Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397363.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_169.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 39454
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.12, T:0.37
Warning! 1641 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:500 original size:171 final size:168
Alignment explanation
Indices: 284--690 Score: 418
Period size: 171 Copynumber: 2.4 Consensus size: 168
274 AATTGACAGT
* * * * * * *
284 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTCTAAAAACCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
1 AAAAGTCCATCTATAGTCACCCATGCCACCAAAAGCCTTATTACTC-CTTTAAATGGTTTTATAA
349 TCTCATAGTTGATTTCAAGATGAATTATTTTACATTGTTTC-TTAAAACAGAA-TATAATTGAAT
65 TCTCATA-TTGATTTCAAGATGAATTATTTTACA-T-TTTCATTAAAACA-AATTATAATTGAAT
* *
412 ATTTGCCTTCGGCAACATGAAAAAAAAACCATTCATTAAG-AAA
126 ATTTACCTTCGGAAACATGAAAAAAAAACCATTCATT-AGCAAA
* * * * * *
455 AAAAGTTCATTTATAGTGACCCATGCCACCCAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATCTATAGTCACCCATGCCACCAAAAGCCTTATTACTC-CTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * * *
520 TCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTCAATTTAAACAAATTATATTTGAATGT
65 TCTCA-TATTGATTTCAAGATGAATTATTTTACATTTTC-ATTAAAACAAATTATAATTGAATAT
* * * *
585 TTACCTTGGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAA
128 TTACCTTCGGAAACATGAAAAAAAAACCATTCATTAGCAAA
* **
626 AAAAGTCCATCTATAGTCACCTATGCCTTCAAAAGCC---TTA---CTTTAAATGGTTTTATAAT
1 AAAAGTCCATCTATAGTCACCCATGCCACCAAAAGCCTTATTACTCCTTTAAATGGTTTTATAAT
685 CTCATA
66 CTCATA
691 ANNNNNNNNN
Statistics
Matches: 198, Mismatches: 33, Indels: 18
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
163 2 0.01
164 21 0.11
168 3 0.02
169 4 0.02
170 4 0.02
171 162 0.82
172 2 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.16, G:0.11, T:0.36
Consensus pattern (168 bp):
AAAAGTCCATCTATAGTCACCCATGCCACCAAAAGCCTTATTACTCCTTTAAATGGTTTTATAAT
CTCATATTGATTTCAAGATGAATTATTTTACATTTTCATTAAAACAAATTATAATTGAATATTTA
CCTTCGGAAACATGAAAAAAAAACCATTCATTAGCAAA
Found at i:1651 original size:171 final size:166
Alignment explanation
Indices: 1223--2060 Score: 462
Period size: 171 Copynumber: 4.9 Consensus size: 166
1213 NNNNNNNNNN
** * *
1223 TTTTATATTTTT-TATTAAAATATATTATAATTGAATGTCCGCTTTGGGAAACCT-ATAGCAAAA
1 TTTTATATTTTTAT-TTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGATTT-GGAAACATGA-AGCAAAA
* * * ** * * *
1286 GCTATCCATTGGCATGAAAAGTCCT-TTTATAGTCATTTAAGTCTTTGAAAGTCTTATTACTCGC
63 GCTATCCATTGGTAAGAAAAGT-CTATTTAGAGTCATCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGC
* *** * *
1350 TTTAAATGGTTCTATAATCTTGTAATTGATTTTAAGTTTT
127 TTTAAATGGATCTATAATCGCATAATTGATTCTAAATTTT
* * * * ** * *
1390 TTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATAATTGATTGTTTGGCTTGTGAAACATGAAGAAAAAAC
1 TTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGATTTG-GAAACATGAAGCAAAAGC
* * * * * *
1455 CATTCATTGGTAAGAAAAATCTATTTACGA-TTATCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
65 TATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTA-GAGTCATCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTT
*
1519 TAAATGGATGTATAATCGCATAATTGATTCTAAATTGAATAT
129 TAAATGGATCTATAATCGCATAATTGATTCTAAATT---T-T
* *
1561 TTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATAGAAAGTTTGATTTAGGAAACATGAAGCAAAAGC
1 TTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGATTT-GGAAACATGAAGCAAAAGC
* * * * *
1626 TATCCATTGGTGAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CTCAAGCCTT-AAAAGGCCTTGTTACTGGCT
65 TATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAGAGTCATC-CAAGCCTTCGAAA-GCCTTATTACTCGCT
* * * ** * **
1689 TTAAATAGTTTTATAATATCATAATTGATT-TGAAGTAGAATGA
128 TTAAATGGATCTATAATCGCATAATTGATTCT--A--A-ATTTT
* * * * * * *** * *
1732 TTTTACATTTTTAGTTGAAATAGATTATATTTGAATGTCT-ACCAAGGGAAACACGAAGAAAAAG
1 TTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGA--TTTGGAAACATGAAGCAAAAG
* * * * * * * * *
1796 -TCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTAGTGT-AACCTATGCCTTCAAAATCCTTATTACTTGT
64 CT-ATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAGAGTCATCC-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGC
* * * *
1859 TTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGAATT-T-AATTTCAAT
127 TTTAAATGGATCTATAATCGCATAATTG-ATTCTAAATTT---T
* ** * * * * *
1901 TTCCTTACATTTTTGGTCAAAATAAATTATAATTGAATGTTTG-TCTTGAGAAACGTTAAGAAAA
1 TT--TTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGAT-TTG-GAAACATGAAGCAAA
* * * * * * * * *
1965 AGCTATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CTTATGCCTTTGAAAACCTTATTTCTCG
62 AGCTATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAGAGTCATC-CAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCG
* * * *
2029 CTTTAAATGGTTTTATACTCTCATAATTGATT
126 CTTTAAATGGATCTATAATCGCATAATTGATT
2061 TTAAGTTAAA
Statistics
Matches: 522, Mismatches: 113, Indels: 69
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 5 0.01
167 124 0.24
168 2 0.00
169 2 0.00
170 15 0.03
171 359 0.69
172 12 0.02
174 1 0.00
175 2 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (166 bp):
TTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGATTTGGAAACATGAAGCAAAAGCT
ATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAGAGTCATCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
AATGGATCTATAATCGCATAATTGATTCTAAATTTT
Found at i:1932 original size:342 final size:342
Alignment explanation
Indices: 1282--2066 Score: 829
Period size: 342 Copynumber: 2.3 Consensus size: 342
1272 AACCTATAGC
* * * * * **
1282 AAAAGCTATCCATTGGCATGAAAAGTCCTTTTATAGTCATTTAAGTCTTTGAAAGTCTTATTACT
1 AAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAACCTTATTACT
* * * ** * ** *
1347 CGCTTTAAATGGTTCTATAATCTTGTAATTGATTTTAAGT----TTTTTTTACATTTTTAGTTAA
66 CGCTTTAAATAGTTTTATAATATCATAATTGATTTGAAGTAGAATGATTTTACATTTTTAGTTGA
* * * * * ** ** * *
1408 AACATATTATAATTGATTGTTTGGCTTGTGAAACATGAAGAAAAAACCATTCATTGGTAAGAAAA
131 AATAGATTATATTTGAATGTCTACCAAGGGAAACACGAAGAAAAAACCATTCATTGGTAAGAAAA
* * *
1473 ATCTATTTACGATTATCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGATGTATAATCGC
196 ATCCATTTACGATTAACCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGATGTATAATCGC
* * * * * * *
1538 ATAATTGATTCTAAATTGAATATTTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATAGAAAGTTTGA
261 AAAATTGATTCTAAATTCAATATTCTTACATTTTTAGTCAAAATAAATTATAATAGAAAGTTTG-
*
1603 T-TT-AGGAAACATGAAGC
325 TCTTGA-GAAACATGAAGA
** * *
1620 AAAAGCTATCCATTGGTGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCC-TT-AAAAGGCCTTGTTA
1 AAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAA--CCTTATTA
*
1683 CTGGCTTTAAATAGTTTTATAATATCATAATTGATTTGAAGTAGAATGATTTTACATTTTTAGTT
64 CTCGCTTTAAATAGTTTTATAATATCATAATTGATTTGAAGTAGAATGATTTTACATTTTTAGTT
**
1748 GAAATAGATTATATTTGAATGTCTACCAAGGGAAACACGAAGAAAAAGTCATTCATTGGTAAGAA
129 GAAATAGATTATATTTGAATGTCTACCAAGGGAAACACGAAGAAAAAACCATTCATTGGTAAGAA
* * * * *
1813 AAGTCCATTTA-G-TGTAACCTATGCCTTCAAAATCCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAA
194 AAATCCATTTACGAT-TAACC-ATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGATGTATAA
* * * * *
1876 TCTCAAAATTGAATT-TAATTTCAAT-TTCCTTACATTTTTGGTCAAAATAAATTATAATTGAAT
257 TCGCAAAATTG-ATTCTAAATTCAATATT-CTTACATTTTTAGTCAAAATAAATTATAATAGAAA
* *
1939 GTTTGTCTTGAGAAACGTTAAGA
320 GTTTGTCTTGAGAAACATGAAGA
* * * *
1962 AAAAGCTATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAACCTTATTTCT
1 AAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAACCTTATTACT
* * * *
2027 CGCTTTAAATGGTTTTATACTCTCATAATTGATTTTAAGT
66 CGCTTTAAATAGTTTTATAATATCATAATTGATTTGAAGT
2067 TAAATNNNNN
Statistics
Matches: 363, Mismatches: 70, Indels: 24
0.79 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
336 3 0.01
337 2 0.01
338 80 0.22
340 1 0.00
341 8 0.02
342 259 0.71
343 6 0.02
344 4 0.01
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (342 bp):
AAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAACCTTATTACT
CGCTTTAAATAGTTTTATAATATCATAATTGATTTGAAGTAGAATGATTTTACATTTTTAGTTGA
AATAGATTATATTTGAATGTCTACCAAGGGAAACACGAAGAAAAAACCATTCATTGGTAAGAAAA
ATCCATTTACGATTAACCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGATGTATAATCGC
AAAATTGATTCTAAATTCAATATTCTTACATTTTTAGTCAAAATAAATTATAATAGAAAGTTTGT
CTTGAGAAACATGAAGA
Found at i:3421 original size:171 final size:169
Alignment explanation
Indices: 2738--12612 Score: 7011
Period size: 171 Copynumber: 57.8 Consensus size: 169
2728 NNNNTACTTA
* * *
2738 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTA-ACTTTTTTTATGAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTATA--TTTTTGATTAAA
* ** * * ** * * * * * *
2802 ATGTATTATAATTGAATGT-TTGCTTTGAGAAACCTGAATCAAAAGCTATCCAATAGTAAAAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* ** * * *
2866 ATCCATTTATAGTCATGCAAG-CTTTCGAAAGCCTTATT-GTTT
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * *
2908 GCTTTAAATGGTTTTATAATATCATAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTTATATTGTTGGTTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAA
* * * *
2973 ATATATTATAATTGAATGTCTTCCTTAGG-AA-ATG-TG---ATGCCATTCATTTGCAAGAAAAG
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* * *
3032 TCCATTTATAGTCACCCATTCCTTTGAAAGCCTTATTA-TTT
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * * *
3073 GCTTTAAAAGGTTTTAGAATCTCAAAATTGATTTGAAGTTAAAATTTTTTACATTTTT-AGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT--GATTTTTTATATTTTTGA-TTAA
* * * * * * * * *
3137 AATACATTATAACTAAATATC-AGCTTCA-AAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGTAAGAAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * * * * *
3200 AGTGCATTTATAGTCTCTCAAGCGTTTAAAAGCCTTATTACT-T
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * *
3243 GCTTTAAATGGTTTTATAACCTCACAATTGATTTTAAATTAGATTTTTTAATATTTTTGATTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTT-ATATTTTTGATTAAA
* * * * * * * * * * *
3308 ACAGATAATATTTGAATATTTGCATTAGGAAACATGAAGAAAAAGGCATTTATTAGCAAGAAAAG
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* * *
3373 TCTATGTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTGTTACTCT
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
3415 CTTTAAAT-GATTTATAATATCATAATTGATTTTCAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTACTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * *
3479 TATATTATAATTGAATATCTACCTTAGAAAACAAGAAGAAAAATCCATTCATCT-GCAAAAAAAG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCAT-TGGCAAGAAAA-
* * * *
3543 GTCTATTTATAGTCAACCATGCCTTTTAAAGCCTTATTACTCG
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
3586 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCACT-ATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTTATA-TTTTGGTTAAT
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAAGTTG-AT-TTTTTATATTTTTGATTAAA
** * * * * * *
3649 GCATTTTATATTTGAATGTCTGCC-TCGAGAAATATGAAGAAAAAGCCATTCATTGAC-AGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* * * * * *
3712 GGTCCATTTATAGCCACTCATGTCTTTGAAAGCATTATTACTCG
127 -GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
3756 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATGACTAATTTTATGTTAGATTTTTTTATATTTTT-AGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA-TTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* * * * ** * * *
3820 ATAGATAATATTTGAATGTATGTC-TCGAGAAACAAGAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAA-AAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* ** * * *
3883 GGTCCATTTATAGCCACTTATACC-TTCGAAAGCTTTATTA-TCCG
127 -GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACT-CT
* * * * * *
3927 CTTTAAATAGTTTTATAATCCCATGATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTGATTGAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * *
3992 CAGATAATATTTTAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCTATTCATTGGCAAGAAAAGT
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGT
* * *
4057 CCATTTATAGCCACTCATGCC-TTCGATAA-ACTTATTACT-T
129 CCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-A-AAGCCTTATTACTCT
* * *
4097 GCTTTAAATGGTTTTATGATCTTATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTTTATTTTTGATTAAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * *
4162 TATATTATAATTGAATGTCTACTTTGGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGTCAAGAAAAGT
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGT
* * ** * * * * *
4227 CCATTAATAATTTCTCAAGCCTTTAAAAACCTTATTACTCG
129 CCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
4268 CTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATCGATTTTACGTTGAATTGTTTTACATTTTTGACTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAAA
* ** * * *
4333 TATATTATAATTCAATGTCTA-CTTAGGGAAATGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTA-GGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
** *
4397 TTTATTTATAGTCACTCGA-GCC-TTCAAAAGCCTTATTACT-T
128 TCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * *
4438 GCTTTAAAT-ATTGTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTGTTTTCTATTTTTTG-TTA
1 -CTTTAAATGGTT-TTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATT-TTTTATA-TTTTTGATTA
* * * * *** * * *
4501 AAATATTTTATAATTGAATGTATACCTCAAGAAATGGGAAGCAAAACCCATCCATTGGCAAGAAA
61 AAATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AA
* * * *
4566 AAGTCAATTTATAGGT-ACTCAAGCCTTT-AGAAGCCTTATTACTCG
125 AAGTCCATTTATA-GTCACCCATGCCTTTCA-AAGCCTTATTACTCT
* * * * *
4611 CTTTAAATGGATTTA-AATCTTATAAATGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTTACATTTTTCATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A--TTTTTTATATTTTTGATTAAA
* * * * * * *
4674 ACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAAAAAAAGCCATTCATTGGAAAGAAAAG
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* * * *
4739 TCTATTTATAGTCACCCATAG-CTTTGAAACCCTTATTACTCA
128 TCCATTTATAGTCACCCAT-GCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
** * * * *
4781 CTTTAAATCATTTTATAGTCTCATAATTGATTTTAATTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTCAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * *
4846 CAGT-TTATAATTGAATGT-TAACCTTAGCAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAAAAA
64 TA-TATTATAATTGAATGTCT-ACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * * * *
4909 AGTTCATTTGTAGTCACCTATGGC-TTCGAAAGCCTTATTACTCG
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * *
4953 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTATGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * * * ** *
5018 TAGATTATAATTGAATGT-TAGTCTAAGAAAACGTGAAAAAAAAGCCATCCAATGAAAAAAAAGA
64 TATATTATAATTGAATGTCTA-CCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA-A
* * * * *
5082 GTCTATTTATAGTCACTCATG-TTTTCGAAAGCATTATTA-TCA
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * * * * * *
5124 CTTTAAA-CGTTTTGTAAACTCACAATTGATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTTATCAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATT-TTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * *
5188 TACATTATAATTGATTGTTTGCCTT-GGAAA-ATGGGAAGCAAAAGCCATCCATTAGG--AGAAA
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACAT--GAAGAAAAAGCCATTCATT-GGCAAG-AA
** * * * * *
5249 AAGTATATTTATAGTCACTCAAGCTTTTAAAAGCCTTATTACTCG
125 AAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * * * * *
5294 CGTTAAATGGTCTTAAAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAACGTTTTTAAAATATTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * ** *
5359 TAGATTATAATTGAATGTCTATCTTAGGAAACATGAACTAAAAGCCATCCATTAGAG-AA-AAAA
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-G-GCAAGAAAA
* * * * *
5422 GTCTATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCATTATTGCTCA
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
5465 CTTTAAA-GGGTTTATAATGTCATAATTGCTTTTAAGTTGAATTCTTTTACTTTTTTTG-TAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTA-TATTTTTGATTAAA
* * * * *
5528 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTT-GAAAAACATGAAGCAATAGCCACTCATT-GTATAGAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAA
*
5591 AGTCCATTTATAGTCACCCAT-ACTTTCGAAAGCCTTATTACT-T
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* ********** * *
5634 ATTTTANNNNNNNNNNTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAGGTTTTTTACATTTTTGGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A--TTTTTTATATTTTTGATTAA
* * * * * * * ** * * **
5699 AATATAATGTAATTAAATGTTTACTTTGGGAAACATGAAGTAAAAGGTATCCATTGACAACTAAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* * * * *
5764 GCCCATTTATAGTCTA-TCAAGTCTTTAAAAGCCTTATTACT-T
127 GTCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
5806 CCTTTAAATGGTTTTATAATCTCACAATTGATTTTAGGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA-TTTTTTATATTTTTGATTAAA
* ** * * * *
5871 ACTA-ATAATCTTTGAATATCTACATTAGGAAACATGAACAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAA
63 A-TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* * * * * *
5935 ATCCATGTACAGTCACCCATACCTTTCAAAGCCTTGTTACTCC
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * *
5978 CTTTAAATGGTTTTGTAATCTAATTATTGATTTTAAGTTGAGTTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA--TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * * * *
6043 GATATTGTCATTGAATGTCTACCCTAGAAAATAAGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAAAAAAGG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-G
* * * *
6108 TCCATTTATAGTCAACTATGTCTTTCAAAGCCTTATTACTCA
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
6150 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTCAAGTTGAATGCTTTTATATTTTTGATTAATA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-AT-TTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * *
6215 CATTTTATATTTAAATGTCTACC-TCGAGAAACATTAAGAAAAAGCCATTCATTGG-TAGAAAAG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-
** * *
6278 GTCCATTTATAACCACCTATGCC-TTCAAAAGCCTTATTAC-CAA
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTC-T
* * ******** *
6321 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATGATTGATTTTANNNNNNNNNNTTTTATATTTTT-AGTTGAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA--AGTTGATTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* ** * * * * * * ** * *
6385 ACAGGTAATATTTTAATATTTGCCTT-GGAAAACATGAAGAAAAAGTGATTCACTAGCAAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* * *
6449 GTCCATTTATAGTCACTCATACC-TTCGATAGCCTTATTACT-T
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * *
6491 GCTTTAAATGGTTCTATGATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTATTATATTTTT-AGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTT-TTATATTTTTGA-TTAA
* * * **
6555 AATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTTGAGAAATATGAA-ATAAAAGCCATCCATTATCAAGAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAA
* * * * *
6618 AAGTCTATTAATAATC-CCTCAAGCC-TTCAAAAGCCTTATTACTCN
125 AAGTCCATTTATAGTCACC-CATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
********* ** * * *
6663 NNNNNNNNNGTTTTATAATCTCATAATCAATTTTACA-TTGAATTGTTTTAGATTTTTAACTAAA
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* ** * * * **
6727 ATATATTATAATTCAATGTCTACC-TAGGGAAATGTGAAGTAAAAGCTATCCATTGATAAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTA-GGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* * *
6791 GTCCATTTATAGTCACTCGA-GCC-TTCGAAAGTCTTATTGCT-T
127 GTCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * *
6833 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTAATTGTTTT-TCATTTTTGGTTCAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATT-TTTTAT-ATTTTTGATTAAA
* * * *** * * *
6897 ATATTTTATAATTGAATGTTTACCTCAGGAAATGGGAAGCAAAACCCATCCATTGGCAAGAAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AAAA
* * * * *
6962 GTCAATTTATAGTTACTCAAGCCTTT-AGAAGCCTTATTACTCG
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCA-AAGCCTTATTACTCT
* *
7005 CTTTAAATGGATTTA-AATCTCATAAATGATTTTAAGTTGCATTTTTTTTATATTTTTGATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A--TTTTTTATATTTTTGATTAAA
* * *
7069 ACATATTATAATT-AAGTGTGTGCCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAA-TGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
7133 GTCCATTTATAGTCACCCATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACTCGT
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTC-T
* * *
7177 -TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAAGTTAAATTTTTT-TGCATTTTTGGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTAT--ATTTTTGATTAAA
* * * * * * * *
7240 ACAGT-TTATTATTGAATGTCTACCTCAGCAAAACATAAATAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAA
63 ATA-TATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * *
7304 AGTCTATTTATAGTCACCCATGAC-TTCGAAAGCCTTATCACT-T
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * *
7347 GCTTTAAATGGTCTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTAAAATGTT-AGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-AT-TTTTTATATTTTTGA-TTAA
* * * * *
7411 AATAGATTATAATTGAATGCCTACCTTAGGAAACATTAAGCAAAAGCCA-TCTATT--TAAGTAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATTGGCAAG--A
* * * * *
7473 AAAGTCCATTTTATAG-CACTCATGCCTTTAAAAGCATTATTGCTCA
124 AAAGTCCA-TTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * *
7519 CTTTAAATGG-TTTATAATGTCATAATT-ATTTTTAAGTTGAATTCTTTTGTATTTTTTATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAA
* * * *
7582 ATATATTATAATTGAATGTCTGCCTTA-GAAA-ATGTAAAGCAAAAGCCATTTATT-GTATAGAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATG--AAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAA
* *
7644 AAGTCCATTTACAGTCAGCCATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACT-T
125 AAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * *
7688 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GAT-TTTTTATATTTTTGATTAAA
* * * * *
7753 ATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAACATGAAGCAAAAA-CCATCCATTGGTAAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAG-AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
** * *
7817 GTCCATTTATAGTTC-GTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACT-T
127 GTCCATTTATAG-TCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
7859 GCTTTAAATGGATTTATAATCTCACAATGGATTTTAGGATGGATTTTGTT-TCCATTTTTGATTA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGATTTT-TTAT--ATTTTTGATTA
* * * ** ** * * * * * *
7923 AAACAAATAATCTTTGAATACCTGCATTAGGAAACGTCAAGAAAAAGCCATTCCTTTGCAAGAAA
61 AAATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
** * * *
7988 AGTCCACGTATAGTCACCCATGCCTTCCAAAGCCTTGTTACTCA
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
8032 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTGTCTTATATTTTTTATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * *
8097 TATATTATAATTGAATATCTACCTCA-AAAACAAGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-G
* *
8161 TCCATTTATAGTCAACCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCG
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
8203 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATTATTGATTTT-AGTTGAATGTTTTTACATTTTTGGTTAATA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-AT-TTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * **
8267 CATTTTATATTTGAATGT-TGACCTCAAGAAATATGAA-AAAAA-AAATTCATTGGCAA-AAAAG
64 TATATTATAATTGAATGTCT-ACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-
* *
8328 GTCTATTTATAGTCACCCATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACTCG
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
*
8371 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AGCTTGGATTTTTTCACT-TTTTT-ATTAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TT-GATTTTTT-A-TATTTTTGATTAA
* * ** * * * * ***
8433 AACAAACAATATTTAAATGTCTACCTCTA-TAAAGC-TAAAGAAAAAGCCATTCATTTATAA-AA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCT-TAGGAAA-CATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAA
*
8495 AAGTCCATTTATAGTTACCCATGCC-TTCAAAAGCCTTATTACT-T
125 AAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* *
8539 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT-TACTTTTTTGGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTATA--TTTTTGATTAA
* * * * * *
8603 AATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTAGAAAACATGAAGCAAAAGCCA-TCTATTTGTAAGAAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAA
* * * * *
8667 AGTCTACTTATAGTC-CATCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACT-T
126 AGTCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * * * * *
8710 GTTTTAAATGGATTTATAATCTCACAATGGATTTTAGGATGGATTTTGTTTTCATTTTT-AGTTC
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGATTTT-TTAT-ATTTTTGA-TTA
* * * ** * * * * *
8774 AAACAGATAATCTTTGAATATCTACATTAGGAAACATCAAGAAAAAGCCATTCCTTTGCAAGAAA
61 AAATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * * *
8839 AGTCCGTGTATAGTCACCCATGCCTTACAAAGCCTTATTACTCG
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
8883 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATTATTGATTTCAAGTTGAATTGTTCTATATTTTTTATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * ** * *
8948 TATATTGTAATTGAATGTCTACCTCA-AAAACAAGAAGAAAAAATCATTCATTAGCAAAAAAAGG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-G
* * * *
9012 TCCATTTATAATCAACCATGCCTTTCAAAGTCTTATTACTCG
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
9054 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTT-AGTTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAGA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTAT-ATTTTTGATTAAAA
* * * * * * *
9118 TGTTTTCTATTTGAATGTTTACCTT-GAGAAACGTGAA-AAAAA-CATTATTCATTGGC-AGAAA
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGC--CATTCATTGGCAAGAAA
* * * *
9179 AGGTCCACTTATAGTCACCCATG-CATTCGAAAGCCTTATTACCCG
126 A-GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * *
9224 CTTGAAATGGTTTTATAATCTCATGATTGATTTTAACTTGGATTTTTTCATATTTTTGATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTT-ATATTTTTGATTAAAA
* * * * * ** ** * **
9289 CAGA-CAAAATTTGAATGTTTACCCCAATAAA-AGTAAAGAAAAAGCCATTCATTTACAAGAAAA
64 TATATTATAA-TTGAATGTCTACCTTAGGAAACA-TGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
9352 GTCCATTTATAGTCACCCATG-CTTTCGAAAGCCTTATTACT-T
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
** *
9394 GCTTTAAATAATTTTATGATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTGTTATATTTTT-AGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTT-TTATATTTTTGA-TTAA
* * * * * * **
9458 AATATATTATAATTGAATATTTACTTTGGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGTTAAGAAAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA
* * * * *
9523 GTCCATTTACAATC-CTTCAAGCC-TTCAAAAGCCTTATTACTCG
127 GTCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
*
9566 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTTTATTATATTTTT--TTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTT-TTATATTTTTGATT-AAA
* ** * * * *
9629 ATATATTATAATTGAATGTCTACTTTAATAAACGTGAAGTAAAAGCCATCCATTGGTAAGAAAAG
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* * *
9694 TCTATTTATAGTTC-CTCGA-GCC-TTCGGAAGCCTTATTACT-T
128 TCCATTTATAG-TCAC-CCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * *
9735 GCTTTAAATGGATTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTCTTTTACATTTCTT-ATTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTT-TTGATTAA
* * ** * * * * *
9799 CATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTTGAGAAATGTTAAGCAAAAGCTATTCATTTGTAAGAAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
** *
9863 AGTCCATTTATAGTCACTTGA-GCC-TTCGAAAGCCTTATTACTTT
126 AGTCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * * * * *
9907 CTTTAAATGATTTTGTAATCTGATAATTGATTTTAAGTTGAAGTTTTTTACAGTTTTGGTCAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * *
9972 TATATTATAACTGATTGTCTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAA-CCATCCATTGGCAAGAAAAG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAG-AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* ** * * *
10036 TCCATTTATAGCCATTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCA
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * * *
10078 CTTTAAATGGTCTTATAATTTTATAATTGATTTTAAGTTGACTTTTTTTATACTGTT-AGTTGAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA--TTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* * * ** * * * *
10142 ATAGATTATAATTGAATATCTACTTTAGGAAATGTAAAGTAAAAGCCATCCATTGG-AGGAAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AAAA
* * * * *
10206 GTTCATTAATAGTTCA--C--GGC-TTCAAAAGCATTATTGCT-T
127 GTCCATTTATAG-TCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* *
10245 GCTTTAAATGG-TTTATAATGTCATAATT-AGTTTTAAGTTGAATTCTTTTACTTTTTTTG-TTA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTG-ATT-TTTTA-TATTTTTGATTA
* * * *
10307 AAATATATTATAATTAAATATCTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATT-GCATAGAA
61 AAATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAA
* *
10371 AAGTCCATTTATAGTCACCCATTCCTTTGAAAGCCTTATTACT-T
125 AAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
10415 GCCTTAAATGGTTTTAGAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTCATTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA-TTTTTTATATTTTTGATTAAA
* * * * * * * *
10480 ATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAATATGAAGCAAAAGTCATCCGTTGGCAAGAAAAG
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* * *
10545 TGCATTTATAGTC-CCTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACT-T
128 TCCATTTATAGTCACC-CATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* ** *
10586 GCTTTAAATAGTTTTATAATCTCGCAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTT-AGTTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-A-TTTTTTATATTTTTGA-TTAA
* * * * * * * *
10650 AACAGA-TACTATTTGAATGTTTACATCAGGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTAGCAAGAAA
62 AATATATTA-TAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * *
10714 AGTCCATGTATAGTCACCCATGCC-TTCTAAAGCCTTGTTACTCC
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * *
10758 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* ** * * * **
10823 TATATTATAATAGAATGTCTACC-TAAAAAATATGGAGAAACAGCCATTCATTCACAAGAAAAG-
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGT
* * *** ** *
10886 CTCATTTATAATTAATAAAACCTTTCAAAGCCTTATTACTCG
129 C-CATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
10928 CTTTAAATAGTTTTGTAATCTCATTATTGATTTTAAGTTTAATTTTTTTATTTTTTTG-TTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * * *
10992 CATTTTATATTTGAATGTCTGCCTCAAGAAACATGAAAAAAAAAGCCATTCATTGAC-AGAAAAG
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATG-AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-
* * * * *
11056 GTCTATTTATAGTCACCTAGGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCA
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
11099 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATGATTGATTTTAAGTTGGGTTTTTTTTATGTTTTTGGTT-AA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT--G-ATTTTTTATATTTTTGATTAAA
* * * * * * ** * ** *
11163 ATAGATAATATTTCAATGCCTGCCCCAGCAAAGGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAG
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG
* * * *
11228 CCCATTTATAGTCACCAATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTT
128 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCT
* * * *
11270 CTTTAAATGGTTTTATAATCGCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTATTACATTTTTTG-CTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTT-TTATA-TTTTTGATTAAA
* * ** *
11334 ATATATTATCATTGAATGTCTACTTTAGGAAATGTGAAGTAAAAGCC-TTCCATTGGCAAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATT-CATTGGCAAGAAAA
* * * *
11398 GTCCATTTGTAGTC-CCTCAAGTC-TTCGAAAGCCTTATTA-TTT
127 GTCCATTTATAGTCACC-CATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
11440 GCTTTAAATGGATTTATAACCTTATAATTCATTTTAGGTTGAATTTTTTACT-TTTTTGATTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTA-TATTTTTGATTAAA
* * * * *
11504 ATATATTATAATTGAGTGTCTA-CTTATGGAAATC-TGAAGCAAAAGCTATCCATTGTCAAGAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTA-GGAAA-CATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * *
11567 AGTCCATTTATAATCACTCGA-GCC-TTCGAAAGCCTTATTACTTT
126 AGTCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * *
11611 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTCATTTTAAGTTAAATATTTTTACATTTTTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GAT-TTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * **** * * *
11676 TAT-TATATAATTAAATGTTTTCCTCAAGAAGTGGGAAGCAAAA-CTCATCCATTGACAAGAAAA
64 TATAT-TATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGC-CATTCATTGGCAAG-AAA
* ** * * * *
11739 ATTTAATTTATAGTTACTCAAGCCTTTGGAAA-CCTTATTACTCGT
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTT-CAAAGCCTTATTACTC-T
* * * * * *
11784 -TTTAAATGGATTTA-AATCTCATAAATGATTTTAAGTTGAATGTTTTTAAAATGTTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-AT-TTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * *
11847 TAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTTGAG-AA-AAAA
64 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCA-TTG-GCAAGAAAA
* * * * * *
11910 GTCCATTTATAGTCACTCAT-ACGTTCAAAAGCATTATTGCTCG
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
11953 CTTTAGATGG-TTTATAATGTCATAATT-ATCTTTAATTTGAATTTTTTTGTATTTTTTATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT-TTTAAGTTG-A-TTTTTTATATTTTTGATTAAA
* * * * * * * *
12016 ATATATTATAATTAAATATCTGCCTTAGAAAACGTAAAGCAAAAGCCATTCATT-GTATAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAA
* ** * *
12080 GTCCATTTATAGTCTCTTATTCC-TTCGAAAGCCTTATTTCT-T
127 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
* * * * *
12122 ACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGACTTTAGGTTGAATTTCATTACATGTTTT-ATTAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTT-TTTATAT-TTTTGATTAA
* * * * * *
12186 AATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTTGAAAAATATAAAGTAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAA
62 AATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * *
12250 AGTCCATTTATAGTCACTCAAGCC-TTCAAAAGCTTTATTACT-T
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTATTACTCT
**
12293 GCTTTAAATAATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTTATATTTTTGATTAAA
1 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATT-TTTTATATTTTTGATTAAA
* * * ** * * * * *
12358 ATATTTTGTAGTTGAATGTCTGTCTTAGGAAATA-GAAAGCAAAACCCATCCATTGACAAGAAAA
63 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATG-AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AAA
* * * * * *
12422 ACTCCATTTATAGTCACTCAAGCATTT-AGAAGCTTTATTACTCG
126 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCA-AAGCCTTATTACTCT
* * *
12466 CTTCAAATGGATTTT-TAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTGTTTATATTTTTTAT
1 CTTTAAATGG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA----TTT-TTTATATTTTTGAT
* * * * * * * * ** *
12530 TAAAACAGATTATAATTGATTTTTTACCTTAAGAAGCGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGATAAAA
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12595 AAAGTCCATTTATAGTCA
124 AAAGTCCATTTATAGTCA
12613 TATATGNNNN
Statistics
Matches: 7790, Mismatches: 1505, Indels: 814
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
164 3 0.00
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Consensus pattern (169 bp):
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* ** * * * * *
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128 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * ** *
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* * * * * *
2995 CCTTAG-GAA-ATG-TG---ATGCCATTCATTTGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCC
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* * * * * * *
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322 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GAATT
* * * * * * * * * * *
3119 TTTTACATTTTTAGTTAAAATACATTATAACTAAATATC-AGCTTCAAAAACATGAAGCAAAAGC
386 TTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTA-CCTGAGAAACATGAAGAAAAAGC
* * * * * * *
3183 CATCCATTGGTA-AGAAAAGTGCATTTATAGTCTCTCAAGCGTTTAAAAGCCTTATTACTTG
450 CATTCATT-G-ACAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
* * * *
3244 CTTTAAATGGTTTTATAACCTCACAATTGATTTTAAATTAGATTTTTTAATATTTTTGATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * * * * *
3309 CAGATAATATTTGAATATTTGCATTAGGAAACATGAAGAAAAAGGCATTTATTAGCAAGAAAAGT
65 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGT
* * * * *
3374 CTATGTATAGTCACCCATGCCTTTC-AAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAAT-GATTTATAATATCA
130 CCATTTATAGTCACCCATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * *
3437 TAATTGATTTTCAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTACTAAAATATATTATAATTGAATATCTACC
194 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACC
* * * *
3502 TTAGAAAACAAGAAGAAAAATCCATTCATCT-GCAAAAAAAGGTCTATTTATAGTCAACCATGCC
259 TTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCAT-TGGCAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCAACCATGCC
* * *
3566 TTTTAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCACT-ATTAATTTTAAGTTGAATG
322 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAAGTTGAAT-
** * * * *
3630 TTTTTATA-TTTTGGTTAATGCATTTTATATTTGAATGTCTGCCTCGAGAAATATGAAGAAAAAG
385 TTTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCT-GAGAAACATGAAGAAAAAG
* * *
3694 CCATTCATTGACAGAAAAGGTCCATTTATAGCCACTCATGTCTTTGAAAGCATTATTACTCG
449 CCATTCATTGACAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
* * * * *
3756 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATGACTAATTTTATGTTAGATTTTTTTATATTTTT-AGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* * * * ** * * * *
3820 ATAGATAATATTTGAATGTATGTC-TCGAGAAACAAGAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAA-AAAA
64 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA
* ** * * * *
3883 GGTCCATTTATAGCCACTTATACCTTCGAAAGCTTTATTA-TCCGCTTTAAATAGTTTTATAATC
128 -GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT-CTCTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * * * * * *
3947 CCATGATTAATTTTAAGTT-AGATTTTTTTACATTTTTGATTGAAACAGATAATATTTTAATGTC
191 TCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTC
* * *
4011 TACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCTATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAG-CCACTCAT
255 TACCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAAC-CAT
* * * * *
4075 GCCTTCGATAA-ACTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATGATCTTATAATTGATTTTAAGTTGA
319 GCCTTTGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
* * * * * * *
4139 TTTTTTTTTATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTTGGGAAACATGAAGTAAA
383 ATTTTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTAC-CTGAGAAACATGAAGAAAA
* * * * ** * * *
4204 AGCCATCCATTGTCAAGAAAAGTCCATTAATAATTTCTCAAGCCTTTAAAAACCTTATTACTCG
447 AGCCATTCATTGAC-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
* * * * * *
4268 CTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATCGATTTTACGTTGAATTGTTTTACATTTTTGACTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* ** * * * *
4333 TATATTATAATTCAATGTCTA-CTTAGGGAAATGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAG
65 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTA-GGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAG
** * * *
4397 TTTATTTATAGTCACTCGA-GCCTTCAAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAAT-ATTGTTATAATC
129 TCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTT-TTATAATC
* * * * * * *
4459 TCATAATTAATTTTAAGTTAAATTGTTTTCTATTTTTTGTTAAAATATTTTATAATTGAATGTAT
191 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCT
* * * * * *
4524 ACCTCA-AGAA-ATGGGAAGCAAAACCCATCCATTGGCAAGAAAAAGTCAATTTATAGGT--ACT
256 ACCTTAGAAAACAT--GAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AAAAGTCCATTTATA-GTCAAC-
* * * *
4585 CAAGCCTTT-AGAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGATTTA-AATCTTATAAATGA-TTTAAGT
316 CATGCCTTTGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * * *
4647 TGAATTTTTTTTACATTTTTCATTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAA
380 TGAA--TTTTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGA-GAAACATGAA
* * * * *
4712 AAAAAAGCCATTCATTGGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATAG-CTTTGAAACCCTTATT
442 GAAAAAGCCATTCATT-GACAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTTGAAAGCCTTATT
*
4776 ACTCA
505 ACTCG
** * * * *
4781 CTTTAAATCATTTTATAGTCTCATAATTGATTTTAATTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTCAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * *
4846 CAGT-TTATAATTGAATGT-TAACCTTAGCAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAAAAA
65 TA-TATTATAATTGAATGTCT-ACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAA
* * * * *
4909 AGTTCATTTGTAGTCACCTATGGCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
127 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * * * ** *
4974 TATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTATGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGT-TA
192 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA
* * * * * * ** * *
5038 GTCTAAGAAAACGTGAAAAAAAAGCCATCCAATGAAAAAAAAGAGTCTATTTATAGTC-ACTCAT
257 -CCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCAAC-CAT
* * * * * * * *
5102 G-TTTTCGAAAGCATTATTA-TCACTTTAAA-CGTTTTGTAAACTCACAATTGATTTTAAGTTAA
319 GCCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
* ** * * * * * * *
5164 ATTGTTTTACATTTTTTATCAAAATACATTATAATTGATTGTTTGCCTTG-GAAA-ATGGGAAGC
383 ATT-TTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACC-TGAGAAACAT--GAAGA
* * ** * * *
5227 AAAAGCCATCCATT-AGGAGAAAAAGTATATTTATAGTCACTCAAGCTTTTAAAAGCCTTATTAC
444 AAAAGCCATTCATTGA-CAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
5291 TCG
507 TCG
* * * ** * * * *
5294 CGTTAAATGGTCTTAAAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAACGTTTTTAAAATATTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * ** * *
5359 TAGATTATAATTGAATGTCTATCTTAGGAAACATGAACTAAAAGCCATCCATTAG-AGAAAAAAG
65 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAAG
* * * * * * * *
5423 TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCATTATTGCTCACTTTAAA-GGGTTTATAATGTCA
129 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * *
5487 TAATTGCTTTTAAGTTGAATTCTTTTACT-TTTTTTGTAAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC
194 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA-TATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC
* * * * * *
5551 CTT-GAAAAACATGAAGCAATAGCCACTCATT-GTATAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCAT-A
258 CTTAG-AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCATGC
*** **********
5613 CTTTCGAAAGCCTTATTACTTATTTTANNNNNNNNNNTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAG
321 CTTT-GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-
* * * * * * * * *
5678 GTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATAATGTAATTAAATGTTTACTTTGGGAAACATGAAGTAAA
384 -TTTTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTAC-CTGAGAAACATGAAGAAAA
** * * * * *
5743 AGGTATCCATTGACA-ACTAAAGCCCATTTATAGTCTA-TCAAGTCTTTAAAAGCCTTATTACTT
447 AGCCATTCATTGACAGA--AAAGTCCATTTATAGTC-ACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC-T
5806 C-
508 CG
* * * *
5807 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCACAATTGATTTTAGGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* ** * * * * * *
5872 CTA-ATAATCTTTGAATATCTACATTAGGAAACATGAACAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAAA
65 -TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAG
* * * * * * *
5936 TCCATGTACAGTCACCCATACCTTTC-AAAGCCTTGTTACTCCCTTTAAATGGTTTTGTAATCTA
129 TCCATTTATAGTCACCCATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
* * * * * *
6000 ATTATTGATTTTAAGTTGAGTTTTTTTATATTTTTGATTAAAAGATATTGTCATTGAATGTCTAC
193 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC
* * * * * * *
6065 CCTAGAAAATAAGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAAAAAAGGTCCATTTATAGTCAACTATGTC
258 CTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCAACCATGCC
* * * * *
6130 TTTCAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTCAAGTTGAATGC
322 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-T
* * * * * *
6195 TTTTATATTTTTGATTAATACATTTTATATTTAAATGTCTACCTCGAGAAACATTAAGAAAAAGC
386 TTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCT-GAGAAACATGAAGAAAAAGC
** ** ** *
6260 CATTCATTGGTAGAAAAGGTCCATTTATAACCAC-CTATGCCTTCAAAAGCCTTATTAC-CAA
450 CATTCATTGACAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-G
* * ********* *
6321 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATGATTGATTTTANNNNNNNNNNTTTTATATTTTT-AGTTGAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA-AGTTGATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* ** * * * * * * ** *
6385 ACAGGTAATATTTTAATATTTGCCTT-GGAAAACATGAAGAAAAAGTGATTCACTAGCAAGAAAA
64 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA
* * * * *
6449 GTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGATAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTCTATGATCT
128 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCT
* *
6513 CATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTATTATA-TTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT
192 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCT
* * * ** * * * *
6577 A-CTTTGAGAAATATGAA-ATAAAAGCCATCCATTATCAAGAAAAGTCTATTAATAATC-CCTCA
256 ACCTTAGA-AAACATGAAGA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAAC-CA
* ** ********** **
6639 AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCNNNNNNNNNNGTTTTATAATCTCATAATCAATTTTACA-TTG
318 TGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA-AGTTG
* *** * * * ** *
6703 AATTGTTTTAGATTTTTAACTAAAATATATTATAATTCAATGTCTACCTAGGGAAATGTGAAGTA
382 AATT-TTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCT-GAGAAACATGAAGAA
* * * * * *
6768 AAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCGA-GCCTTCGAAAGTCTTATTGCT
445 AAAGCCATTCATTGA-CAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
*
6832 TG
508 CG
* * * * *
6834 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTAATTGTTTTT-CATTTTTGGTTCAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATT-TTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * *** * * * *
6898 TATTTTATAATTGAATGTTTACCTCAGGAAATGGGAAGCAAAACCCATCCATTGGCAAGAAAAAG
65 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAG-AAAAG
* * * * * * *
6963 TCAATTTATAGTTACTCAAGCCTT-TAGAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGATTTA-AATCTC
129 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
* * * * *
7026 ATAAATGATTTTAAGTTGCATTTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATT-AAGTGTGT
193 ATAATTGATTTTAAGTTG-AATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAA-TGTCT
* * *
7090 GCCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGC
256 ACCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCATGC
* * * *
7155 CTTCGAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAAGTTAAATT
321 CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT
* * * *
7220 TTTT-TGCATTTTTGGTTAAAACAGT-TTATTATTGAATGTCTACCTCAGCAAAACATAAATAAA
386 TTTTAT--ATTTTTGGTTAAAACA-TATTATAATTGAATGTCTACCTGAG--AAACATGAAGAAA
* * * * * *
7283 AAGCCATTCATTAGTA-AGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATGACTTCGAAAGCCTTATCACTT
446 AAGCCATTCATT-G-ACAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
7347 G
509 G
* * * * *
7348 CTTTAAATGGTCTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTAAAATGTT-AGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* * * * *
7412 ATAGATTATAATTGAATGCCTACCTTAGGAAACATTAAGCAAAAGCCA-TCTATT--TAAGTAAA
64 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATTAGCAAG--AA
* ** * * *
7474 AAGTCCATTTTATAG-CACTCATGCCTTTAAAAGCATTATTGCTCACTTTAAATGG-TTTATAAT
126 AAGTCCA-TTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAAT
* * *
7537 GTCATAATT-ATTTTTAAGTTGAATTCTTTTGTATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGT
190 CTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGT
* ** * * * * * *
7601 CTGCCTTAGAAAATGTAAAGCAAAAGCCATTTATT-GTATAGAAAAGTCCATTTACAGTCAGCCA
254 CTACCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCA
* * *
7665 TGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAA
318 TGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
* * * * *
7730 ATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAACATGAAGCAA
383 AT-TTTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTAC-CTGAGAAACATGAAG-AA
* * * *
7795 AAA-CCATCCATTGGTA-AGAAAAGTCCATTTATAGTTC-GTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTAC
445 AAAGCCATTCATT-G-ACAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
*
7857 TTG
507 TCG
* * * * * **
7860 CTTTAAATGGATTTATAATCTCACAATGGATTTTAGGATGGATTTTGTTTCCATTTTTGATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGATTTT-TTTATATTTTTGATTAAA
* * * ** ** * * * * * *
7925 ACAAATAATCTTTGAATACCTGCATTAGGAAACGTCAAGAAAAAGCCATTCCTTTGCAAGAAAAG
64 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAG
** * * * *
7990 TCCACGTATAGTCACCCATGCCTTCCAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCA
129 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * *
8055 TTATTGATTTTAAGTTGAATTGTCTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATATCTACC
194 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACC
* *
8120 TCA-AAAACAAGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGGTCCATTTATAGTCAACCATGCCT
259 TTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCAACCATGCCT
* * *
8184 TTCAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATTATTGATTTT-AGTTGAATGTT
323 TTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TT
* * * * * * *
8248 TTTACATTTTTGGTTAATACATTTTATATTTGAATGT-TGACCTCAAGAAATATGAA-AAAAA-A
387 TTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCT-ACCT-GAGAAACATGAAGAAAAAGC
* * * * * *
8310 AATTCATTGGCAAAAAAGGTCTATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCG
450 CATTCATTGACAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
* *
8371 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AGCTTGGATTTTTTCACT-TTTTT-ATTAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TT-GATTTTTTTA-TATTTTTGATTAA
* * ** * * * * *
8433 AACAAACAATATTTAAATGTCTACCTCTA-TAAAGC-TAAAGAAAAAGCCATTCATTTA-TAA-A
63 AATATATTATAATTGAATGTCTACCT-TAGGAAA-CATGAAGAAAAAGCCATTCA-TTAGCAAGA
* *
8494 AAAGTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACT-TACTTTAAATGGTTTTATAA
125 AAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAA
* **
8558 TCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACT-TTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATG
189 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA-TATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATG
* * * * * * * * *
8622 TCTGCTTTAGAAAACATGAAGCAAAAGCCA-TCTATTTGTAAGAAAAGTCTACTTATAGTCCATC
253 TCTACCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACC
* * * * * * * * *
8686 AAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTTGTTTTAAATGGATTTATAATCTCACAATGGATTTTAGGATG
317 ATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * ** * * * *
8751 GATTTTGTTTTCATTTTTAGTTCAAACAGATAATCTTTGAATATCTACATTAGGAAACATCAAGA
382 AATTTT-TTAT-ATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGA-GAAACATGAAGA
* * * * **
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444 AAAAGCCATT-CATTGAC-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
8880 TCG
507 TCG
* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
9012 TCCATTTATAATCAACCATGCCTTTC-AAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
129 TCCATTTATAGTCACCCATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
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* * * * * * *
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* * * * * ** * *
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383 ATTTTTT-ATATTTTTGGTTAAAACATATTATAA-TTGAATGTCTACCTGAGA-AACA-TGAAGA
* *
9328 AAAAGCCATTCATTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG-CTTTCGAAAGCCTTATTAC
444 AAAAGCCATTCATTGAC-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTATTAC
*
9392 TTG
507 TCG
** * *
9395 CTTTAAATAATTTTATGATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTGTTATATTTTT-AGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAA
* * * * * * *
9459 ATATATTATAATTGAATATTTACTTTGGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATT-GTTAAGAAAA
64 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAA
* * * * * *
9523 GTCCATTTACAATC-CTTCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
128 GTCCATTTATAGTCAC-CCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * *
9587 CATAATTTATTTTAAGTTGAATTTTATTATATTTTTT-TAAAAATATATTATAATTGAATGTCTA
192 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA
* * * * * * ** *
9651 CTTTA-ATAAACGTGAAGTAAAAGCCATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTTCCTCGA-G
257 CCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCAACCATG
* * * * *
9714 CCTTCGGAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGATTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAAT
320 CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* * * * * ** * *
9779 TCTTTTACATTTCTT-ATTAACATATATTATAATTGAATGTCTACTTTGAGAAATGTTAAGCAAA
385 T-TTTTATATTT-TTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTAC-CTGAGAAACATGAAGAAAA
* * * *
9843 AGCTATTCATTTGTA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTGA-GCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
447 AGCCATTCA-TTG-ACAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
*
9906 T
509 G
* * * * * * * *
9907 CTTTAAATGATTTTGTAATCTGATAATTGATTTTAAGTTGAAGTTTTTTACAGTTTTGGTCAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * *
9972 TATATTATAACTGATTGTCTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAA-CCATCCATTGGCAAGAAAAG
65 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAG-AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAG
* ** * ** * * * *
10036 TCCATTTATAGCCATTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTCTTATAATTTTA
129 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * *
10101 TAATTGATTTTAAGTTGACTTTTTTTATA-CTGTTAGTTGAAATAGATTATAATTGAATATCTAC
194 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC
* * ** * * * * * * *
10165 TTTAGGAAATGTAAAGTAAAAGCCATCCATTGG-AGGAAAAAGTTCATTAATAGTTC-A-C--GG
258 CTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AAAAGTCCATTTATAG-TCAACCATGC
** * * * *
10225 CTTCAAAAGCATTATTGCTTGCTTTAAATGG-TTTATAATGTCATAATT-AGTTTTAAGTTGAAT
321 CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAAT
* * * * * * *
10288 TCTTTTACT-TTTTTTGTTAAAATATATTATAATTAAATATCTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAA
385 T-TTTTA-TATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGA-GAAACATGAAGAAAA
* * * *
10352 AGCCATTCATTGCATAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCCTTTGAAAGCCTTATTACTTG
447 AGCCATTCATTG-ACAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
* * * *
10416 CCTTAAATGGTTTTAGAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTCATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTTATATTTTTGATTAAAA
* * * * * * * * *
10481 TATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAATATGAAGCAAAAGTCATCCGTTGGCAAGAAAAGT
65 TATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGT
* * ** *
10546 GCATTTATAGTC-CCTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATAGTTTTATAATCTC
130 CCATTTATAGTCACC-CATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTC
** * * * * *
10609 GCAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGA-TACTATTTGAATGTTT
193 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTA-TAATTGAATGTCT
* * * * * * *
10672 ACATCAGGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATGTATAGTCACCCATGC
256 ACCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCATGC
* * * *
10737 CTTCT-AAAGCCTTGTTACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTAAAT
321 CTT-TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-
** * * * * * * *
10801 TTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATAGAATGTCTACCTAAAAAATATGGAGAAACAG
384 TTTTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGAGAAACATGAAGAAAAAG
* * * * * ** *
10866 CCATTCATTCACAAGAAAAG-CTCATTTATAATTAATAAAACCTTTCAAAGCCTTATTACTCG
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* * * * *
10928 CTTTAAATAGTTTTGTAATCTCATTATTGATTTTAAGTTTAATTTTTTTATTTTTTTG-TTAAAA
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* * * * * * *
10992 CATTTTATATTTGAATGTCTGCCTCAAGAAACATGAAAAAAAAAGCCATTCATT-G-ACAGAAAA
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* * * * *
11055 GGTCTATTTATAGTCACCTAGGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT
128 -GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* ** * * * * * *
11120 CATGATTGATTTTAAGTTGGGTTTTTTT-TATGTTTTTGGTT-AAATAGATAATATTTCAATGCC
192 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATAT-TTTTT-ATTAAAATATATTATAATTGAATGTC
* ** * ** * *
11183 TGCCCCAGCAAAGGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGCCCATTTATAGTC-ACCAAT
255 TACCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACC-AT
** * *
11247 GCCTTTGAAAGCCTTATTACTTTCTTTAAATGGTTTTATAATCGCATAATTGATTTTAAGTTAAA
319 GCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* * * * * * * ** *
11312 TTTTATTACATTTTTTGCTAAAATATATTATCATTGAATGTCTACTTTAGGAAATGTGAAGTAAA
384 TTTT-TTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGA-GAAACATGAAGAAAA
* * * * * * * *
11377 AGCC-TTCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCCCTCAAGTCTTCGAAAGCCTTATTATTTG
447 AGCCATT-CATTGAC-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
* * * * * *
11441 CTTTAAATGGATTTATAACCTTATAATTCATTTTAGGTTGAATTTTTTACT-TTTTTGATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTA-TATTTTTGATTAAAA
* * * *
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* * *
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* * * * ** * *
11631 TCATAATTCATTTTAAGTTAAATATTTTTACATTTTTGGTTAAAATAT-TATATAATTAAATGTT
191 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATAT-TATAATTGAATGTC
* * * * * * * * ** *
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255 TACCTTAGAAAACAT--GAAGAAAAAGC-CATTCATTGGCAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCAAC
* * * *
11756 TCAAGCCTTTGGAAA-CCTTATTACTCGTTTTAAATGGATTTA-AATCTCATAAATGATTTTAAG
316 -CATGCCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG
* * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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506 CTCG
* * * * *
11953 CTTTAGATGG-TTTATAATGTCATAATT-ATCTTTAATTTGAATTTTTTTGTATTTTTTATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT-TTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAA
* * * * * * * *
12016 ATATATTATAATTAAATATCTGCCTTAGAAAACGTAAAGCAAAAGCCATTCATT-GTATAGAAAA
64 ATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAA
* ** * * *
12080 GTCCATTTATAGTCTCTTATTCCTTCGAAAGCCTTATTTCT-TACTTTAAATAGTTTTATAATCT
128 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * ** * *
12144 CATAATTGACTTTAGGTTGAATTTCATTACATGTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA
192 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA
* * * * * *
12209 -CTTTGAAAAATATAAAGTAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCAAG
257 CCTTAG-AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAAC-CATG
** * * **
12272 CCTTCAAAAGCTTTATTACTTGCTTTAAATAATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
320 CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* * * * * ** * * *
12337 TCTTTTATATTTTTGATTAAAATATTTTGTAGTTGAATGTCTGTCTTAGGAA-ATAGAAAGCAAA
385 T-TTTTATATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGAGAAACAT-G-AAGAAAA
* * * * * *
12401 ACCCATCCATTGACAAGAAAAACTCCATTTATAGTCACTCAAGCATTT-AGAAGCTTTATTACTC
447 AGCCATTCATTGAC-AG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA-AAGCCTTATTACTC
12465 G
509 G
* * *
12466 CTTCAAATGGATTTT-TAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTGTTTATATTTTTTAT
1 CTTTAAATGG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GA---TTTT-TTTATATTTTTGAT
* * * * * * * * * *
12530 TAAAACAGATTATAATTGATTTTTTACCTTAAGAAGCGTGAAGAAAAAGCCATTCATT-GATAAA
60 TAAAATATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAG-CAAG
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124 AAAAGTCCATTTATAGTCA
12613 TATATGNNNN
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CATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACCTT
AGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCATGCCTTTG
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TATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTGAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCA
TTGACAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG
Found at i:6552 original size:22 final size:22
Alignment explanation
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* *
6521 ATTTTAAGTTAAATTTTATTAT
1 ATTTTAAGTTAAAATATATTAT
*
6543 ATTTTTAGTTAAAATATATTAT
1 ATTTTAAGTTAAAATATATTAT
6565 A
1 A
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Statistics
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ATTTTAAGTTAAAATATATTAT
Found at i:14977 original size:170 final size:170
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14554 GGACTAACAG
* * * * * * *
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** * * * *
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* *
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* * * * **
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* * * *
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* * * * ** *
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* * * **
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* *
15140 TTGCTTTAAATGGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTAA
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15179 AAGCCTGTTT
Statistics
Matches: 356, Mismatches: 80, Indels: 15
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Matches are distributed among these distances:
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GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTAACATTTTTTGTTAAA
ATATATTATAATTGAATGTCTATTTTGAGAAACGTGAAGC
Found at i:16265 original size:170 final size:170
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Period size: 171 Copynumber: 73.8 Consensus size: 170
15598 TAAGTTTAGT
* * * * * * * ** *
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** * * * * * * *
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* * *
15736 CTTTAAATGGTTATATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTAGA
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* * * * * * * ** * * *
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*** * * * * * * *
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66 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * *
15906 TTAAATGGCTTTATAATCCCATAATTGATTTTAAGTTGAAG
131 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * *
15947 TTTTTTACCTTTTTAGTTAAAATTTATTATAATTTAATTGAATGTCTACCTTAGAAAATATGAAG
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* * * * ** * *
16012 TA-AAAGGCC-TCCATTAGCCAAAAAAAGTCCATTTATTGTGACACAAATG--TTCAAAAGCTTT
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*
16073 ATTA-TGTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATTAAA
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* * * *
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* * * * * *
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*
16251 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTAA
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* *
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* * * * ** *
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* *
16526 AAA-CCTATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACCTTCGAAAGCCTTATTACT
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* * * *
16590 TGCTTTATATAGTTTTATAATTTCATAATTGATTTGAAGTTAAA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * * * * **
16634 TTTTTTAATATTTTTGGCTAAACTTTATTTTAATTGAATGTTTGCTTTGGGAAATGTGAAG-CAA
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* * * ** *
16698 AAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTC
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* * * * * *
16762 GCTTTAAATAGTTTAATAATCTAATAATTTATTTAAAGTTTAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * ** *
16805 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATAGATCAGATTTGAATATTTGCCTCAAGAAATGTGAAGAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
* * * * * * * * * *
16870 GTCATTTATTAGCAAGAAATGTCCATTTATAATCACCCATACCTTTGAAAGCATTATTACTCGCT
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* * * * *
16935 TTAAATGGTTATATAATCTTATAACTGAATTTAAGTGAGAA
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* * * * * * * *
16976 -TTTTTACATTTTTCA-TTAAAACAGATAATATTTGAATGTGT--CTCAGGATA-GTGAAGAAAA
1 TTTTTTACATTTTT-AGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
*** * * * * *
17036 AAAGATTCAATGGCAAGAAAAATCTATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* *
17101 TTTAAATAG-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTAAA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * *
17141 TTTGTTTATAATTTTTAGTTAAAATACATTATAATTGAACGTCT-GCTTCAGAAAACATGAAG-C
1 TTT-TTTA-CATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAC
* * * * * * * *
17204 AAAACCCATCCGTTGGCAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACTCAAT-CCTTTGAAGGCCTTATCAC
63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
** * ********** *
17268 TCACTTTAAAT-GATTTATAATCTCATAATTGNNNNNNNNNNGAAT
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG-ATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * *
17313 TTTTTTATATATTTGGTTAAAACAGATTCTATTTGAATG-CTTACATTAGGAAACATGAGGAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTC-TACCTTAGGAAACATGAAGACAA
** * *
17377 AATCATTCATTAGCAAGAAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTGGAAAGCCTTATTACTTG
65 AGCCATTCATTGGCAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* ********** *
17442 CATTAAATGGTTTTATNNNNNNNNNNTTGATTTTAAGTTTAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * ** * ** ***
17484 TTATTTTACATTTTTAGCTAAAATATATTATAATCAAATATCTA-CTTCAAAAAACGCAAAGTA-
1 TT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAG-AC
* * * * * * ** * * * *
17547 AAAGCCATCCACTAGCAAGAAATGTCCATTCATAGTCACTTAAACTTTTGAAACCCTTATTACTC
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * *
17612 ACTTTAAATGGTTTTATAGTC-CTATAATTGATTTTGAGTTAAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTC-ATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * *
17655 TTTTTTAACATTTTTAGTTGAAACAGATTATATTTAAATGTTTTCCTTATGAAACATGAAG-CAA
1 TTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* *** * * * * * *
17719 AACCATTCATTGATGAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAACCTTATTACTTAC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * ** **
17784 TTTAAATGGTTTTATAATATCCTAATTGATTTTTTATTTTTTTA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA--TTTTA-AGTTAAA
* * * * *
17828 TGCTTTTCTAAAAAAGTTGAATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCCACTTCTA--AA
1 T--TTTT-T-----A----CATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCT-TAGGAA
** * * * * *
17891 A-ATTGAA-ACAAAAGCCACCCATTGACAAGAAAGGTCCATTTATAGTTACTTAAGCCTTCGAAA
53 ACA-TGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAA
** ** ********** *
17954 GTATTATTACTCACTTNNNNNNNNNNTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAC
116 GCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * * * * * *
18010 TCTTTTACATTTTTTAATTAAAACAGATGATACTTGAATGTCTATCC-TA-AAAAAATTAAGAAA
1 TTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTA-CCTTAGGAAACATGAAGACA
* * * * * * *
18073 AAGCCTTTTATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTTACCTATGCTTTCGAAAGCCTTATTGCTTG
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
*
18138 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGACTTTAAGTTAAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
** * * * * * * ** *
18180 TTTTTTTACACGTTTGGTTAAAATAGATTATATTTAAATGTGTGCC-TCGAGAAATGTGAAGAAA
1 -TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACA
* * ** * * * *
18244 AACCCATTTATTGATAGGAAAAGTCCATTTATAATCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTTTTACTTG
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
*** * * *
18309 CTTTAAAAAATTTTATAATTTTATAATTAATTTTAAGTTAAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * ** * * *
18351 TTTTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTGAACCTTAGAAAAAATGAAGAAAA
1 TTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * ** * * * *
18415 AACCATTTATTAACGAA-AGAAGTCTATTTATAGTCATCC-ATGCCTTTC-AAAACCCTATTACT
65 AGCCATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CCTATGCC-TTCGAAAGCCTTATTACT
* * * *
18477 TGCTTTAAAGGGTTTTGTAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAAT
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
** * * * * * * * *
18522 TTTTTTGTATTTTTGGTTAAAACATTTTATGTTTGAATGTTTGCCTTAAGAAATATGAAGGA-AA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAA-GACAA
* * * * * * * * *
18586 AGTCATTCGTTGACACA-AAAGGTTCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCTTTATTACTTG
65 AGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* *
18650 CATTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * ** *
18692 TTTTGTTATACTGTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAATGTGAAGAAAA
1 TTTT-TTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
** * ** *
18757 AGCCA-TCGATTAGAG-AA-AAAAACCCATTTATAGTCA-TTCATGCCTTCGAAAGTATCATTAC
65 AGCCATTC-ATT-G-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * *
18818 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATATCATAATTGGTTTTAAATTGAAT
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * ** * *
18864 TTTTTTACATTTTT--TTAAAAATATTTTATAATTGAATGTCTGTCTCAGGAAACATGAAGAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTT-AAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * * * * * * * *
18927 AGTCATTCATTGACACGAAAGGTCCATTTACAGTCACCCATACCTTCGAAAACTTTATTACTTGC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* *
18992 ATTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * *
19033 TTTTGTTATACTGTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTACCTTAGCAAACATGAAG-CAA
1 TTTT-TTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * ** * * *
19097 AAGGCA-TCTATTAG-AGAGAAAAACCCATTTATAGTCACGC-ATACCTTCAAAAGCATTATTAC
64 AAGCCATTC-ATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * *
19159 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATATCATAATTGATTTTAAATTAAA
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * ** * *
19204 TTTTTTTTACATTTCTTA-TTAAAATGTATTATAATTCAATATTTTTCTTCA-AAAACGTGAAG-
1 --TTTTTTACATTT-TTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGA
* * * *
19266 CAAAAGCCA-TCTATTTGCAAGAAAGGTCCATATATAGTCA-CTCAAGCC-TCTGAAAGCCTTAT
62 C-AAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTC-GAAAGCCTTAT
*
19328 TACTCT-CTTTAAACGGTTTTATAAT-TGCATAATTGATTTT-AG-T---
123 TACT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-CATAATTGATTTTAAGTTAAA
* ** ** ** *
19371 TTTTTTA-ATTTTTAGTTAAAATAAATTATATTTGAATGTCTACCACAAAAAATGTGAAGAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
** * ** * * *
19435 ATCATTCTTTGGCAAGAAAAGTTTATTTTATAGTCACCCATGGCTTCAAAAGCCTTATTACTTGC
66 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * * *
19500 TTTACATGGTATTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAAT
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * ** *
19542 TTTTTTATATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAACATCT-GCTTAAGGAAACATGAAGTA-A
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAG-ACA
* ** * * * *
19605 AAGCCATCCACTT-GCAAG-AAAGTTTATTTATATTCA-CTCAAGCTTTTGAAA-CCTTTATTAC
64 AAGCCATTCA-TTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCC-TTATTAC
* * *
19666 TTGCTTTAGATGGTTTTATTGTCTTTTATTGTCTCATAATTGATTTTGAA-TTGAAT
126 TTGCTTTAAATGGTTTTA--------TA--ATCTCATAATTGATTTT-AAGTT-AAA
* * * * * *
19722 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAGA-AGATTATATTTGAATGTATACC-TCGAGAAACGTGATGATA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAA-ATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACA
* * * * * * *
19785 AAACCATTCATTGTTCAA-AAAATTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTATTT
64 AAGCCATTCATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * **
19849 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTCTAAGTTGAGG
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * *
19893 TTTTTTACATATTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTA-CTCTAAGAAACATAAAGTA-A
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCT-TAGGAAACATGAAG-ACA
* * * * * * * *
19956 AAGCCATCCGTTGGCCAA-AAGAGTTCATTTATACTCA-CTCAAGTCTTTGAAAGCCTTATTACT
64 AAGCCATTCATTGG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
20019 CGTTTTAAATAGTTTTATAATTTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * * * *
20064 TGTTTTTGCATTTTTTTA-TTAAAACAGATAATATTTGAATATCTACATTAAGAAACATCAAGA-
1 T-TTTTTACA--TTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC
* * * * * ** *
20127 AAAGCCATTTATTGACAAGAAAAGGT-CATTTATAGCCACCCATACCTTCTCAAGTCTTATTACT
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
20191 TG-TGTTAATTAGTTTAATAATCTTATAA-TGCATTTTAAGTTGAA
127 TGCT-TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG-ATTTTAAGTTAAA
* * * * * *
20235 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATATCT-GCTTTGAAAACATGAAG-CAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-AA
** * * * * * * * * **
20298 AGCCAACCACTAGCAA-AAAAATCCATTTATAGTCACTTAAGCTTTCAAAAGCTTTATTACTCAC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * * *
20362 TTTAAATAGTTTTATAATCACAAAATTGATTTTAAGTTAGA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * ** * * *
20403 TTTTGTTACATTTTTGGTTAAAACAAATTATATTTAAATGTCTGTCAT-GGAAAATATGAAGAAA
1 TTTT-TTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGACA
* * * *
20467 AAACCATTTATTTGCAAGAAAAG-CACATTTATGGTCA-CTCATGCCTTCGAAAGCC-TATTACT
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
20529 AGCTTTACATAGTTTTACAATCTCACAATTGATTTTAAGTTAAA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * **
20573 TTTTTTATATTTTTTGTTAAAATATATTACAATTCAATGT-TTGCTTCA--AAATTCATGAAG-C
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAA--CATGAAGAC
* * * * * * * *
20634 AAAAGCCATCCATTGGCAAAAAAAATTC-TTTATAATCA-CTCAAGCCTTCAAAAGCATTATTAC
63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
** * * * *
20697 TCACTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAACTTTAAGTTGAAT
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * *
20743 TTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCTTTAGGAAACGTGAAG-CAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-AA
* * * ** * **
20807 AGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTACATTTATAATCA-CTCAAACCTTTGAAAGCCTTATTACTCC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* * * * * * *
20871 CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAGTTGCTGTAAAGTGAGAT
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AA
* * * * * * *
20914 TTTTTTAC-TTTTCTATTTAAAACAGATAATATTTGAATGTCTACCTTGGGAAACATAAAGAAAA
1 TTTTTTACATTTT-TAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
*** * * ** * * *
20978 ATTGATTCATTAGTAAGAAAAGTTTATTTATAATCACAC-ATGCCTTCAAAAGCCGTATTACTTG
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* * * * *
21042 CTTTAAATCGTTTTTTAATCTCATAATTGACTTTAAGCTGAAT
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAA
* * * *** *
21085 TTTTTTATATTTTT-GATTAAAATATATTATAATTGATTGTCTGTTTTAAGAAACATGAAG-CAA
1 TTTTTTACATTTTTAG-TTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * * * * * * *
21148 AAGGCATCCATTGAG-AAGAAAAGTTCATTTATGGTCA-CTCAAGCCTTTGAAATCTTTATTACT
64 AAGCCATTCATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
** * * *
21211 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTCATTTTATGTTGAA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* ** * * *
21255 TTCTTTTACATTTTTGGTTGGAATGTATTATAATTGAATGTCTGA--TTCAGGAAATATGAAG-C
1 TT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCT-ACCTT-AGGAAACATGAAGAC
* * * * ** ** *
21317 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAATCATTTAAACCTACGAAAGCCTTATTACT
63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
** * * * **
21382 CACTTTAAATGGTTGTATAACCTCATAATTGATTTTAATTTGATT
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * *
21427 TTTTTTACTTTTTTTA-TTAAAACAGT-TAATATTTGAATGTTTACCTT-GGAAA-ACGTATAGA
1 TTTTTTAC-ATTTTTAGTTAAAATA-TATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATG-A-AGA
* * * * * *
21488 GAAACCCATTCATTGGTAAAAAAAGTCCATTTATAGTCA-CTCATACCTCCGAAAGCCTTATTAC
62 CAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * *
21552 TTGCTTTAAACGGTTTTAGAATTTCATAATTAATTTTAAGTTAAA
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * *
21597 TTTCTTTACATCTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATATCTA-CTTTGAAAAACATGAAG-C
1 TTT-TTTACAT-TTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAC
* * * * * * * *
21659 AAAAGCTA-TCTATTGACAAGAAAAGTCTACTTATGGTCA-CTCAAGCCTTCGAAAGCCTTGTTG
63 -AAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
** *
21722 CTCACTTT-AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAGTTAAA
125 CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * *
21767 TTTTTTTCCTTTTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-GCTTCGGTGAACATTAAG-C
1 -TTTTTTAC-ATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGAC
* * * * * * *
21830 AAAAGCCATTCACTGGCAAGAAACGTCCATTTATAGTCA-TTCAAGTCTTTGAAAGCCCTATTAC
63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
*** * * * *
21894 TCATTTTAAATAG-TTTATAATCGCATAATTGATTTTAGGTTGAA
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
** * * * * * * **
21938 TTTTTTTTATTTTTGGTTAAAATAGATAATATTTGAATGTTTGCCTTGGGAAATGTGAAG-CAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-AA
* * * *
22002 AGCCATTCATT-ACTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAATACCTTCAAAAGCCTTATTACTTG
65 AGCCATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* * *
22066 CTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAAGTGATTTTAAGTTAGA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * *
22108 TTTTTATACATTTTTGGTTAAAATA-ACTATAATTGAATGTCTGCTTTAAGAAACATAAAG-CAA
1 TTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * ** * * * * *
22171 AAGCTA-TCTATTGGCAAAAAAAAACCATTTCTAGTCA-CTCAAGCATTCAAAAGTCTTATTACT
64 AAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * ** *
22234 AGCTTTAAATGATTTTATAAACTGATAATTGATTTTGGGTTAGA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * *
22278 TTTTTTCTCATTTTTTGTTAAAATAGATAATATTTGAATGTTTGCCTTAAGAAACATGAAAAAAA
1 TTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * * * * * * *
22343 AGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTAATCGATACTTTCGAAACCCTTATTACTTTC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
** * * **
22408 TTTAAATAATTTTATAATCTCATTATTGATTTTCAGTTGAGC
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
*** * * * * * * * *
22450 TTTTTATTTTTTTTTTGTAAAAATAGATAATATTTGAATGTTTACCTT-GAGAAACGTGATGAAA
1 TTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACA
** * * * *
22514 AAGTTATTCA-TGGCCAAGAAAAGTCCATTCATAATCATCC-ATGTCTTTC-AAAGCTTTATTAC
64 AAGCCATTCATTGG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CCTATG-CCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * ***
22576 TTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGGC
126 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * ***
22621 TTTTTATACATTTTT-GATTGAAATATATTATAATTGAATGTTTACTTTCA-GAAACGCAAAG-C
1 TTTTT-TACATTTTTAG-TTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAC
* * * * * * *
22683 AAAAGTCATCCATTGGTAACAAAAGTCCATTTACAATCA-CTCAAG-CTTACGAAAGCAC-TATT
63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTT-CGAAAGC-CTTATT
* * * * *
22745 ACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCGTAATTGATTTTAAATTGAA
124 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * *
22792 TGTTTTTACAATTTTAGTTAAAAAAAATAATATTTCAATGTTTGCCTT--GAAGGATATGAAGAA
1 T-TTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAA--ACATGAAGAC
* * * *
22855 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTT
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * *
22920 GCTTTAAATGGTTTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTCAG
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * * * **
22963 TTTTTTATATTTTT-GACTAAAACAGATAATATTTAAAAGTTTTCCTTTGGAAATGTGAAG-CAA
1 TTTTTTACATTTTTAG-TTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* ** * * * * ** * *
23026 AAGCTATTCATTGTTAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATACCTTTAAAAGCCTTA-TGCTTA
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
** * * *
23090 CTTTAAATGGTCGTACAAACTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * *
23132 TTTTTATACATTTTGA-TTAAAATATATTCTAATTAAATGTCTGCTTTGGGAAACATTAAG-CTA
1 TTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * * * * * * * * *
23195 AAGTCATCCATTGGTAAGAAAAATCCTTTTTTAATCA-CTCAAGTCTTTGAAAGCCTTATTACTT
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * **
23259 GCTTTAAATAGTTTTATAAACTCATAACTGATTTTAAGTTGTA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * *
23302 TTATTTTACATTCTTAGTTAACACATATAATATTTGAGTGTCTACCTGA-AAAACATGAAGAAAA
1 TT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* *
23366 AGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACC-ATGCCTTCGAAAG-CTTCATTGCTTG
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTT-ATTACTTG
** *
23429 CTTTAAATACTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
** * * * **** ** *
23471 TTTTTTA-ATATTTTTTTTAAAATATATTATAATTAAATATCCGTTTTAGGAAATGTGTAG-CAA
1 TTTTTTACAT-TTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * * * * * * *
23534 AAGCCATCCATTAGTAAGAAAATTCCATTTCTATTCA-CTCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTT
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* ** * *
23598 GCTCTAAATGACTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * *
23641 TTTTTTACATTTTTATTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCTGGAAACATGAAG-CAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAC-A
* * * * *
23704 AAGCAATCCATTGGCAACAAAAGTCCATTTATAGTCA-CTCAAG-CTTACGAAAGCATTATTA-T
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTT-CGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
23766 TCACTTTAAAT-GCTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGCAT
127 T-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
** * * * * * * *
23811 TTTTTTACAAATTTGGTTAATACAAATA-T-TATTTGAATGTTTGCCTT-GAGAGACATGAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAA-A-ATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAC
** * * * *
23873 AAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTTCATTTATACTCACCCATGCCTTCGAAA-ACTTATTACTT
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* *
23937 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGATGAAT
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAA
* * * * * *
23981 TTTTTTACAGTTTTAGTTAAACTATATTACAATTGAATGTATACCTTAGGAAACGTGAAG-CAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-AA
** * * * * *
24045 AGCCA-TCGATTGGCAAGAAAAGTTTATTTATAGTTACTCAAT-CCTTTGAAGGCTTTATTACTT
65 AGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * *
24108 ACTTTAAATGGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * ** * * *
24151 TTTTTGATATTTTTGGTTGAAACATATAATATTTGAATGTTTGCCTTAGGAAATGTAAAAAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
* ** *
24216 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATGCCTTTAAAAGCCTTATTACTTACT
66 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * *
24281 TTAAATGGTTTTATAATCTCATTAGTGATTTTAAGTTTAG
131 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * ***
24321 TTTTTTACACTTTTTTGTTAAAACAGATAATATTTGGATGT-TTTTTTAGGAAAACATGAAG-C-
1 TTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGACA
* *
24383 -A---ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CTCATGCCTTCGAAAGTCTTATTAATT
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * *
24443 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTAATAAGTGATTTTAAGCTGAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * ** *
24486 TATTTATAGATTTTT-GATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT-GCTTCATGAAATGTAAAG-C
1 T-TTTTTACATTTTTAG-TTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAC
* * * * * *
24548 AAAAGCCATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CTCAAGCCTAT-GAAAGCATTTTTA
63 -AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCT-TCGAAAGCCTTATTA
* * *
24611 CTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTCAATA
125 CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AA-A
** * * * * * * *
24659 TTTTTATA-ATTTCGA-TTAAAACA-ACTAACATTTGAATGTTTGCCTT-GAGAGACATGAAGAA
1 TTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATA-TTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAC
* * * *
24720 AAAGTCATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-ATCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACT
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * **
24784 CGTTTTAAATGATTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTGTA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * *
24828 TTGTTTTACGTTCTTAGTTAACACATATAATAGTTGAGTGTCTGCCTT-GAGAAACATGAAGAAA
1 TT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACA
* * * * *
24892 AAGCCGTCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTCTAGTCACC-ATGCCTTCAAAAGCCTTATTGCTTG
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
** *
24956 CTTTAAATACTTTTGTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * ** * **
24998 TTTTTTGACATTTTTGGATAAAGTATATTATAACTGAATGTCT-GCTTAAGGAAATGTGAAG-CA
1 TTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAC-
* * * * * * * * * *
25061 AAAGCTATCCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTCTATTCA-CTCAAGCCTTCAAAAGCCCTATTACT
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * *
25125 TGCTCTAAATGGCTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * *
25169 TTTTTATATATTTTTGGTTAAAATATATTATAGTTAAATGTTTGCTTTAGAAAACGTGAAG-CAA
1 TTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * * ** *
25233 CAGCCA-TCAATTGACAAGAAAAGTCCATTTCTAGTCA-CTCAAGCCTTTAAAAACCTTATTACT
65 -AGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
** * * * * * *
25296 TATTTTAAATGGTTTTACAAACTCATAATTAATTTTAAATTGGAT
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * * *** * * *
25341 TTTTTTATAGTTTTAGTTAAAATAGATAATATTTGAGTGTTTTTGTTGGGAAACGTGAAGAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
* * ** * *
25406 ACCATTCATTGGTAAGAAAAGTTTATTTATAATCA-CTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
66 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
** * *
25470 TTTAAATACTTTTATAATCTCATAATTGATTATAAGTTTAA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
*** * * * * *
25511 TTTTTTGACATTTTTTCATAAAATATATTATAATTAAATGTCCACTTTAGGAAATATGAAG-CAA
1 TTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* ** * * * *
25575 AAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTTAAGCTTTCGAAAGCCTTATTACTTG
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
** **
25640 CTTTAAATGGTTGAACCATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * ** * * * *
25682 TTTTTCTATATTTTCA-TTAAAACAGGTTATATTTGAATGTTTACCTCAAGAAA-AGTGAAGAAA
1 TTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACA-TGAAGACA
* * * * * *
25745 AAGCCATGCATTGACAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATGTCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* **
25810 CTTTAAATGGTTCTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * ** * *
25852 TTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATCATAATTGAATGTCTACTTTAGTAAATGTAAAGAAAA
1 TT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * * * * * * *
25917 AGCCATTCAGTGGTAAGAAAAGTCTATTTACAGTCACTTAAGCCTTCGAAAGCCCTATTACTCGC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * * **
25982 TTTAAGTGG-TTTACAATCTCATAATTAATCGTAAGTTGAAA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * * * * * ** * *
26023 TTTTTCATATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTTGCCTAAAGAAATGTGAACAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
** * * * * *
26088 GATATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAATCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATAACCTGCT
66 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * ** * * *
26153 TTAAATGGCTTTACATTCTTGTAATTAATTTTAAGTTGGAT
131 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
** * * * ** * * * * *
26194 TTTTTTATGTTTTTAGTTAAGACAAATTATATTCAAATGTCTGCCTCAGGATACATTAAGAAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
* *** * *
26259 GCCATTGATTAATAAGAAAAGTCCATTTACAGTCATCC-ATGCCTTCGAGAGCCTTATTACTTGC
66 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * *
26323 TTTAAATGGTTTTAGAATCTCATAATTGATTTTCAGTTGAAT
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * ** *
26365 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATTTATTATAATTGAATTAAATCTCTACCTCAAAAAACTTGAAG
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT-A-T---TTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAG
* * * * * * * * *
26430 TCAAAACCCTCCATTGTCAAGAAAAGTCTATTTATTGTCATAC-AAGCCTTTC-AAAGCCTTATT
61 ACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CCTATGCC-TTCGAAAGCCTTATT
** * *
26493 ACTCACTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAATTGATTTTAAATTAAA
124 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * *
26540 TTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATACTTGAATGTCAACC-TCGAGAAACGTAAAGACA
1 -TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACA
* * * * * *
26604 AACCCATTCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTGACGC-ATACCTTCGAAAGCCTTATTACTT
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* **
26668 GCTTTAAATGCTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTATT
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAA
* * * * * * * *
26712 TTTTTTATATTTTTAGTTAAAATATATTAT-TATTGAATATCTGCTTTA-AAAACGT-CAGGCAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAT-TTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * * * * ** * *
26774 AAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGCCCATTTTTAGACA-CTAAAGCCTTTAAAAACCTTATTACTC
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * *
26838 ACTTTAAATAGTTTTATAATCGCATAATTGATTTTAAGTTAAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * ** * * * *
26881 TTTTTTTATATTTTGAATGAAAGCATATTATAATTGAATGTCTATCTCAGAAAACATGAA-A-AA
1 -TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * * * *
26944 AACCATTGATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATTGTCACC-CTGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * *
27008 TTTACATGATTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * ** * *
27049 TGTTTTTATATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-TGTCAAGAAACAT-AATG-CA
1 T-TTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAA-GAC-
* * * * * * *
27111 AAAGCCA-TCTACTAGCAAGAAAAGTGCATTTATAATCACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
63 AAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * * *
27175 CGCTTAAAATAGTTTTGTAATCTCATAATTGCTTTTAAGTTTGATA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TT-AAA
* * *
27221 TTTTTTAC-TTGTTTAGTTAAAAAATATAATATTTGAATGTCTACCTT-GAGAAACGTGAA-A-A
1 TTTTTTACATT-TTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACA
** * ** * * * * * * *
27282 AAGTGATTGATTGGCAAGAAAAGTTTATTTATAGTTACCCATACTTTTGAAAGTCGTATTACTTG
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* * * * *
27347 CTTTAAATCGTTTTATAACCTAATAATTGTTTTTAAGTTGAAT
129 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * * * * * **
27390 TTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATATTACAATTGAACGTCT-GCTTTGAGAAATGTGAA-ACAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAC-A
* * ** * * ** *
27453 AAGCCATCCATAGGCAAGAAAAGTTTATTTATGGTCA-CTCAAGCCTTCGAAAATCTTATTACTC
64 AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * *
27517 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTTATTTTAAATTAATT
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAA-A
* * * * * * *
27561 TTTTTTACGTTTTTGGTTAAAATGTATTAT-TATTGAATGTTTGCTTTAGGAAACATAAAG-CAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAT-TTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAA
* * * * * * * * * *
27624 GAGCCATCCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAATCA-CTCAGGCCTACAAAAACCTTGTGACTC
65 -AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
*
27688 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAA
128 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAA
* * * *** * * * * * *
27732 TTTTTAAAATTTTTGGTTAAAACGGATAATATTTGAATGTTTAACTT-GAGAAACGTGCAGAAAA
1 TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGACAA
* * ** * * * * * *
27796 AACTATTCATTGATAAAAAAAGTCCATTTATAGTAACTTATGCCTTTG-AAGCCTTATTATTTAC
65 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * * *
27860 TTTAAATAGTTTTACAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAA
130 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * *
27901 TTTCTTTACATTTTGA-TCAAAATATATTATAATTGAATATCTA-CTTCAAGAAACATGAAG-CA
1 TTT-TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAC-
* * * * * * * ** *
27963 AAAGCTATCCACTAGCAAGAGAAGT-CTTTTATGGTCA-CTCAAACCTTCGAAAGCTTTATTACT
63 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
** *
28026 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
127 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
* * * * * * * * * *
28070 -TTCTTATCCTTTTTGGTTAAAATATATTACAATTGAATGTTTGCTTTGGGAAACATTAAG-CAA
1 TTTTTTA-CATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAC-A
* * * * * * * *
28133 AAGCTATTCACTGGCAAAAAAAAGTTCATTTTTAGTCA-CTCAAGCCTTCAAAATCCTTATTACT
64 AAGCCATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
28197 TG
127 TG
28199 TAACGACCTC
Statistics
Matches: 9632, Mismatches: 2328, Indels: 921
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
163 4 0.00
164 57 0.01
165 187 0.02
166 42 0.00
167 98 0.01
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169 938 0.10
170 2677 0.28
171 4073 0.42
172 604 0.06
173 78 0.01
174 6 0.00
175 36 0.00
176 181 0.02
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178 7 0.00
179 5 0.00
180 78 0.01
181 52 0.01
182 10 0.00
183 8 0.00
184 95 0.01
185 2 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGACAAA
GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA
Found at i:16457 original size:341 final size:340
Alignment explanation
Indices: 15680--28198 Score: 7394
Period size: 341 Copynumber: 36.7 Consensus size: 340
15670 AAAGTAATTT
* * * * * * *
15680 ATTGGCAAGAAAAGTTCACTTATAATCACTCATA-TCTTTGAAAGCATTATTACTCGCTTTAAAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * * * * *
15744 GGTTATATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTAGATTTTTT-TATTTTTTGTTAAAACAGATAACA
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* *** * * * *** * * *
15808 TTTGAATGTCTATCTCGGGATACATTAAGAAAAAATGATTCAATGGTAAGAAAAGTCTATTTATA
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * *
15873 GTCACCTATACCTTCGAAAACCTT-GTACTTACTTTAAATGGCTTTATAATCCCATAATTGATTT
195 GTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTT
** * *
15937 TAAGTTGAAGTTTTTTA-CCTTTTTAGTTAAAATTTATTATAATTTAATTGAATGTCTACCTT-A
260 TAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTA-TTAAAA--TA-TAT--TATAATTGAATGTCT-GCTTCA
* * ** *
16000 GAAAATATGAAGTAAAAGGCC-TCC
317 GAAAACATAAAACAAAA-GCCATTC
* * * * * *** * *
16024 ATTAGCCAAAAAAAGTCCATTTATTGTGACACAAATGTTCAAAAGCTTTATTA-TGTGCTTTAAA
1 ATT-GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAA
* * *
16088 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATTAAATTTGTTTACA-TTTTAGTTAAAACAGATTA
64 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTT-TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTA
** * * * *
16152 TATTTGAATGTCTACCTTGGGAAACGTGAAGACAAA-CTCATTCGTTGGCAAGAGAAGTCCATTG
128 TATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGC-CATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTT
* * *
16216 ATAGTCACCTATGCCATCAAAAGCCTTATTAGTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
192 ATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * *
16281 TTTTAAGTTTAATTTTTTAATATTTTTTATTAAAATACATTATAATTAAATGTCTGCTTCAGAAA
257 TTTTAAGTTGAATTTTTT-ATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAA
* *
16346 ACGTAAAACAAAAGCCATCC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * ** * *
16366 ATTGGCAAAAAAAGTCTATTTACAATCACACAAGCCTTTAAAAGCTTTTTTACTTGCTTTAAATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * * * *
16431 GTTTTATAATCTCATAATTCATTTTAAGTTGAATTATTTTACATTTTTAGTTAACACAGACTA-A
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
** **
16495 TTTGAATGTCT-GTTTGGGAAA-ATGTAAAGACAAA-CCTATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTT
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATG--AAGACAAAGCC-ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTT
* * * * *
16557 ATAGTCACTTATACCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTATATAGTTTTATAATTTCATAATTGA
192 ATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * *** * * * * ** *
16622 TTTGAAGTTAAATTTTTTAATATTTTTGGCTAAACTTTATTTTAATTGAATGTTTGCTTTGGGAA
257 TTTTAAGTTGAATTTTTT-ATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAA
** * * *
16687 ATGTGAAGCAAAAGTCATTC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
* ** * *
16707 ATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATA
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * * * * * *
16772 GTTTAATAATCTAATAATTTATTTAAAGTTTAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATAGATCAGAT
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAT
* * * * ** * * * * * *
16837 TTGAATATTTGCCTCAAGAAATGTGAAGAAAAAGTCATTTATTAGCAAGAAATGTCCATTTATAA
131 TTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * * * * *
16902 TCACCCATACCTTTGAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTATATAATCTTATAACTGAATTT
196 TCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT
* * * * * * * * * * *
16967 AAG-TGAGAATTTTTACATTTTTCATTAAAACAGATAATATTTGAATGTGT-C-TCAGGATA-GT
261 AAGTTGA-ATTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAAACAT
*
17028 GAAGAAAAAAAG--ATTC
325 -AA-AACAAAAGCCATTC
* * * * * * *
17044 AATGGCAAGAAAAATCTATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAATA
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * *
17109 G-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTAAATTTGTTTATAATTTTTAGTTAAAATACATTAT
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTT-TTTA-CATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * * * * * *
17173 AATTGAACGTCT-GCTTCAGAAAACATGAAG-CAAAACCCATCCGTTGGCAAGAAAAGCCCATTT
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAG-AAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTT
* * * * ** *
17236 ATAGTCACTCAAT-CCTTTGAAGGCCTTATCACTCACTTTAAAT-GATTTATAATCTCATAATTG
192 ATAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
********** * ** * * * * *
17299 NNNNNNNNNNGAATTTTTTTATATATTTGGTTAAAACAGATTCTATTTGAATG-CTTACATT-AG
256 ATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTC-TGC-TTCAG
* * *
17362 GAAACATGAGGAA-AAAA-TCATTC
318 AAAACAT-A-AAACAAAAGCCATTC
* * * *
17385 ATTAGCAAGAAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTGGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAA
1 ATTGGCAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAA
********** * *
17449 TGGTTTTATNNNNNNNNNNTTGATTTTAAGTTTAATTATTTTACATTTTTAGCTAAAATATATTA
64 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTA
* ** * * *** * * * *
17514 TAATCAAATATCTA-CTTCAAAAAACGCAAAGTA-AAAGCCATCCACTAGCAAGAAATGTCCATT
128 TATTTGAATGTCTACCTT-AAGAAACATGAAG-ACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
* * ** * * * ** *
17577 CATAGTCACTTAAACTTTTGAAACCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAGTC-CTATAATT
191 TATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC-ATAATT
* * * * * * * * * *
17641 GATTTTGAGTTAAATTTTTTA-ACATTTTTAGTTGAAACAGATTATATTTAAATGTTTTCCTT-A
255 GATTTTAAGTTGAATTTTTTATA-TTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATG-TCTGCTTCA
* *
17704 TG-AAACATGAAGCAAAA-CCATTC
317 -GAAAACATAAAACAAAAGCCATTC
*** * * * * *
17727 ATTGATGAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAACCTTATTACTTACTTTAAAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * ** ** * *
17791 GGTTTTATAATATCCTAATTGATTTTTTATTTTTTTATGCTTTTCTAAAAAAGTTGAATTTTTTG
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGA--TTTTA-AGTTAAAT--TTTT-T-----A----CATTTTTAG
* * * * ** *
17856 TTAAAATATATTATAATTGAATGTCCACTTCTAA-AAA-TTGAA-ACAAAAGCCACCCATTGACA
115 TTAAAATATATTATATTTGAATGTCTACCT-TAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCA
* * * * ** ** **********
17918 AGAAAGGTCCATTTATAGTTACTTAAGCCTTCGAAAGTATTATTACTCACTTNNNNNNNNNNTAT
178 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * *
17983 AATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAACTCTTTTACATTTTTTAATTAAAACAGATGATACTTGAA
243 AATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTT-ATTAAAATATATTATAATTGAA
* * * * * *
18048 TGTCT-ATCCTA-AAAAAATTAAGA-AAAAGCCTTTT
306 TGTCTGCTTC-AGAAAACA-TAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * *
18082 ATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTTAC-CTATGCTTTCGAAAGCCTTATTGCTTGCTTTAAAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* ** * *
18146 GGTTTTATAATCTCATAATTGACTTTAAGTTAAATTTTTTTACACGTTTGGTTAAAATAGATTAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA-TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * ** ** * * * ** *
18211 ATTTAAATGTGTGCCTCGAGAAATGTGAAGAAAAACCCATTTATTGATAGGAAAAGTCCATTTAT
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * *** * * *
18276 AATCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTTTTACTTGCTTTAAAAAATTTTATAATTTTATAATTAATT
194 AGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT
* *** *
18341 TTAAGTTAAATTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTGAACCTT-AGAAAAA
259 TTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGT-CTGCTTCAGAAAAC
*
18405 ATGAAGAA-AAAA-CCATTT
323 AT-AA-AACAAAAGCCATTC
** * * * * *
18423 ATTAACGAA-AGAAGTCTATTTATAGTCA-TCCATGCCTTTC-AAAACCCTATTACTTGCTTTAA
1 ATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAGCC-TTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
* * * * ** * * *
18485 AGGGTTTTGTAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTGTATTTTTGGTTAAAACATTTT
63 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATT
* * * * * * * * *
18550 ATGTTTGAATGTTTGCCTTAAGAAATATGAAGGA-AAAGTCATTCGTTGACACA-AAAGGTTCAT
127 ATATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAA-GACAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCAT
* * * * *
18613 TTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCTTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
190 TTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * ** * *
18678 GATTTTAAGTTGAATTTTGTTATACTGTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-AG
255 GATTTTAAGTTGAATTTT-TTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTG-CTTCAG
* ** *
18742 GAAATGTGAAGA-AAAAGCCA-TC
318 AAAACAT-AAAACAAAAGCCATTC
** * * ** * *
18764 GATTAGAG-AA-AAAAACCCATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGTATCATTACTCGCTTTAA
1 -ATT-G-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
* * * * *
18827 ATGGTTTTATAATATCATAATTGGTTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTT--TTAAAAATATTT
63 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTT-AAAATATAT
* ** * * * * * * *
18890 TATAATTGAATGTCTGTCTCAGGAAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTGACACGAAAGGTCCATT
126 TATATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
* * * * * *
18955 TACAGTCACCCATACCTTCGAAAACTTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
191 TATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * *
19020 ATTTTAAGTTGAATTTTGTTATA-CTGTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTACCTT-AG
256 ATTTTAAGTTGAATTTT-TTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-GCTTCAG
* * * *
19083 CAAACATGAAGCAAAAGGCA-TC
318 AAAACATAAAACAAAAGCCATTC
* ** * * * *
19105 TATTAG-AGAGAAAAACCCATTTATAGTCACGCATA-CCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAA
1 -ATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
* * *
19168 ATGGTTTTATAATATCATAATTGATTTTAAATTAAATTTTTTTTACATTTCTTA-TTAAAATGTA
63 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAA--TTTTTTACATTT-TTAGTTAAAATATA
* * * * ** * * *
19232 TTATAATTCAATATTTTTCTTCAA-AAACGTGAAG-CAAAAGCCA-TCTATTTGCAAGAAAGGTC
125 TTATATTTGAATGTCTACCTT-AAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTC
* * *
19294 CATATATAGTCA-CTCAAGCC-TCTGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAACGGTTTTATAAT-TG
187 CATTTATAGTCACCT-ATGCCTTC-GAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-
* * *
19355 CATAATTGATTTT-AG-T---TTTTTTA-A-TTTTTAGTTAAAATAAATTATATTTGAATGTCTA
248 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTG
** * ** *
19413 CCACAAAAAATGTGAAGAA-AAAA-TCATTC
312 CTTCAGAAAACAT-AA-AACAAAAGCCATTC
* ** * * * * *
19442 TTTGGCAAGAAAAGTTTATTTTATAGTCACCCATGGCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTACAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * *
19507 GGTATTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTATTTAAAATATATTAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* ** * * **
19572 AATTGAACATCT-GCTTAAGGAAACATGAAGTA-AAAGCCATCCACTT-GCAAG-AAAGTTTATT
129 ATTTGAATGTCTACCTTAA-GAAACATGAAG-ACAAAGCCATTCA-TTGGCAAGAAAAGTCCATT
* * * * *
19633 TATATTCA-CTCAAGCTTTTGAAA-CCTTTATTACTTGCTTTAGATGGTTTTATTGTCTTTTATT
191 TATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCC-TTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTA--------TA--
* * * *
19696 GTCTCATAATTGATTTTGAA-TTGAATTTTTT-TACATTTTTAGTTAAAGA-AGATTATATTTGA
244 ATCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAATTTTTTATA-TTTTTTA-TTAAA-ATATATTATAATTGA
* * * * ** *
19758 ATGTATACCTC-GAGAAACGTGATGATAAAA-CCATTC
305 ATGTCTGCTTCAGA-AAACAT-AAAACAAAAGCCATTC
* * * * * * * *
19794 ATTGTTCAA-AAAATTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTATTTACTTTAAAT
1 ATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * ** * *
19858 GGTTTTATAATCTCATTATTGATTCTAAGTTGAGGTTTTTTACATATTTGGTTAAAATATATTAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * * * * *
19923 AATTGAATGTTTA-CTCTAAGAAACATAAAGTA-AAAGCCATCCGTTGGCCAA-AAGAGTTCATT
129 ATTTGAATGTCTACCT-TAAGAAACATGAAG-ACAAAGCCATTCATTGG-CAAGAAAAGTCCATT
* * * * * * * *
19985 TATACTCA-CTCAAGTCTTTGAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAATTTCATAATT
191 TATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * *
20049 GATTTTAAGTTGAATTGTTTT-TGCATTTTTTTATTAAAACAGATAATATTTGAATATCTACATT
255 GATTTTAAGTTGAATT-TTTTAT--A-TTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGC-TT
* * * *
20113 AAG-AAACAT-CAAGAAAAGCCATTT
315 CAGAAAACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * ** *
20137 ATTGACAAGAAAAGGT-CATTTATAGCCACCCATA-CCTTCTCAAGTCTTATTACTTG-TGTTAA
1 ATTGGCAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT-TTAA
* * * * * *
20199 TTAGTTTAATAATCTTATAA-TGCATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATT
63 ATGGTTTTATAATCTCATAATTG-ATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATT
* * * * * ** * * *
20263 ATAATTGAATATCTGCTTTGA-AAACATGAAG-CAAAAGCCAACCACTAGCAA-AAAAATCCATT
127 ATATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
* * * * * ** * * *
20325 TATAGTCACTTAAGCTTTCAAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCACAAAATTG
191 TATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* ** * * * *
20390 ATTTTAAGTT-AGATTTTGTTACATTTTTGGTTAAAACAAATTATATTTAAATGTCTG--TCATG
256 ATTTTAAGTTGA-ATTTT-TTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCA--
* *
20452 GAAAATATGAAGAA-AAAA-CCATTT
317 GAAAACAT-AA-AACAAAAGCCATTC
* * * * *
20476 ATTTGCAAGAAAAG-CACATTTATGGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC-TATTACTAGCTTTACAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * *
20539 AGTTTTACAATCTCACAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTATATTTTTTGTTAAAATATATTACA
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * ** * * * * *
20604 ATTCAATGT-TTGCTTCAA-AATTCATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGGCAAAAAAAATTC-TTT
130 TTTGAATGTCTACCTT-AAGAA-ACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTT
* * * * ** * *
20665 ATAATCA-CTCAAGCCTTCAAAAGCATTATTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTA
192 ATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * * *
20729 ACTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCTTTAGGA
256 ATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAA
* * * *
20794 AACGTGAAGCAAAAGCCATCC
320 AACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * ** *
20815 ATTGGCAAGAAAAGTACATTTATAATCACTCAAACCTTTGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAATA
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * * * * * * * *
20880 GTTTTATAATCTCATAGTTGCTGTAAAGTGAGATTTTTTTAC-TTTTCTATTTAAAACAGATAAT
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AATTTTTTACATTTT-TAGTTAAAATATATTAT
** * * *** * * **
20944 ATTTGAATGTCTACCTTGGGAAACATAAAGAAAAATTGATTCATTAGTAAGAAAAGTTTATTTAT
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * *
21009 AATCACAC-ATGCCTTCAAAAGCCGTATTACTTGCTTTAAATCGTTTTTTAATCTCATAATTGAC
194 AGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * * * *
21073 TTTAAGCTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGATTGTCTGTTTTA-AGAA
258 TTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGA-AA
* * * *
21137 ACATGAAGCAAAAGGCATCC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * **
21157 ATTGAG-AAGAAAAGTTCATTTATGGTCACTCAAGCCTTTGAAATCTTTATTACTCACTTTAAAT
1 ATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * ** *
21221 GGTTTTATAATCTCATAATTCATTTTATGTTGAATTCTTTTACATTTTTGGTTGGAATGTATTAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * * * *
21286 AATTGAATGTCTGA--TTCAGGAAATATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATT
129 ATTTGAATGTCT-ACCTT-AAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
* ** ** * ** * *
21348 TATAATCATTTAAACCTACGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTGTATAACCTCATAATTG
191 TATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * * * * *
21413 ATTTTAATTTG-ATTTTTTTTACTTTTTTTATTAAAACAGT-TAATATTTGAATGTTTACCTT-G
256 ATTTTAAGTTGAATTTTTTATA--TTTTTTATTAAAATA-TATTATAATTGAATGTCT-GCTTCA
* * * *
21475 GAAAACGTATAGA-GAAACCCATTC
317 GAAAACATA-AAACAAAAGCCATTC
* * * *
21499 ATTGGTAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CCTCCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAC
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * *
21563 GGTTTTAGAATTTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTCTTTACATCTTTTA-TTAAAATATATTA
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTT-TTTACAT-TTTTAGTTAAAATATATTA
* * * * * * *
21627 TAATTGAATATCTACTTTGAA-AAACATGAAG-CAAAAGCTA-TCTATTGACAAGAAAAGTCTAC
128 TATTTGAATGTCTACCTT-AAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCAT
* * * * **
21689 TTATGGTCA-CTCAAGCCTTCGAAAGCCTTGTTGCTCACTTT-AATGGTTTTATAATCTCATAAT
190 TTATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *
21752 TGATTTTTAGTTAAATTTTTT-TCCTTTTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTC
254 TGATTTTAAGTTGAATTTTTTAT--ATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTC
* ** * *
21816 GGTGAACATTAAGCAAAAGCCATTC
316 AGAAAACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * * *** *
21841 ACTGGCAAGAAACGTCCATTTATAGTCATTCAAGTCTTTGAAAGCCCTATTACTCATTTTAAATA
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * ** * * *
21906 G-TTTATAATCGCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAATAGATAATAT
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAT
* * ** ** *
21970 TTGAATGTTTGCCTTGGGAAATGTGAAG-CAAAAGCCATTCATT-ACTAAGAAAAGTCCATTTAT
131 TTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * *
22033 AGTCACCAATACCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAAGTGATT
194 AGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT
* ** * *
22098 TTAAGTT-AGATTTTTATACATTTTTGGTTAAAATA-ACTATAATTGAATGTCTGCTTTA-AGAA
259 TTAAGTTGA-ATTTTT-TATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGA-AA
* *
22160 ACATAAAGCAAAAGCTA-TC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
* ** * * * * *
22179 TATTGGCAAAAAAAAACCATTTCTAGTCACTCAAGCATTCAAAAGTCTTATTACTAGCTTTAAAT
1 -ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * ** * * * * *
22244 GATTTTATAAACTGATAATTGATTTTGGGTTAGATTTTTTCTCATTTTTTGTTAAAATAGATAAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * * *
22309 ATTTGAATGTTTGCCTTAAGAAACATGAAAAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * * * ** *
22374 AGTAATCGATACTTTCGAAACCCTTATTACTTTCTTTAAATAATTTTATAATCTCATTATTGATT
194 AGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT
* ** * * * * * * * *
22439 TTCAGTTGAGCTTTTTATTTTTTTTTTGTAAAAATAGATAATATTTGAATGTTTACCTTGAG-AA
259 TTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTAT-T-AAAATATATTATAATTGAATGTCT-GCTTCAGAAA
* ** **
22503 ACGTGATGA-AAAAGTTATTC
321 ACAT-AAAACAAAAGCCATTC
* * * * * *
22523 A-TGGCCAAGAAAAGTCCATTCATAATCA-TCCATGTCTTTC-AAAGCTTTATTACTTACTTTAA
1 ATTGG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAG-CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
* * *** *
22585 ATAGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGGCTTTTTATACATTTTT-GATTGAAATATAT
63 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTT-TACATTTTTAG-TTAAAATATAT
* * * * *** * * * *
22649 TATAATTGAATGTTTACTTTCAGAAACGCAAAG-CAAAAGTCATCCATTGGTAACAAAAGTCCAT
126 TATATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCAT
* * * * * *
22713 TTACAATCA-CTCAAG-CTTACGAAAGCAC-TATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCGTA
190 TTATAGTCACCT-ATGCCTT-CGAAAGC-CTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * * * * * * *
22775 ATTGATTTTAAATTGAATGTTTTTACA-ATTTTAGTTAAAAAAAATAATATTTCAATGTTTGCCT
252 ATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTG-CT
* * *
22839 T--GAAGGATATGAAGA-AAAAGCCATTC
314 TCAGAA-AACAT-AAAACAAAAGCCATTC
* * *
22865 ATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * * * *
22929 GGTTTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTCAGTTTTTTATATTTTT-GACTAAAACAGATAAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAG-TTAAAATATATTAT
* * * * ** ** * ** * *
22993 ATTTAAAAGTTTTCCTTTGGAAATGTGAAG-CAAAAGCTATTCATTGTTAAAAAAAGTCTATTTA
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA
* * ** * * ** * *
23057 TAGTCACCCATACCTTTAAAAGCCTTA-TGCTTACTTTAAATGGTCGTACAAACTCATAATTGAT
193 TAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * * * ** *
23121 TTTAAGTTGAA-TTTTTATACATTTTGATTAAAATATATTCTAATTAAATGTCTGCTTTGGGAAA
258 TTTAAGTTGAATTTTTTATA-TTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAAA
* * * * *
23185 CATTAAGCTAAAGTCATCC
322 CATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * * * *
23204 ATTGGTAAGAAAAATCCTTTTTTAATCACTCAAGTCTTTGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATA
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * ** * * * *
23269 GTTTTATAAACTCATAACTGATTTTAAGTTGTATTATTTTACATTCTTAGTTAACACATATAATA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * * *
23334 TTTGAGTGTCTACCTGAA-AAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA
* ** *
23398 GTCACC-ATGCCTTCGAAAG-CTTCATTGCTTGCTTTAAATACTTTTATAATCTCATAATTAATT
195 GTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTT-ATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT
* * * * * * * *
23461 TTAAGTTAAATTTTTTAATATTTTTT-TTAAAATATATTATAATTAAATATCCGTTTTAGGAAAT
259 TTAAGTTGAATTTTTT-ATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAAAC
* ** * *
23525 GTGTAGCAAAAGCCATCC
323 ATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * * *
23543 ATTAGTAAGAAAATTCCATTTCTATTCACTCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTCTAAATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
** * * * *
23608 ACTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTATTTAAAATATATTATAA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAT
** * * *
23673 TTGAATGTCTA-CTTCTGGAAACATGAAG-CAAAAGCAATCCATTGGCAACAAAAGTCCATTTAT
131 TTGAATGTCTACCTT-AAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * *
23736 AGTCA-CTCAAG-CTTACGAAAGCATTATTA-TTCACTTTAAAT-GCTTTATAATCTTATAATTG
194 AGTCACCT-ATGCCTT-CGAAAGCCTTATTACTT-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * * * *
23797 ATTTTAAGTTGCATTTTTTTACAAATTTGGTTAATACAA-ATATTAT--TTGAATGTTTGCCTTG
256 ATTTTAAGTTG-AATTTTTT--ATATTT-TTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTG-CTTC
*
23859 AG-AGACATGAAAA-AAAAGCCATTC
316 AGAAAACAT-AAAACAAAAGCCATTC
** * * * * *
23883 ATTGATAAGAAAAGTTCATTTATACTCACCCATGCCTTCGAAA-ACTTATTACTTGCTTTAAATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * * *
23947 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGATGAATTTTTTTACAGTTTTAGTTAAACTATATTACA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * * * **
24012 ATTGAATGTATACCTTAGGAAACGTGAAG-CAAAAGCCA-TCGATTGGCAAGAAAAGTTTATTTA
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * * *
24075 TAGTTACTCAAT-CCTTTGAAGGCTTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAACCTCATAATTGA
193 TAGTCAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* ** * * * * * *
24139 TTTTAAGTTGAATTTTTGATATTTTTGGTTGAAACATATAATATTTGAATGTTTGCCTT-AGGAA
257 TTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTG-CTTCAGAAA
** *
24203 ATGTAAAAAAAAAGCCATTC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
* * ** *
24223 ATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAC-CTATGCCTTTAAAAGCCTTATTACTTACTTTAAAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * * * *
24287 GGTTTTATAATCTCATTAGTGATTTTAAGTTTAGTTTTTTACACTTTTTTGTTAAAACAGATAAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAATATATTAT
* *** *
24352 ATTTGGATGT-TTTTTTAGGAAAACATGAAG-C--A---ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAG-AAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA
* * * *
24410 TAGTCA-CTCATGCCTTCGAAAGTCTTATTAATTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTAATAAGTGA
193 TAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * * * *
24474 TTTTAAGCTGAATATTTATAGATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCTTCATG-A
257 TTTTAAGTTGAAT-TTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCA-GAA
** * *
24538 AATGTAAAGCAAAAGCCATCC
320 AACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * *
24559 ATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTAT-GAAAGCATTTTTACTCGCTTTAAAT
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT-TCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * ** *
24623 GATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTCAATATTTTTATA-ATTTCGA-TTAAAACA-ACT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AA-ATTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATA-T
* * * * * * * * *
24685 AACATTTGAATGTTTGCCTTGAGAGACATGAAGAAAAAGTCATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATT
126 TATATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
* * * * * *
24750 TATAGTCA-ATCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAAACTCATAATT
191 TATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* ** * * * * * * *
24814 GATTTTAAGTTGTATTGTTTTA-CGTTCTTAGTTAACACATATAATAGTTGAGTGTCTGCCTTGA
255 GATTTTAAGTTGAATT-TTTTATATTTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTG-CTTCA
* * *
24878 G-AAACATGAAGA-AAAAGCCGTCC
317 GAAAACAT-AAAACAAAAGCCATTC
* * * * *
24901 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTCTAGTCAC-CATGCCTTCAAAAGCCTTATTGCTTGCTTTAAATA
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * * *
24965 CTTTTGTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTGACATTTTTGGATAAAGTATATTATA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
** * ** * * * * * *
25030 ACTGAATGTCT-GCTTAAGGAAATGTGAAG-CAAAAGCTATCCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTC
130 TTTGAATGTCTACCTTAA-GAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * * *
25093 TATTCA-CTCAAGCCTTCAAAAGCCCTATTACTTGCTCTAAATGGCTTTATAACCTCATAATTGA
193 TAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
** * * * *
25157 TTTTAAGTTGAATTTTTATATATTTTTGGTTAAAATATATTATAGTTAAATGTTTGCTTTAGAAA
257 TTTTAAGTTGAATTTTT-TATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAA
* * * *
25222 ACGTGAAGCAACAGCCA-TC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
* * ** * **
25241 AATTGACAAGAAAAGTCCATTTCTAGTCACTCAAGCCTTTAAAAACCTTATTACTTATTTTAAAT
1 -ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * * * * * *
25306 GGTTTTACAAACTCATAATTAATTTTAAATTGGATTTTTTTATAGTTTTAGTTAAAATAGATAAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * *** ** * * * * **
25371 ATTTGAGTGTTTTTGTTGGGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTGGTAAGAAAAGTTTATTTAT
129 ATTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
* * **
25436 AATCA-CTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATACTTTTATAATCTCATAATTGAT
194 AGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * * * ** * *
25500 TATAAGTTTAATTTTTTGACATTTTTTCA-TAAAATATATTATAATTAAATGTCCACTTTAGGAA
258 TTTAAGTTGAATTTTTT-ATATTTTTT-ATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAA
* * * *
25564 ATATGAAGCAAAAGCCATCC
321 ACATAAAACAAAAGCCATTC
** * * *
25584 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTTAAGCTTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
** ** * * * **
25649 GTTGAACCATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTCTATATTTTCA-TTAAAACAGGTTATA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTT-TACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * * * * * *
25713 TTTGAATGTTTACCTCAAGAAA-AGTGAAGAAAAAGCCATGCATTGACAAAAAAAGTCTATTTAT
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACA-TGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
* * *
25777 AGTCACCCATGTCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTCTATAATCTCATAATTGATT
194 AGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT
* * ** * * * * *
25842 TTAAGTTGGATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATCATAATTGAATGTCTACTTTAGTAAAT
259 TTAAGTTGAATT-TTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGAAAAC
*
25907 GTAAAGA-AAAAGCCATTC
323 ATAAA-ACAAAAGCCATTC
* * * * * * * *
25925 AGTGGTAAGAAAAGTCTATTTACAGTCACTTAAGCCTTCGAAAGCCCTATTACTCGCTTTAAGTG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * ** * * * * *
25990 G-TTTACAATCTCATAATTAATCGTAAGTTGAAATTTTTCATATTTTTGGTTAAAACAGATTATA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * * ** * * **
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130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * * * * ** *
26119 ATCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATAACCTGCTTTAAATGGCTTTACATTCTTGTAATTAATTT
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* * * * * * * *
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* *
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*** * * *
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1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * *
26330 GGTTTTAGAATCTCATAATTGATTTTCAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAATTTATTAT
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* * * * * * * * * * *
26395 AATTGAATTAAATCTCTACCTCAAAAAACTTGAAGTCAAAACCCTCCATTGTCAAGAAAAGTCTA
129 -A-T---TTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA
* * * ** *
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* * * * ** *
26523 ATTGATTTTAAATTAAATTTTTT-TATATTTTTAGTTAAAATAGATTATACTTGAATGTCAACCT
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* *
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* * * * *
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1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* ** *
26677 GCTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTATTTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATATATTAT
65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * * * * * *
26742 -TATTGAATATCTGCTTTAA-AAACGT-CAGGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGCCCATTT
129 AT-TTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTT
* * * ** * ** * *
26804 TTAGACA-CTAAAGCCTTTAAAAACCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCGCATAATTG
192 ATAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* ** * ** *
26868 ATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTGAATGAAAGCATATTATAATTGAATGTCT-ATCTCAGA
256 ATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCT-TCAGA
* *
26932 AAACATGAAA-AAAA-CCATTG
319 AAACATAAAACAAAAGCCATTC
* * ** *
26952 ATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATTGTCAC-CCTGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTACATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * *
27016 ATTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATGTTTTTATATTTTTTGTTAAAATATATTATA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* ** * * * *
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* * * * * * * * *
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192 ATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * * * * * *
27207 TTTTAAGTTTGATATTTTTTA-CTTGTTTAGTTAAAAAATATAATATTTGAATGTCTACCTTGAG
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* * ** *
27271 -AAACGT-GAA-AAAAGTGATTG
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** * * * * * *
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1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * * * *
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65 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTAT
* * * * * ** * * **
27420 AATTGAACGTCTGCTTTGAGAAATGTGAA-ACAAAAGCCATCCATAGGCAAGAAAAGTTTATTTA
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* * ** ** *
27484 TGGTCA-CTCAAGCCTTCGAAAATCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTTA
193 TAGTCACCT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * ** * * * * *
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* * *
27612 AACATAAAGCAAGAGCCATCC
320 AACATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * * * * **
27633 ATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCAGGCCTACAAAAACCTTGTGACTCACTTTAAATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * *** *
27698 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAATTTTTAAAATTTTTGGTTAAAACGGATAATA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * * * * * * * ** *
27763 TTTGAATGTTTAACTTGAGAAACGTGCAGAAAAAACTATTCATTGATAAAAAAAGTCCATTTATA
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGACAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * * * *
27828 GTAACTTATGCCTTTG-AAGCCTTATTATTTACTTTAAATAGTTTTACAATCTCATAATTAATTT
195 GTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTT
* * * * *
27892 TAAGTTGAATTTCTTTACA-TTTTGATCAAAATATATTATAATTGAATATCTACTTCA-AGAAAC
260 TAAGTTGAATTT-TTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAGA-AAAC
* * * *
27955 ATGAAGCAAAAGCTATCC
323 ATAAAACAAAAGCCATTC
* * * * * * * **
27973 ACTAGCAAGAGAAGT-CTTTTATGGTCACTCAAACCTTCGAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATG
1 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATG
* * * * *
28037 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTCTTATCCTTTTTGGTTAAAATATATTACA
66 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTA-CATTTTTAGTTAAAATATATTATA
* * * * ** * * * * * *
28101 ATTGAATGTTTGCTTTGGGAAACATTAAG-CAAAAGCTATTCACTGGCAAAAAAAAGTTCATTTT
130 TTTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAC-AAAGCCATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTA
* * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * *** * *
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* * *
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** * * * * *
35118 TTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATG-TATG-TTCAAG
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* * * * * * * ** *
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* *
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* * * **
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* * * *
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* ** * * ****************
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* * * * * *
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** * * * * *
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********** *
35734 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGNNNNNNNNNNCTCATAATTGATTTTAAATTGAACTTTTTTA
64 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTA
* * * * * **
35799 CATTTTTTGTTAGAATAGGTTATATTTGAAT-TT-GCATTGGG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAGG
* ** * * * * * * *
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1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGC-CTTCGAA
* * * *
35904 AGTCTTATTACTTGCTTTAAATGGTATTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTTCAT
65 AGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTAC
* * * * * * * * *
35969 ATTTTTTGTTAGAATATATCATAGTTGAATGTTTGCTTCAAG
129 ATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAGG
* * * * * * *
36011 AAACATGAAGCAAAAGTCATCCACT-AGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAA
*
36075 ACCCTTATTA-TGTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAGTTTTTTA
65 AGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTA
* * * * * * *
36138 TATTTTTGGTTCAAACATATTCTCTTTGAATAATT-GCCTCAAG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAAT-GTTAGCCTCAGG
* * * * * * *
36181 AAACGTGAGGAAAAA-ACATTCATTGGCAAGAAAAGTCCACTTATAGTCACCTATGCCTTTGAAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAA
* * *
36245 GCCTTATTACTTG-TGTTAAATGATTTTAAAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTAC
66 GCCTTATTACTTGCT-TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTAC
* * *
36309 ATTTTTGGTGAAAACAGATTATATTTCAATGTCT-GCCTTAGG
129 ATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGCCTCAGG
* * *
36351 AAACATGAAGAGAAAA-CTATTCATT-AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATCCATGCCTTTGA
1 AAACATGAAGA-AAAAGCCATTCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA
* *
36414 AAGTCTTGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTATTTTA
64 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTA
* * * * * * **
36479 TATTTTTTGTT-AAATATATTATAATTGAATGTTTG-CTTTGAG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAG-G
** * * * ** *
36521 AAACGCGAAGCAAATGCCATTTATTGACAAGAAAAGGT-CATTTATAGTCACATAAGCCTTCGAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAA
* * **
36585 AGCCTTATTA-TTCACTTTAAATAGTTTTATAGCCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
65 AGCCTTATTACTT-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTA
** * **
36649 CATTTTTCATTAGAACAGGGTATATTTGAATGTTTGAG-CT-AGG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATG-TT-AGCCTCAGG
* * * * *
36692 AAACATGAACAAAAAGTCATTCAATAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CC-T--ATT----A
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAA
* * * ** ** * *
36749 --TTTATTAGTTACTTTAAACAGTTTTATAATCTCATAATCAATTTTAAATCGAATTTTTTTTAC
66 GCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA--TTTTTTAC
* * * * * * * * * *
36812 TTTTTTGATAAAAAGATATTATAATTGAATATCT-GCTTTA-A
129 ATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGCCTCAGG
* * * * * * * * * * *
36853 AAAAAGTGAAGTAAAAGCCATCCACTGGCAAGAGAAGTCCATTTATATTCACTCAAGCTTTTGAA
1 AAACA-TGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAA
* * *
36918 A-CCTTTATTTCTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
65 AGCC-TTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTA
* * * *
36982 TATTTTTGGTTAAAAAAGATTCTATTTGAATGTCT-GCCTTAGG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGCCTCAGG
* ** * * ** * * *
37025 AAAC-TCGAGGAAAAAATCATTCATTGGCAAGAAAAATCCATTTGCAGTCACCTATACCTTTGAA
1 AAACAT-GAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAA
* *
37089 AGCCTTATTACTTGTTTTAAATGCTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTT
65 AGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA---TTTTTT
* * * * * ** *
37154 ACTTTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-GCTTTTTGA
127 ACATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGC-CTCAGG
* * * * * * * * * * * * *
37199 AAACATTAAGTAGAAGCCATCCACTGGCAAAAAAAGTCCATTTGTAGTCGCTCAGGCTTTTGAAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAA
* * * *
37264 GCGTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATAGATTTTGAA-CTGAATTTTTTATA
66 GCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAATTTTTTACA
* * * * *
37328 -TTTTGAGTTAAATA-AGAATATATTTAAATGTTTGCATTA-G
130 TTTTTG-GTTAAA-ACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAGG
* * * * * * *
37368 AAA-ATGTCAAGAAAAAGTCATTCATTGACAAGAAAAGCCCGTTGATAATCATCCATACCTTCGA
1 AAACATG--AAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA
* * * *
37432 AAG-CTTGATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCCTAATTAAGTTGAAGTTGAATTTTTCT
64 AAGCCTT-ATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT-T
** * * * * * *
37496 A-ATTTTTTTATTAAAATATATTAGAATTGAATTTCTA-CTTTCA--
127 ACA-TTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGC-CTCAGG
** * * * ** * * **** *
37539 AAA-ATGTGGCACAAATGTCATCCATTTCCAAGAAAA-TCTATTTATAGTCACTCAAAATTTTGA
1 AAACATGAAG-A-AAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA
* * * *
37602 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAGAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAATTTTTAC
64 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTAC
* * * * * * * *
37667 ATTTTTTGTGAAGACAAATTACA-ATAAATTGTCTA-CCTCAGA
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* * ** *
37709 AAACATAAAGAAAATGCCATTTGTTGAAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCCGAA
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*** * *
37774 A-CCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAAGTTGAATTTTTT-TA
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* * * * * *
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130 TTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGCCTCAGG
* * * * * * *
37877 AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG--GAGAGAAAGTCTATTTATATTCACTCATGCCTTCAAA
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* * * *
37940 AGCATTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTAC
65 AGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTAC
* * * * * *
38005 ATTTTTGGTTAAAA-TGAATTATAATTAAATGTCAACCTTAGG
129 ATTTTTGGTTAAAACAG-ATTATATTTGAATGTTAGCCTCAGG
* * * ** * ** ** *
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1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAA
* * * **
38112 GCCTTATTA-TTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTCAAGTAAAATTGTTTTAC
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* * * * * *
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129 ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAT-TTGAATGTTAGCCTCAGG
** * *
38218 AAACATG-AGGCAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-CCTCAAGCCTTCGAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACC-CATGCCTTCGAA
****************************************
38281 AGCCTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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********* * * * ** * * * *
38346 NNNNNNNNNTTTTTTTCAATTGTGGTTAAAGGATATTATATTTGAATGTTTGCCT-TGAA
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* * * * * * * * *
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1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAA
* * * * * * * *
38470 GCCTTATTACTCGCATCAAATAGTTTTATACTCTAATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTATAT
66 GCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACAT
* * * ** * *
38535 TATTT--TTAAAAACATATTATAATTAAATGTCCGTCT-TGAG
131 T-TTTGGTT-AAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAG-G
** * * * * *
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* * * * * *
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64 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATT-TTTT
** * * * * * *
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127 ACATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATG-TTAGCCTCAG-G
* * * * * * **
38747 AAACATGAAGCAAAAGCCA-TCTATT-AGCAAGAAAAGTCTACTTATAGTCACTCAAGCTTTTAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA
** * *
38810 AAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTCATACTTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
64 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTA
** * * *
38875 CATTTTTTATTAAAACATATCATA-TTGAATGTTTA-CCT-TGAG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATG-TTAGCCTCAG-G
** *** * * * * *
38917 AAACATGATA-AAAAAATCATTCATTGGTGAGAAAAGTCCATTTATAGCCAACTATACCTTCAAA
1 AAACATGA-AGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAA
* * * * *
38981 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATGTCATAATTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTAT
65 AGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTAC
* * * * * *
39046 ATTTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATG-T--CCATTATGAA
129 A-TTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCC-TCA-G-G
* * * * * * * * *
39089 AAACATGAA-ACACAAGTCA-TCGAATGGCAAGAAAAATCTATTTATATTCACTCATGCCTTTGA
1 AAACATGAAGA-AAAAGCCATTC-ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA
* * * *
39152 AACCCTTATTACTTTCTTTAAACGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
64 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTA
* * * * * * * *
39217 CATGTTGGGTCAAAACATATTATATTTAAATATCTACCCT-AAG
128 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGT-TAGCCTCAGG
* * * * * * * *
39260 AAACGTGAAGAAAAAGTCATTCATTGATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCAACTATACCTTCGAAA
1 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAA
** * * * *
39325 GCCTTATTACTTTATTTTAATGGTTTTACAATGTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATA
66 GCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACA
* * * * **
39390 TTTTT-GTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTG-CTTTGG
130 TTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAGG
* *
39429 AAAACGTGAAGCAAAAGCCATTCATT
1 -AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT
Statistics
Matches: 3652, Mismatches: 969, Indels: 374
0.73 0.19 0.07
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160 1 0.00
161 48 0.01
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163 2 0.00
166 9 0.00
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ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (170 bp):
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GCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACAT
TTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTAGCCTCAGG
Found at i:35353 original size:340 final size:340
Alignment explanation
Indices: 34493--39454 Score: 2979
Period size: 340 Copynumber: 14.5 Consensus size: 340
34483 GAAAACAAAC
* * ** * * * **
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* * *
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65 TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* ** ** * ** *
34621 AGATTATATTTGATTGT-TTGCTT-CCAAAAATTGAA-ACAAAAGCCACCCATTGGCAAAGAAAA
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * *
34812 CTCAGGAAATATGAA-CAAAAAG
319 TTCAAGAAACATGAAGC-AAAAG
* ** * * * * * *
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1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT-CGCT
* * * * * * *
34898 TTAAATAGTTATATAATCTTATAATCGAATTTAAGTTGGATTCTTTTACATTTTTGTTTAAAACA
65 TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * * * ***
34963 GATAATATTTGAATG-CTTGCCTCAAGATACGTGAAGAAAAAATAATTCATTGACAAGAAAAGTC
130 GATTATATTT-AATGTC-TACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTC
* * * *
35027 TATTTACT-GCCACCCATGCCTTCGAAATCCTTGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
193 CATTTA-TAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
* *
35091 AATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTATG-TTC
257 AATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTC
* *
35155 AAGAAACATGAAGTAAAAC
322 AAGAAACATGAAGCAAAAG
* * * * * *
35174 CCATCCATTGGCAGGAAAAGCCCATTTATAGTCACTCAAACCTTTGAAAACCTTATTAGTCGGTT
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * *
35239 TAAATAGTTTTATAATCTCATAATT-AGCTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTGGGTTAAAACA
66 TAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * ** *
35303 GATTATATTTAACTGTCTACCCTAGGAAACATGAAGAGAAAGCCATTCATTAATGAGAAAA-ACC
130 GATTATATTTAA-TGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCC
* * * *
35367 TATTTATAGTCAACCATCCCTTCGGAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATATCATA
194 -ATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * ** * * *
35432 ATTCATATTAAGTTGAATTTTTTTTTATATTTTGGTTAAAATCTATTATAATTCAATGTCTGCTA
258 ATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACAT-TTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCT-
** * *
35497 TC-A-AAAGTTAAAACAAAAG
320 TCAAGAAACATGAAGCAAAAG
* * * *
35516 CCACCCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAG-CTTTCGAAAGCATTATTACTCACT
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGCT
* **************** *
35580 TTAAATAGTTTTGTAATCTCATAATTGATTTT-NNNNNNNNNNNNNNNNATTTTCTAGTTAAAAC
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* * * ** *
35644 AGATTATAATTCAGTGTCTACCTTAGAAAATGTGAA-AAAATGGCCATTCATT-AGCAAGAAAAG
129 AGATTAT-ATTTAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAA-AGCCATTCATTGA-CAAGAAAAG
* * * * **********
35707 CCCATTTATAGTTACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGNNNNNNNNNNCTCA
191 TCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * ** *
35772 TAATTGATTTTAAATTGAACTTTTTTACATTTTTTGTTAGAATAGGTTATATTTGAAT-T-TGCA
256 TAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGC-
** * * *
35835 TT-GGGAAACGTGAAGAAAAAA
319 TTCAAGAAACATGAAGCAAAAG
* * * * ** * * * *
35856 TCATTCAATGGCAAAAAAAGTCCATTTATAGTCA-TCTATTCTTTTCAAAGTCTTATTACTTGCT
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCT
* * * * * * * *
35920 TTAAATGGTATTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTTCATATTTTTTGTTAGAATA
65 TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * ** * * * * * *
35985 TATCATAGTTGAATGT-TTGCTTCAAGAAACATGAAGCAAAAGTCATCCACT-AGCAAGAGAAGT
130 GATTATA-TTTAATGTCTACCTT-AGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGA-CAAGAAAAGT
* * *
36048 CCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAACCCTTATTA-TGTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
192 CCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * ** * *
36112 TAATTGATTTTAAGTTAAGTTTTTTATATTTTTGGTTCAAACATATTCTCTTTGAATAAT-TGCC
256 TAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAAT-GTCTGCT
* * *
36176 TCAAGAAACGTG-AGGAAAAA
320 TCAAGAAACATGAAGCAAAAG
* * * * *
36196 ACATTCATTGGCAAGAAAAGTCCACTTATAGTCAC-CTATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTG-T
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCT
* * *
36259 GTTAAAT-GATTTTAAAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTGAAAA
65 -TTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA
* *
36323 CAGATTATATTTCAATGTCTGCCTTAGGAAACATGAAGAGAAAA-CTATTCATT-AGCAAGAAAA
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* * * *
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* * *
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255 ATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGC
** ** *
36515 TTTGAGAAACGCGAAGCAAATG
319 TTCAAGAAACATGAAGCAAAAG
** * * * *
36537 CCATTTATTGACAAGAAAAGGT-CATTTATAGTCACAT-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTATTCAC
1 CCATCCATTGGCAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCAC-TCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGC
** ** *
36600 TTTAAATAGTTTTATAGCCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCATTAGAAC
64 TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
** * * * * * *
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129 AGATTATATTT-AATGTCT-ACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGT
* * * * **
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** * * * * * *
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* * *
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65 TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * ** * *
36999 GATTCTATTTGAATGTCTGCCTTAGGAAAC-TCGAGGAAAAAATCATTCATTGGCAAGAAAAATC
130 GATTATATTT-AATGTCTACCTTAGGAAACAT-GAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTC
** * * * * *
37063 CATTTGCAGTCACCTATACCTTTGAAAGCCTTATTACTTGTTTTAAATGCTTTTATAATCTCATA
193 CATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
*
37128 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTTAC-TTTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGC
258 ATTGATTTTAAGTT-AA--ATTTTTTACATTTTTT-GTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGC
*** * * *
37192 TTTTTGAAAACATTAAGTAGAAG
319 TTCAAG-AAACATGAAGCAAAAG
* * * * * * * *
37215 CCATCCACTGGCAAAAAAAGTCCATTTGTAGTCGCTCAGGCTTTTGAAAGCGTTATTACTTGCTT
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * * *
37280 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATAGATTTTGAA-CTGAA-TTTTTTATA-TTTTGAGTTAAATA
66 TAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTG-GTTAAA-A
* * * * *
37342 -AGAATATATTTAAATGTTTGCATTA-GAAA-ATGTCAAGAAAAAGTCATTCATTGACAAGAAAA
128 CAGATTATATTT-AATGTCTACCTTAGGAAACATG--AAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAA
* * * * * *
37404 GCCCGTTGATAATCATCCATACCTTCGAAAG-CTTGATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
190 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTT-ATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * * * * * * *
37468 CCTAATTAAGTTGAAGTTGAATTTTTCTA-ATTTTTTTATTAAAATATATTAGAATTGAATTTCT
254 CATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTT-TACA-TTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT
* **
37532 ACTTTC-A-AAA-ATGTGGCACAAATG
317 GC-TTCAAGAAACATGAAGCA-AAA-G
* ** * ***
37556 TCATCCATTTCCAAGAAAA-TCTATTTATAGTCACTCAAAATTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTT
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * ** * * * *
37620 TAAATGGTTTTAGAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAAATTTTTACATTTTTTGTGAAGACAA
66 TAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
* * * * * * * ** *
37684 ATTACAATAAATTGTCTACCTCAGAAAACATAAAGAAAATGCCATTTGTTGAAAAGAAAAGTCCA
131 ATTATATTTAA-TGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCA
***
37749 TTTATAGTCACCCATGCCTTCCGAAA-CCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
195 TTTATAGTCACCCATGCCTT-CGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * * * * *
37813 CTGATTTTAAGTTGAATTTTTT-TATTTTTAG-TAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTTAG
259 TTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAA
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324 GAAACATGAAGCAAAAG
* * * ** *
37893 CCATCCATTGG--AGAGAAAGTCTATTTATATTCACTCATGCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCT
1 CCATCCATTGGCAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCT
* *
37956 TTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA-T
65 TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * * ** *
38020 GAATTATAATTAAATGTCAACCTTAGGAAACTTGAAGAAAAAACTATTCATTGGGAAGAAAATTC
130 G-ATTAT-ATTTAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTC
** ** * *
38085 CATTTATAGTTGCTTATGCTTTCGAAAGCCTTATTA-TTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
193 CATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
* * * * * * *
38149 AATTAATTTCAAGTAAAATTGTTTTACATATTTGGTTAAAATATATTATTATTGAATGTTTGCTT
257 AATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTT
*
38214 CAAGAAACATGAGGC-AAAG
321 CAAGAAACATGAAGCAAAAG
* * *
38233 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCCCTCAAGCCTTCGAAAGCCTTANNNNNNNNNN
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA----------
*************************************************
38298 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTT-
56 --------TTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
* * ** * * * * * * * *
38362 CAATTGTGGTTAAAGGATATTATATTTGAATGTTTGCCTT-GAAAAACATAAAGCAAAAGCTATC
113 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTT-AATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATT
* * * * * * * *
38426 CATTGGCAAGAAAAGTTCATTCATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCATCAAAT
176 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
* * * * * *
38491 AGTTTTATACTCTAATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTATATTATTTT-TAAAAACATATTAT
241 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATT-TTTTGTTAAAATATATTAT
* * * ** * *
38555 AATTAAATGTCCGTCTT-GAGAAA-AAAAAGAAAAAAA
305 AATTGAATGTCTG-CTTCAAGAAACATGAAG-CAAAAG
* * * * * * *
38591 CCATTCATTAGCAAGAAAAGTACATTTAGAGTCACTCATA-CCTTCGAAAGCGTTATTACTCGGT
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCT
* * * * * ** * *
38655 TTAAATGGTTATATAATCTCATAATTGATTTTTCAGTTGAATTGTGTTACATTTTTCATTACATC
65 TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* * * *
38720 AAATAATATTTAAATGTTTACCTT-GAGAAACATGAAGCAAAAGCCA-TCTATT-AGCAAGAAAA
129 AGATTATATTT-AATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATTGA-CAAGAAAA
* * * * * ** ** *
38782 GTCTACTTATAGTCACTCAAGCTTTTAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTC
190 GTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
* * * * * * *
38847 ATACTTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATCAT-ATTGAATGTTTAC
255 ATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-G
* * *
38911 CTT-GAGAAACATGATA-AAAAAA
318 CTTCAAGAAACATGA-AGCAAAAG
* * ** * **
38933 TCATTCATTGGTGAGAAAAGTCCATTTATAGCCAACT-ATA-CCTTCAAAAGCCTTATTACTCGC
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGC
* * * *
38996 TTTAAATAGTTTTATAATGTCATAATTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTTGTTAAAA
64 TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAA
* * * * * * * * *
39061 TATATTATAATTGAATGTC--CATTATGAAAAACATGAA-ACACAAGTCA-TCGAATGGCAAGAA
128 CAGATTAT-ATTTAATGTCTACCTTA-G-GAAACATGAAGA-AAAAGCCATTC-ATTGACAAGAA
* * * * * * * * *
39122 AAATCTATTTATATTCACTCATGCCTTTGAAACCCTTATTACTTTCTTTAAACGATTTTATAATC
188 AAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATC
* * ** * * * * *
39187 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATGTTGGGTCAAAACATATTATATTTAAATATCT
253 TCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT
* * * *
39252 AC-CCTAAGAAACGTGAAGAAAAAG
317 GCTTC-AAGAAACATGAAGCAAAAG
* * ** * * * ***
39276 TCATTCATTGATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCAACT-ATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACTTTA
1 CCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGC
* * * * * *
39339 TTTTAATGGTTTTACAATGTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTT-GTTAAAAT
64 TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* * ** * * *
39403 ATATTATAATTGAATGT-TTGCTTTGGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATTCATT
129 AGATTAT-ATTTAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT
Statistics
Matches: 3552, Mismatches: 895, Indels: 348
0.74 0.19 0.07
Matches are distributed among these distances:
331 47 0.01
332 17 0.00
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335 4 0.00
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340 890 0.25
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342 676 0.19
343 229 0.06
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346 7 0.00
356 3 0.00
357 37 0.01
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359 9 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (340 bp):
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TAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
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TTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
GATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTCAAGA
AACATGAAGCAAAAG
Found at i:38847 original size:172 final size:169
Alignment explanation
Indices: 38378--39421 Score: 691
Period size: 170 Copynumber: 6.1 Consensus size: 169
38368 TGGTTAAAGG
* * * * * * * * *
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* ** * * * *
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* *
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129 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATT-TTTATT-AAAAC
* * **** *
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1 ATATAATATTTAAATGTTTACCTTGAGAAACATAAAG-AAAAAACCATTCATTAGCAAGAAAAGT
* * * * * * *
38612 AC-ATTTAGAGTCACTCATACCTTCGAAAGCGTTATTACTCGGTTTAAATGGTTATATAATCTCA
65 -CTACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCA
* * * *
38676 TAATTGATTTTTCAGTTGAATTGTGTTACATTTTTCATTACATC
129 TAATTGA-TTTTAAGTTGAATT-TTTTACATTTTT-ATTAAAAC
* * * *
38720 AAATAATATTTAAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCA-TCTATTAGCAAGAAAAGT
1 ATATAATATTTAAATGTTTACCTTGAGAAACATAAAGAAAAAACCATTC-ATTAGCAAGAAAAGT
* * * * *
38784 CTACTTATAGTCACTCA-AGCTTTTAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTCA
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*
38848 TACTTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAAC
129 TAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACA-TTTTTATTAAAAC
* * * * * **
38891 ATATCATA-TTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGATA-AAAAAATCATTCATTGGTGAGAAAAGT
1 ATATAATATTTAAATGTTTACCTTGAGAAACAT-AAAGAAAAAACCATTCATTAGCAAGAAAAGT
* * * *
38954 CCATTTATAGCCAACT-ATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATGTCA
65 CTACTTATAGTC-ACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCA
* * * *
39018 TAATTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTTGTTAAAAT
129 TAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACA--TTTTTATTAAAAC
* * * ** * * * * ** * *
39062 ATATTATAATTGAATGTCCA-TTATGAAAAACATGAAA-CACAAGTCA-TCGAATGGCAAGAAAA
1 ATATAATATTTAAATGTTTACCT-TGAGAAACAT-AAAGAAAAAACCATTC-ATTAGCAAGAAAA
* * * * ** * ** *
39124 ATCTATTTATATTCACTCATGCCTTTGAAACCCTTATTACTTTCTTTAAA-CGATTTTATAATCT
63 GTCTACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCT
*** *
39188 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATGTTGGGTCAAAAC
127 CATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACAT-TTTTATTAAAAC
* * * * * * * ** * *
39233 ATATTATATTTAAATATCTACCCTAAGAAACGTGAAGAAAAAGTCATTCATT-GATAAAAAAAGT
1 ATATAATATTTAAATGTTTACCTTGAGAAACATAAAGAAAAAACCATTCATTAG-CAAGAAAAGT
* * *** * * * *
39297 -TCATTTATAGTCAACT-ATACCTTCGAAAGCCTTATTACTTTATTTTAATGGTTTTACAATGTC
65 CT-ACTTATAGTC-ACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTC
* * *
39360 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGTTAAAAT
128 ATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTTATTAAAAC
* * *
39403 ATATTATAATTGAATGTTT
1 ATATAATATTTAAATGTTT
39422 GCTTTGGAAA
Statistics
Matches: 697, Mismatches: 145, Indels: 64
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 5 0.01
170 244 0.35
171 206 0.30
172 236 0.34
173 6 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (169 bp):
ATATAATATTTAAATGTTTACCTTGAGAAACATAAAGAAAAAACCATTCATTAGCAAGAAAAGTC
TACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATA
ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTATTAAAAC
Done.