Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018398511.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_1804.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 3643
ACGTcount: A:0.29, C:0.11, G:0.09, T:0.30
Warning! 714 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:346 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 1--422 Score: 492
Period size: 171 Copynumber: 2.5 Consensus size: 171
* * * *
1 CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACCCGCTTTAAAT
1 CATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCTTTAAAT
* * * *
66 -GCTTTTTTAATCTCATTATTAGTCTAAAGTTAAAGTTTTTTATATTTTTTTATTAAAATAGATT
66 AG-TTTTTTAATCTCATTATTAGTCTAAAGTTAAACTTTTTTACATTTTTTAATTAAAACAGATT
** * * * *
130 ATAATTGAATGTCTGCCTCAAGCAACGTGAAGAAAAAAAATC
130 ATAATTGAACATCTACCTCAAGAAAAGTAAAGAAAAAAAATC
* *
172 CATTGGCAAGAGTAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATGACTCGCTTTAAAT
1 CATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCTTTAAAT
********** *
237 AGTTTTTTAATCTCATNNNNNNNNNNAAGTTGAACTTTTTTACA-TTTTTAATTAAAACAGATTA
66 AGTTTTTTAATCTCATTATTAGTCTAAAGTTAAACTTTTTTACATTTTTTAATTAAAACAGATTA
* *
301 TAATTGAACATCTACCTCAA-AAAAGATAAAGAAAATGATATC
131 TAATTGAACATCTACCTCAAGAAAAG-TAAAGAAAA-AAAATC
* *
343 CATTGGCAAGAGAAGTCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCCTTAAAT
1 CATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCTTTAAAT
*
408 A-TTTTTATAACCTCA
66 AGTTTTT-TAATCTCA
423 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 214, Mismatches: 33, Indels: 8
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.01
170 48 0.22
171 162 0.76
172 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.18, G:0.11, T:0.34
Consensus pattern (171 bp):
CATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCTTTAAAT
AGTTTTTTAATCTCATTATTAGTCTAAAGTTAAACTTTTTTACATTTTTTAATTAAAACAGATTA
TAATTGAACATCTACCTCAAGAAAAGTAAAGAAAAAAAATC
Found at i:449 original size:171 final size:160
Alignment explanation
Indices: 1--529 Score: 409
Period size: 171 Copynumber: 3.1 Consensus size: 160
* * * * * *
1 CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACCCGCTTTAAAT
1 CATTGGCAAGAGAAGTCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCCTTAAAT
* * * *
66 -GCTTTTTTAATCTCATTATTAGTCTAAAGTTAAAGTTTTTTATATTTTTTTATTAAAATAGATT
66 AG-TTTTTTAACCTCATTA--AGT-T---G---AACTTTTTTA-A-ATTTTTATTAAAACAGATT
* * * * *
130 ATAATTGAATGTCTGCCTCAAGCAACG-TGAAGAAAAAAAATC
119 ATAATTGAATGTCTACCTCAA-AAAAGATGAAGAAAAGATATC
* * * *
172 CATTGGCAAGAGTAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATGACTCGCTTTAAAT
1 CATTGGCAAGAGAAGTCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCCTTAAAT
* * *
237 AGTTTTTTAATCTCATNNNNNNNNNNAAGTTGAACTTTTTTACATTTTTAATTAAAACAGATTAT
66 AGTTTTTTAACCTCAT---------TAAGTTGAACTTTTTTAAATTTTT-ATTAAAACAGATTAT
** *
302 AATTGAACATCTACCTCAAAAAAGATAAAGAAAATGATATC
121 AATTGAATGTCTACCTCAAAAAAGATGAAGAAAA-GATATC
343 CATTGGCAAGAGAAGTCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCCTTAAAT
1 CATTGGCAAGAGAAGTCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCCTTAAAT
* * *
408 A-TTTTTATAACCTCANNNNNNNNNNTAAGTTGAATTTTTTTATAATTTTTATTATAACAGATTA
66 AGTTTTT-TAACCTCA---------TTAAGTTGAACTTTTTTA-AATTTTTATTAAAACAGATTA
* * * *
472 TAATT-AATGTCTACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGGTATC
120 TAATTGAATGTCTACCTCAAAAAAGATGAAG-AAAAGATATC
*
513 CATTGGCAAGAAAAGTC
1 CATTGGCAAGAGAAGTC
530 CNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 297, Mismatches: 36, Indels: 51
0.77 0.09 0.13
Matches are distributed among these distances:
169 8 0.03
170 83 0.28
171 193 0.65
172 7 0.02
174 1 0.00
177 1 0.00
178 3 0.01
180 1 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.16, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (160 bp):
CATTGGCAAGAGAAGTCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATCACTCGCCTTAAAT
AGTTTTTTAACCTCATTAAGTTGAACTTTTTTAAATTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGT
CTACCTCAAAAAAGATGAAGAAAAGATATC
Found at i:1073 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 655--1320 Score: 548
Period size: 171 Copynumber: 3.9 Consensus size: 169
645 GAGAAATGTG
* * ** * ** ** *
655 AAGAAAAAGATATCCATTAGCAAGAAAAGTCTATTTATAGCCACTTATGCCTTCAAAAGCCTTAT
1 AAGAAAAAGATATCTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAATCACCCATACCTTCAAAAGCCTTAT
* * * * *
720 TACTCGTTTTAAATGATTTTATAACCTCATAATTAATTTTACTTTGAGTTTTTTTATATTTTTTA
66 TACTTGCTTTAAATGATTTTATAACCTCATAA-TAGTTTTAATTTGAATTTTTTTATA-TTTTTA
* ** * * *
785 TTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTGGATAAACGTG
129 TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATA
* * * * *
826 AAGAAAAAGATATTTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGTCTTAT
1 AAGAAAAAGATATCTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAATCACCCATACCTTCAAAAGCCTTAT
* * * * * * * * *
891 TTCTTACTTTAAATGCTTTTTTAATCTAATGACTAGTTTTAAGTTGAACTTTTTTATATTTTTAT
66 TACTTGCTTTAAATGATTTTATAACCTCAT-AATAGTTTTAATTTGAATTTTTTTATATTTTTAT
956 T-AAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATA
130 TAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATA
* * ** * *
995 AAGAAAATGATATCCT-TTGGTAAGAAAAGTCCATTTGTAATCACCCATACCTTCAAAAACCTTA
1 AAGAAAAAGATAT-CTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAATCACCCATACCTTCAAAAGCCTTA
* * * * * *
1059 TTACTTGGTTTAAATAATTTTATAACCTCATAATTGATTTCAATTTAAATTTTTTTTCTAATTTT
65 TTACTTGCTTTAAATGATTTTATAACCTCATAATAG-TTTTAATTTGAA-TTTTTTTAT-ATTTT
********** *
1124 TATTAAAACAGATTATAATTGAATGTNNNNNNNNNNAAACGTA
127 TATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATA
* * * ** * * *
1167 AAGAAAATGATATCCATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACACATGCCTT-AGAAAGCCTTA
1 AAGAAAAAGATATCTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAATCACCCATACCTTCA-AAAGCCTTA
* * * * * *
1231 TTACTCGCTTTAAATAATTTTATGACCTTATAATTGATTTTAATTTAAATTTTTTTATAATTTTC
65 TTACTTGCTTTAAATGATTTTATAACCTCATAATAG-TTTTAATTTGAATTTTTTTAT-ATTTT-
*
1296 T-TTAAAACATATTATAATTGAATGT
127 TATTAAAACAGATTATAATTGAATGT
1321 TTACCTTGAG
Statistics
Matches: 403, Mismatches: 83, Indels: 18
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
168 3 0.01
169 115 0.29
170 16 0.04
171 144 0.36
172 125 0.31
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (169 bp):
AAGAAAAAGATATCTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAATCACCCATACCTTCAAAAGCCTTAT
TACTTGCTTTAAATGATTTTATAACCTCATAATAGTTTTAATTTGAATTTTTTTATATTTTTATT
AAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATA
Found at i:1287 original size:341 final size:342
Alignment explanation
Indices: 704--1320 Score: 756
Period size: 341 Copynumber: 1.8 Consensus size: 342
694 GCCACTTATG
* * * * * *
704 CCTTCAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAACCTCATAATTAATTTTACTTTGAGT
1 CCTTCAAAAACCTTATTACTCGGTTTAAATAATTTTATAACCTCATAATTAATTTCAATTTAAGT
* *
769 TTTTTTATATTTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTGGATAAACGTGAAGAAAAA
66 TTTTTTATAATTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTGGATAAACGTAAAGAAAAA
** * * * * *
834 GATATTTATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGTCTTATTTCTTACT
131 GATATCCATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAGTCACACATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCACT
** * * * *
899 TTAAATGCTTTTTTAATCTAATGACTAGTTTTAAGTTGAACTTTTTTAT-ATTTT-TATT-AAAC
196 TTAAATAATTTTATAACCTAATAACTAGTTTTAAGTTAAACTTTTTTATAATTTTCT-TTAAAAC
961 AGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATAAAGAAAATGATATCCTTTGGTAAGAAAAGTC
260 AGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATAAAGAAAATGATATCCTTTGGTAAGAAAAGTC
1026 CATTTGTAATCACCCATA
325 CATTTGTAATCACCCATA
* * *
1044 CCTTCAAAAACCTTATTACTTGGTTTAAATAATTTTATAACCTCATAATTGATTTCAATTTAAAT
1 CCTTCAAAAACCTTATTACTCGGTTTAAATAATTTTATAACCTCATAATTAATTTCAATTT-AAG
* * **********
1109 TTTTTTTCTAATTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTNNNNNNNNNNAAACGTAAAGAAAA
65 TTTTTTTATAATTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTGGATAAACGTAAAGAAAA
* * ** *
1174 TGATATCCATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACACATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCGC
130 AGATATCCATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAGTCACACATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCAC
* * * * *
1239 TTTAAATAATTTTATGACCTTATAA-TTGATTTTAATTTAAATTTTTTTATAATTTTCTTTAAAA
195 TTTAAATAATTTTATAACCTAATAACTAG-TTTTAAGTTAAACTTTTTTATAATTTTCTTTAAAA
*
1303 CATATTATAATTGAATGT
259 CAGATTATAATTGAATGT
1321 TTACCTTGAG
Statistics
Matches: 225, Mismatches: 47, Indels: 7
0.81 0.17 0.03
Matches are distributed among these distances:
340 56 0.25
341 141 0.63
342 7 0.03
343 21 0.09
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (342 bp):
CCTTCAAAAACCTTATTACTCGGTTTAAATAATTTTATAACCTCATAATTAATTTCAATTTAAGT
TTTTTTATAATTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTGGATAAACGTAAAGAAAAA
GATATCCATTGGCAAGAAAAACCCATTTATAGTCACACATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCACT
TTAAATAATTTTATAACCTAATAACTAGTTTTAAGTTAAACTTTTTTATAATTTTCTTTAAAACA
GATTATAATTGAATGTCTGCCTCAAAAAACATAAAGAAAATGATATCCTTTGGTAAGAAAAGTCC
ATTTGTAATCACCCATA
Found at i:2373 original size:168 final size:161
Alignment explanation
Indices: 2112--2444 Score: 367
Period size: 168 Copynumber: 2.0 Consensus size: 161
2102 TGGCAAGAGA
2112 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCGGCTTAAATGATTTTATAATCT
1 AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCGGCTTAAATGATTTTATAATCT
* *
2177 CATAATTGATTTTAATTTTAA-TTTTTT-TATTTTTTATT-AAACAGATTATAATTGAATGTCTG
66 CATAATTGATTTTAAGTTGAACTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTG
* *
2239 -CCTCGAAAAACGTAAAGAAAATGATATCCAT
131 TCC-CGAAAAACATAAAGAAAAAGATATCCAT
*
2270 NNNNNNNNNNAGTCCATTTATTGTCACCCATGCCTTTA-AAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAAT-
1 ----------AGTCCATTTATAGTCACCCATGCC-TTAGAAAGCCTTATTACTCGGC-TTAAATG
* * *
2332 AGTTTTGTAATCTCATAATTAGCTTTT-AGTTGAACTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTG
54 A-TTTTATAATCTCATAATT-GATTTTAAGTTGAACTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTA
* * *
2396 TAATTGAATGTTTGTCCCGAGAAACATGAAGAAAAAGATATCCACT
117 TAATTGAATGTCTGTCCCGAAAAACATAAAGAAAAAGATATCCA-T
2442 AGT
1 AGT
2445 AAGAAAAGTC
Statistics
Matches: 145, Mismatches: 11, Indels: 24
0.81 0.06 0.13
Matches are distributed among these distances:
162 3 0.02
167 3 0.02
168 66 0.46
169 14 0.10
170 11 0.08
171 45 0.31
172 3 0.02
ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (161 bp):
AGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAGAAAGCCTTATTACTCGGCTTAAATGATTTTATAATCT
CATAATTGATTTTAAGTTGAACTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTG
TCCCGAAAAACATAAAGAAAAAGATATCCAT
Found at i:2490 original size:171 final size:166
Alignment explanation
Indices: 2084--2853 Score: 564
Period size: 170 Copynumber: 4.5 Consensus size: 166
2074 NNNNNNNNNN
* *
2084 AAAGAAAATGATATCCATTGGCAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAGAAAGCCTTA
1 AAAGAAAATGATATCCA-TAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTA-AAAGCCTTA
* *
2149 TTACTCGGC-TTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAATTTTAATTTTTTTATTTTTTA
64 TTACTC-GCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATTTTTTA
*
2213 TTAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAAAAACGT
128 TTAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAAAAACAT
********* *
2252 AAAGAAAATGATATCCATNNNNNNNNNNAGTCCATTTATTGTCACCCATGCCTTTAAAAGCCTTA
1 AAAGAAAATGATATCCAT-AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCC-TTAAAAGCCTTA
* *
2317 TTACTCGCTTTAAAT-AGTTTTGTAATCTCATAATTAGCTTTT-AGTTGAACTTTTTTATATTTT
64 TTACTCGCTTTAAATGA-TTTTATAATCTCATAATT-GATTTTAAGTTGAA-TTTTTT-TATTTT
* * *
2380 TTATTAAAACAGATTGTAATTGAATGTTTGTCC-CGAGAAACAT
125 TTATT-AAACAGATTATAATTGAATGTCTG-CCTCGAAAAACAT
* * * * ** * **
2423 GAAGAAAAAGATATCCACTAGTAAGAAAAGTCCATTTATGGTCACGGATACCTTCAAAATTCTTA
1 AAAGAAAATGATATCCA-TAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTT-AAAAGCCTTA
********** * * *
2488 TTACTCGCTTTAAATGATTTTANNNNNNNNNNATTGATTTTAATTTGAATCTTTTTATAATTTTA
64 TTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTAT-TTTTTA
* * ** * *
2553 TAAAAATAGATTATAATTGAATGTCTATCTCGAGAAACGT
128 T-TAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAAAAACAT
* * * * *
2593 GAGGAAAAAGATATCCGTTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCAT-ACTTCAAAAGCCTTA
1 AAAGAAAATGATATCC-ATAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTT-AAAAGCCTTA
** * * ******* *
2657 TTACTTACTTTAAATGATTTTATAACCTGATAATTGATTTTAA-TTNNNNNNNNNNTATATTTTT
64 TTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT---GAATTTTTTTATTTTT
* * * **
2721 TATAAAAACAGATTATAATTGAATGCCTGCCTCGAGAAATGT
126 TAT-TAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAAAAACAT
* * * * * * **
2763 GAAG-AGATAGATATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATGTATAGTCATCCATGCTTTCGGAAGCCTT
1 AAAGAAAAT-GATATCCA-TAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTT-AAAAGCCTT
*
2827 ATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAAT
63 ATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAAT
2854 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 472, Mismatches: 107, Indels: 43
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.01
168 85 0.18
169 63 0.13
170 178 0.38
171 138 0.29
172 4 0.01
ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.12, T:0.36
Consensus pattern (166 bp):
AAAGAAAATGATATCCATAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAAAAGCCTTATT
ACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATTTTTTATTA
AACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAAAAACAT
Found at i:3641 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 3190--3643 Score: 457
Period size: 171 Copynumber: 2.7 Consensus size: 171
3180 NNNNNNNNNN
* * * *
3190 TTTTATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACATCAAGAAAAAGATATCGATTG
1 TTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATATCCATTG
* * *
3255 GCAAGCAAAGTTCA-TT-TAGTCACCTA-AGCCTTCGAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATGATT
66 GCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACCTATA-CCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGATT
********** *
3317 NNNNNNNNNNATAATTGATTTTAATTTAAATTTTTTAATAAT
130 TTATAGCCTTATAATTGATTTCAATTTAAATTTTTTAATAAT
* * * * *
3359 TTTTATTAAAAAAGATTATAATTAAATGTCTGCCTCGAGAAATATGAAGAAAAAGATATTCATTA
1 TTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATATCCATTG
* * *********** *
3424 GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAATGNNNNNNNNNNCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTT
66 GCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACCTATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGATTT
* *
3489 TATAGCCTTATAATTGATTTCAATTTGAATTTTTTTATAAT
131 TATAGCCTTATAATTGATTTCAATTTAAATTTTTTAATAAT
* * * * * *
3530 TTTCT-TTAAACCAGATTATAATTGAATGTTTACCACGAGAAACGTGAAGAACAAGATATCCATT
1 TTT-TATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATATCCATT
3594 GGCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACCTATACCTTCAAAAGCCTTATTAC
65 GGCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACCTATACCTTCAAAAGCCTTATTAC
Statistics
Matches: 219, Mismatches: 62, Indels: 6
0.76 0.22 0.02
Matches are distributed among these distances:
169 68 0.31
170 2 0.01
171 148 0.68
172 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.11, T:0.35
Consensus pattern (171 bp):
TTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATATCCATTG
GCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACCTATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGATTT
TATAGCCTTATAATTGATTTCAATTTAAATTTTTTAATAAT
Done.