ** ** * * ***
18086756 ATACTGCAGGGGCATTAGTGAGCCCAAACGGCATCACTAAGAATTCGTAGTGACCATATCTCGTT
256 TTACTGCA----TTTTCGT--G-TTATA--TTTTAATTGTGTTTTTGTA-T-A-TATAT-TAAAT
* * * * ** *** * *
18086821 CTGA-AGGCAGTTTTAGGAATATCTGAATCTCGAATTCGCAACTGATAATAGCTCGATCTCAAAT
308 AT-ATA--TAATTGTA-G-AT-T-T-AA--T-GGCTT-TTTA-T-ATAA-A-ATGGA--TCAAAT
** ** * *** ****** ** * * * *
18086885 C-T-ATTTTTGAGAACAC-TGA-GGCTCCCTTTAG-TTGGTCGAACAAAT-CATCGATGCGCGGC
355 CGTAAAATAAGA-AATACTTGATAAATATGAAGAGATTCAT-G-AC-ATTGAATGGATGTG-GG-
* ** * * * ** *
18086944 AACGGATAT-TTGTTCTTTATCGTCACTTTATTCAGCTGACGATAGTCAATGCACAACCT--CAT
414 AATGG-TATGTTG-T-TGGATAG-CA-TGTA-T-A--TGATGAT-GT---TGCA-AATTTAAAAT
* *** * * * * * ****
18087006 GGT-TCCG-TCCTTCTTTTTCACGAACAA-TACTG-GTGC----ACCCCAAG-G
465 -GTAT-AGAGAATTGTTATTCA-AAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
** * * * * ** * *
18087051 TGAGAAACTTGGT-CG--A-GCG----A-AACCTCTATCCGTCAGTTCTTGCAACTGAGCTTT-C
1 TTTGAAA--TGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTAT--G--AATT-TAACAAATG-G-TTTAG
**** ** * * * * * *** * * **
18087106 A-ACTCCT-TTAACTCG-GT-TGGTGCCATACGATACGGAGCTATCGAAATCG-GCGT--AG---
57 ATAAGAATGGAAAGT-GATTATGGT--TATA--AAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATT
* * ** * ** * * * * * * * *
18087161 --TCCCA-GGTACA-AGCTCAATACCAAACTCT--ACCTCCCGAACAGGT-G-GTAAACCCGGTA
117 TATTCGATGGTTGAGATC-CAGCA-CAAATTATGGA-TTCTCG-ACAGCTCGAGT-GA-GCAGT-
* ** * * * * ** ** *
18087218 ATTC--TTCCGGAA-A-AAC-ATCCGGGTATTCACAAACCACCGGCACAGATTCGGGTTTCT--T
175 A-TCGGAT-CATAATATAGCAATCAGTG-A-TGATTAGTC-CCTG-A-A-A--C---TTTCTAGT
* * * * * * * * *
18087276 TTCTAATTCTTTGTCATCAAGTACATA-CGCAAGGTATGCTTTGCACCCTTTTC---TTACATAT
227 TGCCATTTC-TAG--GT-AAGTTCATATAG-AA-GT-TAC--TGCA---TTTTCGTGTTATAT-T
* *** * *** *** ** * * * *
18087337 TT--CTGTGCCAACATTGCTGATATTACAGCTGGCATCCCCTCCAAGTCCGCAGACTCAATTCGG
279 TTAATTGTG---TTTTTG-T-ATA-TATA--TTAAAT-ATATATAA-T-TGTAGATTTAA-T-GG
* * ** ** * * * *
18087400 ACTACTTCGTTATTTCGCACCTCAAATCAATAGTCTTGCTCTTGCAATTCACAATCGCATCATGC
331 -CT--TT--TTATAT--AAAAT-GGATCAA-A-TC--G----T--AA--AATAA--G-A-AATAC
** * * * * * * * ** * ** * * *
18087465 GCGGTCAACCA-ATCCAAACCAAGGATAACATCAAATT-CATCAAACG-GCAAAAGCATCAAGTC
372 TTGAT-AA--ATAT--GAA--GA-GAT-TCATGACATTGAAT-GGATGTGGGAATG-GT-ATGT-
* ** * * * * ** * **** * * * * * * * *
18087527 CGCCGGAAAACAGGAACCTCGA--AT-TT-C-CAGGGGACATTTCTCACA-CACT-TT-GTCGAC
424 TGTTGGATAGCATGTATAT-GATGATGTTGCAAATTTAAAATGTAT-AGAGAATTGTTATTC-AA
** *** * * * *
18087584 AAGCACGTAATG-ACCCA-AGGGATTTGACACCCGAA
486 AATAAC-TAATGTGTGCATA--AAATT-A-A--AGAG
** * * * * * *
18087619 TTACAAACTCAGTA-GACTCAATAGGT-AAAG-TCTTACTGGATGCTAAGGTTTCACATAT-G-T
1 TTTGAAA-TGA-TACGA---AATGGGTAAAAGAAC---CTGTATG--AA--TTTAACAAATGGTT
* * ** ** * ** *
18087679 AAGAATGAGTAGAACCGGGGTCAATCAAAGCAATTA-CATTAGTATCAAAGAGAGTGAAT--GTA
54 TAG-AT-A--AGAA---TGG------AAAGTGATTATGGTTA-TA-AAAAG-GA-AAAATGGGAA
* * * * ** * ** ** * * * * *
18087741 CCG-GTAATA-ACA-TCAGGCGA-AGAAGCATCCTCGCGGGCACGAA-TA-GCATAAGCTCTAGC
102 TCGTG-ATTAGAGATTTATTCGATGGTTG-A-GATC-C-AGCACAAATTATGGAT--TCTCGA-C
* * ** * ** ** * * *
18087800 AG-GCGCA-CGAGC--T-TCGGATC-TGGTTATATC-ATCTCT-A-GA-TCCTCTCTGACCAC-C
159 AGCTCG-AGTGAGCAGTATCGGATCAT-AATATAGCAATCAGTGATGATTAGTCCCTGA-AACTT
* * * * * ** * ** ** **** *
18087854 ACTAGCATTGCCCATATTTCCAGAT-GGTCTACCTCGAGCAGTGGTAGCACCCGGTTTCCCACTC
221 TCTAG--TTG-CC--ATTTCTAGGTAAGT-T-CATATAGAAGT--TA-C-TGCATTTTCGTGTTA
* * ***** ** **** * * * * * *
18087918 TGATTTTCATTCTGTTCAAACA-ACCTCGGGCAATCTTTAATGAAGTGGTCA-A-CTGATCCGCA
275 T-ATTTTAATTGTGTTTTTGTATATAT-ATTAAATATAT-AT-AA-TTGT-AGATTTAAT-GGC-
* * * ** * * ** * * * *
18087980 CTTGTA-ACAGGA-GCGGTCAGGGAATC-TACAACTCCCCG-AATGCCATTTACCGCAAAT-CGA
332 TTTTTATATAAAATG-GATCA---AATCGTA-AAAT--AAGAAAT-AC-TTGA---TAAATATGA
** * * * ** ** ** * * * *
18088040 CATTTCG-TTCTATCTCGACGTTCATTCCCAACACTGGCG-ACCGAAGTGCCTCG-TGTACCCA-
385 -A--GAGATTC-A--T-GACATTGAAT--GGA-TGTGG-GAATGGTA-TG--TTGTTGGA--TAG
* ** * * * * *** * * **** *** * ** **
18088101 CAGGGGGT-CGATCACGAT-CTCGTCTAAAAAG--GCCCGAA--GTGCCTCTAAACTGGC--CCG
434 CA-TGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTC-AAAATAACTAATG
** * ***
18088158 CAT-CATCTCGAAATCTCTTCGATG
497 TGTGCA--T-AAAAT-T-AAAGA-G
* * ** ** * * * ** * * * *
18088182 TCTGTTGAAGA-GACCTTCCCGAGGAT-CTTTTACGAAACTCT-CCAGTTCCCTCATCAACT-CT
1 --T-TTGAA-ATGA---T-ACGA-AATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATT---T-AACAAATGGT
* ***** *** * * ** *** * **
18088243 TT-GCTTTTCTTTTCTAAGCT-CTT-CGGCTT-TACAAACTCGTTCAA---CAA--GT-ACCACG
53 TTAG-ATAAGAATGGAAAG-TGATTATGG-TTATA-AAA-AGGAAAAATGGGAATCGTGATTA-G
* * * * ** ** * *
18088298 A-A-CT-CTCGTAT--TTCAAGAATGCCAACGAACATTTTTATATATTCATTCAGCCCATCCTCG
112 AGATTTATTCG-ATGGTT-GAG-AT-CC-A-GCACA-AATTATGGATTC--TC-G-ACA-GCTCG
* * * ** * *
18088358 A---AGC-GTTTAC--A-CAT-A-ATAGC-TTC-G-GACGAAACACATTCCC-G-AGCGTATTTG
165 AGTGAGCAGTAT-CGGATCATAATATAGCAATCAGTGATG--A-TTAGTCCCTGAAAC---TTT-
* * * ** * *
18088409 CTAAGTCTAACAAATTTTCGCT-CGTAA--TCAGTA-ACCGACA--TAGAGCCTTGCTTAAGCT-
222 CT-AGT-T-GC-CA-TTT--CTAGGTAAGTTCA-TATA--GA-AGTTACTGCATT--TT-CG-TG
** * ** ** ** * * * * * **
18088467 CAAGAAATTCCTTCCGTTTTTGATCAACAAATCTCTGACTGATATACTTTTTCCGAAACTCAG-T
272 TTATATTTTAATTGTGTTTTTG-T--ATATATAT-TAAAT-ATATA-TAATT--G----T-AGAT
** *** **** ** * * * ** **
18088531 TTGGAAAAACTCCCAAGTTACT-TGCTCTCGGGGCACAA-C--AGAAGTCAG-AGTACTCCACCA
324 TT-----AA-TGGCTTTTTA-TATAAAAT-GGATCA-AATCGTA-AAATAAGAAATACTTGATAA
* * * ** * * * * * **
18088591 ATA-GTAGGCAGAATCACGTAGCAAGGAGATAGCACACTTTAGGCAT--TCATCGGGTGTACAAG
379 ATATG-AAG-AGATTCATG-A-CATTGA-AT-G--GA-TGTGGGAATGGT-AT--GTTGT--TGG
* * *** * * * *** *
18088653 ATAGCTCATCG-AGTACCCGGAT-AGTGTTGTC-CAGCCAAAA--T-T-CAG-CTTGCTCGGCAT
430 ATAG--CAT-GTA-TA---TGATGA-TGTTG-CAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAA
* ** *** * * *
18088710 CATCGCT-ATCCATAGCCTTAAATTCAGTAGCCCCATG
486 AATAACTAATGTGT-GCATAAAATT-A-AAG----A-G
** * *** * ***
18088747 TTTTCGGATTCTG-T-C-AACTGGGGGCTTATTTG-ACCT-TATTTG-GTCCGTT-ACCGGTGGT
1 -TTT--GA-AATGATACGAAAT--GGG--TAAAAGAACCTGTA--TGAAT---TTAACAAATGGT
* *** * * * * * * ** **
18088805 ATT-G-T-AG-GTGCGGGGGT-AGTAT--TTGT----CGG--GAAT-GGAGGTTGTGGAACAGCC
53 -TTAGATAAGAATG-GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGA-ATCGT-GATTAGAG
* * * * ** * * * *
18088856 ATATTAGTTCGAATGTATTGGTTGAACCAATCATTCATCACGCTATAGAATGCTTGTCTAGCTTC
114 AT-TTA-TTCG-ATG-GTT-G-AGATCC-AGCA--CA--A-ATTAT-GGATTCTCGAC-AGC-TC
* * * * ** * *
18088921 -A-T---CA-T-TCGGAT--T-A-CTAGC-ATTAG-GTTGA-GAGTCTGCC-GGCACTGTCCCTT
164 GAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCAGTGATGATTAGTC--CCTGAAACT-T-TCTA
** * * * ** * *** * *
18088971 GTATGGGA--GC-AGGCGCTACACTCTCAAGATCATCAGCTACCTCTCGGTCACGATCGGGATCC
225 GT-TGCCATTTCTA-G-G-TA-AGT-TC-ATAT-AGAAGTTA---CT--G-CATTTTCGTG-T-T
* * ***** * * ** * * * **
18089033 ATTACTATAAACACATTTACAATTGTCAGAAATCACCACACTATCA-AGTAA-T-CACATAAAAT
274 A-TATTTTAATTGTGTTT----TTGT-ATATAT-ATTA-AATAT-ATA-TAATTGTAGATTTAAT
* * *** * * * * **
18089095 GGC-ATGTATAGCTAGACCCAACACATTACGGTAGTCCTAGAATCGACTAAACCGTAGCTCTGAT
329 GGCTTTTTATA--TA-A---AATGGA-T-C--AAATCGTAAAAT--AAGAAA---TA-CT-TGAT
* * ** * ** * * *
18089159 ACCAATTTAATGTAACACCCCGA-ACCCGAGACCGACACTGGA-GTCGGACA-CG-A-GATGTT-
377 A--AA--T-ATG-AAGA----GATTCATGACATTGA-A-TGGATGTGGGA-ATGGTATGTTGTTG
* * * * ** * * **** * * * **
18089218 AACA-AACTTTGA-AAAAT-AT-TTCCAGACACTGCCCA-GTCT-GAGTACTAGTCGCTTCAAAA
429 GATAGCA-TGT-ATATGATGATGTTGCA-A-ATTTAAAATGTATAGAG-AATTGT-TATTC-AAA
* * * * * *
18089277 ATCATATCT--TGAGTTTCA-CAACTCGAAAATCAG
487 AT-A-A-CTAATGTG-TGCATAAAAT--TAAA-GAG
** ** * ** * * * *** *
18089310 TTTTGTGATCTTTCCCTGAAACTAGACT-CATGTCCCCACCTATGTATTTTTTTATA-GAAT--T
1 -TTTGAAAT-GAT-AC-GAAA-T-GGGTAAAAG----AACC--TGTATGAATTTA-ACAAATGGT
* * * ** * * ** ** ** * **** * * * * *
18089371 TTTGGTCAG---GCCAA-TTAGTACAGTT-T-ATTAGTCAAACTCTCCCAT-GTTA-CAGGGGTC
53 TTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAAT-GGGAATCGTGATTAGAGATT
* * * * ** * * * * *
18089428 GACTAC-ACTGACCTT---TTCCCATTAC-GACT-TGGATATCTCTCTGCCAGAGCTTCAATACT
117 TA-TTCGA-TG--GTTGAGAT-CCAGCACAAATTATGG--AT-TCTC-G--ACAGC-TC--GAGT
* * ** * * * * * * * *
18089487 GATGCCGT-TTGTTTCTATGGAA-ATTAG-ACTCAGAGA-GA--AATCCAT-ACA-TATATGGTA
168 GA-GCAGTATCGGATC-AT--AATA-TAGCAATCAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGT-
* * * * *** ** * * **
18089544 TGACTCCTAATTATCTCTGGTAAATTTATAGT-GAA-TT--TCCAAAGTCG-GAACAGGGAATCC
227 TG---CC--ATT-TCT-AGGTAAGTTCATA-TAGAAGTTACTGCATTTTCGTG-TTA--TATTTT
*** * * * * * * * * *
18089604 AGAAACTGTTCTGGCCCTGT-TCCACAAGAACCTGAATATCTCTTACTGTACTG-TTCATATGAT
281 A-ATTGTGTT-T----TTGTAT--A-TA-TA-TTAAATATATATAATTGTA--GATT--TA--A-
* * * * * ** * *
18089667 TGTTTCGTTACTTTCATATGAAAGTAGATTCATCAAGGTTCGATTACATAATTTATTCACTAT-T
328 TG--GC-TT--TTT-ATAT-AAAATGGA-TCA--AA---TCG-TAAAATAA-GAAAT-ACT-TGA
* * * * ** * ** ** * *
18089731 TAATTCCACTCCTACGA-ATTCTTGTGATTTTTCCAATCCACACCACTGCTGCTGTCA-GCCTCT
376 TAAAT--A-T--GAAGAGATTC--ATGA-CATT-GAAT-----GGA-TG-TG--GGAATG-GTAT
** * * ** ** * ** * * * ** *
18089794 GTT-TTCAAAGTAAACCT-TACCTATTTTCGGGGTTTC--ATGGACCAA---CTAGGGCCTTGTC
422 GTTGTT-GGA-T-AGCATGTA--TATGAT-GATGTTGCAAATTTA-AAATGTATAGAGAATTGTT
* * ** * * * * *
18089852 ATAC-ATATGCCCACATATGAT-CATACTTAGCCATTCCAATGGCTGATCA
480 ATTCAAAATAACTA-ATGTG-TGCATA---A--AATT--AA----AGA--G
* * * * * * *
18089901 TTTGCTCAACACTTCCATTCCAACTATAGTTACATCATGAAACCATCTAT-ACATTCATAAACAC
1 TTTG---AA-A--T-GATACGAA--ATGGGTA-A--AAG-AACC-TGTATGA-ATT--T-AACA-
* ** * ** ** ***
18089965 GAATGGTCTAATGCCATACTCCACTTCTACAAGCCATTTTCGCATGGCTGTACACTTATACATTT
47 -AATGGT-TTA-G--ATA--AGA-ATGGA-AAGTGA--TT---ATGG-T-T--A--TA-A-AAAG
* * * *** * * * * * * * * *
18090030 CATAAAGTACTCGAGAAACAACAAT-GGGTAGTCCTATAC-ATGCCATATCAAAATTCAAC-CAA
90 GA-AAA--A-T-GGGAATCGTGATTAGAG-A-T-TTATTCGATG--GT-T-GAGATCCAGCACAA
* * * * * ** *** * * * * * * * * ****
18090092 A--ATAG-TACCCAAAAGAGCCTTTGA-TAGTGT-GG-GC-GACT-TCG-ACTTCA-AGATCCCG
143 ATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCA-ATCAGTGATGATT
* ** ** ** ** * * *
18090147 AGT-CC-GATAGC--TGGAG-AACCAAAAATCTA--TAA-AACAGAGGAGCAGTGTAACGAGTAA
207 AGTCCCTGA-AACTTTCTAGTTGCC--ATTTCTAGGTAAGTTCATA-TAGAAGT-T-AC---T--
* * * ** ** *** * * * * * *
18090204 GCAATTT-ATGCTTAGTAAGTTTGAGCAAGGAATTCCAGCATAAACA-AAGAATA-ACACACATT
261 GCATTTTCGTG-TTA-T-A-TTTTA--ATTGTGTTTTTGTATATATATTA-AATATATATA-ATT
* * * * * * * * * ** ** *
18090266 -TAG-CTAAACGGAATATTT-CATAATA-CG--C-AAT-TTACCGAT-ATCAA-ACTTGCTTCAC
318 GTAGATTTAATGG-CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTA-AAATAAGAAATACTTG-AT-A-
* * * ** * ***** *** * **
18090321 AACATTAACA-ACCCTT-ATGTACATACACAATAGACTAACTTAGCCG-AAG--GCCGG-TAGC-
378 AATATGAAGAGA---TTCATG-ACAT--TGAATGGA-TGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCA
* * * ** ** *
18090379 TCGTTTATCA--ACTG-AGCGAACATTT-ATTTGTA-AG-GGCTCGATTAAATTCAACACAT-AC
436 T-GTATATGATGA-TGTTGC-AA-ATTTAAAATGTATAGAGAATTG-TT--ATTCAA-A-ATAAC
** * *** * **
18090437 GTAACATAT-CCCCATATT-GGGATG
492 -TAATGTGTGCATAAAATTAAAGA-G
* * * * * * * * ** * **** **
18090461 TTTTTCG-AGT-ATTCG--CTGGAATTTTACAGCAAGCT-CATTCA-TTACCAAATCACGTACCT
1 --TTT-GAAATGATACGAAATGG---GTAAAAG-AACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTA-GA
** * ** * * * ** * *** *
18090520 TCGGGATTTAACCG-GA-TATAGCTCCTCGTTCAAATG--CCTTCGGGACATAGCCCAGT-TTTA
58 TAAGAATGGAA-AGTGATTAT-GGT--T-ATAAAAAGGAAAAAT-GGGA-AT----C-GTGATTA
* * ** * * * * * * ** * *
18090580 GTA-ACTCACACAATGCCTTCGGGA-CATAACCCGGATT-T-AATAACTCGCACGAATGCCTTCG
111 G-AGATTTATTCGATG-GTT-GAGATC-CAGCACAAATTATGGAT-TCTCG-AC--A-G-C-TCG
* * * * * ** * * *
18090641 -G-GA-C-TTAACCCGGAT-TTAGTATCACGCACA-AAGGCCTTCGGGGCTTA-ACCC-GGAA-T
165 AGTGAGCAGT-A-TCGGATCATAATAT-A-GCA-ATCA-G---T-GATGATTAGTCCCTGAAACT
* * ** * * ** * * **
18090697 TTGTA-TCTCGCACAAATGCCTTCGGATCTTAGTCCGGATATATTCACTTAGC-ACAAAGCCTTC
220 TTCTAGT-T-GC-C--AT---TTC-TAGGTAAGTTC--ATATA-GAAGTTA-CTGC--A-TTTTC
* ****** ** * * * * * * *
18090760 GGGACTTAGCCCGGACA--GCATTCAATT-AATCATGCACATCTAACA-ATA-ATTCATGGCACA
269 GTG--TTATATTTTA-ATTGTGTT--TTTGTAT-AT--ATAT-TAA-ATATATA-TAATTGTAGA
* ** * * * ** * ** * * ***
18090820 TTCATATTTCATTTTCATTTGCGAAACTCAAACACAA--GGCACATATCGTCCTTGCACATTCGG
323 TTTA-ATGGC-TTTTTATAT---AAAATGGATCA-AATCGTAAAATA-AG-AAAT--AC-TT--G
* * * * * * ** * * * * *
18090883 CTCAATA-GCCACACATAGA-GCATG--ATTTAAT-CACATCGTAAT-TTAAGCTCTCTT--ACT
375 ATAAATATG----A-AGAGATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATG-T-TGTTGGA-T
* * * **** * * * *
18090940 CAAGAACT-TACATCG--GGTGTTGTCGAACGA-TTCCGCTAGCTATTCA-ACCACTTTTTCCTT
432 --AGCA-TGTATAT-GATGATGTTG-C-AA--ATTTAAAAT-G-TA-T-AGA-GAATTGTT-ATT
*** * * * * * * *
18091000 CCCTTTATCGGACTTATTTCCCCTTTGCTCTTGAGCTTAATTAAACA-
483 --CAAAAT--AAC-TA-AT---GTGTG--CAT-A---AAATTAAAGAG
** ** * * *** * * * * ** **
18091047 AAT-AAATTGATTTCATC-ATTTAGGCATCAAAAAGATGAACACAAGGCACTTAGCCCATATTTA
1 TTTGAAA-TGA--T-A-CGAAAT-GG-GT--AAAAGA--ACCTGTATGAATTTAACAAATGGTT-
* * * * * *** ** ** *** *** * *
18091110 TACATTAGACAT-TAAAGT-CTCATACATGCAAAAATCATGCATCAACACAACAT-ATTAGCTA-
54 TAGATAAGA-ATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAAT-GGGA-ATCGTGATTAG--AG
* *** * * * * * * * * * * *
18091171 ATTTCTTTC--CCCTTG-G--CC-G-A-ATATGCATGTCTATTTTTG--GGGTCGATTTCAACAC
114 ATTT-ATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAAT-TATG--GATTCTCGACAGCTCGA-GTGAGCAG
* * * * ** * * **
18091226 T-T--AATACACACATATA-CACA-CTAGTAAAGCA-TCCTCCC----CCTTTTCATCAATTTAA
174 TATCGGAT-CATA-ATATAGCA-ATC-AGTGATG-ATTAGTCCCTGAAAC-TTTC-T--AGTTGC
* * * * * * * *** * *** * * ** * *
18091281 CATATGCATTGCTCA-TTAACAT-GCAAAGTTACATTCGGCCTTAG-AACACATCTTGCTAGCCG
230 CAT-TTC-TAGGTAAGTTCATATAG--AAGTTAC-TGC-ATTTTCGTGTTATATTTTAATTG-TG
* * ** * ** * * ***
18091343 ATTCTTCTCCATTTAGCAACCA-ATGCACAT-ATGTGCTCACACAAAAAT-GC----TA-A-AAA
288 -TTTTTGTATATATATTAA--ATAT--ATATAAT-TG-T-AGA-TTTAATGGCTTTTTATATAAA
* * * *** ** * * * ** * *
18091399 GGA-GGTTCAAGAATCATCAAGCCA-TCATCACATGCATCATTAACAAGCTTCATATT-TTG-CA
344 --ATGGATC-A-AATCGTAAAATAAGAAAT-ACTTG-ATAAATATGAAG----AGATTCATGACA
* * *** ** * *** * ** *
18091460 -TGCAATGGCAT-TAGCACAACCTCCACCTAGGCCGA-ATC-T-TAACTCATCCTCATGCCTCAT
399 TTG-AATGG-ATGTGGGA-ATGGT--ATGTTGTTGGATAGCATGT-A-T-ATGATGATG--T--T
* * * *** * * ** ** * ***
18091520 CACCACAACATCAAACACCAACCA-AGAA-TG--ATGCATCCAT-GGTCAA-GTG-CCAATTCCA
452 --GCA-AA-TTTAAA-ATGTA-TAGAGAATTGTTATTCA-AAATAACT-AATGTGTGC-ATAAAA
* * *
18091578 TCACATAG
508 TTAAAGAG
* * * ** * ** * **
18091586 ---CAAGAT-TTA-GACCATGGGCTAGGTAGAACTCAAGCTAACAA-CTAA-AACAT-GCAT-GC
1 TTTGAA-ATGATACGA-AATGGG-TA-AAAGAAC-C-TG-TATGAATTTAACAA-ATGGTTTAG-
*** * * **** *** * ** * *
18091642 AT-CTCATGGAACA-TCATCAAACATACCTTAGCCTAGCTACATGCATGGCCGAATC-T-CTT-C
57 ATAAGAATGGAA-AGTGATTATGGTTA---TA-AAAAG-GA-A-AAATGG--GAATCGTGATTAG
** * ** *** ** * *** *
18091702 ACCTTTCTTC--TTCTT-TCCT-CATTA-AAATTTTTGGCCAAGGAT-GA-A-C-CAAAGGATGA
112 AGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAA-TTATGG---ATTCTCGACAGCTC-GA-G-TGA
* * * ** * * * ** ** *
18091758 GAAAATTTTTTCTTTGTTTTTCTTTCTAATTTAGGCTAAATGAAGGTGA-GAAAAGGATGAAC-A
170 G--CA--GTATC---G--GATC---ATAATATA-GC--AAT-CA-GTGATGATTA-G-T-CCCTG
** ** * ***** * * *
18091821 AAGATCTTCTCCTCTCTTTTC-TTTAGCTCACGGCAATGGGGGGGAAAGAA-TCAACTACACACT
215 AA-A-CTT-T-CT-AGTTGCCATTT--CT-A-GGTAA--GTTCATATAGAAGT-TACT--GCA-T
* * * * * ** ** * * ** *** * * *
18091884 TTT-TTTTTGTATTCATCATACTCCTTTT-CAT-TAT-TT-AATTTCCATGCCTAT-TATTTTAT
265 TTTCGTGTTATATT-TTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAAT
** ** * * * *
18091943 ---TTTTT-TCCACCCAT-GATGCACCAA-C-AAAACATGTCTATGACATGTCTTGGCCATCAAA
329 GGCTTTTTATATA-AAATGGAT-CA--AATCGTAAA-A----TAAGAAAT-ACTT-G--AT-AAA
*** * * * * *** * * * *
18092001 CT-TGGTCTACCATGCTTGTCA-TGGCCGGCCACTACTAGTAGGG--GGGAAT-TTGACATGCA-
380 -TAT-GAAGA-GATTCATGACATTGAATGG-----A-T-GT-GGGAATGGTATGTTG--TTGGAT
* * * * ** ** **
18092060 AGTCCCCCCTTTGTCCACATGCACTAATAGGTCCT-CACACATTGACCTATCACATTTTAGAATT
432 AG------C-ATGT--ATATG-A-TGAT--GT--TGCA-A-ATTTA-AAAT-GTA-TAGAGAATT
* * * ** * * *
18092124 -TT-CTC-ACATAAGTCCTAT-TG-ACT-AAATT-CACA-
477 GTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCA-TAAAATTAAAGAG
* * * * * * * * *
18092156 --TGAAATCA-ACCAAAT---T-GAAG--CTTG-A--AATTTTCACACAT--TCATA-ATTACAT
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAA-TTTAACAAATGGT-TTAGATAAGA-
*** ** * * * * *** * * * * * ** **
18092206 AT-TCTAGACAATA-AG-TATCACATTCAAACATTTCGGTGACTCG-GTTTAGCGGTCCCGAAAC
63 ATGGAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAA-A-AT-GG-GAATCGTGATTAGAGAT--TTATTC
* *** * ** * * * * ** *** * **
18092267 CACT--TCCCGA-CTAGGGTCAACTT-TGGGATGTCACAGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAAT
122 GA-TGGTTGAGATCCA-GCACAAATTAT-GGAT-TCTC-GA-CA-GCT-CGAGTGA-G-CAGTAT
* * * * * * * * * ** * *
18092328 GGGAATCGTGAT-TAG-AGATTTATTCGATGGTT-GTGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGAC
177 CGG-ATCATAATATAGCA-A-TCAGT-GATGATTAGT--CCCTG-A-AACTT-TCTAGT-T-GCC
** * ** * * * **
18092390 AGCTCGA-GTGAGCAGTATCGGATCATAA--TA-TAGCA--ATC-TGTTATGATTAGTCCTTGAA
231 ATTTCTAGGT-A--AGT-TCATAT-AGAAGTTACT-GCATTTTCGTGTTAT-ATT-TTAATTG--
** * * * * * * *
18092448 ACTTTCTAGCTGCCAT-TTTCTCGGTAAGT-TCATATGGAAGTT-TTGCATTT--TCG-TATTAT
286 TGTTT-T---TG-TATATATAT---TAAATAT-ATAT--AA-TTGTAG-ATTTAATGGCT-TTTT
* * * ** * * ** * * * * *
18092507 ATTTTAATTGTG-T--TTTTGTATATATATTAAATA-TAGAT-AAT-TGTAGA-TTTAATGGC-T
337 ATATAAAATG-GATCAAATCGTA-AAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACAT
** * * ** * * ** * * * *
18092564 T---TTTATAT-GAAATGGATCAAATCG-TGAAATAAG-AAATATTTGATAAAT-ATGAAGAGAT
400 TGAATGGATGTGGGAATGG-T-ATGTTGTTG-GAT-AGCATGTATATGAT-GATGTTGCA-A-AT
* * * * * *
18092622 TCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATTATA-TGATGATGTTGCAA
458 T--T-A-A---AATGTAT-AGAGAA---T-TGTTATT-CA-A--AATA-ACTAATG-TG-TGC--
18092686 ATTTAAAATGTATAGAGAATTG
502 A--TAAAAT-TA-A-AG-A--G
* * * * *** * * * *
18092708 TTATTCAAAAGA-AC-TAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGATACGAAATGG-GTA-
1 -T-TTGAAATGATACGAAATG-G-GTA-A-AA-GAACCTGTATGAATTTA-AC-AAATGGTTTAG
** * **
18092769 A-AAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGTGATTATGGTAATAAAA
57 ATAAGAA--TG---GAAAGTGA-TTATGG-TT--AT---AA---AA-------------------
* *
18092833 AGGAAAAAATGGGAATGGTGAGTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGAT
88 AGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCAGCACAAATTATGGAT
* *
18092898 TCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTTATGATTAGTCCCTGAA
152 TCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCAGTGATGATTAGTCCCTGAA
* * * * *
18092963 ACTTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAATTTCATATGGAAGTTTCTGCATTTTCGTATTATATTTT
217 ACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTACTGCATTTTCGTGTTATATTTT
*
18093028 AATTGTG-TTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATGAAAT
281 AATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGGCTTTTTATATAAAAT
* *
18093092 GGATCAAATCGTGAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGT
346 GGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATGACATTGAATGGATGT
* *
18093157 GAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCAT-TATATGATGATGTTGTAAATTTAAAATGTATAGAGAAT
411 GGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAAAATGTATAGAGAAT
* * * *
18093221 TGTTATTCAAAAGAACTAATGCGTGTATACAATTAAAGAG
476 TGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
*
18093261 TTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * *
18093326 GAATGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAAT-GGGATTAGAGATTT-TTCGATGGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
*
18093389 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGAATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * * *
18093454 CTGTGATGATTAGTCTCTGAAACTTTCTAGTT-CCAGTTTCTTGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
* *
18093518 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTCTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATT-TAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
18093582 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
*
18093647 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* * *
18093712 AATTTAAAATGTATATAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18093773 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * *
18093838 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATGGTGAGTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
18093903 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * * * *
18093968 CTGTTATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAATTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
*
18094033 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTG-TTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
* *
18094097 TAATGGCTTTTTATAT-AAATGGATCAAATCGTGAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
* *
18094161 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCAT-TATATGATGATGTTGTA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* * * *
18094225 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAGAACTAATGCGTGTATACAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
*
18094286 TTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * *
18094351 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAATGGTGAGTAGAGATTTATTCGATGGTTG
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
18094416 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAA
130 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAA
* * * * * *
18094481 TCTGTTATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAATTTCATATGGAAGTTT
195 TCAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTA
* * *
18094546 CTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGGTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGAG
259 CTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGAT
* * *
18094611 TTAATGGCTTTTTATATGAAATGGATCAAATCGTGAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAG
324 TTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAG
*
18094676 ATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCAT-TATATGATGATGTTGC
389 ATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGC
* * *
18094740 AAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAGAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
454 AAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18094802 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * *
18094867 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATGGTGAGTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
18094932 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * * * *
18094997 CTGTTATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAATTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
* *
18095062 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGGTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
* * *
18095127 TAATGGCTTTTTATATGAAATGGATCAAATCGTGAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
* *
18095192 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCAT-TATATGATGATGTTGTA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* * * *
18095256 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAGAACTAATGCGTGTATACAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
*
18095317 TTTGAAATGATACGAAATCGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * *
18095382 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAATGGGGATTAGAGATTT-TTCGATGGTTG
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
* *
18095446 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGCGAGCAGTATCGAATCATAATATAGCAA
130 AGATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAA
* * * * * *
18095511 TCTGTGATGATTAGTCTCTGAAACTTTCTAGTTTCCAGTTTCTTGGTAAGTTCATATGGAAGTTT
195 TCAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTA
*
18095576 CTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATT-TAGAT
259 CTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGAT
18095640 TTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAG
324 TTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAG
* *
18095705 ATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGACGATGTTGC
389 ATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGC
* *
18095770 AAATTTAAAATGTATATAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATAAAATTAAAGAG
454 AAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
* * *
18095832 TTTGATATGATACGAAATGGGTAAAAGAACGTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAGGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* *
18095897 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAAAT-GTGATTCGAGATTTATTCGATGGTT
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGG-AAAAATGGG-AATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTT
* * ** * * *
18095961 GAGATGCGGCACAAAAAAATGGATTCTCGATAGCTCGACTGAGCAGTATCGGATCATTATATAGC
129 GAGATCCAGCAC-AAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGC
* * * * *
18096026 AATCTGTGATGATTTGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTAGGTAAGTTCGTATGGAATT
193 AATCAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGT
* *
18096091 TTCTGCATTTTCGT-TTATATTTTAATTCTG-TTTT-TATATATATT-AA-ATATATAATTGTAG
257 TACTGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAG
*
18096151 ATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAG
322 ATTTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAG
*
18096216 AGATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTT
387 AGATTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTT
* * *
18096281 GCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCACAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
452 GCAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18096345 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATG-ATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * * *
18096409 GAAAGTGATTACGGTAATAAAAGGGAAAAATCGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
* * *
18096474 GATCTAGCACAAATTATGGATTCTAGACAGCTCGAGTGAGCAGTACCGGATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * *
18096539 CTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCGAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
* * *
18096604 TACATTTTCATATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
* *
18096669 TAATGGCTTTTTATACAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
*
18096734 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* * *
18096799 AATTTAAAATATATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAA-TAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
*
18096859 TTTGAAATGATATGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
* * *
18096924 G-AAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTT-TTCGATAGTTCA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
18096987 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATC-GATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * *
18097051 CTGTGATGATT-GTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
*
18097115 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATT-AA-ATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
* * *
18097178 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATTAGATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
* *
18097243 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGACTGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* * *
18097308 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCACAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18097369 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
*
18097434 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
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131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * *
18097560 CTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCT
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTACT
*
18097625 GCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTG-TTTTGTATATATATT-AATATATATAATTGTAGATTT
261 GCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTT
18097688 AATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGAT
326 AATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGAT
*
18097752 TCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAA
391 TCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAA
* *
18097817 ATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTC-AAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
456 ATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18097876 TTTGAAATGATACGAAAT-GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
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66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
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131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * * *
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* * *
18098133 TACATTTTCATATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
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*
18098260 TTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
*
18098325 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTAT-AAATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
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1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
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131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* *
18098572 CTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTT-CCATTTTCTA-GTAAGTTCATATGGAAGTTAC
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTAC
*
18098635 TGCATTTTCGTATTATATTTTAA-TGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGT-GATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
18098698 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAA-AGA
325 TAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGA
18098762 TTCATGACATTGAAT-GATGT-GGAATGGTATGTT-TTGGATAGCATGT-TATGATGATGTTGCA
390 TTCATGACATTGAATGGATGTGGGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCA
* *
18098823 AATTTAAAATGTATAGAGAATT-TTATTC-AAATAACTAATGTGTGTAT-ACATTAAAGAG
455 AATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18098881 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
*
18098946 GAAAGTGATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
18099011 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
131 GATCCAGCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAAT
* * *
18099076 CTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTC
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* *
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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* * * *
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*
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* * *
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* * *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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*
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* *
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*
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1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
*
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*
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* * * *
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*
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*
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*
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* * *
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*
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*
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*
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* * *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* * * *
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*
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*
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*
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* *
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*
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* * * *
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* * *
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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* * *
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*
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*
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*
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* * *
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*
18104221 TGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
260 TGCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATT
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*
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* *
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*
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* * * *
18104671 CTGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCT
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*
18104736 GCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTT
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*
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* *
18104929 ATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
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*
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* * * *
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196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTACT
*
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261 GCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTT
18105310 AATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGAT
326 AATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGAT
*
18105374 TCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAA
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* *
18105439 ATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAG
456 ATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGCATAAAATTAAAGAG
18105499 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
1 TTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATG
18105564 GAAAGTGATTATGG-TATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTT-TTCGATGGTT-A
66 GAAAGTGATTATGGTTATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGA
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* * *
18105691 CTGTGATGATT-GTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCT-GGTAAGTTCATATGGAAGTTTCT
196 CAGTGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTCTAGGTAAGTTCATATAGAAGTTACT
*
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261 GCATTTTCGTGTTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTT
18105817 AATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGAT
326 AATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGAT
*
18105881 TCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAA
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* *
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*
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*
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* *
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* * * *
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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*
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* * *
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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* *
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Consensus pattern (515 bp):
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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* *
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*
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*
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* * *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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* * *
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* *
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455 CAAATTTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATA-AATTAAAGA
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1 GTTTGAAATGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAAT
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*
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*
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* * * * * *
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18079603 TTTAA
325 TTTAA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Alignment explanation
Indices: 18079614--18081230 Score: 2673
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*
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* * *
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* *
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* * *
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* * *
18079938 TTAAGGGCTTTTTATACAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATGTGAAGAG
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*
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*
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*
18080193 GGAAAGTGATTATGGTTATTAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTG
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*
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*
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*
18080387 TTGCATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATT--ATATATATAATTGTAGAT
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*
18080450 TTAATGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGGTAAATATGAAGAG
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*
18080515 ATTCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTAAGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGC
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* * * *
18080641 GTTTGAAATTATACGAAAT-GATAAAAGAA-CTGTCTGAATTTAACAGATGGTTTAGATAAGAAT
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* *
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* * *
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* * * *
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*
18080898 CTGCATTTTCGTATTATATTTTAATCGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGAT
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* * *
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* *
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*
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* *
18081152 GTTTGAAATGATGCGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGGTAAGAAT
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Statistics
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TCATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAA
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*
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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*
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* * *
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** * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * *
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*
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* * *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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195 TTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATG
* *
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260 GCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGATTCAT
*
18093141 GACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCAT-TATATGATGATGTTGTAAATTT
324 GACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTT
* *
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* *
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*
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*
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* * *
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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*
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* *
18094231 AAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAGAACTAATGCGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGA
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*
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* *
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1 GATTATGGTAATAAAAAGG-AAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCC
*
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* *
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* *
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* *
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324 GACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTT
*
18094746 AAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAAGAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATG
389 AAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATG
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* * *
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* *
18095903 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAAATGGGAAAT-GTGATTCGAGATTTATTCGATGGTTGAGATG
1 GATTATGGTAATAAAAAGG-AAAAATGGG-AATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATC
* ** * * *
18095967 CGGCACAAAAAAATGGATTCTCGATAGCTCGACTGAGCAGTATCGGATCATTATATAGCAATCTG
64 CAGCAC-AAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTG
* * * *
18096032 TGATGATTTGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTAGGTAAGTTCGTATGGAATTTTCTGC
128 TGATGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGC
*
18096097 ATTTTCGT-TTATATTTTAATTCTG-TTTT-TATATATATT-AA-ATATATAATTGTAGATTTAA
193 ATTTTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAA
18096157 TGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTC
258 TGGCTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGATTC
18096222 ATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAAT
322 ATGACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAAT
*
18096287 TTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCACAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAA
387 TTAAAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAA
18096352 TGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATG-ATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
452 TGATACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
* * * *
18096415 GATTACGGTAATAAAAGGGAAAAATCGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCTA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
* *
18096480 GCACAAATTATGGATTCTAGACAGCTCGAGTGAGCAGTACCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
66 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
* *
18096545 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCGAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTACATT
131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
*
18096610 TTCATATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
*
18096675 CTTTTTATACAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATG
261 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGATTCATG
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325 ACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTA
*
18096805 AAATATATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAA-TAAAGAGTTTGAAATGA
390 AAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGA
*
18096869 TATGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGG-AAGT
455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
* *
18096929 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTT-TTCGATAGTTCAGATCCA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
18096993 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATC-GATCATAATATAGCAATCTGTGA
66 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
* *
18097057 TGATT-GTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCAGTTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
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196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
* *
18097184 CTTTTTATATAAAATGGATTAGATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATG
261 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGATTCATG
*
18097249 ACATTGAATGGATGTGAGACTGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTA
325 ACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTA
*
18097314 AAATGTATAGAGAATTGTTATTCACAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGA
390 AAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGA
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455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
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1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
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196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
18097693 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTGATAAATATGAAGAGATTCATGA
261 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTGATAAATATGAAGAGATTCATGA
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326 CATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAA
18097823 AATGTATAGAGAATTGTTATTC-AAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGAT
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18097887 ACGAAAT-GGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
456 ACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
*
18097946 GATTATGGTTAT-AAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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66 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
* *
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131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
*
18098139 TTCATATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
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261 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTGATAAATATGAAGAGATTCATGA
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326 CATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAA
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391 AATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGAT
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*
18098454 GATTATGGTTATAAAAAGG-AAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTT-TT-GATGGTTGAGAT-CA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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*
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131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
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196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
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455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
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1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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66 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
*
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196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
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*
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* *
18099465 GATTATGGTTATAAAAAGGAGAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTT-TTCGATGGTTGAGAT-CA
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*
18099591 TGATTAGTCCC-GAAACTTTCTAGTT-CCATTTTCTA-GTAAGTTCATATGGAAGTTACTGCATT
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196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
*
18099718 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCATAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATG
261 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGATTCATG
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325 ACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTA
* *
18099845 AAATGTATAGAGAATT-TTATTCACAATAACTAATGTGTGTATACAGTTAAAGAGTTTGAAATGA
390 AAATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGA
18099909 T-CGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
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1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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66 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
*
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131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
*
18100163 TTCATATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
*
18100228 CTTTTTATACAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATACTTGATAAATATGAAGAGATTCATG
261 CTTTTTATATAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATA-TTGATAAATATGAAGAGATTCATG
*
18100293 ACATTGAATGGATGTGAGAATGGTAAGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTA
325 ACATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTA
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455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
*
18100480 GATTATGGTTATAAAAAGG-AAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTT-TTCGATGGTTGAGAT-CA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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*
18100605 TGATTAGTCCC-GAAACTTTCTAGTT-CCATTTTCTA-GTAAGTTCATATGGAAGTTACTGCATT
131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
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196 TTCGTATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
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*
18100916 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGA-AATAATGGAAAGT
455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
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*
18101040 GCACAAA-TATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGTAGTATCGGATCATAATATAGCAATCTGTGA
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*
18101104 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTT-TGCATT
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*
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326 CATTGAATGGATGTGAGAATGGTATGTTGTTGGATAGCATGTATATGATGATGTTGCAAATTTAA
*
18101362 AAT-TATACAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAA-TAAAGAGTTTGAAATGAT
391 AATGTATAGAGAATTGTTATTCAAAATAACTAATGTGTGTATACAATTAAAGAGTTTGAAATGAT
*
18101425 ATGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAA-AAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
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*
18101549 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATCGAATCATAATATAGCAATCTGTGA
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*
18101614 TGATT-GTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAG-TTCTGCATT
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*
18101741 CTTTTTATACAAAATGGATCAAATCGTAAAATAAGAAATATTTGATAAATATGAAGAGATTCATG
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455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
18101996 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
18102061 GCACAAATTATGGATTCTCGACAGCTCGAGTGAGCAGTATC-GATCATAATATAGCAATCTGTGA
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*
18102125 TGATT-GTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCA-TTTCTCGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
131 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCTAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTGCATT
18102188 TTCGTATT-TATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATT-AA-ATATATAATTGTAGATTTAATGG
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455 TACGAAATGGGTAAAAGAACCTGTATGAATTTAACAAATGGTTTAGATAAGAATGGAAAGT
18102505 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
1 GATTATGGTAATAAAAAGGAAAAATGGGAATCGTGATTAGAGATTTATTCGATGGTTGAGATCCA
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* *
18102635 TGATTAGTCCCTGAAACTTTCGAGTTGCCATTTTCTAGGTAAGTTCATATGGAAGTTTCTACATT
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*
18102700 TTCATATTATATTTTAATTGTGTTTTTGTATATATATTAAATATATATAATTGTAGATTTAATGG
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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* *
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* * ** *
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* **
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* *
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* *
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** *
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1 ATAATATTAAATGAATAATT
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*
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* *
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*
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*
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*
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* * * ** * * * * * *
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*
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*
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* *
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131 ATTTGTTACTTGATAACAACATGTCTAAAATAGACATTTTATTTCTCAAAAATACTTTTTGACAA
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* *
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*
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1 AAAAAAGAACAG
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1 AAA
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AAAAAAGAACAG
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* *
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* * ** *
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* * *
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* *
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* *
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GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATGTG
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* * * *
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* * ** *
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*
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* *
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* ** * *
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*
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18180903 GATTAAATTG
* * * * *
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* * * ** *
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* **
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* *
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18188501 AAATTGTACA
* *
18188511 GCACTAAGGGTGCGATTTGACTATGTT
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* ** *
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1 GCACTAAGTGTGCGATTTGACTATG-TG
* * *
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* *
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* *
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* * * *
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*
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18188688 GGCTCAATAT
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18188501 AAATTGTACA
* * * *
18188511 GCACTAAGGGTGCGATTTGACTATGTTGCACTCAGTGTGCGAAATGAATATGAT-GCACTAAGTG
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* ** *
18188592 GCACTAAGTGTGCGAGTCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACGTGGCACTAAGTG
1 GCACTAAGGGTGCGA-TCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTGGCACTAAGTG
*
18188657 TGCGAGTTGA
65 TGCGAATTGA
18188667 TTATATAGCA
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 9, Indels: 3
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GCACTAAGGGTGCGATCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGTGGCACTAAGTGT
GCGAATTGACCATGCG
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18188497 GATTAAATTG
* * * * *
18188507 TACAGCACTAAGGGTGCGATTTGACTATGTTGCACTCAGTGTGCGAAATGAATATGATGCACTAA
1 TACAGCACTAAGTGTGCGATCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGATGCACTAA
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66 GTGTGCGAATTGACCA
* * ** *
18188588 TGCGGCACTAAGTGTGCGAGTCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGATTTGATTACG-TGGCACT
1 TACAGCACTAAGTGTGCGA-TCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGAT-GCACT
* **
18188652 AAGTGTGCGAGTTGATTA
64 AAGTGTGCGAATTGACCA
* *
18188670 TATAGCACTGAGTGTGCG
1 TACAGCACTAAGTGTGCG
18188688 GGCTCAATAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TACAGCACTAAGTGTGCGATCTGACTATGTAGCACTAAGTGTGCGAAATGAATACGATGCACTAA
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18205977 CTTAACATGT
*
18205987 TTAATTTTAA
1 TTAATTTTGA
18205997 TTAATTTTGA
1 TTAATTTTGA
18206007 TTAATTTTGA
1 TTAATTTTGA
18206017 TT-ATTTT
1 TTAATTTT
18206024 CGACAGATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
9 5 0.19
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TTAATTTTGA
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18210419 CTTTAAAATA
* * *
18210429 GGTAAAATAATCGTAATGCCCATGTAG
1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
* *
18210456 GGTAAAATGACCGTAATACCCCCGTAG
1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
* * *
18210483 GGTAAAATGACCATAATGCCCCCGTAA
1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
* **
18210510 GGTAAAATAACCGTAATGCCCCAATAG
1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
* * * *
18210537 GGTAAAATGACCGTAATACTCTTATAG
1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
* * *
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1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
*
18210591 GGTAAAATGACCGTAATGCCCTTGTAG
1 GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
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18210638 TTGGTGGGTA
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GGTAAAATGACCGTAATGCCCCTGTAG
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18210418 ACTTTAAAAT
* *
18210428 AGGTAAAATAATCGTAATG-CCCATGTAGGGTAAAATGACCGTAATACCCCCGTAGGGTAAAATG
1 AGGTAAAATAACCGTAATGCCCCA-GTAGGGTAAAATGACCGTAATACCCCCATAGGGTAAAATG
*
18210492 ACCATAATGCCCCCGTA
65 ACCATAATGCCCCCATA
* * ** *
18210509 AGGTAAAATAACCGTAATGCCCCAATAGGGTAAAATGACCGTAATACTCTTATAGGGTAAAATGG
1 AGGTAAAATAACCGTAATGCCCCAGTAGGGTAAAATGACCGTAATACCCCCATAGGGTAAAATGA
* *
18210574 CCGTAATGCCCCTATA
66 CCATAATGCCCCCATA
* **
18210590 AGGTAAAATGACCGTAATGCCCTTGTAGGGTAAAATGACCGTAAT
1 AGGTAAAATAACCGTAATGCCCCAGTAGGGTAAAATGACCGTAAT
18210635 GCCTTGGTGG
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 14, Indels: 2
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
81 107 0.96
82 4 0.04
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AGGTAAAATAACCGTAATGCCCCAGTAGGGTAAAATGACCGTAATACCCCCATAGGGTAAAATGA
CCATAATGCCCCCATA
Found at i:18210753 original size:24 final size:24
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18210688 TCTATGGTTA
18210698 AATGACTGATTTGTCTGTGTTTGG
1 AATGACTGATTTGTCTGTGTTTGG
* *
18210722 GATAACTGATTTGTCTGTGATTT-G
1 AATGACTGATTTGTCTGTG-TTTGG
18210746 AATGACTGATTT
1 AATGACTGATTT
18210758 TGAGTATGGC
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 4, Indels: 2
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
24 28 0.90
25 3 0.10
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Found at i:18210868 original size:27 final size:27
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Indices: 18210825--18210890 Score: 73
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18210815 GGAAGTATTG
* *
18210825 TACTGGTGGCTCT-GCCACA-ATCACTGT
1 TACTGGTAGCT-TGGCCACATAT-ACTAT
*
18210852 TATTGGTAGCTTGGCCACATATACTAT
1 TACTGGTAGCTTGGCCACATATACTAT
18210879 TACTGGTAGCTT
1 TACTGGTAGCTT
18210891 TGTTGCGATA
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 4, Indels: 4
0.80 0.10 0.10
Matches are distributed among these distances:
26 1 0.03
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TACTGGTAGCTTGGCCACATATACTAT
Found at i:18210910 original size:26 final size:26
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Indices: 18210872--18210925 Score: 90
Period size: 26 Copynumber: 2.1 Consensus size: 26
18210862 TTGGCCACAT
*
18210872 ATACTATTACTGGTAGCTTTGTTGCG
1 ATACTATTACTGGTAGCTTTGTTACG
*
18210898 ATACTATTGCTGGTAGCTTTGTTACG
1 ATACTATTACTGGTAGCTTTGTTACG
18210924 AT
1 AT
18210926 GCTACTGATG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
26 26 1.00
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ATACTATTACTGGTAGCTTTGTTACG
Found at i:18210969 original size:32 final size:32
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Indices: 18210928--18211206 Score: 235
Period size: 32 Copynumber: 8.7 Consensus size: 32
18210918 GTTACGATGC
**
18210928 TACTGATGGCTTTGTGCAAATCATAGT-ACCGT
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATA-TCACCGT
*
18210960 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATTACCGT
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATCACCGT
* * * **
18210992 TA-TCAATGG-TTGTGTGCTGATCATTTCACTAT
1 TACT-GATGGCTT-TGTGCCGATCATATCACCGT
* * * *
18211024 TATTGAT-GATTGTGTGCCGATCATATCACTGC
1 TACTGATGGCTT-TGTGCCGATCATATCACCGT
* * *
18211056 TACTGATGACTTTGTGCCGATCATGTTACCGT
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATCACCGT
* ***
18211088 TACTGATGGCTATGTGCCGATCATATCACTAC
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATCACCGT
* * * *
18211120 TACTGATAGCTTTGTGCCAATCATGTTACCGT
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATCACCGT
* * *
18211152 TACTGATGGCTGTGTGCC-AGTCATATCACTGC
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGA-TCATATCACCGT
*
18211184 TACTGATGGCTTTGTGCCAATCA
1 TACTGATGGCTTTGTGCCGATCA
18211207 CATTACTGTA
Statistics
Matches: 197, Mismatches: 42, Indels: 16
0.77 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
31 6 0.03
32 187 0.95
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Consensus pattern (32 bp):
TACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATCACCGT
Found at i:18211072 original size:64 final size:64
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Indices: 18210925--18211206 Score: 288
Period size: 64 Copynumber: 4.4 Consensus size: 64
18210915 TTTGTTACGA
* ** * *
18210925 TGCTACTGATGGCTTTGTGCAAATCATAG-TACCGTTACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATTAC
1 TGCTACTGATGACTTTGTGCCGATCAT-GTTACCGTTACTGATGGCTGTGTGCCGATCATATCAC
* * * * * ** * **
18210989 CGTTA-TCAATG-GTTGTGTGCTGATCAT-TTCACTATTATTGATGATTGTGTGCCGATCATATC
1 TGCTACT-GATGACTT-TGTGCCGATCATGTT-ACCGTTACTGATGGCTGTGTGCCGATCATATC
18211051 AC
63 AC
*
18211053 TGCTACTGATGACTTTGTGCCGATCATGTTACCGTTACTGATGGCTATGTGCCGATCATATCAC
1 TGCTACTGATGACTTTGTGCCGATCATGTTACCGTTACTGATGGCTGTGTGCCGATCATATCAC
* *
18211117 TACTACTGAT-AGCTTTGTGCCAATCATGTTACCGTTACTGATGGCTGTGTGCC-AGTCATATCA
1 TGCTACTGATGA-CTTTGTGCCGATCATGTTACCGTTACTGATGGCTGTGTGCCGA-TCATATCA
18211180 C
64 C
* *
18211181 TGCTACTGATGGCTTTGTGCCAATCA
1 TGCTACTGATGACTTTGTGCCGATCA
18211207 CATTACTGTA
Statistics
Matches: 179, Mismatches: 29, Indels: 20
0.79 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
63 6 0.03
64 168 0.94
65 5 0.03
ACGTcount: A:0.21, C:0.21, G:0.21, T:0.36
Consensus pattern (64 bp):
TGCTACTGATGACTTTGTGCCGATCATGTTACCGTTACTGATGGCTGTGTGCCGATCATATCAC
Found at i:18211136 original size:96 final size:94
Alignment explanation
Indices: 18210927--18211206 Score: 285
Period size: 96 Copynumber: 2.9 Consensus size: 94
18210917 TGTTACGATG
*
18210927 CTACTGATGGCTTTGTGCAAATCATAGTACCGTTACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATTACCGT
1 CTACTGAT-GCTTTGTGCCAATCATA-TACCGTTACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATTACCGT
* * * * *
18210992 TA-TCAATGGTTGTGTGCTGATCATTTCACTA
64 TACT-GATGGCTATGTGCCGATCATATCACTA
* * * * * * * *
18211023 TTATTGATGATTGTGTGCCGATCATATCACTGCTACTGATGACTTTGTGCCGATCATGTTACCGT
1 CTACTGATGCTT-TGTGCCAATCATAT-ACCGTTACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATTACCGT
18211088 TACTGATGGCTATGTGCCGATCATATCACTA
64 TACTGATGGCTATGTGCCGATCATATCACTA
* * * *
18211119 CTACTGATAGCTTTGTGCCAATCATGTTACCGTTACTGATGGCTGTGTGCC-AGTCATATCACTG
1 CTACTGAT-GCTTTGTGCCAATCAT-ATACCGTTACTGATGGCTTTGTGCCGA-TCATATTACCG
* * *
18211183 CTACTGATGGCTTTGTGCCAATCA
63 TTACTGATGGCTATGTGCCGATCA
18211207 CATTACTGTA
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Consensus pattern (94 bp):
CTACTGATGCTTTGTGCCAATCATATACCGTTACTGATGGCTTTGTGCCGATCATATTACCGTTA
CTGATGGCTATGTGCCGATCATATCACTA
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18227556 TATTGCATCT
*
18227566 CCCTTAACTCTTATATTCACAA
1 CCCTTAACTCTTATAATCACAA
*
18227588 CCCTTAACTCTCTA-AATCACCA
1 CCCTTAACTCT-TATAATCACAA
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1 CCCT
18227614 AAACACCTTT
Statistics
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CCCTTAACTCTTATAATCACAA
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18237304 CTCAACAATG
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1 ACAATA-CTAAAA-ATTAA
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1 ACAATACTAAAAATTA
18237349 TGACATGGGT
Statistics
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ACAATACTAAAAATTAA
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18237549 TTTTAAAGCC
18237559 TTA TCTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA
1 TTA T-TA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA
18237605 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA T
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA T
18237630 ACATACATTA
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TTA
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18238780 CGAATATGTG
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1 ACTGCTTATGAGCT
18238804 ACTGCTTATGAGCT
1 ACTGCTTATGAGCT
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1 ACT
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ACTGCTTATGAGCT
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18257522 TTTCTCATCC
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1 CAATTTTACCACGAGTAAAATTTTAA
* *
18257558 CAATTTTACCCCTAGTAAAATTTT
1 CAATTTTACCACGAGTAAAATTTT
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CAATTTTACCACGAGTAAAATTTTAA
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Indices: 18275495--18275526 Score: 64
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18275485 AGAAAAAGTG
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1 ATAGATTGGTGAATT
18275510 ATAGATTGGTGAATT
1 ATAGATTGGTGAATT
18275525 AT
1 AT
18275527 CCATTAAATG
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ATAGATTGGTGAATT
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Indices: 18288679--18288734 Score: 87
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18288669 ATACTGCTAT
*
18288679 TTC TTT TTC TTTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC
1 TTC TTC TTC -TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC TTC
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1 TTC TTC TTC TT
18288735 TGGTAAACAG
Statistics
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2 2 0.04
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Consensus pattern (3 bp):
TTC
Done.