Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold243 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 1218968

Tables:   1   2   3   4   

This is table  3  of  4  ( 476 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
636353--636500
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211
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23
21
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
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Score
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38
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.8
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54
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0
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2.6
26
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799196--799256
26
2.3
26
97
0
113
42
26
18
13
1.86
799434--799657
27
8.3
26
81
5
243
18
20
17
42
1.89
799435--799657
54
4.1
54
81
3
270
18
21
17
43
1.89
799436--799657
80
2.8
81
87
2
322
18
21
17
42
1.89
799822--799872
18
2.8
18
81
0
75
25
23
17
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
806320--806352
16
2.1
16
94
0
57
36
6
33
24
1.80
806561--806602
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
806570--806611
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
808972--809039
33
2.1
33
91
0
109
47
11
30
10
1.74
808979--809049
33
2.2
33
82
5
81
52
9
30
7
1.61
809076--809112
19
1.9
19
94
0
65
45
10
43
0
1.39
817234--817605
136
2.7
135
84
4
462
31
25
21
22
1.98
822659--822744
29
3.0
29
87
0
109
25
24
11
38
1.89
827652--827693
18
2.3
19
80
19
54
26
4
23
45
1.73
830886--831030
72
2.0
73
98
1
283
53
4
24
17
1.61

Tables:   1   2   3   4