Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397369.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_932.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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Warning! 2991 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:515 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 1--2713 Score: 1955
Period size: 171 Copynumber: 15.9 Consensus size: 170
* * * * * **
1 TAATTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTACATTTCTTGTTAAAATATATTAAAATTAAATGTCTATC
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTT-AAATATATTATAATTGAATGTTTGCC
* ** ** * * * * * ** *
66 TCGAAAAATATGAAGCAAAAGTCATCCATT-AGTAAGAAAAGTCTAATTACAATTGCTTAATTCT
65 TTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCT
* * ** *
130 TTGAAAGCCTTATTAATCATTTTAAATGGATTTATAATCTCA
129 TCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* ** * ** * ** * *
172 TAATTGGTTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTGAGTGCAACCAGATCGT-ATGTGAATGTCTAC
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGT-TAAATATATTATAAT-TGAATGTTTGC
* * * * * ** * * * * * * ** * *
235 TTTGGAAAATGCGAAGAAAAAGTCATTAATTAATAAGAAAGGTCCATCTACAGTCGCCCATGCCT
64 CTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCT
* * *
300 T-GAAAGCCTTATTACTCACTTTCAATGGTTTCATAATCTCA
129 TCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * *
341 TAATTGATTTTAAATTAAATTTTTTTAGATTTTTTGCTAAATATAATATAATTGAATGTTTACCT
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAATATATTATAATTGAATGTTTGCCT
* * * * * *
406 TGGGAAACGTGCAGTAAAAGTTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAATCGCTTAAGTCTTC
66 TGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTTC
* * ** * *
471 AAAAGCTTTATTACTCAATTTAAATAGTTTTGTAATCTCA
131 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * ** * * * * * * *
511 TAATTCATGTTAGGTTGAATTTTTTCACATTTTCGGTTAAAACAGATAATATTTAAATGTTTACA
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTT-AAATATATTATAATTGAATGTTTGCC
* * * * * * * * * ** * *
576 TTGGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAGGAAAAGTTCATCTATAATCACCCATGCCTT
65 TTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTT
** * * *
641 TAAAAGACTTATTACTAGCTTTAAATGGCTTTATAATCTCA
130 CGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * *
682 TAATTAATTTTGAGTTAAATGTTTTCACATTTTTTATTAAATTATATTATAATTGAACT-TCTG-
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAA-TATATTATAATTGAA-TGTTTGC
** * * * * *
745 CTACAGAAAACGT-ATAACAAAAGGCATTCATTCG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTTAAG
64 CT-TGGGAAACGTGA-AGCAAAAGTCATCCATT-GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAG
*
808 TCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATTTCA
126 TCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * * *
853 TAATTAATTTTAAGTTCAA-TTTTTTAAATTTTTTATTAGAATATATTAAAATTGAGTGTCTGTC
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTA-AATATATTATAATTGAATGTTTGCC
** * * * * ** *
917 TTGAAAAATGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGGCAGGAAAAGCCCATTTGCAGTCGCTTAAGT-TT
65 TTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTT
* * * * *
981 -GAAAGCTTTATTAATCACTTTATATGATTTTATAATCTCA
130 CGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * *
1021 TAATTAATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTTGGTGAAACCAGA-TAGTATTTGAATGTCTT-
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAA-TATATTA-TAATTGAATGT-TTG
* * * * * * ** *
1083 CTTTGAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACCGATA-C
63 CCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTA-AGT
* * *
1147 CTTCGAAGGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTAATAATCTCA
127 CTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * *
1191 TAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTTATTAAATATTTTTTAATTGAATGTCTT-CC
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAATATATTATAATTGAATGT-TTGCC
* * * *
1255 TTGGGAAACATGAAGCAAAAGTCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTTAAGTTTT
65 TTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTT
* * *
1320 CGAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGATTTTATAATCTCA
130 CGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * * *
1361 TAATTCATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTTCTATTAAATATACTATAATTAAATGTCTGCCA
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAATATATTATAATTGAATGTTTGCCT
* *
1426 TGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGGCAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTAAGTCTTC
66 TGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTTC
* * *
1491 GAAAGTCTTATTACTCGATTTAAATAGTTTTATAATCTCA
131 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * * * *** *
1531 TAATTCATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTATAGTTAAAATAGATAATATTTGACTGTCCACA
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTT-AAATATATTATAATTGAATGTTTGCC
* * * * * * * * *
1596 TCGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATTCATT-AGCAAGAAAAGTCTATATATAGTCA-TCCATGCC
65 TTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-TAAGTC
* * *
1659 TTTGAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGGGTTTATAATCTCA
128 TTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * *
1702 TAATTGATTTTGAGTTGAATTATTTCACATTTTTTGTTAAATTATATTATCATTGAACGTTTGCT
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAA-TATATTATAATTGAATGTTTGC-
* * * ** *
1767 CCT-GGACACGTGAAGCAAAAGGCATCCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTAT
64 CTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCT
* * * *
1831 TTGAAAACCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCA
129 TCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* ** * * * * * * * *
1873 TAATTAATTTTAAACTAAATTTTGTTATATTTTTTATAAGAATATATTAAAATTGAGTGTCTGCC
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTA-AATATATTATAATTGAATGTTTGCC
** * * * ** *
1938 TTGAAAAACATGAAGCAAATA-TCATCCATTGGCAGGAAAAGTCCATTTGCAGTTACTTAAGTCT
65 TTGGGAAACGTGAAGCAAA-AGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCT
* * * * *
2002 TCGAAAGCTTTGTTAATTGCTTTAAATGCTTTTATAATCTCA
129 TCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * *
2044 TAATTGA-TTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTGTGAAACCAGA-TAGT-ATCTGAATGTCTT
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAA-TATATTA-TAAT-TGAATGT-TT
** * * * * * * ** * * * * *
2105 -TTTTAGGAAATGTAAAGAAAAAGCCATTCGCTGAAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATGC
62 GCCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGT
* * * *
2169 CTTCGAAGGACTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
127 CTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * *
2213 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATT-AATATATTATAATTGAATATCTGTCT
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAATATATTATAATTGAATGTTTGCCT
* * * *
2277 TGAGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCGCTTAAGTCTTC
66 TGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTTC
* * * *
2342 TAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTTTATCATCTCA
131 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * * * *
2382 TAATTCATTTTAAGTTAAATGTTTTAATATTTTTTATTAAAATATATTAAAATTGAGTATTTGCC
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTT-AAATATATTATAATTGAATGTTTGCC
* * * * ** * *
2447 TT-GAAAACCATGAAGCAAAAGTCATCCATTGGC-AGCAAGAGTCCATTTGCAGTCGCTTAAGTT
65 TTGGGAAA-CGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTC
* * ** *
2510 TTCGAAAGCTTTATTAATTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
128 TTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * *
2553 TAATTGATTTTAAATTGAA-TTTTTTACATTTTTGGTGAAACCAGA-TAGTATTTGAATGTCTT-
1 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAA-TATATTA-TAATTGAATGT-TTG
* * * * * * * ** *
2615 CTTCTT--AAAACATAAAGAAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACCCATG
63 C--CTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAG
* * * *
2678 CCTTCGAAGGGCTTATTACGCGCTTTAAATGGTTTT
126 TCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
2714 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1982, Mismatches: 503, Indels: 115
0.76 0.19 0.04
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.00
168 130 0.07
169 362 0.18
170 692 0.35
171 785 0.40
172 9 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAATATATTATAATTGAATGTTTGCCT
TGGGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGTCTTC
GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
Found at i:4151 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 3765--4839 Score: 732
Period size: 171 Copynumber: 6.3 Consensus size: 170
3755 TGATTTCATG
* * * *
3765 AAAA-ATGAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGATATTATAAAAGCATTAAAAG-GTATTAA
1 AAAATATG-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAA
* * ** *
3828 TAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGGCTGCAAATGGACTTTTCCTAT-C-AATTAATGACTTTTGCT
64 TAAAGCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTT-CT-TGCTAATGAATGACTTTTGCT
** * * * *
3891 TCACGTTTTTTAG-CCAGACACTCAATTTTAATATATTCTAATAA
127 TCACGTTTCCTAGAGCAGACATTCAATTATAATATATT-TAACAA
* *
3935 AAAATAT-AAAAATATTTAACTTAAAATCAATCATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-
1 AAAATATGAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * *
3998 AAAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTGTTTC
65 AAA-GCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTGCTTC
*
4063 ATGTTTCCTAGAGCAGA-AGTTCAATTATAATATAATTTAACAA
129 ACGTTTCCTAGAGCAGACA-TTCAATTATAATAT-ATTTAACAA
* * * * **
4106 AAAATATGAAAAAATTTAACTCAAAATTAATTATGAGACTATAAAATTATTTAAAGCGAGTAATA
1 AAAATATGAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * * * *
4171 AATCTTTAAAAGGCATGAGTGACTATATATGGACTTTTCTTG-TCAATGAATGACTTTTTCTTTA
66 AAGCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTGCT-AATGAATGACTTTTGCTTCA
* * * * * * *
4235 CGTTTTCTA-ATGTAGACATTTAAATATTATCCGT-TTTAACCA
130 CGTTTCCTAGA-GCAGACATTCAATTATAAT--ATATTTAACAA
** * * * * **
4277 AAAATGGGAAAAAATTCAACCTAACATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTGAGTAATA
1 AAAATATGAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * *
4342 AAGCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGAACTTTTTTTGCCAATGGATGACTTTTACTACAC
66 AAGCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTGCTTCAC
* * *
4407 GTTTTCC-AAAGCAAACATTCAATTATATTATATTTAACAA
131 G-TTTCCTAGAGCAGACATTCAATTATAATATATTTAACAA
* * * ********** *
4447 AAAATCTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAAGTATNNNNNNNNNNAACCATTTAAAGTGAGTAATA
1 AAAATATGAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * * * *
4512 AGGCTTTC-AAGGCAT-AGCCCACTGTAGATGGAATTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTTCTTCA
66 AAGCTTTCAAAGACTTAAG-CGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTGCTTCA
* * * * * * *
4575 TGTTTCCTAAAGTAGACATTCAA--ATACTATCTGGTTGCACTA
130 CGTTTCCTAGAGCAGACATTCAATTATAATATAT--TT-AACAA
* * * * ** * *
4617 AAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAATCTATTTAAAATGATTAGT-
1 AAAATATGAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
** * * * ** * * *
4680 AAGCCTTTTGAAGAATTAAGCAATTGCAATTGGACTTTTCTTGCCAATTG-ATGACTTTTACTTC
66 AAG-CTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAA-TGAATGACTTTTGCTTC
* * * * * * *
4744 ATGTTT-TTTGAGATAGACATTCAATTTTAATACATTTTAATAA
129 ACGTTTCCTAGAG-CAGACATTCAATTATAATATA-TTTAACAA
* * * *
4787 GAAATGTAAAAAAATTCAACTTGAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
1 AAAATATGAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
4840 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 704, Mismatches: 167, Indels: 67
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
167 7 0.01
168 10 0.01
169 113 0.16
170 236 0.34
171 315 0.45
172 21 0.03
173 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.13, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (170 bp):
AAAATATGAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
AAGCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTGCTTCAC
GTTTCCTAGAGCAGACATTCAATTATAATATATTTAACAA
Found at i:4736 original size:339 final size:331
Alignment explanation
Indices: 4199--4816 Score: 645
Period size: 339 Copynumber: 1.8 Consensus size: 331
4189 GTGACTATAT
* * * * * *
4199 ATGGACTTTTCTTGTCAATGAATGACTTTTTCTTTACGTTTTCTAATGTAGACATTTAAATATTA
1 ATGGAATTTTCTTGTCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTTTCCTAAAGTAGACATTCAAATACTA
* * * **
4264 TCCGTTTTAACCAAAAATGGGAAAAAATTCAACCTAACATGAATTATGAGATTACAAAACCATTT
66 TCCGGTTGAACCAAAAATGGGAAAAAATTCAACCTAAAACCAATTATGAGATTACAAAACCATTT
* * * * *
4329 AAATTGAGTAATAAAGCTTTCAAAGACTTAAGCGACTATAAATGAACTTTTTTTGCCAATGGATG
131 AAAATGAGTAATAAAGCTTTCAAAGAATTAAGCAACTACAAATGAACTTTTCTTGCCAATGGATG
* *
4394 ACTTTTACTACACGTTTTCCAAAGCA-A-ACATTCAATTATATTATA-TTTAACAAAAAATCTAA
196 ACTTTTACTACACGTTTT-CAAAG-ATAGACATTCAATTATAATACATTTTAACAAAAAATCTAA
4456 AAAAATTCAACTTAAAATCAAGTATNNNNNNNNNNAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCA
259 AAAAATTCAACTTAAAATCAAGTAT----------AACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCA
4521 AGGCATAGCCCACTGTAG
314 AGGCATAGCCCACTGTAG
* *
4539 ATGGAATTTTCTTG-CTAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAAGTAGACATTCAAATACT
1 ATGGAATTTTCTTGTC-AATGAATGACTTTTTCTTCACGTTTCCTAAAGTAGACATTCAAATACT
* * * * * * * *
4603 ATCTGGTTGCACTAAAAAT-GTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAATCTATT
65 ATCCGGTTGAACCAAAAATGGGAAAAAATTCAACCTAAAACCAATTATGAGATTACAAAACCATT
* * ** * * * * *
4667 TAAAATGATTAGT-AAGCCTTTTGAAGAATTAAGCAATTGCAATTGGACTTTTCTTGCCAATTGA
130 TAAAATGAGTAATAAAG-CTTTCAAAGAATTAAGCAACTACAAATGAACTTTTCTTGCCAATGGA
* * *** * * * *
4731 TGACTTTTACTTCATGTTTTTTGAGATAGACATTCAATTTTAATACATTTTAATAAGAAATGTAA
194 TGACTTTTACTACACGTTTTCAAAGATAGACATTCAATTATAATACATTTTAACAAAAAATCTAA
*
4796 AAAAATTCAACTTGAAATCAA
259 AAAAATTCAACTTAAAATCAA
4817 TTATGAGATT
Statistics
Matches: 226, Mismatches: 47, Indels: 10
0.80 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
337 1 0.00
338 6 0.03
339 117 0.52
340 102 0.45
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.12, T:0.35
Consensus pattern (331 bp):
ATGGAATTTTCTTGTCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTTTCCTAAAGTAGACATTCAAATACTA
TCCGGTTGAACCAAAAATGGGAAAAAATTCAACCTAAAACCAATTATGAGATTACAAAACCATTT
AAAATGAGTAATAAAGCTTTCAAAGAATTAAGCAACTACAAATGAACTTTTCTTGCCAATGGATG
ACTTTTACTACACGTTTTCAAAGATAGACATTCAATTATAATACATTTTAACAAAAAATCTAAAA
AAATTCAACTTAAAATCAAGTATAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAGGCATAGCCCA
CTGTAG
Found at i:8850 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 8375--11458 Score: 2095
Period size: 170 Copynumber: 18.1 Consensus size: 169
8365 NNNNNNNNNN
* * * *
8375 AATGGAC-TTTCGTTGGCAATGGATG-CTTTTTGCTTCACGTTTC-CTAAAGCAGACGTTCAATT
1 AATGGACTTTTC-TTGCCAATGGATGAC-TTTTGCTTCACGTTTCTC-AAGGTAGACATTCAATT
* * * ** * *
8437 ATAATATATTTTAACAAAATATGTGAAAAAATTTAACTTAAAATTGATTATGAGACTATAAAATC
63 ATAATATATTTTAATAAAA-ATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACC
** * * * * *
8502 ATTTAAAACGAGTAATAAAGTTTTCAAAGGCATGAA-TGACTATA
126 ATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGAC-TTAAGCGACTATA
* * * * * * * * * * * *
8546 TATGGACTTTTCTTACAAATGAATGGCTTTTTCTTCACCTTTCCCAAAGTAGATATTTAAATACT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTA-T
* * * * * * * ********** *
8611 -TTCTGTTTTAACTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAAAATGANNNNNNNNNNTACAAAACCAT
65 AATATATTTTAA-TAAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * *
8675 TTAAATTGAGTAATAAAGCTTTTGAAGAGTTAAGTGACTATA
128 TTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * *
8717 AATGGACTTTTCTTGTCAATGGATGACTTTTGCTACACGTTTCTCAAGGTAGACACTCAATTTTA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * *
8782 ATATATTTTAATAAAATTGTAAACAAATTCAATTTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTT
66 ATATATTTTAATAAAAATATAAA-AAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* *
8847 AAA-TCAAGTAAT-AAGCCTTTCGAAGACTTAAGCGACTACA
130 AAAGT-GAGTAATAAAG-CTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * *
8887 AATAGACTTTTCTTACCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGCTAGACATTCAATTATA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * *
8951 ATATA-TTTAATAAAAAATATAAAAATAATT-ACCTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACTAT
66 ATATATTTTAAT-AAAAATAT-AAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * * * ** *
9014 TTAAAGCGCGCAAT-AAGTCCTTCGAAGGCATGGGTGACTATA
128 TTAAAGTGAGTAATAAAG-CTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * * * * *
9056 GATGGACTTTTTTTACCAATGAATGATTTTTTCTTCACATTTCTGGAA-GAAGACATTCAA--AT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCT-CAAGGTAGACATTCAATTAT
* * * * * * * * *
9118 ACTATTTGGTTTCACA-AAAAATTTAATAAATTTAACTTAGACTCAATTCTAAGATTATAAAACC
65 AATATAT--TTT-A-ATAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACC
* * * * *
9182 ATTTAAAGCGATTAATAAAGCATTCGAAGACTTAAACGACTACA
126 ATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * * * * * *
9226 AATGAACTTTTCCTACCAATGGATGACTTTTGCTTCATGTTTTTGAAGGAAAACACTCAATTTTA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * *
9291 ATATGTTTTAATAAAAATGTCAAAAAATTCAACTTAAAATAAATTATGAGATTATAAAACCATAT
66 ATATATTTTAATAAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * *
9356 AAA-TCCAGTAAGAAGGCTTTTGAAGACTTAAGCGACTATA
130 AAAGT-GAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* ** * * * *
9396 AATAGACTTTTCTTATCAATGGATGACGTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGAAGACATTCAGTTATA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * *
9461 GTATA-TTTAATATCAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATT
66 ATATATTTTAATA-AAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * ** *
9525 TAAAACT-AGTAAT-AAGTCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATA
129 T-AAAGTGAGTAATAAAG-CTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * * * * * * * *
9566 GATAGACTTTTCTTACTAGTGAATGACTTTTTCTTTATGTTTCCCAAAGAAGACATTCAGA-TAC
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCA-ATTA-
* * * *
9630 T-ATCTGA-TTTCATGAAAAATATAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAGCA
64 TAATAT-ATTTTAAT-AAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* * **
9693 TTTAAAG-GAATTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGGCTGCA
127 TTTAAAGTG-AGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * * *
9736 AATGGACTTTTCCTGCCAATTGATAACTTTTGCTTCACGTTTTTCAAGGCAAACACTT-AATTTT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACA-TTCAATTAT
* * *
9800 AATATATTCTAATAAAAAATATAAAACAATTCAACTGAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCAT
65 AATATATTTTAAT-AAAAATATAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
*
9865 TTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
128 TTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * ** *
9907 AATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTGTTTCATGTTTC-CTGGAGCAGA-AGTTCAATTA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAG-GTAGACA-TTCAATTA
* * * * **
9970 TAATATAATTTAACAAAAAATATAAAAAAATTGAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAATTA
64 TAATATATTTTAA-TAAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* ** * * ** *
10035 TTTAAAGTGAGTAATAAATCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATA
127 TTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * * * * *
10078 GATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTT-CTTTCATGTTTTTCGATGTAGACATTTAAATAT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGC-TTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTAT
* * * * * * * * *
10141 TATCTGTTTTAATTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAACATGAATTATGAGATTACAAAACCAT
65 AATATATTTTAA-TAAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * *
10206 TTAAATTGAGAAATAAAGCTTTCAAAGACTTAAGCAACTATA
128 TTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * *
10248 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTACTGCATGTTT-TCCAAGGTAGACATTCAATTAT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCT-CAAGGTAGACATTCAATTAT
* * * * *
10312 ATTGTA-TTTAACAAAAAATCTACAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTAT
65 AATATATTTTAA-TAAAAATATA-AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * * * *
10376 TTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAGGCAT-GGCCCACTGTA
128 TTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAG-CGACTATA
* * * * * * * * * *
10417 GATAGAATTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTTCTTCGCGTTTCTCAAAGTAGACATTCAAATACT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTA-T
* ** * * * * *
10482 -ATCTAGTTGCACTAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAAATTATAAATCCATT
65 AATATA-TTTTAATAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * * **
10546 TAAAATGATTAGTAAGGCTTTTGAAGAATTAAGCAATTGGA
129 TAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * ** ** *
10587 ATTAGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCATGTTTTTTGAGACAGACATTCAATTTTA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * *
10652 ATACATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAATTTGAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
66 ATATATTTTAAT-AAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * *
10717 TAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGA-TGATA
129 TAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACT-ATA
* * * * * * *
10758 AATGGACTTTCCTTGGCAATGGATGCCTTTTACTTCAC--TTCTTCAGAAGTAGACGTTTAATTA
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTC-TCA-AGGTAGACATTCAATTA
* *
10821 TAATATATTTTAATAACAAATATAAAACAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAATCA
64 TAATATATTTTAATAA-AAATATAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* * * * ** *
10886 TTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAG-GTATGGGTGACTATA
127 TTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACT-TAAGCGACTATA
* * * * * * * * * * *
10929 GATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTTTTCATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * * * *
10994 ATCTGTTTTAACTGAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATT
66 ATATATTTTAA-TAAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* ** * ** * *
11059 TAAATTCTGTAATGAAGCTTTTAAAGACTTGAGCGATTATA
129 TAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* ** *
11100 GATGGACTTTTCTTATCAATGGAGGA-TATTTGCTTCACGTTT-TCAAGGTAGACATTCAATTAT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACT-TTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTAT
* * **
11163 AATATA-TTTAACAGAAAATATTAAAAAAGTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATGTAACCAT
65 AATATATTTTAATA-AAAATA-TAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * * * *
11227 TTAAAGTGGGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTGTA
128 TTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
* * * * * * *** * * *
11269 GAT-TACCTTTTCTTGCAAATGAATGTCTTTTTCTTCGTATTTCCCAAAGTAGACTTTCAA--AT
1 AATGGA-CTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTAT
* * * *
11331 ACTATCTGGTTTCACA-AAAAATGTAAACAATTCAACTTAAAA-CGAATTATGAGATTATAAAAC
65 AATATAT--TTT-A-ATAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATC-AATTATGAGATTATAAAAC
* * *
11394 AATTTAAAATGACTAAT-AAGTCTTTCGAAGACTTAA-CTGACTATA
125 CATTTAAAGTGAGTAATAAAG-CTTTCGAAGACTTAAGC-GACTATA
* *
11439 AATGGACTTTCCTTACCAAT
1 AATGGACTTTTCTTGCCAAT
11459 CTATACCTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (169 bp):
AATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATA
ATATATTTTAATAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
AAGTGAGTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATA
Found at i:9708 original size:510 final size:508
Alignment explanation
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Period size: 510 Copynumber: 6.0 Consensus size: 508
8381 CTTTCGTTGG
* * * *
8391 CAATGGATG-CTTTTTGCTTCACGTTTCCTAAAGCAGACGTTCAATTATAATATATTTTAACAAA
1 CAATGGATGAC-TTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGAAGACATTCAATTATAATATA-TTTAATAAA
* * * ** *
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** * * *
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* * * * *
8584 CTTTCCCAAAGTAGATATTTAAATACTTTCTGTTTTAACTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAA
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* ********** * * * * *
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* * * * * *
8714 ATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGGATGACTTTTGCTACACGTTTCTCAAGGTAGACACTCAATT
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* * * * *
8779 TTAATATATTTTAATAAAATTGTAAACAAATTCAATTTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCA
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* * *
8844 TTTAAATCAAGTAATAAGCCTTTCGAAGACTTAAGCGACTACAAATAGACTTTTCTTAC
450 TTTAAATCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATAGACTTTTCTTAC
**
8903 CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCCAAGCTAGACATTCAATTATAATATATTTAATAAAAAA
1 CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCCAAGGAAGACATTCAATTATAATATATTTAATAAAAAA
* * * * * * *
8968 TATAAAAATAATTACCTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGCGCAATAAGTC
66 TATAAAAA-AATTAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATAAGTC
* * * * *
9033 CTTCGAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTTTTACCAATGAATGATTTTTTCTTCACATTT
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*** * * * ** * * * * * *
9098 CTGGAAGAAGACATTCAAATACTATTTGGTTTCACAAAAAAT-TTAATAAATTTAACTTAGACTC
195 CCCAAAGAAGACATTCAAATACTATCTGTTTTAACTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAAAATC
* * * * *
9162 AATTCTAAGATTATAAAACCATTTAAA-GCGATTAATAAAGCATTCGAAGACTTAAACGACTACA
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* * * * *
9226 AATGAACTTTTCCTACCAATGGATGACTTTTGCTTCATGTTTTTGAAGGAAAACACTCAATTTTA
324 AATGGACTTTTCCTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTTTCAAGGTAAACACTCAATTTTA
* * * *
9291 ATATGTTTTAATAAAAATGTCAAAAAATTCAACTTAAAATAAATTATGAGATTATAAAACCATAT
389 ATATATTTTAATAAAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * *
9356 AAATCCAGTAAGAAGGCTTTTGAAGACTTAAGCGACTATAAATAGACTTTTCTTAT
453 AAATCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATAGACTTTTCTTAC
* * * **
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1 CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGAAGACATTCAATTATAATATATTTAATAAAAA
* * *
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* * * * *
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129 CTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTT
* * * * * *
9607 TCCCAAAGAAGACATTCAGATACTATCTGATTTCA-TGAAAAATAT-AAAAAATCCAACTTAAAA
194 TCCCAAAGAAGACATTCAAATACTATCTGTTTTAACTG-AAAATGTGAAAAAATTCAACCTAAAA
* * * *
9670 TCAATTATGAGATTATAAAAGCATTTAAA-GGAATTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGGCTG
258 TCAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATGG-ATTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTA
* * * *
9734 CAAATGGACTTTTCCTGCCAATTGATAACTTTTGCTTCACGTTTTTCAAGGCAAACACTTAATTT
322 CAAATGGACTTTTCCTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTTTCAAGGTAAACACTCAATTT
* * *
9799 TAATATATTCTAATAAAAAATATAAAACAATTCAACTGAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCA
387 TAATATATTTTAAT-AAAAATATAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* *
9864 TTTAAAGT-GAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTGC
450 TTTAAA-TCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATAGACTTTTCTTAC
* * * * * * *
9923 TAATGAATGCCTTTTGTTTCATGTTTCC-TGGAGCAGA-AGTTCAATTATAATATAATTTAACAA
1 CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCCAAGGA--AGACA-TTCAATTATAATAT-ATTTAATAA
** **
9986 AAAATATAAAAAAATTGAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAATTATTTAAAGTGAGTAATA
62 AAAATATAAAAAAATT-AACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATA
* * * * * *
10051 AATCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTCT-TTCAT
126 AGTCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCTTCAC
** * * * * * *
10115 GTTTTTCGATGTAGACATTTAAATATTATCTGTTTTAATTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAA
191 GTTTCCCAAAGAAGACATTCAAATACTATCTGTTTTAACTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAA
* * * ** * *
10180 CATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTGAGAAATAAAGCTTTCAAAGACTTAAGCAACT
256 AATCAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATGGATTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACT
* * * * * * * *
10245 ATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTACTGCATGTTTTCCAAGGTAGACATTCAATT
321 ACAAATGGACTTTTCCTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTTTCAAGGTAAACACTCAATT
* * * * * *
10310 ATATTGTA-TTTAACAAAAAATCTACAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT
386 TTAATATATTTTAA-TAAAAATATA-AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACC
* * * * * * * * *
10374 ATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAGGCAT-GGCCCACTGTAGATAGAATTTTCTTGC
449 ATTTAAATCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAG-CGACTATAAATAGACTTTTCTTAC
* * * * * * * * * * *
10433 TAATGAATGGCTTTTTCTTCGCGTTTCTCAAAGTAGACATTCAAATACT-ATCTAGTTGCACT-A
1 CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGGAAGACATTCAATTA-TAATATA-TT-TAATAA
* * * * * * * *
10496 AAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAAATTATAAATCCATTTAAAATGATTAGTA
62 AAAATATAAAAAAATT-AACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATA
* ** * * * * * * * *
10560 AGGCTTTTGAA-GAAT---TAAGCAATTGGAATTAGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCT
126 AGTCTTTCAAAGGCATGGGTGA-CTA-TAG-A-TGGACTTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCT
* **** ** * * * *
10621 TCATGTTT-TTTGAGACAGACATTC-AATTTTAATAC-ATTTTAA-TAAAAAATATAAAAAAATT
187 TCACGTTTCCCAAAGA-AGACATTCAAATACT-AT-CTGTTTTAACT-GAAAATGTGAAAAAATT
** * * * *
10682 CAATTTGAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA-GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACT
248 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATG-GATTAATAAAGCTTTCGAAGACT
* * * * * * *
10746 TAAGTGA-TGATAAATGGAC-TTTCCTTGGCAATGGATGCCTTTTACTTCAC-TTCTTCAGAAGT
312 TAAGCGACT-ACAAATGGACTTTTCC-TGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTTTCA-AGGT
* ** * *
10808 AGACGTTTAATTATAATATATTTTAATAACAAATATAAAACAATTCAACTTAAAATCAATTATGA
374 AAACACTCAATTTTAATATATTTTAATAA-AAATATAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGA
* * * * * ** * * *
10873 GACTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAG-GTATGGGTGACTATAGATGGACT
437 GATTATAAAACCATTTAAATCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACT-TAAGCGACTATAAATAGACT
10937 TTTCTTAC
501 TTTCTTAC
* * * * * * * * * * * *
10945 TAATGAATGACTTTTTCATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATTATCTGTTTTAACT-GA
1 CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTT-TCCAAGGAAGACATTCAATTATAATAT-ATTTAA-TAAA
* * * * * * *
11009 AAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTC-TGTAATG
63 AAATATAAAAAAATT-AACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAA-ACGAGTAAT-
* * * * * * * * * *
11073 AAG-CTTTTAAAGACTTGAGCGATTATAGATGGACTTTTCTTATCAATGGAGGA-TATTTGCTTC
125 AAGTCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACCAATGAATGACT-TTTTCTTC
* * * * * * * * * * *
11136 ACGTTT-TCAAGGTAGACATTCAATTA-TAATAT-ATTTAACAGAAAATATTAAAAAAGTCAACT
189 ACGTTTCCCAAAGAAGACATTCAAATACT-ATCTGTTTTAACTGAAAATGTGAAAAAATTCAACC
*** * * * * * *
11198 TAAAATCAATTATGAGATTATGTAACCATTTAAAGTGG-GTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGT
253 TAAAATCAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAA-TGGATTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGC
** * * * * * * * * * * *
11262 GACTGTAGAT-TACCTTTTCTTGCAAATGAATGTCTTTTTCTT--CGTATTTCCCAAAGTAGACT
317 GACTACAAATGGA-CTTTTCCTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGT-TTT-TCAAGGTAAACA
* * * * * *
11324 TTCAA--ATACTATCTGGTTTCACA-AAAAATGTAAACAATTCAACTTAAAA-CGAATTATGAGA
379 CTCAATTTTAATATAT--TTT-A-ATAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATC-AATTATGAGA
* * * *
11385 TTATAAAACAATTTAAAAT-GACTAATAAGTCTTTCGAAGACTTAA-CTGACTATAAATGGACTT
439 TTATAAAACCATTT-AAATCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGC-GACTATAAATAGACTT
*
11448 TCCTTAC
502 TTCTTAC
11455 CAAT
1 CAAT
11459 CTATACCTTT
Statistics
Matches: 2069, Mismatches: 407, Indels: 162
0.78 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
505 2 0.00
506 2 0.00
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517 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (508 bp):
CAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCCAAGGAAGACATTCAATTATAATATATTTAATAAAAAA
TATAAAAAAATTAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATAAGTCT
TTCAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTTTC
CCAAAGAAGACATTCAAATACTATCTGTTTTAACTGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAAAATCA
ATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATGGATTAATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTACAAA
TGGACTTTTCCTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTTTCAAGGTAAACACTCAATTTTAAT
ATATTTTAATAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
TCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATAGACTTTTCTTAC
Found at i:10606 original size:851 final size:847
Alignment explanation
Indices: 8793--11429 Score: 2806
Period size: 851 Copynumber: 3.1 Consensus size: 847
8783 TATATTTTAA
* * ** * * *
8793 TAAAATTGTAAACAAATTCAATTTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTT-AAATCAAGTA
1 TAAAAATGTAAA-AAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAAT-GATTA
* * * * * *
8857 ATAAGCCTTTCGAAGACTTAAGCGACTACAAATAGACTTTTCTTACCAATGGATGACTTTTGCTT
64 ATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCAACTGCAAATAGACTTTTCCTGCCAATGGATAACTTTTGCTT
* * * *
8922 CACG-TTTCCAAG-CTAGACATTCAATTATAATATATT-TAATAAAAAATATAAAAATAATT--A
129 CACGTTTTTCAAGAC-AAACATTCAATTTTAATACATTCTAATAAAAAATATAAAAA-AATTCAA
* * * * * * * * * * **
8982 CCTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGCGCAATAAGTCCTTCGAAGGCATGG
192 TC-TGAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAA
* * ** ** ** * * * *
9047 GTGACT-ATAGATGGACTTTTTTTACCAATGAATGATTTTTTCTTCACAT-TTCTGGAAGAAGAC
256 GCGA-TGATAAATGGACTTTCCTTGGCAATGAATGCCTTTTACTTCACTTCTTC-AGAAGCAGA-
* * ** * * * * * * * *
9110 A-TTCAAATACT-ATTTGGTTTCACAAAAAAT-TTAATAAATTTAACTTAGACTCAATTCTAAGA
318 AGTTCAATTA-TAATATAATTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * ** * * **** * * *
9172 TTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAAGCATTCGAAGACTTAAACGACTACAAATGAACTTTT
382 CTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTT
* * * **** * * * * * *
9237 CCTACCAATGGATGACTTTTGCT-TCATGTTTTTGAAGGAAAACACTC-AATTTTAATATGTTTT
447 CTTACCAATGAATGACTTTT--TATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATT-ATCTGTTTT
* * * * * * *
9300 AATAAAAATGTCAAAAAATTCAACTTAAAATAAATTATGAGATTATAAAACCATATAAATCCAGT
509 AATGAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTCAGT
* * * * *
9365 AAGAAGGCTTTTGAAGACTTAAGCGACTATAAATAGACTTTTCTTATCAATGGATGACGTTTGCT
574 AATAAAGCTTTTAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTATCAATGGATGACTTTTGCT
* * * * * * *
9430 TCACGTTTCCCAAGGAAGACATTCAGTTATAGTATATTTAATATCAAATATAAAAAAATTCAACT
639 TCACGTTTTCCAAGGTAGACATTCAATTATAATATATTTAACA--AAAAATTAAAAAATTCAACT
* * * *
9495 TAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAACTAGTAATAAGTCTTTCAAAGGCATGGGTG
702 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCAT-GGTG
* * * ** *
9560 ACTATAGATAGACTTTTCTTACTAGTGAATGACTTTTTCTTTATGTTTCCCAAAGAAGACATTCA
766 ACTGTAGATAGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTTCTTCGTGTTTCCCAAAGTAGACATTCA
*
9625 GATACTATCTGATTTCA-
831 AATACTATCTG-TTTCAC
* * * * *
9642 TGAAAAATATAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAGCATTT-AAAGGAATTA
1 T-AAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAATG-ATTA
* ** * *
9706 ATAAAGCTTTCGAAGACTTAAGCGGCTGCAAATGGACTTTTCCTGCCAATTGATAACTTTTGCTT
64 ATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCAACTGCAAATAGACTTTTCCTGCCAATGGATAACTTTTGCTT
* * *
9771 CACGTTTTTCAAGGCAAACACTT-AATTTTAATATATTCTAATAAAAAATATAAAACAATTCAA-
129 CACGTTTTTCAAGACAAACA-TTCAATTTTAATACATTCTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAAT
* *
9834 CTGAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAG
193 CTG-AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAG
* ** * *
9899 CGACT-ATAAATGGACTTTTCTT-GCTAATGAATGCCTTTTGTTTCA-TGT-TTCCTGGAGCAGA
257 CGA-TGATAAATGGACTTTCCTTGGC-AATGAATGCCTTTTACTTCACT-TCTT-CAGAAGCAGA
*
9960 AGTTCAATTATAATATAATTTAACAAAAAATATAAAAAAATTGAACTTAAAATCAATTATGAGAC
318 AGTTCAATTATAATATAATTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGAC
* * *
10025 TATAAAATTATTTAAAGTGAGTAATAAATCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTC
383 TATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTC
* * * *** * *
10090 TTGCCAATGAATGGCTTTCTT-TCATGTTTTTCGATGTAGACATTTAAATATTATCTGTTTTAAT
448 TTACCAATGAATGACTTT-TTATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATTATCTGTTTTAA-
* * * *
10154 TGAAAATGTGAAAAAATTCAACCTAACATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTGAGAAA
511 TGAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTCAGTAA
* * ** * *
10219 TAAAGCTTTCAAAGACTTAAGCAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTACTGC
576 TAAAGCTTTTAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTATCAATGGATGACTTTTGCTTC
* * *
10284 ATGTTTTCCAAGGTAGACATTCAATTATATTGTATTTAACAAAAAATCTACAAAAATTCAACTTA
641 ACGTTTTCCAAGGTAGACATTCAATTATAATATATTTAACAAAAAAT-TA-AAAAATTCAACTTA
* **
10349 AAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAGGCATGGCCCAC
704 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGG-TGAC
* * * *
10413 TGTAGATAGAATTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTTCTTCGCGTTTCTCAAAGTAGACATTCAAA
768 TGTAGATAGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTTCTTCGTGTTTCCCAAAGTAGACATTCAAA
*
10478 TACTATCTAGTTGCAC
833 TACTATCT-GTTTCAC
* * *
10494 TAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAAATTATAAATCCATTTAAAATGATTAGT
1 TAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAATGATTAAT
* * * * * * *
10559 AAGGCTTTTGAAGAATTAAGCAATTGGAATTAGACTTTTCTTGCCAATGGATGACTTTTGCTTCA
66 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGCAACTGCAAATAGACTTTTCCTGCCAATGGATAACTTTTGCTTCA
* ** * * *
10624 TGTTTTTTGAGACAGACATTCAATTTTAATACATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAATTTG
131 CGTTTTTCAAGACAAACATTCAATTTTAATACATTCTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAATCTG
*
10689 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGAT
196 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGAT
* * * *
10754 GATAAATGGACTTTCCTTGGCAATGGATGCCTTTTACTTCACTTCTTCAGAAGTAGACGTTTAAT
261 GATAAATGGACTTTCCTTGGCAATGAATGCCTTTTACTTCACTTCTTCAGAAGCAGAAGTTCAAT
* * * *
10819 TATAATATATTTTAATAACAAATATAAAACAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAAT
326 TATAATATAATTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAAT
* * * *
10884 CATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACTAAT
391 CATTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACCAAT
10949 GAATGACTTTTTCATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATTATCTGTTTTAACTGAAAATG
456 GAATGACTTTTT-ATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATTATCTGTTTTAA-TGAAAATG
* *
11014 TAAAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTCTGTAATGAAGCTT
519 TAAAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTCAGTAATAAAGCTT
* * * *
11079 TTAAAGACTTGAGCGATTATAGATGGACTTTTCTTATCAATGGAGGA-TATTTGCTTCACGTTTT
584 TTAAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTATCAATGGATGACT-TTTGCTTCACGTTTT
*
11143 -CAAGGTAGACATTCAATTATAATATATTTAACAGAAAATATTAAAAAAGTCAACTTAAAATCAA
648 CCAAGGTAGACATTCAATTATAATATATTTAACA-AAAA-ATTAAAAAATTCAACTTAAAATCAA
** * * *
11207 TTATGAGATTATGTAACCATTTAAAGTGGGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTGTAGAT
711 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATG-GTGACTGTAGA-
* * * * *
11272 TA-CCTTTTCTTGCAAATGAATGTCTTTTTCTTCGTATTTCCCAAAGTAGACTTTCAAATACTAT
774 TAGACTTTTCTTGCTAATGAATGACTTTTTCTTCGTGTTTCCCAAAGTAGACATTCAAATACTAT
11336 CTGGTTTCAC
839 CT-GTTTCAC
* * * * *
11346 AAAAAATGTAAACAATTCAACTTAAAACGAATTATGAGATTATAAAACAATTTAAAATGACTAAT
1 TAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAATGATTAAT
*
11411 AAGTCTTTCGAAGACTTAA
66 AAGGCTTTCGAAGACTTAA
11430 CTGACTATAA
Statistics
Matches: 1500, Mismatches: 250, Indels: 73
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
849 103 0.07
850 53 0.04
851 718 0.48
852 620 0.41
853 6 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (847 bp):
TAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAATGATTAAT
AAGGCTTTCGAAGACTTAAGCAACTGCAAATAGACTTTTCCTGCCAATGGATAACTTTTGCTTCA
CGTTTTTCAAGACAAACATTCAATTTTAATACATTCTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAATCTG
AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGAT
GATAAATGGACTTTCCTTGGCAATGAATGCCTTTTACTTCACTTCTTCAGAAGCAGAAGTTCAAT
TATAATATAATTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAAT
CATTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTAAAAGGCATGGGTGACTATAGATGGACTTTTCTTACCAAT
GAATGACTTTTTATCACGTTACCCAATGTAGACATTCAAATATTATCTGTTTTAATGAAAATGTA
AAAAAATTCAACCTAAAATGAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAATTCAGTAATAAAGCTTTT
AAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTTCTTATCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTTCCA
AGGTAGACATTCAATTATAATATATTTAACAAAAAATTAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATG
AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGTGACTGTAGATAGACTT
TTCTTGCTAATGAATGACTTTTTCTTCGTGTTTCCCAAAGTAGACATTCAAATACTATCTGTTTC
AC
Found at i:11908 original size:170 final size:172
Alignment explanation
Indices: 11464--14725 Score: 2536
Period size: 170 Copynumber: 19.2 Consensus size: 172
11454 CCAATCTATA
* * * *
11464 CCTTTGAAAGGCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTAAAGTTGAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* ** *** * * * * * **
11529 TCTTTTA-GGTTTCAATTCAAATATATTATAATTGAATGTTTGCTTTAGGAAACATGAAGCCAAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAAA
* * * * ** *
11593 GCCATCCATT-AGCAAAAAAAGTCTATTTATATTCACTAAAG
131 GCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * ** * *
11634 CCTTTGAAATCATTATTACTCACTTTAAATGGTTTTGATAATCTCATCATTGATTTTAAATT-AG
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTT-ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-
* * * * * * * * * *
11698 ATTTTCTTACCTTTTTAGTTACAATAGATAATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAA-AAA
64 ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAA
* *
11762 AAGCTATTCATTGAG-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCACG
129 AAGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * * *
11805 TCTTCAAAAGCCTTATTAGTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATGGATTTTAAGTTAAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
** * ** * * ** * *
11870 TTTTAGATATTTTTGGTTAAAGTATATTATAATTGAATGTCTG-TTTCTGTTAACATGAAGTAAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGGAAACGTGAAGAAAA
* * * * * * *
11934 AGCGATCCATTGA-TAAGAAAAGTCTGA-TTATAATCACTCAAG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACCCATG
* * * * * *
11976 CCTTCGAAAGCCTTATCA-TTCGCTCTAAAAGGTTTTACAATCTCACAATT-CTTGTTAAGTTGA
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGTTGA
* * * *
12039 ATTTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTTGCCTTAGGGAACGTGAAGAAA
64 ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAA
* * * * ** *
12103 AA-CCAATCTTTG-GCTAGAAAAGTTCATTTATAG-CTACTTATA
129 AAGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATG
* * *
12145 CCTTCGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTGATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* *** * * * * *
12209 TTTTTTATATTTTCAATTAAAGCATATTATAATTGAATATCTG-TTTCA-GAAGACAT-AGAGCA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGGAA-ACGTGA-AGAA
* * * *
12271 AAAGCCATCCATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTCTATTCACTCATG
128 AAAGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * *
12315 CCTTCGAAAGCATAATTACTCGCTTTAATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* * * * * * * * * *
12380 TTTTTTATATTTCTAGTTAAAATATATTATAATTAAATATCTGCCCTAAGAAACGTGAACAAAAC
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAAA
* * * * *
12445 GTCATTCATTG-GCAAGAAAAGTCTATTTATAATCACTCATA
131 GCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * *
12486 CCTTCGAATA-CCTTATTACTTTCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATCATCGATTTTAACTTGAA
1 CCTTCGAA-AGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* * * * * * * * *
12550 TTTGTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTAAATGTATGTCTTAGAAAACATAAAGAAAA
65 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAA
* * *
12615 AGCCATTCATT-AGCCA-AAATGTCCATTTATAGCCACCCATG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * ** * *
12656 CCTTTGAAAGCCTTATTAATTATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATTGAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* ** * * * **
12721 TTTTTTATATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTG-GTTTGAGAAACGTGAAGCGAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAG-GAAACGTGAAGAAAA
* * * *
12785 AGCCATTCATTG-GGAAGAAAAGTCCATTTATATTCACCAAAG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * *
12827 CCTTTGAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTACAAT-TCATAATTAATTTTAAGTT-AGA
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-A
* ** * * * * * *
12890 TTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACGGATAATATTTGAATGTCTGTCTTAAGAAAAGTGACG--AA
65 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAA
* *
12953 AGTCCATTCATTGAG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCACG
130 AG-CCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * * * *
12996 CTTTCAAAAGCCTTATTTCTTGCTTTAAATGGTTTCATAAACTCATTATTGATTTGAAGTTGAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
** * ** * * * * * **
13061 TTTTAGATATTTTTTATTAAAATATATTATAATCGAATGTCTG-CTGCAGGTAACATGAATTAAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCT-TAGGAAACGTGAAGAAAA
* * * *** *
13125 AGCGATCCATTG-GTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTTAAG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * **
13167 ACTTCGAAAGCCTTATTAATCGCTTTAAATGGTTTTACAATCTCATAATT-AGTGCTAAGTTGAA
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAA
* * * * *
13231 TTTTTTTACAATTTTGGATAAAACAGATTATATTTGAATCTCTGCCTTA-GAGAACGTGAAG--A
65 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGA-AACGTGAAGAAA
* * * * * *
13293 AAGGCTTTCTTTG-GCAAGAAAAGTCCATTTACAGCCACTCATG
129 AAGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
** * * * * *
13336 TTTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATTTCATAATTCATTTTAAGTTG-AT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* *** * ** * * *
13400 TTTTTTATATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGGCTCGGGAAACGGGGAGCAAAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAAA
* * * * *
13465 GCCATCCATTGA-CAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAG
131 GCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * ** * * * *
13506 CATTCAAAAGCCTTATTACTAACTTTAAATAGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTAGAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* * * * * * *
13571 TGTTTTACACTTTTGGATAAAACAGATTATATTTGAATGTATGCC-TAAGAGAACGTGAAGAAAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGA-AACGTGAAGAAAA
* * * *
13635 AGCCATTCTTTGA-TAAGAAAAGTTCATTTAT-GACCACCCATG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACCCATG
** ** * *
13677 CCTTTAAAAGCCTTATTACCCGATTTAAATGGTTTTAT-ATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* ** * * * * * * * *
13741 TTTTTTATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTAAATTTTTGCTTTGGGAAACGTGGAGGAAAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAAA
* *** * *
13806 GCCATCCATTG-GCAAG-AAAGTTTGTTTATAGTCACTCAAG
131 GCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
** * * * *
13846 -CTGTCGAAAGCCTTATTACTTATTTTAAATAGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTAGGTTGAA
1 CCT-TCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* * * * * * *
13910 TTTTTTTACACTTGTGGTTAAAACAAATTATATTTGAATGTCTACTTTAGGAAACATGAAGAAAA
65 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAA
* * * ** *
13975 AACCATTCTTTG-GCAAGAATAGTTTATTTATAG-CGACTCATG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATG
* * *
14017 CCTTCGAAAGCCTTATTGCTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTAAA
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* ** * * * * * *
14081 TTTTTTGACATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATATATACCTCAAGAAACGT-AAGGAAA
65 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAA-GAAA
* ** *
14145 ACGCCATTCATTG-GCAAG-AAAGTCCATTTATAACCACCCATA
129 AAGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * *
14187 CCTTTGAAAGTCTTATTACTCT-CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTGAG
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* * * * * * * *
14251 TTATTTTACA-TTTTAGTTAAAATATATCATAATTGAATGTATGCCTCAAGAAACGTAAAGAAAA
65 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAA
* * *
14315 A-CTATTCATTGA-CAAG-AAAGTCCATTTATAGCCACTCATG
130 AGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * * *
14355 CCTTTGAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTATGTTGAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* * * * *
14420 TTTTTTACATTTTCGATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTAG-TTTGGGAAACGTGAAGCGAA
66 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCT-GCCTTAGGAAACGTGAAG-AAA
* * * * *
14484 AA-CCATCCATTG-GTAAGAAAAGTCCATTTATATTCACCAAAG
129 AAGCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* * * *
14526 CCTGT-GAAAGCATTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTACAAT-TCATAATTGATTTTAAGTT-AG
1 CCT-TCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-
* * * * *
14588 ATTGTTTTTGCATTTTTGGTTAAAACAAATAATATTTGAATGTCTGCCTTAAGAAACGT-AACG-
64 ATT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAA-GA
* * * **
14651 -AAAGTCCATTCATTGAG-TAGAGAAGTCCATTTATAGTCATCCACA
127 AAAAG-CCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
* *
14696 CCTTCAAAAACCTTATTACTTGCTTTAAAT
1 CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT
14726 TTTTAGACAT
Statistics
Matches: 2443, Mismatches: 567, Indels: 164
0.77 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
167 1 0.00
168 168 0.07
169 398 0.16
170 921 0.38
171 897 0.37
172 58 0.02
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (172 bp):
CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAAA
GCCATTCATTGAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATG
Found at i:12743 original size:681 final size:679
Alignment explanation
Indices: 11461--34375 Score: 5325
Period size: 683 Copynumber: 33.6 Consensus size: 679
11451 TTACCAATCT
* * * *
11461 ATACCTTTGAAAGGCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTAAAGTTG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * *
11526 AATTCTTTTA-GGTTTCAATTCAAATATATTATAATTGAATGTTTGCTTTAGGAAACATGAAGCC
66 AATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACATG-AGCA
* * * * * * * * *
11590 AAAGCCATCCATTAGCAAAAAAAGTCTATTTATATTCACTAAAGCCTTTGAAATCATTATTACTC
129 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* * * * * ** *
11655 ACTTTAAATGGTTTTGATAATCTCATCATTGATTTTAAATTAGATTTTCTTACCTTTTTAGTTAC
194 GCTTTAAATGGTTTT-ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTAA
* * * * * * * *
11720 AATAGATAATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAAAAAAGCTATTCATTGAG-AAGAAAA
258 AATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATG-AAAAAAGCGATCCATTG-GCAAGAAAA
* ** * *
11784 GTCCATTTATAGTCACCCACGTCTTCAAAAGCCTTATTAGTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTC
321 GTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTC
* ** * **
11849 ATAATGGATTTTAAGTTAAATTTTTAGATATTTTTGGTTAAAGTATATTATAATTGAATGTCTGT
385 ATAAT-GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGT
* ** * * * * * ** *
11914 -TTCTGTTAACATGAAGTAAAAGCGATCCATTGATAAGAAAAGTCTGA-TTATAATCACTCAAGC
449 CTT-AGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTG-CAAGAAAAGTC-CATTTATAGCCACTCATGC
* * * * * * *
11977 CTTCGAAAGCCTTATCATTC-GCTCTAAA-AGGTTTTACAATCTCACAATT-CTTGTTAAGTTGA
511 CTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATA-GTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGTTGA
** * * * * *
12039 ATTTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTTTGCCTTAGGGAACGTGAAG-AA
574 ATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAA
* * * * *
12102 AAACCAATCTTTGGCTAGAAAAGTTCATTTATAGCT-ACTT
639 AAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* *
12142 ATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTGATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * *
12207 AATT-TTTTATATTTTCAATTAAAGCATATTATAATTGAATATCTGTTTCAGAAGACATAGAGCA
66 AATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAAGAA-ACAT-GAGCA
* * * * * *
12271 AAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTCTATTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAATTACTC
129 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* *
12336 GCTTTAATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTCTAGTTAAA
194 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAA
* * * *
12401 ATATATTATAATTAAATATCTGCCCTAAGAAACGTGAACAAAA-CGTCATTCATTGGCAAGAAAA
259 ATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAA-AAAAGCG--ATCCATTGGCAAGAAAA
* * * *
12465 GTCTATTTATAATCACTCATACCTTCGAATA-CCTTATTACTTTCTTTAAATAGTTTTATAATCT
321 GTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAA-AGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCT
* * * * *
12529 CATCATCGATTTTAACTTGAATTTGTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTAAATGTATG
384 CATAAT-GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTG
* * * *
12594 TCTTAGAAAACATAAAGAAAAAGCCATTCATTAGCCA-AAATGTCCATTTATAGCCACCCATGCC
448 TCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCATGCC
* * *
12658 TTTGAAAGCCTTATTAAT-TATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATTGAATT
512 TTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT
* * * *
12722 TTTTTATATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTG-GTTTGAGAAACGTGAAGCGAAA
577 TTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAG-GAAACGTGAAGCAAAA
* * *
12786 GCCATTCATTGGGAAGAAAAGTCCATTTATA-TTCAC-C
641 GCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * *
12823 AAAGCCTTTGAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTACAAT-TCATAATTAATTTTAAGTT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * * ** * * *
12887 -AGATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACGGATAATATTTGAATGTCTGTCTTAAGAAA-AGTGA-
65 GA-ATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGT-TTAAGAAACA-TGAG
* * * * *
12949 CGAAAGTCCATTCATTGAG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCACG-CTTTCAAAAGCCTTAT
127 CAAAAG-CCATTCATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTAT
* * * * * * * **
13012 TTCTTGCTTTAAATGGTTTCATAAACTCATTATTGATTTGAAGTTGAATTTTTAGATATTTTTTA
189 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATA-TTTTTA
** * * *
13077 -TTAAAATATATTATAATCGAATGTCTGCTGC-AGGTAACATGAATTAAAAGCGATCCATTGGTA
253 GTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGC-CCTAGGAAACATGAA--AAAAGCGATCCATTGGCA
* * * * * *
13140 AGAAAAGTCCATTTATAGTCATTTAAGACTTCGAAAGCCTTATTAATCGCTTTAAATGGTTTTAC
315 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAA-ACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAT
* ** * * * *
13205 AATCTCATAATTAGTGCTAAGTTGAATTTTTTTACAATTTTGGA-TAAAACAGATTATATTTGAA
379 AATCTCATAATGA-TTTTAAGTTGAATTTTTTTA-TATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAA
* * * * * * * *
13269 TCTCTGCCTTAGAGAACGTGAAG--AAAGGCTTTCTTTGGCAAGAAAAGTCCATTTACAGCCACT
442 TGTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACT
** * * * * * *
13332 CATGTTTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATTTCATAATTCATTTTAAGT
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * ** * *
13396 TG-ATTTTTTTATATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGGCTCGGGAAACGGGGAG
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAG
* * *
13460 CAAAAGCC-ATCCATTGACAAAAAAAGTCTATTTATAG-TCACTC
636 CAAAAGCCAAT-CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* ** * * * *
13503 A-AGCATTCAAAAGCCTTATTACT-AACTTTAAATAGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTAAGT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * * ** *
13566 AGAATTGTTTTACACTTTTGGA-TAAAACAGATTATATTTGAATGTATGCCTAAGAGAACGTGAA
64 TGAATTATTTTACA-TTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAAGA-AACATG-A
* * ** * * * *
13630 GAAAAAGCCATTCTTTGATAAGAAAAGTTCATTTAT-GACCACCCATGCCTTTAAAAGCCTTATT
126 GCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
13694 ACCCGATTTAAATGGTTTTAT-ATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAAT
190 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGT
* * ** * * * *
13758 TAAAATATATTATAATTAAATTTTTGCTTTGGGAAACGTGGAGGAAAAGCCATCCATTGGCAAG-
255 TAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACAT-GA-AAAAAGCGATCCATTGGCAAGA
*** * ** *
13822 AAAGTTTGTTTATAGTCACTCAAGCTGTCGAAAGCCTTATTACTTATTTTAAATAGTTTAATAAT
318 AAAGTCCATTTATAGTCACTCAAACT-TCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAAT
* * * * * * * *
13887 CTCGTAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTTACACTTGTGGTTAAAACAAATTATATTTGAATGTC
382 CTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTC
* * * * * ** *
13952 T-ACTTTAGGAAACATGAAGAAAAAACCATTCTTTGGCAAGAATAGTTTATTTATAGCGACTCAT
446 TGTC-TTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCAT
** * * *
14016 GCCTTCGAAAGCCTTATTGCTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTAA
509 GCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
* * * * * * *
14080 ATTTTTTGACATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATATATACCTCAAGAAACGT-AAGGAA
574 ATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAA
* * *
14144 AACGCCATTCATTGGCAAG-AAAGTCCATTTATAAC-CACCC
639 AA-GCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* ** * *
14184 ATACCTTTGAAAGTCTTATTACTCTCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
14249 AGTTATTTTACATTTT-AGTTAAAATATATCATAATTGAATGTATGCCTCAAGAAACGTAAAG-A
66 AATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACAT-GAGCA
* * * * *
14312 AAAACTATTCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATAGCCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTT
129 AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* * * * * * *
14376 GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTATGTTGAATTTTTTTACA-TTTTCGATTAA
194 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG-TTAA
* * ** * * * *
14440 AACATATTATAATTGAATGTCTAG-TTTGGGAAACGTGAAGCGAAAA-CCATCCATTGGTAAGAA
258 AATATATTATAATTAAATGTCT-GCCCTAGGAAACATGAA---AAAAGCGATCCATTGGCAAGAA
* * * * * *
14503 AAGTCCATTTATATTCAC-CAAAGCCTGT-GAAAGCATTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTACAA
319 AAGTCCATTTATAGTCACTCAAA--CT-TCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAA
** * * * *
14566 T-TCATAATTGATTTTAAGTT-AGATTGTTTTTGCATTTTTGGTTAAAACAAATAATATTTGAAT
381 TCTCATAA-TGATTTTAAGTTGA-ATT-TTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAAT
* * * *
14629 GTCTGCCTTA-AGAAACGT-AACG--AAAGTCCATTCATTG-AGTAGAGAAGTCCATTTATAGTC
443 GTCTGTCTTAGA-AAACATGAA-GAAAAAG-CCATTCATTGCA--AGAAAAGTCCATTTATAGCC
** * * * * * *
14689 A-TCCACACCTTCAAAAACCTTATTACT-TGCTTTAAAT--TTTTAGACAT-T--T--TTG--GT
503 ACT-CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATA-ATCTCATAATTGATTT
** ** * * * * * ** * *** * *
14743 TAAAAT-ATATTATAATCAAATGTCTGCTT-TTGAAACGTGAGGCAAAAGCCATCTAT-TGGC--
566 TAAGTTGA-ATT-TTTTTACAT-T-T-TTTATTAAAACAT-A-TTATAATTGA-ATATCTGCCTT
* * ** ** * * * * * * ***
14803 AAGAAAAGT-TCGTTTATAGTCACTTA-AGCCTTCAAAAG-CC--TTAT---T-ACTC
623 AGGAAACGTGAAG-CAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
** * * * * *
14852 --A-CTTT-AAATGATTTAATAATCTCG---TAATTGATTTTAAGTTGAAT-T--TATTTACACT
1 ATACCTTTGAAA-GCCTT-ATTA-CTCGATTTAAATGGTTTT-A--T-AATCTCATAATT-GA-T
* * ** ** * * ** * **** * *
14907 TTT-GGTTAAAACAGATTATA-TTTGAATGT-CTACCTAGGGGAACATGAA-G-A-----AAAAA
57 TTTAAGTTGAATTATTTTACATTTTCAAT-TAAAACATATTATAA-TTGAATGTATGTTTAAGAA
* ** ** * * * *
14962 TCATTCTTTG-GTAAG--AA-------------AAGTTCATTTATAGCCACTCAT-CCTCTCGAA
120 ACA---TGAGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TTGAA
* ** * * **
15010 AGTCTTATTACTCTTTTTAAATGGTTTTATGATCTCATAATT-ATTTTTAACTTGCATTTTTTTA
181 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTAAATTTTTTTA
* * * ** * * * * * * * *
15074 CATTTTTGGTTAAAATATATTATAGTCCAATGTATACCTTATGAAACATAAAGAAAAATCCATTC
245 TATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACAT-GA-AAAAAGCGATCC
* * * * ** * *
15139 ATTAGCAAG-AAATTCCATTTATAGCCACCCATGCCTTCGAAAACCTTATTACTTGATTTAAAT-
308 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATA
* * ** * *
15202 GATTTTATAATCACATAATTAATTTTATA-CCGAATTTGTTTATATTTTTGATTAAAATATATTA
372 G-TTTTATAATCTCATAA-TGATTTTA-AGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTA
* * * * * *
15266 TAATTGAATGTTTGGT-TTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
434 TAATTGAATGTCT-GTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTG-CAAGAAAAGTCCATTT
*** * * * * * * * *
15330 ATATTTACTAAAGCCTTTGAAAGCATTATTACTC-GCTTTAAATAGCTTTACAAT-TCATAATTG
497 ATAGCCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTG
* ** * * * * * *
15393 ATTTTAAGTT-AGGTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAAAGATAATATTTGAATGTCTGCCTTAAG
562 ATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGG
* * * * *
15457 AAATGTGATG--AAAGTCCATTCATTGAG-TAGAGAAA-TCCATTTATAG-TCACCC
626 AAACGTGAAGCAAAAG-CCAATCATTG-GCAAGA-AAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* ** * * * * *
15509 ACACCTTCAAAAACCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTCATTTT-AGATT
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TT
* *** * *
15573 CAATT-TTTTGACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCTTCT-AGAAACGTGGA
65 GAATTATTTT-ACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TT-TAAGAAACAT-GA
* * * * * * **
15636 GCAAAAGCCATCCATTAGCAAGAAAAGTTCGTTTATAGTCACTTAAGCCTTCAAAAGCCTTATTA
126 GCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * * * * * *
15701 CTCACTTTAAATAGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTACGTTAATTTTTTTTACACTTTTAGTT
191 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTT
* * * * * * * * * * *
15766 AAAACAGATTATATTTGAATGTCT-ACCTAGGAAAACGTGAAGAAAAAACCATTCTTTAGCAAGA
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGG-AAACATG-A-AAAAAGCGATCCATTGGCAAGA
* * ** *
15830 AAAGTTCATTTATAGCCACTCATGCCCTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATAGTTTTATAA
318 AAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATAGTTTTATAA
* * *
15894 TCTCATAATTGATTTTAACTTGAATTTTTTTATA-TTTTAAGTTAAAACATATTATAATTAAATG
381 TCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTGAATG
* * * * * *
15958 TATGCCTTAGGAAACGTAAAGGAAAAA-CCATTCATTGGCAAG-AAAGTCCATTTAT-GCCACCC
444 TCTGTCTTAGAAAACATGAA-GAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTC
* *
16020 ATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT-TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAA-
507 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCT-ACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAG
* ** * * * * * *
16082 TTGAATTGTTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTAAATGTCTG-CTTCCGAAAACATAA
570 TTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTT-AGGAAACGTGA
* * *
16146 AGCAAAAG-C-ATCCATTGTCAAGAAAAATCCATTTATA-TTCACT-
634 AGCAAAAGCCAAT-CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * *
16189 AAAGCTTTTGAAAGCATTGTTACTC-ACTTTAAATGGTTTTATAATCTCGTAATAGATTTTAAGT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * *** * * * * * * * * *
16253 T-AGATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAACAGATAATATTTGAACGTCTGCCTTAGGTAACGTGAA
64 TGA-ATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACATG-A
* * * *
16317 G-AAAAGCCATTCATTCAG-AAGAAAAG--------T-GTCACCCACGCCTTTAAAAGCCTTATT
126 GCAAAAGCCATTCATT-GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
* * * * * ** *
16371 ACTTGCTTTAAATAGTTTCAAAATCTCATAATTGATTTT-AGATTGAATTTTTAGATATTTTTGG
190 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAATTTTTTTATATTTTTAG
* * * * ** * * *
16435 TTAAAATATATTATAATTGAATGTTTG-CTTCAGAAAATGTGGACCAAAAGCCATCTATTGGCAA
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCT-AGGAAACAT-GA-AAAAAGCGATCCATTGGCAA
* * * ** * *
16499 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTTAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTAATA
316 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAA-ACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATA
* * * * *
16564 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTGTTTACACTTTTGGTTAAAACAGATTAT-ATCTGAAT
380 ATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAAT-TGAAT
** * ** * * * *
16627 GTCTACCTTGGGGAACATGAAGAAAAAACCA-TCATTGGCAATAAAAGTTCATTTATAGCCACCC
443 GTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTC
* * * *
16691 ATGCCTACGAAA---TAAATTATTCT-CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACT
507 ATGCCTTCGAAAGCCT-TATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * ** *
16752 TAAATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTATCCCTCGGGAAACGTAAAG
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAG
* * * *
16817 AAAAAGCCATTCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGCT-ACCC
636 CAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * *
16859 ATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGATATAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAGTTG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * ** * * *
16924 AATTGTTTTATATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACTTCT-ACAAACATGAAGC
66 AATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTAT-GTT-TAAGAAACATG-AGC
* * ** * * * *
16988 AATAGCCATCCATTATCAAGAAAAATCCATTTATATTCAC-CAAAGCCTTTGAAAGCATTATTAC
128 AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
** * * * * *
17052 TCATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATAGATTTTAAGTTATATTTTTTCACATTTTTAGTTA
192 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTA
* * * * * * * * * * * * *
17117 AAACAGATAATATTTGACTGGCT-ACCTTGGAAA-ATGTGAGGAAAAGCCAAT-CATCGAG-AGG
257 AAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACA--TGA-AAAAAG-CGATCCATTG-GCAAG
* * * ** *** * *
17178 AAAAG-CCAATCATCGAGAGGAAAAGCCATCATCGAGAGAGGAAAAAGCCAAATCATCGTGAGAA
317 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAA--C-T--TC-------G--AAAGCC---TTAT--T---AC
** * * ** * *
17242 AAGCCCATTT--ATAG-TTCATCCATGCCTTCA-AATCTTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTCAT
360 TTG--C-TTTAAATAGTTTTAT-AAT--C-TCATAATGATT-TTA--AG--TTGAAT--TTT--T
* * * * *
17303 AATCTCATAATTGATTTTAAATTGAATTTTTAGATATTTTTGGTTAAAATAT-ATTATAATCAAA
409 --T-T-AT-A-T--TTTT-GATT-AA-----A-ACA----T-ATTATAAT-TGA--AT-GTC---
* * * * * * * * * *
17367 TGTTTGCTTTGGGAAACGTGGAGCAAAATCCATCCATTGGCAAAAAAAGTTCGTTTATAGCCACT
446 TG--T-C-TTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACT
* * * * * * *
17432 TAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAATGGTTTAATAATCTCCTAATTGATTTTAAGT
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * * * * * * *
17496 TGAATTTTTTTATAGTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTCTACATTA-GAGAATGAGAA
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGA-AACGTGAA
* * * * *
17560 GAAAAAGCCATTCTTTGGTAAGAAAAGTTCATTTATAGC-CACTC
635 GCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * ** * *
17604 ATGCCCTCGAAAGCCGTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTA
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
*** * * * * * * *
17669 AATT-TTTTACATTTTTGGTTAAAATATACTATAATTGAATGTATATCTCAAGAAACGTAAAGAA
66 AATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGT-TTAAGAAACAT-GAGCA
* *
17733 AAAGCCATTCATTGAG-AAG-AAAGTCCATTTATAGCCACTCATGCTTTTGAAAGCCTTATTAC-
129 AAAGCCATTCATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* ** *
17795 CTGATTTAAATATTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTT-GATT
193 C-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG-TT
* * *** * * *
17859 AAAACATATTATAATTGAATGTCTGGTTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGGTAAGAA
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAA--AAAAGCGATCCATTGGCAAGAA
* * * * * *
17924 AAGTCCATTTATATTCACT-AAGGCCATT-GAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTACAA
319 AAGTCCATTTATAGTCACTCAA--AC-TTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAA
* * * * * *
17987 T-TCATAATTGATTTTAAGTT-AGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATATTTGAATG
381 TCTCATAA-TGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATG
* * * * * * * *
18050 TCTGCCTTA-AGAA-ATG-TGACGAAAGTCTATTCA-T-CAAGAAGAGAAGTTCATTTATAGTCT
444 TCTGTCTTAGAAAACATGAAGA-AAAAG-CCATTCATTGCAAG-A-A-AAGTCCATTTATAGCCA
* * * *
18110 CCCATGCCTT-GAAAAGCCTTATT--TCTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTT
504 CTCATGCCTTCG-AAAGCCTTATTAATC-TACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT
* ** ** * * * * * *
18172 AAGTTGAATGTTTAGACATTTTTGGTTCAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTCAGGTAACA
567 AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTT-AGGAAACG
* * ** *
18236 TAAAGTAAAAG-TGATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCATTC
631 TGAAGCAAAAGCCAAT-CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * *
18284 A-AGACTTTAAAAGCCTTATTAATCGCTTTAAATGATTTTACAATCTCATAATT-ATTGTTAAGT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGT
* ** * * * * *
18347 TGAATTTTTTTTACACTTTTGGA-TAAAACAAATTATATTTGAATGTTTGCCTCAA-AGAACATG
64 TGAA-TTATTTTACA-TTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGA-AACATG
* * * *
18410 AAGAAAAAAG-CATTCTTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATGCCTTTGAAAGTCC-T
125 -AG-CAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG-CCTT
** * * *
18473 ATTACTCAATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAAATTTAATTTTTTTATATTTTT
187 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTT
* * * ** * * * * * *
18538 -GATTAAAACATTTTATAATTGAATGT-TTACTTCGATAAACGTGGAGTAAAAGCCATCCATTGG
252 AG-TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAG-GAAACAT-GA-AAAAAGCGATCCATTGG
* * ** ** * *
18601 AAAGAAAAGTCTATTTATAGTCGTTCAAACTTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTA
313 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAAC-TTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTT
* * * * * *
18666 ATAATATCGTAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTT-AGTTAAAACAAATGATATTTG
377 ATAATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTG
* * * * *
18729 AATGTCTG-CTTGGGAAACATGAAGAAAAAACCATT-ATTTAGTAAGAAAAGTTCATTTATAGCC
440 AATGTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCA-TT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCC
* * *
18792 ACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-
503 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA
* * *
18855 A----AA----TTTA-ATTTTTTTATTAAAATATATTATAATTGAATGTATGCCTT-GAGAAACG
568 AGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAG-GAAACG
* * *
18910 T-AAACAAAAGCCATTCATTGGTAAG-AAAGTCCATTTATAGC-CAC-C
631 TGAAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * *
18955 TATGCCGTTGAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTTTATAATCTCACAATTGATTTTAAGTT
1 -ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* ** * * *
19020 AAATGT-TTTTACATTTTTGATTAAAA-ATTATTATAATTGAATGTCTGCTTCAAGAAACGTGAA
65 GAAT-TATTTTACATTTTCAATTAAAACA-TATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACATG-A
* * * * * * * *
19083 GCAAAAGTCATCCATTGGCAGGAAAAGTCCATTTATATTCACTAAAGCCTTTGAAAGCATTGTTA
126 GCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * * * * * *
19148 CTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTGATACTAGATTTTAAGTTAGATTTTTTCACATGTTTAGTT
191 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTT
* * * * * * * * * *
19213 AAAACAGATAATATTTGAATGTCTGTCTTAGGAAA-GTGAAGAAAAGCCATTCATTGAG-AAGAA
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAA-AAAAGCGATCCATTG-GCAAGAA
* * ** * * ** * * * *
19276 AAGTCTATTTATAGTCACCCACGCCTT-TAATAGCTTTCGTATTTGCTTTAAATGGCTTCATAAT
319 AAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAA-AGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAAT
* * * ** * * *
19340 CTCATAATTTATTTCAAATTGAATTTTTAGATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTGATTGTC
382 CTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTC
* ** * ** * * * * *
19405 TG-CTTTGGGAA-ATGTAAAGCAAAAGTTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTA
446 TGTCTTAGAAAACATG--AAGAAAAAGCCATTCATTG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCA
** * * * * *
19468 ACCCTTCAAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAATTGGTTTTATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTTG
508 TGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * *
19532 AATCTTTTTACA-CTTTTAGTTAAAACAGATTATATTTAAATGTCTGCCTT-GTGAAACGTGAAA
573 AATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAG-GAAACGTGAAG
* * * * * *
19595 AAAAAACCATTCTTTAGG-AAGAAAAGTTCATTTATAGC-CACCC
636 CAAAAGCCAATCATT-GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* ** ** * *
19638 ATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATAATTATATAATCTCATAATTGATTTTAACTTG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
19703 AATTCTTTTATAATTTT-AGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGAAAACGTAAGG
66 AATTATTTTA-CATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAG-AAACATGA-G
* * * * * *
19766 AAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAA-TCTATTTATAGCCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
127 CAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * * * * * * *
19830 TTG-TGTTAAGTGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCTGAATTTTTTTACATTGTCAATT
192 TCGCT-TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTT
* * * * * ** * *
19894 AAAACATATTATAATTGAATGT-T-CGCTTCAAGAAGCATGAAGCAGAATTC-ATCCATTAGTAA
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGC-CCT-AGGAAACATGAA--A-AAAGCGATCCATTGGCAA
* * * * * * * * *
19956 GAAAAGTCTATTTATATTCACTAAAACCTTTGAAAGCATTATTAGTCGCGTTAAATCGTTTTATA
316 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAA-CTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATA
* * * * * * * *
20021 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATGTTTGGTTAAACCAAATAATATTTGAATG
380 ATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATG
* * * * * *
20086 CCTGCCTTA-AGAAAC--G-TG-AATA---ATTCATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAAC-
444 TCTGTCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTG-CAAGAAAAGTCCATTTATAG-CCACT
* * * * * *
20142 CATGCCTTCAAAATCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** ** * * * *
20206 TGAATTTTTAGACATTTTTGGTTAAAATATATTATCATTGAACT-TCTG-CTTCAGGTAATGTGA
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAA-TATCTGCCTT-AGGAAACGTGA
* ** * * *
20269 AGTAAAAG-TGATCTATTGGCAACAAAAGTCTATTTACAG-TCACTC
634 AGCAAAAGCCAATC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * *
20314 A-AGCTTTCGAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAATGGTTTCACAATTTCATAATTG-TTGTTAAT
1 ATACCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAG
* * * * * * * * * * * ***
20376 TTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATCATATTTGAATGTTTACTTCTAGGAGTGA-GA
63 TTGAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTAT-GTT-TAAGAAACATG-
* * * * ** * ** * *
20440 AGAAAAAACTATTCTTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCCACACCTTCGAAAGCTTTATT
125 AGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
* * * ********** * *
20505 ACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTANNNNNNNNNNTTTTGTA-TTTTCGA
190 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG-
** * ** * * * * * * *
20569 TTAAAGCATATTATAATTGAATGT-TTTCTTTGAGAAGCATGGAGCAAAAGCCATCTATTTGCAA
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAG-GAAACAT-GA-AAAAAGCGATCCATTGGCAA
* * * * ** * *
20633 GGAAAGTCCGTTTATAGTCACTTAAGCATTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTAATA
316 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAAC-TTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATA
* * * * * *
20698 ATCTCGTAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTGT-AGTTAAAACAGATTATATTTGAAT
380 ATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTGAAT
* ** * * * * * *
20762 G-CTG-CTTTGGGAACGTGAAGAAAAAACCATTCTTTGGCAAGAAAATTTCATTTATAGCCACCC
443 GTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTC
* ** **********
20825 ATACCTTCGAAAGCCTTATT-GCCTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATNNNNNNNNNNT
507 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCT-ACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * * * **
20888 TGAATTTTTTTAC-TTTTTTAGTTAAATTATATTCTAATTAAATGTTTG-CTTCAGGAAATATGA
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTT-AGGAAACGTGA
* * * * * *
20951 AGAAAAAACC-ATCCATTGAC-AGAAAAAGTCCGTTTATAGAT-ATTC
634 AGCAAAAGCCAAT-CATTGGCAAG-AAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
** * * **********
20996 A-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACACGTTTTAAATGGTTTNNNNNNNNNNTAATTGATTTTAAGTT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* *** * * * * * * * *
21060 CAATT-TTTTGACATTTTTGGTTAAAATAGATAATATTTG-AT-TATCTACCTAGGGAAGCATGA
65 GAATTATTTT-ACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGT--TTA-AGAAACATG-
* ** * * * * * * ** *
21122 AGCAAAAGCTATTCATTGATAAAAAAAG-CCTATTTACAATAACCCATACCTTCAAAAGCCTTGT
125 AGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTAT
* * * * *
21186 TACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATATCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTATGTTTTTTG
189 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG
* ** * * ** *
21251 TTAAAATATATTATAATTCAATGTCTGCTTTA-AAAACATGAAGAAAAAGCCATTTATTGACAAG
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATG-A-AAAAAGCGATCCATTGGCAAG
* * * * * ** *** *
21315 AAAAGTCGACTTATACTCTCCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATTGTTTTATAA
317 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAA
* * * ** * *
21380 TCTTATAATTGACTTGAAACTGAATTTTTTTATA-TTTTCAGTTAAAATATATTATAATTGAATG
381 TCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTGAATG
* ** * * * * * *
21444 TCT-ACTTCA-ATAAACATGAAGCGAAAGCCATCCACTGACAAGCAAAGTTCATTTATAGTCATT
444 TCTGTCTT-AGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACT
*********** * * * * * *
21507 CAANNNNNNNNNNGCCTTATTACTC-GCTTTAAATGGTTTAATAATCTCGTAATTGAGTTTAAGT
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * * * * *
21571 TGAA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTATAAGAAAAGTC--CATT--TATA-GT
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATA--AT-TGAATA-TCTGCCTTAGGAAACGT
* * *
21630 G--GC-----CC-ATGCCTT--C---AAAAG-CC--TTATTGCTTACTTC
632 GAAGCAAAAGCCAAT-CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCAC-TC
* ** * * * * * * * **
21664 AAATGGTTTTATAA-TCTCA-TAATTGATTTTAA--G--TT-TAATTTTTTACATT--TTTT--G
1 ATA-CCTTTGA-AAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATA-ATTGATTTTAAG
*****************************************************************
21718 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
63 TTGAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAAGAAACATGAGC
*****************************************************************
21783 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
128 AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
*****************************************************************
21848 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
193 CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTAA
*****************************************************************
21913 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
258 AATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAAAAAAGCGATCCATTGGCAAGAAAAGT
******************* * * * * * * *
21978 NNNNNNNNNNNNNNNNNGCCTTCAAAAGCATTATTAGTCAG-TTTAATTGGTTTTATAATTTCAT
323 CCATTTATAGTCACTCAAACTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCAT
* * * * * * * *
22042 AATTGATTTTAAGCTGGATGTTTTTATATTTTTTATTAAAATATATTATAATTAAATATCTATCT
387 AA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGTCT
** ** ** *
22107 T-GAAAAACATGAA-AAAAGAGTTATTCATTGGCAAG-AAAGTCCATGGATAATCACTTATGCCT
451 TAG-AAAACATGAAGAAAA-AGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCATGCCT
* * * * * * *
22169 TTGAATGCCTTATTACT-TCCTTTAAATATTTTTATTATCTCATAATTGATTTTAACTTGAATTT
513 TCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT
** * * * * * * * *
22233 TTTTACATTTTTGGTTAAAAGATATTCTAATTGAATGTCTGGCTTAGAAAACATAAAGAAAAAGC
578 TTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGC
* * * * * *
22298 CATTCAGTGGCTAGAAAAATCTATTTATAGC-CACCC
643 CAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * *
22334 A-AGCCATTAAAAGCCATATTACT-TATTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* *** * * * * **
22397 TGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTACTTTGAGAAACATGAAT
64 TGAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTAT-GTTTAAGAAACATGAGC
****** * * * ** * * * * **
22462 TGTTTACATT-TTTGGTTAA-AATATATTATAATTGA-ATGTTTACT-TTGAGAAACATGAAGCA
128 AAAAGCCATTCATTGG-CAAGAA-A-AGT-CCATTTATA-G-TCACTCAT--G---CCT-TTG--
* * * * ** *
22523 AAAGCCAT-TTA-TTGGTTAGAAAAGTCCATTTGTACTCACCCACGCTTTCGA-AAGCCTT-ATT
179 AAAGCCTTATTACTCGCTT--TAAA-T-GGTTT-TA-T-A---A---TCTC-ATAA---TTGATT
* ** * * * * * * * * **
22584 ACTCACTTTAAATTATTTTATAATCTTA--T--AAT-TGATTTTAAGCTAAATTTTTTACATTTT
227 --TTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAT-ATTATAA-TTAAA-TGTCTGC--CCT
* ** * * *
22644 CAGTTGAAATAT-ATTACAATTGACTATTTGCTTTAGGACACATGAAGCAAAAGCCATCCACTGG
285 -AG--GAAACATGA--A-AAAAG-CGA--TCCATT-GG---C---AAG---AA---A--------
* * * * * *
22708 TAAGAACAGTCCATTTATAGTCACTTAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTA
320 -------AGTCCATTTATAGTCACTCAA-ACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTT
* * *
22773 ATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTATTTTATATTTTT-AGTTAAAACATATTATATTTG
377 ATAATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTG
** * ** * * * **
22837 AATGTCTACCTTAGGAAATGTTAAGAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTTT
440 AATGTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAG-CC
* * * * * * *
22901 AC-CTATGCCTTCGAAAGCCATACTACT-TGCTTAAAAT-GATTTTATAATCTCAAAATTAATTT
503 ACTC-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTT
* * ** * * * * *
22963 TAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATACATTATAATTGAATGGT-TG-ATTCAAGAAA
566 TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAAT-ATCTGCCTT-AGGAAA
* * * ** * * *
23026 TGTGAGGCAAAGGCC-ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTACA-TTCATTC
629 CGTGAAGCAAAAGCCAAT-CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * * *
23076 A-AGCCTTCGAAAGCCTTATTTCTTGCA-TTAAATAGTTTTGTAATCTCATAATTGATTTTTATT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCG-ATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * *
23139 TG-ATTTTTTTATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTATTTCAGAAAACATGAAG
64 TGAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAAG-AAACATG-AG
* * *** *
23203 CAGAAGCCA-TCTACTCAAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAG-CTTTCGAAAGCCTTATT
127 CAAAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTATT
* * * *
23266 ATTAGCTTTAAATGGTTTAATAATCTCTTAATTGATTTTAAGTT-AATTTTTTTATATTTTTTA-
190 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATA-TTTTTAG
* * * * *** * * * * * * *
23329 TTACAACAGATTATATTTGGTTGTTTG-TCTCGAGAAACATGAAGAAAAAACTATTCATTGGTAA
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAG-GAAACATG-A-AAAAAGCGATCCATTGGCAA
* ** *
23393 GAAAAGTCCATTTATTGTCA-TCCATGCTTTCGAAAACCTTATTAC-T-CATGTTAAATAGTTTT
316 GAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAAC-TTCGAAAGCCTTATTACTTGC-T-TTAAATAGTTTT
* * * * * * * *
23455 ATAAGCTCATAATTAATTTAAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATTTTACAATCGA
377 ATAATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGA
* * * * * * *
23520 ATGTCT-ACTTCAGAAAATATGAAG-CAAA-CCTATCTC-TAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTC
441 ATGTCTGTCTT-AGAAAACATGAAGAAAAAGCC-AT-TCATTGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCC
* * * * *
23581 ACTCAAGCCTTCG-AAGCCTTATTACTC-GCTTTAAATAGTTTAATAATCTCATAATTAATTTTA
503 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA
* ** ** * * * * * * **
23644 AGTTGAATTGTTTTGTATTTTTGGTTCAAACAGATTATATTTGAATGTCTGTCTCAAAAAACGTG
568 AGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTG
* ** * * ** * *
23709 AAGAAAAAATCATTCATAGATAAGAAAAGTCTATTTAT-GATCA-TCC
633 AAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACT-C
* ** * * **
23755 ATGCCTTCAAAAGCCTTACTACTTGCATTT-AATGGTTTTATAATCTTGTAATTGATTTTAAGTT
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCG-ATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * * * * ** **
23819 AAATT-TTTTACATTCTT-AGTTAAAATATATTATAATTGAATTGAAAATTTGCCTTGGGAAATG
65 GAATTATTTTACATT-TTCAATTAAAACATATTATAATTGAA-TG----TATG-TTTAAGAAACA
* * * * * * **
23882 TGAAGTAAAA-ACACTCTATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAATCAATCATGCCTTCAAAAGCCT
123 TG-AGCAAAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCT
* * * * **
23946 TATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAGAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACGTTTT
186 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTT
* * * * *
24011 TGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTTTG--CTATGAGAAACATAAAACAAAAGTC-ATCCATT
251 TAGTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTA-G-GAAACAT-GAA-AAAAG-CGATCCATT
* * * * * *
24073 GGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTGCTCGCTTTAAATGGTT
311 GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAA-ACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTT
* * * ** * *
24138 TTATAATCTCATAATTGATTTT-AGTTGAACTTTTTTACATTTGTGGCTAAAATATATTACAATT
375 TTATAATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATT
* * * *
24202 GAAT-TCT-TACTTCAG-GAA-ATGTAAGGCAAAAGCCA-TCTATTGGTAAGAAAAGTCTATTTA
439 GAATGTCTGT-CTT-AGAAAACATG-AA-GAAAAAGCCATTC-ATT-GCAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * * * * * *
24262 TTGCCATTGAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTAT-GTCTCATAATTAA
498 TAGCCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * * * * ** * *
24325 TTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAATTAAAACAGATAATGTTTGAATGTCTG-CTTTGAGA
563 TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAG-GA
* * * * *
24389 AACGTAAAG-AAATGGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGC-CACTC
627 AACGTGAAGCAAA-AGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * *
24441 ATACCTTCGAAAGTCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTAG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * ** *
24506 AATTGTTTTACATTTGT-GGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCGAA-AAATGTGAGA
66 AATTATTTTACATTT-TCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTAT-GTT-TAAGAAACATGAGC
* * * * * * *
24569 AAAAGCCATCCACTAGCAAGAAATGTCCTTTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTTTTACT
128 AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
24634 CACTTTAAATGGTTTTATAAACTCAGAATTGATTTTAAG-CAGAATTTTTTTATATTTTTTAATT
193 CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AATTTTTTTATA-TTTTTAGTT
* * *** * * * **
24698 AAAATAGATTATAATTGAATAAGTG-CTTCGAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTTATTGGCAAGA
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAG-GAAACATG-A-AAAAAGCGATCCATTGGCAAGA
* * * * *** ** * * * *
24762 AAAGTTCATTTTTAGTTACCCGTGCCTTCGAGTGCCTTGTTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAAT
318 AAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAAT
* * * * * * *
24827 CTCATAATTGATTTCAAGTTTAATTTTTTTACATTGTTCG-TTAAAATAAATTATAATAGAATG-
382 CTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATT-TTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGT
* * * * * * * * *
24890 CT-TGCTCAGGAAACATGAAGGAAAAGCTATCCATTGGAGTGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCA
445 CTGT-CTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCA
* * * * * *
24954 TGCCTTCCAAAGCATTATTACTC-GCTTTAATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
508 TGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* *
25018 AATATTTTTTTTATTGTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGTCTTGAGAAATAGATTAT
573 -A-A-TTTTTTTA----CA--T----T-T-TT-T-ATT-AA-----------A-ACAT--ATTAT
* * * * *
25083 AATT-ACATGTTTGCCTTA-GAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAATAAAAGTCCATTTA
606 AATTGA-ATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA
* *
25146 TAG-TTACCC
670 TAGCTCACTC
* * * *
25155 ACA-CTTTCGAAAGCATTATTACTC-ACTTTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGT
1 ATACCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * ** *** ** * **
25218 TGCATTCTTTT-TATTGTT-GGTTAAAATGGATTATAATTGAATGCCTA-CCTTAGGAAATGTGA
64 TGAATTATTTTACATT-TTCAATTAAAACATATTATAATTGAATG--TATGTTTAAGAAACATG-
* * * *
25280 AGCAATAGCCATCCATTGG-AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTAAAAGCCTTAT
125 AGCAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTAT
*** * * * * * *
25344 TACTAATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAGGTTGAATTTTTTTATATTGTTGG
189 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG
* * * * * * * *
25409 TTAAAATAGATTATAA-TAGAATGTCTG-CTTCAAGAAACGTTAAGCAAAAGCTATCCATTAGAA
254 TTAAAATATATTATAATTA-AATGTCTGCCCT-AGGAAACATGAA--AAAAGCGATCCATTGGCA
* * ** * ** * * * *
25472 AGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATTATTACTCACTATCATTGGTTTTAT
315 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAT
* * * * * * *
25537 AATCTCATAATTGATTTTAAGTAGAATTTGTGTACATTTTTGGA-TAAAATAGATTATATTTGAA
379 AATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTT-GATTAAAACATATTATAATTGAA
* * * **
25601 TGTCTGCCTTA-AGAAACATAAAGGAAAAAGCCA-TCTATTGGCATGAAAAGTCCATTTATAGTG
442 TGTCTGTCTTAGA-AAACATGAA-GAAAAAGCCATTC-ATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCC
* * * * * * *
25664 ACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTG
503 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA
* * * * * * *
25728 AGTTGAATGTTTTTACA--TTTTAGTTAAAACAAAATAT-ATTGAATGTTTGCCTTTGAAAACGT
568 AGTTGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGT
* * * * * * * *
25790 GAAGAAAAAGCTATTCCTTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCGCCC
632 GAAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * *
25837 ACACCTTTGAATGCTTTATTACT-TACTTTAAATGGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTT
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * * * * * * ** * **
25901 GAATTTTTTTATATTGTT-AGTTAAAATAGATCATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACACAAAG
65 GAATTATTTTACATT-TTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTAT-GTTTAAGAAACA-TGAG
* * * * * *
25965 CAAAAGCCATTCATTAG-AGATAAAACT-CAGTTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAACATTATT
127 CAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
* * * * * * * *
26028 ATTCACTTTAAATGGTTCTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGACTTTTATTACAGTTTTTA-
190 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATA-TTTTTAG
* * * * * * * * * * * * *
26092 TTAAAAAATACTATTATTGAATCTTTGCCTTAAGAACCTTGAAGCAAAAGTGGTCCATTAGCAAG
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAA--AAAAGCGATCCATTGGCAAG
* * * * *
26157 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAATCCTTATTACTGGCTTTAAATGGTTTTATAA
317 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAA-ACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAA
* * ** * * * * *
26222 TCTCATAATTAATTTTATGTTGAATTTTTGCACATTTTTGGTTACAATAGT-TTATATTTGAATG
381 TCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACA-TATTATAATTGAATG
* * * * * ** * * * *
26286 TTTGCCCTGGAATACATGAAGAAAACCCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCT
444 TCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCA
* ** * * * * * *
26351 TGACTTCGAAAGCCTTATTGCT-TGCTCTAAATGGTTTTATAAAT-TTA-AATTTGATTTAAATT
508 TGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTAT-AATCTCATAA-TTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
26413 TAAATTTTTTTACA-CTTTTACTTAAAATAGATTATGATTGAATGTCTGTCTTAGGAAACGTCAA
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAA
* ** * *
26477 G-AAAGAGTC-ATCTATT-GCTGGAAACGTCCATTTATAG-TCACCC
635 GCAAA-AGCCAATC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * * * *
26520 ATA-CTTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTCTATAACCTTATAATGGTTTTTAAGTT
1 ATACCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * ** * * * * * ** * **
26584 GAATTTTTTTACACTGTT-GGTTGAGATAGATTATAATTGAATACT-TACCTTAGGAAACACAAA
65 GAATTATTTTACA-TTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAAT-GTAT-GTTTAAGAAACA-TGA
* * * * ** *
26647 GCAAAAGCCATCCATTGG-AGAGAAAAGTCTAATTATATTCACTCATGCCTTCAAAAGCATTATT
126 GCAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
* ** * **
26711 ACT-GCTTTAAACGGTCCTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTAAAT-TTTTTA-T
190 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGT
* * * * * * * ** *
26773 TAAAATATATTATAATTGATTATCT-ACCTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATGGATTGACAAG
255 TAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCT-AGGAAACATGAA--AAAAGCGATCCATTGGCAAG
* * * ** * *** *
26837 ATAAGTCCATTTATAATCGCTCATGTCGTT-GAAAGCAC-CATTACACACTTTAAAT-GGTTTAT
317 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AAC-TTCGAAAGC-CTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAT
* * * * * * *
26899 AATCTTATAATTTATTTTAAGTTAAATTTTGTTACATTTTT-AGTTAAAATATATTATAACTGAA
379 AATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTGAA
* * * * * ** * * * * *
26963 TGTGTGCCTTGGGAAACATAAAGTGAAAGTCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACT
442 TGTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACT
* * * * * * *
27028 CAAG-CTTCGAATGCCTTATTATTC-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATGATTGATTTGAAGT
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
27091 T-AAATTTTTCACA-TTTTTAGTCAAAACAAATTATATTTGAATGTCTGGCTTAGGAAACATGAA
571 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAA
* * * * *
27154 GAAAAAGTCATTCATTCGCAA-AGAAAGTCTATTTATAG-TCACTC
635 GCAAAAGCCAATCATTGGCAAGA-AAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * * * * *
27198 ATGCCTTCGATAGCCTAATTACTCGGTTTAAATGATTCTATAATCTCATAATTGACTTTAAG-TC
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * **
27262 AATTTTTTTACA-TTTCTAATTAAAATATATTATGATTGAATGTCTACTTTGGGAAACATGAAGC
66 AATTATTTTACATTTTC-AATTAAAACATATTATAATTGAATGTAT-GTTTAAGAAACATG-AGC
* * * * * **
27326 AAAAGCCATCCATTCGCAAGAAAAGTCCTTTTATAGTTA-TCCAAGCCTTTGAAAGTTTTATTAC
128 AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* ********** * * *
27390 TTGCTTTAAATGGTTTTATANNNNNNNNNNTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTA-TTC
192 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTA
* * * * * **
27454 AAATAGATTATAATTGAATGTTTG-CCTTGGCAAAACATGAAGAAATAGCTATTTATCT-GCAAG
257 AAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGG--AAACATGAA-AAA-AGCGATCCAT-TGGCAAG
* * * *
27517 AAAAGTCTATTTATAGTCAAC-CATACCTTCGAAAGCCTTATTACCTACTTTAAAT-GCTTTTAT
317 AAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAG-TTTTAT
********* * * * *
27580 AATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTATCATTAAAACAGATTA-CATTGAAA
379 AATCTC-ATAATGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTG-AA
* * * * * * * * * * *
27643 TCTCT-TCCTTGGGAAACGTGAAGAGAAAGGCTTTTACTGGCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCAC
442 TGTCTGT-CTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCA-TTGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCAC
* * * * * * *** *
27707 -CTATACCTTCGAAAGTCTTATTACT-TGCTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAACAAATTTCAA
505 TC-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA
* * * * * * ** * *
27770 GTTGAATTTTTTCATATTGTTTGTT-AAACTAGATTATAATTGAATGTCTATCTAAGG-AACATG
569 GTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAAC-ATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTG
* * * * * * * *
27833 AAGCCAGAGTC-ATCTGTTAG-AAGGAAAAGTCCCTATATAG-TTACTC
633 AAGCAAAAGCCAATC-ATTGGCAA-GAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* ** * * * **********
27879 ATGCCTTCAAAAGCATTATTACTC-ATTTTAAATAGTTGTATAATCTCATANNNNNNNNNNAGTT
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * *** * ** * *
27943 GAATTTTTTTATATTTTTGGTCAAATTATATTATAATTGAATGTCTGCTTTAGGAAACATGATGC
65 GAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACATGA-GC
* * * ** ** *
28008 AAAAGCCATCCATTAGCAAGAAAAG-CTCATTTATAATCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTA-TAA
128 AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* ********** * *
28071 TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTNNNNNNNNNNTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCTCA-
192 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATA-TTTT-T-AG
* * * * * * * * * ** * *
28135 TTAAAATAGATTATAGTTGAATTTCTACCTTAGTAAAATATAAAGAAAAAGTTATTCATTAGCAA
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAG-GAAACAT-GA-AAAAAGCGATCCATTGGCAA
* * * * ** **********
28200 -AAAAGTCCATTTATACTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTANNNNNNNNNNTA
316 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATA
* * ***
28264 ATCTTATAATAGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATGTTGTTTG-TTAAAATGGATTATAATTGAAT
380 ATCTCATAAT-GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATT-TTTGATTAAAACATATTATAATTGAAT
* *** * * * * * * * *
28328 ATCAACCTTTGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGGAAGAAAAAGTCCATTTATAGTCGCTA
443 GTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGCAAG-AAAAGTCCATTTATAGCCACTC
* * * * * * *
28393 ATACCTTCGAAAGCATTATTACTC-ACTCTAAATGGCTTTATAATCTCATAACTGA-TTTAAGTT
507 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * * * * * * *
28456 GAATATTCTTT-CA-TTTTTAGTTAAAATATATTATAACTAAATGTGTCCCTTGGGAAACGTGAA
572 GAAT-TTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAA
* ** * *
28519 GCAAACGCC-ATCTATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAG-TCACAC
635 GCAAAAGCCAATC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
********** *
28563 A-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-ATTTTAAATGGTTTNNNNNNNNNNTAATAGATTTTAAGT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * ** ** * * *
28626 TGAATT-TTTTACAATTTT-GGTTAAAA-AGATTATAATTGAATGCCTA-ACTTGGGAAGCGTAA
64 TGAATTATTTTAC-ATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATG--TATGTTTAAGAAACAT-G
* * * * * *** *
28687 AG-AGAAAGCCATTCATTAGCAAGAAATGTCCATTTACAGTCAGTCACGCCCCCGAAAGACTTAT
125 AGCA-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTAT
* * * * *
28751 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC--AATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTATGG
189 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG
* * * * * ** * *
28814 TTAAAATAGATTATATTTGAATCTCTG-CCTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGTTATTCATTGGTAA
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCT-AGGAAACATG-A-AAAAAGCGATCCATTGGCAA
* * * ** * * *
28878 CAAAAGTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCATAATTA-TTCGCTTTAAATGGTTTTAT
316 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCTTTAAATAGTTTTAT
* * * *
28942 AATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTAAATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAAT
379 AATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAAT
* * * * * * * *
29007 ATCTGTTTTAGAAAACATCATGCAAAAGCCATCCATTGGCAA-ACAAAGTCCGTTTATAGTCACT
443 GTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGA-AAAGTCCATTTATAGCCACT
** * * * * *
29071 CAAACCTTCAAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAA-AGGTTTTACAATCTAATAATTGATTTTAAG
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATA-GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG
* ** * * * * * * ** * * *
29134 TTGAATTTTTTTTACATTTATGGTTAAAATAGATTACATTTTAATCTCTGCCCCAAGAAACATGG
570 TTGAA-TTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGA
* ** *
29199 AGAAAAAGCC-ATCCATTGGCAAGAAAAGTAAATTTTTTAGC-CACTC
634 AGCAAAAGCCAAT-CATTGGCAAGAAAAGTCCA-TTTATAGCTCACTC
** * * * *
29245 A-AGGTTTCGAAAGTCTTATTACTC-ATTTTAGATGGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGC
1 ATACCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * * * * * **
29308 T-AA--ATTTTCACATTTTTTAGTAAAATAGATTATATTTAAATGTTTGCCTAAGGAAACATGAA
64 TGAATTATTTT-ACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAA-GAAACATG-A
* * * * **
29370 GAAAAAACTATTTATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATTTCTTTGAAAGCCTTATTA
126 GCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * * * * *
29435 CGT-GCTTTAAATGGTTCTATAATCTCACAATTAATTTTAAGCTGAATTTTTTAAAATTTTT-GA
191 C-TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG-
* ** * * * * ** *
29498 TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAACCTAAAACAGAAGCCATCCGCTGGCAAA
254 TTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAAA-A-AAGCGATCCATTGGCAAG
* * * * * * *
29563 AAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAACCCTTATTGCCTACTTTAAAT-GGTTT-T-A
317 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAA-ACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAA
* * * * * * *
29625 --T-AT--TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAATATAGATTATATTTAAATGTC
381 TCTCATAATGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTC
* * * * * * *
29685 TGCCTCA-AGAAACATAAAG-AAAAGCCAATCATTGATAAGTAAAG-CCTATTTATAGTGGC-CT
446 TGTCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTG-CAAGAAAAGTCC-ATTTATA--GCCACT
* * * * * * *
29746 -ATGCCTTCAAAAGCCTTACTACT-TGCTTTAAATAGCTTTATAATTTCATAATTAATTTTAAGT
506 CATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * ** ** * * * * **
29809 CAAATTGTTTTTATAGTTTTGGTTAAAATGTGTTATAA-TGAA-ATGTCGACTTCAAGAAATATG
571 TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCT-GCCTT-AGGAAACGTG
** * * * * *
29872 AAGCAAAAGCCACCCATTGACAAAAAAAATTCATTTATA-ATCACTC
633 AAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * *
29918 A-AGCCTTCGAGAGCCTTATTACTC-ACTTTAAAAGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * *** * **
29981 TGAATGT-TTTTACATTTTTAATTAAAAAAGGTTATAATTGAATGTCTACCTCAGAAATTGTGAA
64 TGAAT-TATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAAGAAA-CATG-A
* * * * * * *
30045 G-AAACGCCCTTCGTTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACACATGCCTCTGAAAGTCTTATTA
126 GCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * * * ** *
30109 CTCACTTTAAATAGTTTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTTATATTGGTGGTT
191 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTT
* * * * * * * * **
30174 AAAATAGATTATAATTGAATGGCTGCCTTAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGGTAAGCT
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATGAA--AAAAGCGATCCATTGGCAAGAA
* * * ** * * ** *
30239 AATTCCATTTATACTCATTCATGCCTTCGAAAGCATCATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
319 AAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATC
* * * * * * *
30304 TCATGATTAATTTTAGGTTTAATTTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTG
383 TCAT-AATGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTC
** * * * * * * * ** *
30369 TCCCTTA-AGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTAGTAGGAAAACTCTATTTATAATCACTCAA
446 TGTCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCAT
* * * *
30433 GCCTTCGAAAGCCTTATTACTC-ACTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGA
509 GCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
* * * * * * *
30497 GTTTTTTTATA-TTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTGAAG-A
574 ATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACGTGAAGCA
* * * * *
30560 TAAAGTCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTA-TTATAG-TCACCC
638 -AAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * **********
30601 A-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGGTTAAAATGGTTTTATAATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTT
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * ** * * * * * * **
30665 GAATTTTTTTATATTGTT-GGTTAAAATATATTGTAATTGAATGTCTGCCTCAGGAAATGTGAAG
65 GAATTATTTTACATT-TTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACATG-AG
** * * * *
30729 TGAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCTTTTATAGTGACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
127 CAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * * * **
30794 TCACTTT-AA-GCGATTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTCTT
192 TCGCTTTAAATG-GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGTT
* * * * * * * * *
30857 GAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCCTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCTATTCATTGGCAAG-A
256 AAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATG-A-AAAAAGCGATCCATTGGCAAGAA
** * * * * ** * * *
30921 AAGTCCATTTACGGTCACACATGACTTGGAAAGCCTTAGTACTCACTTGAAGTA-TTTTACAATC
319 AAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATC
* * * * * * * *
30985 TCATAATTTATTTTAAGTTGAATTCTTTTATATTGTTTG-TTCAAATAGAATATAATTAAACGAT
383 TCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATT-TTTGATTAAAACATATTATAATTGAATG-T
* * * * *
31049 -TGCCTTAGGAAACATGAA-TAAAAGCCATTCATT-CAA-AAGCTAAGTCCATTTATAGTCAGTC
445 CTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGCAAGAA---AAGTCCATTTATAGCCACTC
* * * * * *
31110 ATGCTTTCGAAAGCATCATTACTC-CCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
507 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * ********** ** * * * * *
31174 AAATATNNNNNNNNNNTTGGTTAAAATATATTATAATTTAA-AGTCT-ACTTTGAGAAACGTGAT
572 GAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATA-TCTGCCTTAG-GAAACGTGAA
* * * *** *
31237 GCAAAAGCC-CTCAATTGGTAAGAAAGGTTTGTTTATAG-TCACCC
635 GCAAAAGCCAATC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * * ***********
31281 A-AGCCTTTAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAAGGTTTTATAATCCCATAATTNNNNNNNNNNN
1 ATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
************************************************** ** * * **
31345 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACTCAAGCCTTTG--
65 GAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTA-AGAAACATGAGCA
* ** * * * * ** *
31408 AAAGCC-TT-ATT-ACTCGTTTTAAA-T-GATTT-TA-TAATCTTAT--AATTG-AA--TTTAGG
129 AAAGCCATTCATTGGCAAG---AAAAGTCCATTTATAGTCA-CTCATGCCTTTGAAAGCCTTA--
* * ** * ** * * ** * *** *
31461 TTGAAT-GTTTTTTAT-ATTTT-TGGT-T-AAAATGGATTAGAA-TTGAA----TGCCTA-TCTT
188 TT-ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTT
* * * * * * * * * * ** *
31515 AG---GAA-ACA-T-GAAGTAAAAGCCAT-CCATTGG----A-GAGAAAAGTCTATTTATAT-TC
252 AGTTAAAATATATTATAATTAAATGTC-TGCCCTAGGAAACATGAAAAAAG-CGATCCAT-TGGC
* * * * * * * * * *
31567 -AG-ACA-TACCATTAAAAG-CA-TTATTACTTACTTTAAATG-ATTTTGTA-AT-C-TCATAAT
314 AAGAAAAGT-CCATTTATAGTCACTCA-AACTT-C--GAAA-GCCTTAT-TACTTGCTTTA-AAT
* * * ** * * *
31623 TGATTTTA-AGT-T-A-AAT--TTTT-TGTT--ATTTTTAATTA-AAATAT-ATTTATA-AT-TT
371 AG-TTTTATAATCTCATAATGATTTTAAGTTGAATTTTT--TTATATTTTTGATTAAAACATATT
* * * * * ** *
31675 -T-ATT---TGTTTG-CTTTGAGAGACAT-AAGCAAGGAGGTTATTCATTGGCAAAAAAAGTCC-
433 ATAATTGAATGTCTGTCTTAGA-AAACATGAAG-AA-AAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCA
* * * * * ** *
31732 TTTAGAGTCACTCAAGCCTTCCATAA-CCTTATTACT-TGTTTTAAATAGGTTTATAATCTCATA
494 TTTATAGCCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATA
* * * * * * *
31795 ATTGATTTTAAATTAGATTTTTTTTTACA-ATTTGAGTTAAAACATATTATAATAGAATGTCTAC
558 ATTGATTTTAAGTT-GA-ATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGAATATCTGC
* * * * * * *
31859 C-TCGAGAAATGTGAAG-ATGAAGCCATTCATTGACAAAAAAAGTCCATTCATAG-TCAC-C
620 CTTAG-GAAACGTGAAGCA-AAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
** * * *
31917 TATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCA-TTAAATGGTTTAATAATCTCACAATTGATTTTAAGG
1 -ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCG-ATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
31981 TG-ATTTTTTTATATTATT-AGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAATC-TGA
64 TGAATTATTTTACATT-TTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAA-CATG-
* * ** * * **
32043 AGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACTTATACCTTCAAAAGCAC-TAT
125 AGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGC-CTTAT
* * * * * *
32107 TACTCGTTTTAAATAGTTTTATAAACTTATAATTAATATTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTCA
189 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTT-A
* * * * * * * * * * *
32172 -TTAAAACATATAATATTTGAATGTTTG-CATCAGGAAACATGAAGAAATATCCATACAATGGTA
253 GTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCT-AGGAAACATGAA-AAA-AGCGATCCATTGGCA
* * * * * * *
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315 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAT
* * * * * * *
32299 AATATCATAATTGATTTTAAGTT-AGATTTTTTTATATTATTGGTTAAAATAGATTATATTTAAA
379 AATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAA
* * ** * *
32363 TGTTTGCCTCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCA-TCAATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA-CTCA
442 TGTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTC-ATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGC-CA
* * * * *
32426 TTCAAGCCTTCGAAA-CCTTTATTACTC-GCTTTAAAT-GATTTTATAATCTCATAAATGATTTT
504 CTCATGCCTTCGAAAGCC-TTATTAATCTACTTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTT
* * ** * * * ** *
32488 AAGATGAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGAATATAATTGAATGTCTATCTT-GAGAAACA
567 AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAG-GAAACG
* * * * *
32552 TGAA-AAAAAGCCATTCGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATTG-TCACCC
631 TGAAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
** *** *
32599 ATACCTTCAAAAATGTTATTACTC-ACTTCAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * * * * * * * * *
32663 GAATT-TTTTATACTGTTC-ATTAAAATAGATAATAATTGAATATCTGTCTCAGAAAACGTGAAG
65 GAATTATTTTACA-TTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGTTTAAG-AAACATG-AG
* * * * * **
32726 TAAAAGCCA-TCTATTGG-AGGAAAAAAATCCAGTTATAGTCACTCATG-CTTTCAAAAGTATTA
127 CAAAAGCCATTC-ATTGGCA--AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTA
* * * *
32788 TTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA-CGTCATAATT-ATTTTTGAGTTGAA-TTTTTTATATTGT
188 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TCATAATTGA-TTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTT
* * * * * ** * * * * *
32850 TAGTTAAAACAGATTATAATTGAGTGTGT-AACTCAAGAAACATGATGCAAAATCTACCCATTGG
251 TAGTTAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCT-AGGAAACATGA--AAAAAGCGATCCATTGG
* * * * * * * *
32914 -AGTGAAAAGTACATTCATTGTCACTCATACCTTCCAAAGCCTTATTACTCAG-TTTAAATGGTT
313 CA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACT-TGCTTTAAATAGTT
* * * * * * *
32977 TTATAATTTTATAATTGATTTTAAGTCGAATATGTTTACATTTTTTG-TTAAAATATATTATAAT
375 TTATAATCTCATAA-TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATA-TTTTTGATTAAAACATATTATAAT
* * * * * * * * *
33041 TGAATATCTGCCTTAGAAAATATGAAAAAAAAGTCATCCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGT
438 TGAATGTCTGTCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGC
* * * * * * * *
33106 TACTCATGCTTTCTAAAGCCCTATTACTC-GCTTTAAAT-GATTTTATAATCTCATTATTAATTT
502 CACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTT
* * * * * * * ** * *
33169 TAAGTTGATTTTTTTTATATTTTTGATTAAAAAAAATTATATTTGAATCTCTATCTCAGGAAACA
566 TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGGAAACG
* * * * *
33234 TGGAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACCC
631 TGAAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * *
33282 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTCTAAATGGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTAAGTTG
1 ATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * *
33347 AATT-TTTTATA-CTACTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAAGAAATATGAAGC
66 AATTATTTTACATTTTC-AATTAAAACATATTATAATTGAATGTATG-TTTAAGAAACATG-AGC
* * * ** * * * ** *
33410 AAAAACTATCCATT-AAAGAGAAAACTCCATTCATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGTATTAGTAC
128 AAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * * * * *
33474 TCTG-TTTGAATGGTTATGTAATGTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTAAATTTAT-GAC
192 TC-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAG-T
* * * * * * * **
33537 TAAAACAAATTATAATTCAATATCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGTC-ATTCATTGATAAG
255 TAAAATATATTATAATTAAATGTCTGCCCTAGGAAACATG-A-AAAAAG-CGATCCATTGGCAAG
* ** * * *
33601 AAAAGTCTATTTATAGTCCAC-CATGCCTTCAAAAGCATTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATA
317 AAAAGTCCATTTATAGT-CACTCA-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATA
* * * * * * *
33665 ATCTCATATTTAATTTTAAGTTGAATTTGTTTGTATTTATTG-TTAAAACAGATTATATTTAAAT
380 ATCTCATA-ATGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTT-TTGATTAAAACATATTATAATTGAAT
* ** * * *
33729 GTTTACCTT-GAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCAGTGGCAAGAAAACTCCATTTATAGTCAC-
443 GTCTGTCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCA-TTGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACT
* * * * *
33792 CTATGCCTTCAAAAGCTTTATTACT-TGCTGTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG
506 C-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTAATCTACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG
* * * * * * * * *
33856 CTGATTTTTTTTACATTTTTTGTTAAAAAATATTATAATTCAAT-GCGTGCCTCTA-GAACCATA
570 TTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATATC-TGCCT-TAGGAAACGTG
* *** ** * *
33919 AAGAAAAAGCTTTTCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAG-TCACCC
633 AAGCAAAAGCCAATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
* * * * *
33965 ATAAC-TTCAAAGGCCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAATATCATAATTGATTTTAAGTT
1 ATACCTTTGAAA-GCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
* *** * * * *
34029 G-ATTTTTTTACATTTTTGGTCAAAACATATTATAATTAAATGTCT-TCCATAAGAAACATGAAG
65 GAATTATTTTACATTTTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGT--TTAAGAAACATG-AG
* * * * *
34092 CAAAAGCCATCCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAT-CCTTCGGAAGCCTTATTA
127 CAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * ** * * * *
34156 CTTGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA-CCAGAAATGTTTTACATTTTTGGT
191 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AATTTTTTTATATTTTTAGT
* * * ** * *
34220 TAAAAAAAATTATAATTGAATGTC--CACCTCATTAAACATAAATAAAAATTC-AGT-CATTGGC
255 TAAAATATATTATAATTAAATGTCTGC-CCT-AGGAAACAT-GA-AAAAA-GCGA-TCCATTGGC
* * **
34281 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATAACTTCAAAAGCCCTATTACTCACTTTAAATAGTTTT
314 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-A-AACTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTT
* *
34345 ATAATCTCATAGTTAATTTTAAGTTGAATTT
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34376 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 16422, Mismatches: 4545, Indels: 2532
0.70 0.19 0.11
Matches are distributed among these distances:
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GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCTCACTC
Found at i:15201 original size:170 final size:171
Alignment explanation
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14713 ACTTGCTTTA
** * ** * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * *
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* * * *
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* * **
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* * * * * *** *
15234 AATTTGTTTATATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGGTTTAGGAAACGTGAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * ** * *
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* * * *
15363 CGCTTTAAATAGCTTTACAAT-TCATAATTGATTTTAAGTT-
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** *
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* * * *
15702 -TCACTTTAAATAGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTACGTT-
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* * * *
15744 AATTTTTTTTACACTTTTAGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTCTACC-TAGGAAAACGTGAAG
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* * * * * *
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* *
15872 CTCT-CTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTG
128 CT-TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * *
15916 AATTTTTTTATATTTTAAGTTAAAACATATTATAATTAAATGTATGCCTTAGGAAACGTAAAGGA
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* * * * *
15981 AAAA-CCATTCATTGGCAAG-AAAGTCCATTTAT-GCCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
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* *** * * * * * * *
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1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
* * * ** * * * *
16149 AAAAG-CATCCATT-GTCAAGAAAAATCCATTTATATTCACTAAAGCTTTTGAAAGCATTGTTAC
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* * * *
16212 -TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCGTAATAGATTTTAAGTT-
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* * * * * * *
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* * **
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* * *
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** * * ** * * * **
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* * * **
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* * *
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* * * * * *
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1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAAT-TGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * ***
16650 AAAAACCA-TCATTGGCAATAAAAGTT-CATTTATAGCCACCCATGCCTACGAAATAAATTATT-
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA-TTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAA-GCCTTATTA
* * *
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128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * ** *
16754 AATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTATCCCTCGGGAAACGTAAAGAA
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* * *
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* *
16881 TTGATATAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAGTTG
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * ** * * * *
16924 AATTGTTTTATATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACTTCTA-CAAACATGAAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCT-TAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * * *
16988 AATAGCCATCCATTATCAAGAAAAATCCATTTATATTCACCAAAGCCTTTGAAAGCATTATTAC-
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* *
17052 TCATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATAGATTTTAAGTT-
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
17094 ATATTTTTTCACATTTTTAGTTAAAACAGATAATATTTGACTGGCTACCTT-GGAAAATGTG-AG
1 A-ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGG-AAACGTGAAG
* * * * * * * * ** ***
17157 GAAAAGCCAATCATCGAG-AGGAAAA-GCCAATCATCGAGAGGAAAAGCCATCATCGAGAGAGGA
64 AAAAAGCCATTCAT-TAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCA-CCCAAGCC-T--TC-------G-
** * * * * * * ** * * *
17220 AAAAGCCAAATCATCGTGA--GAAA-AGCCCATTTATAGT-TCATCCA-TGCCTTCAAATCTT
116 -AAAGCCTTATTA-CTTGATTTAAATAG---TTTTATAATCTCAT-AATTGATTTTAAGT-TG
* * ** * * *
17278 TATTACTTGCTTTAAATAGTTTCATAATCTCATAA-TTGATTTTAAATTGAAT-T-T---TTA-G
1 AATT--TT--TTTACAT--TTT--TGGT-T-AAAACAT-ATTAT-AATTGAATGTCTACCTTAGG
* ** *** * *** * * *** * * *
17336 ATATTTTTGGTTAAAATATATT-ATAATCAA-ATGTTTGC-TTTGGGAAACGTGGAGCAAAATCC
54 AAACGTGAAG-AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTT---ATA-GT----C---ACCC
* * * * * * ** *
17398 -ATCCATTGGCAAAAAAAGTTCGTTTATAGCCACTTAAGCCTTCAAA-AGCCTTATTA-CTCACT
107 AAGCC-TT--C---GAAAG--C-CTTAT---TACTT--G-ATTTAAATAGTTTTATAATCTCA--
*
17460 TTAAATGGTTTAATAATCTCCTAATTGATTTTAAGTTG
155 -T-AA----TTGAT--T-T--TAA--G---TT-----G
* * * * * * *
17498 AATTTTTTTATAGTTTTGGTTAAAACAGATTATATTTGAATGTCTACATTA-GAGAATGAGAAGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGA-AACGTGAAGA
* * * * * * * *
17562 AAAAGCCATTCTTTGGTAAGAAAAGTT-CATTTATAGCCACTCATGCCCTCGAAAGCCGTATTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA-TTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * *
17626 TCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTT-
129 T-TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
17668 AAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATACTATAATTGAATGTATATCTCAAGAAACGTAAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
17733 AAAGCCATTCATTGAG-AAG-AAAGTCCATTTATAGCCACTCATGCTTTTGAAAGCCTTATTACC
66 AAAGCCATTCATT-AGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
*
17796 TGATTTAAATATTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * *** *
17838 AATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGGTTTAGGAAACGTGAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * *
17903 AAAGCTATCCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATATTCA-CTAAGGCCATT-GAAAGCATTATTAC
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAA-GCC-TTCGAAAGCCTTATTAC
* * * *
17966 TCGCTTTAAATGGTTTTACAAT-TCATAATTGATTTTAAGTT-
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
18007 AGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATATTTGAATGTCTGCCTTAAGAAATGTGACG-
1 A-ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * *
18071 -AAAGTCTATTCATCAAG-AAGAGAAGTT-CATTTATAGTCTCCCATGCCTT-GAAAAGCCTTAT
65 AAAAG-CCATTCAT-TAGCAAGA-AAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCG-AAAGCCTTAT
* * * *
18132 TTCTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
126 TACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * * *
18178 AATGTTTAGACATTTTTGGTTCAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCAGGTAACATAAAGT
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
** * * * ** * ** *
18242 AAAAGTGATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGACTTTAAAAGCCTTATTAAT
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * *
18307 CGCTTTAAAT-GATTTTACAATCTCATAATT-ATTGTTAAGTTG
130 TGATTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGTTG
* * * * * * * * *
18349 AATTTTTTTTACACTTTTGGATAAAACAAATTATATTTGAATGTTTGCCTCA-AAGAACATGAAG
1 AA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGA-AACGTGAAG
* * * * * *
18413 AAAAAAG-CATTCTTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATGCCTTTGAAAGTCC-TATT
64 -AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAG-CCTTATT
** * * * *
18476 ACTCAATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAAATTT
127 ACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
18521 AATTTTTTTATATTTTTGATTAAAACATTTTATAATTGAATGTTTA-CTTCGATAAACGTGGAGT
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * * * *** * *
18585 AAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCGTTCAAACTTTCGAAAGCCTTATTAC-
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
18649 TCACTTTAAATGGTTTAATAATATCGTAATTGATTTTAAGTTG
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * *
18692 AA-TTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAAATGATATTTGAATGTCT-GCTTGGGAAACATGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * *
18755 AAAACCATT-ATTTAGTAAGAAAAGTT-CATTTATAGCCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
66 AAAGCCATTCA-TTAGCAAGAAAA-TTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * *
18818 TCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATTT
129 T-TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * *
18861 AATTTTTTT--A-------TTAAAATATATTATAATTGAATGTATGCCTT-GAGAAACGT-AA-A
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * * * *
18914 CAAAAGCCATTCATTGGTAAG-AAAGTCCATTTATAGCCACCTATGCCGTT-GAAAGCCTTATTA
65 -AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCC-TTCGAAAGCCTTATTA
* * *
18977 CTTGATTTAAATGGTTTTATAATCTCACAATTGATTTTAAGTTA
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * *
19021 AATGTTTTTACATTTTTGATTAAAA-ATTATTATAATTGAATGTCT-GCTTCAAGAAACGTGAAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-TATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAG
* * * * * * * ** * * *
19084 CAAAAGTCATCCATTGGCAGGAAAAGTCCATTTATATTCACTAAAGCCTTTGAAAGCATTGTTAC
64 AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * *
19149 TCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTGATACTAGATTTTAAGTT-
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * **
19191 AGATTTTTTCACATGTTTAGTTAAAACAGATAATATTTGAATGTCTGTCTTAGGAAA-GTGAAG-
1 A-ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * **
19254 AAAAGCCATTCATTGAG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCACGCCTT-TAATAGCTTTCGTA
65 AAAAGCCATTCATT-AGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAA-AGCCTTATTA
* * * * * * * *
19317 TTTGCTTTAAATGGCTTCATAATCTCATAATTTATTTCAAATTG
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * ** * * * * * * * *
19361 AATTTTTAGATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTGATTGTCTGCTTTGGGAAATGTAAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
** * * * * ** * *
19426 AAAGTTATCCATT-GATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTAACCCTTCAAAAGCCTTATTAC-
66 AAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * *
19489 TCACTTTAATTGGTTTTATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTTG
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
19532 AATCTTTTTACACTTTTAGTTAAAACAGATTATATTTAAATGTCTGCCTT-GTGAAACGTGAAAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * *
19596 AAAAACCATTCTTTAGGAAGAAAAGTT-CATTTATAGCCACCCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTA
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA-TTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * *
19659 CTCT-CTTTAAATAATTATATAATCTCATAATTGATTTTAACTTG
128 CT-TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * *
19703 AATTCTTTTATAATTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACGT-AAGGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAA-GA
* * * * *
19767 AAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAA-TCTATTTATAGCCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* *
19830 TTG-TGTTAAGT-GATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCTG
129 TTGAT-TTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* *** * * *
19873 AATTTTTTTACATTGTCAATTAAAACATATTATAATTGAATGT-T-CGCTTCAAGAAGCATGAAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTAC-CTT-AGGAAACGTGAAG
* * ** * * * * * ** * * * *
19936 CAGAATTCATCCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATATTCACTAAAACCTTTGAAAGCATTATTAG
64 AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* ** * *
20001 TCGCGTTAAATCGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
20044 AATTTTTTTACATGTTTGGTTAAACCAAATAATATTTGAATGCCTGCCTTAAGAAACGT---G-A
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * *
20105 ATA---ATTCATTGAG-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCATGCCTTCAAAATCCTTATTACT
66 AAAGCCATTCATT-AGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * *
20166 TGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * * * * *
20208 AATTTTTAGACATTTTTGGTTAAAATATATTATCATTGAACT-TCT-GCTTCAGGTAATGTGAAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAA-TGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAG
* ** * * * * * * *
20271 TAAAAGTGA-TCTATTGGCAACAAAAGTCTATTTACAGTCACTCAAGCTTTCGAAAGCCTTATTA
64 AAAAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * * * *
20335 C-TCACTTTAAATGGTTTCACAATTTCATAATTG-TTGTTAATTTA
128 CTTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGTTG
* * * * * * * ** *
20379 AATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATCATATTTGAATGTTTACTTCTAGG-AGTGAGAAGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCT-TAGGAAACGTGAAGA
* * * * * ** *
20443 AAAAACTATTCTTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCCACA-CCTTCGAAAGCTTTATTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
*****
20507 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTANNNNN
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
***** ** * * * ** * * * * *
20550 NNNNNTTTTGTATTTTCGATTAAAGCATATTATAATTGAATGT-TTTCTTTGAGAAGCATGGAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * * ** *
20614 AAAAGCCA-TCTATTTGCAAGGAAAGTCCGTTTATAGTCACTTAAGCATTCGAAAGCCTTATTAC
65 AAAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * *
20678 -TCACTTTAAATGGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTTG
129 TTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
20721 AATGTTTTTACATTTGTAGTTAAAACAGATTATATTTGAATG-CT-GCTTTGGGAACGTGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
20784 AAAACCATTCTTTGGCAAGAAAATTTCATTTATAGCCACCCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTGCC
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
**********
20848 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATNNNNNNNNNNTTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * ** * * ** **
20890 AATTTTTTTACTTTTTTAGTTAAATTATATTCTAATTAAATGT-TTGCTTCAGGAAATATGAAGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
* * * * ** *
20954 AAAAACCATCCATT-G-ACAGAAAAAGTCCGTTTATAGAT-ATTCAAGCCTTCAAAAGCCTTATT
65 AAAAGCCATTCATTAGCA-AG-AAAATTCCATTTATAG-TCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATT
** * * ********** *
21016 ACACGTTTTAAATGGTTTNNNNNNNNNNTAATTGATTTTAAGTTC
127 ACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * *
21061 AATTTTTTGACATTTTTGGTTAAAATAGATAATATTTGATTATCTACC-TAGGGAAGCATGAAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTA-GGAAACGTGAAGA
* * ** * * * * *
21125 AAAAGCTATTCATT-G-ATAAAAAAAGCCTATTTACAATAACCCATA-CCTTCAAAAGCCTTGTT
65 AAAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAATTCC-ATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATT
* * * * *
21187 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATATCATAATTAATTTTAAGTTA
127 ACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * * * * * * *
21232 AATTTTTTTATGTTTTTTGTTAAAATATATTATAATTCAATGTCTGCTTTA-AAAACATGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
21296 AAAGCCATTTATT-GACAAGAAAAGTCGACTTATACTCTCCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC-
66 AAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * * **
21359 TCATTTTAAATTGTTTTATAATCTTATAATTGACTTGAAACTG
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * ** * *
21402 AATTTTTTTATATTTTCAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCAATAAACATGAAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
* * * * ** **********
21466 GAAAGCCATCCACT-GACAAGCAAAGTT-CATTTATAGTCATTCAANNNNNNNNNNGCCTTATTA
65 AAAAGCCATTCATTAG-CAAG-AAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * * *
21529 CTCGCTTTAAATGGTTTAATAATCTCGTAATTGAGTTTAAGTTG
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * ** *** *
21573 AA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATATTATAAGAAAAGTCCATTTATAGTGGCCCAT
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATA--AT-TG-AATGTCTACCT-TAG-GAAACGT
**** *** *** * * ** * **
21637 GCCTTCAAAAGCC-TT-ATT-GCTTACTTCAAA-TGGTTTTATAATCTCATAATTG-ATT-TTAA
60 G-AAGAAAAAGCCATTCATTAGC--A-AGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAA--GCCTTCGAAA
* * * * *************************
21696 G---T-TTAATT-TTTTACAT-TTTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
119 GCCTTATTACTTGATTTAAATAGTTTT-------------ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT
*
21755 N
171 G
*****************************************************************
21756 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
*****************************************************************
21821 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
*****************************************
21886 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
131 GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
*****************************************************************
21927 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
*** ** ** ** * * ***** * *
21992 NNNGCC-TTCAAAAGCATTATTAGT-CAGTTTAATTGGTTTTATAA--TTTC-ATAATTG-ATT-
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCA-TTT-A-TAGTCACCCAAGCCTTCGA-AA--GCCTTA
* ** * * * * **
22050 TTAAGCTGGATGTTTTTATA-TTTT-TTAT-T-AAAATAT-ATTATAATTAA
125 TT-A-CTTGA--TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAAT-TGATTTTAAGTTG
* * * **** * * * ** *
22097 ATATCTATCTTGAAAAACAT-G--AAAAAAGAGTTATTCATTGGCAA-G-AAAGTCCAT-GGATA
1 A-AT-T-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACATA-TTA-TAATT-G-AATGTCTA--CCTTAGGA-A
* * * ** * * *** * **
22156 ATCACTTATGCCTTTGAATGCC-TT-ATTACTTCCTTTAAATATT---TTTATTA-TCTCATAAT
56 A-C-GTGAAG----AAAAAGCCATTCATTA---GCAAGAAA-ATTCCATTTA-TAGTCACCCAA-
* ** * ** * *
22215 TG-ATT-TTAA--CTTGAATT--TT--TTTACATTTTTGGTTAAAAGATATTC-TAATTGA----
109 -GCCTTCGAAAGCCTT--ATTACTTGATTTAAATAGTT--TT-ATA-AT-CTCATAATTGATTTT
*
22267 ATGTCTG
166 AAGT-TG
** ***** *** * * ** * ** * * ** *
22274 GCTTAGAAAACA--TAAAG-AAAAAGCCAT-TCAGTGGCTAGAAAAATCTA-TTTATAGCCAC-C
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA--CATATTA-T-AATTG-AATGTCTACCTTA-GGAAACGT
* *** *** * * **
22333 CAAGCCATTAAAAGCCA-T-ATTA-CTTATTTTAAA-TGGTTTTATAATCTCATAA---TT-G--
60 GAAG--A--AAAAGCCATTCATTAGC--A-AGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAA
** * * * ** * * * **
22388 A-TTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTACTTTGAG
118 AGCCTT-A-TT-ACTTGATTTAAATAGTT--TT-ATA-ATCTCATAATTG-AT-TTTAAGTT--G
* * * * *
22452 AAACATGAATTGTTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTA-CTTTGAGAAACA
1 --A-AT---TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACG
* * * ** * * * * *
22516 TGAAGCAAAAGCCATTTATTGGTTAGAAAAGTCCATTTGTACTCACCCACGCTTTCGAAAGCCTT
59 TGAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTT
* * *
22581 ATTAC-TCACTTTAAATTA-TTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGCT-
124 ATTACTTGA-TTTAAA-TAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * * * * * * * *
22628 AAATTTTTTACATTTTCAGTTGAAATATATTACAATTGACTATTTGCTTTAGGACACATGAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * ** * *
22693 AAAGCCATCCACTGGTAAGAACAGTCCATTTATAGTCACTTAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTC
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * *
22758 GCTTTAAATGGTTTAATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTG
131 GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * *
22799 AATTATTTTATATTTTTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTACCTTAGGAAATGTTAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * *
22864 AAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTTTACCTATGCCTTCGAAAGCCATACTACT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAG-TCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
22928 TGCTTAAAAT-GATTTTATAATCTCAAAATTAATTTTAAGTTA
130 TGATTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * *
22970 AATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATACATTATAATTGAATGGT-TGA--TTCAAGAAATGTGAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAAT-GTCT-ACCTT-AGGAAACGTGAA
* * * * * * * **
23032 GCAAAGGCCATCCATT-GATAAGAAAAGTCCATTTACATTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATT
63 GAAAAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATT
* * * *
23096 TCTTGCA-TTAAATAGTTTTGTAATCTCATAATTGATTTTTATTTG
127 ACTTG-ATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * *
23141 -ATTTTTTTATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-TTTCAGAAAACATGAAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
* * * * * *
23204 AGAAGCCA-TCTACTCA-AAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCTTTCGAAAGCCTTATTA
65 AAAAGCCATTC-A-TTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * *
23267 -TTAGCTTTAAATGGTTTAATAATCTCTTAATTGATTTTAAGTT-
128 CTT-GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * ** * ** * *
23310 AATTTTTTTATATTTTTTATTACAACAGATTATATTTGGTTGTTTGTC-TCGAGAAACATGAAGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * * * * * * * *
23374 AAAAACTATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATTGTCATCCATGCTTTCGAAAACCTTATTAC-
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * *
23438 TCATGTTAAATAGTTTTATAAGCTCATAATTAATTTAAAGTTG
130 TGAT-TTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * * **
23481 AATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATATTTTACAATCGAATGTCTA-CTTCAGAAAATATGAAG-
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
* * * * *
23544 CAAA-CC-TATC-TCTAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCG-AAGCCTTATTA
65 AAAAGCCAT-TCAT-TAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * *
23605 CTCGCTTTAAATAGTTTAATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTG
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * ** * **
23649 AATTGTTTTGTATTTTTGGTTCAAACAGATTATATTTGAATGTCTGTCTCAAAAAACGTGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
** * * * * * * *
23714 AAAATCATTCA-TAGATAAGAAAAGTCTATTTAT-GATCATCCATGCCTTCAAAAGCCTTACTAC
66 AAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAG-TCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* **
23777 TTGCATTT-AATGGTTTTATAATCTTGTAATTGATTTTAAGTT-
129 TTG-ATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
23819 AAATTTTTTACATTCTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATTGAAAATTTGCCTTGGGAAATGTG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAA-TG----TCTACCTTAGGAAACGTG
* * * * * ** * *
23884 AAGTAAAAA--CACTCTATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAATCAATCATGCCTTCAAAAGCCTT
61 AAG-AAAAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTT
* * * *
23947 ATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAGAATTGATTTTAAGTTG
124 ATTACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * *
23995 AATTTTTTTACGTTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGT-TTGC-TATGAGAAACAT-AAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTA-G-GAAACGTGAAG
* * * * * * * *
24057 ACAAAAGTCATCCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTG
64 A-AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * *
24122 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AGTTG
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * *
24165 AACTTTTTTACATTTGTGGCTAAAATATATTACAATTGAAT-TCTTA-CTTCAGGAAATGT-AAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTC-TACCTT-AGGAAACGTGAA-
* * * * * * * *** *
24227 GCAAAAGCCA-TCTATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATTGCCATTGAAGCCTTTGAAAGCCTTATT
63 GAAAAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATT
* * * * *
24291 ACTTGCTTTAAATGGTTTTAT-GTCTCATAATTAATTTTAAGTTA
127 ACTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * ** * * *
24335 AATTTTTTTATATTTTTAATTAAAACAGATAATGTTTGAATGTCT-GCTTTGAGAAACGTAAAGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
** * * * * *
24399 AATGGCCATTCATT-GACAAGAAAAGTCTATTTATAGCCACTCATA-CCTTCGAAAGTCTTATTA
65 AAAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * *
24462 CTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTAG
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * *
24506 AATTGTTTTACATTTGTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCGAAAAATGTG-AGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * * * *
24569 AAAAGCCATCCACTAGCAAG-AAATGTCCTTTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTTTTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAT-TCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * **
24633 -TCACTTTAAATGGTTTTATAAACTCAGAATTGATTTTAAGCAG
129 TTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * *** * * *
24676 AATTTTTTTATATTTTTTAATTAAAATAGATTATAATTGAATAAGT-GCTTCGAGAAACATGAAG
1 AATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAG
* * * * ** ** *
24740 AAAAAGCCATTTATTGGCAAGAAAAGTT-CATTTTTAGTTACCCGTGCCTTCGAGTGCCTTGTTA
64 AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA-TTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * *
24804 CTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAAGTTT
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * ** * * *
24848 AATTTTTTTACATTGTTCGTTAAAATAAATTATAATAGAATG-CTTGCTCAGGAAACATGAAGGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * * * *
24912 AAAGCTATCCATT-GGAGTGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCCAAAGCATTATTACT
66 AAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * *
24976 CGCTTTAATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * * * ** *
25018 AATATTTTTTTTATTGTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGTCTT-GAGAAA--TAGAT
1 AAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGT-GAA
* * *** * ** * * * ***
25080 TATAATTACATGTTTGCCTTAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAATAAAAGTCCATT-
63 GAAAAAGCCA---TT-CATTAG---C---AAGAAAATTCCATTTATAGTC-ACCCAAG-CC-TTC
* * ** * ** * * * * * * * *
25144 TATAGTTACCCACACTTTCGAAAGCATTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTG
115 GA-A---AGCCTTA-TTAC--TTG-ATT-TAAAT-AGTTT-TATAATCTCATAA--T--TGATT-
**
25209 ATTTTAAGTTG
164 -TTAA--GTTG
* * *** * * *
25220 CATTCTTTTT--ATTGTTGGTTAAAATGGATTATAATTGAATGCCTACCTTAGGAAATGTGAAGC
1 AATT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * ** * **
25283 AATAGCCATCCATT-GGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTAAAAGCCTTATTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * *
25347 -TAATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAGGTTG
129 TTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * *
25390 AATTTTTTTATATTGTTGGTTAAAATAGATTATAATAGAATGTCT-GCTTCAAGAAACGTTAAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAGA
* * * * * * * *
25454 AAAAGCTATCCATTAGAAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATTATTAC-
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * * *
25518 TCACTATCATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTAG
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * *
25561 AATTTGTGTACATTTTTGGATAAAATAGATTATATTTGAATGTCTGCCTTAAGAAACATAAAGGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAA-GA
* * * * ** *
25626 AAAAGCCA-TCTATTGGCATGAAAAGTCCATTTATAGTGACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
65 AAAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * *
25690 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGAGTTG
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
25733 AATGTTTTTACA-TTTTAGTTAAAACAAAATAT-ATTGAATGTTTGCCTTTGAAAACGTGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * *
25796 AAAGCTATTCCTTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCCCACA-CCTTTGAATGCTTTATTACT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* *
25860 T-ACTTTAAATGGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTG
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * *** *
25902 AATTTTTTTATATTGTTAGTTAAAATAGATCATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACACAAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * *
25967 AAAGCCATTCATTAG-AGATAAAACT-CAGTTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAACATTATTA-
66 AAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAATTCCA-TTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * *
26029 TTCACTTTAAATGGTTCTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTG
129 TTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * * * * *
26073 ACTTTTATTACAGTTTTT-ATTAAAAAATACTATTATTGAATCTTTGCCTTAAGAACCTTGAAGC
1 AATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
*** * * * * *
26137 AAAAGTGGTCCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAATCCTTATTACT
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
26202 GGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTATGTTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * * * * * * *
26244 AATTTTTGCACATTTTTGGTTACAATAGT-TTATATTTGAATGTTTGCCCT-GGAATACATGAAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-TATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAA-ACGTGAAG
** * * * ** * *
26307 AAAACCCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCTTGACTTCGAAAGCCTTATTGC
64 AAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * * * *
26372 TTGCTCTAAATGGTTTTATAAAT-TTA-AATTTGATTTAAATTTA
129 TTGATTTAAATAGTTTTAT-AATCTCATAA-TTGATTTTAAGTTG
* ** * * * ** *
26415 AATTTTTTTACACTTTTACTTAAAATAGATTATGATTGAATGTCTGTCTTAGGAAACGTCAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * ** ** *
26480 AGAGTCA-TCTATT-GCTGGAAACGTCCATTTATAGTCACCCATA-CTTTCGAAAGCCTTATTAC
66 AAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * * *
26542 TTGCTTTAAATAGTTCTATAACCTTATAATGGTTTTTAAGTTG
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *** *
26585 AATTTTTTTACACTGTTGGTTGAGATAGATTATAATTGAAT-ACTTACCTTAGGAAACACAAAGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTC-TACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * * * * *
26649 AAAAGCCATCCATT-GGAGAGAAAAGTCTAATTATATTCACTCATGCCTTCAAAAGCATTATTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCA-AGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* ** **
26713 -TGCTTTAAACGGTCCTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
129 TTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * * *
26755 AA--TTTTTAAATTTTTTATTAAAATATATTATAATTGATTATCTACCTCAAGAAACGTGAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
** * * * * * * * *
26818 AAAGCCATGGATT-GACAAGATAAGTCCATTTATAATCGCTCATGTCGTT-GAAAGCAC-CATTA
66 AAAGCCATTCATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAG-CCTTCGAAAGC-CTTATTA
** * * * *
26880 C-ACACTTTAAAT-GGTTTATAATCTTATAATTTATTTTAAGTTA
128 CTTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * **
26923 AATTTTGTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAACTGAATGTGTGCCTTGGGAAACATAAAGTG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * *
26988 AAAGTCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTCAAG-CTTCGAATGCCTTATTA-TT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * *
27051 CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATGATTGATTTGAAGTT-
131 -GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * ** *
27092 AAATTTTTCACATTTTTAGTCAAAACAAATTATATTTGAATGTCTGGCTTAGGAAACATGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * *
27157 AAAGTCATTCATTCGCAA-AGAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGATAGCCTAATTACT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGA-AAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * *
27221 CGGTTTAAAT-GATTCTATAATCTCATAATTGACTTTAAG-TC
130 TGATTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ** * * * * * *
27262 AATTTTTTTACATTTCTAATTAAAATATATTATGATTGAATGTCTACTTTGGGAAACATGAAGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * * **
27327 AAAGCCATCCATTCGCAAGAAAAGTCCTTTTATAGTTATCCAAGCCTTTGAAAGTTTTATTACTT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * ********** *
27392 GCTTTAAATGGTTTTATANNNNNNNNNNTGATTTCAAGTTG
131 GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
27433 AATTTTTTTATATTTTT-ATTCAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-GGCAAAACATGAAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGG--AAACGTGAAG
* * * * * *
27496 AAATAGCTATTTATCT-GCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAACCATA-CCTTCGAAAGCCTTATT
64 AAAAAGCCATTCAT-TAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATT
* **********
27559 ACCT-ACTTTAAAT-GCTTTTATAATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTTG
127 ACTTGA-TTTAAATAG-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * ** * * * * *
27604 AA-TTTTTTATATTTATCATTAAAACAGATTA-CATTGAAATCTCTTCCTTGGGAAACGTGAAGA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTG-AATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * * *
27667 GAAAGGCTTTTACTGGCAAGAAAAGTT-CATTTATAGTCACCTATA-CCTTCGAAAGTCTTATTA
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAA-TTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * *** *
27730 CTTGCTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAACAAATTTCAAGTTG
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * *
27774 AATTTTTTCATATTGTTT-GTT-AAACTAGATTATAATTGAATGTCTATCTAAGG-AACATGAAG
1 AATTTTTTTACATT-TTTGGTTAAAAC-ATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAG
** * * * * * * * * * * *
27836 CCAGAGTCA-TCTGTTAG-AAGGAAAAGTCCCTATATAGTTACTCATGCCTTCAAAAGCATTATT
64 AAAAAGCCATTC-ATTAGCAA-GAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATT
* * **********
27899 AC-TCATTTTAAATAGTTGTATAATCTCATANNNNNNNNNNAGTTG
127 ACTTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * ** * * * * *
27944 AATTTTTTTATATTTTTGGTCAAATTATATTATAATTGAATGTCTGCTTTAGGAAACATGATGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
28009 AAAGCCATCCATTAGCAAGAAAA-GCTCATTTATAATCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTA-TA-A
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTC-CATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * **********
28071 TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTNNNNNNNNNNTTTAAGTTG
130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * * * * * ** *
28114 AATTTTTTTACATTTTTCTCATTAAAATAGATTATAGTTGAATTTCTACCTTAGTAAAATATAAA
1 AATTTTTTTACA-TTTT-TGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAA
** * * *
28179 GAAAAAGTTATTCATTAGCAA-AAAAGTCCATTTATACTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
63 GAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATT
* ********** * *
28242 AC-TCACTTTANNNNNNNNNNTAATCTTATAATAGATTTTAAGTTG
127 ACTTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** *** * * * * *
28287 AATTTTTTTATGTTGTTT-GTTAAAATGGATTATAATTGAATATCAACCTTTGGAAACATGAAGT
1 AATTTTTTTACATT-TTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * *
28351 AAAAGCCATCCATT-GGAAGAAAAAGTCCATTTATAGTC-GCTAATACCTTCGAAAGCATTATTA
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAG-AAAATTCCATTTATAGTCACCCAA-GCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * *
28414 C-TCACTCTAAATGGCTTTATAATCTCATAACTGA-TTTAAGTTG
128 CTTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * *
28457 AATATTCTTT-CATTTTTAGTTAAAATATATTATAACTAAATGTGTCCCTTGGGAAACGTGAAGC
1 AAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * *
28521 AAACGCCA-TCTATT-GATAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACACAAGCCTTTGAAAGCCTTATTA
65 AAAAGCCATTC-ATTAG-CAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * ********** *
28584 C-TCATTTTAAATGGTTTNNNNNNNNNNTAATAGATTTTAAGTTG
128 CTTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
28628 AA-TTTTTTACAATTTTGGTTAAAA-AGATTATAATTGAATGCCTAACTTGGGAAGCGTAAAGAG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* ** * ** *
28691 AAAGCCATTCATTAGCAAG-AAATGTCCATTTACAGTCAGTCACGCCCCCGAAAGACTTATTACT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAT-TCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * *
28755 CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC--AATTGATTTTAAGTTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
28795 AATGTTTTTACATTTATGGTTAAAATAGATTATATTTGAATCTCTGCCTCAGGAAACGTGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
** * * * * * * * *
28860 AAAGTTATTCATTGGTAACAAAAGTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCATAATTA-TT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * *
28924 CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTA
131 -GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * *** * * * * *
28966 AATTTTTTTAAATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATATCTGTTTTAGAAAACATCATGCA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
29031 AAAGCCATCCATTGGCAA-ACAAAGTCCGTTTATAGTCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTATTACT
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGA-AAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * *
29095 TGCTTTAAA-AGGTTTTACAATCTAATAATTGATTTTAAGTTG
130 TGATTTAAATA-GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * ** * * *
29137 AATTTTTTTTACATTTATGGTTAAAATAGATTACATTTTAATCTCTGCCCCAAGAAACATGGAGA
1 AA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * ** * * * ** *
29202 AAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTAAATTTTTTAGCCACTCAAGGTTTCGAAAGTCTTATTAC
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCA-TTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * *
29267 -TCATTTTAGATGGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGCT-
129 TTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * * *
29309 AA-ATTTTCACATTTTTTAG-TAAAATAGATTATATTTAAATGTTTGCCTAAGGAAACATGAAGA
1 AATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * *** * *
29372 AAAAACTATTTATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATTTCTTTGAAAGCCTTATTACG
65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * * *
29437 TGCTTTAAATGGTTCTATAATCTCACAATTAATTTTAAGCTG
130 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * *
29479 AATTTTTTAAAATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAACCT-AA-AA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* ** * * * ** * *
29542 CAGAAGCCATCCGCTGGCAAAAAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAACCCTTATTGC
66 -A-AAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* *
29607 CT-ACTTTAAAT-G--GT-T--T-T-AT-ATTGATTTTAAGTTG
129 TTGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * *
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1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * ** * * * *
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* * ** * * * **
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*
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* ** * ** * *
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1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAA-CGTGAAGA
* * * * * * *
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* *
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* * ** * * * * * * *
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1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * ** * ** * * *
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* * * * * *
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131 GA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * *
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1 AA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGA
* * * * * * * *
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65 AAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * *
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130 TGA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * *
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1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
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* * * **********
30625 GGTTAAAATGGTTTTATAATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTTG
131 GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * **
30666 AATTTTTTTATATTGTTGGTTAAAATATATTGTAATTGAATGTCTGCCTCAGGAAATGTGAAGTG
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * * * * *
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66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* ** * *
30795 CACTTT-AAGCGATTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTG
131 GA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * * * *
30836 AATTTTTTTACATTTTTTCTTGAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCCTAAGAAACGTGAAGAA
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAGAA
* * * ** * * * * *
30901 AAAGCTATTCATTGGCAAG-AAAGTCCATTTACGGTCACACATGACTTGGAAAGCCTTAGTAC-T
66 AAAGCCATTCATTAGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * * * *
30964 CACTTGAAGTA-TTTTACAATCTCATAATTTATTTTAAGTTG
131 GA-TTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * * * * *
31005 AATTCTTTTATATTGTTT-GTTCAAATAGAATATAATTAAACGAT-TGCCTTAGGAAACATGAA-
1 AATTTTTTTACATT-TTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATG-TCTACCTTAGGAAACGTGAAG
* * ** * ** * * * *
31067 TAAAAGCCATTCATTCA-AAAGCTAAGTCCATTTATAGTCAGTCATGCTTTCGAAAGCATCATTA
64 AAAAAGCCATTCATT-AGCAAGAAAATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
*** * *
31131 CTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA
128 CTTGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* ********** * * * * * *
31175 AATATNNNNNNNNNNTTGGTTAAAATATATTATAATTTAAAGTCTA-CTTTGAGAAACGTGATGC
1 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACGTGAAGA
* * * * ** **
31239 AAAAGCC-CTCAATTGGTAAGAAAGGTT-TGTTTATAGTCACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTA
65 AAAAGCCATTC-ATTAGCAAGAAA-ATTCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* *
31302 CTTGCTTTAAA-AGGTTTTATAATCCCATAATT
128 CTTGATTTAAATA-GTTTTATAATCTCATAATT
31334 NNNNNNNNNN
Statistics
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GATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
Found at i:15532 original size:340 final size:338
Alignment explanation
Indices: 14830--19884 Score: 1586
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14820 AGTCACTTAA
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** * * ** * * * * *
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*
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*
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * **
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * *
16043 TGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAA-TTGAA-TTGTTTTACA-TTTTCAAT
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* * * * * * * ** * * * * *
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* ** ** *
16168 AAAAATCCATTTATATTCACTAAA
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* * * * * * * * **
16192 GCTTTTGAAAGCATTGTTAC-TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCGTAA-TAGATTTTAAGTTA
1 GCCTTCGAAAACCTTATTACTTGA-TTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTA-ATTTTAA--CC
* * * * * * * * *
16255 GATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAACAGATAATATTTGAACGTCTGCCTTAGGTAACGTGAAG-A
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* * * ** * * *
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127 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* ** * * *
16375 GCTTTAAATAGTTTCAAAATCTCATAATTGATTTT-AGATTGAA-TTTTTAGATATTTTTGGTTA
192 GCTTTAAATAGTTT-ATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TT-AAGTTTTTTTACACTTTTAGTTA
* * * * * * * * * * ** * *
16438 AAATATATTATAATTGAATGTTTGCTTCAGAAAATGTGGACCAAAAGCCA-TCTATTGGCAAGAA
254 AAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTC-ATTAGCAAG-A
* * ** *
16502 AAGTCTATTTATAGTCACTTAA
317 AAGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * * **
16524 GCCTTCGAAAGCCTTATTAC-TCACTTTAAATGGTTTAATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
1 GCCTTCGAAAACCTTATTACTTGA-TTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAA-CCGA
* * * * * * * * * * * *
16588 ATTGTTTACACTTTTGGTTAAAACAGATTAT-ATCTGAATGTCTACCTTGGGGAACATGAAGAAA
64 ATTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAAT-TGAATGTATGCTTTAGGAAACGTGAAGCAA
* * * * ** * ** * *
16652 AAACCAT-CATTGGCAATAAAAGT-TCATTTATAGCCACCCATGCCTACGAAA---TAAATTATT
128 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCT-TATTACT
* * * *
16712 CTCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTAAATTTTTTTACA-TTTTTGATTA
191 CGCTTTAAATAG-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAGTTTTTTTACACTTTTAG-TTA
* * * * * * ** * * * *
16776 AAATATATTATAATTGAATGTATCCCTCGGGAAACGTAAAGAAAAAGCCATTCATT-GACAAAAA
254 AAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTCATTAG-CAAGAA
*
16840 AGTCCATTTATAGCTACCCAT
318 AGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * ***
16861 GCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGATATAAAT-AGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAGTTGA
1 GCCTTCGAAAACCTTATTACTTGATTTAAATGA-TTTTATAATCTCATAATT-AATTTTAACCGA
* * * * *
16925 ATTGTTTTATATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACTTCTA-CAAACATGAAGCA
64 ATT-TTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCTT-TAGGAAACGTGAAGCA
* * * * * *
16989 ATAGCCATCCATT-ATCAAGAAAAATCCATTTATATTCACCAAAGCCTTTGAAAGCATTATTACT
127 AAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
** * * *
17053 CATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATAGATTTTAAGTTATA-TTTTTTCACATTTTTAGTTA
191 CGCTTTAAATAG-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AGTTTTTTTACACTTTTAGTTA
* * * ** * * * * * *
17117 AAACAGATAATATTTGACTGGCTACCTTGGAAAATGTG-AGGAAAAGCCAATCATCGAG-AGGAA
254 AAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTCAT-TAGCAAG-A
* * **
17180 AAG-CCAATCATCGAGAGGAAAAGCCATCAT
317 AAGTCC-AT--T-TATA-G-CCA-CC--CAT
***** ** * * * * * **
17210 CGAGAGAGGAAAAAGCCAAATCATCGTGA--GAAAAGCCCA-TTTATAGTTCATCCATGCCTTCA
1 -G-CCTTCG-AAAA-CCTTATTA-CTTGATTTAAATG---ATTTTATA-ATC-T-CAT-AATT--
* * ** * * * * * *
17272 AATCTTTATTACTTG--CTTTAAATAGTTTCATAATCTCATAA-TTGATTTTAAATTGAATTTTT
52 AAT-TTTA--AC-CGAATTTTTTATA-TTT-TTGAT-T-AAAACAT-ATTAT-AATTGAA--TGT
** * ** * * * ** * * *
17334 AGATATTTTTGGTTAAAATATATTATAATCAAATG-TTTGCTTTGGGA-AACGTGGAGCAAAATC
105 --ATGCTTTAGG----AA-A-CGT-GAAGCAAAAGCCATCCATT--GACAA----GA--AAAGTC
* ** * * ** * * ** * * *
17397 CATCCATTGGCAAAAAAAGTTCGTTT-ATAGCC--ACTTAAGC-CTTCAAA-AGCCTTATTA-CT
153 TATTTATAGTC-ACTAAAG--CCTTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATAG-TTTATAATCT
* * * *
17456 CACTTTAAATGGTTTAATAATCTCCTAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATAGTTTTGGTTAA
213 CA---T-AA----TTGAT--T-T--TAA--G---TTAA---G--TTTTTTTACACTTTTAGTTAA
* * * * * * * * * * *
17521 AACAGATTATATTTGAATGTCTACATTAGAGAATGAGAAGAAAAAGCCATTCTTTGGTAAGAAAA
255 AAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTCATTAGCAAG-AAA
* *
17586 GTTCATTTATAGCCACTCAT
319 GTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * * * **
17606 GCCCTCGAAAGCCGTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTAA
1 GCCTTCGAAAACCTTATTACT-TGATTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAC-CGA
* * * * * * * * *
17670 ATTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATACTATAATTGAATGTAT-ATCTCAAGAAACGTAAAGAAA
64 ATTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCT-TTAGGAAACGTGAAGCAA
* * * * * * *
17734 AAGCCATTCATTGAGAAG-AAAGTCCATTTATAGCCACTCATGCTTTTGAAAGCCTTATTAC-CT
128 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-
* * * *
17797 GATTTAAATATTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTATA-TTTTTGATTA
192 GCTTTAAATA-GTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAGTTTTTTTACACTTTTAG-TTA
* * * * *** * * * * * * * *
17860 AAACATATTATAATTGAATGTCTGGTTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGGTAAGAAA
254 AAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTCATTAGCAAG-AA
** ** *
17925 AGTCCATTTATATTCACTAAG
318 AGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * * * * **
17946 GCCATT-GAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTACAAT-TCATAATTGATTTTAAGTTAG
1 GCC-TTCGAAAACCTTATTACTTGATTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAA--CCG
* * * * * * * * * * * *
18009 ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATATTTGAATGTCTGCCTTAAGAAATGTG-A-CGA
63 AATTTTTTATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCTTTAGGAAACGTGAAGCAA
* * ** * * * ** * *
18072 AAGTCTATTCATCAAGAAGAGAAGT-TCATTTATAGTCTCCCATGCC-TTGAAAAGCCTTATTTC
128 AAG-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTAAAGCCTTTG-AAAGCCTTATTAC
* * * ** * *
18135 TTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TGTTTAGACATTTTTGGTT
190 TCGCTTTAAATAGTTT-ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAGTTTTTTTACACTTTTAGTT
* * * * * * * ** * * * * * *
18199 CAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGGTAACATAAAGTAAAAGT-GATCCATTGGCAAGA
253 AAAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAG-AAAAATCCATTCATTAGCAAG-
* ** *
18263 AAAGTCCATTTATAGTCATTCAA
316 AAAGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * * * **
18286 GACTT-TAAAAGCCTTATTAATCGCTTTAAATGATTTTACAATCTCATAATT-ATTGTTAAGTTG
1 GCCTTCGAAAA-CCTTATTACTTGATTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATT-TTAA-CCG
* * * * * * * * *
18349 AATTTTTTTTACACTTTTGGA-TAAAACAAATTATATTTGAATGTTTGCCTCA-AAGAACATGAA
63 AA--TTTTTTATA-TTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCTTTAGGA-AACGTGAA
* * * * * * ** *
18412 GAAAAAAG-CATTCTTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATGCCTTTGAAAGTCC-TAT
124 G-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAG-CCTTAT
** * * * * *
18475 TACTCAATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAAATTTAA-TTTTTTTATA-TTTTT
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* ** * * * ** * * * * * *
18538 GATTAAAACATTTTATAATTGAATGTTTA-CTTCGATAAACGTGGAGTAAAAGCCATCCATTGGA
250 G-TTAAAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGA-AAACGTGAAGAAAAATCCATTCATTAGC
* * *** *
18602 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCGTTCAA
313 AAG-AAAGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * * * * * * **
18629 ACTTTCGAAAGCCTTATTAC-TCACTTTAAATGGTTTAATAATATCGTAATTGATTTTAAGTTGA
1 GCCTTCGAAAACCTTATTACTTGA-TTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAA-CCGA
* * * * * * * *
18693 ATTTTTTACATTTTT-AGTTAAAACAAATGATATTTGAATGTCTGC-TTGGGAAACATGAAGAAA
64 ATTTTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCTTTAGGAAACGTGAAGCAA
* * * * * ** * *
18756 AAACCAT-TATTTAGTAAGAAAAGT-TCATTTATAGCCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
128 AAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* * *
18819 CTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-A---AA-TTTAATTT----TTTTA-TTA
191 CGCTTTAAATAG-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAGTTT-TTTTACACTTTTAGTTA
* * * * * * * * * *
18874 AAATATATTATAATTGAATGTATGCCT-TGAGAAACGT-AA-ACAAAAGCCATTCATTGGTAAGA
254 AAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGA-AAACGTGAAGA-AAAATCCATTCATTAGCAAGA
*
18936 AAGTCCATTTATAGCCACCTAT
317 AAGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * ***
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* * * *
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64 AT-TTTTTATATTTTTGATTAAAACA-TATTATAATTGAATGTATGCTTTAGGAAACGTGAAGCA
* * * * * * *
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127 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* * * *
19151 GCTTTAAATAGTTTTATAATCTGATACTAGATTTTAAGTT-AGATTTTTT-CACATGTTTAGTTA
192 GCTTTAAATAG-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAGTTTTTTTACAC-T-TTTAGTTA
* ** * * *
19214 AAACAGATAATATTTGAATGTCTGTCTTAGGAAA-GTGAAG-AAAAGCCATTCATTGAG-AAGAA
254 AAAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTCATT-AGCAAG-A
* * *
19276 AAGTCTATTTATAGTCACCCAC
317 AAGTCCATTTATAGCCACCCAT
* * * * * ** * * * **
19298 GCCTT-TAATAGCTT-TCGTATTTGCTTTAAATGGCTTCATAATCTCATAATTTATTTCAAATTG
1 GCCTTCGAAAACCTTAT--TACTTGATTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTT-TAACCG
* * * * * * * *
19361 AATTTTTAGATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTGATTGTCTGCTTTGGGAAATGTAAAGCA
63 AATTTTT-TATATTTTTGATTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCTTTAGGAAACGTGAAGCA
** * * * **
19426 AAAGTTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTAACCCTTCAAAAGCCTTATTACTC
127 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* * * * *
19491 ACTTTAATTGGTTTTATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTTGAA-TCTTTTTACACTTTTAGTTAA
192 GCTTTAAATAG-TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAGTTTTTTTACACTTTTAGTTAA
* * * * * * * * * *
19555 AACAGATTATATTTAAATGTCTGCCT-TGTGAAACGTGAAAAAAAAACCATTCTTTAGGAAGAAA
255 AAAAGATAATATTTGAATGTCTACCTAAG-AAAACGTGAAGAAAAATCCATTCATTAGCAAG-AA
*
19619 AGTTCATTTATAGCCACCCAT
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* * * * * * *
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1 GCCTTCGAAAACCTTATTACT-TGATTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAC-CGA
* * * * * *
19704 ATTCTTTTATAATTTT-AGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACGT-AAGGA
64 ATT-TTTTATATTTTTGA-TTAAAACATATTATAATTGAATGTATGCTTTAGGAAACGTGAA-GC
* * * * * *
19767 AAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAA-TCTATTTATAGCCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATTAC
126 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * *
19830 TTG-TGTTAAGTGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCTGAA-TTTTTTTACA
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19885 TTGTCAATTA
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TAAATAGTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAGTTTTTTTACACTTTTAGTTAAAAAAGA
TAATATTTGAATGTCTACCTAAGAAAACGTGAAGAAAAATCCATTCATTAGCAAGAAAGTCCATT
TATAGCCACCCAT
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*
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17247 CATTTATAGT
Statistics
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17267 CTTCAAATCT
* * * * * *
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* * * ** * ** * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * *
17619 GTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTAAATTTTTTACATTTT
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* * * * * * * * *
17684 TGGTTAAAATATACTATAATTGAATGTATATCTCAAGAAACGTAAAGAAAAAGCCATTCATTGAG
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* * * * **
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*
17812 ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTT-GATTAAAACATATTATAATTG
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* * * * ** *
17876 AATGTCTGGTTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATATTCA
258 AATGTCTGCTTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCA
*
17941 C-TAAGGCCATT-GAAAGCA
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* *
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* * * * * * ** * **
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* * * * * * * *
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128 GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATACCTTCG-AAAGCCTTATTACCTGATTTAAATGGTT
* * ** * * *
18150 TCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTAGACATTTTTGGTTCAAATATATTATAATT
192 TTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATAATT
* * * * * ** *
18215 GAATGTCTACTTCAGGTAACATAAAGTAAAAGTGATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
257 GAATGTCTGCTTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTC
* **
18280 A-TTCAAGACTTTAAAAGCC
321 ACTT-AAGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18299 TTATTAATCGCTTTAAATGATTTTACAATCTCATAATT-ATTGTTAAGTTGAATTTTTTTTACAC
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGTTGAA--TTTTTTACAT
* * * * * * * *
18363 TTTTGGATAAAACAAATTATATTTGAATGTTTGCCTCAA-AGAACATGAAGAAAAAAGCATTCTT
63 TTTTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTG-CTTAAGA-AACGTGAAGAAAAAACCATTCAT
* * *
18427 TGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATGCCTTTGAAAGTCC-TATTA-CTCAATTTAAATG
126 TGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATACCTTCGAAAG-CCTTATTACCT-GATTTAAATG
* * * * *
18490 GTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAAATTTAATTTTTTTATATTTTT-GATTAAAACATTTTAT
189 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAG-TTAAAACATATTAT
* * * * * *
18554 AATTGAATGTTTACTTC-GATAAACGTGGAGTAAAAGCCATCCATTGGA-AAGAAAAGTCTATTT
253 AATTGAATGTCTGCTTCAG-GAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATT-GACAA-AAAAGTCCATTT
* * *
18617 ATAGTC-GTTCAAACTTTCGAAAGCC
315 ATAGTCACTT-AAGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18642 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTAATAATATCGTAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTT
* * ** * * *
18707 TAGTTAAAACAAATGATATTTGAATGTCTGCTTGGGAAACATGAAGAAAAAACCATT-ATTTAGT
66 TAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTGCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCA-TTGGC
* * *
18771 AAGAAAAGTTCATTTATAGCCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCT-CTTTAAATGGTTTT
130 AAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATTAC-CTGATTTAAATGGTTTT
** *
18835 ATAATCTCATAATTGATTTT-A----AATTTAATT---TTTTTA-TTAAAATATATTATAATTGA
194 ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATAATTGA
* * * ** * *
18891 ATGTATGCCTTGA-GAAACGT-AA-ACAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAGTCCATTTATAGCCA
259 ATGTCTG-CTTCAGGAAACGTGAAGA-AAAAGCCATCCATTGACAAAAAAGTCCATTTATAGTCA
* *
18953 CCTATGCCGTT-GAAAGCC
322 CTTAAGCC-TTCGAAAGCC
* * * *
18971 TTATTACTTGATTTAAATGGTTTTATAATCTCACAATTGATTTTAAGTTAAATGTTTTTACATTT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTT
* * ** *
19036 TT-GATTAAAA-ATTATTATAATTGAATGTCTGCTTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCCATT
65 TTAG-TTAAAACA-TATTATATTTGAATGTCTGCTT-AAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATT
* ** * * * * * * *
19099 GGCAGGAAAAGTCCATTTATATTCA-CTAAAGCCTTTGAAAGCATTGTTA-CTCGCTTTAAATAG
127 GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACCT-GATTTAAATGG
* * * * * * *
19162 TTTTATAATCTGATACTAGATTTTAAGTT-AGATTTTTTCACATGTTTAGTTAAAACAGATAATA
190 TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATA
* * * *
19226 TTTGAATGTCTGTCTT-AGGAAA-GTGAAG-AAAAGCCATTCATTGAGAAGAAAAGTCTATTTAT
254 ATTGAATGTCTG-CTTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTAT
** * * *
19288 AGTCACCCACGCCTT-TAATAGCT
317 AGTCACTTAAGCCTTCGAA-AGCC
** * * * * * * * * *
19311 TTCGTATTTGCTTTAAATGGCTTCATAATCTCATAATTTATTTCAAATTGAATTTTTAGATATTT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT-TACATTT
* * * * ** * * * *** * *
19376 TTAATTAAAATATATTATAATTGATTGTCTGCTTTGGGAAATGTAAAGCAAAAGTTATCCATTGA
65 TTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTGC-TTAAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTGG
* * * ** * * *
19441 TAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTA-ACCCTTCAAAAGCCTTATTA-CTCACTTTAATTGGTT
129 CAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACCTGA-TTTAAATGGTT
* * * * *
19504 TTATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTTGAATCTTTTTACACTTTTAGTTAAAACAGATTATATTT
192 TTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATAATT
* * * * * * *
19569 AAATGTCTGCCTT--GTGAAACGTGAAAAAAAAACCATTCTTTAGGA-AGAAAAGTTCATTTATA
257 GAATGTCTG-CTTCAG-GAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATT--GACAAAAAAGTCCATTTATA
* **
19631 GCCACCCATA-CCTTCGAAAGCC
318 GTCACTTA-AGCCTTCGAAAGCC
* ** * * * *
19653 TTATTACTCTCTTTAAATAATTATATAATCTCATAATTGATTTTAACTTGAATTCTTTTATAATT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTACATTT
* * **
19718 TTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGAAAACGT-AAGGAAAAAGTCATTCATT
65 TTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTG-CTTAAG-AAACGTGAA-GAAAAAACCATTCATT
* * * * *
19781 GGCAAGAAAA-TCTATTTATAGCCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTACTTG-TGTTAAGTGAT
127 GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATTACCTGAT-TTAAATGGT
* * * *
19844 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCTGAATTTTTTTACATTGTCAATTAAAACATATTATAAT
191 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATAAT
* * * * * ** * *
19909 TGAATGT-TCGCTTCAAGAAGCATGAAGCAGAATTCATCCATTAGTA-AGAAAAGTCTATTTATA
256 TGAATGTCT-GCTTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATT-G-ACAAAAAAGTCCATTTATA
* * * * *
19972 TTCACTAAAACCTTTGAAAGCA
318 GTCACTTAAGCCTTCGAAAGCC
* * * * *
19994 TTATTAGTCGCGTTAAATCGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATGT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTT
* * * * * *
20059 TTGGTTAAACCAAATAATATTTGAATGCCTGCCTTAAGAAACGT---G--AATA--ATTCATTGA
65 TTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTG-CTTAAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTG-
* * * * * * *
20117 G-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCAACCATGCCTTCAAAATCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTT
128 GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATTACCTGATTTAAATGGTTT
* ** * * *
20181 CATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTAGACATTTTTGGTTAAAATATATTATCATTG
193 TATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATTATAATTG
* * * ** * * * *
20246 AACT-TCTGCTTCAGGTAATGTGAAGTAAAAGTGATCTATTGGCAACAAAAGTCTATTTACAGTC
258 AA-TGTCTGCTTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTC
* *
20310 ACTCAAGCTTTCGAAAGCC
321 ACTTAAGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * *
20329 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTCACAATTTCATAATTG-TTGTTAATTTAAATTTTTTTATATT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TTAAGTTGAA-TTTTTTACATT
* * * * * * ** * * *
20393 TTTAGTTAAAACAGATCATATTTGAATGTTTACTTCTAGGAGTGAGAAGAAAAAACTATTCTTTG
64 TTTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTGCTT-AAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTG
* * * * *
20458 GCAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCCACACCTTCGAAAGCTTTATTACTTGATTTAAATAGTTT
128 GCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATTACCTGATTTAAATGGTTT
********** ** * *
20523 TATAATCTCATAATTGATTTTANNNNNNNNNNTTTTGTA-TTTTCGATTAAAGCATATTATAATT
193 TATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAG-TTAAAACATATTATAATT
* * * * * * * * * *
20587 GAATGTTTTCTT-TGAGAAGCATGGAGCAAAAGCCATCTATTTG-CAAGGAAAGTCCGTTTATAG
257 GAATGTCTGCTTCAG-GAAACGTGAAGAAAAAGCCATCCA-TTGACAA-AAAAGTCCATTTATAG
*
20650 TCACTTAAGCATTCGAAAGCC
319 TCACTTAAGCCTTCGAAAGCC
* * *
20671 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTAATAATCTCGTAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTT
1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTT
* * ** * *
20736 GTAGTTAAAACAGATTATATTTGAATG-CTGCTTTGGGAACGTGAAGAAAAAACCATTCTTTGGC
65 TTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTGCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTGGC
* * * *
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* ** * *
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*
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* * ********** *
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* * * * * * * * * * * * * * *
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* * * *** * * * *
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* * * ** * * *
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* * * ** * * * *
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** *
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** * * * * ** *
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1 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTT
* * * * * * ** * * * *
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* * * ** ********* *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* ** * * * ** * * * * **
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** * *
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* *
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* * *
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* * *
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128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AATTTT
* ** * *** * * **
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* * * * * ** ** * * *
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* *
24811 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAAGTTTAATTTT
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* * * * * * ** * *
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* * * * * *
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*
24982 AATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTT
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* * * * * ** * ***
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* * * * * * * *
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64 CA---TT-CATT-G----GT-AAG-AAAAGTCTATTTA-TGTCACT-CAAG-CC-TTCGAAAGCC
** * * * * * * * *
25149 TTACCCAC--ACTTTCGAAA-GCATTATTACTCA-CT-TTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTG
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25209 ATT
168 -TT
* ** *
25212 TTAAGTTGCATTCTTTTTATTGTTGGTTAAAATGGATTATAATTGAATGCCTACCTTAGGAAATG
1 TT----T--A--C-----ATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAAATG
* * * * * * **
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*** * * * *
25341 TATTACTAATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAGGTTGAATTTT
115 TATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * * * *
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1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTT-AGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * ** * *
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65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
* *
25526 ATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TAGAATTTG
129 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTA-AATTTT
* * * * * * ** *
25567 TGTACATTTTTGGATAAAATAGATTATATTTGAATGTCTGCCTTAAGAAACATAAAGGAAAAAGC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAA-GAAAAAGC
* * * * * * *
25632 CA-TCTATTGGCATGAAAAGTCCATTTATAGTGACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTT
64 CATTC-ATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * *
25696 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGAGTTGAATGTT
127 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * * * *
25739 TTTACA-TTTTAGTTAAAACAAAATAT-ATTGAATGTTTGCCTTTGAAAACGTGAAGAAAAAGCT
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * * *
25802 ATTCCTTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCCCACA-CCTTTGAATGCTTTATTACTTACTTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* *
25866 AAATGGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * **** *
25908 TTTATATTGTTAGTTAAAATAGATCATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACACAAAGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * *
25973 ATTCATTAG-AGATAAAACTC-AGTTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAACATTATTA-TTCACT
65 ATTCATTGGTA-AGAAAAGTCTA-TTTA-TGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCT
* * * *
26035 TTAAATGGTTCTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGACTTTT
126 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * * * * *
26079 ATTACAGTTTTT-ATTAAAAAATACTATTATTGAATCTTTGCCTTAAGAACCT-TGAAGCAAAAG
1 TTTACA-TTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAA-ATGTGAAGAAAAAG
*** * * * * * * *
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* * *
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** * * * * * ** **
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* * *
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* ** * * * * * * *
26421 TTTACACTTTTACTTAAAATAGATTATGATTGAATGTCTGTCTTAGGAAACGTCAAGAAAGAGTC
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * **** *
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* * * *
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** ** * * * * * * * ***
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* *
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26929 GTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAACTGAATGTGTGCCTTGGGAAACATAAAGTGAAAGTC
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* * * * *
26994 ATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTCAAG-CTTCGAATGCCTTATTA-TTCGCTTT
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* *
27057 AAATGGTTTTATAATCTCATGATTGATTTGAAGTTAAA-TTT
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* * * * * * * ** *
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* * * *
27227 AAATGATTCTATAATCTCATAATTGACTTTAAG-TCAATTTT
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* ** * * ** *
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* * * * * **
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********** * *
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* * * * * * ** *
27439 TTTATATTTTT-ATTCAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-GGCAAAACATGAAGAAATAG
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGG--AAATGTGAAGAAAAAG
* * * * *
27502 CTATTTATCT-GCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAAC-CATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACCTA
63 CCATTCAT-TGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTC-ACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* ********** *
27564 CTTTAAATGCTTTTATAATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTTGAA-TTT
124 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * ** * * * * * * * * *
27609 TTTATATTTATCATTAAAACAGATTA-CATTGAAATCTCTTCCTTGGGAAACGTGAAGAGAAAGG
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTG-AATGTC-TACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * *
27673 CTTTTACTGGCAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCAC-CTATA-CCTTCGAAAGTCTTATTACTTGC
64 CATTCATTGGTAAGAAAAGTCT-ATTTAT-GTCACTC-A-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* *** * *
27735 TTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAACAAATTTCAAGTTGAATTTT
125 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * ** *
27780 TTCATATTGTTT-GTTAAACTAGATTATAATTGAATGTCTATCTAAGGAACA--TGAAGCCAGAG
1 TTTACATT-TTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAA-ATGTGAAGAAAAAG
* * * * * * * * **
27842 TCA-TCTGTTAG-AAGGAAAAGTCCCTATATA-GTTACTCATGCCTTCAAAAGCATTATTACTCA
63 CCATTC-ATTGGTAA-GAAAAGT--CTATTTATGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* * * ********** *
27904 TTTTAAATAGTTGTATAATCTCATANNNNNNNNNNAGTTGAATTTT
124 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * ** * *
27950 TTTATATTTTTGGTCAAATTATATTATAATTGAATGTCTGCTTTAGGAAACATGATGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC-TTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * **
28015 ATCCATTAGCAAGAAAAG-CTCATTTATAATCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTA-TAATCACTTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCT-ATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
********** *
28078 AAATGGTTTTATAATCTNNNNNNNNNNTTTAAGTTGAATTTT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
** * * * * * *
28120 TTTACATTTTTCTCATTAAAATAGATTATAGTTGAATTTCTACCTTAGTAAAATATAAAGAAAAA
1 TTTACA-TTTT-TGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAG-GAAATGTGAAGAAAAA
** * * * * * * **
28185 GTTATTCATTAGCAA-AAAAGTCCATTTATACTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCAC
62 GCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
********** * * *
28248 TTTANNNNNNNNNNTAATCTTATAATAGATTTTAAGTTGAATTTT
125 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
** ** * * * ** *
28293 TTTATGTTGTTT-GTTAAAATGGATTATAATTGAATATCAACCTTTGGAAACATGAAGTAAAAGC
1 TTTACATT-TTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * **
28357 CATCCATTGG-AAGAAAAAGTCCATTTATAGTCGCT-AATACCTTCGAAAGCATTATTACTCACT
64 CATTCATTGGTAAG-AAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAA-GCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * * *
28420 CTAAATGGCTTTATAATCTCATAACTGA-TTTAAGTTGAATATTC
126 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAT-TTT
* * * * * * * * *
28464 TTT-CATTTTTAGTTAAAATATATTATAACTAAATGTGTCCCTTGGGAAACGTGAAGCAAACGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * ***
28528 A-TCTATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACACAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCATTTT
65 ATTC-ATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
********** * *
28592 AAATGGTTTNNNNNNNNNNTAATAGATTTTAAGTTGAA-TTT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * ** * *
28633 TTTACAATTTTGGTTAAAA-AGATTATAATTGAATGCCTAACTTGGGAAGCGTAAAGAGAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * ** * *
28697 ATTCATTAGCAAGAAATGTCCATTTACAGTCAGTCACGCCCCCGAAAGACTTATTACTCGCTTTA
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTA-TGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
* *
28762 AATGGTTTTATAATCTC--AATTGATTTTAAGTTGAATGTT
129 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * **
28801 TTTACATTTATGGTTAAAATAGATTATATTTGAATCTCTGCCTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGTT
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * *
28866 ATTCATTGGTAACAAAAGTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCATAATTA-TTCGCTTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCTTT
*
28930 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * ** * ** * * *
28972 TTTAAATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATATCTGTTTTAGAAAACATCATGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * ** * *
29037 ATCCATTGGCAA-ACAAAGTCCGTTTATAGTCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTT
65 ATTCATTGGTAAGA-AAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * * *
29101 AAAAGGTTTTACAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTT
* * * * * * * ** * ** *
29144 TTTACATTTATGGTTAAAATAGATTACATTTTAATCTCTGCCCCAAGAAACATGGAGAAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * ** * * ** * ***
29209 ATCCATTGGCAAGAAAAGTAAATTTTTTAGCCACTCAAGGTTTCGAAAGTCTTATTACTCATTTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTA-TTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * *
29274 AGATGGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGCTAAA--TT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * * ** *
29314 TTCACATTTTTTAG-TAAAATAGATTATATTTAAATGTTTGCCTAAGGAAACATGAAGAAAAAAC
1 TTTACA-TTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * *** * *
29378 TATTTATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATTTCTTTGAAAGCCTTATTACGTGCTTT
64 CATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * * * *
29443 AAATGGTTCTATAATCTCACAATTAATTTTAAGCTGAATTTT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * **
29485 TTAAAATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAACCT-AA-AACAGAAG
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC-TTAGGAAATGTGAAGAA-A-AAG
* ** * * * * * * * *
29548 CCATCCGCTGGCAAAAAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAACCCTTATTGCCTACTT
63 CCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
*
29613 TAAATGG---T-T--T-T-AT-ATTGATTTTAAGTTGAATTTT
127 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * ** *
29647 TTTACATTTTTGGTTAATATAGATTATATTTAAATGTCTGCCTCAAGAAACATAAAG-AAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * *
29711 AATCATTGATAAGTAAAGCCTATTTATAGTGGC-CT-ATGCCTTCAAAAGCCTTACTACTTGCTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GT--CACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * *
29774 TAAATAGCTTTATAATTTCATAATTAATTTTAAGTCAAATTGTT
127 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TT
* * * * * * * *
29818 TTTATAGTTTTGGTTAAAATGTGTTATAA-TGAAATGTCGACTTCAAGAAATATGAAGCAAAAGC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTG-AATGTCTACTT-AGGAAATGTGAAGAAAAAGC
** ** * * * * **
29882 CACCCATTGACAAAAAAAAT-TCATTTATAATCACTCAAGCCTTCGAGAGCCTTATTACTCACTT
64 CATTCATTGGTAAGAAAAGTCT-ATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * *
29946 TAAAAGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATGTT
127 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
** * ** * *
29989 TTTACATTTTTAATTAAAAAAGGTTATAATTGAATGTCTACCTCA-GAAATTGTGAAG-AAACGC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAAA-TGTGAAGAAAAAGC
* * * * * * * * **
30052 CCTTCGTTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACACATGCC-TCTGAAAGTCTTATTACTCACTT
64 CATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTC-GAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * *
30116 TAAATAGTTTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTCT
127 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* ** * * * * ** *
30159 TTTATATTGGTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGGCTGCCTTAGAAAACATGAAGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
** * * * * * * * **
30224 ATTCATTGGTAAGCTAATTCCATTTATACTCATTCATGCCTTCGAAAGCATCATTACTCACTTTA
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* * * *
30289 AATGGTTTTATAATCTCATGATTAATTTTAGGTTTAATTTTT
129 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTAAATTTT
* * * * ** * *
30331 TTTATATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTGTCCCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCT
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * ** *
30396 ATCCATTAGTAGGAAAACTCTATTTATAATCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
* * *
30461 AATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAGTTTT
129 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * *
30502 TTTATATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTGAAGATAAAGTC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * *
30567 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTA-TTATAGTCACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGGTTAA
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
********** *
30631 AATGGTTTTATAATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTTGAATTTT
129 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * **
30672 TTTATATTGTTGGTTAAAATATATTGTAATTGAATGTCTGCCTCAGGAAATGTGAAGTGAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * **
30737 ATCCATTGGCAAGAAAAGTCCT-TTTATAGTGACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTT
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGT-CTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * *
30801 -AA-GCGATTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
128 AAATG-GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
** * * * * * * *
30842 TTTACATTTTTTCTTGAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCCTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCT
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTAGGAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * * ** *
30907 ATTCATTGGCAAG-AAAGTCCATTTACGGTCACACATGACTTGGAAAGCCTTAGTACTCACTTGA
65 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTA-TGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
* * * * * *
30971 AGT-ATTTTACAATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTCT
129 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
* * * * * * * ** *
31011 TTTATATTGTTT-GTTCAAATAGAATATAATTAAACGAT-TGCCTTAGGAAACATGAA-TAAAAG
1 TTTACATT-TTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATG-TCT-ACTTAGGAAATGTGAAGAAAAAG
*** ** * * * * * * **
31073 CCATTCATTCAAAAGCTAAGTCCATTTATAGTCAGTCATGCTTTCGAAAGCATCATTACTCCCTT
63 CCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* *
31138 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATATN
127 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
********* * * * * * *
31181 NNNNNNNNNTTGGTTAAAATATATTATAATTTAAAGTCTACTTTGAGAAACGTGATGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTAG-GAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * **
31246 -CTCAATTGGTAAGAAAGGTTTGTTTATAGTCACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTTGCTTT
65 ATTC-ATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* *
31310 AAAAGGTTTTATAATCCCATAATT
128 AAATGGTTTTATAATCTCATAATT
31334 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 6722, Mismatches: 1636, Indels: 683
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
161 52 0.01
162 60 0.01
163 6 0.00
164 2 0.00
165 2 0.00
166 3 0.00
167 22 0.00
168 250 0.04
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170 2337 0.35
171 2151 0.32
172 630 0.09
173 132 0.02
174 8 0.00
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176 40 0.01
178 1 0.00
180 6 0.00
181 14 0.00
182 16 0.00
183 17 0.00
184 15 0.00
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187 1 0.00
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189 17 0.00
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191 15 0.00
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198 1 0.00
200 38 0.01
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ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (169 bp):
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TTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAA
TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTT
Found at i:23151 original size:341 final size:342
Alignment explanation
Indices: 22464--31177 Score: 4036
Period size: 341 Copynumber: 25.5 Consensus size: 342
22454 ACATGAATTG
* * * *
22464 TTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTACTTTGAGAAACA--TGAAGCAAAAG
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTAC-TTCAGAAA-ATGTGAAGAAAAAG
* * * * * * * * * **
22527 CCATTTATTGGTTAGAAAAGTCCATTTGTACTCACCCACGCTTTCGAAAGCCTTATTACTCACTT
64 CCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * ** * * *
22592 TAAATTATTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGCTAAA-TTTTTTACATTTTCAGTTGAAATAT
128 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
* * ** * * * * * *
22656 ATTACAATTGACTATTTGCT-TTAGGACACATGAAGCAAAAGCCATCCACTGGTAAGAACAGTCC
193 ATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
* * * *
22720 ATTTATAGTCACTT-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTAATAATCTCATA
258 ATTTATAGTCA-TTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* *
22784 ATTAATTTTAAGTTGAATTAT
322 ATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * *
22805 TTTATATTTTTAGTTAAAACATATTATATTTGAATGTCTACCTT-AGGAAATGTTAAGAAAAAGC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * *
22869 CATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATGTTTAC-CTATGCCTTCGAAAGCCATACTACTTGCTT
65 CATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATG-TCACTC-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * *
22933 AAAATGATTTTATAATCTCAAAATTAATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATAC
128 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
* ** * *
22998 ATTATAATTGAATGGTTGAT-TCAAGAAATGTGAGGCAAAGGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
193 ATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
* * * * *
23062 ATTTACATTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTTCTTGCATTAAATAGTTTTGTAATCTCATAA
258 ATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* *
23127 TTGATTTTTATTTG-ATTTT
323 TTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * ** * *
23146 TTTATATTTTTAATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTATTTCAGAAAACATGAAGCAGAAGCC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * *
23211 A-TCTACTCA-AAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCTTTCGAAAGCCTTATTA-TTAGCT
66 ATTC-A-TTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCT
* * * * * ** *
23273 TTAAATGGTTTAATAATCTCTTAATTGATTTTAAGTT-AATTTTTTTATATTTTTTATTACAACA
127 TTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* ** * * * * * * *
23337 GATTATATTTGGTTGTTTG-TCTCGAGAAACATGAAGAAAAAACTATTCATTGGTAAGAAAAGTC
192 GATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTC
* * * * * * *
23401 CATTTATTGTCATCCATGCTTTCGAAAACCTTATTAC-T-CATGTTAAATAGTTTTATAAGCTCA
257 CATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCA--TTAAATGGTTTTATAATCTCA
* *
23464 TAATTAATTTAAAGTTGAATTTT
320 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * *
23487 TTTATATTTTTTA-TTAAAATATTTTACAATCGAATGTCTACTTCAGAAAATATGAAG-CAAA-C
1 TTTACA-TTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
*
23549 C-TATC-TCTAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCG-AAGCCTTATTACTCGCT
65 CAT-TCAT-TAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * ** *
23611 TTAAAT-AGTTTAATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTGTTTTGTATTTTTGGTTCAAAC
127 TTAAATGA-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* * * * ** * *
23675 AGATTATATTTGAAT-GTCTG-TCTCAAAAAACGTGAAGAAAAAATCATTCATAGATAAGAAAAG
191 AGATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG
* * * * * * *
23738 TCTATTTAT-GATCATCCATGCCTTCAAAAGCCTTACTACTTGCATTTAATGGTTTTATAATCTT
255 TCCATTTATAG-TCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTC
* *
23802 GTAATTGATTTTAAGTT-AAATTT
319 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * *
23825 TTTACATTCTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATTGAAAATTTGCCTT-GGGAAATGTGAAGTA
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAA-TG----TCT-ACTTCAGAAAATGTGAAG-A
* * * * * * *
23889 AAAA--CACTCTATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAATCAATCATGCCTTCAAAAGCCTTATTAC
59 AAAAGCCATTC-ATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * * * * *
23952 TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAGAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACGTTTTTGGTTA
122 TTGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTA
* * * * * * * *
24017 AAACATATTATAATTGAATGTTTGCTAT-GAGAAACATAAAACAAAAGTCATCCATTGGTAAGAA
187 AAACAGATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAA
* * * * *
24081 AAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC
252 AAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATC
*
24146 TCATAATTGATTTT-AGTTGAACTTT
317 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * *
24171 TTTACATTTGTGGCTAAAATATATTACAATTGAAT-TCTTACTTCAGGAAATGT-AAGGCAAAAG
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTC-TACTTCAGAAAATGTGAA-GAAAAAG
* * * * *
24234 CCA-TCTATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATTGCCATTGAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGCT
64 CCATTC-ATTAGTAAGAAAAGTCTATTTA-TGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * **
24298 TTAAATGGTTTTAT-GTCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAATTAAAACA
127 TTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* ** ** * * * * *
24362 GATAATGTTTGAAT-GTCTGCT-TTGAGAAACGTAAAG-AAATGGCCATTCATTGACAAGAAAAG
192 GATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAA-AGCCATCCATTGATAAGAAAAG
* * * * * *
24424 TCTATTTATAGCCACTCATA-CCTTCGAAAGTCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTC
255 TCCATTTATAGTCATTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTC
* *
24488 ATAATTGATTTTAAGTAGAATTGT
319 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* *
24512 TTTACATTTGTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTC-GAAAAATGTG-AGAAAAAGC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAG-AAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * * **
24575 CATCCACTAGCAAGAAATGTCCT-TTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTTTTACTCACTT
65 CATTCATTAGTAAGAAAAGT-CTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * * * ** *
24639 TAAATGGTTTTATAAACTCAGAATTGATTTTAAG-CAGAATTTTTTTATATTTTTTAATTAAAAT
128 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTA-AATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAAC
* * * ** **
24703 AGATTATAATTGAATAAG-TGCT-TCGAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTTATTGGCAAGAAAAG
191 AGATTATAATTGAAT-GGTTGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG
* * * ** ** ** * * **
24766 TTCATTTTTAGTTACCCGTGCCTTCGAGTGCCTTGTTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
255 TCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCA
* *
24831 TAATTGATTTCAAGTTTAATTTT
320 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * ** *
24854 TTTACATTGTTCGTTAAAATAAATTATAATAGAATG-CTTGC-TCAGGAAACATGAAGGAAAAGC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTC-TACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * *
24917 TATCCATTGGAGT--GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCCAAAGCATTATTACTCGCT
65 CATTCATT--AGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * * * *
24980 TTAATTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTTTTT-TATTGTTAGTTAAAA
127 TTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTT-AA-ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA
* * ** * * **
25044 TATATTATAATTGAAT-GTCTG-TCTTGAGAAATA-GATTA-TAATTACATG-TTTGCC-TTAGA
190 CAGATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGA--AGCAA--A-A-GCCAT-CCATT-G-
*
25103 AACGTGAAGAAAAAG-CCATTCATTGGCAATAAAAGTCCATTTATAGTTACCCACACTTTCGAAA
245 -A--T-AAG-AAAAGTCCA-T--TT----AT---AGT-CATTCA-AG-------C-C-TTCGAAA
* ** * * * *
25167 GCATTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGCATTCTT
284 GCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TT
* * ** * * * *
25227 TTT--ATTGTTGGTTAAAATGGATTATAATTGAATGCCTACCTT-AGGAAATGTGAAGCAATAGC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * ** ***
25289 CATCCATT-GGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTAAAAGCCTTATTACTAATTT
65 CATTCATTAGTA-AGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * * * *
25353 TAAAT-AGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAGGTTGAATTTTTTTATATTGTTGGTTAAAATA
128 TAAATGA-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * *
25417 GATTATAATAGAAT-GTCTGCT-TCAAGAAACGTTAAGCAAAAGCTATCCATTAGA-AAGAAAAA
192 GATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GATAAGAAAAG
* * * * * *
25479 TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATTATTAC-T-CACTATCATTGGTTTTATAATCT
255 TCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCA-T-TAAATGGTTTTATAATCT
* *
25542 CATAATTGATTTTAAGTAGAATTTG
318 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * *
25567 TGTACATTTTTGGATAAAATAGATTATATTTGAATGTCTGCCTTAAGAAACA--TAAAGGAAAAA
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTCAGAAA-ATGTGAA-GAAAAA
* * * * * * * *
25630 GCCA-TCTATTGGCATGAAAAGTCCATTTATAGTGACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGC
63 GCCATTC-ATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * * * * *
25694 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGAGTTGAATGTTTTTACA-TTTTAGTTAAAAC
126 TTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* * * ** * * *
25758 AAAATAT-ATTGAATGTTTGC-CT-TTGAAAACGTGAAGAAAAAGCTATTCC-TT-AGTAAGAAA
191 AGATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAG-AAACATGAAGCAAAAGCCA-TCCATTGA-TAAGAAA
*** * * * * * *
25818 AGTCCATTTATAGTCGCCCACA-CCTTTGAATGCTTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAACC
253 AGTCCATTTATAGTCATTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATC
25882 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
317 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * **** *
25908 TTTATATTGTTAGTTAAAATAGATCATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACACAAAGCAAAAGC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * * *
25972 CATTCATTAG-AGATAAAACTC-AGTTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAACATTATTA-TTCAC
65 CATTCATTAGTA-AGAAAAGTCTA-TTTA-TGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GC
* * * * * *
26034 TTTAAATGGTTCTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGACTTTTATTACAGTTTTT-ATTAAAA
126 TTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAA
* * * * ** * * * *** *
26098 AATACTATTATTGAATCTTTGC-CTTAAGAACCTTGAAGCAAAAGTGGTCCATT-AGCAAGAAAA
190 CAGATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-TAAGAAAA
* * * * *
26161 GTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAATCCTTATTACTGGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
254 GTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTC
* *
26226 ATAATTAATTTTATGTTGAATTTT
319 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
** * * * * * * * * ** **
26250 TGCACATTTTTGGTTACAATAGT-TTATATTTGAATGTTTGC-CCTGGAATACATGAAGAAAACC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATA-TATTATAATTGAATGTCTACTTC-AGAAAATGTGAAGAAAAAG
* * * ** * * *
26313 CCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCTTGACTTCGAAAGCCTTATTGCTTGCTC
64 CCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * * * ** *
26378 TAAATGGTTTTATAAAT-TTA-AATTTGATTTAAATTTAAATTTTTTTACACTTTTACTTAAAAT
128 TAAATGATTTTAT-AATCTCATAA-TTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* * * * * * * * * *
26441 AGATTATGATTGAAT-GTCTG-TCTTAGGAAACGTCAAG-AAAGAGTCATCTATTGCT-GGAAAC
191 AGATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAA-AGCCATCCATTGATAAGAAAA
** * * * * *
26502 GTCCATTTATAGTCACCCATA-CTTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTCTATAACCT
254 GTCCATTTATAGTCATTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCT
* * *
26566 TATAATGGTTTTTAAGTTGAATTTT
318 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * * **** *
26591 TTTACACTGTTGGTTGAGATAGATTATAATTGAAT-ACTTACCTT-AGGAAACACAAAGCAAAAG
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTC-TA-CTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAG
* * * * *
26654 CCATCCATT-GGAGAGAAAAGTCTAATTATAT-TCACTCATGCCTTCAAAAGCATTATTAC-TGC
64 CCATTCATTAGTA-AGAAAAGTCT-ATT-TATGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGC
* * ** * * * ** *
26716 TTTAAACGGTCCTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA--TTTTTAAATTTTTTATTAAAAT
126 TTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC
* ** * * ** * *
26779 ATATTATAATTG-ATTATCTAC-CTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATGGATTGACAAGATAAG
191 AGATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG
* ** * * * *** *
26842 TCCATTTATAATCGCTCATGTCGTT-GAAAGCAC-CATTACACACTTTAAATGG-TTTATAATCT
255 TCCATTTATAGTCATTCAAG-CCTTCGAAAGC-CTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCT
* * *
26904 TATAATTTATTTTAAGTTAAATTTT
318 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * ** * **
26929 GTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAACTGAATGTGTGCCTTGGGAAACA--TAAAGTGAAAG
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTCAGAAA-ATGTGAAGAAAAAG
* * * * * * *
26992 TCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTCAAG-CTTCGAATGCCTTATTA-TTCGCT
64 CCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTT-ATGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCT
* * * * * * *
27055 TTAAATGGTTTTATAATCTCATGATTGATTTGAAGTTAAA-TTTTTCACATTTTTAGTCAAAACA
127 TTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * * *
27119 AATTATATTTGAAT-GTCTGGCT-T-AGGAAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTCGCA-AAG-AA
192 GATTATAATTGAATGGT-T-GCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-G-ATAAGAAA
* * * * * * ** * *
27179 AGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGATAGCCTAATTACTCGGTTTAAATGATTCTATAATCT
253 AGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCT
* *
27244 CATAATTGACTTTAAG-TCAATTTT
318 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * ** * ** *
27268 TTTACATTTCTAATTAAAATATATTATGATTGAATGTCTACTTTGGGAAACATGAAGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * **
27333 ATCCATTCGCAAGAAAAGTCCT-TTTATAGTTA-TCCAAGCCTTTGAAAGTTTTATTACTTGCTT
66 ATTCATTAGTAAGAAAAGT-CTATTTAT-GTCACT-CAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* ********** * * * * * * *
27396 TAAATGGTTTTATANNNNNNNNNNTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTT-ATTCAAATAG
128 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
* * ** *
27460 ATTATAATTGAATGTTTGC-CTTGGC-A-AAACATGAAG-AAATAGCTATTTATCTG-CAAGAAA
193 ATTATAATTGAATGGTTGCTC-T--CAAGAAACATGAAGCAAA-AGCCATCCAT-TGATAAGAAA
* ** * * * *
27520 AGTCTATTTATAGTCAACCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACCTACTTTAAATGCTTTTATAATC
253 AGTCCATTTATAGTCATTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATC
**********
27584 TCNNNNNNNNNNTTAAGTTGAA-TTT
317 TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * * * * *
27609 TTTATATTTATCA-TTAAAACAGATTA-CATTGAAATCTCTTCCTT-GGGAAACGTGAAGAGAAA
1 TTTACATTT-TTAGTTAAAATATATTATAATTG-AATGTC-TACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAA
* * * * * * *
27671 GGCTTTTACTGGCAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCAC-CTATA-CCTTCGAAAGTCTTATTACTT
63 GCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCT-ATTTAT-GTCACTC-A-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT
* * ** * * * *
27733 GCTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAACAAATTTCAAGTTGAATTTTTTCATATTGTTT-GTT-A
124 GCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATT-TTTGGTTAA
* * * * * ** *
27796 AACTAGATTATAATTGAAT-G-T-CTATCTAAGGAACATGAAGCCAGAGTCATCTGTTAGA-AGG
188 AAC-AGATTATAATTGAATGGTTGCTCTC-AAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GATAAG
* * * * * * * * *
27857 AAAAGTCCCTATATAGTTACTCATGCCTTCAAAAGCATTATTAC-T-CATTTTAAATAGTTGTAT
250 AAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCA--TTAAATGGTTTTAT
**********
27920 AATCTCATANNNNNNNNNNAGTTGAATTTT
313 AATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * ** * *
27950 TTTATATTTTTGGTCAAATTATATTATAATTGAATGTCTGCTTTAGGAAACATGATGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * **
28015 ATCCATTAGCAAGAAAAG-CTCATTTATAATCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTA-TAATCACTTT
66 ATTCATTAGTAAGAAAAGTCT-ATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* ********** * ** *
28078 AAATGGTTTTATAATCTNNNNNNNNNNTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCTCATTAAAATA
129 AAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACA-TTTT-TGGTTAAAACA
* * * * * ** * *
28143 GATTATAGTTGAAT--TT-CTAC-CTTAGTAAAATATAAAGAAAAAGTTATTCATT-AGCAA-AA
192 GATTATAATTGAATGGTTGCT-CTC-AAG--AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-TAAGAA
* ** * ** * **********
28202 AAGTCCATTTATACTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTANNNNNNNNNNTAAT
252 AAGTCCATTTATAGTCATTCA-AGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAAT
* *
28266 CTTATAATAGATTTTAAGTTGAATTTT
316 CTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
** ** * * ** *
28293 TTTATGTTGTTT-GTTAAAATGGATTATAATTGAATATCAACCTTTGGAAACA--TGAAGTAAAA
1 TTTACATT-TTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTA-CTTCAGAAA-ATGTGAAGAAAAA
* * * * * * **
28355 GCCATCCATT-GGAAGAAAAAGTCCATTTATAGTCGCT-AATACCTTCGAAAGCATTATTACTCA
63 GCCATTCATTAGTAAG-AAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAA-GCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* ** * * * * *
28418 CTCTAAATGGCTTTATAATCTCATAACTGA-TTTAAGTTGAATATTCTTT-CATTTTTAGTTAAA
125 CTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAA
* * * * * *** * * *
28481 ATATATTATAACTAAAT-G-TGTCCCTTGGGAAACGTGAAGCAAACGCCATCTATTGATAAGAAA
189 ACAGATTATAATTGAATGGTTG-CTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAA
* ** * ******
28544 AGTCCATTGATAGTCACACAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC-T-CATTTTAAATGGTTTNNNNNN
253 AGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCA--TTAAATGGTTTTATAAT
**** *
28607 NNNNTAATAGATTTTAAGTTGAA-TTT
316 CTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * ** * *
28633 TTTACAATTTTGGTTAAAA-AGATTATAATTGAATGCCTAACTT-GGGAAGCGTAAAGAGAAAGC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * * ** * *
28696 CATTCATTAGCAAGAAATGTCCATTTACAGTCAGTCACGCCCCCGAAAGACTTATTACTCGCTTT
65 CATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTA-TGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * * * * *
28761 AAATGGTTTTATAATCTC--AATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTATGGTTAAAATAGA
129 AAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGA
* * * * * ** * * *
28824 TTATATTTGAAT-CTCTGC-CTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGTTATTCATTGGTAACAAAAGTCC
194 TTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
* ** * * * *
28887 ATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCATAATTA-TTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
258 ATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-GCATTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* *
28951 ATTAATTTTAAGTTAAATTTT
322 ATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * ** * ** * * *
28972 TTTAAATTTTT-GATTAAAATATATTATAATTGAATATCTGTTTTAGAAAACATCATGCAAAAGC
1 TTTACATTTTTAG-TTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * ** * *
29036 CATCCATTGGCAA-ACAAAGTCCGTTTATAGTCACTCAAACCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTT
65 CATTCATTAGTAAGA-AAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * * * * *
29100 TAAAAGGTTTTACAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTACATTTATGGTTAAAATA
128 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTT-AAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * * * * **
29165 GATTACATTTTAAT-CTCTGC-CCCAAGAAACATGGAGAAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGT
192 GATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGT
** * * * ** * * *
29228 AAATTTTTTAGCCACTCAAGGTTTCGAAAGTCTTATTAC-T-CATTTTAGATGGTTTTATAAACT
256 CCA-TTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCA--TTAAATGGTTTTATAATCT
* *
29291 CATAATTGATTTTAAGCT-AA-ATT
318 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * * * ** *
29314 TTCACATTTTTTAG-TAAAATAGATTATATTTAAATGTTTGCCTAAGGAAACATGAAGAAAAAAC
1 TTTACA-TTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGC
* * * * * *** * *
29378 TATTTATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATTTCTTTGAAAGCCTTATTACGTGCTTT
65 CATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * * * * * * * * *
29443 AAATGGTTCTATAATCTCACAATTAATTTTAAGCTGAATTTTTTAAAATTTTTGATTAAAATATA
129 AAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGA
*** * * * * ** ** *
29508 TTATAATTGAAT-GTCTGCT-TTGGGAAACCTAAAACAGAAGCCATCCGCTGGCAAAAAAAGTCC
194 TTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
* * * * *
29571 ATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAACCCTTATTGCCTACTTTAAATGG---T-T--T-T-AT-A
258 ATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
29627 TTGATTTTAAGTTGAATTTT
323 TTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * *
29647 TTTACATTTTTGGTTAATATAGATTATATTTAAATGTCTGCCTCAAGAAACA--TAAAG-AAAAG
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTC-AGAAA-ATGTGAAGAAAAAG
* * * * * *
29709 CCAATCATT-GATAAGTAAAGCCTATTTATAGTGGC-CT-ATGCCTTCAAAAGCCTTACTACTTG
64 CCATTCATTAG-TAAGAAAAGTCTATTTAT-GT--CACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* * * * *
29771 CTTTAAAT-AGCTTTATAATTTCATAATTAATTTTAAGTCAAATTGTTTTTATAGTTTTGGTTAA
125 CTTTAAATGA-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATT-TTTTTACATTTTTGGTTAA
* * * * * * *
29835 AA-TGTGTTATAA-TGAAAT-GTCGACT-TCAAGAAATATGAAGCAAAAGCCACCCATTGACAAA
188 AACAG-ATTATAATTG-AATGGTTG-CTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAG
* * * * * ** * *
29896 AAAAATTCATTTATAATCACTCAAGCCTTCGAGAGCCTTATTACTCACTTTAAAAGGTTTTATAA
250 AAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAA
*
29961 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATGTT
315 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * ** * * *
29989 TTTACATTTTTAATTAAAAAAGGTTATAATTGAATGTCTACCTCAGAAATTGTGAAG-AAACGCC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * **
30053 CTTCGTTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACACATGCC-TCTGAAAGTCTTATTACTCACTTT
66 ATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTC-GAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * * * * ** *
30117 AAAT-AGTTTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTTATATTGGTGGTTAAAATAG
129 AAATGA-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
* * * * ** *
30181 ATTATAATTGAATGGCTGC-CT-TAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGGTAAGCTAATTC
193 ATTATAATTGAATGGTTGCTCTCAAG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTC
* * * * ** * *
30244 CATTTATACTCATTCATGCCTTCGAAAGCATCATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATG
257 CATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * *
30309 ATTAATTTTAGGTTTAATTTTT
322 ATTGATTTTAAGTTGAA-TTTT
* * * * * *
30331 TTTATATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATGTGTCCCTTAAGAAACA--TGAAGCAAAAG
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCT-ACTTCAGAAA-ATGTGAAGAAAAAG
* * * * * **
30394 CTATCCATTAGTAGGAAAACTCTATTTATAATCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTT
64 CCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTT
* * * * * * * *
30459 TTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAGTTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAT
128 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAG
* * * * *
30524 ATTATAATTGAAT-GTCTAC-CTCAAGAAACGTGAAG-ATAAAGTCATTCATTGGTAAGAAAAGT
193 ATTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGT
* ** * * * *
30586 CTA-TTATAGTCACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCG-GTTAAAATGGTTTTATAATCTCN
256 CCATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCATT-AAATGGTTTTATAATCTCA
*********
30649 NNNNNNNNNTTAAGTTGAATTTT
320 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * **
30672 TTTATATTGTTGGTTAAAATATATTGTAATTGAATGTCTGCCTCAGGAAATGTGAAGTGAAAGCC
1 TTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACTTCAGAAAATGTGAAGAAAAAGCC
* * * * * **
30737 ATCCATTGGCAAGAAAAGTCCT-TTTATAGTGACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTT
66 ATTCATTAGTAAGAAAAGT-CTATTTAT-GTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
** * * * ** *
30801 AAGCGA-TTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTCTTGAAACAGA
129 AAATGATTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGA
* * * * * * **
30865 TTATAATTGAAT-GTCTACCCT-AAGAAACGTGAAGAAAAAGCTATTCATTGGCAAG-AAAGTCC
194 TTATAATTGAATGGT-TGCTCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
** ** * * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * ** *
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* *
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* * * * * * ***
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* * * * *
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* * * ** * *
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321 AATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATA-TTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCC
* * * * * * *
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* * * * *
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447 TTCGAAAGCCTTATTACTCACT-TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT
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511 TT
* ** ** * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * ** * * ** *
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193 GATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCC
* * *
23741 ATTTAT-GATCA-TCCATGCCTTCAAAAGCCTTACTACTTGCA-TTT-AATGGTTTTATAATCTT
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * ** * *
23930 ATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAGAATTGATTTTAAGTTG
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* * * * * *
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128 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATA
* * * * * *
24192 TATTACAATTGAAT-TCTTA-CTTCAGGAA-ATGTAAGGCAAAAGCCATCTATTGGTAAGAAAAG
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320 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCC
* * * * * * *
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* ** * * *
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447 TTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT
24511 T
512 T
* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** **
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*** * * * ** *
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* * * * ** * **
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* * * * * * * *
24834 TTGATTTCAAGTTTAATTTTTTTACATTGTTCGTTAAAATAAATTATAATAGAATG-CTTG-CTC
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* * * * *
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* * * *
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** * * * *
25025 TTTTTATTGTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGTCTTGAGAAATAGATTATAATTACA
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* * *
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51 -------C------A--TGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
** * * * * *
25155 ACACTTTCGAAAGCATTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTG
101 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * * **
25220 CATTCTTTT-TATTGTTGGTTAAAATGGATTATAATTGAATGCCTACCTTAGGAAATGTGAAGCA
166 AATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCA
* * **
25284 ATAGCCATCCATTGG-AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTAAAAGCCTTATTACT
231 AAAGCCATCCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT
* * * * * * *
25348 AATTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTCAGGTTGAATTTTTTTATATTGTTGGTTAA
295 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAA
* * * * * * * *
25413 AATAGATTATAATAGAATGTCTG-CTTCAAGAAACGTTAAGCAAAAGCTATCCATTAGAAAGAAA
360 AATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGGAAACATGAAG-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA
* * * * * * *
25477 AATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATTATTACTCACTATCATTGGTTTTATAATCT
423 AGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT
* *
25542 CATAATTGATTTTAAGTAGAATTTG
488 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * *
25567 TGTACATTTTTGGATAAAATAGATTATATTTGAATGTCTGCCTTA-AGAAACATAAAGGAAAAAG
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGA-AAACATGAA-GAAAAAG
* * * * *
25631 CCA-TCTATTGGCATGAAAAGTCCATTTATAGTGACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCT
64 CCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCT
* * * * *
25695 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGAGTTGAATGTTTTTACA-TTTTAGTTAAAACA
128 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATA
* * * * * * * * * *
25759 AAATAT-ATTGAATGTTTGCCTT-TGAAAACGTGAAGAAAAAGCTATTCC-TTAGTAAGAAAAGT
193 GATTATAATTGAATGTCTACCTTAAG-AAACATGAAGCAAAAGCCA-TCCATTGGCAAGAAAAGT
* * ** * * * * *
25821 CCATTTATAGTCGCCCACACCTTTGAATGCTTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAACCTCAT
256 CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
* * *
25886 AATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTGTTAGTTAAAATAGATCATAATTGAATGTCTACCT
321 AATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCT
** * * * * *
25951 TAGGAAACACAAAGCAAAAGCCATTCATTAG-AGATAAAACT-CAGTTTATTGTCACTCATGCCT
386 TAGGAAACATGAAG-AAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCAAGCCT
* * * * * * *
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448 TCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * * * * *
26079 ATTACAGTTTTT-ATTAAAAAATACTATTATTGAATCTTTGCCTTA-AGAACCTTGAAGCAAAAG
1 TTTACA-TTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAG
*** * * * * * *
26142 TGGTCCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAATCCTTATTACTGGCTT
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* * ** * *
26207 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTATGTTGAATTTTTGCACATTTTTGGTTACAATAG
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* * * * * * * * *
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* * * * ** * *
26335 CATTTATAGTCACCCTTGACTTCGAAAGCCTTATTGCTTGCTCTAAATGGTTTTATAAAT-TTA-
257 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAT-AATCTCAT
* * * * * * * *
26398 AATTTGATTTAAATTTAAATTTTTTTACACTTTTACTTAAAATAGATTATGATTGAATGTCTGTC
321 AA-TTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCC
* * * ** * * *
26463 TTAGGAAACGTCAAGAAAGAGTCA-TCTATT-GCTGGAAACGTCCATTTATAGTCACCCATA-CT
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** * * * * * *
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447 TTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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451 AAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * * * *
27098 TTCACATTTTTAGTCAAAACAAATTATATTTGAATGTCTGGCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGTC
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* * * * *
27163 ATTCATTCGCAA-AGAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGATAGCCTAATTACTCGGTTT
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* * * * * * ** *
27227 AAATGATTCTATAATCTCATAATTGACTTTAAG-TCAATTTTTTTACATTTCTAATTAAAATATA
130 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGA
* * ** * *
27291 TTATGATTGAATGTCTACTTTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTCGCAAGAAAAGTCCTT
195 TTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCAT
* * * ** ** **********
27356 TTATAGTTA-TCCAAGCCTTTGAAAGTTTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATANNNNNNNNNN
260 TTATAGTCACT-CATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *
27420 TGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTA-TTCAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-G
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* * *
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* **********
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512 T
* * ** * * * * * * * * *
27609 TTTATATTTATCATTAAAACAGATTA-CATTGAAATCTCTTCCTTGGGAAACGTGAAGAGAAAGG
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* *** * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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********** * * * * *
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450 GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
** * * * * *
28120 TTTACATTTTTCTCATTAAAATAGATTATAGTTGAATTTCTACCTTAGTAAAATATAAAGAAAAA
1 TTTACA-TTTT-TGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAG-AAAACATGAAGAAAAA
** * * * * * *
28185 GTTATTCATTAGCAA-AAAAGTCCATTTATACTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCACT
63 GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCT
********** * * *
28249 TTANNNNNNNNNNTAATCTTATAATAGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATGTTGTTT-GTTAAAAT
128 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATT-TTTGGTTAAAAT
* * * ** *
28313 GGATTATAATTGAATATCAACCTTTGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGG-AAGAAAAAGT
192 AGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAG-AAAAGT
* * * * * *
28377 CCATTTATAGTCGCTAATACCTTCGAAAGCATTATTACTCACTCTAAATGGCTTTATAATCTCAT
256 CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
* * * * * * * *
28442 AACTGA-TTTAAGTTGAATATTCTTT-CATTTTTAGTTAAAATATATTATAACTAAATGTGTCCC
321 AATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCC
* * * ** * *
28505 TTGGGAAACGTGAAGCAAACGCCA-TCTATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACACAAGCCT
385 TTAGGAAACATGAAG-AAAAGCCATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT
* * ********** *
28569 TTGAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTNNNNNNNNNNTAATAGATTTTAAGTTGAA-TTT
448 TCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * ** * * * * * *
28633 TTTACAATTTTGGTTAAAA-AGATTATAATTGAATGCCTAACTTGGGAAGCGTAAAGAGAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
* * * * * ** *
28697 ATTCATTAGCAAGAAATGTCCATTTACAGTCAGTCACGCCCCCGAAAGACTTATTACTCGCTTTA
66 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * *
28762 AATGGTTTTATAATCTC--AATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTATGGTTAAAATAGAT
131 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGAT
* * * * * * * ** * * *
28825 TATATTTGAATCTCTGCCTCAGGAAACGTGAAGAAAAAGTTATTCATTGGTAACAAAAGTCCATT
196 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
* * * * * * *
28890 TATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCATAATTATTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTA
261 TATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * ** *
28955 ATTTTAAGTTAAATTTTTTTAAATTTTT-GATTAAAATATATTATAATTGAATATCTGTTTTAGA
326 ATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAG-TTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGG
* * * * * *
29019 AAACATCATGCAAAAGCCATCCATTGGCAA-ACAAAGTCCGTTTATAGTCACTCAAACCTTCAAA
390 AAACATGAAG-AAAAGCCATTCATTGGCAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAA
** * * *
29083 AGCCTTATTACTTGCTTTAAAAGGTTTTACAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
453 AGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTT
* * * * * ** *
29144 TTTACATTTATGGTTAAAATAGATTACATTTTAATCTCTGCCCCA-AGAAACATGGAGAAAAAGC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGC
* ** * * * ** * **
29208 CATCCATTGGCAAGAAAAGTAAATTTTTTAGCCACTCAAGGTTTCGAAAGTCTTATTACTCATTT
65 CATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * * * *** *
29273 TAGATGGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGCTAAATTTTCACAT-TTTTTAG-TAAAATAG
129 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAG
* * * * * * * **
29336 ATTATATTTAAATGTTTGCC-TAAGGAAACATGAAGAAAAAACTATTTATTGGCAAGAAAAGTCC
194 ATTATAATTGAATGTCTACCTTAA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCC
** * * * *
29400 ATTTATAGTCACTCATTTCTTTGAAAGCCTTATTACGT-GCTTTAAATGGTTCTATAATCTCACA
258 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC-TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * * * *
29464 ATTAATTTTAAGCTGAATTTTTTAAAATTTTT-GATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCTT
322 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAG-TTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCT
* * * * ** * *
29528 TGGGAAACCT-AAAACAGAAGCCATCCGCTGGCAAAAAAAGTCCATTTATAGTCATTCAAGCCTT
386 TAGGAAACATGAAGA-A-AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* *
29592 CGAAACCCTTATTGC-CTACTTTAAATGG---T-T--T-T-AT-ATTGATTTTAAGTTGAATTTT
449 CGAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * *
29647 TTTACATTTTTGGTTAATATAGATTATATTTAAATGTCTGCCTCA-AGAAACATAAAG-AAAAGC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGC
* ** * * * *
29710 CAATCATTGATAAGTAAAG-CCTATTTATAGTGGC-CT-ATGCCTTCAAAAGCCTTACTACTTGC
65 CATTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGT--CACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGC
* * * * ** *
29772 TTTAAATAGCTTTATAATTTCATAATTAATTTTAAGTCAAATTGTTTTTATAGTTTTGGTTAAAA
127 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTATATTTTTGGTTAAAA
* * * * * *
29837 T-GTGTTATAA-TGAAATGTCGA-CTTCAAGAAATATGAAGCAAAAGCCACCCATTGACAAAAAA
191 TAG-ATTATAATTG-AATGTCTACCTT-AAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAA
* * * * * *
29899 AATTCATTTATAATCACTCAAGCCTTCGAGAGCCTTATTACTCACTTTAAAAGGTTTTATAATCT
253 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * * * * *
29964 CATAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTTTAATTAAAAAAGGTTATAATTGAATGTCTA
318 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTG
* ** * * * * * *
30029 CCTCA-GAAATTGTGAAGAAACGCCCTTCGTTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACACATGCC
383 CCTTAGGAAA-CATGAAGAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCC
* * *
30093 -TCTGAAAGTCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT
447 TTC-GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT
*
30157 CT
511 TT
* ** * *
30159 TTTATATTGGTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGGCTGCCTTAGAAAACATGAAGCAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
* ** * * * * * *
30224 ATTCATTGGTAAGCTAATTCCATTTATACTCATTCATGCCTTCGAAAGCATCATTACTCACTTTA
66 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * * * *
30289 AATGGTTTTATAATCTCATGATTAATTTTAGGTTTAATTTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATA
131 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGA
* * * * * * * *
30354 TTATAATTGAATGTGTCCCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTAGTAGGAAAACTCTAT
195 TTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCAT
* * *
30419 TTATAATCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATT
260 TTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * *
30484 AATTTTAAGTTGAGTTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTACCTCAAG
325 GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGG
* * * * * *
30549 AAACGTGAAGATAAAGTCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTA-TTATAGTCACCCAAGCCTTTGAAA
390 AAACATGAAGA-AAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAA
** * **********
30613 GCCTTATTACTCGGTTAAAATGGTTTTATAATCTCNNNNNNNNNNTTAAGTTGAATTTT
454 GCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * ** **
30672 TTTATATTGTTGGTTAAAATATATTGTAATTGAATGTCTGCCTCAGGAAATGTGAAGTGAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
* * * * * *
30737 ATCCATTGGCAAGAAAAGTCCTTTTATAGTGACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTT-
66 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * * ** * *
30801 AA-GCGATTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTCTTGAAACAGA
131 AATG-GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGA
* * * * *
30865 TTATAATTGAATGTCTACCCTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCTATTCATTGGCAAG-AAAGTCCAT
195 TTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCAT
** * * * * * * * *
30929 TTACGGTCACACATGACTTGGAAAGCCTTAGTACTCACTTGAAGT-ATTTTACAATCTCATAATT
260 TTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * *
30993 TATTTTAAGTTGAATTCTTTTATATTGTTT-GTTCAAATAGAATATAATTAAACGAT-TGCCTTA
325 GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATT-TTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATG-TCTGCCTTA
* *** ** * * *
31056 GGAAACATGAATAAAAGCCATTCATTCAAAAGCTAAGTCCATTTATAGTCAGTCATGCTTTCGAA
388 GGAAACATGAAGAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAA
* * * * * *
31121 AGCATCATTACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATATN
453 AGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
********* * * * * * * * *
31181 NNNNNNNNNTTGGTTAAAATATATTATAATTTAAAGTCT-ACTTTGAGAAACGTGATGCAAAAGC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAGC
* * * *** * * ** *
31245 C-CTCAATTGGTAAGAAAGGTTTGTTTATAGTCACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTTGCTT
65 CATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * **************************************
31309 TAAAAGGTTTTATAATCCCATAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
129 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATT--GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAAT
******************** * * ** * * ** *
31374 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACTCAAG---CCT-TTG--AAAGCC-T-TATT-ACTCGTTTTAA
192 AGATTATAATTGAATGTCTAC-CTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAG---AAA
* * * ** * * ** ** * *
31430 A-T-GATTT-TA-TAATCTTAT-AATT-G-AA--TTTAGGTTGAAT-GTTTTTTAT-ATTTT-TG
253 AGTCCATTTATAGTCA-CTCATGCCTTCGAAAGCCTTA--TT-ACTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * ** *** * * ** *
31483 GT-T-AAAATGGATTAGAA-TTGAA----TGCCTA-TCTTAG-GAAACAT-GA--AGTAAAAGCC
314 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAA-ATAGATTA-TAATTG-A
* * * *** * ** ** ** **
31536 AT-CCAT---TGGAGAGAAA-AGTCTATTTATATTCAGACA-TACCATTAAAAG--CA-TTATTA
376 ATGTC-TGCCT-TAG-GAAACA-T-GAAGAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA-TA
* * * ** * * * * * * ** * * * **
31592 CTTACTTTAAATGATTTTGTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAT-TTTTTGTTAT-TTTTAA
435 GTCAC--TCAA-GCCTTCGAAAGC-C-TTATT-A-CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
*** * *
31655 TT-AAAATATATTTATAATTTT
493 TTGATTTTA-AGTT-GAATTTT
* * * ** * * ** * * * * * *
31676 ATT---TGTTTGCTT-TGAGAGA-CATAAGCAAGGAGGTTATTCATT-G---GC---AA-AAAAA
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAA--TTGAATG-TCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAA
* ** * *** * * * * * * ** **
31728 GTCC-TTTAGAGTC-ACTCAAG-CC-TTCCATAACCTTATTACTTG-TTTTAAATAGGTTTA-TA
63 G-CCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT-TAT-A-GTCACT-CATGCCTTCGAA-AGCCTTATTA
* * * * * * * ** * * *** * *
31787 ATCTC-ATAATTGATTTTA-AAT-T-AGATTTTTTTTTACAATTTG-A-GTTAAAACA-TATT--
122 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT--AAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGG
** ** * * *
31843 -----AT--A--AT-A--GAATGTCTACCTCGAGAAATGTGAAG-ATGAAGCCATTCATTGACAA
185 TTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGGCAA
* * * * * * *
31895 AAAAAGTCCATTCATAGTCAC-CTATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCATTAAATGGTTTAAT
249 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAT
* * *
31959 AATCTCACAATTGATTTTAAGGTG-ATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGATTATAATTGAAT
313 AATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAAT
* * * **
32023 GTTTGCCTTAGGAAATC-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACT
378 GTCTGCCTTAGGAAA-CATGAAG-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * ** * * * * *
32087 TATA-CCTTCAAAAGCAC-TATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAAACTTATAATTAATATTAAG
441 CA-AGCCTTCGAAAGC-CTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG
*
32150 TTAAATTTT
504 TTGAATTTT
* ** * * * * * * * * * *
32159 TTTATATTTTTCATTAAAACATATAATATTTGAATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGAAATATCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
* * * * * * * * *
32224 ATACAATGGTATGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
66 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * *
32289 GATGG-TTTATAATATCATAATTGATTTTAAGTT-AGATTTTTTTATATTATTGGTTAAAATAGA
131 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGA
* * * * *** *
32352 TTATATTTAAATGTTTGCCTCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCAATTGGCAAGAAAAGTCCAT
195 TTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCAT
* * * * * *
32417 TTATACTCATTCAAGCCTTCGAAA-CCTTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAA
260 TTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC-TTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * **
32481 TGATTTTAAGATGAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGAATATAATTGAATGTCTATCTT-G
324 TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAG
* * * * *
32545 AGAAACATGAAAAAAAGCCATTCGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACCCATA-CCTTCAA
389 -GAAACATGAAGAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGA
*** *
32609 AAATGTTATTACTCACTTCAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
452 AAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* ** * * * * * *
32670 TTATAC--TGTTCATTAAAATAGATAATAATTGAATATCTGTCTCAGAAAACGTGAAGTAAAAGC
1 TT-TACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGC
* * * * * ** *
32733 CA-TCTATTGG-AGGAAAAAAATCCAGTTATAGTCACTCATGCTTTCAAAAGTATTATTACTCAC
65 CATTC-ATTGGCA--AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGC
* * *
32796 TTTAAATGGTTTTATAA-CGTCATAATT-ATTTTTGAGTTGAA-TTTTTTATATTGTTAGTTAAA
127 TTTAAATGGTTTTATAATC-TCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAA
* * * * * * * * * *
32858 ACAGATTATAATTGAGTGTGTAACTCAAGAAACATGATGCAAAATCTACCCATTGG-AGTGAAAA
190 ATAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCA-AGAAAA
* * * * * * * *
32922 GTACATTCATTGTCACTCATACCTTCCAAAGCCTTATTACTCAGTTTAAATGGTTTTATAATTTT
254 GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTC
* * * * * * *
32987 ATAATTGATTTTAAGTCGAATATGTTTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATATCTGC
319 ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGC
* * * * * * * * * * *
33052 CTTAGAAAATATGAAAAAAAAGTCATCCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTCATGCTT
384 CTTAGGAAACATG-AAGAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT
* * * * * * *
33117 TCTAAAGCCCTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATTATTAATTTTAAGTTGATTTTT
448 TCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * * * * * ** * * *
33182 TTTATATTTTTGATTAAAAAAAATTATATTTGAATCTCTATCTCAGGAAACATGGAGAAAAAGCC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
* * * * *
33247 ATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTCTA
66 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * ** *
33312 AATGGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATACTACTAGTTAAAATAGAT
131 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGAT
* * * * ** *
33376 TATAATTGAATGTCTGCCTTAAGAAATATGAAGCAAAAACTATCCATT-AAAGAGAAAACTCCAT
196 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCA-AGAAAAGTCCAT
* ** ** * ** * * * *
33440 TCATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGTATTAGTACTCTGTTTGAATGGTTATGTAATGTCATAATT
260 TTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * * * * *
33505 GATTTTAAGTTAAATTTTTTTAAATTTAT-GACTAAAACAAATTATAATTCAATATCTACCTTAG
325 GATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAG-TTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAG
* ** * * *
33569 GAAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCCAC-CATGCCTTCAA
389 GAAACATGAAG-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGT-CACTCAAGCCTTCGA
* ** * * *
33633 AAGCATTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATATTTAATTTTAAGTTGAATTTG
452 AAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
** * * * * *
33694 TTTGTATTTATT-GTTAAAACAGATTATATTTAAATGTTTACCTT-GAGAAACATGAAGAAAAAG
1 TTTACATTT-TTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGA-AAACATGAAGAAAAAG
* * * * *
33757 CCATTCAGTGGCAAGAAAACTCCATTTATAGTCAC-CTATGCCTTCAAAAGCTTTATTACTTGCT
64 CCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCT
* * * * * * *
33821 GTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCTGATTTTTTTTACATTTTTTGTTAAAAAA
128 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATA
* * * * * * ** * **
33886 TATTATAATTCAATG-CGTGCCTCT-AGAACCATAAAGAAAAAGCTTTTCATTGATAAGAAAAGT
193 GATTATAATTGAATGTC-TACCT-TAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGT
* * ** *** *
33949 CTATTTATAGTCACCCATAACTTC-AAAGGCCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAATATCA
256 CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAA-GCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCA
* * * * * * *
34013 TAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTACATTTTTGGTCAAAACATATTATAATTAAATGTCTTCC
320 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCC
* * * * * *
34077 ATAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAATCCTT
385 TTAGGAAACATGAAG-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* *** * *** * *
34142 CGGAAGCCTTATTACTTGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACCAGAAATGT
449 CGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* * ** * ** * * **
34206 TTTACATTTTTGGTTAAAAAAAATTATAATTGAATGTCCACCTCATTAAACATAAATAAAAATTC
1 TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
* ** * * *
34271 AGTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CTATAACTTCAAAAGCCCTATTACTCACTTT
66 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTT
* * *
34335 AAATAGTTTTATAATCTCATAGTTAATTTTAAGTTGAATTT
130 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT
34376 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 8677, Mismatches: 2290, Indels: 866
0.73 0.19 0.07
Matches are distributed among these distances:
463 5 0.00
464 1 0.00
466 1 0.00
467 1 0.00
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TTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGAAAACATGAAGAAAAAGCC
ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGAT
TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
TATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
ATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGA
AACATGAAGAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGC
CTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTT
Found at i:31096 original size:169 final size:169
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30770 TCAAGCCTTT
* * * * *
30780 GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGCGATTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTT
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* * * * * * *
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***
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* *
30949 GAAAGCCTTAGTACTCACTTGAAG-TATTTTACAATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTCTTT
1 GAAAGCCTTAGTACTCACTTGAAGCGA-TTTACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTT
* * * * * * *
31013 TATATTGTTTGTTCAAATAGAATATAATTAAACGAT-TGCCTTAGGAAACATGAA-TAAAAGCCA
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*
31076 TTCATTCAAAAGCTAAGTCCATTTA
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ACATTGTTTCTTCAAACAGAATATAATTAAACGTCTACCCTAAGAAACATGAAGAAAAAGCCATT
CATTCAAAAGAAAGTCCATTTACGGTCACACATGACTTG
Found at i:32251 original size:171 final size:168
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31398 CAAGCCTTTG
* * * * *
31408 AAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAATCTTATAATTGAATTTAGGTT-GAATGTTTT
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* * * * * ** ** * *
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* * * ** *
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* ** * * *
31580 AAAGCATTATTACTTACTTTAAATGATTTTGTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTG
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTT-
* * * * ** *
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* ** * * **
31707 GGTTATTCATTGGCAAA-AAAAGTCC-TTTAGAGTCA-CTCA-AGCCTTCCA
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* * * * * *
31755 TAA-CCTTATTACTTGTTTTAAATAGGTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATTAGATTTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTT
* ** * * * * * * ** *
31819 TTACAATTTGAGTTAAAACATATTATAATAGAATGTCTACCTC-GAGAAATGTGAAG-ATGAAGC
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* * * **
31882 CATTC-ATTGACAAAAAAAGTCCATTCATAGTCACCTATACCTTCA
125 CA-TCAATGGA-AAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * * * *
31927 AAAGCCTTATTACTCGCATTAAATGGTTTAATAATCTCACAATTGATTTTAAGGT-GATTTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTT
* *
31991 ATATTATTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAATC-TGAAGCAAAAGCCAT
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* *
32055 CCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACTTATACCTTCA
128 -CAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * * * *
32097 AAAGCAC-TATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAAACTTATAATTAATATTAAGTTAAATTTTTT
1 AAAGC-CTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTT
* * * * * *
32161 TATATTTTTCATTAAAACATATAATATTTGAATGTTTGCATCAGGAAACATGAAG-AAATATCCA
64 TATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAA-AGCCA
* * * ** *
32225 TACAATGGTATGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATACCTTCA
127 T-CAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * *
32268 AAAGCCTTATTACTTGCTTTAGATGGTTTATAATA-TCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGTTTTATAA-ACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTT
* * *
32332 ATATTATTGGTTAAAATAGATTATATTTAAATGTTTGCCTCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATC
65 ATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATC
* * *
32397 AATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT-ACTCA-TTCA-AGCCTTCG
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* * * *
32438 AAA-CCTTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAATGATTTTAAGAT-GAATGTTT
1 AAAGCC-TTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAG-ATTTTT
* * * * * * * * *
32501 TTACATTTTTGGTTAAAACAGAATATAATTGAATGTCTAT-CTTGA-GAAACATGAA-AAAAAGC
63 TTATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGT-T-TGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGC
** * *** *
32563 CATTCGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACCCATACCTTCA
125 CA-TCAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
*** * * * *
32608 AAAATGTTATTACTCACTTCAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GAATTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTT
* * * * * * * * * *
32672 ATACTGTTCATTAAAATAGATAATAATTGAATATCTGTCTCAGAAAACGTGAAGTAAAAGCCATC
65 ATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATC
* * * ** * *
32737 TATTGGAGGAA-AAAAATCCAGTTATAGTCA-CTCATGCTTTCA
129 -AATGGA--AAGAAAAGTCCATTTATAACCACCT-ATACCTTCA
** * * *
32779 AAAGTATTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAT-AACGTCATAATT-ATTTTTGAGTT-GAATTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAAC-TCATAATTGA-TTTTAAGTTAGATTTTT
* * * * * ** * * * *
32841 TTATATTGTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAGTGTGTAACTCAAGAAACATGATGCAAAATCTA
63 TTATATTATTA-TTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCA
* * ** * * *** *
32906 CCCATTGGAGTGAAAAGTACATTCATTGTCA-CTCATACCTTCC
127 -TCAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCT-ATACCTTCA
** * * * *
32949 AAAGCCTTATTACTCAG-TTTAAATGGTTTTATAATTTTATAATTGATTTTAAG-TCGAATATGT
1 AAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAG-ATTTTT
* * * * * * * * * * ** *
33012 TTACATTTTTTGTTAAAATATATTATAATTGAATATCTGCCTTAGAAAATATGAAAAAAAAGTCA
63 TTATA-TTATTATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCA
* * * * *** * * *
33077 TCCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTTA-CTCATGCTTTCT
127 T-CAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCT-ATACCTTCA
* * * *
33120 AAAGCCCTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATTATTAATTTTAAGTT-GATTTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGA-TTTTTT
* * * * * ** * *
33184 TATATTTTTGATTAAAAAAAATTATATTTGAATCTCTATCTCAGGAAACATGGAGAAAAAGCCAT
64 TATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCA-
* * ** * **
33249 TCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTG
127 TCAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * * *
33291 AAAGCCTTATTACTCGCTCTAAATGGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTAAGTT-GAATTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTT
* * * * * * * * *
33355 ATACTACTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAAGAAATATGAAGCAAAAACTATC
65 ATATTATTA-TTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATC
* ** * * ** * *
33420 CATTAAAGAGAAAACTCCATTCATAGTCA-CTCATGCCTTTA
129 AATGGAA-AGAAAAGTCCATTTATAACCACCT-ATACCTTCA
** * * * * ** *
33461 AAAGTATTAGTACTCTG-TTTGAATGGTTATGTAATGTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTT
* * * * * * * * * * * * *
33525 TAAATTTATGACTAAAACAAATTATAATTCAATATCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGTCAT
64 TATA-TTATTATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCA-
* * * *
33590 TC-ATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCCACC-ATGCCTTCA
127 TCAATGGA-AAGAAAAGTCCATTTATA-ACCACCTATACCTTCA
* * * * *
33632 AAAGCATTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATATTTAATTTTAAGTT-GAATTTGTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAG-ATTT-TT
* * * * * *
33696 TGTAT-TTATTGTTAAAACAGATTATATTTAAATGTTTACCT-TGAGAAACATGAAGAAAAAGCC
63 T-TATATTATTATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCC
* * * ** *
33759 ATTCAGTGGCAAGAAAACTCCATTTATAGTCACCTATGCCTTCA
126 A-TCAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * * * *
33803 AAAGCTTTATTACTTGCTGTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCT-GATTTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGA-TTTTTT
* * * * * * * ** * * * *
33867 TACATTTTTTGTTAAAAAATATTATAATTCAATGCGTGCCTCTA-GAACCATAAAGAAAAAGCTT
64 TATA-TTATTATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTC-AGGAAACATGAAGCAAAAGC-C
* * * ** * *
33931 TTC-ATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATAACTTCA
126 ATCAATGGA-AAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * *
33974 AAGGCCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAATA-TCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAA-ACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTT
* * * * * * * * *
34037 TACATTTTTGGTCAAAACATATTATAATTAAATGTCTT-CCAT-AAGAAACATGAAGCAAAAGCC
64 TATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGT-TTGCC-TCAGGAAACATGAAGCAAAAGCC
* * * ** * *
34100 ATCCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTA-ATCCTTCG
126 AT-CAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATA-CCTTCA
* * * * ** * *
34144 GAAGCCTTATTACTTGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA-CCAGAAATGTTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAG-ATTTTTT
* * * * * * *** ** * ** **
34208 TACATTTTTGGTTAAAAAAAATTATAATTGAATGTCCACCTCATTAAACATAAATAAAAATTCAG
64 TATATTATT-ATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCA-
* * ** *
34273 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATAACTTCA
127 TCAATGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
* * * * *
34315 AAAGCCCTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAGTTAATTTTAAGTT
1 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTT
34370 GAATTTNNNN
Statistics
Matches: 2182, Mismatches: 482, Indels: 252
0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
167 1 0.00
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ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (168 bp):
AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTA
TATTATTATTAAAATAGATTATATTTGAATGTTTGCCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCAA
TGGAAAGAAAAGTCCATTTATAACCACCTATACCTTCA
Found at i:32265 original size:341 final size:339
Alignment explanation
Indices: 31408--34371 Score: 2451
Period size: 341 Copynumber: 8.7 Consensus size: 339
31398 CAAGCCTTTG
* * * *
31408 AAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAATCTTATAATTGAA-TTTAGGTTGAATGTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAATCTCATAATT-AATTTTAAGTTGAAT-TTTT
* *** * * *
31472 TTATATTTTTGGTTAAAATGGATTAGAATTGAATGCCT-ATCTTAGGAAACATGAAGTAAAAGCC
63 TTATATTTTTGATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTCATC--AGGAAACATGAAGAAAAAGCC
* * * ** * **
31536 ATCCATTGG-AGAGAAAAGTCTATTTATATTCAGACATACCATT-AAAAGCATTATTACTTACTT
126 ATTCATTGGTA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACC-TTCAAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * * * *
31599 TAAATGATTTTGTAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTGT-TATTTTTAATTAAAATA
189 TAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTT-TATATTATTAGTTAAAATA
* * * * * * ** *
31663 TATTTATAATTTTATTTGTTTG-CTTTGAGAGACAT-AAGCAAGGAGGTTATTCATTGGCAAA-A
252 GA-TTATAA-TTGA-ATGTTTGCCTTAG-GAAACATGAAGCAA--AAGCCATCCATTGG-AAAGA
* * *
31725 AAAGTCC-TTTAGAGTCACTCAAGCCTTCCA
310 AAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTT-CA
* * * * * * *
31755 TAA-CCTTATTACTTGTTTTAAATAGGTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAATT-AGATTTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGA-ATTTTTT
* ** * * * ** **
31818 TTTACAATTTGAGTTAAAACATATTATAATAGAATGTCTACCTC-GAGAAATGTGAAGATGAAGC
64 TATA-TTTTTGA-TTAAAACAAATTATAATTGAATGTCT-CATCAG-GAAACATGAAGAAAAAGC
** * * * *
31882 CATTCATTGACAAAAAAAGTCCATTCATAGTCACCTATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCATT
125 CATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTT
* * *
31947 AAATGGTTTAATAATCTCACAATTGATTTTAAGGTGATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGAT
190 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGAT
32012 TATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAATC-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCAT
255 TATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAA-CATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCAT
** *
32076 TTATAACCACTTATACCTTCA
319 TTATAGTCACTTATGCCTTCA
* * * * * *
32097 AAAGCACTATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAAACTTATAATTAATATTAAGTTAAATTTTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTT
* * * * * * * *
32162 ATATTTTTCATTAAAACATATAATATTTGAATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGAAATATCCATA
65 ATATTTTTGATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCT-CATCAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATT
* * * * *
32227 CAATGGTATGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAGAT
129 CATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT
* *
32292 GG-TTTATAATATCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTATATTATTGGTTAAAATAGATTAT
194 GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-GATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGATTAT
* * ** * *
32356 ATTTAAATGTTTGCCTCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCAATTGGCAAGAAAAGTCCATTTAT
258 AATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTAT
* * *
32421 ACTCA-TTCAAGCCTTCG
323 AGTCACTT-ATGCCTTCA
* * * * * *
32438 AAACCTTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAATGATTTTAAGATGAATGTTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTT
* * *
32503 ACATTTTTGGTTAAAACAGAA-TATAATTGAATGTCT-ATCTTGAGAAACATGAA-AAAAAGCCA
65 ATATTTTTGATTAAAACA-AATTATAATTGAATGTCTCATC-AG-GAAACATGAAGAAAAAGCCA
* * * *** * *
32565 TTCGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACCCATACCTTCAAAAATGTTATTACTCACTTCAA
127 TTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * *
32630 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATACTGTTCA-TTAAAATAGATA
192 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTATATTATT-AGTTAAAATAGATT
* * * * * * * * * *
32694 ATAATTGAATATCTGTCTCAGAAAACGTGAAGTAAAAGCCATCTATTGGAGGAA-AAAAATCCAG
256 ATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGA--AAGAAAAGTCCAT
* *
32758 TTATAGTCACTCATGCTTTCA
319 TTATAGTCACTTATGCCTTCA
* * * *
32779 AAAGTATTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA-CGTCATAATTATTTTTGAGTTGAA-TTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAATC-TCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * * * * * * * * *
32842 TATATTGTT-AGTTAAAACAGATTATAATTGAGTGTGTAACTCAAGAAACATGATGCAAAATCTA
64 TATATTTTTGA-TTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTCA-TCAGGAAACATGAAGAAAAAGCCA
** * * * * * *
32906 CCCATTGG-AGTGAAAAGTACATTCATTGTCACTCATACCTTCCAAAGCCTTATTACTCAG-TTT
127 TTCATTGGTA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTC-GCTTT
* * * * * * * * *
32969 AAATGGTTTTATAATTTTATAATTGATTTTAAGTCGAATATGTTTACATTTTTTGTTAAAATATA
190 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGA
* * * * ** * * * *
33034 TTATAATTGAATATCTGCCTTAGAAAATATGAAAAAAAAGTCATCCATTAGTAAGAAAAGTCTAT
254 TTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCAT
* * * *
33099 TTATAGTTACTCATGCTTTCT
319 TTATAGTCACTTATGCCTTCA
** * *
33120 AAAGCCCTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATTATTAATTTTAAGTTGATTTTTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTT
* * * *
33185 ATATTTTTGATTAAAAAAAATTATATTTGAATCTCT-ATCTCAGGAAACATGGAGAAAAAGCCAT
65 ATATTTTTGATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTCA--TCAGGAAACATGAAGAAAAAGCCAT
** *
33249 TCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTCTAAA
128 TCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * *
33314 TGGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATACTACTAGTTAAAATAGATTAT
193 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGATTAT
* * * * * * * *
33379 AATTGAATGTCTGCCTTAAGAAATATGAAGCAAAAACTATCCATT-AAAGAGAAAACTCCATTCA
258 AATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAA-AGAAAAGTCCATTTA
* *
33443 TAGTCACTCATGCCTTTA
322 TAGTCACTTATGCCTTCA
* * * * * * * *
33461 AAAGTATTAGTACTCTG-TTTGAATGGTTATGTAATGTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT
1 AAAGCATTATTACTC-GCTTTAAAT-GTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * * * * * * *
33525 TAAATTTATGACTAAAACAAATTATAATTCAATATCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGTCAT
64 TATATTTTTGATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCT-CATCAGGAAACATGAAGAAAAAGCCAT
* * * * *
33590 TCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-CACCATGCCTTCAAAAGCATTATTACTTGCTTTAA
128 TCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * *
33654 ATGGTTTTATAATCTCATATTTAATTTTAAGTTGAATTTGTTTGTAT-TTATT-GTTAAAACAGA
192 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG-ATTT-TTT-TATATTATTAGTTAAAATAGA
* * * * * * * *
33717 TTATATTTAAATGTTTACCTT-GAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCAGTGGCAAGAAAACTCCA
254 TTATAATTGAATGTTTGCCTTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCA
*
33781 TTTATAGTCACCTATGCCTTCA
318 TTTATAGTCACTTATGCCTTCA
* * * * * *
33803 AAAGCTTTATTACTTGCTGTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGCTGATTTTTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAAT-GTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTT
* * * * *
33868 ACATTTTTTG-TTAAAA-AATATTATAATTCAATG-CGTGCCTCTA-GAACCATAAAGAAAAAGC
65 ATA-TTTTTGATTAAAACAA-ATTATAATTGAATGTC-T-CATC-AGGAAACATGAAGAAAAAGC
** * * * * * *
33929 TTTTCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATAACTTCAAAGGCCTTATTACTTGTTTT
125 CATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTT
* * * * * * *
33994 AAATGGTTTTATAATATCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTACATTTTTGGTCAAAACATAT
190 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGAT
* * * * *
34059 TATAATTAAATGTCTT-CCATAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGCAAGAAAAGTCCAT
255 TATAATTGAATGT-TTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCAT
*
34123 TTATAGTCACTTAAT-CCTTCG
319 TTATAGTCACTT-ATGCCTTCA
* * * * * *** * *
34144 GAAGCCTTATTACTTGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACCAGAAATGTTTT
1 AAAGCATTATTACTCGCTTTAAATG-TTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTT
* * * ** * * ** *
34209 ACATTTTTGGTTAAAAAAAATTATAATTGAATGTC-CACCTCATTAAACATAAATAAAAATTCAG
65 ATATTTTTGATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTCA--TCAGGAAACATGAAGAAAAAGCCAT
* * * * *
34273 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATAACTTCAAAAGCCCTATTACTCACTTTAAA
128 TCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * *
34338 TAGTTTTATAATCTCATAGTTAATTTTAAGTTGA
193 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA
34372 ATTTNNNNNN
Statistics
Matches: 2110, Mismatches: 428, Indels: 164
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
339 7 0.00
340 218 0.10
341 1075 0.51
342 494 0.23
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344 18 0.01
345 17 0.01
346 73 0.03
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348 1 0.00
349 2 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (339 bp):
AAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
TATTTTTGATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTCATCAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCA
TTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGG
TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATTTTTTTATATTATTAGTTAAAATAGATTATAAT
TGAATGTTTGCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGT
CACTTATGCCTTCA
Found at i:34821 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 34476--34868 Score: 425
Period size: 170 Copynumber: 2.3 Consensus size: 170
34466 NNNNNNNNNN
* * * *
34476 ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGATTAATAAAGCTTTT-GAAGGCTTAAGTGACTGCAT
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* * * **
34540 ATAGACTTTCGTTGCCAATGGATGACTTTGCTTCACATTTTTCAAGGCAAACACTCAATTTTAAT
65 ATAGACTTTCCTTGCCAATGGATGACTTTGCTTCACATTTCTCAAGACAAACACTCAATTAGAAT
* * * * * *
34605 TTATTTTAATAAAAAATATAAAATAATTTAATTTAAAATCA
130 ATATTTAAATAAAAAAGATAAAATAACTCAAATTAAAATCA
* *
34646 ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAGGCGAGTAATAAGGTTTTCGAAGACTTAAGTGACTATATA
1 ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGTTTTCGAAGACTTAAGTGACTACATA
* * * * * * * **
34711 TGGACTTTCCTTGTCAATGGATGCCTTTTGTTTCACGTTTCCTGAA-ACAGACGTTCAATTAGAA
66 TAGACTTTCCTTGCCAATGGATGAC-TTTGCTTCACATTT-CTCAAGACAAACACTCAATTAGAA
* *
34775 TATATTTAAATAAAAAAGGTAAAA-AACCTCAAATT-AAATTA
129 TATATTTAAATAAAAAAGATAAAATAA-CTCAAATTAAAATCA
* * * * *
34816 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAACAAGGCTTTCAAAGACTTA
1 ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGTTTTCGAAGACTTA
34869 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 185, Mismatches: 34, Indels: 8
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
169 7 0.04
170 126 0.68
171 49 0.26
172 3 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (170 bp):
ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGTTTTCGAAGACTTAAGTGACTACATA
TAGACTTTCCTTGCCAATGGATGACTTTGCTTCACATTTCTCAAGACAAACACTCAATTAGAATA
TATTTAAATAAAAAAGATAAAATAACTCAAATTAAAATCA
Done.