Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Chr10
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Pmatch=0.80,Pindel=0.10
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ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Warning! 2183483 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 73 of 145
Found at i:24188683 original size:9 final size:9
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Indices: 24188669--24188693 Score: 50
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24188659 TGCCCATAGT
24188669 TACTTCAGC
1 TACTTCAGC
24188678 TACTTCAGC
1 TACTTCAGC
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1 TACTTCA
24188694 AGTCTTAATC
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1.00 0.00 0.00
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9 16 1.00
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Consensus pattern (9 bp):
TACTTCAGC
Found at i:24188888 original size:248 final size:247
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Indices: 24188450--24188912 Score: 678
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24188440 ACCTTTAACT
* * * * * *
24188450 TTAATCTGTTCCACTATAATTCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACATCTTTAATCCGCTCCAC
1 TTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGACAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
* * * * *
24188515 TTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCCAGAGAGATAAGATTCGCTACTCCCTGCTTTATTCTGCTTC
66 TTCAGCTATTTCAAGTCATAACACCAGAGAAATAAGATTCGCTA-GCCCTGCTTTAATCTGCTCC
*
24188580 GTTGCTATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCATTCCACTATAATGCCAAA
130 GCTGCTATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCATTCCACTATAATGCCAAA
24188645 GAGATAGGATTCACTGCCCATAGTTACTTCAGCTACTTCAGCTACTTCAAGTC
195 GAGATAGGATTCACTGCCCATAGTTACTTCAGCTACTTCAGCTACTTCAAGTC
24188698 TTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGACAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
1 TTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGACAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
* * * * *
24188763 TTCGGCTATTTGAAGTCTTAACACTAGGGAAATAAGATTCGCT-GCCCTAAGCTTTAATCTGCTC
66 TTCAGCTATTTCAAGTCATAACACCAGAGAAATAAGATTCGCTAGCCCT--GCTTTAATCTGCTC
* ***
24188827 CGCTG-TGATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATGTGTTCCACTATAATGCCA
129 CGCTGCT-ATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCATTCCACTATAATGCCA
*
24188891 AAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
193 AAGAGATAGGATTCACTGCCCA
24188913 CAGCTTTAAT
Statistics
Matches: 190, Mismatches: 22, Indels: 6
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
246 4 0.02
247 1 0.01
248 185 0.97
ACGTcount: A:0.28, C:0.25, G:0.16, T:0.30
Consensus pattern (247 bp):
TTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGACAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
TTCAGCTATTTCAAGTCATAACACCAGAGAAATAAGATTCGCTAGCCCTGCTTTAATCTGCTCCG
CTGCTATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCATTCCACTATAATGCCAAAG
AGATAGGATTCACTGCCCATAGTTACTTCAGCTACTTCAGCTACTTCAAGTC
Found at i:24188987 original size:169 final size:169
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Indices: 24188698--24189602 Score: 1190
Period size: 169 Copynumber: 5.4 Consensus size: 169
24188688 ACTTCAAGTC
*
24188698 TTAATCTGA-TCCACTATAATGCCAAAGAGACAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCA
1 TTAATCT-ATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCA
* * * * * *
24188762 CTTCGGCTATTTGAAGTCTTAACACTAGGGAAATAAGATTCGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTC
65 CTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCAC
** *
24188827 CGCTGTGATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
130 CGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
* * * *
24188867 TTAATGTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCGC
1 TTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
* * *
24188932 TTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTGGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
66 TTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
* *
24188997 ACTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
131 GCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
* * * **
24189036 TTAATCTATTCCACTATAAAG--ATAAGAGATAGGATGCGCTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCA
1 TTAATCTATTCCACTATAATGCCA-AAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCA
* *
24189099 CTTCAGCTACTTCAAGTCTTAACGCTAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCAC
65 CTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCAC
* * * *
24189164 CGCTACAACACTAAGGAAACAATATTCGCTACCTTTAGCT
130 CGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
* * * *
24189204 TTAATCTATTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATGCTCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCAC
1 TTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
* * * * * * **
24189269 TTTAACTATTTCAAGTCTTAACGCTACGGAGACAAGATTCGCTGCCCACAGATTTAATCTGCTTC
66 TTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
* **
24189334 GCTGCAATGCTAGGGAAACACA-ATTCGCTACCTTTAAAT
131 GCTGCAATACTAGGGAAACA-AGATTCGCTACCTTTAGCT
* * **
24189373 TTAATCTATTCCACTATAAT-CCAAAGAGATAGGATTTGCTACCCACAGCTTTAATCTGCTCCAC
1 TTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
* * * * *
24189437 TTCGGTTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTTGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCCCC
66 TTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
* *
24189502 GCTGCAATACTAGGGAAAGAAGATTTGCTACCTTTAGCT
131 GCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
* * * ** *
24189541 TTGATATGTTCCACTATAATGATAAAGAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTC
1 TTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTC
24189603 TGCTGCAATG
Statistics
Matches: 638, Mismatches: 91, Indels: 14
0.86 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
167 2 0.00
168 290 0.45
169 344 0.54
170 2 0.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.25, G:0.17, T:0.29
Consensus pattern (169 bp):
TTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
TTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
GCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
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Period size: 337 Copynumber: 2.7 Consensus size: 336
24188688 ACTTCAAGTC
* * **
24188698 TTAATCTGA-TCCACTATAATGCCAAAGAGACAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCA
1 TTAATCT-ATTCCACTATAAT-ACAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCA
* * * * *
24188762 CTTCGGCTATTTGAAGTCTTAACACTAGGGAAATAAGATTCGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTC
64 CTTCGGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCAC
** * *
24188827 CGCTGTGATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATGTGTTCCACTATAATGCCAA
129 CGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAA
* * *
24188892 AGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCGCTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCC
194 AGAGATAGGA-TCTCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGCC
* * * *
24188957 AGGGAGACAAGATTGGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACCACTGCAACACTAGGGAAACA-AGAT
258 ACGGAGACAAGATTCGCTGCCCACAGATTTAATCTGCACCACTGCAACACTAGGGAAACACA-AT
**
24189021 TCGCTACCTTTAGCT
322 TCGCTACCTTTAAAT
* * *
24189036 TTAATCTATTCCACTATAA-AGATAAGAGATAGGATGCGCTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCAC
1 TTAATCTATTCCACTATAATACA-AAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCAC
* * *
24189100 TTCAGCTACTTCAAGTCTTAACGCTAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
65 TTCGGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACC
* * * * * * *
24189165 GCTACAACACTAAGGAAACAATATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAAAGCCAAA
130 GCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAA
* *
24189230 GAGATAGGATGCTCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCACTTTAACTATTTCAAGTCTTAACGCTA
195 GAGATAGGAT-CTCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGCCA
** * **
24189295 CGGAGACAAGATTCGCTGCCCACAGATTTAATCTGCTTCGCTGCAATGCTAGGGAAACACAATTC
259 CGGAGACAAGATTCGCTGCCCACAGATTTAATCTGCACCACTGCAACACTAGGGAAACACAATTC
24189360 GCTACCTTTAAAT
324 GCTACCTTTAAAT
* * *
24189373 TTAATCTATTCCACTATAATCCAAAGAGATAGGATTTGCTACCCACAGCTTTAATCTGCTCCACT
1 TTAATCTATTCCACTATAATACAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCACT
* * * *
24189438 TCGGTTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTTGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCCCCG
66 TCGGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACCG
* * * **
24189503 CTGCAATACTAGGGAAAGAAGATTTGCTACCTTTAGCTTTGATATGTTCCACTATAATGATAAAG
131 CTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAG
*
24189568 AGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACT
196 AGATAGGATCT-CTGCCCACAGCTTTAATCCACT
24189602 CTGCTGCAAT
Statistics
Matches: 493, Mismatches: 67, Indels: 13
0.86 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
336 3 0.01
337 471 0.96
338 19 0.04
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TTAATCTATTCCACTATAATACAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCACT
TCGGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCACCG
CTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAG
AGATAGGATCTCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGCCACG
GAGACAAGATTCGCTGCCCACAGATTTAATCTGCACCACTGCAACACTAGGGAAACACAATTCGC
TACCTTTAAAT
Found at i:24189641 original size:102 final size:102
Alignment explanation
Indices: 24189465--24189699 Score: 290
Period size: 102 Copynumber: 2.3 Consensus size: 102
24189455 TAACGCTAGG
* * ** * *
24189465 GAGATAAGATTTGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCCCCGCTGCAATACTAGGGAAAGAAGATTTGC
1 GAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACCCCGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGC
* * * *
24189530 TACCTTTAGCTTTGATATGTTCCACTATAATGATAAA
66 TACCTTTAGCATTAATATGTTCCACTATAAAGACAAA
* * *
24189567 GAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC
1 GAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACCCCGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGC
* * * *
24189632 TACCTTTAGCATTAATCTTTTCCCCTATAAAGCCAAA
66 TACCTTTAGCATTAATATGTTCCACTATAAAGACAAA
* * *
24189669 GAGATAGGCTTCGTTGCCCACAGCTTTAATC
1 GAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATC
24189700 TGCTCCACTT
Statistics
Matches: 113, Mismatches: 20, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
102 113 1.00
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Consensus pattern (102 bp):
GAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACCCCGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGC
TACCTTTAGCATTAATATGTTCCACTATAAAGACAAA
Found at i:24189857 original size:269 final size:270
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Indices: 24189304--24189865 Score: 774
Period size: 269 Copynumber: 2.1 Consensus size: 270
24189294 ACGGAGACAA
* * **
24189304 GATTCGCTGCCCACAGATTTAATCTGCTTCGCTGCAATGCTAGGGAAACACAATTCGCTACCTTT
1 GATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCGCTGCAATGCTAGGGAAACACAATTCGCTACCTTT
* *
24189369 AAATTTAATCTATTCCACTATAATCCAAAGAGATAGGATTTGCTACCCACAGCTTTAATCTGCTC
66 AAATTTAATCTATTCCACTATAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCTGCTC
* * * * *
24189434 CACTTCGGTTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTTGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGC
131 CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATATGC
* * * * ** * *
24189499 CCCGCTGCAATACTAGGGAAAGAAGATTTGCTACCTTTAGCTTTGATATGTTCCACTATAATGAT
196 CCCGCTGCAACACTAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGAC
*
24189564 AAAGAGATAG
261 AAAGACATAG
24189574 GATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCAC-TCTGCTGCAATGCTAGGGAAACA-AGATTCGCTACCT
1 GATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTC-GCTGCAATGCTAGGGAAACACA-ATTCGCTACCT
* * * * * *
24189637 TTAGCA-TTAATCTTTTCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCGTTGCCCACAGCTTTAATCT
64 TTA-AATTTAATCTATTCCACTAT-AAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCT
24189701 GCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTA-GGAGATAAGATTCG-TGCCCTCAGCTTTAAT
127 GCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAAT
* * *
24189764 ATGCTCCGCTGCAACGCTAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTTGCTTTAATATGTTCCACTATAA
192 ATGCCCCGCTGCAACACTAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAA
* *
24189829 TGCCGAAGACATAG
257 TGACAAAGACATAG
24189843 GATTTGCTGCCCACAGCTTTAAT
1 GATTTGCTGCCCACAGCTTTAAT
24189866 TAACTCCACT
Statistics
Matches: 257, Mismatches: 31, Indels: 9
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
269 106 0.41
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271 66 0.26
ACGTcount: A:0.28, C:0.24, G:0.17, T:0.31
Consensus pattern (270 bp):
GATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTTCGCTGCAATGCTAGGGAAACACAATTCGCTACCTTT
AAATTTAATCTATTCCACTATAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCTGCTC
CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATATGC
CCCGCTGCAACACTAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGAC
AAAGACATAG
Found at i:24190201 original size:51 final size:51
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Indices: 24190146--24190256 Score: 143
Period size: 51 Copynumber: 2.2 Consensus size: 51
24190136 CTACCTTGAG
** *
24190146 CTTTAATCTGTTCCACTATACA-GCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAA
1 CTTTAATCCATTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAA
* * * *
24190197 CTTTAATCCATTCCACTATAATGCCGAAGAGATAGGACTCACTTCCCATAG
1 CTTTAATCCATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAA
24190248 CTTTAATCC
1 CTTTAATCC
24190257 GCATCACTTC
Statistics
Matches: 52, Mismatches: 7, Indels: 2
0.85 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
50 1 0.02
51 51 0.98
ACGTcount: A:0.32, C:0.28, G:0.13, T:0.28
Consensus pattern (51 bp):
CTTTAATCCATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAA
Found at i:24190204 original size:169 final size:169
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Indices: 24189574--24190205 Score: 842
Period size: 169 Copynumber: 3.8 Consensus size: 169
24189564 AAAGAGATAG
* * * * *
24189574 GATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTG
* * * * * *
24189639 AGCATTAATCTTTTCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCGTTGCCCACAGCTTTAATCTGCT
66 AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24189704 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTA-GGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAA
* * * * * * *
24189742 GATTCG-TGCCCTCAGCTTTAATATGCTCCGCTGCAACGCTAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTG
* * * * * * ***
24189806 TGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCGAAGACATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATTAACT
66 AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24189871 CCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACG-TCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCT-AGGGAGACAA
* *
24189910 GATTAGCTGCCCTCTGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACC-TT
*
24189975 G-GCATTAATCTGTTCTACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
65 GAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
*
24190039 TCCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAA
* * * *
24190079 AATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTG
1 GATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTG
* * *
24190144 AGCTTTAATCTGTTCCACTATACA-GCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCC
66 AGCATTAATCTGTTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCC
24190206 ATTCCACTAT
Statistics
Matches: 403, Mismatches: 54, Indels: 13
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
166 1 0.00
167 127 0.32
168 20 0.05
169 251 0.62
170 4 0.01
ACGTcount: A:0.27, C:0.26, G:0.17, T:0.30
Consensus pattern (169 bp):
GATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTG
AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAA
Found at i:24190295 original size:220 final size:221
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Indices: 24189991--24190434 Score: 687
Period size: 220 Copynumber: 2.0 Consensus size: 221
24189981 AATCTGTTCT
* * *
24189991 ACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTT
1 ACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTC
* * ** * *
24190056 AAGTCTTAACGCTAGGGAGACAAAATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTA
66 AAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCAAGGCTA
24190121 GGGAAACAAGATTCGCTACC-TTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATACA-GCCAAAGAGATAGGAT
131 GGGAAACAAGATTCGCTACCTTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGAT
*
24190184 TCACTGCCCACAACTTTAATCCATTCC
195 TCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCC
* * *
24190211 ACTATAATGCCGAAGAGATAGGACTCACTTCCCATAGCTTTAATCCGCAT-CACTTCAGCTATTT
1 ACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGC-TCCACTTCAGCTATTT
* *
24190275 CAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCAAGGCT
65 CAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCAAGGCT
**
24190340 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAT
130 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAT
*
24190405 TCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCC
195 TCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCC
24190432 ACT
1 ACT
24190435 TCAGTTATTT
Statistics
Matches: 203, Mismatches: 18, Indels: 5
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
220 135 0.67
221 68 0.33
ACGTcount: A:0.28, C:0.27, G:0.16, T:0.28
Consensus pattern (221 bp):
ACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTC
AAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCAAGGCTA
GGGAAACAAGATTCGCTACCTTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATT
CACTGCCCACAACTTTAATCCACTCC
Found at i:24190303 original size:169 final size:168
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Period size: 169 Copynumber: 3.4 Consensus size: 168
24190118 CTAGGGAAAC
* * * * * * * * * *
24190128 AAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATACAGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCC
1 AAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTA-ACAGCCAAGGAGATAAGATTCGCTACCT
** * * * * *
24190193 ACAACTTTAATCCATTCCACTATAATGCCGAAGAGATAGGACTCACTTCCCATAGCTTTAATCCG
65 TTAGCTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCG
24190258 CAT-CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAT
130 C-TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAT
* * * * * * *
24190297 AAGATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCAA-GGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACC
1 AAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCT--AACAGCCAAGGAGATAAGATTCGCTACC
* * *
24190361 TTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATC
64 -TTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATC
* * * * *
24190426 CACTCCACTTCAGTTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACAT
128 CGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAT
* * * * *
24190467 AAGATTTGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACA--CTAGGGGATAAAAATTCGCTAC
1 AAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCT--AACAGCCAAGGAGAT-AAGATTCGCTAC
* *
24190530 CTTTAGCTTTAATCTATTCCACTGTAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATC
63 CTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATC
* *
24190595 CGCTCCACTTCATCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAC
128 CGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAT
* * * * * * *
24190636 AAGATTCGCTGCCCTCACCTTTAATCTGCACTGCTGCAACA-CTAGGGAAACAAGATTCGCTACC
1 AAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCT--AACAGCCAAGGAGATAAGATTCGCTACC
24190700 TTTAGCTTTAAT
64 TTTAGCTTTAAT
24190712 TGCTGCAATG
Statistics
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0.81 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
169 201 0.59
170 138 0.41
171 1 0.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.27, G:0.16, T:0.29
Consensus pattern (168 bp):
AAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTAACAGCCAAGGAGATAAGATTCGCTACCTT
TAGCTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGC
TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAT
Found at i:24190422 original size:170 final size:169
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Period size: 169 Copynumber: 3.0 Consensus size: 169
24190187 CTGCCCACAA
* * * *
24190197 CTTTAATCCATTCCACTATAATGCCGAAGAGATAGGACTCACTTCCCATAGCTTTAATCCGCAT-
1 CTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGC-TC
*
24190261 CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGC
65 CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGC
** *
24190326 TCCGCTGCAAGGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTTTG
130 TCCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACC-TTTAG
* * *
24190367 CTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCC
1 CTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCC
* * * * *
24190432 ACTTCAGTTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACATAAGATTTGCTGCCCT-AAGCTTTAATCTGC
66 ACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAA-CTTTAATCTGC
24190496 TCCGCTGCAACACTAGGGGATAA-AA-ATTCGCTACCTTTAG
130 TCCGCTGCAACACTA-GGGA-AACAAGATTCGCTACCTTTAG
* *
24190536 CTTTAATCTATTCCACTGTAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCC
1 CTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCC
* * * *
24190601 ACTTCATCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCACCTTTAATCTGCA
66 ACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCT
*
24190666 CTGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAG
131 CCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAG
24190705 CTTTAAT
1 CTTTAAT
24190712 TGCTGCAATG
Statistics
Matches: 307, Mismatches: 31, Indels: 15
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
167 2 0.01
168 6 0.02
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171 6 0.02
172 2 0.01
ACGTcount: A:0.28, C:0.27, G:0.16, T:0.29
Consensus pattern (169 bp):
CTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCC
ACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCT
CCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAG
Found at i:24190480 original size:559 final size:556
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Indices: 24189651--24190711 Score: 1549
Period size: 559 Copynumber: 1.9 Consensus size: 556
24189641 CATTAATCTT
* * *
24189651 TTCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCGTTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCACTTCAGCTA
1 TTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCCTTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTA
* * *
24189716 TTTCAAGTCTTAACGCTAGGAGATAAGATTCGTGCCCTCAGCTTTAATATGCTCCGCTGCAACGC
66 TTTCAAGTCTTAACGCCAGGAGATAAGATTCCTGCCCTCAACTTTAATATGCTCCGCTGCAACGC
*
24189781 TAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTTGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCGAAGACATAGGAT
131 TAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTTGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGACATAGGAT
** * * * *
24189846 TTGCTGCCCACAGCTTTAATTAACTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACGTCAGGGAGACAAG
196 TCACTGCCCACAGCTTTAATCAACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGTCAAGGACACAAG
** **
24189911 ATTAGCTGCCCTCTGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTA-GGGA-AACAAGATTCGCTACCTT
261 ATTAGCTGCCCTAAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAACACTAGGGGATAA-AA-ATTCGCTACCTT
* * * * * *
24189974 TGGCATTAATCTGTTCTACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
324 TAGCATTAATCTATTCCACTATAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * **
24190039 TCCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAAAATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
389 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCGCTGCCCTCACCTTTAATCT
* **
24190104 GCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATACAG
454 GCACTGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATACAG
24190169 CCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCA
519 CCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCA
* * *
24190207 TTCCACTATAATGCCGAAGAGATAGGAC-TCACTT-CCCATAGCTTTAATCCGCAT-CACTTCAG
1 TTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGG-CTTC-CTTGCCCACAGCTTTAATCCGC-TCCACTTCAG
*
24190269 CTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGC
63 CTATTTCAAGTCTTAACGCCA-GGAGATAAGATTC-CTGCCCTCAACTTTAATATGCTCCGCTGC
* * * * * *
24190334 AAGGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGA
126 AACGCTAGGAAAACAAAATCCGCTACC-TTTTGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGACA
* *
24190399 TAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGTTATTTCAAGTCTTAACG-CTAAGG
190 TAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCAACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGTC-AAGG
* * *
24190463 ACATAAGATTTGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGGATAAAAATTCGCT
254 ACACAAGATTAGCTGCCCTAAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAACACTAGGGGATAAAAATTCGCT
* *
24190528 ACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTGTAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAA
319 ACCTTTAGCATTAATCTATTCCACTATAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAA
* *
24190593 TCCGCTCCACTTCATCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCACCTTT
384 TCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCGCTGCCCTCACCTTT
*
24190658 AATCTGCACTGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAAT
449 AATCTGCACTGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAAT
24190712 TGCTGCAATG
Statistics
Matches: 446, Mismatches: 50, Indels: 15
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
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557 17 0.04
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559 302 0.68
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561 2 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.26, G:0.16, T:0.29
Consensus pattern (556 bp):
TTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCCTTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTA
TTTCAAGTCTTAACGCCAGGAGATAAGATTCCTGCCCTCAACTTTAATATGCTCCGCTGCAACGC
TAGGAAAACAAAATCCGCTACCTTTTGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGACATAGGAT
TCACTGCCCACAGCTTTAATCAACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGTCAAGGACACAAG
ATTAGCTGCCCTAAGCTTTAATCTACTCCGCTGCAACACTAGGGGATAAAAATTCGCTACCTTTA
GCATTAATCTATTCCACTATAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTC
CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCGCTGCCCTCACCTTTAATCTGC
ACTGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATACAGCC
AAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCA
Found at i:24190540 original size:390 final size:389
Alignment explanation
Indices: 24189818--24190595 Score: 1116
Period size: 390 Copynumber: 2.0 Consensus size: 389
24189808 CTTTAATATG
* ** * *
24189818 TTCCACTATAATGCCGAAGACATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATTAACTCCACTTTAGCTA
1 TTCCACTATAATGCCGAAGACATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCAACTCCACTTCAGCTA
* ** *
24189883 TTTCAAGTCTTAACGTCAGGGAGACAAGATTAGCTGCCCTCTGCTTTAATCTACTCCGCTGCAAT
66 TTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTAGCTGCCCTCAACTTTAATCTACTCCGCTGCAAG
*
24189948 GCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTGGCATTAATCTGTTCTACTATAATGCCAAAGAGATAGG
131 GCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTGGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGG
* * * * *
24190013 ATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGACA
196 ATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACACA
** * **
24190078 AAATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
261 AAATTCGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * *
24190143 GAGCTTTAATCTGTTCCACTATACA-GCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCA
326 GAGCTTTAATCTATTCCACTATA-ATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAACTTTAATCCA
* * * **
24190207 TTCCACTATAATGCCGAAGAGATAGGACTCACTTCCCATAGCTTTAATCCGCAT-CACTTCAGCT
1 TTCCACTATAATGCCGAAGACATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCAAC-TCCACTTCAGCT
* *
24190271 ATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCA-CTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCA
65 ATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATT-AGCTGCCCTCAACTTTAATCTACTCCGCTGCA
* *
24190335 AGGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGAT
129 AGGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACC-TTTGGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGAT
*
24190400 AGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGTTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGAC
193 AGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGAC
* * *
24190465 ATAAGATTTGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGGATAA-AA-ATTCGCT
258 ACAAAATTCGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTA-GGGA-AACAAGATTCGCT
* * *
24190528 ACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTGTAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAA
321 ACCTTGAGCTTTAATCTATTCCACTATAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAACTTTAA
24190593 TCC
386 TCC
24190596 GCTCCACTTC
Statistics
Matches: 344, Mismatches: 39, Indels: 11
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
389 135 0.39
390 201 0.58
391 6 0.02
392 2 0.01
ACGTcount: A:0.28, C:0.26, G:0.16, T:0.29
Consensus pattern (389 bp):
TTCCACTATAATGCCGAAGACATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCAACTCCACTTCAGCTA
TTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTAGCTGCCCTCAACTTTAATCTACTCCGCTGCAAG
GCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTGGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGG
ATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACACA
AAATTCGCTGCCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
GAGCTTTAATCTATTCCACTATAATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAACTTTAATCCA
Found at i:24190693 original size:390 final size:385
Alignment explanation
Indices: 24189899--24190789 Score: 959
Period size: 390 Copynumber: 2.3 Consensus size: 385
24189889 GTCTTAACGT
*
24189899 CAGGGAGACAAGATT-AGCTGCCCTCTGCTTTAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGA
1 CAGGGAGACAAGATTCA-CTGCCCTCAGCTTTAATCT-CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGA
* * *
24189963 TTCGCTACCTTTGGCATTAATCTGTTCTACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAG
64 TTCGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAG
* * * * *
24190028 CTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAAAATTCGCTGCCCTC
129 CTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACACAAAATTCGCTGCCCTA
* * ** *
24190093 TGCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTGTT
194 AGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTATT
* * *
24190158 CCACTATACAGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCATTCCACTATAATGCCG
259 CCACTATACAACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTATAATGCCG
* * ** * * * * * *
24190223 AAGAGATAGGACTCACTTCCCATAGCTTTAATCCGCATCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGC
324 AAGACATA-GACCCACGACACATAGATTCAATCCGCATCACTTCA-C-ATTGCAAGTCTCAACAC
* * *
24190288 CAGGGAGATAAGATTCACTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCTGCAAGGCTAGGGAAACAAGAT
1 CAGGGAGACAAGATTCACTGCCCTCAGCTTTAATCT-CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGAT
* *
24190353 TCGCTACCTTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAG
65 TCGCTACC-TTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAG
* * * *
24190418 CTTTAATCCACTCCACTTCAGTTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACATAAGATTTGCTGCCCTA
129 CTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACACAAAATTCGCTGCCCTA
*
24190483 AGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGGATAA-AA-ATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTA
194 AGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTA-GGGA-AACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTA
* * * *
24190546 TTCCACTGTA-ATACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCATCT
257 TTCCACTATACA-ACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCAC-T-AT-A
** * * * * ** * *
24190610 ATTTC-AAGTCTTA-ACGCCAGGGAGACA-AGATTCGCTGCC-C-TCACCTTTA-ATCTGC-ACT
318 ATGCCGAAGACATAGAC-CCA-CGACACATAGATTCAAT-CCGCATCA-CTTCACAT-TGCAAGT
24190668 GCTGCAACAC
378 -CT-CAACAC
* * * * * *
24190678 TAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAA--T-T--GCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
1 CAGGGAGACAAGATTCACTGCCCTCAGCTTTAATCTCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
* *
24190738 CGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAGGATTC
66 CGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTC
24190790 GATACCTTTA
Statistics
Matches: 423, Mismatches: 64, Indels: 36
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
383 41 0.10
384 31 0.07
386 1 0.00
388 5 0.01
389 71 0.17
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392 13 0.03
393 3 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.26, G:0.17, T:0.29
Consensus pattern (385 bp):
CAGGGAGACAAGATTCACTGCCCTCAGCTTTAATCTCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
CGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCT
TTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGACACAAAATTCGCTGCCCTAAG
CTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAGCTTTAATCTATTCC
ACTATACAACCAAAGAGATAGGACTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTATAATGCCGAA
GACATAGACCCACGACACATAGATTCAATCCGCATCACTTCACATTGCAAGTCTCAACAC
Found at i:24190709 original size:51 final size:48
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Indices: 24190628--24190760 Score: 146
Period size: 45 Copynumber: 2.8 Consensus size: 48
24190618 TCTTAACGCC
* * * * *
24190628 AGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCACCTTTAATCTGCACTGCTGCAACACT
1 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTG---TGCTGCAACACT
**
24190679 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAA--T-TGCTGCAATGCT
1 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTGCTGCAACACT
*
24190724 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTGT
1 AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGT
24190761 TCCACTATAA
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 8, Indels: 9
0.81 0.09 0.10
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (48 bp):
AGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTGCTGCAACACT
Found at i:24190716 original size:45 final size:45
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Indices: 24190667--24190756 Score: 153
Period size: 45 Copynumber: 2.0 Consensus size: 45
24190657 TAATCTGCAC
*
24190667 TGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAAT
1 TGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAAT
**
24190712 TGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAAT
1 TGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAAT
24190757 CTGTTCCACT
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 3, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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TGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAAT
Found at i:24191020 original size:51 final size:51
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Indices: 24190734--24190994 Score: 504
Period size: 51 Copynumber: 5.1 Consensus size: 51
24190724 AGGGAAACAA
* *
24190734 GATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
1 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
24190785 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
1 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
24190836 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
1 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
24190887 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
1 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
24190938 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
1 GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
24190989 GATTCG
1 GATTCG
24190995 CTGCTCATAG
Statistics
Matches: 208, Mismatches: 2, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
51 208 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.18, G:0.14, T:0.33
Consensus pattern (51 bp):
GATTCGATACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGATATAG
Found at i:24210745 original size:169 final size:169
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24210451 NNNNNNNNNN
* * **
24210461 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCAAAGCTTTAATCCACTTTACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * ** * *
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66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* *
24210591 AAGGTTTGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * *
24210630 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCTGCTCCACTTCAGCTACTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * * * * * *
24210695 AACTCCAAGGAGATAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTCCACCGCTGCAACGCCAGGGAAAC
66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* * *
24210760 AAGATCCGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTACACTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * *
24210799 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATTCGCTTCACGTCAGCTATTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * * * * * *
24210864 AACGCCAGGGAGAGAAGATTCGCTGCACTCATCTTTATTCTGCTCCACTACAATGCTAGGGAAAT
66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* **
24210929 AAGATTCGCTACATTTAGCTTTAATCTGTTCCGTTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * *
24210968 TGCCAAAAAGATAAGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCCGCAT-CACTTCAGCTATTTCAAGTAT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC-TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCT
** * * * *
24211032 TAACGTTAGGGAGAGAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGATGCAATGCTAGGGAAA
65 TAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAA
* * *
24211097 CCAGCTTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATGAA
130 CAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTAT-AA
*
24211138 -GCCAAAGAGATAGGATTCGCAGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
** * * * *
24211202 AACGTTAGGGAGACT-ACATTCGCAGCCCTCATCTTTAATCTGCTCCGCTACAATGCTAGGGAAA
66 AACGCCAGGGAGA-TAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAA
* *
24211266 CAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCATTATAA
130 CAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * *
24211306 TGCCAAAAAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTACTTCACGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * * * * *
24211371 AACGCCAGGGAGATAACATTTGCTGCGCTCAGCTTTAATCTGCTCAGCTTCAATGCTTGGGAAAC
66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* * *
24211436 AAGATTTGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTGCACTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * ** * * * * *
24211475 AGCCAAAGAGATAAGTTTCATTGCCCATAGCTTTAATCTGCTTCACTTCAACTATTTCGAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * * * *
24211540 AACACCAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCGGCAATGGTAGGGAAAC
66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* *
24211605 AAGATTTGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * *
24211644 TGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCGCAT-CACTTCAGCTATTTCAAGTAT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC-TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCT
* * * * *
24211708 TAACGTCAGGGAGAAAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGATGCAATGCTAGGGAAA
65 TAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAA
* * *
24211773 CCAA-CTTCCCTACCTTGAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
130 -CAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * * * * *
24211813 TGCCAAAGAGATATGAGTCACTACCCAAAGCTTCAATCCGCTCCACGTCAGCTATTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * * *
24211878 AACGCCAGGGAGACT-AGATTCGCTACCCGCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTGGGGAAA
66 AACGCCAGGGAGA-TAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAA
* * *
24211942 CAATATTCGCAACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAA
130 CAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* ** * * * *
24211982 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTGTAATTGGATCAACTTTAGCTACTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
** * *
24212047 AACGCCAGGGAGATAAGATTCATTGCCCTCAGCATTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAAC
66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
*
24212112 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGATCCACTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * *
24212151 TGCCAAAGGGATACGATTCGCTGCCCATAGCTTTAATCCTCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* * ** * * *
24212216 AACACTAGGGAGATAAGATTTACTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGTTGCAACGCAAGGGAAAC
66 AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* *
24212281 AATATTCGCTACCTTTAGCTTTGATCTGTTCCACTATAA
131 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
**
24212320 TGATAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCC
1 TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCC
24212359 ACTCTGCTGC
Statistics
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TGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
AACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAAC
AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
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Period size: 102 Copynumber: 2.2 Consensus size: 102
24212228 ATAAGATTTA
* ** * * *
24212238 CTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGTTGCAACGCAAGGGAAACAATATTCGCTACCTTTAGCTTT
1 CTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCGCTGCAACGCAAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATT
* * *
24212303 GATCTGTTCCACTATAATGATAAAGAGATAGGATTCG
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* * * *
24212340 CTGCCCACAGCTTTAATCCACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAATAAGATTCGCTACCTTTAGCATT
1 CTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCGCTGCAACGCAAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATT
* * * *
24212405 AATCTTTTCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCG
66 AATCTGTTCCACTATAAAGACAAAGAGATAGGATTCG
*
24212442 CTGCCCACAACTTTAATC
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24212460 TGCTCCACTT
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 18, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
102 102 1.00
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CTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCGCTGCAACGCAAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATT
AATCTGTTCCACTATAAAGACAAAGAGATAGGATTCG
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24212046 TAACGCCAGG
* ** * * **
24212056 GAGATAAGATTCATTGCCCTCAGCATTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC
1 GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCAACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC
* * * * *
24212121 TACCTTTAGCTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGGGATACGATTCGCTGCCCATAGCTTTA
66 TACCTTTAGCATTAATCTGATCCACTATAAAGCCAAAGAGATACGATTCGCTGCCCACAACTTTA
24212186 ATCCT-CTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGATAAGATTTAC-TGCCCTCAGC
131 AT-CTGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTA-GGAGATAAGA-TT-CGTGCCCTCAGC
* * * *
24212249 TTTAATCTGCTCCGTTGCAACGCAAGGGAAACAAT-ATTCGCTACCTTTAGCTTTGATCTGTTCC
192 TTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCAACGAAAAC-ATGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCC
*
24212313 ACTATAATGATAAA
256 ACTATAATGACAAA
* *
24212327 GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAATAAGATTCGC
1 GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCAACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC
** * * *
24212392 TACCTTTAGCATTAATCTTTTCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCGCTGCCCACAACTTTA
66 TACCTTTAGCATTAATCTGATCCACTATAAAGCCAAAGAGATACGATTCGCTGCCCACAACTTTA
* *
24212457 ATCTGCTCCACTTCAGCTATTTCATGTCTTAACGCTAGGAGATAAGATTCGTGCCCTCAGCTTTA
131 ATCTGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGAGATAAGATTCGTGCCCTCAGCTTTA
* *
24212522 ATCTGCTCCGCTGCAACGCTACGAAAACATGATTCGCTACCTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTAT
196 ATCTGCTCCGCTGCAACGCAACGAAAACATGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTAT
*
24212587 AATGCCAAA
261 AATGACAAA
*
24212596 GAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCAACTC
1 GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCAACTC
24212632 CACTTTAGCT
Statistics
Matches: 272, Mismatches: 30, Indels: 8
0.88 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
268 3 0.01
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GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCAACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC
TACCTTTAGCATTAATCTGATCCACTATAAAGCCAAAGAGATACGATTCGCTGCCCACAACTTTA
ATCTGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGAGATAAGATTCGTGCCCTCAGCTTTA
ATCTGCTCCGCTGCAACGCAACGAAAACATGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTAT
AATGACAAA
Found at i:24212748 original size:945 final size:946
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Indices: 24211400--24213302 Score: 2657
Period size: 945 Copynumber: 2.0 Consensus size: 946
24211390 TTGCTGCGCT
** * * * *
24211400 CAGCTTTAATCTGCTCAGCTTCAATGCTTGGGAAACAAGATTTGCTACCTTTAGCTTTAATCTAT
1 CAGCTTTAATCCACTCAGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTAT
* * * * * *
24211465 TGCACTATAAAGCCAAAGAGATAAGTTTCATTGCCCATAGCTTTAATCTGCTTCACTTCAACTAT
66 TCCACTATAAAGCCAAAGAGATAAGCTTCACTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCACTTCAACTAT
*
24211530 TTCGAGTCTTAACACCAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCGGCAATG
131 TTCGAGTCTTAACACCAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCGGCAACG
* * * *
24211595 GTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGA
196 CTACGAAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGA
** *
24211660 TTCACTGCCCACAACTTTAATCCGCATCACTTCAGCTATTTCAAGTATTAACGTCAGGGAGAAAA
261 TTCACTGCCCACAACTTTAATCAACATCACTTCAGCTATTTCAAGTATTAACGCCAGGGAGAAAA
* * *
24211725 GATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGATGCAATGCTAGGGAAACCAACTTCCCTACCTTG
326 GATTAGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGATGCAATGCTAGGGAAACCAAATTCCCTACCTTG
* *
24211790 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATATGAGTCACTACCCAAAGCTTCAATCCGCT
391 AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAGTCACTACCCAAAGCTTCAATCCGCT
* *
24211855 CCACGTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACTAGATTCGCTACCCGCTGCTTTAATCTG
456 CCACGTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCGCTACCCGCTGCTTTAATCTG
* * * * *
24211920 CTCCGCTGCAATGCTGGGGAAACAATATTCGCAACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAATGC
521 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTGAACTTTAATCTATTCCACTATAAAGC
** *
24211985 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTGTAATTGGATCAACTTTAGCTACTTCAAGTCTTAAC
586 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTGTAATCCGATCAACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAAC
* * * * *
24212050 GCCAGGGAGATAAGATTCATTGCCCTCAGCATTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAG
651 GCCAGGGAGACAAGATTCACTACCCTCAGCAATAATCTGCTCAGCTGCAATGCTAGGGAAACAAG
* * *
24212115 ATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGGGATACGATTCGCTGCCCATA
716 ATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGATCCACTATAATGCCAAAGAGATACGATTCGCTGCCCACA
* * * * * *
24212180 GCTTTAATCCTC-TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGATAAGATTTACTGCCC
781 GCATTAATCCACAT-CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGAAAAGATTCACTACCC
* * * * *
24212244 TCAGCTTTAATCTGCTCCGTTGCAACGCAAGGGAAACAATATTCGCTACCTTTAGCTTTGATCTG
845 TCAGCTTTAATCTGCTCCGAT-AAACGCAAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTG
* *
24212309 TTCCACTATAATGATAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
909 TTCCACTATAAAGACAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
* * *
24212347 CAGCTTTAATCCACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAATAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTTT
1 CAGCTTTAATCCACTCAGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTAT
* * * *
24212412 TCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCGCTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCACTTCAGCTAT
66 TCCACTATAAAGCCAAAGAGATAAGCTTCACTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCACTTCAACTAT
* * * *
24212477 TTC-ATGTCTTAACGCTAGG-AGATAAGATTCG-TGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAAC
131 TTCGA-GTCTTAACACCAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCGGCAAC
* * *
24212539 GCTACGAAAACATGATTCGCTACCTTTTGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGG
195 GCTACGAAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGG
** * * * * *
24212604 ATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCAAC-TCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAATGCCAGGGAGAC
260 ATTCACTGCCCACAACTTTAATCAACAT-CACTTCAGCTATTTCAAGTATTAACGCCAGGGAGAA
* * * * *
24212668 AAGATTAGCTGCCTTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAA-CAAGATTCGCTACC
324 AAGATTAGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGATGCAATGCTAGGGAAACCAA-ATTCCCTACC
* * * * * *
24212732 TTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCC
388 TTGAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAGTCACTACCCAAAGCTTCAATCC
* * * * * * *
24212797 GCTCCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAAAATTCGCTGCTCTCTGCTTTACT
453 GCTCCACGTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCGCTACCCGCTGCTTTAAT
* *
24212862 CTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTGAACTTTAATCTGTTCCACTATAA
518 CTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTGAACTTTAATCTATTCCACTATAA
* * * * * *
24212927 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGTTTTAATCCGTTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
583 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTGTAATCCGATCAACTTCAGCTACTTCAAGTCTT
* *
24212992 AACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTACCCTCTGCAATAATCTGCTCAGCTGCAATGCTAGGGAAAC
648 AACGCCAGGGAGACAAGATTCACTACCCTCAGCAATAATCTGCTCAGCTGCAATGCTAGGGAAAC
* *
24213057 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATATGATTCGCTGCCC
713 AAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGATCCACTATAATGCCAAAGAGATACGATTCGCTGCCC
* *
24213122 ACAGCATTAATCCACATCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAAAAGATTCGCTAC
778 ACAGCATTAATCCACATCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGAAAAGATTCACTAC
** * * * * *
24213187 CCTCAGCTTTAATCTGCTTTGATAAATGCTAGTGAAACCAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATTT
843 CCTCAGCTTTAATCTGCTCCGATAAACGCAAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCT
* *
24213252 GTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCA
908 GTTCCACTATAAAGACAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
24213291 CAGCTTTAATCC
1 CAGCTTTAATCC
24213303 GCTCCACTTC
Statistics
Matches: 834, Mismatches: 118, Indels: 11
0.87 0.12 0.01
Matches are distributed among these distances:
944 84 0.10
945 610 0.73
946 14 0.02
947 126 0.15
ACGTcount: A:0.28, C:0.25, G:0.17, T:0.30
Consensus pattern (946 bp):
CAGCTTTAATCCACTCAGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTAT
TCCACTATAAAGCCAAAGAGATAAGCTTCACTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCACTTCAACTAT
TTCGAGTCTTAACACCAGGCAGATAAGATTCGCTGCCCTCAACTTTAATCTGCTCCGCGGCAACG
CTACGAAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGA
TTCACTGCCCACAACTTTAATCAACATCACTTCAGCTATTTCAAGTATTAACGCCAGGGAGAAAA
GATTAGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGATGCAATGCTAGGGAAACCAAATTCCCTACCTTG
AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAGTCACTACCCAAAGCTTCAATCCGCT
CCACGTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAAATTCGCTACCCGCTGCTTTAATCTG
CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTGAACTTTAATCTATTCCACTATAAAGC
CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTGTAATCCGATCAACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAAC
GCCAGGGAGACAAGATTCACTACCCTCAGCAATAATCTGCTCAGCTGCAATGCTAGGGAAACAAG
ATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGATCCACTATAATGCCAAAGAGATACGATTCGCTGCCCACA
GCATTAATCCACATCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGAAAAGATTCACTACCCT
CAGCTTTAATCTGCTCCGATAAACGCAAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTGTT
CCACTATAAAGACAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
Found at i:24212759 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 24212334--24224092 Score: 12387
Period size: 169 Copynumber: 69.6 Consensus size: 169
24212324 AAAGAGATAG
* * ** * *
24212334 GATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCTGCTGCAATGCTAGGGAAATAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * * *
24212399 AGCATTAATCTTTTCCCCTATAAAGCCAAAGAGATAGGCTTCGCTGCCCACAACTTTAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24212464 CCACTTCAGCTATTTCATGTCTTAACGCTA-GGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * *
24212502 GATTCG-TGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTACGAAAACATGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * **
24212566 TGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCAACT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* *
24212631 CCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAATGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* *
24212670 GATTAGCTGCCTTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
*
24212735 AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* *
24212800 CCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24212839 AATTCGCTGCTCTCTGCTTTACTCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTG
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * *
24212904 AACTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGTTTTAATCCGTT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
24212969 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* ** *
24213008 GATTCGCTACCCTCTGCAATAATCTGCTCAGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24213073 AGCTTTAATATGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATATGATTCGCTGCCCACAGCATTAATCCACA
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC-
*
24213138 T-CACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAAAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * * *
24213177 GATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTTTGAT-AAATGCTAGTGAAACCAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24213241 AGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24213306 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCCAGAGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * *
24213345 GATTCGGTACTCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24213410 AACTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * *
24213475 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCCAGAGCGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * **
24213514 GATTCGTTACTCTCTGCTTTATTCAGCTCCGCTGCTATATTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
** * * ** *
24213579 AGCTTTAATCCATTCCACTATAATGCCAAAAAGATAGGATTCGCTGCCCACATCTTTAATTTGCG
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24213644 CCACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24213683 GATTCGCTGCCGTCAGGATTAATCTTCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAGGATTCGCTACCATT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * **
24213748 AGTTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACATCTTTAATCCATT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * *
24213813 CCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24213852 GATTCGCTGGCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * *
24213917 AGCATAAATCTGTTCCAATATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCATTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
**
24213982 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGATAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24214021 GATTAGCTGCCCTCTGCCTTAATCTGCTCCATTTCAATACTAGAGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24214086 ACCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTT-ATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * *
24214150 CCACCTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCTAGAGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * * * ***
24214189 GATTCGCTACTCTCTACTATAA--T--T---C--CAA----A--GAGATAGGATTCGCTGCCCAC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* ** *
24214239 AGCTTTAATCTGCTCCACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCC
66 AGCTTTAATCTG------TTC--C-AC-T--A----TAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCC
* ** * * * *
24214304 TCAGAATTAATCTGCT---C--C-GC----T---G-C--AATGCTAGGGAAACAA
115 ACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** ** * ** ** * * * * * **
24214343 GATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTAATCCACTATAAT-CTCAAAGAGATAGGATTCGATGCCCA
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCT-AGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * * * * * *
24214407 CAACTTTAATCCGCTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGATAAGATTCGCTGCC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCAC--TA--TA----ATG-C----CA--A-AGAGATAGGATTCGCTGCC
* * * * * *
24214472 CTCAGGTTTAATCTGCT---C-T--GC----T---G-C--AATGCTAGGGAAACAA
114 CACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * ** * * ** * * * *
24214512 GATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGATCCAG-TATATTGCCAAAGAGATAGGATTCACTGTCCA
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCC-GCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT--C-G-CTA
* * * * ** ** *
24214576 CAGCTTTATTCCGCTCCAATTCAGCTATTTCAAGTCT-TAACACCAGGGAGATAAGATTCGCTGC
61 C--CTTTA----GCT----TTAATCT-GTTCCA--CTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGC
* * * * *
24214640 CCTCAG-TTTGAATCTGCT---C--C-G----TT---G-C--AATGCTAGGGAAACAA
113 CCACAGCTTT-AATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * * ** * * ** * * * * * * ***
24214681 GATTCGCTACCTTTAGCTTTATTCTGTTCCACTATAATCCCAAAGAGATAGGAGTCACTGCCCAC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * *
24214746 AGCTTTAATCCGCTCCACTTTAGCTATTTCACGTCTTATTAACAGGGAGATAAGATTCTCTGCCC
66 AGCTTTAATCTGTTCCAC--TA--TA----ATG-C----CAA-A--GAGATAGGATTCGCTGCCC
* * * * * *
24214811 TCTGCTTTAATCTGCT---C--C-GC---TGCAA----T-A--CTAGGGAAACAA
115 ACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * ** ** ** * * ** * * * *
24214850 GAGTCGCT-ACCTTTACCTTTAATCTATTCCATTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTTCC-
1 GATTCGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC-TACCT
* * * *
24214913 TCAGCTTTAATCCGCTTCACCTCAGCTATTTTAA-GTCATAACACCAGAGAGATAAGATTCGCAG
64 TTAGCTTTAATCTG-TT---C-CA-CTA---TAATG-C----CA--A-AGAGATAGGATTCGCTG
* * * *
24214977 CCCTCAGCTTTAATCTG-T----TTC-GC--TGT-AA-TGTT-A-GCCA---A-ACAA
112 CCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * *
24215019 GATTCCCT-ACATTTAGCTTTAATCTGTTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAACATTCGCTACCTT
1 GATTCGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * * *
24215083 TAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGC-TTAATCCGC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * *
24215147 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCCAGAGAGATAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * * *
24215187 GACTCGGTACTCTCTGCTTTAATATGCTTCGCTGCAATGCTAGGGAAAGAAGATTCGCTACTTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
** * * *
24215252 AGCTTTAATCCATTCAACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAACTTTAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * *
24215317 CCACTTTAGCTACTTCAAGTCTTCACACTAGGGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24215356 GATTAGCTGCCCTCAGGATTAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCCACCTCT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
*
24215421 AGCTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * *
24215486 CCACTTCAGCTATGTCAACTCTTAACACTAGGGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24215525 GATTCGCTCCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCACCGC-ATAGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAAT-GCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * *
24215589 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACTGCTTTAATCCGC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* **
24215654 TCCACTTCAGCTATTTCAGGTCTTAACGCCAGAAAGACAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
*
24215694 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGAGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24215759 AGCATTAATCTGTTCCACTATAAGGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATTCTCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24215824 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGACACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * **
24215863 GATTCACTGCCATCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAAAGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24215928 AGCTTTAATCTATTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCTGC-
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24215992 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCCAGAGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * ** * *
24216031 GATTCGCAGCCCTCGGCTTTAATCTGCTCTGCTATAATGCTAGCGAAACAAGATTCGCTACATTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* **
24216096 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCATT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24216161 CCACTTCAGCTATTTCAAGTTTTAACGCGAGGGAGACAG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24216200 GATTCGCTGTCGTCTGCATTAATCTGCTCCACTGCAATACTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * *
24216265 AGGTTTAATATGTTCCACTCTAATGCCAAAGAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCATTAATCCGCA
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC-
* * * *
24216330 T-CACATCAGCTATGTCAAGTCTTAAAGCCAGGGAGAAAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * *
24216369 GATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGATGCAATGCTAGGGAAACCATATTCGCTACCTGT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * *
24216434 AGCTTTAATCTATTTCAGTTTAATGCCAAAGAGATA-GATGTCGCTACCCATAGCTTTAATCCGC
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAT-TCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * * **
24216498 TCCACATCAACTATTTCAAGTCTTACCGCTAGGGAGACTG
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24216538 GATTCAG-TACCCTCTGCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCCT
1 GATTC-GCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * **
24216602 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCTAC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * *
24216667 TCCATTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCAAGGGAGATAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24216707 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGTAACGCTAGGCAAACGAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24216772 AGCTTTAATCTGTTCCACAATAATGCCAAAAAGATAAGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24216837 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * *
24216876 GATTCGCAGCCCTCTACTATAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGAGACAAGATTCTCTACCTTC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * ** * *
24216941 AACTTTAATCTGTTCCAGTATAAAGTGAAAGAGATA-GATTCGCTGCCTACAACTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* *
24217005 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGATAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* *
24217044 CATTCGCTGCCTTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24217109 AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24217174 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGACACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * **
24217213 TATTCGCT--CCTCTGCTTTAATATGCTCCACTGCAATGCGGGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * *
24217276 AGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24217341 ACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * *
24217380 GATTTGCTGCCCTCTGCTTTAATCGGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACGACATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* ** * *
24217445 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCATTTCCCACAGCTTTAATCCACT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24217510 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAAGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* *
24217549 GATTCGCTGCCCTCTGCATTAATCTGCTCCGCTGTAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * *
24217614 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAGA-GCCAGATAGATAGGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCAC
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * ** * *
24217678 TTCACTTCAACTATTTTAAGTCTTAACGTTAGTGAGATAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * * *
24217718 GAGTCGCTGCCCCCAGCTTTAATCTACTCCACTACAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
** * * * *
24217783 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATAACAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAACTTGAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* *
24217848 CCACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * *
24217887 GATTCGCAGCCCTCTACTATAATCTGCTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24217952 AGCTTTAATCTATTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTGAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24218017 ACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* ** ** *
24218056 GATTCG-TAGCCCTCT-ATTATAATCTGCTCTACTGCAATGCGGGGGAAATAAGATTCGCTACCT
1 GATTCGCT-GCCCTCTGCTT-TAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCT
* * *
24218119 TTAGCATAAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCG
64 TTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCG
*
24218184 CTACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
129 CTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24218225 GATTTGCTGCCCTCTGCTTTAATCGGCTCCGCAGCAATGCTAGGGAAACAACATTCGC-ACCCTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTA-CCTT
** * ** *
24218289 TAGCTTTAATCTGTTTAACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCATTTCCCACAGCTTTAATCCGC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
*
24218354 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAAGCCAGGGAGACAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * ** *
24218394 GATTCGCTGCCCTCTGCATTAACCTACTCCGCTATAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * ** *
24218459 AACTTTAATCTAG-TCCAGTATAAAGTGAAAGAGATA-GATTCGCTGCCCACAACTTTAATCCGC
66 AGCTTTAATCT-GTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * *
24218522 TCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGATAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * *
24218562 CATTCGCTGCCTTCTGCTTTAATCTGCACCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
*
24218627 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * *
24218692 CTACTTGAGTTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAAACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* **
24218731 TATTCGCT--CCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCGGGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * *
24218794 AGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGAAAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * *
24218859 ACACTTCAGCTATTCCAAGTCTTAATGCCAGGGAGGCAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * *
24218898 GATTTGCTGCCCTCTGCTTTAATCGGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAACATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * ** * *
24218963 AGCTTTAATATGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCATTTCCCACAACTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
*
24219028 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAAGCCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24219067 GATTCTCTGCCCTCTGCATTAATCTGCTCCGTTGTAATGCTAGGGAAATAAGATTCACTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * * *
24219132 AGCTTTAATTTGTTCCACTATAGA-GCCAGATAGATAAGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCAC
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * *
24219196 TCCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGTCAGTGAGATAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24219236 GAGTCGCTGCCCCCAGCTTTAATCTGCTCCAG-TACAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTACCTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCC-GCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
** * * * *
24219300 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATAACAAAGAGATAGAATTCGCTGCCCACAACTTGAATCTGC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
*
24219365 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAA
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * *
24219405 GATTCGCAGCCCTCTACTATAATCTGCTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24219470 AGCTTTAATCTGTTCAACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTGAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * *
24219535 ACACTTCAGCTATTTCAAGTATTAGCACCAGGGAGACAA
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * **
24219574 GATTCGCAGCCCTCT-ATTATAATCTGCTCTGCTCCAATTG-GGGGGAAACAAGATTCGCTACCT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTT-TAATCTGCTCCGCTGCAA-TGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCT
* * * * *
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* *
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* * *
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1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
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* *
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* * *
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1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
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*
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** ** * ** *
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* * *** ** ** * ** * *
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* * *
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49 ------CAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTC
* ** *
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* * * *
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* *
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* *
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* ** ** *
24213540 CTCCGCTGCTATATTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCATTCCACTATAATGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* * ** * *
24213605 CAAAAAGATAGGATTCGCTGCCCACATCTTTAATTTGCGCCACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
* *
24213670 GCTAGGGAGATAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24213683 GATTCGCTGCCGTCAGGATTAATCTTCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAGGATTCGCTACCATT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * **
24213748 AGTTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACATCTTTAATCCATT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * *
24213813 CCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGATAAGATTCGCTGGCCTCAGCTTTAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * * * *
24213878 CTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTTAGCATAAATCTGTTCCAATATAAAGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
*
24213943 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCATTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
**
24214008 GATAGGGAGACAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24214021 GATTAGCTGCCCTCTGCCTTAATCTGCTCCATTTCAATACTAGAGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24214086 ACCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTT-ATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * * * * *
24214150 CCACCTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCTAGAGAGATAAGATTCGCTACTCTCTACTATAA--T-
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * * * *** *
24214212 -T---C--CAA----A--GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCACTTCAGCTA
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCAC-T-A--TA
* * * ** *
24214265 CTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGAATTAATCTGCT---C--C-GC
257 ----AAG-C-CAA----A--GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGC
* * *
24214324 ----T---G-C--AATGCTAGGGAAACAA
310 TATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * ** ** * * * * * *
24214343 GATTCGCT-ACCTTTAGCTTTAATCTAATCCACTATAAT-CTCAAAGAGATAGGATTCGATGCCC
1 GATTCGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCT-AGGGAAACAAGATTCGCTACCT
** * * * * * *
24214406 ACAACTTTAATCCGCTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGATAAGATTCGCTGC
64 TTAGCTTTAATCTGTTCCAC--TA--TA----ATG-C----CA--A-AGAGATAGGATTCGCTGC
* * * * * *
24214471 CCTCAGGTTTAATCTGCT---C-T--GC----T---G-C--AATGCTAGGGAAACAAGATTCGCT
113 CCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCT
* * * ** * * ** * * * *
24214520 -ACCTTTAGCTTTAATCTGATCCAG-TATATTGCCAAAGAGATAGGATTCACTGTCCACAGCTTT
178 GCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCC-GCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT--C-G-CTAC--CTTT
* * * * ** * *
24214583 ATTCCGCTCCAATTCAGCTATTTCAAGTCT-TAACA-CCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAG
235 A----GCT----TTAATCT-GTTCCA--CTATAA-AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAG
* * * *
24214646 -TTTGAATCTGCT---C--C-G----TT---G-C--AATGCTAGGGAAACAA
288 CTTT-AATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * ** * * ** * * * * * * **
24214681 GATTCGCT-ACCTTTAGCTTTATTCTGTTCCACTATAATCCCAAAGAGATAGGAGTCACTGCCCA
1 GATTCGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * * * * * *
24214745 CAGCTTTAATCCGCTCCACTTTAGCTATTTCACGTCTTATTAACAGGGAGATAAGATTCTCTGCC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCAC--TA--TA----ATG-C----CAA-A--GAGATAGGATTCGCTGCC
* * * * * * *
24214810 CTCTGCTTTAATCTGCT---C--C-GC---TGCAA----T-A--CTAGGGAAACAAGAGTCGCT-
114 CACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTG
* * * ** ** ** * * ** * * * * *
24214858 ACCTTTACCTTTAATCTATTCCATTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTTCC-TCAGCTTTA
179 CCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGC-TACCTTTAGCTTTA
* * * * *
24214922 ATCCGCTTCACCTCAGCTATTTTAAGTCATAACACCAGAGAGATAAGATTCGCAGCCCTCAGCTT
242 ATCTG-TT---C-CA-CTA--TAAAG-C----CA--A-AGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTT
* * *
24214987 TAATCTG-T----TTC-GC--TGT-AA-TGTT-A-GCCA---A-ACAA
291 TAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * *
24215019 GATTCCCT-ACATTTAGCTTTAATCTGTTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAACATTCGCTACCTT
1 GATTCGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * * *
24215083 TAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGC-TTAATCCGC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * * * * * *
24215147 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCATAACGCCAGAGAGATAAGACTCGGTACTCTCTGCTTTAATAT
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* * * ** * *
24215212 GCTTCGCTGCAATGCTAGGGAAAGAAGATTCGCTACTTTTAGCTTTAATCCATTCAACTATAATG
195 GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
* * * * *
24215277 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAACTTTAATCTGCTCCACTTTAGCTACTTCAAGTCTTCA
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
* * *
24215342 CACTAGGGAGATAA
325 CGCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24215356 GATTAGCTGCCCTCAGGATTAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCCACCTCT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
*
24215421 AGCTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * * *
24215486 CCACTTCAGCTATGTCAACTCTTAACACTAGGGAGATAAGATTCGCTCCCCTCAGCTTTAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * *
24215551 CTCCACCGC-ATAGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATG
196 CTCCGCTGCAAT-GCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
* * * *
24215615 CCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACTGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAGGTCTTAA
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
**
24215680 CGCCAGAAAGACAA
325 CGCCAGGGAGACAA
*
24215694 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGAGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24215759 AGCATTAATCTGTTCCACTATAAGGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATTCTCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24215824 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGACACAAGATTCACTGCCATCTGCTTTAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
** *
24215889 CTCCGCTGCAATGCTAAAGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAAAGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* * *
24215954 CAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCTGC-CCACTTCAGCTATTTCAAGTCATAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
* *
24216018 GCCAGAGAGATAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * * ** * *
24216031 GATTCGCAGCCCTCGGCTTTAATCTGCTCTGCTATAATGCTAGCGAAACAAGATTCGCTACATTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* **
24216096 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCATT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * *
24216161 CCACTTCAGCTATTTCAAGTTTTAACGCGAGGGAGACAGGATTCGCTGTCGTCTGCATTAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * * * * * *
24216226 CTCCACTGCAATACTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTTAGGTTTAATATGTTCCACTCTAATGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* * * *
24216291 CAAAGAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCATTAATCCGCAT-CACATCAGCTATGTCAAGTCTTAA
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC-TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
* *
24216355 AGCCAGGGAGAAAA
325 CGCCAGGGAGACAA
* * * * * * *
24216369 GATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGATGCAATGCTAGGGAAACCATATTCGCTACCTGT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * *
24216434 AGCTTTAATCTATTTCAGTTTAATGCCAAAGAGATA-GATGTCGCTACCCATAGCTTTAATCCGC
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGAT-TCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * * ** *
24216498 TCCACATCAACTATTTCAAGTCTTACCGCTAGGGAGACTGGATTCAG-TACCCTCTGCTTTAATC
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTC-GCTGCCCTCTGCTTTAATC
* * *
24216562 TGCTCTGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACCCTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAA
194 TGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAA
* ** * *
24216627 GCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCTACTCCATTTCAGCTATTTTAAGTCTTA
259 GCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTA
* *
24216692 ACGCAAGGGAGATAA
324 ACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24216707 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGTAACGCTAGGCAAACGAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24216772 AGCTTTAATCTGTTCCACAATAATGCCAAAAAGATAAGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * *
24216837 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAAGATTCGCAGCCCTCTACTATAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * * * * * *
24216902 CTCCGTTGCAATGCTAGGGAGACAAGATTCTCTACCTTCAACTTTAATCTGTTCCAGTATAAAGT
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* * *
24216967 GAAAGAGATA-GATTCGCTGCCTACAACTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
* *
24217031 ACCAGGGAGATAA
326 GCCAGGGAGACAA
* *
24217044 CATTCGCTGCCTTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24217109 AGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * *
24217174 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGACACAATATTCGCT--CCTCTGCTTTAATATG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* ** *
24217237 CTCCACTGCAATGCGGGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* *
24217302 CAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCGCTACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
24217367 GCCAGGGAGACAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * * * *
24217380 GATTTGCTGCCCTCTGCTTTAATCGGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACGACATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* ** * *
24217445 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCATTTCCCACAGCTTTAATCCACT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* *
24217510 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAAGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCATTAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* *
24217575 CTCCGCTGTAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAGAGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* * * * * * * *
24217640 CAGATAGATAGGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCACTTCACTTCAACTATTTTAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
** * *
24217705 GTTAGTGAGATAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * * * * * * *
24217718 GAGTCGCTGCCCCCAGCTTTAATCTACTCCACTACAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
** * * * *
24217783 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATAACAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAACTTGAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * *
24217848 CCACTTCAGCTACTTCAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAAGATTCGCAGCCCTCTACTATAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * *
24217913 CTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAAAGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* * *
24217978 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTGAATCTGCTACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
24218043 GCCAGGGAGACAA
326 GCCAGGGAGACAA
* ** ** *
24218056 GATTCG-TAGCCCTCT-ATTATAATCTGCTCTACTGCAATGCGGGGGAAATAAGATTCGCTACCT
1 GATTCGCT-GCCCTCTGCTT-TAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCT
* * *
24218119 TTAGCATAAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCG
64 TTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCG
* *
24218184 CTACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTTGCTGCCCTCTGCTTTAATC
129 CTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATC
* * * **
24218249 GGCTCCGCAGCAATGCTAGGGAAACAACATTCGC-ACCCTTTAGCTTTAATCTGTTTAACTATAA
194 TGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTA-CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
** *
24218313 AGCCAAAGAGATAGGATTCATTTCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
258 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
*
24218378 AAAGCCAGGGAGACAA
323 AACGCCAGGGAGACAA
* * * ** *
24218394 GATTCGCTGCCCTCTGCATTAACCTACTCCGCTATAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * ** *
24218459 AACTTTAATCTAG-TCCAGTATAAAGTGAAAGAGATA-GATTCGCTGCCCACAACTTTAATCCGC
66 AGCTTTAATCT-GTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * * * *
24218522 TCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGATAACATTCGCTGCCTTCTGCTTTAATCT
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* *
24218587 GCACCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATG
195 GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
* * * *
24218652 CCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCTTTAATCCGCTCTACTTGAGTTATTTCAAGTCTTAA
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
*
24218717 CGCCAGGGAAACAA
325 CGCCAGGGAGACAA
* **
24218731 TATTCGCT--CCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCGGGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * *
24218794 AGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGAAAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * *
24218859 ACACTTCAGCTATTCCAAGTCTTAATGCCAGGGAGGCAAGATTTGCTGCCCTCTGCTTTAATCGG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* *
24218924 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAACATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAAAGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
** * * *
24218989 CAAAGAGATAGGATTCATTTCCCACAACTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAA
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
24219054 GCCAGGGAGACAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24219067 GATTCTCTGCCCTCTGCATTAATCTGCTCCGTTGTAATGCTAGGGAAATAAGATTCACTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * * *
24219132 AGCTTTAATTTGTTCCACTATAGA-GCCAGATAGATAAGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCAC
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * * * * *
24219196 TCCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGTCAGTGAGATAAGAGTCGCTGCCCCCAGCTTTAATCT
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* * *
24219261 GCTCCAG-TACAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAT
195 GCTCC-GCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA-
* * * * *
24219325 A-ACAAAGAGATAGAATTCGCTGCCCACAACTTGAATCTGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
258 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
*
24219389 AGCGCCAGGGAGACAA
323 AACGCCAGGGAGACAA
* * * * *
24219405 GATTCGCAGCCCTCTACTATAATCTGCTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24219470 AGCTTTAATCTGTTCAACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTGAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * * *
24219535 ACACTTCAGCTATTTCAAGTATTAGCACCAGGGAGACAAGATTCGCAGCCCTCT-ATTATAATCT
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTT-TAATCT
* * ** * *
24219599 GCTCTGCTCCAATTG-GGGGGAAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATATGTTCCACTATAAA
195 GCTCCGCTGCAA-TGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAA
* *
24219663 GACAAAGAGATA-GATTCGCTGCCCACAACTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTA
259 GCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTA
* *
24219727 ACACCAGGGAGATAA
324 ACGCCAGGGAGACAA
* * *
24219742 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATGCAAGGGAAACAAGATTCTCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24219807 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTACCCACAGCCTTAATCCGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* *
24219872 ACACTTCAGCTATTTCATGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCT--CCTCTGCTTTAATCTG
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * * * * *
24219935 CTCCGCTACAATGCTAGAGAAATAAGATTCGCTACCTTTAGCATTAATTTGTTCCACTATAAAGG
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
*
24220000 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
24220065 GCCAGGGAGACAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * * *
24220078 GATTTGCTACACTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCTCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * * *
24220143 AGCTTTAATCTATTCCACTATAGA-GCCAAATAGATATGATTCACCT-CCCACAGCATTGATCCA
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGATTC-GCTGCCCACAGCTTTAATCCG
* * * * * * **
24220206 CTCCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACACCAGTGATATAAGATTCGCTGCCCCCAACTTTAATC
129 CTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATC
* * * * *
24220271 TGCTCCACTACAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTACCTTT-GCCTTTAATCTGTTCCACTATAG
194 TGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAG-CTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * * * *
24220335 AGCCAAATAGATAGAATTCACTTCCCACAGCTTGAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
258 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* *
24220400 AACACCAGTGAGACAA
323 AACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * * *
24220416 GATTCGCTACCCCCAGCTTTAATCTGCTCTGTTGCAATACTAGGGAAACAAGAGTCGCTATCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * *
24220481 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAT-CCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTTGAATCTGC
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTAT-AATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * ** * * * * *
24220545 TACACTTCAGCTATTTCAAGTCTCAGTGCCAGGGGGACAAGATTTGCAGCCCTCTACTATAATCT
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* * *
24220610 GCTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTCTTCCACTATAAAT
195 GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
* * * *
24220675 CCAAAGAGATAGGATTCGTTGCCCACAACTTTAA-----TCCA----AG-GA-TTC--G--TT-G
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
* *
24220724 C-CCA--CA-ACTTTA
325 CGCCAGGGAGAC--AA
* * * * * * * * * * * * *
24220736 -ATCCACT-CCACTTCAGGTATT--TCAGGT---CT-TAACGCCAGGGAGATAAGTTTCGCTGCA
1 GATTCGCTGCC-C-TCTGCT-TTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTAC-
* * * * * * * * * *
24220793 C-TCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGA-AACG-CTAGGGGAACAAGATTCACT----AC--CTTT-A
62 CTTTAGCTTTAATCTGTTCCACT-ATAATGCCAAAGAG-ATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAA
* * * ** *** * *
24220848 ---GCT----TT-A-ATATGTTCCA--CTATAATGCCAAAGAGATTGGATTCGCTGCCCACAGCT
125 TCCGCTCCACTTCAGCTAT-TTCAAGTCT-TAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCT
* * * * * *
24220902 TTAAT-TCGCTCCACTTTTGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTGTCGTGT
188 TTAATCT-GCTCCGC---TGC-A----ATG-C-T------AGGGAAACAAGATTCGCT-ACCTTT
* * * * ** * ** * * ** * *** ** *
24220966 -GCATTAATGTGCTCCGCTGCAATA-CTAGGGAAACAACATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGT
235 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAA-AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * **** ** ** **
24221029 TCCACTCTAATGCCAAAGGGATAGGATTCGCTGCCCA--GAGTATTA
299 TCCACT-TCA-G-CTATTTCA-AGTCTTAAC-G-CCAGGGAG-ACAA
* * * ** * * * * *
24221074 -ATCCG-TATCACATAAGC--T-AT-T--TCAAGTCT-TAAAGCCAGGGAGAA-AAGATTCGATA
1 GATTCGCT-GC-CCTCTGCTTTAATCTGCTC-CG-CTGCAATGCTAGGGA-AACAAGATTCGCTA
* * * ** * ** * * *
24221129 CCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGA-TGCAATGCTAGGGAAACCA-TATTCGCT----AC--CTTT-
61 CCTTTAGCTTTAATCTG-TTCCACTATAATGCCAAAGAGA-TAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTA
* * * ** * * * *
24221185 A---GCT----TTAATCTATTTC-A--CTATAATGCCAAAGAGA-TAGATGTCACTACCCAT-AG
124 ATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCT-TAACGCCAGGGAGACAAGAT-TCGCTGCCC-TCTG
* * * *
24221238 CTTTAATCCGCTCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGACTAGATTCAG-TACCCT
186 CTTTAATCTGCT---C--C-GC----T---G-C--AATGCTAGGGAAACAAGATTC-GCTA-CCT
* * ** ** * * ** * * * * ***
24221302 CT-GCTTTAATCTGCTCTGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCG
233 TTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCG
* ** * *
24221366 ------TTCCGCTA--T--A-----AA-GCCAAAGAGATAG
298 CTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * * * *
24221391 GATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCACTCCATTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCAAGGGAGAT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAAT---CTGC---TCCGC-----T--G-C--AATGCTAGGGAAAC
* * * * * * * * * * *
24221456 AAGATTCACTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCCGCTGTAACG-C-TAGGGAAACGAGATTCGCTA
50 AAGATTCGCT-ACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATA-G-GATTCGCTG
*** * * ** *
24221518 CCTTTAGCTTTAATCTG-T----TCCA-CTA--T-AA----T-A--CCAAAGAGATAAGATTCGC
112 CCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGC
* * * * *
24221567 TGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCGCTAGGGAGACAAGATTC
177 TGCCCTCTGCTTTAATCTGCT---C--C-GC---TGCAA----T---GCTAGGGAAACAAGATTC
* * * *** ** * * ** * * *
24221632 GC-AGCCCTCTA-CTATAATCTGCTCTGTTGCAATGCTAGGGAGACAAGATTCG-T----A-ACC
226 GCTA--CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGC
* * * ** *
24221689 TTT-A---GCT----TT-A-ATATGTTCCA--CTATAAAGCCAAAGAGA-TA
289 TTTAATCCGCTCCACTTCAGCTAT-TTCAAGTCT-TAACGCCAGGGAGACAA
* ** * * *
24221728 GATTAC-CTGCCCACAACTTTAATCCGCTCCACTGCAACTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGA
1 GATT-CGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGC-A--A--T---G-C-T------AGGGAAA
* * * ** * ** * * * * *
24221792 TAACATTCGCTATCCTCT-GCTTTAATCTGCACCGCTGCAATG-CAAGGGAAACAAGATTCGCTA
49 CAAGATTCGCTA-CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAA-AGAGATAGGATTCGCTG
*** ** * ** * *
24221855 CCTTTAGCTTTAATTTG-T----TCCA-CTA--T-AA----T---GCCAAAGAGATAGGATTCGC
112 CCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGC
* * * * * * *
24221904 TACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTC
177 TGCCCTCTGCTTTAATCTGCT---C--C-GC----T---G-C--AATGCTAGGGAAACAAGATTC
* * ** * * ** * * * * *** *
24221969 GCT-CCTCT-GCTTTAATCTGCTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCAT
226 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTT
* * * * *
24222032 TAATCTGTTCCAC-T-A--TA----AAGGC--AA----A--GAGATAG
291 TAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24222064 GATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTACTTTTTAGCTATTTCAA-GTCTTCACACCAGGGAGA
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCT-C-----CGC---TGCAATG-C-T------AGGGAAA
* * * * ** * ** * * * *
24222128 CAAGATTTGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGTTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTAC
49 CAAGATTCGCT-ACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGC
*** ** * * * **** ** * * * *
24222192 CTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTTCTCA--CAG-CTTTA
113 CCACAGCTTTAATCCGCTCCACT-T-CAG-CTATTTCA-AGTCTTAAC-GC-CAGGGAGAC--AA
* * * * * * * * *
24222254 -ATCCGCT-CCACTTCAGC--T-AT-T--TCAAGTCT-TAATGCCAAGGAGACAAGATTCGTTGC
170 GATTCGCTGCC-C-TCTGCTTTAATCTGCTC-CG-CTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCT-A
* ** * * * * * ** * * * * ***
24222310 CCTCT-GCACTAATCTGCTCCGCTACAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAAT
230 CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAAT
* * * * ** * ** * * *
24222374 CTGTTCCACTATAGAGCCAAATCGGTAGGATTCACTTCC-----CAC-A
295 CCGCTCCACT-T-CAGCTATTTC--AAGTCTTAAC-GCCAGGGAGACAA
* *** ** * ** * * * * * * *
24222417 GCTTTAAT-CCACTCCACTTCAA-CTATTTCAAGTCT-TAACGCCAGTGAGATAAGATTCGCTAC
1 GATTCGCTGCC-CTCTGCTTTAATCT-GCTC-CG-CTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTAC
** * * ** * * ** * * * ***
24222479 CCCTAGCTTTAATATGCTCCACTGCAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTACCGTTAGCTTTAATC
62 CTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATC
* * * ** * * * * *
24222544 TGTTCCAC-T-A--TA-AT-AA-----AA----A-AAAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTGAA
127 CGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAA
* * * * *
24222593 TCTGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCGCCCGGGAGACATGATTCGC-AGCCCTCTA-CT
192 TCTGCTCCGC-T--GC-A----ATG-C-TA------GGGAAACAAGATTCGCTA--CCTTTAGCT
* * *** ** * * ** * * *
24222656 ATAATCTGCTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCT----AC--CTTT-A---GCT--A-
239 TTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCAC
* * * * ** *
24222708 -T-A-ATATGTGCCA--CTATAAAGCCAAAGAGA-TA
304 TTCAGCTAT-TTCAAGTCT-TAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * * * *
24222739 GATTAGCTGCCCACAACTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACAACAGGGAGAT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGC-T--GC-A----ATG-C-T------AGGGAAAC
* * * *** ** * ** * * *
24222804 AAGATTCGC-AGCCCTCTA-CTATAATCTGCTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAGGATTCGCTAC
50 AAGATTCGCTA--CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGC
*** * * ** * * *
24222867 CTTTAGCTTTAAT---CT-GA-TCCA-CTA--T-AA----T---GCCAAAGAGATAGGATTCACT
113 CCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCT
* * * * *
24222916 GCCCACAGCTTTAATC-GCTCCACTTCAGCTATTTCGAGTATTAACGCTAGGGAGATAAGATTCG
178 GCCCTCTGCTTTAATCTGCT---C--C-GC---TGC-A--A-T---GCTAGGGAAACAAGATTCG
* * * * * * * ** * * * * * ***
24222980 CTGCCCTCAGCTTTAATCTGGTCCGCTGTAACA-CTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTTAGCTT
227 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA-AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTT
** * ** ***
24223044 TAATATG-T----TCCA-CTA--T--AG---T---GCCAAAGAGATTG
291 TAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * ** * * *
24223076 GATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTTTGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGAC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGC---TGC-A----ATG-C-T------AGGGAAAC
* * * * * * * ** * * ** * * * *
24223141 AAGATTCGCTGTCGTGT-GCATTAATGTGCTCCGCTGCAATACTAGGGAAACAAGATTCGCTACC
50 AAGATTCGCT-ACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCC
*** ** * * * **** *
24223205 TTTAGCTTTAATATGATCCACTCTAATGCCAAAGAGATAGGATTCGTT--C-CCA--CA-ACATT
114 CACAGCTTTAATCCGCTCCACT-TCA-G-CTATTTCA-A-G--TC-TTAACGCCAGGGAGACA--
* * * * * *
24223264 A-ATACGCAT-CACATCAGC--T-AT-T--TCAAGTCT-TAAAG-TCAGGGAGAA-AAGATTCGC
169 AGATTCGC-TGC-CCTCTGCTTTAATCTGCTC-CG-CTGCAATGCT-AGGGA-AACAAGATTCGC
* * * ** * * ** * * *
24223318 TACCCTCAGCTTTAATCTGCTTCGA-TGCAATGCTAGGGAAACCA-TATTCGCT----AC--CTT
228 TACCTTTAGCTTTAATCTG-TTCCACTATAAAGCCAAAGAGA-TAGGATTCGCTGCCCACAGCTT
* * * ** *
24223375 T-A---GCT----TTAATCTATTTC-A--CTATAATGCCAAAGAGA-TA
291 TAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCT-TAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24223412 GATGTCGCTACCCAT-AGCTTTAATCCGCTCCACAACAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAAGGAG
1 GAT-TCGCTGCCC-TCTGCTTTAATCTGCT---C--C-GC----T---G-C--AATGCTAGGGAA
* * * * * ** * ** * * *
24223476 ACTAGATTCAG-TACCCTCT-GCTTTAATTTGCTCCGCTGCAATGCTAGCGAAAGAAGATTCGCT
48 ACAAGATTC-GCTA-CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCT
* *** * * * * *
24223539 ACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCAC-T-A--TA----AAG-C-CAA----A--GAGATAGGATTCG
111 GCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCG
* * * * * * * * *
24223588 CTTCCCACAGCTTTAATCCACTCCATTTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGCAAGGGAGATAAGATT
176 CTGCCCTCTGCTTTAAT---CTGC---TCCGC-----T--G-C--AATGCTAGGGAAACAAGATT
* * * * ** * * * * * ***
24223653 TGCTGCCCTCT-GCTTTAATCTGCTCTGCTATAACG-C-TAGGGAAACGAGATTCGCTACCTTTA
225 CGCT-ACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATA-G-GATTCGCTGCCCACA
* * ** *
24223715 GCTTTAATCTG-T----TCCA-CTA--T-AA----T---GCCAAAGAGATAA
287 GCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24223751 GATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTTCACTTCCGCTATTTCAGGTCTTAGTGCCAGGGAGAC
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAAT---C-T-GC-TCCGC----T---G-C--AATGCTAGGGAAAC
* ** ** ** ** * ** * * *
24223816 AAGATTCGC-AGCCCTCTA-CCATAATCTGCGCCGTTGCAATGCTAGGGAGACAAGATTCGCTAC
50 AAGATTCGCTA--CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGC
*** ** * * * *
24223879 CTTTAGCTTTAATATGTTCCAC-T-A--TA----AAG-C-CAA----A--GAGA-TAGATCCGCT
113 CCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCT
* * * * * *
24223927 GCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCTCCAGGGAGACAAGATTCG
178 GCCCTCTGCTTTAAT---CT--GC-TCCGC---TGCAA----T-GCT--AGGGAAACAAGATTCG
* * ** * * ** * * ** * * * ***
24223992 C-AGCCCTCTA-CTATAATCTACTACATTGCAATGCGAGGGAGACAAGATTCGCTACCTTTAGCT
227 CTA--CCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCT
** * *
24224055 TTAATATGTTCCAC-T-A--TA----AAG-C-TAA----A--GAGA-TA
290 TTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAA
* * * *
24224087 GATTCG-TAGCCCTCTACTATAATCTGCTCTGTTGCAAT-CTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
1 GATTCGCT-GCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* *
24224150 TAGCTTTAATCTGATCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGTTGCCCACAGCTTTAATCCGC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * *
24224215 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTATTAACGCCAGGGAGATAAGATTCCCTGCCCTCAGCTTTAATCT
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* * ** * *
24224280 GCTCCGCTGAAACGCTAGGGGTACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAATG
195 GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
* * * **
24224345 CCAAAGAGATTGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATTCGTTCCACTTTTGCTATTTCAAGTCTTAA
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
*
24224410 CACCAGGGAGACAA
325 CGCCAGGGAGACAA
* * * * * *
24224424 GATTCACTGTCGTCTGCATTAATCTGCTCCGCTGCAATACTAGGGAAACAACATTCGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * * * *
24224489 AGCTTTAATATGTTCCACTCTGATGCCAAAGAGATAGGTTTCGTTGCCCAGAG-TATTAATCCG-
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCT-TTAATCCGC
* * * * * * * * *
24224552 TATCACATAAGCTATTTCAAGTCTTAAAGCCAGGGAGAAAAGAGTCACTACCCTCAGCTTTAATC
130 T-CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATC
* * * * * * * *
24224617 TGTTTCGATGCAATGCTAGGGAAACCATATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTATTTCACTATAAT
194 TGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAA
* * * *
24224682 GTCAAAGAGATA-GATGTCGCTACCCATAGCTTTAATCCGCTCCACATCAGCTATTTCAAGTCTT
259 GCCAAAGAGATAGGAT-TCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
* *
24224746 AACGCTAGGGAGACTA
323 AACGCCAGGGAGACAA
* * * * *
24224762 GATTCAG-TACCCTCTGCATTAATTTGCTTCGCTGCAATGTTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
1 GATTC-GCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTT
* * * * * *
24224826 TAGCTTTAATCCGTTCCGCTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCAC
65 TAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
* * * * *
24224891 TCCATTTCAGCTATTTTAAGTCTTAATGCAAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
130 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* ** * * *
24224956 ACTCCGCTATAATGCTAGGGAAACGAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCCCTATAATG
195 GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
* ** *
24225021 CCAAAGAGATAAGATTCGCTGCCCGTAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAG
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
24225086 CGCCAGGGAGACAA
325 CGCCAGGGAGACAA
* ** * * * * * *
24225100 GATTCACAACCCTCTACTATAATCTGCTCGGCTGCAA-ACTAGGGAAACAAAATTCACTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* *
24225164 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGGCCACAGCTTTAATCCACT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * **
24225229 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA-GACCAGGGAGATAAGATTCGCTGCACTAAGCTTTAATCT
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACG-CCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCT
* * *****
24225293 GCTCCGCTACGATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTA-C-----CTTT-A---G-----CT-NNNNN
195 GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAG
*****************************************************************
24225342 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
260 CCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAA
**************
24225407 NNNNNNNNNNNNNN
325 CGCCAGGGAGACAA
***************************************************************
24225421 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
*
24225486 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATTGGATTCGCGCTGCCCAC--CTTTAATCCG
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATT--CGCTGCCCACAGCTTTAATCCG
* * * * *
24225549 CTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTTTACTATAATC
129 CTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATC
* * * *
24225614 TACTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGGC-ACCTTTAGCTTTAATCTATTCCACTATAG
194 TGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC-GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAA
* * * * * * *
24225678 AGCCAAATAGATAGGATTCACTTCCCATAGCTTTAATCCACTGCACTTCAACTATTTCAAGTCTT
258 AGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTT
** *
24225743 AACGCCAGTAAGATAA
323 AACGCCAGGGAGACAA
* * * * * * *
24225759 GATTCGCTGCCCCCAGCTTTAATCTGCTCCACTACAACGCTAGGGAGACAAGATTTGCTACCTTT
1 GATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
* * * *
24225824 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCATGAATCTGCT
66 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCT
* * * * *
24225889 ACACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAAGATTCGCAGCCCTCTACTATAATCT-
131 CCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATCTG
* * * * *
24225953 CTCTGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGATGCACTATAATGC
196 CTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGC
* *
24226018 CAAAGAGATAGGATTTGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTATTAAC
261 CAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAAC
*
24226083 GCCAGGGAGATAA
326 GCCAGGGAGACAA
* * * **
24226096 GATTCGCTGCCCTCAGCTTTGATCTGCTCCGCTGTAACCCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTT
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* * *
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* * * * * * * *
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*
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* * * *
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* * * *
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* *
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* *
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* * * **
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* * * *
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*
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* * * *
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*
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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*
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* *
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CAAAGAGAT
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*
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* *
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* ** *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* **
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* * ** *
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* * *
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* *
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* * *
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*
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***************************************************************
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****************************************
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********************************************
24225440 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAGCTTTAATCTGTTCCACT
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * ** *
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* * ** *
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* * * * * * **
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* * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
24226453 TAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGCGACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACT
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* *
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* **
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* * * *
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* * * *** * *
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* * ** **
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* * *
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* * *
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** *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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*** * * *
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* * * *
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** * * * * *
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** * * *
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* * *
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* *
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* ** * *
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* *
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* * * *
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** * *
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* * * *
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* *
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*
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * ** * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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1 TAATCTGCTCCGCTGAAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACT
* * *
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* * * * * *
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131 TCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCACTGCCC-TCAGCTT
* * *
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1 TAATCTGCTCCGCTGAAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACT
* * * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * *
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131 TCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCACTGCCCTCAGCTT
* * * *
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* *
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* * * ** * * *
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* *
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* * * * * **
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* *
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* *
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* *
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*
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*
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* * * * *
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* * * **
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* * *
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* * **** * ** *
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*
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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906 GAGATAAGATTCG
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TTAAAGCAAGGGAGAAAAGAGTCACTACCCTCAGCTTTAATCTGTTGCGATCAACGCTAGGGAAA
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ACGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATCCACTGCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAG
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AATGCGAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATATGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGAT
AAGATTCGTAGCCCTCTACTATAATCTGCTCTGT
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* ** * *
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130 ATCTATT
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TCTATT
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* * * * *
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* *** * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* *
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* * * *
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* * ** *
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* *
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* * ** *
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* *
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* * *
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* * **
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* * * *
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*
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* * *
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* * * *
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*
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*
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* * ** * *
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66 GCCCTCTACTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAA
* * * *
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* * * * *
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* * * ** ** *
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* * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * *
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*
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* * * * * *
24236679 AGATAGGATCCGCTGCCCACAGATTTAATCCGCTCCCCTTCAACTATTTGAAGTCTTAGCGCCAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * * ** * * * *
24236744 GGAGACAAGATTCGCTGTCCTTTA-CAATAATCTACTCCGTTGTAATGCTAGGGAAATAAGATTC
66 GGAGATAAGATTCGCTG-CCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
* * * *
24236808 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGCTCCACTATAAAGCCCAAT
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * * * *
24236848 AGATATGATTCACTGCCCGCAGCTTTAATCCGCTTCATTTTAGCTATTTCAAGTCTTAA-GACAA
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACG-CCA
* *
24236912 GGGAGATAACATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTAG-TCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATT
65 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCT-GCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
* *
24236976 CGCTACCTGTAGCTTTAATCTGTCCCACTATAATGCCAAAG
129 CGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * * *
24237017 AGATAGGATTCGTTGCCCATAGCTGTAATCCACTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * * *
24237082 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTTATCTTTAATCTGTTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACATGATTCG
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
*
24237147 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAG
131 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * *
24237186 AGATAGGATTCGCTTCCCACTA-CTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCAAATGTTAATGCCA
1 AGATAGGATTCGCTGCCCAC-AGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCA
* * * * * * **
24237250 GAGACATAAGATTCGCTACCCTAAGCTTTCATCTGCTCGGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTC
65 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
* *
24237315 ACTACCTTTAGGTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24237355 AGATAGGATTCGCTGCCCATAGCTTTAATCCGCTCCACCTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGACAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* *
24237420 GGGGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
* *
24237485 CAACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAG
131 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * *
24237524 AGATAGGATTCGCTTCCCACTGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTATTAATGCC--
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * * * **
24237587 GGAGGCATAAGATTCGCTACCCTCATCTTTCATCTGCTCGGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATT
66 GGA-G-ATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
*
24237652 CGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
129 CGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * * *
24237693 AGATATGATTCACTGCCCAGAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCGTAACACCAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * * * *
24237758 TGAGATAAGATTCGCCAG-CCTCAGCTTTAATTTGCTCCGCTGTAATGCTAGGGAAACAAGATTT
66 GGAGATAAGATTCG-CTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
* *
24237822 GCTATCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCCAAG
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * * * *
24237862 AGATATGATTCCCTACCCACAGCTTTAATCTGCTTCA-TTTATGCTATTTCAAGTCTTAACACCA
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCA-GCTATTTCAAGTCTTAACGCCA
* * * * *
24237926 GAGAGATAAGATTCACTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGTAATTCTAGGAAAACAAGATTC
65 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
* * * *
24237991 GCAACCTTTAGCTTTAATTTGTTCCACTACAATGCCAATG
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24238031 ATATAGGATTCGCAT-CCCACAGCTGTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCA
1 AGATAGGATTCGC-TGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCA
** * * *
24238095 AAGAGATAAGATTCGCTGCCGTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGAAAACAAGATTC
65 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
* * *
24238160 ACTACCTGTAGCTTTAATCTATTCCACTATAATGCCAAAG
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * *
24238200 AGATAGGATTCGCAGCCCACAGCTGTAATCCACTCCACTTCAGCTA-TTCAAAGTCTAAACACCA
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* * *
24238264 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTTAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGGTAGGGAAACATGATTC
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* *
24238329 GCTACCATTAGCTTTAATCTGTTCCACTATCATGCCAAAG
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* * * * * * *
24238369 AGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCTGCTTCATTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGCTAG
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* ** * ** * *
24238434 GGAGACAAGATTCGCTGCCCTTTGCTTTAATCTGCTTCGAGGCAATGCTGGGGAAACAAGATTTG
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
*
24238499 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACAATAATGCCAAAG
131 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * * *
24238538 AGATAGGGTTCACTACCCATAGCTTTATTCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACG-CAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * ** * * * * *
24238602 TGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTCCCTTAATCTGC-CCTGCTGCAAAGCTAGTGAAACAAAATTT
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCC-GCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
* *
24238666 G-TGACCTTTAGCTTTAATTTGTTCCACTATAAAGCC-AAG
130 GCT-ACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24238705 AAGATAGGATTTGCTTCCCACAACTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCA
1 -AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCA
* *
24238770 GGGAGATAAGATTCGTTGCCCTCGGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
65 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
*
24238835 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCTAAG
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24238875 AGATAGGATTCGTTGCCCACAACTTTAATCCGCTTCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * * ** * * *
24238940 GGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTA-CTTTATTCTACGT-CGAGGTAATGCTAGAGACACAAGATT
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTC-AGCTTTAATCTGC-TCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
* * *
24239003 CGCTACCATTAGCTTTAATCTGTACCACTATAATACCAAAG
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** * * * * *
24239044 AGATATTATTCGCTACCCACAGCTTTGATCTGCTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTCACGCCAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * * * * *
24239109 GGAGATAAGATTCGATGCCCTCTGCTTTAATCTGGTCTGCTGCAAAGCTAGGGAAATAAGATTCG
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
*
24239174 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAG
131 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * * * * * * *
24239213 ATATAAGATTCACTTCTCACTA-CATTAATCCGCTCCACTTTC-GCTATTTCAAGTGTTCATGCC
1 AGATAGGATTCGCTGCCCAC-AGCTTTAATCCGCTCCAC-TTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCC
* * * * * * **
24239276 AAGGACATAAGATTCACTACCCTCAGCTTTCATCTGCTCGGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATT
64 AGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATT
* * **
24239341 CGCTACCTTTAGGTTTACTCTGTTGAACTATAATGCCAAAG
129 CGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24239382 TGATAGGATTCGCTGCCCACAGCCTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTTAAGTCTTAATGCCAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* *
24239447 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTTCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCG
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
* * *
24239512 CTATCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTAGAAAGCCAAAG
131 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24239551 AGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCGCTCTACTTCAGGTATTTCAACTCTTAACGCCAG
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
* * *
24239616 GGAGAGAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGGAACGCTAGGGAAACAAGATTCG
66 GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
*
24239681 CTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAATGCC-AAG
131 CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * * *
24239719 AAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCTCTCCACTTCAGGTATTGCAAGTCTTAACACCA
1 -AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCA
* * *
24239784 GGGAGATAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACAAGAGTC
65 GGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTC
24239849 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
130 GCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
* * *
24239889 AGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCTGCTCC
1 AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCC
24239925 GCTGCAATGC
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AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAG
GGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCG
CTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAG
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* * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
24236533 TATAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCA
261 TATAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATCTGTCCCA
* * * *
24236598 CTATAGAGCCAAATAGATACGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTTAACTATTTGA
326 CTATAGAGCCAAAGAGATACGATTCACTTCCCACAGCTGTAATCCACTCCACTTTAACTATTTCA
*
24236663 AGTCTTAACGCCAGG
391 AGTCTTAACACCAGG
* * * * * * *
24236678 TAGATAGGATCCGCTGCCCACAGATTTAATCCGCTCCCCTTCAACTATTTGAAGTCTTAGCGCCA
1 GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGCAA
* * * * *
24236743 GGGAGACAAGATTCGCTGTCCTTTA-CAATAATCTACTCCGTTGTAATGCTAGGGAAATAAGATT
66 GGGAGACAAGATTCGCTG-CCCTCAGCAATAATCTACTCCGCTGTAACGCTAGGGAAACAAGATT
* * * * *
24236807 CGCTACCTTTAGCTTTAATCTGCTCCACTATAAAGCCCAATAGATATGATTCACTGCCCGCAGCT
130 CGCTACCTTTAGCATTAATCTGCTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCT
* ** * * *
24236872 TTAATC-CGCTTCATTTTAGCTATTTCAAGTCTTAAG-ACAAGGGAGATAACATTCGCTGCCCTC
195 TTAATCTC-CTCCACCTCAGCTATTTCAAGTCTT-AGTACAAGGGAGACAACATTCGCAGCCCTC
*
24236935 -AGCTTTAATCTAG-TCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATCTG
258 TA-CTATAATCT-GCTCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATCTG
* * * *
24236998 TCCCACTATA-ATGCCAAAGAGATAGGATTC-GTTGCCCATAGCTGTAATCCACTCCACTTTAGC
321 TCCCACTATAGA-GCCAAAGAGATACGATTCACTT-CCCACAGCTGTAATCCACTCCACTTTAAC
24237061 TATTTCAAGTCTTAACACCAGG
384 TATTTCAAGTCTTAACACCAGG
*
24237083 GAGATAAGATTCGCTGCCC
1 GAGATAGGATTCGCTGCCC
24237102 TTATCTTTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.27, C:0.26, G:0.18, T:0.29
Consensus pattern (405 bp):
GAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCAAGTCTTAACGCAA
GGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCAGCAATAATCTACTCCGCTGTAACGCTAGGGAAACAAGATTC
GCTACCTTTAGCATTAATCTGCTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAGCTT
TAATCTCCTCCACCTCAGCTATTTCAAGTCTTAGTACAAGGGAGACAACATTCGCAGCCCTCTAC
TATAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATCTGTCCCA
CTATAGAGCCAAAGAGATACGATTCACTTCCCACAGCTGTAATCCACTCCACTTTAACTATTTCA
AGTCTTAACACCAGG
Found at i:24237197 original size:912 final size:909
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Indices: 24235878--24237582 Score: 2481
Period size: 912 Copynumber: 1.9 Consensus size: 909
24235868 GCTTCGATGC
* * * *
24235878 AATGCTAGGGAAACCAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTTCACTATAATGCCAAAGAGAT
1 AATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGCTCCACTATAAAGCCAAAGAGAT
* *
24235943 AGAAGTCACTACCCACAACTTGCCGCTCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCATGGAGACT
66 AGAAGTCACTACCCACAACTTGCCGCTCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCAAGGGAGACT
* * * * * * *
24236008 AGATTCATTACCTTCTGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAATAAGATTCGCTACCTT
131 ACATTCACTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCGCTACCTG
* * *
24236073 TAGCTTTAATCCATTCCACTATAATACCAAAGAGATAGAATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGC
196 TAGCTTTAATCCATCCCACTATAATACCAAAGAGATAGAATTCGCTGCCCACAGCTGTAATCCAC
*
24236138 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACTAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATAT
261 TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATAT
*
24236203 GCCCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCTAATATAAAG
326 GCCCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCAATATAAAG
* * *
24236268 CCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCAC-AGCTTTAATCCGCTCCATTTCAGCTATTTCAAGTCTTA
391 CCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACTA-CTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCAAATCTTA
* * * * * * * *
24236332 ATGCAAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGTAACGCTAGGGAAGCG
455 ATGCAAGAGACATAAGATTCGCTACCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACA
*
24236397 AGATTCGCTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
520 AGATTCACTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCA
** *
24236462 CAGCTTTAATCTC-CTCCACCTCAGCTATTTCAAGTCTTAGTGCCAGGGAGACAAGATTCGCAGC
585 CAGCTTTAATC-CGCTCCACCTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGACAGGGAGACAAGATTCGCAGC
** *
24236526 CCTCTA-CTATAATCTGCTCCGTTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAAT
649 CCTC-AGCTATAATCTGCTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTTAGCTTTAAT
* * * *
24236590 CTGTTCCACTATAGAGCCAAATAGATACGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTTAA
713 CTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATACGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAA
* *
24236655 CTATTTGAAGTCTTAACGCCAGGTAGATAGGATCCGCTGCCCACAGATTTAATCCGCTCCCCTTC
778 CTATTTCAAGTATTAACGCCAGGTAGATAGGATCCGCTGCCCACAGATTTAATCCGCTCCCCTTC
24236720 AACTATTTGAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGTCCTTTACAATAATCTACTCCGTT
843 AACTATTTGAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGTCCTTTACAATAATCTACTCCGTT
24236785 GT
908 GT
* * *
24236787 AATGCTAGGGAAATAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGCTCCACTATAAAGCCCAATAGAT
1 AATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGCTCCACTATAAAGCCAAAGAGAT
* * * * * * ** *
24236852 ATG-ATTCACTGCCCGCAGCTTTAATCCGCTTCATTTTAGCTATTTCAAGTCTTAA-GACAAGGG
66 A-GAAGTCACTACCCACAAC-TT--GCCGCTCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACG-CAAGGG
* *
24236915 AGA-TAACATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTAG-TCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCG
126 AGACT-ACATTCACTACCCTCAGCTTTAATCT-GCTCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCG
** * * * *
24236978 CTACCTGTAGCTTTAATCTGTCCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGTTGCCCATAGCTGT
189 CTACCTGTAGCTTTAATCCATCCCACTATAATACCAAAGAGATAGAATTCGCTGCCCACAGCTGT
* * *
24237043 AATCCACTCCACTTTAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCT-TATC
254 AATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCT-GC
* ** *
24237107 TTTAATCTGTTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACATGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCA
318 TTTAATATGCCCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCA
*
24237172 CTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACTACTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCA
383 ATATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACTACTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCA
* * * *
24237237 AATGTTAATGCCAGAGACATAAGATTCGCTACCCTAAGCTTTCATCTGCTCGGCTGCAACACTAG
448 AATCTTAATGCAAGAGACATAAGATTCGCTACCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAG
**
24237302 GGAAACAAGATTCACTACCTTTAGGTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCG
513 GGAAACAAGATTCACTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCG
* * * *
24237367 CTGCCCATAGCTTTAATCCGCTCCACCTCAGCTATTTTAAGTCTTAACGACAGGGGGATAAGATT
578 CTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACCTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGACAGGGAGACAAGATT
* *
24237432 CGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTTAGCT
643 CGCAGCCCTCAGCTATAATCTGCTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTTAGCT
* * *
24237497 TTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACTGCTTTAATCCACTCCAC
708 TTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATACGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCACTCCAC
*
24237562 TTCAGCTATTTCAAGTATTAA
773 TTCAACTATTTCAAGTATTAA
24237583 TGCCGGAGGC
Statistics
Matches: 699, Mismatches: 86, Indels: 19
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Matches are distributed among these distances:
909 71 0.10
910 3 0.00
911 5 0.01
912 618 0.88
913 2 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.26, G:0.17, T:0.30
Consensus pattern (909 bp):
AATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGCTCCACTATAAAGCCAAAGAGAT
AGAAGTCACTACCCACAACTTGCCGCTCCACATCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCAAGGGAGACT
ACATTCACTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGAAAACAAGATTCGCTACCTG
TAGCTTTAATCCATCCCACTATAATACCAAAGAGATAGAATTCGCTGCCCACAGCTGTAATCCAC
TCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTTTAATAT
GCCCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCAATATAAAG
CCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACTACTTTAATCCGCTCCACTTCAACTATTTCAAATCTTAA
TGCAAGAGACATAAGATTCGCTACCCTAAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACAA
GATTCACTACCTTTAGCATTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCAC
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TCAGCTATAATCTGCTCCACTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCAACCTTTAGCTTTAATCTG
TTCCACTATAAAGCCAAAGAGATACGATTCACTTCCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAACTA
TTTCAAGTATTAACGCCAGGTAGATAGGATCCGCTGCCCACAGATTTAATCCGCTCCCCTTCAAC
TATTTGAAGTCTTAGCGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGTCCTTTACAATAATCTACTCCGTTGT
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* *
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*
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* * * *
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* * *
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* * **
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* *
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*
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* * * * * * *
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** * *
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521 TGCAACACTAGGGAAACAAGATTCACTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAGAGCCAAAGA
* * * *
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* *
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* * **
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1 TAATCTACTCCGCTGCAATGCTAGGGAAATAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCCACTCCACT
* * * * * *
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66 ATAATA-CCAAAGAGATA-GAATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCA
* * * *
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129 AGTCTTAACACAAGGGAGACAACATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATAT-GCCCCGCTGCAATGCTA
* *
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193 GGAAAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATCTGTCCCAATATAAAGCCAAAGAGATAGGATTC
* *
24237028 G-TTGCCCATAGCTGTAATCCACTCCACTTT-AGCTATTTCAAGTCTTAACACCAGGGAGATAAG
258 GCTT-CCCACAGCTGTAATCCACTCCA-TTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACAAGGGAGATAAG
* * * *
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321 ATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACGA-GATTCGCTACCTTT
* *
24237155 AGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACTA-CTTTAATC-CG
385 AGCATTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCAC-AGCTTTAATCTC-
* * * * *
24237218 CTCCACTTCAACTATTTCAAATGTTAATGCCAGAGACATAAGATTCGCTA-CCCT-AAGCTTTCA
448 CTCCACCTCAACTATTTCAAATCTTAATGCCAGAGACACAAGATTCGC-AGCCCTCAA-CTATAA
* *
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511 TCTGCTCCGCTGCAACACTAGGGAAACAAGATTCACTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATA
* * * * *
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* * * * *
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TCTTAACACAAGGGAGACAACATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATATGCCCCGCTGCAATGCTAGGA
AAACAAGATTCGCTACCTGTAGCTTTAATCTGTCCCAATATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCT
TCCCACAGCTGTAATCCACTCCATTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACACAAGGGAGATAAGATTCG
CTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACGAGATTCGCTACCTTTAGCATT
AATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCTCCTCCACCT
CAACTATTTCAAATCTTAATGCCAGAGACACAAGATTCGCAGCCCTCAACTATAATCTGCTCCGC
TGCAACACTAGGGAAACAAGATTCACTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAGAGCCAAAGA
GATACGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACCTCAACTATTTGAAGTCTTAACGACAGG
GAGATAAGATCCGCTGCCCACAGATTTAATCCGCTCCCCTTCAACTATTTGAAGTCTTAGCGCCA
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* * *
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* * * * ** * * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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*
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* * *
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* * * *
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* * **
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*
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* *
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** *
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* * * * * * *
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* *
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*
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CAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAAGGAAACAAGAGTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGT
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TTCACTACCCA
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* * ** * * * * * * * ***
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AGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCAC
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* * * * **
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* * ** *
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* * * *
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** ** * *
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196 CTCAGCTTTAATCTGATCCGAGGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCT
* * * *
24239531 GTTCCACTAGAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTAATCCGCTCTACTTCAGGT
261 GTTCCACTAGAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCT
* * * *
24239596 ATTTCAACTCTTAACGCCAGGGAGAGAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGGAA
326 ATTTCAACTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCAGCCTTAATCTGCTCAGCTGCAA
* *
24239661 CGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAATGCC-AAGAAGATA
391 AGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAG-AGATA
* * * *
24239725 GGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCTCTCCACTTCAGGT-ATTGCAAGTCTTAACACCAGGGAG
455 GGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTTCAGCTAATT-CAAGTCTTAACACCAGGGAG
* *
24239789 ATAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACAAGAGTCGCTAC
519 ATAAGATTCGCTACCCTCAGCTTGAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACAAGAGTCACTAC
24239854 CTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTA-TA
584 CTTTAGCTTTAATCTGTTCCAC-AGTA
* * *
24239880 ATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACA
1 ATGCCAAGGAGATAGGATTCACTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACA
* * *
24239945 AGAGTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCA
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** * *
24240010 CAGCTTTAATCCGCTTTATTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTGCC
131 CAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCC
* * *
24240075 CTCTGCTTTAATCTGATTCGAGGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCT
196 CTCAGCTTTAATCTGATCCGAGGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCT
* * *
24240140 GTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGGTTCACTACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCT
261 GTTCCACTAGAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCT
** * *
24240205 ATTTCATGTCTTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCCTTAATCTGCTCAGCTGCAA
326 ATTTCAACTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCAGCCTTAATCTGCTCAGCTGCAA
* *
24240270 AGCTAGGGAAACAAGATTTGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAG
391 AGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAG
* *
24240335 GATTCACTTCCCACAACTTTAATCCACTCCACTTCAGCTAATTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGAT
456 GATTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTTCAGCTAATTCAAGTCTTAACACCAGGGAGAT
* * * *
24240400 AAGATTCGCTGCCCTCAGCTTGAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCACTAGCT
521 AAGATTCGCTACCCTCAGCTTGAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACAAGAGTCACTACCT
24240465 TTAGCTTTAATCTGTTCCACAGTA
586 TTAGCTTTAATCTGTTCCACAGTA
* * * **
24240489 ATGCCAAGGAGATAGGATTCGCTGCCCTCAGCTTGAATCTGCTATGCTGCAATGCTAGGGAAACA
1 ATGCCAAGGAGATAGGATTCACTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAGGGAAACA
* * **
24240554 AGATTCACTAGCTTTAGCTTTAATCTGTTCCAC-AGTAATGCCAGGGAGATAGGATTCGCTGCCC
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*
24240618 TCAGCTTTAAT
130 ACAGCTTTAAT
24240629 TTGCTCGGCT
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CTCAGCTTTAATCTGATCCGAGGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCT
GTTCCACTAGAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCT
ATTTCAACTCTTAACGCCAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCAGCCTTAATCTGCTCAGCTGCAA
AGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAG
GATTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTTCAGCTAATTCAAGTCTTAACACCAGGGAGAT
AAGATTCGCTACCCTCAGCTTGAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAGGGAAACAAGAGTCACTACCT
TTAGCTTTAATCTGTTCCACAGTA
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* * *
24239448 GAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTTCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCGC
1 GAGATAAGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCGC
* * * *
24239513 TATCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTAGAAAGCCAAAGAGATAGGATTCGCTTCCCACAGCTTTA
66 TACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCAC-TCCCACAGCTTTA
* * *
24239578 ATCCGCTCTACTTCAGGTATTTCAACTCTTAACGCCAGGGAGAGAAGATTCGCTGCCCTCAGCTT
130 ATCCGCTCTACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTT
*
24239643 TAATCTGCTCCGCTGG-AACGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCAC
195 TAATCTGCTCCGC-GGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCAC
* *
24239707 TATAATGCC-AAGAAGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCTCTCCACTTCAGGTATTGCA
259 TATAATGCCAAAG-AGATAGGATTCGCTGCCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTGCA
* * *
24239771 AGTCTTAACACCAGGGAGATAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAACGCTAG
323 AGTCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCAGCTGCAAAGCTAG
* *
24239836 GGAAACAAGAGTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAA
388 GGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAA
* * *
24239888 GAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACAAGAGTCGC
1 GAGATAAGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACAAGATTCGC
24239953 TACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTA
66 TACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACT-CCCACAGCTTTA
* * * * *
24240018 ATCCGCTTTATTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCTT
130 ATCCGCTCTACTTCAGCTATTTCAAGTCTTAACGCCAGGGAGATAAGATTCGCTGCCCTCAGCTT
* * *
24240083 TAATCTGATTCGAGGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACT
195 TAATCTGCTCCGCGGCAATGCTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACT
* * * * *
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* * * * *
24240213 TCTTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCTGCCTTAATCTGCTCAGCTGCAAAGCTAGGG
325 TCTTAACACCAGGGAGACAAGATTCGCTACCCTCAGCTTTAATCTGCTCAGCTGCAAAGCTAGGG
*
24240278 AAACAAGATTTGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAAAGCCAAA
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* * * ** *
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* * * * * * * * ** * ** * * *
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51 -GGAAACAAGATTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTC
* * * * * * *
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* ** * * * *
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** *
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** * ** * * * * *
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** * * ** * * * * *** * *
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24240749 TTCAAGTCCTAACTCTA
432 ---AAG-CC-AA----A
* ** *
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1 --GAGATAAGATTCACTGCCCACAGCTTTAATCTGCTCCGCTGCAATGCTAAGGAAACAAGATTC
* *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * *
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*
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*
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *** *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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**
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* * * * * ** ** *
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* * *
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* ** * *
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* ** *
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** *
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* * *
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*
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* * *
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* **
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*
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*
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* * * * *
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* ** * * *
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* * ** * * * *
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* * *
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195 ATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAG
* * * * **
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260 TCCTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGATCCGAGGCAATGCTAGGG
* *
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325 AAACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACT
* * * *
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** * * *
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* * * * *
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520 AATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTT
*
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AATCTGCTCCGCTACAACACGAAGGAAACAAGAGTCGCTACCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACTA
TAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTACCCACAGCTTTAATCCGCTCCACTTCAGCTATTTCAAGT
CCTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGCTGCCCTCAGCTTTAATCTGATCCGAGGCAATGCTAGGGA
AACAAGATTCGCTACCTTTAGATTTAATCTGTTCCACTATAATGCCAAAGAGATAGGATTCACTA
CCCACAGCTTTAATCCACTCCACTTCAGCTATTTCAAGTCCTAACGCTAGGGAGACAAGATTCGC
TGCCCTCAGCCTTAATCTGCTCAGCTGCAAAGCTAGGGAAACAAGATCCGCTACCTTTAGCTTTA
ATCTGTTCCACTATAAAGCCAAAGAGATAGGATTCACTGCCCACAACTTTAATCCACTCCACTTC
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GCAATGCTAGGGAAACAAGATTCACTAGCTTTAGCTTTAATCTGTTCCACAGTAATGCCAA
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* * * * *
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* * *
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1 CTAGGGAAACAAGATTCGCTACCTTCAGCTTTAATCTGCTCCACTACAATG
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1 C
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* * * * ** ** *
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* *
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*
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*
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* * *
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*
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* * * *
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* *
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*
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* * *
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* ** * *
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** * * *** *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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*
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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*
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** * * *
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* * *
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* * * * ** * *
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*
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AGAAAAAAATATAAAAATGGAACCAGCAACGGAAGCACAAAATGGAAGTTCCTCCAATAGTCAAG
AAGAAAACCACAAAGAAGAAGGATGATGAACCTACACAATGGCAACGTAGGTTAGGAAAAGATGT
GCATTACAACACGAGACTACTAGAGTCGATCAAGTCATTTAAGAAACATTTATGGCGAGCCAGGC
GGCAAAGGGCACAAAGTGGCCCAAGAGAGCGAGCAATTCATCCAAGGCCAATGCGACCGAAAAGG
AAGAGGAAGAAAAAGCAC
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** * * *
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* ** * * * *
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*
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* * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * **
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* * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * *
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* * *
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*
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* *
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*
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* *
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TTTTATATAT
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24397857 TTTTGATGTA
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*
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*
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TTTTATAATTTTTATATAT
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*
24398001 TTTTTAATTTTTTGTCATATGTCACATCGTGA
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1 TT
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AATTTCATTAATTATAAAATTATATACAGTTAATTTATTAAATATAAATAAATATAAATCTTTTA
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*
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A
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24405712 TTTGGTTATA
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*
24405740 TTTATTTTTGATATGTT
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1 T
24405758 CATTTAAAAC
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TTTAATTTTGATATGTT
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24407630 TCCAAGGGAT
24407640 GTCATGACATGTTTTGATAAATGAATAGTATTTAACTCGTAATAACAAAAAAATTATTTGGTAAA
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* *
24407705 ATTTGGTAATGTTTCATAACCTATTTCGACGACGAATACGGGTAGGGGGTATTACATTTGTTGGT
66 ATTTGGTAATGTTTCATAACCTATTTCGACGACGAATACGGATAAGGGGTATTACATTTGTTGGT
* *
24407770 ATCAGAGCTTTGATTTAGTCGGTTCTCGGATCGAC
131 ATCAGAGCTTCGATTTAGCCGGTTCTCGGATCGAC
* *
24407805 GTCATGACATGTTTTGATAAATGAATAGTATTTAACTCGTAATAACAAAATATTTATTTGGTAAA
1 GTCATGACATGTTTTGATAAATGAATAGTATTTAACTCGTAATAACAAAAAAATTATTTGGTAAA
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66 ATTTGGTAATGTTTCATAACCTATTTCGACGACGAATACGGATAAGGGGTATTACATTTGTTGGT
*
24407935 ATCAGAGCTTCGATTTAGCCGGTTCTCTGATCGAC
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1 GT
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ATCAGAGCTTCGATTTAGCCGGTTCTCGGATCGAC
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24415686 CCGGTTAACA
* * *
24415696 TAGTAGCTTGCACATAGTACTACACATGTGACCATCACTATCCGATGCACG
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* * * *
24415747 TAGTAGCCTGCACATATAGTACTACACACGTGATCGAAGC-TATCTGGT-ATG
1 TAGTAGCCTGCAC--ATAGTACTACACATGTGA-C-CATCATATCCGGTCATG
*
24415798 CATAGTAGCCTGCACATAGTACTACACATGCGACCTATCAT-TCCGGTACATG
1 --TAGTAGCCTGCACATAGTACTACACATGTGACC-ATCATATCCGGT-CATG
*
24415850 TAGTAGCCTGCACATAGTACTACACACGTGACCATCA
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24415887 CTTTCACTTT
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24435882 TATTATAGTT
*
24435892 TGAGTCTTTAATTATGTCATAATTTGAACATTATTAATA
1 TGAGTATTTAATTATGTCATAATTTGAACATTATTAATA
*
24435931 TGAGT-TTTAATTATATCATAATTTGAACATTATTAATA
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* * *
24435969 TGGGTATTTAATTATGTCATAGTTCGAACATGT-TTAATA
1 TGAGTATTTAATTATGTCATAATTTGAACAT-TATTAATA
24436008 CTTGTTTTCA
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24443584 ACTCTGTCAG
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* *
24443618 TTGTCATTGTTGAGTTATAGTCTT
1 TTGTCATGGTCGAGTTATAGTCTT
24443642 ACACCCTATA
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TTGTCATGGTCGAGTTATAGTCTT
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24450095 TCCTATACAT
24450105 GTATGCTCATACTAGCTCTGAATCG
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*
24450130 GTATGCTCATATTAGCTCTGAATCG
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* * * *
24450155 GTATGCTCTTACGAGCTAT-AAACG
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*
24450179 GTAAGCTCATA
1 GTATGCTCATA
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Statistics
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24460078 AGGAAAAAAA
* *
24460088 AAGCCTTTGTAGCGATCTAAGAAAAAGG
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*
24460116 GAGCCTTTGTGGCGATCTATGAAAAATGG
1 AAGCCTTTGTGGCGATCTATGAAAAA-GG
* * *
24460145 --GCCTTTGTGGTGACCTATAAAAAAGG
1 AAGCCTTTGTGGCGATCTATGAAAAAGG
* * * *
24460171 AAGCGTTTGTGGCAACCTATGAAAACGG
1 AAGCCTTTGTGGCGATCTATGAAAAAGG
* * *
24460199 AAGCCTTTGTGGCAATCTATGAAAACGA
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1 AAGCCTTT
24460235 TATGGTGATT
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 14, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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AAGCCTTTGTGGCGATCTATGAAAAAGG
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* *
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* * *** * *
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*
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1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAA-T
*
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1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACC-ATCGAAT
* *** * *
24467193 ATGAAAAGGGATAGTTTTGACTATCGACT
1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAAT
*
24467222 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATTGAAT
1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAAT
* *** * *
24467251 ATGAAAAGGGATAGTTTTGACTATCGACT
1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAAT
* * *
24467280 ATGAAAAGGGATAGTGATGACCATCAAAT
1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAAT
* ** * *
24467309 AT-AAAATGGGATAGCT-TTGACTATCGACT
1 ATGAAAA-GGGAT-GGTGACGACCATCGAAT
* *
24467338 ATGAAAAGGGATGGCGATGACCATC-AACT
1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAA-T
* * * *
24467367 ATGAAAACGGATTGTGATGACCATCGATT
1 ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAAT
* ** **
24467396 AATGAAAAGGGCTGGTTTCGATTATCGAAT
1 -ATGAAAAGGGATGGTGACGACCATCGAAT
* *
24467426 ATGAAAAGGGATGGTGACGAACAACGAAT
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1 ATGAAAA
24467462 TGAATGGTTT
Statistics
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* * * * * * ** * *
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* * *
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* ** * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * * *
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*
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** *
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*
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* ** * *
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* * * *
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* ** **
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* * *
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***
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* *** * *
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* * *
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* *
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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* * * **
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* * *
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* *
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*
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* * *
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* *
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* * *
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* *
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*
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*
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*
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* * *
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** * *
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*
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1 AC
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* * * * *
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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* *
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* *
24547464 TTGACTTAGATGAGTCTATCCCAACCCTTCTAAGG
1 TTGCCTTAGATGAGTCTATCCCAACCCTTTTAAGG
* * *
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Consensus pattern (35 bp):
TTGCCTTAGATGAGTCTATCCCAACCCTTTTAAGG
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* *
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Statistics
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GGGTCTATCCCAACCTTTTTAAGGTTGACCTTAGAC
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Alignment explanation
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24550005 TAATGATAAA
*
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* * ** *
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1 TTTATTAGTTAAATTTA
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Statistics
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TTTATTAGTTAAATTTATATT
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Alignment explanation
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24551461 TGTGTGTTTT
* * **
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1 TATTATTTATTCTTAATTTCTAAATAATAA
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1 TATTATTTAT
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Statistics
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TATTATTTATTCTTAATTTCTAAATAATAA
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Alignment explanation
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*
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1 AAAGATATTTGAAAAAAAGTAAAAAATGAAAAAGAAAATT
* *
24552373 AAAGATGTTTG-AAAAAATTAAAAAATGAAAAAGAAAATT
1 AAAGATATTTGAAAAAAAGTAAAAAATGAAAAAGAAAATT
24552412 A
1 A
24552413 GAATAAACAT
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 3, Indels: 1
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AAAGATATTTGAAAAAAAGTAAAAAATGAAAAAGAAAATT
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Alignment explanation
Indices: 24555503--24555535 Score: 52
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24555493 AATCCAAAAT
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1 TTTTCAAATATA
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1 TTTTCAAATATA
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1 TTTTCAAATAT
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TTTTCAAATATA
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Alignment explanation
Indices: 24556337--24556362 Score: 52
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24556327 CTGTCAATGA
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1 ATAAATGAACCAG
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Found at i:24562495 original size:50 final size:50
Alignment explanation
Indices: 24562424--24562570 Score: 224
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24562414 NNNNNNNAAA
*
24562424 ATGAGAGGTCTCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCGTTGGCA-CTGAG
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24562474 ATGAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCGTTGGCATCGAG
1 ATGAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCGTTGGCATCGAG
** **
24562524 ATGAGAACATCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGATTTGGCAT
1 ATGAG-AGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCGTTGGCAT
24562571 GTTATTATCA
Statistics
Matches: 90, Mismatches: 5, Indels: 3
0.92 0.05 0.03
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (50 bp):
ATGAGAGGTCCCATGTAAGACCATGTCTGGGACATGGCGTTGGCATCGAG
Done.