Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold121 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 1176681

Tables:   1   2   3   4   

This is table  3  of  4  ( 464 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
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(0-2)
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1.99
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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(0-2)
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159
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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814861--814891
15
2.1
14
94
5
53
83
0
16
0
0.64
821038--821116
30
2.7
29
76
11
72
44
11
1
43
1.48
822103--822276
59
2.9
60
87
2
242
22
17
12
47
1.81
826656--826715
18
3.2
18
88
4
75
48
0
3
48
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
830091--830166
37
2.1
37
97
0
143
48
5
19
26
1.70
831947--832003
25
2.3
25
87
0
87
21
19
17
42
1.90
839078--839112
17
2.0
18
88
5
54
42
0
8
48
1.33
839408--839475
31
2.2
31
83
0
82
47
13
5
33
1.67
844391--844425
17
2.1
17
88
0
52
65
8
2
22
1.34
844407--844466
27
2.1
30
81
9
72
61
5
10
23
1.47
846808--846911
49
2.1
49
87
0
145
50
9
8
30
1.65
852736--852770
17
2.1
17
88
0
52
65
8
2
22
1.34
852752--852811
27
2.1
30
81
9
72
61
5
10
23
1.47
854358--854942
292
2.0
293
99
0
1163
35
13
14
36
1.85

Tables:   1   2   3   4